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   Spea_0492  604460 ..  604472 +  -2.7  -3.54146   CAGCATGATTTTAAA                TGTAA GGC TTACG                TCTTTAGTTAACACA  49 350
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   Spea_0495  606204 ..  606231 + -10.6  -3.53012   ATTGGAATCAATCGC        GTGATGCCGACA GGGA TGTCGGCATAGC         TTTCGCGGGGCAGGA  82 316
   Spea_0496  607089 ..  607103 +   -10  -4.30719   TTAGCTCTTAAAGTA               TCAGCC GTA GGCTGA               TTTATTGTAGGAAAG  89 100
   Spea_0497  608590 ..  608617 +  -8.4  -3.55622   ATAAACCAGAGTCAG        GTGATGCCGACA TGGA TGTCGGCGTAGC         TTTCGCGGGGTTGGC  72 125
   Spea_0498  611994 ..  612006 +  -6.3  -3.01745   TTTGATAATTTTGAC                GCTAT TAA ATAGC                TATCATTATTAACGC  56 307
   Spea_0499  613360 ..  613387 +  -4.8   -5.5112   TATTATCACCCTCAA        TCCCCCGCAGG CTCACCA CCA-CGGGGGA        TTTTTTATTGGTAAA  87 56
   Spea_0500  614551 ..  614561 +  -5.4  -2.91306   TTTTAGCCTTTATGC                 TCTG ATG CAGA                 TGGTTATAGTTATAT  52 148
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   Spea_0505  620028 ..  620048 +    -4  -3.75005   CACTAATCGCTGCTG            CTAGCAAA TTAAT TTAGCTAG            TGTTTATTAAGTTTT  54 35
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   Spea_0509  623254 ..  623269 +    -4  -3.21807   GCGAGGTGGTATTAA              GTGATG AATA TATCAC               TGTTAAGTTTGCTAG  48 78
   Spea_0510  624626 ..  624638 +  -3.5  -3.19789   CTAATAACTAATAAC                TAATT GCT AATTA                TTGAGTGTTGAATGT  46 75
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   Spea_0512  626444 ..  626465 +  -3.1  -3.69216   GATACCAAGCAGAGG           CTTTTTAGA TTGA TTTAAAAGG            TATTTTAAATAAGGC  52 63
   Spea_0513  628149 ..  628176 +  -9.2  -4.91084   AGCCCGCCCTCGCAG        CGAAGCGCCCTAG GAT CTAGGTC-CTTCG        TTTTTGCCTTTTCTT  90 219
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        rbsC  631369 ..  631414 +  -6.4   -3.8822   CCTAGACTCTTTATC GGCAGAGCTTAGCTAACACTCT AACT AGAGTGATA--TGAGTTCTGCC TTTGCATTTACTGTA  66 36
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   Spea_0518  633399 ..  633433 + -14.6  -2.54896   CAGTAACTTATCAAG     TGACTCTTTTTTTGAA GCT TTCAAATAAAGAGTCA     TCAATTAAATCGGCA  95 35
   Spea_0519  634584 ..  634600 +  -8.1  -3.85817   ACTCGCCTTTAATAA              CTGATTT ATA AAATCAG              TTTATACAGAAAGCT  73 88
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   Spea_0528  653772 ..  653800 + -10.4  -3.30635   GTTTTAATACAATAA        CCGAGTGAGA CTTAGTTTA TCTCACTCGG        TTATGAACACCTTTA  77 40
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   Spea_0536  659445 ..  659464 +  -2.8  -2.84989   AGTAAAATGGATCGC            CGCACG TACCGACT CGTGTG             ATTAGTTTTGTGACT  42 1
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   Spea_0538  660305 ..  660325 +  -6.9  -2.72511   ACCGCCCTCCTATCG            TTTAACCCT ATC GGGGTTGAA            GTTTGGACGGATGAC  56 21
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        mepA  668358 ..  668389 + -12.4   -2.9162   AAAGGCCCGTAAAAA      CAAGCCGCC-AACAG TGA CTCTTCGGCGGCTTG      TGATTTCAACACTTG  83 39
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   Spea_0548  674430 ..  674446 +  -2.3   -5.1861   CAGATGGCAGATTGT              TTATTGA TAG TCGATAG              TTTTTTGATAGTAGA  73 248
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        metL  690359 ..  690374 + -10.4   -5.5074   GTTAATCAATAGAAA              GGGCTC ATTT GAGCCC               TTTTTTATTGACTTG 100 48
        metF  691462 ..  691486 + -13.7  -5.45802   TAAGTGATTTATTGA          GCCAATAACCT CGT AGGTTGTTGGC          TTTTTGTTTTAGAGA 100 55
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   Spea_0610  753927 ..  753952 + -11.9  -4.27512   GAAAAAATAAACTTA         GGTGGCTCAAC GTTT GTTTAGCCACC          TTATTTGTTCTAAGG  95 41
   Spea_0611  754467 ..  754486 +  -7.2  -2.80925   GAGGGATCTACAGGG            CTTTGGTA TGCC TACCAGAG             TGAATTTGTGTTTTT  60 69
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   Spea_0613  758581 ..  758597 +  -3.7  -2.87725   TCGTAACAAATGAAG              GGTTTTA CAT TGAAGCC              GTATTATTTTTCAGA  46 35
   Spea_0614  759549 ..  759585 +  -8.9  -3.23555   AAGCTAAAGAGCACA   GGCTAATGAACATAGC GTTTAA GCGA-GTTCATTAGCC    TCTATCTTATTTGCA  70 86
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   Spea_0633  784793 ..  784809 +  -2.2  -5.38047   ATTCACCACTTTAAA              GCAATG TTGGC CATAGC              TTTTTTGTATAGCTA  76 60
   Spea_0634  786703 ..  786736 +  -9.7  -2.60211   GTAGTATTTTTTATA     AGAGTACTTGTTTAC TAGC GCAAACAAGTACTCA      ACTTTTTAAGGAAGT  70 67
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   Spea_0636  788294 ..  788317 + -11.2  -4.33274   AGCGTTAGAGTTAAA          CAGTTAAACA TTAG TGTTTAACTG           TTTTGATAGTGTGCA  93 46
   Spea_0637  788822 ..  788843 +  -8.1  -4.63542   AAAGCTTGTTGCTAA           GGAGG-AATC TTC GATTACCTCC           TTTTTGGCCGTTCTA  82 39
   Spea_0638  790772 ..  790797 +   -12  -5.26918   TAAGCATAAATGAAA         GGCAAAACAG CTAATA CTGTTTTGCC          TTTTTTGTGCACTAT 100 61
   Spea_0641  793548 ..  793580 +   -13  -5.93252   GTCTCATGTGATAAA     GTCGAGCACTAATAT GAAA ATATTAG-GCTCGAC      TTTTTTATTTTTGGG 100 136
   Spea_0642  795913 ..  795936 + -11.8  -5.32699   CTTTTGGATGCAAAA          GCCGAAACAT GAAA GTGTTTCGGC           TTTTTTGATCTTTGG 100 66
   Spea_0643  797107 ..  797126 +  -6.3  -3.44206   TAACGAATAAGGATA            GGCCGCG CGCAGT CGCGTCC             TTATCCTGAGTGTTG  60 38
   Spea_0644  798299 ..  798326 +  -5.6   -4.3739   CCTAATCAAAATCTC        ACGAGCTAGA TCCAAATC TCTAGCTCGC         TTTTGTCCAAAAGTG  70 327
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   Spea_0647 NONE
   Spea_0648  802940 ..  802967 +   -10  -4.35742   AGAGTCGTTAAAAAA        GCCTGTTATCTA ACGC TAAATAACAGGC         TTTTACTGCTTGGCT  90 172
   Spea_0653 NONE
   Spea_0654 NONE
   Spea_0655  812814 ..  812848 + -19.4   -4.4874   ATCAAGCGAGTTGTC     CCCCAGGTAACCCAGC TAT GTTGGCTTACCTGGGG     TTTTAAGTTTTTAAG 100 455
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   Spea_0657  815455 ..  815467 +  -2.7  -2.79183   GCACTAAATTAAAAG                CATTA AGA TAGTG                TGTAATAAAGCTAAA  42 152
   Spea_0658  816128 ..  816149 + -10.9  -3.35695   AAACAGCAAATATGG           CCAGCCTTT GAAT GAAGGCTGG            TTACATTTCTATCGG  80 39
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   Spea_0663  822881 ..  822900 +  -4.4   -2.5409   GGGTATTTCTAAGCC            CATTACATC ACA GATG-AATG            TGGATTAAGAATTCT  47 29
        cysN NONE
   Spea_0665  826157 ..  826167 +  -2.6  -4.77925   CGCATCTAGCTATTG                 TATA GAT TATA                 TTTTTGGAGTTTTTT  65 89
   Spea_0666  826782 ..  826801 +  -2.2   -2.5369   GATTGACTCAGAGAA            GCTAAA AAAAGCGG TTTAGC             GGTTTTATAGCGATT  39 7
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   Spea_0670  831242 ..  831252 +  -3.2  -3.50481   TTTTCGCATTAGGCG                 TTGG TTA CCAG                 TTCTCAATTTAATTT  50 3
   Spea_0671  832460 ..  832477 + -12.7  -5.30616   AGCATGAGTGTATGA             GGAGGCC TTAA GGCCTCC              TTTTTATTTGGATAA 100 41
   Spea_0672  834255 ..  834287 +  -9.2  -3.75517   CAGTAAACGCAAAAA     CAGCGGGGCTACCTC TTTT GAGG-AGTTTCGCTG      TTGATTTTGTGAGGT  76 68
   Spea_0673 NONE
   Spea_0674  835584 ..  835610 + -13.2  -3.27029   TGAGTAAGGTTAATC         TAATGGCTCAAA AGT TTTGAGCCATTG         TCTTGCTTCATGCCC  93 99
   Spea_0678 NONE
   Spea_0679  841806 ..  841824 +  -3.1  -5.26875   CCTAACCCGCCTAAC             GCTTAGT CTTGT GCTAGGC             TTTTTTGCTTCCCCC  76 42
   Spea_0680  843233 ..  843255 + -11.3  -5.42131   GACGGTTTTTATTAA           GCCAGTTGG AACTC CCGACTGGC           TTTTTTATGTACTTC 100 70
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   Spea_0688  850526 ..  850543 + -12.7    -5.186   AACCTAATACAATGA             CTCCCGC AATC GCGGGAG              TTTTTATATATTTTC 100 101
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   Spea_0690  852327 ..  852347 + -15.5  -5.40004   TCTAGACCGAAAAAA            GCCAGCAGT TTA ACTGCTGGC            TTTTTTGCTTTAATG 100 58
   Spea_0700  861637 ..  861654 + -12.7  -5.06816   CAGTCTTAGTAATGA             GCCTCGC AATA GCGAGGC              TTTTTATTGGCACAT 100 134
   Spea_0701  862891 ..  862910 +  -4.9  -5.49729   ATCAGTTCTTCGATT            AGCCACC AAGAGA GGTGGCC             TTTTTTTAGCTGCTT  87 239
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   Spea_0706  869998 ..  870016 +  -2.2  -4.17089   TAGCCATGGCAACGT             CGGTCGCT TCT GGCGCCAG             TTTTAAGGCTTTAGA  55 314
   Spea_0714  879290 ..  879315 + -10.5  -5.72254   GTCAGTTAATAAAAA         CCACTTAAGCT ATTT GGCTTGAGTGG          TTTTTTGTTGTTTGG 100 83
   Spea_0715  881429 ..  881454 +  -8.3  -5.14645   CTAGATGAAAAATAA         GCCCGCC-CA TCATTAT TGAGGCGGGC         TTTTTATTAGGTTCT  90 95
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   Spea_0718  887758 ..  887773 +    -9  -5.61596   AACGGCCAAGAAAAA              GCACCT TTAA AGGTGC               TTTTTTTATGAGCAT 100 462
   Spea_0719  889479 ..  889497 + -13.2  -5.63236   TTTTAAAAAGGAAAA             TGCCAGCA ATT TGCTGGCA             TTTTTGTTTTTAGAT 100 69
   Spea_0722  895282 ..  895304 +  -9.2  -5.92399   GATTAAAAAACAAAA           GCCTTTATCT TAT AGATGGAGGC           TTTTTTGTTTTCTTA 100 120
   Spea_0723  897166 ..  897180 +   -10  -2.53581   ATTGAATGACTTTGG               TCAGGC GCA GCCTGA               TGCATTACCAATGTA  72 428
   Spea_0725  900560 ..  900584 +  -7.1  -4.33417   ATTAAGATTGATTTA          GCTCCTTGGTT ACT GACTGGGGAGC          TTTATTATAAGTGGC  78 46
   Spea_0726 NONE
   Spea_0727  903405 ..  903415 +    -4  -3.60006   GCGTTAAGGCGGAGG                 CATA AAT TATG                 TTTGAGAATATCATT  52 21
   Spea_0728  904459 ..  904482 +  -9.6  -3.12351   CTCACACTCGGGCAA          GAGGGGGA CAACAGCT TCCCCCTC           TTGCATCTCCCCAGC  73 106
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   Spea_0730  906394 ..  906422 +  -7.5  -5.14698   ACTATGCAAAAAAAA        GCACAACCCTA ACTAACA TAGGATTGTGC        TTTTCTTTTAGATTT  86 434
   Spea_0732  910400 ..  910429 + -12.3  -4.15632   CTAAATCTGGGCATA       AAAAAAGCCAGTC AATC GACTGGCTTTTTA        TTTATATGTACTGCT 100 387
   Spea_0734  912310 ..  912341 +  -3.8  -2.81178   AAACGAGCATCTTGA      GGT-AGCTTGGGTAT ATT ATGTCGAAGCTGACC      GTTTACAGTTAGTTC  46 230
   Spea_0735 NONE
   Spea_0736  915631 ..  915646 +  -5.4  -3.17639   CCTCCGTGTAGCAAA              CGAAGT GAGC GCTTCG               TGGTTTATTGCTTTT  54 249
   Spea_0742 NONE
   Spea_0743  920913 ..  920931 + -14.6  -4.60797   CAATGCAAATAAAAA             GGGCCGAT ATA ATCGGCCC             TTTTATCTATCACGG 100 77
   Spea_0745  922628 ..  922639 +  -2.2  -3.28119   GCCACAGTAGCTCAA                GTCT CTGT AGGC                 TTAGTGTCAGTAAGT  45 96
   Spea_0746  923710 ..  923749 +  -8.7  -3.13371   GAGATTTCATCTCCA  GTGTTCAGCCTAGTC-AC CCCCT GTAGTCTAGGCTGAACAA  TCTCTTACTGAACTG  68 113
   Spea_0747  925511 ..  925526 +  -6.8  -5.75599   AATTCTTATTGAAAA              GTCAGC AAAT GCTGGC               TTTTTTTATGCTTTA 100 47
   Spea_0748  926718 ..  926730 +  -4.8  -3.68827   GATCGTTATTGCTCT                GAGC ATCAA GCTC                TTTAAATCGTAGCTG  58 8
   Spea_0752  931311 ..  931336 +  -5.5   -3.3071   ACGTGCTGAATTGAC         GGTTAAGGTTT CATT AAACTGTAACC          TTAATGTCATACTAT  56 85
   Spea_0753  932623 ..  932648 + -17.7  -5.15634   CATACAAAATAAAAA         GGCGGTAAGAG CATG CTCTTACCGCC          TTTTTTGATCGACTA 100 52
   Spea_0756  939697 ..  939710 +  -3.7  -2.71712   AGTTTATTGAAGCTA               GCCTG AAAT CTGGC                CTTTAACGAGAGAAG  45 6
        lysS  941274 ..  941289 + -10.4  -5.71712   GTAAGACTTTAAAAA              CCAGCC ACTA GGCTGG               TTTTTTTATGTCACA 100 65
   Spea_0758  944386 ..  944414 +  -4.4  -4.28774   GACTTTTTGCATAAG        GCGCCGCGCAAC TAATC GTTGCGCATAGC        TTTTAAGTTAGATAA  63 11
   Spea_0760  946137 ..  946156 +  -7.8  -5.86976   TATCGATTTATTGAA            GGACAAGC ATTA GCATGTCC             TTTTTTGTTTTCTGC 100 74
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   Spea_0763  948453 ..  948463 +    -4  -3.10589   GCTATAATCTTCGCC                 CAAA ATA TTTG                 TGTTAACCCTTTTTG  48 138
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   Spea_0765  950940 ..  950963 + -12.4  -5.45802   TAAAGCTAGAGCTAA          GGCGCATTCG GTAA CGATTGCGCC           TTTTTATTTTAGGCC 100 76
   Spea_0771  957889 ..  957908 +  -5.6  -4.22283   ATTATTGTTTGACTA            GGCTAGGA ATTT TCCAGGCC             TTTCCTCTTTTTTTC  67 155
   Spea_0772  959343 ..  959360 + -11.3  -4.84527   TATGAGTAGTAAAAA             GGCCATC AGTT GATGGCC              TTTTTAATGTCTAGG  95 67
   Spea_0774  960380 ..  960396 +  -4.3  -2.93723   CGCGTTATTTTTTAG              GCTGGCG ACT TGCTGGC              TGTCCTTCCTCCCAC  49 147
   Spea_0775  961771 ..  961798 + -15.8  -3.88583   CTAATGGTGGGCCAA        TAAAAAACCGCC GAAA GGCGGTTTTTTA         TTTCTGGAACATTTA 100 69
   Spea_0777  962907 ..  962925 +  -7.4  -4.19746   CAGCGAAGCGTCCTA             GAACCTAG CAC CTAGGATC             TTCTTTTAGAATCCC  76 204
   Spea_0779 NONE
   Spea_0780  965177 ..  965206 + -10.7  -3.17492   GCAGACTTGGTTGAG       CTGGGGAGACGTT AATC AACGGCTCCCCAA        TTGCCTCATTCTTTC  79 138
   Spea_0782  967319 ..  967334 +  -7.6  -3.33009   CCCCCCGAGCCTGAA              CCATCA TCCA TGATGG               TTCTACGGCATTTTC  65 270
   Spea_0784  970419 ..  970451 +   -13  -3.50422   CTTTGCCTTCCTCAA      TAATACTCATGAAC TGTGT GTTCATGGGTATTA      TTCGTTGTAGTTCAT  95 49
   Spea_0785  971552 ..  971584 +  -8.6  -3.50422   CTTTGCCTTCCTCAA      TAATACTCATGAAC TGTGT GTTCATGGGGATTA      TTCGTTGTAGTTCAT  72 49
   Spea_0788  976182 ..  976211 + -17.3  -4.42386   TTAAGGCAAATGATA       CAACGGCTTACCT AATG AGGTAGGCCGTTG        TTTTATCAATAAACA 100 53
   Spea_0789  977482 ..  977500 +    -3  -5.40072   GTCCTCGCAGCGAAG             CGTCCTAG GAT CTAGGTCC             TTTTTTTAAAGCAAA  78 235
         pgk  979092 ..  979107 +    -9  -2.64045   AACGATAGTGACCTT              GGTGAG GCGA CTCACC               CTATTATTGGAGTAA  67 300
   Spea_0791  980243 ..  980262 +  -7.9  -5.48825   GCTTTAGCATAAAAA            TACCTGC CAATGT GCAGGTA             TTTTTTTGCCTGCTG  93 78
   Spea_0792  981226 ..  981242 + -10.1  -5.77734   CTTTTGTCAATAAAA              GGCACCC AAT GGGTGTC              TTTTTGTTTTTGTTT 100 103
   Spea_0793 NONE
   Spea_0794  982790 ..  982807 +  -4.2  -3.69841   CGCCGAAATTTCAGT             TAGACT AAGTGG AGTCTA              TGTTATTTATTAAGC  54 77
   Spea_0795  984402 ..  984422 +  -5.4  -2.68487   AACTTAAAGGTGCAA            GCCCTC TCGCTGACT GAGGGC            TCATCTGATGGTTCG  51 9
   Spea_0798 NONE
   Spea_0799 NONE
   Spea_0804  997670 ..  997691 +  -9.5  -5.95539   TGGCATAATATTGAG           GCGATGTTT CTAG GAACATCGC            TTTTTTTGTTTAAAA 100 108
   Spea_0805  999116 ..  999148 +  -7.9  -3.16743   TTCACGTCTGTACGA      TTTAGTTACAGCAAA TAA TTTGCTTTAACTGAG      TTGAGTCTGTAACTT  65 134
   Spea_0806 1000036 .. 1000053 + -11.3  -5.25803   AGTAATCGCTAAAAA             GGTGAGC CTAG GCTCACC              TTTTTTGTGCCCCTT 100 104
   Spea_0807 1001878 .. 1001898 + -11.2  -5.45802   TGACACCAAGGAAGA            GGGATGCA CTAGT TGCATCCC            TTTTTGTTTTCAGCC 100 54
   Spea_0809 1004484 .. 1004534 + -18.6   -5.0925   AAGCTTGAACACAAA GCCAAGTCGGTACTCAGTTAACAG TCA CTGTTAATTGAATGTCGATTTGGC TTTTTAGTTTTCAGC 100 113
   Spea_0810 1006716 .. 1006734 +  -7.4  -3.09635   TCTAACAATTAAAGT             CGTGGGAT TCC ATCCCACA             TTAGCTAATCAAACT  63 129
   Spea_0811 1008794 .. 1008813 +  -3.5  -2.60904   ATTGCCGCAGAGCGC            GGCGTTA CCCCAT TGGCGCC             ATATTCTAGTTATAA  43 95
   Spea_0812 1009374 .. 1009401 +  -8.4  -3.53012   GTTGGAATCAATCGC        GTGATGCCGACA GGGA TGTCGGCGTAGC         TTTCGCGGGGCAGGA  72 132
   Spea_0815 1013098 .. 1013115 + -11.3  -4.23892   ATGGTAAACAAAAAA             GCCACTC AAAT GAGTGGC              TTTTCAATGCTTAGA  93 183
   Spea_0817 1015072 .. 1015082 +  -2.6  -3.73783   CGAATAGCTTTAGTG                 TTAA AAC TTAA                 TTGTTAGCTTAGATA  50 34
   Spea_0818 1016440 .. 1016458 +  -3.1  -4.11048   ATTTTCCGAGTGCTT             GGCCA TCCTTAAAT TGGCC             TTGTTCTTCTATTGT  56 209
   Spea_0820 1018861 .. 1018885 + -10.8   -5.1861   GAGTGATTAATAACT          TAAGGCTACC TTAGC GGTGGCCTTA          TTTTTTAGTGATAGG 100 136
   Spea_0821 1019866 .. 1019881 + -10.4  -5.79595   AATTCGCAGCTAAAA              GCCACC GCAA GGTGGC               TTTTTTGTTTTAAAA 100 56
   Spea_0827 1027503 .. 1027519 +  -9.4  -5.16572   TGATAGCTTAAAAAA              GGACGC ATTCA GCGTCC              TTTTTTGCGTTAGGT  93 91
   Spea_0828 1028119 .. 1028133 + -11.4  -5.63517   ATAGGTACAAAAAAA               GCAGCC ATT GGCTGC               TTTTTTGTTTGAAAA 100 71
        nrfA 1032266 .. 1032281 + -10.4  -5.79595   TGTTTAATATTAAAA              GCCCTC ATTA GAGGGC               TTTTTTATTTTCAGC 100 57
   Spea_0833 NONE
   Spea_0834 1035301 .. 1035322 + -12.3  -4.06055   AAAACAATAGATTAA           GACCCCAGT GAAA GCTGGGGTC            TTTGCTTTAAAAGCT  93 120
   Spea_0835 NONE
   Spea_0836 1037378 .. 1037399 +  -3.1  -2.89298   TTGTCAGTTATCTTC           TTTTTAAAC AATA GATTAAAAA            TAATTATATGAAATA  44 282
   Spea_0837 1038601 .. 1038616 + -10.4  -5.15634   GTATAAATAGAAAAA              GGAGGC ATTA GCCTCC               TTTTTTGATCAAGTA  93 55
   Spea_0839 NONE
   Spea_0840 1041520 .. 1041531 +  -7.2  -4.08557   CAAGTGCTACAACTT                GCCG ATAG CGGC                 TTATTGTTTGAAGAC  73 224
   Spea_0843 1043087 .. 1043099 +  -6.3  -2.64422   GCAGGCTTGGCATTT                TTCAG ATG CTGAA                TAGTATGGCCTATCT  54 56
   Spea_0844 1044485 .. 1044500 +  -7.6  -5.18715   AAATATTTAAGTTAA              CCTATC GTTA GATAGG               TTTTCTTGTTTTTAT  90 131
   Spea_0845 1046165 .. 1046178 +  -2.4  -2.81547   ATCTACCTTAACCGT               TCCT TGGAGC AGGA                TAATTAATATGGCCA  41 5
   Spea_0846 1047317 .. 1047333 +  -8.1  -2.99259   CAGTGGTTCCTTAAG              GAATTTG CTA CAAATTC              TAGTTATTGTGCGTC  63 127
   Spea_0847 1048389 .. 1048404 +  -6.1  -5.45652   TGAACAATAAAAAAA              CGCAC GTTAAG GTGCG               TTTTTTATTGGGAGT  91 55
   Spea_0850 1050938 .. 1050955 + -12.7  -5.42514   AGCTGCAATTAAAAA             GGGAGCC ACTA GGCTCCC              TTTTTTGGTTTCTGA 100 47
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        truA 1959422 .. 1959441 +  -7.2  -3.11569   AGGATAATCTTAACG            GTAAAGGT TTGG GCCTTTAC             GTTTTAAATGGATAA  63 61
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   Spea_1619 1961394 .. 1961440 +  -5.3  -3.05844   TGATTGTCTTTGTTT GAGAAAAAGTTATTTCGC-CGT GAAA GCGTGAGAAATAACTCTGTCTC TGTTAGAATCGCGCC  51 48
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   Spea_1621 1963631 .. 1963653 + -11.3  -5.42131   GACGGTTTTTATTAA           GCCAGTTGG AACTC CCGACTGGC           TTTTTTATGTACTTC 100 67
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   Spea_1636 1982265 .. 1982288 +  -3.9  -3.16647   GCAGAGGTTGAAGAA          TCATAGCGA GTATTG TTGCTGTGA           GTTTTACTCAGTCAG  48 20
   Spea_1637 1984109 .. 1984126 + -11.3  -5.49569   AATATGTTAAAAAAA             TGCCAGC TATT GCTGGCA              TTTTTTATGTTGATC 100 115
   Spea_1642 1987453 .. 1987463 +  -8.2  -3.06915   TAGGTAAGTCATGGC                 CCGC ACG GCGG                 TTAAATACGGTAACT  63 502
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        panF 2035444 .. 2035464 + -11.1  -3.72621   AATTGATGGCAGCCT            TGGCTAGCC AAG GGCCAGCCA            TTGGTTTATATTTGC  83 41
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         cmk 2513074 .. 2513095 +  -7.3   -3.8512   GCCGGTACTTAACCA           TTTGCCCCA AGGA TGAGGCAAA            TTATTATACTGACTC  71 41
        rpsA 2514826 .. 2514842 +  -2.9  -2.71364   AGCTCGTAAATAATC              GCCTTGA AGT TCAGGGG              TGCTTGCACCCCTAA  41 28
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   Spea_2076 2516755 .. 2516791 +  -3.2  -2.91276   CAGCATTAAAAGGAT   CAGAGG-TCTAGACGG AGAGTAA CCGT-TAGAGCTTCTG   GTTTATCAACAAAAA  44 4
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   Spea_2081 2522291 .. 2522329 + -23.6  -3.65314   GATAAGCTAGTCCTG   CAAATAAAAACGCCACTT TTA AAGTGGCGTTTTTATTTG   TTATTAAAACTTGAA 100 52
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   Spea_2087 2527545 .. 2527577 +  -4.2  -4.55849   AGCTTATCGCTTAGC     GCTTCACGTGCTAGT TTAC GCT-GCATGTTAAGC      TTTGTTTGGGTTTTG  69 255
   Spea_2091 2532858 .. 2532879 +  -5.1  -3.76379   TAAACGCCTTAGCGC           TAGGGAGTC GTCA GCCTTCCTA            TTTGATAAAATATTG  58 63
   Spea_2092 2534069 .. 2534084 +  -7.6  -3.43492   GCAGCTCCCAAGGAG              CGTACA AGGA TGTACG               TTCTACTGCCTGTAA  65 152
   Spea_2093 2535627 .. 2535638 +  -5.8  -3.95022   GCTAAGTGATCTAAA                CAGG TGTC CCTG                 TTTAATCTTGGTGGC  63 364
   Spea_2095 2537878 .. 2537901 +  -9.6  -3.15124   TTTTACATATTAACA          CCGTTAAGCC ACTA GGCTTAGTGG           TCTTAAATACTTTTA  73 86
   Spea_2097 2539718 .. 2539740 +  -9.9  -5.37345   AATTGAATAGCAAAA           GGCTAAGCG AAATG TGCTTAGCC           TTTTTTGTCCTTAAC 100 197
   Spea_2100 2543818 .. 2543852 +   -13  -2.75349   TTCACCGTGACTTCA     GACGTTTATCGCGTTT AAA AACCGCGATAGATGTC     TCAGTTTTCAGGATT  90 169
   Spea_2101 2545384 .. 2545406 + -12.8  -6.25578   GGTTAGCTCTAAAAA           GCGTTATGTC TAA GACATAGCGC           TTTTTTTTGTTTAAT 100 56
   Spea_2102 2545907 .. 2545931 +  -3.6  -3.47751   TAAGTTTTGGTTAAT          CAGTATTCAT TAAGT ATGAGTACAG          TTCTAGATTGTTAAG  50 87
   Spea_2103 2546505 .. 2546518 +  -8.1  -5.40474   TCAGATACAAAAAAA               CCAGC CTAA GCTGG                TTTTTTTAGAAGACT  93 187
   Spea_2106 2550292 .. 2550313 +  -8.1  -5.61881   CGCTTTCTGATAAAA           CGCCTCT-TA CTG TATAGAGGCG           TTTTTGTTTTTAGAA 100 56
   Spea_2113 2558121 .. 2558144 +   -14  -4.84527   GCCACATTTAAAAAA          TCCCGTTATC GCAA GATAACGGGA           TTTTTGCTATCTGGA 100 217
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   Spea_2123 2570074 .. 2570085 +    -3  -3.14132   GATAACAGGAGAAAG                TGAT GGAT ATCA                 TTGATCAAGCACAAA  44 63
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   Spea_2224 2697024 .. 2697040 +  -9.4    -5.252   ATAAAGATAAAAAAA              GCCCTG ATTAA CAGGGC              TTTTTTGTAGCAGTA 100 52
   Spea_2227 2699617 .. 2699674 + -24.7  -3.55444   CTAGTTCACTAAATG GTATCGGGCGTTCAATAAAAAAGGACCT TAG AGGTCCTTTTTTATTGAACGCATGA-AC TTTAAGAGGTAACGC 100 67
   Spea_2235 2709417 .. 2709435 +  -5.9  -5.46629   CGACTCATAAAAAAA             AGGAGCC TATAT GGCTCCC             TTTTTTTGAACTCTT  89 43
         cls 2716767 .. 2716779 +  -3.3  -2.60075   GCTGTTTTCTTTAGC                CGCCA ACG TAGCG                ATTCGTTGGCGCCAC  43 64
   Spea_2241 2717531 .. 2717554 + -15.4  -4.17089   TACAGACAGCAAAAA          GCCCGTTATC TTTC GATAACGGGC           TTTTCAGAATTTGGC 100 89
   Spea_2248 2727327 .. 2727340 +  -3.1  -3.19192   CATAAGTGCGCTTGG               CTTGA GCAA TCAGG                TTCAATTCGCTGGCG  45 387
   Spea_2250 2728665 .. 2728687 +  -6.2  -3.55563   ACCTATCATTGAATA           CGCAACAACA CCC TGATGGTGCG           TTTGCGGAGTCAACT  62 227
   Spea_2253 2734119 .. 2734142 + -13.2  -4.67048   TTACAGTTAACAAAA          TATGCCCGGC AAAT GCTGGGCATA           TTTATTTTCAAATCC 100 54
        ansA 2735446 .. 2735466 + -11.1  -5.45652   ACAGCATAAAAGAAA            GCCCAAGCA TTT TGCCTGGGC            TTTTTTGTTAGCGAT 100 61
   Spea_2258 2738836 .. 2738854 + -13.2  -5.56263   TTGTTAAACTAAAAA             GCCAACAC TCA GTGTTGGC             TTTTTATTTTCTACT 100 77
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   Spea_2268 2746495 .. 2746517 +  -9.9  -5.48213   CGCGAAACAAAAAAA           GGCTAACTC TTTTC GAGTTGGCC           TTTTTATTTTCAATG 100 59
   Spea_2269 2746947 .. 2746965 +  -2.3  -2.82668   ACAAATAATTAGTAT             GCCGGAG AAATA CTATGGC             CTTTGCGCTTTGCGA  41 266
   Spea_2270 2747563 .. 2747573 +  -6.8  -3.75024   AAAATTTGTCCTTGC                 TCGC CCA GCGA                 TTGTTAATCATACAC  66 148
   Spea_2276 2757171 .. 2757196 + -13.4  -5.02323   TCTAATCTAAAGCAA         GGCCACTTTC ATCTAA GAAAGTGGCC          TTTTGTTTATACTGA 100 93
   Spea_2281 2764227 .. 2764241 +  -4.2  -3.93057   CTTCAATCGCTTCAA               TTGCAC CGA GTGCCA               TTTCATCATTTTGAC  58 378
   Spea_2287 2771568 .. 2771578 +    -4  -3.16191   TAAATAACCCGCCAT                 TCAT CGC ATGA                 TTGCTCGACATCTAA  48 208
   Spea_2288 2773366 .. 2773391 + -16.3  -5.36441   GTTAATCCATAAAAA         TGGCGCTAATC TTTT GATTAGCGCCA          TTTTTTATGTAAACC 100 76
   Spea_2293 2781424 .. 2781445 + -10.9  -4.59919   ATGCTTAAACACTTT           GATAGCCCC GTAA GGGGTTATC            TTGTTTTTATGCTTT  91 53
   Spea_2294 2782757 .. 2782782 + -17.7   -4.4017   CTTCCGCTATCAAAA         CAGGCCGCTTA ACGT TAAGCGGCCTG          TTTTATGACCATTCA 100 61
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   Spea_2299 2792196 .. 2792214 +  -7.4  -2.72511   GAGTGCTCAGGCAAA             TATCAGGG ATT CCCCGATA             GTTTAGCCCGCTAAA  59 304
   Spea_2300 2794227 .. 2794240 +  -9.5  -5.31059   AAAATAGCCTAAAAA               GCCGC ATTC GCGGC                TTTTTTAATTAATGT 100 84
   Spea_2302 2796106 .. 2796118 +  -3.4  -3.29704   ACATTTAAAAAGCAA                GGTA ATGCC TACC                TCTATTTAATAACGC  48 249
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        avtA 3210231 .. 3210286 + -27.3  -3.50332   ATTAAATACCGATAA GCGATTGCTCAGGTTTCTAGTCAGA ACTAGA TCTGACTAGAAACCTGAGTCATCGC TTACTTGTCTAGCTA 100 90
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        dinG 3239400 .. 3239410 +  -3.2  -3.05463   TGCCCTACCACCTTT                 TCGC CGT GTGA                 TTGAATAGGACAAGT  45 7
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   Spea_2858 3492570 .. 3492586 + -10.9  -5.45652   CTAACGGTAGGAAAA              GTGCTCA TTA TGAGCAC              TTTTTTATTGCAGCT 100 69
   Spea_2859 3493033 .. 3493044 +    -3  -3.82117   AACCAACATCCAACA                GTAA TTAT TTAC                 TATTTTATAAGTAGC  53 22
   Spea_2860 NONE
   Spea_2861 3494741 .. 3494751 +  -5.4  -5.24129   TACGGCTTAGATTTT                 CCAA TAC TTGG                 TTTTTTATGGAGGGG  85 294
   Spea_2862 3495474 .. 3495488 +  -8.6  -2.50816   GAATTTAGGGGTAAG               GTTAGC GTT GCTAAC               GTTACTGCGTAGGCG  64 287
   Spea_2864 3498842 .. 3498861 + -13.6  -5.96219   TAGAACAATAAAAAA            CGCCGATG ACAT CATCGGCG             TTTTTTTTGTAAATA 100 69
   Spea_2865 3500535 .. 3500545 +  -5.4  -2.75183   CCACAGCCTCAAAGC                 GCAT GCC ATGC                 TGATTAGCTAACGCT  49 419
   Spea_2868 3504144 .. 3504154 +  -5.4  -3.18912   GACTCAGATTGAGTC                 CCAA AGC TTGG                 TTGCTCGCTAAATAG  54 101
   Spea_2886 3525224 .. 3525241 + -11.3   -5.4492   GGCTAAGTTTAGAAA             GGCGTGA TGAT TCACGCC              TTTTTTGTATCTATA 100 60
   Spea_2887 3527956 .. 3527969 +  -6.7  -4.04319   AACACATTACGTGAA               GCACT TATG AGTGC                TTTATAGATTTATCA  71 5
        dapD 3528862 .. 3528890 + -14.7  -4.08958   ACCGCTAAGTTGACT        CAAAAATCCCGCC TTA GGCGGGATTTTTC        TTATTCTTTCACAAT 100 54
   Spea_2889 3529417 .. 3529430 +  -8.1  -5.23292   TGTAAAGCAGTAAAA               GAGGC TGAC GCCTC                TTTTCTTTTGTCTAA  91 54
   Spea_2893 NONE
   Spea_2894 3533088 .. 3533112 + -11.3  -5.02287   CCTGAATGAAGTAAA          GGCACGGCCCC AGA GGAGACGTGCC          TTTTCTATTTTTGTG  95 58
   Spea_2897 3535547 .. 3535563 +    -3  -2.72626   CGATCACTTGGACAC              CTTGCT AAGAA AGTAAG              CTTATCTAGATCTTG  41 10
   Spea_2899 NONE
   Spea_2900 3537261 .. 3537282 +  -8.7  -5.27938   AAACAATTATAAAAA           TGGCGCTTA TATT TCAGCGCCA            TTTTTGTTTAACCCT  93 58
        queF 3538927 .. 3538953 + -13.8   -5.5074   CGAACTCCAAGCAAA         GACCTGTAACGC CCT GCATTACAGGTC         TTTTTTATTAAGTTC 100 42
   Spea_2904 3542113 .. 3542133 + -15.4  -4.26076   CAATTAAACACAAAA            CGGGGCGC ATTTA GCGCCCCG            TTTTAATAAACCTAC 100 55
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   Spea_2909 3560658 .. 3560680 + -13.6  -2.57244   AATTTGCATCGAAGA           GGCTTAAAAC GAA GTTTTAAGCC           TAAGTTAATGACTAA  91 19
   Spea_2910 3562526 .. 3562547 + -11.7  -5.79595   CAAACCAACCTAAAA           GCCACTAAT CTCC ATTAGTGGC            TTTTTTATTTTGACA 100 103
   Spea_2912 NONE
   Spea_2913 3565755 .. 3565766 +  -3.6  -2.87963   TAGCGGATGCCCTGA                CTGG CCAC CCGG                 TATCGTCATTATGGC  44 224
   Spea_2915 3568415 .. 3568446 +  -9.5  -5.40464   GTAAGGTCACAATGA      AGTAGCCAGCCTT GGAATG AAGGCTGGTTACA       TTTTTCTTTGTGCTG 100 21
   Spea_2916 NONE
   Spea_2917 3570684 .. 3570711 +   -10  -3.52906   GCTTATCTAAATTAA        CCTAGTTAGACT AAAT ATTCTAACTAGG         TTCTGTCCAGTTCTG  79 96
   Spea_2918 3571293 .. 3571313 +  -3.2  -4.56597   ACGAACGTTTCTACC            CATTCCCG TGCCT CGGTGATG            TTTTTAAAGCCAGAG  65 269
   Spea_2920 3572973 .. 3572999 +  -8.9  -4.07562   CCTAATGCCAATCGT        CGTTTTCAGAGC TTAA GCTCT-AAAACG         TTTCTGTCCACTTTC  83 72
   Spea_2921 3574950 .. 3574972 +   -12   -3.4934   TTCATTTGATGTGAA           GTACTGAGGG GAT CCCTCTGTAC           TTAGTGTTTGCTGTA  89 19
   Spea_2923 3577644 .. 3577656 +  -6.2  -3.32698   GCCAACAGTAATTTT                CCGC TTATT GCGG                TGTTATGTGAAGTGA  60 110
   Spea_2924 NONE
   Spea_2925 3579078 .. 3579088 +  -5.4  -3.04792   TCGCTTATTAGCGCA                 TGGT TTA ACCA                 TATTCGCCGTGGTGA  53 436
   Spea_2926 3581063 .. 3581099 +  -2.9  -3.71378   AACTAATTGCTATTA    GCTAATGGCTCTTAACT AAT AGCTAAGTGCTAAAAGC    TTTGGCTGTCAGGTC  50 78
   Spea_2927 3582674 .. 3582684 +    -4  -3.38072   AAAGCATGGCCCGTG                 TCTA GGC TAGA                 TTGATATTCACTCGG  51 223
   Spea_2929 3586567 .. 3586582 +    -9  -5.46657   AGCACGAATAAAAAA              TGCAGC CTAG GCTGCA               TTTTTTATTCGGCTA  95 59
   Spea_2933 3594811 .. 3594829 +  -3.8  -3.17194   AATCACGTAGGCAAA             ACGATATC AAT GATGTCGA             TTCCATTAGGGGGCT  48 40
   Spea_2934 3595399 .. 3595409 +  -2.4  -2.77899   GATGCCAAAACAGGC                 CGTG TTT CTCG                 TAATTAATAGCCAAA  41 8
   Spea_2935 NONE
   Spea_2936 3597781 .. 3597791 +  -5.4  -4.23298   ACTTAATCTCACGGC                 GCTA ATC TAGC                 TGTTTTTTAGCTTTC  67 47
   Spea_2937 3599310 .. 3599327 + -12.7  -5.22289   CTGTTCAAACAAAAA             CGCCGTC AATT GACGGCG              TTTTTATGTTTAATG 100 66
   Spea_2941 3602336 .. 3602362 + -11.7  -5.04601   ATAGTCGAATAAAAA        TGGCTGT-CAGC CTAT GCTGTACAGCCA         TTTTTGCTTTCTGCG 100 67
   Spea_2943 3604770 .. 3604785 +  -5.4  -3.04604   CCTCCGTGTAGCAAA              CGAAGT GAGC GCTTCG               TGGTTTATAGCTTGT  53 204
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   Spea_2945 NONE
   Spea_2946 3607185 .. 3607204 +  -3.6  -2.65993   GAACCGATCCGAATA            CAACTG CAATAACT CAGTTG             TAGTATCCCTGTCGT  43 89
   Spea_2949 3611048 .. 3611063 + -10.4  -5.12068   ACTGATACGAAAAAA              GGCACC CTAA GGTGCC               TTTTTATTCGCTATC  93 93
   Spea_2954 3617819 .. 3617832 +  -8.1  -4.86001   TTAGCTAAGCGATAA               CTGCC ATGA GGCAG                TTTTTCTAGGCTAAT  88 188
   Spea_2957 3621349 .. 3621366 + -11.3  -4.73682   AAGTTCATACAAAAA             GGAGAGC TTCT GCTCTCC              TTTTCTATTCTGCCA  95 58
   Spea_2959 NONE
   Spea_2960 3624241 .. 3624259 + -13.2  -5.08088   CTTAAAGTAAAAAAA             CGCCATAC ATT GTATGGCG             TTTTTGTTAGCAATT 100 57
   Spea_2963 3628477 .. 3628491 +  -8.5  -4.40572   TACAATCACTATAAA               GGGGC TTAGC GCCCC               TTTTCTGCCACTTAT  85 55
   Spea_2964 3629262 .. 3629282 + -11.1  -5.70829   CAATGTAGATCAATC            AGGCAACCC CTT GGGTTGCCC            TTTTTTTATCCTGTT 100 196
   Spea_2966 3633662 .. 3633677 + -10.4  -5.48054   ATAACCCATTAAAAA              GGCCTC AATT GAGGCC               TTTTTTGCTTTTCAT 100 53
        rdgC 3639611 .. 3639626 + -11.8   -4.8048   ATGTGTTAATAAAAA              GGCGCC TAAT GGCGCC               TTTTTGCTCTCCCAG 100 49
   Spea_2973 3643763 .. 3643776 +  -2.3  -3.40705   ATAAGCAGTTAAATC               TCAGC TTAT GCCGA                TGTTGATTTCTCTAT  45 37
   Spea_2974 3645411 .. 3645422 +  -4.4  -3.50047   GAAAGCAGAGATAGG                GTCA TCAT TGAC                 TTCTAAGTTTCTCCC  54 8
   Spea_2975 3647024 .. 3647046 +  -6.3  -3.34233   AACGAACTGGTGTTA          CAGGTGAGCG AGTT CGTTC-CCTG           TTATGAAAGTTATCA  60 190
         xni 3647886 .. 3647898 +  -3.4  -3.70505   TTGTTAACACAAAGT                TGCT GCTCA AGCA                TTTACCATTGCTTTA  52 49
   Spea_2977 3648422 .. 3648440 + -10.3   -5.5762   TCTATGAAGCAAAAA             GCAGCGA AGTTA TCGCTGC             TTTTTTGTGTTTGGT 100 93
   Spea_2980 3653675 .. 3653698 + -16.8   -5.1861   TTGAGTGACTAAAAA          GGCCCCATGT TTGC ACATGGGGCC           TTTTTTAATGCTCAG 100 46
   Spea_2985 3657607 .. 3657621 +  -7.1  -5.64274   TCTTCAACTTTTAAA               CCACC AGCTA GGTGG               TTTTTTTGTGCCTAC 100 54
   Spea_2989 NONE
   Spea_2990 3662695 .. 3662705 +  -3.2  -4.53036   AAAGAGACAAAGAAT                 CTCG ATA TGAG                 TTTTGATATTTCTCA  64 42
   Spea_2991 3664622 .. 3664639 + -11.3   -5.7946   ATAGCTAAATAAAAA             GGACTGC CATG GCAGTCC              TTTTTTTATTGCCAG 100 81
        ppnK 3666260 .. 3666275 +  -3.2  -2.67316   TACTAAACTTGGCTG              GGGCAG CAAA CTGTTC               TAAGTTCTTAAGTTC  43 7
   Spea_2994 3668687 .. 3668703 + -13.7  -4.20516   AATCATATCGTGAAA              GCCGCAG AAA CTGCGGC              TTTATTCACTCAAAA 100 81
   Spea_2995 3671603 .. 3671625 + -16.4  -4.38472   GCAAGATAGAATCCA           TTAGGGGCAG CGA CTGCCCCTAA           TTCTTTTCATTTACA 100 69
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   Spea_2997 NONE
   Spea_2998 3674724 .. 3674754 + -10.5  -5.27399   ACATCCATATAAAAA       GCCCTAAGCTCAC TAGAC GTAAGTTTAGGGC       TTTTTTAATATGTTA 100 101
   Spea_3003 3681052 .. 3681082 +    -9  -4.94992   CAGTATTAGATACAA       AACGCGCAATAGAG TCT TTCTACTGCGCGTA       TTTTTATGGCTTTCG  90 82
   Spea_3008 3688369 .. 3688381 +  -5.5  -3.76373   TTATTTTCAACCAGC                GGGCT CCC AGCTC                TTTCGCTGTTAAGGG  61 167
   Spea_3011 3692466 .. 3692483 + -11.3  -5.79595   CTGAACTTGATGAAA             GGCCTCA ATTT TGAGGCC              TTTTTTGTTTTCAGC 100 50
   Spea_3016 3698121 .. 3698138 + -11.3  -5.61881   CTTAGCGATAACAAA             TGGAGCC AATC GGCTCCA              TTTTTGTTTTTAACA 100 46
   Spea_3017 3700082 .. 3700111 +  -9.4  -2.71011   AGGCCAAAAAAGTAA       GTCATGCATAAC CGACAA GTGATGCATGAC        TCATTGAGCAAAAAT  70 119
   Spea_3019 NONE
   Spea_3020 3702701 .. 3702725 + -10.8  -5.20534   TCATTCAATACCCAA          GCCCGCTTAT CAAAA ATAAGTGGGC          TTTTTATTCGTTGAT 100 66
   Spea_3021 3704251 .. 3704276 + -10.5  -4.20531   AGGTAATCGACTAAA         CAATAGGCGCT CTCG GGCGCTTATTG          TTTTCAATACCTATC  89 39
   Spea_3023 3707238 .. 3707253 +  -4.8  -2.96288   TTCGCCGACTAACAG              TTGAAT GGAT ATTCAA               TAATATTTCTGTTTA  51 292
   Spea_3024 3708709 .. 3708726 + -11.3   -5.4492   CCAAAAATATAAAAA             GGAGCGA ATTT TCGCTCC              TTTTTTGTATCTGTA 100 49
   Spea_3025 3709807 .. 3709826 + -12.2  -5.39755   ACTACATAACAAAAA            GCCAGTCA CTGA TGACTGGC             TTTTTTATGGTTATG 100 107
   Spea_3029 NONE
   Spea_3030 3716136 .. 3716154 +  -2.4  -3.30212   ATTTGTTGGCATAGG             TATCGCTT AGC GAGTGGTA             TTAATGATTAGTATT  45 82
   Spea_3031 3716693 .. 3716710 + -12.7  -4.62069   AGCCTTAAGTAAAAA             CGCCGCA GTAT TGCGGCG              TTTTTACAATCAAAG 100 72
   Spea_3033 NONE
   Spea_3035 3722418 .. 3722442 + -15.8  -3.75629   AGTAACTCTTGGCTT          CTGGCCCTGT ATCTA ACAGGGCCAG          TTTGAATTCAGCCTG 100 36
   Spea_3041 3731672 .. 3731692 +  -6.3  -2.50994   CAGTAGGCTATTCGC            TTTAAGATT ACG AGTCTTAAA            ATTACTAGACTTAAC  54 46
   Spea_3044 3735161 .. 3735178 + -12.7  -5.75342   GTCATAAAACAAAAA             CGGACGC ATAA GCGTCCG              TTTTTTTTACACCGC 100 48
   Spea_3056 3751254 .. 3751268 + -11.4   -4.2828   ACAGGCACAAAAAAA               GGAGGC ATA GCCTCC               TTTTAATAGATCAGA  93 188
   Spea_3069 3765108 .. 3765131 + -16.8  -5.75478   TAAGATAAATAAAAA          GAGCCGCTGT TTAT ACAGCGGCTC           TTTTTTTGTCTGCTT 100 80
   Spea_3081 3781173 .. 3781195 + -11.3  -5.42131   GACGGTTTTTATTAA           GCCAGTTGG AACTC CCGACTGGC           TTTTTTATGTACTTC 100 80
   Spea_3091 3796019 .. 3796059 +  -5.7  -5.24129   TTCAAAGTAAAACCT AAAAGGCCACTTA--GCTA TTAAT TAGCAGTAAGTGGCCTTTG TTTTTTCTAACGAGC  85 53
   Spea_3107 3810416 .. 3810445 + -13.7  -4.93547   TATAAGCGGTTAAGC       AAAAACGGTGAGC CTAG GCTCACCGTTTTG        TTTTTGATTCATTAA 100 71
   Spea_3110 3813452 .. 3813464 +  -6.3  -3.01791   AAGGTTAGGTTTTCA                GCATT CAA AATGC                TATTAAAAGGAACAT  56 46
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   Spea_3112 3814634 .. 3814659 + -13.3  -4.72272   TCAAGCTCTAGCTAA         GCCCAGACCAA AACT TCGGTCTGGGC          TTTTTACTGGCAAGC 100 80
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   Spea_3230 3961408 .. 3961425 +  -2.7  -2.61341   TATTGTCTGAAATCG             GATAGGTG TAG CGCC-ATC             TAGCTTCGATTTTTG  41 481
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   Spea_3312 4055268 .. 4055282 +    -5  -4.58395   TCGACAGCGAAGAGA               TTAGCC AAT GGTTAA               TTTTTCGCAAATGAC  71 63
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   Spea_3316 4058178 .. 4058195 +  -2.1  -2.66235   TACCGATTCAGATCC             CATTAGTT AAT AAC-AATG             ATTCATTAATGTCTC  40 16
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   Spea_3321 4063730 .. 4063747 +  -4.9  -3.82656   GCTTTCTCCATCTTT             GCAG-TTC CTA GAACCTGC             TGTTTCTGTTTTACC  61 151
   Spea_3322 4065758 .. 4065780 +   -15  -2.78596   AATGAAATGATTAGA           GCAACAAGTC AAT GACTTGTTGC           TCTAATAAAGCGCTA  95 107
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   Spea_4156 5048441 .. 5048464 + -12.5  -3.07501   ATTGCCTAAATAATA          TCTGGCAGC TATAGT GCTGCCAGA           TATTCCAAATTGTAT  84 44
   Spea_4157 5049140 .. 5049180 +    -5   -4.7254   GCCACAAAACAAAAA GCCAAGTTTAATACTAA AATACTCA TTAGTTTTAA-CTTGGC  TTTTTAGTGCGAGCT  74 52
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        gltA 2177381 .. 2177397 - -12.3  -5.49234   AGACTCAATAAAAAA              GGCACTC AAT GAGTGCC              TTTAAGCTTTACTTA 100 123
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   Spea_1768 2149116 .. 2149174 - -33.1  -3.34522   AGATCTTCTAAGCAA TG-CGTTCGACCCAATAAAAAAGCAGTC ATTA GACTGCTTTTTTATTGGGTCGAACGACA GCGTTACTTATAACG 100 29
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   Spea_1761 2139935 .. 2139946 -  -4.4  -2.84401   TAAATGACAATAGTA                CAAG CTCT CTTG                 GGCTCAGCTGGCCAA  46 389
   Spea_1759 2138086 .. 2138101 -    -6  -4.31433   TACTTCTACAATAAA              TGGCGC TTCG GCGCCT               TTTTCATTTTCAGCC  74 104
   Spea_1757 2136205 .. 2136221 -  -2.9  -3.86822   GAAGCGTTTGAGAAA              GACTGCT TAC AGCAAGC              GATGTCGCGCCATGA  54 182
   Spea_1754 2131885 .. 2131908 -    -6  -3.75105   TGAAGGCACGAAGAA          CTCAAACTAC TCAA GCCGTTTGAG           TTTTTTATCTTCACC  64 195
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   Spea_1169 1413331 .. 1413349 - -13.2  -5.49569   TAGCAACATAAAAAA             TGCAGAGC TTA GCTCTGCA             TTTTGTTTTATGGGT 100 65
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   Spea_1158 1402258 .. 1402281 -  -3.2  -3.12668   TATCTTTAGATTTAA          TTGGTTAATGC CTT GCTTTA-CCAA          CCAATCAGATAGCGG  46 19
   Spea_1157 1401019 .. 1401041 -  -4.7  -3.60925   AACCACTAAATAAGA           GTCTGCCGG GTTTG CTGGCTGAC           TGCGACTCGATGCTA  54 88
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   Spea_1155 1396405 .. 1396419 -  -7.2  -3.20723   CTGGGAGGAAGTCAA               GTCAAA GAC TTTGAC               TCCCACCAGTCATAG  63 48
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   Spea_1152 1393388 .. 1393407 - -13.6  -5.04601   GCCAGAAAGGAAAAA            GCCCACTC CGAG GAGTGGGC             TTCTAAGCTTGCTTT 100 314
   Spea_1149 1387802 .. 1387830 - -14.7  -3.10775   AGCGGGATTTAAAAG        CGGCATGCTCTAG GGA CTAAAACATGCCG        TCAATCATTAGAGCT 100 33
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