yaaA 2945 .. 2957 + -4.8 -5.77571 AAGAATAATGAAAAA GCCA AAAGA TGGC TTTTTGTTTTTTAAT 84 33 MSH_RS00040 10917 .. 10952 + -5 -2.99545 AAATTATTAAAATAT TAATTCAAAAAAATGT GAAT AAATTTTTTTGAAATA TGTATAATATATAAG 52 23 MSH_RS00045 NONE MSH_RS00050 NONE MSH_RS00055 NONE MSH_RS00060 NONE MSH_RS00065 11605 .. 11622 + -4.2 -5.88565 AATATGGGGAAAAAA GATCAA AATTAA TTGATC TTTTTTTATTCTAAC 86 238 MSH_RS00075 NONE trmD NONE MSH_RS00085 14792 .. 14803 + -5.8 -5.52909 AATAATTAAAAAACC CCCA ATTT TGGG TTTTTTTACATCTTA 82 36 MSH_RS00090 NONE tsaB NONE tsaD 17153 .. 17170 + -7.1 -2.79912 CATGGATTATAAAAA GCAATTT TATT AAATTGC TGGCTTCTTTTTAAA 63 474 MSH_RS00125 NONE ffh 22014 .. 22026 + -7.7 -4.39696 AATGTTTTAAAAAAA GTGCA ATT TGCAC TTTCTTAATTTAAAA 81 31 MSH_RS00150 28501 .. 28534 + -15.7 -4.03806 TAAATAAAAAATTAT TTTTAAAAAGTACCT ACAA AGGTACTTTTTAAAA TTTATAAATTTGCTT 100 34 MSH_RS00160 30669 .. 30683 + -4.4 -2.52623 CTTAATTTAAATTAA TATTTT AGG AAAATA ATATTGTGAAAAAGA 48 26 MSH_RS00165 NONE MSH_RS00170 32729 .. 32757 + -2.5 -3.91084 AGAAAAAGGAAGATA ATGTCAAGGAAAT TAA ATTTTCTTGAAAA TTTAATTGAAAATGA 49 25 MSH_RS00175 NONE ulaD NONE MSH_RS00185 NONE araD NONE MSH_RS00195 36878 .. 36909 + -7.5 -5.7946 ACTTCCAAGTTACCA CTCCCAAAAAAAT ATTAAA ATTTTTTTAGGAG TTTTTTTATTAAAAA 100 91 MSH_RS00205 38140 .. 38164 + -4.5 -4.76213 CTTTATAATATGGGA CATAAAATA ATTTTCA TATTTTATG TTTTCTTAAATTTAT 68 506 MSH_RS00230 42978 .. 42988 + -6.8 -3.68853 GTTTAATGATTGGAT CAGC AAT GCTG TTTGGACATTTTTCA 68 132 MSH_RS00320 NONE MSH_RS00325 NONE MSH_RS00330 NONE MSH_RS00335 NONE MSH_RS00340 67018 .. 67032 + -5.6 -3.82191 CGAACCCACAACACA CGGGGT TGA AACCCG TTGTTCTACCGTTGA 64 66 MSH_RS00370 69710 .. 69725 + -3.3 -5.63517 ATTGCAAAACAAAAA CTGAA TAAATT TTCAG TTTTTTGTTTACAAA 77 43 MSH_RS00380 70704 .. 70734 + -13.6 -2.74292 TTCAAAAGAAGTACT TATAAAAGTGGTCT AAT AGACCATTTTTATA TGCTATAATTATTTG 91 10 MSH_RS00385 70835 .. 70865 + -8.5 -5.75538 TCGTTCGCCCCATAT GAAAAAAGATAGC GCGTA GCTATCTTTTTTG TTTTTATTTTTTAAC 100 29 MSH_RS00410 NONE MSH_RS00415 NONE MSH_RS00420 NONE MSH_RS00425 NONE MSH_RS00430 NONE MSH_RS00435 80847 .. 80864 + -9.9 -4.03413 AACGTTAATTTATTT TGCATGC AATT GCATGCA TTTATATGCGAGCGT 93 33 MSH_RS00440 NONE MSH_RS00445 82408 .. 82428 + -10.5 -5.35222 GAAAATAAAAAACCT GAGTTTCCA AGT TGGAAGCTC TTTTTTATACCTTTT 100 69 MSH_RS00450 84210 .. 84238 + -11.9 -5.87996 TAAAAGCGCAAAAAA CGAATACACCT TATTTAT AGGTGTATTCG TTTTTTTCTTCATTA 100 43 MSH_RS00465 NONE MSH_RS00470 86901 .. 86917 + -8.1 -4.93318 AAGTGAAATAAAAAA TGCAATT TGA AATTGCA TTTTTATACATTGTA 91 30 MSH_RS00505 94948 .. 94987 + -16.2 -2.9176 TTCTAATTAAAATTG CAAATAAAAAAGTAAGAG AAAA TTCTTACTTTTTTATTTG TCTCTAACTAAAATT 100 35 MSH_RS00570 106238 .. 106272 + -14.6 -4.68655 AATAATACTTAATTT CAACAAAAAAGTAAGC TAA GCTTACTTTTTTGTTA TTTATTTTCGAGTTA 100 224 MSH_RS00640 NONE MSH_RS00645 NONE MSH_RS00650 123664 .. 123705 + -12 -2.62246 TCTTAAGTAACAAAG GTAACAAAAAAATATCGA AATTAA TCGATATTTTTTTGTTAA ATTGATTCGCATTAC 88 31 MSH_RS00710 NONE MSH_RS00715 NONE MSH_RS00720 NONE MSH_RS00725 NONE MSH_RS00730 NONE MSH_RS00735 141628 .. 141648 + -12.7 -5.55001 CAATTTAATAAAATT GCCGATTTT TAA AAAATCGGC TTTTATTTTTTATTA 100 254 MSH_RS00745 144426 .. 144463 + -16.1 -3.75153 AAACAATAGAAAACA CTAAATAAAAATCAATT TAAA AATTGATTTTTATTTAG TTTAAATTAAGAAAA 100 32 MSH_RS00750 NONE MSH_RS00755 NONE MSH_RS00760 NONE MSH_RS00765 NONE MSH_RS00770 150128 .. 150145 + -3.4 -5.5074 AATAAAACAAAAAAA CTGGCA TAAATC TGCTAG TTTTTTATTGCATTG 73 36 MSH_RS00790 NONE MSH_RS00795 153899 .. 153930 + -16.2 -4.55128 AAATTTAAAAAAGAA TACTAAAAAATGCC TTTT GGCATTTTTTAGTA TTTTACTTTGGAAAT 100 20 MSH_RS00810 NONE MSH_RS00815 158701 .. 158716 + -3.3 -6.08342 AAGACGAAAATTAAA CATTC TTTTTT GAATG TTTTTTTGTTTATTA 83 27 MSH_RS00820 NONE MSH_RS00825 160411 .. 160428 + -5.6 -5.22312 AAAGACATCAAAAAA CAATCC TAAGTT GGATTG TTTTTTGCTATAAAT 78 17 MSH_RS00845 NONE MSH_RS00850 NONE MSH_RS00855 NONE MSH_RS00860 NONE MSH_RS00865 NONE MSH_RS00870 NONE MSH_RS00875 173741 .. 173769 + -16.3 -3.63336 CTTAAAATCCCTAAA CAAAAAACCGAAA TAG TTTCGGTTTTTTG TTTAGCCTGCTATCT 100 36 MSH_RS00905 179184 .. 179197 + -3.1 -6.28401 ATAAAATGAAAAAAA GAACG CATT TGTTC TTTTTTTGTTTTTTA 85 37 MSH_RS00910 NONE MSH_RS00915 180977 .. 181008 + -10.6 -4.5477 GCTTTTTTATTACTT TATTTATATATTTA TTAT TAAATATATAAATA TTTTATAGTCTATTA 100 232 MSH_RS00920 182675 .. 182703 + -4 -5.90981 AATAATTATTAAAAA CAAATACTGTTT GCATA AAACGATATTTG TTTTTTTTAGTCTAC 83 39 MSH_RS00960 193359 .. 193370 + -4.4 -5.80727 TTTAACTATTAAAAA TAGC TAAG GCTA TTTTTTCTTCTTTTT 82 29 MSH_RS00965 NONE trpS NONE MSH_RS00975 NONE MSH_RS00980 197898 .. 197929 + -6.1 -5.1417 AAAATTACAAAAAAT TAAAAGTTGTCAT GTCAAA GTGACAATTTTTA TTTTTAATTTTGTAA 80 23 MSH_RS00985 199465 .. 199509 + -16.1 -5.38054 TTCTTGAAATAGAAT AGCAACTAAAAAAGCTTTAGA AAT TCTAAAGCTTTTTTAGTTGGA TTTTTATTTGTAAGG 100 24 MSH_RS01005 204122 .. 204149 + -12.8 -5.15117 AATGAAGAAAAAAAA CGAATACGCCAT AAAT AAGGCGTATTCG TTTTTTGCGCTTTTA 100 308 MSH_RS01070 NONE MSH_RS01075 NONE MSH_RS01080 NONE MSH_RS01085 NONE MSH_RS01090 227900 .. 227920 + -2.6 -3.26428 CAATTCAAACTAGGA GTTTTATG AAAAA CAAAAAAC TTAAATTAATTCTTG 42 28 MSH_RS01095 228458 .. 228473 + -4.8 -2.94858 TAATTACGTTTTATA TAAATC TGTT GATTTA ATTGTTCCTTCTTTA 52 210 MSH_RS01115 NONE MSH_RS01120 235995 .. 236017 + -7 -4.88067 GTTTTAAAAAATATG TAGCGCCG ATTATTC CGGCGTTA TTTTTATAACTAGCT 85 47 MSH_RS01130 NONE MSH_RS01135 NONE MSH_RS01140 238928 .. 238964 + -15.6 -2.53018 AAATAATAAAATTCA TAATTAAAAATCACCA AATTC TGGTGATTTTTAATTA GCTTATTTTGCTTTT 100 35 gap 296744 .. 296766 + -6.4 -4.35926 ACAAGTTTTTTCACA CTTGCAAT CTTTACA ATTGCAAG TTTTACATTTACAAT 73 155 MSH_RS01370 298621 .. 298635 + -4.4 -3.57915 GCCAGAAAATAATCA TATTTT AGT AAAATA TATTTACTTAATATA 54 29 pdhA NONE MSH_RS01380 300765 .. 300775 + -5.4 -2.95113 GTAGATAAAGTTAAA GAAG TTA CTTC ATTTAAATTTTAGGA 55 2 MSH_RS01385 NONE lpdA 303629 .. 303647 + -11.8 -5.55001 CAATTTAATAAAATT GCCGATTT TAA AAATCGGC TTTTATTTTTTATTA 100 101 MSH_RS01400 307437 .. 307465 + -10.7 -5.9663 AAAAAGAAATTTAGA TATTTTAAATATT AAA AATATTTAAAATA TTTTTTTTAATATTT 100 27 MSH_RS01415 310918 .. 310946 + -12.1 -6.12458 TTGAGACTTTTTGAA TTTCTTAATATAT TTC ATATATTAAGAAA TTTTTTATTTTTTTC 100 282 MSH_RS01435 NONE MSH_RS01440 318383 .. 318393 + -2.6 -4.56775 TAACAAAAATATAAA TTTT AGA AAAA TTTTTGAAAAAGAAT 57 171 MSH_RS01445 318840 .. 318871 + -3.9 -2.88054 ATACAGTTAGTGACC CAAAATAAGTGAT CAAATT ATTACCTATTTTG ATTTGCATTATAACA 45 18 MSH_RS01450 319563 .. 319593 + -7 -5.40474 CCTTTCAAATTAAAA CCTGCTAGTT AAAATCAAAAA AACTAGCAGG TTTTTTTGAAAAAAT 90 385 MSH_RS01455 320482 .. 320500 + -8.2 -5.55001 CAATTTAATAAAATT GTCGATTT TTA AAATCGGC TTTTATTTTTTATTA 100 253 MSH_RS01470 NONE MSH_RS01475 NONE MSH_RS01480 325353 .. 325366 + -2.5 -2.59431 TACTAATTAAAATTT TAAAA ATTG TTTTA TAAATTATGAAAAAA 39 9 MSH_RS01485 NONE MSH_RS01490 NONE MSH_RS01495 328166 .. 328176 + -2.6 -2.62983 CAACTTTCAATTCAT TTTT AGG AAAA TAATATGAAAATAGG 39 12 nadD NONE MSH_RS01505 329980 .. 329990 + -4 -4.41047 GAAAATTAGCGTTTT TTTG TTG CAAA TTTTACTTCGAAAAT 60 32 MSH_RS01510 332707 .. 332718 + -5.8 -6.37666 AAGCAAAACAAAAAA GCCA ATTT TGGC TTTTTTTTGTTTTAT 100 52 MSH_RS01555 NONE MSH_RS01560 NONE MSH_RS01565 NONE glyA 349079 .. 349107 + -10.6 -3.64049 TAAAAAAATACTAAA TAAAAATGTCAA ACATC TTGACATTTTTA TTTCGCGGTTGTTAC 91 27 MSH_RS01605 NONE MSH_RS01610 NONE pfkA 360092 .. 360120 + -7.5 -4.19276 TAATGAAGAAAAAAA CGAATACACCT ATAAATA AGGCGTATTCG TTTTCGCGCTTTTAA 77 145 MSH_RS01655 NONE MSH_RS01660 NONE MSH_RS01665 NONE MSH_RS01670 NONE MSH_RS01675 NONE MSH_RS01680 NONE MSH_RS01685 386428 .. 386453 + -8.5 -5.73563 AATTAATAATAAAAG TAAATAGCTTT TAGT AGAGCTATTTA TTTTTTTAATTTAAT 100 55 MSH_RS01690 NONE MSH_RS01695 NONE MSH_RS01700 389207 .. 389228 + -5.3 -3.97446 CTTAATTAGGAAATA TAAAAAGCT AATA AGTTTTTTA TTTACATTTATTTAT 62 81 MSH_RS01705 NONE MSH_RS01710 390873 .. 390889 + -5.1 -4.37198 AAAAAAACAAAAAAA GCTCC AACAAAG GGAGC TTTTAAATTTCAATT 64 39 MSH_RS01800 NONE MSH_RS01805 NONE MSH_RS01810 416119 .. 416133 + -4.4 -2.8547 GAATCTAGCTAGAAT TATTAA CTT TTAATA TATAATATAAAAAAT 49 29 rpmG NONE secE NONE MSH_RS01825 417126 .. 417140 + -3.6 -4.97159 CTAACACGTATAGAA CGTAAT TAA ATTATG TTATTTTTTATTTTT 67 17 MSH_RS01830 NONE MSH_RS01835 NONE MSH_RS01840 420173 .. 420190 + -9.9 -5.66926 TATTATTTTGGTTTT CTTCTGG TTCT CCAGAAG TTTTATTTTTTTTAC 100 56 MSH_RS01875 NONE MSH_RS01880 428423 .. 428445 + -2.7 -5.2197 AAAAACTCTATGAGT AAGTAGCAGC ACTA GC-GCTACTA TTTTTACTTTTTGTG 68 519 MSH_RS01895 431812 .. 431845 + -7.8 -4.78107 AAAGGATAAGAAAAA TTAAAAAACC-TCTA TTTTT TAGATGGTTTTTTAA TTTTTAATCATAATA 86 32 MSH_RS01900 NONE MSH_RS01905 NONE MSH_RS01910 NONE MSH_RS01915 NONE MSH_RS01920 437281 .. 437301 + -2.7 -3.91434 ATTTTTTTATATTAA TTTTAATTA TGT TAATTGGAA TTTCTGGAATGATTT 49 49 MSH_RS01925 NONE hpt 438499 .. 438526 + -7.9 -4.38712 TCAAATGAATAATTT TTAAAAATCGC TTCAAT GCGGTTTTTAA TTTTCTAAAAATGCA 81 29 MSH_RS01935 NONE MSH_RS01940 NONE MSH_RS01945 NONE MSH_RS01950 NONE MSH_RS01955 444205 .. 444249 + -10.3 -5.4477 TAGAAAACTTTAAAA TAGGCGATTAAAAAAACAGAA ATT TTCTGTTTTTTTAATATCCAA TTTTTTTAAGAATTT 100 28 MSH_RS01985 NONE MSH_RS01990 NONE MSH_RS01995 450760 .. 450777 + -9.9 -5.82388 TTAAACACTTTCAAA GTCGATG TTCT CATCGAC TTTTTTTTGCGCTTT 100 44 nrdF NONE MSH_RS02025 NONE MSH_RS02030 457508 .. 457522 + -8.6 -5.46698 TTTGGCAAACAAAAA CTAGCT TTA AGCTAG TTTTTTGATTTTAAC 100 90 rpsB NONE MSH_RS02095 468865 .. 468893 + -14.9 -4.24745 AAAATAATTTTGCTC TTAAAAAACTAGC GTT GCTAGTTTTTTAA TTTGTCTTGATAGTA 100 34 MSH_RS02105 NONE MSH_RS02110 473226 .. 473242 + -3.1 -4.87893 CATCAATTCATTTTT TAAATTT ACT AAGTTTA TTTTTAATTGAAATT 65 270 MSH_RS02125 NONE MSH_RS02130 477111 .. 477125 + -6.4 -5.86965 TTCATAAAATAAAAA TTCGCG CCT TGCGAA TTTTTTTTACTACAT 93 45 MSH_RS02140 480367 .. 480390 + -9.8 -6.07969 TTTAAGCCTAAAAAA TAAAAAAGCA TTTC TGCTTTTTTA TTTTTTTTCATTTTG 100 23 MSH_RS02195 NONE MSH_RS02200 491937 .. 491972 + -7.8 -5.58209 TTTTTTAGATTTTTT G-CAAAGAAAAACCACT TTA AGTGGTTTCTTTTTGAC TTTTTTTGCATTTGC 100 135 MSH_RS02240 NONE MSH_RS02245 507387 .. 507411 + -6.6 -4.47977 ATTGTTTTATGGAAT TTCTTTTTGA TATCT TCAAGAAGAA TTATTTTCTGTTGTT 75 313 MSH_RS02255 509012 .. 509023 + -5.8 -2.95111 TCGTTGGCAAAAGAG GAGC TAAG GCTC ATTTACTGCTTTTCC 55 180 MSH_RS02275 NONE MSH_RS02280 NONE MSH_RS02285 514202 .. 514216 + -3.6 -4.74504 AAAATACCTTGCGGG GTATTT TTA AAATGC TTTTTGACTTGAAAT 64 39 MSH_RS02300 NONE dnaG NONE MSH_RS02310 NONE MSH_RS02315 522300 .. 522349 + -9.7 -5.03314 AATAAGCCTGCCATA CAAGGTAATATAAAAAATTTGCA ACAA TGCAAATTTTTTATATTCAATTG TTTTTTAGACGTAAA 100 13 MSH_RS02325 534533 .. 534552 + -9.4 -5.90231 AATTAAAACCAAAAA CAAAAGCA AAAA TGCTTTTG TTTTTTTGTATTTGT 100 39 MSH_RS02335 535054 .. 535064 + -3.2 -2.71011 TCGAATCCTGTTGGG TCCA CCA TGGG TGATTACCCAAGCCT 43 19 MSH_RS02340 NONE MSH_RS02345 NONE MSH_RS02350 535440 .. 535456 + -9.5 -6.25741 CACCTCGAAGTATAA CTTCGTT TCA AACGAAG TTTTTTTTATTATTT 100 113 MSH_RS02355 536578 .. 536614 + -15.6 -3.38812 ATTTTTGAAAAACAA TAATTAAAAAACTGCT TATAT AGCAGTTTTTTAATTA TATTATTCGAAAGAA 100 67 MSH_RS02435 NONE MSH_RS02440 NONE ssrA 562637 .. 562677 + -10.1 -3.95677 TATGTTTTTCACCAA TAAAAAAAATTATGCCCTT TCA AAAAGCATAATTTTTTTTA TTGGTTTTTTCGCTT 93 41 MSH_RS02480 576646 .. 576656 + -5.4 -3.15274 ATTGCAATAATTATT CGTT AAC AACG TCTGTTAAATATTTT 56 31 lepA 578958 .. 578983 + -7.7 -5.46698 CACCGTAAAATCTAA CAATAACAATC AATA GATTGTTTTTG TTTTTTAATTTTAAA 95 101 MSH_RS02500 580963 .. 580973 + -6.8 -5.52986 AGTAAATTTAAAAAA TGCC ATT GGCA TTTTTTTAATAAGCT 88 36 MSH_RS02520 583777 .. 583798 + -6 -5.41746 TTTTATTTTTCCAAA TATAGAAG CCGATA CTTCTATA TTTTTTTGCGCCATT 86 412 MSH_RS02555 589503 .. 589515 + -3.5 -3.6512 AACCTTTTTGTCAAT TAATA TAG TATTA TTTAGACATTATTTA 49 46 MSH_RS02560 NONE MSH_RS02565 593016 .. 593032 + -9.5 -5.25893 AATTCATAAAAAAAA TAAGGCA AAT TGCCTTA TTTTTTGGTGTCTAT 100 32 MSH_RS02575 NONE MSH_RS02580 NONE MSH_RS02585 596649 .. 596664 + -6.2 -5.80003 CAGAAAATGAAAAAA TTTGCT ATTT AGCAAA TTTTTTATTTGTTGA 87 14 MSH_RS02600 NONE MSH_RS02605 NONE MSH_RS02610 NONE MSH_RS02615 605617 .. 605662 + -6.6 -4.54477 AGAACTAAATCTTAA TTAATAATTGAAAAAGCC-TA CAAAT TAGGGCTTTTTTAATTATGAA TTTTATAAATTTTCA 75 26 MSH_RS02620 NONE MSH_RS02625 NONE MSH_RS02630 NONE MSH_RS02635 NONE MSH_RS02640 614189 .. 614204 + -3.3 -5.60556 AAACAAAAAAGAAAA GTACT GTAAAA AGTAC TTTTTGTTTTATCTT 73 44 MSH_RS02660 NONE MSH_RS02665 619545 .. 619566 + -11.7 -4.56597 GCTTAATAATTCAAA TAAAAGCCC AACA GGGCTTTTA TTTTTAAAAGAGCGA 100 35 ptsP 621382 .. 621403 + -2.9 -5.95449 AAAAATGTCGCCATC TACGCAAGT AAAA ACTGGCGCA TTTTTTATTTTATTT 85 80 MSH_RS02715 NONE MSH_RS02720 NONE rpsR 633565 .. 633579 + -8.5 -5.80727 TAAATTAACAAAACC GCCGC TAAAT GCGGC TTTTTTATTATTTTT 100 41 MSH_RS02730 NONE MSH_RS02735 NONE MSH_RS02740 NONE MSH_RS02745 NONE MSH_RS02750 637631 .. 637651 + -12.7 -5.75538 CAATTTAATAAAATT GCCGATTTT TAA AAAATCGGC TTTTTATTTTTTAAA 100 80 MSH_RS02755 638284 .. 638294 + -2.6 -4.19648 TGATTTTTTGTATTT TTAA TTA TTAA TTTAGTTTCTCTGTG 53 22 MSH_RS02760 639096 .. 639113 + -7.1 -5.5074 AAAAAATAAAATTAA TGAACAA TTTA TTGTTCA TTTTTTATTAAATTA 91 39 MSH_RS02765 640688 .. 640701 + -2.5 -5.95449 TTTAAAAAATAAGAA TTATA TTTT TATAA TTTTTTGTTTTGTTT 76 176 MSH_RS02770 642647 .. 642666 + -6.6 -5.9362 TGGGGAATAAAAAAA TTATGAAA ATCA TTTCATAA TTTTTTTATATTTTA 93 31 MSH_RS02810 653152 .. 653167 + -9 -5.24003 TGTTGCGAAATAAAA TTGGGC AAAA GCCCAA TTTTTGATTTTTATT 100 28 MSH_RS02955 NONE MSH_RS02960 NONE MSH_RS02965 NONE MSH_RS02970 678207 .. 678217 + -5.4 -3.10789 AATGATGACAGCGAT GCAA GAA TTGC TCATTTGTATCTATT 54 449 cas9 690262 .. 690275 + -8.1 -6.02914 TAGCTGCCGTAAACG CCGAG GTAA CTCGG TTTTTTTTATATAAA 100 148 MSH_RS03035 NONE cas2 691851 .. 691869 + -6.2 -4.05788 TGAAGAAAATAATTC TAAATATT TAA AATATTTA TTTAATTTAGAAAAC 68 384 MSH_RS03060 696490 .. 696504 + -5.7 -5.8096 CACTTAAATATTGAA CCACA CATTT TGTGG TTTTTATTTTTTATA 86 506 MSH_RS03080 701138 .. 701167 + -5.1 -5.8096 TCTGTATTATTAAAT TAAAAGCAAGG TTTTTGTT CCTTGCTTTTC TTTTTATTTTTTGTC 84 123 tig 713021 .. 713047 + -8.1 -5.98675 CATTTTATAAACAAA TCTCAAAGCCA TTTTT TGGTTTTGGGA TTTTTTCTTTTTATA 100 196 MSH_RS03145 NONE MSH_RS03150 NONE MSH_RS03155 715896 .. 715926 + -4.1 -6.11229 AATAATTTTAAAAAT TAAAAACCACATC AATGC GATATGGTTTTTC TTTTTTTATTTTAGT 86 39 MSH_RS03205 735638 .. 735659 + -6.7 -5.56568 CTTTCAGTTCAAGAA TCAGATGAT TAAA ATCATTTGA TTTTTTTAATACTAT 88 14 MSH_RS03210 736581 .. 736595 + -7.2 -3.39061 TGTAAGTTATTAGAG TGTAGT AAA ACTACA TCGTTTTTATTAGGA 67 205 MSH_RS03220 NONE MSH_RS03225 739197 .. 739238 + -9 -2.83403 GCAAAGTAAAATAAA AAAACAAAAAATGCCTAG TAGTAT CTACGCATTTTTTGTTTA ATTTAATAACGAAAA 73 27 MSH_RS03385 760976 .. 761010 + -3.9 -5.45802 AGTGCAACATAAAAA CTTAATTATA-TAAAG TTTT CTTTATTATGATTGAG TTTTTCTTTTAAAAA 75 84 MSH_RS03410 NONE MSH_RS03415 NONE MSH_RS03420 770539 .. 770570 + -12.6 -5.38497 CCAAGTATTAGTTTT TGTAAAGAAGCGTCA ATA TGACGCTT-TTTACA TTTTTTAATTTAAGT 100 55 MSH_RS03425 NONE MSH_RS03430 NONE MSH_RS03435 773239 .. 773261 + -4.9 -5.46698 TAATTAAATAAATAA AAAATAGGC CTTTT GCCTATTTA TTTTTTGCTTTTAAG 79 30 ylqF 777336 .. 777372 + -4.8 -5.95449 AACTTCTTTTGGAAA CATATATAAATCTAAAT TAAA AATTAG-TTTATATATG TTTTTTGTTTTATTT 95 175 MSH_RS03465 778896 .. 778911 + -4.8 -3.41989 CTAAGCATTTGGTTG GTTTTA GCGC TAAAAC TTAAATTTTATAAAT 55 132 tuf 780194 .. 780210 + -6.6 -5.35354 ACAAAATAATAGAAG CTAGCA TCAAT TGCTAG TTTTTTCATTATATA 87 55 MSH_RS03475 NONE MSH_RS03480 781483 .. 781499 + -5.1 -5.90231 AAATTTATAAATTAA TAGTGGC TTA GCCGTTA TTTTTTTGTCTTTAT 88 31 MSH_RS03500 787569 .. 787582 + -2.5 -5.12617 TTTTTGTAAGTGGAG TTATT TATG AATAA TTTTTTAAATGGTTA 64 12 MSH_RS03505 NONE MSH_RS03510 NONE rnc NONE MSH_RS03520 793850 .. 793866 + -6.6 -5.58209 TTCGAAGCTCAAAAC TAGCCA TCGCT TGGCTA TTTTTTTGACTTTAA 88 23 MSH_RS03525 794628 .. 794638 + -4 -3.89614 TAACTCACACTGAAG TTAC TAG GTAA TTTATGGAACTTGAA 54 15 MSH_RS03530 795208 .. 795225 + -4.9 -5.81622 TTAATAATTGAAAAA GAGGAAA TTAT TTTCTTC TTTTTTTAATTTTCT 88 37 MSH_RS03540 NONE MSH_RS03545 NONE MSH_RS03550 798182 .. 798195 + -3.1 -4.20368 AATGAAAAATTTTTA TCAGG ATAT CTTGA TTTATATTAAACTAC 56 2 MSH_RS03555 798691 .. 798707 + -2.3 -3.02984 TTAGAGTTAAGAAAA TTAAATC AAA GCTTTAA CTTTATAGATTTTAA 40 52 MSH_RS03560 NONE MSH_RS03565 799414 .. 799429 + -7.6 -5.03314 ATTTTTAATTAAAAA GCACAA TAAT TTGTGC TTTTTTCGGCGTAAG 90 81 MSH_RS03615 814542 .. 814569 + -9.4 -3.63367 TAACTTTTATACAAA TAAAAAAGTTGT TTAT GCAACTTTTTTA ATTTTTCTTGGAGAA 83 70 MSH_RS03620 NONE MSH_RS03625 NONE MSH_RS03630 NONE MSH_RS03635 NONE MSH_RS03600 809402 .. 809429 - -5.8 -4.56597 TTCTTTTTCTAAAAA TGAAAATAGTTT TTCT AAATTATTTTCA TAATATTTAAATTTA 71 484 MSH_RS03590 NONE MSH_RS03585 NONE MSH_RS03580 801993 .. 802024 - -6.9 -5.63504 AATTTCAGAAAAAAA TAAAATAACCAAA AAAGAA TTTGATTATTTTA ATACTGTTTTTTAAA 90 76 MSH_RS03575 NONE MSH_RS03570 799414 .. 799429 - -7.6 -4.86621 ATTTTTAATTAAAAA GCACAA TAAT TTGTGC TTTTTTCGGCGTAAG 86 49 MSH_RS03495 NONE MSH_RS03490 784741 .. 784755 - -3.5 -5.53288 CCCAAGGCAAAAAAA GCGAT ACACA ACCGC TTTTAGAAAAATCTA 73 92 MSH_RS03485 781544 .. 781560 - -9.5 -5.98675 CATAAAAACAAAAAA CTTTAGC GAA GCTAAAG CTTTGAAAATTATTC 100 102 MSH_RS03460 777114 .. 777167 - -6.5 -6.09196 TTTAAAAGAAAAAAA CTTAGA-TTTAAACAAAGCTTATA TTAAATT TATTAACTTTGTTCAAAATCTAAG TGGAGTAACTTACGA 100 41 MSH_RS03450 NONE MSH_RS03445 NONE MSH_RS03440 773243 .. 773257 - -5.7 -5.85425 TAAATAAATAAAAAA TAGGC CTTTT GCCTA TTTATTTTTTGCTTT 90 40 MSH_RS03405 766441 .. 766463 - -8.5 -5.63504 AATTTTATAAAAAAA CAACACCCT ATTTA AGAGTGTTG CACTGGGAATGATAA 100 75 MSH_RS03400 765293 .. 765321 - -13.3 -5.5604 GTAATGAAGAAAAAA CGAATACGCCT ATAAATA AGGCGTATTCG TTCCCAAATTCTCAC 100 371 MSH_RS03395 762150 .. 762170 - -10.5 -5.35222 AAAAGGTATAAAAAA GAGCTTCCA ACT TGGAAACTC AAGATTTACTACAAA 100 114 MSH_RS03390 760927 .. 760938 - -4.4 -5.71638 GAATAATTAAAAAAA TGCA ATTT TGCA TTTTTCCCAAATTCT 82 68 MSH_RS03380 NONE MSH_RS03375 NONE coaD NONE MSH_RS03365 NONE MSH_RS03360 NONE pyk NONE MSH_RS03350 NONE MSH_RS03345 NONE MSH_RS03340 750128 .. 750158 - -2.7 -5.83226 AATCTAACAAAAAAA TTCACAAAATTTT AGCTA AAAATAATGTGAA TTTTTTAAGTGTAAT 76 72 MSH_RS03335 NONE MSH_RS03330 NONE MSH_RS03325 NONE MSH_RS03320 NONE MSH_RS03315 NONE MSH_RS03310 NONE MSH_RS03305 NONE MSH_RS03300 NONE MSH_RS03295 NONE MSH_RS03290 NONE rpsQ NONE MSH_RS03280 744232 .. 744245 - -2.4 -3.22906 CTACTCCTATAAAAC CTCT AGTGCA AGAG ATACGATTTTTGGAT 41 3 MSH_RS03275 NONE MSH_RS03270 NONE MSH_RS03265 NONE MSH_RS03260 NONE MSH_RS03255 742190 .. 742203 - -2.4 -2.58236 TAAATTCATATTAAT GCTT ATTTAG AAGC TGTTTTCCCTTCTTT 38 14 MSH_RS03250 NONE MSH_RS03245 741086 .. 741098 - -4.9 -2.94872 TTTAAAGACATTATA GTAAA TCC TTTAC ATCTTTATCTCTAAC 52 8 MSH_RS03240 NONE rplK NONE MSH_RS03230 739208 .. 739227 - -2.1 -6.12458 TAAAAAAACAAAAAA TGCCTAG TAGTAT CTACGCA TTTTTTGTTTAATTT 79 96 MSH_RS03215 736348 .. 736369 - -8.1 -5.48213 TATGGAAAAGAAAAA CTACCATTGG TAG CCAA-GGTAG TTTTCAAGTTTAAAG 95 47 MSH_RS03200 NONE MSH_RS03195 NONE tilS 730936 .. 730964 - -2.6 -2.71924 CATTTTTTCCTAAAT TTGGTTTTTTTA AGCAG CAAAAAAACTAA GAAATTTTCACTTAA 39 37 MSH_RS03185 728769 .. 728797 - -13.5 -4.09243 TATATCCTTGGAAAA TAAAATAATTAGC AAA GCTAATTATTTTA AATATACAAATTAAG 100 72 MSH_RS03180 NONE MSH_RS03175 NONE lysS 718237 .. 718253 - -3.7 -3.82748 TATTATATAAAAAAG CAAGG TAGTTAG CCTTG ACTTTTTTTGTTTTT 52 17 MSH_RS03165 NONE MSH_RS03160 715902 .. 715920 - -6 -5.18355 TTTAAAAATTAAAAA CCACATCA ATG CGATATGG TTTTTCTTTTTTTAT 80 37 MSH_RS03140 NONE MSH_RS03135 713087 .. 713120 - -3.3 -5.33921 AAAGTAATTAAAAAA TAAAAAATGAACACA TTAA CATGTCCATTATTTA TATTTTATTTTCAAT 70 57 MSH_RS03125 708812 .. 708833 - -3.1 -6.01369 CAAATAATAAAAAAA TACAAACTT AATA AAATCTGTA TTTTTCAAATTAATT 83 45 MSH_RS03120 NONE rnpA NONE MSH_RS03110 706182 .. 706195 - -6.7 -5.38549 TTTAAATAACAAAAA TCTGC ACAT GCAGA TTTATGCTGGTTTTT 87 27 MSH_RS03105 705019 .. 705041 - -2.8 -3.54755 AGTTTTTAAATAATA CCAAAGTT ATTAAGA AACTTTGA CGAATTCTTTATGTT 45 12 MSH_RS03100 NONE MSH_RS03095 703040 .. 703058 - -7.5 -5.48303 ATAATTTTAAAAAAA CAAGCAA ATTAA TTGCTTG AATTTAATAAGTCTG 100 15 MSH_RS03090 NONE MSH_RS03085 701143 .. 701162 - -5 -4.59376 ATTATTAAATTAAAA GCAAGG TTTTTGTT CCTTGC TTTTCTTTTTATTTT 68 34 MSH_RS03075 699734 .. 699760 - -10.4 -5.1101 TTATTATTTAAAAAA TTAAAAGCAAAA TTA CTTTGCTTTTAA AACGCTGGCTACAAA 100 11 MSH_RS03070 NONE MSH_RS03065 696151 .. 696166 - -6.8 -5.63012 AAAAAGAAAGAAAAA TGCCCC TTTC GGAGCA TTTACAAATCATCAT 88 367 MSH_RS03055 NONE MSH_RS03050 692234 .. 692268 - -13.8 -4.4267 TTTTAAAACTTAAAA CTACGAATAACCCTAC AAT ATAGAGCTATTCGTAG TTTTTTATAATACAA 100 44 MSH_RS03025 NONE MSH_RS03020 684085 .. 684099 - -2.2 -2.78695 GCCATATAAAGTAAG TTTAAT TAT ATCAAA AAATACTACCAAAAT 39 62 map 683334 .. 683347 - -2.4 -2.93853 TTTTGCCAATTAAAT TCCT TTCGTT AGGA TAATTCCTTTTCCGT 39 6 MSH_RS03010 NONE MSH_RS03005 NONE MSH_RS03000 NONE MSH_RS02995 NONE MSH_RS02990 NONE MSH_RS02985 680802 .. 680830 - -8.4 -4.37658 AAGGCTTTTATAAAA TGTAAAAGTTGCA TATT TGCAACTTTT-CA AATATTAAACTAACT 82 30 MSH_RS02980 NONE ffs 677735 .. 677761 - -6.8 -4.79384 AGAACAAAACGAAAA TTTAGTTTTAGA AAA TTTAAAACTAAA AGCTGATTTGAAATT 78 119 MSH_RS02950 NONE MSH_RS02945 NONE MSH_RS02940 NONE MSH_RS02935 NONE MSH_RS02930 670772 .. 670796 - -8.8 -5.18371 TTCCAGAAAATAAAA TAAAAATTGC TGCGT GCAATTTTTA TTTACGTAATTTAAA 100 23 recA NONE MSH_RS02920 668804 .. 668817 - -3.9 -5.45652 ATCGTTAAGAAAAAA TTGTT TTTA AACAA GATAATTTAAAACTC 75 95 MSH_RS02915 667110 .. 667124 - -3.5 -5.53288 CCCAAGGCAAAAAAA GCGAT ACACA ACCGC TTTTAGAAAAATCTA 73 92 MSH_RS02910 663903 .. 663921 - -6.8 -6.32976 AAAAAAATAAAAAAA CTTTAGTT TTT AACCAAAG TTTATGAAAAATTTA 100 109 MSH_RS02905 662716 .. 662742 - -2.5 -5.73978 ATTATAAACAAAAAA TTAAAAAATAT ATCAA AAATTTTTTAA ATTATTTGCCTATTT 73 56 MSH_RS02900 NONE MSH_RS02895 NONE MSH_RS02890 NONE MSH_RS02885 NONE MSH_RS02880 NONE MSH_RS02875 NONE MSH_RS02870 NONE MSH_RS02865 661937 .. 661978 - -5.6 -5.94713 ATTTTATAAAAAAAA TATTTTATTTTTTAGC AAAAAATCAA ACTAAAAAATAAAATA CAAAAAATCTTTTTT 90 49 MSH_RS02860 NONE MSH_RS02855 658455 .. 658479 - -10.9 -4.61231 TCATATTTTGAAAAA TAAAAAACGCT ATA AGCGTCTTTTA TAAATTAATAATTGT 100 23 MSH_RS02840 656411 .. 656421 - -2.6 -4.15222 AGCTTTTGCAACAAA TAAA TCT TTTA GGTATTTTTGGCATT 51 276 rrf NONE MSH_RS02825 653881 .. 653896 - -6.2 -5.80364 ATTTTAATAAAAAAA TGCATT TTAT AATGCA TTTAAAATCTTTTTT 87 407 rplU NONE MSH_RS02815 653152 .. 653167 - -9 -4.86731 TGTTGCGAAATAAAA TTGGGC AAAA GCCCAA TTTTTGATTTTTATT 93 40 MSH_RS02805 649886 .. 649911 - -8.5 -4.13728 CATATATTTGTAAAA TATTTAAACCA TTAG TGGCTTAAATA TCACCTAGATTACCT 79 139 rrf 649562 .. 649602 - -4.4 -3.68761 ATTTTAAAATTATAA TTTTTTATTTTTTATTTT TTCTT AAAAAAGAAAATAAAAAA AAGCAGCTCCCGATT 56 23 MSH_RS02795 NONE MSH_RS02790 647262 .. 647272 - -4 -3.88498 TTTTGATACATTAAA TTTC TTG GAAA AGTTTATGTATTTTT 54 10 MSH_RS02785 NONE MSH_RS02780 644342 .. 644359 - -3.5 -6.02919 CGATAAATAAAAAAA TAGTCAT CGAA ATAACTA TAAATGGAATCAAAA 83 56 MSH_RS02775 642647 .. 642666 - -6.6 -5.7946 TGGGGAATAAAAAAA TTATGAAA ATCA TTTCATAA TTTTTTTATATTTTA 90 31 MSH_RS02710 630039 .. 630049 - -2.6 -3.26319 AATTGCCTATATTAA TAAT TAT ATTA ATAAAAACTAATTTG 42 33 MSH_RS02705 NONE MSH_RS02700 NONE MSH_RS02695 NONE MSH_RS02690 624162 .. 624172 - -2.6 -4.0896 AAACCCTTTCTAAAA TTAA GTC TTAA TGATTATAAAAAACA 51 94 MSH_RS02685 623095 .. 623109 - -7.2 -6.32976 AAAAAAATAAAAAAA TCAAGT TAG ACTTGA AATTTTTAAACTGCT 100 31 MSH_RS02680 NONE fmt 621233 .. 621250 - -8.5 -3.90766 TAGTCAGAAATACAA CTTTTGC AAGA GCAAAAG AAATCGCAAACCACG 80 94 whiA 616590 .. 616600 - -2.6 -2.96611 AAAAAAGTGTATATA TTTT AAC AAAA TAAAGTTCTATAAGC 41 33 MSH_RS02650 NONE MSH_RS02645 614184 .. 614209 - -3.4 -6.01725 AATAAAAACAAAAAA GAAAAGTACT GTAAAA AGTACTTTTT GTTTTATCTTTTTTA 83 38 MSH_RS02595 NONE MSH_RS02590 596649 .. 596664 - -6.2 -5.50313 CAGAAAATGAAAAAA TTTGCT ATTT AGCAAA TTTTTTATTTGTTGA 85 30 MSH_RS02570 593016 .. 593032 - -9.5 -5.97575 AATTCATAAAAAAAA TAAGGCA AAT TGCCTTA TTTTTTGGTGTCTAT 100 46 MSH_RS02550 NONE MSH_RS02545 NONE mgtE NONE MSH_RS02535 NONE MSH_RS02530 NONE pgsA 583258 .. 583283 - -7 -5.86465 AATAATAGAAAAAAA CCAATTTACC GAAGAA GATAAATTGG CTTTTAAAAAACAAA 100 129 MSH_RS02515 NONE MSH_RS02510 582464 .. 582478 - -8.6 -6.01725 AATAAAAATAAAAAA TCACCT TAA AGGTGA TATGGCTGCCTCAGT 100 28 MSH_RS02505 580954 .. 580982 - -10.5 -4.01135 CCCAAGAAGAGTAAA TTTAAAAAATGCC ATT GGCATTTTTTTAA TAAGCTCTCGCAAAA 95 22 MSH_RS02495 578439 .. 578473 - -5.9 -3.97088 TTTGACAAGATGAAA TCATATACAAAAGGA TTTGC TTCTTTTGAATATGA ATTAATTGGATATAA 65 424 MSH_RS02485 576560 .. 576578 - -6 -6.01725 AAGAAAAATAAAAAA TCTCTTCA TTT TGAAGAGC TTAAAGAAAATTCTA 100 88 MSH_RS02475 575274 .. 575301 - -7.3 -5.9667 AAAAATACAAAAAAA TTAAAATTGAA AAATAA TTCAATTTTAA GAGAATTTTTTGTTT 95 39 MSH_RS02470 NONE MSH_RS02465 567015 .. 567032 - -4.9 -6.32976 AAAAAAATAAAAAAA TAGCCAT TAAA ATAGCTA TTTTTTCGTTTTTTC 93 52 MSH_RS02460 NONE MSH_RS02455 564177 .. 564206 - -7.4 -4.95758 ATTATACTATAAAAA TAAAAAAGACTT TTTTAT AAGTCTTCTTTA TAGCTTTAATTATTT 83 31 MSH_RS02450 562646 .. 562668 - -6.4 -6.13503 CACCAATAAAAAAAA TTATGCCCTT TCA AAAAGCATAA TTTTTTTTATTGGTT 100 32 MSH_RS02430 NONE MSH_RS02425 559995 .. 560015 - -10.5 -5.35222 AAAAGGTATAAAAAA GAGCTTCCA ACT TGGAAACTC AGGTTTAAAAAAACG 100 73 MSH_RS02415 552920 .. 552940 - -10.5 -5.53079 AAAAGATATAAAAAA GAGCTTCCA ACT TGGAAACTC AGGTTTTAATTTTTA 100 222 MSH_RS02405 NONE MSH_RS02400 NONE MSH_RS02395 NONE MSH_RS02390 NONE MSH_RS02385 NONE MSH_RS02380 NONE MSH_RS02375 NONE MSH_RS02370 541137 .. 541158 - -7.5 -3.29043 AATTTTCTTTTATAA TTATAATTC TAAT GAATTATAA AAAGTTTAAGATTAC 68 137 MSH_RS02365 NONE MSH_RS02360 536578 .. 536614 - -15.6 -4.40963 ATTTTTGAAAAACAA TAATTAAAAAACTGCT TATAT AGCAGTTTTTTAATTA TATTATTCGAAAGAA 100 28 secG 522308 .. 522341 - -14.3 -3.26449 TGCCATACAAGGTAA TATAAAAAATTTGCA ACAA TGCAAATTTTTTATA TTCAATTGTTTTTTA 100 38 MSH_RS02295 NONE MSH_RS02290 514020 .. 514044 - -7.4 -3.51478 AGATGATAGAAGTAA TTCTTTTTTT GTAAG AAAAAAAGAA GAAAAAAATACTTAT 67 189 deoD NONE MSH_RS02265 NONE deoC 509668 .. 509679 - -4.4 -5.79595 TTGCAAAATAAAAAA TCCA ATAA TGGA TTTAATATTTGGTTT 82 27 MSH_RS02250 507685 .. 507696 - -2.2 -4.67234 ATTGAAGTTTAAAAA CCTC AAAA GAAG CCGTTATTTTTGTAA 56 87 MSH_RS02235 NONE hisS NONE MSH_RS02225 NONE MSH_RS02220 495871 .. 495899 - -4.7 -5.46698 TTGAAAATTAAAAAA GATCCTTCAAGG TAAATG CCCTGAAG-ATC TTTTTTGAAATTAAG 79 78 MSH_RS02215 NONE MSH_RS02210 NONE MSH_RS02205 491948 .. 491960 - -7.7 -5.27335 TTTTGCAAAGAAAAA CCACT TTA AGTGG TTTCTTTTTGACTTT 100 18 MSH_RS02190 491090 .. 491105 - -5.4 -5.65927 TAGGCAAATAAAAAA GCAAGC TCTC ACTTGC ATATGGTGCCCGGAA 86 29 efp NONE MSH_RS02180 NONE MSH_RS02175 NONE MSH_RS02170 487808 .. 487831 - -3.2 -3.43109 TATATTAGTTAAATA CTAAAAACTA AAAC TAGCATTTAG ATTTGTTTTTTCTTG 47 2 MSH_RS02165 NONE MSH_RS02160 NONE MSH_RS02155 NONE MSH_RS02150 NONE MSH_RS02145 480367 .. 480390 - -9.8 -5.09426 TTTAAGCCTAAAAAA TAAAAAAGCA TTTC TGCTTTTTTA TTTTTTTTCATTTTG 100 495 MSH_RS02135 477111 .. 477125 - -5.7 -5.54907 TTCATAAAATAAAAA TTCGC GCCTT GCGAA TTTTTTTTACTACAT 82 35 MSH_RS02120 475501 .. 475523 - -5 -5.9667 AAAAAGAGAAAAAAA TGGAAAAA ACCTAAG TTTTTCCA TTTCAAAATTTAAAT 88 46 MSH_RS02115 472786 .. 472796 - -2.6 -4.05208 ATCGATATTAAATAA TATT TCA AATA ACAAATGTGAAATTA 51 207 MSH_RS02100 468873 .. 468885 - -7.7 -5.00616 TTTGCTCTTAAAAAA CTAGC GTT GCTAG TTTTTTAATTTGTCT 90 22 MSH_RS02085 NONE MSH_RS02080 NONE atpE NONE atpF NONE atpH NONE MSH_RS02060 NONE MSH_RS02055 NONE atpD NONE MSH_RS02045 459763 .. 459776 - -3.9 -5.59655 TAAATTAATAAAAAA TAACA AAAA TGTTA ATTTTTACTTTTTAA 75 30 MSH_RS02040 459118 .. 459128 - -2.6 -4.75219 TAACTATCAATAAAA TTTT ATA AAAA TTTTTCAATTATTTT 59 17 MSH_RS02035 457508 .. 457522 - -8.6 -5.27335 TTTGGCAAACAAAAA CTAGCT TTA AGCTAG TTTTTTGATTTTAAC 100 43 MSH_RS02015 NONE MSH_RS02010 452092 .. 452105 - -5.3 -3.18115 GGCCCATAAAATAAT CATCT CAAG AGATG GCTTTATTTAATTTA 56 54 MSH_RS02005 451639 .. 451649 - -2.6 -2.56432 GAATTTAAAAATCAT TTTT TGG AAAA TTAAGCGTAAATTCC 39 4 MSH_RS02000 450405 .. 450429 - -8.7 -3.27525 TTGTTTTAAATTGAA TAAAGCCCCTA ATT TAAGAGCTTTA AAGCAAACTATGATA 75 341 MSH_RS01980 NONE MSH_RS01975 NONE ybeY NONE cdd NONE MSH_RS01960 444205 .. 444249 - -10.3 -4.29656 TAGAAAACTTTAAAA TAGGCGATTAAAAAAACAGAA ATT TTCTGTTTTTTTAATATCCAA TTTTTTTAAGAATTT 95 15 MSH_RS01890 NONE MSH_RS01885 427966 .. 427977 - -4.4 -6.11229 ATTAAAATAAAAAAA TAGC CTTA GCTA TTTAGTGCATGTGAA 89 27 MSH_RS01870 NONE MSH_RS01865 NONE MSH_RS01860 421640 .. 421653 - -2.5 -4.12942 GTAAAGTTTCTAAAA TTAAA TCCA TTTAA TTAGTATTTTTTAAG 51 26 MSH_RS01855 NONE MSH_RS01850 NONE MSH_RS01845 420005 .. 420053 - -3.6 -5.83226 AATCGAAGAAAAAAA CTAACTTTTACTTTAAATAGAAAT TTT AATTCCACT-AAAGTAAA-GTTAG CTTATGAAAAATTAA 84 98 MSH_RS01795 NONE MSH_RS01790 NONE fba NONE MSH_RS01780 NONE grpE NONE MSH_RS01770 406734 .. 406771 - -8.7 -4.52873 TTTTTATAAAAATAA TAAAAAACGCTCTTTTT TGTT ACAAAAAGCGTCTTTTA TAAATTTATTTAATC 86 61 pepF NONE MSH_RS01760 NONE MSH_RS01755 NONE MSH_RS01750 NONE MSH_RS01745 397799 .. 397821 - -3.5 -5.03314 GCTAGTTCTAAAAAA GTATAAAAG TAATT CTTTTTTAC TTGTTTTCAAGATTT 65 423 MSH_RS01735 395362 .. 395381 - -7.2 -6.23317 ATAAAAATAAAAAAA CCAGAAAC AAAA GTTTCTAG TTTTCGGCAATGGTA 100 45 MSH_RS01730 NONE MSH_RS01725 NONE MSH_RS01720 NONE ftsZ 390873 .. 390889 - -5.1 -6.32976 AAAAAAACAAAAAAA GCTCC AACAAAG GGAGC TTTTAAATTTCAATT 93 103 MSH_RS01650 370538 .. 370562 - -11.7 -2.87029 AATAATTAAAAAATG TACTTATATAC TAA GTATATAAGTA ATAAGGTAAAAGGTA 88 214 MSH_RS01640 368117 .. 368135 - -11.8 -5.55001 TAATAAAAAATAAAA GCCGATTT TTA AAATCGGC AATTTTATTAAATTG 100 181 MSH_RS01635 365377 .. 365389 - -3.5 -2.98223 CACTTATATCATATA TATTT TTT AAATA ATTATTTTTATTAAC 45 353 MSH_RS01625 362077 .. 362108 - -9.7 -5.7946 TTTTTAATAAAAAAA CTCCCAAAAAAAT TTTAAT ATTTTTTTGAGAG TGATAACTTGGAAGT 100 89 MSH_RS01600 NONE MSH_RS01595 NONE rnr NONE MSH_RS01585 NONE MSH_RS01580 NONE MSH_RS01575 349072 .. 349114 - -8 -5.63374 CCAATACTAAAAAAA TACTAAATAAAAATGTCAAA CAT CTTGACATTTTTATTTCGCG GTTGTTACTTCAAAA 100 16 MSH_RS01550 NONE MSH_RS01545 NONE MSH_RS01540 NONE lon 337310 .. 337322 - -4.1 -3.51778 TCATTACATGAAACA CCAGT TAA ACTAG TTGAAGTAATAATTA 51 162 MSH_RS01530 335952 .. 335968 - -3.8 -3.38201 GAATATTTTGAAACA TCAATA CTAGC TATTGA TTTTGCTAATTTTCT 49 163 MSH_RS01525 NONE MSH_RS01520 334979 .. 334997 - -3.9 -5.60993 TTTTGCATAAAAAAA GCAAGTT TTATT AACTTAC AATTTTTAATGAAAT 75 231 MSH_RS01515 332707 .. 332718 - -5.8 -5.85244 AAGCAAAACAAAAAA GCCA ATTT TGGC TTTTTTTTGTTTTAT 90 59 MSH_RS01465 321979 .. 322011 - -9.4 -3.1355 TCTATTTACAGTGAA TCTAATATGAGGCAA CAAC TCGCCTCA-ATTAGA ATTGTAGCATAAAAT 80 56 MSH_RS01460 321656 .. 321687 - -9.7 -5.7946 TTTTTAATAAAAAAA CTCCCAAAAAAAT TTTAAT ATTTTTTTGAGAG TGATAACTTGGAAGT 100 93 MSH_RS01430 314219 .. 314246 - -11.6 -5.05505 ATTATAAATTAAAAA CTAATAACTATT TTAA AATAGTTATTAG TTTTTTGAATTTTAT 100 40 MSH_RS01425 312687 .. 312721 - -8.7 -5.31275 TTGTATTATAAAAAA CTACGAATAGCTCTA TATTG TAGGGTTATTCGTAG TTTTAAGTTTTAAAA 100 138 MSH_RS01405 307439 .. 307463 - -8.9 -3.0122 AAAGAAATTTAGATA TTTTAAATATT AAA AATATTTAAAA TATTTTTTTTAATAT 74 3 MSH_RS01355 291032 .. 291047 - -4.8 -4.01603 TAGCTAAATATTAAA TTTGAA AAAT TTCAAA AATATAAACTATCTT 61 162 MSH_RS01350 NONE MSH_RS01345 NONE MSH_RS01340 286794 .. 286808 - -5.7 -2.75844 CTGTTGATGCTAAAT CAGCT GTTGG AGCTG TTTGAGCCTCTGATG 53 328 MSH_RS01330 284707 .. 284723 - -5.2 -2.71364 TGATTCTTTTAATGA TGTTAG GTTAG CTAACA TTGTTGTAGCTTGAG 50 453 MSH_RS01315 281408 .. 281423 - -4.8 -3.06303 AAATAAAAAAATGCA TTTGAT AAAA ATCAAA AAAACTATAAGTATT 52 134 MSH_RS01305 279697 .. 279711 - -7.2 -4.2602 GAGATGAATAAAGAA CTCTAA TAG TTAGAG AGATTTGTTTAGGAT 75 397 MSH_RS01295 NONE MSH_RS01290 276682 .. 276697 - -4.8 -3.06303 AAATAAAAAAATGCA TTTGAT AAAA ATCAAA AAAACTATAAGTATT 52 134 MSH_RS01285 NONE MSH_RS01280 NONE MSH_RS01275 NONE MSH_RS01270 271701 .. 271714 - -2.5 -5.08824 TTTTTATTTAAAAAA TAAAA TAGT TTTTA ACTTAAATTAATTAA 62 75 MSH_RS01265 NONE MSH_RS01255 268029 .. 268044 - -4.8 -4.06185 TAGATAAATATTAAA TTTGAA AAAT TTCAAA AATATAAACCATCTT 61 156 MSH_RS01250 266740 .. 266752 - -7.7 -2.59431 TTTGTGGATAATCCA CTTGC ATT GCAAG ACCTTTAGAAACTAG 65 520 MSH_RS01245 NONE MSH_RS01235 263133 .. 263149 - -5.2 -2.71364 TGATTCTTTTAATGA TGTTAG GTTTT CTAACA TTGTTGTAGCTTGAG 50 453 MSH_RS01230 NONE MSH_RS01225 NONE MSH_RS01220 NONE MSH_RS01215 257743 .. 257753 - -4 -3.05819 TATAGATTTCTAATA GTTA GTG TAAC TGTTTCTAAAGAATC 46 415 MSH_RS01210 256979 .. 256991 - -4.9 -4.00097 ATAAGTGAACAATAA CTAAA AAT TTTAG GGCATGTTTTTGGTT 60 47 MSH_RS01205 NONE MSH_RS01200 NONE MSH_RS01195 252909 .. 252924 - -4.8 -4.06185 TAGATAAATATTAAA TTTGAA AAAT TTCAAA AATATAAACCATCTT 61 163 MSH_RS01190 NONE MSH_RS01185 NONE MSH_RS01180 NONE MSH_RS01175 247763 .. 247773 - -4 -3.05819 TATAGATTTCTAATA GTTA GTG TAAC TGTTTCTAAAGAATC 46 415 MSH_RS01170 246999 .. 247011 - -4.9 -4.00097 ATAAGTTAACAATAA CTAAA AAT TTTAG GGCATGTTTTTGGTT 60 47 MSH_RS01165 NONE MSH_RS01160 NONE MSH_RS01155 243060 .. 243088 - -13.4 -4.54821 ACTGTAATTATAAAA CAAAAAAGCCAA AATAG TTGGCTTTTTTG TAAAACATTTTGAGG 100 70 gap 241873 .. 241883 - -2.6 -3.60473 TATACATCAAATTAA TAAT TTA ATTA TATATTAATAATTAT 45 142 MSH_RS01145 238928 .. 238964 - -16.3 -2.89538 AAATAATAAAATTCA TAATTAAAAATCACCAA ATT CTGGTGATTTTTAATTA GCTTATTTTGCTTTT 100 43 MSH_RS01125 235885 .. 235911 - -8.3 -5.20333 TAGGTAGAATAAAAA TTAATACAAAA GCAAA TTTTGTATTAA TTGATAAAGATTTTA 93 74 MSH_RS01110 NONE MSH_RS01105 231537 .. 231552 - -9 -5.33785 AACTAGTATAAAAAA TCAGCC ATTT GGCTGA TTTTTCGTTTATTTT 100 45 MSH_RS01065 NONE MSH_RS01060 216199 .. 216214 - -9 -5.61881 TTCTAAAAATAAAAA GCTTCC GCTG GGAAGC TAGGTCACATTTGTG 100 44 prfA NONE prmC NONE MSH_RS01045 212360 .. 212387 - -2.1 -5.88476 AAAACAAATAAAAAA GCTTGTCAAAA ACTAGG TTTTGACAAAG GCTTATTTTGTTTAT 76 62 MSH_RS01040 211764 .. 211796 - -3.8 -4.03179 CACATCATAAGCAAA GTAAAAAATAA-AAT TAAA ATCATTATTTTTTAC CACCTTTATTTTTAT 56 15 MSH_RS01035 211035 .. 211059 - -8.1 -2.87029 AATAATTAAAAAATG TACTTATATAC TAT GTATATAAATA ATAAGGTAAAAGGTA 69 90 MSH_RS01025 NONE MSH_RS01020 205929 .. 205949 - -10.5 -5.35222 AAAAGGTATAAAAAA GAGCTTCCA ACT TGGAAACTC GGGTTATTATTCTAA 100 422 rrf 203840 .. 203874 - -11.2 -4.31549 GAAAATTTAAAATAA TTTTTTTTATTTTTTC TTA AAAAAAATAAAAAAAA GCAGCTCCCGATTTT 100 21 MSH_RS01000 NONE MSH_RS00995 NONE MSH_RS00990 199464 .. 199509 - -14.5 -3.81755 ATTCTTGAAATAGAA TAGCAACTAAAAAAGCTTTAGA AAT TCTAAAGCTTTTTTAGTTGG-A TTTTTATTTGTAAGG 100 29 MSH_RS00945 187183 .. 187196 - -2.5 -3.69216 TTTCTATTTAAAATA TTTAT TTTC ATAAA AACTCTTATTATCTA 47 52 MSH_RS00940 186567 .. 186582 - -3.4 -5.5943 AAATCATTAAAAAAA TATTAA ATAT TTAATA ATTATTAAAAACAAA 73 103 MSH_RS00930 183262 .. 183275 - -2.5 -3.69216 TTTCTATTTAAAATA TTTAT TTTC ATAAA AACTCTTATTATCTA 47 52 MSH_RS00900 NONE MSH_RS00895 NONE MSH_RS00890 NONE MSH_RS00885 NONE MSH_RS00880 173733 .. 173777 - -11.7 -4.24404 AGCTAAAGCTTAAAA TCCCTAAACAAAAAACCGAAA TAG TTTCGGTTTTTTGTTTAGCCT GCTATCTCATTGAAA 100 19 MSH_RS00840 NONE MSH_RS00835 161915 .. 161932 - -2.7 -6.07374 ATAAAAAATAAAAAA TAACCCA ATAG CGAGTTA TTTTAAAATTGATTA 80 38 MSH_RS00830 160404 .. 160435 - -13.3 -2.66321 CTCATGAAAAGACAT CAAAAAACAATCC TAAGTT GGATTGTTTTTTG CTATAAATCGTTAAG 91 26 MSH_RS00805 156580 .. 156607 - -2.8 -3.1247 AGAATCTGAACAAAC TATTCGCATTTC TTTC AAAAAGCAAATA ATCTAATTCTAATTA 42 70 MSH_RS00800 153896 .. 153933 - -14.5 -5.30575 GAAAAATTTAAAAAA GAATACTAAAAAATGCC TTTT GGCATTTTTTAGTATTT TACTTTGGAAATTAT 100 37 MSH_RS00785 NONE MSH_RS00780 151463 .. 151473 - -2.6 -2.8294 TATTTTTCATAATTA TTAT TTG ATAA GTGAAATTATTTTAT 40 15 MSH_RS00775 149965 .. 149983 - -6.8 -4.98911 TATCATAAAAACAAA GAAGCTTT TAA AAAACTTC ACACCATCTACAAAG 83 192 MSH_RS00740 NONE MSH_RS00700 130557 .. 130567 - -2.6 -3.02518 TTTAAGTAAAAACAT TTAT TTT ATAA TCTCTACTTCCATGT 41 15 MSH_RS00695 NONE MSH_RS00690 NONE rpmG 128451 .. 128475 - -8.7 -5.0925 TGGCAAAATTAAAAA TAAAAAAGCCA CTT TGGCTTTTTGA ATTATTTTCTTTCTT 100 27 MSH_RS00680 NONE MSH_RS00675 NONE MSH_RS00670 NONE rsgA NONE MSH_RS00660 NONE MSH_RS00655 123665 .. 123704 - -15.5 -2.50947 CTTAAGTAACAAAGG TAACAAAAAAATATCGA AATTAA TCGATATTTTTTTGTTA AATTGATTCGCATTA 100 38 pgk 120096 .. 120109 - -5.3 -5.49729 AATTATTTAAAAAAA TTAGC AACT GCTAA TTTTTTTCTTGAATT 82 22 MSH_RS00630 NONE rsmD NONE MSH_RS00620 NONE MSH_RS00615 116925 .. 116942 - -2.1 -4.27774 ATTAAAAATTATAAA TCTTAAT CATT ATTAAAA GGGTATTTATAGTAA 52 10 MSH_RS00610 116217 .. 116245 - -4.1 -4.09243 TATAGCTTTGTAAAA TCTAAAATCTTG ACCCGG CAAG-TTTTAGA GTTAGTTAAGTGAAA 56 27 MSH_RS00605 NONE MSH_RS00600 NONE pgmB 111414 .. 111437 - -3.9 -5.26119 TTTGCAAAAATAAAA CACTAAGCA TGCATT CACTTAGTG TTTTTTTGATAAATT 70 44 MSH_RS00590 NONE MSH_RS00585 NONE MSH_RS00580 107819 .. 107841 - -5.7 -2.79096 AGCAGAGAAAGGAAT TCTCCTTTT TTTAG AAAAAGAGA GGTTCCAAAAACGGC 54 215 MSH_RS00565 NONE MSH_RS00560 NONE MSH_RS00555 NONE MSH_RS00550 NONE MSH_RS00545 NONE MSH_RS00540 NONE MSH_RS00535 NONE MSH_RS00530 NONE MSH_RS00525 NONE MSH_RS00520 NONE MSH_RS00515 NONE MSH_RS00510 94952 .. 94983 - -10.5 -3.78087 AATTAAAATTGCAAA TAAAAAAGTAAGA GAAAAT TCTTACTTTTTTA TTTGTCTCTAACTAA 91 23 MSH_RS00500 NONE MSH_RS00495 NONE MSH_RS00490 90233 .. 90246 - -6.7 -5.33921 AAAGTAAGTAAAAAA GCTGA AAAA TCAGC TTTTTACCATTTTTA 87 280 MSH_RS00480 NONE rbfA 87096 .. 87113 - -9.9 -5.99318 AAAAAAAAATAAAAA GCCGATT TTAA AATCGGC AATTTCATTAAATTG 100 92 MSH_RS00460 NONE MSH_RS00455 84210 .. 84238 - -11.9 -5.15117 TAAAAGCGCAAAAAA CGAATACACCT TATTTAT AGGTGTATTCG TTTTTTTCTTCATTA 100 114 rnpB 75563 .. 75583 - -4.8 -5.82036 ACAACAAATAAAAAA TAAATCCC ATAAA GAGATTTA TTGCATCTATAAGCC 88 30 MSH_RS00400 NONE MSH_RS00395 73004 .. 73022 - -9 -5.99154 TATTAAATAAAAAAA TGCAATTT TTT AAATTGCA TCTATTTTATGAAGA 100 32 MSH_RS00390 70842 .. 70858 - -6.6 -5.21709 CCCCATATGAAAAAA GATAGC GCGTA GCTATC TTTTTTGTTTTTATT 83 43 MSH_RS00375 69710 .. 69725 - -3.3 -5.46706 ATTGCAAAACAAAAA CTGAA TAAATT TTCAG TTTTTTGTTTACAAA 73 34 MSH_RS00365 68859 .. 68873 - -2.9 -4.87291 GAGTGTAATTAAAAA TCAAA GTATA TTTGA GCGAATTCCTTGACT 59 4 MSH_RS00360 NONE MSH_RS00355 67325 .. 67335 - -2.6 -3.00298 TTTTTTAATTATATA TTAA TTA TTAA TCTAAATAAACAAGA 41 22 MSH_RS00350 NONE MSH_RS00345 66616 .. 66653 - -6.5 -5.82172 ATGAAGACAAAAAAA TAAGTTACTTTGATCTT TTTT ATAATCCAAGTAACTTA GCTATTGTTAATTCA 100 356 MSH_RS00315 58828 .. 58850 - -5.7 -4.60924 TAAATTTTTGAAAAA TAAAAAAGC ATTAA GCTTTTCTA AATAATTTTTTCATG 71 13 MSH_RS00310 56969 .. 56979 - -2.6 -2.70979 TCCTAACCAAATTTA TTAA ATA TTAA ATCTTCTAAATTCTT 39 2 MSH_RS00305 56652 .. 56662 - -2.6 -2.72096 TCGATTAATGATAAG TTAA ACA TTAA ACTGAAAGTCCGCCA 39 22 MSH_RS00300 NONE MSH_RS00295 NONE MSH_RS00290 NONE rsmI NONE MSH_RS00280 NONE MSH_RS00275 NONE fusA 50660 .. 50674 - -10 -5.4505 TTTTTGAAGAAAAAA TCACCC ATA GGGTGA CTTTATAAATTATTA 100 38 MSH_RS00265 49470 .. 49480 - -5.4 -4.41616 AGTTGTTTAAATAAA CAAC CAA GTTG TAAAAATCTTCTAAT 68 317 MSH_RS00260 NONE MSH_RS00255 NONE MSH_RS00250 NONE MSH_RS00245 44120 .. 44132 - -3.5 -5.098 TAAAAATAAAATAAA TAAAA GTA TTTTA TTTTTATTTCTCTTT 68 29 lepB 43501 .. 43512 - -4.4 -2.58812 TTTAAATTTAATTCA TACG TGTC CGTA TTGTTCTTTCCCTCC 48 217 MSH_RS00220 40047 .. 40073 - -9.7 -4.42748 TTATTTTAAAAATAA CAAAATATCAA ATAAA TTGATATTTTG TTTAAATATTTAACC 93 58 MSH_RS00215 NONE MSH_RS00210 38073 .. 38093 - -6.9 -5.84011 AATAAAAAATAAAAA GCCAACTTT TTA AAAATCGGC AATTTTATTAAATTG 93 114 MSH_RS00140 24916 .. 24931 - -3.4 -2.7497 ACATTATGGTTAAAT TAATAA CTAA TTATTA TTTAGAATTTGGTAA 43 23 MSH_RS00135 22014 .. 22026 - -7.7 -5.41746 AATGTTTTAAAAAAA GTGCA ATT TGCAC TTTCTTAATTTAAAA 100 30 def 19326 .. 19336 - -2.6 -2.89935 AAATATTCTTATATA TTTA TCT TAAA TTAAAATAATATTTT 40 21 MSH_RS00115 NONE MSH_RS00110 NONE MSH_RS00105 16698 .. 16718 - -4.1 -6.00814 AAGAATGAAAAAAAA TAGCTAA TTATCCC TTAGCTA ATTTTTTTGACAATT 86 12 MSH_RS00070 11899 .. 11919 - -12.7 -5.42198 GCGTAAAAAATAAAA GCCGATTTT TAA AAAATCGGC AATTTTATTAAATTT 100 109 coaBC NONE MSH_RS00030 NONE MSH_RS00025 NONE MSH_RS00020 2945 .. 2957 - -4.8 -5.03201 AAGAATAATGAAAAA GCCA AAAGA TGGC TTTTTGTTTTTTAAT 72 42