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        murQ  225263 ..  225273 +  -3.2  -2.78679   ATCAGAGATAGACAA                 CCTT AGG AGGG                 ATTTAAATGACCAAA  43 20
   SAPIG0210 NONE
   SAPIG0211  227764 ..  227787 + -10.4   -5.1675   GCGTGACAAATTAAA          GCAAAGTTCA GATT TGAGCTTTGC           TTTTTTCATAGATGG 100 177
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   SAPIG0213  231665 ..  231692 + -12.8  -3.08446   GTGTGTAATGATTCA        GCCCCCT-CGCTA GAT TAGTGTAGGGGGC        ATTATTATTTCATTA 100 33
   SAPIG0214  232702 ..  232730 + -11.1  -4.33248   TAAGGATGCAAATGA       TCCCCCG-CACT TCACAT AGTGGCGGGGGA        TTTATTCTGGCGTTA 100 7
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   SAPIG0218  238902 ..  238916 +  -2.9    -4.323   AAAAGTAGAAAAAGC               CATTA ATCAA TAATG               TTTTAAATATTTAAC  55 13
         ggt  240946 ..  240957 +    -3  -2.95459   ATATGATCGAGATAG                TATC ACAA GATA                 GTTTATGCGCTTGAT  44 13
   SAPIG0222  243681 ..  243719 + -12.7  -5.08824   AGTCTAAAAAATCAA   GCAATCATTGTGTGAGT ATAAA ACTTACATAATGGTTGC   TTTTTTCAATGAAAA 100 59
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   SAPIG0226  248636 ..  248648 +  -6.3   -2.8805   AAAAATAGGAATACA                TGAGT AAA ACTCA                TGTATAAGAAATACT  58 136
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   SAPIG0229  252141 ..  252182 + -12.6  -2.96216   ATTCACAGTAACAAT CCTCACCATTGAAAAGAGT ATATA AC-CTTTTCAATAGTGAGG TATATGATAATAAAA 100 205
   SAPIG0231  254619 ..  254666 + -10.1  -4.67478   GTGACTCAATGAATT TACTCCTTACAATAAAGACAT ATAGCG GTGTCAATATTGTAGGGAGTA TTGTTTTTATATTTA 100 219
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        pflA  261693 ..  261732 +  -9.4  -4.75174   ATTCAGACCGAAAAG  AAAGCATATGCAACTTCA AGAG TGAAGGGGCATATGCTTC   TTTTTCAATTGAGTA 100 46
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   SAPIG0238  263768 ..  263804 + -13.9  -4.66833   AATAATATAAATAAA    GACCTCTAAAGTTATCA AGA TGATACCTTCAGAGGTC    TTTTTAACGTTGCCA 100 36
   SAPIG0240  266753 ..  266770 +  -5.5  -3.73308   CAAGTCTAGTTCGAA             CACACAC TGAT GTGAGTG              GTTTTCTTTATTTTA  64 308
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   SAPIG0247  277555 ..  277587 + -11.5  -5.75599   CGAATAATAATTAAA      GCTTATGTTGCTA TGTTTTT TAGCGACATAAGC      TTTTTTTATAATTTG 100 34
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   SAPIG0255  286092 ..  286123 +  -6.6   -5.1167   AATAGATACAGTTAA      CCCTAAGG-TGCCTG ATT TAAGCGTCCTTAGGG      TTTTTGTATTGGATT  83 54
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   SAPIG0315  349091 ..  349112 +  -2.4  -2.76171   GTATCAAATAGTTAT           TG-CATCAT TTAAT ATGATGGCA           TAATCTTCAGTAAAT  40 413
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   SAPIG0317  350295 ..  350343 +   -12  -4.82128   ACCGATTAAATAAAG TGCTCTCTTAGAAGTAGATTTT CAGTC AATAACTGCTTTTAAGAGAGCA TTTTGTATTTGATAA 100 72
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   SAPIG0322  356307 ..  356325 +   -11  -4.23487   AATAGTTTTATTAAG             CCGGTACA TCA TGTGCCGG             TATTTTTATGTTTAT 100 36
   SAPIG0323  357633 ..  357652 +  -3.6  -2.97475   TTTTATAGAAAAATA            TAAGACAT AAAA ATGTCATA             ATTTATAGTCGACAA  46 123
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   SAPIG1363 1436496 .. 1436542 +   -14  -4.09739   GATGAAGATTAAAAA TAAACAAGGCGATTTCTATC ATACTCA GATAGAAGTCGCCTTGTTCG TTTTCAAAGAATTAA 100 29
   SAPIG1365 1438425 .. 1438442 +  -2.1  -3.22886   GCGTACTTCTAAGAT             TCT-TAAG TTG CTTATAGA             TATATTATGTAAACT  44 275
   SAPIG1367 1441033 .. 1441067 + -10.9  -5.40072   TTAGGTGGTACCACG    CGTCAGCGTCCTTTAT ATTG AT-AAGGATGCTGGCG     TTTTTTTAGAAAGGA 100 459
   SAPIG1368 NONE
   SAPIG1369 NONE
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        trpB NONE
        trpA 1447585 .. 1447595 +  -2.6  -3.94465   AAAAGTATACGCAAT                 TAAA GCG TTTA                 TGTTTTAGTTTTAAC  52 201
   SAPIG1375 NONE
   SAPIG1376 1450289 .. 1450317 +  -6.1  -5.47914   ATGTAAATGATGTTA        GGGCTTATAGT TATTGAT ACTATAGGCTC        TTTTTTATGCTTTTT  86 41
   SAPIG1377 1451695 .. 1451731 + -13.9  -2.83772   ATATAAATAAAAGCA    CCCCTATCAAATGATAA TCA TTATCAATCGATAGGGG    CTATTTTAATAAAAT 100 31
        pepF 1458323 .. 1458378 + -13.1  -3.91032   TGGGACATAAATCCC TAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC AATTA GAAAAT-ATCTTACTGCTGTTCTCTA TTTATACAATACTTC 100 83
   SAPIG1385 1459592 .. 1459603 +  -4.4   -5.4477   TAAGAACTTAATGTC                CCAA GCTC TTGG                 TTTTTTTGAGGGTTT  78 38
   SAPIG1391 1465082 .. 1465092 +    -4  -2.83345   TACTTTGAAAGGAAT                 GTTT AAA AAAC                 TACTTCATCTGTCCG  47 84
   SAPIG1393 1468097 .. 1468135 +   -14  -5.70761   TAATAGACATTAACT   GGGCGTCTCGATGCTA ATATTTA TAGCATCGAGGTGTCC   TTTTTATTTTATTTT 100 313
   SAPIG1394 1469896 .. 1469910 +  -3.6  -2.88118   ATGATTGTTAAAATA               TTCTAA AAA TTGGAA               ATTATTATAAAATGG  45 48
         asd NONE
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        dapB NONE
   SAPIG1398 1473306 .. 1473331 +  -8.4  -4.18213   GTATAATAATTTCAA         GGTTGAGATA CGATTA TGTCTCAACC          TTATTGTTTATCATT  81 51
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        lysA 1476935 .. 1476971 + -11.6  -3.41291   AAATAAACAAAGTAA    TCCCCGAAGCACAGCA AATTA TACTGTGTCTCGGGGA    ATTTTTAAGATTATT  93 41
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   SAPIG1408 1481336 .. 1481348 +  -5.5  -4.55625   ATCCTAAGATTAAAT                GGGAG ATG CTTCC                TTTTATAATATTCGT  73 72
   SAPIG1432 1506726 .. 1506753 + -11.4  -5.18357   TAGCTTATTTTACGA        CACGCGTTACTT ATTT AAGTGATGCGTG         TTTTTTAATAGATTG 100 152
   SAPIG1433 1507237 .. 1507275 + -13.2  -4.82901   AAAAAGAACAAATAA   AAGGAGCACCGACTGACA AAA TTTCAATCGGTGCTCCTC   TTTTTATCGAAGAAA 100 26
   SAPIG1441 1551246 .. 1551256 +    -4  -4.10657   GTCTTCCCATCATCT                 TTAG AAA CTAA                 TTTTACAAAGTCTCC  59 330
        recU NONE
   SAPIG1450 1557987 .. 1558022 + -16.4  -5.65177   CCACTCAACATAAAA    TCCTCAGTTATACCAT ATTT ATGGTGTAGCTGAGGA     TTTTTTTATAAGTAT 100 42
   SAPIG1477 1586666 .. 1586677 +    -3  -3.34609   ACATAGGCGCTGTTC                CAAA TTCA TTTG                 TATTAATTTGAATGC  48 319
   SAPIG1483 1592257 .. 1592271 +  -4.4  -4.17316   TGTATATTATTTTGC               TTTAAT TTG ATTAAA               TTCTTTTCAAGAAAT  59 121
   SAPIG1524 1626925 .. 1626942 +  -4.2  -3.10499   GATAGTTAAGTCTTC             CCAATT GCTAGG AATTGG              TGTGTTAAGATATTC  50 355
   SAPIG1547 1639709 .. 1639725 +  -3.7  -3.73872   GAGACAAGATTTTTT              GTAGCTA TCT TAGTTGC              TTCTTGAATGTTCAT  54 208
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   SAPIG1554 1643567 .. 1643588 +    -3  -3.19563   AATCAAATATTTTAT           TACATCGA CAATTT TCGATGCA            TATTCATCATATATA  47 407
   SAPIG1562 1651853 .. 1651864 +  -3.6  -4.93696   TGGCGTAACGTATGT                GGCG TTAA CGTC                 TTTTTAATGTTTGCC  70 272
   SAPIG1566 1654729 .. 1654770 +    -4  -4.15029   TTTCAGTAATAAAAA CAGCAGTATGAGGCGTTT CATTATAA AAATGCCT--TACTGCTG TTGTTTATGTACAAT  59 48
        proC 1656906 .. 1656951 +  -4.1  -4.55383   ACCAATAAAAACAAA CCCGCCA-ACACA-TGTATGC ATCATC GCAGGCACTGTGTTTGACGGG TTATTTTTATAAATT  65 33
         zwf NONE
   SAPIG1572 1660835 .. 1660887 + -10.2  -2.54803   ATTAAAAACAAAGAA GCCCCCTAATA-TATCTATAGGTC TACAAAT GGCCT-TAGATTCTATTAGGGGGC ATATTAATATGTTAA  78 44
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   SAPIG1597 1684880 .. 1684917 +    -3  -5.55769   AAATAGATAAAAAAA  TGGAAGCACTTGTAGG-TA AAA TAGTCTAC--GTGCTTCCA  TTTTTTATTCTAAAA  78 35
   SAPIG1599 1686761 .. 1686773 +  -7.7  -3.88559   TCACAGTTGTATGTG                GTGCT TCT AGCAC                TTTATCAGGATCGTT  73 478
        glyS 1715648 .. 1715687 +    -8  -5.12916   TTTCTATTCGAAAAA  GGTATTCAAATAAACACA TCTA TGTGGCTACTTGAATACC   TTTTATTATTTTATG  90 121
        rpsT 1735113 .. 1735142 + -15.3    -5.252   AATAATCTTTTTAAA       TAAAAGTTCAAGC GCAT GCTTGAACTTTTA        TTTTTTATAAAGATA 100 36
   SAPIG1665 1746249 .. 1746260 +    -3  -3.38224   TCTACATTTTTTTCA                TCAT CATT ATGA                 TATTTAACATACCCT  48 361
   SAPIG1687 1770549 .. 1770595 + -12.3   -3.6106   AATGCAAATATTAAA GCGCCCCTTCAATTTTACACT GTGTA AGTGTTTATTTGATGGGGCGC TTTCAAAATATTGAA 100 175
   SAPIG1691 1772933 .. 1772989 + -12.7  -3.30505   TAGCTATAATCAAAA CAAAACTGACTAGTACACGAGGCATA TTCTAC TATGCTT-GTGAACTAGTCAGTTTTA GTTTTATGGTATGGT 100 73
         tag 1804620 .. 1804634 +  -2.2   -4.1822   AATAGACTGTCTCGT               TTTTTA ATG TAGAAA               TTTATTCAAATCACA  52 88
   SAPIG1721 1806009 .. 1806031 + -16.4  -2.71593   ATATACATTTAAAAA           GAGCCTGAAC AAA GTTCAGGCTC           TCAATTTGTCCGTAT 100 153
   SAPIG1750 1840941 .. 1840972 + -12.4   -4.9725   TAAAAACAAGTTTTA      CCCCTGTTGAATAT ATTA AAGTTCAACAGGGG       TTTTTATATGCAACT 100 38
   SAPIG1759 1854732 .. 1854757 +  -7.6  -2.85847   CTGGGGTCCCAACAT         GGAAGCTGAC GAAAAA GTCAGCTTAC          TATAATGTGCAAGTT  66 350
   SAPIG1761 1856854 .. 1856866 +  -7.7  -2.59714   GGACAAAAATGAAAA                GCTTG TTA CAAGC                GTATTCTCATTCAGT  65 47
   SAPIG1763 1858948 .. 1858971 + -11.1  -5.74288   CTTGATCATTATGAA          CCAAGTGCA ACTTTC TGCACTTGG           TTTTTTATTGTTTAT 100 48
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        rpsD 1868778 .. 1868795 + -11.3  -5.82172   ACCGTTCAATACAAA             CACCCAC AATT GTGGGTG              TTTTTTTATATTAAT 100 42
   SAPIG1774 1870310 .. 1870320 +  -2.6  -3.75169   TTTTAGGCTTTTAAA                 TTTT CAG AAAA                 TTTGCTAAAATAGTG  50 87
   SAPIG1775 NONE
        serA 1873135 .. 1873174 + -13.1  -5.37865   TATGTAAATTCAAAA  TGCCAAGAAGACATTGGA TTACT TCCATTG-CTTCTTGGCA  TTTTTTCATTATTAA 100 47
   SAPIG1780 1878179 .. 1878227 + -14.2  -4.48299   GACAGAAAAGTACAT TAAGAGCCTACTCATATTCATTC CTAA GAATGTA-ATGAGTAGGCTCTAA TTTATTTAGCTATGC 100 47
   SAPIG1782 1880851 .. 1880892 +  -6.8  -4.44301   TCCAAATATTAAAAA CAGCAGTAAGATTATTTTC AATTA GAAAATT-TCTCACTGCTG TTCTTTATTTTAAAT  76 77
   SAPIG1786 NONE
   SAPIG1787 1889963 .. 1889977 +    -5  -4.13271   CGGTATTCAATTCTG               TGTGGT AAA ACTACA               TTTGGTTCTTCTATC  64 154
   SAPIG1799 1903737 .. 1903774 + -12.1  -5.95946   CGTAAAACTTAAAAA   TGAGCCACACCCTAATT AGTA AGATAGGATGTGGCTCA    TTTTTTTATTCTTGA 100 70
   SAPIG1808 1914175 .. 1914221 +  -3.4   -5.2204   CATTCAATTAAAAAT GACCTTAATATAACTTAGTCACT AAAA AGTGTC---GTTATATTAAGGTC TTTTTGTTAATTATG  71 85
   SAPIG1813 NONE
   SAPIG1814 1927022 .. 1927047 + -10.6  -4.98436   TACCAACAACAAAAA         GAGGTTTTCA TTAAGT TGAAAACCTC          TTTTTATGCTATTAA 100 101
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   SAPIG1827 1940097 .. 1940111 +  -2.8  -4.74504   ACTTCAAACCATCTC               GAAACA AAC TGTGTC               TTTTTACATTGCGAT  62 198
   SAPIG1829 1940963 .. 1940974 +    -3   -3.9872   TTTATACATGATTGC                CAAT GAAC ATTG                 TATTTTATATATTTT  54 508
   SAPIG1830 NONE
   SAPIG1831 1942766 .. 1942808 + -14.7   -5.4111   AAAACATATTAAGTT TAGCTATGAAAAAAATCTAT GACG ATAG-TTTTTTTCATAGCTA TTTTTTATAGTTATT 100 161
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        crcB NONE
   SAPIG1835 1945704 .. 1945718 +    -5  -3.84523   ATCCTTCAAAAGTTT               TTGGAT CAG GTCCAA               TTCTCTTATCTTGAT  61 292
        pckA 1950937 .. 1950983 + -12.8  -4.57353   ACTTTGCATACTAAT TAA-AG-AGCCAACCATTGTTA TAGTC TAACAATGGTTGGCTCCTCTTA TTTTATATGGTAAAA 100 40
   SAPIG1843 1952797 .. 1952822 +  -9.7   -4.3586   GTTATATCTACTAAA         GGGGGGCGA AATTCGAG TCGCCCCTC          TTTTAATATGCCTGA 100 56
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   SAPIG1848 1957339 .. 1957350 +    -3   -4.0641   CAATATCATTTTCCA                TTTC TGAA GAAA                 TTTGTCTAGGTGACC  55 238
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   SAPIG1868 1973373 .. 1973389 + -12.3  -4.17048   CAGAATAAAATTTCA              GGGTAGC TCG GCTACCC              TTCTTTTACGGAAAA 100 33
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   SAPIG1871 1975206 .. 1975260 +  -7.3  -3.29549   TATTTTATAAAAATA GACCACGCATACCTATCTATAAACG GACAA TGTTTATAAATGAGTTTGCATGGTC TTGAATTGTATTAGT  66 109
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   SAPIG1903 1997707 .. 1997717 +  -2.6  -2.53747   AAGCTCGAACGGGTA                 TAAT ATG ATTA                 ATATTATAACAATTG  40 56
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   SAPIG1906 1999500 .. 1999534 +  -6.6  -2.99947   AGCAAGGTGTTATTA     TTTGTTTTTAGGCTAT GTA ATAGCTTACAATCAAA     TGTATATAGACCTTG  61 53
   SAPIG1907 2000647 .. 2000687 + -18.3  -5.09426   GCCAATAACACAAAA  CCGAGCGACCGTGGTTTAA AAA TCATACCACGGCCGCTCGG  TTTTTTCGCATTAAA 100 33
   SAPIG1916 2012215 .. 2012225 +  -5.4  -4.63184   GCACCCTTGGATAAT                 GACT TGT AGTC                 TTTTTCAACTGCGTT  70 208
        hemL 2033525 .. 2033539 +  -7.2  -3.80189   AGATTCATTTTATAT               CGTTAA CAA TTAACG               TTTAAATTGATATGT  71 96
   SAPIG1958 2034916 .. 2034954 +    -7    -5.186   ATTAAATTTAAAAAA  GCAGTAAGATTATTTTC AATGAA GAAAATC-TCTTACTGC   TTTTTCTATGTTTTG  84 100
   SAPIG1962 2040116 .. 2040156 + -14.2  -5.21709   ATAAAAAATGAACAA  CCGGGCAGAATGAAAATC AAAAC GATTTTTACTCTGTCCGG  TTTTTTAATGTAAAA 100 71
   SAPIG1970 2047422 .. 2047461 +    -3  -4.35461   TTAAAAACGCTTAAT  TATGCGGAGAAGCACTT TATCGAT AAGTAGT-CTCCGCATA  TTTTAATGCTATTAC  57 37
   SAPIG1974 NONE
   SAPIG1975 2050730 .. 2050757 +  -2.6  -4.86613   GATAATACAATGATT        GGCCAAACTGCA TTGT TTCAGTATTGCC         TTTGTTTTAATTTTA  64 111
   SAPIG1976 2052152 .. 2052185 +  -8.9  -5.25893   TAAATAACAACAAAA     CAGAGGTTTTCGCTA ATGA TTGCTAAGACCTCTG      TTTTTTAGTGTATAT 100 38
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   SAPIG1986 2061318 .. 2061357 +  -5.9  -5.46698   TATTATTTTGCTTTA  CGGAGATCACTAGATTCA TTTTC TGAATC-ATTGATCTGCG  TTTTTTCATTTTCAA  85 120
   SAPIG1987 2062183 .. 2062227 +  -9.4  -3.48861   AGACTAAATAAAATA CTCCCTTCAAAGTAAGCATT GTAAA AATGTAAACTTTGCAGGGAG CTTTATTTTATATAA  79 40
        putP 2072485 .. 2072524 + -11.7  -5.33331   TTAACAAATTAAAAA  GGTACTAATGTTAATCA AAATTA TGACTAACATTGGTACC   TTTTTATTATCTTTA 100 51
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   SAPIG2009 NONE
   SAPIG2010 2088612 .. 2088651 +    -8  -5.00611   TAAATAAAATAAAGA  GTCAACCAAGGATTAA AATAGGAA TCCATCCTTGGTTGAC   TTTCTTTTGTTTGTA  88 66
   SAPIG2013 NONE
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   SAPIG2017 2096891 .. 2096938 + -13.8  -3.63489   TAAAAAATCTAATTT AATAGGGTTCAAACATAATTTA TATA TGTATTATGTTTGAACCCTATA TCTATTTATTTTTTA 100 24
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   SAPIG2021 2100748 .. 2100780 + -16.7  -3.89572   TGTAGTATCACTTAA      CACTATTTAAACTTT TAA AAAGTTTAAATAGTG      TTCTTATAATTACCT 100 26
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   SAPIG2050 2124031 .. 2124069 + -10.5  -5.49234   TTACAATAAGACAAA   CTTTGAGGTTGGGAA AATTTAAAA TTCCCAACCTCAAAA   TTTTTTATTAAATGT 100 43
   SAPIG2057 2129911 .. 2129944 +  -2.6  -5.93252   GATAATTAATTTCAA     CCAATAATCTGA TGAGTATGAC TTGGATTATTGG      TTTTTTATTTTTAAA  85 36
         sph 2133640 .. 2133668 +  -8.2  -5.29445   TCAACTAACTAATAA       CTCGCTTCGTTCT AAAA AGT-CGAAGCGAG        TTTTTATTGTTAAAA  93 44
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   SAPIG2430 2505833 .. 2505843 +    -4  -3.10112   AACCGTTTGCATAAA                 TCAA ACC TTGA                 TTCACTAACTTAAGT  49 2
   SAPIG2431 2507229 .. 2507244 +  -4.6  -2.55811   TAATGCTGAAATACC              TGCGGC AGAT GCCACA               CCTTTTAACTTTTTA  47 408
   SAPIG2433 2508997 .. 2509009 +  -2.7  -3.88062   GTTCAGCAATTCATA                CTTTG TAC TAAAG                TTTACTATAATCTAT  52 82
   SAPIG2434 NONE
   SAPIG2435 2513167 .. 2513205 + -10.5    -4.788   TATAACAGTATTTCA   GACACATTTTATTCACA TTTAT TGTGATTAAGGTGTGTC   TTTTTAAATTAATTT 100 166
   SAPIG2436 2513699 .. 2513742 + -15.7  -5.42259   TATAAGATATTAAAA GCAGCAGTAAGAT-GTTTTC TAATT GAAAATTATCTTACTGCTGC TTTTTTTGAGAATAA 100 64
   SAPIG2439 2516711 .. 2516723 +  -4.9  -4.08706   TACTCATATAATGAC                TTTGT AAT ACAAA                TTTATATAATGGAAG  62 212
   SAPIG2440 2517194 .. 2517243 +  -6.1  -3.00017   AAATGAATACATTAC TAAAGCCTTAATGTCATG-CTA CTAACGT TACACATGGTATTAAGGCTTTA TCATTTAAATTTAAA  59 50
   SAPIG2442 NONE
   SAPIG2443 2520834 .. 2520880 + -14.7  -2.59569   AAATATATTTCGAAA CATACAAAAGCGCCAGAAGATA ATCA TTTCCTCTGGCGC-TTTGTATG GTATTAATTTCAAAC 100 215
   SAPIG2462 2542150 .. 2542175 +  -7.7  -2.80464   TTCAGGATCAAGCGC         TGATGTTGGTT CATC AAACAACATCA          CTTTAGGATTCATAG  64 356
   SAPIG2470 2550004 .. 2550035 +  -9.5  -5.46698   AACCGTGATTAAAAA      GAACCGTTGATTC TCAATC GAATCTGCGGTTC       TTTTTTCATTTTCCA 100 97
   SAPIG2471 2551420 .. 2551448 +  -6.8  -5.09173   AATCATTTTATAAAA        TCCTGGGACA CTTCATACT TGTCTCAGGA        TTTTTTAACATATTG  83 48
   SAPIG2472 2551614 .. 2551630 +  -3.8  -4.21275   AATAAATATTCTCAA              GTTAAT AAATA ATTAAC              TTTTAGATGGATTCA  60 53
   SAPIG2473 NONE
   SAPIG2474 2553896 .. 2553937 + -12.5  -3.27523   ACAATAAATAGCTAG TAAAACACGGTCGCCAACAG TAA TTGT-GACGACCGTGTTTTG ATTTATTATCTTAGT 100 30
   SAPIG2484 NONE
   SAPIG2485 2566831 .. 2566849 +  -3.3  -2.53015   TGCACATAAAACGTA             TATAATT TACAT AATTATA             TAAATTAAGGAGTCT  42 175
   SAPIG2486 2568097 .. 2568132 +   -12  -4.11906   ACTTCAACATAATTA    GAACCCTAGCAAAGAT ATCT ATCTTTGTCGGGGTTC     TTCTTTATGAATTAT 100 42
   SAPIG2488 2569474 .. 2569511 + -12.3  -3.24019   TCGCGTGTGTAAAAC   ATAAAATGCGCAAA-CTG GGT CAGGTTTGCGCATTTTAA   ATTTCTATTATTTGT 100 54
   SAPIG2490 2572024 .. 2572052 + -13.3  -5.47399   AATTTAAACATCTCG        CTCTAGTATCAGT TCA ACCGATACTAGAG        TTTTTTTGAAATTAA 100 39
   SAPIG2491 2574243 .. 2574288 + -13.5  -4.91109   CAAGACATAACAACA CCCCGTACATATGAGACAA AGTCATTA TCATCTCATATGTACGGGG TTTTTATAGTCAACA 100 42
   SAPIG2493 2578150 .. 2578166 +    -3  -4.15703   GGTTGAATATCAATA              TTTGGT TCAAC ACCAAG              TTGTTCTTTATACCA  57 250
   SAPIG2503 2588703 .. 2588731 +  -2.5  -5.79595   CAACACACACATTAA       CCAACCATTGAT TTCAAC ATCT-TGGTTGG        TTTTTTATTTTGAAA  81 63
   SAPIG2504 2590335 .. 2590362 +  -4.1   -4.3467   ATCGCATCTAAAAAA        GCACACCTG AATTTGATAA CAGGCGTGC         TTTTCATATGAGAAT  61 45
   SAPIG2509 2595523 .. 2595571 + -10.6  -4.00934   TTATAACATAAAAAT GCCCTCAG-ATAAG-ACTAAGGTT ACA AACCTTAATTCATATTCTGAGGGC TTTAATATTTGAAAT  93 42
   SAPIG2511 2598234 .. 2598275 + -11.8  -4.48299   CATACACATCAAAAA GCACACTTAAAAGTCAGT ATCACA ACTCACTTTTAAGCGTGC  TTTATTTAGATATAC 100 67
   SAPIG2523 2611864 .. 2611897 + -12.6  -3.16079   AGGGATAAATTAAAA     TGCCACTATACAAG ATTCGA CCTGTATAGTGGCA      TGATTTGTTATGATA 100 51
   SAPIG2529 NONE
   SAPIG2530 2616356 .. 2616387 +  -4.5  -5.04222   TTGAATTAAAATAAA      TGGTTGTTTTTGT TGCTAT ACAGAATCAGCCA       TTTTTAATTTAATTC  75 269
   SAPIG2536 NONE
   SAPIG2537 2620553 .. 2620575 +  -7.2  -3.00259   AATCATCACTCCAAT           GTTTATATAG TAT TTATATAAAC           TCTCTCGTCTCTCTA  64 371
   SAPIG2546 NONE
   SAPIG2547 2629815 .. 2629832 +  -2.1  -4.42386   AAATTAATGCGATGA             TTTTTAG CTAA TTAAAAA              TTTTATACATCGAAA  56 15
   SAPIG2548 2631230 .. 2631247 +  -4.1   -4.0896   GCTAGGTTTGATGGT             GCC-GTAC CTT GTGCTGGC             TTTTCAACAAACTTT  62 428
   SAPIG2552 2635349 .. 2635370 +  -4.5  -4.32482   TCTTATTGATCCAAT           CTAATTTGT ACTT ACAAACTAG            TTTTAAATTCTAACT  64 318
   SAPIG2563 2650570 .. 2650607 +  -3.6  -5.25805   TTCTATAAACAAAAA   GCAGTAAAATCATTCCA TCTAT TGAAATGATTC-ACTGC   TTTTTTAAGTTTATT  73 75
   SAPIG2566 NONE
   SAPIG2567 2654207 .. 2654234 +  -4.8  -5.52384   AAAATCATTTTCAAA        TCCCTTCACC CAAATAAT GGTGCGGGGA         TTTTTTTCATCCAAA  85 90
         fbp 2656588 .. 2656616 + -16.9  -3.36655   CTACACCGAAAAAAA        TCCCCTCACTATT GCG AGTAGTGAGGGGA        TTGGTGTATCTATGC 100 133
   SAPIG2569 2657954 .. 2657993 + -12.4  -3.72324   TTCAAAATCAAAAAA  GCGGGCAGATG-AAAAG TAAAAAT CTTTTCCATCTGTCCGC  TTCTTAATAGAACTG 100 75
   SAPIG2573 2660625 .. 2660648 + -13.2  -5.80003   GGTTAAATAAACCTC          GCGATGGTGC TCCA GTACCATCGC           TTTTTTATTTGTTCG 100 35
   SAPIG2574 2661635 .. 2661663 + -12.6   -5.5112   TTTTTTCACGCAAAA       GCCTGCGATT-CA TTTA TGTAATCGCAGGC        TTTTTTATTGCTAAC 100 64
   SAPIG2576 2663663 .. 2663687 + -12.9  -6.32216   AATATATATTTAAAA          GCAAAGGCGCG CCA TGTGCCTTTGC          TTTTTTTTTGTATAT 100 39
   SAPIG2579 2666655 .. 2666694 + -10.9  -5.29782   ATCATAGATAATTAA  GAAGCATCTATCTGG TACTAATAAT CCAGACAGATGCTTC   TTTTTTATCAATATC 100 449
   SAPIG2584 2671520 .. 2671536 +  -6.6  -3.07891   CCTAAACCATCTAAG              TCACCA TTAAT TGGTGA              TACTTTGTAGTTATC  59 312
   SAPIG2593 2680317 .. 2680340 +   -11  -4.90906   CACATCATCTCATGT          TAGCGCTCTG ATTG CAGGGCGCTG           TTTTTAATGTTATCG 100 59
   SAPIG2594 2681105 .. 2681161 +    -2  -5.54885   CTATATTTACTAATC AAAAAACTTCTATCACGAACGC-TTCA AATTCC TGTATGCG-T-GTGATAGAAGTTTTTA TTTTTTGTTCATATT  74 28
   SAPIG2596 2683982 .. 2684022 +  -7.6  -4.85822   AATACAACCTAAAAA  CAGCAGTACGACAGCTTC TCATT GAAATCGTCTTACTGCTG  TTTTCTATTTATAAT  88 64
   SAPIG2598 2687180 .. 2687209 +    -8  -5.23016   TAGCGTATCAAAAAA      TGAGCATCAGGACG CCCT CG-CCTG-TGCTCA       TTTTTTAAATTATTT  90 53
   SAPIG2603 2693350 .. 2693372 +  -5.4   -3.8591   AGTTATAAATAAAAA           GAGCCAACCG CAA TGGATGGCCC           TTGTTCATTATGAAG  61 342
   SAPIG2607 2696254 .. 2696290 + -19.7  -5.63236   TATAGATGCTAAATA    GAGAGATTGTTGTGCAA TGT TTGCACGGCAATCTCTC    TTTTTCTTTTTAAAT 100 126
   SAPIG2608 2698804 .. 2698820 +  -3.7  -3.43553   TAAAGATGCCTAGAT              TCCTTAA TAA TGAAGGA              TTCGTTGGTGATTCT  50 28
   SAPIG2609 2699774 .. 2699797 +  -5.3  -2.94099   TAATCACACCATTGT          CTAATGCGT CTAATA ACGCCTTAG           TATCTACTAAAGAAC  52 363
   SAPIG2621 NONE
   SAPIG2622 2714957 .. 2714994 +  -6.5  -5.63236   AACTGAATGAAAATA   AGCTTGTCATTAAAA CATAGAGA TTTTAGTGACAAGCA    TTTTTGTTTTTGCGT  90 195
   SAPIG2623 2715673 .. 2715683 +    -4  -3.29263   TAAACTCAAAATATA                 TCAA CAC TTGA                 TTCTAAGGAGGATAT  50 213
   SAPIG2624 2716090 .. 2716102 +  -7.7   -5.1925   ACTGAACGAAAATGC                GCTTG TAA CAAGC                TTTTTTCAATTCTAG  90 180
   SAPIG2628 NONE
   SAPIG2629 2719205 .. 2719216 +  -4.4  -3.11292   GAATGGTGAAATGCC                TTGG TAAT CCAA                 ATTTATGTTACAAAT  49 19
   SAPIG2630 NONE
   SAPIG2631 2721192 .. 2721232 + -12.7  -4.72696   TTCTCTAATAAAACA  GCTTGGACAGTTTTCAAAT TAT ATTTGATGGCTGACCAAGC  TTATTTTTATTTACG 100 48
        pyrD NONE
   SAPIG2640 2729023 .. 2729062 +  -9.4  -4.37506   CGATTATATAAATAA  CCCGAGATTTTAGTATGA TTCA TTTCACTAAAGTCTCGGG   TTTCTATTTGATAAT 100 102
   SAPIG2642 2730701 .. 2730735 +  -2.2  -4.91357   GCTTATGTTATTTAG     CAAGGCAAGCCA CTCTTGATTCA TGGTTTGCCTTA     TTTTATTGTATATTT  63 69
   SAPIG2644 2733216 .. 2733251 + -11.3  -3.77486   TGTATAACAAGAGAA    GGCCACACGCTTGG AATCTTAAA CCAAG-GTGTGGCC    CTTTTTATTATTGAT  95 91
        panE 2736253 .. 2736266 +  -3.9  -2.85351   CGCGTATCAACAAAA               TATGT AAGC ACATA                TATAATATAAAAAGA  45 19
   SAPIG2651 2740433 .. 2740470 +  -8.8   -5.8901   TAAAAATTAAAAAAA  TCATTTCC-CATCTG-AT TAAC ATCCAGATGTGGAAATGA   TTTTTTATTTTATAT 100 38
   SAPIG2653 2742569 .. 2742583 +  -7.2  -4.93296   TCAAGGTTTATGACT               TGAGAA ATG TTCTCA               TTTTTATCATACTGG  85 87
   SAPIG2654 2743652 .. 2743692 + -14.9  -4.24204   ATTACGTAAAAAAAA  TCGGACAGCTGAAAAATCT TTA AGATTTCTCAGTTGCCCGA  TTTTAAATATAGCTA 100 157
   SAPIG2661 2753248 .. 2753281 +  -8.3  -5.58522   GGTGCACGAAATAAA     CGGTAACTTCTATCT CTAC AAATAGAAATTACCG      TTTTTGTTTTATATG  95 94
   SAPIG2676 2771138 .. 2771168 +  -9.8  -5.42265   TAAAGCATAAAAAAA       TTCCCGAGCACT ACAACAA GGTGTTCGGGAA       TTTTTTATGGTTTAA 100 38
   SAPIG2680 2773908 .. 2773935 +  -4.8  -3.39505   AGTCACTGTCCGAAT        CCGAATCCGGAT CTGG GTCTGGACTTGG         TTCTGGATCTGGCGT  55 322
   SAPIG2689 2786046 .. 2786092 + -11.2  -4.47786   TACATAAATTCAGAA AAACAGCAGTGAGATATTTT TCTATTT GAAATATCTTACTGCTGTTC TTTATTTGCATAATT 100 72
   SAPIG2690 2788108 .. 2788138 +  -4.9  -5.58454   TTTGAATACTTACAA       GAATAATTGCC ACTAGTAAC GGTAATTATTC       TTTTTTTAGTATCAA  85 20
   SAPIG2691 NONE
        manA 2791161 .. 2791196 + -11.3  -4.44392   CTAAAAACATAAAAA    TCCACACATTAAGGT GATAGA ACCCTAGTGTGTGGA     TTTCATTTTTATTCT 100 93
   SAPIG2694 2796352 .. 2796380 + -14.6  -3.22496   TCTTATTCAATTAAA        CCCGAGGCATTC AGTTC GAACGCCTCGGG        TCATTTTATATAAAT 100 121
   SAPIG2706 2819456 .. 2819479 +  -2.6  -3.17194   TATAAAATTATTAGC          TATAATAATA AAGT TATAATTATA           TTGGATTGGAACACT  43 110
   SAPIG2707 NONE
   SAPIG2708 NONE
   SAPIG2709 NONE
   SAPIG2710 2823296 .. 2823307 +    -3  -2.56046   CCCTCATAAATACTG                TCAT CAAT ATGA                 TAAGTTACAATTTCA  42 231
   SAPIG2718 2830150 .. 2830166 +    -3  -2.76261   TCATGACGAAAGTAT              CAATAC AATAC GTGTTG              CTTTAAACATTGAAA  43 150
   SAPIG2719 NONE
   SAPIG2720 2832223 .. 2832273 + -10.6  -4.02742   AAGCTATGTTAAAAA CACGCGGT-GGGCGAAATCAGTT TGAATT GACTGACTTCGTTTTACCGCGTG TTTAATATTGTTATA  93 46
   SAPIG2733 2845106 .. 2845138 + -11.5  -5.41941   TTAATATATACGAAA      TGCCAACTATATC ATCTCTA GGTATAGTTGGCA      TTTTTCTTTAATTTA 100 66
   SAPIG2735 2847413 .. 2847448 +  -4.1  -4.62054   TACCTTTCAAAACAC    GCTTTGAAAATCC GATTTATAAA GGTTTTTCAAGGC     TGTTTTTTTTATGCG  65 52
         pcp 2848647 .. 2848658 +    -3  -5.14563   CATAAGTCACATTTA                TAAC ATAT GTTA                 TTTTTTGGTCACCAA  71 494
   SAPIG2739 2850038 .. 2850060 +  -6.3  -6.28401   AATATGTGCTTATTA           ACCGTTAAC AACAC GTTAACGGA           TTTTTTTATTTTTTA  95 40
   SAPIG2741 2855566 .. 2855576 +  -2.6  -4.51743   GGGACAGAAATGATA                 TTTT CGC AAAA                 TTTATTTCGTCGTCC  58 60
   SAPIG2743 NONE
        hoxN 2859089 .. 2859109 +  -2.7  -2.53822   GACAGCATTGAGAGC            GTATTTT TCTATCT AAAATAC            ATCTTGTAAAATCCA  40 153
   SAPIG2745 2860014 .. 2860045 +  -9.5  -4.66163   TAATCATAAAAATAC      GGACGTAACTTAC TTTAAT GTAGGTAACGTCC       TTTTTAAATACACAT 100 38
   SAPIG2747 2861846 .. 2861859 +  -2.4  -3.60006   ATCAGTATTAGGTGG               TGTC TCAAAT GACA                TTTAACCATATCGTT  47 7
   SAPIG2748 NONE
   SAPIG2749 2864076 .. 2864098 +  -9.9  -5.31456   AGATTTTAATATCAA           CAAGTAGCG TTTAT CGCTGCTTG           TTTTTTATGAATTGC 100 84
   SAPIG2750 2864653 .. 2864681 + -14.1  -5.70829   ATGAATCGCTTTGAT        TACCAACAAGGTT CTA AATCTTGTTGGTA        TTTTTTTATGCTATT 100 69
        rpmH 2872209 .. 2872230 - -11.7  -6.02546   TTAAACGAAAAAAAA           GATCACTGA TGAG TCAGTGATC            TTATGCAGATAAAAC 100 26
        rnpA NONE
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        gidA NONE
        gidB NONE
   SAPIG2754 2866622 .. 2866650 -  -4.7  -6.09196   CGTAAAACAAAAAAA        GACAAAGCT GTTATGATCTT AGCTTTGTC        TTTTATGTGTTAGTC  93 64
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   SAPIG2752 2865404 .. 2865425 -  -2.3  -3.32109   TGACATACGACAACA           TAAGGG-TTC GAA GACTCCCTTA           AGACAAACTTGTATG  44 156
   SAPIG2751 2864625 .. 2864645 -  -9.1  -5.18371   TCTTACAAAATAAAA            CGACTCATT ATA AATGAATCG            CTTTGATTACCAACA 100 107
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   SAPIG2550 2631949 .. 2631983 - -11.7  -5.09426   TTTAATTTTAAAAAA     CAGGCTTACTTCATA TAATT TATGAAATAAACCTG     TCAATTTTAGATTGA 100 41
        galU 2630895 .. 2630922 -  -8.6  -5.75342   GTTTGCGAAAAAAAA        TACAACCTTGTA CGAA TACAAAGTTGCA         TTAATATAGAATCAT 100 56
   SAPIG2545 2625505 .. 2625517 -  -3.3  -3.58878   TAATAATACTAAATA                CAGGC AAA GCCTC                AACTTTCTTGAATGA  50 288
   SAPIG2544 2624762 .. 2624773 -    -3  -3.17714   TCAAACTTCTATTAA                TACT ATTC AGTA                 GGTTTGAAATTAATA  45 16
   SAPIG2543 2623705 .. 2623717 -  -4.9  -5.13016   AACTAAAACGAAAAA                TTGTT TTT AACAA                ATGAATTTAATTATA  75 196
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   SAPIG2539 2620764 .. 2620811 -   -13  -4.39166   CTTTAGACATTAAAA GCTTCTAACATGATACGGAATT TGAG ATTCCCATATCACATTAGAAGC TTTTTTGTTGCGGTG 100 95
   SAPIG2538 2620178 .. 2620201 - -10.3  -3.82433   ATAAGCATGACTAAA          GCCACATCC AATATA GGACGTGGC           TTTTAGTATCGTTCC  89 170
   SAPIG2535 2618638 .. 2618650 -  -3.5  -3.03243   ACTTATTTTCCAATA                TTAAA AAT TTTAA                ATACATGTGTATAGC  46 196
   SAPIG2534 2617919 .. 2617965 -  -8.9  -4.55295   TTCGGCATAAATAAA GTTCCCTTCAAAGTTTTCATT TTTTC AATGTCTACTTTAAAGGGAAC ATTTCACCTCTATTA  89 49
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   SAPIG2532 2617048 .. 2617060 -    -2  -3.39327   CCTTTATACTTATAA                TAGA TTGAT TCTA                TTTCTTGCTTAAGCT  45 149
   SAPIG2531 2616302 .. 2616351 - -10.5  -2.79415   TATAAAGCAGATAAT TTTCATTTCAAAACATATTTGAT GTCA ATGAAATATGTTTTGAATTAAAA TAAATGGTTGTTTTT  78 123
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   SAPIG2525 2612817 .. 2612835 -  -6.7  -5.00388   TAAATCAAAAATAAA             GAAGACC CTAGT GGCCTTC             TTTTTTGTCTAATTC  82 34
   SAPIG2524 2611864 .. 2611897 - -14.8  -4.62475   AGGGATAAATTAAAA     TGCCACTATACAAG ATTCGA CCTGTATAGTGGCA      TGATTTGTTATGATA 100 78
   SAPIG2522 2609147 .. 2609158 -    -3  -3.57462   TATGTGATTTTCAAA                GATT AATT AATC                 TCCGATTTAAATGTC  50 115
   SAPIG2521 2608212 .. 2608234 - -12.2  -4.41844   AAAAGTTGCAGAAAA           CAAATCGTAA TTA TTACGATTTG           ATTATATACTATATT 100 414
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   SAPIG2512 2598234 .. 2598275 -   -14  -4.86133   CATACACATCAAAAA GCACACTTAAAAGTCAGT ATCACA ACTCACTTTTAAGCGTGC  TTTATTTAGATATAC 100 166
   SAPIG2510 2595522 .. 2595572 -  -9.3   -5.1523   TTTATAACATAAAAA TGCCCTCAG-ATAAG-ACTAAGGTT ACA AACCTTAATTCATATTCTGAGGGCT TTAATATTTGAAATT 100 127
   SAPIG2508 2593519 .. 2593543 -  -2.2  -3.55261   CTCTAATAAAACATA          TCAAATATAG TATTC CCATTTTTGA          AAAATTTAGTGCCAT  47 218
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   SAPIG2506 2591804 .. 2591855 -  -9.7  -5.07053   AATGACTCCAAAAAA GCACGCACGCTTTATATGTCAG AACAGATAA CTGAC-TACAAAGAATGCGTGC CTTTATAAATATTTT 100 129
   SAPIG2505 2590335 .. 2590362 -  -6.3  -5.09225   ATCGCATCTAAAAAA        GCACACCTG AATTTGATAA CAGGCGTGC         TTTTCATATGAGAAT  81 40
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   SAPIG2501 2585812 .. 2585824 -  -2.7  -3.70676   GACATTTAAAACTAA                CATAC TCT ATATG                ATGTTATTAAACATT  50 97
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        panE 2579078 .. 2579118 -  -5.5  -5.20534   ACCAATCAAGAAAAA  CAGCACCAAGATCATTTCA ATT TGAAAGTACCTTACTGCTG  TTCTTTATTTACTAC  81 110
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   SAPIG1366 1438504 .. 1438515 -    -3  -3.04461   GATTCATCCGGAATA                TCTA CATA TAGA                 TCATACGCAGTATTT  44 83
   SAPIG1364 1436490 .. 1436548 -   -15  -2.51547   TTTTTAGATGAAGAT TAAAAATAAACAAGGCGATTTCTATC ATACTCA GATAGAAGTCGCCTTGTTCGTTTTCA AAGAATTAATTGGCA 100 57
        msrA 1434745 .. 1434783 - -12.7  -5.28778   ATGATTTATAAAAAA   CGGTACAGATAAGAA TATTTAAGT TTCCTATCTGTACCG   TTTTTTAATATTGAA 100 105
   SAPIG1355 1421995 .. 1422033 -  -5.5  -5.26119   TTTGCAAAAATAAAA  TAATCCATCAACTGCAAA AAAA TATGCAAT-GATGGACTA   ATGTCAAAAAATTGT  81 40
   SAPIG1354 1421282 .. 1421293 -    -3   -2.9082   ATAGCAAAAACGAAC                TTGT TCAT ACAA                 CATCAGATGTGCTAA  44 106
        mscL 1414426 .. 1414439 -  -3.8  -4.30177   CATTAGATCAAGAAA               CGCT TGAAAC AGCG                TTAGACACTTTATTA  62 240
        lexA 1405568 .. 1405596 - -13.3  -5.14682   TTAGAATAAATAAAA        CCTCTTGAAAACG AAA CTTTTTCAAGAGG        TCCAAAATTTATAAA 100 85
   SAPIG1335 1398918 .. 1398954 - -13.1  -5.20216   TACACCATTAAAAAA    GCGGCAAATGCTATAGA TAA TCTAAAGCATCTGCCGT    GTGGGAATTTATTTA 100 38
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