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GNIT_RS00045   11992 ..   12012 +  -6.8  -2.65174   ATATAAACATCAGAC            AGCAAGGC TTGTT GCCTTGCG            TCAATTAATTCTTTT  57 134
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        ubiA   75148 ..   75185 +  -3.3  -2.65987   TGCCTTCTGCTTCTC   CAGCCATGCTTTTAACG CCTG CGGGAATGGCATCGCTG    ATATTCTTCGCTATT  42 223
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GNIT_RS01055  252857 ..  252874 +  -8.5  -3.10343   TTTTCTGGTTGACTA             GATTGCA CATT TGCAATC              TTGAATAATGCATCT  67 144
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GNIT_RS01065  254864 ..  254874 +    -4  -3.75718   TTAATATTGATTAAG                 TATG AGT CATA                 TTGGTTTTCATTGAA  55 115
GNIT_RS01080  259805 ..  259816 +  -4.4  -3.15579   TATCATTTTTGTTAT                TTGC TTAA GCAA                 TTCATCACCACTTGC  50 462
GNIT_RS01090  261484 ..  261504 + -14.1   -4.2558   GTAATTGATCAAAAA            GCTCGACAT TAA ATGTCGAGC            TTTTAATAAAAAATG 100 63
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GNIT_RS03435  797822 ..  797833 +  -2.2  -3.10597   TAAGGTTCACAGTCG                GGCT GCCA AGTC                 ATTTTGAGTAAGCAA  42 55
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        sspA  809029 ..  809045 +  -3.7  -3.30441   TCTATAAGTAAGTTA              TTAAGAG CGG CTCATAA              TTATGGCCGCTCCTA  50 34
GNIT_RS03505  809667 ..  809700 +  -7.5  -3.35371   CAAAACACCAAGGGG     CCAGGTTTCTTGA AAATCAAA TCAAGAGACCAGG      TTACTTGAAAATCTA  67 47
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GNIT_RS03685  848392 ..  848402 +  -5.4  -4.18802   GAATAATTGGTAAAT                 CACT AAT AGTG                 TTTTAAACTGTGTGT  67 119
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GNIT_RS03950  903862 ..  903900 +  -6.9    -5.055   ATGAAAAGGCAACAA   CCTTAATGAATACGCAT ATTGA ATGTTTATCCATTAAGG   TTTTTTAAACCTTAA  85 67
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GNIT_RS04040  927592 ..  927602 +  -6.8  -3.75153   AATGGGGACGGCAAT                 GACG AAA CGTC                 TTTACCTTGCAAACC  66 24
GNIT_RS04110  945331 ..  945349 +  -7.5  -2.77899   AATGCCTTGGCCGCG             TTGGCAA CGTCT TTGCCAA             TACTTCCTAAACCCA  64 524
GNIT_RS04120  946308 ..  946321 +  -8.1  -2.87354   ACTAAGCTTAGTCAC               TCGCC CTCA GGCGA                TGGTTGCTTAATTCA  66 1
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GNIT_RS04410 1011220 .. 1011235 + -10.4  -4.71426   TAGGCACAATAAAAG              GGCAGC CGAA GCTGCC               TTTTATTAGTAGAAA  95 78
GNIT_RS17630 1015321 .. 1015331 +    -4  -3.29074   ACGATTTATCTCCTG                 TCAT GGT ATGA                 TTAATAATCTGTTTA  50 180
GNIT_RS04425 1016143 .. 1016194 +  -8.8  -2.95652   GCTTTATGTTACGCG GTTTACGCTT-AGATATTCGCCCTC GCA GAGGGCAAATATCAGAAGCGCTAGC ATTTAATTGGATAAA  70 144
GNIT_RS04435 1019971 .. 1020000 +  -8.6  -5.57729   TAAGTAGTAATAAAT       GCCTGCATTATC TTTTGC GTTAATGCGGGC        TTTTTTGTGTTCTTT 100 50
GNIT_RS04450 1025560 .. 1025571 +  -3.6  -3.65351   TGTATTAGCGTATGA                CGGT TTTT GCCG                 TTTAGCTAACCGTCG  54 445
GNIT_RS17635 1027532 .. 1027553 + -10.1  -5.76633   ATAGTTTTTCTGAAA           GCACCTTCC ACTT GGTAGGTGC            TTTTTTTATGTCTGA 100 46
GNIT_RS04465 1028503 .. 1028515 +  -6.9  -2.65388   TTGCAAAGCTTCTAT                CGCTG ACA CGGCG                CTTCTAGCTTGCATG  60 429
GNIT_RS04470 1029660 .. 1029682 + -10.6   -3.5812   GCTTGTAACATCTAG           GGTACGAGTT TTT GGCTCGTACC           TATTTCTCATACATA  82 56
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GNIT_RS04545 1048972 .. 1049001 + -15.3  -2.52676   GCCAATCGTGATTTA       TTTATATGCGAAC TGTG GTTCGCATATAAA        TAGGTTCGCAAAATA 100 331
GNIT_RS04555 1052395 .. 1052409 +  -2.8  -3.74047   TTTGTCAAATTAAGC               CCATTT ATG AAAAGG               TATTTGTTCATGGTT  50 118
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        rimM 1318890 .. 1318902 +  -3.3   -4.7254   AGTCTATTACGGTGG                ACTGG GAC CCAGG                TTTTTAATGAAACCT  67 6
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GNIT_RS06835 1558756 .. 1558769 +  -8.1  -4.19817   ATTCGCGTTGGAAAC               GGCGA CCCT TCGCC                TTTTGAATGAGTCAA  81 2
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GNIT_RS06845 1560423 .. 1560435 +  -2.7  -5.72207   ACATTAAGGCACGAT                GAATA TAT TGTTC                TTTTTTTAATTTAAA  81 34
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        truA 1562228 .. 1562241 +  -3.9  -3.52668   CGAGCTCTTTTGGCC               CTATA TTTT TATAG                TTGTATGGATGACTT  52 12
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GNIT_RS06870 1565526 .. 1565542 +  -2.9  -3.71848   AGAACCAACTATTAA              TGTAGGC CTC GCCAATA              TTGTTGGTAGCGCCA  50 114
GNIT_RS06875 1566098 .. 1566112 +  -2.2  -2.99433   CTTTCTCCAACAAAA               TAAAAG GTT TTTTTA               TGTGTGGTATCGTTG  42 23
GNIT_RS06880 1567740 .. 1567761 + -12.3  -3.47573   TACTCGCTGTTTCTT           CGGCGCTTC TAAT GAAGCGCTG            TTGTCCTCTCCATCA  90 136
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GNIT_RS06890 1570121 .. 1570148 + -12.7  -5.38398   GGTTATAAAAGAAAA        GGCCCCGATAG TTAAAC CTTTCGGGGCC         TTTTTATATTTTTCT 100 119
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GNIT_RS06910 1573779 .. 1573789 +    -4  -4.34353   ACTATTCTTAAATTG                 TTGA TTT TCAA                 TGTTTTTTATATCTG  61 454
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GNIT_RS06925 1581420 .. 1581439 +  -2.1   -3.1637   AAAGTAATAAAAGCA            GCGTG ATGAAAAGTG CACGC             TTGCTAAAAATATCT  43 20
GNIT_RS06930 1582401 .. 1582424 + -15.4  -5.61689   TATTTATTTGAGAGA          GCCGCTTAGT AAAA ACTAAGCGGC           TTTTTTATTGATTTT 100 74
GNIT_RS17670 1587710 .. 1587723 +  -2.4  -4.09739   ACTTCTCGCCATAAG               CTTG TGTTAT CAAG                TTTTAAGAAAGTTAA  53 84
GNIT_RS06960 1588496 .. 1588512 +  -5.1  -3.80858   CTAACATCAGTAACT              GAAGCAA TTT TTGCTAC              TTTGCTCCCTTGTAA  59 68
GNIT_RS06990 1596482 .. 1596516 + -13.1    -3.922   CGAAAAGTGTAAACT     TTCAGAAAGAGCGTA TTTTT TACGCTCTTTCTAAA     TTTACTTAAAGGTTT 100 29
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GNIT_RS07020 1604973 .. 1604996 +  -5.3  -3.40867   ATCCCCAATTTCATC          GCAAGCGAG ACAGCA TTTGCTTGC           TTAATTGCTCACTGC  57 112
GNIT_RS07030 1608400 .. 1608420 +  -6.1  -2.83715   AACTGCGGCTAATAG            CTTGTTGCA ACC TGCGTCAAG            TGTGATCATAATACG  55 51
GNIT_RS07035 1609100 .. 1609128 +  -4.5  -3.24166   TGCAAGATTAACCTA        TCTCGGCGGGT CAACTCT ATCCGCTGAGC        TTGCATTGATTCGAT  51 43
GNIT_RS07045 1610080 .. 1610090 +  -2.6  -3.73953   CATCATGGTTATGCC                 TAAT CTT ATTA                 TTTGATACAGCTCAT  50 101
GNIT_RS07050 1611200 .. 1611210 +    -4   -5.0133   TTATTCTAATCGTTT                 TATC AAT GATA                 TTTTTTAACAGAATG  72 238
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GNIT_RS07060 1614887 .. 1614898 +  -3.6  -2.72462   ACTCAACCGTAACGA                GTGC GCTT GCGC                 CATTTTTATCCATTT  43 190
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GNIT_RS07085 1620053 .. 1620074 + -11.7  -5.61596   AAAGCACGATATAAA           CCAGTAATC ATTT GATTACTGG            TTTTTTTGTGGACAT 100 89
GNIT_RS07090 1620974 .. 1621006 + -12.1  -3.12766   AAGGGGATGGTAAAA      AACGCTGCACTTTAA AAA TTAAAGTGCAGCGAA      TAGTTATTTTGGTAC  87 66
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GNIT_RS07105 1624091 .. 1624107 +  -3.7  -2.74144   AGCCGGGCAAATAAA              TCGATAT AAA ACATCGA              CTTTGAAAATCAACG  45 27
GNIT_RS07110 1624937 .. 1624959 +  -7.8  -4.99035   ATAGTATCTAAACGA           TGGCTTAG TCAGTCT CTAAGCCA           TTTTTCTGTAAATAG  89 37
GNIT_RS07130 1633057 .. 1633068 +    -3  -4.71061   CTCCTTAATGCAAGA                TTGT CGAT ACAA                 TTTTTAAATATAGCT  62 137
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GNIT_RS07140 1637654 .. 1637673 +  -9.3  -3.40403   AGTGTAATGATTAGA            CGCGTCT GCAAAG AGACGCG             TTATCATAAAACGGG  76 49
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GNIT_RS07165 1648243 .. 1648254 +    -3  -2.67803   TTGAGTTGGTAAAAC                TCTT GCGC AAGA                 TAAATTTGATAAGCA  41 42
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GNIT_RS07265 1671420 .. 1671436 +  -6.5  -3.06133   ACTTACCAATAACAC              CAGTAGG TCA CCTCCTG              TTCGATAAGGAATTG  60 82
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GNIT_RS07370 1702010 .. 1702020 +    -4  -4.45115   CAAATCAGGCGGGGG                 CATA AGG TATG                 TTATTTTCTCTTCCT  63 21
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GNIT_RS07410 1712771 .. 1712790 + -13.6  -3.72576   ATTTAAAATAAAAAA            GGCGACTC TTTC GAGTCGCC             TTTAGTGACGAAGGA 100 60
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GNIT_RS07430 1718548 .. 1718571 +  -2.3  -5.61596   TAAAAACAGCAAAAA          GGCGAATTC TTTAAC GTTTTCGCC           TTTTTTTATGAGCGT  80 53
GNIT_RS07435 1719761 .. 1719777 +    -8  -5.48303   AAATATCAAAAAAAA              CGAGCT AAATA AGCTCG              TTTTTTTCAAGTTGT 100 45
GNIT_RS07445 1721381 .. 1721393 +  -3.3  -4.03174   ATCAGACAAAATGGC                GGCTT CTT ATGCC                TTGTTTGATGAGTTT  57 117
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GNIT_RS07465 1728857 .. 1728871 +  -4.2  -3.93288   CTGGGACCGCACTAG               CGCTAT CGT AAAGCG               TTTACTTGAGTGAAG  59 26
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        nusA NONE
GNIT_RS07510 1738261 .. 1738279 + -12.4  -5.68023   TAGAGAAACCAAAGA             CGGGGGCT ATT AGCCTCCG             TTTTTTTCATTATAC 100 58
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GNIT_RS07520 1739727 .. 1739743 +  -6.5  -3.92746   GTGTATTATTACTTC              GCGGGTA TAA TACGCGC              TCTTTTTGGCATGAC  68 53
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GNIT_RS07560 1749583 .. 1749595 +  -4.9  -3.51232   ATAGAGAAGTTATTG                TAGTT AGA AACTA                TTAGTTTAAACGGGA  57 287
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GNIT_RS07570 1754078 .. 1754090 +  -3.4  -3.22491   AGATCATGTCACTAT                TGCA AGAGG TGCA                TTCGTAATGCCATTT  47 6
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GNIT_RS07715 1787043 .. 1787056 +  -3.9  -2.78463   TATGCGTTCGCTGAA               TTCTT TTTA AAGAA                TATGGTGAAAAGAGT  46 131
GNIT_RS07720 1789254 .. 1789269 + -10.4  -5.65177   AAGTAATGCAAAAAA              CCCAGC CTTC GCTGGG               TTTTTTTATGGCTGT 100 57
GNIT_RS07740 1795300 .. 1795320 + -10.5  -2.96321   TGGCTTTATGTCACT            GCCTGTAAT AAA GTTACAGGC            TGGTATTTTCATAAA  78 170
GNIT_RS07745 1797907 .. 1797923 +    -8   -5.7946   TTTTACCTTTTCAAA              GCCAAC CTTGT GTTGGC              TTTTTTTATTAAAGA 100 55
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GNIT_RS07760 1801264 .. 1801278 +  -4.2  -3.60627   CCAAGGTTCAGCCGC               TACTCC ACC GGCGTA               TTTGGCATAAGGTCG  53 469
GNIT_RS07785 1805168 .. 1805190 +    -2  -5.03713   CAAAGGCAAAAGTGA           CAAAAATCCA TTG TGTAATTTTG           TTTTATTTCCTTGTT  66 208
GNIT_RS07805 1811245 .. 1811255 +  -6.8  -3.19463   CGTACCAAATCTAAA                 GGCT TTC AGCC                 TTAGTGACTACTAAC  61 34
GNIT_RS07810 1812546 .. 1812567 +  -6.5  -6.11644   ATAGTTTTCTGAAAA           GCATCTTCC ATTC GGTAGGTGC            TTTTTTTTTACATAC 100 40
GNIT_RS07820 1816877 .. 1816890 +  -3.1  -2.70932   AAACCGTTTGTCTGT               GGAGT GTTT ACTTC                TAATTGAGGGAAGAC  43 326
GNIT_RS07840 1823448 .. 1823462 +  -2.8   -3.8709   AGAGTCCCAATGTAT               GCAATA AGA TACTGC               TTTCTACAAAAATTT  52 205
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         fur 2139976 .. 2139990 +    -5  -4.07885   TAGCAATTAAATTTG               TGCTTG TTA TAAGCA               TTTTGAGCAGCCATC  63 191
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GNIT_RS09360 2165248 .. 2165260 +  -5.5  -4.80656   TCAAAGTAATTCATC                GGTTG CTA CAGCC                TTTTGTCTTCTTCCT  75 32
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GNIT_RS09420 2179603 .. 2179614 +  -4.4  -5.06816   AAAAGAAGAACCGAT                TGCT CCAC AGCA                 TTTTTGTTAAGCGCT  77 131
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GNIT_RS09475 2190978 .. 2191008 +  -3.4   -2.9583   CATTGTAGAAGGTCA      CGCCTTAATGGAA AAGGAG TTAC-TTAAGGCG       TACTTTCGATAGTTC  45 56
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GNIT_RS09540 2204573 .. 2204599 + -16.8  -3.21938   TAGTAGGTTAATAAT         TAAAAAAGCGGC TAA GCCGCTTTTTTA         TTGCTCAAATTTTAG 100 73
GNIT_RS09560 2212351 .. 2212376 +  -5.4  -4.67354   TGTAGATTGTAAAAA         GGGTTGCC CAATTACTCA GGCGACCC          TTTTATATCTATCTT  73 79
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GNIT_RS09575 2218759 .. 2218788 +  -9.4  -5.41941   ATGAACTACAATAAA       CCCCTAAAAGTT AAGTGA GACTTTTGGGGG        TTTTTATTTAGTTTA 100 119
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        gltA 2256128 .. 2256144 + -10.8    -5.252   CTCCCTTTTAATTAA              GGCGCC TTCTT GGCGCC              TTTTTTGTCGAAATA 100 52
GNIT_RS09685 2256606 .. 2256629 + -15.4  -3.38036   TTTGATAGCATGAAC          GAGCCGAGTA TCGA TACTCGGCTC           TATTGATTTGATTGC 100 28
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GNIT_RS09725 2264858 .. 2264882 +  -8.7  -2.94872   TTCAGTCGCCAGTCG          GCAAGCATA ATCCTCA TATGCTTGC          TCCTTATTAAATACC  70 81
        rimO 2270975 .. 2270999 +  -3.6  -3.64716   CTGCAAGTCTTCAGG         CGTATCCA-CGC CGT GCGGTGGA-GCG         TGTTTTGCCACATCA  51 155
GNIT_RS09775 2278158 .. 2278172 +  -2.1  -4.56597   TTTGCGATAACGTTC               CGGTT AGCAC AATCG               TTTTTCCAGCAAACG  61 279
GNIT_RS09795 2286357 .. 2286369 +  -6.2  -3.77209   CTTAGAGGTAAATAA                CGGG AATTG CCCG                TTTCACTCTCTATTT  64 348
GNIT_RS09825 2292713 .. 2292747 +  -9.4  -3.54511   TTTAACAATAAGAAA    GCATCAAACAGCTGG GTGAAG CC-GCTGCTTGATGC     TTATGCTTGACTTAT  78 36
GNIT_RS09865 2301867 .. 2301877 +  -2.6  -3.53811   CTTTTACAAATAACG                 TATT ATA AATA                 TTTACAAACACTCAG  48 48
GNIT_RS09870 2302835 .. 2302859 +  -7.9   -4.2803   TAACTGCTTGATAGT          GGATGCTATTT TTT GGATAGCGTCC          TTTTACATTCAACTC  76 132
        leuS 2308318 .. 2308331 +  -6.7  -4.43351   ACGTTGCCGAACTTA               CGTCT TCAC AGACG                TTATTTTTGCCGTAT  76 65
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        asnB 2478522 .. 2478547 + -10.5  -5.58074   CGGTATCTTTTAAAA         GCGGCTCAATA TATT TATTTAGCCGC          TTTTTTTAATGCTTC 100 54
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GNIT_RS10690 2488422 .. 2488438 +  -3.7  -3.08371   AGTACCTGTGGGTGA              TATACCT ATC AGGCATA              TGTCTTAGGGGTATG  47 1
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GNIT_RS10725 2495601 .. 2495614 +  -5.3  -3.50853   AACAGCACACCATCA               GCAAA TTGT TTTGC                TTGTCCTTGAACAAG  56 216
GNIT_RS17695 2505415 .. 2505427 +  -2.7  -3.41745   GCCGATGTAATAGGT                TTCAG TTT TTGAA                CTTTTTAGATCATTG  46 177
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GNIT_RS10805 2510759 .. 2510774 +    -9  -5.84381   ATAGACACAAAAAAA              GCCTCA ATTT TGAGGC               TTTTTTTATTGATAC 100 65
GNIT_RS10815 2512179 .. 2512206 +  -8.6  -5.93809   ATCTGAAATCAAAAA        CCACCATACTTGA TGA TTAAG-ATGGTGG        TTTTTTTTATGCGAA 100 83
GNIT_RS10840 2517612 .. 2517633 +  -2.3  -4.61231   CAGAGTACATCTGAT           CGA-GATCAA TAT TTGAACCTCG           TTTTTAGCAGTCTGG  61 267
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GNIT_RS10870 2525539 .. 2525565 +    -8  -3.67417   GCTAGTAATGAAAAA         GCCTAACGCG CAATAAC CACGTTAGGC         TTTCAAATTGAATAT  72 110
GNIT_RS10940 2541084 .. 2541099 +    -9   -5.0538   TTTAAACAAAAAAAA              GCTCCT AAAA AGGAGC               TTTTTTGCAGTGCGA 100 136
GNIT_RS10985 2552134 .. 2552145 +  -4.4  -4.45077   GTAATCTGGCGCATA                CAAG ATAC CTTG                 TTTTGCTAATTTTTC  69 432
GNIT_RS10995 2553731 .. 2553745 +  -2.8  -4.32046   AGTTAGCCAGCGTCA               GTTTGA GCT TCAGGC               TTTGCTTTTTGAAAA  57 56
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GNIT_RS11110 2575898 .. 2575909 +    -3  -4.49937   GCGATAAGGTAGTTT                TATC GACT GATA                 TTTTACTGTTGTTAC  60 157
GNIT_RS11115 2578158 .. 2578186 + -12.5   -5.5353   ATTCGAAAAACAAAA        GCCCCATCGTTTT AAT GAAACAATGGGGC        TTTTTTATTGCTCTC 100 112
GNIT_RS11440 2651840 .. 2651851 +  -2.2  -4.00299   GTATAGCCCTTTTGG                CGTA CACG TGCG                 TTATATTATTTTATT  53 350
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        dapD 2716986 .. 2717005 + -12.2  -5.58454   CATACACGTGAACAA            GGGCATAG ATTA CTATGCCC             TTTTTTTACTCTCAA 100 52
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GNIT_RS11750 2721658 .. 2721678 + -12.7  -4.75954   ATCTAGACGAAAAAA            GCAGAAACA TCC TGTTTCTGC            TTTGTTTTCAATTTT 100 60
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GNIT_RS11795 2730611 .. 2730669 + -14.8  -3.83205   GGTTTAGGGGCTCAG TTTTGCTTTTAATAGCCGGCGATCGAGC AAT GCCCGATTGCTGGCTATTAAAATAAACA TTTGATCTACAACGT 100 34
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        pyrG 2766348 .. 2766363 +  -6.8  -4.26871   ATGAAGAGAGCACGA              GCACGT AAAA GCGTGC               TTTCTTAGTAGCTTA  73 48
         eno 2767789 .. 2767816 + -12.8   -4.7878   GAGTAGTTAATGAAA        GCGGCATCTTTA TGGT TTAAGATGCCGC         TTTGTTTTGTGAATA 100 99
GNIT_RS11955 2768867 .. 2768877 +  -5.4  -3.22388   CTAAATCCAAGGTTT                 GCAT GGC ATGC                 TTGCTCGATTGCGTA  54 388
GNIT_RS11970 2773411 .. 2773433 +    -7  -4.65153   CGCTGAATAAGAAAA           GGGTTTACTG ATT TAGTGAGCCC           TTTTGCTTTCTATAG  81 35
GNIT_RS11975 2775398 .. 2775412 +  -7.2  -2.62263   CTATTAAAAAATGAG               GACAAA GCC TTTGTC               TGATATAACGAAACT  60 83
GNIT_RS11980 2777026 .. 2777042 +  -7.9  -2.53392   ATCGTATCTTGCAAC              CTGGCCG TTA CGGCAAG              TAAGTTAAGAGCTTT  62 6
GNIT_RS11985 2779972 .. 2779982 +  -4.6  -3.05844   ATATAAAATGAACTG                 CGCT ACA GGCG                 TCTTCCAGTCGCGAC  49 234
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GNIT_RS12510 2911871 .. 2911901 +  -9.8   -3.5947   CAATATGAAACGTTG      GC-GCTGCTAGCT CTGCGT GGCTAGCAGCAGC       TTATCTATCAAGCTT  80 55
GNIT_RS12540 2923741 .. 2923760 +  -2.2  -3.58522   TTTTATGGCTCATCA            CGTAAA GCTTGTTA TTTACG             TTTAGCCGTAATGCT  47 21
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GNIT_RS12605 2938174 .. 2938185 +  -4.4  -3.53466   TTCAATGGGTACACA                GTTG CCAG CAAC                 ATTTTCTTCGTTTTT  54 457
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GNIT_RS12640 2945775 .. 2945793 +    -9  -3.16564   ATAATAAAAAGAGCT             TATTTGCT GTG AGCAAATA             TTCATAAAATGAGAA  71 105
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        rpsU 3130388 .. 3130408 + -10.4  -5.38054   CAATTAAATTCAAAA            CGGGCGTC TTTAT GACGTCCG            TTTTTGTTTCTGCGA 100 72
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        rpmE 3221877 .. 3221891 + -11.4  -5.61596   AGAACAATTTAAAAA               GAGCGC AAT GCGCTC               TTTTTTTATGCCCAT 100 68
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        fadB NONE
        fadA 3253095 .. 3253115 + -14.1  -5.40625   ACTCAGAAACAAAAA            GGGATGCTA ATT TAGCATCCC            TTTTTTATGTCATAT 100 45
GNIT_RS13970 3260703 .. 3260715 +  -3.3  -4.71426   AGTCGATGAGTTATT                GCCAG ATC CTGAC                TTTTATTAATCAAAG  64 4
GNIT_RS13975 3263015 .. 3263028 +  -2.4  -4.13767   CTGACTATTGTGAAG               CCAA GAGTTA TTGG                TTTTCAAATGGCGAC  55 476
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GNIT_RS14220 3316204 .. 3316215 +    -3  -3.76968   ACTTTCAGTGATTTC                CAAA TTAA TTTG                 TTTGCTAGATACCTT  52 516
GNIT_RS14230 3320400 .. 3320414 +  -6.4  -2.65532   CGCCTGCCAATACTA               GCAGAG GCA CTTTGC               TGCCTTTAAGCTCAT  53 271
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GNIT_RS14320 3345966 .. 3345996 +  -4.7   -3.7511   GGCGAGGGTGGTCAT       CAGCACTAGGC GATAAAAAA GCCTAGAGTTG       TTCTCTTGTAAAACA  59 17
GNIT_RS14330 3350349 .. 3350379 +  -9.1  -5.47159   GTAAACCTTGCTATA      GCCCTA-GCCGATA GTAT TATCGTCCTAGGGC       TTTTTGTTTATTGAA 100 42
GNIT_RS14335 3351770 .. 3351786 +  -5.8  -2.76696   GCTGCAGGAAATAAC              GGTTCG GAGTG CGGACC              ATTGTTGCCAACCGC  50 431
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GNIT_RS14370 3359766 .. 3359787 +  -5.1   -3.5393   GTCCATTGCAAAAGC           CGCAGTTGG AATT CTAACTCCG            TTTGCAAAAAATGCT  56 291
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GNIT_RS14545 3408346 .. 3408362 +  -2.9  -3.60296   GGGGTACCGCGTTTA              GCCGTAA AGT TTGCGCC              TTTCACATCCAAGTC  50 137
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GNIT_RS14630 3429348 .. 3429368 +  -8.3  -5.00616   GAACTCATTGCAAAA            GCCACCT TAGTTAT AGGTGGC            TTTTTTCCAAGAGCG  95 85
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GNIT_RS14640 3433452 .. 3433483 + -15.4  -3.87149   CGCAATAATAAAAAA      GGCCTGA-TTCAGTA CAA TACTGAAATCAGGCC      TTTGCATTTAGTAAG 100 115
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GNIT_RS15390 3628522 .. 3628534 +  -4.9   -3.3771   TCAGCTGACGCCTGC                TATCA AGC TGATA                TATTCTGCTTTGGAG  55 58
GNIT_RS15395 3631135 .. 3631151 +  -2.3  -3.90097   GTGTTCTGAGTAAAT              GTGTT CATTGAT AACAC              TTGTATTTATCACAT  51 81
GNIT_RS15400 3633030 .. 3633061 +  -3.7  -3.65046   AGCGGTTAAGCAAAT      CTTCAACGCCAGCC TCATC GG-TGGCGCTAAAG      TTGTTCCAATCAAGA  53 404
GNIT_RS15425 3638191 .. 3638202 +  -4.4  -4.39571   GTCACTAGCTCTGGT                GCAA ATGA TTGC                 TTTTGAATTTCTAAG  66 431
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GNIT_RS15455 3644062 .. 3644092 + -13.4  -4.30576   TATTAAGTAAAAAAT       CAATGCGACCCATT TTG AGTGGGTCGCATTA       TTTTAATGCTAAGCG 100 31
GNIT_RS15525 3658823 .. 3658839 +  -4.5  -4.16351   TTACTGCAAAATCGT              CGTTAAA CAT TTTAATG              TGTTTTTTACCGTCT  64 233
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        prpE 3743079 .. 3743095 +  -2.3  -4.18488   GAATTGTTAGCTGTA              TTTACGT CAC ACATAAA              TTTATTAAGCTGGCT  56 31
GNIT_RS15880 3745353 .. 3745364 +  -4.4  -3.38522   AAGCATCGCTTGATC                TGCA TTAG TGCA                 TATTTGCGATAGGTC  52 294
GNIT_RS15890 3748551 .. 3748565 +  -2.8  -3.15999   ATAGCGCAAAATTCT               TACGAT ACA AACGTA               TTGCCTGTCTGAAAA  45 61
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        prmA 3878645 .. 3878659 +  -5.7   -4.7373   AGAAATAGTTCTTAA               TCTGC CAAGA GCAGA               TTTTTCCTGAGCTGC  75 33
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         fis 3880276 .. 3880289 +  -3.1  -2.70932   AGTTCGAATATTAAT               GGTTA AGTT TGACC                TCATTCAAAACGAAA  43 82
        purH 3882958 .. 3882978 +  -2.6  -3.83026   ATGAGACACTTTAGG            CATTAGTG CAAAC TGCTAATG            TTTAATATAAACCCG  52 20
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GNIT_RS16755 3964805 .. 3964816 +  -4.4  -4.38116   CTGAAAGCGAATAGT                GTAC TTAC GTAC                 TTTGCTTTTTATGCA  66 27
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GNIT_RS16770 3968523 .. 3968533 +  -5.4  -3.19321   CAACATTGCTAAATT                 CTCA TCT TGAG                 CTTCTTTTGATTCAT  54 226
GNIT_RS16810 3975743 .. 3975755 +  -2.7  -3.14132   AATAGTAAATTGTTG                TTAAG CGT CTTAG                TTGATAAGCGGCGCC  45 114
GNIT_RS16820 3979241 .. 3979276 +  -9.2  -3.23216   AGTAGCCATACGCAA    TAAACTTCATTAACCT GATA AGGTCAGTGGAGTTTA     TTGCTAGTGCTAAAA  75 55
GNIT_RS16825 3980044 .. 3980070 +  -2.9  -3.32844   GCACCGAATTGTCAT         TCGCGGGTATG AGGTA CATGCCCACAA         TTGTCCAATACAACA  46 477
GNIT_RS16840 3983588 .. 3983598 +  -2.4  -4.56113   ATCTAGCACAATCTC                 TCGC TTC GCGC                 TTTCTTTGGTATATT  61 227
GNIT_RS16875 3988457 .. 3988476 +  -7.8  -5.24989   AGCTCAAATGTAAAA            GCCACCTC TTTT GAGATGGC             TTTTTTCGTCTCTAC  95 77
GNIT_RS16910 3998926 .. 3998947 +  -3.1   -2.9043   AACCCGTAATAAAAG           GAATTGCAGC ATT GTTG-AATTC           TCATGTTATTATTGC  44 411
GNIT_RS16915 4001481 .. 4001508 +  -4.2  -3.07443   TATATGCGGGGTTAT        CTTGGTGTTCAT GCAC ATCAAAACCAAG         TTCGCTAACATGTGA  47 79
GNIT_RS16930 4006936 .. 4006952 +  -2.2  -3.51365   CGCGAAACATCTAAC              GCCG CAGCAAGAT CGGC              TTGTGTCCAATCTCG  47 163
GNIT_RS16950 4010305 .. 4010324 + -12.8  -5.38958   AACTAAGCCCCTTTT            GCCCGGCC TTTT GGTCGGGC             TTTTTCTTTCTAGAT 100 149
GNIT_RS16955 4010889 .. 4010923 +   -16  -2.88999   TTACGACATTCACAC     CTAACAGTAGCTTATT CTA AATAAGCTACTGTTCG     TGTGCTATCTCCAAA 100 2
GNIT_RS16990 4021595 .. 4021632 + -16.5  -3.88985   GAAACTCATCAAAAA   CGACGACACAAGTGACA TTTT TGTCACTTGTGTTTTCG    TTTCTAACGCGTTTT 100 59
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GNIT_RS17060 4036142 .. 4036153 +    -3  -3.96827   AGGCTGCAGCGTCTT                TAAC AGGA GTTA                 TTTATGAATAGTTTT  52 3
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        atpC 4113993 .. 4114009 -  -9.4  -5.69793   ACATGAAACAAAAAA              CCCAGC GCTAA GCTGGG              TTTTTAAATCATTGT 100 55
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GNIT_RS17185 4059210 .. 4059239 -  -2.9  -4.11394   ATCGTATTCGCAAAA       CCAGTGTAAAAAA TGGC CTCTCTACACTTG        AAGCCGTGGCCTACG  56 140
GNIT_RS17175 4057719 .. 4057730 -  -7.2  -2.97171   TATTCGACCAAACCA                GCCG GTAG CGGC                 CTCGGCCTTGCGCTT  59 299
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GNIT_RS17135 4048085 .. 4048099 -  -4.2   -3.6581   ACCATTGCGAAAATA               GCCGAA GAC TTAGGC               GTTGTTTCACCTGAA  53 520
GNIT_RS17125 4047157 .. 4047169 -  -2.7  -3.99898   CAATGAACTCATAAA                TATGA ATG CCATA                ACGATCGTGGTTATT  52 36
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GNIT_RS17115 4045422 .. 4045432 -  -6.8  -3.62775   ACCATCTGCCAATAA                 CCAC AAG GTGG                 ATGGACAATGACATG  64 377
GNIT_RS17090 4040397 .. 4040426 - -10.7   -4.2558   CATCTCCCATCAAAA       CGTAAGTGCCAAG CCAT CAAGGCACTTACG        TAACCCACACAAACT  90 40
         rph 4038356 .. 4038371 -  -6.8  -4.64613   TATAAATAAGTAAAA              GGCCTC AATT GAGACC               TTTGTTTTTGTTCGC  78 64
        pyrE 4037632 .. 4037650 -  -3.8  -3.85165   TAGCGTAAAGCTAAA             TACCGTAA TTC TCGCGGTA             TTGATTAATACTAGC  56 2
GNIT_RS17070 4037344 .. 4037361 -  -8.5  -4.57569   TTATTTGTTTAAAAA             GGCTTAA TCCC TTAAGCC              TTTTTTCACTAAATA  88 11
GNIT_RS17035 4027518 .. 4027529 -  -4.4  -3.61421   CAAGCACAGAAAAAG                GCAA TGAA TTGC                 TGATAAAAAGTAAGC  55 90
GNIT_RS17020 4025278 .. 4025289 -  -5.8  -2.58579   TCAACGCCCGATAAG                CCAC GATG GTGG                 ATGGTTGAACTAGAA  50 236
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GNIT_RS16960 4010893 .. 4010919 - -15.4  -3.14026   GACATTCACACCTAA         CAGTAGCTTATT CTA AATAAGCTACTG         TTCGTGTGCTATCTC 100 94
GNIT_RS16945 4007490 .. 4007503 -  -3.9  -4.30576   GGTGTAGTATCAAAA               GTATA TAAA TATAC                TCCATCGAAAGGTAA  61 123
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GNIT_RS16935 4006733 .. 4006745 -  -6.2  -3.51708   GAGCGCGTAAATCAA                CGGC ATTTG GCCG                AAGCGCTGAGTTTTA  60 80
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GNIT_RS16920 4001126 .. 4001156 -  -3.9  -4.20516   GTGCGATGCAAGAAA       CCTGGCAGCGCTA TGCGG TAGTGCTGCGAGT       ATTGGAAAAAGAAAA  62 309
GNIT_RS16905 3993213 .. 3993229 - -10.1  -5.40625   ATACGACATAAAAAA              GCCGCTC ATG AAGCGGC              TATTTTAAGTTTTTA 100 68
GNIT_RS16900 3992943 .. 3992959 -  -2.3  -3.54408   TTTGATGTAAATCAA              TGCCTAA TGA TTAAACA              AAGTACCTGCATAGT  47 12
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GNIT_RS16890 3989920 .. 3989934 -  -2.1  -3.59935   CAATGACTACAAATA              CCAGTG TTCT CAC-GG               TTTTTGCATTTTCCG  47 168
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GNIT_RS16880 3988457 .. 3988476 -   -10  -4.35926   AGCTCAAATGTAAAA            GCCACCTC TTTT GAGATGGC             TTTTTTCGTCTCTAC  91 37
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GNIT_RS16845 3983263 .. 3983278 -  -3.2  -4.89233   CATCAATATTAAAAA              GCCG TTTTATCC CGGC               AGAACGAGAGTAAAC  72 200
GNIT_RS16835 3980716 .. 3980735 -  -2.8  -3.36569   TCAATCGCGCAAATA            GTTCATTG AAGG CAACGCAC             GAAGCGCCCGCTTAA  46 55
GNIT_RS16830 3979241 .. 3979276 -    -7  -3.13728   AGTAGCCATACGCAA    TAAACTTCATTAACCT GATA AGGTCAGTGGAGTTTA     TTGCTAGTGCTAAAA  63 455
GNIT_RS16815 3975468 .. 3975479 -  -4.4  -3.63761   TAAGCTAGATAAAGA                GCAA CGTA TTGC                 AAATGTAGACAATGC  55 298
GNIT_RS16805 3973830 .. 3973855 -  -2.5  -3.50219   AACATTGCTATACAA         CTTGCCG-TATC CAA GTTATCGGCATG         TTCCTGAATTACTTT  48 77
GNIT_RS16800 3973436 .. 3973453 -  -3.5  -3.61398   TCGTCTTTTTAATAA             CTAACTA TCAG TAGTTAA              TGAACTGCATAATCT  50 46
GNIT_RS16795 3972318 .. 3972329 -  -5.8  -4.11295   CTAAACCCACATAAA                GTGC GAAC GCAC                 AATACAGTGTCAGAG  67 231
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GNIT_RS16640 3937907 .. 3937931 -    -5  -5.77853   AATTTTTAAAAAAAA          GCAGACCAAA AGAAA CTCGATCTGC          CTTAGCATAATAACT  88 71
GNIT_RS16635 3936939 .. 3936954 -  -3.2  -3.37935   AGCCAAAATGACGAA              GATAGG CAAC CCTTTC               AAGCACGAGAATATT  48 265
GNIT_RS16625 3935590 .. 3935604 -   -10  -3.07233   GCATAACTGTTAACA               GCCACA CAT TGTGGC               TGTAGTAAAAAATAA  76 69
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GNIT_RS16555 3923049 .. 3923060 -  -2.2  -3.20345   AAGCGGATACCAAGA                TGCC ATGC GACA                 AGCCGATGAGATAAG  44 142
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GNIT_RS16480 3903558 .. 3903572 -  -2.8  -3.12351   GGTTTTTAGACGCAA               CAATGA TTT TCATGG               TTAATTATTCATTCC  45 102
GNIT_RS16475 3902577 .. 3902593 -  -6.6  -4.02108   GTCAGTACAATGAAA              CCATTC AGAGG GAATGG              TCGCGCAGTATCCGT  70 481
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GNIT_RS16400 3888764 .. 3888778 -  -2.8  -2.64933   CATCCATTGACACTA               GAGC TTGTTGC GCTC               TGCAGTTTAAAACTC  41 80
GNIT_RS16395 3887311 .. 3887327 -  -5.1  -4.15006   AGAGGCATCTGAAAA              CGTTGAT TTG AACAACG              TCATTAAAGAGTTAA  63 447
GNIT_RS16365 3880469 .. 3880493 -  -5.1   -3.1637   ATAGATTGGTAGCAA          CGTTAACTATT AAA AATAGTTAGCA          AACGTCTCCTTCACA  53 10
GNIT_RS16320 3871511 .. 3871529 -  -2.5  -3.15236   GAAACTGACAGCTAA            CATCTTGT AACC ACA-GATG             CAGCACTCTACTCTT  45 33
GNIT_RS16305 3867793 .. 3867814 -  -6.7   -4.0098   GTTTAAGTGAAACAA           CTACTTATT ACTG AATAAGCAG            CCGCGATTTTTTAGC  70 122
       groES 3867433 .. 3867448 -  -3.2  -4.56133   CGTTAATAATTAAAA              CTGGAC TATT GTGCAG               TGATTTCTTATTCAA  64 33
       groEL 3865596 .. 3865619 -  -7.5  -5.71983   TTAAGCACAAAAAAA          GCACTAAGC GATTAA ACTTAGTGC           CTCGATTACTATAAT 100 103
GNIT_RS16290 3863486 .. 3863507 -  -8.7  -3.04609   GCATGCAAATGAAAT           CTGTTACCG GAGG CGGTCACAG            TGGTGGCGGGATATT  66 430
GNIT_RS16280 3861564 .. 3861575 -  -2.2   -3.1552   CCCCACCCATTAATA                TGGC AACA ACCA                 CAGTCTCTGCAATTT  43 121
GNIT_RS16275 3859623 .. 3859655 -  -6.3  -4.09685   TTTTATCTGGTAAAA      CGGAAACGCTCACTT ACA AAGCTAGCCTTTCCA      TAACGATTGCGCTGC  67 100
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GNIT_RS16240 3851986 .. 3852020 - -13.8   -5.1104   AAATACACATAAAAA     GTAGCGCTAAAATACA TCT TATTTTTTAGCGCTAC     TGTTAGTTGAAGGGG 100 48
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GNIT_RS16230 3849571 .. 3849585 -  -6.4  -3.35526   TAACCATAAAGGGAA               CCACGA AGC TCGTAG               TGTTTAAAGCAACGT  59 441
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GNIT_RS16205 3844199 .. 3844210 -  -4.4  -3.16177   AGCCCACATACGTAA                TGAG TGAG CTCA                 TTCAAAATGCAAGCT  51 72
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GNIT_RS16125 3819993 .. 3820007 -  -2.1  -3.53091   AGGTCTTCTCTCAAA               CCTTG GAGCG CAAAG               TAACTCAATAAGTAG  47 61
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         upp 3682884 .. 3682899 -  -2.6  -3.16971   TTACTATATAGTTAA              TTG-CTC ACA GAGACAA              ATACTCTGGCTTGTA  45 139
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GNIT_RS14695 3448272 .. 3448282 -  -2.6  -3.80516   AATTAAGGTAGCAAA                 TAAA TGC TTTA                 ATTTTTATTCTTATA  50 101
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GNIT_RS14655 3440410 .. 3440431 - -14.5   -4.8143   GTAACAACGTAAAAA           GGCGCGAAT TAAT ATTCGCGCC            TTTTTTGTTTTATTA 100 86
GNIT_RS14645 3433452 .. 3433483 - -15.4  -5.64873   CGCAATAATAAAAAA      GGCCTGA-TTCAGTA CAA TACTGAAATCAGGCC      TTTGCATTTAGTAAG 100 88
GNIT_RS17755 3427066 .. 3427092 -  -5.1  -4.82901   TTTGCTTTATAAAAA        CCGAGCAG-CGA TTGG CCGACCGCTCGA         TCATATCGTGTCTTT  75 82
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GNIT_RS14600 3420083 .. 3420099 -  -2.9  -3.36803   CAATGGTATCCAGAA              GCCGCTA GGT TAATGGC              AATGGCTGGCGCGGA  46 431
        folE 3414540 .. 3414568 - -12.5  -2.99704   CTTCTAGTAAAGAAG        CCCCCGAAATTTA TGT CAACTTTCGGGGG        TGATTTCAATATCAT  88 56
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        rplL 3387228 .. 3387252 - -17.3  -4.64766   CCTACAGCGCAAAAA          GGCAGGTGATT AAA AATCACCTGCC          TGAGCCTGTTAAGGC 100 60
        rpoB 3382949 .. 3382961 -  -4.8  -3.85909   CCACCGAAATGGAAA                CAGG GCCAA CCTG                TTTTAGCTCTGACGT  61 28
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        fusA 3375197 .. 3375218 -  -3.7  -3.09492   TTCCTAAGTTTAATA           CTCATTCCA ATAT TGGAGTGAA            GTGAACTTCTATAGT  47 56
         tuf 3373949 .. 3373965 - -13.7  -6.23545   CTTAAACAAAAAAAA              GGCGCTC ATT GAGCGCC              TTCTTCGTATTTTCG 100 48
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GNIT_RS12570 2927407 .. 2927428 - -14.5  -5.46698   GCCAAAATCAAAAAA           GGCGAACCT GAGA AGGTTCGCC            TTTATCATGTTAAAA 100 89
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GNIT_RS12535 2922899 .. 2922911 -  -2.7  -3.31415   TAGGACTAAAGTTAA                TCAAG CGT CTTAA                GCAATTTTAAGACCA  46 89
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        aspA 2900624 .. 2900635 -    -3  -3.90588   TATTTGGCAACTAAA                CTAA GTTT TTAG                 GATCCAGCAATTTAC  52 9
        acnA 2897773 .. 2897800 -  -8.5  -3.08996   CAGGTTTAGTGAATA        CCCCCAAAAGT TTGTCT ACTTTCGAGGG         GCTTCACAACGATTG  67 72
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GNIT_RS11455 2654658 .. 2654680 -    -9  -4.90519   AAATTAAAAAAATAA           GCGGCCAGGC AAT GCCTGGCCTA           TCGCTCTGGTATACT 100 128
GNIT_RS11450 2653217 .. 2653228 -  -5.8  -3.03159   GCAATTGCTGTAACA                GAGC GAAA GCTC                 TTGCTGACGGACAGG  56 234
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        phhA 2557216 .. 2557229 -  -6.7  -3.08046   GTCGTATCCGAAAAG               TCACC ACAA GGTGA                TTAAAGTCATATGGT  60 149
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        metG 1604943 .. 1604962 - -10.8  -5.64873   GGCAACAATAAAAAA            GGGATCTA AAGC TAGATCCC             CAATTTCATCGCAAG 100 78
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GNIT_RS06485 1485758 .. 1485774 - -10.8  -4.68593   TTTATTACCTAAAAA              GCCCGC ATTAA GCGGGC              AAAACTAGGGAGTTT  95 47
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GNIT_RS06475 1483429 .. 1483453 -  -2.8  -4.07687   ACGTTGTTTGCAAAA          TAGTTTGAGC TCCGT GCTCATTCTA          AACGCTTAATTCAGC  55 55
GNIT_RS06450 1477494 .. 1477519 - -10.4  -2.52516   TGTGCCAGTATCAAT         GTTGACCGCC ACGCTG GGCGGTCCAC          TGTTTATTTATAGTT  70 71
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        pheA 1328318 .. 1328346 -    -9  -3.54743   CAGCATTAATTAGAA       TG-TGGAATAGCC AAAA GGCTACTCCATCA        ACGCATTAACTGCCG  75 15
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GNIT_RS03565  818601 ..  818620 -   -10  -5.58074   TAACTAGCAAAAAAA            TAGGCCGC ATGA GCGACCTA             TATAATCTATCTACT 100 109
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GNIT_RS00480  112691 ..  112702 -  -2.2  -4.53774   ATAAAGCAACTAAAA                CACT ATAT AGCG                 GCGGTTATTGCGGTG  61 235
GNIT_RS00455  108409 ..  108428 -  -9.3  -4.19238   GCTCTAACGTTAAAA            CGGCCTT GAAAAT AAGGCCG             TGCTGATTGCTCGAT  86 84
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