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 ant(3'')-II  150451 ..  150466 +  -3.2  -5.87996   CATACGGCTATATAA              GATTGC TTAA GCACTC               TTTTTTTATTACTTA  81 82
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        cysK  193415 ..  193446 + -13.3  -3.98816   ATAAAATTAACCATA      TAAAAAAGCCCAT GAATAA ATGGGCTTTTTTA       TTTAATCTTAATTTA 100 37
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BV884_RS05980 1226036 .. 1226081 +  -4.3  -3.93148   ATGTCAGTTGAGGAA GGTATA-AGCTTGTATTGATTA ATT TAGTTGATTTAAGCTATATACC TATTTTTAAAATACT  58 19
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BV884_RS05990 1226617 .. 1226630 +  -8.1  -5.14563   TTGCATAAATTAAAA               CCCAC TTCG GTGGG                TTTTTTAATGGGCGC  93 33
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BV884_RS06010 1228100 .. 1228118 +  -3.2  -2.91924   TCATTTGTGATTACA             TTCTGTTA CAG TAATGGAA             ATTTATAACAAATGG  43 94
BV884_RS06015 1228717 .. 1228731 +  -7.1  -5.77988   ATGTCTTAATCACTA               CCACC TCATC GGTGG               TTTTTTTATGTCTAT 100 81
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BV884_RS06025 1230293 .. 1230309 +  -9.4   -5.4833   GAAACACTTTAATAA              CCCGCT TAAAC AGCGGG              TTTTTTATTGCCTAA 100 29
BV884_RS06030 1231273 .. 1231306 + -11.9  -3.89614   AATCAACTTATTCAG     TAACAAAGCCTATGG AAAC CCATGGGCTTTTTTA      TTTCTAAAAATTAGA 100 39
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BV884_RS06040 1232323 .. 1232335 +  -7.7    -3.617   ATTCTTTTACTCTTT                CCAAG AAC CTTGG                TGTTTGCTTGTATGT  73 247
BV884_RS06045 1232623 .. 1232633 +  -5.4  -2.73124   GGTGAATTCTCAGTA                 GTAG TCA CTAC                 ATTTAGAGAGTAGGC  52 2
BV884_RS06050 1233134 .. 1233147 +  -8.1  -4.65153   TTTATTTGATAGAAA               CCACC TTCG GGTGG                TTTTCCTTTATGTGA  85 46
BV884_RS06060 1234247 .. 1234263 + -12.3   -5.4833   ACTTAAAAAGAACTA              CCCACTC ATT GAGTGGG              TTTTTTATTGCCTAG 100 110
BV884_RS06065 1238606 .. 1238627 +  -9.5  -4.37067   TCGTACTTAATAATT           TGAACCCTT TTCG GAGGGTTCA            TTTTCATAATATTTA  91 31
BV884_RS06070 1239331 .. 1239346 +  -6.8   -5.4833   CCTTATTTCATCAAA              CCACCT TTCG GGGTGG               TTTTTTATTACCTGA  93 78
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BV884_RS06090 1244071 .. 1244087 +  -9.4   -5.4833   TTATAAGAACTTTGA              GCACCC AATTC GGGTGC              TTTTTTATTACCTAA 100 44
BV884_RS06095 1244512 .. 1244525 +  -9.5   -5.1287   TGAAAACAGCTAATG               CCGCC TTCG GGCGG                TTTTTTACATCTGAA 100 28
BV884_RS06100 1245231 .. 1245248 + -11.3  -3.46534   GCATTATAAAAAAAA             GCCCTGA ATGA TCAGGGC              TATTTAATAAACTTC  90 160
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BV884_RS06110 1249673 .. 1249715 + -12.4  -3.25762   AAATATATTTTTAAT TTATATAAAACGAAGCAA AATAGAC TTGCTTCGTTTTATAAAA TGTATTGGTTCTTTT  90 39
BV884_RS06140 1253868 .. 1253897 + -11.6  -3.90608   TTGAAATGTTTACAC       CACATCGCC-CAA GCTAA TTGAGGCGATGTG       TTATTGGTTGTATTT  95 9
        pepP NONE
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BV884_RS06155 1257862 .. 1257882 +  -9.8  -2.55446   ATTTGACCAATTTGG            CTCTTTGC TAAAT GCAAAGAG            ATTGCTAAATTTCTG  74 144
BV884_RS06160 1258215 .. 1258232 +  -9.9  -5.45652   GTTAATATTAAAAAA             GCATCAC TTGA GTGATGC              TTTTTTATTGCCCGT 100 36
BV884_RS06170 1259377 .. 1259413 + -13.4  -4.68424   GCTTAATTTTGATTG   CATAAAAAAGTACCATG TAAG CATGGTACTTTTTT-TG    TTTTTGAATGCATTA 100 35
BV884_RS06180 1261466 .. 1261495 +  -9.4    -3.967   TGCAAAATTTATGCG       CGGTGATGAC ATAGGCATTG GTCATCACCG        TTTAGTTAATAAATT  86 465
BV884_RS06195 1262941 .. 1262953 +  -3.4  -4.09739   TTTACTTTGGATTAA                GAGT TCATT ACTC                TTTTGAGCAAATTAA  56 26
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BV884_RS06205 1264926 .. 1264955 +  -2.4  -3.79519   AGCCATACATATTGG       TTTTATT-GTGAA TAGAT TTCGCCAATAAAA       TTTCATCATCGCCTT  51 356
BV884_RS06225 1272003 .. 1272025 + -11.3  -4.13963   AAGTTATATTCTCAA           CTGAGCCTG CTAGT CGGGCTCAG           TGTTTTTTCGCAAGT 100 62
BV884_RS06230 1273844 .. 1273859 +  -4.8  -3.29461   TAAAGGAAATCCTGT              TATATG GGTT CATATA               TTCTAAAGCGACTTC  54 52
        yejB NONE
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BV884_RS06245 1277530 .. 1277543 +  -5.3   -5.9667   TATTTAAATTTTTAA               TGCAA AAAG TTGCA                TTTTTTTATATTTTT  95 79
BV884_RS06250 1278924 .. 1278952 + -10.5  -4.00476   ATTTCTTAAAGTAAA        GGTACTATTTC TAAGGAT GAAATAGTACC        TTTATGCTCAATTTA  91 43
BV884_RS06275 1284471 .. 1284488 + -11.3  -5.11033   CTTTAAATAAAAAAA             GCCACCT ATAG AGGTGGC              TTTTTTGACCTTATA 100 46
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BV884_RS06290 1288349 .. 1288369 +  -9.7  -5.77988   CGCCAAATTCGAAAA            GCTCCTGTT AAA AGCAGGGGC            TTTTTTTATATCTAT 100 36
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BV884_RS06310 1290217 .. 1290230 +  -5.3  -3.30443   GGGCCTCGTGATACG               CCTAT TTTT ATAGG                TTAATGTCATGATAA  56 30
BV884_RS06315 1291592 .. 1291613 +  -7.9  -3.98172   GTTTGAGCAGAGCAA           GCGCGCGACC ATA GG-CGGGCGC           TTTATCCGTGTTGAT  75 362
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BV884_RS06340 1296484 .. 1296503 +    -5  -2.71712   TTGCAACAGTGCCGA            ATTTAGCG CGGT CGCTAAAC             ATTTCGGCACCACCC  50 80
BV884_RS06345 1296816 .. 1296828 +  -3.3  -4.17296   CCTGAAGCGCGGTGT                CCGGA ATT TCAGG                TTTGTGTCTCTACAA  58 141
BV884_RS06355 NONE
BV884_RS06365 1299215 .. 1299240 + -13.4  -4.96106   AAATGTGATAAAAAA         CACCTGCGTA TACTTC TACGCAGGTG          TTTTTACTATTTATG 100 54
BV884_RS06375 1301489 .. 1301504 +  -6.2  -2.94532   AATTACTGCCGTCTC              CCTAAA ATTT TTTAGG               ATTTACTATGATTTT  58 68
BV884_RS06380 NONE
BV884_RS06385 1303930 .. 1303954 + -14.4  -4.88228   AATTAATTTATAAAA          GCCCACCTTA TTGAT TAAGGTGGGC          TTTTTACTATTAAAT 100 39
BV884_RS06390 1304627 .. 1304647 + -10.5  -5.56264   ACGTATAGTAAAAAA            GCTGCATAG GGG TTATGCAGC            TTTTTTGTGTTTCAA 100 140
BV884_RS06395 1306222 .. 1306240 + -10.3  -5.65927   AAGGAAATTATAGAA             GGGTGTG CTTAC CACACCC             TTTTTTCTTTAGATG 100 93
BV884_RS06400 1307274 .. 1307290 + -10.1  -5.47399   ATCTAAATAAAAAAA              CCGCCTG TGA TAGGCGG              TTTTTTTAACATTGA 100 35
BV884_RS06410 1308517 .. 1308538 + -10.2  -4.05402   TTAAGCATTAAAGAA           GGCCGATT CTTATA AATCGGCC            TCTTTTTCATTGGAG  90 49
        rnhB 1309595 .. 1309632 + -12.9  -5.03713   CTTTCCGTTTAATAT   AACAGAGCCGCTATA AAAAAAAC TATAGCGGCTCTGTG    TTTTCTTTGATTATT 100 495
         gap 1315184 .. 1315199 +  -6.1  -5.71712   CTACACTAAGAGAAA              TCGGG TGTGTT CCCGA               TTTTTTTATGTGGGG 100 236
BV884_RS06440 1316419 .. 1316443 +  -2.1  -3.76413   GAAAAGATTTAAACG          CCAGCAGTAAG TTT TTTACTAATGG          TTTCCAATTTTAACA  47 29
BV884_RS06445 1317818 .. 1317834 + -10.1    -5.626   GCAAAGATAAAAATA              GCCTCCT AAA AGGGGGC              TTTTTTTATACCCTA 100 44
BV884_RS06450 NONE
BV884_RS06455 1319161 .. 1319190 + -14.5  -5.00616   TTATAGAACTGATGT       TAAAAACGGATGC TTGA GCATCCGTTTTTG        TTTTTTAAGGAGCAG 100 51
BV884_RS06475 1323193 .. 1323210 +  -6.3  -5.67063   CCTAAAAAATAAAAA             GCTAACA GTCA TGTTGGC              TTTTTTTATGATAAG  93 56
BV884_RS06480 1323749 .. 1323765 +  -4.3  -3.64716   CCCCAATGTAAATGA              GGGCCTG TGA CACGTCC              TGTTTTACCGACTAG  56 95
        clpB 1327387 .. 1327408 + -10.3  -5.88197   TGCTAAAACCGAAAA           GAGAATATG GAAA CATATTCTC            TTTTTTTATATTTAA 100 49
BV884_RS06500 1328570 .. 1328603 + -14.2  -3.11222   AAGAATGTACATGGT     GAAGTTATCATTAC CGTGAA GTAATGATAACTTC      CTTTTCAAATTCAGA 100 2
BV884_RS06510 1331416 .. 1331445 +  -7.3  -3.89348   AGGTAATCTGAGCAC       GGCTCTAAATT TTCTGGTC AATTTAGGGCC        TTATTCTGTAAAGTT  72 35
BV884_RS06515 NONE
BV884_RS06520 1333829 .. 1333853 +   -13  -4.43844   GATATAAAATATAAA          CAGGTAGATC ATAAA GATCTACCTG          TTTTGTAAATACTAG 100 60
BV884_RS06525 1335458 .. 1335476 + -11.8  -5.61596   TCTAATTTGAAAAAA             GCTTCTCA TTT TGAGAAGC             TTTTTTTATAGAAAT 100 60
BV884_RS06530 1336464 .. 1336476 +  -3.4  -2.61718   TAAACTCAGTACCTG                CAAG ATAGG CTTG                AGTTTTTGCAAGTTG  43 200
BV884_RS06545 1340501 .. 1340517 +  -2.3  -2.78237   TATTAGGTAGTGTAA              GTAATTT ATA AATTTAC              GCTTTTTTACAATTA  40 129
BV884_RS06550 1341221 .. 1341279 + -12.7  -3.36749   TAATTTCATAAGCAA TTTTCAAAAGCATTAAAAAAGCCCCTA AGCAA TAGGGGCTTTTTTAATGCTAAAGCGAA TTAGTGTTGAGCATC 100 30
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BV884_RS06570 1344501 .. 1344519 + -13.2   -5.4588   TCATATTCCAGTTGG             GGCCTGTT TTG AACAGGCC             TTTTTTATAATTTTA 100 59
        hrpA NONE
BV884_RS06590 1350935 .. 1350948 +  -8.1  -5.60993   TAGATTAATTAAAAA               CGCTC GTAA GAGCG                TTTTTTTATGGCACA 100 46
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        cueR NONE
BV884_RS06650 1364438 .. 1364452 + -11.4  -5.17353   CAACGTTGCAGAAAA               GCCCGT GAA ACGGGC               TTTTTTAATGCCTAT 100 251
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BV884_RS06715 1372094 .. 1372136 + -11.6  -2.67981   TCAGCTTATAAAAAA GCCAACTTGCTAAAGCTAT TGAGTT ATAGCCTTA-CAAGTTGGC TCACTTTCATAAAAT  86 30
BV884_RS06725 1373595 .. 1373614 +  -2.1  -5.38047   AATATAGTTAAAAAA            CCCAC TTCTTCCTTT GTGGG             TTTTTTATATGGATA  71 112
BV884_RS06730 1374021 .. 1374043 +    -5  -3.17212   TTAATTACATATTTT           TAACAATTTA GAT TAATTTGTTA           TTCATAAAGTCATAA  52 110
BV884_RS06735 1375050 .. 1375086 + -10.4  -5.40072   TAGCTGATTACAAAG    TGCCTTCCAAATATTA ACACC TTATATTTGGAAGGTA    TTTTTTTAACCACCA 100 44
BV884_RS06750 1376305 .. 1376320 +  -8.2  -5.95539   GATAATATTCAGCTA              CCGCCT TCTG GGGCGG               TTTTTTTATTTAACA 100 80
BV884_RS06755 1376964 .. 1376975 +  -2.2  -2.54896   GAAAAATAAAGTGCA                CCTT TGTA GAGG                 TAACTTACATGAAGA  39 103
BV884_RS06760 NONE
BV884_RS06770 1379885 .. 1379895 +  -2.6  -4.11751   GAAAAATTAACCTTT                 TTTA ACT TAAA                 TTTTGGGAGATTAGT  53 53
BV884_RS06775 NONE
BV884_RS06780 1380445 .. 1380455 +  -5.4  -3.93583   GTGAAATCCCACGCA                 GGAA CAA TTCC                 TTTATGGCTGGATTG  61 37
BV884_RS06785 1381643 .. 1381664 +  -5.9  -5.16572   AAATGCATTTAAAAA           GCCTAGT ATTAATTA ACTAGGC            TTTTTTAAATTGCAT  83 62
BV884_RS06790 1382945 .. 1382970 +  -9.1  -4.87318   CAGCCAATAAAAAAA         CCACCTAATTC TTTC GAATTAAGTGG          TTTTTGAATTTTGGA  93 350
BV884_RS06805 NONE
BV884_RS06810 1386311 .. 1386326 +    -4  -4.73633   GGTAGGCTATTCCTG              CTCATGG ATA CCA-GAG              TTTTATATATTGTTG  65 60
        lptC NONE
        lptA NONE
        lptB 1388170 .. 1388183 +  -4.5  -6.28401   CTGTTTGGTTAAAAA               GAGGT CAAG GCCTC                TTTTTTTATTTTTTA  95 55
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BV884_RS06840 1393215 .. 1393231 + -13.7  -5.33866   AAGATAAGAAAAAAA              GCCCCGA AAT TCGGGGC              TTTTTTATAGGTTTG 100 34
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BV884_RS06890 1402973 .. 1402988 +  -6.2  -2.72217   GACCGATCAAAAATA              TGAGAT GGGT ATCTCA               TGGGTTCTTTAGCTT  57 92
BV884_RS06895 1404780 .. 1404794 +    -5  -2.87319   CGGAGCACTCACCAG               TACTGT TTA GCAGTA               GTTTGCTAGATTGAG  51 43
BV884_RS06900 1406003 .. 1406026 +  -5.9  -4.07885   GAGCACTATCCTTTG          CCTGCTGGC CACATT GCCAGTCGG           TTTTAGCAGGCCGTA  67 203
BV884_RS06910 1407213 .. 1407229 +  -3.7  -5.09259   ATATTTTTGACTTTG              TGGCGAT AAT ATTGCTA              TTTTATTTTACGCTA  69 185
BV884_RS06915 1408994 .. 1409007 +  -6.7  -5.10767   TTTTTTCAATATTTG               CGGAT AGAA ATCCG                TTTTTGTCTTGGCTA  85 398
BV884_RS06935 1412647 .. 1412676 +  -2.8  -5.93252   CAGTTTTTATGAAAG       GCCAAACAGTGC TTTATT GAGGTGTTTGGC        TTTTTTATTTTTGAG  82 43
BV884_RS06940 1412983 .. 1412998 +  -6.2  -4.41494   TGAGACCGTATTAAT              TTTACC AAAT GGTAAA               TTTTAATTGAAAATA  74 27
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        pobA 1538191 .. 1538206 +  -5.4  -5.60993   AAGTAAAAATAAAAA              GGGCAT GAAA ATGCTC               TTTTTTTATAGAAAA  87 46
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        phnW 1545581 .. 1545591 +  -6.8  -2.62714   AACCACCTAAACCAA                 GCTG TAA CAGC                 ATAATTTTTATTAAA  59 11
BV884_RS07570 1546465 .. 1546488 + -15.4  -3.06133   CCAATATATTTTTAA          GCTTAGCTCC CTTG GGAGCTAAGC           TTACCTAAAAAATTA 100 53
BV884_RS07585 1550676 .. 1550729 +  -5.8  -3.79668   GTAGGTGGCTTAGAA GCGGAAGATTAAA-ATTATATTT AAAATCAGA AAATAAAATATTTAATCTTTCGC TTTAATAAGTTAAAT  64 37
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BV884_RS07755 1592209 .. 1592253 +  -6.6   -3.3761   AAATGATCGACCGCA TCAAAGAACAACTACAAACG ATTAA CGTTGTTGGTTGTTATTTGA GTTTTGTTGGCCAGA  65 512
BV884_RS07775 1594927 .. 1594951 +  -4.4   -4.5442   TTCCTTATTTAGGTA          CGTTTAAAAA CTAGT TTTATAAACG          TTTTCTACTTCAACC  68 12
        katE 1597150 .. 1597177 + -12.1  -4.93318   CTTAAATAAAAAAAA        GCCCTGAAAGT TTAAAC GCTTTCAGGGC         TTTTTCTAAATTATG 100 36
BV884_RS07795 1600299 .. 1600335 + -16.9  -4.22535   TAAGCAAACAGTTTT    TGAGAATAAAGGAGGCA TTA TGCCTCCTTTATTTTTA    TTATTTTAAACTTAT 100 38
        umuD 1601502 .. 1601530 +  -3.8   -4.7497   ATATTTATTATTTAA        GTTACCGACCCG AAAAG TGAGTCAGTAAC        TTTTTCCTAAATGAC  68 50
BV884_RS07815 1602793 .. 1602808 +  -7.6  -5.30155   AGATGTAAAAAAAAA              GAAGCT TTAA AGCTTC               TTTTTTAATTGGTAA  91 47
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BV884_RS07860 1612734 .. 1612759 +  -9.7  -2.61383   TTTCGATATCGCTAG         AGCAGTGCCTA AAAG TAGGCGCTGCG          ATTCTAAATAAGACT  74 42
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        madM 1638294 .. 1638314 +  -5.4  -3.83378   TAATCAGGCAAAAGA            GCTGTTGT TATTC GCAGCAGC            TTCTATCTTTTAAAG  61 52
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        pyrF 1792872 .. 1792902 + -11.2  -3.70019   TAAGCCGCTCATCAT       GGCATGTGGTACAT AAT GTGTGCCACATGAC       TGTTTTACCATTGCT  88 88
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        modA 1969127 .. 1969143 +  -3.7  -3.00574   ATGGCTTTAGCGTGT              TGGCT CCAGTCA AGCCA              TGATGTTTTCTCTAA  46 6
        modB NONE
BV884_RS09620 1970502 .. 1970517 +  -3.3  -2.58544   AACTTACGAGAGTCG              GAGTT ATAGAG AACTC               ATTCTGAGCCTGCGG  44 67
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BV884_RS09635 1973258 .. 1973284 +   -11  -2.66602   AAACTGTTATAAAAA         TAAAGGACAGCA TCA TACTGTCCTTTA         TGCATTCTTAAATGA  82 50
        ppk1 1977471 .. 1977499 +  -8.9  -4.18697   CTGGGTAAGGCATAA        GTCATAACAGAAC ATT GACCTGTTATGAC        TTTTCAAATGCTTTT  88 33
        pqqA 1977780 .. 1977814 +   -13  -3.97388   TTTCTATTCAAATCT     GTCATAAGCCCTAG TCTTGTT CTAGGGCTTATGTC     TTTCTAATAAGATAT 100 44
        pqqB NONE
        pqqC NONE
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        pqqE NONE
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BV884_RS09705 1987704 .. 1987728 +  -3.6  -4.56093   ATACTGAACTATAAA          GAACTGCT TTGGTTATT GGCAGTTC          TTTTATACTTAAATT  63 65
BV884_RS09715 1990994 .. 1991027 +  -8.4  -5.52384   TAAGAGAAGTAATCT     GATAGAAAACCTCTT CACTT AGGAGGTTTTCT-TC     TTTTTTTAGTACAGG 100 60
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BV884_RS09745 1998902 .. 1998918 +  -5.1  -3.54051   TTTAAGAAGGCAGAA              CCCTGAT AGG ATAAGGG              TTCTGTGAAATTTGT  56 1
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        adeR NONE
        adeS 2018978 .. 2018988 +  -2.6  -5.04325   TAACCTAACCAAGAT                 TTAT AAA ATAA                 TTTTTATAATTTAAA  66 107
       adeT1 2020067 .. 2020093 +   -11  -3.15252   TGTATAGACTTAAAA         GGTAGAACCTAT AGT ATAAGTTCTACC         TTAACTCATTCATTT  84 77
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BV884_RS09855 NONE
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BV884_RS09890 2030597 .. 2030619 +  -6.3  -5.61881   TAAGTTGAGATAAAA           GACAACGAA ATAAA TCCGTTGTC           TTTTTATTTTTAAGA  93 28
BV884_RS10030 2057048 .. 2057064 +  -2.3  -4.55826   ACGCCCGATAAGCAA              TCGTA CCAATAA TACGA              TTTTGGTCTTTTACC  61 307
BV884_RS10070 2064350 .. 2064364 +  -2.8  -3.02166   CACTCACGGTTGCAA               TAGTAG ATG CGACTA               TCATTTGATTGACGA  43 453
BV884_RS10095 2069727 .. 2069742 +  -2.6  -2.80935   GTATTATCGATCGGT              TGAATT GCAA GATTCA               TCTGGTAAATAAACT  42 48
BV884_RS10100 NONE
BV884_RS10105 2073178 .. 2073208 + -14.3  -2.68356   AAGCGATCTAAAAAA       TAAAAAGAGACCA CAAGT TGGTCTCTTTTTA       CTTCTACATTTAGGT 100 30
BV884_RS10115 NONE
BV884_RS10120 2076733 .. 2076751 +  -8.9  -5.07011   ATAATTAAGAAAAAA             GAGACCA TTCAC TGGTCTC             TTTTTAGTTTCTATG  95 57
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BV884_RS10150 2086872 .. 2086891 +  -7.8   -3.6849   AGTATAAATAAGAAA            GGGGCTAA ATCA TGAGCCCC             TTCTTGACATTAAAT  73 43
BV884_RS10170 2089772 .. 2089807 + -11.4  -2.94218   GTTTTCTTATCAATG    CCAGCAAAGTAT-TCCA ATA TCGACATACTTTGCTGG    TGTCTCATCAGAGAT  86 40
BV884_RS10180 2092483 .. 2092495 +  -4.9  -2.57132   ATTAATTAATTGTTA                TTTCA TAA TGAAA                ATTATCAGCCAAACC  50 132
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BV884_RS10285 2120074 .. 2120110 + -10.3  -4.35044   TCCATTTATTTAAAA    CCCTAAAAGCAAGCC CATCGCT GTTTTGCTTTTAGGG    TTTATATTTGAATCA  95 60
BV884_RS10295 2121499 .. 2121525 +  -8.1  -5.72616   CATAAATTTAAAAAA         CGAATTACAGA ATTAA TCAGTAATTCG         TTTTTTTATATACAT 100 132
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BV884_RS10330 2128723 .. 2128760 +  -9.3  -3.04244   AAAAAATAATTTTAA   AG-AGCCCTTTCTACTTA TTA TAAGAAGAAAGGGCTACG   ATTATTTCTACCATA  74 32
BV884_RS10335 2129140 .. 2129168 +  -4.7  -4.07746   TAAAATAGTTAAGTA        CATAAAGCTAT TATTGAC ATAGCCTTATG        TTCTGTTTTTAAAGA  62 4
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        pcaD 2160468 .. 2160481 +  -5.2  -5.60689   TTCATTTCAAAAAAA               GGCC TATAAC GGCC                TTTTTTATTCTCTCA  87 62
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        pcaU 2187247 .. 2187267 +  -9.9  -3.14881   TTGCTTTTGAGTTTT            TATATCTGT TTG ACAGATATA            TTCGTCACGGCCTTC  73 283
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BV884_RS11705 2394048 .. 2394106 +  -8.6   -3.6834   TTAATTTAATAATAT TGAAA-TACTAGACTAAAAAGCAAGTG AGTATA CTTTTGTTTTTTAGTCTAGAAGTTTCA TTTAAAAATTTTATT  77 37
BV884_RS11710 2395979 .. 2395990 +  -4.4  -2.97021   CAGCTCCCTCTTAAA                GCTT AATA AAGC                 TCTGGTCTTTGCCAA  49 20
BV884_RS11715 2398322 .. 2398338 +  -6.5  -3.68724   GTGAAAGCAATAAAA              CCCTATC GAC GATTGGG              TCTTGTCTTTTTTCT  64 525
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BV884_RS11750 2405362 .. 2405382 +  -3.2  -3.60151   TTTGGACCAAGTACC            CATAGGTC ATAAC GGCCTAAG            TTATCGTTTAAAGCA  50 441
BV884_RS11770 2412412 .. 2412422 +  -5.4  -3.61654   GCATCGCATAAATTT                 TAGC AAG GCTA                 TTTGCAGTAAATGTC  58 438
BV884_RS11790 2417525 .. 2417546 + -13.1  -4.09556   TTATCGACCAAAAAA           TAAGCACCC ATCT GGGTGCTTA            TTTCATTTCAATCTA 100 48
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         tal 2420132 .. 2420160 + -14.1  -5.52096   TTTCATACAAAATTA        CCGATTTTTGTTA TCA TGACAAAAATCGG        TTTTTTATTGGGTTT 100 51
        leuE 2420919 .. 2420948 +  -3.7   -5.1287   GCACAAAAAATGTTC       TTACCTGTCTTACC CCA GGTAAGGCAA-TAA       TTTTTTCACTATGAA  74 115
        benE 2422712 .. 2422763 +    -9  -2.80398   AAGGCTTAAACGAAA GAGTTTGCGCTTCATCATTTA-GAG AAA TTCATAAAAAATTAAGCGCAAACTC TCGTTAAATTAATTA  73 39
BV884_RS11845 2428873 .. 2428892 + -10.8  -4.91109   CTGAGTCGACTAAAA            GCCTAATC CATT GATTAGGC             TTTTTATCATAAAAA 100 44
BV884_RS11850 2430717 .. 2430753 + -14.1  -2.90455   ACGCTATTTTTATGC    CTATATAAAAGCTCTAA CTA TTAGAGCTTTTATATAA    ATCTTTTAATTATCA 100 45
BV884_RS11880 2437590 .. 2437603 +  -2.5  -4.16371   AAACACATGAATCGT               TATTT GAAC AAATA                TTTGATTCTTTAATA  57 225
BV884_RS11910 2443868 .. 2443893 +   -12   -4.8048   TAGTAACTAACATTA         TAAAAGCCCC ATTATC GGGGCTTTTA          TTTTTAGTCTAGGAC 100 54
BV884_RS11930 2447025 .. 2447040 +  -3.2  -2.79188   GCTCTGTGTTTAAAG              CGCTAA TTTT TAAGCG               TACTTCACTTAAGTC  44 221
BV884_RS11970 2454229 .. 2454254 +  -7.7  -4.98672   AACCTCTTATAAAAA         CCTAAAGTC AAAACAAA GACTTTAGG          TTTTCTATTTTTGCA  89 52
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        thiM 2456502 .. 2456521 +  -8.6  -3.88787   AATCCCCTGCTTCTT            CTGGTTGC TCAG GTAACCAG             TTTCTAAAGATGTAA  77 155
BV884_RS12000 2460916 .. 2460943 +  -3.5  -5.41143   TTGACTTACTTTTTG        GGGAATACT TAGCTCCAGC GGTATTCCC         TTTTTTTAAAACCTA  76 89
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BV884_RS12050 2473459 .. 2473471 +  -3.5  -4.56969   TTAGTAAAAAATTTA                TATAA GTA TTATA                TTTCTTTATCACATT  63 289
        nfsB 2474236 .. 2474265 + -16.7  -3.46647   TTATAAGAATTTAGT       GGAGTTCAAAAGA ACAG TCTTTTGAACTCC        TATTTCATAGCTAAG 100 35
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         fis 2560112 .. 2560131 +   -10  -6.02345   GAATAAATGATAAAA            TGCTCACG GCTT CGTGGGCA             TTTTTTTTGTGCTTC 100 35
        purH 2561788 .. 2561808 +  -8.3  -4.10161   TCTAGTCCTCCCTAA            CCCTCCT TTTATTC AGGAGGG            TTTTCCACAATAATG  79 47
        purD 2563191 .. 2563220 + -13.1  -4.56736   TAAAAATTTAAATAG       TAAAAAAGCTCTC TTAT GAGGGCTTTTTTA        TTTTGCTTATTCACT 100 38
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        gloB 2566996 .. 2567023 +    -5  -4.65895   TAAGCTTTCAACCAA        GATACAGTTT AATTTTAA GAACTGTATC         TTTTTGAATAAAGCA  69 46
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        aspT 2589350 .. 2589362 +  -5.5  -3.27808   TCGGACCACTGATTG                TAGGC TTG GCCTG                ATTTTCTACATTGAA  56 12
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BV884_RS12625 2593782 .. 2593800 +  -6.1  -3.45634   CTATCTTGTTGATCA             TTAAGAG AACAC CTCTTAA             TTCCCTTTTCTTGAG  62 279
        proP 2595428 .. 2595453 +  -9.8  -4.50259   CAACGTTTTTTATAA         GAGTAGCGAC TTAAAT GTCGCTATTC          TTTTAATATATTTTT  91 47
BV884_RS12635 2596076 .. 2596104 +    -9  -2.69151   AATAGTTTGGTTAAA        GATAAAAGCCCA TGAAC TGAGCTTTTATC        TCCTCTATAAAACAG  72 36
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BV884_RS12710 2611173 .. 2611189 +  -4.5  -4.19506   CCGTGAAATATAAAA              TTTCATT ATT AATGGAA              TTTTCAACTTAACAT  62 515
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BV884_RS14170 2937862 .. 2937879 + -11.3  -5.37345   GAAAATATAAAAAAA             GGCCTCA AAAT TGAGGCC              TTTTTTATAATTAAA 100 44
BV884_RS14180 2938937 .. 2938956 +  -7.1  -4.88407   GACCATAAAAACCAA            GGCAGCT TTAAAC GGCTGCC             TTTTTCATTAAGTAA  86 33
BV884_RS14195 2939694 .. 2939714 +  -6.8   -5.5353   GCCAAATACTAAAAA            GCCCGC AGCATTAAA GCGGGC            TTTTTTATTGCTCTC 100 37
        nadB 2952078 .. 2952095 +  -9.1   -5.5604   GTTTTTTATAAAAAA             GCACGGT TCAT GCCGTGC              TTTTTTATTACTTAA 100 44
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        dapD 2962898 .. 2962925 + -15.8  -5.51612   CAGTTTGATCAAACA        TCTCTACGATCA ACAC TGATCGTAGAGA         TTTTATTTTTTATAT 100 44
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        htpX 3057966 .. 3057989 +   -14  -5.28481   CGTTTAATGTAAAAA          TAAAGCCTCC AAAT GGAGGCTTTA           TTTTTTGATTACATG 100 43
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        yhbY 3095815 .. 3095826 +    -3   -2.8203   GTTCGTCACGCACAC                TTAG CAAA CTAA                 CTTATTGACTACTTA  43 14
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        carB 3101738 .. 3101762 + -17.2  -5.62552   TTTTTTTCCGATAAG          TCCCGCCACC TTATC GGTGGCGGGA          TTTTTTCATTTTTTT 100 41
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        trpS 3131748 .. 3131759 +  -7.2  -5.73339   ATATAAATCAAAAAA                GCCC TACG GGGC                 TTTTTTTATAATTAT 100 55
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        gltA 3146049 .. 3146064 + -10.4  -5.96219   CATTAATGTAAAAAA              GCTGCC TAAT GGCAGC               TTTTTTTTATAAATA 100 53
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        rpoD 3152116 .. 3152135 + -11.4  -3.62096   AGAAAGAGCTATAAA            CGCCTGCG ATGA TGCAGGCG             TTTCACATGATGAGG  93 82
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        lipB 3153309 .. 3153326 +  -7.1   -3.1243   TGGAATAAAAATATA             TTAGAGT AATT ACTCTAA              ATTTGCTTTTGCATA  64 53
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        gatC NONE
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BV884_RS10135 2082140 .. 2082162 -  -5.6  -4.83243   CTCAGATAAAAGAAA           GCCACTTC TGATATT AAAGTGGC           TGTAATTACATTAAA  74 36
BV884_RS10130 2081755 .. 2081767 -  -6.3   -3.1706   AATTTACCTTACCAA                GACTA TAG TAGTC                AGTAAGCACAATAAT  59 181
BV884_RS10125 2076733 .. 2076751 -  -8.9  -5.57396   ATAATTAAGAAAAAA             GAGACCA TTCAC TGGTCTC             TTTTTAGTTTCTATG 100 56
BV884_RS10110 2073178 .. 2073208 - -14.3  -5.10497   AAGCGATCTAAAAAA       TAAAAAGAGACCA CAAGT TGGTCTCTTTTTA       CTTCTACATTTAGGT 100 69
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BV884_RS10010 2051656 .. 2051671 -  -3.2  -4.63479   CATTATAAATCAAAA              GTGCAT TAAG ATGCGC               TAGTCAGAAAGCTCA  62 25
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BV884_RS09995 2048959 .. 2048976 -  -6.9  -5.56264   TTCAAATATAAAAAA             GCCCACC TTTT GGCGAGC              TTTAATACCAGTGCT 100 94
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        antC 1964579 .. 1964609 - -11.4  -4.81851   ACTTAAATGCAAAAA       TTCAATATACCCCT TAT AAGAGTATATTGAA       TCATTTCAGGTTTAG 100 64
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        chrA 1927156 .. 1927181 - -13.4  -3.87576   TTAAAAATATAAATA         GCCGAACAGT AAAGGA ACTGTTCGGC          CTTATTGAGATTATG 100 72
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BV884_RS07665 1567132 .. 1567148 -  -5.1  -5.24551   GCAAAGCAAGAAAAA              GCTCC ATAAATA GGAGC              TTAGATATTTTATTA  79 38
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BV884_RS07595 1551720 .. 1551746 -    -8    -3.254   GATCCATTTATAAGA         GCCAGCTTTG TTTTTTT CAAGGCTGGC         TTTTTATTGGGTAAG  71 43
BV884_RS07580 1547929 .. 1547952 -  -6.1   -4.8667   TACATTTGATAAAAA          GCACTTCAA GTCGTT TTAAAGTGC           TTAAAATTTGATTAA  80 37
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        pobR 1535958 .. 1535985 -  -6.5   -3.6284   AATTATGAGTTGAAA        CTCTTG-TATCT CTAAT AGATAACAAGAG        TTTCTAAGTTTATTT  64 39
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BV884_RS07425 1517374 .. 1517405 - -13.4  -4.68424   TAAGGTATTTAAAAA      TATTAGACAATTAA ATAT TTAATTGTCTAATA       AATATTTTAAATATT 100 12
        paaZ 1502064 .. 1502092 - -13.2  -5.42259   TGAGTGTTAAAAAAA        TGAGATGGGGAC GAGGT GACCCCATCTCA        TTTTAAACATTAAGC 100 35
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BV884_RS07325 1495421 .. 1495441 -  -9.8  -5.72616   ATTTAGATAAAAAAA            TGGGTTGT ATAGA ACAACCCA            AATCATTATTAAGTG 100 61
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BV884_RS07265 1484813 .. 1484829 -  -5.1  -3.54051   ACAAATTTCACAGAA              CCCTTAT CCT ATCAGGG              TTCTGCCTTCTTAAA  56 1
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BV884_RS07250 1482447 .. 1482472 -  -3.4  -4.37711   TGATTAAAGCTAAAA         CACCAAAA GAGTAAAAAT TTTTGGTG          TTTAACTTCGCTTAG  61 37
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        mutS 1398501 .. 1398530 - -11.6  -3.51232   TTCTCCTTAAAGTAA       GAGCAAACATGC CTATAC ACATGTTTGCTC        AATGAGTGATTATGA  90 35
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        ahpC 1344885 .. 1344918 - -12.6  -4.18018   TGTGCTTATTCAAAA     CAAAAGAACCATCC GATAAA GGATGGTTCTTTAG      GTTTCTAAAATCTAA 100 47
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        ahpF 1341744 .. 1341767 -   -14  -5.14563   TCTCGTATTAAAAAA          GCCTAGCATT TTGT AATGCTAGGC           TTGAATTAAATGATA 100 56
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        trmB 1337068 .. 1337090 -  -9.9  -4.57516   ATATTGAAATGAAAA           GGGCCTAGT TTGTT ACTAAGCCC           TGTTTCTTACTTAAT  93 32
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       rlmKL 1328577 .. 1328596 -  -5.8  -2.53581   TACATGGTGAAGTTA            TCATTACC GTGA AGTAATGA             TAACTTCCTTTTCAA  54 48
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BV884_RS06485 1323193 .. 1323210 -  -4.1  -5.75538   CCTAAAAAATAAAAA             GCTAACA GTCA TGTTGGC              TTTTTTTATGATAAG  86 491
         crp 1321557 .. 1321580 -  -3.2  -3.41024   TTGTTTAAGATAAGA          TATAACTCAT TGAG ATGTGTCATA           GTATTCGTCGTTAGA  48 81
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BV884_RS06460 1319167 .. 1319184 - -11.3  -4.63184   AACTGATGTTAAAAA             CGGATGC TTGA GCATCCG              TTTTTGTTTTTTAAG 100 36
        alaS 1310996 .. 1311021 - -10.5  -2.63079   GTTCCATATAAGCCA         TGACCCTGAGA GGCT TGTCAGGGTCA          GTTACACAAAAAGTG  80 46
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        csrA 1309146 .. 1309173 -   -10  -5.04385   TATATTCCCAAAAAA        TTTAAAGCGACT ATAA AGTCGCTTTAAT         TAGGGAGAGAACAAC 100 47
BV884_RS06405 1307274 .. 1307290 -  -9.4  -5.96894   ATCTAAATAAAAAAA              CCGCCT GTGAT AGGCGG              TTTTTTTAACATTGA 100 43
BV884_RS06370 1299215 .. 1299240 - -13.4  -5.28826   AAATGTGATAAAAAA         CACCTGCGTA TACTTC TACGCAGGTG          TTTTTACTATTTATG 100 36
BV884_RS06350 1296550 .. 1296567 -  -6.9  -2.76291   CAATCTGAAAATTGA             TGCCGGT GAAT ACCGGCT              GGCTGCCGACGATCC  57 312
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        argG 1284471 .. 1284488 - -11.3  -5.95539   CTTTAAATAAAAAAA             GCCACCT ATAG AGGTGGC              TTTTTTGACCTTATA 100 46
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        nudC 1264141 .. 1264152 -  -4.4   -3.8297   AAGAAAAATTGGAAA                TCTC GACA GAGA                 ATATTGTGCTTATGG  59 491
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BV884_RS01140  238872 ..  238890 -  -8.2  -2.78463   AGGTTTTTCACTAGA             GAATGCAT TAT ATGCACTC             AGCGCTGTGGGGCAT  62 225
      tet(B)  237111 ..  237121 -  -2.6  -2.95448   ATTAACAGGCATATA                 TTTT TAC AAAA                 TGAAAAATTAAAGCA  42 94
BV884_RS01125  235256 ..  235279 -  -6.2  -4.59081   CAAATTTATAGAAAA          CATGAAA-TAC CAA GTAATTTCATG          AACATATGATTGTAT  76 57
BV884_RS01115  232878 ..  232910 - -11.5  -2.65264   TTATTAGTCAGATTA      TAAAAGGCCCATTTA TCT CAAATGGGCTTTTTA      TAAAATTAGAGTTTC  86 51
BV884_RS01095  230194 ..  230208 -  -2.8  -2.71708   CAAATTTCACAGAAC               CCTTAT CCT ATCAGG               ATTCTGCCTTCTTAA  40 2
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BV884_RS01085  227815 ..  227845 -    -7  -4.77759   ATAACTTATTAAAAA       TAAAGGGATAGA TCAAAAT TCTACCCCTTCA       TGAAATTATCGTAGT  83 31
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BV884_RS01075  226682 ..  226709 - -11.5  -4.23892   TTGAAGCACTTAAAA        TAATGATCAGC GAGTTA GCTGATCATTA         TTATTGAGATTTCAG 100 356
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BV884_RS01015  214592 ..  214605 -  -9.5  -5.52023   ATGATGAATAAAAAA               GCGCC GTAA GGCGC                TTTTTTTATTTTAAT 100 36
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        dinB  201534 ..  201557 -  -6.2  -3.04398   GTTTTTGTTTAAAAC          TTGTTCTTTT GTAT AAAAAAACAA           CACTTACCATAAGGA  59 29
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