LJP71_RS00020    4304 ..    4317 +  -3.9  -4.11216   ACTTAAAATTAAATA               GATAA TTTC TTATC                TTTTCAAACTAACAA  56 202
LJP71_RS02905    4920 ..    4939 +  -6.5  -4.45544   TGTGAGGGCAATTAT            CTTGGTT ATTCCA AACCAAG             TTTTAGTTCCTCCGA  75 442
LJP71_RS00025    6132 ..    6144 +  -4.9  -3.19463   GAAAAATAATGGTTT                TTCTT TGA AAGAA                TTAATGAATGCTGAA  53 124
LJP71_RS00030    6358 ..    6380 + -10.8  -3.11416   GGTGGTAATAAATAA           TTTTGGTTTT TCC AAAACCAAAA           CTTTAATTCTTTTAC  85 89
LJP71_RS00045   10035 ..   10045 +  -2.6  -4.08767   TTTTTGATATTTAAA                 TATT TTT AATA                 TTTTAAAAACATCAA  51 27
LJP71_RS00050   11373 ..   11396 +  -4.1  -5.19251   CAACTTTTTAGTTAT          TAAAAAATA TAAATT TATTTTTTA           TTTTTGTTGCTATTA  70 86
LJP71_RS00055   12745 ..   12789 + -14.1  -3.08374   ATTATAAAGAACAAA AAAAAGATCAAATTATTTATT TTT AATAAGTAATTTGATCTTTTA ATATTTTATTTATTA 100 40
        rpsF NONE
LJP71_RS00065 NONE
        rpsR   14304 ..   14319 +    -4  -6.15536   ATCCAACAATAAAAA              CAGG-TG TTG CATCCTG              TTTTTTTTATTAATT  86 29
        rplI NONE
        dnaB NONE
        prfA NONE
LJP71_RS00090   20436 ..   20449 +  -3.9  -3.24324   TAAGGTTTGATACAT               TTGAT AAGC ATCAA                TATAATTTTGTTTTA  49 382
        yihA   22002 ..   22025 +  -2.6  -3.74872   AACTTTTTCACTTTG          CAAAAAAAAT TGTA ATTTTTTTTA           TTTCCTCCAATCCAT  47 86
LJP71_RS00105 NONE
LJP71_RS00110   25516 ..   25526 +  -3.2  -2.52946   TTTTTTATTTTATAA                 CTTC AAA GAGG                 AATTTTATGCCAAAA  42 66
LJP71_RS00115 NONE
LJP71_RS00120   28192 ..   28209 +    -2   -5.9218   TGAAAAATTATAAGA             TCAACT CTAAAA AGTTGG              TTTTTTTGTTATATA  76 83
LJP71_RS02910 NONE
LJP71_RS02915   29062 ..   29078 +  -3.8  -3.35798   TTGAAGCCAGATTAT              CTATTA ATGGA TAATAG              TGATTTTTCGTTTAA  49 82
LJP71_RS00150   36970 ..   36988 +  -8.9  -6.08342   AAATAATTTATAAAA             GACCTCT TTTTT AGAGGTC             TTTTTTTGTTTATTA 100 52
LJP71_RS00155   37566 ..   37589 + -11.2  -4.73614   TGAAGCATTTCACAA          TAACCTCTTA TAAA TAAGAGGTTA           TTTCTTTTAATAATA 100 106
LJP71_RS00165   41625 ..   41641 +  -9.5  -5.13344   AAATAAACAAAAAAA              GAGACTT AAA AAGTCTC              TTTTTATCTTAATAT 100 94
        nrdE   45350 ..   45368 +  -5.3  -5.95946   TTTTTGCTAAAATAA             GGCTATC AAATG GATAGTC             TTTTTTTATTCTTAA  90 159
        nrdF   46679 ..   46696 +  -2.7  -6.09196   ACAATAAAAAAAAAG             ACTAGTT TTTA AACTAGC              TTTTTTTGTTTTAAA  80 51
LJP71_RS00190 NONE
LJP71_RS00195   47581 ..   47597 +  -2.9  -3.18505   ACTTTATTTTGGTAT              CTTAGTG TTG CCCTGAG              GTTTGATTTTTAGCA  42 10
LJP71_RS00200   48161 ..   48180 +  -3.7  -4.11394   AACATGCTTTGCATT            GTTATTT AAAGAA AAATAAC             TTTTGGCACTAAAAT  56 7
LJP71_RS00205   49705 ..   49724 +    -3  -3.81322   TGATAAAATAGTTTC            TTATAAGA TGGT TTTTATAA             ATTTTTTATCCTTAA  47 186
LJP71_RS00210   50598 ..   50623 + -10.6  -5.10064   AATTCATAATTATAA         CCTCAAACTA TTTACT TAGTTTGAGG          TTTTTATATCTTACA 100 148
LJP71_RS00215   51198 ..   51212 +  -2.2  -5.34055   AAAACATCCCATTTT               TGATTT TTC AAATTA               TTTTTTCATATTTGT  66 384
        mscL   51876 ..   51892 +  -8.1  -5.83226   AAAGCAATTATAAGG              GACTATT TTT AATAGTC              TTTTTTTATTACGTT 100 83
LJP71_RS00225 NONE
LJP71_RS00230   55565 ..   55588 +    -9  -4.64613   AATATTAAATATAAA          GATCAACTAT AAAA ATAGTTGGTC           TTTTCCTTATTTGTA  89 52
LJP71_RS00235 NONE
LJP71_RS00240 NONE
LJP71_RS00245   57510 ..   57531 +  -6.1  -4.37502   TTTGAATATAATTGT           TTAATTAAA TATT TTTAATTAA            TTTTGCTGTCCTAAT  72 427
LJP71_RS00250 NONE
LJP71_RS00255   58532 ..   58558 + -12.5  -5.47159   ATCAAATATACTAAA         TAAGACTCTCA TTTAT TGAGAGTCTTA         TTTTTATTTATTACC 100 108
LJP71_RS00260   60803 ..   60822 + -10.8  -5.33331   AATAATAACAAAAAA            GCTAGCTT CAAC AAGCTAGC             TTTTTCTTATATTTG 100 70
LJP71_RS00270   62172 ..   62184 +  -6.3  -3.09112   AAAGTAATTTCATTA                CACTT AAA AAGTG                TCTAATGTTTTTTCA  59 349
LJP71_RS00285   63478 ..   63499 +    -3  -2.73364   GTCGGAGGAACTAAA           ACTTGGTT TGGAAT AACCAAGA            TAATTGCCCTCACAC  39 502
LJP71_RS00310   65879 ..   65894 +    -9  -4.25873   AATATAGAAACTAAA              CCCCTT TTTT AAGGGG               TATTTTTTATACCCA  84 43
        dnaB NONE
        ltrA   69868 ..   69880 +  -4.9  -3.01712   ATGTAATAAGGATCC                TTTCA AAA TGAAA                TATTAAACAAAAAAG  52 181
LJP71_RS00330 NONE
LJP71_RS00335   71069 ..   71089 +  -7.6  -2.57013   CAAAAATGAAAAAAA           GA-CCCCTC ATTT GAGGGGGTC            TAAATTAGGTTAAAA  65 78
LJP71_RS00345   73266 ..   73277 +  -4.4  -5.14985   CTTGGGTTTTGCCAT                CTAC AAAA GTAG                 TTTTTATGTGTTTGC  73 255
LJP71_RS00445   95656 ..   95671 +  -7.6  -3.14564   TTGCAACTGCTTTAC              CTAGGA TATG TCCTAG               TTCCTCCACGAGTCC  68 172
LJP71_RS00450 NONE
LJP71_RS00455  100636 ..  100646 +  -2.6  -4.70739   TTATACTGATATTAA                 TTAA ATG TTAA                 TTTTAATTGTTTTTA  57 196
LJP71_RS00460 NONE
LJP71_RS00465  103538 ..  103561 + -11.1  -4.76478   TATTTATTAAAATAA          CCCAAACTG CAATTA CAGTTTGGG           TTTTCCTTTCTTTTG 100 60
LJP71_RS00470  104339 ..  104352 +  -2.5  -3.18869   GAGTTTCCATAATTT               TATTT TTAC AAATA                TTACATAATTTATTA  42 96
        rpsT NONE
LJP71_RS00480  105201 ..  105216 +  -3.4  -3.29063   TTATTATTTGCTTAT              TATTTA TTTA TAAATA               CTTTTACATTTTTCT  46 52
LJP71_RS02925  105491 ..  105506 +  -6.2  -3.98826   TCCTACAGGAAAACC              TTCTTC TAGT GAAGAA               TTTCTACATTGGTGG  66 78
        serS  106998 ..  107031 +  -4.8  -3.89587   AATTTAGAATATAGA     GTCGAATC-TTTTAT GAAAA ATAAAGTGATTCGGC     GTTTTTTATTGGTAA  60 63
LJP71_RS00490  107493 ..  107510 +  -3.5  -3.73107   AATTTATTTTATAAT             CTTTAAT ATTT ATTAGAG              TTTAAGATTTGCTCC  50 41
LJP71_RS00495  108637 ..  108659 +  -2.9  -5.72207   TTTAATAAGATATGT           TATAATAAT GTATG ATTATTGTA           TTTTTTTGGTTTGGC  73 58
        rplU  109069 ..  109083 +  -2.9  -2.61322   CCTATACTAAACTTT               TGATT ACTAA AATCA               CTGTTTAAAAACTAT  39 3
LJP71_RS00505 NONE
        rpmA NONE
        obgE  111157 ..  111173 +  -8.1   -5.4505   AATAAACAAATGCAA              GATCTTA ATA TAAGATC              TTTTTTATTGCCCAA 100 175
LJP71_RS00520  111851 ..  111867 +  -3.8  -2.57654   ATATTGTCCTACTTG              TTTACA AAGAA TGTAAA              ATATTGTGGATTGTT  44 10
        rnpB  112527 ..  112546 + -10.8  -4.12405   TTTATAAACAAAAAA            GCCAAACT GTAA AGTTTGGC             TTTCATTGTCTTTAT  95 219
LJP71_RS00535 NONE
LJP71_RS00540 NONE
LJP71_RS00545 NONE
LJP71_RS00550  119229 ..  119240 +  -4.4  -4.40173   ATAAAAAAAATTAAC                CCTT TGCT AAGG                 TATTTTTTTAGCTTA  64 132
LJP71_RS00555  120827 ..  120853 +  -6.8  -3.24755   ACGAAATAAAAAGGA         GATTAATTTTTA TGT TAAAAATTAACC         ATTTATTTAAAAAAT  63 151
LJP71_RS00595  127555 ..  127588 + -10.5  -3.14132   ATTTTACAGATTTCA     CATTCTATGGCTGACA ATC TGTCGGTCA-AGAATG     TTCCTCCACACAGAA  81 238
LJP71_RS00605  130725 ..  130742 +  -4.2  -3.78087   AACCCCTTATAATTT             GTTCAA ATATAA TTGAAC              TTTAACCTTTTGGTT  56 60
LJP71_RS00610  132700 ..  132729 +  -6.5  -3.13164   GATATAATAAAAGTG       CTTTGGCACTAAA TAAT TTAAGTGCCAAAA        TTAAATCATTACAAA  63 478
LJP71_RS00615  133121 ..  133139 +  -3.3  -3.37796   AATAAAAAGACAATA             TTTTAAA CTTTT TTTAAAA             TTATAAATCATAAAA  47 84
        groL NONE
LJP71_RS00625  135740 ..  135757 +  -8.5  -6.28967   TCATTATTTAAAAAG             CTAGGTT TTTT AACCTAG              TTTTTTTTATTTATC 100 51
LJP71_RS00630 NONE
        mnmA NONE
LJP71_RS00640  141639 ..  141649 +  -2.6  -4.11183   CAAAGAATCAATAAT                 TAAA TAA TTTA                 TTATTTATAATGCAG  51 23
        hisS NONE
        aspS NONE
        tilS  146358 ..  146380 +  -2.1  -3.73224   AAATTAAACTCCAAA           CATTAAAAT ATTTG ATTTCAATG           TTTACTCAAAGATAA  46 85
        ftsH  148510 ..  148539 +  -6.6  -3.48438   TATCTTTACAATTAA       CACCAATTTTAA GTTTGA TTAGAGTTGGTG        TTCGTTATGATAATT  66 98
LJP71_RS00665  149625 ..  149635 +  -2.6  -5.52986   TTATCATTTGTGTTT                 TAAA CTT TTTA                 TTTTTTTCATCCACT  70 66
LJP71_RS00670  150439 ..  150453 +  -5.8   -3.1552   TTATCATACAAATGT               TTTTGT CCA ACAAAA               TATTAATAAATAAAA  56 66
LJP71_RS00675  151511 ..  151525 +  -5.6  -2.72096   AATATTTAGGCCAAA               CAGGCG CTG CTCCTG               CTTCTAATTAATGGA  53 0
LJP71_RS00680 NONE
LJP71_RS00685 NONE
        rpsO  153005 ..  153023 +  -4.6  -6.23317   AATTAATAATTCAAA             TATCACAG CTT TTGTGGTA             TTTTTTTATTTTTAT  90 35
LJP71_RS00695  154017 ..  154039 +  -6.4  -4.94992   TTCATATCTAAATTA           CAAAAGATTT CAT AACTCTTTTG           TTTTTGTCGCTTTCA  80 354
        rplM NONE
        rpsI  154985 ..  155005 +  -2.6  -5.91981   ACGTTAATCCAAAAA            AGAACTTT GTCAA AAAGTTCC            TTTTTTTTAAATTTT  76 34
        gltX NONE
        cysS  158034 ..  158047 +  -3.8  -4.88711   TTATTTAGAAAAAGA               CCTC TTAATT GAGG                TTTTTAATATATTAT  64 151
LJP71_RS00720  159756 ..  159779 +  -9.8   -5.7946   TTTGTTATATGGAAA          GATTAACTTT TGCA AAAGTTAATC           TTTTTTTGTTGAAAA 100 61
        thiI NONE
LJP71_RS00735 NONE
LJP71_RS00740  165299 ..  165315 +  -6.7   -3.6993   CTTCTTATATTTTTG              CAAATAA AGT TTATTTG              TGTTTTGCCTCCATA  68 45
        smpB  166117 ..  166140 +  -8.4  -5.50313   TTGCAATAATAATGA          TACAAAATAA TTAA TTATTTTGTA           TTTTTTGCTTTTATG 100 159
LJP71_RS00750  168176 ..  168197 +  -3.1  -6.14618   ATCAAAAGATAAGAA           TGGTG-TTTG TAA CAAATCACTA           TTTTTTTATTTTGTA  83 153
        nusA NONE
LJP71_RS00760 NONE
        infB NONE
        rbfA  172086 ..  172098 +  -3.5  -3.53224   ATTTTGTTATCTTTG                TTATT AAA AATAA                TTTGCGCACAAAATA  49 121
         pth  172924 ..  172967 + -11.4  -5.18297   AAAAATTTATAAAGG TATAAAAAAAGAGCAAATAT GAAA ATATTTGCTCTTTTTATTTA TTTTATTTCTTCTTG 100 92
LJP71_RS00795 NONE
LJP71_RS00800  179550 ..  179563 +  -2.5  -2.93381   ATTTTTAAAAGATTT               TTTTA AAAA TAAAA                TAATTTAACAATTTC  40 4
LJP71_RS00805 NONE
LJP71_RS00810 NONE
LJP71_RS00815 NONE
LJP71_RS00830  184954 ..  184974 +  -7.6   -6.4275   CCTAGTCTTAATTTA           GACCCCCTC AAAT GAGGGG-TC            TTTTTTTTATTTTTA 100 213
LJP71_RS00835  186331 ..  186347 +  -5.9  -4.24338   TATCTTTTTGAAATA              TGGTAGT TAT ATTACCA              TTTTGAGCTATTTTT  70 127
LJP71_RS00845 NONE
LJP71_RS00850  189691 ..  189715 +  -2.8   -3.3422   TAATTAAATCACAAA          CCCAATCACT TTTAT AGTTTTTGGG          CTTTTTGGAGGAATA  44 41
LJP71_RS00855  190216 ..  190230 +  -3.6  -4.56133   AATCAAGGTATAATA               TTCTAT GTT ATGGAA               TTTTAATTATTAAAA  62 432
LJP71_RS00860  190320 ..  190330 +  -2.4  -2.54325   GTTCGATTCCCACTA                 GCCG CCC CAGC                 ATATATTTCACAAAA  38 17
LJP71_RS00865  190487 ..  190499 +  -2.7  -3.95153   TCCAGCTGGGTCTGC                CATTT TAT AAGTG                TTTATGAGTGATTAA  49 24
LJP71_RS00870 NONE
LJP71_RS00875  190972 ..  190990 +  -6.2  -2.83915   AGTTTTATGATAAAA             TAAATATA AGC TATATTTA             AGTTTTTTATAAAGC  58 282
LJP71_RS00880 NONE
LJP71_RS00885  192366 ..  192384 +  -4.6  -6.11392   CACTTTTCATCACCA             TTAAACGC TGT GAGTTTAA             TTTTTTTATTTGTTT  93 488
LJP71_RS00895 NONE
LJP71_RS00900  194406 ..  194428 +  -3.6  -4.17748   GAATCTTTAACTTTT           TTATAATATT TTT AATTTTATAA           TATTTTTAATTTTAT  56 31
         dut  195528 ..  195540 +  -6.3  -4.22948   GAAATAAAAACTTGA                TGATG CAT CATCA                TTTTGGATCAATTTT  70 449
        rpsB NONE
         tsf  197503 ..  197513 +    -4  -3.07029   AACTCAAATTTAGAC                 TCTT TTA AAGA                 TGTTGCAGATGTTTA  46 77
        pyrH NONE
         frr NONE
LJP71_RS00930  199878 ..  199888 +  -2.6   -5.0065   TTTGCCCTTGCCTTG                 TTAT GAT ATAA                 TTTTATTTGTAAATG  62 90
        tpiA NONE
LJP71_RS00940  201927 ..  201939 +  -3.5  -5.82281   ATTTTTACTTACTTT                TATAA TTT TTATA                TTTTTTTCTCTGTTT  80 77
         fba  203066 ..  203076 +  -2.6   -5.2696   ATATAGCTACAATTA                 TAAA AAA TTTA                 TTTTTTACATTTTAG  64 88
LJP71_RS00950 NONE
LJP71_RS00955 NONE
         gap  206116 ..  206141 +  -6.3  -5.16038   ACAAATAAAACTCCT         TAGATCATTTT TTTG AAAGTGGTCTA          TTTTCTTTATTCTCT  80 64
LJP71_RS00965  207590 ..  207615 +  -5.5  -3.52111   ATTTGGATTTGGTAT         GATATCAGGGT TAAT ATCCTTATATC          TTCTCATCCTTTTAA  60 484
LJP71_RS00975  210482 ..  210494 +  -3.3  -3.51168   AATAAAATTAAACTT                GCCAC GCC GTTGC                TATTTAGATATTTTT  49 108
LJP71_RS00980  212315 ..  212330 +  -6.2  -3.35542   GATTTGCGATTCGTT              GCAAAA GTGG TTTTGC               CTTTTTCAAACTAAC  61 110
LJP71_RS00985 NONE
LJP71_RS00990  214062 ..  214074 +  -3.5  -3.63341   CCCTTGCCCAATATT                TAAAA GAA TTTTA                TTGTTAAAAGGTATT  49 6
LJP71_RS00995  215129 ..  215141 +  -3.5  -3.50737   ATTTTTGCTCTATTG                TTTAT CAA ATAAA                TTCGTATTTGTAAAT  49 14
LJP71_RS01000  216525 ..  216536 +    -3   -5.4833   TAAAAATAATTATTT                TGTA ATCC TACA                 TTTTTTCTTGCCTAA  70 66
        rsgA NONE
        ychF NONE
        ileS NONE
LJP71_RS01020  223629 ..  223650 +  -7.4  -6.17669   CAAAAAGAAACGAAA           CTAAACTG CTAAAA CAGTTTAG            TTTTTTTATTTTATT 100 14
LJP71_RS01025  226547 ..  226565 + -10.4  -5.86465   TTAAAAAACAAAAAA             GACTCTTT TTG AAAGAGTC             TTTTTTTATATTCTT 100 43
        ltrA  242295 ..  242313 +  -7.6  -3.34541   TAGAGTCTCTTTTTT             TACTTTTA TTT TAAAAGTA             CTTTTGATTTGATAG  70 509
        rpmF  244487 ..  244503 +  -2.4   -5.8187   TCATTATTAGACAAA              TTATTT TGTTT AAATAA              TTTTTTTCTTAGATG  76 45
LJP71_RS01095  245461 ..  245480 +  -3.7  -3.78409   TTCATTAAATCATTT            TATCTTT TAATAT AAAGATA             TTTGAATTAACTTAA  52 428
        rpsJ  246171 ..  246186 +  -2.6  -5.25803   ACTATTCATTTTAAT              GTGAAT AAAT ATTTAC               TTTTTTATAACCATT  64 59
        rplC NONE
        rplD NONE
        rplW NONE
        rplB NONE
        rpsS NONE
        rplV NONE
        rpsC NONE
        rplP NONE
        rpsQ NONE
        rplN NONE
        rplX NONE
        rplE NONE
        rpsN NONE
        rpsH  253181 ..  253213 +  -2.2  -2.71144   GTGGCGAAGTTTTAG     CTTAT-ATTTGGTAA TTAA TTGCCAAATCAAAAG      TAGTTAAAGGAGATA  38 12
        rplF NONE
        rplR NONE
        rpsE NONE
        rpmD NONE
        rplO NONE
        secY NONE
LJP71_RS01210 NONE
         map NONE
        infA NONE
        rpmJ NONE
        rpsM NONE
        rpsK NONE
LJP71_RS01240 NONE
        rplQ  260704 ..  260729 +  -4.1  -5.63374   CTTAAATTATCAAAA         CCTTCTT-ATCT TAA GGATTAAGGAGG         TTTTTTTAATATTAA  79 81
        truA  261589 ..  261599 +  -2.6  -4.03308   ACACAAAAAGGAGAA                 TTTA TAC TAAA                 TGTTTATTTCTTTTG  51 63
         tmk NONE
LJP71_RS01260 NONE
        rsmI NONE
        metG NONE
LJP71_RS01275 NONE
LJP71_RS01280  268600 ..  268610 +  -5.4  -3.05247   GAAAGCAAAATCAAA                 CGTT ATG AACG                 GATTTTTTTTAGTCA  55 55
        truB NONE
LJP71_RS01290 NONE
         cmk NONE
         der  272557 ..  272576 +  -6.5  -4.56187   TGATTTAATTATAGT            GGTTGAA AAAAAA TTCAACC             TTATTTTTAATTATC  77 123
LJP71_RS01305  273748 ..  273766 +  -3.2  -3.19513   AATGCAAATAATTAC             CAATAATT TAA AATAATTG             TTGGATTGCGCTTGT  46 111
LJP71_RS01310  274166 ..  274181 +  -6.2  -5.95539   TTTACAATAAAAAAA              CAAACT AACT AGTTTG               TTTTTTTATTTACAC  90 68
LJP71_RS01315 NONE
LJP71_RS01320 NONE
        rpmG  275870 ..  275894 +  -2.3  -3.90744   AAAAAAGAAACATTA          TTTTGAAAATT AAA AATTTTTGGAA          TTATTTCCCAAAGCA  48 172
LJP71_RS01330  277362 ..  277375 +  -3.8  -4.61231   TTAATTATAACAAAC               TCGC ATTAAA GCGA                TTTTTGGCCCTGTAG  62 42
LJP71_RS01335  277473 ..  277484 +  -2.2  -3.19966   ATTTTATTTTTTTAA                TCCA CTTT TGGG                 ATATTTTTTTAACAC  41 43
LJP71_RS01340  277748 ..  277768 +  -4.2  -3.24022   AATAAATATCTGGTA            TTTTTTTA ATCAA TAAAAAAA            CTTTTATCCCCCTTT  51 73
        proS  279599 ..  279609 +  -2.6  -5.30575   TTTTCTTTCTTTTTA                 TAAA CAT TTTA                 TTTTTTACATTTTTA  67 120
        rpmH  279905 ..  279928 +  -9.7  -3.83771   AATTCAAACCAAAAA          TAAACACCG CTTTTT CGGTGTTTA           TTTGATAAATTTCTT  86 65
        rnpA NONE
LJP71_RS01360  282091 ..  282117 +    -6  -3.56836   GTTCTTAATTTTCAT         CCTTATATAAAA ACC TTTTATAAAGGG         TTTGCAAAATAATTT  63 126
LJP71_RS01365  282561 ..  282572 +    -3   -4.4009   ACCAAAAAGCAATTT                TTGA TGCA TCAA                 TTTTGTAACATACGA  55 120
LJP71_RS01370  284174 ..  284197 +  -6.2  -4.60746   TTTTTCATTGTAACT          TGCTTGCAAAT TGT ATTTGCAA-CA          TTTTAATCTTTTTAA  74 86
LJP71_RS01375 NONE
LJP71_RS01380 NONE
         rrf NONE
LJP71_RS01390 NONE
LJP71_RS01395  287629 ..  287641 +  -6.3  -2.67047   ATTAAGTCAATTTTA                CAATC AAT GATTG                GCTTATTTTTTTAAC  57 102
LJP71_RS01400 NONE
LJP71_RS01405  292536 ..  292546 +  -2.6  -3.53012   AAGAAAACAAATAAT                 TAAT ATG ATTA                 TTTACGGAAAAAACC  45 27
        rlmB  293383 ..  293395 +  -3.4  -5.34632   CCCCGGGATATTTTT                TTGC ACAAA GCAA                TTTTTATATTTTATT  70 161
        rpmG NONE
        secE NONE
        nusG  294890 ..  294907 +  -4.3  -2.77013   CGTTCCAAAGAAAGG             TTTTTTA TGGC TAAAAAA              GTTGTTAAAACGGTA  49 217
        rplK NONE
        rplA NONE
        rplJ NONE
        rplL  297106 ..  297121 +    -9  -5.27779   TAAGTAATATAAAAA              CCTGAG TTTT CTCAGG               TTTTTTAGTCTTGCA 100 53
LJP71_RS01450 NONE
        rpoC NONE
        rpsL NONE
        rpsG  306156 ..  306166 +  -3.2  -2.54166   TATAGGAGAATAAAA                 GATG GCA CGTC                 AGTTTTCATTAGAAA  42 49
        fusA NONE
         tuf  309574 ..  309588 +  -6.4  -5.41787   TATTAATAAATAAAA               TCCACA TAA TGTGGG               TTTTTATCTTTTTTA  87 61
LJP71_RS01480  310788 ..  310807 + -10.8  -6.19302   AAAGAAAATAAAAAA            GATCACGA ATAT TCGTGATC             TTTTTTTTATTATAT 100 30
LJP71_RS01505  314817 ..  314827 +  -2.6  -5.27709   TTAGGCATTTATATT                 TATT TTT AATA                 TTTATTTTTTTGTCC  67 91
LJP71_RS01510  316186 ..  316198 +  -3.5  -3.71369   ACATTATTTTAACAT                TATTT TGC AAATA                CTTTTTTGAGTTATT  50 64
LJP71_RS01515  316850 ..  316884 +  -4.4  -6.20267   TTAAATATTTTTCAT     TACAAAAGCTAATCTT TTT AAGGTTAGCTTTTCAG     TTTTTTTATTTTTGC  90 98
         rny NONE
LJP71_RS01525  319770 ..  319783 +  -2.5  -3.78556   ATTTTATTCTGGTTT               TTTAA TTAT TTAAA                TTATTAAATTATTAT  47 138
        miaA NONE
         efp  321413 ..  321427 +  -8.6  -5.86976   AAACACCTTATTTTT               GCAGTT GTA AACTGC               TTTTTTGTTTTATCC 100 40
LJP71_RS01540  322407 ..  322425 +  -3.2   -2.8829   AAGAAATAGGTTTAA             CAATGAAA ACA TTTAATTG             GTTTCCTGGTCATAT  43 53
        ylqF NONE
        topA  325404 ..  325421 +  -8.5  -5.42514   TTATATAACAAAAAA             GACTATC AATC GATAGTC              TTTTTTAATTTATGA 100 99
LJP71_RS01560  329113 ..  329127 +  -2.9  -2.72344   AAATATTGTATTTAT               CAAAA TTAAT TTTTG               TACTTCCAAATCCCA  39 56
LJP71_RS01565 NONE
LJP71_RS01570 NONE
         eno  333655 ..  333670 +  -4.7   -3.6692   TTATTATTGACAAGA              CCATC GTTTAA GATGG               TATTTTGAGGTAGGG  58 104
        gpmI  335276 ..  335295 +  -4.4  -3.70438   CCATAATTAATTATT            TAAGTGAT TTTG ATTACTTA             TTTAGCTAATAATTT  56 66
LJP71_RS01585  336805 ..  336829 +  -4.4  -2.63365   TTTTATATGTCATAA          TGTCATAATT TAACT AATTTTGACA          ATCATTTTTATATTT  48 26
         pyk  338307 ..  338332 + -10.6  -6.17292   TTATATTAAAAAAAA         CAGTAGATTG AATTTA CAATCTACTG          TTTTTTTTTAAATTT 100 119
        pepV NONE
LJP71_RS01610 NONE
LJP71_RS01615 NONE
LJP71_RS01620  344870 ..  344880 +  -2.6  -4.57073   TAAAGAAAGGTTTTA                 TAAT ATG ATTA                 TTTTTAAAACAACTG  57 122
LJP71_RS01625  345311 ..  345359 + -15.1  -3.69621   AGAATAAAATTTTTC ATGATATAATAAAAAAACACCTT TTA AAGGTGTTTTTTTATTATATAAC TTTGAAATTATAAAT 100 34
LJP71_RS01675  354018 ..  354074 + -17.3  -3.61328   ACAAAATAATATCAT TTTATAAAATATAAAAAAGTTAACTTA TTT TAAGTTAACTTTTTTATATTTTAGGGA TTTGGCAATATTAAT 100 32
LJP71_RS01695 NONE
LJP71_RS01700  359061 ..  359072 +  -2.2  -3.41254   TAAAAAGATAAAGAT                CTCT TTTG GGAG                 CTCTTTTTTTTATTT  43 45
        plsY NONE
        ligA NONE
        whiA NONE
        acpS NONE
LJP71_RS01795  378152 ..  378178 +  -7.4  -5.83226   AAAAACACAACAAAA         CATTGTTTGTTA TAA TTACAAACAGTG         TTTTTTTATTCCATT  95 102
LJP71_RS01800 NONE
LJP71_RS01805  379342 ..  379362 +  -6.2  -6.17669   AAATAATTTTTTAAA            GACTTTTC TAATT GAAAGGTC            TTTTTTTATTTTATT 100 35
LJP71_RS01810  380661 ..  380679 +    -6  -5.22794   TTAAAAACAAATTAA             GATCGACT TTA AGTTGGTC             TTTTTTGCTAATTAT  80 98
        lepA  382976 ..  382996 + -11.3  -5.67711   AGAATATTGAAAAAA            CTCCTTATA ATA TATAAGGAG            TTTTTGTTTTATTTA 100 63
LJP71_RS01820 NONE
LJP71_RS01825  386631 ..  386649 + -11.8  -5.47431   TATAAAAACAAAAAA             CACCATCT TAA AGATGGTG             TTTTTTATATCTTAA 100 147
LJP71_RS01845  394799 ..  394811 +  -3.5  -4.03234   AATATGATAAACATA                TTAAA AAT TTTAA                TTTATATCAGCAACA  54 181
LJP71_RS01850  395089 ..  395109 +    -7  -6.08563   ATATAAAGATAAAAA            CTATTTTC ATTAA GAAAATAG            TTTTTTTTATATCTT 100 65
LJP71_RS01860 NONE
LJP71_RS01865  398478 ..  398503 +  -4.1  -5.79588   TAATTTATTATTTAA         CAACTCTTT TGCAAATT AAAGGGTTG          TTTTTTTAATTTTAA  79 458
        argS  400666 ..  400677 +  -4.4  -6.09196   AAATCCCAAAGAAAA                GTCT GCAA AGAC                 TTTTTTTATTTTGGC  89 79
LJP71_RS01875  402668 ..  402679 +    -3  -3.62539   GAATAGAAAAGGAAG                TGAA CAAT TTCA                 TTAATTTAATTAATA  45 49
LJP71_RS01880  403635 ..  403653 +  -2.4  -5.63504   CAACACTATAAGAAA             GACCAT TAATAAT GTGGTC             TTTTTTTATACGATT  73 58
LJP71_RS01885 NONE
LJP71_RS01890  405450 ..  405463 +  -3.9  -3.53012   TATAATATATAAGTA               TGATA TTTT TATCA                TTTAAAACAAAAAGC  51 408
LJP71_RS01895  405605 ..  405645 + -11.5  -5.42198   TATGAAAAGAAATAA  CAAATAAAAAATTGCATGA ATT TCATGTGTTTTTTTATTTG  TTTTATTTTTTAAAA 100 69
LJP71_RS01900 NONE
        trpS  411568 ..  411619 + -11.4   -5.9218   TTTTGATGTATAATA TTTA-TAAATAAAAAAGACAACCCT AAA AAGGTTGTCTTTTTTATTTAATAAC TTTTTTTATTGTGTG 100 35
LJP71_RS01980  430490 ..  430509 +  -4.2  -4.73614   CCCAGGTATACTTCG            GCCAGGTT TCAT ATCTTGGC             TTTGTTTTCATCGTG  68 340
LJP71_RS01990  433752 ..  433779 + -14.4  -3.28714   AAGCCCCAAAATAAA        TAAAGACCAACT TCAA AGTTGGTCTTTA         TATTATCATAAATAT 100 61
LJP71_RS02005  436466 ..  436490 +   -13  -5.54907   AATTATTGAAAACAA          CCATTTACGG CATTC CCGTAAATGG          TTTTTATTTTATCAA 100 67
LJP71_RS02010 NONE
LJP71_RS02015 NONE
LJP71_RS02020 NONE
LJP71_RS02025  440146 ..  440173 +  -7.3  -4.88295   ATAAGTGATAGAAAA        TAAAATTATGT TTTTGT ACATAATTTTA         TTTTTCCATTTGTTT  81 23
LJP71_RS02030 NONE
LJP71_RS02035  441305 ..  441320 +  -6.1  -4.76874   ATATTAATAAAAAAA              CCACC CCAAAA GGTGG               TTTTAATTTTATATT  76 109
LJP71_RS02130  453642 ..  453657 +  -3.4  -4.38712   GCTGATTTAGACGTT              TAATTA TAAA TAATTA               TTTTATACAACTAAA  58 23
        gyrA NONE
LJP71_RS02140 NONE
        tsaE NONE
        tsaB  457573 ..  457589 +  -9.5  -6.06529   AAATAATCCCAAAAA              GAGACTT TTG AAGTCTC              TTTTTTTTATATATA 100 73
LJP71_RS02155  458391 ..  458418 +  -3.6  -4.28254   AAATTATTTGTTAGT        TTGAAAAGATAA GAAA TTATCTATTTAA         TTTTAAGTCTTAAAG  58 14
LJP71_RS02200  469672 ..  469693 +    -3  -2.73364   GTCGGAGGAACTAAA           ACTTGGTT TGGAAT AACCAAGA            TAATTGCCCTCACAC  39 521
        ltrA  471739 ..  471761 + -13.6  -4.30576   TCAATCAATAATGAA           GGCTAACTTT TTG AAAGTTAGCC           TTTTAATAATAACAA 100 221
        dnaX NONE
LJP71_RS02230 NONE
        rpoE  478492 ..  478516 +  -5.8  -5.27769   TTAAGTTCATTAATA          TCCTTTATTC TTGAT GGATAAGGGA          TTTTTCCTTTTTTAT  81 212
LJP71_RS02240 NONE
LJP71_RS02245 NONE
LJP71_RS02250  481956 ..  482010 + -30.8  -3.52358   AATCAAAAAAGTTAA TAATTTAACCAAATAAAAACACCCTT AAT AAGGGTGTTTTTATTTGGTTAAATTA TTAACTTTTTCTTGG 100 26
LJP71_RS02275  486059 ..  486082 +  -8.2   -5.9218   AAGAAAAAAGCAAAA          TCAACTTCGT ATAA GCGGAGTTGA           TTTTTTTATTATATA 100 12
LJP71_RS02375  509178 ..  509213 + -13.7  -5.85178   AAATAGATAATTCTA    TATCTTTACAAACTA CTTTGT TAGTTTGTAAAGATA     TTTTTTTTAAATATT 100 45
LJP71_RS02385 NONE
LJP71_RS02390  511736 ..  511756 + -11.3  -5.66684   TTTTAAAATACAAAA            GACATTCAT TAA ATGAATGTC            TTTTTTTGTAAATTG 100 86
        glnS NONE
LJP71_RS02400 NONE
LJP71_RS02405 NONE
LJP71_RS02410  517315 ..  517328 +  -3.9  -3.42182   ACAAAAAAAGAGATA               TACTA TAAG TAGTA                TTGCTAATTTTTAAT  49 199
        rpsU  517561 ..  517579 +  -3.8  -6.14618   TTTAATCAATTAAAA             GCTACTTG AAA TAAGTTGC             TTTTTTTATTTTATA  86 44
        ybeY NONE
         era NONE
LJP71_RS02430 NONE
        dnaG NONE
        rpoD NONE
LJP71_RS02445  524439 ..  524460 + -10.3  -5.88565   ATATCTATGATTAAA           CCAAACTAT TTTA ATAGTTTGG            TTTTTTTATTATAAG 100 58
LJP71_RS02470  530371 ..  530405 + -14.6  -5.05505   TAATATATAATAAAA     GTTAAACCGCTTAT CTCATCA ATAAGCGGTTTAAC     TTTTTAGTTTATAGT 100 91
LJP71_RS02525 NONE
LJP71_RS02530 NONE
LJP71_RS02535 NONE
LJP71_RS02540  545392 ..  545407 +  -7.6  -5.72622   TTAATATTCAAAAAA              CCAACT TTTA AGTTGG               TTTTTTCTTTATAAA 100 45
LJP71_RS02560  550080 ..  550094 +  -7.2  -4.57837   TTAGAATAACAAAAG               TGATCT ATA AGATCA               TTTTTAAGCGGATAT  79 32
LJP71_RS02565  550240 ..  550259 +  -9.3  -4.91987   ATATTATATTAAAAA            CCCCCTT TTTATT AAGGGGG             TTTTCTTATTAGATT 100 78
LJP71_RS02570  551064 ..  551074 +  -2.6  -4.45115   GAAAAAACTAAAAAG                 TTAA TAG TTAA                 TTGTTTTATATTAAT  55 43
LJP71_RS02575  551511 ..  551527 +  -9.5  -5.27477   AAGAAATAATTAAAA              CCAACTT GTT AAGTTGG              TTTTTTGATTGCCAT 100 167
LJP71_RS02580  553712 ..  553727 +  -6.2  -3.92804   GCTTTCGCGAACTAG              TCAGTA TTGC TACTGA               TTTCGTGATTTGTTC  66 200
LJP71_RS02605  556874 ..  556887 +  -6.7  -5.62045   AATCGAACAAAGGAA               GGGAT GCAA ATCCC                TTTTTTGTTATATAT  88 51
        ssrA  558028 ..  558048 +  -8.5  -4.66953   GAATTAATTCATAAG            CTATTTTTT TCA AAAAAATAG            TTTTTCCAGTGTTAA  85 504
LJP71_RS02680 NONE
LJP71_RS02685  576390 ..  576416 + -12.5  -5.25699   ATTAATCTAAATCAA         TAAGACTCTCA ACAAA TGAGAGTCTTA         TTTTTATTATATAAT 100 36
LJP71_RS02690  576939 ..  576953 +  -2.9  -4.11484   ATGGAAAAATAAATT               TCTTT GAAAA AAAGA               TTTTGAAACATTAAG  51 102
LJP71_RS02695  577165 ..  577191 + -10.3  -4.83593   TTTTTTTTGAGAGTT         GAAACAACCTT TGAGC GAGGTTGTTTC         TTTTTGGTGATTATT 100 41
LJP71_RS02735 NONE
LJP71_RS02740  586758 ..  586773 +  -4.8  -4.11363   TATGAAAAATATTTA              TCATAA GTAT TTATGA               TTATTTAATATTATT  61 61
LJP71_RS02745 NONE
LJP71_RS02750  588032 ..  588046 +  -4.4  -4.43624   ATCCTCACTGTACCC               TATTTT TTT AAAATA               TTTATTGTCTAGTTT  64 53
        recA  589138 ..  589157 +  -9.4  -6.09196   TTAAAAATTCTTTAA            GACTAACT TAAT AGTTAGTC             TTTTTTTCTTTTCAA 100 37
LJP71_RS02765  590833 ..  590849 +  -6.7  -5.47218   AACACACTCAACATT              TGAAATT TGA AATTTCA              TTTTTTTACCTCCGA  88 93
LJP71_RS02770  591831 ..  591850 +  -7.2   -5.4182   TACCTTTAAACCCCA            GACTCTTT TTAC AAAGGGTC             TTTTTATTTGTCATT  90 61
LJP71_RS02775  592817 ..  592874 + -16.9  -2.63073   AACAATTATTTTATT TTTTTATTGAACGAAAGACATAAAT TTCCTTTC ATTTGTGTCTTTCGCTCAATAAAAA CTCTTCTTAAAAACG 100 171
LJP71_RS02780 NONE
        rsmA  595189 ..  595202 +  -5.3  -5.09173   TCACAAAACTCATTA               GGAAA TGAT TTTCC                TTTTTTCCGATATTA  75 71
       spoVG  595739 ..  595755 +  -5.9  -5.54264   ATTAACTTTAAAAAA              TTCCAGA TTT TTTGGAA              TTTTTTTACATGTTT  85 46
LJP71_RS02795  597982 ..  597998 + -12.3  -5.65927   AGCACAAATAAAAAA              CCACCCT AAA AGGGTGG              TTTTTTATTTACATA 100 70
        asnS  619695 ..  619709 -  -5.8  -6.28401   CAAAAAATAAAAAAA               TGTTTT AGA AAAACA               TTTTAGAGTTAAAAA 100 115
LJP71_RS02895 NONE
LJP71_RS02890 NONE
LJP71_RS02885 NONE
LJP71_RS02880 NONE
LJP71_RS02875  613677 ..  613705 -  -3.3  -4.50298   GAAAGGGAAAAAGAA        TTATCAAAATAAA AGT TTTATTTGGTTAA        TTTTATTATTTGTTA  58 93
        mnmE NONE
LJP71_RS02865  611071 ..  611090 -  -2.2  -3.68709   TAACACAAATCACAA            GAAAAAAG GAGT CTTTTTTT             AGTAATTAGTTGATT  46 68
        thrS  608769 ..  608783 -  -3.6  -4.57569   CCATTTGCCTAAAAA               CTAATT GTT AATCAG               GCGAGAGAAAACTCT  62 201
        infC  608017 ..  608038 -  -3.1  -3.39884   AAATACCATTCATAA           CCTTTAA GGGTTATT TTAAAGG            GGACAGAACTGCTGT  47 14
        rpmI  607450 ..  607460 -  -3.2  -2.62546   ATTAAACGAGAATAC                 TGCA TGC CGCA                 TAACATAGCGCCAGC  43 253
LJP71_RS02840  606650 ..  606674 -    -3  -4.17023   CTAATTATTGTAAAA          TGAAAAATTA AAAAA TAATTATTCA          TGAAAAAACATACAA  51 95
LJP71_RS02835 NONE
LJP71_RS02830  604857 ..  604891 -  -8.9  -4.33417   CCTATTTACAAGAAA     CAAACTAAAATATTT TATTC AAATAATTTAGTTTG     CCAATGAGAAATTAT  84 59
        acpP NONE
        leuS  601833 ..  601854 -  -3.2  -4.73388   AATTGCCACCAAAAA           TTAATATT GATGTT AATATTAA            TTAATTAACAATAAT  63 26
         gmk NONE
LJP71_RS02810  600769 ..  600804 -  -5.8  -6.02345   CAATTATAAAAAAAA    TAGTTAAATTACACAAT ATT ATT-TGTAATTTAACTT    ATTTTATCAATTGTG  95 61
        rsmH  599674 ..  599684 -  -2.6  -2.92657   ATAACACATATTATA                 TTTT ATC AAAA                 TTAGAGGGGTTTTGG  40 97
LJP71_RS02800  597968 ..  598012 - -13.9  -3.50302   TCATTATAAAAGACA GCACAAATAAAAAACCACCCT AAA AGGGTGGTTTTTTATTTACAT ATTAAGATTCAAAAC 100 147
LJP71_RS02730  582503 ..  582520 -  -8.5  -4.06419   TTTGGGTATAAACAA             TACCTCT TAAA AGAGGTA              TCCTTGTTATTTGGT  79 32
LJP71_RS02725  581533 ..  581555 -  -3.5   -4.8622   TTTCTTAATTAAAAA           GACTAAG GTGTTTTTA CTTAGTC           TTTTTAATTTATTTT  63 43
LJP71_RS02720  580656 ..  580666 -  -6.8  -3.53012   CTTTCGTTTGCTAAA                 TCCG TTG CGGA                 TATACTAAAATATTT  66 367
LJP71_RS02715  579487 ..  579505 -  -3.2  -4.43392   TTAAAATTAAAATAA             CTTTTAAT TAA ATTTAAAG             GATATAGTACCATAT  58 42
LJP71_RS02710 NONE
LJP71_RS02705  578146 ..  578163 -  -4.9  -3.59583   AGAAGGAGTGTTAAA             GTTATCA TATG CGATAAC              ATCACTTTTAATCCC  56 418
LJP71_RS02700  576937 ..  576947 -    -4  -4.91473   TAATGGAAAAATAAA                 TTTC TTT GAAA                 AAAAGATTTTGAAAC  67 324
        hrcA NONE
LJP71_RS02670 NONE
        dnaK NONE
        dnaJ  568870 ..  568885 -  -7.6   -5.9218   TACATAACAAAAAAA              CCAACT TTTA AGTTGG               TCTCCTTATTATTTT 100 104
LJP71_RS02655  568236 ..  568256 -  -4.7  -3.89354   TCCCCAAAGCAATAA            GACAAACAG GAG CTGTTAATC            GTGTTATACTTGAAG  60 120
LJP71_RS02650  567632 ..  567654 -  -8.6  -6.23317   ATAAAAACAAAAAAA           CAGAAATTAA AAA TTAATTCCTG           TTCTAAATTTATAAA 100 53
        ftsY NONE
         ffh  564737 ..  564749 -  -3.5  -3.34439   TACAAAAATACTTAA                TAAAA AGA TTTTA                TAATTTTAATTATTT  47 35
LJP71_RS02630 NONE
        mutM  559753 ..  559783 -    -5  -3.90048   TCTTTTTTAAAAATA       TTGATCTATTTT ATAGTTG AAAATAAATCAA       TTATAATTCTTTATT  60 26
LJP71_RS02620 NONE
LJP71_RS02615  557307 ..  557334 -  -5.7  -2.82623   TTTTCTTCACAATTA        GCTTTTGCTTA AATAAA TAAGCAAAACC         CGCACTTAAATTAAC  55 327
LJP71_RS02600 NONE
LJP71_RS02595  556217 ..  556230 -  -2.5  -4.12072   AAAAAAGCTAAATAA               TTAAA GTTT TTTAA                TAAACAAATATAATA  51 61
LJP71_RS02590 NONE
LJP71_RS02585  553362 ..  553372 -  -2.6  -6.02914   CTGATACAAAAAAAA                 TTTT TCA AAAA                 ACATTAGAAGCAAAT  86 412
LJP71_RS02945  547643 ..  547655 -  -4.8  -3.25668   AATGCATCTATAACA                CTCC ATTTG GGAG                TTGAAGGTGATTTTT  53 99
LJP71_RS02555 NONE
LJP71_RS02550  546598 ..  546610 -  -2.7   -4.1523   GGCAATTATAAATAA                TTCCA ACT TGAAA                AAATTGCTATTATTT  51 198
LJP71_RS02545  545392 ..  545407 -  -7.6   -5.1615   TTAATATTCAAAAAA              CCAACT TTTA AGTTGG               TTTTTTCTTTATAAA  93 71
LJP71_RS02520  538518 ..  538535 -  -4.8  -6.17669   AACAAAATAAAAAAA             CCCATC AATTAA GACGGG              TTTATTAGGGTATTA  93 84
LJP71_RS02515 NONE
LJP71_RS02940 NONE
LJP71_RS02510 NONE
LJP71_RS02505  534854 ..  534874 -  -2.7  -5.00616   GCGGGTTGTAAAAAA            TAAATTTTT TGC AAATATTTA            GTTTTAGATTTAGAT  62 452
LJP71_RS02500  532071 ..  532081 -  -2.6   -4.8622   TTTGGTAATGAAAAA                 TATT TGG AATA                 TAATTAAAATATCAA  59 300
LJP71_RS02495  530967 ..  530979 -  -3.5  -4.10717   CAAAAAGTCAAATAA                TAAAA TTG TTTTA                TGACAAATATTTGCA  54 184
LJP71_RS02490 NONE
LJP71_RS02485 NONE
LJP71_RS02480  530562 ..  530573 -  -2.2  -2.52543   ATGGTCGGGAAGGCA                GGAT TTGA ACCC                 GCGACCTCCTGGTCC  38 0
LJP71_RS02475  530366 ..  530410 - -15.4  -3.68024   TGTGTTAATATATAA TAAAAGTTAAACCGCTTATC TCATC AATAAGCGGTTTAACTTTTT AGTTTATAGTTTTAT 100 68
LJP71_RS02465  527099 ..  527126 -  -4.4  -4.84527   TTCATATATTAAAAA        TATTATATTTTA TTTT TAAAATGTAATA         GTGCTATTAAAAATT  68 514
         spx  526315 ..  526339 -  -8.1  -6.02914   TTTATATAAAAAAAA          TTAGAATATTT GAA AAACATTCTAA          CTTTGAATTGAAAAT 100 248
        rnhC NONE
LJP71_RS02450  524439 ..  524460 - -10.3  -3.80014   ATATCTATGATTAAA           CCAAACTAT TTTA ATAGTTTGG            TTTTTTTATTATAAG  91 246
LJP71_RS02380  509261 ..  509272 -  -2.2  -5.42862   ATATTCCGAAAAAAA                CCTC ATTT AAGG                 GGGGGTCTAAATCAA  66 97
LJP71_RS02370  507873 ..  507891 -  -3.1  -6.14618   GATAAAATAAAAAAA             GACACTC ATAAA GAATGCC             TTTGGGTTTGTAATT  83 181
        lysS  506024 ..  506037 -  -2.5  -2.96141   TGCAACACAAAATAT               TTAAT TATC ATTAA                CCCATTTTATATAAA  41 144
LJP71_RS02360  505562 ..  505580 -  -4.6  -5.63103   TTTTAACTAAAAAAA             GGTATAAA TTT TTAATACC             TAATCGAGAATTTTT  78 25
        dnaE  502369 ..  502383 -  -4.4  -3.66166   TGTTTAAAAAACAGA               TTTAAT CAA ATTAAA               AACAAAAAAATGAAA  56 160
LJP71_RS02350 NONE
LJP71_RS02935 NONE
LJP71_RS02930 NONE
        asnB  499380 ..  499391 -  -3.6  -4.20516   TTTTTATCTAAGAAA                GGCA CTCG CGCC                 TCTATCCCCAAGCAC  58 27
LJP71_RS02335  498713 ..  498728 -  -3.3  -4.03234   TTTGGTTCATATAAA              TATCC TTTCTG GGATA               AAGTTGTAAAAATTT  54 208
LJP71_RS02330 NONE
        pheS NONE
        pheT  494807 ..  494819 -  -4.9  -3.06183   TCTATTTTTATCTAA                TTTCA ATA TGAAA                GTGTTTAATCAAATT  52 5
LJP71_RS02315  492949 ..  492972 -  -9.8  -6.08563   AAGAGATAAAAAAAA          TACCATATAT TATA ATATATGGTA           TTTCAATTAATATTT 100 39
        pdhA NONE
LJP71_RS02305 NONE
LJP71_RS02300 NONE
        lpdA  487952 ..  487968 -  -6.6  -4.88407   CCATTTAAGGAAAAA              GAACCT ATTAA AGGTTC              TTTTTTTGTTAAAAG  78 53
LJP71_RS02290 NONE
LJP71_RS02285  487131 ..  487143 -  -3.5  -5.56372   AAAGCAAAACAAAAA                TTTAT TTA ATAAA                TGTTGGGCTTTTAAT  73 14
LJP71_RS02280  486059 ..  486082 -  -5.3   -4.9251   AAGAAAAAAGCAAAA          TCAACTTCG TATAAG CGGAGTTGA           TTTTTTTATTATATA  75 110
        plsX NONE
         rnc NONE
LJP71_RS02260  482522 ..  482539 -  -5.7  -5.66989   GAAATACTAAAAAAA             TAATTAC ATAA GTAATTA              TAACACATAAAAAGA  86 75
LJP71_RS02255  481956 ..  482010 - -30.8  -3.54687   AATCAAAAAAGTTAA TAATTTAACCAAATAAAAACACCCTT AAT AAGGGTGTTTTTATTTGGTTAAATTA TTAACTTTTTCTTGG 100 10
LJP71_RS02220  474248 ..  474291 - -12.9  -5.38348   AAAAATATGAAAAAA GAAAATAATAAAGACTATC TTTTAC GATAGTCTTTATTATTTTT GTATTTGGTGCAATT 100 61
LJP71_RS02215  471739 ..  471761 - -13.6  -3.58329   TCAATCAATAATGAA           GGCTAACTTT TTG AAAGTTAGCC           TTTTAATAATAACAA 100 75
LJP71_RS02210  471266 ..  471291 -  -5.5  -3.52111   TTAAAAGGATGAGAA         GATATAAGGAT ATTA ACCCTGATATC          ATACCAAATCCAAAT  60 278
        rpsD  467416 ..  467432 -  -5.8  -5.51046   CAAATACACAAAAAA              CACCCT ATTAA AGGGCG              TTTGAGTTATCTATT  82 32
        mgtA  464239 ..  464253 -  -2.2  -4.40882   TAGAAAGCAAAACAA               TCAATT TAT AATTAA               TTTTTAGCAAGCAAA  54 161
LJP71_RS02185 NONE
LJP71_RS02180  462363 ..  462377 -  -2.9   -5.1675   TCAGGGATTAAAAAA               TAATG CATTC CATTA               TAAGTTAATCTGTAA  64 30
LJP71_RS02175  461419 ..  461436 -  -4.1  -5.57888   AGGAAAAAAAGAAAA             GACCG TGCTGATG CGGTC              TTCGCTTATTTGAAA  75 153
        folP  460254 ..  460268 -  -2.9  -3.34716   TTATGTTGCAAAAAT               TAATG TTTTT CATTA               TTTTAAAAGGGATAA  44 69
        folK NONE
        tsaD  458521 ..  458534 -  -3.9  -5.85011   CAAAAATCAAAAAAA               CAAAT TAGG ATTTG                CTGTAAGATCATATT  83 3
LJP71_RS02125 NONE
LJP71_RS02120 NONE
LJP71_RS02115  448061 ..  448078 -  -8.5  -6.20267   TTAAAAATAAAAAAA             CAATCCA TCAA TGGATTG              TTGCTATTTGAAAGT 100 41
LJP71_RS02110  445743 ..  445766 -  -6.2  -4.60746   TTAAAAAGATTAAAA          TG-TTGCAAAT ACA ATTTGCAAGCA          AGTTACAATGAAAAA  74 86
LJP71_RS02105 NONE
LJP71_RS02100 NONE
         rrf NONE
LJP71_RS02090  442427 ..  442454 -  -2.2  -4.63486   ATTTTGGCAATAAAA        TTATTGTTTTTC TATA AAAAAAGAATAA         AAAAGATAGTAATTG  56 43
LJP71_RS02085 NONE
LJP71_RS02080  442209 ..  442237 -  -3.4  -2.82909   CAAACATATAAACAT        TTTTTGTATTTT ATATA AAAATAAAAAAA        GAAAAAGAAAGATTA  43 49
LJP71_RS02075 NONE
LJP71_RS02070 NONE
LJP71_RS02065 NONE
LJP71_RS02060 NONE
LJP71_RS02055 NONE
LJP71_RS02050 NONE
LJP71_RS02045 NONE
LJP71_RS02040  441305 ..  441320 -  -6.8  -5.85737   ATATTAATAAAAAAA              CCACCC CAAA AGGTGG               TTTTAATTTTATATT  93 190
LJP71_RS02000  435157 ..  435180 -  -5.4  -3.28924   TATTTTCTGCTATAA          TCTATCTTGC TTTC ACAAAATAGA           CCAAAAATATGTTGT  56 86
LJP71_RS01995  433752 ..  433779 - -14.4  -4.66535   AAGCCCCAAAATAAA        TAAAGACCAACT TCAA AGTTGGTCTTTA         TATTATCATAAATAT 100 107
        ltrA  429842 ..  429856 -  -4.4  -4.59882   CCAAAAAATAAACAA               TTTAAA ATG TTTAAA               AACTTATAAAGCTCA  66 345
LJP71_RS01975 NONE
LJP71_RS01970 NONE
LJP71_RS01965  425613 ..  425627 -  -4.4  -4.18303   AGTATAAATTATAAA               TATTAT ACC ATAATA               ATTGATTTTAAAAGC  59 58
LJP71_RS01960 NONE
LJP71_RS01955  422070 ..  422087 -  -7.7  -3.84648   TAACTCAAAAAGGAA             GCCCTTC AACA AAAGGGC              TTTTTTATTTCAAAC  75 67
LJP71_RS01950  420718 ..  420738 -  -3.3  -5.88061   AAAAAATGAAAAAAA            GACTACC GCCATTA GATAGTC            TTTTTTTAGTTAAAA  80 221
        secA NONE
        prfB  416378 ..  416398 -  -8.5   -5.4477   AAATTCTTAAAAAAA            TAAAATCTT TTG AAGATTTTA            ATTAAGGTGAAAGAT 100 304
        rpsP  415957 ..  415973 -  -3.8  -2.64472   TATTTTTGAAATTGA              GAAAAA AATTA TTTTTC              AACTTTAGTGTTAGT  44 17
        trmD  415166 ..  415179 -  -2.5  -4.50159   TTGAATTCAAATAAA               TAATT CTTG AATTA                TTTTTGTAATTCTTG  55 23
        rplS  414735 ..  414751 -  -5.3  -3.16936   AAATGTTATTAAAAG              TTTTTTA TTA TAAAAAA              ATGTATTTCTTTAAA  56 53
        tyrS  413347 ..  413357 -  -2.6  -2.96898   ATAAATAAAAAGTTA                 TTAA TAA TTAA                 AAGACTATTAAAGCG  41 22
LJP71_RS01915 NONE
LJP71_RS01910  411569 ..  411618 - -17.1   -2.5474   TTTGATGTATAATAT TTA-TAAATAAAAAAGACAACCCT AAA AAGGTTGTCTTTTTTATTTAATAA CTTTTTTTATTGTGT 100 15
LJP71_RS01855  395089 ..  395109 -    -7  -5.26155   ATATAAAGATAAAAA            CTATTTTC ATTAA GAAAATAG            TTTTTTTTATATCTT  87 55
        uvrA  390690 ..  390714 -    -3  -2.60244   TTGGCAACTAATTTA          TAATTAAGTT TTTTT AACTAAATTA          AAAGTTGTTTTTTGG  39 475
         tig NONE
         lon  386631 ..  386649 - -11.8  -5.98675   TATAAAAACAAAAAA             CACCATCT TAA AGATGGTG             TTTTTTATATCTTAA 100 41
LJP71_RS01770  370694 ..  370713 -  -9.4  -6.09196   TTGAAAAGAAAAAAA            GACTAACT ATTA AGTTAGTC             TTAAAGAATTTTTAA 100 312
LJP71_RS01765  369945 ..  369966 -    -3  -2.73364   GTGTGAGGGCAATTA           TCTTGGTT ATTCCA AACCAAGT            TTTAGTTCCTCCGAC  39 474
LJP71_RS01760 NONE
LJP71_RS01755 NONE
LJP71_RS01750 NONE
LJP71_RS01745 NONE
LJP71_RS01740  367944 ..  367972 -   -12  -4.07687   ATTTCCTTTCTAAAA        TAAGACTAAGTT AAGAA AACTTAGTCTTA        TTTTTTTATTTAAGC 100 35
LJP71_RS01730 NONE
LJP71_RS01725 NONE
LJP71_RS01720 NONE
LJP71_RS01715  363315 ..  363327 -  -3.5   -4.0044   AATTATTATGAGAAA                TTAAA TAA TTTAA                AGGAAACAAAATATC  52 143
        uvrC  361219 ..  361229 -  -2.6  -3.86346   CCATGTTTTTATAAA                 TATT TTT AATA                 AATGTCTATTTACCC  49 45
        uvrB  358834 ..  358867 -  -3.4  -3.53712   ACTTTTAACAACTAA     TAAAGTTTTAG-TAG AAAAA CTAACTAAAGCTTTA     ATGGAAAAAAATACC  49 245
LJP71_RS01690 NONE
LJP71_RS01685  355473 ..  355483 -  -2.6  -4.34482   GGTTTGAAAAAAAGA                 TTTT CCA AAAA                 TTTAATTTTCCTTGG  53 27
LJP71_RS01680  354036 ..  354056 -  -9.9  -5.65678   ATAAAATATAAAAAA            GTTAACTTA TTT TAAGTTAAC            TTTTTTATATTTTAG 100 54
        alaS  349390 ..  349400 -  -2.6  -3.53012   GTGTTTTTGGGCAAA                 TAAT TTT ATTA                 ATAATTGTTTAAAAG  45 212
        ruvX NONE
LJP71_RS01660  348189 ..  348205 -  -2.3  -3.93695   TTTATTATTCATAAA              TAAAAGA CCT TCTTTTT              TTATTTTTTGATGGT  48 58
        greA NONE
LJP71_RS01650 NONE
        yqeK NONE
        rsmD  345952 ..  345966 -  -2.8  -2.75935   CATATAACCAAATAT               TGTTCA TTT TGAACT               CCTTTTTTATTTTTC  40 72
LJP71_RS01635 NONE
LJP71_RS01630  345317 ..  345353 - -18.5  -2.79312   AAATTTTTCATGATA    TAATAAAAAAACACCTT TTA AAGGTGTTTTTTTATTA    TATAACTTTGAAATT 100 63
LJP71_RS01600  339617 ..  339631 -  -6.4   -5.8901   ATATAAAATAAAAAA               GAGGCT ATA AACCTC               TTTGATATTTTTTAA  93 41
LJP71_RS01595  338307 ..  338332 - -10.6  -5.90981   TTATATTAAAAAAAA         CAGTAGATTG AATTTA CAATCTACTG          TTTTTTTTTAAATTT 100 33
LJP71_RS01555  325404 ..  325421 -  -8.5  -5.60689   TTATATAACAAAAAA             GACTATC AATC GATAGTC              TTTTTTAATTTATGA 100 43
         ffs NONE
LJP71_RS01495 NONE
        mnmG NONE
        rsmG  310788 ..  310807 - -10.8  -5.95449   AAAGAAAATAAAAAA            GATCACGA ATAT TCGTGATC             TTTTTTTTATTATAT 100 49
LJP71_RS01085  243372 ..  243403 - -14.8  -3.10901   AAAGAGTTTAAGACA      TCAAAGACTATTAA ATAA TTAATAGTCTTTGA       ATTGATTATTTGATA 100 129
LJP71_RS01080 NONE
LJP71_RS01075  241478 ..  241497 -  -4.2  -4.73614   CACGATGAAAACAAA            GCCAAGAT ATGA AACCTGGC             CGAAGTATACCTGGG  68 340
LJP71_RS01065  235833 ..  235847 -  -4.4  -4.35042   TTTATTACAAAATAA               TAATTA CTT TAATTA               TACACTAAAAAAAAT  61 193
LJP71_RS01060 NONE
LJP71_RS01055 NONE
LJP71_RS01050  232158 ..  232202 -  -7.6  -3.48276   TTTCTTTGTATATAA CTAGTTGAAAAACAAAAAAA GAAGA TTTTTTTATTTTTCAAATAA ATATTATTTTAATAA  72 100
LJP71_RS01045  230200 ..  230229 -  -5.9  -2.53449   ATATTTTTATAATAC       CGAAAGTAAAAAA ATAG TTTCTTACTTTTG        CAAAACACAGCAAAA  56 261
LJP71_RS01040 NONE
LJP71_RS01035  228195 ..  228218 -  -9.8  -4.36993   AAGTTGAAAAAAATA          GTTTGATTTA AGTA TAAATCAAAC           TTTAATTTTTAATAA  95 99
LJP71_RS01030  226547 ..  226565 - -10.4  -6.04324   TTAAAAAACAAAAAA             GACTCTTT TTG AAAGAGTC             TTTTTTTATATTCTT 100 44
        ltrA  206873 ..  206885 -  -3.5  -2.83449   ATATTTTGATAATTA                TAAAA GCA TTTTA                CTTAATTTATTAATA  45 478
LJP71_RS00890  191544 ..  191566 -  -7.8  -4.34789   TAACTCACAAAAGAA           TTTTTGGGAT GAA ATCCCAGAAA           CTTTAAAACAAGTTT  79 359
LJP71_RS00840 NONE
        priA  174407 ..  174417 -  -2.6  -2.52464   CTCGCCTTTAATTTA                 TATT TTT AATA                 ACTAACTGATTTCAT  39 343
LJP71_RS00780  172934 ..  172957 - -11.2  -5.68039   AAAGGTATAAAAAAA          GAGCAAATAT GAAA ATATTTGCTC           TTTTTATTTATTTTA 100 33
        ltrA  159756 ..  159779 -  -9.8  -3.70902   TTTGTTATATGGAAA          GATTAACTTT TGCA AAAGTTAATC           TTTTTTTGTTGAAAA  90 315
LJP71_RS00600  127326 ..  127337 -  -5.8  -2.96274   CTTTCCATAATTACA                TCGC TCTC GCGA                 ACTAGTCAGTATTGC  55 65
        rpmB NONE
        rpmE NONE
LJP71_RS00580  124756 ..  124779 -  -2.4  -3.27774   TATTTTAAGTATTAA          TCCACATTCC AAAC GAATTATGGA           GATGAATTATTTTAG  41 46
LJP71_RS00575  124170 ..  124189 -  -7.9  -5.07652   TTTTTGAAAATAAAA            GACCATC GGTTGT GATGGTC             TAATTTGGTTGTGAT  90 92
LJP71_RS00570 NONE
LJP71_RS00565  121437 ..  121454 -  -9.9  -5.58179   TATTACAACAAAAAA             GACCGTT TAAA AACGGTC              TTTTTTTATTATGAA 100 85
LJP71_RS00530  112527 ..  112546 - -10.8  -5.72622   TTTATAAACAAAAAA            GCCAAACT GTAA AGTTTGGC             TTTCATTGTCTTTAT 100 98
LJP71_RS00440 NONE
LJP71_RS00435 NONE
LJP71_RS00430   93308 ..   93345 - -14.7  -3.22298   GCTATTTATCATTAA   TATTATTATTATCTTTA ATAT TAAAGATAATAATAATA    TTAATGATAAATACT 100 471
LJP71_RS00425   92016 ..   92035 -  -5.8  -4.81863   AAATGTACAACAAAA            CAACCTTT TTCC AAAGGTTA             TAATTTTATATATCC  73 53
LJP71_RS00420   88568 ..   88581 -  -2.5   -2.7487   GATATAAATAATTTA               TTAAT TTTG ATTAA                CTTATATAAAAACCA  39 205
LJP71_RS00415   86975 ..   87003 -   -12  -4.07687   ATTTCCTTTCTAAAA        TAAGACTAAGTT TTCTT AACTTAGTCTTA        TTTTTTTATTTAAAC 100 200
LJP71_RS00410 NONE
LJP71_RS00405   83967 ..   83978 -    -3  -2.52623   CCTTTCCGATAATAG                TGAT TATT ATCA                 AATATTGAAATATGA  39 90
LJP71_RS00400 NONE
LJP71_RS00395 NONE
LJP71_RS00390   81978 ..   81989 -    -3  -2.52623   CCTTTCCGATAATAG                TGAT TATT ATCA                 AATATTGAAATATGA  39 90
LJP71_RS00385 NONE
LJP71_RS00380 NONE
LJP71_RS00375 NONE
LJP71_RS00370 NONE
LJP71_RS00365   79951 ..   79961 -  -2.6  -3.37655   TTTGGTAAAAAATTA                 TTTT ATT AAAA                 AAAATTGTTTATCTA  44 12
LJP71_RS00360 NONE
LJP71_RS00355 NONE
        ftsH   73444 ..   73454 -  -2.6  -3.28269   AACTGTTAAACTTAA                 TAAA AAT TTTA                 GTTTATTATTTTTTA  42 52
LJP71_RS00340   71210 ..   71229 -  -6.5  -6.11243   AGGCAATAAAAAAAA            GACTAGT TTTTAT ACTAGTC             TTAAATAGTGTTTAT 100 124
LJP71_RS00325   69600 ..   69627 -    -7  -3.70925   TGATGAATAAATCAA        CGATGGCATTGT GTAG ACAGTGCCATAG         AAAGAAAACCAACGA  69 95
LJP71_RS00300   64646 ..   64659 -  -2.4  -4.05402   GTTCAAGGAAAAAGA               GACT TTTAGT AGTC                GGAGGAACTAAAACT  50 115
LJP71_RS00290   63479 ..   63498 -  -6.5  -4.45544   TCGGAGGAACTAAAA            CTTGGTT TGGAAT AACCAAG             ATAATTGCCCTCACA  75 176
LJP71_RS00275 NONE
LJP71_RS00265   60803 ..   60822 - -10.8  -5.70522   AATAATAACAAAAAA            GCTAGCTT CAAC AAGCTAGC             TTTTTCTTATATTTG 100 93
LJP71_RS02920   45350 ..   45368 -  -3.1  -4.17048   TTTTTGCTAAAATAA             GGCTATC AAATG GATAGTC             TTTTTTTATTCTTAA  54 37
LJP71_RS00175 NONE
LJP71_RS00170   41625 ..   41641 -  -9.5  -6.11392   AAATAAACAAAAAAA              GAGACTT AAA AAGTCTC              TTTTTATCTTAATAT 100 237
LJP71_RS00160   37616 ..   37657 - -17.9  -3.03212   AATATTAATCATATA TATAATAAAAACAAGTTAA GTAA TTAACTTGTTTTTATTATA  TCTTAATTTAATTTT 100 28
LJP71_RS00145   31896 ..   31914 - -10.4  -6.02914   TGTATATAAAAAAAA             GAGACTTT AAA AAAGTCTC             TTTTTGGGATTTAGA 100 146
LJP71_RS00140 NONE
LJP71_RS00135   30034 ..   30064 - -17.2  -5.76633   TTAGATACAAAAAAA       GATCCAAACTATTT TTT AAATAGTTTGGATC       AAATTTTTTTCTTTT 100 95
LJP71_RS00130   29589 ..   29605 -  -3.7  -6.13503   TAGTAATAAAAAAAA              TCGCTTT CAT AAAGTGA              ATAGTAAAATATTAA  86 145
        holA   19851 ..   19867 -  -7.3  -6.10489   AATTTTAAAAAAAAA              TGGTCCT TTA AAGACCA              CTTCTGTTAATCAAA  95 276
LJP71_RS00040    7406 ..    7416 -  -2.6  -5.11254   AATAATAAAAATAAA                 TTAT TTT ATAA                 AATTAAAGAAAACAA  64 15
LJP71_RS00035    6358 ..    6380 - -10.8  -4.20367   GGTGGTAATAAATAA           TTTTGGTTTT TCC AAAACCAAAA           CTTTAATTCTTTTAC  95 155
LJP71_RS00015    3107 ..    3125 -  -5.4  -4.02424   ATTAATTACTACAAA             TGATTTAA TAT TTAAACCA             ATATATTTCTTTTAG   0 151
