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        phrB  285732 ..  285745 +  -2.5   -3.1506   AGTCTGCTCTGTTTA               TTTTT GATG AAAAA                TTAATAACAAGGTTT  45 51
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FDF39_RS06605 NONE
FDF39_RS06610 1380186 .. 1380222 +  -2.5  -3.23216   GCAATTTTAAGGTTA    TAAACTGTGAAAAAA GTATTGG TTGTTTCAGAGTTTA    TTGATCCTGATCAAA  45 31
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FDF39_RS06620 NONE
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FDF39_RS06630 1383934 .. 1383959 +  -4.1  -4.36914   TGTGAAATTGTATAG         CCTTAT-AATCC CTA GGCTTGATAAGG         TTTTCTACGGAAGCA  64 70
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        galU 1386923 .. 1386947 + -11.6  -2.95079   TAACAGAGCAATATA          TTCTCTTCCT GTAAA AGGAAGAGAA          GTTTATAGAATATTA  83 87
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        galE 1390923 .. 1390951 + -14.1   -4.9445   ACAATTAAATTCGGA        TAAAAAAGGAGCG ATT TGCTCCTTTTTTA        TTTTTAATTAGTTCT 100 33
        lldP NONE
        lldR NONE
FDF39_RS06675 1396351 .. 1396391 +    -2   -4.0641   AATGTTTTACATATA GGCATTT-GTCACTTTTGA AAGG TCAAAAGTAACCAAAAACC  TTTGTCTCGATGACG  52 91
FDF39_RS06680 1398301 .. 1398314 +  -9.5  -4.75372   TGAGACATAAAAAAA               GGCGC CGAA GCGCC                TTTTTAATAGATGAT 100 44
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        prpB 1401739 .. 1401757 + -10.4  -3.74251   CTGCCTTGCGCTATT             TTCAAAGC GAT GCTTTGAA             TTTGCTCAGGATATA  87 116
        prpC NONE
        acnD 1405738 .. 1405756 +  -6.7  -5.14965   TATTGTTCAAAAAAG             CCCTATC TTGAT GATGGGG             TTTTTTAATGAGAAT  84 63
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FDF39_RS06715 1406861 .. 1406879 + -14.6    -4.946   GTGAAAACTAAAAAA             GCCCGACA TCC TGTCGGGC             TTTTTCGTATTTGGT 100 30
FDF39_RS06725 1408041 .. 1408059 + -14.6  -4.53047   ATGACCATAAAAAAA             GCCCGACA TCC TGTCGGGC             TTTCTTGTATTTGGT 100 63
FDF39_RS06740 1410752 .. 1410772 + -12.7  -2.66008   TGCAGTAAAAATAAA            GAAGCGTAT TTT ATACGCTTC            TCCTATGCCTAATTT  86 225
FDF39_RS06755 1413843 .. 1413858 +  -3.4  -3.76492   GAGTCACAAGTGCCT              TTTTAA AAAA TTAAAA               TTTGATGCAATTCGC  52 20
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FDF39_RS06765 1414749 .. 1414766 + -11.3  -5.86976   ATGTTTTAATGAAAA             GCCCGAA ACTA TTCGGGC              TTTTTTATTTTATAG 100 32
FDF39_RS06775 1418113 .. 1418142 +  -8.7  -3.16564   ATTTTCAAAAGGTGA       GTAAAGCGAGT TCAGTAAT GCTCGCTTTAC        TTGCTCACATCGAGA  73 40
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         alr NONE
FDF39_RS06795 1421586 .. 1421631 +  -4.8  -3.01791   TTTTGGTGAACAGAT TCAGTGACCTATGGCATA CGGTTCAATT TTCGCCATAGGTTGCTGA TCTTAACAAAGGAAT  52 109
FDF39_RS06800 1423118 .. 1423137 +  -8.6  -6.17669   AAGTTTTATTAAAAA            GCCAATCG AACA TGATTGGC             TTTTTTTATTTTCTT 100 39
FDF39_RS06805 1424931 .. 1424948 +  -9.9  -5.52807   TCGATTTACCAGAAA             GCCAATC ATAT GATTGGC              TTTTTATTTATTATT 100 51
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        mmsB 1428437 .. 1428449 +  -4.8  -3.54543   AGGCATAACGGTAAA                GCCA AAGGA TGGC                TTTAAACGAATAAAT  57 33
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FDF39_RS06835 NONE
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FDF39_RS06845 1434655 .. 1434685 + -12.7  -2.88579   GCTATGTAAAAATTA       GGACTCATGCC CCACGGATA GGCATGAGTCC       TATATAAGAAATTAG  86 76
FDF39_RS06860 1437389 .. 1437435 +  -4.3  -5.08367   TTCTAAGCTATATCC TTAAATTACTATATTTTATATA TGCC TATATAAA-TATAATAATTTGA TTTTTAATTTATATT  76 195
FDF39_RS06865 1439784 .. 1439804 +  -7.5  -2.62263   ACTTACGTCCAATTT            GCGGCAGTT TCA ATCTGCTGC            TCGTCTGGAGCAAAT  63 78
FDF39_RS06875 1441792 .. 1441806 +  -3.5  -3.14463   TCTTGTTTCTGAGCT               GCAGC AGGGA GTTGC               TTCATGAACAACCTT  45 4
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FDF39_RS06885 NONE
FDF39_RS06890 1450748 .. 1450761 +  -6.7  -3.06078   TGCTGGAGTGCCCAG               CACCT AATA AGGTG                ATTTATGGTTAATTT  59 61
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FDF39_RS06900 1453453 .. 1453476 +  -9.6  -4.35524   AGATCAAAAGAAAAA          GGCACTTACC TTCC GATAAGTGCC           TTTTGAATTTGGAGC 100 87
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FDF39_RS06925 NONE
FDF39_RS06930 1455949 .. 1455994 +  -7.2  -2.73007   CGAATTAATCATCAG TTT-TGCATCACAATATGCTA ACTAA TTGCATATTGTGATGAATAAA GTTTAGCAAAATGTT  61 33
FDF39_RS06935 1456936 .. 1456959 +  -5.5  -3.21099   AATGCGCCAATTACG          TTATAAGTT AAGAAA AACTTATAA           TTCATGCTGCCAGCA  54 214
FDF39_RS06945 1458048 .. 1458068 + -11.2  -5.56264   AAAGCAAAATAAAAA            CCGGATGA TTCAT TCATCCGG            TTTTTTATATTTAAA 100 46
        guaA 1461271 .. 1461289 + -13.2  -5.46276   ATAATCAAATGAAAA             GGCAGGAT TAA ATCCTGCC             TTTTTTATATCTGTT 100 37
 ant(3'')-II 1462169 .. 1462184 +    -9  -5.87996   CATACGGCTATATAA              GAGTGC TTAA GCACTC               TTTTTTTATTACTTA 100 81
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FDF39_RS06970 1463279 .. 1463292 +  -3.1  -3.13522   ATTGATTGTCTCATT               CATAG CACC CTGTG                TATTACTAAAAGACT  45 77
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FDF39_RS06980 1464791 .. 1464808 +  -9.9  -5.36441   ACAAATGGAATAAAA             CAGCATG TTCA CATGCTG              TTTTTTATGTAAAAA 100 81
FDF39_RS06985 1465524 .. 1465541 +  -8.5   -5.5604   ATATATAAAAGAAAA             GGAACAA ATAT TTGTTCC              TTTTTTATTGCTTAA  95 33
FDF39_RS07000 1470342 .. 1470358 +  -8.7   -5.5074   GGACATATATAAAAA              GGGGGTA AAT TACTCCC              TTTTTTATTAACTTA  95 47
FDF39_RS07005 1471111 .. 1471130 +  -6.5   -5.4477   GGTCTTAAAGAAAAA            GTAGCTA CCGTGA TAGCTAC             TTTTTTTAAAAATTT  87 127
FDF39_RS07015 1472841 .. 1472869 + -12.5  -4.39092   TGCTAAGTACGGTCC        ATCAAGCAGCCTG ATT TAGGCTGCTTGAG        TTTGATTTTTGATTT 100 12
FDF39_RS07035 1475984 .. 1475994 +  -3.2  -2.80935   AGATTGCATGTTCAG                 GGGT GTA ACTC                 TATAATGCCTGCGAT  44 115
FDF39_RS07040 1476488 .. 1476533 +    -4  -4.81083   AATTGAAGATTTTTT GGAGGGTGGCGAGATATCGAC AGTAC GCCGATGT-TCGTTTCCCTTC TTTTTAGTAATTGAC  67 51
        atpB 1477450 .. 1477475 +  -8.3   -3.0623   AACATTAATGGTATT         GCCTAACTGTC AAAC GATGGTTGGGC          TGAATTTTTTTTAAT  68 33
        atpE NONE
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FDF39_RS07065 1480466 .. 1480477 +  -3.6  -3.62275   GATCAACCTTCGGAA                GCTC GAAA GGGC                 TTTCGAATACTAGGT  52 69
        atpG NONE
        atpD NONE
FDF39_RS07080 1483253 .. 1483268 + -10.4  -5.58179   GTTCGAGATTGAAAA              GCCACC GAAA GGTGGC               TTTTTTATTATCATA 100 47
FDF39_RS07085 1483872 .. 1483887 + -10.4   -5.5112   AATTAAATAAAAAAA              GCCACC TTTC GGTGGC               TTTTTTATTGCTAAA 100 35
FDF39_RS07110 1488103 .. 1488116 +  -2.5  -2.92442   TGAAAGCTTGGACAT               TATTT TAAA AAATA                TATGATGTCTTAAGT  42 18
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FDF39_RS07175 1500304 .. 1500355 +  -8.4  -3.99678   TAAGATAAGTTCGGA TTACAGAAATTAGTAAATAAAGAT TGAG ATCTTGGTTTATTAACTTCTGTGA TTTCATTATCACGGT  79 46
FDF39_RS07180 1503636 .. 1503646 +  -5.4  -3.53761   ATTCAATCAGCCCAG                 TCTG TTA CAGA                 TTTGGAAAACGCTTC  59 125
         rrf 1503830 .. 1503857 + -16.4  -5.60993   GCTCATTATTCTAAA        CACCCCAATCTC AAAA GAGGTTGGGGTG         TTTTTTTATAGCAAG 100 38
FDF39_RS07190 1504637 .. 1504647 +  -2.6  -3.59223   TTATATCTTTTTATT                 TTTA ATG TAAA                 TTCCATTTTTTATTT  48 126
        cysK 1505761 .. 1505778 +    -7  -5.37171   TAACCATATAAAAAA             GCCCAT GAATAA ATGGGC              TTTTTATTTAATCTT  89 44
FDF39_RS07215 1508343 .. 1508359 +  -2.3  -3.15579   CCATAAAGATTTCAT              ATTTTTG AAG CAAAAAC              TTCATACAAGCTTGA  44 104
FDF39_RS07220 1509697 .. 1509720 +   -11  -3.83502   TAAATGAGTTCGATC          TGCGGCGGAG TTTA TTCCGCCGTA           TTTAATCTAAGAATA  90 51
FDF39_RS07225 1512268 .. 1512298 + -14.3  -4.62783   GCTCGTGGATAACGA       TAAAAAAGGCTCT GTTTA AGAGCCTTTTTTA       TTTTTAAAGTGAGTG 100 29
FDF39_RS07230 1513168 .. 1513197 +  -5.1   -5.1963   TAAAAATATAAAAAA       CTGAGCACTAT CATGATCA ATATTGCTCAG        TTTTTATTGATTAAA  77 115
FDF39_RS07260 1519954 .. 1519971 +  -8.5  -5.63517   AGAAACATCATAAAA             TAGCTCA ACTT TGAGCTA              TTTTTTATTTGAGAA  95 57
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FDF39_RS07270 NONE
FDF39_RS07275 1522618 .. 1522632 +  -5.6  -2.78197   ACAATTTGACGCTCA               GGTGAC AGA GTCCCC               CTTGTGTCTGTAACA  52 90
        parC NONE
FDF39_RS07285 1526920 .. 1526933 +  -9.5  -5.73563   GATGAATAAAAAAAA               GCGCC GTAA GGCGC                TTTTTTTAGTTTAAT 100 42
FDF39_RS07295 1527813 .. 1527838 +  -5.5  -3.50447   TATTCTTGTTGATCG         TGACAATTAAG TTGA CTTGAGTGTCA          TTCTGTCACCATTCA  57 6
FDF39_RS07300 1528541 .. 1528564 +  -9.6  -5.71983   GGGCTTAATAAAAAA          CCTACCTGTG TGAC CAGAGGTAGG           TTTTTTTATGCTTGA 100 79
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FDF39_RS07410 1550225 .. 1550246 +  -7.3  -3.90744   CACAAGCGACTACAC           CACATCACT AGAC AGTGATGAG            TTATTTACAAAAAGA  73 161
        glnK NONE
FDF39_RS07435 1555575 .. 1555622 +   -18  -5.74122   TTCTTATATCAAAAA CAGTCTTGTGCTGTGATCAAAGC GAT GCTTTGATCTCGG-ACAGGACTG TTTTTTTGTCTCATA 100 51
        nrdR 1556642 .. 1556662 +  -6.9  -3.15861   GCATGCCATATGTAC            GACTAAAAG TTG CTTCTAGTC            TTGATGGGCGTACTG  65 501
FDF39_RS07450 1558595 .. 1558609 +  -2.1  -2.79581   AGATTTGGAGATTGA              GCCATG TTTA CA-GGC               ATTATTGAAAGTTTA  41 65
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        lptF NONE
        lptG 1564570 .. 1564592 +  -5.7   -3.0634   TAGGAAAAAATAGAG          TCTTCACCGA AAAT TCGGT-AAGA           TATTGCGATGAAATT  54 91
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FDF39_RS07495 1567755 .. 1567776 +  -2.2  -3.80745   CCGGAAAGTGTTGCT           GTAGCAGA TAAGTT TCGGCTGC            TTCTGTTAATTGTTT  51 403
        pbpG 1572319 .. 1572336 +  -9.9  -5.28826   AATTATTTTTAAAAA             CGCTTCT TTTA AGAAGCG              TTTTTTATGCCATTT 100 44
FDF39_RS07540 1577431 .. 1577445 +  -5.7  -3.19293   AGAAGAAGGAGTACC               CGCAT GAGTG ATGCG               TTACGTATTGCCCTT  55 19
FDF39_RS07545 NONE
FDF39_RS07550 1579588 .. 1579604 + -10.9  -5.02074   TGTTTCGTATAAAAA              GCCATCA TAT TGATGGC              TTTTTTACGCACTGA 100 54
FDF39_RS07555 NONE
        ftsW 1582307 .. 1582325 + -10.3  -5.42164   TGAAGTTTTATAAAA             GCCCGAT ATCAA ATCGGGC             TTTTTATTATTTATA 100 45
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        pgsA 1646493 .. 1646511 +  -8.9   -5.4505   AAAAGATTTTCAAAA             GCCTTTC CTTGC GAAAGGC             TTTTTTATTGGAAAG  95 46
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        rpsL 2222878 .. 2222901 +  -7.6   -2.5511   GTAGACCCAGTTGAG          TTTTTCGAGA CTAC TCTTGAAAAA           GTTCGTCCTATGGTC  63 364
        fusA 2225535 .. 2225557 + -12.1  -2.77899   GTTAAAAACCAAGTG           CTCATGGAG CGACC CTCCATGAG           TAGTTAATAAAGGAA  84 75
         tuf 2226790 .. 2226807 + -10.5  -5.71712   TTTTCAGTGAAAAAA             GCGCTCC TTTT GGGGCGC              TTTTTTTATATCGAA 100 45
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FDF39_RS10870 2228986 .. 2229002 +  -9.5  -5.89827   AAACTGACTGGAAAA              GAGCAAT TTA ATTGCTC              TTTTTTTTACTCGTT 100 43
        rimI 2230026 .. 2230038 +  -6.3  -3.28416   CATCGGCATGGCGCT                CGTTA ATG TAACG                TTCATATAGATCATA  60 519
FDF39_RS10895 2235534 .. 2235547 +  -8.1  -5.37345   TACAGTTAAAATTAA               GCCTC TTCG GAGGC                TTTTTTATGGTTAAA  90 45
        rhtC 2236301 .. 2236315 +  -7.1  -5.93252   TTAAATAAGAAAAAA               GCCTC TTTAT GAGGC               TTTTTTATTTTTAAG 100 43
FDF39_RS10935 2241608 .. 2241621 +  -8.1  -5.64274   TTATTGTTTCAAAAA               CCACC TTCG GGTGG                TTTTTTTATGGGTGA  93 49
         rep 2243795 .. 2243817 +    -2  -5.79588   AATATTTGGCAAATT           TAAAAGCTTT ATT AAAGCGTTAA           TTTTTTTAATTTTAG  83 3
FDF39_RS10945 2244318 .. 2244342 + -12.3  -4.62471   AAAAAATAATGAAAA          GAAACGCTTGT TTT ACAAGTGTTTC          TTTTTACACCTTGAA 100 50
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        argB 2246857 .. 2246873 +  -4.4  -5.63504   TATTTTTTATTGAAA              GATCAC GCTAA GTGGTC              TTTTTTTATGCCATT  85 48
FDF39_RS10960 2247733 .. 2247744 +    -3  -4.04187   ACAAAATGGCTCAGC                GATA AAGT TATC                 TTATATTTTGTAATA  55 21
FDF39_RS10965 2248751 .. 2248782 +  -4.7  -4.93547   TTTTGTTTATTTAAT      AATAAAGTATTTT GTTTAA AAAATACTTTATC       TTTTTAGTTGGTTAA  75 82
FDF39_RS10970 2249439 .. 2249463 + -11.5  -5.88565   TATACAGTTAGCGCG          GCAAACTATCG TTT CGGTGGTTTGC          TTTTTTTATTGTGCA 100 62
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         fur 2251979 .. 2252000 + -11.7  -5.60993   AAAACAAATAAAAAA           GGAAGGTTA CGTT TAACCTTCC            TTTTTTTATGAAGAA 100 57
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         ggt 2271048 .. 2271065 +  -7.7  -5.60993   GCAAACTTTAAAAAA             GCTGTCA TTTT TGGCAGC              TTTTTTTATAAGGGG  93 42
        ssrA 2271600 .. 2271624 +  -9.4  -5.19261   AGAGTTGATCAAAAA          GCCTTAAATC TTAAT GATTTAGGGC          TTTTTTAATGCCTTT 100 73
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        astA 2628450 .. 2628468 +  -5.2  -2.62018   TATGGATAAATACAA             TCTTGCTC GCT GAGCTGGA             ATTAATTAGCCTGTT  51 109
FDF39_RS12960 2635562 .. 2635574 +  -4.9  -2.87239   TAATCTTGTTTCTAT                TAATG CCA CATTA                TAGTCTTTAGGTATT  51 260
FDF39_RS12980 2638056 .. 2638078 +  -3.6  -3.95071   TAGCTACTTATTTAA           TTTTATTTTT TTC AAAAAGAAAA           TTGTTTCAAAATTTG  57 118
FDF39_RS13005 2642697 .. 2642717 +  -2.7  -4.08958   ATGAAGGCTCCATCC            TTTTTGTAG GTG TTATAAAAA            TTATTATTTCAGGGT  55 462
        mhpT 2651638 .. 2651680 +  -3.5  -5.22006   CAGGTGCTCGCTAAG TTTTAACGAAAGTATGGGG TAGAT CCTCATACTTTCACTACAG TTTTTCTTATGATGA  74 27
FDF39_RS13050 2652221 .. 2652239 +  -3.2  -3.16564   CACACAGAAAATTGA             TTTCATTT TGC AAATGAAC             TTGCTAGCATCGAAG  47 82
FDF39_RS13055 2653291 .. 2653305 +  -5.8  -4.75472   TTGGACGTATCTACT               TTTTGT GCG ACAAAA               TTTTCTTGATGTAAC  75 353
FDF39_RS13085 NONE
FDF39_RS13090 2662186 .. 2662221 + -11.3  -4.26019   TTTAAATATTAAAAA    GCAGGTTAAAACCTT TTATTT GAGGCTTTAACCTGC     TTTTGGATGTGGTTA 100 42
FDF39_RS13115 2668471 .. 2668485 +  -4.2  -2.91507   TAAACGCAAATGCAA               TAAGCG CGT CGCTGA               TGTATGGCGTATATT  48 61
FDF39_RS13140 2674015 .. 2674040 + -13.4  -4.96106   AATGCGATAAAAAAA         CACCTGCGTA TATTTC TACGCAGGTG          TTTTTACTATTTATG 100 55
FDF39_RS13150 2676289 .. 2676304 +  -6.2  -2.94532   AATTACTGCCGTCTC              CCTAAA ATTT TTTAGG               ATTTACTATGATTTT  56 68
FDF39_RS13155 NONE
FDF39_RS13160 2678730 .. 2678754 + -14.4  -4.88228   AATTAATTTATAAAA          GCCCACCTTA TTGAT TAAGGTGGGC          TTTTTACTATTAAAT 100 39
FDF39_RS13165 2679427 .. 2679447 + -10.5  -5.56264   ACGTATAGTAAAAAA            GCTGCATAG GGG TTATGCAGC            TTTTTTGTGTTTCAA 100 140
FDF39_RS13170 2681021 .. 2681039 + -10.3  -5.65927   GAAGAAATTATAGAA             GGGTGTG CTTAC CACACCC             TTTTTTCTTTAGATG 100 92
FDF39_RS13175 2682074 .. 2682090 + -10.1  -5.47399   TCTAAATAAAAAAAA              CCGCCTG TGA TAGGCGG              TTTTTTTAACATTGA 100 36
FDF39_RS13185 2683319 .. 2683340 + -10.2  -4.05402   TTAAGCATTAAAGAA           GGCCGATT CTTATA AATCGGCC            TCTTTTTCATTGGAG  93 49
        rnhB 2684397 .. 2684434 + -12.9  -5.03713   CTTTCCGTTTAATAT   AACAGAGCCGCTATA AAAAAAAC TATAGCGGCTCTGTG    TTTTCTTTGATTATT 100 495
FDF39_RS13275 2693980 .. 2694000 +  -6.9   -3.3344   CTAGAAATTAAAAAA            GCCTGAT GGTCGAG ATCAGGC            TTCTAGGCATTCAAT  65 20
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FDF39_RS13285 2694975 .. 2694995 +  -4.1  -5.03715   ACTGCTAGTTAAAAA            TTTTAACTA CAC TAGTAAAAA            TTTTTTACCGCTACT  76 400
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FDF39_RS13310 2697281 .. 2697298 +  -9.1   -5.4833   CAAATTGTTTTAAAA             GCTCGCC AAAT GGTGAGC              TTTTTTGTTCCATGA 100 101
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FDF39_RS13335 2699988 .. 2699998 +    -4  -3.11192   TAGAAATTATTGACA                 CAAA TTA TTTG                 TTAGATGATCCTGTA  47 38
FDF39_RS13340 2700623 .. 2700639 +    -8  -5.68438   TATAGTTAAGTGAAA              CCCACT CAATA AGTGGG              TTTTTTATTTCCTAC  93 47
FDF39_RS13345 2701224 .. 2701237 +  -8.1   -4.7497   ATCAATGAAAATGAA               CCTCC TATA GGAGG                TTTTTAATGGGTGCA  86 33
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FDF39_RS13355 2702331 .. 2702344 +  -8.1  -5.77853   ACTGCGTAATCAATT               GAGCC TAAT GGCTC                TTTTTTTTGCCCATT 100 24
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FDF39_RS13380 2707242 .. 2707255 +  -8.1  -5.40072   TAATTTTTAACCATA               GCACC TTCG GGTGC                TTTTTTTGCGAGAAG  93 211
FDF39_RS13385 2707483 .. 2707498 +  -8.2   -5.4833   ATTTATAGAAATGAA              GCGTCC TAAA GGGCGC               TTTTTTATTGCCTGC  93 43
FDF39_RS13400 2710453 .. 2710467 +  -4.2  -3.92143   ACGAAAGAGCGCATT               GCTTTG ATT CAACGC               TTTATAGCCATTTTG  59 480
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FDF39_RS13460 2716250 .. 2716266 + -12.3  -5.41143   GAAACCCAGTAAGGA              CCCGCTA ATT TAGCGGG              TTTTTTTACGCCCTC 100 29
FDF39_RS13465 2717281 .. 2717300 +   -10  -5.72622   TTATTCAGTAACAAA            GCCTATGG AATC CCATGGGC             TTTTTTATTTCTAAA 100 46
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FDF39_RS13475 2718119 .. 2718134 +  -4.6  -2.83522   CAAATTGGGTATTGC              CGGGCT GAAA AGCCCA               ATTTGGTCAAAACGT  48 42
FDF39_RS13480 2718621 .. 2718631 +  -5.4  -3.06515   GGTGACCTTTCAGTC                 GTAG TTA CTAC                 ATTTTAAGAGTAGGC  54 8
FDF39_RS13485 2719132 .. 2719145 +  -8.1  -4.65153   TTTATTTGATAGAAA               CCACC TTCG GGTGG                TTTTCCTTTATGTGA  86 46
FDF39_RS13490 2719548 .. 2719563 +  -6.8  -4.68994   GTAAACAAATCACAT              GGC-GCC CTA GGCTGCC              TTTTTAAATAGTAGT  80 37
FDF39_RS13495 2720391 .. 2720404 +  -8.1  -5.60993   ATCGTAATTAAAAAA               GCACC CTAG GGTGC                TTTTTTTCTAGCCAA  93 34
FDF39_RS13505 2721885 .. 2721901 + -12.3  -5.14563   ATCAACTTAACAAAA              CCCACTC ATC GAGTGGG              TTTTTTAATACCCAA 100 45
FDF39_RS13510 2722560 .. 2722575 +  -3.9   -5.4833   AGACTCGATTTATTG              CCGCC GCTTAA GGTGG               TTTTTTATTGCCTGA  79 44
FDF39_RS13515 2726951 .. 2726972 +  -9.5  -4.37067   TCGTACTTAATAATT           TGAACCCTT TTCG GAGGGTTCA            TTTTCATAATATTTA  93 31
FDF39_RS13520 2727675 .. 2727690 +  -6.8   -4.9725   TATTGTTTTAGTAAA              CCACCT TTTG GGGTGG               TTTTTATATGCAAAT  83 77
FDF39_RS13525 2728752 .. 2728765 +  -8.1   -5.4833   GTTAATTTTTTATGA               CCACC TTCG GGTGG                TTTTTTATTACCTGA  93 36
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FDF39_RS13565 2735731 .. 2735741 +    -4  -2.70263   TTTAATGGGTGATTT                 TTGA GCA TCAA                 TAGATTATTATGTAA  45 277
FDF39_RS13575 2736134 .. 2736149 + -10.4   -5.4505   TTATTTGAATCAAAA              CCCACC AATC GGTGGG               TTTTTTATTGCCCGG 100 45
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FDF39_RS13585 2737724 .. 2737737 +  -9.5  -5.60689   TGATTTCTTCTAATA               CCGCC TTAA GGCGG                TTTTTTATTGTCTGG 100 63
FDF39_RS13590 2738768 .. 2738785 +  -2.1    -3.254   AAGAGACCAATGCTT             CAT-ATGA TAG TCATGATG             TCTTCTGAGTCGCTC  43 436
FDF39_RS13605 2744201 .. 2744216 +  -6.1  -5.37043   CTACACTAAGAGAAA              TCGGG TGTGTT CCCGA               TTTTTTATGTGGGGT  84 236
FDF39_RS13610 2745435 .. 2745459 +  -7.9  -3.76413   GAAAAGATTTAAACG          CCAGCAGTAAG TTT TTTACTGATGG          TTTCCAATTTTAACA  73 29
FDF39_RS13615 2746834 .. 2746850 + -10.1  -5.26316   GCAAAGATAAAAATA              GCCTCCT AAA AGGGGGC              TTTTTTATACCCTAC 100 44
FDF39_RS13620 NONE
FDF39_RS13625 2748176 .. 2748205 + -14.5  -4.56597   TTATAGAACTGATGT       TAAAAACGGATGC TTGA GCATCCGTTTTTG        TTTTTAAGGAGCAGG 100 51
FDF39_RS13640 2751016 .. 2751033 +  -6.3  -5.67063   ACCTAAAAATAAAAA             GCTAACA GTCA TGTTGGC              TTTTTTTATGATAAG  89 55
FDF39_RS13650 2752902 .. 2752918 +  -4.3  -3.64716   CCCCAATGTAAATGG              GGGCCTG TGA CACGTCC              TGTTTTACCGACTAG  56 95
        clpB 2756539 .. 2756560 + -10.3  -5.88197   TGCTAAAACCGAAAA           GAGAATATG GAAA CATATTCTC            TTTTTTTATATTTAA 100 49
FDF39_RS13670 2757722 .. 2757755 + -14.2  -2.64412   AAGAATGTACATGGT     GAAGTTATCATTAC CGTGAA GTAATGATAACTTC      CTGTTTCAAATTCAG  93 2
FDF39_RS13680 2760570 .. 2760599 +  -7.3  -3.89348   AGGTAATCTGAGCAC       GGCTCTAAATT TTCTGGTC AATTTAGGGCC        TTATTCTGTAAAGTT  70 35
FDF39_RS13685 NONE
FDF39_RS13690 2762925 .. 2762935 +  -5.4  -4.52266   AAGCTTACAGGTAAA                 GTCT TAC AGAC                 TTTTGCTGTTTAATT  71 2
FDF39_RS13695 2764612 .. 2764630 + -11.8  -5.61596   TCTAATTTGAAAAAA             GCTTCTCA TTT TGAGAAGC             TTTTTTTATAGAAAT 100 60
FDF39_RS13700 2765535 .. 2765567 +  -4.9  -3.31144   GTCGACATGTTTAAG     CGCTGGATGGTCAA AAGGAG TTG-CTTTCCAGCG      TTGTACAGATAGCCC  54 117
FDF39_RS13720 2772237 .. 2772271 +  -8.8  -4.18494   AGTTTAAGTAATTGA     TTATGGCACTAAGT CATTAAA ACTTAATGCCATAA     TTTTAAATAAAAATA  85 71
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FDF39_RS13755 2779688 .. 2779706 + -13.2   -5.4588   TCATATTCCAGTTGG             GGCCTGTT TTG AACAGGCC             TTTTTTATAATTTTA 100 59
        hrpA NONE
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        cueR NONE
FDF39_RS13835 2799627 .. 2799641 + -11.4  -5.17353   CAACGTTGCAGAAAA               GCCCGT GAA ACGGGC               TTTTTTAATGCCTAT 100 252
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FDF39_RS13875 2804496 .. 2804528 +  -2.8  -3.24245   ATGCTCTGTGATGTA      CTACTTTTCATGAT ACGAA ATCATGGAAAGCAA      TTAGCTTATAAATAA  45 48
FDF39_RS13880 2804908 .. 2804931 + -10.4  -5.36441   AATAAAGCAAAAAAA          CCTATCTCTT TTAA AGGAGATAGG           TTTTTTATATCGAGA 100 53
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FDF39_RS13905 2808777 .. 2808796 +  -2.1  -5.38047   CAAGATAGTTAAAAA            CCCAC TTCTTCCTTT GTGGG             TTTTTTATATGGATA  70 110
FDF39_RS13910 2809203 .. 2809225 +    -5  -3.17212   TTAATTACATATTTT           TAACAATTTA GAT TAATTTGTTA           TTCATAAAGTCATAA  54 110
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        queG 3155205 .. 3155222 -  -2.7  -2.56914   GATGGCATTAATTCA             CTGTACA TAAT CATACAG              AATTCGTATTAAAGC  41 77
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        benA NONE
        benB 2792241 .. 2792265 -  -6.3  -2.83822   GGCATGTCATAATGA          CCTGACTCGCA AAA TGCGCGGCAAG          TTCCACATGCACCAT  58 239
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        benE 2789251 .. 2789293 -  -2.1  -4.36862   ATATTAAATAAAGAA TGCCAAAACAGGGATAGCGAA TTA TTTGC-AT-CCTGATTTGGCG TTTGAAGCTTTATTT  57 66
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FDF39_RS13780 2786158 .. 2786185 -  -9.2  -4.40963   ATGGGTTAAAAATAA        TAAAGCAGGCCA AAAT TAGCCCGCTTCA         ATTGAATCAAAAATA  93 42
        ahpC 2780072 .. 2780105 - -12.6  -4.18018   TGTGCTTATTCAAAA     CAAAAGAACCATCC GATAAA GGATGGTTCTTTAG      GTTTTTAAAATCTAA 100 47
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        trmB 2772237 .. 2772271 - -11.7  -2.60423   AGTTTAAGTAATTGA     TTATGGCACTAAGTC ATTAA AACTTAATGCCATAA     TTTTAAATAAAAATA  83 50
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        alaS 2740013 .. 2740038 - -10.5  -2.63079   GTTCCATATAAGCCA         TGACCCTGAGA GGCT TGTCAGGGTCA          GTTACACAAAAAGTG  78 46
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FDF39_RS13560 2734230 .. 2734248 -    -3  -4.23213   GTTACATGGAAGAAA             TAGCCAGC GGT GCAGCCTA             TGAAGGTCGTAAAGA  57 450
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