        rsfS    4139 ..    4163 +  -7.3  -3.50393   TATTAAAATATAAAT          TATCTAAGATA AAT TATCTAAGATA          TTATCTAAGATAAGA  68 258
        dnaN    5515 ..    5527 +  -4.9  -4.08216   ATAACAAAAATATAA                TTCAT TAA ATGAA                TTTTGAAAGAGGTGA  61 64
SMPYRCLA_RS00030    7120 ..    7142 +  -9.2  -2.67515   TTTCCAGAAGATGGT           GTTAGGGTAT TAT ATGCCCTAGC           TAATCTAGTAATGGA  73 501
SMPYRCLA_RS00040 NONE
        rsmA NONE
SMPYRCLA_RS00050   10101 ..   10122 +  -6.1  -3.61812   TATAATTATATTATA           TTATAATTA ATTC TAATTATAA            TTATAATTATATTCT  65 108
        dnaB NONE
SMPYRCLA_RS00060   12592 ..   12609 +  -5.7  -3.50422   AATTAGAATTAATTC             TTAGAAT TCTA ATTCTAA              TTAATTCTAATTAAT  59 127
        mnmE   14308 ..   14326 +  -6.2  -3.31537   TAGGAAAATATAATA             TATTATAT TAT ATATAATA             TTAATATAATATAAT  61 46
SMPYRCLA_RS00070   14559 ..   14575 +  -8.1  -2.88638   ATAATATAATTAACA              GATTATC CTG GATAATC              TATAGTCTAGATTTT  69 128
        dnaE   18462 ..   18478 +  -5.3  -3.84406   ATTCTAAAGACTATA              TAATAAT ATT ATTATTA              TTATTATAATAAAAA  59 42
SMPYRCLA_RS00080   18683 ..   18696 +  -3.9   -3.9749   AGATAATATAAAAAA               TCTAT GAAT ATAGA                TTTCATATTATAAAT  56 127
        tilS NONE
SMPYRCLA_RS00095   21110 ..   21125 +  -3.4  -4.97461   TTGTATTTTTTTTAA              TAAAAT AATT ATTTTA               TTTTTGATATTTCTT  65 313
SMPYRCLA_RS00105   22957 ..   22973 +  -6.5   -3.0122   GAGTATTAATACTCC              GAGGGTT CAA ATCCCTC              TCTCTCCGTTTATTT  62 1
        htpG   25093 ..   25113 +  -8.3    -4.652   GTAATCTAATAATTT            TACTGCGTT TGT AACGCAGAA            TTTTTGGGATAGTTT  85 246
        rplS   26815 ..   26837 +  -6.4  -3.21099   AGAATGTCCAAATAA           TGCCATTATT AAT AATAATGCCA           TTAATAATGCCGCCA  64 102
SMPYRCLA_RS00130   28769 ..   28783 +  -6.4  -3.33708   CGAACCTGCAACCTA               CTGCTT AGA AGGCAG               TTGCTCTATCCATTG  64 86
SMPYRCLA_RS00165   34085 ..   34134 +  -7.7  -3.40907   TACTATTATAGTATA TAGTATAGTA-TACTATTACTAAT ACT ATTACTAATACTATTACTATACTA TTACTATTACTATAA  70 366
SMPYRCLA_RS00175   35085 ..   35096 +  -5.8  -4.25848   TTCTTTTTCTTTTTT                TGCC ATTT GGCA                 TTTTAATAAAAAATT  67 312
         frr NONE
        asnS NONE
SMPYRCLA_RS00205   38435 ..   38445 +    -4  -3.11023   AATAATTTTACTGAA                 CTTT ATG AAAG                 CTTGTTTTGAAGCTT  47 52
        rplU NONE
        rpmA NONE
        ssrA NONE
        rpsF NONE
        rpsR NONE
        rplI NONE
        gltX   42233 ..   42243 +  -5.4  -3.68506   TCTTAGTCTTTGACT                 GACT CTT AGTC                 TTTGACTGACTCTTA  61 315
SMPYRCLA_RS00250 NONE
        ybeY NONE
        mnmG NONE
        glnS   46939 ..   46952 +  -3.9  -4.58076   GTTACAAAAAAAATA               TTAGA TTTT TCTAA                TTTTATATAGCTTAT  62 22
SMPYRCLA_RS00270   48050 ..   48075 +  -2.1  -2.79747   ATTAATAAAATATTA         TTTAATAAA-CT ATG AGATTTATTAGA         AATTTTTGTATTCTC  39 11
        lepA   49874 ..   49888 +  -4.4    -3.767   AAAATTAATATTTAA               TATTTA AAT TAAATA               TTTCCTCAGTAGCTC  57 42
SMPYRCLA_RS00280   49999 ..   50022 +    -9   -2.6252   TAATACCTACCTTGT          GGTATACCTAC CTT GT-GGTATACC          TACCTTGTGGTATAC  73 59
        grpE NONE
SMPYRCLA_RS00295 NONE
        mnmA   57229 ..   57239 +    -4   -5.0133   AAATTATGCTGTATA                 TCTA AGA TAGA                 TTTTTTAAAAAAATA  67 84
SMPYRCLA_RS00310   58855 ..   58865 +  -5.4  -4.23528   TAATAAGATTTGATA                 TCGT TTT ACGA                 TTTAATTTTAAATTA  66 71
        rplM   62458 ..   62474 +  -3.8  -2.62326   TAGTAATGTTAAATA              TTTTTC TTAAT GAAAAA              ATATATTTCTAATTC  43 16
        rpsI NONE
        rpsB NONE
SMPYRCLA_RS00350   64332 ..   64348 +  -8.1  -2.62933   TTGAACCCGCAACCC              TTACCTT GGC AAGGTAA              TACTCTAACCAGTTG  69 156
        queA   77014 ..   77034 +  -2.7  -3.24827   TGCTATGTTAATTCT            TTAAAAATA AAT TATTTTAAA            TTAATGAATTCTCTT  42 22
SMPYRCLA_RS00415 NONE
SMPYRCLA_RS00420 NONE
SMPYRCLA_RS00425 NONE
SMPYRCLA_RS00430 NONE
SMPYRCLA_RS00435 NONE
SMPYRCLA_RS00440 NONE
         tuf NONE
SMPYRCLA_RS00450 NONE
        rplK NONE
SMPYRCLA_RS00460   80754 ..   80771 +  -4.3  -3.29549   ACAATGGGTACTAGT             TATTTAA TATA TTAAATA              TTAACTTATATTAAT  48 11
        rplJ NONE
SMPYRCLA_RS00470 NONE
        rpoB NONE
        rpoC   89766 ..   89782 +  -2.4  -4.69028   AATATAATTTACATT              TATTAA AAGAA TTAATA              TCTTTTTTTTTACCA  56 279
SMPYRCLA_RS00490   91242 ..   91255 +  -3.9  -2.91976   ATCTTTTGATAAAGA               TAATG TCTA CATTA                TGATTATGATTATTC  46 9
SMPYRCLA_RS00495   91508 ..   91522 +  -2.2  -6.43839   TCTTATGAAAAAAAA               TAATTA ATC TAGTTA               TTTTTTTTTTAGTCT  81 103
SMPYRCLA_RS00530 NONE
        leuC NONE
        leuD NONE
        leuB NONE
SMPYRCLA_RS00550 NONE
SMPYRCLA_RS00555  102825 ..  102837 +  -4.9  -3.77171   AACAGTTTTTTAGTT                CATAA AAA TTATG                TAGTTTTTTTTTTAA  58 114
        rpsU  104485 ..  104502 +  -4.3  -5.13137   TATTTTAGGTGATTA             TATAAAA CATT TTTTATA              TTTTTAATTTCTTTC  70 47
SMPYRCLA_RS00590  107259 ..  107275 +  -6.7  -2.56601   AAAAAATAGATGAGA              GTTTTTT GAT AAAAAAC              ATAATTTTTGGTAAA  60 215
SMPYRCLA_RS00595  107636 ..  107646 +    -4  -3.02263   CTTGCTTATCTGATC                 TGAT CTT ATCA                 TCTTGCAAAAAATAT  47 52
SMPYRCLA_RS00605  109524 ..  109580 + -11.4  -4.14739   CTAATTACCTTTTTA GGTACCTTAGGTACC-A-A-GGTACCTT TTACC AAGGTACCTTGTAGGTACC-AAGGTACC TTTTAAGGTAGGTAC  95 46
        sufB  114740 ..  114758 +  -6.2  -3.50047   AAAATAGAAACCATT             TTTTTAAT GTT ATTAAAAA             TTATCGATTTATCAG  63 49
        sufC NONE
SMPYRCLA_RS00635  116825 ..  116841 +  -5.3  -4.00512   GAATATTAATTAGTT              TTAAAAT TTA ATTTTAA              TGTTTTCTTATGAAG  61 28
SMPYRCLA_RS00640  118073 ..  118093 +  -7.1  -3.15532   AATAATATAATTATA            TATATTATA TAA TATAATATA            ATTATTTATTAATTA  65 49
        infB  120149 ..  120161 +  -4.9  -5.24129   AAATCTTTTTAACTC                CATTT AAG AAATG                TTTTTTGTAAAACAC  76 359
SMPYRCLA_RS00665 NONE
        rpmF  121318 ..  121334 + -10.9  -4.28049   TTTTCTAGTTCTTTA              CTGGCTT TAA AAGCCAG              TTTTAAAATTTTACC 100 470
SMPYRCLA_RS00695  125661 ..  125675 +  -4.4  -5.52384   GTTATTTTCTAGAGA               TTTTTT GCT AAAAAA               TTTTTTTAATCCAAG  78 162
        rpsL NONE
        rpsG NONE
        fusA NONE
        rpsJ NONE
        rplC NONE
        rplD NONE
        rplW  131399 ..  131411 +  -3.5  -2.61831   TTTTAAAGTAAAAGA                TTTTA AAG TAAAA                GATTTTTAAAATGCC  43 4
        rplB NONE
        rpsS NONE
SMPYRCLA_RS00750 NONE
        rpsC NONE
        rplP NONE
        rpsQ NONE
        rplN NONE
SMPYRCLA_RS00775 NONE
        rplE NONE
        rpsN NONE
        rpsH NONE
        rplF NONE
        rplR NONE
        rpsE NONE
        rplO  138154 ..  138168 +  -3.6  -2.62144   ACCAGGCGATAAAGT               GAAATT GCA GATTTC               CTATTATGATTTAAC  43 189
        rpmJ NONE
        rpsM NONE
        rpsK NONE
        rpsD  139711 ..  139721 +  -2.6   -2.8829   TTACTAGTAGAATTG                 TATT CTA AATA                 ATTTAATAATAGTAT  39 14
        rpoA NONE
        rplQ NONE
        rsmH  141995 ..  142044 +  -2.3  -3.12142   CACAAAAAAAAGTAT GTTGATTTATCGCATTGTTTGTT TTTA AACAAACAATGAGGAAAGTAAAG TATGTTAAGTATAAG  40 21
        rnpB  142464 ..  142494 +  -4.9   -6.5058   TTTTAATATTTTTTT      TATTAGCTTCCTTA TTGT TAAGGAAGC-AATC       TTTTTTTTTGTTTCT  95 115
        pdhA NONE
SMPYRCLA_RS00880  148109 ..  148125 +  -3.7  -6.34424   AGGAGATTTACATTC              AACCATT ATA AATGGTC              TTTTTTTTTTAAGAA  87 215
SMPYRCLA_RS00890 NONE
        trxB  150443 ..  150472 + -13.7  -3.31322   TACAAATAGCAGTTA       GCAGTTAGCTGCT AATC AGCAGTTAGCTGC        TTATCAGCAGTTAGC 100 306
        ilvB NONE
SMPYRCLA_RS00905  152822 ..  152844 -  -5.1  -4.52415   ATTGACAATAATAAA           TAAATAATA GCATT TATTATTTA           TTATTATGATGATTG  66 240
        ilvC NONE
SMPYRCLA_RS00915  150436 ..  150462 -  -5.9   -3.5241   CATCTTTTACAAATA        GCAG-TTAGCAG TTAG CTGCTAATCAGC         AGTTAGCTGCTTATC  63 474
SMPYRCLA_RS00885  147466 ..  147480 -  -7.2  -5.14819   AAATCAAAAAATAAA               TTCTTC ATT GAAGAA               AGAAAGGATTATATA  87 456
SMPYRCLA_RS00870 NONE
        lysS NONE
        mutL  142139 ..  142151 -  -6.2  -3.24245   CTAGGGATAACGCAA                CGGG TAACT CCCG                TACATCGTGAGATGA  60 248
        tsaD  125233 ..  125256 -    -4   -2.5474   TTTCATTTATAATAT          TTTCTTGTAT AAGA ATATAAGAAA           TAAATAGAAAATGAA  45 298
SMPYRCLA_RS00690 NONE
SMPYRCLA_RS00685 NONE
SMPYRCLA_RS00680 NONE
SMPYRCLA_RS00675  120885 ..  120918 -  -5.5  -3.08015   TTAATGACTGTAATA     GCAATAATTAATAAT TATA ATTAATAATTATAGC      AATAGCTAATTATTT  56 103
SMPYRCLA_RS00655  120056 ..  120066 -  -2.4  -3.08813   TCTTATTTTAAGATA                 GCCC ATA GGGG                 AATTGAACCCCTCTT  41 10
        rpsT  119431 ..  119447 -  -6.7  -3.72527   AAAATTAGCTAATAA              TAATAAG ATA CTTATTA              AAGTATATAATTTAA  68 390
        miaB  111828 ..  111838 -  -2.6  -5.16572   ATTTAATTTAAAAAA                 TTAT GGG ATAA                 TTAGTAATTATTAGT  63 103
SMPYRCLA_RS00615 NONE
        groL  109556 ..  109572 - -10.9  -3.14931   GGTACCTTTTACCAA              GGTACCT TGT AGGTACC              AAGGTACCTTTTAAG  84 250
SMPYRCLA_RS00600  108191 ..  108211 -  -9.8  -3.82262   AACCTTAAGGAAGAA            CCTTAAGG AAGAA CCTTAAGG            AATCTGTAATTCGAA  84 390
SMPYRCLA_RS00585 NONE
        lpdA  105438 ..  105450 -  -3.5  -3.02471   GTTTGATGACATATA                TATTT TTT AAATA                TGTATACTTTTTCCA  45 19
        cgtA  104412 ..  104422 -  -2.6  -4.86216   ACAAAAAAGAAGAAA                 TAAT TTG ATTA                 AAGCGAGATATAAAC  59 72
SMPYRCLA_RS00560  102336 ..  102362 -  -6.6  -3.65522   GAGCTATTTTAAGAA         CTGCATCAGC TATTGGG GTTGATGCAG         TGTTTTTCTGTGATG  66 438
        tyrS   96266 ..   96289 -  -2.6  -2.72511   TCTATTTTTTTAAAG          TTATACTTCA TATT TAAAATATAA           AAGGTAAAAATTTTT  39 2
SMPYRCLA_RS00520 NONE
SMPYRCLA_RS00515   93380 ..   93433 -  -9.2  -2.50035   TATACACTAAGATAT GGTACCCTACACTAT-GGGTACCC-TA CAC TATGGGTACCCTACACTAT-GGGTACC CTACACTATGGTATA  73 48
        serS   91940 ..   91963 -    -7  -2.77109   AAATTTAGACATAAT          TTAATTATAA TTAA TTATAATTAA           TTTAAAGAAATTTTA  63 22
        rpmB NONE
        rpmG   91194 ..   91208 -  -2.2  -5.75342   TTTTTCTAAAAAAAA               TAAAAT ATA ATTCTA               TAATTCCATATCAAA  73 360
SMPYRCLA_RS00485   89108 ..   89121 -  -2.4  -4.67635   GTTAAAATTATAAAA               TCAG GAGATA CTGA                CTTACTAGTAGGTGA  56 413
SMPYRCLA_RS00405 NONE
SMPYRCLA_RS00400 NONE
SMPYRCLA_RS00395   73621 ..   73635 -  -8.6  -2.79915   ATTTATTGGAGGATA               TCGGTT TCG AACCGA               TGACCTACTGCTTGC  72 1
SMPYRCLA_RS00390   70390 ..   70440 -  -9.8  -3.36492   GGTGGAACCTTATAA GGTGGAACCTTATTGCTATAAGGT GGA ACCTTATTGCTATAAGGTGGAACC TTATTGCTAGAATCG  79 281
         rrf   70212 ..   70222 -    -4  -3.75766   TTTATAATCGAATAA                 TCTA GTC TAGA                 AAGCAATGGGCAATG  52 30
        dnaX   69118 ..   69137 -  -3.7  -3.36785   GTATACTTTAATCAA            TCAAATT TCTAGT AATTTGA             TTAAAGTGATTTCGA  46 6
SMPYRCLA_RS00375 NONE
        clpX NONE
        mutS NONE
SMPYRCLA_RS00360   64311 ..   64325 -  -5.6  -4.74103   GCTCTAAGCGAAAAA               CGGGAT TTG AACCCG               CAACCCTTACCTTGG  74 1
SMPYRCLA_RS00355   63727 ..   63739 -  -4.9  -5.05037   TAATATAAAAACAAA                TTCTT TAA AAGAA                AGTTTTATAATATGC  72 497
        dnaK NONE
        infC NONE
        rpmI NONE
        rplT   58422 ..   58434 -  -4.9  -5.69068   TAAAAAGATAAAAAA                GAATA TTT TATTC                GAAGGTCTCTTTGAA  84 387
SMPYRCLA_RS00305   57175 ..   57195 -  -8.3  -3.17763   TGTATAGTTGATTAA            GTGGAGATT TTA AATCGCCAC            TTAAAAGGATCATTG  70 1
        ileS   49863 ..   49873 -  -2.6  -5.73563   AGTAAATTAAAAAAA                 TTAA TAT TTAA                 TATTTAAATTAAATA  72 229
SMPYRCLA_RS00245   41691 ..   41715 -  -4.5  -5.33405   TTTATTAAATAAAAA          TATAAATAAAA ACA TTTTATTTCTA          ATAATAGAATGGTTA  76 502
        trpS   35286 ..   35306 -  -5.6  -2.52015   TTTACATTTATGAAG            TAAATTCA GAGGA TGAATTTA            AAGAATTACTATAAT  53 102
SMPYRCLA_RS00185   34931 ..   34943 -  -3.3  -3.88787   CTATATGCGGATAAA                GGGAT TCG AACCC                TTATATCTTTTTAGA  50 3
SMPYRCLA_RS00180   34353 ..   34368 -  -3.4  -3.35012   AAGAAAAAAAGGATA              TTTTTT GCAG AAAAAA               TGTTAAATTAATAGC  47 491
SMPYRCLA_RS00170   33235 ..   33249 -  -3.6  -6.02546   CCAAAGCAAAAAAAA               TTACTT CCA AAGCAA               AAACTAAAACTAAAG  86 503
        lipA   31886 ..   31896 -  -2.6   -4.0749   TGAAAAAATTAATAA                 TTTA AAT TAAA                 ATTCCGATTGTAGGT  49 215
         der   30460 ..   30490 -  -7.2  -4.02093   TATATAATATAATAA       TATATATAATAATA TAA TATAATTATATATA       ATATATTTTAGACTT  74 64
SMPYRCLA_RS00150 NONE
SMPYRCLA_RS00145 NONE
SMPYRCLA_RS00140 NONE
SMPYRCLA_RS00135   28470 ..   28484 -  -4.4  -3.78693   AAATTTATAAAAAAT               TAAAAT TAG ATTTTA               TTTTAATATATGAAG  56 277
        mtaB   24757 ..   24773 -  -2.3  -6.50278   AAATTAAAAAAAAAA              TAATAAG AGA CTCACTA              GAATTTATATTACTT  86 112
        proS   20477 ..   20493 -  -5.3  -4.95806   AAATTATGAGAAAAA              TTATATT AAA AATATAA              AAAAATATTGCATAA  75 351
SMPYRCLA_RS00085   18494 ..   18510 -  -3.7  -5.22006   TTATTATAATAAAAA              TACCTAA ATA TTAGGTC              TGGTAGTTCAGTAGG  70 99
