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        fusA 1021056 .. 1021078 + -12.1  -2.77899   GTTAAAAACCAAGTG           CTCATGGAG CGACC CTCCATGAG           TAGTTAATAAAGGAA  87 75
         tuf 1022311 .. 1022328 + -10.5  -5.71712   TTTTCAGTGAAAAAA             GCGCTCC TTTT GGGGCGC              TTTTTTTATATCCAA 100 45
NE421_RS04985 1023395 .. 1023410 +  -6.8   -5.9218   GAAAGTAAATGAAAA              GGGCTG TTAA CAGTCC               TTTTTTTATTGTCTA 100 44
NE421_RS04990 1024507 .. 1024523 +  -9.5  -5.89827   AAACTGACTGGAAAA              GAGCAAT TTA ATTGCTC              TTTTTTTTACTCGTT 100 43
        rimI 1025547 .. 1025559 +  -6.3  -3.28416   CATCGGCATGGCGCT                CGTTA ATG TAACG                TTCATATAGATCATA  60 519
NE421_RS05015 1031052 .. 1031065 +  -8.1  -5.37345   TACAGTTAAAATTAA               GCCTC TTCG GAGGC                TTTTTTATGGTTAAA 100 45
        rhtC 1031819 .. 1031833 +  -7.1  -5.93252   TTAAATAAGAAAAAA               GCCTC TTTAT GAGGC               TTTTTTATTTTTAAG 100 43
NE421_RS05055 1037127 .. 1037140 +  -8.1  -5.64274   TTATTGTTTCAAAAA               CCACC TTCG GGTGG                TTTTTTTATGGGTGA 100 49
         rep 1039314 .. 1039336 +    -2  -5.54079   AATATTTGGCAAATT           TAAAAGCTTT ATT AAAGCGTTAA           TTTTTTAATTTTTAG  74 3
         dut 1039837 .. 1039861 + -12.3  -4.62471   AAAAAATAATGAAAA          GAAACGCTTGT TTT ACAAGTGTTTC          TTTTTACACCTTGAA 100 50
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        argB 1042377 .. 1042393 +  -4.4  -5.63504   TATTTTTTATTAAAA              GATCAC GCTAA GTGGTC              TTTTTTTATGCCATT  83 48
NE421_RS05080 1043253 .. 1043264 +    -3  -4.04187   ACAAAATGGCTCAGC                GATA AAGT TATC                 TTATATTTTGTAATA  55 21
NE421_RS05085 1044271 .. 1044302 +  -4.7  -4.93547   TTTTGTTTATTTAAT      AATAAAGTATTTT GTTTAA AAAATACTTTATC       TTTTTAGTTGGTTAA  75 82
NE421_RS05090 1044959 .. 1044983 + -11.5  -5.88565   TATACAGTTAGCGCG          GCAAACTATCG TTT CGGTGGTTTGC          TTTTTTTATTGTGCA 100 62
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NE421_RS05100 1046472 .. 1046496 +   -10  -5.05606   GCTCAATAAGCAAAA          CCCCTCAAGT ATTTC ACTAGAGGGG          TTTCTTTTTATTAGA 100 32
         fur 1047499 .. 1047520 + -11.7  -5.24129   AAAACAAATAAAAAA           GGAAGGTTA CGTT TAACCTTCC            TTTTTTATGAAGAAA 100 57
NE421_RS05125 1050709 .. 1050729 + -16.9   -5.0925   GCAGAATCTAAAAAA            GCCCCGACA GGA TGTCGGGGC            TTTTTAGTTTTAACC 100 196
NE421_RS05140 1056263 .. 1056288 + -10.5  -2.53382   ATAATTAATATGAAA         TAGCCACCG ATAAGAGG CGGTGGCTA          TAAATTAAAAATAAT  79 37
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NE421_RS05155 1058570 .. 1058583 +  -3.1  -3.41602   GAATATGCTTTGGCA               TCAAC TAAT GTTGG                TTGTCCTAGCATAAG  48 66
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         ggt 1066573 .. 1066590 +  -7.7  -5.60993   CAAACTTTAAAAAAA             GCTGTCA TTTT TGGCAGC              TTTTTTTATAAGGGG 100 43
        ssrA 1067125 .. 1067148 + -10.4  -5.68039   TATATAAGACTAAAA          GCCTTAACTA TCAA TAGTTAGGGC           TTTTTTTATGCCTTT 100 73
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        pgaD 1097310 .. 1097334 + -17.3  -4.18094   AGTACATTTATAAAA          GAAAGCCCACA TCA TGTGGGCTTTC          TTTTACGCTAATTTC 100 41
        pnuC 1098999 .. 1099011 +  -3.3  -3.90291   AGAAAGCAGAACTTA                GGTGC TGG GCAGC                TTTAATTGGGAGAAT  54 8
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         def 1116112 .. 1116132 +    -4  -4.11371   ATATAATTTTAATAT            TATCAGCA GGTTG TGCTGAAA            TTTTGCGCGATGTTG  58 140
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NE421_RS05480 1133879 .. 1133898 + -10.8   -3.6445   TAATTGCACAAAAAA            GCCCAATT CTAA AATTGGGC             TTTCAACGTTATTAT  89 38
        nfuA 1140563 .. 1140575 +  -3.3  -5.55769   AGTGAAATAAAAAAG                CCTCG CAA TGGGG                TTTTTTATTATCCAA  79 56
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        mtgA 1151365 .. 1151388 +    -4  -5.85011   ACCCAGATTCCTGAA          TAACACTGTCT TAA AGAT-GTGTTA          TTTTTTTAGTTTTTA  86 23
        ppk1 1153561 .. 1153591 +   -15  -3.11999   AATAAAAAATTATTT       TTAAAAAGCCGATA TCA TGTCGGCTTTTTAA       TTAACTGAATTTCAT 100 36
NE421_RS05570 1154388 .. 1154403 +    -9  -5.85737   ACAGTAAAATAAAAA              GGAGTC CGAA GACTCC               TTTTTTTATTCATGT 100 34
NE421_RS05595 1158834 .. 1158849 +  -6.2  -3.25719   ACAGCTTTTCCTGTA              CTTGAT ACAT ATCAAG               TTGCTCGTCTCCTAA  58 217
        lysS 1161009 .. 1161024 +    -9  -5.49234   TTCAATACAGAAAAA              GGCAGT TTAT ACTGCC               TTTTTTATTAACTAT 100 48
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        cysD NONE
        cysN 1165578 .. 1165591 +  -9.5  -5.83226   AATAAGTTCTAAAAA               CCCGC GTAA GCGGG                TTTTTTTATTGAGTT 100 50
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NE421_RS05920 1224048 .. 1224076 + -10.5  -4.00476   ATTTCTTAAAGTAAA        GGTACTATTTC TAAGGAT GAAATAGTACC        TTTATGCTCAATTTA  91 43
NE421_RS05945 1229597 .. 1229614 + -11.3  -3.70689   TTTAAGTATAAAAAA             GCCACCT ATTG AGGTGGC              TCTTTTGACCTTATA  93 47
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NE421_RS05960 1233590 .. 1233614 + -11.6  -5.76633   TAAAGTAGTAAAAAA          TGCAGTAAGA TTATT TCTTACTGCA          TTTTTTTATGTCTGA 100 151
NE421_RS05965 1234875 .. 1234896 + -13.1  -4.16182   CCAATGATAAAAAAA           TAGCCTGTC AAAC GACAGGCTA            TTTAATTTATGCTGC 100 53
NE421_RS05975 1236496 .. 1236509 +  -6.7  -3.41569   TAATGAGATACTTCT               GGATG ACTT CATCC                TGTTTGCGTACCTGA  62 254
NE421_RS05985 1239228 .. 1239250 +  -9.2  -3.62572   AGCATGTTCAGCTAA           GCAGGATG ACCACAA CATCCTGC           TTTAGAATCATGATC  80 305
NE421_RS05990 1240283 .. 1240313 +  -6.2   -3.2665   TTATGATATTAAAAA       TAGAGAACACGACT ATC AGATGTATTCTCTA       TCTTGTACAGTTTGA  61 35
NE421_RS06015 1244528 .. 1244545 +  -4.8  -5.60993   AAATATGAAAACAAA             GTCTGC CATCGA GCAGGC              TTTTTTTATGCACAA  85 190
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NE421_RS06025 1246055 .. 1246072 +  -7.7  -5.61596   TAAAAATTATTAAAA             CCATAGC TTCG GCTGTGG              TTTTTTTATGCCCAT 100 112
NE421_RS06030 1247365 .. 1247376 +    -3  -3.28712   AGCAAGGGGTAATCA                GTAA AATT TTAC                 TTATAGGACAAACAA  46 210
NE421_RS06035 1248309 .. 1248322 +  -5.3  -5.77853   GACCTAGTTAGAAAA               GAGTA CTTG TACTC                TTTTTTTTGCAGATT  91 45
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NE421_RS06055 1254755 .. 1254785 +  -7.6  -3.73402   TCAAGAAAATCAAAC       GAAGCTGCTAAACA GGT TGTTTAGGGGCATC       TTTAATGACAAATAT  73 2
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NE421_RS06070 1256542 .. 1256568 + -16.8  -3.20723   TTAAGTTTTGATCAA         TCTCCTTGGAAT AAT ATTCCAAGGAGA         TTCAATTGCTAAAGA 100 37
NE421_RS06075 1257957 .. 1257967 +    -4  -3.41422   AAAGATTCCGTTTGT                 TTGT TGT ACAA                 TTATAAGCTTATTTT  51 64
NE421_RS06080 1258145 .. 1258169 + -14.5  -4.18494   CATTAATAATAAAAA          TGAGTAGAACA TTT TGTTCTACTCA          TTTTGAATAACGATC 100 35
        dmeF 1259469 .. 1259480 +  -4.4  -2.83504   AGGAAATTTGAACAA                CACT TATA AGTG                 ATATTTTGCTCCCCA  49 66
NE421_RS06095 1260726 .. 1260759 + -15.6  -5.05079   GTGGGACCACCTCTC     TGTTTTAGTTGGAC AAATAA GTCCAACTAAAACA      TTTTTATATAGTTAT 100 88
NE421_RS06120 1266417 .. 1266443 + -13.8  -4.62772   AAATTATTTTTCAAA         GCTAAGTCACGG TTA TCGTGGCTTAGC         TTTATTTCATTTGGA 100 54
NE421_RS06125 1267799 .. 1267836 +  -5.9  -3.57144   AATGGAGAGGTGTTA   TTATTGCAAATATAT GTTTATCA AAATATTTGCAATAA    TTTAGAAGTGAAAGA  62 79
NE421_RS06130 1269885 .. 1269910 + -11.3  -2.66452   TGGGGATTTTAAATA         TGAGCTTATTC ATTT GAGTAAGCTCA          GTTGATTCTCGAAAT  86 56
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NE421_RS06140 1272224 .. 1272246 +  -6.3  -4.78572   AATAGTATATTTGAA           GAGCTGTCT GGTTG AGGCAGTTC           TTTTCTTAATTGAAG  80 81
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NE421_RS06165 1277954 .. 1277981 +  -7.1  -2.84687   AAGCATTCAGCTAGA        GGCTGTTAACT TCCTAC ATTTAACAGCC         TCTAATACTCATTAG  63 39
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NE421_RS06175 1280585 .. 1280629 +    -2  -3.21416   TAGATCTGACCGCAG TACTTTATTTGCTGCGGGCG GGTGA CTCACGCCGCAAAAAAGGAA TTGATCATGAGCGTA  44 66
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NE421_RS06185 1281815 .. 1281849 +  -7.3  -3.18366   ATGGTGTTGTATTTT     TAAAACGTTAGCG CTGATTTGT CGCTAACGCTTTA     TATGTTGATTAAGCA  66 15
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NE421_RS06200 1283818 .. 1283834 +  -5.1  -5.28166   GAGGCAAGGAAGCCT              CCTCTGT TCA ACAAAGG              TTTTTGTTACTTTTG  79 116
        pcaF 1285849 .. 1285900 +  -3.5  -3.60569   AAATGTTGTCTTTTT CTTCA-AGATATAAGTTGAATATA TTGAT TATATTTAATTTATATGTATGAGG TGTTTGAATTTTTTA  52 519
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NE421_RS06230 1289753 .. 1289765 +  -7.7  -3.50832   ATCATATTATTTCTT                CCGTT TAA AACGG                TATTTACATTTCAAG  71 178
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        astA 1302250 .. 1302262 +  -3.5  -3.02233   GGAATTTATAAGGTT                TTAAA TGA TTTAA                TAATATTTTTAACAT  46 310
NE421_RS06290 1303880 .. 1303894 +  -7.1  -5.01497   AAACCAATAAAAAAA               GCCTC ATTAC GAGGC               TTTTTCTATAATGGT  88 78
NE421_RS06300 1306560 .. 1306576 +  -3.7  -4.82212   GTATCGAATACAGTA              CCTAAAT TAG ATTAAGG              TTTGTTTATTATTTA  66 16
        gudD 1312239 .. 1312256 +  -9.1   -5.5353   AATATTGAATTGATA             GCTGTCC TTTG GGGCAGC              TTTTTTATTGCTATA 100 61
        kdgD 1313255 .. 1313274 +  -2.9  -2.86828   ATTTGGCTGCTCTCA            TTGC-GAC ACTTG GTCCGCAA            TAATTCTAACTGTTT  43 3
NE421_RS06330 1314901 .. 1314929 +  -8.3  -4.21792   CAAATTTAAAAATGG        TGCAGCTTAAT CAAGAGT ATTGAGCTGCA        TATTTTTTAACTTAT  83 32
NE421_RS06335 1315878 .. 1315896 +    -6  -4.73108   GATTAAGATAAAAAA             GAGAGC CTGTTTA GCTCTC             TTTTAATTTTATAAG  74 53
        mhpT 1327058 .. 1327079 +  -9.5  -3.66095   TAAGTTTTAACGAAA           GTATGGGGT TAGA ACCTCATAC            TTTCACTACAGATTT  82 38
NE421_RS06385 1327631 .. 1327649 +  -3.2  -3.16564   CACACAGAAAATTGA             TTTCATTT TGC AAATGAAC             TTGCTAGCATCGAAG  45 82
NE421_RS06390 1328382 .. 1328407 + -12.1  -3.66356   CACTTAAAGTGAAAA         GTTCCTTTATT TTTG AATAAAGGAAC          TTTCGAGTTAAAGCT  95 34
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NE421_RS06425 1337593 .. 1337628 + -11.3  -4.26019   TTAAATATTAAAAAA    GCAGGTTAAAACCTT TTATTT GAGGCTTTAACCTGC     TTTTGGATGTGGTTA 100 37
NE421_RS06450 1343909 .. 1343932 +  -5.4  -3.14686   TAAAGCTTAGTTGCT          TACTGATTTT TTCT AAAATCGGTG           CTTTCTTGGCTTGAA  54 92
NE421_RS06470 1347924 .. 1347946 + -10.7   -4.2237   CCTCAATTAAAAAAA           GCCAACTTA AAGTC TAAGTTGGC           TTTTAACATTAGTTT  95 53
NE421_RS06495 1353526 .. 1353551 +  -7.6  -4.96106   AAATGCGATAAAAAA         CACCTGCATA TACTTC TACGCAGGTG          TTTTTACTATTTATG  89 54
NE421_RS06505 1355800 .. 1355815 +  -3.3  -2.94532   AATTACTGCCGTCTC              CCTAA AGTTTC TTAGG               ATTTACTATGATTTT  45 68
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NE421_RS06515 1358241 .. 1358265 + -10.8  -4.88228   AATTAATTTATAAAA          GCCCACTTTA TTGAT TAAGGTGGGC          TTTTTACTATTAAAT 100 39
NE421_RS06520 1358938 .. 1358958 + -10.5  -5.56264   ACGTATAGTAAAAAA            GCTGCATAG GGG TTATGCAGC            TTTTTTGTGTTTCAA 100 140
NE421_RS06525 1360533 .. 1360551 + -10.3  -5.65927   AAGGAAATTATAGAA             GGGTGTG CTTAC CACACCC             TTTTTTCTTTAGATG 100 93
NE421_RS06530 1361586 .. 1361602 + -10.1  -5.53288   TCTAAATAAAAAAAA              CCGCCTG TGA TAGGCGG              TTTTTTTACATTGAA 100 36
NE421_RS06540 1362829 .. 1362850 + -10.2  -4.05402   TTAAGCATTAAAGAA           GGCCGATT CATATA AATCGGCC            TCTTTTTCATTGGAG  90 49
        rnhB 1363907 .. 1363944 + -12.9  -5.03713   CTTTCCGTTTAATAT   AACAGAGCCGCTATA AAAAAAAC TATAGCGGCTCTGTG    TTTTCTTTGATTATT 100 495
         gap 1369496 .. 1369511 +  -6.1  -5.71712   CTACACTAAGAGAAA              TCGGG TGTGTT CCCGA               TTTTTTTATGTGGGG 100 236
NE421_RS06570 1370731 .. 1370755 +  -7.9  -3.76413   GAAAAGATTTAAACG          CCAGCAGTAAG TTT TTTACTGATGG          TTTCCAATTTTAACA  73 29
NE421_RS06575 1372130 .. 1372146 + -10.1    -5.626   GCAAAGATAAAAATA              GCCTCCT AAA AGGGGGC              TTTTTTTATACCCTA 100 44
NE421_RS06580 NONE
NE421_RS06585 1373473 .. 1373502 + -14.5  -4.56597   TTATAGAACTGATGT       TAAAAACGGATGC TTGA GCATCCGTTTTTG        TTTTTAAGGAGCAGG 100 51
NE421_RS06605 1376315 .. 1376332 +  -6.3  -5.67063   CCTAAAAAATAAAAA             GCTAACA GTCA TGTTGGC              TTTTTTTATGATAAG  93 56
NE421_RS06610 1376871 .. 1376887 +  -4.3  -3.64716   CCCCAATGTAAATGG              GGGCCTG TGA CACGTCC              TGTTTTACCGACTAG  56 95
        clpB 1380508 .. 1380529 + -10.3  -5.71983   TGCTAAAACCGAAAA           GAGAATATG GAAA CATATTCTC            TTTTTTTATAGTTAA 100 49
NE421_RS06630 1381691 .. 1381724 + -14.2  -3.11222   AAGAATGTACATGGT     GAAGTTATCATTAC CGTGAA GTAATGATAACTTC      CTTTTCAAATTCAGA 100 2
NE421_RS06640 1384537 .. 1384566 +  -7.3  -3.89348   AGGTAATATGAGCAC       GGCTCTAAATT TTCTGGTC AATTTAGGGCC        TTATTCTGTAAAGTT  72 35
NE421_RS06645 NONE
NE421_RS06650 1386950 .. 1386974 +   -13  -4.43844   GATATAAAATATAAA          CAGGTAGATC ATAAA GATCTACCTG          TTTTGTAAATACTAG 100 60
NE421_RS06655 1388579 .. 1388597 + -11.8  -5.61596   TCTAATTTGAAAAAA             GCTTCTCA TTT TGAGAAGC             TTTTTTTATAGAAAT 100 60
NE421_RS06660 1389502 .. 1389534 +  -4.9  -3.28712   GTCGACATGTTTAAG     CGCTGGATGGTCAA AAGGAG TTG-CTTTCCAGCG      TTGTACAGACAGCCC  54 117
NE421_RS06675 1393623 .. 1393639 +  -2.3  -2.78237   TATTAGGTAGTGTAA              GTAATTT ATA AATTTAC              GCTTTTTTACAATTA  40 129
NE421_RS06680 1394343 .. 1394401 + -12.7  -3.36749   TAATTTCATAAGCAA TTTTCAAAAGCATTAAAAAAGCCCCTA AGCAA TAGGGGCTTTTTTAATGCTAAAGCGAA TTAGTGTTGAGCATC 100 30
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NE421_RS06700 1397622 .. 1397640 + -13.2   -5.4588   TCATATTCCAGTGGG             GGCCTGTT TCG AACAGGCC             TTTTTTATAATTTTA 100 59
        hrpA NONE
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NE421_RS06820 1424250 .. 1424286 + -11.2  -4.00934   TGCTGAAAATCAACT   TTTGGTTTAAGATCATG ACAG CA-GGTCTTAAACCAAA    TTTAATATTTGAGGT  93 44
        cueR NONE
NE421_RS06830 1425370 .. 1425384 + -11.4  -5.22794   CAACGTTGCAGAAAA               GCCCGT GAA ACGGGC               TTTTTTAATGCTTAT 100 252
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NE421_RS06895 1434526 .. 1434545 +  -2.1  -5.38047   AATATAGTTAAAAAA            CCCAC TTCTTCCTTT GTGGG             TTTTTTATATGGATA  71 112
NE421_RS06900 1434952 .. 1434974 +    -5  -3.17212   TTAATTACATATTTT           TAACAATTTA GAT TAATTTGTTA           TTCATAAAGTCATAA  52 110
NE421_RS06905 1435981 .. 1436017 + -12.6  -5.40072   TAGCTGATTACAAAG    TACCTTCCAAATATTA ACACC TTATATTTGGAAGGTA    TTTTTTTAACCACCC 100 44
NE421_RS06915 1437236 .. 1437251 +  -8.2  -6.23545   GATAATATTCAGCTA              CCGCCT TCTG GGGCGG               TTTTTTTTATTTAAC 100 80
NE421_RS06920 1437897 .. 1437908 +  -2.2  -2.54896   GAAAAATAAAGTGCA                CCTT TGTA GAGG                 TAACTTACATGAAGA  39 103
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        htpX 3285489 .. 3285512 +   -14  -5.28481   CGTTTAATGTAAAAA          TAAAGCCTCC AAAT GGAGGCTTTA           TTTTTTGATTACATG 100 43
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        rpoD 3364533 .. 3364552 + -11.4  -3.62096   AGAAAGAGCTATAAA            CGCCTGCG ATGA TGCAGGCG             TTTCACATGATGAGG  93 82
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        lipB 3365726 .. 3365743 +  -7.1   -3.1243   TGGAATAAAAATATA             TTAGAGT AATT ACTCTAA              ATTTGCTTTTGCATA  64 53
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