   HCD_00025 NONE
        panC    4103 ..    4119 +  -6.5  -2.90392   TTTGAACTTCCGTTT              CCACCGT GAA AGGGTGG              TATCCTTGGCCACTA  59 95
   HCD_00045   10393 ..   10415 +  -4.8  -4.31433   GCATATTAAATCTCT           TAACCCCTTT TAA AAAGGGGCAA           TTTATTCTAAGGCTC  64 32
   HCD_00130   26571 ..   26583 +  -4.1  -2.72511   TTGAAACTCCGCTTA                TCTCT TCA AGAGG                CTTTAAAGAAATCGC  45 115
        gltA   29882 ..   29892 +  -6.8  -2.73474   AATAACGCTTTAAGG                 GGGT TAC ACCC                 ATTATGGTTATAAAC  60 116
   HCD_00150   32403 ..   32425 +  -4.8  -4.31433   GCATATTAAATCTCT           TAACCCCTTT TAA AAAGGGGCAA           TTTATTCTAAGGCTC  64 32
   HCD_00155 NONE
   HCD_00160   35282 ..   35294 +  -4.9  -2.66316   ACGCCATTAAAGGTA                TTGTT TTT AACAA                TCGTATAATGGAGCA  49 125
   HCD_00210 NONE
   HCD_00215 NONE
   HCD_00220   48257 ..   48269 +  -3.4   -3.5764   ACTAGAATTATGAAA                TAGG CATAC CCTA                TTTAGAAGTAGCGTT  50 110
   HCD_00300 NONE
   HCD_00305 NONE
        frdB   63179 ..   63194 +    -4   -4.2828   AAGTGGGTAAAAGCC              GCTAAA AACC TTTGGC               TTTTAGTGAATCAAC  61 21
   HCD_00315   64834 ..   64855 +  -7.3  -2.75064   ACCACTCCCTAATCT           CAAAAAGGG TTAC CCCCTTTTG            TAGTTAGCTAGAACA  63 135
        secG NONE
         frr NONE
        pyrE NONE
   HCD_00400   82797 ..   82823 +  -3.8   -3.0173   AACAATAATTTTCTT         TATTTCAGCTAA AGA TTAGCAAAAATA         TGGTTTAATCTGTGT  46 73
   HCD_00405 NONE
   HCD_00410 NONE
   HCD_00415 NONE
   HCD_00420 NONE
   HCD_00425 NONE
   HCD_00430 NONE
   HCD_00435 NONE
   HCD_00440 NONE
   HCD_00445 NONE
   HCD_00450 NONE
   HCD_00455 NONE
   HCD_00460 NONE
   HCD_00465   95380 ..   95396 +  -2.3  -2.66291   TCAAGATAAAAGAGG              TCTCTTA TGT TAATAGA              TAGTATCCATATCTC  39 6
   HCD_00470 NONE
   HCD_00475 NONE
   HCD_00480  100760 ..  100787 + -10.8  -2.71537   ATGCTTAAAAAAGCT        TAACCTTAACTA ATTT TAGTTAGGGTTA         GTTATAATTAGCTAT  82 121
   HCD_00485 NONE
   HCD_00490 NONE
   HCD_00515  105833 ..  105859 +    -6  -4.15044   TAGCATAAGCAAAGA         CAATTTTTGCTA ACA TGACAAAAATTG         TTTCTTAAGGCAAAG  68 53
   HCD_00520 NONE
   HCD_00525 NONE
   HCD_00530 NONE
   HCD_00535  109627 ..  109643 +  -3.7  -3.22877   CTAATTCATCTATTT              TCTTGTA AAA TACAAGC              TTAAATCTTAATTTA  49 126
   HCD_00540  111165 ..  111185 +  -2.7  -2.52152   ATTAGGAAAACAAGC            TTATGAAAA TCT TTTTTATAG            ATAATTTTGATTCTT  40 20
   HCD_00545 NONE
        trpD NONE
   HCD_00555 NONE
   HCD_00560 NONE
        trpA  116151 ..  116171 +  -8.4  -4.05763   TTTGTTTTGATGTTT            TTAGGCTT AGCGA AAGCCTAA            TCTTTTATGTTTTGG  81 95
   HCD_00615 NONE
   HCD_00620 NONE
   HCD_00625  127047 ..  127065 +    -6  -3.71389   TAGTCTAAAATAAAC             TCGCACAA TTT TTGTGCCA             TTGCTTCTTTATTTG  63 187
   HCD_00650  130615 ..  130631 +    -5  -4.20368   ACTAGGAGCTAGTGG              GAGCGG AAAGA CCGCCC              TTTCTATTGAGCTGG  67 56
        miaA  131542 ..  131557 +  -2.6  -5.35365   TGTTGTGGCATCCGC              TTGAAT TTAT GTTCAA               TTTTTGTTATATTTT  72 94
   HCD_00660 NONE
   HCD_00665 NONE
   HCD_00670  133890 ..  133920 +  -4.2  -4.55295   TAATTCCATCAAAAT       TATCATATAAATCA TAC TTATTTTTATGATA       TTTCTTTGTGAGCAA  68 245
   HCD_00715  142732 ..  142742 +  -3.2  -4.88407   ATAACTCTCAAAAAA                 TCCT CTA GGGA                 TTTTTACTTGCATAA  67 104
        ksgA  145228 ..  145257 +  -5.2  -4.03413   CAAGCTCTTAGAGTA       TGTTTTAAAAGG CTAAGT CCTTTTAAAAAA        TTTATGTGAAGGAAT  64 10
   HCD_00735 NONE
   HCD_00740 NONE
   HCD_00745  149687 ..  149698 +    -3  -4.56358   ACGAATAATTGCACG                CTTT TCAT AAAG                 TTTTATATCGCTATA  62 319
   HCD_00755  152357 ..  152369 +  -6.3  -3.54447   AAGCTCTACCATAAA                GCAAA CCT TTTGC                TCTTTGTAAAATCTC  64 253
   HCD_00770 NONE
   HCD_00775 NONE
   HCD_00780 NONE
        smpB NONE
   HCD_00790 NONE
   HCD_00795 NONE
        rpmH NONE
   HCD_00805 NONE
   HCD_00810 NONE
   HCD_00815 NONE
   HCD_00820 NONE
        trmE  165923 ..  165933 +  -2.6  -4.46112   CCCGTAATTTTAAGG                 TTTT TCT AAAA                 TTTGTTTGAATAAAC  58 400
   HCD_00830 NONE
   HCD_00835  168919 ..  168944 +  -7.7  -3.91213   TTTTGCTTCTTTTTC         TTAGTAGAGAG TTTT CTCTCTATTAG          TATTTCTTTCTGATT  76 92
   HCD_00840 NONE
   HCD_00845  173089 ..  173114 + -11.3  -2.77192   TTTTTAATTATGGGT         GGGTGTTCTAA TTTC TTAGAACACTC          CTTCTTAAAACGCTT  85 15
   HCD_00855 NONE
   HCD_00860  175578 ..  175591 +  -2.5  -3.95231   TTCGTTATCATTCTC               TTTTT CTGT AAAAA                TCTTATTTTTTACTT  52 389
   HCD_00890  180784 ..  180810 +  -8.1  -4.60255   GACAGAGATTACTCG         CGCTTGCAT ATGTGCGGC ATGCAAGCG         TTTTTACACAATTCT  85 437
   HCD_00895 NONE
   HCD_00900  182408 ..  182419 +  -2.2  -3.71308   TTTGTTTTGTTTTTA                GGTA TTCT TGCC                 TTGATTGTTTTAATT  49 141
   HCD_00975  197576 ..  197592 +  -4.3  -4.27033   TCGGGGTTATTCTTT              GCTAGGG TTT CCATGGC              TTTGTCTCTCTTTTC  63 187
   HCD_00985 NONE
   HCD_00990  198577 ..  198593 +  -4.3  -4.27033   TCAGGGTTATTTTTT              GCTAGGG TTT CCATGGC              TTTGTCTCTCTTTTC  63 188
   HCD_01000  199248 ..  199263 +  -4.7  -2.69998   GATTCTGAGTTATTA              GATGC TTAAAT GCATC               CTTAATTGATTTAAT  49 112
   HCD_01005  199815 ..  199825 +  -6.8   -3.1994   TTTAGATTAGTCTCT                 GGCA CTT TGCC                 TTGCTGAATGCTATC  61 99
   HCD_01020  202972 ..  202991 +  -9.2  -4.86939   TATTGACGCTTACAT            CTCCGCCC TAAA GGACGGAG             TTTTTCGCTTTGTTG 100 95
   HCD_01025  203890 ..  203900 +  -5.4   -3.6959   AGATTCACCAATCAA                 GAAG TGG CTTC                 TTTAGCTAATAGTGT  59 479
   HCD_01030  204608 ..  204621 +  -2.3  -3.82061   GTTTAAAGCCTTCTA               CAAGC TCAT GCATG                TTATCTTGTGTATAG  49 361
   HCD_01050  210196 ..  210219 +    -9  -3.45527   TTTAGGCTATAACTA          CACCTTTTAA CCCT TTAAAGGGTG           TCTTTAAATGCTTTT  76 16
   HCD_01055 NONE
   HCD_01060  212819 ..  212835 +  -2.3  -2.71791   AAATGAGAATTTTTA              GGTTTAA GTC TTGAATC              CTTTAGAAGAACCCT  39 12
   HCD_01065 NONE
   HCD_01070  215360 ..  215370 +    -4  -3.03124   ACGATTTTTTTGCTT                 GTTA TAA TAAC                 TCTTAAAAACTAAAA  48 87
   HCD_01075  217739 ..  217775 +  -2.6  -5.16132   TGCGGAATAAATTGA    TAAAAATAATATTTTT TAAAT AAAAGCGTTATTTTTA    TTTTATTTTCGTATA  66 41
   HCD_01080  219514 ..  219524 +  -4.6  -3.66178   TCCAGTAGTCTTAAG                 GGGC GTA GCTC                 TTTACCCTTAAAAAA  57 376
   HCD_01110  225974 ..  225986 +  -3.4  -4.96106   GGTGCTTGTGTTTTT                CATG CTCAT CATG                TTTTTCATGTTTATC  70 167
   HCD_01125 NONE
   HCD_01130  229124 ..  229139 +    -4  -3.61398   CATGTTTAAACTAAA              CGC-CAT AAA ATGAGCG              TTATTAAAAAGGAAG  53 424
   HCD_01150  232979 ..  233000 +  -2.3  -4.39107   GAAGAAATGCTGCGA           GCATCTTGA CTAT TTAAGATGA            TTTCTTGGTTATCTT  58 79
   HCD_01160 NONE
   HCD_01165 NONE
   HCD_01195  242041 ..  242060 + -11.4  -3.37685   GCTTTAGTTAGGAAG            CTCCTCGC TTTA GCGAGGGG             TGTTTCACCAATTTT  93 54
   HCD_01255 NONE
   HCD_01260 NONE
   HCD_01265  261125 ..  261138 +  -2.3  -5.30686   CACTCTAATCGTAGC               TCGCT GTGT GGCGG                TTTTTTCTACCTCTT  73 428
   HCD_01320 NONE
   HCD_01325 NONE
   HCD_01330  274031 ..  274051 +  -4.9  -3.15366   GCGTAGTGGCTTTAT            TTATTATAA AAA TTATAGTAA            TATTAGGGTTTTAGA  52 35
   HCD_01335 NONE
   HCD_01340 NONE
   HCD_01345 NONE
   HCD_01350 NONE
   HCD_01355  278347 ..  278359 +  -2.7  -3.49226   TCTCTTCTCAAGTAA                CATAA TGA TTGTG                TCTTCTTATACGCTT  46 26
   HCD_01360 NONE
   HCD_01365 NONE
   HCD_01370  281949 ..  281963 +  -2.8  -5.63517   AGTGTTTTAAAAAAG               CACTTA GAA TAAGAG               TTTTTTGTTTAAACA  76 14
   HCD_01375 NONE
   HCD_01380 NONE
   HCD_01385 NONE
   HCD_01390  284979 ..  284989 +    -4  -4.23853   AGAATACAGCATAAA                 TTGT GCT ACAA                 TTTCTCTCTATTCTT  61 47
   HCD_01395 NONE
   HCD_01400 NONE
   HCD_01405 NONE
   HCD_01410 NONE
   HCD_01415  289172 ..  289188 +  -3.7  -3.25598   ATATCTTACACTTCC              GCTTTAA TGT TTAATGC              TAATTTATTTTAAAG  49 12
   HCD_01420  290317 ..  290327 +    -4  -4.35958   ATTGATTTTAAGGGT                 TGTT TTA AACA                 TTCTTTGTTTGATAA  63 185
        dapF  292153 ..  292163 +    -4  -2.73007   TTTAATTTGACATGG                 GATA TGC TATC                 ATTTAAAAAGCTATT  47 61
   HCD_01435  293043 ..  293059 +  -8.1  -2.55351   CAAGTAAAAAGTAAC              TGAAAAG TTT CTTTTCA              ATTCATCTACGGAAA  65 201
   HCD_01445  294611 ..  294625 +    -5  -3.08046   TGCTTCATTTGTAGC               CATTGT AAA ACGATG               ATTTTAAGCTACAGA  54 79
        rpsU NONE
        fabG  295834 ..  295855 +  -5.2  -2.90075   GGATTTTAGATGTTT           TGGAACAC AAATAA GTGTTTCA            TATAATTACAGGGCA  53 189
        acpP  296221 ..  296235 +  -2.2  -4.13767   GCTAATAGAGTCTAG               TTTTAT ATC ATAAAG               TTTTAAAGTGAGGAG  52 76
   HCD_01465  297493 ..  297509 +  -6.7  -2.56761   ATTTTTAAGAAAGCC              TAGTATT ATA AATACTA              TAAATTAGGATTTTA  60 23
   HCD_01470  298934 ..  298948 +  -2.9  -4.07568   AAAAAATGCCTGATT               TTTAG CTCCC CTAAA               TTTTGAAAACCACGA  55 504
   HCD_01485  303175 ..  303193 +  -2.4  -5.63517   CTTGCACTTAAACTT             TGGATTTT AAA ATAGTCCA             TTTTTTCTTTAGAGA  80 92
   HCD_01510  306224 ..  306247 +  -3.1   -3.5393   TCTTATAAAAATATA          CTAAGCCCT ATAAGA AAGGCTTGG           TTTCCACCCACTAAT  48 45
   HCD_01555 NONE
   HCD_01560  316778 ..  316793 +  -3.3  -3.90744   TGGCATAAAGGCTTA              CTTCA TAATTT TGAAG               TTCTTTAAAAAGGGG  55 252
   HCD_01575  319913 ..  319933 +  -4.1   -2.9621   AGGGGTGCGAAATGC            GTTTTAAAA TCT TTTTAAGGC            TGATTTAAGTATAAT  48 52
        rpmB  320199 ..  320227 +  -5.4  -5.43866   AGATTTGTTGCTTAA        TGATAAGGGCAT GTTTA ATGCTCTTGTTA        TTTTTTTAAAAGTTG  82 55
   HCD_01585  321500 ..  321512 +  -3.3  -4.18197   AAAGAAGTGGATTAT                GTCTC ATT GTGAC                TTTTACATAAACCCT  55 14
   HCD_01625  329926 ..  329936 +    -4  -4.15044   GTGGTAAATCGCTTG                 TGTT TTG AACA                 TTTATTAAAAAGGGG  59 133
   HCD_01630  330365 ..  330377 +  -2.7  -4.33182   GCCAAGGACACCACC                TTGAA GAG TTCAG                TTCTTTTCTCAATAA  55 145
   HCD_01635 NONE
   HCD_01640 NONE
   HCD_01645 NONE
   HCD_01650 NONE
   HCD_01655  335850 ..  335860 +  -2.4  -3.76373   CCTTGACTTTATCAA                 GGAC AAT GCCC                 TTTAAATGTTAGAAG  49 10
   HCD_01660  337057 ..  337073 +  -3.1  -4.72272   CTAGCTTTAAATCTT              TTAAAAA CTC TTTTTGA              TTTTTGCTAGCAACA  67 479
   HCD_01730  348598 ..  348613 +  -4.8  -3.25015   AATCACAAGCGAACT              TTCAAA GCAA TTTGAA               TTGATAGTAGTTGAA  53 90
   HCD_01735  349023 ..  349042 + -11.4  -3.42373   GCTTTAGTTAGGAAG            CTCCTCGC TTTA GCGAGGGG             TGTTTCACATATTTC  85 54
   HCD_01830  363653 ..  363679 +  -4.5  -2.75844   CTTTATGGCGATTGA        GCGG-AATAAAG ACCT CTTTATGACCGC         CTTTGAAATCAAACG  48 477
   HCD_01865  373208 ..  373235 + -12.2  -4.09739   GTCGGTGAGATTAGA        GTCTTGGAGTAA GGTG TTATTCCAAGAC         TTTTAGCAGACTTAG 100 180
   HCD_01870  379349 ..  379365 +  -7.3  -4.21314   CTAAAGTCTCTAAAA              GGGTTCT TCA AGAACTC              TTTTAAGCTCTTCTT  77 37
   HCD_01875  383143 ..  383170 + -12.2  -4.09739   GTCGGTGAGATTAGA        GTCTTGGAGTAA GGTG TTATTCCAAGAC         TTTTAGCAGACTTAG 100 180
   HCD_01890 NONE
        cysS  389248 ..  389271 +  -5.5  -2.94329   AAAAGATTAATCTCG          GTTATAAAT CAATGT ATTTATAAC           ATTTAATTAGAGATG  56 129
   HCD_01900  393374 ..  393390 +  -3.7  -4.27316   CAAATTTAGGGATGA              GATATAG TTT CTAAATC              TTTTACATTCCAACA  60 12
   HCD_01905 NONE
   HCD_01910 NONE
   HCD_01915 NONE
   HCD_01920  399250 ..  399267 +  -7.1  -3.37685   TTACAAATAAAAGCT             TATCCTT TTAA AAGGATA              TATTTGGAGAGTTTT  66 106
   HCD_01925 NONE
   HCD_01930  402647 ..  402669 +  -6.4  -3.24256   CTAGTAGGTAATTTA           CTTAAAGGAA TAA TTCTTTTAGG           CTTATTTTTCACACT  61 225
   HCD_01960  405634 ..  405653 +  -9.2  -4.86939   TATTGACGCTTACAT            CTCCGCCC TAAA GGACGGAG             TTTTTCGCTTTGTTG 100 95
   HCD_01975 NONE
   HCD_01980  410488 ..  410501 +  -3.1  -4.55295   TTTATCTTTAATTAG               TTCCT TAAA AGGAG                TTTATTTATGGAAAC  62 60
   HCD_01985 NONE
   HCD_01990 NONE
   HCD_01995 NONE
   HCD_02000  414731 ..  414762 +  -9.6  -4.28774   AATTTAGAGAGCAAA      CCATCTAGAGAAGTT GCT ACCTTC-CTAGATGG      TTTTAACTTCCCTAG  91 184
   HCD_02005 NONE
   HCD_02010  418263 ..  418287 +  -7.2   -5.1971   GGGTTTATGGCTATG         CGTTCTAAGCC TTTA GGCTTAG-GCG          TTTTTAGTTTTTACT  86 18
   HCD_02035 NONE
   HCD_02040  424179 ..  424191 +  -4.9  -3.39497   AGAGTGTTTATTTTC                CAAAT CAA ATTTG                ATTTTGTCCTTTTGG  55 380
        pyrG NONE
   HCD_02095 NONE
   HCD_02100  440012 ..  440023 +    -3   -3.3039   GTTATGCGATTTTCT                TAAG AAGT CTTA                 TTCAATTAGTTTTTA  47 58
   HCD_02105 NONE
   HCD_02110  442261 ..  442297 +  -2.3  -5.10461   CCTGCACGCACTTAA   TGAGTCCAAACGCCCA TCTTTT TGGGCGATTTG-CTTA    TTTTTCTTGCCTAAA  69 157
   HCD_02140 NONE
        lpxK  447615 ..  447636 +    -3  -4.92314   TTTTAAAATAGCTCC           CCCCTT AGTTTTTAAA AAGGGG            TTTTTATAAATTCCT  68 192
   HCD_02170  451081 ..  451097 +  -4.3  -3.33922   TTCTAGCCTTAAGTG              CGGTGTC TGT GTCATCG              GTTTTTAAAAGCACT  53 90
   HCD_02180 NONE
         gmk NONE
   HCD_02190 NONE
        argS NONE
   HCD_02200  456745 ..  456770 + -11.3  -3.96148   TGCATAAGAAATAAA         TTAGAGAGAGT CCTA GCTCTCTCTAA          TTTATCCTAAAAAAC 100 27
   HCD_02210  458949 ..  458968 +  -9.2  -2.50816   AATTTTAGTGAAACA            CCCCTCGC TAAA GCGAGGAG             CTTCCTAACTAAAGC  73 503
   HCD_02220  460842 ..  460861 +  -9.2  -4.86939   TATTGACGCTTACAT            CTCCGCCC TAAA GGACGGAG             TTTTTCGCTTTGTTG 100 95
   HCD_02225 NONE
   HCD_02230  461807 ..  461826 +    -8  -2.98479   GTAGAGAAGTTAATC            TTAGCTAA TGTC TTAGCTAA             TATGGTATTTGCTAA  67 126
   HCD_02245 NONE
   HCD_02250  463233 ..  463271 +   -12  -2.97475   AAGACACAAGGAAAA   GGGAGTTAAAAACAAA ATCGTTG TTTGTTCTTAACTCCC   CTTTCTACTAGGGAA  90 400
         tgt  487233 ..  487243 +  -3.2  -3.90048   TTTCTTTTTATAAAT                 CTCA GGA TGGG                 TGTTTTTAAAACGCC  54 43
   HCD_02415  506959 ..  506978 +  -9.2  -4.86939   TATTGACGCTTACAT            CTCCGCCC TAAA GGACGGAG             TTTTTCGCTTTGTTG 100 95
   HCD_02430  509313 ..  509323 +  -2.6  -4.69464   AATAACAACAAGTAG                 TAAT TAC ATTA                 TTTTTAAGGTGTTTT  62 139
   HCD_02480  520621 ..  520636 +  -4.8  -3.25015   AATCACAAGCGAACT              TTCAAA GCAA TTTGAA               TTGATAGTAGTTGAA  53 90
   HCD_02485  521046 ..  521065 + -11.4  -3.40775   GCTTTAGTTAGGAAG            CTCCTCGC TTTA GCGAGGGG             TGTTTCACTGAAAAT  93 54
   HCD_02490 NONE
   HCD_02495 NONE
   HCD_02515  527519 ..  527531 +  -6.9  -3.21593   GTGTTGCGTTAAAAA                GCCCT AAA GGGGC                TATTATCCGCAAATC  62 29
   HCD_02525  529541 ..  529553 +  -4.9  -3.72242   CGTCAAATCTTGCAT                GAAAA TTC TTTTC                TTCTAATTTCTTTAA  59 459
   HCD_02590 NONE
   HCD_02595  544040 ..  544056 +  -7.9  -3.46509   GAGTGCCAAAAAAAA              GGGGGGG TAA CCCTCTC              TTAATCTTATTAAAA  71 169
        pheS NONE
        pheT NONE
   HCD_02650 NONE
        ispH  558916 ..  558938 +  -2.9  -2.85176   ATTCTAAGCAAATTT          G-GTATTTTT CTTA AAAAATACAC           TAAATTTTGGTTTTT  41 34
        rpsA NONE
   HCD_02665 NONE
   HCD_02670 NONE
   HCD_02675 NONE
   HCD_02680 NONE
   HCD_02685 NONE
   HCD_02690  566995 ..  567013 +  -3.2  -3.22094   AGAATGCTTAATTTT             TTTCACAA ACA TTGTAAAA             TACTTTTATCTCAAA  47 30
   HCD_02695 NONE
   HCD_02700  570212 ..  570224 +  -3.5  -2.61728   TGTTCAAAGATATTA                TTTTT TTT AAAAA                GTTAATATTAAACAT  44 276
   HCD_02705 NONE
        ureB  572696 ..  572722 +  -8.1  -2.68942   CTTCTAAAAAAAGAC         TCCCTTAAGGA TATTT TTCTTAGGGGA         ATTATATAAAAACCT  68 34
   HCD_02725 NONE
   HCD_02730  577246 ..  577256 +  -4.6   -3.5393   ACTCACCCATAAAAA                 CCCT TAA GGGG                 TTTAAAACAAATAAT  55 19
   HCD_02765 NONE
   HCD_02770  589376 ..  589390 +  -5.6  -3.14564   CATGCGCTTTTAAAC               CCACAG CGG CGGTGG               TTACTAAAAAAGTCA  55 135
   HCD_02785  592945 ..  592958 +  -5.2  -4.10164   CCCGCTAATTTTTAA               CCCC ACTTAA GGGG                TTTATATAGTGCTAA  64 33
   HCD_02805 NONE
   HCD_02810  598779 ..  598798 +  -9.2  -2.50816   AAGGATAGTGAAACA            CCCCTCGC TAAA GCGAGGAG             CTTCCTAACTAAAGC  73 480
   HCD_02825  600672 ..  600691 +  -9.2  -4.86939   TATTGACGCTTACAT            CTCCGCCC TAAA GGACGGAG             TTTTTCGCTTTGTTG 100 95
   HCD_02830  603019 ..  603047 +  -9.7   -4.9218   CTTTTATTATAAGAT        TTTAAAAAACGCC TCT GGCGTTTTTTATG        TTTTTCTAATCAATG 100 221
   HCD_02915  625580 ..  625593 +  -5.3  -3.14963   GGGAAGACACAATAA               TTAGC TTGG GCTAA                TTAGCTGATTATAAA  54 22
   HCD_02930  627120 ..  627140 +  -7.7  -4.50193   CTAATGGTTGTCTCT            TGTAAAAGC CTA GCTTTTATA            TTTTGCTTCATTAAT  82 280
   HCD_02980  639490 ..  639509 +  -9.2  -4.86939   TATTGACGCTTACAT            CTCCGCCC TAAA GGACGGAG             TTTTTCGCTTTGTTG 100 95
   HCD_03030  652001 ..  652011 +  -2.6  -3.02946   GTTAGGCGATATTCT                 TTTT AGG AAAA                 CTTTATGATTAGAGC  42 7
   HCD_03035 NONE
   HCD_03040  653908 ..  653923 +  -4.6  -3.72695   TATGCGATTAAGTAA              GGGGCT AACA AACCCC               TTTGCTACAGAAAGT  59 261
   HCD_03060 NONE
        fliR NONE
   HCD_03070  659299 ..  659320 +  -2.5  -3.62644   TCCTAATTCTTACAC           TTATA-CATT CAA AATGATATAA           TTATGTGATTCTGAA  48 59
        prfB NONE
   HCD_03080  661243 ..  661262 +  -4.4  -2.59686   TTCTTTTGGAGCTAA            GTAATTTT GAAT AAAATTGC             TGAATTGCTCTCTCC  46 22
   HCD_03085 NONE
   HCD_03090 NONE
   HCD_03095  663343 ..  663358 +    -4  -5.63236   AAGAGCCTAAAGAGT              GCTAAG TCTT TTTAGC               TTTTTGTTTTTAGGT  82 21
   HCD_03100 NONE
   HCD_03105 NONE
   HCD_03110 NONE
   HCD_03115  667604 ..  667624 +  -2.5  -3.90118   TCTTTAAATGGCAAC            CTCTTTTGA AAC TCGCGAGAG            CTTTTTTTAAATCTT  52 390
   HCD_03125  669783 ..  669806 +    -9   -3.2827   CTTTTGCATGTGAAA          GGCTT-TTAGC AAT GCTAATAAGCC          TTGATGCTTCACTGC  71 293
   HCD_03170  676946 ..  676962 +  -2.9  -2.71712   AAAAATAACATAATG              CCTACCA TTT TAGTGGG              GTTTAAGACAAAGAC  41 347
   HCD_03220 NONE
   HCD_03225 NONE
   HCD_03230  685337 ..  685347 +    -4  -3.68244   AAACTCAAAATAAGC                 CTAA GCC TTAG                 TTTAAACTTGCTGGT  53 28
   HCD_03245  689635 ..  689654 +  -4.2  -2.82668   TGCATTTTTATGACT            TCTTAGCC TTAA GGCTCGGA             CTTTAACATTTAAGG  47 0
   HCD_03250  691109 ..  691128 +  -2.2  -3.11208   CAACATTTAGAAGGG            GTTATTTA TGAG TAAAGAAC             TGATTTTAAATCGCA  42 11
   HCD_03255 NONE
   HCD_03260  692292 ..  692304 +  -3.4  -3.98236   TATAACAAAGCAAAA                CCTT ATTTA AAGG                TTTATAATCCAATTT  54 205
   HCD_03265  692710 ..  692721 +    -3  -2.78776   AAAGAAATAACGCTT                TTTC AAAT GAAA                 GTCTTTTCAAGCCTT  43 31
   HCD_03270  693374 ..  693386 +  -4.1   -3.4574   AAAGGATTACTACTA                TATGC TCG GCATG                CTTTTTCATAATAAA  50 401
   HCD_03305  699570 ..  699586 +  -9.5  -4.49389   AGAAACACATTCAAA              CGCTTTT TTA AAAAGCG              TTTTGCTTATAGCCT 100 66
   HCD_03350  706681 ..  706696 +  -2.6   -3.8802   ACAAGGCATTTCTTA              GTATTT TATA AGATAC               TTTGGGTTGTGTTTT  52 78
   HCD_03390 NONE
   HCD_03395 NONE
   HCD_03400  717379 ..  717401 +  -6.3  -3.53224   TGCGTATTGGTGGGG           GCTACACTT GGTAA AAGGGTAGC           TTTCCACACCAGCTA  63 12
   HCD_03405 NONE
   HCD_03435 NONE
   HCD_03440  725540 ..  725553 +  -6.7  -3.48593   TACCACTCTTTTAAC               GCCAT TTTA ATGGC                TTCTATCACACAATC  65 66
   HCD_03455 NONE
   HCD_03460  732317 ..  732328 +    -3  -3.19602   GTTTGATTTAGGGTT                TTTG TAAC CAAA                 TATTACTCTAAAGAA  45 30
   HCD_03465  734096 ..  734111 +  -3.3  -5.79595   TTTTTAAGGGCGTTT              TAACC CATTTT GGTTA               TTTTTTCTTTTAAAG  83 102
   HCD_03470  736306 ..  736329 +  -2.5  -5.25803   TTTCTTCTTGAAAAA          CGCTTTT AACTTCTACA AAAAGCG           TTTTTTCTAAGCGTT  74 442
   HCD_03485  741112 ..  741152 +  -7.8  -2.60392   AAACCTTCTATACTC  TTGTGGCTAGAAAACATT CACTA AATCTTTTTTAGCCCCAA  CTTGATTAAGGGCTA  65 2
   HCD_03490  742007 ..  742017 +    -4  -3.95475   TTGCTTAAAACTTCT                 CTTT TTA AAAG                 TATTTGTTTTAAATA  57 73
   HCD_03500  743668 ..  743700 +  -8.6  -3.79866   ATGCTTGTATTGGGT     CT-AGGTTGGGTG TCTCTCTC CACCCAACCTAAG      TATTTGTATTTGTAA  80 85
   HCD_03505 NONE
   HCD_03510  745731 ..  745753 +  -5.6  -4.26938   GCTATCTCATCTAGA           CTGACACTTT TTA AAAGTGTGGG           TTCTTATTTTATGGA  70 94
   HCD_03515 NONE
   HCD_03520 NONE
   HCD_03525 NONE
   HCD_03530 NONE
        rplM NONE
        rpsI  751642 ..  751658 +  -6.5  -3.37727   AATCTCTTCCAAAGG              GAGGGCT TTA GGCTCTC              TTACTCTCTATATTA  61 39
   HCD_03545  754276 ..  754287 +    -3  -4.33274   TCATTATCGTAGGTA                TCAT TGAG ATGA                 TTTTCATGCTCTAAA  57 476
        glmM NONE
        lspA  760562 ..  760593 +    -3  -2.73483   CGCGTAGCTCAGTTG      GTAGAGCACTACCTT GAC ATGGTAGTGGTC-GC      TGGTTCAAGTCCAGT  43 67
   HCD_03580 NONE
        ureB  763324 ..  763366 +  -5.7  -5.58051   CCTTAAATCTTAGTT TTAGCTCTCTAAATTTTTG TTTAT CAAAGCCTTAGAGAGCTTA TTTTGTTTTTTATTT  88 65
   HCD_03590 NONE
        ureE NONE
   HCD_03600 NONE
   HCD_03605 NONE
   HCD_03610  766989 ..  766999 +  -2.6   -5.0133   ATCCTTTTGTTTTGC                 TAAA TTT TTTA                 TTTTTTAAAAAACTA  66 264
   HCD_03620 NONE
   HCD_03625  769291 ..  769301 +  -3.2  -4.41616   AAAAGCTTGAATGAA                 GGTT AAA AGCC                 TTTGTTTGAGCCACT  60 52
   HCD_03630 NONE
   HCD_03635  774565 ..  774584 +  -4.4  -3.41073   AAAACATTAAAATGC            CTAAAGTA AGCT TATTTTAG             TCTTTAAATACCCTC  52 31
   HCD_03640 NONE
   HCD_03645 NONE
   HCD_03650 NONE
   HCD_03665 NONE
   HCD_03670 NONE
   HCD_03675  782577 ..  782594 +  -7.1  -3.18264   AGTTGCGAATACACC             GAATACA TGCT TGTATTC              TTAGTCGCTCCCCCA  63 387
   HCD_03710  788676 ..  788692 +  -5.1  -3.53174   AAAGCTCTTCAGCTT              GCCCT AAAAGAA AGGGC              TGTTTGTAAAAGTAT  57 19
   HCD_03715 NONE
   HCD_03720 NONE
   HCD_03725 NONE
   HCD_03730 NONE
   HCD_03735 NONE
        engB NONE
   HCD_03745 NONE
   HCD_03750  795543 ..  795555 +  -4.1  -2.90615   AGCGTCTGTAAGCTT                TGCTT GCA AGGCA                TAATTTCCCGGCACT  46 202
   HCD_03765 NONE
        flgB  799957 ..  799968 +    -3  -3.97368   GAATTACGCAATTGA                TTCT AGCA AGAA                 TTTATAAGTTAAGGA  54 7
        flgC NONE
        fliE  800999 ..  801015 +  -5.9  -4.21812   GCTGTGTTGTTTTTT              TGACTTT TAA AGAGTCA              TTGTTTTGAATACCA  70 109
   HCD_03790 NONE
   HCD_03795  804710 ..  804720 +    -4  -2.88822   GAGGTAAGGTAAAAT                 TAGT TTA ACTA                 TAATTATGTCAACAA  47 224
   HCD_03800 NONE
   HCD_03805  806610 ..  806620 +  -5.4  -4.56597   TTAACTCAAACTGCT                 TGCA CCA TGCA                 TTTTTGACAAGCCCG  70 45
        rpsB NONE
         tsf NONE
   HCD_03905  829869 ..  829886 +  -2.7  -4.95806   AAAAACAACCTATCG             CTTAGAT GATT GTCTAGG              TTTTTGTAATGGTTT  64 391
   HCD_03920 NONE
   HCD_03925  831991 ..  832013 +  -2.1  -3.21276   CGCACCCTACTATTT           CTATTTTTA CTTCT TTAAAATAG           TGTTCTAAAACACGC  43 274
   HCD_04085  848935 ..  848949 +  -5.8  -3.10057   TGTTAAATCCATTTT               GATATA ATC TATATC               TATATCTATATCTAT  57 19
   HCD_04090  850194 ..  850204 +    -4  -4.22346   TTTTTTCTTCTAAAA                 GAAA GCG TTTC                 TTTTGAGTGAGTTTC  61 445
   HCD_04110 NONE
   HCD_04115 NONE
   HCD_04120 NONE
   HCD_04125 NONE
   HCD_04130  862188 ..  862198 +  -5.4  -3.07242   TAAAAGTCTGAATAC                 TTGC CTT GCAA                 TCTGTGATTATTATA  53 252
   HCD_04145  864151 ..  864162 +  -4.4  -2.79452   AGTAAATTTTAAAGC                GCTA AACT TAGC                 ATTCTATTAAGGAGT  47 360
   HCD_04150  867149 ..  867172 +  -3.9  -2.99325   TTAGTAAAAAATATA          GATGAGTAT AGATGA ATACCCATC           GTTTAATTGTAGGCA  46 11
   HCD_04155 NONE
   HCD_04160  868553 ..  868573 +    -4  -3.27146   ACTATGAGAAAAAAT            CTCTCAAA CTCTT TTTGGGGG            TGTATTTAGGCTCTT  50 34
   HCD_04165 NONE
   HCD_04170 NONE
   HCD_04175  872350 ..  872360 +  -2.6  -2.73701   AGGGTTTAAGGCTTA                 TTTT AAA AAAA                 CTTGATTTAATAGAG  41 32
   HCD_04180 NONE
   HCD_04185 NONE
   HCD_04190 NONE
        ubiA NONE
   HCD_04200 NONE
   HCD_04205 NONE
   HCD_04210 NONE
   HCD_04215 NONE
   HCD_04220  880264 ..  880275 +  -4.4  -2.73903   ATGCACATGAAAATG                GCTT AAAA AAGC                 ATTTAAAAGGGTTTT  47 20
   HCD_04225  880581 ..  880609 +  -8.3  -5.08601   AATGACTTTGCCTTG        CATTTAAAGGTTA AGA TAGCCTTAAAATG        TTTTTGTTAGAATCA  93 70
   HCD_04230 NONE
   HCD_04235 NONE
   HCD_04240  883244 ..  883256 +  -3.3  -3.07895   ACAAAAATTGAATAA                GCCCT ATT AAGGC                TATATTAAAAATGGG  45 75
   HCD_04245  884682 ..  884694 +  -4.9  -2.53831   GCTGAGATAAAGCAG                CATTT TTG AAATG                GCTTGTTTTTGCACG  49 66
   HCD_04250 NONE
   HCD_04255  886527 ..  886539 +    -2  -2.70268   TTTGAAATTAGCCCC                TTCA AAGCA TGAA                ACTTTTTGATTACGC  39 42
   HCD_04260 NONE
   HCD_04265 NONE
         pgk  889530 ..  889541 +    -3  -2.65774   CGTCATTAACTCTTT                CAAT AAGG ATTG                 CTTATGGTGAATGTG  42 32
   HCD_04275  890493 ..  890506 +  -4.5  -3.83262   TATTTTAAGAAAAAA               GGCTG GCTA TAGCC                TTGTTATGGAGTTTC  59 14
   HCD_04280  891575 ..  891585 +  -5.4  -4.62085   AATTATCGCTCAACT                 GAGT TAA ACTC                 TTATTTTTTCAAGCT  70 348
   HCD_04400 NONE
   HCD_04405 NONE
        murE NONE
   HCD_04415  920486 ..  920515 +  -4.4  -4.67038   TTTTAAATAATTTTT       TAAGGGTTTTTT AGATAG GATAAACCCTTA        TTTTAATTTTAAAGG  65 35
   HCD_04420 NONE
   HCD_04425 NONE
   HCD_04430 NONE
   HCD_04435  923016 ..  923035 +  -3.7  -3.11072   AAAAACTCAATACAA            GATTATA AACAAA TATAATC             TATCTCTTGAATCCA  47 18
   HCD_04440  924296 ..  924312 +  -2.4  -3.73144   ATCCTTGTTTTGGAT              TAAAAT CTTTC ATTTTA              TTGTATTCATAGTAT  49 23
   HCD_04445  926183 ..  926213 +  -5.6   -2.8028   AAAGCGCTTGAGTAT       CCCTAAATAAAAAT AAA ACTTTTATTTAGGA       TAGTGTATTGCTTTT  55 48
   HCD_04450  928650 ..  928663 +  -2.5  -4.37092   TAAAATAGATAGTGT               TTTTA ATTA TAAAA                TTTTCTAAACACAAT  58 33
   HCD_04470  931871 ..  931884 +  -5.3  -4.83169   TTATAGACTTTTTTA               GCATT GCTA AATGC                TTTTTCTAACAAACT  75 194
   HCD_04495  938295 ..  938325 +  -9.8  -3.06302   GCTTACCTTATGAAG       TGATTGAGCGTTAG TCT CTAAGGCTCAATCC       TTGACTGGGCATAAT  78 12
   HCD_04505 NONE
   HCD_04510 NONE
   HCD_04515  941175 ..  941199 +    -3  -2.64872   TTTTTTTCATATTTT          CTTAATTTTT AAAAC AAAATTTAAG          GTATTATTAAATAGA  42 67
   HCD_04520  943900 ..  943915 +  -6.2  -4.77165   TTCTAATTTGCAAAA              GAAATC TTAA GATTTC               TTTTATTCTCACGCA  78 35
   HCD_04525 NONE
   HCD_04530 NONE
        nusA  946725 ..  946738 +  -5.3  -3.65046   TTAAGAGTTAAAATT               GTTTC ATGT GAAAC                TTATTAAAATCAAAA  59 30
   HCD_04540  947886 ..  947902 +  -2.2  -5.22943   TTTTTAGCGTATTTA              TGCTCT AAAAA AGTGCA              TTTTTTAAATTTGAT  68 272
   HCD_04580 NONE
   HCD_04585  958339 ..  958349 +  -2.6  -4.41548   TTTTGAAGCTCTAAA                 TTTT TTA AAAA                 TTTTCTAAACTCTAC  60 380
   HCD_04615 NONE
   HCD_04620 NONE
   HCD_04625 NONE
   HCD_04630 NONE
   HCD_04635 NONE
        thyX NONE
   HCD_04645 NONE
   HCD_04650  969104 ..  969119 +  -4.8  -4.57474   ACTGATTTGTATAGG              TGAAAA ATTT TTTTCA               TTTTGTATGGCTTGC  71 449
   HCD_04665 NONE
   HCD_04670  977180 ..  977194 +  -2.8  -2.79327   AAATCAGCTACATGA               GAGATT TTT AATCGC               ATTTAGATACAATCA  41 15
   HCD_04675  978520 ..  978533 +  -5.3  -3.76224   ATCAAAATAATTGAG               CAAGA CTTC TCTTG                TTTCATAACTCAAAA  61 284
   HCD_04705 NONE
   HCD_04710  982588 ..  982610 +   -10  -3.71649   AAGCCCCCTTGAGTT           GGCTTTGTTT TAA AAATAAAGCC           TTTAAGCTTTAGCCC  86 13
   HCD_04735  987735 ..  987756 +  -6.6  -2.73635   AATTATGTTTTCACT           TTCTAGGG CATACC CCCTAGAG            CTTTAGCACGCTTTC  60 20
   HCD_04760 NONE
   HCD_04765  996853 ..  996867 +  -7.2  -4.08394   GTAAAAAAAGAAAAA               CGATTT TTC AAATCG               TTTTCACACCCCTAT  75 72
   HCD_04775 1000953 .. 1000989 + -17.7   -3.8482   TTTAGAATTTGCTAA    TAAAACTCAAAAACCTT AAA AGGGTTTTTGAGTTTTA    TTTGGCTTGATTTTA 100 228
   HCD_04810 1012018 .. 1012035 +  -2.7   -3.6654   GACGCTAGTGGCAAC             GCTTGAG CTAA TTTAAGC              CTTTTTTAAGATTTG  48 20
        fabZ NONE
   HCD_04820 NONE
        clpX NONE
   HCD_04830 NONE
   HCD_04835 1016969 .. 1016979 +    -4  -2.87132   AGGCGTTACATCAAA                 GTAT TTT ATAC                 TATCTCAAAGAAAGA  47 334
   HCD_04865 1024722 .. 1024734 +  -3.3  -3.46336   TTGTCCGCTTGCCAC                GCCAT ACA AAGGC                TCTTTAAATTCCACT  48 460
   HCD_04875 1026959 .. 1026972 +  -6.7  -3.91897   TAGGGCTAGTTCTAG               CTCGT TAAA ACGAG                TTTGTGCGTCCAAAA  68 349
   HCD_04890 NONE
   HCD_04895 NONE
   HCD_04900 1029687 .. 1029708 +  -8.8    -4.946   TAAGTTAATTCTAGC           CAAGAGAG CTAAAA CTCTCTTG            TTTTTAGTCTTTAGT  93 176
   HCD_04920 1033516 .. 1033529 +  -6.7   -2.9581   TTTCTTATGGTTTGA               GCTTG GCTA CAAGC                TGTCATTAATGGTTT  61 3
   HCD_04925 1034554 .. 1034570 +  -4.4  -3.35522   CATCAATCATTAAGC             CGCC-TG AATA CATGGCG              TGTTTAAAAAACTTG  53 148
   HCD_04935 1036344 .. 1036354 +    -4  -3.36569   TTTTCTATTATCTTT                 TCTA AAT TAGA                 TGTTTAAAAGGTTGG  50 8
   HCD_04940 NONE
   HCD_04945 NONE
   HCD_04950 NONE
   HCD_04955 1039424 .. 1039444 +  -5.5  -3.56568   TAAAAGGAGCGTTTT            TTTGAAGGA TAG TCATTCAAA            TCTTTATGCGTGTGC  58 227
        dnaE NONE
   HCD_04975 1046151 .. 1046167 +  -2.3  -2.77148   TGACACAAAAAGGAA              GAATAAA TTT TATATTC              TAGTGTCTTAATCGC  40 211
   HCD_04980 1050829 .. 1050841 +  -6.3  -2.57344   AAAATCTCAGAGTAG                CGATT AAA AATCG                GTTATAAGCCGAGTG  57 19
   HCD_04985 NONE
   HCD_04990 NONE
   HCD_04995 NONE
   HCD_05000 NONE
   HCD_05005 NONE
   HCD_05010 1054968 .. 1054997 +  -5.1  -2.83846   GTGATTTAAAAGGAG       TTAGAGAGAGTAA GGAG TAAATCTCTCTAA        TGAGTTTTGTATGTA  52 32
   HCD_05015 1056111 .. 1056127 +  -8.1  -5.73563   AAAAAAGCAATATAA              CCATTTT TTT AAAATGG              TTTTTTTGCTTTAAT 100 39
   HCD_05020 NONE
   HCD_05025 NONE
   HCD_05030 1058383 .. 1058401 +    -6  -4.55887   CACTTTGCTTTTTTA             TGGCATGT TTA ACATGGCA             TTTATATTTTTAAAG  73 104
   HCD_05035 NONE
   HCD_05040 1059361 .. 1059374 +  -2.5  -3.60818   CCTACTAATAGAATG               TAAAT GGCT ATTTA                TTTAAACGCTTTTAA  48 23
   HCD_05045 1059684 .. 1059703 +  -9.4  -2.62024   GGAGTTATTGACAAT            TTGTAGCT AATT AGCTACAA             TACATTATGATAATC  73 40
   HCD_05050 NONE
   HCD_05055 1060358 .. 1060373 +    -4  -3.78329   AGCATTTGCTAGTGC              CATGAG TTCG TTCATG               TTTAGCTTAGTAAAA  54 61
        flhA 1064321 .. 1064331 +  -2.6  -2.84325   TAGGCACAATACACA                 TTAA CTT TTAA                 TCATATTTAAGGAAA  41 15
   HCD_05075 1065759 .. 1065774 +  -6.2  -3.06312   TAAATGATTTTCTCT              TCATCA GGAC TGATGA               TTAAATCCCCAATTT  56 388
   HCD_05095 1068835 .. 1068865 +  -2.1  -4.66318   ATTACACTAAATTAT       CTAATTAAATA CAATTATAT TATTTGATTAG       TTTTATTGAAATAAT  58 173
   HCD_05110 1071527 .. 1071546 + -11.4   -3.4096   GCTTTAGTTAGGAAG            CTCCTCGC TTTA GCGAGGGG             TGTTTCACCTATCTT  85 54
   HCD_05160 1080588 .. 1080607 +  -9.2  -4.86939   TATTGACGCTTACAT            CTCCGCCC TAAA GGACGGAG             TTTTTCGCTTTGTTG 100 95
   HCD_05170 1082626 .. 1082657 +    -9  -3.43651   TTCTATTCTGTATTG      TTTTCTTAAAAATC TAAA GAATTTTAAGAAAA       TTCCTTAAGTTCTTT  76 81
   HCD_05180 1085515 .. 1085537 + -10.8   -3.8721   ATTAAAGTCTTTTTT           TAAAGAAATC TAA GATTTCTTTA           TGTTTATTTGGTGTG  95 23
   HCD_05190 1087525 .. 1087544 +  -9.2  -4.86939   TATTGACGCTTACAT            CTCCGCCC TAAA GGACGGAG             TTTTTCGCTTTGTTG 100 95
   HCD_05195 1089124 .. 1089143 +  -2.8  -3.36452   AGACAACAAAGAAGA            GTGTGTTA CTAA TGGCACGC             TTAATATTAAACGCT  45 275
   HCD_05200 1089803 .. 1089829 +    -6  -4.52345   GCTGTGCTTTGATAG         GGGTTAAAAG TTTTTGC TTTTTAACCC         TTTATTTCATGCTGT  73 233
        glmU NONE
   HCD_05215 1094534 .. 1094556 +    -2  -2.96321   GAGTCCTTTAAAAAC           CCTTAAACAC CCT GTATTTAAGC           TAATCTTTTGCTAAC  41 72
   HCD_05220 NONE
   HCD_05225 NONE
   HCD_05230 NONE
   HCD_05235 1098761 .. 1098773 +  -3.5  -4.36508   TTTGAAATGGCTAGG                TTTTT GTA AAAAA                TTCTTGTTTTTATGG  62 17
        ligA 1128419 .. 1128440 +  -4.6  -3.25551   CCTTTAAAAATATGG           GTTTAAAA AACAAA TTTTAAAC            ATTTAATTTTTATTT  53 34
   HCD_05375 NONE
   HCD_05380 NONE
   HCD_05385 NONE
   HCD_05390 1131310 .. 1131326 +  -4.3  -2.72991   TGACACAGCACAACA              GTCGCCG GTG TGGCGAA              TACTTGGGGGTATGG  47 38
   HCD_05395 NONE
   HCD_05400 NONE
   HCD_05405 1135220 .. 1135231 +  -2.2  -3.64703   AGATATTAGGGTTTC                TCGC ATCA GTGA                 TTTGAATAAAACGCA  49 92
         rho NONE
   HCD_05440 1141422 .. 1141433 +  -4.4  -2.67439   CTTATCATTTTTAAT                CTCT ACAT AGAG                 CTCTTTCCTAGAATT  47 262
   HCD_05475 1149178 .. 1149192 +  -2.9   -3.1733   AAACATTTAAAAAAC               TCAAA TAATT TTTGA               TAATTTTCTAAACAA  43 136
   HCD_05480 1149788 .. 1149801 +  -9.5  -3.40371   GTAACCGCTTGTCTT               CGCCC ACAT GGGCG                TTGATTCGTGAAGTG  79 170
   HCD_05485 1151283 .. 1151297 +  -2.1  -3.42985   AATCATAGCCATAAT               TGAGT TTCGC ACTCG               TTGTCCATGTGTTGT  45 507
   HCD_05540 1170922 .. 1170934 +  -3.5  -2.54523   TTCATTTTTAGCGAT                TTTTT AAG AAAAA                TACATTAAGATATAA  44 65
   HCD_05545 1172637 .. 1172654 +  -2.7  -5.14965   GTTTAGGCTCTAAGC             TTAAGCG TAAA TGCTTGA              TTTTTTCATGCAAGT  70 319
   HCD_05560 NONE
   HCD_05565 1177889 .. 1177906 +  -4.9  -3.41991   GAGCGTGCTAAGGAA             TGAGTGA GTAT TCACTTA              ATTATTTTTATTTAA  55 19
   HCD_05570 1179950 .. 1179964 +  -2.8  -5.16206   GTCCGTATGTATTTA               TAGTCT CAA AGGCTG               TTTTTATGTTCCTTT  70 151
   HCD_05680 NONE
   HCD_05685 NONE
   HCD_05690 1206615 .. 1206629 +  -5.7  -3.06183   ATGAGCAGCTTTTGG               GGCTA GGACA TAGCC               TTGAGTGCCAATGCC  53 287
   HCD_05700 1208325 .. 1208338 +  -3.9  -3.96327   CCCATATCATTCCCA               TTTTC GCAT GAAAA                TTTATAATAACCCAT  56 467
   HCD_05720 NONE
        murC NONE
   HCD_05730 NONE
   HCD_05735 NONE
   HCD_05785 NONE
   HCD_05790 1232011 .. 1232025 +  -2.8  -3.95448   ATTACGGCGTTTTAA               TCCTTT TAA ACAGGA               TTTACATTTTAGTGT  52 26
   HCD_05795 1232489 .. 1232508 +  -3.6  -4.92783   AAAGTAGGGTTTTTG            GGCTTA GCCCCCCA TAAGCC             TTTTTATACTCAGTT  68 255
   HCD_05825 1237456 .. 1237470 +  -2.2  -3.32698   CATAGTATTCAAGCT               TTAAAT CTA ATTTGA               TATTGTATCGGCTAG  45 274
   HCD_05850 1245680 .. 1245692 +  -4.8  -2.65306   CATCAGGGCTCATCA                CAGG GCTTG CCTG                ATTGATATATTGTTT  49 172
   HCD_05875 NONE
   HCD_05880 NONE
   HCD_05885 1261159 .. 1261171 +  -4.1  -4.04752   TTACAGGAAACATTG                GCATG CGT TATGC                TTTCTAATATGATTT  59 6
        recR NONE
        truD NONE
   HCD_05905 NONE
        folE NONE
   HCD_05915 NONE
        surE NONE
   HCD_05925 NONE
   HCD_05930 NONE
   HCD_05935 1268763 .. 1268775 +  -3.5  -3.32984   GATAGCCTCTTCTCT                TTTTT CAT AAAAA                TCTTCTAAATTTTCC  48 202
        gltX NONE
   HCD_05970 1278250 .. 1278263 +  -3.1  -4.98616   TCTATACATTCTAAA               GCTGA ACTT TTAGC                TTTTTAATATTTTAG  66 27
   HCD_05975 1279855 .. 1279890 +    -2   -2.6342   CAAAGTCCATTAGTT    TGCTTGTATTGTAA GTGTTATG TTAAAATACACGCA     TGCGTTAATTTAAAC  39 56
   HCD_05980 NONE
   HCD_05985 NONE
   HCD_05990 1283646 .. 1283660 +  -5.8  -4.20768   CACCATAAAGTTACT               TTCATT TAA AATGAA               TTCTTTCTTAAAAAT  70 17
   HCD_05995 NONE
   HCD_06000 NONE
   HCD_06005 NONE
   HCD_06010 NONE
   HCD_06015 1287490 .. 1287503 +  -3.9  -4.53636   TCTTTTAGAAACATC               GTTAA ATTA TTAAC                TTTTCATTATATAAT  64 161
   HCD_06020 NONE
   HCD_06025 NONE
   HCD_06030 NONE
   HCD_06035 NONE
   HCD_06040 1293725 .. 1293736 +  -5.8  -3.65199   ACCATTGTTGTAGAT                GGTG GAAC CACC                 TTTAAGTAAAGACTT  62 5
   HCD_06045 NONE
   HCD_06050 1294932 .. 1294942 +    -4  -3.10905   TTTTCATCATCATCT                 CTTT GAG AAAG                 TTACCTAAATTATCA  49 49
   HCD_06055 NONE
   HCD_06060 NONE
       ispDF 1299146 .. 1299166 +  -4.1  -2.62184   GCTATAGGAAAACGA            TTTGAAAAT TTT ATTATCAAA            TGCTATAAAGGAAAA  46 21
   HCD_06070 1300073 .. 1300096 +  -6.8  -4.82901   TAAATACAATTTACC          CCGCAAATAA AATT TTATTTGGGG           TTTTTATCCCACACA  80 16
   HCD_06075 1301439 .. 1301455 +  -3.7  -3.39772   TATAAAAACCCATTC              CGAAATT AAA AATTCCG              TATTTAAAAGTTTGG  50 392
   HCD_06085 NONE
   HCD_06090 NONE
   HCD_06095 1305067 .. 1305083 +  -5.3  -3.56325   TAGTTTTCATCTCAT              TATTATA TGT TATAATA              TTGTCGTTATGAAAA  59 102
   HCD_06100 1305619 .. 1305654 +  -4.2  -3.41693   TTTAAGGACTTCATT    CAAGTTAAAACGCTTGA GTT TTAGG-GCTTTAACTTG    TTCATTGCTCATGCG  53 63
   HCD_06185 1319051 .. 1319070 +  -9.2  -4.86939   TATTGACGCTTACAT            CTCCGCCC TAAA GGACGGAG             TTTTTCGCTTTGTTG 100 95
   HCD_06190 1321439 .. 1321457 +  -4.5  -2.90992   GCTTTGTAACATTCT             CGCATGC CTGTT GCATGCC             TAATTTACAACCCTT  48 503
   HCD_06255 NONE
   HCD_06260 NONE
   HCD_06265 1335339 .. 1335355 +  -5.9  -3.35046   AGAGTCCTAAAGGCA              CGATTTT TTT AGAATCG              TATTTCAAAAAATAG  59 329
   HCD_06275 1338280 .. 1338292 +  -2.7  -5.08011   CCATTCTAGCTTGAG                TAAGT GAT ACTTG                TTTTTTAGGCATTTT  70 305
   HCD_06295 NONE
   HCD_06300 NONE
        queA NONE
        gidB NONE
   HCD_06315 1343206 .. 1343220 +  -5.8  -3.23572   TATTTTTAATGCAAA               TATTCT AAA AGAATA               TATTCTACCCTAGAT  59 46
   HCD_06320 1343797 .. 1343813 +  -6.5   -2.8805   AAGGTGCAAGCTTTC              GAGGGTT CGA ATCCCTC              TCTCTCCGCCATAGT  58 133
   HCD_06330 NONE
        prmA NONE
   HCD_06340 NONE
   HCD_06345 NONE
   HCD_06350 NONE
   HCD_06355 NONE
   HCD_06360 NONE
   HCD_06365 1351777 .. 1351790 +  -2.5  -2.63579   TTAATTTTCAAGGAA               TTTTA ATGC TAAAA                ACTTTTGATTTTCAT  40 93
   HCD_06370 1353071 .. 1353082 +    -3  -4.37711   TTTGTAGTAGAATAT                CTTA AGCG TAAG                 TTTTAGATTTGATAA  60 169
   HCD_06375 NONE
   HCD_06380 1353984 .. 1353996 +  -4.9  -5.57396   TTGCCTTTATAAAAT                TCTAT GCG ATAGA                TTTTTTCTTGCTTAT  88 198
   HCD_06390 1356299 .. 1356328 +  -4.2  -3.80189   CCACACTCACTTTAA       TCGCACTACTTG ATAGGG CGAGAAGAGCGA        TTTCACTTGCTGTAT  57 393
   HCD_06400 1358326 .. 1358336 +  -3.2  -4.34557   ATGGTGTCTATTTTT                 TGCA AAA TGCG                 TTTGATTTTTCGCTT  59 441
   HCD_06430 NONE
   HCD_06435 NONE
   HCD_06440 NONE
   HCD_06445 NONE
   HCD_06450 NONE
   HCD_06455 NONE
   HCD_06460 NONE
   HCD_06465 1374921 .. 1374950 +  -7.9  -2.65993   CAACAAACTCGCCAC       TAGAGCGTAGCAA CCCT TTTCTACGCTCCA        TACTCTGCATATCCT  65 16
   HCD_06520 1384641 .. 1384664 +  -5.4  -3.75506   TTCTAGCTAGTAGTT          CTTATATGAG TTAT CTTATATGAG           TTATTAGTAAGTTCT  61 62
   HCD_06525 1388069 .. 1388090 +  -6.7  -3.52358   CTTAAAATAAAAAAC           GCTTTAAAA TGCC TTTTAGAGC            TTAAATTTTTCTTAA  65 278
   HCD_06530 NONE
   HCD_06535 1390151 .. 1390180 +  -5.2  -4.75219   AGACAAATAGCATAA       CATTAGATAGTT TTTATT GATTATCTAATG        TTTTATTAATAATTA  72 96
   HCD_06570 NONE
   HCD_06575 1399621 .. 1399634 +  -3.9   -4.2204   AAACTATAAGGGGGT               TTTTC TAAT GAAAA                TTCTTTATTAAAATT  60 183
   HCD_06585 1404103 .. 1404133 +  -4.8  -3.38072   AGCATCATAAAAGGC       GTATTCTTCTTTGA GTT TTAAGGCAGAATGC       TTAATCTTACCTAAG  55 258
   HCD_06620 1410924 .. 1410940 +  -2.2  -4.08692   CAACTAGCCTAGAAA              TCACTC TTTAT GCGTGA              TTTTAAGCAAGATTA  52 9
        flgD NONE
        flgE 1413822 .. 1413836 +  -2.8  -3.04144   AGAAACTGATAAAAA               GGCTTT TTT AAAGAC               TATTAAAGATAAAGA  42 205
   HCD_06650 1415346 .. 1415365 +    -5  -2.94158   TTGTTGAATTAAAAA            CGCTTATT GATA AAAAAGCG             ATTGTATTCTTTGAT  53 91
   HCD_06655 1415942 .. 1415952 +    -4  -5.86976   AAGTAATTTTATAAG                 CAAA CTT TTTG                 TTTTTTCTTTTATCA  89 50
   HCD_06675 1419313 .. 1419323 +    -4  -4.56775   TGAATGAAGTAAAAA                 TCTT TTA AAGA                 TTTTTACCCACCCCT  65 38
   HCD_06710 NONE
   HCD_06715 NONE
        gatC 1433801 .. 1433819 +  -3.2  -3.39668   ACAGAGTATTTAATA             TCAAGT CAAAAAC ACTTGA             TTCTACCATTTAAAA  48 48
   HCD_06725 1434589 .. 1434599 +    -4  -2.80344   CTAAAAACAAGAAAG                 CTTA ATT TAAG                 GTTATTGAGTGCAAA  47 21
   HCD_06730 1435250 .. 1435260 +  -2.6  -2.86308   CCCGTTTCGTTTTTT                 TTTT TGT AAAA                 TACTCTCTTTATTGT  41 44
   HCD_06735 NONE
   HCD_06740 1436662 .. 1436703 +  -8.1    -3.395   CTTTTTTGAGCGTTG GGTTTTTGAGCATGTCTTC TAAA GCATGCGTGCTTAAAAACC  GTTTTGCTTTTAAGC  70 92
   HCD_06805 NONE
         ddl NONE
   HCD_06815 NONE
   HCD_06820 NONE
   HCD_06825 1452938 .. 1452952 +    -5  -4.21908   TTAGAAAGGGAGCTT               CATTGA AAA TCAGTG               TTTTAAGTCCTAGTG  67 20
   HCD_06830 1454116 .. 1454139 +  -4.6  -2.71731   TTTCTAGTATGCCAA          GCATTATCAT AAAA GTGATAAAGC           TACTTCCGCCATAAC  47 198
   HCD_06840 NONE
   HCD_06845 NONE
   HCD_06850 NONE
   HCD_06855 NONE
   HCD_06860 NONE
   HCD_06865 1461574 .. 1461589 +  -3.2  -3.84271   CAATTAAATAGTAGC              GGGCTA CTTC TAGCAC               TTCTTCATCTTGTGA  55 316
   HCD_06920 NONE
   HCD_06925 1472787 .. 1472802 +  -4.8  -3.19668   TTAGTTGATGCAGTG              TTTATG GAGT CATAAA               TTGGCTTGAATAATA  52 11
   HCD_06945 NONE
        flhB 1478944 .. 1478957 +  -5.3  -4.07568   AACGCAAAAAACAAA               GGATT TTTA AATCC                TTTTAAAAGCACAAA  64 6
   HCD_06960 1482741 .. 1482754 +  -3.9  -3.07622   CATAACTAGCTAGTT               TGTTT TCAA AAACA                TTCACTAGAATATCT  47 337
   HCD_07015 NONE
   HCD_07020 1497476 .. 1497488 +  -3.4  -2.99057   TAACCATCAAGGACT                GTGT ATATG ACAC                TGATTATCTTTACAA  44 89
   HCD_07025 1498879 .. 1498894 +    -4  -3.31915   AAATTTTTTGTTTAG              GGCAGAA AGT TTC-GCC              TAGTTTTTATGAGAG  50 106
   HCD_07040 1499975 .. 1499992 +  -7.1  -3.59698   CAAAGCTAAACTAAT             TTTGGAA ACCA TTCCAAA              TTCTGTGTCAAGTAA  69 27
   HCD_07090 1507333 .. 1507349 +  -5.1  -3.21034   TACAACCAATAAAGA              GCCTATT AGT GATGGGC              GTTTTAATATAGATG  54 207
   HCD_07115 1511576 .. 1511607 +  -3.8  -4.70879   AAAAGCCCTTGAGAA      GTTTCATGCATT AAAATAAA GATGCGTGAGAC       TTTTTAAAATTTAGC  66 7
   HCD_07125 1515461 .. 1515478 +  -6.3  -4.47707   GCGTATTAAAACAAT             TAAGAGC TACG GCTCTTG              TTGTTTTTGATAGCG  74 32
        flgL 1531050 .. 1531067 +  -8.5  -3.33922   ATGAGATAATTTCAA             CCAATTG TTTT CAATTGG              ATTTTTAAAGGAGCT  72 268
   HCD_07205 1533022 .. 1533044 +  -6.3  -3.43756   CTTAACAACCTTGTA           TTGAAACGC AAAAA GCGATTCAA           ATTTTTCATGCAATG  63 507
   HCD_07255 1543919 .. 1543931 +  -7.7  -3.94846   CTTTGGCTAGAATTA                TAGGC TAA GCCTA                TTTGCATTTTAATAC  74 423
   HCD_07405 NONE
   HCD_07410 1573524 .. 1573536 +  -3.5  -5.25906   TTTTTTCGGTATCTC                TATTT TGT AAATA                TTTTTATTGCTTTAT  73 141
   HCD_07420 1575121 .. 1575131 +  -2.6  -3.54414   ATTTTTAGCGTGCTT                 TTAT TGT ATAA                 TCTTTGCTTAAAAAT  48 120
   HCD_07425 1577031 .. 1577047 +  -3.8  -4.10161   TTATTAAAGGCGTTG              TGATTT GTTAA AAATCA              TTTTGAAAAATGCTC  57 23
   HCD_07430 1578197 .. 1578207 +    -4  -3.72784   AATAAATTTGCAGAT                 TAGA ACA TCTA                 TTGATTTGTTATAGA  55 36
   HCD_07435 1579168 .. 1579180 +  -4.7  -4.07568   GGCTTTAATATGAGA                GAGCG TTA CGCCC                TTTTCCAAACACGAA  63 194
   HCD_07455 1583124 .. 1583143 +  -9.2  -2.50816   ATTGATAGTGAAACA            CCCCTCGC TAAA GCGAGGAG             CTTCCTAACTAAAGC  73 230
   HCD_07465 1585017 .. 1585036 +  -9.2  -4.86939   TATTGACGCTTACAT            CTCCGCCC TAAA GGACGGAG             TTTTTCGCTTTGTTG 100 95
         dcd 1592145 .. 1592161 +  -8.1  -2.79796   AACTTTTTATACTCC              CTTAAGA TTT TCTTAAG              TATAATCAAATGAGA  68 360
   HCD_07510 1593168 .. 1593186 +  -3.8   -4.5442   AAACACTTGCCTTGG             GGTAAGCT TTT AGCATATC             TTTTGTGCTTGAAAA  66 373
        hemH 1595200 .. 1595212 +  -2.7  -4.08692   TCAAGGATTAGATTG                TTAGG ATA CTTAA                TTTTCAAACAAATTA  53 88
   HCD_07530 NONE
   HCD_07535 1598792 .. 1598802 +  -5.4  -3.30903   GAAGATTCTAGGACT                 GAAG AAA CTTC                 TTCTAAACCCCTTTT  56 86
   HCD_07540 1602089 .. 1602110 +  -5.1  -3.07132   TATAGTTTAAAATAC           TCCTCACTA GACA TAGGGGGGA            TAATTTCTCTAACTA  52 488
   HCD_07580 1608021 .. 1608037 + -10.9  -2.65264   ATTTGCCTATTTCTT              CGCTAAG TTG CTTAGCG              TAATCTAAGTCATCC  78 328
   HCD_07690 NONE
        hemD 1631878 .. 1631888 +  -2.6  -3.05522   ACTACACTACTCTTG                 TTTA TTT TAAA                 GTTTTAAAAGGATTA  43 50
   HCD_07700 1632302 .. 1632323 +  -3.8  -3.38378   AGGCTTAAATTAAGA           GCATTTAA AAAGGC TTGAATGC            CTTTTTAGGCTATAG  50 28
   HCD_07710 1633767 .. 1633796 +  -9.5  -3.40175   AAGAAGTAAACTCTC       TTAAAATAGTGCC ATTT GGTGCTATTTTAA        TCTCTTTTAAACCAT  79 32
   HCD_07715 NONE
   HCD_07720 NONE
   HCD_07725 NONE
   HCD_07730 NONE
   HCD_07735 1638003 .. 1638015 +  -3.4  -2.98472   TTTACAACCAAAAAG                GCTT ACCAA AAGC                ATGTTTTTAATCGCC  44 83
   HCD_07755 NONE
   HCD_07760 1643653 .. 1643663 +  -2.6  -5.25803   AACGGCTGGTTATTT                 TATT ATA AATA                 TTTTTTATGGGGGTT  69 177
   HCD_07765 1645132 .. 1645142 +    -4  -4.59251   GATAGCTTGATTTAT                 CAAA GGC TTTG                 TTTAATTTTTTTTGA  66 478
   HCD_07775 1646528 .. 1646547 +  -9.2  -4.86939   TATTGACGCTTACAT            CTCCGCCC TAAA GGACGGAG             TTTTTCGCTTTGTTG 100 95
   HCD_07780 1649513 .. 1649531 +    -4  -5.92399   TTTTGTTTGTGATTT             TAAAAAAG CGT TTTTTTTA             TTTTTTCTTTTATTC  89 245
   HCD_07785 1649771 .. 1649789 +    -4  -5.92399   TTTGTTTTGTGATTT             TAAAAAAG CGT TTTTTTTA             TTTTTTCTTTTATTC  89 29
   HCD_07795 1652009 .. 1652028 +  -9.2  -4.86939   TATTGACGCTTACAT            CTCCGCCC TAAA GGACGGAG             TTTTTCGCTTTGTTG 100 95
   HCD_07815 1656932 .. 1656945 +  -3.1  -3.53343   ATTTTTAGATAGGCG               GATGC GTTA GTATC                TTTAAACAAAGGATT  48 86
   HCD_07820 NONE
   HCD_07825 1658325 .. 1658349 + -10.8  -4.06502   TAGCTAATCAAAGTT          CCCTTAAGCT CAAAA AGCTTAGGGG          TTTCCTTTAAAAGTG 100 418
   HCD_07850 1665858 .. 1665877 + -11.4  -3.48657   GCTTTAGTTAGGAAG            CTCCTCGC TTTA GCGAGGGG             TGTTTCACTGTTTAA  87 54
        valS NONE
   HCD_07870 1671469 .. 1671491 +  -3.4  -4.85918   GTTAGGTTAAATTGA           GCCTTTAAGG ATA TTTTAGGGGC           TTTTGTTGTATAATC  66 36
        rpsP NONE
   HCD_07880 NONE
        rimM 1672663 .. 1672674 +  -2.2  -2.79291   TTGTAACGCTAAAAT                GCTT TTAA AGGC                 TAGTTAGTGAAATTT  40 7
        trmD NONE
        rplS 1673767 .. 1673787 +  -5.5  -2.70543   AAGTAGTTCTTGGTT            CTACAAAAA TAT TTTTAGTAG            TAATATATAGGGTTT  54 35
   HCD_07900 1674372 .. 1674395 +  -6.8  -3.30418   TTATTTTTTTTATCT          TTCAAGGTTT TTAT GAGCCTTGAA           TATCTTTAATAACTA  64 54
   HCD_07905 1675728 .. 1675743 +  -5.4  -3.53761   TAGATAAGTTTTAAA              GAGTGT TGAA GCACTC               TTTAAAAAAGGCTTA  57 38
   HCD_07910 1677814 .. 1677828 +  -5.8  -5.28826   TCAATTATGGCTGGG               TGTTTT AAA AAAACA               TTTTTTGTGGAATTT  81 18
   HCD_07915 1680580 .. 1680593 +  -3.1  -3.45592   TTTTAAAATTTAGGG               CGTTA AGTT TAGCG                TGTTTGGTGGGACTT  48 113
   HCD_07945 1685517 .. 1685536 +  -9.2  -4.86939   TATTGACGCTTACAT            CTCCGCCC TAAA GGACGGAG             TTTTTCGCTTTGTTG 100 95
   HCD_07975 1691688 .. 1691700 +  -2.7  -4.69048   AAGCTATCCCTTTTA                TGCAA GCT TTGTA                TTTGTTTGGTTTTGT  62 120
   HCD_07980 1692960 .. 1692985 +  -6.9  -3.92178   GACCCCCCCCCCTTG         CTCTAGTTCTT TTTT AAGAGCTTGAG          TTTGATTAAGATGCT  71 48
   HCD_07990 1695662 .. 1695686 + -10.3   -2.9621   CTAATTGAATATGAT          TATCTATAATT AAA AATTATAGATA          TAGTTTACATATGCT  79 33
   HCD_08000 NONE
        porD NONE
        porA NONE
   HCD_08015 1699814 .. 1699836 + -12.8  -3.52177   AAGCTAATTTTAAAG           GCAAGGTGCT TTT AGCACTTTGC           TTACCTTTTTTAACC 100 47
   HCD_08020 NONE
   HCD_08025 1702844 .. 1702856 +  -3.5  -5.07652   TGGAGTAATGTTGCA                TATTT TTA AAATA                TTTTCTTTTAACACA  73 231
   HCD_08040 NONE
   HCD_08045 NONE
   HCD_08050 NONE
   HCD_08055 1710495 .. 1710506 +    -3  -3.48506   TTCTCTTTAAAATAA                TAAG TTGC CTTA                 TCTTTAATGACTTCT  48 317
   HCD_08060 NONE
   HCD_08065 NONE
   HCD_08070 1712122 .. 1712135 +  -5.2  -4.99312   TTTGTAACTCTTGCA               CGCC TTGTGT GGCG                TTTTGTTGTTGTGTT  76 435
   HCD_08095 1716477 .. 1716496 + -11.4  -3.36341   GCTTTAGTTAGGAAG            CTCCTCGC TTTA GCGAGGGG             TGTTTCACAGCTATT  85 54
   HCD_08110 NONE
   HCD_08125 NONE
   HCD_08130 NONE
   HCD_08135 NONE
   HCD_08140 NONE
        minC NONE
        lpxC 1727903 .. 1727917 +  -7.2  -3.42147   CAAAGAAGTTGCGTT               GCAAAA GGC TTTTGC               TTAATCTTAATTAAG  68 7
   HCD_08155 NONE
   HCD_08160 1729411 .. 1729422 +    -3  -3.27704   AGGATTCGTCAATCT                CAAA AGGA TTTG                 TTGCGTTTGAAGAGT  47 69
   HCD_08165 1729599 .. 1729616 +  -2.7  -2.70525   GATTAAGGAGAGAAG             CATAGCA TGAG TGGTATG              GTTGATTTAAAAGAA  40 16
        infB NONE
        rbfA NONE
   HCD_08180 1733611 .. 1733633 +  -4.3  -4.77567   AATCTCTTATCTCGC          CAAATC-CTA TAAG TAGTGATTTG           TTTTATTCTAGCAAT  68 417
   HCD_08235 NONE
   HCD_08240 1740822 .. 1740832 +  -2.6  -3.71148   CTTTTTAAAATCAAA                 TTAA GAC TTAA                 TTATCATTTTGGTGT  50 22
   HCD_08245 1742505 .. 1742518 +  -5.3   -4.0641   AGCTTAGTAGCTTTT               TAGCT AACA AGCTA                TTTCTATGGATGGGG  64 297
   HCD_08255 1743851 .. 1743862 +  -7.2  -3.09516   CCCTAAAGGACAGAC                GGGG TCGC CCCC                 TTAAATCATAGGGGA  65 3
   HCD_08260 1745172 .. 1745182 +  -2.6  -3.14564   AATATTTCAAGCTCT                 TATT AAA AATA                 TTGATAAAGGAATAA  43 20
   HCD_08265 1746313 .. 1746336 +  -8.4  -2.63112   CATGCTATTAAAATT          TCATTTAAAA CTAT TTTTAAATGA           TGATGTCAAGGATTT  68 157
   HCD_08270 1746588 .. 1746600 +  -2.7  -2.81832   CAGGATGGCGATTTG                TAAGC CTT GTTTA                ATTGCTTTCTTGATG  41 23
   HCD_08275 1748131 .. 1748176 +  -4.9  -2.78715   ATCTAGGAGTAAACA TTGTTCTTTTTAGCCTATAAT TATC ATTATCGTCAAAGAAGGACAA TCTAATGAAAACATT  50 114
   HCD_08280 1749319 .. 1749333 +  -4.4  -6.08342   AAAAAAGTATTGTTG               TAAAAA ACA TTTTTA               TTTTTTTCTTTCTTA  91 84
   HCD_08305 NONE
   HCD_08310 1752512 .. 1752523 +  -4.4  -2.81609   AATGAGACCAAAAGA                CTAG AAAG CTAG                 ATTATGTCTTACATT  47 14
   HCD_08315 NONE
   HCD_08320 1755362 .. 1755375 +  -6.7   -5.2422   AGATGTAAGCGTCAA               TAGCC GTTA GGCTA                TTTTTTAGTGTCATT  84 117
   HCD_08330 1757222 .. 1757241 + -11.4  -3.34894   GCTTTAGTTAGGAAG            CTCCTCGC TTTA GCGAGGGG             TGTTTCACCAAGGTT  93 54
   HCD_08335 1759361 .. 1759377 +  -3.7  -3.19102   GCTCAAACTTAATAT              GACTATC CAT GATAATC              TCTAATTTTTGCGTG  48 433
   HCD_08345 1760835 .. 1760857 +  -7.1  -3.11316   GAGATTTTGTAAAAA          TGCCCCCTTA AAGA TAAGGGG-CA           TATATTCCCTACTCA  65 225
   HCD_08355 1772973 .. 1772995 +  -4.9  -3.41002   AACAAATATCTAACT          GCACTCACTT TCCA AAGTGGG-GC           TTGCTTAAATCTTAT  55 39
   HCD_08360 1774225 .. 1774267 +  -6.7  -3.60094   CTAATTACAATAATT TAAATCATAATAGAATA ACAAATTTA TATTCTATTATGATATA TTGTGATTATCTCTC  67 50
   HCD_08365 NONE
   HCD_08370 NONE
   HCD_08375 NONE
   HCD_08380 NONE
   HCD_08385 NONE
   HCD_08390 NONE
   HCD_08395 NONE
   HCD_08400 1778287 .. 1778303 +  -2.9  -5.01535   GATGAGGCAGATAAT              GCGACAT TCA GTGTAGC              TTTTTATCCTTCTGG  66 36
   HCD_08405 1781123 .. 1781136 +  -3.1  -6.17033   ACAATCAATTTGTCT               CTTTC AATT GAGAG                TTTTTTCTTTTTTTT  89 237
   HCD_08415 NONE
   HCD_08420 NONE
   HCD_08425 1787566 .. 1787580 +  -3.5  -5.19819   CAAACCCACAAAAGA               TGCCT AAATA AGGCG               TTTTTAGTTTTGTTT  73 223
   HCD_08450 NONE
   HCD_08455 NONE
         glk NONE
   HCD_08465 NONE
   HCD_08470 NONE
         pgi 1802038 .. 1802050 +  -7.7  -2.78384   ACGCATTGCTACAAG                GGGTT CTA AACCC                TATCATAGCCAGCAA  66 40
   HCD_08485 1804013 .. 1804024 +  -2.2  -5.79595   ATTCTTTTTCATCAG                TCGT TATA GCGA                 TTTTTTCTTTTAAAA  83 286
   HCD_08495 NONE
   HCD_08500 1807466 .. 1807485 +    -5  -2.74853   AAAAAACTTATCAAG            GCCATTTG GTTT TAGATGGC             ATTAATTTCACTTTA  52 72
   HCD_08505 1808177 .. 1808194 +  -2.8  -3.53343   GTTAAAAAAAATTTG             CTAAAA AGAGTA TTTTAG              TTTCAAAAAAGGATT  46 36
   HCD_08510 1809224 .. 1809246 +  -3.4  -3.49065   ATTCTTCAAATCTAA           TCTCTACACT TTT AGTTTTGAGA           TATATTTGTTGTTAA  48 202
   HCD_08515 1809892 .. 1809921 +  -9.5  -3.79113   AGTCTTCGTTTTTTG       GAAAAATCTCTTT AGCT AGGGAGATTTTTC        TTATTCTACAAGGAT  84 51
   HCD_08520 1810598 .. 1810617 +  -2.2   -4.8543   CTTTTTTCAACATAA            GATTCAGCA AGC TG-TGAGTC            TTTTTCTACGCATTC  63 142
   HCD_08540 1814845 .. 1814860 +  -4.8   -2.7634   TAGGTTTTTTATGGT              GATTTT TAAT AAAATC               CTTTAAAATCACATT  50 113
   HCD_08590 NONE
   HCD_08595 NONE
   HCD_08600 1826637 .. 1826650 +  -3.1   -3.9444   TTTTGTTAGAATTGT               CGGTT CTTA AATCG                TTTAATTCAAGTTTC  54 121
        flgG 1827672 .. 1827700 + -13.5  -4.02999   CTAAAAAATTAAAGA        CTATTCTTTAAAT AAT ATTTAAAGAATAG        TTTCATGTATTTTTA 100 230
   HCD_08615 NONE
   HCD_08620 NONE
   HCD_08625 NONE
   HCD_08630 NONE
   HCD_08635 1832630 .. 1832641 +  -2.2  -4.64861   TTTTTTTGAAAAAGA                GCTT AAAA AGGC                 TTTATTTTAGAGCAA  58 88
   HCD_08640 1832582 .. 1832594 -  -2.7  -4.79384   ATAATAAAACTAAAA                CATTA AAT CAATG                GTTTGTTTAAGCAGA  62 79
   HCD_08610 1827670 .. 1827702 - -10.9  -4.42765   GGCTAAAAAATTAAA      GACTATTCTTTAAAT AAT ATTTAAAGAATAGTT      TCATGTATTTTTATA 100 230
   HCD_08575 NONE
   HCD_08570 1820928 .. 1820938 -    -4  -3.81602   GAAACTATAACACAA                 TCTT TAC AAGA                 TAGAGTTTTAAAGAC  55 40
   HCD_08565 NONE
   HCD_08560 NONE
   HCD_08555 1816632 .. 1816651 -  -2.1  -3.25166   TTATGCCAAAAATTA            GCTTGAA ATTCTA TTCTAGC             AAATCCTAGGCAAAA  44 21
   HCD_08550 NONE
   HCD_08545 1814337 .. 1814347 -  -2.6  -2.95409   TAACGACCAAGCACA                 TAAT TGT ATTA                 GTATTTGGGGTAAAA  43 488
   HCD_08535 1812188 .. 1812198 -    -4  -4.94902   GAACTATTACAAAAA                 CAAT GCT ATTG                 TAATTCTGTTTGTTT  70 116
   HCD_08530 1810881 .. 1810914 -  -6.9  -5.27779   TTTAATATTAAAAAA     TAGTTTTCAAAGTAT AGCA AAACTTTGACAACTA      GTTTTAAAAAAGATA  84 42
   HCD_08525 1810185 .. 1810200 -  -3.2  -2.79096   AGCACACAAATTAAT              CTTGGC AAGT GCGAAG               GGTATCAGCCTAGTT  44 401
   HCD_08490 1803422 .. 1803435 -  -4.5  -3.95036   AATGATGGGAAATAA               CAGCA TGTA TGCCG                GCTATACCGGCACAG  59 412
   HCD_08475 1798862 .. 1798906 -  -5.1  -3.90744   TTTTCTGTTAAATAA TCGTTTATTGCTAGAAGTCCA AAG CGGATTTCAAGGAATAAATGA CATTAAACAACATAA  61 266
   HCD_08445 NONE
   HCD_08440 NONE
   HCD_08435 1790683 .. 1790693 -    -4  -3.53091   AGCTTCTTTTTGAAA                 TAGT AAT ACTA                 TACACGACACACTTT  52 246
   HCD_08430 1787898 .. 1787911 -  -5.3   -3.9009   AATTCACCCTATAAA               CCTTA TGGT TAAGG                CAATTTAGGTAAATT  63 253
   HCD_08410 1781264 .. 1781279 -  -6.2  -4.01853   CAATAGGATTAGAAA              GAAAGA TAAA TCTTTC               TTTCCCTTAATCTAT  68 156
   HCD_08350 1760835 .. 1760857 -  -7.1  -4.59109   GAGATTTTGTAAAAA          TGCCCCCTTA AAGA TAAGGGG-CA           TATATTCCCTACTCA  81 127
   HCD_08340 1758647 .. 1758663 - -10.9  -2.65264   GGATGACTTAGATTA              CGCTAAG CAA CTTAGCG              AAGAAATAGGCAAAT  78 328
   HCD_08325 1755329 .. 1755348 -  -9.2  -4.86939   CAACAAAGCGAAAAA            CTCCGTCC TTTA GGGCGGAG             ATGTAAGCGTCAATA 100 95
   HCD_08290 NONE
   HCD_08285 1749721 .. 1749731 -    -4  -3.17219   CATAATCTCTATCAA                 TTCT AAG AGAA                 TACGGATTGATTCAA  49 37
   HCD_08250 1742654 .. 1742668 -  -8.6  -3.29511   TTGATTGTTTTATAA               GGCATA GCC TATGCC               CTAATAAATTGTTTA  74 19
   HCD_08230 NONE
   HCD_08225 NONE
   HCD_08220 NONE
   HCD_08215 NONE
   HCD_08210 1736468 .. 1736484 -  -6.7  -2.52623   TCTTGTGTAGAAGAT              CAAATTT ATT AAATTTG              GCTTGTTATTCTTTC  59 149
   HCD_08205 1736006 .. 1736018 -  -3.4  -3.02511   TGCATTTTTTTAACA                GCTA TTCAC TAGC                CTGTGCTAGATAAGA  44 14
   HCD_08200 1735724 .. 1735734 -  -5.4   -2.6648   AAAAGTAAGATTAAT                 TGGA ATT TCCA                 CATAGAAGCTTGCAT  51 77
   HCD_08195 1734979 .. 1734995 -  -2.3  -4.01943   TGTAGATAAAAAAAT              CAAAACA TTG TTTTTTG              TGCGTTTAGCATGAA  51 286
   HCD_08190 1734298 .. 1734308 -    -4  -3.95036   AATTACGCTAAACAA                 TCTT TCA AAGA                 CAAAAACAAATGCAA  57 322
   HCD_08185 1733403 .. 1733427 -  -2.9  -4.56961   AACATTTAGACAAAA          TCCCAAATATC TTT AATGTTTGAGA          TGTTTGTCTTAGTGC  60 266
        panB NONE
        ruvB 1720494 .. 1720506 -  -3.5  -4.26903   CTCATTTGATGAAAA                TAAAA GAC TTTTA                CTCTCCCCTTGGCTT  59 165
   HCD_08105 NONE
   HCD_08100 1715989 .. 1715999 -    -4  -4.59251   TCAAAAAAAATTAAA                 CAAA GCC TTTG                 ATAAATCAAGCTATC  66 478
   HCD_08090 1714584 .. 1714603 -  -9.2  -4.86939   CAACAAAGCGAAAAA            CTCCGTCC TTTA GGGCGGAG             ATGTAAGCGTCAATA 100 95
   HCD_08085 NONE
   HCD_08080 NONE
   HCD_08075 1711854 .. 1711866 -  -3.4   -3.5764   AACGCTACTTCTAAA                TAGG GTATG CCTA                TTTCATAATTCTAGT  50 180
   HCD_08035 NONE
   HCD_08030 1702648 .. 1702662 -  -2.8  -3.76224   TTTTGATGGATTAAA               CGCTTT ATG AAAGTG               TGTTTAAAACCCCCA  50 15
   HCD_07995 1695661 .. 1695687 -  -6.8  -2.77791   CCTAATTGAATATGA         TTATCTATAATT AAA AATTATAGATAT         AGTTTACATATGCTA  60 9
   HCD_07985 1692938 .. 1692949 -  -5.8   -3.1506   AAATCGTTTGATTAA                GGGT TTTG ACCC                 CCCCCCCTTGCTCTA  57 38
   HCD_07970 NONE
   HCD_07965 NONE
   HCD_07960 NONE
   HCD_07955 NONE
   HCD_07950 1685490 .. 1685503 -  -6.7   -5.2422   AATGACACTAAAAAA               TAGCC TAAC GGCTA                TTGACGCTTACATCT  84 33
   HCD_07940 1683624 .. 1683643 - -11.4   -3.4149   ATCTAAGGTGAAACA            CCCCTCGC TAAA GCGAGGAG             CTTCCTAACTAAAGC  93 54
   HCD_07935 1681753 .. 1681775 - -12.2  -3.00946   TGGCGTTATAAAGTA           GAATGGATTT TAA AAATCCATTC           CGTAAGTCTCATTAG 100 88
   HCD_07860 NONE
        murG 1665370 .. 1665380 -    -4  -4.59251   TCAAAAAAAATTAAA                 CAAA GCC TTTG                 ATAAATCAAGCTATC  66 478
   HCD_07845 1663965 .. 1663984 -  -9.2  -4.86939   CAACAAAGCGAAAAA            CTCCGTCC TTTA GGGCGGAG             ATGTAAGCGTCAATA 100 95
   HCD_07840 NONE
   HCD_07835 NONE
   HCD_07830 1658496 .. 1658508 -  -6.3  -2.71924   TATTGGTGCTTAAAT                GCTTT TTA AAAGC                GTTTTGATTTTTTAA  57 327
   HCD_07810 NONE
   HCD_07805 1654483 .. 1654496 -  -2.5   -3.3579   AAATGGGGTCAAAGA               TAAAT AAAT ATTTA                ATAATTATTATAGCT  45 501
   HCD_07800 1652196 .. 1652213 -  -9.9  -4.61482   TGTTCCAAAAAAGAA             CCCTATC AGAA GATAGGG              TAACCCTTTGAAAAG 100 261
   HCD_07790 1650116 .. 1650135 - -11.4  -3.54626   CAACAAAGTGAAACA            CCCCTCGC TAAA GCGAGGAG             CTTCCTAACTAAAGC  93 54
   HCD_07770 1644635 .. 1644654 - -11.4  -3.43853   TTAATCAGTGAAACA            CCCCTCGC TAAA GCGAGGAG             CTTCCTAACTAAAGC  93 54
   HCD_07750 1639327 .. 1639342 -  -3.2  -2.58638   AAAATTCACACTAAC              CAACCC CTAA GAGCTG               TATTTCTCAACCATC  42 39
   HCD_07745 1639014 .. 1639050 -  -4.6  -3.88985   AAAAGGGCTTAGAAA   GCGTT-CTATAGGACTA GAGA CAATCCTATAGAAAAGC    CATTTGGGTTAATCA  61 53
   HCD_07740 1638177 .. 1638194 -  -5.7  -4.89852   TTATATCCATAAAAA             TTTTCAA GCAC TTGAAAA              ATCTCATTCTAGCTC  77 262
   HCD_07705 1631851 .. 1631863 -  -4.9  -2.56185   AAAGTTAAGGAATAT                TAAGA AAA TCTTA                CTACACTACTCTTGT  49 495
   HCD_07685 NONE
   HCD_07680 NONE
   HCD_07675 1629325 .. 1629335 -    -4  -3.43042   TCTTTGAGTAAAAAT                 CTTA AGC TAAG                 CATAGTAATCCTCAA  52 21
   HCD_07670 1626665 .. 1626678 -  -5.3  -3.57627   GTGCCACAGAAAAAG               GCTTA TTCA TAAGC                TAAAAACCTCTCTTT  59 14
   HCD_07665 NONE
   HCD_07660 NONE
   HCD_07655 NONE
   HCD_07650 NONE
   HCD_07645 NONE
   HCD_07640 NONE
   HCD_07635 1620040 .. 1620052 -  -5.5  -3.44622   TACTCGCATAATCAA                GCGTA AAT CACGC                CACTTAATGTCATTT  60 59
   HCD_07630 NONE
   HCD_07625 1619374 .. 1619393 -  -5.2  -2.87243   CCAGTATTACAATGA            TTAAAAAA CATT TTTTTTAA             CTTCCTATTTTTCAT  52 30
   HCD_07620 1617106 .. 1617119 -  -6.7  -2.91276   TTGTGTGTTATAAAG               CAAGC TTTC GCTTG                TCTCTACTTCCTCTT  61 253
   HCD_07615 NONE
   HCD_07610 1614492 .. 1614512 -  -6.1  -4.13767   CTTTTTATCTTAAAA            GGGAAGTGT TGG AGACCTCCC            TTCTTCATTGTAAAT  70 81
   HCD_07605 NONE
   HCD_07600 1612223 .. 1612234 -  -4.4  -2.81609   AATGTAAGACATAAT                CTAG CTTT CTAG                 TCTTTTGGTCTCATT  47 14
   HCD_07595 NONE
   HCD_07590 NONE
   HCD_07585 1607307 .. 1607323 -  -3.7  -3.19102   CACGCAAAAATTAGA              GATTATC ATG GATAGTC              ATATTAAGTTTGAGC  48 433
   HCD_07575 NONE
   HCD_07570 NONE
   HCD_07565 1604354 .. 1604376 -  -7.1  -3.11316   TGAGTAGGGAATATA          TG-CCCCTTA TCTT TAAGGGGGCA           TTTTTACAAAATCTC  65 29
   HCD_07550 1602016 .. 1602034 -  -3.8  -2.50077   TGCCTACAAAATTAG             GGCGTTTT TTA AAACCACC             AATAACTTCAAAGAC  44 52
   HCD_07545 1601468 .. 1601484 -  -2.3  -4.05877   TATGATATTAAAGAA              TTTTTTC AAG GAAGAAA              CGCACAAGGCAAGTT  53 198
   HCD_07520 1593639 .. 1593650 -  -4.4   -3.5323   AATGGTAAACAAAAC                GCAT TTAA ATGC                 CTACCAATACGATGA  52 18
   HCD_07515 1592522 .. 1592542 -  -3.9  -3.62522   CAATTTTTTTAACAA            GTATGGCTT TGC AAGCCGAAC            TTCATATGTCTAATA  52 445
   HCD_07500 NONE
   HCD_07495 NONE
   HCD_07480 1587534 .. 1587544 -  -5.4  -2.52795   AACTTTTTCAAGCGA                 GCAA CTC TTGC                 AAGCGAGATGGAGTG  51 7
   HCD_07475 1586346 .. 1586366 -  -4.9  -2.59133   ATATATAACTAAGAT            TTTAATTTT AAC AAAATCAAA            TTAAAACAAAATAAG  49 49
   HCD_07470 1584990 .. 1585003 -  -6.7   -5.2422   AATGACACTAAAAAA               TAGCC TAAC GGCTA                TTGACGCTTACATCT  84 119
   HCD_07460 1583124 .. 1583143 - -11.4   -3.4404   ATTGATAGTGAAACA            CCCCTCGC TAAA GCGAGGAG             CTTCCTAACTAAAGC  93 54
   HCD_07450 NONE
   HCD_07445 1580871 .. 1580881 -  -2.6  -2.51181   AGAACATCAAGAGAT                 TTTT TCT AAAA                 GCTTTTCTAATTCCG  40 6
   HCD_07440 1579000 .. 1579010 -  -2.6  -3.17311   AACGAGAAAAAATAG                 TTTT TAA AAAA                 TATCTATAGGGTCTA  43 18
   HCD_07415 1573289 .. 1573303 -  -2.8   -5.1848   AATGAATTTAAAAAA               CAATTG GTG CAAATG               AACCCAGATAATCAA  70 127
   HCD_07400 1570533 .. 1570553 -  -3.3   -3.9735   ATATGAAAAAATTAA            GAACATTAT TCT ATATTGTCC            ACTTCATACCCAAGC  54 10
   HCD_07395 1567926 .. 1567936 -    -4  -2.60723   GTATTCTTAATTAAC                 GATA TAT TATC                 ATAAGAAAAGCATAG  46 181
         fmt NONE
   HCD_07385 NONE
   HCD_07380 NONE
   HCD_07375 NONE
   HCD_07370 NONE
   HCD_07365 NONE
   HCD_07360 NONE
   HCD_07355 1561480 .. 1561496 -    -3  -2.74248   TAATATCTCTCAAAT              TTGCCA TATTG TAGCAA              TCTCCTACTCGCTAT  43 30
   HCD_07350 NONE
   HCD_07345 NONE
        atpC 1558692 .. 1558712 -  -2.6  -3.98683   AGTATAGTAATCAAA            CCACTTTC ATGTA GAAAGTAA            GCCAATGAATCCAAC  52 60
   HCD_07335 NONE
   HCD_07330 NONE
   HCD_07325 NONE
        tolB 1555616 .. 1555642 -  -2.5  -4.64334   AATTCTCCAATAAAA         TAAAATTTAAA GCGAA CTCAAATTTTA         ACTCATATTTGCTTA  60 49
   HCD_07315 NONE
   HCD_07310 NONE
   HCD_07305 1553453 .. 1553468 -    -4  -2.75803   AGAATATTTTAACTA              TCCATG CGAA CATGAA               CAGCCACAACCTCCG  47 7
   HCD_07300 NONE
   HCD_07295 NONE
   HCD_07290 NONE
   HCD_07285 1551079 .. 1551090 -    -3  -3.45776   GTAAAGCGACCATAA                CAAA TCCT TTTG                 CTCTTGTTTCAGTCG  48 90
   HCD_07280 NONE
        flgK 1548823 .. 1548840 -  -4.1  -3.50569   AGCTCAAAAAAATTA             TTGCTTG ATTC CTAGCAA              AGTATCTATCATTCT  52 5
   HCD_07270 1546761 .. 1546771 -  -2.6  -2.96611   AAAAAAGCCCATATA                 TTTT ACA AAAA                 ATTAAAATTCCTTCC  42 27
   HCD_07265 1545426 .. 1545438 -  -2.7  -3.93782   CCATTTAATATCAAA                CAAAA TTT CTTTG                TAATACATAGTGATT  52 334
   HCD_07260 1543120 .. 1543130 -    -4  -3.40743   AAAAAGGTTAAGGAA                 GTTT TAA AAAC                 CGGTGGCATGTTTTT  50 420
   HCD_07250 NONE
   HCD_07245 NONE
   HCD_07230 NONE
   HCD_07225 NONE
   HCD_07220 1534856 .. 1534875 -    -5  -3.23274   GGTGCGATAATTCAA            CAATCTAG CCTA CTAGCTTG             GCACAAAAAGCTTAA  56 89
   HCD_07215 1534329 .. 1534347 -  -4.7  -3.36983   AAAAGTTGTAAGGAA             TAAAAAG ATAAG CTTTTTA             AGAGAGAGAGAGAGA  53 131
   HCD_07210 1533434 .. 1533453 - -10.8  -4.74801   TAATGTCATTAAAAA            GCGTTACA AAAA TGTAACGC             CCAAAAATTTTTAAA 100 52
        rplU NONE
        rpmA 1527472 .. 1527483 -  -2.2  -3.96893   AACAAATTCTACAAA                GAGT AGAG ACCC                 AAATTATAAATATTT  51 102
   HCD_07185 NONE
   HCD_07180 NONE
   HCD_07175 NONE
   HCD_07170 NONE
   HCD_07165 NONE
        obgE 1521088 .. 1521099 -    -3  -2.59039   AAGCATGCTTACAAC                TGAA ACCA TTCA                 TTCCAATAATAATTT  42 76
   HCD_07155 NONE
   HCD_07150 NONE
   HCD_07145 NONE
   HCD_07140 NONE
   HCD_07135 NONE
   HCD_07130 1515884 .. 1515895 -    -3  -3.98083   TATCCAAGCGACAAA                GATT ATGA AATC                 ATAGAGAAGTATAGG  54 457
   HCD_07120 1511617 .. 1511629 -  -4.9  -4.10657   TGAGACTTTTTAAAA                TTTAG CAT CTAAA                AATGCAGTTTTTCTT  62 374
   HCD_07110 NONE
   HCD_07105 1509353 .. 1509363 -  -4.6  -3.70037   TAATTATGAGTTAAA                 GCCC CTT GAGC                 CAGAGCTTACAGAAG  57 3
   HCD_07100 NONE
   HCD_07095 1507450 .. 1507463 -  -3.9  -3.38326   GATAAGCTTAATCAA               TACAA TGAA TTGTA                TCAGTATAGCAATAC  50 199
   HCD_07085 NONE
   HCD_07080 NONE
   HCD_07075 NONE
   HCD_07070 NONE
   HCD_07065 1502172 .. 1502185 -  -5.3   -4.0371   CAGTGGCGATATAAA               CCTTT CATA AAAGG                TTTTAGTCGTTTTAA  64 37
   HCD_07050 NONE
   HCD_07045 1499975 .. 1499992 -  -7.1  -2.74853   CAAAGCTAAACTAAT             TTTGGAA ACCA TTCCAAA              TTCTGTGTCAAGTAA  63 143
   HCD_07010 NONE
        pyrH 1492203 .. 1492230 -  -3.6  -4.42806   TTAGTCTCAAATAAA        GGCGTTATTTT ACCATAG AAAAT-ACGCC        TTGTTGGTGCTTAAT  62 2
        rpoZ NONE
   HCD_06995 NONE
   HCD_06990 NONE
   HCD_06985 NONE
   HCD_06980 1485981 .. 1485994 -  -3.9  -2.71731   TCTATGGCCTAATCA               TTCTT GCTA AAGAA                GCTATCAATACCATC  44 5
   HCD_06975 1485117 .. 1485130 -  -2.5  -2.90496   TCCTTTTTTAAATGA               TTTTA CAAA TAAAA                TAAAAGCGAGTTTGG  42 127
   HCD_06970 NONE
   HCD_06965 1482003 .. 1482013 -  -3.2  -4.90778   CTTAGCTAAAGAAAA                 TGCC TTT GACA                 AAGAGTCCGCATCTT  70 475
   HCD_06955 1478940 .. 1478961 -  -4.5   -5.2166   CAAGAACGCAAAAAA           CAAAGGATT TTTA AATCCTTTT            AAAAGCACAAATATT  77 114
        moaA 1476165 .. 1476178 -  -3.9  -4.17089   CCTAAAGGTTCAAAA               TTACA AAGT TGTAA                AAACCGCGTTTTTAA  57 73
   HCD_06915 NONE
   HCD_06910 1469102 .. 1469118 -    -3  -3.80419   ATGACAGAGCAATAA              CACTTA TTGTC TAAGCG              TAGCCGTAGTCTTAA  52 12
   HCD_06905 1468536 .. 1468560 -  -5.8  -4.17089   TTTAAACTTTCAAAA          TTTTGACTAG CCCTT CTTGTCAAAA          ATAATCCCTATCACA  68 7
        fliD NONE
        fliS NONE
   HCD_06890 1465786 .. 1465797 -    -3   -3.3485   TAAAAAAACCTAAGA                CAAA AATT TTTG                 AATTTTTTTGGCTTT  47 8
   HCD_06885 NONE
   HCD_06880 1463956 .. 1463981 -  -4.1  -4.08485   GTTATCTAAACTAAA         GCACAAAAA TGATAGAG TCTTTGTGC          TTTTTTAGCACAAGA  59 67
   HCD_06875 1462610 .. 1462622 -  -2.7  -3.53722   CTTATATTGATACAA                TAAAC TCA GTCTA                ATAATAACGCTCCAA  46 18
   HCD_06870 1461247 .. 1461275 -  -4.5  -4.96388   AACCATGAAAGAAAA        GCACATCAATCCC CTA GAGCTTATTGTGC        GTAATTAAGGGTTTA  72 43
   HCD_06835 1453861 .. 1453875 -  -4.2  -3.18446   AATGCGATAAAATCA               CTACTC TGA GCGTAG               CTCCGTTATTTGCTG  51 153
   HCD_06800 NONE
   HCD_06795 NONE
   HCD_06790 NONE
   HCD_06785 1444536 .. 1444555 -  -3.6  -3.41325   TATACTCTAAGAATA            CTTAATCA AACT TGTTTAAG             TGTTTTCTAAACTCT  50 21
   HCD_06780 NONE
   HCD_06775 NONE
   HCD_06770 NONE
   HCD_06765 1440371 .. 1440388 -  -4.1  -3.45321   ACCCATAATTTATAA             GCGTTTT TTAT AATACGC              ATTAGTCGCTTCAAT  52 2
   HCD_06760 NONE
   HCD_06755 1438658 .. 1438676 -  -2.4  -2.83504   TGTGTAGTAAAATAT             TGTGGCTA TTG TAACCAAA             CTTTGAGTTACTTTT  40 33
        aspA NONE
   HCD_06745 1436319 .. 1436333 -  -2.8  -3.52079   GAATATCTTAGAGAA               TGGTGA GAT TTACCA               TGATAACCCTTTCAT  48 295
        glyS NONE
   HCD_06700 NONE
   HCD_06695 NONE
   HCD_06690 NONE
   HCD_06685 1422904 .. 1422915 -    -3  -4.74518   AAGCATGAAAAGAAA                TCAA GGCA TTGA                 TAAAGGTATTTTTAG  64 92
   HCD_06680 1419306 .. 1419330 - -11.7  -3.35088   AAAGCTTTGAATGAA          GTAAAAATCTT TTA AAGATTTTTAC          CCACCCCTTTCTGCC  95 67
   HCD_06670 NONE
   HCD_06665 NONE
   HCD_06660 1415634 .. 1415647 -  -3.9   -4.1347   TCTTAACTAGAGAAA               TCTTA GTAT TAAGA                ACCACCAAAAATAGT  58 414
   HCD_06615 NONE
   HCD_06610 1406411 .. 1406441 - -12.9  -3.14672   TTCTATCAAAATAAG       CTTTCTTAAAACA TCAAT TGTTTTAAGAAAG       ACTTGTAATGATTAT 100 72
   HCD_06605 1406019 .. 1406036 -  -2.1  -3.81755   ATTTGTTAAACACAA             CTTTTAA ATAA TTAAAAA              AATTTGATTAGGATT  49 33
   HCD_06600 NONE
   HCD_06595 NONE
   HCD_06590 1403823 .. 1403850 - -10.8  -3.48269   TTTACTAAAGAGCAA        TTTCTAAAGCTC AAAC AAGCTTTAGAAA         AACAGCAAAAAAGCT  87 59
   HCD_06580 1400713 .. 1400735 -  -4.8  -4.31433   GAGCCTTAGAATAAA           TTGCCCCTTT TTA AAAGGGGTTA           AGAGATTTAATATGC  64 32
   HCD_06565 NONE
   HCD_06560 NONE
   HCD_06555 1392323 .. 1392337 -  -2.8  -3.53563   ATAGTGTCTCTTAAA               TGGATT GTT AAACCA               ATTATAACACAAACA  46 167
   HCD_06550 1391602 .. 1391616 -  -7.1   -3.4678   ACGCTTACATTATAA               GGGCT TCGGT AGCCC               ACTTCTTTCTTACAG  68 35
   HCD_06545 NONE
   HCD_06540 1390125 .. 1390135 -  -2.6   -4.2772   TGTAATTAATACAAA                 TAAT CTC ATTA                 AGACAAATAGCATAA  55 365
   HCD_06515 1382556 .. 1382578 -  -4.3  -2.57013   TCCTAATCTAATTGA           TTGTAAAAC TCAGC ATTTTACAA           TAGCAACCCTAAAAT  46 69
        gpsA NONE
        glyQ NONE
   HCD_06500 NONE
   HCD_06495 NONE
   HCD_06490 NONE
   HCD_06485 NONE
   HCD_06480 NONE
   HCD_06475 1375776 .. 1375786 -    -4  -3.57587   ACTAGCTAAATAAGA                 CTTT AAA AAAG                 TTTAAACATGCTATA  53 36
   HCD_06470 1374925 .. 1374946 -  -7.3  -2.79312   AAACTCGCCACTAGA           GCGTAGCAA CCCT TTTCTACGC            TCCATACTCTGCATA  63 215
        pyrB 1362622 .. 1362639 -  -7.1   -3.7108   ATTTCTACACTCAAA             GCTTAAA AATT TTTAAGC              TTTGAAATTTATTGC  71 63
   HCD_06420 1360985 .. 1360996 -    -3  -4.11394   ATTTCATTTCTAAAA                CTTA GCTG TAAG                 GGTTGTCATCAAATG  55 8
   HCD_06415 NONE
   HCD_06410 NONE
   HCD_06405 1357945 .. 1357965 -    -2  -5.09426   TCTAATTGTAAAAAA           TTGCAGTAT CTCA ATACT-CAA            TTTAGCAATTAGCCT  65 34
   HCD_06395 1355432 .. 1355442 -    -4  -4.64766   TGGATATTTTAAAAA                 CTTT TCA AAAG                 CATTTGGGCGGTGTT  66 511
   HCD_06385 1353895 .. 1353913 -  -2.4  -4.62471   AATGGATAGAGAAAA             GCCCTA TTGAAGT TAGGAC             TTATTTAGATATTAA  58 44
   HCD_06325 1343332 .. 1343360 -  -6.9   -3.7732   TGTTTACATCAAGAA        TATTAGCGGTA TTCATTC TACCACTAATA        ACAACATCGTTTATT  69 502
   HCD_06290 NONE
   HCD_06285 1338534 .. 1338554 -  -2.5  -5.12707   TCAAATTCTAAAAAA            GTCTCATCA AAT TGCTGACAC            TGAGCTAAGAGTAAT  66 79
   HCD_06280 1337759 .. 1337777 -  -3.8  -4.70353   TAGAACAAATTAAAA             CCCCAC AAGATGA GTGGGA             CTTAAACAAGGCTTT  66 157
   HCD_06270 1334926 .. 1334954 -  -3.9  -4.69027   AAACTTACGCAAAAA        CTTTCAAAGAAAA GAT TTTTCCTAGCAAG        TCTAAGGCGTTTTCG  66 165
        flgI NONE
   HCD_06245 NONE
   HCD_06240 1329082 .. 1329108 -  -3.2  -3.66874   TTAACTTTATTTAAA         GTTTTTTACA TAACTCC TATAAAAAAC         CTTATTGCTATCCTA  50 81
   HCD_06235 NONE
   HCD_06230 NONE
   HCD_06225 NONE
   HCD_06220 NONE
        hemA NONE
   HCD_06210 NONE
        hemC NONE
   HCD_06200 1322532 .. 1322546 -  -5.8  -4.96996   GTTAAATAAAATAAA               TTTCAT CTA ATGAAA               ATAAGCTTTAATTCT  77 101
   HCD_06195 1321216 .. 1321232 -    -5  -4.07568   TTTTGGGGCTTAAAA              GCACGC AACAA GCGAGC              CATAAGAACCATTAA  64 203
   HCD_06180 1317158 .. 1317177 - -11.4  -3.38522   TAGTTATGTGAAACA            CCCCTCGC TAAA GCGAGGAG             CTTCCTAACTAAAGC  93 54
   HCD_06175 1316646 .. 1316666 -  -3.3  -2.94708   GATTGTGCAAAGAAG            GCTATTATA CTT TGCAATAGC            TTTTTAAAGGGATTT  44 9
   HCD_06170 1315904 .. 1315938 -  -6.6  -3.22091   ACCGTAAGTGATTAA    GCCACAATAA-GCTA GACCGA TAGCATTATTGGGGC     ATTACCGATAACCCA  64 127
        rpsO NONE
   HCD_06160 NONE
   HCD_06155 NONE
   HCD_06150 NONE
   HCD_06145 NONE
        flhF NONE
   HCD_06135 NONE
   HCD_06130 NONE
        fliA NONE
        fliM NONE
   HCD_06115 NONE
   HCD_06110 1306062 .. 1306079 -  -3.5  -4.70613   AAAAGGCTAAGAAAA             TTATGAT TGTA ACCATAA              TATACTATAGCTTAA  66 30
   HCD_06105 1305583 .. 1305598 -  -3.3  -3.71108   AAAAGGAAGGTTAAA              TCAAG GACTAG CTTGA               ATGGTTTTAAGGACT  52 10
   HCD_06080 1301089 .. 1301099 -  -2.6  -4.68645   CATTTAAAACGAAAA                 TTTT CCA AAAA                 CGATAAAGGAACTAT  62 3
   HCD_05960 NONE
   HCD_05955 1273196 .. 1273210 -  -4.2  -3.25192   CCTAAGGCTAGAAGA               CAAGCA AAA TGCATG               ATTTTTCCTTATTGT  50 34
   HCD_05950 NONE
   HCD_05945 1270446 .. 1270468 -  -6.4  -4.26076   TTACCTTTATCAAAA           CACACTTTTT TTA AAAAAGCATG           TTTAATATACTTATT  72 36
   HCD_05940 1268272 .. 1268293 -  -5.2  -3.60971   ACTTTAAGCGTGAAA           CTCTCTCT TTCTTT AGAGAAAG            AAAACAAACGCATTA  57 447
   HCD_05890 1261253 .. 1261263 -    -4  -5.02357   TACAATGAAACAAAA                 CTAA GAC TTAG                 CTTTTTGTCTCAAGT  72 15
   HCD_05870 1251941 .. 1251962 - -10.3  -4.11484   TTTAAGTTTTTAAAA           TAATGCGTT TCAC AACGCATTA            TTTTAGTCCCCCCCC  95 54
        carB 1248619 .. 1248631 -  -3.5  -3.42013   ATGCCATAAGACTAA                TTATT CTA AATAA                TCTTGCAGGGCTAGC  50 13
   HCD_05860 1248058 .. 1248070 -  -4.9  -5.42198   TTCTAAAAAACAAAA                TGTTA TTG TAACA                AAAAAAATATTATCC  81 134
   HCD_05855 1245169 .. 1245180 -  -5.8   -4.8048   CTTGGATAGGAAAAA                TGGG AAAC CCCA                 CAGAAGTGCTATTAG  78 430
   HCD_05845 1241981 .. 1241998 -  -2.1  -3.43203   TTATTATAATACCAA             TAATCTT AAGA AAAATTA              AAAATCCCCTATCGG  45 85
   HCD_05840 1240365 .. 1240375 -    -4  -4.00463   TAAGAATAGAAAACA                 TTCT ATA AGAA                 AAAATTCTAGCATAA  57 95
   HCD_05835 1238719 .. 1238735 -  -3.7  -4.39287   TTAAGTATATCAAAA              TCATATC TAA GAGATGA              AAAATAACCCTCTTA  62 38
   HCD_05830 1237122 .. 1237133 -    -3  -4.64144   AAGAAGTCGCAAAAA                TCAA GCCC TTGA                 TTAGCCCTGGAGCTT  62 178
   HCD_05820 NONE
   HCD_05815 NONE
   HCD_05810 NONE
        motB 1233059 .. 1233072 -  -2.5  -2.79641   ACACAGCAAAAGGGA               TAAAA GAAG TTTTA                TTGTGTGGTTCATTT  41 35
   HCD_05800 1232268 .. 1232282 -    -5  -2.61216   GCACTAAGGAACTCA               CCCTTT TTA AAAGAG               TTAAAAGAGTGTTTT  51 382
   HCD_05780 NONE
   HCD_05775 NONE
   HCD_05770 NONE
        uvrC NONE
   HCD_05760 NONE
   HCD_05755 1218926 .. 1218938 -  -4.9   -3.1585   TGAGTTAATTCAATA                TAATG ACT CATTA                GTTACTCCTAATTAT  52 114
   HCD_05750 1218612 .. 1218640 -  -4.5  -3.16217   GCTAAATCTAACATA        GCTATTAGCCTAG AAG CTTGTCTAATTGC        TCTTTTAAAGCAACT  52 1
   HCD_05745 NONE
   HCD_05740 1216316 .. 1216326 -  -2.6  -3.91488   AAGTTTGTGAAAGAA                 TTTT TGA AAAA                 ACACCCCAAGGTTAG  52 329
        ispG NONE
   HCD_05710 NONE
   HCD_05705 1207558 .. 1207572 -  -3.6  -4.77925   AAAAAATCCTAAAAA               CTTATT TGG AACAAG               AACTCCCCTTAATCG  69 333
   HCD_05695 1206163 .. 1206178 -  -3.3  -2.91772   AACTCGCTCATAAAG              TGCTT TTGCTC AAGCA               TGGAAAAATCACCTC  44 210
   HCD_05675 1202854 .. 1202874 -  -4.1  -3.86346   TCATTGTGTTACAAA            CTTTTTATT TTT ATTAAAAAG            GGCGTATTATATCTT  55 81
   HCD_05670 1202003 .. 1202013 -  -2.6  -3.45031   GCGTTAAAAAGGTAA                 TTTT ATC AAAA                 CTCTTTGTAATTTTC  46 57
        ribA NONE
   HCD_05660 NONE
   HCD_05655 NONE
   HCD_05650 NONE
        mogA NONE
        moaC NONE
   HCD_05635 1197377 .. 1197387 -  -2.6  -2.61548   TTTCATTATAACCTA                 TTTT CTC AAAA                 AGAAAGAATATTGAA  40 160
   HCD_05630 NONE
        napG NONE
        napH NONE
   HCD_05615 NONE
         tig NONE
        clpP NONE
         def NONE
   HCD_05595 1188485 .. 1188495 -  -2.6   -4.1822   TGTGATTTTAAGAAA                 TTTT TCT AAAA                 CTTAATGCCTTAAGC  53 7
   HCD_05590 NONE
   HCD_05585 NONE
   HCD_05580 1181825 .. 1181838 -  -3.1  -3.74868   TTTAAAAATAATCAA               GCGTT CTAA AACAC                CCACCCATAGTTAAA  52 17
   HCD_05575 1179842 .. 1179864 -  -4.9  -3.61517   ACCCTTTCTCAATAA           CAAACCTTT TTAAG AAGGGTTTG           TGATACTAAAACACC  57 31
        lolA 1173181 .. 1173201 -  -6.9  -3.31196   CCAAATGGAGATTAA            CTTACGC AGCTTTA GCGTAAG            CTGGAGCGTAATTTG  64 195
   HCD_05550 1172281 .. 1172291 -  -6.8  -4.15222   AGCCCTTTCAATAAA                 GCCT TTA AGGC                 TAATGAGCAAGACAG  70 81
   HCD_05535 NONE
   HCD_05530 1167132 .. 1167146 -  -2.2  -2.75865   TCTCAAAATAAGGCA               TTAAAA ACC TTCTAA               AAGATAAGATGAATT  40 11
   HCD_05525 NONE
   HCD_05520 NONE
   HCD_05515 1164041 .. 1164055 -  -4.2  -2.61429   TAAAATCCTTACAAC               CCCATT TTA AAAGGG               TTTAAAATATTGTTT  46 4
   HCD_05510 NONE
   HCD_05505 NONE
   HCD_05500 1161420 .. 1161435 -  -3.2  -4.53607   AAAATTATTATAAAA              CTGCCT ATTA AGGAAG               TCATAATCATCATTA  62 280
   HCD_05495 NONE
   HCD_05490 1150808 .. 1150820 -  -2.7  -4.57353   GGCTATTAGAGAAAA                CATTT TTA AAACG                CTAGACGCATTCCAA  60 18
   HCD_05470 1145722 .. 1145740 -  -3.8  -4.13814   AAAAGTTAGAAAGAA             TCTCCCCC AAA AAGAGAGA             CTAAGTGCGGTATTC  57 26
        rplI NONE
   HCD_05460 NONE
        hslU NONE
         era NONE
   HCD_05445 1140884 .. 1140903 -  -2.8   -2.6006   AAGGCATTTTAGAAG            GCGAGCTT TTAG AAACTTGC             ATGCACTACTATTTT  41 505
        rpmE NONE
   HCD_05425 NONE
   HCD_05420 NONE
   HCD_05415 NONE
   HCD_05410 1135140 .. 1135156 -  -3.7  -4.59342   TGTATTATAAAGAAA              GGGTT CAAAAAT AACCC              CTGATTAATCATGCA  64 30
   HCD_05365 1125420 .. 1125432 -  -3.5  -3.54424   TTTTATCCCTTTAAA                TTTAA TCA TTAAA                AATTGAATTTTATGA  52 35
        aspS NONE
         adk NONE
   HCD_05350 NONE
   HCD_05345 1121614 .. 1121628 -  -2.9  -4.15849   ATAATAAGAATCAAA               TCTTA AAACA TAAGA               ATATATTCTTGTATT  53 174
   HCD_05340 1120291 .. 1120301 -  -3.2  -4.19483   CGATATAGATAGAAA                 CACT TTT AGCG                 TTTTTCATGATGTCC  55 303
   HCD_05335 NONE
   HCD_05330 NONE
   HCD_05325 NONE
   HCD_05320 1117723 .. 1117733 -  -5.4  -3.70417   ATTATATTACTTAAA                 TAGC AAC GCTA                 GAATTAGTCGCACGC  59 10
   HCD_05315 NONE
   HCD_05310 NONE
   HCD_05305 NONE
   HCD_05300 NONE
        gatB 1109958 .. 1109980 -  -8.6  -4.86216   ATAAAAAACAAGAAA           CATAAGAAAA AAT TTTTCTCATG           AATTTAATTTCTCTT  93 21
   HCD_05290 NONE
   HCD_05285 NONE
        rnhA NONE
         rnc NONE
   HCD_05270 NONE
   HCD_05265 NONE
   HCD_05260 NONE
   HCD_05255 1102287 .. 1102311 -  -6.7  -3.24879   TTTAAAACCCAAAAT          TTAATCTTAAA AAA TTTAAAATTAA          GGGTTGCTTGTCTCT  64 22
   HCD_05250 1101333 .. 1101362 -  -7.3  -4.61527   AAAACTTGTGAAAAA       TCCCTAATTGAGA GCTG TTTCAATTAGGAA        AAACCGGTTGCTGGT  81 40
   HCD_05245 NONE
   HCD_05240 1098686 .. 1098701 -  -2.6  -3.77219   ATCATTGAAGTTAAA              CTTC-CT ATT AGAGAAG              ATGGCAACCTAAATG  50 173
        fliP 1089526 .. 1089536 -  -5.4  -2.89304   TCTAAAAGAGACAAG                 TAGC AAC GCTA                 AAAATAAAGATGATG  52 391
   HCD_05185 1085632 .. 1085651 - -11.4  -3.43773   TTTTAGAGTGAAACA            CCCCTCGC TAAA GCGAGGAG             CTTCCTAACTAAAGC  93 54
   HCD_05175 1082644 .. 1082660 -  -6.7  -3.99805   TCTTAAAAATCTAAA              GAATTTT AAG AAAATTC              CTTAAGTTCTTTTTC  71 14
   HCD_05165 1080561 .. 1080574 -  -6.7   -5.2422   AATGACACTAAAAAA               TAGCC TAAC GGCTA                TTGACGCTTACATCT  84 46
   HCD_05155 1078695 .. 1078714 - -11.4  -3.34894   AAGTGTCGTGAAACA            CCCCTCGC TAAA GCGAGGAG             CTTCCTAACTAAAGC  93 54
   HCD_05150 NONE
   HCD_05145 NONE
   HCD_05140 NONE
   HCD_05135 NONE
   HCD_05130 NONE
   HCD_05125 NONE
   HCD_05120 NONE
   HCD_05115 1071039 .. 1071049 -    -4  -4.59251   TCAAAAAAAATTAAA                 CAAA GCC TTTG                 ATAAATCAAGCTATC  66 478
   HCD_05105 1069634 .. 1069653 -  -9.2  -4.86939   CAACAAAGCGAAAAA            CTCCGTCC TTTA GGGCGGAG             ATGTAAGCGTCAATA 100 95
   HCD_05100 1068641 .. 1068651 -  -2.6  -4.72029   TGGAACTTAATAAAA                 TTTT TGA AAAA                 TGCAGTGAGCCAAAA  65 451
   HCD_05090 NONE
   HCD_05085 NONE
   HCD_05080 1065459 .. 1065474 -  -6.2  -4.93318   CAGAAGCGACAAAAA              GACTTT AAAA AAAGTC               AAAGATTTTACTCTT  80 33
   HCD_05065 NONE
   HCD_05060 1060183 .. 1060205 -  -4.9  -3.46534   TAAGCGGATTAAATA           GAGAGAGTT TGTAT AAGTCTCTC           AAAAAACACAAAAAA  55 139
   HCD_04965 1040320 .. 1040343 -  -5.5  -4.56133   GTTTAAGAATGAAAA          TATTTTATC AAAAAA GATAAAATA           TTTTATTAAAAATAA  73 43
   HCD_04960 1039296 .. 1039312 -  -3.7  -3.72139   CTAAACTTAAAAAAT              CAAACTA GGA TAGATTG              CCTATCTATGTTATT  54 58
   HCD_04930 NONE
   HCD_04915 1031132 .. 1031145 -  -3.9  -4.06419   TTTGCCCACAAATAA               TCTTT CCTC AAAGA                ACCAAGATCCCCCTA  57 506
   HCD_04910 1030458 .. 1030488 -  -2.1  -4.75372   ATTAGGCACCAAAAA      CCATTCTTTTAATA AATC TATTAAAA-AGTGG       CTAGGTTCAAAGAAA  61 461
   HCD_04905 1029897 .. 1029907 -  -5.4  -5.31275   TTCTACCATAAAAAA                 TGTC AAA GACA                 AGAAATGCAAAATCT  79 318
   HCD_04885 NONE
   HCD_04880 1026164 .. 1026182 -  -8.2  -4.10429   AATCATGGCTCAAAA             CACGCTTT TAG AAAGCGTA             GAAGTTAAGGTCTTA  79 475
        mnmA 1024648 .. 1024669 -  -6.5  -4.42765   GCCTAAAAAATCAAA           GGGGCTTAA ATAA TCACGCCCC            CACCAAGCACCACAT  74 9
   HCD_04860 NONE
   HCD_04855 NONE
   HCD_04850 1020457 .. 1020473 - -12.3  -4.06562   AACTTTAAGGATAAA              CCCCCTA ATT TAGGGGG              CAACTCTTTGAAAAA 100 439
   HCD_04805 NONE
   HCD_04800 NONE
   HCD_04795 NONE
   HCD_04790 NONE
   HCD_04785 1003785 .. 1003801 -  -2.4  -4.07885   CATGTTGTTTTAAAA              TAAAAT AGCTG ATTTTA              TTTGATTTCCTTCTT  52 23
   HCD_04780 1000958 .. 1000984 -   -11  -4.64334   AATTTGCTAATAAAA         CTCAAAAACCTT AAA AGGGTTTTTGAG         TTTTATTTGGCTTGA 100 50
   HCD_04770  997399 ..  997421 -  -4.8  -4.33248   GAACCTTAGAATAAA           TTGCCCCTTT TTA AAAGGGGTTA           AGAGATTTAATATGC  64 32
   HCD_04755 NONE
   HCD_04750  991632 ..  991653 -  -4.3   -2.7224   GGAGAGGATAGAGTA           TCGCCCCAA AAAT TGGGGGCTA            ATAGGGGAGAGACCT  46 40
   HCD_04745  989544 ..  989558 -  -5.7  -3.28159   GCAAAAAGTTAAAAT               CCCTT ATTTA AAGGG               GTCAAAACTTCGTTA  59 62
   HCD_04740  987335 ..  987345 -    -4  -2.86093   TCAAACGCAAAACAC                 TTTG AAT CAAA                 TCACTGGAATCATGA  46 431
   HCD_04730 NONE
   HCD_04725 NONE
   HCD_04720 NONE
   HCD_04715  982604 ..  982621 -  -4.9  -4.56597   GCTTTGTTTTAAAAA             TAAAGCC TTTA AGCTTTA              GCCCACAATATCTAG  68 23
   HCD_04700 NONE
   HCD_04695 NONE
   HCD_04690  978543 ..  978555 -  -2.7  -2.57132   CTCTTGTTTCATAAC                TCAAA ATG TCTGA                ACCTTTAAAGAAAGT  40 501
   HCD_04660 NONE
   HCD_04655 NONE
   HCD_04610 NONE
        dnaA  960096 ..  960106 -    -4  -3.58731   AAAATAGTTTGTAAA                 GAAA GTT TTTC                 ATCAAGGGGTTGGTA  53 463
   HCD_04590  957930 ..  957946 -  -6.5  -3.65812   TGCTTTTGAATACAA              TTCGCCC TTT GTGCGAA              ACTATGCCATTTTTA  66 60
   HCD_04575 NONE
   HCD_04570 NONE
   HCD_04565  949767 ..  949782 -  -6.2  -3.76413   TCTTAAAATTCCAAA              TGTTTC ACAT GAAACA               TTTTATCAGTTTTAT  66 355
   HCD_04500  938294 ..  938325 -  -9.6  -3.16564   GGCTTACCTTATGAA      GTGATTGAGCGTTAG TCT CTAAGGCTCAATC-C      TTGACTGGGCATAAT  78 5
   HCD_04490 NONE
   HCD_04485 NONE
   HCD_04480 NONE
   HCD_04475  931250 ..  931260 -  -5.4  -3.68256   TTTTGACTAAAAAAC                 CTTC AAG GAAG                 CCCTATGGTAGCCAT  59 464
   HCD_04465  929929 ..  929946 -  -2.7  -5.28176   CGTAGCTATAAAAAA             TAAAAGC GTGG GCTTTAA              AAGGTGTATACATAA  69 22
   HCD_04395  915408 ..  915425 -  -5.7   -3.0955   AAATCATATAAACTA             TAAAATG CCAA CATTTTA              ACATAAAAGATTAAG  57 125
   HCD_04390 NONE
   HCD_04385 NONE
   HCD_04380 NONE
   HCD_04375 NONE
   HCD_04370 NONE
   HCD_04365 NONE
   HCD_04360  908276 ..  908287 -  -2.2  -3.05046   TTAGGTCTTTAAAAG                GGCT TGAC AACC                 ACTAAAATCACAATC  41 7
        ubiE NONE
   HCD_04350 NONE
   HCD_04345 NONE
   HCD_04340 NONE
   HCD_04335 NONE
   HCD_04330 NONE
        flgA NONE
   HCD_04320 NONE
        coaD NONE
         tmk NONE
   HCD_04305 NONE
   HCD_04300 NONE
   HCD_04295 NONE
   HCD_04290  894387 ..  894440 - -11.9  -2.64651   AATTTTCTAAATTCA TTCTTTAAGGGGGGCGAAGACAC TCTTCATT GTGTCTTACCCCCCCTTAAAAAT CCCCCCATATTCCGC  89 92
   HCD_04285  892643 ..  892659 -  -8.7  -4.56367   TACCCTATAAAGAAA              CCCCCTA TTT TAAGGGG              GGTGGGGGGGGAACC  89 206
   HCD_04140 NONE
   HCD_04135  861668 ..  861678 -  -3.2  -4.91473   GAATCTAAAAACAAA                 GCCT TAA AAGC                 AAGAAATAGCGCTTA  70 417
   HCD_04105  851833 ..  851848 -  -2.6  -3.32882   AACCACAACAAGATA              GCATAA ACTC TTATAC               CTTCTCCTTATAAAG  45 33
        fumC NONE
        rnhB  849272 ..  849285 -  -6.7    -5.055   CGAACGCTGAAAAAA               TGCGA GACA TCGCA                AACTATCCCCACTGG  82 488
        rpsJ NONE
        rplC NONE
        rplD NONE
        rplW NONE
        rplB NONE
        rpsS NONE
        rplV NONE
        rpsC NONE
        rplP NONE
   HCD_04035 NONE
        rpsQ NONE
        rplN NONE
        rplX NONE
        rplE NONE
        rpsN NONE
        rpsH  840884 ..  840895 -  -4.4  -3.73224   TTATCCTTTACCAAA                TGCT ACAA AGCA                 CTTCGCCACCGACAT  55 6
        rplF NONE
        rplR NONE
        rpsE NONE
        rplO NONE
        secY NONE
   HCD_03975 NONE
        infA  836773 ..  836804 -  -4.6  -3.76393   ATATTTTAATTGAAA      TAACTCTTAAATTC ACTT GTATCTAAAAGTTA       TCCGACCTTTGTCTA  59 6
        rpmJ NONE
        rpsM NONE
   HCD_03955 NONE
        rpsD NONE
   HCD_03945 NONE
        rplQ  833746 ..  833757 -    -3  -2.88788   TTAACCAAAAACCCA                CAAA GAGC TTTG                 GTTAATTACAGATGA  43 45
   HCD_03935  832625 ..  832641 -  -2.3  -2.52574   TTATACAAAAGAATG              GTTTAAC TAA GTTAAAT              AGCTACTTTTCAATC  39 39
   HCD_03930  831434 ..  831458 -  -2.1  -4.98672   GGTAAAAATATAAAA          GATTGTATAGA GAA TCTACCCAAGC          ATTTACAAATTTCTC  66 517
   HCD_03890 NONE
        nhaA NONE
        yajC NONE
        secD NONE
        secF NONE
   HCD_03865 NONE
        leuS NONE
   HCD_03855 NONE
   HCD_03850 NONE
   HCD_03845 NONE
   HCD_03840 NONE
   HCD_03835 NONE
   HCD_03830  810378 ..  810393 -  -3.3  -2.76263   TTGATGACTTAATTA              CCTTT TAGTTT AAAGG               CATAGCAAACGATTA  43 113
   HCD_03825 NONE
   HCD_03820 NONE
   HCD_03815 NONE
   HCD_03810  806606 ..  806620 -  -4.2  -2.84878   TTTTTTAACTCAAAC               TGCTTG CAC CATGCA               TTTTTGACAAGCCCG  47 125
   HCD_03770  798166 ..  798185 -  -7.9   -4.4009   TCTCATCGCACAAAA            GGGCTAA CACTCT TTAGCCC             TTAGCATATCGTGCA  82 19
   HCD_03760  796277 ..  796312 -  -4.2  -4.42325   AGACAGAGAAAAGAA    CCTAATCAAGAAAA TCCAAACT CTCTCTTGATTAAG     CGACAGGTTAAATAC  63 44
   HCD_03755  795303 ..  795319 - -10.9   -3.2819   AGTTAAGATGAGCAA              CAAGCTC TCT GAGCTTG              GCTATCTCACCCCTA  80 69
   HCD_03705 NONE
   HCD_03700 NONE
        metN NONE
   HCD_03690 NONE
   HCD_03685  784410 ..  784420 -    -4  -2.98823   TGCTTTCTATACATA                 TTTC ATT GAAA                 GAGAGCTAAAGATTG  48 64
   HCD_03680  781874 ..  781887 -  -5.3  -2.76261   GCCGAACTTTCAAAG               GCTTT TTTG AAAGC                TAAGAATGCCTTTAC  52 408
   HCD_03660 NONE
        pdxA  777874 ..  777884 -    -4  -3.19383   AAAAAGCTAAGAAAG                 TTGT AAA ACAA                 TACAATGATAGATTC  48 456
   HCD_03615  766764 ..  766777 -  -4.5   -4.8384   GAAATAAGCTAAAAA               CCCTC TTAA GAGAG                TTTGAATGCTAATGC  71 34
        rpsT  758331 ..  758362 -  -6.1  -5.20154   AGAGAAGTTAAAAAA      CGCTTCTTAGAAGA CTTGC TCTT-TAAGAAGCA      AGAGCGATTTTTTTC  82 16
        prfA  756867 ..  756884 -  -3.5  -4.16681   AACACCATTTTAAAA             CAAATAG GGTT CTATTTA              GTAAAACATTGATTA  57 330
   HCD_03555  755067 ..  755080 -  -2.5  -2.60508   TAGTTTTTAAAAAGC               TTTTT ATTT AAAAA                CCATGCTCTATTTTT  40 19
   HCD_03550  753792 ..  753805 -  -5.3  -3.23393   TGGTATTTCACAAGA               CATCT TAGA AGATG                TGGGTGGGAAGAAGT  56 42
   HCD_03495  741962 ..  741974 -  -2.7  -3.06261   TTCTAAGGCCTAATA                CTTCT TTA AAAAG                AGAGATTTAAGAATT  43 148
   HCD_03480 NONE
   HCD_03475  735958 ..  735978 -  -5.5  -3.41359   CTGTGAAAATTAAGA            GGCATTT TGAGTTT AAATGCC            TTGATTTAGTGCTAC  60 318
   HCD_03450  727435 ..  727446 -  -7.2  -2.83519   TTGATAAACATAGTA                GGGC TAAC GCCC                 CTTTTAATTAAAGGT  63 45
   HCD_03445  725503 ..  725521 -  -4.6  -4.61633   ACATACGCTTAAAAA             GTGGTA TTTTCTT TACCAC             TTTTACCACTCTTTT  68 28
   HCD_03430 NONE
   HCD_03425 NONE
        dnaK  721025 ..  721040 -    -4   -3.5394   AAAGGGGGCGTGAAA              GTGG-GT TTT ACTCCAC              TTCCGCATCAATCAC  52 17
   HCD_03415 NONE
   HCD_03410  718043 ..  718060 -  -2.1  -4.18367   CATCACACATAGAAA             TAAAAAA ACTT TTTTTCA              AGCCCCCTTTCGCTT  56 193
        thrS  711153 ..  711174 -  -3.1  -2.63073   TTCGTTTAACAATAC           TTCGTTTTT ACTC AAAAACTAA            CCTCTTGCATTTTAG  42 15
        infC NONE
        rpmI NONE
        rplT NONE
   HCD_03365  708847 ..  708864 -  -6.3  -3.40788   ATCTAATCCAATCAA             GCTCTCT TTTT AGAGAAC              CTGTAAGACCAAAAA  63 46
   HCD_03360  708164 ..  708181 -  -2.7  -4.18259   AAACGCCAAAAAACA             CTCTAAT GCTT ATGAGAG              CCTGATTTTTTCTTC  53 10
   HCD_03355  707014 ..  707034 -  -3.3   -4.4267   TGCGAAAAGGCAAAA            CCTACCTAT AAC ATAGACAGA            TTCTATTTAGTGTAG  60 28
   HCD_03345 NONE
   HCD_03340  704017 ..  704032 -  -3.2  -3.30701   TTGTAGCAAACTCAA              TGACGC ATTC GCACCA               AACTATAAGATTGCA  47 6
   HCD_03335 NONE
   HCD_03330  702019 ..  702032 -  -4.5  -3.38007   CATAGAAACCAAAAT               GCTCC TAAG GGAAC                GATAATAAGAACGCT  55 188
   HCD_03325  701692 ..  701716 -  -2.7  -4.72486   TACAAAGGGTAAAAA          GCCTATTGCTA CCA TGGCTATTGGC          ACGATAATAAAATCA  62 78
   HCD_03320  700656 ..  700670 -  -4.3  -3.97368   GGTTTAAGTTAGAAA               TCCTA GTTTT TAGGA               TTTGTTAAAGGGGTA  57 54
   HCD_03315  700101 ..  700112 -    -3  -2.78776   AAGGCTTGAAAAGAC                TTTC ATTT GAAA                 AAGCGTTATTTCTTT  43 31
   HCD_03310  699570 ..  699586 -  -9.5  -3.79565   AGAAACACATTCAAA              CGCTTTT TTA AAAAGCG              TTTTGCTTATAGCCT  84 263
        alaS NONE
   HCD_03295  696020 ..  696046 -    -6  -4.71061   AGCCACACTCAAAAA         TATCGCTTGA ATTTTCA TCAAACGATA         CTATAAAAATAATAA  75 61
   HCD_03290  695448 ..  695458 -    -4  -4.56775   ATTGTTCCCTAAAAA                 GATA AGC TATC                 AAAAAACCAAATGAT  65 114
   HCD_03285 NONE
   HCD_03280 NONE
   HCD_03275  692668 ..  692678 -  -5.4  -4.33739   CAAAAAAGTTGAAAA                 TCTC ATT GAGA                 CTTTTAAAAAAGAAG  67 393
   HCD_03240 NONE
   HCD_03235  684829 ..  684844 -    -4  -5.24129   TCGCTTTAGAAAAAA              TAGAGC AAAA ACTCTA               TTTTGGCATGCATCA  74 525
   HCD_03215 NONE
   HCD_03210 NONE
   HCD_03205 NONE
   HCD_03200 NONE
   HCD_03195 NONE
   HCD_03190 NONE
   HCD_03185  678330 ..  678342 -  -3.5  -3.01791   ATTTTCTCTCTAAGA                TTTTT TAA AAAAA                TAAACCCCAAAAAAT  46 7
   HCD_03180  677635 ..  677649 -   -10  -2.86033   TAAGGATTAAAATAG               GGCGTT ATT AACGCC               TATTTTTGTTTGTAG  76 102
   HCD_03175  676351 ..  676366 -  -4.7  -4.73388   AATTTTGATTAAAAA              GGCTT TGATTC AAGCC               ATTGAAGTAGCCCTA  74 280
        recA NONE
         eno NONE
   HCD_03155 NONE
   HCD_03150 NONE
        aroK NONE
   HCD_03140  670927 ..  670941 -  -6.4  -3.85114   AAATGCTAGATTAAA               GGGCTT AAA AAACCC               TTTTTACACACTCTT  66 39
   HCD_03135 NONE
   HCD_03130  669095 ..  669116 -    -8  -4.26903   CTTAGTTTATCAAAA           GGGGCAAA GTGTGT TCTGCCCC            GAACAAGATATCTTA  78 486
   HCD_03120  667245 ..  667269 -  -5.7  -4.44914   TATTGAATAAAAGAA          GAGCCTAGACT TCA AAACTAAGCTC          TAAAAGAACCTTTTT  71 82
   HCD_03055 NONE
   HCD_03050 NONE
   HCD_03045  653555 ..  653565 -  -8.2  -3.42459   TAGTGAGAATATCAA                 GGCG TTG CGCC                 CAAATCTTGGCCTAC  70 457
   HCD_03025 NONE
        lysS NONE
   HCD_03015 NONE
   HCD_03010 NONE
   HCD_03005  645679 ..  645697 - -10.4  -3.61889   TAAAAATCTTTGAAA             TGAGCTAA GTT TTAGCTCA             AAACTCAAGGCATTT  85 30
   HCD_03000  642871 ..  642884 -  -5.3   -3.9009   AATTCACCCTATAAA               CCTTA TGGT TAAGG                CAATTTAGGTAAATT  63 253
   HCD_02995 NONE
   HCD_02990  640794 ..  640827 -    -4  -2.82923   ATTATGAAAATCAAG     GCATAAACACAC AAAGCTATGA GTGTGTTTATGA      TAAGTGTTTCTTTTT  47 97
   HCD_02985  639463 ..  639476 -  -6.7   -5.2422   AATGACACTAAAAAA               TAGCC TAAC GGCTA                TTGACGCTTACATCT  84 146
   HCD_02975  637597 ..  637616 - -11.4  -3.34398   TTTTGGTGTGAAACA            CCCCTCGC TAAA GCGAGGAG             CTTCCTAACTAAAGC  93 54
   HCD_02970 NONE
   HCD_02965  635722 ..  635754 -  -2.9  -3.11208   GCGCATTTAAAACCA     TTGAGACAAATCAT GCTTAA ATG-TGTGTCTCAA      CTTCTCATCCTTAAG  43 36
   HCD_02960 NONE
   HCD_02955 NONE
   HCD_02950 NONE
   HCD_02945  630165 ..  630175 -    -4  -2.62098   ACTAGCTTAAAAACC                 CTTT AGA AAAG                 TCTAGGCTAAATCTA  46 27
   HCD_02940  629706 ..  629726 -    -2  -4.24948   TCATTATAGCTAAAA           TTA-TGCTT TTTT AAGCAATAA            TTTAGCTAACCAAAA  54 45
   HCD_02935  626594 ..  626617 - -10.4  -4.09685   TTCCAGCTTTCAAAA          TAGAAATGCG TAAA CGCACTTCTA           TAATGGATAATGAAA  89 446
   HCD_02925  625799 ..  625809 -  -2.6  -2.72227   AATATTTTTGAATGA                 TATT GGC AATA                 ATCTTGGGTTTATTA  40 38
   HCD_02920  625577 ..  625596 -    -8  -3.68738   TATGGGAAGACACAA            TAATTAGC TTGG GCTAATTA             GCTGATTATAAATCT  72 31
   HCD_02910  621933 ..  621955 - -10.8  -3.10409   TACGAATTTACTCAA           GTAAGATTAT TCA ATAATCTTAC           TGACAACACCAGCAC  85 9
        rpmG  621547 ..  621559 -  -4.9  -3.45733   TAAAATACATAAAAT                GAATT TTT AATTC                TAGCTAAAAATAGCT  55 211
        secE NONE
        nusG NONE
        rplK NONE
        rplA  619490 ..  619503 -  -3.9  -2.73994   ACCTCTGCAAGATTA               TCTTT TTTC AAAGA                AATTTTAAGCTTCCT  45 89
        rplJ  618956 ..  618968 -  -3.3  -3.91352   ATATTCTTAATTAAA                GCCAT AAA AAGGC                TATTAGTTTTCTTCT  54 28
        rplL  618516 ..  618534 -  -5.3   -3.8766   CCATACTAGAGCAAA             GAAAGAC ACAAG GTCTCTC             AAAATTTTAGGTTTT  63 39
   HCD_02870 NONE
        rpsL NONE
   HCD_02860 NONE
   HCD_02855  606521 ..  606554 - -14.1  -5.02201   AAAACATTATAAAAA     TAAAGTCGTGTTAGA AATT TCTAACACGACCCTA      CAAAAGCCATTAAAT 100 74
   HCD_02850  605320 ..  605355 - -22.8  -4.18934   TATTATCCCAACAAA    GCGAAAAACTCCGCCC TAAA GGACGGAGTTTTTCGC     TTTGTTGGGATAAAA 100 367
   HCD_02845  604941 ..  604967 -    -6   -2.8785   TAATGAACGATTAGA         CAGACTATTT GGAAAAG AAATAGCCTG         CACCCATCACAACCA  55 3
   HCD_02820  598779 ..  598798 - -11.4  -3.44888   AAGGATAGTGAAACA            CCCCTCGC TAAA GCGAGGAG             CTTCCTAACTAAAGC  93 54
   HCD_02815  598342 ..  598363 -  -9.5  -4.49041   ACACAAAAAACCAAA           GAAAGCGTT CTCA AACGCCTTC            TTCAAGTCAATTAAG 100 36
        hisS NONE
   HCD_02795 NONE
   HCD_02790  592694 ..  592714 -  -4.8  -5.18297   CAAGAATAAACAAAA           TCTCAAAGC TATT GCTTTG-GA            TACATTCTTACCTAA  79 364
   HCD_02780 NONE
   HCD_02775  589155 ..  589168 -  -3.9  -4.75372   ATTAGCCACCAAAAA               TTTCT TAAA AGAAA                TGCAAAACTTACACC  69 120
   HCD_02760 NONE
   HCD_02755 NONE
   HCD_02750 NONE
   HCD_02745 NONE
   HCD_02740  579603 ..  579637 -  -7.8  -4.25104   GCCTTGTTATTAAAA     TTGTAGGGGGAGCGTT AAA AACTCCCCCCCTTTAA     TTTTTGCTAATAACG  79 254
   HCD_02735  577133 ..  577147 -  -3.6  -3.42354   TATCTCAAGCCACAA               GATATT GCC AACATC               GTGCTATGGATTTAT  50 136
   HCD_02720  573554 ..  573564 -    -4  -3.26188   AACATCATAAGTCAA                 TATC ACG GATA                 AAAGGGACACCTCCA  50 4
   HCD_02715  572695 ..  572723 -  -2.4  -4.34482   TCTTCTAAAAAAAGA        CTCCCTTAAGGA TATTT TTCTTAGGGGAA        TTATATAAAAACCTT  54 135
   HCD_02635  553079 ..  553089 -  -6.8  -3.43187   CATAAAAACCACCAA                 CGCT TTT AGCG                 TTTATCCCCACTTAA  65 20
   HCD_02630 NONE
   HCD_02625 NONE
   HCD_02620 NONE
   HCD_02615 NONE
   HCD_02610 NONE
        guaA NONE
   HCD_02600  544962 ..  544972 -    -4  -3.40775   ATTTTGACTTAAAGA                 GTTA TTA TAAC                 TTAATTTTTTTGAGT  52 259
   HCD_02585  539496 ..  539507 -  -2.2  -2.60032   CCTTCCTTAAAAACC                GACT GAAT AGCC                 CACATAGAAGCTAAA  39 5
   HCD_02580  538008 ..  538031 -  -4.6  -5.59502   TAAAAAACTAAAAAA          GCCCTTTTAA GCCC CCAAAAGAGC           TATTTTGAGAGCTTA  85 38
   HCD_02575  536699 ..  536713 -  -5.8   -3.0672   AAAACAGAAGCAAAT               TTTTTC ATA GAAAAA               TCGTGTCTTCTCTTT  57 15
   HCD_02570 NONE
   HCD_02565 NONE
   HCD_02560  534588 ..  534620 -    -2  -3.12327   CGCTCACACTTAACA      CACTCATTGTAAAA CTTCC TTATACAAGGCGTG      TAATATCATTAAACA  42 12
        xseA  533035 ..  533045 -  -2.6  -5.42164   CACAAAGAAGAAAAA                 TAAA AAT TTTA                 GATTGGGAAATTGAT  72 312
        nrdF NONE
         pcm NONE
   HCD_02535 NONE
        truA  529061 ..  529074 -  -3.9  -3.50045   ACCTAGACACCATAA               TAAAG AGCG CTTTA                GAATGGGAAGAACAC  52 52
   HCD_02510  526095 ..  526119 - -12.3   -5.0666   GAGTTAAAAAATAAA          TGCGGTTAAAA AAC TTCTAACCGCA          AGAAGTGAGCTAGAA 100 42
   HCD_02505  525243 ..  525257 -  -2.2  -4.31692   AACCTACCAGCAAAA               TTCTAA TCT TTAAAA               ACTTTGATTTTGATA  54 84
   HCD_02500  523971 ..  523985 -  -4.3  -2.81564   GAAATTCATGCAAAG               CAACT AAAAA AGTTG               AACCCAAATTAGGCG  48 247
   HCD_02475  519154 ..  519173 -  -9.2  -4.86939   CAACAAAGCGAAAAA            CTCCGTCC TTTA GGGCGGAG             ATGTAAGCGTCAATA 100 95
   HCD_02470  517887 ..  517914 -  -9.2  -3.97443   AAAAGCTCAAAAACA        CTCACACCAGCT CAAA AACTAGTGCGAG         CAAGCATGTTCTAAA  86 16
   HCD_02465 NONE
   HCD_02460 NONE
   HCD_02455 NONE
   HCD_02450  514936 ..  514959 -  -5.4  -3.75506   AGAACTTACTAATAA          CTCATATAAG ATAA CTCATATAAG           AACTACTAGCTAGAA  61 62
   HCD_02445  511510 ..  511531 -  -6.7  -3.52358   TTAAGAAAAATTTAA           GCTCTAAAA GGCA TTTTAAAGC            GTTTTTTATTTTAAG  65 278
   HCD_02440 NONE
   HCD_02435  509420 ..  509449 -  -5.2  -4.75219   TAATTATTAATAAAA       CATTAGATAATC AATAAA AACTATCTAATG        TTATGCTATTTGTCT  72 96
   HCD_02425 NONE
   HCD_02420  506932 ..  506945 -  -6.7   -5.2422   AATGACACTAAAAAA               TAGCC TAAC GGCTA                TTGACGCTTACATCT  84 174
   HCD_02410  505066 ..  505085 - -11.4  -3.34517   AGTTTTTGTGAAACA            CCCCTCGC TAAA GCGAGGAG             CTTCCTAACTAAAGC  93 54
   HCD_02405  504227 ..  504238 -    -3  -3.21998   CTAAACTAAAATAAG                CTTT CATA AAAG                 TTTTTCTAAATCCTC  47 17
   HCD_02400  503487 ..  503497 -    -4  -2.98813   AGCTTACAATAATGA                 TAGA CTA TCTA                 AAATACGCTTTTTAG  48 3
   HCD_02395 NONE
   HCD_02390 NONE
   HCD_02385 NONE
   HCD_02380 NONE
   HCD_02375 NONE
   HCD_02370 NONE
   HCD_02365 NONE
   HCD_02360 NONE
   HCD_02355 NONE
   HCD_02350 NONE
   HCD_02345 NONE
   HCD_02340 NONE
   HCD_02335 NONE
   HCD_02330 NONE
   HCD_02325 NONE
   HCD_02320 NONE
   HCD_02315  487075 ..  487090 -  -3.2   -3.6715   TTATTTAAGGCTAAA              GAGCTT ACTT ATGCTC               GTTTAGCAAGCCTTC  52 147
   HCD_02305 NONE
        aroB NONE
   HCD_02295 NONE
   HCD_02290 NONE
   HCD_02285 NONE
   HCD_02280 NONE
   HCD_02275 NONE
   HCD_02270  469186 ..  469210 - -12.3  -3.48598   TAAGGAAGTTAAATA          CCTAAAGAAGT AGG ACTTCTCTAGG          CGTTGGCTCTCTAAA 100 90
   HCD_02265  468339 ..  468355 -  -3.7  -3.07439   TAGAAAAAGATTAGA              TATTGCT TAT AGCACTA              CTGATAAGATAAGAT  47 84
   HCD_02215  458949 ..  458968 - -11.4  -3.41341   AATTTTAGTGAAACA            CCCCTCGC TAAA GCGAGGAG             CTTCCTAACTAAAGC  93 54
   HCD_02205  456741 ..  456774 - -14.2  -4.30719   TTCGTGCATAAGAAA     TAAATTAGAGAGAG TCCTAG CTCTCTCTAATTTA      TCCTAAAAAACACTC 100 218
   HCD_02175  451020 ..  451033 -  -6.7  -3.36991   TACCACTTCTAAACA               GGGTT TTAA AACCC                CACACAGCTTCCTAA  64 17
        flgH NONE
   HCD_02160 NONE
   HCD_02155  447848 ..  447864 -  -3.7  -4.25074   TACGAAACTCTAAAA              CAAGCAA CTT TTCCTTG              TCATCTAAATTAGTA  60 81
   HCD_02150  447368 ..  447384 -    -3  -3.66178   GTGCTGAATTTGAAA              CTAGAA ATTTG TCCTAG              GGTTTTAGAGAAAAT  50 22
   HCD_02135 NONE
   HCD_02130 NONE
        minE NONE
   HCD_02120 NONE
   HCD_02115  442050 ..  442062 -    -2  -3.69469   AGACTGCAAGAAATA                TTGA AGTTA TCAA                ACACCAATGGTTTCA  49 164
   HCD_02085 NONE
        fliF NONE
        fliG NONE
        fliH  431373 ..  431389 -  -2.3  -3.32354   GGTTTAAATTAAAAG              TTTGTTT TTT AATCAAA              ACGCTATACCTTAAA  44 29
   HCD_02065 NONE
   HCD_02060 NONE
   HCD_02055 NONE
   HCD_02050  426305 ..  426317 -  -4.1   -3.4934   TATACCAAATACCAA                CCTTG ATA CAAGA                AAACACTTTGTTACT  52 52
   HCD_02045  423988 ..  424001 -  -2.4  -3.34344   TTATTTTGCAACGAA               CTCA CAATTT TGAG                CCTTTGCATGATTTT  44 301
   HCD_02030 NONE
   HCD_02025 NONE
   HCD_02020  419975 ..  419985 -    -4  -2.90645   AAAAAGATAACACCA                 CTTT TAA AAAG                 AACGCCCTAATTTTA  48 136
   HCD_02015  419021 ..  419046 - -11.3  -4.20136   ATCTTTAAAAGGAAA         CCCTACCTTTT AGAT AAAAGGTAGGA          AAGCCACTCAGCGTT 100 477
   HCD_01970 NONE
   HCD_01965  405607 ..  405620 -  -6.7   -5.2422   AATGACACTAAAAAA               TAGCC TAAC GGCTA                TTGACGCTTACATCT  84 33
   HCD_01955  403741 ..  403760 - -11.4  -3.44255   AGAACCAGTGAAACA            CCCCTCGC TAAA GCGAGGAG             CTTCCTAACTAAAGC  93 54
   HCD_01950 NONE
   HCD_01885 NONE
        ruvA  383721 ..  383733 -  -4.1  -3.77832   CTCCAAACTTAAGAA                TGCAA TTG CTGCA                ACGCTTCTTTAATCG  55 6
        ruvC  368607 ..  368620 -  -2.3  -4.67038   GCCCTAAAACCAAAA               GCCGT TGGA ATGGC                TTACTGCTTTCAGCG  58 190
   HCD_01845  364506 ..  364534 - -13.3  -3.97108   AATTTCAAAAGACAA        GGCATTCTTGAGT AAA AATCAAGAATGCC        TAAAGAAAATAGTCT 100 49
   HCD_01840  363508 ..  363519 -    -3  -3.85389   CTTTAAGAATTTAAA                TATC CTTA GATA                 GTAGTATAAGACACT  52 19
   HCD_01835  363195 ..  363215 - -12.7  -3.63569   CGAATTTCTTAAGAA            GGCTTAGAA TAT TTCTAAGCC            TATAAAAACACCTAT 100 37
        flgE  360450 ..  360461 -    -3  -2.80443   TTATATTGTATTAGA                GTAA TTTT TTAC                 CCTATTGCTTAAGAT  43 27
        hypA NONE
   HCD_01815 NONE
   HCD_01810 NONE
        greA NONE
         dut NONE
   HCD_01795 NONE
   HCD_01790 NONE
   HCD_01785 NONE
   HCD_01780 NONE
   HCD_01775 NONE
   HCD_01770 NONE
   HCD_01765 NONE
   HCD_01760  350833 ..  350853 -  -3.3  -4.70534   GAAAGATATATAAAA            TAGGGTTAA CTC TTAACCGCA            AAATGCCTTTCAATA  64 10
   HCD_01740  348535 ..  348545 -    -4   -4.5187   CTCAAAAAAATTAAA                 CAAA GCC TTTG                 ATAAATCAAGCTATC  63 478
   HCD_01725  347131 ..  347150 -  -9.2  -4.86939   CAACAAAGCGAAAAA            CTCCGTCC TTTA GGGCGGAG             ATGTAAGCGTCAATA 100 95
   HCD_01720 NONE
   HCD_01715 NONE
   HCD_01710 NONE
   HCD_01705 NONE
        thiE  341990 ..  342008 -  -3.2  -3.13676   CATAGCCAAAATAAT             GGATTTAA AGC TTAAATAC             TTATTGATAATTTCA  45 69
   HCD_01695 NONE
   HCD_01690 NONE
   HCD_01685 NONE
   HCD_01680 NONE
   HCD_01675 NONE
   HCD_01670  337244 ..  337256 -  -4.1   -3.4758   CAGTAAGAACACTAA                GCCAA AAA TTAGC                TCCCTTTACTTTCAC  52 37
   HCD_01665  336450 ..  336470 -  -3.3  -5.48028   CAAAGAAAAAGAAAA            GCAACTTTT TTT AAAAGCCAC            ACATCAAAGAACCAA  79 451
   HCD_01620 NONE
        speE NONE
        coaE  326036 ..  326047 -  -4.4  -3.16093   TTAAAGTCAAAACGA                GCTT ATAG AAGC                 GTTTTTAAAAAACAT  49 16
        gatA NONE
   HCD_01600  323097 ..  323122 -  -2.7  -4.62872   ACTAAGTTTTAAAAA         CTCATTAAA CTAGGCTT TTTAACGAG          TTTTTTAATGATCTG  60 60
   HCD_01595  322234 ..  322244 -  -5.4  -3.11812   ATGGACATGACTTAA                 CTCA TCT TGAG                 ATTACAATCTATACT  54 133
   HCD_01590  321685 ..  321698 -  -5.3  -5.29716   CCAATACAACAAAAA               CTAAG ATTT CTTAG                GATTAGCTTCGGTTA  79 12
        mraY NONE
        murD  316517 ..  316528 -    -3  -5.03747   AAATTTTTCAAAAAA                TTTC TCAT GAAA                 GGTATGTTATTCAAG  68 45
   HCD_01550  314922 ..  314934 -  -5.5  -3.22678   AATTCCTGATAAAAC                CACCC AAA GAGTG                CTTTTTAATAAATTT  59 30
   HCD_01545 NONE
   HCD_01540 NONE
   HCD_01535 NONE
   HCD_01530  310753 ..  310764 -    -3  -3.38674   AAAACCCTTAAAAAG                TGAT TGGC ATCA                 TTAAAGTAGAAATTT  48 6
        gyrB  308335 ..  308347 -  -6.3  -2.50994   TGTAATTCTATTAAT                CTATC ATT GATAG                CTCTAGTCTCCAAAA  57 92
   HCD_01520 NONE
   HCD_01515  306015 ..  306029 -  -5.7  -3.89346   TGTTGAGCTGAGAAA               CACTG TGTTT CAGTG               GTTCTTTAACTTTGG  63 291
   HCD_01505 NONE
   HCD_01500 NONE
        fliL  303481 ..  303491 -    -4  -3.21225   GTAAAAATTATTGAA                 TGAT AAA ATCA                 GTGAAAAAGACATTC  49 7
        acpS  302719 ..  302736 -  -2.7  -4.20367   CCTTTCAATAAAGAA             CAAAACC GCAT GGTTTTT              TTAGGCTACGGAATA  57 394
   HCD_01480 NONE
   HCD_01475  298825 ..  298839 -  -7.2  -3.05343   TCTAGAGTTCTAAGA               TTAAGC TAT GCTTAA               AAGAGAATGATTCAA  65 11
   HCD_01440  292873 ..  292884 -  -5.8  -4.63218   CTGCTCCTAACAAAA                GCCT TAAT AGGC                 TTAGAGCCTACCAAA  73 55
   HCD_01425  289841 ..  289851 -    -4  -5.40072   GTCTGTTTAAAAAAA                 GTTT TCT AAAC                 ATTCAAAAAACTTTC  78 335
   HCD_01315  269193 ..  269203 -  -2.6    -4.287   AAATAAATTCTAAAA                 TTAT TCA ATAA                 TAAGAACAGAAAATT  55 114
        oorD NONE
        oorA NONE
        oorB NONE
        oorC NONE
   HCD_01290 NONE
   HCD_01285 NONE
   HCD_01280 NONE
   HCD_01275  261606 ..  261619 -  -6.7  -3.85817   ACTTCTTGCTACAAA               TTGGG TTTA CCCAA                ACAAGCTAAATCGCT  69 244
   HCD_01270  260582 ..  260599 -  -4.9  -3.07935   ATTCTAGCCATTGAA             CCTTCTT TGAA AAGAAAG              TTTGATGTCCCAAAA  52 203
   HCD_01250  254362 ..  254385 -  -8.2   -4.4891   CTGACTAGCATAAAA          GCTAATGCCT TAAA AAGCACTAGC           TCCATACAAATATCC  85 47
   HCD_01245  253563 ..  253575 -  -3.4  -3.97694   AAAGAGATACAAGAA                GCAT AAGAG ATGC                AAGGAATCTAAAAAA  54 42
   HCD_01240  252947 ..  252959 -  -3.5  -2.98813   ATTCTACAATAAGTA                TTTTA TCC TAAAA                ATTTAGTAAAATCAT  46 15
        hemE NONE
   HCD_01230 NONE
   HCD_01225 NONE
   HCD_01220 NONE
   HCD_01215  245841 ..  245855 -  -4.3  -2.73721   AGTAAGGTTCAATCA               GCTAT TTCAT ATAGC               AAAAGATTGAGCCTA  47 222
   HCD_01210  245144 ..  245164 -  -7.5  -3.00785   TAAACAACAGAATGA            CGCTGGGCT TGT AACCCAGAG            CGAAGGTTATTTGCG  64 206
   HCD_01205 NONE
   HCD_01200  241553 ..  241563 -    -4  -4.59251   TCAAAAAAAATTAAA                 CAAA GCC TTTG                 ATAAATCAAGCTATC  66 478
   HCD_01190  240148 ..  240167 -  -9.2  -4.86939   CAACAAAGCGAAAAA            CTCCGTCC TTTA GGGCGGAG             ATGTAAGCGTCAATA 100 95
   HCD_01185 NONE
   HCD_01180 NONE
   HCD_01175 NONE
   HCD_01170  236870 ..  236904 -  -2.3  -5.61689   AAAAGCAATAAAAAA    CTTTATAAACTCACTA AAAA TCGTG-GTTTAGAAAG     GGTGAGTATACCCAT  80 158
   HCD_01155  232587 ..  232597 -  -5.4  -4.59773   TCTTATGCCCAAAAA                 CTAG GAG CTAG                 TAACCTTGCCTTAGG  73 361
   HCD_01145  230766 ..  230784 -  -4.7  -4.16842   GTTATTTTGAAGAAA             CTTTTTT ATCAA AAAAAAG             AAACGCAAATTCATG  62 244
   HCD_01140 NONE
   HCD_01135  228411 ..  228423 -  -2.7   -3.2594   ACCCCAAGAAAACTA                TCCTT AAA AAAGA                CCTTGTTATTTACTT  45 324
   HCD_01120 NONE
   HCD_01115  225440 ..  225455 -  -3.2  -4.65747   CAACCTTTAAGAAAA              CACACT ATCA AGAGTG               AATTTTCTATTCACG  64 443
   HCD_01105 NONE
   HCD_01100 NONE
   HCD_01095  221145 ..  221161 -  -2.3  -2.55213   TATCCATTCAAGCGA              CCCTTAT TGT ATAAAAG              CGGTTTGTTAGCTCT  39 1
   HCD_01090 NONE
   HCD_01085  219114 ..  219125 -  -4.4  -3.24976   AACTCCGTAAAGACA                CACA AATT TGTG                 GCTTAGATTTAGGGG  51 65
        uvrA  206328 ..  206359 - -10.6  -2.58183   AAAACACTTAATTGA      TAATATATATATAT ATAT ATATATATATATTA       AATGATAAAGATTAG  78 58
   HCD_01040  205744 ..  205756 -  -3.5  -3.64703   GGTTTTTGATTGAAA                TTAAA CAT TTTAA                AGAGCCTTTAAGAGT  52 33
   HCD_01035  204234 ..  204247 -  -6.7  -3.23326   ATCAAACTAGCAAGA               GAGCT CTTT AGCTC                AACGCTTAAAAAGAC  61 327
   HCD_01015  201079 ..  201098 - -11.4  -3.54879   TTGAAAAGTGAAACA            CCCCTCGC TAAA GCGAGGAG             CTTCCTAACTAAAGC  93 54
   HCD_01010  199672 ..  199695 -  -2.6    -4.788   AAATCAAGCTAAAAA          CAATTTAA CAAATTAT TTAAATTG           TATGTATTCAAAAAG  65 72
   HCD_00995  198329 ..  198341 -  -3.3  -3.16881   TACCCACTTCACTAA                GCGTT GCC ATCGC                TGGTGGTATAGGATA  47 110
   HCD_00980  197066 ..  197082 -  -4.4  -4.36914   CTTTTCTTTAGAAAA              TAGCGG CACTC CCACTA              GTGAAAGAAACAAAG  66 374
   HCD_00970 NONE
   HCD_00965 NONE
   HCD_00960 NONE
   HCD_00955 NONE
   HCD_00950 NONE
   HCD_00945 NONE
   HCD_00940  186961 ..  186990 -  -5.1  -2.83846   TACATACAAAACTCA       TTAGAGAGATTTA CTCC TTACTCTCTCTAA        CTCCTTTTAAATCAC  52 32
   HCD_00935  185831 ..  185847 -  -8.1  -5.73563   ATTAAAGCAAAAAAA              CCATTTT AAA AAAATGG              TTATATTGCTTTTTT 100 39
   HCD_00930 NONE
   HCD_00925 NONE
   HCD_00920  183557 ..  183575 -    -6  -4.55887   CTTTAAAAATATAAA             TGCCATGT TAA ACATGCCA             TAAAAAAGCAAAGTG  73 104
   HCD_00915 NONE
   HCD_00910  182584 ..  182597 -  -2.5  -3.60818   TTAAAAGCGTTTAAA               TAAAT AGCC ATTTA                CATTCTATTAGTAGG  48 23
   HCD_00905  182247 ..  182262 -    -4  -3.78329   TTTTACTAAGCTAAA              CATGAA CGAA CTCATG               GCACTAGCAAATGCT  54 52
   HCD_00885  178627 ..  178646 -  -6.4   -3.0634   AACCCTATTGCAACA            CCCCCT ACAACAAA AGGGGG             TTTATCATGCTTAAG  60 53
   HCD_00880  177247 ..  177262 -  -3.2  -3.27873   ATATAAGATTAAAAC              GCCACA TGTT TGTTGC               TGGCGTTTTTTACAA  47 3
   HCD_00875 NONE
   HCD_00870 NONE
   HCD_00865  175196 ..  175213 -  -2.8  -4.25104   GTTTGTGTATGAAAA             TAAAAC GGTGGT GTTTTA              AAGGGCATTGTTTTA  55 201
   HCD_00850  172961 ..  172973 -  -2.7  -3.31461   TAGTTATCGCTACAA                GCATT CTA AATAC                TCTGTAGGCGTTTCT  46 202
   HCD_00765 NONE
   HCD_00760  155374 ..  155394 -  -4.7  -4.19735   CTTTTTAAAATTAAA            GGTTTAACA AAA TGCTAACCC            AAGTAAAATATTTTT  64 317
   HCD_00750 NONE
   HCD_00725  143731 ..  143752 -  -2.3  -5.74122   TATTAGATAAAAAAA           TCGCTT-TTG TTT CAATAAGCGT           TGATTTTAAAAATGA  80 133
   HCD_00720  142658 ..  142684 - -10.4  -2.85017   TAAAACAATAGACCA         TTAAAGCCTTTT TTA AAAAAGCTTTAA         AACCGATACACATAA  78 22
   HCD_00710 NONE
        ileS NONE
   HCD_00700 NONE
        fliI NONE
        fliQ NONE
        murB NONE
   HCD_00680 NONE
   HCD_00675  133476 ..  133487 -  -5.8  -3.14931   TTGATTTGTTATGAA                GCAC AAGC GTGC                 TTTTGGCTCACAAAC  58 219
   HCD_00645 NONE
   HCD_00640 NONE
   HCD_00635 NONE
   HCD_00630  126872 ..  126903 - -11.8  -2.89323   AAAATGGGCTAGACA      TTCATTTTGCGTAA AATT TTACGCAAAATGGA       TACATAATGCCATTG  90 90
   HCD_00610 NONE
   HCD_00605 NONE
   HCD_00600 NONE
   HCD_00595  119344 ..  119357 -  -2.5   -3.0079   CATATAAACATCACA               TTTTT GTTT AAAAA                TCCTTATTCTCAGCT  42 19
   HCD_00590 NONE
   HCD_00585 NONE
   HCD_00580 NONE
   HCD_00575  116905 ..  116918 -  -3.1  -5.18371   TTGCATAAAATAAAA               CCATC TCTA AATGG                CACACTGGAAACCAT  71 494
   HCD_00570  115940 ..  115954 -  -2.8  -4.14633   CATTTCTAAAAAAGA               GCATGT GAA AAATGC               TAGAGATATGGGAGC  55 404
   HCD_00510 NONE
   HCD_00505 NONE
   HCD_00500 NONE
   HCD_00495  102137 ..  102151 -  -2.8  -4.39133   CAACAACCATTAAAA               CTTTTG ATA CACAAG               CACCACGCTTTTAGG  58 5
   HCD_00380 NONE
   HCD_00375 NONE
   HCD_00370 NONE
   HCD_00365   75864 ..   75875 -    -3  -4.72556   GCAAAAAGGATAAAA                CTTT GAGA AAAG                 ACTTAACGCTTTTCA  64 28
   HCD_00360 NONE
        aroE NONE
   HCD_00350 NONE
   HCD_00345   71342 ..   71365 -    -9  -3.01712   CCTTGTGGTTTAACA          GCCCTTTTTT TACT AAAAAAGAGC           AAGGTCTAAAAAACC  72 84
        rpsF NONE
   HCD_00335   70323 ..   70334 -  -5.8  -3.17075   GTCTCCTTAATTTAA                CCCT TAAA AGGG                 GATTTCTTCTTCATC  57 17
        rpsR   70006 ..   70026 -  -7.5  -3.03104   TTGAAAATACAAGTA            GGGGGTTAC ATA ATAGCCCCC            CCATGAAAAAATTGA  64 46
   HCD_00325   67373 ..   67386 -  -5.3   -3.9009   AATTCACCCTATAAA               CCTTA TGGT TAAGG                CAATTTAGGTAAATT  63 253
   HCD_00320   64626 ..   64644 -  -4.5  -3.33261   TGGGAAGCTGTAGAA             GGCGGAC GATTA ATCCACC             AAAAAACTTCGCCGG  53 244
        tpiA NONE
   HCD_00290 NONE
        lpxD NONE
   HCD_00280 NONE
         ndk NONE
   HCD_00270 NONE
        rpmF   54486 ..   54498 -  -7.7  -2.91696   CCATAATAATAGAAC                CCCTT ATT AAGGG                TGCTTTTATTACTGG  67 34
   HCD_00260 NONE
   HCD_00255   52372 ..   52386 -  -7.2  -2.70863   CACTAAAAAAACTAT               CTTTTG CAT CAAAAG               TCCTTTTAATAGCTT  62 39
   HCD_00250   51683 ..   51695 -  -3.5   -3.6215   TTAAGCCATCTGAAA                TTTTA GCC TAAAA                GCTTCTCTAAAAACA  52 420
   HCD_00245 NONE
   HCD_00240 NONE
   HCD_00235 NONE
   HCD_00230 NONE
   HCD_00225   48052 ..   48062 -  -2.6  -5.83226   AATGCAAGAAAAAAA                 TAAA AAT TTTA                 AACTATTTTTTACTA  85 374
        dnaG NONE
   HCD_00200   43204 ..   43216 -  -2.7  -4.67168   AAAAACTCTCAAAAA                CTTAA GCC CTAAG                CCAATAAATACGCCC  60 21
   HCD_00195   42141 ..   42153 -  -2.7  -2.79562   AAAATAAGCAAACAT                CAAAA CCC CTTTG                TTTAACCTTAATTAA  41 163
   HCD_00190 NONE
   HCD_00185 NONE
   HCD_00180   38885 ..   38899 -  -2.9  -4.26344   ACATTTTTATTAAAA               CATAA GCTTT TTATG               GCTAGAATACTTTCC  55 345
   HCD_00175   37436 ..   37446 -    -4  -3.14888   AACGACACTTAAAAT                 CATT TCA AATG                 CTTCATAATAAACCC  49 14
   HCD_00170 NONE
   HCD_00165   34932 ..   34949 -    -7   -3.2661   TAACTATCCACAATA             GGCGTT TGGGCG AACGCC              CCTATGGGGGTAATT  63 255
   HCD_00140 NONE
   HCD_00135   26112 ..   26128 -  -3.7  -3.66999   ACCCATTGAGCTAAA              CAAAATC AAA GATTTAG              TAGAGCATTTTAAAC  54 355
   HCD_00125 NONE
   HCD_00120 NONE
   HCD_00115 NONE
   HCD_00110 NONE
   HCD_00105   22079 ..   22096 -  -2.7  -3.17762   AAGAGCGATTAAAAC             TTTGTGA AACA TCACAAT              TTGCTAAAATTCCCT  43 19
   HCD_00100   21103 ..   21115 -  -3.5  -2.56596   TTTTTCATCAACGGA                TTTTA ATG TAAAA                TTCAAAGCCTTTACG  44 5
   HCD_00095   20015 ..   20035 -  -2.7  -3.70081   ACACAAGCCCAAGAA            TAACAAAAA AAA TTTTCATTA            AAATCTCGTTTATTT  48 39
   HCD_00090 NONE
   HCD_00085 NONE
   HCD_00080 NONE
   HCD_00075   16909 ..   16923 -  -2.9  -5.03314   TCTAGGGCTAAAAAA               TAATG TTGCT CATTA               CACACTACAAGCGTT  66 229
   HCD_00060 NONE
   HCD_00055   13411 ..   13421 -    -4  -4.04806   TTGTAGATGAAAGAA                 TTGT AAC ACAA                 ATATTGTTTTTTTTT  59 198
   HCD_00050   11311 ..   11333 -  -4.8  -4.31433   GAGCCTTAGAATAAA           TTGCCCCTTT TTA AAAGGGGTTA           AGAGATTTAATATGC  64 32
       groES NONE
       groEL    5171 ..    5186 -  -7.6  -3.55444   TTTTTAGGGGGCAAA              GAGAAC GAGT GTTCTC               TTTGTAGAGTAAGGG  72 44
   HCD_00020 NONE
   HCD_00015 NONE
        ribH NONE
        nusB NONE
