    BRE_1002    1570 ..    1591 + -10.3  -3.50869   ATGAACAAAATATAA           CAGTACAAA TTCT TTTGTACTG            TTATATCAAATAGTA  91 98
    BRE_1003    3191 ..    3202 +    -3  -3.55657   AAATGCAGAAATATT                GTTA TTTT TAAC                 TCATTTTTTTAGTTA  45 277
    BRE_1017   19204 ..   19219 +    -9   -5.0917   TCATAAAAATAAAAG              CCCACA AAGG TGTGGG               TTTCTTTTTTCCTAA 100 122
    BRE_1018   20469 ..   20494 + -11.3  -3.54741   TATAAAATTATTAAA         CTAAGTCCATA AATA TGTGGACTTAG          TTTGCCAACATCGTC  95 141
    BRE_1019   21699 ..   21709 +  -2.6  -4.65838   ACATAGTTAATTATA                 TATT TGT AATA                 TTTTTGCAATATATG  57 241
    BRE_1039   40991 ..   41026 + -11.4  -3.19969   TTATTAACAAATTCA    TCTCCACCTA-AATCTC ATA GAAATTATAGGTGGAGA    ATTCTTTGTTATTAT  90 34
    BRE_1049   52930 ..   52940 +  -2.6  -3.47227   AAAAATTTTTATTGA                 TATA ATT TATA                 TTATACTAATTAAAA  44 245
    BRE_1050   53843 ..   53865 + -12.2   -4.2349   GCACCTGTTGATTAA           TCTGATCATT CCT AATGATCAGA           TTTTAAATATCAACA 100 26
    BRE_1069   69460 ..   69482 +  -7.8  -3.42548   AATTAAAAGAAACAA           TCTCCATC AATATAC GATGGAGA           TTAATATTAATTCAT  70 99
    BRE_1070   70495 ..   70513 +  -2.4   -5.1356   TTTAAATCTAACTGA             TGATGAAC TTT GTGCATTA             TTTTTCTTCGTAGAA  64 209
    BRE_1072   74196 ..   74218 +  -2.2  -3.76952   ATACAAAATAGGGAT           TTTAATTA TCTTATC TAATTAAA           TTTACATTCAATCAA  46 136
    BRE_1073 NONE
    BRE_1074   77756 ..   77772 +  -3.1  -3.16553   AAAAGTAAATTTAAA              TAATAAT AAT ATTGTTA              TATATTCGTAATTGT  46 55
    BRE_1079   85259 ..   85283 + -10.3  -2.69987   TAAATAATATTGAAC          GTATAAATAAT AAT ATTATTTATAC          CTATTAATTTTTATC  81 88
    BRE_1080   86297 ..   86342 +  -9.9  -2.83012   TTAATTATTTAAAAA CAAGATTCTACACTACAGCTT AAGC AAACAATAGTGTAGGATCTTG TATCATAATAACGTT  80 62
    BRE_1081   87400 ..   87427 +   -10  -4.67651   TCAGATAGATTAATA        ACAGATGTACTA CCAG TAGTACATCTGA         TTTATTTTAAACTCT 100 113
    BRE_1094  100154 ..  100181 + -14.4   -4.1711   AATTTTATAAGTGAA        TTACCAGGAAAT AAGT ATTTCCTGGTAA         TTTGTTAAAAGTAAT 100 264
    BRE_1095  101776 ..  101811 + -11.4   -2.7083   AAAATTAAAAAGAAT    ACTCCACCTATAATTTC TAT GAAATT-TAGGTGGAGA    TGAATTTGTAACGTA  83 154
    BRE_1097  104345 ..  104361 +  -4.5  -5.11881   ATTTAGTGTTTAGAG              TAAGAAA AGG TTTCTTG              TTGTTTTTTTTATTT  73 188
    BRE_1100  109591 ..  109610 +  -6.6  -3.13104   TGATTATAAGATATA            TACAAAAT CTGA ATTTTGTA             ATTTGTTAAATAATT  63 450
    BRE_1102  112763 ..  112792 +  -5.9  -5.56673   ATCAGAATGATTAAA       TAAAGCTTTCAAGG TGT TCTTGAG-GCTTTA       TTTTTTATTATACAT  85 73
    BRE_1103  113697 ..  113722 +  -6.3  -4.04174   TAAATTATTATTTAA         CCCTTTCTGATA ATG TGT-AGAAAGGG         TTTGATTATATAAAA  68 49
        pncA  116164 ..  116178 +  -2.2  -4.52047   TGATTAGTATTGAGG               TTTTAA AAA TTAGAA               TTTTGTAGTATAATA  54 189
    BRE_1106  117084 ..  117102 +    -4  -4.21994   TTATCACCTTAGTTT             TGTTTTTA TGT TAAAAATA             TTTGTATATGTGTTT  58 29
    BRE_1107  118030 ..  118048 +    -4  -4.52873   TAACAATACCTGATT             TTTTGTTA ATG TAATAAAA             TTATTTTTATGAAAA  60 524
        guaA NONE
    BRE_1109  121175 ..  121185 +  -2.6  -4.39226   TTATAATTTTGAATT                 TTAT TAA ATAA                 TTGTTTTATAGTTAT  55 80
    BRE_1110  122383 ..  122399 +  -2.4  -3.36289   TTTGATTTTTGTTTT              TATTAA TGGTC TTAATA              TTCATTAAAATGGTA   0 47
    BRE_1093 NONE
    BRE_1092   96465 ..   96476 -    -3  -4.00532   GCTTTAAATATTAAA                TGAA AACT TTCA                 TCTGTGCCTATTGAT  49 299
    BRE_1090   94984 ..   94996 -  -3.5  -3.09785   TTATATGTTAACATA                TTTTT AAC AAAAA                TTAAATATATGCAAA  45 43
    BRE_1089 NONE
    BRE_1088   93868 ..   93894 -  -9.6  -3.78837   ATATAATTAATATAA         TTTAAAGTCCCA ATG TGGGATTTTAAA         AAAAGAGTAAGAAGG  84 61
       ppap2 NONE
       ppap1 NONE
        pf32   91025 ..   91041 -  -4.5  -3.96618   TGTAAGCTTAAACAA              CAAAATT CTT AATCTTG              TCCATCAAAACTGAG  58 1
        pf49   90137 ..   90168 -   -12  -4.09511   AACATTTTCTTAAAA      TTTTTTCAATTTTT TTAA AAAAATTGAAAAAA       AAACAAAAAAACTCT 100 272
    BRE_1083   88970 ..   88983 -  -2.5  -3.36166   TTTGTAAAAAAGAAC               TAATA TCAA TATTA                AATTTTTTGTTTAAA  44 88
         bsr   87401 ..   87426 - -13.5  -3.81089   CAGATAGATTAATAA         CAGATGTACTA CCAG TAGTACATCTG          ATTTATTTTAAACTC 100 289
    BRE_1078   83507 ..   83521 -  -2.2  -3.53597   ATAACTATAACAACA               TATACT TTA AATATA               ATTACCTTAACCTTA  44 224
    BRE_1077   82789 ..   82799 -  -2.6  -4.33928   TATTTTAAATATAAA                 TTAT AAA ATAA                 CATAAATTAAAATAA  53 43
    BRE_1076   81494 ..   81542 - -15.8  -4.47163   AAGGAAAATAAATAA TAAAAGGGTTATCTTTAAAATT TCTAT AATCTTAAAGATAACCCTTTAA ATGACAAATATCAAT 100 120
    BRE_1075   79061 ..   79100 -  -4.4  -5.16038   ATAGAATAAATAAAA  TAAGAACCTACCTAATAT GCAA ACCTCAGGCAAGTCCTTA   TTTATATTACAGGGT  73 75
    BRE_1068   66682 ..   66711 - -13.1  -3.43788   AAAATATAAATAAAT       TTACCTTAAGACC CAAA AGTCTTAAGGTAA        GTAACTAAATTTATA 100 87
    BRE_1064 NONE
    BRE_1063 NONE
    BRE_1062   62329 ..   62339 -  -2.6  -4.88295   AAATAAACGTAAAAA                 TTTA AGT TAAA                 GTTTTCTAAGCATCA  59 21
    BRE_1061   61729 ..   61739 -  -2.6  -2.74144   CTCCTATTTTTAAAT                 TTAA CTT TTAA                 GTTTAATTTATTTTT  39 40
    BRE_1060 NONE
    BRE_1059 NONE
    BRE_1058 NONE
    BRE_1057   59557 ..   59568 -    -3  -2.84234   CATTAACCTAATAAC                TTTG AAAC CAAA                 AATTTTTCATACACT  40 1
    BRE_1056   58047 ..   58070 -  -2.6  -3.70043   TCTAACATATAAATA          TCCTCATAAAT AAA ATTT-TAAGGA          ATACGCGAGATTGCA  47 19
    BRE_1055   57448 ..   57470 -    -8  -4.41616   ATTCTCCTAAATAAA           TATAATTATA TTA TATAATTATA           TTTTAACCTTTATAA  81 28
    BRE_1054   55987 ..   55998 -  -2.2  -3.70676   GACACTCAAAATCAA                CAGG AGCA CCTA                 AATACCCAGAAATAA  46 469
    BRE_1052   54581 ..   54593 -  -3.5  -3.53744   TCATTTAAACAAAAT                TTAAT AAA ATTAA                TTAATTAAACTTCAA  49 166
    BRE_1051   53843 ..   53865 - -12.2  -3.14564   GCACCTGTTGATTAA           TCTGATCATT CCT AATGATCAGA           TTTTAAATATCAACA  93 222
    BRE_1048   50626 ..   50640 -  -2.2  -4.03782   AATATTATAACCAAA               TTAACT ATA AATTAA               GTTTTTCTTTTAACC  50 15
        nrdI NONE
        nrdE NONE
        nrdF   47082 ..   47113 -  -7.6  -5.33985   TTTAAAAAAAATAAA      CAATTGTTTATATA AATT TATATAAACAATCA       ATAGAATTATCAAAA 100 44
    BRE_1044   45946 ..   45958 -  -2.7  -5.42862   ATATGCCTAAAAAAA                TACCT AAA AGATA                CAAATTTTAGTATGC  67 173
    BRE_1043   44964 ..   44988 -  -7.2  -3.94877   ACCTTTTAATAACAA          TTAAAGGCCC ATAAA GGTCCTTTAA          TCTATAAATTTTTTA  71 27
    BRE_1042   43967 ..   43981 -  -2.2  -5.88061   AAAAAATTAAAAAAA               TCAATA TTC TATTAA               CCAAACTTTTGAAAT  76 165
    BRE_1041   43090 ..   43118 - -12.7  -3.19413   ATAAAATACAAATGA        GAAATAAAGACTT AAC AAGTCTCTATTTC        TATCTATTTCAATTA  95 75
    BRE_1040   40991 ..   41026 - -13.6  -2.77283   TTATTAACAAATTCA    TCTCCACCTA-AATCTC ATA GAAATTATAGGTGGAGA    ATTCTTTGTTATTAT  93 142
    BRE_1038 NONE
    BRE_1037 NONE
    BRE_1036   38406 ..   38417 -    -3  -5.05782   ATTGACTTTAAAAAA                TGAA ATTT TTCA                 AATTAAAATTATGAT  62 34
    BRE_1035   37554 ..   37570 -  -5.3   -3.4617   ATTAAGATGAATTAA              TAAATAA CTA TTATTTA              AAATTTTTTAATTTC  57 87
    BRE_1034   36816 ..   36835 -  -6.6  -2.93585   CGATATGTCAAATTA            CTATATAT ATAA ATATATAG             ATTAGAAATACCTAA  61 60
    BRE_1032   34961 ..   34973 -  -3.5  -4.05208   ACCTATAGTAAAGAA                TAAAT CAC ATTTA                TTTAATCAAACATTT  54 23
    BRE_1031   33541 ..   33570 - -16.7  -5.52807   AATAACAAACAAAAA       CATTAAATGGGCT TATA AGCCCATTTAATG        TTTAATTTATAACCA 100 27
    BRE_1030   32518 ..   32530 -  -4.9  -5.18297   GAATAACAAATAAAA                TGTAT GAT ATACA                CGATATTCATTACAT  74 91
    BRE_1029   31436 ..   31464 -  -6.1  -5.52909   TAATATTTAAAAAAA        TCTTGAGATTCCA ATT CAAAACCTCAAGA        TTTTTCTTTAATTTA  85 38
    BRE_1027 NONE
    BRE_1026   27820 ..   27831 -  -2.2  -4.82901   TTTTTTTCATAAAAA                CTCC TTTT AGAG                 CCTCAACATACTAGA  59 36
    BRE_1025   27003 ..   27015 -  -2.7  -4.28115   ATCTAGAATAAAGAA                CAATA ATT TACTG                TAATTCAAACTCATT  53 36
    BRE_1024   26021 ..   26038 -  -7.1  -2.65274   ATTAAAGATATTAAT             CTCTTTT AATC AAAAGAG              TAACATCAAATACAC  62 80
    BRE_1023   24546 ..   24556 -  -5.4  -3.22396   AATAATGATTAAAAC                 CATG AAA CATG                 CCATCAAATTTGGAT  56 469
    BRE_1021   22763 ..   22780 -  -9.9  -5.93252   TCGAAAAATAAAAAA             GTCCACA TATT TGTGGAC              TTAACTAATAACTAA 100 99
    BRE_1015   15209 ..   15234 -  -2.1  -4.76963   TTATATAATATAAAA         TCTACA-ATAAA GAC TTTATATGTAAA         CTTTGTCATTATCAA  59 351
    BRE_1014   14145 ..   14178 - -10.5  -4.84311   CTCTATATAATAAAA     TTGATGAAGTCCAAA TTTA TATGAACTTCATCAA      CGATTAATTAATTAA 100 72
    BRE_1011   11165 ..   11187 -    -2  -4.68456   ATTATCAAAAAACAA           TGCATAAATA CAT TCTATATGCA           TTTTCATAAAATTAA  56 195
    BRE_1009    9025 ..    9050 - -11.2  -5.19275   ATTCATAAAATAAAA         CTAAGCCTGC ACTTAA GCAGGCTCAG          AGAATATTTATACGT 100 103
    BRE_1008    7657 ..    7682 -  -6.3  -4.29034   AAATAAAAAACATAA         TAAGTCTACAT TTAA ATGCAAACTTA          TTTACAAGTTATTTA  70 93
    BRE_1007    6289 ..    6307 -  -3.8  -5.49234   ATATCTAATAAAAAA             GCCTGC CTTAAGT GCAGAC             TAATTAATAAATTAA  75 75
    BRE_1006    4925 ..    4964 - -13.4    -3.484   TCTATTATATTATAA  TAATAAAACTATATTACA ATAA TATAATATAGTTTTATTA   TAAATTTATACATAA 100 207
    BRE_1005    3939 ..    3959 -  -6.1   -4.8622   TTTCGTAATTAAAAA            GCCCACAAC TTT ACTGTAGGC            CTAAATGTAATTCCA  76 109
    BRE_1004 NONE
    BRE_1001 NONE
