    RMA_0001    1081 ..    1098 +  -7.7  -2.62263   ATAGGTTTTACTGGA             TTCCCGC CTAC GTGGGAA              TGATATAAAAGCCAT  65 284
        trxA NONE
        rfbE NONE
        rfbA NONE
        gltD    6065 ..    6078 +  -6.7  -3.04477   TCTTCTAGTTGTTCA               GGTGA TAAT TCACC                AATTTTTTTTGAATT  62 55
        sca1   23969 ..   24006 +  -5.5  -3.10895   ATAAAACTTCTAACT   TACTGTCATGCCGTGGT CATA GCCACGGTATGACTAAA    TATATCTATATTGCC  54 74
    RMA_0031   32182 ..   32194 +  -3.5  -3.25102   TCAAGAACGCCTTTC                TTAAT ATC ATTAA                TATTATGCGTACCGT  47 429
    RMA_0048   42674 ..   42696 +    -5  -4.27259   GGGGTTGTTATTTTG           TCATTTTTTA TTT TAAAAAACGA           TTTTAAATCTATATG  64 415
        cvpA   44017 ..   44033 +  -5.3  -4.22407   TACCCAAAAGATTAA              TATTAAT GAT ATTAATA              TTTATGGTTTTAATG  66 442
        clpB   55863 ..   55873 +  -5.4  -3.04836   GCTAATGTTATACTT                 TCAG TAC CTGA                 TAATTTATAATAATC  54 299
        rpsF   60136 ..   60146 +  -2.6  -2.93447   TAATTGACGTAACGA                 TTAA TAA TTAA                 ATTTGTAAGAATTAA  42 15
        rpsR NONE
        rplI   60962 ..   60991 +  -8.1  -4.04149   AAGACTGAAACTTCG       GAAGATTTA-GCTG AGT CAGCATAAATTTTC       TTTATCATCTAATTG  79 2
        tilS   62732 ..   62776 +  -8.3  -2.53271   GGTATTTAAGAGGTT ATCTGTAAATAAATTTTAACT ACT AATTAAAATTTATTTATAGAC CTCTTATACCAATAA  67 45
        ftsH   65186 ..   65215 +  -3.7   -3.5394   GAGTACGGAGTACTG       CAAACAAAGAGAA AGAG TTTATTTTGTTTG        TTTACGAAAAGATTT  50 482
        sdhB   66901 ..   66913 +  -4.1  -3.86634   TTTAATTGCAGAACG                TCACG GTG TGTGA                TTCTTAATTAATTAT  56 13
    RMA_0079   70693 ..   70726 + -16.3  -3.19038   AATAAATTGCATTTG     TATCCAAGATGGAAG TCGT CTTTCATCTTGGATA      TTCACTACTTTTGAA 100 73
        yidC NONE
        pgsA NONE
    RMA_0082   73683 ..   73704 +  -2.3  -4.01158   TGTGAGGAAATTGCG           TAGCAATCT CAGG AGTTTGTTA            TTATTTCATGAGATT  52 77
    RMA_0084   75280 ..   75290 +  -6.8  -3.13899   GCACACCGCACTAAT                 GCAG CTG CTGC                 TATTAATGCCGGATT  62 456
        tlc1 NONE
        uhpC NONE
         ndk   80326 ..   80336 +  -2.6  -3.21925   TTAATAAATCTGAAA                 TTAT AGA ATAA                 TTAATGCTAAAATAT  44 15
        gidA NONE
        gidB NONE
         soj NONE
    RMA_0094 NONE
       abcT1 NONE
    RMA_0096 NONE
        kdsA   87532 ..   87561 +  -2.3  -3.63817   TATAAAAATATCCCC       TATTAATTCAATT TTAA AATAGAAGTAATA        ATTTTTTACAATGTA  47 67
         dgt   91321 ..   91335 +    -7  -3.65656   ACGTACTAAAGTGTA               CGCTGC GGT GCTGCG               TTCTGTGTCTCCTAC  67 77
        argS   93206 ..   93233 +  -9.2  -2.80113   GATACCGAGTTGTCA        TTGCGA-GCAGCC TTA GGCTGCGTGGCAA        TCTCATGAAATAATA  73 82
    RMA_0104 NONE
        parC   96451 ..   96487 +  -8.9  -3.83318   ATATTTTATATAGTT    TGATACAAGCGAATT ATTTATA AATTCGCTTGTACCG    TTCTATTATTAAAAG  81 76
         dcd NONE
        secB  100359 ..  100377 +  -3.2  -3.64905   GCTTAATAGTAAAAA             TTTTATCA ATT TGATTAAA             TATTCTTTACTTATG  50 105
        czcR  101212 ..  101224 +  -3.4  -3.09274   ATTTTAGCACAAGGA                GCAT AATTA ATGC                CTTTATCTACTTCTT  46 20
        queF  102146 ..  102176 +  -6.4  -5.93809   GACCACGGAATCTAG       CTTAAAATACTAAT AAT ATTAGTATTTTAGA       TTTTTTTTATGGACC 100 129
         sam NONE
       proP1 NONE
    RMA_0116  108251 ..  108269 +  -6.8  -3.56445   ATGCTGATTTTAGTC             TAGTGTCT GTC AGATACTA             TTATAGTATTATGTT  65 252
        secG  109112 ..  109133 +  -4.5  -2.85699   GGAGCAATTTTTTAC           CCGTTAA CTTTTTTA TTAACGG            ATTTAATAGCTGAGT  49 469
        cysS  116673 ..  116687 +  -8.6  -3.06265   TAAAAGCTTGTAAAT               TACGCA ATA TGCGTA               TATAATTTATAGGCT  72 38
        rpsB  117848 ..  117881 +  -7.7  -4.82901   CTTGATCGCGGGATC     CAGCTTAAAATACTA ATAT TAGTATTTTAAATTG      TTTTTATGGACCCCA  87 82
         tsf  119206 ..  119237 +  -8.2  -3.61175   CAAAGCAAACAAAGG      CGAATTTAGGATAA GTGC TTATTCTAAACTCG       TATTTATAATATCTC  75 323
    RMA_0130 NONE
        vacJ NONE
    RMA_0132 NONE
         prs NONE
         alr NONE
    RMA_0135  130119 ..  130130 +    -3   -3.0693   GAATTATTTTTTAAA                GTAT AGGT ATAC                 TCGTTTAATTTGGAA  45 20
         mkl NONE
    RMA_0137  131627 ..  131638 +  -4.4  -5.08483   GTGAATTAATATTTC                TAGC TAAT GCTA                 TTTTATTTAATTTTA  73 369
        rpmB NONE
        rpmE  134367 ..  134389 +  -7.6  -2.98942   ATTTTTTCTGAATTG           CCGTGCAGTC TAC GACTACTCGG           TATCTATGCAAGAAT  67 139
        engB NONE
        argB NONE
       virB3 NONE
     virB4-1  139023 ..  139053 +  -9.7  -3.91144   TCACAGACTGTATTC       TGAGATCCCGTGG ATAAG CCACGGGATGACA       TTTGTACAATGTGAG  83 83
     virB6-1 NONE
     virB6-2 NONE
     virB6-3  147443 ..  147489 +  -7.9  -4.02719   TCTCAGGAGTTATTT CATGAGATTGCCGCGCAGCCCC ATAC GGGGCTGCTCG-CAATGACGGG TTTACTATTTAATAC  77 96
     virB6-4  150490 ..  150516 +  -5.2  -3.33696   TTATCAAATTCAATG         TCTCTTCTAGAT ATG ATCCAGAAGAAA         TTACTTCAAGACAGG  56 290
        trmD NONE
        rplS  158469 ..  158481 +  -3.3  -4.40003   GCTCAAGCATAGCGT                CCTGC TCG GCAAG                TTTATCTTTATCCAA  60 239
        secF NONE
        nuoF  161182 ..  161192 +    -4  -3.73775   AGATTGCTTCGTCAA                 TTAC TTT GTAA                 TTTCCTCGCAATGAC  53 154
        lepB NONE
         rnc NONE
         era  163780 ..  163826 + -22.7  -2.82635   ACAGGCTTTGTTGGA TGGTTTTTGATGTCATTCCCGC GAAA GCGGGAATGACA-CAAAAGCCA TATAATAATGCCAAT 100 61
        ruvC NONE
    RMA_0167  165223 ..  165235 +  -3.5  -3.68435   GTGAAGAACTGTGCC                TTTTT GAG AAAAA                TATTCTTTTAAAAAC  50 219
        hflK  168835 ..  168877 + -14.3  -3.91908   GCTATTAAACCATAG GGATGCGATGTCATTCCCGC TTTC GCGGGAATGACATCG-AGCG TGTTTTTCACGCTAT 100 26
       hflC2 NONE
        htrA NONE
    RMA_0175 NONE
        sdhC  172748 ..  172758 +    -4  -4.26076   TTGCGGACGTACAAA                 TTAC TTT GTAA                 TTTTCCTCGCAATGA  60 117
        sdhD  173169 ..  173185 +  -2.4  -2.64099   TTTGTAGTAGCGATA              TTTTAT AAAGG ATAAAA              ATTGTCATACCGCGG  40 11
        sdhA NONE
        yqiY  175886 ..  175906 +  -3.4  -3.63283   TTAATTAAAACATAC            TTGCTTTT ATGGA AAAAGTAA            TTATAATTTAAATTT  52 33
        rpsL NONE
        rpsG NONE
        fusA  179154 ..  179171 +  -2.1  -5.45652   TAATAACAAATATTT             TTAATAA ATTT TTATTGA              TTTTTTATTAAAAAT  71 137
        secE  179645 ..  179663 +  -2.4  -2.62616   TAACATAATGCAGCT             TTTGCTTA ATA TCGGCAAA             TAGTATAAGGAATAA  40 4
        nusG  180399 ..  180413 +  -4.3  -6.15536   GAAATAATAAAAAAC               TTCTG ATTTA CAGAA               TTTTTTTTCTTCCTT  95 164
        rplK NONE
        rplA  181762 ..  181782 +    -7  -3.21276   TTTAAGCATTTGTAT            CAGTTTAA ATATA TTAAACTG            TATTATAAAAGGAGA  63 92
        rplJ  182393 ..  182403 +    -4  -4.17316   ATAAGGTTTGTTATA                 GAAT ATT ATTC                 TTATTTTAAAAAAGT  60 103
        rplL  183019 ..  183050 +  -3.1  -5.63517   CTTAAAATCAAAAAA      GCCTTATTTTAGT AATTAA ATTTGAATAAGGC       TTTTTTGTTTAAAAA  77 157
        rpoB  187877 ..  187902 + -10.7  -4.30978   GATAGGTCATTTAAA         CAGATAAAAAA CAAG TTTTTTATCTG          TTTTACTGGATTCCC  95 45
        rpoC  192577 ..  192605 + -16.3  -5.38549   TATTGACAAAAAAAA        GCCTATAAAAAAC TTG GTTTTTTATAGGC        TTTTTCTTATTTCCC 100 367
        pepA  195522 ..  195548 +  -7.2  -2.79915   GATACCGAGTCGTCA         TTGCGAGCAGCC TTA GGCTGCGTGGAA         TCTCATCAAATACCT  63 71
    RMA_0193  196493 ..  196508 +  -4.8  -3.73793   AGGCTGTGTTCAAAG              GTTAAT TTCT ATTAAC               GTTTTTCTTGTATAA  58 40
    RMA_0194  197050 ..  197065 +  -2.6  -3.79203   AAGATAAATTTTTAG              TTTTTG TTTG CGAAAA               TTTGCGATTTTATGT  51 50
        aspS  199102 ..  199123 +  -5.1  -4.18494   AGCCACGGTATGACA           GCGAAAAGT ACTG GCTTTCCGC            TTTTAGCTAGAAATG  64 202
    RMA_0208  212945 ..  212961 +    -3  -5.26119   CAAAATATAATGGAA              TTACCT AAAAA AGGTAG              TTTTGTTTTTACACC  71 172
        nusB NONE
        rrmJ  220431 ..  220451 +  -6.3  -2.98453   TGTTTTTCCCAAATG            CTTATTAGT AAT ATTAATAAG            ATTATGTTTTGCATT  59 514
    RMA_0215  222231 ..  222260 + -15.3  -5.68438   ACAAAACTTTCTAGA       GAGTAAGGTTATA GATC TATAACCTTACTC        TTTTTTATTTAATAA 100 50
    RMA_0218  223804 ..  223830 +  -8.8   -3.0806   GCTGCTCGTAATGAC         GAAAAGGTAGAG TTA CTTCACCTTTTC         TATTCCGGGTTTACA  72 99
        hupA NONE
        holB NONE
         ffh  230710 ..  230733 +  -8.4  -3.18517   AGAAATCCAGTCAAG          CATATAAAAA CAAG TTTTTATATG           GTTATTTTATCAAGT  71 80
        hemN  234611 ..  234631 +  -2.7  -5.44198   TGAAAATTATTCAAG            TAATTTTAA AGT TTATAATTA            TTTTTATTATTTCTT  72 38
    RMA_0247  252265 ..  252278 +  -5.3  -2.73067   GATAAATTAACAATT               CTTCA TCAA TGAAG                TAATATATAATTCAA  52 54
    RMA_0251 NONE
        holA  256882 ..  256894 +  -2.7  -2.71712   AAAGTAAATGAAGAG                TAGAC GAA GTTTA                ATTTGGAAAAGAGCA  40 30
        coq7  257885 ..  257915 +  -8.4   -2.6155   TATAATAATAGACCC       CTGGCATAACTTAA ATA TTAAGTTTTGACAG       ATTGGTCTTGCAACA  67 361
        coxC  259055 ..  259065 +    -4   -3.9442   GTGATTATAATGTGA                 CTTA AAA TAAG                 TGTTTTTAAAATATT  56 53
       virB2  259576 ..  259601 + -14.9   -5.2853   TTATATCTTTAGTAA         TACCCATAAGC CGAA GCTTATGGGTA          TTTTATTTTTAAGTG 100 56
        dapD  261625 ..  261648 +  -8.4  -4.30978   GTTTAACAAAATAAA          CATATAAAAA TAAA TTTTTATATG           TTTTACTGGATTCCG  83 139
        rnhB  277094 ..  277121 +  -9.2  -2.80113   GACACTGAATCGTCA        TTGCGA-GCAGCC ATA GGCTGCGTGGCAA        TCTCATAAAATAATA  73 57
       grxC1 NONE
        atm1  281843 ..  281855 +  -3.5  -3.28001   TTATGTCTCTATTAT                TAAAT ATA ATTTA                TTAAATTTAAGGCTA  48 346
        gyrA  284718 ..  284767 + -14.3  -2.60075   TGCGTGGACCGGTAA AAC-CCACTGTGTCACCCCGTGGT CAC ACCACGGGATGACACAGAGGTGAA ATTGATTCACGCAAC 100 148
    RMA_0278  286804 ..  286824 +  -4.2  -2.88663   TGATTATAATGTATT            TTTATAAA GTTAA TTTATAAA            TGTCTGAAAATAACT  47 6
         def NONE
         fmt  289137 ..  289147 +  -2.4  -3.72576   TTATTGTTTGTTAAA                 ACGC AAA GCGG                 TTTGATAAACAGAGA  48 457
    RMA_0292  296852 ..  296862 +  -6.8  -4.59773   TTGACCACAACAGAG                 CGGT ATG ACCG                 TTTTTCACACTGCCC  79 18
    RMA_0293  297773 ..  297783 +  -3.2  -2.86217   AATAATCTATTGACT                 CTTG AAT CAGG                 CTTTCCGTCTTGCTA  44 507
    RMA_0295  299873 ..  299887 +  -4.3  -3.73068   GTACTGTGGTACTTA               CGTAT TAAGT ATACG               TTATTACATTGGAAG  56 98
        cydA NONE
        cydB  302412 ..  302427 +  -3.2  -2.82352   TTATCCTATGGCTTA              GCGGAT TATT ATCCAC               ATTACTTTTAACTTA  43 88
    RMA_0298 NONE
    RMA_0299 NONE
        lgtF NONE
         mpp  305321 ..  305331 +    -4  -4.38712   AGATTGCTTCGTCAA                 TTAC TTC GTAA                 TTTTCTCGCAATGAC  62 126
        purC  306259 ..  306277 +  -3.9  -4.88129   CGATTAGGTGTCTAC             TCAGGAA CAACA TTTCTGA             TTTTTAATAATTTTT  68 200
    RMA_0303 NONE
        thrS  310223 ..  310240 +  -2.1  -2.63257   GAATGAAAGCTACCT             TTGATAT TAAT ATATTAA              TAGATTATCTACAAT  40 341
    RMA_0307  313455 ..  313482 +  -5.7  -3.71527   AAATGTTGTTTTGAA        TTGTCAATCTT TTTTAC AAGATGGACAA         TTTGAATAATTAGAA  62 283
        tolC NONE
    RMA_0313  318058 ..  318075 +  -3.5  -2.76629   GTATATACACAGTAA             GTTTTTA ATAT TAAAAGC              TCGATTTATCTTGCT  44 132
    RMA_0314  320028 ..  320038 +  -2.6  -3.81672   TTTCAAACAATTTCT                 TTAA AGC TTAA                 TTGCTTTTCTATGTT  51 162
        parE NONE
         ctp  323657 ..  323669 +  -5.5  -3.92522   TGTACGTACGCAATC                TCAGG AAC CCTGG                TTTATGAGATTGCCA  61 115
        barA  325309 ..  325325 +  -2.4  -3.34984   AAAAATTTTTCGGTA              TTATAA AAAAA TTATAA              ATTTTTAAAAAATAT  44 59
    RMA_0318 NONE
    RMA_0319 NONE
    RMA_0320  328059 ..  328075 +  -4.5  -4.21465   CGGGTATTAATGCTA              TTAAACA TGT TGTTTGA              TTCTTTAATTTTAAA  62 64
        rplM NONE
        rpsI  329155 ..  329185 +  -3.5  -4.79949   GGGCGTAGGATCCAG       CTTAAAATATTTA CATTA TTAGTATTTTAAG       TTATTTTTTTGGGGG  66 114
    RMA_0323  330391 ..  330411 + -15.5  -2.81888   GTGCCTATCATCAAC            CTACCGGCT CTC AGCCGGTAG            TGGTTGAGTTTAACA 100 70
    RMA_0325  331635 ..  331645 +    -4  -2.99998   AATTATCATATTAAA                 TTTG TAC CAAA                 TATAGTTAATTTAAT  48 215
    RMA_0326  332449 ..  332491 + -13.9  -2.96009   CTCTAAATAATTAAG TATAGTAAAAGAAATTGAA CATAA TTCAACTTCTTTTACTATA TATATAAAATTTTTA 100 231
         efp  335071 ..  335089 +  -4.4  -2.70932   CAGCGAAGGCATTGC             CCGTGTGG ATA CCACCCCG             TCATTGCGAGCAGCC  48 70
        suhB  336083 ..  336098 +  -3.4  -3.19653   ATTGTTATAATAATA              TTAATA TAAT TATTAA               TTCATAAAGTTATGG  48 70
    RMA_0331 NONE
         psd  337194 ..  337207 +  -4.5  -4.18421   CCGTTATTGCGAGCA               GCCGT AGGC ATGGC                TTGTTTATGTCATTC  62 57
        pssA NONE
        emrA  339274 ..  339287 +  -5.3  -3.35224   AAGATATTTAGATCC               CACTA ATGA TAGTG                TATTTAAAAAAATCT  56 160
    RMA_0335  340409 ..  340420 +    -3  -4.37863   TTTTTCCCTGTAATG                TTTC TGCA GAAA                 TTCTTATTTTTATAT  60 458
    RMA_0338 NONE
        murC  343496 ..  343506 +  -3.2  -2.64872   TCAGCTGTCATACCG                 TGGT TTG ACCG                 GTCTTATTGCATGAC  42 18
        murB  344553 ..  344578 +  -9.3  -4.81357   GGGAATCCAGTAAAA         CATATAAAAAA CAAG TTTTTTATATG          TTTATTTTATAATAT  93 88
         ddl NONE
        ftsQ  346574 ..  346584 +    -4  -3.62046   GATTGCTTCGTCGTA                 TTAC TTT GTAA                 TTCTTCGCGCAATGA  53 101
        ftsA  348008 ..  348024 +  -2.3  -3.57627   TTTAGAAATATTTTG              CTAAGAA TTA TTATTAG              GTTTTTCTCTAGAAC  47 171
    RMA_0346  350445 ..  350457 +  -4.1  -4.15565   AATGAGGCACCTTGG                GCAAG CCC TTTGC                TTTTCAAATAATCAA  62 290
         rne  355109 ..  355126 +  -9.9  -3.11687   GGCTATAATATGTCA             TTCCTGC GAAA GCAGGAA              TTCAGTAATCCTTAA  81 47
        coxW  356328 ..  356342 +  -2.2  -3.37654   AATAATTTGGTGCTG               TTTTTT AAT AAAAAG               TTCCTAATTTATTAA  46 4
       rluA1  357333 ..  357347 +  -2.7  -3.17685   CTCATGTCAAGTGTA               CGCTG TGGTT CTGCG               TTCCGTGTCTCCTTC  43 85
        pbpE  358660 ..  358683 +    -3  -3.18264   ATTTGAAAGAAACAC          G-GAACGCAGC ACC GCAGCGTACAC          TTAGTACGTGAGAGG  46 76
        xth1 NONE
        pdhA  360643 ..  360670 +  -9.2  -2.73875   TATTATTTCATGAGA        TTGCCACGCAGCC TAC GGCTGC-TCGCAA        TGATGTTCACGCAGG  72 96
        pdhB  361824 ..  361834 +  -5.4  -2.76422   AGTTTTTTCTAGCAA                 TGAC TAT GTCA                 ACTTTTTTAGGCATA  52 136
        hlpA NONE
         icd  366989 ..  366999 +  -2.6  -3.73775   AGATTACCTCGTCAA                 TTAT TTC ATAA                 TTTCCTCGCAATGAC  48 96
    RMA_0359 NONE
        mnhB NONE
        ccmB  369112 ..  369122 +  -2.6   -3.1944   CTGTTTAATTAAAAA                 TATT TAT AATA                 TTACGTGATTTTGCT  44 7
    RMA_0362 NONE
        petA NONE
        petB  371465 ..  371502 +  -5.5   -5.5208   TTTGTTATTATTTCA   TGAGATTGCCGTGCAGCC TAT GGCTGCTCG-CAATGACG   TTTTTTGTATTATAC  87 72
    RMA_0365  371796 ..  371812 +  -6.7  -2.78596   AAATTGGGATGATTT              GTATAAT GAA ATTATAC              TGTAATAAAAACATC  59 4
        fbcH  372855 ..  372865 +  -2.4  -2.84051   AATTAGATTAAAAAA                 CTGG ATT CCTG                 CTTTCGTAGAAATGA  42 182
    RMA_0367  373422 ..  373449 +  -4.4  -2.91264   AATGTAAGACTTGAA        TTTAAATAGATA ATTT TATATATTTAAA         TATATAACTAACAAA  49 27
       hspC1  373992 ..  374006 +  -7.2  -4.38116   TGATTAATCAAGCAT               TGCTAA ATA TTAGCA               TTTAATTTTTCTGAA  79 34
        lepA  379113 ..  379139 +  -8.8  -2.77999   AAGATTTGTTATAAG         GAAGTATCTGAA TCT TCCAGATGCTTC         TAATGTTCCTCGGTA  69 84
    RMA_0377  383551 ..  383575 +  -4.4  -3.60948   AATTTTCCTTTAATA          GTTTAATATG AGAAA CAAATTAAAC          TTTAAAGATATGTTG  56 60
    RMA_0382  387057 ..  387068 +    -3  -2.72855   GAGCTAATATAAAAG                CATT AGGT AATG                 TAGTTAAAGAATTTG  42 213
    RMA_0397 NONE
     virB8-2 NONE
     virB9-2  401842 ..  401869 +  -5.6  -2.80113   TGCGTAGATACGTCA        TTG-CAAGCAGCC GTA GGCTGTGTGGCAA        TCTCATGAAATAATA  53 54
      virB10 NONE
      virB11  404483 ..  404503 +  -6.9  -3.32536   TAATTGACGAAGCAA            TCTCAGG CCACAAT CCTGAGA            TTGTCACGCTCCTTT  63 68
       virD4 NONE
        gppA  407958 ..  407970 +  -4.7  -3.53811   AAAAAGCTTTAAAGT                GCTGG ATT CCTGC                TTTCGCAGGAATGAC  56 179
    RMA_0407 NONE
    RMA_0408 NONE
        cysQ  413266 ..  413293 +  -9.2  -2.80113   GATACTAGATCGTCA        TTGCGA-GCAGCC GTA GGCTGCGTGGCAA        TCTCATGAAATAATA  73 33
       nlpD1  417714 ..  417726 +  -4.9  -2.54707   GATAAAATTAAATGA                TTCTA CGT TAGAA                GTGTGTTGTATGTAG  50 335
        thyX NONE
        tolB  420669 ..  420705 + -14.1  -4.66609   CTTGATCGCGGTATC    CAGTTAAAAATACTAAC ATT GTTAGTATTTTTAGTTG    TTTTTGGATCCCGTG 100 97
       cox11  422505 ..  422529 +  -7.3  -2.62515   ATTAATTATAGGATC          TATACCGTATA TGC TATACCGTATA          TGCTATACCAAGGTT  62 242
        mnmA  424776 ..  424816 +  -2.1  -3.16647   TGCGAGGAGCGAAGC GA-CGTGGCAATCT-AG TTAGACCTC CTGAGATTGCCATGCTC CTTTTAGTCGCTCGC  42 50
       atrC1 NONE
        hisS  427875 ..  427889 +  -4.3  -5.97979   CAATCCAGTAAAAAA               TTCTG ATTGA CAGAA               TTTTTTTATTATTGT  91 229
        tolQ NONE
        tolR NONE
    RMA_0434  436144 ..  436154 +  -5.4  -3.73775   AGATTGCTTCATCAA                 TTGC TAT GCAA                 TTTCCTCGCAATGAC  59 130
       spoT2  437793 ..  437812 +  -4.4  -2.63596   AATTAAAAATAATCC            CCAAT-ATC CTA GATAATTGG            TAATATAAACTAAAC  47 66
        hslV NONE
        hslU  447011 ..  447032 +  -5.1  -3.57144   AATATCACCGGGTAT           CCCTGCTTT TACT ATAGTAGGG            TTTGCCGATAAAAAC  58 312
    RMA_0449  449563 ..  449583 + -15.5  -2.81225   GTGCCTATCATCAAC            CTACCGGCT CTC AGCCGGTAG            TGGTTGAGTTATATA 100 70
        lpxB  451739 ..  451756 +  -2.1  -5.73978   AGTAGTAATATGAAC             TATGAAT AAAG ATTTATA              TTTTTTGTTTGTAAT  78 352
    RMA_0454 NONE
        cyaY  453578 ..  453593 +    -4  -3.53779   TATACGCTCCGCTCC              TCGG-CT TAC AGACCGA              TTACTCTTTTCCAAG  51 89
    RMA_0456  454483 ..  454497 +  -4.3  -4.68424   AAAAAATAATAAAAA               TTCTG TAAAT CAGAA               TTTTTAACTAGATTC  68 185
    RMA_0457  455624 ..  455638 +  -5.8   -3.6445   GAGGAATTTGTAGAA               GAATTT AAT AAATTC               TTTGAGAATTATTAT  62 361
    RMA_0459  456412 ..  456432 + -15.5   -2.8304   GTGCCTATCATCAAC            CTACCGGCT CTC AGCCGGTAG            TGGTTGAGTTATTTA 100 70
    RMA_0461  457570 ..  457626 + -15.4  -2.72855   CGTCATTGTGAGGAG TTGCATGGCT-TCTATGTCATTCCCGC TTTC GCGGGAATGACATAGAGAATCACGCAC TAGTTAAACGCTTTA 100 59
    RMA_0471  466881 ..  466906 +  -7.7    -3.794   ATAAAGTTTTTTTAA         GTAAAGCTTTT AAAA AAAAGCTGTAC          TTTACTGGATTCCCG  74 151
    RMA_0472 NONE
    RMA_0473  468355 ..  468366 +  -2.2  -3.97368   AAACCACAGGATGAC                TACC TTAG GGTG                 TTTCTCGATTGACAC  52 155
        capD NONE
        rffE NONE
    RMA_0476  471866 ..  471892 +  -3.2   -4.1891   TTTATCGCCGAATAT         TTATTAAAATTA TAA TAGTTTAAATAA         TTTATGTTAGAAGAA  57 11
    RMA_0477  472665 ..  472686 +  -3.1  -3.55444   AGGAAGAAAATCTAT           TTTTCTAAA GCTC TATAGAAAA            TTTAAACAATAAAAC  48 411
    RMA_0478  474741 ..  474752 +  -4.4  -3.53761   GACCTTGATTATTTC                GTTG AATA CAAC                 TTTCAGGAACGGTTA  55 221
    RMA_0482  478669 ..  478688 +  -4.4  -2.81291   TTAGCAAATATCTCG            TCTAAAAT TAAT ATTTTAGG             GTTTAAAATTATAGC  49 281
        cyoB  482604 ..  482628 +  -8.7  -3.29386   AACTAACACTATATC          CACTATTAGCT GAG AGATAATAGTG          TTGGGTTACTTTTAT  74 13
    RMA_0487  484587 ..  484599 +  -3.4  -5.18357   CCAAGTAAAAGCATA                CTCT CACGA AGAG                TTTTTTAATAAATTA  72 449
    RMA_0490 NONE
        xseB  491795 ..  491808 +  -5.3  -3.58864   TTAAAAAAAGATACT               CGAAT AAAT ATTCG                TATTTCTAGTAGTGA  59 516
        xerD NONE
    RMA_0510 NONE
    RMA_0511  504580 ..  504596 +  -6.7  -5.80727   TCACGGGATCTAAAA              TACTAAT ATT ATTAGTA              TTTTTTATTGTTTTT 100 86
         lnt  507329 ..  507340 +  -4.4  -3.89448   GGTTTAAGTAATATA                CCTA TAAG TAGG                 TTATATGTTTTTGCA  58 271
       ampD1  508733 ..  508748 +  -4.8    -4.788   GGATTCAGTTTAAAA              TACTAA AAAT TTAGTA               TTTTTAAATTACTTT  72 181
        lysK  515030 ..  515065 +    -7  -2.55544   AACGAACGAAGTGAG    TGTGGCAATCTC AGGAAGTTTGAC GAGATTGCCACG     TCGCTTCGCTCCTCG  59 74
    RMA_0526  516081 ..  516108 +   -10  -3.14211   ACTGAAAGGAGCGTG        GCAATCTCAG TAAGTTGC CTGAGATTGC         TTCGTCGACGCCCAT  81 63
         tme NONE
       proP3  521912 ..  521924 +  -4.1  -3.27406   TTCTTCCGTCTTTAA                CTGCA ACC TGTAG                GTTTTATGCTAGGAC  49 262
    RMA_0537  526456 ..  526470 +  -2.8  -4.46155   CATTAAGCATATCAG               CAGC AGTTAGA GCTG               TTTTATCAGTATATA  60 521
    RMA_0544 NONE
        folE  535994 ..  536004 +  -2.4  -3.20028   TCATTTCTGCGGAAG                 CGGG AAT CCAG                 TAATTTTGTCATACC  44 54
        proS  537591 ..  537614 + -11.2  -2.81464   ATTCTTCGTAGACAA          TGATAGTATC ATAT GATACTATCA           TATAATGAATAGTAA  83 205
    RMA_0547  538564 ..  538582 +    -9   -3.2082   AAAGGGGATAAGAAT             CAAACTTA TTA TAAGTTTG             TGTAGTTTTTAATGT  77 2
    RMA_0548 NONE
        ruvA  539616 ..  539656 + -13.2  -3.53811   TGATAAATTAGCAGT  TATTTTATATTAATTTTA ATTAC TAAAATTAATATAAAATA  TTTAGAAAAAATACA 100 38
        ruvB NONE
       msbA1  543632 ..  543650 +  -3.2   -4.3534   CTTAATTTTATTAAT             TATTATTG CAA CACTAATA             TTTTCGTCATTGCGA  60 66
       ampG4  545170 ..  545187 +  -2.1    -3.695   ACACTTGATTTAATT             TGAATAA TATT TTATTTA              TTTAAAATGTTTAGG  47 181
        dacF  546151 ..  546188 +  -7.1  -3.17714   CACAAAGTGGTCGTG   GCAATCTCATGAGGT AATACAAA AACTCTTGAGATTGC    TTCGTCGAAATTTAA  64 62
    RMA_0560  551942 ..  551953 +  -2.2  -5.24129   GCCTCTTTCTGCGGT                GCTT CTAA AGGC                 TTTTTTATACCACAA  68 146
        tlpA NONE
       sppA1 NONE
         dut  554290 ..  554314 +  -8.8  -4.31379   TTAGGTAAAAATAAA          CCTATAAAAA TAAGT TTTTTATAGG          TTTTACTGGATTCCT  87 115
       mltE1 NONE
    RMA_0565  557606 ..  557617 +  -2.2  -4.04206   CACGGCATGACATAG                TAGG TTTA CCTG                 TTTATATAACAATAC  52 196
        mccF  558644 ..  558656 +  -3.3  -4.64952   GCGACCGACTGAAAG                CCTTG TTG CATGG                TTTGTTTATGTCATT  63 74
    RMA_0568  562109 ..  562125 +  -5.9  -4.12942   ATTAACCATAGTTTG              TAGCTGA TTA TTAGCTA              TTTTAGCAAGTTTAG  69 268
       nlpD2 NONE
        lspA NONE
    RMA_0576 NONE
        murD  571056 ..  571073 +  -2.8  -5.80727   GGGTCTAGTTAAAAA             TACTAA ATAATA TTAGTA              TTTTTTATTGTTTTT  79 29
        ftsW NONE
        murG  573749 ..  573763 +    -7  -3.16971   ATGTACCAAAGCGTA               CGCTGC GGT GCTGCG               TTCCGTGTCTCCTAC  62 329
    RMA_0580  574604 ..  574628 +  -4.5   -3.7108   CACTACCAATAGGTT          TATTATTTTTT AAT AAAAATTAATA          TTTGAATATAGAAAT  56 117
    RMA_0581  575306 ..  575322 +  -6.7  -5.43514   GGGTTTAGTTAAAAA              TACTAAT ATT ATTAGTA              TTTTTTAGTTGTTTT  93 70
        dapF NONE
    RMA_0597  585207 ..  585221 +  -4.3  -4.68424   AAATAATTAAAAAAA               TTCTG TAAAT CAGAA               TTTTTAACTGGGTTG  68 80
        pheS NONE
        pheT NONE
        dnaN  590221 ..  590266 + -11.1  -5.02476   TGAGAAATAATTAAA TCTGCCCTATGTCATTCCCGC GTAG GCGGGCATGACATCGAGTGGG TTTTTTGAGCCATAT 100 246
    RMA_0601  590889 ..  590915 +  -4.4  -2.70932   AGGTAATAACAGTAT         TTCCGTCATTGC AAG GAAATTACGGAG         TAATTGACGAAGCAA  48 35
        leuS  593678 ..  593698 + -12.6  -2.91452   TTTTTGAATCTGTCA            TCCCGCGA CTTGA TCGCGGGA            TCTAGTTAAAATACT  90 188
        ilvE  600259 ..  600275 +  -8.1  -2.73364   TGAGATTGCTGCGTC              GAATTAC TAC GTAATTC              TGCTTGCAATGACGA  67 145
        dapA NONE
        smpB  601711 ..  601750 + -13.8   -2.6296   TTTGTTACATAGCTC  GTTATATGTCATTCCTGC TTGC GCGGGAATGACATATAGA   ATTACTTAGACTTTA 100 72
        dsbA  602727 ..  602738 +    -3  -3.73775   AAATTGCTTCGTCAA                TTAC TTAC GTAA                 TTTCCTCGCAATGAC  50 155
    RMA_0622  612039 ..  612051 +  -2.7  -2.71712   TATACTCCTAAGTAA                TAGAC GAA GTTTA                ATTTGGACAAGAGCA  40 42
        recR  612827 ..  612838 +  -4.4  -4.69656   AAATTCTAGATGATG                TTCG CCGG CGAA                 TTTTATTACATCATT  68 80
    RMA_0627  617601 ..  617626 +  -3.4  -4.30978   TATTTGATAAAAAAA         CCATATAAAA ACAAGG TTTGATATGG          TTTTACTGGATTCCC  58 157
        gpsA  618904 ..  618914 +    -4  -4.06419   TCTTCTTTATCTAGT                 TTGT TTA ACAA                 TTCTTTATAAAAACC  58 219
    RMA_0629  620414 ..  620428 +  -5.8  -3.17212   CATGGTCAGTATATT               TTTAAG TGA CTTAAA               TTAATAACATGATGA  57 7
    RMA_0630  621478 ..  621502 + -10.3  -4.72631   ATTTAATAAAATAAA          CATATAAAAAA CTG TTTTTTATATG          TTTTGTTGGATTCCT  95 138
       trxB1  622487 ..  622505 +  -4.7   -5.1287   TGAGGCTGAAACATT             TCTAAAT AAATA ATTTAGA             TTTTTTAGCTGTAAA  79 13
    RMA_0632  623081 ..  623101 +  -4.8  -2.51464   AGTATTTCTCTCAGC           TGTGATCTC TTTA GAG-TCACA            ATTAATAAATCCTAA  50 50
        gabD  624725 ..  624742 +  -9.9  -2.78935   GTTCCTTTTATGTCA             TTCCTGC GAAA GCAGGAA              TCTAGTAAAGAATAT  77 54
    RMA_0634 NONE
        lgtD  626137 ..  626160 +  -8.4  -4.91712   TTTTGACAAAATAAA          CATATAAAAA CAAG TTTTTATATG           TTTTTCTGGATTCCC  90 120
        uvrD  628464 ..  628480 +  -5.1  -3.93659   GACAAAATATTTTTA              CTGCAAT AGA ATCGCAG              TTTGCTCCTTTTAGT  60 301
    RMA_0637  631096 ..  631116 +  -8.2  -3.31726   GATTTTTTATTGTCA            CCCCGTGG CGTGA CCACAGGG            TCTTGTATCACCAGC  71 118
        lon1  634861 ..  634897 +  -7.6  -4.82901   TGTCATCACAGGATC    CAGTTAAAAATACTAA TAATT TTAGTATTTTTTATTG    TTTTTATGGACCCCA  87 253
        yhbH  638003 ..  638021 +  -3.1  -2.95409   AAATAGGAAATAATA             CTAACGT ACAAG ACGGTAG             TGTAATTCATACTTC  43 191
        famC  641328 ..  641341 +  -8.1  -3.05384   ATCTCTGAATCTCTT               GGCGA TACT TCGCC                TTGAATCGCAGCGGA  70 269
        nrdA  647032 ..  647050 +  -4.4  -5.00884   ATATTGTTGAGATGC             GAAACGGC TAT GCCGATGC             TTTTTTAGCAAGAGT  73 278
        nrdF NONE
    RMA_0658  651896 ..  651908 +  -6.3  -4.56969   CCTGATGCAGACAAG                GCATT GAC AATGC                TTTATTTATGACCTT  76 265
        tlc4  665465 ..  665475 +  -2.6  -3.90491   ATTAAATTTTCTCAA                 TAAT AAT ATTA                 GTTTTTTCTTGATAT  51 23
        sca4  668953 ..  668963 +  -6.8    -4.005   TTTTTATAACAGGAT                 GGCA GCT TGCC                 TTTATGCATTAGTTT  71 136
         rbn  671170 ..  671180 +  -2.6  -3.92869   TATGCGTAGGCGCCA                 TAAA TTT TTTA                 TTTATCCGTAAATAA  53 480
    RMA_0677  672585 ..  672595 +    -4  -3.73775   GGATTGCTTCGTCAA                 TTAC TTT GTAA                 TTTCCTCGCAATGAC  53 176
        def2  673323 ..  673348 +  -6.1  -3.18086   GACTCGTATCTTCAC         GTACTAGTCGC TGCG GTGACCAGTGC          TTCCGTGTCTCCTTT  61 89
    RMA_0679 NONE
    RMA_0684  681490 ..  681504 +  -4.2  -3.53563   GTTTCCTACAAATTC               CTCTCT ATA AGCGAG               TTTCCGAAGAAGTCT  51 146
       bioY2  682886 ..  682923 + -17.9  -2.83903   CAGTGGATCTAAAGT   GTCGATGTCATTTCCGC TTGC GCGGGAATGACATCGAG    TAGGTTTTTCGAGCC 100 61
        folC NONE
        sodB NONE
        rssA  686921 ..  686963 +  -3.5  -2.60211   AGGGGGTGAGTTAGG TGTTTTTATGTCATTCCCGC GAAA GCAGGAATGACATC-GAGCG GGTTTTTCGAGCCAT  44 32
        birA  688159 ..  688178 +  -3.6  -3.08934   TTTCTCAAACCAAGT            GTTGTTAC TCAC GTAAAAAC             TATTGAAATATGTCA  46 349
    RMA_0691  689453 ..  689473 +  -3.3  -4.03413   AAATTGTATGGTTTT            GGATTATAA AAA TGATGATCC            TTTATCTGAAGGGCT  56 350
    RMA_0693  690642 ..  690669 + -18.6  -3.14261   GCGTGGATAGGTTTA        TGTCATTCCCGC CTAC GCGGGAATGACA         TTGAGTAGATTTTTC 100 172
    RMA_0697  693693 ..  693704 +  -2.2  -4.11394   TAAATTTTATGCCTA                CGGT TCAA ATCG                 TTTTAACAGTAAAGT  52 102
    RMA_0699 NONE
    RMA_0700  694383 ..  694393 +  -2.6  -2.95102   CCTTGTCGTTTCAAT                 TTTT TTT AAAA                 CTTTCTAAATAAAAT  42 7
        infC  695098 ..  695110 +  -4.7   -4.1523   TTGTTTCATGAGGTT                GCCAC GTC GAGGC                TTTGTCTCTCCTCGC  62 98
        pdhC  696417 ..  696444 + -11.4  -2.80443   TGATATAAGTCGTCA        TTGCGA-GCAGCC ATA GGCTGCGTTGCAA        TCTCGTCAAATATCC  86 33
        prfA NONE
        recJ NONE
    RMA_0705  700952 ..  700973 +  -3.1  -4.19817   TTGGGTTGACAATAT           GC-TATTAAC GTT GTTAGTATGC           TTTTACATACATAGA  57 211
         rho  702554 ..  702572 +    -6  -3.09516   GTTGTTCGTCGGCTC             GCCTATTA TTA TTATAGGC             TTCGCTCCTCACGCC  57 66
       sppA2 NONE
        himD  703891 ..  703905 +  -7.2   -3.6106   ATATTTTTCCATGGG               TCTTCA TAT TGAAGA               TTTAGAACTCTTCAA  70 115
    RMA_0713  709082 ..  709103 +  -3.8  -3.02144   TAATACAAAATTATA           GCTTATTA AAAATG TAATGAGC            TATTAAAAAGCATAA  48 186
    RMA_0714 NONE
    RMA_0715  710288 ..  710304 +  -2.3  -2.57881   TTATTTCATTAATAT              TAGCA AAATTAC TGCTA              GTTATCAACAAATTC  39 296
    RMA_0716 NONE
        traE NONE
    RMA_0718 NONE
    RMA_0719 NONE
        traB NONE
        traV NONE
    RMA_0722  716320 ..  716336 +  -3.7   -2.9175   AATATTTTATATAAA              TCCTTTT AGT ATAAGGA              TGTGATTAGGATATC  45 64
    RMA_0723  718052 ..  718065 +  -2.5  -4.50988   TTTTTAGATCCATTT               TTTAT TTTT ATAAA                TTGTTTTTAGTATGA  58 122
        traU  719974 ..  719992 +  -2.5  -4.61873   TTATTTGATCTGGCG            TAAAC-GC AGTT GCTGTTTA             TTTTGATTTGTAAAA  60 1
        trbC NONE
        traN NONE
        traF  723128 ..  723138 +  -2.6   -2.8294   CAGCATCATGATGGA                 TTAA AGG TTAA                 TGATTATGAGCAATG  42 30
        traH NONE
        traG NONE
    RMA_0732 NONE
      traD_F  730461 ..  730489 +  -8.3   -2.8136   AGAAACATTACAACC        TTGGGATAGCA TTTTTTT TGCTATCTCAA        CTCTTTCTTCAGCTT  67 324
    RMA_0736  737561 ..  737577 +  -5.9  -4.16921   ATAATAGGCTACTGG              CAGTCAT CTT ATGATTG              TTTTAAGAATTATTA  69 367
    RMA_0745 NONE
    RMA_0746  743986 ..  744002 +  -8.1  -3.93769   TATTTTTAGGTAAAA              TTCTATG AAT CATAGAA              TTCATTTTTTCCACT  79 404
    RMA_0748  746569 ..  746589 +  -6.9  -3.28791   CTTCTAGATTCTTGG            TTGCTGGTA ATT TAGCAGCAA            TTCTACGGCGACGAT  65 435
    RMA_0750  748866 ..  748881 +  -4.8  -4.74611   GGTTAATATGCTCTT              GAAAAT TATT ATTTTC               TTCTTTTTTATCCTG  72 225
     traD_Ti  758172 ..  758183 +    -3  -4.35644   AACTTGATTGGCAAT                TTTG TGAC CAAA                 TTCTTTTATAATAAT  60 378
        dam2  761211 ..  761228 +  -2.7  -3.36968   AATTTACTTAATACC             CCAAAAT CAAT ATATTGG              TTATAACGTTCAATA  47 468
    RMA_0757  763540 ..  763550 +  -2.6  -5.02606   AAGCTTTATTTCCAT                 TATT TAT AATA                 TTTTATTATTTAGTC  66 114
         cmk  764219 ..  764257 +  -4.9  -2.54632   AACAAATTATATAAA  GAATAAAATAACTT-GAA AAAG TGCTAGGTTATTTTATTC   GATTTTATGGCGTTG  50 10
        rpsA  766125 ..  766177 +  -2.8  -3.65224   GAGAAACTGTAAGTT TCAACGAAGCAATCTCA-GGAGT TCTATGCT ACTTCATGAGATTGCCACGTCGG TTATTAAAATAACCT  48 62
        clpP NONE
         fni  770692 ..  770704 +  -6.3  -2.64466   ACTTCTTCAAGATAA                TTACC TTT GGTAA                ATTCGTTAATGACTT  57 123
    RMA_0778  777732 ..  777743 +    -3  -4.19238   TAGTTTATCTTATTG                TAAC TCAA GTTA                 TTTTAGCGTTGCCGG  57 99
       mltE2 NONE
    RMA_0780  779139 ..  779156 +  -5.7  -3.22858   ATTGTTTCGATATAA             CAATTTT ATAT AAAATTG              TGTTAGTATAGTTAA  59 72
    RMA_0781  780122 ..  780164 +  -4.2  -2.66274   AAACGGAGCATTATC TTTTAACGAGGCTTTAACAA TGA TAGGTCAAGCTCCGTTAAAA ATTAATTCTCCAGAG  46 229
    RMA_0785 NONE
       lpdA2  784330 ..  784346 +  -6.7  -4.67353   TAAAACCACTAAAAA              TACTAAT AAT ATTAGTA              TTTTTAACTAGATCC  79 200
    RMA_0787  785302 ..  785313 +    -3  -4.69415   GAGATACAAGTTACA                TTAG TTGG CTAA                 TTTGTTTCTATTCAT  62 355
    RMA_0790  788220 ..  788232 +  -3.5  -3.29739   TATATTTCATGGTAT                TTTTT ATA AAAAA                TTAATATAAATTGGA  48 114
    RMA_0791  789663 ..  789673 +    -4  -4.15565   AAACTTTAAAAAAAT                 CTTT TAA AAAG                 TTTTGAAGTACTGGA  60 265
       mccF2 NONE
        hemC  794744 ..  794754 +    -4  -3.47063   ATAATTTAATTCTTT                 TTTG CTG CAAA                 TTATAAGATTTTTTT  51 51
        plsC  798412 ..  798424 +  -3.5  -3.37091   GTGAAAAGCAAAAAT                TATTA AAT TAATA                TTAGGTTTTAAAAAT  48 15
    RMA_0805  798973 ..  798997 +  -4.4   -4.7878   GGGAATCCAGTAAAA          CCTATAAAAA ACTTG TTTTTTTAGG          TTTATTTTGTCAATA  70 71
    RMA_0806  800328 ..  800342 +  -4.3  -6.25741   CAATCCAGTTAAAAA               TTCTG TAAAT CAGAA               TTTTTTTTATTATTT  95 142
        tlc3 NONE
    RMA_0817 NONE
        ispB  810832 ..  810858 +  -3.6  -2.61274   TAGCTCAGCTGGATA         GAGCGTTGCCCT CCG AAGGCAAAGGTC         GTTGGTTCAAATCCA  44 70
       nuoN1  829045 ..  829055 +  -5.4  -5.13343   CAGTAGTTTTAGTAG                 GCTT CCT AAGC                 TTTTCTTTTAGATTC  79 74
    RMA_0837  833116 ..  833129 +  -4.5  -3.63953   TGTTTTGGAAAATGG               CGGCA TATT TGCTG                ATTTTCTTATTTTAA  55 307
        ubiX  835643 ..  835657 +  -4.3  -5.73339   GCAATCCAGTAAAAA               TTCTG ATTTA CAGAA               TTTTTTTATCATTCT  87 252
        dnaB  837353 ..  837380 + -14.3  -3.23598   ACGTTAGTGAGCATG        GCAATCTCAGG CATTTT CCTGAGATTGC         TTCGTCAGTTACTTC 100 96
       rluA2  839684 ..  839701 +  -2.1  -2.76671   ATATTGGAAAAATAA             TTAGTAA TGTG TTATTAA              TGCATTTTAACTAAT  40 26
    RMA_0846 NONE
    RMA_0847 NONE
        radA NONE
    RMA_0849  845054 ..  845068 +  -2.8  -4.68424   AAATAATTAAAAAAA               TGCTAA AAA TGAGCA               TTTTTAACTGGATTG  60 61
        recO  846213 ..  846251 +  -4.8  -3.09772   CCTCTACTATTTTAT TCC--ATGTCATT-CCCGC TTTC GCGGGAAATGACATAAGGG  CTTTTCAAAATTTCC  52 338
    RMA_0851  847021 ..  847041 +  -6.2  -2.78463   TAGTTAAAAAAAGTA            GGAATCCA CTTAC TGGATTTC            TGTAATCAACGAAAT  57 34
    RMA_0864  860064 ..  860082 +  -5.2  -3.54129   GTGAATCAGTAAAAT             CCACTGTG TCA TACCGTGG             TTTGACCACGGTATC  58 258
    RMA_0876  874577 ..  874601 +  -4.4   -4.7878   GGGAATCCAGTAAAA          CCTACAAAAA ACTTG TTTTTTTAGG          TTTATTTTGTCAATA  70 126
        ntrX NONE
    RMA_0889  884777 ..  884798 +  -7.5  -3.25261   GGGAATCCAGTAAAA           CATATAAAA AATT TTTTATATG            CTTATTTTGTTAAAG  69 139
        panF  896222 ..  896232 +  -2.6  -3.80026   TTACGAGGCAAGTCA                 TATA AAA TATA                 TTATATATTTACTTG  51 21
    RMA_0900  896944 ..  896982 +  -3.3    -5.055   ATCTATGGTCGCGTC  GCA-TACTGCTTTA-TACG AAC CGAAATAATGCAGTAATGC  TTTTTTACGAGTTGC  71 358
        prsA  910773 ..  910788 +  -4.8  -2.86722   CTACTATAGGCTTAC              CTAAAT CATT ATTTAG               TATAGTAATATCTTT  51 373
    RMA_0918  917049 ..  917063 +  -4.2  -4.46493   TAAACTATTAGGTCA               ATAGGC TAT GCCTAA               TTTTAATATATTTAA  62 525
        mgtE  918535 ..  918551 +  -5.3  -3.42078   GATTTTCAAAGTCGA              TAATATT ATT AATATTA              TTCTCATAAGATATA  58 134
        yajC NONE
        secD  924240 ..  924251 +  -2.2  -5.00895   TTGTGTAAAAGAGTA                GACT TTGT GGTC                 TTTTTATGTCATGCC  65 33
    RMA_0927 NONE
    RMA_0928 NONE
        ccmE  925647 ..  925657 +    -4  -3.41051   GATTGCTTAGTCGAA                 TTAC GTT GTAA                 TTCTCCTCGCAATGA  51 94
         ppa  926349 ..  926372 +  -9.8  -4.30978   AATTAACAAAATAAA          CCTATAAAAA CAAG TTTTTATAGG           TTTTACTGGATTCCC  90 145
        mviN NONE
        traX NONE
    RMA_0933  929603 ..  929631 +  -5.9  -3.19157   ACTGAAAGGAGCACG        GCAATCTCAGGAC TTT GGCACGAGATTGC        TTCGTCGAATTACTA  59 119
        scoA NONE
        scoB  934699 ..  934710 +  -2.2  -4.21974   AGATAAACCTGATAA                TCTC GATT GGGA                 TTTATTAGATAATGC  54 175
        pspE NONE
        dnaA  947009 ..  947019 +  -5.4  -4.21974   AAATGTCATACCGTG                 GTCA AGC TGAC                 TTTGTTGCATGGTCC  66 39
        pat1  950756 ..  950767 +    -3   -4.3078   CAGATGATGTACTAG                GTTA TCTC TAAC                 TTTCTTAATGTCATT  57 15
        rpmI  958053 ..  958072 +  -3.6  -3.37344   AATATTAAAAAATAT            TTTTTACC GTAC GGTATAAA             TTAATTAACTAGGAG  48 2
        rplT  958456 ..  958490 +   -18  -4.02424   CATATTTAAGTATTT     AATGTCATCCCGTGGT CAA GCCACGGGATGACATA     TTTATAATAATTAAT 100 32
        rpmH NONE
        rnpA  959361 ..  959398 + -10.7  -2.83903   TTGTTGCATGGCTCG   TTTTATGTCATTCCTGC GAAA GCGGGAATGACATCGAG    TAGGTTTTTCGAGCC  81 344
    RMA_0972  965560 ..  965580 + -15.5  -2.81969   GTGCCTATCATCAAC            CTACCGGCT CTC AGCCGGTAG            TGGTTGAGTTATTCA 100 70
    RMA_0979  974408 ..  974426 +  -3.9  -4.27474   ATTGTTTAAACAACA             TGGTTCT AAATC AGAATCA             TTTGTTGATGAATTT  60 162
        ileS  979028 ..  979040 +  -6.9  -3.36492   ATAACTCCTCCACAG                CTCCC TCC GGGGG                TTCTAAAATTAAAAG  63 132
         aas  989539 ..  989553 + -11.4  -3.31144   TGAGATTTCTTCGTC               GACGCC TAT GGCGTC               TTCTCGCAATGACGA  88 90
        ubiG  991827 ..  991863 + -10.5  -4.42653   CTTGATCGCGGGATC    CAGTTAAATATACTAAT ATT ATTAGTATGTTTAGTTG    TTTTCTGGATACCGT  95 137
        gltX  993448 ..  993464 +  -2.4  -2.69319   TAGGAAAAGAAAATA              TTTTAA AAAGG TTAAAA              ATTATATGAAAGATT  40 0
    RMA_0993  994075 ..  994103 +  -3.2  -3.92143   ACTGAAAGGAGCGTG       GCAATCTCAAGAT TTTG GTCC-GAGATTGC        TTTGTCAAAATTTTC  52 94
      spoT14  996607 ..  996640 +  -6.1  -3.61652   AATAAATTAAATTTG     TGTCCAAGATAGAAG CCGT CTTTCATCTTGGAGA      TTCATTATTTCCAAC  64 44
        grpE NONE
        perM NONE
    RMA_1009 1008509 .. 1008519 +  -2.6  -5.17353   ATATGGCAGTACTTT                 TAAA TGA TTTA                 TTTTTTCCTCAGTAT  69 219
    RMA_1043 NONE
    RMA_1044 NONE
        fumC 1030282 .. 1030313 +  -2.5  -3.69364   CTGTACAAAATCTTA      TAAATAGGATAAT ATTATA ATTAGTCTATTTA       TTATATATATTACCT  48 81
    RMA_1046 NONE
    RMA_1047 1031163 .. 1031185 +  -7.2  -4.01564   GAAAATAATCCACAT           TTTTCATAAA AAG TTTATGGAAA           TTTCTAAATCTTTTA  74 190
        ftsZ 1032755 .. 1032773 +  -2.5   -3.5764   TCAAAAAGATTTAAA             GTTTTTT ATAGC AAAAAGC             TTTGCAAATCAAATT  48 182
    RMA_1055 1039013 .. 1039027 +  -4.2  -2.60211   GGTTCAAGTCCGGCC               GCGGGT ACC ATTCGC               CATTTTTAGGCAAGT  46 248
        xseA 1045858 .. 1045885 +  -9.2  -2.80113   TGGTTTTTATCGTCA        TTGCGA-GCAGCC GTA GGCTGCGTGGCAA        TCTCATGAAATAATG  73 47
    RMA_1060 1046743 .. 1046762 +  -5.8  -4.34771   TACTCCTTTTTATTT            CTATTACA TATT TGTAGTAG             TTTTACTCGGTTTTA  69 395
        xth2 1048257 .. 1048275 +    -6  -4.95843   AAAAATATATGACGA             TTGTCGGT ACA ATCGGCAA             TTTTATGTTTTATGT  80 264
        engA 1050078 .. 1050110 +  -2.7  -3.80573   AATATATAAATGTTC      TCACTGCAAATCG GCAAGAA CGGTATGCATTGA      TTTAGTAATACTAGG  51 277
        mutM 1055882 .. 1055899 +  -2.8  -4.10437   TTTTAAAACTATTTA             TAAAGA TAAAGC TCTTTA              TTATTTAATTAGTAG  53 56
       proP4 1066105 .. 1066129 +  -5.9  -5.14965   ATAAATCCAGTAAAA          CATATAAAAAT TAA ATTCTTATATG          TTTTTTACTAGAAAT  83 37
        valS NONE
    RMA_1088 NONE
    RMA_1089 1072734 .. 1072752 +  -5.3  -2.87598   TTATTTGCGACCAAT             CCCAAAG GTAAA TTTTGGG             CTCTTTTATCAAACT  53 481
    RMA_1093 1075537 .. 1075555 +  -4.6  -4.00445   CGAACAATTGTTATA             GATCATAA CAA TTATGACC             TTATTATTGATAGTG  60 251
    RMA_1102 1080081 .. 1080091 +    -4  -2.65344   AAAATAAATAGGATA                 TGTA GTT TACA                 AATTTTATTAATACT  46 39
       msbA2 1086310 .. 1086326 + -12.3  -3.17051   CTGTGACACAAGATC              CCGTGGT CAA ACCACGG              TATTGATACTGAACG  90 126
    RMA_1109 1087237 .. 1087258 +  -4.5  -3.62275   TATTGCGTAGATCGG           TTTTTTCGT CACT GCGAGAAAA            TTTACAATAGTAAAT  56 490
        bcr2 NONE
    RMA_1111 NONE
        lolD 1090779 .. 1090789 +    -4  -5.45726   TAATTTTGGCTCTTT                 TTTG CTG CAAA                 TTTTTTTGAAATATG  77 101
    RMA_1113 1092848 .. 1092858 +  -2.6  -4.11938   AAAATCTATAATTAC                 TAAT ATA ATTA                 TTTATAGTTAATTTA  53 60
    RMA_1114 NONE
        ccmF 1096186 .. 1096205 +  -3.6   -3.9467   AAAATTTTTATACTA            TTCGGA TGATCAGC TCCGAA             TTGTTCTATCTGATT  54 65
         bcp 1108560 .. 1108571 +    -3  -3.91084   GCTTTATTATCGCCG                GTTT GCTC AAAC                 TTTAATTGCGGGTGA  55 254
    RMA_1139 1118736 .. 1118746 +  -5.4  -3.72576   CAAATGCATATATAT                 GTCA AAG TGAC                 TTTAATGACCAAAGA  59 183
    RMA_1147 NONE
        coaE NONE
        dnaQ 1124472 .. 1124521 +  -2.9  -3.16647   GATAGGCAAAGCCTC GA-CGTGGCAATCTCAGGCATT TTATATT ATTTCATGCGATTGCCACGCTC CTTTTAGTCGCTCGC  45 58
       surf1 NONE
    RMA_1151 1128224 .. 1128240 +  -2.3   -3.2087   ATTTCAATAACATTA              TTAGATA AAA TAACTAA              ATCTTTTTTATTAAC  44 423
        fabD 1129669 .. 1129679 +  -3.2   -3.6608   TTATTAACTAGTGAT                 TGGC AGA GCTA                 TTTAGATAAGGTAAT  50 145
        tlc5 1138314 .. 1138324 +  -8.2  -4.65895   TTTTTTGATCCACGC                 GGGC AAT GCCC                 TTTTTAGCTAGGAAC  85 139
         nth 1146164 .. 1146184 +  -4.7  -4.76087   ATGTGTTGTCATTAT            CCTCAATAA GTT TTATAGGGG            TTTGTTTATTATCTA  72 283
    RMA_1178 1148175 .. 1148186 +  -4.4  -3.64283   ACGACATCAGATCAC                TCCT CCTT AGGA                 TTCTTAGCAAATTTA  56 488
    RMA_1183 1150796 .. 1150823 +   -15  -3.14261   TACGAACGTTCAGGA        TGTCATTCCTGC GAAA GCGGGAATGACA         TTGAGTAGGTTTTTC 100 86
        pgpA NONE
        rplU NONE
        rpmA 1152558 .. 1152574 +  -6.7  -4.14739   AAAAACAATTTAAAG              TACTAAT ATT ATTAGTA              TTTTAAGCTGGATCC  71 155
        lysC 1154151 .. 1154170 +    -3  -3.35542   CTCAGAGGCTATCTA            TGA-AGTTA TTT TAACTCTCA            ATTTTTAGGAGTAAA  46 257
    RMA_1189 1155043 .. 1155065 +  -7.6   -2.6244   GTTTAAATATCTTAA           CCGATCCGGT ACG GTCGGAGCGG           GTTAGTCCTTTTACT  65 371
    RMA_1190 1155853 .. 1155863 +    -4   -4.2828   TGTGTTTTGTCTACC                 CATA CTA TATG                 TTTTACTGGATCCCG  60 60
        trmE 1165571 .. 1165581 +  -5.4  -3.02745   TTGCATAACCAACCT                 CCTT CTA AAGG                 TAATTTGTACGTCAA  54 160
    RMA_1199 1167369 .. 1167381 +  -4.1  -4.71426   TAAAGGCTATTATGG                CTATC GTT GATGG                TTTTCTTACTCCCCC  65 247
        recA NONE
        fabG 1171393 .. 1171416 +  -6.2  -5.47159   TAAAAATTAATAAGA          TTATTTTGTG CTAG CATAAAATAA           TTTTTTGTGTTAAAA  88 38
        acpP NONE
        fabF 1173276 .. 1173299 +  -8.4  -4.39329   AGGAATCCAGTAAAA          CATATAAAAA CAAG TTTTTATATG           TTTATTCTATCAAAT  85 186
         uup 1175181 .. 1175191 +  -2.6  -4.72631   AAATACAAGATTAAT                 TTTT GTT AAAA                 TTTTCTTGACTTAAT  60 27
    RMA_1208 1176587 .. 1176608 +  -9.5   -4.6709   TATAACATTCTAAAA           GCTGTAACT ATAT AGTTGCAGC            TTTTGTATCATTTTG  93 282
        smpA 1185647 .. 1185658 +    -3  -3.73775   AGATTGCTTCGTCAA                TTAC TTAC GTAA                 TTTCCTCGCAATGAC  50 96
        ftsY 1186753 .. 1186763 +  -5.4  -3.73775   AGATTGCTTCGTCAA                 TTGC TAT GCAA                 TTTCCTCGCAATGAC  59 136
        polA 1189808 .. 1189820 +  -3.4  -3.58522   AATCGACTATAATAA                TCCA AATTA TGGA                TTTGACGGTAATGGT  52 401
    RMA_1230 NONE
       ampG3 1202488 .. 1202500 +  -3.5  -3.14931   CGTTTATAATATTGA                TATAT AAT ATATA                TTGCTGCGAAATGAA  46 56
        tatC NONE
        serS NONE
     virB4-2 NONE
    RMA_1235 NONE
        terC NONE
    RMA_1237 1212653 .. 1212692 + -12.2  -2.75039   TATTTATATGAAAGC  TACAATGTCATCCCGCGGT CAA GCCGCGGGATGACAC-GAA  TAATTCAACTATATA  89 54
    RMA_1238 1214459 .. 1214473 +   -10  -2.99259   ATTTATTGACTCTCC               TACGCC AAT GGCGTA               TAATTATTATGAGTA  81 102
        nuoJ NONE
        nuoK NONE
       nuoL1 1218130 .. 1218166 +  -6.7  -3.23598   AACGTAGAGAGCGTG    GCAATCTCATGAAAT AATAACA AATTCCTGAGATTGC    TTCGTCAATTACTTC  63 80
        nuoM NONE
        ccmA 1220959 .. 1220976 +  -7.1  -2.81312   TTATGAGTTCCTCTT             TTATTCC GGTA GGAATAA              TGTAATGAATGCATT  63 282
       bolA2 1247604 .. 1247621 +  -3.5  -4.88736   GTAATAGAAGGTTTA             TTATCAG ACAT TTGATAA              TTTTTATCAGTGCTG  68 356
        infA 1256039 .. 1256053 +  -2.1  -2.90511   TTAACTAAGGGGCGT               GTGAT TCATC GTCAC               TAGTCTTTATAAGTA  41 8
         maf 1256745 .. 1256757 +  -3.5  -4.96501   TAAAAATACTAAAAT                TATTA ATA TAATA                TTTGTTTTTCTAGAC  69 55
         map 1277318 .. 1277330 +  -4.9  -3.69506   TTTGCCGATTACGAA                TTACT TGA AGTAA                TGTTATTTTCGGCTA  58 404
       mraY2 NONE
    RMA_1306 1279291 .. 1279338 + -11.5  -4.08767   AGGTGTTGTTGCCTG GCTCAGT-TTATGTCATTCCCGC TTCC GCGGGAATGACATCGTAC-GGGC TTTTCGAACCATACA 100 102
         omp NONE
    RMA_1314 1285327 .. 1285350 +  -4.7  -3.76219   AGGCAGAACTAATCG          GCATTTATT CTATTT AATGAATGC           TATTTATTGTCCACT  58 116
        znuC 1286491 .. 1286509 +  -5.3  -3.17723   AACTATTTTTAATAA             CTAAGTC TTGCT GACTTGG             TTCCATTGCAAGTAA  54 399
         ssb NONE
    RMA_1321 1294357 .. 1294367 +  -6.8  -2.93857   CAAACATTTACATAT                 GCTG TAT CAGC                 TGCTTGTATGTATGT  61 158
    RMA_1324 1296262 .. 1296279 + -11.3  -3.12488   AGACTTCCAATGTCA             TTCCCGC ATAG GCGGGAA              TCTAGTTTATATTTA  87 56
        htpG 1298243 .. 1298256 +  -2.5  -4.35116   AGCCATATTATAACT               TTAAA CTTT TTTAA                TTTTAATGTAGAATA  58 28
        hemA 1299814 .. 1299828 +  -4.3  -5.73672   CAATCCAGTAAAAAA               TTCTG ATTTA CAGAA               TTTTTTTAATTATTT  87 167
         tig 1302663 .. 1302675 +  -4.9  -4.37199   AAGAGCAACGTATTA                CTTTA ATT TAAAG                TTTATTAATTGTCAT  67 15
    RMA_1333 1307874 .. 1307886 +  -3.5  -3.12402   GCCAGAAGTAAAAGA                TTTTA TTT TAAAA                TTAGGTAATAATTTA  46 273
        hemK 1310992 .. 1311018 +  -6.7  -3.09834   CTCCTATATTCACTT        GAGGTATAG-GG CTAA CTGCTATACCTC         TTACATCATGAGATG  59 47
    RMA_1344 NONE
        mutL 1321311 .. 1321324 +  -2.3  -3.27129   CACTCCTTGCAGTCG               TTCGC AATG GCGTA                TCTCTCTTTATCTTG  44 123
        rpmG NONE
        rpsP 1322019 .. 1322039 +  -9.7  -3.82097   ATTCAGCCCCTGTCA            TCCCGCTAT TTG ATTGCGGGA            TTTAGTAAATTTGAC  83 91
       ampD2 NONE
        lipB NONE
    RMA_1350 1324367 .. 1324377 +  -5.4  -3.53224   CTATTATTACTGCAG                 CTCT CAT AGAG                 TTTGAAGGGCAGCTG  59 112
        dapE 1329374 .. 1329397 +  -7.4  -3.05844   GGAAATACTTTAATG          TCATTCCCGC AGAG GCAGGAATGG           TATTACCATACGCGG  64 28
        holC 1330087 .. 1330099 +  -4.9  -4.50976   AATAAAATCTAGATT                TTTTG AAG CAAAA                TTTTGTAATATAAAA  69 118
        phnP NONE
        glnQ 1334011 .. 1334046 +  -7.9  -2.80935   AAGATAAAATTATAG    CCTATAATTAGTATT TAATTT AGTATTAATTATAGG     TATACTCGATGAACT  66 52
    RMA_1366 1334537 .. 1334549 +  -4.7  -3.53811   TAATTTGTTTAGAAA                GCTGG ATT CCTGC                TTTCGCAGGAATGAC  56 159
    RMA_1368 1336260 .. 1336275 +    -4  -3.92869   GACTTCCTGCATAAC              TTGCTT CTAA AGGCAA               TTTGTACGTCGATCC  56 40
       pntA1 NONE
       pntA2 1341518 .. 1341531 +  -3.9   -3.5944   GCCCCGAATTTTATG               TTATC TCCC GATAA                TTTACCAATGTCAAT  52 419
       sec59 NONE
        dnaG NONE
        rpoD 1346296 .. 1346323 +  -4.8  -2.64218   TACTTATACTGTTAT        CCCGTGATTCGGG ATC TCAGGA-CACGGG        CTTGTGATACAAGAT  50 44
        truA 1347135 .. 1347158 +  -6.8  -3.07935   TAAATTTTGTCATTA          CAATGCCT CCCTGCAT AGGCATTG           TTACGTGGATACCAT  62 47
    RMA_1380 NONE
    RMA_1381 NONE
    RMA_1382 1353451 .. 1353477 +  -9.7   -3.0161   GACGAAGCAATCCAG         TAAAAATTCTG ATTTA CAGAATTTTTA         ATTATTGTTCTAGAT  76 77
       proP7 NONE
        hemF 1356406 .. 1356430 + -11.5  -3.10879   TTTTTAAAATCATAA          CCGGAATGGCA AAA TGCTATTTCGG          TGTGTTGAGATTACT  87 43
        hemE NONE
        hemH NONE
    RMA_1387 1357675 .. 1357689 -  -3.6  -5.09259   TACTTCAAAAGAAAA               TTTAGA AAT CCTAAA               AGTTGAGATAGCAGA  69 354
        alaS 1347235 .. 1347245 -  -5.4  -2.80443   GGATATTTGACGAGA                 TTGC CAC GCAA                 GTACTACGGCTGCTC  53 105
        greA 1341206 .. 1341245 -  -7.3  -2.83903   GGGTCGAAAAACCTA CTCG--ATGTCGTTCCCGC GTAG GCGGGAATGACATAACAAG  TCATACGGTTAACGT  63 63
        lolA NONE
        dnaX NONE
    RMA_1369 1336766 .. 1336781 -  -6.1  -3.39274   AAGAATGACATAAGA              GCCGT GTTAAA ACGGC               ATTTTAAAGCCTGGT  62 16
    RMA_1363 1331763 .. 1331775 -  -7.7   -2.6563   TCTTTCAATAATGTA                GCTAC ATT GTAGC                GCACATATTAAAAAC  65 82
        dinJ NONE
    RMA_1361 1331232 .. 1331246 -  -4.2  -3.89085   ATAATTAAAAACCAA               GTGCAC TGT GTGAAC               CTAATCGTATTAACT  56 0
    RMA_1360 1329518 .. 1329532 -  -5.8  -4.72201   TCTCATAAAAAATAA               CATAAA ATT TTTATG               CAGCAATTTAGTATT  77 493
        nhaA 1324019 .. 1324033 -  -4.2  -3.33412   TAATGTTATAGAACA               GCAGGT AAT ACTTGC               TCCGAGTAAAATAAT  51 282
    RMA_1340 1315466 .. 1315479 -  -2.5  -5.54264   AAAGATTCAAAAAAA               TAAAA TATT TTTTA                TTAATTTGAGGTCTT  75 39
    RMA_1339 NONE
       vapC3 NONE
        glyQ NONE
        glyS NONE
    RMA_1335 1310916 .. 1310930 -  -4.2  -3.29973   TCAAAAAGCTATTAA               GGCG AATAGAA CGCC               GAAATTTATGATTTT  51 31
    RMA_1332 1305754 .. 1305770 -  -3.7  -3.06302   ATTACCTGCATTTAA              TAGCAGA ATA TCTGTTA              TAAAAATTGTAACTA  46 137
    RMA_1331 1305264 .. 1305285 -  -2.4  -3.54743   CATCAGTAAGTATAA           TCCTAATT TAATGC AATTAGAA            ATGAATTATGATTTA  46 86
        gltA NONE
        obgE 1302472 .. 1302489 -  -7.1  -3.16421   GCAACAAGCACGTAA             TTTTCCT GGGC AGGAAAA              TATGATATTTGATTT  65 352
    RMA_1323 1294683 .. 1294695 -  -3.5  -3.74762   AATAGTTAGTAATAA                TTATA ATC TATAA                TATTGCCGACGTTTC  52 223
        uvrA 1289486 .. 1289500 -  -7.2  -4.91109   TTTTTATTATAAAAA               TTAAGC TTA GCTTAA               AGACAAGCATATTCT  86 484
    RMA_1312 NONE
    RMA_1311 1282637 .. 1282647 -  -2.4  -2.72144   TCATTCCCGCGAAAG                 CGGG AAT CCAG                 TAAATAAAAACTAAA  40 52
        ccmC NONE
        fdxA 1281293 .. 1281305 -  -4.9  -4.17274   AATTAAATAATTAAA                CATTA TCT TAATG                GCATATATAACATAT  64 253
    RMA_1308 1280388 .. 1280427 -  -5.2   -4.7254   AGTTGTTAGTAAAAA  CGATATTAGATAATAATT TTAC AATTTTTATCTAAATTCG   ACAAAAAATAGTCTT  71 188
    RMA_1307 1279554 .. 1279575 -  -9.5  -6.04953   ACACAAACAAAAAAA           GGAGCCTTT AATT AAAGACTCC            TTTTTCGTGTTAATA 100 65
        ftsK 1272668 .. 1272686 -  -5.3  -3.68836   AGAGCCATGCAACAA            CGCCTACG GCTG CGTAG-CG             CATGACGAAAAAAAA  59 45
    RMA_1297 1271139 .. 1271151 -  -6.3  -3.24195   TAATAAAAATTAAAT                CACTT AAA AAGTG                TTATTTTAACGCAAC  61 209
        ompA 1265148 .. 1265172 - -14.5  -5.42514   TTATAAAGCAAAAAA          GCCTATATAGT CAA ACTATATAGGC          TTTTTTATGATTATA 100 51
        surA NONE
        ubiD 1261651 .. 1261661 -  -2.6  -5.08169   AGATATTTCAAAAAA                 TTAA CAA TTAA                 TATAAACAGTATACG  66 160
        pldA 1259030 .. 1259045 -  -3.2  -5.31456   GGAATCTAGAAAAAA              GCGCAA TTAT TTGAGC               TTTTAATATAAAAAA  71 111
        xerC 1257331 .. 1257345 -  -2.2  -4.10007   ATAAGGTTTTTAAAA               TAATAT AAT ATATCA               CTTAAAATTAACGCA  52 66
        dksA 1256456 .. 1256467 -    -3  -5.38047   CAGTTAGACAAAAAA                TAGT TCAG ACTA                 TTGTTAAGTTCAAAA  74 406
    RMA_1270 1247102 .. 1247114 -    -2  -3.29981   CAGTACAATGAAAAT                TACT GATTT AGTA                GGAGATCAAGACCAT  44 489
    RMA_1268 NONE
        kefB NONE
    RMA_1266 1244258 .. 1244272 -  -3.4  -4.04326   GAAGGAAACACGAAA               CACAGC ACT GCAGCG               TACATAAAAGTACGT  56 101
    RMA_1265 1242779 .. 1242789 -  -2.6  -3.56704   CCTCTACCAAACCAA                 TATT CAT AATA                 ATCTTTAGCGATGTC  46 512
        miaB NONE
        mrcA 1238110 .. 1238124 -  -4.4  -3.98915   CAGAAATACAGCAAA               TTTTAA AAA TTAAAA               GTTCGATTTATCTCG  60 118
       lpdA1 1233880 .. 1233890 -  -5.4  -2.87252   CAACAAGAGCAAGGA                 GTCT ATA AGAC                 GAGGAGCGGAGCGTA  53 107
        atpH 1233179 .. 1233214 -  -5.4  -2.55544   CGAGGAGCGAAGCGA    CGTGGCAATCTCATAA AATA TCCTGAGATTGCTTCG     TCAATTACTTCGTAA  51 67
        atpA NONE
        atpG 1230461 .. 1230475 -  -4.2  -3.72968   ACGAGTATATCTAAA               CCGCTT CCG AACCGG               CTATAATCTCTATTA  53 6
        atpD 1228822 .. 1228855 - -12.5  -3.17875   AATATAGTAAAATTA     CTACGTCATTCCCGC GTAG GCGGGAATGACATCA      ACGTCACTTCAACGT  90 29
        atpC NONE
        acnA 1225610 .. 1225620 -  -5.4  -3.35798   ATTGCGTACGTACAA                 TTGC TAC GCAA                 TTTCCTCACAATGAC  56 53
    RMA_1249 NONE
        nuoG 1223047 .. 1223057 -  -2.4  -5.03409   TTACAAAAAAAAGAA                 CTGG ATT CCCG                 CTTTTGCGGGAATGA  66 70
        nuoH NONE
        nuoI 1221284 .. 1221304 -  -8.4  -4.00469   TGAAGAGTAATTAAA            CGAGTATA TTACC TATACTCG            TAATCTTTGTGTAGT  79 13
         udg 1196633 .. 1196645 -  -6.3  -3.62275   ATCCAGTACTTTAAA                GCTTT TTA AAAGC                TCGATTTATCTCGCT  64 95
        dnaE 1192895 .. 1192939 - -11.5  -4.15899   AAAAACATCAAAGAA TATTACTCATTGTGAGCAGCC TAT GGCTGCTCACAATGACGACTC GGTATCCACACACAA 100 91
        rpmF NONE
        fabH 1183732 .. 1183746 -  -3.4  -3.01041   AATTTGAAGGAGACA               CGGCAC GCA GAACCG               CAGCGTACATAGAGG  46 125
         pal 1182836 .. 1182856 -    -9  -6.02919   TTATAAATAAAAAAA            GGCCGAGT AGTAA ACTCGACC            TTTTAGGATACTATA 100 55
    RMA_1214 1181186 .. 1181231 -  -2.1  -4.70879   TCTAAATTCTAAAAA CACTT-CTATAGAACTGTTAAC AAA ATAAACAGTCCCATAGTAAATA AAAATTTAATATAGA  59 162
        mreB NONE
        mreC 1179136 .. 1179152 -  -3.8  -4.67353   GGATCCAGTTAAAAA              TACTAA AATTA TTAGTA              TTTTTTATTGTTTTT  65 148
    RMA_1211 NONE
         gmk 1177810 .. 1177820 -  -3.2  -5.76237   TATAGAAAGAAAAAA                 CGAC AAA GTCA                 AAACGCTTTTTCTCG  81 23
    RMA_1209 1176385 .. 1176401 - -10.9  -5.09762   CCTGAACAAAGAAAA              GCAGCTT TAG AAGCTGC              AAAAGTACAATTTGA 100 218
    RMA_1200 1167714 .. 1167731 -  -2.1  -2.79209   TAAGCACTAAGATCA             TTTAACCA TTA TGGT-AAA             TAGTGCAAAAATAGC  41 259
    RMA_1197 NONE
    RMA_1196 NONE
    RMA_1195 NONE
    RMA_1194 NONE
    RMA_1193 1158119 .. 1158132 -  -5.3  -3.37685   AAAATCCTTTAAAGA               CCTTT ATGT AAAGG                TGGACTTCATATATC  58 40
       proP5 1156430 .. 1156450 -  -4.7  -2.92667   TTAACTCTTAAACCA            TTCTTCTGC ATT GCTAAAGAA            ATTTCTTGCCTCAAC  51 255
        tatA 1150853 .. 1150865 -  -4.8  -3.69283   CAAGCCATGCAACAA                GGCT GGTCA AGCC                ACGGGATGACAAAGG  58 56
    RMA_1182 1148741 .. 1148751 -  -2.6  -3.97388   ATATTCTACTATAAA                 TTTA TAT TAAA                 TCTTTTGCTTATTCA  53 21
    RMA_1181 NONE
    RMA_1177 1146477 .. 1146490 -  -5.3  -3.88291   CAGCATGGTTATAAA               CATCT CTAT AGATG                AAGTATCAAGCGAGT  61 514
       grxC2 NONE
    RMA_1173 1144072 .. 1144112 -    -4  -3.15027   ATCTCGTACCAAAAT CCTGAGATTGCCACGCAGCC TAC GGCTGC-TCGCAATGAC-GG CTATTTATAAAATTA  48 4
        glyA NONE
        lipA 1141713 .. 1141725 -  -7.7  -2.89935   AAATACTCGTATACA                CGTGT GTT ACACG                TATGATATCATATAT  66 129
    RMA_1170 NONE
    RMA_1169 NONE
        tlyC 1139360 .. 1139390 -  -2.6  -4.44461   AATAATGTCATAAAA       TTATATTTTCCATG TTT CATGGTAATTATCA       TTGACAATTAGGTTT  58 360
    RMA_1167 1138264 .. 1138284 - -11.9  -3.31726   GTCTGCGACACAAGA            TACCGCGGT CAA ACCACGGTA            TGACACCGAACGCGT  89 466
        phbC NONE
    RMA_1146 NONE
        rnhA NONE
    RMA_1144 NONE
    RMA_1143 1119847 .. 1119867 - -12.7  -6.01369   TAAACAATAAAAAAA            CCGAATCTA AAC TAGATTCGG            CTAAATTTAATGATT 100 59
         tgt 1114309 .. 1114322 -  -3.1   -3.7511   TTTTTCATAACATAA               CCTAC TTAA GTAAG                TTTACATGTAATAAG  50 63
        ligA 1111871 .. 1111886 -  -3.2  -2.79312   AAATGTTTGACTATA              TCGGCA AAAT TGCCTA               CATGATAAATATGAC  43 144
    RMA_1127 NONE
        lpxK NONE
        htrB 1108373 .. 1108383 -  -5.4  -3.73775   GTCATTGCGAGGAAA                 TTGC ACA GCAA                 TTGACGAAGCAATCT  59 84
        himA 1106840 .. 1106863 -  -5.4  -4.39998   TATTGACACAATAAA          CCTAAAAAAA CAAG TTTTTATAGG           TTTTACTGGATTCCC  69 109
    RMA_1122 NONE
    RMA_1121 1105398 .. 1105418 - -12.6  -3.01924   GACTGTGTCCTAAGA            TACCGCGG TCGAG CCGCGGTA            TGACATTAAATGAAT  90 48
    RMA_1120 1104459 .. 1104479 - -15.5  -2.80779   ATCACAACTCAACCA            CTACCGGCT GAG AGCCGGTAG            GTTGATGATAGGCAC 100 70
      spoT11 1103594 .. 1103632 -    -9  -4.73614   TAGTATTAAAACAAA   CTTATCAAACGTGCGTCA AGA TATCCCACATTTGATAAG   GAAATAACCTAATAT  90 243
        ompB 1098515 .. 1098536 - -10.9  -4.65032   GAAAGCACAAACAAA           GCCCCCTTT TGTC AAAGAGGGC            TTTTTTCTTGAGGAA 100 67
    RMA_1107 NONE
        exsB 1082788 .. 1082823 - -17.2  -3.02639   ATTTTTAAATAATGA    GTATACAAGGTGAAAA ACAG TTTCCACCTTGTATAC     AAATTTACTGCATAT 100 83
        rimJ NONE
        clpX 1080686 .. 1080720 -  -7.4   -3.3506   TTTAAACCGCTATAA     TACTAGTTTAGGATAA ATT TTATACTAAATTAGTA     TTGTCCCGTGGTCAA  66 155
        ubiA 1066105 .. 1066129 -  -8.1  -4.33767   ATAAATCCAGTAAAA          CATATAAAAAT TAA ATTCTTATATG          TTTTTTACTAGAAAT  83 149
         tmk NONE
        metG 1062288 .. 1062298 -    -4  -2.77148   TCTATTAACATATTA                 TACT CTT AGTA                 GGTGTGTCATACTGC  46 63
        tatD 1060804 .. 1060823 -  -5.1  -3.25223   TAGGTATATTATGAA            TCTTCAA TTTGTT TTGAAGA             TATAATGCAAGTGCA  54 514
    RMA_1076 1058278 .. 1058289 -    -3   -3.1577   AGCTAATATTCAAGA                CTAT TGAC ATAG                 CGTTATTGCTTATAT  45 420
    RMA_1074 1057129 .. 1057149 - -15.5  -2.81969   CCAATAACTCAACCA            CTACCGGCT GAG AGCCGGTAG            GTTGATGATAGGCAC 100 70
        ubiE 1054098 .. 1054109 -    -3  -2.81464   TTATCATCTATTATA                TACT CCGA AGTA                 AAATAAAGAGTAGTA  43 153
        ubiB 1052583 .. 1052593 -  -2.6  -4.23615   AGGATATTTAATAAA                 TAAA TCT TTTA                 GTTTCATAATAATAA  55 85
        ostA 1042083 .. 1042094 -  -2.2  -4.87133   ATTTTTCAAATAAAA                CGAG CATA CTCA                 CATGTTTAAAACTTT  62 23
    RMA_1057 NONE
        ksgA 1039592 .. 1039614 -    -5  -4.08689   GACTCAAGAACTAAA           TTGTATTTAC CTA GTAAATAGAA           AAAGCCGTATTTTTG  62 392
        cspA 1038246 .. 1038264 -  -4.7  -5.16133   ATTATAAGACAAAAA             CAAAATA TTTAC TATTTTG             ATAAAGATGACTAGG  79 95
        rhlE 1036480 .. 1036494 -  -6.4  -3.37796   TGCGAGCAGCCATAA               GACTGC GTG GCAATC               TCATGAGATAATAAT  62 115
       ampG2 1035026 .. 1035042 -  -3.8  -4.67353   GGAGCCAGTTAAAAA              TACTAA AATTA TTAGTA              TTTTTTATTGTTTTT  65 147
    RMA_1051 1034019 .. 1034053 -  -6.7  -5.31456   GCAACCCAGAAAAAA     TAATCAAAAATTCTG TAAAT CAGAATTTTTTACTA     GATTGCTTCGTCGAA  88 123
         tuf 1025718 .. 1025755 - -13.9  -4.17657   TATTACATCTTAAAA   CATAAATACCTATTATT TTTT AATAATAGGTATTTATA    AAATCAATTAATTAT 100 33
        rpsJ NONE
        rplC NONE
        rplD NONE
        rplW NONE
        rplB NONE
        rpsS NONE
        rplV NONE
        rpsC NONE
        rplP NONE
        rpmC NONE
        rpsQ NONE
        rplN 1020069 .. 1020085 -  -2.9  -3.39595   TTTAATCATTTATAA              CACTTCC TCT GCAAGCG              ACATTATTCTAACAT  48 3
        rplX NONE
        rplE NONE
        rpsN NONE
        rpsH NONE
        rplF NONE
        rplR NONE
        rpsE NONE
        rpmD NONE
        rplO NONE
        secY NONE
         adk 1014327 .. 1014337 -    -4  -4.08219   ATAATATAAAAAAAT                 CTTT GAT AAAG                 TCAATTTATTTTTAG  58 26
        rpsM NONE
        rpsK NONE
        rpoA NONE
        rplQ NONE
        rpsT 1011359 .. 1011383 -  -4.4  -4.91712   GGGAATTTAGAAAAA          GTACTAAAAT TTAGT ATTTTTGTAC          TGGATTATTTCGTCA  70 381
         rph 1004892 .. 1004906 -  -4.3  -6.01369   GAAATAATAAAAAAA               TGCTA TAAAT TAGCA               TTTTTTGCAATGACG  91 67
       groES  999759 ..  999772 -  -2.5  -4.64861   TCTCCTTAAAACAAA               TTATT AATT AATAA                TACCAAATACGTCGC  60 15
       groEL  998069 ..  998079 -    -4  -2.59881   GATCTATTGCATAAC                 CTAT CTT ATAG                 AGAGATATAGACTTA  46 38
      spoT12  996314 ..  996324 -    -4   -4.4846   TAATCCAAGAACAAA                 GATA TGA TATC                 GCACTTATTAAAGTA  65 414
    RMA_0994  994567 ..  994587 - -15.5   -2.7386   AATTTATCTCAACCA            CTACCGGCT GAG AGCCGGTAG            GTTGATGATAGGCAC 100 70
        znuB NONE
        tfoX  989388 ..  989398 -    -4  -3.67792   CTACATTTACCGAAA                 GTAA TTA TTAC                 CGATTCAGGAATACC  52 353
    RMA_0987  985173 ..  985193 - -15.5  -2.84417   TAATAAACTCAACCA            CTACCGGCT GAG AGCCGGTAG            GTTGATGATAGGCAC 100 70
        pccB NONE
        accC  981200 ..  981210 -  -2.6  -4.45771   ATCTGAAAATATAAA                 TAAT TGA ATTA                 TCCTTTACAGAACCT  58 47
        rpsU  973326 ..  973349 - -11.2  -5.89921   ATGACAATAAAAAAA          GCTAGAAATA TTAA TATTTCTAGC           TTTATATTTAGTATG 100 57
        ntrY  970913 ..  970923 -    -4  -2.77629   ATATGAAATGACAAG                 TTAG GTG CTAA                 TATTGGTAACCATTT  46 322
    RMA_0973  966463 ..  966483 -  -3.3   -3.1479   ATAATTCATACCTAA            TTAACGCGA GTT TCGAATTAA            CAGAGCATAGAATTT  46 47
        corA  963526 ..  963538 -  -4.9  -4.40358   AGTCATCCTATAAAA                TAAGT CCT ACTTA                CTTATTTTATATAAG  67 178
    RMA_0970  963008 ..  963028 - -15.5  -2.78891   AGTCCAACTCAACCA            CTACCGGCT GAG AGCCGGTAG            GTTGATGATAGGCAC 100 70
    RMA_0967  959277 ..  959306 -    -6  -2.61216   TGACGAAGCAATCCA       GTAAAAAATTCTG ATTTA CAGA-TTTTTTAC       TATTTTTTATAGATT  55 221
        nrdG  956817 ..  956829 -  -3.3  -4.07455   CATCAACATCACAAA                GCAAC ATA GATGC                TGACAAAATTATCTT  56 223
        rplY  955524 ..  955534 -  -2.4   -2.9127   GACAATTAAAGATTA                 CCGG ATT CCCG                 CTTCTAGCTAGGAAT  42 128
         pth  954749 ..  954761 -    -2  -3.44284   GTCGTAGGAATAACA                TTGA ATATA TCAA                ACTATCTTATTCTTA  46 22
        ychF  952633 ..  952655 -  -3.4  -4.39748   TATCATATAAAAGAA           TACCTTCATT CTT AATGTCGGTA           TAAAAATAACACCCT  61 418
    RMA_0946 NONE
         mfd  941320 ..  941330 -  -5.4  -3.73775   GTCATTGCGAGGAAA                 TTGC ATA GCAA                 TTGACGAAGCAATCT  59 120
        murE  939702 ..  939727 - -10.7    -3.794   CGGGAAGCCAGTAAA         CATATAAAAAG CTTG CTTTTTATATG          TTTATTTTATCAAAT  89 137
        murF  938264 ..  938274 -  -2.6  -3.66384   AACCAAACCACACAA                 TATT AAG AATA                 TCCTAGTGTATTTAT  48 37
        mraY NONE
       rickA  935226 ..  935250 -  -4.4  -4.79683   AATTGATAAAATAAA          CCTAAAAAAA CAAGT TTTTTATAGG          CTTTACTGGCTTCCC  70 63
        recG NONE
    RMA_0924  921423 ..  921439 -  -2.3  -3.54424   TTTGATCCCCTTAAA              CTTTTTA CAT TAAAACG              CCGTTATTTTATTTA  46 231
       proP9  919469 ..  919484 -  -2.6    -3.745   GGACGTAGCAAAACA              CGT-AGA AGG TCTAACG              AGAATTAAATCTTAC  48 207
        gyrB  912896 ..  912925 -  -7.9  -2.89848   GAAAACTGATTAAAT       TGTCATCCCGCGAC TTA ATCGCGGGATC-CA       GTTAAAAATACTAAT  66 102
        murA  911511 ..  911535 -  -2.8  -2.64705   CACAAGGCAAGGAAC          GCAGCACTTA ATACG TGAGTACCGC          AGCTCTTGTAGAACG  40 73
        rpoZ  911016 ..  911041 - -12.7  -3.24188   CTATATCAGTACCAA         CACCGATAAGC ATTT ACTTATCGGTG          TCATAATCTTCGCCA 100 13
        acpS  910347 ..  910358 -    -3  -3.86944   TGCAGAAGTACTAAA                GAAA TATA TTTC                 TGATTTAGAAGCTAA  52 300
        secA  906190 ..  906205 -  -2.6  -2.84878   CGCTCCAAGGGAAAT              CTTTAGC TTT GCTAA-G              TGTAAATTCCTTGCT  42 443
    RMA_0908  904505 ..  904522 -  -3.5  -3.73968   AAAGTTTTTACTAAA             TTTCAAA AAAA CTTGAAA              TCCTTATCGGAAGTG  52 150
    RMA_0903  899551 ..  899562 -  -4.4  -2.67747   TCTCTATAGCATAAC                GAAC TGCG GTTC                 TTGGCATTTGTAAAG  48 102
    RMA_0902  898824 ..  898848 -  -4.4   -3.9163   AAATTACACATTAAA          CCTAAAAAAA CAAGT TTTTTATAGG          TTTTACTGGATTCCC  58 88
        uvrC  896640 ..  896651 -  -4.4  -3.50953   CCAAGAACTTAAAGA                TCCT ATTG AGGA                 TATAAAAAGCTAGCC  54 228
        mraZ NONE
        mraW NONE
        ftsL  891204 ..  891227 -  -6.9  -2.74792   TCAGTACTTTTAAAC          CTTTTCAAA ACTTAA TTTGAAAAG           TAAAAAATCTTTGAA  59 261
       pbpA2  889054 ..  889065 -    -3  -3.61908   ACAGTTTTAAAAAAT                GAAT ATGG ATTC                 TACAATAACGCACAA  50 394
    RMA_0892 NONE
       pbpA1  886122 ..  886138 -  -6.7  -4.66609   GAGTCTAGTTAAAAA              TACTAAT ATT ATTAGTA              TTTTAAGTTGTTTTC  79 404
    RMA_0890  884777 ..  884798 -  -7.5  -4.30978   GGGAATCCAGTAAAA           CATATAAAA AATT TTTTATATG            CTTATTTTGTTAAAG  80 108
    RMA_0887 NONE
        ubiH  879104 ..  879123 -  -6.5  -3.31144   TGTGGAGGCTCAGAA            GCTTTTG TTTGTG CAAAAGC             TCTACTCTTTCAGGG  61 319
       comF2  876495 ..  876505 -  -2.6  -3.47322   CTTTACGATAAGGAA                 TAAT TTT ATTA                 TATAATTGGTATTTG  46 495
    RMA_0872  865365 ..  865378 -  -3.9  -2.82623   TTGTGTTCACAACTA               GAATT ATGT AATTC                GTTGAACGCTACTAA  47 139
    RMA_0870 NONE
    RMA_0869 NONE
    RMA_0863  858327 ..  858337 -  -2.6  -3.21778   TTATTATAGGAAAAG                 TTTT ATA AAAA                 AGAATAACAGAATGA  44 3
    RMA_0862 NONE
    RMA_0861 NONE
        tyrS  856206 ..  856242 -  -9.7  -3.87562   ATAGAAAATATACAA    TTTGTCTAATTGAAAGT TGC AGTTTCAATTAGACATA    ATATATTTGAGCCAT  83 87
        tlyA  855210 ..  855220 -    -4   -5.1764   GATATAATAGAAAAA                 TTAG AAC CTAA                 TATGGATATAGTAGA  74 195
    RMA_0856  853520 ..  853536 -  -9.4  -5.56673   ATTTATAACAAAAAA              GGTGGG ATAAA CCCACC              TAATCTATAATTTTT 100 339
    RMA_0855 NONE
        nusA  851376 ..  851399 -  -5.5  -3.18105   GGAATCCACTAAAAT          CTATAAAAA AACTTG TTTTTATAG           GTTTATTTTATCAAG  56 116
        infB  848459 ..  848474 -  -2.6  -4.67608   GAGGTCAAGATAAAA              GCTAAT AATT ATTAAC               TTTTTATTATATTTT  60 307
    RMA_0852  847018 ..  847029 -  -2.2  -5.47218   TCCTAGTTAAAAAAA                GTAG GAAT CCAC                 TTACTGGATTTCTGT  71 68
        priA  832618 ..  832629 -  -4.4  -3.62414   AGAAACTACAAAAAT                GGAT AATA ATCC                 TATTTGGAAAAATAT  55 227
        hemB  830544 ..  830555 -    -3  -3.28712   TTCGCCTCTTTATAA                TGAT TTAC ATCA                 AATTGATAATTTTGA  46 92
    RMA_0835  828473 ..  828485 -  -2.7  -3.55761   GAGCCATTCGTCAAA                CTTCT CTA AAAAG                ATTAATGGCTTATAG  48 523
    RMA_0829  821402 ..  821416 -  -3.6  -4.21462   ATTGAGGATTTAAAA               TCACAT ATT ATATGA               TAACTGATTTTTCTT  58 39
        iscR  818969 ..  818979 -  -2.6  -3.56092   GCATTATGGTCTAAA                 TATA TCA TATA                 TTTAAATTTGAGTTT  46 19
        spl1  817795 ..  817836 - -13.1  -2.63585   GTATAGTTTAAACAG TCATCGATGTCATTCCCGC GGAA GCGGGAATGACATAAACGG  AGCCGTGCAACAACG 100 47
        iscS  816484 ..  816511 -  -9.2  -3.24365   GGATATTTGACAAGA        TTGCCACGCAGCC TAC GGCTGC-TCGCAA        TGACGATATTCTCAA  77 37
        iscU NONE
       iscA2  815619 ..  815629 -    -4  -4.77775   AGCGGAGAAAAGAAA                 TCAA TTA TTGA                 TTTTAAAGTGTGACA  68 15
        potE  813119 ..  813133 -  -4.3  -5.10497   AATCCAGTTAAAAAA               TTCTG ATTTA CAGAA               TTTTTTTATTATTTT  73 105
        pepP  810717 ..  810729 -  -4.1   -4.9448   AGTTATTAAATAAAA                TTCCG GTT CAGAA                TATTTATAAAGACTA  73 376
       ampG1  803872 ..  803885 -  -2.5  -4.74132   ATACGGTATTAAAAA               TATTA TACT TAATA                TATCATTCATTATTG  63 35
        lysE NONE
    RMA_0810 NONE
    RMA_0809  801309 ..  801323 -  -2.8  -4.76123   AAATTAGTAATAAAA               GCCCTA AAA TAAGAC               TAAAGAACAAGGTAG  63 148
        trpS  796373 ..  796383 -  -6.8  -3.60151   TTTTTTAAATCATAA                 GCAG CAA CTGC                 ACATGTTTCTTATCA  67 268
    RMA_0789 NONE
         rnd  785150 ..  785161 -    -3  -4.12037   TAGAAACAGGACAAA                TATC CGGC GATA                 CTCAGACTGGAGATA  55 229
        rpmJ NONE
    RMA_0775 NONE
        glmU  774423 ..  774447 -  -4.4  -5.21683   ATCCAAAAAAATAAA          CCTATAAAAA CAAAT TTTTTGTAGG          TTTTACTGGATTCCC  77 126
    RMA_0772  772300 ..  772324 -  -5.7  -3.06501   GATATCCCCAGGGAA          TTTCTCCAACA GGC TGTTGGAGGAT          TTGTTCATCGTTATA  57 311
    RMA_0770 NONE
    RMA_0769  771088 ..  771098 -  -5.4  -2.74741   ATTAGAGGGTAATCA                 GCAA CGG TTGC                 AGTGGTTAAACGTAT  52 61
    RMA_0767  770476 ..  770499 -  -8.2  -2.91429   TAAAAGCGGCAGATA          CTTCTGAAAG CTTG CTTTCCGAAG           AGATACAATTGATAA  67 269
    RMA_0756  760964 ..  760977 -  -2.5  -3.41738   GCTCTAAGAAATAGA               TTTAA AGAA TTAAA                CTACTATAACTAATC  46 60
    RMA_0754  758619 ..  758645 -  -8.2  -3.95148   AGATATTGAAGTAAA         GTCTTGTAAA TATTTAT TTTACAAGAC         TTTAAGTTATTTAGT  77 43
       spoT6  757619 ..  757631 -  -2.7  -4.49389   ACTGCAGAAGGAAAA                CTTAA GAT TCAAG                AAAGAAAAGCTCGCA  60 239
       dnaE2  748748 ..  748763 -  -7.6  -3.91488   AATCTTTCCAAATAA              GCATAC GCAT GTATGC               AACTTATACAATCCT  74 45
    RMA_0749  745675 ..  745689 -  -2.8  -4.46155   TATATACTGATAAAA               CAGC TCTAACT GCTG               CTGATATGCTTAATG  60 507
    RMA_0747  743759 ..  743771 -  -3.5  -4.17089   GTCAAATTCGTAAAA                TTATT AAA AATAA                AGGAGTGTCATTGTC  58 106
    RMA_0742  740378 ..  740398 - -15.5  -2.82602   CAGTAAACTCAACCA            CTACCGGCT GAG AGCCGGTAG            GTTGATGATAGGCAC 100 70
    RMA_0740 NONE
    RMA_0739  738219 ..  738248 -  -7.4  -4.36914   GTTTTTGTTATAAAA       TTTGCTAAAAAT GCGTAA ATTTTCAGCAAA        TTGTCGTTTTTTACT  79 318
     traA_Ti NONE
    RMA_0734  730184 ..  730197 -  -6.7  -3.89448   TCCAAAAACATAGAA               GCCAT TTTA ATGGC                ATTTTTAAAAGATTT  69 220
        bpl1  681131 ..  681158 -  -5.8  -3.19212   ATCACTTAGAATATA        TAACTTCTTT ACTAGAAA AAAGAAGTTA         TCTTGTATCGGATTC  59 347
        ppdK  676959 ..  676994 -  -8.6  -5.05782   ACGGAGTCCAAAAAA    CAATAAAAAATACTAA TATT TTAGTATTTTTAACTG     GATCCCGTGGTCAAG  95 155
    RMA_0682  674911 ..  674921 -  -5.4  -3.71527   TCTGAACTACGGAAA                 TTGC ATA GCAA                 TTGACGAGGCAATCT  59 167
        addA  673956 ..  673985 -  -4.5  -2.79239   TTACATCAAAATTGA       TCAAATCACAC-TG GAA CATATATGATTTGA       GACAATGGATTTAGC  49 172
        glnA  670713 ..  670736 -  -6.8  -3.27985   TATGAAAATATAAAG          TGAAGTGC AGCTTAAA GCACTTCA           TCAGTATTTAGTGTT  63 169
        hipB  668922 ..  668945 -    -7  -3.75571   GAATCTAGTAAAACA          TATAAAAAAA TAAG TTTTTTTATA           ACAGGATGGCAGCTT  67 45
        truB NONE
        rpsO  662453 ..  662480 -  -9.2  -3.75665   GGATATTTGACGAAA        TTGCCACGCAGCC TAC GGCTGC-TCGCAA        TGAATGACGATCATC  80 44
         pnp  660020 ..  660034 -  -7.8  -2.73364   CCGTCATTGCAAGCA               GCAGCC GTA AGCTGC               ACGGCAATCTCATGA  65 114
        kpsF NONE
    RMA_0667 NONE
    RMA_0666  657714 ..  657728 -  -5.8  -4.68424   CAATCCAGTTAAAAA               TACTAA TCT TTAGTA               TTTTTTTTAATTATT  74 99
       abcT2  656777 ..  656795 -  -8.8  -4.08767   GTCATTCCTGCAAAA             GAGCCTTG TTG CATGGCTC             GGAAAACCTACTCGA  82 126
        exoC  655082 ..  655094 -  -4.8  -3.70149   GTCAGACTATTTAAA                CCGT TAGAT ACGG                CTACGTCACTGTTAA  58 268
        miaA  653523 ..  653539 -    -3  -4.87291   TATTTTAATCAAAAA              TCTGAT AAGAA ACCAGA              ATTAGAAAATAAAGT  65 181
       trxB2  639272 ..  639283 -    -3  -3.73775   GTCATTGCGAGTAAA                TTAC GTAA GTAA                 TTGACGAAGCAATCT  50 122
        folD  638213 ..  638226 -  -2.4   -3.9122   TATCTCGCCAAAGAA               GAGA ATTAAA TCTC                AAGAATTATGGATGG  51 160
    RMA_0642 NONE
        tdcB  631144 ..  631164 - -11.2  -3.04263   AGCTGAGTCCTAAGA            TACCGCGA TCAAG TCGCGGTA            TGACATTAAAGGTTA  84 41
        ppnK  614913 ..  614932 -  -2.3  -5.08824   TTCTTAGTCAAAAAA            TTATTAA TATTTT TTAATAA             TTACCCACCGAATTG  65 26
    RMA_0621 NONE
        rbfA  610524 ..  610544 -  -4.2  -3.88178   ATACAATAACCTAAA            TATTAAAA CAATT TTTTAATA            AATTATTAGATTCTT  56 55
    RMA_0619  608585 ..  608598 -  -2.4  -3.53012   CCGCTTCCGTGGAAA               TGAC ATTCAG GTCA                TAAAATATAATTGCT  46 39
    RMA_0618  606407 ..  606423 -  -3.8  -5.80727   AAAAACAATAAAAAA              TACTAA AATTA TTAGTA              TTTTTAACTAGATCC  86 90
    RMA_0617  605326 ..  605338 -  -6.3  -2.73797   ACCCATACAAATTCA                TGCAT ATG ATGCA                ATAAAAATCTTATTA  57 125
        sucC NONE
        sucD  602422 ..  602434 -  -4.1  -4.29326   CGGAAATTGAAGAAA                TTGCC GAT AGCAA                TGAGATTAAAGATTT  64 406
        ompR NONE
        envZ  596844 ..  596894 - -13.7  -2.65298   GTGAGCGACTACAAG GAGCGTGACAATCTCATGAAAC AATATAAA ATTTC-TGAGATTATCACGCTC TCGGCTTTGCCTCTC 100 85
        uppS NONE
        cdsA NONE
    RMA_0604  595109 ..  595126 -  -4.1  -4.37346   AAAAATTAAAAAAGA             CTGGATC CCGC GATCAAG              TTGTGGAATGACAAC  62 50
        rnd2  594031 ..  594045 -  -4.3  -3.55447   TTATCTATTATATAA               TTGGT TGCCC ACCAA               AATGCGGCAAAAACA  54 369
    RMA_0593 NONE
    RMA_0592  580707 ..  580717 -  -2.4   -3.2048   GTTAAATTGCAGCAA                 CCAC TTG GAGG                 ATGCATTATGATTTT  44 414
        coxB  565035 ..  565047 -  -3.5  -3.39028   TAGAACTTCTAAATA                TAATT AAT AATTA                GTTAGCTGCCAATTT  50 23
        coxA NONE
    RMA_0569  561724 ..  561734 -  -5.4  -3.28785   GGGTAAAATATTCAA                 TTGC TTG GCAA                 GAACAATGTGGACCT  55 190
    RMA_0567  558703 ..  558714 -    -3  -4.15565   TCCAGTACTTTAAAA                CTTT TTTT AAAG                 CTCGATTTATCTCGC  57 129
    RMA_0559  549987 ..  550001 -  -3.6  -2.94527   TAAGATATACAATTA               TTATCA TTA TGACAA               GGATAGATAATAAAA  45 84
    RMA_0558 NONE
    RMA_0557 NONE
        ispZ  547894 ..  547910 -  -2.1  -3.53811   GTTATCTCTGTGAAA              GCAGAGG GAT CCAGTGC              TTTTCTGTATATTAG  46 164
        osmY NONE
        rlpA  546135 ..  546145 -  -6.8  -2.82635   ATCGTCATTACGAGA                 CCAC AAA GTGG                 TCGTGGCAATCTCAT  61 164
        mutT  532975 ..  532985 -    -4  -3.59738   GATGATATTGTCAAA                 CTAA GGT TTAG                 ATTATGAAAAAATAC  53 412
        kdsB NONE
        pyrG NONE
        tlc2  528316 ..  528339 -  -5.4  -4.33165   GGAAATCTAGTAAAA          CCTATAAAAA TTTG TTTTTTTAGG           TTTATTTTTTAATAA  66 209
    RMA_0538  525478 ..  525495 - -11.3  -2.73124   GCTGATGGTTCAAAC             CTCCACC TTCA GGTGGAG              AAACTTTAGTTTGAA  86 516
         mdh NONE
    RMA_0531 NONE
    RMA_0530  519287 ..  519297 -  -6.8  -2.54639   ATTGGTAAACAAATG                 CCTC AAG GAGG                 AGATAAGCATAAAAA  59 326
        dsbB  512295 ..  512305 -  -2.4   -5.5762   AGCAAATAGAAAAAA                 GGTG TAC CGCC                 ATAATTGTCTACTGT  75 434
        fabI  504342 ..  504375 -  -4.7  -5.00138   TAGTGAAATGAAAAA     TTCTCATACTCCTTT AAAG ATAGAAGTACAAGAA      CAGTTAGAACAAATC  75 358
    RMA_0506 NONE
        rfaL  497704 ..  497716 -  -2.7   -3.3062   CTCAAATAGCATCAA                TTATC AAT GACAA                TATCAGGTTTAACTA  44 9
        nuoA NONE
        nuoB NONE
        nuoC NONE
        nuoD  494637 ..  494651 -  -5.6  -2.79952   AGAGCAACGCAAGTA               CAAGCC CAC GGCATG               ACCCATATATTACCT  53 35
        nuoE NONE
    RMA_0498 NONE
         mpg  492346 ..  492356 -  -5.4  -3.54149   AATAAGAGACTACAA                 GCTT ATA AAGC                 AAGCGAGCAAATGCA  58 331
        rimM  487747 ..  487760 -  -2.5  -4.52873   GGTCCATAAAAACAA               TAAAT ACAA ATTTA                GTATTTTTAACTGGA  58 123
        asmA  484684 ..  484694 -    -4  -5.67283   AATCCAAATAAAAAA                 TCAT TAT ATGA                 AGACCTTATTATTTT  81 342
        rpsD  480749 ..  480785 - -10.5  -4.85599   GGCACTCCATAAAAA    TAATAAAAAAATGCTAA AAA TTAGCATTTTTTTACTT    CCTTGCTTCGTCAAA 100 204
    RMA_0483  478497 ..  478544 -  -8.2  -3.62046   CTATTCTCCTAATAA TTTTAT-TTCAGCATACAAATCT TCA AGATTTATATACTGATCATAAAA ATTATTATAGTCATG  75 418
    RMA_0481 NONE
    RMA_0480  475607 ..  475643 -  -6.9  -3.16647   GGCATCTAGGAAAAG    CAACTAAAAATGT ATGTTGTTGTG ACATTTTTAGTTG    GATACTGTGGACAAG  62 19
    RMA_0479  474508 ..  474524 -    -3  -3.65201   GAATACGTGCAACAA              TCTCTA GAATA CAGAGA              TGGCTTAAAAAGCAT  50 51
    RMA_0470  464370 ..  464380 -  -2.6  -4.48967   AATTATAAAAAAAGA                 TTTA AGT TAAA                 CGGTACTTAATTATA  58 332
       hflC1  463347 ..  463364 -  -4.3  -3.80768   GATATATAAAACTAA             TTATTAT TACA ATAATAA              ATCTTTATAAATTGC  58 40
       tdpX1  462687 ..  462698 -    -3  -3.40611   TCCACTTTAATAACA                GTAA TATA TTAC                 AGCTTCTCTGCATGT  48 22
        topA  459048 ..  459060 -  -7.7  -3.14683   AGACCCCGTGATCAA                GTCAC GGG GTGAC                ACTAAACCATTTACG  67 36
        gltX  457381 ..  457394 -  -3.8  -4.50259   AAAAAGACAGTAAAA               GCAG GAGTAA CTGC                AGGATATGTAGCTTA  65 250
    RMA_0453  451165 ..  451179 -  -2.8  -4.22009   AGCAGGTAATAGAAA               GCCAAA AAA TTTTGC               AGCAATTAGGATTTA  55 255
    RMA_0441  444115 ..  444136 - -10.3  -3.23598   GAAGCAATCCAGTAA           GAAATGCTA ATTT TAGCATTTC            TTTAATTTTTTTCTG  83 85
        pkcI NONE
         asd  442663 ..  442675 -  -3.5  -4.02334   TAGTTATATTATAAA                TAATT ATT AATTA                ATTCTTCAGCAATTT  56 6
        aprD  440784 ..  440811 -  -4.3  -3.22884   GTAGTAATTGACGAA        GCAATCTCGATA GAATT CAT-GAGATTGC        CACGCTCACTAACGT  52 102
    RMA_0437  439019 ..  439039 -  -2.7  -3.05844   TTTCGTAGCCTAACA            TATAAATAA CCT TTATATATA            ATTAGATTACAAAAT  43 154
       proP2  437668 ..  437697 -  -2.3  -4.53475   ATGTTATAAAAATAA       TTTAAAGTTTAAT ATAA ATTCTACTTTAAA        TAAAATTATAAATTT  59 31
    RMA_0429  430777 ..  430797 -  -3.9  -3.66784   TTAGTTTTAACATAA            GGCTTAACA AAT TGTGGAGCC            ATTAGTTTTACATTA  53 289
    RMA_0419  422496 ..  422508 -  -4.9  -2.82521   GGTATTAAAATTAAT                TATAG GAT CTATA                CCGTATATGCTATAC  51 21
        rpoH  420679 ..  420695 -  -8.1  -4.67353   GTATCCAGTTAAAAA              TACTAAC ATT GTTAGTA              TTTTTAGTTGTTTTT  85 82
        lacA NONE
        mutS NONE
    RMA_0404  407938 ..  407957 -  -2.2  -4.54727   TTTTTTAAAGTAAAA            TCTTTAAA AAGC TTTAAAGT             GCTGGATTCCTGCTT  59 114
     virB8-1 NONE
     virB9-1 NONE
        mnhC NONE
       nuoN2 NONE
       nuoL2 NONE
       vapB1  394653 ..  394666 -  -5.3  -3.53012   TTTCCTCTTTCTAAA               GCTAT GATT ATAGC                AGTATCAATAATTAA  58 37
       vapC1 NONE
       nuoL3  392628 ..  392641 -  -5.3  -6.04419   AAAATAATAAAAAAA               TTCTG TAAT CAGAA                TTGTTTACTGGATTG  95 108
        ptrB  390197 ..  390209 -  -6.3  -4.28656   ATCCAATACTTAAAA                GCTTT ATA AAAGC                TTTATTGAAATTTTA  70 166
        rodA  388685 ..  388697 -  -4.9  -3.24411   ATCGGTCTAAATACA                TATGT TGA ACATA                ATGCAGCTGCTTCAT  54 359
        prfB  375854 ..  375866 -  -6.3   -4.1552   TATTCTTCCAATAAA                GAACT ATC AGTTC                TTTATTCACTGCTAA  70 137
    RMA_0369  373767 ..  373789 -  -6.4  -4.08317   TAAGGTTAAAGTAAA           CGGTAATAAA TTA TTTATTACAG           GGAATATAGAAGAAA  69 486
        typA  361487 ..  361498 -    -3  -5.49729   AATCAGTGAAAAAAA                CTAA TCGT TTAG                 TTGTGGTGGAAGAAG  77 378
    RMA_0348  351129 ..  351153 -  -2.9   -3.6471   TGCCAAATTATACAA          GTTATATTATG TTA CAGAATATTAC          ACATATACTCGATGC  50 311
        lpxC  350030 ..  350042 -  -2.7  -3.47011   TAAAAATGTAATGAA                TCCAT TTT ATGAA                AATCCTAGTAAAGCC  47 172
        cycM NONE
    RMA_0344  347897 ..  347933 - -10.4  -2.75577   GGACCGGAAAATGCA   TTTAGTGTCATTCCCGC TTTC GTGGGAATGACA-TAAA    ATGATCCACGCAACA  80 100
       bolA1 NONE
    RMA_0336  339678 ..  339698 -  -2.7  -4.54727   TGCTTGAAACTAAAA            CAAATAA GCAATAT TTATTTG            ATTTTTCCTATGTAT  60 432
        pleD NONE
        nudH  332448 ..  332492 - -13.3  -3.61652   GCTCTAAATAATTAA GTATAGTAAAAGAAATTGAAC ATA ATTCAACTTCTTTTACTATAT ATATAAAATTTTTAC 100 37
    RMA_0308  314356 ..  314366 -    -4  -4.87133   ATGCTTTAAAGAAAA                 GTAT AAA ATAC                 TACTTTTCAAAGAAA  68 45
       abcT3  297464 ..  297474 -  -5.4  -3.68827   CACGGACCACTTAAA                 GTTG AAG CAAC                 AGGAGAAACAGTGGC  59 127
         n2B  293692 ..  293708 -  -5.3  -3.24488   GTCCTGTAAATAAAT              TTTAATT AGT AATTAAA              GAGCTTTTTTAGCGA  56 179
        uvrB  276975 ..  276988 -  -2.3  -4.85599   TTTATGGCACAAAAA               TTCCG GCTA CGGTA                CCAAAGAACATATCG  65 258
        hscB NONE
        hscA  274108 ..  274120 -  -3.5  -3.16039   AATTAGTTCGATTAA                TTATA TAT TATAA                TATTTTATATATAAC  46 46
        fdxB NONE
    RMA_0268 NONE
         imp NONE
        uspA  271142 ..  271156 -  -4.3  -5.54894   AATCCAGTAAAAAAA               TGCTA TAAAT TAGCA               TTTTTTTTATTTTTT  83 131
        pbpC  263381 ..  263393 -  -4.9  -2.88434   AATAATTTATCAAAT                GTAAA TTC TTTAC                CGTTTGCGATAATCT  51 266
    RMA_0256  259576 ..  259601 - -14.9  -3.16191   TTATATCTTTAGTAA         TACCCATAAGC CGAA GCTTATGGGTA          TTTTATTTTTAAGTG 100 403
    RMA_0250  254821 ..  254843 -  -9.2   -5.4505   TTCTTTAATAAAAAA           CGGTAAGTAT GTA AAACTTACCG           ATTAAATTTAAAGCT 100 48
        dnaK  248732 ..  248758 -  -4.5  -3.19157   TAGTAATTTGATGAA        GCAATCTCAGGA TATT TAC-GAGATTGC         CACACAGCCTATAGC  52 64
        dnaJ  247122 ..  247148 -  -5.9  -3.46913   ACACAGAACGCAGAA        CCGCAGCGTACA CTTT TGTACG-TGAGG         ATTCGAGTACCGGAT  61 423
        comL NONE
        recN  244225 ..  244258 -  -6.9  -3.87815   TTGCATTTCCATAAA     TAAAGAT-TGGCTTTC ATG GAAGGCCATACCTTTA     GCAAGCCCAACCGGC  69 341
        sucA  240615 ..  240642 - -14.3  -3.15758   ATAAGCGTCGACGAA        GCAATCTCAGG CAAATT CCTGAGATTGC         CACGCTCCTTTTAGT 100 78
        sucB  239290 ..  239317 -  -9.2  -2.80113   TATTATTTCATGAGA        TTGCCACGCAGCC TAC GGCTGC-TCGCAA        TGACAATTTTTTACA  73 36
    RMA_0237 NONE
        cutA NONE
        gltP  236702 ..  236712 -  -2.6  -5.00616   TTTGTTTCTAAAAAA                 TTTT TAA AAAA                 TACAGTAGATTTATA  66 499
        acrF NONE
    RMA_0219  223651 ..  223676 -  -6.3  -3.27029   GTTTAGGAAGGAATA         TATTACGTGCTG AAA CAGCA-GCAATA         ACTGCTATAGTACAA  61 165
    RMA_0217 NONE
    RMA_0216  222233 ..  222258 - -12.1  -2.89323   AAAACTTTCTAGAGA         GTAAGGTTATA GATC TATAACCTTAC          TCTTTTTTATTTAAT  88 32
    RMA_0214  219954 ..  219973 -  -2.9  -4.74767   ATAATGAATATAAAA            GGC-GAAA GGTGA TTTCTGCC            TATAAATTTATTATA  65 57
    RMA_0211  217174 ..  217184 -  -2.4  -4.11183   CGGTATGACAAAGAA                 CTGG ATT CCCG                 CTTTTAGCTAAGAAT  53 132
        omp1  214666 ..  214678 -  -3.5  -3.17194   AGCGTGGCAATCCAA                TAAAA AAA TTTTA                AAATGCTCAAGACTA  46 93
    RMA_0209  212937 ..  212947 -  -2.6  -3.79687   ATTCTTTACAAAATA                 TAAT GGA ATTA                 CCTAAAAAAGGTAGT  51 504
        emrB NONE
        mnhE NONE
        pyrH  209611 ..  209641 -  -2.7  -2.61216   TGACGAAGCAATCTA       GTAAAAAATTCTG ATTTA CAGCATTTTTTAT       TATTTTTGTTAGATT  40 145
         frr  208751 ..  208767 -  -3.8  -4.67353   GGATCCAGTTAAAAA              TACTAA AATTA TTAGTA              TTTTTTATTGTTTTT  65 166
        gatC NONE
        gatA NONE
        gatB  204749 ..  204759 -    -4  -4.26076   TCATTGCGAGGAAAA                 TTAC GTA GTAA                 TTGACAAAGCAATCT  60 98
        yqiX NONE
    RMA_0199  203467 ..  203489 -  -2.1  -4.72772   AAAAAATAACCAAAA           TTAAATCTT TGTAT AAGATTTAT           GAAAATATAATAGAG  59 3
        dapB  202485 ..  202497 -  -3.5  -3.29739   TTCAAGCTATATTAA                TTATA TTT TATAA                ATATCTTGCATTGAA  48 13
    RMA_0197  201563 ..  201584 -  -7.9   -3.8062   CAAGCCGTACAACAA           TGCCCCCGC TTTT GCGGGGATA            TGACATCGAGGTCTT  74 142
    RMA_0196  198863 ..  198875 -  -7.7  -4.02334   TATGTAGAGGATAAA                GCTCT AAA AGAGC                TAAGCATTATGCTCT  76 343
    RMA_0191  192577 ..  192605 - -16.3  -5.96219   TATTGACAAAAAAAA        GCCTATAAAAAAC TTG GTTTTTTATAGGC        TTTTTCTTATTTCCC 100 59
         mrp NONE
    RMA_0170 NONE
    RMA_0169 NONE
    RMA_0168  164835 ..  164845 -    -4  -4.76312   CATAACATTCAAAAA                 TTAG CTA CTAA                 AGAAGAAATAGAGCA  67 190
    RMA_0160  158213 ..  158224 -  -2.2   -3.5891   GGCTAGAATTAAAGA                GAGA CATA TCCC                 TATTGCTAAAACTAA  47 229
    RMA_0139 NONE
    RMA_0138  132230 ..  132252 -  -3.5  -3.48593   CATGTGTCCATAGAA           TTAGGATTT TGATT AGATCCTAA           TAAATATTGCTGAAT  50 307
    RMA_0129 NONE
    RMA_0128 NONE
        aatA  122571 ..  122598 -    -7  -2.80443   GGATATTTGACGAGA        TTGTCACGCAGCC TAT GGCTGCTCG-CAA        TGACGATTTGGTATC  61 52
    RMA_0126 NONE
        kdtA  120151 ..  120161 -  -6.8  -3.62518   GCAAACATGCTTAAA                 GCAG ATC CTGC                 TTTTTTAAAGATACA  67 291
        sca2  109580 ..  109606 - -13.2    -4.258   TTATGCATTAAGAAA         GGATAAGCTCTT AGG AAAAGCTTATCC         TGATTTAAATTTTCT 100 50
        ompW  104458 ..  104489 -  -5.9  -6.32976   AAAAAAATAAAAAAA      CTG-GATCCCGCGA TCAAG TCGCGGGATGACAA      ATACGCTTCAAGAAC 100 53
        pntB NONE
    RMA_0111  102153 ..  102169 -  -6.7  -4.15453   GAATCTAGCTTAAAA              TACTAAT AAT ATTAGTA              TTTTAGATTTTTTTT  74 223
    RMA_0106   97267 ..   97309 -   -16  -2.91086   AAATCATATATCACA TGATTACCATATATTATGGT TGT ATCACAATATATGGTAATCA GAGAAAATCAATATC 100 333
       iscA1   89231 ..   89243 -  -2.7  -4.75309   CTAAATTTAAGAAAA                TCTCA AGC TGAAA                CATTAAAACAAAGTT  63 304
        def3   75753 ..   75763 -  -2.6  -4.62471   CTGAAGCTTTAAAAA                 TTTT AGA AAAA                 CACCTTGTTAATGAT  60 443
    RMA_0083   73369 ..   73386 -  -4.2  -4.58395   CTTATTGGGGAAAAA             CAATAG AAGATA CTATTG              AGATTTTGCAAGAAT  67 443
         lgt NONE
    RMA_0077   66958 ..   66978 -  -6.1    -3.409   AAATTTGTAATAATA            CCATGACAC AAG GTGACATGA            ATTATTGTGTCGCTG  62 306
        aco1   57674 ..   57686 -  -6.3  -2.91199   TAATGCCTAATTAGA                TACCT TTA AGGTA                TTTAATTGATTATAC  58 4
         gcp   56344 ..   56372 - -16.3  -2.87132   CTCTTTTTTTATATA        TGTAATTACCATG AAA CATGGTAATTACA        TATCATACTACTAAA 100 101
    RMA_0064   55710 ..   55755 - -16.3  -5.02074   GCATGGCTCAAAAAA CGCGTTTGATATCATTCCCGC TTTC GCGGGAATGACACAAAACGAG CAATGCAATAAGACC 100 99
    RMA_0057 NONE
    RMA_0056   46789 ..   46799 -  -6.8  -2.84955   ACAAGTAGCAGCACA                 CCGA AAG TCGG                 CTATAATGTAGGTGC  61 185
    RMA_0049   41825 ..   41836 -  -2.2  -2.54344   GAAAACTAGTAATAT                GGACG ATT CG-CC                TAAAATTAAGTTTAC  39 484
    RMA_0043   37532 ..   37564 -  -4.2  -3.12488   GAAATATAAATCATA      GTGTCTCCTTTCCT GAATA AGAAAAAGAAACTC      CGCCATGCACTCCTG  48 450
        recF   33948 ..   33960 -  -4.7  -3.53811   GTCATTCCTGCGAAA                GCAGG AAT CCAGC                ATAAAGCGAGATAAA  56 126
    RMA_0032   31638 ..   31664 -  -4.4   -2.6183   AAAAATGTTGATAAT         GATCGTTCTTAC AGT GAAAGAACACTC         TACGAATCAGCTTTA  47 386
        dsbG NONE
    RMA_0029 NONE
        atpB NONE
        atpE   28836 ..   28846 -  -2.6  -3.83042   TCATTTAAAAATGAA                 TTTT AAG AAAA                 AATAAGTAACATAGC  51 17
        atpX NONE
        atpF   27823 ..   27836 -  -5.3  -3.27298   TGTGTTAATGATGAA               GCAAT TTAA ATTGC                TAGCTAGTGGTTAGT  56 29
        pcnB NONE
        znuA NONE
    RMA_0017   14357 ..   14369 -  -4.9   -3.9122   GATTTTTTTAAATAA                GATAT TAA ATATC                TTTCTTGTAGGAAAA  60 96
        lpxD    7807 ..    7817 -  -5.4  -3.73775   GTCATTGCGAGGAAA                 TTGC ATA GCAA                 TTGACGAAGCAATCT  59 150
        fabZ NONE
        lpxA NONE
