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         rrf  195447 ..  195474 + -16.4  -5.71712   GCTCATTATTCTAAA        CACCCCAATCTC AAAA GAGGTTGGGGTG         TTTTTTTATATGGGA 100 38
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        cysK  197369 ..  197400 + -13.3  -3.98816   ATAAAATTAATCATA      TAAAAAAGCCCAT GAATAA ATGGGCTTTTTTA       TTTAATCTTAATTTA 100 37
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LO012_RS05040 1037928 .. 1037963 +  -3.6  -3.73775   GAATTTGCTAAAAAA    TGAACAAATAATGGT GATCTGA ATCA-TATTTGTTCA    TTTGGTGGGCATAAA  52 75
LO012_RS05045 1038118 .. 1038141 +  -9.6  -5.20633   ATAGCCACCATTTTA          AAAACCACGC TCCT GCGTGGTTTC           TTTTTATCTATTTTT 100 31
LO012_RS05080 1046337 .. 1046365 + -10.5  -5.14563   CTTACAATTATGTGC        CCTTAAAAAGAGG TGT TTTCTTTTTAAGG        TTTTTTAATAACGGG 100 171
        rpsL 1046793 .. 1046807 +    -2   -3.8646   TAGTCCAAAAGCCCT               TTAGCG TTT CGCTTG               TTTGAATTCTTCATA  50 52
        rpsG 1047514 .. 1047540 + -11.6  -3.65542   CCCGCTTGAGTATTC         GTGCGCATCAAT TTA ATTGGTGCGCCC         TGTTTTAAAGATAAC  93 143
        fusA 1049763 .. 1049785 + -12.1  -2.77899   GTTAAAAACCAAGTG           CTCATGGAG TGACC CTCCATGAG           TAGTTAATAAAGGAA  87 75
         tuf 1051019 .. 1051034 +  -8.2  -6.02914   TTTCAGTGAAAAAAG              CGCTCC TTTT GGGGCG               TTTTTTTTATATCGA 100 46
LO012_RS05105 1052102 .. 1052117 +  -6.8  -5.62045   GAAAGTAAGTGAAAA              GGGCTG TTAG CAGTCC               TTTTTTATTGTCTAT 100 44
LO012_RS05110 1053212 .. 1053228 +  -9.5  -6.17184   AAACTGACTGGAAAA              GAGCAAT TTA ATTGCTC              TTTTTTTTTACTCGT 100 42
        rimI 1054253 .. 1054265 +  -6.3  -3.28416   CATCGGCATGGCGCT                CGTTA ATG TAACG                TTCATATAGATCATA  60 519
LO012_RS05135 1059758 .. 1059771 +  -8.1  -5.37345   TACAGTTAAAATTAA               GCCTC TTCG GAGGC                TTTTTTATGGTTAAA 100 45
        rhtC 1060518 .. 1060546 + -14.8  -4.57341   GATAATTTTAAATAA        GAAAAAAGCCTC TTTAT GAGGCTTTTTTC        TTTTTAAGCAAACTT 100 36
LO012_RS05175 1065833 .. 1065846 +  -8.1  -5.64274   TTATTGTTTCAAAAA               CCACC TTCG GGTGG                TTTTTTTATGGGTGA 100 49
         rep 1068020 .. 1068042 +    -2  -5.85011   AATATTTGGCAAATT           TAAAAGCTTT ATT AAAGCGTTAA           TTTTTTTAATTTTTA  78 3
         dut 1068544 .. 1068568 + -12.3  -4.62471   AAAAAATAATGAAAA          GAAACGCTTGT TTT ACAAGTGTTTC          TTTTTACACCTTGAA 100 50
LO012_RS05190 NONE
        argB 1071083 .. 1071099 +  -4.4  -5.63504   TATTTTTTATTGAAA              GATCAC GCTAA GTGGTC              TTTTTTTATGCCATT  83 48
LO012_RS05200 1071959 .. 1071970 +    -3  -4.04187   ACAAAATGGCTCAGC                GATA AAGT TATC                 TTATATTTTGTAATA  55 21
LO012_RS05205 1072977 .. 1073008 +  -4.7  -4.93547   TTTTGTTTATTTAAT      AATAAAGTATTTT GTTTAA AAAATACTTTATC       TTTTTAGTTGGTTAA  75 82
LO012_RS05210 1073665 .. 1073689 + -11.5  -5.88565   TATACAGTTAGCGCG          GCAAACTATCG TTT CGGTGGTTTGC          TTTTTTTATTGTGCA 100 62
LO012_RS05215 NONE
LO012_RS05220 1075178 .. 1075202 +   -10  -5.05606   GCTCAATAAGCAAAA          CCCCTCAAGT ATTTC ACTAGAGGGG          TTTCTTTTTATTAGA 100 32
         fur 1076205 .. 1076226 + -11.7  -5.60993   AAAACAAATAAAAAA           GGAAGGTTA CGTT TAACCTTCC            TTTTTTTATGAAGAA 100 57
LO012_RS05245 1079416 .. 1079436 + -16.9  -5.18355   GCAGAATCTAAAAAA            GCCCCGACA GGA TGTCGGGGC            TTTTTAGTTTTTAAC 100 196
LO012_RS05260 1084971 .. 1084995 + -12.9  -2.53995   ATAATTCATATGAAA          TAGCCACCGAT AAA AGCGGTGGCTA          TAAATTAAAATAAAT  95 37
LO012_RS05270 1086256 .. 1086266 +  -5.4  -3.83486   CCACAAAAACTGATA                 CGAT TAG ATCG                 TTATTAAATTTTATA  61 45
LO012_RS05275 1087672 .. 1087689 +  -3.4  -3.57441   CTGACCTTGCACAGG             TTCGAC TGGAAT GTCGAG              TTGTAATTGTGAGTT  50 467
LO012_RS05290 1090042 .. 1090054 +  -6.9  -5.63374   TTAAGCATTTAAAAA                GCGCT CAG GGCGC                TTTTTTTCATATTAA 100 51
LO012_RS05295 NONE
LO012_RS05300 1092978 .. 1092995 +  -7.7  -5.42259   ACTAAACATCAAAAA             GCATCTC TTCG GAGGTGC              TTTTTTTAGGCCTAC 100 36
         ggt 1095275 .. 1095292 +  -7.7  -5.60993   AAGCTTTAAAAAAAA             GCTGTCA TTTT TGGCAGC              TTTTTTTATAAGGGG 100 44
        ssrA 1095892 .. 1095912 + -10.5  -2.61602   ATATAACTAGCCATA            GTGTACATG CAC CGTGTACAC            TGCCTTGTACATTGC  80 138
LO012_RS05315 1097283 .. 1097297 +  -4.3  -3.67564   AGGCCAGCCGACAAG               CAAGT CCCCA ACTTG               TTTACCTAGCTACTT  56 120
LO012_RS05320 1098283 .. 1098306 +  -3.8  -5.30686   TAAAACCCATACTAA          ACCCATATTC TTTT GTATATGGGC           TTTTTTATGACTATT  74 205
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LO012_RS05355 1102980 .. 1103016 +  -3.8   -2.7624   AATAGGTGGACATAA    GGTGGACATGAT TCAAGGTAAATAT ATCTTGTCCACC    TACTATGATTTTAAT  46 160
LO012_RS05360 1103474 .. 1103484 +  -2.6  -3.16683   AATTCAATTAGTAGG                 TTTA GCT TAAA                 TTAATAAACTCAACT  43 204
LO012_RS05365 1104941 .. 1104965 +  -6.5  -2.76492   TGGGCCCTTTAAATG          CTTGGTTAGTT CCC AATTAGCCGAG          ATTTCCAGTAAGTAC  57 6
LO012_RS05370 1105226 .. 1105241 +  -3.2  -4.00066   GTTAAACCTTATTTA              GCCC TAGTAAAT GGGC               TTTATAGCTTCTGAA  55 208
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LO012_RS05380 1107738 .. 1107750 +  -9.1  -5.28176   TCTAGAAATAAAAAA                GCCCT GAA AGGGC                TTTTTTATAGATCAG  95 36
LO012_RS05385 1111521 .. 1111541 +  -6.3  -5.02231   GAAGATCAAATTAAT            TTATATTGC GAT GTAATATAA            TTTTTAGTATTTTTA  82 39
LO012_RS05390 1113397 .. 1113415 +  -5.4  -3.11702   ATTAAAGAAGAAGTT             TGGTTTAA CAA TTAAATCA             TAATTTATTAAATGG  54 11
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LO012_RS05400 1115521 .. 1115536 +  -2.6   -2.8155   TCTGGGTATAAATAT              TTAATG CTGC CATTGA               TCGATTTTCATTGTC  42 22
LO012_RS05405 1116406 .. 1116425 +    -8  -4.67038   CTTTTAGAACAACTT            TGGAAATT GTTA AATTTCCA             TTTTCATTTTCGGAA  84 167
LO012_RS05435 1123220 .. 1123233 +  -3.9  -4.07486   CGACATTAAACACTC               TATGT TTTT ACATA                CTTTTTTGTTTTGAT  58 522
LO012_RS05445 1124087 .. 1124113 +  -7.3  -3.54741   TAAAGTCCAATCGAA        GCTGAG-CCGAA ATTG TTCGGGCACAGC         TTTACGGGCATAATG  68 71
LO012_RS05450 1126101 .. 1126120 +  -2.1  -2.74488   GTTTTTAGAAAACCA            CTGCTGA AATAGC TCAACAG             TGGTTGAAGTCATTA  40 48
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LO012_RS05530 1145002 .. 1145050 +  -7.9  -3.61356   GTTCTGTTAGGACAG TTTGAACTTAAGGACTAAA TAAATGTGAAT TTTAGTTCTTAAGTTTAAA TTTCACATAAATAAT  73 172
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        pgaD 1148881 .. 1148897 + -12.3  -5.82316   CATTTATAAAAGAAA              GCCCACA TCA TGTGGGC              TTTTTTTTCGCTAAT 100 45
        pnuC 1150565 .. 1150577 +  -3.3  -3.90291   AGAAAGCAGAACTTA                GGTGC TGG GCAGC                TTTAATTGGGAGAAT  54 8
LO012_RS05560 1150923 .. 1150937 +  -7.1  -5.53991   AGAGTATTAAAAAAA               GCGAC TTAAC GTCGC               TTTTTTTAATAGATA 100 52
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LO012_RS05635 1165505 .. 1165521 +  -9.4  -5.68438   GCAGCATTAAAAAAA              CCACGC AATCG GCGTGG              TTTTTTATTTAATAA 100 46
         def 1167677 .. 1167697 +    -4  -4.11371   ATATAATTTTAATAT            TATCAGCA GGTTG TGCTGAAA            TTTTGCGCGATGTTG  58 140
LO012_RS05650 1169039 .. 1169067 +  -6.7  -4.20531   AAAGACTTATAGCGA        CATCGCAGCACTT CTA AACTGCTGAGGTG        TTTTACCTAGATGTC  74 1
LO012_RS05660 1171153 .. 1171180 + -11.4   -4.8048   TTAAATAAATGAAAA        GACTCTCAGC CATATTCA GCTGAGAGTC         TTTTTAATATGAACA 100 33
LO012_RS05670 1173408 .. 1173420 +  -2.7  -3.64915   AGCACTTCAAGCTTT                TCATT ACG AATGG                TTCTGATTTCTACCC  50 437
LO012_RS05680 NONE
LO012_RS05685 1176171 .. 1176183 +  -2.6   -3.2827   CTGGTTCTGCGTGTT                CCGG CAAAA CTGG                TTAATCGTTAAATAA  44 2
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LO012_RS05695 1178099 .. 1178129 +   -14  -4.57341   AACTTTCAAATTGAA       AAGGGCGTGATGGA AAT TCCTTCACGCCCTA       TTTTTAAACAGGGTT 100 49
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LO012_RS05710 1185448 .. 1185467 + -10.8  -3.69836   TAATTGCACAAAAAA            GCCCAATT CTAA AATTGGGC             TTTCAACTTCATTAT  89 38
        nfuA 1192131 .. 1192143 +  -5.5  -5.95946   AGTAAAATAAAAAAG                CCTCG CAA TGAGG                TTTTTTTATTATTCA  95 56
LO012_RS05745 1194544 .. 1194572 + -15.5  -3.65693   TTCTAATCAATAAAA        TAATAAAGGCGCT TTA AGCGCCTTTGTTA        TTTAAAATCTCTAAT 100 35
LO012_RS05760 1197538 .. 1197564 + -14.6  -2.91582   ATAAAGATTTAAAAC         TAAAAGGTGCCT ATA GGGCACCTTTTA         TGTATGGATAAGCTA 100 48
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LO012_RS05775 1201639 .. 1201651 +  -4.9  -4.32579   GGTTAATCGCCATAA                TCATT AAT AATGA                TTTCTTATCAAGTAT  68 293
        mtgA 1202988 .. 1203010 +    -2  -2.54166   TCAAATTGACATAAT           TTTGCAGCAT ACT ATTTTGCAGA           GATTTTGGTTGGAAA  39 77
        ppk1 1205130 .. 1205160 +   -15  -3.11999   AATAAAAAATTATTT       TTAAAAAGCCGATA TCA TGTCGGCTTTTTAA       TTAACTGAATTTCAT 100 36
LO012_RS05800 1205946 .. 1205983 + -14.5  -3.31598   TCCCTAACAGCACAG   TAAAATAAAAAGGAGTC CGAA GACTCCTTTTTTTTTTA    TTCATGTAAGTTTGT 100 23
LO012_RS05825 1210406 .. 1210421 +  -6.2  -3.25719   ACAGCTTTTCCTGTA              CTTGAT ACAT ATCAAG               TTGCTCGTCTCCTAA  58 217
        lysS 1212581 .. 1212596 +    -9  -5.49234   TTCAATGCAGAAAAA              GGCAGT TTAT ACTGCC               TTTTTTATTAACTAT 100 48
LO012_RS05840 1214210 .. 1214250 +  -9.4  -4.57569   TTTTAGTTAACCTTA TAATAAGAAAGAGAAG-CT ACAG AGACTTCTCTTTTTTATTG  TTTTTAGAGAAATCG  93 42
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        cysD NONE
        cysN 1217151 .. 1217164 +  -9.5  -5.83226   AATAAGTTCTAAAAA               CCCGC GTAA GCGGG                TTTTTTTATTGAGTT 100 50
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        astA 1324489 .. 1324502 +  -3.1  -2.62018   ATAAATACAATCTTG               CTC-GC TAA GCTGAG               ATTAATTAGCCTGTT  42 115
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        gudD 1336446 .. 1336463 +  -9.1   -5.5353   AATATTGAATTGATA             GCTGTCC TTTG GGGCAGC              TTTTTTATTGCTATA 100 61
        kdgD 1337462 .. 1337481 +  -2.9  -2.86828   ATTTGGCTGCGCTCA            TTGC-GAC ACTTG GTCCGCAA            TAATTCTAACTGTTT  43 3
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        mhpT 1351265 .. 1351286 +  -9.5  -3.66095   TAAGTTTTAACGAAA           GTATGGGGT TAGA ACCTCATAC            TTTCACTACAGATTT  82 38
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LO012_RS06490 1357833 .. 1357868 + -15.7  -4.26019   TTAAATATTAAAAAA    GCAGGTTAAAACCTT TTATTT GAGGTTTTAACCTGC     TTTTGGATGTGATTA 100 37
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LO012_RS06585 1378965 .. 1378986 + -10.2  -4.05402   TTAAGCATTAAAGAA           GGCCGATT CTTATA AATCGGCC            TCTTTTTCATTGGAG  90 49
        rnhB 1380043 .. 1380080 + -12.9  -5.03713   CTTTCCGTTTAATAT   AACAGAGCCGCTATA AAAAAAAC TATAGCGGCTCTGTG    TTTTCTTTGATTATT 100 495
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LO012_RS07010 1456755 .. 1456765 +  -4.6  -3.70571   TTTGGCTCAATTAGG                 GGCG CTT TGCC                 TTTCAAATCTTTGTG  56 42
         gap 1463539 .. 1463554 +  -6.1  -5.71712   CTACACTAAGAGAAA              TCGGG TGTGTT CCCGA               TTTTTTTATGTGGGG 100 236
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LO012_RS10150 2095111 .. 2095125 +  -4.4  -4.57569   TCTTTGGAAAATTGA               TTTAAA CCA TTTAAA               TTTTTGAGAAAGTGA  68 104
LO012_RS10155 2096171 .. 2096188 +  -8.4  -3.38191   TGATTTATAAAAAAA             GCAGGC TTTTAT GCCTGC              TTCTCACAATTTTTT  73 50
LO012_RS10165 2098145 .. 2098161 +  -8.7  -3.03243   ATTGGTTTCTCCTGA              GCTGCGT CAA ATGCAGC              TCTTGCCGCATCAAT  67 53
LO012_RS10175 2099225 .. 2099250 + -13.4  -2.81326   TTAAAAATATAAATA         GCCGAACAGT AAAGGA ACTGTTCGGC          CTTATTAAGATTATG 100 37
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LO012_RS10240 2114215 .. 2114241 +  -3.8  -3.11584   CCTACTGCATCGTAT         CAATAATTTAGG CAT TCAAGATTATTG         TCTATTAAATAATCT  48 20
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LO012_RS10250 2116339 .. 2116349 +  -2.6   -3.6682   TAAATTCTTTGATAA                 TTTA GAG TAAA                 TTTCAATAAGTCAAA  48 155
LO012_RS10255 2117363 .. 2117390 + -10.8  -4.69549   TTTCATTATAAAAAA        GAAGATGT-AGGA AAA TCCTTACATCTTC        TTTTAATTTTAAATT 100 45
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LO012_RS10290 2125226 .. 2125239 +  -2.4  -3.96216   GGTCATTACGGTCTT               TACC GTAACG GGTA                TTGTTTAAATCAGCA  53 4
LO012_RS10295 2126086 .. 2126106 +  -9.8   -5.2189   ATTGTTTTATGAAAG            CCGCTTAT TTTAT ATAAGCGG            TTTTTTACTCGTTAA 100 45
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        modA 2140053 .. 2140069 +  -3.7  -3.05714   ATGGCTTTAGCGTGT              TGGCT CCAGTCA AGCCA              TGATGTTTTCTTTAA  46 6
        modB NONE
LO012_RS10370 2141567 .. 2141577 +  -2.6  -4.40358   AATAATAAAATATTC                 TTAA GCT TTAA                 TTTTATAAAATACAT  58 206
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        ppk1 2148397 .. 2148425 +  -8.9  -4.18697   CTGGGTAAGGCATAA        GTCATAACAGAAC ATT GACCTGTTATGAC        TTTTCAAATGCTTTT  88 33
        pqqA 2148706 .. 2148740 +   -13  -3.97388   TTTCTATTCAAATCT     GTCATAAGCCCTAG TCTTGTT CTAGGGCTTATGTC     TTTCTAATAAGATAT 100 44
        pqqB NONE
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        adeS 2202187 .. 2202203 +  -3.7  -4.64423   ATAATTTAATAAATA              GCTTG TCTTGAT CAAGC              TTTGTATTTTTCTTC  66 431
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        catC NONE
        catA 2285198 .. 2285231 + -10.5  -2.89178   GCTTAATTGAAAGTG     TATGTGAGTTAAAAG TTCG CTTTTGACTCACAAA      ATTTACTCCATTTAT  81 35
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        pcaD 2289209 .. 2289222 +  -8.1  -5.60689   ATTCATCTCTAAAAA               GGCCA ATCA TGGCC                TTTTTTATTCTCTCA 100 61
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LO012_RS11175 2308708 .. 2308722 +  -3.5  -3.09749   TTTCACAATACGTAA               TGCCG AGGAC TGGCA               TATATCTTGGAAATG  46 108
LO012_RS11180 2310006 .. 2310030 + -15.9  -5.33785   AATTCTAAATAAAAA          TTACCCCCTAA AAT TTAGGGGGTAA          TTTTTTATCCTAATT 100 33
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        pcaU 2316033 .. 2316053 +  -9.9  -3.14881   TTGTTTTTGAGTTTT            TATATCTGT TTG ACAGATATA            TTCGTCACGGCCTTC  73 322
LO012_RS11310 2335648 .. 2335676 + -16.3  -3.85859   AGGGTAAATAAAAAA        GTGCTATTTCTAA CAC TTAGAAATAGCAC        TTATATTTAAATATT 100 34
LO012_RS11330 2340325 .. 2340352 + -11.5  -4.07124   GCTTCTGTTCAAGAA        TGCCCAAATTA TTTTTT TAATTTGGGCA         TTTATATAAATAGTC 100 41
LO012_RS11335 2341402 .. 2341424 + -10.7  -4.19177   TTAAGGTATAAAAAA           TAAAGCCCA AGATC TGGGCTTTA           TTTATATTCAAAGAT  95 37
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LO012_RS15790 3234394 .. 3234404 +    -4  -5.09245   GTTTTTTATATTTTT                 TGAA AAT TTCA                 TTTTTCTAATTTTAA  70 44
LO012_RS15795 NONE
LO012_RS15800 3235200 .. 3235211 +    -3  -3.39842   CTAAAAATAAAAGGA                TCTA AAAG TAGA                 ATTTTCTCTTAAGAT  48 79
LO012_RS15805 3236539 .. 3236566 +  -3.6  -5.06414   TTATTTAGTATTATT        TTGGGAATAT TCACTTCC ATATTCTCAA         TTTTTCTTACAGAAA  69 244
LO012_RS15810 3237427 .. 3237446 +  -7.8  -5.26875   ATATAAACAAAAAAT            GCCCCTGT TTCT ACAGAGGC             TTTTTTAATTGAAAA  91 218
LO012_RS15835 3244891 .. 3244909 +  -9.6  -5.00642   TTGTATAAATAAAAA             GCTTACCT CTC GGGTAAGC             TTTTTATATGAATTC 100 74
LO012_RS15850 3247922 .. 3247947 +  -7.7  -3.52762   CTTGTTTAATTTAAA         TACATTCTTCG ATCG CAAAGAATGTA          TTGATTCCTTATTTT  71 149
        htpX 3248979 .. 3249002 +   -14  -5.28481   CGTTTAATGTAAAAA          TAAAGCCTCC AAAT GGAGGCTTTA           TTTTTTGATTACATG 100 43
LO012_RS15870 3254180 .. 3254198 + -10.3  -6.02919   ATCTTCATAAAAAAA             CAGGGCA ATGAA TGCCCTG             TTTTTTTATTTATCA 100 45
LO012_RS15880 3255776 .. 3255793 + -11.3  -5.53288   GAAAAATAAAAAAAA             TCCCTGC GAAT GCAGGGA              TTTTTTTGGGTTAAA 100 154
LO012_RS15910 3272353 .. 3272383 + -15.7  -3.30441   TCTAATTGCTCTATA       TAAAAAAGGTCGC CATGT GCGACCTTTTTTA       TTATGCGGCATCATC 100 36
LO012_RS15930 3277819 .. 3277840 + -10.2  -3.31322   TCATAACATAAAAAA           GACGCTGT TCTCTT ACAGCGTC            TTATAAAAACTTACA  82 35
LO012_RS15945 NONE
LO012_RS15950 3279945 .. 3279958 +  -8.1  -5.71983   GGTGTCATAAAGAAT               CCAGC GTAA GCTGG                TTTTTTTATACTTAA 100 59
LO012_RS15960 3282090 .. 3282103 +  -8.1  -5.64274   GGTGCCATAAAGAAT               CCAGC GTAA GCTGG                TTTTTTTATGCCTGA 100 59
LO012_RS15965 3282467 .. 3282489 +  -7.8  -3.15758   CAAAAATTTTGAAAA           TCGAGAGT AATCACC ACTCTCGA           TTCATCACCAATTCT  67 16
        yhbY 3287101 .. 3287112 +    -3   -2.8203   GTTCGTCACGCACAC                TTAG CAAA CTAA                 CTTATTGACTACTTA  43 14
LO012_RS15995 3287675 .. 3287693 +  -8.9  -5.83226   TTAAAAAACAAAAAA             GCGAGAA ATTAA TTCTCGC             TTTTTTTATTAACTT 100 37
        carA NONE
        carB 3293024 .. 3293048 + -17.2  -5.62552   TTTTTTTCCGATAAG          TCCCGCCACC TTATC GGTGGCGGGA          TTTTTTCATTTTTTT 100 41
        greA 3293588 .. 3293604 +  -9.4  -5.35815   GGTAATACACTTGAA              CCCCTC TTTAT GAGGGG              TTTTTATTTAATATG 100 41
LO012_RS16020 NONE
LO012_RS16025 3294851 .. 3294880 +   -10  -2.62098   CGTTAAAATTAAAAA       GCCTGTCTAGCT TAATGT AGCAAGGCAGGC        AATTTTTAAAATACT  77 35
LO012_RS16035 3296223 .. 3296248 +  -6.2  -3.36749   TCAAGTCTAGCTATA         CAGCCAAATG GCAAAG CATTTTGCTG          TTCATATTCACCGTC  60 224
        trpS 3325766 .. 3325777 +  -7.2  -5.73339   ATATAAATCAAAAAA                GCCC TACG GGGC                 TTTTTTTATAATTAT 100 55
LO012_RS16115 3336190 .. 3336208 + -13.2  -3.76232   AAAATTAAAAAAAAA             CGCACATC AAG GATGTGCG             TTCTCTATTTGCGCA 100 422
        gltA 3341823 .. 3341838 + -10.4  -5.64274   CATTAATGTAAAAAA              GCTGCC TAAT GGCAGC               TTTTTTTATAAATAA 100 53
LO012_RS16155 3343417 .. 3343438 +  -9.5  -5.31059   TAGAGTTTCAAAAAA           GGCATTTAG TTTT CTAGATGCC            TTTTTTAATTCATAT 100 48
        rpoD 3346625 .. 3346644 + -11.4  -3.62096   AGAAAGAGCTATAAA            CGCCTGCG ATGA TGCAGGCG             TTTCACATGATGAGG  93 82
LO012_RS16175 3346956 .. 3346994 +   -12  -3.89903   AACTGCGCTTTAATT   TTAAAATGCCATGACA AATTTAA TGTCATGGCATTTTTA   TTTATACCAATCTTT 100 28
        lipB 3347818 .. 3347835 +  -7.1   -3.1243   TGGAATAAAAATATA             TTAGAGT AATT ACTCTAA              ATTTGCTTTTGCATA  64 53
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LO012_RS16190 3349625 .. 3349651 +   -11   -5.4492   AAGCAAAAAGCTAAA         GGTCTGATTTTT ATG ACAAATCAGACC         TTTTTTATATCTATG 100 60
LO012_RS16195 3351249 .. 3351264 + -10.4    -5.626   ATGAATAATAAAAAA              GGCGCT TAAA AGCGCC               TTTTTTTATGGACTC 100 33
LO012_RS16205 3352340 .. 3352371 + -13.3  -3.13164   TAGATCAAGCTTAAA      TAAAAATAAGGCC ACTAAG GGCCTTATTTTTA       TTCAGTACTTAAGAA 100 27
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LO012_RS16255 3361819 .. 3361836 +  -8.5  -3.54459   CAGGCTTGAAAAAAA             GTGTACT GGCA AGTACAC              TTTCAACGGCGTTCA  76 140
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        adeI NONE
        adeJ NONE
        adeK 3368458 .. 3368473 +  -6.8  -5.45652   CACTTTCTTATAAAA              GCTCAC TTCG GTGGGC               TTTTTTATTGCAACT  93 50
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LO012_RS16285 3369798 .. 3369812 +  -2.8  -4.74858   GGGTTTTTCCATCAA               TTTAGC ACG GCGAAA               TCTTTTTTTTATTTC  63 488
LO012_RS16305 3374436 .. 3374461 + -14.9  -4.84363   AATTTAATTGTAATA         TAAAGGGCTGA TTAT TCAGCCCTTTA          TTTTTCATAGTTTAA 100 55
LO012_RS16325 3378607 .. 3378619 +  -6.3   -3.7046   ACAGACCCAGATTTG                TTCCA AAA TGGAA                TTTAGCACTTTTTTC  64 291
LO012_RS16330 3379852 .. 3379871 +  -9.3  -6.04324   TCTAAAGTGCTTAAG            GCGACGA TACTAT TCGTCGC             TTTTTTATTTTTTAA 100 46
LO012_RS16335 3380967 .. 3380983 + -10.1  -2.85784   CTGAAATATTAATAA              CACCCTG ATG CGGGGTG              TACTTAATTGCATTA  73 310
LO012_RS16365 3388437 .. 3388447 +  -5.4  -3.69341   GAACGAATCTGGTCT                 GATG GGC CATC                 TTAATTTATCTTGCC  59 49
LO012_RS16370 3389452 .. 3389466 +  -4.3  -4.12188   GCTACAGTGGTAAAA               GTGAT ATGAA ATCAC               TTTTACCCATCATAA  60 79
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LO012_RS16380 3390882 .. 3390901 +   -10  -5.60556   GACATTGAAATAAAA            CGGTGACA ATCA TGTCGCCG             TTTTTCTTTTATATT 100 59
LO012_RS16400 3395366 .. 3395385 +  -8.6  -5.73978   TTAAAACTATAAAAA            GTCATTGC CTCG GCAATGGC             TTTTTTGTTTATAAT 100 56
LO012_RS16405 3395581 .. 3395594 +  -3.1  -5.44721   TAGTCCGACATAGAC               CGAGA TAAT TCTTG                TTTTTTTACGGTACT  74 119
LO012_RS16410 3397150 .. 3397169 +  -6.5  -2.79098   CAAACAGCGCTTGAC            TGTGCAA TTATAT TTGCACA             TAATTAGTACATAGA  58 277
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LO012_RS16425 3398188 .. 3398203 +  -6.1  -4.15006   ATTAAAAATTAAAAA              CCCTC ATTAAA GAGGG               TTTTGAGCTAGCTGT  68 36
LO012_RS16430 3398584 .. 3398595 +    -3  -5.15682   GAGAAAAAATGTGCG                CAAA AGCA TTTG                 TTTTATTTGTATTTT  71 46
LO012_RS16490 3412339 .. 3412357 +  -3.7  -5.24129   GCTAGAAACAAATAA             ACCCGCT GATTA GGCGGGC             TTTTTTGTAGAAAGA  72 13
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LO012_RS16720 3439049 .. 3439065 +  -3.7  -3.71913   CAAAAGATTAATAAA              CTGTG AACCCGA CACAG              TCTTTTAAATGTGGG  52 30
LO012_RS16725 3441458 .. 3441474 +  -9.4  -5.24647   AATCCCCCCTTCGAA              CCCACC ACCAC GGTGGG              TTTTCTTTTGTCTAT 100 39
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LO012_RS16775 3445633 .. 3445652 + -12.2  -4.32678   AGAAAAGCACAGAAT            GGCATCCT AAAA AGGATGCC             TTATTTGTTTGAGGG 100 16
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LO012_RS16805 3452043 .. 3452070 +  -7.1  -3.54158   ATTAAGATAGGGTTA        GAAGACCAC TTTCAAATTT GTGGTCTTC         TTGATTATTCACGTA  68 36
LO012_RS16815 3454248 .. 3454287 +  -6.6  -2.87527   AAATCTTTGACCATT  TTTCTTGGATTTATGACA AAAA TGTCATAAAAACAAGCAA   CTTTAATAATAGATA  61 302
LO012_RS16820 3456021 .. 3456049 + -17.7  -3.95724   AAAAACTAATCTAAA        TAAAAAAGGCGCT ATA AGCGCCTTTTTTA        TTGTCTATTTTTTCT 100 46
LO012_RS16830 3457620 .. 3457637 +  -9.9  -5.48303   TTCGGTATAAAAAAA             CCACTGA TGAA TCAGTGG              TTTTTTTACAGTTAT 100 41
LO012_RS16835 3459168 .. 3459192 +  -9.3  -5.26875   CGAGTTAGGAAAAAT          TAAGGGGCTTT AAA ATGGCCCCTTA          TTTTTTAATTGCGCG  95 33
        gatC 3464446 .. 3464477 +  -2.4  -2.51509   TGTATCTTGTTCCTC      GCG-TGATTGAATAA CTT TTAATCAATCAACCC      ATCTTCCCTATTTTG  40 12
        gatA NONE
        gatB 3467486 .. 3467503 +  -5.5  -5.25803   TAACTCAATAAAAAA             GCTTCGA TTTA TCGGGGC              TTTTTTATACCACTT  80 51
LO012_RS16885 3468234 .. 3468262 +  -9.8  -3.16564   TCACCCCAAATACAA       TAAAGCCTGC-AT TTAG ATAGCAGGCTTTA        TTACTAAAATAGAAA  76 51
LO012_RS16900 3470849 .. 3470862 +  -9.5  -3.04125   AATAACCATAAAAAA               CCCGC TTTC GCGGG                CTCTTTTTACTTATG  76 44
LO012_RS16935 3478200 .. 3478235 + -13.5  -4.93365   TGATTAAAGATGCAA    GACAATCACTCTCTT AAAATC AAGAGAGTGATTGGC     TTTTTGCTTGTCGAA 100 34
        yccS NONE
LO012_RS16950 3482423 .. 3482452 + -13.1  -3.41051   ATAATTTCACCTCTT       TAAAAAGCCTCCT TTAC AGGAGGTTTTTTA        TTATGCTAAAAATAA 100 37
LO012_RS16955 3485134 .. 3485164 + -10.6  -5.08601   TCAATAAATAACAAA      GCCGAGTAATAGC CAAAAT GCT-TTACTCGGC       TTTTTATTACAATCA 100 44
LO012_RS16960 3486417 .. 3486433 +  -7.9  -3.21593   TCGAACCCGCGACCC              CCGGCGT GAC AGGCCGG              TATTCTAACCAACTG  65 415
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LO012_RS17010 3489403 .. 3489421 + -11.8  -6.20267   CTTAACATTTAAAAA             CCTTATCG TTT CGATAAGG             TTTTTTTATTTTTAA 100 47
        dapE 3490664 .. 3490693 + -13.1  -4.46215   AGATCAGGAATTAGA       TAAAAAGCATCCT CTTT AGGGTGCTTTTTA        TTATTTTTAACTGTG 100 49
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LO012_RS17075 3508929 .. 3508969 + -13.8  -3.06515   GCGTTAATAAATACA TAAA-TAAAAAAGCAGCTT TTAG AAGCTGCTTTTTTAATTTA  ATTTTACGCCTGAAC 100 34
LO012_RS17100 3511870 .. 3511891 + -10.1  -4.55287   TTTAATAAATTAAAA           GCCCGTGGA TAAA TCTGCGGGC            TTTTCTATAGATACA  93 46
LO012_RS17105 3512708 .. 3512742 + -11.6  -4.84017   GTCAGTAAAATAATC     CAATACGCCACTCT CTTAAGT AGAGTGGCGTATTA     TTTTTCTCCACAGTT 100 28
LO012_RS17110 3513726 .. 3513739 +  -9.5  -5.07652   AGTAAAGAGACAATA               GCCCC ACAT GGGGC                TTTTCTTTTACCACC 100 39
        mutM NONE
LO012_RS17140 3520431 .. 3520447 +  -8.7  -5.31275   CTATGTAATAAAAAA              CGGTACT CTA GGTACCG              TTTTTTATACTCAAA  95 491
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LO012_RS17180 3528815 .. 3528832 + -11.3  -5.27779   CGCCATAAAAAAAAA             GCGACTC TAGC GAGTCGC              TTTTTTACTGTTCAA 100 106
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LO012_RS17195 3532116 .. 3532131 +    -9  -5.24129   AAGCCTTTTTTAAAA              TCCCAC TTCG GTGGGA               TTTTTTATGAAAAAA  95 44
LO012_RS17200 3532675 .. 3532708 + -11.2  -3.57971   ATACTTAAATCTTTA     GCCCTTATAGAGAT CTCAGT GTTTCTATAAGGGC      TTTAAACATCGATAT  89 33
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        aspS 3588792 .. 3588840 + -11.4  -4.44819   AGAAAGAAGCTTAAT TGCTCTTTAATAAAAAACCCTGC AATT GCAGGGTTTTTTATTAA-GAAAA TTTTAATGTGTTATC 100 27
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LO012_RS08405 1737288 .. 1737306 -    -6  -2.62983   CCTATTTTGAGATCA             GCACAAGT TTT AATTGTGC             TGATTTTTTGCATCA  55 16
LO012_RS08395 1735215 .. 1735240 -    -9    -3.254   GATCCATTTATAAGA         GCCAGCTTTG TTTTTT CAAGGCTGGC          TTTTTATTGGGTAAG  77 43
LO012_RS08380 1731424 .. 1731447 -  -3.2   -4.8667   TACATTTGATAAAAA          GCACTTCA GGTCGTTT TAAAGTGC           TTAAAATTTGATTAA  65 37
LO012_RS08375 1730103 .. 1730127 -  -9.4  -3.23216   CGTTAGTACCATCAA          TCCTATAGGC ATAGG ACCTATAGGA          TTTTTTGTGATGGAT  78 45
        pobR 1718995 .. 1719021 -  -3.7   -2.9699   ATTAGATCTAGAAAT         TTTTCAGGCGC TTCGT GGGGCTGAAAA         TGTAAATCAAGACAT  47 488
LO012_RS08320 1717788 .. 1717811 -   -11  -5.27779   TTGAATATTAAAAAA          GGCCTTGTTC AAGT GAACGAGGCC           TTTTTTATTTTAAGC 100 35
LO012_RS08265 1707176 .. 1707186 -  -2.6  -2.57564   GTATTTCCCTATAAC                 TTAT TCA ATAA                 AGGTCTATTTACCTT  40 59
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LO012_RS08245 1703620 .. 1703633 -  -3.8  -3.57792   TCACTCATGCTCAAA               GCCA GTTGGT TGGC                TGGGCATGAGTGCAG  53 65
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LO012_RS08185 1694514 .. 1694532 -  -7.5  -5.44721   ATGATGTTAAAAAAA             GCTCTAT TTAAT ATAGAGC             TTTTGAGCTATTAAT 100 45
LO012_RS08180 1694035 .. 1694057 -  -3.5  -2.66787   TCAATATTCATATTA           CATATCAAA GTATT TTAGATATG           CAAAATATATATTTA  44 237
LO012_RS08175 1693287 .. 1693300 -  -2.4  -2.67386   AAAACTCATCAGAAT               CAAG TATCAG CTTG                GTTTGATCCTTCAGG  40 419
        paaZ 1673907 .. 1673935 - -13.2  -5.42259   TGAGTGCTAAAAAAA        TGAGATGGGGAC GAGGT GACCCCATCTCA        ATTTAAACATTAAGC 100 35
LO012_RS08075 1670372 .. 1670394 -  -8.5  -3.12999   TCACTTGAGAGTGAA           CGTCAAAAG TGGTT CTTCTGACG           TTGGAGAGTTATCAA  72 132
LO012_RS08070 1668733 .. 1668757 -  -9.4  -5.63103   TTTGAACTAAAAAAA          GGAGTTCATC ACTTG GATAAACTCC          TTTAAAAATATTAAA 100 36
        abaF 1667262 .. 1667284 -  -8.5  -5.38047   TATTTAGATAAAAAA           TTGGGCTGT ATAAA ACAACCCAA           AATTATTGTTAAGCA 100 61
LO012_RS08030 1660716 .. 1660735 - -10.8  -5.65177   ATATCTATAAAAAAA            GAGGCTAA CAAT TTAGCCTC             TTTTTTACTTCTATT 100 43
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        ahpC 1493240 .. 1493273 - -12.6  -4.18018   TGTGCTTATTCAAAA     CAAAAGAACCATCC GATAAA GGATGGTTCTTTAG      GTTTTTTAAAATCTA 100 48
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        ahpF 1490098 .. 1490121 -   -14  -5.14563   TCTCGTATTAAAAAA          GCCTAGCATT TTGT AATGCTAGGC           TTGAACTAAATGATA 100 56
LO012_RS07160 1489584 .. 1489624 -   -23  -4.62872   AGCAATTTTCAAAAA  GCATTAAAAAAGCCCCTA AGTGA TAGGGGCTTTTTTAATGC  TATAGTTAATTAGTG 100 35
        trmB 1485421 .. 1485443 -  -9.9  -4.57516   ATATTGAAATGAAAA           GGGCCTAGT TTGTT ACTAAGCCC           TGTTTCTTACTTAAT  93 32
LO012_RS07140 1484298 .. 1484309 -  -5.8  -3.46647   CTGATTTAGCAAATA                GCCT AAGT AGGC                 GTGTATATCAATATA  58 368
       rlmKL 1475741 .. 1475760 -  -5.8  -2.53581   TACATGGTGAAGTTA            TCATTACC GTGA AGTAATGA             TAACTTCCTTTTCAA  54 48
LO012_RS07085 1470358 .. 1470375 -  -4.1  -5.75538   CCTAAAAAATAAAAA             GCTAACA GTCA TGTTGGC              TTTTTTTATGATAAG  86 491
         crp 1468719 .. 1468734 -  -7.6  -5.71712   TTGCATATAAAAAAA              GCAAAC CGAA GTTTGC               TCTTTATTCAATAAT 100 50
LO012_RS07060 1467522 .. 1467539 - -11.3  -4.63184   AACTGATGTTAAAAA             CGGATGC TTGA GCATCCG              TTTTTGTTTTTAAGG 100 35
        alaS 1459351 .. 1459376 - -10.5  -2.63079   GTTCCATATAAGCCA         TGACCCTGAGA GGCT TGTCAGGGTCA          GTTACACAAAAAGTG  80 46
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