CLL_0001     274 ..     309 + -15.2  -4.02132   TGGATTTATTAATAA    TAAAATAAACTAATGA TTTT TCATTAGTTTATTTTA     TTTGTAAATTTGGAG 100 29
    CLL_0002     676 ..     698 +  -7.8  -2.71712   ATAGCAAAATACTTA           TAGACTGTTT AAA AAACAGTCAA           ATTTAAGGGGGACAA  65 181
    CLL_0004     967 ..    1000 + -12.7  -4.16016   AAAAAACATAAATAC     TGTGAGAGTTTATTT TAAA AAATATACTCTCACA      TTTATTGAGGGATAA 100 39
    CLL_0005 NONE
    CLL_0006 NONE
    CLL_0007    5663 ..    5685 + -13.6  -4.36595   TTTAAATTAGAAAAA           CCATCACATA TTA TATGTGATGG           TTTTAAATTTAAATA 100 36
    CLL_0008 NONE
    CLL_0009 NONE
    CLL_0010    9069 ..    9092 + -12.6  -5.44721   AAATTAGATTTTGAA          CTGGATTAAG ATAA CTTAATCCAG           TTTTTTTAAGGTGGT 100 41
    CLL_0011 NONE
    CLL_0012   11131 ..   11153 + -10.8  -2.88249   ATTTTTACCTAAAAA           CTTTGTAAAA AAC TTTTACAAAG           TATGTAAAAAGTATG  83 42
    CLL_0013 NONE
    CLL_0014   12068 ..   12078 +    -4  -4.18018   AGTAGGATTAAGAAA                 TTAG ATT CTAA                 TTTTAAATAGGGGAG  58 5
    CLL_0015 NONE
    CLL_0016   14392 ..   14429 +  -5.9  -2.73124   AAAGAGAGATAAATA   GTCAAGTATATAAGGTAT AAA AT-CTTTATATACTTGAA   ATTTAAGAAATAGAG  57 29
    CLL_0018 NONE
    CLL_0019   15718 ..   15746 +  -9.1  -5.36441   TAATATTAATTAAAA        TAAATCACTAATT TTA ATTTAGTGATTTA        TTTTTTATCTAAAAA 100 38
    CLL_0020   16311 ..   16321 +  -2.6  -3.57792   ACAAATAAGATATAG                 TTTA TAA TAAA                 TTTGGGAGTAACTAA  45 19
    CLL_0021 NONE
    CLL_0022   16876 ..   16899 + -11.2  -3.29829   TAGAAATTAAATTAA          CCAATTAAAG AAAA CTTTAATTGG           TTATAAAAAAATATA  86 18
    CLL_0023 NONE
    CLL_0024   17856 ..   17872 +  -5.3   -3.6993   ATGTAAGTATAATGG              TATTAAA TTT TTTAATA              TGTTTTCAGTCAATA  57 391
    CLL_0025   17993 ..   18017 +  -2.9  -2.53715   TTTCATTTATGGGAT          TATCGAATATT AAG AATTTACGATA          GTTCGTCATACTAAA  41 0
    CLL_0026 NONE
    CLL_0027   18639 ..   18651 +  -3.5  -3.61398   TGTAGTACTAATTTA                TATAA ATT TTATA                TTATTAGGAGGAAAG  50 67
    CLL_0028   19272 ..   19305 + -15.7  -2.73364   ACTTTATCTTAATTA     TATTATAACGTACTT TTAA AAGTACGTTATAATA      TAATTAAGATAAAGG 100 339
    CLL_0029   19725 ..   19740 +    -4  -3.30124   GTAGCTAAATAAAGC              TATCTC TCAG GAGGTA               TTATGAAAGGTAAAG  48 29
    CLL_0030 NONE
    CLL_0031   20463 ..   20476 +  -5.3  -2.90345   GACGATAAATTAATC               CCATT AATA AATGG                ATTTGATATGAAATT  51 310
    CLL_0032   20726 ..   20774 +  -6.5  -5.40072   CGTATGTAGGTTTAA TAAAATAATAATATTTTAATCAA ACT TTATTTAAAATATCATTATTTTA TTTTTTTGCCACAAA  93 139
        botR   24907 ..   24917 +  -2.6  -4.35524   CTATATTAGTTTATA                 TTTT TAA AAAA                 TTTTAGGTTTACAAA  54 9
        ntnH NONE
    CLL_0038   32621 ..   32668 +  -5.2  -4.36596   TATAAAATCTTAAAT TTAAAGGATGTAGCTAAATTTTA ATA TTAAATA-AGCTACATCTTTTAG TTTATTCATTATAAG  66 90
    CLL_0040   34085 ..   34130 + -23.9  -5.47159   AAAAATATTAAAAAA TCAAGAATAAAAAAGCTCTTA ACTT TAAGAGCTTTTTTATTCTTGA TTTTTTATGTTGAAA 100 16
    CLL_0042   34804 ..   34820 +  -2.2  -2.96991   AGAAATGAAAAAAAT              GTCATG AAAAG CTTGAC              TAATTATATTATGCG  39 19
    CLL_0044   35799 ..   35831 +    -8  -6.20267   AGAGAACAATTTCAA      GCATTTTAGTAT AAAAAGTAC ATACTAAAATGC      TTTTTTTATTTTTAA 100 495
    CLL_0045   37397 ..   37415 +  -5.4  -4.11295   AATTAGTTTTGTAGT             TTTAATTG TTT CAATTAAG             TTTCTATGGGTTTCC  65 102
    CLL_0046   38468 ..   38491 +  -6.2  -3.51365   GAATGTAGTATATAA          TTAGTATATT AATT GATATACTAA           TTATATAAAGTATAA  63 195
    CLL_0047 NONE
    CLL_0048   39792 ..   39816 + -12.3  -4.84527   TGAATAGTAAATAAA          GGGAGTTGTAT TTT ATACAATTCCC          TTTTTCATATATAAA 100 27
    CLL_0050 NONE
    CLL_0051   41296 ..   41316 +  -8.4  -5.16133   TTCTTAGAATGAAAA            GAAGTTAC ATTAA GTAACTTC            TTTTTATATTCTCCT  95 44
    CLL_0052   41685 ..   41695 +  -2.6  -3.63336   TATAAGAATGTCCCT                 TTTT TGA AAAA                 TTTGCCATACTATAT  45 36
    CLL_0053 NONE
    CLL_0054   42359 ..   42385 +  -3.2  -5.53288   TAGATAGATTATCAG         TAAATTAATTAT AAA ATCATTAGTTTA         TTTTTTTGGCTTAAA  71 52
    CLL_0055 NONE
    CLL_0056   47542 ..   47564 +  -9.3  -3.01924   TAAATAATAAAATAA           TCTGTTTAG ATAAA CTAAACAGA           TATTAGAAGGGAATA   0 34
        ha33 NONE
        ha17 NONE
        ha70   20731 ..   20769 -  -6.4  -4.64676   GTAGGTTTAATAAAA   TAATAATATTTTAATCAA ACT TTATTTAAAATATCATTA   TTTTATTTTTTTGCC  77 138