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        murJ   54827 ..   54879 + -14.4  -4.63932   CGAAAGGTGTTCAGC TCCTATGAAAGAACCCTTTGAGCC GTTGA GTCTCAAAGGGTTTTTTTATGGGC TTTTATTGCACGATG 100 58
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        cadR  216331 ..  216361 + -15.7  -3.65314   AACGTTATACGAATC       TAAAAATGGGAGC CTATA GCTCCCATTTTTA       TTGTTAAACATTAAA 100 288
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CTZ23_RS01050  219973 ..  220001 +  -2.3  -3.59033   AATTTTCCCCGCTCA        TGGTGGGGTAG CCTAAAA CATTCCCACCA        CTTTTATTATTTAAA  48 15
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CTZ23_RS02165  431523 ..  431540 + -11.3  -5.25803   CTCTCCAGACGACAA             GGACTGC AATT GCAGTCC              TTTTTTATGGAGCTT 100 45
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CTZ23_RS02545  508924 ..  508959 +   -15  -2.62184   TCAGACCTTATACTT    TTCCATGCATGTGAAT CATG ATTGACATGCATGGAA     TCCTCTAAAACGGCA 100 46
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CTZ23_RS04450  914382 ..  914427 +  -4.2  -3.14132   ATGCGTAAATTTACA GATGTTTTGCTTTGAAAT-TG AAAAA CATAAGCCAAAGCAAAACATC TTCGTGACAAAAGGA  50 113
        ureE NONE
CTZ23_RS04460  915678 ..  915690 +  -7.7  -3.54475   TCACCTCACCTTAGC                GCAGT ATG ACTGC                TTATCTCCTAAGAGG  68 118
        ureG  916388 ..  916403 +  -3.2  -5.56673   CCCTGATTCTAAAAA              GATGGC TACG GCTGTC               TTTTTTCTTGTGAGT  81 67
CTZ23_RS04470  917124 ..  917141 +  -9.9  -5.93809   CGTATAAATCAAAAA             GGATTCC ATCT GGAATCC              TTTTTTTTATAACCC 100 34
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CTZ23_RS04490  921915 ..  921932 +  -3.5  -2.65808   CGAACCTGAGTTCGT             CATGAACA AAG TGT-CATG             TACATTGTTAAAAAT  43 61
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CTZ23_RS04500  923005 ..  923023 +  -8.2  -3.32832   TTCAGATATAAAAAA             GCTGAATT CAG GATTCAGC             TTCAATATTTTTGAC  70 114
CTZ23_RS04515  926235 ..  926252 +  -8.4    -5.626   TATAAGCTGAAAAAA             CCGAGG CACTGA CCTCGG              TTTTTTTATGGGCTA 100 53
CTZ23_RS04535  929882 ..  929897 +    -9  -4.37092   CCGAAAACAACAAAA              GAGAGC CGAA GCTCTC               TTTTGTGGAGAAGAT  84 218
CTZ23_RS04545  933826 ..  933837 +  -5.8   -4.4891   GCGGTGTGGTCGGGG                CGCT GGCT AGCG                 TTTTATCATAATAGC  75 192
CTZ23_RS04560  936443 ..  936474 + -15.4  -5.71712   GTTATAAATACACGA      TAATGCCATTGTTG CAGT CAACAATGGCGTTA       TTTTTTTGTCTAAAA 100 67
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        lldR NONE
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CTZ23_RS04595  946383 ..  946403 +  -2.6  -3.68836   AGTGTCATTTGCACA            GGCTTT ATGCAAGTC AAAGCC            TTATTCGGTCAGTGT  49 496
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CTZ23_RS04620  949334 ..  949351 +  -5.5  -5.46698   CCGTACAGGTCAAAA             GCCGGTT AGAA GATCGGC              TTTTTTGATTTTGGA  83 44
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CTZ23_RS04635  952559 ..  952574 +  -2.6    -5.055   ACGCGTTATGCGGTC              TAGCTA GAAA TAGTTA               TTTTTTAAACATTCA  70 23
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CTZ23_RS04655 NONE
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        yejB  967267 ..  967287 +  -4.6  -3.14132   TAATTTTGAATCACG            GGGGGCCA AATAA TGTCTCCC            TTGATGCAGGCGCGA  50 13
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        cueR  993883 ..  993910 + -10.7  -4.30833   GGAATTGAATTGCAG        GGGGATGAATC AATGCA GATTCATCCTC         TTTCTTCATGCTTTA  87 55
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        genX  996881 ..  996901 + -11.2   -5.1417   CCTGATCAACAAAAA            TACCCGTG CACGA CACGGGTA            TTTTTAATTTTATGA  93 79
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CTZ23_RS04925 1018168 .. 1018188 + -11.9  -5.71983   GCTCATACTGAAAAA            CCCGTAAAC ACA GTTTGCGGG            TTTTTTTATGGTTGG 100 47
        rpsB 1024178 .. 1024202 + -12.2  -4.27117   CGTCATGTATGCAGG         CGGCCCATGAG TATC CTC-TGGGCCG          TTTCTGTTCTAAAAA  95 96
CTZ23_RS04955 1025142 .. 1025156 + -12.8  -5.60993   TTATTTTGCGAAAAA               GCCCCG TTT CGGGGC               TTTTTTTATGACCAA 100 42
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        ahpF 1046593 .. 1046621 +  -7.5  -6.17268   TATTGTTTTTTTACA        GGAACTGAGAT CGCTAAC AGCTCAGTTCC        TTTTTTTTGTTGTAC 100 111
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        arsB NONE
        arsH 1051852 .. 1051872 +  -7.6  -5.40474   TTTCATAAAAACGCA           CCGTGTCTG CACT CAGAC-CGG            TTTTTTTGACCAAAT  95 374
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        tsaA 1054658 .. 1054672 +  -3.4  -4.01411   TTTGAGGCTAAACAT               GCGGCT ATC GGCCTC               TTTGGCTTTTTGCTG  58 363
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        pheA 1072157 .. 1072177 + -11.1  -3.10545   TAAAATTCTCTGGTT            GCCGTGTGC GCT GCATGCGGC            TGCTTTTCACCTGTA  80 38
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CTZ23_RS05225 1075570 .. 1075591 + -14.5  -4.21322   AAAAATAACCCAAAA           CAGCCAAGC TTTT GCTTGGCTG            TTTGCTTTATATTGC 100 45
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        yaaA 1078164 .. 1078188 +  -4.1  -4.74706   AAGAGTTGTTGCATG          CCTGCATCCAC AAT GGGGATGCCTG          TTTTTCCGTGTTGCC  71 517
CTZ23_RS05265 1084707 .. 1084724 + -11.3  -5.61596   CTATACTATAAAAAA             CCGATGC TCAG GCATCGG              TTTTTTTATGCAGAT 100 57
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CTZ23_RS05285 1089443 .. 1089453 +  -3.2  -4.69464   AGGATTGGCTGAGAG                 CGGT TTG ATCG                 TTTTTGACCTGTTTT  67 420
CTZ23_RS05305 1092865 .. 1092881 +  -3.6  -3.05597   AGAACAGGGAAATCG              CGCTGG GTATG CCGGTG              ATTTTCAAACATAAG  48 44
CTZ23_RS05310 1095761 .. 1095777 +    -8  -5.24129   CATTCATATAAAAGA              TCTCCC TAAAC GGGAGA              TTTTTTATGAAGCCG 100 56
CTZ23_RS05330 1100089 .. 1100123 +  -4.5  -2.72839   TACTGTTTCTGGCGT    GCGAAA-CAGTGCATCA ATT TCAT-CACTGCTTTCGC    TACTTGCCGGTAGTT  46 510
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        hemL 1105871 .. 1105890 +  -9.4  -3.59979   ATGCTTTAGGTTAAA            TTGAAGAG CATG CTCTTCAA             TTTAACATCAAAGGC  78 95
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CTZ23_RS05385 NONE
CTZ23_RS05390 1111516 .. 1111533 + -11.3  -5.99154   TTTTTTAAATTCAAG             CCTAGGC TGGT GCCTAGG              TTTTTTTATTTCGTC 100 99
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CTZ23_RS05405 1114614 .. 1114635 + -10.9  -3.16177   AATATGAATTAAAAA           GCCCAATCG CTAA TGATTGGGC            TTGCCTATATACAAT  80 115
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CTZ23_RS05415 1117153 .. 1117172 +    -8  -3.57783   ATCGGAAAAAACGTC            TGCAATTT GCGC AAATTGCA             TTGTAATTGTGGTGC  70 81
CTZ23_RS05420 1117909 .. 1117926 +  -5.5  -4.04474   TCCTCATGAATTTAA             GCTCACT TTTT GGTGGGC              TTTATGTCAAAATAT  65 51
        rapA 1120895 .. 1120937 +  -3.4  -5.19212   AGCACCTTCTGAACT GCACCCCGAAAGTTGGAC ACTTTTA GTCTAATTTGAAGGGTGC TTTTTTAATACTGAT  75 60
CTZ23_RS05430 1121318 .. 1121353 +  -2.7  -3.04144   AGCTAAATAAATGTA    TTGGTCAGGCGTAG AGTGTTGAA CTA-GCCTGGCTAA    TCTTGAGAATCGCAG  43 31
CTZ23_RS05435 1122308 .. 1122318 +  -5.4  -3.14307   GATCATGATCATGGT                 TTGC TCG GCAA                 TGATTTTACGTTCAT  52 112
CTZ23_RS05445 NONE
CTZ23_RS05450 1125282 .. 1125304 +  -7.8   -5.4833   TGTTAAGACAAAAAA           GGCAATTTTT ATA GGAAATTGCC           TTTTTTATTGAATAG 100 45
CTZ23_RS05455 NONE
CTZ23_RS05460 NONE
CTZ23_RS05465 NONE
CTZ23_RS05470 1127769 .. 1127796 +    -2  -2.97475   AAATTGAAAATACTA        CATGCCTATTTA ACTT TAAGTAGGGAGG         ATTTGTCATGCAAAG  42 3
CTZ23_RS05475 1129246 .. 1129263 +  -9.9  -5.61689   TCAATCCACTAAAAA             CCCACAA TAAA TTGTGGG              TTTTTTATTGCTTTT 100 43
CTZ23_RS05490 1131691 .. 1131706 +  -2.6  -4.05669   GTGAAAAGTTTAAAA              TAATCA AATT TGATTG               TGTTTTTATCCGATT  55 96
CTZ23_RS05495 1132005 .. 1132021 +  -3.1  -5.10208   TTTAAATCAGTTATA              TAAATTG AAT TAATTTA              TTTTTATTAGAGTTC  71 13
CTZ23_RS05505 1133364 .. 1133391 +  -7.8  -5.45726   TGCCAGTTTCGCTGC        AAAAAGCTCATC TTCT GATGGGCTTTTG         TTTTTTTAGCATCTG 100 42
        dusB 1134619 .. 1134636 + -11.3  -5.24531   TATCTATCATAATTA             TGGCGCT TCAG AGCGCCA              TTTTTTATCCCCGAT 100 46
CTZ23_RS05515 1135434 .. 1135469 +   -18  -3.43676   AAGACACTATCAGGC    CAATAAAAAACATCTC CGCG GAGATGTTTTTTATTG     TTCTCGCTTAGTGAC 100 48
CTZ23_RS05525 1137965 .. 1137976 +  -5.8  -3.20111   TCAGCAGCAGCTCTC                CCCA CAAC TGGG                 CTTTGCTTTTTAATG  57 1
CTZ23_RS05530 NONE
CTZ23_RS05535 1139378 .. 1139397 +  -8.5  -5.61596   AGGGTAAAAGAAAAA            CCGCCCG ATTTGC TGGGCGG             TTTTTTTATAAAGGT 100 51
CTZ23_RS05560 1144233 .. 1144247 +  -5.6  -3.66844   TGTACCTCAATTCAA               GGTCGC AAC GAGACC               TTGTTAAAGTGTAAA  59 54
CTZ23_RS05570 1146145 .. 1146162 +  -6.3  -3.54424   ATTGCCATCAATATG             GCTATTC CGGA GAATGGC              TTTGGCACCATCGGC  61 352
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CTZ23_RS05595 1153532 .. 1153542 +  -5.4  -3.52628   TAATGCTTAGGTTAA                 GATG AAC CATC                 CTTTTATTTGAAGTC  57 115
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CTZ23_RS05605 1155144 .. 1155165 + -13.1  -5.68039   TCCAAAATTCAAAAA           GCCTGAATC ATCT GATTCAGGC            TTTTTTTATGCGTTT 100 37
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        lptC NONE
        lptA NONE
        lptB 1159131 .. 1159141 +  -2.4  -4.41348   CAAACACTTCAACAG                 AGCG TGG CGCG                 TTTATTTACCCCCCA  59 312
CTZ23_RS05645 1163826 .. 1163842 + -12.3  -5.55769   TTCAATTCAACTTAA              CCTCCCA ATT TGGGAGG              TTTTTTATTATCAAA 100 43
CTZ23_RS05650 NONE
CTZ23_RS05655 1165191 .. 1165201 +    -4  -4.18762   GTCATCCGCTGAGGA                 CTTA TGC TAAG                 TTTTAGATAACAATT  59 96
CTZ23_RS05660 1166195 .. 1166221 +  -3.2  -5.66338   TATGTAAGTTTATAA         AAAATAAAATAA ATA TTATTTTGTTTG         TTTTTTGTTCTGTTT  81 121
CTZ23_RS05735 1186539 .. 1186555 + -10.8  -3.45051   TAGAAGCATAAAAAA              CCCCGC ATTCA GCGGGG              CTTTTTCACTTAATC  83 82
        mnmG 1196980 .. 1197001 + -13.7  -5.39721   CCTAATCTGTAAAAA           GCCCGCGGT TGAG ATCGCGGGC            TTTTTTATGTGCTGA 100 46
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CTZ23_RS05795 1200689 .. 1200703 +  -2.8  -3.14132   TTGTTCGAGGCCGAT               GCATGA GGC TCATGA               TTAATCACCAGACCC  44 20
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CTZ23_RS05805 NONE
CTZ23_RS05810 1202801 .. 1202818 +  -9.9  -5.14563   AAATGAATAAAAAAA             GAACCTC CATT GAGGTTC              TTTTTTAATCGAGCA  93 60
CTZ23_RS05875 1216430 .. 1216458 + -19.1  -3.37245   TAATTGTTATTAACA        CAGGAATACTGCA GGC TGCAGTATTCCTG        TTGATCTTAGACTGA 100 42
CTZ23_RS05895 1220971 .. 1220984 +  -3.8  -4.85177   TCATATTCACTCCAT               GTCC AAGAGC GGAC                TTTTTAATGTCATTT  68 511
        prfA NONE
        prmC 1223217 .. 1223244 +  -5.5  -3.74872   ATCGGGTGACTATCG        GGCAACTCGGC GATTAA GTCAGGTTGCC         TTTAATCGCCTGAAT  62 9
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CTZ23_RS05935 1228106 .. 1228137 +  -2.8  -3.14683   TCAGCGTTTGGTAAT      CGCCCGGGCTGTGGC CCA GCCTTAAACCG-GCG      TTAATACAGCAATAT  44 1
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CTZ23_RS05955 1233200 .. 1233220 +    -4  -3.22298   TTTATAGACATCGCC            CAGCTTTT ATATA ACAAGCTG            TTGCTGCTACATCGC  49 41
        folB NONE
CTZ23_RS05965 1234185 .. 1234206 + -12.3   -4.6856   ACACGCATGATAAAA           CAGCCTGCG AGGA TGCAGGCTG            TTTTTGGAATCTTTC 100 133
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CTZ23_RS05985 1243691 .. 1243709 +  -8.1  -5.24531   ACCTTGACTTGAAAA             TGCGCTC CACAC GGGCGCA             TTTTTTCTGGCCGAT 100 49
CTZ23_RS05990 1244150 .. 1244177 + -11.4  -5.67063   GTCATGAACCCAGAA        TGCCAGATGACA TATC TGTAATCTGGCA         TTTTTTTGTGCTCAC 100 41
CTZ23_RS05995 1244741 .. 1244770 + -19.5  -4.49781   TCCCACAATTTTTCA       CAAGAGGAAGCTC ATTT GAGCTTCCTCTTG        TTTTATGGGTATTTT 100 91
CTZ23_RS06005 1248923 .. 1248946 +  -8.2  -5.93809   AAATTGAGTTAGAAA          TAAGGGCTAA GTAA TCAGCCCTTA           TTTTTTTTATGCAAA 100 59
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CTZ23_RS06015 1251525 .. 1251547 +    -5  -2.99951   AAGCATTTTTTATCT           GAAATTTGGA TGT TTTAAATTTC           TCATTTCATCGTTAA  51 210
CTZ23_RS06025 1255442 .. 1255462 +  -2.4  -3.65313   AATTAAAGCGCCTAG            GGCACAGC CGGTT GCGGTGAC            TTTGGGCTGTAATTC  50 232
CTZ23_RS06045 1261146 .. 1261164 +  -7.4  -5.93252   AATTTAAATAAAAAA             GCTCATCA TTG TGGTGGGC             TTTTTTATTTTTAGC 100 176
CTZ23_RS06050 1261476 .. 1261492 + -10.9  -5.60993   CAGATTTAAAAAAAA              CTCCTCA CGT TGAGGAG              TTTTTTTATGGCAGC 100 52
CTZ23_RS06065 1264295 .. 1264307 +  -7.7  -2.78495   CAACTGATTAACATG                TGGCT GAT AGCCA                TAGCTTTTAATAATG  59 501
CTZ23_RS06090 1268437 .. 1268457 + -12.6  -4.74103   CAGCCATAAAAAAAA            GCCACTGC ACCAG GCAGTGGC            TTTTTCAGTTAAGGC 100 84
CTZ23_RS06100 1271657 .. 1271677 + -10.5  -3.19778   GGAATCCCCCCTAAA            TCCCTCTTT AAA AAAGGGGGA            CTTTTCCTCCCTTTT  78 56
CTZ23_RS06105 1272655 .. 1272679 + -10.8  -5.37865   ACTTTAAGTCATCGC          GCCTAAGTCC AAACC GGATTTAGGC          TTTTTTCATTGTTCA 100 34
CTZ23_RS06110 1274009 .. 1274031 +  -4.1  -2.71461   GATTTTTGGTCCAGC           CTTGTGCTA TGTTC TGGCACTAG           TCAATTTGATGTTGT  45 53
CTZ23_RS06115 1274535 .. 1274562 +  -9.2  -5.27335   TATACTGATTTTTAA        TCCCTTTTTTGC TGGC GCGAACAAGGGA         TTTTTCTTTGGAAGC 100 64
CTZ23_RS06120 1276807 .. 1276837 +  -9.1  -4.30014   AGATAAGGCAACAGG      GCATCCCGCATTTC GCTT GGAAT-CGGGGTGC       TTTTACGTTGCTGCG  80 78
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CTZ23_RS06150 1282338 .. 1282351 +  -8.1  -5.11937   CCATTTCATAAAAAA               GAGGC CTGA GCCTC                TTTTTTAAAATTCTT  91 49
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CTZ23_RS06165 1287314 .. 1287330 +  -7.3   -3.0264   GTCCAATCGGGCTGA              TCTGGTC GCG GATCAGA              TCTTGCAACGGATTT  59 479
         pgk 1290549 .. 1290566 +  -7.7  -5.27923   TGCAAGATGACAAAA             GGTTGAC CTCG GTCAGCC              TTTTTTATGCACTTC 100 53
CTZ23_RS06190 1290969 .. 1290986 + -11.3  -5.81412   TAATTTGTATAAAAG             TCCCTGC ATTG GCAGGGA              TTTTTTTTAAATACG 100 65
CTZ23_RS06195 1292131 .. 1292147 +  -9.4  -4.64844   GTATTTATAAAAAAA              GCCCAC ATTGC GTGGGC              TTTTCTGTATCTGAA  88 52
CTZ23_RS06200 1293328 .. 1293345 +  -6.9   -3.3636   AAATCAAGCCGAAAT             CAGGGAC TTTC GCCCCTG              TATTATGTAATGTAG  64 283
        hpaI 1295088 .. 1295124 +  -3.8  -3.18264   AACCTGACAGATGAG   GCAGGAGGTGGG-GA-TG TAT CAGTCATTCACCTGCTGC   TTAATAGGTCCAGCG  48 53
CTZ23_RS06230 1298330 .. 1298349 + -11.4  -5.26918   TAGATGATTGAAAAA            GCCTGCTG GACT CAGCGGGC             TTTTTTATGCGGTGT 100 54
CTZ23_RS06240 1299908 .. 1299920 +  -9.1  -3.76224   TACTGGCCAATAATG                CCCAG GGT CTGGG                TTTGCTGGCTGCAGA  76 28
CTZ23_RS06265 1306521 .. 1306534 +  -8.1  -5.64274   TATCAAAAACCAAAA               GGAGC CGAA GCTCC                TTTTTTTATGGATGA 100 65
        aspA 1309987 .. 1310015 +  -9.6  -5.10933   CAGTAAAACAGTAAA        GGCTCAAGGTCA TGTAT TGGCTTTGGGCC        TTTTGTTTTCGGTCG  91 55
CTZ23_RS06290 1313284 .. 1313298 +  -4.2  -4.51777   GGCAGACTTTCGGGT               CTTGCT GTG GGCGAG               TTTTGGTTGTCATCT  66 135
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CTZ23_RS06300 1316135 .. 1316156 +  -7.3   -5.8187   CTTCACTTGCTTTTT           GCCGAAC CTCACACT GTTCGGC            TTTTTTTATTGAGTG 100 62
CTZ23_RS06315 1319967 .. 1319990 +  -7.4  -2.74263   TTCAGTAAAATCGAA          AGC-CCTGCCA ATA TGGCAGGAGCA          CTTTCAAGATGACCT  56 162
CTZ23_RS06325 NONE
CTZ23_RS06330 1323137 .. 1323154 + -11.3  -5.60993   AAGGCCAATAAAAAA             CCCAGTC CATG GACTGGG              TTTTTTTATGCAACA 100 66
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CTZ23_RS06345 1326346 .. 1326363 +  -2.7  -3.41988   AGTTAGATACTCATT             GATGC CCGCAACA GCATC              TATTATTCAATCAAC  47 24
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        rodA 1330056 .. 1330069 +  -8.1  -4.93365   GCTGTTATAAAAAAA               GCCTC ATCT GAGGC                TTTTTGGTTATGAGC  90 51
         ffs 1331312 .. 1331328 +    -3  -5.03945   GTGCCGAAGCTTTGC             TGGTAGG GTTG CC-ACCA              TTTTTATAATTCTTA  70 18
CTZ23_RS06400 NONE
CTZ23_RS06405 1336316 .. 1336330 + -11.4  -3.66216   GCAGATACAAAAAAA               GCCCTG AAT CAGGGC               TCTTTCTGCTTTGCG  85 220
CTZ23_RS06415 NONE
CTZ23_RS06420 1338023 .. 1338033 +  -2.4  -2.64726   TGGAGCTGTAATCAA                 CCCG ATT CGGC                 ATTCATCTTCTAGAA  40 30
CTZ23_RS06425 1338868 .. 1338881 +  -6.7  -5.98675   ACTCTCAAGTTAAAA               GCATC TTCG GATGC                TTTTTTGTTTTTATA 100 42
CTZ23_RS06430 NONE
CTZ23_RS06435 1343083 .. 1343102 +  -8.6  -2.74523   GCCGTTATAGAATAT            TCACGTCC TTTG GGATGTGA             TAGTATTAGCCATCA  68 183
CTZ23_RS06440 NONE
CTZ23_RS06445 1345174 .. 1345205 + -14.6  -4.29325   AACCCTCTATCAAGC      CAAAAAAACCACGC CGGA GCGTGGTTTTTCTG       TTTTAAGTCTTAGTG 100 80
CTZ23_RS06490 1352113 .. 1352131 +  -4.6  -3.25942   GCGTCTGGGGAGTAT             TGCTTTTA CCC TCAAAGCA             TTGCTATAAAGGCAT  52 98
CTZ23_RS06495 1352501 .. 1352516 + -11.8  -5.52023   TTAAGCAGTATTAAA              CGCGCC TCCT GGCGCG               TTTTTTATTAATAAT 100 45
CTZ23_RS06500 1354503 .. 1354518 + -11.8  -5.89921   ATAGCATCAAAAAAA              CCGGCG CAAG CGCCGG               TTTTTTTATTGTGCT 100 46
CTZ23_RS06510 1355923 .. 1355938 +  -2.5  -4.47485   ATTGGGATAAATATC              GCTGG TAATGC TCAGC               TTTTCTGCAGTTTTT  60 18
CTZ23_RS06515 1356668 .. 1356684 + -12.3  -4.67353   TGTTTATATAATGAA              GCCAACC TGA GGTTGGC              TTTTTAAATCCATAA 100 44
CTZ23_RS06545 NONE
CTZ23_RS06550 NONE
        recR 1363268 .. 1363303 +    -7  -2.87553   GTCCATAACCGTATG    CGCATGAAATAAGTAC TCCG GTGCTTATTTCATCAG     ATTTCAACTTTTTAA  60 14
CTZ23_RS06560 1364687 .. 1364720 +  -3.9  -5.92337   TTTGTACACAATCAC     GACTGATGCGTTAAT AATC ACTAATGTATCCGTC      TTTTTTTTGATGTAT  93 71
CTZ23_RS06565 1365064 .. 1365080 +  -5.1  -3.17571   GGTTGAGCCAGAAGG              CTTACGC GGT GCCTAAG              TTAAATTCAGGAGTT  52 10
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CTZ23_RS06575 1366379 .. 1366403 +  -4.4   -4.4715   CCGTCGTTAAGGGAG         TAATCGCCACA TGTT TGTG-CGATTG          TTTTATACCTTAAGA  66 31
CTZ23_RS06580 1367677 .. 1367703 +    -5  -2.76046   TGGCGGGCAGTTTAT         TCCACCGCATCT GAA AGCGGCGATGGA         TGATATTAAAGTTGC  50 126
CTZ23_RS06605 1370833 .. 1370872 + -13.1  -3.14745   TGACTTAAGCAGCAG  TGGCTCAATTTTACTCG CCAGTT CGGGTAAAATTGGGTCA   TCTATCTTGTGCAAA  95 33
CTZ23_RS06610 1371547 .. 1371561 +  -2.8  -3.64086   GTAATGGTTGGGATA               GGCT CTTAACA AGCC               GTTTTTGGTTTCTTC  51 309
        ftsY 1375467 .. 1375483 + -10.1  -5.76633   AAGCAGCTCAAAAAA              CTCCGCG ATT TGCGGAG              TTTTTTTATATATCC 100 39
CTZ23_RS06630 1376346 .. 1376362 +  -3.6  -5.60993   GCTAAACCAAAGAAA              GGGCGC ATTCA GTGCTC              TTTTTTTATGGCAAA  83 49
CTZ23_RS06635 1377176 .. 1377189 +  -8.1  -5.72622   GAAAAGATTATAAAA               CCAGC TTCG GCTGG                TTTTTTATTTATAGA 100 56
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         rrf 1383186 .. 1383209 + -12.4  -5.71712   GCTCATTATTCAAAA          TCCCCCGAGC AAAA GCTAGGGGGA           TTTTTTTATGTGGGA 100 38
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CTZ23_RS06680 1387030 .. 1387044 +  -8.6  -3.27406   CTAGACAGTGATTAA               CTTCTG CAG CAGAAG               CTTTTATACTGCGAG  72 47
        ybaK 1387858 .. 1387871 +  -2.3  -3.07816   AAGTTCAACCGAGCC               GCCCA CCTG TGTGC                TTAACTCCATGGCAA  42 329
CTZ23_RS06700 1389771 .. 1389785 +  -2.7  -3.57144   ATCATCTTCCAATTA               CAGGC AATTC GCCGG               TTTGGGAATACCGGC  49 100
CTZ23_RS06740 1395554 .. 1395571 +  -8.4  -3.30159   TATATTCGCCATAGC             CGCTGC ATCAGG GCAGCG              TTATAACAGCATTGA  70 100
        fumC 1397134 .. 1397161 +  -9.2  -3.53298   CTTATAAAAAGAAAA        CCCAACATATGG ATTG CTATATGCTGGG         TTAGTTTGCGCTACT  77 150
CTZ23_RS06750 1397913 .. 1397935 +  -7.1  -6.04324   GAGCTGATTCTAAAA           CCATTTAAC TTCGT GTTAGATGG           TTTTTTCTTTTTTAA 100 56
CTZ23_RS06755 1400770 .. 1400795 +   -12  -4.87133   CTAAGTATATAAAAA         TCCCCATGTA ATAAAC TACATGGGGA          TTTTCTTTAGGAGGT 100 57
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        cydB NONE
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CTZ23_RS06855 1421357 .. 1421376 +  -2.2  -2.79321   ATACGATGCATAGGA            TTCTG-GCT GAT AGTTCAGAA            TGATATTGATGTCGC  41 430
CTZ23_RS06870 1423493 .. 1423516 + -10.4  -5.24129   ATTGTATTGAATGAA          T-AGCCCCTGA ACC TCAGGGGCTTA          TTTTTTATCAGCACC 100 47
CTZ23_RS06875 1424954 .. 1424968 +  -8.5  -5.37593   ACTTAAAAAATAAAA               CGCCC AAATC GGGCG               TTTTTTCATTTAGGC 100 61
        cysK 1441338 .. 1441356 +  -6.6  -5.03314   AATAGCCATAAAAAA             GCTCGCCA TCG TTGCGGGC             TTTTTTAGGCGTCAC  83 57
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        nirD 1449176 .. 1449225 +  -9.4  -3.15663   TTACGCCACAGTGTG GCTCAGGTTTTGCCTACTTTTC CCGAAA GAAAAGTAGGTCGAACCGAAGC TTAATCCAGATAAAT  74 179
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CTZ23_RS07115 1479120 .. 1479139 +   -10  -5.93252   CTATAGATTAAAAAA            GCCGGAAG GACA CTTCTGGC             TTTTTTGTTTTTAGA 100 48
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CTZ23_RS07170 1491993 .. 1492016 +   -11  -3.06133   CTTTATATGTATTAA          TCCCAGCTCC CGAA GGAACTGGGA           TTACCTACAAAATTA  80 145
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CTZ23_RS07575 1572816 .. 1572839 + -10.3  -2.56761   CCGATTAATCACTAA          CTGCGGTAG TAAATC CTGCCGCAG           TAAATTCCCATTTTC  76 47
        ilvA 1582626 .. 1582656 + -15.7  -3.51232   AAATAAAATCCAGTT       TAAAAAACCGCCA TTCGC TGGCGGTTTTTTA       TTGGTTTACACAAAC 100 35
CTZ23_RS07625 1583389 .. 1583400 +  -4.4  -3.10775   TTGATCAGCTGAAAC                GCTT ATCC AAGC                 ATTTTAAATAGCCAT  50 3
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CTZ23_RS07655 NONE
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CTZ23_RS07745 1607833 .. 1607846 +  -2.3  -3.56903   TATCCGCTGCATTCA               TGACC TGAC GGCCA                ATTTTTGATTCTGTA  47 365
CTZ23_RS07755 1610204 .. 1610218 +  -3.6  -4.25873   TTCATCACTTTTTTT               TCAGTA ATC TATTGA               TCTTTTTTATAACAA  62 54
CTZ23_RS07760 1611409 .. 1611427 + -10.3   -3.8698   AAACTGACTCAAAAA             CGCCATC GTCAA GATGGCG             TTTCCATTTCAGTTG  83 40
CTZ23_RS07765 1612105 .. 1612121 +  -3.7  -3.51032   GCACATCGGCAATAC              TCTGG CGCATTT CCAGA              TTGTGCTTGGCCAGT  50 147
CTZ23_RS07775 1613292 .. 1613304 +  -4.8  -2.87132   AGGCTAATCACACTG                GCCA TCAGC TGGC                TATCTCCACCCAAAA  47 110
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CTZ23_RS07855 1631304 .. 1631323 + -10.8  -5.64006   GTAATCACAAAAAAA            TAAGCTCC TTCG GGAGCTTA             TTTTTTTAATTGGAT 100 56
CTZ23_RS07865 1632786 .. 1632806 +  -8.4  -3.55563   AACAGCAAAAAAAAA            GCTTATCT AAGAC AGATAAGC            TTTGAAAACTACAAT  73 71
        brnQ 1635417 .. 1635437 +    -4  -4.30014   CCCGAGTCGTTAAAG            TCCGGTTT TACCC AAACCCGA            TTTTAAATTGCTCAA  62 48
CTZ23_RS07880 1636147 .. 1636164 +  -8.5  -2.79183   TTTAACCGACCCAGA             TGGATGA GCCT TCATCCA              TCTGCTCAGAATGAG  66 43
CTZ23_RS07890 1637706 .. 1637723 +  -6.9  -5.37593   GCCAGACACAAAAAA             GCCCCAC ATCA GTGAGGC              TTTTTTGATTTACCA  91 81
CTZ23_RS07900 1640763 .. 1640796 +  -9.9  -5.61881   GCTTATGACAAAGAA     TCGAAAAAGTTCAGTT GGG GACT-AACTTTTTCGA     TTTTTATTTTTGGCA 100 62
CTZ23_RS07915 1644400 .. 1644427 +  -8.5  -3.61398   AAATACCCAAAAAAA        TGCCAGTCAAT CTCTTA ACTGACTGGCA         TTATTCCGAAGAAGG  73 8
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CTZ23_RS08135 1685495 .. 1685515 +  -2.4  -3.54424   GATTGGTTCTAAATA            GCCGCTTC ATACA GACACGGC            TTTAAAGAGATACGG  46 25
CTZ23_RS08160 1693599 .. 1693624 + -11.3  -5.95946   TTTATCCTTCCCTTT         GCAGAAC-CATC TCA GATGCGTTCTGC         TTTTTTTGTTGTTCA 100 118
CTZ23_RS08165 1694769 .. 1694797 +  -7.5  -3.55966   GACAGTGAAATGAAA        GCCTAAATGAC TTGAGTC GTCCTTTAGGC        TTGGTATTTTAATAA  70 50
CTZ23_RS08175 1697779 .. 1697802 + -14.6  -5.06414   TACCGTTTCAACCTG          CGCCCGATGT ATGT GCATCGGGCG           TTTTTATTACAACAC 100 75
CTZ23_RS08180 1698712 .. 1698754 + -11.6   -4.7153   CCTTACATTTATCAT CATCATAAAAAAAGCACCC TAAAGT GGGTGCTTTTTTTA-GCTG TTTTTGCGATTATTT 100 60
CTZ23_RS08200 1703816 .. 1703832 +    -8  -5.60689   AAAGATATTAAAAGA              CCCATC TACGT GATGGG              TTTTTTATTATCTGC 100 46
CTZ23_RS08205 1704284 .. 1704305 + -13.1     -3.67   GCTCATAAGATTCAA           GGAATCCAG TTAG CTGGATTCC            TGTTTTAAGACTTCC 100 57
CTZ23_RS08215 1705197 .. 1705210 +  -2.3  -3.12395   TTGTAGCGGAATAAT               CACCG CCAG CTGTG                CTTTTAAATAATCAC  43 143
        ruvC 1707699 .. 1707725 +  -6.6  -3.84246   TGGAAGCCATCTTGA         TCCCGATTAG CTATGTC CAAATCGGGA         TTTCCTGCTTAACGG  67 42
        queG 1710633 .. 1710651 +  -5.2  -3.36878   TCCCCACACAAGTCC             TACAGCGC GTG GTGCTGAA             TTGTGGCTCAATAGA  54 70
CTZ23_RS08255 1710952 .. 1710976 + -13.7  -4.75174   TGTTCCCTCGCTCAA          CAAAGTCCACT TCA GGTGGACTTTG          TTTTTGGATTACGTC 100 53
        bioB 1712088 .. 1712106 +  -7.4    -5.626   TCCTCACACGAAAAA             GCCTATCT TCT GGATGGGC             TTTTTTTATGAAGTA  93 44
CTZ23_RS08270 1714651 .. 1714669 + -13.2  -5.26316   ACAAGATAGAAAAAA             GCGCTGAT AGA ATCAGCGC             TTTTTTATGGGATCA 100 59
        paaZ 1728191 .. 1728207 +  -6.6  -6.02919   TTTAGCTCCAAAAAA              GGAATC TTTAT GATTCC              TTTTTTTATTTATAC 100 51
CTZ23_RS08360 1732519 .. 1732545 +   -16  -4.33907   TAAATAGATGAAGAA         TAAAACCGGGGC GAT GCTCCGGTTTTA         TTTTGGGTGTTTCTA 100 38
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CTZ23_RS08950 1850354 .. 1850383 + -18.1  -3.08867   CTTAAAGCGCAAAGA       TAAAAAACGCGCC ATCT GGCGCGTTTTTTA        TGTCTTAGAAATTAA 100 36
CTZ23_RS08960 1852918 .. 1852936 +   -11  -5.37345   GATAAAGTCAAAAAA             TACGCGCT ACA GGCGCGTA             TTTTTTATGGTTGCC 100 48
        ychF 1855155 .. 1855172 +  -9.9  -5.70829   GATATCAATGAAAAA             CCCTCAA ATAT TTGAGGG              TTTTTTTATACTCTT 100 47
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        dapC 1862473 .. 1862490 +  -9.9   -5.0925   GCTGATATTAAAAAA             TCCACTC TATT GAGTGGA              TTTTTCATTTTAGGC  93 43
CTZ23_RS09015 1864886 .. 1864904 + -10.3  -5.24129   AAATACAATAAAAAA             GCCGTGA TCAAT TCACGGC             TTTTTTGTGCAGACG 100 45
        gloB 1867768 .. 1867778 +  -6.8  -2.91924   AGATAATTTTTAAAG                 CGGT TTA ACCG                 GTTTATAACAGCTGG  58 28
CTZ23_RS09035 1868764 .. 1868790 + -10.1  -4.90778   GTTCTCATAACTTGA         GCCCGTTGAAC CGTCT GTTCTGCGGGC         TTTTCTTTGGGTAGG  93 78
CTZ23_RS09070 1872918 .. 1872939 +  -8.7   -4.2074   TCATCATGTTGAAAA           GCCCAACCT TGTG AGATTGGGC            TTTCTATCTTAAGGA  83 110
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CTZ23_RS09095 1876425 .. 1876445 +  -6.9  -3.69283   CCGAAAATAAAAAAA            CTGCCTAAA AGT TTTAAGCAG            TTCTTGAGTCACTTC  67 107
CTZ23_RS09170 1890320 .. 1890346 +   -16  -5.48054   AGATGAAATAAAAAA         TGGATCAGTTCC TCT GGAGCTGATCCA         TTTTTTCATTTTGAT 100 57
CTZ23_RS09185 1892542 .. 1892558 +  -2.3  -3.25341   TTTCTCTACCTTTTT              TCCTT AATTTGC AAGGA              TATTGGTATTAAGAT  45 85
        rpoH 1893519 .. 1893531 +  -6.9  -5.25893   ACTAAAGTTAAAAAA                GGGCG GTC TGCCC                TTTTTTGCTGTCTGT  91 56
CTZ23_RS09195 1894101 .. 1894112 +  -4.4  -2.54371   GAACAGCTAGGAAAC                TGCA GGTA TGCA                 CATTTATTTAAACGG  47 51
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CTZ23_RS09205 1895179 .. 1895195 + -10.9   -5.4756   CGAAACATGAAAAAA              GGACTCA GCT TGAGTCC              TTTTTTATTGCGGTT 100 101
CTZ23_RS09215 1897527 .. 1897543 + -12.3  -5.24531   TGCCTAAAGAAAAAA              CGCCTGA TAA TCAGGCG              TTTTTTATAGCAGAT 100 55
        trmB 1900932 .. 1900949 + -11.3  -5.64274   ATTAAAGTTAAAAAA             GCGCTGA AATT TCAGCGC              TTTTTTTATACCTGC 100 42
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CTZ23_RS09285 1914266 .. 1914284 + -13.2  -4.72029   TCAACTAAATAAAAA             GGACGACT TGA AGTCGTCC             TTTTATTCCCTTAAC 100 104
        rlmL 1921252 .. 1921272 +  -5.4  -5.08824   GATTAGCAATAAAAA            GCCTGCTA CCCTA TAGCAGGA            TTTTTTACATCGGAA  78 107
CTZ23_RS09325 1925639 .. 1925658 + -10.8  -5.30686   CTGCTATATGCTTAA            GGCAAATC TTCG GATTTGCC             TTTTTTATGCCTGTT 100 49
CTZ23_RS09330 1926877 .. 1926895 + -11.8  -4.75356   TCATGCATAAAAAAA             TGCCTCAT CAT ATGAGGCA             TTTTTAAATCTATTT 100 67
CTZ23_RS09370 1936674 .. 1936697 +  -8.9  -2.63079   TCACTTTTGTGTAAC          TGACCCTGG CGGCAA TCAGGGTCA           TGGCTTATATGGAAC  67 43
CTZ23_RS09375 1938055 .. 1938088 + -14.8  -3.67878   AAAACTACAAAAAAT     CAGAGCCACTATAG TATTTT TTATAGTGGCTCTG      TTATATTGAAATAAT 100 83
        csrA 1938515 .. 1938542 +    -7  -5.43866   TTAAAGTTATCTTGT        TATAAAGCGGCT CTAC GGCCGCTTTAAG         TTTTTTTAGCGCTTC  91 44
        epmB 1955000 .. 1955013 +  -3.9  -3.76952   ACCGCTTTTTGGGGT               TTCAA CTGC TTGAA                TTTGAGTTAAATAAC  55 13
CTZ23_RS09470 NONE
CTZ23_RS09475 1958863 .. 1958887 +   -13  -4.14243   GATCATCTCATTGAT          GTACAAGACC AATAA GGTCTTGTAC          TTTTCACCTGAAGTG 100 11
CTZ23_RS09500 1965922 .. 1965935 +  -9.5  -5.61596   AAAAGCAAAAAAAAA               GCGCC CGCA GGCGC                TTTTTTTATACGACT 100 53
CTZ23_RS09510 1967711 .. 1967728 + -11.3  -5.75822   AATCTGCATAAAAAA             GCCGCAT GATG ATGCGGC              TTTTTTTAATTTCTG 100 67
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CTZ23_RS09535 1971609 .. 1971633 + -10.8  -4.16182   TACTTTTTCCGATAA          GCCGATTTCT CCCAT AGAAGTCGGC          TTTGCTTTATCCTAA  86 57
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        gltA 2250741 .. 2250756 + -10.4  -5.61596   TCAACGACGAAAAAA              CCACCC GTTT GGGTGG               TTTTTTTATGGACAT 100 53
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CTZ23_RS10890 2260719 .. 2260739 + -14.1  -4.15565   CAGACAAAAAAAAGA            GACCAAGCT GAG AGCTTGGTC            TTTTAAAATGGTGGC 100 114
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        smpB 2263469 .. 2263488 +  -9.3  -5.26316   GTTTGACATAAAAAA            TGCCTCC AACATG GGAGGCA             TTTTTTATGGCGTCA 100 59
        bamD 2267160 .. 2267191 +   -11  -3.28712   GGGGAACAAAGACTT      TTGCCTACTTTGGG TCTT TCCAAAGTAGGAAA       TTCTCCACACAAAGC  82 150
CTZ23_RS10950 2269410 .. 2269435 +  -8.3  -3.84451   GCGGCATTAAAACAA         CGCTGAACCAT CACA ATGGCTTAGCG          TTTAGATTTACGCCG  75 41
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        lolB 2273100 .. 2273110 +  -3.2  -3.06796   TTAATTTTGTGCTGT                 CATG ATT CGTG                 TTCCCTCACCTGCCA  46 37
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        rpoD 2284911 .. 2284929 + -12.4  -4.35581   GTAGCAATGCCAAAA             CGCCTGCG CCT TGCAGGCG             TTTTCAATCTTTTGA  95 83
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        putP 2328238 .. 2328259 + -13.1  -5.41746   CATGCAAAAACAAAA           TAGCCAGTG ACAT CACTGGCTA            TTTTTTTAGCAACTT 100 47
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CTZ23_RS11720 2408688 .. 2408699 +  -4.4  -3.39068   GCAGCAATTTCGGCA                GGAA TCTT TTCC                 ATTTTCTTGAGCTGC  50 501
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CTZ23_RS01780  365202 ..  365221 -    -5  -5.64274   CTAGGCATAAAAAAA            GAACCG TGCAAGAT CGGTTC             TTTTTCTGGGCAAAA  85 50
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         bfr  321666 ..  321695 - -16.7  -2.53015   ACATTGCTCAATCCA       TAAAAAAGACCGG AACT CCGGTCTTTTTTA        TGTAGTTAATCTTTT 100 50
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CTZ23_RS01215  250017 ..  250040 -    -9  -5.71983   CGAAGCATAAAAAAA          GACCCAAATT TTGC AATTTGAGTC           TTTCTAAACATTCTG 100 39
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        uvrA  179146 ..  179161 - -10.4   -3.5944   ATTTACAGTCTCAAA              GGGCTC TTGT GAGCCC               TTTCTATATCACTTC  81 34
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CTZ23_RS00700  148981 ..  148996 - -10.4  -5.97979   ACAACAATAAAAAAA              CCGCTC AAGT GAGCGG               TTTTTTGCTTTTAAT 100 49
CTZ23_RS00645  134515 ..  134528 -  -4.5  -4.21194   CTGGATTATTTAAAA               GCCAA CAAT CTGGC                CTTGGGCGCCAGCCT  64 409
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         xth  121261 ..  121297 - -12.6  -4.42062   TATGTCGGAAATAAA   CCT-CTATTGAGTGAAC AATT GTTCACTCAATAGGAAG    GTTTTTAGTTGAGTT 100 30
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        puuE  112675 ..  112703 -  -3.4  -3.59087   AAGATCAGTGCCAAA       CTTCAG-TGAAAAT CCA ATTTTCAACTGA-G       ATAGCTAAAGCTGCA  51 62
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