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NONE CLCT_RS05065 NONE CLCT_RS05070 975079 .. 975093 + -2.2 -3.61164 CCTAACAATAAAGAT TTATTT AAA AAATGA GTTTTTTCGAAGGTT 44 11 CLCT_RS05075 NONE truB NONE csrA NONE CLCT_RS05090 NONE smpB NONE CLCT_RS05100 NONE CLCT_RS05105 NONE CLCT_RS05110 NONE CLCT_RS05115 983100 .. 983118 + -6.1 -4.64861 TTTGGAATGATTTTT GCTTTTA ACCTA TAAAAGC TTTATTTTAAAGGAA 74 79 flgB NONE flgC NONE fliE NONE CLCT_RS05135 986188 .. 986202 + -3.6 -4.92385 ACTAATCCGAACTAA CTTTAA AAT TTAGAG TTTTATTTGACTCTA 67 26 alaS NONE CLCT_RS05160 992230 .. 992244 + -4.4 -4.15543 GAACTTTTGAAAGCA TTTTTA TGA TAAAAA TTTTAAAAATATTTC 59 17 CLCT_RS05165 994206 .. 994249 + -12.9 -3.39327 AAAATTATCCTTTTG TTTTCCTTTATATGTTTTA ATATCA TAAAACTTATAAAGGAAAA TTATGAATATCACAA 95 62 msrP 995128 .. 995138 + -2.6 -4.72272 TATAAAGACATGGAT TTAA AGG TTAA TTTTTAATGAGCAAA 57 8 CLCT_RS05175 995696 .. 995708 + -3.5 -4.20368 GAGAAAAAAAGTAAC TTTTT TAT AAAAA TTTGTATTCAAATGA 56 16 CLCT_RS05180 997694 .. 997717 + -12.6 -2.57335 TAATGAATTATAAAA TCAAACTCCT TTTT AGGAGTTTGA TAAATTAACTCTTGT 89 28 CLCT_RS05200 NONE CLCT_RS05205 1001890 .. 1001923 + -4.1 -3.49076 AACTTTAAATTTACA TCTCCTT-GAAATTGT GCT ATGATTTTTAAGGAGA TTAATTATGCATTTT 51 33 CLCT_RS05210 NONE CLCT_RS05215 1003029 .. 1003051 + -7.1 -5.14949 AATTTCAATTTTAAA TACCTAGTT TCATT AGCTAGGTA TTTTATTATTTTCTT 87 41 CLCT_RS05220 NONE CLCT_RS05225 1004868 .. 1004878 + -5.4 -5.1861 ACATCAAACTCTAAA TGTG TAT CACA TTTTTTACTAATAAA 79 437 ribE NONE pgeF NONE CLCT_RS05300 1018642 .. 1018655 + -2.5 -4.70266 TTTAAAAAACTGCTC TTTAT TGGC ATAAA TTTTTCCATCATCTT 62 331 CLCT_RS05315 NONE CLCT_RS05320 NONE CLCT_RS05325 1021882 .. 1021917 + -12.2 -3.70102 TAGATAACTCCTTAG TTTTTAAAGATCTAGT TTTT GCTAGATCTTTAAAGA TATTTAGTTTTAAAT 95 101 CLCT_RS05330 1023428 .. 1023447 + -12.2 -3.35197 ATTCTAATTATAAAA GCTAAGCC TTTT GGCTTAGC TTACTATATCTAAAA 95 34 CLCT_RS05340 NONE CLCT_RS05345 NONE CLCT_RS05350 NONE CLCT_RS05355 NONE CLCT_RS05360 NONE CLCT_RS05365 NONE CLCT_RS05370 NONE ccsB NONE CLCT_RS05380 1033479 .. 1033492 + -2.5 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-2.98823 CTTAACGGGTCTCGA GGGTT CAA ATCCC TCTCTGTCCGCCACC 45 0 CLCT_RS06160 NONE CLCT_RS06165 1196357 .. 1196367 + -6.8 -3.19157 TTTTGCATAAATACA GCCT TAA AGGC TTCATAAGCTTCCTC 62 264 CLCT_RS06175 1198456 .. 1198466 + -2.6 -3.59814 ATATGTTTTATTGTA TTTT TAA AAAA CTTTTTATATCATCA 45 40 CLCT_RS06180 1199424 .. 1199477 + -3.3 -5.14698 GAAAGCGTAAATTCT TTATTTGTATAAATTCTTTGCAAGG ATTG CCTTGCAAAGAAAATCTAAAATTAG TTTTCTTTTAAATTT 68 14 CLCT_RS06185 NONE CLCT_RS06190 1201330 .. 1201340 + -4 -2.66733 CGAAAATAACCAAAT TCTA AGC TAGA TAGTATCACTTAAAA 46 259 ruvB NONE CLCT_RS06210 1204048 .. 1204075 + -4.2 -2.5571 AAAGCATTTTGTATA AAAGCGATTATT TTTC AATAATCGCTAA AATTTCTTCTTCACT 48 25 CLCT_RS06220 1206316 .. 1206332 + -2.2 -3.43437 CCTATACCCATATGC GAAGCT TTTAT AGCCTC TTCTAAGCTTTTATG 45 291 modA NONE CLCT_RS06245 NONE CLCT_RS06250 1212062 .. 1212074 + -3.5 -4.48741 GATGACTTATGGATT TTTTA TCT TAAAA TTTTATACTAGCTTA 58 81 CLCT_RS06255 1212505 .. 1212531 + -10.3 -2.612 TGGGATTAAAACTTA GTGCT-TAAGCC TTTT GGCTTAAAGCAC 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CTTTAACATAAGTAT 61 4 pseF NONE CLCT_RS06390 NONE CLCT_RS06395 NONE CLCT_RS06400 1240522 .. 1240559 + -5.7 -3.54919 AGAGATCTTTTATTA GCTAAACAATACAAAGA TGTA TCTTTTGCTTGTTTAGC TTTAGAAGGCTCCTT 59 81 pseH 1242077 .. 1242100 + -4.6 -3.37655 AATCGAGCATACTAC GCAAGAACTT CCAA AAGTATTTGC TACTTTTTTGACAAA 53 368 CLCT_RS06430 1245421 .. 1245436 + -6.2 -2.9585 TAAACGACGAATTCT TCCTTT TACT AAAGGA TCTCCTTCACTTTGT 59 374 CLCT_RS06460 1252148 .. 1252159 + -4.4 -3.35073 ATTCAATGTAAGTAT CTTG ATTT CAAG TTACTTACAAATCCT 53 44 CLCT_RS06465 1252661 .. 1252675 + -2.9 -4.4648 AAATAGAATTTTTCT TTTCA AAAAC TGAAA TTTTATAATGAAAAT 55 3 CLCT_RS06470 NONE rpmF NONE plsX NONE CLCT_RS06485 1255630 .. 1255644 + -3.6 -5.15117 TTCTATATTTTCTTG TTGAGT GAT ACTTAA TTTTTTAAGCTTTTC 70 493 CLCT_RS06505 NONE CLCT_RS06510 1262015 .. 1262025 + -2.6 -3.74077 AGAGCCTTTAAAATA TTTT TCT AAAA TTTGACTCTCTCCAA 50 200 trpB 1263683 .. 1263707 + -10.1 -5.27709 AAAAAGGTGAAATTT ATGGTTGAAGT AAA ACTTCAACCAA TTTATTTTTTTGTGC 100 18 CLCT_RS06530 NONE CLCT_RS06535 1269072 .. 1269106 + -5.8 -3.07655 TTTTTACTATACAAA AAATGATTTTTGGTGA AAA TCACCAAAAATCAAGC ATGTTTTTTAGCAAA 55 60 surE NONE CLCT_RS06690 NONE CLCT_RS06695 NONE blaOXA 1300484 .. 1300501 + -2.7 -4.37886 AAAATCCCATTTTTA TTTAGCA TATT TGCAAAA TTTTCTAAAAGCTCA 58 327 CLCT_RS06725 1304700 .. 1304719 + -2.2 -5.03747 AGTCTTTAAGAGAGA TTTTCAAG GATT TTTGAAAG TTTTTTACACACTTT 61 9 CLCT_RS06745 1307550 .. 1307565 + -3.2 -4.32048 GTTGTATCAGTTTGA GCAAGA TAAA TCATGC TTTTAGGTATTCTTG 57 435 ilvE NONE CLCT_RS06810 NONE CLCT_RS06815 NONE CLCT_RS06820 1321504 .. 1321515 + -4.4 -5.16237 CACCACTATATCTTT GTCT TCTA AGAC TTTTTTCATAGGATT 72 347 miaA 1338272 .. 1338282 + -4 -4.93968 AAAAACTTAATATAA TTTG CTT CAAA TTTTTCATTATCACT 70 500 folE NONE fliI 1387695 .. 1387717 + -2 -5.44119 AAAGATGATTGATAC GCAATAATTG GAA TGATTTTTGC TTTTTTTACGATAAA 66 19 CLCT_RS07185 NONE CLCT_RS07190 NONE CLCT_RS07195 1389753 .. 1389766 + -3.9 -4.4296 ATCCATTTGATTTAA TGTTA AATT TAACA TTTTAGTGTATATTA 60 78 nifS NONE CLCT_RS07205 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-2.72537 CTCCAAAGGAAGCTT AAGTTTTGATGACT TCTA AGTC-TCAAAACTA CTCGTTTTTTTATAC 50 7 CLCT_RS07330 NONE CLCT_RS07335 1421348 .. 1421372 + -13.7 -3.06694 TATACACTTGATTAA TCTTAAGGCGT TTT ACGCCTTAAGG ATTTTAAAGCTAGAT 100 26 CLCT_RS07340 1422099 .. 1422109 + -2.6 -4.59773 ATAAATATTTAATTT TAAT ATA ATTA TTTTTAAACATAAGC 57 58 CLCT_RS07345 1422905 .. 1422929 + -10.2 -2.88579 TAATCTAGAACAAAA TGATTAAGCA TAGCT TGCTTAATCA TGTATAAAAACTTGA 80 19 CLCT_RS07360 NONE CLCT_RS07365 1427442 .. 1427452 + -2.6 -3.94812 CGAGCTTAGAAATGG TTTT AGC AAAA TATTTTTAAATGGAA 49 6 CLCT_RS07375 1430138 .. 1430173 + -8.4 -4.32905 TGATACAAAAAGCAA TCAACATGAAACGCTA ATTT TAGCCTTTCATGATGG TTCTTTTGAATTTTT 80 9 ffs 1430757 .. 1430780 + -6.2 -3.86202 CAGTCATCTGGGGGA GGGT-TTTTAA AAT TTAAAATACCC TTTAATATCCTCACA 66 24 CLCT_RS07395 1432953 .. 1432970 + -2.8 -3.60006 GTATATCATTAGGGC GTAAAA TACCAT TTTTAC TTTGCAAATATGCTT 48 288 cgb 1436969 .. 1436991 + -13.6 -4.12456 AAAGCTAAGTAATCA TAGGCTTTGA TGT TCAAAGCCTA TTTTAAAAATGCTAT 100 29 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-2.5 -3.17218 ATTTTAAGCACAATG TAAAA ATAT TTTTA TATAATTTTCATTTT 42 40 CLCT_RS07635 1484465 .. 1484480 + -3.4 -4.4267 AAAGCTGTAGTAATA TAAAAT CATA ATTTTA TTTTAAATTTTACAA 58 291 CLCT_RS07640 1486510 .. 1486532 + -12.2 -3.97602 ATCAAATAACACTCA TATCAAGGAA TAT TTCCTTGATA TATTTTTACATATAT 100 32 CLCT_RS07650 1488208 .. 1488222 + -7.2 -4.62471 TCTTCTATAGCTACC TCATCA AAT TGATGA TTTTTAAAGATTAGA 81 320 ruvC 1487767 .. 1487786 - -2.2 -5.00412 AAAGATAATCAAAAA TTAGAATT AAAA AATTCAAA ATCTGCAGGTAGCTT 63 155 CLCT_RS07645 1486507 .. 1486535 - -8.3 -2.75471 ACCATCAAATAACAC TCATATCAAGGAA TAT TTCCTTGATATAT TTTTACATATATTTT 69 28 CLCT_RS07620 NONE CLCT_RS07615 NONE hemJ 1479330 .. 1479355 - -9.2 -2.97588 ATGGAATTTAAAGGA TAAAAAGCCT AAAAAA AGGCTTTTTA TTAAAATGGTCTTAC 78 26 CLCT_RS07600 1477704 .. 1477728 - -10.1 -3.36518 GGAAAACTTTTATAA CAACTGAGTCT TTA AGACTTAGTTG TTAATGCATTTGAAT 87 26 rpsU 1469554 .. 1469567 - -8.1 -4.74539 AATAATCGAAGAAAA GCCGA AAAT TCGGC TTTTGGTATTAGAGT 88 34 CLCT_RS07565 1468911 .. 1468924 - -2.5 -3.60957 TTAACAAAAAAAGTA TTAAT AAAA ATTAA TTGCTTTAATTTATC 45 31 CLCT_RS07560 NONE CLCT_RS07555 NONE CLCT_RS07550 NONE CLCT_RS07545 NONE CLCT_RS07540 NONE CLCT_RS07535 NONE CLCT_RS07530 1462918 .. 1462938 - -9.8 -3.61652 GTTTTAAATAATTAA CTAAACCC TTAAT GGGTTTAG TTTAGGTGATATGAG 89 52 CLCT_RS07515 NONE CLCT_RS07510 NONE CLCT_RS07505 1458377 .. 1458391 - -4.2 -3.72229 ATATCAAGATAAACA TCGCAT TGG AGGCGA CATCCGGATTCGAAC 56 16 CLCT_RS07500 1458184 .. 1458212 - -11.3 -2.96387 TAGATATAGAATAAT CTTCTTAATTTCT TTA AGAAATTAAGAAA TATCTTTTTAAATAT 87 72 CLCT_RS07490 1454991 .. 1455014 - -7.6 -3.12749 GGAAGAATTTGAATA TTAAAAGCCT TTTT AGACTTTTAA TATTTTAAATTAAGA 68 30 CLCT_RS07475 NONE CLCT_RS07470 NONE CLCT_RS07465 NONE CLCT_RS07460 NONE CLCT_RS07455 NONE tsaD 1447438 .. 1447448 - -4 -3.29043 AAGCCTTTTTCATAA TACA CCT TGTA AATTTTTCACTTTAG 48 9 CLCT_RS07445 1446455 .. 1446469 - -7.2 -3.25719 TTATTATAGTATTAA TGAGTA TAT TACTCA TACTTTAAATATAAA 66 419 CLCT_RS07425 NONE CLCT_RS07420 1436969 .. 1436991 - -13.6 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