gyrB 4893 .. 4921 + -10.5 -5.18371 TGGATGTGTAAATTT ATCATTGAAGAAA TCA TTTCTTCAATGAG TTTTGTTTTGTAAGA 100 30 LT41_RS00030 7997 .. 8029 + -2.4 -5.48163 GTAGTATTATCGCCA TGTTTTTATA-ATTT TTGC AAATCTATAAAAATA TTTTTTAATTTATTT 70 15 gltB NONE gltD 14154 .. 14170 + -2.9 -5.20328 ATAAATTCTTTATGA GCTTTTG TGC CATAGGC TTTGTTTTTTTCAAA 71 93 ilvD 17477 .. 17499 + -13.6 -4.03815 GCGGTTTTAGATATG GAATGAAAGG CTT CCTTTCATTC TTCTATTTCTTTGGT 100 20 queC 20259 .. 20269 + -5.4 -4.7497 GATCAATTACGGCAA TCAC ATT GTGA TTTTTGCTAAGTGCA 74 198 purB NONE nrdA 30358 .. 30376 + -5.3 -4.11484 CAATAAATACTAAAA CCCAATG AAAAA TATTGGG TTTTAAGAGATTAAG 64 35 pyrG NONE recJ 35817 .. 35827 + -2.6 -4.95876 TTGTTGTTAAAGAGA TTTT ATA AAAA TTTTTACTTATAATT 63 18 ansA 36902 .. 36917 + -3.4 -5.18561 AAATTCAAGAGTATT TTTTAA AATA TTAAAA TTTTTTAAATATTTC 69 12 LT41_RS00145 NONE LT41_RS00150 NONE LT41_RS00155 39464 .. 39486 + -7.8 -4.56187 TTAATATATATACTT CCTTTAGGTT TTA AACCTAAATG TTCTTTTTAATTATC 86 208 LT41_RS00160 42733 .. 42743 + -5.4 -4.57341 AATAAAGCATCACTT CCTT GTT AAGG TTTTTAAGAAGACTT 70 41 rrf 43132 .. 43152 + -4.9 -4.48299 AATTAATAATCAGTT TTTTTAGTT TGT AATTAAAAA TTTATTTACATGTAA 66 68 LT41_RS00175 NONE LT41_RS00180 NONE LT41_RS00185 51753 .. 51784 + -8.8 -4.4767 GAAAAAATTCCATAG TGCCAAGCTAAGCT TTAA AGCTTAGCTTGAAA TTTTATCATCAGTCC 86 15 LT41_RS00200 55139 .. 55171 + -15.1 -3.4072 TTTAGCCAAAGATGA GGATTAATTTTGGGC TAA GCCCAAAATTAATCA TTCTCCTGGGAAGTG 100 19 LT41_RS00220 NONE fliK NONE flgD NONE flgE 63686 .. 63705 + -4.4 -5.1286 CCATTAATATGAAAA GATAATTT TTAG GAATTATC TTTTTCTAATTTTTC 75 21 ffs 66778 .. 66792 + -5.7 -3.56568 GTGTTTTGGCCTATA CCTAC TCCTT GTAGG TTTGGAAGATAATTC 62 237 LT41_RS00255 67131 .. 67143 + -2.7 -3.87364 TCAAATTCTCTTATT TAGCT TAT AGTTA TTCTATTATTGTGGC 50 225 LT41_RS00260 NONE LT41_RS00265 NONE LT41_RS00270 67923 .. 67936 + -2.3 -2.70528 ACACACTATTTCTTT GCTTC CATT GCAGC TCATATATCAGTAAT 39 114 LT41_RS00275 68202 .. 68231 + -13.9 -3.48395 TTAGGATTTTATTAA TAATTTCTAGGAA TTAA TTCCTAGAAATTA TTCTATAAAACCGCT 100 26 LT41_RS00300 72554 .. 72564 + -2.6 -4.73105 TTATGGAGAAAATTC TAAA AAT TTTA TTATTTTTTATCCAT 58 23 LT41_RS00350 NONE sppA 81672 .. 81682 + -2.6 -4.21954 ATTTTTGTAATATTT TTAT GCA ATAA TTATTTATATCTTAG 54 63 LT41_RS00360 82755 .. 82788 + -9.1 -5.25799 CTTAGTCTTTAAGCT TAATGTCCATTTTAT TATT GTAAAATGGACATTC TTTTTCTATTGTTTT 100 36 LT41_RS00410 NONE cydA NONE cydB 93967 .. 93982 + -9 -3.7574 CAAAATATTGCAATT TGCCCA TTTT TGGGCA TCTTTTAATCATAAA 81 195 aspA NONE dcuA 98618 .. 98634 + -4.5 -3.73775 ATATTCATTTTTAAT TTTCTTT AAG AAAGGAA TTTAATGAAGATAAA 56 112 LT41_RS00445 NONE LT41_RS00450 NONE lpoB 101058 .. 101078 + -5.4 -5.77632 GAATAAAATTTTTTA GCTCAAGT GTTTA GCTTGGGC TTTTTTTATGATTTT 90 58 LT41_RS00460 NONE LT41_RS00465 103661 .. 103690 + -11 -2.82773 CTAGGCTTTTAAATT TTTAGAGTTTGA TTTTTC TCAAACTCTAAA CTCTTTCTTAAATTC 84 29 rplU NONE rpmA 104390 .. 104421 + -13.2 -3.89617 GTATATCCTGCATAA GTTTTTAGGACGCT TTTT AGCGTCTTGAAAAC TTTAAATTTATAAAT 100 26 obgE 105548 .. 105586 + -7.6 -5.0133 AAAATTTTAACAATC TAGGAAGTGTTTTATATT AAA AATTTCAAACACTCCCTA TTTTTTCAAAAAATA 90 40 proB 106453 .. 106465 + -3.5 -3.53012 TCAAATAAGCTATAA TTAAA ACT TTTAA TTTCACACAAAGCGA 50 67 fmt NONE birA NONE LT41_RS00500 108783 .. 108799 + -4.5 -2.65223 TATCAAAATTTGGCG TATTCTA TAT TAGGATA ATTATAATGGGGTTA 48 8 LT41_RS00505 109655 .. 109673 + -3.2 -2.72558 TAACCAAAATCTTAG CTTTTTTA TGG TAAAATAG TCCTTCAAAAATTCT 42 38 LT41_RS00510 NONE LT41_RS00515 NONE atpH NONE atpA NONE atpG NONE atpD NONE atpC 115388 .. 115399 + -4.4 -3.27786 TTCAAAACTTGATAA TGCA AGGA TGCA TTAATGAATTTTGAA 51 10 LT41_RS00545 NONE LT41_RS00550 NONE LT41_RS00555 NONE tolB 118365 .. 118377 + -3.5 -3.35867 TGGTAAAAATTTCAA TTTTA GGT TAAAA TTAATTAAAAATTAG 49 35 pal NONE LT41_RS00570 NONE slyD 120450 .. 120475 + -2.5 -4.33258 TGTGGCGGCGGTGGT TGCGGTTGTCA TTAA TGAAGACTGCG TTTATATTTCCAGGT 54 11 fabD NONE pfs NONE LT41_RS00590 NONE LT41_RS00595 123343 .. 123363 + -2.5 -3.21099 TATGGTATTGAAATT GTTTAATGC AAG GCTTTATAC TTCATACTCAAAAAG 43 20 recO NONE ybeY 124458 .. 124468 + -2.6 -3.09288 TTTTTGCCGATTTAC TTTA GAA TAAA ATTTATTCCAAGGTG 42 117 LT41_RS00610 125487 .. 125499 + -6.3 -4.44461 CCTATCATGAGTCCA TCACA TTT TGTGA TTTTATAAACTTCTT 74 333 tyrA NONE LT41_RS00655 NONE lpxC NONE LT41_RS00665 NONE thrB NONE LT41_RS00675 NONE infB NONE rbfA NONE rimP NONE LT41_RS00695 NONE LT41_RS00700 143818 .. 143828 + -2.6 -4.09685 TGATAAAGCCAAGTC TTTT AGT AAAA TTTTCAGCAATAAAG 53 178 LT41_RS00720 148458 .. 148486 + -12 -4.90917 GGTTTTAATTAATCA TTTATACCTAGT AAAAA ACTAGGTATAAA TTTTTCCTTCAATTT 100 33 LT41_RS00725 150378 .. 150392 + -8.6 -3.92602 CTAAATAAAAATAAA GTTGCT TTT AGCAAC TTTATAAAATCTTAA 82 37 miaA 164801 .. 164811 + -4 -4.78107 ATCGAAAAATAAATG TTCT ATT AGAA TTTTTACTCCTAGTA 65 29 LT41_RS00835 165655 .. 165702 + -8 -2.79289 TATTTTGTAGAATAC GAATAGCTTTTGATATAAGTCTA TTA TAGACTTATATCAAG-GCTGGGC ATTATTGAGCTGGTG 68 112 sodB 167006 .. 167023 + -2.7 -3.2891 ACAAACTAAGCAAAA CAAGTGG AAAA TTACTTG ATTTTGGTTGTGGAA 43 215 LT41_RS00880 NONE LT41_RS00885 NONE LT41_RS00890 NONE LT41_RS00895 NONE LT41_RS00900 NONE LT41_RS00905 179076 .. 179096 + -2.5 -4.35524 TTATTTCTTAAGGAG CTTCATTGG ACC CCAGTCAGG TTTTGGATTTAAACC 54 119 LT41_RS00910 180437 .. 180454 + -8.5 -4.97405 AATAAAGATGAAGAA TAAGCCT CTTT AGGCTTA TTTCTTTTTGTAAAT 100 23 folE NONE fliI 191679 .. 191689 + -2.6 -4.69549 ACTTTACGCATAGGA TTAA GTT TTAA TTTTACTTTTAAATT 60 371 LT41_RS01010 198860 .. 198876 + -5.2 -4.62069 GAACTTTTGATTTTT CAATGA TTGGT TCATTG TTTTATGATATTTTT 70 52 LT41_RS01015 201018 .. 201033 + -9 -3.80858 AAGATGCTTAATTTT TGGGGT TAAA ACCCCA TTTAATCCATTCTGA 81 30 uppP NONE thrS NONE infC 204339 .. 204364 + -10.5 -4.19276 GTAACTCCAAAAAAA GCTTAATCCAC TTTT GTGGATAAAGC TTTTAAAGGTTTTAA 93 20 LT41_RS01035 205603 .. 205617 + -7.2 -4.12188 GATCCAAAGTTATTT TCAAGA ATA TCTTGA TTTTGCCAGTAATAA 75 154 argC NONE LT41_RS01050 NONE argB NONE argD NONE LT41_RS01070 213989 .. 214004 + -4 -5.72622 ATAGTATTTAAAGAT GACTTT TTAA GAAGTC TTTTTTCTTTGTAGA 86 145 cynT NONE LT41_RS01115 221674 .. 221694 + -11.3 -5.40072 GCAAAAGCTAAAAAA TAGCAAGAT TTT ATCTTGCTA TTTTTTTAAACCGGC 100 23 rpmI NONE rplT 226548 .. 226585 + -8.7 -5.1615 CTTTGATTTTTTAGT ATAAGAATTTCAAGATT TTTG ATTCTTGAAATTCTTAA TTTTTTCAGTATTGA 100 35 cheP 229589 .. 229605 + -10.9 -2.62024 ACAAAAAAGATTAAA GAGCCTT TTT AAGGCTC TAAATTGTAGTGATG 82 27 cheQ 230532 .. 230547 + -4 -4.04474 ATAAGCAAAATTCCA CCTATT TGAA GATAGG TTTGTATAGAAGTAT 58 463 moaC NONE LT41_RS01190 NONE LT41_RS01195 233489 .. 233506 + -8.5 -3.20326 TTCGTTAAAAAATAA TATCCCA TTTT TGGGATA TTAAATATCTATTTC 73 26 eptC NONE dgkA NONE LT41_RS01215 NONE pyrC 237889 .. 237912 + -6.8 -4.75219 TTTCAACAAAAGAAC TTACAGCTTC TTTA GAAGTTGTGA TTTTGTTCATGCTTA 83 401 zupT 241671 .. 241688 + -9.9 -3.33399 TTTGCTTGGACAATA GAAAGCC TTGC GGCTTTC TTAAATTTAGTTCGC 82 25 LT41_RS01275 NONE bcp NONE LT41_RS01285 250319 .. 250333 + -4.4 -5.07971 AATTTTTAATGATTT TTTTAT ATA ATAAAA TTTTTAATTGTTTTC 72 74 fabZ NONE lpxA NONE clpX NONE mreB NONE mreC 254779 .. 254806 + -2.2 -3.88559 AGCAGAGTGTTTATT TTTTAAAATTAT ATCG ATAATTTCAAAG TTTATAAAACTAATT 49 202 carB 258123 .. 258136 + -2.5 -3.64703 TTTGCAAGAGTGGCT TAAAT CTTG ATTTA TTTAGCTCAAACAGA 46 16 LT41_RS01320 259045 .. 259059 + -5.8 -3.08812 CCTGCATTTAAAGCT TCAAAA CAT TTTTGA CTTTGTTCAAGAGAA 57 519 surE NONE LT41_RS01380 NONE LT41_RS01385 271177 .. 271201 + -5.1 -2.64218 ATGTATTTTTGATTT GAGTAAAGTGA TAT TCATTTTAATC CTTGTACTAAAAAAT 50 498 LT41_RS01405 274055 .. 274067 + -6.3 -4.34947 TTTAGAAATTCCTCT TCACT AAG AGTGA TTTTAATAATATCTT 74 213 bioA 280839 .. 280853 + -2.8 -5.10516 AAAATGATATCTAAG GCTTTA TAA TCAAGC TTTTCTTTGATTTTT 66 382 rplY NONE pth NONE LT41_RS01475 NONE lysA 285251 .. 285266 + -3.4 -4.5536 CTTTAGAAGAGAAAT TTTTAA AGGC TTAAAA TGTTTTTTTTAGATG 58 12 LT41_RS01485 NONE pheA NONE hisC NONE fliF NONE fliG NONE fliH NONE dxs 293653 .. 293669 + -3.1 -4.53777 AATATAAACTTCTTT TAATGAA AAT TTTATTA TTATTTTTACTTAAA 58 60 perR 294126 .. 294160 + -10.3 -3.02632 TTAAGCAAAATAAGG TTAAAATAACCCATA TATTT TAAGGGTTATTTTAA TGGTTTATGAAATTC 79 37 LT41_RS01525 NONE ubiE NONE xseA NONE serC NONE LT41_RS01545 298653 .. 298665 + -4.9 -2.80575 TGGAAAGCTAAGAGA GAATT AAA AATTC TCTCCTCCAAATTTT 50 19 ahpC 302767 .. 302781 + -7.1 -5.30199 ATTTCTTAGTATAAA GCCTC TTTAC GAGGC TTTTTCTTCATTTTT 95 40 flhB 303998 .. 304017 + -5.8 -2.92712 TATTTTGTTAATAAG CTCAAGAA CCGA TTTTTGAG TACTTGTATCTGCTG 56 64 LT41_RS01605 NONE LT41_RS01610 310846 .. 310856 + -2.6 -5.79595 GGATTTACTAAAGTA TTTT TCT AAAA TTTTTTCTTTTCCAA 79 200 LT41_RS01630 315088 .. 315098 + -4.6 -3.95653 CTTACACACACTCTT CGCT CTT GGCG TTTCTAAACTTCTTT 60 143 trpE NONE trpD NONE trpF NONE trpB NONE trpA 320559 .. 320571 + -3.5 -2.83915 ATTTTATATTTACTA TAATT TTA AATTA AGTTTTTTATAAAGG 45 60 LT41_RS01660 NONE fliN NONE LT41_RS01670 322145 .. 322155 + -5.4 -3.12962 TGATTGATTGCTAAT GCTA TGG TAGC TGGTTTTGCAATTTT 55 47 LT41_RS01700 326834 .. 326855 + -11.7 -3.97446 CTATAAGGTTCCAAA CAAGCTCTA TTTT TAGAGCTTG TTTAAATTTCTTTAT 100 35 glmM NONE lspA NONE hemJ 329337 .. 329354 + -3.5 -4.46212 ACCAAATTCAGTTGC GATTAAA GCAT TTTGATC TTTTATGATGGCACC 61 208 LT41_RS01725 331270 .. 331284 + -2.8 -3.94846 AAAGCTTCATCTTTA TTAAGC TTG GCTAAA TTTACATTTTGGTAA 51 420 rpsU 339066 .. 339077 + -7.2 -5.4251 GACTCTAACCCAAAA GCCC GAAA GGGC TTTTTTATATCTACA 95 33 LT41_RS01760 NONE LT41_RS01765 NONE LT41_RS01770 NONE LT41_RS01775 NONE LT41_RS01780 NONE LT41_RS01785 NONE LT41_RS01790 345744 .. 345757 + -5.3 -2.73203 AAAGCTGCAAAAATA CCTAA AATT TTAGG ATAATTTTTTGTTTT 52 356 der NONE aroK NONE trpS NONE serS 355268 .. 355282 + -2.2 -4.59109 AATTCATATTCCTGA TGTTTT GAA AAAATA TTTTTAAAGAGTATA 57 4 pflB 357765 .. 357784 + -9.4 -4.87893 AATAACAACTAAAAA TGCTTAGA AATT TCTAAGCA TTTTTAGTTAAGCTT 100 29 gatC 364394 .. 364404 + -3.2 -4.07877 AGAATGATTAACTTA GCAT TTA GTGC TTATTTGTAGAATAA 54 34 LT41_RS01900 NONE fur NONE lysS NONE glyA NONE LT41_RS01920 NONE LT41_RS01925 369611 .. 369632 + -2.5 -4.63542 TTGCAAAAGATGCTT TTTC-TTTTA CTT TAAAATGAAA TTTTTAGCAGTTATA 58 6 aroE 370438 .. 370450 + -4.9 -5.36441 GTTATTTTTCTTGTA TAAGA AAA TCTTA TTTTTTGTGTGAGAA 80 48 lgt NONE frdC NONE frdA NONE frdB 375843 .. 375863 + -10.5 -2.57881 AGAAATAAATAAATC TTTCCCCTT TTT AAGGGGAAG ATTATGAAAGAATTA 81 29 LT41_RS01960 NONE LT41_RS01965 NONE LT41_RS01970 380563 .. 380584 + -6.7 -4.5287 TTAATTCTAAAGATA TAGAGCTTT ATTA AAAGTTCTA TTTTCATTACTTTCA 76 12 LT41_RS01975 NONE LT41_RS01980 383170 .. 383195 + -13.5 -2.72973 TTAGCTTGATAATAA CTTGAGAGTTT TTGA AAACTCTCAAG ATTATAAATTTTTAA 100 32 LT41_RS01995 384919 .. 384933 + -4.4 -5.0916 TAATGATTTGTTATG TTTTAT CTA ATAAAA TTTTTATATTGAAAA 72 48 LT41_RS02000 385550 .. 385572 + -11.4 -4.10363 AAAAATAATTTTTTA GTCTAAGAGT CTT GCTCTTAGAC TTTGTAAATTTTTAT 95 33 LT41_RS02015 NONE LT41_RS02020 NONE LT41_RS02025 388340 .. 388355 + -3.4 -2.72144 ACAATTTCTTAAAAA TTTTTA TAAG TAAAAA ATTTAAGGAAAATCA 42 125 LT41_RS02030 NONE LT41_RS02035 390306 .. 390357 + -3.2 -3.30159 TAAAAAGGAACGCTT TTTGCTTGTATAGTTTTTGCATAT TTTG AAAGGAGAAAACTATGCAGGTAAA TTATAGAACGATTAG 47 59 LT41_RS02040 390737 .. 390751 + -10 -4.84539 GCAATTTAATCAAAA GCTCCA TTT TGGAGC TTTTATATTTACTTG 100 32 LT41_RS02050 NONE LT41_RS02055 393659 .. 393676 + -2.8 -5.08255 TTTTTTATAAATCTT GTTTTT TAATTT AAAAAC TTTTCTTTTAAAAAT 63 242 LT41_RS02060 NONE LT41_RS02065 NONE LT41_RS02070 395865 .. 395887 + -7.8 -4.56187 TTAATATATATACTT CCTTTAGGTT TTA AACCTAAATG TTCTTTTTAATTATC 86 208 LT41_RS02075 399134 .. 399144 + -5.4 -4.57341 AATAAAGCATCACTT CCTT GTT AAGG TTTTTAAGAAGACTT 70 41 rrf NONE gpmI NONE fabG NONE LT41_RS02105 404760 .. 404792 + -13.9 -3.53262 ATTTTATTAACTATA TATTAATTAAGATAA ATA TTATCTTAATTAATA TTAACTTTTTGTTAT 100 51 sdhA NONE sdhB NONE sdhC 408734 .. 408752 + -10.3 -3.65084 AAAATTGCATAAAAA CATGGGC AAAAA GCCCATG TTTAAAGATTTAATT 84 29 acpP 409789 .. 409801 + -2.7 -3.51329 CTTGCAAGGAGCTTA TTCTT GAA AAGAG TTGTAGTTACAGGTA 46 49 fabF NONE accA 411965 .. 411983 + -6.2 -2.98545 TTTACTTCGCTTTTT TAAATAAT TTT ATTATTTA TAATTGTTATCAAAA 59 44 LT41_RS02155 NONE LT41_RS02160 414851 .. 414881 + -10.6 -2.51207 AAAATTAAAGATTAT TTAGGTTAAACCTT AAA AAGGTTCAACCTAG GATTTTAATGATCTG 81 22 rpe NONE dnaQ 418252 .. 418267 + -3.4 -2.97653 GGGAAGATTTATAAA TTTTAA TACT TTAAAA ATTTATACTCACCCT 44 151 thiC 419933 .. 419943 + -4 -3.60818 TTATCTTCACTAAAG TCAA ATT TTGA TTTAGCGGCTTTTAA 53 351 nusA 424964 .. 424985 + -8.9 -5.24129 GTTTAAAATTTAAAA TATTTGTGA ATTT TCACAAATA TTTTTTATAAAACCA 100 28 LT41_RS02235 NONE LT41_RS02240 NONE recG 430293 .. 430313 + -8.4 -3.2614 AAAGGTAAAAAAAGA TTTGGCAA AAAAA TTGCCAAA TTAATGTCCGCCGTA 73 1 nssR NONE LT41_RS02260 432095 .. 432106 + -3 -3.10775 TTGAAAAAAGGTTGC TTCA TGCT TGAA CTTTTAAATACCGAT 44 15 LT41_RS02265 NONE LT41_RS02270 433609 .. 433619 + -3.2 -2.56596 CTTACTTTTATTTTT GCTG GTT TAGC TCAGTTGGTAGAGCA 42 117 LT41_RS02275 NONE LT41_RS02280 NONE LT41_RS02285 433924 .. 433950 + -3.8 -3.01708 TAAAAGAACTGGGAG CTGTATTTTAAA ACC TTTAACTTACAG TATATATCCCATTTA 46 47 LT41_RS02290 NONE tuf 435354 .. 435382 + -9.7 -5.00884 TTATTAAATAATTTA ATAAAGCCAAGTT AAA AGCTTGGCTTTAA TTTTTTAAGGAAAAT 100 30 rpmG NONE LT41_RS02305 NONE secE NONE nusG NONE rplK NONE rplA 437597 .. 437616 + -7.9 -5.09259 CTTGATATGAAATAA GAGTTGC TTTTTT GCAACTC TTTTGTTTTAAAATA 95 26 rplJ NONE rplL 438647 .. 438670 + -10.4 -6.20267 GCTTTAAAGTTAGAA GAAGATTTGC CAAG GCAAGTCTTC TTTTTTTATTTTTAC 100 47 rpoB NONE rpoC 447427 .. 447446 + -10.8 -3.18239 AATAAAACTCTATTT TATAGCCC TTCG GGGCTATA TTAATACAGTGTATC 85 36 LT41_RS02355 NONE LT41_RS02360 NONE LT41_RS02365 450995 .. 451011 + -8.1 -4.89063 ATAGGTTATGCCATT TTTGAAG TGC CTTCAAA TTTATTTTTGCATAA 89 244 LT41_RS02375 NONE fucP NONE LT41_RS02385 NONE LT41_RS02390 NONE aldA 456661 .. 456684 + -11.2 -2.92851 AAACAATGATTTTTA TCCTATCTAA ATTT TTAGATAGGA GTTATTATAATCTTG 84 32 rpsL 457382 .. 457398 + -5.2 -3.53744 AATCATTCATACAGA CAAATC CGTTA GATTTG ATTTTGTTTGAGTAA 59 39 rpsG NONE fusA 460004 .. 460019 + -10.4 -4.10164 ACGGTTAAATTTTTA GCGGGA TTTT TCCCGC TTTCTGTCCTCGTAG 93 33 LT41_RS02415 460097 .. 460111 + -4.2 -3.50808 GAATCTCGCCGTGGA CACCAT TTT ATGGGG TGTTATTATGATAAA 54 21 LT41_RS02420 NONE LT41_RS02425 NONE LT41_RS02430 NONE LT41_RS02435 NONE trpC 463342 .. 463352 + -5.4 -4.05788 AAAGATGAAGGAAAG GCTT TAA AAGC TTTGCTTTAAGGAGG 64 5 LT41_RS02445 NONE mnmH 465072 .. 465087 + -3.4 -2.99449 TTAAATTTATATTTT TTTAAA TCAT TTTAAA TATAATTATCTCGCA 44 252 LT41_RS02455 466358 .. 466376 + -3.9 -4.7254 AGAAAAAGCTTATAC TTTAGCT TAGTT GGCTAAA TTTTTACTAAAAAGT 62 16 alaS NONE maf NONE pbpA 474395 .. 474424 + -13.9 -2.80411 GAAAGCGAGATTATA TTTTGAAAGTAGA AAGA TCTACTTTCAAAA TGATTAAGCTTTTTT 100 20 LT41_RS02500 NONE purC NONE purS NONE purQ 480468 .. 480482 + -2.2 -4.75309 AAAATGCTTAAAGGC TTTTTA TTT TGAAAA TTTTATTAACTTTAA 60 14 LT41_RS02520 NONE plsC NONE crcB 482730 .. 482752 + -2.1 -2.74322 AATTTACTTTAGAAT TTGTATTTT TTGCT AAAATACCA CTTTAAAAAATTACA 39 48 htpG NONE LT41_RS02540 484900 .. 484915 + -3.2 -3.21595 TAGATGGCGGAATGC TAGCCC TTAA GGGTTG TTAATGCTAGGAATT 45 6 LT41_RS02545 485595 .. 485607 + -6.3 -4.00526 AAAGTATACTTTTTG GTACT TTA AGTAC TTTAATTATGCAATT 68 267 LT41_RS02580 493749 .. 493784 + -10.8 -2.63637 ACTTAATTAAAAATA TTTAAAGTTTGTTTGA AAAC TAAAACAAACTTTAAA CTTACTCTTGCATTT 82 31 icd NONE mdh NONE sucC NONE sucD NONE oorD NONE oorA NONE oorB NONE oorC 501870 .. 501886 + -10.9 -3.80893 CATATTCATAATAAA TTCCGCA TCA TGCGGAA TTTAACTTCTAAAAT 89 30 LT41_RS02625 NONE LT41_RS02630 NONE LT41_RS02635 NONE hemA NONE proS NONE LT41_RS02650 NONE hemC NONE ubiD 509860 .. 509880 + -2.7 -5.0065 TTTTGCTTATTATTT TTTTATTAT TGA AAAATAAAA TTTTCTTTATAGGTG 63 76 flaG NONE fliD NONE fliS NONE LT41_RS02680 513076 .. 513094 + -6.6 -2.85366 GTTACCAAAATCGCT GGTGGGCT TTT ACCCCGCC GTTTCACCTTTTCCA 61 182 efp 513931 .. 513951 + -2.6 -5.24449 AATAATACAAAAAAA GCTTTTGGA CTAT TCCAA-GGC TTTTTTAAATTTATA 66 36 LT41_RS02695 NONE LT41_RS02700 NONE LT41_RS02705 516817 .. 516835 + -3.3 -4.10161 AAATATATTTTTTGA TATTATA AGCCC TATAATA TTTTAAAGGATGATA 54 116 LT41_RS02710 NONE LT41_RS02715 NONE LT41_RS02730 522265 .. 522282 + -8.5 -5.56372 TTCTGTGCTTTAAAA TTTAGCC TTTG GGCTAAA TTTTTATTTTAGTTT 100 28 LT41_RS02735 523757 .. 523781 + -8.7 -5.28315 AAAAGAATTTTTAAA GATCTATCTTT ATA GGAGATAGATC TTTTTTAAATTTTAT 100 11 dnaB 526296 .. 526309 + -2.5 -3.36166 TTAATAAAATAAGTT TTTAA TATT TTAAA GTTATTTTTTACGAC 44 43 LT41_RS02750 NONE LT41_RS02755 527146 .. 527173 + -6.9 -3.74693 TAAAACTTAAAAATT TCACTTCCCCC TTGACT GGGGGGGGGGA TTTGATAAAATACAA 69 31 LT41_RS02760 527400 .. 527419 + -2.2 -3.5393 AATATATCGAACTCA TTTTAGAA GAAT TTCAAAAA TTTGGAGGAAATAGT 45 132 LT41_RS02765 528330 .. 528340 + -4 -3.53012 GGAACATCTTATCTT TCAT TTG ATGA TTTCAAAAAGAAAAA 50 409 LT41_RS02785 NONE LT41_RS02790 NONE LT41_RS02795 532575 .. 532595 + -5.5 -4.08692 AGTCTATTTAAACAC GCTTTGAAA GTT TTTAAAAGC TTTTAAAAAAGCTTA 64 61 LT41_RS02800 NONE LT41_RS02805 NONE LT41_RS02810 533838 .. 533875 + -7.2 -5.055 CATTTGGGTAAAAAG CTTAACAAAAGTGCTT AAATTA AAGCACTTTGATTAAG TTTTTTAAAACTTAA 90 8 LT41_RS02815 534335 .. 534389 + -9.1 -3.37761 TGGAGTAATTAAGGC GTATTAGAAAATTTAA-CAAATCTAC TAAG GTGGATTTGATTAAGTTTTTTAAAAC TTAAATTTATTAGAA 77 19 LT41_RS02820 534763 .. 534775 + -9.1 -3.08046 CTTTGACTTCGCAAT GTGGC AAA GCCAC CTTTTGCGATAAAGA 74 35 LT41_RS02825 NONE LT41_RS02830 535605 .. 535637 + -7.2 -4.62872 TTAGACTTAAAAGAA TTTAA-CAAGTCCGC TAAG GCGGATTTGATTAAG TTTTTAAAACTTAAT 81 21 LT41_RS02835 NONE LT41_RS02840 536382 .. 536418 + -3.1 -4.86731 AAAAAAGCCAAAAAA TTTAACAAAGTCCATTG ATT TAATGGGCTTGATTAAG TTTTATTTAGCAAGG 63 79 LT41_RS02845 536599 .. 536611 + -3.4 -2.90573 TTTTTAAAAAAAGAA CTCT ATATA AGAG GTTTGCTATGAGTCC 43 2 LT41_RS02850 537069 .. 537092 + -9.8 -4.76191 TAAAAATAGATATAA TCCTTTAAAA GCTT TTTTAAAGGA TTTATTTTGATCTGT 100 47 LT41_RS02855 NONE LT41_RS02860 537799 .. 537811 + -7.7 -3.41073 CATTATGCCCTTTGG TCGCT TTA AGCGA TGTTTGGATAGACTA 68 68 LT41_RS02925 NONE LT41_RS02930 NONE LT41_RS02935 NONE LT41_RS02940 NONE LT41_RS02945 NONE LT41_RS02950 NONE LT41_RS02955 NONE LT41_RS02960 NONE LT41_RS02965 NONE LT41_RS02970 NONE LT41_RS02975 554233 .. 554245 + -7.7 -3.62597 AAGAGAGGGGTCAAG GGGAT GAA ATCCC TTGTTGCAAGGTGGA 70 106 LT41_RS02980 NONE LT41_RS02985 555330 .. 555349 + -6.6 -5.0133 CGAGTGTTAAAAAGG CTTTAAAA ACGA TTTTAAAG TTTTTTAAAAAGATG 85 294 LT41_RS02995 557391 .. 557405 + -2.2 -3.70076 ACAACAATTTGGGGT TAAAAT GAT ATTTTG TTTAGGTGAGTTTGA 47 23 LT41_RS03000 NONE LT41_RS03005 NONE LT41_RS03010 558919 .. 558936 + -5.5 -4.83615 TTTGAAGGGTAATAA GGAAGAC TAAA GCCTTCC TTTTTCTAAAAACTA 74 29 LT41_RS03015 559840 .. 559857 + -8.5 -5.13722 ATTTTTAAAAGCTAA GAGAGTA AAAA TACTCTC TTTTATTTTAGTAAA 100 33 LT41_RS03040 562192 .. 562208 + -5.3 -2.89039 GAAAAACTTTCAAAT TTTTTTA AAT TAAAAAA TCTATAAGGATAATT 53 2 LT41_RS03045 NONE LT41_RS03050 NONE LT41_RS03055 NONE LT41_RS03060 565689 .. 565701 + -9.1 -3.28712 GGGGAGATTTGAACT CCCGA CCT TCGGG TTATGAGCCCGACGA 75 72 LT41_RS03075 NONE LT41_RS03080 567391 .. 567403 + -3.3 -4.18697 AAAAGACTTAATTTA GCACT TAA AGAGC TTTTACAATAATTTT 54 2 ilvI NONE ilvN NONE lpxD 570563 .. 570602 + -11.7 -2.52681 AAGATTAACATCGCA TCGCCATAAGAGTAAAA GCGATA TTTTTCTTTTATGGCGA GTTCATAAAGTTTTA 87 33 nudH NONE lysC NONE LT41_RS03130 576146 .. 576160 + -2.2 -3.20367 AAGGTGCAATTAGGA TAAATA TTT TGTTTA TTAGTAAGATTATTA 42 23 LT41_RS03135 NONE folP NONE ligA NONE LT41_RS03150 NONE tlyA NONE ribF NONE cmoA 583559 .. 583575 + -6.6 -4.31379 TTACCCTCTTCATTT GTTGGT TTAAC ACCAAC TTTTAATGCATTAAT 74 483 peb4 NONE fbaA 587680 .. 587700 + -6.9 -5.40279 CTGTATAAACAAAAA CTAAGCATT TTA AAAGCTTAG TTTTATTTTGTTTTA 95 22 LT41_RS03205 NONE LT41_RS03210 NONE LT41_RS03215 591357 .. 591371 + -2.2 -5.22006 GTTAATAGAAAGATT TTTAGA ATA TTTAAA TTTTTCTTCTAATAC 68 350 LT41_RS03240 596941 .. 596955 + -2.2 -3.89524 TGATGTGATGATGGC TTTAGA ATT TTTAAA TTTATAAAATAGAAT 49 4 LT41_RS03245 NONE LT41_RS03250 NONE LT41_RS03255 601982 .. 601997 + -7.6 -2.87211 AAATCACTTTTGGCA CCATTG ATTG CAATGG TATCTAAGAAAACAT 66 497 pstS 606778 .. 606794 + -4.5 -4.15044 GTAAAAGCTGGAAAA GTTTTTT AAG GAAAAAC TTTGTTAAAAGAAAA 60 17 pstC NONE pstA NONE pstB NONE LT41_RS03300 610837 .. 610867 + -2.1 -4.61482 GAGTATATTAAATAT TTATATTTAAAAA AGTAA TTTTTAAGTAGAA TTGTTTTTTAAAAGA 57 39 LT41_RS03305 NONE LT41_RS03310 612841 .. 612855 + -4.4 -3.53881 CAAAGAGAGAAAGAA TTTTTA AGT TAAAAA TGTTATATTTATAGT 54 14 LT41_RS03315 NONE hypF NONE hypB 617386 .. 617405 + -3 -3.40481 ATAAGGTGCTTAAAC TTAAAAAG GAGC TTTTTTAA TGTGTTTGTCTATAC 47 6 hypC NONE hypD NONE hypE NONE hypA 620203 .. 620238 + -7.4 -3.33315 AAACTAAAAAAAATA TATTTTTAAAT-TTATT TTA AATAAAATTTAAAAATA TTATAAAAATATTGA 68 152 LT41_RS03350 NONE LT41_RS03355 623931 .. 623964 + -11.3 -3.95535 CTACTTGTTAAAAAT TTCATCCTGATAATT TTAA AATTATTAGGATGGA TGTTTTTAAGGTTAT 95 81 ilvC NONE LT41_RS03375 NONE dprA NONE ruvX 630391 .. 630413 + -2.1 -4.25256 AAACTTTATACCAAA GATGAAATG CAAAA TATTTTATC TTCTTTTGCTCAAGA 53 48 LT41_RS03390 631538 .. 631561 + -2.6 -4.26398 TTGCAATCTTGAAAT TTTAGTAA CTATTTTT TTACTAAA TATTTTTTGCTGTTC 55 327 LT41_RS03415 NONE recN 637334 .. 637344 + -4 -2.79312 AAAAATTTCCTTTCT TTTG AAA CAAA TATAATAAAAAATTT 45 80 cbrR NONE LT41_RS03430 NONE LT41_RS03435 NONE LT41_RS03440 NONE LT41_RS03445 NONE LT41_RS03450 NONE LT41_RS03455 NONE yihA NONE LT41_RS03465 643849 .. 643862 + -2.5 -3.65351 TTTAGCTTATGTGTT TTTTA AAGG TAAAA TTTAAATGAGAATGC 46 7 mrdA 645692 .. 645707 + -4.8 -5.055 TTAGTTGTAAATTGA GTTTTT CAAA AAAAAC TTTTTTAGCAATTGG 74 44 LT41_RS03525 NONE tsaE NONE lptB 658518 .. 658531 + -6.7 -3.45768 GTATTATTTAGGAGC GGAGT TTAA ACTCC TTGATTGATGTTAAA 65 4 rpoN 659832 .. 659848 + -5.3 -2.62933 CACTTTTGTTTTATA TTTAAAT TTA ATTTAAA TAATATAAAAAATTA 52 68 dcuB 661383 .. 661406 + -12.6 -3.95911 TTATCTTTAACAATT TTTAGCAGGA TTTT TCCTGCTAAA TTCTTCATTTGTCTT 100 31 kdpC 666506 .. 666524 + -2.5 -2.85996 ACTTTAAATATACAA CATTTAG AAAGC TTAAATG ATTTAGTCGCTAATA 41 470 LT41_RS03580 NONE LT41_RS03585 NONE LT41_RS03590 NONE priA 672983 .. 673000 + -4.3 -3.15274 GTGTAAATAAGTGAT TTATTTT TTAT AAAATAA TCTATTACATCTTTT 50 162 ispG 675480 .. 675496 + -10.9 -4.13945 AATAAAAGCCAAGAA GCAAGGT TTA ACCTTGC TTTTAGAATGGCCAT 93 36 pta NONE ackA 679007 .. 679031 + -7.4 -4.58283 ATTAAATTTTAAAAA CTATATAAAT CTTTC ATTTATATAG TTTTTAGCAAGGTTA 81 36 LT41_RS03630 683662 .. 683677 + -2.6 -3.08201 TAGAGAAGCCTTCTA GTAAAA TATT TTTTGC CTTTTGAGCATCTTC 43 270 LT41_RS03645 NONE ftsA NONE ftsZ 689458 .. 689479 + -7.4 -5.04325 AAATTGATTTTTAAA GCAAGATT GAGTCA AATCTTGC TTTTTATAGTTTAAA 90 40 LT41_RS03660 NONE flgG 691267 .. 691293 + -12.5 -5.00884 TTTAATTCTTTTTTG TTTAATGGCGT GTTAA ACGCCATTAAA TTTTTTAGCAAGAGT 100 61 LT41_RS03675 NONE LT41_RS03680 NONE purE NONE LT41_RS03690 NONE glyQ NONE LT41_RS03700 NONE LT41_RS03705 NONE waaA NONE LT41_RS03715 700098 .. 700108 + -2.6 -2.60211 AATTTGGCTTTGATA TAAA AAA TTTA GATTTTTAAAGCCAT 40 6 ffh 701524 .. 701563 + -8.3 -5.18355 GAAGACAGTTTTAAA TTTTATTTATAAATACT TTTTAT AGTATCTATAAATAAAA TTTTTAATTTTTAAG 100 27 rpsP NONE LT41_RS03730 NONE rimM 702567 .. 702584 + -2.1 -3.20747 TTGCACGCAAGATGC TTTTTTA ATTT TAGAAAA TTCATGAAATTTAGT 42 1 trmD NONE rplS 703697 .. 703719 + -5.1 -4.39724 AGTCTAACAATTAAA TAATTATAA TTAAT TTATAATTA TTATTTATTTGATTT 68 63 uraH NONE LT41_RS03755 NONE LT41_RS03760 705897 .. 705918 + -7.4 -5.5604 GAGAAAATGTTATGA TAGAGTGT TTGATT ACACTCTA TTTTTTATTAATTGA 100 26 dnaE 709942 .. 709966 + -9.5 -3.39483 TTTCTAATAAATATG CTTAAGTAAGA TTG TTTTACTTAAG ATTTTTAAATAAAAT 80 21 LT41_RS03800 714620 .. 714634 + -2.9 -5.4251 GGGATTAATTCTTTA TGATA AATAA TATCA TTTTTTATATATGAA 74 437 LT41_RS03815 NONE LT41_RS03820 NONE LT41_RS03825 NONE LT41_RS03830 NONE LT41_RS03835 NONE LT41_RS03840 NONE LT41_RS03845 722306 .. 722327 + -11.7 -3.57161 TAACTTTTTAAGCTA TAAGCGTGA AAAT TCACGCTTA TTCTAATTCATATTT 91 30 LT41_RS03870 NONE LT41_RS03875 728343 .. 728377 + -4.5 -4.84761 TTTGCTGGTTAAAAA TTGTTTAAAGCTTGA TTAAT TCAAGTTTTAAAGAG TTTTTATAAAGCTCT 69 29 LT41_RS03880 729413 .. 729439 + -2.5 -3.05046 ATAGAAGCTGCCGCA TCATTTTTA ATGCTGGGC TAAAAATGA GTTTTGAAGAGATAG 42 5 LT41_RS03885 NONE LT41_RS03890 729802 .. 729819 + -5.6 -3.86346 AAAAGCTTAACAAAA GTGCTT AAATTA AAGCAC TTTATAGAAACCTCG 62 18 LT41_RS03895 NONE LT41_RS03900 730888 .. 730906 + -6 -3.45404 TAAAAATTTAACAAA GTCCATTG ATT TAATGGGC TTGATTAAGTTTTAG 60 38 LT41_RS03905 NONE LT41_RS03910 NONE LT41_RS03915 NONE LT41_RS03920 NONE LT41_RS03925 733611 .. 733633 + -9.3 -5.73978 ACTAAAGTTTGCAAA GAATTAGAG TAATT CTCTAATTC TTTTTTCTTTCTCAT 100 14 LT41_RS03935 734853 .. 734866 + -5.3 -3.54717 TTGAGTTTTGCTTGT GCTTT TTTA AAAGC TTCATTATCATTTTT 58 215 LT41_RS04000 745059 .. 745076 + -4.1 -2.95966 AAAAAGCAAGATGGA CTTATCC ATAA GGAAAAG ATTGTGTTTAGTTTT 50 15 LT41_RS04005 NONE LT41_RS04010 745693 .. 745718 + -4.8 -4.28049 ATCAAAAAAGCATTG CAAAAGATCT TCTTAT AGCTCTTTTG TTTTCAACTTTTGCA 64 52 LT41_RS04015 NONE LT41_RS04020 NONE LT41_RS04025 NONE LT41_RS04030 NONE LT41_RS04035 NONE LT41_RS04040 NONE LT41_RS04045 NONE LT41_RS04050 NONE LT41_RS04055 NONE LT41_RS04060 NONE LT41_RS04065 NONE LT41_RS04070 NONE LT41_RS04075 754153 .. 754178 + -9.1 -3.3854 TTTTGGTAGAAGCAG GAGTTATAGCT TAGA GGCTATAGCTC TTATAAGTCATACTT 77 12 LT41_RS04085 NONE LT41_RS04090 757346 .. 757363 + -5.5 -4.83615 AAGAAGTGATGGCAA GGAAGAC TAAA GCCTTCC TTTTTCTAAAAACTA 74 32 LT41_RS04095 758267 .. 758284 + -8.5 -5.13722 ATTTTTAAAAGCTAA GAGAGTA AAAA TACTCTC TTTTATTTTAGTAAA 100 33 LT41_RS04135 766364 .. 766376 + -3.4 -2.78463 TAATAAAATAAGAGA GCTT ATAGA AAGC TCTCCTGAAGCAAAT 43 218 LT41_RS04145 NONE LT41_RS04150 NONE LT41_RS04155 770440 .. 770462 + -7.8 -4.56187 TTAATATATATACTT CCTTTAGGTT TTA AACCTAAATG TTCTTTTTAATTATC 86 208 LT41_RS04160 773709 .. 773719 + -5.4 -4.57341 AATAAAGCATCACTT CCTT GTT AAGG TTTTTAAGAAGACTT 70 41 rrf 774497 .. 774519 + -5.6 -3.61715 ATGTTGGGTTAGGGT GGATAGACTA TGA TTGTCTATTC TTGTTGGCGAGAATG 59 457 LT41_RS04170 775560 .. 775576 + -2.3 -3.38966 TAGTGATACTACTAA GTTTAAG ATA TTTAGAC TTATGAATACATTTT 43 435 LT41_RS04175 NONE LT41_RS04180 776507 .. 776517 + -5.4 -4.96848 TTAGCTTAATTTATA TACC AAT GGTA TTTTTATATGAAAAG 77 132 cfrA 779633 .. 779648 + -2.6 -5.83211 AAAACTAAAGGGCTT TTAAAG TCTT CTTTAG TTTTTTATTTTAATA 78 52 hrcA NONE grpE NONE dnaK 783136 .. 783162 + -8.1 -2.71742 TCTTCTAAAATCTTC ATTCAAGCCTT GTTAA AAGGCTTGAAC TCAATTCTATTTTAT 67 41 LT41_RS04210 NONE LT41_RS04215 NONE LT41_RS04220 NONE LT41_RS04225 NONE LT41_RS04230 792212 .. 792222 + -2.6 -4.44277 AAATTAACACAAGTT TATA ATT TATA TTTTGGCTTTTGCTA 56 39 LT41_RS04235 792603 .. 792623 + -9.1 -3.61764 TGCTGTGCTTAAAAA GCCTTAAAG TAA TTTTAAGGC TTTAGGGCTTAATAA 79 19 LT41_RS04315 810360 .. 810395 + -2.8 -4.37092 TTAACTATAGATTGA TAAAATTTCCTTTATA TTAT TATAAAGAAAGGTTTA TTTTATGAAAAAAAT 54 26 peb2 811196 .. 811212 + -2.3 -3.63627 TAATCACTCCTAAAA CATTAAT TGC AATAATG TTTAAAATATCAAAA 45 81 tpx 811773 .. 811795 + -7.8 -5.10968 TGCCATTAATTTTGA TTAAGCCC ATTCTTA GGGCTTAA TTTTTATATCTTCAT 100 32 napA NONE napG NONE napH NONE napB NONE napL NONE napD NONE tatA2 NONE LT41_RS04365 NONE LT41_RS04370 NONE cca NONE purU 821004 .. 821020 + -2.3 -4.87133 TATAATATTTTAATG CGATAAT TTT ATTATAG TTTTATTTAAAGCAT 60 28 LT41_RS04390 NONE flgS 824251 .. 824267 + -5.3 -3.75153 GGAACAGATCTTGCT TATATTA TTT TAATATA TTTAGGTTGAAGGCA 60 67 LT41_RS04405 NONE LT41_RS04410 NONE LT41_RS04415 NONE LT41_RS04420 827285 .. 827302 + -8.5 -3.37091 TTTACTAAAATAAAA GAGAGTA TTTT TACTCTC TTAGCTTTTAAAAAT 75 28 LT41_RS04450 832091 .. 832103 + -9.1 -3.90738 CTTCATTATTCAGTG CTCCC ACT GGGAG TTTGGTAATTGTTTA 83 143 LT41_RS04520 NONE LT41_RS04525 NONE LT41_RS04530 NONE LT41_RS04535 843338 .. 843350 + -9.1 -3.29144 TTCAGGTGGGTTAAG GGAGC GTA GCTCC TTATCGCAAGGATGA 75 92 LT41_RS04540 NONE LT41_RS04545 844135 .. 844152 + -4.1 -2.95966 AAAAAGCAAGATGGA CTTATCC ATAA GGAAAAG ATTGTGTTTAGTTTT 50 15 LT41_RS04550 NONE LT41_RS04555 844769 .. 844794 + -4.8 -4.28049 ATCAAAAAAGCATTG CAAAAGATCT TCTTAT AGCTCTTTTG TTTTCAACTTTTGCA 64 52 LT41_RS04560 845190 .. 845228 + -9.3 -2.54801 GTATTGACCCTTGTA TTTTAAAAGGTTTTAAA CGCAA TTTAAAGCTTTTTAAAA CTATATTTGAAAATA 72 47 terL NONE LT41_RS04570 NONE LT41_RS04575 849346 .. 849360 + -3.6 -2.87564 CATCTGGGTTTTGGT TTAGAT AAA ATCTAG TCTATCCAAACATCG 45 82 LT41_RS04655 858206 .. 858225 + -2.2 -4.62904 GCGTTGTAGGATATT TTAAAAAG ACTA CTCTTTAA TTTTTAAAGGTGTTT 57 6 murJ 865996 .. 866006 + -2.6 -3.11634 TTTAAAGGAGTTTTT TAAT GAG ATTA TTAGATAGTGTAACA 42 23 cysS NONE msbA 869102 .. 869117 + -2.6 -3.75718 AAAGCAAAGAAAAAA C-AAAGC CCA GCTTTAG TTAATTTTAGTTAGA 48 6 pyrD NONE LT41_RS04710 NONE LT41_RS04715 NONE LT41_RS04720 873330 .. 873354 + -2.2 -4.47485 CTTAAAGATCCATTT TCTGCC-ATTT TTTT ACATGGGCAGA TTTTATAAAATTTTT 57 229 nadE NONE lpxK NONE thrC NONE kdsB 877979 .. 877995 + -5.3 -3.75153 GGAACAAATTTTGCT TATATTA TTT TAATATA TTTAGGTTGAAGGCA 60 55 LT41_RS04755 NONE LT41_RS04760 NONE glnH 880311 .. 880339 + -4.1 -5.71295 TAAAAGGATTTAAGA TAATGAAAAAAGT TGC ATTTTTTTTGTTA TTTTTGTTTTTATCT 82 116 LT41_RS04775 880815 .. 880828 + -5.3 -3.07935 AGCTTTCCACAAGCC TTTGC ACTA GCAAA TTCCATCCATCCACT 54 48 glmU NONE coaBC NONE LT41_RS04795 NONE uppS 885639 .. 885663 + -3 -5.14894 GCGCAATTTTGCTTA TTTTGGTTTA TTCTT TAAGTCAAAA TTTTTATGATTTTTT 69 272 LT41_RS04810 NONE truA 888025 .. 888046 + -3.1 -2.87672 ATCGCCATAATCAAG CT-TGGTAGA AAA TCTATCATAG TCGATTTTTACTATA 43 139 LT41_RS04830 890074 .. 890094 + -10.5 -3.04501 CCTTGCTAAGAAATA CTCCACATT CAA GATGTGGAG TATTGACAAATTGAT 83 32 ogt 898265 .. 898288 + -4 -4.57837 ATATTATTTTTTGAC TTTTTTCTTT TAAA AAAGAAATAA TTTTTGCAAAACTAT 65 349 LT41_RS04890 903305 .. 903319 + -5.8 -5.11937 ATTGTCATAATAAGG CATTAT AAA ATAATG TTTTTTAAAATTATT 84 450 LT41_RS04910 NONE psd 908299 .. 908319 + -4.1 -4.12267 TTCAAGATCTAAATT TTTCATACT TCT AGTATCAAA TTTACTTCTTATGAT 58 339 folD NONE lepB 915808 .. 915834 + -11.1 -3.90316 GAGGATAAATTAAGC TAATGTTTGTG AAAAA CACAAACATTA TATTTTTAAAAGCGT 95 23 LT41_RS04995 NONE dsbI 924256 .. 924274 + -2.5 -3.68024 TGTCTCCTTTGACCG CTATTAT CATGA ATAATGG TTATGTCTTAAGCGA 48 230 dsbA 926236 .. 926271 + -12.2 -5.2112 GTAATATGAAATAAT AAATTTTTAAGGCAAT AAAA ATTGCCTTAAAAATTA TTTTTTGATCATATT 100 27 LT41_RS05020 927655 .. 927684 + -9.5 -3.31946 TTTAAAAGAAGGTGA TTGGATAAATAGT TTGC ACTCTTTATCCAA ATTTTCTATCCCGTA 78 76 rpsO 932528 .. 932543 + -3.9 -4.43272 ATAAATAATTTTTAA GCCCT TTTTAC GGGGC TTTTGCCTTTTAAAT 60 33 LT41_RS05065 938054 .. 938075 + -2.1 -3.36166 CAACCTTGTGTCGGT TCGAGTCCG ACCT CGGGCACCA CTTATTTTTTGCGGG 43 4 LT41_RS05070 938404 .. 938420 + -2.2 -5.95286 CTCATTTTCTTTGTA GCTCAA TTTTT TGGAGC TTTTTTCTTTTTGGT 81 269 LT41_RS05125 951830 .. 951864 + -10.3 -4.37886 CCTCAAGCTTTATTT TAATTTAAATGGTAG AAAAA CTACCATTTAAACTA TTTTGTCAAAGGTAG 91 23 LT41_RS05140 NONE glnQ 954151 .. 954175 + -11.6 -4.25283 GTTTTAAATCATTAA TTCATAAGCC ACTAA GGCTTATGAA TTTTAATCCCAACAT 100 26 LT41_RS05170 958805 .. 958819 + -5.8 -2.63182 AACAGGTAACACACA TTGAAA AAT TTTCAA AATTTTATATTCAAA 55 22 LT41_RS05175 NONE LT41_RS05180 NONE LT41_RS05185 960347 .. 960370 + -9.6 -3.01497 CTTAAGCAAAAAGAT CGGTTGAGAG GTAT CTTTCAGCCG TATCGTTTAGCATAG 77 46 LT41_RS05205 964454 .. 964482 + -3.3 -4.946 CTTTGAGTGGCTATT GAAATTTCTTT TTTAATT ACAGAAATTTC TTTTTCATCTTTAGT 69 415 rpiB NONE LT41_RS05260 NONE apt NONE LT41_RS05270 NONE LT41_RS05275 NONE ychF 976681 .. 976704 + -9.7 -2.75876 GCATTTTAGATTCAA TGTTTAGGC AAAATA GCCTAAACA ATATTTATAAATTTT 75 19 atpE 984789 .. 984801 + -6.2 -5.37043 ATAAAACTTATCAAA GCCC TTTTT GGGC TTTTTTCTATGCGGT 93 37 LT41_RS05315 985075 .. 985085 + -5.4 -2.84671 TTTTCAAAAACCATC CCTT AAA AAGG ATTATTCAATGTTTG 53 203 LT41_RS05320 986020 .. 986033 + -5.3 -3.05503 AGCTCAAATTATATG GCTAA ATTT TTAGC TAATTCTTTAACTTT 54 40 lolA 996433 .. 996443 + -2.6 -4.63993 AAAATTTTTCTAAAG TTTT TTT AAAA TTATTTTTTCCAATT 60 501 LT41_RS05400 999437 .. 999461 + -11.7 -4.44548 ATACAAAACAAATAA GATTTATTGAT TTA ATCAATAAATC TTTTAGTTAAATCTG 100 26 LT41_RS05485 NONE LT41_RS05490 1014635 .. 1014648 + -2.5 -3.03169 AAAAAAATTAAAGGA TTTTT ATGA AAAAA ATATTTTTAATATTT 42 17 LT41_RS05495 1015811 .. 1015841 + -11.4 -2.78405 AAGGCAAACAAGCAA GCTTTGAAGAATTA AAA TAATTCTTCAAAGA GCTTTTTTAACTGCA 84 6 LT41_RS05505 1018892 .. 1018937 + -13.9 -4.89852 ACATTTATGCAAGGA TA-AAATAAATCATTCCTATTT TTA AGATAGGAATGATTTATTTGTA TTTTTATAAATATAA 100 290 LT41_RS05515 NONE LT41_RS05520 1022539 .. 1022556 + -2.1 -4.91852 AAGCTTTGGGAAGTA TTTTTGA GTTT TTAAAAA TTTATTTTTGATCAA 62 19 cmoB NONE LT41_RS05530 1024576 .. 1024591 + -3.4 -3.74238 CTACCATAAGTATCT TTATTT TTAT AAATAA TTTCAACTTGTTTGC 52 419 LT41_RS05545 NONE LT41_RS05560 1029705 .. 1029740 + -2.8 -4.28361 TAAAAACTTCAAAAA CATTAAAAGC-AAGA TTAAATT TCTTTGCTCTTAATG TTTTCATAACATTAA 54 53 yaaA NONE LT41_RS05585 1033462 .. 1033476 + -5.8 -2.64616 GCATCGTACTAGAAG TTTTAC CTT GTAAAA TAATATGCATAGAGC 55 162 ribA NONE rsmG 1040265 .. 1040280 + -9 -5.22006 ATATTGTATTTTAAA GTAGCC CTAA GGCTAC TTTTTATTCTGCTAA 100 22 LT41_RS05640 NONE rpoD 1045388 .. 1045402 + -4.2 -4.61527 AAATCAGGATGAATT TCATGC GAA GCAAGA TTTTTAAAAAGTTTT 65 423 LT41_RS05660 1046764 .. 1046774 + -4 -4.00868 AAAATCATCTTGCGA GTTA GTA TAAC TTTCATTGTAAATCA 58 241 tgt NONE LT41_RS05695 1055405 .. 1055422 + -7.1 -4.15543 AAAAAACAAACAAAA TAAGCAA AATT TTGCTTA TTTTAAGAATATTTA 73 23 LT41_RS05700 1055687 .. 1055704 + -2.7 -5.2189 TTTGCAGCCAAAGCA GAAACAA ATTC TAGTTTC TTTTTTGCTGCTTCA 69 176 cmeD NONE cmeE NONE cmeF 1080426 .. 1080452 + -3.9 -5.17054 TATGAGAGAGAAAAA TTAAATTAACC CAAAT GATTAATTTAA TTTTTTAAGTATTAT 70 17 ftsW NONE murG 1086013 .. 1086024 + -3 -3.76492 CTTTTATAAGATAAA TATC CAAA GATA TTTACTAAAATTCCA 50 27 LT41_RS05955 NONE LT41_RS05960 1113183 .. 1113193 + -2.6 -5.0925 TTTGCATTTTATAAT TAAT ATT ATTA TTTTTGATTTTAAGG 63 57 LT41_RS05970 1114442 .. 1114459 + -7.1 -3.65351 TAAAATTTATTTAAA TTTTGCT TTTA AGCAAAA TTTAAATAAAAATAA 67 27 pgsA NONE rseP NONE LT41_RS05985 1117111 .. 1117126 + -5.4 -3.84825 TTATGCAAAATCCTT GCTCAT AAAA ATGGGC TTTAATATCCATAAG 62 73 rpsF NONE ssb NONE rpsR 1118368 .. 1118388 + -8.4 -4.37211 CTATAATCTTTTAAA GCAAACTT GTAAA AAGTTTGC TTTCTTATACATTTA 85 35 fliW NONE proC NONE ctsT NONE LT41_RS06030 NONE LT41_RS06035 1124172 .. 1124182 + -5.4 -4.20806 AGCGAGCTTAACACA GTCT AAA AGAC TTTGATTTTCGCATA 66 52 lnt 1141572 .. 1141600 + -7.6 -3.6014 ATTAATTCTTTATAA TTATACAAGCCT TGTTT AAGCTTGTATAA TATTGTTAATTTTTT 70 220 sstT NONE pyrB NONE LT41_RS06135 NONE LT41_RS06140 1147215 .. 1147227 + -2 -3.2632 AAAAATAAAGATATT TTCA AAAAA TGAA TCTATTTGAAGATTT 42 14 LT41_RS06145 NONE truB NONE csrA NONE ispE NONE smpB NONE LT41_RS06170 NONE clpS NONE clpA NONE aat 1155205 .. 1155219 + -10 -3.34236 ATTACTTAAAAATAA GCGTGA AAA TCACGC TTATGACATCGCTTT 82 32 LT41_RS06205 NONE waaC NONE htrB NONE LT41_RS06315 NONE LT41_RS06320 1183799 .. 1183815 + -2.3 -5.33405 GAAAAATATCCACTT TTGATAA ATT TTTTCAA TTTTTCTTTACTAGG 71 403 LT41_RS06330 1186053 .. 1186063 + -5.4 -5.10154 TTTTAGCCCACATTG TCCA AAA TGGA TTTTTAGTTTTAAGT 81 451 cstIII NONE neuB1 NONE neuC 1189978 .. 1190002 + -8.7 -2.50077 AGCGAAGAAAATAAA CTTCATAGTTA TTA TAACTATGTAG CTAGTTTTATACCGC 70 412 LT41_RS06360 1191182 .. 1191198 + -2.3 -5.60993 TAAAAAGAGTTAATA ATATAAG CTT CTTATAA TTTTTTTATAAAAAA 70 9 waaF 1194017 .. 1194030 + -5.3 -3.31322 ATATTAAGCTCTTTT GCTTT TTTT AAAGC TTCTAAAACATTAGG 56 175 LT41_RS06400 1197693 .. 1197714 + -6.7 -5.60993 ATAATTTCTAAAAAA GGCTTTTCTT TTT AAGAAA-GCC TTTTTTTATCCAAAG 100 37 rho NONE dnaX 1203702 .. 1203722 + -2.6 -4.13711 TAATCATTTTGCTTA TGCAAAAA CATTT TTGTTGCA TTTATACTCTTTTAA 53 523 ldh 1209698 .. 1209712 + -8.6 -5.1166 AAAGATAAAATTTAA GCCTTT TTA AAAGGC TTTTTGATTTTAATA 100 26 LT41_RS06495 NONE LT41_RS06500 1214579 .. 1214589 + -6.8 -5.14563 ATATCAAATTCCAAA TGCG TAT CGCA TTTTTTGCTCAAAAA 88 455 LT41_RS06600 1235499 .. 1235513 + -4.4 -5.41359 AATTTAAGTAAAGCT TATTTT TCT AAAATA TTTTTTCCTTTAATT 78 34 luxS 1239631 .. 1239641 + -2.6 -3.50488 TTATTTTTTAAACGA TTAA GCT TTAA TTAATATATTTTTAT 46 50 LT41_RS06625 NONE LT41_RS06630 NONE metE NONE metF 1244822 .. 1244842 + -2.7 -3.41114 GAAGAGCTTCATGCT TAGAAAATA AAC TATTTTTTG CTTTTATCTTAACTT 44 23 LT41_RS06670 NONE rny NONE LT41_RS06680 NONE LT41_RS06685 1252810 .. 1252836 + -2.3 -3.85254 CCAAATAATTACAAA GGGTAAAATTT CAAAA AAATTAAACCC TATTTTATAATCATC 50 281 LT41_RS06705 1256744 .. 1256762 + -8.2 -5.67529 TGATTAAAGAATTTA GAAGAGTT GCA AGCTCTTC TTTTTCTTTTTCATT 100 69 groES NONE groL 1262809 .. 1262825 + -10.9 -2.74514 TCTAACCTCTTATCA GCAAGGA TTT TCCTTGC TGATTACCAATTTAA 82 48 LT41_RS06750 1265404 .. 1265414 + -2.6 -2.63073 AAACAAGCTATAAAA TTTT ACA AAAA ATATTCTTAAGGAGG 40 5 LT41_RS06755 1265687 .. 1265715 + -7.6 -3.02867 CAAACAAAATAAAAA ACTTTATCACAA TTTTT TTGTGATAAAGA CTTATTAATTTTTTA 65 29 cbpA NONE hspR NONE kefB NONE LT41_RS06795 NONE LT41_RS06800 1273406 .. 1273418 + -4.9 -3.62505 TAGTGAACTTAAAGA CTTTT TGC AAAAG TATTTATAAGTTTTT 56 4 glyS NONE LT41_RS06810 1276287 .. 1276297 + -4 -3.85891 AAATTTAATGCTATT TTTC AAT GAAA TTTAGTGACTTTTTC 54 17 LT41_RS06815 1277564 .. 1277574 + -5.4 -3.4574 GTTTTAGCCCCTAAA GAAC GAA GTTC CTTTTTAATCATAGC 58 347 pdxJ NONE pdxA 1280341 .. 1280354 + -5.3 -3.06183 TATAAGCTTCTTGCA TGCAA TCAC TTGCA TTGAGTAAAGATAAA 54 233 LT41_RS06840 NONE ciaC 1282548 .. 1282561 + -2.5 -3.82505 AGAAAAATTGACCAA TTTAA TTTA TTAAA TTCTGTTATAATTTT 48 160 hemE NONE LT41_RS06855 1284960 .. 1284974 + -2.8 -4.82901 GGTAAAGTTAAAAAA TACTCA TAA TGTGTA TTTTTATGCCGACCC 63 467 guaA 1289686 .. 1289734 + -8 -4.42464 GAATAATCCATTTTT TTCTAGCTCTTATTTTTAATATAA AAT TTTTAT-AAAAATAAG-GCTAGAA TTTATTTAAGAAATT 83 35 LT41_RS06880 1291405 .. 1291422 + -2.7 -3.6761 ACCTAGCGGTTTTCT TTGACTT TTTG GGGTCAA TCTTTGTTAAACGGC 48 207 purD NONE LT41_RS06890 NONE LT41_RS06895 NONE pnp NONE LT41_RS06905 1297946 .. 1297962 + -5.1 -4.30441 TAAAACAAGAAAAAA GCTAGTT AAT ATCTAGC TTTTGCGTGTTATCC 66 63 LT41_RS06920 1300418 .. 1300444 + -9.5 -4.93288 TCCTTAAAATTACAC GCCTAGCTTAA ATCCC TTTAGCTAGGC TTTTCTTTAGATGTT 100 123 porA 1301873 .. 1301891 + -10.2 -5.64274 CAAGTCTAACTTCAA GGCGGGGT TTT GCTCCGCC TTTTTTTATGCCTGA 100 49 racR NONE racS NONE recR 1306035 .. 1306045 + -6.8 -2.70498 TACATCTCCTATACT CGCA CCT TGCG CTTCTATACAGTCTA 59 343 mrdB 1326476 .. 1326490 + -2.2 -3.81651 ATTTTTAAGCATTAA TAAGAT ATA ATTTTA TCTTTTAATTCAACT 47 44 LT41_RS07040 1326729 .. 1326745 + -7.3 -2.62616 TCGAACTGCCGACAC GCAGATT TTC AGTCTGC TGCTCTACCGACTGA 62 167 ktrB NONE ktrA 1328926 .. 1328961 + -5.6 -5.68438 ACTAAGCAAGATTTA AAGCCTTACAAGCCTTT ACA AAACGCTT-TAAGGCTG TTTTTTCTTTGGTAG 90 36 salC 1333730 .. 1333760 + -12.9 -3.07344 AGATAAAAATTACAA TTAAAATTTCCCT TTAAT AGGGAAATTTTAA TGTCTTGCAAGATAA 100 35 dcd NONE pseB NONE pseC NONE LT41_RS07110 NONE LT41_RS07115 1340523 .. 1340533 + -2.6 -2.61873 TATATGAAAAGCTTC TTTT ATG AAAA ATATTTAAAGGTAGT 40 18 legH NONE LT41_RS07125 NONE LT41_RS07130 NONE LT41_RS07135 NONE LT41_RS07140 NONE LT41_RS07145 NONE LT41_RS07150 1345728 .. 1345752 + -13.1 -4.58213 AATTTAGCAAAGCTT GATTAAAACCT TTA AGGTTTTAATC TTTTATCGTTAATTC 100 20 LT41_RS07160 1348525 .. 1348537 + -2.7 -3.9693 AAAATTGATAGAAAG GTTTT AAA AGAAC TTGTTTAAATAAATA 50 5 LT41_RS07165 1348788 .. 1348833 + -13.5 -3.68435 AAATATCAAAAAAAT GCTTGAAACTGCAATGAAAGA CTAA TCTTTCCTTGCAAGTTCAAGC TGTTCTTTTAAAGAA 100 1 pseF NONE pseG NONE pseH 1353399 .. 1353414 + -3.2 -5.94597 CCACAGAGGTTAAAA GAAGCT CTCC AGCTCC TTTTTTTTCATATTC 85 241 pseI NONE LT41_RS07215 NONE legB NONE legC NONE LT41_RS07230 NONE LT41_RS07235 1361659 .. 1361675 + -5.3 -2.70932 CACATCCAATCAACT TATTTTT CAT AAAAATA TAATTAAAACAAGGA 52 59 LT41_RS07240 1362791 .. 1362801 + -4 -4.66833 AGAAAAACTTGGAAT GAAT CCT ATTC TTTTTAGCGTTGAAG 62 411 LT41_RS07250 NONE legI NONE legG NONE LT41_RS07265 NONE ptmF NONE legF NONE ptmA NONE pseD NONE LT41_RS07290 NONE LT41_RS07295 NONE pseE 1377832 .. 1377842 + -6.8 -2.91264 TCAAGATTTGTTGTG GCTG TTT CAGC TATATCCATCACAGC 61 300 mobA NONE pldA NONE ceuB 1395352 .. 1395369 + -6.3 -4.6526 TAGTAGCTATTTGTA TCGCTGT TTCA ACAGTGA TTTTTCAAACTTTAT 76 163 LT41_RS07385 NONE LT41_RS07390 NONE LT41_RS07395 NONE LT41_RS07400 1397498 .. 1397515 + -8.5 -3.37091 TTTACTAAAATAAAA GAGAGTA TTTT TACTCTC TTAGCTTTTAAAAAT 75 28 LT41_RS07430 1402304 .. 1402316 + -9.1 -3.90738 CTTCATTATTCAGTG CTCCC ACT GGGAG TTTGGTAATTGTTTA 83 143 LT41_RS07500 NONE LT41_RS07505 NONE LT41_RS07510 NONE LT41_RS07515 1413551 .. 1413563 + -9.1 -3.29144 TTCAGGTGGGTTAAG GGAGC GTA GCTCC TTATCGCAAGGATGA 75 92 LT41_RS07520 NONE LT41_RS07525 1414348 .. 1414365 + -4.1 -2.95966 AAAAAGCAAGATGGA CTTATCC ATAA GGAAAAG ATTGTGTTTAGTTTT 50 15 LT41_RS07530 NONE LT41_RS07535 1414982 .. 1415007 + -4.8 -4.28049 ATCAAAAAAGCATTG CAAAAGATCT TCTTAT AGCTCTTTTG TTTTCAACTTTTGCA 64 52 LT41_RS07540 1415403 .. 1415441 + -9.3 -2.54801 GTATTGACCCTTGTA TTTTAAAAGGTTTTAAA CGCAA TTTAAAGCTTTTTAAAA CTATATTTGAAAATA 72 47 terL NONE LT41_RS07550 NONE LT41_RS07555 1419559 .. 1419573 + -3.6 -2.87564 CATCTGGGTTTTGGT TTAGAT AAA ATCTAG TCTATCCAAACATCG 45 82 LT41_RS07640 1428740 .. 1428760 + -6.9 -4.3129 GCACCGCACTTGTAG GTCCTATAA CCT TTTTAGGAC TTTTAGTAGTAAATA 74 414 ceuD NONE ceuB 1430845 .. 1430867 + -8.4 -3.54424 GAGACCCGTTAAGAT CTGCACCCTT AGC AGGGGTGTGG TTTCAGCCACTCACC 73 141 ppk 1436283 .. 1436309 + -8.9 -3.64371 TAAGGAAAACTAAAA GTTTTTAGGGT TTTAC ACCTTAAAAAC TTTAAACTATGAATT 79 28 ruvB 1438234 .. 1438250 + -2.3 -4.27512 TATTTGAGGAGTAAA TTTTGCA AAA TGGAAAA TTCTTTCTTATAAGC 53 27 amaA 1439280 .. 1439299 + -10.8 -4.73682 AAGAATTTAATTTAA CTTGCCTT AAAA AAGGCAAG TTTTATGTTCTAGGC 100 26 mqnE NONE LT41_RS07730 NONE LT41_RS07735 1451045 .. 1451063 + -3.2 -4.86621 TTTGCTATAATTTTA CTTTTAAA ATT TTTAGGAG TTTTTGCTTGAGAAT 63 44 LT41_RS07740 NONE LT41_RS07745 NONE LT41_RS07750 1455291 .. 1455312 + -3.7 -4.88405 CAAAGCATTAAAAAC CGCTCTTGCT TTA ATCAAG-GCG TTTTCTTTAAAAGTT 66 497 LT41_RS07760 NONE LT41_RS07765 1458186 .. 1458196 + -2.6 -4.76193 TCATTTCCTGCATTC TTTT GGC AAAA TTTTCTCTTGTAGTT 63 491 selA NONE selB 1462589 .. 1462646 + -2.4 -3.68292 TAGAAAATCATTATA GAATTAAACGTAATTTATTTAAAG GATTTATAAA CTATGAAAAAATTAAGTTTAATTC TTGTCTGTTCAGCAT 47 38 LT41_RS07785 NONE LT41_RS07790 1463882 .. 1463903 + -7.4 -4.16921 TTTAAGAAAAGACAA TCAAGAGT ATAAAA ACTCTTGA TTTTAAGAATTATTA 75 36 katA 1467015 .. 1467048 + -3.3 -3.47227 GCTTTAGAAAAATAA TTTTTACTT-GCCACT TTT GGTGGCAAACTAAAGA TTATAATAATTAAGG 47 26 LT41_RS07815 1467518 .. 1467541 + -5.5 -4.68528 ATGAGCCTAAAAATA CTAAAATTT ATCAAA AAATTTTAG TTATTTTTTAAATTT 70 2 LT41_RS07825 1468797 .. 1468815 + -5.3 -3.14924 GCTTTATAAAAAAAT CAATGCT CACAT GGCATTG CTTTTAAGTGGTTTA 55 94 LT41_RS07850 NONE feoB 1476535 .. 1476548 + -3.9 -5.40474 CATCAAAATTTTGCT CTATA AAAG TATAG TTTTTTTCAAAGGAT 77 345 nadD NONE rsfS 1482365 .. 1482394 + -6.6 -4.63542 AAAAAAGGTAGGGTT TAAAAAGGCTAA ATTTAA TTAGCCTTTTAA TTTTTAGAGATTATC 76 23 fliL NONE acpS 1485173 .. 1485193 + -12.7 -4.21737 ATGATAATGGTTTTG CTATAGCCA TAG TGGCTATAG TTTGATTATTTTCCT 100 0 ciaI NONE dut NONE LT41_RS08090 1526005 .. 1526018 + -5.3 -3.9941 TTTTCTTTTAAAAAA GATGA AATT TCATC TTTACTTATAAAGAG 64 492 LT41_RS08105 1529598 .. 1529610 + -3.5 -3.75169 TCGTAATAATAGATT TTTTA ATG TAAAA TTTGCTAAAATAATA 52 77 prfB 1530808 .. 1530822 + -11.4 -4.53142 AAAATTAGAAAGATA GCGGGA TTT TCCCGC TTGTTTTATTATCTT 95 83 LT41_RS08130 1534392 .. 1534402 + -2.6 -3.83502 TTAAAAAATCACACT TTAA AGG TTAA TTTGATATGAAAATC 48 5 LT41_RS08135 NONE rsmD 1535449 .. 1535464 + -3.3 -3.23899 TTGGATCAACTAGCT TAAGC TTTTAC GCTTA TTAACTTACTTGGAA 45 6 flgI NONE LT41_RS08150 NONE flgM 1537181 .. 1537215 + -4.4 -2.90075 TTAATCTAAAACTTT CATTCTCCTTTTTTTT GAG AGAGAAAAGGAGAAAA TATGCTTAAACAAAG 48 32 LT41_RS08160 NONE flgK 1539470 .. 1539494 + -12.3 -2.63596 ATGCTTGATACCTTA CTAGGGCTTAA ATC TTAAGCTCTAG TAATATCAAATGAAA 88 8 LT41_RS08170 NONE LT41_RS08175 NONE yedE NONE yedF 1571089 .. 1571112 + -12.6 -3.31515 CTAAGATTTTTAATA CAAAAGCCTT AAAA AAGGCTTTTG TTCTCAAAGCTCTTT 100 14 cueO NONE moaD NONE moaE NONE LT41_RS08420 1592151 .. 1592177 + -13.8 -4.7261 TAGTGGAGTAATTAG CCCTAGTGGAGT TTC AATCCACTAGGG TTTATTTTAGTCCCT 100 115 coaE NONE dapF NONE LT41_RS08460 1601755 .. 1601776 + -2.4 -5.88471 TTCTTAGGCCAAAAT CTTTAAAA TAAATC TTTTGAAG TTTTTTTTCATCATG 79 354 LT41_RS08500 1609908 .. 1609935 + -5.6 -3.27687 CAAGAAAAGACTAAA AATTAAGCAGGT TTTA ACCTGCTTAAAA TATCATTTTTTACTT 55 27 LT41_RS08505 NONE pxpB NONE LT41_RS08515 1612845 .. 1612867 + -9.9 -4.05446 ATATAAAAGTTAATC GCCAAAGGG TGAGC TCCTTTGGC TTTATGATTAAACAC 90 359 LT41_RS08535 1614984 .. 1615008 + -14.5 -3.83409 ATTTCTTGGTATAAA TTCAAGACTCT TAA AGAGTCTTGAA TTTACTCATCTCTCA 100 2 LT41_RS08580 1627052 .. 1627087 + -12.4 -2.98582 AAAATATCGTTTAAG TAATAAATTAATATAT CAAT ATATATTAATTTATTA ATTTATACATGTTAT 91 27 LT41_RS08600 1630924 .. 1630953 + -8 -2.73508 AAGAGGTTTTAACCT TAGATAACTAGC CAAAAA GCTAGTTATCTC TAAATTTACTTATTG 67 29 cgb 1654924 .. 1654936 + -9.1 -3.79623 TGATAAATAATATAA GCCCA TTT TGGGC TTTAATCAAATTTTT 81 31 LT41_RS08725 1658845 .. 1658858 + -2.4 -3.78958 ATTTTAATAATTTTT GCTA AAATTA TAGC CTTTTTATTTCATGA 47 72 infA 1659122 .. 1659141 + -6.6 -2.60032 TAAGTTATTTAAAAG CTAATTTT AGAT AAAATTAG AGTTTTTGCGACAAA 58 43 rpmJ NONE rpsM NONE rpsK NONE rpsD NONE rpoA NONE rplQ 1662202 .. 1662219 + -9.9 -3.28984 TGTAGTTTAATCAAA TCCTAGC TTTT GCTAGGA TTAATACTTCAATTA 81 31 hisG NONE hisD NONE hisB 1665599 .. 1665609 + -3.2 -2.63102 TGAAAATTTAGCCAG CTCT AAA GGAG TGATATGAAAATCAT 42 7 hisH NONE hisA NONE LT41_RS08790 NONE hisF NONE hisI 1669723 .. 1669739 + -2.1 -2.96963 ATTAAAATTCACATA ACTTGCC CCT GGCATGA TGGTTGTTCCTGCTG 41 485 ispDF NONE LT41_RS08820 NONE LT41_RS08825 NONE pgpA 1675323 .. 1675339 + -3.1 -4.28651 TAGTTTTTTGGGATA TAAATTT AAA AGATTTA TTTTGAAATTTTGCT 56 3 rpsT NONE prfA 1677152 .. 1677165 + -2.5 -3.63305 GTTCACTTACTTCAC TTATA TAAA TATAA TTTCCCCATTGTGTG 48 404 chuA NONE chuB NONE chuC NONE chuD 1682674 .. 1682684 + -2.6 -4.25104 TTAAATTTGGCCATT TAAA AAG TTTA TTTTGATGAAGCAAA 55 294 kgtP 1685101 .. 1685113 + -7.7 -2.64099 CCAAAGCCCCTATAT CAAGC AAA GCTTG GTTGTGATCAAAGGC 65 442 LT41_RS08885 1686517 .. 1686555 + -13.6 -3.41114 TATTTGCAAATAACT TATAGCAAAATAAACT CCTTTTA AGTTTATTTTGCTATA CTTTTATCTTCAATT 100 28 LT41_RS08890 NONE LT41_RS08895 NONE LT41_RS08900 NONE LT41_RS08905 NONE ribD NONE LT41_RS08915 1688955 .. 1688967 + -6.3 -3.09635 TTCAGCAGCGTTGCA TGCTT TAA AAGCA TTAGCTCCTAAAACT 59 306 exbB NONE exbD NONE LT41_RS08950 1694482 .. 1694492 + -4 -5.08255 TACAATTTGTGCTTC TTGA TTT TCAA TTTTATTTTGAAAAT 70 68 LT41_RS08965 1696629 .. 1696644 + -9 -6.11229 AAATATTGCAATCAA GCCCAT GAAA ATGGGC TTTTTTTATTTTAAT 100 90 dnaG NONE LT41_RS08995 NONE LT41_RS09000 NONE murE NONE LT41_RS09010 NONE LT41_RS09015 NONE ispA NONE tkt NONE iamB 1709105 .. 1709127 + -2.8 -2.93073 TTTATTCTCTGTTAT TTTAACTTCT ACA GGAATTTAAA TGGTTATTAAAGCAC 41 4 iamA 1709826 .. 1709836 + -4 -2.93393 TTGCAAAATGAACGA CTTT TTA AAAG ATTTATGGAGTAAAA 45 2 LT41_RS09040 NONE LT41_RS09045 NONE LT41_RS09050 1711915 .. 1711953 + -12 -4.10657 ATAGTAATCGTTTGT TCTCTTTAAGCAAATATA ATA TATTTTAGCTTAAAGAGA TTTTCCAAACTCTAA 100 43 LT41_RS09085 NONE LT41_RS09090 1720395 .. 1720413 + -11 -3.89368 GCCAAAATAATTTTA CGCTCGGA TTT TCCGAGTG TTTGAATATTTTTAT 95 31 LT41_RS09095 NONE LT41_RS09100 NONE LT41_RS09105 NONE LT41_RS09110 NONE LT41_RS09115 NONE traF 1726140 .. 1726156 + -6.7 -3.75115 TACCCATTTTTTCTT TGATTTT AAG AAAATCA TTGGTTTTATGAACA 67 304 LT41_RS09185 NONE fliQ NONE murB 1733864 .. 1733875 + -3 -4.90079 AGTATAATTATTATA TAGT CTTC ACTA TTTTCTTATTACAGT 63 146 LT41_RS09200 NONE LT41_RS09205 1737445 .. 1737478 + -11.3 -4.26142 CTACTTGTTAAAAAT TTCATCCTGATAATT TTAA AATTATTAGGATGGA TGTTTTTATTGTATT 95 81 LT41_RS09210 1739480 .. 1739494 + -3.6 -4.77896 AATTTAATTTTGCAT TTTTTG CTG CAAGAA TTTTTCCATTGCTTG 66 160 LT41_RS09370 NONE rlmN NONE LT41_RS09380 1763399 .. 1763411 + -3.5 -4.72556 ATATAATTATACTAC TTTTT ACT AAAAA TTTTCTGATTTTTAA 62 142 LT41_RS09390 NONE LT41_RS09395 NONE LT41_RS09400 1763804 .. 1763818 + -4.3 -3.40403 AGCCACCATCACCCT TCCTT ATACA AAGGA TTATCATGCAAAACA 52 33 LT41_RS09405 1764718 .. 1764735 + -5.7 -2.9756 ATTTTCAAAACTCAC CAAAATA GAGC TATTTTG ATATTCTTTTTTATT 56 389 LT41_RS09430 1769873 .. 1769911 + -5.5 -2.6296 GATGATGTTGAAAAA TACTTTATCGGTGGAGGT TGAA ATC-CTACCGATAAAATA CTTCATTAAAATTTA 52 5 LT41_RS09450 1772465 .. 1772479 + -5.7 -3.73953 GTTTAAATCATCAAA GCACA AAAGG TGTGC TTTGATACACATCAT 63 35 ruvC 1777713 .. 1777732 - -3.6 -5.0133 TATTGCTTTAAAAAA TTTAACGC TTTG GCTTTAAA AAACTTTTGCGTTTA 68 176 flgE 1774961 .. 1775002 - -14.1 -3.06073 CACATTGCTTAAAAT TTTATTGC-AACTCACCCCT AGC AAGAGTGAGTTAGCAATAAA TTGAAGGCAGTTCAA 100 144 metB NONE metA 1772460 .. 1772484 - -11.6 -2.94299 CAAGAGTTTAAATCA TCAAAGCACA AAAGG TGTGCTTTGA TACACATCATAATTG 90 1 queF 1771214 .. 1771226 - -3.5 -5.48623 AAAGAGAAATAAAAA TATTT TAA AAATA GCTATAAATTTAAGA 76 112 LT41_RS09435 1769873 .. 1769911 - -6.3 -4.60487 GATGATGTTGAAAAA TACTTTATCGGT-GGA GGTTGAAA TCCTACCGATAAAATA CTTCATTAAAATTTA 76 31 leuA NONE leuB NONE leuC NONE leuD 1764097 .. 1764134 - -3.6 -4.0044 AATTATGATGATAAA GCCTTTTATCT-ACACC GTTTA GCTGTCAAACAAAAGGC AAAAGGCAAAGGCGT 56 225 LT41_RS09385 1762989 .. 1763002 - -3.8 -3.5774 AGTCAAGCTTTTAAA TGGC ATTAAA GCCA AAGTGAATTTAATAC 53 319 rsmA NONE LT41_RS09360 1758696 .. 1758709 - -5.2 -4.57073 GATCTTCCTTAAAAA GGGC GTTTTT GCCC TTTTTTACATTACAA 70 30 LT41_RS09355 1757740 .. 1757762 - -4.2 -4.40561 TTCCTTTAAAAAGAA CTCGTTAGTT AAA AACTAACCAA TTTATAAAAATTGAA 64 180 rpsJ NONE rplC NONE rplD NONE rplW NONE rplB NONE rpsS NONE rplV NONE rpsC NONE rplP NONE rpmC NONE rpsQ NONE rplN NONE rplX NONE rplE NONE rpsN NONE rpsH NONE rplF NONE rplR NONE rpsE NONE rplO NONE secY 1747944 .. 1747965 - -10.3 -4.38114 AAAACCTAGAATAAA TTAGCAAGA AAAA TCTTGCTAA TTTTATTTATTACAA 91 35 topA NONE bioB NONE LT41_RS09230 NONE gltA 1740966 .. 1740993 - -8.6 -3.54548 AATTATACAAGAAGA TTTTGTGGAATT TTTA ATTTCCACAAAA ATTTTAATTAAATTT 77 33 cysQ NONE LT41_RS09215 1739335 .. 1739359 - -5.9 -3.3082 AACTGATTAAAGATA TTTTAAACTAA AGC TTAGTTTAAGA GCTTTAGGTGGAAAA 60 15 recA NONE eno 1729382 .. 1729404 - -5 -3.39328 AAGCCCAAAAAATCA TTTTTATAAC ATG GGTATAAAAA CTTTTTTTTCTTGTG 54 69 LT41_RS09170 NONE cgpA NONE LT41_RS09160 1727653 .. 1727669 - -3.1 -2.92818 ATAAATAAAAGGAAG TATTTTA TCA CAAAATA ATTTTAAAGTCAAGG 43 35 LT41_RS09155 NONE LT41_RS09150 NONE LT41_RS09145 NONE LT41_RS09140 NONE LT41_RS09135 1727070 .. 1727081 - -3 -3.56568 GAATTATTTTTCAAA TCTT TTGC AAGA TAATTTTTAAATTTA 48 142 LT41_RS09130 1726484 .. 1726498 - -4.4 -4.3179 TTAAAAAACTAGAAA TTTTTA ACT TAAAAA GCTTAAAATTTAGAT 62 134 LT41_RS09125 1725865 .. 1725875 - -2.6 -4.92239 GTAAAAAGCTAAAAA TTTA CTT TAAA GCTTTTTATCCCCTA 63 21 LT41_RS09080 1716659 .. 1716691 - -5 -5.49729 AATTATTTAAAAAAA CAAGCCCAAGATACC AAAA AGT-TCTTAAGCTTG TTCTTAAGATATTTA 83 38 nhaA NONE nhaA NONE LT41_RS09065 NONE murI NONE map 1712057 .. 1712093 - -13.5 -4.00914 AAACTAAAATAAATA TTTAGATAATTTAACAA TTT TTATTAAATTATCTAAA CCATATTTATGTTTT 100 198 LT41_RS08985 NONE rnhA NONE rnc NONE aroC 1696629 .. 1696644 - -9 -3.37901 AAATATTGCAATCAA GCCCAT GAAA ATGGGC TTTTTTTATTTTAAT 77 31 LT41_RS08960 NONE LT41_RS08955 1694334 .. 1694347 - -5.3 -3.31232 TTTGTTAGATAAAAG TGCTT TAGA AAGCA TAAGAAAAGCTTCTT 56 130 LT41_RS08935 1692050 .. 1692069 - -4.4 -3.67864 GAAGTGAATGTGAAA CTTAAAAA ATAA TTTTCAAG CTTTCATTCTCAACA 56 7 LT41_RS08930 1691508 .. 1691529 - -7.4 -5.77571 ATCAAAAAATAAAAA TTTGGAAG ACTATG CTTCCAAA TTTTTGCATCAAATT 100 67 sdaC NONE sdaA 1688660 .. 1688689 - -9.5 -5.243 CAAAGGATGAAAAAA TACACTAAAGTGT AAAA ACACTTTAGCATA CTGTTTTTAAATTTG 100 18 mutY NONE LT41_RS08870 1681892 .. 1681905 - -3.9 -4.71382 AGAAGGACTTAAAAA TTTTG GTAT CAAAA GTATCAATTTAAAAG 65 522 LT41_RS08845 1676604 .. 1676617 - -6.7 -3.60412 GAAGCGGAGATAGAA GCGAA CGCA TTCGC ACTTACAATTTTCCA 67 195 mrp NONE dapD 1669252 .. 1669272 - -11.3 -4.00914 AAATTAAAAGAAAGA CATAAAGCT TAA AGCTTTATG TAAAATAAATTTATA 95 41 LT41_RS08720 1656585 .. 1656600 - -3.4 -4.26189 TTATAAACTCCAAAA TATAAT TTTA ATTATA ACATTTTAAGAGTGA 56 44 LT41_RS08715 1654924 .. 1654936 - -9.1 -3.93744 TGATAAATAATATAA GCCCA TTT TGGGC TTTAATCAAATTTTT 83 27 LT41_RS08705 1651496 .. 1651506 - -2.6 -4.00411 TAAAATTTTAAAGAA TTAT AAA ATAA AAAATAAGAAGCCAC 50 92 LT41_RS08700 NONE LT41_RS08695 NONE LT41_RS08690 NONE LT41_RS08685 NONE LT41_RS08680 NONE nuoA NONE nuoB NONE nuoC NONE nuoD NONE LT41_RS08655 NONE LT41_RS08650 NONE nuoG NONE nuoH NONE nuoI NONE nuoJ NONE nuoK NONE nuoL NONE nuoM NONE nuoN 1633321 .. 1633335 - -2.2 -4.62313 TAAAATTAAAAATAA TATTCT CAT AAAATA ATTATAGCAAAACTC 57 41 pflA 1630931 .. 1630946 - -5.4 -3.52192 TTTAACCTTAGATAA CTAGCC AAAA AGCTAG TTATCTCTAAATTTA 59 42 LT41_RS08595 1628311 .. 1628321 - -5.4 -2.96249 TGGGATTAATAATGA GCTT TTA AAGC TGCATTTAGATCTTT 54 125 LT41_RS08575 1625861 .. 1625884 - -9.7 -5.26247 TTAAAAGAAATAAAA GATGCCTTA AAAGCA TAAGGCATC TTTATTTATAGGCTT 100 31 hsdM NONE mloB 1622389 .. 1622404 - -3.4 -4.04355 AAAAAATACACGAAA TAAATT CGAG AATTTA AATTCGGAATTTCCT 54 176 hsdS NONE rloH NONE hsdR 1616158 .. 1616174 - -5.3 -4.28656 AGTCAAGAGTGAAAA TAATTTT TTA AAAATTA GTATAAATACTGGAT 66 170 LT41_RS08540 1614984 .. 1615008 - -14.5 -3.85817 ATTTCTTGGTATAAA TTCAAGACTCT TAA AGAGTCTTGAA TTTACTCATCTCTCA 100 27 LT41_RS08525 1613433 .. 1613443 - -2.6 -3.75897 AATTTTTAAGTCAAA TTTT TTA AAAA ATTTTTTTCAAGTGT 48 19 LT41_RS08520 1612150 .. 1612164 - -7.2 -3.3579 AAACCTTTTTAAATA CTACTT ATA AAGTAG GTTTAAAAAGCGATA 66 369 LT41_RS08495 NONE LT41_RS08490 1607281 .. 1607291 - -2.6 -4.30231 AATAATTAAGATAAA TTTT ATA AAAA ATGGGAATATTTGTA 54 69 acs 1605200 .. 1605223 - -9.7 -3.06831 TGAATTTTCATGCAA CAAGGCAAA GTTCTT TTTGCCTTG TTATTCAAACTCTGC 77 26 galU NONE pgi 1603003 .. 1603061 - -7.5 -4.14392 TTTTAATTTTTAAAA TTATAACATAAAATTCTTAAATAATAAT TATT ATTATTAATTAAAAATTTT-TATTATAA TTTTAACTTAAAATC 75 68 LT41_RS08470 1602504 .. 1602520 - -5 -2.57931 CCTAGTTTGTATAAT TGGGGC ATAAA GCCCCT TAAATTACATTTTGC 49 30 LT41_RS08465 1601035 .. 1601047 - -4.8 -2.76693 AAATTCCAAAATCCA TGGG TATAG CCCA AGCTTTAGTTGAAAG 50 401 purM 1598296 .. 1598315 - -9.4 -5.28983 CTTAAAATACAAAAA TAAAGCGT ATTA ACGCTTTA TTTTCACTCTAAAAC 100 29 cas1 NONE cas2 1592150 .. 1592178 - -10.3 -2.78547 TTAGTGGAGTAATTA GCCCTAGTGGAGT TTC AATCCACTAGGGT TTATTTTAGTCCCTT 79 274 nspC 1587205 .. 1587221 - -2.3 -4.66609 TATTTGATTTAAAAA TCACTGA ATT TCAATAA AATTCCACAAGGATT 57 188 LT41_RS08395 NONE LT41_RS08390 NONE fdhA NONE fdh3B NONE fdhC 1581801 .. 1581822 - -13.1 -3.12962 AAAAGCTTAAAACTA CCGCTATGT AATA ACATAGCGG TTAAAGATTAAATTT 100 33 fdhD NONE LT41_RS08365 1580065 .. 1580075 - -4 -4.0613 CCTAAAATAAAAAAT TTAG GTT CTAA TTTTAACATATTTTT 56 101 ccaA 1577919 .. 1577932 - -6.7 -4.55016 AGAAAAAATTTAAAA GCTCA AAAA TGAGC TTTTTTTAAAATCTT 76 31 yedF NONE selD 1576230 .. 1576240 - -4 -4.52042 ACAAAAATTAAGAAA TGAT AAT ATCA TTTTCTTGCTTATTT 60 7 putA NONE putP 1571089 .. 1571112 - -12.6 -3.06315 CTAAGATTTTTAATA CAAAAGCCTT AAAA AAGGCTTTTG TTCTCAAAGCTCTTT 100 29 LT41_RS08325 NONE purA 1568152 .. 1568166 - -7.2 -3.30243 ATTTACTTTTCATAA GATGAT AGT ATCATC TCTTTCAGGGCTAGT 68 5 LT41_RS08315 NONE LT41_RS08310 1567184 .. 1567196 - -4.9 -4.7153 AAAGAATGTTAAAAA TGAAA AAT TTTCA TTATTTTAATCACCT 68 39 LT41_RS08305 NONE carA 1565462 .. 1565472 - -2.6 -2.69601 CTCACATCAAATTCA TAAA TTC TTTA AAAATATACTTACTT 40 1 LT41_RS08295 1564789 .. 1564801 - -2.7 -3.84633 GATCTTTAAAAAAAT CTTTC ATT GAAAA GCCTTAAAACCTATA 50 16 LT41_RS08290 NONE LT41_RS08285 1562832 .. 1562849 - -5.7 -2.97381 AGAATATTAATTATA CATTTTT TCTT AAAAATG ATAATTTTGTTAATC 57 77 ccoN NONE ccoO 1560612 .. 1560628 - -2.3 -2.57672 CACATCAAAAACTAT TGATAAA TGT TCCATCA TCTTACTTTAAGCTA 38 28 ccoQ NONE ccoP NONE LT41_RS08260 NONE LT41_RS08255 NONE LT41_RS08250 NONE LT41_RS08245 NONE LT41_RS08240 NONE LT41_RS08235 1552919 .. 1552949 - -8.6 -3.96386 GTATAAAAAATAATA TTAATTTTTACTTA ATT TAAGTAAAAATAAA GTTTATATTTCCAAA 82 28 rplM NONE rpsI 1552027 .. 1552043 - -12.3 -3.99917 AAAAAATTGTAGAAA GGTGGGA AAA TCCCACC AAAAATATTAACGTT 100 33 cadF NONE LT41_RS08215 1550282 .. 1550292 - -2.6 -3.27298 TTTTTTAACTATCAA TTTA CTA TAAA TTCTCTTAAAAGGCG 43 59 nifJ 1546636 .. 1546657 - -3 -4.41348 TCTTGTGCAAACAAA GTGCTAAA ACACAA TGTAGCAC TAAAAATATATTTTA 58 41 ctsR NONE mshL NONE ctsP NONE LT41_RS08190 NONE ctsE NONE LT41_RS08180 1540964 .. 1540975 - -3 -3.85724 AAAAACTAATGGAAA GTTT ATAA AAAC TTTATTTTTAATCGT 52 79 thiL NONE truD 1531107 .. 1531121 - -5 -3.68351 TCTTGATTACCTAAA TCAAAC ATA GCTTGA TCGTTGCCATTGTTT 58 248 LT41_RS08115 1530808 .. 1530822 - -11.4 -3.40925 AAAATTAGAAAGATA GCGGGA TTT TCCCGC TTGTTTTATTATCTT 87 111 rimO NONE tilS 1525152 .. 1525170 - -5.4 -4.95957 GAAATCAACCAAAAA TATTACCA TTA TGATAATA CAAACGAAGTTTCAA 76 376 LT41_RS08075 1523046 .. 1523062 - -2.4 -3.32684 TTTTAAACAAAATCA TAAAAA TTTAT TTTTTA CAAAACTCAAGCTTT 43 16 kpsM NONE kpsT NONE kpsE NONE kpsD 1518761 .. 1518773 - -4.9 -2.74461 TATTCATTTTTAAAC CTTAA AGA TTAAG CACAACATTGGTTGC 50 14 kpsF NONE LT41_RS08045 NONE LT41_RS08040 NONE LT41_RS08035 NONE LT41_RS08030 NONE LT41_RS08025 1508001 .. 1508029 - -6.7 -3.09671 AGTGGAATTTGAAGA CCATCAGCCTTTA TAT TTAAGGCTAAAGG TAAATTTGTGTTATA 62 485 LT41_RS08015 NONE LT41_RS08010 NONE LT41_RS08005 NONE LT41_RS08000 1505530 .. 1505549 - -4.3 -4.49781 AAAACATCCATAAAA GGCTTTG GTTTAT CAAAACC AGCCTTTGCAAAACG 64 73 LT41_RS07995 NONE LT41_RS07990 NONE LT41_RS07985 NONE LT41_RS07980 NONE LT41_RS07975 NONE LT41_RS07970 NONE LT41_RS07965 NONE LT41_RS07960 NONE LT41_RS07955 1493279 .. 1493289 - -4 -3.98172 AGTAATACCTATAAA CAAA ATA TTTG CTCACTTTCACATTC 54 8 LT41_RS07950 NONE LT41_RS07945 NONE cysC NONE kpsC NONE kpsS 1488157 .. 1488182 - -4.8 -2.93853 CTCTCTTAATCAAAG CTTTTTAGTC TTATTT GTCTAAAAAG AAATTTTTATAAAAA 50 10 LT41_RS07925 NONE LT41_RS07920 NONE LT41_RS07915 1484975 .. 1485001 - -5.8 -3.29973 TTAAAAATCCAGCAA CTCTAGCAGGTC TTT GGGCTGCTAAAG AAGCCGCTAGCAAGG 59 223 pgmL NONE LT41_RS07895 1482371 .. 1482388 - -5.6 -4.58395 GGTAGGGTTTAAAAA GGCTAA ATTTAA TTAGCC TTTTAATTTTTAGAG 70 35 gap NONE pgk NONE tpiA NONE fabI NONE LT41_RS07860 1476074 .. 1476090 - -2.9 -3.39595 TGTAATGATTTATAA TCCCTGC TTT GCAGCAA CTATAGTTTTTTCAA 48 147 LT41_RS07820 1467012 .. 1467051 - -5.3 -4.86033 AAAGCTTTAGAAAAA TAATTTTTA-CTTGCCAC TTTTG GTGGCAAACTAAAGATTA TAATAATTAAGGAAA 74 516 LT41_RS07805 NONE LT41_RS07800 NONE fldA 1463882 .. 1463903 - -7.4 -4.0865 TTTAAGAAAAGACAA TCAAGAGT ATAAAA ACTCTTGA TTTTAAGAATTATTA 75 38 LT41_RS07770 1457632 .. 1457657 - -2.7 -4.2237 AAACTAATTGTAAAA CTCATTTTAAA CTTT TTAAAAATGAA ACTCATGGAAGTGTC 55 81 rdgB NONE LT41_RS07720 NONE glmS NONE LT41_RS07710 NONE fumC 1439280 .. 1439299 - -10.8 -3.22106 AAGAATTTAATTTAA CTTGCCTT AAAA AAGGCAAG TTTTATGTTCTAGGC 85 35 LT41_RS07690 NONE ssrA 1436283 .. 1436309 - -6.7 -4.72729 TAAGGAAAACTAAAA GTTTTTAGGGT TTTAC ACCTTAAAAAC TTTAAACTATGAATT 78 81 nrfH NONE nrfA 1431620 .. 1431637 - -9.9 -5.67711 CAAAGAAAAGAAAAA GCCCTAT GATT ATAGGGC TTAAGAATTATTTTT 100 33 LT41_RS07665 1430931 .. 1430949 - -11.8 -3.8648 AAAAAATAAATAATA CCTAGCTT AAA AAGCTAGG AAAAATCAAAGGCTA 100 31 LT41_RS07660 1430698 .. 1430712 - -5.8 -3.23975 AGTCTTTAAAAACTA TGATTT TAG AAATCA AAAACGCTGTAAAAT 58 115 LT41_RS07635 NONE LT41_RS07630 NONE LT41_RS07625 1424802 .. 1424822 - -5.5 -4.08692 TAAGCTTTTTTAAAA GCTTTTAAA AAC TTTCAAAGC GTGTTTAAATAGACT 64 61 LT41_RS07620 NONE LT41_RS07615 NONE LT41_RS07610 1423522 .. 1423559 - -7.2 -5.055 TTAAGTTTTAAAAAA CTTAATCAAAGTGCTT TAATTT AAGCACTTTTGTTAAG CTTTTTACCCAAATG 90 8 LT41_RS07605 1423008 .. 1423062 - -9.1 -3.37761 TTCTAATAAATTTAA GTTTTAAAAAACTTAATCAAATCCAC CTTA GTAGATTTG-TTAAATTTTCTAATAC GCCTTAATTACTCCA 77 19 LT41_RS07600 1422622 .. 1422634 - -9.1 -3.08046 TCTTTATCGCAAAAG GTGGC TTT GCCAC ATTGCGAAGTCAAAG 74 35 LT41_RS07595 NONE LT41_RS07590 1421760 .. 1421792 - -7.2 -4.62872 ATTAAGTTTTAAAAA CTTAATCAAATCCGC CTTA GCGGACTTG-TTAAA TTCTTTTAAGTCTAA 81 21 LT41_RS07585 NONE LT41_RS07580 1420979 .. 1421015 - -3.1 -4.86731 CCTTGCTAAATAAAA CTTAATCAAGCCCATTA AAT CAATGGACTTTGTTAAA TTTTTTGGCTTTTTT 63 79 LT41_RS07575 1420786 .. 1420798 - -3.4 -2.90573 GGACTCATAGCAAAC CTCT TATAT AGAG TTCTTTTTTTAAAAA 43 2 LT41_RS07570 1420305 .. 1420328 - -9.8 -4.76191 ACAGATCAAAATAAA TCCTTTAAAA AAGC TTTTAAAGGA TTATATCTATTTTTA 100 47 LT41_RS07565 NONE LT41_RS07560 1419586 .. 1419598 - -7.7 -3.41073 TAGTCTATCCAAACA TCGCT TAA AGCGA CCAAAGGGCATAATG 68 68 LT41_RS07495 NONE LT41_RS07490 NONE LT41_RS07485 NONE LT41_RS07480 NONE LT41_RS07475 NONE LT41_RS07470 NONE LT41_RS07465 NONE LT41_RS07460 NONE LT41_RS07455 NONE LT41_RS07450 NONE LT41_RS07445 1403110 .. 1403122 - -7.7 -3.62597 TCCACCTTGCAACAA GGGAT TTC ATCCC CTTGACCCCTCTCTT 70 106 LT41_RS07440 NONE LT41_RS07435 1402006 .. 1402025 - -6.6 -5.0133 CATCTTTTTAAAAAA CTTTAAAA TCGT TTTTAAAG CCTTTTTAACACTCG 85 294 LT41_RS07425 1399950 .. 1399964 - -2.2 -3.70076 TCAAACTCACCTAAA CAAAAT ATC ATTTTA ACCCCAAATTGTTGT 47 23 LT41_RS07420 NONE LT41_RS07415 NONE LT41_RS07410 1398419 .. 1398436 - -5.5 -4.83615 TAGTTTTTAGAAAAA GGAAGGC TTTA GTCTTCC TTATTACCCTTCAAA 74 29 LT41_RS07405 1397498 .. 1397515 - -8.5 -5.13722 TTTACTAAAATAAAA GAGAGTA TTTT TACTCTC TTAGCTTTTAAAAAT 100 33 LT41_RS07360 NONE LT41_RS07355 NONE cdsA NONE dxr 1389071 .. 1389093 - -2.8 -2.89944 ATAAAAAATAAAATT GTTAAAAAAA TTT TCATTTTAAC TCCTTAAATACTCTC 41 21 LT41_RS07340 NONE tsaD NONE LT41_RS07330 1386084 .. 1386107 - -6.8 -2.82516 TTTTTCATCATCATA CCAAAGCTTA AATT CAAGCTTTGA TTCTCTTTTTATATC 61 91 LT41_RS07320 1383097 .. 1383115 - -2.4 -3.72576 TTTTTTTCTAGCAAA TTCATGGA AGT TCCTTAAA AGAATCGATGATAAT 47 8 LT41_RS07315 1381210 .. 1381229 - -7.2 -2.89655 CCTTTTAAAAAAATT CAAGCTCA TCCA TGAACTTG TTAAATGCTATATCG 64 80 LT41_RS07310 1379411 .. 1379428 - -9.9 -5.79595 GTTTAAAATAAAAAA GCCTAGT TTAA ACTAGGC TTGGATTTGTATATA 100 57 LT41_RS07305 1377561 .. 1377584 - -9.7 -3.10134 AAAGCACTTTAAAAG CTTAGATGC ATAAAA GCATCTAAG AAATTATTGAAGAAG 77 29 pseA NONE hisH NONE LT41_RS07195 1353030 .. 1353051 - -3.1 -4.08394 ATACGCTTTTGAAAA CTTAAAAGT AAAT ACTCTTAAA GCTTATGTTTTCAAA 55 122 LT41_RS07175 NONE LT41_RS07170 1348787 .. 1348834 - -12.2 -5.69023 AAAATATCAAAAAAA TGCTTGAAACTGCAATGAAAGA CTAA TCTTTCCTTGCAAGTTCAAGCT GTTCTTTTAAAGAAC 100 0 LT41_RS07155 1345341 .. 1345354 - -3.8 -3.95883 CATCATGGAAAAATA CGCT AATTTA AGCG CTTGTTCACTACCTG 56 418 accB NONE accC 1333730 .. 1333760 - -12.9 -3.79689 AGATAAAAATTACAA TTAAAATTTCCCT TTAAT AGGGAAATTTTAA TGTCTTGCAAGATAA 100 22 LT41_RS07075 NONE LT41_RS07070 NONE upp 1329596 .. 1329606 - -5.4 -2.87344 CATCTCTTTTATAGA GTGT TAA ACAC TCTATCTCCTGCATC 53 8 LT41_RS07060 1328842 .. 1328860 - -3.8 -3.92373 TACCTGATTTAGAAA CCACGACA GTT TATAGTGG AGATGTTGTAATACT 56 77 LT41_RS07045 1326539 .. 1326553 - -7.8 -3.25942 AGTTGGTTAGAGCAA CCGGCT CAT AACCGG TTGGTCGCAGGTTCG 69 168 LT41_RS07030 NONE LT41_RS07025 NONE trmB NONE LT41_RS07015 NONE LT41_RS07010 1320408 .. 1320429 - -3.8 -6.32976 AAAAAAACAAAAAAA GATAAGAA TATTTT TTCTCATC TTTTAACCTTAAACA 93 21 LT41_RS07005 1319231 .. 1319248 - -4.2 -2.86288 TAAATTCCATTAAAT TTAGCT AATTTA AGCTAA TGAGTTCCAAAGGAT 48 12 pyrH NONE rpoZ NONE spoT NONE tyrS NONE LT41_RS06980 NONE amiA NONE mnmC 1309922 .. 1309935 - -5.3 -3.91084 TCACTCTTAATTAAA GCTTA ATCA TAAGC CTTTTTTAAGTTTGC 62 18 hydA NONE hydB NONE cybH NONE hydD 1305381 .. 1305393 - -3.5 -4.83246 CGATAAAGAAAGAAA TAAAA ACA TTTTA TGTATAGTTGAAAGC 66 346 dnaJ 1301935 .. 1301963 - -3.3 -5.38951 AATTTATATAAAAAA TTTTCCC-AAGC TAAAAC GCTTTAGGAAAA TTAAGACTTAAACCA 72 26 LT41_RS06915 NONE LT41_RS06910 1297946 .. 1297962 - -5.1 -5.77677 TAAAACAAGAAAAAA GCTAGTT AAT ATCTAGC TTTTGCGTGTTATCC 90 10 LT41_RS06870 NONE uvrC NONE LT41_RS06860 1284353 .. 1284363 - -5.4 -2.88433 AGGTGAAAAACTAAG CTTC AAT GAAG AAGAATTATTAAAAA 53 177 LT41_RS06835 1279828 .. 1279850 - -6.4 -4.55383 AATTTACAAAAAGAA TTGCTTTTAA ATT TTAAAGGCAA TGGCGTTTATCTACC 76 298 LT41_RS06820 1277213 .. 1277243 - -4.2 -4.73388 AATTTTGATGAAAAA TTTCATTTTTTCGA ATT TCAAAAAAACTAAA ATTTTATATTTTTCA 69 21 htrA 1267907 .. 1267931 - -12.3 -2.82666 TTAAACTAAAATTTA TAACGAAAGGA AAA TCCTTCCGTTA TTTTTATTTAAGCAG 88 29 LT41_RS06770 NONE LT41_RS06765 1265919 .. 1265934 - -3.4 -2.88667 TTTCACAAAAATGCA TTTTTT ATGT AAAAAA ATTAATTTACTCCTT 43 32 LT41_RS06760 1265688 .. 1265714 - -11.1 -5.95449 AAACAAAATAAAAAA CTTTATCACAA TTTTT TTGTGATAAAG ACTTATTAATTTTTT 100 85 dccR NONE dccS 1262644 .. 1262657 - -5.3 -4.13654 CTGTTAAAGTAGAAA GAGTA GCTT TACTC AATGCAGTTTCTGTA 64 197 LT41_RS06725 1258157 .. 1258173 - -5.3 -3.4582 TGAGTCCATTAAACA TTTTTTA CCT TAAAAAA TCTTATTTAATAATT 57 18 LT41_RS06720 NONE LT41_RS06715 NONE LT41_RS06710 1256632 .. 1256645 - -4.5 -3.54741 GAGCAGGTTGTTAAA GAAGC CCTA GCCTC GAATCAACCTAATCC 54 77 LT41_RS06700 NONE glcD 1253288 .. 1253304 - -4.5 -3.76174 AAATTTAGTAAAATA GTAAAAA AAT TTTTCAC CTTCTAAAGTCCCAT 56 29 rbn 1252417 .. 1252435 - -3.2 -2.52017 TTTAAATTTAAAATT TATGGA ACTAATA TCCATA TCCCATTTTGGATTT 42 88 LT41_RS06665 1247982 .. 1247992 - -2.6 -5.40072 CCTTTTTTAAAAAAA TTAA ACA TTAA AGTATAGCCTTTTGT 69 22 ftsY NONE radA 1245730 .. 1245740 - -2.6 -3.33744 GGTTTCCTCAAAAAT TTTA TTC TAAA CTCGGAATTTTAGCA 44 68 atpB 1245032 .. 1245042 - -3.2 -3.43039 AAATTCTAAAATATA GATC AAT GACC TTCCTCAACAACAGT 47 17 LT41_RS06645 1244634 .. 1244644 - -2.6 -4.12942 CTAAATTTGTTAAAA TTTT AGA AAAA TATGAAAATAATGCT 53 227 gatB NONE gpsA NONE LT41_RS06605 1235061 .. 1235076 - -6.2 -2.75891 ACACGGAGCCAATGA TATAGC CAAT GCTATA GGTCCTTTTGCAGCG 57 447 LT41_RS06595 NONE cetC 1230849 .. 1230859 - -2.6 -4.13945 ATTTTTAGGCGAAAA TTAT ACA ATAA AAAAGATTAAATATA 52 47 cetA NONE cetB 1228828 .. 1228859 - -12.6 -2.61736 AAGATTATATAATAT TTAGACTTAAAACA AACT CGTTTTAAGTCTAA CAAAAATTTATTTAG 95 33 mnmG NONE arsB NONE petA NONE petB NONE petC 1222617 .. 1222662 - -2.1 -4.77719 TAAAATTGAAGAAAA GATAGAATTTTTGCCAC AGATATAAAATA GTGGCAAAAATTTTATA ATACTAATGTAATTT 60 29 cfa NONE rpsB NONE tsf 1219400 .. 1219412 - -3.4 -3.54459 TTAACCGTTTTTAAA GTTG TGCAG CAAC TTCAGCCGCAAAATC 48 8 LT41_RS06530 NONE fliR NONE LT41_RS06520 NONE gmk NONE tatA 1215752 .. 1215762 - -4 -3.84027 TCATTAAAAATAATA CTTT TCA AAAG ACTAAACCTTAAGCT 54 34 argS 1214146 .. 1214170 - -8.7 -2.96873 ATTTTTACTAAACTA TTAAAACAGCA AAA TGCGGTTTTAA TGTTCCATTTTGTTT 71 22 LT41_RS06490 NONE ppi 1212183 .. 1212196 - -2.5 -2.60508 TAGTTTCGAAAAAGT TTTAA AATT TTAAA TTTTATCGCAAATTT 40 21 omp50 NONE LT41_RS06475 1210357 .. 1210371 - -7.1 -4.946 ATTAAACAGTAAAAA GCGGT TTTAC ACCGC TTTTTTTATTTACCT 86 31 LT41_RS06470 1209698 .. 1209712 - -8.6 -3.46285 AAAGATAAAATTTAA GCCTTT TTA AAAGGC TTTTTGATTTTAATA 75 7 LT41_RS06460 NONE LT41_RS06455 NONE LT41_RS06450 1207028 .. 1207083 - -6.5 -3.03575 ATAAAAATTTATACA TCTTATATCCTTTTTTGCTTGACAT TTTAAG ATATTAAGCTAAAAAGGATATAAAT ATTTGTTATTTTTAT 59 46 czcD NONE LT41_RS06440 NONE copA 1203754 .. 1203782 - -6.3 -3.18507 AATATATTTTAGTAA TATTAATTATATA TAA TATATTATTAATA AAAATTAAATTTTTA 61 38 LT41_RS06430 NONE LT41_RS06425 1203125 .. 1203143 - -9.6 -2.95472 ATATGCTTAAAGAAG GGGCCAAA AAA TTTGACCC ACAAGAAGATCTTAA 75 83 LT41_RS06410 NONE ccoS 1197693 .. 1197714 - -6.7 -5.06103 ATAATTTCTAAAAAA GGCTTTTCTT TTT AAGAAA-GCC TTTTTTTATCCAAAG 86 15 gmhB NONE rfaD NONE rfaE1 NONE gmhA 1193593 .. 1193605 - -4.8 -3.63744 CCCTTTGTCAAAATA TCGC TTTTT GCGA TCTTTTCATCACAAA 58 268 waaV NONE LT41_RS06365 1191183 .. 1191197 - -5.8 -3.78168 AAAAAGAGTTAATAA TATAAG CTT CTTATA ATTTTTTTATAAAAA 63 21 LT41_RS06325 1183295 .. 1183312 - -4.2 -4.24654 AAAATTTAAAAAAGA TCCTTT GAATTT AAAGGA AAAATTACCTATAAT 60 118 LT41_RS06300 1177921 .. 1177934 - -2.5 -3.158 AAATAAATTTTAATA TATTT TCTT AAATA CTTAAGATCGAACTT 43 27 galE NONE pglK NONE pglH NONE pglI NONE pglJ NONE pglB 1169981 .. 1169994 - -2.5 -3.60792 TTTTCAACCCTTAAA TTTTA AGTT TAAAA ACTTTAGCATCTCTA 46 7 pglA NONE pglC NONE pglD NONE LT41_RS06250 1166949 .. 1166970 - -2.3 -3.96624 TATGCGGAGGAGAAA GAAAAAATC TCAT GATTTATCC TTTGTGTAAAACAAA 49 112 pglE NONE pglF NONE pglG NONE cheY NONE prmA NONE ftsH NONE LT41_RS06215 NONE pssA 1158240 .. 1158264 - -11.7 -2.74514 TCAAAGTTCCAATCA TTCCATTAAAA ATC TTTTAATGGAA TATCTTGAAATTATA 87 229 LT41_RS06200 NONE LT41_RS06195 NONE cetZ 1155202 .. 1155222 - -12.7 -4.7078 TTAATTACTTAAAAA TAAGCGTGA AAA TCACGCTTA TGACATCGCTTTAGC 100 23 metK 1141572 .. 1141600 - -9.8 -3.31501 ATTAATTCTTTATAA TTATACAAGCCT TGTTT AAGCTTGTATAA TATTGTTAATTTTTT 80 39 yajC NONE secD NONE secF NONE leuS NONE LT41_RS06090 NONE LT41_RS06085 NONE folC 1131492 .. 1131508 - -7.3 -3.66356 ACTTCTAAGCCCAAA GCCTCTT CAA AAGAAGC TATTTTATCTTCTAT 72 301 LT41_RS06070 NONE mfd 1127624 .. 1127651 - -2.2 -2.53876 TTTTATTCCAATCCA TTTTAA-GCCTTT CTT AAATGCGTTAAAA TTGCCTCTAAAATAT 38 0 LT41_RS06060 NONE LT41_RS06055 NONE thiD NONE thiE NONE hemD 1123644 .. 1123661 - -4.9 -5.10877 ACAATAAATTAAAAA TTTGCCT AAAA AGACAAA CAAAACATTGCCTTG 75 506 LT41_RS06010 NONE lon 1118251 .. 1118265 - -4.3 -5.32944 GGCACAAGCAAAAAA TACCA AGAAA TGGTA GAAGTTGCAATCAAA 81 178 ileS NONE LT41_RS05945 NONE gatA NONE guaB NONE xseB NONE LT41_RS05925 NONE LT41_RS05920 1102863 .. 1102879 - -5.2 -3.68351 TTTGCATCATTTAAA CCTTTA TACTT TAAAGG CTAAATTTTAGCACT 60 67 murC NONE LT41_RS05910 NONE mutS NONE LT41_RS05900 1094878 .. 1094896 - -3.2 -3.70902 TTTTTCATAGCTAAA CCTTATAA AAT TTACAAAG TTTAGCGAAAAATGC 50 42 npdA NONE LT41_RS05890 NONE dapE NONE thiS NONE thiF NONE thiG NONE thiH NONE LT41_RS05860 NONE LT41_RS05855 1088043 .. 1088056 - -2.5 -2.92192 TTTCATTGAATTATA TTTAT TTAG ATAAA AAAAATGTGCTAGTT 41 35 LT41_RS05850 1086697 .. 1086716 - -6.4 -3.99955 AATACACTAAGCAAA GGTATAGC TAAA GCAATACC TATAATCGAAGAAAT 68 461 pycA NONE LT41_RS05825 NONE ate NONE LT41_RS05815 1080426 .. 1080452 - -6.1 -5.05601 TATGAGAGAGAAAAA TTAAATTAACC CAAAT GATTAATTTAA TTTTTTAAGTATTAT 79 30 lepA 1073432 .. 1073448 - -6.7 -4.18697 AAAATTATTTTAAAA TTGTATT AAA AATACAA GCAAATTTCAAGCCA 73 57 LT41_RS05790 NONE LT41_RS05785 NONE gyrA NONE flgP NONE flgQ NONE flgR NONE asd NONE LT41_RS05755 NONE LT41_RS05750 NONE LT41_RS05745 NONE livJ NONE livK NONE livH NONE livM NONE livG NONE livF NONE ccsA 1056010 .. 1056021 - -3 -2.78798 ATGGTTCATTTAAAG TTTG CCCA CAAA ATTTCGCTTCCTTCT 43 8 LT41_RS05705 1055400 .. 1055427 - -9.4 -5.08015 AAGCTAAAAAACAAA CAAAATAAGCAA AATT TTGCTTATTTTA AGAATATTTATATAT 100 137 LT41_RS05685 NONE aroB NONE LT41_RS05675 NONE mtaB NONE LT41_RS05665 1046537 .. 1046561 - -5.9 -4.15029 ATCTTATATAAAGAA TTTGATGAT TAAACAT ATCATCAAA CCTGCATTATATCTT 67 21 LT41_RS05655 NONE LT41_RS05650 1044940 .. 1044956 - -2.9 -4.12151 ATAAAAAAACTCAAA CACCCTA AAG TAGGAAG AAAACTAAAAAATTA 55 75 LT41_RS05635 1040925 .. 1040941 - -3.1 -5.28831 ATTAATAAAATAAAA TTTTCTA AAA TAAAAAA TAATTTTTATTACCA 72 35 LT41_RS05630 1040265 .. 1040280 - -9 -3.60805 ATATTGTATTTTAAA GTAGCC CTAA GGCTAC TTTTTATTCTGCTAA 79 29 hemB NONE argF NONE LT41_RS05605 NONE hemN NONE LT41_RS05595 NONE LT41_RS05590 1033220 .. 1033232 - -2.7 -4.43879 ATTACTCAACCAAAA CATAC AAA ATATG AAAGAAGATATAGTC 58 121 LT41_RS05575 NONE hipO 1030308 .. 1030321 - -2.5 -3.61465 CCCCAAAAAAGAAAT TTTAT ACCT ATAAA TTTGTAAAAAATGGT 48 218 cjaA 1027478 .. 1027498 - -9.8 -3.33865 TATCCTAAATCAATA TAAAGGGC AAAAA GCCCTTTA TTAAATTTTTCCACC 80 26 cjaB 1025726 .. 1025737 - -3 -3.71108 AAAATGAATTTGAAA TTTG CGAT CAAA GTAAAAAACTTTTAA 50 499 LT41_RS05540 NONE LT41_RS05535 1024141 .. 1024151 - -4.6 -3.48153 ATCAACAATCCAGAA GCCG TAG CAGC TGCATTAATGGCCTC 54 57 LT41_RS05500 1015812 .. 1015840 - -14.9 -2.76911 AGGCAAACAAGCAAG CTTTGAAGAATTA AAA TAATTCTTCAAAG AGCTTTTTTAACTGC 100 7 rpmH NONE rnpA NONE yidD NONE yidC NONE LT41_RS05460 NONE mnmE NONE purL NONE LT41_RS05445 NONE purH 1004346 .. 1004389 - -14.4 -3.55203 AAAATTTTTCGGAAA TATTTTACACATAATTTAAT TTTT ATTAAATTATGTGTAAAAAA CATAACATTCTATTA 100 44 LT41_RS05435 1003816 .. 1003833 - -4.1 -3.55071 TTATATCTTTTTAAA CACCTTC TAAA GAATGTG ATATATCCATAACCC 54 44 LT41_RS05430 NONE LT41_RS05425 NONE LT41_RS05420 1002251 .. 1002266 - -9 -2.86661 AATTTAAGAAGATTA CCTCGA TATT TCGAGG CTTTAGGATATTATT 73 36 LT41_RS05415 NONE LT41_RS05410 NONE LT41_RS05405 999434 .. 999464 - -10 -4.87008 AATATACAAAACAAA TAAGATTTATTGAT TTA ATCAATAAATCTTT TAGTTAAATCTGCAA 100 9 pif1 NONE LT41_RS05390 995749 .. 995759 - -5.4 -3.93166 TTTTCAAAAAAGCAA GTCT TAT AGAC AAAGATAAACTTGTA 61 220 secA 992772 .. 992784 - -3.4 -3.16783 TATTCAAGCTAAAAT TCCT TGCTT AGGA CCACTTTTTCCATGG 45 1 LT41_RS05375 NONE glnP NONE LT41_RS05365 NONE LT41_RS05360 990501 .. 990527 - -3.2 -3.08358 GTAAAGAAGTAGAGA TTATAAAACC TATTTAT GATTTTATAA AATGGTGGTCACTAT 44 28 LT41_RS05355 NONE LT41_RS05350 990298 .. 990309 - -5.8 -3.86202 GGCCACTAGACGAAA GGGT CATA ACCC TAACAATAAAAATGG 66 38 LT41_RS05345 NONE LT41_RS05340 990116 .. 990142 - -3.2 -3.08358 GTAAAGAAGTAGAGA TTATAAAACC TATTTAT GATTTTATAA AATGGTGGTCACTAT 44 28 LT41_RS05335 NONE LT41_RS05330 NONE aas 985910 .. 985932 - -5.7 -3.91911 GCTATGGTAATGAAA GCTAAACTA GATAG TAATTTAGC CGTAAGTGCTGTAGC 64 106 LT41_RS05305 982875 .. 982885 - -4 -2.64472 TATTTTTCAAACTCA CTTT AAA AAAG CGGCTATCATAACTA 44 12 LT41_RS05300 NONE pycB NONE pckA NONE argH 976681 .. 976704 - -9.7 -3.12999 GCATTTTAGATTCAA TGTTTAGGC AAAATA GCCTAAACA ATATTTATAAATTTT 78 30 cheB' NONE cheR NONE pebC NONE peb1A NONE LT41_RS05230 NONE LT41_RS05225 967573 .. 967592 - -8 -4.81249 CTGTAAATTTAAAAA GCTTATAT AAAA ATATAAGC TTTTTTAAGAAATAT 89 30 prsA 966530 .. 966550 - -7.7 -4.82678 GCATAAAAATGAAAA GCTTAAAAA TAA TCTTTAAGC TTTTTTAATCTAAAT 86 35 cstA NONE kcuS 963986 .. 963998 - -4.9 -2.56596 GGCTTTAGTAACTTA TGTAA GTG TTACA AGAGATGGAAAGAAA 50 131 ciaB 961717 .. 961735 - -3.3 -2.72121 AAAAACAATATCAAG TAAAAAA CAGCT TTTTTTA AGTTTTTTTCAAAAA 42 47 hupB 961334 .. 961352 - -8.9 -4.27694 TTAATTAAGAAAGAA GGCTAGA ATTTA TCTAGCC GAAGTTTTATTTTTT 86 32 cysM 960297 .. 960319 - -8.6 -3.15197 CAAGAAATTTTAAGA GAACTTAGAA TTT TTCTAAATTC TCAATAATTATACTT 73 39 LT41_RS05165 NONE alr NONE LT41_RS05155 955687 .. 955697 - -2.6 -3.67611 TTTACTTTAACATAA TTTT TAT AAAA AGGACTTTATGATTT 48 76 LT41_RS05150 954151 .. 954175 - -11.6 -3.32769 GTTTTAAATCATTAA TTCATAAGCC ACTAA GGCTTATGAA TTTTAATCCCAACAT 90 28 LT41_RS05135 NONE thiJ 951839 .. 951855 - -6.6 -3.76125 TTATTTTAATTTAAA TGGTAG AAAAA CTACCA TTTAAACTATTTTGT 66 32 pheS NONE pheT NONE aroA NONE ispH NONE rpsA NONE LT41_RS05095 NONE serA NONE LT41_RS05085 NONE LT41_RS05080 NONE LT41_RS05075 938111 .. 938127 - -9.5 -2.62983 CTCAGGGGTAGAGCA CAACCTT GCC AAGGTTG GGGTCGCGAGTTCGA 74 89 flgL 935539 .. 935549 - -2.6 -3.91846 AAAATCAAAGCCAAA TTAT ACC ATAA AAAATTTTACATATA 50 32 ftsK 932302 .. 932315 - -3.8 -5.03747 AAATTCGCTAAAAAA CCAG GTGATA CTGG TTCAACAGAAGTTCA 70 316 LT41_RS05045 NONE flhA NONE LT41_RS05035 NONE LT41_RS05030 928217 .. 928231 - -5.8 -2.71018 AAAATTAAAATACAC TTTTTC ATT GAAAAA AATCTTTGTATTTAT 55 15 LT41_RS05025 927565 .. 927578 - -2.5 -4.56597 TGTGGTTTTTAAAAA TTTTT ATTT AAAAA TTAAAGCATTTATTT 60 39 xerD NONE pabB NONE pabA NONE LT41_RS04975 918262 .. 918294 - -5.8 -4.56597 TTTTTCCTTGAAAAA GTTTAAAAATGC ACCATTATA GCATTCTTAAAC TTTTGAAAAAATATA 73 42 murA NONE moeA 915811 .. 915831 - -8.4 -3.27667 GATAAATTAAGCTAA TGTTTGTG AAAAA CACAAACA TTATATTTTTAAAAG 73 26 LT41_RS04950 NONE hemL NONE LT41_RS04940 NONE LT41_RS04935 NONE LT41_RS04930 NONE LT41_RS04925 NONE LT41_RS04920 907658 .. 907670 - -4.1 -4.55798 TAGTGTAAATGAAAA GCATT TAG AACGC ATTAGTAATTTGTAT 65 337 gltX NONE LT41_RS04900 NONE LT41_RS04895 902740 .. 902764 - -11.5 -2.93089 GATTATTTTAAAGTA TCTCTTCCTAG TGT CAAGGAAGAGA TTAGGCTTGTAGCTA 87 38 mobB NONE fbp NONE LT41_RS04875 NONE metG NONE LT41_RS04865 897779 .. 897803 - -7.2 -3.02564 AGAAAAAATTAATCA TCCAAAAGCT TTTAG AGCTGTTGGA AATGCAAATTCTAAA 64 155 acnB 894893 .. 894906 - -3.9 -2.6296 TAAATTTGAATTAAT TTTCA AGTT TGAAA TTTTCAATCTCATTA 44 7 LT41_RS04850 NONE LT41_RS04845 NONE LT41_RS04840 NONE trmA 889590 .. 889602 - -2 -3.338 ATTAACTAAAGTGAA TTCA AAAAA TGAA AAAAGTGTTATAATA 43 477 LT41_RS04825 NONE ilvA 887916 .. 887926 - -4 -3.43756 TATGTTATTAAAAAC TTTC ATA GAAA TTAAAAGCCTTTTGG 49 7 fliP 880623 .. 880645 - -11.4 -3.14602 TTTATTCTATCAAGA CCCTAGAAAA AGT CTTTCTAGGG CGAACAGCCTTAGTA 87 169 LT41_RS04730 873480 .. 873492 - -2.7 -3.0634 AATTCCATTTTAATA TACCT TAA AAGTA TCTAAGCCAAGAGGG 42 17 LT41_RS04725 873130 .. 873157 - -11.6 -5.27938 ACTTTTAAATAAAAA TTAAGAAAAATC AATG GATTTTTCTTAA AAATATTTTTCAATC 100 35 LT41_RS04685 NONE ruvA NONE ddlA 860962 .. 860991 - -7.3 -4.07568 TTTTTCTTCCTAAAA TACGCTAAATTTT ATGT ATAATTTAGCGCA TTTTGACTTAAAAGC 75 41 LT41_RS04670 NONE LT41_RS04665 NONE murF 858340 .. 858376 - -4.7 -5.42259 TGATTTCTAAAAAAA TCTCATCAAAATACTAT AAA ATAATACTTTGATTAAA ATTTTTCTCACTTTA 80 232 LT41_RS04650 NONE LT41_RS04645 854884 .. 854904 - -5.5 -4.08692 TAAGCTTTTTTAAAA GCTTTTAAA AAC TTTCAAAGC GTGTTTAAATAGACT 64 61 LT41_RS04640 NONE LT41_RS04635 NONE LT41_RS04630 853604 .. 853641 - -7.2 -5.055 TTAAGTTTTAAAAAA CTTAATCAAAGTGCTT TAATTT AAGCACTTTTGTTAAG CTTTTTACCCAAATG 90 8 LT41_RS04625 853090 .. 853144 - -9.1 -3.37761 TTCTAATAAATTTAA GTTTTAAAAAACTTAATCAAATCCAC CTTA GTAGATTTG-TTAAATTTTCTAATAC GCCTTAATTACTCCA 77 19 LT41_RS04620 852704 .. 852716 - -9.1 -3.08046 TCTTTATCGCAAAAG GTGGC TTT GCCAC ATTGCGAAGTCAAAG 74 35 LT41_RS04615 852009 .. 852041 - -7.2 -4.62872 ATTAAGTTTTAAAAA CTTAATCAAATCCGC CTTA GCGGACTTG-TTAAA TTCTTAATTTTGAAT 81 29 LT41_RS04610 NONE LT41_RS04605 851282 .. 851294 - -4.9 -5.41143 TATCCTTTAAAAAAA CTTTT TAA AAAAG CCTTTGTTGCTTTGT 80 4 LT41_RS04600 850766 .. 850801 - -3.4 -4.86731 CCTTGCTAAATAAAA CTTAATCAAACCCACT AATT AGTGAGTTTTGTTAAA TTTTTGGCTTTTTTT 63 79 LT41_RS04595 850573 .. 850585 - -3.4 -2.90573 GGACTCATAGCAAAC CTCT TATAT AGAG TTCTTTTTTTAAAAA 43 2 LT41_RS04590 850092 .. 850115 - -9.8 -4.76191 ACAGATCAAAATAAA TCCTTTAAAA AAGC TTTTAAAGGA TTATATCTATTTTTA 100 47 LT41_RS04585 NONE LT41_RS04580 849373 .. 849385 - -7.7 -3.41073 TAGTCTATCCAAACA TCGCT TAA AGCGA CCAAAGGGCATAATG 68 68 LT41_RS04515 NONE LT41_RS04510 NONE LT41_RS04505 NONE LT41_RS04500 NONE LT41_RS04495 NONE LT41_RS04490 NONE LT41_RS04485 NONE LT41_RS04480 NONE LT41_RS04475 NONE LT41_RS04470 NONE LT41_RS04465 832897 .. 832909 - -7.7 -3.62597 TCCACCTTGCAACAA GGGAT TTC ATCCC CTTGACCCCTCTCTT 70 106 LT41_RS04460 NONE LT41_RS04455 831793 .. 831812 - -6.6 -5.0133 CATCTTTTTAAAAAA CTTTAAAA TCGT TTTTAAAG CCTTTTTAACACTCG 85 294 LT41_RS04445 829737 .. 829751 - -2.2 -3.70076 TCAAACTCACCTAAA CAAAAT ATC ATTTTA ACCCCAAATTGTTGT 47 23 LT41_RS04440 NONE LT41_RS04435 NONE LT41_RS04430 828206 .. 828223 - -5.5 -4.83615 TAGTTTTTAGAAAAA GGAAGGC TTTA GTCTTCC TTATTACCCTTCAAA 74 29 LT41_RS04425 827285 .. 827302 - -8.5 -5.13722 TTTACTAAAATAAAA GAGAGTA TTTT TACTCTC TTAGCTTTTAAAAAT 100 33 LT41_RS04385 820504 .. 820524 - -9.1 -4.04326 GAAGCAAATATCAAA GCTGTGATT TCA AATCACAAC TCTTTAAAGGATTTA 85 499 LT41_RS04310 NONE valS NONE LT41_RS04300 NONE LT41_RS04295 802608 .. 802622 - -8.6 -4.15006 ATATTTATCTTAAAA GGAGAT ATA ATCTCC TTATTTTTTGAAACC 83 26 LT41_RS04290 801639 .. 801655 - -8 -5.4833 GTATTTAAGAAAAAA GTCCCT AGGTA AGGGAC AAAATTAAAAAGCAG 100 30 LT41_RS04285 NONE LT41_RS04280 800031 .. 800043 - -7.7 -4.21989 TATAAGTTTAACAAA GCCTT TAG AAGGC TTTGTATAGAGTTAA 77 37 flgA NONE LT41_RS04270 798743 .. 798753 - -2.6 -4.60678 TAAAAATATAACAAA TTTA AAC TAAA AATTTTGCCATTTTT 58 21 coaD NONE tmk NONE hisS NONE speA NONE cysE 793900 .. 793932 - -5.1 -4.27796 CAATAAATGTGAAAA TTTGTATTAATTTTT AGG AAAAATTAATACGCA TAATAATACATATAA 66 63 aspB 792603 .. 792623 - -8.4 -4.56597 TGCTGTGCTTAAAAA GCCTTAAA GTAAT TTTAAGGC TTTAGGGCTTAATAA 90 34 LT41_RS04185 776199 .. 776215 - -5.9 -3.28368 AGTCAATCCACAATA TACAAGC AAA ACTTGTA GTGTATGTGGAAATA 59 302 LT41_RS04120 759983 .. 759993 - -2.6 -3.17212 TTATGATGTTATTAA TTTT AAC AAAA TACAATCATGATTTT 43 0 LT41_RS04115 NONE LT41_RS04110 NONE LT41_RS04105 NONE LT41_RS04100 758267 .. 758284 - -8.5 -3.37091 ATTTTTAAAAGCTAA GAGAGTA AAAA TACTCTC TTTTATTTTAGTAAA 75 28 LT41_RS04080 754084 .. 754103 - -2.2 -3.93864 AGCAAGAAAGTGAAA TTGAAGAT TTGA ATCTTAAA GATTTTAAAGCTTTA 50 200 LT41_RS03995 744095 .. 744110 - -3.4 -3.32986 TATTGATAAAAAGCA TTTTAA ATCC TTAAAA AATCATCTTTTGGTA 47 12 LT41_RS03990 NONE LT41_RS03985 NONE LT41_RS03980 741719 .. 741763 - -5.2 -3.02043 AATCTTTTTCTAATA TCTTTTTAGCTTTAAAAGCA TTTTT TGCCTTTAAAGCTAAAATTG TGCGTTTTACTCTAA 54 32 LT41_RS03975 NONE LT41_RS03970 NONE terL NONE LT41_RS03960 NONE LT41_RS03955 736222 .. 736238 - -3.8 -4.30014 TTCATCAAGCTAAAA TTATCT TAATT AGATAA GGTTGATACCTAAAA 58 102 LT41_RS03950 NONE LT41_RS03945 NONE LT41_RS03940 734494 .. 734505 - -2.2 -4.48221 TACCAAGCTACAAAA CCCT ACTT AGAG ATGAAGAATTAAAAC 57 180 LT41_RS03930 733611 .. 733633 - -9.3 -3.59627 ACTAAAGTTTGCAAA GAATTAGAG TAATT CTCTAATTC TTTTTTCTTTCTCAT 79 6 LT41_RS03865 NONE LT41_RS03860 724480 .. 724519 - -6.7 -2.9652 TAAAATGTAACCATA GAAAAATAAAATGATAC TTTTTG GTTGCATTTTATTTTTC TACAAACCTTAAACT 62 51 hisJ 722306 .. 722327 - -11.7 -2.53213 TAACTTTTTAAGCTA TAAGCGTGA AAAT TCACGCTTA TTCTAATTCATATTT 87 23 corA NONE mog 714149 .. 714195 - -3.8 -3.51058 ATAAGCAAAGATGAA GCTTCGGCAAGTCTGCTT GCTAGACAATT AAGCAGACTTATCAGAGC TAATAAATTTTAATT 50 35 LT41_RS03795 NONE LT41_RS03790 NONE LT41_RS03785 NONE flaC 710603 .. 710622 - -10.8 -5.252 CATTTTGATAAAAAA TAAGCCCT ATTT AGGGCTTA TTTTATTGTAATAAA 100 28 LT41_RS03775 709522 .. 709534 - -6.3 -4.04608 AAGAAATAGAAAACA TCATC AAA GATGA AAATTTAAAAAATAA 68 449 glnA 691026 .. 691046 - -6.8 -3.57263 ATCTTTATCTTGAAA CAGGAGCA AGTGG TGCACCTG TTGCGGGTATAGCAG 67 277 rsmH NONE LT41_RS03635 683399 .. 683419 - -6.3 -3.48924 GTATGTTTTAGATAA GATTATTCA TTC TAAATAATC TAAAATTTGATTTTG 64 11 LT41_RS03625 679007 .. 679031 - -7.4 -4.71482 ATTAAATTTTAAAAA CTATATAAAT CTTTC ATTTATATAG TTTTTAGCAAGGTTA 81 18 flgH 675480 .. 675496 - -10.9 -3.84389 AATAAAAGCCAAGAA GCAAGGT TTA ACCTTGC TTTTAGAATGGCCAT 93 28 cipA 672565 .. 672619 - -4.4 -4.94487 TTAGAAAATAGAAAA GATCTTTACCCCCCATTTAAACGCCT TTT AAGAGTTCTTATAGAAGATAAAGATC AAAAAAGTGCACAAA 73 262 uvrB 667687 .. 667699 - -2.7 -5.38054 TCCTATAAATAAAAA CAATA TTT TATCG AAACCTTTGTTGTTT 69 314 argG NONE rplI NONE hslV NONE hslU NONE era NONE LT41_RS03495 NONE LT41_RS03490 650918 .. 650956 - -7.9 -3.65638 ATAATTAAATTACAA TATTTTTAAATATTTTT TTTAT AATAATATTTAAAAATA TAATATTTTAATATT 74 42 LT41_RS03480 NONE LT41_RS03475 645732 .. 645764 - -8 -3.34488 AATTGGTTTAAAAAT CTTGTATTAAAC AAATTATAA GTTTAATACAAG GAAAATTTATCTATG 72 55 aspS NONE adk NONE ppa NONE msrA 631353 .. 631374 - -7.3 -5.08255 ACTTTGAAAAGAAAA TCACAGCGT GAAA AGGCTGTGA ATAAAGTTGAATTTT 90 63 LT41_RS03365 NONE holA 623598 .. 623610 - -6.3 -4.25104 TTTTCTCTACTAAAA CAAGT CTT ACTTG GTTTAGAGATTGGTT 72 521 ctf NONE LT41_RS03270 NONE LT41_RS03265 NONE LT41_RS03260 601353 .. 601398 - -3 -4.74132 ATATTTTAGGAAAAA GT-GAATTAAAAG-ATTATTTG GATG CAAACAATACTTTAAATTCTAC CCAGCAAGAATTTTT 65 140 dsbD NONE LT41_RS03225 592419 .. 592442 - -9.8 -2.6369 ATAACTTTAAAAACT TATAAGCTAT CCAT ATAGCTTATA TCGTAAGTATTTTTT 75 1 LT41_RS03220 590974 .. 590995 - -10.3 -2.60797 TTTATATACATCAAG GTGGAATTT TAGG AAATTCCAC TATGTTAGAGAGATA 80 54 nth NONE LT41_RS03185 NONE LT41_RS03180 583804 .. 583825 - -4.6 -3.07222 AGCAACGATAAATTA TTTTTCTT CATTGT AAGAAAAA ATAGGTAAAGACCAT 52 1 LT41_RS03175 NONE LT41_RS03170 582799 .. 582811 - -3.4 -3.63744 CGTCCTCCTAAAAGA CAAG AATTG CTTG ATCAAATTTATAAAA 52 305 LT41_RS03115 572762 .. 572773 - -3 -5.09225 ATTTTACTTAAAAAA CTTA AATT TAAG ATGAGAGATATAAAG 66 21 tatB NONE tatC NONE queA 570303 .. 570321 - -2.4 -4.19472 CAATATAGGTCAAAA TTGTATCA TTG TGGCACAA ACTGGAATTTCAGGT 55 248 LT41_RS03070 NONE LT41_RS03065 565645 .. 565655 - -2.6 -4.90778 TCTATCTAAATAAAA TTTA TTT TAAA TCCTTAACTGGTTGC 61 34 LT41_RS03035 NONE LT41_RS03030 NONE LT41_RS03025 NONE LT41_RS03020 559840 .. 559857 - -8.5 -3.37091 ATTTTTAAAAGCTAA GAGAGTA AAAA TACTCTC TTTTATTTTAGTAAA 75 28 LT41_RS02990 555039 .. 555051 - -9.1 -3.90738 TAAACAATTACCAAA CTCCC AGT GGGAG CACTGAATAATGAAG 83 143 LT41_RS02920 NONE LT41_RS02915 NONE LT41_RS02910 NONE LT41_RS02905 543834 .. 543846 - -9.1 -3.29144 TCATCCTTGCGATAA GGAGC TAC GCTCC CTTAACCCACCTGAA 75 92 LT41_RS02900 NONE LT41_RS02895 543032 .. 543049 - -4.1 -2.95966 AAAACTAAACACAAT CTTTTCC TTAT GGATAAG TCCATCTTGCTTTTT 50 15 LT41_RS02890 NONE LT41_RS02885 542390 .. 542415 - -4.8 -4.28049 TGCAAAAGTTGAAAA CAAAAGAGCT ATAAGA AGATCTTTTG CAATGCTTTTTTGAT 64 52 LT41_RS02880 541956 .. 541994 - -9.3 -2.54801 TATTTTCAAATATAG TTTTAAAAAGCTTTAAA TTGCG TTTAAAACCTTTTAAAA TACAAGGGTCAATAC 72 47 terL NONE LT41_RS02870 NONE LT41_RS02865 537824 .. 537838 - -3.6 -2.87564 CGATGTTTGGATAGA CTAGAT TTT ATCTAA ACCAAAACCCAGATG 45 82 LT41_RS02780 529046 .. 529065 - -2.2 -4.62904 AAACACCTTTAAAAA TTAAAGAG TAGT CTTTTTAA AATATCCTACAACGC 57 6 LT41_RS02740 523757 .. 523781 - -7.3 -3.65722 AAAAGAATTTTTAAA GATCTATCT TTATAGG AGATAGATC TTTTTTAAATTTTAT 72 63 proA NONE LT41_RS02720 518449 .. 518466 - -8.5 -3.32159 TTAGATTAAATTTAA TTGGCAA AGAA TTGCCAA ATTTTAAAAGTATGG 74 501 rnpB 512869 .. 512897 - -2.6 -5.64328 AAGAAAAAAACAAAA GC-TGTTGAAATT CAAA AATTTCAAAAAGC GTTGACATATTTTAA 74 45 mltG NONE flgB NONE flgC NONE fliE NONE pbpB 486746 .. 486764 - -4.6 -4.66609 GATGGCAGCTAAAAA TTTAGCCG AAA CAACTAAA AATTTAAAAATTATC 68 385 LT41_RS02495 477028 .. 477063 - -5.6 -2.89881 TATTTAGTTTATATA CTTGCTATTATATAAC TTTA GTCATATAATGTCAAG TTAATTGAGTAAAAT 53 75 clpB 474395 .. 474424 - -13.9 -2.88236 GAAAGCGAGATTATA TTTTGAAAGTAGA AAGA TCTACTTTCAAAA TGATTAAGCTTTTTT 100 29 LT41_RS02470 NONE LT41_RS02465 NONE hemH 466390 .. 466413 - -6.8 -4.73388 AATTTTTACTAAAAA GTCCTTGT AATCATAA ACAAGGAC TTCAAAATCATTCTT 82 39 LT41_RS02350 447419 .. 447455 - -4.6 -5.01823 AGAACAAGAATAAAA CTCTATT-TTATAGCCC TTCG GGGCTATATTAATACAG TGTATCTAAATCATT 74 17 ctb 430291 .. 430315 - -5.8 -5.61824 GAAAAGGTAAAAAAA GATTTGGCAA AAAAA TTGCCAAATT AATGTCCGCCGTACT 90 24 LT41_RS02230 424964 .. 424985 - -8.9 -4.4267 GTTTAAAATTTAAAA TATTTGTGA ATTT TCACAAATA TTTTTTATAAAACCA 86 17 LT41_RS02220 423511 .. 423527 - -4.5 -3.97674 TTAGCACTCAAAGAA TATGTAC CTC ATACATA AAATCATTATCATCA 58 1 miaB NONE LT41_RS02210 NONE LT41_RS02205 NONE LT41_RS02200 NONE LT41_RS02195 419526 .. 419540 - -4.2 -3.68351 CCCTGATGATTTAAA CTCATG TTC CATGTG TGGAAAAATGTGTGC 53 84 rpmB 416372 .. 416390 - -7.5 -4.24002 TTGGAAATTTTAAAA TTGAGGA ATAAA TCCTCAA AATTATTTAGAATTT 77 28 LT41_RS02170 NONE LT41_RS02165 414850 .. 414882 - -7.1 -2.93992 GAAAATTAAAGATTA TTTAGGTTAAACCTT AAA AAGGTTCAACCTAGG ATTTTAATGATCTGA 62 29 tenA 408734 .. 408752 - -10.3 -4.90296 AAAATTGCATAAAAA CATGGGC AAAAA GCCCATG TTTAAAGATTTAATT 100 27 mraY NONE murD 399259 .. 399273 - -3.6 -4.9792 TATTCTATATAAAAA CTTATC AAA GATAAA AGATAAGAAAAGAAG 68 438 LT41_RS02045 390737 .. 390751 - -10 -4.45664 GCAATTTAATCAAAA GCTCCA TTT TGGAGC TTTTATATTTACTTG 91 48 LT41_RS02010 386506 .. 386517 - -3 -3.09158 CTAATAAAAACATTA TCAA ATCC TTGA TTTTAATAAAAGTGA 44 73 LT41_RS02005 385445 .. 385457 - -2.7 -4.81249 CTTTAAATGGAAAAA TCAAA CGC TCTGA TTTTAAATTTGCAAC 63 115 LT41_RS01990 383361 .. 383373 - -3.5 -3.06815 AGTTCTTTTAATAGA TATTT TGG AAATA ATCCTCTGCAGACAC 46 374 LT41_RS01935 370387 .. 370403 - -6.6 -2.86705 AGATGATAAAAAATG CAATGC AACAG GCATTG ATTTTAAAGTAGAAT 58 112 LT41_RS01890 NONE LT41_RS01885 NONE LT41_RS01880 NONE LT41_RS01875 361418 .. 361430 - -4.9 -3.19513 AGAAGTTTAATTGAA TTTGT TTT ACAAA AAGTTAAATTTCATT 53 76 mqo NONE pyk 358490 .. 358522 - -10.9 -2.8967 AAAAATTTATAAGGA CATTAAATTCCTT ATTTTCA AAGGAATTTAATG TTTTATTGTAGATAA 82 28 LT41_RS01860 357755 .. 357794 - -17.6 -3.7732 TTTTGATATTAATAA CAACTAAAAATGCTTAGA AATT TCTAAGCATTTTTAGTTA AGCTTGAAGATCTAG 100 23 LT41_RS01830 NONE kdsA NONE ribH NONE nusB NONE pyrF NONE LT41_RS01805 346879 .. 346889 - -4 -2.98493 TTTATTATTAAACTA TAAC AAT GTTA ATACAGGATTAATTT 46 34 msrP NONE LT41_RS01795 345369 .. 345379 - -4 -5.06585 GAAAGTATACAAAAA GAAT TAA ATTC AAGTTTTGATAAAAG 70 56 ccoG NONE cmeR 336620 .. 336643 - -2.6 -5.05577 AAATTAAATTAAAAA TTGTAATA GTAATATT TATTACAA AAATTTTTGGCTAAT 63 73 cmeA NONE LT41_RS01735 NONE cmeC 330880 .. 330909 - -11 -2.53759 AAGATTTTTAATTTA TTTAGAGAATAG AACAAA CTATTCTCTAAA AGACATATCTAAATT 83 34 LT41_RS01720 328825 .. 328842 - -2.7 -4.19624 CATGCTGAACATAAA GACAATA AAGG TTTTGTC GAGGTTGTAAAAATT 55 334 plsY NONE folB NONE hsrA 323914 .. 323934 - -12.7 -2.55755 AAATAAAGATAAATT TTTTGCACC GAA GGTGCAAAA TTGTTAAGATTTTTT 95 29 fdxB NONE LT41_RS01675 322045 .. 322086 - -4.2 -5.20633 AAAAACAGAGAAAAA TTTTG-ATTCTTTTTTT GAAGAGAAT AAAAAAAGAATTCAAAA TCTTATAGAGCAGCG 74 59 LT41_RS01625 313957 .. 313972 - -7.6 -4.33487 ATAATATTAAAAGAA CTTGGA TAAA TCCAAG TTAAAAATTTATAAA 77 26 uvrA 311068 .. 311079 - -3 -4.49041 ATATAAAAAATCAAA CATA AAAT TATG ATTTTTGTGTATTTT 58 21 LT41_RS01615 310609 .. 310633 - -4.4 -4.09739 GCAAGGCTTTTAAAA CTTATAAAAG AGAGG CTTTTAAAAG GAGTTTGCTATGAAA 60 19 polA NONE motA NONE motB 303717 .. 303732 - -4 -3.99985 GATACAGGTAAAGAA CAAGCCC CTA GGG-TTG TTGCCAAAGGAGTGG 58 258 fdxA 301625 .. 301654 - -11 -4.12279 GAAAGTTAAATTAAA TTAAAAAGCTAG GAATCT CTAGCTTTTTAA TTTTTTAAAATTATG 95 36 ndk NONE LT41_RS01565 300789 .. 300809 - -7 -3.46007 ATAAAATTTAATTAA TTATTGCA ATTTA TGCAATAA AAATAATCACTCAAA 65 1 rpmF NONE plsX NONE fabH 298649 .. 298669 - -11.3 -3.27525 CTTTTGGAAAGCTAA GAGAGAATT AAA AATTCTCTC CTCCAAATTTTAAAA 86 12 LT41_RS01460 NONE LT41_RS01455 NONE bioD 279959 .. 279989 - -10.6 -3.2794 TTGGACGCACAGGAA CTTTGTTTGCCTTA CAT CAATGCAAACAAAG CCCCGATTTTATCTG 83 505 bioF NONE LT41_RS01435 NONE bioC NONE modA NONE LT41_RS01420 NONE modB NONE modC 273815 .. 273825 - -2.6 -5.65678 ATAAAAGAGAAAAAA TTTT AGA AAAA TATTTAGATGAACTT 75 152 panB 272060 .. 272070 - -2.6 -2.64416 TATCCTTAGTATAAT TTAT CTA ATAA TTCATCATCTAAATA 40 5 panC NONE panD 270747 .. 270798 - -12.8 -5.186 TAAAAGATATAAAAA TCATTTTTTTCTATCTTAGATAAA TGAA TTTATCTAAGATAGAAAAAATTAC AAAAATAGCTAGATG 100 41 peb3 266369 .. 266388 - -10.8 -3.69283 GAAGTTATGCAAGAA TACACGCT AAAA AGCGTGTA TGAAGGTTTATTCTC 89 33 lpxB NONE greA NONE LT41_RS01350 NONE cheV NONE cheA NONE cheW 260137 .. 260163 - -3.8 -4.82855 CATCAAAGTCAAAAA CACAAAGTTTAA TCA TTAAAATTCGCG CTTAAGCAAAGCTTC 65 14 serB NONE tal 258475 .. 258507 - -10.1 -2.58822 TTGCTGATATAATAC TTGATGAGAAATTTT TCG AAAATATCCCATCAA AAATATTAAAACTTT 77 70 ilvE NONE LT41_RS01265 NONE LT41_RS01260 NONE LT41_RS01255 245161 .. 245173 - -3.5 -4.29106 TTCTATATTAATAAA TATTA TAT TAATA AAACTTAAATTATTA 58 130 LT41_RS01250 NONE LT41_RS01245 241671 .. 241688 - -9.9 -3.21276 TTTGCTTGGACAATA GAAAGCC TTGC GGCTTTC TTAAATTTAGTTCGC 81 32 LT41_RS01235 238583 .. 238607 - -7.9 -4.18161 CATAAATTTTTAAAA TTCAAGCCC TTTTTTT GGGCTCGAA TGACTAATTAAAACC 80 33 LT41_RS01230 237749 .. 237765 - -5.3 -3.79519 AATTTGATGATTAAA TTTTTAA CCA TTAAAAA CTCCTTTGAAATAAT 60 75 LT41_RS01225 237424 .. 237435 - -2.2 -4.68512 TTAGAAGAAAAAGAA TGGC AAGT ACCA AATGTTTATGAAGAT 59 128 xth 233486 .. 233509 - -11.2 -5.03747 AAATTCGTTAAAAAA TAATATCCCA TTTT TGGGATATTA AATATCTATTTCTAT 100 23 LT41_RS01180 NONE LT41_RS01175 229589 .. 229605 - -10.9 -4.20024 ACAAAAAAGATTAAA GAGCCTT TTT AAGGCTC TAAATTGTAGTGATG 93 483 LT41_RS01160 227633 .. 227652 - -2.2 -3.87104 TCTATATCACAATAA CTAAATAA TGTT TTATTTGG GTTGATTTCCATAGG 49 67 LT41_RS01150 226510 .. 226524 - -8.6 -4.56597 CTGCTTTTGCAAAAA TTGCAG AGG CTGCAA AAAAAGCACTTTGAT 90 92 LT41_RS01135 224561 .. 224571 - -2.6 -2.96711 TTTATAATTTATATA TTTT TTA AAAA ATTATTTTAAACCAT 42 32 LT41_RS01130 224031 .. 224049 - -3.2 -4.84527 TTTATATAGCAAAAA TGAGAAAT ACT ATTTCTTA AATTTTTCTTCGTAA 63 16 iscS NONE LT41_RS01120 221674 .. 221694 - -11.3 -5.2696 GCAAAAGCTAAAAAA TAGCAAGAT TTT ATCTTGCTA TTTTTTTAAACCGGC 100 31 LT41_RS01105 218278 .. 218303 - -9.9 -3.13919 TTGAAACTTGAAAAG TTTTTGTGAGA AAAA TCCCACAAAAA TTTATCTGCTATTGA 81 27 secG NONE frr NONE pyrE NONE LT41_RS01085 NONE nrdB NONE LT41_RS01075 213344 .. 213356 - -2.7 -3.31103 AAAATTTAAAAATCA TAGTC CCA AACTA GGTCAAAATGTTTTT 44 507 pcm 212588 .. 212598 - -2.6 -3.86524 AGAGTTTTTGATAAA TTTT GTA AAAA AAGTTTATTCTTTCC 50 30 LT41_RS01005 NONE LT41_RS01000 196285 .. 196295 - -2.6 -2.67708 AAAGTGATGACATTA TAAA ATT TTTA AGTGAAGTGAATGTG 40 44 LT41_RS00995 195882 .. 195896 - -8.6 -3.88559 AATGATTTTTATAAA TCCCTT GTT AAGGGA TTTATATTAATAAGC 82 32 LT41_RS00990 NONE LT41_RS00985 193419 .. 193434 - -3.4 -4.07568 CTTTTTCCTTGAAAA TAAAAT ATTG ATTTTA GCATTTATTTTGTAA 54 57 dapB NONE purF 191336 .. 191351 - -3.4 -5.13343 TAATTTAAAATAAAA TTATTT AATA AAATAA TCTCCATCAAAACTG 69 10 tig NONE clpP 187300 .. 187317 - -4.9 -3.53343 AACCTTTGTTTTAAA TGATCTC CAAA GAAATCA TTTAAAACTTTTTTC 56 23 def NONE LT41_RS00945 NONE LT41_RS00940 NONE LT41_RS00935 NONE purN 182571 .. 182581 - -4 -4.35044 CCATTCAAACATAAA TTTC CTT GAAA ATTTTAAAATTTTTT 58 83 LT41_RS00925 NONE LT41_RS00920 NONE LT41_RS00915 180437 .. 180454 - -8.5 -3.88641 AATAAAGATGAAGAA TAAGCCT CTTT AGGCTTA TTTCTTTTTGTAAAT 82 23 LT41_RS00875 NONE cfbpA 171355 .. 171365 - -3.2 -3.13109 TACATTATCTAAAAC CGAC TTC ATCG TAAATTTTAACCGCT 45 4 cfbpB NONE cfbpC 168843 .. 168855 - -4.9 -5.01042 AATTTAAACTAAAAA TTGAT AAT ATCAA AACTTATTTTCTCTT 74 6 LT41_RS00855 167573 .. 167592 - -10.8 -4.53163 TTATATAGGACAAAA GTAAGTGC TCTA GCACTTAC TCTCCTAAGCTTGGA 93 22 LT41_RS00840 165660 .. 165697 - -10.9 -3.27771 TGTAGAATACGAATA GCTTTTGATATAAGTCTA TTA TAGACTTATATCAAG-GC TGGGCATTATTGAGC 85 32 LT41_RS00830 164493 .. 164503 - -2.6 -4.55295 CGTGGGATAAAGAAA TTTT AAA AAAA CGTATTAAAACTAGA 60 305 ubiA NONE LT41_RS00815 NONE LT41_RS00810 NONE moaA NONE LT41_RS00800 NONE LT41_RS00795 NONE LT41_RS00790 NONE LT41_RS00785 NONE LT41_RS00780 158190 .. 158200 - -4 -2.98907 TAAGAAAAGTTAAAG CAAA ATT TTTG AAGCTATAGCTATGA 46 9 rpmE NONE rsmI NONE rlmB NONE LT41_RS00760 NONE LT41_RS00755 NONE LT41_RS00750 NONE hom NONE LT41_RS00740 NONE trxA 151453 .. 151469 - -10.9 -3.95725 AATTTTTAAGAAGAA GGCTAGT TAT ACTAGCC TTTAGTTTATAGTAA 93 32 trxB 150374 .. 150396 - -12.2 -5.33026 GAAGCTAAATAAAAA TAAAGTTGCT TTT AGCAACTTTA TAAAATCTTAATGCA 100 33 LT41_RS00715 NONE LT41_RS00710 NONE LT41_RS00705 143405 .. 143416 - -4.4 -3.88766 ATCCTAGATACCAAA TGGA AAAT TCCA AATGATAGTGAAGAT 58 263 bamA 129495 .. 129507 - -2.7 -2.64324 AAGCATCTAAAAATT CTTTC ATT AAAAG CGTGTTCCAAGATTA 40 19 LT41_RS00640 128786 .. 128796 - -2.6 -2.75891 ATATTCACCTAATTA TTTT TTA AAAA TTCTAAGATTATATC 40 8 accD NONE LT41_RS00630 NONE dksA NONE LT41_RS00620 126127 .. 126137 - -4 -2.74605 TTTTGCTAAAATCTA TCAT TGT ATGA GTTGATTTAGATCGA 44 15 LT41_RS00615 124934 .. 124949 - -2.6 -5.26316 TCATCGCAGAAAAAA CTGCAAG AAA CTT-CAG AAGAAGACAAAAAAG 69 280 ung 94791 .. 94811 - -5.6 -3.74519 AATATTTTTATTAAA GTTTAAAA TAATT TTTTAAAC TATTTTCCAATCTAT 60 20 LT41_RS00425 93917 .. 93952 - -2.7 -3.67022 CAAACTATAAAGCAA GATAAGATTTAAACC GATATA AGTATAAATCTTTTC AAAATATTGCAATTT 48 64 cdtA NONE cdtB NONE cdtC 88566 .. 88591 - -8.5 -5.30448 AAATAAATATAAAAA TAGAACAAGAT AAAA ATCTTATTCTA AAGGGGTAGCAGCTG 100 18 lctP 86672 .. 86709 - -6.7 -4.65819 AAAAGCAAAGTAAAA TTTCTAACAAATATTC TAAAAAC GAATATTTGTT-GAAA TAAAACTTAAATTTT 78 46 LT41_RS00385 NONE LT41_RS00380 NONE LT41_RS00375 83760 .. 83788 - -12.7 -3.50111 TATTAAAAATTAAGA CTTACTGATTCTA GTA TAGAATCAGTAAA TAATAATATGTGCAA 100 18 LT41_RS00370 NONE LT41_RS00365 82835 .. 82845 - -2.6 -5.28176 TCTATCGAGAAAAAA TTTT CAC AAAA TGAGCATTTTGTATC 69 166 aroQ NONE folK 78483 .. 78494 - -5.8 -2.62735 ATATTCCTTATATCA TGCC TAAA GGCA AAATTACACTCACTC 55 6 flhF NONE flhG NONE LT41_RS00325 NONE fliA NONE fliM NONE fliY 72959 .. 72974 - -4 -3.39595 GGTAATTATTTACAA GTGCTTG ATC CAAGC-C ATGGAGAATATATAA 49 237 LT41_RS00290 69945 .. 69974 - -4.5 -3.14602 TTTATTTTATTAAGA TTAGGAATTTAAA GACT TTTAAATCCTTAA GCTTTAATATCTATA 51 22 LT41_RS00285 NONE mnmA 68202 .. 68231 - -13.9 -3.17212 TTAGGATTTTATTAA TAATTTCTAGGAA TTAA TTCCTAGAAATTA TTCTATAAAACCGCT 100 23 LT41_RS00245 NONE LT41_RS00240 63297 .. 63311 - -2.8 -5.40474 AGGCGTCGAAAAAAA TGTAGT TAC ACAACA AGATGGTGTAGCTGA 72 408 typA NONE LT41_RS00210 56301 .. 56311 - -2.6 -4.94962 ATAATTTAAATAAAA TTAA ATT TTAA AGTGTTACTAAAAGT 63 104 LT41_RS00205 55139 .. 55171 - -15.1 -2.86124 TTTAGCCAAAGATGA GGATTAATTTTGGGC TAA GCCCAAAATTAATCA TTCTCCTGGGAAGTG 100 23 LT41_RS00195 NONE LT41_RS00190 51280 .. 51293 - -2.5 -4.87626 TTTTAACATTAAAAA TATTA TTTT TAATA TAGTATTTAAATTTA 63 525 thyX 31863 .. 31873 - -2.6 -3.84674 ATGGTAGCATAACAA TATT TTA AATA AGATAAAATTAGTAT 50 44 LT41_RS00120 30352 .. 30382 - -7.8 -3.6761 GGTTGCCAATAAATA CTAAAACCCAAT GAAAAAT ATTGGGTTTTAA GAGATTAAGAATTGT 76 30 LT41_RS00105 25533 .. 25545 - -4.9 -3.75115 CCTGTATAAAATTAA CAAAT TTC ATTTG GAAAATCTCGCTTTT 58 135 LT41_RS00100 24660 .. 24670 - -2.6 -3.77206 TATAATTTTAGTAAA TTAT TTA ATAA TTGATATTTTTTATT 48 19 LT41_RS00095 NONE LT41_RS00090 21886 .. 21913 - -7.9 -3.66095 AAATTTTTATTGAAA TTCCACGTTAA GTTAAA TTAACGTGAAA AAAGTTACTGAAAGC 76 30 dba NONE dsbI 20077 .. 20102 - -13.5 -3.57873 AGATAAGATTAAATA TAAGTCCTAGT TTTC ACTAGGACTTA AAGCTTAGTTTAAAG 100 30 LT41_RS00070 18081 .. 18091 - -2.6 -3.69216 TTTTTATTTAAAACA TATT GAA AATA GGAGTATAAAAATCT 48 44 LT41_RS00065 17480 .. 17496 - -9.5 -3.15999 GTTTTAGATATGGAA TGAAAGG CTT CCTTTCA TTCTTCTATTTCTTT 78 23 rrc 14984 .. 14996 - -4.9 -3.25166 TTATCTTAAAAAGGA TAAGA ATT TCTTA ACTTAACCCAAAAAT 53 28 LT41_RS00050 14679 .. 14692 - -8.1 -4.40561 TTTTTCTAAAAAGAA GGGCA AAAA TGCCC TTTTATTCTACTGTG 83 28 rnhB 13745 .. 13757 - -3.5 -4.66388 AAAATGACAAAGAAA TTTTT AGG AAAAA CTCATGTAGAAGGTG 63 355 LT41_RS00025 NONE LT41_RS00020 4894 .. 4920 - -14 -2.64803 GGATGTGTAAATTTA TCATTGAAGAAA TCA TTTCTTCAATGA GTTTTGTTTTGTAAG 100 19