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LTT61_RS05400	LTT61_05400	rfbC	rfbC	1092881	1093447	+	dTDP-4-dehydrorhamnose 3%2C5-epimerase		gene	gene-LTT61_RS05400	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05400
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LTT61_RS05465	LTT61_05465		LTT61_RS05465	1104349	1104825	+	carboxymuconolactone decarboxylase family protein		gene	gene-LTT61_RS05465	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05465
LTT61_RS05470	LTT61_05470		LTT61_RS05470	1104827	1105483	-	TetR/AcrR family transcriptional regulator		gene	gene-LTT61_RS05470	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05470
LTT61_RS05475	LTT61_05475		LTT61_RS05475	1105498	1105701	-	hypothetical protein	incomplete%3B partial in the middle of a contig%3B missing N-terminus	pseudogene	gene-LTT61_RS05475	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05475
LTT61_RS05485	LTT61_05485		LTT61_RS05485	1106170	1107111	-	TauD/TfdA family dioxygenase		gene	gene-LTT61_RS05485	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05485
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LTT61_RS05500	LTT61_05500		LTT61_RS05500	1111003	1112316	+	NtaA/DmoA family FMN-dependent monooxygenase	This protein belongs to a clade of FMN-dependent monooxygenases%2C within a broader family of flavin-dependent oxidoreductases%2C the luciferase-like monooxygenase (LMM) family%2C some of whose members use coenzyme F420 rather than FMN.	gene	gene-LTT61_RS05500	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05500
LTT61_RS05505	LTT61_05505		LTT61_RS05505	1112393	1113070	-	cutinase family protein		gene	gene-LTT61_RS05505	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05505
LTT61_RS05510	LTT61_05510		LTT61_RS05510	1113151	1113381	-	hypothetical protein		gene	gene-LTT61_RS05510	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05510
LTT61_RS05515	LTT61_05515		LTT61_RS05515	1113559	1114506	+	alpha/beta hydrolase		gene	gene-LTT61_RS05515	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05515
LTT61_RS05520	LTT61_05520		LTT61_RS05520	1114458	1115171	-	cysteine hydrolase		gene	gene-LTT61_RS05520	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05520
LTT61_RS05525	LTT61_05525		LTT61_RS05525	1115236	1115763	+	AAA family ATPase		gene	gene-LTT61_RS05525	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05525
LTT61_RS05530	LTT61_05530		LTT61_RS05530	1115814	1116161	+	UBP-type zinc finger domain-containing protein		gene	gene-LTT61_RS05530	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05530
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LTT61_RS05555	LTT61_05555		LTT61_RS05555	1118822	1119073	-	hypothetical protein		gene	gene-LTT61_RS05555	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05555
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LTT61_RS05565	LTT61_05565		LTT61_RS05565	1120292	1120933	+	response regulator transcription factor		gene	gene-LTT61_RS05565	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05565
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LTT61_RS05580	LTT61_05580		LTT61_RS05580	1123492	1123962	-	grhN		gene	gene-LTT61_RS05580	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05580
LTT61_RS05585	LTT61_05585		LTT61_RS05585	1124067	1125212	+	helix-turn-helix transcriptional regulator		gene	gene-LTT61_RS05585	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05585
LTT61_RS05590	LTT61_05590		LTT61_RS05590	1125392	1126507	+	polyprenyl synthetase family protein		gene	gene-LTT61_RS05590	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05590
LTT61_RS05595	LTT61_05595	crtI	crtI	1126522	1128018	+	phytoene desaturase family protein		gene	gene-LTT61_RS05595	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05595
LTT61_RS05600	LTT61_05600		LTT61_RS05600	1128015	1128962	+	phytoene/squalene synthase family protein		gene	gene-LTT61_RS05600	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05600
LTT61_RS05605	LTT61_05605		LTT61_RS05605	1129027	1129431	-	ATP-binding protein		gene	gene-LTT61_RS05605	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05605
LTT61_RS05610	LTT61_05610		LTT61_RS05610	1129504	1129947	-	response regulator		gene	gene-LTT61_RS05610	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05610
LTT61_RS05615	LTT61_05615		LTT61_RS05615	1129944	1131692	-	SpoIIE family protein phosphatase		gene	gene-LTT61_RS05615	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05615
LTT61_RS05620	LTT61_05620		LTT61_RS05620	1131799	1134120	+	ATP-binding protein		gene	gene-LTT61_RS05620	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05620
LTT61_RS05625	LTT61_05625		LTT61_RS05625	1134323	1134652	+	anti-sigma factor antagonist	This anti-anti-sigma factor%2C or anti-sigma factor antagonist%2C belongs to a family that includes characterized members SpoIIAA%2C RsbV%2C RsfA%2C and RsfB.	gene	gene-LTT61_RS05625	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05625
LTT61_RS05630	LTT61_05630		LTT61_RS05630	1134705	1135541	+	crotonase/enoyl-CoA hydratase family protein		gene	gene-LTT61_RS05630	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05630
LTT61_RS05635	LTT61_05635		LTT61_RS05635	1135651	1136250	-	NAD(P)-binding domain-containing protein		gene	gene-LTT61_RS05635	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05635
LTT61_RS05640	LTT61_05640		LTT61_RS05640	1136316	1136690	+	helix-turn-helix domain-containing protein		gene	gene-LTT61_RS05640	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05640
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LTT61_RS05710	LTT61_05710		LTT61_RS05710	1147853	1148239	+	DUF1304 domain-containing protein		gene	gene-LTT61_RS05710	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05710
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LTT61_RS05720	LTT61_05720		LTT61_RS05720	1149625	1150638	-	crotonase/enoyl-CoA hydratase family protein		gene	gene-LTT61_RS05720	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05720
LTT61_RS05725	LTT61_05725		LTT61_RS05725	1150725	1150871	-	hypothetical protein		gene	gene-LTT61_RS05725	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05725
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LTT61_RS05735	LTT61_05735		LTT61_RS05735	1151444	1152268	+	hypothetical protein		gene	gene-LTT61_RS05735	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS05735
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LTT61_RS06500	LTT61_06500	mftD	mftD	1323312	1324523	-	mycofactocin biosynthesis FMN-dependent deaminase MftD	MftD%2C an enzyme found in the mycofactocin biosynthesis locus%2C performs an oxidative deamination of 3-amino-5-[(p-hydroxyphenyl)methyl]-4%2C4-dimethyl-2-pyrrolidinone (AHDP). The resulting compound%2C now called pre-mycofactocin (PMFT)%2C is a biologically active redox cofactor that can oxidize the non-exchangeable NADH of TIGR03971 family SDR-type oxidoreductases.	gene	gene-LTT61_RS06500	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS06500
LTT61_RS06505	LTT61_06505	mftE	mftE	1324520	1325215	-	mycofactocin biosynthesis peptidyl-dipeptidase MftE		gene	gene-LTT61_RS06505	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS06505
LTT61_RS06510	LTT61_06510	mftR	mftR	1325309	1325962	+	mycofactocin system transcriptional regulator	MftR%2C the mycofactocin system transcriptional regulator%2C is an uncharacterized TetR family DNA-binding transcription factor. Its role is inferred by context. It occurs as part of the biosynthesis locus for mycofactocin%2C a partially characterized electron carrier derived from the terminal Val-Tyr dipeptide of the precursor peptide MftA%2C through a radical SAM enzyme-mediated process.	gene	gene-LTT61_RS06510	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS06510
LTT61_RS06515	LTT61_06515		LTT61_RS06515	1326035	1326940	+	STAS domain-containing protein		gene	gene-LTT61_RS06515	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS06515
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LTT61_RS06620	LTT61_06620	efeB	efeB	1355211	1356461	-	iron uptake transporter deferrochelatase/peroxidase subunit		gene	gene-LTT61_RS06620	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS06620
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LTT61_RS09035	LTT61_09035		LTT61_RS09035	1865589	1866287	+	SIMPL domain-containing protein	The SIMPL domain is named for its presence in mouse protein SIMPL (signalling molecule that associates with mouse pelle-like kinase). Bacterial member BP26%2C from Brucella%2C was shown to assemble into a channel-like structure%2C while YggE from E. coli has been associated with resistance to oxidative stress.	gene	gene-LTT61_RS09035	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS09035
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LTT61_RS09125	LTT61_09125		LTT61_RS09125	1881716	1883128	-	ethanolamine ammonia-lyase subunit EutB		gene	gene-LTT61_RS09125	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS09125
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LTT61_RS15320	LTT61_15320	mftF	mftF	3239048	3240448	-	mycofactocin biosynthesis glycosyltransferase MftF	Members of this protein family%2C MftF%2C are glycosyltransferases%2C members of PF00535 (glycosyl transferase family 2). The encoding gene is found as part of the mycofactocin cassette%2C in Mycobacterium tuberculosis%2C many other Actinobacteria%2C and occasional members of other lineages. Mycofactocin itself%2C a putative redox carrier%2C is a heavily modified derivative of the C-terminal Val-Tyr dipeptide of the mycofactocin precursor MftA (TIGR03969).	gene	gene-LTT61_RS15320	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS15320
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LTT61_RS28190	LTT61_28190		LTT61_RS28190	6110683	6111069	-	ankyrin repeat domain-containing protein		gene	gene-LTT61_RS28190	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS28190
LTT61_RS28195	LTT61_28195		LTT61_RS28195	6111074	6111709	-	UdgX family uracil-DNA binding protein	This protein belongs to the uracil DNA glycosylase superfamily%2C members of which act in excision repair of DNA. However%2C it belongs more specifically to UdgX branch%2C whose founding member was found to bind uracil in DNA (where it does not belong)%2C without cleaving it%2C appears to promote DNA repair by a pathway involving RecA%2C rather than base excision.	gene	gene-LTT61_RS28195	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS28195
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LTT61_RS28235	LTT61_28235		LTT61_RS28235	6118010	6119038	-	alpha/beta hydrolase family protein		gene	gene-LTT61_RS28235	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS28235
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LTT61_RS30215	LTT61_30215	mftC	mftC	6535844	6537025	-	mycofactocin radical SAM maturase	MftC is a radical SAM/SPASM enzyme that catalyzes the first two steps in biosynthesis of the electron carrier mycofactocin from the terminal Val-Tyr dipeptide of the precursor peptide MftA.	gene	gene-LTT61_RS30215	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS30215
LTT61_RS30220	LTT61_30220	mftB	mftB	6537022	6537306	-	mycofactocin biosynthesis chaperone MftB	MftB%2C a small protein%2C is a peptide chaperone that assists the radical SAM enzyme MftC in performing two modifications to the C-terminal Val-Tyr dipeptide of the mycofactocin precursor peptide%2C MftA. MftB's role is analogous to the role of PqqD in the biosynthesis of PQQ%2C a cofactor that derives entirely from a Tyr and a Glu in the precursor PqqA.	gene	gene-LTT61_RS30220	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS30220
LTT61_RS30225	LTT61_30225	mftA	mftA	6537296	6537385	-	mycofactocin precursor MftA	Mycofactocin is a small molecule electron carrier derived from the final two amino acids%2C Val-Tyr%2C of MftA%2C the mycofactocin precursor. It plays a role in redox homeostasis and the metabolism of alcohols and aldehydes in Actinobacteria%2C including Mycobacterium tuberculosis.	gene	gene-LTT61_RS30225	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS30225
LTT61_RS30230	LTT61_30230		LTT61_RS30230	6537514	6538368	+	thioesterase family protein		gene	gene-LTT61_RS30230	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=LTT61_RS30230
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