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LFT50_RS06830	LFT50_06830		LFT50_RS06830	1380504	1380809	+	hypothetical protein		gene	gene-LFT50_RS06830	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS06830
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LFT50_RS10800	LFT50_10800		LFT50_RS10800	2303106	2303384	-	hypothetical protein		gene	gene-LFT50_RS10800	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS10800
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LFT50_RS10810	LFT50_10810		LFT50_RS10810	2303628	2305013	-	NtaA/DmoA family FMN-dependent monooxygenase	This protein belongs to a clade of FMN-dependent monooxygenases%2C within a broader family of flavin-dependent oxidoreductases%2C the luciferase-like monooxygenase (LMM) family%2C some of whose members use coenzyme F420 rather than FMN.	gene	gene-LFT50_RS10810	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS10810
LFT50_RS10815	LFT50_10815		LFT50_RS10815	2305010	2306131	-	LLM class flavin-dependent oxidoreductase		gene	gene-LFT50_RS10815	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS10815
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LFT50_RS15805	LFT50_15805		LFT50_RS15805	3399560	3399829	+	ATP-binding protein	frameshifted%3B incomplete%3B partial in the middle of a contig%3B missing N-terminus	pseudogene	gene-LFT50_RS15805	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS15805
LFT50_RS15810	LFT50_15810		LFT50_RS15810	3399917	3400174	-	alkylmercury lyase		gene	gene-LFT50_RS15810	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS15810
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LFT50_RS15820	LFT50_15820		LFT50_RS15820	3401485	3402208	-	zf-HC2 domain-containing protein	frameshifted	pseudogene	gene-LFT50_RS15820	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS15820
LFT50_RS15825	LFT50_15825		LFT50_RS15825	3402352	3402447	-	RNA polymerase subunit sigma	Member of the extracytoplasmic function sigma factors which are active under specific conditions%3B binds with the catalytic core of RNA polymerase to produce the holoenzyme and directs bacterial core RNA polymerase to specific promoter elements to initiate transcription%3B in M. tuberculosis this protein regulates polyketide synthases and secreted or membrane proteins%3B incomplete%3B partial in the middle of a contig%3B missing N-terminus	pseudogene	gene-LFT50_RS15825	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS15825
LFT50_RS15830	LFT50_15830		LFT50_RS15830	3403645	3404022	-	BlaI/MecI/CopY family transcriptional regulator		gene	gene-LFT50_RS15830	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS15830
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LFT50_RS21690	LFT50_21690		LFT50_RS21690	4672079	4672738	-	UdgX family uracil-DNA binding protein	This protein belongs to the uracil DNA glycosylase superfamily%2C members of which act in excision repair of DNA. However%2C it belongs more specifically to UdgX branch%2C whose founding member was found to bind uracil in DNA (where it does not belong)%2C without cleaving it%2C appears to promote DNA repair by a pathway involving RecA%2C rather than base excision.	gene	gene-LFT50_RS21690	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS21690
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LFT50_RS21830	LFT50_21830		LFT50_RS21830	4717767	4719308	-	DHA2 family efflux MFS transporter permease subunit		gene	gene-LFT50_RS21830	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS21830
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LFT50_RS23765	LFT50_23765		LFT50_RS23765	5114943	5116205	+	cytochrome P450		gene	gene-LFT50_RS23765	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23765
LFT50_RS23770	LFT50_23770		LFT50_RS23770	5116171	5116725	-	TetR family transcriptional regulator		gene	gene-LFT50_RS23770	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23770
LFT50_RS23775	LFT50_23775	mftG	mftG	5116849	5118294	-	mycofactocin system GMC family oxidoreductase MftG		gene	gene-LFT50_RS23775	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23775
LFT50_RS23780	LFT50_23780	mftF	mftF	5118303	5119721	-	mycofactocin biosynthesis glycosyltransferase MftF	Members of this protein family%2C MftF%2C are glycosyltransferases%2C members of PF00535 (glycosyl transferase family 2). The encoding gene is found as part of the mycofactocin cassette%2C in Mycobacterium tuberculosis%2C many other Actinobacteria%2C and occasional members of other lineages. Mycofactocin itself%2C a putative redox carrier%2C is a heavily modified derivative of the C-terminal Val-Tyr dipeptide of the mycofactocin precursor MftA (TIGR03969).	gene	gene-LFT50_RS23780	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23780
LFT50_RS23785	LFT50_23785	mftE	mftE	5119718	5120449	-	mycofactocin biosynthesis peptidyl-dipeptidase MftE		gene	gene-LFT50_RS23785	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23785
LFT50_RS23790	LFT50_23790	mftD	mftD	5120613	5121800	-	mycofactocin biosynthesis FMN-dependent deaminase MftD	MftD%2C an enzyme found in the mycofactocin biosynthesis locus%2C performs an oxidative deamination of 3-amino-5-[(p-hydroxyphenyl)methyl]-4%2C4-dimethyl-2-pyrrolidinone (AHDP). The resulting compound%2C now called pre-mycofactocin (PMFT)%2C is a biologically active redox cofactor that can oxidize the non-exchangeable NADH of TIGR03971 family SDR-type oxidoreductases.	gene	gene-LFT50_RS23790	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23790
LFT50_RS23795	LFT50_23795	mftC	mftC	5121803	5123014	-	mycofactocin radical SAM maturase	MftC is a radical SAM/SPASM enzyme that catalyzes the first two steps in biosynthesis of the electron carrier mycofactocin from the terminal Val-Tyr dipeptide of the precursor peptide MftA.	gene	gene-LFT50_RS23795	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23795
LFT50_RS23800	LFT50_23800	mftB	mftB	5123011	5123352	-	mycofactocin biosynthesis chaperone MftB	MftB%2C a small protein%2C is a peptide chaperone that assists the radical SAM enzyme MftC in performing two modifications to the C-terminal Val-Tyr dipeptide of the mycofactocin precursor peptide%2C MftA. MftB's role is analogous to the role of PqqD in the biosynthesis of PQQ%2C a cofactor that derives entirely from a Tyr and a Glu in the precursor PqqA.	gene	gene-LFT50_RS23800	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23800
LFT50_RS23805	LFT50_23805	mftA	mftA	5123337	5123426	-	mycofactocin precursor MftA	Mycofactocin is a small molecule electron carrier derived from the final two amino acids%2C Val-Tyr%2C of MftA%2C the mycofactocin precursor. It plays a role in redox homeostasis and the metabolism of alcohols and aldehydes in Actinobacteria%2C including Mycobacterium tuberculosis.	gene	gene-LFT50_RS23805	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23805
LFT50_RS23810	LFT50_23810	mftR	mftR	5123529	5124122	+	mycofactocin system transcriptional regulator	MftR%2C the mycofactocin system transcriptional regulator%2C is an uncharacterized TetR family DNA-binding transcription factor. Its role is inferred by context. It occurs as part of the biosynthesis locus for mycofactocin%2C a partially characterized electron carrier derived from the terminal Val-Tyr dipeptide of the precursor peptide MftA%2C through a radical SAM enzyme-mediated process.	gene	gene-LFT50_RS23810	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23810
LFT50_RS23815	LFT50_23815		LFT50_RS23815	5124119	5125162	+	DUF2332 family protein		gene	gene-LFT50_RS23815	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23815
LFT50_RS23820	LFT50_23820		LFT50_RS23820	5125224	5126084	-	aldo/keto reductase		gene	gene-LFT50_RS23820	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23820
LFT50_RS23825	LFT50_23825		LFT50_RS23825	5126651	5127478	+	inositol monophosphatase family protein		gene	gene-LFT50_RS23825	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23825
LFT50_RS23830	LFT50_23830		LFT50_RS23830	5127486	5128673	-	FAD-dependent oxidoreductase		gene	gene-LFT50_RS23830	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23830
LFT50_RS23835	LFT50_23835		LFT50_RS23835	5128699	5129517	-	mycofactocin-coupled SDR family oxidoreductase		gene	gene-LFT50_RS23835	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23835
LFT50_RS23840	LFT50_23840		LFT50_RS23840	5129609	5130469	-	SHOCT domain-containing protein		gene	gene-LFT50_RS23840	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23840
LFT50_RS23845	LFT50_23845		LFT50_RS23845	5131018	5131302	-	PE family protein	incomplete%3B partial in the middle of a contig%3B missing C-terminus	pseudogene	gene-LFT50_RS23845	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23845
LFT50_RS23850	LFT50_23850	tuf	tuf	5131474	5132664	-	elongation factor Tu		gene	gene-LFT50_RS23850	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23850
LFT50_RS23855	LFT50_23855	fusA	fusA	5132775	5134880	-	elongation factor G		gene	gene-LFT50_RS23855	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23855
LFT50_RS23860	LFT50_23860	rpsG	rpsG	5134962	5135432	-	30S ribosomal protein S7		gene	gene-LFT50_RS23860	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23860
LFT50_RS23865	LFT50_23865	rpsL	rpsL	5135432	5135806	-	30S ribosomal protein S12		gene	gene-LFT50_RS23865	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23865
LFT50_RS23870	LFT50_23870		LFT50_RS23870	5136064	5136708	-	TetR/AcrR family transcriptional regulator		gene	gene-LFT50_RS23870	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23870
LFT50_RS23875	LFT50_23875		LFT50_RS23875	5136905	5137282	+	DUF3060 domain-containing protein		gene	gene-LFT50_RS23875	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23875
LFT50_RS23880	LFT50_23880		LFT50_RS23880	5137312	5137773	+	DUF3060 domain-containing protein		gene	gene-LFT50_RS23880	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23880
LFT50_RS23885	LFT50_23885		LFT50_RS23885	5137813	5138580	-	crotonase/enoyl-CoA hydratase family protein		gene	gene-LFT50_RS23885	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23885
LFT50_RS23890	LFT50_23890		LFT50_RS23890	5138577	5139296	-	PaaX protein		gene	gene-LFT50_RS23890	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23890
LFT50_RS23895	LFT50_23895		LFT50_RS23895	5139299	5140237	-	crotonase/enoyl-CoA hydratase family protein		gene	gene-LFT50_RS23895	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23895
LFT50_RS23900	LFT50_23900		LFT50_RS23900	5140234	5141862	-	acyl-CoA dehydrogenase family protein		gene	gene-LFT50_RS23900	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23900
LFT50_RS23905	LFT50_23905		LFT50_RS23905	5141910	5142754	-	polyhydroxybutyrate depolymerase	frameshifted	pseudogene	gene-LFT50_RS23905	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23905
LFT50_RS23910	LFT50_23910		LFT50_RS23910	5142782	5143537	-	deoxyribonuclease IV		gene	gene-LFT50_RS23910	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23910
LFT50_RS23915	LFT50_23915		LFT50_RS23915	5143726	5147676	-	DNA-directed RNA polymerase subunit beta'		gene	gene-LFT50_RS23915	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23915
LFT50_RS23920	LFT50_23920		LFT50_RS23920	5147721	5151254	-	DNA-directed RNA polymerase subunit beta		gene	gene-LFT50_RS23920	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23920
LFT50_RS23925	LFT50_23925		LFT50_RS23925	5151663	5152673	-	ATP-binding cassette domain-containing protein		gene	gene-LFT50_RS23925	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23925
LFT50_RS23930	LFT50_23930		LFT50_RS23930	5152846	5154348	-	carotenoid oxygenase family protein		gene	gene-LFT50_RS23930	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23930
LFT50_RS23935	LFT50_23935		LFT50_RS23935	5154420	5155109	+	TetR/AcrR family transcriptional regulator		gene	gene-LFT50_RS23935	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23935
LFT50_RS23940	LFT50_23940	rplL	rplL	5155159	5155551	-	50S ribosomal protein L7/L12		gene	gene-LFT50_RS23940	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23940
LFT50_RS23945	LFT50_23945	rplJ	rplJ	5155596	5156219	-	50S ribosomal protein L10		gene	gene-LFT50_RS23945	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23945
LFT50_RS23950	LFT50_23950		LFT50_RS23950	5156478	5156930	-	DUF1772 domain-containing protein		gene	gene-LFT50_RS23950	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23950
LFT50_RS23955	LFT50_23955		LFT50_RS23955	5156970	5157890	-	ROK family protein		gene	gene-LFT50_RS23955	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23955
LFT50_RS23960	LFT50_23960		LFT50_RS23960	5157895	5158512	-	hypothetical protein		gene	gene-LFT50_RS23960	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23960
LFT50_RS23965	LFT50_23965		LFT50_RS23965	5158509	5162699	-	NEW3 domain-containing protein		gene	gene-LFT50_RS23965	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23965
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LFT50_RS23975	LFT50_23975		LFT50_RS23975	5163328	5163912	+	DinB family protein		gene	gene-LFT50_RS23975	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23975
LFT50_RS23980	LFT50_23980		LFT50_RS23980	5163953	5165299	+	AarF/ABC1/UbiB kinase family protein		gene	gene-LFT50_RS23980	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23980
LFT50_RS23985	LFT50_23985		LFT50_RS23985	5165302	5166207	+	alpha/beta fold hydrolase		gene	gene-LFT50_RS23985	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS23985
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LFT50_RS24000	LFT50_24000		LFT50_RS24000	5168310	5169008	+	YciI family protein		gene	gene-LFT50_RS24000	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS24000
LFT50_RS24005	LFT50_24005		LFT50_RS24005	5169013	5170230	+	sigma-70 family RNA polymerase sigma factor		gene	gene-LFT50_RS24005	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS24005
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LFT50_RS24020	LFT50_24020	nusG	nusG	5171651	5172454	-	transcription termination/antitermination protein NusG		gene	gene-LFT50_RS24020	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS24020
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LFT50_RS24095	LFT50_24095		LFT50_RS24095	5180965	5181969	-	patatin-like phospholipase family protein		gene	gene-LFT50_RS24095	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS24095
LFT50_RS24100	LFT50_24100	cynS	cynS	5181970	5182437	-	cyanase		gene	gene-LFT50_RS24100	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LFT50_RS24100
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