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        recF NONE
        gyrB NONE
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        rpsR   12824 ..   12853 + -12.9  -5.52384   TCAAGTATTTAAAAA       GGATGTTCCCGCT AAAA AGCAGGAGCATCC        TTTTTTTGGTGAGCG 100 41
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CYG41_RS01105  228543 ..  228574 +  -8.1  -5.15969   CTAAACAATTTGAAA      GATCGCTGGTG GGAAATGCGG CATCAGCGATC       TTTTTTCGATTGACA  95 51
CYG41_RS01110  228953 ..  228976 +  -2.3  -4.17132   CTTACACTCCGATCC          CTAACCGCG CCGGCT CGCGCTCAG           TTTATTAGGAGGTTT  55 119
CYG41_RS01120  230375 ..  230393 +  -5.3  -3.17392   ATTTAAAACGATGGG            TGGCAGGT AGCT ACC-GCCA             TTAAATTCAAAAATG  53 94
CYG41_RS01125 NONE
CYG41_RS01130  231645 ..  231687 + -26.6  -4.36411   CCGTTAATTAAAAAA TAGCGCTTTTGCACCGGGTT ATT GATCCGGTGCAAAAGCGCTA TTTTGATACTTCGTC 100 34
CYG41_RS01145  233211 ..  233224 +  -3.9  -2.77433   CAGATTAGCTGGGCG               TGTAA GCTT TTACA                TCCTCTATGTTATCA  45 48
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CYG41_RS01160  234233 ..  234280 +   -15  -4.93547   TAATCATTCAAAAAA TGCCAATCAATCCGCGGCCGGAA AAT TTGCG-CCGTGGCTTGGTTGGCA TTTTTGCTTCGTTGA 100 43
CYG41_RS01170  235965 ..  235998 + -12.5  -5.47431   ATTAGTAAATTCATA     ACCCGCCGTTGTGACA AAG TG-CATAACGGCGGGC     TTTTTTGTGTGTTGA 100 111
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         pcp  242331 ..  242356 + -11.1  -5.14563   TTCACGTTGATATTT         TCCGCAAGCTC ACTA GGGCGTGCGGA          TTTTTTAATGGCCGA 100 48
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        guaB  252570 ..  252606 + -10.9  -5.14563   AGATATTCAGTTTAA    GAGCTTGCAGTTACC CACTTGA GGCAGCTGCAGGCTC    TTTTTTAGTGAGCGC 100 44
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        greA  258115 ..  258125 +  -2.4  -4.00443   TGTCAGAAGAGCAAG                 CACC TGA GGCG                 TGTTTTTCATCATGG  53 109
CYG41_RS01335  259784 ..  259796 +    -2  -4.64144   TACAGGAAGGCTGAT                TTGA ATGCG TCAA                TTTTTCACCGTTATT  63 27
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CYG41_RS02310  458993 ..  459027 + -12.9  -5.38054   TGAATTAAGCAATCA     TGGCTTGTTCCCGGT ACTCA ACTGGGGTCAAGCCA     TTTTTGTTTCTCGAA 100 370
CYG41_RS02375  471577 ..  471587 +  -2.4  -4.09511   TAATCCTCCTCGGGT                 GCAG CGA CAGC                 TTTTGCGCGCATCTT  55 76
CYG41_RS02385  474848 ..  474858 +  -8.2  -3.37017   TTCCCGTGTTGCCAG                 CGGC CAT GCCG                 TTAATATTGAAGGTT  66 464
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CYG41_RS02405  481687 ..  481707 +  -8.3   -4.0641   ACGTAATGTACATGA            CCACCTC AGAATAG GAGGTGG            TTTATGTGCGTAAAA  77 127
CYG41_RS02410  483239 ..  483273 + -13.1  -3.31022   ATGGATAAATAGAAA     CTCAAGGTTGAATGG CGTTA TCATTCAATCTTGAG     TTAGTCATATTTGAT 100 74
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CYG41_RS02420  486709 ..  486737 +  -8.8  -5.17507   ATACTGACCTTGAAT        CGCCCCTGTCCG TGTTC TGGATAGGGGCA        TTTTTCTTGAATTTT 100 45
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CYG41_RS02430  489570 ..  489618 +   -17  -4.06179   AGCTGAAGTAAAGCC GCGGTAATTAAAAGATCGGCTC TCAAT GGGCCGATCTTTTAATTACCAA TTTATAAATTTTAGA 100 19
CYG41_RS02470  496233 ..  496249 +  -2.2  -3.26471   GCGATTGCGAAAGAC              TGTAGC AAAAC GCTGCG              TTCCTATCCGCATGC  45 55
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CYG41_RS02480  497624 ..  497634 +  -5.4  -4.45738   TCCACGTGCCAGAAG                 TGGA TTT TCCA                 TTTGTTGTTGAGCTA  69 401
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CYG41_RS02545  510268 ..  510288 +  -4.1  -3.53012   TGAATAAGCCGATTA            GCTATTT ACAAAAG AAATAGC            TTTCAGACAGAGGCG  52 6
CYG41_RS02550  511825 ..  511849 +  -9.9  -3.20991   TGCTTCTTTGACCTG          TGCTTGGGCGG TAT CCGCCAAAGCC          TTGAGTTGCGTTGCC  70 337
CYG41_RS02660  529527 ..  529544 +  -4.2  -5.03715   GAAAGGCTTTAAAAA             TAAGCA AATCAA TGCTTA              TTTTTTAGCGGTAAT  74 29
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CYG41_RS02675  531910 ..  531941 +   -16  -3.72678   AACGAGAGACGAAAA      GAACCCACTCGC AATTTTCA GCGAGTGGGTTC       TTTAAATAGTCTTTG 100 98
CYG41_RS02685  535189 ..  535241 + -21.7  -3.63895   ATGGGAGTGCAACAA TGAAAACAGGCACGGCTTAAGTT TGAAAGT GACTTAAGCCGTGCCTGTTTTTG TTTGGAGTGGTTGAC 100 46
CYG41_RS02700  538094 ..  538112 +  -5.3  -3.32294   CCCGAGTTTAACCGC            CGCAC-TG GCAT CATGTGCG             TTGTGAACACTTTCA  54 467
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CYG41_RS02720  541169 ..  541222 + -22.2  -3.56142   GCATCATGATGAAAA TTGAATGTAAAAAGCCGTC-TCCAG TTTTT CAGGATGACGGCTTTTTACATTCAA TTGCTTATTACTGAA 100 63
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CYG41_RS02735  544523 ..  544536 +  -3.1  -3.78775   GCCCGCAGATCCGCA               C-CGCT AAA AGCGAG               TTTGCTAATAGAGGA  53 19
CYG41_RS02740  545946 ..  545971 +    -4  -5.15634   GAATCCATCAAAAAA         AGCCTGTCATC ATCGC GATG-CAGGCG         TTTTTTGATCCCATA  78 50
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        cysK  574563 ..  574593 +   -17   -5.0916   GTAAGCAAAATAGAA       GCGGCGATCAATTG GGT CAGTTGATCGTCGC       TTTTTGTCTTGAGAA 100 59
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CYG41_RS03630  723354 ..  723368 +  -6.4  -2.59537   TAATGCTGGTGAATT               CTTTGG TTA CCGAAG               CCTTTATTTGTCCGT  53 162
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CYG41_RS03655  727248 ..  727283 +   -12  -5.46698   AGCTTCAAAATAGAA    GCGTACTATTTCAGGT TTTT ACAAGAAATAGTACGC     TTTTTTGCTTTTCCG 100 73
        lexA  728554 ..  728593 + -13.2  -4.96646   CCCTCACATCAAAAA  GACATTTACCAGCTACTTT ATC GAAGTGG-TGGTAAATGTC  TTTTTGATTATGTAC 100 69
CYG41_RS03700  734156 ..  734183 +  -5.6  -5.60993   AATCCTATATAAAAA        TCGATTCTAACG TATT TGCTGGAATCGA         TTTTTTTCTGGGCAG  95 101
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CYG41_RS03720  738184 ..  738221 + -23.1  -4.44797   TTAATAGTTTGAAGT   GCAACAAAAAAAGAGCC AGCT GGCTCTTTTTTTGTTGC    TTTTAATGTTGATGG 100 43
CYG41_RS03730  739928 ..  739954 + -12.3  -4.06904   CCCATAGAGCAAACT         CAGCGCTTGGC TTTTT GTCGAGCGCTG         TTTCTAATTGGCTCA  95 370
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CYG41_RS03750  745123 ..  745173 + -21.4  -2.81173   TTTGAAGAAAGCATC CAAAAAGGCAGTTGCGATACGATC TGT GATCATACCGCAACTGCCTTTTGG TGTCATCGGATTAAT 100 85
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CYG41_RS03770  749506 ..  749534 +  -3.9  -4.74103   TGATTTGCTTTGAAA       CGACTCCCGC CAATAAACCC GC-GGAGTCG        TTTTTCGGTTGGGGG  67 52
CYG41_RS03775  749757 ..  749771 +  -2.8   -3.5362   ATGTTTTGGAGATGA               TGTTTG TGT CAACCA               TATTTATGCGGGTTG  48 79
CYG41_RS03780  750269 ..  750280 +  -2.2  -2.83403   AATGCCTATGAAGTT                CGGT TAAC ATCG                 GTTTAATGGACGCAA  41 8
CYG41_RS03785  751510 ..  751552 +   -20  -2.71011   TCGGAGTGTAAGTGG CCCTGGACCGAAATGGCCGG GCT TTGGCCATTTTGATCCAGGG TCCTTACACGGAGAT 100 70
CYG41_RS03790  752569 ..  752608 + -17.4  -4.23045   GATAGGGAGACAAAA  GGCGAATGCATTTTCC ATATGTGC GGAGAATGCATTCGCC   TTTATTCAGTCATTA 100 87
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        queA  764983 ..  765006 + -13.2  -4.82901   GAAGGTATATAAAAA          CCGGTTTGCG CGTT TGCAAACCGG           TTTTTATAACGGACG 100 98
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        yajC  767070 ..  767088 +  -7.4  -5.75342   TGATGTTAACAGAGA             GACCGGTT CTT GACTGGTC             TTTTTTTTACGGCCA 100 54
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        alaS  781780 ..  781821 +  -2.3  -5.65496   AAATCAAACAATGGA CATCAGGAGTTAGGATGGCG TTT TGCTGAC-TGACTTCTGGTG TTTTTGTTTTTGCTG  82 62
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        trxA  787972 ..  787995 +  -8.2   -5.4477   AATTTGTGATCCAGA          CACACTGATT GAAT GGTCAGTGTG           TTTTTTTGACCATTT 100 44
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        dltA  790035 ..  790045 +  -2.6  -3.55071   TGCAGAGGTAAATCA                 TTAA TGC TTAA                 TTTACAACCGTATGA  48 22
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        ccpA  804220 ..  804257 + -12.9  -5.09521   CATAGACGATAAAAA   GCAGATGAATCAGCGC ATATATG GCGC-GGTTCATCTGC   TTTTTGGTTTGTTGG 100 80
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CYG41_RS04350  842869 ..  842894 +  -8.4  -5.27938   GATTTTATTTGGATG         CAGCTATCAA GCATAA TTGATGGCTG          TTTTTATTTGGCGAT 100 79
CYG41_RS04355  844919 ..  844933 +  -2.8  -4.09739   GGAAACCTGCACACA               CGAAAC TTT GTTTAG               TTTTGAGGGGATTAC  57 59
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         rrf  848240 ..  848250 +  -2.4  -4.23104   TGCGAGGGTAGGAAG                 CTGC CAC GCTG                 TTTATTCCGGTTTAG  55 17
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CYG41_RS04520  875009 ..  875044 + -17.8  -5.61881   AGCTTCTAAATAAAA    GTATCCCATTTTCACG CGAT CGCGAAAATGGGATAC     TTTTTATTTTTGCCA 100 110
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        thiI 1257066 .. 1257108 + -18.7  -5.37593   AAAAATTGAATAAAA GCGGTAGTTGCTGATAAGT TATTT GCTTATCGGTAACTACCGC TTTTTTAGTTTAGCG 100 39
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CYG41_RS07610 1468116 .. 1468146 +  -5.5   -2.7728   CCAGTACTTGAAAAT      G-GGTCACAGCATGG CGG CCAT-CTGCGACCAC      TGCTTGGCGTTTGCG  49 353
CYG41_RS07640 1472120 .. 1472153 + -11.2  -4.72272   TTGACGTAAAAAAAA     GCCTGAAAC-TCCAG CAATA TTGGAAGTTTCAGGC     TTTTTGATCGAAACG 100 71
         cls 1474723 .. 1474767 + -22.3  -4.58395   AAGGCGCAAATGATA ACAACGCCGGTTCAACGATGT GAT GCTTCGTTGAACCGGCGTTGC TTTTTGAAAAATGGC 100 196
        nrdH 1477435 .. 1477454 +  -9.3    -5.626   GATGCCTTGAAGCAA            CTGGCTG TTTGAT CAGCCAG             TTTTTTTATCGCATC 100 14
        nrdE 1479697 .. 1479713 + -10.1  -4.65895   TTGATAATCTTTTAA              CAGGGGG ATC TCCCCTG              TTTTTACATAAGGAG 100 37
        nrdF 1480743 .. 1480779 + -10.4  -5.30616   CTCATGACAGCAAAA   CAGCCTTTGCAGACA ATTAGTTA TGTCT-CAAAGGCTG    TTTTTGTTTGCCTGA 100 51
CYG41_RS07685 1482272 .. 1482301 +  -2.9  -3.19463   TAATTTGCCGTTTAC       TTTGCCGG-CTG CCGTTTC CAGACCGTCAAA       TTCGTCAATCATGGC  45 299
CYG41_RS07695 1485280 .. 1485304 + -14.3  -4.83593   ATTTTTCTATAAAAA          GGGGCAGCC ATTTGTC GGCTGCCCC          TTTTTGATCATTCTT 100 55
        recU NONE
CYG41_RS07740 1492811 .. 1492846 + -11.9  -5.03994   GACATCATTAAAAAA    GCACCGCTACCGATT TGAGAT GGTCAGTAGCGGTGC     TTTTTATATGTGAAA 100 93
         mvk NONE
        mvaD NONE
CYG41_RS07805 1511633 .. 1511648 +  -4.6  -3.66288   TCCATTGACTAACTT              GCCGAT TGCA AACGGC               TTATGTTCAAACGTG  57 186
CYG41_RS07895 1530030 .. 1530072 +  -5.1  -3.00994   GAGTGGTAACTGGAT GC-TGGTTATTAGCAACGTGA TTA TCATGG-GCTAATAACTAGGC TGTGTATGCAATTGG  52 436
CYG41_RS08010 NONE
CYG41_RS08015 NONE
CYG41_RS08020 1554596 .. 1554610 +  -3.6  -3.64933   ACATGGATAAAAAGT               TTAGTA AGA TGCTAA               CTTTTTTCCAGTTGC  53 208
CYG41_RS08125 1571764 .. 1571811 + -14.3  -3.66883   GCCATTTAATTTCTG CCCCGTATGGTGGGACCTGATG CTTTT TATCAGGGCCGAC-ATACGGGG TTTCGAGTATCTTGG  95 87
CYG41_RS08155 1578193 .. 1578208 +  -6.1  -3.32647   ATCAGATAGCCGACA              CCGGT CAGAAT ACCGG               TTGCTGTGGTTGCGA  57 312
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CYG41_RS08175 1582612 .. 1582662 + -21.5  -4.06778   AGCGCAAATCGAATA TAAAGAGCCGCTCAATCAGGCAT GAAAA ATTGCTGATTGAGCGGCTCTTTA TTTGAATTTTTTACT 100 66
CYG41_RS08225 1590011 .. 1590055 +    -8  -4.36914   TGAAGCATAAAAAGA GAGGCGGATAAAATTGCAC AATGTAAA GTGCAGTTTGG-CCGCCTC TTTTATGACGCAAAG  79 31
CYG41_RS08260 NONE
CYG41_RS08265 1595726 .. 1595753 + -12.7  -3.21774   GTTTAAAGCTCAAAA        GGCCTCCGGAG ACACAC CTCCAGAGGCC         CTATTTTTTATTGCT  93 35
CYG41_RS08275 1597280 .. 1597290 +  -5.4  -3.78329   GGTGCAACCCGGGCC                 GTGA CAA TCAC                 TTTACCTTGCTGCCG  59 503
CYG41_RS08345 1623678 .. 1623700 +  -7.7  -5.85244   GCAAATTCTAAAAAA           TCGGCGCTG TTTAC CAGTGTCGA           TTTTTTATTTTAGTT 100 42
CYG41_RS08350 NONE
CYG41_RS08355 1624587 .. 1624628 + -10.1  -4.36914   TCAGTAAATCAAAAA CAGGCACCCAGTAGGCTGA CTAT TTTGCCTCTTGCGTGCCTG  TTTTGTAACCACAAG  93 46
CYG41_RS08465 NONE
CYG41_RS08470 1652725 .. 1652738 +  -8.1  -4.02302   GATGCAATTCGTCTT               CGGTG ATGT CACCG                TCTTTTTCCTGTCGC  73 212
CYG41_RS08510 1658270 .. 1658286 +  -5.8  -5.09521   CACGGAGAAGTATAA              GGTTCG CTTGT CGAGCC              TTTTTCCTTTGTTAC  85 26
CYG41_RS08515 NONE
CYG41_RS08520 1660528 .. 1660571 + -19.8  -4.61199   GAAGATAAAAAAATA GAACATCCGCTACTTTGTGC AAAA GCCAAAAGTAGCGGATGTTC TTTTATATCTAAGCT 100 25
CYG41_RS08590 NONE
CYG41_RS08595 1671175 .. 1671203 + -12.5  -4.96848   CACGAAACGCAAAAA        TCGTCACACCTCA AAC TCGGGTGTGACGA        TTTTTATATGCACGC 100 50
CYG41_RS08730 1702183 .. 1702217 + -10.9  -5.18726   GTGACCAAGCAAAAA    GCGATTCAAGTAAGAC CGAT GTCTC-CTTGAATCGC     TTTTTGTTATGCCGG 100 62
CYG41_RS08815 1715066 .. 1715076 +  -3.2  -2.65884   ATACAAAGAAATGAC                 CTGA TTA TCGG                 CTTATCGCTTCATGG  42 27
CYG41_RS08820 1715321 .. 1715377 + -13.2  -3.38726   AGTCCTTTCTATCAC AAAAATAGCACCGGCTGTACACCCTG CGACA TAAGGTATACAACCGGTGCTATTTTG TCATTTTTTCAACTG 100 122
CYG41_RS08845 1724287 .. 1724325 + -15.5  -5.23316   TCTAGTCAAAAAAAA  CGATTCCAGCCTGCGCAA TTTA TTGCA-AGGCTGGAATCG   TTTTTTAGTGTCCTG 100 75
CYG41_RS08860 1726833 .. 1726853 +  -6.9  -5.60864   ATTTTTACCAAAAAA            GCAATCG ACTTGAG CGATTGC            TTTTTTTGCTGTCTA 100 55
CYG41_RS08895 1735908 .. 1735949 +    -8  -4.61648   AACTTATAATTAAAA GTCCGCCACCAGTGAA ACAACGACAA TTCGCTGGCAGCGGAC  TTTATTATTCTTCTT  86 65
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        yidC 1749826 .. 1749844 +  -4.5  -5.32944   TACCAACACATTGAA             GTCGTCT TTATT AGGCGGC             TTTTTTGATTGTCGA  82 43
CYG41_RS08990 1755256 .. 1755287 + -10.8  -3.14931   ACGGCTTGACAATCC      CGGCCAGCCACTGG TTTC CCAGTTGCTGGATG       TTCATGGCGGCTGAC  76 271
CYG41_RS09050 1764582 .. 1764605 +  -2.4  -3.70773   TCAAAACTAAAGGAG          TGGATTTCCA TGAT TGAACATCCA           TTATTAGGTATGAAC  49 9
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CYG41_RS09070 1767869 .. 1767905 + -13.8   -4.7078   AACTTGATACAAAAA    GCACGCCGTTCCATTC ACAAA GAATGAAACGACGTGC    TTTTTAACTACTTAG 100 65
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CYG41_RS09125 1779006 .. 1779017 +  -4.4  -3.03771   GAAAGCTCGTCTAAG                CAGA GTGA TCTG                 TATTCAAACATGTCA  47 86
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CYG41_RS09205 1800814 .. 1800841 + -12.7  -3.29162   TAAGACTCGAAAAAA        GGCTCGTGAGC TTATCT GCCCACGAGCC         TCTCTTTAAAATTTT  95 73
CYG41_RS09220 1802788 .. 1802806 +  -4.4  -4.56775   CGCCGATATGTCAGC             CGCCGCTT TTC ATGCCGCG             TTTTTGGCCAAGGAT  68 345
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CYG41_RS09255 1807243 .. 1807253 +  -2.4  -3.66028   GTTGGCTTTATACAA                 GCCG TGA CGGA                 TTCTTGAAAGTTATG  49 64
CYG41_RS09260 1808279 .. 1808303 +  -8.5  -5.80364   TGAGTCATGCAAAAA          CGACCTCGC ATCATGC GCGAGGCCG          TTTTTTTGTTCCGGT 100 50
CYG41_RS09280 1813078 .. 1813120 + -13.6  -3.63744   GTTAGAACCTGAAAA GCTCCCATAATCGCTAGC GTTTTTA GCTAACCATTATGGGAGC TCTTTTAAACCACAA 100 84
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CYG41_RS09305 1816454 .. 1816490 +  -4.5  -5.26875   CATACAACTCAAAAC    GTTCCTTTAAACTTC ACGAACA GGAGTTTAAGGGCGC    TTTTTTGGTTACGCC  82 64
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CYG41_RS09315 1819387 .. 1819404 +  -3.3  -5.02476   AAGAACACGAAAAAA             TCCACTC ATTT GAGCGGG              TTTTTTAAACCATCT  71 76
CYG41_RS09335 1822370 .. 1822388 +  -5.2  -4.14392   CACCAAGATTCAGCG             TCCGGCTT TAC AGGCTGGG             TTTTGGCGATTCAAA  65 138
CYG41_RS09350 NONE
CYG41_RS09355 1825900 .. 1825923 +  -2.3  -5.07523   CTTACACTCCGACTT          CTAAGCGCG CCGGCT CGCGCTCAC           TTTTGTTTGTGTCTC  68 88
CYG41_RS09360 NONE
CYG41_RS09365 1827794 .. 1827845 + -11.7   -5.4492   TCTTTAACGAATAAA GCGAGTAGCTAAGCACACGAC CGTCATTGTT GTCTTGTGGCTAGCTACTCGC TTTTTTATCTGTCTA 100 49
CYG41_RS09470 1847717 .. 1847729 +  -6.3  -2.92018   ACCAGCTTTTCTTTT                TCTTC GGT GAAGA                TCTGCTTAGCCTGTT  54 505
CYG41_RS09490 1852068 .. 1852096 +   -14   -5.7946   GAGGCTCGCACTAAA        TCGGTTCAAGCA TAAAT TGCTTGAACCGG        TTTTTTTATTCCGAA 100 101
CYG41_RS09495 1852745 .. 1852793 + -14.8  -4.53685   GGTCAGTCCGGAAAC ACAGGCATCAAA-AAAGCGACCG TAAA TGGCCGCTTTTTTTGATGCCTGC TTTTGATTATAGTTT 100 138
CYG41_RS09515 1857633 .. 1857654 +  -2.3  -5.85737   AGAAGCACACCCTGA           CAAGC-CG CTTAGTT CGTGCTTG           TTTTTTTATTCATAT  85 106
CYG41_RS09535 1861493 .. 1861520 +  -2.6  -3.79747   TGCAAACTGCGGTTA        ACCTGGATTTCA AACT TGGCATCCGGGC         TTTGATAATCAATCG  54 210
        rlmD 1863246 .. 1863256 +    -4  -3.38836   CTAAGTGAGGTCCTC                 TTTC AAT GAAA                 ATTTATTTTGCCAAT  51 131
CYG41_RS09550 1863739 .. 1863774 +  -9.1  -4.77896   GGCATAATCAAAAAA    GCTTCCGT-CCCCT TCAATGACC AGGGGTGCGGAAGC    TTTTTGAATTGATTC 100 34
CYG41_RS09585 1870586 .. 1870597 +  -3.6  -4.43477   TTGGCTTTATCCACC                GGCC AGTT GGTC                 TTTTACTTAACTAGG  65 0
CYG41_RS09610 1873477 .. 1873514 +  -6.4  -4.93898   TAATCGCTACAAAAA   GCCTTG-GACGTTGA ATGAGCTGC TCACCGTCACAAGGC   TTTTTCTACTGGTAT  84 60
CYG41_RS09625 NONE
CYG41_RS09630 1875911 .. 1875945 + -13.1  -5.86976   CCCGCATCATAGCAA     GATCCGATCAACA AGGTATTAC TGTTGATCGGATC     TTTTTTATTTTATAC 100 32
CYG41_RS09635 1876710 .. 1876722 +  -3.4  -2.57136   TGCTGGGCGAACAAA                TGGT AGTGC ACCA                ATTCATGCTTGATGA  42 257
CYG41_RS09725 1903219 .. 1903245 +  -8.1  -2.72455   ACGCATACAAAAATC         CGTTTGACAAA ATCGC TATGTCAAACG         ACTTTTTGCTTCTGA  60 68
CYG41_RS09760 1911488 .. 1911498 +    -4   -3.4052   AAAAAATAAGCAGGT                 CTAA TTG TTAG                 TTACTTGAATTGAGC  51 22
CYG41_RS09765 1912865 .. 1912907 +    -3  -5.27477   CACCACAACAAAAAA CGCTAGGAACATCGGCCACTGT CAG ACGGTG-C-GAT-T-CCTAGCG TTTTTTAATTCAGAT  79 84
CYG41_RS09805 1920056 .. 1920072 +  -2.3  -2.60496   GAAAAATCTAAAATA              ATTTTGT CGC ACAAAAA              GTCTTTACAGCGCAA  40 158
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CYG41_RS09815 1920288 .. 1920322 +   -18  -5.52986   ATCATACAACTTAAA     TCGCAGATGCACTGGT AAA ACCAGTACGTCTGCGA     TTTTTTTAATCAAGT 100 37
CYG41_RS09820 NONE
CYG41_RS09825 1921815 .. 1921868 +   -15  -3.72027   TAAGGCAACAATTCC AATAAAATAGCTTCGATC-TGACTG TTAAT CTGTCATGATCGAAGCTATTTTATG TTATTGCTGGCCCGT 100 38
CYG41_RS09880 1933516 .. 1933548 + -12.1  -5.04601   GTGCGTAATAAAAAA      CGACCTGAAAGATGA CAT TCATCCTTCAAGTCG      TTTTTCATTTGTAAG 100 102
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CYG41_RS09930 NONE
CYG41_RS09935 1942583 .. 1942608 +    -4  -3.17075   CAGCCTTGATTTTAG         TCTGTCAATC CTGTAT GCTTGACAGG          TTAAATTAGAAAAAA  49 32
        rpmG 1942812 .. 1942850 + -14.1  -5.81622   CAGTTCATCAGCCAA   TATCGCATTCTGTCAGT TTTTT ACTGATAGAACGCGATA   TTTTTTTGCTTTTGT 100 49
CYG41_RS09955 1946363 .. 1946402 + -10.6   -5.1675   TGACGTCATTTCAAA  AGCACCGCGAATGCCAGT AAAA GTTGGCTTTCGCGGCGCC   TTTTTTGATCGCTCC 100 44
CYG41_RS09965 1948157 .. 1948168 +  -3.6    -5.252   TAACGCTTCGCCATG                GCTC CAGC GGGC                 TTTTTTCTCCAAGTC  79 503
CYG41_RS10050 1960997 .. 1961020 +  -3.8  -2.83403   CCACAATAATCGGAT          CATTCCCGTT TGGT AACGGTAACG           CTTTGATAGCAAAAA  45 413
CYG41_RS10060 NONE
CYG41_RS10065 1962449 .. 1962460 +  -4.4  -4.21933   TTATCGTCTTAGGTT                TAGC TATT GCTA                 TTATTTTCCCGTTCG  61 29
CYG41_RS10070 1963603 .. 1963632 + -10.2  -3.98649   TATTGTCCAAAATAC       TAACCGTTTGAT GAGGTG ATCAAGCGGTTA        TTGTTGTGTCTTCTG  89 71
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CYG41_RS10085 1967033 .. 1967044 +    -3  -3.60627   AGTCGGTTTAGCTTC                TGAT TGTT ATCA                 TTTCGCATCGAATGG  51 47
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CYG41_RS10195 1990495 .. 1990533 + -12.7   -4.8143   CATATCTCAAAAAAG  CTGTCAGAGCCTTCATAT CAGC AT-TGAGGGTTCTGACAG   TTTTTGCCTTATTAG 100 92
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CYG41_RS10210 1997733 .. 1997745 +  -7.7  -3.25479   GCCGTGATCAAGCCT                TCGTC ATT GACGA                TTCACTATTTAGTGG  66 227
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CYG41_RS10245 2001654 .. 2001688 + -13.1  -4.34402   CTGATACTGCGAAAA     GGAAGCCTTTTCT AGAAATCAA AGAAAAGGCTTCC     TTTTCGTATGGCCGC 100 37
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CYG41_RS10295 2012005 .. 2012022 +  -8.4  -4.72386   ATTGGCACACAAAAA             GCGCTC TGGCAT GAGCGC              TTTTTAGATACTTTC  91 40
CYG41_RS10330 2019668 .. 2019684 +    -3  -2.87051   TTAATGCTGCTCAAT              CAGGAT GTGAA ATTCTG              CTTTGATACTCGCCA  43 37
CYG41_RS10335 2020727 .. 2020755 +  -7.3  -5.04597   GACTAATGGTAAAAA        CCGCGCCCTTACT GTT AATATGGTCGCGG        TTTTTGTCTATGCAT  89 35
CYG41_RS10340 2021300 .. 2021327 + -12.8  -4.55023   GGTTCACCAACAAAA        CGGTCGATGC ATAACTGC GCATCGACCG         TTTTATAGTATTCAA 100 68
CYG41_RS10355 2024656 .. 2024713 + -10.7  -4.70772   AGCCGCTTTTTTTGA TGAAACCAAAAGGGTCACACAACCA-GC TTT GCATGGTTGTGTGACCCTTTTTCAGACA TTTTATTCCCTATCT 100 72
CYG41_RS10375 2030673 .. 2030703 +  -6.1   -5.1287   AGATTAGCTATATGA       TGTCCCGGCAACG AAACC TGTTGCTAGGGCA       TTTTTTGGCTGTAAC  87 80
CYG41_RS10380 2032071 .. 2032089 +  -7.4  -3.53012   TGAAATTGGTCTTAA             GCGGAG TGGGCTT CTCCGC             TTTAGACCAAGGCCG  66 264
        hflX 2033716 .. 2033767 +  -8.8  -4.87786   TAATTGACACCAATA GGGACCTTGCTTTTCGCTGCTTA ATCATTG TAAGCAG-GATTGGCACGGTCCC TTTTTATAGCGTTAA 100 51
CYG41_RS10465 2050886 .. 2050924 +  -8.8  -4.30809   AATAACTAAAGCAAA   TCGGTCCTGACCAGACAA AGT TCGTCTGCCGAGGACCGA   TTTTAATGGCTATTA  86 49
CYG41_RS10505 2056764 .. 2056798 + -16.6  -4.30844   AGTAAAAACGTTAAA     GGCCTCTAACGACAAG ATT TTTGTCATTAGAGGCC     TTTTAGTGCTGCCAT 100 87
CYG41_RS10540 2064199 .. 2064244 +   -15  -3.00704   ACCGTTTTAACTGGC GA-CTCAAAAAGCAGCAGCCA TTTTT TGGTTGCTGCTTTTTGCGATC TCTAATTTAGCACCT 100 45
CYG41_RS10575 2075918 .. 2075963 + -20.7  -3.10732   TTTCAAACTGCAAAT TAAAAGCAGCTGTCAACGCAT CTTC ATGCGCTGGCAGCTGCTTTTG TATTGCCATTGATAT 100 60
CYG41_RS10620 2087472 .. 2087519 + -20.3  -4.56367   AAACAGATAATAAAT GGAACCACCATGAATTGAT CAAATTTCAA ATCAATTCATGGTGGTTCC TTTATTTCTCGGGTA 100 43
CYG41_RS10705 2105530 .. 2105570 + -14.1  -4.55697   TATACCACAAAAAAA  CACCGATTCACTGGCCATT TTG AAAGGGCACTGAATCGGTG  TTTATTTATGCAAGT 100 101
CYG41_RS10800 2123282 .. 2123328 +  -5.1  -4.56314   CTAATCTAATAAAAA GACTGGAACAAAGCATCTC ATCTTTCCA GAGATGCTCCGTCCCAGCC TTTTGGTTATCTTCG  70 55
CYG41_RS10825 NONE
        yaaA 2130483 .. 2130532 + -14.5  -5.37865   AGTTGACTTCCGAGA ATGGCCTACAACCAAGTCCAG CTTTACTT TTGGGCTTGGTTGTAGGTCAC TTTTTTAGTTGTTAG 100 45
CYG41_RS10835 2131406 .. 2131428 +  -8.5  -4.72846   ATCGGATGCAAAAAA          GTCACGC-CA ACAA TGAGCGTGAC           TTTTTACATATATCA  91 67
CYG41_RS10850 2135373 .. 2135384 +  -2.2  -4.96848   TCACGCTCACTTTAA                GTCT GGGG GGAC                 TTTTTATGTCAAAGA  68 26
CYG41_RS10855 2136441 .. 2136461 + -10.4  -5.63504   CAAGTATCAAAGAAA            CCGCCGAT AACAA GTCGGCGG            TTTTTTTCTAACCTT 100 459
        pglX NONE
CYG41_RS10915 2158732 .. 2158778 + -23.4  -3.65902   AATTGGCACATTTCT TG-GCACACAAATGGGCGATC AACACA GATCGCCCATTTGTGTGCTCA TTTAAGTGGCGTAAA 100 39
CYG41_RS10940 2168758 .. 2168793 +  -9.9  -4.18197   ATCAGCGACTGAATC    GAAAAGTGGCGTACTC ACAAC GAG-GCGTCACTTTTC    TTTTGCCTAAAAACT  88 40
CYG41_RS11115 2203765 .. 2203785 +  -3.9  -3.17762   ATCGTTTATTTCATC            GGCGGTAAG AAA TTTCCCGTC            ATTTTAGTCAGTATT  48 18
CYG41_RS11120 2205029 .. 2205067 +  -8.3   -4.4261   CCGTTCAACCCAAAA   CTGGTCCTAATGACA TCTATCTTC TGTCATTAAGACCGG   TTTTCATGTTCCCGC  87 132
CYG41_RS11140 2208779 .. 2208825 + -14.6   -4.2828   GTTCTAGATTGTTAA CTAAAACGTGCCCCAAAAGT AAAAACC GCTTTTGGGGCACGTTTGCG TTTTCATCAATCAAA 100 54
CYG41_RS11175 2215129 .. 2215162 +    -6  -3.97674   GCTCACACAAAAATA     GCAGCCGCG-GACTT TAATC AAATCTCACGGCTGC     TTATTTGAATCATAG  66 9
CYG41_RS11200 NONE
CYG41_RS11205 2222278 .. 2222319 + -19.7  -5.27477   GACATCAACCAAAAA GTGGCTCCG-TTGCGATTTT ACA ACAATCGCAAACGGAGCCAC TTTTTTAATTAAGCT 100 57
CYG41_RS11250 NONE
CYG41_RS11255 NONE
CYG41_RS11260 2231525 .. 2231544 +  -8.5  -5.11613   GCTACGCTTGATTAA            CCGTCGC TATTCT GCGGCGG             TTTTTTGCGTCCTCT 100 50
CYG41_RS11270 2233735 .. 2233749 +  -2.8  -3.53811   TAGTTCGGCGTATAA               TAAGTG CAA CCCTTA               TTTGCCCGAAATGCC  48 68
CYG41_RS11275 2235310 .. 2235321 +  -4.4  -3.33815   ACCTATCTCATTGAC                GCTT TAAG AAGC                 TTAATTGCAACACAT  51 101
CYG41_RS11285 2236718 .. 2236759 + -14.5   -4.0098   ACTAACACTTAAAAA GCACAAGCCACAGACAGAA TGAG TTCTGGCTGCAGCTTGTGC  TTGTTTAGGTTCAAA 100 76
CYG41_RS11295 2239373 .. 2239387 +  -4.2  -3.93256   AATGTTTTTTAGACG               GTTTCC AAT GGAATC               TTGTTTACAAGTATC  59 290
CYG41_RS11310 2241882 .. 2241896 +  -4.4  -4.58395   AGCCCTATGACCTGC               TTTTTT ACA AAAAAA               TTTTTAAACCGTCAA  68 508
CYG41_RS11325 2245114 .. 2245138 + -14.5  -4.69664   AAAAATTAACAATTA          GCACAATGTTT CAC AAACATTGTGC          TTTTTAAGTGGTATG 100 172
CYG41_RS11330 2246449 .. 2246489 + -13.4  -4.74103   ACTGCTTTTTGAATG CGCCAGAAGTCATTACAGC AAAT GCTGCC-TGACTTCTGGCG  TTTTTGGGTTCAAAA 100 80
CYG41_RS11335 NONE
CYG41_RS11340 NONE
CYG41_RS11345 NONE
CYG41_RS11350 2250089 .. 2250102 +  -2.3  -2.84527   TTTGGCAAGGGGAGG               CGTGC ACAT GCGTG                ATTTGGTCAAACTTG  41 11
CYG41_RS11355 2250755 .. 2250782 +  -7.7  -5.12474   ACCCGTAAACAAAAA        GACGCCATTTC ATAATC GAGATGGCGAC         TTTTTGTATCTTCTC  95 40
CYG41_RS11375 2255919 .. 2255935 +  -2.1  -4.14392   GGCCTGATCATATGG              CTCGGGT GAT ACCGGTG              TTTTCGCCGTTGAAG  57 288
CYG41_RS11455 2279504 .. 2279516 +  -3.3  -3.48593   ATAAAGCCACATGGA                CAAGC TAT GCTGG                TTCTATCAACAAATG  49 198
CYG41_RS11460 2279777 .. 2279791 +  -7.2  -3.18264   TGGTTAGCATCGCCA               GCATAA AAT TTATGC               TTGATGCGTGGCAAA  62 20
CYG41_RS11470 2280564 .. 2280576 +  -4.1  -3.37877   TTCTCGTTAAACACG                CAAGT TAA GCTTG                ATTTTGTTGGGACAT  51 18
CYG41_RS11485 2282873 .. 2282883 +  -3.2  -3.45023   CGGTTGCGCCGATCA                 CGAT CAA GTCG                 TTGTGATGATCGTGG  50 141
CYG41_RS11495 2283922 .. 2283941 +  -5.7  -5.60993   TTCGAAGTGATGAAG            GAGTCGT CTGAAA ACGGCTC             TTTTTTTGTGAGCGC 100 44
CYG41_RS11505 2285180 .. 2285206 +  -7.9  -5.10064   GTGCGTAATGTAAAA         GCGCTGTTCGG CCTGA CCGCATGGCGC         TTTTTGTCTATTAAA  95 157
        queG NONE
CYG41_RS11515 2286957 .. 2286998 + -10.3  -5.32565   GAATAATCCTAAAAA TACCGCAACCCGATC ACATGAAACGCC GATCAGGTTGCGGTA  TTTTTTAATTGATTG 100 98
CYG41_RS11530 2288703 .. 2288744 +  -6.8    -4.652   CAACCCACGTAAAAA GCACGCGTTAGCAATTCCCAA TGC TAGGGAATTG--A-CGCGTGC TTTTTAAACTGATTT  79 57
CYG41_RS11550 2293244 .. 2293280 + -13.9  -4.77986   CATTTCAAAATAATA    GCGTACCATTTCTCG ACTTTTG CAAGAAATGGTACGC    TTTTTGACTCTTTCG 100 125
CYG41_RS11565 NONE
CYG41_RS11570 2297301 .. 2297328 +   -12   -4.8667   AAAGCCGTCTAAAAA        GCCGTCCCTAGA TTTC TCTAAGGGCGGC         TTTTTATAACCTCTG 100 58
CYG41_RS11590 2302993 .. 2303011 +  -3.9  -4.56597   GAAATTGGTTTGGTT            GTGG-AGA ATGT TCTGCCAC             TTTTTGCGCGGGACG  68 78
CYG41_RS11615 NONE
CYG41_RS11620 2309535 .. 2309575 + -20.6  -5.02074   AGAACCCACAAAAAA GTCGGCTCCGGCGCTGCAT TTTC ATGC-GTGCTGGAGCCGAC  TTTTTTACGCCATAA 100 82
CYG41_RS11650 2314940 .. 2314980 + -14.2  -5.41143   GAAAAGAATATAAAA  GAACTGGTTCCAACAACA AATTC TGCTGTTAGAACCAGTTC  TTTTTTTGCACGCTA 100 82
CYG41_RS11695 2321185 .. 2321218 + -14.1  -5.45802   TGGGTAATTAAAAAA     GCAGTTCTAAGTGAT GAAA ATTGCTTAGAACTGC      TTTTTATTTTCAAAC 100 44
CYG41_RS11775 NONE
CYG41_RS11780 NONE
CYG41_RS11785 2334153 .. 2334195 + -10.8  -4.62783   CAGTCGCGTATCCAA GCCGATAT-GCGTGCA-CGT TAAAC GCGCTGCATGCCATATCGGC TTTTTCGACTGGGTG 100 47
CYG41_RS11790 2335208 .. 2335252 +  -2.8  -5.02074   TTAACCAAAAGAAAA ACCGGCATTCAG-CATGGCGT TTAC ACACCATATCTGTATGTCGGA TTTTTTAAACCATAG  70 53
CYG41_RS11800 2342579 .. 2342630 + -12.4  -3.57263   CGTTTAACTTTATAC AAAAAGCACCTCGCCT-TTCGCGGT ATT ACCACGATTAAGCGAGGTGCTTTTA TTTGAAAATGAGACT 100 157
CYG41_RS11815 2345171 .. 2345198 +    -7  -4.67011   TCGGTATCACTAAAA        GCGGGTCTAG CACTTAAA CTAGAGCCGC         TTTTTGCATGCGATT  79 77
CYG41_RS11835 2348165 .. 2348194 + -15.2  -3.87994   TATAATAATCATAAA       GAAAGGCGTACT AAAAAC AGTACGCCTTTC        TTTGTGGCCATGGAT 100 136
CYG41_RS11885 2366588 .. 2366615 + -10.6  -4.86621   CACAGTATGCAAAAA        GCCTTGGTCCAA TTTT TCGGATCAAGGC         TTTTTACTTGCCGGT 100 109
CYG41_RS11975 2381945 .. 2381970 +  -8.3  -5.00616   ATTGTCTACACAAAA         GGCTCTGGGTG GACT TACCTAGAGTC          TTTTTTCAAGAGCGG 100 40
CYG41_RS11980 NONE
CYG41_RS11985 NONE
CYG41_RS11990 2384104 .. 2384130 +  -9.5   -5.5112   TTAACCGGATCTTAA         GCAACCAGC AGAAATTGA GCTGGTTGC         TTTTTTGTTAATGCA 100 47
CYG41_RS11995 2385078 .. 2385099 +  -6.6  -5.53288   GCTGAATTGAAGGAA           CAATCAGC TCATCT GCTGGTTG            TTTTTTTGCGTTCCA  91 80
CYG41_RS12000 2386095 .. 2386112 +    -7   -4.1347   TTACAAGCAAAAAAA             GTCCCA TAAAAT TGGGAC              TTTCTGTACTTCAAA  71 155
CYG41_RS12015 2388192 .. 2388236 + -13.7  -4.42206   AACAGTTTGCAAAAA GCAGCAAG-TCCACCCGTCT TAGCAC AGACGGGGCGAACTTGCTGC TTTGTTAATTTCATT 100 122
CYG41_RS12075 2399186 .. 2399238 + -12.2  -4.45175   AAGAACTTTCTCGAA ACATAAAAGCAACGCAAACTCATG AGTAG CATGGGTTTGCGTTGCTTTTGCAC TTTCATTTTTTAGTG 100 61
CYG41_RS12095 2404087 .. 2404116 + -12.2  -4.08692   CATCTGAACCGCGTC       GAGGTCATCGGG ATGCCG CCTGATGGCCTC        TTTTCAACGCCATTA 100 55
CYG41_RS12155 2415167 .. 2415185 +   -11  -5.21709   AAAATCCTTCTCGAA             GCTGCCGA ACC TTGGCAGC             TTTTTTGGTATGAGC 100 42
CYG41_RS12165 NONE
CYG41_RS12170 2418289 .. 2418319 + -10.6  -4.96848   AGGATAACTGGAAAA       GTCTCGTAATTTTG ATC TAAAGTTACGAGGC       TTTTTGTATACCGCC 100 59
CYG41_RS12175 NONE
CYG41_RS12180 NONE
CYG41_RS12185 2421673 .. 2421689 +  -5.8  -4.86033   CCAAGACCACTCAAA              GTCGCT TGAAC AGCGGC              TTTTTATGCAAGTTT  78 44
CYG41_RS12190 2423953 .. 2423990 + -12.3  -4.66163   CGCTTACAGAAAAAA   GTGTCC-CAAAAGTCA TGACTAC TGACTTTTGAGGACAC   TTTTTAAATACAAAT 100 118
CYG41_RS12210 NONE
CYG41_RS12215 2430155 .. 2430188 +  -6.2  -5.09225   CTATGTATCAAAAAA     GAATCCCT-TCAG CCTTAAAAA CTGATAGGGATTC     TTTTTTCGGTCGAAT  87 174
CYG41_RS12255 2436407 .. 2436446 + -10.7  -4.32804   GGTAACACCAAAAAA  CGCAGGTAAGCACGTTG AAAAGA CCTTGTGCTTGCCTGCG   TTTTCGCTTAATTGT 100 36
CYG41_RS12310 2450818 .. 2450859 +   -13  -5.06451   AAATGTCTCTTTTAA CTCGAAGCGAGAACGGCA AAAACC TGCCGAACTCACTTCGAG  TTTTTTGCACTACTG 100 81
CYG41_RS12315 2451729 .. 2451747 +  -3.8  -5.07567   TCATCTTCCCGCTAA             GTCAGC CATTTGC GCTGGC             TTTTTTAAAATCTGA  73 52
CYG41_RS12320 NONE
CYG41_RS12325 NONE
CYG41_RS12330 2453845 .. 2453859 +  -6.4  -3.31322   CAAAATAACGATCGC               CGGTTG CCC CAATCG               TTGTAAACAATTGGC  59 103
CYG41_RS12340 2455546 .. 2455568 +  -9.8   -4.2338   ATAACCATCACAAAA           CCCCACTCCG ATT TGAAGTGGGG           TTATTTGTGTTGCTA  88 276
CYG41_RS12375 NONE
CYG41_RS12380 2464038 .. 2464085 + -21.6  -4.07618   CCTGAAACCAAGAAA CCTCTGAAACTAATGTGGTGAG CTCA CTTACCACACTGGTTTCAGAGG TTTAATTCTTGGCAA 100 225
CYG41_RS12385 2464986 .. 2465002 + -13.7   -5.0538   TGAACATCCGTAGAA              GCCCCGA GAA TCGGGGC              TTTTTTGGGATCAAG 100 251
CYG41_RS12415 2468054 .. 2468078 +  -6.6  -3.16564   TAATTGGATGAACAA         TCGGCAGTTTA TACT TAAA-TGCCGA          TTCGTAAGCTGGCGG  57 387
CYG41_RS12475 2475340 .. 2475361 +  -5.9  -2.78032   GTTGCGTCCGGTCAC           TCAGCAGCGT TAA ACGC-GTTGA           ATCTTTTCAAAGGAG  53 13
CYG41_RS12480 2476576 .. 2476596 +  -8.9  -5.39755   AAGTTCTTCATGTGA            GTCGAGCCG TAA CAGCTCGGC            TTTTTTGTGATTGTA 100 74
CYG41_RS12500 NONE
CYG41_RS12505 2480160 .. 2480170 +  -5.4   -3.1552   TGTTCATTAATGTAT                 TGAG CGC CTCA                 TGTTGCTGAATCGGC  52 516
CYG41_RS12520 2484589 .. 2484627 + -14.1  -4.70879   ATGCGTATACAAAAA   GTCCGATAAACTGGT TCATCATCC ACCAGTTTATCGGGC   TTTTTGGGCTTTCGA 100 122
CYG41_RS12525 2485242 .. 2485272 + -14.1   -4.3586   TTAGTTGCAGCAAAA       CGCCGCCTATC CGAAGAAAA GATAGGCGGCG       TTTTGGTGTCGCTGG 100 121
CYG41_RS12540 2488741 .. 2488758 +  -3.5  -3.38224   ACCTCACCTTTCTTT             TATGTTG ACAT TAACATA              TGTTTGGAATACCAT  49 74
CYG41_RS12545 2489465 .. 2489515 + -12.8  -4.11295   ATCTTTCCGGAAAAA TGACCTTAGAGCAAAGCGCCTT GAATGAA AAGACGTCTTGCTTTAAGGTCA TTTGTATCACTTTGA 100 41
CYG41_RS12550 2489921 .. 2489966 + -11.4  -4.73614   TTTTCGAGAAAAAAA CAAGGTATATTCCTTTACAC TTCAAT GTGTATAAGGATATACCTTG TTTCTTTTCATACTG 100 45
CYG41_RS12580 2494644 .. 2494660 + -12.3  -5.52384   GTCTGGTCAGGAAAA              GTCCGCA AAT TGCGGAC              TTTTTTTAGTGAGCG 100 177
CYG41_RS12585 2495556 .. 2495566 +  -3.2  -3.89957   TATTTACTACTTTCA                 GTTG TGA CAGC                 TTGTTGATTGTTGGC  53 169
CYG41_RS12595 NONE
CYG41_RS12600 2497658 .. 2497683 + -13.3  -5.03994   GTTACTATACCAAAA         GCCGTCTCATC TGCA GGTGAGGCGGC          TTTTTATGTGTCCAG 100 47
CYG41_RS12635 2505352 .. 2505382 +    -9  -5.00895   TACATTAAACAAAAA       CCAGCTAGGCAG CAATTGA CTGTCGAGCTGG       TTTTTGTGTGGTGAG 100 80
CYG41_RS12725 NONE
CYG41_RS12730 2522768 .. 2522781 +  -3.7  -2.72733   CGGCCAAAAAAGTCA               CACCG AATC CGGCG                TAGATTTAATCTTTT  44 9
CYG41_RS12735 2523212 .. 2523243 + -15.9  -4.65895   AAAACTAAACATCAT      GAACCGCGCCCCT GCAAAA AGGGACGCGGTTC       TTTTTGGGTGAGCGC 100 47
CYG41_RS12750 2524500 .. 2524537 + -17.2  -4.43879   GAATTCATTTGCAAA   GAGGCTCTAAAGACTG ACCTAC CAGTCCTTAGAGCCTC    TTTTGGTTGCATAGT 100 116
        psiE 2544031 .. 2544081 + -29.5  -2.94099   CTCGGGTTATATGAC TTCACGCAAAAAGGAATCGCAGC TGACC GTTGCGATTCCTTTTTGCGTGAA TATATCCTGACCGGA 100 103
CYG41_RS12940 2546353 .. 2546402 +    -8  -5.16071   AGGCAACACCGTTTT TGTCGTCGGTGAT-C-ACGAAAGA CTAG TCTTTCGTAGCAACACCGCCGCCA TTTTTCTTGATAATT  95 14
CYG41_RS12965 2550822 .. 2550863 + -17.5   -4.3739   TCGCGTGCATATAAA AAAGCGGCGCAAGTATCTT TTTC AAGATACTTACGCCGCTTC  TTTTGTGGCCAGATG 100 120
CYG41_RS13070 2572084 .. 2572142 + -22.9  -3.07816   GCGCAGGGATCTGCG -TGTAAG-GGCCTCGAACGCAATGGCC AAGCCCG GGCCATTGTGTTCGAGGCCACTTACAC TTCGATCCCTAAACG 100 21
CYG41_RS13125 2585243 .. 2585277 + -23.1  -4.05788   GAGTATCAAAGTAGA     TCAACCCCAGAGACG AAAAA CGTCTCTGGGGTTGA     TTTCGTTTACGCCAC 100 90
CYG41_RS13130 2587430 .. 2587452 +   -12  -5.40072   ATATTGATTTTTATT           TGGTCGCCCA CTT TGGACGACCA           TTTTTTTGGAAACAA 100 499
CYG41_RS13140 NONE
CYG41_RS13145 2589916 .. 2589933 +  -4.1  -3.39784   ACTCATCAAACATAG             CTATCAG GTCG CTGACAG              TCTTCTTCCGCATGA  51 62
CYG41_RS13150 2590827 .. 2590850 +  -8.1  -4.51097   TCACGCTTACAAAAA          GCTCGGCAG CATTGA CTGTCGGGC           TTTTGTGATGGTTGA  82 139
CYG41_RS13155 2591727 .. 2591762 + -14.1   -5.0133   ATGCCTATCAAAAAA    GTCCTCTGTAGCAAC TTATTC GTTGCCACAGGGGAC     TTTTTTCAAAGGCTA 100 44
CYG41_RS13180 2599318 .. 2599330 +  -4.7  -3.61398   GAATAATAAGTACGG                GCCGG TTG CCGCC                TTGTTCCGACCCGAC  55 299
CYG41_RS13220 2606558 .. 2606580 +  -2.7  -3.14931   GTAATAGTTCACCGC          CA-GCAGCCA TATA TCGCTGCATG           TTCATACCCAGTAAC  45 211
CYG41_RS13230 2607764 .. 2607777 +  -6.7  -5.89921   TTAGCGTTAAAAAAG               CAGCT GAAA AGCTG                TTTTTTTGTTATCCT 100 44
CYG41_RS13255 2613455 .. 2613471 + -12.3   -5.2189   GATGATCACAAAAAA              GCAGCGA ATA TCGCTGC              TTTTTTGATGCTTAA 100 79
CYG41_RS13290 NONE
CYG41_RS13295 2619340 .. 2619361 +  -6.5  -3.75153   CGAGCCACTTAGCCA           CGGCCCAGCG ATG CG-TCGGCCG           TTTCAATTCGGCCAA  63 72
CYG41_RS13305 NONE
        mscL 2621359 .. 2621396 + -19.3  -4.46072   TCAATAAAAATCAAA   TGGCTCAAGGAAGACGC AGCA GCGTTATCCTTGAGCCA    TTTCTGTTTATTCCC 100 54
CYG41_RS13355 NONE
        fetB 2629121 .. 2629158 + -12.1  -5.56112   CTCCGAAAATAAAAA   GTTTCTGCAGAAGCGAA TCTT TTTGCCTCTGCAGCAAC    TTTTTTGGTTTTTAT 100 51
CYG41_RS13410 2635809 .. 2635828 +  -9.2  -5.39721   TTAATCGTTCAAAAA            CCAGCCAC AGAT GCGGCTGG             TTTTTTATATGGTGA 100 55
CYG41_RS13425 2637096 .. 2637120 +  -4.2  -5.24531   AAACAATCTTTTAAT          GCCGCCTG AGGTTTATG CAGACGGC          TTTTTTGTGCACACT  78 39
CYG41_RS13430 NONE
CYG41_RS13435 2638803 .. 2638838 +  -8.3  -5.18357   ATTCACGCAGCCAAA    CCGAC-CACTCACGCA TAATT TGCGTCAGCGAGTCGG    TTTTTTGGTAGGTTA 100 8
CYG41_RS13440 NONE
CYG41_RS13445 2642627 .. 2642659 +  -4.1  -5.16681   TGACGTCACCCAGAA      GGCACACTATGAAGA ATC TTGGCATGGTGTGTC      TTTTATTATTTTTAA  78 52
CYG41_RS13450 NONE
CYG41_RS13455 2643486 .. 2643518 + -16.5  -3.37236   TAACCATAAACGCAT      AAAAAGGGCACTTCA TTT TGAAGTGCCCTTTTA      TTATAGCGTTCAATT 100 38
CYG41_RS13515 2651536 .. 2651588 + -17.2  -3.81879   ATCCAGTTGGTACTG CGCCAGAACGTCATTCAGCGGTTGT TGAT ACAGCTGCTGGAAGGC-TTCTGGCG TTGTTGCGTTTTCGG 100 52
CYG41_RS13525 2653108 .. 2653131 + -12.5  -4.81851   TAAGTTACTCAAAAA          GCCTGCTGA TCAGTT TCAGCAGGC           TTTTTGAATTTAGCT 100 60
CYG41_RS13555 2660476 .. 2660489 +  -3.7  -2.53263   TGATCTTTATTTTGC               GGCCG GTAA CGACC                TGCCTTAAGCCTAAA  44 4
CYG41_RS13560 NONE
CYG41_RS13565 2661982 .. 2662020 +  -7.7  -5.10767   TAATCGCCAAAAAAA  TCAGTTCTTCCTGCAG CCCACTAA CT-TAGGAAGAACTGA   TTTTTATATTCCGTC  95 78
CYG41_RS13575 NONE
CYG41_RS13595 NONE
CYG41_RS13600 NONE
CYG41_RS13605 NONE
CYG41_RS13610 NONE
CYG41_RS13615 2670474 .. 2670511 +  -4.2  -5.10163   TCGAGCACTCAAAAA   AGGATAGACCTAGCAA ACTTGA TTGCTAAATCTATCCC    TTTTGTTTTAACGTT  78 83
CYG41_RS13640 2674803 .. 2674817 +  -2.7  -2.57931   GCACGCATACTGAAT               CGGAG AGGAG CGCCG               GTTATGAAGAATGCA  41 110
CYG41_RS13645 2677123 .. 2677157 + -18.8  -4.75219   AAGGCTATTGGCAGA     CAAACGCCCTTGTC GCAAAAA GACAAGGGCGTTTG     TTTTATTCGTGATTA 100 39
CYG41_RS13650 2678296 .. 2678310 +  -2.1  -2.57769   TGCACTGTGCCATTC              TG-GGC AAAA GCCGCA               ATATATTTGGTCAAT  39 255
CYG41_RS13680 2681895 .. 2681942 + -16.6  -3.36983   ATAAACCGACCGGAA CGTATAAAAGCCACCCATCG CAGAACAA TGATGGGTGGCTTTTATACA TTCATTAACGCTTTT 100 37
CYG41_RS13705 2686061 .. 2686084 + -12.5  -4.66953   TGTAAAATCGCATAC          GCCTTACGC ATCACC GCGTAAGGC           TTTTTGGCATATTCC 100 56
CYG41_RS13710 2689094 .. 2689125 +  -5.8  -5.37345   TCCTCAAAAATAAAA      CAGCTCCGGAGT CAAAAAAC ACTCCGAAGCCG       TTTTTTATACTTACG  86 61
CYG41_RS13730 2692243 .. 2692273 + -12.6  -5.64421   AAACAAACAAAGCTT       TCCTGGCGAGTAGA TTC TATGCTCGCCGGGA       TTTTTTGTTTAAGGT 100 126
CYG41_RS13735 2693423 .. 2693433 +  -8.2  -3.38224   ATATTAGCCGCAAAT                 GCCG CAT CGGC                 TGTTTGCGCTAACGT  66 329
CYG41_RS13750 2695299 .. 2695329 +  -4.1   -5.1861   CCAAAAATGTGTGAA      TCACCTGCTGCATCC GCT GGA--CAGAAGGTGA      TTTTTTGATGGTCGG  80 87
CYG41_RS13760 2697828 .. 2697853 + -11.8  -5.00895   CAATCATCACAAAAA         CGCCCGCTGC CAATAC GCAACGGGCG          TTTTTGTATCATGAG 100 217
CYG41_RS13775 2699150 .. 2699204 + -13.6  -3.63589   GCTCTTTTCCTATCA AGCAAAAGCCGCAACCAGACTCACAT CAT GTGTAAGTCTGGTTGCGGCTAGTACG TTTACGCATATTTTA 100 164
CYG41_RS13785 2701358 .. 2701402 +  -9.6  -5.09204   TTTCTATCATAGTCA GTCGCA-ACAAAAAGCAGGTCA CCA TGGCCTGCTTTTTGTCTGA-AC TTTTTGTTGCCATCT 100 29
CYG41_RS13810 2706567 .. 2706599 +  -4.9   -5.4111   TTCGGTATGTAAAAA     GCAATCCCTTTGGC CTATAT GACGA-GGGATTGC      TTTTTTCTGCTTATT  82 44
CYG41_RS13835 NONE
CYG41_RS13840 NONE
CYG41_RS13845 2713652 .. 2713673 + -15.9  -4.46404   ACTATTGTTTGGAAA           CCCGCATGG CTAG CCATGCGGG            TTTTACTGTTCCTTG 100 53
CYG41_RS13850 NONE
CYG41_RS13855 NONE
CYG41_RS13860 2717447 .. 2717479 + -10.8  -2.73067   CAATATCAATGCAAA     GTAGCTCCTAAATGA TTTT TC-TTTAGGGGCTAC      TGCTGTATCGTTAAA  76 63
CYG41_RS13870 2719234 .. 2719261 +   -10  -2.78384   GTTGCTGAAGATTTC        TGGATGTTGAAT TCAT GTTCAACATCCG         TCTGATACAACGGCC  68 344
CYG41_RS13880 2720964 .. 2720990 + -12.4  -4.68424   GACCGAATGTAAAAA         GGATCGCACT AAGCAGC AGTGCGATCC         TTTTTCAATACGTTC 100 59
CYG41_RS13950 2735893 .. 2735906 +  -2.4  -5.03715   TCACCAGCCACTACG               TAGG CAACTC CCTA                TTTTTTGCCAATGAT  68 42
CYG41_RS13965 2739249 .. 2739274 +  -8.4  -5.96894   TTATTCATAACCTTT         TTCACTATCG TCTCTT CGATAGTGAG          TTTTTTTATTTCAAT 100 105
CYG41_RS13975 2741177 .. 2741192 +  -6.1  -5.63103   TTAACCTTAAAAAAA              GCAGC AATGAG GCTGC               TTTTTTTCATTCAAC 100 76
CYG41_RS14025 NONE
CYG41_RS14030 2754831 .. 2754878 +   -16  -3.08349   AATTTAAGCACAAAA TAATAAAGCACCAGGA-ACTC TAACGCT GAGTTTCCTGGTGCTTTATTG TGTTCAGCCTTCTTT 100 74
CYG41_RS14045 2758765 .. 2758778 +  -6.7   -3.6715   ATGAAAGGCTATTTA               GCATG CCAT CATGC                TTTCACCTTGGATGA  65 484
CYG41_RS14185 2784376 .. 2784395 +  -7.8  -5.21709   AATGAATCGTCTAAA            GCCGGCAA GCAA TTGGCGGC             TTTTTTCGTGTGCAG  95 44
CYG41_RS14210 2787578 .. 2787589 +  -4.4   -2.9961   CGACAAAGTTTGTGG                TGGT GAAG ACCA                 TGTCATATTGTTTAG  47 239
CYG41_RS14235 NONE
CYG41_RS14240 2796625 .. 2796663 + -14.8  -5.72207   ATCTGTAAATTAAAA   CAGGCATTGTACCAGT GTTTTGG GCTGGTATAATGCCTG   TTTTTTTGCTTTGCG 100 87
CYG41_RS14265 NONE
CYG41_RS14270 2803695 .. 2803736 +  -4.7  -4.39998   GTAATGAATCTAAAA GGCGTACTATTTTCTCA-AT GAG ATGTCAAAAAATAGTACGTC TTTATTGTGTAGATA  66 386
CYG41_RS14315 2812156 .. 2812168 +  -2.7  -3.92178   GTAAAACGTTGCTGT                TTTGA ATA TCGAA                TTTCATTCGCGTGAT  54 463
CYG41_RS14385 2829608 .. 2829618 +    -4  -3.90112   ACTACGTGAGTTTAA                 GTAA ATT TTAC                 TTTAATTAGAAAGGA  57 102
CYG41_RS14390 NONE
CYG41_RS14395 2831723 .. 2831754 + -10.2  -5.40004   TATAAAAATCAAAAA      CTGCTTCGAAAGCA AGAT TGCTTCCAAAGCAG       TTTTTTAATTTCGTG 100 77
CYG41_RS14470 2845528 .. 2845567 +  -9.5  -3.24925   ACCGCAGAAAGAAAA  GCACGGGCTACTTTCC TATGAGACC GGAAA-TAGTCCGTGC  TTAATCGTATGCAAT  74 117
CYG41_RS14480 2847893 .. 2847912 +  -8.6  -3.86346   TTAACTTTTCCCTTG            CTTTGGAG TGCG CTCCAAGG             TTTATAACAAAGTCA  75 172
CYG41_RS14485 NONE
CYG41_RS14490 2849395 .. 2849424 +  -5.9  -5.40072   ACCAGAGTATCTCCG       TAGCC-ACTTTC GAATGCA GAAAGTTGGCTA       TTTTTTTCGCGCCAA  86 125
CYG41_RS14515 2852763 .. 2852799 +  -8.9  -4.90266   ATGGGTATTTAAAAA   GCAATCGCCTCGTC TCCAAAAACT GACGAG-CGATTGC    TTTTTAATTGCTACA 100 40
CYG41_RS14560 2859336 .. 2859363 + -12.8  -2.71001   TTTAATCCGCACGAT        GGCGTCAGACAA AGTT TTGTCTGGCGTC         CTTCATTTCCGCATA  91 194
CYG41_RS14565 2860327 .. 2860339 +  -6.2  -5.68023   CCAAATTGTCACCGC                GCCG ATACC CGGC                TTTTTTTCGTTGTCA 100 78
CYG41_RS14580 2864028 .. 2864077 +  -3.8  -4.65895   CTTGCAACTCTAACC GTTTGTCAGGTTATTT-GTCAAG CGATA TTTAACTAAAAAGCCTGACGAAC TTTTTAGCTAAAGCG  67 245
CYG41_RS14585 2865531 .. 2865557 + -10.2  -5.58522   TCGTTTTCATAAAAA         TGCTGTCATCTG ACT TGGATGACGGCA         TTTTTCTTTTGTCTG 100 49
CYG41_RS14605 2869725 .. 2869758 + -15.5  -2.90456   TGAAAGCGCAAAAGA     GCCTCGATCAAAAGA CGAA TCTTTTAATCGAGGC      TCTCATCATTTAATT 100 124
CYG41_RS14645 2878719 .. 2878736 +  -3.5   -3.1082   AACATTTTGCTTGCA             TATTCAT TCCA ATGAGTA              TATATTCAATCCATA  48 63
CYG41_RS14650 2880213 .. 2880225 +  -3.4  -4.05788   GCCTGATTGAAAAAC                GGTT TAATT AACC                TTTGCTTTAGCACGC  56 15
CYG41_RS14655 NONE
        argH 2882940 .. 2882983 + -18.5  -2.94032   TGCATCACGACAAAA TAAAATCGGTCTTAGAGTG GCAAGA CGCTCTAAGACCGATTTTG CTTTCCTTACGACAT 100 65
CYG41_RS14685 NONE
CYG41_RS14690 2887722 .. 2887764 +   -18  -4.82998   TTCCAGAAATTCAAA GCAAGCAAAAAGACGACT CACTTGA AGTCGTCTCTTTGCTTGC TTTATTTTACTTTGA 100 104
CYG41_RS14700 2889034 .. 2889047 +  -5.2  -4.03885   CTCCGACTTCTAACC               GCGC CGGTTC GCGC                TTACTTTTTTTAGGA  63 401
CYG41_RS14710 NONE
CYG41_RS14715 2890293 .. 2890304 +  -4.4   -4.7254   TTCGCAGTTGACGCC                CACT AAGG AGTG                 TTTTTCATGACAAGT  68 264
CYG41_RS14720 2890966 .. 2891000 + -13.7  -4.45771   GATTTACAGGTTGAA     TCGGTCTTAGAGGCG AAATA TGTCTCTAAGGCCGA     TTTCTCTTTTCGCAT 100 57
CYG41_RS14725 NONE
CYG41_RS14730 NONE
CYG41_RS14735 2894837 .. 2894877 +  -7.7   -5.1523   ACCGCTCCATAAAAA AACAGCTCACA-GCCTTC AAAAAA GAAGTCCTGTGAGCTGTC  TTTTTGTCTTATACG  95 74
CYG41_RS14745 2895557 .. 2895577 +  -6.8  -4.20042   CATTATAAAACAAAA            GCCCAGAC TTTGT GTCTGAGC            TTTTGAAGTCTTGGT  71 33
CYG41_RS14770 2901046 .. 2901078 +  -5.6  -4.16943   ATATCACACCAAAAA     GGACGCACTCGCC ATCCTCTC GGC-AGTACGTCC      TTTTCAACTGTAAAC  68 98
CYG41_RS14785 2903441 .. 2903460 +  -6.4  -2.64099   CAGCGATGCGTCATG            GCTTTAGC AGAA GCTATAGC             ATTGTCATAAAGCAC  54 102
CYG41_RS14790 2904334 .. 2904348 +  -2.1  -3.33696   GATCGACAACAACAC               CACTG CATGC TAGTG               TTGCTTCCGCACCCC  45 151
CYG41_RS14795 2904983 .. 2905003 +  -4.7  -3.61506   CTATCCCGTTAAAAC            TATCCACCA AAA TGTTGGGTA            ATTTTTTCACGGTGA  57 29
CYG41_RS14805 2906103 .. 2906124 +  -7.3  -2.95341   TTAACCTCAGGATGA           TTCTGCCAA TAGA TAGGCAGAA            ATTTAATCTTCCAGT  59 168
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CYG41_RS14825 2910940 .. 2910966 + -10.9  -4.73388   AAAAGCATACAAAAA         CGCGACCCT GAATTTCCG AGGGTCGCG         TTTTTGGTGCCGGTT 100 71
CYG41_RS14855 2914849 .. 2914889 + -11.1  -2.71011   TCGGCGTGTAAGTGG  CCTGGGGCGTGATGGCC CGGTTTT GGCCATTGCGACCAAGG  TCCTTACACGCAGAT  72 153
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CYG41_RS14870 2917026 .. 2917037 +  -4.4  -3.21199   AAACGCATCATGAGC                TGGT ACCA ACCA                 TTGCCTTAATCAGTC  49 5
CYG41_RS14875 2917869 .. 2917879 +  -3.2  -4.13945   AGCGATTGGCATGAT                 CGCT AAA AGTG                 TTTTAAGCTGAGGGT  58 40
CYG41_RS14880 2918909 .. 2918935 +  -9.4  -5.08169   ATACCACTCAAAAAA         TCGGCTCAGGAT AAT ATCCCGAACCGA         TTTTTTAGCATATCT 100 103
CYG41_RS14900 2923739 .. 2923777 + -14.1  -4.21322   CGAATCATTTAAAAA  GCGAATGAG-TCTCCTTA AACT TTAGGAGAACTCATTCGC   TTTAGTTTATGTTGC 100 103
CYG41_RS14915 2925705 .. 2925732 +    -7  -4.27467   TGGCATGGCGTTTAA        TTCGCCGACAAG TTGG TTTGTCAGCGAG         TTTGTGTTCGTGTTG  74 110
CYG41_RS14925 2928927 .. 2928980 +  -8.3    -3.281   TGCAGAAACTGCATG TAAG-GGACTTAGACGCAATGGCTAA AAC TGGGCTATTACGTCTGAGGCCGCTTA TGTTCTAGCTTACGG  69 178
CYG41_RS14930 2930677 .. 2930719 +    -5  -4.88067   CACGGAAAATTGAAG TGCCCCATAATTGTTAGA CAGATAC TCTAATGATAGTGGGGTA TTTTTATGACTAAAT  74 90
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CYG41_RS14940 2932248 .. 2932259 +  -2.2  -3.83026   ATGAAACACCTAAAC                CGAG GATG CTTG                 TTTCATGTGGAACAG  51 167
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CYG41_RS14985 2941421 .. 2941442 +  -4.5  -4.27316   TTATGCCAGACTTTC           GAAAATCAT AGTT ATGATCTTC            TTTTGACTTCACAAC  64 441
CYG41_RS14995 2942595 .. 2942605 +  -4.6  -3.58505   TTATTCCGAAGCATT                 TGGC AGC GCCG                 TCTTCTTATTGGTAA  57 273
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CYG41_RS15040 2949303 .. 2949318 +    -4  -2.87051   CACCCTATAACAGTT              CCA-GCA CTC TGCATGG              CTTTCATGGTCGGGA  46 63
CYG41_RS15045 2949572 .. 2949582 +  -2.4   -3.6053   TCGACTTTTAGCTTG                 CCTC TAA GTGG                 TTACTTTGTCAAGGA  49 30
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CYG41_RS15100 2958645 .. 2958668 + -12.4  -4.03995   AGAGCATAATTTAGT          GGGGTGTGCC TTAG GGTACGCCCC           TATTTTTATAAGGAG 100 40
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CYG41_RS15110 2959529 .. 2959544 + -10.4  -5.74122   TATCATTGGGCAAAG              CGGGCA GAGA TGCCCG               TTTTTTTGTGTGCTG 100 247
CYG41_RS15135 2962866 .. 2962889 +  -7.4  -5.58454   TCGTTGCCATTTCCT          CCGCGTAG CCTTCAAA CTGCGCGG           TTTTTTTAATCTAAA 100 83
        nagB 2970813 .. 2970844 +  -5.8  -5.04733   GGTAAACATTAAAAA      CTCGACCCTGGAAA ATTT TATCTGGGGTCGAA       TTTTGTTTCTGCTTC  82 92
CYG41_RS15170 2971822 .. 2971845 +    -6  -5.39221   TTAATTCGGTTTTAA          CCTCATCG GCCACATG CGGTGAGG           TTTTTTGGTTCTTCT  86 37
CYG41_RS15175 2972767 .. 2972806 +  -6.5  -4.44797   ATCCTGCTAAGCTAA  TCGGCTTTCGAGAAGACG TATCT TGTCA-CTCGAAGGTCGA  TTTTCATATTCATGC  74 390
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CYG41_RS15185 2974928 .. 2974967 +    -8  -4.99134   CTAACCAATTGAAAA  CGAGTGAGTCTCTG GAGAATAAAAAA CGGAGATTCACTCG   TTTTTGGTTTCACGT  95 71
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CYG41_RS15200 2978247 .. 2978269 +   -12  -4.82667   GACTGCATAACGAAA           CCGTCGCG CAAAAGT CGCGACGG           TTTTTGCTATCGTAA 100 80
CYG41_RS15205 2979621 .. 2979658 +  -6.4   -4.7497   TTTGCCATAACAAAA   GATCCCACCAC-ATGAG CAGAA CTCATCGTGATAGGATC   TTTTTAATCACTACA  80 57
CYG41_RS15230 2991172 .. 2991184 +  -6.3  -4.51847   TTACTCTCCACTTCA                TGATG TTT CATCA                TTTTATCAGTTATTT  74 238
CYG41_RS15240 2992510 .. 2992537 + -14.3   -5.1861   TAGTTAATTTGAAAA        GCCTTAGTGAG GAAATG CTCACTAAGGC         TTTTTTAATCCTCCG 100 63
CYG41_RS15245 2993000 .. 2993018 +  -3.8  -3.34715   ATCATTTGGATGGTG             TCGGAGGC GCA GCTTTTGA             TGTTTAGCAAACCTG  49 130
CYG41_RS15250 2993284 .. 2993308 + -11.5  -5.31275   ATTCCAACTTAAAAA          GAATCGCAGCA AAG TGCTTCGATTC          TTTTTTCTAGTCCAA 100 94
CYG41_RS15280 2998617 .. 2998637 + -11.1  -5.52384   CTGGGTTCAAAAAAA            CCGCGATCA CAC TGACCGCGG            TTTTTTTAATACAAA 100 88
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CYG41_RS15320 3006793 .. 3006811 +  -8.8  -2.88446   AATCAGGATCATTTC             GCGTCCAA TTT TCGGACGC             ATGTTTTATGGAATT  67 39
CYG41_RS15330 3006633 .. 3006649 -  -4.3  -5.03314   GCCACCCCTAAAAAA              GCTAGGA AAG TCCCCGC              TATAACGCATCCATG  77 381
CYG41_RS15315 3004944 .. 3004962 - -13.2  -5.75342   CTGCTCTAAAAAAAA             CCACTGAC GCG GTCAGTGG             CTTAGGCAGATAATA 100 27
        rnpA 3004010 .. 3004023 -  -2.3  -3.09492   CTCTTAATCTCAACA               TGGTC AAAT GACCT                CGATATCTTCGTTCA  43 15
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        mnmG 2998617 .. 2998637 - -13.3  -5.40072   CTGGGTTCAAAAAAA            CCGCGATCA CAC TGACCGCGG            TTTTTTTAATACAAA 100 69
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CYG41_RS15130 2960730 .. 2960745 -  -8.2  -4.70659   GCTGACATGCAAAAA              GACGGC CGCG GCCGCC               TTTTAAAAATTGTTA  91 38
CYG41_RS15125 2960310 .. 2960332 -   -12  -4.90002   CAAGAGATAATAAAA           TAGCCGCCCA TAA TGGACGGCCA           CCGCCTGCCAAGCAG 100 171
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CYG41_RS15115 2959794 .. 2959818 - -11.5  -5.00642   CAATGGATACAAAAA          TAGCCACCTCA TAG CGAAGTGGCTA          TTTTGTGTTAGTCAT 100 33
CYG41_RS15025 2947705 .. 2947721 -  -5.9  -2.95789   ATGATATTAATCACA              TTGCTTC TAT GAAACAA              AATTAGTTCTATTGT  54 42
CYG41_RS15020 2946297 .. 2946335 - -14.8  -6.13503   CAGCAACAAAAAAAA   TCACGACCCGCAAGCATA TTT TATACTTACGAATCGTGA   TTTTTTTATCTATTC 100 153
CYG41_RS15015 2945177 .. 2945191 -  -2.8  -3.54475   TTTTCCATCACACAA               GCTACT GTG ATTAGC               GATTAATCGACCGCG  48 21
CYG41_RS15010 2944295 .. 2944316 -  -5.8  -5.27938   ATCCTTAAAGAAAAA           GCCGCCTC TTCACT GAGACGAC            TCTTTCAAATTCTAT  86 37
CYG41_RS15005 2943543 .. 2943564 -  -5.1  -3.11955   ATAATCATCACGCAA           CCG-GGCGAA TCA TTTGCCACGG           TATCACCTTCAAATT  53 218
CYG41_RS15000 2942262 .. 2942272 -    -4  -4.08767   TTTATCTGCTGAAAA                 CAAA CAC TTTG                 TCGTTCCTTATACCC  60 333
CYG41_RS14990 2941081 .. 2941120 -  -7.5  -5.36441   CGCCCACATAAAAAA CGTTAACGTCAATCAAACT GAAT AGTT-GATC-ACGTTAACG  CTTTTAATATTGGAC  91 96
CYG41_RS14975 2936976 .. 2936992 -  -2.2  -3.76759   ATCAACCTTAGCAAA              CCGTTT GAACA AAGCGG              CTTTTCCTTCCATCA  51 345
CYG41_RS14965 2935555 .. 2935567 -  -6.9  -4.46656   TCTATAAGATTAAAA                CCGGA CAA CCCGG                GGACGGCAGCATTGC  76 75
CYG41_RS14960 2935083 .. 2935102 -  -2.2  -3.41602   CTGACTTTACTAGAA            TCCTGTCAA ATT TTG-CAGAA            GAAAAGAAAGATGAC  47 156
CYG41_RS14955 2934464 .. 2934498 -    -3  -4.98917   CAAAAGATAACAAAA     GATTCTACGCAA CAGCGTTAAGC TCACGTAGAATC     TTTGTTTTTCCGATT  71 57
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CYG41_RS14945 2932064 .. 2932098 -  -9.3  -5.10461   TTCACTCAATAAAAA     TGGCCTGACCCCGAT TGAAT ATCGGAATCAGACCG     CTGCGTAACTAATTT 100 227
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CYG41_RS14905 2923739 .. 2923777 - -14.1   -4.7078   CGAATCATTTAAAAA  GCGAATGAG-TCTCCTTA AACT TTAGGAGAACTCATTCGC   TTTAGTTTATGTTGC 100 85
CYG41_RS14895 2921234 .. 2921252 -  -3.1  -4.42748   CCAGTTTAAAAATAA             CTGGTTG TGCGC CAACCAC             CGTCACTCAGTACAT  63 219
CYG41_RS14890 NONE
CYG41_RS14885 2918909 .. 2918935 - -13.8  -5.11613   ATACCACTCAAAAAA         TCGGCTCAGGAT AAT ATCCCGAACCGA         TTTTTTAGCATATCT 100 62
CYG41_RS14860 2914532 .. 2914551 -  -2.8  -3.62046   CGACTGCCTCAACAA            GATCGACA TTTT CGTTGATC             TCAGCACCACCGACC  51 219
CYG41_RS14850 2913859 .. 2913877 -    -6  -2.70932   GCCCCCTTCTAACGA             CGATCACA TGT TGTCATCG             CTGGGGCTATCATAA  52 56
CYG41_RS14845 2912982 .. 2913027 - -18.5  -3.06183   GGGACCTGCATGTAA GGACCTTGGTCGCAATGGCC AAGACCG GGCCATCACGACCAAGG-CC ACTTACACTCCAGTC 100 118
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CYG41_RS14830 2910929 .. 2910976 - -13.7   -5.0538   TCTTAGTTGAAAAAA GCATACAAAAACGCGACCCT-GA ATTT CCGAGGGTCGCGTTTTTGG-TGC CGGTTAGTATTCAAG 100 57
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CYG41_RS14810 2905728 .. 2905752 - -10.1   -5.1861   CTGATCAGCAAAAAA          TGATACGCC AAATTAA GGCGTATCA          TCAACAGAAATACAA 100 219
CYG41_RS14800 2904784 .. 2904812 -    -9  -4.49314   GACTAGCAAAAAGAA        GTTGATACTCCA AATTA TGGAATACCAAC        ATCTTAAAGCGAAAG  90 324
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CYG41_RS14775 2901046 .. 2901078 -  -8.5  -4.83269   ATATCACACCAAAAA     GGACGCACTCGCCA TCCTCT CGGC-AGTACGTCC      TTTTCAACTGTAAAC 100 98
CYG41_RS14765 2898507 .. 2898533 -  -3.8  -5.25805   AACAAACCTAAAAAA         GAAGCGTA TACATTGCAAG TACGCTTC         AAAAAAGATTTTTTT  80 84
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        cadA 2865823 .. 2865865 - -16.5  -5.52384   CTTGCACCAAAAAAA GGTCCAATCAGATGCGC TTATATCGC GCGTATCTGATTGGACC CTGAAATCTCTTGAT 100 54
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         rrf 1922683 .. 1922693 -  -2.4  -4.23104   CTAAACCGGAATAAA                 CAGC GTG GCAG                 CTTCCTACCCTCGCA  55 17
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        recX 1858792 .. 1858805 -  -2.4  -4.29432   CAAACCTCATGAAAA               TACG ACAGCG CGTA                AGCAAGGCGGACGGC  58 139
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CYG41_RS06050 1155956 .. 1155967 -  -4.4  -4.12254   TAGCACCACAAAGAA                TAGG CAAA CCTA                 TAATATAGCTGGTCT  61 71
CYG41_RS06040 1154170 .. 1154189 -  -4.2  -5.16237   AACCCCAGCAAAAAA            GCGGCC CTCATTTT GACCGC             TTGCTTGCTATTAAA  78 36
CYG41_RS05980 1144312 .. 1144332 -  -6.8  -5.60993   TTTCCCAGAAAAAAA            GCTTGGCG GCAAG CGTCAAGC            TCGATTTGAATTAGG 100 36
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CYG41_RS05970 1142570 .. 1142597 -  -6.3   -5.0538   TGTGAGCGCAAAAAA        GCCGTTGAGCA GACAGT TGATCAACGAC         TTTTTTCTCTGGGCA  84 48
CYG41_RS05965 1141984 .. 1142005 -  -2.3  -2.80994   TTCAACGTCATTATA           GATAATCAG GTAT CTAATTTTC            ATTTTTCCTTATCTA  41 57
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CYG41_RS05690 1105174 .. 1105186 -  -2.7  -3.79481   TAAATGGAACCGAAA                TTAAC CTG GTCAA                TGATATACAGCTTCA  52 429
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CYG41_RS05660 1101553 .. 1101580 -  -6.2  -3.24613   GACCAAGGAATTGAA        CGCACGCCTTTA ATCG CAAGGGCTTGCG         CGTTTTGAAATAAGG  59 137
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CYG41_RS05575 1084981 .. 1084999 -  -2.3  -3.98378   GACAGGGAATAATAA             TTGCCAC GCTTT GCGGCAT             GAAACGGCCTCCTCA  53 92
CYG41_RS05570 1084027 .. 1084068 - -16.8  -5.02439   ATATAACCAGAAAAA TAAGGCAAGCTGACCTTG ATTTTG CAAAGTCGGCTTGCCTTA  TTCACTTAATCTCGC 100 27
CYG41_RS05560 1081923 .. 1081935 -  -2.7  -3.04398   CTCCTTTTTGAAAAC                CTTGA AAA TCAAA                TATTGTTATTAATTA  43 97
CYG41_RS05555 1079077 .. 1079094 -  -4.1  -5.71295   ATACAAAAATAAAAA             GCAACCC GATA AGATTGC              TTTTTGCATTGTTTG  90 178
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CYG41_RS05520 1071453 .. 1071480 - -17.2  -5.00616   GCGCTCCGCAAAAAA        GCCATTTGCCAA AAAG TTGGCAAATGGC         TTCGTATCGAGATCA 100 78
CYG41_RS05495 1067181 .. 1067206 - -16.9  -4.36931   TAAGGCATACGAAAA         GGCTCGCACTG AAAT CAGCGCGAGCC          TTTTGCCTACTTACT 100 39
CYG41_RS05470 1061861 .. 1061901 - -16.9  -2.71011   ACCTGCGTGTAAGGA  CCTCAGCCGCAATGGCCAA AAC CCGGCCATCACGTCTGAGG  CCGCTTACACTCCGG 100 171
CYG41_RS05420 1054663 .. 1054689 -  -9.5  -5.58454   CTCACATCAAAAAAA         GTGCGATCC GATTTTGCT GGATCGCAC         TTTTTGCATCTTATG 100 36
CYG41_RS05390 1052503 .. 1052517 -  -3.4  -3.61922   AATATTCATGCGAAA               GCCCCC CGT GTGAGC               GAGTCAATTACGACT  51 46
CYG41_RS05385 1051530 .. 1051554 - -11.5  -4.74504   AGCGGAACTTAAAAA          GTCGAATTGCA TTG TGCCATTCGAC          TTTTTAACCTTACTT 100 35
CYG41_RS05380 1050360 .. 1050375 -  -5.4  -3.90744   TCTTGCGTCAAACAA              CGCGTT ATGA AACACG               TGATGAAGCCTTAAC  61 150
CYG41_RS05375 1049627 .. 1049658 - -15.3  -4.87893   AAGCGTAAGCAAAAA      GGCAACGATTGCC ATGTCA GACAATCGTTGCC       TTTTTTCAATCTTGG 100 31
CYG41_RS05365 1046571 .. 1046605 - -10.1   -5.4756   AAGGTTAATAAAAAA     GCGAGTCGAATTC TTGGTGATG GAAGTCGACTCGC     TTTTTATTTTAACCA 100 59
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CYG41_RS05290 1024743 .. 1024758 -  -6.1  -2.55784   CAACGCAATGAATAT              GCGCT ATAGTG AGCGC               GAGCCGGCGCGGTTA  53 13
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CYG41_RS05260 1020077 .. 1020088 -  -2.2  -3.37303   TAACAAATAATCGAA                GGTA AGTT CACC                 GTTTTGGGATGTTCT  45 192
CYG41_RS05245 1018426 .. 1018445 -  -3.5  -3.30159   TGAATCCGTTGATAA            GTTGCAG GTTACT CTGCAGC             TTATTTTGCTGGTCG  49 54
        ssrA 1014491 .. 1014524 - -15.4  -5.49568   AACCCAAAATAAAAA     GCCCCGAAACGCTG ATTTAA CAGCATTTCGGGAC      TAACCAGAAACAAGA 100 51
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CYG41_RS04445  862488 ..  862517 -  -6.5  -5.12474   CAGAATACATAAAAA       CGTCCTTAGAA GCACGAAA TTCTAAGGGCG        TTTTTTGGCTGTCTT  87 61
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CYG41_RS04400  852599 ..  852637 -   -17  -5.61596   ACGGGCATAAAAAAA  TCGGCCTTAGAG-AACG TCAATT CGTTTCTCTAAGGCCGA   TTTTGCATAGCAGCG 100 71
CYG41_RS04385  848817 ..  848846 - -10.1  -5.58209   TGAAAGTTAAAAAAA       TCCTCCCTAAACT GTTG AATTAAGGGAGGA        GATTTAGTGTTGACG 100 53
CYG41_RS04335  837601 ..  837640 -   -13  -4.17878   TGAAATTAAATTAAA  TGGGATCCCGGAGACA GTTACTTA TGTCTTCAGGATCCCA   TTTTTAATTGATGAT 100 80
CYG41_RS04310  831311 ..  831350 -   -21  -5.29385   AATTCAAGCAAAAAA  TTGTCCCATGATTGCCTT GGAC ACGGCAATCATGGGACAA   TCTTGAACTGGCCTA 100 59
CYG41_RS04155  820138 ..  820150 -  -3.3  -2.71712   CTTCTCCGTTCAAAG                TGGGC GTT GGCCA                GTGTGCTTAGCAGTC  42 86
CYG41_RS04150  819600 ..  819610 -  -2.6  -4.21827   TGAAACATGCGAAAA                 TTTT AGA AAAA                 CATCAATAAATATCG  57 28
CYG41_RS04145  818820 ..  818856 -  -7.3  -4.76274   CAAAGCAATAGAAAA    GGCGCAGTACATGTT GTTTATA AACATGCGTTGCGCC    TTTTTGTTATTTGAT  85 43
CYG41_RS04100  810750 ..  810764 -  -2.1  -4.09108   TTTAAGGCATAGAAA               CGAAT GAATG ACTCG               ATCATTGATAATGCG  55 86
        pepV  809174 ..  809216 -  -5.7  -3.89346   TTTGCATCGCACAAA CGCCAGGAGTCACCGCAAC ATTGTGA GTTGC--CGACTTCTGGCG CTTGGGTTGCATGAT  63 95
CYG41_RS04090  808342 ..  808359 -  -2.8  -3.41234   TACCAACTGAACGAA             TTTAGT GATCTA ACTAAA              TTGCTCTTGGCTAAT  48 60
CYG41_RS04075  804220 ..  804257 - -10.7  -4.96762   CATAGACGATAAAAA   GCAGATGAATCAGCGC ATATATG GCGCGG-TTCATCTGC   TTTTTGGTTTGTTGG 100 95
CYG41_RS04065  801609 ..  801645 - -12.5  -5.16572   AGTGAATCTAAAAAA    GGTTCTAGCAATGAC TGAGCTT GTCATTGTTAGAACC    TTTTTTACTAGATTG 100 86
CYG41_RS04045  799543 ..  799583 - -18.5  -2.70932   GTCTGCGTGTAAGGA  CCTTAAGCGCAATGGCC AAGTGCG GGCCATCACGCTTAAGG  CCACTTACACTCCGA 100 30
CYG41_RS04030  798337 ..  798348 -  -2.2  -3.21595   AAGGTCGATCATGAA                CCTG CTTG CAGA                 TTCAGCGGCGGTGTA  43 7
CYG41_RS04025  797335 ..  797361 -    -3  -4.30978   CTTAATTGATTAAAA        CCAGCAAAGCA AATGAA TGCGT-GCTGG         TTTTTTTGCTGTCAT  61 40
CYG41_RS04015  795772 ..  795791 -  -7.8  -5.00895   GCGAGTATAGAAAAA            CGGTCCCA ATTA CGGAACCG             TTTTTTATATGGTCA  95 55
CYG41_RS04000  792900 ..  792949 - -21.1  -5.38249   ACCAAGCATAAAAAA CGAAGGGCAAACGAATTTCTCCCA TGT CGGGA-AAATCCATTTGCCCTTCG TTTATTTTCTGTATG 100 50
CYG41_RS03845  761346 ..  761397 - -16.9  -2.65476   AGCATTGATTAGAAC CAAAAATGGCACTGCACAAGTTCG AATAG CGAACCTG-GCAGCGCCATTTTCA TGTCACCATGTTTAA 100 37
CYG41_RS03830 NONE
CYG41_RS03825  757274 ..  757286 -  -6.3  -3.59803   ACCACATCAAATCAA                GTTAG CTG CTAAC                GGCTATCCATCCCCG  61 314
CYG41_RS03810  754696 ..  754731 - -12.6  -4.83169   AGCCGGTTAGAAAAA    GAAGTCGCGGTGCTGTC ACT GATAGCGCCGCGACT-C    TTTTTAATGAAATGG 100 88
        nrdI  753666 ..  753692 -  -9.4  -5.69473   CAGATTATAAAAAAA         CAAGGCAAACAG AGT CAGATTGCCTTG         TACGGGGTCTCGATG 100 482
CYG41_RS03795  752569 ..  752608 - -15.9  -4.56358   GATAGGGAGACAAAA  GGCGAATGCATTTTCCA TATGTG CGGAGAATGCATTCGCC   TTTATTCAGTCATTA 100 38
CYG41_RS03760  745629 ..  745640 -  -4.4  -3.53444   TCATCGTTTTTTAAA                GCTA GGTG TAGC                 TTACCGCCAATTGAT  52 26
CYG41_RS03755  745129 ..  745167 - -23.4  -4.72386   GAAAGCATCCAAAAA   GGCAGTTGCGATACGATC TGT GATCATACCGCAACTGCC   TTTTGGTGTCATCGG 100 68
        pepF  742428 ..  742458 - -12.8  -3.67285   AGAATACAGGTCAAA       CAAAAACCGCAT GATAAAA ATGCGGTTTTTG       TCGTTCTTATGCCTG 100 32
CYG41_RS03735  739568 ..  739593 -  -5.3  -4.10657   GGATATCGTTGAAAA         CCCACCGTTGT CTTG ACTTCAGTGGG          TTCTGTGTTTTGTGA  65 130
CYG41_RS03725  738196 ..  738209 -  -8.1  -5.80364   AGTGCAACAAAAAAA               GAGCC AGCT GGCTC                TTTTTTTGTTGCTTT 100 40
CYG41_RS03710  735109 ..  735122 -  -5.2  -3.05327   CCTAAAAAAAAGTGA               GCGC GAGCCA GCGC                GGTTAGGGATCGGAG  52 125
CYG41_RS03705  734156 ..  734183 -  -4.9  -4.98522   AATCCTATATAAAAA        TCGATTCTAAC GTATTT GCTGGAATCGA         TTTTTTTCTGGGCAG  77 48
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         amt  645082 ..  645098 -    -3  -4.06502   TACCTTCAAATCAAA             TC-GCCA TCAG TGGCTGA              TACGTTATTCAGCGG  56 41
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        metF  602403 ..  602449 - -16.2  -4.36914   CGCTTGCGCACAAAA CCCGTTTTCTTTG-CGTGG ATTTAGCTGA CCACGGCAAAGAAAACGGG TTGCAGAGTGTGTGC 100 51
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        brnQ  580756 ..  580798 - -22.3  -4.22652   TGATAGCAGGTAAAA GGCAGGTACCGAAGACT TAGAAGTGC AGTCTTCGGTACCTGCC TTTTTATGGATTTAG 100 115
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         fba  531910 ..  531941 -   -16   -4.4084   AACGAGAGACGAAAA      GAACCCACTCGC AATTTTCA GCGAGTGGGTTC       TTTAAATAGTCTTTG 100 50
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CYG41_RS02380  471355 ..  471365 -    -4  -3.87869   TGAACGGGGCACAAA                 TGAA CGG TTCA                 ATCGAGAACTTCGCT  57 221
CYG41_RS02370  468236 ..  468253 -  -4.9  -3.88175   CACATAGGACAATAA             TGAATCC AAAT AGATTCA              GCTTTTTCCTGCAAA  59 471
CYG41_RS02365  467927 ..  467946 -  -2.8  -3.41795   AAATTTGCACCAGAA            CCGTG-GCT TTA ATCACACGG            GAAAACAGGTGTAAA  48 18
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        menC  434302 ..  434345 - -17.7  -3.65812   TTTTTCTCAAGATAA TTCCAGAGCCTGTATGTGC AGATGA ACATATACAGGCTCTGGAA TTTAACTAATCACGT 100 66
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        pepT  364809 ..  364831 - -11.3  -4.66163   AGTTGCACGCAAAAA           GCCCCATGC TGTTT GCATGAGGC           CGAGTGGATAGAGAG 100 91
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        lepB  302799 ..  302838 - -15.9  -5.53991   CAGCGATCAAAAAAA  TACCATCCGCCGTTACT GAAGTG AGTAACGACGGGTGGTA   CTTTTCGTGTATCTT 100 46
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        brnQ  296333 ..  296366 -  -6.1  -4.60041   AGTTAGTGTCAAAAA     GCATGGCCAC-TTC GGTATTT GAAGGCGACCATGC     TTTTTTGTGTCTTAT  77 73
        pepF NONE
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CYG41_RS00470   93606 ..   93616 -  -6.8   -4.2651   AAATATTGAAAATAA                 CCGT TAA ACGG                 TACTAGTTCGCCGAT  74 28
CYG41_RS00465   93227 ..   93273 - -15.4  -3.68222   TTCCAAGGCGAATAA CAACAAAGGACACAACCG GTTTTGGTCTG CGGATGTGTCCTTTGTTG TTATCAGTCAGGATT 100 29
CYG41_RS00455   91603 ..   91621 -    -3  -4.55689   ATTACTCACAGAAAA             CGCCCGTA AAA TGCAGGCA             TTGGAAAAGCAAGCG  65 408
CYG41_RS00430   87568 ..   87609 - -15.4  -3.21747   TTACGTGACGAGTAA CAAAAAAACCGAGATCAC TAAACT GTGATCTCGGCTTTTATG  GCGGCCTGATTCATC 100 36
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CYG41_RS00415   85299 ..   85322 -    -3  -2.71089   TAGAAATGCAAACAT          GGTCACACCT CCTT AGGTGCGTCT           CGGGTATCTTCAGTT  42 4
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CYG41_RS00400   83022 ..   83041 -  -6.4  -5.27779   TTGAACATGAAAAAA            GACGACTC GGGT AAGTCGCC             TTTTTACTGTTTGCT  89 50
CYG41_RS00395   82414 ..   82471 -  -4.3  -4.60041   AGTTACCTTGAAAAA CCGAATCAAGATCCAATAACGAAAG ATCAAGTG CTTTCTGTATTTGGTTTTGATTCGG CAAAGTTTCCTGACG  68 100
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CYG41_RS00375   78860 ..   78877 -    -7  -5.71712   GCCCATACAAAAAAA             GCGTTG AAAAAA CAACGC              TTTATTCGAGACTAT 100 46
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CYG41_RS00365   74743 ..   74771 -  -9.6  -5.53991   CAGGGACGAAAAAAA        CACCTGTCGCAT TGATG AAACGACAGGTG        TTTTTGTTGCTGCTG 100 97
CYG41_RS00350   71864 ..   71880 - -10.9  -3.39895   GTTTCTATCAATTAA              CCTGATG CAG CATCAGG              TCACTGACGACGATA  81 303
CYG41_RS00345   70393 ..   70419 -  -6.5  -5.58454   TTGACATTAAAAAAA         CGCAATCCATG ATTTA CATGGCATGCG         TTCCGTAAGTCCATA 100 72
CYG41_RS00315   62870 ..   62880 -  -3.2   -5.1971   ATTAAAAAGGAAAAA                 GTCG AAT CAAC                 AACAGTTATCCGCGT  75 150
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        uxuA   59688 ..   59704 -  -2.1  -3.64703   GTGGGTCCATTCAAA              CACAGGG TTG CCCCAAG              CATTTTCCATGGTTT  49 317
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         eda   56618 ..   56654 - -12.4  -4.67692   TCAAAACTAAATAAA    GAGGCTCTAGGGAC GATTGAAGT GTCCCTAGAGTCTC    TTTTTGGCTGATGGT 100 250
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CYG41_RS00260   46118 ..   46145 -  -9.9  -5.42259   CGATCCTCAAAAAAA        CCGAACCAACA AGGTGG CGTCGGTTCGG         TTTTCCATCAGTCGC 100 101
CYG41_RS00250   44346 ..   44371 -  -6.7  -6.06723   GGCCTCAAAAAAAAA         GGCACGCCAGC TCTC GTCGGTGTGCC          TTCCTTTTTAAACCT 100 138
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CYG41_RS00180   31417 ..   31437 - -14.7  -5.21709   TTTTACATGAAAAAA            GCAGCCGCG ATC CGCGACTGC            ATGACAAAATTGTAA 100 42
CYG41_RS00175   29882 ..   29926 - -11.8  -5.46276   AATACACATAAAAAA TAACCCTCTGAAC-A-TGTCTT CAA ATGACAGTTGTTCAGAGGGTTA TTTAGTTCAACGGTA 100 100
CYG41_RS00160   25504 ..   25516 - -10.5  -3.72576   TTTGCCTTCATGAAA                GGCCC TTT GGGCC                TTTCATTGGTGCGGA  79 428
CYG41_RS00130   20129 ..   20141 -  -4.9  -3.97088   TTTTATAAGAGTAAA                TTACA CAA TGTAA                AATTTAGCTATACCT  61 392
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CYG41_RS00080   12824 ..   12853 - -12.9   -4.7078   TCAAGTATTTAAAAA       GGATGTTCCCGCT AAAA AGCAGGAGCATCC        TTTTTTTGGTGAGCG 100 120
CYG41_RS00055   10651 ..   10667 -  -2.3  -3.68886   AGCAATTCACGCAAA              CAGAA GTAAGCG TTCTG              AATAAGCAACAATAA  49 162
CYG41_RS00040    9186 ..    9222 - -10.9  -4.41895   AAGCGTCAATGAAAA    TACCGTTCGAATGGGTA GTT TGCCAGTTCGAACGGTA    TTTTTGTGCCTCGTT 100 315
