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        ssrA  802538 ..  802562 +  -7.8  -5.53079   GTCTCCATATTTGTA          GCCTACAACC TTTGT GGATGTGGGC          TTTTTTATATGTTTT  95 31
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        clfA  811570 ..  811587 + -11.3  -5.29385   ATGATTCATGAAGAA             GCCACCT TAAA AGGTGGC              TTTTTTACTTGGATT 100 66
         vwb  813365 ..  813400 +  -5.7  -5.24449   CAATGATGCAATCTA   GTA-TAGTCCACATTCT AAAT AGG-TGTGGACTATTAC    TTTTTTCACTTTATA  84 132
         emp  814682 ..  814714 +  -8.6  -5.44119   ACCTATTATTTTAAA      TATAGTCTACAATC TATGT GGTTGTAGGCTGTA      TTTTTTTACGCTAAG 100 74
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        istB  816956 ..  816996 +  -9.3   -3.1371   ACATCTATCAACAAA  TTATTTTGCTTTTCTACTT TGA AAGTTGAATAGTAAAATAA  TCTTAAATAATTATT  78 102
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        gcvH  828414 ..  828436 + -11.4  -4.94262   ATAATCACCGTGTAA           CTCCTTAATC TAA GATTGAGGAG           TTTATTTTTAGTCTG 100 37
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I5044_RS11655 2376980 .. 2377009 +  -4.9  -4.48741   TCGAAACATACAAAA       GCGCCAGAAGATA ATCA TTTCCTCTCGCGC        TTTTATACTGAATTA  68 224
        fmhA 2398846 .. 2398895 +  -2.3  -5.03713   CAACATAACAAAGAA CCACGCATCATGTATATGGCAT CATCGCC ATACTAAA-ACATGATACGTGG TTTTATTTGATTATT  64 62
I5044_RS11790 2403061 .. 2403099 + -11.9  -5.28778   ACTTCACATATTTAA   GAGCTGCATATACAC TCACTCCTT GTGTACATGCAGCTC   TTTTTTATAAGTAGT 100 135
I5044_RS11810 2407087 .. 2407118 +  -9.5  -6.34616   AACCGTGATTAAAAA      GAACCGTTGATTC TCAATC GAATCTGCGGTTC       TTTTTTTTATTTTCC 100 52
        hlgA 2408504 .. 2408532 +  -6.8  -5.09173   AATCATTTTATAAAA        TCCTGGGACA CTTCATACT TGTCTCAGGA        TTTTTTAACATATTG  84 48
        hlgC NONE
        hlgB 2410984 .. 2411015 + -10.2  -4.70353   AAATAGCTAGTAAAA      CACGGTCGCCAACAG TAA TTGT-GACGACCGTG      TTTTGATTTATTATC 100 35
I5044_RS11885 NONE
I5044_RS11890 2423818 .. 2423876 +  -8.3  -5.37043   ATGATAAACATTAAT TCCCTATACTTTATCTGTATCACTACG TTATT CGTGATGATGCATTAAGAGTATAGGGA TTTTTTATATAAACT  93 59
I5044_RS11895 2425195 .. 2425230 +   -12  -4.11906   ACTTCAACATAATTA    GAACCCTAGCAAAGAT ATCT ATCTTTGTCGGGGTTC     TTCTTTATGAATTAT 100 42
I5044_RS11905 2426573 .. 2426608 + -15.8  -2.52785   CGCGTGTGTAAAACA    TAAAATGCGCAAA-CTG GGT CAGGTTTGCGCATTTTA    AATTTCTATTATTTG 100 55
I5044_RS11915 2429121 .. 2429149 + -13.3  -5.42259   AATTTAAACATCTCG        CTCTAGTATCAGT TCA ACCGATACTAGAG        TTTTTTTGAAAATAA 100 39
I5044_RS11920 2431340 .. 2431385 + -13.5   -5.0916   CAAGATATAACAACA CCCCGTACATATGAGACAA AGTCATTA TCATCTCATATGTACGGGG TTTTTATATTCAACA 100 42
I5044_RS11930 2435248 .. 2435264 +    -3  -4.15703   GGTTGAATATCAATA              TTTGGT TCAAC ACCAAG              TTGTTCTTTATACCA  57 250
I5044_RS11985 2445803 .. 2445831 +  -2.5  -5.79595   CAACACACACATTAA       CCAACCATTGAT TTCAAC ATCT-TGGTTGG        TTTTTTATTTTGAAA  78 72
I5044_RS11990 2447435 .. 2447462 +  -4.1   -4.3467   ATCGCATCTAAAAAA        GCACACCTG AATTTGATAG CAGGCGTGC         TTTTCATATGAGAAT  61 45
I5044_RS12015 2452625 .. 2452673 + -10.6  -4.00934   TTATAACATAAAAAT GCCCTCAG-ATAAG-ACTAAGGTT ACA AACCTTAATTCATATTCTGAGGGC TTTAATATTTGAAAT  91 42
I5044_RS12025 2455338 .. 2455379 + -11.8  -4.48299   CATACACATCAAAAA GCACACTTAAAAGTCAGT ATCACA ACTCACTTTTAAGCGTGC  TTTATTTAGATATAC 100 67
I5044_RS12085 2469108 .. 2469141 + -12.6  -3.16079   GGGGATTAATTAAAA     TGCCACTATACAAG ATTTGA CCTGTATAGTGGCA      TGATTTGTTATGATA 100 51
I5044_RS12120 NONE
I5044_RS12125 2474569 .. 2474588 +  -5.1  -4.01564   AAATAAATAAAGAGG            TTTGTGA TGTATT TCACAAA             TTTATCACTATTTTG  61 466
I5044_RS12175 2484784 .. 2484801 +  -2.1  -4.42386   AAATTAATGCGATGA             TTTTTAG CTAA TTAAAAA              TTTTATACATCGAAA  55 15
I5044_RS12180 NONE
I5044_RS12185 2485864 .. 2485891 +   -10    -3.272   TGTTTGCGAAAGAAA        TGCAACCTTGTA CGAA TACAAAGTTGCA         TTAATATAGAATCAT  83 93
        sarU 2495522 .. 2495539 +  -4.1   -4.0896   GCTAGGTTTGATGGT             GCC-GTAC CTT GTGCTGGC             TTTTCAACAAACTTT  62 513
I5044_RS12275 2514921 .. 2514957 + -15.4  -5.25805   TTCTATAAACAAAAA    GCAGTGAATCATTCCA TCTAT TGAAATGATTCACTGC    TTTTTTAAGTTTATT 100 75
I5044_RS12285 2516413 .. 2516424 +    -3  -3.83675   TTTCTTTAATTTATT                TTGT TATT ACAA                 TTATTGCTTCAATTG  51 353
I5044_RS12295 2519434 .. 2519462 + -16.9  -3.36655   GCTACACCGAAAAAA        TCCCCTCACTATT GCG AGTAGTGAGGGGA        TTGGTGTATCTATGC 100 132
I5044_RS12300 2520800 .. 2520839 + -12.4  -3.72324   TTCAAAATCAAAAAA  GCGGGCAGATG-AAAAG TAAAAAT CTTTTCCATCTGTCCGC  TTCTTAATAGAACTG  95 75
I5044_RS12320 2523471 .. 2523492 +  -8.7  -6.08342   GTTAAACAAATCTCG           CGATGGTGC GCCA GTGCCATCG            TTTTTTTATTTGTTC 100 36
I5044_RS12325 2524517 .. 2524550 + -14.9  -5.51402   AGGCAATGTAAAAAA     GCTGATTTCTATTAA TTAT TTGATAGAAATCAGC      TTTTTTTAAATGTAT 100 101
I5044_RS12340 2528417 .. 2528453 + -13.9   -4.6645   TAAATTAATATATAT    TTAAAAGCAAAGGCGCG CCA TGTGCCTTTGCTTTTTA    TTTTGTATATCTGTA 100 33
I5044_RS12355 2531422 .. 2531461 + -16.6  -5.29782   ATGAAAGATAATTAA  GAAGCATCTATCTGGTAC TAAT GATCCAGATAGATGCTTC   TTTTTTATCAATATC 100 454
I5044_RS12385 2534948 .. 2534958 +  -5.4  -4.25111   TCATCTAGACCACTA                 CATC TTA GATG                 ATTTTTTTATTTTCT  65 91
I5044_RS12390 2536287 .. 2536303 +  -6.6  -3.07891   CCTAAACCATCTAAG              TCACCA TTAAT TGGTGA              TACTTTGTAGTTATC  59 312
I5044_RS12440 2545833 .. 2545857 +  -7.2  -4.90906   CACATCATCTCATGT         TAGCG-CTCTG ATTG CAGGGGCGCTA          TTTTTAATGTTATCG  85 59
I5044_RS12445 2546624 .. 2546680 +    -2  -5.54885   CTATATTTACTAATC AAAAAACTTCTATCACGAACGC-TTCA AATTCC TGTATGCG-T-GTGATAGAAGTTTTTA TTTTTTGTTCATATT  70 28
I5044_RS12455 2549501 .. 2549541 +   -12  -4.85822   AATATAACCTAAAAA  CAGCAGTAAGACAGCTTC TCATT GAAATCGTCTTACTGCTG  TTTTCTATTTATAAT 100 64
        clpL 2552653 .. 2552682 +  -7.3  -5.23016   TAGCGTATCAAAAAA       TGAGCATCAGGA CGCCCTC TCCTG-TGCTCA       TTTTTTAAATTATTT  91 53
        farR 2558548 .. 2558588 +  -4.9  -5.69262   ACATTCATAATAAAA ACGATAGT-GTACACG TTAATGAATT CGTGTACTACTATCGC  TTTTTATTTTTATCG  83 68
        cwrA 2561726 .. 2561762 + -19.7  -5.61881   TATAGATGCTAAATA    GAGAGATTGTTGTGCAA TGT TTGCACGGCAATCTCTC    TTTTTCTTTTTAAAA 100 126
I5044_RS12515 2564447 .. 2564459 +  -7.7   -5.1925   ACTGAACGAAAATGC                GCTTG TAA CAAGC                TTTTTTCAATTCTAG  91 199
        copZ 2565157 .. 2565180 +  -5.3  -2.94099   TAATCACACCATTGT          CTAATGCGT CTAATA ACGCCTTAG           TATCTACTAAAGAAC  52 363
I5044_RS12590 2580935 .. 2580972 +  -6.5  -5.63236   AACTGAATGAAAATA   AGCTTGTCATTAAAA CATATAGA TTTTAGTGACAAGCA    TTTTTGTTTTTGCGT  95 195
I5044_RS12595 2581651 .. 2581661 +    -4  -3.29263   TAATCTCAAAATATA                 TCAA CAC TTGA                 TTCTAAGGAGGATAT  49 213
I5044_RS12600 2582025 .. 2582036 +    -3  -4.19735   TGGGCTTTTTATTTA                TTCT TTTG AGAA                 TTTCATTTTAGCAGA  55 137
I5044_RS12620 NONE
I5044_RS12625 NONE
I5044_RS12630 NONE
I5044_RS12635 2586943 .. 2586983 + -12.7  -4.72696   TTCTCTAATAAAACA  GCTTGGACAGTTTTCAAAT TAT ATTTGATGGCTGACCAAGC  TTATTTTTGTTTACG 100 48
I5044_RS12675 NONE
I5044_RS12680 2594763 .. 2594815 + -10.2  -3.96337   ATATTTACGATTATA TAGATAACCCGAGATTTTAGTATGA TTCA TTTCACTAAAGTCTCGGGTT-TCTA TTTGATAATTTTTAA  91 95
I5044_RS12690 2596453 .. 2596481 +  -7.5  -4.51787   TATGTTATTTAGCAA        GGCAAGCCA CTCTCGATTCA TGGCTTGCC        TTATTTTATTGTATA  80 72
I5044_RS12700 2598954 .. 2598989 + -11.3  -3.77486   AGTGATAGAAGAGAA    GGCCACACGCTTGG AATCTTAAA CCAAG-GTGTGGCC    CTTTTTATTATTGAT  93 80
I5044_RS12725 2602688 .. 2602701 +  -3.9  -2.85351   CGCGTATCAACAAAA               TATGT AAGC ACATA                TATAATATAAAAAGA  46 19
I5044_RS12740 2606870 .. 2606907 +  -8.8   -5.8901   TAAAAATTAAAAAAA  TCATTTCC-CATCTG-AT TAAC ATCCAGATGTGGAAATGA   TTTTTTATTTTATAT 100 38
I5044_RS12750 2609006 .. 2609020 +  -7.2  -4.93296   TCAAGGTTTATGACT               TGAGAA ATG TTCTCA               TTTTTATCATACTGG  85 87
I5044_RS12755 2610000 .. 2610037 + -10.1  -4.87893   TAAACTACTAAAAAG   GACTCATACAT-GTGCTT TAA AGGCATTGTGTATGAGTC   TTTTTGATTAAAGTT 100 68
I5044_RS12765 2612282 .. 2612322 + -13.5  -3.99819   ATCATAAATAAACAA  GCAGTCCAGTGCGTA TCATCATACCT TACGCATTGGACTGC  TTTGCTATGTTTATT 100 34
I5044_RS12795 2618978 .. 2618993 +  -2.6   -4.5477   AAATATTTTTAATGT              CTTTTT TTAG AAAAGG               TTTTATAATGTATTA  58 39
I5044_RS12800 2619685 .. 2619718 + -12.7  -4.91873   GGTGCACGAAATAAA     CGGTAATTTCTATCT CAAT AAATAGAAATTACCG      TTTTTGCTTAATATG 100 94
I5044_RS12815 2622856 .. 2622881 +  -6.1  -3.46848   CTAACATAAAAAGAA         GCCAAGGCAAC GGAT GTTACCTTGAC          TTCTAATACATTTTC  62 212
I5044_RS12850 2630235 .. 2630273 + -10.4  -3.53115   TTCTAAATATAAAAT   GCCTCCTAATGACATACT ATT AGTACATCATTAAGAGGC   TCTTGTGTTATTTGC  88 56
I5044_RS12900 2638934 .. 2638953 +  -5.8  -3.33711   CATCTTGCGCCTTGT            TCAATTCA GCAA TGAGTTGA             TTGCCTTTATCCGTC  61 265
I5044_RS12965 2653314 .. 2653360 + -13.4  -4.47786   TACATAAATTCAGAA AAACAGCAGTAAGATATTTT TCTATTT GAAATATCTTACTGCTGTTC TTTATTTGCATAATT 100 72
I5044_RS12970 2655376 .. 2655406 +  -4.9  -5.90981   TTTGAATACTTACAA       GAATAATTGCC ACTAGTAAC GGTAATTATTC       TTTTTTTTAGTATCG  87 20
I5044_RS12975 NONE
        manA 2658430 .. 2658465 + -10.6  -4.44392   CTAAAAACATAAAAA    TCCACACATTAAGG AGCTATAA CCCTAATGTGTGGA     TTTAATTTTTATTCT  91 93
I5044_RS12990 2663591 .. 2663619 + -14.6  -3.22496   TCTTATTCAATTAAA        CCCGAGGCATTC AGTTC GAACGCCTCGGG        TCATTTTATATAAAT 100 121
I5044_RS13050 NONE
I5044_RS13055 NONE
I5044_RS13060 2689373 .. 2689395 +    -5  -3.11634   AATCTTTCAAAAATC           TTGTTGAT AAATTAC ATCAACAA           TTAACTGATATGCGA  52 133
I5044_RS13065 NONE
I5044_RS13070 2690298 .. 2690308 +  -2.6  -3.05536   TATTTTTCTGGTCTC                 TTTA TCG TAAA                 TATTCCCCCTAATTT  42 126
        pgaC NONE
        icaD NONE
        icaB NONE
        icaC 2699329 .. 2699379 + -10.6  -4.02742   AAGCTATGTTAAAAA CACGCGGT-GGGCGAAATCAGTT TGAATT GACTGACTTCGTTTGACCGCGTG TTTAATATTGTTATA  91 46
I5044_RS13195 2712700 .. 2712732 + -11.5  -5.00138   AATATATATACGAAA      TGCCAACTATATC ATCCCTA GGTATAGTTGGCA      TTTTTCGTTTAACTC 100 67
I5044_RS13205 2715005 .. 2715040 +  -4.1  -4.25873   TACCTATCAAAACAC    GCTTTGAAAATCC AATTTATAAA GGTTTTTCAAGGC     TGTTTTTTATGCGCA  58 52
         pcp 2716237 .. 2716248 +    -3  -5.14563   CATACGTCACATTTA                TAAC ATAT GTTA                 TTTTTTGGTCACCAA  71 494
        bstA 2717628 .. 2717650 +  -6.3  -5.85425   AATATGTGCTTATTA           ACCGTTAAC AACAC GTTAACGGG           TTTTTTATTTGTTTA 100 40
I5044_RS13230 2719283 .. 2719309 + -10.9  -5.08367   AAAATATTTAAATTA         GCGCTCGAATC TCATC GATTTGGGCGC         TTTTTAATTTGTATT 100 39
I5044_RS13240 NONE
I5044_RS13245 2722664 .. 2722695 +  -6.8  -3.66908   GCTACACTCTCAGTA      GTCATCTTTAAA TCGTTTCT TTTAGAGATGAC       TTCATTTTGAGAGCG  66 109
I5044_RS13250 2723636 .. 2723667 +  -9.5  -4.66163   TAATCATAAAAATAC      GGACGTAACTTAC TTTAAT GTAGGTAACGTCC       TTTTTAAATACACAT 100 38
I5044_RS13255 2723908 .. 2723919 +    -3   -4.4078   GCCACACCCTTCTTT                TGAA CCGC TTCA                 TTTTACTTAAGCAAG  57 4
        vraD 2725468 .. 2725481 +  -2.4  -3.60006   ATCAGTATTAGGTGG               TGTC TCAAAT GACA                TTTAACCATATCGTT  47 7
        vraE NONE
        vraH 2727784 .. 2727815 +  -5.8  -2.62184   GTATCCAAGATGATT      ATCACCTTACGACC CTTA GGTCGTAAGGCAAC       TGATATAGAAAACAC  55 169
        vraH 2729451 .. 2729473 +  -9.9  -5.31456   AGGTTTTAATATCAA           CAAGTAGCG TTTAT CGCTGCTTG           TTTTTTATGAATTGC 100 84
I5044_RS13305 2730028 .. 2730056 + -14.1  -5.70829   ATGAATCGCTTTGAT        TACCAACAAGGTT CTA AATCTTGTTGGTA        TTTTTTTATGCTATT 100 69
        rpmH 2737877 .. 2737898 - -11.7  -6.02546   TTAAACGAAAAAAAA           GATCACTGA TGAG TCAGTGATC            TTATGCAGATAAAAC 100 26
        rnpA NONE
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        mnmG NONE
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         noc 2732290 .. 2732318 -  -4.7  -6.09196   CGTAAAACAAAAAAA        GACAAAGCT GTTATTATCTT AGCTTTGTC        TTTTATGTGTTAGTC  95 64
I5044_RS13320 2731347 .. 2731360 -  -2.5  -2.76696   TCTGCCTCCAATAAT               TTATT ACTT AATAA                CTGAATACAACTAAT  40 59
I5044_RS13315 NONE
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I5044_RS13285 2728202 .. 2728227 -  -4.7  -5.38951   AAGCTATATAAAAAA         GCCGTTGGTCTC TTC GAAA-CTACGGC         TTTTCTCCGTGCTAT  79 45
I5044_RS13260 2723864 .. 2723909 - -12.9  -3.34715   CACTCTGCGCAAACA CAACAAAAAGGATGTGGCACAA ACT TCATGCCACACCCTTCTT-TTG AACCGCTTCATTTTA 100 42
        rarD 2719515 .. 2719557 -  -7.4  -5.99154   CATGAAATAAAAAAA CACTTTCGCTTAAATTCAT TTAATT ATGAATTCAAA-GAAAGTG CTTTATTTCATATTT 100 161
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