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659917 + -12.6 -5.79588 ATGAAGTCTTCAAGA CACAATATATAGAGGAAACCGTTA TTTA TTGCGTTTTCGTCTATATATTGTG TTTTTTTCGTTTTGA 100 37 IHV08_RS03580 NONE IHV08_RS03585 661598 .. 661631 + -14 -4.7254 ATGATGTAATCAAAC GGCTCAAACCCTTG ATATAC CAAGGGTTTGAGCG TTTTTCATCACCCGT 100 467 IHV08_RS03595 664255 .. 664290 + -6.4 -3.69449 ATAGAAAACTTAGAG TAGAGTACCATA CATCTCAAAAAA TATGGTACTCTA TATTTTAAGATCTTA 65 37 IHV08_RS03600 666386 .. 666420 + -5.2 -5.5762 TATTTATTCAAAAAA GGTAGCTTAATCAGT TGCTGT ACTGAT-AAGATACC TTTTTTATCTTTAAT 85 112 gutB 670244 .. 670265 + -6.6 -3.60323 ATCGCTGAGTGAACA GGGAGGAT CTTCGT ATTCTCCC TCTTGTTTACTGGTA 65 33 IHV08_RS03615 NONE IHV08_RS03620 672767 .. 672803 + -2.4 -5.87996 TTGTAAATCATTGAA GATGTTTCTTGAAAGTC TTTG GACTTTTGGGGG-CATC TTTTTTTATTGCTTA 90 35 IHV08_RS03625 673644 .. 673670 + -14.4 -3.27674 ATAAGTAATACATAG GAGGCCGCAGCT TTC GGCTGCGGCGTC ATTTTATCATAAAAT 100 33 IHV08_RS03630 NONE IHV08_RS03635 NONE IHV08_RS03640 676511 .. 676535 + -15.8 -5.63517 CTCATACAGTGAAAA GTCCGGAGTG ATCAG CACTCCGGAC 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28 IHV08_RS05685 1083647 .. 1083671 + -4.4 -4.32857 TTGTATGTTGTCAAA GGATTGTC-AG CGAA CTAGATAATCC TTTCTCTTTGCAAGA 64 8 IHV08_RS05690 1086070 .. 1086095 + -13.5 -5.83226 CTTCATAAAGAAAAA GAACTTGTTTC CTTG GAAACAAGTTC TTTTTTTGTTACATT 100 33 IHV08_RS05700 1088114 .. 1088129 + -6.2 -5.34365 GTGTTTTTTACAAGA GAAACA ATGG TGTTTC TTTTTCTTCTTCTCG 91 155 IHV08_RS05710 NONE IHV08_RS05715 1089862 .. 1089887 + -17.6 -4.4078 TTAAAGATTAAAAAA GCCTGCGGGG CAAGAA CCCCGCAGGC TTTTCATTAACCAGA 100 30 IHV08_RS05730 1092482 .. 1092492 + -2.4 -2.77135 TGTGGGAAGGATAAA GGAG GAG CACC ATGTTATTTATAGAC 41 27 IHV08_RS05735 NONE IHV08_RS05740 1094207 .. 1094232 + -6.2 -5.59564 CTATGACAGTACTGA CACTC-AGGGC TTTTT GCTCTTGAGTG TTTTTTTCAGTTTCT 89 35 lcfB 1095859 .. 1095891 + -18 -4.26079 TTTGCCCCAATAAAA TGAAAAAGCGAAGC GGTTA GCTTCGCTTTTTCA TTTTCAATCCTTTGC 100 28 IHV08_RS05755 1097723 .. 1097748 + -9.1 -4.93316 GCTGACAAATAAAAA GAAGCAGGT ATGGAGGA ACCTGCTTC TTTTTACTATTATTG 91 29 IHV08_RS05765 NONE IHV08_RS05770 1100861 .. 1100890 + -11.6 -5.24129 GCTTTAACAGGATCA GCTTGCAGAGAA TGTTAT TTTTCTGCAAGC TTTTTTGTGGACAGG 100 34 IHV08_RS05775 1102048 .. 1102065 + -11.3 -5.39905 AGAAATAAAAGAAAA GACAGGC AAAC GCCTGTC TTTTTCTTATTTGAT 100 33 IHV08_RS05810 1109898 .. 1109918 + -14.1 -3.71888 AACGGATAATAAAAA GCCAATCCT TGA AGGATTGGC TTATTCGCTCTGCTT 100 32 comK 1111034 .. 1111057 + -13.2 -3.74251 ATTAGAAAATAGAAA GGAGCTGACCC ACA GGG-CAGCTCC TTTCATAAACCTATG 100 36 IHV08_RS05830 1112460 .. 1112480 + -14.1 -5.1485 GGTAAATAAGAAAAA GCAATCTGG TGT CCAGATTGC TTTTTCTATTGCTTA 100 36 IHV08_RS05850 NONE lepB 1116098 .. 1116115 + -7.1 -2.51393 GAGCTATAATCAAAA TTGTTAC CTGT GTAACAA AATTTATATATTTTT 59 111 IHV08_RS05860 1117695 .. 1117705 + -4 -3.88498 CAGCCGAGTATAATT CAAT TCG ATTG TTTCATCTGTAACAA 57 28 IHV08_RS05865 1118302 .. 1118319 + -11.3 -4.7339 TTTTAAATAAAAAAA CACGCAC TGCG GTGCGTG TTTTTCGCGTTTCTT 91 31 ntdR 1124070 .. 1124090 + -5.5 -4.68593 TTTATATAAGAAAAA GAGGTTA TTCATTT TAACCTC TTTTTCAATAGTAAG 72 70 IHV08_RS05905 1128550 .. 1128571 + -10.2 -5.0538 CTGTCCAAATAAAAA GAGGGTTC TTTTTT GAACCCTC TTTTTTACGCTGCCA 93 29 addB NONE addA NONE IHV08_RS05930 NONE sbcC NONE hlpB 1141786 .. 1141812 + -8.8 -4.51196 AAAAATGACTAAAAA GCAGCC-CTCT CTTTGC AGAGCGGCTGC TTTTATCCGTTTCCA 84 33 IHV08_RS05985 1146480 .. 1146501 + -4.3 -5.252 GCTGAATAAAACTGG AGGGCGG ACCCGGAC CCGCCCG TTTTTTCTGACAATC 79 36 IHV08_RS05990 1146958 .. 1146980 + -7.7 -5.90231 AGAAAAACCTATGAA CCCGGCTCT TTGAT AGAGTTGGG TTTTTTTATATTTAT 100 42 wprA 1149801 .. 1149819 + -11.7 -5.63517 AAAAGTAACCAAAAA GCGGTGC TCGAT GCACCGC TTTTTTATTTGCCCC 100 33 asnB 1152447 .. 1152483 + -6.1 -5.24129 AGATTTAAATAAGAA GGATAGAT-GAGCA GGGAAATATA TGCTCTATCTATCC TTTTTTGTACAACAG 84 77 farP 1154069 .. 1154089 + -5.4 -3.03243 ATATCTAAAAAAACA CCCGGTCTT GATT GAG-CCGGG TGTTACGCCATACCT 53 33 IHV08_RS06025 NONE degA 1157479 .. 1157494 + -10.4 -5.32944 CGCTCAACACATGAG CCCGCT AATG AGCGGG TTTTTTCATTATGAC 100 27 iolX 1159002 .. 1159019 + -6.9 -3.76402 ATGATACTGTGACTC CAGCTCG GCAG CGTGCTG TTTAATCGCTGCCAT 66 313 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AACACATACATGAAA CTCTTCTC CTTTCA GAGAAGAG TTTTTTATTGAGATA 100 40 IHV08_RS07240 1370047 .. 1370067 + -4 -6.04324 ATAACAATTAAGATG GCTCTC TCTTGTAAT GAGAGC TTTTTTCTTTTTTAA 100 30 IHV08_RS07245 NONE IHV08_RS07250 1371304 .. 1371342 + -6.7 -6.09196 ACGGAGGGAAAAAAG CCCGGGAGAGTCAATCTC ATGT GAGAC-GACTGTCCGGGG TTTTTTTGTTTTCGG 100 160 ykkC NONE ykkD 1372050 .. 1372064 + -2.9 -3.14647 ATTCTGTCATAAATT GATTT TTATC AAATC TTCAGTATAATGGAT 44 29 purU 1373301 .. 1373334 + -13.3 -5.88565 GTGGTACCACGGAAA CCCATTTCGTCCTTA TGAA TCAGGATGAAATGGG TTTTTTTATTGTAGA 100 307 IHV08_RS07270 NONE proA 1375749 .. 1375771 + -10.7 -5.24129 ATGTTCAATGAAAAA GCTTATCTC ATTAC GAGATAAGC TTTTTTATACGCGAA 100 48 IHV08_RS07280 1376283 .. 1376312 + -9.3 -5.52986 TGCTGAATAAATAAA AAGAGGATGCCTT GTAC AAGGCATCCTCAA TTTTTTTGATGGAGT 100 31 IHV08_RS07290 1377313 .. 1377334 + -13.1 -5.21709 TAAAATAATGACCGG CATCCTGAG GATT CTCAGGATG TTTTTTGGTGTCGGA 100 33 IHV08_RS07295 1377525 .. 1377549 + -7.1 -4.52347 TTGGAGAAATAACAA GGACCAGGC CGCGCAT 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+ -10.5 -5.47218 GAATAGTAGCACAAG TAGCAACCTATAT CAC ATGTAGGTTGTTA TTTTTTTCCGTGCGG 100 35 coaBC NONE priA NONE IHV08_RS08620 NONE IHV08_RS08625 NONE rsmB NONE rlmN NONE prpC NONE prkC 1649644 .. 1649659 + -3.2 -2.77013 AACAAGGAGGGAAAA TATGCC TGAG GGCAAA ATTATTAAGGCGCTA 44 39 rsgA NONE IHV08_RS08655 1651214 .. 1651240 + -3.1 -4.84527 AGCAGCTTTAGAAAA GAGC-TGGGCATA CAA TA-GCCTAAGCTC TTTTTCCTGTATGCA 67 40 IHV08_RS08660 NONE spoVM 1652107 .. 1652131 + -12.8 -3.85542 TTCACCACATAAAAA CGCCTGCCAC ATATC GGGGCAGGCG TTCATTTTGTTATAC 95 64 IHV08_RS08675 NONE IHV08_RS08680 1654640 .. 1654668 + -19.1 -3.68394 TATATAGTTTCTGCA GAATAGAAGGGCA ATT TGCCCTTCTATTC TTATGTCTGCTTTTA 100 20 sdaAB NONE sdaAA NONE recG NONE fapR NONE plsX NONE fabD NONE fabG NONE acpP 1662142 .. 1662153 + -7.2 -4.25458 TCCCGCCGAAACGCG GGGC TTTA GCCC TTTATTCGTGCAGTT 76 55 rncS 1663004 .. 1663025 + -8.7 -3.75535 TACGAAACAATAAAA TCCCCCTTA TGAC TCAGGGGGA TTTCAGTATGTATGC 76 28 smc NONE ftsY 1667678 .. 1667697 + -7.8 -5.8096 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+ -4.1 -3.08522 ATTTAATTGTGAAAT CTTTG CTT CAGAG CTTTTAGGGTAGGTG 48 6 fliQ NONE fliR NONE flhB 1704221 .. 1704233 + -2.7 -3.53012 AAAACAAAAAGTATA TTGAA TTT TTCGA TTTAAAAGGAGAGAA 47 22 flhA NONE flhF NONE IHV08_RS08970 NONE IHV08_RS08975 1709350 .. 1709371 + -4.5 -2.67058 AAAAAAGAGAGGGTG TGATTCAAA TGGA TATGAATCA GTATTTAGATGTCTT 47 23 IHV08_RS08980 NONE IHV08_RS08985 NONE IHV08_RS08990 1712496 .. 1712529 + -3.9 -3.48378 GAAAAGCTCTTTGTC GCCTTAGGTGCA-TCA TTA TGAGTACAACTGAGGC TGTTGTTATAAAGGT 51 5 IHV08_RS08995 NONE sigD NONE swrB 1714405 .. 1714417 + -4.8 -3.28924 TTTATGCAGAGGGTG CTGC AGGCG GCAG TTCTGCACAAAAATG 54 98 rpsB 1715228 .. 1715256 + -12.6 -5.00616 GTAACCTATTCAAAA GGTGATAAGAGG GACTG CCTTTTATCACC TTTTTTCAAGAAAAA 100 37 IHV08_RS09015 1716244 .. 1716268 + -13.7 -4.61633 TCTTTTCAGGCAGTA TAGGGGACACA TTT TGTGTTCCCTA TTTTTAAAACTATAT 100 70 IHV08_RS09020 NONE frr 1717654 .. 1717690 + -2.4 -3.29038 TACAATAGATAATAG TGAAAAGACCCTCT CATGTTTAC AGGGGGTTTTTTTG TTAATACTGTTGATT 45 53 IHV08_RS09030 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-5.19261 CGTCTTAAAAAGGAA AGCCTGCTCCA TAA TGGAGCAGGCA TTTTTTAATCCCTTT 100 33 IHV08_RS09125 1740771 .. 1740791 + -11.2 -5.71712 AGAAAACATCTGAAA CATCGGCT GCCGG AGCCGATG TTTTTTTATATGGAA 100 72 dpaA NONE dpaB NONE asd 1743601 .. 1743634 + -8.3 -3.08996 TTCTAAAGACGAATA GAAGAGAGTAAGGC GCTATCA GCC-TGCTCTCTTC TGTTACGTCCGAATA 68 52 dapG NONE dapA 1745810 .. 1745841 + -4.4 -4.71418 ACAGTGAAACAAACG CGGTCATTCTCA TATTCAGC TGAGTTTGACCG TTTCTTTTACATATT 71 52 IHV08_RS09155 1747637 .. 1747663 + -18.2 -5.37345 AGTATAATGACTGAC TAAAGACCGGAG CTG CTCCGGTCTTTA TTTTTTGTCCTTCAA 100 34 tepA NONE tepJ 1748751 .. 1748769 + -7.4 -4.38203 TCCTACAGAAAAAAC GCAGCC TGTAAAC GGCTGC TTTCTTCATTATGTA 78 86 spoIIIE 1751167 .. 1751199 + -4.8 -4.15657 TCAAAAGAGAAATAT GATGAGCTCTCTTC TTAAT GAAGGGAGTTCCGC TTTCTATAGTTGTCA 63 8 IHV08_RS09175 1752057 .. 1752076 + -3.5 -5.95539 AAACGATTCTAAAAA CGGACGC CTGTAT GTGTCTG TTTTTTTATTTGCAC 91 29 bcbE 1753394 .. 1753412 + -5.3 -5.47399 AGAAAAAAACTTAGG GACGGTCT AGCC AG-CCGTC TTTTTTTGCGCTTCC 83 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AATGGACAAATGGGATCTCA TTTTTCGAGGAGGCT 64 33 IHV08_RS10100 NONE IHV08_RS10105 2017155 .. 2017180 + -11.3 -2.87931 TACTCTATTGTGAAA CCAAGAGAATG ACGG TATTCTCTTGG TCTGTGCCACATCCC 78 14 IHV08_RS10145 NONE IHV08_RS10150 2027536 .. 2027568 + -14.2 -3.45231 GAATAAAACAAATCT GAGGAGAGCGAGAT TCATT GTCACGCTCTCCTC TGTTTAGCTGTATGG 100 35 IHV08_RS10165 NONE IHV08_RS10170 2029055 .. 2029085 + -9.1 -3.85698 GACTAGCCATACAAA CGGAGCTAACTTA AAAGG TCAGTTAGCTCTG TTTGTAGAAGCAACC 76 35 hpaB 2032626 .. 2032645 + -7.1 -4.20024 AGAACAATGAAAAAA CAGCGGG AAAAGA TCCGCTG TTTCGTATTTTTTAT 76 31 IHV08_RS10195 2035521 .. 2035549 + -13.1 -5.01535 GCTACTGATATAAAA GAGGCCCTGCGTT AAA AACGCTGTGCCTC TTTTTATACTTATAG 100 33 IHV08_RS10200 2036916 .. 2036926 + -4 -4.12857 GTATCGTACTTAAAC TTAC TAT GTAA TTCTTTGTCATCGTT 59 487 IHV08_RS10230 2040886 .. 2040896 + -5.4 -2.79505 TAGTCATAAATCACA GTCA CTT TGAC ATTTGACTCAGCTAT 52 219 IHV08_RS10250 NONE IHV08_RS10260 2044656 .. 2044666 + -8.2 -3.68738 CTTGACAAACTCATG CGCC GCC GGCG TTATCTCTTCAAATG 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IHV08_RS11285 NONE IHV08_RS11290 2211955 .. 2211978 + -6 -3.71848 GTATGAACCAGAATG GAGTTATGCT GGAC AGCATGACAC TTGTTCATGGCGGAC 64 480 IHV08_RS11300 NONE IHV08_RS11305 2213887 .. 2213905 + -5.3 -5.45802 AATTTTCAAAGAATT CACCTGT AACCA ATAGGTG TTTTTATTTTGCAAA 83 59 IHV08_RS11310 2215708 .. 2215724 + -5.1 -4.24534 CTCTAAATTTTAGGA GGTGATG TAA TGTCACC TTTCTATATTCATTA 66 95 IHV08_RS11315 NONE IHV08_RS11320 2216425 .. 2216450 + -7.6 -5.88061 ACCGAGATAACCCCC TGCCCTTCTC TTAATT GAGGAGGGTA TTTTTTTCGTTTTTT 100 31 IHV08_RS11325 2217666 .. 2217684 + -3.2 -3.17194 TACAAAGAGGAGAGT GTTTATAT GAA ATTTAAAC TTGCATTAGCCACCT 46 9 IHV08_RS11330 2217824 .. 2217842 + -13.2 -5.02502 TGTTTAAATGTTTAA CCCTTCTC AAT GAGAAGGG TTTTTATATCCTCTA 100 34 IHV08_RS11355 2221826 .. 2221852 + -3.6 -4.39448 TCCCAATAAGTAAAA CGCCCAGCAT TTTTATT AAGCTGGGCA TTGTTTTCATTATTT 64 28 IHV08_RS11370 2223116 .. 2223144 + -7.4 -6.37666 CTTAGTACAAACAAT GACCTGTGGGTGT TGGA GCACCC-CTGGTC TTTTTTTTATTTTAT 100 123 yokF 2230657 .. 2230676 + -7.9 -5.93252 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.. 3384822 + -9.9 -5.22039 TCCGAATGAAAAAAA TCCCTCT ATCA AGAGGGA TTTTTTACGTTTCCA 100 32 modA NONE modB 3387315 .. 3387331 + -13.7 -5.26875 AAACGCACTAAAAAA CTCCCCG TAA CGGGGAG TTTTTTGATTAAAAC 100 30 yvgO 3388889 .. 3388908 + -10.7 -5.68039 CTTAATATAAAAAAA GCTGGCG CTCTAA CGCCAGC TTTTTTTCTGCATTT 100 36 IHV08_RS17740 3398319 .. 3398355 + -20.5 -4.3014 CCCGGCAGGCTACCA TAAAAGAAACCTCTCCG TCA TGGAGAGGTTTCTTTTA TTTTACTGACTATCT 100 91 iolW 3406928 .. 3406949 + -13 -4.87291 AGCAATAAAACAAAA GCCTCCCC AAATAA GGGGAGGC TTTTTCATTAGAATG 100 33 IHV08_RS17840 3417757 .. 3417792 + -12 -4.77719 TGACACATCATTCAA TATAGAAAACGCTTGG ATCT CCTTGCGTTTTCTATA TTTTATTGACTTTTG 100 21 rghR NONE IHV08_RS17855 NONE catR 3419464 .. 3419495 + -11.6 -6.04324 GACTAATTGCTAAAA CGGCTCTGATCTCA AAGA TGAGAAAAGAGCCG TTTTTTATTTTTTCC 100 35 IHV08_RS17865 3421284 .. 3421319 + -17.2 -3.49653 AGTTTACGATTTAAA TAGAAAAAAGAGGCTGG ACT CCAGCCTCTTTTT-CTA TTCTATGCAGCTGAT 100 27 IHV08_RS17890 3425588 .. 3425607 + -7.8 -5.55769 CGAAGCCGTAAAAAA 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-4.2 -2.96216 TCTTATCACGATATA CGGCAT TTT ATGCGG GCCAAGTCCCAAATG 49 60 yoyG NONE IHV08_RS10750 NONE IHV08_RS10745 NONE IHV08_RS10740 NONE IHV08_RS10735 NONE IHV08_RS10730 NONE ablB 2124307 .. 2124323 - -2.3 -2.62184 TTTCGGTTTATACCA TTTGTTT TTC AAACGAA CTCCTCCTCGCGCTT 40 49 ablA NONE IHV08_RS10715 2122624 .. 2122640 - -3 -3.48144 AAGAATACTGAAACA TGACTC AGGAG AAGTCA AAATAGTTGCGTTTC 47 13 IHV08_RS10710 2122288 .. 2122305 - -11.3 -5.71712 GGGGACATAAAAAAA TCCGCAG TGAT CTGCGGA TGAAACAGCTATTAT 100 37 IHV08_RS10705 NONE IHV08_RS10695 2121021 .. 2121049 - -16.2 -3.84873 ATAGAACACGAATAA TAAAACCGGAGC TGACC GCTCCGGTTTTA AGCCTCACTCATCTT 100 30 pgpB NONE yodL 2119964 .. 2119979 - -10.4 -4.46581 TAAAACTGCAGAAAA CTGCGG GTTT CCGCAG TTTTCTTTTCATTAT 89 37 deoD 2118887 .. 2118912 - -11.9 -4.09117 CGCATTCATAAAGAA GAGGC-TGCCGG CAC CCAGCACGCCTC TTGATATATTTTATT 95 36 ldcB 2117986 .. 2118010 - -11.5 -3.52717 ACCAGACACAATGAA GCCCGCTTA TCTAGTG TAAGCGGGC TTTTCATTTTAAATT 85 34 ctpA 2115327 .. 2115349 - -17.8 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