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        rpmG 1346499 .. 1346527 +  -5.9  -5.63504   GATTTGAAAATAAAG        CGGGCTTACCTAT TAT ATTGGGGAGCTCG        TTTTTTTATGAAATT  90 62
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LQK05_RS11660 2314510 .. 2314546 + -11.1  -4.78572   TATCTGGAACCTAAA    TAAATCCCCTCACTA CCGCTAA TAGTGAAGGGATTTA    TTTTATTGCTTAGAC 100 239
LQK05_RS11860 2337786 .. 2337808 + -10.6   -5.4251   ACTTCAAAGAAAAAA           CGACTACCAA TCA TTGGCAGTCG           TTTTTTGTGTCTGGA 100 177
LQK05_RS11880 2342498 .. 2342528 +    -7   -5.1286   ACACCAAGCAAATAC       CCTACAGTACAT CATTAGC ATGTATTGTGGG       TTTTTCTACTTTTTG  86 42
LQK05_RS11885 2343850 .. 2343894 + -13.2  -3.14587   ATGTCATAAATAAAA GCCCCCTTT-TCACAATAT ACATTTAC ATATTGTGGTAAAGGGGGC TCTCATTTTCTACGA 100 350
LQK05_RS11900 2345225 .. 2345236 +    -3  -4.68424   AATACGTTATATTGA                TGAA TTGC TTCA                 TTTTTCGCTCAATTA  62 101
        mspA 2345893 .. 2345926 + -14.9  -5.25893   AGGCAATGTAAAAAA     GCTGATTTCTATTAA TTAT TTGATAGAAATCAGC      TTTTTTGATATGTAT 100 207
LQK05_RS11925 2353308 .. 2353320 +  -4.9  -4.62904   TCACAATAACAGTTT                CAATT GAA AATTG                TTTTTGAAAATATTT  69 268
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LQK05_RS11940 2355906 .. 2355917 +    -3   -2.7035   ACTTGTATCCCATAG                CATT TCAA AATG                 TAATGTATCCCTCAA  43 304
LQK05_RS11950 2356437 .. 2356453 +  -6.5  -3.32294   TTTGAAATTCTCTAT              GTTGGGG CCC CGCCAAC              TTGTAAAAACTTTAA  61 72
        moaC 2361258 .. 2361295 +  -2.2  -4.49311   TAAATTATTTTGTAA   GCTCAT-GAATCAGA TGATTTAAT TCTGGTTTAATGAGC   TTTTCTAATGCTAAT  57 38
        fdhD 2366219 .. 2366255 + -13.2  -5.58179   AAAACAATTTAAAAA    GCAGTAAGTTGATTTC TACTC GAAACCAGCTTACTGC    TTTTTTATTCTAATA 100 127
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        ureC 2375238 .. 2375262 +  -2.2  -3.62046   ACTCAAAGATACTTC          TTATTCTAGG AGGAA CATAGAATGA          TTGTTGAAGAAATCC  46 17
        ureE NONE
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        ureG NONE
LQK05_RS12080 2377865 .. 2377917 + -13.2  -3.89336   ATATTAAAATAAAAA GACTAGT-GTACCTTGTTTCAAGCTT AAT AAGCT-GAAATAAGGTATGGCTAGTC TTTAACTTTAATTAA 100 34
LQK05_RS12105 2383376 .. 2383404 + -14.7   -5.4387   ATGGCTATGTTTTAC        GCCAACAAGGTTT CAA GAGCCTTGTTGGC        TTTTTTAATTTCTAT 100 47
LQK05_RS12125 2387086 .. 2387119 + -12.8  -6.04419   TTAATCTCATTGTAA     CTTTGACTAATTTT TATTAC AAAATTAGTCAAAG      TTTTTTTATTCTTTT 100 77
LQK05_RS12130 2387846 .. 2387870 +    -8  -5.69023   TCATCAACAAACTTT         GAGCTT-TCCT TTAT AGGAGAAGCTC          TTTTTTTGCTATTTT 100 91
LQK05_RS12135 2389123 .. 2389159 + -11.7  -4.50841   TTATAAAAACAAGAA    CCCCCATATGTTGAG CTCTCGT TTCAACATACGGGGG    TTTTCATATTGTTGT 100 53
LQK05_RS12175 2398849 .. 2398890 + -13.4  -3.80279   TCGATTCCTAAAAAA CAGCAGTAAGATGATTTTC AATTA GAAAAT-ATCTTGCTGCTG TTCTCTATTTATACA 100 30
LQK05_RS12190 2400830 .. 2400855 +  -9.3  -3.57263   CAGTATGACTTACGG         TAATATATCAA TATA TTGATATATTA          TTTGCACATGGGAGT  84 249
LQK05_RS12195 2402061 .. 2402107 + -10.3  -4.27443   TTCTTATATTAAAAA CAAACGCAGTTGATTAACGGA TTCAT TCCATATATCAATTGCGTTTG TTATTTTAATAATGC  91 163
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LQK05_RS12210 2404926 .. 2404939 +  -5.9  -3.05294   ATAACATCTAATCCA               GCTGC AATC GCGGC                TGTTGCACCATTTAC  57 444
LQK05_RS12230 2407236 .. 2407285 +  -6.2  -5.86465   TATATCATAATAAAA GACACAT--CTATACGATGATCATT TAC AATGATTG-CGTATAGTGATGTGTC TTTTTTTGTATTATT 100 31
LQK05_RS12240 2410118 .. 2410129 +  -4.4   -2.9756   TTCGAAACCATGCAC                CATG GCAT CATG                 ATATTCTTTTTTCTT  50 149
LQK05_RS12280 2419641 .. 2419671 +  -7.7  -3.37464   TTATATGGACTTTTA      GAGGCTCT-TTAAC TTAA GTTATTAGAGCCTC       TTATGCAGTTGCTCA  70 14
        sdpC 2422397 .. 2422438 + -16.1  -4.60143   ACAAATAATAACAAA GCGCTTGCTAGTA-CCTCTT AAA AAGATGATGCTAGCAAGCGC TTTTCTATACTATAT 100 33
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LQK05_RS12335 2429860 .. 2429897 +  -2.7  -5.42975   TATCTCCTTATAAGT   CAATCAATCGTGCCGTCA ACA TG-CGGATGGGTTGATTG   TTTTTCTTTGTATCC  71 80
        gltS 2431366 .. 2431395 + -13.7  -3.98661   CACCAAACTCATAAA       TAAAAGAGGAGGC CTTC GCCCCCTCTTTTA        TTTATCCTCGATGTA 100 42
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LQK05_RS12360 2434471 .. 2434521 +   -15  -3.11905   TTTTCAAAAACAAAA CCCAATTACGATTTCATGTCAAAT ATC ATCTTGCATGAAATCGTAACTGGG TCATTTATATGTTAT 100 68
LQK05_RS12370 2436777 .. 2436791 +    -5  -3.79162   AATTCACGCATATGA               TCTTGT ACA ACAGGA               TTCGTTTTATCTAAC  59 500
LQK05_RS12385 2439917 .. 2439946 +    -8  -5.65496   CTATCAATATAAAAA       TGCCGAGATT TCCACATAAT AATCTCGGCA        TTTTTATTTTTGATG 100 131
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        hssR NONE
        hssS 2450156 .. 2450196 +  -8.6  -3.97283   ATTCACATTAATCTC TACCTCCTGAAA-AAACAT TTCT GTTTTTATTTCAGGAGGTA  TCTTTTATATTGATT  80 30
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LQK05_RS12445 2451231 .. 2451265 +  -7.3  -4.28187   TTAACAACTAAAAAA     CGGTAATGTCTAT CACATTAAA AAAGACATTACCG     TTTCATTTATTATTT  76 47
LQK05_RS12460 2456800 .. 2456843 +  -5.5  -5.53288   ACTTTAAAATATGCA AAAAACGGTAAACCCTA ATTCATATTA TAGAGTTTACCGTTTTA TTTTTTTAACTTGCA  82 103
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LQK05_RS12485 2461974 .. 2461996 +  -9.2  -3.69613   TTCAAATGACAAAAA           GAGCTTGG AGTAATC CCAAGCTC           TTGTGCTTTATCTTT  80 32
LQK05_RS12520 2467215 .. 2467225 +    -4  -3.10112   AACCGTTTGCATAAA                 TCAA ACC TTGA                 TTCACTAACTTAAGT  48 2
LQK05_RS12525 2468610 .. 2468625 +  -4.6  -2.51849   TAATGCTGAAATACC              TGCGGC AGAT GCCACA               CCTTTTAACTTCTTA  47 407
LQK05_RS12535 2470378 .. 2470390 +  -2.7  -3.88062   GTTCAGCAATTCATA                CTTTG TAC TAAAG                TTTACTATAATCTAT  49 82
         rsp 2473870 .. 2473887 +  -2.8  -2.81133   GTTAAAGGCTATTTA             TATCAT AAGGAG ATGATA              TGTAATGAGTAACTC  41 74
LQK05_RS12545 2474442 .. 2474480 + -10.4    -4.788   ATGTATTGTTTTTTA   GACACACTTTATTCACAT TTA ACGTGATTAGGGTGTGTC   TTTTTAAATTAATTT 100 153
LQK05_RS12550 2474989 .. 2475032 +   -17  -4.62872   TATATACGAGTAAAA GCAGCGGTAAGTTGATTTCCA ATT TGGAA-TCATCTTACTGCTGC TTTTTAAGAATTACT 100 78
LQK05_RS12565 2478000 .. 2478012 +  -4.9  -4.08706   TACTCATATAATGGC                TTTGT AAT ACAAA                TTTCTATAATGGAAG  63 211
LQK05_RS12570 2478480 .. 2478534 + -11.9  -3.66999   TTAAAATGAATACAC TACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGA ATA TTGC-GCATGATATTAAGGCTTT-GTA TTTAACTAAATGAAT  95 47
LQK05_RS12585 2481930 .. 2481959 +  -4.9  -4.48741   TCGAAACATACAAAA       GCGCCAGAAGATA ATCA TTTCCTCTCGCGC        TTTTATACTGAATTA  68 218
        fmhA 2504580 .. 2504629 +  -2.3  -5.03713   CAACATAACAAAGAA CCACGCATCATGTATATGGCAT CATCACC ATACTAAA-ACATGATACGTGG TTTTATTTGATTATT  64 62
LQK05_RS12730 2508795 .. 2508833 + -11.9  -5.64274   ACTTCACATATTTAA   GAGCTGCATATACAC TCACTCCTT GTGTACATGCAGCTC   TTTTTTTATAAGTAG 100 135
         sbi 2512614 .. 2512645 +  -7.3  -5.46698   AACCGTGATTAAAAA      GAACCGCTGATTC TTAATC GAATCTACGGTTC       TTTTTTCATTTTCCA  95 52
        hlgA 2514030 .. 2514058 +  -6.8  -4.62302   AATCATTTAAAAAAA        TCCTGGGACA CTTCATACT TGTCTCAGGA        TTTTTCAACATATTG  76 48
        hlgC NONE
        hlgB 2516510 .. 2516541 + -10.2  -4.70353   AAATAGCTAGTAAAA      CACGGTCGCCAACAG TAA TTGT-GACGACCGTG      TTTTGATTTATTATC 100 35
LQK05_RS12825 NONE
LQK05_RS12830 2529238 .. 2529296 +  -8.3  -5.37043   ATGATAAACATTAAT TCCCTATACTTTATCTGTATCACTACG TTATT CGTGATGATGCATTAAGAGTATAGGGA TTTTTTATATAAACT  93 58
LQK05_RS12835 2530615 .. 2530650 + -14.2  -4.11906   ACTTCAACATAATTA    GAACCCTAGCAAAGAT ATCT ATCTTTGTCAGGGTTC     TTCTTTATGAATTAT 100 42
LQK05_RS12845 2531993 .. 2532028 + -15.8  -2.52785   CACGTGTGTAAAACA    TAAAATGCGCAAA-CTG GGT CAGGTTTGCGCATTTTA    AATTTCTATTATTTG 100 55
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LQK05_RS12860 2536762 .. 2536807 + -13.5   -5.0916   AGACATAACAACACC CCCCGTACATATGAGACAA AGTCATTA TCATCTCATATGTACGGGG TTTTTATATTCAACA 100 44
LQK05_RS12870 2540448 .. 2540500 +  -9.4  -4.65458   AAGACATAATAAAAA GACTTGTTCGAGCCGTGCGTTTGATA ATA TATCAG-C-CACGATTCGACCAAGTC TTTATTCTTTGTATA 100 32
LQK05_RS12925 2551358 .. 2551370 +  -7.7   -5.1925   ACTGAACGAAAATGC                GCTTG TAA CAAGC                TTTTTTCAATTCTAG  91 226
LQK05_RS12930 2553195 .. 2553222 +  -4.1   -4.3467   ATCGCATCTAAAAAA        GCACACCTG AATTTGATAG CAGGCGTGC         TTTTCATATGAGAAT  61 45
LQK05_RS12965 2559284 .. 2559332 +  -6.2  -4.00934   TTATAACATAAAAAT GCCCTCAG-ATAAG-ACTAAGGAT ACA AACCTTAATTCATATTCTGAGGGC TTTAATATTTGAAAT  68 42
LQK05_RS12975 2561998 .. 2562039 + -11.8  -4.48299   CATACACATCAAAAA GCACACTTAAAAGTCAGT ATCACA ACTCACTTTTAAGCGTGC  TTTATTTAGATATAC 100 67
LQK05_RS13035 2575425 .. 2575458 + -12.6  -3.16079   AGGGATAAATTAAAA     TGCCACTATACAAG ATTTGA CCTGTATAGTGGCA      TGATTTGTTATGATA 100 51
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LQK05_RS13060 2578882 .. 2578901 +  -5.1  -4.01564   AAATAAATAAAGGGG            TTTGTGA TGTATT TCACAAA             TTTATCACTATTTTG  61 466
LQK05_RS13070 2579367 .. 2579393 +  -3.8  -4.12859   TATCCTCACTTGGAG         TATATTGTACAG AAT CTGTAAAATAAA         TGTTTTCTTCTTTAT  59 64
LQK05_RS13130 2591678 .. 2591695 +  -2.1  -4.42386   AAATTAATGCGATGA             TTTTTAG CTAA TTAAAAA              TTTTATACATCGAAA  55 15
LQK05_RS13135 NONE
LQK05_RS13140 2592759 .. 2592786 +  -4.2    -3.272   TGTTTGCGAAAAAAA        TACAACCTTGTA CGAA TACAAAGTTGCA         TTAATATAGAATCAT  49 94
        sarU 2601687 .. 2601704 +  -4.1   -4.0896   GCTAGGTTTGATGGT             GCC-GTAC CTT GTGCTGGC             TTTTCAACAAACTTT  62 513
LQK05_RS13230 2620477 .. 2620514 +    -8  -5.25805   TGCTATAAATAAAAA   GCAGTAAAATCATTTCG ATGGC TGGAATGATTT-ACTGC   TTTTTTAGGTTTATT  93 73
LQK05_RS13235 NONE
LQK05_RS13240 2622479 .. 2622506 +  -4.8  -5.61596   AAAATCATTTTCAAA        TCCCTTCACC CAAATAAT GGTGCGGGGA         TTTTTTTATCCAAAT  83 91
LQK05_RS13245 2624857 .. 2624885 + -16.9  -3.36655   CTACACCGAAAAAAA        TCCCCTCACTATT GCG AGTAGTGAGGGGA        TTGGTGTATCTATGC 100 131
LQK05_RS13250 2626222 .. 2626261 + -12.4  -3.72324   TTCAAAATCAAAAAA  GCGGGCAGATG-AAAAG TAAAAAT CTTTTCCATCTGTCCGC  TTCTTAATAGAACTG  95 75
LQK05_RS13270 2628893 .. 2628916 + -13.2  -5.46657   GGTTAAATAAATTTT          GCGATGGTGC AACT GTACCATCGC           TTTTTTGTTCGCATC 100 35
LQK05_RS13275 2629899 .. 2629927 + -12.6   -5.5112   TTTTTTCACGCAAAA       GCCTGCGATT-CA TTTA TGTAATCGCAGGC        TTTTTTATTGCTAAC 100 64
LQK05_RS13285 2631923 .. 2631959 + -13.9   -4.6645   AATTAATATATATAT    TTAAAAGCAAAGGCGCG CCA TGTGCCTTTGCTTTTTA    TTTTGTATATCTGTA 100 35
LQK05_RS13295 2633921 .. 2633931 +  -2.4  -3.66921   CATTAATTTATAATT                 GAGG TGT CCAC                 TTTGAAATTAGAATT  47 28
LQK05_RS13300 2634656 .. 2634697 + -13.4  -3.54926   AAAATCGGTATGTAG TACATAAAAAGGAGCGGCA TCCAT TGTCGCTCCTTTTTAT-TA TGTATTTTTACAATC 100 26
LQK05_RS13310 2636268 .. 2636289 + -11.7  -2.72344   ATGTAGTGGTTCTTA           CACATTAGC CACA GCTAATGTG            TACTTAAAAATAGGA  93 171
LQK05_RS13340 2640423 .. 2640433 +  -5.4  -4.25111   TCATCTAGACCACTA                 CATC TTA GATG                 ATTTTTTTATTTTCT  65 91
LQK05_RS13345 2641761 .. 2641777 +  -6.6  -3.07891   CCTAAACCATCTAAG              TCACCA TTAAT TGGTGA              TACTTTGTAGTTATC  59 311
LQK05_RS13390 2650573 .. 2650596 + -13.2  -4.93316   CACATCATCTCATGT          TAGCGCTCTG ATTG CAGGGCGCTA           TTTTTAATGTTATTG 100 59
LQK05_RS13395 2651362 .. 2651420 +  -2.9  -5.54885   ACTATATTTACTAAT CAAAAAACTTCTATCACGAACGC-TTCA AATTCC TGTATGCG-T-GTGATAGAAGTTTTTTA TTTTTTGTTCATATT  73 27
LQK05_RS13405 2654235 .. 2654275 + -14.2  -3.80279   AATAAAACCTAAAAG  CAGCAGTAAGACCACTTC TAATT GAAATCGTCTTACTGCTG  TTCTCTATTTATAAC 100 63
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        farR 2663329 .. 2663367 +  -8.4  -5.98675   CATTCATAATAAAAA  CGATAGT-GTACACG TTAATGAATT CGTGTACTACTATCG   TTTTTTATTTTTATC 100 69
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