locus-tag class description CsakCS09_RS00045 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS00050 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS00055 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS00060 PF00497 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3 CsakCS09_RS00075 PF16576 Barrel-sandwich domain of CusB or HlyD membrane-fusion CsakCS09_RS00075 PF00529 HlyD membrane-fusion protein of T1SS CsakCS09_RS00080 PF08361 MAATS-type transcriptional repressor, C-terminal region CsakCS09_RS00080 PF00440 Bacterial regulatory proteins, tetR family CsakCS09_RS00085 PF00563 EAL domain CsakCS09_RS00085 PF03707 Bacterial signalling protein N terminal repeat CsakCS09_RS00085 PF00990 Diguanylate cyclase, GGDEF domain CsakCS09_RS00090 PF02954 Bacterial regulatory protein, Fis family CsakCS09_RS00095 PF01207 Dihydrouridine synthase (Dus) CsakCS09_RS00110 PF00474 Sodium:solute symporter family CsakCS09_RS00115 PF06196 Protein of unknown function (DUF997) CsakCS09_RS00120 PF00289 Biotin carboxylase, N-terminal domain CsakCS09_RS00120 PF02785 Biotin carboxylase C-terminal domain CsakCS09_RS00120 PF02786 Carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP binding domain CsakCS09_RS00125 PF00364 Biotin-requiring enzyme CsakCS09_RS00135 PF01220 Dehydroquinase class II CsakCS09_RS00140 PF01794 Ferric reductase like transmembrane component CsakCS09_RS00145 PF00174 Oxidoreductase molybdopterin binding domain CsakCS09_RS00150 PF08240 Alcohol dehydrogenase GroES-like domain CsakCS09_RS00150 PF00107 Zinc-binding dehydrogenase CsakCS09_RS00155 PF00563 EAL domain CsakCS09_RS00155 PF17157 Gammaproteobacterial periplasmic sensor domain CsakCS09_RS00155 PF00990 Diguanylate cyclase, GGDEF domain CsakCS09_RS00170 PF04085 rod shape-determining protein MreC CsakCS09_RS00175 PF04093 rod shape-determining protein MreD CsakCS09_RS00180 PF02545 Maf-like protein CsakCS09_RS00185 PF00575 S1 RNA binding domain CsakCS09_RS00185 PF10150 Ribonuclease E/G family CsakCS09_RS00190 PF13502 AsmA-like C-terminal region CsakCS09_RS00190 PF13116 Protein of unknown function CsakCS09_RS00195 PF01523 Putative modulator of DNA gyrase CsakCS09_RS00200 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS00200 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS00205 PF07869 Protein of unknown function (DUF1656) CsakCS09_RS00210 PF13533 Biotin-lipoyl like CsakCS09_RS00215 PF04632 Fusaric acid resistance protein family CsakCS09_RS00220 PF00171 Aldehyde dehydrogenase family CsakCS09_RS00225 PF01337 Barstar (barnase inhibitor) CsakCS09_RS00230 PF07338 Protein of unknown function (DUF1471) CsakCS09_RS00235 PF07338 Protein of unknown function (DUF1471) CsakCS09_RS00240 PF01316 Arginine repressor, DNA binding domain CsakCS09_RS00240 PF02863 Arginine repressor, C-terminal domain CsakCS09_RS00250 PF02866 lactate/malate dehydrogenase, alpha/beta C-terminal domain CsakCS09_RS00250 PF00056 lactate/malate dehydrogenase, NAD binding domain CsakCS09_RS00255 PF13180 PDZ domain CsakCS09_RS00260 PF00595 PDZ domain CsakCS09_RS00260 PF13180 PDZ domain CsakCS09_RS00265 PF06295 Protein of unknown function (DUF1043) CsakCS09_RS00270 PF03969 AFG1-like ATPase CsakCS09_RS00280 PF00572 Ribosomal protein L13 CsakCS09_RS00285 PF00380 Ribosomal protein S9/S16 CsakCS09_RS00295 PF00043 Glutathione S-transferase, C-terminal domain CsakCS09_RS00295 PF02798 Glutathione S-transferase, N-terminal domain CsakCS09_RS00300 PF04386 Stringent starvation protein B CsakCS09_RS00305 PF07729 FCD domain CsakCS09_RS00305 PF00392 Bacterial regulatory proteins, gntR family CsakCS09_RS00310 PF00701 Dihydrodipicolinate synthetase family CsakCS09_RS00315 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS00320 PF00480 ROK family CsakCS09_RS00325 PF04074 YhcH/YjgK/YiaL CsakCS09_RS00330 PF03797 Autotransporter beta-domain CsakCS09_RS00335 PF14691 Dihydroprymidine dehydrogenase domain II, 4Fe-4S cluster CsakCS09_RS00335 PF07992 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase CsakCS09_RS00340 PF00310 Glutamine amidotransferases class-II CsakCS09_RS00340 PF04898 Glutamate synthase central domain CsakCS09_RS00340 PF01645 Conserved region in glutamate synthase CsakCS09_RS00340 PF01493 GXGXG motif CsakCS09_RS00350 PF04055 Radical SAM superfamily CsakCS09_RS00350 PF16199 Radical_SAM C-terminal domain CsakCS09_RS00355 PF00989 PAS fold CsakCS09_RS00355 PF01627 Hpt domain CsakCS09_RS00355 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS00355 PF00512 His Kinase A (phospho-acceptor) domain CsakCS09_RS00355 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS00355 PF18415 Histidine kinase receptor ArcB trans-membrane domain CsakCS09_RS00365 PF00912 Transglycosylase CsakCS09_RS00370 PF00381 PTS HPr component phosphorylation site CsakCS09_RS00375 PF03668 P-loop ATPase protein family CsakCS09_RS00380 PF00359 Phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 2 CsakCS09_RS00385 PF02482 Sigma 54 modulation protein / S30EA ribosomal protein CsakCS09_RS00390 PF04552 Sigma-54, DNA binding domain CsakCS09_RS00390 PF04963 Sigma-54 factor, core binding domain CsakCS09_RS00390 PF00309 Sigma-54 factor, Activator interacting domain (AID) CsakCS09_RS00395 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS00395 PF12399 Branched-chain amino acid ATP-binding cassette transporter CsakCS09_RS00400 PF03968 OstA-like protein CsakCS09_RS00405 PF06835 Lipopolysaccharide-assembly, LptC-related CsakCS09_RS00415 PF01380 SIS domain CsakCS09_RS00415 PF00571 CBS domain CsakCS09_RS00420 PF01699 Sodium/calcium exchanger protein CsakCS09_RS00425 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS00430 PF02405 Permease MlaE CsakCS09_RS00435 PF02470 MlaD protein CsakCS09_RS00440 PF05494 MlaC protein CsakCS09_RS00445 PF13466 STAS domain CsakCS09_RS00450 PF01722 BolA-like protein CsakCS09_RS00455 PF00275 EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase) CsakCS09_RS00460 PF13693 Winged helix-turn-helix DNA-binding CsakCS09_RS00465 PF00348 Polyprenyl synthetase CsakCS09_RS00470 PF00829 Ribosomal prokaryotic L21 protein CsakCS09_RS00475 PF01016 Ribosomal L27 protein CsakCS09_RS00480 PF00892 EamA-like transporter family CsakCS09_RS00485 PF01926 50S ribosome-binding GTPase CsakCS09_RS00485 PF01018 GTP1/OBG CsakCS09_RS00490 PF00512 His Kinase A (phospho-acceptor) domain CsakCS09_RS00490 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS00490 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS00495 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS00495 PF00486 Transcriptional regulatory protein, C terminal CsakCS09_RS00500 PF02113 D-Ala-D-Ala carboxypeptidase 3 (S13) family CsakCS09_RS00505 PF01272 Transcription elongation factor, GreA/GreB, C-term CsakCS09_RS00505 PF03449 Transcription elongation factor, N-terminal CsakCS09_RS00510 PF01985 CRS1 / YhbY (CRM) domain CsakCS09_RS00515 PF01728 FtsJ-like methyltransferase CsakCS09_RS00520 PF01434 Peptidase family M41 CsakCS09_RS00520 PF06480 FtsH Extracellular CsakCS09_RS00520 PF17862 AAA+ lid domain CsakCS09_RS00520 PF00004 ATPase family associated with various cellular activities (AAA) CsakCS09_RS00525 PF00809 Pterin binding enzyme CsakCS09_RS00530 PF02878 Phosphoglucomutase/phosphomannomutase, alpha/beta/alpha domain I CsakCS09_RS00530 PF02879 Phosphoglucomutase/phosphomannomutase, alpha/beta/alpha domain II CsakCS09_RS00530 PF02880 Phosphoglucomutase/phosphomannomutase, alpha/beta/alpha domain III CsakCS09_RS00530 PF00408 Phosphoglucomutase/phosphomannomutase, C-terminal domain CsakCS09_RS00535 PF03840 Preprotein translocase SecG subunit CsakCS09_RS00550 PF02576 RimP N-terminal domain CsakCS09_RS00550 PF17384 RimP C-terminal SH3 domain CsakCS09_RS00555 PF13184 NusA-like KH domain CsakCS09_RS00555 PF00575 S1 RNA binding domain CsakCS09_RS00555 PF08529 NusA N-terminal domain CsakCS09_RS00560 PF04760 Translation initiation factor IF-2, N-terminal region CsakCS09_RS00560 PF08364 Bacterial translation initiation factor IF-2 associated region CsakCS09_RS00560 PF11987 Translation-initiation factor 2 CsakCS09_RS00560 PF00009 Elongation factor Tu GTP binding domain CsakCS09_RS00565 PF02033 Ribosome-binding factor A CsakCS09_RS00570 PF16198 tRNA pseudouridylate synthase B C-terminal domain CsakCS09_RS00570 PF01509 TruB family pseudouridylate synthase (N terminal domain) CsakCS09_RS00570 PF09157 Pseudouridine synthase II TruB, C-terminal CsakCS09_RS00575 PF00312 Ribosomal protein S15 CsakCS09_RS00585 PF00013 KH domain CsakCS09_RS00585 PF03725 3' exoribonuclease family, domain 2 CsakCS09_RS00585 PF01138 3' exoribonuclease family, domain 1 CsakCS09_RS00585 PF00575 S1 RNA binding domain CsakCS09_RS00585 PF03726 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase, RNA binding domain CsakCS09_RS00590 PF07719 Tetratricopeptide repeat CsakCS09_RS00590 PF13181 Tetratricopeptide repeat CsakCS09_RS00600 PF00271 Helicase conserved C-terminal domain CsakCS09_RS00600 PF00270 DEAD/DEAH box helicase CsakCS09_RS00600 PF12343 Cold shock protein DEAD box A CsakCS09_RS00600 PF03880 DbpA RNA binding domain CsakCS09_RS00605 PF03222 Tryptophan/tyrosine permease family CsakCS09_RS00610 PF00296 Luciferase-like monooxygenase CsakCS09_RS00615 PF01136 Peptidase family U32 CsakCS09_RS00620 PF01136 Peptidase family U32 CsakCS09_RS00625 PF02036 SCP-2 sterol transfer family CsakCS09_RS00630 PF13508 Acetyltransferase (GNAT) domain CsakCS09_RS00635 PF01541 GIY-YIG catalytic domain CsakCS09_RS00645 PF01965 DJ-1/PfpI family CsakCS09_RS00650 PF13460 NAD(P)H-binding CsakCS09_RS00655 PF03773 Predicted permease CsakCS09_RS00665 PF04972 BON domain CsakCS09_RS00670 PF13580 SIS domain CsakCS09_RS00675 PF02021 Uncharacterised protein family UPF0102 CsakCS09_RS00680 PF04348 LppC putative lipoprotein CsakCS09_RS00685 PF00590 Tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) Methylases CsakCS09_RS00695 PF17954 Quercetinase C-terminal cupin domain CsakCS09_RS00695 PF02678 Pirin CsakCS09_RS00700 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS00700 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS00705 PF00356 Bacterial regulatory proteins, lacI family CsakCS09_RS00705 PF13407 Periplasmic binding protein domain CsakCS09_RS00710 PF08244 Glycosyl hydrolases family 32 C terminal CsakCS09_RS00710 PF00251 Glycosyl hydrolases family 32 N-terminal domain CsakCS09_RS00715 PF00367 phosphotransferase system, EIIB CsakCS09_RS00715 PF02378 Phosphotransferase system, EIIC CsakCS09_RS00720 PF02264 LamB porin CsakCS09_RS00720 PF11471 Maltoporin periplasmic N-terminal extension CsakCS09_RS00725 PF00294 pfkB family carbohydrate kinase CsakCS09_RS00730 PF05656 Protein of unknown function (DUF805) CsakCS09_RS00735 PF13409 Glutathione S-transferase, N-terminal domain CsakCS09_RS00740 PF07681 DoxX CsakCS09_RS00745 PF06551 Protein of unknown function (DUF1120) CsakCS09_RS00765 PF06551 Protein of unknown function (DUF1120) CsakCS09_RS00770 PF00345 Pili and flagellar-assembly chaperone, PapD N-terminal domain CsakCS09_RS00775 PF13953 PapC C-terminal domain CsakCS09_RS00775 PF00577 Outer membrane usher protein CsakCS09_RS00775 PF13954 PapC N-terminal domain CsakCS09_RS00795 PF13997 YqjK-like protein CsakCS09_RS00800 PF07332 Putative Actinobacterial Holin-X, holin superfamily III CsakCS09_RS00805 PF05957 Bacterial protein of unknown function (DUF883) CsakCS09_RS00810 PF06476 Protein of unknown function (DUF1090) CsakCS09_RS00815 PF13721 SecD export protein N-terminal TM region CsakCS09_RS00820 PF09335 SNARE associated Golgi protein CsakCS09_RS00825 PF00392 Bacterial regulatory proteins, gntR family CsakCS09_RS00825 PF07729 FCD domain CsakCS09_RS00830 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS00840 PF02614 Glucuronate isomerase CsakCS09_RS00845 PF04295 D-galactarate dehydratase / Altronate hydrolase, C terminus CsakCS09_RS00845 PF08666 SAF domain CsakCS09_RS00850 PF10688 Bacterial inner membrane protein CsakCS09_RS00855 PF00375 Sodium:dicarboxylate symporter family CsakCS09_RS00860 PF03741 Integral membrane protein TerC family CsakCS09_RS00865 PF01408 Oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold CsakCS09_RS00870 PF02698 DUF218 domain CsakCS09_RS00875 PF01863 Protein of unknown function DUF45 CsakCS09_RS00880 PF05175 Methyltransferase small domain CsakCS09_RS00885 PF07992 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase CsakCS09_RS00885 PF00724 NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family CsakCS09_RS00890 PF00202 Aminotransferase class-III CsakCS09_RS00895 PF00990 Diguanylate cyclase, GGDEF domain CsakCS09_RS00900 PF08447 PAS fold CsakCS09_RS00900 PF00015 Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signalling domain CsakCS09_RS00905 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS00905 PF00015 Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signalling domain CsakCS09_RS00905 PF02203 Tar ligand binding domain homologue CsakCS09_RS00910 PF03551 Transcriptional regulator PadR-like family CsakCS09_RS00915 PF04954 Siderophore-interacting protein CsakCS09_RS00915 PF08021 Siderophore-interacting FAD-binding domain CsakCS09_RS00920 PF04055 Radical SAM superfamily CsakCS09_RS00920 PF08497 Radical SAM N-terminal CsakCS09_RS00920 PF11842 Domain of unknown function (DUF3362) CsakCS09_RS00925 PF01042 Endoribonuclease L-PSP CsakCS09_RS00930 PF02748 Aspartate carbamoyltransferase regulatory chain, metal binding domain CsakCS09_RS00930 PF01948 Aspartate carbamoyltransferase regulatory chain, allosteric domain CsakCS09_RS00935 PF00185 Aspartate/ornithine carbamoyltransferase, Asp/Orn binding domain CsakCS09_RS00935 PF02729 Aspartate/ornithine carbamoyltransferase, carbamoyl-P binding domain CsakCS09_RS00945 PF02863 Arginine repressor, C-terminal domain CsakCS09_RS00945 PF01316 Arginine repressor, DNA binding domain CsakCS09_RS00950 PF03606 C4-dicarboxylate anaerobic carrier CsakCS09_RS00955 PF02729 Aspartate/ornithine carbamoyltransferase, carbamoyl-P binding domain CsakCS09_RS00955 PF00185 Aspartate/ornithine carbamoyltransferase, Asp/Orn binding domain CsakCS09_RS00960 PF00696 Amino acid kinase family CsakCS09_RS00975 PF04074 YhcH/YjgK/YiaL CsakCS09_RS00980 PF00185 Aspartate/ornithine carbamoyltransferase, Asp/Orn binding domain CsakCS09_RS00980 PF02729 Aspartate/ornithine carbamoyltransferase, carbamoyl-P binding domain CsakCS09_RS00985 PF06877 Regulator of ribonuclease activity B CsakCS09_RS00990 PF06175 tRNA-(MS[2]IO[6]A)-hydroxylase (MiaE) CsakCS09_RS01000 PF00583 Acetyltransferase (GNAT) family CsakCS09_RS01005 PF05987 Bacterial protein of unknown function (DUF898) CsakCS09_RS01010 PF08264 Anticodon-binding domain of tRNA CsakCS09_RS01010 PF00133 tRNA synthetases class I (I, L, M and V) CsakCS09_RS01010 PF10458 Valyl tRNA synthetase tRNA binding arm CsakCS09_RS01015 PF04364 DNA polymerase III chi subunit, HolC CsakCS09_RS01020 PF00883 Cytosol aminopeptidase family, catalytic domain CsakCS09_RS01020 PF02789 Cytosol aminopeptidase family, N-terminal domain CsakCS09_RS01030 PF03739 Lipopolysaccharide export system permease LptF/LptG CsakCS09_RS01035 PF03739 Lipopolysaccharide export system permease LptF/LptG CsakCS09_RS01045 PF02733 Dak1 domain CsakCS09_RS01045 PF02734 DAK2 domain CsakCS09_RS01055 PF08240 Alcohol dehydrogenase GroES-like domain CsakCS09_RS01055 PF00107 Zinc-binding dehydrogenase CsakCS09_RS01075 PF00145 C-5 cytosine-specific DNA methylase CsakCS09_RS01085 PF02796 Helix-turn-helix domain of resolvase CsakCS09_RS01085 PF00239 Resolvase, N terminal domain CsakCS09_RS01165 PF05598 Transposase domain (DUF772) CsakCS09_RS01165 PF01609 Transposase DDE domain CsakCS09_RS01220 PF01609 Transposase DDE domain CsakCS09_RS01220 PF05598 Transposase domain (DUF772) CsakCS09_RS01235 PF00589 Phage integrase family CsakCS09_RS01235 PF13356 Arm DNA-binding domain CsakCS09_RS01285 PF02463 RecF/RecN/SMC N terminal domain CsakCS09_RS01335 PF05638 Type VI secretion system effector, Hcp CsakCS09_RS01345 PF04286 Protein of unknown function (DUF445) CsakCS09_RS01350 PF00155 Aminotransferase class I and II CsakCS09_RS01350 PF00392 Bacterial regulatory proteins, gntR family CsakCS09_RS01360 PF08845 Toxin SymE, type I toxin-antitoxin system CsakCS09_RS01365 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS01365 PF17912 MalK OB fold domain CsakCS09_RS01370 PF13416 Bacterial extracellular solute-binding protein CsakCS09_RS01375 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS01380 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS01385 PF07745 Glycosyl hydrolase family 53 CsakCS09_RS01390 PF08532 Beta-galactosidase trimerisation domain CsakCS09_RS01390 PF02449 Beta-galactosidase CsakCS09_RS01390 PF08533 Beta-galactosidase C-terminal domain CsakCS09_RS01395 PF02378 Phosphotransferase system, EIIC CsakCS09_RS01395 PF00367 phosphotransferase system, EIIB CsakCS09_RS01400 PF02264 LamB porin CsakCS09_RS01405 PF00356 Bacterial regulatory proteins, lacI family CsakCS09_RS01410 PF12802 MarR family CsakCS09_RS01415 PF00529 HlyD membrane-fusion protein of T1SS CsakCS09_RS01415 PF16576 Barrel-sandwich domain of CusB or HlyD membrane-fusion CsakCS09_RS01430 PF00356 Bacterial regulatory proteins, lacI family CsakCS09_RS01435 PF00367 phosphotransferase system, EIIB CsakCS09_RS01435 PF02378 Phosphotransferase system, EIIC CsakCS09_RS01440 PF00232 Glycosyl hydrolase family 1 CsakCS09_RS01445 PF02133 Permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin CsakCS09_RS01450 PF07969 Amidohydrolase family CsakCS09_RS01455 PF03797 Autotransporter beta-domain CsakCS09_RS01455 PF12951 Passenger-associated-transport-repeat CsakCS09_RS01455 PF00082 Subtilase family CsakCS09_RS01465 PF00015 Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signalling domain CsakCS09_RS01465 PF02203 Tar ligand binding domain homologue CsakCS09_RS01465 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS01470 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS01470 PF00990 Diguanylate cyclase, GGDEF domain CsakCS09_RS01475 PF00990 Diguanylate cyclase, GGDEF domain CsakCS09_RS01480 PF00884 Sulfatase CsakCS09_RS01485 PF01695 IstB-like ATP binding protein CsakCS09_RS01490 PF17948 DnaT DNA-binding domain CsakCS09_RS01495 PF02566 OsmC-like protein CsakCS09_RS01500 PF01047 MarR family CsakCS09_RS01505 PF12821 Threonine/Serine exporter, ThrE CsakCS09_RS01510 PF06738 Putative threonine/serine exporter CsakCS09_RS01515 PF00196 Bacterial regulatory proteins, luxR family CsakCS09_RS01520 PF00196 Bacterial regulatory proteins, luxR family CsakCS09_RS01525 PF04073 Aminoacyl-tRNA editing domain CsakCS09_RS01530 PF02378 Phosphotransferase system, EIIC CsakCS09_RS01535 PF06276 Ferric iron reductase FhuF-like transporter CsakCS09_RS01535 PF11575 FhuF 2Fe-2S C-terminal domain CsakCS09_RS01540 PF00990 Diguanylate cyclase, GGDEF domain CsakCS09_RS01545 PF07256 Protein of unknown function (DUF1435) CsakCS09_RS01565 PF08468 Methyltransferase small domain N-terminal CsakCS09_RS01565 PF05175 Methyltransferase small domain CsakCS09_RS01570 PF03603 DNA polymerase III psi subunit CsakCS09_RS01575 PF00583 Acetyltransferase (GNAT) family CsakCS09_RS01580 PF13419 Haloacid dehalogenase-like hydrolase CsakCS09_RS01585 PF00009 Elongation factor Tu GTP binding domain CsakCS09_RS01585 PF16658 Class II release factor RF3, C-terminal domain CsakCS09_RS01585 PF03144 Elongation factor Tu domain 2 CsakCS09_RS01590 PF04972 BON domain CsakCS09_RS01595 PF07043 Protein of unknown function (DUF1328) CsakCS09_RS01600 PF01734 Patatin-like phospholipase CsakCS09_RS01605 PF01026 TatD related DNase CsakCS09_RS01610 PF07670 Nucleoside recognition CsakCS09_RS01610 PF07662 Na+ dependent nucleoside transporter C-terminus CsakCS09_RS01610 PF01773 Na+ dependent nucleoside transporter N-terminus CsakCS09_RS01615 PF01791 DeoC/LacD family aldolase CsakCS09_RS01620 PF00591 Glycosyl transferase family, a/b domain CsakCS09_RS01620 PF02885 Glycosyl transferase family, helical bundle domain CsakCS09_RS01620 PF07831 Pyrimidine nucleoside phosphorylase C-terminal domain CsakCS09_RS01625 PF01676 Metalloenzyme superfamily CsakCS09_RS01630 PF01048 Phosphorylase superfamily CsakCS09_RS01635 PF03099 Biotin/lipoate A/B protein ligase family CsakCS09_RS01635 PF10437 Bacterial lipoate protein ligase C-terminus CsakCS09_RS01640 PF10144 Bacterial virulence factor haemolysin CsakCS09_RS01645 PF18429 Domain of unknown function (DUF5609) CsakCS09_RS01650 PF18073 Rubredoxin metal binding domain CsakCS09_RS01655 PF01381 Helix-turn-helix CsakCS09_RS01655 PF13521 AAA domain CsakCS09_RS01660 PF00107 Zinc-binding dehydrogenase CsakCS09_RS01660 PF08240 Alcohol dehydrogenase GroES-like domain CsakCS09_RS01665 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS01665 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS01670 PF01061 ABC-2 type transporter CsakCS09_RS01675 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS01680 PF17101 Stealth protein CR1, conserved region 1 CsakCS09_RS01680 PF11380 Stealth protein CR2, conserved region 2 CsakCS09_RS01685 PF04464 CDP-Glycerol:Poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase CsakCS09_RS01685 PF00535 Glycosyl transferase family 2 CsakCS09_RS01695 PF05159 Capsule polysaccharide biosynthesis protein CsakCS09_RS01700 PF05159 Capsule polysaccharide biosynthesis protein CsakCS09_RS01705 PF02563 Polysaccharide biosynthesis/export protein CsakCS09_RS01705 PF10531 SLBB domain CsakCS09_RS01715 PF12848 ABC transporter CsakCS09_RS01715 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS01725 PF01464 Transglycosylase SLT domain CsakCS09_RS01725 PF14718 Soluble lytic murein transglycosylase L domain CsakCS09_RS01730 PF01371 Trp repressor protein CsakCS09_RS01735 PF01931 Protein of unknown function DUF84 CsakCS09_RS01740 PF00300 Histidine phosphatase superfamily (branch 1) CsakCS09_RS01745 PF12833 Helix-turn-helix domain CsakCS09_RS01745 PF06445 GyrI-like small molecule binding domain CsakCS09_RS01750 PF05981 CreA protein CsakCS09_RS01755 PF00486 Transcriptional regulatory protein, C terminal CsakCS09_RS01755 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS01760 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS01760 PF00512 His Kinase A (phospho-acceptor) domain CsakCS09_RS01760 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS01765 PF06123 Inner membrane protein CreD CsakCS09_RS01770 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS01770 PF00486 Transcriptional regulatory protein, C terminal CsakCS09_RS01780 PF00588 SpoU rRNA Methylase family CsakCS09_RS01790 PF01842 ACT domain CsakCS09_RS01790 PF13840 ACT domain CsakCS09_RS01790 PF00742 Homoserine dehydrogenase CsakCS09_RS01790 PF03447 Homoserine dehydrogenase, NAD binding domain CsakCS09_RS01790 PF00696 Amino acid kinase family CsakCS09_RS01795 PF00288 GHMP kinases N terminal domain CsakCS09_RS01795 PF08544 GHMP kinases C terminal CsakCS09_RS01800 PF00291 Pyridoxal-phosphate dependent enzyme CsakCS09_RS01800 PF14821 Threonine synthase N terminus CsakCS09_RS01805 PF03883 Peroxide stress protein YaaA CsakCS09_RS01810 PF01235 Sodium:alanine symporter family CsakCS09_RS01815 PF00923 Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase CsakCS09_RS01820 PF00994 Probable molybdopterin binding domain CsakCS09_RS01825 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS01830 PF01184 GPR1/FUN34/yaaH family CsakCS09_RS01835 PF00012 Hsp70 protein CsakCS09_RS01840 PF00684 DnaJ central domain CsakCS09_RS01840 PF00226 DnaJ domain CsakCS09_RS01840 PF01556 DnaJ C terminal domain CsakCS09_RS01850 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS01850 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS01870 PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 CsakCS09_RS01875 PF06965 Na+/H+ antiporter 1 CsakCS09_RS01880 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS01880 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS01885 PF01649 Ribosomal protein S20 CsakCS09_RS01895 PF06574 FAD synthetase CsakCS09_RS01895 PF01687 Riboflavin kinase CsakCS09_RS01900 PF00133 tRNA synthetases class I (I, L, M and V) CsakCS09_RS01900 PF06827 Zinc finger found in FPG and IleRS CsakCS09_RS01900 PF08264 Anticodon-binding domain of tRNA CsakCS09_RS01905 PF01252 Signal peptidase (SPase) II CsakCS09_RS01910 PF00254 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CsakCS09_RS01915 PF02401 LytB protein CsakCS09_RS01920 PF01156 Inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase CsakCS09_RS01925 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS01925 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS01930 PF02272 DHHA1 domain CsakCS09_RS01930 PF01411 tRNA synthetases class II (A) CsakCS09_RS01930 PF07973 Threonyl and Alanyl tRNA synthetase second additional domain CsakCS09_RS01940 PF01074 Glycosyl hydrolases family 38 N-terminal domain CsakCS09_RS01940 PF09261 Alpha mannosidase middle domain CsakCS09_RS01940 PF07748 Glycosyl hydrolases family 38 C-terminal domain CsakCS09_RS01945 PF02378 Phosphotransferase system, EIIC CsakCS09_RS01955 PF01418 Helix-turn-helix domain, rpiR family CsakCS09_RS01955 PF01380 SIS domain CsakCS09_RS01960 PF01113 Dihydrodipicolinate reductase, N-terminus CsakCS09_RS01960 PF05173 Dihydrodipicolinate reductase, C-terminus CsakCS09_RS01965 PF00988 Carbamoyl-phosphate synthase small chain, CPSase domain CsakCS09_RS01965 PF00117 Glutamine amidotransferase class-I CsakCS09_RS01970 PF02142 MGS-like domain CsakCS09_RS01970 PF02787 Carbamoyl-phosphate synthetase large chain, oligomerisation domain CsakCS09_RS01970 PF02786 Carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP binding domain CsakCS09_RS01980 PF06004 Bacterial protein of unknown function (DUF903) CsakCS09_RS01985 PF02525 Flavodoxin-like fold CsakCS09_RS01990 PF00999 Sodium/hydrogen exchanger family CsakCS09_RS01990 PF02254 TrkA-N domain CsakCS09_RS01995 PF01810 LysE type translocator CsakCS09_RS02000 PF00186 Dihydrofolate reductase CsakCS09_RS02005 PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase CsakCS09_RS02010 PF04379 ApaG domain CsakCS09_RS02015 PF00398 Ribosomal RNA adenine dimethylase CsakCS09_RS02020 PF04166 Pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxA CsakCS09_RS02025 PF09312 SurA N-terminal domain CsakCS09_RS02025 PF00639 PPIC-type PPIASE domain CsakCS09_RS02030 PF04453 LPS transport system D CsakCS09_RS02030 PF03968 OstA-like protein CsakCS09_RS02035 PF05099 Tellurite resistance protein TerB CsakCS09_RS02035 PF00226 DnaJ domain CsakCS09_RS02040 PF00849 RNA pseudouridylate synthase CsakCS09_RS02045 PF18337 RapA N-terminal Tudor like domain CsakCS09_RS02045 PF00271 Helicase conserved C-terminal domain CsakCS09_RS02045 PF12137 RNA polymerase recycling family C-terminal CsakCS09_RS02045 PF00176 SNF2 family N-terminal domain CsakCS09_RS02045 PF18339 RapA N-terminal Tudor like domain 1 CsakCS09_RS02050 PF03104 DNA polymerase family B, exonuclease domain CsakCS09_RS02050 PF00136 DNA polymerase family B CsakCS09_RS02055 PF00596 Class II Aldolase and Adducin N-terminal domain CsakCS09_RS02060 PF02610 L-arabinose isomerase CsakCS09_RS02060 PF11762 L-arabinose isomerase C-terminal domain CsakCS09_RS02065 PF02782 FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain CsakCS09_RS02070 PF02311 AraC-like ligand binding domain CsakCS09_RS02070 PF12833 Helix-turn-helix domain CsakCS09_RS02075 PF09335 SNARE associated Golgi protein CsakCS09_RS02080 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS02085 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS02095 PF00496 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle CsakCS09_RS02095 PF12793 Sugar transport-related sRNA regulator N-term CsakCS09_RS02105 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS02110 PF00694 Aconitase C-terminal domain CsakCS09_RS02115 PF00330 Aconitase family (aconitate hydratase) CsakCS09_RS02120 PF00180 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase CsakCS09_RS02125 PF08502 LeuA allosteric (dimerisation) domain CsakCS09_RS02125 PF00682 HMGL-like CsakCS09_RS02130 PF08054 Leucine operon leader peptide CsakCS09_RS02135 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS02135 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS02145 PF02775 Thiamine pyrophosphate enzyme, C-terminal TPP binding domain CsakCS09_RS02145 PF00205 Thiamine pyrophosphate enzyme, central domain CsakCS09_RS02145 PF02776 Thiamine pyrophosphate enzyme, N-terminal TPP binding domain CsakCS09_RS02150 PF10369 Small subunit of acetolactate synthase CsakCS09_RS02155 PF00532 Periplasmic binding proteins and sugar binding domain of LacI family CsakCS09_RS02155 PF00356 Bacterial regulatory proteins, lacI family CsakCS09_RS02160 PF02381 MraZ protein, putative antitoxin-like CsakCS09_RS02165 PF01795 MraW methylase family CsakCS09_RS02170 PF04999 Cell division protein FtsL CsakCS09_RS02175 PF00905 Penicillin binding protein transpeptidase domain CsakCS09_RS02175 PF03717 Penicillin-binding Protein dimerisation domain CsakCS09_RS02180 PF08245 Mur ligase middle domain CsakCS09_RS02180 PF02875 Mur ligase family, glutamate ligase domain CsakCS09_RS02180 PF01225 Mur ligase family, catalytic domain CsakCS09_RS02185 PF08245 Mur ligase middle domain CsakCS09_RS02185 PF01225 Mur ligase family, catalytic domain CsakCS09_RS02185 PF02875 Mur ligase family, glutamate ligase domain CsakCS09_RS02190 PF10555 Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide-transferase signature 1 CsakCS09_RS02190 PF00953 Glycosyl transferase family 4 CsakCS09_RS02195 PF02875 Mur ligase family, glutamate ligase domain CsakCS09_RS02195 PF08245 Mur ligase middle domain CsakCS09_RS02200 PF01098 Cell cycle protein CsakCS09_RS02205 PF03033 Glycosyltransferase family 28 N-terminal domain CsakCS09_RS02205 PF04101 Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain CsakCS09_RS02210 PF02875 Mur ligase family, glutamate ligase domain CsakCS09_RS02210 PF08245 Mur ligase middle domain CsakCS09_RS02210 PF01225 Mur ligase family, catalytic domain CsakCS09_RS02215 PF07478 D-ala D-ala ligase C-terminus CsakCS09_RS02215 PF01820 D-ala D-ala ligase N-terminus CsakCS09_RS02220 PF08478 POTRA domain, FtsQ-type CsakCS09_RS02220 PF03799 Cell division protein FtsQ CsakCS09_RS02225 PF02491 SHS2 domain inserted in FTSA CsakCS09_RS02230 PF00091 Tubulin/FtsZ family, GTPase domain CsakCS09_RS02230 PF12327 FtsZ family, C-terminal domain CsakCS09_RS02235 PF03331 UDP-3-O-acyl N-acetylglycosamine deacetylase CsakCS09_RS02240 PF06558 Secretion monitor precursor protein (SecM) CsakCS09_RS02245 PF07517 SecA DEAD-like domain CsakCS09_RS02245 PF02810 SEC-C motif CsakCS09_RS02245 PF01043 SecA preprotein cross-linking domain CsakCS09_RS02245 PF07516 SecA Wing and Scaffold domain CsakCS09_RS02250 PF00293 NUDIX domain CsakCS09_RS02255 PF03884 DNA gyrase inhibitor YacG CsakCS09_RS02260 PF07072 Cell division protein CsakCS09_RS02265 PF01121 Dephospho-CoA kinase CsakCS09_RS02270 PF00478 IMP dehydrogenase / GMP reductase domain CsakCS09_RS02275 PF00482 Type II secretion system (T2SS), protein F CsakCS09_RS02280 PF00437 Type II/IV secretion system protein CsakCS09_RS02280 PF05157 Type II secretion system (T2SS), protein E, N-terminal domain CsakCS09_RS02285 PF07963 Prokaryotic N-terminal methylation motif CsakCS09_RS02290 PF01729 Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain CsakCS09_RS02290 PF02749 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain CsakCS09_RS02295 PF01510 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase CsakCS09_RS02300 PF17113 Regulatory signalling modulator protein AmpE CsakCS09_RS02305 PF05270 Alpha-L-arabinofuranosidase B (ABFB) domain CsakCS09_RS02305 PF04616 Glycosyl hydrolases family 43 CsakCS09_RS02315 PF00324 Amino acid permease CsakCS09_RS02325 PF07729 FCD domain CsakCS09_RS02325 PF00392 Bacterial regulatory proteins, gntR family CsakCS09_RS02330 PF17831 Pyruvate dehydrogenase E1 component middle domain CsakCS09_RS02330 PF00456 Transketolase, thiamine diphosphate binding domain CsakCS09_RS02335 PF00198 2-oxoacid dehydrogenases acyltransferase (catalytic domain) CsakCS09_RS02335 PF00364 Biotin-requiring enzyme CsakCS09_RS02335 PF02817 e3 binding domain CsakCS09_RS02340 PF07992 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase CsakCS09_RS02340 PF02852 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain CsakCS09_RS02345 PF05818 Enterobacterial TraT complement resistance protein CsakCS09_RS02355 PF11737 Protein of unknown function (DUF3300) CsakCS09_RS02365 PF00330 Aconitase family (aconitate hydratase) CsakCS09_RS02365 PF06434 Aconitate hydratase 2 N-terminus CsakCS09_RS02365 PF11791 Aconitate B N-terminal domain CsakCS09_RS02375 PF06062 Uncharacterised protein family (UPF0231) CsakCS09_RS02380 PF02675 S-adenosylmethionine decarboxylase CsakCS09_RS02385 PF17284 Spermidine synthase tetramerisation domain CsakCS09_RS02390 PF09691 Type II secretion system pilotin lipoprotein (PulS_OutS) CsakCS09_RS02395 PF07731 Multicopper oxidase CsakCS09_RS02395 PF00394 Multicopper oxidase CsakCS09_RS02395 PF07732 Multicopper oxidase CsakCS09_RS02400 PF01011 PQQ enzyme repeat CsakCS09_RS02405 PF00156 Phosphoribosyl transferase domain CsakCS09_RS02410 PF00484 Carbonic anhydrase CsakCS09_RS02415 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS02420 PF01061 ABC-2 type transporter CsakCS09_RS02425 PF01522 Polysaccharide deacetylase CsakCS09_RS02430 PF02261 Aspartate decarboxylase CsakCS09_RS02435 PF02569 Pantoate-beta-alanine ligase CsakCS09_RS02440 PF02548 Ketopantoate hydroxymethyltransferase CsakCS09_RS02445 PF01288 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase (HPPK) CsakCS09_RS02450 PF12627 Probable RNA and SrmB- binding site of polymerase A CsakCS09_RS02450 PF01743 Poly A polymerase head domain CsakCS09_RS02450 PF12626 Polymerase A arginine-rich C-terminus CsakCS09_RS02455 PF00749 tRNA synthetases class I (E and Q), catalytic domain CsakCS09_RS02460 PF01258 Prokaryotic dksA/traR C4-type zinc finger CsakCS09_RS02465 PF17746 SfsA N-terminal OB domain CsakCS09_RS02465 PF03749 Sugar fermentation stimulation protein RE domain CsakCS09_RS02470 PF02834 LigT like Phosphoesterase CsakCS09_RS02475 PF00271 Helicase conserved C-terminal domain CsakCS09_RS02475 PF08482 ATP-dependent helicase C-terminal CsakCS09_RS02475 PF04408 Helicase associated domain (HA2) CsakCS09_RS02475 PF00270 DEAD/DEAH box helicase CsakCS09_RS02480 PF14814 Bifunctional transglycosylase second domain CsakCS09_RS02480 PF00905 Penicillin binding protein transpeptidase domain CsakCS09_RS02480 PF00912 Transglycosylase CsakCS09_RS02480 PF14812 Transmembrane domain of transglycosylase PBP1 at N-terminal CsakCS09_RS02485 PF00593 TonB dependent receptor CsakCS09_RS02485 PF07715 TonB-dependent Receptor Plug Domain CsakCS09_RS02490 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS02495 PF01497 Periplasmic binding protein CsakCS09_RS02500 PF01032 FecCD transport family CsakCS09_RS02505 PF00202 Aminotransferase class-III CsakCS09_RS02510 PF00654 Voltage gated chloride channel CsakCS09_RS02515 PF01521 Iron-sulphur cluster biosynthesis CsakCS09_RS02520 PF03458 UPF0126 domain CsakCS09_RS02525 PF01497 Periplasmic binding protein CsakCS09_RS02530 PF01048 Phosphorylase superfamily CsakCS09_RS02535 PF01966 HD domain CsakCS09_RS02535 PF13286 Phosphohydrolase-associated domain CsakCS09_RS02540 PF00595 PDZ domain CsakCS09_RS02545 PF11944 Protein of unknown function (DUF3461) CsakCS09_RS02550 PF00132 Bacterial transferase hexapeptide (six repeats) CsakCS09_RS02550 PF14602 Hexapeptide repeat of succinyl-transferase CsakCS09_RS02550 PF14805 Tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase N-terminal CsakCS09_RS02555 PF01909 Nucleotidyltransferase domain CsakCS09_RS02555 PF01842 ACT domain CsakCS09_RS02555 PF01966 HD domain CsakCS09_RS02555 PF08335 GlnD PII-uridylyltransferase CsakCS09_RS02560 PF00557 Metallopeptidase family M24 CsakCS09_RS02565 PF00318 Ribosomal protein S2 CsakCS09_RS02570 PF00889 Elongation factor TS CsakCS09_RS02575 PF00696 Amino acid kinase family CsakCS09_RS02580 PF01765 Ribosome recycling factor CsakCS09_RS02585 PF08436 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase C-terminal domain CsakCS09_RS02585 PF13288 DXP reductoisomerase C-terminal domain CsakCS09_RS02585 PF02670 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase CsakCS09_RS02590 PF01255 Putative undecaprenyl diphosphate synthase CsakCS09_RS02600 PF17820 PDZ domain CsakCS09_RS02600 PF02163 Peptidase family M50 CsakCS09_RS02605 PF01103 Surface antigen CsakCS09_RS02605 PF07244 Surface antigen variable number repeat CsakCS09_RS02610 PF03938 Outer membrane protein (OmpH-like) CsakCS09_RS02615 PF04613 UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase, LpxD CsakCS09_RS02615 PF00132 Bacterial transferase hexapeptide (six repeats) CsakCS09_RS02620 PF07977 FabA-like domain CsakCS09_RS02625 PF00132 Bacterial transferase hexapeptide (six repeats) CsakCS09_RS02625 PF13720 Udp N-acetylglucosamine O-acyltransferase; Domain 2 CsakCS09_RS02630 PF02684 Lipid-A-disaccharide synthetase CsakCS09_RS02635 PF01351 Ribonuclease HII CsakCS09_RS02640 PF01336 OB-fold nucleic acid binding domain CsakCS09_RS02640 PF07733 Bacterial DNA polymerase III alpha NTPase domain CsakCS09_RS02640 PF17657 Bacterial DNA polymerase III alpha subunit finger domain CsakCS09_RS02640 PF14579 Helix-hairpin-helix motif CsakCS09_RS02640 PF02811 PHP domain CsakCS09_RS02645 PF03255 Acetyl co-enzyme A carboxylase carboxyltransferase alpha subunit CsakCS09_RS02655 PF03711 Orn/Lys/Arg decarboxylase, C-terminal domain CsakCS09_RS02655 PF03709 Orn/Lys/Arg decarboxylase, N-terminal domain CsakCS09_RS02655 PF01276 Orn/Lys/Arg decarboxylase, major domain CsakCS09_RS02660 PF00903 Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily CsakCS09_RS02665 PF11734 TilS substrate C-terminal domain CsakCS09_RS02665 PF01171 PP-loop family CsakCS09_RS02665 PF09179 TilS substrate binding domain CsakCS09_RS02670 PF00034 Cytochrome c CsakCS09_RS02675 PF07073 Modulator of Rho-dependent transcription termination (ROF) CsakCS09_RS02680 PF06786 Uncharacterised protein family (UPF0253) CsakCS09_RS02685 PF07152 YaeQ protein CsakCS09_RS02690 PF00472 RF-1 domain CsakCS09_RS02695 PF17185 NlpE C-terminal OB domain CsakCS09_RS02695 PF04170 NlpE N-terminal domain CsakCS09_RS02700 PF04073 Aminoacyl-tRNA editing domain CsakCS09_RS02700 PF00587 tRNA synthetase class II core domain (G, H, P, S and T) CsakCS09_RS02700 PF03129 Anticodon binding domain CsakCS09_RS02705 PF01980 tRNA-methyltransferase O CsakCS09_RS02705 PF18389 TrmO C-terminal domain CsakCS09_RS02710 PF16358 RcsF lipoprotein CsakCS09_RS02715 PF03180 NLPA lipoprotein CsakCS09_RS02720 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS02725 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS02725 PF09383 NIL domain CsakCS09_RS02760 PF00248 Aldo/keto reductase family CsakCS09_RS02765 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS02765 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS02770 PF03372 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family CsakCS09_RS02775 PF08241 Methyltransferase domain CsakCS09_RS02780 PF01476 LysM domain CsakCS09_RS02780 PF01464 Transglycosylase SLT domain CsakCS09_RS02785 PF16123 Hydroxyacylglutathione hydrolase C-terminus CsakCS09_RS02785 PF00753 Metallo-beta-lactamase superfamily CsakCS09_RS02790 PF08241 Methyltransferase domain CsakCS09_RS02795 PF00075 RNase H CsakCS09_RS02800 PF00929 Exonuclease CsakCS09_RS02810 PF00795 Carbon-nitrogen hydrolase CsakCS09_RS02815 PF09317 Domain of unknown function (DUF1974) CsakCS09_RS02815 PF02771 Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal domain CsakCS09_RS02815 PF02770 Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain CsakCS09_RS02815 PF00441 Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain CsakCS09_RS02820 PF13580 SIS domain CsakCS09_RS02825 PF13230 Glutamine amidotransferases class-II CsakCS09_RS02830 PF03734 L,D-transpeptidase catalytic domain CsakCS09_RS02835 PF00817 impB/mucB/samB family CsakCS09_RS02835 PF11799 impB/mucB/samB family C-terminal domain CsakCS09_RS02835 PF11798 IMS family HHH motif CsakCS09_RS02840 PF07687 Peptidase dimerisation domain CsakCS09_RS02840 PF01546 Peptidase family M20/M25/M40 CsakCS09_RS02845 PF00156 Phosphoribosyl transferase domain CsakCS09_RS02850 PF06500 Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1100) CsakCS09_RS02855 PF07417 Sigma factor-binding transcriptional regulator Crl CsakCS09_RS02860 PF00267 Gram-negative porin CsakCS09_RS02865 PF00696 Amino acid kinase family CsakCS09_RS02865 PF01472 PUA domain CsakCS09_RS02870 PF00171 Aldehyde dehydrogenase family CsakCS09_RS02880 PF00589 Phage integrase family CsakCS09_RS02900 PF12961 Domain of unknown function (DUF3850) CsakCS09_RS02935 PF00436 Single-strand binding protein family CsakCS09_RS03025 PF00772 DnaB-like helicase N terminal domain CsakCS09_RS03025 PF03796 DnaB-like helicase C terminal domain CsakCS09_RS03045 PF05772 NinB protein CsakCS09_RS03065 PF05866 Endodeoxyribonuclease RusA CsakCS09_RS03130 PF03592 Terminase small subunit CsakCS09_RS03250 PF00535 Glycosyl transferase family 2 CsakCS09_RS03255 PF04138 GtrA-like protein CsakCS09_RS03260 PF06755 CbtA_toxin of type IV toxin-antitoxin system CsakCS09_RS03265 PF06154 CbeA_antitoxin, type IV, cytoskeleton bundling-enhancing factor A CsakCS09_RS03270 PF06174 Protein of unknown function (DUF987) CsakCS09_RS03275 PF04002 RadC-like JAB domain CsakCS09_RS03280 PF03230 Antirestriction protein CsakCS09_RS03285 PF06006 Bacterial protein of unknown function (DUF905) CsakCS09_RS03305 PF13280 WYL domain CsakCS09_RS03305 PF08220 DeoR-like helix-turn-helix domain CsakCS09_RS03310 PF06067 Domain of unknown function (DUF932) CsakCS09_RS03315 PF01926 50S ribosome-binding GTPase CsakCS09_RS03325 PF01609 Transposase DDE domain CsakCS09_RS03325 PF05598 Transposase domain (DUF772) CsakCS09_RS03330 PF13180 PDZ domain CsakCS09_RS03335 PF01435 Peptidase family M48 CsakCS09_RS03345 PF02254 TrkA-N domain CsakCS09_RS03345 PF00999 Sodium/hydrogen exchanger family CsakCS09_RS03345 PF02080 TrkA-C domain CsakCS09_RS03350 PF00085 Thioredoxin CsakCS09_RS03380 PF01434 Peptidase family M41 CsakCS09_RS03380 PF06480 FtsH Extracellular CsakCS09_RS03380 PF00004 ATPase family associated with various cellular activities (AAA) CsakCS09_RS03380 PF17862 AAA+ lid domain CsakCS09_RS03390 PF07724 AAA domain (Cdc48 subfamily) CsakCS09_RS03390 PF00004 ATPase family associated with various cellular activities (AAA) CsakCS09_RS03390 PF17871 AAA lid domain CsakCS09_RS03390 PF02861 Clp amino terminal domain, pathogenicity island component CsakCS09_RS03390 PF10431 C-terminal, D2-small domain, of ClpB protein CsakCS09_RS03395 PF00011 Hsp20/alpha crystallin family CsakCS09_RS03405 PF12728 Helix-turn-helix domain CsakCS09_RS03445 PF07638 ECF sigma factor CsakCS09_RS03460 PF13356 Arm DNA-binding domain CsakCS09_RS03460 PF00589 Phage integrase family CsakCS09_RS03470 PF14659 Phage integrase, N-terminal SAM-like domain CsakCS09_RS03470 PF00589 Phage integrase family CsakCS09_RS03470 PF13356 Arm DNA-binding domain CsakCS09_RS03525 PF13614 AAA domain CsakCS09_RS03560 PF05598 Transposase domain (DUF772) CsakCS09_RS03560 PF01609 Transposase DDE domain CsakCS09_RS03590 PF01546 Peptidase family M20/M25/M40 CsakCS09_RS03590 PF07687 Peptidase dimerisation domain CsakCS09_RS03595 PF00496 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle CsakCS09_RS03600 PF00675 Insulinase (Peptidase family M16) CsakCS09_RS03605 PF04055 Radical SAM superfamily CsakCS09_RS03605 PF13186 Iron-sulfur cluster-binding domain CsakCS09_RS03610 PF05402 Coenzyme PQQ synthesis protein D (PqqD) CsakCS09_RS03615 PF03070 TENA/THI-4/PQQC family CsakCS09_RS03620 PF12706 Beta-lactamase superfamily domain CsakCS09_RS03625 PF08042 PqqA family CsakCS09_RS03630 PF01244 Membrane dipeptidase (Peptidase family M19) CsakCS09_RS03655 PF12833 Helix-turn-helix domain CsakCS09_RS03655 PF01965 DJ-1/PfpI family CsakCS09_RS03665 PF01042 Endoribonuclease L-PSP CsakCS09_RS03670 PF00440 Bacterial regulatory proteins, tetR family CsakCS09_RS03680 PF00106 short chain dehydrogenase CsakCS09_RS03680 PF00561 alpha/beta hydrolase fold CsakCS09_RS03685 PF00356 Bacterial regulatory proteins, lacI family CsakCS09_RS03690 PF02929 Beta galactosidase small chain CsakCS09_RS03690 PF00703 Glycosyl hydrolases family 2 CsakCS09_RS03690 PF16353 Domain of unknown function(DUF4981) CsakCS09_RS03690 PF02836 Glycosyl hydrolases family 2, TIM barrel domain CsakCS09_RS03690 PF02837 Glycosyl hydrolases family 2, sugar binding domain CsakCS09_RS03695 PF01306 LacY proton/sugar symporter CsakCS09_RS03700 PF00390 Malic enzyme, N-terminal domain CsakCS09_RS03700 PF03949 Malic enzyme, NAD binding domain CsakCS09_RS03715 PF09383 NIL domain CsakCS09_RS03715 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS03720 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS03725 PF03180 NLPA lipoprotein CsakCS09_RS03735 PF05870 Phenolic acid decarboxylase (PAD) CsakCS09_RS03740 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS03740 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS03755 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS03755 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS03760 PF13360 PQQ-like domain CsakCS09_RS03760 PF01011 PQQ enzyme repeat CsakCS09_RS03765 PF01594 AI-2E family transporter CsakCS09_RS03770 PF00916 Sulfate permease family CsakCS09_RS03770 PF01740 STAS domain CsakCS09_RS03775 PF00484 Carbonic anhydrase CsakCS09_RS03785 PF08668 HDOD domain CsakCS09_RS03785 PF00563 EAL domain CsakCS09_RS03795 PF00293 NUDIX domain CsakCS09_RS03800 PF08220 DeoR-like helix-turn-helix domain CsakCS09_RS03800 PF00455 DeoR C terminal sensor domain CsakCS09_RS03810 PF03279 Bacterial lipid A biosynthesis acyltransferase CsakCS09_RS03815 PF03969 AFG1-like ATPase CsakCS09_RS03820 PF01848 Hok/gef family CsakCS09_RS03830 PF01654 Cytochrome bd terminal oxidase subunit I CsakCS09_RS03840 PF01568 Molydopterin dinucleotide binding domain CsakCS09_RS03840 PF00384 Molybdopterin oxidoreductase CsakCS09_RS03840 PF04879 Molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 domain CsakCS09_RS03840 PF12838 4Fe-4S dicluster domain CsakCS09_RS03840 PF10588 NADH-ubiquinone oxidoreductase-G iron-sulfur binding region CsakCS09_RS03845 PF00324 Amino acid permease CsakCS09_RS03850 PF02574 Homocysteine S-methyltransferase CsakCS09_RS03855 PF04069 Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system CsakCS09_RS03860 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS03865 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS03870 PF02668 Taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family CsakCS09_RS03885 PF00490 Delta-aminolevulinic acid dehydratase CsakCS09_RS03890 PF02464 Competence-damaged protein CsakCS09_RS03895 PF03797 Autotransporter beta-domain CsakCS09_RS03900 PF15977 Winged helix-turn-helix DNA binding CsakCS09_RS03905 PF00144 Beta-lactamase CsakCS09_RS03915 PF05992 SbmA/BacA-like family CsakCS09_RS03920 PF07759 Protein of unknown function (DUF1615) CsakCS09_RS03925 PF10954 Protein of unknown function (DUF2755) CsakCS09_RS03930 PF10953 Protein of unknown function (DUF2754) CsakCS09_RS03935 PF07478 D-ala D-ala ligase C-terminus CsakCS09_RS03935 PF01820 D-ala D-ala ligase N-terminus CsakCS09_RS03945 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS03950 PF10796 Sigma-S stabilisation anti-adaptor protein CsakCS09_RS03960 PF00083 Sugar (and other) transporter CsakCS09_RS03965 PF03807 NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent CsakCS09_RS03965 PF14748 Pyrroline-5-carboxylate reductase dimerisation CsakCS09_RS03975 PF04239 Protein of unknown function (DUF421) CsakCS09_RS03980 PF02639 Uncharacterized BCR, YaiI/YqxD family COG1671 CsakCS09_RS03985 PF09849 Uncharacterized protein conserved in bacteria (DUF2076) CsakCS09_RS03990 PF01202 Shikimate kinase CsakCS09_RS03995 PF16362 YaiA protein CsakCS09_RS04000 PF07302 AroM protein CsakCS09_RS04005 PF06865 Pyrimidine/purine nucleoside phosphorylase CsakCS09_RS04010 PF04381 Putative exonuclease, RdgC CsakCS09_RS04015 PF00480 ROK family CsakCS09_RS04020 PF13476 AAA domain CsakCS09_RS04025 PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase CsakCS09_RS04025 PF12320 Type 5 capsule protein repressor C-terminal domain CsakCS09_RS04030 PF00486 Transcriptional regulatory protein, C terminal CsakCS09_RS04030 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS04035 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS04035 PF00512 His Kinase A (phospho-acceptor) domain CsakCS09_RS04035 PF00989 PAS fold CsakCS09_RS04035 PF11808 Phosphate regulon sensor protein PhoR CsakCS09_RS04040 PF05525 Branched-chain amino acid transport protein CsakCS09_RS04045 PF00324 Amino acid permease CsakCS09_RS04050 PF02903 Alpha amylase, N-terminal ig-like domain CsakCS09_RS04050 PF00128 Alpha amylase, catalytic domain CsakCS09_RS04065 PF04336 Acyl carrier protein phosphodiesterase CsakCS09_RS04070 PF02547 Queuosine biosynthesis protein CsakCS09_RS04075 PF01702 Queuine tRNA-ribosyltransferase CsakCS09_RS04080 PF02699 Preprotein translocase subunit CsakCS09_RS04085 PF02355 Protein export membrane protein CsakCS09_RS04085 PF13721 SecD export protein N-terminal TM region CsakCS09_RS04085 PF07549 SecD/SecF GG Motif CsakCS09_RS04090 PF02355 Protein export membrane protein CsakCS09_RS04090 PF07549 SecD/SecF GG Motif CsakCS09_RS04095 PF03502 Nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx CsakCS09_RS04100 PF11622 Protein of unknown function (DUF3251) CsakCS09_RS04105 PF03477 ATP cone domain CsakCS09_RS04110 PF00383 Cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region CsakCS09_RS04110 PF01872 RibD C-terminal domain CsakCS09_RS04115 PF00885 6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase CsakCS09_RS04120 PF01029 NusB family CsakCS09_RS04125 PF00586 AIR synthase related protein, N-terminal domain CsakCS09_RS04125 PF02769 AIR synthase related protein, C-terminal domain CsakCS09_RS04130 PF04608 Phosphatidylglycerophosphatase A CsakCS09_RS04135 PF00248 Aldo/keto reductase family CsakCS09_RS04140 PF02780 Transketolase, C-terminal domain CsakCS09_RS04140 PF02779 Transketolase, pyrimidine binding domain CsakCS09_RS04140 PF13292 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase CsakCS09_RS04145 PF00348 Polyprenyl synthetase CsakCS09_RS04150 PF02609 Exonuclease VII small subunit CsakCS09_RS04155 PF02926 THUMP domain CsakCS09_RS04155 PF02568 Thiamine biosynthesis protein (ThiI) CsakCS09_RS04160 PF01965 DJ-1/PfpI family CsakCS09_RS04165 PF08546 Ketopantoate reductase PanE/ApbA C terminal CsakCS09_RS04165 PF02558 Ketopantoate reductase PanE/ApbA CsakCS09_RS04170 PF04461 Protein of unknown function (DUF520) CsakCS09_RS04175 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS04180 PF01040 UbiA prenyltransferase family CsakCS09_RS04185 PF03626 Prokaryotic Cytochrome C oxidase subunit IV CsakCS09_RS04190 PF00510 Cytochrome c oxidase subunit III CsakCS09_RS04195 PF00115 Cytochrome C and Quinol oxidase polypeptide I CsakCS09_RS04200 PF06481 COX Aromatic Rich Motif CsakCS09_RS04200 PF00116 Cytochrome C oxidase subunit II, periplasmic domain CsakCS09_RS04205 PF00012 Hsp70 protein CsakCS09_RS04215 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS04220 PF03923 Uncharacterized lipoprotein CsakCS09_RS04220 PF08139 Prokaryotic membrane lipoprotein lipid attachment site CsakCS09_RS04225 PF01722 BolA-like protein CsakCS09_RS04230 PF05698 Bacterial trigger factor protein (TF) C-terminus CsakCS09_RS04230 PF00254 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CsakCS09_RS04230 PF05697 Bacterial trigger factor protein (TF) CsakCS09_RS04235 PF00574 Clp protease CsakCS09_RS04240 PF10431 C-terminal, D2-small domain, of ClpB protein CsakCS09_RS04240 PF07724 AAA domain (Cdc48 subfamily) CsakCS09_RS04240 PF06689 ClpX C4-type zinc finger CsakCS09_RS04245 PF05362 Lon protease (S16) C-terminal proteolytic domain CsakCS09_RS04245 PF02190 ATP-dependent protease La (LON) substrate-binding domain CsakCS09_RS04245 PF00004 ATPase family associated with various cellular activities (AAA) CsakCS09_RS04250 PF00216 Bacterial DNA-binding protein CsakCS09_RS04255 PF13145 PPIC-type PPIASE domain CsakCS09_RS04270 PF00753 Metallo-beta-lactamase superfamily CsakCS09_RS04275 PF06508 Queuosine biosynthesis protein QueC CsakCS09_RS04280 PF12793 Sugar transport-related sRNA regulator N-term CsakCS09_RS04280 PF00496 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle CsakCS09_RS04305 PF01037 Lrp/AsnC ligand binding domain CsakCS09_RS04305 PF13404 AsnC-type helix-turn-helix domain CsakCS09_RS04310 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS04310 PF00664 ABC transporter transmembrane region CsakCS09_RS04315 PF00664 ABC transporter transmembrane region CsakCS09_RS04315 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS04320 PF00543 Nitrogen regulatory protein P-II CsakCS09_RS04325 PF00909 Ammonium Transporter Family CsakCS09_RS04335 PF09619 Type III secretion system lipoprotein chaperone (YscW) CsakCS09_RS04340 PF01035 6-O-methylguanine DNA methyltransferase, DNA binding domain CsakCS09_RS04345 PF18395 Cas3 C-terminal domain CsakCS09_RS04345 PF18019 HD domain CsakCS09_RS04350 PF09481 CRISPR-associated protein Cse1 (CRISPR_cse1) CsakCS09_RS04360 PF09344 CT1975-like protein CsakCS09_RS04375 PF01867 CRISPR associated protein Cas1 CsakCS09_RS04380 PF09707 CRISPR-associated protein (Cas_Cas2CT1978) CsakCS09_RS04415 PF00583 Acetyltransferase (GNAT) family CsakCS09_RS04415 PF00814 Glycoprotease family CsakCS09_RS04420 PF12792 CSS motif domain associated with EAL CsakCS09_RS04420 PF00563 EAL domain CsakCS09_RS04425 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS04430 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS04430 PF09383 NIL domain CsakCS09_RS04435 PF03180 NLPA lipoprotein CsakCS09_RS04445 PF02203 Tar ligand binding domain homologue CsakCS09_RS04445 PF00015 Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signalling domain CsakCS09_RS04445 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS04450 PF01197 Ribosomal protein L31 CsakCS09_RS04455 PF00444 Ribosomal protein L36 CsakCS09_RS04460 PF10777 Inner membrane protein YlaC CsakCS09_RS04465 PF14602 Hexapeptide repeat of succinyl-transferase CsakCS09_RS04465 PF12464 Maltose acetyltransferase CsakCS09_RS04470 PF05321 Haemolysin expression modulating protein CsakCS09_RS04475 PF10757 Biofilm formation regulator YbaJ CsakCS09_RS04480 PF00873 AcrB/AcrD/AcrF family CsakCS09_RS04485 PF16576 Barrel-sandwich domain of CusB or HlyD membrane-fusion CsakCS09_RS04485 PF00529 HlyD membrane-fusion protein of T1SS CsakCS09_RS04495 PF12795 Mechanosensitive ion channel porin domain CsakCS09_RS04495 PF12794 Mechanosensitive ion channel inner membrane domain 1 CsakCS09_RS04495 PF00924 Mechanosensitive ion channel CsakCS09_RS04500 PF10689 Protein of unknown function (DUF2496) CsakCS09_RS04505 PF07445 Primosomal replication protein priC CsakCS09_RS04510 PF04304 Protein of unknown function (DUF454) CsakCS09_RS04515 PF00156 Phosphoribosyl transferase domain CsakCS09_RS04520 PF12170 DNA polymerase III tau subunit V interacting with alpha CsakCS09_RS04520 PF12168 DNA polymerase III subunits tau domain IV DnaB-binding CsakCS09_RS04520 PF12169 DNA polymerase III subunits gamma and tau domain III CsakCS09_RS04525 PF02575 YbaB/EbfC DNA-binding family CsakCS09_RS04535 PF02753 Pili assembly chaperone PapD, C-terminal domain CsakCS09_RS04535 PF00345 Pili and flagellar-assembly chaperone, PapD N-terminal domain CsakCS09_RS04540 PF13953 PapC C-terminal domain CsakCS09_RS04540 PF00577 Outer membrane usher protein CsakCS09_RS04540 PF13954 PapC N-terminal domain CsakCS09_RS04555 PF02132 RecR protein CsakCS09_RS04555 PF13662 Toprim domain CsakCS09_RS04560 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS04560 PF00183 Hsp90 protein CsakCS09_RS04565 PF05191 Adenylate kinase, active site lid CsakCS09_RS04570 PF13556 PucR C-terminal helix-turn-helix domain CsakCS09_RS04570 PF17853 GGDEF-like domain CsakCS09_RS04570 PF05651 Putative sugar diacid recognition CsakCS09_RS04575 PF02447 GntP family permease CsakCS09_RS04580 PF02595 Glycerate kinase family CsakCS09_RS04585 PF00762 Ferrochelatase CsakCS09_RS04590 PF00294 pfkB family carbohydrate kinase CsakCS09_RS04595 PF02254 TrkA-N domain CsakCS09_RS04595 PF00999 Sodium/hydrogen exchanger family CsakCS09_RS04605 PF02872 5'-nucleotidase, C-terminal domain CsakCS09_RS04605 PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase CsakCS09_RS04610 PF04073 Aminoacyl-tRNA editing domain CsakCS09_RS04615 PF01963 TraB family CsakCS09_RS04620 PF00403 Heavy-metal-associated domain CsakCS09_RS04625 PF13411 MerR HTH family regulatory protein CsakCS09_RS04640 PF01957 NfeD-like C-terminal, partner-binding CsakCS09_RS04650 PF00085 Thioredoxin CsakCS09_RS04655 PF00106 short chain dehydrogenase CsakCS09_RS04660 PF13472 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase family CsakCS09_RS04665 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS04675 PF00581 Rhodanese-like domain CsakCS09_RS04680 PF00291 Pyridoxal-phosphate dependent enzyme CsakCS09_RS04680 PF00571 CBS domain CsakCS09_RS04685 PF01053 Cys/Met metabolism PLP-dependent enzyme CsakCS09_RS04690 PF17769 Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase C-terminal domain CsakCS09_RS04690 PF02222 ATP-grasp domain CsakCS09_RS04695 PF00731 AIR carboxylase CsakCS09_RS04700 PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase CsakCS09_RS04705 PF00160 Cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/CLD CsakCS09_RS04710 PF09190 DALR domain CsakCS09_RS04710 PF01406 tRNA synthetases class I (C) catalytic domain CsakCS09_RS04715 PF00356 Bacterial regulatory proteins, lacI family CsakCS09_RS04715 PF00532 Periplasmic binding proteins and sugar binding domain of LacI family CsakCS09_RS04720 PF00358 phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 1 CsakCS09_RS04720 PF00367 phosphotransferase system, EIIB CsakCS09_RS04720 PF02378 Phosphotransferase system, EIIC CsakCS09_RS04730 PF02882 Tetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, NAD(P)-binding domain CsakCS09_RS04730 PF00763 Tetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, catalytic domain CsakCS09_RS04740 PF00589 Phage integrase family CsakCS09_RS04770 PF12961 Domain of unknown function (DUF3850) CsakCS09_RS04810 PF00959 Phage lysozyme CsakCS09_RS04815 PF03245 Bacteriophage Rz lysis protein CsakCS09_RS04850 PF04717 Type VI secretion system, phage-baseplate injector CsakCS09_RS04875 PF00015 Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signalling domain CsakCS09_RS04875 PF02203 Tar ligand binding domain homologue CsakCS09_RS04875 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS04880 PF04107 Glutamate-cysteine ligase family 2(GCS2) CsakCS09_RS04890 PF17837 4'-phosphopantetheinyl transferase N-terminal domain CsakCS09_RS04890 PF01648 4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily CsakCS09_RS04895 PF07715 TonB-dependent Receptor Plug Domain CsakCS09_RS04895 PF00593 TonB dependent receptor CsakCS09_RS04905 PF00756 Putative esterase CsakCS09_RS04905 PF11806 Domain of unknown function (DUF3327) CsakCS09_RS04910 PF03621 MbtH-like protein CsakCS09_RS04915 PF00501 AMP-binding enzyme CsakCS09_RS04915 PF00550 Phosphopantetheine attachment site CsakCS09_RS04915 PF00668 Condensation domain CsakCS09_RS04915 PF00975 Thioesterase domain CsakCS09_RS04920 PF03079 ARD/ARD' family CsakCS09_RS04930 PF00596 Class II Aldolase and Adducin N-terminal domain CsakCS09_RS04935 PF00155 Aminotransferase class I and II CsakCS09_RS04940 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS04940 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS04945 PF10417 C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin CsakCS09_RS04945 PF00578 AhpC/TSA family CsakCS09_RS04950 PF13192 Thioredoxin domain CsakCS09_RS04950 PF07992 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase CsakCS09_RS04955 PF00582 Universal stress protein family CsakCS09_RS04960 PF00107 Zinc-binding dehydrogenase CsakCS09_RS04960 PF08240 Alcohol dehydrogenase GroES-like domain CsakCS09_RS04960 PF13823 Alcohol dehydrogenase GroES-associated CsakCS09_RS04965 PF14760 Rnk N-terminus CsakCS09_RS04965 PF01272 Transcription elongation factor, GreA/GreB, C-term CsakCS09_RS04970 PF02447 GntP family permease CsakCS09_RS04975 PF01547 Bacterial extracellular solute-binding protein CsakCS09_RS04980 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS04985 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS04990 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS04990 PF08402 TOBE domain CsakCS09_RS04995 PF00128 Alpha amylase, catalytic domain CsakCS09_RS04995 PF16657 Maltogenic Amylase, C-terminal domain CsakCS09_RS05000 PF00128 Alpha amylase, catalytic domain CsakCS09_RS05000 PF16657 Maltogenic Amylase, C-terminal domain CsakCS09_RS05010 PF00445 Ribonuclease T2 family CsakCS09_RS05015 PF03606 C4-dicarboxylate anaerobic carrier CsakCS09_RS05020 PF07017 Antimicrobial peptide resistance and lipid A acylation protein PagP CsakCS09_RS05025 PF00313 'Cold-shock' DNA-binding domain CsakCS09_RS05030 PF02537 CrcB-like protein, Camphor Resistance (CrcB) CsakCS09_RS05035 PF00795 Carbon-nitrogen hydrolase CsakCS09_RS05040 PF02416 mttA/Hcf106 family CsakCS09_RS05045 PF16881 N-terminal domain of lipoyl synthase of Radical_SAM family CsakCS09_RS05045 PF04055 Radical SAM superfamily CsakCS09_RS05050 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS05050 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS05055 PF03099 Biotin/lipoate A/B protein ligase family CsakCS09_RS05060 PF04359 Protein of unknown function (DUF493) CsakCS09_RS05065 PF07943 Penicillin-binding protein 5, C-terminal domain CsakCS09_RS05065 PF00768 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase CsakCS09_RS05075 PF03330 Lytic transglycolase CsakCS09_RS05075 PF05036 Sporulation related domain CsakCS09_RS05080 PF01098 Cell cycle protein CsakCS09_RS05085 PF00905 Penicillin binding protein transpeptidase domain CsakCS09_RS05085 PF03717 Penicillin-binding Protein dimerisation domain CsakCS09_RS05090 PF02590 Predicted SPOUT methyltransferase CsakCS09_RS05100 PF01467 Cytidylyltransferase-like CsakCS09_RS05105 PF06144 DNA polymerase III, delta subunit CsakCS09_RS05105 PF14840 Processivity clamp loader gamma complex DNA pol III C-term CsakCS09_RS05110 PF04390 Lipopolysaccharide-assembly CsakCS09_RS05115 PF13603 Leucyl-tRNA synthetase, Domain 2 CsakCS09_RS05115 PF08264 Anticodon-binding domain of tRNA CsakCS09_RS05115 PF00133 tRNA synthetases class I (I, L, M and V) CsakCS09_RS05120 PF07295 Zinc-ribbon containing domain CsakCS09_RS05125 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS05130 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS05135 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS05140 PF00497 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3 CsakCS09_RS05145 PF00795 Carbon-nitrogen hydrolase CsakCS09_RS05150 PF03471 Transporter associated domain CsakCS09_RS05150 PF00571 CBS domain CsakCS09_RS05155 PF02130 Uncharacterized protein family UPF0054 CsakCS09_RS05160 PF02562 PhoH-like protein CsakCS09_RS05165 PF00919 Uncharacterized protein family UPF0004 CsakCS09_RS05165 PF04055 Radical SAM superfamily CsakCS09_RS05165 PF01938 TRAM domain CsakCS09_RS05170 PF01494 FAD binding domain CsakCS09_RS05205 PF13537 Glutamine amidotransferase domain CsakCS09_RS05205 PF00733 Asparagine synthase CsakCS09_RS05210 PF13344 Haloacid dehalogenase-like hydrolase CsakCS09_RS05215 PF00480 ROK family CsakCS09_RS05215 PF01047 MarR family CsakCS09_RS05220 PF01979 Amidohydrolase family CsakCS09_RS05225 PF01182 Glucosamine-6-phosphate isomerases/6-phosphogluconolactonase CsakCS09_RS05230 PF02378 Phosphotransferase system, EIIC CsakCS09_RS05230 PF00358 phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 1 CsakCS09_RS05230 PF00367 phosphotransferase system, EIIB CsakCS09_RS05240 PF00749 tRNA synthetases class I (E and Q), catalytic domain CsakCS09_RS05240 PF03950 tRNA synthetases class I (E and Q), anti-codon binding domain CsakCS09_RS05245 PF03573 outer membrane porin, OprD family CsakCS09_RS05250 PF03174 Chitobiase/beta-hexosaminidase C-terminal domain CsakCS09_RS05250 PF02838 Glycosyl hydrolase family 20, domain 2 CsakCS09_RS05250 PF00728 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain CsakCS09_RS05250 PF03173 Putative carbohydrate binding domain CsakCS09_RS05260 PF01475 Ferric uptake regulator family CsakCS09_RS05265 PF00258 Flavodoxin CsakCS09_RS05270 PF01402 Ribbon-helix-helix protein, copG family CsakCS09_RS05275 PF12697 Alpha/beta hydrolase family CsakCS09_RS05280 PF03925 SeqA protein C-terminal domain CsakCS09_RS05280 PF17206 SeqA protein N-terminal domain CsakCS09_RS05285 PF02878 Phosphoglucomutase/phosphomannomutase, alpha/beta/alpha domain I CsakCS09_RS05285 PF00408 Phosphoglucomutase/phosphomannomutase, C-terminal domain CsakCS09_RS05285 PF02879 Phosphoglucomutase/phosphomannomutase, alpha/beta/alpha domain II CsakCS09_RS05285 PF02880 Phosphoglucomutase/phosphomannomutase, alpha/beta/alpha domain III CsakCS09_RS05290 PF13520 Amino acid permease CsakCS09_RS05295 PF03711 Orn/Lys/Arg decarboxylase, C-terminal domain CsakCS09_RS05295 PF01276 Orn/Lys/Arg decarboxylase, major domain CsakCS09_RS05295 PF03709 Orn/Lys/Arg decarboxylase, N-terminal domain CsakCS09_RS05300 PF10940 Protein of unknown function (DUF2618) CsakCS09_RS05305 PF00486 Transcriptional regulatory protein, C terminal CsakCS09_RS05305 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS05310 PF02702 Osmosensitive K+ channel His kinase sensor domain CsakCS09_RS05310 PF00512 His Kinase A (phospho-acceptor) domain CsakCS09_RS05310 PF13492 GAF domain CsakCS09_RS05310 PF13493 Domain of unknown function (DUF4118) CsakCS09_RS05310 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS05315 PF02669 K+-transporting ATPase, c chain CsakCS09_RS05325 PF03814 Potassium-transporting ATPase A subunit CsakCS09_RS05330 PF09604 F subunit of K+-transporting ATPase (Potass_KdpF) CsakCS09_RS05335 PF10725 Protein of unknown function (DUF2517) CsakCS09_RS05340 PF08349 Protein of unknown function (DUF1722) CsakCS09_RS05345 PF03441 FAD binding domain of DNA photolyase CsakCS09_RS05345 PF00875 DNA photolyase CsakCS09_RS05350 PF01784 NIF3 (NGG1p interacting factor 3) CsakCS09_RS05355 PF02682 Carboxyltransferase domain, subdomain C and D CsakCS09_RS05360 PF02626 Carboxyltransferase domain, subdomain A and B CsakCS09_RS05365 PF03746 LamB/YcsF family CsakCS09_RS05390 PF06827 Zinc finger found in FPG and IleRS CsakCS09_RS05390 PF06831 Formamidopyrimidine-DNA glycosylase H2TH domain CsakCS09_RS05390 PF01149 Formamidopyrimidine-DNA glycosylase N-terminal domain CsakCS09_RS05395 PF00285 Citrate synthase, C-terminal domain CsakCS09_RS05400 PF01127 Succinate dehydrogenase/Fumarate reductase transmembrane subunit CsakCS09_RS05405 PF01127 Succinate dehydrogenase/Fumarate reductase transmembrane subunit CsakCS09_RS05410 PF02910 Fumarate reductase flavoprotein C-term CsakCS09_RS05410 PF00890 FAD binding domain CsakCS09_RS05415 PF13085 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain CsakCS09_RS05425 PF02779 Transketolase, pyrimidine binding domain CsakCS09_RS05425 PF00676 Dehydrogenase E1 component CsakCS09_RS05425 PF16870 2-oxoglutarate dehydrogenase C-terminal CsakCS09_RS05425 PF16078 2-oxoglutarate dehydrogenase N-terminus CsakCS09_RS05430 PF00364 Biotin-requiring enzyme CsakCS09_RS05430 PF00198 2-oxoacid dehydrogenases acyltransferase (catalytic domain) CsakCS09_RS05430 PF02817 e3 binding domain CsakCS09_RS05435 PF08442 ATP-grasp domain CsakCS09_RS05435 PF00549 CoA-ligase CsakCS09_RS05440 PF00549 CoA-ligase CsakCS09_RS05440 PF02629 CoA binding domain CsakCS09_RS05445 PF07702 UTRA domain CsakCS09_RS05445 PF00392 Bacterial regulatory proteins, gntR family CsakCS09_RS05450 PF00359 Phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 2 CsakCS09_RS05450 PF02302 PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIB subunit CsakCS09_RS05450 PF02378 Phosphotransferase system, EIIC CsakCS09_RS05455 PF01074 Glycosyl hydrolases family 38 N-terminal domain CsakCS09_RS05455 PF07748 Glycosyl hydrolases family 38 C-terminal domain CsakCS09_RS05455 PF09261 Alpha mannosidase middle domain CsakCS09_RS05460 PF01654 Cytochrome bd terminal oxidase subunit I CsakCS09_RS05465 PF02322 Cytochrome bd terminal oxidase subunit II CsakCS09_RS05470 PF08173 Membrane bound YbgT-like protein CsakCS09_RS05475 PF09600 Cyd operon protein YbgE (Cyd_oper_YbgE) CsakCS09_RS05480 PF03061 Thioesterase superfamily CsakCS09_RS05485 PF01618 MotA/TolQ/ExbB proton channel family CsakCS09_RS05490 PF02472 Biopolymer transport protein ExbD/TolR CsakCS09_RS05495 PF06519 TolA C-terminal CsakCS09_RS05500 PF07676 WD40-like Beta Propeller Repeat CsakCS09_RS05500 PF04052 TolB amino-terminal domain CsakCS09_RS05505 PF00691 OmpA family CsakCS09_RS05510 PF13174 Tetratricopeptide repeat CsakCS09_RS05510 PF16331 TolA binding protein trimerisation CsakCS09_RS05545 PF02445 Quinolinate synthetase A protein CsakCS09_RS05550 PF04973 Nicotinamide mononucleotide transporter CsakCS09_RS05555 PF01545 Cation efflux family CsakCS09_RS05565 PF00793 DAHP synthetase I family CsakCS09_RS05570 PF00300 Histidine phosphatase superfamily (branch 1) CsakCS09_RS05575 PF01263 Aldose 1-epimerase CsakCS09_RS05580 PF00288 GHMP kinases N terminal domain CsakCS09_RS05580 PF08544 GHMP kinases C terminal CsakCS09_RS05580 PF10509 Galactokinase galactose-binding signature CsakCS09_RS05585 PF02744 Galactose-1-phosphate uridyl transferase, C-terminal domain CsakCS09_RS05585 PF01087 Galactose-1-phosphate uridyl transferase, N-terminal domain CsakCS09_RS05590 PF16363 GDP-mannose 4,6 dehydratase CsakCS09_RS05595 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS05600 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS05600 PF03459 TOBE domain CsakCS09_RS05605 PF10766 Multidrug efflux pump-associated protein AcrZ CsakCS09_RS05615 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS05620 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS05620 PF03459 TOBE domain CsakCS09_RS05630 PF10282 Lactonase, 7-bladed beta-propeller CsakCS09_RS05635 PF01095 Pectinesterase CsakCS09_RS05640 PF01161 Phosphatidylethanolamine-binding protein CsakCS09_RS05650 PF00202 Aminotransferase class-III CsakCS09_RS05655 PF04055 Radical SAM superfamily CsakCS09_RS05655 PF06968 Biotin and Thiamin Synthesis associated domain CsakCS09_RS05660 PF00155 Aminotransferase class I and II CsakCS09_RS05665 PF08241 Methyltransferase domain CsakCS09_RS05675 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS05690 PF00271 Helicase conserved C-terminal domain CsakCS09_RS05690 PF12344 Ultra-violet resistance protein B CsakCS09_RS05690 PF04851 Type III restriction enzyme, res subunit CsakCS09_RS05690 PF02151 UvrB/uvrC motif CsakCS09_RS05690 PF17757 UvrB interaction domain CsakCS09_RS05700 PF01933 Uncharacterised protein family UPF0052 CsakCS09_RS05705 PF04055 Radical SAM superfamily CsakCS09_RS05705 PF06463 Molybdenum Cofactor Synthesis C CsakCS09_RS05710 PF00994 Probable molybdopterin binding domain CsakCS09_RS05715 PF01967 MoaC family CsakCS09_RS05720 PF02597 ThiS family CsakCS09_RS05725 PF02391 MoaE protein CsakCS09_RS05730 PF01027 Inhibitor of apoptosis-promoting Bax1 CsakCS09_RS05735 PF03706 Lysylphosphatidylglycerol synthase TM region CsakCS09_RS05740 PF13091 PLD-like domain CsakCS09_RS05745 PF03372 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family CsakCS09_RS05750 PF11076 Putative inner membrane protein YbhQ CsakCS09_RS05765 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS05770 PF16576 Barrel-sandwich domain of CusB or HlyD membrane-fusion CsakCS09_RS05775 PF09209 Tetracyclin repressor-like, C-terminal domain CsakCS09_RS05775 PF00440 Bacterial regulatory proteins, tetR family CsakCS09_RS05780 PF00271 Helicase conserved C-terminal domain CsakCS09_RS05780 PF00270 DEAD/DEAH box helicase CsakCS09_RS05785 PF00232 Glycosyl hydrolase family 1 CsakCS09_RS05790 PF00232 Glycosyl hydrolase family 1 CsakCS09_RS05795 PF02378 Phosphotransferase system, EIIC CsakCS09_RS05795 PF00367 phosphotransferase system, EIIB CsakCS09_RS05795 PF00358 phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 1 CsakCS09_RS05800 PF00874 PRD domain CsakCS09_RS05800 PF03123 CAT RNA binding domain CsakCS09_RS05805 PF13307 Helicase C-terminal domain CsakCS09_RS05805 PF06733 DEAD_2 CsakCS09_RS05805 PF00270 DEAD/DEAH box helicase CsakCS09_RS05820 PF00577 Outer membrane usher protein CsakCS09_RS05820 PF13954 PapC N-terminal domain CsakCS09_RS05820 PF13953 PapC C-terminal domain CsakCS09_RS05825 PF00345 Pili and flagellar-assembly chaperone, PapD N-terminal domain CsakCS09_RS05825 PF02753 Pili assembly chaperone PapD, C-terminal domain CsakCS09_RS05830 PF00419 Fimbrial protein CsakCS09_RS05835 PF02885 Glycosyl transferase family, helical bundle domain CsakCS09_RS05840 PF07338 Protein of unknown function (DUF1471) CsakCS09_RS05845 PF01258 Prokaryotic dksA/traR C4-type zinc finger CsakCS09_RS05850 PF01613 Flavin reductase like domain CsakCS09_RS05855 PF05971 RNA methyltransferase CsakCS09_RS05860 PF00924 Mechanosensitive ion channel CsakCS09_RS05865 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS05870 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS05875 PF00497 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3 CsakCS09_RS05885 PF00210 Ferritin-like domain CsakCS09_RS05890 PF00892 EamA-like transporter family CsakCS09_RS05895 PF13505 Outer membrane protein beta-barrel domain CsakCS09_RS05900 PF00884 Sulfatase CsakCS09_RS05910 PF02742 Iron dependent repressor, metal binding and dimerisation domain CsakCS09_RS05910 PF01325 Iron dependent repressor, N-terminal DNA binding domain CsakCS09_RS05920 PF16576 Barrel-sandwich domain of CusB or HlyD membrane-fusion CsakCS09_RS05920 PF00529 HlyD membrane-fusion protein of T1SS CsakCS09_RS05925 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS05930 PF02321 Outer membrane efflux protein CsakCS09_RS05935 PF03734 L,D-transpeptidase catalytic domain CsakCS09_RS05935 PF17969 L,D-transpeptidase C-terminal domain CsakCS09_RS05940 PF12848 ABC transporter CsakCS09_RS05940 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS05945 PF13018 Extended Signal Peptide of Type V secretion system CsakCS09_RS05945 PF05860 haemagglutination activity domain CsakCS09_RS05945 PF04829 Pre-toxin domain with VENN motif CsakCS09_RS05945 PF13332 Hemagglutinin repeat CsakCS09_RS05950 PF01055 Glycosyl hydrolases family 31 CsakCS09_RS05950 PF13802 Galactose mutarotase-like CsakCS09_RS05950 PF16338 Domain of unknown function (DUF4968) CsakCS09_RS05950 PF17137 Domain of unknown function (DUF5110) CsakCS09_RS05955 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS05960 PF00356 Bacterial regulatory proteins, lacI family CsakCS09_RS05965 PF00899 ThiF family CsakCS09_RS05970 PF03453 MoeA N-terminal region (domain I and II) CsakCS09_RS05970 PF03454 MoeA C-terminal region (domain IV) CsakCS09_RS05970 PF00994 Probable molybdopterin binding domain CsakCS09_RS05980 PF08352 Oligopeptide/dipeptide transporter, C-terminal region CsakCS09_RS05980 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS05985 PF00496 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle CsakCS09_RS05990 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS05995 PF12911 N-terminal TM domain of oligopeptide transport permease C CsakCS09_RS05995 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS06000 PF00919 Uncharacterized protein family UPF0004 CsakCS09_RS06000 PF18693 TRAM domain CsakCS09_RS06000 PF04055 Radical SAM superfamily CsakCS09_RS06005 PF07995 Glucose / Sorbosone dehydrogenase CsakCS09_RS06010 PF00043 Glutathione S-transferase, C-terminal domain CsakCS09_RS06010 PF13417 Glutathione S-transferase, N-terminal domain CsakCS09_RS06015 PF00768 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase CsakCS09_RS06015 PF07943 Penicillin-binding protein 5, C-terminal domain CsakCS09_RS06020 PF00455 DeoR C terminal sensor domain CsakCS09_RS06020 PF08220 DeoR-like helix-turn-helix domain CsakCS09_RS06025 PF01569 PAP2 superfamily CsakCS09_RS06035 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS06045 PF00669 Bacterial flagellin N-terminal helical region CsakCS09_RS06045 PF00700 Bacterial flagellin C-terminal helical region CsakCS09_RS06045 PF08884 Flagellin D3 domain CsakCS09_RS06050 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS06055 PF00440 Bacterial regulatory proteins, tetR family CsakCS09_RS06065 PF02080 TrkA-C domain CsakCS09_RS06065 PF06826 Predicted Permease Membrane Region CsakCS09_RS06070 PF11045 Putative inner membrane protein of Enterobacteriaceae CsakCS09_RS06075 PF00881 Nitroreductase family CsakCS09_RS06080 PF08443 RimK-like ATP-grasp domain CsakCS09_RS06080 PF18030 RimK PreATP-grasp domain CsakCS09_RS06085 PF10722 Putative bacterial sensory transduction regulator CsakCS09_RS06090 PF13416 Bacterial extracellular solute-binding protein CsakCS09_RS06095 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS06095 PF08402 TOBE domain CsakCS09_RS06100 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS06105 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS06110 PF10767 Protein of unknown function (DUF2593) CsakCS09_RS06115 PF05958 tRNA (Uracil-5-)-methyltransferase CsakCS09_RS06120 PF00497 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3 CsakCS09_RS06125 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS06130 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS06135 PF00497 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3 CsakCS09_RS06140 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS06145 PF12883 Protein of unknown function (DUF3828) CsakCS09_RS06150 PF01906 Putative heavy-metal-binding CsakCS09_RS06155 PF01510 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase CsakCS09_RS06160 PF01370 NAD dependent epimerase/dehydratase family CsakCS09_RS06165 PF01212 Beta-eliminating lyase CsakCS09_RS06170 PF00205 Thiamine pyrophosphate enzyme, central domain CsakCS09_RS06170 PF02775 Thiamine pyrophosphate enzyme, C-terminal TPP binding domain CsakCS09_RS06170 PF02776 Thiamine pyrophosphate enzyme, N-terminal TPP binding domain CsakCS09_RS06175 PF00175 Oxidoreductase NAD-binding domain CsakCS09_RS06175 PF00970 Oxidoreductase FAD-binding domain CsakCS09_RS06175 PF00111 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain CsakCS09_RS06180 PF03063 Prismane/CO dehydrogenase family CsakCS09_RS06185 PF03956 Lysine exporter LysO CsakCS09_RS06190 PF11398 Protein of unknown function (DUF2813) CsakCS09_RS06195 PF04393 Protein of unknown function (DUF535) CsakCS09_RS06200 PF16576 Barrel-sandwich domain of CusB or HlyD membrane-fusion CsakCS09_RS06205 PF02687 FtsX-like permease family CsakCS09_RS06205 PF12704 MacB-like periplasmic core domain CsakCS09_RS06205 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS06210 PF00313 'Cold-shock' DNA-binding domain CsakCS09_RS06215 PF02617 ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS CsakCS09_RS06220 PF00004 ATPase family associated with various cellular activities (AAA) CsakCS09_RS06220 PF17871 AAA lid domain CsakCS09_RS06220 PF10431 C-terminal, D2-small domain, of ClpB protein CsakCS09_RS06220 PF02861 Clp amino terminal domain, pathogenicity island component CsakCS09_RS06220 PF07724 AAA domain (Cdc48 subfamily) CsakCS09_RS06225 PF01176 Translation initiation factor 1A / IF-1 CsakCS09_RS06230 PF03588 Leucyl/phenylalanyl-tRNA protein transferase CsakCS09_RS06235 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS06235 PF00664 ABC transporter transmembrane region CsakCS09_RS06240 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS06240 PF00664 ABC transporter transmembrane region CsakCS09_RS06245 PF07992 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase CsakCS09_RS06260 PF01037 Lrp/AsnC ligand binding domain CsakCS09_RS06265 PF01580 FtsK/SpoIIIE family CsakCS09_RS06265 PF13491 4TM region of DNA translocase FtsK/SpoIIIE CsakCS09_RS06265 PF17854 FtsK alpha domain CsakCS09_RS06265 PF09397 Ftsk gamma domain CsakCS09_RS06270 PF03548 Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA CsakCS09_RS06275 PF16193 AAA C-terminal domain CsakCS09_RS06275 PF12002 MgsA AAA+ ATPase C terminal CsakCS09_RS06275 PF00004 ATPase family associated with various cellular activities (AAA) CsakCS09_RS06280 PF00587 tRNA synthetase class II core domain (G, H, P, S and T) CsakCS09_RS06280 PF02403 Seryl-tRNA synthetase N-terminal domain CsakCS09_RS06290 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS06295 PF04055 Radical SAM superfamily CsakCS09_RS06300 PF02901 Pyruvate formate lyase-like CsakCS09_RS06300 PF01228 Glycine radical CsakCS09_RS06305 PF01226 Formate/nitrite transporter CsakCS09_RS06310 PF02624 YcaO cyclodehydratase, ATP-ad Mg2+-binding CsakCS09_RS06310 PF18381 YcaO cyclodehydratase C-terminal domain CsakCS09_RS06315 PF04239 Protein of unknown function (DUF421) CsakCS09_RS06320 PF00266 Aminotransferase class-V CsakCS09_RS06325 PF00275 EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase) CsakCS09_RS06330 PF02224 Cytidylate kinase CsakCS09_RS06335 PF00575 S1 RNA binding domain CsakCS09_RS06340 PF00216 Bacterial DNA-binding protein CsakCS09_RS06345 PF03772 Competence protein CsakCS09_RS06345 PF00753 Metallo-beta-lactamase superfamily CsakCS09_RS06350 PF00664 ABC transporter transmembrane region CsakCS09_RS06350 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS06355 PF02606 Tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase CsakCS09_RS06360 PF06224 Winged helix DNA-binding domain CsakCS09_RS06365 PF03966 Trm112p-like protein CsakCS09_RS06370 PF02348 Cytidylyltransferase CsakCS09_RS06375 PF13404 AsnC-type helix-turn-helix domain CsakCS09_RS06375 PF01037 Lrp/AsnC ligand binding domain CsakCS09_RS06385 PF01636 Phosphotransferase enzyme family CsakCS09_RS06390 PF02698 DUF218 domain CsakCS09_RS06395 PF13847 Methyltransferase domain CsakCS09_RS06400 PF17193 MukF C-terminal domain CsakCS09_RS06400 PF17192 MukF middle domain CsakCS09_RS06400 PF03882 MukF winged-helix domain CsakCS09_RS06405 PF04288 MukE-like family CsakCS09_RS06410 PF04310 MukB N-terminal CsakCS09_RS06410 PF16330 MukB hinge domain CsakCS09_RS06415 PF03734 L,D-transpeptidase catalytic domain CsakCS09_RS06415 PF01471 Putative peptidoglycan binding domain CsakCS09_RS06420 PF05951 Bacterial protein of unknown function (DUF882) CsakCS09_RS06425 PF00753 Metallo-beta-lactamase superfamily CsakCS09_RS06430 PF00155 Aminotransferase class I and II CsakCS09_RS06435 PF00267 Gram-negative porin CsakCS09_RS06445 PF00152 tRNA synthetases class II (D, K and N) CsakCS09_RS06445 PF01336 OB-fold nucleic acid binding domain CsakCS09_RS06450 PF17767 Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) N-terminal domain CsakCS09_RS06450 PF04095 Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family CsakCS09_RS06455 PF11940 Domain of unknown function (DUF3458) Ig-like fold CsakCS09_RS06455 PF01433 Peptidase family M1 domain CsakCS09_RS06455 PF17432 Domain of unknown function (DUF3458_C) ARM repeats CsakCS09_RS06460 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS06465 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS06470 PF00296 Luciferase-like monooxygenase CsakCS09_RS06475 PF09084 NMT1/THI5 like CsakCS09_RS06480 PF03358 NADPH-dependent FMN reductase CsakCS09_RS06485 PF01180 Dihydroorotate dehydrogenase CsakCS09_RS06490 PF07126 Cell-division protein ZapC CsakCS09_RS06495 PF03476 MOSC N-terminal beta barrel domain CsakCS09_RS06495 PF03473 MOSC domain CsakCS09_RS06495 PF00111 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain CsakCS09_RS06500 PF10672 S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase CsakCS09_RS06500 PF01170 Putative RNA methylase family UPF0020 CsakCS09_RS06500 PF02926 THUMP domain CsakCS09_RS06505 PF16326 ABC transporter C-terminal domain CsakCS09_RS06505 PF12848 ABC transporter CsakCS09_RS06505 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS06510 PF04403 Paraquat-inducible protein A CsakCS09_RS06515 PF02470 MlaD protein CsakCS09_RS06520 PF03886 ABC-type transport auxiliary lipoprotein component CsakCS09_RS06525 PF04957 Ribosome modulation factor CsakCS09_RS06530 PF07977 FabA-like domain CsakCS09_RS06535 PF13654 AAA domain CsakCS09_RS06535 PF05362 Lon protease (S16) C-terminal proteolytic domain CsakCS09_RS06540 PF17414 MatP C-terminal ribbon-helix-helix domain CsakCS09_RS06540 PF06303 MatP N-terminal domain CsakCS09_RS06545 PF00691 OmpA family CsakCS09_RS06545 PF01389 OmpA-like transmembrane domain CsakCS09_RS06550 PF03846 Cell division inhibitor SulA CsakCS09_RS06555 PF04993 TfoX N-terminal domain CsakCS09_RS06555 PF04994 TfoX C-terminal domain CsakCS09_RS06560 PF12805 FUSC-like inner membrane protein yccS CsakCS09_RS06565 PF03733 Inner membrane component domain CsakCS09_RS06570 PF12462 DNA helicase IV / RNA helicase N terminal CsakCS09_RS06570 PF13361 UvrD-like helicase C-terminal domain CsakCS09_RS06570 PF00580 UvrD/REP helicase N-terminal domain CsakCS09_RS06575 PF02142 MGS-like domain CsakCS09_RS06580 PF13380 CoA binding domain CsakCS09_RS06585 PF08755 Hemimethylated DNA-binding protein YccV like CsakCS09_RS06590 PF17785 PUA-like domain CsakCS09_RS06590 PF10672 S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase CsakCS09_RS06595 PF00708 Acylphosphatase CsakCS09_RS06600 PF04358 DsrC like protein CsakCS09_RS06605 PF01027 Inhibitor of apoptosis-promoting Bax1 CsakCS09_RS06615 PF00496 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle CsakCS09_RS06640 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS06640 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS06645 PF00753 Metallo-beta-lactamase superfamily CsakCS09_RS06650 PF13993 YccJ-like protein CsakCS09_RS06655 PF03358 NADPH-dependent FMN reductase CsakCS09_RS06660 PF10685 Stress-induced bacterial acidophilic repeat motif CsakCS09_RS06665 PF00860 Permease family CsakCS09_RS06670 PF01613 Flavin reductase like domain CsakCS09_RS06675 PF00881 Nitroreductase family CsakCS09_RS06680 PF00561 alpha/beta hydrolase fold CsakCS09_RS06685 PF01042 Endoribonuclease L-PSP CsakCS09_RS06690 PF00857 Isochorismatase family CsakCS09_RS06695 PF00296 Luciferase-like monooxygenase CsakCS09_RS06700 PF00440 Bacterial regulatory proteins, tetR family CsakCS09_RS06700 PF08362 YcdC-like protein, C-terminal region CsakCS09_RS06715 PF18327 Proline utilization A proline dehydrogenase N-terminal domain CsakCS09_RS06715 PF14850 DNA-binding domain of Proline dehydrogenase CsakCS09_RS06715 PF01619 Proline dehydrogenase CsakCS09_RS06715 PF00171 Aldehyde dehydrogenase family CsakCS09_RS06725 PF00474 Sodium:solute symporter family CsakCS09_RS06735 PF07670 Nucleoside recognition CsakCS09_RS06735 PF07662 Na+ dependent nucleoside transporter C-terminus CsakCS09_RS06735 PF01773 Na+ dependent nucleoside transporter N-terminus CsakCS09_RS06740 PF03239 Iron permease FTR1 family CsakCS09_RS06745 PF13473 Cupredoxin-like domain CsakCS09_RS06745 PF09375 Imelysin CsakCS09_RS06750 PF04261 Dyp-type peroxidase family CsakCS09_RS06755 PF02562 PhoH-like protein CsakCS09_RS06765 PF00384 Molybdopterin oxidoreductase CsakCS09_RS06785 PF00345 Pili and flagellar-assembly chaperone, PapD N-terminal domain CsakCS09_RS06785 PF02753 Pili assembly chaperone PapD, C-terminal domain CsakCS09_RS06790 PF00577 Outer membrane usher protein CsakCS09_RS06790 PF13954 PapC N-terminal domain CsakCS09_RS06790 PF13953 PapC C-terminal domain CsakCS09_RS06795 PF00419 Fimbrial protein CsakCS09_RS06800 PF02826 D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD binding domain CsakCS09_RS06805 PF02811 PHP domain CsakCS09_RS06810 PF02613 Nitrate reductase delta subunit CsakCS09_RS06815 PF06496 Protein of unknown function (DUF1097) CsakCS09_RS06825 PF01661 Macro domain CsakCS09_RS06830 PF13091 PLD-like domain CsakCS09_RS06835 PF01757 Acyltransferase family CsakCS09_RS06845 PF04349 Periplasmic glucan biosynthesis protein, MdoG CsakCS09_RS06850 PF00535 Glycosyl transferase family 2 CsakCS09_RS06855 PF07119 Protein of unknown function (DUF1375) CsakCS09_RS06860 PF13984 MsyB protein CsakCS09_RS06865 PF03279 Bacterial lipid A biosynthesis acyltransferase CsakCS09_RS06875 PF12368 Rhodanase C-terminal CsakCS09_RS06875 PF00581 Rhodanese-like domain CsakCS09_RS06875 PF17773 UPF0176 acylphosphatase like domain CsakCS09_RS06880 PF04264 YceI-like domain CsakCS09_RS06885 PF01292 Prokaryotic cytochrome b561 CsakCS09_RS06890 PF01266 FAD dependent oxidoreductase CsakCS09_RS06895 PF13991 BssS protein family CsakCS09_RS06900 PF06183 DinI-like family CsakCS09_RS06905 PF01979 Amidohydrolase family CsakCS09_RS06910 PF07273 Protein of unknown function (DUF1439) CsakCS09_RS06915 PF04399 Glutaredoxin 2, C terminal domain CsakCS09_RS06915 PF13417 Glutathione S-transferase, N-terminal domain CsakCS09_RS06920 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS06930 PF13302 Acetyltransferase (GNAT) domain CsakCS09_RS06935 PF04337 Protein of unknown function, DUF480 CsakCS09_RS06940 PF01408 Oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold CsakCS09_RS06945 PF03023 Lipid II flippase MurJ CsakCS09_RS06950 PF05130 FlgN protein CsakCS09_RS06955 PF04316 Anti-sigma-28 factor, FlgM CsakCS09_RS06960 PF13144 Chaperone for flagella basal body P-ring formation CsakCS09_RS06965 PF00460 Flagella basal body rod protein CsakCS09_RS06970 PF06429 Flagellar basal body rod FlgEFG protein C-terminal CsakCS09_RS06970 PF00460 Flagella basal body rod protein CsakCS09_RS06975 PF13861 FlgD Tudor-like domain CsakCS09_RS06975 PF13860 FlgD Ig-like domain CsakCS09_RS06975 PF03963 Flagellar hook capping protein - N-terminal region CsakCS09_RS06980 PF00460 Flagella basal body rod protein CsakCS09_RS06980 PF06429 Flagellar basal body rod FlgEFG protein C-terminal CsakCS09_RS06980 PF07559 Flagellar basal body protein FlaE CsakCS09_RS06985 PF00460 Flagella basal body rod protein CsakCS09_RS06985 PF06429 Flagellar basal body rod FlgEFG protein C-terminal CsakCS09_RS06990 PF00460 Flagella basal body rod protein CsakCS09_RS06990 PF06429 Flagellar basal body rod FlgEFG protein C-terminal CsakCS09_RS06995 PF02107 Flagellar L-ring protein CsakCS09_RS07000 PF02119 Flagellar P-ring protein CsakCS09_RS07005 PF10135 Rod binding protein CsakCS09_RS07005 PF01832 Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase CsakCS09_RS07010 PF00460 Flagella basal body rod protein CsakCS09_RS07010 PF06429 Flagellar basal body rod FlgEFG protein C-terminal CsakCS09_RS07015 PF00669 Bacterial flagellin N-terminal helical region CsakCS09_RS07020 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS07025 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS07025 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS07030 PF00575 S1 RNA binding domain CsakCS09_RS07030 PF10150 Ribonuclease E/G family CsakCS09_RS07030 PF12111 Polyribonucleotide phosphorylase C terminal CsakCS09_RS07040 PF01479 S4 domain CsakCS09_RS07040 PF00849 RNA pseudouridylate synthase CsakCS09_RS07045 PF11254 Protein of unknown function (DUF3053) CsakCS09_RS07050 PF02545 Maf-like protein CsakCS09_RS07055 PF02620 Large ribosomal RNA subunit accumulation protein YceD CsakCS09_RS07060 PF01783 Ribosomal L32p protein family CsakCS09_RS07065 PF02504 Fatty acid synthesis protein CsakCS09_RS07070 PF08541 3-Oxoacyl-[acyl-carrier-protein (ACP)] synthase III C terminal CsakCS09_RS07070 PF08545 3-Oxoacyl-[acyl-carrier-protein (ACP)] synthase III CsakCS09_RS07075 PF00698 Acyl transferase domain CsakCS09_RS07085 PF00550 Phosphopantetheine attachment site CsakCS09_RS07090 PF02801 Beta-ketoacyl synthase, C-terminal domain CsakCS09_RS07090 PF00109 Beta-ketoacyl synthase, N-terminal domain CsakCS09_RS07095 PF01063 Amino-transferase class IV CsakCS09_RS07100 PF02618 YceG-like family CsakCS09_RS07105 PF02223 Thymidylate kinase CsakCS09_RS07110 PF09115 DNA polymerase III, delta subunit, C terminal CsakCS09_RS07115 PF01026 TatD related DNase CsakCS09_RS07120 PF02378 Phosphotransferase system, EIIC CsakCS09_RS07120 PF00367 phosphotransferase system, EIIB CsakCS09_RS07125 PF07715 TonB-dependent Receptor Plug Domain CsakCS09_RS07125 PF00593 TonB dependent receptor CsakCS09_RS07130 PF01230 HIT domain CsakCS09_RS07135 PF07233 Protein of unknown function (DUF1425) CsakCS09_RS07140 PF13036 Peptidoglycan-synthase activator LpoB CsakCS09_RS07145 PF01636 Phosphotransferase enzyme family CsakCS09_RS07150 PF00933 Glycosyl hydrolase family 3 N terminal domain CsakCS09_RS07155 PF05728 Uncharacterised protein family (UPF0227) CsakCS09_RS07160 PF07992 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase CsakCS09_RS07165 PF05433 Glycine zipper 2TM domain CsakCS09_RS07170 PF00440 Bacterial regulatory proteins, tetR family CsakCS09_RS07175 PF07338 Protein of unknown function (DUF1471) CsakCS09_RS07180 PF03734 L,D-transpeptidase catalytic domain CsakCS09_RS07180 PF17969 L,D-transpeptidase C-terminal domain CsakCS09_RS07180 PF01476 LysM domain CsakCS09_RS07185 PF17757 UvrB interaction domain CsakCS09_RS07185 PF03461 TRCF domain CsakCS09_RS07185 PF00271 Helicase conserved C-terminal domain CsakCS09_RS07185 PF00270 DEAD/DEAH box helicase CsakCS09_RS07185 PF02559 CarD-like/TRCF domain CsakCS09_RS07190 PF02687 FtsX-like permease family CsakCS09_RS07190 PF12704 MacB-like periplasmic core domain CsakCS09_RS07195 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS07200 PF02687 FtsX-like permease family CsakCS09_RS07200 PF12704 MacB-like periplasmic core domain CsakCS09_RS07205 PF00480 ROK family CsakCS09_RS07210 PF02146 Sir2 family CsakCS09_RS07215 PF13416 Bacterial extracellular solute-binding protein CsakCS09_RS07220 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS07225 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS07230 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS07230 PF08402 TOBE domain CsakCS09_RS07240 PF07687 Peptidase dimerisation domain CsakCS09_RS07240 PF01546 Peptidase family M20/M25/M40 CsakCS09_RS07245 PF08007 Cupin superfamily protein CsakCS09_RS07250 PF08918 PhoQ Sensor CsakCS09_RS07250 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS07255 PF00486 Transcriptional regulatory protein, C terminal CsakCS09_RS07255 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS07260 PF08328 Adenylosuccinate lyase C-terminal CsakCS09_RS07260 PF00206 Lyase CsakCS09_RS07265 PF04356 Protein of unknown function (DUF489) CsakCS09_RS07275 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS07275 PF00015 Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signalling domain CsakCS09_RS07280 PF00293 NUDIX domain CsakCS09_RS07285 PF00849 RNA pseudouridylate synthase CsakCS09_RS07290 PF00180 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase CsakCS09_RS07310 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS07310 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS07315 PF07859 alpha/beta hydrolase fold CsakCS09_RS07330 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS07330 PF02203 Tar ligand binding domain homologue CsakCS09_RS07330 PF00015 Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signalling domain CsakCS09_RS07340 PF02677 Epoxyqueuosine reductase QueH CsakCS09_RS07345 PF00313 'Cold-shock' DNA-binding domain CsakCS09_RS07360 PF01584 CheW-like domain CsakCS09_RS07360 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS07370 PF04393 Protein of unknown function (DUF535) CsakCS09_RS07385 PF04343 Protein of unknown function, DUF488 CsakCS09_RS07390 PF06418 CTP synthase N-terminus CsakCS09_RS07390 PF00117 Glutamine amidotransferase class-I CsakCS09_RS07395 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS07400 PF04284 Protein of unknown function (DUF441) CsakCS09_RS07405 PF04073 Aminoacyl-tRNA editing domain CsakCS09_RS07410 PF10685 Stress-induced bacterial acidophilic repeat motif CsakCS09_RS07415 PF00563 EAL domain CsakCS09_RS07415 PF12792 CSS motif domain associated with EAL CsakCS09_RS07425 PF04285 Protein of unknown function (DUF444) CsakCS09_RS07430 PF08298 PrkA AAA domain CsakCS09_RS07430 PF06798 PrkA serine protein kinase C-terminal domain CsakCS09_RS07435 PF06629 MltA-interacting protein MipA CsakCS09_RS07440 PF01263 Aldose 1-epimerase CsakCS09_RS07445 PF00044 Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase, NAD binding domain CsakCS09_RS07445 PF02800 Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase, C-terminal domain CsakCS09_RS07450 PF01641 SelR domain CsakCS09_RS07455 PF07023 Protein of unknown function (DUF1315) CsakCS09_RS07460 PF00857 Isochorismatase family CsakCS09_RS07465 PF00710 Asparaginase, N-terminal CsakCS09_RS07465 PF17763 Glutaminase/Asparaginase C-terminal domain CsakCS09_RS07470 PF01343 Peptidase family S49 CsakCS09_RS07475 PF00881 Nitroreductase family CsakCS09_RS07480 PF00586 AIR synthase related protein, N-terminal domain CsakCS09_RS07480 PF02769 AIR synthase related protein, C-terminal domain CsakCS09_RS07485 PF01131 DNA topoisomerase CsakCS09_RS07485 PF01751 Toprim domain CsakCS09_RS07490 PF07383 Protein of unknown function (DUF1496) CsakCS09_RS07495 PF00293 NUDIX domain CsakCS09_RS07500 PF03372 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family CsakCS09_RS07505 PF00202 Aminotransferase class-III CsakCS09_RS07510 PF04958 Arginine N-succinyltransferase beta subunit CsakCS09_RS07515 PF00171 Aldehyde dehydrogenase family CsakCS09_RS07520 PF04996 Succinylarginine dihydrolase CsakCS09_RS07525 PF04952 Succinylglutamate desuccinylase / Aspartoacylase family CsakCS09_RS07530 PF07813 LTXXQ motif family protein CsakCS09_RS07535 PF05962 HutD CsakCS09_RS07545 PF00892 EamA-like transporter family CsakCS09_RS07550 PF02540 NAD synthase CsakCS09_RS07555 PF04355 SmpA / OmlA family CsakCS09_RS07560 PF00199 Catalase CsakCS09_RS07560 PF06628 Catalase-related immune-responsive CsakCS09_RS07560 PF18011 C-terminal domain found in long catalases CsakCS09_RS07565 PF10729 Cell division activator CedA CsakCS09_RS07575 PF05015 RelE-like toxin of type II toxin-antitoxin system HigB CsakCS09_RS07580 PF01381 Helix-turn-helix CsakCS09_RS07585 PF00375 Sodium:dicarboxylate symporter family CsakCS09_RS07590 PF04307 LexA-binding, inner membrane-associated putative hydrolase CsakCS09_RS07600 PF13419 Haloacid dehalogenase-like hydrolase CsakCS09_RS07605 PF14002 YniB-like protein CsakCS09_RS07610 PF03881 Fructosamine kinase CsakCS09_RS07615 PF11080 Endoribonuclease GhoS CsakCS09_RS07620 PF00294 pfkB family carbohydrate kinase CsakCS09_RS07625 PF04338 Protein of unknown function, DUF481 CsakCS09_RS07635 PF00083 Sugar (and other) transporter CsakCS09_RS07635 PF08946 Osmosensory transporter coiled coil CsakCS09_RS07645 PF03974 Ecotin CsakCS09_RS07655 PF07859 alpha/beta hydrolase fold CsakCS09_RS07660 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS07660 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS07665 PF00583 Acetyltransferase (GNAT) family CsakCS09_RS07670 PF00587 tRNA synthetase class II core domain (G, H, P, S and T) CsakCS09_RS07670 PF02824 TGS domain CsakCS09_RS07670 PF07973 Threonyl and Alanyl tRNA synthetase second additional domain CsakCS09_RS07670 PF03129 Anticodon binding domain CsakCS09_RS07675 PF05198 Translation initiation factor IF-3, N-terminal domain CsakCS09_RS07675 PF00707 Translation initiation factor IF-3, C-terminal domain CsakCS09_RS07680 PF01632 Ribosomal protein L35 CsakCS09_RS07685 PF00453 Ribosomal protein L20 CsakCS09_RS07690 PF01409 tRNA synthetases class II core domain (F) CsakCS09_RS07690 PF02912 Aminoacyl tRNA synthetase class II, N-terminal domain CsakCS09_RS07695 PF01588 Putative tRNA binding domain CsakCS09_RS07695 PF03147 Ferredoxin-fold anticodon binding domain CsakCS09_RS07695 PF17759 Phenylalanyl tRNA synthetase beta chain CLM domain CsakCS09_RS07695 PF03483 B3/4 domain CsakCS09_RS07695 PF03484 tRNA synthetase B5 domain CsakCS09_RS07700 PF00216 Bacterial DNA-binding protein CsakCS09_RS07705 PF01032 FecCD transport family CsakCS09_RS07710 PF00255 Glutathione peroxidase CsakCS09_RS07715 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS07720 PF00877 NlpC/P60 family CsakCS09_RS07725 PF02378 Phosphotransferase system, EIIC CsakCS09_RS07730 PF11975 Family 4 glycosyl hydrolase C-terminal domain CsakCS09_RS07730 PF02056 Family 4 glycosyl hydrolase CsakCS09_RS07735 PF00356 Bacterial regulatory proteins, lacI family CsakCS09_RS07740 PF00563 EAL domain CsakCS09_RS07745 PF02696 Uncharacterized ACR, YdiU/UPF0061 family CsakCS09_RS07750 PF00793 DAHP synthetase I family CsakCS09_RS07755 PF03618 Kinase/pyrophosphorylase CsakCS09_RS07760 PF01326 Pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate binding domain CsakCS09_RS07760 PF02896 PEP-utilising enzyme, TIM barrel domain CsakCS09_RS07760 PF00391 PEP-utilising enzyme, mobile domain CsakCS09_RS07770 PF01915 Glycosyl hydrolase family 3 C-terminal domain CsakCS09_RS07770 PF00933 Glycosyl hydrolase family 3 N terminal domain CsakCS09_RS07770 PF14310 Fibronectin type III-like domain CsakCS09_RS07780 PF01594 AI-2E family transporter CsakCS09_RS07785 PF13183 4Fe-4S dicluster domain CsakCS09_RS07785 PF01565 FAD binding domain CsakCS09_RS07785 PF02913 FAD linked oxidases, C-terminal domain CsakCS09_RS07790 PF03061 Thioesterase superfamily CsakCS09_RS07795 PF00328 Histidine phosphatase superfamily (branch 2) CsakCS09_RS07800 PF01521 Iron-sulphur cluster biosynthesis CsakCS09_RS07805 PF01458 Uncharacterized protein family (UPF0051) CsakCS09_RS07810 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS07815 PF01458 Uncharacterized protein family (UPF0051) CsakCS09_RS07820 PF00266 Aminotransferase class-V CsakCS09_RS07825 PF02657 Fe-S metabolism associated domain CsakCS09_RS07830 PF03734 L,D-transpeptidase catalytic domain CsakCS09_RS07830 PF17969 L,D-transpeptidase C-terminal domain CsakCS09_RS07830 PF01476 LysM domain CsakCS09_RS07835 PF04728 Lipoprotein leucine-zipper CsakCS09_RS07840 PF02887 Pyruvate kinase, alpha/beta domain CsakCS09_RS07840 PF00224 Pyruvate kinase, barrel domain CsakCS09_RS07845 PF01075 Glycosyltransferase family 9 (heptosyltransferase) CsakCS09_RS07850 PF16168 Adhesin of bacterial autotransporter system, probable stalk CsakCS09_RS07850 PF13018 Extended Signal Peptide of Type V secretion system CsakCS09_RS07850 PF16168 Adhesin of bacterial autotransporter system, probable stalk CsakCS09_RS07850 PF13018 Extended Signal Peptide of Type V secretion system CsakCS09_RS07850 PF03797 Autotransporter beta-domain CsakCS09_RS07850 PF03797 Autotransporter beta-domain CsakCS09_RS07860 PF01266 FAD dependent oxidoreductase CsakCS09_RS07865 PF00171 Aldehyde dehydrogenase family CsakCS09_RS07870 PF07883 Cupin domain CsakCS09_RS07870 PF01381 Helix-turn-helix CsakCS09_RS07875 PF07722 Peptidase C26 CsakCS09_RS07880 PF00120 Glutamine synthetase, catalytic domain CsakCS09_RS07885 PF00324 Amino acid permease CsakCS09_RS07890 PF00158 Sigma-54 interaction domain CsakCS09_RS07890 PF01590 GAF domain CsakCS09_RS07895 PF00586 AIR synthase related protein, N-terminal domain CsakCS09_RS07895 PF02769 AIR synthase related protein, C-terminal domain CsakCS09_RS07900 PF01924 Hydrogenase formation hypA family CsakCS09_RS07905 PF01455 HupF/HypC family CsakCS09_RS07910 PF02492 CobW/HypB/UreG, nucleotide-binding domain CsakCS09_RS07915 PF01155 Hydrogenase/urease nickel incorporation, metallochaperone, hypA CsakCS09_RS07920 PF11046 Transcriptional repressor of hyc and hyp operons CsakCS09_RS07925 PF13247 4Fe-4S dicluster domain CsakCS09_RS07930 PF00361 Proton-conducting membrane transporter CsakCS09_RS07935 PF00146 NADH dehydrogenase CsakCS09_RS07940 PF00329 Respiratory-chain NADH dehydrogenase, 30 Kd subunit CsakCS09_RS07940 PF00374 Nickel-dependent hydrogenase CsakCS09_RS07940 PF00346 Respiratory-chain NADH dehydrogenase, 49 Kd subunit CsakCS09_RS07945 PF12838 4Fe-4S dicluster domain CsakCS09_RS07950 PF01058 NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 Kd subunit CsakCS09_RS07955 PF07450 Formate hydrogenlyase maturation protein HycH CsakCS09_RS07960 PF01750 Hydrogenase maturation protease CsakCS09_RS07965 PF08971 Glycogen synthesis protein CsakCS09_RS07975 PF13247 4Fe-4S dicluster domain CsakCS09_RS07975 PF12800 4Fe-4S binding domain CsakCS09_RS07980 PF00384 Molybdopterin oxidoreductase CsakCS09_RS07980 PF01568 Molydopterin dinucleotide binding domain CsakCS09_RS07980 PF04879 Molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 domain CsakCS09_RS07985 PF01300 Telomere recombination CsakCS09_RS07985 PF07503 HypF finger CsakCS09_RS07985 PF00708 Acylphosphatase CsakCS09_RS07985 PF17788 HypF Kae1-like domain CsakCS09_RS07990 PF03824 High-affinity nickel-transport protein CsakCS09_RS08000 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS08000 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS08005 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS08025 PF00732 GMC oxidoreductase CsakCS09_RS08025 PF05199 GMC oxidoreductase CsakCS09_RS08030 PF00171 Aldehyde dehydrogenase family CsakCS09_RS08035 PF00440 Bacterial regulatory proteins, tetR family CsakCS09_RS08035 PF13977 BetI-type transcriptional repressor, C-terminal CsakCS09_RS08040 PF02028 BCCT, betaine/carnitine/choline family transporter CsakCS09_RS08060 PF05943 Type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108, tail sheath CsakCS09_RS08145 PF01554 MatE CsakCS09_RS08150 PF00677 Lumazine binding domain CsakCS09_RS08155 PF00356 Bacterial regulatory proteins, lacI family CsakCS09_RS08160 PF00232 Glycosyl hydrolase family 1 CsakCS09_RS08165 PF02378 Phosphotransferase system, EIIC CsakCS09_RS08175 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS08180 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS08180 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS08185 PF00356 Bacterial regulatory proteins, lacI family CsakCS09_RS08195 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS08200 PF00877 NlpC/P60 family CsakCS09_RS08205 PF00462 Glutaredoxin CsakCS09_RS08210 PF00929 Exonuclease CsakCS09_RS08215 PF00903 Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily CsakCS09_RS08220 PF00724 NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family CsakCS09_RS08225 PF00440 Bacterial regulatory proteins, tetR family CsakCS09_RS08225 PF16925 Tetracyclin repressor-like, C-terminal domain CsakCS09_RS08230 PF00884 Sulfatase CsakCS09_RS08230 PF08019 Phosphoethanolamine transferase EptA/EptB CsakCS09_RS08235 PF06945 Protein of unknown function (DUF1289) CsakCS09_RS08240 PF00248 Aldo/keto reductase family CsakCS09_RS08245 PF00080 Copper/zinc superoxide dismutase (SODC) CsakCS09_RS08250 PF04632 Fusaric acid resistance protein family CsakCS09_RS08255 PF16576 Barrel-sandwich domain of CusB or HlyD membrane-fusion CsakCS09_RS08255 PF00529 HlyD membrane-fusion protein of T1SS CsakCS09_RS08260 PF07869 Protein of unknown function (DUF1656) CsakCS09_RS08265 PF01047 MarR family CsakCS09_RS08270 PF05433 Glycine zipper 2TM domain CsakCS09_RS08275 PF03702 Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase CsakCS09_RS08280 PF09864 Membrane-bound lysozyme-inhibitor of c-type lysozyme CsakCS09_RS08285 PF01243 Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase CsakCS09_RS08285 PF10590 Pyridoxine 5'-phosphate oxidase C-terminal dimerisation region CsakCS09_RS08290 PF01479 S4 domain CsakCS09_RS08290 PF00579 tRNA synthetases class I (W and Y) CsakCS09_RS08295 PF08543 Phosphomethylpyrimidine kinase CsakCS09_RS08300 PF02798 Glutathione S-transferase, N-terminal domain CsakCS09_RS08300 PF00043 Glutathione S-transferase, C-terminal domain CsakCS09_RS08305 PF00854 POT family CsakCS09_RS08310 PF00730 HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein CsakCS09_RS08310 PF00633 Helix-hairpin-helix motif CsakCS09_RS08310 PF10576 Iron-sulfur binding domain of endonuclease III CsakCS09_RS08315 PF02508 Rnf-Nqr subunit, membrane protein CsakCS09_RS08320 PF04205 FMN-binding domain CsakCS09_RS08325 PF03116 NQR2, RnfD, RnfE family CsakCS09_RS08330 PF01512 Respiratory-chain NADH dehydrogenase 51 Kd subunit CsakCS09_RS08330 PF13237 4Fe-4S dicluster domain CsakCS09_RS08330 PF13375 RnfC Barrel sandwich hybrid domain CsakCS09_RS08330 PF10531 SLBB domain CsakCS09_RS08335 PF04060 Putative Fe-S cluster CsakCS09_RS08340 PF02508 Rnf-Nqr subunit, membrane protein CsakCS09_RS08345 PF10754 Protein of unknown function (DUF2569) CsakCS09_RS08350 PF05321 Haemolysin expression modulating protein CsakCS09_RS08355 PF01408 Oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold CsakCS09_RS08355 PF02894 Oxidoreductase family, C-terminal alpha/beta domain CsakCS09_RS08360 PF13593 SBF-like CPA transporter family (DUF4137) CsakCS09_RS08365 PF00962 Adenosine/AMP deaminase CsakCS09_RS08370 PF00155 Aminotransferase class I and II CsakCS09_RS08375 PF00367 phosphotransferase system, EIIB CsakCS09_RS08375 PF02378 Phosphotransferase system, EIIC CsakCS09_RS08380 PF00532 Periplasmic binding proteins and sugar binding domain of LacI family CsakCS09_RS08380 PF00356 Bacterial regulatory proteins, lacI family CsakCS09_RS08385 PF00419 Fimbrial protein CsakCS09_RS08390 PF02753 Pili assembly chaperone PapD, C-terminal domain CsakCS09_RS08390 PF00345 Pili and flagellar-assembly chaperone, PapD N-terminal domain CsakCS09_RS08395 PF13953 PapC C-terminal domain CsakCS09_RS08395 PF13954 PapC N-terminal domain CsakCS09_RS08395 PF00577 Outer membrane usher protein CsakCS09_RS08420 PF06097 Bacterial protein of unknown function (DUF945) CsakCS09_RS08425 PF01238 Phosphomannose isomerase type I CsakCS09_RS08430 PF05681 Fumarate hydratase (Fumerase) CsakCS09_RS08430 PF05683 Fumarase C-terminus CsakCS09_RS08435 PF00206 Lyase CsakCS09_RS08435 PF10415 Fumarase C C-terminus CsakCS09_RS08440 PF05472 DNA replication terminus site-binding protein (Ter protein) CsakCS09_RS08445 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS08445 PF00512 His Kinase A (phospho-acceptor) domain CsakCS09_RS08445 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS08450 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS08450 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS08460 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS08460 PF00486 Transcriptional regulatory protein, C terminal CsakCS09_RS08470 PF13520 Amino acid permease CsakCS09_RS08475 PF07338 Protein of unknown function (DUF1471) CsakCS09_RS08480 PF12769 4TM region of pyridine nucleotide transhydrogenase, mitoch CsakCS09_RS08480 PF01262 Alanine dehydrogenase/PNT, C-terminal domain CsakCS09_RS08480 PF05222 Alanine dehydrogenase/PNT, N-terminal domain CsakCS09_RS08485 PF02233 NAD(P) transhydrogenase beta subunit CsakCS09_RS08490 PF00582 Universal stress protein family CsakCS09_RS08495 PF00325 Bacterial regulatory proteins, crp family CsakCS09_RS08495 PF00027 Cyclic nucleotide-binding domain CsakCS09_RS08500 PF01035 6-O-methylguanine DNA methyltransferase, DNA binding domain CsakCS09_RS08500 PF02870 6-O-methylguanine DNA methyltransferase, ribonuclease-like domain CsakCS09_RS08505 PF01713 Smr domain CsakCS09_RS08520 PF00296 Luciferase-like monooxygenase CsakCS09_RS08525 PF08352 Oligopeptide/dipeptide transporter, C-terminal region CsakCS09_RS08525 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS08530 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS08530 PF12911 N-terminal TM domain of oligopeptide transport permease C CsakCS09_RS08535 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS08540 PF00496 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle CsakCS09_RS08550 PF06964 Alpha-L-arabinofuranosidase C-terminal domain CsakCS09_RS08560 PF00893 Small Multidrug Resistance protein CsakCS09_RS08575 PF02322 Cytochrome bd terminal oxidase subunit II CsakCS09_RS08580 PF01654 Cytochrome bd terminal oxidase subunit I CsakCS09_RS08585 PF00392 Bacterial regulatory proteins, gntR family CsakCS09_RS08585 PF00155 Aminotransferase class I and II CsakCS09_RS08590 PF13416 Bacterial extracellular solute-binding protein CsakCS09_RS08595 PF08402 TOBE domain CsakCS09_RS08595 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS08600 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS08605 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS08610 PF00171 Aldehyde dehydrogenase family CsakCS09_RS08620 PF05598 Transposase domain (DUF772) CsakCS09_RS08620 PF01609 Transposase DDE domain CsakCS09_RS08655 PF13442 Cytochrome C oxidase, cbb3-type, subunit III CsakCS09_RS08655 PF00034 Cytochrome c CsakCS09_RS08660 PF01568 Molydopterin dinucleotide binding domain CsakCS09_RS08660 PF00384 Molybdopterin oxidoreductase CsakCS09_RS08660 PF04879 Molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 domain CsakCS09_RS08665 PF13247 4Fe-4S dicluster domain CsakCS09_RS08665 PF12800 4Fe-4S binding domain CsakCS09_RS08670 PF04976 DMSO reductase anchor subunit (DmsC) CsakCS09_RS08675 PF11953 Domain of unknown function (DUF3470) CsakCS09_RS08675 PF00037 4Fe-4S binding domain CsakCS09_RS08685 PF02203 Tar ligand binding domain homologue CsakCS09_RS08685 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS08685 PF00015 Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signalling domain CsakCS09_RS08720 PF00496 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle CsakCS09_RS08725 PF10735 Protein of unknown function (DUF2526) CsakCS09_RS08730 PF14833 NAD-binding of NADP-dependent 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase CsakCS09_RS08730 PF03446 NAD binding domain of 6-phosphogluconate dehydrogenase CsakCS09_RS08735 PF04657 Putative inner membrane exporter, YdcZ CsakCS09_RS08740 PF00583 Acetyltransferase (GNAT) family CsakCS09_RS08745 PF08671 Anti-repressor SinI CsakCS09_RS08745 PF01381 Helix-turn-helix CsakCS09_RS08750 PF00107 Zinc-binding dehydrogenase CsakCS09_RS08750 PF16884 N-terminal domain of oxidoreductase CsakCS09_RS08755 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS08755 PF08352 Oligopeptide/dipeptide transporter, C-terminal region CsakCS09_RS08760 PF02423 Ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin family CsakCS09_RS08770 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS08775 PF12911 N-terminal TM domain of oligopeptide transport permease C CsakCS09_RS08775 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS08780 PF00496 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle CsakCS09_RS08785 PF00392 Bacterial regulatory proteins, gntR family CsakCS09_RS08785 PF07729 FCD domain CsakCS09_RS08795 PF00015 Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signalling domain CsakCS09_RS08795 PF02203 Tar ligand binding domain homologue CsakCS09_RS08795 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS08800 PF00106 short chain dehydrogenase CsakCS09_RS08805 PF00128 Alpha amylase, catalytic domain CsakCS09_RS08805 PF16657 Maltogenic Amylase, C-terminal domain CsakCS09_RS08810 PF05015 RelE-like toxin of type II toxin-antitoxin system HigB CsakCS09_RS08815 PF01381 Helix-turn-helix CsakCS09_RS08820 PF00593 TonB dependent receptor CsakCS09_RS08820 PF07715 TonB-dependent Receptor Plug Domain CsakCS09_RS08830 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS08835 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS08840 PF02668 Taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family CsakCS09_RS08855 PF00324 Amino acid permease CsakCS09_RS08860 PF00144 Beta-lactamase CsakCS09_RS08865 PF00881 Nitroreductase family CsakCS09_RS08870 PF01361 Tautomerase enzyme CsakCS09_RS08875 PF05067 Manganese containing catalase CsakCS09_RS08880 PF05974 Domain of unknown function (DUF892) CsakCS09_RS08885 PF00797 N-acetyltransferase CsakCS09_RS08890 PF12833 Helix-turn-helix domain CsakCS09_RS08890 PF12852 Cupin CsakCS09_RS08900 PF08240 Alcohol dehydrogenase GroES-like domain CsakCS09_RS08900 PF00107 Zinc-binding dehydrogenase CsakCS09_RS08935 PF00106 short chain dehydrogenase CsakCS09_RS08940 PF06719 AraC-type transcriptional regulator N-terminus CsakCS09_RS08940 PF12833 Helix-turn-helix domain CsakCS09_RS08945 PF03851 UV-endonuclease UvdE CsakCS09_RS08960 PF00563 EAL domain CsakCS09_RS08960 PF08668 HDOD domain CsakCS09_RS08970 PF07995 Glucose / Sorbosone dehydrogenase CsakCS09_RS08980 PF00877 NlpC/P60 family CsakCS09_RS08985 PF09278 MerR, DNA binding CsakCS09_RS08985 PF00376 MerR family regulatory protein CsakCS09_RS08990 PF12697 Alpha/beta hydrolase family CsakCS09_RS09030 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS09030 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS09030 PF00512 His Kinase A (phospho-acceptor) domain CsakCS09_RS09030 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS09030 PF09984 Uncharacterised signal transduction histidine kinase domain (DUF2222) CsakCS09_RS09030 PF01627 Hpt domain CsakCS09_RS09035 PF00703 Glycosyl hydrolases family 2 CsakCS09_RS09035 PF02837 Glycosyl hydrolases family 2, sugar binding domain CsakCS09_RS09035 PF02836 Glycosyl hydrolases family 2, TIM barrel domain CsakCS09_RS09035 PF16355 Domain of unknown function (DUF4982) CsakCS09_RS09040 PF01204 Trehalase CsakCS09_RS09045 PF03797 Autotransporter beta-domain CsakCS09_RS09045 PF00657 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase CsakCS09_RS09050 PF01232 Mannitol dehydrogenase Rossmann domain CsakCS09_RS09050 PF08125 Mannitol dehydrogenase C-terminal domain CsakCS09_RS09060 PF08448 PAS fold CsakCS09_RS09060 PF00990 Diguanylate cyclase, GGDEF domain CsakCS09_RS09060 PF05231 MASE1 CsakCS09_RS09060 PF08447 PAS fold CsakCS09_RS09060 PF00563 EAL domain CsakCS09_RS09060 PF13426 PAS domain CsakCS09_RS09065 PF03707 Bacterial signalling protein N terminal repeat CsakCS09_RS09065 PF00990 Diguanylate cyclase, GGDEF domain CsakCS09_RS09065 PF00563 EAL domain CsakCS09_RS09070 PF00990 Diguanylate cyclase, GGDEF domain CsakCS09_RS09075 PF13811 Domain of unknown function (DUF4186) CsakCS09_RS09080 PF04960 Glutaminase CsakCS09_RS09085 PF17200 Single Cache domain 2 CsakCS09_RS09085 PF00015 Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signalling domain CsakCS09_RS09085 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS09090 PF00171 Aldehyde dehydrogenase family CsakCS09_RS09095 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS09095 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS09100 PF00583 Acetyltransferase (GNAT) family CsakCS09_RS09105 PF00056 lactate/malate dehydrogenase, NAD binding domain CsakCS09_RS09105 PF02866 lactate/malate dehydrogenase, alpha/beta C-terminal domain CsakCS09_RS09110 PF02567 Phenazine biosynthesis-like protein CsakCS09_RS09115 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS09120 PF01047 MarR family CsakCS09_RS09125 PF12833 Helix-turn-helix domain CsakCS09_RS09130 PF13999 MarB protein CsakCS09_RS09135 PF00892 EamA-like transporter family CsakCS09_RS09140 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS09155 PF02342 TerD domain CsakCS09_RS09165 PF02342 TerD domain CsakCS09_RS09170 PF02342 TerD domain CsakCS09_RS09175 PF03741 Integral membrane protein TerC family CsakCS09_RS09180 PF05099 Tellurite resistance protein TerB CsakCS09_RS09185 PF02342 TerD domain CsakCS09_RS09190 PF02342 TerD domain CsakCS09_RS09210 PF11202 Phosphoribosyl transferase (PRTase) CsakCS09_RS09210 PF15608 PELOTA RNA binding domain CsakCS09_RS09235 PF02342 TerD domain CsakCS09_RS09240 PF00092 von Willebrand factor type A domain CsakCS09_RS09245 PF00092 von Willebrand factor type A domain CsakCS09_RS09285 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS09290 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS09295 PF02653 Branched-chain amino acid transport system / permease component CsakCS09_RS09300 PF02653 Branched-chain amino acid transport system / permease component CsakCS09_RS09310 PF13458 Periplasmic binding protein CsakCS09_RS09315 PF00392 Bacterial regulatory proteins, gntR family CsakCS09_RS09315 PF07729 FCD domain CsakCS09_RS09320 PF00289 Biotin carboxylase, N-terminal domain CsakCS09_RS09320 PF02785 Biotin carboxylase C-terminal domain CsakCS09_RS09320 PF02786 Carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP binding domain CsakCS09_RS09320 PF02785 Biotin carboxylase C-terminal domain CsakCS09_RS09320 PF00289 Biotin carboxylase, N-terminal domain CsakCS09_RS09320 PF00364 Biotin-requiring enzyme CsakCS09_RS09320 PF00364 Biotin-requiring enzyme CsakCS09_RS09320 PF02786 Carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP binding domain CsakCS09_RS09325 PF01425 Amidase CsakCS09_RS09335 PF01717 Cobalamin-independent synthase, Catalytic domain CsakCS09_RS09345 PF10685 Stress-induced bacterial acidophilic repeat motif CsakCS09_RS09350 PF01062 Bestrophin, RFP-TM, chloride channel CsakCS09_RS09360 PF01432 Peptidase family M3 CsakCS09_RS09365 PF00106 short chain dehydrogenase CsakCS09_RS09370 PF00392 Bacterial regulatory proteins, gntR family CsakCS09_RS09370 PF07729 FCD domain CsakCS09_RS09380 PF14001 YdfZ protein CsakCS09_RS09385 PF08125 Mannitol dehydrogenase C-terminal domain CsakCS09_RS09385 PF01232 Mannitol dehydrogenase Rossmann domain CsakCS09_RS09390 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS09395 PF02746 Mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme, N-terminal domain CsakCS09_RS09395 PF13378 Enolase C-terminal domain-like CsakCS09_RS09400 PF02694 Uncharacterised BCR, YnfA/UPF0060 family CsakCS09_RS09405 PF06932 Protein of unknown function (DUF1283) CsakCS09_RS09410 PF13302 Acetyltransferase (GNAT) domain CsakCS09_RS09415 PF06788 Uncharacterised protein family (UPF0257) CsakCS09_RS09420 PF06649 Protein of unknown function (DUF1161) CsakCS09_RS09425 PF00384 Molybdopterin oxidoreductase CsakCS09_RS09425 PF01568 Molydopterin dinucleotide binding domain CsakCS09_RS09425 PF04879 Molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 domain CsakCS09_RS09430 PF13247 4Fe-4S dicluster domain CsakCS09_RS09430 PF12800 4Fe-4S binding domain CsakCS09_RS09435 PF04976 DMSO reductase anchor subunit (DmsC) CsakCS09_RS09440 PF02613 Nitrate reductase delta subunit CsakCS09_RS09445 PF06942 GlpM protein CsakCS09_RS09450 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS09455 PF04069 Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system CsakCS09_RS09460 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS09465 PF00571 CBS domain CsakCS09_RS09465 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS09475 PF00480 ROK family CsakCS09_RS09480 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS09480 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS09485 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS09490 PF02074 Carboxypeptidase Taq (M32) metallopeptidase CsakCS09_RS09495 PF00089 Trypsin CsakCS09_RS09500 PF00893 Small Multidrug Resistance protein CsakCS09_RS09505 PF00893 Small Multidrug Resistance protein CsakCS09_RS09515 PF00817 impB/mucB/samB family CsakCS09_RS09515 PF11799 impB/mucB/samB family C-terminal domain CsakCS09_RS09515 PF13438 Domain of unknown function (DUF4113) CsakCS09_RS09520 PF00717 Peptidase S24-like CsakCS09_RS09525 PF01136 Peptidase family U32 CsakCS09_RS09525 PF12392 Collagenase CsakCS09_RS09530 PF07883 Cupin domain CsakCS09_RS09530 PF01381 Helix-turn-helix CsakCS09_RS09535 PF03594 Benzoate membrane transport protein CsakCS09_RS09540 PF11769 Protein of unknown function (DUF3313) CsakCS09_RS09545 PF03848 Tellurite resistance protein TehB CsakCS09_RS09550 PF18836 Beta solenoid repeat from YDCK CsakCS09_RS09555 PF13302 Acetyltransferase (GNAT) domain CsakCS09_RS09560 PF04349 Periplasmic glucan biosynthesis protein, MdoG CsakCS09_RS09565 PF00135 Carboxylesterase family CsakCS09_RS09570 PF07063 Domain of unknown function (DUF1338) CsakCS09_RS09580 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS09580 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS09585 PF00724 NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family CsakCS09_RS09590 PF05974 Domain of unknown function (DUF892) CsakCS09_RS09595 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS09595 PF00015 Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signalling domain CsakCS09_RS09595 PF02203 Tar ligand binding domain homologue CsakCS09_RS09600 PF08240 Alcohol dehydrogenase GroES-like domain CsakCS09_RS09600 PF00107 Zinc-binding dehydrogenase CsakCS09_RS09605 PF02583 Metal-sensitive transcriptional repressor CsakCS09_RS09615 PF00083 Sugar (and other) transporter CsakCS09_RS09615 PF08946 Osmosensory transporter coiled coil CsakCS09_RS09620 PF01292 Prokaryotic cytochrome b561 CsakCS09_RS09625 PF13472 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase family CsakCS09_RS09625 PF07859 alpha/beta hydrolase fold CsakCS09_RS09630 PF00171 Aldehyde dehydrogenase family CsakCS09_RS09635 PF02698 DUF218 domain CsakCS09_RS09640 PF00903 Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily CsakCS09_RS09660 PF13533 Biotin-lipoyl like CsakCS09_RS09665 PF02321 Outer membrane efflux protein CsakCS09_RS09670 PF01596 O-methyltransferase CsakCS09_RS09680 PF11898 Domain of unknown function (DUF3418) CsakCS09_RS09680 PF00270 DEAD/DEAH box helicase CsakCS09_RS09680 PF07717 Oligonucleotide/oligosaccharide-binding (OB)-fold CsakCS09_RS09680 PF04408 Helicase associated domain (HA2) CsakCS09_RS09680 PF00271 Helicase conserved C-terminal domain CsakCS09_RS09685 PF02525 Flavodoxin-like fold CsakCS09_RS09695 PF07027 Protein of unknown function (DUF1318) CsakCS09_RS09700 PF13617 YnbE-like lipoprotein CsakCS09_RS09705 PF11739 Dicarboxylate transport CsakCS09_RS09710 PF00389 D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, catalytic domain CsakCS09_RS09710 PF02826 D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD binding domain CsakCS09_RS09715 PF03724 META domain CsakCS09_RS09720 PF03891 Domain of unknown function (DUF333) CsakCS09_RS09725 PF02775 Thiamine pyrophosphate enzyme, C-terminal TPP binding domain CsakCS09_RS09725 PF01855 Pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase, thiamine diP-bdg CsakCS09_RS09725 PF01558 Pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase CsakCS09_RS09725 PF17147 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase core domain II CsakCS09_RS09725 PF10371 Domain of unknown function CsakCS09_RS09735 PF08240 Alcohol dehydrogenase GroES-like domain CsakCS09_RS09735 PF00107 Zinc-binding dehydrogenase CsakCS09_RS09740 PF00171 Aldehyde dehydrogenase family CsakCS09_RS09745 PF01590 GAF domain CsakCS09_RS09745 PF02954 Bacterial regulatory protein, Fis family CsakCS09_RS09745 PF00158 Sigma-54 interaction domain CsakCS09_RS09770 PF01171 PP-loop family CsakCS09_RS09775 PF01544 CorA-like Mg2+ transporter protein CsakCS09_RS09785 PF10753 Toxin GhoT_OrtT CsakCS09_RS09800 PF00990 Diguanylate cyclase, GGDEF domain CsakCS09_RS09800 PF03707 Bacterial signalling protein N terminal repeat CsakCS09_RS09800 PF00563 EAL domain CsakCS09_RS09800 PF13188 PAS domain CsakCS09_RS09805 PF10685 Stress-induced bacterial acidophilic repeat motif CsakCS09_RS09830 PF00496 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle CsakCS09_RS09835 PF00246 Zinc carboxypeptidase CsakCS09_RS09840 PF02746 Mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme, N-terminal domain CsakCS09_RS09840 PF13378 Enolase C-terminal domain-like CsakCS09_RS09845 PF08534 Redoxin CsakCS09_RS09850 PF18024 Helix-turn-helix domain CsakCS09_RS09850 PF00158 Sigma-54 interaction domain CsakCS09_RS09855 PF05128 Domain of unknown function (DUF697) CsakCS09_RS09860 PF04317 YcjX-like family, DUF463 CsakCS09_RS09865 PF00356 Bacterial regulatory proteins, lacI family CsakCS09_RS09865 PF00532 Periplasmic binding proteins and sugar binding domain of LacI family CsakCS09_RS09870 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS09870 PF17912 MalK OB fold domain CsakCS09_RS09870 PF03459 TOBE domain CsakCS09_RS09875 PF13419 Haloacid dehalogenase-like hydrolase CsakCS09_RS09880 PF03632 Glycosyl hydrolase family 65 central catalytic domain CsakCS09_RS09880 PF03636 Glycosyl hydrolase family 65, N-terminal domain CsakCS09_RS09880 PF03633 Glycosyl hydrolase family 65, C-terminal domain CsakCS09_RS09885 PF01408 Oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold CsakCS09_RS09885 PF02894 Oxidoreductase family, C-terminal alpha/beta domain CsakCS09_RS09890 PF01261 Xylose isomerase-like TIM barrel CsakCS09_RS09895 PF00107 Zinc-binding dehydrogenase CsakCS09_RS09900 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS09905 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS09910 PF01547 Bacterial extracellular solute-binding protein CsakCS09_RS09915 PF00128 Alpha amylase, catalytic domain CsakCS09_RS09920 PF09584 Phage shock protein PspD (Phageshock_PspD) CsakCS09_RS09925 PF04024 PspC domain CsakCS09_RS09930 PF06667 Phage shock protein B CsakCS09_RS09935 PF04012 PspA/IM30 family CsakCS09_RS09940 PF02954 Bacterial regulatory protein, Fis family CsakCS09_RS09940 PF00158 Sigma-54 interaction domain CsakCS09_RS09945 PF00496 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle CsakCS09_RS09950 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS09955 PF12911 N-terminal TM domain of oligopeptide transport permease C CsakCS09_RS09955 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS09960 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS09960 PF08352 Oligopeptide/dipeptide transporter, C-terminal region CsakCS09_RS09965 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS09985 PF17876 Cold shock domain CsakCS09_RS09985 PF08206 Ribonuclease B OB domain CsakCS09_RS09985 PF00575 S1 RNA binding domain CsakCS09_RS09985 PF00773 RNB domain CsakCS09_RS09990 PF13426 PAS domain CsakCS09_RS09990 PF00990 Diguanylate cyclase, GGDEF domain CsakCS09_RS09990 PF00563 EAL domain CsakCS09_RS09995 PF00378 Enoyl-CoA hydratase/isomerase CsakCS09_RS10005 PF00923 Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase CsakCS09_RS10010 PF04055 Radical SAM superfamily CsakCS09_RS10015 PF01228 Glycine radical CsakCS09_RS10015 PF02901 Pyruvate formate lyase-like CsakCS09_RS10020 PF00455 DeoR C terminal sensor domain CsakCS09_RS10020 PF08220 DeoR-like helix-turn-helix domain CsakCS09_RS10025 PF05433 Glycine zipper 2TM domain CsakCS09_RS10030 PF01253 Translation initiation factor SUI1 CsakCS09_RS10035 PF00215 Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family CsakCS09_RS10040 PF18073 Rubredoxin metal binding domain CsakCS09_RS10045 PF06305 Lipopolysaccharide assembly protein A domain CsakCS09_RS10050 PF01569 PAP2 superfamily CsakCS09_RS10055 PF00925 GTP cyclohydrolase II CsakCS09_RS10060 PF00330 Aconitase family (aconitate hydratase) CsakCS09_RS10060 PF00694 Aconitase C-terminal domain CsakCS09_RS10070 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS10070 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS10075 PF01131 DNA topoisomerase CsakCS09_RS10075 PF08272 Topoisomerase I zinc-ribbon-like CsakCS09_RS10075 PF01396 Topoisomerase DNA binding C4 zinc finger CsakCS09_RS10075 PF01751 Toprim domain CsakCS09_RS10080 PF10692 Protein of unknown function (DUF2498) CsakCS09_RS10085 PF01343 Peptidase family S49 CsakCS09_RS10085 PF08496 Peptidase family S49 N-terminal CsakCS09_RS10090 PF00106 short chain dehydrogenase CsakCS09_RS10095 PF02572 ATP:corrinoid adenosyltransferase BtuR/CobO/CobP CsakCS09_RS10095 PF12557 Cob(I)alamin adenosyltransferase N terminal CsakCS09_RS10100 PF00849 RNA pseudouridylate synthase CsakCS09_RS10100 PF01479 S4 domain CsakCS09_RS10105 PF01300 Telomere recombination CsakCS09_RS10110 PF02811 PHP domain CsakCS09_RS10120 PF04715 Anthranilate synthase component I, N terminal region CsakCS09_RS10120 PF00425 chorismate binding enzyme CsakCS09_RS10125 PF00591 Glycosyl transferase family, a/b domain CsakCS09_RS10125 PF00117 Glutamine amidotransferase class-I CsakCS09_RS10125 PF02885 Glycosyl transferase family, helical bundle domain CsakCS09_RS10130 PF00697 N-(5'phosphoribosyl)anthranilate (PRA) isomerase CsakCS09_RS10130 PF00218 Indole-3-glycerol phosphate synthase CsakCS09_RS10135 PF00291 Pyridoxal-phosphate dependent enzyme CsakCS09_RS10140 PF00290 Tryptophan synthase alpha chain CsakCS09_RS10155 PF03922 OmpW family CsakCS09_RS10160 PF03692 Putative zinc- or iron-chelating domain CsakCS09_RS10170 PF04279 Intracellular septation protein A CsakCS09_RS10175 PF00593 TonB dependent receptor CsakCS09_RS10175 PF07715 TonB-dependent Receptor Plug Domain CsakCS09_RS10180 PF03061 Thioesterase superfamily CsakCS09_RS10185 PF03544 Gram-negative bacterial TonB protein C-terminal CsakCS09_RS10190 PF03795 YCII-related domain CsakCS09_RS10205 PF13091 PLD-like domain CsakCS09_RS10205 PF13396 Phospholipase_D-nuclease N-terminal CsakCS09_RS10210 PF04269 Protein of unknown function, DUF440 CsakCS09_RS10215 PF00027 Cyclic nucleotide-binding domain CsakCS09_RS10215 PF00520 Ion transport protein CsakCS09_RS10220 PF08352 Oligopeptide/dipeptide transporter, C-terminal region CsakCS09_RS10220 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS10225 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS10225 PF08352 Oligopeptide/dipeptide transporter, C-terminal region CsakCS09_RS10230 PF12911 N-terminal TM domain of oligopeptide transport permease C CsakCS09_RS10230 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS10235 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS10240 PF00496 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle CsakCS09_RS10245 PF01914 MarC family integral membrane protein CsakCS09_RS10255 PF00465 Iron-containing alcohol dehydrogenase CsakCS09_RS10255 PF00171 Aldehyde dehydrogenase family CsakCS09_RS10260 PF00265 Thymidine kinase CsakCS09_RS10265 PF00816 H-NS histone family CsakCS09_RS10270 PF01370 NAD dependent epimerase/dehydratase family CsakCS09_RS10275 PF03721 UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family, NAD binding domain CsakCS09_RS10275 PF00984 UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family, central domain CsakCS09_RS10275 PF03720 UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family, UDP binding domain CsakCS09_RS10280 PF00483 Nucleotidyl transferase CsakCS09_RS10285 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS10290 PF02810 SEC-C motif CsakCS09_RS10295 PF00551 Formyl transferase CsakCS09_RS10295 PF01842 ACT domain CsakCS09_RS10320 PF00106 short chain dehydrogenase CsakCS09_RS10330 PF02665 Nitrate reductase gamma subunit CsakCS09_RS10335 PF02613 Nitrate reductase delta subunit CsakCS09_RS10340 PF13247 4Fe-4S dicluster domain CsakCS09_RS10340 PF14711 Respiratory nitrate reductase beta C-terminal CsakCS09_RS10345 PF01568 Molydopterin dinucleotide binding domain CsakCS09_RS10345 PF00384 Molybdopterin oxidoreductase CsakCS09_RS10345 PF14710 Respiratory nitrate reductase alpha N-terminal CsakCS09_RS10350 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS10355 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS10355 PF13675 Type IV pili methyl-accepting chemotaxis transducer N-term CsakCS09_RS10355 PF07730 Histidine kinase CsakCS09_RS10355 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS10360 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS10360 PF00196 Bacterial regulatory proteins, luxR family CsakCS09_RS10365 PF11924 Inverse autotransporter, beta-domain CsakCS09_RS10370 PF01161 Phosphatidylethanolamine-binding protein CsakCS09_RS10375 PF01568 Molydopterin dinucleotide binding domain CsakCS09_RS10375 PF04879 Molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 domain CsakCS09_RS10375 PF04324 BFD-like [2Fe-2S] binding domain CsakCS09_RS10375 PF00384 Molybdopterin oxidoreductase CsakCS09_RS10380 PF03460 Nitrite/Sulfite reductase ferredoxin-like half domain CsakCS09_RS10380 PF07992 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase CsakCS09_RS10380 PF13806 Rieske-like [2Fe-2S] domain CsakCS09_RS10380 PF01077 Nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S domain CsakCS09_RS10380 PF18267 Rubredoxin NAD+ reductase C-terminal domain CsakCS09_RS10380 PF04324 BFD-like [2Fe-2S] binding domain CsakCS09_RS10385 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS10390 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS10405 PF03861 ANTAR domain CsakCS09_RS10405 PF08376 Nitrate and nitrite sensing CsakCS09_RS10410 PF02635 DsrE/DsrF-like family CsakCS09_RS10415 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS10415 PF00015 Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signalling domain CsakCS09_RS10415 PF02203 Tar ligand binding domain homologue CsakCS09_RS10425 PF04752 ChaC-like protein CsakCS09_RS10430 PF06150 ChaB CsakCS09_RS10435 PF01699 Sodium/calcium exchanger protein CsakCS09_RS10440 PF00793 DAHP synthetase I family CsakCS09_RS10445 PF13369 Transglutaminase-like superfamily CsakCS09_RS10450 PF04247 Invasion gene expression up-regulator, SirB CsakCS09_RS10455 PF13847 Methyltransferase domain CsakCS09_RS10455 PF17827 PrmC N-terminal domain CsakCS09_RS10460 PF03462 PCRF domain CsakCS09_RS10460 PF00472 RF-1 domain CsakCS09_RS10465 PF01488 Shikimate / quinate 5-dehydrogenase CsakCS09_RS10465 PF00745 Glutamyl-tRNAGlu reductase, dimerisation domain CsakCS09_RS10465 PF05201 Glutamyl-tRNAGlu reductase, N-terminal domain CsakCS09_RS10470 PF03550 Outer membrane lipoprotein LolB CsakCS09_RS10475 PF00288 GHMP kinases N terminal domain CsakCS09_RS10475 PF08544 GHMP kinases C terminal CsakCS09_RS10480 PF13793 N-terminal domain of ribose phosphate pyrophosphokinase CsakCS09_RS10480 PF14572 Phosphoribosyl synthetase-associated domain CsakCS09_RS10485 PF01740 STAS domain CsakCS09_RS10485 PF00916 Sulfate permease family CsakCS09_RS10495 PF10762 Protein of unknown function (DUF2583) CsakCS09_RS10500 PF01195 Peptidyl-tRNA hydrolase CsakCS09_RS10505 PF01926 50S ribosome-binding GTPase CsakCS09_RS10505 PF06071 Protein of unknown function (DUF933) CsakCS09_RS10510 PF03695 Uncharacterised protein family (UPF0149) CsakCS09_RS10510 PF02810 SEC-C motif CsakCS09_RS10525 PF02525 Flavodoxin-like fold CsakCS09_RS10535 PF02627 Carboxymuconolactone decarboxylase family CsakCS09_RS10540 PF00155 Aminotransferase class I and II CsakCS09_RS10540 PF00392 Bacterial regulatory proteins, gntR family CsakCS09_RS10545 PF01204 Trehalase CsakCS09_RS10550 PF07715 TonB-dependent Receptor Plug Domain CsakCS09_RS10550 PF00593 TonB dependent receptor CsakCS09_RS10555 PF04226 Transglycosylase associated protein CsakCS09_RS10560 PF07238 PilZ domain CsakCS09_RS10560 PF07317 Flagellar regulator YcgR CsakCS09_RS10565 PF01464 Transglycosylase SLT domain CsakCS09_RS10570 PF02016 LD-carboxypeptidase N-terminal domain CsakCS09_RS10570 PF17676 LD-carboxypeptidase C-terminal domain CsakCS09_RS10585 PF02080 TrkA-C domain CsakCS09_RS10585 PF00999 Sodium/hydrogen exchanger family CsakCS09_RS10585 PF03471 Transporter associated domain CsakCS09_RS10590 PF00842 Alanine racemase, C-terminal domain CsakCS09_RS10590 PF01168 Alanine racemase, N-terminal domain CsakCS09_RS10595 PF01266 FAD dependent oxidoreductase CsakCS09_RS10600 PF04293 SpoVR like protein CsakCS09_RS10605 PF00392 Bacterial regulatory proteins, gntR family CsakCS09_RS10605 PF07840 FadR C-terminal domain CsakCS09_RS10610 PF06450 Bacterial Na+/H+ antiporter B (NhaB) CsakCS09_RS10615 PF02600 Disulfide bond formation protein DsbB CsakCS09_RS10630 PF03692 Putative zinc- or iron-chelating domain CsakCS09_RS10635 PF01557 Fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family CsakCS09_RS10640 PF05166 YcgL domain CsakCS09_RS10645 PF05209 Septum formation inhibitor MinC, N-terminal domain CsakCS09_RS10645 PF03775 Septum formation inhibitor MinC, C-terminal domain CsakCS09_RS10650 PF01656 CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain CsakCS09_RS10655 PF03776 Septum formation topological specificity factor MinE CsakCS09_RS10660 PF00570 HRDC domain CsakCS09_RS10660 PF01612 3'-5' exonuclease CsakCS09_RS10665 PF00501 AMP-binding enzyme CsakCS09_RS10665 PF13193 AMP-binding enzyme C-terminal domain CsakCS09_RS10670 PF03843 Outer membrane lipoprotein Slp family CsakCS09_RS10675 PF00814 Glycoprotease family CsakCS09_RS10680 PF04851 Type III restriction enzyme, res subunit CsakCS09_RS10680 PF13307 Helicase C-terminal domain CsakCS09_RS10685 PF01042 Endoribonuclease L-PSP CsakCS09_RS10690 PF00487 Fatty acid desaturase CsakCS09_RS10700 PF04116 Fatty acid hydroxylase superfamily CsakCS09_RS10720 PF01370 NAD dependent epimerase/dehydratase family CsakCS09_RS10725 PF08545 3-Oxoacyl-[acyl-carrier-protein (ACP)] synthase III CsakCS09_RS10725 PF08541 3-Oxoacyl-[acyl-carrier-protein (ACP)] synthase III C terminal CsakCS09_RS10730 PF03701 Uncharacterised protein family (UPF0181) CsakCS09_RS10735 PF00425 chorismate binding enzyme CsakCS09_RS10735 PF04715 Anthranilate synthase component I, N terminal region CsakCS09_RS10740 PF00293 NUDIX domain CsakCS09_RS10745 PF03315 Serine dehydratase beta chain CsakCS09_RS10745 PF03313 Serine dehydratase alpha chain CsakCS09_RS10750 PF00563 EAL domain CsakCS09_RS10750 PF12792 CSS motif domain associated with EAL CsakCS09_RS10755 PF03471 Transporter associated domain CsakCS09_RS10755 PF03741 Integral membrane protein TerC family CsakCS09_RS10760 PF03830 PTS system sorbose subfamily IIB component CsakCS09_RS10760 PF03610 PTS system fructose IIA component CsakCS09_RS10765 PF03609 PTS system sorbose-specific iic component CsakCS09_RS10770 PF03613 PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component CsakCS09_RS10775 PF06173 Protein of unknown function (DUF986) CsakCS09_RS10780 PF02659 Putative manganese efflux pump CsakCS09_RS10785 PF13847 Methyltransferase domain CsakCS09_RS10790 PF00313 'Cold-shock' DNA-binding domain CsakCS09_RS10795 PF10736 Protein of unknown function (DUF2627) CsakCS09_RS10805 PF12706 Beta-lactamase superfamily domain CsakCS09_RS10810 PF13974 YebO-like protein CsakCS09_RS10815 PF13998 MgrB protein CsakCS09_RS10820 PF13996 YobH-like protein CsakCS09_RS10825 PF01614 Bacterial transcriptional regulator CsakCS09_RS10825 PF09339 IclR helix-turn-helix domain CsakCS09_RS10830 PF01435 Peptidase family M48 CsakCS09_RS10835 PF03572 Peptidase family S41 CsakCS09_RS10835 PF17804 Tail specific protease N-terminal domain CsakCS09_RS10835 PF11818 C-terminal domain of tail specific protease (DUF3340) CsakCS09_RS10835 PF00595 PDZ domain CsakCS09_RS10840 PF17516 ProQ C-terminal domain CsakCS09_RS10840 PF04352 ProQ/FINO family CsakCS09_RS10845 PF13185 GAF domain CsakCS09_RS10850 PF04403 Paraquat-inducible protein A CsakCS09_RS10855 PF02470 MlaD protein CsakCS09_RS10860 PF13636 RNA-binding PUA-like domain of methyltransferase RsmF CsakCS09_RS10860 PF17125 N-terminal domain of 16S rRNA methyltransferase RsmF CsakCS09_RS10860 PF01189 16S rRNA methyltransferase RsmB/F CsakCS09_RS10865 PF07351 Protein of unknown function (DUF1480) CsakCS09_RS10875 PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase CsakCS09_RS10885 PF10709 Protein of unknown function (DUF2511) CsakCS09_RS10890 PF05425 Copper resistance protein D CsakCS09_RS10895 PF04234 CopC domain CsakCS09_RS10900 PF06440 DNA polymerase III, theta subunit CsakCS09_RS10905 PF00929 Exonuclease CsakCS09_RS10910 PF00326 Prolyl oligopeptidase family CsakCS09_RS10910 PF02897 Prolyl oligopeptidase, N-terminal beta-propeller domain CsakCS09_RS10915 PF04391 Protein of unknown function (DUF533) CsakCS09_RS10920 PF13995 YebF-like protein CsakCS09_RS10930 PF07130 YebG protein CsakCS09_RS10935 PF02222 ATP-grasp domain CsakCS09_RS10940 PF01081 KDPG and KHG aldolase CsakCS09_RS10945 PF00920 Dehydratase family CsakCS09_RS10950 PF00479 Glucose-6-phosphate dehydrogenase, NAD binding domain CsakCS09_RS10950 PF02781 Glucose-6-phosphate dehydrogenase, C-terminal domain CsakCS09_RS10955 PF01418 Helix-turn-helix domain, rpiR family CsakCS09_RS10955 PF01380 SIS domain CsakCS09_RS10960 PF00224 Pyruvate kinase, barrel domain CsakCS09_RS10960 PF02887 Pyruvate kinase, alpha/beta domain CsakCS09_RS10965 PF03279 Bacterial lipid A biosynthesis acyltransferase CsakCS09_RS10970 PF01476 LysM domain CsakCS09_RS10970 PF08525 Opacity-associated protein A N-terminal motif CsakCS09_RS10970 PF01551 Peptidase family M23 CsakCS09_RS10975 PF01297 Zinc-uptake complex component A periplasmic CsakCS09_RS10980 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS10985 PF00950 ABC 3 transport family CsakCS09_RS10990 PF05491 RuvB C-terminal winged helix domain CsakCS09_RS10990 PF05496 Holliday junction DNA helicase RuvB P-loop domain CsakCS09_RS10990 PF17864 RuvB AAA lid domain CsakCS09_RS10995 PF01330 RuvA N terminal domain CsakCS09_RS10995 PF07499 RuvA, C-terminal domain CsakCS09_RS11000 PF02075 Crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC CsakCS09_RS11005 PF01709 Transcriptional regulator CsakCS09_RS11010 PF00293 NUDIX domain CsakCS09_RS11015 PF00152 tRNA synthetases class II (D, K and N) CsakCS09_RS11015 PF02938 GAD domain CsakCS09_RS11015 PF01336 OB-fold nucleic acid binding domain CsakCS09_RS11020 PF00857 Isochorismatase family CsakCS09_RS11025 PF01904 Protein of unknown function DUF72 CsakCS09_RS11030 PF01124 MAPEG family CsakCS09_RS11035 PF13649 Methyltransferase domain CsakCS09_RS11040 PF08003 Protein of unknown function (DUF1698) CsakCS09_RS11045 PF01476 LysM domain CsakCS09_RS11045 PF04972 BON domain CsakCS09_RS11055 PF00012 Hsp70 protein CsakCS09_RS11060 PF03932 CutC family CsakCS09_RS11065 PF00155 Aminotransferase class I and II CsakCS09_RS11070 PF00107 Zinc-binding dehydrogenase CsakCS09_RS11070 PF08240 Alcohol dehydrogenase GroES-like domain CsakCS09_RS11070 PF13823 Alcohol dehydrogenase GroES-associated CsakCS09_RS11080 PF06185 YecM protein CsakCS09_RS11085 PF03485 Arginyl tRNA synthetase N terminal domain CsakCS09_RS11085 PF05746 DALR anticodon binding domain CsakCS09_RS11085 PF00750 tRNA synthetases class I (R) CsakCS09_RS11090 PF15977 Winged helix-turn-helix DNA binding CsakCS09_RS11095 PF07470 Glycosyl Hydrolase Family 88 CsakCS09_RS11110 PF06366 Flagellar protein FlhE CsakCS09_RS11115 PF00771 FHIPEP family CsakCS09_RS11120 PF01312 FlhB HrpN YscU SpaS Family CsakCS09_RS11125 PF04344 Chemotaxis phosphatase, CheZ CsakCS09_RS11130 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS11135 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS11135 PF01339 CheB methylesterase CsakCS09_RS11140 PF01739 CheR methyltransferase, SAM binding domain CsakCS09_RS11140 PF03705 CheR methyltransferase, all-alpha domain CsakCS09_RS11150 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS11150 PF00015 Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signalling domain CsakCS09_RS11150 PF02203 Tar ligand binding domain homologue CsakCS09_RS11180 PF01584 CheW-like domain CsakCS09_RS11185 PF09078 CheY binding CsakCS09_RS11185 PF01584 CheW-like domain CsakCS09_RS11185 PF02895 Signal transducing histidine kinase, homodimeric domain CsakCS09_RS11185 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS11185 PF01627 Hpt domain CsakCS09_RS11190 PF13677 Membrane MotB of proton-channel complex MotA/MotB CsakCS09_RS11190 PF00691 OmpA family CsakCS09_RS11195 PF01618 MotA/TolQ/ExbB proton channel family CsakCS09_RS11200 PF05280 Flagellar transcriptional activator (FlhC) CsakCS09_RS11205 PF05247 Flagellar transcriptional activator (FlhD) CsakCS09_RS11210 PF00582 Universal stress protein family CsakCS09_RS11215 PF00982 Glycosyltransferase family 20 CsakCS09_RS11220 PF02358 Trehalose-phosphatase CsakCS09_RS11225 PF02653 Branched-chain amino acid transport system / permease component CsakCS09_RS11230 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS11235 PF00532 Periplasmic binding proteins and sugar binding domain of LacI family CsakCS09_RS11250 PF00210 Ferritin-like domain CsakCS09_RS11255 PF03605 Anaerobic c4-dicarboxylate membrane transporter CsakCS09_RS11270 PF10964 Protein of unknown function (DUF2766) CsakCS09_RS11280 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS11290 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS11290 PF00015 Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signalling domain CsakCS09_RS11290 PF02203 Tar ligand binding domain homologue CsakCS09_RS11300 PF00210 Ferritin-like domain CsakCS09_RS11305 PF03222 Tryptophan/tyrosine permease family CsakCS09_RS11335 PF01066 CDP-alcohol phosphatidyltransferase CsakCS09_RS11340 PF08459 UvrC Helix-hairpin-helix N-terminal CsakCS09_RS11340 PF02151 UvrB/uvrC motif CsakCS09_RS11340 PF01541 GIY-YIG catalytic domain CsakCS09_RS11345 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS11345 PF00196 Bacterial regulatory proteins, luxR family CsakCS09_RS11350 PF10769 Protein of unknown function (DUF2594) CsakCS09_RS11355 PF00196 Bacterial regulatory proteins, luxR family CsakCS09_RS11355 PF03472 Autoinducer binding domain CsakCS09_RS11360 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS11365 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS11370 PF00291 Pyridoxal-phosphate dependent enzyme CsakCS09_RS11375 PF00497 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3 CsakCS09_RS11380 PF02899 Phage integrase, N-terminal SAM-like domain CsakCS09_RS11385 PF04539 Sigma-70 region 3 CsakCS09_RS11385 PF04542 Sigma-70 region 2 CsakCS09_RS11385 PF04545 Sigma-70, region 4 CsakCS09_RS11410 PF08889 WbqC-like protein family CsakCS09_RS11415 PF01041 DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family CsakCS09_RS11430 PF00700 Bacterial flagellin C-terminal helical region CsakCS09_RS11430 PF00669 Bacterial flagellin N-terminal helical region CsakCS09_RS11440 PF02561 Flagellar protein FliS CsakCS09_RS11445 PF05400 Flagellar protein FliT CsakCS09_RS11450 PF13987 YedD-like protein CsakCS09_RS11455 PF04143 Sulphur transport CsakCS09_RS11460 PF01206 Sulfurtransferase TusA CsakCS09_RS11465 PF02586 SOS response associated peptidase (SRAP) CsakCS09_RS11470 PF01209 ubiE/COQ5 methyltransferase family CsakCS09_RS11475 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS11475 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS11490 PF08279 HTH domain CsakCS09_RS11490 PF13280 WYL domain CsakCS09_RS11505 PF02049 Flagellar hook-basal body complex protein FliE CsakCS09_RS11510 PF01514 Secretory protein of YscJ/FliF family CsakCS09_RS11510 PF08345 Flagellar M-ring protein C-terminal CsakCS09_RS11515 PF14841 FliG middle domain CsakCS09_RS11515 PF14842 FliG N-terminal domain CsakCS09_RS11515 PF01706 FliG C-terminal domain CsakCS09_RS11520 PF02108 Flagellar assembly protein FliH CsakCS09_RS11525 PF18269 T3SS EscN ATPase C-terminal domain CsakCS09_RS11525 PF00006 ATP synthase alpha/beta family, nucleotide-binding domain CsakCS09_RS11530 PF02050 Flagellar FliJ protein CsakCS09_RS11535 PF02120 Flagellar hook-length control protein FliK CsakCS09_RS11540 PF03748 Flagellar basal body-associated protein FliL CsakCS09_RS11545 PF01052 Type III flagellar switch regulator (C-ring) FliN C-term CsakCS09_RS11545 PF02154 Flagellar motor switch protein FliM CsakCS09_RS11550 PF16973 Flagellar motor switch protein FliN N-terminal CsakCS09_RS11550 PF01052 Type III flagellar switch regulator (C-ring) FliN C-term CsakCS09_RS11555 PF04347 Flagellar biosynthesis protein, FliO CsakCS09_RS11560 PF00813 FliP family CsakCS09_RS11565 PF01313 Bacterial export proteins, family 3 CsakCS09_RS11570 PF01311 Bacterial export proteins, family 1 CsakCS09_RS11575 PF00196 Bacterial regulatory proteins, luxR family CsakCS09_RS11580 PF10781 Dextransucrase DSRB CsakCS09_RS11595 PF09926 Uncharacterized small protein (DUF2158) CsakCS09_RS11600 PF05661 Protein of unknown function (DUF808) CsakCS09_RS11605 PF00892 EamA-like transporter family CsakCS09_RS11610 PF03852 DNA mismatch endonuclease Vsr CsakCS09_RS11615 PF18284 DNA methylase N-terminal domain CsakCS09_RS11615 PF00145 C-5 cytosine-specific DNA methylase CsakCS09_RS11620 PF01966 HD domain CsakCS09_RS11625 PF00267 Gram-negative porin CsakCS09_RS11630 PF06183 DinI-like family CsakCS09_RS11645 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS11645 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS11650 PF00990 Diguanylate cyclase, GGDEF domain CsakCS09_RS11650 PF00360 Phytochrome region CsakCS09_RS11650 PF00563 EAL domain CsakCS09_RS11650 PF01590 GAF domain CsakCS09_RS11660 PF06167 Glucose-regulated metallo-peptidase M90 CsakCS09_RS11670 PF00083 Sugar (and other) transporter CsakCS09_RS11670 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS11675 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS11675 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS11680 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS11680 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS11690 PF00296 Luciferase-like monooxygenase CsakCS09_RS11695 PF00563 EAL domain CsakCS09_RS11695 PF04940 Sensors of blue-light using FAD CsakCS09_RS11700 PF01048 Phosphorylase superfamily CsakCS09_RS11700 PF10423 Bacterial AMP nucleoside phosphorylase N-terminus CsakCS09_RS11710 PF00589 Phage integrase family CsakCS09_RS11710 PF13356 Arm DNA-binding domain CsakCS09_RS11715 PF18273 Type III R-M EcoP15I C-terminal domain CsakCS09_RS11715 PF01555 DNA methylase CsakCS09_RS11720 PF04851 Type III restriction enzyme, res subunit CsakCS09_RS11720 PF08774 VRR-NUC domain CsakCS09_RS11800 PF05930 Prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA) CsakCS09_RS11815 PF13296 Putative type VI secretion system Rhs element Vgr CsakCS09_RS11815 PF04717 Type VI secretion system, phage-baseplate injector CsakCS09_RS11815 PF10106 Uncharacterized protein conserved in bacteria (DUF2345) CsakCS09_RS11820 PF01554 MatE CsakCS09_RS11830 PF04363 Protein of unknown function (DUF496) CsakCS09_RS11835 PF04632 Fusaric acid resistance protein family CsakCS09_RS11840 PF06445 GyrI-like small molecule binding domain CsakCS09_RS11845 PF00768 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase CsakCS09_RS11845 PF07943 Penicillin-binding protein 5, C-terminal domain CsakCS09_RS11855 PF08411 Exonuclease C-terminal CsakCS09_RS11855 PF00929 Exonuclease CsakCS09_RS11860 PF13520 Amino acid permease CsakCS09_RS11870 PF00202 Aminotransferase class-III CsakCS09_RS11875 PF07722 Peptidase C26 CsakCS09_RS11880 PF01370 NAD dependent epimerase/dehydratase family CsakCS09_RS11895 PF01634 ATP phosphoribosyltransferase CsakCS09_RS11895 PF08029 HisG, C-terminal domain CsakCS09_RS11900 PF00815 Histidinol dehydrogenase CsakCS09_RS11905 PF00155 Aminotransferase class I and II CsakCS09_RS11910 PF00475 Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase CsakCS09_RS11915 PF00117 Glutamine amidotransferase class-I CsakCS09_RS11920 PF00977 Histidine biosynthesis protein CsakCS09_RS11925 PF00977 Histidine biosynthesis protein CsakCS09_RS11930 PF01502 Phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase CsakCS09_RS11930 PF01503 Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase CsakCS09_RS11935 PF02706 Chain length determinant protein CsakCS09_RS11940 PF03446 NAD binding domain of 6-phosphogluconate dehydrogenase CsakCS09_RS11940 PF00393 6-phosphogluconate dehydrogenase, C-terminal domain CsakCS09_RS11945 PF01370 NAD dependent epimerase/dehydratase family CsakCS09_RS11955 PF13439 Glycosyltransferase Family 4 CsakCS09_RS11955 PF00534 Glycosyl transferases group 1 CsakCS09_RS11965 PF00535 Glycosyl transferase family 2 CsakCS09_RS11970 PF00535 Glycosyl transferase family 2 CsakCS09_RS11980 PF01041 DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family CsakCS09_RS11990 PF05523 WxcM-like, C-terminal CsakCS09_RS11995 PF00483 Nucleotidyl transferase CsakCS09_RS12000 PF16363 GDP-mannose 4,6 dehydratase CsakCS09_RS12005 PF00483 Nucleotidyl transferase CsakCS09_RS12015 PF13439 Glycosyltransferase Family 4 CsakCS09_RS12015 PF00534 Glycosyl transferases group 1 CsakCS09_RS12020 PF04230 Polysaccharide pyruvyl transferase CsakCS09_RS12030 PF02397 Bacterial sugar transferase CsakCS09_RS12035 PF02879 Phosphoglucomutase/phosphomannomutase, alpha/beta/alpha domain II CsakCS09_RS12035 PF02878 Phosphoglucomutase/phosphomannomutase, alpha/beta/alpha domain I CsakCS09_RS12035 PF02880 Phosphoglucomutase/phosphomannomutase, alpha/beta/alpha domain III CsakCS09_RS12035 PF00408 Phosphoglucomutase/phosphomannomutase, C-terminal domain CsakCS09_RS12040 PF01050 Mannose-6-phosphate isomerase CsakCS09_RS12040 PF00483 Nucleotidyl transferase CsakCS09_RS12045 PF13579 Glycosyl transferase 4-like domain CsakCS09_RS12045 PF00534 Glycosyl transferases group 1 CsakCS09_RS12050 PF00293 NUDIX domain CsakCS09_RS12055 PF01370 NAD dependent epimerase/dehydratase family CsakCS09_RS12060 PF16363 GDP-mannose 4,6 dehydratase CsakCS09_RS12070 PF00132 Bacterial transferase hexapeptide (six repeats) CsakCS09_RS12075 PF00535 Glycosyl transferase family 2 CsakCS09_RS12085 PF00534 Glycosyl transferases group 1 CsakCS09_RS12085 PF13439 Glycosyltransferase Family 4 CsakCS09_RS12090 PF00132 Bacterial transferase hexapeptide (six repeats) CsakCS09_RS12095 PF00535 Glycosyl transferase family 2 CsakCS09_RS12100 PF02706 Chain length determinant protein CsakCS09_RS12100 PF13807 G-rich domain on putative tyrosine kinase CsakCS09_RS12100 PF13614 AAA domain CsakCS09_RS12105 PF01451 Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase CsakCS09_RS12110 PF02563 Polysaccharide biosynthesis/export protein CsakCS09_RS12110 PF10531 SLBB domain CsakCS09_RS12110 PF18412 Outer-membrane lipoprotein Wza C-terminal domain CsakCS09_RS12115 PF03471 Transporter associated domain CsakCS09_RS12115 PF03741 Integral membrane protein TerC family CsakCS09_RS12115 PF00571 CBS domain CsakCS09_RS12120 PF05170 AsmA family CsakCS09_RS12125 PF00692 dUTPase CsakCS09_RS12130 PF00485 Phosphoribulokinase / Uridine kinase family CsakCS09_RS12135 PF13426 PAS domain CsakCS09_RS12135 PF00990 Diguanylate cyclase, GGDEF domain CsakCS09_RS12135 PF00563 EAL domain CsakCS09_RS12135 PF08448 PAS fold CsakCS09_RS12135 PF05231 MASE1 CsakCS09_RS12135 PF08447 PAS fold CsakCS09_RS12140 PF00730 HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein CsakCS09_RS12140 PF06029 AlkA N-terminal domain CsakCS09_RS12150 PF00012 Hsp70 protein CsakCS09_RS12160 PF05973 Phage derived protein Gp49-like (DUF891) CsakCS09_RS12165 PF13533 Biotin-lipoyl like CsakCS09_RS12175 PF00873 AcrB/AcrD/AcrF family CsakCS09_RS12180 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS12185 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS12185 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS12185 PF00512 His Kinase A (phospho-acceptor) domain CsakCS09_RS12190 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS12190 PF00486 Transcriptional regulatory protein, C terminal CsakCS09_RS12195 PF01136 Peptidase family U32 CsakCS09_RS12195 PF16325 Peptidase family U32 C-terminal domain CsakCS09_RS12200 PF00781 Diacylglycerol kinase catalytic domain CsakCS09_RS12205 PF01791 DeoC/LacD family aldolase CsakCS09_RS12210 PF08543 Phosphomethylpyrimidine kinase CsakCS09_RS12215 PF02110 Hydroxyethylthiazole kinase family CsakCS09_RS12235 PF11776 Nickel/cobalt transporter regulator CsakCS09_RS12240 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS12240 PF12848 ABC transporter CsakCS09_RS12255 PF02203 Tar ligand binding domain homologue CsakCS09_RS12255 PF00015 Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signalling domain CsakCS09_RS12255 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS12260 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS12260 PF04397 LytTr DNA-binding domain CsakCS09_RS12265 PF06580 Histidine kinase CsakCS09_RS12265 PF07694 5TMR of 5TMR-LYT CsakCS09_RS12275 PF10609 NUBPL iron-transfer P-loop NTPase CsakCS09_RS12290 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS12300 PF01609 Transposase DDE domain CsakCS09_RS12300 PF05598 Transposase domain (DUF772) CsakCS09_RS12315 PF16576 Barrel-sandwich domain of CusB or HlyD membrane-fusion CsakCS09_RS12320 PF09334 tRNA synthetases class I (M) CsakCS09_RS12320 PF01588 Putative tRNA binding domain CsakCS09_RS12325 PF13411 MerR HTH family regulatory protein CsakCS09_RS12335 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS12340 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS12345 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS12350 PF04069 Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system CsakCS09_RS12355 PF00933 Glycosyl hydrolase family 3 N terminal domain CsakCS09_RS12355 PF01915 Glycosyl hydrolase family 3 C-terminal domain CsakCS09_RS12355 PF14310 Fibronectin type III-like domain CsakCS09_RS12360 PF01565 FAD binding domain CsakCS09_RS12360 PF09330 D-lactate dehydrogenase, membrane binding CsakCS09_RS12370 PF00768 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase CsakCS09_RS12375 PF04893 Yip1 domain CsakCS09_RS12380 PF09335 SNARE associated Golgi protein CsakCS09_RS12395 PF00753 Metallo-beta-lactamase superfamily CsakCS09_RS12400 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS12400 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS12405 PF01207 Dihydrouridine synthase (Dus) CsakCS09_RS12410 PF01381 Helix-turn-helix CsakCS09_RS12420 PF03788 LrgA family CsakCS09_RS12425 PF04172 LrgB-like family CsakCS09_RS12430 PF00383 Cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region CsakCS09_RS12430 PF08211 Cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region CsakCS09_RS12435 PF02698 DUF218 domain CsakCS09_RS12445 PF02653 Branched-chain amino acid transport system / permease component CsakCS09_RS12450 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS12455 PF13407 Periplasmic binding protein domain CsakCS09_RS12460 PF00356 Bacterial regulatory proteins, lacI family CsakCS09_RS12470 PF04235 Protein of unknown function (DUF418) CsakCS09_RS12475 PF01227 GTP cyclohydrolase I CsakCS09_RS12480 PF06779 Uncharacterised MFS-type transporter YbfB CsakCS09_RS12485 PF00756 Putative esterase CsakCS09_RS12490 PF00324 Amino acid permease CsakCS09_RS12495 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS12495 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS12500 PF03601 Conserved hypothetical protein 698 CsakCS09_RS12505 PF01261 Xylose isomerase-like TIM barrel CsakCS09_RS12510 PF01261 Xylose isomerase-like TIM barrel CsakCS09_RS12510 PF00903 Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily CsakCS09_RS12515 PF02302 PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIB subunit CsakCS09_RS12515 PF02378 Phosphotransferase system, EIIC CsakCS09_RS12520 PF00294 pfkB family carbohydrate kinase CsakCS09_RS12525 PF00381 PTS HPr component phosphorylation site CsakCS09_RS12525 PF00359 Phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 2 CsakCS09_RS12530 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS12535 PF03692 Putative zinc- or iron-chelating domain CsakCS09_RS12545 PF08207 Elongation factor P (EF-P) KOW-like domain CsakCS09_RS12545 PF09285 Elongation factor P, C-terminal CsakCS09_RS12545 PF01132 Elongation factor P (EF-P) OB domain CsakCS09_RS12550 PF03786 D-mannonate dehydratase (UxuA) CsakCS09_RS12555 PF08125 Mannitol dehydrogenase C-terminal domain CsakCS09_RS12555 PF01232 Mannitol dehydrogenase Rossmann domain CsakCS09_RS12560 PF07683 Cobalamin synthesis protein cobW C-terminal domain CsakCS09_RS12560 PF02492 CobW/HypB/UreG, nucleotide-binding domain CsakCS09_RS12565 PF01569 PAP2 superfamily CsakCS09_RS12570 PF00877 NlpC/P60 family CsakCS09_RS12575 PF00563 EAL domain CsakCS09_RS12575 PF12792 CSS motif domain associated with EAL CsakCS09_RS12580 PF00496 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle CsakCS09_RS12585 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS12590 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS12590 PF12911 N-terminal TM domain of oligopeptide transport permease C CsakCS09_RS12595 PF08352 Oligopeptide/dipeptide transporter, C-terminal region CsakCS09_RS12595 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS12600 PF13989 YejG-like protein CsakCS09_RS12605 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS12610 PF01479 S4 domain CsakCS09_RS12610 PF00849 RNA pseudouridylate synthase CsakCS09_RS12615 PF00271 Helicase conserved C-terminal domain CsakCS09_RS12615 PF04851 Type III restriction enzyme, res subunit CsakCS09_RS12620 PF01386 Ribosomal L25p family CsakCS09_RS12625 PF04245 37-kD nucleoid-associated bacterial protein CsakCS09_RS12630 PF07208 Protein of unknown function (DUF1414) CsakCS09_RS12635 PF00884 Sulfatase CsakCS09_RS12635 PF11893 Domain of unknown function (DUF3413) CsakCS09_RS12645 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS12655 PF01476 LysM domain CsakCS09_RS12655 PF07979 Intimin C-type lectin domain CsakCS09_RS12655 PF11924 Inverse autotransporter, beta-domain CsakCS09_RS12655 PF02368 Bacterial Ig-like domain (group 2) CsakCS09_RS12655 PF02369 Bacterial Ig-like domain (group 1) CsakCS09_RS12680 PF00345 Pili and flagellar-assembly chaperone, PapD N-terminal domain CsakCS09_RS12680 PF02753 Pili assembly chaperone PapD, C-terminal domain CsakCS09_RS12690 PF00916 Sulfate permease family CsakCS09_RS12690 PF01740 STAS domain CsakCS09_RS12695 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS12700 PF13532 2OG-Fe(II) oxygenase superfamily CsakCS09_RS12705 PF02870 6-O-methylguanine DNA methyltransferase, ribonuclease-like domain CsakCS09_RS12705 PF12833 Helix-turn-helix domain CsakCS09_RS12705 PF01035 6-O-methylguanine DNA methyltransferase, DNA binding domain CsakCS09_RS12705 PF02805 Metal binding domain of Ada CsakCS09_RS12710 PF02424 ApbE family CsakCS09_RS12715 PF00267 Gram-negative porin CsakCS09_RS12720 PF01627 Hpt domain CsakCS09_RS12720 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS12720 PF16359 RcsD-ABL domain CsakCS09_RS12725 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS12725 PF00196 Bacterial regulatory proteins, luxR family CsakCS09_RS12730 PF09456 RcsC Alpha-Beta-Loop (ABL) CsakCS09_RS12730 PF00512 His Kinase A (phospho-acceptor) domain CsakCS09_RS12730 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS12730 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS12735 PF00521 DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A CsakCS09_RS12735 PF03989 DNA gyrase C-terminal domain, beta-propeller CsakCS09_RS12750 PF03477 ATP cone domain CsakCS09_RS12750 PF02867 Ribonucleotide reductase, barrel domain CsakCS09_RS12750 PF00317 Ribonucleotide reductase, all-alpha domain CsakCS09_RS12755 PF00268 Ribonucleotide reductase, small chain CsakCS09_RS12760 PF00111 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain CsakCS09_RS12765 PF03009 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family CsakCS09_RS12770 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS12775 PF00994 Probable molybdopterin binding domain CsakCS09_RS12780 PF07437 YfaZ precursor CsakCS09_RS12785 PF00512 His Kinase A (phospho-acceptor) domain CsakCS09_RS12785 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS12790 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS12790 PF00486 Transcriptional regulatory protein, C terminal CsakCS09_RS12795 PF00717 Peptidase S24-like CsakCS09_RS12920 PF03245 Bacteriophage Rz lysis protein CsakCS09_RS12925 PF00959 Phage lysozyme CsakCS09_RS12955 PF05866 Endodeoxyribonuclease RusA CsakCS09_RS12975 PF05772 NinB protein CsakCS09_RS13090 PF00589 Phage integrase family CsakCS09_RS13090 PF13356 Arm DNA-binding domain CsakCS09_RS13105 PF01970 Tripartite tricarboxylate transporter TctA family CsakCS09_RS13110 PF09997 Predicted membrane protein (DUF2238) CsakCS09_RS13115 PF00501 AMP-binding enzyme CsakCS09_RS13115 PF13193 AMP-binding enzyme C-terminal domain CsakCS09_RS13120 PF13378 Enolase C-terminal domain-like CsakCS09_RS13125 PF00378 Enoyl-CoA hydratase/isomerase CsakCS09_RS13130 PF12697 Alpha/beta hydrolase family CsakCS09_RS13135 PF02775 Thiamine pyrophosphate enzyme, C-terminal TPP binding domain CsakCS09_RS13135 PF16582 Middle domain of thiamine pyrophosphate CsakCS09_RS13135 PF02776 Thiamine pyrophosphate enzyme, N-terminal TPP binding domain CsakCS09_RS13140 PF00425 chorismate binding enzyme CsakCS09_RS13145 PF05957 Bacterial protein of unknown function (DUF883) CsakCS09_RS13150 PF13673 Acetyltransferase (GNAT) domain CsakCS09_RS13155 PF12706 Beta-lactamase superfamily domain CsakCS09_RS13160 PF00361 Proton-conducting membrane transporter CsakCS09_RS13165 PF00361 Proton-conducting membrane transporter CsakCS09_RS13170 PF00361 Proton-conducting membrane transporter CsakCS09_RS13170 PF00662 NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 N-terminus CsakCS09_RS13175 PF00420 NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 4L CsakCS09_RS13180 PF00499 NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6 CsakCS09_RS13185 PF12838 4Fe-4S dicluster domain CsakCS09_RS13190 PF00146 NADH dehydrogenase CsakCS09_RS13195 PF04879 Molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 domain CsakCS09_RS13195 PF10588 NADH-ubiquinone oxidoreductase-G iron-sulfur binding region CsakCS09_RS13195 PF00384 Molybdopterin oxidoreductase CsakCS09_RS13195 PF01568 Molydopterin dinucleotide binding domain CsakCS09_RS13200 PF10589 NADH-ubiquinone oxidoreductase-F iron-sulfur binding region CsakCS09_RS13200 PF10531 SLBB domain CsakCS09_RS13200 PF01512 Respiratory-chain NADH dehydrogenase 51 Kd subunit CsakCS09_RS13210 PF00346 Respiratory-chain NADH dehydrogenase, 49 Kd subunit CsakCS09_RS13210 PF00329 Respiratory-chain NADH dehydrogenase, 30 Kd subunit CsakCS09_RS13215 PF01058 NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 Kd subunit CsakCS09_RS13220 PF00507 NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 3 CsakCS09_RS13230 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS13230 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS13235 PF00155 Aminotransferase class I and II CsakCS09_RS13245 PF02080 TrkA-C domain CsakCS09_RS13245 PF03600 Citrate transporter CsakCS09_RS13250 PF13419 Haloacid dehalogenase-like hydrolase CsakCS09_RS13255 PF03887 YfbU domain CsakCS09_RS13260 PF04217 Protein of unknown function, DUF412 CsakCS09_RS13265 PF00871 Acetokinase family CsakCS09_RS13270 PF07085 DRTGG domain CsakCS09_RS13270 PF01515 Phosphate acetyl/butaryl transferase CsakCS09_RS13275 PF06643 Protein of unknown function (DUF1158) CsakCS09_RS13280 PF12833 Helix-turn-helix domain CsakCS09_RS13285 PF16295 Tetracyclin repressor-like, C-terminal domain CsakCS09_RS13285 PF00440 Bacterial regulatory proteins, tetR family CsakCS09_RS13290 PF00293 NUDIX domain CsakCS09_RS13295 PF12850 Calcineurin-like phosphoesterase superfamily domain CsakCS09_RS13300 PF14834 Glutathione S-transferase, C-terminal domain CsakCS09_RS13300 PF02798 Glutathione S-transferase, N-terminal domain CsakCS09_RS13305 PF02798 Glutathione S-transferase, N-terminal domain CsakCS09_RS13305 PF00043 Glutathione S-transferase, C-terminal domain CsakCS09_RS13310 PF08338 Domain of unknown function (DUF1731) CsakCS09_RS13310 PF01370 NAD dependent epimerase/dehydratase family CsakCS09_RS13325 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS13330 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS13335 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS13340 PF00497 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3 CsakCS09_RS13345 PF00497 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3 CsakCS09_RS13350 PF02441 Flavoprotein CsakCS09_RS13355 PF00156 Phosphoribosyl transferase domain CsakCS09_RS13360 PF02674 Colicin V production protein CsakCS09_RS13365 PF05036 Sporulation related domain CsakCS09_RS13370 PF02875 Mur ligase family, glutamate ligase domain CsakCS09_RS13370 PF08245 Mur ligase middle domain CsakCS09_RS13375 PF17848 Acetyl-coA carboxylase zinc finger domain CsakCS09_RS13375 PF01039 Carboxyl transferase domain CsakCS09_RS13380 PF09335 SNARE associated Golgi protein CsakCS09_RS13385 PF01416 tRNA pseudouridine synthase CsakCS09_RS13390 PF02774 Semialdehyde dehydrogenase, dimerisation domain CsakCS09_RS13390 PF01118 Semialdehyde dehydrogenase, NAD binding domain CsakCS09_RS13395 PF00389 D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, catalytic domain CsakCS09_RS13395 PF11890 Domain of unknown function (DUF3410) CsakCS09_RS13395 PF02826 D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD binding domain CsakCS09_RS13405 PF03797 Autotransporter beta-domain CsakCS09_RS13405 PF12951 Passenger-associated-transport-repeat CsakCS09_RS13405 PF00082 Subtilase family CsakCS09_RS13415 PF02801 Beta-ketoacyl synthase, C-terminal domain CsakCS09_RS13415 PF00109 Beta-ketoacyl synthase, N-terminal domain CsakCS09_RS13420 PF01266 FAD dependent oxidoreductase CsakCS09_RS13420 PF05430 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase CsakCS09_RS13425 PF08891 YfcL protein CsakCS09_RS13430 PF04315 Elongation factor P hydroxylase CsakCS09_RS13435 PF01925 Sulfite exporter TauE/SafE CsakCS09_RS13440 PF03411 Penicillin-insensitive murein endopeptidase CsakCS09_RS13445 PF01264 Chorismate synthase CsakCS09_RS13450 PF05175 Methyltransferase small domain CsakCS09_RS13455 PF01713 Smr domain CsakCS09_RS13460 PF00300 Histidine phosphatase superfamily (branch 1) CsakCS09_RS13465 PF00725 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain CsakCS09_RS13465 PF02737 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD binding domain CsakCS09_RS13465 PF00378 Enoyl-CoA hydratase/isomerase CsakCS09_RS13470 PF02803 Thiolase, C-terminal domain CsakCS09_RS13470 PF00108 Thiolase, N-terminal domain CsakCS09_RS13475 PF04175 Protein of unknown function (DUF406) CsakCS09_RS13485 PF03349 Outer membrane protein transport protein (OMPP1/FadL/TodX) CsakCS09_RS13490 PF04333 MlaA lipoprotein CsakCS09_RS13495 PF03918 Cytochrome C biogenesis protein CsakCS09_RS13500 PF03918 Cytochrome C biogenesis protein CsakCS09_RS13505 PF08534 Redoxin CsakCS09_RS13510 PF01578 Cytochrome C assembly protein CsakCS09_RS13510 PF16327 Cytochrome c-type biogenesis protein CcmF C-terminal CsakCS09_RS13515 PF03100 CcmE CsakCS09_RS13520 PF04995 Heme exporter protein D (CcmD) CsakCS09_RS13525 PF01578 Cytochrome C assembly protein CsakCS09_RS13530 PF03379 CcmB protein CsakCS09_RS13535 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS13545 PF01226 Formate/nitrite transporter CsakCS09_RS13555 PF00589 Phage integrase family CsakCS09_RS13555 PF13356 Arm DNA-binding domain CsakCS09_RS13630 PF00230 Major intrinsic protein CsakCS09_RS13635 PF00106 short chain dehydrogenase CsakCS09_RS13640 PF02776 Thiamine pyrophosphate enzyme, N-terminal TPP binding domain CsakCS09_RS13640 PF00205 Thiamine pyrophosphate enzyme, central domain CsakCS09_RS13640 PF02775 Thiamine pyrophosphate enzyme, C-terminal TPP binding domain CsakCS09_RS13645 PF03306 Alpha-acetolactate decarboxylase CsakCS09_RS13650 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS13650 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS13655 PF01544 CorA-like Mg2+ transporter protein CsakCS09_RS13670 PF00155 Aminotransferase class I and II CsakCS09_RS13675 PF07350 Protein of unknown function (DUF1479) CsakCS09_RS13680 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS13680 PF07694 5TMR of 5TMR-LYT CsakCS09_RS13680 PF06580 Histidine kinase CsakCS09_RS13685 PF04397 LytTr DNA-binding domain CsakCS09_RS13685 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS13690 PF02685 Glucokinase CsakCS09_RS13695 PF00205 Thiamine pyrophosphate enzyme, central domain CsakCS09_RS13695 PF02775 Thiamine pyrophosphate enzyme, C-terminal TPP binding domain CsakCS09_RS13695 PF02776 Thiamine pyrophosphate enzyme, N-terminal TPP binding domain CsakCS09_RS13700 PF00248 Aldo/keto reductase family CsakCS09_RS13705 PF10697 Protein of unknown function (DUF2502) CsakCS09_RS13710 PF01566 Natural resistance-associated macrophage protein CsakCS09_RS13715 PF01773 Na+ dependent nucleoside transporter N-terminus CsakCS09_RS13715 PF07670 Nucleoside recognition CsakCS09_RS13715 PF07662 Na+ dependent nucleoside transporter C-terminus CsakCS09_RS13720 PF05231 MASE1 CsakCS09_RS13720 PF00563 EAL domain CsakCS09_RS13735 PF07037 Putative transcription regulator (DUF1323) CsakCS09_RS13745 PF00749 tRNA synthetases class I (E and Q), catalytic domain CsakCS09_RS13780 PF12843 Putative quorum-sensing-regulated virulence factor CsakCS09_RS13785 PF03119 NAD-dependent DNA ligase C4 zinc finger domain CsakCS09_RS13785 PF12826 Helix-hairpin-helix motif CsakCS09_RS13785 PF03120 NAD-dependent DNA ligase OB-fold domain CsakCS09_RS13785 PF01653 NAD-dependent DNA ligase adenylation domain CsakCS09_RS13785 PF00533 BRCA1 C Terminus (BRCT) domain CsakCS09_RS13790 PF04354 ZipA, C-terminal FtsZ-binding domain CsakCS09_RS13800 PF00291 Pyridoxal-phosphate dependent enzyme CsakCS09_RS13805 PF00381 PTS HPr component phosphorylation site CsakCS09_RS13810 PF05524 PEP-utilising enzyme, N-terminal CsakCS09_RS13810 PF02896 PEP-utilising enzyme, TIM barrel domain CsakCS09_RS13810 PF00391 PEP-utilising enzyme, mobile domain CsakCS09_RS13815 PF00358 phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 1 CsakCS09_RS13820 PF17263 Family of unknown function (DUF5329) CsakCS09_RS13825 PF00291 Pyridoxal-phosphate dependent enzyme CsakCS09_RS13830 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS13835 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS13840 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS13850 PF04261 Dyp-type peroxidase family CsakCS09_RS13855 PF06572 Protein of unknown function (DUF1131) CsakCS09_RS13860 PF11143 Protein of unknown function (DUF2919) CsakCS09_RS13865 PF04076 Bacterial OB fold (BOF) protein CsakCS09_RS13870 PF00583 Acetyltransferase (GNAT) family CsakCS09_RS13875 PF01520 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase CsakCS09_RS13880 PF01218 Coproporphyrinogen III oxidase CsakCS09_RS13885 PF01008 Initiation factor 2 subunit family CsakCS09_RS13890 PF01636 Phosphotransferase enzyme family CsakCS09_RS13905 PF02653 Branched-chain amino acid transport system / permease component CsakCS09_RS13910 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS13915 PF00465 Iron-containing alcohol dehydrogenase CsakCS09_RS13920 PF05977 Transmembrane secretion effector CsakCS09_RS13935 PF04328 Selenoprotein, putative CsakCS09_RS13940 PF13722 5TM C-terminal transporter carbon starvation CstA CsakCS09_RS13940 PF02554 Carbon starvation protein CstA CsakCS09_RS13945 PF03061 Thioesterase superfamily CsakCS09_RS13955 PF00550 Phosphopantetheine attachment site CsakCS09_RS13955 PF00857 Isochorismatase family CsakCS09_RS13960 PF13193 AMP-binding enzyme C-terminal domain CsakCS09_RS13960 PF00501 AMP-binding enzyme CsakCS09_RS13965 PF00425 chorismate binding enzyme CsakCS09_RS13970 PF01497 Periplasmic binding protein CsakCS09_RS13975 PF05977 Transmembrane secretion effector CsakCS09_RS13980 PF01032 FecCD transport family CsakCS09_RS13985 PF01032 FecCD transport family CsakCS09_RS13990 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS13995 PF00390 Malic enzyme, N-terminal domain CsakCS09_RS13995 PF01515 Phosphate acetyl/butaryl transferase CsakCS09_RS13995 PF03949 Malic enzyme, NAD binding domain CsakCS09_RS14000 PF00923 Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase CsakCS09_RS14005 PF02779 Transketolase, pyrimidine binding domain CsakCS09_RS14005 PF00456 Transketolase, thiamine diphosphate binding domain CsakCS09_RS14005 PF02780 Transketolase, C-terminal domain CsakCS09_RS14025 PF06674 Protein of unknown function (DUF1176) CsakCS09_RS14030 PF00293 NUDIX domain CsakCS09_RS14035 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS14035 PF00196 Bacterial regulatory proteins, luxR family CsakCS09_RS14040 PF00873 AcrB/AcrD/AcrF family CsakCS09_RS14055 PF03960 ArsC family CsakCS09_RS14060 PF01546 Peptidase family M20/M25/M40 CsakCS09_RS14060 PF07687 Peptidase dimerisation domain CsakCS09_RS14065 PF13980 Uncharacterised protein family (UPF0370) CsakCS09_RS14070 PF02230 Phospholipase/Carboxylesterase CsakCS09_RS14075 PF05127 Helicase CsakCS09_RS14075 PF13718 GNAT acetyltransferase 2 CsakCS09_RS14075 PF17176 tRNA-binding domain CsakCS09_RS14075 PF08351 Domain of unknown function (DUF1726) CsakCS09_RS14080 PF04228 Putative neutral zinc metallopeptidase CsakCS09_RS14085 PF01259 SAICAR synthetase CsakCS09_RS14090 PF06804 NlpB/DapX lipoprotein CsakCS09_RS14095 PF00701 Dihydrodipicolinate synthetase family CsakCS09_RS14100 PF01842 ACT domain CsakCS09_RS14105 PF00578 AhpC/TSA family CsakCS09_RS14110 PF01594 AI-2E family transporter CsakCS09_RS14120 PF01435 Peptidase family M48 CsakCS09_RS14125 PF03960 ArsC family CsakCS09_RS14130 PF00308 Bacterial dnaA protein CsakCS09_RS14135 PF00860 Permease family CsakCS09_RS14145 PF00586 AIR synthase related protein, N-terminal domain CsakCS09_RS14145 PF02769 AIR synthase related protein, C-terminal domain CsakCS09_RS14150 PF00551 Formyl transferase CsakCS09_RS14155 PF17941 Polyphosphate kinase C-terminal domain 1 CsakCS09_RS14155 PF13090 Polyphosphate kinase C-terminal domain 2 CsakCS09_RS14155 PF02503 Polyphosphate kinase middle domain CsakCS09_RS14155 PF13089 Polyphosphate kinase N-terminal domain CsakCS09_RS14160 PF02541 Ppx/GppA phosphatase family CsakCS09_RS14165 PF05231 MASE1 CsakCS09_RS14165 PF00563 EAL domain CsakCS09_RS14170 PF11119 Protein of unknown function (DUF2633) CsakCS09_RS14200 PF01381 Helix-turn-helix CsakCS09_RS14205 PF04610 TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein CsakCS09_RS14240 PF00589 Phage integrase family CsakCS09_RS14240 PF13356 Arm DNA-binding domain CsakCS09_RS14245 PF00117 Glutamine amidotransferase class-I CsakCS09_RS14245 PF00958 GMP synthase C terminal domain CsakCS09_RS14245 PF02540 NAD synthase CsakCS09_RS14250 PF00571 CBS domain CsakCS09_RS14250 PF00478 IMP dehydrogenase / GMP reductase domain CsakCS09_RS14255 PF02601 Exonuclease VII, large subunit CsakCS09_RS14255 PF13742 OB-fold nucleic acid binding domain CsakCS09_RS14260 PF02868 Thermolysin metallopeptidase, alpha-helical domain CsakCS09_RS14260 PF16485 Protealysin propeptide CsakCS09_RS14260 PF01447 Thermolysin metallopeptidase, catalytic domain CsakCS09_RS14270 PF07191 zinc-ribbons CsakCS09_RS14275 PF14714 KH-domain-like of EngA bacterial GTPase enzymes, C-terminal CsakCS09_RS14275 PF01926 50S ribosome-binding GTPase CsakCS09_RS14280 PF13360 PQQ-like domain CsakCS09_RS14285 PF09976 Tetratricopeptide repeat-like domain CsakCS09_RS14290 PF13393 Histidyl-tRNA synthetase CsakCS09_RS14290 PF03129 Anticodon binding domain CsakCS09_RS14295 PF04551 GcpE protein CsakCS09_RS14300 PF13464 Domain of unknown function (DUF4115) CsakCS09_RS14310 PF04055 Radical SAM superfamily CsakCS09_RS14315 PF00334 Nucleoside diphosphate kinase CsakCS09_RS14320 PF06832 Penicillin-Binding Protein C-terminus Family CsakCS09_RS14320 PF00912 Transglycosylase CsakCS09_RS14320 PF00905 Penicillin binding protein transpeptidase domain CsakCS09_RS14325 PF11974 Bacterial alpha-2-macroglobulin MG3 domain CsakCS09_RS14325 PF17973 Bacterial Alpha-2-macroglobulin MG10 domain CsakCS09_RS14325 PF17970 Bacterial Alpha-2-macroglobulin MG1 domain CsakCS09_RS14325 PF07703 Alpha-2-macroglobulin bait region domain CsakCS09_RS14325 PF17962 Bacterial macroglobulin domain 6 CsakCS09_RS14325 PF00207 Alpha-2-macroglobulin family CsakCS09_RS14325 PF17972 Bacterial Alpha-2-macroglobulin MG5 domain CsakCS09_RS14325 PF01835 MG2 domain CsakCS09_RS14325 PF07678 A-macroglobulin TED domain CsakCS09_RS14330 PF00358 phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 1 CsakCS09_RS14330 PF00367 phosphotransferase system, EIIB CsakCS09_RS14330 PF02378 Phosphotransferase system, EIIC CsakCS09_RS14335 PF02056 Family 4 glycosyl hydrolase CsakCS09_RS14335 PF11975 Family 4 glycosyl hydrolase C-terminal domain CsakCS09_RS14340 PF00581 Rhodanese-like domain CsakCS09_RS14345 PF01418 Helix-turn-helix domain, rpiR family CsakCS09_RS14345 PF01380 SIS domain CsakCS09_RS14360 PF07179 SseB protein N-terminal domain CsakCS09_RS14360 PF14581 SseB protein C-terminal domain CsakCS09_RS14365 PF12404 Peptidase CsakCS09_RS14365 PF00883 Cytosol aminopeptidase family, catalytic domain CsakCS09_RS14370 PF04384 Iron-sulphur cluster assembly CsakCS09_RS14375 PF00111 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain CsakCS09_RS14380 PF00012 Hsp70 protein CsakCS09_RS14385 PF07743 HSCB C-terminal oligomerisation domain CsakCS09_RS14390 PF01521 Iron-sulphur cluster biosynthesis CsakCS09_RS14395 PF01592 NifU-like N terminal domain CsakCS09_RS14400 PF00266 Aminotransferase class-V CsakCS09_RS14405 PF02082 Transcriptional regulator CsakCS09_RS14410 PF00588 SpoU rRNA Methylase family CsakCS09_RS14415 PF00459 Inositol monophosphatase family CsakCS09_RS14420 PF03824 High-affinity nickel-transport protein CsakCS09_RS14425 PF06226 Protein of unknown function (DUF1007) CsakCS09_RS14430 PF00874 PRD domain CsakCS09_RS14435 PF12832 MFS_1 like family CsakCS09_RS14445 PF13411 MerR HTH family regulatory protein CsakCS09_RS14450 PF00464 Serine hydroxymethyltransferase CsakCS09_RS14455 PF00042 Globin CsakCS09_RS14455 PF00970 Oxidoreductase FAD-binding domain CsakCS09_RS14455 PF00175 Oxidoreductase NAD-binding domain CsakCS09_RS14460 PF00543 Nitrogen regulatory protein P-II CsakCS09_RS14465 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS14465 PF00158 Sigma-54 interaction domain CsakCS09_RS14470 PF13942 YfhG lipoprotein CsakCS09_RS14475 PF00512 His Kinase A (phospho-acceptor) domain CsakCS09_RS14475 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS14480 PF02769 AIR synthase related protein, C-terminal domain CsakCS09_RS14480 PF18072 Formylglycinamide ribonucleotide amidotransferase linker domain CsakCS09_RS14480 PF18076 Formylglycinamide ribonucleotide amidotransferase N-terminal CsakCS09_RS14490 PF14437 MafB19-like deaminase CsakCS09_RS14500 PF02378 Phosphotransferase system, EIIC CsakCS09_RS14500 PF00367 phosphotransferase system, EIIB CsakCS09_RS14505 PF01380 SIS domain CsakCS09_RS14510 PF01380 SIS domain CsakCS09_RS14510 PF01418 Helix-turn-helix domain, rpiR family CsakCS09_RS14515 PF12838 4Fe-4S dicluster domain CsakCS09_RS14520 PF01648 4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily CsakCS09_RS14525 PF03740 Pyridoxal phosphate biosynthesis protein PdxJ CsakCS09_RS14530 PF02565 Recombination protein O C terminal CsakCS09_RS14530 PF11967 Recombination protein O N terminal CsakCS09_RS14535 PF07650 KH domain CsakCS09_RS14535 PF01926 50S ribosome-binding GTPase CsakCS09_RS14540 PF14622 Ribonuclease-III-like CsakCS09_RS14540 PF00035 Double-stranded RNA binding motif CsakCS09_RS14550 PF10502 Signal peptidase, peptidase S26 CsakCS09_RS14555 PF06421 GTP-binding protein LepA C-terminus CsakCS09_RS14555 PF03144 Elongation factor Tu domain 2 CsakCS09_RS14555 PF00009 Elongation factor Tu GTP binding domain CsakCS09_RS14555 PF00679 Elongation factor G C-terminus CsakCS09_RS14570 PF17188 MucB/RseB C-terminal domain CsakCS09_RS14570 PF03888 MucB/RseB N-terminal domain CsakCS09_RS14575 PF03873 Anti sigma-E protein RseA, C-terminal domain CsakCS09_RS14575 PF03872 Anti sigma-E protein RseA, N-terminal domain CsakCS09_RS14580 PF08281 Sigma-70, region 4 CsakCS09_RS14580 PF04542 Sigma-70 region 2 CsakCS09_RS14585 PF02910 Fumarate reductase flavoprotein C-term CsakCS09_RS14585 PF00890 FAD binding domain CsakCS09_RS14590 PF05175 Methyltransferase small domain CsakCS09_RS14595 PF00271 Helicase conserved C-terminal domain CsakCS09_RS14595 PF00270 DEAD/DEAH box helicase CsakCS09_RS14600 PF01228 Glycine radical CsakCS09_RS14605 PF03167 Uracil DNA glycosylase superfamily CsakCS09_RS14610 PF00588 SpoU rRNA Methylase family CsakCS09_RS14610 PF08032 RNA 2'-O ribose methyltransferase substrate binding CsakCS09_RS14615 PF00085 Thioredoxin CsakCS09_RS14620 PF03942 DTW domain CsakCS09_RS14625 PF13380 CoA binding domain CsakCS09_RS14625 PF00583 Acetyltransferase (GNAT) family CsakCS09_RS14625 PF13607 Succinyl-CoA ligase like flavodoxin domain CsakCS09_RS14630 PF13091 PLD-like domain CsakCS09_RS14635 PF10043 Predicted periplasmic lipoprotein (DUF2279) CsakCS09_RS14640 PF00083 Sugar (and other) transporter CsakCS09_RS14650 PF02775 Thiamine pyrophosphate enzyme, C-terminal TPP binding domain CsakCS09_RS14650 PF00205 Thiamine pyrophosphate enzyme, central domain CsakCS09_RS14650 PF02776 Thiamine pyrophosphate enzyme, N-terminal TPP binding domain CsakCS09_RS14660 PF03205 Molybdopterin guanine dinucleotide synthesis protein B CsakCS09_RS14690 PF10431 C-terminal, D2-small domain, of ClpB protein CsakCS09_RS14690 PF02861 Clp amino terminal domain, pathogenicity island component CsakCS09_RS14690 PF17871 AAA lid domain CsakCS09_RS14690 PF07724 AAA domain (Cdc48 subfamily) CsakCS09_RS14690 PF00004 ATPase family associated with various cellular activities (AAA) CsakCS09_RS14695 PF02578 Multi-copper polyphenol oxidoreductase laccase CsakCS09_RS14700 PF00849 RNA pseudouridylate synthase CsakCS09_RS14700 PF01479 S4 domain CsakCS09_RS14705 PF13525 Outer membrane lipoprotein CsakCS09_RS14715 PF02482 Sigma 54 modulation protein / S30EA ribosomal protein CsakCS09_RS14720 PF01817 Chorismate mutase type II CsakCS09_RS14720 PF00800 Prephenate dehydratase CsakCS09_RS14725 PF08450 SMP-30/Gluconolactonase/LRE-like region CsakCS09_RS14730 PF01817 Chorismate mutase type II CsakCS09_RS14730 PF02153 Prephenate dehydrogenase CsakCS09_RS14735 PF00793 DAHP synthetase I family CsakCS09_RS14750 PF01245 Ribosomal protein L19 CsakCS09_RS14755 PF01746 tRNA (Guanine-1)-methyltransferase CsakCS09_RS14760 PF05239 PRC-barrel domain CsakCS09_RS14760 PF01782 RimM N-terminal domain CsakCS09_RS14765 PF00886 Ribosomal protein S16 CsakCS09_RS14770 PF02978 Signal peptide binding domain CsakCS09_RS14770 PF02881 SRP54-type protein, helical bundle domain CsakCS09_RS14770 PF00448 SRP54-type protein, GTPase domain CsakCS09_RS14775 PF01578 Cytochrome C assembly protein CsakCS09_RS14780 PF01595 Cyclin M transmembrane N-terminal domain CsakCS09_RS14780 PF00571 CBS domain CsakCS09_RS14780 PF03471 Transporter associated domain CsakCS09_RS14785 PF01025 GrpE CsakCS09_RS14795 PF01513 ATP-NAD kinase CsakCS09_RS14800 PF02463 RecF/RecN/SMC N terminal domain CsakCS09_RS14805 PF04355 SmpA / OmlA family CsakCS09_RS14810 PF03658 RnfH family Ubiquitin CsakCS09_RS14815 PF03364 Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport CsakCS09_RS14820 PF01668 SmpB protein CsakCS09_RS14855 PF12728 Helix-turn-helix domain CsakCS09_RS14855 PF00145 C-5 cytosine-specific DNA methylase CsakCS09_RS14880 PF02413 Caudovirales tail fibre assembly protein, lambda gpK CsakCS09_RS14995 PF05840 Bacteriophage replication gene A protein (GPA) CsakCS09_RS15000 PF02086 D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase CsakCS09_RS15005 PF12961 Domain of unknown function (DUF3850) CsakCS09_RS15030 PF06892 Phage regulatory protein CII (CP76) CsakCS09_RS15040 PF02899 Phage integrase, N-terminal SAM-like domain CsakCS09_RS15040 PF00589 Phage integrase family CsakCS09_RS15045 PF18766 SWI2/SNF2 ATPase CsakCS09_RS15045 PF04313 Type I restriction enzyme R protein N terminus (HSDR_N) CsakCS09_RS15045 PF11867 Domain of unknown function (DUF3387) CsakCS09_RS15080 PF05598 Transposase domain (DUF772) CsakCS09_RS15080 PF01609 Transposase DDE domain CsakCS09_RS15085 PF00015 Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signalling domain CsakCS09_RS15085 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS15085 PF02743 Cache domain CsakCS09_RS15090 PF01679 Proteolipid membrane potential modulator CsakCS09_RS15105 PF06610 L-alanine exporter CsakCS09_RS15110 PF09400 Protein of unknown function (DUF2002) CsakCS09_RS15115 PF05957 Bacterial protein of unknown function (DUF883) CsakCS09_RS15120 PF00462 Glutaredoxin CsakCS09_RS15125 PF07972 NrdI Flavodoxin like CsakCS09_RS15130 PF08343 Ribonucleotide reductase N-terminal CsakCS09_RS15130 PF00317 Ribonucleotide reductase, all-alpha domain CsakCS09_RS15130 PF02867 Ribonucleotide reductase, barrel domain CsakCS09_RS15135 PF00268 Ribonucleotide reductase, small chain CsakCS09_RS15140 PF00571 CBS domain CsakCS09_RS15140 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS15145 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS15150 PF04069 Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system CsakCS09_RS15155 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS15165 PF01047 MarR family CsakCS09_RS15170 PF16576 Barrel-sandwich domain of CusB or HlyD membrane-fusion CsakCS09_RS15170 PF00529 HlyD membrane-fusion protein of T1SS CsakCS09_RS15175 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS15180 PF00563 EAL domain CsakCS09_RS15180 PF00990 Diguanylate cyclase, GGDEF domain CsakCS09_RS15180 PF03707 Bacterial signalling protein N terminal repeat CsakCS09_RS15185 PF02664 S-Ribosylhomocysteinase (LuxS) CsakCS09_RS15190 PF04262 Glutamate-cysteine ligase CsakCS09_RS15195 PF09335 SNARE associated Golgi protein CsakCS09_RS15200 PF13419 Haloacid dehalogenase-like hydrolase CsakCS09_RS15235 PF02599 Global regulator protein family CsakCS09_RS15240 PF02272 DHHA1 domain CsakCS09_RS15240 PF01411 tRNA synthetases class II (A) CsakCS09_RS15240 PF07973 Threonyl and Alanyl tRNA synthetase second additional domain CsakCS09_RS15245 PF02631 RecX family CsakCS09_RS15250 PF00154 recA bacterial DNA recombination protein CsakCS09_RS15255 PF02464 Competence-damaged protein CsakCS09_RS15260 PF13406 Transglycosylase SLT domain CsakCS09_RS15265 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS15270 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS15275 PF00497 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3 CsakCS09_RS15285 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS15285 PF02203 Tar ligand binding domain homologue CsakCS09_RS15285 PF00015 Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signalling domain CsakCS09_RS15295 PF05190 MutS family domain IV CsakCS09_RS15295 PF00488 MutS domain V CsakCS09_RS15295 PF01624 MutS domain I CsakCS09_RS15295 PF05188 MutS domain II CsakCS09_RS15295 PF05192 MutS domain III CsakCS09_RS15305 PF01977 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase CsakCS09_RS15310 PF02441 Flavoprotein CsakCS09_RS15315 PF01047 MarR family CsakCS09_RS15320 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS15320 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS15325 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS15335 PF00140 Sigma-70 factor, region 1.2 CsakCS09_RS15335 PF04545 Sigma-70, region 4 CsakCS09_RS15335 PF04539 Sigma-70 region 3 CsakCS09_RS15335 PF04542 Sigma-70 region 2 CsakCS09_RS15340 PF01551 Peptidase family M23 CsakCS09_RS15340 PF01476 LysM domain CsakCS09_RS15350 PF01975 Survival protein SurE CsakCS09_RS15355 PF01142 tRNA pseudouridine synthase D (TruD) CsakCS09_RS15360 PF02542 YgbB family CsakCS09_RS15365 PF01128 2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase CsakCS09_RS15370 PF04977 Septum formation initiator CsakCS09_RS15375 PF12084 Protein of unknown function (DUF3561) CsakCS09_RS15385 PF00009 Elongation factor Tu GTP binding domain CsakCS09_RS15390 PF01507 Phosphoadenosine phosphosulfate reductase family CsakCS09_RS15395 PF10414 Sirohaem synthase dimerisation region CsakCS09_RS15395 PF14824 Sirohaem biosynthesis protein central CsakCS09_RS15395 PF00590 Tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) Methylases CsakCS09_RS15400 PF04389 Peptidase family M28 CsakCS09_RS15405 PF01507 Phosphoadenosine phosphosulfate reductase family CsakCS09_RS15410 PF01077 Nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S domain CsakCS09_RS15410 PF03460 Nitrite/Sulfite reductase ferredoxin-like half domain CsakCS09_RS15415 PF00667 FAD binding domain CsakCS09_RS15415 PF00258 Flavodoxin CsakCS09_RS15415 PF00175 Oxidoreductase NAD-binding domain CsakCS09_RS15420 PF01242 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase CsakCS09_RS15425 PF04055 Radical SAM superfamily CsakCS09_RS15430 PF04536 TPM domain CsakCS09_RS15435 PF04131 Putative N-acetylmannosamine-6-phosphate epimerase CsakCS09_RS15440 PF00367 phosphotransferase system, EIIB CsakCS09_RS15440 PF02378 Phosphotransferase system, EIIC CsakCS09_RS15440 PF00358 phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 1 CsakCS09_RS15445 PF01380 SIS domain CsakCS09_RS15445 PF01418 Helix-turn-helix domain, rpiR family CsakCS09_RS15455 PF00113 Enolase, C-terminal TIM barrel domain CsakCS09_RS15455 PF03952 Enolase, N-terminal domain CsakCS09_RS15460 PF06418 CTP synthase N-terminus CsakCS09_RS15460 PF00117 Glutamine amidotransferase class-I CsakCS09_RS15465 PF03819 MazG nucleotide pyrophosphohydrolase domain CsakCS09_RS15470 PF13291 ACT domain CsakCS09_RS15470 PF04607 Region found in RelA / SpoT proteins CsakCS09_RS15470 PF02824 TGS domain CsakCS09_RS15475 PF01938 TRAM domain CsakCS09_RS15475 PF05958 tRNA (Uracil-5-)-methyltransferase CsakCS09_RS15480 PF09984 Uncharacterised signal transduction histidine kinase domain (DUF2222) CsakCS09_RS15480 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS15480 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS15480 PF00512 His Kinase A (phospho-acceptor) domain CsakCS09_RS15480 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS15480 PF01627 Hpt domain CsakCS09_RS15485 PF00258 Flavodoxin CsakCS09_RS15490 PF00849 RNA pseudouridylate synthase CsakCS09_RS15495 PF04287 tRNA pseudouridine synthase C CsakCS09_RS15500 PF07348 Syd protein (SUKH-2) CsakCS09_RS15505 PF14489 QueF-like protein CsakCS09_RS15505 PF14819 Nitrile reductase, 7-cyano-7-deazaguanine-reductase N-term CsakCS09_RS15510 PF11892 Domain of unknown function (DUF3412) CsakCS09_RS15510 PF14793 Pyrimidine/purine nucleotide 5'-monophosphate nucleosidases CsakCS09_RS15510 PF03641 Possible lysine decarboxylase CsakCS09_RS15520 PF03313 Serine dehydratase alpha chain CsakCS09_RS15520 PF03315 Serine dehydratase beta chain CsakCS09_RS15525 PF02739 5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain CsakCS09_RS15525 PF01367 5'-3' exonuclease, C-terminal SAM fold CsakCS09_RS15530 PF01728 FtsJ-like methyltransferase CsakCS09_RS15530 PF18125 RlmM ferredoxin-like domain CsakCS09_RS15535 PF04241 Protein of unknown function (DUF423) CsakCS09_RS15540 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS15540 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS15545 PF06004 Bacterial protein of unknown function (DUF903) CsakCS09_RS15550 PF00266 Aminotransferase class-V CsakCS09_RS15555 PF02657 Fe-S metabolism associated domain CsakCS09_RS15560 PF00899 ThiF family CsakCS09_RS15565 PF03562 MltA specific insert domain CsakCS09_RS15565 PF06725 3D domain CsakCS09_RS15575 PF11741 AMIN domain CsakCS09_RS15575 PF01520 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase CsakCS09_RS15580 PF00696 Amino acid kinase family CsakCS09_RS15580 PF00583 Acetyltransferase (GNAT) family CsakCS09_RS15585 PF13538 UvrD-like helicase C-terminal domain CsakCS09_RS15590 PF00580 UvrD/REP helicase N-terminal domain CsakCS09_RS15590 PF12705 PD-(D/E)XK nuclease superfamily CsakCS09_RS15590 PF13361 UvrD-like helicase C-terminal domain CsakCS09_RS15595 PF00675 Insulinase (Peptidase family M16) CsakCS09_RS15595 PF16187 Middle or third domain of peptidase_M16 CsakCS09_RS15595 PF05193 Peptidase M16 inactive domain CsakCS09_RS15600 PF17946 RecC C-terminal domain CsakCS09_RS15605 PF07963 Prokaryotic N-terminal methylation motif CsakCS09_RS15605 PF12528 Type II secretion prepilin peptidase dependent protein C CsakCS09_RS15610 PF10713 Protein of unknown function (DUF2509) CsakCS09_RS15615 PF07963 Prokaryotic N-terminal methylation motif CsakCS09_RS15620 PF07963 Prokaryotic N-terminal methylation motif CsakCS09_RS15625 PF00303 Thymidylate synthase CsakCS09_RS15630 PF01790 Prolipoprotein diacylglyceryl transferase CsakCS09_RS15635 PF01590 GAF domain CsakCS09_RS15635 PF05524 PEP-utilising enzyme, N-terminal CsakCS09_RS15635 PF02896 PEP-utilising enzyme, TIM barrel domain CsakCS09_RS15635 PF00391 PEP-utilising enzyme, mobile domain CsakCS09_RS15640 PF00293 NUDIX domain CsakCS09_RS15645 PF02976 DNA mismatch repair enzyme MutH CsakCS09_RS15650 PF03741 Integral membrane protein TerC family CsakCS09_RS15655 PF06004 Bacterial protein of unknown function (DUF903) CsakCS09_RS15660 PF00248 Aldo/keto reductase family CsakCS09_RS15665 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS15670 PF00501 AMP-binding enzyme CsakCS09_RS15670 PF01553 Acyltransferase CsakCS09_RS15675 PF00356 Bacterial regulatory proteins, lacI family CsakCS09_RS15685 PF00392 Bacterial regulatory proteins, gntR family CsakCS09_RS15685 PF07729 FCD domain CsakCS09_RS15690 PF02302 PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIB subunit CsakCS09_RS15695 PF00232 Glycosyl hydrolase family 1 CsakCS09_RS15700 PF02378 Phosphotransferase system, EIIC CsakCS09_RS15705 PF00356 Bacterial regulatory proteins, lacI family CsakCS09_RS15710 PF02784 Pyridoxal-dependent decarboxylase, pyridoxal binding domain CsakCS09_RS15710 PF00278 Pyridoxal-dependent decarboxylase, C-terminal sheet domain CsakCS09_RS15715 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS15715 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS15720 PF01177 Asp/Glu/Hydantoin racemase CsakCS09_RS15730 PF02706 Chain length determinant protein CsakCS09_RS15735 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS15740 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS15745 PF03459 TOBE domain CsakCS09_RS15745 PF17912 MalK OB fold domain CsakCS09_RS15745 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS15765 PF14583 Oligogalacturonate lyase CsakCS09_RS15770 PF06178 Oligogalacturonate-specific porin protein (KdgM) CsakCS09_RS15775 PF02803 Thiolase, C-terminal domain CsakCS09_RS15775 PF00108 Thiolase, N-terminal domain CsakCS09_RS15780 PF15977 Winged helix-turn-helix DNA binding CsakCS09_RS15785 PF01810 LysE type translocator CsakCS09_RS15865 PF00270 DEAD/DEAH box helicase CsakCS09_RS15865 PF09382 RQC domain CsakCS09_RS15865 PF16124 RecQ zinc-binding CsakCS09_RS15865 PF00570 HRDC domain CsakCS09_RS15865 PF00271 Helicase conserved C-terminal domain CsakCS09_RS15870 PF00239 Resolvase, N terminal domain CsakCS09_RS15870 PF02796 Helix-turn-helix domain of resolvase CsakCS09_RS15885 PF01476 LysM domain CsakCS09_RS15885 PF01551 Peptidase family M23 CsakCS09_RS15890 PF01336 OB-fold nucleic acid binding domain CsakCS09_RS15890 PF00152 tRNA synthetases class II (D, K and N) CsakCS09_RS15900 PF01368 DHH family CsakCS09_RS15900 PF02272 DHHA1 domain CsakCS09_RS15900 PF17768 RecJ OB domain CsakCS09_RS15905 PF13098 Thioredoxin-like domain CsakCS09_RS15905 PF10411 Disulfide bond isomerase protein N-terminus CsakCS09_RS15910 PF00589 Phage integrase family CsakCS09_RS15910 PF02899 Phage integrase, N-terminal SAM-like domain CsakCS09_RS15915 PF00258 Flavodoxin CsakCS09_RS15920 PF07254 Membrane-bound toxin component of toxin-antitoxin system CsakCS09_RS15925 PF03937 Flavinator of succinate dehydrogenase CsakCS09_RS15930 PF01571 Aminomethyltransferase folate-binding domain CsakCS09_RS15935 PF03006 Haemolysin-III related CsakCS09_RS15940 PF04266 ASCH domain CsakCS09_RS15945 PF01418 Helix-turn-helix domain, rpiR family CsakCS09_RS15945 PF01380 SIS domain CsakCS09_RS15950 PF00232 Glycosyl hydrolase family 1 CsakCS09_RS15960 PF02347 Glycine cleavage system P-protein CsakCS09_RS15965 PF01597 Glycine cleavage H-protein CsakCS09_RS15970 PF08669 Glycine cleavage T-protein C-terminal barrel domain CsakCS09_RS15970 PF01571 Aminomethyltransferase folate-binding domain CsakCS09_RS15975 PF01494 FAD binding domain CsakCS09_RS15980 PF01494 FAD binding domain CsakCS09_RS15985 PF05195 Aminopeptidase P, N-terminal domain CsakCS09_RS15985 PF00557 Metallopeptidase family M24 CsakCS09_RS15990 PF03695 Uncharacterised protein family (UPF0149) CsakCS09_RS16000 PF05164 Cell division protein ZapA CsakCS09_RS16010 PF01812 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family CsakCS09_RS16015 PF00389 D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, catalytic domain CsakCS09_RS16015 PF01842 ACT domain CsakCS09_RS16015 PF02826 D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD binding domain CsakCS09_RS16020 PF06026 Ribose 5-phosphate isomerase A (phosphoriboisomerase A) CsakCS09_RS16025 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS16025 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS16030 PF04402 Protein of unknown function (DUF541) CsakCS09_RS16035 PF01810 LysE type translocator CsakCS09_RS16040 PF05552 Conserved TM helix CsakCS09_RS16040 PF00924 Mechanosensitive ion channel CsakCS09_RS16045 PF01116 Fructose-bisphosphate aldolase class-II CsakCS09_RS16050 PF00162 Phosphoglycerate kinase CsakCS09_RS16055 PF00044 Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase, NAD binding domain CsakCS09_RS16055 PF02800 Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase, C-terminal domain CsakCS09_RS16060 PF03747 ADP-ribosylglycohydrolase CsakCS09_RS16065 PF02780 Transketolase, C-terminal domain CsakCS09_RS16065 PF02779 Transketolase, pyrimidine binding domain CsakCS09_RS16065 PF00456 Transketolase, thiamine diphosphate binding domain CsakCS09_RS16070 PF01435 Peptidase family M48 CsakCS09_RS16075 PF00491 Arginase family CsakCS09_RS16080 PF17810 Arginine decarboxylase helical bundle domain CsakCS09_RS16080 PF17944 Arginine decarboxylase C-terminal helical extension CsakCS09_RS16080 PF02784 Pyridoxal-dependent decarboxylase, pyridoxal binding domain CsakCS09_RS16085 PF11036 Virulence promoting factor CsakCS09_RS16095 PF00438 S-adenosylmethionine synthetase, N-terminal domain CsakCS09_RS16095 PF02773 S-adenosylmethionine synthetase, C-terminal domain CsakCS09_RS16095 PF02772 S-adenosylmethionine synthetase, central domain CsakCS09_RS16100 PF00083 Sugar (and other) transporter CsakCS09_RS16105 PF17283 SprT-like zinc ribbon domain CsakCS09_RS16105 PF10263 SprT-like family CsakCS09_RS16110 PF04231 Endonuclease I CsakCS09_RS16115 PF04452 RNA methyltransferase CsakCS09_RS16120 PF02955 Prokaryotic glutathione synthetase, ATP-grasp domain CsakCS09_RS16120 PF02951 Prokaryotic glutathione synthetase, N-terminal domain CsakCS09_RS16125 PF02622 Uncharacterized ACR, COG1678 CsakCS09_RS16130 PF03652 Holliday junction resolvase CsakCS09_RS16145 PF00437 Type II/IV secretion system protein CsakCS09_RS16150 PF01168 Alanine racemase, N-terminal domain CsakCS09_RS16155 PF02325 YGGT family CsakCS09_RS16160 PF02594 Uncharacterised ACR, YggU family COG1872 CsakCS09_RS16165 PF01725 Ham1 family CsakCS09_RS16170 PF06969 HemN C-terminal domain CsakCS09_RS16170 PF04055 Radical SAM superfamily CsakCS09_RS16175 PF07732 Multicopper oxidase CsakCS09_RS16175 PF07731 Multicopper oxidase CsakCS09_RS16175 PF00394 Multicopper oxidase CsakCS09_RS16180 PF01553 Acyltransferase CsakCS09_RS16185 PF03989 DNA gyrase C-terminal domain, beta-propeller CsakCS09_RS16185 PF00521 DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A CsakCS09_RS16195 PF02525 Flavodoxin-like fold CsakCS09_RS16200 PF03992 Antibiotic biosynthesis monooxygenase CsakCS09_RS16205 PF00141 Peroxidase CsakCS09_RS16210 PF01751 Toprim domain CsakCS09_RS16210 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS16210 PF00986 DNA gyrase B subunit, carboxyl terminus CsakCS09_RS16210 PF00204 DNA gyrase B CsakCS09_RS16215 PF05728 Uncharacterised protein family (UPF0227) CsakCS09_RS16220 PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase CsakCS09_RS16225 PF06853 Protein of unknown function (DUF1249) CsakCS09_RS16230 PF00293 NUDIX domain CsakCS09_RS16235 PF02321 Outer membrane efflux protein CsakCS09_RS16240 PF06693 Protein of unknown function (DUF1190) CsakCS09_RS16245 PF03738 Glutathionylspermidine synthase preATP-grasp CsakCS09_RS16250 PF02900 Catalytic LigB subunit of aromatic ring-opening dioxygenase CsakCS09_RS16255 PF02535 ZIP Zinc transporter CsakCS09_RS16260 PF00926 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase CsakCS09_RS16265 PF04380 Membrane fusogenic activity CsakCS09_RS16270 PF01467 Cytidylyltransferase-like CsakCS09_RS16270 PF00294 pfkB family carbohydrate kinase CsakCS09_RS16275 PF03710 Glutamate-ammonia ligase adenylyltransferase CsakCS09_RS16275 PF08335 GlnD PII-uridylyltransferase CsakCS09_RS16280 PF01928 CYTH domain CsakCS09_RS16285 PF08239 Bacterial SH3 domain CsakCS09_RS16290 PF01743 Poly A polymerase head domain CsakCS09_RS16290 PF12627 Probable RNA and SrmB- binding site of polymerase A CsakCS09_RS16290 PF01966 HD domain CsakCS09_RS16295 PF02673 Bacitracin resistance protein BacA CsakCS09_RS16300 PF02152 Dihydroneopterin aldolase CsakCS09_RS16305 PF02660 Glycerol-3-phosphate acyltransferase CsakCS09_RS16310 PF00814 Glycoprotease family CsakCS09_RS16320 PF01165 Ribosomal protein S21 CsakCS09_RS16325 PF08275 DNA primase catalytic core, N-terminal domain CsakCS09_RS16325 PF10410 DnaB-helicase binding domain of primase CsakCS09_RS16325 PF08278 DNA primase DnaG DnaB-binding CsakCS09_RS16325 PF01807 CHC2 zinc finger CsakCS09_RS16330 PF03979 Sigma-70 factor, region 1.1 CsakCS09_RS16330 PF04539 Sigma-70 region 3 CsakCS09_RS16330 PF00140 Sigma-70 factor, region 1.2 CsakCS09_RS16330 PF04546 Sigma-70, non-essential region CsakCS09_RS16330 PF04542 Sigma-70 region 2 CsakCS09_RS16330 PF04545 Sigma-70, region 4 CsakCS09_RS16340 PF03167 Uracil DNA glycosylase superfamily CsakCS09_RS16420 PF09695 Bacterial protein of unknown function (YtfJ_HI0045) CsakCS09_RS16430 PF00348 Polyprenyl synthetase CsakCS09_RS16435 PF01070 FMN-dependent dehydrogenase CsakCS09_RS16440 PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase CsakCS09_RS16450 PF01593 Flavin containing amine oxidoreductase CsakCS09_RS16460 PF04116 Fatty acid hydroxylase superfamily CsakCS09_RS16465 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS16465 PF00015 Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signalling domain CsakCS09_RS16465 PF02203 Tar ligand binding domain homologue CsakCS09_RS16470 PF02554 Carbon starvation protein CstA CsakCS09_RS16470 PF13722 5TM C-terminal transporter carbon starvation CstA CsakCS09_RS16475 PF04328 Selenoprotein, putative CsakCS09_RS16480 PF02492 CobW/HypB/UreG, nucleotide-binding domain CsakCS09_RS16480 PF07683 Cobalamin synthesis protein cobW C-terminal domain CsakCS09_RS16500 PF11101 Protein of unknown function (DUF2884) CsakCS09_RS16505 PF04320 Protein with unknown function (DUF469) CsakCS09_RS16510 PF02390 Putative methyltransferase CsakCS09_RS16515 PF14815 NUDIX domain CsakCS09_RS16515 PF00633 Helix-hairpin-helix motif CsakCS09_RS16515 PF00730 HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein CsakCS09_RS16515 PF10576 Iron-sulfur binding domain of endonuclease III CsakCS09_RS16520 PF04362 Bacterial Fe(2+) trafficking CsakCS09_RS16525 PF01464 Transglycosylase SLT domain CsakCS09_RS16525 PF11873 Membrane-bound lytic murein transglycosylase C, N-terminal domain CsakCS09_RS16530 PF01874 ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase CsakCS09_RS16535 PF03802 Apo-citrate lyase phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase CsakCS09_RS16540 PF04223 Citrate lyase, alpha subunit (CitF) CsakCS09_RS16545 PF03328 HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family CsakCS09_RS16550 PF06857 Malonate decarboxylase delta subunit (MdcD) CsakCS09_RS16555 PF08218 Citrate lyase ligase C-terminal domain CsakCS09_RS16555 PF00583 Acetyltransferase (GNAT) family CsakCS09_RS16560 PF01557 Fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family CsakCS09_RS16565 PF03390 2-hydroxycarboxylate transporter family CsakCS09_RS16570 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS16570 PF17203 Single cache domain 3 CsakCS09_RS16575 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS16575 PF12431 Transcriptional regulator CsakCS09_RS16580 PF03709 Orn/Lys/Arg decarboxylase, N-terminal domain CsakCS09_RS16580 PF01276 Orn/Lys/Arg decarboxylase, major domain CsakCS09_RS16580 PF03711 Orn/Lys/Arg decarboxylase, C-terminal domain CsakCS09_RS16585 PF04474 Protein of unknown function (DUF554) CsakCS09_RS16595 PF09906 Uncharacterized protein conserved in bacteria (DUF2135) CsakCS09_RS16600 PF08486 Stage II sporulation protein CsakCS09_RS16600 PF10062 Predicted secreted protein (DUF2300) CsakCS09_RS16605 PF00207 Alpha-2-macroglobulin family CsakCS09_RS16605 PF07703 Alpha-2-macroglobulin bait region domain CsakCS09_RS16605 PF01835 MG2 domain CsakCS09_RS16610 PF06672 Protein of unknown function (DUF1175) CsakCS09_RS16615 PF09909 Uncharacterized protein conserved in bacteria (DUF2138) CsakCS09_RS16630 PF03062 MBOAT, membrane-bound O-acyltransferase family CsakCS09_RS16665 PF04717 Type VI secretion system, phage-baseplate injector CsakCS09_RS16670 PF09997 Predicted membrane protein (DUF2238) CsakCS09_RS16675 PF00356 Bacterial regulatory proteins, lacI family CsakCS09_RS16680 PF02302 PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIB subunit CsakCS09_RS16685 PF02378 Phosphotransferase system, EIIC CsakCS09_RS16690 PF02255 PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIA subunit CsakCS09_RS16695 PF02264 LamB porin CsakCS09_RS16700 PF00924 Mechanosensitive ion channel CsakCS09_RS16705 PF03350 Uncharacterized protein family, UPF0114 CsakCS09_RS16725 PF00455 DeoR C terminal sensor domain CsakCS09_RS16725 PF08220 DeoR-like helix-turn-helix domain CsakCS09_RS16735 PF02472 Biopolymer transport protein ExbD/TolR CsakCS09_RS16740 PF01618 MotA/TolQ/ExbB proton channel family CsakCS09_RS16750 PF01053 Cys/Met metabolism PLP-dependent enzyme CsakCS09_RS16755 PF09335 SNARE associated Golgi protein CsakCS09_RS16760 PF12833 Helix-turn-helix domain CsakCS09_RS16760 PF06719 AraC-type transcriptional regulator N-terminus CsakCS09_RS16765 PF00465 Iron-containing alcohol dehydrogenase CsakCS09_RS16770 PF00248 Aldo/keto reductase family CsakCS09_RS16775 PF12883 Protein of unknown function (DUF3828) CsakCS09_RS16785 PF13417 Glutathione S-transferase, N-terminal domain CsakCS09_RS16785 PF04399 Glutaredoxin 2, C terminal domain CsakCS09_RS16790 PF00440 Bacterial regulatory proteins, tetR family CsakCS09_RS16795 PF00356 Bacterial regulatory proteins, lacI family CsakCS09_RS16800 PF02378 Phosphotransferase system, EIIC CsakCS09_RS16800 PF00367 phosphotransferase system, EIIB CsakCS09_RS16805 PF00128 Alpha amylase, catalytic domain CsakCS09_RS16805 PF11941 Domain of unknown function (DUF3459) CsakCS09_RS16810 PF02525 Flavodoxin-like fold CsakCS09_RS16815 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS16815 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS16820 PF13597 Anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase CsakCS09_RS16820 PF03477 ATP cone domain CsakCS09_RS16830 PF05016 ParE toxin of type II toxin-antitoxin system, parDE CsakCS09_RS16835 PF04221 RelB antitoxin CsakCS09_RS16840 PF00359 Phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 2 CsakCS09_RS16840 PF08279 HTH domain CsakCS09_RS16840 PF05043 Mga helix-turn-helix domain CsakCS09_RS16840 PF00874 PRD domain CsakCS09_RS16845 PF07071 KDGP aldolase CsakCS09_RS16850 PF03841 L-seryl-tRNA selenium transferase CsakCS09_RS16855 PF01979 Amidohydrolase family CsakCS09_RS16890 PF07361 Cytochrome b562 CsakCS09_RS16895 PF01523 Putative modulator of DNA gyrase CsakCS09_RS16900 PF04751 Protein of unknown function (DUF615) CsakCS09_RS16910 PF02875 Mur ligase family, glutamate ligase domain CsakCS09_RS16910 PF08245 Mur ligase middle domain CsakCS09_RS16910 PF01225 Mur ligase family, catalytic domain CsakCS09_RS16915 PF00316 Fructose-1-6-bisphosphatase, N-terminal domain CsakCS09_RS16920 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS16920 PF00015 Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signalling domain CsakCS09_RS16920 PF02203 Tar ligand binding domain homologue CsakCS09_RS16925 PF02653 Branched-chain amino acid transport system / permease component CsakCS09_RS16930 PF02653 Branched-chain amino acid transport system / permease component CsakCS09_RS16935 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS16940 PF13407 Periplasmic binding protein domain CsakCS09_RS16945 PF00719 Inorganic pyrophosphatase CsakCS09_RS16950 PF02203 Tar ligand binding domain homologue CsakCS09_RS16950 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS16950 PF00015 Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signalling domain CsakCS09_RS16955 PF06094 Gamma-glutamyl cyclotransferase, AIG2-like CsakCS09_RS16960 PF04357 TamB, inner membrane protein subunit of TAM complex CsakCS09_RS16965 PF07244 Surface antigen variable number repeat CsakCS09_RS16965 PF01103 Surface antigen CsakCS09_RS16965 PF17243 POTRA domain TamA domain 1 CsakCS09_RS16970 PF01625 Peptide methionine sulfoxide reductase CsakCS09_RS16980 PF01595 Cyclin M transmembrane N-terminal domain CsakCS09_RS16980 PF03471 Transporter associated domain CsakCS09_RS16980 PF00571 CBS domain CsakCS09_RS16985 PF06526 Protein of unknown function (DUF1107) CsakCS09_RS16990 PF09695 Bacterial protein of unknown function (YtfJ_HI0045) CsakCS09_RS16995 PF00459 Inositol monophosphatase family CsakCS09_RS17000 PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase CsakCS09_RS17000 PF02872 5'-nucleotidase, C-terminal domain CsakCS09_RS17005 PF01638 HxlR-like helix-turn-helix CsakCS09_RS17010 PF05368 NmrA-like family CsakCS09_RS17020 PF12833 Helix-turn-helix domain CsakCS09_RS17020 PF02805 Metal binding domain of Ada CsakCS09_RS17020 PF01035 6-O-methylguanine DNA methyltransferase, DNA binding domain CsakCS09_RS17020 PF02870 6-O-methylguanine DNA methyltransferase, ribonuclease-like domain CsakCS09_RS17030 PF00892 EamA-like transporter family CsakCS09_RS17035 PF00015 Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signalling domain CsakCS09_RS17035 PF02203 Tar ligand binding domain homologue CsakCS09_RS17035 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS17040 PF01814 Hemerythrin HHE cation binding domain CsakCS09_RS17040 PF04405 Domain of Unknown function (DUF542) CsakCS09_RS17045 PF00324 Amino acid permease CsakCS09_RS17050 PF01346 Domain amino terminal to FKBP-type peptidyl-prolyl isomerase CsakCS09_RS17050 PF00254 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CsakCS09_RS17060 PF04225 Opacity-associated protein A LysM-like domain CsakCS09_RS17060 PF08525 Opacity-associated protein A N-terminal motif CsakCS09_RS17065 PF03948 Ribosomal protein L9, C-terminal domain CsakCS09_RS17065 PF01281 Ribosomal protein L9, N-terminal domain CsakCS09_RS17070 PF01084 Ribosomal protein S18 CsakCS09_RS17075 PF00436 Single-strand binding protein family CsakCS09_RS17080 PF01250 Ribosomal protein S6 CsakCS09_RS17085 PF00326 Prolyl oligopeptidase family CsakCS09_RS17090 PF07338 Protein of unknown function (DUF1471) CsakCS09_RS17095 PF07338 Protein of unknown function (DUF1471) CsakCS09_RS17100 PF02203 Tar ligand binding domain homologue CsakCS09_RS17100 PF00015 Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signalling domain CsakCS09_RS17100 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS17105 PF02770 Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain CsakCS09_RS17105 PF00441 Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain CsakCS09_RS17105 PF18158 Adaptive response protein AidB N-terminal domain CsakCS09_RS17110 PF03738 Glutathionylspermidine synthase preATP-grasp CsakCS09_RS17115 PF06693 Protein of unknown function (DUF1190) CsakCS09_RS17120 PF03994 Domain of Unknown Function (DUF350) CsakCS09_RS17125 PF00588 SpoU rRNA Methylase family CsakCS09_RS17125 PF08032 RNA 2'-O ribose methyltransferase substrate binding CsakCS09_RS17130 PF00575 S1 RNA binding domain CsakCS09_RS17130 PF08206 Ribonuclease B OB domain CsakCS09_RS17130 PF00773 RNB domain CsakCS09_RS17130 PF08461 Ribonuclease R winged-helix domain CsakCS09_RS17130 PF17876 Cold shock domain CsakCS09_RS17135 PF02082 Transcriptional regulator CsakCS09_RS17140 PF00709 Adenylosuccinate synthetase CsakCS09_RS17145 PF09838 Uncharacterized protein conserved in bacteria (DUF2065) CsakCS09_RS17150 PF01145 SPFH domain / Band 7 family CsakCS09_RS17155 PF12221 Bacterial membrane protein N terminal CsakCS09_RS17155 PF01145 SPFH domain / Band 7 family CsakCS09_RS17160 PF01926 50S ribosome-binding GTPase CsakCS09_RS17160 PF16360 GTP-binding GTPase Middle Region CsakCS09_RS17160 PF13167 GTP-binding GTPase N-terminal CsakCS09_RS17165 PF17209 Hfq protein CsakCS09_RS17175 PF01119 DNA mismatch repair protein, C-terminal domain CsakCS09_RS17175 PF08676 MutL C terminal dimerisation domain CsakCS09_RS17180 PF01520 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase CsakCS09_RS17185 PF02367 Threonylcarbamoyl adenosine biosynthesis protein TsaE CsakCS09_RS17190 PF01256 Carbohydrate kinase CsakCS09_RS17190 PF03853 YjeF-related protein N-terminus CsakCS09_RS17195 PF08331 Domain of unknown function (DUF1730) CsakCS09_RS17220 PF00929 Exonuclease CsakCS09_RS17225 PF03193 RsgA GTPase CsakCS09_RS17230 PF02666 Phosphatidylserine decarboxylase CsakCS09_RS17235 PF12795 Mechanosensitive ion channel porin domain CsakCS09_RS17235 PF00924 Mechanosensitive ion channel CsakCS09_RS17235 PF12794 Mechanosensitive ion channel inner membrane domain 1 CsakCS09_RS17240 PF00152 tRNA synthetases class II (D, K and N) CsakCS09_RS17245 PF02910 Fumarate reductase flavoprotein C-term CsakCS09_RS17245 PF00890 FAD binding domain CsakCS09_RS17250 PF13085 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain CsakCS09_RS17250 PF13183 4Fe-4S dicluster domain CsakCS09_RS17255 PF02300 Fumarate reductase subunit C CsakCS09_RS17260 PF02313 Fumarate reductase subunit D CsakCS09_RS17265 PF08212 Lipocalin-like domain CsakCS09_RS17270 PF00893 Small Multidrug Resistance protein CsakCS09_RS17275 PF00196 Bacterial regulatory proteins, luxR family CsakCS09_RS17280 PF08085 Entericidin EcnA/B family CsakCS09_RS17285 PF08085 Entericidin EcnA/B family CsakCS09_RS17290 PF01132 Elongation factor P (EF-P) OB domain CsakCS09_RS17290 PF08207 Elongation factor P (EF-P) KOW-like domain CsakCS09_RS17290 PF09285 Elongation factor P, C-terminal CsakCS09_RS17295 PF04055 Radical SAM superfamily CsakCS09_RS17300 PF13698 Domain of unknown function (DUF4156) CsakCS09_RS17305 PF00118 TCP-1/cpn60 chaperonin family CsakCS09_RS17310 PF00166 Chaperonin 10 Kd subunit CsakCS09_RS17315 PF04186 FxsA cytoplasmic membrane protein CsakCS09_RS17320 PF00206 Lyase CsakCS09_RS17320 PF10415 Fumarase C C-terminus CsakCS09_RS17325 PF03605 Anaerobic c4-dicarboxylate membrane transporter CsakCS09_RS17330 PF03091 CutA1 divalent ion tolerance protein CsakCS09_RS17335 PF02683 Cytochrome C biogenesis protein transmembrane region CsakCS09_RS17335 PF11412 Disulphide bond corrector protein DsbC CsakCS09_RS17350 PF00589 Phage integrase family CsakCS09_RS17350 PF13356 Arm DNA-binding domain CsakCS09_RS17365 PF02384 N-6 DNA Methylase CsakCS09_RS17430 PF00816 H-NS histone family CsakCS09_RS17485 PF04717 Type VI secretion system, phage-baseplate injector CsakCS09_RS17495 PF03824 High-affinity nickel-transport protein CsakCS09_RS17500 PF02798 Glutathione S-transferase, N-terminal domain CsakCS09_RS17505 PF04962 KduI/IolB family CsakCS09_RS17510 PF03812 2-keto-3-deoxygluconate permease CsakCS09_RS17515 PF13990 YjcZ-like protein CsakCS09_RS17520 PF00350 Dynamin family CsakCS09_RS17525 PF08274 PhnA Zinc-Ribbon CsakCS09_RS17525 PF03831 PhnA domain CsakCS09_RS17530 PF05845 Bacterial phosphonate metabolism protein (PhnH) CsakCS09_RS17545 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS17545 PF00183 Hsp90 protein CsakCS09_RS17565 PF00375 Sodium:dicarboxylate symporter family CsakCS09_RS17570 PF00501 AMP-binding enzyme CsakCS09_RS17570 PF16177 Acetyl-coenzyme A synthetase N-terminus CsakCS09_RS17570 PF13193 AMP-binding enzyme C-terminal domain CsakCS09_RS17575 PF04341 Protein of unknown function, DUF485 CsakCS09_RS17580 PF00474 Sodium:solute symporter family CsakCS09_RS17585 PF02894 Oxidoreductase family, C-terminal alpha/beta domain CsakCS09_RS17585 PF01408 Oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold CsakCS09_RS17590 PF00999 Sodium/hydrogen exchanger family CsakCS09_RS17595 PF00860 Permease family CsakCS09_RS17600 PF13417 Glutathione S-transferase, N-terminal domain CsakCS09_RS17605 PF00376 MerR family regulatory protein CsakCS09_RS17605 PF09278 MerR, DNA binding CsakCS09_RS17610 PF12833 Helix-turn-helix domain CsakCS09_RS17615 PF00563 EAL domain CsakCS09_RS17615 PF12792 CSS motif domain associated with EAL CsakCS09_RS17620 PF15940 Family of unknown function CsakCS09_RS17630 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS17630 PF00990 Diguanylate cyclase, GGDEF domain CsakCS09_RS17635 PF00436 Single-strand binding protein family CsakCS09_RS17645 PF17760 UvrA interaction domain CsakCS09_RS17645 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS17645 PF17755 UvrA DNA-binding domain CsakCS09_RS17660 PF04237 YjbR CsakCS09_RS17665 PF01894 Uncharacterised protein family UPF0047 CsakCS09_RS17670 PF08479 POTRA domain, ShlB-type CsakCS09_RS17670 PF17287 POTRA domain CsakCS09_RS17670 PF03865 Haemolysin secretion/activation protein ShlB/FhaC/HecB CsakCS09_RS17675 PF00155 Aminotransferase class I and II CsakCS09_RS17680 PF00842 Alanine racemase, C-terminal domain CsakCS09_RS17680 PF01168 Alanine racemase, N-terminal domain CsakCS09_RS17685 PF00772 DnaB-like helicase N terminal domain CsakCS09_RS17685 PF03796 DnaB-like helicase C terminal domain CsakCS09_RS17690 PF08240 Alcohol dehydrogenase GroES-like domain CsakCS09_RS17690 PF00107 Zinc-binding dehydrogenase CsakCS09_RS17695 PF09583 Phage shock protein G (Phageshock_PspG) CsakCS09_RS17700 PF01207 Dihydrouridine synthase (Dus) CsakCS09_RS17715 PF01475 Ferric uptake regulator family CsakCS09_RS17720 PF05532 CsbD-like CsakCS09_RS17725 PF01554 MatE CsakCS09_RS17730 PF01726 LexA DNA binding domain CsakCS09_RS17730 PF00717 Peptidase S24-like CsakCS09_RS17735 PF01219 Prokaryotic diacylglycerol kinase CsakCS09_RS17740 PF01553 Acyltransferase CsakCS09_RS17745 PF01040 UbiA prenyltransferase family CsakCS09_RS17750 PF04345 Chorismate lyase CsakCS09_RS17755 PF07148 Maltose operon periplasmic protein precursor (MalM) CsakCS09_RS17760 PF02264 LamB porin CsakCS09_RS17765 PF17912 MalK OB fold domain CsakCS09_RS17765 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS17775 PF01547 Bacterial extracellular solute-binding protein CsakCS09_RS17780 PF14785 Maltose transport system permease protein MalF P2 domain CsakCS09_RS17780 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS17785 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS17795 PF00132 Bacterial transferase hexapeptide (six repeats) CsakCS09_RS17795 PF12804 MobA-like NTP transferase domain CsakCS09_RS17795 PF14602 Hexapeptide repeat of succinyl-transferase CsakCS09_RS17800 PF06082 Exopolysaccharide biosynthesis protein YbjH CsakCS09_RS17805 PF06251 Capsule biosynthesis GfcC CsakCS09_RS17810 PF11102 Group 4 capsule polysaccharide lipoprotein gfcB, YjbF CsakCS09_RS17815 PF11106 Exopolysaccharide production protein YjbE CsakCS09_RS17820 PF00342 Phosphoglucose isomerase CsakCS09_RS17830 PF01842 ACT domain CsakCS09_RS17830 PF00696 Amino acid kinase family CsakCS09_RS17835 PF10127 RNA repair pathway DNA polymerase beta family CsakCS09_RS17840 PF01139 tRNA-splicing ligase RtcB CsakCS09_RS17855 PF00158 Sigma-54 interaction domain CsakCS09_RS17855 PF06956 Regulator of RNA terminal phosphate cyclase CsakCS09_RS17860 PF01758 Sodium Bile acid symporter family CsakCS09_RS17865 PF11656 YjbD family (DUF3811) CsakCS09_RS17875 PF02690 Na+/Pi-cotransporter CsakCS09_RS17880 PF02574 Homocysteine S-methyltransferase CsakCS09_RS17880 PF00809 Pterin binding enzyme CsakCS09_RS17880 PF02607 B12 binding domain CsakCS09_RS17880 PF02310 B12 binding domain CsakCS09_RS17880 PF02965 Vitamin B12 dependent methionine synthase, activation domain CsakCS09_RS17890 PF01614 Bacterial transcriptional regulator CsakCS09_RS17890 PF09339 IclR helix-turn-helix domain CsakCS09_RS17895 PF06315 Isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase (AceK) CsakCS09_RS17900 PF00463 Isocitrate lyase family CsakCS09_RS17905 PF01274 Malate synthase CsakCS09_RS17910 PF04204 Homoserine O-succinyltransferase CsakCS09_RS17940 PF00132 Bacterial transferase hexapeptide (six repeats) CsakCS09_RS17945 PF07369 Protein of unknown function (DUF1488) CsakCS09_RS17950 PF01488 Shikimate / quinate 5-dehydrogenase CsakCS09_RS17950 PF18317 Shikimate 5'-dehydrogenase C-terminal domain CsakCS09_RS17950 PF08501 Shikimate dehydrogenase substrate binding domain CsakCS09_RS17955 PF01300 Telomere recombination CsakCS09_RS17960 PF01396 Topoisomerase DNA binding C4 zinc finger CsakCS09_RS17965 PF04361 Protein of unknown function (DUF494) CsakCS09_RS17970 PF02481 DNA recombination-mediator protein A CsakCS09_RS17970 PF17782 DprA winged helix domain CsakCS09_RS17975 PF01327 Polypeptide deformylase CsakCS09_RS17980 PF02911 Formyl transferase, C-terminal domain CsakCS09_RS17980 PF00551 Formyl transferase CsakCS09_RS17985 PF01189 16S rRNA methyltransferase RsmB/F CsakCS09_RS17985 PF01029 NusB family CsakCS09_RS17990 PF02254 TrkA-N domain CsakCS09_RS17990 PF02080 TrkA-C domain CsakCS09_RS17995 PF01741 Large-conductance mechanosensitive channel, MscL CsakCS09_RS18000 PF03889 Alternative ribosome-rescue factor A CsakCS09_RS18005 PF13411 MerR HTH family regulatory protein CsakCS09_RS18010 PF09350 Domain of unknown function (DUF1992) CsakCS09_RS18015 PF01196 Ribosomal protein L17 CsakCS09_RS18020 PF03118 Bacterial RNA polymerase, alpha chain C terminal domain CsakCS09_RS18020 PF01000 RNA polymerase Rpb3/RpoA insert domain CsakCS09_RS18020 PF01193 RNA polymerase Rpb3/Rpb11 dimerisation domain CsakCS09_RS18025 PF01479 S4 domain CsakCS09_RS18025 PF00163 Ribosomal protein S4/S9 N-terminal domain CsakCS09_RS18030 PF00411 Ribosomal protein S11 CsakCS09_RS18035 PF00416 Ribosomal protein S13/S18 CsakCS09_RS18040 PF00444 Ribosomal protein L36 CsakCS09_RS18045 PF00344 SecY translocase CsakCS09_RS18050 PF00828 Ribosomal proteins 50S-L15, 50S-L18e, 60S-L27A CsakCS09_RS18055 PF00327 Ribosomal protein L30p/L7e CsakCS09_RS18060 PF03719 Ribosomal protein S5, C-terminal domain CsakCS09_RS18060 PF00333 Ribosomal protein S5, N-terminal domain CsakCS09_RS18065 PF00861 Ribosomal L18 of archaea, bacteria, mitoch. and chloroplast CsakCS09_RS18070 PF00347 Ribosomal protein L6 CsakCS09_RS18075 PF00410 Ribosomal protein S8 CsakCS09_RS18080 PF00253 Ribosomal protein S14p/S29e CsakCS09_RS18085 PF00281 Ribosomal protein L5 CsakCS09_RS18085 PF00673 ribosomal L5P family C-terminus CsakCS09_RS18090 PF17136 Ribosomal proteins 50S L24/mitochondrial 39S L24 CsakCS09_RS18090 PF00467 KOW motif CsakCS09_RS18095 PF00238 Ribosomal protein L14p/L23e CsakCS09_RS18100 PF00366 Ribosomal protein S17 CsakCS09_RS18105 PF00831 Ribosomal L29 protein CsakCS09_RS18110 PF00252 Ribosomal protein L16p/L10e CsakCS09_RS18115 PF07650 KH domain CsakCS09_RS18115 PF00189 Ribosomal protein S3, C-terminal domain CsakCS09_RS18120 PF00237 Ribosomal protein L22p/L17e CsakCS09_RS18125 PF00203 Ribosomal protein S19 CsakCS09_RS18130 PF00181 Ribosomal Proteins L2, RNA binding domain CsakCS09_RS18130 PF03947 Ribosomal Proteins L2, C-terminal domain CsakCS09_RS18135 PF00276 Ribosomal protein L23 CsakCS09_RS18140 PF00573 Ribosomal protein L4/L1 family CsakCS09_RS18145 PF00297 Ribosomal protein L3 CsakCS09_RS18150 PF00338 Ribosomal protein S10p/S20e CsakCS09_RS18155 PF01478 Type IV leader peptidase family CsakCS09_RS18160 PF00210 Ferritin-like domain CsakCS09_RS18165 PF04324 BFD-like [2Fe-2S] binding domain CsakCS09_RS18175 PF03144 Elongation factor Tu domain 2 CsakCS09_RS18175 PF03143 Elongation factor Tu C-terminal domain CsakCS09_RS18175 PF00009 Elongation factor Tu GTP binding domain CsakCS09_RS18180 PF03764 Elongation factor G, domain IV CsakCS09_RS18180 PF03144 Elongation factor Tu domain 2 CsakCS09_RS18180 PF14492 Elongation Factor G, domain II CsakCS09_RS18180 PF00679 Elongation factor G C-terminus CsakCS09_RS18180 PF00009 Elongation factor Tu GTP binding domain CsakCS09_RS18185 PF00177 Ribosomal protein S7p/S5e CsakCS09_RS18190 PF00164 Ribosomal protein S12/S23 CsakCS09_RS18195 PF04077 DsrH like protein CsakCS09_RS18200 PF02635 DsrE/DsrF-like family CsakCS09_RS18205 PF02635 DsrE/DsrF-like family CsakCS09_RS18210 PF13309 HTH domain CsakCS09_RS18210 PF08348 YheO-like PAS domain CsakCS09_RS18215 PF00254 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CsakCS09_RS18215 PF01346 Domain amino terminal to FKBP-type peptidyl-prolyl isomerase CsakCS09_RS18220 PF04102 SlyX CsakCS09_RS18225 PF00254 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CsakCS09_RS18230 PF09526 Probable metal-binding protein (DUF2387) CsakCS09_RS18235 PF00999 Sodium/hydrogen exchanger family CsakCS09_RS18235 PF02254 TrkA-N domain CsakCS09_RS18240 PF02525 Flavodoxin-like fold CsakCS09_RS18245 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS18245 PF12848 ABC transporter CsakCS09_RS18250 PF05816 Toxic anion resistance protein (TelA) CsakCS09_RS18260 PF04095 Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family CsakCS09_RS18265 PF13793 N-terminal domain of ribose phosphate pyrophosphokinase CsakCS09_RS18265 PF14572 Phosphoribosyl synthetase-associated domain CsakCS09_RS18275 PF00561 alpha/beta hydrolase fold CsakCS09_RS18280 PF06794 Uncharacterised protein family (UPF0270) CsakCS09_RS18285 PF00485 Phosphoribulokinase / Uridine kinase family CsakCS09_RS18290 PF02566 OsmC-like protein CsakCS09_RS18295 PF00027 Cyclic nucleotide-binding domain CsakCS09_RS18295 PF13545 Crp-like helix-turn-helix domain CsakCS09_RS18300 PF12805 FUSC-like inner membrane protein yccS CsakCS09_RS18305 PF00202 Aminotransferase class-III CsakCS09_RS18310 PF00117 Glutamine amidotransferase class-I CsakCS09_RS18315 PF02661 Fic/DOC family CsakCS09_RS18320 PF10832 Protein of unknown function (DUF2559) CsakCS09_RS18325 PF00160 Cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/CLD CsakCS09_RS18330 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS18335 PF03460 Nitrite/Sulfite reductase ferredoxin-like half domain CsakCS09_RS18335 PF01077 Nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S domain CsakCS09_RS18335 PF04324 BFD-like [2Fe-2S] binding domain CsakCS09_RS18335 PF18267 Rubredoxin NAD+ reductase C-terminal domain CsakCS09_RS18335 PF07992 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase CsakCS09_RS18340 PF13806 Rieske-like [2Fe-2S] domain CsakCS09_RS18345 PF10414 Sirohaem synthase dimerisation region CsakCS09_RS18345 PF14824 Sirohaem biosynthesis protein central CsakCS09_RS18345 PF00590 Tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) Methylases CsakCS09_RS18350 PF13520 Amino acid permease CsakCS09_RS18355 PF01380 SIS domain CsakCS09_RS18360 PF01261 Xylose isomerase-like TIM barrel CsakCS09_RS18365 PF00294 pfkB family carbohydrate kinase CsakCS09_RS18370 PF00392 Bacterial regulatory proteins, gntR family CsakCS09_RS18370 PF07702 UTRA domain CsakCS09_RS18375 PF13978 Protein of unknown function (DUF4223) CsakCS09_RS18380 PF00579 tRNA synthetases class I (W and Y) CsakCS09_RS18385 PF13419 Haloacid dehalogenase-like hydrolase CsakCS09_RS18390 PF00834 Ribulose-phosphate 3 epimerase family CsakCS09_RS18395 PF02086 D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase CsakCS09_RS18400 PF05036 Sporulation related domain CsakCS09_RS18405 PF01761 3-dehydroquinate synthase CsakCS09_RS18410 PF01202 Shikimate kinase CsakCS09_RS18415 PF00263 Bacterial type II and III secretion system protein CsakCS09_RS18415 PF03958 Bacterial type II/III secretion system short domain CsakCS09_RS18440 PF00905 Penicillin binding protein transpeptidase domain CsakCS09_RS18440 PF17092 Penicillin-binding protein OB-like domain CsakCS09_RS18440 PF00912 Transglycosylase CsakCS09_RS18445 PF00293 NUDIX domain CsakCS09_RS18450 PF07095 Intracellular growth attenuator protein IgaA CsakCS09_RS18455 PF13419 Haloacid dehalogenase-like hydrolase CsakCS09_RS18460 PF01479 S4 domain CsakCS09_RS18465 PF01430 Hsp33 protein CsakCS09_RS18470 PF13687 Domain of unknown function (DUF4153) CsakCS09_RS18480 PF01293 Phosphoenolpyruvate carboxykinase CsakCS09_RS18485 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS18485 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS18485 PF00512 His Kinase A (phospho-acceptor) domain CsakCS09_RS18490 PF00486 Transcriptional regulatory protein, C terminal CsakCS09_RS18490 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS18495 PF03449 Transcription elongation factor, N-terminal CsakCS09_RS18495 PF01272 Transcription elongation factor, GreA/GreB, C-term CsakCS09_RS18500 PF17674 HHH domain CsakCS09_RS18500 PF00575 S1 RNA binding domain CsakCS09_RS18500 PF16921 Tex protein YqgF-like domain CsakCS09_RS18500 PF09371 Tex-like protein N-terminal domain CsakCS09_RS18505 PF04023 FeoA domain CsakCS09_RS18510 PF07670 Nucleoside recognition CsakCS09_RS18510 PF02421 Ferrous iron transport protein B CsakCS09_RS18510 PF07664 Ferrous iron transport protein B C terminus CsakCS09_RS18510 PF17910 FeoB cytosolic helical domain CsakCS09_RS18515 PF09012 FeoC like transcriptional regulator CsakCS09_RS18525 PF00561 alpha/beta hydrolase fold CsakCS09_RS18530 PF00156 Phosphoribosyl transferase domain CsakCS09_RS18535 PF01521 Iron-sulphur cluster biosynthesis CsakCS09_RS18535 PF01106 NifU-like domain CsakCS09_RS18540 PF00313 'Cold-shock' DNA-binding domain CsakCS09_RS18545 PF02446 4-alpha-glucanotransferase CsakCS09_RS18550 PF00343 Carbohydrate phosphorylase CsakCS09_RS18555 PF17874 MalT-like TPR region CsakCS09_RS18555 PF00196 Bacterial regulatory proteins, luxR family CsakCS09_RS18560 PF08220 DeoR-like helix-turn-helix domain CsakCS09_RS18560 PF00455 DeoR C terminal sensor domain CsakCS09_RS18565 PF12122 Cytoplasmic N-terminal domain of rhomboid serine protease CsakCS09_RS18565 PF01694 Rhomboid family CsakCS09_RS18570 PF00581 Rhodanese-like domain CsakCS09_RS18575 PF16901 C-terminal domain of alpha-glycerophosphate oxidase CsakCS09_RS18575 PF01266 FAD dependent oxidoreductase CsakCS09_RS18580 PF00360 Phytochrome region CsakCS09_RS18580 PF00990 Diguanylate cyclase, GGDEF domain CsakCS09_RS18580 PF00563 EAL domain CsakCS09_RS18580 PF01590 GAF domain CsakCS09_RS18590 PF00343 Carbohydrate phosphorylase CsakCS09_RS18595 PF00534 Glycosyl transferases group 1 CsakCS09_RS18595 PF08323 Starch synthase catalytic domain CsakCS09_RS18600 PF00483 Nucleotidyl transferase CsakCS09_RS18605 PF02922 Carbohydrate-binding module 48 (Isoamylase N-terminal domain) CsakCS09_RS18605 PF00128 Alpha amylase, catalytic domain CsakCS09_RS18605 PF18390 Glycogen debranching enzyme C-terminal domain CsakCS09_RS18610 PF00128 Alpha amylase, catalytic domain CsakCS09_RS18610 PF02806 Alpha amylase, C-terminal all-beta domain CsakCS09_RS18610 PF02922 Carbohydrate-binding module 48 (Isoamylase N-terminal domain) CsakCS09_RS18615 PF02774 Semialdehyde dehydrogenase, dimerisation domain CsakCS09_RS18615 PF01118 Semialdehyde dehydrogenase, NAD binding domain CsakCS09_RS18620 PF01914 MarC family integral membrane protein CsakCS09_RS18630 PF02447 GntP family permease CsakCS09_RS18635 PF01202 Shikimate kinase CsakCS09_RS18640 PF00356 Bacterial regulatory proteins, lacI family CsakCS09_RS18640 PF00532 Periplasmic binding proteins and sugar binding domain of LacI family CsakCS09_RS18645 PF02678 Pirin CsakCS09_RS18645 PF17954 Quercetinase C-terminal cupin domain CsakCS09_RS18650 PF01408 Oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold CsakCS09_RS18650 PF02894 Oxidoreductase family, C-terminal alpha/beta domain CsakCS09_RS18655 PF00583 Acetyltransferase (GNAT) family CsakCS09_RS18665 PF10956 Protein of unknown function (DUF2756) CsakCS09_RS18670 PF03009 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family CsakCS09_RS18675 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS18675 PF17912 MalK OB fold domain CsakCS09_RS18680 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS18685 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS18690 PF13416 Bacterial extracellular solute-binding protein CsakCS09_RS18700 PF02604 Antitoxin Phd_YefM, type II toxin-antitoxin system CsakCS09_RS18705 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS18710 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS18710 PF12399 Branched-chain amino acid ATP-binding cassette transporter CsakCS09_RS18715 PF11862 Domain of unknown function (DUF3382) CsakCS09_RS18715 PF02653 Branched-chain amino acid transport system / permease component CsakCS09_RS18720 PF02653 Branched-chain amino acid transport system / permease component CsakCS09_RS18725 PF13458 Periplasmic binding protein CsakCS09_RS18735 PF12568 Acetyltransferase (GNAT) domain, PanZ CsakCS09_RS18740 PF13458 Periplasmic binding protein CsakCS09_RS18750 PF00202 Aminotransferase class-III CsakCS09_RS18755 PF00392 Bacterial regulatory proteins, gntR family CsakCS09_RS18755 PF00155 Aminotransferase class I and II CsakCS09_RS18760 PF04542 Sigma-70 region 2 CsakCS09_RS18760 PF04545 Sigma-70, region 4 CsakCS09_RS18765 PF02687 FtsX-like permease family CsakCS09_RS18765 PF18075 FtsX extracellular domain CsakCS09_RS18770 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS18775 PF02881 SRP54-type protein, helical bundle domain CsakCS09_RS18775 PF00448 SRP54-type protein, GTPase domain CsakCS09_RS18785 PF06611 Protein of unknown function (DUF1145) CsakCS09_RS18795 PF07947 YhhN family CsakCS09_RS18800 PF00403 Heavy-metal-associated domain CsakCS09_RS18805 PF06808 Tripartite ATP-independent periplasmic transporter, DctM component CsakCS09_RS18815 PF03480 Bacterial extracellular solute-binding protein, family 7 CsakCS09_RS18820 PF01206 Sulfurtransferase TusA CsakCS09_RS18825 PF02592 Putative vitamin uptake transporter CsakCS09_RS18830 PF08786 DcrB CsakCS09_RS18835 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS18840 PF01594 AI-2E family transporter CsakCS09_RS18845 PF00877 NlpC/P60 family CsakCS09_RS18850 PF00120 Glutamine synthetase, catalytic domain CsakCS09_RS18860 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS18860 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS18860 PF00512 His Kinase A (phospho-acceptor) domain CsakCS09_RS18865 PF00486 Transcriptional regulatory protein, C terminal CsakCS09_RS18865 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS18870 PF05425 Copper resistance protein D CsakCS09_RS18875 PF04234 CopC domain CsakCS09_RS18880 PF05275 Copper resistance protein B precursor (CopB) CsakCS09_RS18885 PF07732 Multicopper oxidase CsakCS09_RS18885 PF07731 Multicopper oxidase CsakCS09_RS18885 PF00394 Multicopper oxidase CsakCS09_RS18895 PF01476 LysM domain CsakCS09_RS18895 PF08525 Opacity-associated protein A N-terminal motif CsakCS09_RS18895 PF01551 Peptidase family M23 CsakCS09_RS18905 PF04945 YHS domain CsakCS09_RS18915 PF00873 AcrB/AcrD/AcrF family CsakCS09_RS18920 PF03050 Transposase IS66 family CsakCS09_RS18920 PF13005 zinc-finger binding domain of transposase IS66 CsakCS09_RS18920 PF13007 Transposase C of IS166 homeodomain CsakCS09_RS18920 PF13817 IS66 C-terminal element CsakCS09_RS18925 PF05717 IS66 Orf2 like protein CsakCS09_RS18935 PF16576 Barrel-sandwich domain of CusB or HlyD membrane-fusion CsakCS09_RS18940 PF11604 Copper binding periplasmic protein CusF CsakCS09_RS18945 PF02321 Outer membrane efflux protein CsakCS09_RS18955 PF01609 Transposase DDE domain CsakCS09_RS18955 PF05598 Transposase domain (DUF772) CsakCS09_RS18960 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS18960 PF00486 Transcriptional regulatory protein, C terminal CsakCS09_RS18965 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS18965 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS18965 PF00512 His Kinase A (phospho-acceptor) domain CsakCS09_RS19000 PF13401 AAA domain CsakCS09_RS19000 PF11426 Tn7 transposition regulator TnsC CsakCS09_RS19005 PF00665 Integrase core domain CsakCS09_RS19010 PF08722 TnsA endonuclease N terminal CsakCS09_RS19010 PF08721 TnsA endonuclease C terminal CsakCS09_RS19020 PF01384 Phosphate transporter family CsakCS09_RS19025 PF10625 Universal stress protein B (UspB) CsakCS09_RS19030 PF00582 Universal stress protein family CsakCS09_RS19035 PF04445 Putative SAM-dependent methyltransferase CsakCS09_RS19040 PF01432 Peptidase family M3 CsakCS09_RS19045 PF04378 Ribosomal RNA large subunit methyltransferase D, RlmJ CsakCS09_RS19050 PF07992 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase CsakCS09_RS19050 PF02852 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain CsakCS09_RS19070 PF04076 Bacterial OB fold (BOF) protein CsakCS09_RS19080 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS19080 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS19085 PF03631 Virulence factor BrkB CsakCS09_RS19095 PF00083 Sugar (and other) transporter CsakCS09_RS19095 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS19100 PF05170 AsmA family CsakCS09_RS19105 PF00563 EAL domain CsakCS09_RS19110 PF00294 pfkB family carbohydrate kinase CsakCS09_RS19115 PF05193 Peptidase M16 inactive domain CsakCS09_RS19115 PF00675 Insulinase (Peptidase family M16) CsakCS09_RS19120 PF00375 Sodium:dicarboxylate symporter family CsakCS09_RS19125 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS19125 PF17154 Gammaproteobacterial periplasmic sensor domain CsakCS09_RS19125 PF00563 EAL domain CsakCS09_RS19125 PF00990 Diguanylate cyclase, GGDEF domain CsakCS09_RS19130 PF05420 Cellulose synthase operon protein C C-terminus (BCSC_C) CsakCS09_RS19135 PF01270 Glycosyl hydrolases family 8 CsakCS09_RS19140 PF03170 Bacterial cellulose synthase subunit CsakCS09_RS19145 PF00535 Glycosyl transferase family 2 CsakCS09_RS19145 PF03552 Cellulose synthase CsakCS09_RS19145 PF07238 PilZ domain CsakCS09_RS19150 PF06564 Cellulose biosynthesis protein BcsQ CsakCS09_RS19155 PF10945 Cellulose biosynthesis protein BcsR CsakCS09_RS19160 PF10995 Cellulose biosynthesis GIL CsakCS09_RS19165 PF11120 Cellulose biosynthesis protein BcsF CsakCS09_RS19170 PF11658 Cellulose biosynthesis protein BcsG CsakCS09_RS19175 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS19175 PF08352 Oligopeptide/dipeptide transporter, C-terminal region CsakCS09_RS19180 PF08352 Oligopeptide/dipeptide transporter, C-terminal region CsakCS09_RS19180 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS19185 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS19185 PF12911 N-terminal TM domain of oligopeptide transport permease C CsakCS09_RS19190 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS19195 PF00496 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle CsakCS09_RS19215 PF00884 Sulfatase CsakCS09_RS19215 PF08019 Phosphoethanolamine transferase EptA/EptB CsakCS09_RS19220 PF02566 OsmC-like protein CsakCS09_RS19225 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS19230 PF03797 Autotransporter beta-domain CsakCS09_RS19235 PF03352 Methyladenine glycosylase CsakCS09_RS19245 PF01568 Molydopterin dinucleotide binding domain CsakCS09_RS19245 PF18364 Molybdopterin oxidoreductase N-terminal domain CsakCS09_RS19245 PF00384 Molybdopterin oxidoreductase CsakCS09_RS19250 PF13488 Glycine zipper CsakCS09_RS19250 PF00691 OmpA family CsakCS09_RS19255 PF09223 ZinT (YodA) periplasmic lipocalin-like zinc-recruitment CsakCS09_RS19260 PF00356 Bacterial regulatory proteins, lacI family CsakCS09_RS19270 PF00294 pfkB family carbohydrate kinase CsakCS09_RS19275 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS19280 PF02826 D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD binding domain CsakCS09_RS19280 PF00389 D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, catalytic domain CsakCS09_RS19285 PF11254 Protein of unknown function (DUF3053) CsakCS09_RS19290 PF01848 Hok/gef family CsakCS09_RS19300 PF01381 Helix-turn-helix CsakCS09_RS19310 PF05746 DALR anticodon binding domain CsakCS09_RS19310 PF02092 Glycyl-tRNA synthetase beta subunit CsakCS09_RS19315 PF02091 Glycyl-tRNA synthetase alpha subunit CsakCS09_RS19320 PF13983 YsaB-like lipoprotein CsakCS09_RS19325 PF01757 Acyltransferase family CsakCS09_RS19335 PF00857 Isochorismatase family CsakCS09_RS19340 PF00370 FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain CsakCS09_RS19340 PF02782 FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain CsakCS09_RS19350 PF13407 Periplasmic binding protein domain CsakCS09_RS19355 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS19360 PF02653 Branched-chain amino acid transport system / permease component CsakCS09_RS19365 PF12833 Helix-turn-helix domain CsakCS09_RS19370 PF01832 Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase CsakCS09_RS19375 PF00128 Alpha amylase, catalytic domain CsakCS09_RS19380 PF00155 Aminotransferase class I and II CsakCS09_RS19385 PF13802 Galactose mutarotase-like CsakCS09_RS19385 PF01055 Glycosyl hydrolases family 31 CsakCS09_RS19400 PF14659 Phage integrase, N-terminal SAM-like domain CsakCS09_RS19400 PF00589 Phage integrase family CsakCS09_RS19400 PF13356 Arm DNA-binding domain CsakCS09_RS19405 PF05598 Transposase domain (DUF772) CsakCS09_RS19405 PF01609 Transposase DDE domain CsakCS09_RS19410 PF01022 Bacterial regulatory protein, arsR family CsakCS09_RS19415 PF06953 Arsenical resistance operon trans-acting repressor ArsD CsakCS09_RS19420 PF02374 Anion-transporting ATPase CsakCS09_RS19425 PF02040 Arsenical pump membrane protein CsakCS09_RS19430 PF03960 ArsC family CsakCS09_RS19440 PF02374 Anion-transporting ATPase CsakCS09_RS19445 PF06953 Arsenical resistance operon trans-acting repressor ArsD CsakCS09_RS19455 PF03358 NADPH-dependent FMN reductase CsakCS09_RS19470 PF00582 Universal stress protein family CsakCS09_RS19475 PF01740 STAS domain CsakCS09_RS19475 PF00916 Sulfate permease family CsakCS09_RS19510 PF06067 Domain of unknown function (DUF932) CsakCS09_RS19515 PF04002 RadC-like JAB domain CsakCS09_RS19520 PF06174 Protein of unknown function (DUF987) CsakCS09_RS19525 PF06154 CbeA_antitoxin, type IV, cytoskeleton bundling-enhancing factor A CsakCS09_RS19530 PF06755 CbtA_toxin of type IV toxin-antitoxin system CsakCS09_RS19555 PF00248 Aldo/keto reductase family CsakCS09_RS19560 PF00132 Bacterial transferase hexapeptide (six repeats) CsakCS09_RS19560 PF14602 Hexapeptide repeat of succinyl-transferase CsakCS09_RS19560 PF12804 MobA-like NTP transferase domain CsakCS09_RS19565 PF02625 XdhC and CoxI family CsakCS09_RS19565 PF13478 XdhC Rossmann domain CsakCS09_RS19570 PF01315 Aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, a/b hammerhead domain CsakCS09_RS19570 PF02738 Molybdopterin-binding domain of aldehyde dehydrogenase CsakCS09_RS19575 PF03450 CO dehydrogenase flavoprotein C-terminal domain CsakCS09_RS19575 PF00941 FAD binding domain in molybdopterin dehydrogenase CsakCS09_RS19580 PF10518 TAT (twin-arginine translocation) pathway signal sequence CsakCS09_RS19580 PF00111 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain CsakCS09_RS19580 PF01799 [2Fe-2S] binding domain CsakCS09_RS19585 PF00535 Glycosyl transferase family 2 CsakCS09_RS19590 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS19590 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS19595 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS19600 PF08240 Alcohol dehydrogenase GroES-like domain CsakCS09_RS19600 PF00107 Zinc-binding dehydrogenase CsakCS09_RS19605 PF02129 X-Pro dipeptidyl-peptidase (S15 family) CsakCS09_RS19615 PF02517 CPBP intramembrane metalloprotease CsakCS09_RS19620 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS19620 PF00512 His Kinase A (phospho-acceptor) domain CsakCS09_RS19625 PF00486 Transcriptional regulatory protein, C terminal CsakCS09_RS19625 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS19630 PF00576 HIUase/Transthyretin family CsakCS09_RS19645 PF02611 CDP-diacylglycerol pyrophosphatase CsakCS09_RS19655 PF00365 Phosphofructokinase CsakCS09_RS19660 PF16916 Dimerisation domain of Zinc Transporter CsakCS09_RS19660 PF01545 Cation efflux family CsakCS09_RS19665 PF07813 LTXXQ motif family protein CsakCS09_RS19670 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS19670 PF00486 Transcriptional regulatory protein, C terminal CsakCS09_RS19675 PF16527 Two-component sensor protein CpxA, periplasmic domain CsakCS09_RS19675 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS19675 PF00512 His Kinase A (phospho-acceptor) domain CsakCS09_RS19675 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS19680 PF00588 SpoU rRNA Methylase family CsakCS09_RS19685 PF06426 Serine acetyltransferase, N-terminal CsakCS09_RS19685 PF00132 Bacterial transferase hexapeptide (six repeats) CsakCS09_RS19690 PF07479 NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase C-terminus CsakCS09_RS19690 PF01210 NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase N-terminus CsakCS09_RS19695 PF02556 Preprotein translocase subunit SecB CsakCS09_RS19700 PF00462 Glutaredoxin CsakCS09_RS19705 PF00581 Rhodanese-like domain CsakCS09_RS19715 PF01676 Metalloenzyme superfamily CsakCS09_RS19715 PF06415 BPG-independent PGAM N-terminus (iPGM_N) CsakCS09_RS19720 PF01551 Peptidase family M23 CsakCS09_RS19725 PF04748 Divergent polysaccharide deacetylase CsakCS09_RS19730 PF00535 Glycosyl transferase family 2 CsakCS09_RS19735 PF00107 Zinc-binding dehydrogenase CsakCS09_RS19735 PF08240 Alcohol dehydrogenase GroES-like domain CsakCS09_RS19740 PF00155 Aminotransferase class I and II CsakCS09_RS19745 PF01370 NAD dependent epimerase/dehydratase family CsakCS09_RS19750 PF01075 Glycosyltransferase family 9 (heptosyltransferase) CsakCS09_RS19755 PF01075 Glycosyltransferase family 9 (heptosyltransferase) CsakCS09_RS19760 PF01075 Glycosyltransferase family 9 (heptosyltransferase) CsakCS09_RS19765 PF00534 Glycosyl transferases group 1 CsakCS09_RS19765 PF13439 Glycosyltransferase Family 4 CsakCS09_RS19770 PF13439 Glycosyltransferase Family 4 CsakCS09_RS19770 PF00534 Glycosyl transferases group 1 CsakCS09_RS19780 PF00535 Glycosyl transferase family 2 CsakCS09_RS19795 PF04413 3-Deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase (kdotransferase) CsakCS09_RS19800 PF00535 Glycosyl transferase family 2 CsakCS09_RS19805 PF01467 Cytidylyltransferase-like CsakCS09_RS19810 PF01149 Formamidopyrimidine-DNA glycosylase N-terminal domain CsakCS09_RS19810 PF06827 Zinc finger found in FPG and IleRS CsakCS09_RS19810 PF06831 Formamidopyrimidine-DNA glycosylase H2TH domain CsakCS09_RS19815 PF00471 Ribosomal protein L33 CsakCS09_RS19820 PF00830 Ribosomal L28 family CsakCS09_RS19825 PF04002 RadC-like JAB domain CsakCS09_RS19830 PF04127 DNA / pantothenate metabolism flavoprotein CsakCS09_RS19830 PF02441 Flavoprotein CsakCS09_RS19835 PF00692 dUTPase CsakCS09_RS19840 PF00440 Bacterial regulatory proteins, tetR family CsakCS09_RS19845 PF00156 Phosphoribosyl transferase domain CsakCS09_RS19850 PF01138 3' exoribonuclease family, domain 1 CsakCS09_RS19850 PF03725 3' exoribonuclease family, domain 2 CsakCS09_RS19855 PF03755 YicC-like family, N-terminal region CsakCS09_RS19855 PF08340 Domain of unknown function (DUF1732) CsakCS09_RS19860 PF03458 UPF0126 domain CsakCS09_RS19865 PF03120 NAD-dependent DNA ligase OB-fold domain CsakCS09_RS19865 PF01653 NAD-dependent DNA ligase adenylation domain CsakCS09_RS19875 PF00625 Guanylate kinase CsakCS09_RS19880 PF01192 RNA polymerase Rpb6 CsakCS09_RS19885 PF13291 ACT domain CsakCS09_RS19885 PF04607 Region found in RelA / SpoT proteins CsakCS09_RS19885 PF02824 TGS domain CsakCS09_RS19890 PF12105 SpoU, rRNA methylase, C-terminal CsakCS09_RS19890 PF00588 SpoU rRNA Methylase family CsakCS09_RS19895 PF00270 DEAD/DEAH box helicase CsakCS09_RS19895 PF00271 Helicase conserved C-terminal domain CsakCS09_RS19895 PF17191 RecG wedge domain CsakCS09_RS19905 PF00345 Pili and flagellar-assembly chaperone, PapD N-terminal domain CsakCS09_RS19905 PF02753 Pili assembly chaperone PapD, C-terminal domain CsakCS09_RS19910 PF00577 Outer membrane usher protein CsakCS09_RS19910 PF13954 PapC N-terminal domain CsakCS09_RS19910 PF13953 PapC C-terminal domain CsakCS09_RS19935 PF00860 Permease family CsakCS09_RS19940 PF05170 AsmA family CsakCS09_RS19950 PF00583 Acetyltransferase (GNAT) family CsakCS09_RS19950 PF09500 Putative thioesterase (yiiD_Cterm) CsakCS09_RS19955 PF02580 D-Tyr-tRNA(Tyr) deacylase CsakCS09_RS19960 PF03631 Virulence factor BrkB CsakCS09_RS19965 PF13419 Haloacid dehalogenase-like hydrolase CsakCS09_RS19970 PF00455 DeoR C terminal sensor domain CsakCS09_RS19970 PF08220 DeoR-like helix-turn-helix domain CsakCS09_RS19975 PF00294 pfkB family carbohydrate kinase CsakCS09_RS19980 PF14833 NAD-binding of NADP-dependent 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase CsakCS09_RS19980 PF03446 NAD binding domain of 6-phosphogluconate dehydrogenase CsakCS09_RS19985 PF01791 DeoC/LacD family aldolase CsakCS09_RS19995 PF01263 Aldose 1-epimerase CsakCS09_RS20000 PF01055 Glycosyl hydrolases family 31 CsakCS09_RS20020 PF06178 Oligogalacturonate-specific porin protein (KdgM) CsakCS09_RS20025 PF00009 Elongation factor Tu GTP binding domain CsakCS09_RS20025 PF00679 Elongation factor G C-terminus CsakCS09_RS20025 PF03144 Elongation factor Tu domain 2 CsakCS09_RS20035 PF00120 Glutamine synthetase, catalytic domain CsakCS09_RS20035 PF03951 Glutamine synthetase, beta-Grasp domain CsakCS09_RS20040 PF00512 His Kinase A (phospho-acceptor) domain CsakCS09_RS20040 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS20040 PF00989 PAS fold CsakCS09_RS20045 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS20045 PF00158 Sigma-54 interaction domain CsakCS09_RS20045 PF02954 Bacterial regulatory protein, Fis family CsakCS09_RS20050 PF04055 Radical SAM superfamily CsakCS09_RS20050 PF06969 HemN C-terminal domain CsakCS09_RS20055 PF04220 Der GTPase activator (YihI) CsakCS09_RS20060 PF01926 50S ribosome-binding GTPase CsakCS09_RS20065 PF02739 5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain CsakCS09_RS20065 PF01367 5'-3' exonuclease, C-terminal SAM fold CsakCS09_RS20065 PF00476 DNA polymerase family A CsakCS09_RS20065 PF01612 3'-5' exonuclease CsakCS09_RS20070 PF01553 Acyltransferase CsakCS09_RS20075 PF01323 DSBA-like thioredoxin domain CsakCS09_RS20080 PF01636 Phosphotransferase enzyme family CsakCS09_RS20085 PF06288 Protein of unknown function (DUF1040) CsakCS09_RS20090 PF12804 MobA-like NTP transferase domain CsakCS09_RS20095 PF03205 Molybdopterin guanine dinucleotide synthesis protein B CsakCS09_RS20120 PF00392 Bacterial regulatory proteins, gntR family CsakCS09_RS20120 PF07729 FCD domain CsakCS09_RS20125 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS20130 PF00356 Bacterial regulatory proteins, lacI family CsakCS09_RS20135 PF00294 pfkB family carbohydrate kinase CsakCS09_RS20140 PF13407 Periplasmic binding protein domain CsakCS09_RS20145 PF02653 Branched-chain amino acid transport system / permease component CsakCS09_RS20150 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS20155 PF05025 RbsD / FucU transport protein family CsakCS09_RS20165 PF02705 K+ potassium transporter CsakCS09_RS20170 PF12592 Protein of unknown function (DUF3763) CsakCS09_RS20170 PF17868 AAA lid domain CsakCS09_RS20170 PF07728 AAA domain (dynein-related subfamily) CsakCS09_RS20175 PF05762 VWA domain containing CoxE-like protein CsakCS09_RS20180 PF03590 Aspartate-ammonia ligase CsakCS09_RS20185 PF01037 Lrp/AsnC ligand binding domain CsakCS09_RS20190 PF00258 Flavodoxin CsakCS09_RS20195 PF13932 GidA associated domain CsakCS09_RS20195 PF01134 Glucose inhibited division protein A CsakCS09_RS20200 PF02527 rRNA small subunit methyltransferase G CsakCS09_RS20205 PF03899 ATP synthase I chain CsakCS09_RS20210 PF00119 ATP synthase A chain CsakCS09_RS20215 PF00137 ATP synthase subunit C CsakCS09_RS20220 PF00430 ATP synthase B/B' CF(0) CsakCS09_RS20225 PF00213 ATP synthase delta (OSCP) subunit CsakCS09_RS20230 PF00306 ATP synthase alpha/beta chain, C terminal domain CsakCS09_RS20230 PF00006 ATP synthase alpha/beta family, nucleotide-binding domain CsakCS09_RS20230 PF02874 ATP synthase alpha/beta family, beta-barrel domain CsakCS09_RS20235 PF00231 ATP synthase CsakCS09_RS20240 PF02874 ATP synthase alpha/beta family, beta-barrel domain CsakCS09_RS20240 PF00006 ATP synthase alpha/beta family, nucleotide-binding domain CsakCS09_RS20245 PF00401 ATP synthase, Delta/Epsilon chain, long alpha-helix domain CsakCS09_RS20245 PF02823 ATP synthase, Delta/Epsilon chain, beta-sandwich domain CsakCS09_RS20250 PF12804 MobA-like NTP transferase domain CsakCS09_RS20250 PF00132 Bacterial transferase hexapeptide (six repeats) CsakCS09_RS20255 PF01380 SIS domain CsakCS09_RS20270 PF12849 PBP superfamily domain CsakCS09_RS20275 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS20280 PF00528 Binding-protein-dependent transport system inner membrane component CsakCS09_RS20285 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS20290 PF01895 PhoU domain CsakCS09_RS20295 PF00756 Putative esterase CsakCS09_RS20295 PF02922 Carbohydrate-binding module 48 (Isoamylase N-terminal domain) CsakCS09_RS20300 PF13419 Haloacid dehalogenase-like hydrolase CsakCS09_RS20305 PF00860 Permease family CsakCS09_RS20310 PF03358 NADPH-dependent FMN reductase CsakCS09_RS20335 PF03591 AzlC protein CsakCS09_RS20360 PF01926 50S ribosome-binding GTPase CsakCS09_RS20360 PF12631 MnmE helical domain CsakCS09_RS20360 PF10396 GTP-binding protein TrmE N-terminus CsakCS09_RS20365 PF14849 YidC periplasmic domain CsakCS09_RS20365 PF02096 60Kd inner membrane protein CsakCS09_RS20370 PF01809 Putative membrane protein insertion efficiency factor CsakCS09_RS20375 PF00825 Ribonuclease P CsakCS09_RS20380 PF00468 Ribosomal protein L34 CsakCS09_RS20390 PF00308 Bacterial dnaA protein CsakCS09_RS20390 PF08299 Bacterial dnaA protein helix-turn-helix CsakCS09_RS20390 PF11638 DnaA N-terminal domain CsakCS09_RS20395 PF02768 DNA polymerase III beta subunit, C-terminal domain CsakCS09_RS20395 PF02767 DNA polymerase III beta subunit, central domain CsakCS09_RS20395 PF00712 DNA polymerase III beta subunit, N-terminal domain CsakCS09_RS20405 PF02463 RecF/RecN/SMC N terminal domain CsakCS09_RS20410 PF00986 DNA gyrase B subunit, carboxyl terminus CsakCS09_RS20410 PF00204 DNA gyrase B CsakCS09_RS20410 PF18053 DNA gyrase B subunit insert domain CsakCS09_RS20410 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS20410 PF01751 Toprim domain CsakCS09_RS20420 PF01848 Hok/gef family CsakCS09_RS20425 PF00392 Bacterial regulatory proteins, gntR family CsakCS09_RS20425 PF07729 FCD domain CsakCS09_RS20430 PF05035 2-keto-3-deoxy-galactonokinase CsakCS09_RS20435 PF01081 KDPG and KHG aldolase CsakCS09_RS20440 PF13378 Enolase C-terminal domain-like CsakCS09_RS20440 PF02746 Mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme, N-terminal domain CsakCS09_RS20445 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS20450 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS20455 PF02826 D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD binding domain CsakCS09_RS20455 PF00389 D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, catalytic domain CsakCS09_RS20460 PF07676 WD40-like Beta Propeller Repeat CsakCS09_RS20460 PF12566 Protein of unknown function (DUF3748) CsakCS09_RS20465 PF07119 Protein of unknown function (DUF1375) CsakCS09_RS20470 PF00011 Hsp20/alpha crystallin family CsakCS09_RS20475 PF00011 Hsp20/alpha crystallin family CsakCS09_RS20480 PF07702 UTRA domain CsakCS09_RS20480 PF00392 Bacterial regulatory proteins, gntR family CsakCS09_RS20485 PF02378 Phosphotransferase system, EIIC CsakCS09_RS20485 PF00367 phosphotransferase system, EIIB CsakCS09_RS20490 PF11975 Family 4 glycosyl hydrolase C-terminal domain CsakCS09_RS20490 PF02056 Family 4 glycosyl hydrolase CsakCS09_RS20495 PF02656 Domain of unknown function (DUF202) CsakCS09_RS20500 PF02656 Domain of unknown function (DUF202) CsakCS09_RS20510 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS20545 PF08765 Mor transcription activator family CsakCS09_RS20590 PF13401 AAA domain CsakCS09_RS20590 PF01471 Putative peptidoglycan binding domain CsakCS09_RS20660 PF03237 Terminase-like family CsakCS09_RS20670 PF04233 Phage Mu protein F like protein CsakCS09_RS20780 PF02413 Caudovirales tail fibre assembly protein, lambda gpK CsakCS09_RS20790 PF02413 Caudovirales tail fibre assembly protein, lambda gpK CsakCS09_RS20795 PF02796 Helix-turn-helix domain of resolvase CsakCS09_RS20795 PF00239 Resolvase, N terminal domain CsakCS09_RS20805 PF13677 Membrane MotB of proton-channel complex MotA/MotB CsakCS09_RS20805 PF00691 OmpA family CsakCS09_RS20810 PF06761 Intracellular multiplication and human macrophage-killing CsakCS09_RS20810 PF14331 ImcF-related N-terminal domain CsakCS09_RS20810 PF06744 Type VI secretion protein IcmF C-terminal CsakCS09_RS20820 PF06812 ImpA, N-terminal, type VI secretion system CsakCS09_RS20825 PF05591 Type VI secretion system, VipA, VC_A0107 or Hcp2 CsakCS09_RS20830 PF05943 Type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108, tail sheath CsakCS09_RS20850 PF05638 Type VI secretion system effector, Hcp CsakCS09_RS20895 PF04965 Gene 25-like lysozyme CsakCS09_RS20900 PF05947 Type VI secretion system, TssF CsakCS09_RS20910 PF17871 AAA lid domain CsakCS09_RS20910 PF00004 ATPase family associated with various cellular activities (AAA) CsakCS09_RS20910 PF10431 C-terminal, D2-small domain, of ClpB protein CsakCS09_RS20910 PF07724 AAA domain (Cdc48 subfamily) CsakCS09_RS20915 PF00069 Protein kinase domain CsakCS09_RS20930 PF06715 Gp5 C-terminal repeat (3 copies) CsakCS09_RS20930 PF04717 Type VI secretion system, phage-baseplate injector CsakCS09_RS20950 PF03527 RHS protein CsakCS09_RS20950 PF05593 RHS Repeat CsakCS09_RS20980 PF05598 Transposase domain (DUF772) CsakCS09_RS20980 PF01609 Transposase DDE domain CsakCS09_RS20985 PF04717 Type VI secretion system, phage-baseplate injector CsakCS09_RS21080 PF00121 Triosephosphate isomerase CsakCS09_RS21090 PF07305 Protein of unknown function (DUF1454) CsakCS09_RS21095 PF05656 Protein of unknown function (DUF805) CsakCS09_RS21100 PF00175 Oxidoreductase NAD-binding domain CsakCS09_RS21100 PF00970 Oxidoreductase FAD-binding domain CsakCS09_RS21105 PF03320 Bacterial fructose-1,6-bisphosphatase, glpX-encoded CsakCS09_RS21110 PF05068 Mannitol repressor CsakCS09_RS21115 PF01232 Mannitol dehydrogenase Rossmann domain CsakCS09_RS21115 PF08125 Mannitol dehydrogenase C-terminal domain CsakCS09_RS21120 PF02302 PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIB subunit CsakCS09_RS21120 PF02378 Phosphotransferase system, EIIC CsakCS09_RS21120 PF00359 Phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 2 CsakCS09_RS21125 PF13417 Glutathione S-transferase, N-terminal domain CsakCS09_RS21125 PF00043 Glutathione S-transferase, C-terminal domain CsakCS09_RS21130 PF03841 L-seryl-tRNA selenium transferase CsakCS09_RS21130 PF12390 Selenocysteine synthase N terminal CsakCS09_RS21135 PF00009 Elongation factor Tu GTP binding domain CsakCS09_RS21135 PF03144 Elongation factor Tu domain 2 CsakCS09_RS21135 PF09107 Elongation factor SelB, winged helix CsakCS09_RS21135 PF09106 Elongation factor SelB, winged helix CsakCS09_RS21140 PF00465 Iron-containing alcohol dehydrogenase CsakCS09_RS21145 PF00480 ROK family CsakCS09_RS21155 PF07944 Beta-L-arabinofuranosidase, GH127 CsakCS09_RS21170 PF06296 RelE toxin of RelE / RelB toxin-antitoxin system CsakCS09_RS21180 PF04216 Protein involved in formate dehydrogenase formation CsakCS09_RS21185 PF01292 Prokaryotic cytochrome b561 CsakCS09_RS21190 PF13247 4Fe-4S dicluster domain CsakCS09_RS21190 PF09163 Formate dehydrogenase N, transmembrane CsakCS09_RS21200 PF02634 FdhD/NarQ family CsakCS09_RS21215 PF03591 AzlC protein CsakCS09_RS21225 PF00356 Bacterial regulatory proteins, lacI family CsakCS09_RS21225 PF00532 Periplasmic binding proteins and sugar binding domain of LacI family CsakCS09_RS21230 PF16875 Glycosyl hydrolase family 36 N-terminal domain CsakCS09_RS21230 PF16874 Glycosyl hydrolase family 36 C-terminal domain CsakCS09_RS21235 PF01306 LacY proton/sugar symporter CsakCS09_RS21240 PF05336 L-rhamnose mutarotase CsakCS09_RS21245 PF00465 Iron-containing alcohol dehydrogenase CsakCS09_RS21250 PF00596 Class II Aldolase and Adducin N-terminal domain CsakCS09_RS21255 PF06134 L-rhamnose isomerase (RhaA) CsakCS09_RS21260 PF00370 FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain CsakCS09_RS21260 PF02782 FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain CsakCS09_RS21270 PF02311 AraC-like ligand binding domain CsakCS09_RS21270 PF12833 Helix-turn-helix domain CsakCS09_RS21275 PF02311 AraC-like ligand binding domain CsakCS09_RS21275 PF12833 Helix-turn-helix domain CsakCS09_RS21280 PF06379 L-rhamnose-proton symport protein (RhaT) CsakCS09_RS21285 PF00081 Iron/manganese superoxide dismutases, alpha-hairpin domain CsakCS09_RS21285 PF02777 Iron/manganese superoxide dismutases, C-terminal domain CsakCS09_RS21290 PF03473 MOSC domain CsakCS09_RS21290 PF03475 3-alpha domain CsakCS09_RS21295 PF01070 FMN-dependent dehydrogenase CsakCS09_RS21300 PF00392 Bacterial regulatory proteins, gntR family CsakCS09_RS21300 PF07729 FCD domain CsakCS09_RS21305 PF02652 L-lactate permease CsakCS09_RS21320 PF10928 Protein of unknown function (DUF2810) CsakCS09_RS21325 PF02782 FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain CsakCS09_RS21325 PF00370 FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain CsakCS09_RS21330 PF00230 Major intrinsic protein CsakCS09_RS21335 PF06005 Cell division protein ZapB CsakCS09_RS21340 PF03737 Aldolase/RraA CsakCS09_RS21345 PF01040 UbiA prenyltransferase family CsakCS09_RS21350 PF10431 C-terminal, D2-small domain, of ClpB protein CsakCS09_RS21350 PF07724 AAA domain (Cdc48 subfamily) CsakCS09_RS21350 PF00004 ATPase family associated with various cellular activities (AAA) CsakCS09_RS21355 PF00227 Proteasome subunit CsakCS09_RS21360 PF05036 Sporulation related domain CsakCS09_RS21365 PF00356 Bacterial regulatory proteins, lacI family CsakCS09_RS21370 PF00270 DEAD/DEAH box helicase CsakCS09_RS21370 PF18074 Primosomal protein N C-terminal domain CsakCS09_RS21370 PF18319 PriA DNA helicase Cys-rich region (CRR) domain CsakCS09_RS21370 PF17764 3′ DNA-binding domain (3′BD) CsakCS09_RS21370 PF00271 Helicase conserved C-terminal domain CsakCS09_RS21375 PF01197 Ribosomal protein L31 CsakCS09_RS21380 PF01340 Met Apo-repressor, MetJ CsakCS09_RS21385 PF01053 Cys/Met metabolism PLP-dependent enzyme CsakCS09_RS21390 PF00696 Amino acid kinase family CsakCS09_RS21390 PF03447 Homoserine dehydrogenase, NAD binding domain CsakCS09_RS21390 PF00742 Homoserine dehydrogenase CsakCS09_RS21400 PF02219 Methylenetetrahydrofolate reductase CsakCS09_RS21405 PF08447 PAS fold CsakCS09_RS21405 PF13426 PAS domain CsakCS09_RS21405 PF00015 Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signalling domain CsakCS09_RS21410 PF06039 Malate:quinone oxidoreductase (Mqo) CsakCS09_RS21420 PF00345 Pili and flagellar-assembly chaperone, PapD N-terminal domain CsakCS09_RS21420 PF02753 Pili assembly chaperone PapD, C-terminal domain CsakCS09_RS21425 PF13954 PapC N-terminal domain CsakCS09_RS21425 PF13953 PapC C-terminal domain CsakCS09_RS21425 PF00577 Outer membrane usher protein CsakCS09_RS21435 PF00311 Phosphoenolpyruvate carboxylase CsakCS09_RS21440 PF07687 Peptidase dimerisation domain CsakCS09_RS21440 PF01546 Peptidase family M20/M25/M40 CsakCS09_RS21445 PF01118 Semialdehyde dehydrogenase, NAD binding domain CsakCS09_RS21445 PF02774 Semialdehyde dehydrogenase, dimerisation domain CsakCS09_RS21450 PF00696 Amino acid kinase family CsakCS09_RS21455 PF00764 Arginosuccinate synthase CsakCS09_RS21460 PF14698 Argininosuccinate lyase C-terminal CsakCS09_RS21460 PF00206 Lyase CsakCS09_RS21465 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS21465 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS21470 PF07992 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase CsakCS09_RS21470 PF02852 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain CsakCS09_RS21475 PF00440 Bacterial regulatory proteins, tetR family CsakCS09_RS21480 PF07226 Protein of unknown function (DUF1422) CsakCS09_RS21485 PF05958 tRNA (Uracil-5-)-methyltransferase CsakCS09_RS21490 PF00593 TonB dependent receptor CsakCS09_RS21490 PF07715 TonB-dependent Receptor Plug Domain CsakCS09_RS21495 PF01177 Asp/Glu/Hydantoin racemase CsakCS09_RS21535 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS21535 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS21540 PF04219 Protein of unknown function, DUF CsakCS09_RS21545 PF13335 Magnesium chelatase, subunit ChlI C-terminal CsakCS09_RS21545 PF01078 Magnesium chelatase, subunit ChlI CsakCS09_RS21555 PF02776 Thiamine pyrophosphate enzyme, N-terminal TPP binding domain CsakCS09_RS21555 PF02775 Thiamine pyrophosphate enzyme, C-terminal TPP binding domain CsakCS09_RS21555 PF00205 Thiamine pyrophosphate enzyme, central domain CsakCS09_RS21565 PF01063 Amino-transferase class IV CsakCS09_RS21570 PF00920 Dehydratase family CsakCS09_RS21575 PF00291 Pyridoxal-phosphate dependent enzyme CsakCS09_RS21575 PF00585 C-terminal regulatory domain of Threonine dehydratase CsakCS09_RS21580 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS21580 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS21585 PF07991 Acetohydroxy acid isomeroreductase, NADPH-binding domain CsakCS09_RS21585 PF01450 Acetohydroxy acid isomeroreductase, catalytic domain CsakCS09_RS21595 PF00580 UvrD/REP helicase N-terminal domain CsakCS09_RS21595 PF13361 UvrD-like helicase C-terminal domain CsakCS09_RS21600 PF02541 Ppx/GppA phosphatase family CsakCS09_RS21605 PF00271 Helicase conserved C-terminal domain CsakCS09_RS21605 PF00270 DEAD/DEAH box helicase CsakCS09_RS21610 PF00085 Thioredoxin CsakCS09_RS21615 PF00006 ATP synthase alpha/beta family, nucleotide-binding domain CsakCS09_RS21615 PF07498 Rho termination factor, N-terminal domain CsakCS09_RS21615 PF07497 Rho termination factor, RNA-binding domain CsakCS09_RS21620 PF00953 Glycosyl transferase family 4 CsakCS09_RS21625 PF02706 Chain length determinant protein CsakCS09_RS21630 PF02350 UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase CsakCS09_RS21635 PF03720 UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family, UDP binding domain CsakCS09_RS21635 PF00984 UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family, central domain CsakCS09_RS21635 PF03721 UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family, NAD binding domain CsakCS09_RS21645 PF01041 DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family CsakCS09_RS21650 PF01943 Polysaccharide biosynthesis protein CsakCS09_RS21655 PF07429 4-alpha-L-fucosyltransferase glycosyl transferase group 56 CsakCS09_RS21660 PF06899 WzyE protein, O-antigen assembly polymerase CsakCS09_RS21665 PF03808 Glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF family CsakCS09_RS21670 PF00324 Amino acid permease CsakCS09_RS21705 PF07719 Tetratricopeptide repeat CsakCS09_RS21705 PF07219 HemY protein N-terminus CsakCS09_RS21710 PF04375 HemX, putative uroporphyrinogen-III C-methyltransferase CsakCS09_RS21715 PF02602 Uroporphyrinogen-III synthase HemD CsakCS09_RS21720 PF01379 Porphobilinogen deaminase, dipyromethane cofactor binding domain CsakCS09_RS21720 PF03900 Porphobilinogen deaminase, C-terminal domain CsakCS09_RS21725 PF01295 Adenylate cyclase, class-I CsakCS09_RS21725 PF12633 Adenylate cyclase NT domain CsakCS09_RS21730 PF01491 Frataxin-like domain CsakCS09_RS21735 PF13627 Prokaryotic lipoprotein-attachment site CsakCS09_RS21740 PF01678 Diaminopimelate epimerase CsakCS09_RS21745 PF04340 Protein of unknown function, DUF484 CsakCS09_RS21750 PF02899 Phage integrase, N-terminal SAM-like domain CsakCS09_RS21750 PF00589 Phage integrase family CsakCS09_RS21755 PF13419 Haloacid dehalogenase-like hydrolase CsakCS09_RS21760 PF13361 UvrD-like helicase C-terminal domain CsakCS09_RS21760 PF00580 UvrD/REP helicase N-terminal domain CsakCS09_RS21765 PF01544 CorA-like Mg2+ transporter protein CsakCS09_RS21770 PF10947 Protein of unknown function (DUF2628) CsakCS09_RS21780 PF00892 EamA-like transporter family CsakCS09_RS21785 PF03061 Thioesterase superfamily CsakCS09_RS21790 PF02253 Phospholipase A1 CsakCS09_RS21795 PF16124 RecQ zinc-binding CsakCS09_RS21795 PF09382 RQC domain CsakCS09_RS21795 PF00271 Helicase conserved C-terminal domain CsakCS09_RS21795 PF00270 DEAD/DEAH box helicase CsakCS09_RS21795 PF00570 HRDC domain CsakCS09_RS21800 PF01810 LysE type translocator CsakCS09_RS21805 PF01810 LysE type translocator CsakCS09_RS21810 PF12146 Serine aminopeptidase, S33 CsakCS09_RS21820 PF00892 EamA-like transporter family CsakCS09_RS21825 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS21825 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS21830 PF08267 Cobalamin-independent synthase, N-terminal domain CsakCS09_RS21830 PF01717 Cobalamin-independent synthase, Catalytic domain CsakCS09_RS21835 PF01738 Dienelactone hydrolase family CsakCS09_RS21840 PF01048 Phosphorylase superfamily CsakCS09_RS21845 PF02646 RmuC family CsakCS09_RS21850 PF01209 ubiE/COQ5 methyltransferase family CsakCS09_RS21855 PF02036 SCP-2 sterol transfer family CsakCS09_RS21860 PF03109 ABC1 family CsakCS09_RS21865 PF02416 mttA/Hcf106 family CsakCS09_RS21875 PF00902 Sec-independent protein translocase protein (TatC) CsakCS09_RS21880 PF01026 TatD related DNase CsakCS09_RS21890 PF02357 Transcription termination factor nusG CsakCS09_RS21895 PF01977 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase CsakCS09_RS21900 PF00175 Oxidoreductase NAD-binding domain CsakCS09_RS21900 PF00970 Oxidoreductase FAD-binding domain CsakCS09_RS21910 PF02803 Thiolase, C-terminal domain CsakCS09_RS21910 PF00108 Thiolase, N-terminal domain CsakCS09_RS21915 PF00725 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain CsakCS09_RS21915 PF02737 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD binding domain CsakCS09_RS21915 PF00378 Enoyl-CoA hydratase/isomerase CsakCS09_RS21925 PF00557 Metallopeptidase family M24 CsakCS09_RS21930 PF01205 Uncharacterized protein family UPF0029 CsakCS09_RS21930 PF09186 Domain of unknown function (DUF1949) CsakCS09_RS21935 PF02386 Cation transport protein CsakCS09_RS21940 PF12724 Flavodoxin domain CsakCS09_RS21965 PF01565 FAD binding domain CsakCS09_RS21965 PF02873 UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase, C-terminal domain CsakCS09_RS21970 PF02237 Biotin protein ligase C terminal domain CsakCS09_RS21970 PF03099 Biotin/lipoate A/B protein ligase family CsakCS09_RS21970 PF08279 HTH domain CsakCS09_RS21975 PF00485 Phosphoribulokinase / Uridine kinase family CsakCS09_RS22000 PF00009 Elongation factor Tu GTP binding domain CsakCS09_RS22000 PF03143 Elongation factor Tu C-terminal domain CsakCS09_RS22000 PF03144 Elongation factor Tu domain 2 CsakCS09_RS22005 PF00584 SecE/Sec61-gamma subunits of protein translocation complex CsakCS09_RS22010 PF00467 KOW motif CsakCS09_RS22010 PF02357 Transcription termination factor nusG CsakCS09_RS22015 PF03946 Ribosomal protein L11, N-terminal domain CsakCS09_RS22015 PF00298 Ribosomal protein L11, RNA binding domain CsakCS09_RS22020 PF00687 Ribosomal protein L1p/L10e family CsakCS09_RS22025 PF00466 Ribosomal protein L10 CsakCS09_RS22030 PF00542 Ribosomal protein L7/L12 C-terminal domain CsakCS09_RS22030 PF16320 Ribosomal protein L7/L12 dimerisation domain CsakCS09_RS22035 PF04560 RNA polymerase Rpb2, domain 7 CsakCS09_RS22035 PF10385 RNA polymerase beta subunit external 1 domain CsakCS09_RS22035 PF00562 RNA polymerase Rpb2, domain 6 CsakCS09_RS22035 PF04565 RNA polymerase Rpb2, domain 3 CsakCS09_RS22035 PF04561 RNA polymerase Rpb2, domain 2 CsakCS09_RS22035 PF04563 RNA polymerase beta subunit CsakCS09_RS22040 PF04997 RNA polymerase Rpb1, domain 1 CsakCS09_RS22040 PF00623 RNA polymerase Rpb1, domain 2 CsakCS09_RS22040 PF04998 RNA polymerase Rpb1, domain 5 CsakCS09_RS22040 PF04983 RNA polymerase Rpb1, domain 3 CsakCS09_RS22040 PF05000 RNA polymerase Rpb1, domain 4 CsakCS09_RS22050 PF12833 Helix-turn-helix domain CsakCS09_RS22055 PF02255 PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIA subunit CsakCS09_RS22060 PF02302 PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIB subunit CsakCS09_RS22065 PF06968 Biotin and Thiamin Synthesis associated domain CsakCS09_RS22065 PF04055 Radical SAM superfamily CsakCS09_RS22070 PF05690 Thiazole biosynthesis protein ThiG CsakCS09_RS22075 PF02597 ThiS family CsakCS09_RS22080 PF00899 ThiF family CsakCS09_RS22085 PF02581 Thiamine monophosphate synthase CsakCS09_RS22090 PF13667 ThiC-associated domain CsakCS09_RS22090 PF01964 Radical SAM ThiC family CsakCS09_RS22095 PF04353 Regulator of RNA polymerase sigma(70) subunit, Rsd/AlgQ CsakCS09_RS22100 PF09297 NADH pyrophosphatase zinc ribbon domain CsakCS09_RS22100 PF00293 NUDIX domain CsakCS09_RS22105 PF01208 Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D) CsakCS09_RS22110 PF04493 Endonuclease V CsakCS09_RS22115 PF04222 Protein of unknown function (DUF416) CsakCS09_RS22120 PF00216 Bacterial DNA-binding protein CsakCS09_RS22125 PF07356 Protein of unknown function (DUF1481) CsakCS09_RS22130 PF02844 Phosphoribosylglycinamide synthetase, N domain CsakCS09_RS22130 PF01071 Phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp (A) domain CsakCS09_RS22130 PF02843 Phosphoribosylglycinamide synthetase, C domain CsakCS09_RS22140 PF00300 Histidine phosphatase superfamily (branch 1) CsakCS09_RS22160 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS22165 PF01278 Omptin family CsakCS09_RS22180 PF08279 HTH domain CsakCS09_RS22180 PF13280 WYL domain CsakCS09_RS22200 PF00072 Response regulator receiver domain CsakCS09_RS22200 PF00486 Transcriptional regulatory protein, C terminal CsakCS09_RS22205 PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase CsakCS09_RS22215 PF00873 AcrB/AcrD/AcrF family CsakCS09_RS22225 PF00293 NUDIX domain CsakCS09_RS22240 PF00440 Bacterial regulatory proteins, tetR family CsakCS09_RS22240 PF02909 Tetracyclin repressor-like, C-terminal domain CsakCS09_RS22245 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS22255 PF00126 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family CsakCS09_RS22255 PF03466 LysR substrate binding domain CsakCS09_RS22260 PF17074 Darcynin, domain of unknown function CsakCS09_RS22275 PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase CsakCS09_RS22280 PF10798 Biofilm development protein YmgB/AriR CsakCS09_RS22290 PF10798 Biofilm development protein YmgB/AriR CsakCS09_RS22295 PF00563 EAL domain CsakCS09_RS22295 PF04940 Sensors of blue-light using FAD CsakCS09_RS22300 PF13411 MerR HTH family regulatory protein CsakCS09_RS22305 PF02203 Tar ligand binding domain homologue CsakCS09_RS22305 PF00015 Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signalling domain CsakCS09_RS22305 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS22310 PF00903 Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily CsakCS09_RS22315 PF00583 Acetyltransferase (GNAT) family CsakCS09_RS22335 PF00561 alpha/beta hydrolase fold CsakCS09_RS22340 PF00358 phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 1 CsakCS09_RS22340 PF00367 phosphotransferase system, EIIB CsakCS09_RS22340 PF02378 Phosphotransferase system, EIIC CsakCS09_RS22345 PF02746 Mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme, N-terminal domain CsakCS09_RS22345 PF13378 Enolase C-terminal domain-like CsakCS09_RS22350 PF07702 UTRA domain CsakCS09_RS22350 PF00392 Bacterial regulatory proteins, gntR family CsakCS09_RS22355 PF05154 TM2 domain CsakCS09_RS22365 PF00563 EAL domain CsakCS09_RS22365 PF00360 Phytochrome region CsakCS09_RS22365 PF00990 Diguanylate cyclase, GGDEF domain CsakCS09_RS22365 PF01590 GAF domain CsakCS09_RS22380 PF05638 Type VI secretion system effector, Hcp CsakCS09_RS22395 PF02386 Cation transport protein CsakCS09_RS22400 PF03960 ArsC family CsakCS09_RS22405 PF02040 Arsenical pump membrane protein CsakCS09_RS22410 PF01022 Bacterial regulatory protein, arsR family CsakCS09_RS22415 PF00701 Dihydrodipicolinate synthetase family CsakCS09_RS22420 PF00892 EamA-like transporter family CsakCS09_RS22435 PF05943 Type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108, tail sheath CsakCS09_RS22450 PF00691 OmpA family CsakCS09_RS22450 PF05736 OprF membrane domain CsakCS09_RS22460 PF07724 AAA domain (Cdc48 subfamily) CsakCS09_RS22460 PF00004 ATPase family associated with various cellular activities (AAA) CsakCS09_RS22460 PF17871 AAA lid domain CsakCS09_RS22460 PF10431 C-terminal, D2-small domain, of ClpB protein CsakCS09_RS22475 PF04717 Type VI secretion system, phage-baseplate injector CsakCS09_RS22475 PF10106 Uncharacterized protein conserved in bacteria (DUF2345) CsakCS09_RS22475 PF13296 Putative type VI secretion system Rhs element Vgr CsakCS09_RS22505 PF13098 Thioredoxin-like domain CsakCS09_RS22540 PF10820 Protein of unknown function (DUF2543) CsakCS09_RS22545 PF00005 ABC transporter CsakCS09_RS22550 PF01032 FecCD transport family CsakCS09_RS22555 PF01497 Periplasmic binding protein CsakCS09_RS22560 PF07690 Major Facilitator Superfamily CsakCS09_RS22565 PF00589 Phage integrase family CsakCS09_RS22565 PF02899 Phage integrase, N-terminal SAM-like domain CsakCS09_RS22580 PF00176 SNF2 family N-terminal domain CsakCS09_RS22580 PF00271 Helicase conserved C-terminal domain CsakCS09_RS22585 PF00106 short chain dehydrogenase CsakCS09_RS22600 PF02203 Tar ligand binding domain homologue CsakCS09_RS22600 PF00015 Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signalling domain CsakCS09_RS22600 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS22610 PF01979 Amidohydrolase family CsakCS09_RS22625 PF00015 Methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) signalling domain CsakCS09_RS22625 PF02203 Tar ligand binding domain homologue CsakCS09_RS22625 PF00672 HAMP domain CsakCS09_RS22640 PF00689 Cation transporting ATPase, C-terminus CsakCS09_RS22640 PF00690 Cation transporter/ATPase, N-terminus CsakCS09_RS22645 PF08007 Cupin superfamily protein CsakCS09_RS22650 PF00746 LPXTG cell wall anchor motif CsakCS09_RS22655 PF00128 Alpha amylase, catalytic domain CsakCS09_RS22655 PF02922 Carbohydrate-binding module 48 (Isoamylase N-terminal domain) CsakCS09_RS22660 PF00128 Alpha amylase, catalytic domain CsakCS09_RS22665 PF00128 Alpha amylase, catalytic domain CsakCS09_RS22665 PF11941 Domain of unknown function (DUF3459) CsakCS09_RS22665 PF02922 Carbohydrate-binding module 48 (Isoamylase N-terminal domain) CsakCS09_RS22670 PF07804 HipA-like C-terminal domain CsakCS09_RS22670 PF13657 HipA N-terminal domain CsakCS09_RS22690 PF06276 Ferric iron reductase FhuF-like transporter CsakCS09_RS22690 PF04183 IucA / IucC family CsakCS09_RS22700 PF04183 IucA / IucC family CsakCS09_RS22700 PF06276 Ferric iron reductase FhuF-like transporter CsakCS09_RS22705 PF13434 L-lysine 6-monooxygenase (NADPH-requiring) CsakCS09_RS22710 PF00593 TonB dependent receptor CsakCS09_RS22710 PF07715 TonB-dependent Receptor Plug Domain CsakCS09_RS22720 PF08775 ParB family CsakCS09_RS22720 PF02195 ParB-like nuclease domain CsakCS09_RS22725 PF13614 AAA domain CsakCS09_RS22725 PF18607 ParA helix turn helix domain