FOC41_RS00020 NONE FOC41_RS00025 NONE FOC41_RS00030 10058 .. 10103 + -10.7 -5.31877 TTCGAGGTATTAGAC ACCATTCCGGGAAG-TAAGTAA TGA TTGCTTATCTTTCTGGAATGGC TTTTTTATAATCAAT 100 76 FOC41_RS00035 10541 .. 10562 + -3.1 -3.42257 AAAATAAAAAGAAGA TTGTTGT ATAGTTGA ACAACAA TTCGTATATTTGCAG 48 44 FOC41_RS00040 NONE FOC41_RS00045 11178 .. 11189 + -4.4 -3.3353 CGTTAGGTTGTAGGA TCGA ATTT TCGA TGTCTTTATAAGAAG 52 3 FOC41_RS00050 11664 .. 11711 + -23.2 -5.40072 AGATTAAAAAAAACA TGGTGGGAAATTTGAAAAAGAT AACT GTCTTTTTCAAATTTCCCACCG TTTTTTTGAGGAAGA 100 50 FOC41_RS00065 NONE FOC41_RS00070 NONE FOC41_RS00075 15655 .. 15699 + -14 -2.6462 TGGTGATTTTTATCC TATTT-ATTACTGTGGTGGTT AATT GACCACCACAGTAGTGAAATA CTCTTTAAATACCTC 100 35 FOC41_RS00090 18972 .. 18998 + -11.7 -4.84017 TCCCTGTCTCTCCGC TAGAAAGCAGC TTTTT GCTGCTTTCTG TTTTTATGGAGAGTT 100 27 FOC41_RS00095 19156 .. 19183 + -12.8 -4.89519 TTTAATATTAATGAA CGGCTGTTTTGA CTTA TCAAGGCAGCCG TTTGTTTTATATTGT 100 57 FOC41_RS00115 26452 .. 26491 + -5 -3.9748 TTTTTCTAATTTTGT GGCTTTCTGTCCAAGT AGTATATA AAATGGACAGTAAGCC CTTTTTTTGTGGGTA 62 164 FOC41_RS00120 NONE FOC41_RS00125 NONE FOC41_RS00130 31579 .. 31614 + -9.2 -5.1167 GAAATCGAATAAAAA GGGTTGCGCAAT-AC CGGATTA GTGATTGTGCAACCC TTTTTGTATTCCATT 95 53 FOC41_RS00135 NONE FOC41_RS00140 34475 .. 34509 + -11 -5.1848 AATGTTCTAGGTAAA TCTCCTTTATTGTT CGTAATA GACAATAAAGGAGA TTTTTTGCATTGGTT 100 200 FOC41_RS00145 36155 .. 36207 + -10.4 -4.91109 AACATAAACTATAAA TGCAAGTTTCATTTATATAATT AGAACTTGC AATTATATAAATGAAACTTTCG TTTTTATAATCAAAG 100 131 FOC41_RS00150 NONE FOC41_RS00155 42639 .. 42649 + -2.6 -3.13907 GGGGCAGAAGAAGTT TTAT TTT ATAA TATATGTTGATATGA 43 118 FOC41_RS00160 43082 .. 43110 + -8.2 -5.5353 GCAAATATAAGAACA GGGGA-GTCGTCA AATG TAACGACATCCCC TTTTTTATTGGTGTG 100 72 FOC41_RS00165 NONE FOC41_RS00170 NONE FOC41_RS00175 NONE FOC41_RS00180 NONE FOC41_RS00185 NONE FOC41_RS00190 53616 .. 53626 + -4 -2.56715 ACAATAAATGAATAA TTCA AAA TGAA TAGATTGATACGAAT 45 34 FOC41_RS00195 55290 .. 55309 + -4.4 -3.22924 AGACAGAATGGTTGT TTCTTGTCT TTG AGACA-GAA TCTTCCTGCTTTAGA 52 287 FOC41_RS00210 NONE FOC41_RS00215 60633 .. 60684 + -13 -2.8001 TCAGGCGTACCGAGA CCCGGATGTCAGGCATACCAACAC CCGG GTGTCAGCATGCTTGGGATCCGGG TGTCATACAACTTGT 100 104 FOC41_RS00225 63454 .. 63493 + -18.2 -3.57883 TTAGTTTGACAAAGA GATTGTTCAAGGAATCAG AGTA CTAATTCCTTGAACAATC TTTCCAAAGTCTTAT 100 37 FOC41_RS00240 NONE FOC41_RS00245 NONE FOC41_RS00250 71046 .. 71096 + -7.9 -5.32944 CATTGAGTAAATAAT TTAATCCCTTCGTATTTGTCTATG TGCA TATAGA-GAATACGAAGGGATGAC TTTTTTAATTATAAG 100 131 FOC41_RS00255 74240 .. 74292 + -15.6 -4.08706 GAAGCAAACTTTAAA TGCAAGTTTTGTTTTTAT-AAT-CAA AGC TTGCATTTATAAAAACAAAACTTGCA TTTATATAATCAGAA 100 257 FOC41_RS00260 75286 .. 75303 + -4.1 -2.80579 GTCAGAATTTACAAA GAGGTGT TTGT ATGCCTC ATCTTATTTTAGAGA 47 84 FOC41_RS00265 78561 .. 78577 + -2.3 -3.08314 ACCAGAAATGTAACA GTTGGAT TAA ATTTAAC CTTTTAAACATTGAA 42 2 FOC41_RS00270 NONE FOC41_RS00275 NONE FOC41_RS00280 83094 .. 83132 + -8.4 -3.84271 ATTCTGATATAAAGG GGAAGATATCAAAG TGAAAAAGAGC CTTTGGTATCTTCC 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AAAATAAGTTGAACC TGTT TTA AACA TTGTCACAATGAAAA 49 18 FOC41_RS00445 124561 .. 124571 + -4 -3.72347 ATCAGTATTAGTAAA CAAA AAT TTTG TCTTTTCAATAATTT 53 30 FOC41_RS00450 126298 .. 126327 + -10.3 -4.11838 ACCTATAGGAAATAA GTATTAGGTATTA CACC TAATACTTAATAC TTTATCTCATGCTTT 91 26 FOC41_RS00465 NONE FOC41_RS00470 130876 .. 130902 + -14.5 -4.66609 ATAATGAATAAAAAA GCGGTCTCATC TTTTC GATGAGGCCGC TTTTTGAATAGAATA 100 69 FOC41_RS00480 132465 .. 132503 + -5.5 -2.60382 ATCACACCCTAGCTC TTTCTTACTTTTGTGTA TTACT TATACAAAGGGAAGGAA ATTAATATCCTTATT 52 50 FOC41_RS00485 133617 .. 133637 + -3.2 -3.15574 CTCCAAAGGAATGCC TCTATCCG CAATC CGGACGGA TATTCATAAGCTTCG 45 126 FOC41_RS00490 NONE FOC41_RS00495 NONE FOC41_RS00500 NONE FOC41_RS00505 NONE FOC41_RS00510 NONE FOC41_RS00515 NONE FOC41_RS00520 144875 .. 144903 + -14.7 -3.53012 TTCCTTTTAAACCAA CGGGTCGTTTCTT TTA AAGGAACGACCTG TTTCACACCGAGAAA 100 77 FOC41_RS00525 145839 .. 145867 + -10.5 -3.29096 ATTATATACTTTTGC TTTCAAGACATCA AAA TGATATCTTGAAA TTGATGATTCCTCAG 83 178 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-2.9 -3.51411 ATCCCTGTTAAGTAA GCGAAAA GCATTA TTTTTGC TTCGTTTACAAGCAT 48 58 FOC41_RS01545 410077 .. 410088 + -3 -3.32343 AAAGATTTAGTTACT TTTG CGTT CAAA TTATGAAAATATAAC 46 70 thrS NONE FOC41_RS01555 412748 .. 412777 + -2.9 -3.78419 AGAATAAGAAAAGGA TGCGTAACGCGC AGGTATA GTGCGTTGC-CA TTATATATTTAATAA 52 34 rpmI NONE rplT 413481 .. 413509 + -17.7 -5.27476 TTTACGAGTTACAAA GTGTCAGTTACTA AGC TAGTAACTGACAC TTTTCTTTTGTTAGG 100 51 FOC41_RS01570 415051 .. 415061 + -6.8 -2.90941 CGATTGATTTCATCA GGAC AGG GTCC ATTTGATGATTAATA 56 485 FOC41_RS01610 423957 .. 423970 + -5.3 -3.62859 AAGTTCTAGATTGCG TCAAC AAAA GTTGA TTTAAAAATTATGCT 59 32 FOC41_RS01615 424138 .. 424175 + -20.3 -4.59853 CTAGCGGCTCTCAAA TTAGAACGCTGATTATT AATT AATAATCAGCGTTCTAA TTTTTACAGGATTCC 100 30 FOC41_RS01625 NONE FOC41_RS01630 NONE FOC41_RS01635 430433 .. 430457 + -2.2 -3.53811 AATTAACCATACCAA TCTATAATGG AAATA CGATTATGGA TTTCACAAAACTGGC 46 137 FOC41_RS01640 NONE FOC41_RS01645 432906 .. 432919 + -2.5 -4.03234 AATCACTTTTTGTTT TATTA ATAC TAATA TTTATATGAAAAAAC 53 49 FOC41_RS01650 NONE FOC41_RS01655 NONE FOC41_RS01660 NONE FOC41_RS01665 NONE FOC41_RS01670 NONE FOC41_RS01675 NONE FOC41_RS01680 NONE FOC41_RS01685 NONE FOC41_RS01690 NONE FOC41_RS01695 NONE FOC41_RS01700 NONE FOC41_RS01705 NONE FOC41_RS01710 454177 .. 454187 + -2.6 -3.03038 CTTAAAATTTAAAGT TATT TGA AATA TCTGATTTAAATATG 43 109 FOC41_RS01715 455487 .. 455532 + -18.9 -2.70708 ATCAATAAAAATAAA TC-TTCAAATACCAAAATGATA TTT TATCATTTTGGTATTTGAATGA TGCTATAATTGAATT 100 128 FOC41_RS01770 NONE FOC41_RS01775 476983 .. 476993 + -2.6 -5.42514 AATCTATTTAATAAC TTAA CAC TTAA TTTTTTAGTTTATGA 72 39 FOC41_RS01780 NONE FOC41_RS01785 481433 .. 481460 + -10 -5.94214 CATTTATGAATAAAA GAGGGAATCT ACTCAACC AGATTCCCTC TTTTTTTGTTATATT 100 54 FOC41_RS01790 NONE FOC41_RS01795 485934 .. 485962 + -12.6 -4.44099 ATCAAAATAAAAAAA TCCTCGATTTTC ATCCG GAGAATCGAGGA TTTATATTATTTGTT 100 57 FOC41_RS01820 492187 .. 492216 + -9.4 -4.41633 GAATAACCAATTTAA CAGCAACCTGTT CTCAAC AATGGGTTGCTG TTCTTTTTAGCACTA 91 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767465 + -3.8 -2.55361 AAATGGAAAACCGGA TTCATGTA AGGCAA TACATGGA ATACTTTTTGCCTGC 45 501 FOC41_RS02895 768469 .. 768493 + -12.9 -5.92399 TATTTTTTACTGAAA GCGAGGGTTGC TTG GCAATCTTCGC TTTTTTGTTTTATTG 100 47 FOC41_RS02900 770665 .. 770677 + -3.3 -3.02402 TATGGATGCCTCTTG CCAGA TAG TCCGG ATTGTTTAGTATACA 46 18 FOC41_RS02905 772583 .. 772595 + -4.9 -2.96899 GCAGCCGATAAATAA TCTTA TTG TAAGA TATGCTTCGTTCCAC 51 43 FOC41_RS02910 774963 .. 775012 + -3 -5.61596 TTAGTTAGTGGAGTA GTCCTTGATTAATGG-ATCCTCT TTTAT AGTGGAGATTGTTAATCAGGGAC TTTTTTTATAGGAAT 77 53 FOC41_RS02915 NONE FOC41_RS02920 776800 .. 776819 + -10 -4.07678 AATAGAATGAGGACA GGCTGTGT ATAT ACGCAGCC TTTACTGTTTTAGAA 90 58 FOC41_RS02925 NONE FOC41_RS02930 NONE FOC41_RS02935 NONE FOC41_RS02940 NONE FOC41_RS02945 786507 .. 786536 + -15.2 -4.93696 ATATATTAAACAAAA CGGGGTGAAATT AGCAAA AATTTCACCCCG TTTTTACTCTTTCAG 100 288 FOC41_RS02955 792139 .. 792157 + -3.1 -3.26779 CACCACAGAGGACAC GGAGGAC ACAGA GTTCTTC TCTCTCTTTTCCGCA 46 56 FOC41_RS02960 796550 .. 796590 + -2.6 -4.47259 AACAGAAAAATAGAA GCGGGACATTAAGAAGTTT GAAT ATACTTCC-GGTGTCCTGC TTTTCATATTCTGAT 58 65 FOC41_RS02965 797654 .. 797670 + -3.7 -3.09004 AACAGAAATACTCCC TTGCAGA TGT TCTACAA TCGTTTTGCAGATAG 47 109 FOC41_RS02980 NONE FOC41_RS02985 807053 .. 807076 + -6.8 -5.64421 AATGAATCATATAAA GGTATCCA CATTGCGT TGGATACC TTTTTTATTTGGCCT 100 40 FOC41_RS02990 NONE FOC41_RS02995 809210 .. 809227 + -2.7 -2.88758 TGAGGGCACTACCTT TGTGGTGA AGC TC-CCGCA TATCTAAGAAATTCT 42 1 mgtA 812080 .. 812127 + -7.9 -4.35189 CGAATTGTCTGTCAA GAGTTTTTGCCCCTAAAATTA ATTTCA TATATTTAGGAGCAAGAACTC TTATTTATTTAGATT 82 99 FOC41_RS03005 813738 .. 813748 + -4 -3.72037 GAACCATGATAAACA GTTA ACA TAAC TTATCTCCTTTTTGC 53 71 FOC41_RS03035 818898 .. 818908 + -6.8 -2.66216 TTTATTCATTTTGTA CACG TCG CGTG GTTATCCTCATAAAC 59 223 FOC41_RS03045 821096 .. 821121 + -9.7 -3.37493 AGGTTGCGGGGAAGC GCTGGGCAATG CGCC CGTTGCCGAGC TTCCTCTATTCAAAG 80 482 FOC41_RS03060 NONE FOC41_RS03065 NONE FOC41_RS03070 NONE FOC41_RS03075 NONE FOC41_RS03080 830734 .. 830746 + -5.5 -4.79352 TTTCAGGCAACATTG CGGGA CTG TCTCG TTTTCTTCTACGTCG 74 64 FOC41_RS03085 NONE FOC41_RS03090 832241 .. 832278 + -12.1 -5.77677 TTGTTTTGTTTGTGT GGTGCACCTTC-TACCTA GAG TGGGAAAGGAGGTGCACC TTTTTTATTCTTTTG 100 256 FOC41_RS03100 NONE FOC41_RS03105 837595 .. 837607 + -2.7 -3.06796 GCGGATTACACGGTT TATGA GAA TCGTA TTACATAAAGTAACA 43 66 FOC41_RS03110 NONE FOC41_RS03115 841520 .. 841563 + -19 -3.39036 ACAATCTGAATTTGC GCCCTGAAAGGGCATAATTG TATA CAGTTCCGCCCTTTCAGGGC TTGTGACTGGTGTGT 100 107 FOC41_RS03120 844403 .. 844422 + -2.8 -3.44646 GTTAGTGATAAGTGA TTAGCAGG GTGA TCTGCCAA CTTGTTTTTTATATG 46 62 FOC41_RS03125 848935 .. 848959 + -2.9 -3.08211 AAGGAGAGAGATAAC CGATTACAAAA TGC TTTCTTAATCG TCCTTTTAGAAACCT 45 27 FOC41_RS03130 850657 .. 850668 + -2.2 -3.29511 GATACATTGTCTAAA CGGA AAAG TCTG TTGTAACCGGATGAA 44 8 FOC41_RS03135 853837 .. 853861 + -10.8 -4.89729 CTATAAAACAGAAAA TCCCGTTGAA GACTA TTCAGCGGGA TTTTTGCATTTTATA 100 35 FOC41_RS03140 NONE FOC41_RS03145 854947 .. 854994 + -12.3 -5.82036 GCATTAAAAGATTGA CGCGGCCTTTCACAGGAGGTTTA ATTT TAAACA-C-TGTGAAAGGCTGCG TTTTTTATTTGTTCT 100 83 FOC41_RS03155 NONE FOC41_RS03160 NONE FOC41_RS03165 858402 .. 858435 + -15.5 -5.45802 CTTGATCTTATAAAA TCGTCCTTACTACAA CCTA TCGTAGTAAGGACGA TTTTTCTTTTAGGAA 100 93 FOC41_RS03175 860446 .. 860473 + -8.6 -2.90763 GAAAGTCAGTATATA TGATAGTAGCAT GAGT ATGATACTATCA TATATACACTATAAA 71 49 FOC41_RS03195 863928 .. 863941 + -5.3 -3.9534 TATGAAAGATAAGAA TAGTG CTTG CACTA TTTGTACGTATAAAT 61 71 FOC41_RS03200 865340 .. 865373 + -12.7 -3.58766 GAGCATCCTATAGGG TGACAAATGTCACTT TATA AGGTGATATTTGTCA TTCTGTAATATGATT 100 173 FOC41_RS03205 NONE FOC41_RS03210 869459 .. 869478 + -3.6 -4.57073 ACGCAGTCCGACAAT CAGG-GCTT TGG AAGCATCTG TTTTTCCCGGAAGTA 64 379 FOC41_RS03220 871171 .. 871182 + -5.8 -3.2178 TAATTTTCGATAAAC GGAG AGTG CTCC TGTGTTATGCTGTAA 54 515 FOC41_RS03235 NONE FOC41_RS03240 876180 .. 876196 + -2.3 -2.94099 TTTCAGTAATTATGG TATAACA ATC TGTAATA TATATACTAACAAGC 41 100 FOC41_RS03245 877360 .. 877379 + -5 -3.1096 ATTAGAAAAATAGTG CTTTACCC AATC GGCTAAAG GTTTTCCCGTCTGTT 52 28 FOC41_RS03250 NONE FOC41_RS03255 NONE FOC41_RS03260 NONE FOC41_RS03265 NONE FOC41_RS03270 883407 .. 883444 + -18.7 -5.08824 GCTTTGAAAAAGAAA GTTCTCCTCTGTTATAG ATAC CCATAACAGAGGAGAAC TTTTTTAAATACAAC 100 82 FOC41_RS03300 893342 .. 893371 + -3 -5.93252 CCGCTCTTTTGAAAA TCAGGTGGT-TAT CTTAA ATAAACTGCCTGA TTTTTTATTTTTCAA 85 34 FOC41_RS03305 893983 .. 894009 + -2.4 -5.02231 ACTTTAGAAAATTAA TGCATGAA GAATAGGGCAG TTCATGCA TTTTTCGTATTTTTG 66 110 FOC41_RS03310 895584 .. 895622 + -15.6 -5.64006 ATTGTATATCATTAT AAAAAGGATGAAAGCGAT TGA ATCGTTTTCATCCTTTTC TTTTTTTCCTTCCAT 100 47 FOC41_RS03315 NONE FOC41_RS03320 898004 .. 898027 + -3 -3.10975 TGTCCCAATGGGAGC GGACTAGGGA TAGC TCCCTGTACC TGTTCCATAGTCAAT 43 279 FOC41_RS03340 NONE FOC41_RS03345 902407 .. 902438 + -7.5 -4.84182 CTCACAAACAACAAA CGATGACATAATTC CTGGT GGAT-ATGTCATCG TTTATTATTTTTTAC 87 70 tsaD 908120 .. 908143 + -3.2 -2.79796 ATTCTCGTGTGACGT TATAATTGGG TATA CCTTATTATA TATAATAGGATAAAA 43 21 FOC41_RS03360 NONE FOC41_RS03365 NONE rpmG NONE FOC41_RS03375 910201 .. 910227 + -11.7 -5.57396 GCTATAACTGCAAAA TCCTCTCATTG GCGAA CAATGAGGGGA TTTTTTATTGCTTCT 100 57 ftsY NONE rimO NONE FOC41_RS03390 NONE FOC41_RS03395 914282 .. 914319 + -14.4 -2.55712 AGTAGTTATAATCCA TTCACCCGACC-ATGCA AATCC TGTATTGGTCGGGTGAA GTGTTATGGATGTAC 100 40 FOC41_RS03400 915526 .. 915553 + -4.2 -3.08464 TAATACAGTCAATAA GTAGTCATAAAT ATCT ATGCATGACTAC TTAACTACCTACTAA 48 51 FOC41_RS03405 NONE FOC41_RS03410 917520 .. 917553 + -4 -3.22476 ATATATAGGTCTACA GTTATACAATCTTT TTGTAT AAAGGATGTATAGC TTAATACTAAATAGT 49 4 FOC41_RS03415 NONE FOC41_RS03420 919632 .. 919645 + -3.9 -2.8598 AGAACATTCACCTGT TTTCT AATA AGAAA TAGTTATACGTATGT 47 9 FOC41_RS03425 NONE FOC41_RS03430 NONE FOC41_RS03435 923129 .. 923152 + -2.6 -6.23209 TATTCAAGAAAAAAA GATA-AGCAAA TAA TTTGTTTTATC TTTTTTTTTGCTTAA 85 62 FOC41_RS03440 923528 .. 923552 + -8.7 -4.73617 ATATAACAAACTGAA TCCCAATTG AATCAAA CAATTGGGA TTTCTTATTTGTTTT 89 42 FOC41_RS03445 924768 .. 924807 + -11.1 -5.30616 TAATATTATGTTTAA TAGAAAAAGGAGTAA TATAATGACC TTACTCCTTTTTCTA TTTTTATTTAAATGA 100 83 FOC41_RS03460 931702 .. 931723 + -10.9 -6.06529 TTTAATATGCCATAA TGTCAGACC TTCG GGTCTGGCA TTTTTTTTGTCTCTG 100 66 htpG 933878 .. 933911 + -9.1 -4.81249 ACATACTTCAAGAAA GAGCATT-CAACGT TAAATAC ACGTTGTAATGCTC TTTTTCAATTTAAAA 93 62 FOC41_RS03470 936348 .. 936360 + -2.6 -3.24411 AAAAGCTTGCTAATT CGGG AAAAG TCCG TATCTTTGCACCCGT 44 63 FOC41_RS03475 NONE FOC41_RS03480 NONE FOC41_RS03485 936666 .. 936688 + -12.8 -5.54907 GTCGCGATCACGAAA TCCTCTGCAT TTG ATGCGGAGGA TTTTTATTTTCTCCC 100 30 trmD 943453 .. 943485 + -9.2 -5.60556 AAGTGTAAATAAAAA CGACGATGAAGATT ACGTA AATCCTCACCGTCG TTTTTATTTTATCTT 100 45 FOC41_RS03545 949470 .. 949502 + -15.1 -3.98683 CCTATAAGAATAAAA TAGCGTCACTATC CGTTCAA GATAGTGACGCTA TTTGCTTACTATGGT 100 78 FOC41_RS03575 958381 .. 958426 + -22.3 -4.26903 TTTCAGTTTTATCAA TAGGCAAAAGGCAAAAAGAGT TTAT ATTCTTTTTGCCTTTTGCCTG TTTTCATCGGATAAA 100 89 FOC41_RS03580 959449 .. 959459 + -5.4 -3.91032 AACATTCGGACTGCT TCCT CCC AGGA TTTGTCCGATCATTG 63 511 FOC41_RS03605 NONE FOC41_RS03610 NONE FOC41_RS03615 963837 .. 963875 + -14.1 -4.40237 ATAAAGAAAAAAGAA GGGCACAGAG-TCAAAAT CTAA ATTTAGAACTCTGTGCCC TTTTAATATATCATC 100 80 FOC41_RS03635 968626 .. 968671 + -14.4 -3.44517 CTCTTATCGGGTGAA TAAAATAAAAGTCTGACACA AATCAA TGTGCCGGACTTTTATTTTA TCTTATTCACTCTTA 100 59 FOC41_RS03655 NONE FOC41_RS03660 NONE FOC41_RS03665 972515 .. 972535 + -10.5 -5.4387 ATTGAATGGTGTTGA GCTGATACA GTT TGTATCGGC TTTTTTCGTTTATGT 100 63 FOC41_RS03670 974042 .. 974069 + -9.3 -4.93661 ACATAATGGTGTTGA GCTGGATAAAA CAATGA TTTTATCCGGC TTTTGTTGTTCCTAT 95 79 dnaN NONE FOC41_RS03680 NONE FOC41_RS03685 NONE FOC41_RS03690 NONE FOC41_RS03695 978269 .. 978280 + -3 -3.57883 GAGGTAAAAGTCGAA GATA ATTG TATC TTTGAAAACTATTAT 50 21 dnaB 979877 .. 979904 + -8.5 -4.63048 AAAAGAATGGTGTTG CGCCGGATTTT GAAGAA AAAATCCGGCA TTTGTTATTTGTAAG 89 88 FOC41_RS03705 980700 .. 980713 + -5.9 -2.87344 TGATAATGTGTTAAT CGCTG GAAA CGGCG TCTATGAAGAAGCTC 56 182 FOC41_RS03715 NONE FOC41_RS03720 NONE terL 984249 .. 984259 + -4 -3.56568 ACATATAAAAGAGTT TTTG CCA CAAA TATTTGTAAATATGA 51 88 FOC41_RS03730 NONE FOC41_RS03735 986591 .. 986610 + -3.6 -3.23335 GAATGATGATTTTAT TTCCCT GTTCATCA AGGGAA TGTCTATTTCTAGCG 48 306 FOC41_RS03745 988974 .. 988984 + -2.6 -3.57171 CCTCGGTCTGGAAGA TTAA TAA TTAA TTCATTGTATTATGT 48 22 FOC41_RS03750 NONE FOC41_RS03755 NONE FOC41_RS03760 NONE FOC41_RS03765 NONE FOC41_RS03770 NONE FOC41_RS03775 NONE FOC41_RS03780 NONE FOC41_RS03785 NONE FOC41_RS03790 993557 .. 993570 + -3.1 -3.10343 AAGCTCTAGGATTAA CGTTT AATC AGACG TTGGATAGTAGCTAT 45 53 FOC41_RS03795 993841 .. 993874 + -8.3 -5.23316 TTAGAGTATGTTTTC TAGTCCCTTGTATCT GTGA AGATATGGGGGATTA TTTTTTAATCTCCTG 93 95 FOC41_RS03805 NONE FOC41_RS03810 NONE FOC41_RS03815 1000258 .. 1000268 + -6.8 -2.78639 AAGGCTTCTTCACTA TCGG ATA CCGA ATTGTTAGCGGTGTT 59 98 FOC41_RS03835 NONE FOC41_RS03840 NONE FOC41_RS03845 NONE FOC41_RS03850 NONE FOC41_RS03855 NONE FOC41_RS03860 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FOC41_RS04055 1037873 .. 1037910 + -19.3 -5.60689 AGTATAAAAGTAGAA GTTCCGCCTATTCTTGC TAAT GCAAGTGTAGGCGGAAC TTTTTTGTTGTATCC 100 122 serB 1040031 .. 1040042 + -3 -3.05596 AAAAAATAGATTATC TTTG CTGA CAAA TTAAATAAAAGAATG 45 48 FOC41_RS04070 1041344 .. 1041370 + -6.6 -5.65927 GGCTTTTTTAATCCG GCACTATACGAT CTG AATGTATGGTGC TTTTTTATTTGGATG 100 46 FOC41_RS04090 NONE FOC41_RS04095 1045848 .. 1045879 + -14.6 -5.99154 CTTGATAATAAAAAA TAGCGCCACTTGTTC AGA GGAC-AGTGGCGCTA TTTTTTTATTTAGTC 100 48 uxaC 1050064 .. 1050102 + -4.7 -5.5353 GTTACACTATAAAAA AACCGCTAC-CAAAGTCGA ATA TAG-CTTTGAGTAGCGGTA TTTTTTATTCCTATA 85 50 FOC41_RS04125 NONE FOC41_RS04130 NONE FOC41_RS04135 NONE FOC41_RS04140 1053728 .. 1053749 + -15.9 -4.00532 TTTATAGTTCAACCA GCCCGCACA AATC TGTGCGGGC TTTAATATTTCAAAA 100 120 FOC41_RS04145 NONE dcm NONE FOC41_RS04155 NONE FOC41_RS04160 NONE FOC41_RS04165 1057981 .. 1057994 + -6.7 -2.8655 CTATTCGAAAAGAAA GCGAA CCAA TTCGC TATACTCTCAATCAA 61 84 FOC41_RS04170 1058965 .. 1058992 + -9.9 -3.2614 AGTATCCTGCATTAA GTGGTTCCGCA TAAAGT TCCGGAACCAC TTAATCTACGCAATA 82 343 FOC41_RS04175 1060225 .. 1060246 + -2.2 -4.19678 CTTTCAGGAATTCTT CAGCTCTT TTCCGT AGGTGCTG TTTATTGGCATGTCC 54 49 FOC41_RS04180 1060850 .. 1060878 + -3.9 -3.92832 ATATATGCGGCATTT TATTTTGCTATCT ACT GGATAGCTGAGTA TTGTTTACGAACTTT 56 82 FOC41_RS04185 1061646 .. 1061666 + -2.6 -3.00994 TCGCAAGTCCAACAG GCGTTATT CCAAT AATAAAGC TATGTGTAAGATTGA 43 11 FOC41_RS04190 NONE FOC41_RS04195 NONE FOC41_RS04200 NONE FOC41_RS04205 NONE FOC41_RS04210 NONE FOC41_RS04215 NONE FOC41_RS04220 NONE FOC41_RS04225 NONE FOC41_RS04230 NONE FOC41_RS04235 NONE FOC41_RS04240 NONE FOC41_RS04245 NONE FOC41_RS04250 NONE FOC41_RS04255 NONE FOC41_RS04260 1068987 .. 1068997 + -2.6 -2.82519 TTTCGGGAGATATGT TTTT TAG AAAA TAATTAATATAATAA 42 12 FOC41_RS04265 NONE FOC41_RS04270 NONE FOC41_RS04275 NONE FOC41_RS04280 NONE FOC41_RS04285 1073378 .. 1073410 + -15.8 -3.14344 ACTCAGATAAACTAA TACGGGTAGTCAAT AAGAA GTTGACTACCCGTA TTCCTAGAAAGGATA 100 31 umuD NONE FOC41_RS04310 NONE FOC41_RS04315 1077626 .. 1077648 + -9.9 -4.69324 ACAGAGAGCATAAGA GAGGTAGCT TATTC GGCTACCTC TTTATTGTTTATTAT 93 28 FOC41_RS04375 NONE FOC41_RS04380 NONE FOC41_RS04385 1094003 .. 1094030 + -12.9 -3.86202 CAGTTAGATAATCAA TAATGGGTAGC AAGAAA GCTACCCATTA TTTCATCTCATCGCA 100 30 FOC41_RS04525 NONE FOC41_RS04530 NONE FOC41_RS04535 1134054 .. 1134074 + -2 -2.53249 GGTTTCTTTAAATAG TTTTTAAA CCGCT TTTAAAAG GTATGTTATGTACAA 39 30 FOC41_RS04540 1136644 .. 1136656 + -5.5 -3.68302 CAGCCGAAACTGACA CTCCT GAA GGGAG TTCTTGACCTGTTAC 59 41 FOC41_RS04545 NONE FOC41_RS04550 1138302 .. 1138352 + -16.3 -5.07011 CACATACTAACAAAA TGCGAGTAGACGCACAGCCGGGGGC AAA GACCCTTGCTG--CGTCTACTCGCA TTTTTGCTTTATGTG 100 423 FOC41_RS04560 1138741 .. 1138754 + -4.5 -3.54424 GTATAAACCGCAATA TGGCG TTAT CGTCA TTTGCACAGATGAAA 54 124 FOC41_RS04565 NONE FOC41_RS04570 NONE FOC41_RS04575 1141395 .. 1141423 + -8.9 -5.47821 AGACTATAAAGTTTA GCCGCGCAA AGTTTTTTTTC TTGCGCGGC TTTTTTTGAATAGAT 100 32 FOC41_RS04645 1150310 .. 1150334 + -10.9 -4.46656 TTGCAATTAGAAAAA CTTCTATATAG TAA CTATATGGAAG TTTTAGTATTATAAA 100 363 FOC41_RS04650 1150627 .. 1150668 + -14.7 -3.57462 TATATCTAAATTAAT TAAAGGCTATATACCCCGT CTAA ATGGAGTGTATAGCCTTTA TTTAAGCCTAAAATA 100 67 FOC41_RS04665 1152541 .. 1152558 + -8.4 -3.32521 GAGGAAAAAGAAAAA GGCAGC CAATAA GCTGCC TTCTCCAAATATCAT 71 14 FOC41_RS04695 1157014 .. 1157059 + -13.6 -3.2115 ATATCAAACTAATAA AATAGAAATGCACTCTTATC TGACAT GATTAGAGTGCATTTCTATA TTCATAAATGATTTA 100 52 FOC41_RS04705 NONE FOC41_RS04710 NONE FOC41_RS04715 1159132 .. 1159164 + -11.4 -4.76312 AAAAACAAATACGAA GGAGATGAAACATC ATATA GGAGTTTCATCTCC TTTTTCAATCTTATC 100 45 FOC41_RS04720 1159925 .. 1159935 + -6.8 -3.88498 CTTCGGTATTCAATA CTGG CAT CCAG TTTAATATCTCCGGA 68 292 FOC41_RS04730 1162947 .. 1162977 + -15.6 -5.80003 AAGATTAATTTGAAA CACTGGGATGTTTT TTA AAATCATCCCAGTG TTTTTTATTTCTTCC 100 144 FOC41_RS04760 1170218 .. 1170250 + -9.2 -5.50774 GCTATCCAAGGCATA TAGTGACGCTATCC GGACA GCATAGCGTCACTC TTTTTATTTCTTGTA 100 88 FOC41_RS04770 1172901 .. 1172926 + -9.9 -2.72471 TACCTGCGGCAGATA G-GTTGCAGATA AAG TATCTGCAACAC GTTATATAATCAAAG 77 255 thiD NONE fabD 1180940 .. 1180966 + -16 -5.47159 CTTTAAATATATGAA GCGTGTTGGTAA CTA TTGCCAACACGC TTTTTTATATTAAGC 100 63 sucC NONE sucD 1183221 .. 1183234 + -2.5 -4.22346 ACTTATCGTTTAGAG TAAAT CTGC ATTTA TTTTACATACCTTTC 55 120 FOC41_RS04855 1192652 .. 1192670 + -5.2 -3.07915 TTTCTTTCAACAGTT CGAGCCGT GAA ACAGCTTG CTTTAATTTCTCAGC 51 278 FOC41_RS04865 NONE FOC41_RS04870 1195416 .. 1195438 + -9.2 -3.54543 CTATTTTGTTTCCCA GTGTGGAACT TAT AGTTTCACGC TTTGAAACCATCAGT 78 207 FOC41_RS04875 NONE FOC41_RS04880 NONE FOC41_RS04885 1198635 .. 1198660 + -2.5 -2.80622 TAGACGATTTCGGAT TCTG-ACCGACA TGG TGCCGGAGCAGA GTTTCCATCCGTGTT 42 21 FOC41_RS04890 NONE FOC41_RS04895 1201391 .. 1201426 + -11.2 -4.38712 AGATCTGTATACTCT TCATCCCTCGGTCACT TATG AATGACCGGGGGATTA TTTTATGCACATCAC 100 53 FOC41_RS04900 1202026 .. 1202059 + -20.5 -3.89354 GTAATAAACGAGAAA GCCCCCGCAGATATT CAAT AATATTTGCGGGGGC TTCTTGATTTAAAGA 100 61 FOC41_RS04935 1208368 .. 1208393 + -8.4 -5.48213 GAATCACTATTAACA TCCGGTAACA GTTAAA TGTTATCGGA TTTTTCTTTTAAATA 100 34 FOC41_RS04940 1209671 .. 1209706 + -11.2 -4.91109 GTTATAACTAAAAGA GTGAAG-GGGAAACGTG TTT CCCGCTTCCCCCTTCAC TTTTTCTACTCCAAC 100 34 FOC41_RS05175 1253444 .. 1253470 + -9.5 -5.1417 ATCACTTAGCAGAAA GGCTGATTATC AAATG GTTAATCAGCC TTTTTACTTTTCTAA 100 129 FOC41_RS05180 1254575 .. 1254604 + -15.3 -3.63694 TCAAATTGCTAATAA TAAAGCGATGAAT TCAA ATTCATCGCTTTA TTATTAGCCCTAGAT 100 167 FOC41_RS05190 1256174 .. 1256202 + -7.5 -3.4268 ACCCCTAGAAAAAAA GCACTGCAAAC CTACTTT GTTTACAGTGC TCTTTCCGATTATCA 71 33 prs 1274679 .. 1274708 + -10.9 -5.38054 CAGGAAATTATAAAA TGGATAATGACCG CTTT TGGTTATTATCCA TTTTTCTTTGTACCA 100 88 FOC41_RS05390 1309236 .. 1309268 + -9.3 -2.87211 ACTATAATGAAAGGA TAGTGACGCTATG ACAACAA CATACCGTCACTA TCTATAAGGGAAGAT 73 159 FOC41_RS05395 NONE FOC41_RS05400 1310506 .. 1310544 + -11.9 -3.60627 AAAGCTGATAAAAAA GGTACGAAAAATCTGTG CTTTT CACAAATTCTTCGTACC TTTACGCTCCGGTAA 95 53 pyrB 1311508 .. 1311518 + -5.4 -2.99584 TATCACATTAGATGA CGTT AAA AACG ATATTTTATTATGAG 54 1 FOC41_RS05410 1312013 .. 1312070 + -2.2 -2.89971 TCACCACAGATTACA CGGATTCACACAGATTTTTATTTTAT GGAATA ATAATATCTATATCTGTGTTAATCTG TGTAATCTGTGGTGA 41 48 FOC41_RS05415 NONE FOC41_RS05420 NONE FOC41_RS05425 1314896 .. 1314923 + -12.8 -6.08342 CTTAATCCCATTTAA GGTCTGCTCTTT ACGA AAGGAGCAGGCC TTTTTTTATTTATTA 100 80 aspT NONE aspD 1320373 .. 1320388 + -6.2 -4.42386 AAAGCATCAAAAGAA TGAACT AAGT AGTTCA TTTTATAAATGAGAA 74 23 FOC41_RS05450 NONE FOC41_RS05455 NONE FOC41_RS05460 NONE FOC41_RS05465 1326645 .. 1326655 + -4.6 -3.50832 CACCACGAATCAAAT TCCG GGT CGGG TGTTTGAGTTTCCGG 54 226 FOC41_RS05475 NONE FOC41_RS05480 1329820 .. 1329837 + -9.9 -5.77988 AGGTTAACAAAGGTT GGAGCAA GGCG TTGCTCC TTTTTTTATGTCTAT 100 217 FOC41_RS05490 1331505 .. 1331522 + -9.9 -5.72616 AGGTTAACAAAGGTT GGAGCAA GGCG TTGCTCC TTTTTTTATGTCCAT 100 233 FOC41_RS05500 1333853 .. 1333893 + -13.1 -2.54325 GATATTCCTTTATCT TTATTTATTGCATATTT ATTTTGA AAATATGCAATAAATAA CTATCTTTGCACCAA 100 88 FOC41_RS05505 NONE FOC41_RS05510 1335154 .. 1335179 + -11.3 -2.70354 ACAAACTTGATATCA GCAT-AGGAGAC AGC GTCTCCTAATGC TACCTTTATAGCGAA 77 91 purT NONE FOC41_RS05570 1348459 .. 1348497 + -8.2 -5.63236 TTTATATAAGAAAAA CTCCAGCTATGGTGAC GGATAAA GTTACATTAGCTGGAG TTTTTCTTTTTAACT 100 108 FOC41_RS05645 1364531 .. 1364570 + -10 -4.11322 TATCAACACAAAAAA GCCGCAGTTGAGCACATT TGTA AGTGTACTCGCTTGCGGC TATTTTTGTACTTAC 90 41 FOC41_RS05660 1370865 .. 1370894 + -6.6 -3.64466 AAGAGTAAAGCAATG GATGCTAC-TATC TGTCC GGTATGTAGCATC TTATCTGTATCCAAT 64 193 FOC41_RS05680 1375209 .. 1375239 + -12.7 -2.7089 CATCCGGAAACGGTA GCGGAATAAAGCA TTAAC TGCTTTACTCCGC CTGTTGGTTTTTATT 95 17 FOC41_RS05700 NONE FOC41_RS05705 1382489 .. 1382500 + -3 -3.2375 GATAAAATCAATTTT GAAT TACG ATTC TTGAATTATCACATC 46 57 FOC41_RS05710 NONE FOC41_RS05715 NONE FOC41_RS05720 1385958 .. 1385979 + -4.4 -3.92694 CATTGTTGTAACATT GGTTACAG AATCAG CTGAAACC TTTCCTCTACTTTTG 58 99 hcp 1387686 .. 1387707 + -8.7 -3.34013 ATAACAATCAATCAA GCGGGGATT TGGA GATTCCCGC TTGATTGACAGAATA 74 41 FOC41_RS05735 1390617 .. 1390646 + -6.5 -4.52589 CCTTGGCAAGACATT CGTTTCATCTTCA TGCG TGGAGACGAAATG TTTTATATAGGCCAA 74 102 FOC41_RS05740 1392510 .. 1392559 + -15.3 -3.31196 TTAAACGCAGATTAA CGCGGATTATCGCAGATTA ATTTATCTTTTA AAATCTGCGATAATCCGCG TTAATCTGCGTTTAA 100 49 FOC41_RS05750 NONE FOC41_RS05755 1396732 .. 1396752 + -8.3 -4.12947 AAGGAACAAAAGTAC GGGTGATTT TTT AATTCACCC TTCTTTCATTCCTTT 79 12 FOC41_RS05775 1403381 .. 1403391 + -5.4 -3.25234 CATACGCACAGCATC TTCC AAA GGAA TATTGGCTTTCTTCA 54 450 FOC41_RS05825 1408370 .. 1408398 + -11.9 -3.58343 GTAAGACTATGAAAA GCGTAGCTTTA GATTAGA TAAAGCTACGC TTTACAGATGCTAAA 95 37 FOC41_RS05845 NONE FOC41_RS05850 1415846 .. 1415870 + -12.2 -5.055 TATACTTATGGAAAA GGTCGTTGTG TTTTT CACAGCGACC TTTTTTACAGATTAA 100 60 FOC41_RS05855 NONE thiS NONE FOC41_RS05865 NONE FOC41_RS05870 NONE thiC NONE thiH NONE FOC41_RS05885 NONE FOC41_RS05890 1424434 .. 1424448 + -2.8 -4.08216 GTTCTGTGTCATTAC CTAAGT CAA ACTTTG 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-5.38054 TGTTTTAAGTTTGCG GATAGACTTTATT GTGA AATAAGGTCTATC TTTTTATTTATCAAC 100 154 FOC41_RS07010 NONE FOC41_RS07015 1681729 .. 1681765 + -8.2 -5.03405 TGAATATATAAAAAA CTCCTGATACTAAGTCT GGAT ATAC-TAGTATCGGGAG TTTTTGTCTCATCTT 91 42 FOC41_RS07020 1682739 .. 1682753 + -2.1 -4.25681 AAGTAAAATTTTTCT GCCACT GTAG AG-GGC TTTATTCAATTCACT 54 251 FOC41_RS07035 1689904 .. 1689937 + -9.1 -4.09015 ATAATAAAAAGAAAA GAGGATATTGTGAAAA GTA TGTTC-CAATATCCTC TTTATCCTATATTTT 85 37 trpB NONE FOC41_RS07055 NONE FOC41_RS07060 NONE trpD NONE trpC NONE FOC41_RS07075 NONE FOC41_RS07080 1698440 .. 1698471 + -11.8 -4.35348 TCCTTTCCTCGCCAA TATTGCTGCTGTTG TTTA CAACAGTAGTAATA TTTCTCTTCTCTTCT 100 247 FOC41_RS07085 1700010 .. 1700066 + -13.4 -3.18023 TTAAATCCATCTATT GTAACCCCCTGATTTTCA-TTTTAAAC AGTT GTATAAAAGTGAAAATCAGGGGATTTC TCTTCATCATCATCA 100 42 FOC41_RS07090 1702640 .. 1702668 + -13.3 -5.27477 ACAATTAATCTTTAA CACGGATTCCA GTTTTTA TGGAATCCGTG TTTTTTCATTAAGAT 100 46 FOC41_RS07095 NONE FOC41_RS07100 NONE FOC41_RS07105 NONE 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AAAAGATTGCCGGCC GCTTC TCC GTAGC TATTTAATCTATCAT 50 6 FOC41_RS07235 NONE FOC41_RS07240 1740060 .. 1740089 + -19.5 -4.4017 TATTGAACTGAAAAA GAAGAACGGCCAA CGTT TTGGCCGTTCTTC TTTTATACCCATTCC 100 30 FOC41_RS07260 NONE FOC41_RS07270 NONE FOC41_RS07275 NONE FOC41_RS07280 NONE FOC41_RS07285 NONE FOC41_RS07290 NONE FOC41_RS07295 NONE FOC41_RS07300 1745652 .. 1745673 + -8.7 -5.95539 ACGACGCGAAAAAAA TCGGACGAT AACA ACCGTCCGA TTTTTTTGTTTCCCG 100 45 FOC41_RS07400 1760818 .. 1760836 + -11.8 -3.08133 ACGCAAGTGGCATAA TCGCTTGT GGT ACAAGCGA TTGAATAGGTCGGTA 89 95 FOC41_RS07405 NONE FOC41_RS07410 NONE FOC41_RS07415 1764762 .. 1764804 + -9.8 -4.36914 ATGAACACAAACACC CCCGCAAACAACCTCCGTGA CCT TAACGGGGGCTGTTTCCTGG TTTTATAACCGCACA 91 41 FOC41_RS07420 NONE FOC41_RS07425 NONE FOC41_RS07430 1766465 .. 1766491 + -7.9 -3.04415 GTACACCTTACGGAA CGCCGCCTCGT GCGTG GCGAAGTGGCG TATCATTTCCTCGTC 62 525 FOC41_RS07470 NONE FOC41_RS07475 NONE FOC41_RS07480 1775138 .. 1775165 + -17 -4.19177 ATTTTTTCAGTGGTC GGCGCTTCGGGT GGGA 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.. 2093426 + -14.7 -5.40072 AATAAGCATAAAAAA CTCCCGATAGGAT TAA ATTCTGTCGGGAG TTTTTTTAGAAAAAC 100 63 kbl 2100078 .. 2100089 + -4.4 -3.26779 ACTCCGAAGCAAGGT TTCC TTGC GGAA TCTATATTTTAGGCG 52 40 FOC41_RS09080 2100858 .. 2100874 + -6.5 -3.96068 TTCTGTTTGTAGAAA CGGCTGA AAA TCATCCG TTGTTCTTCGCGTGG 66 214 FOC41_RS09135 2111430 .. 2111444 + -2.8 -2.60988 TATAAATGAGTTAAT CCAATT AAA ATTTGG TGCGTTAGTTCAGTT 40 67 FOC41_RS09140 2111544 .. 2111569 + -9.1 -6.01725 GTAAATTAAAGCAAA GCTCTGAAATT CAAG AAATTCAGAGC TTTTTTCTTTTTCTT 100 52 FOC41_RS09175 NONE FOC41_RS09180 2120693 .. 2120704 + -2.2 -2.58638 TAATTGGAATAATCT GCGA TAAT TTGC GTTAATCTGCGTTTT 39 145 nrdD NONE nrdG 2134941 .. 2134977 + -10.9 -4.73105 TCTTAATAAGAGAAA CGCTCAAACGGAGTATG TTA TATTTACCGTTTGAGCG TTCTTTTTTCTAACT 100 35 FOC41_RS09265 2141066 .. 2141079 + -5.9 -2.62579 TTTCCGATAATTCAA CGGGG TCTG TCCCG CATTTCTTTTAAAGA 50 230 FOC41_RS09275 2142835 .. 2142879 + -13 -3.95475 TCACTATAAAAGAAA GTCGCTTCTCTGTTAGAATC TGATT GATTCTTTCAAAGAAGCGAC 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-4.93296 ACAGACGATGAAAAA GATGTGTCCG GCAAAGAA CAGGCACATC TTTTTCTACTAATAA 66 41 FOC41_RS12410 NONE FOC41_RS12415 NONE FOC41_RS12420 2959978 .. 2960009 + -20.4 -2.57013 GGAAAAGACATTCAA TAAGCCCCATAGTG ACAT CACTATGGGGCTTA TACGTTCACTTGGCA 100 80 FOC41_RS12430 2962706 .. 2962724 + -11.7 -4.39226 CCTGATAATCAAAAA CGGCGTG GTCTA CACGCCG TTATTTTATCCTTCT 100 229 FOC41_RS12445 2965616 .. 2965642 + -12.4 -6.15717 AAAACAAAATTAAAA TAGAGAAAGGCG GTA CACCTTTCTCTA TTTTTTTTATCTTTG 100 55 FOC41_RS12450 NONE FOC41_RS12455 NONE FOC41_RS12460 2970602 .. 2970615 + -5.3 -3.71794 TTAAAAATTAACAAA TCGTT TATT AACGA TTTAAATGATTGAAT 59 235 rpiA 2971550 .. 2971577 + -11.4 -3.52093 AGTTAGTAGAACTAG GTTATCTGACAC CCGG GTGTCAGACAAC TTATACTTGCAGTCT 90 130 FOC41_RS12475 NONE FOC41_RS12480 2977149 .. 2977172 + -9.6 -5.18371 AGAGACGAACAAAAA TAGGCCAACC GTGA GGTTCGCCTA TTTTATTTTATCCAA 100 106 FOC41_RS12490 NONE FOC41_RS12495 2979980 .. 2980008 + -8.2 -2.70023 TGTTTTTGCGTAAAA GCGTAAATGCAA ATTAG TTGCATCTGCGC TACCTTATCTTTGTA 67 28 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3019587 .. 3019634 + -15 -4.21744 TATATAATATAAGAT AAAGAGCGGTGGATGAACAGGA GATT TCCTTATCATTCACCGCTCTTC TTTCATTTATTCAAT 100 74 FOC41_RS12710 3035496 .. 3035519 + -12.6 -4.07568 GTTATTCATTAAAAA GGAGGATTAA ATAC TTAATCCTCC TTTTAACAAAGCACA 100 16 FOC41_RS12745 3044958 .. 3045008 + -8.4 -5.63504 GTATTAAATTATAAA GTATTAAGTATTAATTCCGTGCGG ACA CAGCCGGGCTTTAATACTTAATAC TTTTTTTATGCCGTT 100 46 FOC41_RS12755 NONE FOC41_RS12760 3048833 .. 3048847 + -6.4 -3.64882 GCCGTTATCACAGCT TCCTCT TCG GGAGGA TTCTCATTATTCTTG 62 470 aroC NONE FOC41_RS12775 3051589 .. 3051644 + -16.7 -2.87132 GTTATAAACGATACA TATAAAAGAGTGGTGGACA-A-GCTTG ATTA CAAGCATTTATCCACCACTCTTTTATA TATCTACCACACCGA 100 61 FOC41_RS12785 3054007 .. 3054017 + -4.6 -3.08211 CGGCATCCTTCTCCA CCTC TTC GGGG TACTTTTGCAGCAAT 49 193 FOC41_RS12850 3077598 .. 3077635 + -11.6 -5.0666 TTAGCATATAAACAA TAAAGCCGGC-TATATCC AAAT GGA-ATACGCCGGCTTTA TTTATTTTTTCAATC 100 48 cobU NONE cobT NONE FOC41_RS12875 NONE cobC NONE FOC41_RS12885 3084615 .. 3084627 + -3.3 -3.25823 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TTTTTTCTCATAAGG 100 104 FOC41_RS13025 NONE lysS NONE FOC41_RS13040 NONE FOC41_RS13045 3132308 .. 3132354 + -13.4 -3.98114 GTAAACTATAAACAA TGAACGGTGAAC-AA-CTATGC TATAT GCATGGATTTGTTCACCGTTCA TTATTATATTCAATT 100 62 FOC41_RS13055 NONE FOC41_RS13060 NONE fkp 3137682 .. 3137712 + -7.7 -4.32046 AACCATAAAAAACAA GCTTGGACAGATTC AAAC GAAA-TGTCCAAGC TTTAATTTTTCAACG 80 78 FOC41_RS13070 3138610 .. 3138638 + -3.2 -5.71712 ATAGAAAACAAAAAA CGCAACTACT AACAGATGA AGTAATTGCG TTTTTTTCTGTGACC 81 41 FOC41_RS13080 NONE FOC41_RS13085 3140672 .. 3140728 + -19.7 -5.56263 ACAGTGAAATAAAAA CAATGAGCGGTGAACAACTAATGCAAT ATA AATGCATATCTTGTTCACCGCTCATTG TTTTTATTTTATGCT 100 48 FOC41_RS13100 3145540 .. 3145550 + -5.4 -4.37198 TATAACATGATAATA CGTA CCA TACG TTTTCCGTTTAGATT 70 191 FOC41_RS13110 3148686 .. 3148709 + -3.4 -3.01712 CAAAAACATCTATCA TGTTTATTCAT CAG AT-AATAAACA TGTTAGCAAAAAGAA 46 113 FOC41_RS13115 NONE FOC41_RS13120 3150834 .. 3150844 + -4 -3.30651 CTATCTTTGCATAAT TCAT CAG ATGA TATTATGATATGACC 49 260 FOC41_RS13125 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+ -3 -3.27212 ACTTGAAACAAAGGT GTAT ATGA ATAC TAATTTTGTTAACTT 46 209 FOC41_RS13370 3204933 .. 3204970 + -2.8 -4.62002 TCAAAAAATAAGAAA TACAATCCTGACTTTT CCCGTT AATTATCAGGATTGTA TTTTATCTGCTTCAT 60 30 FOC41_RS13385 NONE FOC41_RS13390 NONE tsaE NONE FOC41_RS13400 NONE FOC41_RS13405 3209772 .. 3209786 + -3.5 -3.18634 AGCTTTCCGTATCTT TTGCC GGTTG GGCGA TATATTCCTTCAAAT 46 259 FOC41_RS13440 3216836 .. 3216860 + -8.5 -3.84279 GCACCGCACAAAAAA GGGGTATACTC ACA GAGCACACCCC TTATCTTAATTTTAT 79 177 FOC41_RS13500 3237039 .. 3237066 + -7.1 -5.18715 CTATATAAATAAAAA GAGACTATGTT TTCTAC AACATTGTCTC TTTTATTATTTTTCT 91 66 FOC41_RS13510 NONE pssA NONE FOC41_RS13520 3243191 .. 3243202 + -7.2 -3.1364 TAATAGCCTGCATCT CGGC ATGA GCCG TTACATCATTCAATG 62 316 FOC41_RS13535 3244048 .. 3244064 + -2.3 -3.00017 GGAAGCGTTTTATCC TCCTTTA TAT TAAAGAA TGCTTTGGCTTTACA 42 13 FOC41_RS13540 NONE FOC41_RS13545 3245315 .. 3245329 + -2.9 -3.66401 ATCTTTGGAACGTGC GTTTT TATAT AAAAC TCTTTCATTTATGAA 50 67 FOC41_RS13560 3248800 .. 3248810 + -4 -3.18571 CCAGTGAGGCTATCC GATA AAT TATC TCTATATTTGCGGCA 49 34 FOC41_RS13565 3249571 .. 3249623 + -2.2 -5.59962 ATCAGAAAATAAAAA GTGTGAATTTTGCAACAGTAGTTTT TATC AAAGCTA-TACAGCGAAATTCGCAC TTTTTATTTCTTTTC 74 40 FOC41_RS13605 NONE FOC41_RS13610 NONE rsgA 3269270 .. 3269298 + -5.3 -3.46088 TTACTTTTTTCTTCT TTAAACCTTTCCC TTT GGGAGAAGTCTAA TCTTTGATGACATAT 58 52 FOC41_RS13620 NONE FOC41_RS13625 NONE FOC41_RS13630 3274841 .. 3274875 + -11.6 -4.84527 CATTTATTTTTTTTA TTGGGTTAATCTTCTT ATC GGGAGGGTTAACCCAA TTTTTACTGTATAAA 100 53 pelA 3276139 .. 3276173 + -15.8 -4.3255 CTTAAAATAAGAAGA GGGGCTGTCTAACAAT AAA ATAGTCAGACAGCCCC TTTATTAATTCAAGG 100 104 FOC41_RS13645 3278643 .. 3278657 + -4.2 -4.35339 TTTCCGTGTCAGGTT TCAGTC GCT GACGGA TTTCTTCATTGGTCT 64 500 FOC41_RS13675 3289138 .. 3289182 + -13.8 -2.80016 TTACGAATATTATCA CTCGTCCCATTTAAAGGAAT AAAGC GTTCCTTTAAAAGGAACGAG TCATTGGTCGTAGAG 100 204 FOC41_RS13680 3292799 .. 3292809 + -2.6 -2.7127 AGCTATGGTTTTGGA TTTA ATG TAAA ATTCTAATTAGCTAA 40 8 FOC41_RS13685 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-3.1 -3.57144 ATCGACATTTTGGGA CAAGT TTAT GCTTG TTTCAAGATAAGAGA 50 171 FOC41_RS13775 NONE FOC41_RS13780 NONE gpmA NONE FOC41_RS13790 3314838 .. 3314855 + -4.2 -3.08966 ATAACCAGAACTATT GATATC AAATAA GATATC TTAGCTAAACTTTAC 48 14 FOC41_RS13795 NONE pfkA 3316469 .. 3316496 + -4 -2.82516 CACTGCTTGGAAAGA CACTCCGGGAGG CAGA CATACCGGACTG TATCATCATCGGGAA 47 55 glgP 3319252 .. 3319263 + -2.2 -2.58638 TAATTGAAATAATCT GCGA TAAT TTGC GTTAATCTGCGTTTT 39 126 FOC41_RS13810 3320135 .. 3320153 + -4.6 -2.52933 TAACATAGTCATGAA TATTATGC TTA GCACAATA ATTAGTGAATTGACC 48 50 FOC41_RS13815 3321605 .. 3321617 + -4.9 -4.77442 ACTGATAAAATTCAA TATCT TGG AGATA TTTATTTCTTCTCTT 72 476 FOC41_RS13830 NONE FOC41_RS13835 3328001 .. 3328031 + -11.2 -3.10545 TTATATATTAAGAAA TGCTCCCTATCTCG TTT TGAGATGGGGAACA TACTTTTCAAATATG 84 98 FOC41_RS13840 3328716 .. 3328747 + -14.8 -3.24411 AATAGAATGGCCGTA TAAGAAAACTTCTT TCAA AAGAAGTTTTCTTA TCTATTTAAGACAAT 100 83 FOC41_RS13850 3330163 .. 3330182 + -2.1 -3.23279 AGAATTTACGATAGT TGCTCCA 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-5.1925 AAGTTTTCCAAAAAA TAAGGGAGTTGCAC GTTAA GTACAACTCCCTTA TTTTTTGAATTATCA 100 69 FOC41_RS14000 NONE FOC41_RS14005 NONE FOC41_RS14010 3362874 .. 3362893 + -5.7 -3.90328 CTCGCCTTTCATAAA TTCCTGC AATTTG GCAGGGA TTTCTACCGCTTCTC 63 236 FOC41_RS14030 3369317 .. 3369345 + -10.5 -4.05067 TATTTCTATTAGGCA GGGATAACTTATT TCT AATAAATTATCCC TATTTTTGTACCCTA 91 49 radA NONE FOC41_RS14040 NONE FOC41_RS14045 NONE FOC41_RS14050 3375756 .. 3375804 + -14.9 -3.97368 CGCTGACAATAACCC CAAACAGGCTGACAATAAAAG ATTCGGA CTTTTATTGTCAGCCTGTCTC TTTGTAGATTAACAG 100 143 FOC41_RS14075 3380982 .. 3381005 + -13.2 -5.5353 TACAAAAAATCTATA GGCTGCTTTC TACG GAAGGCAGCC TTTTTTATTGCTCTA 100 48 FOC41_RS14100 3386419 .. 3386438 + -5.6 -5.71295 ATAAGGCATTTGGGA GGCTTCCA CTTC TGGGTGCC TTTTTCTTTTTATCT 87 50 FOC41_RS14145 NONE FOC41_RS14150 3400685 .. 3400713 + -16.1 -3.61398 GATAAATAACAGAAA GCCCCTTGACTCA AAA TGAATCAAGGGGC TTCTTAAAAAACGGC 100 62 FOC41_RS14180 3408955 .. 3408992 + -6.5 -2.62935 AACCTGTTCATAAAA ATTCGATGCTGTATCA AATTTAC 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-3.2 -3.51329 TTAAAAAACAAAGTG TTAGATTT ACA AAATCGAA TTATAATTCAAAATC 48 103 FOC41_RS14460 NONE FOC41_RS14465 3500839 .. 3500892 + -14.4 -5.27923 ACAATTCATAGCCTT TCGGTTATAATC-GAAG-AGTTCAAT GCAG ATTGCACTTCTTCTGATTATAACCGA TTTTTTATCAAGTTA 100 40 FOC41_RS14480 NONE proC 3505726 .. 3505738 + -2.6 -4.77719 CCGATTTTCAACAAA CGGG CAGCT TCCG TTTTATTCCCTTTTG 68 176 FOC41_RS14495 NONE FOC41_RS14500 3510062 .. 3510102 + -9 -5.27335 TCTGTAAATAATGAA CGGTGAGCAAACT-CCCTG ATAA TGGGGCAGAGTGCTCACCG TTTTTCTTTAAACAG 95 60 FOC41_RS14505 NONE FOC41_RS14510 3511567 .. 3511610 + -9.8 -6.28401 TTACGTTAATAATAA AAAAGGTAAAAGGTAGCTTT TAAT ATAGATACCTTTTACCTTTC TTTTTTTATTTTTTC 100 64 rplS 3516812 .. 3516834 + -12.8 -5.62045 ATTCGAAATAAAAAA GGGAACTTCA TTA TGAGGTTCCC TTTTTTATTGTATAT 100 57 FOC41_RS14540 NONE FOC41_RS14545 NONE FOC41_RS14550 NONE FOC41_RS14555 NONE FOC41_RS14560 3524030 .. 3524086 + -4.6 -4.49311 AGTATAGTAGTTCCT TAAAACATATCCGTTGGTTCATTC GTTATTATA GAAAGAACTAACGGATATGAAGTA TTTTATCGTCCTAGT 65 61 msrB 3525159 .. 3525188 + -11.6 -4.84274 ATTAGAAAAACAGAA CGGTGGATTATCC CATAA GGA-AATCCACCG TTTTTAATGTAGTTA 100 77 FOC41_RS14575 3528168 .. 3528188 + -3.2 -3.79866 AGTGCTATTGCTTCT CGTACTTC CGGAA GAAGAGCG TCTTTCTGTTTGTCC 53 122 FOC41_RS14600 3533001 .. 3533033 + -15.1 -4.68103 CAATATTAGCAAAAA GCCGAAAAAGAGA AAATACA TCTCTTTTTCGGC TTTTATTCCAATTAC 100 46 FOC41_RS14645 3544766 .. 3544803 + -17.3 -4.84359 TCTATTCAAAATCAA TAGCGGAAGCTTTTCAT CCGG ATGAAAAACTTCCGCTA TTTTTGTCAAAGTAC 100 74 FOC41_RS14650 3546266 .. 3546295 + -4.2 -5.0133 TTAATCATTCCATCT GGATGCGGGCAA TTCTTT TTTCCCGTAACC TTTTTTCCAGGCATA 70 45 FOC41_RS14665 3550347 .. 3550382 + -7.9 -5.05601 ATAAAGAATAAAAAA GGAGAATCA-GTA-GTA TCAA TACATACCTGATTCTCC TTTTTATATCTAATA 89 49 FOC41_RS14680 3552875 .. 3552894 + -2.1 -3.01119 TTTATGTTGTATTTT TGCGGTT CAAACT AAACGCA TGTATCTGCATGAGT 42 87 FOC41_RS14685 NONE FOC41_RS14690 NONE FOC41_RS14695 NONE FOC41_RS14700 3558067 .. 3558084 + -9.9 -2.70017 AGCAGCAATAAAAAA GGGAAGT TTTT ACTTCCC CTCTTTCGCTTTGAA 77 30 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-2.77344 CCCCGGTTCGATTCC TGGT GGC ACCA CTTCTTAAGCAATCG 52 13 FOC41_RS14815 3584858 .. 3584896 + -11.9 -4.21607 CTCATTCCGACAAAA TAAAGGGTAGCTTTCTG GAGTA CAGTAAGTTGCCCTTTA TTTCTATTCAGTCAC 100 29 FOC41_RS14820 3586737 .. 3586753 + -3.6 -5.54907 TTATATTATAATATC AAGGCC TTTTC GGCCTC TTTTTATTTTATAAA 79 165 FOC41_RS15025 3631811 .. 3631834 + -3.8 -3.70109 CCGCTGAAGCTTGTT CATCAGTGAA ATAC TGCACTGACG TTATTGGCTGATATG 53 228 FOC41_RS15295 3668315 .. 3668343 + -8.8 -2.78816 TCAGACTGCTCAAGA CCCGGGTCTCAT ACATC ACGACACCCGGG TGTCGTACAACATAG 69 89 FOC41_RS15300 3668943 .. 3668983 + -8.5 -5.75342 CCTAAAACAAAACTT CGTTCCTCCTTACTCTTA TATTTT TAAGAA-AAGGGGGAACG TTTTTTTTCAGAACA 100 53 FOC41_RS15305 NONE FOC41_RS15310 3672209 .. 3672256 + -21 -4.24711 AAGCTCCTTAATAAA CAAAGAATCACCTTTACCACAG ATAA TTGTGATAAAGGTGATTCTTTG TTTATTAAGGTTTTG 100 193 FOC41_RS15325 3677627 .. 3677648 + -8.7 -3.44848 TGAAGCATTACGCCT TCAGCCGTA GAGC TACGGCAGA TATTTCCTAAACAGA 71 415 FOC41_RS15365 3685550 .. 3685562 + -3.3 -3.25823 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GGGAAATA ATC TGTTTACC TTTCTCTTTCTGTTC 61 494 FOC41_RS17995 NONE FOC41_RS18000 4498700 .. 4498728 + -11.8 -4.16909 CCTCATAGATTGAAA TACGCCACTTCT TCAGC AGAAGCGGCGTA TCTTTTTGTTAGAAT 100 47 FOC41_RS18015 4503933 .. 4503946 + -8.1 -2.8474 TAAGGAACTGGAATA GTCCG GTGG CGGAC TCATTATCGGTGCAG 61 493 FOC41_RS18065 4514020 .. 4514072 + -8.9 -4.80417 ATCAAGTCCCGAACA TATTTTGATTGGTAATGATTTTATT GCA AATAATGTTATTACTAATCGAAGTA TTTCTTATTTTTATA 93 147 FOC41_RS18070 4514818 .. 4514849 + -6.2 -3.50358 CATTCATTCCATAAT TCTTTTTTTATTTT TCTA AAAATAAAAAAACA TTCTGATACTTCTTT 62 7 FOC41_RS18075 4516333 .. 4516343 + -2.6 -3.85698 TAGGTACACAAAAGT TTAA TTA TTAA TTTATGAGAGAAAAA 51 63 FOC41_RS18080 NONE FOC41_RS18085 NONE FOC41_RS18090 4521994 .. 4522006 + -3.3 -2.70932 TGGTAAAATGGAAAT TCCTG TTG CCGGA TAATTAAAAAACGGA 44 10 FOC41_RS18095 4523728 .. 4523768 + -9.1 -4.7923 CTATATAGATTATGC GGGGAATCGCATTGAGTCT TGA ATACTTTATGTGATTCTCC TTTGTTTATTTGAAT 93 52 FOC41_RS18100 NONE FOC41_RS18105 NONE FOC41_RS18110 NONE FOC41_RS18115 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CTCTCGAATTTACAG CATT TTTG AATG TCTTGCGTCTAATAA 45 276 FOC41_RS19640 4986728 .. 4986739 + -5.8 -4.00038 AAGTGCGGCGGTAGG GGAG ATTA CTCC TTTGTCCTCCTGCTC 63 353 FOC41_RS19770 5024429 .. 5024448 + -2.2 -3.09785 AGAATTAGATTATAT TTGTTC AGTGGTTA GAACAA TATCTTGAAATATGA 42 76 FOC41_RS19775 NONE FOC41_RS19780 NONE FOC41_RS19785 5027972 .. 5028006 + -10.9 -5.19212 TATAATAAATATGAA TATAGGTGTTGGGTC TAAAC GATGCAACACCTATA TTTTTTCATAATAAT 100 52 FOC41_RS19795 NONE FOC41_RS19800 NONE fucP NONE FOC41_RS19810 5033630 .. 5033657 + -16.4 -3.55563 GGGTATGTAATAAGT GAGAGGAGGCTG AATA CAGTCTCCTCTC TTTGGGAGATAGGGT 100 83 FOC41_RS19815 5035490 .. 5035502 + -6.3 -4.63932 ATATGTATTTGTAAC CAATG AAA CATTG TTTTATTAGAAAATA 76 48 FOC41_RS19820 5038223 .. 5038252 + -12.3 -4.64861 TGAATAAAGAAAGAA CGACCTTGTTCCTT TAA AAGGAAC-GGGTCG TTTCTTTTAAACCAA 100 99 FOC41_RS19825 5040290 .. 5040301 + -4.4 -2.88366 TGATCGGACTGTATG CAAC ATCT GTTG GTTATTAATTAGAAA 49 6 FOC41_RS19830 NONE FOC41_RS19835 5044790 .. 5044805 + -6.2 -4.07089 GTTTGCTGTGAAGAG GATATG GAAG CATATC TTTGATATTTATGTT 68 40 FOC41_RS19840 NONE FOC41_RS19845 NONE FOC41_RS19850 NONE FOC41_RS19855 NONE FOC41_RS19860 5055972 .. 5055985 + -6.7 -3.54297 ATTCCCGCAGAATCC GGGAT GGTA ATCCC TTATGGTTACTGAAT 65 16 FOC41_RS19865 NONE FOC41_RS19870 NONE FOC41_RS19875 NONE FOC41_RS19880 5064042 .. 5064070 + -12.6 -4.22214 GCACGCTCGTCCGGA TAGCGGAGTCTCT CGAT AGAG-CTCCGCTA TTATTTTAAATAGAT 100 85 FOC41_RS19885 NONE FOC41_RS19890 NONE FOC41_RS19895 5068780 .. 5068817 + -6.4 -3.86283 GATAAACATACTAGA GAGCAGTTGGGTTA CTCTTCTTTT TTACTCAACTGCTC TTTCATATACATTGA 66 36 FOC41_RS20010 NONE FOC41_RS20015 NONE FOC41_RS20020 5108060 .. 5108093 + -11.2 -6.15536 GTTTTGTTTGTGTGT GATGCATTCTTGTC TGGTGT GATAGGAATGCATC TTTTTTTTATTAATT 100 165 FOC41_RS20035 5110901 .. 5110932 + -11.7 -4.16443 AATGAAAAATAGAAA CGGTGAATAATGG TTGCAT CCAATATTCACCG TTTATCATTTACTGT 100 40 folP NONE FOC41_RS20055 5116136 .. 5116193 + -11 -4.62051 TTGTAATCACATACC GGACAAATGGTCGGAAGATGAGCATGGTA AAA TGCC-T-CTCATCTTCCGACCATT-GTTG TTTTATCTGCTATTT 100 46 FOC41_RS20060 NONE FOC41_RS20065 5119696 .. 5119720 + -11.4 -3.10244 ACTAAAATATCTCGT GGGACAGGAG AAAAA CACCTGTCCC TGATTTGTTAAACCA 87 41 FOC41_RS20070 NONE FOC41_RS20075 5124466 .. 5124503 + -20.2 -5.52807 GATATTTCTTTTGGA TGTGAGTTCGGGATAA ATACCC TTATCCCGAACTCACA TTTTTATTTGTTATT 100 43 FOC41_RS20080 5125902 .. 5125944 + -18.2 -5.35224 AAACTATAAATGCAA GCTTTGATTATATAAATGAA ACT TGCATTTATATAATCAAAGC TTTTGTTTTTATAAA 100 410 FOC41_RS20095 NONE FOC41_RS20100 5135501 .. 5135511 + -2.4 -3.07431 GGAGTGGGCTAATAA GTGG AAT CCTC GTTTATATCGTATTA 43 61 FOC41_RS20105 NONE FOC41_RS20110 NONE FOC41_RS20115 5139348 .. 5139363 + -8.2 -2.64735 ATCTGTATATGCGTA CCGGGC AGTC GCTCGG TACTATACATGCACT 59 202 pta NONE FOC41_RS20145 5144886 .. 5144909 + -11 -6.10295 GATATACAAAAAAAA GATGGACTCG ATTT CGAGCCCATC TTTTTTTTGTCTTAC 100 54 FOC41_RS20150 5145998 .. 5146048 + -17.8 -3.62849 TTGTTTAAAAGGAAT GTTGTCTGACACCCGGGTCTCA ATACGTC TGACACTCGGGTGTCAGACAAG TTATACTTTCATGGA 100 75 radC 5149082 .. 5149120 + -7.7 -4.84359 GTAAAGTAGTGAAAC CTATCTGATCTGATATTT CAGT AAATGTCAGATCGG-TGG TTTTTATCAGAGTAA 86 157 FOC41_RS20170 NONE FOC41_RS20175 5158302 .. 5158314 + -4.9 -2.79915 AACCCGAAATGGTAA TCATT AAT AATGA TATAATAGGATAGAT 51 26 FOC41_RS20180 NONE FOC41_RS20185 NONE FOC41_RS20190 5164613 .. 5164668 + -9.2 -2.90941 TGACAGGTATTAGTT TGAATCCCCTTATTTATCCTTGTTTT GTAT ATGAAGAGGACAAATAGGGGGATTCG TATCTGGAATATACT 73 45 FOC41_RS20195 5167474 .. 5167503 + -15.9 -5.5762 TAAATGATATATTCT TTAGGCACGGGAT ACGC ATTCCGTGCCTAA TTTTTTATGTTTCAT 100 101 FOC41_RS20200 5167941 .. 5167957 + -3.8 -4.88918 CTCGTAACTGGTAAT TAAATG AAGAA CATTTA TTTTCTTTCCGATGC 68 95 FOC41_RS20205 5168761 .. 5168811 + -6.4 -2.72227 GAACAAAATATAAAA CAAGGGCACAAAGAAGTAGCAG AAAAATAAC CTGC--CATCTTTGTGCCTTTG TCGTTAGAGAATCTT 57 78 FOC41_RS20245 5184943 .. 5184955 + -2.7 -3.42407 AATGTTATTCACAGA TAGCA ATA TGTTA TTACTTCGTAATATA 46 39 FOC41_RS20250 5186514 .. 5186541 + -14.2 -5.20633 GTATGAATATAAAAA TAGCCGGAAGTC CTTG GACTCCCGGCTA TTTTTATATGTTTTT 100 48 rpmH 5187494 .. 5187544 + -20.2 -4.57073 ATAATCACTTGTCAT CAG-GAAACAAAAAAGGCGGAGA ATTTAA TCTTCGCCTTTTTTGTTTCTCTG TTTTTCAAGGGGATA 100 40 FOC41_RS20265 NONE FOC41_RS20270 NONE FOC41_RS20275 5190589 .. 5190636 + -6.6 -3.84246 AGTATTAAGTATCAA GTATAAAGTATTAACCATGCG GTTTGTA CGCA-GTCTAATACTTTATAC TTATTACTTAATACT 69 40 FOC41_RS20280 NONE FOC41_RS20285 NONE FOC41_RS20290 5192926 .. 5192951 + -13.5 -5.11937 AAAGAAATAGAGAAA TAAAGTGCTGA TTTA TCAGCACTTTA TTTTTTGGGGTTATT 100 23 FOC41_RS20320 5200785 .. 5200804 + -5.7 -4.16681 ATTCTTGGTACATTT GGCATCC ATTTCG GGATGTC TTTTCAGATAGTCTT 67 424 prmC NONE FOC41_RS20370 5210278 .. 5210288 + -4 -2.82082 TTCAATTTCTGTACT TTTG CGG CAAA TAATTAATAGTTAGT 47 72 FOC41_RS20375 5210983 .. 5211015 + -7.7 -6.14618 CATATTTGGTAAAAA GAACTGTTCGGGCAA TAT TTGGCCGGATTGTTC TTTTTTTGTTTTATA 100 60 FOC41_RS20380 NONE argH 5212812 .. 5212849 + -13.7 -2.71712 GGAAGATAAAATAGA C-TTTCGGAGGATAGTTT TTT AAACTTTCCTCCGAAAAG ATTTGGCAGAAACAA 100 32 FOC41_RS20390 NONE FOC41_RS20395 5213087 .. 5213115 + -15.5 -5.98675 CGAGTATTCTTTATA GGCTTTATGAATC ATT GATTCATGAAGCC TTTTTTATTTTTATG 100 41 FOC41_RS20400 NONE FOC41_RS20405 5215045 .. 5215063 + -6 -3.38272 AATCTCTTTTAATAT TAGCGTAA TAT TGACGCTA TTCTGAATGATCCTA 61 124 FOC41_RS20410 NONE FOC41_RS20415 NONE FOC41_RS20420 NONE FOC41_RS20425 5222471 .. 5222518 + -10.2 -5.13648 TTTTTGAATATGAGT GAAAGCCTGCTTACTGAAAAGAT AAT ATTCTTTTGGTAAGCAGG-TTTC TTTTATTTATGTTTG 100 79 FOC41_RS20440 5229441 .. 5229480 + -11.6 -4.08706 GCAATATCGTTCGAA TGGTAGTGGAGAGACT AAATAAAA AGTCTCTCCATTCCCA TTTATATACTGAAAA 100 4 FOC41_RS20445 NONE FOC41_RS20450 NONE FOC41_RS20455 5234823 .. 5234835 + -3.5 -2.64794 GATTAAACTTGACCT TTTAA ATA TTAAA TAGTATGAGATTAAA 44 21 FOC41_RS20460 NONE FOC41_RS20465 NONE FOC41_RS20470 5239358 .. 5239404 + -4.7 -2.73681 GTTTTTTATATTCAT TTCTTT-CTGC-ATGGCGGCGG CTCTGT CCGCC-CAATTGCAGGAAAGAA TGGTTAAAGTGAATG 50 58 FOC41_RS20475 5240752 .. 5240788 + -9 -3.81672 TAACCATTGATAATA GGCTGATAATAAAA TATCCCGAC TTTTATTGTCAGCC TTACTTTTATCTCTT 81 156 FOC41_RS20485 5244388 .. 5244424 + -14.7 -3.29161 ATCTATTAAATAACA GGCTGACAATAAAAGTA CGA TCTTTTTATTGTCAGCC TATTGTCATAGCTTA 100 57 FOC41_RS20500 NONE FOC41_RS20505 NONE FOC41_RS20510 NONE FOC41_RS20515 NONE FOC41_RS20520 NONE FOC41_RS20525 5259451 .. 5259475 + -12.9 -4.84602 AACTGGTAAGGAAAG GGGAGGTGCTT ATG AGGCATCTCCC TTTCTTTCTTTATAT 100 53 FOC41_RS20535 5265643 .. 5265683 + -15.8 -3.38727 TTGTTGGGTAGATAT GAGAAGAACGATATTACA TCATC TGTAATATCGTTCTTCTA TTGATTAGAGTTGTT 100 75 rhaB NONE FOC41_RS20585 NONE rhaT NONE rhaD NONE fucO 5279408 .. 5279440 + -7.8 -5.63504 TTGTTTTTATATAAA CATCCGGGG-ATACT TGAA AGTACACTCCGGATG TTTTTTTATACCCTT 100 59 FOC41_RS20605 NONE FOC41_RS20610 5284683 .. 5284698 + -7.6 -4.86731 GTTTTCTTTAATTGG GTGTGT CCGC ACACAC TTTTATTTAGCAGAC 87 153 FOC41_RS20615 NONE FOC41_RS20620 NONE FOC41_RS20625 NONE FOC41_RS20630 5291847 .. 5291890 + -11.4 -3.80625 CAAACTATAAACGAA GCTTCCGTTTTTATAAATGCA AGT TGCGTTTATAAAAACA-AAGC TTTCAATTATGAAAA 95 144 FOC41_RS20635 NONE FOC41_RS20640 NONE FOC41_RS20645 NONE FOC41_RS20650 NONE FOC41_RS20655 NONE FOC41_RS20660 5302491 .. 5302529 + -19.1 -2.81133 CTTTTTCGAGGAACA TAAAAGCCGGCTGATTC ATGAG GGATCAGCCGGCTTTTG TATGGTGAATAACTA 100 47 FOC41_RS20670 NONE fabG NONE FOC41_RS20680 5305205 .. 5305218 + -3.1 -3.40867 TTTTTCTTGTAAACT CTAGC GACA GTTAG TTAATTCCTAAATAG 48 157 FOC41_RS20685 5307809 .. 5307855 + -7.7 -4.89852 TTTTAAGAAATAAGT TAGTCCTGATTACAT-CTTT CCTTTAAA AAAGAATGTAATCAAGACTA TTTTTATAACTATGG 87 271 FOC41_RS20715 5319752 .. 5319762 + -4.6 -2.60032 GAGGTTCAGCAGTAG CCTG TGG CGGG AATTTTTAAAGAAAA 48 26 FOC41_RS20720 NONE FOC41_RS20725 NONE FOC41_RS20730 NONE FOC41_RS20735 NONE FOC41_RS20740 NONE FOC41_RS20745 5331548 .. 5331560 + -4.7 -4.49352 AAGGTTATTCCTTGA CAGGC TCA GCCGG TTTGTCTTTTGATGT 67 156 FOC41_RS20765 NONE FOC41_RS20770 5337426 .. 5337436 + -6.8 -3.65351 ATCTATCAGTGAAAG GGGA AAG TCCC TTTGCCTGAAAATGG 67 57 FOC41_RS20775 5338855 .. 5338865 + -2.6 -2.71144 CTAAATACTTGATAA TTAA AAC TTAA TACTTAACCCCAATG 40 43 FOC41_RS20780 NONE FOC41_RS20785 5341850 .. 5341870 + -5.5 -2.7674 GATTTATATCTATAA TCGTTTGTG TAA TACAAATGA TAATTAGATAGTATG 52 26 FOC41_RS20790 NONE FOC41_RS20795 NONE FOC41_RS20800 NONE FOC41_RS20805 NONE FOC41_RS20810 NONE FOC41_RS20815 5352718 .. 5352762 + -3 -5.1244 AAAATAATGTAAATG CGAGGAAGGGTATA-GATGGT TTTT ATCTTAATATATCCTTCCTTG TTTTTATATTAATAA 67 57 FOC41_RS20820 5354296 .. 5354312 + -4.5 -5.03145 GGCGAACGCTGCTTT TATTATC AAA GATAGTA TTTTTTAAGGAATTC 73 11 FOC41_RS20825 NONE FOC41_RS20830 5361485 .. 5361496 + -4.4 -4.15088 ATTGATATTTGTCCT GTTG GATT CAAC TATTTTTGTAATTTT 60 74 FOC41_RS20835 5362503 .. 5362526 + -9.6 -6.20267 TGATTAAGATAGAGA GCAGCCATTC ATAA GAATGACTGC TTTTTTTGTTTTTCA 100 52 FOC41_RS20840 5364668 .. 5364712 + -6.3 -3.74361 CTCGGTGTCGAAACA GGTGTTTCTCGTTGAGGAACG AGG CGTTCCTCGGTGTCGGTCACC TTCTTCCTCGGTGTC 64 119 FOC41_RS20845 5366853 .. 5366883 + -12.7 -6.15536 CATATATGCGAAGAG GCGTTGATTTTCC GTTGA GGAGAGTCAACGC TTTTTTTTATTAATT 100 59 purH NONE 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-3.8 -5.71712 TATAACACTCAAAAA CGCATCCTAT TTCG ATTCGATGCG TTTTTTTGTCTCAAC 86 56 FOC41_RS20965 NONE FOC41_RS20970 5394172 .. 5394221 + -20.5 -4.90455 GAAATAAATAAAAAA GACACGGATTGTCTCAATTATATA GAA TATAT-ATAGAGACAATCCGTGTC TTTTTATAAATATAT 100 34 FOC41_RS20980 NONE FOC41_RS20985 5396622 .. 5396652 + -10.6 -6.11243 TGGAAGGGTAATAAA AAAACTTCTGTCAT CGG GTGACAGAAGTTTC TTTTTTTTCTTAGCT 100 30 tig 5398761 .. 5398791 + -8.4 -5.77988 ATAAAGTCACAGAAA CACAGAGTTTTTAT AAA ATTATAACTCTGTG TTTTTTTGTGTCTCT 100 60 clpP NONE clpX 5400858 .. 5400877 + -3.6 -3.76775 TTTGCTTGGTAATTA CGAAGTTG TTTA TAACTTTG TTTGGCTCTCTTGAA 54 104 recQ 5403145 .. 5403191 + -16.1 -2.53903 AAAGCGAAAAAAATA GGCGTGCAGGTATGCGGTTTT GAATA AAAACCGTATATTTGCACGCA ATAATTTTTAAACGC 100 42 guaB 5404718 .. 5404768 + -11.2 -4.56978 ACGGTGAACTATTAA CGGTGAACGGTGAACAGGCTGT ATAATCA GCAGGGTGTTCACTGCTCACCG TTTGTTGTTTGAAAA 100 50 FOC41_RS21020 5406327 .. 5406338 + -3 -2.62933 GAGGTTTTAAAAACA GTTA ATAA TAAC TGATGTAACCGATTA 42 11 FOC41_RS21025 NONE FOC41_RS21030 5408619 .. 5408630 + -4.4 -2.64973 AAGTATCCGGGTTGG GTCA AGAA TGAC TGATATAACCTTGCT 48 11 FOC41_RS21035 NONE FOC41_RS21040 5410717 .. 5410727 + -2.6 -3.56643 AGGAAGCTGGAGTTT TTAA TTG TTAA TTTACGAAGTATGAG 46 22 mutL 5412661 .. 5412674 + -3.9 -3.24381 TAAATTCATCTTTTC CTAAA ACCT TTTAG TTCAGTTCGTGTTAT 49 47 FOC41_RS21050 5413980 .. 5414038 + -12.9 -5.093 TCGCCTGCTGAGAGA GAGAAGGCGGCTGAAAGCG--AAT-CCT GAAATA AGGTATTTTCGCTTTCAGCTGCCTTTTC TTTTCTTATTTTAGG 100 75 FOC41_RS21055 5417016 .. 5417053 + -13 -3.0517 AATTATATATTATAA TAAAGGCTGCC-ATTCT TTCTT AGAGTAGGCAGCCTTTA CTTTATATGATACGT 100 47 FOC41_RS21065 5418526 .. 5418554 + -5.4 -5.93809 TTAGTTCTTTGGTAA TGCGTTAATCCTT TTTT GAGGGT-AACGCA TTTTTTTTATGGACG 95 18 carB 5421861 .. 5421888 + -16.4 -5.67283 TCAAAATAAAAAGAA CTCCCTCTTTGG AATG CCAAAGGGGGAG TTTTTTGTTTAAGTT 100 58 yaaA NONE FOC41_RS21085 5425349 .. 5425359 + -4.6 -2.79098 TGTTGCAGTCGGGAA TCCG GCA CGGG TGATTCGTAAATAAG 49 1 FOC41_RS21090 NONE FOC41_RS21095 5425759 .. 5425782 + -8.2 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-27.2 -3.91897 TTGGATTAAAACCAA CGAGATGTCCCTCACCGAGGAA CTTATCC TTCCTCGGTGAGGGACATCTCA TTTCTCGGTGAGGAA 100 256 FOC41_RS21315 NONE FOC41_RS21320 NONE FOC41_RS21325 NONE FOC41_RS21330 NONE FOC41_RS21335 NONE FOC41_RS21340 NONE recG 5488870 .. 5488880 + -4 -3.9131 CGTAGGAAAACACTA TCTT TGG AAGA ATTTTTTTAGTAAAT 56 191 FOC41_RS21350 NONE FOC41_RS21355 5490321 .. 5490363 + -11.6 -4.9445 GTAATACAATATCTT TAG-AAGAGGGCACTTTAA TATAAT TTAGAGTGCCCTCTTTCTG TTTTTACTTAATTAT 100 61 FOC41_RS21360 NONE FOC41_RS21365 NONE FOC41_RS21370 5493171 .. 5493228 + -13.9 -4.18058 AATTAAATGATAGTT GATAAATGATAGTTGATAGT-TGCTATG TAG TATAGCCTGCTATCGACTATCGTTTATC TTTTCAACTATCATT 100 35 FOC41_RS21375 NONE folE 5494830 .. 5494843 + -2.4 -3.73647 TCTATGACGGTTACC GGAA TTTCGT TTCC TTCTTCATCGGTCAG 51 512 FOC41_RS21440 5507960 .. 5507979 + -8.6 -4.12397 TTATAAAAAGACGAA TGTCACCT TATA GGGTGACA TTTATCATTCTATAA 82 166 FOC41_RS21565 NONE FOC41_RS21570 5538028 .. 5538063 + -6.4 -5.01422 TGATCTGTTTTTATA GAACGATGTAGATTC TCACAAT 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FOC41_RS22480 5838389 .. 5838399 + -2.6 -3.33315 GAATTATGTTACAAT TAAA TTA TTTA TTATGAGACTGTTGA 44 51 FOC41_RS22485 5838831 .. 5838846 + -2.6 -3.24771 TTAAAAGATATTTTC TAAGTT TAAT AACTTG TACTTGTTTTTATTT 44 89 FOC41_RS22490 NONE FOC41_RS22495 5841000 .. 5841055 + -15.1 -2.7411 ATATAAGAAATAATA TTGCCACTTGCTACTCTTTGA-TTAG GAATA CTATTTCAAAGAGTGCCAAGTGGCAA TAAGTTTAGTTGTTT 100 53 FOC41_RS22510 5847086 .. 5847138 + -5.6 -3.34895 GTAATCGACACCTTG TCACAGGGGAACT-CTGCCCGTC ATATGCGC GGCAGTCTGCAGTTCCTCTGTGA TTACTTCGGCATAAC 56 37 FOC41_RS22515 5848236 .. 5848246 + -4 -4.59853 TCTTGTCAGCCCTAT TAGA TAC TCTA TTTTTAGAACGTTGG 69 231 FOC41_RS22530 5852208 .. 5852227 + -2.8 -2.80821 CAGAAGAAACCGTAA CTCCACAG CCTG TTGTGAAG TGATCTGTTTACCAA 42 3 FOC41_RS22535 NONE FOC41_RS22540 NONE FOC41_RS22545 5859200 .. 5859214 + -5.8 -3.01726 CGAAATAGATTAAAA CAATAT TGA ATATTG ATTTATATGAGAAAA 57 51 FOC41_RS22550 NONE FOC41_RS22555 NONE FOC41_RS22560 5866276 .. 5866305 + -9.4 -5.32699 AAGTTTATAAGGAAA GAACAATCCGGT TACAGT ATCGGGTTGTTC TTTTTTCATATTTGA 100 65 FOC41_RS22565 5869944 .. 5869994 + -10.8 -3.33744 TTATAAACTATAAAC GCAAGTTCTGTTTTTATAAATGAA GCC TTTGATTATAAAAACAAAGCTTGC ATTTTTAAAAACAGA 85 146 FOC41_RS22580 NONE FOC41_RS22585 NONE rhaM NONE FOC41_RS22595 5881328 .. 5881344 + -4.4 -4.12397 AATATTACTTTTAAG CGGTTG CTTTA CAACTG TTTGTACTTCTATGA 60 91 FOC41_RS22600 5882387 .. 5882415 + -10.3 -5.4505 TCTGTATGAGCCAGA GGCTGCGAATCTT TAT GGGGTTTGCAGCC TTTTTTGTTGCAAAA 100 235 FOC41_RS22605 NONE FOC41_RS22610 5886955 .. 5886973 + -4 -3.83756 TAAGTTTGATTTTAT TTATTAAT CAA ATTAATAG TTTAAATTATAATTT 56 69 FOC41_RS22615 NONE FOC41_RS22620 NONE FOC41_RS22625 NONE FOC41_RS22630 NONE FOC41_RS22635 5896399 .. 5896411 + -3.5 -3.06501 ATTGACACAAAATCC TTATT ATG AATAA TTAAATAACGATATA 46 13 FOC41_RS22640 NONE FOC41_RS22645 NONE FOC41_RS22650 NONE FOC41_RS22655 5904713 .. 5904744 + -12.4 -4.42062 ATTATTAGGGTGGAG TGACGCGGGTTTTT GAAT GAGAATCCGCGTCA TTTGTTTCAAAAATA 100 68 FOC41_RS22660 NONE FOC41_RS22665 NONE FOC41_RS22670 NONE 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AGCGAGGGGTACAAA GGATG GAAT CATCC TTGATATCAACGATG 59 143 FOC41_RS22810 NONE FOC41_RS22815 NONE FOC41_RS22820 5945196 .. 5945217 + -10.9 -4.45068 GCATTAATTTGTTGA CGGAGGTAC GCTA GTATCTCCG TTTCTTGTTCCGGAT 100 51 FOC41_RS22935 5968188 .. 5968224 + -7.6 -2.83396 ATTTCAGGCAAAATA CTATGAGAAACAGCTTT TTGA AAAG-TATTTCTCATAG TGCTATTGCTTTGAA 66 319 FOC41_RS23010 5985188 .. 5985216 + -5.4 -5.31091 AAACAGACAGAAAAA GTCTTTCTATTT CAAAA GAATAGAGGGAC TTTTGTTTTATTGTG 80 189 FOC41_RS23015 NONE truA NONE FOC41_RS23025 NONE FOC41_RS23030 5991920 .. 5991941 + -2.3 -3.83756 TCATTTCCGGTGTAT TTGCTTCCA CACT TTGAAGTAA TTTGAATTGTGCTTT 51 64 recF NONE FOC41_RS23085 6003785 .. 6003807 + -4.9 -2.90571 AACGGTAAGTTTAAC CGTA-CTGCC GTCC GGCAGATATG TCTGCTTACCAGCTT 51 259 mscL 6011404 .. 6011442 + -15.7 -5.1485 TGATTCTAATTAAAA TAAAGGAGATTC-CAAGT ATAA ACTTGTGAATCTCCTTTA TTTTTCTCTTCATTA 100 38 guaA 6013054 .. 6013112 + -25.3 -4.15473 GGGAATAATAACATT -ATCCATCATAAAAATAGCCTCAACAGGA ATT TCC-GTTGAGGCTATTTTTATGATGGATA GTTTTTTTTGATTGC 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GATATACCCCATGAA TTGACCGGAAAACT ATACA ATCTTTCCAGTCTA TACAGTGGGTGTATG 44 201 FOC41_RS24895 6458077 .. 6458120 - -8.2 -3.67112 ATGATAGTTTAACAA CTGTCAAGCTTTCGTTTAAC AGAT GTCAAACGAAAGCTCGCTTG GTAATGAGATAAATA 75 172 FOC41_RS24890 6455400 .. 6455424 - -4.3 -4.56775 ACTTCTGTCTAAAAA GCCTGTTAT GGATCTG ATAGCAGGC TTTTTATGTATCATA 68 86 FOC41_RS24885 NONE FOC41_RS24880 NONE FOC41_RS24875 6447775 .. 6447785 - -4 -3.40403 TTTTGTGGATTAGAA TTGA AGA TCAA TACCAAATGTAAATA 51 9 FOC41_RS24870 6446018 .. 6446075 - -6.5 -4.08216 TGATTTTGTTGAAAA TGGTTTTAATTTTCTCCAATATGCCCT ATCT AAGGCATATTGGAGAAAATTTTATTTA AATTACCACTTAGGA 68 28 FOC41_RS24865 NONE FOC41_RS24860 6442536 .. 6442556 - -3.9 -3.91357 CCATAATGATAAGAA GCCTCTCCT AAG AAAAGGGGC AGGGAGAGGCTTTGA 56 47 FOC41_RS24855 6440878 .. 6440899 - -3.1 -2.74877 AAACTAATAATGAAG CATATTAAT TCTT ATTTATATG TCCTCCTCTTAGCGG 42 34 FOC41_RS24850 6439196 .. 6439206 - -2.6 -2.64695 CTTAATACATAATAC TTAA TAC TTAA AAAAATCACACTCTT 40 31 FOC41_RS24845 NONE FOC41_RS24840 NONE FOC41_RS24835 6434098 .. 6434138 - -18 -5.24531 ATTCTCTATAAAAAA TATCCCGTTATTCAATTT ATAGA AAATTGAATAACGGGACA GTTTTTTGGGGGGAG 100 44 FOC41_RS24830 6433000 .. 6433033 - -11.9 -4.64861 TGTTTTTAAAAGAAA CCCGTAAGTTCTTTGA AGT TCAAAGG-CTTACGGG TACAAAGATATATAT 100 115 FOC41_RS24825 6430936 .. 6430974 - -14.9 -2.98942 ATCCTTTGATATATA CAAAAATAGCTGAAAGA GAGAT TCTTCCAGCTATTCTTG TTTCAGTATATTAAG 100 44 FOC41_RS24770 6419436 .. 6419452 - -2.3 -2.85351 GGCTTCCAGACCATA GTGAA TTCTTTT TTCAC TCAAATGGTGGAGGC 41 102 FOC41_RS24765 NONE FOC41_RS24760 NONE FOC41_RS24755 6416977 .. 6417004 - -11.5 -3.37198 TCCTGATAGATAATA TGTTTCCATCT ATAAAA AGATGGAAACA ATATAATAAATAGCT 88 7 FOC41_RS24750 6414503 .. 6414514 - -3 -4.05677 AAATAATGGAAAGAA GTTT GAGT AAAC AAATGTCTTATGAGG 55 190 FOC41_RS24715 6406732 .. 6406742 - -2.6 -4.41895 AATTGCGAATTAAAA TATT AAG AATA TTGGAATTGTTAGCT 58 91 FOC41_RS24710 NONE FOC41_RS24705 NONE recA 6403889 .. 6403923 - -13.7 -5.8096 TATAAAAAAGAAAAA GGTGGGAGAATGATCG TAAA CGA-CTTTCTCCCACC 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ATTGTCCGGGGA TGAATTATTCAAGTA 100 54 FOC41_RS24550 6373831 .. 6373854 - -2.4 -5.52096 AAATCCAAGAAAAAA GCATTCAG GTATTAGT CTGGATGC TTTTTTATATATATA 75 140 FOC41_RS24540 NONE FOC41_RS24535 NONE FOC41_RS24530 6371266 .. 6371277 - -4.4 -2.91201 AAAAGAGCAGAAGCA GACT AATT AGTC GTTTCATCAGGTGTG 49 16 FOC41_RS24525 NONE FOC41_RS24520 NONE FOC41_RS24515 6368899 .. 6368914 - -4.7 -4.57791 AATGAAAGAAAAGAA GCGAA CCTTAT TTCGC TATGTATTTTTTCAT 69 17 FOC41_RS24495 NONE FOC41_RS24490 NONE FOC41_RS24485 NONE FOC41_RS24480 NONE FOC41_RS24475 6358094 .. 6358107 - -3.1 -3.58446 TAGACAAAAAAACTA TCTGC TTCG GCAAA TGTTTATATGAGCAT 50 29 FOC41_RS24465 6355936 .. 6355970 - -5.3 -2.87621 AAGAATATAAGATTA TAGGATAAGTGCTATAC TTC GC-TAG-ACTTATCCTA TTTTCGTATTACTTG 53 34 FOC41_RS24450 NONE FOC41_RS24445 NONE floA 6351637 .. 6351647 - -2.4 -4.9138 ATGACTGAAATAAAA TCGG ATT CCGG CGTTTGTGAACGATT 63 39 FOC41_RS24435 6350517 .. 6350564 - -7.3 -5.84381 TTATTAATAAAAAAA CAATGGCTTGAATC-TACAC ATATTATCA GTGAAAGATTCAAGCCATTA TACCTTCTTTTAATT 100 87 mnmE NONE FOC41_RS24415 6345255 .. 6345267 - -7.7 -2.91681 TTTCAACTTTACAGA TCCCT TTC AGGGA GGAATTCATGTAGAA 61 190 FOC41_RS24400 6340701 .. 6340712 - -3 -3.11208 GTTGATGCAAAAGTA GAAA ATAA TTTC CATAGTGCTGTCATA 45 174 FOC41_RS24395 NONE FOC41_RS24390 NONE FOC41_RS24385 NONE FOC41_RS24380 NONE FOC41_RS24375 NONE FOC41_RS24370 NONE FOC41_RS24365 NONE FOC41_RS24360 NONE FOC41_RS24355 6329086 .. 6329099 - -3.9 -5.06451 GACTATTTTAAAAAA TATTG CAAC CAATA AATGATGAAAGGAAT 70 466 FOC41_RS24345 NONE FOC41_RS24340 NONE FOC41_RS24335 NONE FOC41_RS24330 6318413 .. 6318439 - -13.2 -5.5112 TGTATGAACAAAAAA TTCCCTTTTTCC TTT AGAAAAAGGGAA TTTTGAAAATATTAT 100 229 FOC41_RS24325 6317769 .. 6317790 - -10.9 -3.57816 AAGACTAATAACCAA GTGACGGCA AAAA TGCCATCAC CCTGCTGTCACCTCT 89 108 bla NONE FOC41_RS24280 NONE FOC41_RS24275 6302438 .. 6302448 - -4 -3.44608 AAACATCGAGCAGAA GATA TTT TATC CCATCACGTTTCCTA 52 402 FOC41_RS24265 6300892 .. 6300904 - -4.9 -2.9518 CTCAAGAGTTAGATA CAAAA ACT TTTTG 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ATATATACAATAAAA GATGCACAGATCACCGATC ATA AATCGATTCTCTGTGCATC ACTACTACTCTAAAA 100 67 FOC41_RS16785 4115709 .. 4115734 - -10.5 -4.75288 TCATACCAAAAGAAA GCTGCAACCTC ATAA AAGATTGCAGC CTGAAATTCTTTATT 100 74 FOC41_RS16780 4114162 .. 4114183 - -2.3 -3.2812 CAGCGAGGACAAAAG CACAAGAAA CCCG TATCTTGTA TTTCGCATTACGCCC 44 43 FOC41_RS16775 NONE FOC41_RS16770 4112083 .. 4112110 - -11.4 -4.63586 ATATTATATACAAAA GCAGCACAAAGT GAAT ACTTCATGCTGC TTTTTATTAATATAA 100 76 FOC41_RS16765 4110974 .. 4111001 - -7.1 -3.25234 TGAATAAACTCAATA GGTGAAACCAA GAAGGT TCAGTTTCACC TGAATTTCTCCCTTG 66 124 FOC41_RS16740 4104242 .. 4104257 - -5.4 -4.72029 TTTAATCGAAGAAAA CCTCTC TTCG GAGAAG ATTGATATTACCTAT 74 413 FOC41_RS16730 NONE FOC41_RS16725 NONE FOC41_RS16720 NONE FOC41_RS16715 NONE FOC41_RS16710 4090767 .. 4090801 - -15.9 -2.69151 TCTTCTTATACACTA TGCCCGCCTATTACT TTTAC AGCAATAGACGGGCA CATAGATGTATTATT 100 76 FOC41_RS16705 4086518 .. 4086537 - -5 -3.10622 GACCTGTAAAATAAG CCCAGAACA CTC CGT-CTGGG ACATTTTTACCAGAG 52 51 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FOC41_RS15985 NONE FOC41_RS15980 3860819 .. 3860831 - -5.5 -2.94416 TAGCTTTATCAGACA GCCAC AAC ATGGC TTCTTTTTATCGTCT 53 32 FOC41_RS15975 NONE FOC41_RS15970 3855524 .. 3855581 - -20.9 -3.11786 TATATCCAATATACA GGGCATATATGCGCAACGTGTTGGATA TATA TGTCCAACACGTTGCGTATATATACTC TACAATTCAGGTATT 100 516 FOC41_RS15965 3851328 .. 3851338 - -2.6 -2.80533 CCTTAAAATTAGAAG TTAA CAT TTAA ACCTACCGAGATGGT 42 8 FOC41_RS15960 3849235 .. 3849269 - -13.1 -4.72617 CCATAAAATAATAAA GGCGTAGACAAGAGAA TCAA CTCTCTT-TCTACGCC TTTCATTCTTTCTAT 100 65 FOC41_RS15945 3845913 .. 3845938 - -13.3 -5.24799 CCAGAAATAGAAAAA GCCTCTTCCGA ACAT TCGGTAGAGGC TTTTTCTATTGATTA 100 150 FOC41_RS15915 3837393 .. 3837411 - -14.6 -5.82281 AAAGATACAAAAAAA GGAGACGC ATC GCGTCTCC TCTCCTAATTTCTTT 100 53 FOC41_RS15910 3835474 .. 3835511 - -13.7 -3.73042 GGGGGGAGTAAAACA TACGAGGTTCCTTTTAT ATAT ATAAAAGAAACCCCGCA GAAGTCTATTTTGTT 100 52 FOC41_RS15905 3834172 .. 3834222 - -10.6 -2.72855 GAAAGGCGCGAATTA CGCAGTTCACACAACTTCTCGA ATACTCA CCAAGAATTCGTGTGAACTGTG 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.. 3126320 - -6.8 -3.45366 TTCTGAATTAATCAA GTCC TGG GGAC AGGTGATATGCTATG 62 413 FOC41_RS13020 NONE FOC41_RS13015 NONE FOC41_RS13010 3120018 .. 3120057 - -13.8 -5.31877 ACCTATGAGAAAAAA TACTCATACCAATGGGAA TATA TTCTCATAGGTATGAGTA TTTTTTCTCATAAGG 100 63 FOC41_RS13000 3117550 .. 3117593 - -8.4 -5.40625 ATATGAGATAAAAAA GACTATTTTAAAGGCCGA AACTCTCA TCTTCCTTTAAAATAGTC TTTTTACATTCCATT 100 70 FOC41_RS12990 NONE FOC41_RS12985 NONE FOC41_RS12980 NONE FOC41_RS12975 3109081 .. 3109098 - -2 -3.31625 TAAACCAATTACCAA TTCGGA TTCTGC TCCAAA TTACCATTCAAATCA 44 1 FOC41_RS12970 NONE FOC41_RS12965 NONE FOC41_RS12960 NONE FOC41_RS12955 3103044 .. 3103080 - -8.8 -4.4595 TTATAAAATGTAAAA TCCCCGGTGTC-CTGTC AAGC AACATCGACACCGAGGA AAATAAGCTGTTTAT 88 37 FOC41_RS12950 3101446 .. 3101466 - -2.6 -3.99324 GCCTATTATCATAAA GACGG-AGT AGAT ACTACCATC TGGTTTGCTTCAGAC 54 403 FOC41_RS12895 3085105 .. 3085115 - -3.2 -4.07687 ATGCCCTGTGCAAAA CACT CGA AGCG GAAGGTCCTTTAAAG 57 445 FOC41_RS12860 3078334 .. 3078353 - -2.2 -3.29704 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.. 2452597 - -7.1 -3.44146 GCTCTCCAGAATGAA TGCTGTTTATC ACATCA GATAAGCAGCA TTTTTTATTAATATC 68 45 FOC41_RS10570 2451703 .. 2451735 - -11.5 -4.53636 ACTATATAACCAAAA TAGTAACGCCATC ACATCAG GATAGCGTTACTA TTTTTATATACTCAT 100 78 FOC41_RS10560 2450413 .. 2450468 - -25.2 -2.63079 CTTCCACAGAAGTGA TTTTATATAAAAAGTGGGGGCAGGAT AATT ATCCTGCCCCCACTTTTTATGTAGAA TATATGATCTATCAA 100 188 FOC41_RS10525 2443948 .. 2443980 - -11.4 -3.41587 TTGTATAAAATTGAA GAGGGAGACAGC CATTGAAAC GCTATCTCCCTC ACATCATTATTAACT 90 67 FOC41_RS10515 2441861 .. 2441902 - -7.4 -5.5074 TAATTGAAGAAAAAA TAAGCCTCCTTGTCAG TCGTCGTATT CTGACAGGAAGGCTCA TCACTTTGACCTTAA 100 68 FOC41_RS10505 NONE FOC41_RS10500 NONE FOC41_RS10495 NONE FOC41_RS10490 NONE FOC41_RS10485 NONE FOC41_RS10480 NONE FOC41_RS10475 NONE FOC41_RS10470 2437759 .. 2437780 - -10.1 -2.71364 TTAGGGTTTTAAGTA TTGGCGGTG CGGA CACCGCCAT CCCGTTCAAAATTCT 77 31 FOC41_RS10465 2437397 .. 2437420 - -11.6 -4.46112 GCTCACTGAAAGAAA GTAGGGCGGC TCTC GCCGCCCCGC CACTCAAAAGCGTGT 100 29 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- -6.1 -2.71503 CCTAACAAGAACGGA GCCTTGGCA GTT TACCAAGCC TTTTTACCAGTTCCC 57 149 FOC41_RS07910 1879447 .. 1879469 - -2.6 -3.37533 CCTCAAAACGACTAA CGATGTCTAT GTA ATGGCCACCG AATACAGTCACGAAA 46 287 pstC NONE pstA NONE FOC41_RS07875 1871694 .. 1871721 - -2.1 -3.18735 TTAATATTCTATCAA TTGGGT--TCCAG ATAC CCGGATTACCCAA AACGTCCCGTTATGT 44 18 phoU 1870884 .. 1870911 - -12.9 -4.42238 TCATTTGAAGCAAAA TCTCCTGTAAC TTGTCC GTTACAGGAGA CAAATATAAGATATT 100 83 FOC41_RS07865 NONE FOC41_RS07860 1869309 .. 1869367 - -25 -4.07568 GTCGTTCCTTTAAAA GGAAAGCATCGTTGGTTTAAAAGGAACG TCC CCTTCCTTTAAAACCAACGATGCTTTCT GTTATATGCTTATCC 100 71 FOC41_RS07845 1866138 .. 1866150 - -2.7 -3.29829 CACAGTTGCTCATAA CACAA ACA TTGTA TTAGTCAAATTCAAT 44 26 FOC41_RS07840 1864959 .. 1864971 - -3.3 -4.18094 CAAACGATTCGAAAA GAACG AAC CGCCC TATACGGCTGCAGAA 60 362 FOC41_RS07825 NONE FOC41_RS07820 1861233 .. 1861248 - -2.6 -3.767 CATTCATTCAGTAAA GTCA-GA TTT TCATGAC ACCGATTCCAGGTAA 51 11 FOC41_RS07815 1859397 .. 1859426 - -7.2 -5.62288 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FOC41_RS07760 NONE FOC41_RS07755 NONE FOC41_RS07750 NONE FOC41_RS07745 NONE FOC41_RS07740 NONE FOC41_RS07735 1840640 .. 1840684 - -7.3 -5.37865 CTAACAATGAAAAAA GAATATCCCCTTGCACATGC AAAGCA GCATGTACAAGGGGAT-TGA AAGTCCTTTATAGGA 100 58 FOC41_RS07730 NONE glgP 1836163 .. 1836200 - -19.5 -5.51046 CAAACAGATAAAAAA TTCAGCCCCTGTCATTCT CAA AGAAT-ACAGGGGCTGAA TGTATGTATGAAAGT 100 76 potA NONE FOC41_RS07710 NONE FOC41_RS07705 NONE FOC41_RS07700 1830329 .. 1830369 - -11.1 -3.51406 GACGATAAATACCAA GCACGGCGAACATCCTGCC ATC AGCATTCTGTTCACCGTGC TTCTTATTTCTTACC 87 99 FOC41_RS07625 1810829 .. 1810849 - -4.9 -2.62983 TTTATCTCCATATTA TCTATTTTA TCA TAAAATAAA AATGTTACCGACTCA 50 30 FOC41_RS07620 1810074 .. 1810103 - -18.1 -2.75713 AATACAGATATATCA TAGGGCAATGATC TAAC GATCATTGCCCTA TTTTGTTTATATTTT 100 303 FOC41_RS07600 NONE FOC41_RS07595 NONE FOC41_RS07590 NONE FOC41_RS07585 1802654 .. 1802670 - -2.2 -4.59511 AACACTGGCTAAAAA CAAACC GGGAT GGATTG ACTTCAACGCTGGTG 64 302 FOC41_RS07570 NONE FOC41_RS07565 1798069 .. 1798105 - -15.3 -6.01187 AAGGAAATAAAAAAA CAAGCCACCGAAATGAG TCA CTCATTCCGATGGCCTA TCCCCTTTAAACACC 100 161 FOC41_RS07525 NONE FOC41_RS07520 1785978 .. 1786024 - -8.2 -2.94561 CCGGAACAAATATCA GCAGGTAAAAATGAAAATAAAC CTC GTTATTTTTGATTATTACCTGC AATAATATTATATTT 68 238 FOC41_RS07515 NONE FOC41_RS07510 1783860 .. 1783908 - -11.7 -3.29511 CGGACGGGGCTACAA CGGAACACCCGTATCGGCTCC TTATACG GGTGCAAATACGGGCGTTCGG GAAAGTTCCTTTCGA 89 137 FOC41_RS07505 NONE FOC41_RS07500 1782900 .. 1782919 - -2.8 -2.62613 TTTTACGGCAAATAT CGA-GCGGT TGT ACCGCCTTG TCGTGCCTTATTCCA 40 86 FOC41_RS07495 1781774 .. 1781801 - -10.6 -4.57516 AGATGTAAACGAAAA GCCGACGGAAGT ACAG ATTTCCATCGGC TTTTTTCATATGTCC 95 54 FOC41_RS07465 1769809 .. 1769825 - -3.6 -2.65271 GATAATGTTATACTA TCAGCC GATTT GGCTGT TATTTTCTTCAAGTA 44 41 FOC41_RS07460 1768740 .. 1768753 - -3.1 -3.28791 ATGTTCGGTGGATAA TCCTC ATTA AAGGA GATTGATCCGCTTGT 46 53 FOC41_RS07455 NONE FOC41_RS07450 NONE FOC41_RS07445 NONE FOC41_RS07440 NONE FOC41_RS07435 1765855 .. 1765866 - -4.4 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.. 1615047 - -9.6 -5.57396 ATAATCAATAAAAAA CGGCAGACAACA AAAAA TGCTGTCTCCCG TTTTGAGCTGTATAT 100 343 FOC41_RS06760 NONE FOC41_RS06755 NONE FOC41_RS06750 1606756 .. 1606766 - -2.6 -2.57468 TTTTATCATATCAAC TAAT TTT ATTA TATGTCATTTATTAT 40 37 FOC41_RS06745 NONE FOC41_RS06740 1602303 .. 1602320 - -2.7 -2.70419 ATTAAAGTTAAACAC TTGCTTT TTCT AAGGCAA AAATAGAGCAATACA 40 149 FOC41_RS06735 NONE FOC41_RS06730 NONE FOC41_RS06725 NONE FOC41_RS06720 NONE FOC41_RS06715 NONE FOC41_RS06710 NONE FOC41_RS06705 NONE FOC41_RS06700 NONE FOC41_RS06695 NONE FOC41_RS06690 1585439 .. 1585465 - -14 -3.40907 CCACATGAATATCAA TTCTCGAAATAA ATT TTATTTCGAGAA TTCCTTAATTCTTTG 100 14 FOC41_RS06680 NONE FOC41_RS06675 NONE FOC41_RS06670 NONE FOC41_RS06665 1579521 .. 1579531 - -2.6 -2.52516 TTTTCTATCAGGAAC TTTA TCA TAAA TAATTCTTCCATTTA 40 100 FOC41_RS06660 1578361 .. 1578400 - -14.6 -3.58208 GGTGATAAGAAGTAA TAAAACAGCTC-TTTCCCT GAA AGGGAAACGAGCTGTTTTT ATATTATTATCCTTA 100 38 FOC41_RS06635 1573836 .. 1573893 - -8 -2.79128 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TTTCTACTCCAACGT 100 29 FOC41_RS04930 1207209 .. 1207238 - -7.9 -5.5353 GATAGCAATAAAAAA GGGTTGTCCGACGT GTC ATATCGG-CAACCC TTTATCATTTATAAA 100 51 FOC41_RS04925 NONE FOC41_RS04920 1205346 .. 1205369 - -9.6 -5.75478 AAGGACATAAAAAAA GCATCGGCCT GGTA AAACCGATGC TCTAACACATTTATC 100 203 FOC41_RS04915 1204563 .. 1204573 - -2.6 -2.73443 CTACTACCATATAAG TTAA ATT TTAA AGTTTATATTCTAGG 40 47 FOC41_RS04910 NONE FOC41_RS04905 1202026 .. 1202059 - -18.3 -4.20981 GTAATAAACGAGAAA GCCCCCGCAGATATT CAAT AATATTTGCGGGGGC TTCTTGATTTAAAGA 100 46 FOC41_RS04860 1192294 .. 1192321 - -5.6 -3.29147 CGCAATAGAATTGAA CTTCCCGGAT CAGTCTAC ATTCGGGAAG TTCTTTAAAAGGAAT 56 93 FOC41_RS04850 NONE FOC41_RS04845 1188784 .. 1188818 - -9.6 -5.74122 TATTATATAAAAAAA TAAAAGACTACCTT TCAACCG AAGATAGTCTTTTA TCCGTATATCATTTT 100 45 FOC41_RS04840 NONE FOC41_RS04835 NONE FOC41_RS04830 NONE FOC41_RS04825 1184836 .. 1184852 - -2.3 -2.78032 CTTTCTGCAAAACAT CTTTTTT ATG AAAATAG GCCAATACTTAACGT 40 84 FOC41_RS04820 1184332 .. 1184363 - -17.4 -3.72742 TGAGGATTAACAGAA GAAAGGCGCGCTAG TTAC CTAGTGCGCCTTTC TCTATTACTGTATAT 100 51 FOC41_RS04815 1183128 .. 1183138 - -3.2 -4.46775 TATTGAAAAGATAAA CTCC CAA AGAG AAAGAAAAGACAAAA 60 124 FOC41_RS04790 NONE FOC41_RS04785 NONE xylA NONE xylE 1173355 .. 1173393 - -11.2 -5.27938 AGTTTCAAATAAAAA CAATTATGACACCATACC ATT GGTACGATGTCATAATCT TAATAGAACCATGCC 100 87 FOC41_RS04765 1170174 .. 1170228 - -21.7 -4.2717 AGTATTCTATCAAAA GGGCGTCACTATATGCCCCGGATAG TGACG CTATCCAAGGCATATAGTGACGCTA TCCGGACAGCATAGC 100 51 FOC41_RS04755 NONE FOC41_RS04750 1164915 .. 1164968 - -16.3 -3.49168 ATTATAAGTTAAACA TAACGAGCTACAAGTGCCGTGCGTAA ACT TTGCGCA-GCTACTTGTAGCTCGTTA CCTGTAGCCTACTTG 100 48 FOC41_RS04745 NONE FOC41_RS04740 1163143 .. 1163167 - -4.3 -3.79747 GCAGGTATCAGCAAA TAATGAGAAGC AAA GCGTTTCATTA CAATCAGTTGTTTGA 58 29 FOC41_RS04735 1162634 .. 1162664 - -4.1 -3.74762 AATATGTATGAACAA CCATTAACGGCCAA TGGC TTGATCG-TAATGG GAAATGAAGGGAATG 55 140 FOC41_RS04725 1159132 .. 1159164 - -10.1 -3.61428 AAAAACAAATACGAA 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FOC41_RS04425 NONE FOC41_RS04420 1110572 .. 1110585 - -9.5 -4.87318 TTTAAAACTTAAAAA GCCCC TACC GGGGC TAATTAAGCGTAACT 100 58 FOC41_RS04415 NONE FOC41_RS04410 NONE FOC41_RS04405 1108376 .. 1108413 - -16 -3.53224 GATTTTTGGTGCAAA TTTAAAGCCTGTTTAA ACTCAA TTAAACAGGCTTTAAA TTTAATCAATGATCA 100 27 FOC41_RS04400 NONE FOC41_RS04395 1096046 .. 1096075 - -12.9 -2.79098 TCTATCTATTAATCA TGAGGGGTATCGA ATAA CCGATACCCCTCT TCCTATTATTTTATC 100 31 FOC41_RS04390 1094003 .. 1094030 - -12.9 -3.50332 CAGTTAGATAATCAA TAATGGGTAGC AAGAAA GCTACCCATTA TTTCATCTCATCGCA 100 28 FOC41_RS04370 NONE FOC41_RS04365 1088181 .. 1088201 - -11.1 -4.7497 CGTATGTATTAAAAA GGAGCGGGA TTA TTCCGCTCC CTGTTATATAATAAT 100 47 FOC41_RS04360 NONE FOC41_RS04355 NONE FOC41_RS04350 NONE FOC41_RS04345 NONE FOC41_RS04340 NONE FOC41_RS04335 NONE FOC41_RS04330 NONE FOC41_RS04325 1078316 .. 1078339 - -13.2 -4.84918 TTTATAAACATAAAA GCCCCGACTA CACT TAGTCGAGGC TCATTCCTTTTGGAG 100 131 FOC41_RS04300 1074433 .. 1074444 - -3 -4.07885 TATTTCTTTTTAAAA TGAA 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