        dnaA    1740 ..    1751 +    -3  -3.14211   CTATTTCTATTCTAA                CAAT AAGA ATTG                 TTAATAAAGGAGGCT  42 255
      dnaN_1 NONE
   CLJ_B0003    3095 ..    3125 +  -4.3  -3.72027   ATGAAATGTATAAAA       TTATTTAAATTTT TATAT AAATTTTAAATAA       TTGTTACTAAAAAAT  56 18
        recF NONE
   CLJ_B0005    4524 ..    4534 +    -4  -2.80443   CGCTAACTAAAAGAA                 CAAA AGT TTTG                 TATAATGAGCTGTAA  45 0
        gyrB NONE
        gyrA    8984 ..    9031 +   -16  -4.48987   AATTTAAATGAAGAA TAAATAATAAGAAAGATCAGCA TTAA TGCTGATCTTTCTTATTATAAA TTTTAATTATAAAAA 100 23
   CLJ_B0014 NONE
   CLJ_B0015 NONE
   CLJ_B0016 NONE
   CLJ_B0017   19435 ..   19460 +  -8.3   -4.0749   ATTAATATCTGTAAA         GAACCCCATGT ATTT ATAAGGGGTTC          TTATTCATTTTTTGA  79 58
   CLJ_B0018 NONE
   CLJ_B0019 NONE
   CLJ_B0020   22370 ..   22400 + -11.9  -5.94214   GGGTGGCAACGCGGA       GCTTTTCGTCCCT TTTAT AGGGACGAGGGGC       TTTTTTTATTATATT 100 288
      serS_1   24237 ..   24262 + -12.1  -5.80817   CTCTTTCTCCGCCAA         GACATTTAACA TTAA TGTTAAATGTC          TTTTTTTATATTAAG 100 505
        megL   30901 ..   30928 + -10.8  -4.27483   TATAAAAAATATAAA        TGTTGATTCTTT ATGC AAGGAATCAACA         TTTGCTTTTATAAAT  95 47
   CLJ_B0033   31668 ..   31684 +  -7.9  -2.89055   AGGGGCAACTCTATC              GGGGGTT CGA ATCCCCC              TCTCTCCGCCATTTA  66 244
      dnaX_1 NONE
   CLJ_B0037 NONE
        recR   34766 ..   34807 +  -6.2  -2.98407   TTTTATGAATATAAA TCCCATTTTGTGT-CTATT ATTGA AATAGGAGATAAAATGGGA GGTTTTTTTATAATG  59 46
   CLJ_B0039   35079 ..   35112 + -11.3  -5.80727   AAAATTTATATTTAA     TAAACCATTAGAAAT ATAA AATTCTAATGGTTTA      TTTTTTATTATTTTT 100 39
        bofA   35595 ..   35619 +  -2.9  -2.75081   TAACTATGAGAGGAG          GCTTATCGAAA TTT TTTCGATAAAA          TAAATTTTGAAAATA  39 145
        sfsA NONE
   CLJ_B0042   36856 ..   36867 +    -3  -3.60525   AAAAATAATGAAGAA                TTGT TAGA ACAA                 TTATATGTGAATAAA  45 19
   CLJ_B0043   37705 ..   37728 + -12.6  -4.58685   TGAACAATCCTAAAG          GAGCTTAAGT TTAA ACTTAAGCTC           TTTTTAAGAAAGTTT 100 28
   CLJ_B0044 NONE
   CLJ_B0045   39068 ..   39108 +    -5   -5.1286   TGTTTATGATTTAAA CCTCTATTCTTA-ATTTGA GCGG TTATATATAAGAATAGGGG  TTTTTATAATTTTTG  74 289
   CLJ_B0046   39937 ..   39947 +  -2.6  -3.61971   ATTAGCCATAAAGAA                 TAAA AAT TTTA                 TATTGTTGTTATATA  45 71
   CLJ_B0047 NONE
   CLJ_B0048   42183 ..   42233 +  -4.4  -4.78752   ATATATATGATATAA TAACAACTGTTCTTTGGTTCT GAAAATTAAA AGAAACAAAGA-TAGTTGTTA TTTTTCAGTTATGAT  68 152
   CLJ_B0061 NONE
   CLJ_B0062   56393 ..   56426 +  -4.7  -5.49729   AATAAATAGAAGAAA     TAAATCCCTAGAATA TTAA TAAATTAGGGATTTA      TTTTTTTAGCTACTT  79 36
   CLJ_B0069   63348 ..   63378 +  -9.9  -3.31937   AATAAATTATGAAAA       GCTGTTGGTATAT GTATA GTATATCAACAGC       TTAAATTATATTTAT  87 7
   CLJ_B0075   69912 ..   69931 +  -9.4  -4.56436   TAATATAATAAAAAA            GATAGCAA ATGT TTGCTATC             TTCTTTTATTTAATG  93 38
   CLJ_B0080   76540 ..   76563 + -12.6    -5.243   GGTGGCGCCTCCAAA          GGAGTTTTAG GATA CTAAAACTCC           TTTTTTAATAATTTA 100 183
   CLJ_B0084   79302 ..   79327 + -13.5   -4.0865   AAAATATTTATCAAA         TAAGAGACTAG CTAG CTAGTCTCTTA          TTCTATTTTATTAAA 100 7
   CLJ_B0086 NONE
   CLJ_B0087 NONE
   CLJ_B0088 NONE
   CLJ_B0089 NONE
   CLJ_B0090 NONE
   CLJ_B0091 NONE
   CLJ_B0092 NONE
   CLJ_B0093   85867 ..   85896 + -14.5  -4.22858   AGACTAATTTATTGT       TAAAAAGGCCGTC AAAA GACGGTCTTTTTA        TTCTTTATATATTAT 100 34
   CLJ_B0094 NONE
   CLJ_B0095   87591 ..   87601 +  -2.6  -4.20875   TATTCTATAGATATA                 TAAA TAA TTTA                 TTATATTTTTTAATA  53 23
   CLJ_B0096   88881 ..   88904 + -12.6   -4.3208   TATAAAACAACAAAA          GTGGAAACTA AAAT TAGTTTCCAC           TTTTAGCTTATACAA 100 54
   CLJ_B0098   90635 ..   90689 +   -20  -4.84359   TTTTGTATATTTTTA TAGATCACTTAAAAAGTTATTATTAA TCC TTAATAATGGCTTTTTAAGTGATTTA TTTTTGTAAAAGTAA 100 46
      arcA_1   92262 ..   92295 +  -9.2   -3.9993   AAATATAAGTTTAAA     TAAGAGTTCA-CTTA TAAAT TAAGATGAACTCTTA     TATTTTTGGTAAATT  86 40
   CLJ_B0102   94490 ..   94534 +  -5.1  -5.15682   TTTTAAATATACAAG GCTATGAAATATAGGGCATAT TAT ATAAACTCTTAATTTCATAGC TTTTATTTGTATTTT  74 110
        spmA NONE
        spmB   96220 ..   96234 +  -5.8  -2.89511   TTGAACAGTACAAAC               TTCATT TAA AATGAA               CTTTAAATTATATCC  54 101
   CLJ_B0106   96729 ..   96754 +  -3.5  -5.17353   TAAATTATTAGAAAA         TAGTAAAGTTAT TAT ATG-CTTTACTA         TTTTTTAATAAATAT  68 38
   CLJ_B0107 NONE
   CLJ_B0108 NONE
   CLJ_B0109   99823 ..   99846 + -11.2  -4.16943   AAACATGTATATAAA          TAAAGAGCTT TTGT AAGCTCTTTA           TTTTAGGCTGTAGAC 100 27
        udgA NONE
   CLJ_B0112  102730 ..  102762 + -15.9   -5.5208   ACAGCGAAATTTACG      CCTCTATATAAAACT AAA GGTTTTATATAGAGG      TTTTTTATATTATAA 100 340
        metG  104765 ..  104801 + -10.3  -4.75372   ATATCAAATTAAGAA    CTAAGCTGTTGACAAAT AAA GTTTGTTAGCAGCTTTG    TTTTTGGTACATAAT 100 56
   CLJ_B0114  106385 ..  106404 +  -3.7  -3.52204   TAGGAATTTTATCTC            CTATATT AAGTAG AATATAG             TTAATTTGCCAATGG  51 6
   CLJ_B0115  107447 ..  107457 +  -2.6  -5.07275   TTATTTAAAAAGCAA                 TTAT ATA ATAA                 TTTTTATATATATAA  62 123
   CLJ_B0116  108642 ..  108659 +  -9.9  -5.80817   TTAGATTAATTTAAG             TAGGAGC GTTA GCTCCTA              TTTTTTTCTATTAAA 100 32
   CLJ_B0117 NONE
        ksgA  110064 ..  110076 +  -3.5  -3.61609   AAAACTTTCAGATTG                TATAT ATG ATATA                TTATAATTTAAATAA  49 7
   CLJ_B0119  111454 ..  111479 +  -9.1  -5.57729   TTAATACCTGTTAAA         TAGAGGCATGT TAAT ACATGTCTCTG          TTTTTTATGTTGTTT 100 23
   CLJ_B0120  112228 ..  112276 +  -8.9  -3.53188   GTATCGAAGTTGATA GCTCCCCTTAAGGAAGATAGATT AAA AATCTGTTATCGCAAAGGGGAGC ATTTTTGTGCATATA  79 51
   CLJ_B0121  113222 ..  113240 + -12.4  -4.08216   AAGATTCTTGTAAAA             CCCCATGC ATT GCGTGGGG             TTTTGCAAAAAATAA 100 44
   CLJ_B0122 NONE
   CLJ_B0123  115141 ..  115151 +  -2.6  -3.58536   GATAGTAGAATGAAA                 TTTT TAG AAAA                 TTTGAAAATGGCTTT  45 28
   CLJ_B0125  117259 ..  117314 +   -24  -4.33928   AACTTTAAAAATTTA TATAAATAGTAATAAGGCTTCAATGA ATAT TCATTGAGGCCTTATTATTATTTATA TTTATATTTAAAATA 100 17
   CLJ_B0126  117615 ..  117642 +  -5.8  -3.11999   TATAGATGTAATTTT        TATATTGCTTTT AAAT AAAATCAATATA         TTCGATAGATTTACT  56 36
   CLJ_B0127  117832 ..  117846 +  -4.4  -4.68103   TAAGACAAGCTAAAA               TAAATT ATG AATTTA               TTTTATTACAATTGA  66 134
   CLJ_B0129 NONE
   CLJ_B0130  120167 ..  120210 + -12.9  -5.31275   TGTTATGATAAAATA TAACAAGAACATATATTTT TAAAAT AAAATAAATGTTCTTGTTA TTTTTTGTAGTAAAA 100 33
        nrdD NONE
        nrdG  123187 ..  123215 + -14.9  -5.24796   CTATTTAATAAAAGG        GTGTATAACTTTA AAA TAAAGTTATACAC        TTTTTGTTGTCTACA 100 90
        ileS  129003 ..  129037 + -10.3  -5.58179   TAGCATGTATAATTT     TATGCATAGAATAAA AATTG TTTATTCTATGCACA     TTTTTTATTATAATA 100 38
   CLJ_B0138  130160 ..  130198 +  -6.4   -4.3898   TATTAATATATTTTA  TAAGAAAAGATGTG-TA GATAAA TAGCACATCTTTTTTTA   TTTTATCAAAATGGT  75 46
   CLJ_B0139  134431 ..  134464 +  -4.2  -3.61517   ATCTTTTTTCACCAA     TGCTATATTT-TATA CATAA TATATGAATATAGCA     TTATTGGGAGAGGAT  54 48
   CLJ_B0140  135555 ..  135588 + -12.1  -5.63645   AATATATATAAAAAA     TAGTATGGATATTAA TTTT TTAATATCCATATTA      TTTTTTATATTTTCA 100 30
   CLJ_B0141 NONE
   CLJ_B0142 NONE
   CLJ_B0143  138733 ..  138761 + -14.9  -5.83822   TGTTATTATTTTAAA        TAACTTAGTGATT TTA AATCACTAAGTTA        TTTTTTTTGAATATA 100 42
   CLJ_B0144  140349 ..  140372 +    -9  -5.35815   TTTTATATAAATTAA          GGTATTTCAT TTTA ATGAGATACC           TTTTTATTTACTCTA 100 51
   CLJ_B0145  141846 ..  141875 +  -8.8  -5.57729   TTAAAAAGTATTTAA       GAGTCAAAATTT AGGAAA AAATTTTGGCTC        TTTTTTATATTATTT 100 87
   CLJ_B0147 NONE
   CLJ_B0148 NONE
   CLJ_B0149  145154 ..  145164 +    -4  -2.80589   AATAAGGCTATGAAG                 TTAG ATT CTAA                 TAGCTTTGTTTAAAG  45 2
   CLJ_B0150  146241 ..  146278 +  -8.7  -5.08483   TTAAATAGATATAAA   CACTATCAAATTATTTT ATTA AATAAAATTTGATAGTG    TTTTCTTTAATTTTA 100 63
        cotS  148635 ..  148673 + -13.5  -2.54841   AGAATAATGAATATA   TTAAGGCATATGAAGCT TACGT AGTTTTATATGCCTTAA   ATAGTTTTATTAACA  91 34
   CLJ_B0153  149630 ..  149643 +  -2.4  -3.00215   AATATAGAGAAGGAT               TTCC TAAATC GGAA                TATGTATAGAGATTT  40 3
   CLJ_B0154  150090 ..  150110 + -11.3  -7.00209   TGTATTATAAATGGA            TTGGTACTT AAT AAGTACCAA            TTTTTTTTTTTTTAT 100 31
   CLJ_B0155  151839 ..  151878 +  -8.9  -4.06182   ATATAAATAAAAAAG  CTCTATATGACAATAAT AGTATA AGTATTGTTATATAGAG   TATTTTTGTGCATAA  82 114
   CLJ_B0156 NONE
        cphB NONE
        cphA  155417 ..  155456 + -12.6  -5.62219   AGCTTTAGCATAGGA  TTAAAGCTACAATTTATGA ATA TCATGA-TTGTAGCTTTAA  TTTTTTTGATGTATT 100 28
         ipk  156359 ..  156396 +  -5.9  -6.41881   ATATAATAGTTGAAA   GACCATAGAAATATATTT TAA GAAT-TATTTATATGGTC   TTTTTTTTTATTATC 100 35
   CLJ_B0160  156689 ..  156704 +  -4.8  -4.20148   AAGTTTAATATTATA              TATTCT GCAA AGAATA               TTGTTTTAAAATAGT  64 1
   CLJ_B0161 NONE
   CLJ_B0162 NONE
   CLJ_B0163 NONE
      spoIIR  161355 ..  161379 +  -7.3   -3.1733   AAAAGATAAATAAAA          CTCTGTATT TGAAAAT AATACAGAG          TAATTTTATAACAAA  65 32
        ypeB  164382 ..  164413 + -11.9  -4.29304   TAATATAATTTAAAA      TAAAGAGTGAATA ATAGTG TATTCACTCTTTA       TTTGTATTATAATAA 100 38
   CLJ_B0167 NONE
   CLJ_B0168  165928 ..  165981 +  -6.4  -3.58269   ATAGAGTTACATAAT CAATATTAACTCTCTTAAA-ATTGT GTAAA GCATTGTTTGAGAGGGTTAATGTTG TTTAAAAATAAATTA  66 48
   CLJ_B0169  166363 ..  166380 +  -2.1   -2.9547   AAATATAGCACAACA             TAATAAT TTGT GTTATTA              TATATAAGTATGTTT  40 52
        pyrG  168257 ..  168270 +  -2.5  -3.93401   TTTTGGTGTTGTTTT               TTTAT TTAT ATAAA                TTATTAATTTATAGG  49 111
   CLJ_B0171  168782 ..  168803 + -10.3   -5.1502   ATATATGATGGTTTA           GAGTAACTT TTAA AAGTTACTC            TTTATTTTTATTTAT 100 25
         rho  170408 ..  170436 + -14.9  -2.85565   TAAATAAAAAATAAA        TAAAACCTAATCT GAA AGATTAGGTTTTA        TACTATTTAACGTCT 100 34
         tdk NONE
   CLJ_B0175 NONE
        prmC NONE
        prfA NONE
   CLJ_B0178 NONE
   CLJ_B0179  175803 ..  175819 +  -2.3  -3.33261   GTATTATAGCTGGAT              TAGTTAT AAT AAAACTA              TTATAAAACTTAGGA  43 3
   CLJ_B0180 NONE
   CLJ_B0181  177381 ..  177393 +  -3.5  -3.28416   GGTGGTTTATCTTCT                TTTTT TGC AAAAA                TTAATATAAATAATG  46 43
        rpiB NONE
         upp  178582 ..  178629 +  -8.3  -5.37043   AATACTTTTAGTAAA TAGATAACTATAAAAATAA AGAATAATAA TTATTTTTATAGTTATTTA TTTTTTCTATAAGAT 100 88
   CLJ_B0185 NONE
        tagO NONE
        mnaA  182421 ..  182431 +  -2.6  -5.13344   TAAAGAGAAGTAACA                 TAAT TAT ATTA                 TTTTTATGTTACTCT  64 62
        atpI NONE
        atpB NONE
        atpE  184229 ..  184265 + -13.4  -3.53012   TTTAAGGTAATTTAA    TTTTATAAGTACCTAT TTATT ATAGGTGCTTATAAAA    TTTAAGGCCGAAGGG 100 36
        atpF NONE
        atpH NONE
        atpA NONE
        atpG NONE
        atpD NONE
        atpC  189555 ..  189610 + -18.1  -5.96219   AGAGAAAGTTTTATA GCTTACAAGGTATACATAACTTT GACATTAAAA AATGTTATGTATACCTTGTAAGC TTTTTTTTGTAAGTA 100 39
   CLJ_B0197  190433 ..  190444 +    -3  -2.62983   ACACCACAGATAAAC                CTAA CATA TTAG                 TAATATCGAAATGGA  39 14
      murA_1  191752 ..  191775 +  -4.6  -5.33331   GTGTATGATAAATAA          CTCATGGTGA TTAT TTGCTATGAG           TTTTTATTATATTTA  76 53
      spoIID  193150 ..  193166 +  -3.7  -4.25388   ATATAAAAGTGTATG              TCTAGTC TAA GAATAGA              TTTAATTTTAATATA  58 119
   CLJ_B0200 NONE
   spoIIID_1 NONE
         mbl  195727 ..  195774 + -16.9    -3.272   ATATAAATGAATACA TAT-AAAATTAAAGCTCATGAG CAATA CTCATGAGCTTTAATTTTTATA TTAATGTAAAATAAT 100 54
   CLJ_B0210  198041 ..  198059 +  -8.9  -5.42198   GTAGTTAGACAATAA             CCTCTTC TTATT GAAGAGG             TTTTATTTTTTAGAC 100 47
      metK_1  199297 ..  199335 +  -9.1  -5.19212   ATATTAGTATTAATA  TGAAAAGGAATGGACATG ATAA CATG-CCATTCCTTTATA   TTTTTTCATAATAAT 100 45
   CLJ_B0213 NONE
   CLJ_B0214 NONE
   CLJ_B0215  203630 ..  203658 +  -8.3  -4.93898   CTAATTTTAACTAAT        TGAGGCTTATAGT ATA ACTATAGGTCTTA        TTTTTATAATAATAT  91 253
        yfiA  204392 ..  204419 +  -7.9  -5.07275   AAAGAATTAGTAAAA        GTAGACATATA CAAGGA TGTATGTCTAC         TTTTTATATATATAA  90 63
        secA  207108 ..  207131 +  -5.3  -4.44974   TATATTATAATAAAA          CCGGAAACT TTATTT GGTTTCTGG           TTTTATAACCTTTAA  68 44
   CLJ_B0218 NONE
        prfB  208544 ..  208562 + -11.8  -4.90296   TTTATAATTTTTAAT             GATGCTAC ATT GTAGCATC             TTTTTATAGAATTTT 100 299
   CLJ_B0221  212221 ..  212254 + -14.1  -4.98531   AATTGTAACTATGAT     TACAAAGCCCTGATA GTAT TATCAGGGCTTTTTA      TTTTTCATTTGGAAA 100 228
   CLJ_B0223  212912 ..  212943 +    -9  -4.02119   ATATAAATATAATAA      CTGATTAAATAG CTATTATT CTATTTAATCAG       TATTTTATTATGATA  82 42
   CLJ_B0224 NONE
   CLJ_B0225 NONE
   CLJ_B0226  215736 ..  215764 +  -5.4  -4.45068   TCATATAAATTTTGA       TCCCGTAAAGATT ATTT AAACTT-ACGGGA        TTTATTATTGACAAT  68 7
   CLJ_B0227 NONE
   CLJ_B0228  218614 ..  218658 +   -17   -3.5944   ATTTATTCATATAAA TAAAATAAAAATCCTATGGA ACATG TTCATAGGATTTTTATTTTA TTTAGAAATCTAGAT 100 27
   CLJ_B0230  220666 ..  220682 +    -3  -3.97364   CTTCTAAAGCTTATT              CATGTG CTTAT TACATG              TATTTTCTATATTTA  49 249
   CLJ_B0239  228368 ..  228408 + -13.8  -3.52079   TTAATATCAAAAAAA TAGTAGATAGATTTATTCT TAAC AGAA-AAATCTATCTACTA  TTATATCAAATATTA 100 231
   CLJ_B0243  232451 ..  232477 + -16.8  -4.55287   TGAATATTAATGAAA         TAAGGAAAGTGC TAC GCACTTTCCTTA         TTTTGTGTCAGTAAC 100 31
   CLJ_B0244  232792 ..  232807 +    -9  -5.16472   TATTAATAAAAAAAA              TCGTGG GAAA CCACGA               TTTTTTAAAATTTTT 100 73
   CLJ_B0246  233946 ..  233976 +  -9.2  -3.99275   AATTAGGTTAAAATA       TCCACAGGATTT ATTGTTA AAATCTTGTGGA       TTTGCTATTATATAA  86 35
   CLJ_B0247 NONE
   CLJ_B0248  235711 ..  235743 +  -6.5  -5.71983   ATTTAATAATATATA      AAAAATAAACAGC ACTAGAG GCTGTTTATTTTC      TTTTTTTGTGCTTAG  90 92
   CLJ_B0251  239582 ..  239619 + -18.9  -6.09196   AATAAATATAAAAAA   CACATGTAATAAACTTA TGGA TAAGTTTATTACATGTG    TTTTTTTATTTTCGA 100 92
        sleB  240727 ..  240756 + -10.9  -5.80817   ACCACGGAGAATATA       CTTCGTCTCTATA TTTT TATAGAGATGGAG        TTTTTTTATATTAAG 100 318
      cysK_1 NONE
        cysE NONE
   CLJ_B0255  243355 ..  243382 +  -2.8  -4.43477   TAAAGAGAAACTTAA        TTTAGATTGAGT TCTT ACTCTATATAAA         TTTTAGTTGAATCAC  55 70
        plsD  244147 ..  244160 +  -2.5  -3.64682   GGTATATATAATAAT               TAAAA CTTG TTTTA                TTTGGAAGTTTAATA  45 23
         nth  244945 ..  244962 +  -2.7  -5.87688   GTTTTGCTATTAAAG             ATATCCA CATG TGGATAA              TTTTTTTTAGATTCT  76 87
   CLJ_B0258  246559 ..  246591 + -10.6  -3.20878   ATAGGACGTTTACTT      AGCTCTATTGCCAC AGGAC GTGGCATTAGAGCG      TTAGCTTAAATATTA  87 377
   CLJ_B0262  251424 ..  251467 + -15.7  -2.57522   ATTAAGTTTTTAGAA TAAGCCCTCTTAAAATAGA TTTAAT TTTATTTTGAGAGGGCTTA ATTAATATAAATTAA 100 69
   CLJ_B0263  253058 ..  253085 +  -4.2  -4.24342   TTTAGAAATAAATTG        CATACTATAACT AAGG AGGGATAGTATG         TTTATTCCTAAAACA  61 146
        splB  254086 ..  254118 + -13.1   -4.0031   GCATTAATTACATTA      TATAGAGAATTAACA TTT TGTTAATTCTTTATA      TTCTTTACTAAAGCT 100 21
   CLJ_B0265 NONE
   CLJ_B0266  255683 ..  255709 +  -7.4  -5.29846   TAAAATACTTTTCAA         GCTATATTTCGA TCA TAGAGATATAGC         TTTTTATTTAAAATT  90 41
   CLJ_B0267  257093 ..  257134 + -14.2  -3.13593   TATTAGGAATATAAT G-TTATAAAAGCTAGATGT ACTTA ACATCTAGCTTTTATAAGC TATATATATTATAAT 100 54
   CLJ_B0268 NONE
   CLJ_B0269 NONE
   CLJ_B0270  260809 ..  260836 + -12.2  -5.93252   TAGTAGATAACTTAA        TGGAGTTAGAAA TAGA TTTCTAGCTCCA         TTTTTTATTTTTGAA 100 31
   CLJ_B0271  261659 ..  261687 +    -4   -5.1167   ATTATAAGTAAAAAA       GAGGCCATT-TTA TATT TAATAATGGGCTC        TTTTTATATTGGATT  70 44
        rpoN  263204 ..  263226 +  -3.5  -5.99154   AAAGCGTTTTTAAAA           GCATGAT TTATAGATT ATCATGC           TTTTTTTATTTAATA  83 28
        cggR  264524 ..  264534 +  -2.6  -2.91924   GAAAATGAATAATAC                 TAAA TAA TTTA                 ATTTATAAAAGATAA  40 29
       gap_1  265664 ..  265680 +  -5.2  -4.19648   ATAATTAAAAGTTCT              CCTTTT ATAAA AAAAGG              TTTGGTTTCTCTATA  64 84
         pgk NONE
        tpiA NONE
        gpmI  269536 ..  269546 +  -2.6  -2.75327   AATAGAGAAACTATA                 TTTA AAA TAAA                 ATAATTTTTTTTAAA  39 39
         eno  270890 ..  270914 + -11.5  -3.88498   AATTTTTAAAACAAG          GGACTGCTCAT AGT ATGGGTAGTCC          TTTAATCTATAAAAA 100 42
        secG  271387 ..  271410 +    -7  -4.50193   ATAATTAACAGCTAT          TTTTTTATAA AAAT TTATAAAAAA           TTTTAATTAATTAGT  77 82
         rnr  273729 ..  273769 + -15.2  -2.74784   AAGTTGAAAATTATT TAAGAGAAACTCAGT-TTA AAAT TAATACTGAGTTTCTCTTA  TAAGTTTTAAAAAAT 100 39
        surE  275063 ..  275084 +  -3.9   -3.8211   TGTTTGAAATGAATT           TACATAG-AT GAT ATACTATGTA           TTATTATAACTAAAA  52 219
        smpB  275820 ..  275835 +  -4.8  -2.87457   AACTACTATAGCTTA              TTCATA TGTT TATGAA               ATGTATTTTTTTATC  51 249
   CLJ_B0285  279585 ..  279599 +  -2.8  -4.15106   AAGTCTATATGCCTT               TTGGTC AAG GAACAA               TTTTCCCGATTGGTG  51 299
   CLJ_B0288 NONE
   CLJ_B0289  284024 ..  284045 +  -9.5    -5.626   ACCTCTACCCAAAAA           TCTACGACA GAAA TGTCGTGGA            TTTTTTTGTGACATA 100 190
   CLJ_B0290  285903 ..  285942 + -12.4  -5.12707   ATGATTAAATAAGAG  GTATGCTTGAAAGTGAAT TTTA AATCAGTTTCAAGCATAC   TTTTTTACAGTTTGA 100 96
   CLJ_B0291  287090 ..  287115 +  -9.1  -5.13344   AAATACATGATTTAG         TACCCTGAAAT GGTA ATCTCAGGGTA          TTTTTGTATTCATCT 100 128
   CLJ_B0292  287933 ..  287967 +  -5.2  -5.00884   ATATTATGATATTAG     GTCAATTGTTTAGA TAAAAAT TCTAAATAGTTGGC     TTTTTTAAAGGAGAT  72 32
   CLJ_B0293 NONE
   CLJ_B0294 NONE
   CLJ_B0295 NONE
   CLJ_B0296  292791 ..  292816 +  -7.6  -5.46706   CACGATACGTATAAC         CCTGTACTGG AGAAAA TCAGTACGGG          TTTTTATTTTGCGGT 100 104
   CLJ_B0297  294253 ..  294280 + -10.1  -4.81249   TAAGTATATTAAAAA        TAACAGTTAGT TTATGT ACTAACTGTTA         TTTTTGCATTTAAAG 100 135
   CLJ_B0299  296159 ..  296195 + -12.6  -4.21974   TTGTTTAAGATAAAA    TATAAAGACTGCTGAT ATTTA ATCATCAGTCTTTATA    TTTATTAGGTGATAG 100 33
   CLJ_B0300 NONE
   CLJ_B0301  298219 ..  298229 +    -4  -3.09823   TCCATCAAATAACTT                 CTTA AAG TAAG                 TATAATTTTGAAAGG  46 29
   CLJ_B0302 NONE
   CLJ_B0303  299216 ..  299237 +  -3.1  -3.70511   AGTATAAAAAGGAGA           TAAGTTGTT ATGA AAAAACTTA            TTATTAACTCATATT  50 72
   CLJ_B0304  300297 ..  300307 +    -4  -3.85909   TTTTTAGAGAATAAT                 TCTA AAA TAGA                 TTTACATTTAGATCA  54 81
   CLJ_B0305  301633 ..  301676 +  -6.4  -4.46212   TAGTACATTTTGAAG TGCACCT-CA-AAGTTTAGA AAAAAA TCTAAATTTGTGGAGGTGCA TTTTCTGGTAAAAAG  75 295
   CLJ_B0314  308083 ..  308139 +   -18   -3.6215   CAATATAATAAATAA TTAATATACTCCCATATCTAGTTAAAT TTAT ATTTTA-TAGATATGGGAGTATATTAA TTTAACATGAGTTCG 100 26
   CLJ_B0315 NONE
   CLJ_B0316 NONE
   CLJ_B0317 NONE
   CLJ_B0318  311027 ..  311037 +  -2.6  -2.54523   GTATGGGATATAGGT                 TTAA TGT TTAA                 TAAATTAAGATATAG  39 15
   CLJ_B0319  312804 ..  312826 +  -7.2  -5.32699   AGCCATTAGGTCTTT           CTTAATTAAT TAT ATTAATTAGG           TTTTTTAATGTTTCA  90 402
   CLJ_B0321  315435 ..  315478 +  -8.6  -3.47713   TTTAAAAAAGTTTAT TAAGAAAGGTAATTAA ATAGATACAACC TTAATTACCTTTCTTA TATTTAGAATTTTTA  74 48
   CLJ_B0322  317118 ..  317138 +  -6.9  -4.84359   ATATAAATATAAAAA            TAGCAACTT AAA ATGTTGCTA            TTTTTATAAAACTAA  78 44
   CLJ_B0325  319466 ..  319476 +  -2.6  -3.50775   GTAATTATAACTTTC                 TAAT AAA ATTA                 TGTTATTAATATTTA  45 23
   CLJ_B0326 NONE
   CLJ_B0327 NONE
   CLJ_B0328  321447 ..  321474 +  -2.8   -5.9873   TTATATTCAAAATGA        AAGAGAAATC AATACAAA GATTTCTCTA         TTTTTTTTATAATAA  76 60
   CLJ_B0329 NONE
   CLJ_B0330  324309 ..  324330 +  -6.6  -5.28281   GTATAAACATGAAAA           GCCATCAT AAATGA GTGATGGC            TTTTATTTATTTTAT  87 48
   CLJ_B0331  326544 ..  326554 +  -2.6  -2.62983   CAAAACAATTGATGG                 TAAA TAA TTTA                 TAATATGAAAATAAA  39 285
      glvA_1  327988 ..  328029 +  -8.1  -4.11394   ATTGTAAAATTAATT GAGACTGCCAAAAGTAGAT TAAA ACCTATTTTAGACAGTCTC  TTTTGAAAATAAGGT  79 87
   CLJ_B0333  328646 ..  328660 +  -4.4  -3.46399   CATATTTTAAAATTC               TAATTA TGA TAATTA               TATATTTTAAGTTTA  53 53
   CLJ_B0334  329688 ..  329715 +  -5.8  -5.31545   TTTAGTATTAGATTT        CATAATAATG TTTTATTT CATTATTATG         TTTTTTAATATTATT  81 51
   CLJ_B0336  330343 ..  330371 + -12.6  -5.05712   TTAATGAATATTTTA        CCCCTTGAATAG CTAGT CTATTTAAGGGG        TTTTTAGTTGTTTAT 100 41
   CLJ_B0337  330812 ..  330824 +  -3.5  -3.10761   GATAATAATGCAGTG                TTTTT TAT AAAAA                TATCCTTTATTCACC  45 56
   CLJ_B0338  331384 ..  331406 +  -5.6  -2.96329   ATTTTTTTTATAATG           GGTGTAACTT AGA AGGTTACAAC           TACTTATTAAATTCA  55 45
   CLJ_B0339 NONE
   CLJ_B0340  332930 ..  332951 +  -5.9   -5.1417   TTTTTACAAGTAAAG           CCTATGAGA ATTT TGTCATAGG            TTTTTACTTTTATAA  80 168
   CLJ_B0341  333968 ..  333991 + -10.4  -5.08824   AGTAATGTTGAGTAA          CGTGTTATCT AAAG AGGTAACACG           TTTTTTACATAAGAA 100 26
   CLJ_B0342  335819 ..  335842 +  -9.7  -3.32521   AAGAAATTTAGTTAG          GAGTGACTA TTAATT TAGTCACTC           TTATAAAAATATAGT  82 175
      glvA_2 NONE
   CLJ_B0344  337936 ..  337966 + -11.9  -3.39908   ATATATTTAGTAAAA       GCTCGGAAAGTGG ATATA CCATGTTCCGAGC       TATGTTTTAAACAAG  95 75
        ilvD NONE
         eda NONE
   CLJ_B0347  341631 ..  341648 +  -4.3  -2.69468   GAATAATGTGGAATA             TATTATA AAAA TATAATA              TAATGTATAAAAATA  48 212
         ade  343656 ..  343669 +  -2.5  -3.17075   CATAATCACTTGATA               TTTTA AATT TAAAA                TTAGATTAGAAGAAA  42 201
   CLJ_B0350 NONE
   CLJ_B0351  346009 ..  346061 + -12.6  -3.50393   TTTTAATAATTAAAT TTAGCCCTTAGG-TAAGTATAAATAA GAT TTATTTAT-CTTGTCCTAAGGGTTAA TTATATAAAATCACA  95 92
   CLJ_B0352 NONE
   CLJ_B0353  347763 ..  347786 +  -4.8   -3.5936   AGCGTTATCGTTAAT          TTTGATATTA TCTT TAATATTAAA           TTTAGCAAATTTGAA  56 191
   CLJ_B0355  351419 ..  351441 + -16.4  -4.43307   TTATTTATTTAAATT           GCCACAGGTA TAG TACCTGTGGC           TTATTTTATTGGAGA 100 56
   CLJ_B0356 NONE
   CLJ_B0357 NONE
   CLJ_B0358 NONE
   CLJ_B0359  355954 ..  355978 +  -9.4  -3.16534   ATATAATTATATAGA          TAGGAGTGTT ATGTG AGCACTCCTA          CTTTTAGTGAACTTA  80 35
   CLJ_B0361  358495 ..  358529 +   -11  -2.94912   ATCAACAGCCTGTGG     GATTTAGATACTTGTA TAC TATAAGCATCTAAATC     TCTATAAATTAAAAG  87 80
   CLJ_B0363 NONE
   CLJ_B0364 NONE
   CLJ_B0365 NONE
   CLJ_B0366 NONE
   CLJ_B0367  365384 ..  365422 +  -6.3  -6.08342   CTTAAAGGTAAAAAA   TTAACGACTTAAAAT CTAAAAGCA ATTTTCAGTCGTTAA   TTTTTTTATTTATTC  95 36
   CLJ_B0370 NONE
       xpt_1  368492 ..  368519 +  -4.4  -4.20768   GATACTAATTATTTA        TATAATTGTATT TATA AATGTAATTATA         TTATTTATTGCAGAT  61 216
   CLJ_B0372 NONE
   CLJ_B0373  370460 ..  370491 +  -9.8  -6.15536   TATTAAATATATAAA      TAGAATAG-ATAGTT TAA AACTATACTATTCTA      TTTTTTTTATTAATT 100 48
      uppP_1 NONE
   CLJ_B0375 NONE
   CLJ_B0376  374318 ..  374356 + -16.3  -2.72991   GTTTAATAAGAGTGT   TTAAAGGGTAATGTAGC GACCA GCTGCATTACCCTTTAG   TAATTAGGCATATAC 100 249
   CLJ_B0378 NONE
   CLJ_B0379  375806 ..  375834 + -11.8  -5.48054   CTGTTTATTTCTAAA        CCACACTTCGGT ATTCA ACTGGAGTGTGG        TTTTTTAATTTTGAT 100 186
   CLJ_B0382  378001 ..  378033 +  -8.6  -3.72119   ATTATATATTTATAC     TAAGGAGATGGAAGA GAAT TCA-CCATCTCCTTA      ATTTTTATTATAATA  76 127
   CLJ_B0383  379149 ..  379161 +  -5.5  -4.39386   GAATTATGGAAATAA                TCAGC TAA GCTGG                TTTTAATAATTTAAA  68 7
   CLJ_B0384  380826 ..  380874 + -19.3  -5.62045   AATTAATATAAATTA CATGTCCAAAACCATTATTCTAA AAT TTGAAATAATGGTTTTGGGCATG TTTTTTATTGTCTAT 100 41
   CLJ_B0385  381713 ..  381726 +  -2.5  -3.72152   TATTAGGGTGATAAA               TATAT TAGA ATATA                TTATAATTTTAATTA  47 54
   CLJ_B0386 NONE
   CLJ_B0387 NONE
   CLJ_B0388  383144 ..  383160 + -10.9  -4.44667   AAAAAAAGAGATCGA              GATCGGT TTA ACCGATC              TTTCTTGTTAGAAAA 100 39
   CLJ_B0389  385069 ..  385105 + -13.3  -5.64304   TTGTATGTAGATAAA    TCCTATTATAAATGCAA AAT TTGCACTTATAATAGGG    TTTTTTATTATGTTA 100 188
   CLJ_B0390  385740 ..  385764 +  -6.5   -5.5112   AATAGTTATAAAAAG          CCATATGCAAT ATA AGTGTATATGG          TTTTTTATTCATAGA  88 119
   CLJ_B0391 NONE
   CLJ_B0392  388383 ..  388433 + -14.6  -5.47159   AATAATAATTATTTA TGAAATAAATTCTCTAAAATTGCA TAC TATAATTTTAGAGAATTTATTTTA TTTTTATTTATTAAG 100 40
   CLJ_B0393 NONE
   CLJ_B0394  389711 ..  389723 +  -4.9  -3.33261   ATAGATTAATTATGT                GTTAA AAT TTAAC                TTAATATATAAATAT  55 56
   CLJ_B0395  390028 ..  390046 +  -4.6  -5.24989   AGTATAACTTGTACA             GTAAAGTT AGT ATCTTTAC             TTTTTTCATCTATAA  73 158
   CLJ_B0396  391947 ..  391982 +  -2.2  -5.09521   AAATAGAAGTTTAAA    TAGGCTATACTTATA AAAAAAA TATAA-TATAGCTTA    TTTTTGATTTATTAA  64 145
   CLJ_B0397  392973 ..  392988 +  -4.8  -4.00532   GATTTCCAAACATTT              GTAAAT ATAA ATTTAC               TTTAATATTTGGAAA  60 72
   CLJ_B0399  395370 ..  395392 +  -9.2  -3.55761   AGAAATATGAATAAA           GAGGCTATCT AAA GGATAGTCTC           TTTCACAAATAAATA  83 39
   CLJ_B0400  396627 ..  396671 +   -12  -5.43414   TTTAATAATAAAAAA TAACTATGTAAGAAATATATT TTAA AGTATATTTCTT-CATAGTTA TTTTTTATATATAAT 100 95
        adhE  399669 ..  399698 +  -8.7  -5.47218   TATTTATACAAAAAG       TGCTCTAGGTTGT ATTA ACAATCTAGGGTA        TTTTTTTGAGTAAAA 100 120
   CLJ_B0402  400169 ..  400183 +  -2.9  -3.17075   GGGGAAAATTAATGT               TAACA GTGCG TGTTA               TTAAATTAAGAAAAA  42 29
   CLJ_B0403  401077 ..  401131 + -23.3  -5.32699   TATAAAAAGCATTAA TAAAATACAGCTTGATGTCCCAAGG CTTTA CATTGGGACATCAAGCTGTATTTTC TTTTTTACTCTTTCA 100 284
   CLJ_B0406  403870 ..  403892 +  -5.8  -4.15854   TGCTATGTAAAAAAA           TTATTATAGA AGG TTTATAATAA           TTTTGAAATAAGTTT  64 329
   CLJ_B0407  404933 ..  404943 +    -4  -3.14978   AAAGCTCTAAAATAG                 TATG TAT CATA                 TATCTTAAATTATAG  48 26
   CLJ_B0408 NONE
   CLJ_B0409  407143 ..  407158 +  -3.4  -3.44334   TGATACAAATTTATT              TTATAT TTAA ATATAA               TTAATATTAATTTAA  47 38
   CLJ_B0410  408793 ..  408809 +  -7.3  -2.72511   GAGAGTCCAAATCTT              CGATTTG GTG CGAATCG              CTTTCACAGAGTGCG  62 135
   CLJ_B0411 NONE
   CLJ_B0412  410191 ..  410241 + -20.3    -2.882   TAGTGAACATTTAAA TAATAAGAAGGTGTTTCAAAATA AAATC TATTTTGAAACACCTTCTTTTTA GTTTAGATATTTAAA 100 60
   CLJ_B0415  415961 ..  415982 +  -3.1  -4.01227   TAAATTATAATTTTT           CTATAAAAT GTAA ATTTAATAG            TTCTTATATATTTAT  52 31
   CLJ_B0416  416820 ..  416850 +  -5.4  -4.38116   AAATAAGAACAAAAA       GGAAACCCTAACAT ATA ATAAAAGGGTTTCC       TTTAGTTTTTATAGA  68 130
   CLJ_B0417  418380 ..  418426 +  -9.2  -3.08603   TTATAAAGGTATAAA TTAACACCTATAAGTTATG-GG AAATA CTACA-AACTTATAGGTGTTAA ATTTTAACCATATTT  78 110
   CLJ_B0419  421147 ..  421173 + -16.8   -4.1891   ATAACAGGGCAAATA         TAAGGAAAGTGC ATA GCACTTTCCTTA         TTTATATTAAGAAAG 100 23
   CLJ_B0420 NONE
   CLJ_B0421 NONE
   CLJ_B0422  424118 ..  424149 + -15.4  -2.68719   GATGAATAAAATTTA      TTAAAACCTGGTGC AATT GCATCAGGTTTTAA       GTTATAATATAATGA 100 32
   CLJ_B0423  426020 ..  426040 +  -9.8   -5.1101   CTATACTCTAAAAAA            GGAAAGTG GTGCG CACTTTCC            TTTTTTAAGTAATGG 100 411
   CLJ_B0424 NONE
   CLJ_B0425 NONE
   CLJ_B0426 NONE
   CLJ_B0427 NONE
   CLJ_B0428 NONE
   CLJ_B0429  432122 ..  432149 +   -13  -4.92783   AGAGTATAGAAAAAA        GAGTTAAGTAAA ATTT TTTACTTAACTC         TTTTTATACTGCATT 100 87
   CLJ_B0430  433561 ..  433598 + -13.1  -3.79747   AGTATAGAGTATAGA   AAAAAGAGTTAAGTAAA TAAA TTTACTTAACTCTTTTA    TTTAATGATCAATAA 100 82
   CLJ_B0434  440810 ..  440841 + -17.6   -5.5762   ATAGTCATATCAAAA      GGCTATTGAATAGA TTAT TCTATTCAATAGCC       TTTTTTATCTTTGGT 100 239
   CLJ_B0435  443075 ..  443116 + -14.9  -4.39287   GAAGATAAAACATAT TAAGGGACTATTAAATGAA ATAA TTCATTTAATAGTCTTTTA  TTTTCATGTAATTAA 100 33
   CLJ_B0436  443658 ..  443670 +  -4.9  -3.35185   TCTCATTAAAATAGA                TAACA ACA TGTTA                GTTATTTTTGTATAT  55 251
   CLJ_B0437  448649 ..  448668 + -12.2  -5.74086   AATATAGTAAAAAAA            GTGGGAAG TAAA CTTCCCAC             TTTTTTGTTTAATTT 100 68
   CLJ_B0439  452865 ..  452897 + -12.1  -4.53607   ACTAAGGGAAATACT      AAAGGGCAGATACAA AAA TTGTATCTGCCCATG      TTTTATAATAATTTT 100 76
   CLJ_B0441  456038 ..  456078 +  -9.3  -5.69793   GAATAAAATAATATA  GATATAGAATTTATAGTTT ATA AGACTATTTATTCTATATC  TTTTTTATTTAATAT 100 60
   CLJ_B0442  457539 ..  457556 +  -4.3  -5.17576   TTTTGGGATAAAGTT             TTTTATT ACAT AATAAAA              TTTTTTGCATTCCTA  73 253
      pstA_1 NONE
   CLJ_B0445  460026 ..  460053 +  -2.9  -3.42354   CATTAAATAGTTTTC        TTATAGAACTT AGCTTA AAGTTATATAA         TTATAAATTACAGTA  44 59
   CLJ_B0446  460631 ..  460678 +    -9  -4.48743   AATAATATAACTCAA TAAAAGCTATGAAATTAATAGG AGAAAG CCTA--AATTTCATAGCTTTTA TTTATTTGAACTTTT  86 73
   CLJ_B0447  462429 ..  462459 +   -20   -3.4015   CAAACAAAAGTGTAA       TAAGAGGAAAGTGC GAT GCACTTTCCTCTTA       TTGTGGAATTATTCT 100 65
   CLJ_B0449  464065 ..  464095 +  -5.6  -6.23545   AACATAGACAAAAAG       GTGTCTCAAAAT TAAATCT ATTTTTAGACAC       TTTTTTTTATTTAAG 100 39
   CLJ_B0450 NONE
   CLJ_B0451  465246 ..  465257 +    -3  -4.09685   TAAAGTTGTTAGTAA                CTAA ATAT TTAG                 TTTTGAAAAATAAAA  51 22
   CLJ_B0452  466099 ..  466115 +  -4.5  -3.40403   CTAATTATTGTATTA              TTATCAT AAG GTGATAA              TTATGATAGAAGAGG  53 70
   CLJ_B0454  466870 ..  466880 +  -2.6  -4.20371   TAAAAACAAAATACA                 TATT ATT AATA                 TTAATTTTTTTTTCA  55 343
   CLJ_B0455  468243 ..  468280 + -14.5  -4.10566   TTGTTAATATGAGTA   TAAGCACAACATAAAAT TTAA ATTATATGTTGTGCTTA    TTTGTATAATAATAT 100 44
   CLJ_B0456  469451 ..  469507 + -24.4  -4.07107   TAAAAAATAAAAAAA GAACAGAGAATGGATAAAAAGGTTTT GGTTA AAAATCTTTTTATCTATTCTCTGTTC TTTCTAATATGTTAT 100 87
   CLJ_B0459 NONE
        rnhA  476246 ..  476256 +  -2.6   -3.6422   AAGCCATGAATGAAT                 TTAA TGT TTAA                 TATTTTACAGAAATG  45 15
   CLJ_B0461  476499 ..  476520 + -13.1   -4.9792   ATAATGAGATAAAAA           GATTTGGGG AAAG CCCCAAATC            TTTTTATATACAATA 100 29
   CLJ_B0462 NONE
   CLJ_B0463  479424 ..  479440 +  -5.9  -3.67417   TGGCAACAGAGCTAA              GTAAACG TCC TGTTTAC              TTTACGCTTAAATAT  65 184
   CLJ_B0464 NONE
   CLJ_B0465  480092 ..  480104 +  -3.5  -3.34043   TGTTATTTTGGTATA                TATTT GTA AAATA                TTATAAAATAATAGG  47 161
   CLJ_B0466  480875 ..  480890 +  -2.6  -3.35539   AGTATAATTGCACGA              TAAAAG TAAC CTTTTG               TGTATTTAATTAATA  44 165
   CLJ_B0467  481886 ..  481913 +  -8.6  -4.77173   AAATTTAATCTTATA        TAAGCATGGATA GAAA TATCGATGCTTA         TTTATTTTGTGACAA  88 40
        clpB  485412 ..  485422 +    -4   -5.5353   CTACATAGGTTTCAT                 TGAA TTC TTCA                 TTTTTTATTACTGTA  82 524
        manA  488716 ..  488754 +  -8.5  -3.52896   TCTTTTTTAAGGAGG   TATTCACAATACTTTTT TAATT GAAAAATATTGTGAATA   TTATATAAATAATAA  75 245
   CLJ_B0472  489959 ..  489973 +  -4.4  -4.90002   GTGAATTATAAAAAG               TAATAA AGA TTATTA               TTTTCTTATATGTTC  68 23
      uppP_2  490944 ..  490984 + -13.8  -5.00895   TAAAGAGCGTTGTTA TATATGACTATTAGCA-AT GTAA ATCTGCTAATAGTCATATA  TTTTTATATAATACC 100 46
   CLJ_B0474  491400 ..  491413 +  -6.7  -2.52464   AGTCGAGCGATGAAG               CTTCC TTCG GGAAG                TGGATTAGCGGCGGA  59 356
   CLJ_B0484  498245 ..  498283 + -14.2  -6.22691   GCAAGAAATTAAGAG   GAGAGTGTCTCAAAAT AGATTTA ATTTTGAGACATTCTC   TTTTTTTTATTATTA 100 29
   CLJ_B0485 NONE
   CLJ_B0486 NONE
   CLJ_B0487  504038 ..  504071 + -12.1  -5.93809   TATAATTGTATTCAA     GTTTTTCTTATAATT TTAA GATTATAAGAAAAAC      TTTTTTTTATAAAAG 100 269
   CLJ_B0488  505398 ..  505420 +  -6.3  -5.95286   CAAGTACGTCTATAT           GCCTTGAGT GTAAA GCTTAAGGC           TTTTTTGTTTTTGAT  90 432
   CLJ_B0490  507283 ..  507309 + -16.8  -4.16033   AATGGATGCATAAAA         TAAGGAAAGTGC TTA GCACTTTCCTTA         TTGTTCTTCTTTAGG 100 28
        addB  514435 ..  514469 +  -9.6  -4.30933   ATAATTATAAACAAA     GAGTTTATTAATAGTA TAG TTTTATTAATAAACTC     TTTATTAAATTTGTG  89 54
   CLJ_B0497 NONE
   CLJ_B0498  516693 ..  516721 +  -8.2  -4.88326   TAATGTAAATTATGA        CCTACTAATGGT TAATT ACCAATGGTAGG        TTTTAGTTTTTATTT  88 46
        hypB  518620 ..  518635 +  -4.8  -3.52813   TTTTATAATCTATTG              TAAACA CTAG TGTTTA               TGTATTTTATGGTTT  56 200
   CLJ_B0501 NONE
        hypA NONE
   CLJ_B0503  522806 ..  522824 + -10.4  -5.70522   ATTTATAGTAAAAAA             TGTAGGTT AAA AACCTACA             TTTTTTATTCTTATT 100 51
        addA  528813 ..  528823 +  -2.6  -2.64155   TATATTATGTAAAAT                 TAAA ATT TTTA                 TAAATTTAAGGAAGG  39 138
   CLJ_B0508 NONE
        pepT  532246 ..  532268 + -12.2  -3.01309   TTAAAGTCTGTAGAG           CTAATTCCTA AGG TAGGAATTAG           TATAGTTCTATCTAT 100 436
   CLJ_B0511  534441 ..  534457 +  -8.1  -3.46586   AGCAAGCCGCTAACA              CAAAATC AAA GATTTTG              GTTTTCTGTTTAAAG  74 145
   CLJ_B0512  535027 ..  535039 +  -4.9  -3.35597   TTAACTAAAAGTTAT                TGAAT GAT ATTCA                TATTTAACGAATCAG  55 67
   CLJ_B0513  535363 ..  535389 +  -5.3  -5.60864   TAACATCAATTAAAG         TACTTTTAGAG TGCGT CTTTAAAGGTA         TTTTTTTAATATGTA  82 48
   CLJ_B0514 NONE
   CLJ_B0515  536488 ..  536498 +    -4  -2.64872   TTAATAATCAAAAAA                 TACA TAT TGTA                 ATTAATATATTTAAA  44 95
   CLJ_B0516  538245 ..  538255 +    -4  -4.68601   TTTATAGCTATCTAT                 TACT AAA AGTA                 TTTCTTGTTTTAACT  62 299
   CLJ_B0519  540971 ..  541010 +  -7.6  -5.38054   GGTGAATATAAAAAA  GTATAAGATAAAAT-TTTA TTA TAAAGATTATATCTTATAC  TTTTTATTTATAAAA 100 299
   CLJ_B0525 NONE
         ddl  546765 ..  546794 +  -8.1  -5.65927   AATTAGAATAAAAAA       TACTTATAGATTG TAAG TGATCTATAAGTA        TTTTTTATTTGAATG 100 48
   CLJ_B0527 NONE
   CLJ_B0528 NONE
   CLJ_B0529 NONE
   CLJ_B0530 NONE
   CLJ_B0531  551298 ..  551315 +  -3.5  -2.55351   ATTTTATTAAAAAAA             TTTATCT TGGA AGATAGA              GTTCATATAAAAAGA  42 9
   CLJ_B0532  552208 ..  552249 +  -9.8  -4.50487   ATTGCATAATATAAA GCACTATGTAGATTATTT TAGAGT GAATAATTTATATAGTGC  TTATTTTATATTTAT 100 114
   CLJ_B0533 NONE
   CLJ_B0534 NONE
   CLJ_B0535  555292 ..  555305 +  -2.5  -3.75863   TCTAACAAAAAAACT               TATAA ATAA TTATA                TTTAGTGAAAATTTT  47 7
   CLJ_B0536 NONE
   CLJ_B0537  556818 ..  556841 + -11.2  -4.28487   TGATAGTTTAATTAG          GAGTTTTTGT TTTC ACAAAAACTC           TTTAATTTTATAATA 100 57
   CLJ_B0538  558205 ..  558243 +   -12  -4.11623   TATAGTTTTAAGGAA   GAGGGTGTCTTAAAAT AGATTTA ATTTTAGGATACCCTC   TTTAATTTCATGATA 100 65
   CLJ_B0539  559202 ..  559214 +  -4.9  -2.92656   TTAGAATATTTACAT                TTATC AAG GATAA                TATATAAATAAGTTT  51 6
   CLJ_B0540  559922 ..  559944 +    -2  -3.54424   TCTGAGAATTTTAAA           GAAAGGAA TGCATAT TTCCTTAC           TTTGAAGACGTGGCA  44 110
   CLJ_B0541 NONE
   CLJ_B0542  561166 ..  561208 +  -9.5  -3.36578   TATGATTAACCAAAA TAAAAGTGTGGAGTA AAAATATAAAAAC TACTCCACACTTTTA CTTTATTTAATTTAA  82 62
        sbcD NONE
        sbcC NONE
   CLJ_B0547  567740 ..  567778 + -19.4  -5.22289   TTTAAATAGAGGAAA   TAAGATGTTTCAAAATAA AAT TTATTTTGAAACATCTTA   TTTTTCTGTTTCATA 100 78
   CLJ_B0548  569405 ..  569442 + -17.5  -5.22943   TAATTGAGAAAATAA   TAAGGGTTTATATTAAA ATTT TTTAATATAAACCCTTA    TTTTTTACCTTTAAT 100 65
   CLJ_B0549 NONE
      cadA_1  572880 ..  572890 +  -2.6  -3.09273   TTAAAATTTGGGCTG                 TAAT ATA ATTA                 TATATGTTCAAAGAA  41 406
   CLJ_B0554  574393 ..  574404 +  -4.4   -4.5265   CTAAAGAGAGGTAAA                GAAG ACCT CTTC                 TTTTCTGATGTAATT  64 59
   CLJ_B0556  576353 ..  576366 +  -2.5  -4.41844   TTTATTTAAAAGTTT               TAATA GACC TATTA                TTTTATAGGAATTTT  58 524
   CLJ_B0558  578375 ..  578417 +   -13  -3.90416   TATACTATATGTAAG TAGAGGGTGCCTCAAAAT CAAATAT ATTTTGAGGTGTCCTCTA TATTTTATGTGCTAT 100 226
   CLJ_B0559 NONE
   CLJ_B0560  580796 ..  580824 + -11.8  -5.48054   CTGTTTATTTCTAAA        CCACACTTCGGT ATTCA ACTGGAGTGTGG        TTTTTTAATTTTGAT 100 167
   CLJ_B0563  582515 ..  582553 +  -5.5  -2.73408   ATTTAAACCCAGGTA  GCCAGGTGATTATAAT TTAATATT ATTTTA-TCACCTGGC   TAATATCATTTGGAT  53 90
        sagB NONE
        sagC NONE
        sagD NONE
   CLJ_B0567 NONE
   CLJ_B0568  587487 ..  587506 +  -4.3  -5.19879   AAGTTTTGGAAATGA            TTGGCTA AGTACG TAGCCGA             TTTTTATATTTCCAC  73 132
        sagG NONE
        sagH NONE
        sagI  590975 ..  591002 +   -10  -4.10429   AACAGAGTTCTTGGA        TTTAGAGTGAGT TTTT ACTCCCTCTAAA         TTTTAGAAAATGATT  93 64
   CLJ_B0572  591971 ..  592009 +  -9.8  -5.39221   TTTTAGAATTTAAAA   GATGGTTCTTCAAAAT GTATTTA ATCTTGAGGAACCATC   TTTTTTAGTTATTAT 100 35
        trmB  596442 ..  596477 +  -8.5  -2.52635   ATTTTTATTGGGAAA    CATAATAACATATCC TTAATT GGAGGTGTTATTATG     ATTGGTGGTAACAAT  68 204
   CLJ_B0577  596761 ..  596806 + -15.3  -3.01119   TATTCTTTTAAATAA TATTAAAACAGGTATTTCTATA AAT TA-AGGAATACCTGTTTTAATA TATCTCTAAATAAAT 100 48
        fabG NONE
   CLJ_B0580  599512 ..  599541 +  -4.2  -4.73613   AGCAAAAGAAGGAAA       GGCC-CCCAGCAA TTATT TTGCGGGTAGGCC       TTTTATTCATACTAA  68 80
   CLJ_B0582  603099 ..  603140 + -22.1  -5.56568   GTAAATGGTGTTTAA TATGTGGTTAGAAAGATAT TTTA ATATCTTTCTAACCACATA  TTTTTTTAATAATAT 100 37
   CLJ_B0583  604809 ..  604850 + -19.2  -5.35224   ATTTAGCTAGATATA GCCAACATAATTAGTTTA AATATG TAAACTAATTATGTTGGC  TTTTGTTTTTATAAA 100 238
   CLJ_B0584  605456 ..  605468 +  -3.5  -3.06361   ATATATAAATTCTTT                TAATT TAC AATTA                TGTATATAATTAGTC  45 4
   CLJ_B0585  607561 ..  607601 + -13.8  -4.56775   AATATAAAATTAAGA  TAAAGTTATAAACAATAT TTTAT GTATTGTTTATAACTTTA  TTTTTACAAAAAAAT 100 49
   CLJ_B0586  608925 ..  608956 +  -8.8  -5.86976   GTGGCAACGCGGATA      CTTCCGTCCCATAT TTAT ATATGAGATGGGAG       TTTTTTATTTTATGG 100 414
      serS_2  610521 ..  610537 +  -8.1  -3.67417   TGGCAACAGAGCTAA              GTAAACA TCC TGTTTAC              TTTACGCTTAAATAT  76 252
   CLJ_B0588  613248 ..  613268 +  -2.6  -5.10208   TTTGGAATTAATATA            TTAAATGG ATAAA CCAATTAA            TTTTTATTAAACTTA  64 30
         ceo  616047 ..  616080 +  -3.2  -5.64304   CATAAGAATATAAAA     GACCACTTGTAT GCTTATAAAA AAGCAAGTGGTC      TTTTTTATTATATTA  77 163
   CLJ_B0593 NONE
   CLJ_B0594  619496 ..  619506 +  -2.6   -5.1848   TTGATAGTGTTCTTA                 TTAT AAA ATAA                 TTTTTTAAATTACTT  64 147
   CLJ_B0596  621489 ..  621514 +  -9.9  -5.47159   TAAATTGTTTTTATA         CTGCTGATCAAA TCT TTTG-TCAGCAG         TTTTTTATATTGCAA 100 47
   CLJ_B0598  623260 ..  623311 +  -9.3  -5.09245   ATATATTAGAAATAT AAAGCTATAGGAATAGAT--ATTAA GCTT TTAATTTATCTATTCCTATAGCTTA TTTTTATACTTTTAA 100 24
   CLJ_B0601  626411 ..  626462 +  -7.6  -4.67641   TTAAAGGTATTAAAA CAAGAAATACTTTTAGAGAAAATA GCTA TCTATTGACTAAAAGTATTTCTTG TTTTAATTTTCAACT  83 399
   CLJ_B0603  627885 ..  627916 +    -3  -5.56112   AGTTTCATATAAAAA      CACACTAAAATCCA GTTT TAGAGGTTAGTGTG       TTTTTTAGTTTTTAT  70 50
   CLJ_B0604  629986 ..  630023 + -11.7  -4.98531   ATTAAGGAACAAAAA   GCTATGAATTTTGGAATA TAA TATTCTAAA-TTCATAGC   TTTTTACTTTAAAAA 100 155
   CLJ_B0605  631963 ..  631982 +   -10  -4.18401   TAGACTTATTGAAAG            CCCTGTGC AAAT GTACAGGG             TTTTAAAATCTATAA  93 103
   CLJ_B0606 NONE
   CLJ_B0607  633717 ..  633750 +  -7.8  -5.72616   AAATATAAAAAAATG     TACTTCATAAACATA TGAAT TA-GTTTATGAAGTA     TTTTTTTATCTGAGT 100 80
   CLJ_B0612  638757 ..  638775 +  -7.5  -4.88222   TATAACATATCATGG             GACTGAT TCTAT ATCAGTC             TTTTTGCATTTTCAT  86 233
   CLJ_B0613  639513 ..  639560 + -20.6  -4.57581   GTTTTATTTAACAAA TAGACATAAAAATTATTAAATT CAGT AATTTAATAATTTTTATGTCTA TTTATTATTTAGACT 100 76
   CLJ_B0615 NONE
   CLJ_B0616  643191 ..  643225 +  -8.8  -5.74122   ATAATAAATAAAGAA     GATCCATAGATTTG ATTTACA CAAATCTATGGATG     TTTTTTTATCTAATA 100 30
        pepP  645888 ..  645898 +  -5.4  -3.76008   GAAAGGCAAATCAAT                 TCTC TAA GAGA                 TTCTAATTTGTTTTT  61 100
   CLJ_B0624  648668 ..  648719 + -15.6  -3.99229   TTTAAGGTTAAAAAT TAGCACTATGAATATTATTGAAAT AAAT AATTCGATAATATTCATAGTGCTC TTATTATCTTGCTAT 100 174
   CLJ_B0626 NONE
   CLJ_B0627 NONE
   CLJ_B0628  650605 ..  650629 +  -9.5  -4.93296   AGTAAAGATAAAAAA          TACATTTCATG GTT TATGAAATGTA          TTTTTATCCTAGTAG 100 62
   CLJ_B0631  653177 ..  653190 +  -2.5  -3.59315   TAATTAAAACTTAAA               TAATA AAGT TATTA                TTTAAAAGTAATTAA  45 202
   CLJ_B0632  654272 ..  654298 +  -6.8  -4.98468   TTTTTTATATTGGTA         GTTTTAAAATTA ATT TTATTTTAAAAC         TTGTTTTTTTATTGT  80 186
   CLJ_B0633  657032 ..  657055 +  -8.2  -5.72622   TATAAGTTTGAAAAG          GCTGGCAATA ATAA TATTGCTGGC           TTTTTTGTTTATAAA 100 36
        mscL  659763 ..  659773 +  -2.6  -3.52102   ACTTATAATTATTAG                 TAAT AAA ATTA                 TTATGTAAATAAAAT  45 77
   CLJ_B0637  660644 ..  660674 +  -9.1  -4.15932   TAAAAATTAAAAAAT       GGGGTATTTCAAG TTTAT TTTGAAACACCCC       TTCTTATATTTTTAT  82 38
   CLJ_B0639  661495 ..  661506 +    -3  -2.96274   GTTATTATTTATATA                CAAT TAAA ATTG                 TGTCATTATACAAAA  41 47
   CLJ_B0640  662804 ..  662817 +  -3.9  -3.53164   ATTTATGTAGAATTA               GAAAT AAAT ATTTC                TTATATAAGTACTCT  51 132
   CLJ_B0641 NONE
   CLJ_B0642 NONE
   CLJ_B0643  664821 ..  664860 +   -14  -4.29493   ATTTTAAATTTAAAA  GGCTATGAATTTGGAA-TA TTA TACTTCTAAATTCATAGCC  TTTATATATTTAATC 100 56
   CLJ_B0644  667186 ..  667208 + -10.6  -4.38748   ATTGCAAAATCTTTA           CCCCTGTG ATTCTTA CACAGGGG           TTATTTATTTATAAA 100 498
        potA NONE
        potB NONE
       potCD  671290 ..  671323 +  -9.7  -4.57063   TTAAAAGTTTTCTAA     CCAGGTGAGAAATTA TCCT TGATTTCACATCTGG      TTTCTTATGTTTTGC  93 49
   CLJ_B0648 NONE
   CLJ_B0649  672775 ..  672797 +  -6.4  -3.65046   GTGGCCATGCCAAAA           TTACTATGAA ACA TTCAAAGTAA           TTATTAGGCTAACGG  66 3
   CLJ_B0651  675625 ..  675638 +  -3.9  -4.90455   ATATTAGTTCACAAA               TAAAG TATT CTTTA                TTTTTATAGCTATCT  64 205
   CLJ_B0653  676680 ..  676691 +    -3  -5.25656   ATATGTAATTGTTGC                CTTT GTAG AAAG                 TTTTTTAATCCTTTT  64 210
   CLJ_B0654  677073 ..  677083 +  -2.6  -2.64766   AAAAATATAGAAATT                 TTTA TTA TAAA                 CATTTATTTTACTAA  39 40
   CLJ_B0655  677678 ..  677708 + -12.8  -4.27584   TATAAATATCCAAAA       TCCATGCATTTAAT ATT ATAAAATGCATGGA       TTTTGCGTTAAAAAT 100 5
   CLJ_B0658  681051 ..  681076 + -12.1  -3.20109   ATGAAGGAATAGAAA         CCCATAATTAA ATGA TTAATTATGGG          TTAAATGATTTTATA  93 87
   CLJ_B0659  682392 ..  682418 +  -6.8  -4.72386   AAAAAGAAGCCGAAG         TTTCTAACTA TAGTGGT TAGTTAGAAA         TTTTTAGCTACTTTA  77 6
   CLJ_B0661  684470 ..  684483 +  -3.9  -4.34557   AGAAATTAATTACTA               TCATA ACAG TATGA                TTTAATTTTTGAATT  58 139
      lepB_1  685216 ..  685252 + -16.3  -5.30686   TAAAATTATAAAAAA    TTAAAGTGGTATTTATT TTT AGTAAATACCACTTTAA    TTTTTTATGGATATT 100 116
   CLJ_B0663  687010 ..  687030 +  -6.3  -2.97747   TTAATTAAGTCCCTA            TAAAATAGG GCA TCTATTTTA            TCTATGATATAAAAA  59 377
   CLJ_B0664 NONE
   CLJ_B0665  688031 ..  688045 +  -4.3  -3.57651   CTGCTAAAAAATTTT               CACAA GGATA TTGTG               TTGTATGCTCTGGAA  54 509
   CLJ_B0666  688521 ..  688537 +  -7.3  -2.72511   GAGAGTCCAAATCTT              CGATTTG GTG CGAATCG              CTTTCACAGAGTGCG  62 159
   CLJ_B0667 NONE
   CLJ_B0668  691118 ..  691128 +    -4  -2.71791   TTGTTATGATTTATA                 CATT TTT AATG                 ATTTAAAGGAGAGGT  44 32
   CLJ_B0669 NONE
   CLJ_B0670  693525 ..  693548 +  -3.2  -3.28712   AAACTCTACCTTAAG          CTTAAACTCT ATTT ATAGTTTAGG           TTATGGAAAGGAGAA  46 158
   CLJ_B0671 NONE
   CLJ_B0672 NONE
   CLJ_B0673 NONE
   CLJ_B0674  698367 ..  698379 +  -4.1  -4.17048   ATCCCTTTTTAATAG                GCTGT GGT ATAGC                TTCTTTTACGGCGCA  56 416
   CLJ_B0675  699055 ..  699069 +  -4.4  -3.10053   TATATAATATTTTTT               TATTAT GTC ATAATA               TATATTCCCATGTAT  50 75
   CLJ_B0676  699980 ..  700006 + -16.8  -4.43189   ACTCTGTACTCTAAA         TAAGGAAAGTGC GTC GCACTTTCCTTA         TTTTATGCACTTGGT 100 333
   CLJ_B0677  700874 ..  700910 +  -9.1  -5.51402   ATAAATTAAAAAGAT    TAAGGTATAATAAATAT ATA AAATTTATTATATCTTA    TTTTTTTGAATCTAT 100 235
   CLJ_B0678  701931 ..  701976 +  -4.4  -5.84432   TAAATAAATTAAAAG CCTTAATCATAAAGTAAATTT TTTTT AAAAGTACTTTAT-ATTAAGG TTTTTTTGTGTTATA  86 97
   CLJ_B0679  703067 ..  703101 +  -8.2  -5.26155   AGAAAAGTTAATACG     TTAATTTTATATTTGG TAT TCAAATTTAAAATTAA     TTTTTATGTTTCTAT  95 324
   CLJ_B0680  705197 ..  705252 + -12.3   -4.5954   TCAATTTAATAATAA CAGGGTTATGTTAAGAAATTATTAT ACTAAC ATTATATTTTCTTAACATAACCCTA TTTTATATAATATAA 100 56
        asnC  711160 ..  711172 +  -4.9  -3.68886   AAGAATAATGTAACT                TACTA TAA TAGTA                TTTGAATACATTGCT  58 214
   CLJ_B0684  712166 ..  712182 +    -8  -4.96106   GTTATAATATAAAAA              CCTCAG TATAT CTGAGG              TTTTTGGTATTTGTA  90 255
   CLJ_B0687  714672 ..  714682 +  -5.4  -2.73741   AATGGTTAATGGTAA                 TCCA AAC TGGA                 ATTATCATTGTGAAT  53 369
   CLJ_B0688 NONE
   CLJ_B0689 NONE
   CLJ_B0690 NONE
   CLJ_B0691  719143 ..  719163 +  -4.1  -3.75505   GTGGAATGTATGAAA            GATTATC CGTTTTA GATAATC            TTATGCTTTTTGCAA  52 510
   CLJ_B0693  720748 ..  720758 +  -5.4  -5.00616   ACTGGAATTTCATCT                 GACT TGT AGTC                 TTTTTTAGCAAAACC  74 325
      rodA_1  726002 ..  726012 +  -6.8  -4.22352   AATTAAGGCTATTTT                 GAGG CAT CCTC                 TTATATTTTTATTTA  73 495
   CLJ_B0699  728563 ..  728583 + -12.7  -5.46657   CATTATTATAAAAAA            TCTCTCAGT ATA ACTGAGAGA            TTTTTTATTGAAATA 100 30
   CLJ_B0700  730504 ..  730533 + -10.9  -5.07652   ATATTTTATATAACA       AAATTGGAAAGTC ATAA GACTTTCCAATTG        TTTTCTTTTAAAGCA 100 123
   CLJ_B0702  732056 ..  732068 +  -3.5  -2.90583   ATAAAAAAATAGAAG                TTTTA TCA TAAAA                ATTTAGATTCTGTTA  43 29
   CLJ_B0703  732638 ..  732662 + -10.1    -3.456   AGATTTAATAAAATA          GGACTTACTGT GAT AAAGTAAGTCC          TTGCTTCATCTATTG  87 39
   CLJ_B0707  735772 ..  735796 + -10.7  -5.93252   TTATTCTAGGGTAAA          GCACCAATCCT TAG GGGATAGGTGC          TTTTTTATTTTTGCC 100 148
   CLJ_B0709  736819 ..  736838 +  -6.4   -5.9218   ATTGTTGAATTTTAA            GCTGTGGG AGTA TCCATAGC             TTTTTTTATTATATA  93 442
   CLJ_B0710  738854 ..  738910 + -10.6  -4.02882   ACTAACTTAAAATAT TAAATACAAAACTTTAAAGAGAACTG CGCTA CGGTTCTCTTTAAAATTTATTATTTA CTTTTTATTTTTTCA  95 62
        rhlE  742078 ..  742101 +  -6.8  -6.09196   AAATATAAAAAAAGA          TGATTTCTGT ATTA ACAGGAGTCA           TTTTTTTATTTTGGG 100 49
   CLJ_B0714  743154 ..  743178 + -11.5  -4.78149   TAAATAATAAAATTA          CCTGCATCTTA ATT TTAGATGCAGG          TTTTTAAATTATAAG 100 38
   CLJ_B0715 NONE
   CLJ_B0716  745242 ..  745263 + -14.5  -4.10331   TCGCATTTTTGAAAA           GCCTCATGC ACTT GCATGAGGC            TTTATAATTCCTTAA 100 56
   CLJ_B0718 NONE
   CLJ_B0719  749652 ..  749663 +  -5.8  -3.03124   GTGTACTAGCATTTG                CACC TTTC GGTG                 TATTAGAGAATAACC  55 344
   CLJ_B0720 NONE
   CLJ_B0721  750907 ..  750936 + -10.2  -3.35001   GGGGTAAAAATAAAC       TCCAGTAGTTAT TAATAT ATAGCTACTGGA        ATTTTATATGGTATA  87 74
   CLJ_B0722  753971 ..  753999 +  -3.1  -5.30616   CATATAAAGAAAAAG        ATGTAGCACTATT ATT AGCGGTGCTACAC        TTTTTCTTTAACTAA  70 42
        licT  756663 ..  756691 +  -6.1   -3.0879   ATTAGGTTGGCTAAA        CCTTCATTTTATA AAA TAAGAAATGGAGG        ATTTTAAAATGAATT  59 195
   CLJ_B0726 NONE
   CLJ_B0727  759598 ..  759624 +  -9.6  -3.88178   AATGATATTAAAAAA         GCTGTGGTAATT AAA AATTATTACAGC         TTTAAATTATTATAT  86 252
   CLJ_B0728  760726 ..  760736 +  -6.8  -6.12458   TTATTTTAGAGAAAA                 GTGC TTT GCAC                 TTTTTTATTTTTTTG 100 42
   CLJ_B0729  762116 ..  762128 +  -3.5  -2.69998   GATTATGCTAAGTAA                TTATT AGA AATAA                ATTAGTTACTTTAAT  43 42
         ric NONE
   CLJ_B0731  763668 ..  763693 +  -9.1  -5.43621   TTATAAATAAAAAAA         TAAGACCGTCA TTAT TGACTGTCTTA          TTTTTTATAATTTGT 100 55
        gltS  766436 ..  766462 +  -9.6  -4.13014   TATAAAAATAAAGAA         GAGTATCTTC CGTGGTT GAAGATACTC         TTTTAGCGCTATAAA  86 479
   CLJ_B0735  767094 ..  767105 +    -3  -2.67803   TCAAAGATATGACTA                TTCT GTAG AGAA                 TAAATTTAGTGAGGA  39 61
   CLJ_B0737  770365 ..  770379 +  -5.8  -2.87501   TGGGAAAACTATTAG               CATTAA AAA TTAATG               TAGTCTTTAATAGCC  54 90
   CLJ_B0738  770590 ..  770608 +  -8.9  -5.64274   TGTATTTTCTAAAAG             CCACATG GGTAA CATGTGG             TTTTTTTGTACCTAA 100 29
   CLJ_B0739 NONE
   CLJ_B0740 NONE
   CLJ_B0741  773674 ..  773703 +  -3.7  -3.84906   AAATTTAAAAAAGGA       CATCAATATAATA AGAT TACTATATCGATG        TATTTTCTAACTTAT  54 443
   CLJ_B0742  775373 ..  775398 + -10.5  -4.51238   TCACCTTTACAAGTA         AATCCACGACA GTTT TGTCGTGGATA          TTTGTATTTTATAAC 100 173
   CLJ_B0743  776548 ..  776560 +  -4.9  -3.24478   AGCATAATATTTCAT                TAGTA TTT TACTA                TATATTGTATAATAT  53 99
      greA_1  777147 ..  777194 +   -21  -4.16279   ACAAATAATGTAAAA TAGAGGGACTGTTCTTAGATTT AAAT AAAATTAAGAACAGTCCCTCTA TTTTAGAATAATATA 100 98
   CLJ_B0745  778153 ..  778182 +  -8.8   -5.1287   AATAAGGTTATAATA       TAATTGCATTGG GATAAA CTAATGCAATTA        TTTTTTACATATAAA 100 184
   CLJ_B0746 NONE
   CLJ_B0747  781014 ..  781043 +  -3.1  -3.60048   TATATGCAAAATAAT       TTTTAG-TGGTAAT AAT ATTACAATCTAAAA       CTTTTTTAAGAGAGG  49 59
   CLJ_B0748  781379 ..  781405 +   -14  -3.57797   CATCTGTAATCTAAA         TAAGGAATTTGT GTC ACAAATTCCTTA         TTATATGCCTTTGCA 100 151
   CLJ_B0749  781739 ..  781759 +  -7.6  -4.57209   AATTATGAAATTAAA            GCCTTGGA GAAAA TTCAAGGC            TTTTGTGCTTAATAT  83 62
   CLJ_B0750 NONE
   CLJ_B0751 NONE
   CLJ_B0752  782912 ..  782932 +    -4  -5.71712   TTTAATTGTAAAAAA            GTTTTGGA GAAAA TCCAAGGC            TTTTTTTGTGTCAAA  79 121
   CLJ_B0753  786439 ..  786487 +   -13  -3.90112   TTGACTTTAATAAAA TTAAGGATATAATAAATAATGT TAAAT AAATTATTTGTTATATCCTTAA TTTGGTTAGAGAAAG 100 104
   CLJ_B0754 NONE
   CLJ_B0755  787206 ..  787221 +  -3.4    -3.224   TATAAATGATTGAAC              TATTTT TTAG AAAATA               TATTATGGGAAATTA  46 131
   CLJ_B0756  788475 ..  788504 + -15.3  -2.69259   TTGCTATATTAGTCA       CAGTTAAGTTAGT TATA ACTAACTTAACTG        ATATTGTTGTACCTA 100 406
   CLJ_B0757  789809 ..  789831 +   -10  -2.55722   TAATTTGCTATAGTA           GTCATAGCTA AAT TAGTTATGAC           TAACTTCGCTAATAT  78 196
   CLJ_B0758 NONE
        fhuB NONE
        fhuG  793329 ..  793348 +  -5.1  -2.68009   TAGATAAAGGTATAC            TTCATAG ATTTTA CTATGAA             TAAATTATGTATTTT  50 200
        fhuC NONE
        nifH NONE
   CLJ_B0763 NONE
   CLJ_B0764  797478 ..  797515 + -10.1  -5.58179   ATGATTAGATATATA   GTGTAGATGTTAGAATCA AAT TGATTCTT-CATCTGCAC   TTTTTTATTGTCATA 100 33
   CLJ_B0765 NONE
   CLJ_B0766  800175 ..  800203 +  -5.4  -4.87052   AAAATAAAATAAAAA       CAGTGCCA-GATT ATAT AATGATGGCACTG        TTTTATTAATTTATA  73 48
        gcvT  803340 ..  803350 +    -4  -4.19506   ATATATAAATTCACA                 CTAA TGT TTAG                 TTTTCAGGTTAAAAT  56 76
        gcvH  803794 ..  803819 +  -3.3  -3.01712   ATGTGAAGAGTTAGA         TAAGGAGGCAT AATT ATGTTTCCATA          TATTCCAAACACAGA  45 13
       gcvPA NONE
       gcvPB  806809 ..  806866 +  -7.3  -4.21768   TAACTTATTGTACTT TATAAGAGTTAAGATTTAAGAAAAGTA AAAA TACAATTCTTATTTCTTAACTCTTAAA TTTTGAAATTAATTA  75 231
   CLJ_B0772  808295 ..  808309 +  -4.4  -3.63078   TAAAAAATAAGAGTT               TTTTAT ATG ATAAAA               TTGTATAATTCATTT  54 31
   CLJ_B0773  809481 ..  809530 +  -6.1   -5.5762   TAAAAAGGTATAAAA GAATCTATTTTTTAAGTGGTTAGC GTT GTTAAATACTTG-AAAGTAGATTC TTTTTTATATTTAAT  85 46
   CLJ_B0774  810286 ..  810331 +  -9.9  -4.13872   TATGGGAAAATCTAA CCTTTTTTACTTACGATTCGG TGAA TCGTATCATAAGTAAGAGAGG TTTATATCCTTAAGT  93 455
   CLJ_B0776  811275 ..  811300 +  -4.1  -4.30995   ACGAACTCTACACTT         TAACACCA-GAC TTT GTGATGGTGTTA         TTCTTTTATCAAAAG  58 23
   CLJ_B0777 NONE
   CLJ_B0778  812961 ..  812985 +  -7.9  -3.23638   TAGGCATAAAAAAGA          GGACTTACTGT AAT AAGGTAAGTCC          TTGATACATCTTTAA  68 196
   CLJ_B0781 NONE
   CLJ_B0782  816136 ..  816154 +  -4.6  -3.69681   TAACATCATCTTTAG             TTAGATTG TTT CGATCTAG             TATTTCATTTATTGA  57 450
   CLJ_B0784  818663 ..  818692 +  -3.6  -5.71712   GTCATCGGATAAAAA       TATGGTTATTGC AAATTA GCAGTGACCATC        TTTTTTTGTATAGCA  79 94
   CLJ_B0785  819307 ..  819344 + -11.5   -3.4968   ATGATTAATATAAAA   GGCATGTTTTTCACATT TATT ACTATGAAAAACATGCC    TTAAATTTTTATACT  95 33
   CLJ_B0786  821069 ..  821097 + -10.4  -4.21343   TAAGGGTGAAGTGAT       GAGGAGCTATCCA GCAA TGGA-GGCTCCTC        TTTCTCTATATTGGG  95 43
   CLJ_B0787  822120 ..  822141 +  -8.1  -4.91511   AAAAAATTATGAGAA           TAGTGACAT ATAG GTGTCACTA            TTTTTGTGATAGAAT  91 13
   CLJ_B0788  823111 ..  823124 +  -2.5  -4.08181   TAAATGATATATTGC               TTATT TTTA AATAA                TTTCATATTATTTTT  51 324
   CLJ_B0789  823891 ..  823921 +  -6.5  -2.84103   TAAATACCTTTTTTA       TATTATAGATATT TGAGT AATATTTATAATA       TCTAATAAATATTTT  61 196
   CLJ_B0796  831571 ..  831582 +    -3  -2.57132   TTGATGATAATGAAA                TTTG TTAT CAAA                 ATTATAAAAAGGAGA  39 172
   CLJ_B0797  831860 ..  831913 + -17.9  -3.14344   GGGAATAAAATTTAT AGAAGTGCACTCAAAATGCTAG-TTA TTT TAATCTAACATTTTGAGTGCACTTCA TTAATACAAACAATC 100 41
   CLJ_B0802  835040 ..  835052 +  -2.7  -2.88579   GTAATGGTCTATAGG                GAATA GAA TGTTC                TCTATAAAACGTTAA  40 192
   CLJ_B0803 NONE
   CLJ_B0804  836973 ..  836989 +  -9.5  -2.75647   AGTAAGTAATTCATA              CCAAATC GTA GATTTGG              GTTCTCTACTTAAAG  75 84
   CLJ_B0805  837177 ..  837206 + -13.1  -5.96219   AGAGCACCAAAAAGA       TGAGTATTTCACT AGAA AGTGAGATACTCA        TTTTTTTTATAAATA 100 4
   CLJ_B0806  838277 ..  838315 +  -8.2  -5.19879   TATTAATGAAACAAA   AAGGTCACATATTGGGTT AAG ATTCCAAAATGTGACCTA   TTTTTGTATTTAGAA  95 54
   CLJ_B0807 NONE
   CLJ_B0808  838963 ..  838981 +   -11  -4.60041   AGAATAATCTAAAAA             GCTCTCAC ATT GTGAGGGC             TTTTTACAACTGAAT 100 34
   CLJ_B0809  839709 ..  839739 +  -8.5  -5.46657   ACTATATTTAAAAAA       GATACTATAGG GATTAATGA CCTATAGTATC       TTTTTTATTAGAATA 100 154
   CLJ_B0810  840629 ..  840644 +  -3.2  -3.20207   TAATATGGGGTTAGG              TTGTGG AAAT CCCCAA               TTAATAGCTAATCTT  46 369
   CLJ_B0812  842480 ..  842492 +  -2.7  -3.15659   AGAAAGGTTCCTTCT                TTTCA TGA TGAAG                TATATGTATTTGCAT  42 478
   CLJ_B0814 NONE
   CLJ_B0815  845072 ..  845095 + -10.4  -5.65177   ATAAAGTTAGATATA          CACTAGGTAC AAAA GTATCTAGTG           TTTTTTTATAGATGT 100 47
   CLJ_B0816 NONE
        thyA NONE
   CLJ_B0818 NONE
   CLJ_B0819  848989 ..  849012 +    -9  -4.82901   ATCATTGAAATTAAA          GGTACTTTTA TTAT TAAAAGTGCC           TTTTTATAGAAGGGA  93 55
      thiD_2  849875 ..  849888 +  -2.5  -2.91322   GTTAAGTTAAAACCC               TTTAT TAGA ATAAA                TGATTTAAAAGCTAT  40 36
   CLJ_B0821  850330 ..  850374 +    -6  -5.10767   GTCTTATAAATAAAA TCTAGTGAAAATTTTAGGTT ATATA AATAAGAAATTTTCACTAGA TTTTTATGTTAAATA  80 84
   CLJ_B0823 NONE
   CLJ_B0824  854007 ..  854025 +  -6.7  -5.48054   TTTAAATAATAAAAA             GTCAGAG AAATC CTCTGGC             TTTTTTAATTTTAAT  88 136
   CLJ_B0825  855048 ..  855066 +  -4.6  -5.29846   CCCTTTAATTTTTTT             ACTTAAGA CTT TCTTAAGG             TTTTTCTTTAGAATT  76 209
   CLJ_B0826 NONE
   CLJ_B0827  857057 ..  857071 +  -3.6  -4.07687   GTAATTTGATGTACA               GGTTAT TTA ATAATC               TTTTAGACAAAACAT  56 46
   CLJ_B0828 NONE
   CLJ_B0829  859313 ..  859348 +  -7.8  -4.42386   AAGAGGTATATTTAA    GTGCTAAAAGTAATAT ATAT ATATGACTTTTAACAC     TTTTATAAGTGGACA  81 376
   CLJ_B0830 NONE
   CLJ_B0831  862138 ..  862162 + -12.3  -4.77079   AGGAAAATGTAAAAA          GCATTCAATCT TTG AGATTGAGTGC          TTTTGTTAATATATC 100 56
   CLJ_B0832 NONE
   CLJ_B0833  866024 ..  866054 +  -8.6  -3.36991   ATTATCTTCTAAATT       TTAATTAGTGTAAA GTT TTTATACTAGTTAA       TCTTTAAAAGTAATA  74 383
   CLJ_B0834  866326 ..  866343 +  -4.9  -5.67063   ATATTTCAATAAAAA             GAACTTA GAAA TAGGTTC              TTTTTTTATACTAAA  84 56
   CLJ_B0835  867316 ..  867326 +  -2.6   -3.6581   AACTGAGGGGGATAA                 TTTT GTT AAAA                 TATTTTAGAAATCCT  47 195
   CLJ_B0836  868607 ..  868617 +    -4  -3.94812   GATATTAAAATTAAA                 TCTA TTT TAGA                 TATTTTTAAGTGAAA  54 52
   CLJ_B0837  869432 ..  869474 + -13.8  -3.78879   ATAGATTAATTTAAA TAGAAGAGGAGCTAACTAAA TGA TTTAATTAGCTCCTTTTTTA TTATATTATGGTATA 100 47
   CLJ_B0839 NONE
   CLJ_B0840 NONE
   CLJ_B0841  873457 ..  873472 +  -6.2  -4.07687   CTGTTCTAATGATTT              CCTAAA TAGT TTTAGG               TTTTAGGGCAGCCCT  68 57
   CLJ_B0843  874833 ..  874847 +  -6.4  -3.51232   AATTACGGCTTAAAA               GGGAGT TAT ACTTCC               TTGGTTTAAAAAAGG  66 50
      dapB_1 NONE
   CLJ_B0845  877314 ..  877337 + -10.4  -4.75288   ATTGTATATACACAA          CACTAGGTAC AAAA GTATCTAGTG           TTTCTTTTAATGTAA 100 209
   CLJ_B0846  878610 ..  878620 +  -2.6  -3.56821   AGAAGTTAAAGTATA                 TAAA GAT TTTA                 TTTAAAAAGTGTGGT  45 131
   CLJ_B0847  879050 ..  879090 +  -5.2  -2.91684   AGTGAATTAAATTTG TAAATTCCAATTTAATATT GAGT AATAT-AAATTAGAATTTA  GTTTAGTAGTTGTAA  51 36
   CLJ_B0848  880660 ..  880677 +  -5.7  -3.03441   TGCAATAAAATGGCA             TGTAAAA ACCA TTTTACA              TATTAAAAAGTAGTG  55 118
   CLJ_B0849  881530 ..  881551 +  -5.9  -3.91911   TGTCTATTCTTTAAA           GAGACAC GATATTAG GTGTCTC            TTTGATTCAGCTAAA  66 190
   CLJ_B0851 NONE
   CLJ_B0852  883364 ..  883402 + -13.5    -3.424   CTAATTCATAGAAAA   TAAATAGGAGTTCTC AAAATAAAA GAGAACTCCTATTTA   TGTATTGTTTTAAAT 100 443
   CLJ_B0853  884934 ..  884963 +  -3.1  -4.68645   ATTATTTAAATTTAG       GGAAATATTT-TAT CTA ATATAAATATTACC       TTTTGATTTTAAATA  60 74
   CLJ_B0854  886405 ..  886436 + -11.6  -3.62522   TAAACAGAGTTCTTG      GCTTCAGAGGGAGT TTTT ACTCCCACTAAAGC       TTATTAACAGAATTC  95 38
        brnQ  888469 ..  888493 +  -8.7  -6.01725   TAATATAATAAAAAA          CACCTTGTTGT AAA ATAATAAGGTG          TTTTTTGTTTTTGTT 100 43
      feoA_1  891636 ..  891651 +    -4  -4.67692   TAAAAAATTAATATA              CTTTGC GGGA GTAAAG               TTTATTTGATTTTAA  62 96
   CLJ_B0858 NONE
      feoB_1  894170 ..  894213 + -20.1  -3.16323   ATATATAAAAAATAA GACCTTTGTTTTAACAAAT AATGAA ATTTGTTAAAACAAAGGTC TTGCTCCAAGATTTT 100 185
        cobC  895070 ..  895081 +    -3  -3.93658   AGATTAGTACTATGT                GAAA GTAG TTTC                 TTCTTTACAGGTCTT  49 40
   CLJ_B0862 NONE
        cobS  897753 ..  897765 +  -3.5  -2.63112   GAAATAACATTTTTA                TTAAT TTT ATTAA                TGATGTAAAAACTTT  43 5
   CLJ_B0864  898824 ..  898857 +  -8.7   -3.1739   TTAAAAATTTTTTAC     CCAGTGGAGGCGCCA TCCG TGGCTTCACCACCGG      TTCCTCACGTCCTGT  75 121
   CLJ_B0865  899414 ..  899426 +  -4.9  -3.53761   TTTAGAAGTTAAAAC                TACTA TTG TAGTA                TTTGAAAAGGAGTTG  56 121
   CLJ_B0866 NONE
   CLJ_B0867  900123 ..  900177 +  -2.4  -4.93333   CATAAAATTAGAAAA TCACTATCAAAATGAATAATGCTATT TTT AGTGTTATTTTAAATTTTGATAGTGA TTTTGTATTTTAATT  61 251
   CLJ_B0868  901790 ..  901835 + -14.3  -3.53444   TTATCCTCATAAAAA ATGAACCCTTCATGTTAGA ACTTTTTA TCTAACATGGAGGGTTCAC TTCATTGTTAAAGCA 100 49
   CLJ_B0869  902427 ..  902439 +  -2.7   -2.8084   AATAATTAAAGTAAA                TTTCA GTT TGAGA                TAGTTCAATGTTTAT  40 60
        folP  903740 ..  903755 +  -3.4  -2.83593   AAAATATAATCAAAA              TTAAAT TATA ATTTAA               ATTGTATCTTCTGGT  43 82
   CLJ_B0871 NONE
        folK  904664 ..  904674 +  -2.6  -3.21668   TAAATATTTCTAGTT                 TATT TTT AATA                 TATTCCTCTAATAAT  42 38
   CLJ_B0873  905277 ..  905304 + -14.4  -4.17132   ATATAATAATATAAA        TTAGTGTAGGAT ATAT ATCCTACACTAA         TTTATTACAAAATTT 100 92
   CLJ_B0874 NONE
   CLJ_B0875  908040 ..  908079 + -13.4  -2.79796   AGTTTAAAATATTTA  TTAAATTATAAGTAAGTA GAAA TATTTACTTATAATTTAA   TGTAATGAAGTAAGC  93 52
   CLJ_B0876  909537 ..  909548 +  -2.2  -4.52703   TATAACTCTTTTAAT                GTCT TTAA AGGC                 TTTTGTAGTAATTTC  54 286
   CLJ_B0877  910461 ..  910474 +  -8.1  -5.12707   TTACGAATTAAAAAA               GCTGC GATA GCAGC                TTTTTTAAAATTTCA  95 289
   CLJ_B0878 NONE
   CLJ_B0879  912403 ..  912434 +  -4.4  -5.27938   GAACAATTACTCAAG      CACCGCATTATTCA AATT TGAATTTTACGGTG       TTTTTGTTTCGCAAT  76 108
        nimA  914501 ..  914550 + -11.5  -2.57211   TTTTCTTTATAAACA GAGGTCTTGGCTTTAGAGGGAGT TTTT ACTCCCACTAAAGCTTAGAAATC GTTATCCAGAGACGT  85 381
   CLJ_B0885  918559 ..  918569 +  -5.4   -3.6106   ATCACTTATCCTAAT                 GCAA GAT TTGC                 TTTGAGGGTATTAGA  59 221
   CLJ_B0886  919980 ..  920011 +  -7.4  -2.87252   CAATACAAACATAAA      GCCTAGCTATTATA TAAG TACAATAGCTAGAC       TAATTAATATTATTG  63 145
   CLJ_B0887 NONE
   CLJ_B0888  921963 ..  922000 + -10.6  -5.87688   ATGTCTTATGTAGAA   TCAGGATAGCTTTGCC TTGATT GGCTGAGCCATCCTGA    TTTTTTTTACCTTCT 100 121
   CLJ_B0892 NONE
   CLJ_B0893 NONE
   CLJ_B0894  925319 ..  925363 + -21.1  -3.63991   TGGAATTCATCGAAC TAATAACCTGGTATAGGCAGT TCT GCTGCCTATACCAAGTTATTA TTCTTGAAAATGCTC 100 23
   CLJ_B0895  926614 ..  926625 +    -3  -5.75538   TCCTTTCTTTACTGG                GAAA TCAA TTTC                 TTTTTCTTTTTTAAG  83 510
   CLJ_B0898  928553 ..  928564 +    -3  -4.24338   TAAAATATCGTATTG                TTCA GAAA TGAA                 TTTTACGATGTTTTT  53 93
        lipA  930315 ..  930342 + -14.4  -5.31275   AATAATAAGATACAA        CTAGCTTATCAT ACTT ATGATAAGCTAG         TTTTTTATACTGAAA 100 49
   CLJ_B0903  933982 ..  933992 +  -5.4  -3.33509   ACCAAGATTAAAATT                 TAGC ATT GCTA                 TTAAATTGTTTAAGG  57 99
   CLJ_B0904  935009 ..  935041 + -10.9  -3.59279   ATAAGTAATATTAAA      TAATCCAAAGATA TCTTAAC TATCTTTGGATTA      TTCATTATTATACTA  95 281
   CLJ_B0906  936641 ..  936660 +  -8.6  -4.99134   TATCATCACTAAAAA            CCACGATA GAAA TGTCGTGG             TTTTTGATTTAACCT  91 135
   CLJ_B0909  939105 ..  939143 +  -6.1  -5.19879   ATCTCACCACAAAAA   TGTGGAGATTTAGCCAG GCTAA TTGGATAAATTCCCACA   TTTTTGTGTTTAAGA  80 219
   CLJ_B0912  941035 ..  941064 +    -3  -5.36965   ATTAGAAGTTAAAAA       TCGCGTAATT AAAGAAAGGA AATTATGCGA        TTTTTTGTAATATTA  67 126
   CLJ_B0913  941656 ..  941682 + -13.2  -5.08824   ATAAATAAATTTAAA         GAGATTTTACCA TTT TGGTAGAATCTC         TTTTTTAGATAGGAA 100 33
   CLJ_B0914  943063 ..  943102 +  -5.2  -2.50195   TAGATAAATAGGAAT  ACTTTTAGTGAAGATTAT TTAT ATATTCTTCACTAAAACA   CTATTAATCATCAAT  50 482
   CLJ_B0916  944148 ..  944180 + -11.5  -3.70983   ATAAAAGATTAAAAG      TAAGCCAATGAGATT AAA AGTATCATTGGCTTA      TGTTATATTTTTTTA  95 109
   CLJ_B0918  946499 ..  946543 +    -8  -5.67063   GAGAAGCATGGTTAT AAAGAAGCTGTCTCAAAATA TATTT TATTCTGAGGCAGCCTCTTG TTTTTTTATAGTAAG 100 24
   CLJ_B0920  947545 ..  947561 +  -8.1  -2.87026   ATTTTTTCTTAGTAC              GACATAA CAT TTATGTC              TATCATATCCATCTA  68 173
   CLJ_B0922 NONE
   CLJ_B0923  949087 ..  949120 + -13.4  -3.35476   GAGTACGATTATAAG     TAAGCCAATGATAC CAATAA GTGTCATTGGCTTA      TGTTATAATTGATTG 100 291
   CLJ_B0924  950046 ..  950065 +  -2.2  -3.78775   TTGGAGATATGTTAC            TATTTTTC AAAG GAGGAATA             TTTGATGATAGACAC  46 77
   CLJ_B0925 NONE
   CLJ_B0926  951556 ..  951587 +  -2.2  -6.04953   TAATGTAATAAAAAA      TAGTGGCACCCAAT TTGT AATAGGAGCTACTA       TTTTTTTATTTCTAT  79 81
   CLJ_B0928 NONE
   CLJ_B0929  955481 ..  955518 + -10.1  -4.66057   CTCGCATTTACCATT   CAGCTCAGAAAATTAAA GTTA TTTGATTTTCTGGGCTA    TTTTAATTTCTATAT 100 69
   CLJ_B0930  956333 ..  956358 +  -2.7  -2.68761   TATAATAATCATAAT         CTTTTGTTATT TTTT AATAATAGAGG          GTATTTCATAATAAT  39 203
   CLJ_B0931 NONE
   CLJ_B0932  957175 ..  957209 +  -7.8  -2.57471   GAAAATTAAAATAGA     GTCAGTACACTGAGAA TTA TCCCCAGTGCACTGGC     CATTTATTTGATACT  65 27
   CLJ_B0941  963410 ..  963422 +    -2  -4.24338   TGAGGGAGAAAATTC                TTCA TGAAT TGAA                TTTTGGGGTGTTTTT  52 19
   CLJ_B0942  964458 ..  964468 +  -5.4  -3.08314   ACATTCTTATACATC                 CGTT AGA AACG                 CTTTTCCCAATTGAA  54 186
   CLJ_B0945  965884 ..  965896 +  -4.8  -3.28405   AGTATATAATATGCA                GGGT GATTA ACCC                TTGATACTGTGTTAT  53 420
   CLJ_B0947 NONE
   CLJ_B0948 NONE
   CLJ_B0949  969340 ..  969352 +  -3.5  -4.48934   TGAGACACCCTCTTT                TATTT TAA AAATA                TATTTTTGTTTTTTA  58 92
   CLJ_B0951 NONE
   CLJ_B0952  973849 ..  973862 +  -2.5  -4.58395   TGAAACAAAATTAAT               TTTAA GGAA TTAAA                TTTTTGAAAAATGAG  57 283
        ilvE NONE
   CLJ_B0954  975913 ..  975940 + -10.8  -5.27335   TAATACAATTTATTA        TAGACTATTAAG TATG CTTAGTAGTCTA         TTTTTCTTTGAAAAA 100 124
   CLJ_B0955  976735 ..  976751 +  -5.3  -3.16177   GGAGATAATATTTTC              TAAAATA GTT TATTTTA              TTAAGTATCTAAAGT  56 68
   CLJ_B0956  977605 ..  977615 +    -4  -3.86935   ATACAAGTGGTTATG                 CAAT GGC ATTG                 TTATTATAATAATTA  54 6
   CLJ_B0957  979352 ..  979390 +   -15   -5.5353   CATAAGTTTATTGAA   CTGCTTTATATTTGTTAT AAT ATAATAAATATAAGGCAG   TTTTTTGTTAGTGTG 100 98
        cobU  980243 ..  980280 +    -8  -5.06735   AAAAGGTCTATAAAA   CCTTAGATTTATCA GAAAGATTAA TGATGAATCTAAGG    TTTTTATAATTTATA  90 102
   CLJ_B0959  981389 ..  981420 +  -6.1    -5.626   ATTAATCTAAAAAAA      TAGATATATTTGT ATATGA ACTAATATATCTA       TTTTTTTGTGCAATG  85 40
   CLJ_B0963  982883 ..  982912 + -15.3   -5.0916   ATTTTTAACAATGCA       TTGGCTATAAACT CTAA AGTTTATAGCCAA        TTTTTATATTGAAAA 100 16
        cobQ NONE
        cobD  985405 ..  985421 +  -6.7  -2.64679   CTTTTATTTAAAATA              TAAAGAA TAG TTCTTTA              ATCTTTAAAATTAAT  60 23
   CLJ_B0966  986878 ..  986892 +  -2.2  -4.13767   TTAAAAGAAATAAAT               TAGAAT TAA ATTTTA               TTTTAAGATAAGAAG  50 23
        cbiM NONE
        cbiN NONE
        cbiQ  988733 ..  988743 +  -2.6  -5.08824   TTATTTTAATACTAT                 TATT AGT AATA                 TTTTTTAAATAAAAA  62 3
   CLJ_B0970 NONE
        hemC  990668 ..  990678 +    -4  -3.86194   GTTTGTTTATAGGAA                 CTTT ATA AAAG                 TTTATAAAGAGGATT  54 104
   CLJ_B0972  992464 ..  992480 +  -5.3  -3.29144   ACTATGTCAGAAAAA              TATAATT ATT AATTATA              TTGTGGGGGGGATGA  56 137
   CLJ_B0973  992885 ..  992898 +  -3.1  -4.56914   CAAACAGAATTCTTG               GTTTC AGAG GAAGC                TTTTACTTTCACTAA  60 226
        hemB  994330 ..  994366 + -14.7  -2.90238   TATATAAAATGATGA    GAGTTGAGTTTTTTCAT CTC ATGAAAAAGCTCCACTC    TGTACTCTGTACTCT 100 312
        cobB NONE
   CLJ_B0976  996315 ..  996328 +  -2.5  -4.65153   ACAATAATTTTGTTT               TTTAT TTAA ATAAA                TTTTAATTTATATGA  57 17
        cbiC  997225 ..  997235 +  -2.6  -3.74749   ACACTAAAAGATTAT                 TTTT GAG AAAA                 TTTGAGATTTGTGAT  47 235
   CLJ_B0980  999420 ..  999431 +    -3  -3.11559   AATTAAAAAGAATGG                TTTC TAAA GAAA                 TATTGACATTCTAGT  41 61
   CLJ_B0981 NONE
   CLJ_B0982 1001124 .. 1001140 +  -5.3  -2.92175   GAAAATAACATATCC              TAATATT GTT AATATTA              TATAATATCTTGGGA  54 90
   CLJ_B0983 NONE
   CLJ_B0984 NONE
   CLJ_B0985 NONE
        cbiD 1003953 .. 1003973 +  -5.6  -3.14051   TGGGAAGAGGAATAC            TTTATTCT TCTAT AGAATAAA            TGTTAATGAAGCTAC  56 6
        cbiE 1004804 .. 1004823 +    -3  -3.84266   TATATAAAAGTTAAG            TTTTAAAT GAAT GTTTAAAA             TTTAATATAGGATGT  49 20
   CLJ_B0988 NONE
        cbiT NONE
   CLJ_B0990 1006316 .. 1006331 +  -2.6  -5.36965   TATTGTTTCTTTGAG              TATAGC TCTA GTTATA               TTTTTTCTAATATTA  67 164
   CLJ_B0991 1006920 .. 1006943 +  -4.8  -3.91897   CTTAAAAGGGAAAAG          TAATTATAAA ATTT TTTATAATTG           TTTATAAATAAGGCA  60 63
   CLJ_B0992 1007517 .. 1007533 +  -2.3  -4.08394   AACAATAGTAATTTT              GTATTAA TTA TTAAAAC              TTTTAGGAGGAATAT  50 50
   CLJ_B0993 1007896 .. 1007907 +    -3  -2.59564   GGAAACAAAATAGAT                GAAA TTTT TTTC                 GTTATGGCGTAAAAG  39 28
   CLJ_B0994 NONE
   CLJ_B0995 1008999 .. 1009018 +  -2.3  -2.80016   AATACTTAAAATTAA            TTTATAT GAAGAA ATATAAA             TCATTGATACTAAGG  39 72
        cobI 1009906 .. 1009921 +  -3.2  -3.73775   ATAAACAGAGTTCTT              GGCTTC AGAG GGAGTC               TTTACTCCCACTAAA  50 172
        cobM 1010933 .. 1010943 +    -4  -2.91144   GGTAGAGAATTAAAA                 TCTT AAT AAGA                 TAATTTAGAACATGA  45 146
   CLJ_B0998 1012255 .. 1012276 +  -3.1   -3.7948   CTATAACTTTTAAAT           TTATTTAAG TTAT CATAAATAA            TTTAATAAGTGTTAA  50 35
        cobJ NONE
        cobK 1014103 .. 1014115 +  -3.5  -4.13945   ATTATAAATCTTGAT                TAATT TAA AATTA                TTTTAAAATAAACAT  54 202
   CLJ_B1001 NONE
   CLJ_B1002 1014884 .. 1014898 +  -4.4  -3.33009   AAAATATATAAATTG               TATATT GAA AATATA               TTATAAAAAGTTTTA  53 78
        cbiK NONE
   CLJ_B1004 1016633 .. 1016646 +  -2.5  -4.30576   AATGTTGAGGAGATA               TAAAT ATAT ATTTA                TTTTAATACTGCAAA  53 23
        cobO NONE
   CLJ_B1006 1018239 .. 1018260 + -10.3  -6.09196   CAAAATTTTTTAAAG           GTATGTGAT TTTT ATCACATAC            TTTTTTTATTTTACA 100 18
   CLJ_B1007 NONE
        asrA NONE
        asrB NONE
        arsC 1021964 .. 1021998 +  -9.6  -5.46706   TAATAAATGTAAAAA     GTAATGAATTTCAA TAGATGT TTGAAATTCATTGC     TTTTTGTTTTGAAAT 100 69
   CLJ_B1011 1023307 .. 1023357 +  -2.4  -4.85782   AGCTAATTAATATAT TTAAGAATAACTAGGTA--ACAGTG TTAT TGCTGTAGTACCTAGTTATT-TTAA TTTATTTTTAAGCAG  59 44
   CLJ_B1012 NONE
   CLJ_B1013 NONE
   CLJ_B1014 1027214 .. 1027232 +  -3.9  -5.61824   CTACTAAAGCTTATT             TACATGT TTGTT ACGTGTA             TTTTTTTGCCTTTTC  75 258
   CLJ_B1015 NONE
   CLJ_B1016 1029869 .. 1029883 +  -5.7  -2.53759   ACTGCTCCACAGGAC               GTGTC ATCAG GACAC               TAGATTAAAACTATT  52 130
   CLJ_B1023 NONE
   CLJ_B1024 1039346 .. 1039362 +  -3.7  -3.13073   ATATTTAGTAGGGTT              GTGTAAT TGT AATACAC              TCTCTTGCTAAGGAT  48 141
   CLJ_B1025 1040013 .. 1040029 +  -3.8  -3.88971   ACATATAAATTTCCA              GAAAAA AATAG TTTTTC              TTGTGTTCTTGTGTA  54 62
   CLJ_B1026 NONE
   CLJ_B1027 NONE
   CLJ_B1028 1042482 .. 1042507 + -12.1  -5.27779   ATAATATTTATATTA         GCTTTATGATT AAAA AATCATAAAGC          TTTTTTAATATTGAC 100 119
   CLJ_B1029 NONE
   CLJ_B1030 1044036 .. 1044049 +  -2.5  -4.77983   AAATGTAAATAAAAG               TTTAT ATTT ATAAA                TTTTGTTCATATATT  59 70
   CLJ_B1036 NONE
   CLJ_B1037 1055129 .. 1055139 +  -2.6  -4.16284   TAAGGATGTTACCAT                 TTTA AGG TAAA                 TTTATTACAGCCTAT  51 38
   CLJ_B1039 1056982 .. 1057006 +  -2.9  -3.10134   TTATAGGTGCCATAA          TTACATCTATA AAA TGTAGGTGAAA          ATTTTAAAATACTTT  41 3
        recQ NONE
   CLJ_B1041 1059969 .. 1060007 +   -17  -2.80345   AAATATTTACTAAAA   GAGGGTGTATCAAAATAA ATT TAATTTTGATGCACCCTC   TAAATTTTATACGAT 100 73
   CLJ_B1043 1061785 .. 1061831 +   -12  -4.32402   AAGTAACCTATAATA TACACCTTTCAT-ATAATGCT GTTAAA AGCACTATAATGAAAGGTGTA TTATTTTGATTGAAA 100 88
   CLJ_B1044 1064482 .. 1064504 +  -5.1  -3.17982   TTCATAGCCTATTAA           TAATTTATA AAATA TATAAATTA           TTAATACAAATTTCT  53 196
   CLJ_B1045 NONE
   CLJ_B1046 NONE
   CLJ_B1047 NONE
   CLJ_B1048 1068009 .. 1068025 +  -2.3  -2.76225   GATTTTTAAAGGAGG              TATAAAC TAT GTCTATA              TCATTAGCATTAGTT  39 32
   CLJ_B1049 1068852 .. 1068876 +  -8.8   -5.6473   ATTTTTATAAGAAGA          TATACACAAA ATAAA TTTGTGTATA          TTTTTTTGCTATTGT 100 90
        lctP NONE
   CLJ_B1051 NONE
   CLJ_B1052 NONE
   CLJ_B1053 NONE
   CLJ_B1054 1075646 .. 1075688 + -15.2  -5.76237   TTTTTAAGTGAAAAA TGGAGAAGCGCATGAATA TTTTTTT TATTCATGTGTTTCTCCA TTTTTTATTTGTATG 100 53
   CLJ_B1055 1076031 .. 1076053 +  -5.6   -5.1287   AGAATTCAAACTAGT           TATGTCTTTG TTT CGAAGACAAA           TTTTTTCAATATAGA  78 49
   CLJ_B1056 1077072 .. 1077097 +  -3.3  -5.48063   ATTTATTTATAAAAA         GCTATTTGAAT TATT ATTCTTATAGC          TTTTTTCTATTACAT  73 42
   CLJ_B1057 NONE
   CLJ_B1058 1078315 .. 1078346 +  -7.4  -3.65068   TGATAGGATTAAAAA      CCGCCAATTAAC CCTTAATA GTTAATTAGCGG       TTGTACTATTTTTAT  68 75
   CLJ_B1061 1081979 .. 1082009 +  -2.1  -2.65815   CAAGCTGTTTAAAAA       TATTAAATTAATT AGCTA AATGAATTTGATA       TAATCTAAATATGCA  38 233
   CLJ_B1062 1082901 .. 1082917 +  -5.1  -3.09897   TAAATAAATCTTGAC              ACTCTAG TAA CTAGAGA              CTTTATAATTTATAA  52 27
   CLJ_B1063 1083878 .. 1083918 +   -23  -3.07895   TAGATATAAGTACAA  GCATAAAGAGATTAGGGT ATATA ACCCTAATCTCTTTATGC  TATATTGAAGATGCA 100 91
   CLJ_B1065 1087414 .. 1087455 + -10.6  -5.04733   GAATAAGGAAGTCTG TATAGAAGTAGAATCTTTA AATAA TAGAGATTCTACTTCT-TA TTTTGTTTATAATTA 100 492
   CLJ_B1066 NONE
   CLJ_B1067 1088826 .. 1088838 +  -4.9  -3.93262   AATGATCTTTTGTAT                TAGTT GCA AACTA                TTTAAGTTTATTGGA  60 68
   CLJ_B1068 NONE
   CLJ_B1069 1090223 .. 1090246 +  -9.6  -3.37057   GAAAGAATGTAAAGA          TAAAGGGGCG GTCG CTCCCCTTTA           TTAATCTATATCTAT  82 85
   CLJ_B1071 1092045 .. 1092062 +  -5.7   -2.5055   AATCCAATAAAGAAT             TTCAATA ATAT TATTGAA              GTATGTTATAAAATA  52 117
   CLJ_B1073 1093934 .. 1093949 +  -4.8  -3.52187   TTCATTTAAATATTA              TAGAAT TAGG ATTCTA               CTTTCTTTATTTTCT  56 63
   CLJ_B1074 1094801 .. 1094832 + -17.4  -3.62522   TAAACAGAGTTCTTG      GCTTCAGAGGGAGT TTTT ACTCCCACTGAAGC       TTATTAACAGACTTC 100 38
      feoA_2 NONE
      feoB_2 NONE
   CLJ_B1078 1098186 .. 1098235 +  -5.4  -5.70522   ATAAAAAATAAAAAA GAATCTATTTTTCAAGTGCTTAGC TTTA GCAAA-TACTTGAAGA-TAGATTC TTTTTTATTGTTCTT  86 37
   CLJ_B1080 NONE
         tlp 1100825 .. 1100839 +  -4.4  -3.29973   ATGGATATATGTAAT               TTTTTA TAA TAAAAA               TTAGTAGCTTTTTAC  53 27
   CLJ_B1082 NONE
   CLJ_B1083 NONE
   CLJ_B1084 1103406 .. 1103419 +  -2.5  -3.62597   TAGAGGAGTACTATA               TATTT TGGA AAATA                TTATTCAGAAATAAG  45 190
   CLJ_B1085 1103678 .. 1103694 +  -8.1  -3.72905   TTATTATCTCAGCAA              TATTCAC ACT GTGAATA              ATTTTTTAGTATGGT  76 115
   CLJ_B1086 1103842 .. 1103854 +  -4.9  -3.68366   TACATTTTACTAATT                CATAT AGT ATATG                TTAATTTTACAATAA  58 28
   CLJ_B1087 1105457 .. 1105482 +  -6.2  -6.09196   AAGATAGATAAAAAA         GAGAAGGGTA ATATTG TACACTTCTC          TTTTTTTATTTTAAG  95 330
   CLJ_B1089 1108075 .. 1108091 +  -5.9   -4.2704   TTATATATAGTTAAC              CATCTAT TAT ATAGGTG              TTTATTAATGGTGAG  70 50
   CLJ_B1090 1108625 .. 1108648 + -12.6    -4.371   AATTATATACTTAAA          TAGCTAGAGA TTAA TCTCTAGCTA           TTTTGATATAATAAA 100 44
   CLJ_B1091 NONE
   CLJ_B1092 1111214 .. 1111248 + -10.2  -3.46008   AGTTATAAATAAAAA     GGGAGTTTCAAAATTA GAT TTATTTTGAGACTTCC     TCTTAATTTTATGGT  87 266
   CLJ_B1095 NONE
   CLJ_B1096 NONE
   CLJ_B1097 1115838 .. 1115848 +    -4  -3.25009   AAAGATATAGAGGAC                 CAAA GAA TTTG                 TATATATTTCTAATT  48 2
   CLJ_B1098 1116882 .. 1116895 +  -3.9  -2.82933   ATCAAGTAGTGAAAG               CTTAT AGAT ATAAG                TGTAATAGATTAGAA  45 32
   CLJ_B1099 NONE
   CLJ_B1100 1118191 .. 1118221 +   -10   -5.3236   AGCTATAGAGAAAAA       CCTATAATTGAT AATAGAA ATCAATTATAGG       TTTTTTATAAATTAT 100 138
   CLJ_B1101 1119524 .. 1119545 +  -3.8  -5.08255   ATACCATGGTTATTT           TTATCAGT TTTTGT GCTGATAA            TTTTATTTTCAGCAT  70 338
   CLJ_B1105 1123238 .. 1123257 +  -4.4  -3.73224   TGATTATAATGAAAA            GTAAATTT TAAT GAATTTAC             TTTAATCACAAATCA  56 287
   CLJ_B1106 1123935 .. 1123948 +  -3.1  -2.94313   GTTGAACTATTATCA               GCAGA TGAT TTTGC                TAATTCTTCGGCTAT  45 405
   CLJ_B1108 1128012 .. 1128044 + -13.7   -4.4572   ATTGTTAATATAAAA      TAAAGTGCGTCTTTT ATA AAAGGACGTACTTTA      TTTGTTTAAAATGTT 100 145
   CLJ_B1109 1130381 .. 1130394 +  -2.5  -5.48054   AAAATTTAAGATAAC               TAATA AAAT TATTA                TTTTTTAATTTTAAT  70 98
   CLJ_B1110 1131563 .. 1131596 + -11.2  -4.75289   TAAATAATAACACAG     TAGTGCTAAAGGTC AAATAG GAACTTTAGCACTA      TTTTATATTATACTC 100 101
   CLJ_B1111 1132645 .. 1132658 +  -2.5  -2.90723   TCTTCATTTTTCTCA               TTTAA AAAG TTAAA                TATAATTCCACCTAC  42 434
   CLJ_B1115 1138350 .. 1138383 + -13.5  -5.06414   TAGAAGATGTAAAAA     TAGAGATATGGAATT TTAA AATTCTATATCTCTA      TTTTTATTGAAAAGC 100 49
   CLJ_B1116 1139044 .. 1139056 +  -3.5  -3.89607   AGATTCGGGTTGAGT                TTATT TTG AATAA                TTACTTTTTGTGGTA  52 166
   CLJ_B1117 1140132 .. 1140180 + -17.2  -4.61873   AGGCAGAGATATTGA GAGCCTTAATTTAAAACGGG-AT TATT ATACCCATTTTAAATTAAGGCTC TTTTGATTTATAAGG 100 157
   CLJ_B1118 1141619 .. 1141641 +  -2.1  -2.50291   GGAAATTCAAAAATA           TTATATTAG AAAAA CTAATTTAA           ATTAATGAGGTAATT  38 17
   CLJ_B1119 NONE
   CLJ_B1120 1143315 .. 1143355 + -20.9  -2.79574   TGTAAAAATTAAATA  TCAATAAGGATAGCTAATA TAA TATTAGCTATCCTTATTGG  TGGTTAATAAATATC 100 29
        glpT 1145123 .. 1145146 + -15.4  -5.43414   GGTACCGCGGATAAT          CCGTCTCTGT TTTT ACAGAGACGG           TTTTTTATATATAAT 100 411
        argS 1147262 .. 1147280 +  -2.5   -5.5762   CTACTAAAGCTTATT             TATATGT TTATT ACATGTA             TTTTTTATCTTTGCT  70 278
        arcT 1148864 .. 1148881 +  -5.7  -3.86194   TTCATAAAACTATTT             TCATATA TAAA TATATGA              TTTATGGAGGGAATT  62 278
   CLJ_B1124 1149321 .. 1149363 +  -5.1  -5.88197   GCTACGATAAAAATA CACTTAATGAACTAATT CATTTTGCT AAGAAGTTCATTAAGTG TTTTTTTATCTTTGC  88 66
   CLJ_B1128 1152491 .. 1152513 + -10.7  -4.84311   TTAATTAAAATAAAA           GAAAAAGGG TTAAC CCCTTTTTC           TTTTGTTATATAAAG 100 122
   CLJ_B1129 1153408 .. 1153435 +   -13   -2.9676   ATATATGTTAAAAAG        TGCACAATTTTA ATTT TAAAATTGTGCA         TAAATTTTTTGTCGT  93 100
   CLJ_B1130 1155410 .. 1155447 + -11.5  -4.65263   ATAAATTTTTCAAGA   GTATTGGGTTAGAGGTA TATT TCTCTCTAATCCAATAC    TTTATTTTAACCAAT 100 67
   CLJ_B1131 1156434 .. 1156459 +  -9.1  -6.17669   AAAATTTCGCTTATT         AAAGCTAGAGA TTTT TCTCTAGCTTA          TTTTTTTATTTTATT 100 212
   CLJ_B1133 NONE
   CLJ_B1134 1158141 .. 1158161 +  -2.7  -4.07885   CATCATATAAAAATT            TTTAAAAAA TAT TATTTTAAA            TTTTAGGAGGAGCTA  51 42
   CLJ_B1135 1158971 .. 1158986 +  -3.3  -4.52266   TGAAAAATACAAAGG              TGTTG TAATTC CAACA               TTTTAGTATTTAATT  58 4
   CLJ_B1136 1160115 .. 1160125 +    -4  -3.35774   TTGATATAATTATAT                 TTCA AAA TGAA                 TTATGCAAATTTCTC  49 147
   CLJ_B1137 1161519 .. 1161537 +  -7.6   -2.6563   AAGAGTTTTTAATCT             TGAAAATT AAA AATTTTCA             TAACTTCTTACAGGA  65 156
   CLJ_B1138 1162578 .. 1162623 + -17.5  -3.73509   ACAACCTGGAACAAA TTTATAAACTAAGGAAAGTGTA GAT TA-ACTTTCCTTAGTTTATAAA TTTAGAATTTGATAT 100 14
   CLJ_B1140 1164090 .. 1164104 +  -3.6  -4.13014   AATATGGGTTAATTA               TTACTG ATA TAGTAA               TTTTAACAATATAAA  56 130
   CLJ_B1141 1165194 .. 1165204 +  -2.6  -3.22491   TATATTGATTAAAAG                 TTAA TAG TTAA                 TTACTAGTACAATTT  42 135
   CLJ_B1142 1165660 .. 1165681 + -11.7  -5.17744   ATAGAAAAAATAAAA           TCTCAGCTA TAAT TAGCTGAGA            TTTTTCTTAGTGTAT 100 165
       gap_2 1168774 .. 1168817 +    -9  -4.94262   AAAATAAGATTAAAA GAGACTATCTCAGAATAAAT TTAA ATCTATTCTGAGACGGCCTC TTTCTTTTTAATATA 100 171
   CLJ_B1146 NONE
   CLJ_B1147 NONE
   CLJ_B1148 1173130 .. 1173145 +    -9  -5.35815   AATATAAATAAAAAA              GTCAGG ATTT CCTGAC               TTTTTATTTAGTGTA 100 51
   CLJ_B1151 NONE
   CLJ_B1152 1178863 .. 1178896 +  -8.4  -4.88388   GAACTTATAATTAAA     GCTTAGAGATAATT TTGATT AGTTATTTCTAAGC      TTTTTATAAGGTTCT  88 84
   CLJ_B1153 1179807 .. 1179836 +  -8.1  -2.76227   GATAAGAATAATAAG       TAAAATCTATGAT AGAA ATCATAGCTTTTA        TAAATTTATGTTAAA  69 64
   CLJ_B1154 1180979 .. 1181013 + -17.6  -3.71148   TAGATTAAAAGTAAA     TAGCTGATTTAAATTA TTG TAATTTAAATCAGCTA     TTTAAGTAGATTTTA 100 160
   CLJ_B1155 NONE
   CLJ_B1156 NONE
   CLJ_B1157 NONE
   CLJ_B1158 NONE
   CLJ_B1159 NONE
   CLJ_B1160 NONE
   CLJ_B1161 1187937 .. 1187950 +  -2.3   -4.9792   TTATTTTGAAACATT               CCCTT TTAG GGGGG                TTTTTATGTGGGCTA  61 81
   CLJ_B1162 NONE
   CLJ_B1163 1188958 .. 1188968 +    -4  -3.31175   CATTATATTTAGTAA                 TCTA AAA TAGA                 GTTTTATAATATATG  49 152
   CLJ_B1164 NONE
         maa 1189915 .. 1189962 +  -8.9  -5.62288   ACTAAGTAGGAATAG TAATGACTTCAGTAAGTT-TAT ACAAA ATAAAACTTGCTAAAGTCATTA TTTTTATTTTATTAA 100 267
   CLJ_B1167 1191597 .. 1191619 +  -6.4  -3.98649   CTAAAGTTGAATATG           TTTTAAGAGA TAA TCACTTAAAA           TTATTATATGTTATA  69 52
   CLJ_B1168 1192273 .. 1192298 +  -9.8  -4.52502   TATTATAATAAAAGA         GGGCAAGAGT TAAAAT ACTCTTGCTC          TTCTTTATTTTTAGA 100 13
   CLJ_B1169 1193914 .. 1193952 +  -9.8  -3.54048   GTTTTTAGTGATAAA   GAGGGCGTTTCAAAAT TAAATAT ATTTTGAAACACCTTC   CTTTTATTATCTTAT  89 61
   CLJ_B1171 1195551 .. 1195583 +    -5  -5.72622   TTAGGTTTAAGAAAA      GTTGCTAATGAT TATTAAAGT ATCTTTAGCAAC      TTTTTTATTTATACA  84 53
        mgtE 1197419 .. 1197461 + -25.4  -3.81473   AAATATTAGAAAAAA TAAGCATAGGTATGTTTAAG ACA CTTAAACATACCTATGCTTA TTTAAATATATTTTT 100 86
   CLJ_B1173 1199630 .. 1199641 +  -5.8  -3.18571   TACAAAGAAAATTAA                TGGG ATTA CCCA                 TATATATTTGAAAGG  56 214
   CLJ_B1174 NONE
   CLJ_B1175 1202122 .. 1202157 +  -4.2  -3.04248   GAATAAGGTAAGGTA    TTAATTTTGAATACTT CACA AAGTATTCAAGAAGAA     TATTGAAAAATCTTA  50 231
   CLJ_B1176 NONE
   CLJ_B1177 1208661 .. 1208671 +  -6.8  -3.81651   ATAACAACAAAGAAA                 GCTG TTT CAGC                 TCTTTTAATTGCAGT  69 469
   CLJ_B1179 NONE
   CLJ_B1180 1211417 .. 1211445 +  -6.8  -5.08086   ATATTATTTTTTTAG        GCTGTTGATAAA CATAT TTTGTCAGCGGC        TTTTGTATTTTTTAT  80 58
   CLJ_B1181 1212314 .. 1212324 +  -3.2  -3.07332   ATCATTAATATTTAT                 GGAG CTT TTCC                 TAATTTAGTTTAAAT  45 96
   CLJ_B1182 NONE
   CLJ_B1183 1213373 .. 1213384 +  -4.4  -2.71967   ATAATTATTTTTCGA                CCTA TGAT TAGG                 GGTTATTTTTTTTAA  48 145
   CLJ_B1184 1213784 .. 1213794 +  -2.6   -3.5221   AAGTTCATTGAAAGA                 TTAA GAA TTAA                 ATTTTTAGCTTTTAT  45 78
   CLJ_B1185 1214923 .. 1214935 +  -3.5  -3.75665   ACTGACATTACAATT                TATAA TAA TTATA                TTTAATACAGTATAC  50 128
       xpt_2 1215723 .. 1215762 + -11.2  -4.41895   ATAGTAAGATAAAAA  TTTAAAGTTATAGTTATT ATTA AATAATTATAACTTTGAA   TTTTAATTGGAAATT 100 195
   CLJ_B1187 1216606 .. 1216635 +  -6.7  -5.79595   TCAACCTATAAGCTT       TAGTTATAGTTGA TGAT TTAACTATAATTA        TTTTTTATTTTAAAA  90 199
   CLJ_B1188 NONE
   CLJ_B1189 1218758 .. 1218789 +  -3.1  -4.77775   AAGTTGTTAATAATT      TAAGCCAGTGG AGTTTTTTTG CTATTGGCTTA       TTTATTTTATAAAAT  63 52
   CLJ_B1190 1220406 .. 1220441 +    -2   -5.8187   AAAGTTAATAAAAAA    TATATCCTAGGAAATA TAAT TAATTTATGGGATATA     TTTTTTTATTAGCTA  76 253
   CLJ_B1191 NONE
   CLJ_B1192 1222779 .. 1222797 +  -4.6  -4.79667   ACCAAAGATAAAAAA             CATTAATG AAC CATTCATG             TTTTTAATAAGTTTT  68 58
   CLJ_B1193 1223662 .. 1223711 +  -3.3  -4.90002   AGAGAAGCTTTAAAA TAAAAATAAACATTCAT-AAATAA ACA TAGTGTCGTGAATGTTTATTTTTA TTTTATTGTATATTA  63 28
   CLJ_B1194 1225157 .. 1225181 +  -7.9  -5.89827   TAAATTTATAAAAAA          GATTGTTGCAC TTT GTGTAGCAGTC          TTTTTTTTCCTACTT 100 142
   CLJ_B1195 NONE
   CLJ_B1196 NONE
   CLJ_B1197 1229072 .. 1229114 +  -9.5  -4.89063   TTTTTAAATTAAAAA GGATTTATTGCTAAGGAATA TTTT TA-TACTTAGCAGTAAATCC TTTGTTTTTACATGA  95 29
   CLJ_B1199 NONE
   CLJ_B1200 1232820 .. 1232836 +  -5.3  -3.69297   TGATTTGGCTATACT              TTTTATT TTA AATAAAA              TTATATATAATTTTT  61 111
        rpsA 1234313 .. 1234351 +  -8.5  -3.66117   TAATTTAAGCGATAT  GCATTACTAAAACACT TGTATAAT AG-GTTTTAGTAATGC   TATTTATATAGTTAC  76 58
   CLJ_B1202 1234899 .. 1234909 +  -2.6  -4.87133   TTATTATAAAAATGA                 TTTA TGG TAAA                 TTTTGTTTCAAAAAT  59 42
   CLJ_B1203 1235731 .. 1235767 +    -7  -2.92157   TGTTATTATTCTTAA   CTATAAGATTAAAGCATC ATA GAT-CTTTAATC-TATAG   TATCTAAAATTGGTA  63 286
   CLJ_B1204 NONE
   CLJ_B1205 NONE
   CLJ_B1206 1239078 .. 1239095 +  -9.1  -4.49316   ATTCATCTATAATAG             GCAGCTC TTAG GGGCTGC              TTTATTATTGCTGCT  86 99
   CLJ_B1207 1241358 .. 1241408 +   -11  -4.14511   TAATAGAGAAAATTT CAAAATAGATTTAATTTTAATATT TGT GGTGTTAAAATTAAATCTATTTTA TTTTAAAATAAGCTT 100 63
   CLJ_B1209 NONE
   CLJ_B1210 1245218 .. 1245230 +  -6.3  -3.37974   TAACCTAAGGTATAG                TTTGC TTA GCAAA                ATTATTTTTATTCAT  61 412
        panE 1246442 .. 1246460 +    -4   -2.5294   AATATAATATAAAAA             TAATGTAT AAT ATATATTA             GTATTATAGAAAGTG  44 233
   CLJ_B1212 NONE
        folD 1248042 .. 1248083 +   -14  -5.22006   TTAAAAGTAAAAAGT AAAGCCTGTATCCTATGT TAGTTT ATATAGGATACAGGCTTA  TTTTTCTTATAATAA 100 50
   CLJ_B1214 1249202 .. 1249247 + -10.8  -2.94532   AAAATTTAATAACTA TAAATAAACACTATCAAAAC CTATTA GAATTGATAGTGTTTATTTA CTTTAATCTAATTTT  85 90
   CLJ_B1216 1250209 .. 1250231 +  -3.4  -4.89521   ATGAAAAATAATTAA           CCTGCTGA CTTATTT TCAGTGGG           TTTTATTTAACATAT  63 41
   CLJ_B1217 1251116 .. 1251130 +  -2.2  -4.42806   TAAGAAATTATCAAG               TAATAA TTA TTATTG               TTTATTTGAAACTAG  54 93
   CLJ_B1218 1251983 .. 1252014 +   -16  -3.62522   TAAACAGAGTTTTTG      GCTTCAGAGGGAGT TTTT AATCCCTCTGAAGC       TTATTAACAGACTTC 100 38
   CLJ_B1219 1253197 .. 1253210 +  -2.5  -5.04222   AAAGTAAATCTAATA               TTTTA TAAA TAAAA                TTTTTACTTTACTTA  62 146
      cysK_2 NONE
   CLJ_B1221 1255046 .. 1255060 +  -4.4  -3.27923   AGAATAGGAAAAGCT               TATTAA AAT TTAATA               TTAATAGTATTAGGA  51 20
   CLJ_B1222 NONE
   CLJ_B1223 1257190 .. 1257221 +   -16  -3.62522   TAAACAGAGTTCTTG      GCTTCAGAGGGAGT TTTT ACTCCCTCTAAAGC       TTATTAACAGAATTC 100 70
   CLJ_B1224 NONE
   CLJ_B1225 NONE
        mnmA 1259777 .. 1259811 + -16.1  -5.31519   AGTAAAGAAATAAAA     GAGATTCTCAAAATA AAATC TATTTTGAGAATCTC     TTTTTATTTAAATAT 100 36
   CLJ_B1227 1260297 .. 1260314 +  -2.1  -5.07011   AAATATATAAATATA             TTTAGAT TAAA ATTTAAA              TTTTTACTTTATATA  61 221
   CLJ_B1228 1261159 .. 1261175 +  -2.3  -2.50791   GATATATGAGGGGAC              TAATAGT ATG ACTTTTA              CTAATTTTATAAATA  38 15
   CLJ_B1229 1262644 .. 1262688 + -21.2  -4.08394   ATATCTTAATCAAAG GGCACTTGCAAATATTAGAT TTTTT ATTTAATATTTGCAAGTGCC TTTTAAAAAGAGTGT 100 160
        bcrA NONE
   CLJ_B1231 1264594 .. 1264645 +  -3.8  -4.66057   TTTTTAATGAAATAT GTTAAGAAGAAAAAGTGCTAATCT TGTG AGGATGGCGCATTTTTTTCTTTGC TTTTAATTTCTATAT  62 79
   CLJ_B1232 1267014 .. 1267036 +  -2.8  -4.19276   TTTACAAAGTTGTAG           CATTATTTAA TGA TTAGATAAAG           TTTTAAAACTTTTGA  51 9
   CLJ_B1233 1267542 .. 1267570 +  -9.8  -5.05505   GATACTAACCAAAAA       TAGAAGGG-AACT TATA AGTTTCCCTTCTA        TTTTTGATTTATACT 100 23
   CLJ_B1235 1271952 .. 1271993 + -19.9  -4.38313   TTTAATTTTCATTTA TAACCCAATGTAGGTAATA ACAT TATTACTTACATTGGGTTA  TTTTAAATTTCATAT 100 36
   CLJ_B1236 1273724 .. 1273758 + -14.6  -4.53303   GGACTTAATACAAAA     TGAGCTAGTAAAATAT GTT AAATTTTACTAGCTCA     TTTTATATAAAAATA 100 33
   CLJ_B1237 1276036 .. 1276069 +  -9.2  -4.06148   TATAAAGATTAGAAA     TAAAGAAGTATATT TTATTT AATATGCTTCTTTA      TTTATCTAGCATATT  86 29
   CLJ_B1240 1279709 .. 1279730 +  -7.2  -4.62336   GAATAATTATTAAGA           GGATGCCC GGATAA GGGCTTCC            TTTTTCAAATAAGCT  79 35
   CLJ_B1241 NONE
   CLJ_B1242 1282562 .. 1282593 +   -12  -3.23853   TCAAAATAATTTAAA      TAAGTTATAAATAT TATA ATATTTATAACTTA       TCTTAATTAAGAAAG  93 435
   CLJ_B1243 1284825 .. 1284854 + -12.3  -5.22039   CCACGTGAGTATAAC       TCCCGTCCTCTAGT TAA GCTAGAG-ACGGGA       TTTTTTGCATTTAAA 100 413
      tyrS_1 1286351 .. 1286378 +  -8.7  -5.63504   AATAATATTTAAAAA        CATTATCATTT AATTTA AAATGATAATG         TTTTTTTATGAGATT 100 92
   CLJ_B1245 NONE
   CLJ_B1246 NONE
   CLJ_B1247 1288624 .. 1288664 +   -10  -5.21709   TGTAAAATAAATAAA TTTAAGCTTCAAG-GGAGT TAAA ACTCTACTAGAAGCTTAAA  TTTTTTGGTATAAAA 100 92
   CLJ_B1249 NONE
   CLJ_B1250 1290314 .. 1290354 + -17.3  -4.62471   ATAATAAATAATGCT  TAAGATAATTTAGGAGAAA GGA TTTCTCCTAAATTATCTAA  TTTTATATGTGGATT 100 68
   CLJ_B1251 1293341 .. 1293356 +  -4.8  -2.58731   TACAAAAAAACATTA              TTTCTT TATA AAGAAA               GTGTTAATTATATAA  50 15
   CLJ_B1252 1294964 .. 1294982 +   -11  -3.00544   TAATTTAACTAGTAA             CCCAGTAC ATG GTGCTGGG             TCTCTCATAATTTTA  87 46
   CLJ_B1253 NONE
   CLJ_B1254 1296432 .. 1296479 +  -9.6  -3.70102   TTTAATAAAAATTAG GGATGTATTTTTATAGATGATA GGTA TATTATTTATATAAATATATCC TATTTAATTTTACAT  84 10
        sdhB NONE
        sdhA 1298442 .. 1298479 + -10.3  -4.07595   TTTATTTGTTTATAG   TATTTATTTGTATTTAA TTAA TTGAGTACAAATAAATA    TTGTTTACTATCTAT  95 125
   CLJ_B1258 1299715 .. 1299763 + -14.3  -3.25341   GTACTTAATAATTAA ATAAAAGCTATGAATTAGGAAAA TAA TTTTCTAAATTCATAGCTTTTAA TCTTAATATTAAGCT 100 89
   CLJ_B1260 1300796 .. 1300830 +  -9.5  -3.46183   TACAGAAGAAAAGGC     TATATAAGGAGAGTG ATACA CACTTTCCTTATAAA     ATTTCTTTTATAACT  82 19
   CLJ_B1269 NONE
       cotJB NONE
       cotJC 1311037 .. 1311068 + -10.5  -3.00774   TTCTTTGGATTGTTT      TTATATTTGTAAC TCATTT GTTACAAATATAA       TGTATAATTACAATA  85 159
   CLJ_B1272 NONE
   CLJ_B1273 1313400 .. 1313440 +  -3.6  -6.00086   TATATTTAATTATAG CAGTTCCTTTTGTTATTGAG GTT TTCA-TAATAAAAGG-GCTG TTTTTTTTATAATCT  86 192
   CLJ_B1274 1314326 .. 1314366 +  -6.1  -4.69549   TTCAATTTTTTTGAT  TTACTCCTAGATCCCCACG TGC TGTGAGGAATTAGGGGGAA  TTTTAATTTTAAATT  74 203
         dut 1315774 .. 1315797 + -11.8  -4.46267   TAATATTAGTAAAAG          GTGCTGAAGG TTAA CTTTCAGCAC           TTTTCATTGAATTAT 100 38
   CLJ_B1279 1317804 .. 1317839 + -19.4  -4.79752   AATATATAAATATTA    CAAGCACGAATTAATT AACT AATTAATTCGTGCTTG     TTTTCTATTATTGAA 100 4
   CLJ_B1281 NONE
   CLJ_B1282 1320171 .. 1320194 + -10.4  -4.21194   TATATTCAGATACTT          TAGACGTTCA TAGA TGAGCGTCTA           TTTTGCATGGTAGGC  95 116
   CLJ_B1283 NONE
   CLJ_B1284 NONE
   CLJ_B1285 NONE
   CLJ_B1286 NONE
   CLJ_B1287 1322390 .. 1322400 +  -4.6  -3.60364   TTTTCCGCCACGAAA                 GGGC ACT GTCC                 TATTCTTCTTATGGA  54 154
   CLJ_B1289 1325631 .. 1325662 + -10.5  -5.85737   CATAATATGGTTAAA      CATTTCATAAAAA CGAATA TTTTTATGAAATG       TTTTTTTGTTGATAT 100 165
   CLJ_B1290 1326372 .. 1326423 +  -9.1  -4.68124   AGTTACTCATAGACC TCCATATACAAAAAGAACTCCATT TTATT ACTGGAGTTCTTTTTGTATG-GAA TTTTCTATATATTGG  89 105
   CLJ_B1291 1326749 .. 1326778 +    -6  -5.49579   AAATATAAAAATGGA       GAATATTATTTA CTTAGA TGAATAATATTC        TTTTATTTTTTATAG  85 1
   CLJ_B1292 1326924 .. 1326942 +  -4.5  -3.30243   AATAAAAAAAATAAA             GCCTAGC AGAAG GCTAGAC             TTATCCCAAGTCCCT  53 46
   CLJ_B1293 1327982 .. 1328029 +  -8.2  -5.61689   AATTTACTAAATCAA CATAAATAAAAA-CTCTAGAG GATTAAG CTTTGGAGCTTTTTATTTATG TTTTTTATTACTTTT 100 48
   CLJ_B1294 1329266 .. 1329276 +  -2.6  -3.97307   ACAAAATAATTAAAG                 TTAT ATA ATAA                 TTATTATTGAATAGG  49 316
   CLJ_B1295 1329519 .. 1329571 + -26.3  -3.03771   CTATAGATGAAGCTA TAAATTTATAAAATAAGGAAGTTGC GAT GCAACTTCCTTATTTTATGAATTTA TATTCAAAACTATAG 100 15
        grdX 1333166 .. 1333188 +    -8  -2.50291   AATGCACTAAATTAA           TTTTATATAA GAT TTATATAAAA           ATTGCTAGAATCATT  65 26
        grdE NONE
   CLJ_B1301 1336026 .. 1336053 +  -4.4  -2.86539   TAAATTGCGGGGGGA        TAAGAT-ATGAAC AAT GTTTATGATCTTA        TAATTATAGGTTCAG  49 175
        trxB NONE
   CLJ_B1303 NONE
        grdC NONE
        grdD 1340772 .. 1340803 + -17.4  -3.62522   TAAACAGAGTTCTTG      GCTTCAGAGGGAGT TTTT ACTCCCACTGAAGC       TTATTAACAGAATTC 100 91
   CLJ_B1308 NONE
   CLJ_B1309 1344288 .. 1344329 + -17.9  -5.39721   ATAAATGAAAAAACG TTAATTTTGAACAAAATAA TATA TTATTTTGTTCAAAATTAA  TTTTTTGTCTAATAA 100 95
        mtnK 1345918 .. 1345932 +  -2.2  -4.13767   ACTTAAAAATAACTG               TTTTAT ATA ATAAGA               TTTTCAAATAAAAAA  50 79
        mtnA NONE
   CLJ_B1312 NONE
   CLJ_B1313 NONE
   CLJ_B1314 NONE
   CLJ_B1315 1350901 .. 1350929 + -17.7  -3.21912   AATAAAGTAAAATAA        TAAATTGGGGGAT TTT ATCCCCCAATTTA        TTAATCACTTAGCAA 100 26
        araD 1351706 .. 1351718 +  -4.9   -3.3341   GGCGGTCATGTACAA                GTTAT ACT ATAAC                TTAATGGTATTTTGT  55 126
   CLJ_B1317 1352638 .. 1352649 +  -4.4  -3.54459   CGGAGCTTATGCGGA                GAAG GGGG CTTC                 TTTAAAAGAAGTTAC  54 89
   CLJ_B1318 NONE
   CLJ_B1319 1353463 .. 1353521 + -24.7  -2.84053   ATTAATTATCTAAAA -GTAAGAAAGAATAATACTAAGTTCTAA ATTT TTAGAACTTAGTATTATTCTTTCTTACA ATTTAAATCCTTTAA 100 96
   CLJ_B1320 1354154 .. 1354192 + -11.8  -4.72846   TTATCTTGCGGATCC   ATGACCAGTCACCTAATG TTT TGTGAGGTGACTGGTCAA   TTTTTAAATATGTCA 100 199
   CLJ_B1322 1356243 .. 1356256 +  -2.5  -2.80479   TCCATTCAAGTATTA               TATTT ATCT AAATA                TCAATTTTAATTAAG  40 81
   CLJ_B1323 1356743 .. 1356753 +  -2.6  -3.08415   TTTTGATTTATAAAT                 TTAA AAA TTAA                 GTTATTTATAATTAG  41 54
   CLJ_B1324 NONE
   CLJ_B1325 1357991 .. 1358005 +  -4.3  -3.73068   CAACGCATAAAATAT               GTTAG GCGGG CTAAC               TTATTAAATTGCAAA  56 366
   CLJ_B1326 NONE
   CLJ_B1327 1359702 .. 1359728 + -12.6  -3.87538   TGTTATGAAAAATTA         CTTTAATAGTTA TAA TAACTATTAAAG         TTGTTATAATAATTT 100 406
   CLJ_B1331 NONE
   CLJ_B1332 NONE
   CLJ_B1333 NONE
   CLJ_B1334 NONE
   CLJ_B1335 1366285 .. 1366297 +  -3.5  -3.08776   TATTAAGGTATATAG                TTTAA TTA TTAAA                TGATTTTAAGAGGTT  45 107
        guaD 1366816 .. 1366847 + -10.2  -3.70914   GCTTATAAAATAAAC      CCAGTAGCAAGCAT TAAG AAGCTTTCTACTGG       ATTTTGTTTTAGTTT  90 49
        topB 1369596 .. 1369629 + -12.7  -5.68438   TGTCTTGAATAATGA     GACT-CATGTATAGCT TTT AGCTATGCATGGAGTC     TTTTTTATTTCATAG 100 250
   CLJ_B1338 1370349 .. 1370367 +  -3.3  -3.50808   CATTAATTGGAGGGA             TTTTTTT GAAGA AAAAAAA             TGTTATTGTAATAGA  49 86
   CLJ_B1339 1370616 .. 1370631 +  -3.4  -4.06678   TAGTAACTAAAATAT              TATTTT TATA AAAATA               TTTCTATACATAAAT  54 51
   CLJ_B1340 1372067 .. 1372085 +  -3.2  -3.39288   ACTAAATATAATTCA             TTTTAACA ATA TGTAAAAA             TATTATTAAAGGGTA  47 156
   CLJ_B1341 1374023 .. 1374055 +  -8.6  -5.28561   AAAAAATAACAAAAA      GCTAGAACTTTAAT ATGAA ATTATGGTTCTAGC      TTTTTGTTATATATT 100 47
   CLJ_B1342 1375764 .. 1375803 +  -8.8  -3.23684   ATAATAAGCATGGAG  GGATGTGTTACTAACGTA AGAT TATGTTAATAGTACATCC   TCTACTTTTTATATA  75 131
   CLJ_B1343 NONE
   CLJ_B1344 NONE
   CLJ_B1345 1379885 .. 1379908 +  -6.2  -3.44794   AGAAAATACTTGGAA          TAGTAAGTTA ATGT TAATTTACTA           TTATGGTAATAACTT  61 174
   CLJ_B1346 1382181 .. 1382211 +   -17  -3.62522   TAAACAGAGATCTAA       GCTTTAGAGGGAGT TTT ACTCCCACTAAAGC       TTATTAACAGACTTC 100 79
   CLJ_B1347 1383699 .. 1383714 +  -2.6  -4.02163   TAATTACTAAATAAA              GTAATA AAAC TATTGC               TTATTATTCCTATAT  51 88
   CLJ_B1348 1384046 .. 1384069 +   -14   -5.4251   GAATTCGTAATTAAA          CCTGTAAGAG GTTA CTCTTACAGG           TTTTTTGTGTCTCAG 100 43
   CLJ_B1350 NONE
   CLJ_B1351 1388156 .. 1388169 +  -2.5  -3.61398   GTAAACAAAATTATA               TAAAA TAAA TTTTA                TTATTGAAAAGGGAG  45 109
        copZ 1388442 .. 1388476 + -10.2  -4.89729   TTATGAGTTTAAAAA     GGGTGTCTCAAAAT TAAATCT ATTTTGAGGTACCC     TTTTTACATTTTGTA 100 57
   CLJ_B1353 1391140 .. 1391178 + -11.3  -5.04325   TAATATGTATTAAGA   AAGGTTTTCTCAAAATA TATTT TATTTTGAGAAGACCTC   TTTTTATGCTTTAAG 100 81
   CLJ_B1354 1393304 .. 1393343 + -10.5  -5.05782   AATGACATAGATGTA  TAAAAGTAACAATAAAA CTCTAA TTTTATTGTTATTTTTA   TTTTTTGAAATAGAT 100 101
   CLJ_B1355 1394417 .. 1394430 +  -2.5   -3.1978   ATTATAAATTAGAAG               TATAT AGAA ATATA                TGTTACTATAGCAAT  42 128
   CLJ_B1356 1394838 .. 1394868 + -17.2  -5.25893   CATCATCATTAAAAA       TAAAAGGAAAGTAC CTA GTACTTTCCTTTTA       TTTTTTAGTGTATAT 100 29
   CLJ_B1357 1396162 .. 1396192 + -14.2  -4.79451   GATATAAATTAACAA       AATAAGGAAAGTGC TAC GCACTTTCCTTATA       TTTTATCTTTGGCCT 100 29
   CLJ_B1362 NONE
   CLJ_B1363 NONE
   CLJ_B1364 NONE
   CLJ_B1366 1400579 .. 1400593 +  -2.8  -3.12327   ATTTCTTAAATCTAA               CTACAG CAA CTTTAG               TCTTAGGTGTAGGAG  43 124
   CLJ_B1367 NONE
   CLJ_B1368 NONE
   CLJ_B1369 NONE
   CLJ_B1370 NONE
   CLJ_B1371 1403386 .. 1403405 +  -2.3   -3.4252   ACAGAATGAGAAAAT            TTATTTA GGAGGA TAAATAA             TTATGCTAAATAAAG  43 18
   CLJ_B1372 NONE
   CLJ_B1373 NONE
   CLJ_B1374 NONE
   CLJ_B1375 NONE
   CLJ_B1376 NONE
   CLJ_B1377 1405496 .. 1405510 +  -2.9  -4.07687   GGAGAATAGACACAA               TACAA AGAAA TTGTA               TTTTAGAAAGAGGGT  51 32
   CLJ_B1378 NONE
   CLJ_B1379 NONE
   CLJ_B1380 NONE
   CLJ_B1381 NONE
   CLJ_B1382 1407291 .. 1407301 +  -2.6  -3.43151   ATTAATAAATATGGA                 TTTA AAA TAAA                 TTAATTCGTAATTCA  44 11
   CLJ_B1383 NONE
   CLJ_B1384 NONE
   CLJ_B1385 NONE
   CLJ_B1386 1409724 .. 1409755 +  -3.9  -3.19889   AATTAAAACTAAATA      GGTGTAAGGAT-TA AAATG TATATTCTTGCACC      TTAACTGTATTAGTA  48 48
   CLJ_B1387 NONE
   CLJ_B1388 NONE
   CLJ_B1389 NONE
   CLJ_B1390 1411425 .. 1411451 +  -8.8  -3.66401   GTGTATGTACTAAAA         GCACTTAAGG AATAAAG CCTTGAGTGC         TCTTTAATTTATGAA  79 194
   CLJ_B1391 NONE
   CLJ_B1392 1412262 .. 1412286 +  -2.3  -3.84901   TTTAAAACAGTAAAG          TTTAACATA ATGAGCA TGTGTTAAA          TTGATTTTTACTAAA  48 46
   CLJ_B1393 1412711 .. 1412731 +  -2.7  -3.73995   ACATAGCCCCCCTAA            TGAAAAAAT CGG ATTTTTTAA            ATTTTTTATAGACCG  47 42
   CLJ_B1394 NONE
   CLJ_B1395 1414959 .. 1414971 +  -2.7  -3.02144   AGATACAAATTATTT                TGGAT GCT ATTCA                TATTAAAGGAGGTGA  41 7
   CLJ_B1396 NONE
   CLJ_B1397 NONE
   CLJ_B1398 NONE
   CLJ_B1399 NONE
   CLJ_B1400 NONE
   CLJ_B1401 1419192 .. 1419211 +  -2.9  -3.26811   TGTAAAATAATGAAG            CATTTAC TTAATT GTAGATG             ATTTTAATATATTTA  42 218
   CLJ_B1402 NONE
   CLJ_B1403 NONE
   CLJ_B1404 NONE
   CLJ_B1405 NONE
   CLJ_B1406 1421882 .. 1421894 +  -2.7  -3.85522   AATTTTTAGAAACTA                TTTAG GTA CTGAA                TTATTATAGTGCCTT  49 21
   CLJ_B1407 1424496 .. 1424516 +  -9.8   -4.4078   CAAGCAAATTTAGCT            TAAGAGGG TCACT CCCTCTTA            TTTTAGTTAGGAGGG 100 23
   CLJ_B1408 NONE
   CLJ_B1409 1425974 .. 1425988 +  -2.8  -3.76775   ATTAAGAGGTGATAA               AATGGA TAA TCCATA               TTTAACTATATTACA  47 36
   CLJ_B1410 NONE
   CLJ_B1411 NONE
   CLJ_B1412 1427690 .. 1427723 +  -3.3   -5.4833   AATTCTTGAAAGTGT     GGTGGTAAATAAT GTTTAATA AGTATTTACCATC      TTTTTTATTAGATAA  73 7
   CLJ_B1413 NONE
   CLJ_B1414 NONE
   CLJ_B1415 NONE
   CLJ_B1416 1430542 .. 1430554 +  -7.7  -5.80951   TAAAGGCAAAGTAGG                CACCT AAT AGGTG                TTTTTTATTTTGCCT 100 71
   CLJ_B1417 NONE
   CLJ_B1418 1431045 .. 1431064 +  -5.7  -5.83226   GTAAAAGAAAGTAAA            GAGCAGG AATAAA CCTGTTC             TTTTTTTATTAAATT  90 14
   CLJ_B1419 1431935 .. 1431958 +  -8.9  -5.93252   TAAATAAGTTGTAAA          GGTACTCTC TTTTAT GGGAGTACC           TTTTTTATTTTTGAA 100 34
   CLJ_B1420 1433410 .. 1433438 +  -7.5  -5.83211   TTTGTTATAGATTAA        CAAGGTACTTCTG TAA TGGAAGTACCTTC        TTTTTTATTTTGCTG 100 218
   CLJ_B1421 1434015 .. 1434037 +  -9.2  -4.53777   ATGTAAATTTTTAAA           GGTACTTCTG TAA TGGAAGTACC           TTCTTTTTCATTGGA  93 200
   CLJ_B1422 1434272 .. 1434289 +  -8.4  -3.21925   TAAAATAAACCCATA             GGGAGG GTAAAA CCTCCC              TTACTAATAAAATAT  72 33
   CLJ_B1423 NONE
   CLJ_B1424 1434871 .. 1434898 +  -5.7  -4.32804   AAAATAAGAATAAAA        GAGGTAGCTTCT TAAAT AGA-GCTATCTC        TTTTAAATTACTTGT  66 34
   CLJ_B1425 1436010 .. 1436032 +  -8.5  -4.99134   TATTAAATATAAAAA           CTCTAGAGG GTTAA CCTTTAGAG           TTTTTCATTTGACGT  91 47
   CLJ_B1427 1437227 .. 1437268 + -11.9  -4.98672   GTATATTTTAAATTT TAAAAAGACCTATTTAGTT ATTT AACTAAATAGGTCTTTAAA  TTTTATATTTTTACA 100 129
   CLJ_B1429 1439062 .. 1439104 +  -6.5  -5.48213   ATTAAATTTAAAATG TACCTTATAGAGTAGGT AATAAAAAA GTCTACTCTATGGGGTA TTTTTATTTTAAATA  88 348
   CLJ_B1430 1440649 .. 1440677 +  -4.6   -3.6914   AATGTATTTTTTATG       GGGCAG-CCTC AGGTATTA GAGGACTGTCC        TTAATTTATTACCGT  56 208
        trkA NONE
        trkH 1444230 .. 1444266 +  -3.3  -2.98823   GATACTTTTTTGCAG   GTTTGTATCT-ATGAA GTTTAA TTCATGAAATACAAAC    TCTATCTAAAGAAAA  45 192
   CLJ_B1433 NONE
   CLJ_B1434 1447200 .. 1447245 +  -8.7  -4.32177   TAAATATAAGTTAAA GCCACACTAAG-AAAAATAT AATTTAA ATATTTTTACTTAATGTGGC TTTCTTATAGGATAA  84 41
         rbr 1452792 .. 1452828 +  -8.1  -5.09259   TATTAAATACAAAAA    GCTATGAAACAGAGG GATAACA CCTCAATTTCATAGC    TTTTATTTTACAATG  91 114
   CLJ_B1440 1454724 .. 1454756 +  -2.9  -5.64421   AAAATTAAAGCTATT      TTTATTTTAAAACAG TCT CTATTTTAAAGTATA      TTTTTTATTTCAAGT  73 287
   CLJ_B1442 1457934 .. 1457988 +   -22  -3.78902   TCAATTTTAATATAT TAGTATTACAGCACATAATAGTATAT AAA ATAATCTATTATGTGCTGTAATACTA TTTAAATATTAATTG 100 65
   CLJ_B1444 1459241 .. 1459254 +  -6.7  -2.78672   AAATTTTAGTTTATG               GCCTA TGGT TAGGC                TAATATGTATTTAAA  61 125
   CLJ_B1445 1459972 .. 1459988 +  -2.3  -4.63932   ACATATAAAAATAGA              GGAAT TAAATAT ATTCC              TTTTATTAACAAATA  56 161
   CLJ_B1446 1461950 .. 1462003 + -13.7  -3.12505   ATTTTGATAATTACA TTTTTACATTGATCTGAAATTTAAAC TAA GTATTA-TTTCAGATCAATGTAAAAA TATTAACTATAGAAT 100 43
   CLJ_B1447 1462656 .. 1462669 +  -3.9  -4.28487   GATTAGTATAAAATT               TTCTT CAAT AAGAA                TTTGATTTTATAATA  58 159
        noxA 1463942 .. 1463972 +  -9.8  -3.04291   AATTTAGTTACAAAA       AATAAGGAAAGTGC GAG GCACTTTCCTTAAA       ATATTTTATTTAATC  82 21
   CLJ_B1451 NONE
   CLJ_B1452 1466223 .. 1466273 + -12.2  -4.77079   AATATAAATAGAATA TTGAAAGGAGATGCCTCAAGAT ACATTTA ATCTTAAGACATCTCCTTTTAA TTTTATTAGTATATA 100 30
   CLJ_B1454 1468408 .. 1468435 +  -5.7  -5.26316   AAGGAATGTTATAAA        GCTATAGGA TGTTTATTTT TCCTATAGC         TTTTTTATAAAGTAA  78 41
   CLJ_B1455 NONE
   CLJ_B1456 NONE
   CLJ_B1457 1471782 .. 1471792 +    -4  -4.67354   TAGTGTATCTATAAA                 GTAA TCT TTAC                 TTTTATCTATGTCTT  65 414
   CLJ_B1460 1474601 .. 1474622 +    -6  -5.67711   ATTTAGATGGTGAAG           CAATGAAT ATAAAA ATTCATTG            TTTTTATTTTATTTA  87 75
        murQ NONE
   CLJ_B1462 1477435 .. 1477447 +  -3.3  -2.66912   AAAAATTTCCTACCC                GGTAG AGA CAACC                TCCTCTGGCTTCACT  43 254
   CLJ_B1463 1478801 .. 1478813 +  -4.9  -3.86015   ATTAAGGCAATTATT                TACTA TAC TAGTA                TTTGTAAAGGAGATG  60 110
   CLJ_B1464 1479693 .. 1479704 +    -3  -3.50721   AGAAATAATATTAAG                TAAG TATT CTTA                 TATTATTAGTTAGTT  45 33
   CLJ_B1465 1480763 .. 1480792 +  -6.5  -4.12416   AGCTAATACAAAAAA       GCCTCTTAGGA TAAAAAAT TCTTAGGAGGC        TTATATTTTATTATT  71 115
   CLJ_B1466 NONE
   CLJ_B1467 1482700 .. 1482721 +  -9.5  -4.92757   TTCAAAAGATTAAAA           GAACTGCTT ATAT AGGCAGTTC            TTTTGTTATTCATAA 100 138
   CLJ_B1468 1484706 .. 1484716 +  -2.6  -4.74052   TAAGAAAATGGGTAC                 TTTA TAA TAAA                 TTATTTTTCTTTACT  59 19
   CLJ_B1469 NONE
   CLJ_B1470 1486649 .. 1486691 +  -9.6  -3.91473   AATGATTAAATATAA TAAAACACTATCAAAT ATTTTTATACA ATTTGATAGTGTTTTA TTTATAAAAATTTCT  86 129
   CLJ_B1472 1489225 .. 1489256 + -10.4  -5.30616   TAAAATTTAATAAGA      TATAGATGGCTTTT TAAG AAGAGTCATCTATA       TTTTTATTTGGATAA 100 31
   CLJ_B1473 NONE
   CLJ_B1474 NONE
   CLJ_B1475 1492904 .. 1492917 +  -3.9  -2.72613   TTTTACAGGTTAAAA               GATTT TTGC AAATC                ATTCATTTAACCTTT  44 81
   CLJ_B1477 1495622 .. 1495649 +   -13  -5.60993   TTAATTTATAAAAAA        GTAACACTTATA AAAT TATAAGTGTTAC         TTTTTTTGTAAAGGG 100 130
   CLJ_B1480 1498517 .. 1498532 +  -4.8  -3.24548   GATAAGATGATTTAC              TAAGAA AGAC TTCTTA               ATTTATTCTGTAGTT  53 132
   CLJ_B1482 1501250 .. 1501268 +  -3.2  -3.30662   TCTCATATTATTGTT             TATTTAAC AGC GTTAAAAA             TATATGTTTGTTTAA  47 69
   CLJ_B1483 1501893 .. 1501932 + -12.7  -4.15044   AAAATAGGGTAGTAT  TTAAAATATTTTGTATA TATTAT TATACAAAATATTTTAA   TTTATTAAAGAAACC 100 29
   CLJ_B1484 NONE
   CLJ_B1485 1504635 .. 1504657 +  -2.8  -2.55437   AAAAAGTATTTTGAA           TAAAAAGGTA GTG TATCTTTATA           ATATTAATGTTAGTG  39 27
   CLJ_B1486 1505360 .. 1505370 +    -4  -2.83905   CGCATAATATTTATT                 TTCT AGA AGAA                 TATAATAAATTATAG  45 0
   CLJ_B1487 NONE
   CLJ_B1488 1506446 .. 1506473 + -14.4  -3.44608   AAATAAATTATTAAA        TTAAGCACCATT TATA AATGGTGCTTAA         TTATGATGGATGTTT 100 35
   CLJ_B1489 1507902 .. 1507916 +  -2.2   -4.2204   ATATAGTAATACTAT               TAGTAT AAT ATATTA               TTGTTTATTAAAATT  52 93
         rnz 1509546 .. 1509593 +    -3  -4.13561   AAAAAAACCTAGGAT TATTTGATGCTATAGCTATA GTTATAGG TATGGTTATAGGATCAGGTA TATTTTTTAAGCCAG  51 413
   CLJ_B1492 NONE
   CLJ_B1493 NONE
   CLJ_B1494 1513356 .. 1513398 + -10.9  -5.93809   AAGACAATGGTAAAA CTTCCTTAAATTTTCTATT ATATA ATTAGAAAATTTGAGGAGG TTTTTTTTATGAGCA 100 162
   CLJ_B1495 1514387 .. 1514400 +  -2.5  -3.05844   GTTTCTATAGGAATT               TTTTA TATT TAAAA                TATTAAAATGAGAAG  41 67
   CLJ_B1496 NONE
   CLJ_B1497 NONE
   CLJ_B1498 1517282 .. 1517298 +  -2.3  -4.06527   TTTTATTCCACTCCA              TTCTGTA AAA TACATAA              TTATATTTTCCTTTT  50 330
      pepD_1 1522013 .. 1522024 +    -3  -2.87132   ATTGTAAAAAGATGT                TACA GAAT TGTA                 TGTATGGAGGGGAGA  40 48
   CLJ_B1503 1522967 .. 1522986 +  -9.4  -6.23317   ACAATAAATAAAAAA            TTGTGCTT GATC AAGCACAA             TTTTTTTGTTTTTGT 100 51
   CLJ_B1504 1524403 .. 1524452 + -20.7  -4.78107   TTAATTATAGATAAG TTAAAAGAGGTTGTCTGAAAATAA AAT TTATTTTCAGACAA-CTCTTTTAA TTTTTAGTGGTAATA 100 205
   CLJ_B1506 NONE
   CLJ_B1507 NONE
   CLJ_B1508 1529044 .. 1529063 +  -2.2  -5.02502   AATATAAGGTAAAAA            TGTCTAAGG GTT TCTTAG-CA            TTTTTATATAATATA  61 76
   CLJ_B1509 NONE
   CLJ_B1510 NONE
   CLJ_B1511 NONE
   CLJ_B1512 NONE
   CLJ_B1513 1534745 .. 1534758 +  -3.9  -2.71011   GTGTATTATATAATT               GTTAT AGCT ATAAC                TAATTAAAAAAAGGT  44 268
   CLJ_B1514 1535902 .. 1535936 +   -11  -4.87665   TATAATAAATTTAAA     TAAGTCTATAAAGATA TTG TAACTTTATAGGCTTA     TTTTTATGAATAAAA 100 45
   CLJ_B1515 1537495 .. 1537506 +  -2.2   -3.6869   ACAATGAATAAACTA                TCAC AAAA GTGG                 TTTAAACTTGATATA  46 59
   CLJ_B1516 NONE
   CLJ_B1517 1538630 .. 1538658 + -11.8  -4.88222   CTGTTTATTTCTAAA        CCACACTTCGGT ATTCA ACTGGAGTGTGG        TTTTTAAATTTTGAT 100 102
   CLJ_B1520 1540337 .. 1540387 + -16.1  -3.66883   GTGAATTTACAATTA TATATAATAAAAACACTATCA CTTATATTT TGATAGTGTTTTTATTATATA TTTAAAGTATATTAA 100 125
   CLJ_B1522 1542638 .. 1542690 + -15.3  -5.38348   AAAAAATTAATAAAA GTATATTAAATATTCCACCAACT TTTAATT AGTTGGTGGAATATTTTAAATAC TTTTTTCCTGTTTTT 100 31
        bdhA 1544654 .. 1544681 +  -5.7  -3.96452   AGAGTAAAAATCGGA        GGACTGTTAAT TATTTC ATTAATGGTCC         TTTAACTTTTAATTC  62 140
   CLJ_B1525 1545186 .. 1545200 +  -4.4  -2.50074   TTTATTAGTATATAA               TAATAA TTT TTATTA               GTCTATTATAGAAAA  48 64
   CLJ_B1526 1546859 .. 1546908 + -14.8   -3.5861   TAATAATAAAAAATT TAAAAGCTATGAATTGAAAAAT TTTATT ATATTTCAATTCATAGCTTTTG TTGCTTATTATAAGT 100 43
   CLJ_B1528 NONE
   CLJ_B1529 1550455 .. 1550469 +   -10  -5.56263   ATATTTGATTATTTC               GCAGCT AAA AGCTGC               TTTTTCTTTTGTAAT 100 92
   CLJ_B1530 1551104 .. 1551121 +  -2.1  -2.96899   TAAATTTGATATTTT             CTTTAGCT TCT AG-TAAAG             TATACTTAATTAACA  40 63
   CLJ_B1531 1553370 .. 1553385 +  -6.2   -3.1637   CGAAGGATTTACAAC              CTTTTC AATA GAAAAG               TTCATAAAAATATAT  60 225
   CLJ_B1532 1553968 .. 1553998 +  -8.5  -4.27316   ATATAATTTTATTAA       GCTCATATTCT AAAAATTAG AGAATATGAGC       TTTTAAATTAAGAAA  80 167
   CLJ_B1533 1556282 .. 1556331 + -10.1  -2.57211   GAATAGGCATAAACA GAGTTCTTGGCTTCAGAGGGAGT TTTT ACTCCATCTAAAGCTTAGAAATC GTTATCCAGGGACGT  78 35
   CLJ_B1534 1557740 .. 1557750 +  -2.6  -4.15453   AGGATAGTAATATAA                 TTTA GAT TAAA                 TTTTAAAATAGGTTG  51 45
   CLJ_B1535 1558669 .. 1558721 + -11.7  -3.55203   TTAATGTTATATGTT TAATATATTCCACTAAGGTAGATTT TTC ATGTTTACTTTAGTGGAATATCTTA TTTAAAGAAACTTTT  95 67
   CLJ_B1536 1560050 .. 1560060 +  -2.6  -2.70826   TAAAAAAAGATGTGT                 TTAA GTT TTAA                 TAATATATAAGTATG  39 15
   CLJ_B1537 1561705 .. 1561741 +   -14  -5.73978   AATAAGATAAAAAAA    CATTAGATTGGCAAGG TGTTT TCTTGCTAATCTAATG    TTTTTTATTTGTAAT 100 31
   CLJ_B1539 1564135 .. 1564160 +  -9.2  -5.07107   ATAATAAATGAAAAA         TAGAACTTAG ATTTAA CTAAGTTCTA          TTTTTTAACCCTTTG 100 23
   CLJ_B1541 1567079 .. 1567093 +  -3.6  -3.18239   AATAGTATTATGAAC               CTATAT TTA ATATGG               TTAATACAATATATA  48 232
   CLJ_B1542 1569646 .. 1569694 +  -7.8   -4.1466   ATTGATTCTAAAAAT TGGGTATATAGGTAAATT CGGTTTTTATATA AATATACCTATATACCCA TTTTAAAAATTACAT  77 120
   CLJ_B1552 1585343 .. 1585363 +    -7  -4.17023   AGTGGATAGTTTTTC            GTATTTAC CAGTT GTAAATAC            TTTTAAAATGATTCC  72 368
        mraZ 1588138 .. 1588154 +  -2.3  -3.33671   ATTATATTTTAACTA              TTTAGAT TTA ATCTTAA              TTATAAAATAAGTGT  43 47
        mraW 1589146 .. 1589156 +  -2.6  -2.99473   TGAGTTTAATGCTTT                 TAAA AAT TTTA                 TATCTAATACTTTAA  41 46
   CLJ_B1557 NONE
   CLJ_B1558 1591919 .. 1591959 +   -10  -4.01597   TAATATAATAAAAAA TTGGCATGCAGTAATACAG GGTT CTGTG-TATTGCATGCTAA  TATTTTGTTAGTTCT  93 38
        murE NONE
        murF 1595010 .. 1595030 +  -2.6  -4.09117   AAAATAGGAGGTGAC            TTGCTC ACATAATTA GAGCAA            TTATTTATGAATAGA  51 34
        mraY 1595972 .. 1595984 +  -3.4  -3.41527   AATATTATGTTTAGT                TGCT TTCTT AGCA                TTATAATAAGCATTA  47 7
   CLJ_B1562 1597186 .. 1597204 +  -7.5  -6.12328   ATACTATATAAAAAA             TAGCAAC ATTTA GTTGCTA             TTTTTTTTATATTCT 100 30
   CLJ_B1563 NONE
   CLJ_B1564 NONE
         sbp NONE
   CLJ_B1566 1600131 .. 1600147 +  -2.3  -4.38154   TTAAAAGTGTTTAAT              TCTGAAG GAC TTTTAGA              TTTTATAGAGAATAT  54 46
   CLJ_B1567 NONE
   CLJ_B1568 1601349 .. 1601364 +  -4.8  -2.69468   ATTGGAATAAATAAG              TATTTG GAGG CAAATA               TGGTATCTAACACTA  50 27
   CLJ_B1569 NONE
   CLJ_B1570 1602395 .. 1602405 +  -2.6  -4.07647   AATTAAAATATTATT                 TAAA AAA TTTA                 TTTGATTTGAGGTGT  51 10
   CLJ_B1571 1603085 .. 1603121 +   -14  -2.77109   TATAAAAGAGGATTA    ACAAAAGAGTTTTTGC ATATA GCAAAAACTCTTTTGA    GTTATGTATAAGTTT 100 25
        aroB NONE
        mtnN NONE
        aroF 1606306 .. 1606323 +  -4.3  -3.14522   TTAAAAATCGCTTAA             TATAATT ATAA AATTATA              TTAAATCTGAGTTAA  51 136
        aroA 1607702 .. 1607719 +  -4.3  -4.83269   TTAGATAGATTTAAA             TTTTTTA TATA TAAAAAA              TTTTTACTATAATAT  68 37
   CLJ_B1576 1608650 .. 1608699 + -13.7  -3.57406   ACGTCTCTGGATAAC GATTTCTAAGCTTTAGTGGGAGT AAAA ACTCCCTCTAAAGCCAAGAACTC TGTTTATAATAGAAC 100 145
        lspA NONE
   CLJ_B1578 1610569 .. 1610593 + -15.9  -5.39721   TACACGGAATTATTA          TGCCTTTACTC ACA GAGTAAAGGCA          TTTTTTATCTGATGA 100 346
      pyrR_1 NONE
        pyrP 1612708 .. 1612735 + -15.8  -4.51238   ATAGAGAACAGAGAA        GGCACTAATGTA GATA TACATTAGTGCC         TTTATGTTTTGTGGA 100 65
         xth 1613806 .. 1613820 +  -4.4  -2.74012   AAATAATTTTTCTTG               TTAAAA TAT TTTTAA               TACTTAGGATAATAA  48 79
   CLJ_B1584 1615226 .. 1615239 +  -2.5  -3.13042   ACCCACTAGCTAAAG               TTAAA GTGT TTTAA                TATCTATCATTTTTT  42 124
   CLJ_B1585 NONE
        modA NONE
        modB 1617721 .. 1617733 +  -4.9  -3.74693   CATGAAAATGTTTAA                TACAT TAT ATGTA                TTTGCTCAGGTAAAG  58 167
   CLJ_B1588 NONE
   CLJ_B1589 1619219 .. 1619271 +   -14  -5.44119   ATTTTACTGTAGTTT TTTCAGTGGTTATATGATTTAATAG AAGA TTAA-AAATCATATAACCACTGAAA TTTTTTTGAAATAAA 100 48
   CLJ_B1590 1620600 .. 1620611 +  -2.2  -4.72986   AAACAGAGTTCTTGG                CTTC AAAG GGAG                 TTTTTGCTCCCACTA  56 161
   CLJ_B1591 1621207 .. 1621221 +  -4.4  -3.53563   CTAAGGGTAATAATT               TAAAAA ATA TTTTTA               TTTAGAAAGGAGTGT  54 263
   CLJ_B1592 NONE
   CLJ_B1593 1623873 .. 1623894 +  -3.1  -4.36914   TTGATATAGAAAGAG           GTAATTTTA TGGC TAGGATTAC            TTTTATAAAGAAGCA  56 159
   CLJ_B1594 1625664 .. 1625679 +  -6.2   -3.1478   ATATATAATTAAAAT              TTTACC ATTA GGTAAA               TCTTAATGGAGTGAT  60 78
   CLJ_B1595 NONE
   CLJ_B1596 NONE
        mtbC 1628237 .. 1628247 +  -2.6  -2.89475   ATTTAAATGAATAAG                 TTTT TGT AAAA                 TATACTATATAAATA  40 50
   CLJ_B1598 1629333 .. 1629347 +  -8.6   -2.5547   AATTGTGACTTAGAA               GGTAGT TAT ACTACC               CTTGGTCTAAAAAAT  68 44
   CLJ_B1600 NONE
   CLJ_B1601 NONE
   CLJ_B1602 1632676 .. 1632694 +  -7.6  -4.67755   AAAAAAATTTAAAGC             TATAGTTA ACT TAACTATA             TTTTTAAATAAATAT  83 59
   CLJ_B1603 1633676 .. 1633719 + -16.4  -3.94411   ATTGTTAAATACAAA GATAATGGTGTCTCAAAATA AATT TATTTTGAGACACTATCATC TTATATTATTATTTT 100 71
   CLJ_B1605 1636014 .. 1636054 + -15.8   -4.0492   AATATGTAAAATAAA  TATAAGGATGGAGAATGT AAGTA AAATTCTCCATCCTTATA  TTTATGTAAACATTA 100 32
        asnA 1637394 .. 1637452 +    -8  -3.57977   AAGTAATTATTAAAT GATTCTAATATTAAGATGGATTTTATT ATGAAA AATAGCCT-CATCTTAATATTAGAATC ATTTTTATAATATTA  72 60
   CLJ_B1608 NONE
   CLJ_B1609 1643248 .. 1643277 +  -6.5  -5.72118   TTTTAATGTGGAAAA       TACACTTCAGTAG TATG CTTATGAAGTGTA        TTTTTTATCTTTTTT  90 84
   CLJ_B1610 1644623 .. 1644658 + -20.8  -4.75954   GTAGTTAAAATTTTT    GAACCCTAACAAATTG CTTG CAATTTGTTAGGGTTC     TTTCTTTTCGATTTT 100 17
   CLJ_B1612 NONE
   CLJ_B1613 NONE
   CLJ_B1614 NONE
   CLJ_B1615 1649068 .. 1649083 +  -3.4  -3.84825   GGAATAAAGGGATAA              TTTATT TTTA AATAAA               TTTAATATAAATAAG  52 26
   CLJ_B1616 1650717 .. 1650734 +  -2.1  -2.73635   AGACCGGATGCATTA             TTTAAAG TATT TTTTAAA              GTTTCAGCAGATTTA  38 268
   CLJ_B1618 1652887 .. 1652909 +  -4.2  -5.46698   AAATCACTACTTAAA           GTACTATTTG TAT TATATAGTAC           TTTTTTGATTTTGAA  78 27
   CLJ_B1620 1654962 .. 1655005 + -19.3  -5.28755   AAAGAAAGCATAACT TTTACCCATTCCCTTTTAA ATCCTC TTAAAAGGGAATGGGTAAG TTTTTTGCTATCTTT 100 179
   CLJ_B1622 NONE
   CLJ_B1623 1658229 .. 1658266 +  -3.6   -5.1971   ACTAAGCAGATAAAA   GCTAGAAAATTAGAAA TATAAC TATTTAAATTTCTAGC    TTTTTAATTTTTAAT  70 116
   CLJ_B1624 1660582 .. 1660601 +  -5.2   -3.2534   TCAAAATATAAATAA            TTTATTAT AATT ATAATAAA             TTAAATTGTAATGGT  53 30
   CLJ_B1625 1660891 .. 1660913 +  -5.6  -3.31792   TTCGATAGACTTGCA           GCATGGGATA AAA TATTCTGTGC           TTATGGGAATCCTAG  57 182
   CLJ_B1626 1661909 .. 1661923 +  -2.8  -3.55378   ATAAAGATTCGCTAT               GAGAAG TCC CTTATC               TGTTTATAGCTAAAT  45 144
   CLJ_B1629 1664780 .. 1664792 +  -2.7  -5.23016   TCTAGTTCTCTTAGT                TGTTG AGT TAACA                TTTTTTGAGTTATTT  69 336
   CLJ_B1632 NONE
         ogt NONE
   CLJ_B1634 1667527 .. 1667559 + -11.5  -5.46706   CACTAAAAAGTAAAA      GCAGTATGATTAATT TGT AGTCAATCATACTGC      TTTTTATTTTAAGAT 100 71
   CLJ_B1635 NONE
   CLJ_B1636 1669885 .. 1669923 +  -9.8  -5.00765   ACATGATTTTTAAAA   CACAATTCCAATGGAAAT TTT ATTTTCACTAGAATTGTG   TTTTTATAATTAATT 100 201
   CLJ_B1637 1671386 .. 1671406 +    -2  -3.94381   GAAAACTGACAGAAC            TTTTTTAA ATACA TTAAAAGA            TTTATCAGCTTCTAT  48 77
   CLJ_B1638 1672753 .. 1672772 + -10.8  -5.75538   ATAGAAATATGAATT            GTGGTACA ACGA TGTACCAC             TTTTTATTTTTTAAA 100 361
   CLJ_B1639 1674419 .. 1674462 +  -4.9  -4.33956   CAGGATCTATTTTGA TACAAGCCGGTATTTTGTGAA ATAA TTCA-GAAA-ACCGGCTTATA TTTCTATATTTTCCA  64 147
   CLJ_B1640 NONE
   CLJ_B1641 1675530 .. 1675546 +  -2.3  -2.53964   TTTTAAATGATAAAC              CTAAAAT TTT ATTTAAG              ATATCTTCTGTAATA  38 68
   CLJ_B1642 1676640 .. 1676671 + -16.2  -5.36965   TAAAAAATGCTAAAA      TAGACTTAGTTAGT TAGA ACTAACTAAGTCTA       TTTTTTATCCTATTC 100 81
   CLJ_B1643 NONE
   CLJ_B1644 1680404 .. 1680448 + -16.1  -4.18763   TAAATCAATAGTAAA GTAAATAAGTCAGCTAAGATT TAA AAGCTTAACTGACTTATTTAC TTTTAAAAGTTTATT 100 118
   CLJ_B1645 NONE
   CLJ_B1646 NONE
   CLJ_B1647 1682336 .. 1682346 +    -4  -5.30616   TTTGCTAAAGAATGA                 CTTA AAT TAAG                 TTTTTCTTTAAATAC  75 89
   CLJ_B1650 1686124 .. 1686154 +  -9.9  -3.89971   TTTATTTGTAATTAA       GAGCATTTAATCT TATAT GGATTAAGTGCTC       TTTGCTATGATTATA  93 47
   CLJ_B1653 1688054 .. 1688069 +  -7.6  -5.93809   AATCAACCTTTAAAA              TCAACC GAAA GGTTGA               TTTTTTTTGTGAAAG 100 77
   CLJ_B1654 NONE
   CLJ_B1655 NONE
   CLJ_B1656 NONE
   CLJ_B1657 1693562 .. 1693589 + -10.8  -5.63504   AATATTTTATGGCAA        CTAGCTTAGTAT ATTA ATATTAAGCTAG         TTTTTTTATAAAATT 100 54
   CLJ_B1662 NONE
   CLJ_B1663 1699173 .. 1699183 +  -2.6  -3.53091   CTTTGGATTGAAATT                 TTTA AAA TAAA                 TTTAGGAGGAAAAAT  45 16
        queD NONE
   CLJ_B1665 NONE
        folE 1700877 .. 1700915 +  -2.6  -3.16982   AATAAATTAATGATG   CTTTATACAAAATAAAGA AGT TTTTAGTTTTGGATAGAG   GTTTATTAATATAAA  42 11
   CLJ_B1667 1701725 .. 1701740 +  -3.4  -3.25162   TTGAAAAAGAGTATT              TAAAAT AATA ATTTTA               TATGTATTGTTTGTC  46 18
   CLJ_B1668 1702922 .. 1702938 +  -2.3  -3.28924   TAAATATTATATTGG              GAATTTA TTA TAAATAC              TTATAAGGGAGAATA  41 157
   CLJ_B1669 1703792 .. 1703815 +  -7.5  -5.09225   AAAAGGAATTTATAG          GACTAAGTC AACAGA GGCTTAGTC           TTTTTTAGATACAGT  90 106
        deoC 1704684 .. 1704715 +  -9.7  -2.89564   AATAAACATAATAGA      TTGTTAATCTGTT TTTTAT AACAGATTAGCAA       TCTATAGGATAAAAA  76 36
        rbsK 1705971 .. 1706006 + -16.4  -4.37886   ATATATTTTTAAAAA    CAAAGAACCCCTATAC ATTA GTGTAGGGGTTTTTTG     TTTTGTGGAAAATAA 100 73
        hisZ NONE
        hisG 1708364 .. 1708374 +  -2.6  -2.77148   TTTAGTGAGTTGATG                 TATT TTT AATA                 TACTATCTTACTAAA  40 70
        hisD 1709701 .. 1709715 +  -3.6  -3.30781   ATAACAATAATTTTT               CATTTT AGT AAGATG               TTAAGTTTAAATTGA  49 18
        hisB 1710421 .. 1710435 +  -2.1  -2.63102   GAATAAATGGAGTTA               TGTCT ACTAA AGGCA               TACTATAGAAATAAT  38 3
        hisH NONE
        hisA NONE
        hisC NONE
        hisF 1713911 .. 1713926 +  -2.6  -3.08813   AAGAAGGCTTTAGTG              TAAGAC TTTA GTTTTA               TGTATTAAAATGGGG  41 15
        hisI 1714465 .. 1714487 +    -7  -2.88452   GATAGAAAAGATAAG           CCGGTAGAAG GTT CTTATACTGG           ATATTTGTTTGAAAA  63 209
   CLJ_B1682 NONE
   CLJ_B1683 NONE
   CLJ_B1684 1716328 .. 1716376 + -16.7   -5.0133   TTATAGGTACATTAA TATTAAAGAAGTTTATATTAT AAAATAG ATAATATAAACTTCTTTAATA TTTTTTAGCAGAATC 100 3
   CLJ_B1686 1718813 .. 1718827 +  -5.6  -3.23711   TTATTTATAAATACA               GCCACT ATA AGGGGC               TTAATACCTTGTACA  56 51
   CLJ_B1687 1720615 .. 1720654 + -12.4  -2.94872   ATAATTATAAGGATT  CTATGGTTCAAATGGAGT TTTT ATTTCAATTGAACCATAG   TAATTCTTAACTAGC  90 72
   CLJ_B1688 1722061 .. 1722100 + -10.4  -4.77757   TATTATAGAAAGAAA  TCACTAAAAATCAACTATA GTA TA-AGTTGTTTTTTAGTGA  TTTTAATTTTTAAAA 100 109
   CLJ_B1689 NONE
   CLJ_B1690 NONE
   CLJ_B1691 NONE
   CLJ_B1692 NONE
   CLJ_B1693 1726618 .. 1726657 +   -14   -4.4078   TATTATAAAAATAAA  TCACTAGAAATTAATTAG AGTT CTGATTAATTTTTAGTGA   TTTTAATTGGAAAAA 100 98
      arcA_2 1728341 .. 1728394 +    -8  -4.18494   CTTAAGATAACCCAA TTATTTAGAT-ATGTTAACATAAAT TATAT AATTATGTTAACATAATCTATATAA TTTTGCATGAAAATC  77 31
        arcD 1730071 .. 1730091 +  -7.6  -4.89852   ATATAAATAATAAAA            GGATAGCC TTAGT GGTTATCC            TTTTTCTACATATAC  86 218
   CLJ_B1697 1731753 .. 1731765 +  -2.7  -4.32482   GAAGAAACTAAAATA                TAAGG TCT CTTTA                TTTTAAGTTGTAAAT  53 64
   CLJ_B1699 1732647 .. 1732657 +    -4  -2.85813   TACAAACTGAATAAT                 TGTT TGA AACA                 TCGTATTATTGAAAT  45 27
   CLJ_B1700 1733115 .. 1733148 + -18.5  -3.10522   TTTTTATATTAGAAT     GGACAGCTTAATATA AAAA TATATTAAGCTGTCC      TATATTAAATAAAAT 100 306
   CLJ_B1702 NONE
   CLJ_B1703 1738272 .. 1738300 + -11.8  -5.48054   CTGTTTATTTCTAAA        CCACACTTCGGT ATTCA ACTGGAGTGTGG        TTTTTTAATTTTGAT 100 226
   CLJ_B1706 1740056 .. 1740091 +  -3.4  -5.71712   TAGATAATGAAAAAA    CCAGACAATACATAGAT TTA ATCTGTG-ATATTCTGG    TTTTTTTATATGAAG  77 34
   CLJ_B1707 1741438 .. 1741462 +  -2.2  -6.17033   AATAAATTATAAAAA          TGTTCTAAAG TGATT TTTTGGAGCA          TTTTTTATTTTTTTT  82 46
   CLJ_B1708 NONE
   CLJ_B1709 1745085 .. 1745116 +  -7.5   -5.2166   AAACAAGGAGAAGAA      TAAAAGGATAGTC TTAACT GGCTATTCTTTTA       TTTTTTAAATTATTA  93 64
   CLJ_B1710 1746558 .. 1746570 +  -3.5  -2.65547   ATTTAGCATAATAAG                TTAAT AAA ATTAA                TGAATTTGAAAATTT  43 143
   CLJ_B1711 1747772 .. 1747795 +  -6.8  -3.42574   AGTTTAGAACTATGA          GTATTAGTTC TAAA GGACTAGTAC           TTATAGTAGAATTAA  64 117
   CLJ_B1712 NONE
   CLJ_B1713 NONE
   CLJ_B1714 1752097 .. 1752152 + -16.7  -3.30781   ATTTAAAAAAAGTAA TA-GGACAGTTCACAAATTTTAAGTT ATTTC AACTTAAAGTATGTGAACTGTCCATA TTAAATTTCAGTTAG 100 35
   CLJ_B1715 1753052 .. 1753089 + -13.9  -2.69601   CATAAGGCAATAACA   CTTTAAATCTTCTTATCT TAA AG-TAAGAAGATTTAAAG   TGAGTTTGATATAGA 100 141
   CLJ_B1717 1755316 .. 1755327 +    -3   -2.8547   AACATTTTCTTATAT                CTAT TAAT ATAG                 TATAGTATAGGCCGT  40 58
   CLJ_B1718 1755961 .. 1755983 +   -10  -4.99134   CACATCTTTTAAAAA           CATACCTATT TTC GATAGGTATG           TTTTTGCTTTGGAAT 100 147
   CLJ_B1719 1756270 .. 1756285 +  -3.2  -3.94381   AATGGCAAGACCTAG              CCCAGA TCCA TCTGTG               TTTCTAGCCTTATCT  54 180
   CLJ_B1722 NONE
   CLJ_B1723 1760910 .. 1760936 +  -6.6  -6.02919   ATATAAATAAAAAAA         TCCCCTAAGAAT TCA ATCCTTAGAGGA         TTTTTTTATTTATAA 100 127
   CLJ_B1728 1764451 .. 1764462 +  -2.2  -2.56095   AGAGGATAAAAAACT                CTAC AAAG GTGG                 TGGATTCCATGTACG  38 45
   CLJ_B1729 1764693 .. 1764737 + -16.1  -4.21314   TTAGAAGTAAATAAA TGAGGGGATATTTCAAGATTA AAT TTATTTTGAAATATCCCCTTA TTTTAAAATATTATT 100 68
        metF 1769923 .. 1769936 +  -2.5   -2.5789   TAGCAGTTTAAAAAA               TAATA CTAA TATTA                GTTCATAGTGTTTGC  39 30
   CLJ_B1733 NONE
   CLJ_B1734 1773286 .. 1773309 +  -6.8  -4.56629   GTTAAACACATAAAA          CACTTACC TTTATACC GGTAAGTG           TTTTGTAGTCTTGTA  77 185
        acoR 1777315 .. 1777330 +  -7.6  -5.79595   ATTAACCTATGAAAA              CCTTGT ATTT ACAAGG               TTTTTTCTTTTGGCA 100 95
   CLJ_B1738 NONE
        acoA NONE
        acoB 1779776 .. 1779797 +  -3.7  -3.14564   CTAACCTAAAGAAAC           ATAAAGGGG TGGT TCCCTTTAA            TTAATAGGAGGATAA  48 37
   CLJ_B1741 NONE
        acoC NONE
        acoL NONE
   CLJ_B1744 1783858 .. 1783907 + -17.7  -3.34715   AATTTATTTTTAAAG TAGAAAAGAAAAAGTATTTCACT AAAA AGTGAAATACTCTTTCTTTTTTA TATTTAGACAAAATA 100 107
   CLJ_B1745 NONE
   CLJ_B1746 1786939 .. 1786975 +  -5.4  -5.64274   TTCTATATAAAGCAA   TAGCGGTAGTTATATAT TAGG AT-TTTAACTACCGTTA    TTTTTTTATAAATAA  86 123
        thrC NONE
        thrB NONE
   CLJ_B1749 1791106 .. 1791118 +  -2.7  -4.74103   TAAGAAAGACTATAT                TCTTT GAA AAGGA                TTTTTAAGTTCAAAG  59 163
       hom_1 1792941 .. 1792956 +  -4.8  -3.10192   ACCAATCTTTATAGG              TTCAAA TAAA TTTGAA               TATAATTTACTTTTC  52 498
   CLJ_B1751 1795139 .. 1795173 + -12.4  -5.65496   TTTATACAGTAAAAA     ACAGCTTAATGTATAG TTT TTATACATTAAGCTGC     TTTTTATTTTTAGTG 100 171
   CLJ_B1752 1796720 .. 1796757 + -14.5  -3.22877   TTGTATAACTTATAA   CTTTAAAACTTCCTTTT TAAA AAGAGGAAGTTTTAGAG    TTGCATATTACTTTA 100 76
   CLJ_B1753 NONE
      gltA_1 1799283 .. 1799304 +  -5.2  -5.83211   ATTAATTATAAAAAA           CTTCAACG TGATTT TGTTGAAG            TTTTTTATTTTAATA  88 41
   CLJ_B1755 1801474 .. 1801520 +    -2  -4.94972   ATAAATGACATAAAA GAGTTTGAT-T-CTCTAGAA TCTTAAATT TTTTAGAGTAGATCAAACTC TTTTTACTTATACTA  61 72
   CLJ_B1756 1802813 .. 1802843 +  -2.7  -5.43414   AATATTTATTTAGAA      TGCCGTATTATTCA TAAG TGAATT-TACGGTA       TTTTTTATGTCTCAT  67 46
   CLJ_B1757 1804093 .. 1804126 +   -12  -5.01546   TTAGATTATAAAAAA     GAGTCAAGTAATAT GATGGG ATATTACTTGGCTC      TTTTTATATGGATTT 100 109
   CLJ_B1758 1805549 .. 1805576 +  -7.8  -4.67353   ATTAAATATCAAAGA        GCACTTAAGG AATATAAA CCTTAGGTGC         TTTTTGCATACCTAA  83 40
   CLJ_B1759 NONE
   CLJ_B1760 1806306 .. 1806339 +  -8.3  -3.46858   CTTATATTAACTAAG     GGCCACCTATAAA TAATTAAT TTTATAGATGGCC      TGTGTTTTAATCTAA  74 84
   CLJ_B1761 1806776 .. 1806789 +  -3.8  -6.20267   GGTTAAGTTTTAAAA               GGCT AATAAG AGCC                TTTTTTTATTTTTAA  87 35
   CLJ_B1762 NONE
   CLJ_B1763 1808927 .. 1808957 + -12.8  -3.14587   AATTAAACATATAAA       CAAAAACCGTAC TAAAAAC GTACGGTTTTTG       TCTCGTTTTATAAAA  95 35
   CLJ_B1767 NONE
   CLJ_B1768 NONE
   CLJ_B1769 NONE
   CLJ_B1770 NONE
   CLJ_B1771 1813740 .. 1813752 +  -2.7  -3.64703   AATTTAAAGAAATAG                CAGAA ATA TTTTG                TTTGGATCCAAGCAC  45 202
   CLJ_B1773 NONE
   CLJ_B1774 NONE
   CLJ_B1775 NONE
   CLJ_B1776 NONE
   CLJ_B1777 NONE
   CLJ_B1778 NONE
   CLJ_B1779 NONE
   CLJ_B1780 1816954 .. 1816966 +  -2.7  -2.52623   AAACTGAAAATGGCT                TTACA AGA TGTGA                GTGTTATAAAAAAGA  39 79
   CLJ_B1781 NONE
   CLJ_B1782 NONE
   CLJ_B1783 NONE
   CLJ_B1784 NONE
   CLJ_B1785 NONE
   CLJ_B1786 NONE
   CLJ_B1787 NONE
   CLJ_B1788 NONE
   CLJ_B1789 1820483 .. 1820495 +  -3.5  -3.32963   CTAATATTGTAGGGA                TAATT TGA AATTA                TTATGCACTAAAAAT  47 49
   CLJ_B1790 NONE
   CLJ_B1791 NONE
   CLJ_B1792 NONE
   CLJ_B1793 NONE
   CLJ_B1794 NONE
   CLJ_B1795 1822182 .. 1822193 +  -4.4  -2.99319   TACAAAAATATTAAG                TACC TATA GGTA                 TATATCTAGGCACTT  50 47
   CLJ_B1796 NONE
   CLJ_B1797 NONE
   CLJ_B1798 NONE
   CLJ_B1799 NONE
   CLJ_B1800 NONE
   CLJ_B1801 NONE
   CLJ_B1802 NONE
   CLJ_B1803 1824670 .. 1824683 +  -2.5  -3.33261   GATTAACGCAATAGC               TTATA GTAC TATAA                TTATAGGGATTACAA  44 35
   CLJ_B1804 NONE
   CLJ_B1805 1825442 .. 1825458 +  -3.1  -3.11359   TAGAATGGGAGGAGA              TTTTTTA TAA TGAAAAA              CTTTGATTTTGGAAA  45 16
   CLJ_B1806 NONE
   CLJ_B1807 1826678 .. 1826697 +  -5.7  -3.57825   AAGGGCAACTGCAAA            GCATCCA TTAATT TGGGTGC             TTCCTATTTTATAGA  59 124
   CLJ_B1808 1827028 .. 1827056 +  -4.6  -4.96848   TGTATGTACTAAAAA        GCACTTAGCATA GTAAA TATGTTAGGCGC        TTTTTATATAGAAGA  70 178
   CLJ_B1810 NONE
   CLJ_B1811 NONE
   CLJ_B1812 NONE
   CLJ_B1813 1829432 .. 1829444 +  -2.7  -2.78679   AAGATGAAATAAGAG                GAAGT AGT ATTTC                GTTTGACTAAGGAGG  40 3
   CLJ_B1814 NONE
   CLJ_B1815 NONE
   CLJ_B1816 1832342 .. 1832357 +  -6.2  -5.79595   AAAATTGAACTGTAA              GTCTTA TTTA TAAGAC               TTTTTTATTTTGCCC  87 26
   CLJ_B1817 NONE
   CLJ_B1818 NONE
   CLJ_B1819 NONE
   CLJ_B1820 NONE
   CLJ_B1821 NONE
   CLJ_B1822 NONE
   CLJ_B1823 NONE
   CLJ_B1824 NONE
   CLJ_B1825 NONE
   CLJ_B1826 NONE
   CLJ_B1827 NONE
   CLJ_B1828 1838481 .. 1838492 +  -2.2  -3.16676   ACTTATTAGATAAAT                TTGG AAAG CCAG                 TATTAGGTTAATAGG  41 3
   CLJ_B1830 NONE
   CLJ_B1831 1839787 .. 1839808 +  -6.6  -5.04082   AAATAAGAACTTAAA           GCACTTAC TTTAAT GTAGGTGC            TTTTATTATTGTTTG  80 60
   CLJ_B1832 NONE
   CLJ_B1833 NONE
   CLJ_B1834 NONE
   CLJ_B1835 NONE
   CLJ_B1836 NONE
   CLJ_B1837 NONE
   CLJ_B1838 NONE
   CLJ_B1839 NONE
   CLJ_B1840 NONE
   CLJ_B1841 1848518 .. 1848528 +  -2.6  -2.63102   ATTGACAAATTTTCG                 TATA TCA TATA                 TACTATACAAATGAT  39 193
   CLJ_B1842 1849113 .. 1849125 +  -4.8  -5.54338   TAAAGGCAAAGTAAG                CACC GAGTA GGTG                TTTTTATTTTGCTTA  79 198
   CLJ_B1843 1849974 .. 1849985 +  -2.2  -3.24422   GTATTTAATATAGCT                CCTT TTTA GAGG                 TGATTTTTGGAGGTG  41 17
   CLJ_B1844 NONE
   CLJ_B1845 1850426 .. 1850445 +  -5.7  -5.80817   GTGAAAGAAAGTAAA            GAGCAGG AATAAA CCTGTTC             TTTTTTTATATTAAA  86 14
   CLJ_B1846 1851236 .. 1851265 + -15.2   -5.4505   AAGATATTAAATTTA       GAAGGTAGTTCC TTAATT GGAACTACCTTC        TTTTTTATTGACAAA 100 31
   CLJ_B1847 1851920 .. 1851948 + -16.9  -6.09888   TAAGCTATCAATTTT        GAGGGTACTTCTA TAA TGGAAGTACCCTC        TTTTTTTTATTGGAA 100 10
   CLJ_B1848 NONE
   CLJ_B1849 NONE
   CLJ_B1850 1852810 .. 1852833 +  -4.5  -5.49729   AATAAAAATAAAAGA          GGCAGCTTC TTAAAT GGAGCTACC           TTTTTTTAACTACTT  78 36
   CLJ_B1851 1853516 .. 1853538 +  -8.5  -4.99134   ATATAAATAAAAAAA           CTCTAGAGG GTTAA CCTTTAGAG           TTTTTCATTTGACGT  91 43
   CLJ_B1852 NONE
   CLJ_B1853 NONE
         alr 1856674 .. 1856712 +  -9.8  -5.17786   ACGGTTTTAAGTCTG   AACACCTAATTCTTCA GATACCA TGAGGAATTAGGTGTG   TTTTTAATTTTCTTA 100 189
   CLJ_B1855 1858472 .. 1858495 +  -4.1  -3.48506   AGGAAATATAATTGA          TTATATTAA TAGTTT TTAATATAA           TATTTAATGCATTAT  51 63
   CLJ_B1856 1859898 .. 1859933 +  -5.6  -4.72729   AAAATAAATAATGAA    CCCTGTTTAATTAT TGAGAAAT ATAACTAAGCAGGG     TTTTAATTTTGCTTC  71 61
   CLJ_B1857 1861009 .. 1861043 +  -8.7  -5.56264   TTTAAAAGATGAAGA     CCTATGAAATCCTTA TATTT TAAGGAGATCATAGG     TTTTTTATATTTAAA 100 99
   CLJ_B1859 1864107 .. 1864145 + -15.5  -5.50723   TTTTATGTTCATACA   TCCCTATTTAGCTAGGC GAGAA GCATGGCTAAATAGGGA   TTTTTATTTTAATAA 100 51
   CLJ_B1861 1868387 .. 1868425 + -10.5    -3.376   AAATTTTAAATAGAA   GATGGTGTCTGAAAACA TATTT TATTTTGAGACACCATC   TCTTATGTAATTAAG  90 32
   CLJ_B1863 1870034 .. 1870046 +  -3.5  -2.78596   TTTTTTCAAAAATAA                TAAAT TAC ATTTA                TGTAGTGAAAAAATA  43 91
   CLJ_B1864 1871677 .. 1871705 +  -2.5  -3.42459   GTATCTCATAGTAAA        TTAACTTATTTAC AAA GAAAATAAGGTAG        TTGATATTATGAATA  44 2
   CLJ_B1865 NONE
   CLJ_B1866 NONE
   CLJ_B1867 1874804 .. 1874818 +  -2.8  -2.73741   TTTTAGTATCTATAT               CACTAA ATG TGAGTG               CTTCTAGTTCTCCCT  41 485
   CLJ_B1871 NONE
   CLJ_B1872 1877664 .. 1877680 +  -2.4  -3.58905   AGAGTTCCTAAAAAG              TATTTT GAAGA AAAATA              TTATATCTAAGGAGT  44 168
   CLJ_B1874 NONE
   CLJ_B1875 NONE
   CLJ_B1876 NONE
   CLJ_B1877 NONE
   CLJ_B1878 NONE
   CLJ_B1879 NONE
   CLJ_B1880 NONE
   CLJ_B1881 NONE
   CLJ_B1882 NONE
   CLJ_B1883 NONE
   CLJ_B1884 NONE
   CLJ_B1885 1881826 .. 1881840 +  -2.9  -4.07687   GGAGAATAGACACAA               TACAA AGAAA TTGTA               TTTTAGAAAGAGGGT  51 32
   CLJ_B1886 NONE
   CLJ_B1887 NONE
   CLJ_B1888 NONE
   CLJ_B1889 NONE
   CLJ_B1890 1883049 .. 1883061 +  -3.5  -3.32963   CTAATATTGTAGGGA                TAATT TGA AATTA                TTATGCACTAAAAAT  47 49
   CLJ_B1891 NONE
   CLJ_B1892 NONE
   CLJ_B1893 NONE
   CLJ_B1894 NONE
   CLJ_B1895 NONE
   CLJ_B1896 NONE
   CLJ_B1897 NONE
   CLJ_B1898 NONE
   CLJ_B1899 1886803 .. 1886839 +  -4.6  -4.67755   TGTATGTACTAAAGG   GCACTTGGA--ACAGACT TTT AATCTGTAATCCAGGTGC   TTTTTACATACCTGT  66 196
   CLJ_B1900 NONE
   CLJ_B1901 1887811 .. 1887823 +  -3.4  -3.00476   AATTTTTAAAATGAA                TGTG TTATT CACA                TATATAATTAAACAT  45 126
   CLJ_B1902 NONE
   CLJ_B1903 1888924 .. 1888944 +  -4.2  -3.32343   AAATAATAAATTAAA            TTAATAAA TATTT TTTATTAA            TTATAAAGCTATAGG  53 27
   CLJ_B1904 NONE
   CLJ_B1905 NONE
   CLJ_B1906 NONE
   CLJ_B1907 NONE
   CLJ_B1908 1894581 .. 1894594 +  -2.4  -2.82668   CTGGTGCTTAACTAA               GAGT TTTTAC ACTC                CTTTAAAATTTAAGG  39 30
   CLJ_B1909 1894861 .. 1894878 +  -3.5  -2.89921   TTAAAAAGTATTATA             TTGCAAT TACA ATTGTAA              TATATAGGAGTTGAT  43 8
   CLJ_B1910 NONE
   CLJ_B1911 NONE
   CLJ_B1912 1895890 .. 1895910 +  -2.7  -3.55761   AATATTCCTTAAAAA            TATAAAATA TGT TATTCTATA            TTTGGGGGGTGCATA  45 48
   CLJ_B1913 1896354 .. 1896372 + -11.8  -5.79595   AAATATAGGGATTAA             GAACATGC AAT GCATGTTC             TTTTTTATTTTGGAG 100 26
   CLJ_B1914 NONE
   CLJ_B1915 NONE
   CLJ_B1916 NONE
   CLJ_B1917 1901348 .. 1901369 +  -5.9   -5.7946   ATGCAAAATATGTAA           GGTGTAGTT TTAT AACTATGCC            TTTTTTTATTGGGGG  87 26
   CLJ_B1918 NONE
   CLJ_B1919 NONE
   CLJ_B1920 NONE
   CLJ_B1921 NONE
   CLJ_B1922 NONE
   CLJ_B1923 NONE
   CLJ_B1924 NONE
   CLJ_B1925 NONE
   CLJ_B1926 1907202 .. 1907219 +  -4.3  -2.70354   AATATGTAGAGAAGA             TTTTATT ACAC AATAAAA              TAAATTTATAAAAGC  48 32
        uviB NONE
   CLJ_B1928 1907661 .. 1907683 +  -4.9  -6.36459   AGTAAGGATAGAAAA           GAGCAAGAC AAATA GTTTTGTTC           TTTTTTTTTATTAAA  95 11
   CLJ_B1929 1908486 .. 1908508 +  -4.8  -5.25799   GATATTAATTTTAAA           GGTACTCCTG TAA TGGGAATACC           TTTTTGTATTATTTT  74 33
   CLJ_B1930 1908914 .. 1908935 +  -7.3  -4.59081   ATTATTTAAATAAGA           GAACCCC AATAAAAA GGGGTTC            TTTTGTATGGATTTA  79 55
   CLJ_B1931 1909037 .. 1909065 + -14.7  -4.66537   TAAACTATCAATTTT        GAGGGTACTTCGA TAA TGGAAGTACCCTC        TTTTCTATTGGAAAA 100 10
   CLJ_B1932 NONE
   CLJ_B1933 NONE
   CLJ_B1934 NONE
   CLJ_B1935 1909960 .. 1909990 + -11.4  -4.21141   AATTAAATATATAAA       TAAAAACCGTAC TAAAAAC GTACGGTTTTTA       TTTGATTTCTTAAAA 100 70
   CLJ_B1936 1911151 .. 1911174 +  -6.8  -3.78775   AAATAAAAAAATAAA          GGCGTACCATA GCT TA-GGTATGCC          TTTAATCATAGCAAA  68 145
   CLJ_B1938 1913183 .. 1913208 +  -9.8  -3.46285   TGCAAAATTATAAAG         CAGCCTCTAT GAGTGA ATAGGGGCTG          TTAATATTTAAAGTG  87 105
   CLJ_B1939 1914079 .. 1914123 + -12.6  -5.10029   AATTAGTATTATTAG GAAGATAGCGTATCAAAAATA AATC TA-TTTTGATACACTATCTTC TTTTTTCAAATTAAT 100 95
   CLJ_B1941 1916244 .. 1916260 +  -8.1  -3.64703   AGTATACAAAATAAA              TGGTATA TTA TATACCA              TTTACATAAAGGAGA  75 136
   CLJ_B1942 NONE
   CLJ_B1943 1917037 .. 1917064 +  -3.6  -4.27192   ACAAGAATAGTGGAG        GTGATAATATAA TGAT TTATACTATTAC         TTTTAATCCAGCTTT  58 40
      pfkB_1 1918036 .. 1918067 +  -8.9  -3.15574   GGTTTAATAAATTAA      TAAAAATCCCACA ATAAAA TGTGGGACTTTTA       TATTAATCAAATTGC  75 108
   CLJ_B1946 1920073 .. 1920093 +  -5.5  -5.42259   TTTATAAATAATAGG            TATGCATTA GGG TAAAGCATA            TTTTTTTGGACATCA  81 70
   CLJ_B1947 1921219 .. 1921264 + -16.7  -3.41422   ATATACATGAGTTAA TTCTATATGTATTACTTCAAA ACTC TTTAAAGTAATACATATAGAA TTATAAGCTTATTTT 100 90
   CLJ_B1949 1922210 .. 1922226 +  -2.4  -3.23447   TGGTGGATTATTTGA              TAAATA GATAA TATTTA              TATTGTGGAGGTTAC  41 19
   CLJ_B1950 1923308 .. 1923335 + -14.4  -5.33405   TTTTAACAATAAAAA        TCTGTGAGTAAA ATAT TTTACTCACAGA         TTTTTATTTAATGCC 100 127
   CLJ_B1953 1927239 .. 1927275 +  -9.7  -5.49234   AATTTAAAATATGAA    TTGAAGAAGTATGGTGA TGC TTAGTATACTTCTTCAA    TTTTTTATTAAATAT 100 47
   CLJ_B1955 NONE
   CLJ_B1956 1930535 .. 1930579 + -14.6  -3.38727   TCATTTGTCATAGGA TTAAGCGACTCGCTGCAAAT CTGTT ATTTGTAGTGAATCGCTTAA TTAGTTAGAATTATT 100 92
   CLJ_B1958 1933138 .. 1933176 + -10.4  -5.08255   TTAATAACATAAAAA   GGTGGTGTCTTAAAATAA AAG TTATTTTGAGGCTCCTCC   TTTTGTTTTGAAAAT 100 42
   CLJ_B1959 1934289 .. 1934324 +  -2.8  -4.99947   TAAATAAAAGAAAAA   GCATCTGCTATATTGG ATATAA CCAA-A-AGTAGATGC    TTTTATTTAATTAAA  62 34
        dbpA 1935959 .. 1935994 + -11.6   -4.1552   GTCAGAATAATTTAA    TCTATTTATATAATAT TTGG GTATTATATAAATAGA     TTTATTAAGAAAATA 100 79
   CLJ_B1961 1940561 .. 1940609 + -11.5  -2.67717   TTTAATTTAAAATCA CAAAGGGATTTAACATATAATT ATTAAA AATTA-GTGTTAGATCCCTTTG TAGATTCTTAAATTT  86 68
   CLJ_B1962 1945030 .. 1945065 + -11.6  -5.06052   TATATAGGAATAAAG    GAGAATTAACATTTTTA TAT TAAAAA-GTTAATTCTC    TTTTCTATTTTTTAG 100 75
   CLJ_B1963 1946343 .. 1946381 +  -7.8  -4.43309   CTAGTAAATTATTAA  TACTCCCTATTATCACAA CTAGA TTGTGA-A-TAGGGAGTA  TTTTAATTAAAATTG  81 55
   CLJ_B1965 NONE
        cheX 1948913 .. 1948942 +  -8.1  -4.24726   TTTATTTAATATAAA       TAAGCACTTAT AACTTTGA ATAAGTGCTTA        TTTTAAAATTATTCT  80 81
   CLJ_B1968 NONE
   CLJ_B1969 1951648 .. 1951682 + -11.7  -4.42851   AAGCAATTTAATTGA     GGAATCATACAAGAA TTTAT TTCTTATATGATTCC     TTTTAAATTTATTAG 100 82
        xerC 1954200 .. 1954218 +  -3.2  -4.04187   ATTGGTAAAGCACTT             TAAAATCT TAT AGATTCTA             TTATGTTTTATACTG  54 223
        lexA 1955777 .. 1955816 + -11.9   -5.1485   GATTGTTAATAAAAA  TAATTCCTAGAAGT-ATT AAGAG AATAACTTCTAGGAATTA  TTTTTATATTAATTC 100 97
   CLJ_B1980 1966654 .. 1966701 + -11.7  -3.04269   ACTTACTAGATAAAA TAAATTATCTCCTTTTAGGTT AAAATA AAACTAGAAGGAGATGATTTA TGTGTATGATGTAAA  90 61
   CLJ_B1981 1966861 .. 1966871 +  -2.6  -2.64962   AGAGAATATATTTTA                 TTAA GAT TTAA                 ATATATTTATTAAAT  39 22
      aspB_1 1968114 .. 1968130 +  -7.3  -5.58522   ATAGCAAATAAAAAA              TAACCCT TTT GGGGTTA              TTTTTATTTTATGTA  91 30
   CLJ_B1995 1983882 .. 1983933 + -14.8  -3.84961   ATATAATTATAAAAC TAACAAAGCAAAGATGCCCGCTGT TTTT ATAGCGGGTATTTTTGTTTTTTTA TTTCCTCATTGAGTA 100 71
   CLJ_B1996 1986249 .. 1986291 + -25.4  -3.37727   TTAAACTTTAATTAA TATAAAATGGGACCTAGATT AAA AATCTAGGTCCCATTTTATA TTCCTATATATATTA 100 30
   CLJ_B2001 1990913 .. 1990966 + -14.5  -3.34236   ACGATAAAGATTAAA TTAAAAGGCTATAATTTTT-AGAATA TTA TATTCTTAGAAGTTATAGCCTTTTGA TTATAAAATAAGTTT 100 49
   CLJ_B2007 NONE
   CLJ_B2008 NONE
   CLJ_B2009 1996790 .. 1996804 +  -2.2  -4.48333   GTTTTTAATAAATTA               TTATTA TAA TGATAA               TTTTAATTCATCTAT  54 97
   CLJ_B2010 1998615 .. 1998644 +  -6.5     -2.84   AAGTAGTTAATCTAA       TGTGGAAAAGTCA TTTT TGGCTTTTTCACC        TAGTTCTCACATCCT  61 49
   CLJ_B2014 2001425 .. 2001463 +   -15  -3.02947   GATATAAAAAGTTAG   GTAGGGTTAATATTTT TTTACTT AAAATATTAACCCTAC   TATATATAATAAATA 100 126
   CLJ_B2015 2002039 .. 2002063 + -13.7  -4.54821   AAACGTTCTAGGATC          GGCTTAGTGTT CTC AGCACTAAGCC          TTTTCTAATTAGAAT 100 152
   CLJ_B2017 2003300 .. 2003324 + -13.7  -4.54821   AAACGTTCTAGGATC          GGCTTAGTGTT CTC AGCACTAAGCC          TTTTCTAATTAGGAT 100 152
   CLJ_B2018 2003895 .. 2003920 +  -4.7  -4.88067   AATTAATAACAAAAG         CAGCCAGTTTT AATA AACACTGACTG          TTTTTCTAGATACAT  70 86
   CLJ_B2025 2014125 .. 2014165 +  -6.5  -4.09864   ATCTCAAAATTAAAA  TAGATTTAATTTTAAAGTT CGA AATATAAAAATTAAATCTA  TTTTGAGACATCCCT  71 67
   CLJ_B2027 2016031 .. 2016071 +  -5.1  -3.48772   AGAGCATAAAATAAA  TTTATTAATGAAATTTTTA AGA TAAAAAATCTATTAATAAA  TTATATAAGGAGGTT  56 32
        ytfJ 2016539 .. 2016561 +  -6.3   -4.2243   GAAATCTAAATAAAA           GCCCCTA TTACATACT TAGGGGC           TTTTACACTATTTCT  70 32
   CLJ_B2041 2027825 .. 2027838 +  -3.1  -4.49716   TCTCTAAAGGATTCT               TTGCC ATTG GGTAA                TTTTACCTTTTGTTT  60 519
   CLJ_B2097 2071344 .. 2071380 + -11.2   -5.4433   AATACACAATAAAAA    GAATGTCAAAAATATA ATAGG TATATCTTTGACATTC    TTTTTATTTATATCT 100 290
       fbp68 2087815 .. 2087825 +    -4   -3.6215   TCCAAAAGAACCTAA                 TTTG AAA CAAA                 TTTAGAATAGATTAA  51 10
      truA_1 2088769 .. 2088799 +   -12  -3.16288   CCCCTAAAGGATAAC       GACTTCTAAGGAGT AAA ACTTCTAAGAAGTC       TGTTAATAAGCTTTA  93 155
   CLJ_B2119 2091633 .. 2091666 +  -9.5  -3.44553   AAAGAGAATGACAGA     CCGGTGGAGAAAACA ATGA TGAAGTCTCCACCGG      TTATACAATTTTTAA  82 174
   CLJ_B2123 NONE
   CLJ_B2124 NONE
   CLJ_B2125 2100413 .. 2100432 +  -2.8  -3.97102   GCTATTTTGAGACAT            CCTCTTTC ACCA GAAAGGAG             TTCTTAATTTTGCAT  49 303
   CLJ_B2127 2102142 .. 2102189 +  -5.3  -4.17448   TTAATACTAATAAAA TACTTAAAAGCTGTAAATAATT CTCGA AATT-TTTACAGCCTTTAAATA TTTCTAATTTGATTC  64 52
   CLJ_B2133 2107448 .. 2107459 +  -4.4  -3.21099   CATTTAATTTTACAT                TGCT TCCA AGCA                 TTAATAGTAAAAAAA  51 94
   CLJ_B2136 2112874 .. 2112888 +  -4.4  -2.98457   TAGGAATAAAAAATA               TTATTT TAA AAATAA               ATTAATTTTTTGTAA  50 6
   CLJ_B2137 2113521 .. 2113566 + -13.7  -3.01918   TGTTTTTTAAAACTA TATCCCCTTAATTTATTATTA TATA TAATAATAAATTAAGGGGTAA TCATTTATGGAATAA 100 100
   CLJ_B2156 2132729 .. 2132778 +  -5.5  -4.89063   GCATTTAAATAATAT GTTTTCT-ATGATTAATAATTCTT CAA AATAATTATTAATCATAATAGAAC TTTATTTTTCAATAA  73 341
   CLJ_B2160 2138275 .. 2138314 +  -2.2  -5.02777   AGAAACTTTAGAAAA  TGACTTAACATAGTATAG GCAT CTGCCATATGTTGAGTCA   TTTATTTTTGTATCT  61 13
   CLJ_B2161 2139420 .. 2139454 +   -16  -3.58269   TTTTATACGTTAATC     TGAGAAGAGTCAACAA GAA TTGTTGACTCTTCTGA     TTTAGAAATCCCTTC 100 28
   CLJ_B2162 NONE
   CLJ_B2163 2143586 .. 2143617 + -11.8  -4.66625   TAAGACTTATAAAAG      GCAGTGCTAAGTATA TTA TA-ACTTGGCACTGC      TTTCTTTCTATATGT 100 136
   CLJ_B2170 2151019 .. 2151069 + -15.1  -5.38497   CAAAGATAGTAAACT GTACCCTGTAAGATAAACACAG AAAAGAGG CTGTGTTAA-CTTACAGGGTAC TTTTTTCCTTTCAAT 100 32
   CLJ_B2171 NONE
   CLJ_B2172 2154627 .. 2154662 + -10.7  -5.26316   GGTTAAGTATATGTA    AGTAGGTAAATTTGT ATAAAA ACAAATTTACCTACA     TTTTTTATAGCATAA 100 70
   CLJ_B2181 NONE
   CLJ_B2182 NONE
   CLJ_B2183 NONE
   CLJ_B2184 2168756 .. 2168791 + -11.5  -3.45788   ATCAAAATATTAAAG    GTCAAAGTATAAAAA CAACTT TTTTTATACTTTGGC     TCTTATATTATACGC  95 172
      pcaC_2 NONE
   CLJ_B2187 2171054 .. 2171091 +   -16  -5.23644   ACAGCATATTAAAAA   CCAAAATACAGAATTT ACAATA AAATTCTGTATTTTGG    TTTTTATATTTGCTT 100 29
   CLJ_B2188 2172293 .. 2172310 +  -6.3  -3.38726   TTGCTTTAATTACAG             TTGCTCC ATTA GGAGTAA              TAATTTTTTCCCCTC  63 335
   CLJ_B2191 2178361 .. 2178400 + -10.2  -3.74454   TTTATACTATTATAA  GGACTTATTTGGGTTTAT TTCT AAAAGCTCGAATAAGTCC   TATTATTATTTTTAC  90 160
        treP 2180146 .. 2180188 + -13.2  -3.34398   AAACCAATTATATCT TAAAATAGAAAA-GGAGGA TTAAAT TCCTCCCTTTTCTATTTTA TATTTAAGCAAAAGG 100 39
        treC NONE
        treR 2182691 .. 2182732 + -19.2  -4.00684   GATAGGTTTATATTT GCGCCTTTAAAATAAAAT TAAATC ATTTTATTTTAAAGGCGC  TTCTTCCTTTTATAT 100 92
   CLJ_B2201 2189003 .. 2189043 +  -8.7  -5.45802   AGGGGGGTCTCAAAA  TAGTCTTAATTTTAAAA CCGTAAA TATTAAAATTAAGACTA  TTTTTATTTTGAGAC 100 82
        gldA 2191890 .. 2191903 +  -3.9  -3.33922   TTTTTCAACATTTTT               GTTAA TTAT TTAAC                CTTTTTAGAGAGGGT  49 56
   CLJ_B2208 2197447 .. 2197494 + -19.1  -5.25799   CCCTCTTTAAATACA TCTATGTGAATATATATTTTA AAACCA TAAAATATATATTCACATAGA TTTTTATATTGTTTT 100 58
   CLJ_B2215 2205288 .. 2205321 + -12.7  -3.53387   GAAAACTTTAACAAA     TTCTAAAGAGGATAA CAAA TAATCCTCTTTAGAA      TTGATTATATATCTA  95 4
   CLJ_B2216 2206445 .. 2206474 + -16.7  -3.71378   TATAGAACATATAAA       TAATAGGAACTGC TTTA GCAGTTCCTATTA        TTTAAATATAAAATA 100 44
   CLJ_B2218 2209180 .. 2209225 +  -5.5  -3.37902   TCCCTGGATAACCAT TTCCTAAGCTTTAGTGGTAGT AAGT ACTCCCTCTGAAGATTAGAAA TCTGTTTATAGTATT  57 273
   CLJ_B2241 2228486 .. 2228503 +  -2.7  -3.66556   CATGTCAAGAAAAGG             GAATTGT TACG ACAATGC              TTGTATTGAAAGCTT  47 495
   CLJ_B2246 2233460 .. 2233470 +    -4  -3.05597   GAAATTCGTTGAAAA                 TTTC TAT GAAA                 CTTTTAACAACTAAA  46 48
   CLJ_B2247 2234524 .. 2234552 + -11.8  -5.48054   CTGTTTATTTCTAAA        CCACACTTCGGT ATTCA ACTGGAGTGTGG        TTTTTTAATTTTGAT 100 149
   CLJ_B2264 2253478 .. 2253503 +  -6.1  -5.88471   GTATTTAGATATTTA         CTGCCCTAAGT TGAA GCTAAGGGTAG          TTTTTTTTGCTCATA  90 103
   CLJ_B2269 NONE
        rfbB 2260328 .. 2260342 +  -2.8  -2.59742   AGTATGTAAAAATCA               TAAAGG AGG CCATTA               ATTATGGAAATTGAC  39 283
   CLJ_B2271 2260707 .. 2260750 + -14.1  -3.67634   ACCGATACGTAAAAG CAAG-AGAGAGGCGTTG-CCC TTAA GGGATAGCGCCTCTCTACTTG TCTTTTGAAGTAGTC 100 93
   CLJ_B2272 2261251 .. 2261294 + -10.5   -3.6543   ACCGATACGGAAAAG CAAG-AGAGAGGCGTTG-CCT TCAA GGGATAGCGCCTCTCTACTTG TCTTTTGAAGGCTTA  91 93
   CLJ_B2291 NONE
   CLJ_B2292 2285096 .. 2285131 + -15.1  -3.24245   AATATCTAACAAAAA    TACCCTTATAATACA TTTATT TGTATTATAAGGGTA     TTAACTTATAACTAA 100 66
   CLJ_B2294 NONE
   CLJ_B2295 2290571 .. 2290601 +   -12   -4.4267   AACTATATGAGAAAG       TTGACAATGAGCAG TTA TTGCACATTGTCAA       TTTTCAGTTTTAAGA 100 54
   CLJ_B2298 2293099 .. 2293122 +  -4.7  -4.71463   TTTTACTCTAAATCC          TACTAAGGT AAGATA ACTTTAGTA           TTTCTTGTTTTAGTT  68 78
   CLJ_B2331 2323680 .. 2323724 + -20.5  -5.48213   ATAACCCAGAATCAT CAAAACTAACCATCATTATAA CTA TGATAATGATGGTTAGTTTTG TTTTTGTTTTACATA 100 54
   CLJ_B2364 2360788 .. 2360806 +    -6   -3.1364   GAGTAAGCGACTCAC             ACCAAATC TGA GATTTGGG             TTCCCTGCTTAAATA  60 67
   CLJ_B2369 2364398 .. 2364434 + -15.5  -4.19506   CTTGCAAAACAAAAA    CCTATCTTAAGCATT ATATTTC AATGCTTAAGATAGG    TTTTAAAGTTAAAAT 100 56
   CLJ_B2372 2367304 .. 2367323 +  -4.4   -3.3581   TCATATCCCCATTGA            TTTTACAA GGTT TTGTAGAA             GTTTTTCCAGGTAAT  53 392
   CLJ_B2387 2382618 .. 2382645 +  -8.6  -3.14132   AAGATTGTTCATCAA        CTAAGAAAGGTA GGAA TGTCTTTCTTAG         TTGATGAACACAAAC  72 187
   CLJ_B2389 2385512 .. 2385542 +  -5.5  -5.48303   ATTATTTAATAAAAA       TCAGGACCTAC TTTATCATT GTAAGTCCTGA       TTTTTTTAAAATTGT  82 32
   CLJ_B2390 2388867 .. 2388888 +  -3.7  -3.08679   AGTACATCAACTATA           CGCTACTAT GAAG ATAGTGGCA            TCTTGCCTGCCCCAA  46 119
   CLJ_B2391 2389283 .. 2389302 +  -3.7  -4.95896   GAAGATTGCAGATAT            GAATATT TATTTT AATATTC             TTTTTATAAATTTAT  67 118
   CLJ_B2392 2389915 .. 2389933 +  -8.8  -4.61199   AAGCATTTATAAAAA             GCCCTCAC AAT GTGAGAGC             TTTTCTCTATAAAGT  89 64
   CLJ_B2398 2396147 .. 2396198 +  -5.4  -3.23094   TAAAAAACTGTATAA GGATTTCTAAGTTTAAGAGGGAAT AAAA ACTTACTCTTAAGCTTAAAAATTC GTTTGTTAATTTCCA  56 65
   CLJ_B2399 NONE
   CLJ_B2409 2410750 .. 2410761 +    -3  -2.85712   AAGGAGGTATTTAAA                TATG TTTG CATA                 TACTTGTAAATATGC  40 27
   CLJ_B2410 2412708 .. 2412718 +    -4  -3.23881   TTTCACATTCTTTTG                 CAAA ATT TTTG                 ATTTATCTTTATAAT  48 291
        fosX 2416970 .. 2416997 + -11.4  -3.60899   TTTATTAAAGTAAAA        TCCAGCTGAAAT AAAA ACTTCAGCTGGA         TTCATTTACATTTTA  95 149
   CLJ_B2419 2423326 .. 2423336 +    -4  -4.85599   TCCGCAGGCTCCCCA                 CAAA TTC TTTG                 TTTTTATAACATACA  70 510
   CLJ_B2421 2425844 .. 2425878 + -14.5  -3.48505   CGATAACTTTTTAAA     GGGACTATCCCAAAA ATAAA TTTTGAGATAGTCCC     TCTTCATTTTTAACA 100 112
   CLJ_B2424 NONE
   CLJ_B2425 2428242 .. 2428254 +  -4.9  -3.12702   CTTAAAACCAAAAGA                TCTTT ATA AAAGA                ATTTATTAAATAATA  53 4
   CLJ_B2426 2430984 .. 2430996 +  -4.9  -4.67942   TTGATAATCAAAAAT                GTTAA ACA TTAAC                TTTTAATTTATTAAG  68 14
   CLJ_B2431 2436053 .. 2436080 +  -5.6  -3.04274   AAATTTGCAATTTAA        TAGGTGGTTAAT TAAA ACTAACCACCCA         TGTACTTATTCGTTG  55 15
   CLJ_B2446 2451801 .. 2451813 +  -9.1  -4.13767   TTTTTTTGCTATTTC                GGGAG TAG CTCCC                TTTTGAGGTCCAAAA  88 514
   CLJ_B2447 2453568 .. 2453580 +  -3.5  -2.99393   TTTATATTTATATTA                TATTA TTG TAATA                TCATTCTATATTTTT  45 70
   CLJ_B2448 2453883 .. 2453896 +  -3.9  -3.42056   AGCCAAAGGTTATTG               CTATA TGAG TATAG                TTATAAATTCCAGCT  50 180
   CLJ_B2453 2457717 .. 2457751 +  -5.2  -4.91573   CAACAAAAGTAAAAA     TACTGTCTTAAAAT ATATTTA ATTTTGAGACAGCA     TTTTTGCTCTATTTT  72 103
   CLJ_B2457 2462736 .. 2462757 +    -8  -5.94214   CTACATGATAAATGC           TGCCTGCT TTAAAT AGCAGGCG            TTTTTTTGTTATCTT 100 43
   CLJ_B2461 NONE
   CLJ_B2462 2467518 .. 2467555 +  -7.1   -3.8125   ATATTAGCTTTAACA   GCATCTAAAGCTAGAGA ACTT TATCTAACTCTAGATGC    TATTTTAATTAAAGA  70 78
   CLJ_B2477 NONE
   CLJ_B2478 2478559 .. 2478579 + -12.7  -5.28176   ATTCCATACAAAAAA            GAACCCTAT TAA ATAGGGTTC            TTTTTTGTGAGTAAG 100 214
   CLJ_B2484 2481083 .. 2481117 + -15.3  -2.67747   ATTTAGTATAATATA     GGACGGCTTAATATA TTTTT TATATTAAGCTGTCC     ATTCTAATATAAAAA 100 40
   CLJ_B2494 2487468 .. 2487485 +  -8.4  -3.98016   CCAATTAACAACTAA             GGAGCC TTAACT GGCTCC              TATTTTATTGGTGGT  78 16
   CLJ_B2531 2518740 .. 2518754 +  -2.8  -3.64259   CATATATGCCTCCTA               TATTGC TAT GCCATA               TTCTTGGCCATAATT  45 492
   CLJ_B2574 2542085 .. 2542103 +  -3.9  -3.76607   CATAAAAGTATTGAA             GGACTTT CTGAA AAAGTTC             TTTAAGTGTATGTTC  52 221
   CLJ_B2578 NONE
   CLJ_B2579 2544526 .. 2544548 +  -4.2  -4.88485   TTCCATTAGAACTTC           TCAAACTTAA ATT TAAGGTTTGA           TTATTTTTTTGATTA  68 3
   CLJ_B2580 2546182 .. 2546208 + -11.8  -4.51847   GAAGTAGAATCTGCA         TAAAAGCTCATA TTT TATGGGCTTTTA         TTTTATACCTTATTT 100 23
   CLJ_B2581 2548009 .. 2548020 +    -3  -2.90508   TTCTCAGTTATCTGG                CAAA AAAT TTTG                 TGATTGTATAAATTG  40 133
   CLJ_B2582 2549390 .. 2549420 +  -9.9  -2.68419   TGAGCAAAAATAAAA       AGCTGTTGATAAA ATATA TTTATCAACAGCC       TAATATAGCTTCTTA  79 524
   CLJ_B2592 2559092 .. 2559102 +  -5.4  -3.57572   TCTCCAAGTATATGA                 CTTG ATA CAAG                 TATTGTTATCTCTTT  59 420
   CLJ_B2597 2563874 .. 2563896 +  -7.8  -4.82333   GATAAGATAAAGAAA           GAGTAGATAA ATT TTTTCTACTC           TTTTTAAATTGTTAT  86 20
   CLJ_B2611 NONE
   CLJ_B2612 2576077 .. 2576110 +    -4  -4.48903   TTCAACATCTAAAAA     GCTTTCCATGAT AAAATAATAA ATCATAGAAAGC      TTTTACTATCTTTTA  60 60
      gidA_1 2582016 .. 2582032 + -12.3  -4.32233   TAGTATAAAAATTCA              GGAGCCA ATA TGGCTCC              TTTTAAAATTTTTAT 100 33
   CLJ_B2621 2584208 .. 2584218 +  -5.4  -3.69836   GTCTTGCATGTAAAC                 CAGT TGA ACTG                 TTTACAGTTAATTCT  59 274
   CLJ_B2658 2624410 .. 2624428 + -11.8   -5.4148   TATTTTTCAAAAAAA             GAGAACAC TCA GTGTTCTC             TTTTTTAATTATTTG 100 64
   CLJ_B2664 NONE
   CLJ_B2665 2633099 .. 2633144 + -12.7  -2.82623   ATTGAAATAAACATA GTTCTTGGCTTCAGAGGGAGT TTTT ACTCCCTCTAAAGCTTAGAAA TCGTTATCCAGGGAC  91 87
   CLJ_B2699 2664674 .. 2664704 +  -8.5  -5.59655   AAATGAATAAAAAAA       TCTATCTGATTAT AAATA AGAATCAGATAGA       TTTTTTATTAATTTA 100 39
   CLJ_B2712 2676285 .. 2676304 +  -9.4  -3.75153   TTTATAATAAAAAAA            TAAAGGCA TTTC TGCCTTTA             TTTAGATTGAAGACA  84 195
   CLJ_B2720 2683344 .. 2683358 +  -4.4    -3.695   AATAAAAAATACTAT               TTATTA ATG TAATAA               TATTTAATTTTAAAA  56 19
   CLJ_B2721 2684646 .. 2684670 +  -2.8   -5.5353   CTCTACACTTTCTTC          TAAAGAAGCC GCAAA GGCTTCTAAA          TTTTTTCTTAATATA  76 95
        rpmB 2691012 .. 2691061 +  -9.7  -5.75538   AGGTACAACGTGCTA TATAACACAAAAAATGCAGTTGT TTAA ACAATTGCATTTTTTATTTTATG TTTTTATTTTTTAAC 100 21
   CLJ_B2768 2731819 .. 2731850 + -16.2  -3.03243   AGATTATATGATATT      TTAAAAAAAGGACC AAAA GGTCCTTTTTTTAA       TATTACCAAATGCAT 100 22
   CLJ_B2782 2743240 .. 2743254 +  -2.9  -5.18866   TTATTTTTTATATAT               GATTT AAATG AAATC               TTTTATTTCTTTAAC  64 239
   CLJ_B2804 2767214 .. 2767234 + -12.7  -4.99134   AAGTATATAATAAAA            GCAGGAATT TTT AATTCCTGC            TTTTTAATTTACACT 100 104
   CLJ_B2808 2772925 .. 2772959 +  -7.4  -5.04601   TTTTAAAAAAAACGC     CCTATTTAGTTATA ATTTCTC TTTAACTAAATAGG     TTTTTAATTTATAAA  83 71
   CLJ_B2826 2796399 .. 2796409 +  -5.4   -3.5256   ATGTAAAAACAATAA                 CTGT TCT ACAG                 TATTTAGCTTCTTTA  59 168
   CLJ_B2830 2798767 .. 2798789 +  -3.5   -4.1043   AGTGAATATATGACT           TTTTAACCT AATAA AGGTTTAAA           TTTATAATCTTTAGA  54 103
   CLJ_B2831 2803961 .. 2803975 +  -5.8   -2.6574   GAAAATATTATGGAA               GATTAA AAA TTAATC               TGATATAAATAATTG  53 20
   CLJ_B2832 NONE
   CLJ_B2833 2806466 .. 2806498 + -15.9  -3.77437   TAAAGAAAATTAATA      GCAAATAAGCTTAAA ATT TTTAGGCTTATTTGC      TTATATCTTATTAAT 100 18
   CLJ_B2834 2807692 .. 2807702 +  -2.6  -2.98942   AGCAATAAATAATTT                 TATT GAA AATA                 TATATCTAGAAAAAT  41 213
   CLJ_B2847 2819462 .. 2819479 +  -9.9  -4.35327   ATACAAATAAAACAA             CCACAGA TTTA TCTGTGG              TTTCATTTTTAATAA  95 31
   CLJ_B2867 2843420 .. 2843467 +  -9.7  -3.76125   ATTAATCTAATAAAA TAAATAGCTATAAAAATAA TTAAAATGCT TTATTTTTGTAGCTATTTA TTTAAATTAAACTAC  84 124
   CLJ_B2905 2877611 .. 2877644 + -10.5  -3.84712   TTAAAACTAAGTAAA     CTT-TGAAGAAGTTGC ATT GCAACTTCTTCCTAAG     TTTGGTCTAAACTTG  95 20
   CLJ_B2989 2968245 .. 2968257 +  -3.5    -5.186   TTCATCTTTTACTAT                TAATT TAA AATTA                TTTTTATATATTTTA  73 445
   CLJ_B2992 2973354 .. 2973380 + -16.8  -4.11625   TCCTATTACGAACTT         TAAGGAAAGTGC TAT GCACTTTCCTTA         TTTCATGTTTATTTT 100 23
        uvsE 2976809 .. 2976825 +  -5.3  -3.59802   TGTATGACTTTATTT              TTAAAAA TCT TTTTTAA              TACTTTTTTTATATT  59 174
   CLJ_B2996 NONE
   CLJ_B2997 2979726 .. 2979736 +    -4  -4.84246   GGAATATTATTTACT                 TTAG TCT CTAA                 TTTATTTATTATTTT  68 345
   CLJ_B3002 NONE
   CLJ_B3003 2987992 .. 2988004 +    -2  -3.60798   TAAAGAAATATATTG                TTGT AAAAA ACAA                TTAATTTATAAAAAT  44 436
   CLJ_B3004 2988260 .. 2988274 +  -2.8  -3.72576   TAAAAAATAAAATTT               CTACTT TAA AAGGAG               TTTAATAAAAACGAG  47 6
   CLJ_B3005 2989185 .. 2989221 + -16.2  -3.29013   CAAAAACAAGCTTTA    CGAAATAAGGAAAGTG CTATA CACTTTCCTTATTTTG    TTACATTCTTGAAGT 100 18
   CLJ_B3011 2998218 .. 2998228 +    -4  -4.36366   CTTTGGTTTGTTATA                 TACA ATC TGTA                 TTTATATATTTTCTC  58 84
   CLJ_B3014 3002071 .. 3002085 +  -4.4  -3.97959   TAATAATATTTAAAT               TTAAAT ACT ATTTAA               TTTAATATCTTATTT  58 291
         hcp 3007766 .. 3007787 +  -4.5  -3.72989   TTTTATTATATTAAA           TTTGTTTGC TAAC GCAAATAGA            TTTGGGTGTAAATTT  56 473
   CLJ_B3021 3010638 .. 3010695 +  -9.7  -4.16121   ATTTAAAAATTAATT TAAAATAAAACACTATACAATTTTT TATTTGAC AAAATTTGCATAGTGTTTTATTTTG TTTATAATATTTTTA  86 127
   CLJ_B3023 3014102 .. 3014135 + -14.3  -3.30159   CCTCATGACTAACAA     TTTTTACAACATTTT ATAT AAAATGTTGTAAAAA      TTATGAAGAAATTGA 100 102
   CLJ_B3031 3022645 .. 3022681 +  -6.1   -5.2197   TTTTAAAATTAAAAA    GCTATATATTTGTAA CCATATA TTACAAATGCATAGC    TTTTTAATTTTTATA  80 67
   CLJ_B3034 3026363 .. 3026414 + -10.5  -3.80461   CACTAAATAGATTTA TATGGCTATGAAAATAAATTTGT TTTTAT ACAAAGTTACCTTCATAGCCATA TTTAATGATAAATTC  91 120
   CLJ_B3043 3038745 .. 3038755 +  -2.6  -4.02034   AATAAAAAAAATTAT                 TATT TTA AATA                 TATTATTTTTTATTT  51 201
   CLJ_B3044 3039878 .. 3039894 +  -8.1  -3.39471   TTTGATACAGTAAGC              CCTATAA GTC TTATAGG              TTCCTTAAAATTTAT  73 246
   CLJ_B3057 3056255 .. 3056268 +  -2.5  -4.18934   AAAAGGTTAAGTAAT               TATTA AATT TAATA                TTTATTAAAATCATA  51 27
   CLJ_B3058 3058434 .. 3058478 + -12.7  -4.58644   ATTTAATATTCGAAA TAAA-AAATGTCAAGCTAAA CTTACT TTTAGCTTGACATTTATTTA TTTTACTTATTACTT 100 65
   CLJ_B3063 3065068 .. 3065108 +  -6.4   -3.1876   ATTTTTATACCCAAA  GGTGTAATACCAATAT CCATAAATT ATATTAGTATTACGCC  TTAATAAATAAACTT  63 158
        nagE 3067812 .. 3067855 + -15.8  -3.05333   TTCTTATGTATAACT TAAAAGCCTACAAATATA TGAATATT TATATTTGTAGGCTTTTA TCTATAGTTATCTAT 100 65
   CLJ_B3066 3069647 .. 3069679 + -12.3  -3.84901   GAATATATATTTAGA      TAAAAGGTGACAT TTATGTT ATGTCACCTTTTA      TTCATTTTTAGTCAA 100 51
   CLJ_B3070 3073307 .. 3073339 +  -6.4  -5.10004   AAAAATAAGCAAAAA      TAAAAGGTGACACA TATAC TATGCCACCTTTTA      TTTTTGCTTATTTTT  83 215
   CLJ_B3078 NONE
   CLJ_B3079 NONE
   CLJ_B3080 3083506 .. 3083532 +  -7.4  -5.63103   TAAACAAAAAAATAA         GGGATTTGCTAT TTT GTAGTAAATTCC         TTTTTTTGCTTGAAA  91 171
   CLJ_B3081 3085041 .. 3085053 +  -3.3  -4.07568   GCGCCAGGTATGGGC                GGTGC AAT GGACC                TTTTAGCAGGAGCAA  54 415
   CLJ_B3092 3096398 .. 3096411 +  -2.5  -6.23317   ATAATAATAAACTTT               TATAA AAAC TTATA                TTTTTTTATTTTTGT  82 461
   CLJ_B3108 3109391 .. 3109422 +  -6.7   -5.4833   ATATTTCAAGATAAA      TAGCATCCTTG CATATGCAAA CGAGGATGCTA       TTTTTTATTGAGTAA  88 77
   CLJ_B3109 NONE
   CLJ_B3110 3111397 .. 3111413 +  -3.7  -3.28105   CTATATTTTAATACG              CACTTAT AAA ATAAGCG              TCTATTATATATTGT  48 379
   CLJ_B3111 3112446 .. 3112473 +  -9.4  -2.62889   CTGCCTTTTCTAACA        GTAAATCAAATT GCGA AATTTGATTTGC         CTTGGTCTGTTGATC  75 220
   CLJ_B3115 NONE
   CLJ_B3116 3118541 .. 3118565 + -10.1  -3.71552   CTAAAGGATAACGAC          TTCTAAGGAGT AAA ACTCCTAAGAA          TTCTGTTAATAAGCT  90 334
   CLJ_B3123 3125934 .. 3125992 +  -9.5  -5.73978   TTCGAAAATACACAC -CAAATAATAGCAGTCTTTTTTAATT TTATCTCT AATTAAAAAAGACTGCTATTGTTTAC TTTTTTATTTATACT 100 89
   CLJ_B3144 NONE
   CLJ_B3145 NONE
   CLJ_B3146 NONE
   CLJ_B3147 NONE
   CLJ_B3148 NONE
   CLJ_B3149 NONE
   CLJ_B3150 NONE
   CLJ_B3151 3161356 .. 3161384 +   -12   -5.1286   TAAATAAACAAAAAA        TCCTAATTCATT AAATA AATGAATTAGGA        TTTTTCTACTTTTTA 100 34
   CLJ_B3152 3161841 .. 3161862 +  -6.1  -3.73512   TTTTGTTATTTGAAA           TATTATTTT ATTT AAAATAATA            TTATATATTAATTAT  65 49
   CLJ_B3153 3162829 .. 3162844 +  -4.8  -4.76963   AATTATTATCTTCCA              TTTTCT TTTT AGAAAA               TTTTATATTCTCTAG  71 337
   CLJ_B3163 3176651 .. 3176664 +  -6.7  -3.52192   ATGAAAAAAGTAGAA               CCTCT ATTT AGAGG                TTCTATAAAATTAAA  66 15
   CLJ_B3173 3184895 .. 3184911 +  -5.2  -3.14468   ATATTTAAGCGTGAA              GTAAAC AGGAC GTTTAC              TTAGCTCTGCTGCCA  53 127
   CLJ_B3175 NONE
   CLJ_B3176 NONE
   CLJ_B3177 3187796 .. 3187832 +  -5.4  -4.99134   TATAAATACTTAAAA   GCTATGAAAT-TAAGGT ATTA ACTATATATTTCATAGC    TTTTTCATTTAAAAT  75 138
   CLJ_B3181 NONE
   CLJ_B3182 3193228 .. 3193238 +    -4  -3.31144   TATTTCTGTTTGAAA                 CAAA TCA TTTG                 TTATAAAAGTCAAGA  49 241
   CLJ_B3184 3196093 .. 3196121 +  -6.1  -5.15969   AAGGCACCATTAAAA        GCTGATTTCTA AATTGAA TAGGAGTCAGC        TTTTTTAAATTCCAC  80 119
   CLJ_B3188 3197884 .. 3197908 +  -8.5  -2.73006   GGAGCTCGGACTTTC          CTCTCCCGTAC AGT GTACGGCAGCG          ATTGTCTGGCTTACT  69 391
   CLJ_B3197 3207061 .. 3207090 + -10.9  -2.95322   AGCTTTCCAACACCA       GTTTGGTCTATTC TTTG GAATGGATCAAAC        TCATATATTTTTTTA  83 292
        rpsT 3234550 .. 3234579 +  -7.3  -5.89659   TTATTATTAGTAATT       CTACTTCTGTT TGCGTATT AACAGAGGTAG        TTTTTATTTTTTTAT  95 92
   CLJ_B3230 3242476 .. 3242490 +  -2.8   -4.7254   TCTTTTATAATAATG               TCTCCA TAA TGGAAA               TTTTTCGTAACAACT  57 163
   CLJ_B3266 3276648 .. 3276670 +  -6.4  -5.64873   GTAGTAAATAAAAAA           CTTCATCT GCTAAAA AGATGAAG           TTTTTTATTATTCCA  90 54
   CLJ_B3308 3308283 .. 3308298 +    -4  -3.53224   GATATTAAAATATAT              TTGAAC ACAT GTTCGA               TTTCGGAAAGGAGTC  51 289
   CLJ_B3309 3308911 .. 3308924 +  -3.9   -3.1085   TAAGCACTAGAGAAA               TTCTA GAGC TAGAA                TATTCAATGAATTAA  46 466
   CLJ_B3311 NONE
   CLJ_B3312 3312608 .. 3312635 + -11.6  -3.12289   TATAAATTCAAAAGA        GATTAGATATAT ATAA ATATATCTAATC         TCTTAAGCTGTTTTA  93 112
   CLJ_B3318 3314767 .. 3314811 + -13.9  -3.90582   GACACGAATACTTAA TAGATAAAATAAGGAAAGCGC ATA GCACTTTCCTTATTTTATTAA TCTTCTTTTTCTATT 100 19
       hpt_1 3342447 .. 3342469 + -12.2  -5.35815   AAAGAATAATAAAAA           TGTAAAGCTT ACA AAGCTTTACA           TTTTTGTTTAATCTC 100 32
   CLJ_B3348 3345785 .. 3345826 + -14.1  -4.19953   AAAAGAACAAACGAT AAAAAGAATAAAAACTCCT TCTT GGGAGTTTTTATTCTTTTG  TTTTAGGATTAAATA 100 24
   CLJ_B3357 3352787 .. 3352824 +  -5.1  -4.98531   TTTTTATAATAAAAA   GCTATGAGTTTAACAATA TAA TATTGC-AAATTCGTAGC   TTTTTAATTTAAAAA  72 57
   CLJ_B3383 3393027 .. 3393039 +  -4.9  -6.02919   TTATTAAATCTTATA                GAAAA AGA TTTTC                TTTTTTTATTTATAC  93 401
   CLJ_B3391 3405904 .. 3405931 +   -10  -4.08689   TTAGATTTCTAAAAA        CTCCTTGCATTT TATT AAATACAAGGAG         TTTAATTATTAGCTG  93 99
   CLJ_B3393 3408032 .. 3408042 +  -2.4   -3.9693   AAAATTGTTACCTTT                 GTGC TTA GCTC                 TTCTTTCAGTGAATC  48 39
   CLJ_B3394 3408829 .. 3408847 +  -3.2  -5.76949   TTTCTTTAACTAAAT             TTAATTGA CTA TCCATTAA             TTTTTTTTCCAAATC  83 426
   CLJ_B3407 3422057 .. 3422080 +  -4.8  -3.55444   AATAAGTTTTAATAG          TTTTTAGTTT GGCC AAATTAAAAA           TTTAGGAAATCCCCC  56 166
         asd NONE
        dapA 3435535 .. 3435555 + -12.7  -3.93038   TTAATGTAATATAAA            GTGTAGAGA TTA TCTCTACAC            TTTACTATTAAAATA 100 32
      dapB_2 3436723 .. 3436733 +  -5.4  -4.21908   TTTTAATAGGCCGCA                 GGTA AAC TACC                 TTTTAAGTCGTAATA  66 372
   CLJ_B3427 3438956 .. 3439013 + -12.5  -5.60556   ATTAATTTATTTAAA TATAC-TTGAGAATAGTATGTACAACTT AAA AAGTTGTACATACTATTCTTTATGCATG TTTTTCTTTTATATT 100 92
   CLJ_B3431 3441952 .. 3441978 + -10.3  -3.00342   ATCATAATACTAAAA         TACCTGTAGGT TCTCC ACCTATAGGTA         TGGATTTTTTATTAT  85 42
   CLJ_B3433 3443719 .. 3443729 +  -5.4  -5.69793   CTAAGGCTAATATAA                 CTGT AAT ACAG                 TTTTTTATTTGATGT  91 522
   CLJ_B3438 3450726 .. 3450738 +  -3.5  -2.51057   TATTTTCCTATAATA                TATTA AAA TAATA                AATTTATATTTAAAA  42 64
   CLJ_B3439 NONE
   CLJ_B3440 3452273 .. 3452286 +  -2.4  -3.97602   ATTTAGAACTACTTA               GCAA AATGAA TTGC                TTTATGAATGTATTA  48 278
   CLJ_B3442 NONE
   CLJ_B3443 3458558 .. 3458593 + -10.8  -4.90778   AATTTTTTATTTTCA    TAAGTCTATTTAGAAA TTTT TTTCTGAATAGATTTA     TTTTCTTTGCATAAA 100 45
   CLJ_B3444 3459117 .. 3459148 + -11.8   -4.6902   TTAATCTATATAAAA      TGCTAGTAACTTTT ATAT AAAAGCTACTAGCA       TTTTTACCATTCTCC 100 113
   CLJ_B3449 3463248 .. 3463258 +  -2.6  -3.44622   AAGAAACTTATGTCT                 TATT TTA AATA                 TTAATTCTAAAAATA  44 11
   CLJ_B3450 NONE
   CLJ_B3451 3464620 .. 3464648 +  -8.9  -4.11897   TTTATAAAAAACTAG        GGGTAGAACTTAT AGA ATAAGCTCTCCCC        TTTATATAAATTTAT  82 6
   CLJ_B3462 3477325 .. 3477338 +  -3.1  -3.67597   AGATTTTGTTGTTAA               TGTTC AAAA GAACG                TTCTTAAATAAGAAA  50 1
   CLJ_B3463 3478514 .. 3478538 + -11.6  -5.52347   AATAATTTTTTTGGA          TGAACACCTA ATTAA TAGGTGTTCA          TTTTTTAATTTTATT 100 36
   CLJ_B3465 NONE
   CLJ_B3466 NONE
   CLJ_B3467 3482087 .. 3482115 +  -6.7  -5.32599   AATAAAATATAAAAA        CGACAGAGCACTT AAT AATGGCTCTGTTG        TTTTTATATTTTATC  87 43
   CLJ_B3484 3499306 .. 3499326 +  -7.7   -4.2717   TAGATTTTGTTATGA            TATCAAAGG ATT TCTTTGATA            TTTTCATAGCATCAT  79 387
   CLJ_B3492 3508502 .. 3508540 + -14.3  -3.17586   CAGAAAGTTAGTAAT   TAATAAGCACTTAAATT AGATA GATTTAAGTGCTTATTA   TATTGCTGCCTTAAT 100 30
   CLJ_B3494 3510889 .. 3510914 +  -9.3  -2.52795   TGGGGGGTTGTTGCA         TCAAATATATA AATT TATATATTTGA          TGCATTAGGGAGATT  75 77
   CLJ_B3543 3538427 .. 3538473 + -21.4  -5.13473   TTTTATATACACTTA AAAATTAATATGAGGATATTGC AAT GCAATATCCTCATATTAATTTA TTTTTTGGATATAAT 100 18
   CLJ_B3544 3538745 .. 3538760 +  -6.2  -3.11326   TTCTTTATAATAACA              TTACCA TCTA TGGTAA               TATATTGCCCTTGTA  60 68
   CLJ_B3557 3554621 .. 3554659 +   -12   -4.0031   ACTATAGAATTAAAA   TAGGATGTCTCAAAAT TAAGGCC ATTTTGAGACATCCTC   TTCTTTAATAAAAAT 100 96
   CLJ_B3562 3558543 .. 3558577 + -16.1  -4.53034   AGTTTAACAAGCAAA     TAAGATGATTTCTGT ATTAA ACAGAAATCATCTTA     TTTTAATTATATCCA 100 65
      ldhA_1 3560074 .. 3560123 +  -8.4   -3.1704   TCTTTTTTTAAAAAT GAAAGCGTTTTCATGATTTACT AATCTCAA AGTAAAT-A-GAAAACGCTTTC TATTACCATTTTATT  72 47
   CLJ_B3578 3579297 .. 3579324 +  -5.7  -5.74684   CTACAAAAATAAAAA        TAAGAAACTCT ATATAA AGAGTCTCTTA         TTTTTATTTTTATTA  86 64
   CLJ_B3582 3582224 .. 3582249 +  -6.3  -3.78168   CATATTGTATAAAAA         TATGAGAAAAT TATA ATTTCCTCATA          TTCTTGCCTATTTTT  65 10
   CLJ_B3588 3591417 .. 3591427 +  -2.6  -4.19735   TATGGAATAATATCT                 TTTA AAA TAAA                 TTTAATTTTAACACC  53 31
        cstA 3595821 .. 3595861 + -14.4  -4.33153   AGAATAACATAAAAA  GAATGTCTCAAAATTAAA TTTAT TTTCATTTTGAGACATTC  TTTCTTACTATTCAA 100 34
   CLJ_B3595 3605029 .. 3605055 + -11.1  -5.20783   ATATTACATAAAAGA         TACACTACATA AACTA TATGTAGTGTA         TTTTTATCTTTAAGT 100 114
   CLJ_B3601 NONE
   CLJ_B3602 NONE
   CLJ_B3603 NONE
        rimI 3612242 .. 3612276 +   -13  -4.48221   ATATTAAATATAGTA     GGGTGCCTCAAAATAA ATT TAATTTTGAGACACCC     TTTTATAAATTACTC 100 82
   CLJ_B3610 3617665 .. 3617694 + -15.3  -5.38549   AATCTAAAACAAAAA       GAAATGAGACTTA AATT TAAGTCTCATTTC        TTTTTATTATTTAAA 100 39
   CLJ_B3612 3620674 .. 3620696 +  -6.4  -5.69262   TATAAAGAATAAAAA           GTTTTCATAA GTA TAATGAAAAC           TTTTTATTTTTATAA  90 58
   CLJ_B3616 3623178 .. 3623214 +  -8.9  -4.95167   ATCTTATAAATAAAA    CCCTATTTAGTTGCAAA TTT TATTTAACTAAATAGGG    TTTTCTTGTTGGTTA 100 123
   CLJ_B3622 3637747 .. 3637779 +  -2.2  -2.71693   ACTTAATTTTTTACT      CCATATATAAAT CCTCTAAAA ATCTATATATGG      TAACTTTCATTAGTA  38 40
   CLJ_B3623 3639057 .. 3639111 + -18.4  -5.28166   TTTCACAAGAACAAA TAACTGCTAATTGCTAAGAGTTTA ATTTTTA TAGACTCTTAGGAATTAGCAGTTA TTTTTATTAATTTTA 100 137
   CLJ_B3638 3658629 .. 3658658 +  -7.9  -3.05667   TTTTATCCATTCAAA       TAGTAAGAGCTCC ATAA GGAGCTCCTAATA        GCTTTTTTATTTTTC  67 23
   CLJ_B3711 3738097 .. 3738130 + -16.3  -4.65916   ACAATTTATATAAAA     TGGGTGTATAAAAGT TTTT ACTTTTATGCACCCA      TTTTGTTAAAATAGG 100 45
   CLJ_B3712 3738923 .. 3738964 +  -8.4  -4.19472   AATGAAATCAAAAAA TAAAATTCTGCTAAAAAT AACCAC GTTTTTAACAGAATTTTA  TTTTACACTCTCTTA  79 61
   CLJ_B3740 3764162 .. 3764197 +  -9.9  -4.20284   TATAAAAAATCAAAA    GGATTTAGCGCAAAA ATCAAA TTGTGTGCTAAATCC     TATTTTATTTATTTG  95 62
   CLJ_B3747 3772987 .. 3773029 + -18.4  -3.46336   TATTATAAAAACACC TAAATAAAAAGATTTAAAAT CAA ATTTTAAATCTTTTTATTTA TCTTTAAATTCAACT 100 46
   CLJ_B3818 3826384 .. 3826441 + -19.7  -4.30793   ATTAGGCAAATATAG TATGAGATAAAGTATAGCACAAAGTAT TAAA ATACTTTGTGCTATACTTTATCTAGCA TTATTTGTTCTCTAA 100 16
        murC 3886128 .. 3886142 +  -3.6  -4.88711   AATCCATCGGGAGGT               GTTTTT ATG AGAAAC               TTTTTAATATCTTCT  64 84
   CLJ_B3879 3886597 .. 3886617 + -11.3  -6.18768   TGTCACCCCGACCAA            GAACTACTT TAA AAGTAGTTC            TTTTTTTTATATTTT 100 180
   CLJ_B3881 3888088 .. 3888098 +  -2.6  -3.77808   TTAAACACCCTGTTA                 TAAT TTT ATTA                 TTATATTGTAATGGG  47 76
   CLJ_B3882 3888854 .. 3888897 +  -4.6  -2.60065   TCCCTGGATAACTAT TTCTAAGCTTCAGAGGGAGT AAAA ATTCCCTCTAAATCCAAGAA CTCTGTTTATAACAT  48 108
   CLJ_B3883 3889448 .. 3889486 + -14.9  -3.25356   TAAATTTATAAAATT   TCTCCTAGATTTCATCA TATCT TTATGAAATCTAGGAGA   TTAAATTAATTATAC 100 30
   CLJ_B3887 NONE
   CLJ_B3888 3894870 .. 3894898 +    -4  -3.64902   ATGTTATCATATATA        CTTGATATAGAA TCCGC TTCTTTATTAAG        TTCATTTATAGTCTT  53 379
   CLJ_B3894 3901384 .. 3901425 + -14.8   -2.7676   AATCTTTTAGATATA TAAAATAAAAGCACACCT AGTATC AGGTGTGCTTTTATCTTA  TAATATTAAAATTTC 100 23
      murA_2 3903612 .. 3903628 +  -8.1   -3.1996   GATCTTTAGGGGCTA              CTATAGT TAG ACTATAG              TTAAGTTACAATTTA  72 9
   CLJ_B3897 NONE
   CLJ_B3898 NONE
   CLJ_B3899 3905613 .. 3905649 +  -7.5  -4.19879   AATATGGAACTAAGA    GGTTTATCATTAAATAA AAT TTATTTATTGGTAGGCC    TTTTAGAGCTTTTCT  78 95
   CLJ_B3900 3906501 .. 3906515 +  -2.8   -5.9362   TTGGATATCCTACAA               TAACTG CTC CTGTTA               TTTTTTTGTCTTTTG  76 325
   CLJ_B3904 NONE
   CLJ_B3905 3910399 .. 3910409 +    -4  -2.70932   CTAATAATAAAAATA                 TTAG TGA CTAA                 TAATTGAAAGGAAAG  44 15
       map_2 3911320 .. 3911374 + -16.3  -3.85539   CTTCATTATATAAAT TTTAATGCTGCAATTAAAAATATTA ATCAC TATAATTTTTAATTGCAGCATTAAA TTTAATATAAATATA 100 41
   CLJ_B3908 NONE
   CLJ_B3909 3915159 .. 3915175 + -10.9  -5.84432   ATTTTGGTATTTTAA              CTTTCCC TTT GGGAAAG              TTTTTTTATCTTATA 100 236
   CLJ_B3910 NONE
   CLJ_B3911 NONE
        thiH NONE
   CLJ_B3913 3919216 .. 3919253 + -13.1  -4.98616   ATCTAATATAAAAAA   TACACTTAATAAACAAA CTCA TATGTTTATTAAGTGTA    TTTTTCATATTTTCG 100 62
   CLJ_B3914 3921049 .. 3921075 +   -14  -4.94168   GTAAAATAATTTTTA         GAGTATAAAGTT TAA AACTTTATACTC         TTTATTTTATTATAT 100 207
   CLJ_B3915 3922561 .. 3922580 +  -6.6  -4.84582   AATTATAATAATAAA            TTGTATAA TATA TTATACAA             TTTTATATATTTTTT  78 175
   CLJ_B3917 3924042 .. 3924073 + -10.4  -5.74122   ATTAAAGAATTTAAA      TGGATAACAAGT AAAAGGAA ACTTGTTATCCA       TTTTTTTATATAATA 100 36
   CLJ_B3918 3924594 .. 3924608 +  -4.4   -2.7094   CATTATAAAAAAAAA               TTATAA TTC TTATAA               CTTATATAAATAACA  48 50
   CLJ_B3919 NONE
   CLJ_B3920 3926957 .. 3926968 +  -5.8  -5.97575   TATATAACAAAAAAA                GAGC ATAT GCTC                 TTTTTTTTATACATT  90 43
   CLJ_B3937 NONE
   CLJ_B3938 3943131 .. 3943158 + -14.4  -3.67297   AATATACAAAATAAA        TAAAGTAGCTAG AAAT CTAGCTACTTTA         TTCTATATGTATAAT 100 23
   CLJ_B3952 3947052 .. 3947066 +  -4.4  -4.77036   CTTTCTAGCAATTTA               TAAATA TCT TATTTA               TTTTTCATCATAAAA  68 92
   CLJ_B3972 NONE
        ytvI 3967190 .. 3967222 +  -5.8  -5.67063   GCAAAATGTATAAAA     CCTCTT-TTAGTGGAT ATA ATCC-CTAACAGGAGG     TTTTTTTATGATAAG  86 43
   CLJ_B3974 3968062 .. 3968108 + -16.2  -3.72152   AAAAATATTCATTAT AAAAACCTCCCTTTATGAAGTA TTA TTTTTCATAAAGGGAGGTTTTA TTCTAATTTTCATTA 100 276
        rpmH 3977253 .. 3977268 -  -8.2  -4.84359   GCATCTGCAGAAAAA              GGCCAC TAAT GCGGCC               CTTATGCTGTCAATC  88 27
        rnpA NONE
   CLJ_B3985 NONE
        oxaA NONE
         jag 3975343 .. 3975360 -  -9.9  -5.23765   CAAATAATATAAAAA             GAAAGCC TTTA GGCTTTC              CTTAAATTTATTACA 100 16
        trmE NONE
      gidA_3 3972016 .. 3972026 -  -3.2  -4.67011   AATTCCATTTAAAAA                 CCTC CAA AAGG                 ATTTTCTAGTTTTCT  60 31
        gidB NONE
   CLJ_B3979 3970386 .. 3970409 - -11.2  -5.52096   AAATTTAATAAAAAA          TAGATGTTTC ACGT GAAACATCTA           CTATTTTTTAGGTAT 100 26
         soj NONE
   CLJ_B3977 NONE
   CLJ_B3976 3968067 .. 3968103 -   -14   -4.9218   TATTCATTATAAAAA    CCTCCCTTTATGAA GTATTATTT TTCATAAAGGGAGG    TTTTATTCTAATTTT 100 33
   CLJ_B3975 3967479 .. 3967489 -    -4   -4.4874   GCTAAAAATTTAAAA                 GAAA CTA TTTC                 TATTATAGATTCTAA  63 349
   CLJ_B3971 NONE
   CLJ_B3970 NONE
   CLJ_B3969 3963376 .. 3963399 -  -6.9  -5.88565   TTTATAACAAAAAAA          CTATTGATA TTACTC TATCAATAG           CTAATAAAAAAACTA  93 50
   CLJ_B3968 3961932 .. 3961952 -  -9.7  -3.18264   CTCCCCACGGACTAA            CGGCTGTAC TTT GTACAGCAG            GGATCTTATCGTACA  80 83
        rpsF NONE
       ssb_1 NONE
        rpsR 3960856 .. 3960877 -  -8.8  -5.76633   TGATATACAAAAAAA           CTGACTAC AAATTA GTAGTCAG            TTTTATGTAAATTTA 100 45
   CLJ_B3964 NONE
   CLJ_B3963 NONE
   CLJ_B3962 NONE
        rplI NONE
   CLJ_B3960 NONE
        dnaB 3953659 .. 3953681 -  -4.2  -5.42198   TGGGAAAAAATAAAA           GCCCTATA AAATAAA TATAGGAC           TTTGTATTTTTTATT  76 36
   CLJ_B3958 3951591 .. 3951627 - -10.3  -4.23054   ATATATTATCTAAAA    TAGCCTACCACAGACTT TGA AAACTTGTAGTAGGCTA    ATTGTTATTTCTATA  95 127
   CLJ_B3957 3951195 .. 3951205 -  -2.6  -4.18763   AACAAAGGTTTAAAA                 TATT TTC AATA                 GAATTCACGAATATT  51 141
   CLJ_B3956 3949728 .. 3949754 -  -8.9  -5.19275   ATTTAGAAAATAAAA         TATTGCAGCTA AATTA TAACTGCAATA         TTTTTATTCCTTTAT 100 37
        purA 3948157 .. 3948171 -  -2.2  -2.81888   TCCTAAATTTAATTA               TTATTA TAT CAATAA               ATTAATGTTCTTTAA  39 102
   CLJ_B3954 3947908 .. 3947927 -  -6.5  -5.83226   AACTTAATAAAAAAA            CTCTATG GTAAAA CATAGAG             TTTTTTTATTTTACT  93 36
   CLJ_B3953 3946995 .. 3947047 -  -4.7  -5.36181   AAATAAAAAAATAAA TTGCTAGAAA-TGCTT-TTAATTAA TTTTT TTAATTAGGAAACACTTTCTAGCAA TTTATAAATATCTTA  77 64
   CLJ_B3951 NONE
   CLJ_B3950 3943966 .. 3943987 -  -4.3  -3.36175   AATGGCGACCCAGAA           GGGGCTCGA ACCC TCGACCTCC            GGCGTGACAGGCCGG  53 417
   CLJ_B3936 3940027 .. 3940049 -  -7.8   -5.9218   TATATAATAAAAAAA           TATCACTGTC AAT GATAGTGATA           TTTTTTTATTATCAT 100 37
   CLJ_B3935 NONE
   CLJ_B3934 NONE
        fabH NONE
      acpP_2 3937024 .. 3937049 -  -2.7  -2.73483   ATTTTATTCCAACCA         TATGAGAAAAT ATGG ATTTCTTCATA          GTTTTAATTCCTCCT  39 151
   CLJ_B3931 3936116 .. 3936128 -  -3.5  -4.11371   TAATATCCTCCAAAA                TAAAT ATT ATTTA                TAACCTAATAGTGTA  54 19
        fabD NONE
        fabG NONE
        fabF NONE
        accB NONE
        fabZ NONE
        accC NONE
        accD NONE
        accA 3929034 .. 3929065 - -14.7   -4.1466   ATGGAATTTTTAAAA      GGAGTATTTAGTG CTTATT CACTAAATACTCC       CATATTTCTAAATTT 100 8
   CLJ_B3922 NONE
   CLJ_B3921 3926957 .. 3926968 -  -5.8   -5.9218   TATATAACAAAAAAA                GAGC ATAT GCTC                 TTTTTTTTATACATT  90 32
   CLJ_B3916 3922561 .. 3922580 -  -6.6  -4.54323   AATTATAATAATAAA            TTGTATAA TATA TTATACAA             TTTTATATATTTTTT  75 18
   CLJ_B3907 3911319 .. 3911375 - -13.5  -4.08974   ACTTCATTATATAAA TTTTAATGCTGCAATTAAAAATATTAA TCA CTATAATTTTTAATTGCAGCATTAAAT TTAATATAAATATAT 100 44
   CLJ_B3903 3908272 .. 3908286 -  -2.2  -2.62024   GATTATGATAATGCA               TTTCAT CGA ATAAAA               TTAGTAAAAATTTTT  38 13
   CLJ_B3902 3906734 .. 3906789 -  -5.1  -3.71687   GTAAAACAGTGTAAA TTTCTTTATTATGATAAGATTGAAT ATAGTG ATTGGATCTTATCATAATGAAGGAA TTGCTAGCCAGTTCT  58 257
   CLJ_B3895 3901382 .. 3901427 - -19.5  -2.89323   AAAATCTTTTAGATA TATAAAATAAAAGCACACCTA GTAT CAGGTGTGCTTTTATCTTATA ATATTAAAATTTCTT 100 29
        murI NONE
   CLJ_B3892 NONE
   CLJ_B3891 NONE
   CLJ_B3890 3896675 .. 3896714 -  -2.5  -5.04249   TCTTTAAAAAATAAA  CACTATC-AACATTAT TAAACTACG ATAATATTTGATAGTG  TTTTAATGATTTTTT  62 99
   CLJ_B3889 3894584 .. 3894628 -  -3.9  -3.55416   AATAATAAAATAAAT GAAAGCTATGAAAT-T-GAGG AATCA CCTGTATATTTCATAGCTCTC TTAAAATAAAATTTA  51 86
   CLJ_B3886 3891228 .. 3891257 - -10.3  -5.40072   TTCCTCCCAAAAAAA       GTATCTGTGA-ATA TTA TATGTCACAGATAC       TTTTTTTTCAAAACA 100 42
   CLJ_B3885 3890251 .. 3890261 -  -2.6  -3.09516   CCCCCCATTATTTAA                 TATT TTA AATA                 TTTATATGAATTTTA  41 38
   CLJ_B3884 3889448 .. 3889486 - -14.9  -2.57274   TAAATTTATAAAATT   TCTCCTAGATTTCATCA TATCT TTATGAAATCTAGGAGA   TTAAATTAATTATAC 100 49
        purR 3883662 .. 3883672 -  -2.6  -4.22283   CAAAAAAATATTAAA                 TTTT TTG AAAA                 TTACATTATCTGAAT  53 31
       spoVG 3883260 .. 3883275 -    -9  -5.93252   TTCAAAAATAAAAAA              GGAGCT TATA AGCTCC               TTTTTAGATATTTTA 100 38
        glmU NONE
        prsA 3880710 .. 3880766 - -17.3  -3.26719   TTTACAAATAGTTAA CTATATAAAATAAAGTACCCATAGAA TTTATT TTCTATGAGTACTTTATTTTATAT-G TATTGATTAATCTTC 100 32
   CLJ_B3873 NONE
   CLJ_B3872 NONE
   CLJ_B3871 3877236 .. 3877274 - -10.6   -4.3767   TTATACTATAATAAA   TAAATAATAAAGAGACTT ATT AGGTCCCTTTACTATTTA   TTATATATTATATTT 100 40
         pth NONE
         mfd NONE
        prsA 3871948 .. 3871970 -  -9.3  -5.27335   TCTTCCAAATAAAAA           TCATGTGTA ATTAA TACACATGA           TTTTTATTTATTATA 100 36
   CLJ_B3867 3871193 .. 3871210 - -11.3  -4.71828   AGTTTATTAATAAAA             CCTGTGC TTAA GCACAGG              TTCATATTAAGTATA 100 46
     spoVB_3 NONE
   CLJ_B3865 3867995 .. 3868014 -  -5.8  -4.08767   GTTACCTCCTTAAAA            TTAAGTAG TTTC CCACTTAA             AGTTTTATACATTAT  64 114
         hup 3867664 .. 3867681 -  -4.1  -5.85425   TAAATAAACAAAAAA             CCCAGAT TAAA ACCTAGG              TTTTTATATTTATTA  83 38
   CLJ_B3863 3867330 .. 3867376 -  -9.8  -4.49981   TATATTACTATAAAA TAAAAGGTTCTAAAAAATCGTA TTT TAAAAACTTTTAGAACCTTTTA TTTTGAAACTTATAT 100 35
        yabP NONE
   CLJ_B3861 3866493 .. 3866505 -  -3.5  -4.36914   CTTCCCTTTATAAAA                TATAA ACC TTATA                GTTATATTTTATTAT  56 85
   CLJ_B3860 NONE
   CLJ_B3859 3865715 .. 3865727 -  -6.9  -5.59962   TAAAATAAATAAAAA                GGCCC CTA AGGCC                TTTTATTTTAATAGC  88 33
      spoIIE 3862170 .. 3862188 -  -2.5  -4.49906   GAATATTTAAACAAA             TTAAGTA CTTAC TACCTAA             CTTCATATTCTCTTT  55 48
        tilS NONE
       hpt_2 NONE
      ftsH_2 3858209 .. 3858232 -  -7.5   -5.1615   TTAATATGTAAAAAA          GAGCAGATG ATAAAA CATCTACTC           TTTTATTCTAACTAT  93 33
         fhs 3856258 .. 3856277 -  -7.1  -4.11501   TTAAATACAATGAAA            GAGCAGC CTTGCC GCTGCCC             TTTATGCTTGATTTA  73 112
        coaX NONE
   CLJ_B3845 NONE
   CLJ_B3844 3853535 .. 3853550 -  -2.6  -4.58213   TAAGTAATTATAAAA              CAGG-TA ATT TATCCTG              TCAATATTTCAGTAT  57 50
        greA NONE
        lysS 3851158 .. 3851213 -  -4.8  -5.47159   TTTTAATATAAAAAA GGCTATAGCAACAAAGGGACGA CTTAATCGCGGT TCCACCCTTTTTGGCTATAGCC CTACTTTCTAATTAA  79 241
        glyS 3849613 .. 3849649 - -18.5  -4.16205   TATAATTAAATTAAA    GCTATAAATTATAGAAT AAT ATTCTATAATTTATAGC    TTCTTAATTTAAATA 100 95
        murD 3847327 .. 3847366 -   -11  -5.35354   TAGAGAATTAAAAAA  GAATCCTATCAGTATTAA TATT TTAAAACCAATAGGATTC   TTCTATATCTAATAT 100 157
      fusA_2 3834368 .. 3834422 - -29.4  -4.20024   ATAAAAAACACTAAA TAAAATATAGTATAAAAATCACCTAG TTT CTAGGTGATTTTTATACTATATTTTA TTTTTACTAGATAAT 100 16
   CLJ_B3825 3833571 .. 3833581 -  -2.6  -3.60502   AGATACAGGGGTAAA                 TAAT GTC ATTA                 TATTAAATTATTATT  45 323
        ctsR NONE
   CLJ_B3823 NONE
   CLJ_B3822 NONE
        clpC 3828936 .. 3828963 - -11.6  -5.48303   ATAATTTTAAAAAAA        CCAATAATTAAA TAAA TTTAATTATTGG         TTTAAAATTAAATTC 100 46
        radA NONE
   CLJ_B3819 3826391 .. 3826434 -   -23  -2.86722   AAATATAGTATGAGA TAAAGTATAGCACAAAGTAT TAAA ATACTTTGTGCTATACTTTA TCTAGCATTATTTGT 100 16
   CLJ_B3817 NONE
        ispD 3823765 .. 3823795 - -12.7  -4.26393   CATACAATATATAAA       CAAAACTCGCCCC TTATT AGGACGAGTTTTG       TTGCTAAGTTAGCTT 100 29
   CLJ_B3815 3822008 .. 3822021 -  -2.5  -3.60627   CCATCCCATTCTAAA               TTATA TTTT TATAA                TAAACCATATAATAT  45 55
        ilvA NONE
        cysS NONE
   CLJ_B3812 NONE
        thyX NONE
   CLJ_B3810 NONE
   CLJ_B3809 3816764 .. 3816785 -  -2.4  -4.64861   CCCCCCCAAAATAAA           TATAACCA CATATT TGATTATA            CATTAGTGTTAATAA  56 56
        sigH 3815974 .. 3815990 -  -4.3  -3.92075   ACTTGGAGCGAGAAA              CGGGGAT CGA ACCCGCG              GCAACTAGCTTGGGA  58 136
       tuf_2 3814555 .. 3814578 -  -9.6   -4.1585   TCATAACCCTTAAAA          GGACTAGGTC TAGA AACCCAGTCC           CTATAATTTCAAATT  86 39
        rpmG 3814230 .. 3814240 -  -3.2  -3.91689   ATAAAGGACATCAAA                 TCCG AAA CAGA                 TTATTTTGTTTCCTT  52 26
        secE NONE
        nusG 3813372 .. 3813389 -  -3.5   -3.1506   AAATCCTCCCACTAA             TTAAAAC AATT GTCTTAA              TAGCTAATCAAGTTT  46 29
        rplK NONE
        rplA 3811995 .. 3812019 - -12.9  -4.52415   ATTTATAATAATAAA          GGTCTCTCCGC AAG ACAGAGAGACC          CAATATACTTTATAT 100 157
        rplJ NONE
        rplL 3810996 .. 3811017 - -10.2   -5.2422   AAGTATACTAAAAAA           GGGGTACT TACTTT AGTACCCC            TCTATGTAGAGTAAA 100 42
        rpoB NONE
        rpoC 3803394 .. 3803419 - -11.3  -3.73936   AAATTCCATTAATAA         GGAAACAAAGT AATA ACTTTGCTTCC          TATATTAAAACATAT  95 93
   CLJ_B3795 3803095 .. 3803105 -  -6.8  -2.71918   TTATTCTATAAATAT                 GCCA AAT TGGC                 TACTTATTAGCTAAT  60 43
        rpsL 3802600 .. 3802617 -  -2.1     -4.31   GCAAATTAATATAAA             CTATATA TATC TATATAA              ACGCCGAAGACATAG  52 78
        rpsG 3802007 .. 3802029 -   -15  -4.44974   TCAAATTTGACAAAA           CTGTTTTGGC ACA GCCAAAACAG           TTTTGTATTAGTATC 100 33
      fusA_1 NONE
       tuf_1 3798596 .. 3798625 - -13.1  -3.87994   ACTTATTTTTATAAA       CAAAAGGAAAGAG CGTC CTCTTTCCTTTTA        GATATTATATATTTA 100 63
        rpsJ 3797928 .. 3797939 -    -3  -3.22894   CATAATAGTTAGCAA                TAGA TTTC TCTA                 TCACTTAAATAAATT  42 39
        rplC 3797234 .. 3797244 -  -2.6  -3.64703   TCCTTTCTATTTAAA                 TTAA GCC TTAA                 CTGTATTTCTTATTT  45 15
        rplD NONE
        rplW NONE
        rplB 3795378 .. 3795405 -   -13  -3.29987   CATATGATTACAAGA        TTGAAGAGAATA TTAA TATTCTCTTCAA         ATCTATTTATCATGT  95 28
        rpsS NONE
        rplV NONE
        rpsC NONE
        rplP NONE
        rpmC NONE
        rpsQ NONE
        rplN NONE
        rplX NONE
        rplE NONE
        rpsN NONE
        rpsH NONE
        rplF NONE
        rplR NONE
        rpsE NONE
        rpmD NONE
        rplO NONE
        secY NONE
         adk NONE
       map_1 NONE
   CLJ_B3766 NONE
        infA NONE
        rpmJ NONE
        rpsM NONE
        rpsK NONE
        rpsD 3784099 .. 3784109 -  -2.6   -2.8085   GCAACTGATCTAAAT                 TAAA TTA TTTA                 TTATTTACTGTATAA  40 26
        rpoA NONE
        rplQ 3782672 .. 3782704 -  -9.4  -4.38171   TATATTATAGCAAAA     TGGGGACTAAGT-TA ACTT TATACTTAATCCCCA      AAGAATTATACTAAT  93 31
   CLJ_B3758 NONE
        cbiO NONE
   CLJ_B3756 NONE
        truA NONE
        rplM NONE
        rpsI 3778368 .. 3778390 -  -9.2  -5.72254   TTAAACAATAAAAAA           GGAAAGACAA AAA TAGTCTTTCC           TCTTGATTCCATATT 100 39
   CLJ_B3752 3776390 .. 3776412 -  -7.1  -5.61596   ATTTTCATAAAAAAA           CTCTACTTA TTAAC TAAGCAGAG           TTTTTCACAATATAA  91 95
        cwlD 3775479 .. 3775514 -   -13  -4.84359   CGATCTTTATAAAAA    TAAATTCATATATTTC CTTG GAAATATATGAACTTA     TTTTTACTCTTTATC 100 29
   CLJ_B3750 3774520 .. 3774530 -  -2.6  -4.22858   AGAATATATAAATAA                 TATA AAC TATA                 ATTTTTATATTATTT  53 30
   CLJ_B3749 NONE
   CLJ_B3748 3772985 .. 3773031 - -11.4  -4.08042   TTTATTATAAAAACA CCTAAATAAAAAGATTTAAAAT CAA ATTTTAAATCTTTTTATTTATC TTTAAATTCAACTAT 100 97
        ptsI 3768983 .. 3769000 -  -2.7  -5.75945   ATTGTGTAAAAAAAA             CTCCATG AAAA CATAAAG              TTAACATGAAGTTTT  73 45
   CLJ_B3745 NONE
   CLJ_B3744 NONE
        iadA 3765554 .. 3765564 -  -6.8  -2.87564   TCACCCTCCGATATA                 CCCT TAT AGGG                 TATGCATTTACTTAT  61 102
         trx 3765176 .. 3765203 - -10.8   -4.5366   CTAAAAAATGTAAAA        TTGAGAATAACA TTAA TGCTATTCTCAA         TTTATTTTATATTAA 100 37
      gidA_2 3764162 .. 3764197 -  -7.7  -4.90477   TATAAAAAATCAAAA    GGATTTAGCGCAAAA ATCAAA TTGTGTGCTAAATCC     TATTTTATTTATTTG  86 114
   CLJ_B3738 NONE
   CLJ_B3737 NONE
   CLJ_B3736 NONE
       buk_2 3758442 .. 3758456 -  -4.4   -3.1582   GTATTTCATCAAAAC               TTTTAA TCA TTAAAA               CACACCTCTTCCTCA  51 13
         ptb NONE
       buk_1 3756213 .. 3756226 -  -3.9   -4.3898   AGCATTTTCATAAAA               TGAAA CCCT TTTCA                CATATAATAAAAAAT  60 240
   CLJ_B3732 NONE
   CLJ_B3731 NONE
   CLJ_B3730 NONE
   CLJ_B3729 3753214 .. 3753229 -  -3.2  -3.16774   TCAGATAAAACTACA              GAACAG TTAG CTGTAC               CTCCTCTCATTTCTG  46 166
        glmM 3751282 .. 3751329 - -20.5  -5.89921   ATTATAATAAAAAAA CATAAGGGTAATTTATAATTA ACCTAA TAATTATAAATTACCCTTATG TTTTAAAAATATAAA 100 50
   CLJ_B3726 NONE
   CLJ_B3725 NONE
        gutM NONE
   CLJ_B3723 3747939 .. 3747952 -  -3.1  -2.77899   TTTTGCCATCAATTA               CACCT CCTA AAGTG                AAATTTTTGTAGATA  43 18
   CLJ_B3722 3746867 .. 3746915 - -18.1  -2.57192   ACTTAATTTAAGTTA TTTAAATATAAGAATAAAAGAAT GTA ATTCTTTTATTCTTATATTTAAT TTTTAATCAAATCTA 100 38
   CLJ_B3721 NONE
        srlD NONE
   CLJ_B3719 NONE
   CLJ_B3718 3743713 .. 3743730 -  -8.5  -2.61548   GGCTAGTAGAACTTA             CTCAGAT GTTA ATCTGAG              TTTCCCTTATAACTC  69 470
        glmS 3741573 .. 3741611 -   -15   -4.7153   AAATAAGTGTAAAAA   TAAAATTCCAGTAAAAAT AAA ATTTTTACTGGAATTTTG   ATGCAAAATCTCTGA 100 98
        sodC 3740795 .. 3740822 -   -10    -5.626   CATTTCATAAAAAAA        GAAAACCAGAAG TAAT CTCCTGATTTTC         TCTCCTTATTTTTGA 100 115
   CLJ_B3714 NONE
   CLJ_B3713 3738923 .. 3738964 -  -9.9  -5.41359   AATGAAATCAAAAAA TAAAATTCTGCTAAAAA TAACCACG TTTTTAACAGAATTTTA  TTTTACACTCTCTTA 100 130
      rpsD_1 3735635 .. 3735645 -    -4  -2.91395   ACCTCTTGTATAAAG                 TTTG TGT CAAA                 TAATTTTTGTGTTGC  45 246
   CLJ_B3709 3734901 .. 3734927 - -11.8  -5.69473   TAGATCATAAAAAAA         TAAAGGACTAGA AAA TCTAATCCTTTA         TTTTTATACTTTTAT 100 51
   CLJ_B3708 3733730 .. 3733752 -  -4.9   -5.9218   TATATAATAAAAAAA           CTTCTTGCA GATAA CACAAGAAG           TTGATTTCCTCTATA  88 208
   CLJ_B3706 3732232 .. 3732280 -  -7.2  -5.45652   ATTTCTAATAAAAAA TAATAACACAAATTTACTTT-AT TTCT ATAAAAGTTATTTTGTGTTATTA TATTACTTATTATAT  91 50
   CLJ_B3705 3731492 .. 3731524 -  -7.9  -5.12785   TAAGTAAAAAACAAA      GGATAAATAGTTAAA ATC TATTACTATTTATCC      TTATAAATTATATAT  93 48
        acpS NONE
   CLJ_B3703 NONE
   CLJ_B3702 NONE
         alr 3727445 .. 3727463 -  -5.4  -3.09803   TAAGGCTATGTAATA             CCTATAAT TTA ATTATAGA             GTTTTAGGAATTTCA  55 113
   CLJ_B3700 NONE
   CLJ_B3699 3726752 .. 3726774 -  -8.5  -5.59357   ATGATATTAAAAAAA           GATAAGGGC AAAAA ACCCTTATC           CTATTTAATTCAAAG 100 30
   CLJ_B3698 NONE
   CLJ_B3697 3724713 .. 3724733 -  -5.3  -4.79752   TTTAAGAATACAAAA            GGGAAGGTA AAG TACCAACCC            TTTTTGATAAAAAAT  73 43
   CLJ_B3696 3724245 .. 3724263 -  -8.2  -2.99871   TTCCACATGAAATTA             CACCTTCT GTG AAAAGGTG             TTATAGACTAAATAT  71 90
   CLJ_B3695 3723289 .. 3723329 -   -13  -4.18094   TAAATTATTGTAAAA  TATAAAAAGATGTTTGTA AATAA TACAAACATCTTCCTATA  TTTTGCTAACCCTCT 100 31
   CLJ_B3694 NONE
   CLJ_B3693 3721493 .. 3721507 -  -4.4   -5.8901   ACAGAAAATAAAAAA               TTAATT TTA AATTAA               TTTTTTTATTTATAA  86 131
   CLJ_B3692 3720137 .. 3720165 - -16.3  -2.82623   CCCTCTCCATAACTA        TGGTTTAGTTAGA AAG TCTAACTAAACCA        TCTATATAAAAATAT 100 58
   CLJ_B3691 NONE
        uvrB NONE
        uvrA 3713943 .. 3713974 -  -8.1  -3.65529   ATATTTGTATTTAAA      GGACTAGCACCTA TATGTT TATATGCTAGTCC       CAAATAAATTATAAC  75 34
   CLJ_B3688 NONE
   CLJ_B3687 NONE
   CLJ_B3686 NONE
   CLJ_B3685 3709809 .. 3709845 - -11.2  -4.33739   TAAAAAATTCTAAAA    TTAAATAAATCTTGTG AGTTA CACAAGATTTATTTAG    TGAAATTATATTTTA 100 31
   CLJ_B3684 NONE
        uvrC NONE
   CLJ_B3682 3706406 .. 3706418 -  -3.5  -2.54098   GCCCTTAATCAAGAT                TTAAA TCC TTTAA                CTTTCCTTTATTCTT  42 2
        murB 3705364 .. 3705394 - -12.7  -4.46854   CCATTTAACAATAAA       CTAGGGAAGTCAT TTGTT AAGACTTCCCTAG       TTTGTTATATTCTAA 100 37
   CLJ_B3680 NONE
   CLJ_B3679 NONE
   CLJ_B3678 3702047 .. 3702085 -    -9  -4.51765   TATAACTCAAACAAA   GAGAGTGTCTCACAAC AAGATAG ATTTTGAGACACCCTC   CTTTGCAAAATATTA  86 54
        dnaE 3698330 .. 3698355 - -10.7  -5.68039   AAATTTATAAAAAAA         TATTAGAAGAA ACAC TTCTTCTAATA          TTTTTCATTTTATTT 100 64
        pfkA NONE
        pykA NONE
   CLJ_B3674 3694083 .. 3694101 -  -4.5  -5.69262   TTATAAAAACAAAAA             GAGCACC ATAAA GGTGCTA             AAGAAGATCAGTTGC  82 172
   CLJ_B3673 3693375 .. 3693405 -  -4.9  -3.69481   CATAACAAAAACACA       GGATAAATAGT AACAATTAA ACTATCTATCC       CTAGATTTTTTCTAA  58 184
      rumA_2 3691735 .. 3691754 -  -6.4  -5.46657   TATGCCAAGAAAAAA            GACGCTCA TTTC TGAACGCC             TAAACAAAAGAAAAG  88 216
   CLJ_B3671 NONE
   CLJ_B3670 NONE
   CLJ_B3669 NONE
   CLJ_B3668 NONE
   CLJ_B3667 3685875 .. 3685917 - -17.9  -3.01831   TGGCCAAAAACATCA TCTGCCACAACTGCGGT TTTTTTATT ACCGCAGTTGTGGCAGC ATTCCTTTGTAATTT 100 169
   CLJ_B3666 3684383 .. 3684417 -  -7.3  -4.55118   TAAGCTTATAGAAAA     CAACGACATCAAAAT TTTTC ATTCCGATGTCTTTG     GTACTTCATGATATA  77 505
   CLJ_B3665 3683383 .. 3683399 -  -9.5  -3.82353   CATTTAAAAATAAGA              GTGGATT ATA AATCCAC              AGGTATTTTCTTAAC  84 14
   CLJ_B3664 3682132 .. 3682142 -    -4  -2.93532   ATTTAAATTAATAAT                 TTCA TAT TGAA                 CTCCTTTTTCTTGCA  45 82
   CLJ_B3663 3681841 .. 3681857 -  -3.7  -3.05844   CCTTTGATTTCAATA              TAATCCT GCA AGGGTTA              TTCTTTATCTCCATT  46 23
   CLJ_B3662 3680512 .. 3680535 -  -3.8  -4.14013   TAAAACGTTTTAAAA          GGGGTATGAA AACT CCCATACGCC           TATATTGCAGCGGGG  56 411
   CLJ_B3661 NONE
   CLJ_B3660 3678611 .. 3678622 -  -2.2  -3.83844   GGCATTAATTAATAA                TCCC ATCT GAGA                 CAATCCTGCCTGTTG  48 295
   CLJ_B3657 NONE
   CLJ_B3656 NONE
   CLJ_B3655 NONE
   CLJ_B3654 NONE
   CLJ_B3653 3674314 .. 3674326 -  -2.7  -5.31519   ATATTGAAATAAAAA                TTCTC AAG AAGAA                AGTAACAGTTTTTAC  67 96
   CLJ_B3652 3672836 .. 3672868 -   -10  -3.15699   AGCCACTGATCAATA     GGGACACTGAATAAC TATC GTTTTTCAGTG-CCC      TCCCTATACTCTATA  85 262
   CLJ_B3651 3672296 .. 3672322 -  -8.1   -5.4492   GACACACACAAAAAA        GCAACATAGGGA AGTT TCCC-ATGTCGC         TTTTCTTAAAATTAT 100 37
   CLJ_B3650 3670527 .. 3670537 -  -2.6  -3.60475   AAGTTGTATCTTAAA                 TTTT GTA AAAA                 TTGATATCAAGTATT  45 104
        speD 3669971 .. 3669991 -  -4.1  -2.75865   CTTTAAAATAATCCA            TATCTATGA ATA TTATAGATA            TATCACAGCGCTGTT  44 146
   CLJ_B3647 3669288 .. 3669317 -  -7.2  -4.99035   TTATGTACATAAAAA       CACAGTCGCATT CTATAT AATGCAACCGCG        CTTTGAATACCATAA  83 106
   CLJ_B3646 NONE
   CLJ_B3645 3666224 .. 3666247 - -11.8  -4.35581   GGAAAATATTTAAAA          GCCATATGCA TCAT TGCATACGGC           TTTTATTATAACCAA 100 47
   CLJ_B3644 3663399 .. 3663420 -  -5.3   -5.4505   GTTTGCAACAAAAAA           GTGTGTATAT TTA AT-TACACAC           TTACACTATTACTAA  81 18
   CLJ_B3643 3662946 .. 3662957 -    -3  -2.54181   CAATATAAAATAATT                TAAG ATTA CTTA                 TTTTCTTGTAAAATA  39 53
   CLJ_B3642 3662412 .. 3662441 -  -2.3  -2.87274   TCCTATAATTAATTA       TAAGAATTTAATA AATA TATTTTATTCTTA        TTAGCTTATAATCTC  39 31
   CLJ_B3641 3661361 .. 3661382 -  -5.9  -3.41527   CAATTCTTAGCATAA           GATAGAGCT TTGG AACTCTACC            TCATAATTAGAATAT  61 137
   CLJ_B3640 3659972 .. 3659989 -  -7.7  -4.24338   AAAAATACGTTAAAA             GAGCCTC CTAA GAAGCTC              TTAATTAAATAAACT  78 156
   CLJ_B3639 3658635 .. 3658652 - -11.3  -3.47029   CCATTCAAATAGTAA             GAGCTCC ATAA GGAGCTC              CTAATAGCTTTTTTA  93 131
   CLJ_B3637 NONE
   CLJ_B3636 3655918 .. 3655929 -    -3  -3.24925   ACTTCAGAGTAGTAA                TGAA CTAC TTCA                 TATGAATAATTTGAG  42 49
   CLJ_B3635 NONE
   CLJ_B3634 3653583 .. 3653612 -  -2.9  -5.26875   TTTTTAAGTAAAAAA       GAAAGGTCTCC CTTTTCCT GAAAACCCTTC        TATACTATATCTGCT  64 42
   CLJ_B3633 3651667 .. 3651710 - -10.6  -5.05505   ATTATAAACCAAAAA GAATCTATAACATAGACCTT TATA AATGTCTACCTTATAGATTC CATTTCAACTTTACT 100 72
   CLJ_B3632 NONE
   CLJ_B3631 3650048 .. 3650058 -    -4  -3.03007   AATACCCTTTCAATA                 TCAT AAA ATGA                 TTTATCGAATATTTA  46 43
   CLJ_B3630 NONE
   CLJ_B3629 3647713 .. 3647730 -  -2.8  -3.07994   TTTAATTTTATTGAA             TTATTC TTTATG GAATAA              AAATTATTCTTTATT  41 36
   CLJ_B3628 3646979 .. 3647005 -  -4.5  -5.95539   TTGTAAATAAAAAAA        CTTCTAATCCCT ATAC AGGGACC-GAAG         TTATGTCGGCGGTAC  86 379
        proS 3645414 .. 3645444 - -10.6  -4.57755   ACCTACTATATAAAA       GGTATAGAAAAATC ATT GATTCCCCTATACC       CTTTAATTTCCTAAT 100 80
   CLJ_B3626 3643484 .. 3643539 - -18.4   -3.8211   TGTTATTTAGAATAA TCTTAAATTTATTATTAAATATTTGT TACG AAAAATATTTAATAATAAATTTAAGA CAAAATTATGAATAT 100 392
      ftsH_1 NONE
   CLJ_B3624 3639057 .. 3639111 - -16.2  -4.51812   TTTCACAAGAACAAA TAACTGCTAATTGCTAAGAGTTTA ATTTTTA TAGACTCTTAGGAATTAGCAGTTA TTTTTATTAATTTTA 100 124
   CLJ_B3621 3634805 .. 3634836 - -15.4  -6.07374   ATAAAAAATAAAAAA      TAATGCAACAAAGG AACA CCTTTGCTGCATTA       TTTTAATAATACAAA 100 296
        lysC NONE
        lysA 3632108 .. 3632142 -  -6.7  -5.99154   CATTAAATAAAAAAA     TCTTATTGAGTTA GTTCAAATT CAACTCAATAAGA     TTTTTTATTTATCAT 100 89
         cgs 3623178 .. 3623214 -    -7  -4.99645   ATCTTATAAATAAAA   CCCTATTTAGTTGCAAAT TTT ATTT--AACTAAATAGGG   TTTTCTTGTTGGTTA  83 104
   CLJ_B3615 3622200 .. 3622243 - -11.4  -5.31456   TTAATTTACAAAAAA TATGTAAAACCCTATTTA TCTATAAT TAAATAGGGTTTTACTTA ATTGTTAATAAGGAA 100 111
   CLJ_B3614 3621763 .. 3621784 -  -9.5  -5.82281   AAATATATAAAAAAA           CCCTACAAC AAAA GTTATAGGG            CGAATTATCGCGGTA 100 137
        trpS 3620658 .. 3620711 - -11.7  -3.14327   TAATAAAATTACAGA CTATAAAGAATAAAAAGTTTTCATAA GTA TAATGAAAACTTTTTATT-TTTATAA AAATTTATCCTATCT  93 35
        prfC 3617665 .. 3617694 - -15.3  -5.49568   AATCTAAAACAAAAA       GAAATGAGACTTA AATT TAAGTCTCATTTC        TTTTTATTATTTAAA 100 72
   CLJ_B3609 3616218 .. 3616229 -    -3  -4.09243   TATATTTTTTTAAAA                TGTA TGGG TACA                 TTATTTAAATAAATT  51 30
   CLJ_B3608 3615565 .. 3615592 - -13.6  -4.17523   AAACAATTCGTAAAA        TAAGGAAGTTGC GAAC GCAACTCCCTTA         TTTTATGCTTTTCAT 100 23
   CLJ_B3607 3614264 .. 3614280 -  -3.1  -4.24338   AAAAATAGTCTAAAA              TATTACA TTT TATAATA              TTTTTTATCTATTTT  56 30
   CLJ_B3606 3613640 .. 3613676 - -12.6  -4.08767   TTTATTTTTGCAAAA    TTAAAGCTATTGAAGA TTCCC TCATCAATAGCTTTAA    TACTTATTATATAAA 100 91
      tyrS_2 3612235 .. 3612283 - -12.7  -3.91196   TTTACATATATTAAA TATAGTAGGGTGCCTCAAAATAA ATT TAATTTTGAGACACCCTTTTATA AATTACTCTACAACT 100 28
   CLJ_B3600 3608092 .. 3608103 -    -3  -3.10597   CCTTTTATTTAAAAT                TACT TTTT AGTA                 GTGATATATTATACT  41 3
   CLJ_B3599 3607104 .. 3607120 -  -2.3  -3.93664   ACCGAATATACCAAA              GAAGA ACATAAA TCTTC              TCCTCTCAAATTAGT  48 80
   CLJ_B3598 3606565 .. 3606591 - -15.3   -4.3586   TCATGCACATGAAAA         GGCCAGTAATC TTTAC GATTACTGGCC         TTTTTAATGGCAGGG 100 160
   CLJ_B3596 3605029 .. 3605055 - -11.1  -3.90416   ATATTACATAAAAGA         TACACTACATA AACTA TATGTAGTGTA         TTTTTATCTTTAAGT 100 73
   CLJ_B3594 3602826 .. 3602848 -    -8  -3.74475   ATAAACCTAATATAA           TAATATAATA ATT TATTATATTA           TTCAATGATATAGTA  73 248
         pyc 3599136 .. 3599157 - -10.9   -4.8048   TTCCCATAGTAAAAA           GCACCGCTT CCCC AAGCAGTGC            TTTTTTTTTATTTAT 100 45
   CLJ_B3592 3595821 .. 3595861 - -14.4  -5.21506   AGAATAACATAAAAA  GAATGTCTCAAAATTAAA TTTAT TTTCATTTTGAGACATTC  TTTCTTACTATTCAA 100 33
   CLJ_B3590 3592523 .. 3592536 -  -3.1  -4.18018   TTCTTTCATCTAAAA               CACCT CCTT AGGTA                TACAAAACATAACTT  54 6
   CLJ_B3589 3591537 .. 3591547 -    -4  -2.53125   ATTCCTCACAAAAGG                 TTAG GAT CTAA                 GAGTGAATCCAAAGA  44 230
   CLJ_B3587 3588638 .. 3588663 -  -4.9  -4.83759   AACCAAATCTAAAAA         TGAATAAAATT TAAT ATTTTTATTCA          GTCTTATTTATTAAG  70 19
   CLJ_B3586 NONE
      gltA_2 3586070 .. 3586101 - -16.2  -4.69559   AAATTTGAAAATAAA      TAAGCTGTACTTTA AATA TAAAGTACAGCTTA       TAGGTTATAACTAAT 100 76
   CLJ_B3584 3584937 .. 3584947 -  -2.6  -2.75343   TCCATATTTTTAAAT                 TTTA TAT TAAA                 TATTATTTTGTAATT  39 163
   CLJ_B3583 3583332 .. 3583376 - -11.9  -5.04249   TTTTTAAAAAATAAA TATAGCTATAAAAATAATTTA AAA TACTTTATTTTTATAGCTATA TATTAACTAAAACTA 100 68
   CLJ_B3581 3582224 .. 3582249 -  -8.5   -4.8667   CATATTGTATAAAAA         TATGAGAAAAT TATA ATTTCCTCATA          TTCTTGCCTATTTTT  88 10
       groES NONE
       groEL 3579297 .. 3579324 -  -7.9  -5.69262   CTACAAAAATAAAAA        TAAGAAACTCT ATATAA AGAGTCTCTTA         TTTTTATTTTTATTA 100 38
        guaB NONE
        guaA 3574987 .. 3575035 -  -5.8  -4.47611   TATTACAAAAAAATA TAAAAAGTGCTTTCAATATACTTT AAT ATAGTA-AT-GAAAACACTTTTTA AATATATAATTTTAT  68 58
   CLJ_B3574 3572999 .. 3573027 -   -12  -4.68846   ACGAATAAATTAAAA        TTCCAGTAAAAA ATTCA TTTTTACTGGAA        TTTCTAATTTTTACT 100 289
   CLJ_B3573 NONE
        fldA NONE
        fldI NONE
        fldB NONE
        fldC 3566747 .. 3566758 -    -3  -4.17491   AGTAAATTTTGAAAA                CTTT TATT AAAG                 TGTTTCTGAAAAAGC  51 20
   CLJ_B3568 NONE
   CLJ_B3567 NONE
   CLJ_B3566 3563368 .. 3563417 - -11.7  -4.75372   ACTATTTATTAAAAA TATATACAAGAAACAAAAGGAGG AAAA CCTCATTTTGTTTCTTGCAAGTA AATTAATTAACCTTC 100 41
   CLJ_B3565 3562007 .. 3562064 - -16.9  -3.86202   CTTTATTATATCAAA TAGATATAAAATATAAAAAGCAGGCTT TTTA AAGTCTGCTTTTTATATTTTATATTCA CCCTTATTACATTCA 100 10
      ldhA_2 3560074 .. 3560123 -  -8.4  -3.33744   TCTTTTTTTAAAAAT GAAAGCGTTTTCATGATTTACT AATCTCAA AGTAAAT-A-GAAAACGCTTTC TATTACCATTTTATT  74 141
   CLJ_B3561 3556966 .. 3556986 -  -4.9  -2.71364   CCATGGTTTCAATGA            TTAATAATA TTA TATTATCAA            ACAATATATAACCAT  50 125
   CLJ_B3560 3556555 .. 3556576 - -11.7  -5.09762   ATTTTAATATAAAAA           GCTGTTGAA GTAA TTCAACAGC            CATTTTTTCATTATT 100 44
         pgi NONE
   CLJ_B3558 3554621 .. 3554659 -   -12  -4.53636   ACTATAGAATTAAAA   TAGGATGTCTCAAAAT TAAGGCC ATTTTGAGACATCCTC   TTCTTTAATAAAAAT 100 80
   CLJ_B3556 3552202 .. 3552221 -    -3  -3.23984   TAAATCCACCACCAA            TATTAAAC ATAT ATTTAATA             TTATCGTTTATCTTT  42 50
   CLJ_B3555 3551492 .. 3551512 - -14.1  -3.94868   TATAACAAATTTAAA            GGAAAGTGC AGG GCACTTTCC            TTTTTATACTCCATA 100 29
   CLJ_B3554 3550530 .. 3550552 -  -7.8  -5.64328   AATAAAAAAATAAAA           CAGCCTAT TGGGGTT ATAGGCTG           CTTACAATAAATAAA 100 189
   CLJ_B3553 3550081 .. 3550102 - -11.7  -4.39571   CTTATAAATTTAAAA           TGTGCTAGT AAAA ACTAGCACA            CAATAATTAATCCTA 100 42
        pcrA NONE
        ligA NONE
   CLJ_B3550 3545260 .. 3545296 - -10.6  -5.38958   ATTTATAAATAAAAA   TCCTATTTAGTTA-AAT TGCC ATTATAACTAAATAGGA    TTTTATTTATAAATT 100 129
   CLJ_B3549 3543763 .. 3543802 -  -2.5  -4.12532   TTTTTTACATAGAAA  TAA-AAAAAACTACCT GTAAAAATT AGGCAGTTTTTTATTA  TATTATATAACCTCT  51 28
        gatC NONE
        gatA NONE
        gatB 3540383 .. 3540404 -  -9.5  -5.60993   TTTTCCATAAAAAAA           TCCCCACAT TTTT ATGTGAGGA            TCTTTTATTCTAATA 100 42
   CLJ_B3545 3538431 .. 3538469 - -22.2  -4.73448   ATATACACTTAAAAA   TTAATATGAGGATATTGC AAT GCAATATCCTCATATTAA   TTTATTTTTTGGATA 100 261
   CLJ_B3542 NONE
   CLJ_B3541 3535436 .. 3535452 -  -3.7  -3.31322   TCGAACCCTTGACAA              CCAGA ACCACAA TCTGG              CGCTCTACCAACTGA  49 444
   CLJ_B3518 3531906 .. 3531939 -  -5.4  -4.41716   ACAGGACATAAGAAA    CCAGGAGTAGA-GCTA AAAC TGGCGTCT-CTCCTGG     ATAAAATTTTTTAAT  68 145
   CLJ_B3517 3531495 .. 3531507 -  -3.5  -2.80511   TCTATAATTTAAGCA                TAAAA ATT TTTTA                TAGTTTTAGTTAATG  43 6
      hgdC_3 3530505 .. 3530529 - -15.9  -5.33866   TAAAGGTATAAAAAA          TGCCTTCCTTT TTT AAAGGAAGGCA          CAATTATACTCTAGC 100 203
        pyrB NONE
        pyrI NONE
        pyrC NONE
        pyrF NONE
        pyrK NONE
        pyrD 3525198 .. 3525208 -  -2.6  -4.13014   CTTATATTTTCAAAA                 TTTA TTT TAAA                 TAATTTCCCTTATTT  51 21
        pyrE 3524550 .. 3524578 -  -6.9  -5.79588   TTAAAACTAAAAAAA        TGTCCCAAAAT TAAATCT ATTTTGAGACA        ACTCTTATTTTAAAA  90 42
   CLJ_B3507 3523486 .. 3523508 -  -6.4  -3.75884   CCTCAAATAAAGCAA           GAGTGTAT ACACTTA ATACACTC           TTAAAACTCTTATAT  68 86
   CLJ_B3506 3522671 .. 3522701 -  -5.6   -2.5294   TATTGTTTACAATAT       TTTTCATCATAATA AAA TATTTTGAAGAAAA       TCTTTTGATTCTATT  52 1
         tig 3521151 .. 3521180 - -11.6  -2.52353   ATAATTATTAAAACT       TAGTTGCCAGAA AATATA TCCTGGCAACTA        TATCATTATCTATTA  85 52
        clpP NONE
        clpX 3519158 .. 3519184 - -13.2  -5.30189   TATAATAGTAAAAAA         TAACACCAAGAT AAA ATCTTGGCGTTA         TTTTTACGCTGTTTC 100 29
        lonB NONE
         lon NONE
        engB NONE
   CLJ_B3499 3513487 .. 3513531 - -19.9  -5.16472   AAAAATTTCAAAAAA TAAAAGCAATAAAATATCCAT AAA ATAGATATTTTATTGCTTTTA TCTAATACACAAGCA 100 68
   CLJ_B3498 NONE
   CLJ_B3497 3512610 .. 3512622 -  -4.8  -2.76225   AATTAATGGCAAGGA                GGGT AATGA ACCC                TCCTAAGTTATTAGC  51 36
   CLJ_B3496 3512131 .. 3512154 -  -6.2  -5.44721   ATTATGCTAAAAAAA          TAGAAAGAACT TTA AGT-CTTTCTA          TAAAAAGTAGTATTT  83 39
   CLJ_B3495 3510847 .. 3510865 - -14.6  -5.67529   AATTAAAAACAAAAA             GGGACCGT TTT ACGGTCCC             AAGGGGGATGGGGGG 100 157
   CLJ_B3493 3508505 .. 3508537 - -10.9  -3.41982   AAAGTTAGTAATTAA      TAAGCACTTAAAT TAGATAG ATTTAAGTGCTTA      TTATATTGCTGCCTT  93 54
   CLJ_B3491 3507140 .. 3507157 -  -4.3  -2.92712   CATTATATATAAGTA             TAATTTA CATT TAAATTA              CTTCAATATAAATTC  49 97
      rplY_2 3506394 .. 3506416 -  -4.3  -5.55698   TATAACCTAAAAAAA           TAAAATTAG GTTCT CTAATTCTA           TTTACGAGAAATAAA  78 102
   CLJ_B3489 3505842 .. 3505869 -  -6.2  -5.88197   TTAAAGATAAAAAAA        CCCCCTGGAC TTTTTATT GCCCAGGCGG         TCGACATTCTAACTT  90 203
         pfl 3503150 .. 3503196 - -14.8  -3.39895   CTCCTTATCAAGTAA TTATAATACTCAGATGAAGAAT ATT ACTCTCCACCTGAGTATTAGAA AAACTTATCTAGGGC 100 136
        pflA 3502412 .. 3502442 -  -2.8  -4.16016   CTATGTTTTAATAAA       TTATTTAAATATGA TTT TTATATTGAAATAA       TTTTCTTTAATTCTT  51 12
   CLJ_B3486 3501191 .. 3501225 - -11.8  -5.46698   TCTAAAATGAAAAAA     TAAAAGAGTTACTA AAATTAA TAGTAACTCTTTTA     TAATTATATTTAGAT 100 42
   CLJ_B3485 3498724 .. 3498734 -    -4  -5.34208   AAAAAAAATTAAAAA                 TAGA TTA TCTA                 TGCATGGATGTAAAT  78 331
   CLJ_B3483 NONE
   CLJ_B3482 3497057 .. 3497102 - -18.3  -3.66921   AATTTTAATTTTAAA GTTTAATAAATATTAATTTTA TGAT TAAAATTAATATTTATTAAAC TCTAACCCTATTATC 100 109
         lgt 3496080 .. 3496122 - -10.1  -4.94058   CTAAGCCAAACAAAA TACTCCTACAAATAGCAAT ATAAA ACTGCTATTTGTAGGATTC ATTAACTCTACGCAT 100 129
   CLJ_B3479 3494774 .. 3494798 -  -6.6  -5.02476   ATATTTTGTAAAAAA          TAAAGGTAAT ATAAA ATCACCTTTA          TTCTTTATCTTATTT  80 35
   CLJ_B3478 3493758 .. 3493784 -  -4.5  -3.91073   TTAAAAAAACAAAAG         CTGCTGATAAA ACAAA TCTACCAACAG         TAAAAAATATAAAGT  58 85
   CLJ_B3477 3492038 .. 3492085 -  -8.7  -4.28432   AAGTTCAATTTAAAA TGTACCCTATAGTGTAGAC TTTTTTAATT ATCTACTCTATAGAGTACA CCTTGTAATTTTCTA  84 90
   CLJ_B3476 NONE
   CLJ_B3475 3490473 .. 3490502 -  -8.1  -5.60993   TTTTGTATAAAAAAA       TAACTTAGAATAA TATA TCATCCTAAGTTA        TTTTAAAAATTTTTA 100 38
         crt 3489317 .. 3489330 -  -2.5  -3.04517   ATGCCCCCTTAAAAT               TTAAT ATTT ATTAA                TAAAATTTGGTTTTC  41 12
         hbd NONE
   CLJ_B3472 3487158 .. 3487194 -   -12  -3.14468   TTGTATTATATTTAA    TTACATCATTAAAATA AATTA TATTTTAATGATGCAA    TGTTAATATTATTCT  93 95
         bcd NONE
   CLJ_B3470 NONE
   CLJ_B3469 3484027 .. 3484057 -  -8.5  -5.80364   ATGGGAATAAAAAAA       GAATGTGATATAT TATTT ATATTTCACATTC       CTTTTTTATATGATT 100 88
   CLJ_B3468 3482074 .. 3482128 - -16.2   -5.0133   CATCTTCTTAAAAAA TAAAATATAAAAACGACAGAGCACTT AAT AATGGCTCTGTTGTTTTTATATTTTA TCAAGTTAAATTATA 100 31
   CLJ_B3464 3478518 .. 3478534 -  -6.6  -3.14211   ATTTTTTTGGATGAA              CACCTA ATTAA TAGGTG              TTCATTTTTTAATTT  63 174
   CLJ_B3461 NONE
   CLJ_B3460 NONE
   CLJ_B3459 NONE
   CLJ_B3458 3471392 .. 3471417 -  -4.9  -6.09888   TTGGAACAAAAAAAA         CTATTGATA ACTTGATA TATCAATAG          TTTTTGCTATTTATT  91 54
   CLJ_B3457 NONE
   CLJ_B3456 NONE
   CLJ_B3455 NONE
        proC 3465893 .. 3465903 -  -2.6  -3.28712   CTCCCCTTTCCAGAA                 TATT GGC AATA                 TTCTGATTATTACCT  42 120
   CLJ_B3453 NONE
   CLJ_B3452 3464619 .. 3464648 - -10.9  -3.44801   TTTTATAAAAAACTA       GGGGTAGAACTTAT AGA ATAAGCTCT-CCCC       TTTATATAAATTTAT  93 51
   CLJ_B3447 NONE
        recX NONE
   CLJ_B3445 3459117 .. 3459148 -   -14  -4.57474   TTAATCTATATAAAA      TGCTAGTAACTTTT ATAT AAAAGCTACTAGCA       TTTTTACCATTCTCC 100 29
   CLJ_B3441 3451987 .. 3452015 - -11.8  -5.48054   ATCAAAATTAAAAAA        CCACACTCCAGT TGAAT ACCGAAGTGTGG        TTTAGAAATAAACAG 100 373
   CLJ_B3437 3448389 .. 3448409 -  -4.8   -3.6144   AAAAATAAAAAATTA            CTGTAATT TCTTT AATCACAG            TCTTAGTTTTCTCAC  56 233
   CLJ_B3436 NONE
        valS 3444638 .. 3444668 -  -6.2  -4.38927   TTTTTATATAATAAA       TACAGGAAAGTTAC AAA ATGTCTTTCCTGTA       TTTCTATTATTTTAT  72 115
        folC 3443202 .. 3443238 -  -7.5  -5.71638   CAAGAAGCAAAAAAA    CAAAATAAGGAAAGCAT CTA ACACTTTCCTTACCTTA    TTAATTTTCTCATAT 100 18
   CLJ_B3432 3441521 .. 3441531 -  -2.6   -4.5265   AATTATATTAGAAAA                 TAAT CTA ATTA                 ATTATTTTACTTTGC  60 432
   CLJ_B3430 3440310 .. 3440335 - -10.7  -3.55071   TTACACGCTCCTAAA         GAAAATAACTA TTTT TAGTTATTTTC          TTCAGTTTACAATAT  91 182
   CLJ_B3429 NONE
   CLJ_B3428 3438968 .. 3439000 - -18.1   -3.3705   AAATATACTTGAGAA      TAGTATGTACAACTT AAA AAGTTGTACATACTA      TTCTTTATGCATGTT 100 30
   CLJ_B3426 NONE
   CLJ_B3422 3431426 .. 3431452 - -15.2   -3.4285   TTATGTAACTTATAA         CAGCAGAGCCAT TAA AAGGCTCTGCTG         CATAAAATCATACTA 100 41
   CLJ_B3421 NONE
   CLJ_B3420 NONE
   CLJ_B3419 NONE
   CLJ_B3418 3427443 .. 3427464 -  -3.1  -4.13246   CAGTTCAGACATAAA           TTTAAAGAT AAGT ATCTTAAAA            TACATACAATTTTGA  54 93
   CLJ_B3417 3427010 .. 3427046 -    -9  -3.61603   ATTTATAAAAATATA    CTTACCTAATAAATAT TATAT ACTTTTATTAGGTAAG    TCAATAGATTAGTGC  79 43
   CLJ_B3416 NONE
        hslO 3424817 .. 3424844 -   -13  -5.39755   TATAAGCATAAAAAA        GAGAGATAATAT TTAA ATATTATCTCTC         TTTGGAGGCGCCACC 100 491
   CLJ_B3409 NONE
   CLJ_B3408 3421826 .. 3421838 -  -3.5  -3.65426   TGATAAAGTTCTAAA                TTTTT TAA AAAAA                CATAATGTAAAGCCT  52 452
   CLJ_B3406 3419849 .. 3419871 -  -7.7  -6.02919   TTACAAATAAAAAAA           CCCATCCCA ACACA TGGGACGAG           TGTATTTTCGTGGTT 100 309
        thrS 3417668 .. 3417683 - -10.4  -5.14682   GTATAATAAATAAAA              GACGGC ATAA GCCGTC               TTCATAAACAATAAT 100 242
        infC NONE
        rpmI NONE
        rplT 3416443 .. 3416461 -  -8.9  -5.36314   TAAAATATTAAAAAA             TACGGCT ATTTA AGCCGTA             TTAATTCTTATAATT 100 47
   CLJ_B3400 NONE
   CLJ_B3399 3414315 .. 3414328 -  -2.5  -3.70925   TTAGTAATAAATTAA               TTTAT ATTC ATAAA                ATCAGCATTAATTAT  47 40
   CLJ_B3398 3413183 .. 3413205 -  -8.4  -5.55769   TTTTATAATAAAAAA           GTCCATCCCC TAA AGGGACGAAC           TAAATCCGCGGTACC 100 293
        pheS 3412080 .. 3412098 -  -6.2  -2.71263   AACGTGTTGTAATTA             TTTAATTT TTA AAATTAAA             GTATAGATTTAAAAT  57 34
        pheT NONE
   CLJ_B3395 3408727 .. 3408762 -  -5.7  -5.67063   CTTATTATAAAAAAA   TAACCGTACACA--TAC CAAT GTAAGTGTGTACGGCTA    TTTTTTATTTACTTT  86 30
   CLJ_B3392 3405904 .. 3405931 - -12.2  -4.61231   TTAGATTTCTAAAAA        CTCCTTGCATTT TATT AAATACAAGGAG         TTTAATTATTAGCTG 100 94
   CLJ_B3390 3402558 .. 3402588 - -11.3  -4.23853   AATAATATATAGAAA      GACTTCGCATCCCT ATAC AGGGAC-CGAAGTC       TTAATATCCAAAGTA 100 355
   CLJ_B3389 NONE
   CLJ_B3388 3397268 .. 3397325 -  -6.1   -4.0162   CCTCTACACTATAAA TAAATTA-ATAGCTTAGATTTTAGTAAA AAG TTCATCTAAACCTAAGCTATATAATTTA AATCTACTTTATCTC  68 29
   CLJ_B3387 3396650 .. 3396661 -    -3  -2.84812   ATTCATAGGACTATA                TTCT GATG AGAA                 CTTTAAAACTTATTT  40 35
   CLJ_B3386 3395227 .. 3395243 -  -3.1  -3.89346   TTTTTATCGTATAAA              TTCTATA ATT TATAAAA              TAATTTTAAGGTTCA  52 204
   CLJ_B3385 3393776 .. 3393814 -  -6.2  -5.60993   CGCTTTATAAAAAAA   TAAATAAGCTCTTGTGTA TAT TAATTAAGAGCTTATTTA   TTAATTAATTTTAAA  85 268
   CLJ_B3384 3392590 .. 3392622 -  -6.3  -3.55764   AAAAACTAAAAGAGA      CAGGATTATATGTAC AAG GTACAGAGGATCCTG      AGGTTGAATATATAA  64 240
      rplY_1 3390462 .. 3390474 -  -4.9  -3.97674   TTATTATCCAAAGAA                TATAG AAA CTATA                GTACTATCTAAATTC  60 1
   CLJ_B3381 3387710 .. 3387764 -   -28  -5.30339   ATGAAAATACAAAAA TATTTAAATTATGCATAGGATAATTT TTT AAATTATCCTATGCATAATTTAAATA TTTTTAGTTTTAAAA 100 35
   CLJ_B3380 NONE
        galU 3385585 .. 3385601 -  -5.8  -6.20267   TTAAAAATAAAAAAA              GGTGGC TTTTC ACCACC              TTTTTTTATTTAGTT 100 31
   CLJ_B3378 3381995 .. 3382022 -  -7.9  -4.18197   ATTTTGTAGTTAAAA        TATAGAGGCTA CTTTCT TAACCTCTATA         TTTACAGAATATTTT  77 47
   CLJ_B3377 3378835 .. 3378858 -  -7.6  -5.63645   CTAAAATATAAAAAA          CCATCAATTA TATG TAATTAATGG           TTTTTTATTTATAAT 100 118
   CLJ_B3376 3375830 .. 3375854 -  -7.9  -5.48054   AGTAAAATTAAAAAA          CCGTTGACAAA GGA CCTGTCAACAG          TTTTTTAACTATATA 100 34
   CLJ_B3375 NONE
   CLJ_B3374 3372334 .. 3372363 - -13.1   -3.2048   TCCAAATTTTATTAA       TTAGGATAAGTCC AAAA GAACTTATCCTAA        TATTAATATTATAGT 100 34
   CLJ_B3373 3371127 .. 3371178 -   -15  -5.16132   TATATTAAAATAAAA TTTTAAAATTACCACCATAATATA ATAT CATATTTTGATGGTAATTTTAAAA ATTTAATTTTTATTT 100 47
   CLJ_B3372 NONE
   CLJ_B3371 3368998 .. 3369013 -  -3.4  -4.41047   ATCCTCCAATTAAAA              TAAAAT TTTT ATTTTA               ATTTATTTTTTATTC  58 28
   CLJ_B3370 NONE
   CLJ_B3369 NONE
   CLJ_B3368 3365367 .. 3365379 -  -4.9  -3.12803   AAAAGTATTATTGAA                GATTT GTT AAATC                CTCTACTACTTTTAT  53 5
   CLJ_B3367 NONE
   CLJ_B3366 NONE
   CLJ_B3365 3361921 .. 3361934 -  -3.9  -3.17382   AACAATTATATTCAA               TCTAT TTAT ATAGA                GGTATTAACTATTCT  48 30
   CLJ_B3364 3360600 .. 3360616 -  -6.6  -5.23316   TATTACATTAAAAAA              GGAGTT TTTAT AACTCC              TTTTTACAAAGATCA  83 38
   CLJ_B3363 3359313 .. 3359348 -  -9.3  -3.04937   ACAAATATAATGATA    TTTAAAAAAGGAGTT TTAAAC AACTCCTTTTTTATA     TTTATTAATAATTTA  78 64
   CLJ_B3362 NONE
        mviN 3356124 .. 3356135 -  -4.4  -5.28683   AGGAACAGTAAAAAA                GCTA ATAA TAGC                 TGATAATATTGGTCC  76 489
   CLJ_B3359 3353920 .. 3353972 - -11.4  -3.85698   GCTGCTCTCTATAAA CAGAGTTCTTGGCTTCAGAGGGAGT TTTT ACTCCCGCTGAAGCTTAGAAATC-G TTATCCAGGGACGTA 100 156
   CLJ_B3358 3352787 .. 3352824 -  -2.9  -5.18726   TTTTTATAATAAAAA   GCTATGAGTTTAACAATA TAA TATTGC-AAATTCGTAGC   TTTTTAATTTAAAAA  64 260
   CLJ_B3356 3349675 .. 3349691 -  -5.2  -3.46304   TGTAAAATAGATGAA              GAAGTT ATAAA AACTTC              TAAAGAATTTCTTAC  55 315
     spoIIAA NONE
     spoIIAB NONE
        sigF 3347854 .. 3347875 -  -5.9  -5.59502   CAAAAAACTAAAAAA           CCATATGAA AATA TGCATATGG            TTTTTATACAGTAAG  85 29
    spoVAC_2 NONE
    spoVAD_2 NONE
    spoVAE_2 3345790 .. 3345821 - -13.3   -5.0809   AACAAACGATAAAAA      GAATAAAAACTCC TTCTTG GGAGTTTTTATTC       TTTTGTTTTAGGATT 100 20
   CLJ_B3347 3342447 .. 3342469 - -12.2  -5.40014   AAAGAATAATAAAAA           TGTAAAGCTT ACA AAGCTTTACA           TTTTTGTTTAATCTC 100 33
   CLJ_B3345 3339895 .. 3339917 -  -5.1   -3.3941   ATCACACTTAATTAA           TAATAATTA TTTTG TAATTATTA           TATTCTACACCTTGC  55 98
   CLJ_B3344 3339653 .. 3339683 - -13.6  -5.40072   TCTTTTTTAAAAAAA       TAAGCTATAAATCT AAA AGATTTACAGCTTA       TTTTTTATATTTTAT 100 45
   CLJ_B3343 3339239 .. 3339251 -  -3.5  -2.62933   CAATTCTTTATATTA                TATAA TAC TTATA                GGAGTTATTACAACT  43 82
   CLJ_B3342 3338065 .. 3338083 -    -4  -2.98802   GACCAAATTTACATA             TAAAAAAT AAA ATTTTTCA             TTCGATCCTATTATA  46 207
   CLJ_B3341 3336529 .. 3336561 -  -3.7  -3.23853   CTTTTTTAATTAATA      TATATAAATTCAT AAGAACA ATGGATTTATATA      TTAATTTAATCTTTC  48 26
   CLJ_B3340 NONE
   CLJ_B3339 NONE
   CLJ_B3338 3334196 .. 3334249 - -21.5  -3.76224   CTCTTATTCACTAAA TAAGAAAATTACGACTTAACAGCCC TTAA AGGTTGTTAAGTCGTAATTTCCTTA TATTATTACTCTTCC 100 31
   CLJ_B3337 3333426 .. 3333459 -  -9.9  -5.64006   ATTCAACTAAAAAAA     CATAGCTTGCATATTA GTG TAA-ATGCAAGCTATA     TTTCCAATATTAGTT 100 97
        ruvA NONE
        ruvB NONE
        queA 3330650 .. 3330660 -  -2.6  -3.43104   AATTACTTAATAATA                 TTAT TTA ATAA                 ACATAGCATCTCCAA  44 15
         tgt 3329402 .. 3329422 -  -7.1  -2.66291   GATATATTTATATTA            TTTTATATT TAA AATATAAAA            TTTATTATAACATTT  62 67
        yajC 3328892 .. 3328943 - -10.5  -3.05463   ATTTTTTTTATTCAA CATAAAACACCCCCTC-ATATTTA GTATT TATGTATTAAGGGGGTGTTTTATG ATAATTTATTTATCC  85 31
   CLJ_B3331 NONE
   CLJ_B3330 3328265 .. 3328286 - -11.7  -4.36903   TTCAGTAAATATAAA           GCAGTAACT TTAA AGTTACTGC            TTTTAGCTTATATTA 100 38
   CLJ_B3329 3326724 .. 3326758 -  -6.1  -4.13244   TTATAAGAATAAGAA     CATAATTTATTAT GTTTGTTTT ATAATAAATTATG     TACTAATTTTCTTTT  68 42
        secD NONE
        secF 3324507 .. 3324525 - -11.8  -4.61747   TTAATAATTAGAAAA             TCCAAGCT TAA AGCTTGGA             TTTTTATACAAATAT 100 46
   CLJ_B3326 NONE
         apt 3322713 .. 3322733 - -14.1  -4.19735   CTCCTCAAAATCAAA            GGCTGGTTT ATA AAACCAGCC            AATATTTTTTATTTC 100 104
        relA NONE
         dtd NONE
   CLJ_B3322 NONE
   CLJ_B3321 NONE
        hisS NONE
        aspS 3314767 .. 3314810 - -15.8  -3.21062   GACACGAATACTTAA TAGATAAAATAAGGAAAGCGC ATA GCACTTTCCTTATTTTAT-TA ATCTTCTTTTTCTAT 100 23
   CLJ_B3317 3313998 .. 3314012 -  -3.6   -3.1352   TTTTAATGTAATACA               TTACGA AAA TCATAA               TTTTTTAAAATTTTA  48 57
   CLJ_B3316 NONE
   CLJ_B3315 3313366 .. 3313395 -  -5.8  -4.29907   ATAGCATAAGATAAA       TATGAGTGTACT GTAAAT AGTGCACCCATA        ATAAACTATATATTT  66 67
   CLJ_B3314 3312921 .. 3312952 - -13.4  -3.57144   CCTTTTATCTTTAAA      TATATTACAAACTT AATT AAGTTTGTAATATA       AGTTTGTGTTATTTT 100 130
   CLJ_B3313 3312606 .. 3312637 - -14.8  -4.39571   TCTATAAATTCAAAA      GAGATTAGATATAT ATAA ATATATCTAATCTC       TTAAGCTGTTTTAAC 100 78
   CLJ_B3307 NONE
   CLJ_B3306 NONE
   CLJ_B3305 NONE
   CLJ_B3304 NONE
   CLJ_B3303 3304727 .. 3304742 -  -3.2  -3.59262   TTTGATATCTTTAAA              GGCCTT TAGA AATGCC               TTTTGGTTTGAATTT  49 52
   CLJ_B3302 3304090 .. 3304121 -   -16  -3.62522   GAAGTCTGTTAATAA      GCTTTAGAGGGAGT AAAA ACTCCCTCTGAAGC       CAAGAACTCTGTTTA 100 38
   CLJ_B3301 NONE
   CLJ_B3300 NONE
   CLJ_B3299 NONE
   CLJ_B3298 NONE
   CLJ_B3297 NONE
   CLJ_B3296 NONE
   CLJ_B3295 3300487 .. 3300521 -  -2.2  -5.42198   GTTTAAAAAACAAAA     GGTTAAAAGCTAAC TTTTATT ATTGGCATTTAACC     ACTGAATAACATCTT  66 0
   CLJ_B3294 NONE
   CLJ_B3293 NONE
   CLJ_B3292 NONE
   CLJ_B3291 NONE
   CLJ_B3290 3295529 .. 3295541 -  -4.1  -3.09491   TATATATTTAGGTAA                GCTCA AAT TAAGC                ACCTTCTTTATATTC  46 20
   CLJ_B3289 NONE
   CLJ_B3288 NONE
   CLJ_B3287 NONE
   CLJ_B3286 NONE
   CLJ_B3285 NONE
   CLJ_B3284 3289016 .. 3289026 -  -2.6  -3.25864   ATTTAATAAAATAAT                 TTAA TAG TTAA                 TTTTAATATCTCCAC  42 15
   CLJ_B3281 NONE
   CLJ_B3280 NONE
   CLJ_B3279 3284678 .. 3284709 -  -6.8  -5.70829   AATATTACAAAAAAA      TTAGAGCAATAGAAA TAA TATCTAT-GCTCTAA      TTTTTTGCAATAAAA  90 70
   CLJ_B3278 NONE
   CLJ_B3277 3284117 .. 3284137 -  -8.3  -5.18726   TTCGCATAATAAAAA            GAGCAGG TTTTACT CCTGCTC            CTTACTTTCCTTAAC  95 14
        aroC NONE
        polA NONE
        coaE NONE
   CLJ_B3271 3277668 .. 3277682 -  -4.2  -3.66883   TTAATATATTCTAAA               CACATG GTG CAGGTG               ATGGGACTTGAACCC  56 197
   CLJ_B3268 3277172 .. 3277182 -  -2.6  -3.56959   ATATAATTTATATAA                 TTAT ATC ATAA                 TATATTTTTTTTAAT  45 7
        pheB 3276648 .. 3276670 -  -6.4  -5.68438   GTAGTAAATAAAAAA           CTTCATCT GCTAAAA AGATGAAG           TTTTTTATTATTCCA  90 33
   CLJ_B3265 3275042 .. 3275087 -  -3.7  -5.96894   ACTTAAATAAAAAAA GCTATCAAATTTAAAATATTAT AAT ATAATACTCTAAACTC-ACAGC TTTTTAATTTAAAAA  83 80
   CLJ_B3264 3274197 .. 3274215 -  -8.9  -4.72473   TTAAGCAAAAAATAA             GCATCTG AAAAA CAGATGC             TATTTATTATTTACT  89 25
   CLJ_B3263 NONE
         maf NONE
        radC NONE
   CLJ_B3260 NONE
        mreC NONE
        mreD NONE
   CLJ_B3257 3267291 .. 3267333 - -10.9  -4.13767   TTTTCCATTTTAAAA TATCCACACTATCTATTAT ATAAA ATAATTTATAGTGTGGATA TAGTTTATATTTATT 100 40
        minC NONE
        minD NONE
        minE 3265404 .. 3265427 -    -9   -4.7173   TATCACACGCAAAAA          GCTATGTACA AATT TATACATAGC           TTAAAAAATTTCTTA  89 50
      rodA_2 3264005 .. 3264060 - -13.9  -4.63048   TCTATAAATAACAAA GTCATATATTGTTAAAAATCCTA AGTTTTTAAA CAGAATTTTTAACAATATATGAC TTCTAATTCTTAAGG 100 200
   CLJ_B3252 NONE
   CLJ_B3251 3262155 .. 3262210 -  -6.7  -3.08438   TATTACATTTTAACA TATAAGCATGGATAAAAACAAT TACAAAAGAATCC ATTGTTCT-ATCCATGCTTATA AAAGCTTTCTTATTT  62 39
   CLJ_B3250 NONE
   CLJ_B3249 NONE
   CLJ_B3248 3258008 .. 3258020 -  -6.3  -2.60244   TCGCCAATTAAGGTA                CATGA AAA TCATG                TTTAACACCTTTTCT  57 97
        rplU NONE
   CLJ_B3245 NONE
        rpmA 3256995 .. 3257013 - -10.3  -5.09426   TTGAATCCTAAAAAA             GCACCCT TTATC AGGGTGC             TTTTAATTATTCAGC 100 32
        obgE NONE
   CLJ_B3242 3254867 .. 3254891 -  -5.1  -2.92516   AATACTAGACTAAAG          GATTAACAAAC AAT GCTTACTAATC          ACTAATCAGTTTTGG  51 184
        nadD 3254155 .. 3254176 -  -6.1  -4.24534   TAATCAACACATAAA           TTAAATTTA TGCA TAAATTTAA            TTATAATTTAATATC  70 48
   CLJ_B3240 NONE
   CLJ_B3239 NONE
   CLJ_B3238 3251835 .. 3251854 - -10.8  -5.18355   CCTAAAAACCAAAAA            TGAAGGGA AAAA TCCCTTCA             TTTTATGTATGCTAT 100 37
   CLJ_B3237 3250539 .. 3250578 -  -6.6  -4.66938   ATTTTTAATACAAAA  GCTATGAAATATAGATTT AATA ACATCTTAATTTCATAGC   TTTTATTTTTTTATG  77 85
   CLJ_B3235 3248309 .. 3248319 -  -3.2  -3.53811   CTGATGTTCTTGAAA                 GCTC TGT AAGC                 CTTACTTCTTTTTTC  49 193
        selA NONE
        selB 3243519 .. 3243548 -  -2.3  -5.47218   CTTTACTGAAAAAAA       TATGAATAGCTAAA GAT TTTAGC-ATCCTTA       TAAAGATATAAATAT  69 398
   CLJ_B3229 3240601 .. 3240644 - -10.6    -5.093   TCTAAAATAATAAAA CCTATAAGTTAGTATTATAA TTAA TTCCATTACTAACTTATAGG TTATTTATACTTTTA 100 198
   CLJ_B3228 3237607 .. 3237618 -    -3  -2.63636   AAATATTATAACTCA                TGAA ACAT TTCA                 CCTCCATATTATTAT  39 119
   CLJ_B3227 NONE
   CLJ_B3226 NONE
        holA 3234477 .. 3234524 - -16.1  -3.82499   ATTAAATGCATTAAA CGCTTAAAATAAATAA-CCCGT ATTTA ACGGGTTTATTTATTTTAAGCA CATATAGAATTTATT 100 19
         gpr NONE
   CLJ_B3222 NONE
   CLJ_B3221 3231233 .. 3231243 -  -2.6   -3.6501   AATAATCACTGTAAA                 TTAT AAC ATAA                 AACTCCGGTGATATG  45 75
        lepA NONE
   CLJ_B3219 3228114 .. 3228124 -  -2.6  -5.04385   TATATTTTCAAAAAA                 TTTA TAT TAAA                 TTTTAAAAATCTCAC  62 76
        hrcA NONE
        grpE NONE
        dnaK 3224265 .. 3224295 - -12.1  -3.64703   GTTTTTGTACTTAAA      TTAAGGGA-GGAGT ACAA ACTCCCTCCCTTAA       TTCATACCTATTATA  95 76
        dnaJ 3223027 .. 3223057 - -18.6  -4.49344   AAATCCACCACAAAA       TATAAGGAAAGTGC GTT GCACTTTCCTTATA       TTAGTCTTTGAACCC 100 26
        prmA 3221750 .. 3221764 -  -5.8   -3.1733   CTTTTTATAAAATTA               CTAAAA TGA TTTTAG               TTTATTTTAGATACT  56 22
   CLJ_B3213 NONE
   CLJ_B3212 3219588 .. 3219598 -    -4  -3.71981   AATATTCAATAAATA                 GATT AAA AATC                 CTTCTACTCTAATAA  52 34
   CLJ_B3211 NONE
        rpsU NONE
   CLJ_B3209 3218382 .. 3218398 - -10.9   -5.1764   TATATAATATAAAAA              GCTGAGT TTT ACTCAGC              TTTTACTATTTACTC 100 31
        yqfC NONE
   CLJ_B3207 NONE
   CLJ_B3206 NONE
   CLJ_B3205 NONE
   CLJ_B3204 3213455 .. 3213469 -  -4.4  -3.89822   TATTTACTCTACAAA               TTATTT TGT AAATAA               ATTATAGCATTATTT  58 54
         cdd NONE
         era 3211836 .. 3211846 -  -5.4  -3.35832   AAATCCCTTAAAAAG                 TCCT GAA AGGA                 ATCTATTAACTGGGC  57 289
   CLJ_B3200 3210621 .. 3210636 -  -3.4  -4.86731   CTTTTGTAAATAAAA              TTTTAT CATT ATAAAA               GCTTATTGTTTAGCA  63 100
   CLJ_B3199 NONE
        ppdK 3206799 .. 3206830 -  -8.8  -5.27399   TAATATATTAAAAAA      GATGTAAGCCAATT TTAC ACTAGGCTTACATC       CCTTATACTTATACT 100 42
   CLJ_B3196 NONE
        dnaG NONE
        rpoD 3201371 .. 3201387 -  -5.1  -6.82077   AGTAAAAAAAAAAAA              GCACC TTATATT GGTGC              ATTAATCTAAATAAT 100 27
   CLJ_B3193 3200419 .. 3200432 -  -2.5  -3.24633   ATATATTCCATAACA               TTATA ATAT TATAA                AAAAACATATAATAT  42 20
   CLJ_B3192 NONE
   CLJ_B3191 3198842 .. 3198870 -  -9.1  -5.47431   TGAATATATAAAAAA        TAGAAATGAGT ACATTAA ACTCATTTCTA        TTTATATTTGTAGGG 100 23
   CLJ_B3190 3197540 .. 3197560 -  -7.6  -5.28983   GGCAAAATAGAAAAA            CACCAGGT ATGAA ACCTAGTG            TTTTCAATGGCACGA 100 461
   CLJ_B3186 3196184 .. 3196208 -  -7.3  -2.64099   CTCGTCTATCATAAC          TTGTAATTCAT CAA ATGTATTACAA          CTTCTATAATCAATC  62 152
   CLJ_B3183 3192979 .. 3193007 - -11.8  -5.48054   ATCAAAATTAAAAAA        CCACACTCCAGT TGAAT ACCGAAGTGTGG        TTTAGAAATAAACAG 100 331
   CLJ_B3180 3190736 .. 3190781 - -11.6  -4.26559   TAAGCAAAACAATAA GGCCTAAAATT-TAATAGCAT TATTC ATGCTATTAAAATCTTAGACC TAAACCCATTCAATA 100 122
   CLJ_B3179 NONE
   CLJ_B3178 3187847 .. 3187863 -  -5.3  -4.18018   CTTTTTCATTTAAAA              TAAAATT TAT AATTTTA              AAAATCTTACAAACA  64 109
   CLJ_B3174 3184751 .. 3184763 -  -3.4  -3.35706   AATGATACTTTATAA                TGCA ATAAA TGCA                GCTCTTAAAAGATCT  47 326
   CLJ_B3172 3183207 .. 3183222 -  -3.4   -4.1897   AAGTACATAGATAAA              TATTTT ATTG AAAATA               TAATATTTTAAGTAT  54 14
   CLJ_B3171 NONE
   CLJ_B3170 NONE
   CLJ_B3169 NONE
   CLJ_B3168 3180251 .. 3180276 -  -4.7  -6.02919   TTAGAAATAAAAAAA         TAAAGCCCACC CGAA GGTAAGCTTTT          TATACTATATATAAT  91 211
      purF_2 NONE
        thiC NONE
   CLJ_B3164 3176645 .. 3176670 -  -9.1   -5.4387   ATATAAATGAAAAAA         GTAGAACCTCT ATTT AGAGGTTCTAT          AAAATTAAAGTACAT 100 345
   CLJ_B3162 NONE
   CLJ_B3161 3172574 .. 3172606 -  -2.9  -4.14764   CTCTAAATAAGGAAA      TTATTATAACAGCTT TTA AAGGTATTAAAATAA      GAAATACTTTTAGTG  51 275
   CLJ_B3160 NONE
        mnmA 3170565 .. 3170592 -  -3.6  -5.89921   ACTATAACAAAAAAA        TCTATG-CTAACC ATT AGTTAATCATAGA        TTTTCTCATAATTTA  83 179
   CLJ_B3158 3167562 .. 3167605 -  -5.6  -3.52102   ATTTTACTTATATAA TAGTCAATAAATTAATGATT TTTT AATTGTTAAATTATTGACTA GCCTATCCATTATGT  59 373
   CLJ_B3157 3165551 .. 3165577 - -13.2  -4.64383   AAGTACAAATTAAAA         TTCAGATAGAGT AAA ACTCCATCTGAA         TTAAACTTTTATTTA 100 99
   CLJ_B3155 3163569 .. 3163606 - -18.1  -3.75153   TTCCTTTAATTCAAA   TATAGCCTAAAGAACTA TTAA TAGTTCCTTAGGCTATA    TTTATATATATATTT 100 39
   CLJ_B3154 3162349 .. 3162359 -  -2.6  -3.94954   TGAATATAGAAAATA                 TATT TTA AATA                 TTTCTAAAGAAAATA  52 298
   CLJ_B3143 3152682 .. 3152710 -  -7.6  -5.68438   TTACTAAATAAAAAA        GATACAAAGC CTATTATCT GCTTTGTATC        TTTTATTATCAAAAT 100 112
        dpaL NONE
   CLJ_B3141 NONE
        hydA 3148277 .. 3148334 - -17.1  -2.59069   ATTTAGAAAAATTAC CTCAATAAATTTATTATTAAAATGATA AATT TATCATTTTAATAATAAATTTACTAAA TGTTATAAATATTCA 100 144
   CLJ_B3139 NONE
   CLJ_B3138 3143862 .. 3143874 -  -3.5  -2.61728   ATTTTTAATATTAAT                TTATA ACA TATAA                CTATATTCATTTATG  43 13
   CLJ_B3137 NONE
   CLJ_B3136 3141144 .. 3141170 -   -11  -3.48474   GAAATGTATAATGAA         GAAATGGAGATA AAT TCTCTCCATTTC         ACCATTTATTTTTAT  95 115
   CLJ_B3135 3138197 .. 3138230 -  -8.1  -4.77925   AAAAAACGTGAAAAA     CCGGTGGTAAAACTA AAAT TAGCATCTCCACCGG      GTAAAACTTTATGAT  88 143
        purE NONE
        purC 3136467 .. 3136484 -  -2.8  -2.61831   TCTATTTTAAAAATT             TAATCT TCTCTT AGATTA              TTCCCAGCTGCTGTA  39 65
      purF_1 3134965 .. 3134979 -  -2.2  -4.11692   TAGTTATTCTCAAAA               TTTAAA AAA CTTAAA               TTCCCTATTCCAAAC  50 30
        purM 3133850 .. 3133871 -  -6.1  -3.91144   TGTATATTCTATAAA           TAATTAATT CCCC AATTAATTA            TTTTAAAGCTCTAAC  66 82
        purN 3133020 .. 3133062 - -11.6  -3.09288   TATGTCCCAATAAAC TGCCACTCATATACTTTCTT TTT AAAAAAGCATATGAGTAGTA CTATTTTAATTTATA  90 147
        purH 3131444 .. 3131457 -  -5.3  -2.98015   TTTAATTATTATACA               TTAGG TGAC CCTAA                TTTAGTGTTTAAAAT  55 27
        purD 3130107 .. 3130155 -  -2.8  -5.77632   AAAATTATAAAAAAA TAATAGCAAATACATATAGTTAT TTCT ATTAA-ATATGTATTTGCTATTT ATTATTAATATTATT  73 36
   CLJ_B3126 3129087 .. 3129114 -  -7.1  -5.80951   ATTCAAAATAAAAAA        CCTTCGTCA AACTTAAACA TGACGAAGG         TATATTAACAACACT  93 351
        mgtA 3125941 .. 3125984 - -15.8  -4.07595   ATACACACCAAATAA TAGCAGTCTTTTTTAATT TTATCTCT AATTAAAAAAGACTGCTA TTGTTTACTTTTTTA 100 149
      pepD_3 3122744 .. 3122765 -  -9.5  -5.56264   CTTAAATATAAAAAA           TCTCTAGAG TTTC CTCCAGAGA            TTTATATACGAAACA 100 247
        ribD NONE
        ribE 3120611 .. 3120621 -    -4  -3.01912   TGAGATGTATATATA                 TCAA TTT TTGA                 CGTTTTTATAATAAG  46 225
   CLJ_B3118 3119249 .. 3119262 -  -2.5  -3.93695   GGTATTATCTATAAA               TAAAA TATA TTTTA                ATCAAATAATCACTC  49 71
        ribH 3118578 .. 3118609 - -17.4  -3.62522   GAATTCTGTTAATAA      GCTTCAGTGGGAGT AAAA ACTCCCTCTGAAGC       CAAGAACTCTGTTTA 100 58
   CLJ_B3114 3114774 .. 3114807 -  -6.9  -4.50988   TCATATTAAAAACAA     TAATTAAGAGCCCCT TTAC AGATACTCTTAATTA      TTTATCCATTCTATT  75 36
      rumA_1 3112973 .. 3113003 - -12.2  -4.56775   ATTTTTGGTGAAAAA       TAATCACTGAAATT ATG AATTTCAATGATTA       TTTCCCTTATTCAAT 100 192
   CLJ_B3105 3104007 .. 3104037 -  -5.5  -2.58861   GATTACTTTTATAAT       TTGAGCTGTCA GCCACGCTA TGACAGCACAA       CTCAATAAACTATTA  53 144
   CLJ_B3103 NONE
   CLJ_B3102 3103169 .. 3103183 -  -2.8  -3.09878   CTTATTTATTTAACA               GGGTTT CAG AAACCA               AAACCTATCAACCTT  41 16
   CLJ_B3101 3102881 .. 3102906 -  -9.9  -2.73771   GTATACCTTCCAAAT         TATCAACTAAG ACAA CTTAGTCGATA          TTTATAATTTTTCAT  79 27
   CLJ_B3100 3101698 .. 3101736 - -14.2  -3.20747   AGTAAATTGTAGCAA   TAAAGCCTTCAAAAGT GTATTGG ACTCTTGAAGGCTTTA   TTCTATACAATTTGC 100 296
   CLJ_B3099 3101233 .. 3101269 -  -9.6  -5.64274   TTATTTATAAAAAAA    TAAGAGCCGCAAGAAT TAATT ATTCTTACAGCTCATA    GATATACGTAGTTAA 100 273
   CLJ_B3098 3099447 .. 3099466 -  -2.2  -2.73508   TAAGAAGCAAAGCCA            GTATAATT AGCG ACTTATAC             TACTCCATGCAAGCG  38 126
   CLJ_B3097 3098078 .. 3098103 - -11.3  -5.03994   TTTTATACATAAAAA         GAAAGGTCCTA GAAT TAAGACCTTTC          TTTTTCAGTGTCAAA 100 292
   CLJ_B3096 NONE
   CLJ_B3095 3097460 .. 3097478 -  -3.1  -5.31456   TTAATTTATAAAAAA             GCCCTCA TACTT TAAGAGC             TCTTTAAGTTATTCT  70 34
   CLJ_B3094 3096532 .. 3096586 -  -8.4  -3.95817   TAATATTCAACTAAA TTAAAAGATACCCTATAGCATAGAC AAATAA ATTTAT-CTATAGGATATCTTTTAA CTATTATTTAAGGTT  78 318
   CLJ_B3093 3095608 .. 3095618 -    -4   -4.6391   AATAATTATAGAAAA                 CATT ATA AATG                 AATTGCTAAAAGATG  65 434
   CLJ_B3091 NONE
   CLJ_B3090 3093818 .. 3093828 -  -2.6  -4.25873   TGTTTATAAAAAATA                 TAAT TAT ATTA                 TGCTAAATCCCACAC  53 321
   CLJ_B3088 3091568 .. 3091613 - -15.1  -4.88405   AATTGTGAAATAAAA TCTAATAGGATGGAGAATGTA GTAT TATATTCCCCATCCTATTAAA ATTTTCTAATATATA 100 202
   CLJ_B3086 NONE
   CLJ_B3085 NONE
   CLJ_B3084 3086619 .. 3086644 -  -2.6   -5.7946   TGGTGAATAAAAAAA         GAAAGCCTAT AAATAA ATATGCCTTC          TTTTTTGTATATTCT  73 67
   CLJ_B3083 3085763 .. 3085782 - -13.6   -4.4017   TGAAGCGTTATAAAA            CCCCATGC ATTT GCATGGGG             TTCTTGAACAATCTG 100 141
   CLJ_B3075 3079221 .. 3079233 -  -6.3  -2.52464   TTCTTTTCGAATTTA                CATGA AAC TCATG                CTCACGATTTAACTT  56 271
   CLJ_B3073 3076298 .. 3076311 -  -3.1  -4.07568   TCCTTTGCGCTAAAA               GCACA TTAT TATGC                CTATTTGTTTATAGA  54 43
   CLJ_B3072 3075016 .. 3075050 -  -2.9   -4.7889   ACAAATATTCAAAAA     GGACCAACTCACCAA AATTG TCCATGAATTGATCC     TAAATTTATATTTTA  59 46
   CLJ_B3071 3073307 .. 3073339 - -10.8  -5.10004   AAAAATAAGCAAAAA      TAAAAGGTGACACA TATAC TATGCCACCTTTTA      TTTTTGCTTATTTTT 100 129
   CLJ_B3069 NONE
   CLJ_B3068 NONE
   CLJ_B3067 3069652 .. 3069674 -  -7.8  -4.56358   TATATTTAGATAAAA           GGTGACAT TTATGTT ATGTCACC           TTTTATTCATTTTTA  83 107
        ptbA 3065068 .. 3065108 -  -6.4   -3.7108   ATTTTTATACCCAAA  GGTGTAATACCAATAT CCATAAATT ATATTAGTATTACGCC  TTAATAAATAAACTT  68 71
   CLJ_B3062 3063045 .. 3063056 -  -4.4  -3.54382   TTTAATAAATATTAA                TCCA TTAC TGGA                 AAACCAACTCATACT  54 18
        nagA NONE
        nagB NONE
   CLJ_B3059 3058441 .. 3058470 - -12.4  -5.64421   ATTCGAAATAAAAAA       TGTCAAGCTAAA CTTACT TTTAGCTTGACA        TTTATTTATTTTACT 100 36
   CLJ_B3056 3054564 .. 3054614 - -10.3  -3.42395   TCTATGATTGAAAGA TAAAATCTAGTGAAGA--TGTTATT CTA AATAGCAAATCTTCACTAGATTTTA TATTTTTACAATTAT  90 136
   CLJ_B3055 3052115 .. 3052127 -  -3.5  -3.63148   ATTACTTTAAAAAAT                TATTT GCA AAATA                TAAATGTATTTTTCT  49 199
   CLJ_B3054 3051187 .. 3051214 - -14.4  -3.01924   TATTTTTTGTTAATA        TTGGCTTAGTTT ATAC AAACTAAGCCAA         TATTATACATGTTCA 100 141
   CLJ_B3053 3050523 .. 3050557 - -15.4  -4.77775   ACTTTATAAAATAAA     TCCTTATAAACTATTT GAA AAATAGCTTATAAGGA     TTTTTATTTATCTCA 100 104
   CLJ_B3052 NONE
   CLJ_B3051 3047474 .. 3047486 -  -2.7  -2.91383   ATCCTTACTTATATA                TAACC TAT AGTTA                TATTAGCATCAGCGT  40 64
   CLJ_B3050 3046626 .. 3046667 -  -9.2  -5.92399   TAAGAAAATAAAAAA TAATAAGAATATATAATA ACCTAA TATTACACATTCTTATTA  TTTTAGCTTATACTA 100 132
   CLJ_B3049 3044914 .. 3044936 -    -7  -5.56673   ATTTACAACAAAAAA           TGTCTCGACC CTT AGCCAAGACA           TTTGTATAGACTTAT  91 293
        pyrR 3043952 .. 3043980 - -16.3  -6.09888   GTTTAACAAAAAAAA        TAGACCATTTCTA ACT TAGAAATGGTCTA        TTTTCATTATTTAAG 100 373
   CLJ_B3047 NONE
   CLJ_B3046 3041233 .. 3041271 - -17.8  -3.86822   TAATTTCCTTATAAA   CAGATTAAAAACCACTAA TTA TAAGTGGTTTTTAATCTG   TTTATAAAATTATTA 100 85
        dinB 3039659 .. 3039705 -  -8.3  -4.66535   AAGCTCTAAAATAAA CTATCCCCTGTGAATAATA-AT ATTA ATATACTATCCACAGGGGTTAA AATTATTTATCTTTT  85 137
        nrdA 3034343 .. 3034359 -  -5.3  -3.01712   CTCCTTTCTTTAACA              TATATTT TGT AAATATA              GTTATTGTTTTAAAA  55 178
        nrdB 3033222 .. 3033259 - -11.7  -4.83722   AATATTATAATAAAA   TAGTCTAACAAAATG-TA TTT TATCACTTTGTTAGACTA   TTTTTATAACTTTAT 100 54
   CLJ_B3040 3031993 .. 3032038 - -11.5  -3.89956   TTACTATATAGTAAA TAAAAGCTATGAAATTAAGTT ATTA ATCTTAATTCCATAGCTTTTC CTTTTAATATAAAGC 100 112
   CLJ_B3039 3031180 .. 3031193 -  -5.3  -3.61398   GCTTTTCCTTAATAA               TCCAA TCTG TTGGA                GAGTCCCATTGATCT  59 241
   CLJ_B3037 3029112 .. 3029133 -  -7.3  -5.74122   TATTATATAAAAAAA           GCAGTGTCC ATTA AGACACTAC            TTTAGACCTATTTGT  93 22
   CLJ_B3036 3027694 .. 3027708 -  -7.2  -3.88787   GTATATTCTTACAAA               GTGAAA TAT TTTCAC               ATTAATAATTCATTT  71 154
   CLJ_B3035 3026360 .. 3026417 -  -8.8  -2.58215   TATCACTAAATAGAT TTATATGGCTATGAAAATAAATTTGT TTTTAT ACAAAGTTACCTTCATAGCCATATTT AATGATAAATTCTTT  72 126
   CLJ_B3033 3024507 .. 3024541 - -11.8  -5.37593   TTTTAAATTAAAAAA     CATTATGAAATTAATT TAC AACTAACTTCATAATG     TTTTTATTTTAATAA 100 67
   CLJ_B3032 3022645 .. 3022681 -  -6.8   -5.0925   TTTTAAAATTAAAAA    GCTATATATTTGTAAC CATAT ATTACAAATGCATAGC    TTTTTAATTTTTATA  80 36
   CLJ_B3030 3021534 .. 3021560 - -11.7   -4.8622   GTTGTTAATTAAAAA         TGGCTGTTGAC ATATA ATCAACAGCCA         ATAAAAAATCTTTTC 100 44
   CLJ_B3029 3019848 .. 3019878 -  -9.2  -5.22104   CAAAAAATAACAAAA       GCTAAGAAACAAAT AAA ATTTACCTCTTAGC       TCCTAAATTCTCTAG 100 75
   CLJ_B3028 3018828 .. 3018860 -  -8.7  -5.04597   AGCTATACATAAAAA      TACTCTTAGAAATTA TAT CAATCTCTAAAAGTA      TTTTTAAATAATTAT 100 142
   CLJ_B3027 3018229 .. 3018268 - -10.5  -5.38951   AATTTATATAAAAAA  GCACTATAAAAATTTATT TAAAG AATAAATTTT-ATAGTGC  TTTTTTATATGTTTT 100 140
       gerAA NONE
   CLJ_B3025 NONE
       gerAC 3014218 .. 3014275 - -23.5  -4.62336   ACCTTATTTTAAAAA TGGAAAAGATATGAATCAGATATATACT ATA AAT-TATATCTGATTCATATCTTTTCCA TTTTGAATTATTAGG 100 147
   CLJ_B3022 3010643 .. 3010690 -  -9.6  -4.34711   AAAATTAATTTAAAA TAAAACACTATACAATTTTT TATTTGAC AAAATTTGCATAGTGTTTTA TTTTGTTTATAATAT  89 82
   CLJ_B3020 3007625 .. 3007640 -  -6.2  -2.95994   TGAAAGAAAAACCTA              CAAAAG GATG CTTTTG               TTCCACTCTTCTACA  59 348
   CLJ_B3018 3004567 .. 3004579 -  -4.9  -3.53343   AATCTCTGTTTTAAA                CTATT GTT AATAG                TTTAAATTAAAATAT  56 124
   CLJ_B3017 NONE
   CLJ_B3016 NONE
   CLJ_B3015 3001834 .. 3001869 -  -6.4  -5.47159   TTTTAATATAAAAAA    TGCTAGTAA-CATTAAC TTA GTTATTAATTACTAGCA    CTTTTTATATCATTA  88 318
        glpF 3000125 .. 3000135 -  -2.6  -4.21303   AAAAATAATTATAAA                 TATT ATT AATA                 ACAAAATTTTTTAAA  53 131
        glpK 2998051 .. 2998067 -  -5.1  -3.37975   ACCTATCATCTATAA              TATGTCC TTT GGGCATA              ATGAACCAATGATGT  56 463
   CLJ_B3010 2994410 .. 2994425 -  -7.6  -6.08342   CAATAAACAAAAAAA              CACCTT ATTT AAGGTG               CTTTTGTACTTTTTG 100 255
   CLJ_B3009 2992439 .. 2992453 -  -4.4  -5.80817   GCTAATATAAAAAAA               TAAAAA GTA TTTTTA               AATAAAATAAATAGT  82 186
   CLJ_B3008 2991701 .. 2991720 -  -2.3  -5.47821   ATTTATTGAAAAAAA            TAAAAAT CAGTGC ATTTTTA             ATATTTATATAGGCG  69 235
        galE NONE
   CLJ_B3006 2989190 .. 2989216 - -13.2  -3.75015   ACAAGCTTTACGAAA         TAAGGAAAGTGC TAT ACACTTTCCTTA         TTTTGTTACATTCTT 100 79
   CLJ_B3001 2985371 .. 2985402 - -10.4  -5.22039   TTCAAACTTAAAAAA      TAATATGCTGATAT ATAA ATATCTGCATATTA       AAATAGTATATATAT 100 105
   CLJ_B3000 2983131 .. 2983153 -  -3.5  -3.64103   TATTTACATGGCAAA           GGCTAAATA TATAT TATTTAGTC           TTTTTATCTAAAACT  49 33
   CLJ_B2999 NONE
        glpP 2979487 .. 2979521 -  -3.1  -5.99154   GATTAAATAAAAAAA    CATATGTGAT-TATAA TTCC TTTTACACCACATATG     TTTTTTAATATATAT  83 109
   CLJ_B2995 2976342 .. 2976365 - -10.4  -5.47218   CGTTATGGAAAAAAA          CTACACTCTT TATA AAGAGTGCAG           TAAATTAGTTAATTC 100 441
   CLJ_B2993 2973352 .. 2973382 -  -9.8  -2.52635   ATTCCTATTACGAAC       TTTAAGGAAAGTGC TAT GCACTTTCCTTATT       TCATGTTTATTTTCT  78 21
        recJ 2970135 .. 2970149 -   -10   -4.2231   AATTACGACTTAAAA               GGGAGT TAT ACTCCC               CATGGTTTTAAAAAA  95 442
   CLJ_B2990 2967888 .. 2967926 -  -7.1  -4.92757   GCATTAACAATAAAA  GCCCTATTTAATTGTAAAT TTT ATTTAC--CTAAATAGGGC  TTTATGTATTTTCTA  83 38
        murG 2965817 .. 2965830 -  -2.5  -3.69449   TAACACTTTAAAACA               TAAAA ATCA TTTTA                AATTGCAAAAAATTC  47 467
   CLJ_B2987 2962043 .. 2962056 -  -8.1   -5.8187   TATTTAATAAAAAAA               GAGCC TTTC GGCTC                TTTTTATTATTGTTC 100 32
   CLJ_B2986 2961607 .. 2961647 - -10.2  -4.91511   ATTTTATGATAAAAA TATACCAAGTAAATAATTA TTAA TAACTATTTACTTGGTA-A  TGAAATATTTTTATA 100 58
   CLJ_B2985 2960989 .. 2961012 - -11.8  -4.62054   TTAACCAAAGCAAAA          GAGCCTCTGT AATG ACAGAGACTC           TTTTTACAATACTAT 100 37
   CLJ_B2984 2960088 .. 2960102 -  -2.1  -4.41494   TAGTTTCAATTAAAA               TCCAC AATCA GTGAA               CATAATTTGAATTAA  54 49
   CLJ_B2983 2959046 .. 2959065 -  -5.2  -3.03798   ATTTTTAGAAATAAT            TTTTATAT CATA ATATAAAA             TTATATTTTTTATCC  52 126
   CLJ_B2982 2958047 .. 2958062 -    -9  -4.64766   CTTATAGTTTAAAAA              CCTTGC AAAA GCAAGG               TTTTTTAGTTTATAT  89 53
   CLJ_B2981 2955991 .. 2956031 -  -4.3    -4.183   GTAATTCTTAATAAA  TAATGTAGATAATAATTAT AAA ATAATTATTATAGTCATTA  CAATTTTAACAATTT  59 46
   CLJ_B2980 NONE
        cheW NONE
        cheD NONE
        cheB NONE
        cheR NONE
        cheA NONE
        cheC 2948204 .. 2948217 -  -2.5  -3.53012   TTCTTTCCCTCCAAA               TTAAT ACAA ATTAA                CTTACTCCTAATGTA  45 22
        cheY 2947752 .. 2947790 -  -5.4  -4.64861   TCCTCTCAAAATAAA   CTATCAGTGCATTAAGAA TTT TACCTAATGCACCTATAA   GTTTTAAACTTTAAG  71 62
   CLJ_B2972 NONE
        fliM NONE
        fliN 2945030 .. 2945067 - -10.3  -4.67038   TTTTTAAAACTAAAA   GCTATGAATTTA-AAATA TTA TACTTCTAAATTCATAGC   TTCTCCCTTTTTAAT 100 114
   CLJ_B2969 NONE
   CLJ_B2968 2943928 .. 2943944 -  -5.1  -4.83615   TATTTCGTATAAAAA              TAGGCAG AGA CTGCGTA              AGGCTATATAGCCTT  70 55
        flgK NONE
        flgL NONE
        fliW NONE
        csrA NONE
   CLJ_B2963 2939702 .. 2939724 -    -2  -2.97017   AATTCCATAACCACA           CCACCTTATA AAG TTTAAAATGG           CTGAAATATTTTTAT  40 50
   CLJ_B2962 NONE
        fliS NONE
        fliD NONE
   CLJ_B2959 NONE
   CLJ_B2958 2935072 .. 2935095 -  -4.4  -4.10672   TTAATTTAAAGGAAA          CTCCGCCTCC TTAC GTCGACGGAG           TAATCTCTACTAACT  59 64
   CLJ_B2957 2933986 .. 2934020 -   -19   -5.3236   ATAACTTATAAAAAA     CAAAAGACTTTACATA AAT TATGTAAAGTCTTTTG     TTTTTATAAAGAAAC 100 102
   CLJ_B2956 NONE
   CLJ_B2955 NONE
   CLJ_B2954 NONE
   CLJ_B2953 NONE
   CLJ_B2952 2927303 .. 2927325 -  -7.2  -3.31915   CTTTTACAAAAACTA           TTTAGTATAA GCA CTATACTAAA           TTATAAAAATCTAAT  67 96
   CLJ_B2951 2926053 .. 2926077 - -12.3  -3.84648   GCTAATATTAGTAAA          GAGTATACTTC TTA GAAGCATACTC          TAATAAATAAACTAC 100 160
   CLJ_B2950 NONE
   CLJ_B2949 2924208 .. 2924220 -  -7.7  -5.83211   TAGCAAAAGAAAAAA                GGCTT AGA AAGCC                CTATTTAACTATTTT 100 57
   CLJ_B2948 2923311 .. 2923359 - -14.6  -2.70932   TTTTTTTCTTAATTA TAAACACTAATATAAAAAA-ATT AAAT AATATTTTTTATATTAGTGTTTA AATTATATATTTCTT 100 39
   CLJ_B2947 2921962 .. 2921975 -  -5.3  -4.49556   GTTTCACTAAACAAA               TTGCA ATTT TGCAA                AAATAAGTTTTTAGA  68 229
   CLJ_B2946 NONE
   CLJ_B2945 NONE
   CLJ_B2944 NONE
   CLJ_B2943 NONE
   CLJ_B2942 NONE
   CLJ_B2941 NONE
   CLJ_B2940 NONE
   CLJ_B2939 NONE
   CLJ_B2936 NONE
   CLJ_B2935 NONE
   CLJ_B2934 2906542 .. 2906558 -  -4.5  -3.51279   ATATTTTATAAAAAT              TTACAAT TCT ATTGCAA              TTCACATATATCATG  54 17
   CLJ_B2933 NONE
   CLJ_B2932 2904163 .. 2904192 -  -4.5  -3.53224   TAGTTTTTTGTGAAA       TTATGTAATAAAT TGAA ACTTACCACATAA        TTTTTTCATTTAATA  54 15
   CLJ_B2931 NONE
   CLJ_B2930 2901873 .. 2901903 -  -8.4  -4.67478   TAAACATAAAAATAA       GCACCAACAGCT TTTTTTT AGCTATTGATGC       TTCTAATCTAATTTT  85 302
   CLJ_B2929 2900502 .. 2900515 -  -3.1  -3.65351   CTATTTTTATTCAAA               TGAGA GTAA TCCCA                AAAATCATTATAATC  49 172
   CLJ_B2928 2899426 .. 2899452 -  -3.1  -5.16472   AAAAACTTTAAAAAA         TAAAAAGGTCC ATCAA AAACCTCTTTA         TCTTTCCCTGTTTAA  68 436
   CLJ_B2927 2895796 .. 2895831 - -10.6  -4.16814   TCATTAGATAAAGAA    GATCCTAAGCTGGT GCAATTAT ACCAACCTAGGATC     TTTTATTATGTTTTG  95 100
        fliC NONE
   CLJ_B2925 2893778 .. 2893814 -  -4.7  -5.64421   ATTTCAAATAAAAAA   GCAATGAAATATAAGA TTATCC TCTTA-ATTTCATAGC    TTGTATCTATATTAT  84 178
   CLJ_B2924 2893532 .. 2893542 -  -2.6  -3.58361   ATAAAAATTAACTAA                 TATT ATA AATA                 TCGTTAGTGTAATAA  45 106
   CLJ_B2923 2893221 .. 2893248 -  -2.8  -3.02144   CCATTCTTTTTAATA        TACCGTAAAAAA CAAT TTATTTACTGTA         TTTTTTATTATACAT  41 93
   CLJ_B2922 2892938 .. 2892963 -  -7.9  -3.08581   ATCAATCTTTAAAAT         TAATATATAAT GGCA ATTATATATTA          TCCTATACTGCTCTA  67 84
   CLJ_B2921 2892659 .. 2892699 -  -8.6  -5.95946   TTAAGAACAAAAAAA TTCTAAGCTTTTTTGAAGT AAAA ACCTCTA-AAAGCTTAGAA  TTTTTTTATTAAACT 100 43
   CLJ_B2920 NONE
   CLJ_B2919 NONE
   CLJ_B2918 NONE
   CLJ_B2917 2889032 .. 2889047 -    -9  -3.53012   TTTTTGTTTTTTAAA              GTGGTG ATAA CACCAC               TTTTTTAAGCTTTTA  79 38
   CLJ_B2916 NONE
         glf NONE
   CLJ_B2914 NONE
   CLJ_B2913 NONE
   CLJ_B2912 NONE
   CLJ_B2911 2882351 .. 2882361 -  -2.6  -2.92777   TTTTATATATTAAAG                 TTTA ATT TAAA                 TTTACTATACTCTTC  40 2
   CLJ_B2910 NONE
   CLJ_B2909 NONE
   CLJ_B2908 2878784 .. 2878796 -  -3.5  -3.26471   TTACTCTTATATTAA                TAATA TAT TATTA                TTTAGTAAACTTATC  46 49
   CLJ_B2907 2878087 .. 2878112 -  -9.1  -5.00027   ATTAAAAATATAAAA         GAGAACCGTCA TTTT TAACGATTCTC          TTTATATTTATTCCT 100 33
   CLJ_B2906 2877611 .. 2877644 - -10.5  -4.07675   TTAAAACTAAGTAAA     CTT-TGAAGAAGTTGC ATT GCAACTTCTTCCTAAG     TTTGGTCTAAACTTG  95 21
         cls 2874967 .. 2874979 -  -4.9  -2.71263   AATTTTGTTTAACCA                CTTTA TAA TAAAG                CCGAAAAAATTCTAG  50 15
   CLJ_B2903 NONE
   CLJ_B2902 2874050 .. 2874082 - -12.2  -4.44915   TAATTATGCACAAAA      TAAGCCCTGTTACA TAAAT TGTAACAGAGCCTA      TTTACCAAACTATTC 100 27
        argG NONE
        argH 2871102 .. 2871118 -  -3.1  -4.70107   CATTAAAACAAGAAA              TACTTTT AGA AAAAATA              GGTATCTAGAAAAAT  60 160
   CLJ_B2899 2870329 .. 2870339 -  -2.6  -3.06583   ATAAGATTTTTAATA                 TTTA TTT TAAA                 AATTAACAATAAGTA  41 28
   CLJ_B2898 2869306 .. 2869335 -  -8.1  -4.46835   ATAAGCTCAAATAAA       GCATCTTTAAT TTATCTTT ATTAAAGATGC        AATTTTGTTATTTAG  82 33
        flgB NONE
        flgC NONE
        fliE NONE
        fliF NONE
        fliG NONE
        fliH NONE
        fliI NONE
        fliJ NONE
        fliK NONE
        flgD NONE
   CLJ_B2887 NONE
   CLJ_B2886 2858425 .. 2858460 - -13.7   -3.1247   ATTTTTTATATTTAA    TGTAATAGTTAATAG ATAAAA CTATTAACTATTACA     TTATTTTTATGTTTA 100 68
   CLJ_B2885 NONE
      motA_2 NONE
      motB_2 NONE
        fliL 2855953 .. 2855966 -  -3.9  -3.13737   CAACACTTAAAATCA               CTTTT ATTT AAAAG                CTTTTAAAATTTATA  48 56
   CLJ_B2881 NONE
        fliP NONE
        fliQ NONE
   CLJ_B2878 NONE
        flhA NONE
        flhF NONE
        flhG NONE
   CLJ_B2874 NONE
        fliA NONE
   CLJ_B2872 2846326 .. 2846342 -  -2.3  -4.29738   CTATACCTATTAAAA              TTTTTCT ATC AGAAAGA              AAAGTAATAATTTCT  52 42
   CLJ_B2871 2846133 .. 2846156 -  -2.6  -3.85817   ACTTTCCTTTATAAA          TTTATATTTA AAAT TAAATATATA           AAAATAATTTATTTT  49 34
        flgG NONE
        flgG 2844337 .. 2844387 - -13.1  -3.61178   CCCATTTATTCCAAA TAAAAAAACTATGAAATAAAAGA ATTTA TCTTGTACTTCATAGTTTTCTTA TTTTGAATTAAATTT 100 124
   CLJ_B2868 2843420 .. 2843467 -  -7.5  -4.72631   ATTAATCTAATAAAA TAAATAGCTATAAAAATAA TTAAAATGCT TTATTTTTGTAGCTATTTA TTTAAATTAAACTAC  83 95
   CLJ_B2866 NONE
   CLJ_B2865 NONE
   CLJ_B2864 2836651 .. 2836669 -  -5.3  -6.77747   CAATAAAAAAAAAAA             TCCTCCT ATTAA AGGAGAA             TCTTATTTTTTACCT 100 15
   CLJ_B2863 NONE
   CLJ_B2862 2833937 .. 2833963 -  -9.7   -3.6968   TTACAAGTCTAATAA         TTTAATACCAT TTAAT ATGGTATTAAA         TACACCTTCCTTTAA  84 322
   CLJ_B2861 NONE
   CLJ_B2860 NONE
   CLJ_B2859 2831091 .. 2831107 -  -2.3  -3.75332   ATTTTTGAAGTTAAA              TTCTCTA AGT TAGACAA              CAAATATCACTCCCT  46 64
   CLJ_B2858 NONE
   CLJ_B2857 NONE
   CLJ_B2856 NONE
   CLJ_B2855 NONE
   CLJ_B2854 NONE
   CLJ_B2853 2825322 .. 2825338 -  -8.7  -5.36441   TCCCCATATAAAAAA              GCAGCAA TAG CTGCTGC              TTTTTATACCATATT 100 29
       def_3 NONE
   CLJ_B2851 2823001 .. 2823050 - -11.3   -4.4078   TGTTCCTAATTAAAA TTAAACAGCTATAAATCTGAAA TTTAATC TTTCAAATTTATAGCTGTT-AA CTTTTAATACATAAT 100 347
   CLJ_B2850 2821596 .. 2821610 -  -2.2  -5.16132   CATATTAAAAGAAAA               TATTAA ATA CTAATA               GTTATCTATGTATCT  64 240
   CLJ_B2849 2820183 .. 2820218 - -10.8  -5.72622   TTTATAAAGAAAAAA    CTACGAACTTAGAA-TA TTA TATTTCTAAGTTCATAG    TTTTTTAAATTTAAA 100 148
   CLJ_B2848 2819462 .. 2819479 -  -9.9  -4.60302   ATACAAATAAAACAA             CCACAGA TTTA TCTGTGG              TTTCATTTTTAATAA 100 34
        glpX 2817736 .. 2817774 - -10.6  -4.61873   TTCTATAAATTAAAA   GAGTATGTATTAAGCT ATAATGG AGTTTAATACATACTC   TTATATATAAGGATT 100 73
   CLJ_B2845 NONE
   CLJ_B2844 NONE
   CLJ_B2843 2815080 .. 2815098 -  -2.4   -4.2828   TTCTATCCATTAAAA             CCACCTAT TCA ATAGATTG             CTCATAAAATCCAAT  52 1
   CLJ_B2842 2813908 .. 2813926 -  -2.5  -3.35816   GAAATATAATCAAGA             CTCAATA GAAAT TATTAAG             TTTTACTTTATCATT  44 28
   CLJ_B2841 NONE
   CLJ_B2840 2812354 .. 2812370 -  -8.1   -2.8934   CTTTAAAGTAGTATA              GAATAAG AGA CTTATTC              CCTTTAAAGGTCATG  69 53
   CLJ_B2839 NONE
        hprK NONE
   CLJ_B2837 2810423 .. 2810464 -  -6.3  -5.69023   AAAACATTAAAAAAA CTAACTA-AATTTTTTTATA TTT CATTAAAAAATTATAGTTAG CTTTATTGTAAAAAT  87 98
   CLJ_B2836 NONE
   CLJ_B2835 2807367 .. 2807381 -  -2.2  -5.01732   AATCTGGCTAAAAAA               TATAAC AAA ATTATA               ACTGGCGGTTCAGAT  65 474
   CLJ_B2829 2797275 .. 2797285 -  -2.6  -3.19255   CTAATATAGAGTTAA                 TTAT AAT ATAA                 ATTTTTCTATTACTT  42 15
   CLJ_B2828 2796770 .. 2796823 - -18.7  -2.94669   AAAAATAATTAAGGA GCATG-TTATGAAATAAGGAAAGTGC GTG GCACTTTCCTTATTTCATAAACATAG TAAAGGTAGAAACTA 100 9
        glyA 2794011 .. 2794042 - -10.9  -2.70404   ATATCACAAGAATAT      GGGCTTATGCTCC TGTTTT GGGACATAAGCCC       TATCTATTATGTGTA  83 54
        arcC 2792495 .. 2792507 -  -3.5  -3.33348   CCTAATAGTATAATA                TTTAT TTT ATAAA                TTTTTATATTTTAGA  47 81
        argF 2791418 .. 2791449 - -16.2  -5.21709   GGGTATATCAAAAAA      TAAAAGGAAGAATG TTTC CATTCTTCCTTTTA       TTTTATATATTTAAT 100 43
   CLJ_B2822 NONE
   CLJ_B2821 NONE
   CLJ_B2820 NONE
   CLJ_B2819 NONE
   CLJ_B2818 NONE
   CLJ_B2817 NONE
   CLJ_B2816 NONE
   CLJ_B2815 2783477 .. 2783488 -    -3    -3.524   TACTCACCTACATAA                CTAA AATA TTAG                 TGCAATAGTCGCAAT  45 14
   CLJ_B2814 NONE
   CLJ_B2813 NONE
   CLJ_B2812 NONE
   CLJ_B2811 NONE
   CLJ_B2810 2773521 .. 2773556 -  -2.2  -5.32882   TATTATTATAAAAAA    TAAATTTAA-ACTACAC ATT ATATAGTATTAAATTCA    ACTTTTATCTGATTT  66 324
   CLJ_B2809 2772899 .. 2772916 -  -2.1  -4.53303   TAGTTTCATATAAAA             TTCAAAA TATT TTTTAAA              AAAAACGCCCTATTT  54 125
   CLJ_B2807 2770157 .. 2770177 -  -7.1  -4.22554   GCATTTAACAAATAA            TTTTTAATT ATT AATTAAAAA            TCTTATATTATACTG  75 363
   CLJ_B2806 2768320 .. 2768369 -  -8.3  -3.05709   TAAGCATAAAAATAC CTCCATAATATAATATTAAAC TCTTATAT ATATAATATTACATTATGGAG TATTATTAAATAGGA  71 89
   CLJ_B2805 2767214 .. 2767234 - -12.7  -4.86822   AAGTATATAATAAAA            GCAGGAATT TTT AATTCCTGC            TTTTTAATTTACACT 100 113
   CLJ_B2803 2765307 .. 2765340 -  -5.5  -5.45802   TTTTCAAAAGAAAAA     TCCCCCT-TTTTATTA TTA TACTAAAAAAGGAGGA     TCTTTTTATATGTTA  82 42
   CLJ_B2802 2764258 .. 2764270 -  -3.5  -5.69379   ATATAAGTAAAAAAA                TAATT TAA AATTA                ATATCTATATTATAC  77 96
        hisJ 2763291 .. 2763319 -  -7.5   -4.7373   TCACCTCACTAAAAA        GACTTTAACTCTC ATT GTAAGTTAAAGCC        CTTGTTTTATCAAGT  86 145
   CLJ_B2800 2761977 .. 2762004 -  -3.6   -5.0916   TTTTTAATACAAAAA        GTATAGTC-TTAA TTA TAAAGGACTATAC        TAAAATATTAATTTC  67 42
   CLJ_B2799 NONE
        iscS NONE
   CLJ_B2797 2759652 .. 2759685 -  -9.8  -5.52384   GTTTTATCAAAAAAA     TAAAAAATACCCTC TCTAAT GAGGGTATTTTTAA      AATATCTTATATAAA 100 78
   CLJ_B2796 NONE
   CLJ_B2795 2757968 .. 2757999 - -13.8  -3.62522   GAAGTCTGTTAATAA      GCTTCAGAGTGAGT AAAA ACCCCCTCTGAAGC       CAAGAACTCTGTTTA 100 54
        alaS NONE
   CLJ_B2793 2754496 .. 2754521 - -13.5   -4.2349   TTTCCATATTTAAAA         TAAAAATGCCC TAAA GGGCATTTTTA          TTTTTTTAATTTATC 100 31
   CLJ_B2792 NONE
   CLJ_B2791 2753614 .. 2753630 -  -3.8  -3.02211   TAATTTCAAATTATA              TATTCA TAAAC TGAATA              AAAACTATTATTCTT  46 33
   CLJ_B2790 NONE
   CLJ_B2789 2750889 .. 2750910 - -10.3  -5.47821   ATTTACTCAAAAAAA           TTGGATACT TCCT AGTATCCAA            CTTGGTTCACCTTAT 100 422
        typA 2748785 .. 2748813 - -15.5  -3.10513   ATAGGTTAATATAGA        CAAACAACCAGCT CTA AGCTAGTTGTTTG        TTTAGAATTATAATG 100 46
   CLJ_B2787 2747676 .. 2747710 -  -3.7  -3.77437   ATTAATAATACATAA    GGTGACCCTTTAATTT TAAA ATATTATAGG-TCACC     TGCAGCAAAATATAT  52 40
   CLJ_B2786 NONE
   CLJ_B2785 2745745 .. 2745766 -  -3.2  -3.25823   CTTTCTTCACACTAA           TATATAAA TATGTT TTTATATA            TTATTTATTTTTTAT  46 26
         udk 2744922 .. 2744958 - -10.4  -5.19328   ATCTCATAATAAAAA    CACCTCATTTTAGCTA AATTA TAACCAAAATAAGGTG    TTTTATTCTAAATTA 100 66
   CLJ_B2783 2742839 .. 2742850 -    -3  -3.79995   TGAATTATAATATAA                CTTT CAGA AAAG                 AAATAAAGGTTGGCA  47 418
   CLJ_B2781 2742041 .. 2742051 -  -2.6  -3.14848   TGTTGGTATTAAAAT                 TATT TAA AATA                 TTCCCTTCTGTTGTT  42 62
   CLJ_B2780 NONE
   CLJ_B2779 NONE
   CLJ_B2778 2739482 .. 2739493 -    -3  -2.53392   AAATCTCGTAATTTA                CTAT TGTT ATAG                 TAGTCTTTTTTTATT  39 348
   CLJ_B2776 NONE
   CLJ_B2775 2737554 .. 2737587 -  -6.2   -5.0133   TATCCTCCTAAAAAA     CACCTCTTAAATCTG ATATA CA-ATTTGAGAGGTG     TTTTTTTATTTATTT  78 51
   CLJ_B2774 NONE
   CLJ_B2772 2734983 .. 2735000 -  -7.7  -5.36441   TTTGTATATAAAAAA             GAGCCCT GTTA AGAGCTC              ATTTCTTTTTTAACT 100 24
        sigK 2733768 .. 2733779 -    -3  -3.59935   TAACGATTATAAATA                TTCT GTAA AGAA                 TCTCCTAACATAAAA  45 115
        aroE NONE
        pilT 2731828 .. 2731841 -  -8.1  -5.45726   GATATTTTAAAAAAA               GGACC AAAA GGTCC                TTTTTTTAATATTAC 100 84
   CLJ_B2767 2729949 .. 2729965 - -10.9  -5.88061   AAAAAAGCAAAAAAA              GGAAAGC TAT GCTTTCC              TCTAGTTAACTTTTT 100 27
        ftsA NONE
        ftsZ 2727397 .. 2727417 - -14.1  -5.76633   TTACATATAAAAAAA            GTAGGGAAC AAT GTTCCCTAC            TTTATAATTACTTCC 100 33
     spoIIGA 2726296 .. 2726306 -  -2.6  -3.62176   AATAATACCTTTAAA                 TTTA TCA TAAA                 AGTCCCTCCTATATA  45 34
        sigE NONE
        sigG 2724682 .. 2724710 - -13.4  -5.65496   GATTAAAAATAAAAA        GCTACTGATAAA AAATA TTTATCAGTAGC        TTAAAGTGTTCTCTA 100 63
   CLJ_B2761 2724237 .. 2724247 -    -4  -2.62184   CTTTTCTTTAGATTA                 CTAA AAT TTAG                 CTATATATATTAATT  44 117
        nrdR 2723688 .. 2723716 -  -6.9  -5.86976   TTACAAAATAAAAAA        CCCAATACTATTA CCA TAATAGCATTAAG        TTTTTACATGCTTAA  93 62
   CLJ_B2759 NONE
   CLJ_B2758 2721933 .. 2721944 -    -3  -4.09685   CTTCACCTTTTAAAA                TTCA CTAT TGAA                 TCTATATCCTATTCC  51 8
   CLJ_B2757 2720148 .. 2720185 - -12.3  -5.07275   CTATATATAGAAAAA   TGAAGAAGTTTTTGTTA TAGG CACCAAAAACTTCTTCA    TTTTATATTTTTATT 100 46
        pstS 2719066 .. 2719077 -  -4.4  -4.46854   CTATTTAATAATAAA                GCTT TACT AAGC                 TATAATAATTACTTA  64 34
        pstC NONE
      pstA_2 NONE
        pstB NONE
        phoU 2715340 .. 2715389 -  -9.3  -2.57211   ACGTCCCTGGATAAC GATTTCTAAGCTTTAGTGGGAGT AAAA ACACCCTCTGAAGCTAAGAACTC TGTTTATAATATTAT  75 262
   CLJ_B2751 NONE
        engA 2712310 .. 2712320 -  -2.6  -3.13412   AATTTAAGAAATAAG                 TTTA TAT TAAA                 AATTCCTATGCATTC  42 107
        gpsA 2711118 .. 2711150 -  -6.6  -6.14618   CATAAAATAAAAAAA      CACTATAAAATTTT TATTT AAAATTTCATAATG      TTTTTATAATAAACT 100 106
      spoIVA 2708960 .. 2708988 -  -5.4  -2.50345   AGCCTACAAAAGGAT        GATTTTGTTCCG CTTTT CTAAACAAAATC        TTTAATTATAATATT  52 449
        ansA NONE
   CLJ_B2746 NONE
   CLJ_B2745 NONE
         gmk NONE
        rpoZ NONE
       coaBC 2704211 .. 2704262 - -18.2  -3.35996   TACGTCCATGGATAA CGATTTCTAAGCTTCAGAGGGAGT AAAA ACTCCCTCTGAAGCCAAGAACTCT GTTTATCCGCTAAAT 100 88
        priA 2701783 .. 2701795 -  -4.9  -3.42352   AAATTTAAAAAATTA                TAACA AAC TGTTA                GGATTTATATCTATA  55 10
         def NONE
         fmt 2700276 .. 2700286 -  -2.6  -3.45768   TTTAATACTAATTAA                 TTAT AGA ATAA                 AAAATATATTATATC  44 90
   CLJ_B2738 NONE
         sun NONE
   CLJ_B2736 NONE
   CLJ_B2735 NONE
   CLJ_B2734 NONE
        rsgA NONE
         rpe NONE
   CLJ_B2731 2691666 .. 2691706 -  -7.9  -4.10363   ATAAAAATCTAGAAA  TGAGAGTATCTTAAAAT AGATTTA ATTTTAAAACACCCTCA  TTTTATTTTTGTATA  77 168
   CLJ_B2730 2691195 .. 2691213 -  -4.6  -5.48514   ATCAATAAATAAAAA             CTGTTATA AAA TTTAACAG             CTGTATAATAAAATA  78 74
   CLJ_B2729 2691026 .. 2691047 -  -5.9  -5.53436   ATATAACACAAAAAA           TGCAGTTGT TTAA ACAATTGCA            TTTTTTATTTTATGT  85 43
   CLJ_B2727 NONE
   CLJ_B2726 2688612 .. 2688637 - -12.1  -3.84619   AAAGTTTAAATATAA         TAAAAAAAGCC CTTA GGCTTTTTTTA          TTCTACAGACATTAT 100 23
        recG NONE
   CLJ_B2724 NONE
        coaD 2685087 .. 2685105 -  -3.2  -3.10558   TAGATATGCTAAAAG             CTTAATAA CAT CCATTAAG             TAACCCTCCTAAATA  45 34
   CLJ_B2722 2684183 .. 2684206 - -11.2  -5.09685   TAATACAGATAAAAA          CCTAATAGAA GGGT TTCTATTAGG           CTTAGTAGAAATGAC 100 396
   CLJ_B2719 2680032 .. 2680050 -  -3.2  -3.75153   TTTTTTTAATTTAAA             TTAAATCA TAT TGGTTTAA             TTTATAATATAAAGT  50 2
   CLJ_B2718 NONE
   CLJ_B2717 2678016 .. 2678042 -  -9.5  -4.27443   TTAGCATGAAAATAA         GCTGTAGACTA TCTGG TTGTCTACAGC         CTGAAACAAAGGCAT  89 66
   CLJ_B2716 2677706 .. 2677723 -  -2.8  -3.89524   ATTTCACTTCATAAA             TACTAT TTTTTT ATAGTA              AAAACATAAATCCAT  49 10
   CLJ_B2715 NONE
   CLJ_B2714 2676285 .. 2676304 -  -9.4  -5.88565   TTTATAATAAAAAAA            TAAAGGCA TTTC TGCCTTTA             TTTAGATTGAAGACA 100 314
   CLJ_B2711 NONE
   CLJ_B2710 2673925 .. 2673974 -   -22   -5.0916   TTTCTAATATAAAAA CAAACAGGGAAGTTTAATGATA TTTTTG TATCATTAAACTTCCCTGTTTA ATATAATTTATTTAA 100 45
      prdA_2 NONE
   CLJ_B2706 2669539 .. 2669555 -  -3.8   -3.0264   AAACCTTTTGTAATA              GTTAAA CTCAT TTTAAC              CTTACCTTCCTTCCT  46 95
        prdB 2668760 .. 2668799 - -13.2  -4.10552   TTTTATTAAAGCAAA  TGCAATAATG-AGTTCAGT AAA ACTGCACTACATTATTGCA  TTTTTTATTTTTAAG 100 50
   CLJ_B2704 2668135 .. 2668148 -  -5.3  -4.07618   TTCTGAAGAACCAAA               TTCAG CTAC CTGAA                TACCACATTCTTCTG  64 304
   CLJ_B2701 2666024 .. 2666056 -    -7  -5.86061   TTTTATTAAAAAAAA      GATGGACTCCACGC AATAA ACATCGAGCCCATC      TTTAAGTAATCATTG  95 170
   CLJ_B2700 2664674 .. 2664704 -  -8.5   -5.9003   AAATGAATAAAAAAA       TCTATCTGATTAT AAATA AGAATCAGATAGA       TTTTTTATTAATTTA 100 133
   CLJ_B2697 2661606 .. 2661619 -  -3.1  -3.67597   TTTCTTATTTAAGAA               CGTTC TTTT GAACA                TTAACAACAAAATCT  50 1
   CLJ_B2696 2660370 .. 2660391 - -10.3  -5.88565   TGCACAATAAAAAAA           GAGAATCTT TAAA AAGATTCTC            TTTTTACGAAAATTT 100 75
   CLJ_B2695 2659866 .. 2659898 -  -5.1  -5.64873   TTTAATAACAAAAAA      GCTTATAATCT ATTATTTTGTA AGATTATAAGC      CTTCTATATAAATTA  84 145
   CLJ_B2694 2658497 .. 2658549 - -13.6  -3.87373   TATATTTTTTATAAA CAGAGCTCTTGGCTTCAGAGGGAGT TTTT ACTCCCTCTGAAGCTTAGAAATC-G TTATCCAGAAACGTA 100 189
      prdA_1 NONE
   CLJ_B2690 NONE
   CLJ_B2689 NONE
   CLJ_B2688 2653296 .. 2653321 - -14.9  -4.07568   CTTGTTCTTTTAAAA         GAGCTCTACTT AGCA AAGTAGAGCTC          TTTTTTAATTATTAA 100 37
   CLJ_B2687 2653098 .. 2653108 -  -2.6  -3.81259   ATATAATTGACTAAA                 TTTT AGG AAAA                 TTTGAAATAGAATTT  47 106
   CLJ_B2686 2652003 .. 2652028 - -11.3  -5.82388   AAACTTGAAAAAAAA         CCAGGTAAAAT TTAA ATTTCACCTGG          TTTTCAGCATTCAAT 100 85
        eutD 2650695 .. 2650731 -  -9.1   -3.2614   TATTCGTGATATTAA    TCAATTAATTTATCATC TAA AATAATAAATCAATTGA    TTATACAAAAATTAA  75 50
        ackA 2649337 .. 2649349 -  -3.5  -3.55487   TTATAGCAACCACAA                TTTAT TAT ATAAA                GGGCATATTAAAAAG  49 100
   CLJ_B2683 NONE
        rpmF 2648583 .. 2648600 -  -4.1  -5.95946   TTAACAAGAAAAAAA             GAAAGCC TTAC GACTTCC              TTTTTTATAATTATT  83 36
        plsX NONE
        acpP 2647171 .. 2647192 -  -8.7  -4.66537   TTTTTTAATATAAAA           TCCCCGC TAATAAAG GCGGGGA            TAAAAATCAATTATT  89 36
         rnc NONE
   CLJ_B2678 2645215 .. 2645264 - -11.2  -2.90941   TATCAATTAGTAAAC TAAAATATA-TATCCCCACCG AATATGAAA CAGTGGGGATACTATATTTTA TATTAACTTGATAAT  85 50
         smc 2641370 .. 2641380 -  -8.2  -2.82635   AGTGGGAGTATTAGA                 GCGG CTG CCGC                 CTCTGCACAACCATT  69 91
        ftsY 2640241 .. 2640266 - -11.3  -4.98616   TCAAAATATTAAAAA         GCTGTCAAGTA TTTT TACTTAACAGC          CATAATGTTTTTTAT 100 131
   CLJ_B2675 NONE
         ffh 2638460 .. 2638472 -  -6.3  -4.19817   TCTATTTATTTAAAA                TGGTA ATT TACCA                AATAAACCTTTTTTA  70 7
        rpsP 2638183 .. 2638194 -  -2.2   -3.1364   CAGTTAACTATTTAA                CAGA AATA CCTG                 CTTTTTCGATTAATT  41 6
   CLJ_B2672 2637905 .. 2637924 - -10.8  -5.43414   ATTATATATAAAAAA            GAGTTAGG CGCA CCTAACTC             TTCTAGATTATTTCA 100 28
        rimM NONE
        trmD 2636579 .. 2636600 -  -6.1  -3.07575   AAAATTTTTATTCAA           TATTTTTTA CAAC TAAAAAATA            TTTTTCCTATAATTT  59 32
        rplS 2636081 .. 2636100 -  -5.7  -5.58454   CTTATATGAAAAAAA            GGGACTT ATGCTA AAGCCCC             TTATGTTTCATTATA  82 36
      lepB_2 2635519 .. 2635541 -  -3.6  -3.61371   AAACTTCACCTTAAA           CTAAAAAT TCTATTT ATTTTTAG           AATATAAACTACCAA  51 12
        rbgA 2634285 .. 2634307 -  -9.3  -2.55459   TATACTTATAAAATT           GGATACATT GCTCT AATGTATCC           TTCAATTATATAATA  75 65
        rnhB 2633100 .. 2633143 - -16.2  -2.68607   TTGAAATAAACATAG TTCTTGGCTTCAGAGGGAGT TTTT ACTCCCTCTAAAGCTTAGAA ATCGTTATCCAGGGA 100 123
        dprA 2629490 .. 2629500 -  -3.2  -4.07687   ATTTCTCTGGTAAAA                 CTGA TAA CCAG                 AGTTACACCCCCTTA  54 368
        topA 2627326 .. 2627351 -  -2.9  -4.28254   TTTCAACATTTAAAA         TATATTAAATAA TAA TTATTTA-TATA         AACTAATTATTTATA  53 43
        codY 2626362 .. 2626385 - -11.2   -5.2422   AATTATACTAAAAAA          TAAAGAAGTC CTAA GACTTCTTTA           CTATTTTATCTTCTT 100 26
        rpsB 2625393 .. 2625420 -  -7.1  -4.32201   TTAACTAATTTAAAA        GGTAAATGAGA GATTAG TCTCACCTACC         TTATATTTTTCATTT  75 53
         tsf 2624410 .. 2624428 - -11.8  -5.41143   TATTTTTCAAAAAAA             GAGAACAC TCA GTGTTCTC             TTTTTTAATTATTTG 100 34
        pyrH NONE
         frr 2622751 .. 2622766 -    -9    -5.243   TAAATTATTAAAAAA              CCTGCT AATA AGCAGG               TTATAATGTTTATAT 100 35
        uppS NONE
        cdsA 2621087 .. 2621114 -  -4.3  -5.42514   TTATAAAGTAAAAAA        CTCAATCTA AGAATAAATA TAGATTGAG         CTTTTTATTTATATT  76 41
   CLJ_B2653 NONE
   CLJ_B2652 NONE
         dxr 2618305 .. 2618315 -  -2.6  -2.95102   ATTGTACCTATAAAT                 TAAT TTT ATTA                 TTATATATCATATTT  41 26
        rseP NONE
        ispG 2615971 .. 2615986 -  -6.2  -2.79492   TTCCTAACCTTAAAT              TAGAGT TAAA ACTCTA               CTACCTAAAGCTAAG  58 114
        polC 2611315 .. 2611334 -   -10  -4.40003   TTTTACAAATAGAAA            GAGCGGGT TTAT ACCCACTC             TGTGCTTTAACATAT 100 190
   CLJ_B2647 NONE
        nusA NONE
   CLJ_B2645 NONE
   CLJ_B2644 NONE
        infB NONE
        rbfA NONE
   CLJ_B2641 NONE
        truB NONE
        ribF 2603515 .. 2603544 - -11.1  -2.89955   AAATAAATATATAAT       TGTAAATTAATTT TTAT AAATTAATTTACA        TACTTTGTCTTTTAG  85 21
        rpsO 2603108 .. 2603137 -  -5.9  -4.32049   TATAATTTATTAAAA       TAAT-AGAGCGG GCTTTAG CCGCTCTTATTA       CTTTTATTACTTTCT  70 32
        pnpA 2600747 .. 2600758 -  -5.8   -5.8096   GATAAAAAATAAAAA                GGCA GATA TGCC                 CTTCTATTTTTTATT  86 39
   CLJ_B2636 2599226 .. 2599280 -  -8.2  -2.87146   TTCTTCCATAATAAT CCTCCCATTACTTCTCATAATATTCA TAT TCAATATTATGAAAAATAGTGAGAGC TTATTACAAAATATA  69 41
   CLJ_B2635 NONE
        dapG 2597495 .. 2597542 - -11.6   -3.0353   TCTGCCATAAATAAT TACCTCCTACCATATGCATATAA ATA TCTTGTGCATATGGTAG-AGGTA CTATACATAAAAAAT  90 209
   CLJ_B2633 2596789 .. 2596812 -  -9.7  -2.98381   TAAGGCATTAAAGTA          CCATAGGAT TTATAC ATCCTATGG           TTTTTGTTTTTCATC  78 20
        ftsK NONE
   CLJ_B2631 NONE
        pgsA 2592243 .. 2592275 - -10.1  -3.43553   CAACTTAATATAATA      TAAATAAAAGCCCCC TAC AGGAACTTTTATTTA      AATTATTGACAATAT  87 55
        recA 2591080 .. 2591096 -  -6.6  -5.60993   TTTTTCATAAAAAAA              GTAGGA TAAAC TCCTAC              TTTTATCCTTCCTTA  88 28
   CLJ_B2628 2589257 .. 2589305 - -10.8  -5.27769   ACAAAAAATTAAAAA TTCCTTTTAAATTTTGTAAATT TTAGC AACTTATAAAACTTAAAAGGAA TTTATTTTATAATCT 100 43
       spoVS 2588878 .. 2588901 - -10.4  -4.27211   TTGAAATAAATTAAA          GGACTTGAAT ATAA ATTCAAGCCC           TTTTGTTTTATGTTT  95 48
   CLJ_B2626 NONE
   CLJ_B2625 NONE
   CLJ_B2624 2586161 .. 2586188 - -14.4  -3.38768   TCATACTATTGATAA        GACCTTAAGATT TTTT AATCTTAAGGTC         TTATTTTTCTCCTAA 100 74
      aspB_3 2584328 .. 2584339 -    -3  -3.08934   CTACAGATTTCAACA                GTTT TTAT AAAC                 CATTACATGATATTA  41 41
        ptsH 2583962 .. 2583978 -  -6.5  -5.15682   AAAACATAAATAAAA              GGCTCCC CAA AAGAGCC              CTTAATTTTTATTCT  83 34
        purB 2582016 .. 2582032 - -12.3  -2.89738   TAGTATAAAAATTCA              GGAGCCA ATA TGGCTCC              TTTTAAAATTTTTAT  89 49
   CLJ_B2618 NONE
   CLJ_B2617 2579457 .. 2579482 -  -7.7  -5.10064   CTCAATACATAAAAA         GAAAGATCCTA AAAT TAAGACCTTTC          TTTTTTGGTGTTCCG  93 165
   CLJ_B2616 2578676 .. 2578708 - -13.8  -4.69622   ATATAACTTTAAAAA      TAAAGAGATTTTGA TATTT TCAAAATCTCTTTA      TTATACTATATATTA 100 38
   CLJ_B2615 NONE
   CLJ_B2614 NONE
   CLJ_B2613 2575965 .. 2575979 -  -2.8   -5.8187   GAGCCAATAAAAAAA               GGTGAT CCT ATCATC               ATAACAAAAATAGAT  81 162
   CLJ_B2610 2573987 .. 2573997 -  -2.6  -3.49864   CCTATATAATAAAAT                 TTTA ATA TAAA                 TAACATAGTACTAAA  45 180
   CLJ_B2609 2572885 .. 2572923 -  -5.5  -3.69333   TATAATCTATTTAAA   TAAAAAAAAGTAATGCC ATATA AGCAATACTTTTTTTAA   AAAATTTAACTCATT  61 239
   CLJ_B2606 2570397 .. 2570424 -  -2.2  -3.48668   ATTACGATATTAGAA        TATTTAAATAAA ATAT CTTTTTTAAATA         CTTTCAACTATTTTT  44 19
   CLJ_B2605 NONE
   CLJ_B2604 2568293 .. 2568310 -  -7.1  -4.79683   AACTTACAAAACAAA             GGTATTT ATTT AAATACC              TTTCAAATTAAAGCA  81 517
   CLJ_B2603 NONE
         tgl 2566323 .. 2566363 -  -5.3  -5.80364   ACTGTAATAAAAAAA  CTATCAGGCCAGATGCTTA ATC TAGGCATCTGGCCATTTCG  CTTTTAATAATATAG  86 29
   CLJ_B2601 NONE
       def_1 2565370 .. 2565393 -  -7.6  -3.37493   TTTTTAATATACTAA          TAAGAAAAGA GATT TCTTTTCCTA           GCGCAAGTTTTTGCA  70 69
   CLJ_B2599 2564277 .. 2564289 -  -3.5  -4.21607   TTTATCCAACATAAA                TAAAT CTT ATTTA                TAATCTATTTACAGT  56 34
   CLJ_B2598 2563874 .. 2563896 -  -7.8  -4.70921   GATAAGATAAAGAAA           GAGTAGATAA ATT TTTTCTACTC           TTTTTAAATTGTTAT  83 42
   CLJ_B2596 2561966 .. 2561997 -    -6  -5.28414   TAATAAATATAAAAA      CACTGTATTATTCA AATT TTAATAATGCAGTG       TTTTTACAAACTTAT  83 98
   CLJ_B2595 NONE
   CLJ_B2594 2559687 .. 2559733 - -12.7  -2.80244   CCTTTTAATAAATAG TTAAGGATTACCCCTCATCCAT ATTT ATAG-TAAGGGATAATCCTTAA ATTCAAGCTACGTAA  91 154
   CLJ_B2593 2558588 .. 2558601 -  -2.5  -2.79641   ATATACTAAAAGCTA               TAAAT TCAA ATTTA                GAAAAGTATCCATAC  41 164
   CLJ_B2591 2557958 .. 2557968 -  -2.6  -3.32109   TCACATATTACAATA                 TTTA ACA TAAA                 AGACCTCCTAATTAA  44 58
   CLJ_B2590 2556970 .. 2556983 -  -2.5  -3.91402   TTATATAAAGTTAAA               TTTAA AATA TTAAA                AAACTTTTAGTAATA  49 273
   CLJ_B2589 2555605 .. 2555640 -  -9.2  -2.93975   AGCCTCTAAAAATAC    TTATAGGGATTAGTTA AAAT TAACTAATCCCTATTT     TAATCTGCTAAAAGT  78 199
   CLJ_B2588 NONE
   CLJ_B2587 NONE
        sodA 2551195 .. 2551214 - -12.2  -3.17447   TAAAAAATTATAAAG            CCCCATGT ATTC ACATGGGG             TTTTTGAACAATCTT  93 101
        msrB 2550454 .. 2550483 -  -6.1  -3.53761   TAATTCCCCCCTAAA       TATTAATATGTATA AAT TATACA-ATTAATA       TGACAATAAGTAAAC  63 150
   CLJ_B2584 2549391 .. 2549419 - -13.4  -5.65496   GAGCAAAAATAAAAA        GCTGTTGATAAA ATATA TTTATCAACAGC        CTAATATAGCTTCTT 100 447
   CLJ_B2583 2548904 .. 2548925 - -14.5  -4.89393   TAAAGTTTAGAAAAA           CCCCAGGTA TTTC TACCTGGGG            CCCTTTGAATAACTT 100 86
   CLJ_B2577 NONE
   CLJ_B2576 NONE
   CLJ_B2575 2541782 .. 2541800 -    -4   -3.5394   AAATCTTCTGGTAAA             TTAATTTC AAT AAAATTAA             ATCCTCCATTAGATT  52 290
   CLJ_B2573 NONE
   CLJ_B2572 2541083 .. 2541093 -    -4  -3.14564   TTACTTGGCTATTAA                 TCAT CTT ATGA                 ATAGTTGTGCCTATT  48 36
   CLJ_B2571 NONE
   CLJ_B2570 2540692 .. 2540703 -  -5.8  -4.61527   AAAATTTTTTAAAAA                GGCT TTTC AGCC                 TTGCTTATCTATATA  71 42
   CLJ_B2569 NONE
   CLJ_B2568 NONE
   CLJ_B2567 NONE
   CLJ_B2566 2538105 .. 2538132 - -10.7  -2.55351   GTGTGTTATACTAAG        GGACAAGAGCT TTGTAG AGCTCTTATCC         AGCTTTTAAATCAAT  81 70
   CLJ_B2565 NONE
   CLJ_B2564 NONE
   CLJ_B2563 NONE
   CLJ_B2562 NONE
   CLJ_B2561 2534748 .. 2534760 -  -2.7  -2.82987   CCAATATTTATCATA                GTAAC TAC ATTAC                CTCTTTTAATGCTTT  40 17
   CLJ_B2560 NONE
   CLJ_B2559 NONE
   CLJ_B2558 2533864 .. 2533908 -  -2.9  -3.07043   TTTAGTATTGTAATA CGCTGTAGGTATAAGAATACC TAA AATGCCCCTATACCTACAGTA TTTAGTTATTTAAAA  41 35
   CLJ_B2557 NONE
   CLJ_B2556 NONE
   CLJ_B2555 NONE
   CLJ_B2554 NONE
   CLJ_B2553 NONE
   CLJ_B2552 NONE
   CLJ_B2551 2530407 .. 2530418 -    -3  -4.42851   CCAATAAATGCAAAA                CAAA TTTA TTTG                 CTAACATCACATTAT  55 99
   CLJ_B2550 NONE
   CLJ_B2549 NONE
   CLJ_B2548 NONE
   CLJ_B2547 NONE
   CLJ_B2546 NONE
   CLJ_B2545 2527464 .. 2527487 -  -6.7  -5.09762   ACTTTAATATAAAAA          GACACCTGG AATTAA CCAAGTGCC           CTTTAGTACATACAC  83 158
   CLJ_B2544 2526154 .. 2526181 -  -7.8  -4.67353   TTAGGTATGTAAAAA        GCACCTAAGG TTTATATT CCTTAAGTGC         TCTTTGATATTTAAC  83 40
   CLJ_B2543 NONE
   CLJ_B2542 NONE
   CLJ_B2541 2525364 .. 2525379 -  -6.8  -5.36441   TTTGTATATAAAAAA              GAGCCC TTAT GAGCTC               TTTTTTAAATTAATA  87 59
   CLJ_B2540 NONE
   CLJ_B2539 NONE
   CLJ_B2538 2522122 .. 2522132 -  -2.6  -3.53761   TAACTTCCTCTCAAA                 TAAT TGT ATTA                 TATATCTTATTGTAT  45 40
   CLJ_B2537 NONE
   CLJ_B2536 NONE
   CLJ_B2535 NONE
   CLJ_B2534 NONE
   CLJ_B2533 NONE
   CLJ_B2532 2518266 .. 2518277 -    -3  -5.12707   GTAAATGGGAAAAAA                TTAG ATAG CTAA                 ATTTCTATTCTTTTT  64 22
   CLJ_B2530 NONE
   CLJ_B2529 NONE
   CLJ_B2528 NONE
   CLJ_B2527 2515585 .. 2515605 -  -8.3  -4.30161   TTATATAAAACTAAA            GAGCAGCCA AAC TGACTACTC            TAATTAATATACTGT  80 29
   CLJ_B2526 NONE
   CLJ_B2525 NONE
   CLJ_B2524 NONE
   CLJ_B2523 NONE
   CLJ_B2522 2513972 .. 2513985 -  -2.4   -2.8552   TTGTACTCATTAAAT               TACC TCCTTC GGTA                TTTTGTATTTTAATC  39 6
   CLJ_B2521 2513315 .. 2513334 -  -3.6  -4.81851   ATTTAAATTTAAAAA            GAGAGC-AT ATT ATAGCCCTC            TATTTTTAAGGTTGT  64 31
   CLJ_B2520 NONE
   CLJ_B2519 2512657 .. 2512673 -  -2.4  -3.76373   CCTCCAATATGTAAA              TATATA TCAAT TATATA              ATATATATTACAATA  46 50
   CLJ_B2518 2511533 .. 2511550 -  -7.7  -5.64274   TGAGGTATAAAAAAA             GAACCGC CTAA GCAGTTC              TAAACTTTTTATATT 100 46
   CLJ_B2517 NONE
   CLJ_B2516 NONE
   CLJ_B2515 NONE
   CLJ_B2514 2501771 .. 2501782 -    -3  -2.64987   AAATATTTCATATTA                TCAA CTCC TTGA                 AATTATTGCTACCCC  39 14
   CLJ_B2513 NONE
   CLJ_B2512 2501209 .. 2501222 -  -3.8  -5.54338   TAACCAAAATAAAAA               GACC TTACAT GGTC                TCTATTTTGCCTTTA  75 85
   CLJ_B2511 2500738 .. 2500758 -  -6.2  -5.30155   CCAGTAATTAAAAAA            GAACCTGT TTAAC ACAAGTTC            TTTTAATAGTATATA  83 28
   CLJ_B2510 NONE
   CLJ_B2509 NONE
   CLJ_B2508 2499329 .. 2499357 -  -9.7  -6.02919   TCACAAATAAAAAAA        TAAGGTACTCCCA TTA CAGAAGTACCTTA        AAAATCTATTTTAAA 100 31
   CLJ_B2507 NONE
   CLJ_B2506 2496757 .. 2496788 -    -3   -4.6155   AAAAAATAAAAAAGA      GATAGCCATAGCGT ACCA AAGCTACAACTACC       ATCTTTAAACACACA  57 168
   CLJ_B2505 2495705 .. 2495734 - -10.9  -5.75599   TAAATGATAAAAAAA       TGGTAGTTATAGC GTAA ACTACAACTACCA        TTTTTAATGATACAT 100 289
   CLJ_B2504 NONE
   CLJ_B2503 2495001 .. 2495021 -  -5.4  -5.68039   AAATCCACAAAAAAA            GAACCCTA TTCAT TGGGGTTC            TTTTTGCTTAAGCAA  86 161
   CLJ_B2502 2492867 .. 2492898 - -11.1  -5.61596   ACTGGTATAAAAAAA      TAAAAAGCAACCT AATTAA AGGTTGCTTTCTA       ATATTTTTCTTTATG 100 36
   CLJ_B2501 NONE
   CLJ_B2500 2491436 .. 2491461 -  -5.6  -4.69326   ATATCGAATAGAAAA         GCTACC-TATA ATTAA TATATGGTAGC         ATAACATAAAATTTT  71 39
   CLJ_B2499 2491177 .. 2491196 -  -6.4  -5.60689   CTATAGAATAAAAAA            GCTCCTAG TCTT CCAGGAAC             CATATTTCTTCAACT  88 10
   CLJ_B2498 2490797 .. 2490812 -  -6.2  -3.63968   TTTTAAAGGCTTAAA              GCTATA TTTT TATAGC               CATACAACTTCACTT  63 48
   CLJ_B2497 NONE
   CLJ_B2496 NONE
   CLJ_B2495 2487468 .. 2487485 -  -8.4  -3.58329   CCAATTAACAACTAA             GGAGCC TTAACT GGCTCC              TATTTTATTGGTGGT  75 25
   CLJ_B2492 NONE
   CLJ_B2491 2484332 .. 2484354 -  -9.2  -4.56629   CATAACATCAGAAAA           GGAGAGGT CTTCTTT ACCTCTCC           TAGACTTTTTCTTAT  93 344
   CLJ_B2490 NONE
   CLJ_B2489 2483640 .. 2483655 -    -9  -5.24989   TTATATATTAAAAAA              GAGCTC TTAT GAGCTC               TTAAAAAATTCTTAA 100 37
   CLJ_B2487 2482941 .. 2482964 - -12.6  -3.85389   TTTGAATAATCTAAA          GGATTGGTAT TTAA ATACCAATCC           TAGAGAATTATAAAT 100 142
   CLJ_B2486 2481951 .. 2481961 -  -2.6  -3.18274   TTTATGGTAATTGAA                 TAAA ATT TTTA                 AGTCAACAACTATTT  42 149
   CLJ_B2485 2481083 .. 2481117 - -13.1   -3.2059   ATTTAGTATAATATA     GGACGGCTTAATATA TTTTT TATATTAAGCTGTCC     ATTCTAATATAAAAA 100 141
   CLJ_B2483 2480492 .. 2480508 -  -3.8  -3.89695   TCTCTATAAATATAA              TATGAA ACTTA TTCATA              AAGGTGCATAAATCT  54 40
   CLJ_B2482 2479892 .. 2479915 -  -6.7  -5.09762   ACTTTAATATAAAAA          GACACTTGG AATTAA CCAAGCGCC           TTTTGAATAATATGC  83 110
   CLJ_B2481 NONE
   CLJ_B2480 NONE
   CLJ_B2479 2478545 .. 2478593 - -14.9  -4.68124   CCAATATATAGAAAA TTCCATACAAAAAAGAACCCTAT TAA ATAGGGTTCTTTTTTGTGAGTAA GGAGGTCTATGCTTA 100 347
   CLJ_B2476 2474339 .. 2474364 -  -9.9  -4.07885   GACCTCTTTTTAAAA         GAGATACTTAA ATCC TTAAGCATCTC          TTTAACGTATCTAAT  93 36
   CLJ_B2475 NONE
   CLJ_B2474 2473722 .. 2473758 - -11.9  -5.42131   TAATCATATAAAAAA    GTATTGTCAATCTAAAT AAT ATTTAAGTTGACAATAC    TTTTTATTCTCTTTC 100 68
   CLJ_B2473 NONE
        bioB NONE
        bioD NONE
   CLJ_B2470 NONE
   CLJ_B2469 2470868 .. 2470903 - -16.5  -5.31855   TACCAATAATAAAAA    TCGGTGTTAATTATC AATTAA GATAATTAACACCGA     TTTTTATTTATATAT 100 33
   CLJ_B2468 2469991 .. 2470001 -  -2.6  -4.19177   ATTTTTCAACATAAA                 TAAT AAA ATTA                 GTCTGAAATAATATT  51 23
   CLJ_B2467 2469419 .. 2469447 -  -2.5  -3.81488   TTTTCTTAAATACAA        TATGACTTAAAAA TTG TTTTTTTGCCATA        TCATTACATATTCCA  47 3
   CLJ_B2465 2469011 .. 2469033 -  -4.2  -2.99958   TTAATAATATTAAAT           TTCCCAATAT GTC ATATAGGAAA           TAAACACCATTATTG  50 123
   CLJ_B2464 NONE
   CLJ_B2463 2467518 .. 2467555 - -11.5   -3.0497   ATATTAGCTTTAACA   GCATCTAAAGCTAGAGA ACTT TATCTAACTCTAGATGC    TATTTTAATTAAAGA  90 107
   CLJ_B2460 2465864 .. 2465883 -    -3   -3.1733   CTCTCTATAAAATGA            TATAATAC TGAA ATATTATA             ATTTACTTAAATATA  42 21
   CLJ_B2459 2464839 .. 2464871 - -10.1  -5.00467   TCAATAATAACAAAA     TAGAAAAAGCGCCT TATTTT AGGCGC-TTTTCTA      CTATTTATAAACTCA 100 114
   CLJ_B2458 2462826 .. 2462854 - -12.6  -4.82855   TATCAAATTTAAAAA        GCTGCTGACAAA ATATA TTTGTCAACAGC        CTGAAATTTATTAAA 100 97
   CLJ_B2456 2460022 .. 2460063 -  -8.3  -4.24606   AAGTTATATCTAAAA TGTAAATAAGAGCTACT TTTTTATT AGCAACCCTTATTTACA  TCTTAATCATTTCCT  80 67
   CLJ_B2455 2458517 .. 2458537 -    -9  -3.73106   CTAAAATGCGAATAA            GAGCCGCT TTTAT AGCGACTC            TTATTTTTAATATGT  79 175
   CLJ_B2454 2457717 .. 2457751 -  -5.2  -5.17786   CAACAAAAGTAAAAA     TACTGTCTTAAAAT ATATTTA ATTTTGAGACAGCA     TTTTTGCTCTATTTT  74 120
   CLJ_B2452 NONE
   CLJ_B2451 2455996 .. 2456039 -   -17  -4.68593   GTTATTACCTAAAAA GTGGGTGTAACAAAATTGCT TTAA AGTAGTTTTGTTACACCCAC TTTACTTTTTACTTA 100 151
   CLJ_B2450 NONE
   CLJ_B2449 2453693 .. 2453722 - -13.1    -5.252   CATTTTTATAAAAAA       TCTACCTTATACT TTAA AGTACAAGGTAGA        TTTTAAAATCAAAAT 100 91
        glxK 2450936 .. 2450984 -  -3.6  -5.90231   ATAAATATAAAAAAA TTATGTAAAAATAGACTT AGCATAACAAATA AAATCTATTTTTACACAA TCATTTCTATAGATT  83 350
   CLJ_B2444 2449321 .. 2449371 - -13.2  -4.08064   AAGGGTGTTTTAAAA TAAAATAGATTTAACTTTAATACT AGA AATATTAAAATTAAATCTATTTTG AGACAGACCCTTCTA 100 96
      pepD_2 2447365 .. 2447411 -  -4.1  -3.91911   TCGAGCCTAAGGAAA TTGATTTCTTATGATTAACATA AACT TATATTTAAC-TAAGAAATCAA TTTTCCAATTATTTA  54 52
   CLJ_B2442 NONE
   CLJ_B2441 2444914 .. 2444936 -  -5.6  -4.98522   AATTTCATACAAAAA           GAGCCCTA TTCAATT TAGGACTC           TCGTCAAAATAAGGA  75 107
   CLJ_B2440 2444083 .. 2444104 -  -4.4  -5.14563   TTTTTGATTAAAAAA           GCCTCAGA AATTAA TCCAAGGC            TTTATTATATCTAAT  73 36
   CLJ_B2439 2441937 .. 2441962 - -16.3  -5.10208   TAATCTTAATAAAAA         GCCCTATAGGT TTAC ACCTATAGGGC          TTTACTTTACAAGCT 100 257
      motA_1 2440300 .. 2440313 -  -3.9  -3.28217   CAAAAGAAGAGTTAA               CATAT CTGA ATATG                GAATAAGCCATGTTT  48 95
   CLJ_B2436 2438819 .. 2438843 - -11.5  -3.38724   ATAAAAAATATAAAG          CCCTATAGGCC TCA AACCTATAGGG          TTTTTATCTATAAAT  95 112
   CLJ_B2435 NONE
   CLJ_B2434 2437374 .. 2437388 -  -5.8  -3.11208   TTCCACTTAAAACCA               CTAAAT CCA ATTTAG               CACCTCCTTGGCTTT  55 11
   CLJ_B2433 NONE
   CLJ_B2432 2436055 .. 2436078 - -10.4  -3.15056   ATTTGCAATTTAATA          GGTGGTTAAT TAAA ACTAACCACC           CATGTACTTATTCGT  87 33
   CLJ_B2428 2432676 .. 2432709 - -12.8  -4.50159   TTTAATGCAAATAAA     GAAATAACTACAAA TTTTAT TTTGTAGTTATTTC      TTGAATTAGTCTGAA 100 46
   CLJ_B2427 2431128 .. 2431155 -   -10  -4.67168   AAAAATCTTCAAAAA        GAGTATCCCACT TTTT AGTGAAATACTC         CTATTTTAACAATAT 100 78
   CLJ_B2423 NONE
   CLJ_B2422 2425844 .. 2425878 - -16.7  -3.58533   CGATAACTTTTTAAA     GGGACTATCCCAAAA ATAAA TTTTGAGATAGTCCC     TCTTCATTTTTAACA 100 73
   CLJ_B2420 2422675 .. 2422689 -    -5  -3.45023   TTATTACTATGATAA               TTGAAG AGG CCTCAA               AAATGAATTATCAAT  57 419
   CLJ_B2418 2421022 .. 2421034 -  -3.5  -2.65766   CTAAACTTCATAGGA                TTTAT TGA ATAAA                ATTTCCATTTATACA  43 34
   CLJ_B2417 NONE
        pdxA NONE
        gntP 2416970 .. 2416997 - -13.6  -4.58773   TTTATTAAAGTAAAA        TCCAGCTGAAAT AAAA ACTTCAGCTGGA         TTCATTTACATTTTA 100 38
   CLJ_B2413 2415385 .. 2415420 -  -8.6  -5.27938   ATTTGTAAATAAAAA    TAAAGAATCTCCTA AAATTAAG TAGAAGATTCTTTA     TAACTATATATAATT 100 97
   CLJ_B2412 2414429 .. 2414461 - -13.7  -3.12668   TTTTAAATGCTAATA      TAATTAAACTCCCAC AAT GTGAGAGCTTAATTA      TATTATTATTTTAAC 100 40
   CLJ_B2411 2412371 .. 2412384 -  -2.3  -3.39142   TTTATATGTAAGGAA               CCTCA AATA TGTGG                TTCTCTAGGTGCTGC  45 382
   CLJ_B2408 2407861 .. 2407885 -  -4.5  -4.29738   TTATATTTATTAAAA          TTTGTTTTAAT ACC ATTAAAAAAAA          TTTATTATATTATTA  61 244
   CLJ_B2407 NONE
   CLJ_B2406 NONE
   CLJ_B2405 2403735 .. 2403745 -    -4  -3.22653   ATTATGTCTATAATA                 TTTC TGA GAAA                 GTTTGTATTCTTGTT  48 7
   CLJ_B2404 NONE
   CLJ_B2403 NONE
   CLJ_B2402 2400337 .. 2400375 - -11.3  -3.79113   ATTTCTTTATAATAA  CCTCCCTGATTCTAATAT CTTT AAATTAGAAT-AGGGAGG   TTTATAATAAAATTT  95 89
   CLJ_B2401 NONE
   CLJ_B2400 2397929 .. 2397940 -  -5.8  -3.10164   GGAGCTAGGAGTGAA                GCCA AGGA TGGC                 GCCTCTCCTAGGTAG  55 132
   CLJ_B2396 2393292 .. 2393345 -   -17  -4.37554   AAACTTAAATATAAA CATAGTTCTAAGCTTCAGAGGGAGT TTTTT ACGCCCACTGAAGCTTAGAACT-CG TTATCCGGGGACGTA 100 107
   CLJ_B2394 2390470 .. 2390489 -  -3.6  -4.85129   ACTAGACATTAAAAA            TCTTTTCT ATCA AGTAAAGA             TGGCAATTTGTCAAC  64 108
   CLJ_B2393 2389915 .. 2389933 -   -11  -4.89339   AAGCATTTATAAAAA             GCCCTCAC AAT GTGAGAGC             TTTTCTCTATAAAGT 100 50
   CLJ_B2388 2382607 .. 2382656 -   -14  -3.63464   CGTTAAATAAGAAGA TTGTTCATCAACTAAGAAAG GTAGGAATGT CTTTCTTAGTTGATGAACAC AAACACTGTATATCA 100 137
   CLJ_B2386 2381382 .. 2381414 -  -5.6  -4.66163   ATTGCGACGTAAAAA      CACCTCAACATTCA ATTCG TGAATAATGTGGTG      TTTGAGTAAATTGTT  71 63
        cas6 NONE
        cmr1 NONE
   CLJ_B2383 NONE
   CLJ_B2382 NONE
   CLJ_B2381 NONE
        cmr4 NONE
        cmr5 NONE
   CLJ_B2378 2372047 .. 2372058 -    -3   -2.6953   TTAACTATAATGAAT                GTTT AATT AAAC                 TCCATATCATTTTTA  39 58
   CLJ_B2377 2371656 .. 2371692 -  -6.8  -4.43221   AAATACGTGATAAAA   CCTATCCT-AAGCATTA AATA TAAAACTTTAGGATAGG    CTCATGAATTAACGT  75 172
   CLJ_B2376 NONE
   CLJ_B2375 2370348 .. 2370360 -  -4.9  -2.71268   CTTCAGTATAGAGCA                TAAAG CAG CTTTA                CTTTCAAGAGGATAT  50 43
         enr 2368101 .. 2368149 -  -9.2  -3.97983   TAAAAAAATACATAA TAAAAACCTATTCTAATCCTTA TATAT CAATGCTTAGAATAGGCTTTTA TTTTTAATTCACTTG  86 160
   CLJ_B2371 NONE
   CLJ_B2370 2364398 .. 2364434 - -16.2  -5.45802   CTTGCAAAACAAAAA    CCTATCTTAAGCATTA TATTT CAATGCTTAAGATAGG    TTTTAAAGTTAAAAT 100 62
   CLJ_B2367 2362137 .. 2362147 -    -4  -3.33922   ACTGTTGTTAAAAAT                 CTTT CTG AAAG                 CTCTAACACCCCTTT  49 313
   CLJ_B2366 2361046 .. 2361063 -  -2.1  -4.57073   TAGGCTTTTGAAAAA             CTTTT-AG CTC CTGAAAAG             TAAGCTACTACAGCC  56 301
        plsY 2358702 .. 2358722 -  -4.8  -4.93696   TTTAAATACTAAAAA           CCTGTCCTA AAAA TA-GACAGG            TTTTTAAAATTAATC  72 311
   CLJ_B2362 2357629 .. 2357648 -  -6.5  -6.01187   AAGTAAATAAAAAAA            GGATACT GACATT AGTATCC             CTTTGTGTGGCAATA 100 197
   CLJ_B2361 NONE
   CLJ_B2360 NONE
   CLJ_B2359 NONE
        ulaA 2354476 .. 2354490 -  -4.4  -3.07242   TATAATAACTATAGA               TTTTAT CAT ATAAAA               AAGAAGTGCAAATAT  50 99
   CLJ_B2357 2352221 .. 2352239 -  -6.7  -5.20781   TATTACAAAACAAAA             GCTCCCA GATTA TGAGAGC             TTTTCTTTTAATTAT  83 46
   CLJ_B2356 2351376 .. 2351394 - -13.2    -5.626   CATCGGATAAAAAAA             GCTCTCAC AAT GTGAGAGC             TTCTATCTAAGTAAA 100 200
   CLJ_B2355 NONE
   CLJ_B2354 2347981 .. 2348006 - -10.5  -4.43681   GATGCAACATTAAAA         CCCTAGACTAA TTAA TTAGCCCAGGG          TTTAATGGTGGATAC 100 108
   CLJ_B2353 NONE
   CLJ_B2352 NONE
   CLJ_B2351 2342260 .. 2342270 -  -3.2   -4.3665   TAAGCCAAACACAAA                 CAAC ATA GCTG                 GTAGCAGTGTTATGA  56 450
   CLJ_B2349 NONE
   CLJ_B2348 2339724 .. 2339744 -  -2.6  -4.63932   TATTTTTTAATAAAA            CTACTCTG ATAAA CAAAGTAA            TCCGCTATTATTTTA  57 389
   CLJ_B2347 2338461 .. 2338472 -    -3  -2.71712   TGCCCTCCTTTAAAT                TTTG AAAC CAAA                 TATACTATTTTAATC  39 80
   CLJ_B2346 2337537 .. 2337549 -  -3.5  -3.22678   AACTTTTTATAAAAT                TAATA CTT TATTA                TAGGTTTTATAAAGT  46 62
   CLJ_B2345 2336409 .. 2336439 -   -12  -4.84527   TTTATATATCAAAAA       CAGGTAGTCCAATT TAA ACTTAGACTACCTG       TATGCCTGTAAATAT 100 69
   CLJ_B2344 NONE
   CLJ_B2343 NONE
   CLJ_B2342 2334244 .. 2334275 -  -9.6  -4.09864   ATTTAGTCTGCAAAA      GCCCTAATCACTAT TTCT ATAGCAATTAGGAC       TTTATATCTTACTTA  86 133
   CLJ_B2341 NONE
   CLJ_B2340 2330551 .. 2330568 -  -9.9  -3.71115   ATCCATAATAAAAAG             CAGCATC CTAA GATGCTG              TTTTATTTATTCTTC  90 28
   CLJ_B2339 2329654 .. 2329668 -  -2.8  -3.00946   TCTCCTTATAAATCA               GTTTGT TCT ACAAGC               ACTGAAATTGAATTC  41 1
   CLJ_B2338 2329008 .. 2329057 -    -6  -4.18908   ATATTGTTAAAACAA TAATTAAAAGCCTCAATCACCA TTCTAT TGTTAATTAAGGCTATTAATCA ATCATATAATCTATA  68 246
   CLJ_B2337 NONE
   CLJ_B2336 2327327 .. 2327345 -    -6  -2.59421   CCAATAAGGATTAAT             CTGCTAAG TAG CTCAGCAA             TTTGGTCTGCATTTT  57 297
   CLJ_B2333 NONE
   CLJ_B2332 2323679 .. 2323725 -   -17  -2.87654   AATAACCCAGAATCA TCAAAACTAACCATCATTATAA CTA TGATAATGATGGTTAGTTTTGT TTTTGTTTTACATAG 100 48
   CLJ_B2330 2320652 .. 2320673 -  -9.5  -4.70613   AAAATTCGAACAAAA           TACCACCCA TTAA TGAGTGGTA            TAAAATAGTCTATCC  93 35
   CLJ_B2329 2319602 .. 2319623 - -11.7  -4.31166   TGATAAATATAGAAA           TACCTGGAT AATA ATCCAGGTA            TTTTTAATTCTATAA 100 150
   CLJ_B2328 NONE
   CLJ_B2327 2317717 .. 2317740 -    -3  -2.79501   TATATGTTGATTATA          TCCCTTCCCC TTTG GGGGAAAGTC           AATATATTTTTTATA  40 182
   CLJ_B2325 2317138 .. 2317152 -  -2.1  -3.27743   CACCACGAACTAATA               CAGAT ATATA ACCTG               ATGCAACATTTTCAT  41 170
   CLJ_B2323 NONE
   CLJ_B2322 2312735 .. 2312772 -  -8.6  -2.54702   ATATATCTTAATTTA   CATCTGCAATCTACAA AACAGG CTGTAGATTGCAGACT    TTATATAAATTATTT  68 97
   CLJ_B2321 NONE
   CLJ_B2320 NONE
   CLJ_B2319 NONE
   CLJ_B2318 NONE
   CLJ_B2317 NONE
   CLJ_B2316 NONE
   CLJ_B2315 NONE
   CLJ_B2314 NONE
   CLJ_B2313 NONE
        eutE NONE
   CLJ_B2311 NONE
   CLJ_B2310 2304469 .. 2304493 - -10.1  -4.99435   TGGAATAATGAAAAA          CGCCACTAAAT TAG ATTTAGCGACG          TTTTCTTATTTTAGA 100 43
   CLJ_B2309 2304052 .. 2304062 -    -4  -3.90112   GCTCTTCTAATGAAA                 CTTT TAT AAAG                 ATAAAACTTTAGTGA  54 76
      cadA_2 2302007 .. 2302031 -  -7.9  -5.17507   AAAACGCAATAAAAA          CGCCCCTAAAT TAG ATTTAGCGACG          TTTTCTTATTTACGC  93 54
   CLJ_B2307 NONE
   CLJ_B2306 2298611 .. 2298639 -  -9.7  -5.01535   TCATAATTATAAAAA        CAAAAACTCCCAC TAT GTGAGAGCTTTTA        ATTTATTATTTACTA 100 9
   CLJ_B2305 2297915 .. 2297959 - -11.1   -5.4251   TTCATATATAAAAAA TATACTATATCAGTAAATAAA TTT TATCTTTACCGATATAGTATA TAATTCAAAACATAT 100 141
   CLJ_B2304 NONE
   CLJ_B2303 2295484 .. 2295502 -  -4.7  -4.42788   TTTAACTTCAGAAAA             TAACTTT AGTAA AAAGTTA             TTTTCTTCCTCAATA  66 59
   CLJ_B2302 2295163 .. 2295175 -    -2  -2.96899   TTGGAACGAAGCACA                TTGT TCTTT ACAA                GTTTTTTATTATACG  40 145
   CLJ_B2301 NONE
   CLJ_B2300 2294086 .. 2294107 -  -8.1  -4.20007   TAAAAATTAAAAATA           CAGAGAATT TCTA AATCCTCTG            TCCAGCTGGTATAGA  80 323
   CLJ_B2299 2292709 .. 2292734 - -10.5  -4.07124   TATTATCTATATAAA         GCCTGTATCTA GAAG TAGATGCAGGC          TTAGATATTTATATT  95 500
   CLJ_B2296 2290566 .. 2290606 - -12.8  -2.76272   AAATAAACTATATGA  GAAAGTTGACAATGAGCA GTTAT TGCACATTGTCAATTTTC  AGTTTTAAGATACAT  91 98
   CLJ_B2293 2285096 .. 2285131 - -15.1  -5.12971   AATATCTAACAAAAA    TACCCTTATAATACA TTTATT TGTATTATAAGGGTA     TTAACTTATAACTAA 100 224
   CLJ_B2290 2283634 .. 2283654 -  -2.6  -3.41125   TTCATATATTTATAA            GAATCACT TCTTT AGCAATTC            TTCTTCCCCCTTATT  44 97
   CLJ_B2289 2282320 .. 2282335 -  -7.6  -4.25256   TTTCCATCAAAAGAA              CCTTGA TTTC TCAAGG               TTATAACTGCGTTTC  78 144
   CLJ_B2288 NONE
   CLJ_B2287 NONE
   CLJ_B2286 NONE
   CLJ_B2285 NONE
   CLJ_B2284 2272438 .. 2272463 - -11.2  -2.80761   TTGGAATAAATTAAG         GTGCCAGATG AGTAAA CACCTGGCAC          TATTTCTAATAACAT  85 108
   CLJ_B2283 2271241 .. 2271272 -  -8.8  -5.20216   TAGATGATTAAAAAA      CAGCAGG-AGGACTA AAA TTATCCTGCCTGCTG      TTTTCTTTTATATGT 100 45
   CLJ_B2282 2270800 .. 2270831 -  -2.2  -4.38927   TTTTCACACAAGAAA      GCCCTCGAACATGT GTAC ATACACCCAAGGGC       CTTAAATCATTGATA  54 183
   CLJ_B2281 2269467 .. 2269492 -  -8.5   -4.7629   GCATCAATGTAAAAA         TAGCGGAAA-AT TCA ATATTTCCGCTA         TTTTTTCTCTTCAAT  88 60
   CLJ_B2280 2269041 .. 2269066 - -12.1   -5.5112   TTGATTAATAAAAAA         GACCTTTTATA TTTC TATAAAAGGTC          GTAAAAATCACTATA 100 187
        codB 2267692 .. 2267703 -    -3  -2.64298   TCACTAAAAAATCAT                CTTA ATAT TAAG                 CAACGTACTCATCAC  39 21
        codA 2265917 .. 2265929 -  -2.6  -3.65809   AATAATTAAAGAAGA                CGGA TTACC CCCG                TATTTTAGACAATAT  47 516
   CLJ_B2276 2264959 .. 2264982 -  -8.9  -5.18726   TTCCCACAACAAAAA          GCGGAG-AGC ATCTA GCTTCTCCGC          TGGGAACAATAGCCT 100 165
   CLJ_B2275 2262748 .. 2262758 -  -6.8  -2.85585   TCCGAAAATACACTA                 CCGA TTT TCGG                 AGGCATCTGTTTATT  61 249
   CLJ_B2274 NONE
   CLJ_B2273 NONE
   CLJ_B2268 NONE
   CLJ_B2267 2255640 .. 2255650 -  -2.6  -2.51888   GCTCAAATTTAACAT                 TTAT CAC ATAA                 TGAATCCAATTTGCA  39 76
   CLJ_B2266 NONE
   CLJ_B2265 2253659 .. 2253703 -  -2.4  -5.31275   GCTTACTATAAAAAA CGGCTTCTTCCCAACATATCC TTTGCT GG-T-TGTTTG-AAGAAGCCG TTTTTTATATTTAAT  66 182
   CLJ_B2263 2251552 .. 2251563 -  -5.8  -3.55548   TAACATCTTTTTAAA                GGCA GGTC TGCC                 CTCAATGGATTTTCC  59 341
   CLJ_B2261 2250436 .. 2250447 -  -4.4  -3.12666   CTATATTCAAAATTA                TACC ACAG GGTA                 AGTTATTTTTAAATA  51 136
   CLJ_B2260 2249721 .. 2249765 - -30.5  -2.78384   GTCTTTTTCATTAGA TAAACAAACTGCGGTGTTCGA ATT TCGAACACCGCAGTTTGTTTA TCTAATTTTTAGGCA 100 87
   CLJ_B2259 2247677 .. 2247700 -  -8.2  -5.19251   CAATATGAATAAAAA          TCCCGATTTT TTTA AAATTCGGGA           TTTTTATCATTATCT  95 55
   CLJ_B2258 NONE
   CLJ_B2257 NONE
   CLJ_B2256 2242312 .. 2242322 -  -2.6  -2.62192   GCTTACTCAACTAAT                 TATT AAA AATA                 GACTGCATATTTTTG  39 10
   CLJ_B2255 2241529 .. 2241551 -  -8.5  -4.71482   AGCAAAGCCCAAAAA           GACAGGTAA TAAAT TTACCTGCC           TAAAATATCAATATA  85 176
   CLJ_B2254 2238809 .. 2238821 -  -3.5  -3.64299   CATAGGATAAACTAA                TTTAA TTT TTAAA                TATATTTGGTTTTGG  49 14
   CLJ_B2253 NONE
   CLJ_B2252 2237596 .. 2237618 - -12.1  -4.52047   TAGGATATTATAAAA           GTCCCATAG TATAT CTATGGGAC           TCCATTTATTTCAAT 100 337
   CLJ_B2251 NONE
   CLJ_B2250 NONE
   CLJ_B2249 NONE
   CLJ_B2248 2234038 .. 2234056 -  -4.6  -2.98778   GAATATCAAGAAGCA             GAAGCA GAATTCA TGCTTC             GTCACTGTGCAGGCG  51 488
   CLJ_B2245 2230417 .. 2230441 -  -9.4  -5.35222   AAAAGTTATAAAAAA          GAAGCCATTG AAAAA CAATGACTTC          TTTAAATAAATATTC 100 77
   CLJ_B2244 2228645 .. 2228673 - -11.8  -5.48054   ATCAAAATTAAAAAA        CCACACTCCAGT TGAAT ACCGAAGTGTGG        TTTAGAAATAAACAG 100 151
   CLJ_B2240 2225735 .. 2225746 -    -3  -2.75769   CTCCTAAATTAGAAC                TGAA TTTT TTCA                 CTTTCAAAATCATAA  39 7
   CLJ_B2239 NONE
   CLJ_B2238 2224358 .. 2224368 -  -3.2  -3.34527   ACTCAAAAATATACA                 GGAA CTT TCCC                 CCTTACTATAGTTTT  47 41
   CLJ_B2237 NONE
   CLJ_B2236 2223617 .. 2223636 - -10.8   -3.1886   ATTCAATTTTATTAA            GGGATACA AAAA TGTATCCC             TTAATTCATCTTTAT  87 37
   CLJ_B2235 NONE
   CLJ_B2234 2221101 .. 2221126 - -11.3  -4.27316   TCCCTTAACCCAAAA         TTCCCTCAAAC CATA ATTTGAGGGAA          AGAAAATACACTTCA 100 296
   CLJ_B2231 2219099 .. 2219140 -  -9.2  -4.83243   TTTACACAAAATAAA TAAGCTAAGGCA-T-TAAAT TAAT ATTTATAGTGCCTTAGCTTA TTGTTTTTTATTTTT  95 259
   CLJ_B2229 NONE
   CLJ_B2228 2217840 .. 2217856 -  -5.2  -4.40003   TGCTATAAATATAAA              GGATAA ATTTA TTATCC              TAAACCTTATTATAC  66 116
   CLJ_B2227 2217511 .. 2217552 -  -8.2  -4.03183   AGTTACAAAACATAA TAAAATCGGAGTAATGGC TTTAAC ACTATAACTCCGATTTTA  CTTATTATCCAAACA  79 61
   CLJ_B2226 2216999 .. 2217016 -  -2.7  -5.04325   GTTAAATTATAAAAA             TAAAGTC TTTT GTCTTTA              TTAAGTTTTGTATCT  62 89
   CLJ_B2225 2215589 .. 2215605 -  -5.9  -3.21872   CTTAAACATATCTAA              GTAGAAT TAT ATTCCAC              TTATTCTATAAACCA  60 339
   CLJ_B2224 2214224 .. 2214252 -  -8.2  -4.81249   TTTGAAATTTAAAAA        CCACACTCCAGT TGAAT ACTGAAATGCGG        TTTTTAAATAAATAT  88 190
   CLJ_B2223 2212271 .. 2212285 -    -5  -2.70932   CCTCTGCTCTAACCA               CTACAC TTT GTATAG               CTTGGTAGTATATCT  50 512
   CLJ_B2220 NONE
   CLJ_B2219 2209005 .. 2209026 -  -2.3  -4.91084   AATAAAACTTAAAAA           CACAAAAAG ACAT CTTCTTTTG            AAGTGCACCTTAAAA  59 230
   CLJ_B2217 2206437 .. 2206482 - -17.3  -3.75519   AATAAACATATAGAA CATATAAATAATAGGAACTGC TTTA GCAGTTCCTATTATTTAAATA TAAAATATAGACCTC 100 72
   CLJ_B2214 2201913 .. 2201932 -    -8  -3.00138   ATTCATATTAAAGGA            TTTTTGCA TCTT TGCAAAAA             CATTCTCACTTTTGC  67 31
   CLJ_B2213 2200344 .. 2200354 -  -2.6  -4.86385   AGGTGGAAAAATAAA                 TTTT CTA AAAA                 ATTCCACCTGAACTT  59 45
   CLJ_B2212 2199568 .. 2199590 -  -9.4  -6.11229   ACGAAAATAAAAAAA           TTTGTATAAT GAT ATTATACAAA           TTTTTAAAGTCTTAT 100 37
   CLJ_B2210 NONE
   CLJ_B2209 2197443 .. 2197498 - -13.9  -3.53224   TATTCCCTCTTTAAA TACATCTATGTGAATATATATTTTA AAACCA TAAAATATATATTCACATAGATTTT TATATTGTTTTTTTA 100 62
   CLJ_B2207 2195562 .. 2195594 - -10.1   -5.4756   AATTCTAATAAAAAA      GCTGCCTTAAAAT AGATTTA ATTTTAAGGCAAC      TTTTTTATTATTTTT 100 33
   CLJ_B2206 2194177 .. 2194201 -  -8.9   -3.5944   CTAAAAAATTTATAA          TATAAATTTAT AAT ATAAATTTATA          AACATATTCAGATGT  79 8
   CLJ_B2205 2193992 .. 2194002 -  -2.6  -3.08032   TTTTTCTTAAAACTA                 TTTA ACA TAAA                 TTACACCTACTTTTG  41 16
   CLJ_B2204 NONE
   CLJ_B2202 2189003 .. 2189043 - -10.1  -4.07687   AGGGGGGTCTCAAAA  TAGTCTTAATTTTAAAACC GTA AATATTAAAATTAAGACTA  TTTTTATTTTGAGAC  93 275
   CLJ_B2200 NONE
   CLJ_B2199 2186923 .. 2186946 - -11.2  -5.63645   TGAAAATACAAAAAA          GAGATTTTCA ATAT TGAAAATCTC           TTTTCATATAGATTT 100 40
        gatY NONE
      pfkB_2 NONE
   CLJ_B2196 2183515 .. 2183526 -    -3  -3.42574   CCAATGCTATTATAA                GTTA TAAT TAAC                 TTAGTAACAAGGTAT  44 59
       hsp90 2173850 .. 2173866 -  -3.1  -3.76781   AAATATTTGATGAAA              TTTTTCA TCT TAAAAAA              TAGCCTAATATAAAA  50 402
   CLJ_B2189 2171806 .. 2171819 -  -2.5  -5.46706   ACCTGAAAATAAAAA               TATTT ACTT AAATA                GAGGAAGCGTATACT  72 410
   CLJ_B2185 2168756 .. 2168791 -  -9.3  -3.04486   ATCAAAATATTAAAG    GTCAAAGTATAAAAA CAACTT TTTTTATACTTTGGC     TCTTATATTATACGC  78 233
   CLJ_B2179 2161118 .. 2161138 -  -4.1  -3.03644   AAAAATTAATAAGTA            TTGACTTTT AAT AAAATTCAA            TTTATAAAGCAATAT  46 41
   CLJ_B2178 NONE
   CLJ_B2177 NONE
   CLJ_B2176 NONE
   CLJ_B2175 2157063 .. 2157099 -    -7  -3.19848   CAAAATCTATGAACA    TATTTTAAATAATCAT TATGT ATCATTATTTAAAATA    AAAAATAGGGCTATC  65 306
   CLJ_B2174 NONE
   CLJ_B2173 2154628 .. 2154661 - -14.2  -3.16267   GTTAAGTATATGTAA     GTAGGTAAATTTGT ATAAAA ACAAATTTACCTAC      ATTTTTTATAGCATA 100 177
   CLJ_B2169 NONE
   CLJ_B2168 NONE
   CLJ_B2167 NONE
   CLJ_B2166 NONE
   CLJ_B2165 2145857 .. 2145886 -  -7.2  -4.50976   CCTTATATGACAAAA       GGATGCTGCAAA CGTTTT TATACAGCATCC        TTTTTCTTCTCCTCT  77 86
   CLJ_B2164 2143586 .. 2143617 -  -9.6  -3.27639   TAAGACTTATAAAAG      GCAGTGCTAAGT-AT ATT ATAACTTGGCACTGC      TTTCTTTCTATATGT  80 45
   CLJ_B2159 NONE
   CLJ_B2158 2133717 .. 2133765 -   -12  -4.59342   TTTATCATAAATAAA TCACCCCTTTATAGCTAATTTA TTTTG TAGATTAACTATAAAGGGGCGG TTCTTTATTGTTTTA 100 127
   CLJ_B2157 2132729 .. 2132778 -  -5.5  -2.73829   GCATTTAAATAATAT GTT-TTCTATGATTAATAATTCTT CAA AATAATTATTAATCATAATAGAAC TTTATTTTTCAATAA  53 27
   CLJ_B2155 NONE
   CLJ_B2154 2129596 .. 2129642 -  -4.8  -3.69976   AAAATATGTTAATAA GATTCAGATGGAG--AGATTAT TTATC ATAATCTAACCTCATCTGAATC TAAAAATCATTGGAT  58 158
   CLJ_B2153 2128569 .. 2128599 -  -4.2  -3.95621   ACTAAATCTCATAAA       TTTTTTAACTTC AACATAG GAAGTTAAAGAA       TAAACCTTTTGGGCA  58 238
   CLJ_B2151 2127005 .. 2127044 - -11.2  -5.75599   TAAATTATAAAAAAA  TACAAAATATTATATACT CTAC ATTATATAATATTTTGTA   CCATTATAACACATT 100 130
        tupA NONE
   CLJ_B2149 NONE
   CLJ_B2148 2124602 .. 2124616 -  -5.8  -2.65388   CATTTAATTTATAAC               TTCTAA CTC TTAGAA               TAAGAAAATAATTCA  53 118
         mog NONE
        moeA NONE
   CLJ_B2145 NONE
        moaA NONE
        moaC NONE
   CLJ_B2142 2118902 .. 2118915 -  -2.5  -4.01902   ACAGCTATCAAATAA               TTTTA ATGC TAAAA                ATGGGATAAAACCTC  51 20
        aorR 2116774 .. 2116801 -  -8.6  -3.54436   TATATACCTAGATAA        GAGCTTAACTTT ATCT AAAGTCAAACTC         TCTTCTTCGTATATA  75 190
         aor 2114621 .. 2114659 -  -3.4  -2.73529   CTCTATATAAAGTTA   TAGAAAGACTTTTA TTTTTTAGCTT TAAAAGCCTTCCTA   TTTATAAATATTTAC  43 108
        moaD NONE
        moeB 2113523 .. 2113564 - -16.3  -3.09823   TTTTTTAAAACTATA TCCCCTTAATTTATTATTA TATA TAATAATAAATTAAGGGGT  AATCATTTATGGAAT 100 138
   CLJ_B2135 NONE
   CLJ_B2134 2107822 .. 2107840 -  -3.2  -4.36778   AAATACAACCTAAAA             CTTTAAAA ATA TTTTTAAG             ACACTTCTGCATTTT  56 21
   CLJ_B2132 NONE
   CLJ_B2131 2105535 .. 2105547 -  -2.7  -4.41609   TATTATAAATACAAA                TACTC ACT AAGTA                TTCACTTCCTTTCCA  55 130
   CLJ_B2130 2104694 .. 2104704 -    -4  -3.84715   AAAATATAGCAATAA                 CATA AAT TATG                 CTTATGTTTTATTTT  54 41
   CLJ_B2129 NONE
   CLJ_B2128 2102142 .. 2102189 - -10.4  -4.78753   TTAATACTAATAAAA TACTTAAAAGCTGTAAATAATTC TCG AAATT-TTTACAGCCTTTAAATA TTTCTAATTTGATTC 100 127
        msrA 2100217 .. 2100227 -  -3.2  -3.90511   AATTACAAAAACCAA                 GAGA GTG CCTC                 AAAATAAAAATAGAC  52 281
       cloSI 2094739 .. 2094794 - -20.4  -4.01454   TGAAAAATAATATAA TTAAAATACTGCCTAAAAATAGA-AGT TAT ACTTTCTATTTTTAGGCAGTATTTTTA ATAATAAATTAAGCT 100 52
   CLJ_B2121 2092486 .. 2092513 -  -5.8  -3.39352   TAATGTAAAACTTAA        TTATGATTAAAT TTTA ACTCAATCATAA         TTTTAGTTAAACATA  57 154
   CLJ_B2120 2091633 .. 2091666 -  -9.5  -3.06605   AAAGAGAATGACAGA     CCGGTGGAGAAAACA ATGA TGAAGTCTCCACCGG      TTATACAATTTTTAA  78 155
   CLJ_B2118 NONE
   CLJ_B2117 2088870 .. 2088890 -    -7  -4.69326   ATATTTAATAGAAAA            TACATGTA AAAAA TACATGTA            ATAAATGCATAAAGT  79 64
        dapF NONE
   CLJ_B2113 NONE
   CLJ_B2112 2083615 .. 2083627 -  -4.9  -2.76693   AAATTTGAAAATTTA                TCTAT ATT ATAGA                CACATATATAAAAAG  51 125
   CLJ_B2111 2081964 .. 2081974 -    -4  -2.64739   AAGTTTAAAAGACAC                 TTTC TTA GAAA                 TATATACTGAAAATG  44 100
   CLJ_B2110 2080877 .. 2080889 -  -3.5  -2.88959   TTACATTAAATACTA                TAAAT ACT ATTTA                GTTGGTTACACTATA  43 36
   CLJ_B2109 NONE
   CLJ_B2108 NONE
   CLJ_B2107 NONE
   CLJ_B2106 NONE
   CLJ_B2105 NONE
   CLJ_B2104 2075374 .. 2075397 -  -7.5  -4.62441   TTTTATATAAATAAA          TACTCCCGA ATTTAA TCAGGAGTA           TTTCTATTTTACAAA  83 29
   CLJ_B2103 2074406 .. 2074425 -  -4.3  -5.02715   ATAGCAAATTAAAAA            GACCTTC TAATTT GAAAGTC             TTTTATAAATCATTA  70 44
   CLJ_B2102 NONE
   CLJ_B2101 NONE
   CLJ_B2100 NONE
   CLJ_B2099 2071344 .. 2071380 - -13.4  -5.28561   AATACACAATAAAAA    GAATGTCAAAAATATA ATAGG TATATCTTTGACATTC    TTTTTATTTATATCT 100 33
   CLJ_B2098 2070832 .. 2070848 -    -3  -3.44051   TTTTGAGTATTACAA              CGATGT TAATG ACATCA              ACTGTAAGTGCAGCT  48 298
   CLJ_B2096 2070262 .. 2070292 -  -2.1  -3.18849   TTTATACCACTAAGA      TAG-CTATTTATAA TATT TTATACATAGACTA       CATGTAAACAATACA  41 12
   CLJ_B2095 2069944 .. 2069955 -    -3  -3.79419   TCCTCCTATAAAATA                TTAC TAGT GTAA                 TTTTATATAAGTATT  47 106
   CLJ_B2094 2069408 .. 2069425 -  -5.7    -3.615   AGTTTTATATAAACA             CATATAA TCTC TTATATG              CAATATACATAGCTA  59 114
   CLJ_B2093 NONE
   CLJ_B2092 NONE
   CLJ_B2091 NONE
   CLJ_B2090 NONE
   CLJ_B2089 NONE
   CLJ_B2088 2066395 .. 2066408 -  -2.5  -4.15565   TTTATCACTCCAAAA               TAAAT TTAA ATTTA                TAAAAATCTTCTTCT  51 1
   CLJ_B2087 NONE
        aroK 2065144 .. 2065156 -  -4.9  -4.01703   ATAATACTCAAACAA                TGATA TTT TATCA                AAACTTCACTTTATT  61 108
        aroQ 2064596 .. 2064606 -  -5.4  -3.46602   CTTTTTATATTATAA                 CCTT TGT AAGG                 CCTTATATACCAAAT  57 60
         efp 2063975 .. 2063992 -  -5.7  -2.92951   CACATCCTTATAAAT             TATACTA TCTA TAGTATA              GACTAAACTCTTTCC  54 28
   CLJ_B2083 2063499 .. 2063528 - -16.7  -5.24129   TTTTTGTATAAAAAA       CACCCTATAAGAT TAAA ATCTTATAGGGTG        TTTTAACTAATCATT 100 32
    spoIIIAA NONE
    spoIIIAB 2061851 .. 2061864 -  -2.5  -2.52464   CCCCTTTTTAACCTA               TATAT TTTT ATATA                GTATTTTTATATAAA  39 32
   CLJ_B2080 NONE
    spoIIIAD NONE
    spoIIIAE 2060049 .. 2060062 -  -3.9  -3.64371   AAGTTATATTTTAAA               TTATG TGCC CATAA                AAACCTTTCCTGCAG  51 12
    spoIIIAF 2059378 .. 2059389 -    -3  -4.09243   TATACTTTTTTAAAA                TACA TATT TGTA                 TTTTATTTTAAATTC  51 59
    spoIIIAG 2058646 .. 2058665 -    -3  -2.72144   TCATTCCCCCCAAAT            TATAATTC TACA AAATTATA             TGCATAAGATTTAAT  39 48
   CLJ_B2075 NONE
   CLJ_B2074 2057594 .. 2057614 - -11.2  -4.12532   TTCTCTACATAGAAA            CACCCTCT ACCTG AGAGGGTG            CAATTATTTATTATT 100 36
        nusB 2057014 .. 2057034 - -10.5  -4.44797   TTATTAATATTAAAA            GTGAAAAGC TAA GCTCTTCAC            TTTTTAAATATTTAT 100 46
        xseA 2055690 .. 2055713 -    -7  -3.37796   GTTTATTATTTACAA          TTTAATAATT TCTA AATTATTAAA           TATAAACACTATAAC  67 91
        xseB NONE
   CLJ_B2070 2053967 .. 2053992 -    -7  -2.55896   TTCAGCAAGCAATAG         CCTAAAGGTT TGGCCT AACCTTTAGA          TTTAAACTTAACCTC  62 478
   CLJ_B2069 NONE
         dxs 2051207 .. 2051222 -  -3.4  -2.83249   CTTCATATAATATTA              TATAAT CTTT ATTATA               TTTTTAACAATACCC  43 7
   CLJ_B2067 NONE
        ppnK NONE
        argR NONE
        recN 2047111 .. 2047130 -  -7.2  -5.52384   TTTGTATTAAAAAAA            GCCATTTC GTGA GAAATGAC             TTTATTAACAGTTAC  91 241
   CLJ_B2062 NONE
       hom_2 NONE
        metA 2043364 .. 2043406 -  -9.4  -5.60993   TTTTTCATAAAAAAA GGCTCTAAATAGATTGTGTT ATT AATACAATTTATTTAGAGCT TTTTTGAATTTTTAA 100 198
      spoIVB 2041609 .. 2041642 -  -9.1  -4.78477   ATATATAAAAAATAA     TAAAGTGTAAGATAC TCTA ATTTCTTACACTTTA      TATGGTAACACATAT  93 314
       spo0A 2040551 .. 2040589 -   -12  -4.82901   TTTTTTGCATAAAAA   TAGACTCCCTTCATTC TACCTAT GAATGAAGAAAGTCTA   TTAGTATTTTTTTGA 100 117
   CLJ_B2057 NONE
   CLJ_B2056 NONE
   CLJ_B2055 2039143 .. 2039163 -  -4.1  -4.21275   TTAATCTACCTAAAA            CATTTTTCT GAA ATAAAAATG            CGCCCTAAGACAAAA  58 62
   CLJ_B2051 2037899 .. 2037918 -  -5.7  -5.52096   AAATTTAATAAAAAA            GAACAGG TTTATT CCTGCTC             CTTACTTTCCTTTAC  82 14
   CLJ_B2050 2037020 .. 2037030 -  -2.6  -3.28842   TATATAATAGCAATA                 TTTA TTT TAAA                 TTTCTAAATAAAACT  42 16
   CLJ_B2048 2035303 .. 2035332 -  -8.8  -5.51612   ACACAAAAAATAAAA       TAAGGTAAAGTA AATTAA TACTCTACCTTA        TATAATACATCAAAA 100 317
   CLJ_B2047 2034119 .. 2034158 - -10.4  -2.88961   GAAAATACCACTACA  TAATAAATTAAGTTCTAT ATTC AAAGAACCTAATTTATTA   ATTGATTCGTCATAT  82 519
   CLJ_B2046 2032920 .. 2032940 -  -2.7  -3.63715   TATATAATCAGAGAA            TTTATGT TAGAGCT ACATAAA            ATGAAAAAGAGAGAA  45 330
   CLJ_B2045 2031698 .. 2031708 -    -4  -3.60296   TATTGTTACTGCAAA                 TAAC ATA GTTA                 CTATTAATGCTTTTT  51 117
   CLJ_B2044 2030048 .. 2030065 -  -9.9  -5.22481   TATAAACAAATAAAA             GCTCTAG ATTT CTAGAGC              TTTGTTTGTAAGATG 100 405
   CLJ_B2043 2028088 .. 2028117 -  -4.4  -5.30189   TAGAACACTAAAAAA       TAGAAGGGAT TAAATTTAGT ATCCCCTCTA        TTTTTATATAAATTA  76 45
   CLJ_B2042 2027343 .. 2027353 -  -2.6  -3.41708   TTAATTAAAATCCAA                 TTTT TAA AAAA                 TATCTTCTATAAAAA  44 55
      spoIIM NONE
   CLJ_B2039 2026305 .. 2026321 -  -3.1  -3.69809   TATTCAACAAATTAA              TTTAAAA ACC TCTTAAA              AAATTATTAAAAACT  50 10
        xerD 2025382 .. 2025397 -  -2.5  -3.13504   GCTTTATTAAAATTA              TGCCC TTGGAT GAGCA               TTTTTATATACTTCT  42 7
        punA 2024261 .. 2024287 -  -3.8  -3.85817   ATTCCTCCCTACAAA         GCAATTATTATA TAA TATAAGGATTGC         CTCCAAATAGATTTA  54 264
         pdp 2022891 .. 2022912 -  -2.5  -3.75629   TAGCTTTAATTTAAA           CATACTTTAA AAA TTAAA-TATG           CTTTTATGAATGCTT  47 49
   CLJ_B2035 2022512 .. 2022536 -  -8.7  -5.52023   ATTATCAATAAAAAA          CACAATAAACC TAA AGCTTATTGTG          TAAATTTATATTTAT 100 70
   CLJ_B2034 2021326 .. 2021381 -  -5.8  -3.12606   TTATATATTACCTAA CTTGTT-AGGACCATTAACCTATTTTA TAT TTAAATATGTTAATGGTCCTTAAGAAT TATTTTAATTTAAAT  56 25
   CLJ_B2033 2020438 .. 2020451 -  -3.9  -4.68994   ATTATCACGGAAAAA               TTTTC TATG GAAAA                AATTAAATTTTATTA  62 74
        dacF 2019096 .. 2019120 - -11.6  -4.48299   TCATACTTAAATAAA          GCTAACATGA AATAA TCATGTTAGC          TTTTACCCTCCTTTT 100 59
   CLJ_B2031 NONE
        scpA NONE
        scpB 2016534 .. 2016566 - -10.8  -3.87551   ATCATGAAATCTAAA      TAAAAGCCCCTA TTACATACT TAGGGGCTTTTA      CACTATTTCTTAGTT  95 52
   CLJ_B2026 2014125 .. 2014165 -  -4.3  -4.67641   ATCTCAAAATTAAAA  TAGATTTAATTTTAAAGTT CGA AATATAAAAATTAAATCTA  TTTTGAGACATCCCT  66 52
   CLJ_B2024 2011651 .. 2011679 - -14.9   -5.2696   TCAAAACGCAAAAAA        TCCTACAAATAAT TAT ATTATTTGTAGGA        GTCATTAGCATTACG 100 216
   CLJ_B2023 2010305 .. 2010343 -  -7.6  -5.37043   ATTTTATATAAAAAA   GAGGATACCCCAAAAT AGCCTTA ATTTTAGGACACCCTC   TTATTATTATACAAA 100 106
   CLJ_B2022 NONE
   CLJ_B2021 NONE
   CLJ_B2020 2005783 .. 2005802 -  -5.1  -3.88601   TAAAACCTACAATAA            CCTATAT AACTTA ATATAGG             TTTTATAGTTTTAAG  60 139
   CLJ_B2019 2003895 .. 2003920 -  -6.9  -3.55474   AATTAATAACAAAAG         CAGCCAGTTTT AATA AACACTGACTG          TTTTTCTAGATACAT  66 105
   CLJ_B2016 2002315 .. 2002325 -  -2.6  -4.54343   ATAAATCCAAAGAAA                 TTAT TAC ATAA                 ATTCAAAAAATATAA  55 285
        hypE 1998434 .. 1998457 -  -6.8  -3.81846   AGAAAAAACTAAAGA          CACTTAAAGA AAGT TCTTTTAGTG           CAGCAGAAGAAGTAA  69 212
   CLJ_B2006 NONE
   CLJ_B2005 1992762 .. 1992780 -  -2.4  -4.34008   TATTAATGAAAACAA             TTCCATAA GTA TAACGGAA             TTTAATAGTACAACT  52 169
   CLJ_B2004 1992148 .. 1992190 - -11.7   -4.7173   TATTATATCTAAAAA TATAGAAATACCACAAGGAA TATA TCCCTTGTGGTACTT-TATA CTATTTTATTTTTCT 100 31
   CLJ_B2003 NONE
      pcaC_1 1990913 .. 1990966 -  -7.9  -4.05181   ACGATAAAGATTAAA TTAAAAGGCTATAA-TTTTTAGAATA TTA TATTCTTAGAAGTTATAGCCTTTTGA TTATAAAATAAGTTT  77 73
   CLJ_B2000 NONE
   CLJ_B1999 1987451 .. 1987484 -  -9.8  -4.31329   GTAAAAATTTCAAAA     TAACCTTCAAAGAA TATAAC TTCTCTGAAGGCTA      TTTCAATTTTAACAT  95 62
   CLJ_B1998 NONE
   CLJ_B1997 1986249 .. 1986291 - -25.4   -3.3907   TTAAACTTTAATTAA TATAAAATGGGACCTAGATT AAA AATCTAGGTCCCATTTTATA TTCCTATATATATTA 100 21
   CLJ_B1994 1981626 .. 1981673 -   -11  -3.42996   TATTAGGGATTATAA TTCTAATAAATCAAAGCTTTAT TAGA ATTAAGCTTTGATTTATAAAAA TATAGCTTATACTTT  93 224
   CLJ_B1993 1980231 .. 1980241 -  -2.6  -4.04209   TCAAATTATGACAAA                 TTAA TTT TTAA                 TTTACACTTTTTATC  51 83
   CLJ_B1992 1978883 .. 1978909 - -16.8  -3.60098   ACTCTGTACTCTAAA         TAAGGAAAGTGC GTC GCACTTTCCTTA         TATTATACTAATTTA 100 28
        rluB 1977651 .. 1977672 -  -7.5  -3.77464   ATATTATTCACCAAA           TATAGTTTT ACAT AAAACTATA            TTTTTGAAATTATTT  73 122
   CLJ_B1990 1976443 .. 1976461 -  -2.5  -5.72118   AAAAAACAGAAAAAA            GAGGT-AT AAAA ATGACCTC             TTTTTTACACAAGCT  73 67
        gluD 1974962 .. 1974983 -  -9.5   -5.1971   ACTAAAAACGAAAAA           GAGGCTTGA TAAC TCAAACCTC            TTTTTTATTTATATT 100 46
   CLJ_B1988 NONE
        aroH 1973084 .. 1973100 -  -5.3   -3.6075   ATTAACACTATATAA              TTTTATA TTC TATAAAA              TCTATAAAAATTCCT  59 41
         cmk NONE
   CLJ_B1985 1970287 .. 1970329 -  -3.9  -5.36965   TAAGATTATAAAAAA TAAAATATATGCATTA-ATA TTTT CATCTAATACATATACTTTA TACATTTAAATTATA  72 84
   CLJ_B1984 NONE
   CLJ_B1983 1968114 .. 1968130 -  -6.6  -5.69793   ATAGCAAATAAAAAA              TAACCC TTTTG GGGTTA              TTTTTATTTTATGTA  90 34
        miaB 1963573 .. 1963588 -  -7.6  -5.41746   AATCTTTTAAAAAAA              GCTCTT ATTC AAGAGC               TTTTTAATTTATATT 100 40
        mutS 1960621 .. 1960640 - -10.8  -2.73771   TTATTATATAGATTA            GTACCACT TATA AGTGGTAC             TAGGTTAATAAAAAT  81 111
        mutL NONE
        miaA 1957612 .. 1957627 -  -3.4  -4.56969   AATTCTATAAATAAA              TTAAAA ATCC TTTTAA               TTCTATTTATCTTTT  60 28
         hfq 1957272 .. 1957292 -  -6.2  -5.80248   TAACATATAAAAAAA            GAATAGGC AATTA ACCTATTC            TTTATCTTTATAATC  87 20
   CLJ_B1974 1955777 .. 1955816 - -11.9  -5.07486   GATTGTTAATAAAAA  TAATTCCTAGAAGT-ATT AAGAG AATAACTTCTAGGAATTA  TTTTTATATTAATTC 100 112
   CLJ_B1972 1954158 .. 1954168 -  -2.6   -4.1347   TGGTAATTATATAAA                 TATA CTG TATA                 TCTGACATACGCTAT  51 182
   CLJ_B1970 1951648 .. 1951682 - -13.9  -2.57757   AAGCAATTTAATTGA     GGAATCATACAAGAA TTTAT TTCTTATATGATTCC     TTTTAAATTTATTAG 100 126
   CLJ_B1967 1948913 .. 1948942 -  -8.1  -4.21607   TTTATTTAATATAAA       TAAGCACTTAT AACTTTGA ATAAGTGCTTA        TTTTAAAATTATTCT  80 113
   CLJ_B1964 1946343 .. 1946381 -  -8.5  -3.34227   CTAGTAAATTATTAA  TACTCCCTATTATCACAAC TAG ATTGTGA-A-TAGGGAGTA  TTTTAATTAAAATTG  74 83
        cheV 1930535 .. 1930579 - -12.4  -2.62616   TCATTTGTCATAGGA TTAAGCGACTCGCTGCAAAT CTGTT ATTTGTAGTGAATCGCTTAA TTAGTTAGAATTATT  88 36
   CLJ_B1954 1927391 .. 1927419 -  -7.6  -4.91852   GCTATTAAAAATAAA        CACTATCAAATT TTAAT AAATTGATAGTG        TTTTTCATATATTTA  90 86
   CLJ_B1952 1924045 .. 1924099 - -13.6  -2.69528   TTAAATTTAAATGTA TATTTATATCCTATAATAAAAA TGGAAATAAAT TTTTTATTATAGGATATAAATA TAATCATAATAAAAT  91 312
        safA 1923308 .. 1923335 - -14.4  -5.29445   TTTTAACAATAAAAA        TCTGTGAGTAAA ATAT TTTACTCACAGA         TTTTTATTTAATGCC 100 40
   CLJ_B1948 1921219 .. 1921264 - -18.9  -3.12874   ATATACATGAGTTAA TTCTATATGTATTACTTCAAA ACTC TTTAAAGTAATACATATAGAA TTATAAGCTTATTTT 100 26
   CLJ_B1945 1918036 .. 1918067 - -11.1  -3.68738   GGTTTAATAAATTAA      TAAAAATCCCACA ATAAAA TGTGGGACTTTTA       TATTAATCAAATTGC  95 28
   CLJ_B1940 1914082 .. 1914120 - -10.7  -3.23692   TAGTATTATTAGGAA  GATAGCGTATCAAAAATA AATC TA-TTTTGATACACTATC   TTCTTTTTTCAAATT  87 63
   CLJ_B1937 1911147 .. 1911178 -  -8.2  -5.95539   GGTTAAATAAAAAAA      TAAAGGCGTACCATA GCT TA-GGTATGCCTTTA      ATCATAGCAAATATC 100 118
   CLJ_B1870 1875692 .. 1875708 -  -2.3  -3.61889   GAAAAATGTCGGAAA              TATATCT ACC AGTTATA              TTTTTTGTGTTAATA  44 131
   CLJ_B1869 NONE
   CLJ_B1868 1874112 .. 1874122 -  -2.6  -4.26386   GTAAAAATGAAATAA                 TAAA ACT TTTA                 AAAATGCTACAAAAT  55 273
   CLJ_B1862 1868387 .. 1868425 - -12.7  -3.84619   AAATTTTAAATAGAA   GATGGTGTCTGAAAACA TATTT TATTTTGAGACACCATC   TCTTATGTAATTAAG 100 36
   CLJ_B1860 1864107 .. 1864145 - -13.3  -2.88544   TTTTATGTTCATACA   TCCCTATTTAGCTAGGC GAGAA GCATGGCTAAATAGGGA   TTTTTATTTTAATAA  93 114
   CLJ_B1858 1861009 .. 1861043 -  -8.7  -3.33884   TTTAAAAGATGAAGA     CCTATGAAATCCTTA TATTT TAAGGAGATCATAGG     TTTTTTATATTTAAA  77 132
   CLJ_B1766 NONE
   CLJ_B1765 NONE
   CLJ_B1764 1809150 .. 1809170 -  -7.1  -3.60948   CAAGAGACTTTGAAA            TTTTTATAT ATA ATATAAAAA            TAATTAGAAATAGCT  68 360
   CLJ_B1735 1773423 .. 1773454 -   -16  -3.59583   ATAACGATTTCTAAA      GCTTTAGTGGGAGT AAAA ACTCCCTCTAAAGC       CAAGAATTCTGTTTA 100 74
        colG 1764869 .. 1764885 -  -2.4  -4.16259   ATATAATTATATAAA              TATATT GCATT AATATA              TTTTTTTAAACACAA  50 431
   CLJ_B1727 1763477 .. 1763522 - -10.9  -3.97356   AAAGTAAAATTTAAA TAGGCTTTACCTAAATATCTAT ATT ATAG-TATTTAAGTAAAGTCTA TTTGTTTTCCTTTGG 100 23
   CLJ_B1726 NONE
   CLJ_B1725 1761467 .. 1761490 -    -9  -4.55544   AATATATAATGAAAA          GGACAGGA-TA TAA TATTCCTGTCC          CTATTAATAACTTGT  89 110
   CLJ_B1721 NONE
   CLJ_B1720 1755961 .. 1755983 -  -9.3  -4.59109   CACATCTTTTAAAAA           CATACCTAT TTTCG ATAGGTATG           TTTTTGCTTTGGAAT 100 207
   CLJ_B1716 1753050 .. 1753091 - -17.1   -3.7744   AACATAAGGCAATAA CACTTTAAATCTTCTTATCT TAA AG-TAAGAAGATTTAAAGTG AGTTTGATATAGATA 100 160
   CLJ_B1705 NONE
   CLJ_B1704 1738213 .. 1738236 -  -5.4  -3.23481   AAATTAAAGCTAATA          TTATTTTGGT ATGA ACCCAAATAA           GTAGACATTTTTAAA  56 56
   CLJ_B1701 1733114 .. 1733149 -   -15   -3.4678   ATTTTTATATTAGAA    TGGACAGCTTAATATA AAAA TATATTAAGCTGTCCT     ATATTAAATAAAATT 100 39
   CLJ_B1696 1730071 .. 1730091 -  -5.4  -5.06472   ATATAAATAATAAAA            GGATAGCC TTAGT GGTTATCC            TTTTTCTACATATAC  75 31
   CLJ_B1685 1716328 .. 1716376 - -16.7  -3.28912   TTATAGGTACATTAA TATTAAAGAAGTTTATATTAT AAAATAG ATAATATAAACTTCTTTAATA TTTTTTAGCAGAATC 100 30
   CLJ_B1660 1695442 .. 1695479 - -11.7  -4.88388   ATAATTGCATAAAAA   GTTTTAAAAGAATGT TGATTTTT ACATTCTTTTAAAAC    TTAGTGTTTAGATTA 100 61
   CLJ_B1659 NONE
   CLJ_B1658 1693519 .. 1693559 - -17.3  -4.55485   TATAAAAAAATTAAA  GCCATAAAATATTAATACT TAA AGTAGTAATATTTTATGGC  AACTAGCTTAGTATA 100 79
   CLJ_B1652 NONE
   CLJ_B1651 1685926 .. 1685946 -  -2.5  -5.66868   AATGAAGCAAAAAAA            TGGGGGA ATAACTG TCTCCCA            AGTTTAGAAGTAAAT  81 397
   CLJ_B1648 1682182 .. 1682221 -  -9.6  -4.90869   ATCAGTAATGAAAAA  TAAGCCTAGGAACAAAAAT TAT AATTTTATTCCTAGGCT-A  TTTATATATTTTAAA 100 115
   CLJ_B1630 1664236 .. 1664246 -  -5.4   -3.5771   AAAAATTTCCCTAAA                 TCTC ATA GAGA                 GGAAATAAAATTTTT  59 396
   CLJ_B1628 NONE
        chiA 1661798 .. 1661814 -  -4.5  -4.75289   GAGGATAAGAGAAAA              TAAAACC AAC AGTTTTA              GAATAAATGCTAAAG  68 202
   CLJ_B1621 1654961 .. 1655006 - -14.3  -2.82261   GAAAGAAAGCATAAC TTTTACCCATTCCCTTTTAAA TCCT CTTAAAAGGGAATGGGTAAGT TTTTTGCTATCTTTT 100 6
   CLJ_B1619 1652959 .. 1652994 -  -3.6  -4.99312   AACATAATAAGAAAA    GAACCTTAA-TTTAG TATATAG CTAAAATTAAAGTTC    TTTTTATTGTTTTCC  67 170
         ldh 1650590 .. 1650602 -  -6.3  -3.48696   GGACAATAATATGAA                TACCT TTA AGGTA                GACAGATTAAAGAAT  63 121
   CLJ_B1611 1644619 .. 1644662 -  -6.8  -3.13853   GGAAGTAGTTAAAAT TTTTGAACCCTAACAAATTG CTTG CAATTTGTTAGGGTTCTTTC TTTTCGATTTTCTTT  63 52
   CLJ_B1607 1637394 .. 1637452 -  -7.9  -2.91342   AAGTAATTATTAAAT GATTCTAATATTAAGATG-GATTTTATT ATGA AAAATAGCCTCATCTTAATATTAGAATC ATTTTTATAATATTA  66 38
   CLJ_B1604 1633676 .. 1633719 - -16.4  -4.33258   ATTGTTAAATACAAA GATAATGGTGTCTCAAAATA AATT TATTTTGAGACACTATCATC TTATATTATTATTTT 100 147
   CLJ_B1582 1612708 .. 1612735 - -15.8  -3.75578   ATAGAGAACAGAGAA        GGCACTAATGTA GATA TACATTAGTGCC         TTTATGTTTTGTGGA 100 47
        ychF 1585800 .. 1585848 - -20.2  -2.82208   AAAGTATGTACTATA CATTAATAAAAAATCACCATTG CTAAC CAATAGTGATTTTTTATTAATG AGATAGATTAAACGT 100 33
      hlyIII 1584582 .. 1584598 -  -5.3  -4.57474   GGAAGGCAGACAAAA              TAAAAAT AGT ATTTTTA              GATAACGAGGAAAGC  70 524
        nadA NONE
        nadB NONE
        nadC 1580403 .. 1580418 -  -3.4  -4.18676   TTATAAATTAAACAA              TTATAA GCAC TTATAA               TATTTTAAGATATAT  54 276
       npr_5 NONE
       npr_4 1576466 .. 1576499 -  -9.9  -3.92075   ATTTTTACTTATAAA     CCTATTGATATTT ATATAGCA AAATATCAATAGG      TTTATAATTTTATAT  93 72
       npr_3 1574566 .. 1574584 -  -3.2  -3.92075   ATTTTTACTTATAAA             CTTTTTAA TGT TTATAAAG             TAAAATGCTAAAATT  52 83
       npr_2 1572639 .. 1572681 - -14.7  -2.98729   TATAATTATTATATA TAAATAAGATGATTTCTTAC TTAG GTA-GAAATCATCTTATTTA TTTAAATTCAGTTTT 100 86
       npr_1 1570795 .. 1570837 - -10.4  -2.98729   TATAATTATTATATA TAAATAAGATGATTTC-TA TGCAGG TATGAAATCATCTTATTTA TCTAAATTTAGTTTT  85 78
   CLJ_B1540 1564135 .. 1564160 -  -9.2  -5.10877   ATAATAAATGAAAAA         TAGAACTTAG ATTTAA CTAAGTTCTA          TTTTTTAACCCTTTG 100 23
       spoVB 1561705 .. 1561741 - -11.1  -5.86465   AATAAGATAAAAAAA    CATTAGATTGGCAAG GTGTTTT CTTGCTAATCTAATG    TTTTTTATTTGTAAT 100 20
   CLJ_B1527 1546864 .. 1546903 - -12.5  -4.55016   ATAAAAAATTTAAAA  GCTATGAATTGAAAAAT TTTATT ATATTTCAATTCATAGC   TTTTGTTGCTTATTA 100 105
   CLJ_B1523 1542638 .. 1542690 - -15.3  -4.95211   AAAAAATTAATAAAA GTATATTAAATATTCCACCAACT TTTAATT AGTTGGTGGAATATTTTAAATAC TTTTTTCCTGTTTTT 100 18
   CLJ_B1521 1540337 .. 1540387 - -16.1  -2.86539   GTGAATTTACAATTA TATATAATAAAAACACTATCA CTTATATTT TGATAGTGTTTTTATTATATA TTTAAAGTATATTAA 100 74
   CLJ_B1519 NONE
   CLJ_B1518 1538214 .. 1538225 -  -4.4  -5.09762   ATTGGAAGATAAAAA                GGAT TATT ATCC                 TTCCAAGTTATCTGG  72 425
   CLJ_B1505 1524402 .. 1524453 - -17.2  -3.65002   ATTAATTATAGATAA GTTAAAAGAGGTTGTCTGAAAATAA AAT TTATTTTCAGACAA-CTCTTTTAAT TTTTAGTGGTAATAA 100 66
        cspA 1519836 .. 1519853 -  -9.9   -5.1764   TATATAATATAAAAA             CCACCTT AATA AAGGTGG              CGTGGTATTTGCTAT 100 85
   CLJ_B1500 1519139 .. 1519164 -  -9.3  -3.20307   GTAAGATTATTAATA         TCTTTATATAA ATAT TTATATAAAGA          GCATATATTAGAAAA  80 115
   CLJ_B1499 1517810 .. 1517838 -  -4.6  -4.03782   AATATTATAATTAAA        GATTTTGTGCAG AAGAG CGGAACAAAATC        ATCCTTTTGTAGGTT  59 337
   CLJ_B1481 1498026 .. 1498037 -    -3  -3.66867   AAACAATTATAAAGA                CTTT AAAG AAAG                 TTTAGAAAAATTATA  50 523
   CLJ_B1479 NONE
   CLJ_B1478 1495622 .. 1495649 -   -13  -5.31456   TTAATTTATAAAAAA        GTAACACTTATA AAAT TATAAGTGTTAC         TTTTTTTGTAAAGGG 100 186
   CLJ_B1471 1486649 .. 1486691 -  -9.6  -3.87925   AATGATTAAATATAA TAAAACACTATCAAAT ATTTTTATACA ATTTGATAGTGTTTTA TTTATAAAAATTTCT  86 57
   CLJ_B1459 NONE
   CLJ_B1458 1471415 .. 1471443 -  -9.7  -2.85947   TGTAATATAACAGCA        TCAGTGACTGT TATAAAG ACAGCCACTGA        TAGTAATTAATATTA  76 196
   CLJ_B1453 1466221 .. 1466275 - -11.8  -3.99432   TAAATATAAATAGAA TATTGAAAGGAGATGCCTCAAGAT ACATTTA ATCTTAAGACATCTCCTTTTAATT TTATTAGTATATACT 100 140
   CLJ_B1450 1464748 .. 1464776 -  -4.7  -4.34916   ATAAAAAATAAAATA        CCTTTTTTATCTA CTT TAAACAAAGAAGG        ATCTCTCCTAAAGGA  64 269
        ptsG 1454495 .. 1454507 -  -2.7  -3.60971   ATTTTAACCCGTAAA                TATAG AAA CTACA                TTCATAAGCACTTCA  45 279
   CLJ_B1436 NONE
   CLJ_B1435 1448203 .. 1448224 -  -4.5  -3.72989   AAATTTACATCCAAA           TCTATTTGC GCTA GCAAACAAA            TTTAATATAATAAAA  56 471
   CLJ_B1428 1437233 .. 1437262 - -15.3  -4.70879   TTTAAATTTTAAAAA       GACCTATTTAGTT ATTT AACTAAATAGGTC        TTTAAATTTTATATT 100 42
   CLJ_B1365 1400244 .. 1400255 -    -3  -2.50338   ATAAGTTACCAAGAG                CATT AGCA AATG                 AAATTCAAACATTAA  42 239
   CLJ_B1361 NONE
   CLJ_B1360 NONE
   CLJ_B1359 1396678 .. 1396690 -  -3.5  -3.53343   AAGTCCCCCTTTAAA                TAATA GTA TATTA                TCTAATATTTTAACA  49 129
        nimB 1396164 .. 1396190 - -16.8  -4.87052   TATAAATTAACAAAA         TAAGGAAAGTGC TAC GCACTTTCCTTA         TATTTTATCTTTGGC 100 30
   CLJ_B1330 NONE
   CLJ_B1329 1359828 .. 1359863 -  -8.6  -5.40004   TATTAAATTAAAAAA    CTATGAATTT-GGATTA TTA TATTCCTAAATTCATAG    CTTTTACTTATTTAA 100 94
   CLJ_B1328 1359213 .. 1359224 -    -3  -4.94703   AAGAGAAAAAAACAA                TGTA TATC TACA                 AGCATTATATGCTTT  66 188
   CLJ_B1321 1354063 .. 1354073 -  -5.4  -4.74611   TAGTATAAAAAAGAA                 GCTT CTT AAGC                 CAATTTATTTCGCTA  73 288
   CLJ_B1297 1331023 .. 1331034 -    -3  -3.25472   AGATTTTTAAACATA                TAGA CACC TCTA                 ATCTTTTCTTTTGTA  42 52
        gapN 1329519 .. 1329571 - -24.1  -2.59686   CTATAGATGAAGCTA TAAATTTATAAAATAAGGAAGTTGC GAT GCAACTTCCTTATTTTATGAATTTA TATTCAAAACTATAG 100 15
   CLJ_B1288 1322390 .. 1322400 -  -2.4  -3.72576   TTTTCCGCCACGAAA                 GGGC ACT GTCC                 TATTCTTCTTATGGA  46 210
   CLJ_B1280 1317801 .. 1317842 - -13.3  -3.70043   GTTAATATATAAATA TTACAAGCACGAATTAATT AACT AATTAATTCGTGCTTGTTT  TCTATTATTGAAAGT 100 126
   CLJ_B1278 1316500 .. 1316519 - -10.8  -4.85177   AAATTATATTAAAAA            GCTAGTCT ATTA AGACTAGC             TTTAATAATTATTTC 100 34
   CLJ_B1277 1315774 .. 1315797 -  -9.6  -3.20553   TAATATTAGTAAAAG          GTGCTGAAGG TTAA CTTTCAGCAC           TTTTCATTGAATTAT  80 49
   CLJ_B1275 1314283 .. 1314301 -  -4.6  -2.76771   AAACAAAAACAAAGT             TTAAGGAA AGC TTCCATAA             CTAGCCACTTTCAAT  49 115
   CLJ_B1268 1307892 .. 1307923 -  -6.6  -4.57482   CTATTTAGAAATAAA      CGGTATCAAAAGGA TAAA TCCAATTAATACCG       TCCTTTTACTTATTA  77 46
   CLJ_B1267 NONE
   CLJ_B1266 1305884 .. 1305930 - -16.4  -3.28497   TTACTTTAAATTTAA CAAAAGAATCATTATATAGTAT TTT ATTCTATATAATGATTCTTTTA AGATTGTTATTTATT 100 32
   CLJ_B1265 1304836 .. 1304847 -  -2.2  -4.55023   TCCAACAGGAGAAAA                GCCT GTTA AGAC                 TTTTTTATCTTCTGA  54 287
   CLJ_B1263 1302919 .. 1302929 -  -2.6   -5.4433   ATATACAAAGAAAAA                 TAAT TAC ATTA                 TTAAATCTTTATAGC  67 68
   CLJ_B1261 1300718 .. 1300728 -    -4  -4.97158   GCATATTAAAGAAAA                 TGAT AAT ATCA                 TAAGAGTAGACTATT  70 121
   CLJ_B1259 1299716 .. 1299762 - -15.6  -4.08689   TACTTAATAATTAAA TAAAAGCTATGAATTAGGAAAA TAA TTTTCTAAATTCATAGCTTTTA ATCTTAATATTAAGC 100 73
   CLJ_B1257 1298389 .. 1298425 -  -6.7  -4.99134   ATTTTAAATGAAAAA    GCTATGAAATATAGG ATCAATA CCTTAATTTCATAGC    TTTTATTTGTTTATA  80 142
   CLJ_B1248 1288624 .. 1288664 -  -7.8   -4.8743   TGTAAAATAAATAAA TTTAAGCTTCAAG-GGAGT TAAA ACTCTACTAGAAGCTTAAA  TTTTTTGGTATAAAA  86 54
   CLJ_B1238 1276036 .. 1276069 -    -7  -4.12037   TATAAAGATTAGAAA     TAAAGAAGTATATT TTATTT AATATGCTTCTTTA      TTTATCTAGCATATT  73 39
   CLJ_B1234 1267542 .. 1267570 -  -9.8  -4.91873   GATACTAACCAAAAA       TAGAAGGG-AACT TATA AGTTTCCCTTCTA        TTTTTGATTTATACT 100 39
   CLJ_B1215 1249202 .. 1249247 - -11.5  -2.98003   AAAATTTAATAACTA TAAATAAACACTATCAAAACC TATT AGAATTGATAGTGTTTATTTA CTTTAATCTAATTTT  90 141
   CLJ_B1208 1241363 .. 1241403 -  -7.3  -4.29656   GAGAAAATTTCAAAA  TAGATTTAATTTTAATA TTTGTGG TGTTAAAATTAAATCTA  TTTTATTTTAAAATA  75 69
   CLJ_B1198 1229072 .. 1229114 -  -7.3  -4.98531   TTTTTAAATTAAAAA GGATTTATTGCTAAGGAATA TTTT TA-TACTTAGCAGTAAATCC TTTGTTTTTACATGA  83 44
   CLJ_B1178 1208243 .. 1208283 -  -4.9  -4.17109   AATAAGGAAATTAAA TAGTAAGGGAGG-ACATT AAAATA AACAAACCTCCCTTACTA  TTATTAATTATATTA  61 33
   CLJ_B1170 1193914 .. 1193952 -  -9.8  -3.91897   GTTTTTAGTGATAAA   GAGGGCGTTTCAAAAT TAAATAT ATTTTGAAACACCTTC   CTTTTATTATCTTAT  93 63
        birA 1189915 .. 1189962 -  -9.6  -2.52082   ACTAAGTAGGAATAG TAATGACTTCAGTAAGTTTATAC AAA ATA-AAACTTGCTAAAGTCATTA TTTTTATTTTATTAA  75 283
   CLJ_B1150 1175070 .. 1175083 -  -4.5  -6.06529   CATACATAAAAAAAA               CTCCC CAAA GGAAG                TTTTTTATGATTATA  89 109
   CLJ_B1149 1173130 .. 1173145 -    -9   -5.7827   AATATAAATAAAAAA              GTCAGG ATTT CCTGAC               TTTTTATTTAGTGTA 100 72
   CLJ_B1145 1168774 .. 1168817 - -13.4  -4.53703   AAAATAAGATTAAAA GAGACTATCTCAGAATAAAT TTAA ATCTATTCTGAGACGGCCTC TTTCTTTTTAATATA 100 81
        gltX 1165646 .. 1165695 -  -4.5  -6.60239   AAAAATAAAAAAAAA TAGAAAAAATAAAATCTCAGCTA TAAT TAGCTGAGATTTTTCTTAGTGTA TATTTATTACAATTT 100 60
      feoA_3 NONE
      feoB_3 NONE
   CLJ_B1125 1149321 .. 1149363 -  -5.1  -4.08042   GCTACGATAAAAATA CACTTAATGAACTAATT CATTTTGCT AAGAAGTTCATTAAGTG TTTTTTTATCTTTGC  61 152
   CLJ_B1114 1134253 .. 1134265 -  -3.5  -2.91681   GTCTAATTGTATACA                TTAAT AAT ATTAA                TTTCAACATAATGTA  43 315
   CLJ_B1113 NONE
   CLJ_B1112 1132554 .. 1132564 -  -2.6  -4.61873   TGCTATAAATCAAAA                 TATT CCA AATA                 AAATAAATCCTATTA  57 9
   CLJ_B1104 1121728 .. 1121759 -   -16  -3.62522   GAAGTCTGTTAATAA      GCTTTAGTGGGAGT AAAA ACTCCCTCTAAAGC       TTAGAAATCTGTTTA 100 73
   CLJ_B1103 NONE
   CLJ_B1102 1119272 .. 1119311 -  -3.6  -5.54907   GCTATAAAATAAAAA  CCCATTGAAAGGCAAATA TTAA TTTTAGTCTTTTAATGGG   CTTAATTTTTTATGT  75 117
   CLJ_B1094 1112223 .. 1112233 -  -5.4  -2.75183   ATTTTTATTGAAGTA                 TGAG GTT CTCA                 TTTCTAAATTCAACT  53 4
   CLJ_B1093 1111214 .. 1111248 -  -5.8  -5.38958   AGTTATAAATAAAAA     GGGAGTTTCAAAATTA GAT TTATTTTGAGACTTCC     TCTTAATTTTATGGT  81 67
   CLJ_B1088 1105457 .. 1105482 -  -6.2  -5.46276   AAGATAGATAAAAAA         GAGAAGGGTA ATATTG TACACTTCTC          TTTTTTTATTTTAAG  85 52
   CLJ_B1079 1098186 .. 1098235 -  -3.2  -6.07374   ATAAAAAATAAAAAA GAATCTATTTTTCAAGTGCTTAGC TTTA GC-AAATACTTGA-AGATAGATTC TTTTTTATTGTTCTT  83 375
   CLJ_B1072 1092173 .. 1092197 -  -5.7  -3.96156   AGACTTAATAAAATA          GGACCTACCAT AAA AAAGTAAGTCC          TTGTTACGTCTCTTA  62 91
   CLJ_B1070 1090223 .. 1090246 -  -9.6   -3.5256   GAAAGAATGTAAAGA          TAAAGGGGCG GTCG CTCCCCTTTA           TTAATCTATATCTAT  83 37
        aspC 1083872 .. 1083923 - -14.9  -3.65314   AATTTATAGATATAA GTACAAGCATAAAGAGATTAGGGT ATATA ACCCTAATCTCTTTATGCT-ATAT TGAAGATGCATTTTA 100 195
   CLJ_B1060 1080415 .. 1080444 - -12.3  -2.57026   TATATTTATATTAAT       TAGGTAGCAAGCT GTTA AGTTTGCTACCTA        GTCCAATTATGAATA  86 90
   CLJ_B1059 1078315 .. 1078346 - -10.3  -4.79223   TGATAGGATTAAAAA      CCGCCAATTAACC CTTAAT AGTTAATTAGCGG       TTGTACTATTTTTAT 100 55
   CLJ_B1042 1059969 .. 1060007 - -14.8  -4.31412   AAATATTTACTAAAA   GAGGGTGTATCAAAATAA ATT TAATTTTGATGCACCCTC   TAAATTTTATACGAT 100 173
   CLJ_B1038 1055660 .. 1055674 -  -4.3  -3.81488   GCTCCTTAAAGATAA               TTTCC AGTGA GGAAA               GACAGGTATAAAAGA  56 92
         add 1048716 .. 1048751 -  -4.1  -5.83226   AATTTAATAAAAAAA    CCTACTTTAAGAATT AAAATA AAAGCTTAAAGCAGG     CTCTTATGAATAATT  83 136
   CLJ_B1034 NONE
   CLJ_B1033 NONE
   CLJ_B1032 NONE
   CLJ_B1031 1044503 .. 1044549 -    -4  -5.33124   AATAAGAAAAGAAAA CAATTATATAATTTCAAAAAAT GGA AATCATTGAAGTTATATAACTG TTTGTCTTTTAGAGA  72 173
   CLJ_B1022 1036565 .. 1036589 -    -6  -5.94214   AAGAGAATAAAAAAA          TTTAATTTTA ATATA TAAAATTAAA          TCTTTTTAGAGATAA  90 58
        gldA NONE
       dhaKL 1033319 .. 1033348 -  -5.8  -5.61881   GGGTAAAAATAAAAA       CCCCAGTAAAAA ATAAGG TGTTTACTGGAG        TTTTTAGGTTAAATT  82 83
   CLJ_B1019 NONE
   CLJ_B1018 NONE
   CLJ_B1017 1029778 .. 1029795 -  -2.1  -4.91657   AATTAAGAAAATAAA             TATCTAT AAAA ATAAATA              GAATACTTTATTTGT  61 373
   CLJ_B0961  982570 ..  982593 -  -2.5  -5.03201   AATAATAAGGAAAAA          GTCTATAAA TAATTG TTTATTGAC           AGTAAGCTATATTTG  62 76
        tipA  981389 ..  981420 -  -6.1  -5.54192   ATTAATCTAAAAAAA      TAGATATATTTGT ATATGA ACTAATATATCTA       TTTTTTTGTGCAATG  85 85
   CLJ_B0950  969240 ..  969268 - -11.8  -5.48054   ATCAAAATTAAAAAA        CCACACTCCAGT TGAAT ACCGAAGTGTGG        TTTAGAAATAAACAG 100 129
   CLJ_B0944  964856 ..  964899 -  -5.4  -3.57619   AAATTTGAAAGAAGA TAGATGCAACTACAATAATT TTAT AAAAACTGTAGCAGCATCTA TTTTTTTAATTAGCT  59 57
   CLJ_B0943  963909 ..  963922 -  -3.9  -3.29211   TAATTGCAAAGCCAA               CAATA GATA TATTG                CTTGAAATAACAAAG  49 481
   CLJ_B0937  960114 ..  960139 -  -2.5   -4.3129   TAGGTATGAGTAAAA         GGAGATAGTTT AATA AAACATTCCCC          TTTTATATTATTGTG  53 33
   CLJ_B0933  957175 ..  957209 - -12.2  -3.54408   GAAAATTAAAATAGA     GTCAGTACACTGAGAA TTA TCCCCAGTGCACTGGC     CATTTATTTGATACT  95 116
      mraY_1  951556 ..  951587 -  -2.2   -5.5074   TAATGTAATAAAAAA      TAGTGGCACCCAAT TTGT AATAGGAGCTACTA       TTTTTTTATTTCTAT  69 132
   CLJ_B0921  947169 ..  947191 -  -2.8  -4.69512   AAAACAGAAAAAGAA          GTATGC-AC TTTTTT GTAGCATAC           TTACCATTAGGAGAG  57 232
   CLJ_B0919  946502 ..  946540 - -11.9  -3.88559   AAGCATGGTTATAAA   GAAGCTGTCTCAAAATA TATTT TATTCTGAGGCAGCCTC   TTGTTTTTTTATAGT 100 63
   CLJ_B0917  944255 ..  944284 - -12.3  -2.70115   TAAATCAAAAGAGAT       GGACCGTTATAGA TTAT TCTATAACGGTCG        TAGAATAGTGGTAGA  88 123
   CLJ_B0915  943065 ..  943100 - -12.2  -2.58491   GATAAATAGGAATAC    TTTTAGTGAAGATTAT TTAT ATATTCTTCACTAAAA     CACTATTAATCATCA  88 31
   CLJ_B0911 NONE
   CLJ_B0910  939105 ..  939143 -  -5.4  -4.91511   ATCTCACCACAAAAA   TGTGGAGATTTAGCCA GGCTAAT TGGATAAATTCCCACA   TTTTTGTGTTTAAGA  75 78
   CLJ_B0908  937191 ..  937236 - -13.8  -2.54574   GATGCTAAGTAATAC CTTCTTATAAAATGTATTCA AAATTA TGAATACACTTTATAAGAAA TCTATACCAAGCTGA 100 77
   CLJ_B0907  936641 ..  936660 -  -6.4  -4.78107   TATCATCACTAAAAA            CCACGATA GAAA TGTCGTGG             TTTTTGATTTAACCT  78 234
   CLJ_B0905  935009 ..  935041 - -10.9  -3.97812   ATAAGTAATATTAAA      TAATCCAAAGATA TCTTAAC TATCTTTGGATTA      TTCATTATTATACTA 100 38
   CLJ_B0902 NONE
   CLJ_B0901  931677 ..  931687 -    -4  -2.73903   AAAATTCCTCCAAAT                 CATT ATT AATG                 TATATAGTAGTGTTT  44 154
        oxdD  930315 ..  930342 - -14.4  -3.79345   AATAATAAGATACAA        CTAGCTTATCAT ACTT ATGATAAGCTAG         TTTTTTATACTGAAA 100 135
   CLJ_B0897  927376 ..  927409 -  -8.4  -4.84527   TTTATAGATGAAAAA     TAAAAAACTCCCTA AATCAA TAGGAAGTTCTTTA      TGTAATCTTATTTAG  88 37
   CLJ_B0896  926097 ..  926115 -  -7.5  -3.67102   TTATATAAATTAGAA             CCATATG ATATA CATATGG             TCTTACAATTATAAT  73 353
   CLJ_B0891  923358 ..  923369 -  -5.8  -4.58283   TAATGTTTTTAAAAA                GGCA ATAA TGCC                 TTTTTAAATTTTACT  71 36
   CLJ_B0890 NONE
   CLJ_B0889  921963 ..  922000 - -10.6  -3.35798   ATGTCTTATGTAGAA   TCAGGATAGCTTTGCC TTGATT GGCTGAGCCATCCTGA    TTTTTTTTACCTTCT  90 159
   CLJ_B0884 NONE
   CLJ_B0883 NONE
   CLJ_B0882  914501 ..  914550 -  -9.3  -3.51934   TTTTCTTTATAAACA GAGGTCTTGGCTTTAGAGGGAGT TTTT ACTCCCACTAAAGCTTAGAAATC GTTATCCAGAGACGT  83 211
   CLJ_B0880  912581 ..  912603 -  -7.1  -4.46854   ATATAAAAGTCAAAA          GGACTA-CCT TATG AGGATAGTCC           TTATTTAACTATTTA  77 34
   CLJ_B0856  888563 ..  888597 -  -8.8  -4.35361   TATAATAAAACTAAA     GGTTGTCTCAAAAT TAAATCT ATTTTGAGACAATC     CTTTTCACAAGATAA  84 54
   CLJ_B0850  881530 ..  881551 -  -5.9  -3.55444   TGTCTATTCTTTAAA           GAGACAC GATATTAG GTGTCTC            TTTGATTCAGCTAAA  63 32
   CLJ_B0842  873275 ..  873287 -  -4.9  -3.34431   AAAATATGCTGATAA                TATAG TTG CTATA                AAGAATGGTAACATA  53 249
   CLJ_B0838  869437 ..  869469 - -11.5  -3.86372   TTAATTTAAATAGAA      GAGGAGCTAACTAAA TGA TTTAATTAGCTCCTT      TTTTATTATATTATG 100 72
   CLJ_B0822  850263 ..  850278 -  -2.6  -4.59591   AACAAAATAGTAAAA              GAAAAA TAAA CTTTTC               CAAGGATTAGTAAGA  57 297
   CLJ_B0813  841921 ..  841934 -  -6.7  -3.53012   TTGGTTTGGGCCAAA               TCCCA GACA TGGGA                ACAGTCATTGTTAAA  65 198
   CLJ_B0801  834093 ..  834118 -  -8.5  -5.04222   CAAGTAAAGGAAAAA         CAAGAACAAAT AATT ATTTATTCTTG          TTTTTATTTAAATAA  91 13
   CLJ_B0800  833275 ..  833301 -  -7.4  -5.54264   AAAGATCTAAAAAAA         GATACCTGTG TGAAAAT CACAAGTATC         TTTATTTTTGACATT  91 129
   CLJ_B0799 NONE
   CLJ_B0798  831864 ..  831909 - -19.5  -3.60587   ATAAAATTTATAGAA GTGCACTCAAAATGCTAG-TTA TTT TAATCTAACATTTTGAGTGCAC TTCATTAATACAAAC 100 68
   CLJ_B0795  829743 ..  829767 -  -4.3   -3.3514   ATGGAGATTTTACAA          CAGTTACAATA AAA TCTGGTAACTG          GCAAAATATTAATGC  53 442
   CLJ_B0793  826474 ..  826492 -  -3.2  -3.70902   TTTTTTAGATTGAAA             TAACTTTA TTG TTAAGTTA             TTTCAATCTAAAATT  50 44
        metC NONE
        luxS NONE
   CLJ_B0790  823739 ..  823770 - -14.6  -2.86619   AGTAAATTTAACAAC      GCTTCAAAGGGAGT TTTT ACTCCCTCTAAAGC       TTAGGAAATGTTTAT 100 178
   CLJ_B0783  815836 ..  815846 -  -3.2  -2.89668   CAATATTCCTACATA                 CCCA GTT TGGA                 ACAAAAAAGTTCATA  43 61
   CLJ_B0779  812959 ..  812987 -  -3.2  -5.29782   TATAGGCATAAAAAA        GAGGACTTAC TGTAATAAG GTAAGTCCTT        GATACATCTTTAAAG  70 299
   CLJ_B0767  800175 ..  800203 -  -5.4  -5.70761   AAAATAAAATAAAAA       CAGTGCCA-GATT ATAT AATGATGGCACTG        TTTTATTAATTTATA  86 45
   CLJ_B0734  765877 ..  765889 -  -7.7  -3.39028   CATAACTTCTAAATA                TGGTG CAT CACCA                AAAGCATTTTTTATT  71 205
   CLJ_B0732  763668 ..  763693 -  -9.1  -6.02919   TTATAAATAAAAAAA         TAAGACCGTCA TTAT TGACTGTCTTA          TTTTTTATAATTTGT 100 43
   CLJ_B0724  754518 ..  754543 -  -9.1  -6.02919   TTATAAATAAAAAAA         TAAGACGGTCA TTAT TGACTGTCTTA          TTTTTTTATAATTTA 100 43
   CLJ_B0723  753972 ..  753998 -  -4.4  -4.33302   ATATAAAGAAAAAGA         TGTAGCACTATT ATT AGCGGTGCTACA         CTTTTTCTTTAACTA  61 21
   CLJ_B0717  745242 ..  745263 - -14.5  -4.09685   TCGCATTTTTGAAAA           GCCTCATGC ACTT GCATGAGGC            TTTATAATTCCTTAA 100 88
   CLJ_B0712  739860 ..  739907 - -13.3  -2.62396   TACTTTTTTATAGTA TGAGTTTTATAATTTTAAAAA ATATAA TATTTAAAATTATAAAACTCA TATATAGAGTATCAA  91 86
   CLJ_B0711  738865 ..  738899 - -10.2  -4.83032   ATATTAAATACAAAA     CTTTAAAGAGAACTGC GCT ACGGTTCTCTTTAAAA     TTTATTATTTACTTT 100 30
   CLJ_B0708  735772 ..  735796 -   -10  -3.60627   TTATTCTAGGGTAAA          GCACCAATCC TTAGG GGATAGGTGC          TTTTTTATTTTTGCC  89 11
   CLJ_B0706  734236 ..  734262 - -13.2  -4.14615   AAAAATGTTTTAAAA         TATCCTGCCTAA TTA TTAGACAGGATA         AAAATTTGTTATTGT 100 14
   CLJ_B0705  733145 ..  733172 -  -9.4  -5.13521   AAACTATTTAAAAAA        TAAAGAACTATT TTAA AATAGTCCTTTA         AAATGATACCTATAT 100 81
        csaA  732638 ..  732662 - -10.1  -3.96156   AGATTTAATAAAATA          GGACTTACTGT GAT AAAGTAAGTCC          TTGCTTCATCTATTG  93 54
         cat  730507 ..  730530 - -12.6  -4.84311   TTTTATATAACAAAA          TTGGAAAGTC ATAA GACTTTCCAA           TTGTTTTCTTTTAAA 100 139
         cfa  725565 ..  725613 -  -6.8   -3.6944   GTCTCAAGATAAACA GAGTTCTTGGCTTCAGAGGGAGT TTTT ACTCCA-CTGAAGCTTAGAAATC GTTATCCAGGGACGT  68 433
   CLJ_B0696 NONE
   CLJ_B0695  721857 ..  721876 -  -2.2  -3.08056   AGTTTCAAAAAATAT            TTTGTTAT AATT ATAACAAT             TTCAAATACACCTTA  40 38
   CLJ_B0694  720529 ..  720550 - -10.1  -3.99806   ATAAGGCATTATAAA           GCCCCATGC ACGA GTATGGGGC            TTGAACAAGCTTAGC  93 105
        clpP  712166 ..  712182 -    -8   -5.1523   GTTATAATATAAAAA              CCTCAG TATAT CTGAGG              TTTTTGGTATTTGTA  93 77
   CLJ_B0682  707121 ..  707155 -    -3  -5.04356   TTAAATAAGTAAAAA     GGTTGTTTCAAAAT AGATTTA ATTTTGAAGTAACC     TTTTTATTTACTTTA  62 100
   CLJ_B0681  705197 ..  705252 - -15.2  -3.99494   TCAATTTAATAATAA CAGGGTTATGTTAAGAAATTATTATA CTAA CATTATATTTTCTTAACATAACCCTA TTTTATATAATATAA 100 256
   CLJ_B0660  682694 ..  682704 -    -4  -3.05384   TCGTTTTTCAGTTAA                 GAAT ATT ATTC                 ATAAATATTTAATCA  46 34
   CLJ_B0656  677669 ..  677718 - -13.3  -4.32857   TGTCCTAAATATAAA TATC-CAAAATCCATGCATTTAAT ATT ATAAAATGCATGGATTTTGCGTTA AAAATATTTTTTGAT 100 60
   CLJ_B0652  675547 ..  675579 -  -8.4  -3.20878   TAATATTTAAGCTAA      CGCTCTAATGCCAC GTCCT GTGGCAACAGAGCT      AAGTAAACGTCCTGT  72 94
   CLJ_B0650  672775 ..  672797 -  -6.4  -4.13767   GTGGCCATGCCAAAA           TTACTATGAA ACA TTCAAAGTAA           TTATTAGGCTAACGG  71 249
   CLJ_B0638  660644 ..  660674 - -10.6  -3.90007   TAAAAATTAAAAAAT       GGGGTATTTCAA GTTTATT TTGAAACACCCC       TTCTTATATTTTTAT  95 115
   CLJ_B0634  656909 ..  656920 -  -5.8  -4.22554   CTACTGAAGAAATAA                CTGC ATCA GCAG                 AGGAACAAGCAGCAG  70 281
   CLJ_B0623  647471 ..  647496 -  -2.7  -3.60035   TATAAATATAAGTAA         GATTTAGTTCT TGTT AAAAATAAATC          TTTGACATGGGTATC  45 3
   CLJ_B0622  646880 ..  646898 -  -6.8  -3.70689   TAAATATATATATAA             GACATACT ATA AGTATATC             CAATATCTTTGTTTA  68 13
   CLJ_B0621 NONE
   CLJ_B0620  645649 ..  645670 -  -4.5  -4.45945   AGTTATGAAGTAAAA           TTAAAACCA GGTA TGGTTATAA            CCAATGAACCAGGTC  67 316
        nadE  639509 ..  639564 -   -22  -3.05715   AAGTGTTTTATTTAA CAAATAGACATAAAAATTATTAAATT CAGT AATTTAATAATTTTTATGTCTATTTA TTATTTAGACTAGTT 100 128
   CLJ_B0611  637257 ..  637273 -  -2.3  -2.56596   GCTTTCATTAATCCA              CCTTCTT TCT AAGAAAA              ATATAACCATATATT  38 1
   CLJ_B0610  636529 ..  636562 - -17.7  -5.38054   TTTTATAAATAAAAA     GACCTTTGCCCTATA TTTA TATAGGACAAAGGTC      TTGCAATCTCTTAAA 100 176
   CLJ_B0608  633626 ..  633637 -    -3  -5.23016   AAACAAGGGAAAAAA                TTTC ATGG GAAA                 TACTTATCTAAAATT  71 189
   CLJ_B0602  626411 ..  626462 -  -7.6  -4.33165   TTAAAGGTATTAAAA CAAGAAATACTTTTAGAGAAAATA GCTA TCTATTGACTAAAAGTATTTCTTG TTTTAATTTTCAACT  78 71
   CLJ_B0600  623701 ..  623711 -  -2.6  -2.61602   TTAATGTATAATTTA                 TTAT ATC ATAA                 TAGAAAAAACAAATA  39 119
   CLJ_B0599  623263 ..  623308 -   -11  -4.41609   TATTAGAAATATAAA GCTATAGGAATAGAT--ATTAA GCTT TTAATTTATCTATTCCTATAGC TTATTTTTATACTTT 100 76
   CLJ_B0597  621292 ..  621308 -  -6.6  -5.59879   TAGAAATAGAAAAAA              TGGATC CATAT GATCCA              TTAAAAAAAACTTGT  90 297
   CLJ_B0595  619380 ..  619396 -  -3.1  -5.59357   AGTATATTAAAAAAA              TCATATA TTT TATATAA              ATATTAATTAAAATA  73 217
   CLJ_B0592  616047 ..  616080 -  -3.1  -4.82162   CATAAGAATATAAAA     GACCACTTGTATGCT TATA AAAAAGCAAGTGGTC      TTTTTTATTATATTA  63 58
   CLJ_B0590  614008 ..  614036 -  -6.3  -3.30658   TTACATTAAAAATTA        TTTATATAACAAT TTA ATTATTATACAAA        GCATGGTAAAATATT  61 70
   CLJ_B0589  613288 ..  613298 -  -2.6  -3.51904   TATTAAACTTAAAGA                 TTTA TAT TAAA                 AAATAATTAGAATAC  45 255
   CLJ_B0581  599512 ..  599541 -  -6.4  -4.21737   AGCAAAAGAAGGAAA       GGCCC-CCAGCAA TTATT TTGCGGGTAGGCC       TTTTATTCATACTAA  73 67
         tpx  596761 ..  596806 - -13.1   -3.9122   TATTCTTTTAAATAA TATTAAAACAGGTATTTCTATA AAT TA-AGGAATACCTGTTTTAATA TATCTCTAAATAAAT 100 52
   CLJ_B0575  593915 ..  593927 -  -3.5  -3.10098   ATCATGTTAAAATTA                TTAAA TAT TTTAA                TCATCCCCCTATAAA  45 129
   CLJ_B0574  592615 ..  592649 - -10.4  -2.93891   ATTTTCAAAATATTA     TAAAATAATTTTGAAA TCA TCTCAAAATTATTTCA     AAAAAAACATTAAAA  85 18
   CLJ_B0573  591971 ..  592009 -  -9.8   -4.3208   TTTTAGAATTTAAAA   GATGGTTCTTCAAAAT GTATTTA ATCTTGAGGAACCATC   TTTTTTAGTTATTAT  95 55
   CLJ_B0562 NONE
   CLJ_B0561  580713 ..  580729 -  -5.2  -4.30719   GTTGGGTATAATAAA              TTTGAG GTTGT CTCAAA              ATAAAATATATTTTG  64 87
   CLJ_B0557  576007 ..  576030 -  -7.5  -3.46888   TATGCATAATAAAAG          GGTGACAAT TACAAT ATTGCCACC           TAAATTTTTCCTACA  70 258
   CLJ_B0555  574385 ..  574401 -  -3.7  -3.57246   ATGATGAACTAAAGA              GAGGT AAAGAAG ACCTC              TTCTTTTCTGATGTA  51 2
   CLJ_B0544 NONE
   CLJ_B0543  561166 ..  561208 - -10.2  -4.46615   TATGATTAACCAAAA TAAAAGTGTGGAGTAA AAATATAAAAA CTACTCCACACTTTTA CTTTATTTAATTTAA 100 32
      thiD_1  544001 ..  544017 -  -3.1  -2.50947   CTTAATTAATAAATT              TTTATTT TCT AAACAAA              TTGCTTCCTTTATTC  42 150
      thiM_1 NONE
        thiE  542442 ..  542465 -  -4.8  -3.33315   TTAACATTGCCAGAA          TAAAAAATAC ACTG ATATTTTTTA           TCTTTGTTATATTAA  55 81
   CLJ_B0520  540971 ..  541010 -  -7.6  -5.47159   GGTGAATATAAAAAA  GTATAAGATAAAAT-TTTA TTA TAAAGATTATATCTTATAC  TTTTTATTTATAAAA 100 60
   CLJ_B0518 NONE
   CLJ_B0517  538064 ..  538080 -  -2.4  -4.70107   TATTAAAATAAGAAA              TATTTT TAGAG AAAATA              TATATCTAGAAAAAT  56 242
   CLJ_B0510  532089 ..  532113 - -10.3  -3.02698   TTATTTTATATAAAT          TTAGATATAAT CTA ATTATATCTAA          GCAGTACCTTCTTTT  85 22
   CLJ_B0504  522806 ..  522824 - -10.4  -5.22312   ATTTATAGTAAAAAA             TGTAGGTT AAA AACCTACA             TTTTTTATTCTTATT 100 266
   CLJ_B0499  516761 ..  516774 -  -2.5   -5.4433   ATATATAAATAAAAA               TTATT TAAG AATAA                GTTATATTATTTTCA  67 170
   CLJ_B0496  514435 ..  514469 -  -7.5  -4.63526   ATAATTATAAACAAA     GAGTTTATTAATA GTATAGTTT TATTAATAAACTC     TTTATTAAATTTGTG  83 87
        panB  509195 ..  509214 -  -6.6  -2.78384   CCCCTGGTTATTAGA            TAAGTATT CTTA AATACTTA             TTACTTTAAGATTTA  61 233
        panC  508238 ..  508249 -  -4.4  -4.72986   TAGTGGGAGTAAAAA                CTTC CTTT GAAG                 TTTAGAACTTTGTTT  66 77
        panD  507584 ..  507594 -  -2.6  -2.78298   TAACTAAATTATAAG                 TTTT AGG AAAA                 TATTAATAAAAACAA  40 41
   CLJ_B0491  507283 ..  507309 - -16.8  -4.43501   AATGGATGCATAAAA         TAAGGAAAGTGC TTA GCACTTTCCTTA         TTGTTCTTCTTTAGG 100 23
   CLJ_B0483  496453 ..  496481 - -13.3  -5.13344   ATATGAATATAAAAA        GGATGTTGGTATA TTT TATTCCAACATCC        TTATTTGCATACAAA 100 63
   CLJ_B0470 NONE
   CLJ_B0469  484956 ..  485007 -    -4  -4.67038   GGTTGAAAATTAAAA CAAGAAATACTTTTAGTCAATAGA TATC TATTTTCTCTAAAAATATTTCTTG TTTTAATACCTTTAA  62 122
   CLJ_B0458  472797 ..  472811 -  -6.4  -2.70525   CTTTTTTAAACCAAG               GGTAGC ATA ACTACC               TTTTAAGTTGTAAAT  60 44
   CLJ_B0457  469451 ..  469507 -   -20  -6.28401   TAAAAAATAAAAAAA GAACAGAGAATGGATAAAAAGGTTTT GGTTA AAAATCTTTTTATCTATTCTCTGTTC TTTCTAATATGTTAT 100 336
   CLJ_B0453  466369 ..  466399 -  -2.7  -5.79595   GTTTAAAAGAAAAAA      GCATACTC-ACACT ATAC AGTGTAAAGTATGT       CATAAAGAGGTGCAG  81 175
   CLJ_B0448  462423 ..  462465 -  -7.8   -5.3472   AAAAAACAAACAAAA GTGTAATAAGAGGAAAGTGC GAT GCACTTTCCTCTTATTGTGG AATTATTCTATTGAA 100 17
   CLJ_B0440  452868 ..  452894 - -18.2  -4.02206   AAGGGAAATACTAAA         GGGCAGATACAA AAA TTGTATCTGCCC         ATGTTTTATAATAAT 100 31
   CLJ_B0438  448649 ..  448668 - -12.2  -5.62219   AATATAGTAAAAAAA            GTGGGAAG TAAA CTTCCCAC             TTTTTTGTTTAATTT 100 34
   CLJ_B0433  434736 ..  434746 -  -2.6  -5.30339   ATTAAAATATAAAAA                 TAAA TTA TTTA                 AAAAAGTTATTTATT  67 32
   CLJ_B0432 NONE
   CLJ_B0431  433566 ..  433593 -   -13  -5.40625   AGAGTATAGAAAAAA        GAGTTAAGTAAA TAAA TTTACTTAACTC         TTTTATTTAATGATC 100 124
   CLJ_B0418  418380 ..  418426 -  -9.2  -4.04319   TTATAAAGGTATAAA TTAACACCTATAAGTTATG GGAAATACTA CA-AACTTATAGGTGTTAA ATTTTAACCATATTT  86 29
   CLJ_B0414  413106 ..  413142 -  -2.4  -5.79595   TTTTAAAATAAAAAA    TAAAGTTGCCTATA AAAATTTAG TAACGGCAACTTTA    TATTAAAATATTATT  73 58
   CLJ_B0413  410191 ..  410241 -   -21  -3.77087   TAGTGAACATTTAAA TAATAAGAAGGTGTTTCAAAATAA AAT CTATTTTGAAACACCTTCTTTTTA GTTTAGATATTTAAA 100 81
   CLJ_B0405  401772 ..  401810 - -17.1  -4.87893   AAGTGTAATTAAAAA   TTCACCTAATTTCTCAC AAGAG GTAAGAAATTAGGTGAA   AACTTATAAATCCAT 100 140
   CLJ_B0404  401082 ..  401126 - -23.9  -4.76123   AAAGCATTAATAAAA TACAGCTTGATGTCCCAAGGC TTT ACATTGGGACATCAAGCTGTA TTTTCTTTTTTACTC 100 3
   CLJ_B0398  392958 ..  393005 -  -3.9  -5.05712   ATAAATAATTAAAAA GATTTCCAAACATT--TGTAAAT ATAA ATTTACTTTAATATTTGGAAATC TTTTATATATAAATA  67 70
   CLJ_B0381 NONE
   CLJ_B0380  375431 ..  375451 -  -5.4  -3.45032   TAATAACAGGTATAA            TGGGAGCT GTAAT AGCTCCTA            TAGTGTGTAAGATAT  57 375
   CLJ_B0368  365384 ..  365422 -    -7  -5.22039   CTTAAAGGTAAAAAA   TTAACGACTTAAAATC TAAAAGC AATTTTCAGTCGTTAA   TTTTTTTATTTATTC  87 31
   CLJ_B0362  358460 ..  358488 - -11.2  -3.04792   GGAGGAGTGGGAATA        GCTGTTGATAAA ATATG CTTATCAACAGC        CTGTGGGATTTAGAT  87 68
   CLJ_B0360  355954 ..  355978 -  -7.2  -3.07506   ATATAATTATATAGA          TAGGAGTGTT ATGTG AGCACTCCTA          CTTTTAGTGAACTTA  64 136
   CLJ_B0348  341006 ..  341042 -    -4  -3.25942   ATTGCCTTATATTAA    TATATTTTCTGC TGGAATATTAGAT GCAGAAAATATA    TTAGATATGAGCTGT  50 462
   CLJ_B0335  329640 ..  329655 -  -6.2  -3.99957   GTAAATATTTAGAAA              GAATCA AAGT TGATTC               AGTTTAATACCCAAA  66 70
   CLJ_B0324 NONE
   CLJ_B0323  317118 ..  317138 -  -6.9  -5.26155   ATATAAATATAAAAA            TAGCAACTT AAA ATGTTGCTA            TTTTTATAAAACTAA  83 37
   CLJ_B0313  307414 ..  307425 -    -3  -3.42809   AATATTATTAACCAA                GTAT TCAT ATAC                 CACCTCATTTAGTTG  44 34
   CLJ_B0312 NONE
    spoVAC_1 NONE
    spoVAD_1 NONE
    spoVAE_1  304429 ..  304458 - -15.1  -2.87051   CTTCCACTATGAAAT       CCCCGACAATACA GAAA TGTGTTGTCGGGG        TTATTTTAGTTAGTA 100 258
   CLJ_B0306  301698 ..  301712 -  -3.6  -3.47868   GGTAAAAAGAATATA               TTCAAC TGG ATTGAA               ATTAGAGATTGAATT  51 180
   CLJ_B0283  275429 ..  275443 -  -3.5  -3.23274   GGTTTTACAACTCAA               CAGGG GTATA CCCTA               ATTCCTTTATCATTG  49 471
   CLJ_B0261  248973 ..  248989 -  -5.3  -2.72434   CTTAATAAAATACAT              TAAATTA GAG TAATTTA              TATTAATATATTATT  53 94
   CLJ_B0260 NONE
   CLJ_B0259  246375 ..  246388 -  -3.9  -5.24531   AGGGCTCAGAAAAAA               TTTTC AATA GAAAA                TTCATGCGTAGCATG  70 347
   CLJ_B0249  235716 ..  235738 -  -6.4  -5.48787   ATAATATATAAAAAA           TAAACAGC ACTAGAG GCTGTTTA           TTTTCTTTTTTTGTG  88 23
        pssA  232792 ..  232807 -    -9  -6.13503   TATTAATAAAAAAAA              TCGTGG GAAA CCACGA               TTTTTTAAAATTTTT 100 30
   CLJ_B0242 NONE
   CLJ_B0241  229425 ..  229437 -  -9.1  -3.33261   ACAGGGACACATTAA                GTCCC TAT GGGAC                TTTTGTTTATTAACT  77 183
         fba  228368 ..  228408 - -13.8  -5.63374   TTAATATCAAAAAAA TAGTAGATAGATTTATTCT TAAC AGAA-AAATCTATCTACTA  TTATATCAAATATTA 100 60
   CLJ_B0238 NONE
   CLJ_B0237 NONE
   CLJ_B0236 NONE
   CLJ_B0235  224115 ..  224133 -  -8.2  -5.86976   TTATAAAATAAAAAA             GAGTCCTT AAG AAGAACTC             TTTTGGCTGCCCATG 100 157
   CLJ_B0233  223274 ..  223303 -  -3.7  -6.14618   TATAAAATAAAAAAA       CCTTCATCTCC-TA ACT TATAGAGACGAAAG       GTTATCCGCGGTACC  86 286
        leuS NONE
   CLJ_B0231  220182 ..  220195 -  -8.1  -2.94412   TTGAAGCTTAAATCA               GCTGC AGAT GCAGC                GTCTAACTTAGACAA  69 307
   CLJ_B0229  218614 ..  218658 - -14.8  -4.06678   ATTTATTCATATAAA TAAAATAAAAATCCTATGGA ACATG TTCATAGGATTTTTATTTTA TTTAGAAATCTAGAT 100 7
   CLJ_B0220  208089 ..  208099 -    -4  -5.72622   CTCATAAAGAAAAAA                 TAGA AGA TCTA                 ACAGGAGAACTAAAG  88 316
   CLJ_B0204  196354 ..  196391 -  -2.1  -3.43676   TATATTCAAAACACA   CCCCTCCTTATATTAAT ATAT ATGAATATAAGGAGTTA    AATATTATTGGATTT  43 30
   CLJ_B0203  195727 ..  195774 - -17.6   -3.2592   ATATAAATGAATACA TAT-AAAATTAAAGCTCATGAGC AAT ACTCATGAGCTTTAATTTTTATA TTAATGTAAAATAAT 100 74
   CLJ_B0184  178582 ..  178629 -  -6.1  -3.74519   AATACTTTTAGTAAA TAGATAACTATAAAAATAA AGAATAATAA TTATTTTTATAGTTATTTA TTTTTTCTATAAGAT  65 161
        rpmE  170404 ..  170441 - -10.3  -5.82036   ATAATAAATAAAAAA   TAA-ATAAAACCTAATCT GAA AGATTAGGTTTTATACTA   TTTAACGTCTTCGTT 100 23
   CLJ_B0165  161355 ..  161379 -  -7.3  -5.15682   AAAAGATAAATAAAA          CTCTGTATT TGAAAAT AATACAGAG          TAATTTTATAACAAA  87 31
   CLJ_B0151  146241 ..  146278 -  -8.7  -4.24623   TTAAATAGATATAAA   CACTATCAAATTATTTT ATTA AATAAAATTTGATAGTG    TTTTCTTTAATTTTA  84 125
   CLJ_B0146  141804 ..  141822 -  -3.3  -5.46276   AAGACATATAAAAAA             TATAATT TTATT AATTATA             TATTTACATTAAAAA  73 88
   CLJ_B0136  124772 ..  124796 -  -7.3  -6.04419   AAAATAATAAAAAAA          TAGCTATTTTT ATT ATAAATAGCTA          AATCATATTAAGTAT 100 23
   CLJ_B0135 NONE
   CLJ_B0134 NONE
   CLJ_B0133  123336 ..  123365 - -10.1  -4.76892   AGATGAAGTGAAAAA       GGATAGAAAGCAA GCTA TAGCTCTCTATCC        TACGATTTAAGCTAT 100 32
   CLJ_B0128  117832 ..  117846 -  -4.4  -4.35874   TAAGACAAGCTAAAA               TAAATT ATG AATTTA               TTTTATTACAATTGA  61 229
   CLJ_B0110   99823 ..   99846 - -11.2  -4.09542   AAACATGTATATAAA          TAAAGAGCTT TTGT AAGCTCTTTA           TTTTAGGCTGTAGAC 100 78
   CLJ_B0103   94576 ..   94586 -  -2.6  -4.20888   CTAATTGAAAAAATA                 TTTT ATT AAAA                 ATTTCTTGATTATAG  53 115
   CLJ_B0101   92858 ..   92874 - -10.9  -5.79526   ATACTTTAAAAAAAA              GTGCAAC AAA GTTGCAC              ATTAAGATATATTTT 100 27
        ispF   92262 ..   92295 -  -9.2  -3.72485   AAATATAAGTTTAAA     TAAGAGTTCA-CTTA TAAAT TAAGATGAACTCTTA     TATTTTTGGTAAATT  84 63
   CLJ_B0097   88876 ..   88909 - -14.9  -4.38141   TTTTATATAAAACAA     CAAAAGTGGAAACTA AAAT TAGTTTCCACTTTTA      GCTTATACAATTAAA 100 68
   CLJ_B0085   79302 ..   79327 - -13.5  -3.81154   AAAATATTTATCAAA         TAAGAGACTAG CTAG CTAGTCTCTTA          TTCTATTTTATTAAA 100 23
   CLJ_B0083 NONE
   CLJ_B0082   76540 ..   76563 - -12.6  -3.53012   GGTGGCGCCTCCAAA          GGAGTTTTAG GATA CTAAAACTCC           TTTTTTAATAATTTA  95 30
   CLJ_B0055 NONE
   CLJ_B0054   47373 ..   47396 - -12.6  -3.78775   CGGTGGATCACCAAA          GCACTTTACA AAAT TGTAAAGTGC           TTTTTATTTTTCAAC  95 204
   CLJ_B0029   27576 ..   27594 -  -5.3  -5.03227   ATAGTATAAATAAAA            GCCCTAAC CTTA GTT-GGGC             TTATTAATATTATTT  75 35
   CLJ_B0028   25819 ..   25832 -  -2.5  -3.27475   TCTTCTATTATAATA               TTTTA TCAT TAAAA                AACCTCTTTCTAAGT  42 123
         psd   24915 ..   24936 - -11.7  -5.40464   CACCATAAATAAAAA           GTCTTTCGA TAAA TCGAAAGAC            TTTTTATTTTCTGCT 100 29
