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   Sfri_0671  784708 ..  784737 +  -4.3  -3.03309   ATCTAACTATAGAGT       TTACCTCTACTAT ATAG GTAGCTGAGGTAA        TCGTTGTTATTCACC  50 66
   Sfri_0683  810428 ..  810443 +  -4.7  -2.65139   CATAGTTATTTTGGC              CACCT AAATAG AGGTG               ATATTATTACCTCGT  49 19
   Sfri_0684 NONE
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   Sfri_0715  841105 ..  841119 +  -3.5  -4.20783   AATTAAACTATCGGT               TGGCG ATATG TGCCA               TTTGTTAGCTAGGCT  59 35
   Sfri_0716  841939 ..  841954 +  -6.2  -3.41125   ACCCTTTCGACATCA              TTATCC AATG GGATAA               TTCTACATATATAAA  59 63
   Sfri_0717  843142 ..  843154 +  -5.5  -3.30701   TAATTGGGTTTATTT                TGTCG ATT CGGCA                TTCAGTTTGGTGAAG  57 97
   Sfri_0718  845640 ..  845657 + -11.3  -4.15366   TTACCCAAACAAAAA             CGCACTC GTAA GAGTGCG              TTTAGTTGTTTCACT  89 239
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   Sfri_0733  859545 ..  859556 +  -4.4  -4.07568   GGGTGATACAAAATA                CAAC GCTT GTTG                 TTTTGAGCCACAAGC  61 94
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   Sfri_0737  863848 ..  863884 + -10.2  -3.14931   AAAACAACCTTAAAA    GATCAGTAAGACCTAG TGTTT CTAGGTCTTACCGGAC    TTAGTGGCAGATGAA  77 337
   Sfri_0738  866456 ..  866477 + -13.7    -5.252   TTTGCATAGTAAAAA           GCCCGTCAC TTAT GTGGCGGGC            TTTTTTGTCGCACTA 100 55
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        pbpG 1000761 .. 1000785 + -11.5  -5.65177   ATGACCACAATTAAC          GCCCATTCACT TTT ATTGAATGGGC          TTTTTTTATCAATAT 100 48
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   Sfri_1445 1726627 .. 1726643 +  -6.6  -5.23292   CTGTGATAATAAGTA              CCGATT AATAC AATCGG              TTTTATTTTCTATCC  86 48
   Sfri_1446 1727225 .. 1727236 +  -4.4  -3.00863   ACCATTCTGCTGTTT                TCCT TGCT AGGA                 TCGCTTTTTTTGATG  50 58
   Sfri_1447 1731186 .. 1731209 + -11.8  -5.58179   ACGATGTTAATACAA          CCGATATCAC TTAG GTGATGTCGG           TTTTTTATTATCCTA 100 66
        cysB 1735337 .. 1735378 + -13.3  -3.58037   TATCGATAATGCTTA TTACATAAAAAACCTCGCG AATC TGCGAGGTTTTTTGTTTAA  TTTAAAGGCTTAGTA 100 48
         upp 1738002 .. 1738054 + -17.4   -3.1505   TGATTTACATCATGT ACGAGACAATAAAAACGGGAGCCTT TAGT AAGGCTCCCGTTTTTATT-TCTAGC TTGATAAGCCGTCGT 100 77
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   Sfri_1615 NONE
   Sfri_1616 1925158 .. 1925185 +   -12  -5.75945   ATTAAAAACTGAAAA        CGGGATTGGCTC CAGT GCGCCAATTCCG         TTTTTTTTGCAACGT 100 81
   Sfri_1617 1926757 .. 1926767 +    -4    -3.254   CAATGGTATACAAAG                 TGAT CAA ATCA                 TATTGTCAGTCGCTG  48 130
   Sfri_1618 1928086 .. 1928108 +    -7  -3.89695   CGCCGTTCATCAGCA           CGGTTCGC GACTTCG GCGAACTG           TTGTCTTTGTGCCAA  67 215
   Sfri_1624 NONE
   Sfri_1625 1936508 .. 1936522 +  -2.8  -2.70932   ACCAGGCCAATTGTT               AGTGAT TGA ATCACA               TGATTAAACAGGAGC  41 4
   Sfri_1626 1937392 .. 1937413 + -12.3  -5.38047   ATAGCCAATAAAAAA           GCAGAGTCC AATA GGGCTCTGC            TTTTTTGTATCAATA 100 247
   Sfri_1630 1943544 .. 1943558 +    -5  -3.96148   CCGAAAATAACCAAG               GTATGG CAA TCATAC               TTTGTAATGACGCCC  61 142
   Sfri_1631 1944337 .. 1944367 +    -7  -2.79574   GCAACAGTAACAGAA       CAATGTTTTTACGC TAT GGATAAAAACATTG       TGGTTGCTGGCTGTA  61 83
   Sfri_1632 NONE
   Sfri_1633 1945497 .. 1945525 + -11.2   -5.4477   TTGTTAGATGTGACA       TAACCACGTAGAG GTGA CTCT-CGTGGTTA        TTTTTTTAGCCATTT 100 45
   Sfri_1639 1953637 .. 1953648 +  -4.4  -3.99229   TTCTTTGGTGTTGAG                GAAC AATG GTTC                 TTGTTGTATTCCTGT  59 181
   Sfri_1646 NONE
   Sfri_1647 1957443 .. 1957471 + -14.9  -5.80364   TTCTTAAATTCAAAA        TAGACTTTATGTT TTA AACATAAAGTCTA        TTTTTTTATTGCCCT 100 51
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   Sfri_1652 1959910 .. 1959933 +  -4.6   -4.4017   AGCATTTGTGTTACG          TCAATTTAGC GTTT GCTGAGTTGG           TTTTGTGGGGATTAC  66 297
   Sfri_1653 NONE
   Sfri_1654 1961414 .. 1961431 +  -2.7  -3.50393   CTGAAGATTTTAAGC             GGTGA CCGTTTTC TCACC              TTGTATGAAATCCAA  48 69
   Sfri_1655 1962829 .. 1962841 +  -4.8  -2.83164   GGTCAAACCCTGACT                GCCA GTGGG TGGC                TGTGATGATCGCTGC  50 8
   Sfri_1656 NONE
   Sfri_1657 1963812 .. 1963837 +  -3.3  -3.83705   GCAACTTTTGATCGC         CTAAATCTTTG TGTC CATAGCTTTAG          TTTGCTGCTACTTTT  55 350
   Sfri_1658 1966060 .. 1966078 +  -8.9  -4.86033   GGCTACAAACAGAAA             TGGCTAC TTGAT GTAGCCA             TTTTTATGGGCATTT 100 264
   Sfri_1659 1966637 .. 1966651 +  -2.1  -3.03124   CTATTGCTCAATCAC               CTAAC AAAAA GTTGG               TGTTCGCACCTACGG  42 41
   Sfri_1660 NONE
   Sfri_1661 1967977 .. 1967989 +  -6.3  -3.00476   CGGTCATGCTCGCTT                CTCTT TTT AAGAG                TATCTAGTTAGACGT  56 470
   Sfri_1663 1970138 .. 1970156 +  -8.9  -4.86033   GGCTACAAACAAAAA             TGGCTAC TTGAT GTAGCCA             TTTTTATGGGCGTTT 100 204
   Sfri_1664 1970625 .. 1970637 +  -4.9  -3.78775   CACATAACAAGAGGC                TATTG CGT CAATA                TTTCATAGTAAACAA  59 34
   Sfri_1665 1971307 .. 1971325 +  -8.9  -4.60924   CCTATAAACAAAAAA             TGGCTAC TTGAT GTAGCCA             TTTTTAGGGCGTTTA  90 115
   Sfri_1667 1973377 .. 1973388 +    -3  -2.74696   CGCAACGCACAAATA                CTAA AACG TTAG                 GTGTTTCATTAATTA  41 411
   Sfri_1668 1974064 .. 1974074 +  -6.8  -3.51597   AATAACAGTTGCCCA                 TCGC TTC GCGA                 TTATAATTAACCATT  64 60
   Sfri_1669 NONE
   Sfri_1670 1976739 .. 1976777 + -16.9  -4.59773   AAAGCCAATTCTACC   AACGCCATATGTGGCGT AAAAC ACGCCATATATGGCGTA   TTTTTACCCCTAAAA 100 204
   Sfri_1671 NONE
   Sfri_1672 1977923 .. 1977938 +  -3.2  -2.78596   TTCCCTTACTCAAAC              CAATGC GCTA GCAATG               TGTAATGCAAACATG  44 104
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   Sfri_1678 1984581 .. 1984608 + -11.2   -4.7254   CTTTTACAACAACAG        GGCCGCGAACTC GATT GAGTCAGCGGCC         TTTTTAATGGCAAAT 100 61
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   Sfri_1684 1990942 .. 1990959 +  -3.3  -3.60296   AGCGTTTGCAGTCGG             TGGGTGG TTAG CCGCTCG              TTTGCCGTAACACTA  50 15
   Sfri_1685 NONE
   Sfri_1686 1993818 .. 1993835 +  -3.4  -3.34344   CCGCGCCGTATTAGC             GTTTCG CGGTAA CGAAGC              TTAATTAAGAGGTCA  48 4
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        rrmA 1999492 .. 1999505 +  -3.9  -4.69028   TCCAGCTTTACTGCC               GTTAA GGCT TTAAC                TATTTTTTTTTACAG  66 242
   Sfri_1693 1999773 .. 1999794 +  -9.5  -6.18768   TTAAAAGATTTAAAA           CTGTAGCAA TTAA TTGCTGCAG            TTTTTTTTGTGTTTT 100 61
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   Sfri_1703 NONE
   Sfri_1704 2009761 .. 2009788 + -11.4  -4.44667   ATACGTGGTTGTTAA        TGGCTTTCAATC ATCA GGTTGAGAGCCA         TTTGTTGTTAAGAAG  95 43
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   Sfri_1706 2011176 .. 2011196 + -14.1  -5.54264   AACATCAGCTAAAAA            TACCGCTCA TTA TGAGCGGTA            TTTTTTTGGCTGTTT 100 86
   Sfri_1707 2014545 .. 2014579 + -13.8  -3.02745   AAATATTCGCTAAAA     TAATAAGGAAGGCGCA ACA TGCGCCTTTTTTATTG     TGCTTTCTCCATACA 100 64
        pheS NONE
        pheT NONE
        ihfA 2018718 .. 2018741 + -12.5  -5.29885   GATCTGTATTACGAA          GAGCCACTC TTAATT GAGTGGCTC           TTTTGTTTTTGAATT 100 69
   Sfri_1711 2019917 .. 2019927 +  -2.6  -2.96452   CCAGGTGAACAAGAA                 TTTT ACT AAAA                 TATAATTATCACCAT  43 17
   Sfri_1712 2020862 .. 2020889 + -14.4  -3.36492   TGAGTTTACCTCCAA        TAAAAAAGACGC AAAT GCGTCTTTTTTA         TTGTGCGATTAACGC 100 38
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   Sfri_1722 2030645 .. 2030660 +  -4.6  -3.46509   CACCATATGCAAAGT              GCGGAG CTAA CTCAGC               TTGATATTGTTGAAA  55 175
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   Sfri_1734 2043261 .. 2043285 + -17.3  -5.80951   CACCAAACTAAAAAA          GGATACTCGCA TTA TGCGAGTATCC          TTTTTTGTTTTAAGT 100 66
   Sfri_1738 NONE
   Sfri_1739 2046480 .. 2046494 +  -4.3  -4.23758   TCTGAGAAAATTAAA               CAGTA AATTG TACTG               TTTTAGGTGTAAAAT  63 20
   Sfri_1740 2047003 .. 2047045 + -20.4  -3.60818   TGAATAATCAATTCT TTAAATATAAAAAAGACCTC ATT GAGGTCTTTTTTATATTTGA TTTCGAACATTTTGC 100 34
   Sfri_1743 2050633 .. 2050649 +  -9.5  -5.40072   TACACGTTAAAAAAA              CCAATCA AAT TGATTGG              TTTTTTTACAACAAA 100 74
   Sfri_1748 2056987 .. 2057012 + -11.9  -5.43487   CGCACTGAATAAAAA         GCCCC-ACAGCT AAA GGCTGTTGGGGC         TTTTTTATATCGTTT 100 63
   Sfri_1750 2059658 .. 2059682 +  -9.4  -2.80077   TATTATCACCAGATG         CGCTGTAC-AC TTTA GTCGTACAGCG          TGAATTTTATACCAA  73 42
   Sfri_1751 2060574 .. 2060595 + -13.1   -5.4833   TCAAGTAATAAAAAA           CGCCAAATG AATT CATTTGGCG            TTTTTTATTACGTGA 100 94
   Sfri_1756 2065391 .. 2065406 +  -2.6  -4.24294   GTTTATATAAAAGGT              TTTTCA ATGC TGGAAA               TTTTAACTGATTGGT  57 45
   Sfri_1757 2066541 .. 2066563 + -10.6  -5.55769   TTGGATACACATTAA           GCTAACCCCA TTA TGGTGTTAGC           TTTTTTATTATCAGG 100 87
   Sfri_1771 2079974 .. 2080001 +    -7  -5.31275   TAAGTTCGCTTTATA        ACACCAGGTTGG TTTA TCAACTTGGTGG         TTTTTTATAGTGGCG  95 38
   Sfri_1772 2081283 .. 2081296 +  -2.3  -4.24887   AAGGATAATTTTTTT               ATGGC AGGT GCCAG                TTTATTAACTCTATT  56 222
   Sfri_1773 2082312 .. 2082330 + -11.8  -5.52986   AAACATACAAAAAAA             GCATAGTC TAT GACTATGC             TTTTTTTCGTGGCAT 100 122
   Sfri_1781 NONE
   Sfri_1782 2094709 .. 2094734 +  -5.5  -2.67244   TATTAGCGCCTCTTA         TGCCGGTAA ATTGAGTG TTATCGGCA          TCAATTTCAATATAG  51 159
   Sfri_1783 2095410 .. 2095439 + -15.2  -2.58892   TCAATAAATTGTAGC       TTAGACCTCGCT TTATCT AGCGAGGTCTAA        TGCATTAATCTCGAT  95 339
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   Sfri_1791 2111952 .. 2111962 +    -4  -2.71593   GGGTTCAACCAGCAC                 CTAA ACT TTAG                 TACATTTATCCATCT  45 435
   Sfri_1792 2114542 .. 2114563 + -10.2  -4.43477   AATAAACATAAAAAA           TGCCGCAT ATATTA ATGCGGCA            TTTTGATTGAATAAA  91 91
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   Sfri_1831 NONE
   Sfri_1832 2164425 .. 2164437 +  -2.7  -2.83073   TCAGAACGGAGAGCA                TCATG AAT TATGA                ATTATTAATCCAACT  42 20
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   Sfri_1835 2167864 .. 2167879 +  -2.6  -3.92075   TTAGGTTGCTGGGAG              CACAGCA TAG TG-TGTG              TTTCTCAGTAACCAT  52 63
   Sfri_1836 2168725 .. 2168741 +  -2.2  -2.66296   GGCTTGAAATCTTAT              AAACGC CGCAA GCGTTG              GTTATAACTATTATT  40 2
   Sfri_1837 2170213 .. 2170234 +  -9.5  -3.04443   TTACTTAAACATGAT           CTACAAGGC AGAG GCTTTGTAG            TGTAGTTATTCTAAA  74 150
   Sfri_1838 2171302 .. 2171313 +  -2.2  -3.63228   GCCGTACCCTTCGGG                CAGC GTTT GTTG                 TTCATTTCTACTGCG  47 387
   Sfri_1839 2172169 .. 2172181 +  -2.7  -3.43445   TAAATGAACATTATT                TGAAT TGA GTTCA                GTTTTATTAGTGGTG  46 256
   Sfri_1840 2172998 .. 2173014 + -12.3  -5.37345   ACGTGAATTAAAAAA              GCGCCTT AAT AAGGCGC              TTTTTTGTGGTTAAA 100 174
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   Sfri_1844 2178042 .. 2178071 +  -3.6  -3.93367   TCCTGTACCGCGAAA      GC-T-AGCGGGCCA TCCA TGGCCAGCTCACGC       TATTTTCTTCGACGG  56 318
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   Sfri_1849 2186849 .. 2186894 + -16.6  -2.57026   TGCACGTAGTCGTTA TTAGCCAAAAATGGCTAA GCTTGCATTA TTAGCCATTTTTGGCTAA ATTGGTCTAAGTCTG 100 207
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   Sfri_1851 2188888 .. 2188898 +  -3.2  -3.34895   GTGAAAAAGTCTGCC                 GCGA TAT TTGC                 TTAATTAGCACTACA  48 524
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   Sfri_1854 2191795 .. 2191807 +  -4.1  -3.16683   CAGTGATGTCATTGA                CTGAG TGT TTCAG                TTGATGGCATCACGT  48 80
   Sfri_1856 2193954 .. 2193981 +  -2.1  -2.77182   ATTATCGTAATGTCT       TG--CGTGTGGCGT GTT ACGCC-CACGGTCA       TAATTGCATATAAGG  41 31
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   Sfri_1858 2196120 .. 2196145 + -12.7   -5.1287   AACGTTAATCAGCAT         GCCGAGTC-TCA TTA TGATGACTCGGC         TTTTTTCGATATAGA 100 33
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   Sfri_1860 2200079 .. 2200096 + -11.3  -5.10154   ATGTTATTAATAAAA             CCTCAGC TTTT GCTGAGG              TTTTTGCTTTTAGAT 100 54
   Sfri_1861 2202763 .. 2202788 + -16.3  -5.64873   TAGTCTTACTAAAAA         GGGCTTAGCAA TTTA TTGCTAAGCCC          TTTTTTATTATTACG 100 109
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   Sfri_1866 2208238 .. 2208262 + -10.1  -3.08867   AAGTCATTATGTGGC          TCAATTTGGTC TCT GACCAAATGGA          TATCTTGCAGCTTAC  76 443
   Sfri_1870 2215476 .. 2215491 +  -2.6  -5.27938   CTATAACTCTAAATT              GATAGTC ATC GACT-TC              TTTTTCTTTGACCAT  76 364
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   Sfri_1877 2220722 .. 2220745 +   -14   -5.0925   TTACGAAACAAAAAA          GCCGTTGAAT CAAT ATTCAACGGC           TTTTTAATTTTAACA 100 79
   Sfri_1879 2223499 .. 2223516 +  -6.3  -3.97689   TATTTTGGTATTCGG             TTGGGGT GTAT ATCCCAA              TTATTTGACATTGTA  65 366
   Sfri_1880 2225063 .. 2225075 +  -5.5   -4.5287   CATTTTACTACAGCT                CCGGT GAT ATCGG                TTTTAATTGCTTTGA  70 242
   Sfri_1882 2225884 .. 2225895 +    -3  -3.74397   AAGCGGTCATATAAT                TGTT GTTA AACA                 CTTTTTTGTGGGAGT  50 67
   Sfri_1883 2228485 .. 2228505 +  -6.9  -3.06501   AACCGATTTATTGAA            CAATCGTGA ATT TCGTGATTG            TTCAATACCGATATA  62 124
   Sfri_1886 2230431 .. 2230454 +  -3.8  -4.60041   CGGTATAAATAAAAA          AGACGCCAAT TTAT ATTGACGTCC           TTTTTAAGGGTGAAT  66 61
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        pssA 2276925 .. 2276950 + -14.9  -5.21709   CTAATGCATTTATCA         GTTCATCACCA ATAT TGGTGATGAAC          TTTTTTCATCTCAGA 100 48
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        cpdB 2783498 .. 2783526 + -10.4  -5.14163   CTCGCAGACTAAATG        CAAAAAAGGCGC TTTAT GCGCCTTTTTTA        TTTTTATTACTCAGT 100 44
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   Sfri_2867 3450994 .. 3451012 + -14.6  -5.63504   CGAACTAACATAAAA             CGGCAACC TGA GGTTGCCG             TTTTTTTGTCAAATT 100 61
   Sfri_2873 3457130 .. 3457146 +  -3.1   -3.1505   TCGCGACACATTAGT              TTTTAAT GTA ATTAAAG              TTAGTAAGGAATCAT  47 27
   Sfri_2874 3457475 .. 3457500 + -13.4  -5.37865   AACTGTATTAAACAA         CAAAGCCGCT TAACTT AGCGGCTTTG          TTTTTTGGTTGTTAA 100 59
   Sfri_2880 3463950 .. 3463961 +  -5.8  -3.92804   GGAGTAAAGTCATAT                TGGC TATA GCCA                 TTTGATGCTTTATTG  65 335
   Sfri_2881 3464942 .. 3464961 +  -7.8  -2.52464   ACATTCATCAAACCA            GCTAGCGC GTCA GCCCTAGC             TCCCTTCGCAACAAA  60 316
        rpsT 3479030 .. 3479043 +  -9.5  -5.64274   TTAAGATTCAAAAAA               CCGGC TCAG GCCGG                TTTTTTTATCACTAA 100 52
   Sfri_2895 3481595 .. 3481610 +    -9  -4.72272   ATCAGACACTAAAAA              GCCCTT ATTT AAGGGC               TTTTTAGTGAGCAAA 100 67
   Sfri_2898 3486870 .. 3486898 +  -9.7  -4.98255   GCTACTTTACACAAT        AAAAAATACGCCT TCA GGGCGTATTTTTG        TTTTTATCGTTACCC 100 46
   Sfri_2899 3488393 .. 3488410 + -11.3  -5.79595   CGCTATACTTTAGAA             GTCGCTG CTTG CAGCGAC              TTTTTTATTTTAAGA 100 55
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         pgi 3491292 .. 3491307 +    -9  -5.68039   AGCCTTGAATAAAAA              CCTCAG CTTG CTGAGG               TTTTTTTATGCGTTT 100 51
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   Sfri_2922 3512357 .. 3512372 +    -9  -3.54459   TAAATTTATGACAAT              TTGGCC AATA GGCCAA               TTTCACACCACTTCA  75 134
   Sfri_2923 3513700 .. 3513714 + -11.4  -5.46657   TTTACACTTAAAAAA               GGCGCT GCA AGCGCC               TTTTTTATTGCCATG 100 44
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        thyA 3530862 .. 3530891 + -18.1  -4.86033   AACTAACAAAAAAAA       CGCCTTTGTTCAA CTAC TTGAACAAAGGCG        TTTTTGTAACAGTTT 100 54
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        anmK 3573592 .. 3573620 +  -2.5  -2.73619   GGTTTACTTTTGCAA       TTGTGG-CCTCA ATGTTA TGATGCCCACAA        ATTTGCCCAATCGTT  41 57
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   Sfri_3117 3729621 .. 3729639 +  -7.4  -5.33405   AGTAAGATCAAAAAA             CCACGG CTAATGA CCGTGG             TTTTTATTTACTAGC  95 89
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   Sfri_3124 3740097 .. 3740107 +  -6.8  -3.11564   GCCTCTGCCGATTTA                 GCTC ATC GAGC                 TGTTCGCTAAGTTTG  59 282
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   Sfri_3134 3752076 .. 3752092 +  -5.1  -3.36968   CTACAACCGTCAGCG              GCTCG TCCAAAC CGAGC              TTCTGCACTTGGGTA  55 244
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