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FHQ13_RS27670  170870 ..  170891 +  -2.3   -3.4247   CCAACATTATCATAT           TGAGAGCTAT CAT AAAGCTC-CA           TATTATTAAACTTAT  45 402
FHQ13_RS27675  172208 ..  172221 +  -2.3  -4.67048   TGAGAATAACCGTTC               GGAAC ATTT GTCCC                TTTATTTTGAGGTGG  61 400
FHQ13_RS00845  173207 ..  173237 +  -9.8  -3.80019   CTGGATAAAGTGAAA       CCCCCACTGT TAAAAACAGAC ACAGTGGGGG       TTCTTGCATTTCTAA  86 131
FHQ13_RS27690  175570 ..  175586 +  -6.6  -3.14564   CAATCGCCGCATTTA              GCTCAT GTAAA ATGAGC              TTCATCCAAAGCTCA  62 108
FHQ13_RS00875  178485 ..  178514 + -11.6  -4.26188   ACCGGGTTATATAAA       TAGCACACCTTC AATAAG GAAGGTGTGTTA        TTTTACATCTATAAA 100 23
FHQ13_RS27730 NONE
FHQ13_RS00885  179838 ..  179863 +   -12  -4.31085   CTTCAAACAGAAAAA         GCGTTACTCA TGAGAT TGAGTAACGC          TTTTACCTTAATATA 100 3
FHQ13_RS27735  180763 ..  180782 + -10.8   -4.6635   CTATAAAAAAAGAAG            CCACTAAG TTTC CTTAGTGG             TTTTATTAACAATTT 100 168
FHQ13_RS27740  181789 ..  181800 +  -2.2  -3.86481   GTACCTCTTTTGAAC                TTCC TATT GGAG                 TTATTGTGCGTTCTT  51 223
FHQ13_RS27750  184882 ..  184903 +  -5.2  -3.92373   GCTATCACTATAACG           TTTAGCTG GTTCCG CAGCTAAG            TTTCTCACTCGCGTA  63 491
FHQ13_RS00925  185840 ..  185861 + -10.2  -4.30014   GTATCTAAATAGAAA           GACCAGTC TTACAT GACTGGTC            TTTTACATTCATACA  95 29
FHQ13_RS00945  188551 ..  188583 + -10.8  -4.12037   CTATAAAAATTCAAA      CCACTATTCTCT CTTTCATTT AGAGAATAGTGG      TTTATCATATTTCTA 100 62
FHQ13_RS27780  193668 ..  193678 +  -2.6  -3.92001   GATTATCTGAAAGCA                 TAAA ACT TTTA                 TTATTATCTCCTATA  52 134
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FHQ13_RS01025  201758 ..  201789 + -11.7  -4.85195   AAAGATTAATAAAAA      TAGGCTAGAGGGT TCGCAT ATCCTCTAGCCTG       TTTTTAACTTATTTT 100 32
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        rpiA  204223 ..  204242 +  -7.2  -4.88711   GAAATTGTAATAAAA            GCTAACTT TTTA AAGTTGGC             TTTTTAGTATGTTCT  85 31
FHQ13_RS01050  204773 ..  204809 + -11.1  -5.28176   TTATCATAATAAAAA    GGGTAGTATATGAAT CTTATGT ATTCATACACTACCC    TTTTTTATAAATAGA 100 32
FHQ13_RS27860  206660 ..  206676 +  -3.7  -4.53163   AAAGTTAAATAAAAA              GCATC CTATTTA GATGC              TTTTCTAATGTATAA  64 479
FHQ13_RS27870  207363 ..  207373 +    -4  -4.86731   GGATTACAGAAAACT                 TCAT ACG ATGA                 TTTTATTTCAACACC  70 333
FHQ13_RS27880  208385 ..  208395 +    -4  -4.27192   CTATCATCACTAATA                 GAAT AAT ATTC                 TTTTAATCCCACTTT  61 108
FHQ13_RS27885  209390 ..  209404 +  -7.2  -2.91807   CTTAGCAAAAATCCA               GAAGAA CAT TTCTTC               ATTTAACTTTAATAA  61 337
FHQ13_RS27895  210703 ..  210742 +   -14  -3.55784   TGTAATGTAAAACTG  TAAATAGCTAGTAAAACA AAGT TATTTTACTAGCTATTTA   TTGATTGCTTTTATG 100 476
FHQ13_RS27905  211750 ..  211767 +  -5.5  -2.60909   CCTCATACATGTTGC             ACTCCAG CCAT CTGGAGA              ATCTTCTGTCGCTTT  54 459
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FHQ13_RS27935  215394 ..  215415 +  -5.9  -5.10497   AACAGATAATGAAAA           GCGCAAATT ATAT GATTTGTGC            TTTTTTAGCTAAGTT  83 470
FHQ13_RS01130  216949 ..  216979 +    -2  -5.07275   TTTCAATATAAAAAA      GAGGATCTTCATA CAGTAC TA-GAAAATCCTC       TTTTTATATGTATCC  69 52
FHQ13_RS27955  218384 ..  218401 +  -4.2  -3.06183   AGTACACTCGAAATA             TAGTCT AAAAAC AGACTA              TTCGGTGCAAATACG  50 125
FHQ13_RS01155  222878 ..  222899 + -10.2  -4.81083   TAAACCCCTTAAGTT           GACCTGCT TATATT AGCAGGTC            TTTTTCATGATTACA 100 140
FHQ13_RS01160  224111 ..  224140 +  -5.9  -4.31065   AGTACTTGATAAAAA       TAAGTCGATTT CCAAACAT AAATCGGCTTA        TTTAGTTTTCTCTCT  70 78
FHQ13_RS01165  224611 ..  224636 +  -7.7   -5.4505   AAAAATACAAAAAAA         GAAAGCATCTA ACTC TGGATGTTTTC          TTTTTTATTGAAAAC 100 43
FHQ13_RS01170  225193 ..  225209 + -10.9  -5.66229   TAATCACCCAAAAAA              GAGTACG TAT CGTACTC              TTTTTTATTATTAAT 100 38
FHQ13_RS01195  228742 ..  228765 + -12.6  -4.50193   ACGAATAAACGATTA          TAAGGATAGC TAAC GCTATCCTTA           TTTTAATTCGTTAAT 100 33
FHQ13_RS01215  232383 ..  232401 +  -2.5  -3.78329   AAAAGTAGAGGGATT             TCTTATT AGTAA AATAGGA             TTTGACTTGATAAAC  50 98
FHQ13_RS01220  232788 ..  232812 + -10.2   -5.8187   ATTTCACATAAAAAA          CGTTTTAAAC ATAAA GTTTAAAACG          TTTTTTTATTCAATG 100 145
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FHQ13_RS01305  249144 ..  249173 + -10.1  -5.76237   AGAATATAATAAAAA       CCGCTATAAATTC ATTC GGAATTATAGCGG        TTTTTTATTTATATA 100 40
FHQ13_RS01310  249528 ..  249552 + -12.9  -4.18119   TCTATACTAAAAAAA          TCGGAACGGCT CAT AGCCATTCCGA          TTTCTATACTTTAGT 100 31
FHQ13_RS28070  252101 ..  252111 +    -4  -4.12188   TAATGTACTCTCCAA                 CTTT TTT AAAG                 TTTTCCAAGTCATAA  59 525
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FHQ13_RS28080  254209 ..  254219 +  -2.6  -3.69319   CAGCAGATACATCTA                 TAAA TGC TTTA                 TTATCCTTCTTTTCT  50 174
FHQ13_RS01350  257779 ..  257805 +  -8.1  -3.54741   CTATATCCATTCAAT         ATAAAAAGCCC AATCC GGGCTTTTTAA         TTTGGGAAACTAATA  74 22
FHQ13_RS28090  259210 ..  259232 +  -5.6  -6.11392   ATTCCAATAAAAAAA           CAATCCCTTT TTA GAATGGATTG           TTTTTTTGTTTCTTT  93 142
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FHQ13_RS01475  280023 ..  280046 + -11.1  -4.87893   CGTACATACGAAAAA          GCTCCTTTC CAATTA GAAAGGAGC           TTTTTCATTACGCTT 100 49
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        exsC  293288 ..  293312 +  -3.6   -5.4492   TTGTACTTGAGAAAA         GCGAG-GCGTA GTTA TACGTTCTTGC          TTTTTTATATGTATC  81 60
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FHQ13_RS28460  312699 ..  312710 +  -4.4  -2.81072   CACTGTTTTCTATAA                TAGG TGCT CCTA                 CTTGTATTAACTCAC  48 216
FHQ13_RS28465  313567 ..  313578 +    -3  -4.91511   ACAATGAAATCTTTC                TATC CCTG GATA                 TTTTTCTCCTAAACT  68 209
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FHQ13_RS28505  318750 ..  318770 +  -9.8   -4.1399   TTTCTTATATAAAAA            TCCCTACA AACAC TGTAGGGA            TTTATGTGTAAATCA  91 306
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FHQ13_RS01745  321452 ..  321475 +  -8.3  -4.38219   ACAGTAAGAAATTAT          GGATTGAAT ATACAA ATTCAATCC           TATTTTTTATATTAT  85 56
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FHQ13_RS28535  326102 ..  326116 +  -2.8   -3.1247   AGCATTTTTCTCTTG               CATTAC TTT GTAAAG               TTGCGTGTGACCCAT  45 138
FHQ13_RS28540  327378 ..  327400 +  -6.4  -2.75165   GAATACGGATTTACA           TCTAAAATGA TAG TCATTTTAGC           AATTTTTCTATCCTG  58 470
FHQ13_RS28555  329454 ..  329464 +    -4  -4.07133   ATAGTCGTATTATCT                 TTAG AAA CTAA                 TTGTTTCTCCAAGTC  59 290
FHQ13_RS28585  335646 ..  335662 +  -2.3  -5.14626   ATTCTTTTGCGTAGT              TATTGTG TTG CATAATG              TTTTGTTTTAATAAT  65 229
FHQ13_RS28590  337350 ..  337391 +  -2.3  -3.85362   CTAATGTGTTACGTG TTGCTCTTTCGTATGTGCGG ATA CCGCGCTCAC-AAAGAATAA TTTGATCGTTACCTT  51 135
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FHQ13_RS28620  344099 ..  344115 +  -2.9  -4.12532   TGACGCTTTCCACTC              TGAATCC ACT GGGTACA              TTTGTATGTAACCAA  55 285
FHQ13_RS01830  345265 ..  345305 +  -9.9  -4.81359   TAATGATGTTGCGAT  CAAAAAACAAGCCTAACAT AAT ATGTTAGGCTTGTTATATA  TTTTGTATTTCAGTT 100 10
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        lsrF  363170 ..  363192 + -10.7  -5.37593   GAATTAATGTGAAAA           GACAGACTA TTTAT TAGTCTGTC           TTTTTTACTTTACAG 100 34
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        proC  372861 ..  372892 + -14.6  -3.96452   TCACTACATGATAAA      CGGCCAAACTCA TATATACT TGAGTTTGGCCG       TTTCAGTTTTAATTA 100 94
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        cynS  381114 ..  381136 +  -4.9  -4.25283   TCATGCCCAGTACCT           GCATCAG CACCATAAT CTGATGC           TTTTCCTGGAACAGT  65 143
FHQ13_RS28800  382742 ..  382752 +    -4  -3.60323   TCTACATCTTTGAGC                 TTAC GAA GTAA                 TATTGTTTGGTGCTG  53 363
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FHQ13_RS02145  408705 ..  408756 + -25.6  -4.00934   TTTAATTTGAAAATA TAAAGCCAACATATCCCTGTTCTA TAAT TAGAACAGGGATATGTTGGCTTAG TTTAATGTTTAACAT 100 117
        mgtE  412723 ..  412734 +  -5.8  -3.31802   GCTGGATCATCATGC                GCGT AGCC ACGC                 TCTTGTAGTAATTTC  59 133
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FHQ13_RS02370  451899 ..  451940 + -20.5  -3.10597   TTTAAGTATTTTAAA CAAAACCGCTTATGCTTCA AAAA TGAAGCATAAGCGGTTTTC  CTTTTGAATACAGAA 100 36
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FHQ13_RS29150  464560 ..  464571 +  -4.4  -3.65112   GGCGAACGTAATCAT                GTGA CCTT TCAC                 TTCTCTCATTTCCCT  57 140
FHQ13_RS29155  465555 ..  465571 +    -8  -3.24122   TTCTATCTCCCTTTC              GTTCCG AATTA CGGAAC              TTAAATTCCGTTTTT  69 271
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FHQ13_RS02465  468529 ..  468559 +   -20  -3.56643   TCATACATATAAAAA       GCATGGGTTTGATT AGT AATCAAACCCATGC       TTTAAAAACTATGAC 100 160
        tnpA  470554 ..  470565 +    -3  -3.96542   AAAAAACATTTATAT                CAAA TCGT TTTG                 TTTGAGTTTATTTAA  54 21
FHQ13_RS26960  471746 ..  471791 + -13.6  -3.19835   AAGAATATCCCGCTT TTAAACAAAAGAAGCCCCCT TTTTAC AGACGGCTTCTTTTGTTTAA CTTTATCTTATTAAA 100 89
FHQ13_RS02510  476635 ..  476666 + -20.4  -4.62471   AGAAAAAATCAAAAA      CAAGCCGTTTCACT AATT AGTGAAACGGCTTG       TTTTTAAGCGTTCAA 100 96
FHQ13_RS02520  478705 ..  478733 + -11.8  -3.47751   TGTTTCTGTAAAAAA        GCTGTTGAAAGG ACTTC CCCTTCAACAGC        TTCTACATTATTAAC  95 90
FHQ13_RS02535  485434 ..  485462 +  -5.3  -4.74132   AAAGGGTGATTAAAA        CGGGTTACGCT ACATAAA AGCATAATCCG        TTTTTAATGAAATAT  72 258
FHQ13_RS02540  485988 ..  486015 + -14.4  -5.47159   GATACACCTAAAAAA        TAAAAAAGTGGC CAAC GCCACTTTTTTA         TTTTTGTTTATTACG 100 23
FHQ13_RS02555  488476 ..  488502 + -11.1   -5.8187   TATTCTTAATGAAAA         GATAAGATTAC ATTTC GTAATCTTATC         TTTTTTTATTAAATG 100 54
        ansR  492184 ..  492220 + -12.6  -5.08178   CACTTTTGAAGAATA   CGCCATTCTTTC-TGTA AATT TATAAGAAAGAATGGCG    TTTTTGTATGTCTAT 100 340
FHQ13_RS02635  508543 ..  508571 + -11.1  -3.61398   AAAGTGAAACTTTAA        TCAGTGGGGGT TTTGTTC ATCCCCACTGA        TTATTAGCCCACACC  90 186
FHQ13_RS02695  524714 ..  524748 +  -7.3  -4.36262   ATTCCTTTAGAAAAA     CCCAAATTTCTCA ATTTAATGC TGAGATATTTGGG     TTTTAATATAGGTAT  79 48
FHQ13_RS02725  532701 ..  532727 + -15.4  -3.75332   AGTAGATAGTATAAA         TTTAGTGCTGAT TAA ATCAGCACTAAA         TTTAAATTAAAAAGT 100 80
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FHQ13_RS02740  535897 ..  535927 + -13.4  -3.89346   CTTTGCTTTCTAAAT       CAAAACCACCGGTA TAA TGCCGGTGGTTTTC       TTTCTACAATACGGA 100 28
FHQ13_RS02780  544170 ..  544193 +  -9.6  -4.42974   AGCAAATAAATAAAA          GAGCCAATTC ATAC GATTTGGCTC           TTTATTCTCTCTCCC 100 28
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        satA  557724 ..  557740 +    -3  -4.96848   ATGAAAAAGGCTATT             GCTAGTG TTAC CAC-AGC              TTTTTCTCTCCCAAG  68 362
FHQ13_RS02880  564679 ..  564702 +  -9.7  -4.88485   CGAGAATAATGTAAA          TAAGCTGTC CATGTA GACAGCTTA           TTGTTTTTTTGCTTA 100 115
FHQ13_RS02900  569098 ..  569118 + -11.3   -5.4492   TAGTAACAAAAAAAA            GAACATTGA TTT TCAATGTTC            TTTTTTATATCTCTA 100 115
FHQ13_RS02915  573460 ..  573474 +  -5.8  -4.09685   TTTGAAACGGAGAGA               TAAAGT GAA ACTTTA               TTTTGCGGGATAGAA  68 23
FHQ13_RS02920  573915 ..  573939 + -13.1  -5.96219   TTATATCAATAAAAA          GAAATAGGATA TTC TATCCTATTTC          TTTTTTTTATGAGTA 100 19
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        paiB  622134 ..  622164 +  -5.7  -3.42768   TTAATTAAAAAAGAA       TCTATTTTGAA AACAGATGA TTCAAAATAGA       TTCTCACGTTTTAGT  60 147
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FHQ13_RS03445  679955 ..  679979 + -15.9  -4.39426   GTAAAAATATAAGAA          GGGATTGATCA TAA TGATCAATCCC          TTTTATCAAAATATA 100 128
        hisS  686310 ..  686327 +  -8.4  -5.32599   TATTTATAATACGAA             CCACCC TCGTTT GGGTGG              TTTTTCTATTTTATA  93 32
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FHQ13_RS04155  814884 ..  814912 +  -2.5  -2.79008   TAGAGAGGAGAAAAT        CCTATTAAAAAAA TTA TTTTATTGCTAGG        TAGTGTATTGATTAT  41 94
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        pepF  849516 ..  849546 + -17.8  -5.33026   TCAACATTATAAAAA       GCATGCAGAGTATA TGA TATGCTCTGCATGC       TTTTTATTTGAATTA 100 29
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        pssA  875557 ..  875592 + -13.4  -4.37348   ACGTCAGTCCACTTT    TAACAGGAGCTCCCTT TATC AAGAGAGCTCCTGTTC     TTATTTCTTCTTCTT 100 201
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FHQ13_RS04645  921862 ..  921911 + -18.3  -5.85425   AAAGAATCTACATGA TTAATGAAGAAAGAGCATCCT TCTCTTAC AGGATGCTCTTTCTTCATTTA TTTTTTCTTTATTTA 100 26
FHQ13_RS04655  930242 ..  930286 + -18.9  -3.49951   ATTATTAGAATTGAT GAATAACAAAAAGGTGTGCTA AAA TAGCACACCTTTTTGTTTTAC TTCTCTAAAAATATA 100 20
        dhaS  938549 ..  938591 + -23.9   -3.2313   TGGCTTAACTTAAAT TAATGAAAAGAACCTGACC TACCT GGTCAGGTTCTTTTCATTA TGTATTCCTTTAAAC 100 23
FHQ13_RS04700  939669 ..  939704 +   -15  -3.77789   GGACCTACTACCCAA    CAAAATAAACCGAGAG ACAT CTCTCGGTTTATTTTC     TATATTTTTTTGCAT 100 71
FHQ13_RS04790 NONE
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FHQ13_RS07225 1442545 .. 1442567 + -13.4  -5.61596   TATTCAAGTAAAAAA           GAAGCCCGCC AGT GACGGGCTTC           TTTTTTTATACAAGT 100 30
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FHQ13_RS07315 1456772 .. 1456808 + -16.9   -3.6336   CAAATTTTCTTGGCG    TGTGAAATAACCTCCTT TTA AAGAAGGTTATTTCACA    TTCTCTCTCCTATCC 100 16
FHQ13_RS07330 1458708 .. 1458732 +    -3   -3.2963   AACGAATTCTCTTTA          CAAGTAAA CGTTATCAT TTTACTTG          TTGTAAAAACATGAT  47 39
FHQ13_RS07335 1460124 .. 1460143 + -13.6  -5.63103   TATTGGTTAAAAAAA            CACCGAGG AAAT CCTCGGTG             TTTTTTTACTTAAAC 100 31
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FHQ13_RS07435 1477478 .. 1477496 + -10.3   -4.9251   ATTACATTATAAAAA             GGTGCGT ATAAA ACGCACC             TTTTACTTTTTTATT 100 29
FHQ13_RS07450 1479940 .. 1479957 +  -9.9  -5.46657   GAAAGAAACAAAAAA             CAGGCTT GCAT AAGCCTG              TTTTTTATTGCGCTA 100 13
FHQ13_RS07460 1480566 .. 1480587 +  -8.8  -5.93252   TAATTTTACATGTGA           CATGCACA TTTTTT TGTGCATG            TTTTTTCTTTTTAGC 100 38
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        ribH 1484618 .. 1484643 +  -9.1  -5.16472   AAACAATGGGCATAA         AAAAAAGAGGC TGCG GCCTCTTTTTA          TTTTTTCACCTTTTT 100 26
        nhaC 1493427 .. 1493447 +  -9.8  -5.24799   ATAATATAACAAAAA            GGATTACC AAATC GGTAATCC            TTTTTATATTTCTCG 100 37
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FHQ13_RS07540 1497456 .. 1497485 + -16.7   -2.8076   TTGAAAACAAACGTA       TAAAGCTGCTTCT AAAT AGAAGCAGCTTTA        TGATTCGTAATAGTT 100 23
FHQ13_RS07580 1504043 .. 1504070 + -15.8  -5.30155   GAAAACAATAAAAAA        TAGGAGATTTCC ATGT GGAAATCTCCTA         TTTTTTACTTAATGA 100 30
        proI 1506836 .. 1506859 + -11.8  -5.04175   AGAAAAATAGAAAAA          GGAGCTCAAG TTTA TTTGAGCTCC           TTTTTCTATAATTAC 100 31
FHQ13_RS07620 1510686 .. 1510715 + -15.3  -4.17537   TCTCGTAATCTATAA       TAAAAAAGCACTG GTTA CAGTGCTTTTTTA        TTTATACTTATTTAA 100 33
        mgtA 1514837 .. 1514866 +    -8  -3.36803   CTGTATAATAGGAAA       GGTGTCATGA TTTTACTACT TCATGACACC        TTCTACATAAACTTA  69 237
      prli42 1518676 .. 1518703 + -15.8  -4.52589   TTACACATGACAAAA        TAAACCATCTCG ACAT CGAGATGGTTTA         TTTTATATAAAACAC 100 73
FHQ13_RS07755 1537732 .. 1537754 +  -9.9  -5.80364   TTATAAATAAAAAAA           TGAGACCGT TACAC GCGGTCTCA           TTTTTTTATTGGCAT 100 55
FHQ13_RS07765 1538682 .. 1538698 +  -8.7  -5.47964   ACGAAGAATAATACA              GTCCTGT TTT GCAGGAC              TTTTTATTATTTTCT 100 30
FHQ13_RS07845 1554912 .. 1554929 +  -6.3  -5.47159   ACGAAATAGAAAAAA             GCTATCG AAAA TGATAGC              TTTTTTCTATTCACA  86 12
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FHQ13_RS07930 1565900 .. 1565944 + -13.1  -2.90992   AAGGCAAAAAAAGCA AAAAGAAAGACCGTGCTTCCT TTT AGGAAATACGGTCTTTTTTTA TACTTTGAAGCACTT 100 0
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FHQ13_RS07955 1569540 .. 1569550 +  -5.4  -5.95946   GTGAGCAATTATTTT                 TCGT TAT ACGA                 TTTTTTTATTATTAC  91 177
FHQ13_RS07960 1570438 .. 1570463 + -12.7  -5.37345   TTTACTATAAAAAAA         TAAGAGGTGGC AATT GCCATCTCTTA          TTTTTTATAATTCCA 100 31
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FHQ13_RS08150 1596756 .. 1596781 +  -7.6   -5.5074   TCATAATGAAAAAAA         GACGCTAACA TACAAT TGTCAGCGTC          TTTTTTATTCCGTTC  95 35
FHQ13_RS08165 1598091 .. 1598111 + -12.7  -5.32944   TATTATGTAAAAAAA            GAACGTGAT CCA ATCACGTTC            TTTTTTCATTATACG 100 31
        metI NONE
        metC 1608789 .. 1608818 +  -8.8  -4.89393   ATGCATAGAGAAAAA       GAAGATATGAGA TTAGGT TTTCATATCTTC        TTTTTATGCGGTTTA  93 33
FHQ13_RS08210 1609533 .. 1609554 +  -6.7  -5.09259   CATTATCACCATAAA           GAAGC-GAAT GAC ATTCAGCTTC           TTTTCTTTTAACCTG  83 97
FHQ13_RS08215 1610298 .. 1610323 + -14.9  -5.55695   AGTCGTATTAAAAAA         CAAGACACAGT ATAT ACTGTGTCTTG          TTTTTTATATTGTTA 100 138
FHQ13_RS08230 1612460 .. 1612491 + -14.6   -2.6162   ATCGAGATTTTACAC      AAAAAGAGGAAGGG TTCC CCCTTCCTCTTTTC       ATATTTCACAACTTA 100 62
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FHQ13_RS08310 1628330 .. 1628342 +  -5.5  -4.04474   ATAGTAAAAGTGAAA                CCGAG TAC TTCGG                TTTCTATAGCCCTAT  68 84
        ispG 1629549 .. 1629580 + -15.4  -4.42386   CAAGAACAATAAAAA      GAAGGTTGC-CACAA TAT TTGTGAGCAACCTTC      TTTTCTACGTAAAAA 100 29
FHQ13_RS08340 1633118 .. 1633136 + -11.7  -3.71321   CAACTACTAAAATAA             GGAGGGG ATTTC CCCCTCC             TTATTGCGCTTTAAT  95 26
FHQ13_RS08355 NONE
        ispH 1637463 .. 1637508 + -12.9  -3.32343   AAAGTGAAAAAAGAA CAATAATAAAAACCGTTGCTT GCAT GAGCAACGGTTTTTATTTTTC TTATACAAATATAAA 100 20
FHQ13_RS08455 1655100 .. 1655120 +  -9.8  -5.67967   AGAACAATAAAAAAA            CGTCTCAT ACGAA ATGAGACG            TTTTTTTATGCTAAT 100 135
        rpsT 1669959 .. 1669974 +    -9  -5.71712   AAGGCGTTTAAAAAA              CGATCC ATTT GGATCG               TTTTTTTATATACAA 100 39
FHQ13_RS08540 1671522 .. 1671542 + -11.2   -4.1193   TTATCGGTTCTTAAA            GACTGCCA CTTCA TGGCAGTC            TTCTCTTTTTCATCT 100 27
       comER 1676147 .. 1676191 +   -11  -5.07486   TAAAAATACATCTTC TTTATAAAACAAAAGCAACC TTCTC GGTTGCTTTTGTTTTATCCG TTTTTCTTCGCCATG 100 159
FHQ13_RS08605 1681837 .. 1681850 +  -3.8  -3.84961   CGAATAAACAAGTAC               TCCC ATCTAG GGGA                TTTCATCATTAAGTA  54 140
FHQ13_RS08620 1684782 .. 1684807 +  -7.8  -5.54338   TTATAAAAATAAAAA         GAGTTATTTT CTTTGA AAAATAACTC          TTTTTATTTTACTTA  95 35
FHQ13_RS08640 1688377 .. 1688396 +  -8.6  -5.43487   ACCACTATAAAAAAA            GGTTCTCG CCAA TGAGAACC             TTTTTTCTATCATTT 100 31
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FHQ13_RS08685 1694975 .. 1694999 + -11.6  -5.97979   AAATAACAATTAAAA          CTGCCTAAAA TGATC TTTTAGGCAG          TTTTTTTATTCTTCT 100 35
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FHQ13_RS08790 1716575 .. 1716597 + -16.4  -5.37593   TGCGTTAACAAAAAA           GAGAAGCTCC TAA GGAGCTTCTC           TTTTTTAGTTTAGAG 100 33
FHQ13_RS08860 1730399 .. 1730423 + -11.5  -3.59946   ATAAATATATGATTA          GCCCTCTATTT CTT ACATAGAGGGC          TTCTATACTTACACA  93 37
FHQ13_RS08870 1731894 .. 1731913 + -12.2  -4.84529   GGGTGCATAAAAAAA            CTCCCTTG TCTA CAAGGGAG             TTTTTCAATTTATCG 100 31
FHQ13_RS08910 1739920 .. 1739936 +  -4.3  -3.23274   AACATAAACGAAAAC              GTCACCA TTA TGGAGGC              TTCGCTTATGAAAAC  50 39
FHQ13_RS08915 1740589 .. 1740624 + -14.2  -4.68908   GCAGAGAATTAAAAA    CAGGGATGTCACTT TTTTAACC GAGTGACATCCCTG     TTTGTTTTCGGTGAA 100 29
       spoVB 1757574 .. 1757601 + -13.6  -3.48036   AATAAGGTGAAACTT        TAATCAGTGGGG TAAT CTCCACTGATTA         TTAGTTATACTAATC 100 36
FHQ13_RS08985 1759141 .. 1759151 +  -5.4  -3.02144   TATTAAAGCCATACT                 GTTC AAA GAAC                 TCTTCGCGGAAATCG  53 388
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FHQ13_RS09065 1773771 .. 1773797 +  -5.2  -5.20216   GTTTATTAATGTAAA         GCACAGAG TTTTTATCATT CTCTGTGC         TTTTTTAATGCTATA  79 32
FHQ13_RS09070 1774623 .. 1774643 + -11.2  -4.77983   TAGCGGGATAAAGAA            TCCCACCT TCTGC AGGTGGGA            TTTTATTAATCTATT 100 157
FHQ13_RS09235 NONE
FHQ13_RS09240 1809573 .. 1809592 +  -9.2  -5.98675   TTAGCAAAACAAAAA            CGCGCGAC ATTC GTCACGCG             TTTTTTGTTTTTGTA 100 46
FHQ13_RS09280 1820167 .. 1820190 + -12.6  -4.85599   TAACTAAACAGAAAA          CCTTGTTATC AAAA GATAACAAGG           TTTTTGTAGCGTACC 100 34
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FHQ13_RS09370 1834795 .. 1834825 +  -8.5  -5.55769   ATCGGCATAAAAAAA      GGGTATGGTTCTAT AGAG AT-GAACCATACTC       TTTTTTATTGTCCCC  95 31
FHQ13_RS09375 1835627 .. 1835653 +  -8.1  -6.01369   TCTGAATAAAAAAAT        GCGAGC--CCTCA TTA TGAGGAAGCTCGC        TTTTTTTATTCTTTC 100 54
FHQ13_RS09395 1839484 .. 1839527 + -25.8   -4.2074   TTAAAATCATTTGAT GTAAAATAAAAGAGGATGGC ATTC GCCATCCTCTTTTATTTTAC TTTCTCTGTTAAAGG 100 17
FHQ13_RS09410 1842135 .. 1842157 + -13.6  -5.31519   ATGGAAGACAAAAAA           TAAGAGAGCA AAT TGCTCTCTTA           TTTTTCTTTCACTCT 100 23
FHQ13_RS09435 1846663 .. 1846690 +  -9.3  -5.63645   TAAGCATTACCTACA        GTCAACTAGAC ATATCA GTTTAGTTGAC         TTTTTTGTATTTTCA 100 38
FHQ13_RS09480 NONE
        fhuB 1858800 .. 1858835 + -14.2  -2.53822   GGGAAGAAAGTTAAT    TAAAAGACGGCTTCAT ATAT GTGAAGCCGTCTTTTC     CTATTATGGCATAAA 100 23
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FHQ13_RS09500 1860516 .. 1860538 +  -6.3  -4.32048   TATATATACAAAAAA           GGAGTTAGT ATAAC ACCAACTCC           TTTTACGTATTCTTA  72 51
FHQ13_RS09540 NONE
FHQ13_RS09545 1866284 .. 1866336 + -11.6  -4.27483   AGAGTACAAAATATC GTTCAAT-AAGAAAAGGAGCTCAAG TAAA CTCGAGCTCCTTTTCTTTATTAACC TTTAATTTTCTCGAT 100 17
        isdG 1868168 .. 1868213 + -16.5  -5.74086   CAGTCCTTTTTTAAA GTATAGAATATGAGAAGCGTT ATCT ATCACTTCTCATATTCTATAC TTTTTTCTTTAATTT 100 44
        rnhC 1884935 .. 1884966 + -11.8  -3.81689   TTAAAATAGTATCGA      CAAAAACAGGAG CCTACAAA CTCCTGTTTTTG       TTTCATCCTACTATT  95 32
FHQ13_RS09630 1885447 .. 1885460 +  -3.8  -3.07192   TATATCTGATAATCT               TGGC GTGATG GCCA                TCTATTACAGCCCTT  47 159
        tnpA NONE
FHQ13_RS09640 1887347 .. 1887394 + -13.1  -4.63526   TCATGATAAAAAGAT GTAACACATAAAAAGGAGAGTC GCCAA GACTCTCCTTTTTATGT-TAGC TTTGTTTCTGCTTCT 100 254
        sspI 1894364 .. 1894387 +  -9.6  -5.40072   TAAGCAATTTGAAAA          TCACCTTTGC ATAA GCTAAGGTGA           TTTTTTTGCAGAAAA 100 38
FHQ13_RS09675 1895090 .. 1895115 +  -8.3  -5.12916   GTTATCAATGAGAAA         GAGGCATCACT ACAG GGTGATACCTC          TTTTATTATTTTATG  93 30
FHQ13_RS09680 1896083 .. 1896122 + -10.3  -4.48741   CATGTTGGCATTCTT  GAGTTAAAAAGAGGTATC ATCGC GATACCTCTCTTT-ACTC  TTTTATCATAACTTC 100 19
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FHQ13_RS09690 1897056 .. 1897076 + -11.2  -4.85894   TAAAAAGACAAAAAA            GCAGGGAA ATTAA TTCCCTGC            TTTTCTATTTGGTTT 100 38
FHQ13_RS09705 1900449 .. 1900484 + -15.8   -3.3941   GGCCTTTTTAAAACA    TA-AAAAAGCGAAGGAG AAG CTCCTTCGCTTTTTCTA    TTAATTAAATGTAAT 100 30
FHQ13_RS09745 1907649 .. 1907680 + -13.2  -2.57463   AATATCACTATAATA      CAAAAGAGCAAGCT TCTC AGCTTGCTCTTTTA       CTTATGACGACGGTT 100 28
FHQ13_RS29270 1921083 .. 1921131 + -14.2  -4.55826   GAAGGGTTCTTCAAC TAAAAATAGCGCTAGCAT-CCTT ATGA AAGGTATGCTAGCGCTATTCATA TTTTCATCTTTTAAA 100 23
        ytvI 1927956 .. 1927982 + -16.8  -3.51694   CAAAAAACTTACCTG         TAATCAGTGGGA AAT TCCCACTGATTA         TTCCTTGTACTTATT 100 62
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FHQ13_RS09885 1940339 .. 1940365 +  -8.8  -4.49389   AGAAAGAAAAATAAA        GAAGGAG-GGC TTTAGC GCCGCTCCTTC         TTTTCGTTCTAACAT  88 27
FHQ13_RS09895 1941778 .. 1941821 + -12.7  -3.28001   GCTGAAGTCTATGAA GCAACGTAAAAAAGCATCA ATATTG TGATGCTTTTTTACGTCCC TTAACTTTCAAAATC 100 17
FHQ13_RS09910 1943992 .. 1944019 +  -4.2  -4.84146   TACACACGTAAAAAA        CCCTTCACTT TTCTTTTC AAATGAAGGG         TTTCTTTTCTATAGT  68 30
        pepQ 1945966 .. 1945983 +  -9.1  -5.20783   TAAAATAATAAAAAA             GGCAGCG GGAG TGCTGCC              TTTTTCTATTTCCCT 100 33
FHQ13_RS09935 1947675 .. 1947698 +  -6.1  -3.84587   AATATTACTAAAAAA          GAAGGCCACT CAAAA AGT-GCCTTC          TTCTATTTCACTAAT  66 30
FHQ13_RS09950 1948188 .. 1948237 +   -11  -4.18303   GTAAAAGCCCGATTG GTGAGGGCTGATAATCAGTGGGGG ATGC CCCCCACTGATTAA-AGTT-TCAC TTTATAGTTTATCCT 100 15
FHQ13_RS09990 1953792 .. 1953815 +  -8.9   -5.1417   AATTTATAGATAAAA          CACCAAGTC CACATA GGCTTGGTG           TTTTTCATTTTATAA 100 39
FHQ13_RS10000 1954801 .. 1954826 +  -8.9  -5.24515   TGATTAAAAGAAAAA         CGACTGCAGGC GAAT GCCATCAGTCG          TTTTCTTTCTTTATT 100 34
FHQ13_RS10020 1958519 .. 1958529 +    -4    -5.626   AGCAACAAGCTCTTC                 TTCA TAT TGAA                 TTTTTTTCTGACATG  85 181
FHQ13_RS10035 1960108 .. 1960129 + -10.1  -5.70829   CAACAAATTAAAAAA           GCGAAAGGC TTCG GCCTCTCGC            TTTTTTTATGCTCTT 100 30
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FHQ13_RS10050 1962232 .. 1962255 +  -9.6  -4.76191   ATCCAAAAGAAAAAA          GACGAAATCC TATA GGATCTCGTC           TTTCTTTTCATATAT 100 11
FHQ13_RS10080 1967647 .. 1967684 + -18.8  -4.41616   TTTATAAGATTAAAA   TAACCGCAGAATTATG AAATTC CATAATTCTGCGGTTA    TTTATTTCCCCCGAT 100 34
FHQ13_RS10125 1978582 .. 1978608 + -10.9  -3.66844   AAGTAAACATAAAAA         TCCCCACCTCA GTTCG TTAGGTGGGGA         TTCTTCACATATGAA  90 6
FHQ13_RS10135 1979887 .. 1979935 + -13.3  -5.87996   TATGTAAAAAGAAAA GAGCGAGTTATCGATTTAGTACG TCC TGTACAAAACCGATAGCTCACTC TTTTTTTATTGATTA 100 34
        rpsD 1982150 .. 1982183 +  -3.8   -5.8187   AGAGTATTATTAAAA     GCCTTAGGAACCTTG TTTAT CAAGGGGCCTG-GGC     TTTTTTTATTGAATA  85 57
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FHQ13_RS10155 1983902 .. 1983914 +  -4.1  -4.97405   TCCATACAAATCCTC                CTGTT TAT AACGG                TTTATTTTTATCAAT  70 409
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        acuC 1992652 .. 1992676 +  -5.8  -5.14682   TGTACTAAACGAAAA         GGAGGCTCGTT TTTG AAT-AGCCTCC          TTTTATTTATTGTCG  79 33
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        mscL 1998653 .. 1998685 + -17.9  -2.97925   CATAATTGAACGGAT      AAAAAGGCATGTCCC CTT GGGACATGCCTTTTC      TATATGCTATAACGT 100 36
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FHQ13_RS10425 2034578 .. 2034598 + -14.1  -5.95286   GAGCAACAATAAAAA            GGATGACCA TTT TGGTCATCC            TTTTTTATTTTTCAT 100 29
FHQ13_RS10440 2036012 .. 2036050 + -16.3  -3.87075   TTGTCCCAACATAAA   ACATAAAAAAGAGCTGG GTGAG CCAGCTCTTTTTTATGC   TTTATAAACGATCAT 100 27
FHQ13_RS10455 2037221 .. 2037233 +  -3.4  -6.34424   TCACTAAATTTAAAA                TAGC TGGCC GCTA                TTTTTTTTTTAAAAA 100 34
        moaC 2042541 .. 2042574 + -13.3  -3.11207   TCATAATCCTCTCTC     CGTTGAGCCTAAAGG GTTT CCTTTAGGTTCAACC      TATATATCTTGCATA 100 35
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       gerHC 2055465 .. 2055499 +  -8.7  -5.88565   TGAGAAATGATTGAA    CTCCTCTCTCCAGCATG ATA CAA-C-GGAGAGAGGAG    TTTTTTTATTATCAA 100 38
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FHQ13_RS10630 2070701 .. 2070721 + -11.2  -5.34365   AACATAACAAAAAAA            GACGTGCA CTCAC TGCACGTC            TTTTTGTTATTCTCC 100 162
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FHQ13_RS10655 2075447 .. 2075466 +  -9.3  -5.71712   CAGAAGTAAATTTCC            GCTGCCA TAAGAT TGGCAGC             TTTTTTTATATAAAA 100 32
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FHQ13_RS10665 2077282 .. 2077304 +  -9.2  -4.21974   GCTTAAATAGAAAAA           CTCCCTTC AAAAAAC GAAGGGAG           TTTATTACATGGTCA  89 35
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FHQ13_RS10685 2079667 .. 2079714 + -13.9  -3.29461   ATTCCAACGTAATTA TAAAT-AAAAAAAGCTTTGCGC TCACC GCGCAAAGCTTTTTTTCATATA TTATAGACCAGCTTG 100 19
        pckA 2083145 .. 2083170 + -14.9  -4.22949   CACTTACATAAAAAA         GAAGCTTACGT GAAA ACGTAAGCTTC          TTTCTATATCTTATA 100 150
FHQ13_RS10705 2084253 .. 2084286 + -16.3  -4.36931   CCAAAAATAAAAAAA     TAGGAAAGCAGATCA TAGG TGATCTGTTTTCCTA      TTTTGATATAGGTTC 100 23
FHQ13_RS10720 2087041 .. 2087063 + -13.6  -4.74801   TTATAAATTTTTAAA           GAGATAGCTA ATT TAGCTATCTC           TTTTTACTAAACTTA 100 35
FHQ13_RS10735 2089541 .. 2089558 +  -5.6  -2.54193   TTAATCCTACTCCGG             CAGTAG GTCCCG CTACTG              TAACTTGGACTAGTA  54 352
FHQ13_RS10755 2092845 .. 2092869 +  -2.1  -3.49835   ATATAATCACTTTAA         GCCG-ATTGG CTCCTT CCAAAACGGC          TCTTCTATTATTCAA  45 120
FHQ13_RS10765 2094001 .. 2094024 + -11.2  -5.59962   AATACTATGAAAAAA          GAACTTGTAT CGTT ATACAAGTTC           TTTTTGTTTCTTTTA 100 200
FHQ13_RS10775 2097654 .. 2097687 + -22.7  -3.61894   AACCAAGCATAATAA     GAAAGAGGTCGTCCA CCGT TGGACGACCTCTTTC      TTATTCCCCACACTT 100 29
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FHQ13_RS10795 NONE
FHQ13_RS10800 2101133 .. 2101168 +  -4.1  -4.75954   TTGGAAAAAGAAAAA    GAAGCTGACTCAAAAC AGTGC GCTAT-AGTCAGCTTC    TTTCTTTTACCTTTT  68 18
FHQ13_RS10815 2103570 .. 2103599 + -10.1  -4.78597   GACAAAAAATAATAA       GAGGAGGCAGTTAT TCA AAAAC-GCCTCCTC       TTTCTTTATTATTCA 100 87
        ytzI 2105442 .. 2105461 +  -3.6  -3.53511   ATTGGATCATATACA            GGTCAAAA TAAA TTTTTACC             TCTTTCATAATTTCT  50 96
FHQ13_RS10845 2105902 .. 2105914 +  -3.4  -3.71998   TTACGGATTTTTTTA                GCAT TTCTC ATGC                TTCTCTTACTCACTC  52 84
FHQ13_RS10850 2106465 .. 2106482 +  -4.1  -4.82678   AGCACAATAAAAAAA             CTGCC CTTTCACA GGCAG              TTTTCCTTTTTATCC  68 64
        yidD 2107804 .. 2107817 +  -4.5   -3.8505   TACCATTTTTTTATT               CGGGA ATTT TCCTG                TTTCATACTCTTCGT  59 499
        cydA 2109452 .. 2109464 +  -6.3  -2.91452   TGAGGGAGGTGTGGC                TCATG TCT CATGA                TATGCTTGCAATCAT  59 13
        cydB 2110492 .. 2110511 + -10.8  -5.29782   CACTAAAATAAAAAA            GACACTTC ATTT GAAGTGTC             TTTTTTGTACGTATG 100 35
FHQ13_RS10885 2112598 .. 2112620 +   -15  -4.37157   ATTTTCTTAATAGCA           TCCCATCCTT TGA AAGGATGGGA           TTTCTTATACTGATT 100 31
FHQ13_RS10890 2113666 .. 2113695 + -20.9  -5.30348   AATCGTTATGAAAAA       GAGGGTGTGCCAA AATT TTGGCACACCCTC        TTTTTATTATTAAGT 100 39
FHQ13_RS10915 2117362 .. 2117392 + -14.2  -2.85008   TTAAAAAGTAAAACA       AAAAAGCTTTGCGA AAT TCGCAAAGCTTTTC       CTATTTATTATGAGC 100 30
        thiT 2120834 .. 2120852 +  -8.8  -5.23316   GAATACACAAAAAAA             GGGCGCTT AAT GAGCGCTC             TTTTTTCATATCGTA 100 16
         hpt 2126535 .. 2126566 +  -3.7  -4.53439   TCCAATTAATAGGGA      GAAGCTGTTCTAA AATACA TGGGAACAGCTCC       TTTCTTTCCATTTAC  64 133
FHQ13_RS10975 2127506 .. 2127541 +   -15  -3.47841   TCCTGCGGTTGTGTA    AAGAAAAAAACGAGTG CTAG CACTCGTTTTTTTCTC     TTCTAATCTAGCTAT 100 25
FHQ13_RS10985 2128925 .. 2128970 + -12.4  -2.82193   TTTAGGACATAAATA G-TGATAAAAAAAGAGCTTGAA TAGT TTCAAGCTCTTTTTT-ATCAAC TCTCCTCAATATCAT 100 25
FHQ13_RS11050 2140510 .. 2140537 +  -9.9  -4.55849   TGATAAAAAAACAAA        GCTGCTCTTCC CTAAAA GGAAAAGCAGC         TTTATTTACATTTTC 100 38
FHQ13_RS11070 NONE
FHQ13_RS11075 2144052 .. 2144075 +  -8.3   -5.0538   CATATGCAAGCAAAA          TGTATGAGA ACTCAC TCTCATACA           TTTTTTGCAATACAA  93 47
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FHQ13_RS11085 NONE
FHQ13_RS11090 NONE
FHQ13_RS11095 2150891 .. 2150917 + -17.4  -4.28589   AAAATATGAATAAAA         TGGCCTTGTGCG TAT TGCACAAGGCCA         TTTTCAATAGTTTTT 100 32
FHQ13_RS11105 2151983 .. 2151996 +  -2.4  -3.35597   GAGCTCATAAAAATG               GTGA AGAAAC TCAC                TGTTTAAAACATGCC  44 5
FHQ13_RS11110 2152737 .. 2152784 + -22.6  -3.73414   AGAAAGCACAAAAAA CGAATAAAACCTACAGA-GAAAT TAC ATTTCCTCTGTAGGTTTTATTCG TTTAAATCTGATCTC 100 42
FHQ13_RS11190 2171069 .. 2171088 + -11.4  -4.84527   ATACTTTCTATAAAA            GGAGCTGC TTAT GCGGCTCC             TTTTTCATATCTGAA 100 28
FHQ13_RS11195 2171914 .. 2171934 + -14.1  -4.88067   AAAGAATAAAAAAAA            GCATTCCGA AAA TCGGAATGC            TTTTTATCGCTAGCT 100 32
FHQ13_RS11205 2173374 .. 2173418 +  -2.3  -3.70902   AATAAAATAATAAAA TTAAAACACCCTTGCTT GCAGTAATAAA GTGAAAGGGTGTTTTAA TTTACGTCTACAAAC  49 73
FHQ13_RS11210 2173875 .. 2173895 +  -8.3  -5.10163   ATGAAAAAGAGTAAA            CAGTGCC CTTATCA GGCACTG            TTTTATTTTGCCATT  93 210
FHQ13_RS11215 NONE
FHQ13_RS29280 2174969 .. 2175009 + -17.3  -3.31598   CTTTCTTAAGCAAAA  TAAATAAAACGAGCTTAAT TTT ATTAAGCACGTTTTATTTA  TTAATATCCATTTCT 100 32
FHQ13_RS11245 NONE
FHQ13_RS11250 2188451 .. 2188484 + -19.1  -3.34013   GATAAAGTGAAACTT     TAATCAGTGGGGGGT GTTC ATCCCCCACTGATTA      TTAGTTGAACCAATC 100 39
FHQ13_RS11385 2198345 .. 2198362 +  -5.6   -5.8096   GTAACGTAAAACAAA             CTCTCT TTAATT AGAGAG              TTTTTCTTTTTTCTA  93 37
FHQ13_RS11390 2199895 .. 2199931 + -24.1  -4.11371   AACTTTTCGATAAAA    TAATAAAAAGCGACCGG AAT CCGGTCGCTTTTTATTA    TTTTAAACGCTCTTC 100 499
FHQ13_RS11405 2201863 .. 2201906 + -20.7  -3.06679   ATATATATCATAAGA TAAAGTAAAAGAGGAACGC TCATAT GCGTTCCTCTTTTACTTTG TTAACTCGGACTCTT 100 99
FHQ13_RS11425 2205457 .. 2205481 + -17.3  -5.80364   ACTGAATAAACGAAA          GGCAAGATGAC ATC GTCATCTTGCC          TTTTTTTGTTAACAT 100 42
FHQ13_RS11430 2206488 .. 2206510 + -14.2  -2.78715   GGATAATATAAAAAA           GGCTGTCGGA AAT TCTGACAGCC           TATAATGAACAGCTT 100 124
FHQ13_RS11440 2208211 .. 2208228 +    -7  -4.86293   CATTTCACAAAGAAA             GCTACC ATTCAC GGTAGC              TTTTACTTTTTCTTC  82 206
FHQ13_RS11455 2209573 .. 2209603 +   -12   -3.3382   CTCTAAAAAACAAAA       CGACCAAATTACAT AAT GTGCAATTTGGTCG       TTACTGTGTGCTCAC  95 35
FHQ13_RS11465 2211851 .. 2211871 + -13.3  -5.35354   TATGTAGTAAAAAAA            GCGCTCTGA TAA TCAGGGCGC            TTTTTTACTTATATC 100 34
FHQ13_RS11475 2213436 .. 2213471 + -16.9  -5.86465   GGAACCGCGGGCAAA    CGCTCGTCCCTAGGC AAATAA GCCTTGGGATGAGCG     TTTTTTTATGTTCTT 100 242
        glyS 2214955 .. 2214977 +  -9.9  -5.46698   TAATTATAAGAAAAA          GAGGCTGCTC ATAA GAGC-GCCTC           TTTTTTACTTTTCAC 100 38
FHQ13_RS11490 2216254 .. 2216270 +  -2.3  -4.35926   ACAGGAGGTTAACAT              TATGAGA AGA TTTCATG              TTTTAGATTTAGCAT  54 75
FHQ13_RS11495 2216856 .. 2216883 + -15.8  -5.80817   TTTCATAATAAAAAA        GAGTTATTGCAG ATTG CTGCAATAACTC         TTTTTTTATATTAAG 100 33
        cdaS 2220493 .. 2220526 + -15.5  -2.73452   AACAAACCTATAAAA     AGAAGACTGTTCCAA AATA TTGGAACAGTCTTCA      CTTATACTCTTATTC 100 156
FHQ13_RS11540 2226489 .. 2226522 + -19.9  -4.52589   TTTAATATGTAAAAA     TAAAAGCTCCTTCCA TACG TGGAAGGAGCTTTTA      TTTTATATACCACGA 100 36
FHQ13_RS11550 2237300 .. 2237316 +    -8  -5.71983   GTTAGCCTAAAAAAA              GATGCC CATTC GGCATC              TTTTTTTGTCGTTAA 100 31
FHQ13_RS11555 2238767 .. 2238791 +  -5.7  -5.09895   TCGACTAGCTACTTG          GAGTCATGTAT TAT ACGCATGGCTC          TTTTTTAAATGGATC  79 33
FHQ13_RS11565 2240193 .. 2240217 +  -8.7  -4.67354   TTGAAAGCAAAAAAA          GGAATTGAC CCTGTTC GTCAATTCC          TTTTCTATCTGTCTT  89 18
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        fetB 2247139 .. 2247159 + -12.6  -3.90298   GTGACATAATAAAAA            GAGGAGGC TATTC GCCTCCTC            TTCTATTTACTTACG 100 194
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FHQ13_RS11985 2309940 .. 2309962 +  -2.1  -4.67552   GTTGCCCACACGAAA           GATACATAA ATCAA TTATTTATC           TTCTTTTTTCATAAA  58 90
FHQ13_RS12005 2313034 .. 2313079 + -15.9  -3.65224   AAAAGGTTAATAAAT TAAAGGGCATAACATATTA GTCATATA TAATATGTTATGCCCTTTG TTATTCAACTAACGT 100 40
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FHQ13_RS12165 2341809 .. 2341834 +  -9.2  -5.46129   GAATAATACTTTTAA         TCACCTTAAT GAATGG ATTAAGGTGA          TTTTTTAATTTGTTC 100 35
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FHQ13_RS12230 2359612 .. 2359644 + -17.1  -4.89339   TACTAATCTGAATAT      AAGCCCGAATCATGC CCT GCATGGTTCGGGCTA      TTTTTATCCGTAATT 100 35
        crcB NONE
        crcB 2366992 .. 2367009 + -11.3  -4.49556   GGAATATGAAAAAAA             GCGACTC TATT GAGTCGC              TTTCTTTCATAAGAA 100 32
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        clpP 2416038 .. 2416056 + -11.7  -5.58179   AGATACATAAAAAAA             GCGCCCT ATTAC AGGGCGC             TTTTTTATTATCATG 100 158
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       abc-f 2440895 .. 2440912 + -12.7  -3.48063   CATAGAATACAAAAA             GCCGTGC ATCA GCACGGC              TTCTCACTTTAGATA 100 100
FHQ13_RS12740 NONE
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        speD 2477233 .. 2477248 +    -9  -3.39895   TTCGAGATAAAAAAA              CCTTGC ATAA GCAAGG               TTCATTCATCCACCG  76 169
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FHQ13_RS12845 2482390 .. 2482418 + -14.8  -3.92324   AACGTAAATAAAAAA        TAAGCTATCCGA AAAAA TCGGATAGCTTA        TTTCATCTTAAGAAA 100 30
FHQ13_RS12855 2485452 .. 2485506 + -13.3  -5.29385   TAGGACGTAAAATTA TA-TGAACAAATAAAAGGTGCCACCCT CAT ATGGTGGCACCTTTTATT-GTTCACTC TTTTTTAATTCCATT 100 31
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FHQ13_RS18665 3636338 .. 3636363 +  -9.1  -5.71295   TGTGTAAATAGAAAA         CTTCCACCT TATTATCT AGGTGGAAG          TTTTTGTTTTTGTAT 100 34
FHQ13_RS18680 3640247 .. 3640265 +  -2.3  -2.57132   CACGTAAAAGGCAGT             GCGAGTG AAAAG CGCTAGC             CTTCTAAAGGAGGAA  39 127
FHQ13_RS18685 3640653 .. 3640675 + -16.4  -5.63517   AGCGTAATAGTGGAA           GACGCTCCTA GTT TAGGAGCGTC           TTTTTTGTTTAGGGA 100 34
        alsS NONE
        alsD 3644859 .. 3644887 + -13.3  -4.74215   TGCAGAGTAAGAGGG        AAAGACTGTTCCA TTT TGGAACAGTCTTC        TTTTATTCGTAATGT 100 31
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FHQ13_RS18720 3650821 .. 3650849 + -16.2  -4.19817   AACGGATGTATAAAA        GGCATCAGAGAT ATATA ATCTCTGATGCC        TTTTAAGTGAATACA 100 39
FHQ13_RS18730 3654355 .. 3654381 + -19.6  -5.31275   TTGCATAAGAAGAAA         GAGGTTGTTCCG AGT CGGAACAACCTC         TTTTTTATCCTGCAG 100 33
FHQ13_RS18735 3656210 .. 3656243 + -20.5  -5.10064   CGAAAAAATAGAAAA     TGCAGGATGCCCCAT ATCT ATGGGGTATCCTGCA      TTTTTCTGTATTAAA 100 30
FHQ13_RS18750 3659225 .. 3659268 +  -6.2  -5.02201   AGATGGTAATTAGAA TATCTCACAATCTTACATAA ATTA TAATGTAGAGTTGTGGGATA TTTTTATAATGTTTT  81 39
FHQ13_RS18755 NONE
        csaB 3662279 .. 3662305 +  -6.7  -5.40279   GATCATATGGAAAAA         GGCACTTTATT AAAAA AGTAAAGTGTC         TTTTATTTTGTTTTG  89 5
FHQ13_RS18765 3664321 .. 3664351 + -15.6  -5.09204   TAATTAAATAAAAAA       GAAGGTGCTACTAA TAT TTCGTAGCACCTTC       TTTTTATTCCGCTAT 100 38
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FHQ13_RS18795 3669176 .. 3669216 + -13.7  -3.53343   TAATTTCATAGATAA  TAGAGAGCTGATTAAAGAT ATT ATTTTTAATCAGCTTTTTA  TTTGGCAAAGCGATT 100 38
FHQ13_RS18800 3671156 .. 3671207 + -22.2  -4.50993   AACGTGTCTTCTTTC CGTTAATAAATAATAAGAGATTGCC ATT GGCAGTCTCTT-TTATTTATTAACG TTTCTCTTTATTTCC 100 20
FHQ13_RS18805 3672278 .. 3672297 + -13.6  -4.85177   GAATAGAAAGAGAAA            GGTCACCC GTTT GGGTGACC             TTTTTAGTGTAGTTT 100 35
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FHQ13_RS18820 3674758 .. 3674775 +  -5.5   -5.5353   AAGATTGAGTTTTGA             GACTGCC TTTT GGTGGTC              TTTTTTGTTGATGTG  88 26
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FHQ13_RS18835 3678210 .. 3678231 +  -9.5  -3.75153   ATAAGAAACAATAAA           GAAGCTGGT GGAA ATCAGCTTC            TTTAGCTTGAGGGGG  84 37
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FHQ13_RS18915 3694359 .. 3694372 +  -3.9  -2.75992   AAGTAAGAAAAAGTT               GAATA TTAA TATTC                TAATATTCAATAGAA  45 24
FHQ13_RS18920 3694813 .. 3694852 +   -19  -3.05715   TATATAACAGGCATT  TCAAATGAGCCATACAGCT TAT AG-TGTATGGCTCATTTGA  TTGCATGCCCAACTT 100 55
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         bsh 3781103 .. 3781147 +  -9.6  -5.42265   TGAGACTAATAAAAA CACCTCCATTTAATTTGCATAC TTA GTATGCGAATTT-A-GGAGGTG TTTTTTATCATTTAC 100 57
FHQ13_RS19440 3782170 .. 3782210 + -10.8  -4.14013   TAAAATAGAATGAAA CT-TTAATCATCGAGAATA TTTT TATTCTCGATGATTATTAG  TTTTCAGCGATTTTA 100 344
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FHQ13_RS19470 3789761 .. 3789795 +   -13  -5.73978   ATAGTAAGTAGGAGA     GCAAGTAGTTTTAGCG GAG TGCTGGAACTGCTTGC     TTTTTTATTTATCCT 100 49
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FHQ13_RS19505 3794836 .. 3794857 +  -5.2  -5.57396   ATAATTGGTGAAAAA           CTCTGTAA TAAATT TTACAGGG            TTTTTTGTTAGTTCT  86 41
FHQ13_RS19510 3796428 .. 3796442 +  -5.8  -3.30854   TTGGTGAGGGCTGAT               TAAAGT TTC ACTTTA               TTAGTATCCATTCTT  59 207
        glpP 3797822 .. 3797878 +  -3.5  -5.45802   ACGGAGAAAAGTAGA GATCCACA-TTT-CATTGTTTCTATATA AATT TATATAGAAGC-GTGCAAGCTGTGGGTC TTTTTCTTTTGACAA  76 112
        glpF NONE
        glpK 3800341 .. 3800391 + -11.5  -5.32944   GGTAGGAGATTTGGA GAGACCAC-AACGC-GCTATAGA GGCGAAA TCTATAGCGGAGTTTGTGGTCTC TTTTTTCGTTATCAA 100 79
        glpD 3802113 .. 3802138 + -14.1    -5.626   GCGTAAAATAGAAAA         CCACCTGAAGG GGAG CCTTTAGGTGG          TTTTTTTATGGAATA 100 35
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FHQ13_RS19545 3803560 .. 3803604 + -13.8  -3.06183   GCTGCGTTAGCGTAA GATAGAGAACCACCTGAAGG GGGAG CCTTTAGGTGGTTTTTTCTC TTGACTAAAAATAAA 100 269
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        hemH NONE
        hemY 3839628 .. 3839660 + -16.5  -4.39329   GCACAATAAATTATA      AGAAACGCCTTCAAT CAT ATTGAAGGCGTTTCG      TTTATTATATAAAAT 100 32
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        clpB 3929364 .. 3929412 + -13.5  -3.43264   GTCGTTCATGTGAAA TAAAAATAAAAAAGAGTTCGGAT AAA ATCCGGACTCTTTTTTAGTGTTG TTCTACTGGCTCGTT 100 23
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FHQ13_RS26205 5122797 .. 5122811 +  -2.2  -4.30978   CCATCACCATCAAGT               TAAAGT TTC ATTTTA               TTTTGCTAACTTGAG  54 205
FHQ13_RS26215 5125911 .. 5125959 + -13.5  -3.98842   CCGCTAAAATACTAT GAAAAGATACTAGAGACTACTAC AAT GTGATATTCTCTAGTATTTTTTC TTTATCCATATTATC 100 415
FHQ13_RS26225 5126866 .. 5126889 + -11.8  -3.98448   CGTTTTTAATGCAAA          TAAGCTGTCC GTTT GGGCAGCTTA           TTATATTTATTACTA 100 41
FHQ13_RS26230 5127725 .. 5127749 + -13.6   -4.9218   TAATTAGTAGAAAAA          GGAAGGGGCC TATTT GGCTCCTTCC          TTTTTCTCATACATA 100 271
FHQ13_RS26235 5129430 .. 5129458 + -16.9  -3.81287   TAATCGACCATAACA        TAAAGCCGAGTGC AAT GCACTTGGCTTTA        TTTAATCGTCCTGTA 100 28
FHQ13_RS26240 5130915 .. 5130928 +  -2.5  -2.81208   AGAAGCTTATCAATT               TTTAA TGTA TTAAA                CTATTTTGAATAACA  41 82
FHQ13_RS26245 5131774 .. 5131811 + -10.7  -5.84381   ATTATTCCAGTAAAA   GGCTAGAGATTAACTAT TGAA ATAGATAGTCTCCAGCC    TTTTTTTATTAGTGG 100 80
FHQ13_RS26250 5132880 .. 5132911 +  -6.6  -5.59502   AAATAAAGTTAAAAA      TCCACATCTACAGA GGTA TTGGTGGGTGTGGA       TTTTTTAATTTTTTA  90 324
        colA 5136238 .. 5136269 +   -11  -5.84381   AATCATTGTTTTTTT      TAGAAGGGGTCTGT CACG ATAGACTCCTTCTG       TTTTTTTATTCATAC 100 62
FHQ13_RS26270 5137642 .. 5137682 +  -8.6  -5.46698   CCATAAAGTAAAAAA TACGTTATTCCTTTCTCTA ATTA TGCAG-AAGGAATAACGTA  TTTTTTCATTTTAAG 100 202
FHQ13_RS26290 5144834 .. 5144870 +  -8.3  -5.58209   CCGTAACATGAAAAA   CGTTATTCTTTCTCTA GAATCA TAG-GAAAGGATAACG    TTTTTTTACATTTAG  95 180
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FHQ13_RS26300 5148364 .. 5148386 + -13.6  -5.24129   ACGTCGTTTCTTTTA           GGAATCCTTA TTA TAAGGATTCC           TTTTTTGTACCAAAA 100 412
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FHQ13_RS26310 5151404 .. 5151444 + -12.9  -3.57119   AAATAAAATAGGTAT  TTGGGTCAATAACATCT TTGATTT AAATGTTATTGACCCAA  TTTAGAAAATATCTA 100 366
FHQ13_RS26315 5152820 .. 5152841 + -13.1  -5.47159   TTTTGGGAACGGAAG           GCAGGCATA TATT TATGCCTGC            TTTTTTGTATTAAAA 100 103
FHQ13_RS26320 5155059 .. 5155081 +  -4.2  -5.14965   TTAAATTTCAAAAAA           GCATTCTT TCTAATC GAGAATGC           TTTTTTGCTGCGACT  72 127
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FHQ13_RS26330 5156745 .. 5156782 + -14.4  -5.35365   TAGATTCTATATGGT   AAAAGAGGAAGGTTCA CTTTAA TGAACCTTCCTCTTTG    TTTTTATTCTCTTTT 100 24
FHQ13_RS26340 5161097 .. 5161141 + -13.9  -3.31188   GTAAAAAATGAAATA TGAAATAAGAGATAGTGGCGA TCA TAGCTACTATCTCTTATTTTG TTAATAATTCTCATA 100 89
         bla 5162239 .. 5162264 + -10.5  -5.21506   TATAAAGTTAGAAAA         CGACTCTTTTC GTGT GATAAGAGTCG          TTTTTGTATTCTTAT 100 84
FHQ13_RS26350 5163267 .. 5163292 +  -9.8  -5.93809   GGCCAGAAATTGTAG         TCGTGCAGCT AAATTA AGCTGTACGA          TTTTTTTTATACAAA 100 9
FHQ13_RS26355 5163771 .. 5163821 + -17.2  -4.05208   AATTTATAGTTTAAA TGAAACAGAGTCGACTTTAGGA AATGAAA TGCTAATGTCGACTCTGTTTCA TTGTTTAATATCGGT 100 46
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FHQ13_RS26370 5166394 .. 5166431 + -14.5  -3.90352   TACATTACTTTTAAG   TAAAAATAAATCGCCTT TAAA AAGGCGATTTATTTTCA    TTATATATTTTTGAT 100 61
FHQ13_RS26380 5168011 .. 5168040 +  -5.1  -5.66684   AATTCGACACAAAAT       CTCCTATGTTGTT GTAG AACAATGTAGGAA        TTTTTTTGTGCATTA  91 55
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       abc-f 5232402 .. 5232412 +  -5.4  -3.56366   ACGGTCATATTCTTA                 TGTC TAT GACA                 TTTACGACCGTTCTT  59 248
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        tenA 5245643 .. 5245676 + -12.1  -5.55769   AGAATAGAAGTAATG     T-TATAGATAGGTATG GAT CATACCTATCTATATA     TTTTTTCTTGTCAAA 100 41
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FHQ13_RS26795 5248158 .. 5248178 +  -2.5  -5.62552   TGATATTTGTAAAAA            GGGCACC GAATTAA GGTGTTC            TTTTTTGGTTTTTTT  76 45
FHQ13_RS26800 5249114 .. 5249155 + -12.6  -4.91712   AAGAATATAAGATGA TAGGTTAAACAAACCTTG ATATAA CAACGTTTGTTTGACCTA  TTTTTATGAATTGCA 100 18
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FHQ13_RS26815 5252366 .. 5252404 + -15.6  -3.86897   GTAATTAATATAATA   TTAGAAATGACACTATCA AAT TGATAGTGTCATTTCTGC   TTTATAGAGAATGGA 100 37
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FHQ13_RS26915 5264306 .. 5264329 + -11.8  -5.26119   CGAGAATTATGTAAA          TAAGCTGTCC ATAT GGGCAGCTTA           TTTTATTTTTCCGCA 100 125
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FHQ13_RS26925 5266132 .. 5266154 +    -5  -3.15663   TTTTCGCCGTACTTG           TTAAAAGTAT TAA ATTCTTTTAA           TTGATGAAGATGAAT  53 293
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FHQ13_RS26955 5268045 .. 5268063 +    -3  -3.06915   AGATAGCAATAAAAT             AACCCTTG GAA CAAGGGAG             TTAGCTCGGCTGCCT   0 53
FHQ13_RS26930 5265740 .. 5265761 -  -9.5  -4.29845   GAACCGAAGTGAAAA           GTCAGCTCA ATCT TGAACTGAC            TTTTATGAGTAATGA  86 125
FHQ13_RS26910 5260867 .. 5260897 - -10.6  -3.98083   GATGCAATGGATAAA       GCAATGACTAGGTT TAA AATCTAATCATTGC       TTATTTCTTTTTAAA  93 216
FHQ13_RS26895 5258262 .. 5258293 - -18.2  -4.24623   CTAAATATATATAAA      CACCATTCTCCCCA TATA TGAGGAGAATGGTG       CTAAGTTGTGATACA 100 42
FHQ13_RS26820 5252369 .. 5252401 - -19.5  -2.86349   ATTAATATAATATTA      GAAATGACACTATCA AAT TGATAGTGTCATTTC      TGCTTTATAGAGAAT 100 239
FHQ13_RS26805 5249114 .. 5249155 - -10.4  -2.87621   AAGAATATAAGATGA TAGGTTAAACAAACCTTG ATATAA CAACGTTTGTTTGACCTA  TTTTTATGAATTGCA  78 60
FHQ13_RS26750 5239139 .. 5239177 - -17.7  -5.16472   AAAAATCTTAAAAAA   GAGCTCGAGGTTGAT GGATACTTT ATCAACCTCGAGCTC   TTTTTAATACCGTTT 100 48
FHQ13_RS26705 5229179 .. 5229201 -  -8.4   -5.4505   TTTTGTAAGAAAAAA           GCTCGCCCTT TGA AAGAGCTAGC           TTCATGAATTTTAAT  95 40
FHQ13_RS26685 5225618 .. 5225663 - -14.3  -5.08601   TTACTTGAATAAAAA GAAAACACCGAAAGTATATAT AAAA ACAGGTACTTTCGGTGTTTTC TTTTTTACTATCGTG 100 33
FHQ13_RS26680 5224973 .. 5224996 -   -11  -5.38958   AGTTAGAAATAAAAA          CGGCAAGCTA GAAT TCGCTTGCCG           TTTTTTTTATAGTTT 100 32
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FHQ13_RS26665 5222786 .. 5222809 - -11.8  -4.66264   CAAAATCCCCAAAAA          GAGCACTTGC GGAA ACAAGTGCTC           TTTTATTTTTTGTTT 100 116
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FHQ13_RS26630 5216616 .. 5216658 - -10.8  -2.60685   AATTGAAAGTAAGAT GCGTAGTATTTCAAATGCAC AAG GTGAATTTGAAATACCACAT GGAGTTTGTGGTGAA  82 242
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FHQ13_RS26600 5211317 .. 5211359 - -13.1  -4.33621   CAGCTAATTAATAAA TGCTGTTGTTTAACCA-AAG TTTC CTTGCAGTTAAACAACAGCA TTCTTAAATATTGAT 100 29
FHQ13_RS26570 5206195 .. 5206225 -  -6.3  -3.41988   TTTTAGTTAATAATA      GCCTCCTTAATACT AGTT AATAC-AAGGAGGC       ATTAAATTTTTAATA  63 42
FHQ13_RS26565 5204607 .. 5204637 - -12.9  -3.71389   TAAACAAATAAGTAA       TAAAAAAAGGCAT GTTTT ATGCCTTTTTTTA       TTTTATTAATATCTC 100 62
FHQ13_RS26525 5192285 .. 5192324 -   -14  -5.40625   ACATTACATAAAAAA  CACGTTACTATTCTCATTA AAA TAA-AAGAATAGTAACGTG  TTTTTTGGTTTGGAA 100 135
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FHQ13_RS26485 5183575 .. 5183605 - -12.9   -4.7078   GTAATTATGGAAAAA       GTTCAATTTCTTA TATGG TAAGAAATTGAAC       TTTTTATTTGTAATA 100 41
FHQ13_RS26480 5182379 .. 5182405 - -10.2  -4.96646   TGATAGAATTAAAAA         CCGACTTGCA TCTCAAG CGCAAGTCGG         TTTTATATATATAAG 100 49
FHQ13_RS26470 5181909 .. 5181940 -   -11  -4.34947   AATATATGAGGAAAA      TAAAAAAAGAGGGC TAAT GCCCTCTTTTTCTT       TTAATTTGGTAATTA 100 38
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FHQ13_RS26435 5177225 .. 5177245 -  -6.9  -5.23644   AATTAAATATAAAAA            GGCGATT ATCTTCA AATCGCC            TTTTAGGTAATGCCG  84 48
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FHQ13_RS26335 5156749 .. 5156778 - -15.9  -4.16943   TTCTATATGGTAAAA       GAGGAAGGTTCAC TTTA ATGAACCTTCCTC        TTTGTTTTTATTCTC 100 5
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FHQ13_RS26275 5137642 .. 5137682 -  -6.5  -5.42514   CCATAAAGTAAAAAA TACGTTATTCCTTTCT CTAATTATGC AGAA-GGAATAACGTA  TTTTTTCATTTTAAG  86 183
FHQ13_RS26265 5136493 .. 5136527 - -10.9  -5.05113   GGTAGACAAAGAAAA     GAGCGTGTTTTGA AAAAAATAA CCAAAACACGCTC     TTAATATTTTCAGTT 100 140
FHQ13_RS26210 5122494 .. 5122512 -  -2.4  -5.09225   ATGTCAGCCAAAAAA             TACCCCAT CAT ATCGAGTA             ATGGAGAAGGTTGGA  69 498
FHQ13_RS26105 5078526 .. 5078574 - -13.6  -2.51888   TTTGAAACCTAATAG TGTATATAAAAAGGTTAGAGAA GTTAA TTCTCTAACCTTTTTATATTAA TGTATGAAATTTAAA 100 123
FHQ13_RS26085 5074639 .. 5074669 - -14.3  -4.20817   TACAGGTGAAAAGAA       CAAAAGAAAATGC ATAGA GCATTTTCTTTTG       TTTTTTTATTTAATA 100 31
FHQ13_RS26055 5069903 .. 5069930 - -12.9  -3.64488   AATGCTCTTAAAATA        GAAAAGGATGG TGCTTT CCATCCTTTTC         CTTATGTATTTTGAG 100 105
FHQ13_RS26020 5064731 .. 5064754 -  -7.6  -4.62904   AAAGATTTGGAAAAA          GGGTTACA-AT CGA ATCTGTAACCC          TTTTTTTCTATTAAA  83 134
FHQ13_RS26000 5059592 .. 5059614 - -12.2  -4.99638   ATAGTGATATAAAAA           GAGTACATAT CGA ATATGTACTC           TTGAAAAAAGGAAGT 100 200
FHQ13_RS25995 5058513 .. 5058533 -  -4.7  -5.95449   AAATAAAATAAAAAA            GAGCACC ATGCATA AGTGCTC            TTTAAGATAGGAGGT  91 388
FHQ13_RS25960 5055009 .. 5055034 -  -9.7  -5.27476   CGGAACAAAATAAAA         GAGCGGCTAGC AAAA GCTAACTGCTC          AATACAAGGAGATAC 100 101
FHQ13_RS25940 5050456 .. 5050489 -  -8.9  -5.18297   TAAGAATAAATAAAA     GGGAGTCAGAACTTA GGAA CAAGTGCTGATTCCC      TATTTGTTTACGGTT 100 119
FHQ13_RS25885 5039003 .. 5039038 -   -12  -5.44198   AATAAATAACAAAAA    GCGCCTTAAAAGCTAAG TAT CACAGCTTT-AAGGCGC    TTTTTTTATGAGATT 100 41
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FHQ13_RS25845 5031864 .. 5031889 - -12.1  -5.52384   CGGTCAGTAAAAAAA         GATGAATTCTT TTAA AAGAATTCATC          CATAAAATAAACTAT 100 340
FHQ13_RS25830 5029547 .. 5029575 -  -6.1  -5.30155   TTATTAATTAAAAAA        GACAGATTCTT AATGAAA AGGAATCTGTC        TTTTTTGTTCTGAAT  82 55
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FHQ13_RS25805 5024795 .. 5024820 -  -4.1  -4.61747   GTAAGAATTACAAAA         CTACCCCAAAAG AAA CTTTTGAAGT-G         TTGCGGAAATCTTTT  65 490
FHQ13_RS25765 5015532 .. 5015579 -    -5  -4.07687   ACTTTGTTTTGAAAA GAGATTATTCTACTAGATCGTT GTGA AACGGTTTCATAGGATAATCTC TTTTGTTTAGTTTTG  64 32
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        cspD 5008094 .. 5008119 -    -7  -4.84527   GTTATATATTAAAAA         GGTTGTTAACC TTGCT GGT-AACAACC         TTTTTATTGTTTGAA  80 41
FHQ13_RS25715 5007813 .. 5007862 -   -20   -4.0942   TATTGAGGACATAAA TTTATAATAAAAAAAACCTCTT AATTAA AAGAGGTTTTTTTTATTATAAA TTAACCTAATTTAGG 100 26
FHQ13_RS25705 5006375 .. 5006402 - -12.9  -5.50774   TAGAATAAATAAAAA        CTGTTCCTTCA GCAAAA TGAAGGAACAG         TTTTTATTTATTTTA 100 33
FHQ13_RS25685 5002799 .. 5002820 - -13.1  -4.29928   AATGAATAGGTAAAA           GCATGACAG TATA CTGTCATGC            TTTTTTATTAGAACT 100 20
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FHQ13_RS25525 4970050 .. 4970061 -    -3  -5.38249   ATGAATTAGAAAAAA                TGTT TGAA AACA                 TGGCAAATCAATATA  74 365
FHQ13_RS25510 4968482 .. 4968515 - -16.3  -5.30616   TTACTTAAATAAAAA     CAAGAAACCAGCCTAT AAA AT-GGCTGGTTTCTTG     TTTATTTAACAGCTT 100 27
FHQ13_RS25450 4950330 .. 4950355 - -17.7  -4.53303   TATTTTTATATAAAA         TAGCCCCTGCT GTTG AGCAGGGGCTA          TTTTGTGTTGTTTTA 100 38
FHQ13_RS25440 4949447 .. 4949483 - -12.5  -2.79574   CATATGTATGAATCA    TAAAACGTCGTCTCT TCATATT AGAGGCGACGTTTTA    TTTTATAAAATATCT 100 39
FHQ13_RS25415 4942915 .. 4942951 - -14.8  -5.72053   TAATTAAATAAAAAA   GGCTATATAGTAGCTGT AATT ACA-CTACTATATAGCC    TCGATTTTATACCGC 100 138
FHQ13_RS25410 4942140 .. 4942173 - -15.5  -2.82208   AAATCAGTTATTAGA     TGAAAACCACCACTA TTAA TAGTGGTGGTTTTCG      TCTTGTTAATTATTT 100 31
FHQ13_RS25365 4931830 .. 4931865 -   -10  -5.04265   AAAAAATATTAAAAA    GCACTTAAGATTTGTGA AAA TTAC-AATCTTAAGTGC    TTTTTTCGTTTAAAT 100 65
FHQ13_RS25355 4928592 .. 4928614 - -12.1  -4.10855   AAAATGTTTTTAAAA           GAAAGGAGG ATTAA CCTCCTTTC           TTTTTTAGTGAGTGT 100 46
       gerPF 4925433 .. 4925455 - -13.5  -5.31072   AGAATATAAGAAAAA           GCAGCTAGC TTTGT GCTAGCTGC           TGAGCCCCAGGGAAA 100 144
FHQ13_RS25290 4919638 .. 4919660 -    -7  -5.71712   GGTTACATAAAAAAA           GAGCATACAT AAA AAGTACGCTC           CAAAGAAAGATAGGT  95 217
FHQ13_RS25265 4916553 .. 4916594 - -14.7  -3.67402   ATAATTGTGAAAATA GATGAAAACCCTCTGAAAA ATAT TTTCCAGAGGGCTTTCATT  TTAGTATGCTTCTAA 100 26
FHQ13_RS25260 4915356 .. 4915377 -  -7.4  -5.61596   ACGTTCATAAAAAAA           GAACCTAT GTCATA ATAGGTTC            TTTCTTCATTGGCTC  90 8
FHQ13_RS25230 4912116 .. 4912128 -  -3.5  -3.16055   TAAAGCCGGTATGAA                TAAAT TAG ATTTA                GGAAAGTTAAAGTCA  47 219
FHQ13_RS25175 4901104 .. 4901133 - -15.2  -4.87389   CATTTCAAAAATAAA       CAGTCTACACCA AATGAA TGGTGTAGACTG        TTTTAATTTGTGAGT 100 28
FHQ13_RS25165 4899269 .. 4899299 -  -4.8  -5.14965   ACTTGCACTAAAAAA       CGAGTAGGAAAT GTTTACG ATTCCATACTCG       TTTTTTACGCTTCTA  75 66
        racA 4895397 .. 4895421 - -14.5  -5.14563   CTCTTCATTAAAAAA          GACCCTTATTA TTT TAATAAGGGTC          TAAAAATTATAATCC 100 32
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FHQ13_RS24685 4798040 .. 4798061 -  -6.7  -3.38191   AAAAAAGTTTTAGAA           CTTCTCTTT GAAT AAAGAAAAG            ATTCTTTGAAGAAGT  65 301
FHQ13_RS24660 4795125 .. 4795141 -  -6.6   -5.8187   TATTCAATAAAAAAA              GATGCT GAAAT AGCATC              TGAATGTAAAGAAAT  95 45
FHQ13_RS24650 4791958 .. 4791989 - -16.2  -4.98103   TAACAAAATATAAAA      TAAAGCAGATTCTA AATA TAGAATCTGCTTTA       TTATGAAATACTTGT 100 47
FHQ13_RS24635 4790323 .. 4790341 -  -7.5  -5.46657   TACGTTAATAAAAAA             GAAGCTT AGTAA AAGCTTC             TTTTTTATTACTATT  90 36
         ric 4789403 .. 4789434 - -10.2  -4.98531   TCGCGAAACGAAAAA      GCAGGCCATAAGTA TTTA CACTCATGTCCTGC       ACTTGATTTATGCTT 100 33
        nirB NONE
        nirD 4786466 .. 4786485 -  -9.3  -4.18762   AATTTTTATTTAAAA            GGAAGCC AGAGGA GGCTTCC             TTTCGAAAATTACAT  88 35
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        exsB 4684929 .. 4684943 -  -9.2  -5.25805   AATAAATGTAAAAAA               GGCCGC AAA ACGGCC               TTTTTTGGGTGGTAT 100 46
        namA 4678837 .. 4678891 - -16.4  -3.66643   CAAATGAAATTACAA CGATA-GAATAAATAAAACCGAGAAG AATGA CTTCTCGGTTTTATTTATTCGTAT-G AATTTTTCCTGGTGC 100 11
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        nadE 4653285 .. 4653307 -  -6.4  -5.47431   TTAACATATAAAAAA           GAAGCTAA ATGAAGA TTAGCTTC           TTTTTTATGTTTAAT  86 41
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FHQ13_RS23275 4516114 .. 4516165 -  -7.1  -3.68827   GAGTTAGCATCTAAA TAAAAAAGATAGATACAAGC GAGGAAATATAGT GCTTGT-TCTATCTTTTTTA TAGTTAAACTAGATA  69 29
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        msrA 4506852 .. 4506878 -  -8.7  -5.65496   TATCAAAAATAAAAA         CGCAACGTACT AAAAA AGCACGATGCG         TTTTTATTATTTTTT 100 32
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        pyrH 4466519 .. 4466539 -    -9  -3.85704   TGATGAATTAGGAAA            GGGTGCCT ACAAA AGACACCC            TTTTTTGGTGGGAAA  80 44
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        exsE 4455836 .. 4455855 - -13.6  -4.95758   ATTATATGAGAAAAA            CCTTCCGC AATT GCGGAAGG             TTTTTTATTTTTCGA 100 30
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        asnB 4426654 .. 4426692 - -14.8  -3.24032   ATGTGCTAATTAATA   TAAAAGGAGTTCAAGGCT TTT ATCCTTGAACTCCTTTTT   GTTAAGCAATATGAA 100 27
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FHQ13_RS22520 4374297 .. 4374320 -  -8.2  -2.63858   TATCATATTTACAAT          GGGCACAATA ATGA TATTGTGCCT           CCCCCTTTACATCAT  68 32
        cheR 4373477 .. 4373500 - -12.5  -4.67353   CGAGTTATGTAAAAA          GGTCGTCAC TCCATT GTGACGACC           TCTTTTATATTTTTT 100 30
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        hemL 3286470 .. 3286500 - -14.3   -5.5762   ATGAAATAGAAAAAA       GGAAAAAAGAAAG GTGAG CTTTCTTTTTTCC       TTTTAATGAAGGAAT 100 40
FHQ13_RS16830 3281786 .. 3281804 - -13.2  -5.52384   TTTTTAGTAAAAAAA             CCTGCTGA ATT TCAGCAGG             TCTCAAATTGTTACT 100 101
FHQ13_RS16825 3280405 .. 3280430 -   -12  -4.33674   AACATATAACAGAAA         CAGCTCCTTT AGCATA AAAGGAGCTG          TTTTTTATTCGTCTT 100 30
FHQ13_RS16800 3276695 .. 3276716 - -10.2  -5.80003   GCAATAAATAAAAAA           GTGTTCCC AATCTA GGGAACAC            TTTTTTAATCGTAAG 100 30
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        glsA 3253518 .. 3253536 - -11.8  -5.63517   TGGCGAAATAAAAAA             TCCTGCTA GTA TAGCAGGA             TAACTCGCGATTAAA 100 36
FHQ13_RS16675 3253011 .. 3253026 -    -9  -4.66395   AAAAAAACATTAAAA              GCACCT ACAT AGGTGC               TTTTTTACCGTATAT  89 30
FHQ13_RS16660 3251257 .. 3251282 -  -9.1  -3.58522   ATTAGTATGTTGAAA         TCGTACAGGTA TGTA TACTTGTACGA          TTTTTTAGTGAACTA  81 84
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FHQ13_RS16635 3246094 .. 3246111 -  -5.5  -5.95539   TGGCAAATAAAAAAA             TCGGGCT AAGT AGCTCGA              TTTTTTTAGTATTAA  93 37
       yfkAB 3238785 .. 3238804 - -12.2  -6.22691   CAATAACAAAAAAAA            CGTCAGCT TATA AGCTGACG             TTTTTTTTATAATGT 100 32
FHQ13_RS16585 3236216 .. 3236239 - -12.4  -4.37658   AACTTTTCGACAAAA          CAAGCCCACC TAAG GGGGGGCTTG           TTTTATTTTATAGTC 100 33
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FHQ13_RS16575 3235283 .. 3235307 - -10.1  -5.42975   GTACATAAAGAAAAA          GAAAAACCGCT AAT AGCGGTTTTTT          TAGCTGAAAGCAATA 100 25
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        ahpC NONE
        ahpF 3142861 .. 3142886 - -19.1  -5.66338   AAATATAATAAAAAA         GACGCGCTACC AATA GGTAGCGCGTC          TTTTTTATTAGTTAC 100 33
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        pdaB 2924854 .. 2924884 - -15.6   -5.1861   GGTATGATTAAAAAA       GCTCTACCACCTTC TTG AAAGGTAGTAGAGC       TTTTTATGCGTGAAG 100 57
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