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CWR56_RS02985  615953 ..  615970 +  -2.7  -3.16936   ATAAAATAGTGTTTG             TTCTGTT TTAT AACTGAA              ATTTTGATAACATTT  41 32
CWR56_RS02990  617181 ..  617192 +  -4.4  -2.74012   CTCTGCATATTTAAA                CCTT AGTA AAGG                 TAGTTAAAGTAGTAG  48 340
CWR56_RS02995  618357 ..  618379 +  -3.6  -3.27771   AGGTAATTGCTAGAG           CTAATATT ATAGATA AATATTAG           TATTGATATTCTAGG  46 241
CWR56_RS03000  619273 ..  619291 +  -2.5  -4.21275   ACAATGTGTTGACAT             GTTGTAT CTATC ATATAAC             TTTTAGATAGGTTAA  51 1
CWR56_RS03005  619909 ..  619919 +    -4  -3.68351   TGATATATAAGTTTA                 TAAG GTT CTTA                 TTTCAATAATGCAAA  52 309
CWR56_RS03010  621232 ..  621266 +  -5.8  -3.78934   AGGTGTATAAATAAA     GGAGATAATTCAAAAT AAA AGTTTGAACCATCTCC     TTCTTATAGAAAAAC  63 162
CWR56_RS03015  621816 ..  621854 + -10.7  -4.57341   AATTTATTCAAAAAA   GTTATATATTTATAACA AGAGG TGTTATAAATACATAAC   TTTTTAAGGGGGATT  95 53
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        tcdB  653342 ..  653373 +  -4.4  -5.24799   ATTTACCAATAAAAA      GGTGGACTATGATG AATG CACAGTAGTTCACC       TTTTTATATTTCTAA  73 132
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        cooS NONE
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        glpK  770309 ..  770323 +  -2.8  -2.85841   TTTACATGTATAGGA               GGAATT AAA AATGCC               CTTTGATAAAATTAT  39 56
CWR56_RS03595  771640 ..  771667 + -12.2  -3.79902   AGTTTAGACATAAAT        GGAGCTAAATAA ATAA TTATTTGGCTCC         TTAATTTTAATTTAT 100 231
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CWR56_RS03615  774575 ..  774595 +  -2.7  -2.69799   AGGAATATATGGTAT            CTTAAATAT ATA ATATTTAAA            TAATGTATAAGCTCA  39 135
CWR56_RS03620  775074 ..  775088 +  -4.4  -3.54543   ACAGTTTTAATGCTA               TTATAA ATT TTATAA               TTTGAAGGAGTAGAT  53 84
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CWR56_RS04440  958005 ..  958039 + -12.4  -3.66643   AATATAGTTTTAATA     TTTAAGGAGACAGATT ATA ATTTTGTCTCCTTAAA     TTATGCTTTAATTTG  95 91
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        pepT 1053882 .. 1053906 +  -6.7  -4.99134   TATTTTTATAAAAGA          TAATTATTTTT ATA AAAGATAATTA          TTTTTAGTTTAGGGT  83 156
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         rny 1323141 .. 1323170 + -14.5  -4.39407   TAGAAATTTAAATTT       GCCACAAGATATG ATAA TATATCTTGTGGC        TTTTAAATTGTTTAA 100 75
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CWR56_RS07930 1714948 .. 1714973 +  -9.2  -4.96848   AAATAAAATAAAAAA         GATAAATCCT AATCAA AGGATTTATC          TTTTTGTATAGAAAA  93 496
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        recQ 1753662 .. 1753686 +  -5.1  -6.09196   TATACGATTATAAGA         GTGC-TTTCC AAACGA GGAAAAGCAC          TTTTTTTATTTTCAA  86 295
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        grdB 1794165 .. 1794204 +  -8.2  -6.11243   ACTGAAATAAAAAAA  GATATCAAAAAATAATTT TTTA AAATTATTTTACGATATC   TTTTTTTTATTAGGT 100 58
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         gap 1821005 .. 1821043 +  -4.3  -5.68438   AAAACTAAAAAAAAA  GATTATGAAAAATATT GAAGGAAA AAT-TTTTTCATAATC   TTTTTTCTTTCATGC  75 91
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CWR56_RS08510 1822541 .. 1822581 + -17.3  -5.64274   ATAATATACAAAAAA  TGGTTGTTGATATGTAA TAAGAAT TTACATATCAACAACCA  TTTTTTTCTGACTAA 100 63
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CWR56_RS08570 1837694 .. 1837705 +    -3  -3.65426   TATTGTGAGGAGATT                TTTG TGAA CAAA                 TTTAAAGATTTATAG  48 118
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CWR56_RS08595 1843835 .. 1843871 +  -5.4  -5.96894   AAATAAATTATTTAA    GAGTGTATAAAAAC GATTTTTAG GTTTTTATATGCTC    TTTTTTTATTTGAAT  93 43
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         ade 1879978 .. 1880006 +  -4.7  -5.29445   AAAGTAATAATAAAT       GAGGCTT-TCTC AAAATA GAGATAAGTCTC        TTTTTATTGTTGAAA  73 49
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CWR56_RS10465 2234128 .. 2234185 +   -15  -3.13475   AATTTATATTTTTAC TTAA-AAAGTTAATAGGTATC-TAATTT ATTA AAATTAAGATACCTATTAACTTTATTAA TTAAGTGTACAATTA 100 119
CWR56_RS10520 2247938 .. 2247989 +  -3.4  -2.91912   CTAAATTATTTAATC CTACAGCTTAACTATATAAAT-TTG TTC TAACATTTATATAGTTAAGCTAAAA TATCTGAATAAATAA  44 37
CWR56_RS10590 2265220 .. 2265230 +  -2.6  -3.79419   GAATATTTTTCCATT                 TAAT ATT ATTA                 TATTTTATAAGAGCA  47 69
CWR56_RS10595 2265813 .. 2265857 +  -4.6  -4.96523   TAATATAATAAAGAA GGTGTTTTAATGAAAA TCAAGATTGATTC TTATCATTAAAACACC TTTTATTATTCGTTT  70 55
CWR56_RS10635 NONE
CWR56_RS10640 2276229 .. 2276279 + -16.7  -2.84801   ATTTTATTAAATTCT TAGAGACTGAAATTTTAAAATCA TAATT TGATTTTAGGATTTCAGTCTTTA TCATATTTAAAGATA 100 45
CWR56_RS10700 NONE
CWR56_RS10705 2290369 .. 2290389 +  -7.7   -5.9667   TTATATAAAAAAAAA            GGTTATTTG AAA TAAATAACC            TTTTTTTGTCTTTTT 100 52
CWR56_RS10710 2291319 .. 2291339 + -11.3  -2.92267   TCTAGTAGGTTTTAA            TGGCATATT TTA AATATGCCA            TAGTTGATTTATAAG  84 175
CWR56_RS10730 2295279 .. 2295303 +  -9.5  -5.64421   TATAATTTCAAAAAA          GTATTGGATAA TAA TTATTCAATAC          TTTTTTATTTCGGGT 100 42
CWR56_RS10735 2296217 .. 2296239 +  -2.1  -5.54079   CCCAAAGTAAAAAAA           TATTGAATA GTAAA TATTCAGTG           TTTTTTCATTTTTGG  68 42
CWR56_RS10740 2297432 .. 2297442 +  -5.4  -5.24129   AGATGTTAAACAACT                 TAGC TAT GCTA                 TTTTTTATCAAGAAA  81 206
CWR56_RS10755 2298998 .. 2299011 +  -6.7  -2.61274   TATGACACGGTTCTG               CCCAT AAGA ATGGG                ATTGGTTGAAATACC  60 320
CWR56_RS10765 NONE
CWR56_RS10770 2300702 .. 2300742 + -15.8   -5.4251   TTTTTAATAAAAAAA  TCATGCTACATCAATAGT AAGCA ACTATTAATGTAGCATGA  TTTTTTGTATCTAAA 100 296
CWR56_RS10860 2320617 .. 2320633 +  -3.1  -3.71075   CTTCATTCATTCTCA              TATAGAA AGC TTTTATA              TCTTTTGGATAATCT  52 497
CWR56_RS10990 2345173 .. 2345189 +  -6.6  -3.13773   TGAATATTTTTAAAG              TACTGC ATAAA GCAGTA              GTTTTCAGTGTACAC  62 52
CWR56_RS11160 2377508 .. 2377523 +  -6.2  -2.98494   ATTTTGTAATCAAAA              GTTACA GCTG TGTAAC               TGTAATATTATTCTC  60 59
CWR56_RS11165 2377988 .. 2378028 +  -6.5  -5.46706   AATAAATAACTAATA AAAAATGGATG-CAAATT GATATA AATTTGACATCCATTTTC  TTTTTATTTTAAAGT  93 32
CWR56_RS11180 2382041 .. 2382067 +  -8.2  -5.24551   TATTGTAACAAAAAA         GGATAGTATA ATTACCC TATACTATCC         TTTTTCTTAATTTAA  93 129
CWR56_RS11190 2384990 .. 2385023 +  -2.7  -5.93809   TGTATAAATTAAAAA    CTACTCCTTTTACTT ATATAA AAGTAA--GGAGTAG     TTTTTTTTATGAAAA  75 34
CWR56_RS11205 2388094 .. 2388138 + -12.6  -2.78935   AAAGTTAATAAAATA TACAATAAAAAATCGAGGCAT TATA ATACCTCGA-TTTTTATTGTA TCTAGTACAAACTAT  90 50
        ytvI 2404492 .. 2404529 +  -4.4  -2.79289   CATTTTTATTTAAAT   TAAAAAGGGCTT-TCTC AAATA GGGATAAGTTCTTTTTA   ATTGTTAAAATGATG  49 52
CWR56_RS11275 2410178 .. 2410220 +  -4.5  -5.40474   TGCATAAATAAAAAG TATAGAATCCCAA-GTCA-AT TTT ATATGGCTTTCGGATTCTATA TTTTTTTGAAAAAAT  76 34
CWR56_RS11315 2419636 .. 2419661 +  -5.7   -4.4078   TTAAGAGTATCATTA         GCAATAATA-AT TTT ATGTATTATTGC         TTTTAGTTAAAAAAA  69 173
CWR56_RS11320 NONE
CWR56_RS11325 2421646 .. 2421668 +  -4.9   -5.4433   ATTAAAAGACAAAAA           CTGATAGAA TTATT TCCTATCAG           TTTTTATTTGTATCT  79 36
CWR56_RS11330 2423135 .. 2423160 +    -7  -6.44931   AAAAAATAATTGTAT         TGCACACAAT ATTTTA ATTGTGTGTA          TTTTTTTTTGTTGTT 100 32
CWR56_RS11335 NONE
CWR56_RS11340 2424515 .. 2424537 + -11.4  -4.90136   ATTTTAAATAAAAAA           CAGAGTGACT TAA AGTTACTCTG           TTTTTACTCTTCATT 100 117
CWR56_RS11365 NONE
CWR56_RS11370 2429641 .. 2429667 +  -9.6   -5.9218   GCTTAGTTATAACTA         TAGAAGTGTACT GCG AATACACTTCTA         TTTTTTTATTATATC 100 254
CWR56_RS11380 2430382 .. 2430392 +    -4  -2.54812   TATTTTTAGCTAAAA                 TTGT TCG ACAA                 ATTGCTGATATAAGT  45 81
CWR56_RS11385 2430919 .. 2430950 +  -8.8  -2.81535   GAAAGTATAAAAAAA      GAAGGTAACAACCA ACTC TAGTTGCTACCTTC       TAATCTATTTAACTA  72 18
CWR56_RS11450 2439735 .. 2439760 +  -7.7  -5.60689   GCTTAGTTATAACTA         CAGAAGTGTAT TGGC ATACACTTCTA          TTTTTTATTATATCA 100 126
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CWR56_RS11470 2441838 .. 2441858 +    -7  -4.73388   ATGTCAGCCAGTTGC            CAAAAAGA TATTT TCTTTTTG            TTTTTCATGAAAGTT  79 291
CWR56_RS11475 2442084 .. 2442101 +  -3.5  -4.59081   TAGACAGATTTTTTT             CTAGAAA ACCC TTTTTAG              TTTTATCTACATTTA  60 38
CWR56_RS11480 2442516 .. 2442531 +  -7.6  -6.23545   TAGATTTTTCGGAAA              GACTCT TTTA AGAGTC               TTTTTTTTATTTACG 100 45
        modA 2443925 .. 2443935 +  -5.4   -3.1154   ATATTTAAAAAATAT                 GGTT TTG AACC                 TGTTAAGTAGTGATT  56 5
CWR56_RS11490 NONE
CWR56_RS11495 NONE
CWR56_RS11500 2446179 .. 2446204 +  -9.1  -3.84451   AATCATATCATCAAG         GAGTACACAAA TATA TATGTGTACTC          TTTAAATTTAAAAAG  82 43
CWR56_RS11505 2447329 .. 2447357 +  -6.8  -4.91109   ATTATTTGAGATTTT        GTGATATAGCAC TTTTT GTGCTATACTAC        TTTTTCTCATACAAC  81 79
CWR56_RS11510 NONE
CWR56_RS11515 2450311 .. 2450360 +  -7.5  -3.95772   ATAATCAGTTACATC TCTGTTACCTAAGATTACAATTTT GTA ATATTTGTAATCTTAGGT-ACAAA TTTACATTTATTCTT  73 244
CWR56_RS11605 2472202 .. 2472212 +  -5.4  -5.13344   ACTTATCTCTATTTT                 GAGA CAG TCTC                 TTTTTATATTAGTAT  81 79
CWR56_RS11655 2484971 .. 2484988 +  -4.3  -4.90778   TATAAACTAAATTTA             TATTATA CAGA TATAATA              TTTTGTTTAAATACA  65 31
CWR56_RS11715 2499170 .. 2499186 +  -2.3  -4.86133   ACCTATCATTTTTAT              CTAAAGG TCA TTTTTAG              TTTTTCATATATGTA  58 127
CWR56_RS11795 2510779 .. 2510801 +  -2.8  -4.47052   AATGATAAAAAAGTA          GGC-AATCT CAAGTT AGATTTGCC           TCTTTTTTATTTAAT  54 80
CWR56_RS11800 2511429 .. 2511445 +  -2.4  -2.98778   ATAAAACTTAGGAGG              TTATTT ATGAA AAATAA              TAATTTAAATTGTGC  41 79
CWR56_RS11805 2511788 .. 2511835 +   -11  -5.01732   ATACAAAGCAAAATT GAACCTATCAAATAGATGTCTTT ATT AATGATGTCTATTT-ATAGGTTC TTTTTTAAAACAATT 100 70
CWR56_RS11870 NONE
CWR56_RS11875 2519064 .. 2519078 +    -5  -3.05384   TATTTACAGATGTAA               TCACTT CAG GAGTGA               TTACATGAACAAAAA  53 131
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CWR56_RS11885 2520302 .. 2520346 + -20.5  -3.75024   ATCACAAATCACTTA TCACAAATCACAAGTGATT AATCACA AATCACTTGTGATTTGTGA TTCTTAATGATACAA 100 371
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CWR56_RS12045 2551918 .. 2551967 +  -6.7  -3.58552   TTATAACATTTATAT TTAAATAGTGTCTCATTTAAATT GAAA AATCATATTGAGACACTATTTAA TATATTTTTAGATTT  67 48
CWR56_RS12070 2555674 .. 2555693 +    -5  -3.38207   TTTCATCTACTAATT            CAATGCAT AAAA AGGCATTG             TTAGTATCTTCAGTA  57 249
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CWR56_RS12135 2568111 .. 2568165 + -24.3  -3.39668   ACTAAATATTCATAA GAAAAGAAATAGCAGTAGTATAATA ATCTA TATTATATTACTGCTATTTCTTTTC TTATGAAGTTTCAAC 100 36
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CWR56_RS12150 NONE
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CWR56_RS12410 NONE
CWR56_RS12415 2628569 .. 2628609 + -13.7  -4.41494   AATTTAACTACTAAA  TTAAGCAGAGATTTGAA AGACTAG TTCAAATTTCTGCTTAA  TTTTAATTCAAAATA 100 34
CWR56_RS12500 2648438 .. 2648451 +  -8.1  -5.86976   TCTTATATATAATAA               CCCCT ATGT AGGGG                TTTTTTATTTTGTAA 100 56
CWR56_RS12525 2654189 .. 2654219 +  -7.1  -3.36671   ATAATTAGGCTAAAA       GTATGAATATAAA ATTGC TTTGTATTCATGC       TTCTAGCCTTCAAAT  66 85
CWR56_RS12550 2658859 .. 2658911 +  -3.8  -3.33885   AATTTTTATATAAAA TATGGTATATACTTAAGTAA TCTAAAACAAATT CTACTTATGTATATACCATA TTAATAGTTTAAATT  46 120
        manA 2667965 .. 2667999 + -10.3    -4.183   AAACCTAGCTAAAAA     TAGGCTATCATAA TAATTTACC TTATGATAGCCTA     TTTCTTACAACTTAA  89 46
CWR56_RS12620 2677593 .. 2677650 + -14.7  -3.77089   CTATACTTATCCTTA TAAATCTAAAAGTACTGAGATAATAAT TATA ACTATTATCTCAGTACTTTTAATTTTA TGTTTATGTATTTTT 100 74
CWR56_RS12640 2682249 .. 2682285 +  -6.7  -5.43514   TAAATTAGACTATTT    ATAAAAGGCATATTGTT AAA ATCAATATGCCCTTTAA    TTTTTTGATTATTTT  93 38
CWR56_RS12655 NONE
CWR56_RS12660 2688488 .. 2688531 +  -2.6  -5.28166   AGTTAATACAGAAAA GGAGTTATCCTATGAACAA TTTAAGT TTGCTC-TGTGATAACTCC TTTTTATTCATTTTA  63 35
        aspD NONE
CWR56_RS12710 2700437 .. 2700456 +  -3.6   -5.5762   AAGTGTAATTGTAGT            TGTATGCT TCCA AGCATATG             TTTTTTCTATTTCAT  74 458
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CWR56_RS12770 NONE
CWR56_RS12775 2715426 .. 2715457 + -10.4  -3.53012   TTTCTAAATAGTAAA      TATAAAACTGCC TTAATATC GGCAGTTTTATA       TTTACACAAAACAAA  86 30
CWR56_RS12780 2716296 .. 2716331 + -10.7  -3.08002   AAATAAACACTAAAA    GCCAAATAACAATTT AAATAC AAAATGTTATTTGGC     TAATTTAGTTTGATA  83 124
CWR56_RS12835 2729339 .. 2729355 +  -6.7  -2.64803   CTATATTAGCTATAA              TCTAAAT ATT ATTTAGA              TACATTTCCAGCTAC  60 159
CWR56_RS12845 2732425 .. 2732457 + -12.3  -4.37092   GAATAACACTCAAAA      TAAATGGCTAACT TTTTACC AGTTAGCCATTTA      TTTTATCAGAAAACT 100 40
        rpmB 2756150 .. 2756183 + -12.7  -3.96337   AGCTTAGTAACCACG     TTTAAAAGCCTACTT CCGT AAGTAGGCTTTTTAA      TTTAATCATTTTTAC 100 34
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CWR56_RS12975 NONE
CWR56_RS12980 NONE
CWR56_RS12985 2762436 .. 2762465 + -12.4  -3.36823   CTTAATTTTAGATAA       TTGAGAATTGAG TGTACT CTCAATTCTCAA        TTAAATTTTGGGAGG  93 49
CWR56_RS12990 2765284 .. 2765310 +  -3.7  -5.09895   TTTGTAAAATAAAAA         GGTGAACCTTG TATAT TAGGATTCACC         TTTTTTAAATAAATC  65 144
CWR56_RS13110 2792075 .. 2792086 +  -2.2  -6.02919   TTTTGATTTGGTTTT                CTCT ACTA GGAG                 TTTTTTTATTTCTGC  85 401
CWR56_RS13165 2804677 .. 2804709 +  -2.7  -5.24129   AATAAATAGAAAAAG      GAGATGTCTCAAGAT AAA AATTTGAACCATCTC      TTTTTTATACAAAAA  63 39
CWR56_RS13170 2805530 .. 2805549 +  -4.4  -2.72263   AATCAAAACGAAATT            TCATTAGA AAAA TTTAATGA             GTTTAAAGAAACTAT  48 321
CWR56_RS13175 2805890 .. 2805900 +  -2.6  -2.60194   TTCTAGACTGATTCC                 TATA AAT TATA                 ATTAATTAAAAAAAT  39 10
CWR56_RS13180 NONE
CWR56_RS13185 2807180 .. 2807217 +  -5.9  -5.65927   AATACAATATGTATT   TACCTTATAAAGT ATTAAAAAATTA ACTTTATAAGGTA    TTTTTTATTTAAATA  95 323
CWR56_RS13205 2812891 .. 2812925 +   -19  -4.15066   TGATAAAATTAAAAA     GCCATATAAAAATGTT TTA AACATTTTTATATGGC     TTTAATTTCTCAATC 100 55
CWR56_RS13215 2814603 .. 2814637 +  -7.3  -4.69324   AGATAATTAATAAAA     GTGAACTATTTAAGT TATCT ACTTTAACAGTTCAC     TTTCTTATTTATTCT  79 52
CWR56_RS13265 2825099 .. 2825132 +  -7.5  -4.87389   ATTATTAAAATAAAA     GCGATACATGAATTT TTAA ATGTCCATGTATCGC      TTTATTTTTGCCATA  84 310
CWR56_RS13305 2836061 .. 2836085 +  -2.9  -5.64873   ATAAAATTAAAATAT         GGC-TGTCTC AAAATA GAGATAAGCC          TTTTTTATTGTTGAA  71 37
CWR56_RS13470 2870832 .. 2870856 +  -7.2  -5.35222   TTTTTACATAAAAAA          GTGAACATTG ATTAA CAAAGTTCAC          TTTTTTATAAATTTT  93 441
CWR56_RS13485 2875963 .. 2876001 +  -5.5  -5.36314   TTTATTTTAATAAAA   CTTGAAGTATTAGTG TATTTATCT TACTAATACCTCAAG   TTTTTTAATGTTTTA  84 56
CWR56_RS13515 NONE
CWR56_RS13520 NONE
CWR56_RS13525 2887449 .. 2887474 +  -4.7  -5.67529   TATAGAAAATAAAAA         CAGTGATTATC TAAA GATATACACTG          TTTTTATTTTTCGTT  79 50
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CWR56_RS13550 2892299 .. 2892326 + -11.4  -3.40403   TAGTTATTATATTTA        GGGCTTGAAGAA AGTA TTCTTCAGGTCC         TTCTACTAAGGAGGG  89 38
CWR56_RS13555 2893658 .. 2893678 +    -7  -3.25823   AGAAATTATTGTAAT            TACATTAG GATTA CTAATGTA            TTAATATAAAACAAA  66 1
CWR56_RS13560 2895128 .. 2895176 +  -8.4  -3.27181   TTTTTCCATACATAT CAAAAGAGTATCTC-TAAGTGAT AAAA AACACAAATGAGATACTCTTTTG TATCTATTTTAAAAT  74 48
CWR56_RS13595 2903752 .. 2903797 + -12.3  -5.10154   AACCTATTATAAAAA GGCAATTTATTTAATAAAAAA TATT TTTAATATTAAATAAATTGCC TTTTTAATTTTGGAT 100 48
CWR56_RS13625 2908668 .. 2908694 +  -8.1  -4.99435   TTATACCATAAAAAA         TGAGCTATCTC TATTT GAGATAACTCA         TTTTTGATTATTAAA  90 66
CWR56_RS13665 2918353 .. 2918381 +  -4.7  -4.99435   ATTTATATTAAAAAC       GAAGC-TATCTC AATATA GGGATAAGCTTC        TTTTTAATTGTTAAA  70 132
CWR56_RS13685 2923849 .. 2923884 + -12.2  -3.35695   TTTTAAATTTATAAA    TAGCAAAATCACTTTA TATG TAAATTGATTTTGCTA     TTAACTTTGTATAGA  90 98
CWR56_RS13690 2925332 .. 2925388 + -10.8  -5.04908   TAACATAAATTTCAA TTGTTTTGTAAATATGA-ATATATAAA TATA TTTATATACATCATATATACAAAACAA TTGTTTTTTTATTTT 100 38
CWR56_RS13720 2934165 .. 2934186 +  -8.9  -3.18383   TATAAAATAAAAAAA           TCTATACTT TTAA AAGTATAGA            TTCCTAACTGACAGT  76 87
        srtB 2945876 .. 2945909 + -14.2   -2.8919   GATTTAAAACTCACA     GACACAGTTTAAAA CAATAA TTTTAAACTGTGTC      ATCTTTTATACCTAT 100 34
        pdaA 2952531 .. 2952553 +  -2.9  -4.31837   ATAGCTACACATCTA           TTTTTAATT TATAC AATTAAAGA           TTTATTCGATTTATT  54 361
CWR56_RS13825 2961855 .. 2961869 +  -2.8  -2.74865   GGTATAGAATAGGAG               GTCCTT TCT AATGAC               TGATATGTCTATGAT  39 15
CWR56_RS13830 2962561 .. 2962572 +  -4.4  -2.75481   ATCCACTTATGGCTT                CAAC TCCA GTTG                 TCATTCCAATTGCCC  47 248
CWR56_RS13850 2966093 .. 2966109 +  -5.3  -2.62091   ATGCTCTGAAATTAC              TTAATAT TAA ATATTAA              CTTGTGAATAAATAT  50 143
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        nhaC NONE
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CWR56_RS13960 2993389 .. 2993417 +  -2.5  -4.99435   ATAATAGTATACAAA       GAGGC-TGTCTC AAAATA GAGATAAGCTTC        TTTTTCATTGTTGAA  61 76
CWR56_RS14015 3008670 .. 3008721 + -10.9  -5.77856   TTGATGTTTATTAAA TATCAATGTAATTTTCGCATAAATA AACT TATTTAT-C-AAAATTACATTGATA TTTTTTTGATTTCTT 100 51
CWR56_RS14025 3010910 .. 3010963 + -12.1   -4.1721   CCAATAATTTGATGA TAAATACATACCTCTTAAATGCAAA TTAC TTTGTATTTATGGGGTGTGTTTTTA TTTTAAAATATAAAT 100 56
CWR56_RS14030 3012292 .. 3012314 +    -5  -3.57867   ATTTTAATCTACATT           TATAAAATAC TCT GTATTTTAAA           TTAACTTTTTTATTA  57 188
CWR56_RS14130 3037201 .. 3037214 +  -5.3  -2.79501   ATCAATTTTGTATCA               TTAGC AGAA GCTAA                TATCATCAACGTATC  52 315
CWR56_RS14145 3041880 .. 3041917 +  -7.3   -3.4149   ATAATTTTTAGGAAA   TAAAAACAGACTG CCCATTATTAAT CAGTCTGTTTTTA    TGTTTCACATTAGAT  68 23
CWR56_RS14255 3076730 .. 3076751 +  -5.3  -3.63655   GTAATTAAACTAACA           TAG-TGTAGA GTA TCTACAACTA           TTAGTTTGATTATAC  57 69
CWR56_RS14260 3077855 .. 3077896 + -10.5  -3.33129   TACTAATACATAAGA TTAAGGTTTAGAATATTTT TTGT AAAATACTCTAAACCCTAA  TTAATATACTATTAT  85 72
CWR56_RS14280 3083007 .. 3083017 +  -2.6  -3.05765   CATTATACCTTCATT                 TATT AAA AATA                 TATCTATCTCAAATT  41 41
CWR56_RS14285 3083791 .. 3083826 +  -5.8  -2.85879   AATCAGAAAGTTATC    TTTATAAATTATAGTT TTAG ATTTATAATTTATAAA     ATATTTATGTTCTTT  55 174
CWR56_RS14290 3084271 .. 3084311 +  -2.8  -4.96646   AGTCTTAAAATCAAA  GAGTATCAGTAAAT CTATAAAAAAACA ACTTACTGATACTC  TTTTTAATTATATGA  61 84
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CWR56_RS14330 3094347 .. 3094378 +  -7.4  -3.38378   ATACAAATAATAAAA      TAGCCACTACAA TCCATAAT TTGCAGTGGCTA       CTTTTTACACTATCA  70 207
CWR56_RS14355 3098777 .. 3098830 + -12.2  -4.60143   TCAAAGTAATTCAAA TAATTAACTACCTTAGTATAGAAT ACTTAC ATTCTATATTAAGGTAGTTTATAA TTTTATGTACTATAT 100 46
CWR56_RS14360 3099953 .. 3099976 + -12.6  -4.74787   AAACGCAATATAAAA          GAGATGCTAT TATA ATAGCATCTC           TTTATTTATATTTAT 100 90
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CWR56_RS14430 3122867 .. 3122885 +  -4.6  -2.81471   ACCATATAAAGTAAT             TCCCTTTA AGA TAAATGGA             TATACTGAACTTGTA  50 349
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CWR56_RS15045 3263848 .. 3263860 +  -4.9   -2.6993   GAGAATATCAAGTAT                CTTAT ACT ATAAG                TAAATTTAACTTTAT  50 219
CWR56_RS15115 3280837 .. 3280850 +  -5.3  -6.04953   TATACAAACAAAAAA               CTCAT TACA ATGAG                TTTTTTTGTTTATAT  86 168
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CWR56_RS15285 3320463 .. 3320490 +  -8.5  -3.81741   ATTAATGAAATATAA        GGGTTATGACT ATATAC AGCCATAACCC         TTTAAATTATACATT  79 26
CWR56_RS15320 3327374 .. 3327414 + -12.2   -3.0948   TTTAATTAAACGTAA  CCTCTTGATATAAATTTG AGCTA TAAATCTATATCAAGAGG  TGCTATTTTATTTTT  89 143
CWR56_RS15400 3348241 .. 3348278 +  -2.1  -4.69664   ACATAAAATAGATAA   GCTGTCACACTAAAAAGT CTA AATTAATA-TGTGACAGC   TTTTTACCTAATATA  55 82
CWR56_RS15435 3358860 .. 3358879 +  -6.6  -5.58209   AAGATATTAAAAAAA            TTATGTTT AATT AAACATAA             TTTTTTTACGTTTAG 100 31
CWR56_RS15440 3360738 .. 3360761 + -12.6  -2.50381   ATTTATGTAAAAATC          GGTATAACAC CCTG GTGTTATACC           AATTTTACTAAATTC  90 45
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CWR56_RS15535 3385158 .. 3385199 +  -6.9  -3.35298   CTCTTAAATACCTAA GTGGCTGTTAAATAA-AATT ATA AATTGTTATATGACAGTCAC TTAATCGTTTAATTA  66 78
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CWR56_RS16030 3507795 .. 3507845 + -15.2  -5.72207   CTATTAATTATTACA AGCAATAAAGCCATAAATATTGAA ATT TTCAATATTTATGGCTTTATTTTA TTTTTTTAATTTAAA 100 56
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CWR56_RS16105 3524749 .. 3524761 +  -4.9  -3.35867   ACATTATTTTACTTA                CATTA ATT TAATG                TTACTTAAAAATTAA  54 153
CWR56_RS16120 3527887 .. 3527897 +  -2.6  -3.35542   ATTTACTGAAAAATC                 TATA AGA TATA                 ATTTTTAGAAGTAAA  42 21
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CWR56_RS16130 3529117 .. 3529150 + -10.5  -5.57729   AACAAATACTAAAAA     CCGTCAAGCACGAATA AAC TATTCAT-CTTGACGG     TTTTTTATGTTATTT 100 52
CWR56_RS16195 3544848 .. 3544870 + -10.7  -5.43414   GAGTGATAAATTAGA           CGTACAAAG TATAC CTTTGTACG           TTTTTTGTATATAAT 100 298
CWR56_RS16200 3545993 .. 3546009 +  -2.3   -2.7218   GCTTTATCATACGAT              TTAGTAT AAT ATACAAA              CTTGTATAAATATAT  38 17
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        dapD 3548856 .. 3548897 + -10.3  -5.10077   TAAAAAATTAATTAA AAAGGTGTCTCTGTGTGAAT TTA ATTCAC-CAGAGGCACCCTC TTTTTTACAATATTT 100 84
CWR56_RS16225 3551451 .. 3551505 + -10.5  -4.27117   TTTGTACATAATAAA TCTCAATCTATTTAGGTATTCATATT CATC AATTTGAATATCTAATT-GATTGAGA TTTCTATTCTAAAAG  93 43
CWR56_RS16245 3556512 .. 3556524 +  -4.9    -3.671   AGATTCTGCAAAACA                CTTAT AGT ATAAG                TTTAAAGCTTTCTTT  57 14
CWR56_RS16325 3574871 .. 3574905 +  -7.2  -4.41548   ATACATGTATAAAAA     GTGTCAAAAAATAGAC ACC GTCTTTTTATCGACAC     TTTTCTAACATATAC  79 47
CWR56_RS16335 3576254 .. 3576277 + -16.8  -4.25527   ACACCTGGGTATCAA          CAGGGCTGCT AATT AGCAGCCCTG           TTTCTCTATATTTAT 100 54
CWR56_RS16340 3577101 .. 3577112 +  -5.8   -4.5081   GATATTTCTAATCCT                TGGG GAAT CCCA                 TTTATTTCAATATTT  71 174
CWR56_RS16350 3578257 .. 3578300 +  -9.3  -5.42975   ATTAAAAACTTATTT TATATAAAAAGAGTTGTCCA TTTTT TAGACAACTCTTTTT-TATA TTTTTATTTGTATAC 100 67
CWR56_RS16375 3586275 .. 3586288 +  -3.9  -4.76312   AAATTTATTATAAGT               TTTCT TGCC AGAAA                TTTTTAGGTGTTATA  65 396
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        feoB 3605565 .. 3605603 +  -3.3  -5.24531   AAATAAGATAAAAGT  GGGTGTCTCA-AAATTAA CTTT TTAGTTCATGAGGCACTC   TTTTTTATAGAAAAT  66 61
CWR56_RS16590 3635050 .. 3635062 +  -4.9  -4.05816   TAAGTCAATAATTTT                TTAGT TGA ACTAA                TTTATACTAATTTTC  61 63
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CWR56_RS16610 3639491 .. 3639507 + -10.9  -4.36063   ATTAACATAAAAAAA              GGAGCTT TTA AAGCTCC              TTTTCATCATCTTAT  95 68
CWR56_RS16655 3650161 .. 3650193 +  -5.8  -5.47159   TATTATAATAAAAAA     GATGGAGCTTTTAAT CATA AATAAAA-CTCCATC      TTTTTTATATTACAA  84 61
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CWR56_RS16705 3659988 .. 3660016 + -12.7  -3.61239   AAACATATTAAAAAA        TAGTGGCTTTAAA TTT TTTAAAGTCACTA        TTCTATATAAATATA  95 55
CWR56_RS16755 3668235 .. 3668268 + -14.1   -2.7927   TTTATCAAAAGAAAA     TGAGCCAGTATAATT ATAA AACTATACTGGCTCA      TCCTTAGATATCTTT 100 99
CWR56_RS16795 3676828 .. 3676842 +  -7.2  -2.92192   TAGTGAAGTATACAT               TCTAGT TAA ACTAGA               TATACTTCACTAAAA  64 83
CWR56_RS16805 3678020 .. 3678033 +  -2.3   -3.5241   TCTAAAAGCTTAAAA               GCTAC ATGT GGAGC                TGTTTCTGGACAATA  45 106
CWR56_RS16820 3681588 .. 3681616 +  -8.3  -3.89957   GGATATAAACTTAAT       GAGG-CTATCTC AAAATA GAGATAGACCTC        TTCTTCATTGTTGAG  76 161
CWR56_RS16850 3689129 .. 3689144 +  -5.4  -5.52347   AAAAACACTTAGAAA              GGCTTT ATAA AGAGCC               TTTTTTGCTTTTATT  89 318
CWR56_RS16875 3694389 .. 3694429 +  -4.3  -4.35693   TTATAAATTTGCAAA  TAAGCTATATTAAAAAATA TAA TAATTTTTTATATAACTTA  TTCTTTTATAACTTT  60 299
CWR56_RS16880 3695245 .. 3695290 +   -18  -4.67635   TAAATTGTCTGGAAA TCACCTCTTCATTTGTTATA AAAACA TACAACAAATGAAGAGGTGA TTTTATGGTTTTAAA 100 107
         cls 3711815 .. 3711825 +  -2.6  -4.41844   TTATCAGCAGTTTTA                 TAAA TCT TTTA                 TTTTATAAAAATTTT  54 23
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CWR56_RS17140 3759278 .. 3759299 + -11.7  -4.13945   TGAAACCCATTAAAA           TAGGGAGTT TAAC AACTCCCTA            TTTTGAAGTCACAAT  95 47
CWR56_RS17150 3760636 .. 3760664 +   -12    -3.767   TCCTTAATCAAAAAA        TATTACTGGAAT ACAAA ATTCCAGTAATA        TTTGATAACTAAATA 100 139
CWR56_RS17200 3771844 .. 3771871 +  -4.3   -4.9725   TATTTATTATAAAAA        TAGGTTAAAAA TGAATT TTTCTAACCTA         TTTTTATATAAGACT  67 42
CWR56_RS17210 3773921 .. 3773935 +  -2.8  -2.71763   ATGATATTATAAGCG               TCAATG CCA CAATGA               TAGTATAATTATAAG  39 69
        nagA 3775590 .. 3775602 +  -3.4  -5.38054   TAGTTAACACTACTA                TTGG AAGTC CCAA                TTTTTCTTTATCAGA  74 501
CWR56_RS17225 3777545 .. 3777555 +  -2.6  -4.81863   ATTTCCTCTAGTCAC                 TATA ATG TATA                 TTTTGTTATCGATTT  62 393
CWR56_RS17335 3792992 .. 3793003 +  -5.8  -3.02402   TATAAATTAATTTTG                GGGA TAAA TCCC                 ATTGTTTAGTATGGC  56 31
CWR56_RS17545 3838865 .. 3838891 + -12.5  -3.68704   ATATAAAATAATTTA         GGCTATCAAAT ATCTA ATTTGATAGCC         TTCTTAAAGTCTTAT  95 42
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CWR56_RS17875 3904212 .. 3904223 +    -3  -4.05067   TACTAAAATAGGGCT                TAGA ATTA TCTA                 TATTTTTATCCCATA  52 227
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        yaaA NONE
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         rrf 4041418 .. 4041428 +  -2.6  -3.53224   ATTATATAGTATAGG                 TAAA GTT TTTA                 TTTGGAAAGAAGGTG  44 121
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         ffs 4045773 .. 4045791 +  -5.3   -5.9003   TATATAAAAGACTAA             TCCCTTA GATAA TGAGGGA             TTTTTTTATTAATTT  84 48
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         rrf NONE
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CWR56_RS18830 4063656 .. 4063691 +  -7.1  -5.59962   AAATAAATTAAAAAG    CACTCTGAAATGTTT AATAAA AAATGTTTTAGAGTG     TTTTTATTTATTTTA 100 49
        fusA 4065864 .. 4065900 + -12.6  -4.98758   TTTTTAGGGTTTTAA    CTAGGTATAGGTTTAT GTTAG GTAAACTTATACCTAG    TTTTTATACATTTTT 100 87
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CWR56_RS18875 4076912 .. 4076955 + -10.8  -5.88565   TTATAATAAAAAAGA GTTTATCTCAAAA-TTGATTA TTC TAATCAAATTTTAAGATAAAC TTTTTTTATTATAAA 100 127
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CWR56_RS18895 4082657 .. 4082679 +  -5.6  -6.17268   ACTATTTATGAAGGT           GGTGGTAC AAGAAAA GTATCACC           TTTTTTTTGTTATAC  95 320
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CWR56_RS18905 NONE
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        galE 2937330 .. 2937366 -  -4.7  -2.54344   TAAAATTACCAATAC    CTTATATTTACAAATTT GTT ACATTTATACATATAAG    TATATATTCTATTCT  48 34
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        aroE 2928892 .. 2928924 -    -3  -2.94888   AATGGATTTAAAGTA     TAGT-CAGTTAAA ACTTCAAA TTTAACTGGACTA      TGAGGCAAAACCCAC  42 116
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        brnQ 2919780 .. 2919823 - -10.6  -4.75776   AATCCAATCTAAAAA GTACTATGGGTAGATT AGGTTTAGATTA AACCTACCCATAGTAC TAAAAATTAATATAT 100 67
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        acpP 1068429 .. 1068455 - -11.2  -3.42374   TTTTATGAAGAAAAG         TAATTTATATAC TTA GTATATAAATTA         AATATAAGAGCGTGT  87 145
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CWR56_RS02390  480598 ..  480609 -    -3  -3.27994   CCAATTTTAGACTAA                TTAC TTAT GTAA                 TATTAACTTGTAAAG  45 52
CWR56_RS02360  471574 ..  471588 -  -2.8   -2.5661   TATATTAATTAATAT               GCAC AAAATAA GTGC               TATAAATTTTATTTA  38 34
CWR56_RS02355  470253 ..  470271 - -13.2  -5.75538   TGTAAAAAACAAAAA             GACTCCAC AAA GTGGAGTC             TTTATAAATTTAACA 100 64
CWR56_RS02260  445274 ..  445286 -  -3.5  -2.70826   TATATGTATATACTA                TTTAT CTA ATAAA                AGAGCAGTTAAATCC  43 10
CWR56_RS02250  443546 ..  443564 -  -2.4  -4.08317   TAATTTTAAATCAAA             TTAATGAG AAC CCCATAAA             TTTTTTTAACACTTA  49 70
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CWR56_RS02240  440691 ..  440703 -  -6.3  -3.47804   AGAATGTAGAACTAA                GCATT AGC AATGC                AAACACAATACGAGA  63 287
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CWR56_RS02160  425317 ..  425331 -  -4.4  -2.55351   GCCTTGTATATGAAT               TTAATT GAT AATTAA               TATGAAAATTATGTG  48 68
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         fba  371543 ..  371583 -  -4.3  -4.34267   TTATACAACTTAAAA GAGATGGCTTAAAAATAA ATTTAA TTA-CTTTAAGTCATCTC  TTTTCTTTTATAAAT  58 55
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        uvrA  180631 ..  180647 -  -2.3   -2.9059   ACCTATTATAATAAT              TCTTCTA TAA TATAAGA              CATTCTATAATTTTA  39 70
CWR56_RS01010  179588 ..  179619 -  -8.9  -3.63627   TTTTTATATCTTAAA      TCCAAATAGCC AATAAAGTAA GGCTATTTGGA       TTTTTAATAAATTCT  80 80
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        yyaC   88720 ..   88765 - -10.7  -5.15526   ATATAAAAGTAAAAA GGTAGATAATTTGGAGTATTT AATC AGATACTCTAAAATATCTACC TTTTTATATAAAGAA 100 66
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