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HUO02_RS02565  497641 ..  497655 +  -2.2  -2.74605   AGCCCAGCCATTTTA               TTTAAA AAT TTTGAA               TCACTTTTAGAGCGA  41 31
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HUO02_RS02575  497848 ..  497864 +  -5.1  -2.64765   CACTTTCTTTTCAAA              GTGCTGA TCA TCATCAC              TAGCTTATATGCTTA  49 39
HUO02_RS02580  497996 ..  498022 +  -9.6  -5.73339   GCCGCATCTCAATGA         TACCAAGGAT AATAGAG ATCCTTGGTA         TTTTTTTGTGCTTAT 100 35
HUO02_RS02585  498272 ..  498299 +  -7.8  -5.50499   TAAGGGTACTGAAAA        GGCTTAATCTTT TTTA AAAGGCTAAGCC         TTTTTTTGGCTATAA 100 40
HUO02_RS02590  499450 ..  499462 +  -6.3   -2.8474   AACCCTCTACACCTG                GATAC GGT GTATC                TACTTGTGGATAGAA  54 494
HUO02_RS02605  501343 ..  501365 +    -5  -2.78237   AGTGATCAAAATACT           CAAAGTAT CTGGCCA ATACTTTG           CTTGGTTCTTATTTG  50 388
HUO02_RS02615  502852 ..  502871 + -12.2   -5.4182   AAGTTTTGAATGAAA            GAGCAGGA TTAC TCCTGCTC             TTTTTCTTTCTAATT 100 468
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HUO02_RS02625  505273 ..  505301 + -11.8  -5.58522   AAGAAGCTTTGTTAT        GCCAGTTCTTCT CCCGA AGGAGAGCTGGC        TTTTTATTTTCTATA 100 275
HUO02_RS02630  505753 ..  505778 +  -6.2  -5.72622   CGGCCGCATCAATGA         TACCAAGGGT TTTGAC ACCATTGGTA          TTTTTTGTTTATAAA 100 101
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HUO02_RS02660  508993 ..  509018 + -11.3  -4.48987   GTAGAAACAAAGGGG         TACCATTAGTG TCAT CGCTAATGGTA          TTTTCCTTCTAAGAA  90 49
HUO02_RS02665  510262 ..  510274 +    -2  -4.51378   TCACTTTGTCGACAC                TAGA CTAAA TCTA                TTTTGTGATATCGAT  59 18
HUO02_RS02670  511288 ..  511301 +  -3.9  -2.79749   TGGAATAATATAAGA               TCTTT ATAA AAAGA                ATTATATTGAGGGTA  45 237
HUO02_RS02675  512872 ..  512903 + -11.1  -5.60993   TCGGCCGCATACCAA      TAATACCAAGGGT TTGACC ACCTTTGGTATTA       TTTTTTTGTGCGGAA 100 483
HUO02_RS02685  515163 ..  515188 +  -8.4  -5.56673   GCCGCATCCTAATGA         TACCAAGGGT TTTGAC ACCTTTGGTA          TTTTTTGTTGTAAGT 100 419
HUO02_RS02695  516804 ..  516827 +  -3.2  -4.08767   TACTGGGTTTGAAGG          CACTCGTGA TTCATTT TCACG-GTG          TTTTCAAACCATAGC  57 215
        cspC  517285 ..  517306 +    -8  -5.84432   AATCGTTTATACAAA           CAGGCTCT TTATAT AGGGCCTG            TTTTTTTATGTTCTC 100 46
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HUO02_RS02740  523626 ..  523651 +  -4.8  -5.63517   GCCGCATCACAATGA         TACCAAGGGT TCTGAC ACTTTTGGTA          TTTTTTGTTTGCAGC  85 503
HUO02_RS02745  524968 ..  524980 +  -3.3   -4.0641   ATACCGAGTTCCGCT                AAGCC ATG GGCTG                TTTATATAACTCCAG  58 463
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        guaA  650017 ..  650038 +  -9.5  -6.21477   TAAATCAATAAAAAA           CGTCTCTTT TAAA AAAGAGGCG            TTTTTTTTTCATCTT 100 38
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        cyoE  835196 ..  835207 +  -3.6  -4.20707   TCATCCTTGACCGTT                TCCG GAAT CGGG                 TCTTTTTTCGTCAGC  60 340
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        fbpA 1274654 .. 1274687 +    -4  -5.71712   CCCTATAAAGAACGG     AACCCTTATACA AATTAAATGA TGTATAAGGGTA      TTTTTTTATATAAAA  89 8
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        abbA 1349930 .. 1349952 +  -3.5   -5.4505   AGCGGCCTATAAATT           GATACTC GATTGCAAA GAGTATC           TTTTTTATTGACGGA  78 43
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        ccpC 1351525 .. 1351542 +  -9.9  -6.28401   CGCCCATTTTAGAAA             GACAGCA ATCA TGCTGTC              TTTTTTTATTTTTTA 100 29
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        dapD 1354283 .. 1354306 + -12.5  -4.06864   TGGTTTGATAGAATG          GGCGTGGAT GATAAA ATCCACGCC           TTATTCTTATCTCAA 100 45
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        moaD 1363733 .. 1363759 + -13.1   -5.4251   GAGGGTGAAAAAAGA        GCCGGATGTGCA TCAT TGC-CATCCGGC         TTTTTTGTATATAGG 100 33
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HUO02_RS08865 1811423 .. 1811433 +    -4  -2.57647   GCCCAGTCTGCATTG                 TTCA AAT TGAA                 ATTCATGTGATGAAT  45 80
HUO02_RS08870 1812388 .. 1812420 +  -3.6  -3.10175   ATAGATTGAGATAAG      TTCTTCAACAAA CAAAGAAGA TCTGTTGAAGAA      GTTCTTTTCAAAGAT  48 182
HUO02_RS08875 1813047 .. 1813061 +  -6.4  -5.88197   CTTTGTCGAAAAAAC               CTTGCT GAA AGCAGG               TTTTTTTGTGTTTAA 100 67
HUO02_RS08880 1813524 .. 1813547 +  -3.9  -4.69435   GTCTGGGATGTGAAG          CTAAGGGGA ATATGA TCTTCTTAG           TATTTTTTTTATTCC  68 28
HUO02_RS08885 1814336 .. 1814355 +  -6.4  -4.13945   CAATACAGCCGTAAG            CAAGTCTG CAGC CAGACCTG             TTTTACGGTGAGACT  71 231
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        parE 1844336 .. 1844358 +  -3.4   -3.8901   GTCGCTGAGGAGGTT           TAATAGTGGC ACA GCCAGAATTA           TTTCATGATTTACCG  55 23
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        galU 1919455 .. 1919474 +  -2.2  -2.56864   CTGAAGAAATCGTGC            GTTAAAAA ATAA TTTGTAAC             CATTTTGCTTGTCAA  40 21
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         ggt 1976359 .. 1976397 + -20.6  -4.32579   GAAAAATGACAAGGT   GAAAAGCCTCGTTTCTCA AGC TGAGAAACGAGGCTTTTG   TTTATTCTGCACTGT 100 32
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        loaP 2348025 .. 2348050 + -11.9  -5.71712   AGCATATCAAAAAAA         GCATCAACAGC ATGT GCCGTTGATGC          TTTTTTTATATAAAC 100 39
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        guaC 3044842 .. 3044862 + -11.3  -5.64006   CAAAAAATAAAAAAA            TGACATTCA ATA TGAATGTCA            TTTTTTTCATTAAAT 100 56
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HUO02_RS14945 3063519 .. 3063541 + -11.2  -5.65177   AAGAAATACAGAATA           AGGACGGCCG TCA TGGCCGTCCC           TTTTTTTATAGATGT 100 25
HUO02_RS14970 3067382 .. 3067414 + -13.5  -5.48623   GCAGGAAAAAGTAAA      CACACAGCCGCCA GGAAAGA TTGCGGCTGTGTG      TTTTTATTTATCTTT 100 27
HUO02_RS15005 3075356 .. 3075374 +    -3   -5.1615   GCGCATCAATCGGTA             TCGGCCTA TGC TTGGCAGA             TTTTTTGCATCTTAA  70 381
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        phoB 3084215 .. 3084231 +  -2.2  -4.56597   AGACAGACGATTTTC             GCTC-CG AAAC CGCGGGC              TTTTTCGGCAAGCCG  63 339
HUO02_RS15070 3090040 .. 3090062 +  -9.2  -5.09762   CTTCAATCAAAAAAA           CGCTAAGG TTCGTTT CCTTAGCG           TTTTCTTTCTTCAGC  91 20
HUO02_RS15080 3090790 .. 3090809 + -10.7  -5.42164   TAAACATAAAGAAAA            CCGGAGC CCTTAA GCTCCGG             TTTTTCTTATTTATA 100 38
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HUO02_RS15105 3094631 .. 3094648 + -14.1   -4.4261   TCAATAAACAAAAAA             CCCCGCC ATAT GGCGGGG              TTTTACTATTAACCG 100 34
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HUO02_RS15265 3121124 .. 3121141 +  -5.5   -5.5604   AGGAAAGAGAGAAAG             GGATTGC TGCG GCGGTCC              TTTTTTCTTGGTTCA  86 46
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HUO02_RS15295 3126419 .. 3126443 + -10.1  -5.66684   AGAATAACGAAAAAA          GCTGAACCT CAGTTGC AGGTTCAGC          TTTTTTTATGCGTTC 100 34
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HUO02_RS15440 3153731 .. 3153758 + -12.1  -2.72799   AAGAAGATACACACC        GGCTTGCAGAG TTCCGT CTCTGCAAGTC         TCCTCTGTGTGAAAA  86 40
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        modB 3165533 .. 3165560 +  -8.4  -4.99134   CCGCTTGACCGATCC        GCCTTCC-GCGCA CCT TTCGCCGGGAGGC        TTTTTGATTTAAAAT  90 33
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        yvfG 3271966 .. 3271990 + -11.5  -4.45544   GAGAAACAAAATAAA          CCTTCCGCT CATTCAA AGCGGAAGG          TTTTCCTTCGTGCCG 100 27
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        clpP 3301795 .. 3301821 + -12.4  -5.75599   GTAATGCCAAAAAAA         CCTGCAAGAG CTGATGT CTCTTGCAGG         TTTTTTTATGCTTTA 100 37
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        galU 3401995 .. 3402041 + -13.3  -4.32046   GAAAAAGAAGAAGCT GA-CGAATAGAAAAAGCTGCCG AATC CGGCAGCTTTTTTTATGTGATC TTTACTTTTTAGACG 100 17
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HUO02_RS16850 3444705 .. 3444728 +  -4.6  -4.64846   CTCCCATGAAAAAAA          CTGCCTGCTGT ATA AGAG-AGGCAG          TTTTATCATTTATGG  68 41
HUO02_RS16870 3448248 .. 3448269 +  -7.2   -4.7497   CACCATTCGTAAATA           GGCTGCCG GCTAAA CGGAAGCC            TTTTTCCTCAATCAG  81 41
HUO02_RS16875 3449047 .. 3449066 + -12.2  -5.19916   GAAACTAGTCAAAAA            GACCCCTT TCGA AAGGGGTC             TTTTTTGAGTCTTTT 100 63
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        chrB 3452328 .. 3452339 +    -3  -4.31166   AAAGGAATGTCGGCC                TCAT GATC ATGA                 TTTATGTATTTATGG  58 20
        chrA 3452873 .. 3452888 +    -9  -5.30616   CATTTATAAAGAAAA              GCACCT GGAC AGGTGC               TTTTTGTTTCAGTCC 100 32
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HUO02_RS17040 3474099 .. 3474134 + -14.9  -2.87404   AATCACATTAAACGC    AAAAAGACCGGCTCT CTCAGA AGAGCCGGTCTTTTA     TGTCGTCCTTACTGT 100 30
HUO02_RS17065 3477896 .. 3477914 +  -8.9  -4.69048   CCTTTCTATACAAAA             TGGGCTT TTTAT AAGCCCA             TTTGTTTGCTTTTAT  88 494
HUO02_RS17080 3479858 .. 3479878 +  -6.8  -3.68222   AACAGATTATCCCCT            TCCGCATG AAGCG CCTGCGGA            TTATTGACATTGACG  63 272
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HUO02_RS17110 3484873 .. 3484891 + -17.4   -5.7946   CTGATATGACAAAAA             GCCGGGGG CAG CCCCCGGC             TTTTTTTATTCGGCC 100 37
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HUO02_RS17135 3490286 .. 3490312 + -14.5  -5.10029   TATAAACAGGCAGAA        CGCCCGGAGACA GAAA TGTC-CCGGGCG         TTTTTTCAGCTTCAT 100 36
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HUO02_RS17165 3494705 .. 3494725 +  -7.6  -5.14563   TTTGAATGACAAAAA            GAGCTGAT CGCGC GTCAGCTC            TTTTTTAATAAAGCA  89 32
         cls 3496837 .. 3496858 + -10.9  -4.50976   TCGCCGATTTTGTAA           TTCCCGAGG TGTT TCTCGGGAA            TTTTCTGATATAAAA  90 26
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        xynA 3498796 .. 3498819 + -11.2  -2.62668   CTAGCGGCATGAACC          CATCTCTTTT TAAC AAAAGAGATG           ATTCATTACATCATA  78 348
HUO02_RS17270 3512741 .. 3512770 + -13.7  -5.40004   GTTAATATAGAAAAA       GAATCCTTCTCAG ACAG CCGAGAAGGATTC        TTTTTTAGTTTCCTG 100 36
HUO02_RS17365 3527791 .. 3527816 + -16.9  -5.20216   TCCATTGTAACAAAA         GCCCGCCGTGTG CGT CAC-CGGCGGGC         TTTTTTCATGATGTA 100 330
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        racA 3530926 .. 3530954 + -14.7  -2.59564   TTTCAATTCTAATCA        AAAAAGCTCCCTG AAA CAGGGAGCTTTTC        ATTATGCAGTCAGCG 100 29
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         cls NONE
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HUO02_RS17610 3577733 .. 3577755 + -14.1  -3.74519   GGCAAAAAAGACTGA           GCCCGGTGC ATTGC GCGCCGGGC           TTTAATCCGCGTCTT 100 26
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HUO02_RS17660 3585327 .. 3585347 +  -3.3  -3.91897   CCCCTTTCCTTGTCA            TGGAAAAAG GGG TTTTTGCCA            TTTGTCAATGACGCG  55 49
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HUO02_RS17715 3594196 .. 3594217 + -11.5  -4.14392   TTTTCTATAAAAAAA           GCCGGCCCT CGTA AAGGCCGGC            TTTTGCGGATTACAG  90 31
HUO02_RS17725 3596231 .. 3596247 + -10.8  -5.04601   CACGTGTAACACCCA              CCCGCC TGTCC GGCGGG              TTTTTCCTTTGTCAG  93 32
HUO02_RS17730 3597130 .. 3597150 + -15.5  -4.35483   AGCATATAATAAAAA            CATCCCGCT CTC AGCGGGATG            TTTCTTGTAATGAAG 100 32
HUO02_RS17770 3605864 .. 3605886 + -11.9  -5.88565   GGAAAACAAAGTAAA           GCCCGCCGC TTTTT GCGGAGGGC           TTTTTTTCTTATCCG 100 27
        gerQ 3628115 .. 3628143 +  -5.4  -6.02919   GAGATAAATCAAAAA       GCCAATCGCTC ACTTGACA GAG-GATTGGC        TTTTTTTCTTTATAA 100 34
HUO02_RS17920 3634506 .. 3634528 + -10.6  -4.32035   AAAATAAAATAAATA           TCCCCCTC ATTACCC GAGGGGGA           TTATTTCATTTTTTT  87 34
HUO02_RS17950 3642021 .. 3642042 + -12.3  -4.59944   TGAATAACCGAACAA           CCCTGCTGG AGCA TCAGCAGGG            TTTCTTTCTGATCAT 100 34
HUO02_RS17960 3644690 .. 3644700 +  -5.4  -3.76811   GAAGTGTTCTTCATT                 CGTA TCG TACG                 TGTTTTCATGATATA  59 270
        ywcE 3647768 .. 3647799 + -11.7  -5.15167   CCAATAAAGGCACAA      AAAACCCTCTTCG CATAAA CGAAGAGGGTTTC       TTTTTATTCCTGATG 100 34
HUO02_RS18005 3652499 .. 3652522 + -12.4   -5.0538   AGAGGATAAAAAAAA          GCCTCGTCCC TTAT GGGATGGGGC           TTTTTTCCGGTAGAG 100 32
        sinI 3656849 .. 3656875 +    -5  -3.17273   CAATGAAAAACACCA         TCCGCCAGCGGT AAG ATTACAGGCGGA         TCCTTTTACTATATG  52 12
HUO02_RS18035 3657756 .. 3657777 +  -2.3  -3.61175   GGCCGAGAGGAGCAT           GTAATGGAT TCAC ATTCATTTC            TGTTTGTCGTCTGTG  48 22
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        pepT 3718875 .. 3718893 +  -8.9  -5.95539   GAGCGCGCTTAAAAA             CCAAAGC CCCCT GCTTTGG             TTTTTTTCTTTCACA 100 29
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HUO02_RS18340 3720387 .. 3720409 + -12.1  -5.88197   ATTTGCGGACGCAAG           CTCTTCCCT ATCCG AGGGAAGAG           TTTTTTTATATTTCA 100 216
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        citN 3729265 .. 3729286 + -13.1  -4.58076   GTTTTAATTAAAAAA           GGATTTCCG CCAG CGGAAATCC            TTTTCTGTACATTAT 100 34
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        hutP 3750959 .. 3750997 +  -9.8  -4.96848   GATTTCAGATGATAG  GGGGCTATG-CGTGAAA TATCAT TTTCATGGCATAGCTCC   TTTTTGTATGGGCGC  93 52
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        ahpC 3807836 .. 3807847 +  -2.2  -2.57136   GTAGGTAAAATCTAA                GGAG TGCA TTCC                 ATTGGTACTTGATGC  40 26
        ahpF 3809386 .. 3809405 + -13.6  -5.13473   GGAATTAATGTGAAA            GCCGCCAT ATGA ATGGCGGC             TTTTTTACATATACT 100 33
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HUO02_RS18895 3840175 .. 3840194 +  -9.3  -4.19648   ATCCATACAAAAAAA            GGCTGAG ATGCTC CTCAGCC             TTTCGTTTATATCTG  82 41
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HUO02_RS19080 3873262 .. 3873284 +   -12  -6.13503   GCAGAATAACCAACA           CACCCCGG AAACCCG CCGGGGTG           TTTTTTTTATTGCTC 100 32
HUO02_RS19085 3874359 .. 3874377 +  -8.9  -5.14563   ATCAAGAAAAAATAA             CCTCTCT TTTTT AGAGAGG             TTTTTTCCTAGGCCC  91 26
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        motB 1302837 .. 1302858 -  -8.7  -5.73978   ATCAGAAATAAAAAA           GGAAGCCAT TTGA AAGGCTTCC            TTTTTTATATTACTG 100 35
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        metE 1262176 .. 1262202 - -15.2    -5.252   CACGCCCAGAAAAAA         CAGCCACCCGCA AGT TACGGATGGCTG         TTTTTTTATACAAGC 100 31
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        lacG 1183887 .. 1183930 -   -12  -3.37685   AAAACCTCCTAAAGA CG-GCACACATGATGAAAAGA GAC TCTTTTCACCATGTATGATCG TTAAATGATTGTTTT  89 26
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        trpS 1115797 .. 1115818 -   -13  -5.29385   AAGTGAACTAAAAAA           GAGGCGGG GATTCT CCCGCCTC            TTTTCTTTATCTTCT 100 32
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        fosB 1089835 .. 1089856 -  -2.3  -4.92757   TCAGTAATAAGAAAA           TGCACCT CGGATTTT AGGTACA            TCCTAAAGTTTGGAG  66 104
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        hmoB 1005508 .. 1005524 - -13.7  -5.21709   CGGGACATCAAAAAA              GCCGGAG AAT CTCCGGC              GGTTTTCAGTCTATT 100 31
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        fabF  574380 ..  574399 - -10.8  -5.42514   GGAGAAAGCAAAAAA            GGAGTGAA ATGA TTCACTCC             TTTTTTTGATGCCCG 100 41
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HUO02_RS02290  455328 ..  455341 -  -5.2  -3.20349   CTCTTAAATTGAAGA               CGCC AGATAA GGCG                TTTTTTCGTAATATC  52 55
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