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-5.2189 ATAATCATCAAAAAA TGGGCTTC-TCAGAAT TTTT ATTCTGAAGAAACCCA TTTTTTAATAGTTGC 100 43 DNA52_RS00955 192997 .. 193037 + -7.6 -5.22794 GACTTAAAATTAAAA GTACCCG-AATGCGTGCCA CTAG TGACAGGCGTTGCGGGTGC TTTTTTGCTGGTTGT 100 50 DNA52_RS00960 194442 .. 194471 + -11.5 -5.60993 TTAATTAATCGTGGA CGGTCAGGGTGAT ATTA ATCAGCTTGACCG TTTTTTTGTGGCAAG 100 37 DNA52_RS00965 195357 .. 195380 + -15.4 -5.63103 TCGAGCCTGAGTTAA GAGCTTCAGC AGAC GCTGAAGCTC TTTTTTTAGTTAAAG 100 125 DNA52_RS00970 196396 .. 196454 + -18.1 -3.78124 ATTGCTATAAGTAAA CGTAATAATAAAAAAATCGACTAAACTC ACGC GAGTTTGGTCGATTTTTTTATTGTT-TG TTGTTAGTAGTTCCT 100 52 DNA52_RS00990 199949 .. 199989 + -9.9 -3.68351 TCTCAAATACGAGTC TTATTCTAAGCCGGAAG AAAGACA CTTCCGCCTAAGAATAA TTTGGCTACTGAGCA 80 345 radA NONE DNA52_RS01015 203262 .. 203291 + -7.9 -5.8187 GGTTAAGCGATTCAA CGGTAGCAACTCAT TTG ATGGGG-GCTACCG TTTTTTTGTTCAATG 100 40 DNA52_RS01020 205222 .. 205267 + -6.9 -5.48623 TGACTGCATATGAAA GTATCTTTTGTATGGTGGAGT TTCG GTTCCGCCGTGCGAGGGATGC TTTTTATTTGTGTTT 91 184 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TTTTATGCTACATAG 66 103 DNA52_RS03240 NONE DNA52_RS03245 NONE DNA52_RS03250 NONE DNA52_RS03255 NONE DNA52_RS03260 NONE DNA52_RS03265 NONE DNA52_RS03270 NONE DNA52_RS03275 NONE DNA52_RS03280 NONE rfbA NONE rfbC NONE rfbB 684419 .. 684448 + -10.1 -5.00616 ACAGAAGATTTTGAA TAAGCGGAGTGTC GATT GACAGTTCGCTTA TTTTTTAGGAGGAAA 93 45 rfbD 685318 .. 685366 + -24.3 -3.53012 TTACAGTAGTAAAAA TATAAAGGTTCTGGGATTCCAAA TGG TATGGAATCCCAGAACCTTTATG TTTACCCGAAAGAAA 100 32 DNA52_RS03315 NONE DNA52_RS03320 NONE DNA52_RS03325 690209 .. 690222 + -2.3 -2.87146 GAAATACCACGAAAA CAGCG AAAG CACTG GTTGTTCTAGAAGAA 41 2 DNA52_RS03330 NONE DNA52_RS03335 NONE DNA52_RS03340 NONE DNA52_RS03345 NONE DNA52_RS03350 NONE DNA52_RS03355 NONE DNA52_RS03360 NONE DNA52_RS03365 NONE DNA52_RS03370 NONE DNA52_RS03375 699671 .. 699729 + -7.9 -5.37345 GCTTATATATAAGAA -AGTCTGAAATGTTCTGCATCATAAT GGTTTGTA GTTGTGGTGCAGAATATTTTAGACTC TTTTTTATAATTAAA 100 56 DNA52_RS03380 NONE DNA52_RS03385 702482 .. 702518 + -15.4 -4.91977 ACAACGAATTAAAAG 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+ -6.5 -3.75863 AAACTTTGTTTAGTT TTGAGAG GTCTAA CTCTCAA TTTAATAAGCGTTTT 67 67 DNA52_RS03675 766043 .. 766065 + -8.5 -2.55213 TCCATTTAGGCCCAT TGGAACCGA ACCAG TTGGTTCCA TAAGTTGAATACCTC 64 27 DNA52_RS03680 766291 .. 766316 + -6.9 -3.17075 CGCTAAACTCATTAA TCGCATTTACC GTTA GGTAAATGAGG TTAAGTTAACAAGGG 62 159 DNA52_RS03685 769232 .. 769243 + -4.4 -3.10732 CGGTCGAGGACTTAA CCAA GTAA TTGG TGTTCCGGTTCATAT 50 21 rrf 769415 .. 769425 + -3.2 -3.62597 TGCGAGGGTAGGACG TTGC CAT GCGA TTATTCCGACATAGC 51 17 DNA52_RS03695 NONE DNA52_RS03700 769588 .. 769600 + -3.3 -3.30006 TTATACCTGTTTCAA GGGTT CGA ATCCC TTACTCTCCGTTAGT 48 3 DNA52_RS03705 769691 .. 769701 + -4.6 -2.83119 TAACATGGGTTCGAA TCCC GTA GGGG TCATTATGGAGGATT 48 10 DNA52_RS03710 769783 .. 769803 + -4 -2.97171 CCCTGTATCCTCCAT CTGATGAG AGTTA CTCATCAA TAATTTAATAGACTC 47 25 DNA52_RS03715 NONE DNA52_RS03720 NONE DNA52_RS03725 NONE DNA52_RS03730 NONE DNA52_RS03735 770223 .. 770241 + -3.1 -3.55761 ATGCGCTGGTTCGAA TCCAGCT AACCC AGTTGGG TTTGGGCAATAAATG 51 9 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.. 859513 + -4.8 -2.64735 AAAAATTAAAAGGAG GCCA ACTAA TGGC TAATATCAATACAAT 49 32 DNA52_RS04195 NONE DNA52_RS04200 NONE DNA52_RS04205 NONE DNA52_RS04210 NONE DNA52_RS04215 NONE DNA52_RS04220 862954 .. 862968 + -2.8 -3.67989 ATAGAACTAATTATC TAAAGG CTT CCTTAA TTTGGGTGGCCTTTT 49 37 DNA52_RS04225 NONE DNA52_RS04230 NONE DNA52_RS04235 NONE DNA52_RS04240 870553 .. 870574 + -5 -4.67353 CTAGCAACACTTAAA GGCTTCCC AATTAA GGGTGGCC TTTTTACATAACTAA 70 37 DNA52_RS04245 NONE DNA52_RS04250 NONE DNA52_RS04255 876148 .. 876158 + -3.2 -2.62184 CTTAAATCGGCCACA GTTG ACC CAGC TAGTCTAACGGACCC 43 348 DNA52_RS04265 NONE DNA52_RS04270 NONE DNA52_RS04275 878454 .. 878464 + -5.4 -3.53012 AGTTATTTACATTGC GGAA AAG TTCC TTTAGGAGGGAAAAA 57 10 DNA52_RS04280 879354 .. 879377 + -6 -5.82172 AGGTGATGAGGATAA TCTTCTGCTT TGAT GGGCGGAAGA TTTTTTTATATTACT 100 367 DNA52_RS04305 882303 .. 882328 + -13.4 -5.86061 TTGGCATCAGGCAAG CAAGTCGTCC CCTAAC GGACGACTTG TTTTTTTTGATAGCA 100 41 DNA52_RS04325 NONE sat NONE cysC NONE DNA52_RS04340 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.. 1041535 + -8.4 -5.2189 AATCAGCTTTTTTCG TGCCAGTATC TTAATT GATACTGGTA TTTTTTAATCATTAA 100 43 rpmG 1041768 .. 1041785 + -7.7 -5.37043 CGTGAAACAAAATAA CAACGGG GACT CCTGTTG TTTTTTCTGTAACAT 100 26 DNA52_RS05020 NONE DNA52_RS05025 NONE DNA52_RS05030 NONE DNA52_RS05035 1044390 .. 1044416 + -8.8 -5.31275 AAAATCAATCGTCAA GAAGCTTGGA AGTAATG TCCGAGCTTC TTTTTTATACTAAGC 100 44 DNA52_RS05040 1045343 .. 1045354 + -2.2 -3.24755 GTCTCAGGCCCCCGA CCGT TTTA ATGG ATTTCTTTAAACCGT 45 91 DNA52_RS05045 1045923 .. 1045955 + -7.8 -5.72053 CGAAGTATTAAAAAA TGGCGGCTAGAACAA CAAC TTGTTC-GGCCACCA TTTTTTATTTAATTA 100 30 DNA52_RS05055 NONE miaA NONE DNA52_RS05065 NONE glnA 1049826 .. 1049857 + -2.1 -5.19328 GAGATAAAAATACGA CGGTTAGGGCACC TTAAAT GGCGAACTAGCCG TTTTTGTTATAAAAT 72 51 DNA52_RS05075 NONE DNA52_RS05080 1051832 .. 1051849 + -2.7 -2.77013 GTAACGGGGGTATTA GATGTTA GAAC TAACAAC GTTATTACAACAGTC 42 41 DNA52_RS05085 1052378 .. 1052414 + -10.3 -5.42862 TAACTATTAAAAAAA TAACCTAATTGCGCGAT TTG ATCACGTAACTAGGTTA 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AAGTG CCGGC TTAACTCCGGAACAA 43 7 DNA52_RS05775 NONE DNA52_RS05780 NONE DNA52_RS05785 NONE DNA52_RS05790 NONE DNA52_RS05795 NONE DNA52_RS05800 NONE DNA52_RS05805 NONE DNA52_RS05810 NONE DNA52_RS05815 NONE DNA52_RS05820 NONE DNA52_RS05825 NONE DNA52_RS05830 1185105 .. 1185128 + -13.2 -5.93809 TAATGAATTTGCTAA TCCCCTACGT TTTG GCGTAGGGGA TTTTTTTTGTAAAAA 100 51 DNA52_RS05845 1187020 .. 1187045 + -2.4 -4.29226 CAAGTAAAAAAAACT CGCACTAACC TTAATT GGCCGGTGCG GTTTTTTTTTAATCT 57 150 DNA52_RS05880 1190002 .. 1190039 + -7.1 -5.03314 TTTAGATGAAAAATG AACAAGATGAGAAACCA AAAT TAGTTTCTCACCTTGTC TTTTTTAACGCTCAG 85 53 DNA52_RS05905 1194257 .. 1194278 + -8.8 -5.56673 ATGTAGTTTCATTGA TCCCTCAT AAAAAC ATGAGGGA TTTTTTATTATGGAT 100 90 DNA52_RS05910 1195114 .. 1195145 + -11 -4.72333 TTGAGATATCGTAAA GGTCTTACTGGC GTTTATTG GCTAGTAAGACC TTTTTAAATGTGCTT 91 94 DNA52_RS05920 1196426 .. 1196464 + -22 -4.08317 TTTAATACAATAAGA TAACGGTCCCATCAGTAA CAA TGACTGATGGGACCGTTA TTTGATTTGCGATTA 100 113 DNA52_RS05945 1199574 .. 1199589 + -3.2 -2.61374 AAATTAAACGACAGA CCCC TGGTTTTT GGGG TAAATTGTCACTATT 43 119 DNA52_RS05955 1200116 .. 1200141 + -16.3 -3.55444 GTAATCATAAAAAAA CGGATGGTGAT TTTG ATCACCATCCG TTTGCGCCGTGCCCA 100 188 DNA52_RS05975 1202829 .. 1202858 + -5.5 -5.4477 AATAGGTTGTTCATT GCCGGACCGGTCG AATA TGACGTGGCCGGC TTTTTTTAAAAGTTT 83 36 lysA 1204232 .. 1204260 + -15.5 -5.13473 ATTAGTCACCCAAAA GCATTTCAAGAGT TAG GCTCTTGAAATGC TTTTTTAGGTCTGCT 100 41 DNA52_RS05985 NONE DNA52_RS05990 1206420 .. 1206457 + -7.8 -4.38171 ACAACATTGAATTTT CGGACCGTTGGATGCCCT TAAT GGGGCGT--AGCGGTCCG TTTTGCTATGCTATA 80 31 DNA52_RS05995 1206925 .. 1206938 + -2.4 -4.65895 CGCGAGGTCGCGAAT TCAC GAGGAA GTGA TTTTTCGATGAAAAC 61 144 DNA52_RS06000 1207234 .. 1207272 + -8.2 -5.52384 ACTGAGTAAACAAAC GATTGTTGTCTGACCCTT GAT AGGGGGCGGATGATAATC TTTTTTTCGTACCAC 100 32 DNA52_RS06010 NONE DNA52_RS06015 1210564 .. 1210600 + -12.5 -4.68994 GAACAACAACTAAAA TGGCACTTCCAGA ATTGAATTTTA TCTGGAAGTGCCA TTTTTGAGTGGTGAT 100 69 DNA52_RS06025 NONE DNA52_RS06030 1214084 .. 1214118 + -10.1 -5.40474 CTGAATTATTCGAAA TCGTGTGTTTATGCT AAGTC GGCCTGAACACACGA TTTTTTTGCGCCAAT 100 44 DNA52_RS06035 NONE DNA52_RS06040 NONE DNA52_RS06045 1219305 .. 1219354 + -5.9 -4.79053 TTGGTTATAACAAAA ACGCGTCATCACAAG-TATAGAAT GAC ATTCCGTAGTTTGTGATGACACGC TTTGTTTTAATCTTT 77 126 DNA52_RS06075 1227303 .. 1227313 + -5.4 -3.57783 ACGTAGAAGGCGCCC TGAG CGA CTCA TTATGATTATCCTGG 59 117 DNA52_RS06080 NONE DNA52_RS06085 NONE asnS 1230343 .. 1230367 + -16.5 -3.21099 GGTTAGTTTTATTAA GAGCGTGGGAC CTA GTCTCACGCTC TTAATAGTGAAAGGA 100 53 DNA52_RS06095 1231164 .. 1231199 + -12.7 -5.42259 CTGATTTTAAATAAA GTGGTGGCGATTGCCT GTGCG AGGCG-TCGCTACCAC TTTTTTTCGGGATGG 100 71 DNA52_RS06100 1231684 .. 1231729 + -17.9 -5.14563 GGTAACACGGAAAAA CGTCCATTCGTCCTTAATCTGA TAA TCAGATTAGAGACG-ATGGACG TTTTTTAATGGGAGG 100 329 DNA52_RS06105 NONE DNA52_RS06110 NONE DNA52_RS06115 NONE DNA52_RS06120 1234978 .. 1235020 + -15.7 -4.98531 GTCAGTGATGATTAA AGCTGGTCACACGA-CGTCA ACAT TGACGCTCGTGCGACCAGCC TTTTTAGTTTGGGAC 100 44 DNA52_RS06150 NONE gpsB NONE rnpB 1243378 .. 1243405 + -17.2 -5.8187 CATTTAGACAGGAGA CTGGGACAAAAG TTCG CTTTTGTCCCAG TTTTTTTATTCGATC 100 46 DNA52_RS06165 1244764 .. 1244799 + -17 -4.11394 TGAGTAGCCTTAAAA GAGCGTGTTTAATCGG GTGA CCGACTAAGCACGCTC TTTTAAGGCTAACGT 100 117 DNA52_RS06175 1246195 .. 1246207 + -4.1 -2.97188 GGATCCGTGCTGTGA TATGC GAA GCATG TGTGTCATAATGTAA 47 26 DNA52_RS06180 1247603 .. 1247639 + -13.9 -3.51124 TACAATAGGGCGACG GGTCACTGAGTCATGC AGAGCA GCG-GACTCAGTGACC TATTTAGTCATTGGT 100 33 DNA52_RS06185 NONE DNA52_RS06190 NONE DNA52_RS06195 1250951 .. 1250981 + -13.4 -5.40474 CAGTTGATTACTAAA CGACTTTCAGCAAG TTA TTAGCTGAAAGTCG TTTTTTTGAGGAAAT 100 71 DNA52_RS06200 1252026 .. 1252038 + -3.4 -4.63184 CGCAGGCTCGAACGG TGAC GTTTA GTCA TTTTTAGACTACCTT 64 6 DNA52_RS06205 NONE DNA52_RS06210 1253726 .. 1253751 + -12.7 -4.32048 AATGACACTAAAAAA CGGTACTCAGA TTAG TTTGAGTACCG TTTTGCGTATTATTG 100 129 DNA52_RS06220 NONE DNA52_RS06225 1257289 .. 1257337 + -3.1 -3.72141 AGCAAAGTCGCCAGC 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-8.7 -5.48303 ATGCGTACATAATTA GCATGCCAG GAGA CTGGTGTGC TTTTTTTGCGATTAT 100 42 DNA52_RS14620 3017704 .. 3017737 + -9.1 -5.83226 TCAGATGTCAAAAAA CTGTTTTAGCGAGTAA AGT TTA-TCGCCAAAACAG TTTTTTTGTTGACTT 100 85 DNA52_RS14625 NONE DNA52_RS14630 NONE DNA52_RS14635 3021144 .. 3021173 + -2.8 -4.57569 AATACGTATCTTAGA CAGCCG-ACGGAT GTTTA ATCCGGACGACTG TTTTTCGACCGGTGG 62 42 DNA52_RS14640 3022907 .. 3022939 + -13.5 -5.29385 TTGTTTGCACAAAAA CTAAGGGTCACAGCA ATG TACTGTGGCCCTTGG TTTTTTACTTAGCTT 100 96 dhaS 3024536 .. 3024549 + -2.5 -2.55668 CTTAAAGTTGAGACG TAATT TACT AATTA ATTCCTGTGCGAGTC 39 292 dhaK NONE dhaL NONE DNA52_RS14670 NONE DNA52_RS14675 3028108 .. 3028131 + -4.5 -5.55769 GTTAAATACTCACAA CTGTGCCGA TTTTGT TGGGCGCAG TTTTTTGTTATAAAG 84 36 DNA52_RS14680 NONE DNA52_RS14685 NONE DNA52_RS14690 3032052 .. 3032083 + -14 -4.84274 AGGTTGATGGACCAA TAAATCCTAACGTT TTTA AGCGTTAGGATTTA TTTTTGGTATGATTC 100 134 DNA52_RS14695 3033473 .. 3033502 + -12.3 -4.56597 ATTGTAATTTAAGGG GGCTGAAACAAAA TTCG TTTTGTCTCAGCC 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