        dnaA NONE
        dnaN    2531 ..    2542 +    -3  -4.46212   GACTATCAATGATTA                TCAT GCCT ATGA                 TTTTGTAATAAAACA  58 6
        gyrB    4895 ..    4923 + -10.5  -5.18371   GATGTGTAAAAATTT        ATCATTGAAGAAA TGA TTTCTTCAATGAG        TTTTGTTTTGTAAGA 100 32
   CJSA_0006    8025 ..    8040 +  -3.4  -4.94811   ATTTTTGCAAATCTA              TTAAAA TATT TTTTAA               TTTATTTATTTTTAA  66 40
        gltB NONE
   CJSA_0008 NONE
        gltD   15911 ..   15927 +  -2.9  -5.20328   ATAAATTCTTTATGA              GCTTTTG TGC CATAGGC              TTTGTTTTTTTCAAA  69 93
        ilvD   19234 ..   19256 + -13.6  -4.03815   GCGGTTTTAGATATG           GAATGAAAGG TTT CCTTTCATTC           TTCTATTTCTTTGGT 100 20
   CJSA_0016   22017 ..   22027 +  -5.4   -4.7497   GATCAATTACGGCAA                 TCAC ATT GTGA                 TTTTTGCTAAGTGCA  72 198
        purB NONE
        nrdA   32116 ..   32134 +  -5.3  -4.11484   CAATAAATACTAAAA             CCCAATG AAAAA TATTGGG             TTTTAAGAGATTAAG  64 35
        pyrG NONE
        recJ   37575 ..   37585 +  -2.6  -4.95876   TTGTTGTTAAAGAGA                 TTTT ATA AAAA                 TTTTTACTTATAATT  63 18
        ansA   38660 ..   38675 +  -3.4  -5.18561   AAATTCAAGAGTATT              TTTTAA AATA TTAAAA               TTTTTTAAATATTTC  69 12
   CJSA_0030 NONE
   CJSA_0031   46148 ..   46162 +  -2.2  -2.78088   AAGCATATAAAGGTA               TTAATG ATA TATTAA               ATTCTTAAAAAATTT  40 3
   CJSA_0032 NONE
   CJSA_0033   52162 ..   52193 +  -5.9  -4.48072   GAAAAAATTCCATAG      TGCCAAGCTAAGC CTTAAA GCTTAGCTTGAAA       TTTTATCATCAGTCT  71 60
   CJSA_0036   55548 ..   55580 + -15.1   -3.4072   TTTAGCCAAAGATGA      GGATTAATTTTGGGC TAA GCCCAAAATTAATCA      TTCTCCTGGGAAGTG 100 19
   CJSA_0040 NONE
   CJSA_0041 NONE
        flgD NONE
        flgE   64098 ..   64117 +    -8   -5.1286   CCATTAATATGAAAA            GATAATTC TTAG GAATTATC             TTTTTCTAATTTTTC 100 21
   CJSA_0051 NONE
   CJSA_0052   74053 ..   74066 +  -4.5  -3.60971   TCAGTGCTTGTATTT               CCTGT TTCA GCAGG                TTTCCCGCTTAGGAT  57 396
   CJSA_0061 NONE
        sppA   82217 ..   82227 +  -2.6  -4.21954   ATTTTTGTAATATTT                 TTAT GCA ATAA                 TTATTTATATCTTAG  54 63
   CJSA_0063   83300 ..   83333 +  -9.1  -5.25799   CTTAGTCTTTAAGCT     TAATGTCCATTTTAT TATT GTAAAATGGACATTC      TTTTTCTATTGTTTT 100 36
   CJSA_0073 NONE
        cydA NONE
        cydB   94600 ..   94613 +  -3.9  -4.75308   TTGTGTCAAAAATTT               TGATA TTTG TATCA                TTTTTGGATATTAAT  66 284
        aspA NONE
        dcuA   99158 ..   99174 +  -4.5  -3.73775   ATATTCATTTTTAAT              TTTCTTT AAG AAAGGAA              TTTAATGAAGATAAA  56 112
   CJSA_0080 NONE
   CJSA_0081 NONE
   CJSA_0082  101598 ..  101618 +  -5.4  -5.77632   GAATAAAATTTTTTA            GCTCAAGT GTTTA GCTTGGGC            TTTTTTTATGATTTT  90 58
   CJSA_0083 NONE
   CJSA_0084  104201 ..  104230 +   -11  -2.82773   CTAGGCTTTTAAATT       TTTAGAGTTTGA TTTTTC TCAAACTCTAAA        CTCTTTCTTAAATTC  84 29
        rplU NONE
        rpmA  104930 ..  104961 + -13.2  -3.89617   GTATATCCTGCATAA      GTTTTTAGGACGCT TTTT AGCGTCTTGAAAAC       TTTAAATTTATAAAT 100 26
        obgE  106086 ..  106124 +  -7.6  -5.02074   AAAAATTTAACAATC   TAGGAAGTGTTTTATATT AAA AATTTCAAACACTCCCTA   TTTTTTCAAAAATAA  90 23
        proB  106990 ..  107002 +  -3.5  -3.53012   TCAAATAAGCTATAA                TTAAA ACT TTTAA                TTTCACACAAACAAA  50 67
         fmt NONE
        birA NONE
   CJSA_0091  109324 ..  109340 +  -4.5  -2.65223   TATCAAAATTTGGCG              TATTCTA TAT TAGGATA              ATTATAATGGGGTTA  48 8
   CJSA_0092  110196 ..  110214 +  -3.2  -2.72558   TAACCAAAATCTTAG             CTTTTTTA TGG TAAAATAG             TCCTTCAAAAATTCT  42 38
       atpF' NONE
        atpF NONE
        atpH NONE
        atpA NONE
        atpG NONE
        atpD NONE
        atpC  115929 ..  115940 +  -4.4  -3.27786   TTCAAAACTTGATAA                TGCA AGGA TGCA                 TTAATGAATTTTGAA  51 10
       exbB3 NONE
       exbD3 NONE
   CJSA_0102 NONE
        tolB  118906 ..  118918 +  -3.5  -3.35867   TGGTAAAAATTTCAA                TTTTA GGT TAAAA                TTAATTAAAAATTAG  49 35
         pal NONE
   CJSA_0105 NONE
        slyD NONE
        fabD NONE
        mtnA NONE
   CJSA_0109 NONE
   CJSA_0110  123884 ..  123904 +  -2.5  -3.21099   TATGGTATTGAAATT            GTTTAATGC AAG GCTTTATAC            TTCATACTCAAAAAG  43 20
   CJSA_0111 NONE
   CJSA_0112  124999 ..  125009 +  -2.6  -3.09288   TTTTTGCCGATTTAC                 TTTA GAA TAAA                 ATTTATTCCAAGGTG  42 117
   CJSA_0113  126028 ..  126040 +  -6.3  -4.44461   CCTATCATGAGTCCA                TCACA TTT TGTGA                TTTTATAAACTTCTT  74 333
        tyrA NONE
   CJSA_0122 NONE
        lpxC NONE
   CJSA_0124 NONE
        thrB  136908 ..  136924 +  -2.3  -2.84422   AAAAACCGCTTTGAG              CAAAATA TGT TATTTAG              ATTTAAAGTTGTTTT  40 104
   CJSA_0126 NONE
        infB NONE
        rbfA NONE
   CJSA_0129  140563 ..  140576 +  -2.5  -3.97368   ATAAACACAAAAAAC               TATAA AATT TTATA                TTTGTAGGTTAAAAG  50 92
   CJSA_0130 NONE
   CJSA_0131  144066 ..  144076 +  -2.6  -4.09685   TGATAAAGCCAAGTC                 TTTT AGT AAAA                 TTTTCAGCAATAAAG  53 178
   CJSA_0135  148687 ..  148715 +  -9.8  -4.90917   GGTTTTAATTAATCA        TTTATACCTAGT GAAAA ACTAGGTGTAAA        TTTTTCCTTCAATTT 100 33
   CJSA_0136  150607 ..  150621 +  -8.6  -3.92602   CTAAATAAAAATAAA               GTTGCT TTT AGCAAC               TTTATAAAATCTTAA  82 37
        miaA  165029 ..  165039 +    -4  -4.78107   ATCGAAAAATAAATG                 TTCT ATT AGAA                 TTTTTACTCCTAGTA  65 29
        sodB NONE
   CJSA_0160 NONE
   CJSA_0161  167800 ..  167819 + -10.8  -2.80994   TTATATAGGACAAAA            GTAAGTGC TCTA GCACTTAC             TCTCCTAAGCTTGGA  82 22
   CJSA_0167 NONE
   CJSA_0168 NONE
       exbB1 NONE
       exbD1 NONE
       tonB1 NONE
   CJSA_0172  179303 ..  179323 +  -2.5  -4.35524   TTATTTCTTAAGGAG            CTTCATTGG ACC CCAGTCAGG            TTTTGGATTTAAACC  54 119
   CJSA_0173  180664 ..  180681 +  -8.5  -4.97405   AATAAAGATGAAGAA             TAAGCCT CTTT AGGCTTA              TTTCTTTTTGTAAAT 100 23
        folE NONE
        flil  191906 ..  191916 +  -2.6  -4.69549   ACTTTACGCATAGGA                 TTAA GCT TTAA                 TTTTACTTTTAAATT  62 371
   CJSA_0195  205826 ..  205841 +    -9  -3.80858   AAGATGCTTAATTTT              TGGGGT TAAA ACCCCA               TTTAATCCATTCTGA  81 30
        uppP NONE
        thrS NONE
        infC  209147 ..  209172 +  -4.7  -4.19276   GTAACTCCAAAAAAA         GCTTAATCCAC TTTT GTAGATAAAGC          TTTTAAAGGTTTTAA  61 20
   CJSA_0199  210411 ..  210425 +  -7.2  -4.12188   GATCCAAAGTTATTT               TCAAGA ATA TCTTGA               TTTTGCCAGTAATAA  75 154
        argC NONE
   CJSA_0202 NONE
        argB NONE
        argD  217389 ..  217409 +  -4.2  -4.23999   CTAAAGAGTTTTTAA            TAAATTTT GTAAA AAAATTTA            TTCTTTTCCATCTAC  62 26
   CJSA_0206  218793 ..  218808 +    -4  -5.72622   ATAGTATTTAAAGAT              GACTTT TTAA GAAGTC               TTTTTTCTTTGTAGA  88 145
        cynT NONE
   CJSA_0215  226476 ..  226496 + -11.3  -5.00616   GCAAAAGCTATAAAA            TAGCAAGAT TTT ATCTTGCTA            TTTTTTAAACCGGCA 100 23
        rpmI NONE
        rplT  231349 ..  231386 +  -8.7   -5.1615   CTTTGATTTTTTAGT   ATAAGAATTTCAAGATT TTTG ATTCTTGAAATTCTTAA    TTTTTTCAGTATTGA 100 35
   CJSA_0225  234390 ..  234406 + -10.9  -2.62024   ACAAAGAAGATTAAA              GAGCCTT TTT AAGGCTC              TAAATTGTAGTGATG  82 27
   CJSA_0226  235333 ..  235348 +    -4  -4.04474   ATAAGCAAAATTCCA              CCTATT TGAA GATAGG               TTTGTATAGAAGTAT  59 463
        moaC NONE
   CJSA_0230 NONE
   CJSA_0231  238290 ..  238307 +  -8.5  -3.20326   TTCGTTAAAAAATAA             TATCCCA TTTT TGGGATA              TTAAATATCTATTTC  73 26
   CJSA_0233 NONE
        dgkA NONE
   CJSA_0235 NONE
        pyrC  242315 ..  242337 + -13.6  -3.78141   CAATTAAAACATTGA           TTTTCCACCT TAA AGGTGGAAAA           TTTAAGCTTTATTTA 100 26
   CJSA_0240  246595 ..  246612 +  -9.9  -3.33399   TTTGCTTGGACAATA             GAAAGCC TTGC GGCTTTC              TTAAATTTAATTCGC  82 25
   CJSA_0247 NONE
   CJSA_0248 NONE
   CJSA_0249  255243 ..  255257 +  -4.4  -5.07971   AATTTTTAATGATTT               TTTTAT ATA ATAAAA               TTTTTAATTGTTTTC  72 74
        fabZ NONE
        lpxA NONE
        clpX NONE
        mreB NONE
        mreC  259703 ..  259730 +  -2.2  -3.88559   AGCAGAGTGTTTATT        TTTTAAAATTAT ATCG ATAATTTCAAAG         TTTATAAAACTAATT  49 202
        carB  263047 ..  263060 +  -2.5  -3.64703   TTTGCAAGAGTGGCT               TAAAT CTTG ATTTA                TTTAGCTCAAACAGA  46 16
   CJSA_0256  263969 ..  263983 +  -5.8  -3.08812   CCTGCATTTAAAGCT               TCAAAA CAT TTTTGA               CTTTGTTCAAGAGAA  57 519
        surE NONE
   CJSA_0268 NONE
   CJSA_0269  276072 ..  276096 +  -5.1  -2.64218   ATGTATTTTTGATTT          GAGTAAAGTGA TAT TCATTTTAATC          CTTGTACTAAAAAAT  51 498
   CJSA_0273  278950 ..  278962 +  -6.3  -4.34947   TTTAGAAATTCCTCT                TCACT AAG AGTGA                TTTTAATAATATCTT  72 213
        bioA  285734 ..  285748 +  -2.8  -5.10516   AAAATGATATCTAAG               GCTTTA TAA TCAAGC               TTTTCTTTGATTTTT  66 382
        rplY NONE
         pth NONE
   CJSA_0287 NONE
        lysA  290146 ..  290161 +  -3.4   -4.5536   CTTTAGAAGAGAAAT              TTTTAA AGGC TTAAAA               TGTTTTTTTTAGATG  58 12
   CJSA_0289 NONE
        pheA NONE
        hisC NONE
        fliF NONE
        fliG NONE
        fliH NONE
         dxs  298548 ..  298564 +  -3.1  -4.53777   AATATAAACTTCTTT              TAATGAA AAT TTTATTA              TTATTTTTACTTAAA  58 60
        perR  299021 ..  299055 + -10.3  -3.02632   TTAAGCAAAATAAGG     TTAAAATAACCCATA TATTT TAAGGGTTATTTTAA     TGGTTTATGAAATTC  79 37
   CJSA_0297 NONE
        ubiE NONE
        xseA NONE
        serC NONE
   CJSA_0301  303548 ..  303560 +  -4.9  -2.80575   TGGAAAGCTAAGAGA                GAATT AAA AATTC                TCTCCTCCAAATTTT  50 19
        ahpC  307659 ..  307673 +  -7.1  -5.63012   ATTTCTTAGTATAAA               GCCTC TTTAC GAGGC               TTTTTCTTTATTTTT 100 40
        flhB  308888 ..  308907 +  -5.8  -2.92712   TATTTTGTTAATAAG            CTCAAGAA CCGA TTTTTGAG             TACTTGTATCTGCTG  56 64
   CJSA_0313 NONE
   CJSA_0314  316008 ..  316023 +  -2.5  -5.86465   AAGTCTAGATAATAT              CCTGT GTAAGA ACGGG               TTTTTTTGTGTTCTT  85 472
   CJSA_0318  319978 ..  319988 +  -4.6  -3.95653   CTTACACATACTCTT                 CGCT CTT GGCG                 TTTCTAAACTTCTTT  60 107
        trpE NONE
        trpD NONE
        trpF NONE
        trpB NONE
        trpA  325447 ..  325459 +  -3.5  -2.83915   ATTTTATATTTACTA                TAATT TTA AATTA                AGTTTTTTATAAAGG  45 60
   CJSA_0324 NONE
        fliN NONE
   CJSA_0326  327033 ..  327043 +  -5.4  -3.12962   TGATTGATTGCTAAT                 GCTA TGG TAGC                 TGGTTTTGCAATTTT  54 47
      ccpA-2  331721 ..  331742 + -11.7  -3.97446   CTATAAGGTTCCAAA           CAAGCTCTA TTTT TAGAGCTTG            TTTAAATTTCTTTAT 100 35
        glmM NONE
        lspA NONE
   CJSA_0335  334224 ..  334241 +  -3.5  -4.46212   ACCAAATTCAGTTGC             GATTAAA GCAT TTTGATC              TTTTATGATGGCACC  62 208
   CJSA_0337  336024 ..  336035 +    -3  -3.75598   AGCAATTTCATAGAT                TCTT TTGT AAGA                 TTGTTCGCTTGCTTG  52 285
        rpsU  343953 ..  343964 +  -7.2   -5.4251   GACTCTAACCCAAAA                GCCC GAAA GGGC                 TTTTTTATATCTACA  95 33
   CJSA_0344 NONE
   CJSA_0345 NONE
   CJSA_0346 NONE
   CJSA_0347 NONE
   CJSA_0348 NONE
   CJSA_0349 NONE
   CJSA_0350  350629 ..  350642 +  -5.3   -2.5322   AAAGCTGCAAAAATA               CCTAA AATT TTAGG                ATAATTTCTTGTTTT  51 357
        engA NONE
        aroK NONE
        trpS NONE
        serS  360153 ..  360167 +  -2.2  -4.59109   AATTCATATTCCTGA               TGTTTT GAA AAAATA               TTTTTAAAGAGTATA  57 4
   CJSA_0363  362650 ..  362669 +  -9.4  -4.87893   AATAACAACTAAAAA            TGCTTAGA AATT TCTAAGCA             TTTTTAGTTAAGCTT 100 29
        gatC  369279 ..  369289 +  -3.2  -4.07877   AGAATGATTAACTTA                 GCAT TTA GTGC                 TTATTTGTAGAATAA  54 34
   CJSA_0372 NONE
         fur NONE
        lysS NONE
        glyA NONE
   CJSA_0376 NONE
   CJSA_0377  374496 ..  374517 +  -2.5  -4.63542   TTGCAAAAGATGCTT           TTTC-TTTTA CTT TAAAATGAAA           TTTTTAGCAGTTATA  58 6
        aroE  375323 ..  375335 +  -4.9  -5.36441   GTTATTTTTCTTGTA                TAAGA AAA TCTTA                TTTTTTGTGTGAGAA  80 48
         lgt NONE
        frdC NONE
        frdA NONE
        frdB  380728 ..  380748 + -10.5  -2.57881   AGAAATAAATAAATC            TTTCCCCTT TTT AAGGGGAAG            ATTGTGAAAGAATTA  81 29
   CJSA_0384 NONE
   CJSA_0385 NONE
   CJSA_0386  385448 ..  385469 +  -6.7   -4.5287   TTAATTCTAAAGATA           TAGAGCTTT ATTA AAAGTTCTA            TTTTCATTACTTTCA  76 12
   CJSA_0387 NONE
   CJSA_0388  388055 ..  388080 + -13.5  -2.72973   TTAGCTTGATAATAA         CTTGAGAGTTT TTGA AAACTCTCAAG          ATTATAAATTTTTAA 100 32
   CJSA_0389  388849 ..  388866 +  -6.3   -3.0442   CTTCAAATTCCATTT             TTGTAGC ATTT GCTGCAA              CTTTATAGTCTTGTG  59 391
   CJSA_0391  389804 ..  389818 +  -4.4   -5.0916   TAATGATTTGTTATG               TTTTAT CTA ATAAAA               TTTTTATATTGAAAA  72 48
   CJSA_0392  390435 ..  390457 + -11.4  -4.10363   AAAAATAATTTTTTA           GTCTAAGAGT CTT GCTCTTAGAC           TTTGTAAATTTTTAT  95 33
   CJSA_0395 NONE
   CJSA_0396 NONE
   CJSA_0397  393225 ..  393240 +  -3.4  -2.72144   ACAATTTCTTAAAAA              TTTTTA TAAG TAAAAA               ATTTAAGGAAAATCA  42 125
   CJSA_0398 NONE
   CJSA_0399  395191 ..  395242 +  -3.2  -3.30159   TAAAAAGGAACGCTT TTTGCTTGTATAGTTTTTGCATAT TTTG AAAGGAGAAAACTATGCAGGTAAA TTATAGAACGATTAG  47 59
   CJSA_0400  395622 ..  395636 +   -10  -4.84539   GCAATTTAATCAAAA               GCTCCA TTT TGGAGC               TTTTATATTTACTTG 100 32
   CJSA_0402 NONE
   CJSA_0403  398544 ..  398561 +  -2.8  -5.08255   TTTTTTATAAATCTT             GTTTTT TAATTT AAAAAC              TTTTCTTTTAAAAAT  63 242
         pgm NONE
        fabG NONE
   CJSA_0408  409672 ..  409704 + -13.9  -3.53262   ATTTTATTAACTATA      TATTAATTAAGATAA ATA TTATCTTAATTAATA      TTAACTTTTTGTTAT 100 51
        sdhA NONE
        sdhB NONE
        sdhB  413645 ..  413663 + -10.3  -3.65084   AAAATTGCATAAAAA             CATGGGC AAAAA GCCCATG             TTTAAAGATTTAATT  84 29
        acpP  414700 ..  414712 +  -2.7  -3.51329   CTTGCAAGGAGCTTA                TTCTT GAA AAGAG                TTGTAGTTACAGGTA  46 49
        fabF NONE
        aacA  416876 ..  416894 +  -6.2  -2.98545   TTTACTTCGCTTTTT             TAAATAAT TTT ATTATTTA             TAATTGTTATCAAAA  59 44
   CJSA_0417  419759 ..  419789 + -10.6  -2.51207   AAAATTAAAGATTAT       TTAGGTTAAACCTT AAA AAGGTTCAACCTAG       GATTTTAATGATCTG  81 22
         rpe NONE
        dnaQ NONE
        thiC  424821 ..  424831 +    -4  -3.06796   TCGCTTCTTAGAGTT                 GATA TTT TATC                 TTCACTAAAGTCAAA  49 330
        nusA  429873 ..  429894 +  -8.9  -5.24129   GTTTAAAATTTAAAA           TATTTGTGA ATTT TCACAAATA            TTTTTTATAAAACCA 100 28
   CJSA_0432 NONE
   CJSA_0433 NONE
        recG  435202 ..  435222 +  -8.4   -3.2614   AAAGGTAAAAAAAGA            TTTGGCAA AAAAA TTGCCAAA            TTAATGTCCGCCGTA  73 1
        nssR NONE
        paqP  437004 ..  437015 +    -3  -3.10775   TTGAAAAAAGGTTGC                TTCA TGCT TGAA                 CTTTTAAATACCGAT  44 15
   CJSA_0438 NONE
        paqQ  438785 ..  438799 +  -4.2  -3.57462   CCAAGCTGAGGGTCG               CGGG TTCGAGT CCCG               TTTCCCGCTCCAATA  54 384
         tuf  440263 ..  440291 +  -9.7  -5.00884   TTATTAAATAATTTA        ATAAAGCCAAGTT AAA AGCTTGGCTTTAA        TTTTTTAAGGAAAAT 100 30
        rpmG  440508 ..  440524 +  -5.1  -2.73542   TCCAACGGTAGAGCG              CCGGATT CCA AATCCGA              TGGTTGGGGGTTCGA  52 64
        secE NONE
        nusG NONE
        rplK NONE
        rplA  442506 ..  442525 +  -7.9  -5.09259   CTTGATATGAAATAA            GAGTTGC TTTTTT GCAACTC             TTTTGTTTTAAAATA  95 26
        rplJ NONE
        rplL  443556 ..  443579 + -10.4  -6.20267   GCTTTAAAGTTAGAA          GAAGATTTGC CAAG GCAAGTCTTC           TTTTTTTATTTTTAC 100 47
        rpoB NONE
        rpoC  452336 ..  452355 + -10.8  -3.18239   AATAAAACTCTATTT            TATAGCCC TTCG GGGCTATA             TTAATACAGTGTATC  85 36
        dapA NONE
        uxaA NONE
        uxaA NONE
   CJSA_0454 NONE
   CJSA_0455 NONE
   CJSA_0456 NONE
        fucP NONE
   CJSA_0458 NONE
   CJSA_0459 NONE
         ald NONE
         ald  461569 ..  461592 + -11.2  -2.92851   AAACAATGATTTTTA          TCCTATCTAA ATTT TTAGATAGGA           GTTATTATAATCTTG  84 32
        rpsL  462290 ..  462306 +  -5.2  -3.53744   AATCATTCATACAGA              CAAATC CGTTA GATTTG              ATTTTGTTTGAGTAA  59 39
        rpsG NONE
        fusA  464912 ..  464927 + -10.4  -4.10164   ACGGTTAAATTTTTA              GCGGGA TTTT TCCCGC               TTTCTGTCCTCGTAG  93 33
   CJSA_0465 NONE
   CJSA_0466 NONE
   CJSA_0467 NONE
   CJSA_0468 NONE
        trpC  468250 ..  468260 +  -5.4  -4.05788   AAAGATGAAGGAAAG                 GCTT TAA AAGC                 TTTGCTTTAAGGAGG  64 5
   CJSA_0470 NONE
   CJSA_0471  469980 ..  469995 +  -3.4  -2.99449   TTAAATTTATATTTT              TTTAAA TCAT TTTAAA               TATAATTATCTCGCA  44 252
        alaS NONE
         maf NONE
        pbpA  479292 ..  479321 + -13.9  -2.80411   GAAAGCGAGATTATA       TTTTGAAAGTAGA AAGA TCTACTTTCAAAA        TGATTAAGCTTTTTT 100 20
        ctpA NONE
        purC NONE
        purS NONE
        purQ  485356 ..  485370 +  -2.2  -4.75309   AAAATGCTTAAAGGC               TTTTTA TTT TGAAAA               TTTTATTAACTTTAA  60 14
   CJSA_0485 NONE
        plsC NONE
        crcB  487618 ..  487640 +  -2.1  -2.74322   AATTTACTTTAGAAT           TTGTATTTT TTGCT AAAATACCA           CTTTAAAAAATTACA  39 48
        htpG NONE
   CJSA_0489 NONE
   CJSA_0490 NONE
   CJSA_0491  492343 ..  492370 +  -3.4  -6.12458   ATAAGAACATTTTGC        ATCGTTTTAGCG GCTT CGCTAGAAAGAA         TTTTTTCTTTTTTTA  88 353
   CJSA_0497  498637 ..  498672 + -10.8  -2.63637   ACTTAATTAAAAATA    TTTAAAGTTTGTTTGA AAAC TAAAACAAACTTTAAA     CTTACTCTTGCATTT  82 31
         icd NONE
         mdh NONE
        sucC NONE
        sucD NONE
        oorD NONE
        oorA NONE
        oorB NONE
        oorC  506758 ..  506774 + -10.9  -3.80893   CATATTCATAATAAA              TTCCGCA TCA TGCGGAA              TTTAACTTCTAAAAT  89 30
   CJSA_0506 NONE
   CJSA_0507 NONE
   CJSA_0508 NONE
        hemA NONE
        proS NONE
   CJSA_0511 NONE
        hemC NONE
        ubiD  514749 ..  514769 +  -2.7   -5.0065   TTTGCTTATTATTTT            TTTTATTAT TGA AAAATAAAA            TTTTCTTTATAAGTG  63 77
        flaG NONE
        fliD NONE
        fliS NONE
   CJSA_0517  517961 ..  517981 +  -5.3  -3.76413   TGTTACCAAAATCGC            TGGTGGGCT TTT ACCCCGCCG            TTTCACCTTTTCCAC  60 181
         efp  518817 ..  518837 +  -2.6  -5.24449   AATAATACAAAAAAA           GCTTTTGGA CTAT TCCAA-GGC            TTTTTTAAATTTATA  66 36
   CJSA_0519 NONE
   CJSA_0520 NONE
   CJSA_0521  521703 ..  521721 +  -3.3  -4.10161   AAATATATTTTTTGA             TATTATA AGCCC TATAATA             TTTTAAAGGATGATA  54 116
   CJSA_0522 NONE
   CJSA_0523 NONE
   CJSA_0526  527151 ..  527168 +  -8.5  -5.56372   TTCTGTGCTTTAAAA             TTTAGCC TTTG GGCTAAA              TTTTTATTTTAGTTT 100 28
   CJSA_0527  528643 ..  528667 +  -8.7  -5.28315   AAAAGAATTTTTAAA          GATCTATCTTT ATA GGAGATAGATC          TTTTTTAAATTTTAT 100 11
        dnaB  531182 ..  531195 +  -2.5  -3.36166   TTAATAAAATAAGTT               TTTAA TATT TTAAA                GTTATTTTTTACGAC  44 43
   CJSA_0530 NONE
   CJSA_0531  532032 ..  532059 +  -6.9  -3.74693   TAAAACTTAAAAATT        TCACTTCCCCC TTGACT GGGGGGGGGGA         TTTGATAAAATACAA  69 31
   CJSA_0534 NONE
   CJSA_0535 NONE
   CJSA_0536 NONE
   CJSA_0537  536514 ..  536527 +  -3.9  -4.18164   AATATGAAATTTACG               CTTTT GCCA AAAAG                TTCTTTTAAAAGCTT  56 3
   CJSA_0538 NONE
   CJSA_0539  537790 ..  537802 +  -9.1  -3.28712   GGGGAGATTTGAACT                CCCGA CCT TCGGG                TTATGAGCCCGACGA  75 72
        ribB NONE
   CJSA_0541  539492 ..  539504 +  -3.3  -4.18697   AAAAGACTTAATTTA                GCACT TAA AGAGC                TTTTACAATAATTTT  54 2
        ilvB NONE
        ilvH NONE
        lpxD  542664 ..  542703 + -11.7  -2.52681   AAGATTAGCATCGCA  TCGCCATAAGAGTAAAA GCGATA TTTTTCTTTTATGGCGA   GTTCATAAAGTTTTA  87 33
        nidH NONE
        lysC NONE
   CJSA_0551  548247 ..  548261 +  -2.2  -3.20367   AAGGTGCAATTAGGA               TAAATA TTT TGTTTA               TTAGTAAGATTATTA  42 23
   CJSA_0552 NONE
        folP NONE
        ligA NONE
   CJSA_0555 NONE
        tlyA NONE
        ribF NONE
   CJSA_0558  555660 ..  555676 +  -6.6  -4.31379   TTACCCTCTTCATTT              GTTGGT TTAAC ACCAAC              TTTTAATGCATTAAT  74 483
        peb4 NONE
         fba  559781 ..  559801 +  -6.9  -5.40279   CTGTATAAACAAAAA            CTAAGCATT TTA AAAGCTTAG            TTTTATTTTGTTTTA  95 22
   CJSA_0566 NONE
   CJSA_0567 NONE
   CJSA_0568  563458 ..  563472 +  -2.2  -5.22006   GTTAATAGAAAGATT               TTTAGA ATA TTTAAA               TTTTTCTTCTAATAC  68 350
   CJSA_0572 NONE
   CJSA_0573  569041 ..  569055 +  -2.2  -3.89524   TGATGTGATGATGGC               TTTAGA ATT TTTAAA               TTTATAAAATAGAAT  49 4
   CJSA_0574 NONE
   CJSA_0575 NONE
   CJSA_0576  573932 ..  573948 +  -2.4  -5.61881   ATACTAATCCATTTT              TTTAAA TTGTT TTTAAA              TTTTTGTTTTTCAAA  74 347
        pstS  578878 ..  578894 +  -4.5  -3.72576   GTAAAAGCTGGAAAA              GTTTTTT AAG GAAAAAC              TTTGCTAAAAGAAAA  56 17
        pstC NONE
        pstA NONE
        pstB NONE
   CJSA_0585 NONE
   CJSA_0586  582967 ..  582997 +  -2.1  -4.61482   GAGTATATTAAATAT       TTATATTTAAAAA AGTAA TTTTTAAGTAGAA       TTGTTTTTTAAAAGA  57 39
   CJSA_0587 NONE
   CJSA_0588  584971 ..  584985 +  -4.4  -3.53881   CAAAGAGAGAAAGAA               TTTTTA AGT TAAAAA               TGTTATATTTATAGT  54 14
   CJSA_0589 NONE
        hypF NONE
        hypB  589515 ..  589534 +    -3  -3.40481   ATAAGGTGCTTAAAC            TTAAAAAG GAGC TTTTTTAA             TGTGTTTGTCTATAC  47 6
        hypC NONE
        hypD NONE
        hypE NONE
        hypA  592204 ..  592234 + -12.9  -2.93357   GACTTGTGATGGAGT       GAAAGTAAAATCA ATAAA TGATTTTACTTTC       TGCTTTCAAATGCTT  95 24
        ilvC NONE
   CJSA_0600 NONE
        dprA NONE
   CJSA_0602 NONE
   CJSA_0603  600837 ..  600863 +  -6.8  -3.98107   TTTTTGCTGTTCTTC         GATGAAATTTTG AGC TAAAATTTTATC         TTCTTCATTTTCGTA  71 369
         pnk NONE
        recN  606590 ..  606600 +    -4  -2.79312   AAAAATTTCCTTTCT                 TTTG AAA CAAA                 TATAATAAAAAATTT  45 80
        cbrR NONE
   CJSA_0611 NONE
   CJSA_0612 NONE
        rlpA NONE
   CJSA_0614 NONE
   CJSA_0615 NONE
   CJSA_0616 NONE
        engB NONE
   CJSA_0618  613105 ..  613118 +  -2.5  -3.65351   TTTAGCTTATGTGTT               TTTTA AAGG TAAAA                TTTAAATGAGAATGC  46 7
        pbpC  614948 ..  614962 +  -5.8    -5.055   TTAGTTGTAAATTGA               GTTTTT CAA AAAAAC               TTTTTTAGCAATTGG  79 44
   CJSA_0631 NONE
   CJSA_0632 NONE
   CJSA_0633  627777 ..  627790 +  -6.7  -3.45768   GTATTATTTAGGAGC               GGAGT TTAA ACTCC                TTGATTGATGTTAAA  65 4
        rpoN  629087 ..  629100 +  -2.5  -4.18294   ATTACACTTTTGTTT               TATTT TTAG AAATA                TTATTCTTTAATTTA  52 64
        dcuB  630600 ..  630623 + -12.6  -3.95911   TTATCTTTAACAATT          TTTAGCAGGA TTTT TCCTGCTAAA           TTCTTCATTTGTCTT 100 31
   CJSA_0636  631169 ..  631185 +  -3.1  -4.07763   TTTCTTTCGTGATTT              TTTATTT ACA AGATAAA              CTTTTTTTTAAATCC  54 345
        kdpB NONE
        kdpB NONE
        kdpB NONE
        kdpC NONE
        kdpD  636491 ..  636505 +  -2.8   -4.5538   AAAAATCACAGGAGT               TTTGCT TTT AGCAAC               TTTTATAGCTTTTGT  56 48
        kdpD  637313 ..  637323 +  -5.4  -4.88795   CTCAAGTGCTTTAGC                 TGCT TCA AGCA                 TTTGTTTTCTTAACT  74 196
   CJSA_0645 NONE
   CJSA_0646 NONE
   CJSA_0647 NONE
        priA  642239 ..  642256 +  -4.3  -3.15274   GTGTAAATAAGTGAT             TTATTTT TTAT AAAATAA              TCTATTACATCTTTT  49 162
        ispG  644736 ..  644752 + -10.9  -4.13945   AATAAAAGCCTAAAA              GCAAGGT TTA ACCTTGC              TTTTAGAATGGCCAT  93 36
         pta NONE
        ackA  648479 ..  648493 +  -7.2  -5.01535   AATTCTTGTTTTAGC               TCATCA AAA TGATGA               TTTTTATCATTGTAA  86 252
   CJSA_0655  652918 ..  652933 +  -2.6  -3.08201   TAGAGAAGCCTTCTA              GTAAAA TATT TTTTGC               CTTTTGAGCATCTTC  43 270
   CJSA_0658 NONE
        ftsA NONE
        ftsZ  658714 ..  658735 +  -7.4  -5.04325   AAATTGATTTTTAAA           GCAAGATT GAGTCA AATCTTGC            TTTTTATAGTTTAAA  90 40
       flgG2 NONE
        flgG  660523 ..  660549 + -12.5  -5.00884   TTTAATTCTTTTTTG         TTTAATGGCGT GTTAA ACGCCATTAAA         TTTTTTAGCAAGAGT 100 61
   CJSA_0664 NONE
   CJSA_0665 NONE
        purE NONE
   CJSA_0667 NONE
        glyQ NONE
   CJSA_0669 NONE
   CJSA_0670 NONE
        kdtA NONE
   CJSA_0672  669354 ..  669364 +  -2.6  -2.60211   AATTTGGCTTTGATA                 TAAA AAA TTTA                 GATTTTTAAAGCCAT  40 6
         ffh  670780 ..  670819 +  -8.3  -5.18355   GAAGACAGTTTTAAA  TTTTATTTATAAATACT TTTTAT AGTATCTATAAATAAAA   TTTTTAATTTTTAAG 100 27
        rpsP NONE
   CJSA_0675 NONE
        rimM  671823 ..  671840 +  -2.1  -3.20747   TTGCACGCAAGATGC             TTTTTTA ATTT TAGAAAA              TTCATGAAATTTAGT  42 1
        trmD NONE
        rplS  672913 ..  672925 +  -3.5  -5.20333   AAAGAGCTTAAAAAA                TAATT TAT AATTA                TTTTTATTATAAGTC  70 23
   CJSA_0679 NONE
   CJSA_0680 NONE
   CJSA_0681  675152 ..  675173 +  -7.4   -5.5604   GAGAAAATGTTATGA           TAGAGTGT TTGATT ACACTCTA            TTTTTTATTAATTGA 100 26
        dnaE  679197 ..  679221 +  -9.5  -3.39483   TTTCTAATAAATATG          CTTAAGTAAGA TTG TTTTACTTAAG          ATTTTTAAATAAAAT  80 21
   CJSA_0688  683874 ..  683888 +  -2.9   -5.4251   GGGATTAATTCTTTA               TGATA AATAA TATCA               TTTTTTATATATGAA  72 437
   CJSA_0691 NONE
   CJSA_0692 NONE
   CJSA_0693 NONE
   CJSA_0694 NONE
   CJSA_0695 NONE
   CJSA_0696 NONE
   CJSA_0697  691559 ..  691580 + -11.7  -3.57161   TAACTTTTTAAGCTA           TAAGCGTGA AAAT TCACGCTTA            TTCTAATTCATATTT  91 30
   CJSA_0699 NONE
   CJSA_0700 NONE
   CJSA_0701 NONE
   CJSA_0702 NONE
   CJSA_0703 NONE
   CJSA_0704 NONE
   CJSA_0705  697963 ..  697975 +  -3.4  -2.78463   TAATAAAATAAGAGA                GCTT ATAGA AAGC                TCTCCTGAAGCAAAT  43 218
   CJSA_0707  706562 ..  706584 +    -7  -2.60423   TTTTTATTCAATAAA           ACTCTCACTT CTT AAGTGGGAGA           TGAATTGCTTACAGT  60 27
   CJSA_0708  707172 ..  707188 +  -2.3  -3.38966   TAGTGATACTACTAA              GTTTAAG ATA TTTAGAC              TTATGAATACATTTT  43 435
   CJSA_0711  709077 ..  709089 +  -3.5  -4.62475   TATTAAATTAATAAT                TATTA TCA TAATA                TTTTGATTTCTAAAT  62 83
        cfrA  711245 ..  711260 +  -2.6  -5.83211   AAAACTAAAGGGCTT              TTAAAG TCTT CTTTAG               TTTTTTATTTTAATA  78 52
        hcrA NONE
        grpE NONE
        dnaK  714745 ..  714773 + -11.9  -5.15117   TAATCTTAAAATCTC        TATTCAAGCCTTT TTA AAAGGCTTGAAAA        TTTTTTAAAATTTTA 100 38
   CJSA_0716  716028 ..  716038 +  -2.6  -4.44277   AAATTAACACAAGTT                 TATA ATT TATA                 TTTTGGCTTTTGCTA  56 39
   CJSA_0717  716448 ..  716481 + -12.8  -3.28472   AGGTTTTAATTTGCC     TAAATAATTCTAGG CTTTAA CCTAGAATTATTTA      TAGTTTTTAATGAAA 100 48
   CJSA_0733 NONE
        peb2  735015 ..  735027 +  -3.5  -3.21218   AAAAATAATTAATAT                TTATA GGA TATAA                TTACTCCTAAAACAT  47 56
         tpx  735617 ..  735639 +  -7.8  -5.10968   TGCCATTAATTTTGA           TTAAGCCC ATTCTTA GGGCTTAA           TTTTTATATCTTCAT 100 32
        napA NONE
        napG NONE
        napH NONE
        napB NONE
        napL NONE
        napD NONE
   CJSA_0742 NONE
   CJSA_0743 NONE
   CJSA_0744 NONE
   CJSA_0745 NONE
        purU  745071 ..  745081 +  -3.2  -3.92324   TAAGCGATATCAAAA                 GGAG AAA TTCC                 TTTGATATTGAAAGC  54 248
   CJSA_0748 NONE
        flgS  748098 ..  748114 +  -5.3  -3.75153   GGAACAAATTTTGCT              TATATTA TTT TAATATA              TTTAGGTTGAAGGCA  60 67
   CJSA_0750  749773 ..  749783 +    -4  -4.00468   TTGCGTCCTTTATAG                 CTTT TAC AAAG                 TTTATAGCTTGTGCT  57 345
        mviN  756924 ..  756934 +  -2.6  -3.11634   TTTAAAGGAGTTTTT                 TAAT GAG ATTA                 TTAGATAGTGTAACA  42 23
        cysS NONE
        msbA  760030 ..  760045 +  -2.6  -3.75718   AAAGCAAAGAAAAAA              C-AAAGC CCA GCTTTAG              TTAATTTTAGTTAGA  48 6
        pyrD NONE
   CJSA_0761 NONE
        dapA NONE
   CJSA_0763  764258 ..  764282 +  -2.2  -4.47485   CTTAAAGATCCATTT         TCTGCC-ATTT TTTT ACATGGGCAGA          TTTTATAAAATTTTT  56 229
        nadE NONE
        lpxK NONE
        thrC NONE
        kdsB  768907 ..  768923 +  -5.3  -3.75153   GGAACAAATTTTGCT              TATATTA TTT TAATATA              TTTAGGTTGAAGGCA  60 55
   CJSA_0770 NONE
   CJSA_0771 NONE
        glnH  771233 ..  771261 +  -4.1  -5.71295   TAAAAGGATTTAAGA        TAATGAAAAAAGT TGC ATTTTTTTTGTTA        TTTTTGTTTTTATCT  82 116
   CJSA_0773 NONE
   CJSA_0774  771735 ..  771748 +  -5.3  -3.07935   AGCTTTCCACAAGCC               TTTGC ACTA GCAAA                TTCCATCCATCCACT  54 48
        glmU NONE
         dfp NONE
   CJSA_0778 NONE
        uppS  776300 ..  776324 +  -3.7  -2.83119   AAATAGAGAAAGAAC          TTTTGGAAAAT GAT ATTTTTCATAA          TAATTCTAGGGGCTT  45 13
   CJSA_0780 NONE
   CJSA_0781 NONE
        truA  778946 ..  778967 +  -3.1  -2.87672   ATCGCCATAATCAAG           CT-TGGTAGA AAA TCTATCATAG           TCGATTTTTACTATA  43 139
   CJSA_0785  780995 ..  781015 + -10.5  -3.04501   CCTTGCTAAGAAATA            CTCCACATT CAA GATGTGGAG            TATTGACAAATTGAT  83 32
         ogt  789166 ..  789185 +  -3.6  -5.79595   ATCAATCTTATTAAA            GTCAAATA TTAT TTTTTGAC             TTTTTTCTTTTAAAA  85 329
   CJSA_0797  794226 ..  794240 +  -5.8  -5.11937   ATTATCATAATAAGG               CATTAT AAA ATAATG               TTTTTTAAAATTATT  84 450
   CJSA_0801 NONE
         psd  799042 ..  799056 +  -5.7  -3.05596   TCATCTTCTTTAATA               GGAAC TCCGT GTTCC               TTGGCTAAAGAAATA  57 161
        folD NONE
        lepP  806729 ..  806755 + -11.1  -3.90316   GAGGATAAATTAAGC         TAATGTTTGTG AAAAA CACAAACATTA         TATTTTTAAAAGCGT  95 23
   CJSA_0818 NONE
        dsbB  815028 ..  815038 +  -5.4  -4.12198   ACTTAGCAAAACTCT                 TTGC ATG GCAA                 TTTTGGCGGGTTCTA  64 81
        dsbA  817169 ..  817204 + -12.2   -5.2112   AGTAATATGAAATAA    TAAATTTTAAGGCAAT AAAA ATTGCCTTAAAAATTA     TTTTTTGATCATATT 100 26
   CJSA_0825  818587 ..  818616 +  -9.5  -3.31946   TTTAAAAGAAGGTGA       TTGGATAAATAGT TTGC ACTCTTTATCCAA        ATTTTCTATCCCGTA  78 76
        rspO  823460 ..  823475 +  -3.9  -4.43272   ATAAATAATTTTTAA              GCCCT TTTTAC GGGGC               TTTTGCCTTTTAAAT  60 33
   CJSA_0844  842762 ..  842796 + -10.3  -4.37886   CCTCAAGCTTTATTT     TAATTTAAATGGTAG AAAAA CTACCATTTAAACTA     TTTTGTCAAAGGTAG  91 23
   CJSA_0847 NONE
        glnQ  845083 ..  845107 + -11.6  -4.25283   GTTTTAAATCATTAA          TTCATAAGCC ACTAA GGCTTATGAA          TTTTAATCCCAACAT 100 26
   CJSA_0853  849737 ..  849751 +  -5.8  -2.63182   AACAGGTAACACACA               TTGAAA AAT TTTCAA               AATTTTATATTCAAA  55 22
   CJSA_0854 NONE
   CJSA_0855 NONE
   CJSA_0856  851279 ..  851302 +  -9.6  -3.01497   CTTAAGCAAAAAGAT          CGGTTGAGAG GTAT CTTTCAGCCG           TATCGTTTAGCATAG  77 46
   CJSA_0860  855395 ..  855410 +  -4.8  -4.95618   GCTATTGAAATTTCT              TTTCTA ATTG TAGAAA               TTTCTTTTTCATCTT  72 424
        rpiB NONE
   CJSA_0871 NONE
         apt NONE
   CJSA_0873 NONE
        pepA NONE
   CJSA_0875  867613 ..  867636 +  -9.7  -2.75876   GCATTTTAGATTCAA          TGTTTAGGC AAAATA GCCTAAACA           ATATTTATAAATTTT  75 19
        atpE  875721 ..  875733 +  -6.2  -5.37043   ATAAAACTTATCAAA                GCCC TTTTT GGGC                TTTTTTCTATGCGGT  93 37
   CJSA_0882  876952 ..  876965 +  -5.3  -3.05503   AGCTCAAATTATATG               GCTAA ATTT TTAGC                TAATTCTTTAACTTT  54 40
        lolA  887366 ..  887376 +  -2.6  -4.63993   AAAATTTTTCTAAAG                 TTTT TTT AAAA                 TTATTTTTTCCAATT  60 501
   CJSA_0891  890370 ..  890394 + -11.7  -4.44548   ATACAAAACAAATAA          GATTTATTGAT TTA ATCAATAAATC          TTTTAGTTAAATCTG 100 26
   CJSA_0907 NONE
   CJSA_0908  905572 ..  905585 +  -2.5  -3.03169   AAAAAAATTAAAGGA               TTTTT ATGA AAAAA                ATATTTTTAATATTT  42 17
   CJSA_0909  906748 ..  906778 + -11.4  -2.78405   AAGGCAAACAAGCAA       GCTTTGAAGAATTA AAA TAATTCTTCAAAGA       GCTTTTTTAACTGCA  84 6
   CJSA_0911  909829 ..  909874 + -13.9  -4.89852   ACATTTATGCAAGGA TA-AAATAAATCATTCCTATTT TTA AGATAGGAATGATTTATTTGTA TTTTTATAAATATAA 100 290
   CJSA_0913 NONE
   CJSA_0914 NONE
   CJSA_0915 NONE
   CJSA_0916 NONE
   CJSA_0917 NONE
   CJSA_0918  913476 ..  913493 +  -2.1  -4.91852   AAGCTTTGGGAAGTA             TTTTTGA GTTT TTAAAAA              TTTATTTTTGATCAA  62 19
   CJSA_0919 NONE
   CJSA_0920  915513 ..  915528 +  -3.4  -3.74238   CTACCATAAGTATCT              TTATTT TTAT AAATAA               TTTCAACTTGTTTGC  52 419
        pepD NONE
        jlpA  920640 ..  920674 +  -3.8  -4.35461   TAAAAACTTCAAAAA    CATTAAAAGCAA-GA TTAAAT TCTTTGCTCTTAATG     TTTTCATAATATTAA  58 53
   CJSA_0927 NONE
   CJSA_0932  924399 ..  924413 +  -5.8  -2.64616   GCATCGTACTAGAAG               TTTTAC CTT GTAAAA               TAATATGCATAGAGC  54 162
        ribA NONE
        gidB  931202 ..  931217 +    -9  -5.22006   ATATTGTATTTTAAA              GTAGCC CTAA GGCTAC               TTTTTATTCTGCTAA 100 22
   CJSA_0943 NONE
        rpoD  936325 ..  936339 +  -4.2  -4.61527   AAATCAGGATGAATT               TCATGC GAA GCAAGA               TTTTTAAAAAGTTTT  65 423
   CJSA_0947  937701 ..  937711 +    -4  -4.00868   AAAATCATCTTGCGA                 GTTA GTA TAAC                 TTTCATTGTAAATCA  57 241
         tgt NONE
   CJSA_0954  946348 ..  946365 +  -7.1  -4.15543   AAAAAACAAACAAAA             TAAGCAA AATT TTGCTTA              TTTTAAGAATATTTA  73 23
        cmeD NONE
        cmeE NONE
        cmeF  971369 ..  971395 +  -6.8  -5.52909   TATGAGAGAGAAAAA         TTAAATTAACCA AAA TGATTAATTTAA         TTTTTTTAAGTATTA 100 17
   CJSA_0981 NONE
        murG  977095 ..  977111 +  -5.1  -2.80438   AAACCTTGAGCTAAA              GCAGAAA GCT TTGCTGC              TACTTGGGTATTTGA  52 165
   CJSA_1005 NONE
   CJSA_1006 1004128 .. 1004138 +  -2.6   -5.0925   TTTGCATTTTATAAT                 TAAT ATT ATTA                 TTTTTGATTTTAAGG  63 57
   CJSA_1007 NONE
        rdxA 1005387 .. 1005404 +  -7.1  -3.65351   TAAAATTTATTTAAA             TTTTGCT TTTA AGCAAAA              TTTAAATAAAAATAA  67 27
        pgsA NONE
   CJSA_1010 NONE
   CJSA_1011 1008056 .. 1008071 +  -5.4  -3.84825   TTATGCAAAATCCTT              GCTCAT AAAA ATGGGC               TTTAATATCCATAAG  62 73
        rpsF NONE
         ssb NONE
        rpsR 1009314 .. 1009334 +  -8.4  -4.37211   TATAATCTTTTAAAA            GCAAACTT GTAAA AAGTTTGC            TTTCTTATACATTTA  85 36
   CJSA_1017 NONE
        proC NONE
        ctsT NONE
   CJSA_1020 NONE
   CJSA_1021 1015118 .. 1015128 +  -5.4  -4.00124   AGCGAGCTTAACACA                 GTCT AAA AGAC                 TTTGATTCTCGCATA  63 52
        cutE 1032517 .. 1032545 +  -7.6   -3.6014   ATTAATTCTTTATAA        TTATACAAGCCT TGTTT AAGCTTGTATAA        TATTGTTAATTTTTT  70 220
   CJSA_1039 NONE
        pyrB NONE
        pepF NONE
   CJSA_1042 1038161 .. 1038173 +    -2   -3.2632   AAAAATAAAGATATT                TTCA AAAAA TGAA                TCTATTTGAAGATTT  42 14
   CJSA_1043 NONE
        truB NONE
        csrA NONE
   CJSA_1046 NONE
        smpB NONE
   CJSA_1048 NONE
        clpS NONE
        clpA NONE
         aat 1046151 .. 1046165 +   -10  -3.34236   ATTACTTAAAAATAA               GCGTGA AAA TCACGC               TTATGACATCGCTTT  82 32
   CJSA_1055 NONE
        waaC NONE
        htrB NONE
   CJSA_1077 NONE
   CJSA_1078 1074750 .. 1074766 +  -2.3  -5.33405   GAAAAATATCCACTT              TTGATAA ATT TTTTCAA              TTTTTCTTTACTAGG  68 403
   CJSA_1080 1077004 .. 1077014 +  -5.4  -5.10154   TTTTAGCCCACATTG                 TCCA AAA TGGA                 TTTTTAGTTTTAAGT  76 451
      cstIII NONE
       neuB1 NONE
       neuC1 NONE
       neuA1 1082132 .. 1082148 +  -2.3  -5.60993   TAAAAAGAGTTAATA              ATATAAG CTT CTTATAA              TTTTTTTATAAAAAA  70 9
        waaF 1084970 .. 1084983 +  -5.3  -3.31322   ATATTAAGCTCTTTT               GCTTT TTTT AAAGC                TTCTAAAACATTAGG  56 175
   CJSA_1093 1088646 .. 1088667 +  -7.3  -5.60993   ATAATTTCTAAAAAA           GGCTTTCCT TTTT AAGAAAGCC            TTTTTTTATCCAAAG 100 37
         rho NONE
        dnaX NONE
   CJSA_1098 1096431 .. 1096452 +  -5.8  -2.78725   ACTTATACTCACACT           TGCAGCAG ATAAAG CTGCCGCA            TCATTGATCCCATCT  55 312
         ldh 1102043 .. 1102057 +  -8.6   -5.1166   AAAGATAAAATTTAA               GCCTTT TTA AAAGGC               TTTTTGATTTTAATA 100 26
   CJSA_1111 NONE
   CJSA_1112 1106921 .. 1106931 +  -6.8  -5.14563   ATATCAAATTCCAAA                 TGCG TAT CGCA                 TTTTTTGCTCAAAAA  83 455
        dctA 1125664 .. 1125677 +  -5.3   -3.5393   TCATAATGCTGGAAT               GAACT AATG AGTTC                TTTGGAGGAAATCAT  59 19
   CJSA_1132 1128150 .. 1128164 +  -4.4  -5.41359   AATTTAAGTAAAGCT               TATTTT TCT AAAATA               TTTTTTCCTTTAATT  78 34
        luxS 1132282 .. 1132292 +  -2.6  -3.50488   TTATTTTTTAAATGA                 TTAA GCT TTAA                 TTAATATATTTTTAT  46 50
   CJSA_1137 NONE
   CJSA_1138 NONE
        metE NONE
        metF 1137474 .. 1137494 +  -2.7  -3.41114   GAAGAGCTTCATGCT            TAGAAAATA AAC TATTTTTTG            CTTTTATCTTAACTT  44 23
   CJSA_1146 NONE
   CJSA_1147 NONE
   CJSA_1148 NONE
   CJSA_1149 1145462 .. 1145488 +  -2.3  -3.85254   CCAAATAATTACAAA         GGGTAAAATTT CAAAA AAATTAAACCC         TATTTTATAATCATC  49 281
   CJSA_1153 1149396 .. 1149414 +  -8.2  -5.67529   TGATTAAAGAATGTA             GAAGAGTT GCA AGCTCTTC             TTTTTCTTTTTCATT 100 69
       groES NONE
       groEL 1155461 .. 1155477 + -10.9  -2.74514   TCTAACCTCTTATCA              GCAAGGA TTT TCCTTGC              TGATTACCAATTTAA  82 48
   CJSA_1162 1158056 .. 1158066 +  -2.6  -2.63073   AAACAAGCTATAAAA                 TTTT ACA AAAA                 ATATTCTTAAGGAGG  40 5
   CJSA_1163 1158339 .. 1158367 +  -7.6  -3.02867   CAAACAAAATAAAAA        ACTTTATCACAA TTTTT TTGTGATAAAGA        CTTATTAATTTTTTA  65 29
        cbpA NONE
        hspR NONE
        kefB NONE
   CJSA_1170 NONE
   CJSA_1171 1166057 .. 1166069 +  -4.9  -3.62505   TAGTGAACTTAAAGG                CTTTT TGC AAAAG                TATTTATAAGTTTTT  56 4
        glyS NONE
   CJSA_1173 1168938 .. 1168948 +    -4  -3.85891   AAATTTAATGCTATT                 TTTC AAT GAAA                 TTTAGTGACTTTTTC  54 17
   CJSA_1174 1170215 .. 1170225 +  -5.4   -3.4574   GTTTTAGCCCCTAAA                 GAAC AAA GTTC                 CTTTTTAATCATAGC  57 347
        pdxJ NONE
        pdxA 1172992 .. 1173005 +  -5.3  -3.06183   TATAAGCTTCTTGCA               TGCAA TCAC TTGCA                TTGAGTAAAGATAAA  54 233
   CJSA_1179 NONE
   CJSA_1180 1175094 .. 1175122 +  -3.2  -2.98714   AAAACTCAAACTACA        TAAACGAGAATT CCAAT AATTCTCGTAAA        ATTTCTAATAACTCT  44 55
        hemE NONE
   CJSA_1182 1177611 .. 1177625 +  -2.8  -4.82901   GGTAAAGTTAAAAAA               TACTCA TAA TGTGTA               TTTTTATGCCGACCC  62 467
   CJSA_1186 NONE
        guaA 1182336 .. 1182384 +    -8  -4.42464   GGAATAATCCATTTT TTCTAGCTCTTATTTTTAATATAA AAT TTTTAT-AAAAATAAG-GCTAGAA TTTATTTAAGAAATT  83 34
   CJSA_1188 1184055 .. 1184072 +  -2.7   -3.6761   ACCTAGCGGTTTTCT             TTGACTT TTTG GGGTCAA              TCTTTGTTAAACGGC  48 207
        purD NONE
   CJSA_1190 NONE
   CJSA_1191 NONE
         pnp 1190074 .. 1190098 +  -2.1  -4.21787   TCTGTGGATTTGTGC          GAGTGAGTGAA TTT TTAACTCATCC          TTTTGAGCCTTTTTT  53 20
   CJSA_1193 NONE
   CJSA_1194 1191097 .. 1191108 +    -3   -2.8459   TTTCATCATAAAATT                TCAT ATCT ATGA                 TGCTGTGTTTGTATC  43 297
   CJSA_1197 1193293 .. 1193319 +  -9.5  -4.93288   TCCTTAAAATTACAC         GCCTAGCTTAA ATCCC TTTAGCTAGGC         TTTTCTTTAGATGTT 100 123
        porA 1194745 .. 1194763 + -12.4  -5.64274   CAAGTCTAACTTCAA             GGCGGAGT TTT GCTCCGCC             TTTTTTTATGCCTGA 100 49
        racR NONE
        racS NONE
        recR 1198907 .. 1198917 +  -6.8  -2.70498   TACATCTCCTATACT                 CGCA CCT TGCG                 CTTCTATACAGTCTA  60 343
        mrdB 1219601 .. 1219617 +  -7.3  -2.62616   TCGAACTGCCGACAC              GCAGATT TTC AGTCTGC              TGCTCTACCGACTGA  63 297
        ktrB NONE
        ktrA 1221798 .. 1221833 +  -5.6  -5.68438   ACTAAGCAAGATTTA    AAGCCTTACAAGCCTTT ACA AAACGCTT-TAAGGCTG    TTTTTTCTTTGGTAG  90 36
   CJSA_1227 1226602 .. 1226633 + -11.9  -3.07344   AGATAAAAATTACAA      TTAAAATTTCCCT TATAAT AGGGAAATTTTAA       TGTCTTGCAAGATAA  90 35
         dcd NONE
        pseB NONE
        pseC NONE
   CJSA_1233 NONE
   CJSA_1234 NONE
   CJSA_1235 NONE
   CJSA_1236 NONE
       acpP2 NONE
   CJSA_1238 NONE
   CJSA_1239 NONE
   CJSA_1240 NONE
       fabH2 NONE
       acpP3 1238600 .. 1238624 + -13.1    -4.386   AATTTAGCAAAGCTT          GATTAAAACCT TTA AGGTTTTAATC          TTTTATCACCAATTC 100 20
   CJSA_1245 1242603 .. 1242615 +  -2.7   -3.9693   AAAATTGATAGAAAG                GTTTT AAA AGAAC                TTGTTTAAATAAATA  50 5
   CJSA_1246 1242865 .. 1242910 + -13.5  -3.68435   AAATATCAAAAAAAT GCTTGAAACTGCAATGAAAGA CTAA TCTTTCCTTGCAAGTTCAAGC TGTTCTTTTAAAGAA 100 1
        pseF NONE
        pseG NONE
        pseH 1247460 .. 1247475 +  -3.2  -5.94597   CCACAGAGGTTAAAA              GAAGCT CTCC AGCTCC               TTTTTTTTCATATTC  86 241
        pseI NONE
        maf1 NONE
   CJSA_1257 NONE
   CJSA_1258 1255033 .. 1255043 +  -2.6  -3.05844   AGTGTCAGAAGAAAA                 TAAA CAA TTTA                 TGTTAAAATGAAAAC  42 23
   CJSA_1259 NONE
   CJSA_1260 NONE
   CJSA_1261 NONE
   CJSA_1262 NONE
       neuB2 NONE
       neuC2 NONE
   CJSA_1265 NONE
   CJSA_1266 NONE
        ptmB NONE
        ptmA NONE
        pseD NONE
        maf3 NONE
        maf4 NONE
        pseE 1272877 .. 1272887 +  -6.8  -4.25104   AGTGTAGTTACACCT                 GCTG TTT CAGC                 TTTTACTCCAAGAGA  74 354
        mobA NONE
        pldA NONE
        ceuB NONE
        ceuC NONE
        ceuD NONE
        ceuE 1293014 .. 1293036 +  -8.4  -3.54424   GAGACCCGTTAAGAT           CTGCACCCTT AGC AGGGGTGTGG           TTTCAGCCACTCACC  77 141
         ppk 1298452 .. 1298478 +  -8.9  -3.64371   TAAGGAAAACTAAAA         GTTTTTAGGGT TTTAC ACCTTAAAAAC         TTTAAACTATGAATT  79 28
        ruvB 1300403 .. 1300419 +  -2.3  -4.27512   TATTTGAGGAGTAAA              TTTTGCA AAA TGGAAAA              TTCTTTCTTATAAGC  53 27
        amaA 1301449 .. 1301468 + -10.8  -3.97088   AAGAATTTAATTTAA            CTTGCCTT AAAA AAGGCAAG             TTTGATGTTCTAGGC  93 26
   CJSA_1302 NONE
   CJSA_1303 NONE
   CJSA_1304 1313215 .. 1313233 +  -3.2  -4.86621   TTTGCTATAATTTTA             CTTTTAAA ATT TTTAGGAG             TTTTTGCTTGAGAAT  63 44
   CJSA_1305 NONE
   CJSA_1306 NONE
   CJSA_1307 1317461 .. 1317482 +  -3.7  -4.88405   CAAAGCATTAAAAAC           CGCTCTTGCT TTA ATCAAG-GCG           TTTTCTTTAAAAGTT  68 497
   CJSA_1309 NONE
   CJSA_1310 1320356 .. 1320366 +  -2.6  -4.76193   TCATTTCTTGCATTC                 TTTT GGC AAAA                 TTTTCTCTTGTAGTT  62 491
        selA NONE
        selB 1324759 .. 1324816 +  -2.4  -3.68292   TAGAAAATCATTATA GAATTAAACATAATTTATTTAAAG GATTTATAAA CTATGAAAAAATTAAGTTTAATTC TTGTCTGTTCAGCAT  47 38
   CJSA_1314 NONE
   CJSA_1315 1326052 .. 1326073 +  -7.4  -4.16921   TTTAAGAAAAGACAA           TCAAGAGT ATAAAA ACTCTTGA            TTTTAAGAATTATTA  75 36
        katA 1329185 .. 1329218 +  -3.3  -3.47227   GCTTTAGAAAAATAA     TTTTTACTT-GCCACT TTT GGTGGCAAACTAAAGA     TTATAATAATTAAGG  47 26
   CJSA_1320 1329688 .. 1329711 +  -5.5  -4.68528   ATGAGCCTAAAAATA          CTAAAATTT ATCAAA AAATTTTAG           TTATTTTTTAAATTT  70 2
   CJSA_1322 1330967 .. 1330985 +  -5.3  -3.14924   GCTTTATAAAAAAAT             CAATGCT CACAT GGCATTG             CTTTTAAGTGGTTTA  55 94
        metC NONE
        metC NONE
      purB-2 1335196 .. 1335211 +  -5.4  -4.24326   CATACAGAAGCTATT              TTGCAC GCAA GTGCGA               TTTTAACTCCTCTTT  66 328
   CJSA_1328 NONE
        feoB 1338704 .. 1338717 +  -3.9  -5.40474   CATCAAAATTTTGCT               CTATA AAAG TATAG                TTTTTTTCAAAGGAT  76 345
        nadD NONE
   CJSA_1336 1344534 .. 1344563 +  -6.6  -4.63542   AAAAAAGGTAGGGTT       TAAAAAGGCTAA ATTTAA TTAGCCTTTTAA        TTTTTAGAGATTATC  76 23
        fliL NONE
        acpS 1347342 .. 1347362 + -12.7  -4.21737   ATGATAATGGTTTTG            CTATAGCCA TAG TGGCTATAG            TTTGATTATTTTCCT 100 0
   CJSA_1374 NONE
         dut NONE
   CJSA_1376 1388188 .. 1388201 +  -5.3   -3.9941   TTTTCTTTTAAAAAA               GATGA AATT TCATC                TTTACTTATAAAGAG  63 492
        prfB 1391207 .. 1391221 + -11.4  -4.53142   AAAATTAGAAAGATA               GCGGGA TTT TCCCGC               TTGTTTTATTATCTT  95 83
   CJSA_1383 NONE
   CJSA_1384 NONE
   CJSA_1385 NONE
        flgI NONE
   CJSA_1387 NONE
   CJSA_1388 1397580 .. 1397614 +  -4.4  -2.90075   TTAATCTAAAACTTT     CATTCTCCTTTTTTTT GAG AGAGAAAAGGAGAAAA     TATGCTTAAACAAAG  48 32
   CJSA_1389 NONE
        flgK 1399869 .. 1399893 + -12.3  -2.63596   ATGCTTGATACCTTA          CTAGGGCTTAA ATC TTAAGCTCTAG          TAATATCAAATGAAA  88 8
   CJSA_1391 NONE
   CJSA_1392 NONE
   CJSA_1422 NONE
   CJSA_1423 1431499 .. 1431512 +  -6.7  -4.77165   ATTTTTAATCCAAAA               GCCTT AAAA AAGGC                TTTTATTCTCAAAGC  82 19
   CJSA_1437 NONE
        moaD NONE
        moaE NONE
       moaA2 1452554 .. 1452580 + -13.8   -4.7261   TAGTGGAGTAATTAG         CCCTAGTGGAGT TTC AATCCACTAGGG         TTTGTTTTAGTCCCT 100 115
        coaE NONE
        dapF NONE
   CJSA_1448 1462333 .. 1462354 +  -2.4  -5.88471   TTCTTAGGCCAAAAT           CTTTAAAA TAAATC TTTTGAAG            TTTTTTTTCATCATG  83 354
   CJSA_1456 1470486 .. 1470513 +  -5.6  -3.27687   CAAGAAAAGACTAAA        AATTAAGCAGGT TTTA ACCTGCTTAAAA         TATCATTTTTTACTT  55 27
   CJSA_1457 NONE
   CJSA_1458 NONE
   CJSA_1459 1473423 .. 1473445 +  -9.9  -4.05446   ATATAAAAGTTAATC           GCCAAAGGG TGAGC TCCTTTGGC           TTTATGATTAAACAC  91 359
   CJSA_1462 NONE
   CJSA_1463 1475873 .. 1475886 +  -2.3  -5.85244   GAGCTTACACCCATA               GCCAA AGCA TCGGC                TTTTTTGTTTTCATT  83 421
   CJSA_1471 1487516 .. 1487551 + -12.4  -2.98582   AAAATATCGTTTAAG    TAATAAATTAATATAT CAAT ATATATTAATTTATTA     ATTTATACATGTTAT  91 27
   CJSA_1472 1487885 .. 1487895 +  -2.6  -5.13521   TACTTCGCCTCTTAT                 TAAT CCT ATTA                 TTTTTTCCATGCTTT  66 138
   CJSA_1473 NONE
        arsR 1489188 .. 1489198 +  -2.6  -3.38603   CCCATTCTATATCGC                 TTTT TGA AAAA                 TATTTCACACTATTT  46 335
   CJSA_1476 1491389 .. 1491418 +    -8  -2.73508   AAGAGGTTTTAACCT       TAGATAACTAGC CAAAAA GCTAGTTATCTC        TAAATTTACTTATTG  67 29
         cgb 1515389 .. 1515401 +  -9.1  -3.79623   TGATAAATAATATAA                GCCCA TTT TGGGC                TTTAATCAAATTTTT  81 31
   CJSA_1501 1519310 .. 1519323 +  -2.4  -3.78958   ATTTTAATAATTTTT               GCTA AAATTA TAGC                CTTTTTATTTCATGA  47 72
        infA 1519587 .. 1519606 +  -6.6  -2.60032   TAAGTTATTTAAAAG            CTAATTTT AGAT AAAATTAG             AGTTTTTGCGACAAA  58 43
        rpmJ NONE
        rpsM NONE
        rpsK NONE
        rpsD NONE
        rpoA NONE
        rplQ 1522667 .. 1522684 +  -9.9  -3.28984   TGTAGCTTAATCAAA             TCCTAGC TTTT GCTAGGA              TTAATACTTCAATTA  81 31
        hisG NONE
        hisD NONE
        hisB 1526064 .. 1526074 +  -3.2  -2.63102   TGAAAATTTAGCCAG                 CTCT AAA GGAG                 TGATATGAAAATCAT  42 7
        hisH NONE
        hisA NONE
   CJSA_1514 NONE
        hisF NONE
        hisI 1530188 .. 1530204 +  -2.1  -2.96963   ATTAAAATTCACATA              ACTTGCC CCT GGCATGA              TGGTTGTTCCTGCTG  41 485
       ispDF NONE
   CJSA_1520 NONE
   CJSA_1521 NONE
        pgpA 1535788 .. 1535804 +  -3.1  -4.28651   TAGTTTTTTGGGATA              TAAATTT AAA AGATTTA              TTTTGAAATTTTGCT  56 3
        rpsT NONE
        prfA 1537617 .. 1537630 +  -2.5  -3.63305   GTTCACTTACTTCAC               TTATA TAAA TATAA                TTTCCCCATTGTGTG  48 404
        chuA NONE
        chuB NONE
        chuC NONE
        chuD 1543139 .. 1543149 +  -2.6  -4.25104   TTAAATTTGGCCATT                 TAAA AAG TTTA                 TTTTGATGAAGCAAA  55 294
        kgtP 1545566 .. 1545578 +  -7.7  -2.64099   CCAAAGCCCCTATAT                CAAGC AAA GCTTG                GTTGTGATCAAAGGC  65 442
   CJSA_1533 1546982 .. 1547020 + -13.6  -3.41114   TATTTGCAAATAACT   TATAGCAAAATAAACT CCTTTTA AGTTTATTTTGCTATA   CTTTTATCTTCAATT 100 28
        ribD NONE
   CJSA_1535 1549422 .. 1549434 +  -6.3  -3.09635   TTCAGCAGCATTACA                TGCTT TAA AAGCA                TTAGCTCCTAAAACT  60 306
       exbB2 NONE
       exbD2 NONE
       tonB2 1554949 .. 1554959 +    -4  -5.08255   TACAATTTGTGCTTC                 TTGA TTT TCAA                 TTTTATTTTGAAAAT  68 68
   CJSA_1545 1557095 .. 1557110 +    -9  -6.11229   AAATATTGCAATCAA              GCCCAT GAAA ATGGGC               TTTTTTTATTTTAAT 100 90
        dnaG NONE
   CJSA_1551 NONE
   CJSA_1552 NONE
        murE NONE
   CJSA_1554 NONE
   CJSA_1555 NONE
        ispA NONE
         tkt NONE
        iamB 1569571 .. 1569593 +  -2.8  -2.93073   TTTATTCTCTGTTAT           TTTAACTTCT ACA GGAATTTAAA           TGGTTATTAAAGCAC  41 4
        iamA 1570292 .. 1570302 +    -4  -2.93393   TTGCAAAATGAACGA                 CTTT TTA AAAG                 ATTTATGGAGTAAAA  45 2
   CJSA_1560 NONE
   CJSA_1561 NONE
   CJSA_1562 1572381 .. 1572419 +   -12  -4.10657   ATAGTAATCGTTTGT   TCTCTTTAAGCAAATATA ATA TATTTTAGCTTAAAGAGA   TTTTCCAAACTCTAA 100 43
   CJSA_1569 1580316 .. 1580337 +  -3.1  -2.78216   AAAAGGAGTAAAATC           ATGATAAAA AAAG TTTTATCAG            TAGTTGCTGCAGCTG  43 22
         p19 1580861 .. 1580879 +   -11  -3.89368   GCCAAAATAATTTTA             CGCTCGGA TTT TCCGAGTG             TTTGAATATTTTTAT  95 31
   CJSA_1571 NONE
   CJSA_1572 NONE
   CJSA_1573 NONE
   CJSA_1574 NONE
   CJSA_1575 NONE
   CJSA_1576 1586606 .. 1586622 +  -6.7  -3.75115   TACCCATTTTTTCTT              TGATTTT AAG AAAATCA              TTGGTTTTATGAACA  69 304
   CJSA_1585 NONE
        fliQ NONE
        murB 1594349 .. 1594363 +  -4.4  -2.69151   TTTTGTATTTTATAT               TATTTT TAA AAAATA               TAATATATAGAACAA  48 165
   CJSA_1588 1597822 .. 1597855 + -11.3  -4.26142   CTACTTGTTAAAAAT     TTCATCCTGATAATT TTAA AATTATTAGGATGGA      TGTTTTTATTGTATT  95 81
   CJSA_1589 1599857 .. 1599871 +  -3.6  -4.77896   AATTTAATTCTGCAT               TTTTTG CTG CAAGAA               TTTTTCCATTGCTTG  66 160
   CJSA_1596 1608319 .. 1608340 + -10.3  -5.09762   AAAACCTAGAATAAA           TTAGCAAGA AAAA TCTTGCTAA            TTTTATTTATTACAA 100 22
   CJSA_1621 NONE
   CJSA_1622 NONE
   CJSA_1623 1623776 .. 1623788 +  -3.5  -4.72556   ATATAATTATACTAC                TTTTT ACT AAAAA                TTTTCTGATTTTTAA  62 142
   CJSA_1624 1625095 .. 1625112 +  -5.7   -2.9756   ATTTTCAAAACTCAC             CAAAATA GAGC TATTTTG              ATATTCTTTTTTATT  56 389
   CJSA_1629 1630281 .. 1630301 +  -8.4   -3.1996   GGTTGATTTCATTAA            TGCAAGTT ATAAA AACTTGCA            TTAGATTAAAATTTA  73 35
        ruvC 1634298 .. 1634317 -  -3.6   -5.0133   TATTGCTTTAAAAAA            TTTAACGC TTTG GCTTTAAA             AAACTTTTGCGTTTA  68 176
        flgE 1631540 .. 1631592 -  -9.6  -4.88495   ATACAGATAAGAAAA TGCAATTTTATTGC-AACTCACCCCT AGC AAGAGTGAGTTAGCAAT-AAATTGAA GGCAGTTCAAGCCTA 100 139
   CJSA_1631 1630840 .. 1630850 -  -6.8  -3.08464   TGAGCATGCATCCAA                 GCTG CAT CAGC                 ACCTATAAAAAAACC  62 253
        leuA NONE
        leuB NONE
        leuC NONE
        leuD 1624558 .. 1624583 -  -5.5  -3.04894   AATTTTTGCGAAAAT         TTTGCCTTG-GA AAA TCACAAGGCAAG         TTTAAGAGCAGATAC  56 153
        ksgA NONE
   CJSA_1619 1619072 .. 1619085 -  -5.2  -4.57073   GATCTTCCTTAAAAA               GGGC GTTTTT GCCC                TTTTTTACATTACAA  70 30
   CJSA_1618 1618115 .. 1618137 -  -4.2  -4.40561   TTCCTTTAAAAAGAA           CTCGTTAGTT AAA AACTAACCAA           ATTTATAAAAATTGA  64 181
        rpsJ NONE
        rplC NONE
        rplD NONE
        rplW NONE
        rplB NONE
        rpsS NONE
        rplV NONE
        rpsC NONE
        rplP NONE
        rpmC NONE
        rpsQ NONE
        rplN NONE
        rplX NONE
        rplE NONE
        rpsN NONE
        rpsH NONE
        rplF NONE
        rplR NONE
        rpsE NONE
        rplO NONE
        secY 1608319 .. 1608340 - -10.3  -4.38114   AAAACCTAGAATAAA           TTAGCAAGA AAAA TCTTGCTAA            TTTTATTTATTACAA  91 35
        topA NONE
        bioB NONE
   CJSA_1593 NONE
        gltA 1601342 .. 1601369 -  -8.6  -3.54548   AATTATACAAGAAGA        TTTTGTGGAATT TTTA ATTTCCACAAAA         ATTTTAATTAAATTT  77 33
        cysQ NONE
   CJSA_1590 1599712 .. 1599736 -  -5.9   -3.3082   AACTGATTAAAGATA          TTTTAAACTAA AGC TTAGTTTAAGA          GCTTTAGGTGGAAAA  60 15
        recA NONE
         eno 1589848 .. 1589870 -    -5  -3.39328   AAGCCCAAAAAATCA           TTTTTATAAC ATG GGTATAAAAA           CTTTTTTTTCTTGTG  54 69
   CJSA_1582 NONE
        cgpA NONE
   CJSA_1580 1588119 .. 1588135 -  -3.1  -4.39227   ATAAATAAAAGGAAA              TATTTTA TCA CAAAATA              ATTTTAAAGTCAAGG  58 35
   CJSA_1579 NONE
   CJSA_1578 1586809 .. 1586819 -    -4  -3.57572   AAATATATAATAATA                 CTTT TAT AAAG                 TTAATATCATCACAT  50 61
   CJSA_1577 1586331 .. 1586341 -  -2.6  -4.92239   GTAAAAAGCTAAAAA                 TTTA CTT TAAA                 GCTTTTTATCCCCTA  63 21
   CJSA_1568 1577125 .. 1577157 -    -5  -5.49729   AATTATTTAAAAAAA     CAAGCCCAAGATACC AAAA AGT-TCTTAAGCTTG      TTCTTAAGATATTTA  83 38
       nhaA1 NONE
       nhaA2 NONE
        nlpC NONE
        murL NONE
         map 1572523 .. 1572559 - -13.5  -4.00914   AAACTAAAATAAATA    TTTAGATAATTTAACAA TTT TTATTAAATTATCTAAA    CCATATTTATGTTTT 100 198
   CJSA_1549 NONE
        rnhA NONE
         rnc NONE
        aroC 1557095 .. 1557110 -    -9  -3.37901   AAATATTGCAATCAA              GCCCAT GAAA ATGGGC               TTTTTTTATTTTAAT  77 31
   CJSA_1544 1555486 .. 1555504 -  -6.8  -3.59262   TTTTACACTTTCAAA             CCAATTTG AAA CAAATTGA             TTTACTTCGCCATTA  67 312
   CJSA_1539 1552517 .. 1552536 -  -4.4  -3.67864   GAAGTGAATGTGAAA            CTTAAAAA ATAA TTTTCAAG             CTTTCATTCTCAACA  56 7
   CJSA_1538 1551975 .. 1551996 -  -7.4  -5.77571   ATCAAAAAATAAAAA           TTTGGAAG ACTATG CTTCCAAA            TTTTTGCATCAAATT 100 67
        sdaC NONE
        sdaA 1549127 .. 1549156 -  -9.5   -5.4148   CAAAGAATGAAAAAA       TACACTAAAGTGT AAAA ACACTTTAGCATA        CTGTTTTTAAATTTG 100 18
        mutY NONE
   CJSA_1530 1542357 .. 1542370 -  -3.9  -4.71382   AGAAGGACTTAAAAA               TTTTG GTAT CAAAA                GTATCAATTTAAAAG  66 522
   CJSA_1525 1537069 .. 1537082 -  -6.7  -3.60412   GAAGCGGAGATAGAA               GCGAA CGCA TTCGC                ACTTACAATTTTCCA  67 195
         mrp NONE
        dapD 1529717 .. 1529737 - -11.3  -4.00914   AAATTAAAAGAAAGA            CATAAAGCT TAA AGCTTTATG            TAAAATAAATTTATA  95 41
   CJSA_1500 1517050 .. 1517065 -  -3.4  -4.26189   TTATAAACTCCAAAA              TATAAT TTTA ATTATA               ACATTTTAAGAGTGA  56 44
   CJSA_1499 1515389 .. 1515401 -  -9.1  -3.93744   TGATAAATAATATAA                GCCCA TTT TGGGC                TTTAATCAAATTTTT  83 27
   CJSA_1497 1511961 .. 1511971 -  -2.6  -4.00411   TAAAATTTTAAAGAA                 TTAT AAA ATAA                 AAAATAAGAAGCCAC  50 92
   CJSA_1496 NONE
   CJSA_1495 NONE
   CJSA_1494 NONE
   CJSA_1493 NONE
   CJSA_1492 NONE
        nuoA NONE
        nuoB NONE
        nuoC NONE
        nuoD NONE
   CJSA_1487 NONE
   CJSA_1486 NONE
        nuoG NONE
        nuoH NONE
        nuol NONE
        nuoJ NONE
        nuoK NONE
        nuoL NONE
        nuoM NONE
        nuoN 1493786 .. 1493800 -  -2.2  -4.62313   TAAAATTAAAAATAA               TATTCT CAT AAAATA               ATTATAGCAAAACTC  57 41
        pflA 1491349 .. 1491368 -  -6.6  -3.16743   AAGTGATATAGCTAA            TAATATCT TAGA AGATATTA             AGAAGAAGAGGTTTT  61 85
   CJSA_1475 1488773 .. 1488790 -  -3.5   -3.7282   TTATGGGATTAATAA             TG-AGCTT TTA AAGCTGCA             TTTAGATCTTTTTGA  54 121
   CJSA_1470 1486325 .. 1486348 -  -9.7  -5.26247   TTAAAAGAAATAAAA          GATGCCTTA AAAGCA TAAGGCATC           TTTATTTATAGGCTT 100 31
        hsdM NONE
        mloB 1482853 .. 1482868 -  -3.4  -4.04355   AAAAAATACACGAAA              TAAATT CGAG AATTTA               AATTCGGAATTTCCT  54 176
        hsdS NONE
        rloH NONE
        hsdR 1476622 .. 1476638 -  -5.3  -4.28656   AGTCAAGAGTGAAAA              TAATTTT TTA AAAATTA              GTATAAATACTGGAT  66 170
   CJSA_1464 1475423 .. 1475457 -    -6  -3.58731   AAAAGAGCTTTTAAA    CATCGCTAA-G-CAAA GGGGA TTTGACATTAGCGATG    TGGTTTTTGATAAGT  62 47
   CJSA_1461 1474011 .. 1474021 -  -2.6  -3.75897   AATTTTTAAGTCAAA                 TTTT TTA AAAA                 ATTTTTTTCAAGTGT  48 19
   CJSA_1460 1472728 .. 1472742 -  -7.2   -3.3579   AAACCTTTTTAAATA               CTACTT ATA AAGTAG               GTTTAAAAAGCGATA  66 369
   CJSA_1455 NONE
   CJSA_1454 1467859 .. 1467869 -  -2.6  -4.30231   AATAATTAAGATAAA                 TTTT ATA AAAA                 ATGGGAATATTTGTA  54 69
         acs 1465778 .. 1465801 -  -9.7  -3.06831   TGAATTTTCATGCAA          CAAGGCAAA GTTCTT TTTGCCTTG           TTATTCAAACTCTGC  77 26
        galU NONE
         pgi 1463581 .. 1463639 -  -7.5  -4.14392   TTTTAATTTTTAAAA TTATAACATAAAATTCTTAAATAATAAT TATT ATTATTAATTAAAAATTTT-TATTATAA TTTTAACTTAAAATC  75 68
   CJSA_1450 1463082 .. 1463098 -    -5  -2.57931   CCTAGTTTGTATAAT              TGGGGC ATAAA GCCCCT              TAAATTACATTTTGC  49 30
   CJSA_1449 1461749 .. 1461765 -  -2.3  -4.31943   TCCAGATAAAAAACA              CAAAATT AAA ATTTTTG              ATAGTCTGCAAGATA  54 261
        purM 1458874 .. 1458893 -  -9.4  -5.28983   CTTAAAATACAAAAA            TAAAGCGT ATTA ACGCTTTA             TTTTCATTCTAAAAC 100 29
   CJSA_1443 NONE
        cas1 NONE
        cas2 1452553 .. 1452581 - -10.3  -2.78547   TTAGTGGAGTAATTA        GCCCTAGTGGAGT TTC AATCCACTAGGGT        TTGTTTTAGTCCCTT  79 406
        nspC 1447608 .. 1447624 -  -2.3  -4.66609   TATTTGATTTAAAAA              TCACTGA ATT TCAATAA              AATTCCACAAGGATT  57 188
   CJSA_1435 NONE
   CJSA_1434 NONE
        fdhA NONE
        fdhB NONE
        fdhC 1442204 .. 1442225 - -13.1  -3.12962   AAAAGCTTAAAACTA           CCGCTATGT AATA ACATAGCGG            TTAAAGATTAAATTT 100 33
        fdhD NONE
        modE 1440468 .. 1440478 -    -4  -3.86397   TCCTAAAATAAAAAT                 TTAG ATT CTAA                 TTTTAACATATTTTT  54 101
   CJSA_1428 1438317 .. 1438344 -  -4.2  -5.48787   ATAATATAGAAAAAA        TTTAAAAGCTCA AAAA TGAGCTTTTTTA         AAATCTTTTTTTATT  80 23
   CJSA_1427 1437559 .. 1437573 -  -4.4  -2.83403   TTTTTTGCATGAAAT               TTAAAA TTG TTTTAA               GACCACCCGGGCTTA  48 111
        selD 1436635 .. 1436645 -    -4  -4.52042   ACAAAAATTAAGAAA                 TGAT AAT ATCA                 TTTTCTTGCTTATTT  60 7
        putA NONE
        putP 1431499 .. 1431512 -  -6.7  -4.27584   ATTTTTAATCCAAAA               GCCTT AAAA AAGGC                TTTTATTCTCAAAGC  74 34
        purA 1428557 .. 1428571 -  -7.2  -3.30243   ATTTACTTTTCATAA               GATGAT AGT ATCATC               TCTTTCAGGGCTAGT  68 5
   CJSA_1420 NONE
   CJSA_1419 1427589 .. 1427601 -  -4.9   -4.7153   AAAGAATGTTAAAAA                TGAAA AAT TTTCA                TTATTTTAATCACCT  68 39
   CJSA_1418 NONE
        carA 1425867 .. 1425877 -  -2.6  -2.69601   CTCACATCAAATTCA                 TAAA TTC TTTA                 AAAATATACTTACTT  40 1
   CJSA_1416 1425194 .. 1425206 -  -2.7  -3.84633   GATCTTTAAAAAAAT                CTTTC ATT GAAAA                GCCTTAAAACCTATA  50 16
   CJSA_1415 NONE
   CJSA_1414 1423237 .. 1423254 -  -5.7  -2.97381   AGAATATTAATTATA             CATTTTT TCTT AAAAATG              ATAATTTTGTTAATC  57 77
        ccoN NONE
        ccoO 1421017 .. 1421033 -  -2.3  -2.57672   CACATCAAAAACTAT              TGATAAA TGT TCCATCA              TCTTACTTTAAGCTA  38 28
        ccoQ NONE
        ccoP NONE
   CJSA_1409 NONE
   CJSA_1408 NONE
   CJSA_1407 NONE
   CJSA_1406 NONE
   CJSA_1405 NONE
   CJSA_1404 1413319 .. 1413359 -  -8.7  -5.26316   TGATTGTATAAAAAA  TAATATTAATTTTTACTTA ATT TAAGTAAAAATTAAGTTTA  TATTTCCAAAATTTG 100 23
        rplM NONE
        rpsl 1412432 .. 1412448 - -12.3  -3.99917   AAAAAATTGTAGAAA              GGTGGGA AAA TCCCACC              AAAAATATTAACGTT 100 33
        cadF NONE
   CJSA_1400 1410687 .. 1410697 -  -2.6  -3.27298   TTTTTTAACTATCAA                 TTTA CTA TAAA                 TTCTCTTAAAAGGCG  43 59
   CJSA_1399 1407041 .. 1407062 -    -3  -4.41348   TCTTGTGCAAACAAA           GTGCTAAA ACACAA TGTAGCAC            TAAAAATATATTTTA  58 41
        ctsR NONE
        ctsD NONE
        ctsP NONE
        ctsX NONE
        ctsE NONE
   CJSA_1393 1401363 .. 1401374 -    -3  -3.85724   AAAAACTAATGGAAA                GTTT ATAA AAAC                 TTTATTTTTAATCGT  52 79
        thiL NONE
        truD 1391670 .. 1391682 -  -3.5   -3.7456   ATAACTATACCTAAA                TTTAA AAT TTAAA                TATCATTTTTGCAAT  52 86
   CJSA_1380 1391207 .. 1391221 - -11.4  -3.40925   AAAATTAGAAAGATA               GCGGGA TTT TCCCGC               TTGTTTTATTATCTT  87 111
   CJSA_1378 NONE
        tilS 1387335 .. 1387353 -  -5.4  -4.95957   GAAATCAACCAAAAA             TATTACCA TTA TGATAATA             CAAACGAAGTTTCAA  74 376
   CJSA_1373 1385229 .. 1385245 -  -2.4  -3.32684   TTTTAAACAAAATCA              TAAAAA TTTAT TTTTTA              CAAAACTCAAGCTTT  43 16
        kpsM NONE
        kpsT NONE
        kpsE NONE
        kpsD 1380944 .. 1380956 -  -4.9  -2.74461   TATTCATTTTTAAAC                CTTAA AGA TTAAG                CACAACATTGGTTGC  50 14
        kpsF NONE
        tagD NONE
   CJSA_1366 NONE
        tagF NONE
   CJSA_1364 NONE
   CJSA_1363 1370576 .. 1370586 -    -4  -3.98842   TATAATATTGATAAA                 TTTC TAA GAAA                 AAATACTAATACTCT  54 96
   CJSA_1362 NONE
   CJSA_1361 NONE
   CJSA_1360 NONE
   CJSA_1359 NONE
   CJSA_1358 NONE
   CJSA_1357 NONE
   CJSA_1356 NONE
   CJSA_1355 NONE
   CJSA_1354 NONE
   CJSA_1353 NONE
   CJSA_1352 NONE
   CJSA_1351 NONE
   CJSA_1350 NONE
   CJSA_1349 1355448 .. 1355458 -    -4  -3.98172   AGTAATACCTATAAA                 CAAA ATA TTTG                 CTCACTTTCACATTC  54 8
   CJSA_1348 NONE
   CJSA_1347 NONE
        cysC NONE
        kpsC NONE
        kpsS 1350326 .. 1350351 -  -4.8  -2.93853   CTCTCTTAATCAAAG         CTTTTTAGTC TTATTT GTCTAAAAAG          AAATTTTTATAAAAA  50 10
   CJSA_1343 NONE
   CJSA_1342 NONE
   CJSA_1341 1347144 .. 1347170 -  -5.8  -3.29973   TTAAAAATCCAGCAA         CTCTAGCAGGTC TTT GGGCTGCTAAAG         AAGCCGCTAGCAAGG  59 223
        algC NONE
   CJSA_1337 1344540 .. 1344557 -  -5.6  -4.58395   GGTAGGGTTTAAAAA             GGCTAA ATTTAA TTAGCC              TTTTAATTTTTAGAG  70 35
        gapA NONE
         pgk NONE
        tpiA NONE
        fabI NONE
       hydA2 1338243 .. 1338259 -  -2.9  -3.39595   TGTAATGATTTATAA              TCCCTGC TTT GCAGCAA              CTATAGTTTTTTCAA  46 147
   CJSA_1321 1329182 .. 1329221 -  -5.3  -4.86033   AAAGCTTTAGAAAAA  TAATTTTTA-CTTGCCAC TTTTG GTGGCAAACTAAAGATTA  TAATAATTAAGGAAA  74 516
   CJSA_1318 NONE
   CJSA_1317 NONE
        fldA 1326052 .. 1326073 -  -7.4   -4.0865   TTTAAGAAAAGACAA           TCAAGAGT ATAAAA ACTCTTGA            TTTTAAGAATTATTA  75 38
   CJSA_1311 1319802 .. 1319827 -  -2.7   -4.2237   AAACTAATTGTAAAA         CTCATTTTAAA CTTT TTAAAAATGAA          ACTCATGGAAGTGTC  55 81
   CJSA_1308 NONE
   CJSA_1301 NONE
        glmS NONE
   CJSA_1299 NONE
        fumC 1301449 .. 1301468 - -10.8  -3.22106   AAGAATTTAATTTAA            CTTGCCTT AAAA AAGGCAAG             TTTGATGTTCTAGGC  85 35
   CJSA_1295 1298452 .. 1298478 -  -6.7  -4.72729   TAAGGAAAACTAAAA         GTTTTTAGGGT TTTAC ACCTTAAAAAC         TTTAAACTATGAATT  78 440
        nrfH NONE
        nrfA 1293789 .. 1293806 -  -9.9  -5.67711   CAAAGAAAAGAAAAA             GCCCTAT GATT ATAGGGC              TTAAGAATTATTTTT 100 33
   CJSA_1291 1293100 .. 1293118 - -11.8   -3.8648   AAAAAATAAATAATA             CCTAGCTT AAA AAGCTAGG             AAAAATCAAAGGCTA 100 31
   CJSA_1284 NONE
   CJSA_1283 NONE
        cdsA NONE
         dxr 1284067 .. 1284089 -  -2.8  -2.89944   ATAAAAAATAAAATT           GTTAAAAAAA ATT TCATTTTAAC           TCCTTAAATACTCTC  41 21
   CJSA_1280 NONE
   CJSA_1279 NONE
   CJSA_1278 NONE
        maf7 NONE
        maf6 1278094 .. 1278112 -  -2.4  -3.72576   TTTTTTTCTAGCAAA             TTCATGGA AGT TCCTTAAA             AGAATCGATGATAAT  47 8
   CJSA_1275 1276207 .. 1276226 -  -7.2  -2.89655   CCTTTTAAAAAAATT            CAAGCTCA TCCA TGAACTTG             TTAAATACCATATCG  64 80
        flaA 1274405 .. 1274423 -  -6.7  -5.79595   GTTTAAAATAAAAAA             GCCTAGC ATTAA ACTAGGC             TTGGATTTGTATATA 100 56
        flaB 1272552 .. 1272575 -  -9.7  -3.10134   AAAGCACTTTAAAAG          CTTAGATGC ATAAAA GCATCTAAG           AAATTATTGAAGAAG  77 29
        pseA NONE
        hisH NONE
        hisF 1247105 .. 1247128 -  -4.6  -3.70102   ACTTAAAAGTAAATA          CTCTTAAAGC TTAT GCTTTCAAAG           ACAATCGCAAAGCTT  57 106
   CJSA_1248 NONE
   CJSA_1247 1242864 .. 1242911 - -12.2  -5.69023   AAAATATCAAAAAAA TGCTTGAAACTGCAATGAAAGA CTAA TCTTTCCTTGCAAGTTCAAGCT GTTCTTTTAAAGAAC 100 0
   CJSA_1244 NONE
   CJSA_1243 1238213 .. 1238226 -  -3.8  -3.95883   CATCATGGAAAAATA               CGCT AATTTA AGCG                CTTGTTCACTACCTG  56 418
        accB NONE
        accC 1226602 .. 1226633 - -11.9  -3.79689   AGATAAAAATTACAA      TTAAAATTTCCCT TATAAT AGGGAAATTTTAA       TGTCTTGCAAGATAA  95 22
        gltX NONE
   CJSA_1225 NONE
         upp 1222468 .. 1222478 -  -5.4  -2.87344   CATCTCTTTTATAGA                 GTGT TAA ACAC                 TCTATCTCCTGCATC  53 8
   CJSA_1223 1221714 .. 1221732 -  -3.8  -3.92373   TACCTGATTTAGAAA             CCACGACA GTT TATAGTGG             AGATGTTGTAATACT  56 77
   CJSA_1219 NONE
   CJSA_1218 NONE
        trmB NONE
   CJSA_1216 NONE
   CJSA_1215 1213280 .. 1213301 -  -3.8  -6.32976   AAAAAAACAAAAAAA           GATAAGAA TATTTT TTCTCATC            TTTTAACCTTAAACA  93 21
   CJSA_1214 1212103 .. 1212120 -  -4.2  -2.86288   TAAATTCCATTAAAT             TTAGCT AATTTA AGCTAA              TGAGTTCCAAAGGAT  48 12
        pyrH NONE
        rpoZ NONE
        spoT NONE
        tyrS NONE
   CJSA_1209 NONE
        amiA NONE
        mnmC 1202794 .. 1202807 -  -5.3  -3.91084   TCATTCTTAATTAAA               GCTTA ATCA TAAGC                CTTTTTTAAGTTTGC  62 18
        hydA NONE
        hydB NONE
        hydC NONE
        hydD 1198253 .. 1198265 -  -3.5  -4.70887   CGATGAAGAAAGAAA                TAAAA ACA TTTTA                TGTATAGTTGAAAGC  66 346
        dnaJ 1194807 .. 1194835 -  -3.3  -5.38951   AATTTATATAAAAAA       TTTTCCC-AAGC TAAAAC GCTTTAGGAAAA        TTAAGACTTAAACCA  72 26
   CJSA_1196 NONE
   CJSA_1195 1190601 .. 1190614 -  -2.5  -5.03945   GAATAATTATAAAAA               TTTAA GGAG TTAAA                AATGCCTTTTGTAAA  63 233
   CJSA_1185 NONE
        uvrC NONE
   CJSA_1183 1177004 .. 1177014 -  -5.4  -2.88433   AGGTGAAAAACTAAG                 CTTC AAT GAAG                 AAGAATTATTAAAAA  52 177
   CJSA_1178 1172479 .. 1172501 -  -6.4  -4.55383   AATTTACAAAAAGAA           TTGCTTTTAA ATT TTAAAGGCAA           GGGCGTTTATCTACC  76 298
   CJSA_1175 1169864 .. 1169894 -  -4.2  -4.73388   AATTTTGATGAAAAA       TTTCATTTTTTCGA ATT TCAAAAAAACTAAA       ATTTTATATTTTTCA  69 21
        htrA 1160559 .. 1160583 - -12.3  -2.82666   TTAAACTAAAATTTA          TAACGAAAGGA AAA TCCTTCCGTTA          TTTTTATTTAAGCAC  88 29
   CJSA_1165 NONE
   CJSA_1164 1158340 .. 1158366 - -11.1  -5.95449   AAACAAAATAAAAAA         CTTTATCACAA TTTTT TTGTGATAAAG         ACTTATTAATTTTTT 100 252
        dccR NONE
        dccS 1155296 .. 1155309 -  -5.3  -4.13654   CTGTTAAAGTAGAAA               GAGTA GCTT TACTC                AATGCAGTTTCTGTA  64 197
   CJSA_1157 1150809 .. 1150825 -  -5.3   -3.4582   TGAGTCCATTAAACA              TTTTTTA CCT TAAAAAA              TCTTATTTAATAATT  57 18
        ribE NONE
   CJSA_1155 NONE
   CJSA_1154 1149284 .. 1149297 -  -4.5  -3.54741   GAGCAGGTTGTTAAA               GAAGC CCTA GCCTC                GAATCAACCTAATCC  57 77
   CJSA_1152 NONE
        glcD NONE
         rbn 1145069 .. 1145087 -  -3.2  -2.52017   TTTAAATTTAAAATT             TATGGA ACTAATA TCCATA             TCCCATTTTGGATTT  42 88
   CJSA_1145 1140634 .. 1140644 -  -2.6  -5.40072   CCTTTTTTAAAAAAA                 TTAA ACA TTAA                 AGTATAGCCTTTTGT  69 22
        ftsY NONE
        radA 1138400 .. 1138410 -  -2.6  -3.71917   ATTCTAAACTCGAAA                 TTTT AGC AAAA                 TCTTACTTATATTTT  48 50
        atpB 1137684 .. 1137694 -  -3.2  -3.43039   AAATTCTAAAATATA                 GATC AAT GACC                 TTCCTCAACAACAGT  47 17
   CJSA_1141 1137286 .. 1137296 -  -2.6  -4.12942   CTAAATTTGTTAAAA                 TTTT AGA AAAA                 TATGAAAATAATACT  53 227
        gatB NONE
        gpsA NONE
       pyrC2 1127712 .. 1127727 -  -6.2  -2.75891   ACACGGAGCCAATGA              TATAGC CAAT GCTATA               GGTCCTTTTGCAGCG  58 447
   CJSA_1131 NONE
   CJSA_1129 1123507 .. 1123533 -  -3.9  -3.68757   GTGAAAATTATACAA         TAAAAAAGATA AAATA TATCTTATTTA         ATTATTTTCTTGTAA  52 23
        cetA NONE
        cetB 1121494 .. 1121525 - -12.6  -2.61736   AAGATTATATAATAT      TTAGACTTAAAACA AACT CGTTTTAAGTCTAA       CAAAAATTTATTTAG  95 33
        gidA NONE
        arsB NONE
        petA NONE
        petB NONE
        petC 1115283 .. 1115328 -  -2.1  -4.77719   TAAAATTGAAGAAAA GATAGAATTTTTGCCAC AGATATAAAATA GTGGCAAAAATTTTATA ATACTAATGTAATTT  60 29
         cfa NONE
        rpsB NONE
         tsf 1112066 .. 1112078 -  -3.4  -3.54459   TTAACCGTTTTTAAA                GTTG TGCAG CAAC                TTCAGCCGCAAAATC  48 8
   CJSA_1118 NONE
        fliR NONE
   CJSA_1116 NONE
         gmk NONE
        tatA 1108094 .. 1108104 -    -4  -3.84027   TCATTAAAAATAATA                 CTTT TCA AAAG                 ACTAAACCTTAAGCT  54 34
        argS 1106025 .. 1106039 -  -8.6  -2.89283   AAAAAAATTCAAGTA               GGCATA GCC TATGCC               GTATGGGAACTTTTA  72 495
   CJSA_1110 NONE
         ppi 1104525 .. 1104538 -  -2.5  -2.76422   TAGTTTCAAAAAAGT               TTTAA ATTT TTAAA                TTTTATCGCAAATTT  41 21
       omp50 NONE
   CJSA_1107 1102702 .. 1102716 -  -7.1    -4.946   ATTAAACAGTAAAAA               GCGGT TTTAT ACCGC               TTTTTTTATTTACCT  86 31
   CJSA_1106 1102043 .. 1102057 -  -8.6  -3.46285   AAAGATAAAATTTAA               GCCTTT TTA AAAGGC               TTTTTGATTTTAATA  75 7
   CJSA_1104 NONE
   CJSA_1103 NONE
   CJSA_1102 1099373 .. 1099428 -  -6.5  -3.03575   ATAAAAATTTATACA TCTTATATCCTTTTTTGCTTGACAT TTTAAG ATATTAAGCTAAAAAGGATATAAAT ATTTGTTATTTTTAT  59 46
   CJSA_1101 NONE
   CJSA_1100 NONE
   CJSA_1099 1096138 .. 1096156 - -11.8  -3.33361   TATTAATGAGATCAA             GGCTTAGA TTT TCTAAGCC             TTAAAGAATTAAACA  90 3
   CJSA_1095 NONE
   CJSA_1094 1088646 .. 1088667 -  -9.5  -5.06103   ATAATTTCTAAAAAA           GGCTTTCCT TTTT AAGAAAGCC            TTTTTTTATCCAAAG 100 15
        gmhB 1087698 .. 1087714 -  -2.3  -2.64144   TTTTCATTTAAATAT              CCTTTTC CTT AAAAAAG              TTCAAAATTTCTTTT  39 1
        hldD NONE
        hldE NONE
        gmhA 1084546 .. 1084558 -  -4.8  -3.63744   CCCTTTGTCAAAATA                TCGC TTTTT GCGA                TCTTTTCATCACAAA  57 268
        waaV NONE
   CJSA_1086 1082133 .. 1082147 -  -5.8  -3.78168   AAAAAGAGTTAATAA               TATAAG CTT CTTATA               ATTTTTTTATAAAAA  63 21
        wlaN 1076313 .. 1076324 -    -3  -3.29147   TTGAAGAGAATGCAA                CTTT AGCA AAAG                 AGTATTTTAAATATG  47 268
   CJSA_1079 1074246 .. 1074263 -  -4.2  -4.24654   AAAATTTAAAAAAGA             TCCTTT GAATTT AAAGGA              AAAATTACCTATAAT  61 118
        wlaX 1068872 .. 1068885 -  -2.5    -3.158   AAATAAATTTTAATA               TATTT TCTT AAATA                CTTAAGATCGAACTT  43 27
        galE NONE
        pglK NONE
        pglH NONE
        pgll NONE
        pglJ NONE
        pglB 1060932 .. 1060945 -  -2.5  -3.60792   TTTTCAACCCTTAAA               TTTTA AGTT TAAAA                ACCTTAGCATCTCTA  46 7
        pglA NONE
        pglC NONE
        pglD NONE
   CJSA_1064 1057900 .. 1057921 -  -2.3  -3.96624   TATGCGGAGGAGAAA           GAAAAAATC TCAT GATTTATCC            TTTGTGTAAAACAAA  49 112
        pglE NONE
        pglF NONE
        pglG NONE
        cheY NONE
        prmA NONE
        ftsH NONE
   CJSA_1057 NONE
        pssA 1049191 .. 1049215 -  -9.5  -2.74514   TCAAAGTTCCAATCA          TTCCATTAAAA ATC TTCTAATGGAA          TATCTTGAAATTATA  74 229
        msrB NONE
   CJSA_1053 1047033 .. 1047044 -    -3  -2.61728   ATTTCTAAGATCAAG                CATT TCAT AATG                 TCTTTGAGTTATATC  42 522
        metK 1032517 .. 1032545 -  -9.8  -3.31501   ATTAATTCTTTATAA        TTATACAAGCCT TGTTT AAGCTTGTATAA        TATTGTTAATTTTTT  80 39
        yajC NONE
        secD NONE
        secF NONE
        leuS 1025780 .. 1025792 -  -3.4  -2.75064   TTTTTCATTTAATCA                CTAG ATTAA CTAG                CTTTCCTTCCACATA  42 2
   CJSA_1032 NONE
   CJSA_1031 NONE
        folC NONE
   CJSA_1029 NONE
   CJSA_1028 NONE
         mfd NONE
   CJSA_1026 NONE
   CJSA_1025 NONE
        thiD NONE
        thiE NONE
        hemD 1014590 .. 1014607 -  -4.9  -5.10877   ACAATAAATTAAAAA             TTTGCCT AAAA AGACAAA              CAAAACATTGCCTTG  75 506
   CJSA_1016 NONE
         lon 1009314 .. 1009334 -  -8.4  -4.12198   TATAATCTTTTAAAA            GCAAACTT GTAAA AAGTTTGC            TTTCTTATACATTTA  83 55
        ileS NONE
   CJSA_1003 NONE
        gatA NONE
        guaB NONE
   CJSA_1000 NONE
   CJSA_0999 NONE
   CJSA_0998  993808 ..  993824 -  -5.2  -3.68351   TTTGCATCATTTAAA              CCTTTA TACTT TAAAGG              CTAAATTTTAGCACT  60 67
        murC NONE
   CJSA_0996 NONE
        mutS NONE
        cjeI  985823 ..  985841 -  -3.2  -3.70902   TTTTTCATAGCTAAA             CCTTATAA AAT TTACAAAG             TTTAGCGAAAAATGC  50 42
        npdA NONE
   CJSA_0992 NONE
        dapE NONE
        thiS NONE
        moeB NONE
        thiG NONE
        thiH NONE
   CJSA_0986 NONE
   CJSA_0985  978988 ..  979001 -  -2.5  -2.92192   TTTCATTGAATTATA               TTTAT TTAG ATAAA                AAAAATGTGCTAGTT  41 35
   CJSA_0984 NONE
   CJSA_0983  976841 ..  976853 -  -4.9  -2.79823   TTTTTTAAAAGCAAT                GTTAA AAC TTAAC                TTAGAAGATATTTCT  50 98
        pycA NONE
   CJSA_0979 NONE
   CJSA_0978 NONE
   CJSA_0977  971369 ..  971395 -    -9  -5.05601   TATGAGAGAGAAAAA         TTAAATTAACCA AAA TGATTAATTTAA         TTTTTTTAAGTATTA 100 31
        lepA  964375 ..  964391 -  -6.7  -4.18697   AAAATTATTTTAAAA              TTGTATT AAA AATACAA              GCAAATTTCAAGCCA  73 57
        mapA NONE
   CJSA_0971 NONE
        gyrA NONE
   CJSA_0969 NONE
   CJSA_0968 NONE
        flgR NONE
         asd NONE
   CJSA_0965 NONE
   CJSA_0964 NONE
   CJSA_0963 NONE
        livJ NONE
        livK NONE
        livH NONE
        livM NONE
        livG NONE
        livF NONE
   CJSA_0956  946953 ..  946964 -    -3  -2.78798   ATGGTTCATTTAAAG                TTTG CCCA CAAA                 ATTTCGCTTCCTTCT  43 8
   CJSA_0955  946343 ..  946370 -  -9.4  -5.08015   AAGCTAAAAAACAAA        CAAAATAAGCAA AATT TTGCTTATTTTA         AGAATATTTATATAT 100 137
   CJSA_0952 NONE
        aroB NONE
   CJSA_0950 NONE
   CJSA_0949 NONE
   CJSA_0948  937474 ..  937498 -  -5.9  -4.15029   ATCTTATATAAAGAA          TTTGATGAT TAAACAT ATCATCAAA          CCTGCATTATATCTT  67 21
   CJSA_0946 NONE
   CJSA_0945  935877 ..  935893 -  -2.9  -4.12151   ATAAAAAAACTCAAA              CACCCTA AAG TAGGAAG              AAAACTAAAAAATTA  53 75
   CJSA_0942  931862 ..  931878 -  -3.1  -5.28831   ATTAATAAAATAAAA              TTTTCTA AAA TAAAAAA              TAATTTTTATTACCA  72 35
   CJSA_0941  931202 ..  931217 -    -9  -3.60805   ATATTGTATTTTAAA              GTAGCC CTAA GGCTAC               TTTTTATTCTGCTAA  79 29
        hemB NONE
        argF NONE
   CJSA_0936 NONE
        hemN NONE
   CJSA_0934 NONE
   CJSA_0933  924157 ..  924169 -  -2.7  -4.43879   ATTACTCAACCAAAA                CATAC AAA ATATG                AAAGAAGATATAGCC  58 121
   CJSA_0931 NONE
   CJSA_0930  922785 ..  922797 -  -2.7  -3.25567   ATACTCCAAAAAGCA                CTCAT AAT ATAAG                CAGTTTGATTTGGAT  43 84
   CJSA_0929 NONE
        hipO  921366 ..  921419 -  -5.5  -3.73402   AGAGCTTTTAGCAAA CCTTCCTTCAAACCTAAAACTCAAA GAAA TTCAAATCAAAGGTTTAAAGGAAGA AATTGTGCTTGAAAT  60 54
        cjaA  918415 ..  918435 -  -9.8  -3.33865   TATCCTAAATCAATA            TAAAGGGC AAAAA GCCCTTTA            TTAAATTTTTCCACC  80 26
        cjaB  916791 ..  916803 -  -2.7  -4.24397   AGAATGCAAGATAAA                CAAAT CAA ATTCG                CACTTTTTGCAAGAT  55 370
   CJSA_0922 NONE
   CJSA_0921  915078 ..  915088 -  -6.8  -3.48153   ATCAACAATCCAGAA                 GCTG TAG CAGC                 TGCATTAATGGCCTC  65 57
   CJSA_0910  906749 ..  906777 - -14.9  -2.76911   AGGCAAACAAGCAAG        CTTTGAAGAATTA AAA TAATTCTTCAAAG        AGCTTTTTTAACTGC 100 7
        rpmH NONE
        rnpA NONE
   CJSA_0904 NONE
   CJSA_0903 NONE
   CJSA_0902 NONE
        trmE NONE
        purL NONE
   CJSA_0899 NONE
        purH  895263 ..  895285 -  -3.6  -4.57837   ATAGTTTCCTAAAAA           TAAAATTTTT CGG AAATATTTTA           CACATAATTTATTTA  62 85
   CJSA_0897 NONE
   CJSA_0896 NONE
   CJSA_0895  893182 ..  893201 -  -7.8  -2.67401   CAAATTTAAGAAGAT            TGCCTCGA TATT TCGAGGCT             TTAGGGCATTATTTA  67 34
   CJSA_0894 NONE
   CJSA_0893 NONE
   CJSA_0892  890367 ..  890397 -   -10  -4.87008   AATATACAAAACAAA       TAAGATTTATTGAT TTA ATCAATAAATCTTT       TAGTTAAATCTGTAA 100 9
   CJSA_0890 NONE
   CJSA_0889  886682 ..  886692 -  -5.4  -3.93166   TTTTCAAAAAAGCAA                 GTCT TAT AGAC                 AAAGATAAACTTGTA  63 220
        secA  883705 ..  883717 -  -3.4  -3.16783   TATTCAAGCTAAAAT                TCCT TGCTT AGGA                CCACTTTTTCCATGG  45 1
   CJSA_0886 NONE
        glnP  881231 ..  881242 -  -5.8  -3.86202   GGCCACTAGACGAAA                GGGT CATA ACCC                 TAACAATAAAAATGG  66 466
   CJSA_0884 NONE
         aas  876842 ..  876864 -  -5.7  -3.91911   GCTATGGTAATGAAA           GCTAAACTA GATAG TAATTTAGC           CGTAAGTGCTGTAGC  66 106
   CJSA_0880  873807 ..  873817 -    -4  -2.64472   TATTTTTCAAACTCA                 CTTT AAA AAAG                 CGGCTATCATAACTA  44 12
   CJSA_0879 NONE
        pycB NONE
        pckA NONE
        argH  867613 ..  867636 -  -9.7  -3.12999   GCATTTTAGATTCAA          TGTTTAGGC AAAATA GCCTAAACA           ATATTTATAAATTTT  78 30
        cheB NONE
        cheR NONE
        pebC NONE
       peb1A NONE
   CJSA_0865 NONE
   CJSA_0864  858505 ..  858524 -    -8  -4.81249   CTGTAAATTTAAAAA            GCTTATAT AAAA ATATAAGC             TTTTTTAAGAAATAT  89 30
        prsA  857462 ..  857482 -  -7.7  -4.82678   GCATAAAAATGAAAA            GCTTAAAAA TAA TCTTTAAGC            TTTTTTAATCTAAAT  86 35
        cstA NONE
   CJSA_0861  854918 ..  854930 -  -4.9  -2.56596   GGCTTTAGTAATTTA                TGTAA GTG TTACA                AGAGATGGAAAGAAA  49 131
        ciaB  852649 ..  852667 -  -3.3  -2.72121   AAAAACAATATCAAG             TAAAAAA CAGCT TTTTTTA             AGTTTTTTTCAAAAA  42 47
        hupB  852266 ..  852284 -  -8.9  -4.27694   TTAATTAAGAAAGAA             GGCTAGA ATTTA TCTAGCC             GAAGTTTTATTTTTT  86 32
        cysM  851229 ..  851251 -  -8.6  -3.15197   CAAGAAATTTTAAGA           GAACTTAGAA TTT TTCTAAATTC           TCAATAATTATACTT  73 39
   CJSA_0852 NONE
         alr NONE
   CJSA_0850  846619 ..  846629 -  -2.6  -3.67611   TTTACTTTAACATAA                 TTTT TAT AAAA                 AGGACTTTATGATTT  48 76
   CJSA_0849  845083 ..  845107 - -11.6  -3.32769   GTTTTAAATCATTAA          TTCATAAGCC ACTAA GGCTTATGAA          TTTTAATCCCAACAT  90 28
   CJSA_0846 NONE
        thiJ  842771 ..  842787 -  -6.6  -3.76125   TTATTTTAATTTAAA              TGGTAG AAAAA CTACCA              TTTAAACTATTTTGT  66 32
        pheS NONE
        pheT NONE
        aroA NONE
        ispH NONE
        rpsA NONE
   CJSA_0838 NONE
        serA NONE
   CJSA_0836 NONE
   CJSA_0835 NONE
   CJSA_0834  829043 ..  829059 -  -9.5  -2.62983   CTCAGGGGTAGAGCA              CAACCTT GCC AAGGTTG              GGGTCGCGAGTTCGA  75 89
        flgL  826471 ..  826481 -  -2.6  -3.91846   AAAATCAAAGCCAAA                 TTAT ACC ATAA                 AAAATTTTACATATA  50 32
        ftsK  823234 ..  823247 -  -3.8  -5.03747   AAATTCGCTAAAAAA               CCAG GTGATA CTGG                TTCAACAGAAGTTCA  70 316
   CJSA_0830 NONE
        flhA NONE
   CJSA_0828 NONE
   CJSA_0827  819149 ..  819163 -  -5.8  -2.71018   AAAATTAAAATACAC               TTTTTC ATT GAAAAA               AATCTTTGTATTTAT  55 15
   CJSA_0826  818497 ..  818510 -  -2.5  -4.56597   TGTGGTTTTTAAAAA               TTTTT ATTT AAAAA                TTAAAGCATTTATTT  60 39
   CJSA_0824 NONE
   CJSA_0823 NONE
   CJSA_0822  817173 ..  817200 -   -13  -4.61162   ATATGAAATAATAAA        TTTTAAGGCAAT AAAA ATTGCCTTAAAA         ATTATTTTTTGATCA 100 27
        xerD NONE
        pabB NONE
        pabA NONE
       fspA2  809183 ..  809215 -  -5.8  -4.56597   TTTTTCCTTGAAAAA      GTTTAAAAATGC ACCATTATA GCATTCTTAAAC      TTTTGAAAAAATATA  73 42
        murA NONE
        moeA  806732 ..  806752 -  -8.4  -3.27667   GATAAATTAAGCTAA            TGTTTGTG AAAAA CACAAACA            TTATATTTTTAAAAG  73 26
   CJSA_0809 NONE
        hemL NONE
   CJSA_0807 NONE
   CJSA_0806 NONE
   CJSA_0805 NONE
   CJSA_0804 NONE
   CJSA_0803  798762 ..  798778 -  -2.3  -3.84183   TTTTACTAGAAAATA              TGAAAAT TTA AATTTCA              AAAAAGGCGAAGAAC  49 150
        gltX NONE
   CJSA_0799 NONE
   CJSA_0798  793661 ..  793685 - -11.5  -2.93089   GATTATTTTAAAGTA          TCTCTTCCTAG TGT CAAGGAAGAGA          TTAGGCTTGTAGCTA  87 38
        mobB NONE
         fbp NONE
   CJSA_0794 NONE
        metG NONE
   CJSA_0792  788700 ..  788724 -  -7.2  -3.02564   AGAAAAAATTAATCA          TCCAAAAGCT TTTAG AGCTGTTGGA          AATGCAAATTCTAAA  64 155
        acnB  785814 ..  785827 -  -3.9   -2.6296   TAAATTTGAATTAAT               TTTCA AGTT TGAAA                TTTTCAATCTCATTA  44 7
   CJSA_0789 NONE
   CJSA_0788 NONE
   CJSA_0787 NONE
        trmA  780511 ..  780523 -    -2    -3.338   ATTAACTAAAGTGAA                TTCA AAAAA TGAA                AAAAGTGTTATAATA  43 477
   CJSA_0784 NONE
        ilvA  778837 ..  778847 -    -4  -3.43756   TATGTTATTAAAAAC                 TTTC ATA GAAA                 TTAAAAGCCTTTTGG  49 7
        fliP  771543 ..  771565 - -11.4  -3.14602   TTTATTCTATCAAGA           CCCTAGAAAA AGT CTTTCTAGGG           CGAACAGCCTTAGTA  91 169
   CJSA_0765  764408 ..  764420 -  -2.7   -3.0634   AATTCCATTTTAATA                TACCT TAA AAGTA                TCTAAGCCAAGAGGG  42 17
   CJSA_0764  764058 ..  764085 - -11.6  -5.27938   ACTTTTAAATAAAAA        TTAAGAAAAATC AATG GATTTTTCTTAA         AAATATTTTTCAATC 100 35
   CJSA_0756 NONE
        ruvA NONE
         ddl  751890 ..  751919 -  -7.3  -4.07568   TTTTTCTTCCTAAAA       TACGCTAAATTTT ATGT ATAATTTAGCGCA        TTTTGACTTAAAAGC  75 41
   CJSA_0753 NONE
   CJSA_0752 NONE
        murF  749502 ..  749518 -  -5.9  -2.62171   GACATTTGCAAATAC              TTATGCG AAT CACATAA              AGCTAGGTGCATCGT  55 18
   CJSA_0747  744351 ..  744371 -  -9.1  -4.04326   GAAGCAAATATCAAA            GCTGTGATT TCA AATCACAAC            TCTTTAAAGGATTTA  88 499
   CJSA_0732 NONE
        valS NONE
   CJSA_0730 NONE
   CJSA_0729  726454 ..  726468 -  -8.6  -4.15006   ATATTTATCTTAAAA               GGAGAT ATA ATCTCC               TTATTTTTTGAAACC  83 26
   CJSA_0728  725485 ..  725501 -    -8   -5.4833   GTACTTAAGAAAAAA              GTCCCT AGGTA AGGGAC              AAAATTAAAAAGCAG 100 30
   CJSA_0727 NONE
   CJSA_0726  723877 ..  723889 -  -7.7  -4.21989   TATAAGTTTAACAAA                GCCTT TAG AAGGC                TTTGTATAGAGTTAA  77 37
        flgA NONE
   CJSA_0724  722589 ..  722599 -  -2.6  -4.60678   TAAAAATATAACAAA                 TTTA AAC TAAA                 AATTTTGCCATTTTT  58 21
        coaD NONE
         tmk NONE
        hisS NONE
        speE NONE
        cysE  717746 ..  717778 -  -5.1  -4.27796   CAATAAATGTGAAAA      TTTGTATTAATTTTT AGG AAAAATTAATACGCA      TAATAATACATATAA  66 63
        aspB  716452 ..  716477 -  -9.9  -3.55622   TTTAATTTGCCTAAA         TAATTCTAGGC TTTA ACCTAGAATTA          TTTATAGTTTTTAAT  84 23
       tonB3  707811 ..  707827 -  -5.9  -3.28368   AGTCAATCCACAATA              TACAAGC AAA ACTTGTA              GTGTATGTGGAAATA  58 302
        hisJ  691559 ..  691580 - -11.7  -2.53213   TAACTTTTTAAGCTA           TAAGCGTGA AAAT TCACGCTTA            TTCTAATTCATATTT  87 23
        corA NONE
        mogA NONE
   CJSA_0687 NONE
   CJSA_0686 NONE
   CJSA_0685 NONE
        flaC  679858 ..  679877 - -10.8    -5.252   CATTTTGATAAAAAA            TAAGCCCT ATTT AGGGCTTA             TTTTATTGTAATAAA 100 28
   CJSA_0683  678923 ..  678933 -    -4  -5.68039   AAAGCTATAAAAAAA                 TTTG GAG CAAA                 AAAAGATTTTAAAAA  88 305
        glnA  660282 ..  660302 -  -6.8  -3.57263   ATCTTTATCTTGAAA            CAGGAGCA AGTGG TGCACCTG            TTGCGGGTATAGCAG  67 277
        mraW NONE
   CJSA_0656  652655 ..  652675 -  -6.3  -3.48924   GTATGTTTTAGATAA            GATTATTCA TTC TAAATAATC            TAAAATTTGATTTTG  64 11
   CJSA_0654  648263 ..  648287 -  -7.4  -4.71482   ATTAAATTTTAAAAA          CTATATAAAT CTTTC ATTTATATAG          TTTTTAGCAAGGTTG  81 18
        flgH  644728 ..  644760 - -12.9    -5.093   TGTAAAAGAATAAAA      GCCTAAAAGCAAGGT TTA ACCTTGCTTTTAGAA      TGGCCATATCGCTTC 100 20
        cipA  641821 ..  641875 -  -4.4  -4.94487   TTAGAAAATAGAAAA GATCTTTACCCCCCATTTAAACGCCT TTT AAGAGTTCTTATAGAAGATAAAGATC AAAAAAGTGCACAAA  70 262
        uvrB  636938 ..  636950 -  -2.7  -5.38054   TCCTATAAATAAAAA                CAATA TTT TATCG                AAACCTTTGTTGTTT  72 319
        argG NONE
        rplI NONE
        hslV NONE
        hslU NONE
         era NONE
   CJSA_0625 NONE
   CJSA_0624  620179 ..  620216 -  -8.9  -3.65638   ATAATTAAATTACAA   TATTTTTAAATATTTTT TTAT AATAATATTTAAAAATA    TAACATTTTAATATT  79 42
   CJSA_0623  619048 ..  619064 -  -6.6  -3.85859   AATATCCAAATATAA              CTTGCT ATAGG AGCAAG              TACGATGATAAAAAT  68 13
   CJSA_0622  618489 ..  618500 -    -3   -3.6106   TGTAATATTTTTAAA                TGAT TTAT ATCA                 TAATGTTACTTTTTT  48 104
   CJSA_0621 NONE
   CJSA_0620  614986 ..  615020 - -10.3  -4.58283   CAATTGGTTTAAAAA     CCTTGTATTAAAC AAATTATAA GTTTAATACAAGG     AAAATTTATCTATGT  95 54
        aspS NONE
         adk NONE
         ppa NONE
        msrA  600610 ..  600631 -  -7.3  -5.08255   ACTTTGAAAAGAAAA           TCACAGCGT GAAA AGGCTGTGA            ATAAAGTTGAAATTT  90 63
   CJSA_0598 NONE
   CJSA_0597 NONE
   CJSA_0596  592208 ..  592230 -  -7.9   -3.6682   TGTGATGGAGTGAAA           GTAAAATCA ATAAA TGATTTTAC           TTTCTGCTTTCAAAT  76 22
         cft NONE
        algl NONE
   CJSA_0578 NONE
   CJSA_0577  573589 ..  573604 -    -4  -4.98255   TTTTAATGATAAAAA              CTTAGA ATTT CCTAAG               TATTAAATTTAATAA  68 34
        dsbD NONE
   CJSA_0570  564520 ..  564543 -  -9.8   -2.6369   ATAACTTTAAAAACT          TATAAGCTAT CCAT ATAGCTTATA           TCGTAAGTATTTTTT  75 1
   CJSA_0569  563075 ..  563096 - -10.3  -2.60797   TTTATATACATCAAG           GTGGAATTT TAGG AAATTCCAC            TATGTTAGAGAGATA  78 54
         nth NONE
   CJSA_0562 NONE
   CJSA_0561  555905 ..  555926 -  -4.6  -3.07222   AGCAACGATAAATTA           TTTTTCTT CATTGT AAGAAAAA            ATAGGTAAAGACCAT  52 1
   CJSA_0560 NONE
   CJSA_0559  554900 ..  554912 -  -3.4  -3.63744   CGTCCTCCTAAAAGA                CAAG AATTG CTTG                ATCAAATTTATAAAA  50 305
   CJSA_0548  544863 ..  544874 -    -3  -5.09225   ATTTTACTTAAAAAA                CTTA AATT TAAG                 ATGAGAGATATAAAG  66 21
        tatB NONE
        tatC NONE
        queA  542404 ..  542422 -  -2.4  -4.19472   CAATATAGGTCAAAA             TTGTATCA TTG TGGCACAA             ACTGGAATTTCAGGT  52 248
   CJSA_0528  528643 ..  528667 -  -7.3  -3.65722   AAAAGAATTTTTAAA          GATCTATCT TTATAGG AGATAGATC          TTTTTTAAATTTTAT  72 63
        proA NONE
   CJSA_0524  523390 ..  523405 -  -4.8  -4.09739   TCAATTTTTTGAAAA              TTTAAG TAAG CTTAAA               ATGCAAATAGAAATT  62 448
   CJSA_0496 NONE
        flgB NONE
        flgC NONE
        fliE NONE
        pbpB  491634 ..  491652 -  -4.6  -4.66609   GATGGCAGCTAAAAA             TTTAGCCG AAA CAACTAAA             AATTTAAAAATTATC  68 403
   CJSA_0480  481925 ..  481960 -  -5.6  -2.89881   TATTTAGTTTATAGA    CTTGCTATTATATAAC TTTA GTCATATAATGTCAAG     TTAATTGAGTAAAAT  53 75
        clpB  479292 ..  479321 - -13.9  -2.88236   GAAAGCGAGATTATA       TTTTGAAAGTAGA AAGA TCTACTTTCAAAA        TGATTAAGCTTTTTT 100 29
   CJSA_0475 NONE
   CJSA_0474 NONE
        hemH  471271 ..  471283 -  -3.5  -3.54424   GTTTAGTCGGCTAAA                TTTTT ACC AAAAA                AGTTTAAAAAAATGA  50 65
   CJSA_0450  452328 ..  452364 -  -4.6  -5.01823   AGAACAAGAATAAAA   CTCTATT-TTATAGCCC TTCG GGGCTATATTAATACAG    TGTATCTAAATCATT  74 17
         ctb  435200 ..  435224 -  -5.8  -5.61824   GAAAAGGTAAAAAAA          GATTTGGCAA AAAAA TTGCCAAATT          AATGTCCGCCGTACT  90 24
   CJSA_0431  429873 ..  429894 -  -8.9   -4.4267   GTTTAAAATTTAAAA           TATTTGTGA ATTT TCACAAATA            TTTTTTATAAAACCA  86 17
   CJSA_0429  428420 ..  428436 -  -4.5  -3.97674   TTAGCACTCAAAGAA              TATGTAC CTC ATACATA              AAATCATTATCATCA  58 1
        miaB NONE
   CJSA_0427 NONE
   CJSA_0426 NONE
   CJSA_0425 NONE
   CJSA_0424  424435 ..  424449 -  -4.2  -3.68351   CCCTGATGATTTAAA               CTCATG TTC CATGTG               TGGAAAAATGTGTGC  53 84
        rpmB  421280 ..  421298 -  -7.5  -4.24002   TTGGAAATTTTAAAA             TTGAGGA ATAAA TCCTCAA             AATTATTTAGAATTT  77 28
   CJSA_0419 NONE
   CJSA_0418  419758 ..  419790 -  -7.1  -2.93992   GAAAATTAAAGATTA      TTTAGGTTAAACCTT AAA AAGGTTCAACCTAGG      ATTTTAATGATCTGA  62 29
   CJSA_0412  413645 ..  413663 - -10.3  -4.90296   AAAATTGCATAAAAA             CATGGGC AAAAA GCCCATG             TTTAAAGATTTAATT 100 27
        mraY NONE
        murD  404149 ..  404163 -  -7.2   -4.9792   TATTCTATATAAAAA               CTTATC AAA GATAAG               TAAAGAAGAAAGAAA  90 449
   CJSA_0401  395622 ..  395636 -   -10  -4.45664   GCAATTTAATCAAAA               GCTCCA TTT TGGAGC               TTTTATATTTACTTG  91 48
   CJSA_0394  391391 ..  391402 -    -3  -3.09158   CTAATAAAAACATTA                TCAA ATCC TTGA                 TTTTAATAAAAGTGA  44 73
   CJSA_0393  390330 ..  390342 -  -2.7  -4.81249   CTTTAAATGGAAAAA                TCAAA CGC TCTGA                TTTTAAATTTGCAAC  62 115
   CJSA_0390  388246 ..  388258 -  -3.5  -3.06815   AGTTCTTTTAATAGA                TATTT TGG AAATA                ATCCTCTGCAGACAC  46 374
   CJSA_0379  375272 ..  375288 -  -6.6  -2.86705   AGATGATAAAAAATG              CAATGC AACAG GCATTG              ATTTTAAAGTAGAAT  58 112
   CJSA_0370 NONE
   CJSA_0369 NONE
   CJSA_0368 NONE
   CJSA_0367  366303 ..  366315 -  -4.9  -3.19513   AGAAGTTTAATTGAA                TTTGT TTT ACAAA                AAGTTAAATTTCATT  53 76
         mqo NONE
         pyk  363375 ..  363407 - -10.9   -2.8967   AAAAATTTATAAGGA      CATTAAATTCCTT ATTTTCA AAGGAATTTAATG      TTTTATTGTAGATAA  82 28
   CJSA_0364  362640 ..  362679 - -17.6   -3.7732   TTTTGATATTAATAA  CAACTAAAAATGCTTAGA AATT TCTAAGCATTTTTAGTTA   AGCTTGAAGATCTAG 100 23
   CJSA_0358 NONE
        kdsA NONE
        ribH NONE
        nusB NONE
        pyrF NONE
   CJSA_0353  351764 ..  351774 -    -4  -2.98493   TTTATTATTAAACTA                 TAAC AAT GTTA                 ATACAGGATTAATTT  46 34
   CJSA_0352 NONE
   CJSA_0351  350253 ..  350263 -    -4  -5.06585   GAAAGCATACAAAAA                 GAAT TAA ATTC                 AAGTTTTGATAAAAG  72 24
   CJSA_0342 NONE
        cmeR  341513 ..  341530 -  -5.7  -5.05577   AAATTAAATTAAAAA             TTGTAAT TTTT ATTACAA              AAATTTTTGGCTAAT  79 73
        cmeA NONE
        cmeB NONE
        cmeC  335769 ..  335798 -   -11  -2.53759   AAGATTTTTAATTTA       TTTAGAGAATAG AACAAA CTATTCTCTAAA        AGACATATCTAAATT  83 14
   CJSA_0336  333712 ..  333729 -  -2.7  -4.19624   CATGCTGAACATAAA             GACAATA AAGG TTTTGTC              GAGGTTGTAAAAATT  53 334
   CJSA_0331 NONE
        folB NONE
   CJSA_0329  328802 ..  328822 - -12.7  -2.55755   AAATAAAGATAAATT            TTTTGCACC GAA GGTGCAAAA            TTGTTAAGATTTTTT  95 29
        fdxB NONE
   CJSA_0327  326933 ..  326974 -  -4.2  -5.20633   AAAAACAGAGAAAAA TTTTG-ATTCTTTTTTT GAAGAGAAT AAAAAAAGAATTCAAAA TCTTATAGAGCAGCG  75 59
   CJSA_0317  318847 ..  318862 -  -7.6  -4.33487   ATAATATTAAAAGAA              CTTGGA TAAA TCCAAG               TTAAAAATTTATAAA  77 26
        uvrA  315958 ..  315969 -    -3  -4.49041   ATATAAAAAATCAAA                CATA AAAT TATG                 ATTTTTGTGTATTTT  58 21
   CJSA_0315  315499 ..  315523 -  -4.4  -4.09739   GCAAGGCTTTTAAAA          CTTATAAAAG AGAGG CTTTTAAAAG          GAGTTTGCTATGAAA  59 19
        polA NONE
        motA NONE
        motB  308505 ..  308519 -    -7  -3.28765   AGACTTCAAATGGAA               GCTGCG CGT CGCCGC               ATGGTTCAAGATGTT  64 361
        fdxA  306528 ..  306543 -  -4.7  -5.56372   AAATTAAAAGAAAAA              GCTAG GAATCT CTAGC               TTTTTAATTTTTTAA  83 43
         ndk NONE
   CJSA_0305 NONE
        rpmF NONE
        plsX NONE
        fabH  303544 ..  303564 - -11.3  -3.27525   CTTTTGGAAAGCTAA            GAGAGAATT AAA AATTCTCTC            CTCCAAATTTTAAAA  86 12
   CJSA_0284 NONE
   CJSA_0283 NONE
        bioD  284854 ..  284884 - -10.6   -3.2794   TTGGACGCACAGGAA       CTTTGTTTGCCTTA CAT CAATGCAAACAAAG       CCCCGATTTTATCTG  83 505
        bioF NONE
   CJSA_0279 NONE
        bioC NONE
        modA NONE
   CJSA_0276 NONE
        modB NONE
        modC  278710 ..  278720 -  -2.6  -5.65678   ATAAAAGAGAAAAAA                 TTTT AGA AAAA                 TATTTAGATGAACTT  76 152
        panB  276955 ..  276965 -  -2.6  -2.64416   TATCCTTAGTATAAT                 TTAT CTA ATAA                 TTCATCATCTAAATA  40 5
        panC NONE
        panD  275642 ..  275693 - -12.8    -5.186   TAAAAGATATAAAAA TCATTTTTTTCTATCTTAGATAAA TGAA TTTATCTAAGATAGAAAAAATTAC AAAAATAGCTAGATG 100 41
        peb3  271293 ..  271312 - -10.8  -3.69283   GAAGTTATGCAAGAA            TACACGCT AAAA AGCGTGTA             TGAAGGTTTATTCTC  89 33
        lpxB NONE
        greA NONE
   CJSA_0262 NONE
        cheV NONE
        cheA NONE
        cheW  265061 ..  265087 -  -3.8  -4.82855   CATCAAAGTCAAAAA         CACAAAGTTTAA TCA TTAAAATTCGCG         CTTAAGCAAAGCTTC  65 14
        serB NONE
         tal  263399 ..  263431 - -10.1  -2.58822   TTGCCGATATAATAC      TTGATGAGAAATTTT TCG AAAATATCCCATCAA      AAATATTAAAACTTT  76 70
        ilvE NONE
   CJSA_0245 NONE
   CJSA_0244 NONE
   CJSA_0243  249702 ..  249724 -  -6.4  -4.81212   GCTAGGACAACAAAA           GAAATGAAAA TCT TTTTCATTAC           TATTCCTTAATATAA  79 503
   CJSA_0242 NONE
   CJSA_0241  246595 ..  246612 -  -9.9  -3.21276   TTTGCTTGGACAATA             GAAAGCC TTGC GGCTTTC              TTAAATTTAATTCGC  81 32
   CJSA_0239  243384 ..  243408 - -10.1  -4.18161   CATAAATTTTTAAAA          TTCAAGCCC TTTTTTT GGGCTTGAA          TGATTAATTAAAACC  90 33
   CJSA_0238  242550 ..  242566 -  -5.3  -3.79519   AATTTGATGATTAAA              TTTTTAA CCA TTAAAAA              CTCCTTTGAAATAAT  60 75
   CJSA_0237  242311 ..  242341 -  -8.4  -3.81651   ATTTCAATTAAAACA       TTGATTTTCCACCT TAA AGGTGGAAAATTTA       AGCTTTATTTACAAG  79 23
         xth  238287 ..  238310 - -11.2  -5.03747   AAATTCGTTAAAAAA          TAATATCCCA TTTT TGGGATATTA           AATATCTATTTCTAT 100 23
   CJSA_0228 NONE
   CJSA_0227  234390 ..  234406 - -10.9  -4.05319   ACAAAGAAGATTAAA              GAGCCTT TTT AAGGCTC              TAAATTGTAGTGATG  93 483
   CJSA_0224 NONE
   CJSA_0223  231311 ..  231325 -  -8.6  -4.56597   CTGCTTTTGCAAAAA               TTGCAG AGG CTGCAA               AAAAAGCACTTTGAT  90 92
   CJSA_0220  230565 ..  230585 -  -2.6  -3.64488   AATCTTTCCAAAATA            TTGCTGAT TTTTT ATAAGCAA            AAGGTGTGCCAAGTT  46 56
   CJSA_0219  229362 ..  229372 -  -2.6  -2.96711   TTTATAATTTATATA                 TTTT TTA AAAA                 ATTATTTTAAACCAT  42 32
   CJSA_0218  228832 ..  228850 -  -3.2  -4.84527   TTTATATAGCAAAAA             TGAGAAAT ACT ATTTCTTA             AATTTTTCTTCGTAA  63 16
        iscS NONE
   CJSA_0216  226469 ..  226503 - -13.2  -2.54166   TTTGCAAGCAAAAGC     TATAAAATAGCAAGAT TTT ATCTTGCTATTTTTTA     AACCGGCATAACGCG 100 23
   CJSA_0213  223080 ..  223107 - -12.2  -4.24002   TTTGAAACTTGAAAA        GTTTTTGTGAGA AAAA TCCCACAAAAAC         TTATCTGCTATTGAA 100 26
        secG NONE
         frr NONE
        pyrE NONE
   CJSA_0209 NONE
        nrdF NONE
   CJSA_0207  218527 ..  218540 -  -5.3  -3.08991   AGCGTTGTAACAAAG               GGAAA AAAA TTTCC                GCCACGCTCTTTGAT  54 127
         pcm  217393 ..  217403 -  -2.6  -4.16284   AGAGTTTTTAATAAA                 TTTT GTA AAAA                 AATTTATTCTTTTCC  52 29
        tetO  199316 ..  199356 - -10.6  -5.37171   AATACGAAACAAAAA GAGCCGATG-ATTCGTGAA TTGT TCCACAATTTCATCGGCTC  TGCGTCTTAAGCGTC 100 257
   CJSA_0192  198867 ..  198885 -  -3.8  -5.41359   AATTAAAGCAAAAAA             TAGGCAAA GTT CTTGCCGA             ATTTACGCCTGCGGA  73 133
   CJSA_0190  196115 ..  196129 -  -8.6  -3.88559   AATGATTTTTATAAA               TCCCTT GTT AAGGGA               TTTATATTAATAAGC  82 32
   CJSA_0189 NONE
   CJSA_0188  193646 ..  193661 -  -3.4  -4.07568   CTTTTTCCTTGAAAA              TAAAAT ATTG ATTTTA               GCATTTATTTTGTAA  54 57
        dapB NONE
        purF  191563 ..  191578 -  -3.4  -5.13343   TAATTTAAAATAAAA              TTATTT AATA AAATAA               TCTCCATCAAAACTG  69 10
         tig NONE
        clpP  187527 ..  187544 -  -4.9  -3.53343   AACCTTTGTTTTAAA             TGATCTC CAAA GAAATCA              TTTAAAACTTTTTTC  56 23
         def NONE
   CJSA_0180 NONE
   CJSA_0179 NONE
   CJSA_0178 NONE
        purN  182798 ..  182808 -    -4  -4.35044   CCATTCAAACATAAA                 TTTC CTT GAAA                 ATTTTAAAATTTTTT  58 83
   CJSA_0176 NONE
   CJSA_0175 NONE
   CJSA_0174  180664 ..  180681 -  -8.5  -3.88641   AATAAAGATGAAGAA             TAAGCCT CTTT AGGCTTA              TTTCTTTTTGTAAAT  82 23
   CJSA_0166 NONE
   CJSA_0165  171582 ..  171592 -  -3.2  -3.13109   TACATTATCTAAAAC                 CGAC TTC ATCG                 TAAATTTTAACCGCT  45 4
   CJSA_0164 NONE
   CJSA_0163  169070 ..  169082 -  -4.9  -5.01042   AATTTAAACTAAAAA                TTGAT AAT ATCAA                AACTTATTTTCTCTT  74 6
   CJSA_0162  167800 ..  167819 - -10.8  -4.53163   TTATATAGGACAAAA            GTAAGTGC TCTA GCACTTAC             TCTCCTAAGCTTGGA  93 22
   CJSA_0158  165888 ..  165925 - -10.9  -3.27771   TGTAGAATACGAATA   GCTTTTGATATAAGTCTA TTA TAGACTTATATCAAG-GC   TGGGCATTATTGAGC  85 32
   CJSA_0157  164721 ..  164731 -  -2.6  -4.55295   CGTGGGATAAAGAAA                 TTTT AAA AAAA                 CGTATTAAAACTAGA  60 305
        ubiA NONE
   CJSA_0154 NONE
   CJSA_0153 NONE
        moaA NONE
   CJSA_0151 NONE
   CJSA_0150 NONE
   CJSA_0149 NONE
   CJSA_0148 NONE
   CJSA_0147  158418 ..  158428 -    -4  -2.98907   TAAGAAAAGTTAAAG                 CAAA ATT TTTG                 AAGCTATAGCTATAA  46 9
        rpmE NONE
   CJSA_0145 NONE
   CJSA_0144 NONE
   CJSA_0143 NONE
   CJSA_0142 NONE
   CJSA_0141 NONE
         hom NONE
   CJSA_0139 NONE
        trxA  151681 ..  151697 - -10.9  -3.95725   AATTTTTAAGAAGAA              GGCTAGT TAT ACTAGCC              TTTAGTTTATAGTAA  93 32
        trxB  150603 ..  150625 - -12.2  -5.33026   GAAGCTAAATAAAAA           TAAAGTTGCT TTT AGCAACTTTA           TAAAATCTTAATGCA 100 33
   CJSA_0134 NONE
   CJSA_0133 NONE
   CJSA_0132  143653 ..  143664 -  -4.4  -3.88766   ATCTTAGATACCAAA                TGGA AAAT TCCA                 AATGATAGTGAAGAT  57 263
   CJSA_0120  130036 ..  130048 -  -2.7  -2.64324   AAGCATCTAAAAATT                CTTTC ATT AAAAG                CGTGTTCCAAGATTA  40 19
   CJSA_0119  129327 ..  129337 -  -2.6  -2.75891   ATATTCACCTAATTA                 TTTT TTA AAAA                 TTCTAAGATTATATC  40 8
        accD NONE
   CJSA_0117 NONE
   CJSA_0116 NONE
   CJSA_0115  126668 ..  126678 -    -4  -2.74605   TTTTGCTAAAATCTA                 TCAT TGT ATGA                 GTTGATTTAGATCGA  44 15
        dusB  125475 ..  125490 -  -2.6  -5.26316   TCATCGCAGAAAAAA              CTGCAAG AAA CTT-CAG              AAGAAGACAAAAAAG  69 280
         ung   95331 ..   95351 -  -5.6  -3.74519   AATATTTTTATTAAA            GTTTAAAA TAATT TTTTAAAC            TATTTTCCAATCTAT  60 20
   CJSA_0076   94461 ..   94496 -  -2.7  -3.67022   CAAACTATAAAGCAA    GATAAGATTTAAACC GATATA AGTATAAATCTTTTC     AAAATATTGCAATTT  48 64
        cdtA NONE
        cdtB NONE
        cdtC   89110 ..   89135 -  -8.5  -5.30448   AAATAAATATAAAAA         TAGAACAAGAT AAAA ATCTTATTCTA          AAGGGGTAGCAGCTG 100 18
        lctP   87217 ..   87254 -  -6.7  -4.65819   AAAAGCAAAGTAAAA   TTTCTAACAAATATTC TAAAAAC GAATATTTGTT-GAAA   TAAAACTTAAATTTT  78 45
   CJSA_0068 NONE
   CJSA_0067 NONE
   CJSA_0066   84305 ..   84333 - -12.7  -3.50111   TATTAAAAATTAAGA        CTTACTGATTCTA GTA TAGAATCAGTAAA        TAATAATATGTGCAA 100 18
   CJSA_0065 NONE
   CJSA_0064   83380 ..   83390 -  -2.6  -5.28176   TCTATCGAGAAAAAA                 TTTT CAC AAAA                 TGAGCATTTTGTATC  69 166
        aroQ NONE
        folK   79028 ..   79039 -  -5.8  -2.62735   ATATTCCTTATATCA                TGCC TAAA GGCA                 AAATTACACTCACTC  55 6
        flhF NONE
   CJSA_0057 NONE
   CJSA_0056 NONE
        fliA NONE
        fliM NONE
        fliY   73503 ..   73518 -    -4  -3.39595   GGTAATTATTTACAA              GTGCTTG ATC CAAGC-C              ATGGAGAATATATAA  52 238
   CJSA_0050 NONE
   CJSA_0049   70488 ..   70517 -  -4.5  -3.14602   TTTATTTTACTAAGA       TTAGGAATTTAAA GACT TTTAAATCCTTAA        GCTTTAATATCTATA  51 22
   CJSA_0048 NONE
        mnmA   68745 ..   68774 - -13.9  -3.17212   TTAGGATTTTATTAA       TAATTTCTAGGAA TTAA TTCCTAGAAATTA        TTCTATAAAACCGCT 100 23
   CJSA_0045 NONE
   CJSA_0044   64098 ..   64117 -    -8  -4.44797   CCATTAATATGAAAA            GATAATTC TTAG GAATTATC             TTTTTCTAATTTTTC  83 14
        typA NONE
   CJSA_0038   56705 ..   56719 -  -4.4  -3.89182   TAAGAATAATTTAAA               TAAAAT TAA ATTTTA               GAGTGTTACTAAAAG  58 105
   CJSA_0037   55548 ..   55580 - -15.1  -2.86124   TTTAGCCAAAGATGA      GGATTAATTTTGGGC TAA GCCCAAAATTAATCA      TTCTCCTGGGAAGTG 100 23
   CJSA_0035 NONE
   CJSA_0034   52101 ..   52116 -  -3.4  -4.30809   GAACATCTAGTAAAA              TTATAT CGTG ATATAA               AAAAGATTTAAATAA  56 111
        thyX   33621 ..   33631 -  -2.6  -3.84674   ATGGTAGCATAACAA                 TATT TTA AATA                 AGATAAAATTAGTAT  50 44
   CJSA_0025   32110 ..   32140 -  -7.8   -3.6761   GGTTGCCAATAAATA       CTAAAACCCAAT GAAAAAT ATTGGGTTTTAA       GAGATTAAGAATTGT  76 30
   CJSA_0022   27291 ..   27303 -  -4.9  -3.75115   CCTGTATAAAATTAA                CAAAT TTC ATTTG                GAAAATCTCGCTTTT  58 135
   CJSA_0021   26418 ..   26428 -  -2.6  -3.77206   TATAATTTTAGTAAA                 TTAT TTA ATAA                 TTGATATTTTTTATT  48 19
      ccpA-1 NONE
   CJSA_0019   23644 ..   23671 - -10.1  -3.66095   AAATTTTTATTGAAA        TTTCACGTTAA GTTAAA TTAACGTGAAA         AAAGTTACTGAAAGC  85 30
         dba NONE
        dsbI   21835 ..   21860 - -13.5  -3.57873   AGATAAGATTAAATA         TAAGTCCTAGT TTTC ACTAGGACTTA          AAGCTTAGTTTAAAG 100 30
   CJSA_0015   19838 ..   19848 -  -2.6  -3.69216   TTTTTATTTAAAACA                 TATT GAA AATA                 GGAGTATAAAAATCT  48 44
   CJSA_0014   19237 ..   19253 -  -9.5  -3.15999   GTTTTAGATATGGAA              TGAAAGG TTT CCTTTCA              TTCTTCTATTTCTTT  78 23
         rbr   16741 ..   16753 -  -4.9  -3.25166   TTATCTTAAAAAGGA                TAAGA ATT TCTTA                ACTTAACCCAAAAAT  53 28
       comEA   16436 ..   16449 -  -8.1  -4.40561   TTTTTCTAAAAAGAA               GGGCA AAAA TGCCC                TTTTATTCTATTGTG  83 28
        rnhB   15502 ..   15514 -  -3.5  -4.66388   AAAATGACAAAGAAA                TTTTT AGG AAAAA                CTCATGTAGAAGGTG  64 355
   CJSA_0005 NONE
   CJSA_0004    4896 ..    4922 -   -14  -2.84171   ATGTGTAAAAATTTA         TCATTGAAGAAA TGA TTTCTTCAATGA         GTTTTGTTTTGTAAG 100 19
