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        pflA 3532305 .. 3532347 + -16.8  -4.85177   GTTATCACAATAAAA TAAGGTAAAATATAAGATTT AAA AAACCTTATATTTTACCTTA TTTTTAGTATACTTT 100 59
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        srtB 1225039 .. 1225059 - -11.3  -3.73953   ACCAGCTCCAGTAAA            GACTATGTT TTT AACATAGTC            TTTTTTATTATATAA  90 239
        pdaA 1218654 .. 1218666 -  -4.1  -4.62471   TTGAATTGGCAAAAA                GGAAC TTT ATTCC                TGTGATAACAGGTCT  65 327
JJC01_RS05775 1209579 .. 1209593 -  -2.8  -2.70528   ATCATTGACATATCA               GTCATT AGA AAGGAC               CTCCAATTCTATACC  39 15
JJC01_RS05770 1208647 .. 1208666 -    -2  -3.58159   TTAAAAATGCAAAGA            CACTCAGC TTGT GCTGCTTG             TGGAAAATGTGCTAC  47 469
JJC01_RS05735 1202278 .. 1202293 -  -6.2  -4.39828   AAGAGCTTTAGAAAA              TACTGT GTAT ACAGTA               GGAGTAAATTTAGTA  74 348
JJC01_RS05720 1199532 .. 1199542 -    -4  -3.14878   GCCTCTAATGTAATA                 CTAA AAC TTAG                 TGTTAATGTAGGGAG  49 222
JJC01_RS05615 1176451 .. 1176476 - -16.3  -4.11183   GTTTATTATAAATAA         GTGGGAGTAGA TTTT TCTACTCCCAC          TTTGTATATTATTAT 100 74
JJC01_RS05555 1163614 .. 1163667 - -10.4  -5.80003   TGAATAAATAAAAAA TATCAATGTAATTTTTGATA-AAATA AATT TATTTATAT-AAAAATTACATTGATA TTTAATAAACATCAA 100 50
JJC01_RS05545 1161116 .. 1161170 -  -3.1  -5.18726   TTTTTACAATAAAAA TAAGTACACACCTATCAATTA-CAAA ATAA TTTGCTTCTTGAAAGGCATGCACTTA CTGTCAAATTCTGTA  66 71
JJC01_RS05540 1159651 .. 1159661 -    -4  -3.46936   AAACTGCATTAAACA                 GTTT ATT AAAC                 TTAGTTCAGTAGTAA  50 279
JJC01_RS05430 1130256 .. 1130266 -  -2.6  -5.05712   ATAAAGAAGGAAAAA                 TAAA GGA TTTA                 AGATTTTATGTAGAA  66 314
JJC01_RS05225 1075272 .. 1075319 - -15.4  -2.71681   TAAGGGTGTCAAGTA TAATCAAATCAATAT-CTGTAGA TAC TCTACAGTATATTGTTTTGATTA CCTTTGACACCCTAT 100 57
JJC01_RS05220 1074128 .. 1074165 - -17.5  -3.95449   TTAGAATATATTAAA   TAAGGTTTAGAATATTA TCAA TAATATTCTAAACCTTA    TTTGTATTTATAAAT 100 72
JJC01_RS05200 1069043 .. 1069056 -  -3.9  -4.15029   ATTTGAGATAAATAA               CATTT TAGT AAATG                TAAATAGATTATTAA  56 37
JJC01_RS05195 1068241 .. 1068261 -  -3.4  -3.72678   TAAATATTATGTAAA           TTATAGACC TAAA GG-CTATAA            TTTTATAAAGATAAA  50 183
JJC01_RS05190 1067760 .. 1067801 - -11.9   -4.3208   TGTTAGAATTGAAAA GAGTATCAGCAAAGTTATT TTTT AATAAACTTACTGATACTC  TTTATATTTAAGCTT 100 71
JJC01_RS05170 1061786 .. 1061813 - -10.1  -5.27477   ATGTTAATTAAAAAA        GAAGTTTACTA GTATAG TAGTAAACTTC         TTTTAGATTTTCTAT 100 154
JJC01_RS05150 1057537 .. 1057548 -    -3  -4.73864   TGAAGTAAGATAAAA                GTAA AAGC TTAC                 TTTAGCATCATTTGT  58 221
JJC01_RS05115 1050287 .. 1050339 - -12.4  -4.49939   ATATAAGCTATAAAA TTATAAGCTACCTTAATATAGAAT ATAAA ATTCTACACTAAGGTAGCTAATTA TTTGTAATTAGATTT 100 47
JJC01_RS05110 1049152 .. 1049183 -  -8.8  -5.72616   ATTTATATAAAAAAA      TTAAGAGATGCTAG TATG CTAGCATCTCTTTT       ATATTGCGTGAAAAA 100 71
JJC01_RS05085 1040520 .. 1040544 -  -4.3  -4.30416   AGTATTAACTTAAAA          GACAGTTGA TAAATAG TCAGCTGTC          TTTTTTTAATCAATT  58 83
JJC01_RS05005 1017962 .. 1017972 -    -4  -4.01493   ATAAAAGATATTAAA                 GTTT TAC AAAC                 AATAGTAGAAGGGGA  57 243
JJC01_RS04995 1015000 .. 1015037 -  -5.2  -5.86976   TCATAAAATAAAAAA   TGAGATAC-CTTAAA ATTATTTTA TTTAAGAGTATCTCA   TTTTGATTTTTATGT  84 74
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JJC01_RS04980 1012424 .. 1012455 - -10.3   -3.2913   TTGAAACAGCAAAAG      GAGAAGTGCCATT TTTAAT AATTGCACTTCTC       TTTATTTTTATTGTA  81 229
JJC01_RS04775  964967 ..  964980 -  -3.9  -2.87725   GCCTAAAAATAAGAT               TTTAG AATT CTAAA                GTTTTTTTAGTACAG  46 62
JJC01_RS04770  962863 ..  962901 - -12.9  -4.73432   TTAAATAGAAATAAA  GAAACGTTTTATGTATTA AAAT TAA-ACATAAAACGTTTC   GATATATTATATATG 100 49
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JJC01_RS04760 NONE
JJC01_RS04755  959895 ..  959905 -  -3.2  -3.86346   TTATTGGCTTACAAA                 GAAG ACT CCTC                 TCAGACATATTATAC  50 331
JJC01_RS04750  957530 ..  957570 -  -3.7  -3.95502   TTGAAAAATAAAAAG TCCTGTCTC---AAAATGAT TAAA ATCATTTTATAGAGACAGGA TATTATTTTACAGCA  52 28
JJC01_RS04720  951406 ..  951444 - -16.5  -3.82031   TTAACTATTATGAAA   GAGTGTTTTTAATAATT TCTAT AATTATTAAAAACACTC   TTTTTTATTAAAATA 100 88
JJC01_RS04680  942332 ..  942346 -  -4.4  -3.63627   TTTCCATATCCCAAA               TTTTTT GTA AAAAAA               TATTTCACAAAATCT  55 222
JJC01_RS04675  941111 ..  941145 -  -3.9  -4.07595   ACACATATTAAAGAA    GTCTATTCTTATAA TTTATTGT TTATA-GAATAGAC     TTTTTTATATAAATT  56 52
JJC01_RS04560  912938 ..  912978 - -10.1  -4.79223   TTATATTACTAAAAA  TTGCTATGAAATTAG TCTAATAATAT CTAATTTCATAGCAA  TTTTAATTACCATTA  95 157
JJC01_RS04445  886749 ..  886768 -    -3  -4.59511   AAGAGGCTTTAAAAA            TAAATAAA AAAG TTTATTCA             TTTAGAAATAAAAGT  62 343
JJC01_RS04400  876960 ..  876990 -  -9.9  -5.70829   AAGAGCATAAAAAAA       CAAAGTTGCTG TAATTAAGT CAGCAACTTTG       TTTTTATCAATCTAA 100 37
JJC01_RS04395  875593 ..  875609 -  -3.8   -2.8001   ATAAGTGTGATTATA              TTAAGA GATTT TCTTAA              ATAATTCTATAATTT  44 9
JJC01_RS04340  861968 ..  861980 -  -2.7  -4.72188   TGAATGTAAAATAAA                CACTA TTT TAATG                TGTTAAAAAAATATA  56 322
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JJC01_RS04260  843785 ..  843830 - -13.8  -4.05678   TTGTTAAATAAAATA TATAAATAAAAATACTAGTC AATTAA GACTAGTATTTTTATTTATT GTTAAATCAGATAAA 100 44
JJC01_RS04225  832830 ..  832887 - -20.5  -3.71883   GAATATAATTTGAAA TAGTATTACGAATCAAAAAGCAGGGAGA TTA TCTACCTG-TTTTTGATTCATAATACTA TTTATAAAAATTATT 100 23
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JJC01_RS04180  823929 ..  823942 -  -5.3  -2.87003   CTAGTAACAACAGGA               GGTAA CCAT TTACC                ACAAATAGCATCTAT  51 40
JJC01_RS04175  822093 ..  822136 - -10.7   -3.6268   TAATTTAAATTACAA CAAAGTGCCTATATTTGAAT AATAA ATCCAAA-ATAGGCACTTTA AAATTATTGTAACCA  88 29
JJC01_RS04160  817253 ..  817278 - -10.5   -2.7814   ATTTATACTTTAAAG         GGGTTATGGCT GTGT AGTCATAACCC          TTATTTAAGATTATT  83 368
JJC01_RS04130  811629 ..  811679 -   -13  -5.56573   AGAAATAAATAAAAA TACAACCACTTAATACAGATTTAG AAT CTAAATTTATATTAAGAGATTGTA TTTAATTAAATTAAT 100 169
JJC01_RS04000  782253 ..  782306 - -20.1  -5.66684   GAATTTATAAAAAAA GTAGAGATAATGAAATAGGGATATA TTAA TATATCCCTATTTCATTATCTCTTT TACAATAGGGATATC 100 8
JJC01_RS03970  773758 ..  773770 -  -4.1  -3.10344   TTTGGAGCTAAGATA                CTGAA TAA TCCAG                ATATAGCTAAAAAGG  49 379
JJC01_RS03880  752842 ..  752883 - -12.6   -4.8048   TTTGTATACCAAAAA GGCTGTAAGTAAATTTGT TTTTAC ACAAATCTATTTACAGCC  TCATATATTATACTA 100 45
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JJC01_RS03750  725239 ..  725249 -  -2.6  -2.53263   GTCACCTCCAATTTA                 TTTT GCC AAAA                 TACGTTTTGAAGCAA  38 12
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JJC01_RS03740  724252 ..  724289 -  -9.5  -3.45768   TTTAATAGCAATTAA   GCTAATCATTAATTAAGT GTA ACA-AATTAATGATTAGC   TATAGTAAATCTAAT  80 40
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JJC01_RS03730  722561 ..  722587 - -10.3   -4.6821   AATTTCAATATAAAA         GGTGAACTATA TTTAT TATAGTCCACC         TTTTTTATATTTTTT  90 175
JJC01_RS03720  720493 ..  720549 -  -9.8  -3.50491   CAACATAAAAAAGTA CGTAAAATAAAAGCTGGACTAATGAT TTTAT ATTATTGGTCCAGTTTTTATTTTATG AATTGAGTCAGATAT  80 108
JJC01_RS03620  693139 ..  693180 -  -2.4  -4.25437   AAAGCAATACATAAA GGCTATAATTAGATTTAC AGAAAA GTAAATTTATCCACAGCC  TTTTGGTATACACAG  51 162
JJC01_RS03580  683429 ..  683459 - -15.8  -5.66229   ATTAATAATAAAAAA       TATTACTGGAATTT TTA AAATTCCAGTAATA       TCAAATTTAAATTAC 100 92
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JJC01_RS03550  674884 ..  674901 -    -2  -3.63341   AAGAGTCTGGAATAA             CTACTT TGATGG AAGCAG              AATTAAAAAAATGGA  47 369
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        dapA  633578 ..  633600 - -10.7  -5.43414   ATTATATACAAAAAA           CGTACAAAG GTATA CTTTGTACG           TCTAGTTTATCACTC 100 298
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        dapA NONE
        dapB NONE
        dapD  629649 ..  629690 -  -9.7  -5.30686   AATAGCTATAAAAAA GAGGGTGTCTCTA-ATGAAT TAA ATTCATATAGAGACACCTTT TAATCAATAATATTA 100 49
        dapB  627031 ..  627058 -   -10  -3.93659   AGCAAAAGCAGTAAA        TACACTTACCTC ATCA GATGTAAGTGTA         AGTTTAAGTTTTTTA  90 334
JJC01_RS03230  600515 ..  600538 - -14.6  -4.91285   ATGAAGACAAGAAAA          CAGGGCTACC AATC GGCAGCCCTG           TTGATACCCAGGTGT 100 54
JJC01_RS03225  599812 ..  599838 -  -4.5  -3.75571   CAAGGTAGGAAAAGA        GCCTAC-AACTA TAGT TTGTTTGTAGGC         CTTAATGTATGTCTC  55 27
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JJC01_RS03195  594027 ..  594064 - -11.6  -2.79878   GCTATTGATTCAAAG   CTGTCTTAATGTAGAA GAAATT TTCTATATTAAGACAG    TTTCTATTATGTAAA  86 178
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        feoB  571073 ..  571103 -  -8.3  -5.36441   TTTTTATACAAAAAA       GGGTGTAGCACTA TTTTC TAGTGCGACAGCC       CCTTAATTGTTCTAA 100 117
JJC01_RS03095  570154 ..  570164 -  -5.4  -3.34125   GATAATTAAAAAGCA                 CCTT TAT AAGG                 TATATTTTTAATTTT  57 85
JJC01_RS03050  553386 ..  553441 -  -5.2  -5.57396   ATAATGAACAAAAAA GAAGGAGTTG-TCTTAAAA-TTGATT TTTTCT AATCAAATTTTAAGTTCAACTCCTTT AAAATTTAGGCTAAT  82 133
JJC01_RS02970  536928 ..  536968 -    -7  -4.67692   TTAAAATCAAATAAA  GGATGCCTCAAAATGT TTTTAAGGG AAATTTTGTGGCATCC  TTGTTGTTTATAAGC  79 137
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JJC01_RS02950  532678 ..  532695 -  -5.5  -4.36063   ATAAGATGATGAAAA             GGAGCTT TAAA AGGCTCC              TTTTTTTATGCTAAT  69 57
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JJC01_RS02860  512916 ..  512956 -  -6.3  -3.63782   TAACATCATTTTAAA  TAAGTATAGCAGCTTTAAA AAA TACAAAGAAGCTATACTTA  TTTGTGTATAATAGC  65 209
JJC01_RS02830  506239 ..  506264 -  -7.8  -4.21768   TAACTAATGTCAAAA         TAATCATGTT TAAATG AACATGATTA          TTTTTTTGTTTAAAA  78 330
JJC01_RS02790  499793 ..  499804 -  -2.2  -4.06384   TTGGAACACCAGAAA                GTCC AAAT AGAC                 ATGATAAAACTCGTC  52 310
JJC01_RS02780  498584 ..  498602 -  -4.6  -2.84203   AAAAGGGAAGATAAT             TGCTAC TATTTGT GTAGCA             GCTTTACCTGTTGGT  50 285
        mgtA  490438 ..  490452 -  -8.6  -3.12895   TTGCCGATGAAGATA               GAAGCT TTA AGCTTC               CAGATTAACCTCTAC  73 449
JJC01_RS02755  488535 ..  488557 -  -2.1  -4.69326   ACATCTAAGAGAAAA          GA-TTGAAGA TAAT CCTTCAAATC           CTAAAATACTTATAA  61 160
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