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CHC80_RS01085  226480 ..  226494 +  -4.2  -4.07885   GACGTAACAACTCTG               CCAGTT CCG GGCTGG               TTTTGAGAGAGGCTG  62 214
CHC80_RS01120  233068 ..  233088 + -12.6  -5.20735   CTCTGCAAAGAAATT            GGGCTTCC ACCCG GGAAGCCC            TTTCTTTTTTGTTCG 100 44
CHC80_RS01140  236902 ..  236928 +  -5.3  -2.94422   ATATTACCAGCGATA        GTTGTT-AC-GGG TTT CCCAGTCAACAAC        CTCTTTTTCCGCCTG  50 136
CHC80_RS01170  242819 ..  242829 +  -6.8  -2.78596   ATCTCTGTCGACCAT                 CGCA TAT TGCG                 TATCGTAAGCCACTG  52 433
CHC80_RS01200  249288 ..  249299 +  -5.8  -3.30124   CCTGTGCCGGATGGC                GGCA TAAA TGCC                 TTATCCGGCCTACAA  56 50
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        malG  251925 ..  251940 + -10.4  -5.66684   TATGGTCGTATTTTG              GCGCTC TTCG GAGCGC               TTTTTTTATGCGTTA 100 106
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        purH NONE
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        zraP  310658 ..  310681 + -12.4  -3.08679   GGTAAAGCATGTTTG          CCGAATGGCG GCTT CGCCATCCGG           TATTCCATCAAAAGC  83 36
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        trmA  350398 ..  350411 +  -4.5  -3.53811   TCCGCGGTGTCCTCC               TTGCG GTTA CGCAG                TTTAAAGCCAATCCA  54 91
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        ptsP NONE
         fsa NONE
        gldA  374275 ..  374298 +   -14  -3.67976   ATAAGGTCTGAGCAA          TACTCCTGAC AATA GTCAGGAGTA           TTTCAGCTTGCTGAC 100 37
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CHC80_RS05825 1191827 .. 1191840 +  -2.3  -4.56775   GGAGACTAAAAATGG               CAGGC TTTG GCCTC                TTTTTAAGAGGCGGT  61 520
CHC80_RS05830 1192790 .. 1192815 +  -8.3  -2.60813   TGGATACCACCTGTA         GCGTAGCGT GATGAGGG GCGCTACGC          ATATTTCGCACAATA  63 20
CHC80_RS05835 1195273 .. 1195289 +  -2.1  -3.86266   CCAACACCAGGGAAA              TCGTGGC TGC GCCGTGC              TTATTATGATGATGT  53 73
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CHC80_RS05845 1196845 .. 1196856 +  -7.2  -3.30124   ATTTTGCCGATTGGC                GGCG CGAA CGCC                 TTATCCGGCCTGCGA  63 40
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        mlaD NONE
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        murA 1210842 .. 1210865 + -11.7  -4.17048   CTGTACGCTGAATAA          CCCCCGCGA ACGCGA TTGCGGGGG           TTGTTTTACAGACAC  95 45
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        obgE 1215548 .. 1215567 + -16.4  -4.94147   GCCTACAAAAGCCAA            CGGGCCGC ATTT GCGGCCCG             TTTTATTATGTTCTT 100 73
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CHC80_RS05995 1219049 .. 1219063 +  -2.8  -3.40899   TAGAGTATCCTGACG               CTGTTT TTA ACACAG               TTGTAATAAGAGGTT  47 84
        hflB 1221068 .. 1221087 + -12.8  -5.86609   TAGCGCTCACCGAAA            CCCTGGGG CTTG CCCCGGGG             TTTTTCTTTTTTTAA 100 65
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CHC80_RS06015 1223418 .. 1223432 +  -5.7  -4.00469   GCTTAAATTGCCCTT               GCGAA GGTCA TTCGC               TTTGGTTAGTATTCA  63 132
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CHC80_RS06025 1223982 .. 1223997 +    -9  -5.92337   ATATTCCGAAAGAAA              GACGCT GAAA AGCGTC               TTTTTTTTCGTCTGT 100 41
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CHC80_RS06065 1233724 .. 1233738 +  -2.8  -3.95071   GTAGAATACCGCCGT               TTAACG TCG CGTAAA               TTATTTAACAGTTTA  54 75
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         pnp 1236483 .. 1236503 + -18.3  -3.57792   GTAAGGTAGCCTTTT            GCCCTCCGC AGT GCGGAGGGC            TTTAGACCTGGCTGG 100 37
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CHC80_RS06090 1240939 .. 1240965 +  -8.7  -2.61144   ACCAGTAATTGAACG         AGCCGGATGAG CTGTT TTCATCCGGCA         ATATTTCACAAGTCC  63 33
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CHC80_RS06125 1246732 .. 1246768 +  -5.9  -3.75169   CAAACGCTTCGCGTT   CCG-TCACAAGGCGCT CTTTCT GGCGCTTTGTGAGCTG    TTTGATGCGATACTC  60 74
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CHC80_RS06230 1265434 .. 1265451 +    -7  -4.08064   TCAAACATATGAAAA             CATGGC CCTTAA GCCATG              TTTTGCGAGGCGCTT  70 221
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CHC80_RS06245 1269274 .. 1269302 + -10.2  -2.64803   TCGCTAACGACGTTG        TGCCCGGATGGC GTGTA GCGATCCGGGCC        TGAATTTCAGGCTGG  70 34
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        rnpB 1270926 .. 1270939 +  -9.5   -5.0925   CACTTCTTCATAAAA               CCCGC TTCG GCGGG                TTTTTGCTTTTACAG  93 36
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        pflB 1278939 .. 1278978 +  -2.7  -3.08798   TTACTCAGGCGATGT  AACGTGAACGGGGCGATC GTGTG GATCGCCCCGCG-ACGGA  TCTTCACTGAACGGT  43 24
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CHC80_RS06305 1283430 .. 1283467 + -11.4  -3.57144   CGGGTCTACCCGTTA  TCA-GCCGGATCG-GGCG CTTG CGCCGCCATCCGGCATGA   TTTCAGGCTGCGGCC  87 98
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CHC80_RS06400 1297413 .. 1297424 +  -3.6  -4.27316   TACCTAACCCTTCGC                CCGG CTTG CTGG                 TTTTGCGTTGCAGCA  64 420
CHC80_RS06420 1302644 .. 1302684 + -12.7  -2.78384   GGTAGCAATGGTAAT G-ACATCCGCCCGGT-AGC AACAG GCTTACCGGGCGGATGCGC TCTGATAGAAGGCGG  82 52
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CHC80_RS06435 1306247 .. 1306264 + -11.3   -3.5275   GTCAGAAACAAAAAG             GCCACTC TTTA GAGTGGC              TTAATTATATGATTT  85 59
CHC80_RS06445 1307087 .. 1307104 + -14.1  -3.95073   GGCCTGATAAAAAAA             CGCCGCC TTGC GGCGGCG              TTTATACGTGTGCGG 100 112
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        tsaD 1312761 .. 1312787 +  -5.8  -3.01712   CCGGTCAACCCTTGT        GGGCCG-ATCC CCAGAC GGTTGCGGCCC         TCTTCCAGACGCAGC  52 228
        folB 1313930 .. 1313948 +  -3.1  -3.40051   AAACGGTTATATATG             GGGTCTT AACGC GAGATCC             ATTTTTGCAGTGTTT  48 69
CHC80_RS06490 1314876 .. 1314907 + -11.6  -3.64822   GTCTGATAAGTGCAG      CGCCATCAGGCA ATTTATCG TGCCGGATGGCG       TTTAGCTGGCGGGGT  87 96
CHC80_RS06505 1318435 .. 1318464 +  -8.5  -2.94708   TATGCGGACTTGTAG       GCCGGAT-CAGGCG AAA CGCCGCCATCCGGC       ATTATTTAAAGGATA  65 90
CHC80_RS06510 1321314 .. 1321326 +  -5.5  -3.82484   GCAAGCTGGCGGAAG                TGGCT GGT AGCCG                TTTGAATTATGCTAT  61 8
CHC80_RS06515 1322893 .. 1322906 +  -2.3  -5.76949   TTCGACGCGTATCTC               GCGGT TGAC GCTGC                TTTTTTTTCGACCTA  91 106
CHC80_RS06535 1326100 .. 1326127 +  -9.8  -4.93316   ATTATTCAGATCTTA        TATGAGCGGGCC GTCA GGCCCGTTCACG         TTTTTACTCTTGTTG  93 68
        ribB 1327545 .. 1327564 + -12.2  -5.50925   TCATGGTTGAAAAAA            GCCGATGA GATG TCATCGGC             TTTTTTGTATTCCTT 100 50
CHC80_RS06565 1331460 .. 1331506 +  -2.3  -4.19177   AGCGCATATCCTTGA CG-GGCAGCCGGATGT-TGCCT GGCTAA AGGCCTGCATCCGGC-GCGACG TTTCTCTTAACCGAT  57 39
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        parE 1341404 .. 1341423 +  -8.6   -3.0636   TCTCGCGGATCTCGA            CGTGTAAC GGTT GTTGCACG             CTTTATCTGGTCTGC  66 19
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        parC 1348480 .. 1348523 + -13.3  -3.61103   CCATCCGGCGCTCTG CCGT-TGCCGGATGACGACGC AGTA GCGTC-TTATCCGGCCTACGG TTTCAGATCGGATTA 100 80
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        exbB NONE
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CHC80_RS06925 1405179 .. 1405192 +  -3.8  -3.85698   AATCTGTTTACACGC               CGCA GCAGGA TGCG                TTTCTGCCAGCACAA  56 418
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         pgk 1454658 .. 1454677 +   -15   -3.6053   AAGAAGTAATCGTTA            CGGGCAGG GATT CCTGCCCG             TTGATTTATCGCCGA 100 32
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        rumA 1579426 .. 1579452 + -10.9  -2.52464   CGCATGTAATGATTA        CC-GGCTTACCG ACTT CGGTAGGCCTGG         TCCCTTAAGGAGAGG  74 32
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        pyrG 1585855 .. 1585878 + -13.9  -4.08164   AAAAAGTTAGAACGG          CGGTGCACC CTCAGC GGTGCACCG           TTTGTCTGAAGTTTT 100 40
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        cysH 1595827 .. 1595843 +  -9.4  -4.29176   TGCTGCTATGAAAAA              TCCGGC AGGCA GCCGGA              TTTTAAATTGGCTAT  84 67
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CHC80_RS14550 2883085 .. 2883100 +  -5.4  -3.84514   TTAGTTTTTAACAGG              GCATTG TGAG CGATGC               TTTCATCCTTAAGCT  61 444
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        mdoD 2895465 .. 2895475 +  -3.2  -3.25356   CGTTATGTCGACGAT                 CGTA TCA TGCG                 TTAGTCAGTTTGCCT  46 11
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CHC80_RS14615 2897471 .. 2897491 + -11.1   -4.4084   CCCCAGTAATATAAA            GGTCGGGTA CTA TCCCCGACC            TTTTCCTGTATGATT  90 32
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CHC80_RS15525 3076930 .. 3076957 + -14.8   -4.2828   GGGTAACTGATCCCC        CGCCGGGCGCAG GTCA CTGCGCCCGTTG         TTTTACTGCATCCCG 100 31
CHC80_RS15530 3077716 .. 3077733 + -11.3  -3.71649   GATGACGGTAAAAAA             GCGACCT TTAC AGGTCGC              TTTCCCCTTTCACAG  91 69
CHC80_RS15540 3079257 .. 3079285 + -13.3  -4.20868   ACAATTCGCTAATAT        TTTATCCTGTCGT TTA ACGACAGGATAAC        TTCTTCTTTTGCGCC 100 29
CHC80_RS15545 3079971 .. 3079992 + -14.5  -4.07885   GCATAAGTCTGAGTA           CGCAGAAGG TACG CCTTCTGCG            TTTTAGAGAGGGATA 100 35
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CHC80_RS15560 3081546 .. 3081559 +  -4.5   -4.2558   GCAGCCATGTCAGCG               CG-GGC GAG GCCTCG               TTTTGCTGCCACGTC  66 117
CHC80_RS15570 3083900 .. 3083919 +   -10  -2.91276   ACGTCGGATAACTGG            CTCACGGA ATTG TCCGTGGG             ATTTCTCACAAAGCC  72 224
CHC80_RS15575 3085144 .. 3085168 + -14.3  -3.72228   TTCCTCGCTAATCAT          CTCCCCCGCAT TTC ATGCGGGGGAA          TCTTATTTTCCGTTA 100 30
CHC80_RS15585 3087421 .. 3087440 +   -10  -4.39828   GCGATAATACGACGA            TAGCCGTC GCAT GGCGGCTA             TTTTCTCGACATGTT  87 34
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CHC80_RS15595 3088143 .. 3088153 +  -6.8  -3.17392   ATAGCCAAGACAAAC                 CGCA ATA TGCG                 TTGGATTACGCACTA  56 441
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CHC80_RS15830 3130015 .. 3130033 + -14.6  -5.75342   CCTGCGTAATAAAAA             TGGCGCAC ATC GTGCGCCA             TTTTTTTTACCCACA 100 46
CHC80_RS15835 3130339 .. 3130357 + -14.6  -5.64274   ACGCACGATATAAAA             TGGCGCAC ATC GTGCGCCA             TTTTTTTGTCCGTCG 100 45
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CHC80_RS15895 3144258 .. 3144284 + -15.8  -3.56862   CAAGCAGTCATAATC         CCGTCGGGCGGC ATT GCCGCCCGATGC         TTTAGCGACGTTTAT 100 28
        rprA 3144667 .. 3144688 +  -9.5  -5.21709   GTCGAAACGGTGTCG           GTGGTGCTA TTTA TAGCATCAC            TTTTTTCATATAAAA 100 147
CHC80_RS15905 3145198 .. 3145208 +  -5.4  -2.62616   CGTTCAGGCGGCATC                 TCTG AGT CAGA                 TAATATGAAAAATCG  50 151
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CHC80_RS15965 3159191 .. 3159220 + -19.3  -3.08283   CTGCGGTATAAATTG       CCGGATGGCGACG TTAA CGCCGCCATCCGG        TATTACACTACTTCT 100 30
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CHC80_RS15980 3163984 .. 3164006 + -15.6  -4.21631   CCGCTTTTAATAGCT           CGCCCATCCT GCC GGGATGGGCG           TTTCTTCGATGCGTT 100 31
CHC80_RS15985 3164328 .. 3164361 +  -3.9  -2.52676   TGTTAACCAAATAAC    G-CT-CCGCCAGCAG ACGATG CTGCTGGCGTCAGGC     TAACTTGAACAACTG  44 27
CHC80_RS16070 3179716 .. 3179747 +  -6.6  -3.16961   AGGCGTCACCACGGA      AT-AACCGGGTTACG TAA CGTAACCCGGTACAA      TATTACATCTTATAG  59 40
CHC80_RS16080 3181775 .. 3181790 + -11.8  -3.01791   AAAATCGGTTAACGG              GCGGCG CATC CGCCGC               TGTTAAAAACACAGT  81 71
CHC80_RS16085 3182141 .. 3182151 +  -4.6  -3.50466   CCGCCGCGGCGCGTC                 CGCG ATG TGCG                 TTAGTTCGTATTTTT  54 50
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CHC80_RS16100 3184512 .. 3184536 +  -7.8  -3.53012   GTCAACGGGCAATTA         GCCGCTGAGCC AGAC GGCA-AGCGGC          TTTGACAGAGACAAA  67 58
CHC80_RS16105 3185240 .. 3185251 +  -4.4  -3.30038   CGCCAAAATCATTTT                TGGT ATAA ACCA                 TTCCATTTGAATATA  52 49
CHC80_RS16110 3186808 .. 3186838 +  -9.8   -5.5112   AAAATGTCTGTCACT       AAAAACGCCGGT CTCCAGT ACCGGCGTTTTG       TTTTTTCTTAGTCAG 100 89
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CHC80_RS16125 3189944 .. 3189958 +  -2.8   -3.1211   CGAGGCATCCAGAAT               GCGT AAAAAGC ACGC               TTCGGTGATCTCCTC  43 264
CHC80_RS16170 3196718 .. 3196744 +  -3.7   -2.7535   GTACTTCTACTGTTG         TGCCGGATA TCGCTCGTC TATCCGGCC         TCCTCTCTTCCCAGC  45 43
CHC80_RS16175 3197783 .. 3197796 +  -3.8  -4.36127   TGCGGAAAGTTATTC               TGCC GCAGCA GGCA                TTTTACCTTCTTGCG  64 106
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         gap 3218152 .. 3218169 + -11.3  -5.95166   CACAGTCATTGGTAA             GAGCGAC TCAG GTCGCTC              TTTTTTTTGCTTAAA 100 51
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CHC80_RS16335 3229257 .. 3229287 +  -2.5  -4.62069   CCTGTTAGCAATACG       CGGCGTTGATG GCAATTTAA TGACAACGCCG       TTTTTCACGTAGAGA  65 180
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CHC80_RS16360 3232506 .. 3232518 + -10.5  -3.91716   CCGTAACCAGCCACA                GCGCC CGA GGCGC                TTCTTTCGGCAGTAA  80 148
CHC80_RS16375 3233384 .. 3233414 + -14.3  -2.90219   TAAATTCATTTTGAA       TAATAAAGGCTAC CTGTC GTAGCCTTTATTA       TCTCTGAAAGTTCTG  89 115
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CHC80_RS16555 3256949 .. 3256984 + -10.5  -2.94329   CGCTGTGAAGAGAGT    GCCGCTAACCTCTTG ACACGA CAACAGGTTAGCGAC     CTTTACTTCCACGTG  72 49
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        mnmA 3265241 .. 3265290 +  -2.8  -4.93877   GGTCTGATTATTCAA TACACAACACCATTCAAGTCGC CTCAAA GCGGCTTAAAAGATGAAGTGTA TTTTATTTGATACAA  70 34
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        sifA 3277099 .. 3277112 +  -3.1  -4.05085   GATCGGATGAGAATA               GTCAT TTAA ATGGC                CTTTTTTTTCCCGCT  57 147
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CHC80_RS16700 3287934 .. 3287962 + -10.3  -2.85069   ATTGCATAAGCGTCA       GGCCGGGCGTCA TTACTC TG-CGTCCGGCC        TAATCTTTACAAATT  72 32
CHC80_RS16705 3289066 .. 3289087 + -15.9  -5.74684   CTGACCGACAAAAAA           GCCTCGCGA TGCA TCGCGAGGC            TTTTTCTTTTTATTG 100 51
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CHC80_RS16760 3298976 .. 3298993 + -12.7  -3.44146   AGCGCCATTAAAAAA             GGCAGCC GAAT GGCTGCC              TTAATTCTCCCCAAC  93 66
CHC80_RS16835 3312335 .. 3312349 +   -10  -4.13945   CTACAGCAATAAACG               GCCTAC TCT GTAGGC               TTTTCAAATACCGCT  82 29
CHC80_RS16860 3318490 .. 3318507 + -12.7  -5.25803   AAATGCTGATACAAA             GCCGACC GCCA GGTCGGC              TTTTTTATGCCCCTT 100 44
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CHC80_RS16960 3335741 .. 3335763 +  -5.4  -2.86492   AAACGCACGCCGCGC           CGGATGCTGG AAC CCGGCGCCTG           ATTTGATACCTGTCG  51 2
        grxB 3336485 .. 3336507 + -10.6   -4.7657   ATCTAACGCCCGCCA           GGCGGCAA CCCTTTC TTGCCGCC           TTTTTCAGCTTTTTC  95 35
CHC80_RS16970 3337168 .. 3337183 + -11.8  -5.47218   CCAATTGATTTCGGA              GGGCGC GCTC GCGCCC               TTTTTTTACGTGCAA 100 33
CHC80_RS16975 3338347 .. 3338362 +  -6.2  -3.06696   ATATATTGGATTTAA              CTGTAT ATAT ATACAG               TATATTCAACAGGGG  56 62
CHC80_RS16980 3338656 .. 3338671 + -11.8  -5.63517   CAGTGATGTATGTTT              GCCGGG TCGC CCCGGC               TTTTTTATTTGCGCA 100 52
        bssS 3339197 .. 3339212 + -10.4  -2.73799   GCTCCCCCTCTCTCA              GGCACC GTAA GGTGCC               TCACTTATTTCTGGC  71 49
CHC80_RS16990 3340410 .. 3340428 +  -9.5   -4.1822   TAGCCAATAATTTGT             CGGCCCC GTAAA GGGGCTG             TTTATTAAGGTAAGC  84 31
CHC80_RS16995 3340649 .. 3340659 +  -4.6  -3.28791   TAATGCCAGTTCCTG                 CCGT TGC GCGG                 TTATCAGGGGGAAAT  52 116
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        putA 3379246 .. 3379263 +  -9.1   -4.7373   ACTGTGGTTAATTAA             GGCTCCG TCAA TGGAGCC              TTTTTACTCGCGTCA  90 42
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CHC80_RS17455 3416460 .. 3416497 +  -8.5  -4.86731   TACGTAACTGATTGT   ATTTAAAAGGCCGGAAA GCGA TATCCGGCCATTTAAAC    TTTTATTTCGCCAGC  89 30
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        mgsA 3418309 .. 3418335 + -15.8  -2.76737   CTGAAATAAACGCTA         CGCGGGCGGGAT GCT GTACCGCCCGCG         CTTTAGGGCTTCCTC 100 32
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        yccS 3423150 .. 3423185 + -14.1  -2.55351   GCGAATGAGCCCAGT   CGGCAAGCTCCTGGCGA CGAC TCGCCGGGAGC--GCCG    CTTCATGTACGCCGA  81 41
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CHC80_RS17575 3444291 .. 3444312 +  -4.5  -3.17075   CTATAACGATGCATT           TGATAGTGA GCTT TAACTATCA            TTGGATTACAAGGAG  50 10
CHC80_RS17580 3445037 .. 3445073 +  -2.1   -3.8594   AACCCACTGAGTTAC    GGTAGCCGTAGAGATAC CAA GTAGTTCAGCAGCTTCC    TTTCGTGTCAATGTT  52 285
CHC80_RS17590 3445403 .. 3445437 +  -8.5  -2.91269   GGGCTATAAAATTGT     GCAGGCCGCCAGT TTCAATATC ACCGGCGGACTGC     CTTATCTTTAGTCAC  65 99
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CHC80_RS17865 3480723 .. 3480738 +  -7.5  -5.82281   TTTTAAAACTACTAA              CCGCC TGAACT GGCGG               TTTTTTTATGTCTTT 100 46
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        pncB 3488776 .. 3488802 + -12.3  -3.41745   TTAACCATGCCTGTG         CGAAGCGCCCG GAAAG TGGGCGCTTTG         TTACTCTTCTGACCA  90 37
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CHC80_RS17920 3492555 .. 3492574 +  -5.7   -4.6526   CCTAAATTCTCAATG            GTTCGCG AGCAGG TGCGAAC             TTTTTACAGGTTTCT  74 65
CHC80_RS17925 3494135 .. 3494151 + -13.7  -5.78622   TTACGTCACACTCAA              GGCCAGC TAT GCTGGCC              TTTTTTTTCGCCTGA 100 44
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CHC80_RS17935 3497214 .. 3497244 + -14.2  -3.50853   GACTGGCGTGACCGA       TAAAAAAGCCTGCA ATG TGCAGGCTTTTTCA       TTCTGCTTACCAGAC 100 50
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CHC80_RS18060 3528193 .. 3528210 +    -2   -3.1247   AGTAAATAAAAAATC             CACTTA AGAAGG TAGGTG              TTACATGTCCGAGCT  42 63
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        pflA 3532933 .. 3532954 + -11.6  -4.39568   TTACCCGCTTTTAAA           CGGCTACC CATGAC GGTAGCCG            TTTTGCTGTCTGGAT  93 53
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CHC80_RS18180 3557957 .. 3557980 + -13.2  -3.69364   CAGCGTTAATTTGCC          TCCCCGCGCCA GTT TGG-GCGGGGA          TTATGTCTATTGCAT 100 32
CHC80_RS18185 3558200 .. 3558219 +   -10  -6.10489   CATATTTAAGAAAGA            GCTCGTAC GAAA GTACGGGC             TTTTTTTTTCACATT 100 39
CHC80_RS18190 3558551 .. 3558570 +  -8.6  -5.49809   CATATTCAAGAAAGA            GTTCGTAC GAAA GTACGGAC             TTTTTTTCGCATTTG 100 39
        cspD 3561934 .. 3561954 + -12.6  -5.27335   ATCCAGGAGGCAAAA            TGCCAGCC CGATC GGCTGGCA            TTTTTATTTAACGCC 100 62
CHC80_RS18225 3566442 .. 3566456 +  -4.2  -3.95324   CAGCGCAGGCAGCGC               CGTGAG ATG TTCGCG               TTCTTCTTCCCGATC  60 283
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CHC80_RS18250 3571737 .. 3571765 +   -11   -2.7464   AAACGTTCCATCATA       GGCCCGGTAAGCG TCAG CGCT-ACCGGGCG        ATTTGCCGCTCGCTT  74 46
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CHC80_RS18270 3577635 .. 3577647 +  -4.8  -4.11692   CACCCCGCCGGACAT                TCGC CAGCC GCGA                TTTTCCAGCTCAATG  62 475
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        artM 3582165 .. 3582191 + -10.9  -5.68039   ATATTGAATAAATCC         GACGGACAAGT GGTTA ACCTGTCCGTC         TTTTTTTATCCATTT 100 118
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CHC80_RS18395 3598502 .. 3598512 +  -8.2  -3.09933   TAAAATCGCTTCACG                 CGCC AGC GGCG                 TTCGATCCGTTACAA  60 253
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        treC 4747692 .. 4747722 +  -3.9  -3.16921   CCTTATACGGATAAA       CGCCACAAACC TATTGACAC GGGCTGTGGCG       TTGCTCCAGGTTACT  48 49
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        iolC 4770466 .. 4770494 + -16.7  -3.02043   ATGCCTGCCTCATCA        CGCCCCGTGTCTG CAT CGGACAAGGGGCG        TGTTCAAGGACGATT 100 40
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        deoB 4619438 .. 4619460 -  -5.6  -3.63922   ACGTGTGTCAAAACA           GTGAAATACC CTA AGTATTTCGC           GTTGTAGGAAGGCGA  59 133
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        thrL 4586766 .. 4586788 -   -12  -5.75342   CTGGTCGAAAAAAAA           GCCCGCAC TGTTCAG GTGCGGGC           TTTTTTCTGTGTTTC 100 41
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         tal 4578458 .. 4578468 -  -5.4  -2.68487   TTAATGATTACAGCA                 GATC GCC GATC                 ATTTTTTCCAGTTTT  50 7
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CHC80_RS11540 2324775 .. 2324787 -  -2.6  -3.70505   TAAATTAAGGCGAAA                CGCA AATAA CGCG                TTTTAATGATCCAAA  50 180
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CHC80_RS11530 2322226 .. 2322252 -   -13  -3.54475   TTGCTTATCAGATAA        CCCGGCGCAGC GAAACT GC-GCGCCGGG         CTTCATACCGCGAGC 100 40
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        fghA 2313809 .. 2313821 -  -9.1  -2.74012   GGAGGAGGTGAATTA                CAGCG CGG CGCTG                GAAAATTCATTATGT  66 35
        serB 2310987 .. 2310998 -    -3  -2.59431   TCGCGTTATAATTCA                TCTT CAAT AAGA                 AAAAGAAGCAATTCG  40 4
CHC80_RS11470 2309585 .. 2309617 - -19.2  -2.98823   CGTTTCTGACAGAGA      CTGGCGACAGCCGC GTTTT GCCGCTGTCGCCAG      AATGTTATAACCGAT 100 30
CHC80_RS11460 2307382 .. 2307392 -    -4  -3.31931   TGACATAATTATTAA                 CAAT TAA ATTG                 ATAATTATTATCGTT  50 11
CHC80_RS11445 2303509 .. 2303521 -  -4.1  -3.21218   ACGGTTCATTACGAA                CGCTA TGA TAACG                GGTTAACAGGCGTGA  48 52
CHC80_RS11440 2302556 .. 2302593 - -12.9  -3.73486   GGCATAAGAGAAACA   CGCTAAAAAAGGCAGAG CGCG CTCTGCCTTTTTTATTG    CCTGAAGAACATTGA 100 44
CHC80_RS11420 2296932 .. 2296952 -  -2.6  -4.83615   TAGCGTGCATAAAAA            TATGTTAC AAACG GAAACATA            TACAAAGCTATCCTT  72 297
CHC80_RS11400 2294793 .. 2294821 -  -7.4  -2.77779   TCAATAAAGAAAAGG       GTCAGACTGCGCC CTGG GGCGCAGCC-GAA        AAATGCGAAACTTAA  58 37
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CHC80_RS11390 2292835 .. 2292870 - -13.6  -4.01853   GAATATCATCATAAA    TTACCTTCAACGAT-GT AAA ACTATCGCTGAAGGTAA    TGTTAATTACATAGG 100 41
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CHC80_RS11335 2279717 .. 2279746 -  -4.9  -3.61517   ATCTCTCTTTAATAA       TTCCTGCTACAGG CGAC CCAGCAACAGGTA        AGTGATCTGCTTTGC  57 101
CHC80_RS11330 2279375 .. 2279390 - -11.8  -5.68039   AAACGCATAAAAAAA              CCCCGC CGGG GCGGGG               TTTTTCTTCAACTTC 100 48
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CHC80_RS11285 2272153 .. 2272180 - -11.4   -4.4767   GTAGTTATTATAAAA        TAAAAAGAGGGG CAAG CCCCTCTGTTTA         TTTTGAAATCTGCTT 100 23
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CHC80_RS11190 2258747 .. 2258786 - -15.6  -2.78206   CAGGAGAAATAAGAC  CCTGAC-GGCCCGGTGGCG CGG CGCCACCGGGCCTGGCTTG  TTACTGCATTCCGCG  93 26
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         flk 2121359 .. 2121380 - -14.5  -3.54424   GTGGAGGTTGTGAAA           CGCGTACCT GCAC AGGTACGCG            GTACGGCGCTCGGCG  95 192
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         tkt 2021945 .. 2021985 - -14.2  -3.40371   GAGTCTACGAAGTAA  TTTTGCACAGCCTACAGA ACAGG TCTGCAGACTGTGCAAAG  TCTGTGTTGCTAACG 100 47
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        mutS 1630073 .. 1630090 -  -6.9  -3.26444   TGTCTGAACAATAGA             CAGGCGC TTCT GTGCCTG              AAAAAGGAAAGACCA  59 476
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        queD 1590391 .. 1590404 -  -2.3  -2.80252   ACTGTCAGAACATTA               CCGGT ATAA AGCGG                ATTTACGCGCTTATC  39 299
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        fucI 1554505 .. 1554519 -  -4.2  -3.94381   AGATAACTCCATAAA               CGCC GCCCGAT GGCG               CTACGCTTATCCGGC  57 96
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        rarD 1545427 .. 1545438 -  -2.2  -2.79327   CGATCCGACGCAAAT                CCAG GTCG CTGA                 TTTGGCGAAAACTAT  39 381
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CHC80_RS06930 1404566 .. 1404591 - -10.6  -3.53811   GTGACCCCCTGGAAA         CGCATAATCT CGCAGC AGATTATGCG          GATAAAGTGAAAATA  74 268
CHC80_RS06915 1400567 .. 1400583 -  -7.2  -3.66256   CATATGGGGAAAAGA              CCCGCA ATTGA CGCGGG              TTAAAAAGAACGCTT  67 41
CHC80_RS06890 1394849 .. 1394861 -  -7.7  -3.08312   AACGCAGCGAGCGAA                CCTGA TAA TCAGG                CAGACAGTCCACCTT  62 79
        uxuA 1388027 .. 1388051 - -16.5  -3.62275   ATTGAGTAGGGGAAA          TCGCATGACGC GTC GCGCCATGCGA          AAGAAGGTTATTTGC 100 33
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CHC80_RS06835 1380038 .. 1380070 -   -10  -2.76468   CAGCAGGGAATACCA     TGCCGGATGACGACA TTAC TACC-TCATCCGGCA      TCATGGTTTAACTTT  71 33
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CHC80_RS06745 1365669 .. 1365701 -    -5  -3.19705   AAGGGAAAAAGGATA     CTACGATTTTCTTCC GTGC GGAT-AAAACCGTAG      AGTATGAAACCCTGA  52 234
CHC80_RS06725 1363140 .. 1363168 -  -4.5  -4.20516   CCCGGACGCAACAAA        CGCAGACTTTTCC ACG GAAATTGTCTGCA        TATATGTCCATCCCC  64 48
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CHC80_RS06680 1352766 .. 1352784 - -12.4  -3.56821   ATTACATCCTGTAAA             GGGCAGGA GAA CCCTGCCC             GGCAGATTTACATAT  93 33
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CHC80_RS06635 1342540 .. 1342564 -  -4.3  -3.67068   AGCAAAATGTGCAAA          GTCTTTTGC GTTTTTG GCAAAAGTC          TCTGTTACCAACTTA  55 30
CHC80_RS06630 1341885 .. 1341897 -  -4.1  -3.10894   AGGATGACCAGTTAA                GCAAA AAT TTCGC                TCAGATGCTTGCGAT  47 9
CHC80_RS06625 1341472 .. 1341516 -  -7.3  -2.64794   GCGAATCCGACATGA CGCCGCAGCCTGATGGCGACAC TTGC GCATCG-CATCAGG--GCGACG TCAGACGAGGGTAAT  57 44
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        ygjG 1299255 .. 1299280 -  -8.3  -2.78211   ACCCGGGGAAAACAG         GCCGGATAAGCA CAG CGCC-ATCCGGC         ATCGTTTTTAAACCT  64 33
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        garD 1265434 .. 1265451 -  -7.7  -4.46493   TCAAACATATGAAAA             CATGGCC CTTA AGCCATG              TTTTGCGAGGCGCTT  82 52
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CHC80_RS05660 1156186 .. 1156204 - -13.1  -5.47914   AAAAAGCATAAAAAA             GCCCCCG GCAGG CGGGGGC             AAGTCGTCGGGTTAG 100 52
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        accC 1133766 .. 1133782 - -10.8  -5.72622   CCCAGAAATAAAAAA              GGCCGG ATTCA CCGGCC              TTTTGAGATTAACGT 100 45
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         fis 1129114 .. 1129139 -  -8.2    -5.252   GATGCGTATAAAAAA         GGCGCTTCCC CATGCC GAGTAGCGCC          TTTTTAAACAAGCAG  91 55
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        feoA 1022362 .. 1022374 -  -4.1  -3.14602   CTCACTGTATTAACA                GGAAA CCG CTTCC                ACTTCTATTAACGCC  48 7
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        treF  909341 ..  909362 -  -5.9  -5.60689   GCAGACAATAAAAAA           TGGCTGA AAATTCAG TCAGCCA            TTTATGATGCGATTC  93 58
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        yhjD  903868 ..  903906 -  -5.3  -2.69151   TGGGTCTACACATCA  GTAGGCCGAATGACGACGC CGT GCGT-GCCATTCGG-CAGC  AAGCCGCAGACTAGC  48 36
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        bcsG  878486 ..  878509 - -13.8  -2.71144   CATGCGCCCGAACCA          GGCCGCAGGG GAAA CCTTGCGGCC           TTTTTCGGTTTACTG  86 35
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CHC80_RS04195  855581 ..  855620 -  -2.9  -3.34716   CCATCCGCTAAAAAC GGCCA-GCG-GCAAAATCG AAAT CTATTCTGCGCGCATTGCC  AGCTATGGTTATGCG  47 504
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CHC80_RS04180  851743 ..  851783 -  -7.8  -2.79098   GCGACCCAGTAATGA CAGTCTGCCCGATAAGCGC AAGCCA GCGCTTATCGGGC---CTG TAGCGTTATCCCGCC  60 31
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CHC80_RS04165  849755 ..  849774 - -11.4  -6.09888   TTGGAATAAAAAAAA            TCCCCGCC ATCA GGCAGGGA             TTCAAAATGCTGAGC 100 50
CHC80_RS04160  848900 ..  848922 -    -7  -5.72622   GCCAGAAACAAAAAA           GAGCCCATGT ATT AAATGGACTC           TTTCGCTGATGCCTC 100 189
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