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CTTTTT TATAGCGTA TTTTTTTCGGCTATA 100 48 rho 3295279 .. 3295308 + -16.7 -3.90291 TCAATTAATCTTCAA TAAAAAGCCACTC TTTT GAGTGGCTTTTTA TTTGGTTGACAAGCT 100 41 LRO55_RS15525 3295945 .. 3295961 + -10.9 -5.42259 TAGATTAGAAAAAAA GAGGACA TTT TGTCCTC TTTTTTTACGCCTAA 100 50 LRO55_RS15545 3300954 .. 3300989 + -9.9 -4.21812 AAAATAATTCTGTTA TT-TCGAAGCCGAACT CAGGT AGTTCGGCTTCGCCAA TTATTTTGGCTCCCA 89 64 nreB 3304207 .. 3304220 + -6.7 -5.80951 TAGGTATAAATTAGA GCATC TTCG GATGC TTTTTTATTTTAAAT 100 47 LRO55_RS15595 3310069 .. 3310119 + -12.9 -2.80464 AAGAACGTGCTGAAA ATATATAAATAAAAAAGCGACGC CTTGA GCGTCGCTTTTTTATTTAAGTGC ATTTAGCCTTGATCA 100 18 LRO55_RS15645 3317650 .. 3317681 + -13.2 -2.80589 AGAAAGTAATTCGAA TTAAAAAGGCTGTC ATTT GACAGCCTTTTTAC TCAATTTATTTAAAC 100 32 LRO55_RS15670 3326192 .. 3326205 + -2.4 -3.38314 TCTACCAAATAGGTA TGAC TGAGCT GTCA TGTTTCCAGATTACA 46 45 LRO55_RS15675 NONE LRO55_RS15680 NONE LRO55_RS15685 3328816 .. 3328826 + -2.6 -2.64274 TAATTGTCAGGAAAA TATA CCC TATA TGAATTTAGAACCAT 40 97 rsfS 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holA 3362138 .. 3362148 + -2.6 -3.37939 TATCCTCATTTCGCT TTTA TAC TAAA TTAAATTTTAAACTT 46 93 LRO55_RS15835 NONE LRO55_RS15840 NONE LRO55_RS15845 3367118 .. 3367143 + -9.7 -2.64551 TGGTGGCAATATCCA CAGTCGTGTGC CATA GCGTACGGCTG ATTCTGGCTGCTTTT 74 208 LRO55_RS15855 3368696 .. 3368712 + -9.4 -4.37157 TCTTAAAAAAACAAA GCCGCT ATTAA AGCGGC TTTATTATACTAATT 91 133 rsgA 3372346 .. 3372363 + -8.5 -3.00498 GCTTTGCACTTGAAG TGGTGAT TTTG ATCACCA TCTATATACGCTATA 72 51 LRO55_RS15880 NONE grxC NONE secB 3373611 .. 3373625 + -8.5 -5.76633 TCCTTTAGTAAAAAA CCGCG TTTAT CGCGG TTTTTTTATGTCTGC 100 52 nagZ 3406252 .. 3406271 + -3.6 -4.85599 AAAAATTCGATTTAA CTTACCAA GTAA TTGATAAG TTTTTATGACATAAG 66 26 LRO55_RS16065 3407572 .. 3407590 + -4.6 -3.25102 AATTAAACATTCAAT TGAAAAAG TAC CTTCTTCA TCTTCTAAATGCAGT 51 202 LRO55_RS16075 3410345 .. 3410384 + -18.2 -4.90079 ATCGATCTACTATTC CAAACAAAAACGCCTGAT TAAT ATCAGGCGTTTTTGTTTA TTTTATTATTCAAAT 100 40 LRO55_RS16105 NONE LRO55_RS16110 3418768 .. 3418778 + -5.4 -3.18735 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NONE tatC 3439550 .. 3439571 + -7.3 -5.36441 TCATGTTTTAAAAAA GCCTGAAAT TCAA AATTCAGGC TTTTTTATATAGACC 100 45 LRO55_RS16205 3441903 .. 3441935 + -16.6 -4.65895 TTTCTTTCACCAGAA TAAAAGAAACCTGC TTTGT GCAGGTTTCTTTTA TTTTTGACTAAACGA 100 41 LRO55_RS16210 3444416 .. 3444435 + -10 -5.16841 TTATGCTTATAAAAA TGCCGGTC AATT GATCGGCA TTTTTATTACTATCG 100 46 lgt 3446148 .. 3446165 + -7.7 -5.61277 TTAATATCTAAATTA GAGGAGT TTCG GCTCCTC TTTTCTTTTTTTATG 100 37 LRO55_RS16225 3446931 .. 3446943 + -4.8 -3.71794 TTCGATTTATCAAAA TCGC GCCAA GCGA TTTGACTAATTACGT 58 381 thyA NONE LRO55_RS16240 NONE LRO55_RS16245 NONE msrA 3450214 .. 3450244 + -14.3 -3.06915 AATAAATTAGAGCAA TAAAAAAGCAACC AATGA GGTTGCTTTTTTA TTGCGTAAACTAAAT 100 36 LRO55_RS16280 3455719 .. 3455752 + -6.1 -4.62471 GTTGCGCTAACTGAT CAAGGCATGATCT-GT TAT ACTAAATCATGCCTCG TTTTTACCAATTCCG 76 31 rpmB NONE rpmG 3456304 .. 3456322 + -9.6 -6.17292 TAGCCTCGAAAAAAA CGACTTCA CAA TGAGGTCG TTTTTTTTTGCATTT 100 44 LRO55_RS16295 3458152 .. 3458181 + -15.3 -3.06312 ATTCATTAACTGATA TAAAAAGCGTACT CAAG AGTACGCTTTTTA TTAGCTCAAGAATTT 100 32 LRO55_RS16350 3468269 .. 3468299 + -14.3 -3.21099 ATAAATATCCCCTAA TAAAATGGCAAGT ATTGA ACTTGCCATTTTA TTAATAGTGAGGAGG 100 50 LRO55_RS16360 3470522 .. 3470546 + -15.1 -5.80817 AAAGAACGTAAAAAA GAGCCTCCTTA AAT TAAGGGGGCTC TTTTTTTATATTAAG 100 59 LRO55_RS16365 3471400 .. 3471434 + -3.8 -4.19276 ACACTCAATTGAACA GTGTATTACG-AC-GA TAAAT TCAGTTCGTGATACAC TTTTGCCAGTTTTAA 60 69 LRO55_RS16370 3472537 .. 3472547 + -3.2 -2.57132 ATCCTTTGTTCCGCT GATG TTA CGTC CTTGTAACACAGCGA 42 154 LRO55_RS16375 3473793 .. 3473809 + -10.8 -4.7373 AACCTCATAAAAAAA CCCGCG ATCAA CGCGGG TTTTTACTACAATAA 100 39 asd 3478264 .. 3478283 + -9.3 -4.75372 CAGTCAAAACAAAAA GCCGATC ACATTA GATCGGC TTTTTCGTAACTGGT 93 57 LRO55_RS16395 3479778 .. 3479788 + -2.6 -5.04249 AGTTAGCTCGCTTTA TATT GCA AATA TTTATTTTTTAAGGG 66 52 LRO55_RS16400 3481109 .. 3481126 + -9.9 -4.42386 ATCGTTTTACCATAA GCAGTCA AAGA TGACTGC TTTTGTGCCTGAAAA 93 46 LRO55_RS16405 NONE truA 3483202 .. 3483219 + -4.1 -3.96291 TATTTAACTGAGCTG CAACCGT TTCC AAGGTTG TTTCTCCGCTTTCTA 57 300 infA 3484467 .. 3484484 + -5.5 -5.5074 AGTGAATGCAAAAAA GCCACTT CATG ATGTGGC TTTTTTATTGCGTTG 84 43 LRO55_RS16430 3485473 .. 3485489 + -9.4 -5.24129 ATAAGCATAAAAAAA CGCAGC GTTGA GCTGCG TTTTTTATAAGAAGC 100 44 LRO55_RS16455 3489895 .. 3489905 + -4 -2.50291 AGAAAGAGACAACGG CTTA GGC TAAG ATTAGTGCGGTAATT 45 21 LRO55_RS16460 3491091 .. 3491103 + -3.3 -4.44914 TTCTTCAAGAAGATT GCCAC TAC GTGTC TTCTTTTCTTCGGTC 62 241 LRO55_RS16485 NONE ptsP 3497411 .. 3497435 + -13.7 -4.68908 TTAATATATAAATAA TAAAGGAGGGC AAT GCTCTCCTTTA TTTATTTTAGATAGC 100 37 katG 3500107 .. 3500127 + -14.1 -4.81851 TCAAAATAATAAAAA GCCAGTTCA ATT TGAACTGGC TTTTTAAATTTAAAT 100 47 hcaR 3502821 .. 3502876 + -5.4 -3.05775 GATTAATAAGAACAC CTTTATAAAAAGTATA-AGTAAATA TTATTTT TATTTATTTTATACTTTTTATAAAC ATTTTAGCCCATGCT 54 73 LRO55_RS16510 3503740 .. 3503757 + -9.9 -4.8622 TTATAAAAACAAAAA GTCATCC GTTT GGATGAC TTTTTAGTTAAAAGC 100 49 LRO55_RS16535 3510896 .. 3510917 + -11.7 -6.25741 GCTAATTTAAACAAA CCTAGTCAT TTCG ATGACTAGG TTTTTTTTGTTATTT 100 59 LRO55_RS16540 3512947 .. 3512958 + -3 -2.87362 TTATAGGCAATCATG CAAA TGTT TTTG ATTTACCTCTTGTGT 43 77 LRO55_RS16545 3513103 .. 3513118 + -3.2 -3.07113 ACCACTTATCTGTTT TGACCT ATTT GGGTCG TTAGCTCAGCTGGTA 45 37 LRO55_RS16550 3513200 .. 3513218 + -10.3 -5.97979 ACCAAATTCTAAAAA GCCTCTC ACTGC GAGAGGC TTTTTTTATTGTTAT 100 37 LRO55_RS16560 3515022 .. 3515051 + -13.7 -3.00798 CACTCGCTAAAATCA AAAAAGCCGCATC TGAT GATGCGGCTTTTA CTTTGCTTCATTATA 100 31 LRO55_RS16570 3516784 .. 3516799 + -3.2 -5.24799 GTGTGCTACTCACTT TGCAGC GTTA GCTTCA TTTTTATATTTATAA 71 15 abeM 3518180 .. 3518200 + -14.1 -4.17657 CAAACCTAATAAAAA GAGCCGATA AAA TATCGGCTC TTTTACACTATGCTG 100 32 LRO55_RS16590 3522343 .. 3522357 + -5.8 -4.49556 CATTGACTTTTTAAT TGTTAT GTT ATAACA TTTCTTTAATCAAAA 72 75 LRO55_RS16595 3522686 .. 3522718 + -5 -5.72616 ACACTTAAATCATTG GAAGCCTAAG ACTATCTCCTCCA CTTAGGCTTC TTTTTTTATGTCCGT 90 64 LRO55_RS16600 3523398 .. 3523411 + -8.1 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.. 3183221 - -2.2 -2.58714 TTTTATATTAAGCCA TTCATT TCA AATAAA AATTTATATACATTT 39 65 moaCB NONE LRO55_RS14985 3181019 .. 3181029 - -3.2 -3.83323 CTTATATAACTCAAA GTCC TAA AGAC TAATGAACTCAATGA 52 18 LRO55_RS14980 NONE LRO55_RS14975 NONE LRO55_RS14970 3179532 .. 3179543 - -4.4 -3.47475 ATAAATTTAAGAAGA GAAG ACAT CTTC ATCTAATCTTATACA 54 54 LRO55_RS14965 3176873 .. 3176897 - -17.3 -3.44146 TTTCCTTACAATTAA GGATGGCAATC AAA GATTGCCATCC AATTTCACTCATAGT 100 60 fdhD 3176047 .. 3176058 - -4.4 -2.82023 CACCTAGACCAATTA CTGA AGCA TCAG AATTTATTGTGTATA 49 29 LRO55_RS14935 NONE bfmR NONE bfmS 3167097 .. 3167138 - -13.3 -4.11183 CTCGATTATAAATAA TGCAATAAAAAAGCACCTT TATG AAGGTGCTTTTTTATTGGC TTTCAAAGGAGGTTG 100 2 ndhC NONE LRO55_RS14905 3163533 .. 3163549 - -5.2 -3.14463 AATTTTCTCGATGAA CATATC GGTTA GATATG TCAAAGCACCGTCAA 54 45 nuoC NONE nuoE NONE nuoF NONE nuoG 3157115 .. 3157166 - -3.8 -3.60098 AGTTCTCAGCCCAAA GTGGCGTTTGACGTATAATTTCTTG ATT CATGA-ATTACACTCCTAAAGCCAC TGAAACAGGCTCAGC 53 8 nuoH 3156106 .. 3156116 - -4 -2.71325 CCAGCTAGAAATTTA TACA TTT TGTA CTCCCTGCTGTCCTA 46 38 nuoI NONE nuoJ NONE nuoK NONE nuoL NONE nuoM NONE nuoN 3149722 .. 3149739 - -11.3 -6.09888 GCTCAATAAAAAAAA GCCTCCA GATT TGGAGGC TTTTTTGTACACTAG 100 43 upp 3148928 .. 3148939 - -4.4 -3.02511 CTTACTTTTTCAATA CTGT TATT ACAG CAGAAAATTAAAAAG 50 107 LRO55_RS14840 3148492 .. 3148517 - -9.1 -3.69702 TATTAGTTAAGACAA TTAAGGGAAGC TACC ACCTCCCTTAA TTTTGCATTACGTAC 80 118 LRO55_RS14835 3147489 .. 3147507 - -6.1 -3.66883 GCAATACACGCCAAA TGATTGA AGCTG TCAATCA GTTTCAGCTTGATTT 64 509 LRO55_RS14825 3146179 .. 3146210 - -8.2 -2.53392 AAATTCGTGAATTTA TGGATATGTTTGTC CATT AATAAACATATCCA TAAAAATAGTTTTAA 67 62 LRO55_RS14815 3145199 .. 3145222 - -14 -5.03747 AAAGGTTGCAAAAAA GCCTTTAGGT CTTC ACCTAAAGGC TTGATATCAAGATAT 100 64 LRO55_RS14810 3143282 .. 3143305 - -12.5 -4.62085 ACGGCCAAAAAAGAA CGACCACTC AATATA GAGTGGTCG AACTTATCACAAAAA 100 86 LRO55_RS14805 3142862 .. 3142878 - -6.5 -3.64703 GGCTTCGCAGTTAAA CCGTCTG GAA CAGAAGG ATATCGTACCGCTGA 64 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-11.1 -3.62859 AGCATAAGGTTTAAA GAGAGCATC GATATA GATGCTCTC TTTTGGTTTAAGCGA 89 33 LRO55_RS11765 2497752 .. 2497762 - -2.6 -2.81088 AATCTATTTAATAAT TTAA TTT TTAA TCTTCAGATAGATTA 42 22 LRO55_RS11760 2497107 .. 2497128 - -10.1 -5.24129 TTTGGGCAGAAAAAA GCCCCATGC ACAG GGATGGGGC TATCTCTTTTAATTT 100 41 LRO55_RS11755 NONE LRO55_RS11750 NONE atzF NONE LRO55_RS11740 2493532 .. 2493550 - -11 -4.87807 GTAAGACATTAAAAA GCCCAAGC TGA ACTTGGGC TTTTTTTATTTGGCT 100 40 LRO55_RS11715 2488805 .. 2488820 - -4 -5.26316 CTATTTTATAAAAAA CAGACA GAAT TGTCTA TTTATATAAAATAGC 74 71 LRO55_RS11710 NONE LRO55_RS11705 NONE LRO55_RS11700 2479659 .. 2479688 - -3.7 -4.42491 TAAAAAAGATATAAA GTGAATTAAAAAC TTAC ACTATTAATTCAC TTTTAAAAGTTGTTA 61 210 LRO55_RS11695 NONE LRO55_RS11690 NONE LRO55_RS11685 2473187 .. 2473197 - -4 -3.63991 TATCACCTTGAATAA TGAA CAT TTCA TTCACATTAAATACT 53 32 LRO55_RS11680 2472017 .. 2472031 - -2.8 -4.84017 AAGTCTGCATAAAAA TGGCTT TAT AACCCA TTTTTATTGAACGAC 63 417 LRO55_RS11665 NONE tssB NONE tssC NONE 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