locus-tag	class	description
EQ029_RS00005	PF11638	DnaA N-terminal domain
EQ029_RS00005	PF08299	Bacterial dnaA protein helix-turn-helix
EQ029_RS00005	PF00308	Bacterial dnaA  protein
EQ029_RS00010	PF02767	DNA polymerase III beta subunit, central domain
EQ029_RS00010	PF02768	DNA polymerase III beta subunit, C-terminal domain
EQ029_RS00010	PF00712	DNA polymerase III beta subunit, N-terminal domain
EQ029_RS00020	PF02463	RecF/RecN/SMC N terminal domain
EQ029_RS00025	PF00204	DNA gyrase B
EQ029_RS00025	PF00986	DNA gyrase B subunit, carboxyl terminus
EQ029_RS00025	PF02518	Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase
EQ029_RS00025	PF01751	Toprim domain
EQ029_RS00030	PF03989	DNA gyrase C-terminal domain, beta-propeller
EQ029_RS00030	PF00521	DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A
EQ029_RS00035	PF01256	Carbohydrate kinase
EQ029_RS00040	PF00587	tRNA synthetase class II core domain (G, H, P, S and T)
EQ029_RS00040	PF02403	Seryl-tRNA synthetase N-terminal domain
EQ029_RS00045	PF03591	AzlC protein
EQ029_RS00055	PF00561	alpha/beta hydrolase fold
EQ029_RS00065	PF01368	DHH family
EQ029_RS00065	PF02272	DHHA1 domain
EQ029_RS00070	PF03948	Ribosomal protein L9, C-terminal domain
EQ029_RS00070	PF01281	Ribosomal protein L9, N-terminal domain
EQ029_RS00075	PF00772	DnaB-like helicase N terminal domain
EQ029_RS00075	PF03796	DnaB-like helicase C terminal domain
EQ029_RS00080	PF00709	Adenylosuccinate synthetase
EQ029_RS00095	PF00072	Response regulator receiver domain
EQ029_RS00095	PF00486	Transcriptional regulatory protein, C terminal
EQ029_RS00100	PF00989	PAS fold
EQ029_RS00100	PF02518	Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase
EQ029_RS00100	PF00672	HAMP domain
EQ029_RS00100	PF00512	His Kinase A (phospho-acceptor) domain
EQ029_RS00105	PF07435	YycH protein
EQ029_RS00115	PF00753	Metallo-beta-lactamase superfamily
EQ029_RS00120	PF02590	Predicted SPOUT methyltransferase
EQ029_RS00140	PF01451	Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase
EQ029_RS00145	PF02040	Arsenical pump membrane protein
EQ029_RS00150	PF01022	Bacterial regulatory protein, arsR family
EQ029_RS00160	PF07563	Protein of unknown function (DUF1541)
EQ029_RS00165	PF18766	SWI2/SNF2 ATPase
EQ029_RS00165	PF04313	Type I restriction enzyme R protein N terminus (HSDR_N)
EQ029_RS00165	PF12008	Type I restriction and modification enzyme - subunit R C terminal
EQ029_RS00295	PF00534	Glycosyl transferases group 1
EQ029_RS00300	PF08245	Mur ligase middle domain
EQ029_RS00300	PF02875	Mur ligase family, glutamate ligase domain
EQ029_RS00300	PF01225	Mur ligase family, catalytic domain
EQ029_RS00310	PF00924	Mechanosensitive ion channel
EQ029_RS00325	PF07683	Cobalamin synthesis protein cobW C-terminal domain
EQ029_RS00325	PF02492	CobW/HypB/UreG, nucleotide-binding domain
EQ029_RS00330	PF01297	Zinc-uptake complex component A periplasmic
EQ029_RS00340	PF02525	Flavodoxin-like fold
EQ029_RS00350	PF07687	Peptidase dimerisation domain
EQ029_RS00350	PF01546	Peptidase family M20/M25/M40
EQ029_RS00360	PF00587	tRNA synthetase class II core domain (G, H, P, S and T)
EQ029_RS00360	PF07973	Threonyl and Alanyl tRNA synthetase second additional domain
EQ029_RS00360	PF02824	TGS domain
EQ029_RS00360	PF03129	Anticodon binding domain
EQ029_RS00380	PF01757	Acyltransferase family
EQ029_RS00385	PF00535	Glycosyl transferase family 2
EQ029_RS00385	PF18674	TarS beta-glycosyltransferase C-terminal domain 1
EQ029_RS00390	PF01297	Zinc-uptake complex component A periplasmic
EQ029_RS00395	PF00950	ABC 3 transport family
EQ029_RS00400	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS00405	PF07683	Cobalamin synthesis protein cobW C-terminal domain
EQ029_RS00405	PF02492	CobW/HypB/UreG, nucleotide-binding domain
EQ029_RS00410	PF05525	Branched-chain amino acid transport protein
EQ029_RS00420	PF00496	Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle
EQ029_RS00425	PF00528	Binding-protein-dependent transport system inner membrane component
EQ029_RS00430	PF00528	Binding-protein-dependent transport system inner membrane component
EQ029_RS00435	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS00435	PF08352	Oligopeptide/dipeptide transporter, C-terminal region
EQ029_RS00440	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS00460	PF07690	Major Facilitator Superfamily
EQ029_RS00465	PF13411	MerR HTH family regulatory protein
EQ029_RS00475	PF00571	CBS domain
EQ029_RS00475	PF03471	Transporter associated domain
EQ029_RS00475	PF01595	Cyclin M transmembrane N-terminal domain
EQ029_RS00485	PF01872	RibD C-terminal domain
EQ029_RS00495	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS00500	PF00324	Amino acid permease
EQ029_RS00505	PF00881	Nitroreductase family
EQ029_RS00525	PF04650	YSIRK type signal peptide
EQ029_RS00550	PF00356	Bacterial regulatory proteins, lacI family
EQ029_RS00555	PF00294	pfkB family carbohydrate kinase
EQ029_RS00560	PF05025	RbsD / FucU transport protein family
EQ029_RS00565	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS00570	PF02653	Branched-chain amino acid transport system / permease component
EQ029_RS00575	PF13407	Periplasmic binding protein domain
EQ029_RS00580	PF02558	Ketopantoate reductase PanE/ApbA
EQ029_RS00580	PF08546	Ketopantoate reductase PanE/ApbA C terminal
EQ029_RS00585	PF02548	Ketopantoate hydroxymethyltransferase
EQ029_RS00590	PF02569	Pantoate-beta-alanine ligase
EQ029_RS00595	PF02261	Aspartate decarboxylase
EQ029_RS00605	PF02557	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase
EQ029_RS00610	PF01380	SIS domain
EQ029_RS00610	PF01418	Helix-turn-helix domain, rpiR family
EQ029_RS00615	PF02302	PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIB subunit
EQ029_RS00620	PF02378	Phosphotransferase system, EIIC 
EQ029_RS00625	PF02255	PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIA subunit
EQ029_RS00640	PF01869	BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
EQ029_RS00650	PF05656	Protein of unknown function (DUF805)
EQ029_RS00660	PF05192	MutS domain III
EQ029_RS00660	PF01624	MutS domain I
EQ029_RS00660	PF00488	MutS domain V
EQ029_RS00660	PF05188	MutS domain II
EQ029_RS00660	PF05190	MutS family domain IV
EQ029_RS00665	PF11208	Protein of unknown function (DUF2992)
EQ029_RS00670	PF02040	Arsenical pump membrane protein
EQ029_RS00675	PF02525	Flavodoxin-like fold
EQ029_RS00680	PF03606	C4-dicarboxylate anaerobic carrier
EQ029_RS00695	PF12867	DinB superfamily
EQ029_RS00700	PF16363	GDP-mannose 4,6 dehydratase
EQ029_RS00710	PF07690	Major Facilitator Superfamily
EQ029_RS00730	PF00890	FAD binding domain
EQ029_RS00735	PF00171	Aldehyde dehydrogenase family
EQ029_RS00740	PF00107	Zinc-binding dehydrogenase
EQ029_RS00740	PF08240	Alcohol dehydrogenase GroES-like domain
EQ029_RS00745	PF01047	MarR family
EQ029_RS00750	PF02852	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
EQ029_RS00750	PF07992	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
EQ029_RS00765	PF00155	Aminotransferase class I and II
EQ029_RS00775	PF02852	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
EQ029_RS00775	PF07992	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
EQ029_RS00780	PF00676	Dehydrogenase E1 component
EQ029_RS00785	PF02780	Transketolase, C-terminal domain
EQ029_RS00785	PF02779	Transketolase, pyrimidine binding domain
EQ029_RS00790	PF00198	2-oxoacid dehydrogenases acyltransferase (catalytic domain)
EQ029_RS00790	PF00364	Biotin-requiring enzyme
EQ029_RS00790	PF02817	e3 binding domain
EQ029_RS00795	PF07992	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
EQ029_RS00795	PF02852	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
EQ029_RS00800	PF03551	Transcriptional regulator PadR-like family
EQ029_RS00815	PF09855	Nucleic-acid-binding protein containing Zn-ribbon domain (DUF2082)
EQ029_RS00820	PF00892	EamA-like transporter family
EQ029_RS00830	PF04464	CDP-Glycerol:Poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase 
EQ029_RS00860	PF04650	YSIRK type signal peptide
EQ029_RS00880	PF13411	MerR HTH family regulatory protein
EQ029_RS00885	PF02525	Flavodoxin-like fold
EQ029_RS00900	PF05154	TM2 domain
EQ029_RS00910	PF00185	Aspartate/ornithine carbamoyltransferase, Asp/Orn binding domain
EQ029_RS00910	PF02729	Aspartate/ornithine carbamoyltransferase, carbamoyl-P binding domain
EQ029_RS00915	PF00696	Amino acid kinase family
EQ029_RS00925	PF01381	Helix-turn-helix
EQ029_RS00935	PF10437	Bacterial lipoate protein ligase C-terminus
EQ029_RS00935	PF03099	Biotin/lipoate A/B protein ligase family
EQ029_RS00945	PF01661	Macro domain
EQ029_RS00950	PF01597	Glycine cleavage H-protein
EQ029_RS00955	PF00296	Luciferase-like monooxygenase
EQ029_RS00960	PF00724	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
EQ029_RS00965	PF06968	Biotin and Thiamin Synthesis associated domain
EQ029_RS00965	PF04055	Radical SAM superfamily
EQ029_RS00975	PF00939	Sodium:sulfate symporter transmembrane region
EQ029_RS00980	PF05684	Protein of unknown function (DUF819)
EQ029_RS00985	PF07286	Protein of unknown function (DUF1445)
EQ029_RS00995	PF02028	BCCT, betaine/carnitine/choline family transporter
EQ029_RS01000	PF01979	Amidohydrolase family
EQ029_RS01010	PF01182	Glucosamine-6-phosphate isomerases/6-phosphogluconolactonase
EQ029_RS01015	PF04131	Putative N-acetylmannosamine-6-phosphate epimerase
EQ029_RS01020	PF01380	SIS domain
EQ029_RS01020	PF01418	Helix-turn-helix domain, rpiR family
EQ029_RS01025	PF00480	ROK family
EQ029_RS01030	PF00701	Dihydrodipicolinate synthetase family
EQ029_RS01035	PF00474	Sodium:solute symporter family
EQ029_RS01055	PF02517	CPBP intramembrane metalloprotease
EQ029_RS01060	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS01065	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS01065	PF08352	Oligopeptide/dipeptide transporter, C-terminal region
EQ029_RS01070	PF00528	Binding-protein-dependent transport system inner membrane component
EQ029_RS01075	PF00528	Binding-protein-dependent transport system inner membrane component
EQ029_RS01080	PF00496	Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle
EQ029_RS01085	PF01470	Pyroglutamyl peptidase
EQ029_RS01100	PF07690	Major Facilitator Superfamily
EQ029_RS01105	PF02275	Linear amide C-N hydrolases, choloylglycine hydrolase family
EQ029_RS01115	PF00581	Rhodanese-like domain
EQ029_RS01115	PF12368	Rhodanase C-terminal
EQ029_RS01115	PF17773	UPF0176 acylphosphatase like domain
EQ029_RS01120	PF08450	SMP-30/Gluconolactonase/LRE-like region
EQ029_RS01125	PF02878	Phosphoglucomutase/phosphomannomutase, alpha/beta/alpha domain I
EQ029_RS01125	PF02879	Phosphoglucomutase/phosphomannomutase, alpha/beta/alpha domain II
EQ029_RS01125	PF02880	Phosphoglucomutase/phosphomannomutase, alpha/beta/alpha domain III
EQ029_RS01125	PF00408	Phosphoglucomutase/phosphomannomutase, C-terminal domain
EQ029_RS01145	PF06100	MCRA family
EQ029_RS01150	PF17755	UvrA DNA-binding domain
EQ029_RS01150	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS01150	PF17760	UvrA interaction domain
EQ029_RS01155	PF00797	N-acetyltransferase
EQ029_RS01165	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS01175	PF01381	Helix-turn-helix
EQ029_RS01180	PF02082	Transcriptional regulator
EQ029_RS01185	PF00892	EamA-like transporter family
EQ029_RS01190	PF07690	Major Facilitator Superfamily
EQ029_RS01200	PF00149	Calcineurin-like phosphoesterase
EQ029_RS01200	PF02872	5'-nucleotidase, C-terminal domain
EQ029_RS01210	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS01215	PF00528	Binding-protein-dependent transport system inner membrane component
EQ029_RS01220	PF00528	Binding-protein-dependent transport system inner membrane component
EQ029_RS01245	PF00344	SecY translocase
EQ029_RS01250	PF16993	Accessory Sec system protein Asp1
EQ029_RS01255	PF16929	Accessory Sec system GspB-transporter
EQ029_RS01260	PF15432	Accessory Sec secretory system ASP3
EQ029_RS01265	PF01043	SecA preprotein cross-linking domain
EQ029_RS01265	PF07517	SecA DEAD-like domain
EQ029_RS01265	PF07516	SecA Wing and Scaffold domain
EQ029_RS01270	PF00534	Glycosyl transferases group 1
EQ029_RS01280	PF00672	HAMP domain
EQ029_RS01280	PF00512	His Kinase A (phospho-acceptor) domain
EQ029_RS01285	PF00486	Transcriptional regulatory protein, C terminal
EQ029_RS01285	PF00072	Response regulator receiver domain
EQ029_RS01305	PF01625	Peptide methionine sulfoxide reductase
EQ029_RS01320	PF00296	Luciferase-like monooxygenase
EQ029_RS01325	PF07690	Major Facilitator Superfamily
EQ029_RS01335	PF04069	Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
EQ029_RS01340	PF03176	MMPL family
EQ029_RS01345	PF03466	LysR substrate binding domain
EQ029_RS01345	PF00126	Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
EQ029_RS01350	PF00149	Calcineurin-like phosphoesterase
EQ029_RS01355	PF01468	GA module
EQ029_RS01360	PF03606	C4-dicarboxylate anaerobic carrier
EQ029_RS01365	PF02378	Phosphotransferase system, EIIC 
EQ029_RS01365	PF00367	phosphotransferase system, EIIB
EQ029_RS01365	PF00358	phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 1
EQ029_RS01370	PF01832	Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase
EQ029_RS01370	PF01832	Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase
EQ029_RS01370	PF05257	CHAP domain
EQ029_RS01370	PF05257	CHAP domain
EQ029_RS01375	PF01061	ABC-2 type transporter
EQ029_RS01415	PF02863	Arginine repressor, C-terminal domain
EQ029_RS01415	PF01316	Arginine repressor, DNA binding domain
EQ029_RS01425	PF13520	Amino acid permease
EQ029_RS01430	PF00027	Cyclic nucleotide-binding domain
EQ029_RS01440	PF00356	Bacterial regulatory proteins, lacI family
EQ029_RS01445	PF00753	Metallo-beta-lactamase superfamily
EQ029_RS01450	PF08240	Alcohol dehydrogenase GroES-like domain
EQ029_RS01450	PF00107	Zinc-binding dehydrogenase
EQ029_RS01455	PF13630	SdpI/YhfL protein family
EQ029_RS01460	PF09587	Bacterial capsule synthesis protein PGA_cap
EQ029_RS01465	PF06426	Serine acetyltransferase, N-terminal 
EQ029_RS01465	PF00132	Bacterial transferase hexapeptide (six repeats)
EQ029_RS01470	PF02776	Thiamine pyrophosphate enzyme, N-terminal TPP binding domain
EQ029_RS01470	PF00205	Thiamine pyrophosphate enzyme, central domain
EQ029_RS01470	PF02775	Thiamine pyrophosphate enzyme, C-terminal TPP binding domain
EQ029_RS01480	PF02525	Flavodoxin-like fold
EQ029_RS01490	PF02706	Chain length determinant protein
EQ029_RS01495	PF13614	AAA domain
EQ029_RS01505	PF02719	Polysaccharide biosynthesis protein
EQ029_RS01525	PF00535	Glycosyl transferase family 2
EQ029_RS01530	PF12464	Maltose acetyltransferase 
EQ029_RS01530	PF00132	Bacterial transferase hexapeptide (six repeats)
EQ029_RS01535	PF01370	NAD dependent epimerase/dehydratase family
EQ029_RS01540	PF03721	UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family, NAD binding domain
EQ029_RS01540	PF03720	UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family, UDP binding domain
EQ029_RS01540	PF00984	UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family, central domain
EQ029_RS01545	PF13477	Glycosyl transferase 4-like
EQ029_RS01545	PF00534	Glycosyl transferases group 1
EQ029_RS01550	PF02397	Bacterial sugar transferase
EQ029_RS01560	PF01041	DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family
EQ029_RS01565	PF03816	Cell envelope-related transcriptional attenuator domain
EQ029_RS01570	PF00245	Alkaline phosphatase
EQ029_RS01575	PF00072	Response regulator receiver domain
EQ029_RS01575	PF00486	Transcriptional regulatory protein, C terminal
EQ029_RS01580	PF02518	Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase
EQ029_RS01585	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS01615	PF01507	Phosphoadenosine phosphosulfate reductase family
EQ029_RS01620	PF00667	FAD binding domain
EQ029_RS01620	PF00258	Flavodoxin
EQ029_RS01620	PF00175	Oxidoreductase NAD-binding domain 
EQ029_RS01625	PF01077	Nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S domain
EQ029_RS01625	PF03460	Nitrite/Sulfite reductase ferredoxin-like half domain
EQ029_RS01630	PF00590	Tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) Methylases
EQ029_RS01635	PF14824	Sirohaem biosynthesis protein central
EQ029_RS01640	PF01925	Sulfite exporter TauE/SafE
EQ029_RS01645	PF14306	PUA-like domain
EQ029_RS01645	PF01747	ATP-sulfurylase
EQ029_RS01655	PF03600	Citrate transporter
EQ029_RS01660	PF05257	CHAP domain
EQ029_RS01670	PF03605	Anaerobic c4-dicarboxylate membrane transporter
EQ029_RS01675	PF02028	BCCT, betaine/carnitine/choline family transporter
EQ029_RS01685	PF00171	Aldehyde dehydrogenase family
EQ029_RS01690	PF00732	GMC oxidoreductase
EQ029_RS01690	PF05199	GMC oxidoreductase
EQ029_RS01695	PF12833	Helix-turn-helix domain
EQ029_RS01700	PF01546	Peptidase family M20/M25/M40
EQ029_RS01700	PF07687	Peptidase dimerisation domain
EQ029_RS01705	PF07690	Major Facilitator Superfamily
EQ029_RS01710	PF01546	Peptidase family M20/M25/M40
EQ029_RS01710	PF07687	Peptidase dimerisation domain
EQ029_RS01725	PF13193	AMP-binding enzyme C-terminal domain
EQ029_RS01725	PF00501	AMP-binding enzyme
EQ029_RS01735	PF00126	Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
EQ029_RS01735	PF03466	LysR substrate binding domain
EQ029_RS01740	PF02896	PEP-utilising enzyme, TIM barrel domain
EQ029_RS01740	PF01326	Pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate binding domain
EQ029_RS01740	PF00391	PEP-utilising enzyme, mobile domain
EQ029_RS01745	PF03618	Kinase/pyrophosphorylase
EQ029_RS01750	PF06039	Malate:quinone oxidoreductase (Mqo)
EQ029_RS01755	PF00155	Aminotransferase class I and II
EQ029_RS01755	PF00392	Bacterial regulatory proteins, gntR family
EQ029_RS01770	PF03551	Transcriptional regulator PadR-like family
EQ029_RS01775	PF00274	Fructose-bisphosphate aldolase class-I
EQ029_RS01805	PF03180	NLPA lipoprotein
EQ029_RS01810	PF00202	Aminotransferase class-III
EQ029_RS01815	PF13520	Amino acid permease
EQ029_RS01820	PF00205	Thiamine pyrophosphate enzyme, central domain
EQ029_RS01820	PF02775	Thiamine pyrophosphate enzyme, C-terminal TPP binding domain
EQ029_RS01820	PF02776	Thiamine pyrophosphate enzyme, N-terminal TPP binding domain
EQ029_RS01825	PF03306	Alpha-acetolactate decarboxylase
EQ029_RS01855	PF02677	Epoxyqueuosine reductase QueH
EQ029_RS01865	PF01180	Dihydroorotate dehydrogenase
EQ029_RS01870	PF03881	Fructosamine kinase
EQ029_RS01890	PF00561	alpha/beta hydrolase fold
EQ029_RS01920	PF05979	Bacterial protein of unknown function (DUF896)
EQ029_RS01925	PF00296	Luciferase-like monooxygenase
EQ029_RS01935	PF01551	Peptidase family M23
EQ029_RS01945	PF03976	Polyphosphate kinase 2 (PPK2)
EQ029_RS01960	PF01593	Flavin containing amine oxidoreductase
EQ029_RS01965	PF00535	Glycosyl transferase family 2
EQ029_RS01975	PF01593	Flavin containing amine oxidoreductase
EQ029_RS01980	PF00155	Aminotransferase class I and II
EQ029_RS01985	PF00389	D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, catalytic domain
EQ029_RS01985	PF02826	D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD binding domain
EQ029_RS01990	PF00403	Heavy-metal-associated domain
EQ029_RS01995	PF00403	Heavy-metal-associated domain
EQ029_RS02010	PF12464	Maltose acetyltransferase 
EQ029_RS02010	PF14602	Hexapeptide repeat of succinyl-transferase
EQ029_RS02015	PF00171	Aldehyde dehydrogenase family
EQ029_RS02035	PF01544	CorA-like Mg2+ transporter protein
EQ029_RS02045	PF01035	6-O-methylguanine DNA methyltransferase, DNA binding domain
EQ029_RS02045	PF02870	6-O-methylguanine DNA methyltransferase, ribonuclease-like domain
EQ029_RS02050	PF01154	Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase N terminal
EQ029_RS02050	PF08540	Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase C terminal
EQ029_RS02055	PF02803	Thiolase, C-terminal domain
EQ029_RS02055	PF00108	Thiolase, N-terminal domain
EQ029_RS02060	PF00368	Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductase
EQ029_RS02065	PF01476	LysM domain
EQ029_RS02065	PF05257	CHAP domain
EQ029_RS02075	PF00126	Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
EQ029_RS02075	PF03466	LysR substrate binding domain
EQ029_RS02085	PF03788	LrgA family
EQ029_RS02090	PF04172	LrgB-like family 
EQ029_RS02095	PF00205	Thiamine pyrophosphate enzyme, central domain
EQ029_RS02095	PF02776	Thiamine pyrophosphate enzyme, N-terminal TPP binding domain
EQ029_RS02095	PF02775	Thiamine pyrophosphate enzyme, C-terminal TPP binding domain
EQ029_RS02100	PF13683	Integrase core domain
EQ029_RS02100	PF01610	Transposase
EQ029_RS02105	PF00358	phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 1
EQ029_RS02105	PF02378	Phosphotransferase system, EIIC 
EQ029_RS02105	PF00367	phosphotransferase system, EIIB
EQ029_RS02110	PF00107	Zinc-binding dehydrogenase
EQ029_RS02110	PF08240	Alcohol dehydrogenase GroES-like domain
EQ029_RS02120	PF00085	Thioredoxin
EQ029_RS02125	PF02866	lactate/malate dehydrogenase, alpha/beta C-terminal domain
EQ029_RS02125	PF00056	lactate/malate dehydrogenase, NAD binding domain
EQ029_RS02130	PF07859	alpha/beta hydrolase fold
EQ029_RS02135	PF00892	EamA-like transporter family
EQ029_RS02155	PF08245	Mur ligase middle domain
EQ029_RS02160	PF14102	Capsule biosynthesis CapC
EQ029_RS02175	PF00370	FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
EQ029_RS02175	PF02782	FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
EQ029_RS02185	PF03315	Serine dehydratase beta chain
EQ029_RS02185	PF01842	ACT domain
EQ029_RS02190	PF03313	Serine dehydratase alpha chain
EQ029_RS02205	PF04203	Sortase domain
EQ029_RS02215	PF00389	D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, catalytic domain
EQ029_RS02215	PF02826	D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD binding domain
EQ029_RS02220	PF00881	Nitroreductase family
EQ029_RS02225	PF00171	Aldehyde dehydrogenase family
EQ029_RS02235	PF00903	Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily
EQ029_RS02250	PF00171	Aldehyde dehydrogenase family
EQ029_RS02255	PF01047	MarR family
EQ029_RS02260	PF00903	Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily
EQ029_RS02265	PF00903	Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily
EQ029_RS02270	PF01738	Dienelactone hydrolase family
EQ029_RS02285	PF06874	Firmicute fructose-1,6-bisphosphatase
EQ029_RS02290	PF09335	SNARE associated Golgi protein
EQ029_RS02295	PF00899	ThiF family
EQ029_RS02300	PF05690	Thiazole biosynthesis protein ThiG
EQ029_RS02305	PF05690	Thiazole biosynthesis protein ThiG
EQ029_RS02305	PF02597	ThiS family
EQ029_RS02310	PF01266	FAD dependent oxidoreductase
EQ029_RS02320	PF07690	Major Facilitator Superfamily
EQ029_RS02335	PF09954	Uncharacterized protein conserved in bacteria (DUF2188)
EQ029_RS02340	PF04607	Region found in RelA / SpoT proteins
EQ029_RS02350	PF13411	MerR HTH family regulatory protein
EQ029_RS02355	PF07729	FCD domain
EQ029_RS02355	PF00392	Bacterial regulatory proteins, gntR family
EQ029_RS02360	PF00370	FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
EQ029_RS02360	PF02782	FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
EQ029_RS02365	PF02447	GntP family permease
EQ029_RS02380	PF00483	Nucleotidyl transferase
EQ029_RS02385	PF00293	NUDIX domain
EQ029_RS02410	PF00106	short chain dehydrogenase
EQ029_RS02415	PF01546	Peptidase family M20/M25/M40
EQ029_RS02415	PF07687	Peptidase dimerisation domain
EQ029_RS02420	PF13089	Polyphosphate kinase N-terminal domain
EQ029_RS02420	PF02503	Polyphosphate kinase middle domain
EQ029_RS02420	PF17941	Polyphosphate kinase C-terminal domain 1
EQ029_RS02420	PF13090	Polyphosphate kinase C-terminal domain 2
EQ029_RS02430	PF03806	AbgT putative transporter family
EQ029_RS02440	PF05343	M42 glutamyl aminopeptidase
EQ029_RS02450	PF01053	Cys/Met metabolism PLP-dependent enzyme
EQ029_RS02455	PF01645	Conserved region in glutamate synthase
EQ029_RS02470	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS02475	PF03649	Uncharacterised protein family (UPF0014)
EQ029_RS02480	PF02518	Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase
EQ029_RS02480	PF00512	His Kinase A (phospho-acceptor) domain
EQ029_RS02485	PF00072	Response regulator receiver domain
EQ029_RS02485	PF00486	Transcriptional regulatory protein, C terminal
EQ029_RS02495	PF07690	Major Facilitator Superfamily
EQ029_RS02500	PF00135	Carboxylesterase family
EQ029_RS02505	PF13520	Amino acid permease
EQ029_RS02510	PF08818	Domain of unknown function (DU1801)
EQ029_RS02515	PF00107	Zinc-binding dehydrogenase
EQ029_RS02515	PF08240	Alcohol dehydrogenase GroES-like domain
EQ029_RS02520	PF00571	CBS domain
EQ029_RS02520	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS02525	PF00528	Binding-protein-dependent transport system inner membrane component
EQ029_RS02530	PF04069	Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
EQ029_RS02535	PF00528	Binding-protein-dependent transport system inner membrane component
EQ029_RS02540	PF04172	LrgB-like family 
EQ029_RS02545	PF03788	LrgA family
EQ029_RS02550	PF04397	LytTr DNA-binding domain
EQ029_RS02550	PF00072	Response regulator receiver domain
EQ029_RS02555	PF07694	5TMR of 5TMR-LYT
EQ029_RS02555	PF02518	Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase
EQ029_RS02555	PF06580	Histidine kinase
EQ029_RS02560	PF07690	Major Facilitator Superfamily
EQ029_RS02565	PF08546	Ketopantoate reductase PanE/ApbA C terminal
EQ029_RS02565	PF02558	Ketopantoate reductase PanE/ApbA
EQ029_RS02570	PF07274	Protein of unknown function (DUF1440)
EQ029_RS02580	PF02096	60Kd inner membrane protein
EQ029_RS02585	PF00144	Beta-lactamase
EQ029_RS02590	PF13520	Amino acid permease
EQ029_RS02595	PF00999	Sodium/hydrogen exchanger family
EQ029_RS02600	PF00324	Amino acid permease
EQ029_RS02620	PF13649	Methyltransferase domain
EQ029_RS02625	PF04405	Domain of Unknown function (DUF542)  
EQ029_RS02625	PF01814	Hemerythrin HHE cation binding domain
EQ029_RS02630	PF07690	Major Facilitator Superfamily
EQ029_RS02640	PF02595	Glycerate kinase family
EQ029_RS02655	PF16916	Dimerisation domain of Zinc Transporter
EQ029_RS02655	PF01545	Cation efflux family
EQ029_RS02665	PF00300	Histidine phosphatase superfamily (branch 1)
EQ029_RS02675	PF07690	Major Facilitator Superfamily
EQ029_RS02680	PF00497	Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
EQ029_RS02685	PF00528	Binding-protein-dependent transport system inner membrane component
EQ029_RS02690	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS02695	PF02388	FemAB family
EQ029_RS02710	PF09223	ZinT (YodA) periplasmic lipocalin-like zinc-recruitment
EQ029_RS02710	PF01297	Zinc-uptake complex component A periplasmic
EQ029_RS02715	PF04264	YceI-like domain
EQ029_RS02740	PF03460	Nitrite/Sulfite reductase ferredoxin-like half domain
EQ029_RS02740	PF07992	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
EQ029_RS02740	PF18267	Rubredoxin NAD+ reductase C-terminal domain
EQ029_RS02740	PF04324	BFD-like [2Fe-2S] binding domain
EQ029_RS02740	PF01077	Nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S domain
EQ029_RS02745	PF00355	Rieske [2Fe-2S] domain
EQ029_RS02750	PF00590	Tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) Methylases
EQ029_RS02755	PF00384	Molybdopterin oxidoreductase
EQ029_RS02755	PF01568	Molydopterin dinucleotide binding domain
EQ029_RS02755	PF14710	Respiratory nitrate reductase alpha N-terminal
EQ029_RS02760	PF14711	Respiratory nitrate reductase beta C-terminal
EQ029_RS02760	PF13247	4Fe-4S dicluster domain
EQ029_RS02765	PF02613	Nitrate reductase delta subunit
EQ029_RS02770	PF02665	Nitrate reductase gamma subunit
EQ029_RS02780	PF07730	Histidine kinase
EQ029_RS02780	PF02518	Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase
EQ029_RS02785	PF00196	Bacterial regulatory proteins, luxR family
EQ029_RS02785	PF00072	Response regulator receiver domain
EQ029_RS02790	PF07690	Major Facilitator Superfamily
EQ029_RS02795	PF00011	Hsp20/alpha crystallin family
EQ029_RS02800	PF01047	MarR family
EQ029_RS02810	PF00375	Sodium:dicarboxylate symporter family
EQ029_RS02815	PF01610	Transposase
EQ029_RS02815	PF13683	Integrase core domain
EQ029_RS02825	PF16242	Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase like
EQ029_RS02830	PF12833	Helix-turn-helix domain
EQ029_RS02840	PF00367	phosphotransferase system, EIIB
EQ029_RS02840	PF02378	Phosphotransferase system, EIIC 
EQ029_RS02885	PF07992	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
EQ029_RS02890	PF00583	Acetyltransferase (GNAT) family
EQ029_RS02895	PF08240	Alcohol dehydrogenase GroES-like domain
EQ029_RS02895	PF00107	Zinc-binding dehydrogenase
EQ029_RS02900	PF09375	Imelysin
EQ029_RS02905	PF10518	TAT (twin-arginine translocation) pathway signal sequence
EQ029_RS02905	PF04261	Dyp-type peroxidase family 
EQ029_RS02910	PF03239	Iron permease FTR1 family
EQ029_RS02915	PF00902	Sec-independent protein translocase protein (TatC)
EQ029_RS02920	PF02416	mttA/Hcf106 family
EQ029_RS02925	PF13673	Acetyltransferase (GNAT) domain
EQ029_RS02930	PF00535	Glycosyl transferase family 2
EQ029_RS02930	PF04464	CDP-Glycerol:Poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase 
EQ029_RS02935	PF02652	L-lactate permease
EQ029_RS02940	PF00534	Glycosyl transferases group 1
EQ029_RS02940	PF17101	Stealth protein CR1, conserved region 1
EQ029_RS02940	PF11380	Stealth protein CR2, conserved region 2
EQ029_RS02940	PF17103	Stealth protein CR4, conserved region 4
EQ029_RS02940	PF17102	Stealth protein CR3, conserved region 3
EQ029_RS02945	PF06039	Malate:quinone oxidoreductase (Mqo)
EQ029_RS02955	PF04397	LytTr DNA-binding domain
EQ029_RS02960	PF02518	Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase
EQ029_RS02960	PF00672	HAMP domain
EQ029_RS02960	PF00512	His Kinase A (phospho-acceptor) domain
EQ029_RS02965	PF00072	Response regulator receiver domain
EQ029_RS02965	PF00486	Transcriptional regulatory protein, C terminal
EQ029_RS02970	PF02687	FtsX-like permease family
EQ029_RS02975	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS02985	PF12802	MarR family
EQ029_RS02995	PF07690	Major Facilitator Superfamily
EQ029_RS03010	PF07690	Major Facilitator Superfamily
EQ029_RS03035	PF01544	CorA-like Mg2+ transporter protein
EQ029_RS03040	PF01070	FMN-dependent dehydrogenase
EQ029_RS03045	PF03616	Sodium/glutamate symporter
EQ029_RS03050	PF02245	Methylpurine-DNA glycosylase (MPG)
EQ029_RS03055	PF01381	Helix-turn-helix
EQ029_RS03065	PF02694	Uncharacterised BCR, YnfA/UPF0060 family
EQ029_RS03070	PF01263	Aldose 1-epimerase
EQ029_RS03080	PF06026	Ribose 5-phosphate isomerase A (phosphoriboisomerase A)
EQ029_RS03085	PF02517	CPBP intramembrane metalloprotease
EQ029_RS03090	PF00491	Arginase family
EQ029_RS03095	PF00916	Sulfate permease family
EQ029_RS03095	PF01740	STAS domain
EQ029_RS03100	PF01546	Peptidase family M20/M25/M40
EQ029_RS03100	PF07687	Peptidase dimerisation domain
EQ029_RS03110	PF01613	Flavin reductase like domain
EQ029_RS03125	PF01380	SIS domain
EQ029_RS03125	PF01418	Helix-turn-helix domain, rpiR family
EQ029_RS03130	PF02378	Phosphotransferase system, EIIC 
EQ029_RS03130	PF00367	phosphotransferase system, EIIB
EQ029_RS03140	PF13419	Haloacid dehalogenase-like hydrolase
EQ029_RS03160	PF00324	Amino acid permease
EQ029_RS03165	PF01380	SIS domain
EQ029_RS03165	PF01418	Helix-turn-helix domain, rpiR family
EQ029_RS03170	PF00367	phosphotransferase system, EIIB
EQ029_RS03170	PF02378	Phosphotransferase system, EIIC 
EQ029_RS03175	PF01380	SIS domain
EQ029_RS03190	PF13280	WYL domain
EQ029_RS03190	PF08279	HTH domain
EQ029_RS03200	PF03816	Cell envelope-related transcriptional attenuator domain
EQ029_RS03205	PF04879	Molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 domain
EQ029_RS03205	PF12838	4Fe-4S dicluster domain
EQ029_RS03205	PF10588	NADH-ubiquinone oxidoreductase-G iron-sulfur binding region
EQ029_RS03205	PF01568	Molydopterin dinucleotide binding domain
EQ029_RS03205	PF00384	Molybdopterin oxidoreductase
EQ029_RS03210	PF06689	ClpX C4-type zinc finger
EQ029_RS03210	PF07724	AAA domain (Cdc48 subfamily)
EQ029_RS03210	PF10431	C-terminal, D2-small domain, of ClpB protein 
EQ029_RS03225	PF01494	FAD binding domain
EQ029_RS03230	PF00389	D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, catalytic domain
EQ029_RS03230	PF02826	D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD binding domain
EQ029_RS03235	PF00893	Small Multidrug Resistance protein
EQ029_RS03240	PF00893	Small Multidrug Resistance protein
EQ029_RS03245	PF05257	CHAP domain
EQ029_RS03255	PF02317	NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase, alpha-helical domain
EQ029_RS03255	PF02558	Ketopantoate reductase PanE/ApbA
EQ029_RS03260	PF03553	Na+/H+ antiporter family
EQ029_RS03265	PF01610	Transposase
EQ029_RS03265	PF13683	Integrase core domain
EQ029_RS03270	PF05257	CHAP domain
EQ029_RS03295	PF08028	Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain
EQ029_RS03295	PF02770	Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain
EQ029_RS03295	PF02771	Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal domain
EQ029_RS03300	PF01497	Periplasmic binding protein
EQ029_RS03305	PF01156	Inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase
EQ029_RS03310	PF02632	BioY family
EQ029_RS03320	PF02634	FdhD/NarQ family
EQ029_RS03330	PF00528	Binding-protein-dependent transport system inner membrane component
EQ029_RS03335	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS03335	PF03459	TOBE domain
EQ029_RS03340	PF00899	ThiF family
EQ029_RS03345	PF00994	Probable molybdopterin binding domain
EQ029_RS03350	PF01967	MoaC family
EQ029_RS03355	PF03454	MoeA C-terminal region (domain IV)
EQ029_RS03355	PF00994	Probable molybdopterin binding domain
EQ029_RS03355	PF03453	MoeA N-terminal region (domain I and II)
EQ029_RS03365	PF02391	MoaE protein
EQ029_RS03370	PF02597	ThiS family
EQ029_RS03375	PF12804	MobA-like NTP transferase domain
EQ029_RS03380	PF06463	Molybdenum Cofactor Synthesis C
EQ029_RS03380	PF04055	Radical SAM superfamily
EQ029_RS03385	PF01047	MarR family
EQ029_RS03395	PF01047	MarR family
EQ029_RS03410	PF02388	FemAB family
EQ029_RS03415	PF00873	AcrB/AcrD/AcrF family
EQ029_RS03435	PF06800	Sugar transport protein
EQ029_RS03445	PF01131	DNA topoisomerase
EQ029_RS03445	PF01751	Toprim domain
EQ029_RS03450	PF00860	Permease family
EQ029_RS03465	PF00338	Ribosomal protein S10p/S20e
EQ029_RS03470	PF00297	Ribosomal protein L3
EQ029_RS03475	PF00573	Ribosomal protein L4/L1 family
EQ029_RS03480	PF00276	Ribosomal protein L23
EQ029_RS03485	PF00181	Ribosomal Proteins L2, RNA binding domain
EQ029_RS03485	PF03947	Ribosomal Proteins L2, C-terminal domain
EQ029_RS03490	PF00203	Ribosomal protein S19
EQ029_RS03495	PF00237	Ribosomal protein L22p/L17e
EQ029_RS03500	PF00189	Ribosomal protein S3, C-terminal domain
EQ029_RS03500	PF07650	KH domain
EQ029_RS03505	PF00252	Ribosomal protein L16p/L10e
EQ029_RS03510	PF00831	Ribosomal L29 protein
EQ029_RS03515	PF00366	Ribosomal protein S17
EQ029_RS03520	PF00238	Ribosomal protein L14p/L23e
EQ029_RS03525	PF00467	KOW motif
EQ029_RS03525	PF17136	Ribosomal proteins 50S L24/mitochondrial 39S L24
EQ029_RS03530	PF00281	Ribosomal protein L5
EQ029_RS03530	PF00673	ribosomal L5P family C-terminus
EQ029_RS03535	PF00253	Ribosomal protein S14p/S29e
EQ029_RS03540	PF00410	Ribosomal protein S8
EQ029_RS03545	PF00347	Ribosomal protein L6
EQ029_RS03550	PF00861	Ribosomal L18 of archaea, bacteria, mitoch. and chloroplast
EQ029_RS03555	PF00333	Ribosomal protein S5, N-terminal domain
EQ029_RS03555	PF03719	Ribosomal protein S5, C-terminal domain
EQ029_RS03560	PF00327	Ribosomal protein L30p/L7e
EQ029_RS03565	PF00828	Ribosomal proteins 50S-L15, 50S-L18e, 60S-L27A
EQ029_RS03570	PF00344	SecY translocase
EQ029_RS03575	PF05191	Adenylate kinase, active site lid
EQ029_RS03580	PF01176	Translation initiation factor 1A / IF-1
EQ029_RS03585	PF00444	Ribosomal protein L36
EQ029_RS03590	PF00416	Ribosomal protein S13/S18
EQ029_RS03595	PF00411	Ribosomal protein S11
EQ029_RS03600	PF03118	Bacterial RNA polymerase, alpha chain C terminal domain
EQ029_RS03600	PF01000	RNA polymerase Rpb3/RpoA insert domain
EQ029_RS03600	PF01193	RNA polymerase Rpb3/Rpb11 dimerisation domain
EQ029_RS03605	PF01196	Ribosomal protein L17
EQ029_RS03610	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS03615	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS03620	PF02361	Cobalt transport protein
EQ029_RS03625	PF01416	tRNA pseudouridine synthase
EQ029_RS03630	PF00572	Ribosomal protein L13
EQ029_RS03635	PF00380	Ribosomal protein S9/S16
EQ029_RS03640	PF02146	Sir2 family
EQ029_RS03645	PF00455	DeoR C terminal sensor domain
EQ029_RS03645	PF08220	DeoR-like helix-turn-helix domain
EQ029_RS03650	PF02502	Ribose/Galactose Isomerase
EQ029_RS03655	PF02502	Ribose/Galactose Isomerase
EQ029_RS03660	PF00294	pfkB family carbohydrate kinase
EQ029_RS03665	PF01791	DeoC/LacD family aldolase
EQ029_RS03670	PF02255	PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIA subunit
EQ029_RS03675	PF02378	Phosphotransferase system, EIIC 
EQ029_RS03675	PF02302	PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIB subunit
EQ029_RS03680	PF00232	Glycosyl hydrolase family 1
EQ029_RS03690	PF00296	Luciferase-like monooxygenase
EQ029_RS03695	PF00107	Zinc-binding dehydrogenase
EQ029_RS03695	PF08240	Alcohol dehydrogenase GroES-like domain
EQ029_RS03700	PF02028	BCCT, betaine/carnitine/choline family transporter
EQ029_RS03715	PF03780	Asp23 family, cell envelope-related function
EQ029_RS03720	PF04183	IucA / IucC family
EQ029_RS03720	PF06276	Ferric iron reductase FhuF-like transporter
EQ029_RS03725	PF05977	Transmembrane secretion effector
EQ029_RS03730	PF06276	Ferric iron reductase FhuF-like transporter
EQ029_RS03730	PF04183	IucA / IucC family
EQ029_RS03735	PF01168	Alanine racemase, N-terminal domain
EQ029_RS03740	PF01497	Periplasmic binding protein
EQ029_RS03745	PF01032	FecCD transport family
EQ029_RS03750	PF01032	FecCD transport family
EQ029_RS03755	PF07670	Nucleoside recognition
EQ029_RS03760	PF03992	Antibiotic biosynthesis monooxygenase
EQ029_RS03770	PF04307	LexA-binding, inner membrane-associated putative hydrolase
EQ029_RS03775	PF01704	UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase
EQ029_RS03780	PF03006	Haemolysin-III related
EQ029_RS03785	PF07690	Major Facilitator Superfamily
EQ029_RS03790	PF17080	Multidrug Resistance efflux pump
EQ029_RS03795	PF07690	Major Facilitator Superfamily
EQ029_RS03800	PF10609	NUBPL iron-transfer P-loop NTPase
EQ029_RS03805	PF13683	Integrase core domain
EQ029_RS03805	PF01610	Transposase
EQ029_RS03855	PF02457	DisA bacterial checkpoint controller nucleotide-binding
EQ029_RS03865	PF02878	Phosphoglucomutase/phosphomannomutase, alpha/beta/alpha domain I
EQ029_RS03865	PF00408	Phosphoglucomutase/phosphomannomutase, C-terminal domain
EQ029_RS03865	PF02880	Phosphoglucomutase/phosphomannomutase, alpha/beta/alpha domain III
EQ029_RS03865	PF02879	Phosphoglucomutase/phosphomannomutase, alpha/beta/alpha domain II
EQ029_RS03870	PF01380	SIS domain
EQ029_RS03875	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS03895	PF16916	Dimerisation domain of Zinc Transporter
EQ029_RS03895	PF01545	Cation efflux family
EQ029_RS03900	PF01022	Bacterial regulatory protein, arsR family
EQ029_RS03905	PF13460	NAD(P)H-binding 
EQ029_RS03910	PF01238	Phosphomannose isomerase type I
EQ029_RS03930	PF00210	Ferritin-like domain
EQ029_RS03935	PF01048	Phosphorylase superfamily
EQ029_RS03940	PF01791	DeoC/LacD family aldolase
EQ029_RS03945	PF02885	Glycosyl transferase family, helical bundle domain
EQ029_RS03945	PF00591	Glycosyl transferase family, a/b domain
EQ029_RS03945	PF07831	Pyrimidine nucleoside phosphorylase C-terminal domain
EQ029_RS03950	PF01676	Metalloenzyme superfamily
EQ029_RS03960	PF02664	S-Ribosylhomocysteinase (LuxS)
EQ029_RS03980	PF03630	Fumble 
EQ029_RS03990	PF05066	HB1, ASXL, restriction endonuclease HTH domain
EQ029_RS03995	PF06418	CTP synthase N-terminus
EQ029_RS03995	PF00117	Glutamine amidotransferase class-I
EQ029_RS04005	PF01116	Fructose-bisphosphate aldolase class-II
EQ029_RS04010	PF00275	EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)
EQ029_RS04020	PF00171	Aldehyde dehydrogenase family
EQ029_RS04025	PF00006	ATP synthase alpha/beta family, nucleotide-binding domain
EQ029_RS04025	PF07498	Rho termination factor, N-terminal domain
EQ029_RS04025	PF07497	Rho termination factor, RNA-binding domain
EQ029_RS04030	PF01197	Ribosomal protein L31
EQ029_RS04035	PF00265	Thymidine kinase
EQ029_RS04040	PF00472	RF-1 domain
EQ029_RS04040	PF03462	PCRF domain
EQ029_RS04045	PF17827	PrmC N-terminal domain
EQ029_RS04045	PF05175	Methyltransferase small domain
EQ029_RS04050	PF01300	Telomere recombination
EQ029_RS04050	PF03481	Putative GTP-binding controlling metal-binding
EQ029_RS04055	PF01451	Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase
EQ029_RS04060	PF04260	Protein of unknown function (DUF436) 
EQ029_RS04065	PF00464	Serine hydroxymethyltransferase
EQ029_RS04075	PF02350	UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase
EQ029_RS04085	PF00119	ATP synthase A chain
EQ029_RS04090	PF00137	ATP synthase subunit C
EQ029_RS04095	PF00430	ATP synthase B/B' CF(0)
EQ029_RS04100	PF00213	ATP synthase delta (OSCP) subunit
EQ029_RS04105	PF00006	ATP synthase alpha/beta family, nucleotide-binding domain
EQ029_RS04105	PF02874	ATP synthase alpha/beta family, beta-barrel domain
EQ029_RS04105	PF00306	ATP synthase alpha/beta chain, C terminal domain
EQ029_RS04110	PF00231	ATP synthase
EQ029_RS04115	PF00006	ATP synthase alpha/beta family, nucleotide-binding domain
EQ029_RS04115	PF02874	ATP synthase alpha/beta family, beta-barrel domain
EQ029_RS04120	PF02823	ATP synthase, Delta/Epsilon chain, beta-sandwich domain
EQ029_RS04120	PF00401	ATP synthase, Delta/Epsilon chain, long alpha-helix domain
EQ029_RS04130	PF00275	EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)
EQ029_RS04135	PF07977	FabA-like domain
EQ029_RS04145	PF00436	Single-strand binding protein family
EQ029_RS04150	PF06737	Transglycosylase-like domain
EQ029_RS04155	PF03070	TENA/THI-4/PQQC family
EQ029_RS04160	PF08543	Phosphomethylpyrimidine kinase
EQ029_RS04165	PF02110	Hydroxyethylthiazole kinase family
EQ029_RS04170	PF02581	Thiamine monophosphate synthase
EQ029_RS04175	PF02096	60Kd inner membrane protein
EQ029_RS04180	PF13683	Integrase core domain
EQ029_RS04180	PF01610	Transposase
EQ029_RS04185	PF01966	HD domain
EQ029_RS04190	PF13396	Phospholipase_D-nuclease N-terminal
EQ029_RS04190	PF13091	PLD-like domain
EQ029_RS04195	PF02583	Metal-sensitive transcriptional repressor
EQ029_RS04215	PF01098	Cell cycle protein
EQ029_RS04220	PF01820	D-ala D-ala ligase N-terminus
EQ029_RS04220	PF07478	D-ala D-ala ligase C-terminus
EQ029_RS04225	PF01225	Mur ligase family, catalytic domain
EQ029_RS04225	PF02875	Mur ligase family, glutamate ligase domain
EQ029_RS04225	PF08245	Mur ligase middle domain
EQ029_RS04230	PF00270	DEAD/DEAH box helicase
EQ029_RS04230	PF00271	Helicase conserved C-terminal domain
EQ029_RS04240	PF03703	Bacterial PH domain
EQ029_RS04245	PF03703	Bacterial PH domain
EQ029_RS04250	PF01648	4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily
EQ029_RS04255	PF00842	Alanine racemase, C-terminal domain
EQ029_RS04255	PF01168	Alanine racemase, N-terminal domain
EQ029_RS04265	PF02452	PemK-like, MazF-like toxin of type II toxin-antitoxin system
EQ029_RS04270	PF08673	Phosphoserine phosphatase RsbU, N-terminal domain
EQ029_RS04270	PF07228	Stage II sporulation protein E (SpoIIE)
EQ029_RS04275	PF01740	STAS domain
EQ029_RS04280	PF13581	Histidine kinase-like ATPase domain
EQ029_RS04285	PF04545	Sigma-70, region 4
EQ029_RS04285	PF04539	Sigma-70 region 3
EQ029_RS04285	PF04542	Sigma-70 region 2 
EQ029_RS04290	PF09371	Tex-like protein N-terminal domain
EQ029_RS04290	PF00575	S1 RNA binding domain
EQ029_RS04290	PF17674	HHH domain
EQ029_RS04290	PF16921	Tex protein YqgF-like domain
EQ029_RS04295	PF10263	SprT-like family
EQ029_RS04295	PF17283	SprT-like zinc ribbon domain
EQ029_RS04330	PF00585	C-terminal regulatory domain of Threonine dehydratase
EQ029_RS04330	PF00291	Pyridoxal-phosphate dependent enzyme
EQ029_RS04335	PF00694	Aconitase C-terminal domain
EQ029_RS04340	PF00330	Aconitase family (aconitate hydratase)
EQ029_RS04345	PF00180	Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase
EQ029_RS04350	PF08502	LeuA allosteric (dimerisation) domain
EQ029_RS04350	PF00682	HMGL-like
EQ029_RS04355	PF07991	Acetohydroxy acid isomeroreductase, NADPH-binding domain
EQ029_RS04355	PF01450	Acetohydroxy acid isomeroreductase, catalytic domain
EQ029_RS04360	PF10369	Small subunit of acetolactate synthase
EQ029_RS04365	PF00205	Thiamine pyrophosphate enzyme, central domain
EQ029_RS04365	PF02776	Thiamine pyrophosphate enzyme, N-terminal TPP binding domain
EQ029_RS04365	PF02775	Thiamine pyrophosphate enzyme, C-terminal TPP binding domain
EQ029_RS04370	PF00920	Dehydratase family
EQ029_RS04375	PF02367	Threonylcarbamoyl adenosine biosynthesis protein TsaE
EQ029_RS04380	PF00814	Glycoprotease family
EQ029_RS04385	PF00583	Acetyltransferase (GNAT) family
EQ029_RS04390	PF00814	Glycoprotease family
EQ029_RS04400	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS04400	PF16326	ABC transporter C-terminal domain
EQ029_RS04400	PF12848	ABC transporter
EQ029_RS04405	PF02629	CoA binding domain
EQ029_RS04405	PF06971	Putative DNA-binding protein N-terminus
EQ029_RS04410	PF04143	Sulphur transport
EQ029_RS04415	PF01206	Sulfurtransferase TusA
EQ029_RS04420	PF00909	Ammonium Transporter Family
EQ029_RS04425	PF13407	Periplasmic binding protein domain
EQ029_RS04425	PF00356	Bacterial regulatory proteins, lacI family
EQ029_RS04430	PF00251	Glycosyl hydrolases family 32 N-terminal domain
EQ029_RS04430	PF08244	Glycosyl hydrolases family 32 C terminal
EQ029_RS04435	PF00294	pfkB family carbohydrate kinase
EQ029_RS04440	PF00072	Response regulator receiver domain
EQ029_RS04440	PF04397	LytTr DNA-binding domain
EQ029_RS04455	PF04647	Accessory gene regulator B
EQ029_RS04460	PF00795	Carbon-nitrogen hydrolase
EQ029_RS04475	PF02517	CPBP intramembrane metalloprotease
EQ029_RS04480	PF00166	Chaperonin 10 Kd subunit
EQ029_RS04485	PF00118	TCP-1/cpn60 chaperonin family
EQ029_RS04490	PF00589	Phage integrase family
EQ029_RS04490	PF14659	Phage integrase, N-terminal SAM-like domain
EQ029_RS04550	PF00392	Bacterial regulatory proteins, gntR family
EQ029_RS04555	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS04565	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS04605	PF10282	Lactonase, 7-bladed beta-propeller
EQ029_RS04610	PF00171	Aldehyde dehydrogenase family
EQ029_RS04615	PF01368	DHH family
EQ029_RS04615	PF02833	DHHA2 domain
EQ029_RS04620	PF00857	Isochorismatase family
EQ029_RS04630	PF00800	Prephenate dehydratase
EQ029_RS04630	PF01817	Chorismate mutase type II
EQ029_RS04635	PF02898	Nitric oxide synthase, oxygenase domain
EQ029_RS04640	PF04095	Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
EQ029_RS04640	PF17956	Nicotinate phosphoribosyltransferase C-terminal domain
EQ029_RS04640	PF17767	Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) N-terminal domain
EQ029_RS04645	PF02540	NAD synthase
EQ029_RS04650	PF10035	Uncharacterized protein conserved in bacteria (DUF2179)
EQ029_RS04655	PF14044	NETI protein
EQ029_RS04660	PF10397	Adenylosuccinate lyase C-terminus
EQ029_RS04660	PF00206	Lyase
EQ029_RS04665	PF01371	Trp repressor protein
EQ029_RS04670	PF01884	PcrB family
EQ029_RS04675	PF00580	UvrD/REP helicase N-terminal domain
EQ029_RS04675	PF13361	UvrD-like helicase C-terminal domain
EQ029_RS04680	PF01653	NAD-dependent DNA ligase adenylation domain
EQ029_RS04680	PF03120	NAD-dependent DNA ligase OB-fold domain
EQ029_RS04680	PF03119	NAD-dependent DNA ligase C4 zinc finger domain
EQ029_RS04680	PF00533	BRCA1 C Terminus (BRCT) domain
EQ029_RS04680	PF12826	Helix-hairpin-helix motif
EQ029_RS04685	PF07537	CamS sex pheromone cAM373 precursor
EQ029_RS04690	PF00474	Sodium:solute symporter family
EQ029_RS04695	PF02686	Glu-tRNAGln amidotransferase C subunit
EQ029_RS04700	PF01425	Amidase
EQ029_RS04705	PF02934	GatB/GatE catalytic domain
EQ029_RS04705	PF02637	GatB domain
EQ029_RS04710	PF00781	Diacylglycerol kinase catalytic domain
EQ029_RS04715	PF05958	tRNA (Uracil-5-)-methyltransferase
EQ029_RS04725	PF11799	impB/mucB/samB family C-terminal domain
EQ029_RS04725	PF00817	impB/mucB/samB family
EQ029_RS04735	PF00210	Ferritin-like domain
EQ029_RS04740	PF08353	Domain of unknown function (DUF1727)
EQ029_RS04740	PF08245	Mur ligase middle domain
EQ029_RS04745	PF07685	CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase domain
EQ029_RS04750	PF06081	Aromatic acid exporter family member 1
EQ029_RS04755	PF00557	Metallopeptidase family M24
EQ029_RS04760	PF00106	short chain dehydrogenase
EQ029_RS04780	PF02518	Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase
EQ029_RS04780	PF07730	Histidine kinase
EQ029_RS04785	PF00196	Bacterial regulatory proteins, luxR family
EQ029_RS04785	PF00072	Response regulator receiver domain
EQ029_RS04790	PF03631	Virulence factor BrkB
EQ029_RS04800	PF01451	Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase
EQ029_RS04805	PF06569	Protein of unknown function (DUF1128)
EQ029_RS04810	PF02073	Thermophilic metalloprotease (M29)
EQ029_RS04815	PF03061	Thioesterase superfamily
EQ029_RS04825	PF04055	Radical SAM superfamily
EQ029_RS04825	PF08756	YfkB-like domain
EQ029_RS04835	PF01965	DJ-1/PfpI family
EQ029_RS04840	PF00912	Transglycosylase
EQ029_RS04845	PF02631	RecX family
EQ029_RS04855	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS04855	PF01476	LysM domain
EQ029_RS04865	PF04307	LexA-binding, inner membrane-associated putative hydrolase
EQ029_RS04870	PF14815	NUDIX domain
EQ029_RS04870	PF00730	HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein
EQ029_RS04875	PF04167	Protein of unknown function (DUF402)
EQ029_RS04880	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS04880	PF00664	ABC transporter transmembrane region
EQ029_RS04885	PF06081	Aromatic acid exporter family member 1
EQ029_RS04890	PF00202	Aminotransferase class-III
EQ029_RS04895	PF00578	AhpC/TSA family
EQ029_RS04900	PF02826	D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD binding domain
EQ029_RS04900	PF00389	D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, catalytic domain
EQ029_RS04905	PF01475	Ferric uptake regulator family
EQ029_RS05065	PF00528	Binding-protein-dependent transport system inner membrane component
EQ029_RS05070	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS05075	PF08331	Domain of unknown function (DUF1730)
EQ029_RS05080	PF00588	SpoU rRNA Methylase family
EQ029_RS05085	PF01182	Glucosamine-6-phosphate isomerases/6-phosphogluconolactonase
EQ029_RS05100	PF10415	Fumarase C C-terminus
EQ029_RS05100	PF00206	Lyase
EQ029_RS05105	PF01479	S4 domain
EQ029_RS05105	PF00849	RNA pseudouridylate synthase
EQ029_RS05110	PF13185	GAF domain
EQ029_RS05110	PF07730	Histidine kinase
EQ029_RS05115	PF00072	Response regulator receiver domain
EQ029_RS05115	PF00196	Bacterial regulatory proteins, luxR family
EQ029_RS05125	PF04286	Protein of unknown function (DUF445)
EQ029_RS05130	PF06133	Control of competence regulator ComK, YlbF/YmcA
EQ029_RS05140	PF13514	AAA domain
EQ029_RS05145	PF01966	HD domain
EQ029_RS05145	PF01336	OB-fold nucleic acid binding domain
EQ029_RS05150	PF00639	PPIC-type PPIASE domain
EQ029_RS05165	PF01230	HIT domain
EQ029_RS05170	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS05175	PF05975	Bacterial ABC transporter protein EcsB
EQ029_RS05185	PF01208	Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)
EQ029_RS05190	PF00762	Ferrochelatase
EQ029_RS05195	PF01593	Flavin containing amine oxidoreductase
EQ029_RS05245	PF00501	AMP-binding enzyme
EQ029_RS05245	PF13193	AMP-binding enzyme C-terminal domain
EQ029_RS05255	PF01809	Putative membrane protein insertion efficiency factor
EQ029_RS05260	PF00293	NUDIX domain
EQ029_RS05265	PF00326	Prolyl oligopeptidase family
EQ029_RS05270	PF01293	Phosphoenolpyruvate carboxykinase
EQ029_RS05275	PF00438	S-adenosylmethionine synthetase, N-terminal domain
EQ029_RS05275	PF02772	S-adenosylmethionine synthetase, central domain
EQ029_RS05275	PF02773	S-adenosylmethionine synthetase, C-terminal domain
EQ029_RS05285	PF00248	Aldo/keto reductase family
EQ029_RS05290	PF02537	CrcB-like protein, Camphor Resistance (CrcB)
EQ029_RS05295	PF02537	CrcB-like protein, Camphor Resistance (CrcB)
EQ029_RS05305	PF00923	Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
EQ029_RS05320	PF00196	Bacterial regulatory proteins, luxR family
EQ029_RS05320	PF04542	Sigma-70 region 2 
EQ029_RS05330	PF13457	GW (Gly-Tryp) dipeptide domain
EQ029_RS05330	PF01832	Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase
EQ029_RS05335	PF01610	Transposase
EQ029_RS05335	PF13683	Integrase core domain
EQ029_RS05345	PF01872	RibD C-terminal domain
EQ029_RS05345	PF00383	Cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region
EQ029_RS05350	PF00677	Lumazine binding domain
EQ029_RS05355	PF00925	GTP cyclohydrolase II
EQ029_RS05355	PF00926	3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase
EQ029_RS05360	PF00885	6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase
EQ029_RS05365	PF01619	Proline dehydrogenase
EQ029_RS05370	PF12146	Serine aminopeptidase, S33
EQ029_RS05375	PF01047	MarR family
EQ029_RS05380	PF06962	Putative rRNA methylase
EQ029_RS05385	PF16199	Radical_SAM C-terminal domain
EQ029_RS05385	PF04055	Radical SAM superfamily
EQ029_RS05390	PF07690	Major Facilitator Superfamily
EQ029_RS05395	PF09334	tRNA synthetases class I (M)
EQ029_RS05395	PF13603	Leucyl-tRNA synthetase, Domain 2
EQ029_RS05395	PF00133	tRNA synthetases class I (I, L, M and V)
EQ029_RS05395	PF08264	Anticodon-binding domain of tRNA
EQ029_RS05410	PF07564	Domain of Unknown Function (DUF1542)
EQ029_RS05410	PF01468	GA module
EQ029_RS05425	PF01943	Polysaccharide biosynthesis protein
EQ029_RS05425	PF14667	Polysaccharide biosynthesis C-terminal domain
EQ029_RS05430	PF00849	RNA pseudouridylate synthase
EQ029_RS05430	PF01479	S4 domain
EQ029_RS05440	PF01546	Peptidase family M20/M25/M40
EQ029_RS05445	PF01063	Amino-transferase class IV
EQ029_RS05450	PF01636	Phosphotransferase enzyme family
EQ029_RS05455	PF02390	Putative methyltransferase 
EQ029_RS05460	PF00753	Metallo-beta-lactamase superfamily
EQ029_RS05470	PF05343	M42 glutamyl aminopeptidase
EQ029_RS05475	PF00085	Thioredoxin
EQ029_RS05480	PF07285	Protein of unknown function (DUF1444)
EQ029_RS05485	PF01588	Putative tRNA binding domain
EQ029_RS05485	PF14794	Domain of unknown function (DUF4479)
EQ029_RS05490	PF09397	Ftsk gamma domain
EQ029_RS05490	PF17854	FtsK alpha domain
EQ029_RS05490	PF01580	FtsK/SpoIIIE family
EQ029_RS05495	PF01225	Mur ligase family, catalytic domain
EQ029_RS05495	PF08245	Mur ligase middle domain
EQ029_RS05495	PF02875	Mur ligase family, glutamate ligase domain
EQ029_RS05500	PF06103	Bacterial protein of unknown function (DUF948)
EQ029_RS05510	PF01817	Chorismate mutase type II
EQ029_RS05510	PF00793	DAHP synthetase I family
EQ029_RS05515	PF00356	Bacterial regulatory proteins, lacI family
EQ029_RS05520	PF00850	Histone deacetylase domain
EQ029_RS05525	PF00583	Acetyltransferase (GNAT) family
EQ029_RS05530	PF13193	AMP-binding enzyme C-terminal domain
EQ029_RS05530	PF00501	AMP-binding enzyme
EQ029_RS05535	PF01268	Formate--tetrahydrofolate ligase
EQ029_RS05540	PF00905	Penicillin binding protein transpeptidase domain
EQ029_RS05540	PF00912	Transglycosylase
EQ029_RS05545	PF00579	tRNA synthetases class I (W and Y)
EQ029_RS05545	PF01479	S4 domain
EQ029_RS05555	PF07690	Major Facilitator Superfamily
EQ029_RS05560	PF13180	PDZ domain
EQ029_RS05565	PF01553	Acyltransferase
EQ029_RS05570	PF00367	phosphotransferase system, EIIB
EQ029_RS05570	PF02378	Phosphotransferase system, EIIC 
EQ029_RS05580	PF02826	D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD binding domain
EQ029_RS05580	PF01842	ACT domain
EQ029_RS05580	PF00389	D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, catalytic domain
EQ029_RS05585	PF00266	Aminotransferase class-V
EQ029_RS05590	PF02566	OsmC-like protein
EQ029_RS05595	PF03009	Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family
EQ029_RS05600	PF01479	S4 domain
EQ029_RS05600	PF00163	Ribosomal protein S4/S9 N-terminal domain
EQ029_RS05610	PF13185	GAF domain
EQ029_RS05615	PF06160	Septation ring formation regulator, EzrA 
EQ029_RS05620	PF00266	Aminotransferase class-V
EQ029_RS05625	PF02568	Thiamine biosynthesis protein (ThiI)
EQ029_RS05625	PF02926	THUMP domain
EQ029_RS05630	PF01925	Sulfite exporter TauE/SafE
EQ029_RS05635	PF08534	Redoxin
EQ029_RS05640	PF02384	N-6 DNA Methylase
EQ029_RS05645	PF00871	Acetokinase family
EQ029_RS05650	PF13683	Integrase core domain
EQ029_RS05650	PF01610	Transposase
EQ029_RS05655	PF00582	Universal stress protein family
EQ029_RS05660	PF01262	Alanine dehydrogenase/PNT, C-terminal domain
EQ029_RS05660	PF05222	Alanine dehydrogenase/PNT, N-terminal domain
EQ029_RS05665	PF00557	Metallopeptidase family M24
EQ029_RS05665	PF01321	Creatinase/Prolidase N-terminal domain
EQ029_RS05680	PF07085	DRTGG domain
EQ029_RS05680	PF00392	Bacterial regulatory proteins, gntR family
EQ029_RS05680	PF03061	Thioesterase superfamily
EQ029_RS05680	PF00571	CBS domain
EQ029_RS05685	PF02272	DHHA1 domain
EQ029_RS05685	PF01368	DHH family
EQ029_RS05690	PF01336	OB-fold nucleic acid binding domain
EQ029_RS05690	PF07733	Bacterial DNA polymerase III alpha NTPase domain
EQ029_RS05690	PF17657	Bacterial DNA polymerase III alpha subunit finger domain
EQ029_RS05690	PF14579	Helix-hairpin-helix motif
EQ029_RS05690	PF02811	PHP domain
EQ029_RS05695	PF03949	Malic enzyme, NAD binding domain
EQ029_RS05695	PF00390	Malic enzyme, N-terminal domain
EQ029_RS05700	PF17848	Acetyl-coA carboxylase zinc finger domain
EQ029_RS05700	PF01039	Carboxyl transferase domain
EQ029_RS05705	PF03255	Acetyl co-enzyme A carboxylase carboxyltransferase alpha subunit
EQ029_RS05710	PF00365	Phosphofructokinase
EQ029_RS05715	PF02887	Pyruvate kinase, alpha/beta domain
EQ029_RS05715	PF00224	Pyruvate kinase, barrel domain
EQ029_RS05715	PF00391	PEP-utilising enzyme, mobile domain
EQ029_RS05720	PF01207	Dihydrouridine synthase (Dus)
EQ029_RS05725	PF13683	Integrase core domain
EQ029_RS05725	PF01610	Transposase
EQ029_RS05730	PF00324	Amino acid permease
EQ029_RS05735	PF00285	Citrate synthase, C-terminal domain
EQ029_RS05740	PF00180	Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase
EQ029_RS05745	PF00486	Transcriptional regulatory protein, C terminal
EQ029_RS05745	PF00072	Response regulator receiver domain
EQ029_RS05750	PF02518	Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase
EQ029_RS05750	PF00989	PAS fold
EQ029_RS05750	PF16736	Single Cache-like 
EQ029_RS05750	PF00512	His Kinase A (phospho-acceptor) domain
EQ029_RS05755	PF02739	5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain
EQ029_RS05755	PF01367	5'-3' exonuclease, C-terminal SAM fold
EQ029_RS05755	PF00476	DNA polymerase family A
EQ029_RS05760	PF06827	Zinc finger found in FPG and IleRS
EQ029_RS05760	PF01149	Formamidopyrimidine-DNA glycosylase N-terminal domain
EQ029_RS05760	PF06831	Formamidopyrimidine-DNA glycosylase H2TH domain
EQ029_RS05765	PF01121	Dephospho-CoA kinase
EQ029_RS05770	PF00044	Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase, NAD binding domain
EQ029_RS05770	PF02800	Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase, C-terminal domain
EQ029_RS05775	PF03477	ATP cone domain
EQ029_RS05785	PF07319	Primosomal protein DnaI N-terminus
EQ029_RS05785	PF01695	IstB-like ATP binding protein
EQ029_RS05790	PF07973	Threonyl and Alanyl tRNA synthetase second additional domain
EQ029_RS05790	PF03129	Anticodon binding domain
EQ029_RS05790	PF00587	tRNA synthetase class II core domain (G, H, P, S and T)
EQ029_RS05790	PF02824	TGS domain
EQ029_RS05795	PF00324	Amino acid permease
EQ029_RS05800	PF05198	Translation initiation factor IF-3, N-terminal domain
EQ029_RS05800	PF00707	Translation initiation factor IF-3, C-terminal domain
EQ029_RS05805	PF01632	Ribosomal protein L35
EQ029_RS05810	PF00453	Ribosomal protein L20
EQ029_RS05825	PF05697	Bacterial trigger factor protein (TF)
EQ029_RS05825	PF05698	Bacterial trigger factor protein (TF) C-terminus
EQ029_RS05825	PF00254	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase
EQ029_RS05830	PF06689	ClpX C4-type zinc finger
EQ029_RS05830	PF10431	C-terminal, D2-small domain, of ClpB protein 
EQ029_RS05830	PF07724	AAA domain (Cdc48 subfamily)
EQ029_RS05835	PF01926	50S ribosome-binding GTPase
EQ029_RS05840	PF00745	Glutamyl-tRNAGlu reductase, dimerisation domain
EQ029_RS05840	PF01488	Shikimate / quinate 5-dehydrogenase
EQ029_RS05840	PF05201	Glutamyl-tRNAGlu reductase, N-terminal domain
EQ029_RS05845	PF01578	Cytochrome C assembly protein
EQ029_RS05850	PF01379	Porphobilinogen deaminase, dipyromethane cofactor binding domain
EQ029_RS05850	PF03900	Porphobilinogen deaminase, C-terminal domain
EQ029_RS05860	PF00490	Delta-aminolevulinic acid dehydratase
EQ029_RS05865	PF00202	Aminotransferase class-III
EQ029_RS05875	PF03352	Methyladenine glycosylase
EQ029_RS05880	PF00133	tRNA synthetases class I (I, L, M and V)
EQ029_RS05880	PF08264	Anticodon-binding domain of tRNA
EQ029_RS05880	PF10458	Valyl tRNA synthetase tRNA binding arm
EQ029_RS05885	PF02875	Mur ligase family, glutamate ligase domain
EQ029_RS05885	PF08245	Mur ligase middle domain
EQ029_RS05895	PF04002	RadC-like JAB domain
EQ029_RS05920	PF04085	rod shape-determining protein MreC
EQ029_RS05930	PF00829	Ribosomal prokaryotic L21 protein
EQ029_RS05935	PF04327	Cysteine protease Prp
EQ029_RS05940	PF01016	Ribosomal L27 protein
EQ029_RS05945	PF01926	50S ribosome-binding GTPase
EQ029_RS05945	PF01018	GTP1/OBG
EQ029_RS05945	PF09269	Domain of unknown function (DUF1967)
EQ029_RS05955	PF07499	RuvA, C-terminal domain
EQ029_RS05955	PF01330	RuvA N terminal domain
EQ029_RS05960	PF05496	Holliday junction DNA helicase RuvB P-loop domain
EQ029_RS05960	PF05491	RuvB C-terminal winged helix domain
EQ029_RS05960	PF17864	RuvB AAA lid domain
EQ029_RS05965	PF02547	Queuosine biosynthesis protein
EQ029_RS05970	PF01702	Queuine tRNA-ribosyltransferase
EQ029_RS05975	PF02699	Preprotein translocase subunit
EQ029_RS05980	PF02355	Protein export membrane protein
EQ029_RS05980	PF07549	SecD/SecF GG Motif
EQ029_RS05985	PF17768	RecJ OB domain
EQ029_RS05985	PF02272	DHHA1 domain
EQ029_RS05985	PF01368	DHH family
EQ029_RS05985	PF10141	Single-strand DNA-specific exonuclease, C terminal domain
EQ029_RS05990	PF00156	Phosphoribosyl transferase domain
EQ029_RS05995	PF13291	ACT domain
EQ029_RS05995	PF02824	TGS domain
EQ029_RS05995	PF04607	Region found in RelA / SpoT proteins
EQ029_RS06000	PF02580	D-Tyr-tRNA(Tyr) deacylase
EQ029_RS06005	PF01520	N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase
EQ029_RS06005	PF08239	Bacterial SH3 domain
EQ029_RS06010	PF13393	Histidyl-tRNA synthetase
EQ029_RS06010	PF03129	Anticodon binding domain
EQ029_RS06015	PF00152	tRNA synthetases class II (D, K and N) 
EQ029_RS06015	PF02938	GAD domain
EQ029_RS06015	PF01336	OB-fold nucleic acid binding domain
EQ029_RS06025	PF00899	ThiF family
EQ029_RS06030	PF05496	Holliday junction DNA helicase RuvB P-loop domain
EQ029_RS06030	PF12002	MgsA AAA+ ATPase C terminal
EQ029_RS06030	PF16193	AAA C-terminal domain
EQ029_RS06035	PF02082	Transcriptional regulator
EQ029_RS06040	PF00296	Luciferase-like monooxygenase
EQ029_RS06045	PF00266	Aminotransferase class-V
EQ029_RS06060	PF18335	ATP-dependent RecD-like DNA helicase SH3 domain
EQ029_RS06060	PF14490	Helix-hairpin-helix containing domain
EQ029_RS06060	PF13538	UvrD-like helicase C-terminal domain
EQ029_RS06065	PF02272	DHHA1 domain
EQ029_RS06065	PF01411	tRNA synthetases class II (A)
EQ029_RS06065	PF07973	Threonyl and Alanyl tRNA synthetase second additional domain
EQ029_RS06070	PF06135	IreB regulatory phosphoprotein
EQ029_RS06075	PF03652	Holliday junction resolvase
EQ029_RS06080	PF06949	Protein of unknown function (DUF1292)
EQ029_RS06090	PF01136	Peptidase family U32
EQ029_RS06095	PF16325	Peptidase family U32 C-terminal domain
EQ029_RS06095	PF01136	Peptidase family U32
EQ029_RS06100	PF00485	Phosphoribulokinase / Uridine kinase family
EQ029_RS06105	PF01272	Transcription elongation factor, GreA/GreB, C-term
EQ029_RS06105	PF03449	Transcription elongation factor, N-terminal
EQ029_RS06110	PF02682	Carboxyltransferase domain, subdomain C and D
EQ029_RS06115	PF02626	Carboxyltransferase domain, subdomain A and B 
EQ029_RS06120	PF00364	Biotin-requiring enzyme
EQ029_RS06125	PF02785	Biotin carboxylase C-terminal domain
EQ029_RS06125	PF00289	Biotin carboxylase, N-terminal domain
EQ029_RS06125	PF02786	Carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP binding domain
EQ029_RS06130	PF03746	LamB/YcsF family
EQ029_RS06135	PF01566	Natural resistance-associated macrophage protein
EQ029_RS06140	PF01048	Phosphorylase superfamily
EQ029_RS06150	PF01926	50S ribosome-binding GTPase
EQ029_RS06155	PF18317	Shikimate 5'-dehydrogenase C-terminal domain
EQ029_RS06155	PF08501	Shikimate dehydrogenase substrate binding domain
EQ029_RS06155	PF01488	Shikimate / quinate 5-dehydrogenase
EQ029_RS06160	PF01985	CRS1 / YhbY (CRM) domain
EQ029_RS06165	PF01467	Cytidylyltransferase-like
EQ029_RS06170	PF01966	HD domain
EQ029_RS06180	PF13649	Methyltransferase domain
EQ029_RS06185	PF10531	SLBB domain
EQ029_RS06190	PF00383	Cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region
EQ029_RS06195	PF13567	Domain of unknown function (DUF4131)
EQ029_RS06195	PF00753	Metallo-beta-lactamase superfamily
EQ029_RS06195	PF03772	Competence protein
EQ029_RS06200	PF06144	DNA polymerase III, delta subunit
EQ029_RS06205	PF01649	Ribosomal protein S20
EQ029_RS06210	PF00009	Elongation factor Tu GTP binding domain
EQ029_RS06210	PF06421	GTP-binding protein LepA C-terminus
EQ029_RS06210	PF03144	Elongation factor Tu domain 2
EQ029_RS06210	PF00679	Elongation factor G C-terminus
EQ029_RS06215	PF06969	HemN C-terminal domain
EQ029_RS06215	PF04055	Radical SAM superfamily
EQ029_RS06220	PF01628	HrcA protein C terminal domain
EQ029_RS06225	PF01025	GrpE
EQ029_RS06230	PF00012	Hsp70 protein
EQ029_RS06235	PF00684	DnaJ central domain
EQ029_RS06235	PF01556	DnaJ C terminal domain
EQ029_RS06235	PF00226	DnaJ domain
EQ029_RS06245	PF04452	RNA methyltransferase
EQ029_RS06250	PF00919	Uncharacterized protein family UPF0004
EQ029_RS06250	PF01938	TRAM domain
EQ029_RS06250	PF04055	Radical SAM superfamily
EQ029_RS06255	PF01165	Ribosomal protein S21
EQ029_RS06260	PF01972	Serine dehydrogenase proteinase
EQ029_RS06260	PF01957	NfeD-like C-terminal, partner-binding
EQ029_RS06265	PF12127	SigmaW regulon antibacterial
EQ029_RS06275	PF02562	PhoH-like protein
EQ029_RS06280	PF02130	Uncharacterized protein family UPF0054
EQ029_RS06285	PF01219	Prokaryotic diacylglycerol kinase
EQ029_RS06290	PF00383	Cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region
EQ029_RS06295	PF01926	50S ribosome-binding GTPase
EQ029_RS06295	PF07650	KH domain
EQ029_RS06300	PF02565	Recombination protein O C terminal
EQ029_RS06300	PF11967	Recombination protein O N terminal
EQ029_RS06305	PF03129	Anticodon binding domain
EQ029_RS06305	PF00587	tRNA synthetase class II core domain (G, H, P, S and T)
EQ029_RS06310	PF00571	CBS domain
EQ029_RS06310	PF08279	HTH domain
EQ029_RS06315	PF03618	Kinase/pyrophosphorylase
EQ029_RS06320	PF00772	DnaB-like helicase N terminal domain
EQ029_RS06320	PF01807	CHC2 zinc finger
EQ029_RS06320	PF08275	DNA primase catalytic core, N-terminal domain
EQ029_RS06325	PF00140	Sigma-70 factor, region 1.2
EQ029_RS06325	PF04542	Sigma-70 region 2 
EQ029_RS06325	PF04539	Sigma-70 region 3
EQ029_RS06325	PF04545	Sigma-70, region 4
EQ029_RS06325	PF03979	Sigma-70 factor, region 1.1
EQ029_RS06330	PF04816	tRNA (adenine(22)-N(1))-methyltransferase
EQ029_RS06335	PF01784	NIF3 (NGG1p interacting factor 3)
EQ029_RS06340	PF00270	DEAD/DEAH box helicase
EQ029_RS06340	PF00271	Helicase conserved C-terminal domain
EQ029_RS06345	PF01261	Xylose isomerase-like TIM barrel
EQ029_RS06350	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS06355	PF00950	ABC 3 transport family
EQ029_RS06360	PF01475	Ferric uptake regulator family
EQ029_RS06365	PF02777	Iron/manganese superoxide dismutases, C-terminal domain
EQ029_RS06365	PF00081	Iron/manganese superoxide dismutases, alpha-hairpin domain
EQ029_RS06370	PF00905	Penicillin binding protein transpeptidase domain
EQ029_RS06370	PF03717	Penicillin-binding Protein dimerisation domain
EQ029_RS06375	PF00471	Ribosomal protein L33
EQ029_RS06380	PF01812	5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family
EQ029_RS06390	PF06014	Bacterial protein of unknown function (DUF910)
EQ029_RS06395	PF00480	ROK family
EQ029_RS06400	PF01910	Thiamine-binding protein
EQ029_RS06405	PF00753	Metallo-beta-lactamase superfamily
EQ029_RS06410	PF00437	Type II/IV secretion system protein
EQ029_RS06415	PF00482	Type II secretion system (T2SS), protein F
EQ029_RS06420	PF07963	Prokaryotic N-terminal methylation motif
EQ029_RS06445	PF01202	Shikimate kinase
EQ029_RS06450	PF01571	Aminomethyltransferase folate-binding domain
EQ029_RS06450	PF08669	Glycine cleavage T-protein C-terminal barrel domain
EQ029_RS06455	PF02347	Glycine cleavage system P-protein
EQ029_RS06460	PF00266	Aminotransferase class-V
EQ029_RS06465	PF00581	Rhodanese-like domain
EQ029_RS06470	PF03099	Biotin/lipoate A/B protein ligase family
EQ029_RS06485	PF01321	Creatinase/Prolidase N-terminal domain
EQ029_RS06485	PF00557	Metallopeptidase family M24
EQ029_RS06490	PF09285	Elongation factor P, C-terminal
EQ029_RS06490	PF08207	Elongation factor P (EF-P) KOW-like domain
EQ029_RS06490	PF01132	Elongation factor P (EF-P) OB domain
EQ029_RS06495	PF00364	Biotin-requiring enzyme
EQ029_RS06500	PF02786	Carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP binding domain
EQ029_RS06500	PF02785	Biotin carboxylase C-terminal domain
EQ029_RS06500	PF00289	Biotin carboxylase, N-terminal domain
EQ029_RS06505	PF03780	Asp23 family, cell envelope-related function
EQ029_RS06510	PF01029	NusB family
EQ029_RS06515	PF13742	OB-fold nucleic acid binding domain
EQ029_RS06515	PF02601	Exonuclease VII, large subunit
EQ029_RS06520	PF02609	Exonuclease VII small subunit
EQ029_RS06525	PF00348	Polyprenyl synthetase
EQ029_RS06530	PF01316	Arginine repressor, DNA binding domain
EQ029_RS06530	PF02863	Arginine repressor, C-terminal domain
EQ029_RS06535	PF13476	AAA domain
EQ029_RS06540	PF02852	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
EQ029_RS06540	PF07992	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
EQ029_RS06545	PF00676	Dehydrogenase E1 component
EQ029_RS06550	PF02779	Transketolase, pyrimidine binding domain
EQ029_RS06550	PF02780	Transketolase, C-terminal domain
EQ029_RS06555	PF00198	2-oxoacid dehydrogenases acyltransferase (catalytic domain)
EQ029_RS06555	PF02817	e3 binding domain
EQ029_RS06555	PF00364	Biotin-requiring enzyme
EQ029_RS06560	PF06491	Disulphide isomerase
EQ029_RS06565	PF11728	Putative aromatic acid exporter C-terminal domain
EQ029_RS06565	PF06081	Aromatic acid exporter family member 1
EQ029_RS06575	PF01546	Peptidase family M20/M25/M40
EQ029_RS06575	PF07687	Peptidase dimerisation domain
EQ029_RS06580	PF00393	6-phosphogluconate dehydrogenase, C-terminal domain
EQ029_RS06580	PF03446	NAD binding domain of 6-phosphogluconate dehydrogenase
EQ029_RS06585	PF00356	Bacterial regulatory proteins, lacI family
EQ029_RS06590	PF00128	Alpha amylase, catalytic domain
EQ029_RS06590	PF16657	Maltogenic Amylase, C-terminal domain
EQ029_RS06605	PF00479	Glucose-6-phosphate dehydrogenase, NAD binding domain
EQ029_RS06605	PF02781	Glucose-6-phosphate dehydrogenase, C-terminal domain
EQ029_RS06610	PF12706	Beta-lactamase superfamily domain
EQ029_RS06615	PF03807	NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent
EQ029_RS06615	PF14748	Pyrroline-5-carboxylate reductase dimerisation
EQ029_RS06620	PF00106	short chain dehydrogenase
EQ029_RS06630	PF00248	Aldo/keto reductase family
EQ029_RS06635	PF00293	NUDIX domain
EQ029_RS06640	PF01475	Ferric uptake regulator family
EQ029_RS06645	PF02899	Phage integrase, N-terminal SAM-like domain
EQ029_RS06645	PF00589	Phage integrase family
EQ029_RS06655	PF02616	Segregation and condensation protein ScpA
EQ029_RS06660	PF04079	Segregation and condensation complex subunit ScpB
EQ029_RS06665	PF01479	S4 domain
EQ029_RS06665	PF00849	RNA pseudouridylate synthase
EQ029_RS06670	PF00486	Transcriptional regulatory protein, C terminal
EQ029_RS06670	PF00072	Response regulator receiver domain
EQ029_RS06675	PF00672	HAMP domain
EQ029_RS06675	PF02518	Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase
EQ029_RS06675	PF18698	Histidine kinase sensor domain
EQ029_RS06675	PF00512	His Kinase A (phospho-acceptor) domain
EQ029_RS06680	PF12822	ECF transporter, substrate-specific component
EQ029_RS06695	PF00271	Helicase conserved C-terminal domain
EQ029_RS06695	PF00270	DEAD/DEAH box helicase
EQ029_RS06700	PF01476	LysM domain
EQ029_RS06710	PF00710	Asparaginase, N-terminal
EQ029_RS06710	PF17763	Glutaminase/Asparaginase C-terminal domain
EQ029_RS06715	PF02224	Cytidylate kinase
EQ029_RS06720	PF00575	S1 RNA binding domain
EQ029_RS06725	PF14714	KH-domain-like of EngA bacterial GTPase enzymes, C-terminal
EQ029_RS06725	PF01926	50S ribosome-binding GTPase
EQ029_RS06730	PF07479	NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase C-terminus
EQ029_RS06730	PF01210	NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase N-terminus
EQ029_RS06735	PF00216	Bacterial DNA-binding protein
EQ029_RS06745	PF01209	ubiE/COQ5 methyltransferase family
EQ029_RS06750	PF00348	Polyprenyl synthetase
EQ029_RS06755	PF00334	Nucleoside diphosphate kinase
EQ029_RS06760	PF01264	Chorismate synthase
EQ029_RS06765	PF01761	3-dehydroquinate synthase
EQ029_RS06770	PF00275	EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)
EQ029_RS06780	PF08864	UPF0302 domain
EQ029_RS06780	PF08858	IDEAL domain
EQ029_RS06785	PF07187	Protein of unknown function (DUF1405)
EQ029_RS06790	PF04298	Putative neutral zinc metallopeptidase
EQ029_RS06795	PF03819	MazG nucleotide pyrophosphohydrolase domain
EQ029_RS06800	PF00534	Glycosyl transferases group 1
EQ029_RS06800	PF13439	Glycosyltransferase Family 4
EQ029_RS06805	PF12627	Probable RNA and SrmB- binding site of polymerase A
EQ029_RS06805	PF01743	Poly A polymerase head domain
EQ029_RS06805	PF13735	tRNA nucleotidyltransferase domain 2 putative
EQ029_RS06810	PF02237	Biotin protein ligase C terminal domain
EQ029_RS06810	PF03099	Biotin/lipoate A/B protein ligase family
EQ029_RS06810	PF08279	HTH domain
EQ029_RS06815	PF04851	Type III restriction enzyme, res subunit
EQ029_RS06815	PF00929	Exonuclease
EQ029_RS06815	PF13307	Helicase C-terminal domain
EQ029_RS06820	PF00152	tRNA synthetases class II (D, K and N) 
EQ029_RS06820	PF01336	OB-fold nucleic acid binding domain
EQ029_RS06825	PF07261	Replication initiation and membrane attachment
EQ029_RS06830	PF10576	Iron-sulfur binding domain of endonuclease III
EQ029_RS06830	PF00633	Helix-hairpin-helix motif
EQ029_RS06830	PF00730	HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein
EQ029_RS06840	PF00905	Penicillin binding protein transpeptidase domain
EQ029_RS06840	PF00912	Transglycosylase
EQ029_RS06845	PF03838	Recombination protein U
EQ029_RS06855	PF06908	YspA SLOG family
EQ029_RS06860	PF05103	DivIVA protein
EQ029_RS06870	PF02926	THUMP domain
EQ029_RS06870	PF01170	Putative RNA methylase family UPF0020
EQ029_RS06880	PF00350	Dynamin family
EQ029_RS06885	PF01367	5'-3' exonuclease, C-terminal SAM fold
EQ029_RS06885	PF02739	5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain
EQ029_RS06890	PF04650	YSIRK type signal peptide
EQ029_RS06890	PF01468	GA module
EQ029_RS06890	PF07564	Domain of Unknown Function (DUF1542)
EQ029_RS06895	PF01468	GA module
EQ029_RS06895	PF04650	YSIRK type signal peptide
EQ029_RS06895	PF07564	Domain of Unknown Function (DUF1542)
EQ029_RS06905	PF02592	Putative vitamin uptake transporter
EQ029_RS06915	PF08712	Scaffold protein Nfu/NifU N terminal
EQ029_RS06915	PF13769	Virulence factor
EQ029_RS06920	PF08712	Scaffold protein Nfu/NifU N terminal
EQ029_RS06920	PF13769	Virulence factor
EQ029_RS06925	PF06491	Disulphide isomerase
EQ029_RS06930	PF00303	Thymidylate synthase
EQ029_RS06935	PF00186	Dihydrofolate reductase
EQ029_RS06940	PF02645	Uncharacterised protein, DegV family COG1307
EQ029_RS06945	PF01625	Peptide methionine sulfoxide reductase
EQ029_RS06950	PF01641	SelR domain
EQ029_RS06955	PF00358	phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 1
EQ029_RS06960	PF06855	YozE SAM-like fold
EQ029_RS06965	PF01471	Putative peptidoglycan binding domain
EQ029_RS06965	PF03572	Peptidase family S41
EQ029_RS06965	PF17820	PDZ domain
EQ029_RS06975	PF03033	Glycosyltransferase family 28 N-terminal domain
EQ029_RS06975	PF04101	Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain
EQ029_RS06980	PF01569	PAP2 superfamily
EQ029_RS06985	PF00486	Transcriptional regulatory protein, C terminal
EQ029_RS06985	PF00072	Response regulator receiver domain
EQ029_RS06990	PF02518	Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase
EQ029_RS06990	PF00512	His Kinase A (phospho-acceptor) domain
EQ029_RS06990	PF18719	ArlS sensor domain
EQ029_RS06995	PF02779	Transketolase, pyrimidine binding domain
EQ029_RS06995	PF00676	Dehydrogenase E1 component
EQ029_RS06995	PF16870	2-oxoglutarate dehydrogenase C-terminal
EQ029_RS07000	PF00198	2-oxoacid dehydrogenases acyltransferase (catalytic domain)
EQ029_RS07000	PF02817	e3 binding domain
EQ029_RS07000	PF00364	Biotin-requiring enzyme
EQ029_RS07020	PF07728	AAA domain (dynein-related subfamily)
EQ029_RS07020	PF08406	CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal 
EQ029_RS07025	PF00092	von Willebrand factor type A domain
EQ029_RS07030	PF05525	Branched-chain amino acid transport protein
EQ029_RS07035	PF05816	Toxic anion resistance protein (TelA)
EQ029_RS07045	PF00708	Acylphosphatase
EQ029_RS07055	PF00313	'Cold-shock' DNA-binding domain
EQ029_RS07060	PF13683	Integrase core domain
EQ029_RS07060	PF01610	Transposase
EQ029_RS07065	PF00278	Pyridoxal-dependent decarboxylase, C-terminal sheet domain
EQ029_RS07065	PF02784	Pyridoxal-dependent decarboxylase, pyridoxal binding domain
EQ029_RS07070	PF01168	Alanine racemase, N-terminal domain
EQ029_RS07070	PF00842	Alanine racemase, C-terminal domain
EQ029_RS07075	PF01546	Peptidase family M20/M25/M40
EQ029_RS07080	PF08503	Tetrahydrodipicolinate succinyltransferase N-terminal
EQ029_RS07080	PF00132	Bacterial transferase hexapeptide (six repeats)
EQ029_RS07080	PF14602	Hexapeptide repeat of succinyl-transferase
EQ029_RS07085	PF05173	Dihydrodipicolinate reductase, C-terminus
EQ029_RS07085	PF01113	Dihydrodipicolinate reductase, N-terminus
EQ029_RS07090	PF00701	Dihydrodipicolinate synthetase family
EQ029_RS07095	PF02774	Semialdehyde dehydrogenase, dimerisation domain
EQ029_RS07095	PF01118	Semialdehyde dehydrogenase, NAD binding domain
EQ029_RS07100	PF00696	Amino acid kinase family
EQ029_RS07100	PF13840	ACT domain 
EQ029_RS07105	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS07105	PF12848	ABC transporter
EQ029_RS07110	PF13509	S1 domain
EQ029_RS07110	PF17783	CvfB-like winged helix domain
EQ029_RS07115	PF12849	PBP superfamily domain
EQ029_RS07120	PF00528	Binding-protein-dependent transport system inner membrane component
EQ029_RS07125	PF00528	Binding-protein-dependent transport system inner membrane component
EQ029_RS07130	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS07135	PF01895	PhoU domain
EQ029_RS07140	PF08439	Oligopeptidase F
EQ029_RS07140	PF01432	Peptidase family M3
EQ029_RS07150	PF01497	Periplasmic binding protein
EQ029_RS07160	PF02388	FemAB family
EQ029_RS07165	PF02388	FemAB family
EQ029_RS07175	PF00290	Tryptophan synthase alpha chain
EQ029_RS07180	PF00291	Pyridoxal-phosphate dependent enzyme
EQ029_RS07185	PF00697	N-(5'phosphoribosyl)anthranilate (PRA) isomerase
EQ029_RS07190	PF00218	Indole-3-glycerol phosphate synthase
EQ029_RS07195	PF00591	Glycosyl transferase family, a/b domain
EQ029_RS07200	PF00117	Glutamine amidotransferase class-I
EQ029_RS07205	PF04715	Anthranilate synthase component I, N terminal region
EQ029_RS07205	PF00425	chorismate binding enzyme
EQ029_RS07210	PF05343	M42 glutamyl aminopeptidase
EQ029_RS07215	PF02153	Prephenate dehydrogenase
EQ029_RS07220	PF00817	impB/mucB/samB family
EQ029_RS07220	PF11799	impB/mucB/samB family C-terminal domain
EQ029_RS07220	PF11798	IMS family HHH motif
EQ029_RS07225	PF01361	Tautomerase enzyme
EQ029_RS07230	PF03816	Cell envelope-related transcriptional attenuator domain
EQ029_RS07235	PF01625	Peptide methionine sulfoxide reductase
EQ029_RS07240	PF09924	Uncharacterised conserved protein (DUF2156)
EQ029_RS07240	PF03706	Lysylphosphatidylglycerol synthase TM region
EQ029_RS07245	PF01594	AI-2E family transporter
EQ029_RS07250	PF00874	PRD domain
EQ029_RS07250	PF03123	CAT RNA binding domain
EQ029_RS07255	PF01235	Sodium:alanine symporter family
EQ029_RS07260	PF03989	DNA gyrase C-terminal domain, beta-propeller
EQ029_RS07260	PF00521	DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A
EQ029_RS07265	PF00986	DNA gyrase B subunit, carboxyl terminus
EQ029_RS07265	PF00204	DNA gyrase B
EQ029_RS07265	PF01751	Toprim domain
EQ029_RS07265	PF02518	Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase
EQ029_RS07270	PF02660	Glycerol-3-phosphate acyltransferase
EQ029_RS07280	PF03061	Thioesterase superfamily
EQ029_RS07285	PF00330	Aconitase family (aconitate hydratase)
EQ029_RS07285	PF00694	Aconitase C-terminal domain
EQ029_RS07290	PF02028	BCCT, betaine/carnitine/choline family transporter
EQ029_RS07295	PF01741	Large-conductance mechanosensitive channel, MscL
EQ029_RS07300	PF13476	AAA domain
EQ029_RS07305	PF00149	Calcineurin-like phosphoesterase
EQ029_RS07310	PF07301	Protein of unknown function (DUF1453)
EQ029_RS07320	PF02779	Transketolase, pyrimidine binding domain
EQ029_RS07320	PF02780	Transketolase, C-terminal domain
EQ029_RS07320	PF00456	Transketolase, thiamine diphosphate binding domain
EQ029_RS07325	PF05979	Bacterial protein of unknown function (DUF896)
EQ029_RS07335	PF00717	Peptidase S24-like
EQ029_RS07335	PF01726	LexA DNA binding domain
EQ029_RS07340	PF14504	CAP-associated N-terminal
EQ029_RS07340	PF00188	Cysteine-rich secretory protein family
EQ029_RS07345	PF00478	IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
EQ029_RS07350	PF00253	Ribosomal protein S14p/S29e
EQ029_RS07355	PF00471	Ribosomal protein L33
EQ029_RS07360	PF00199	Catalase
EQ029_RS07360	PF06628	Catalase-related immune-responsive
EQ029_RS07365	PF00324	Amino acid permease
EQ029_RS07380	PF08544	GHMP kinases C terminal 
EQ029_RS07380	PF00288	GHMP kinases N terminal domain
EQ029_RS07385	PF00291	Pyridoxal-phosphate dependent enzyme
EQ029_RS07390	PF01842	ACT domain
EQ029_RS07390	PF03447	Homoserine dehydrogenase, NAD binding domain
EQ029_RS07390	PF00742	Homoserine dehydrogenase
EQ029_RS07395	PF00696	Amino acid kinase family
EQ029_RS07395	PF13840	ACT domain 
EQ029_RS07410	PF00565	Staphylococcal nuclease homologue
EQ029_RS07425	PF00196	Bacterial regulatory proteins, luxR family
EQ029_RS07425	PF00072	Response regulator receiver domain
EQ029_RS07430	PF02518	Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase
EQ029_RS07430	PF07730	Histidine kinase
EQ029_RS07440	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS07445	PF13396	Phospholipase_D-nuclease N-terminal
EQ029_RS07445	PF13091	PLD-like domain
EQ029_RS07490	PF00120	Glutamine synthetase, catalytic domain
EQ029_RS07490	PF03951	Glutamine synthetase, beta-Grasp domain
EQ029_RS07495	PF13411	MerR HTH family regulatory protein
EQ029_RS07500	PF06838	Methionine gamma-lyase 
EQ029_RS07505	PF16360	GTP-binding GTPase Middle Region
EQ029_RS07505	PF13167	GTP-binding GTPase N-terminal
EQ029_RS07505	PF01926	50S ribosome-binding GTPase
EQ029_RS07510	PF00255	Glutathione peroxidase
EQ029_RS07515	PF17209	Hfq protein
EQ029_RS07530	PF16901	C-terminal domain of alpha-glycerophosphate oxidase
EQ029_RS07530	PF01266	FAD dependent oxidoreductase
EQ029_RS07535	PF00370	FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
EQ029_RS07535	PF02782	FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
EQ029_RS07540	PF00230	Major intrinsic protein
EQ029_RS07550	PF08676	MutL C terminal dimerisation domain
EQ029_RS07550	PF01119	DNA mismatch repair protein, C-terminal domain
EQ029_RS07555	PF05190	MutS family domain IV
EQ029_RS07555	PF05192	MutS domain III
EQ029_RS07555	PF05188	MutS domain II
EQ029_RS07555	PF00488	MutS domain V
EQ029_RS07555	PF01624	MutS domain I
EQ029_RS07565	PF06133	Control of competence regulator ComK, YlbF/YmcA
EQ029_RS07570	PF04055	Radical SAM superfamily
EQ029_RS07570	PF00919	Uncharacterized protein family UPF0004
EQ029_RS07570	PF01938	TRAM domain
EQ029_RS07580	PF05908	Poly-gamma-glutamate hydrolase
EQ029_RS07585	PF02775	Thiamine pyrophosphate enzyme, C-terminal TPP binding domain
EQ029_RS07590	PF01855	Pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase, thiamine diP-bdg
EQ029_RS07590	PF01558	Pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase
EQ029_RS07590	PF17147	Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase core domain II
EQ029_RS07595	PF13277	YmdB-like protein
EQ029_RS07605	PF12072	Domain of unknown function (DUF3552)
EQ029_RS07605	PF00013	KH domain
EQ029_RS07605	PF01966	HD domain
EQ029_RS07610	PF00154	recA bacterial DNA recombination protein
EQ029_RS07615	PF02464	Competence-damaged protein
EQ029_RS07615	PF18146	Damage-inducible protein CinA KH domain
EQ029_RS07615	PF00994	Probable molybdopterin binding domain
EQ029_RS07620	PF01066	CDP-alcohol phosphatidyltransferase
EQ029_RS07630	PF11868	Protein of unknown function (DUF3388)
EQ029_RS07640	PF05193	Peptidase M16 inactive domain
EQ029_RS07640	PF00675	Insulinase (Peptidase family M16)
EQ029_RS07645	PF05193	Peptidase M16 inactive domain
EQ029_RS07650	PF00392	Bacterial regulatory proteins, gntR family
EQ029_RS07650	PF07702	UTRA domain
EQ029_RS07655	PF01580	FtsK/SpoIIIE family
EQ029_RS07655	PF09397	Ftsk gamma domain
EQ029_RS07655	PF17854	FtsK alpha domain
EQ029_RS07660	PF17770	Ribonuclease J C-terminal domain
EQ029_RS07660	PF00753	Metallo-beta-lactamase superfamily
EQ029_RS07660	PF07521	Zn-dependent metallo-hydrolase RNA specificity domain
EQ029_RS07665	PF03726	Polyribonucleotide nucleotidyltransferase, RNA binding domain
EQ029_RS07665	PF00013	KH domain
EQ029_RS07665	PF01138	3' exoribonuclease family, domain 1
EQ029_RS07665	PF03725	3' exoribonuclease family, domain 2
EQ029_RS07665	PF00575	S1 RNA binding domain
EQ029_RS07670	PF00312	Ribosomal protein S15
EQ029_RS07675	PF01687	Riboflavin kinase
EQ029_RS07675	PF06574	FAD synthetase
EQ029_RS07680	PF16198	tRNA pseudouridylate synthase B C-terminal domain
EQ029_RS07680	PF01509	TruB family pseudouridylate synthase (N terminal domain)
EQ029_RS07685	PF02033	Ribosome-binding factor A
EQ029_RS07690	PF00009	Elongation factor Tu GTP binding domain
EQ029_RS07690	PF11987	Translation-initiation factor 2
EQ029_RS07690	PF04760	Translation initiation factor IF-2, N-terminal region
EQ029_RS07695	PF01248	Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family
EQ029_RS07700	PF04296	Protein of unknown function (DUF448)
EQ029_RS07705	PF00575	S1 RNA binding domain
EQ029_RS07705	PF08529	NusA N-terminal domain
EQ029_RS07705	PF13184	NusA-like KH domain
EQ029_RS07710	PF17384	RimP C-terminal SH3 domain
EQ029_RS07710	PF02576	RimP N-terminal domain
EQ029_RS07715	PF11490	DNA polymerase III polC-type N-terminus II
EQ029_RS07715	PF07733	Bacterial DNA polymerase III alpha NTPase domain
EQ029_RS07715	PF02811	PHP domain
EQ029_RS07715	PF14579	Helix-hairpin-helix motif
EQ029_RS07715	PF14480	DNA polymerase III polC-type N-terminus I
EQ029_RS07715	PF00929	Exonuclease
EQ029_RS07715	PF17657	Bacterial DNA polymerase III alpha subunit finger domain
EQ029_RS07720	PF04073	Aminoacyl-tRNA editing domain
EQ029_RS07720	PF03129	Anticodon binding domain
EQ029_RS07720	PF00587	tRNA synthetase class II core domain (G, H, P, S and T)
EQ029_RS07725	PF02163	Peptidase family M50
EQ029_RS07725	PF13180	PDZ domain
EQ029_RS07735	PF01255	Putative undecaprenyl diphosphate synthase
EQ029_RS07740	PF01765	Ribosome recycling factor
EQ029_RS07745	PF00696	Amino acid kinase family
EQ029_RS07750	PF00889	Elongation factor TS
EQ029_RS07755	PF00318	Ribosomal protein S2
EQ029_RS07760	PF06018	CodY GAF-like domain
EQ029_RS07760	PF08222	CodY helix-turn-helix domain
EQ029_RS07765	PF07724	AAA domain (Cdc48 subfamily)
EQ029_RS07765	PF10431	C-terminal, D2-small domain, of ClpB protein 
EQ029_RS07770	PF00227	Proteasome subunit
EQ029_RS07775	PF00589	Phage integrase family
EQ029_RS07775	PF02899	Phage integrase, N-terminal SAM-like domain
EQ029_RS07780	PF01134	Glucose inhibited division protein A
EQ029_RS07785	PF01751	Toprim domain
EQ029_RS07785	PF01396	Topoisomerase DNA binding C4 zinc finger
EQ029_RS07785	PF01131	DNA topoisomerase
EQ029_RS07790	PF02481	DNA recombination-mediator protein A
EQ029_RS07795	PF02388	FemAB family
EQ029_RS07800	PF02629	CoA binding domain
EQ029_RS07800	PF00549	CoA-ligase
EQ029_RS07805	PF00549	CoA-ligase
EQ029_RS07805	PF08442	ATP-grasp domain
EQ029_RS07810	PF01351	Ribonuclease HII
EQ029_RS07815	PF01926	50S ribosome-binding GTPase
EQ029_RS07820	PF09586	Bacterial membrane protein YfhO
EQ029_RS07830	PF01245	Ribosomal protein L19
EQ029_RS07835	PF01746	tRNA (Guanine-1)-methyltransferase
EQ029_RS07840	PF01782	RimM N-terminal domain
EQ029_RS07840	PF05239	PRC-barrel domain
EQ029_RS07845	PF00886	Ribosomal protein S16
EQ029_RS07850	PF00448	SRP54-type protein, GTPase domain
EQ029_RS07850	PF02881	SRP54-type protein, helical bundle domain
EQ029_RS07850	PF02978	Signal peptide binding domain
EQ029_RS07855	PF04297	Putative helix-turn-helix protein, YlxM / p13 like
EQ029_RS07860	PF00448	SRP54-type protein, GTPase domain
EQ029_RS07860	PF02881	SRP54-type protein, helical bundle domain
EQ029_RS07865	PF06470	SMC proteins Flexible Hinge Domain
EQ029_RS07865	PF02463	RecF/RecN/SMC N terminal domain
EQ029_RS07870	PF14622	Ribonuclease-III-like
EQ029_RS07870	PF00035	Double-stranded RNA binding motif
EQ029_RS07875	PF00550	Phosphopantetheine attachment site
EQ029_RS07885	PF00698	Acyl transferase domain
EQ029_RS07890	PF02504	Fatty acid synthesis protein
EQ029_RS07895	PF01575	MaoC like domain
EQ029_RS07900	PF17191	RecG wedge domain
EQ029_RS07900	PF00271	Helicase conserved C-terminal domain
EQ029_RS07900	PF00270	DEAD/DEAH box helicase
EQ029_RS07905	PF00565	Staphylococcal nuclease homologue
EQ029_RS07910	PF13684	Dihydroxyacetone kinase family
EQ029_RS07910	PF02734	DAK2 domain
EQ029_RS07915	PF03780	Asp23 family, cell envelope-related function
EQ029_RS07920	PF00830	Ribosomal L28 family
EQ029_RS07925	PF04265	Thiamin pyrophosphokinase, vitamin B1 binding domain
EQ029_RS07925	PF04263	Thiamin pyrophosphokinase, catalytic domain
EQ029_RS07930	PF00834	Ribulose-phosphate 3 epimerase family
EQ029_RS07935	PF03193	RsgA GTPase
EQ029_RS07935	PF16745	RsgA N-terminal domain
EQ029_RS07940	PF03793	PASTA domain
EQ029_RS07940	PF00069	Protein kinase domain
EQ029_RS07950	PF04055	Radical SAM superfamily
EQ029_RS07955	PF01029	NusB family
EQ029_RS07955	PF01189	16S rRNA methyltransferase RsmB/F
EQ029_RS07960	PF00551	Formyl transferase
EQ029_RS07960	PF02911	Formyl transferase, C-terminal domain
EQ029_RS07965	PF01327	Polypeptide deformylase
EQ029_RS07975	PF00271	Helicase conserved C-terminal domain
EQ029_RS07975	PF18319	PriA DNA helicase Cys-rich region (CRR) domain
EQ029_RS07975	PF18074	Primosomal protein N C-terminal domain
EQ029_RS07975	PF17764	3′ DNA-binding domain (3′BD)
EQ029_RS07975	PF04851	Type III restriction enzyme, res subunit
EQ029_RS07980	PF02441	Flavoprotein
EQ029_RS07980	PF04127	DNA / pantothenate metabolism flavoprotein
EQ029_RS07985	PF01192	RNA polymerase Rpb6 
EQ029_RS07990	PF00625	Guanylate kinase
EQ029_RS07995	PF05670	NFACT protein RNA binding domain
EQ029_RS08010	PF00156	Phosphoribosyl transferase domain
EQ029_RS08015	PF00215	Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
EQ029_RS08020	PF02142	MGS-like domain
EQ029_RS08020	PF02786	Carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP binding domain
EQ029_RS08020	PF02787	Carbamoyl-phosphate synthetase large chain, oligomerisation domain
EQ029_RS08025	PF00117	Glutamine amidotransferase class-I
EQ029_RS08025	PF00988	Carbamoyl-phosphate synthase small chain, CPSase domain
EQ029_RS08030	PF01979	Amidohydrolase family
EQ029_RS08035	PF00185	Aspartate/ornithine carbamoyltransferase, Asp/Orn binding domain
EQ029_RS08035	PF02729	Aspartate/ornithine carbamoyltransferase, carbamoyl-P binding domain
EQ029_RS08040	PF00860	Permease family
EQ029_RS08045	PF00156	Phosphoribosyl transferase domain
EQ029_RS08050	PF01479	S4 domain
EQ029_RS08050	PF00849	RNA pseudouridylate synthase
EQ029_RS08055	PF01252	Signal peptidase (SPase) II
EQ029_RS08060	PF05257	CHAP domain
EQ029_RS08060	PF01476	LysM domain
EQ029_RS08070	PF11066	Protein of unknown function (DUF2867)
EQ029_RS08070	PF13460	NAD(P)H-binding 
EQ029_RS08075	PF00133	tRNA synthetases class I (I, L, M and V)
EQ029_RS08075	PF08264	Anticodon-binding domain of tRNA
EQ029_RS08075	PF06827	Zinc finger found in FPG and IleRS
EQ029_RS08080	PF05103	DivIVA protein
EQ029_RS08090	PF02325	YGGT family
EQ029_RS08095	PF04472	Cell division protein SepF
EQ029_RS08100	PF01168	Alanine racemase, N-terminal domain
EQ029_RS08105	PF02578	Multi-copper polyphenol oxidoreductase laccase
EQ029_RS08110	PF00091	Tubulin/FtsZ family, GTPase domain
EQ029_RS08110	PF12327	FtsZ family, C-terminal domain
EQ029_RS08115	PF02491	SHS2 domain inserted in FTSA
EQ029_RS08120	PF03799	Cell division protein FtsQ
EQ029_RS08120	PF08478	POTRA domain, FtsQ-type
EQ029_RS08125	PF08245	Mur ligase middle domain
EQ029_RS08125	PF02875	Mur ligase family, glutamate ligase domain
EQ029_RS08130	PF00953	Glycosyl transferase family 4
EQ029_RS08135	PF03793	PASTA domain
EQ029_RS08135	PF03717	Penicillin-binding Protein dimerisation domain
EQ029_RS08135	PF00905	Penicillin binding protein transpeptidase domain
EQ029_RS08140	PF04977	Septum formation initiator
EQ029_RS08145	PF01795	MraW methylase family
EQ029_RS08150	PF02381	MraZ protein, putative antitoxin-like
EQ029_RS08155	PF10079	Bacillithiol biosynthesis BshC 
EQ029_RS08165	PF13419	Haloacid dehalogenase-like hydrolase
EQ029_RS08170	PF05480	Staphylococcus haemolytic protein
EQ029_RS08175	PF05480	Staphylococcus haemolytic protein
EQ029_RS08180	PF05480	Staphylococcus haemolytic protein
EQ029_RS08185	PF05480	Staphylococcus haemolytic protein
EQ029_RS08190	PF05480	Staphylococcus haemolytic protein
EQ029_RS08285	PF00574	Clp protease
EQ029_RS08370	PF00692	dUTPase
EQ029_RS08435	PF01381	Helix-turn-helix
EQ029_RS08460	PF14659	Phage integrase, N-terminal SAM-like domain
EQ029_RS08460	PF00589	Phage integrase family
EQ029_RS08465	PF12850	Calcineurin-like phosphoesterase superfamily domain
EQ029_RS08470	PF01725	Ham1 family
EQ029_RS08475	PF01177	Asp/Glu/Hydantoin racemase
EQ029_RS08480	PF13085	2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain
EQ029_RS08480	PF13183	4Fe-4S dicluster domain
EQ029_RS08485	PF00890	FAD binding domain
EQ029_RS08485	PF02910	Fumarate reductase flavoprotein C-term
EQ029_RS08490	PF01127	Succinate dehydrogenase/Fumarate reductase transmembrane subunit
EQ029_RS08495	PF08459	UvrC Helix-hairpin-helix N-terminal
EQ029_RS08495	PF01541	GIY-YIG catalytic domain
EQ029_RS08495	PF02151	UvrB/uvrC motif
EQ029_RS08500	PF00085	Thioredoxin
EQ029_RS08505	PF01713	Smr domain
EQ029_RS08505	PF00488	MutS domain V
EQ029_RS08510	PF02811	PHP domain
EQ029_RS08510	PF14716	Helix-hairpin-helix domain
EQ029_RS08510	PF14791	DNA polymerase beta thumb 
EQ029_RS08520	PF05164	Cell division protein ZapA
EQ029_RS08525	PF11858	Domain of unknown function (DUF3378)
EQ029_RS08525	PF01351	Ribonuclease HII
EQ029_RS08530	PF17759	Phenylalanyl tRNA synthetase beta chain CLM domain
EQ029_RS08530	PF01588	Putative tRNA binding domain
EQ029_RS08530	PF03484	tRNA synthetase B5 domain
EQ029_RS08530	PF03483	B3/4 domain
EQ029_RS08530	PF03147	Ferredoxin-fold anticodon binding domain
EQ029_RS08535	PF02912	Aminoacyl tRNA synthetase class II, N-terminal domain
EQ029_RS08535	PF01409	tRNA synthetases class II core domain (F)
EQ029_RS08540	PF08032	RNA 2'-O ribose methyltransferase substrate binding
EQ029_RS08540	PF00588	SpoU rRNA Methylase family
EQ029_RS08545	PF01783	Ribosomal L32p protein family
EQ029_RS08560	PF05636	HIGH Nucleotidyl Transferase
EQ029_RS08565	PF01467	Cytidylyltransferase-like
EQ029_RS08580	PF09902	Uncharacterized protein conserved in bacteria (DUF2129)
EQ029_RS08585	PF03009	Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family
EQ029_RS08590	PF06133	Control of competence regulator ComK, YlbF/YmcA
EQ029_RS08595	PF14504	CAP-associated N-terminal
EQ029_RS08595	PF00188	Cysteine-rich secretory protein family
EQ029_RS08605	PF01040	UbiA prenyltransferase family
EQ029_RS08610	PF02628	Cytochrome oxidase assembly protein
EQ029_RS08615	PF02785	Biotin carboxylase C-terminal domain
EQ029_RS08615	PF02436	Conserved carboxylase domain
EQ029_RS08615	PF00289	Biotin carboxylase, N-terminal domain
EQ029_RS08615	PF02786	Carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP binding domain
EQ029_RS08615	PF00364	Biotin-requiring enzyme
EQ029_RS08615	PF00682	HMGL-like
EQ029_RS08620	PF01098	Cell cycle protein
EQ029_RS08625	PF07408	Protein of unknown function (DUF1507)
EQ029_RS08635	PF09963	Uncharacterized protein conserved in bacteria (DUF2197)
EQ029_RS08640	PF00009	Elongation factor Tu GTP binding domain
EQ029_RS08640	PF14492	Elongation Factor G, domain II
EQ029_RS08640	PF00679	Elongation factor G C-terminus
EQ029_RS08640	PF03144	Elongation factor Tu domain 2
EQ029_RS08650	PF00459	Inositol monophosphatase family
EQ029_RS08655	PF06335	Protein of unknown function (DUF1054)
EQ029_RS08660	PF01566	Natural resistance-associated macrophage protein
EQ029_RS08670	PF01610	Transposase
EQ029_RS08670	PF13683	Integrase core domain
EQ029_RS08680	PF13416	Bacterial extracellular solute-binding protein
EQ029_RS08685	PF00528	Binding-protein-dependent transport system inner membrane component
EQ029_RS08690	PF00528	Binding-protein-dependent transport system inner membrane component
EQ029_RS08695	PF08402	TOBE domain
EQ029_RS08695	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS08700	PF09856	Predicted transcriptional regulator (DUF2083)
EQ029_RS08700	PF06114	IrrE N-terminal-like domain
EQ029_RS08700	PF01381	Helix-turn-helix
EQ029_RS08705	PF05256	Uncharacterised protein family (UPF0223)
EQ029_RS08710	PF02852	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
EQ029_RS08710	PF07992	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
EQ029_RS08715	PF00364	Biotin-requiring enzyme
EQ029_RS08715	PF02817	e3 binding domain
EQ029_RS08715	PF00198	2-oxoacid dehydrogenases acyltransferase (catalytic domain)
EQ029_RS08720	PF02779	Transketolase, pyrimidine binding domain
EQ029_RS08720	PF02780	Transketolase, C-terminal domain
EQ029_RS08725	PF00676	Dehydrogenase E1 component
EQ029_RS08735	PF01327	Polypeptide deformylase
EQ029_RS08740	PF07288	Protein of unknown function (DUF1447)
EQ029_RS08745	PF00753	Metallo-beta-lactamase superfamily
EQ029_RS08745	PF07521	Zn-dependent metallo-hydrolase RNA specificity domain
EQ029_RS08745	PF17770	Ribonuclease J C-terminal domain
EQ029_RS08755	PF04304	Protein of unknown function (DUF454)
EQ029_RS08760	PF02080	TrkA-C domain
EQ029_RS08760	PF02254	TrkA-N domain
EQ029_RS08765	PF02322	Cytochrome bd terminal oxidase subunit II
EQ029_RS08770	PF01654	Cytochrome bd terminal oxidase subunit I
EQ029_RS08790	PF05524	PEP-utilising enzyme, N-terminal
EQ029_RS08790	PF00391	PEP-utilising enzyme, mobile domain
EQ029_RS08790	PF02896	PEP-utilising enzyme, TIM barrel domain
EQ029_RS08795	PF00381	PTS HPr component phosphorylation site
EQ029_RS08805	PF10672	S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase
EQ029_RS08805	PF17785	PUA-like domain
EQ029_RS08825	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS08830	PF02361	Cobalt transport protein
EQ029_RS08835	PF01071	Phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp (A) domain
EQ029_RS08835	PF02843	Phosphoribosylglycinamide synthetase, C domain
EQ029_RS08835	PF02844	Phosphoribosylglycinamide synthetase, N domain
EQ029_RS08840	PF02142	MGS-like domain
EQ029_RS08840	PF01808	AICARFT/IMPCHase bienzyme
EQ029_RS08845	PF00551	Formyl transferase
EQ029_RS08850	PF00586	AIR synthase related protein, N-terminal domain
EQ029_RS08850	PF02769	AIR synthase related protein, C-terminal domain
EQ029_RS08855	PF13537	Glutamine amidotransferase domain
EQ029_RS08855	PF00156	Phosphoribosyl transferase domain
EQ029_RS08860	PF00586	AIR synthase related protein, N-terminal domain
EQ029_RS08860	PF18072	Formylglycinamide ribonucleotide amidotransferase linker domain
EQ029_RS08860	PF02769	AIR synthase related protein, C-terminal domain
EQ029_RS08870	PF02700	Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase
EQ029_RS08875	PF01259	SAICAR synthetase
EQ029_RS08880	PF02826	D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD binding domain
EQ029_RS08880	PF02222	ATP-grasp domain
EQ029_RS08880	PF17769	Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase C-terminal domain
EQ029_RS08885	PF00731	AIR carboxylase
EQ029_RS08890	PF00763	Tetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, catalytic domain
EQ029_RS08890	PF02882	Tetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, NAD(P)-binding domain
EQ029_RS08905	PF00970	Oxidoreductase FAD-binding domain
EQ029_RS08905	PF00175	Oxidoreductase NAD-binding domain 
EQ029_RS08905	PF00042	Globin
EQ029_RS08915	PF00116	Cytochrome C oxidase subunit II, periplasmic domain
EQ029_RS08915	PF02790	Cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane domain
EQ029_RS08920	PF00115	Cytochrome C and Quinol oxidase polypeptide I
EQ029_RS08925	PF00510	Cytochrome c oxidase subunit III
EQ029_RS08930	PF03626	Prokaryotic Cytochrome C oxidase subunit IV 
EQ029_RS08935	PF01156	Inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase
EQ029_RS08940	PF00144	Beta-lactamase
EQ029_RS08945	PF03816	Cell envelope-related transcriptional attenuator domain
EQ029_RS08950	PF10804	Protein of unknown function (DUF2538) 
EQ029_RS08955	PF13673	Acetyltransferase (GNAT) domain
EQ029_RS08960	PF13457	GW (Gly-Tryp) dipeptide domain
EQ029_RS08960	PF01832	Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase
EQ029_RS08975	PF01757	Acyltransferase family
EQ029_RS08980	PF00155	Aminotransferase class I and II
EQ029_RS08985	PF00378	Enoyl-CoA hydratase/isomerase
EQ029_RS08990	PF12697	Alpha/beta hydrolase family
EQ029_RS08995	PF02775	Thiamine pyrophosphate enzyme, C-terminal TPP binding domain
EQ029_RS08995	PF16582	Middle domain of thiamine pyrophosphate
EQ029_RS08995	PF02776	Thiamine pyrophosphate enzyme, N-terminal TPP binding domain
EQ029_RS09000	PF00425	chorismate binding enzyme
EQ029_RS09005	PF01040	UbiA prenyltransferase family
EQ029_RS09055	PF10437	Bacterial lipoate protein ligase C-terminus
EQ029_RS09055	PF03099	Biotin/lipoate A/B protein ligase family
EQ029_RS09060	PF09953	Uncharacterized protein conserved in bacteria (DUF2187)
EQ029_RS09080	PF02386	Cation transport protein
EQ029_RS09085	PF13180	PDZ domain
EQ029_RS09090	PF03741	Integral membrane protein TerC family
EQ029_RS09095	PF00009	Elongation factor Tu GTP binding domain
EQ029_RS09095	PF03144	Elongation factor Tu domain 2
EQ029_RS09095	PF16658	Class II release factor RF3, C-terminal domain
EQ029_RS09105	PF01225	Mur ligase family, catalytic domain
EQ029_RS09105	PF02875	Mur ligase family, glutamate ligase domain
EQ029_RS09105	PF08245	Mur ligase middle domain
EQ029_RS09110	PF04101	Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain
EQ029_RS09110	PF06925	Monogalactosyldiacylglycerol (MGDG) synthase
EQ029_RS09115	PF07690	Major Facilitator Superfamily
EQ029_RS09125	PF00756	Putative esterase
EQ029_RS09130	PF01594	AI-2E family transporter
EQ029_RS09140	PF02254	TrkA-N domain
EQ029_RS09140	PF02080	TrkA-C domain
EQ029_RS09140	PF00999	Sodium/hydrogen exchanger family
EQ029_RS09145	PF01769	Divalent cation transporter
EQ029_RS09145	PF03448	MgtE intracellular N domain
EQ029_RS09145	PF00571	CBS domain
EQ029_RS09150	PF00849	RNA pseudouridylate synthase
EQ029_RS09155	PF01513	ATP-NAD kinase
EQ029_RS09160	PF04607	Region found in RelA / SpoT proteins
EQ029_RS09170	PF01928	CYTH domain
EQ029_RS09175	PF01152	Bacterial-like globin
EQ029_RS09185	PF08439	Oligopeptidase F
EQ029_RS09185	PF01432	Peptidase family M3
EQ029_RS09195	PF05389	Negative regulator of genetic competence (MecA)
EQ029_RS09200	PF03960	ArsC family
EQ029_RS09205	PF00579	tRNA synthetases class I (W and Y)
EQ029_RS09215	PF01610	Transposase
EQ029_RS09215	PF13683	Integrase core domain
EQ029_RS09225	PF00496	Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle
EQ029_RS09230	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS09230	PF08352	Oligopeptide/dipeptide transporter, C-terminal region
EQ029_RS09235	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS09235	PF08352	Oligopeptide/dipeptide transporter, C-terminal region
EQ029_RS09240	PF12911	N-terminal TM domain of oligopeptide transport permease C
EQ029_RS09240	PF00528	Binding-protein-dependent transport system inner membrane component
EQ029_RS09245	PF00528	Binding-protein-dependent transport system inner membrane component
EQ029_RS09255	PF00109	Beta-ketoacyl synthase, N-terminal domain
EQ029_RS09255	PF02801	Beta-ketoacyl synthase, C-terminal domain
EQ029_RS09260	PF08541	3-Oxoacyl-[acyl-carrier-protein (ACP)] synthase III C terminal  
EQ029_RS09260	PF08545	3-Oxoacyl-[acyl-carrier-protein (ACP)] synthase III
EQ029_RS09270	PF17871	AAA lid domain
EQ029_RS09270	PF10431	C-terminal, D2-small domain, of ClpB protein 
EQ029_RS09270	PF07724	AAA domain (Cdc48 subfamily)
EQ029_RS09270	PF00004	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)
EQ029_RS09270	PF02861	Clp amino terminal domain, pathogenicity island component
EQ029_RS09275	PF01757	Acyltransferase family
EQ029_RS09280	PF01883	Iron-sulfur cluster assembly protein
EQ029_RS09290	PF07992	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
EQ029_RS09290	PF02852	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
EQ029_RS09295	PF07457	Protein of unknown function (DUF1516)
EQ029_RS09300	PF01557	Fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family
EQ029_RS09305	PF00580	UvrD/REP helicase N-terminal domain
EQ029_RS09305	PF13361	UvrD-like helicase C-terminal domain
EQ029_RS09305	PF12705	PD-(D/E)XK nuclease superfamily
EQ029_RS09310	PF12705	PD-(D/E)XK nuclease superfamily
EQ029_RS09310	PF13361	UvrD-like helicase C-terminal domain
EQ029_RS09315	PF10502	Signal peptidase, peptidase S26 
EQ029_RS09320	PF10502	Signal peptidase, peptidase S26 
EQ029_RS09325	PF09335	SNARE associated Golgi protein
EQ029_RS09330	PF00342	Phosphoglucose isomerase
EQ029_RS09335	PF00764	Arginosuccinate synthase
EQ029_RS09340	PF14698	Argininosuccinate lyase C-terminal
EQ029_RS09340	PF00206	Lyase
EQ029_RS09345	PF03009	Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family
EQ029_RS09350	PF00208	Glutamate/Leucine/Phenylalanine/Valine dehydrogenase
EQ029_RS09350	PF02812	Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerisation domain
EQ029_RS09355	PF00202	Aminotransferase class-III
EQ029_RS09360	PF00724	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
EQ029_RS09370	PF00575	S1 RNA binding domain
EQ029_RS09375	PF00160	Cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/CLD
EQ029_RS09385	PF00361	Proton-conducting membrane transporter
EQ029_RS09385	PF13244	Domain of unknown function (DUF4040)
EQ029_RS09385	PF00662	NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 N-terminus
EQ029_RS09390	PF04039	Domain related to MnhB subunit of Na+/H+ antiporter
EQ029_RS09395	PF00420	NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 4L
EQ029_RS09400	PF00361	Proton-conducting membrane transporter
EQ029_RS09405	PF01899	Na+/H+ ion antiporter subunit
EQ029_RS09410	PF04066	Multiple resistance and pH regulation protein F (MrpF / PhaF)
EQ029_RS09415	PF03334	Na+/H+ antiporter subunit
EQ029_RS09425	PF03061	Thioesterase superfamily
EQ029_RS09430	PF13726	Na+-H+ antiporter family
EQ029_RS09430	PF03553	Na+/H+ antiporter family
EQ029_RS09435	PF02789	Cytosol aminopeptidase family, N-terminal domain
EQ029_RS09435	PF00883	Cytosol aminopeptidase family, catalytic domain
EQ029_RS09440	PF07992	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
EQ029_RS09445	PF01521	Iron-sulphur cluster biosynthesis
EQ029_RS09450	PF07293	Protein of unknown function (DUF1450)
EQ029_RS09455	PF07992	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
EQ029_RS09460	PF07315	Protein of unknown function (DUF1462)
EQ029_RS09465	PF01106	NifU-like domain
EQ029_RS09470	PF04914	DltD protein
EQ029_RS09475	PF00550	Phosphopantetheine attachment site
EQ029_RS09480	PF03062	MBOAT, membrane-bound O-acyltransferase family
EQ029_RS09485	PF00501	AMP-binding enzyme
EQ029_RS09485	PF13193	AMP-binding enzyme C-terminal domain
EQ029_RS09495	PF02826	D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD binding domain
EQ029_RS09495	PF00389	D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, catalytic domain
EQ029_RS09500	PF13344	Haloacid dehalogenase-like hydrolase
EQ029_RS09505	PF01934	Protein of unknown function DUF86
EQ029_RS09515	PF06265	Protein of unknown function (DUF1027)
EQ029_RS09520	PF16881	N-terminal domain of lipoyl synthase of Radical_SAM family
EQ029_RS09520	PF04055	Radical SAM superfamily
EQ029_RS09525	PF02872	5'-nucleotidase, C-terminal domain
EQ029_RS09530	PF01925	Sulfite exporter TauE/SafE
EQ029_RS09535	PF01904	Protein of unknown function DUF72
EQ029_RS09540	PF03060	Nitronate monooxygenase
EQ029_RS09550	PF01458	Uncharacterized protein family (UPF0051)
EQ029_RS09555	PF01592	NifU-like N terminal domain
EQ029_RS09560	PF00266	Aminotransferase class-V
EQ029_RS09565	PF01458	Uncharacterized protein family (UPF0051)
EQ029_RS09570	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS09585	PF05532	CsbD-like
EQ029_RS09590	PF03180	NLPA lipoprotein
EQ029_RS09595	PF00528	Binding-protein-dependent transport system inner membrane component
EQ029_RS09600	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS09600	PF09383	NIL domain
EQ029_RS09610	PF01751	Toprim domain
EQ029_RS09615	PF01597	Glycine cleavage H-protein
EQ029_RS09620	PF03960	ArsC family
EQ029_RS09625	PF00085	Thioredoxin
EQ029_RS09635	PF01487	Type I 3-dehydroquinase
EQ029_RS09640	PF02566	OsmC-like protein
EQ029_RS09650	PF01810	LysE type translocator
EQ029_RS09655	PF00300	Histidine phosphatase superfamily (branch 1)
EQ029_RS09695	PF00583	Acetyltransferase (GNAT) family
EQ029_RS09700	PF05908	Poly-gamma-glutamate hydrolase
EQ029_RS09730	PF01668	SmpB protein
EQ029_RS09735	PF00575	S1 RNA binding domain
EQ029_RS09735	PF00773	RNB domain
EQ029_RS09735	PF08206	Ribonuclease B OB domain
EQ029_RS09735	PF17876	Cold shock domain
EQ029_RS09740	PF12146	Serine aminopeptidase, S33
EQ029_RS09745	PF03840	Preprotein translocase SecG subunit
EQ029_RS09755	PF03952	Enolase, N-terminal domain
EQ029_RS09755	PF00113	Enolase, C-terminal TIM barrel domain
EQ029_RS09760	PF06415	BPG-independent PGAM N-terminus (iPGM_N)
EQ029_RS09760	PF01676	Metalloenzyme superfamily
EQ029_RS09765	PF00121	Triosephosphate isomerase
EQ029_RS09770	PF00162	Phosphoglycerate kinase
EQ029_RS09775	PF00044	Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase, NAD binding domain
EQ029_RS09775	PF02800	Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase, C-terminal domain
EQ029_RS09780	PF04198	Putative sugar-binding domain
EQ029_RS09800	PF08338	Domain of unknown function (DUF1731)
EQ029_RS09800	PF01370	NAD dependent epimerase/dehydratase family
EQ029_RS09810	PF00574	Clp protease
EQ029_RS09820	PF02650	WhiA C-terminal HTH domain
EQ029_RS09820	PF14527	WhiA LAGLIDADG-like domain
EQ029_RS09820	PF10298	WhiA N-terminal LAGLIDADG-like domain
EQ029_RS09825	PF01933	Uncharacterised protein family UPF0052
EQ029_RS09830	PF03668	P-loop ATPase protein family
EQ029_RS09835	PF07992	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
EQ029_RS09845	PF14602	Hexapeptide repeat of succinyl-transferase
EQ029_RS09850	PF01790	Prolipoprotein diacylglyceryl transferase
EQ029_RS09855	PF07475	HPr Serine kinase C-terminal domain
EQ029_RS09855	PF02603	HPr Serine kinase N terminus
EQ029_RS09860	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS09860	PF17755	UvrA DNA-binding domain
EQ029_RS09860	PF17760	UvrA interaction domain
EQ029_RS09865	PF12344	Ultra-violet resistance protein B
EQ029_RS09865	PF02151	UvrB/uvrC motif
EQ029_RS09865	PF00271	Helicase conserved C-terminal domain
EQ029_RS09865	PF17757	UvrB interaction domain
EQ029_RS09865	PF04851	Type III restriction enzyme, res subunit
EQ029_RS09880	PF00106	short chain dehydrogenase
EQ029_RS09885	PF01476	LysM domain
EQ029_RS09885	PF05257	CHAP domain
EQ029_RS09895	PF01043	SecA preprotein cross-linking domain
EQ029_RS09895	PF07516	SecA Wing and Scaffold domain
EQ029_RS09895	PF07517	SecA DEAD-like domain
EQ029_RS09895	PF02810	SEC-C motif
EQ029_RS09900	PF16321	Sigma 54 modulation/S30EA ribosomal protein C terminus
EQ029_RS09900	PF02482	Sigma 54 modulation protein / S30EA ribosomal protein
EQ029_RS09915	PF02645	Uncharacterised protein, DegV family COG1307
EQ029_RS09920	PF01205	Uncharacterized protein family UPF0029
EQ029_RS09920	PF09186	Domain of unknown function (DUF1949)
EQ029_RS09925	PF00953	Glycosyl transferase family 4
EQ029_RS09930	PF00990	Diguanylate cyclase, GGDEF domain
EQ029_RS09945	PF01546	Peptidase family M20/M25/M40
EQ029_RS09945	PF07687	Peptidase dimerisation domain
EQ029_RS09950	PF02595	Glycerate kinase family
EQ029_RS09970	PF02873	UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase, C-terminal domain
EQ029_RS09970	PF01565	FAD binding domain 
EQ029_RS09980	PF01497	Periplasmic binding protein
EQ029_RS09985	PF01497	Periplasmic binding protein
EQ029_RS09990	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS09995	PF01032	FecCD transport family
EQ029_RS10000	PF01032	FecCD transport family
EQ029_RS10005	PF00268	Ribonucleotide reductase, small chain
EQ029_RS10010	PF08343	Ribonucleotide reductase N-terminal
EQ029_RS10010	PF00317	Ribonucleotide reductase, all-alpha domain
EQ029_RS10010	PF02867	Ribonucleotide reductase, barrel domain
EQ029_RS10015	PF07972	NrdI Flavodoxin like 
EQ029_RS10025	PF14489	QueF-like protein
EQ029_RS10030	PF00854	POT family
EQ029_RS10035	PF00781	Diacylglycerol kinase catalytic domain
EQ029_RS10040	PF06941	5' nucleotidase, deoxy (Pyrimidine), cytosolic type C protein (NT5C)
EQ029_RS10045	PF00155	Aminotransferase class I and II
EQ029_RS10050	PF00854	POT family
EQ029_RS10055	PF00528	Binding-protein-dependent transport system inner membrane component
EQ029_RS10060	PF00571	CBS domain
EQ029_RS10060	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS10065	PF00270	DEAD/DEAH box helicase
EQ029_RS10065	PF00570	HRDC domain
EQ029_RS10065	PF16124	RecQ zinc-binding
EQ029_RS10065	PF09382	RQC domain
EQ029_RS10065	PF00271	Helicase conserved C-terminal domain
EQ029_RS10070	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS10070	PF16326	ABC transporter C-terminal domain
EQ029_RS10070	PF12848	ABC transporter
EQ029_RS10075	PF02535	ZIP Zinc transporter
EQ029_RS10080	PF00884	Sulfatase
EQ029_RS10085	PF02626	Carboxyltransferase domain, subdomain A and B 
EQ029_RS10090	PF02682	Carboxyltransferase domain, subdomain C and D
EQ029_RS10105	PF04715	Anthranilate synthase component I, N terminal region
EQ029_RS10105	PF00425	chorismate binding enzyme
EQ029_RS10110	PF00117	Glutamine amidotransferase class-I
EQ029_RS10110	PF00591	Glycosyl transferase family, a/b domain
EQ029_RS10110	PF02885	Glycosyl transferase family, helical bundle domain
EQ029_RS10115	PF06508	Queuosine biosynthesis protein QueC
EQ029_RS10120	PF01242	6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase
EQ029_RS10125	PF04055	Radical SAM superfamily
EQ029_RS10135	PF00535	Glycosyl transferase family 2
EQ029_RS10140	PF13683	Integrase core domain
EQ029_RS10140	PF01610	Transposase
EQ029_RS10145	PF00248	Aldo/keto reductase family
EQ029_RS10150	PF01595	Cyclin M transmembrane N-terminal domain
EQ029_RS10150	PF03471	Transporter associated domain
EQ029_RS10150	PF00571	CBS domain
EQ029_RS10160	PF00294	pfkB family carbohydrate kinase
EQ029_RS10165	PF08220	DeoR-like helix-turn-helix domain
EQ029_RS10165	PF00455	DeoR C terminal sensor domain
EQ029_RS10170	PF04073	Aminoacyl-tRNA editing domain
EQ029_RS10180	PF07690	Major Facilitator Superfamily
EQ029_RS10200	PF03441	FAD binding domain of DNA photolyase
EQ029_RS10200	PF00875	DNA photolyase
EQ029_RS10205	PF00939	Sodium:sulfate symporter transmembrane region
EQ029_RS10215	PF07683	Cobalamin synthesis protein cobW C-terminal domain
EQ029_RS10215	PF02492	CobW/HypB/UreG, nucleotide-binding domain
EQ029_RS10220	PF01047	MarR family
EQ029_RS10225	PF01610	Transposase
EQ029_RS10225	PF13683	Integrase core domain
EQ029_RS10230	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS10230	PF00664	ABC transporter transmembrane region
EQ029_RS10235	PF00664	ABC transporter transmembrane region
EQ029_RS10235	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS10240	PF02673	Bacitracin resistance protein BacA
EQ029_RS10250	PF02639	Uncharacterized BCR, YaiI/YqxD family COG1671
EQ029_RS10255	PF03641	Possible lysine decarboxylase
EQ029_RS10260	PF13302	Acetyltransferase (GNAT) domain
EQ029_RS10275	PF00583	Acetyltransferase (GNAT) family
EQ029_RS10285	PF04306	Protein of unknown function (DUF456)
EQ029_RS10290	PF07690	Major Facilitator Superfamily
EQ029_RS10295	PF03466	LysR substrate binding domain
EQ029_RS10295	PF00126	Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
EQ029_RS10305	PF01717	Cobalamin-independent synthase, Catalytic domain
EQ029_RS10315	PF01709	Transcriptional regulator
EQ029_RS10335	PF01476	LysM domain
EQ029_RS10335	PF05257	CHAP domain
EQ029_RS10340	PF01384	Phosphate transporter family
EQ029_RS10345	PF01865	Protein of unknown function DUF47
EQ029_RS10350	PF02687	FtsX-like permease family
EQ029_RS10355	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS10360	PF02518	Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase
EQ029_RS10365	PF00072	Response regulator receiver domain
EQ029_RS10365	PF00486	Transcriptional regulatory protein, C terminal
EQ029_RS10370	PF01370	NAD dependent epimerase/dehydratase family
EQ029_RS10380	PF07859	alpha/beta hydrolase fold
EQ029_RS10395	PF03610	PTS system fructose IIA component
EQ029_RS10400	PF02734	DAK2 domain
EQ029_RS10405	PF02733	Dak1 domain
EQ029_RS10410	PF01032	FecCD transport family
EQ029_RS10415	PF01032	FecCD transport family
EQ029_RS10420	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS10425	PF10035	Uncharacterized protein conserved in bacteria (DUF2179)
EQ029_RS10425	PF02588	Uncharacterised 5xTM membrane BCR, YitT family COG1284
EQ029_RS10430	PF07662	Na+ dependent nucleoside transporter C-terminus
EQ029_RS10430	PF01773	Na+ dependent nucleoside transporter N-terminus
EQ029_RS10435	PF04464	CDP-Glycerol:Poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase 
EQ029_RS10435	PF00535	Glycosyl transferase family 2
EQ029_RS10445	PF00664	ABC transporter transmembrane region
EQ029_RS10445	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS10450	PF00768	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase
EQ029_RS10450	PF07943	Penicillin-binding protein 5, C-terminal domain
EQ029_RS10455	PF01467	Cytidylyltransferase-like
EQ029_RS10460	PF00535	Glycosyl transferase family 2
EQ029_RS10465	PF04464	CDP-Glycerol:Poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase 
EQ029_RS10470	PF01061	ABC-2 type transporter
EQ029_RS10475	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS10480	PF03808	Glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF family
EQ029_RS10490	PF01325	Iron dependent repressor, N-terminal DNA binding domain
EQ029_RS10490	PF18357	Diphteria toxin repressor SH3 domain
EQ029_RS10490	PF02742	Iron dependent repressor, metal binding and dimerisation domain
EQ029_RS10495	PF00999	Sodium/hydrogen exchanger family
EQ029_RS10500	PF07687	Peptidase dimerisation domain
EQ029_RS10500	PF01546	Peptidase family M20/M25/M40
EQ029_RS10515	PF03334	Na+/H+ antiporter subunit
EQ029_RS10520	PF04066	Multiple resistance and pH regulation protein F (MrpF / PhaF)
EQ029_RS10525	PF01899	Na+/H+ ion antiporter subunit
EQ029_RS10530	PF00361	Proton-conducting membrane transporter
EQ029_RS10535	PF00420	NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 4L
EQ029_RS10540	PF04039	Domain related to MnhB subunit of Na+/H+ antiporter
EQ029_RS10545	PF13244	Domain of unknown function (DUF4040)
EQ029_RS10545	PF00361	Proton-conducting membrane transporter
EQ029_RS10545	PF00662	NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 N-terminus
EQ029_RS10550	PF00589	Phage integrase family
EQ029_RS10550	PF02899	Phage integrase, N-terminal SAM-like domain
EQ029_RS10580	PF00561	alpha/beta hydrolase fold
EQ029_RS10600	PF13419	Haloacid dehalogenase-like hydrolase
EQ029_RS10605	PF01032	FecCD transport family
EQ029_RS10610	PF01497	Periplasmic binding protein
EQ029_RS10625	PF00730	HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein
EQ029_RS10625	PF10576	Iron-sulfur binding domain of endonuclease III
EQ029_RS10625	PF00633	Helix-hairpin-helix motif
EQ029_RS10630	PF00750	tRNA synthetases class I (R)
EQ029_RS10630	PF05746	DALR anticodon binding domain
EQ029_RS10630	PF03485	Arginyl tRNA synthetase N terminal domain
EQ029_RS10665	PF08741	YwhD family
EQ029_RS10670	PF01966	HD domain
EQ029_RS10680	PF03358	NADPH-dependent FMN reductase
EQ029_RS10685	PF00248	Aldo/keto reductase family
EQ029_RS10695	PF07992	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
EQ029_RS10695	PF02852	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
EQ029_RS10700	PF00313	'Cold-shock' DNA-binding domain
EQ029_RS10705	PF07293	Protein of unknown function (DUF1450)
EQ029_RS10710	PF08544	GHMP kinases C terminal 
EQ029_RS10710	PF00288	GHMP kinases N terminal domain
EQ029_RS10720	PF08544	GHMP kinases C terminal 
EQ029_RS10720	PF00288	GHMP kinases N terminal domain
EQ029_RS10725	PF03099	Biotin/lipoate A/B protein ligase family
EQ029_RS10730	PF01515	Phosphate acetyl/butaryl transferase
EQ029_RS10735	PF06778	Chlorite dismutase
EQ029_RS10740	PF06738	Putative threonine/serine exporter
EQ029_RS10755	PF13520	Amino acid permease
EQ029_RS10760	PF04241	Protein of unknown function (DUF423)
EQ029_RS10770	PF03167	Uracil DNA glycosylase superfamily
EQ029_RS10775	PF08543	Phosphomethylpyrimidine kinase
EQ029_RS10780	PF07690	Major Facilitator Superfamily
EQ029_RS10795	PF02803	Thiolase, C-terminal domain
EQ029_RS10795	PF00108	Thiolase, N-terminal domain
EQ029_RS10800	PF13193	AMP-binding enzyme C-terminal domain
EQ029_RS10800	PF00501	AMP-binding enzyme
EQ029_RS10805	PF01380	SIS domain
EQ029_RS10810	PF00215	Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
EQ029_RS10820	PF02585	GlcNAc-PI de-N-acetylase
EQ029_RS10825	PF02649	Type I GTP cyclohydrolase folE2
EQ029_RS10835	PF01225	Mur ligase family, catalytic domain
EQ029_RS10835	PF08245	Mur ligase middle domain
EQ029_RS10835	PF02875	Mur ligase family, glutamate ligase domain
EQ029_RS10850	PF10425	C-terminus of bacterial fibrinogen-binding adhesin
EQ029_RS10850	PF17210	SdrD B-like domain
EQ029_RS10850	PF04650	YSIRK type signal peptide
EQ029_RS10850	PF17961	Bacterial Ig domain
EQ029_RS10850	PF00746	LPXTG cell wall anchor motif
EQ029_RS10855	PF17210	SdrD B-like domain
EQ029_RS10855	PF00746	LPXTG cell wall anchor motif
EQ029_RS10855	PF10425	C-terminus of bacterial fibrinogen-binding adhesin
EQ029_RS10855	PF17961	Bacterial Ig domain
EQ029_RS10855	PF04650	YSIRK type signal peptide
EQ029_RS10860	PF04650	YSIRK type signal peptide
EQ029_RS10860	PF17041	E domain
EQ029_RS10860	PF00746	LPXTG cell wall anchor motif
EQ029_RS10860	PF07501	G5 domain
EQ029_RS10865	PF03358	NADPH-dependent FMN reductase
EQ029_RS10875	PF14437	MafB19-like deaminase
EQ029_RS10880	PF01712	Deoxynucleoside kinase
EQ029_RS10885	PF01712	Deoxynucleoside kinase
EQ029_RS10890	PF13419	Haloacid dehalogenase-like hydrolase
EQ029_RS10905	PF00583	Acetyltransferase (GNAT) family
EQ029_RS10930	PF01063	Amino-transferase class IV
EQ029_RS10935	PF01370	NAD dependent epimerase/dehydratase family
EQ029_RS10940	PF00149	Calcineurin-like phosphoesterase
EQ029_RS10940	PF02872	5'-nucleotidase, C-terminal domain
EQ029_RS10945	PF02423	Ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin family
EQ029_RS10950	PF00293	NUDIX domain
EQ029_RS10950	PF13344	Haloacid dehalogenase-like hydrolase
EQ029_RS10960	PF00155	Aminotransferase class I and II
EQ029_RS10965	PF01546	Peptidase family M20/M25/M40
EQ029_RS10965	PF07687	Peptidase dimerisation domain
EQ029_RS10970	PF00009	Elongation factor Tu GTP binding domain
EQ029_RS10970	PF03144	Elongation factor Tu domain 2
EQ029_RS10970	PF03143	Elongation factor Tu C-terminal domain
EQ029_RS10975	PF00679	Elongation factor G C-terminus
EQ029_RS10975	PF14492	Elongation Factor G, domain II
EQ029_RS10975	PF03764	Elongation factor G, domain IV
EQ029_RS10975	PF00009	Elongation factor Tu GTP binding domain
EQ029_RS10975	PF03144	Elongation factor Tu domain 2
EQ029_RS10980	PF00177	Ribosomal protein S7p/S5e
EQ029_RS10985	PF00164	Ribosomal protein S12/S23
EQ029_RS10990	PF01248	Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family
EQ029_RS10995	PF00623	RNA polymerase Rpb1, domain 2
EQ029_RS10995	PF04997	RNA polymerase Rpb1, domain 1
EQ029_RS10995	PF05000	RNA polymerase Rpb1, domain 4
EQ029_RS10995	PF04983	RNA polymerase Rpb1, domain 3
EQ029_RS10995	PF04998	RNA polymerase Rpb1, domain 5
EQ029_RS11000	PF00562	RNA polymerase Rpb2, domain 6
EQ029_RS11000	PF04563	RNA polymerase beta subunit
EQ029_RS11000	PF04561	RNA polymerase Rpb2, domain 2
EQ029_RS11000	PF04560	RNA polymerase Rpb2, domain 7
EQ029_RS11000	PF10385	RNA polymerase beta subunit external 1 domain
EQ029_RS11000	PF04565	RNA polymerase Rpb2, domain 3
EQ029_RS11005	PF05175	Methyltransferase small domain
EQ029_RS11010	PF00542	Ribosomal protein L7/L12 C-terminal domain
EQ029_RS11010	PF16320	Ribosomal protein L7/L12 dimerisation domain
EQ029_RS11015	PF00466	Ribosomal protein L10
EQ029_RS11020	PF13683	Integrase core domain
EQ029_RS11020	PF01610	Transposase
EQ029_RS11025	PF00687	Ribosomal protein L1p/L10e family
EQ029_RS11030	PF00298	Ribosomal protein L11, RNA binding domain
EQ029_RS11030	PF03946	Ribosomal protein L11, N-terminal domain
EQ029_RS11035	PF02357	Transcription termination factor nusG
EQ029_RS11040	PF00584	SecE/Sec61-gamma subunits of protein translocation complex
EQ029_RS11045	PF00471	Ribosomal protein L33
EQ029_RS11055	PF05991	YacP-like NYN domain
EQ029_RS11060	PF08032	RNA 2'-O ribose methyltransferase substrate binding
EQ029_RS11060	PF00588	SpoU rRNA Methylase family
EQ029_RS11065	PF00636	Ribonuclease III domain
EQ029_RS11070	PF09190	DALR domain
EQ029_RS11070	PF01406	tRNA synthetases class I (C) catalytic domain
EQ029_RS11075	PF00132	Bacterial transferase hexapeptide (six repeats)
EQ029_RS11080	PF00749	tRNA synthetases class I (E and Q), catalytic domain
EQ029_RS11090	PF18073	Rubredoxin metal binding domain
EQ029_RS11095	PF10431	C-terminal, D2-small domain, of ClpB protein 
EQ029_RS11095	PF02861	Clp amino terminal domain, pathogenicity island component
EQ029_RS11095	PF00004	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)
EQ029_RS11095	PF17871	AAA lid domain
EQ029_RS11095	PF07724	AAA domain (Cdc48 subfamily)
EQ029_RS11100	PF00217	ATP:guanido phosphotransferase, C-terminal catalytic domain
EQ029_RS11105	PF02151	UvrB/uvrC motif
EQ029_RS11110	PF17727	CtsR C-terminal dimerization domain
EQ029_RS11110	PF05848	CtsR N-terminal HTH domain
EQ029_RS11115	PF07662	Na+ dependent nucleoside transporter C-terminus
EQ029_RS11115	PF01773	Na+ dependent nucleoside transporter N-terminus
EQ029_RS11120	PF01174	SNO glutamine amidotransferase family
EQ029_RS11125	PF01680	SOR/SNZ family
EQ029_RS11130	PF00155	Aminotransferase class I and II
EQ029_RS11130	PF00392	Bacterial regulatory proteins, gntR family
EQ029_RS11135	PF07681	DoxX
EQ029_RS11220	PF01336	OB-fold nucleic acid binding domain
EQ029_RS11220	PF00152	tRNA synthetases class II (D, K and N) 
EQ029_RS11225	PF01288	7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase (HPPK)
EQ029_RS11230	PF02152	Dihydroneopterin aldolase
EQ029_RS11235	PF00809	Pterin binding enzyme
EQ029_RS11240	PF00291	Pyridoxal-phosphate dependent enzyme
EQ029_RS11245	PF01430	Hsp33 protein
EQ029_RS11250	PF01434	Peptidase family M41
EQ029_RS11250	PF06480	FtsH Extracellular
EQ029_RS11250	PF17862	AAA+ lid domain
EQ029_RS11250	PF00004	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)
EQ029_RS11255	PF00156	Phosphoribosyl transferase domain
EQ029_RS11260	PF11734	TilS substrate C-terminal domain
EQ029_RS11260	PF01171	PP-loop family
EQ029_RS11265	PF00575	S1 RNA binding domain
EQ029_RS11275	PF01479	S4 domain
EQ029_RS11280	PF03819	MazG nucleotide pyrophosphohydrolase domain
EQ029_RS11280	PF00590	Tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) Methylases
EQ029_RS11285	PF14667	Polysaccharide biosynthesis C-terminal domain
EQ029_RS11285	PF01943	Polysaccharide biosynthesis protein
EQ029_RS11290	PF02559	CarD-like/TRCF domain
EQ029_RS11290	PF00271	Helicase conserved C-terminal domain
EQ029_RS11290	PF00270	DEAD/DEAH box helicase
EQ029_RS11290	PF17757	UvrB interaction domain
EQ029_RS11290	PF03461	TRCF domain
EQ029_RS11295	PF01195	Peptidyl-tRNA hydrolase
EQ029_RS11300	PF01386	Ribosomal L25p family
EQ029_RS11300	PF14693	Ribosomal protein TL5, C-terminal domain
EQ029_RS11305	PF14572	Phosphoribosyl synthetase-associated domain
EQ029_RS11305	PF13793	N-terminal domain of ribose phosphate pyrophosphokinase
EQ029_RS11310	PF00132	Bacterial transferase hexapeptide (six repeats)
EQ029_RS11310	PF00483	Nucleotidyl transferase
EQ029_RS11315	PF04026	SpoVG
EQ029_RS11320	PF01042	Endoribonuclease L-PSP
EQ029_RS11325	PF09182	Bacterial purine repressor, N-terminal
EQ029_RS11325	PF00156	Phosphoribosyl transferase domain
EQ029_RS11330	PF08544	GHMP kinases C terminal 
EQ029_RS11330	PF00288	GHMP kinases N terminal domain
EQ029_RS11335	PF06257	Biofilm formation stimulator VEG
EQ029_RS11340	PF00398	Ribosomal RNA adenine dimethylase
EQ029_RS11345	PF13331	Domain of unknown function (DUF4093)
EQ029_RS11345	PF01751	Toprim domain
EQ029_RS11350	PF01026	TatD related DNase
EQ029_RS11355	PF01588	Putative tRNA binding domain
EQ029_RS11355	PF09334	tRNA synthetases class I (M)
EQ029_RS11355	PF08264	Anticodon-binding domain of tRNA
EQ029_RS11360	PF00590	Tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) Methylases
EQ029_RS11365	PF01541	GIY-YIG catalytic domain
EQ029_RS11370	PF05175	Methyltransferase small domain
EQ029_RS11375	PF06156	Initiation control protein YabA
EQ029_RS11380	PF04468	PSP1 C-terminal conserved region
EQ029_RS11385	PF09115	DNA polymerase III, delta subunit, C terminal
EQ029_RS11390	PF06153	Cyclic-di-AMP receptor
EQ029_RS11395	PF02223	Thymidylate kinase
EQ029_RS11400	PF01276	Orn/Lys/Arg decarboxylase, major domain
EQ029_RS11400	PF03711	Orn/Lys/Arg decarboxylase, C-terminal domain
EQ029_RS11405	PF13302	Acetyltransferase (GNAT) domain
EQ029_RS11425	PF02132	RecR protein
EQ029_RS11425	PF13662	Toprim domain
EQ029_RS11430	PF02575	YbaB/EbfC DNA-binding family
EQ029_RS11435	PF12169	DNA polymerase III subunits gamma and tau domain III
EQ029_RS11450	PF00392	Bacterial regulatory proteins, gntR family
EQ029_RS11450	PF07702	UTRA domain
EQ029_RS11455	PF16657	Maltogenic Amylase, C-terminal domain
EQ029_RS11455	PF00128	Alpha amylase, catalytic domain
EQ029_RS11460	PF02378	Phosphotransferase system, EIIC 
EQ029_RS11460	PF00367	phosphotransferase system, EIIB
EQ029_RS11470	PF07992	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
EQ029_RS11470	PF14691	Dihydroprymidine dehydrogenase domain II, 4Fe-4S cluster
EQ029_RS11475	PF04898	Glutamate synthase central domain
EQ029_RS11475	PF01493	GXGXG motif
EQ029_RS11475	PF01645	Conserved region in glutamate synthase
EQ029_RS11475	PF00310	Glutamine amidotransferases class-II
EQ029_RS11500	PF00293	NUDIX domain
EQ029_RS11510	PF05257	CHAP domain
EQ029_RS11510	PF01476	LysM domain
EQ029_RS11515	PF01053	Cys/Met metabolism PLP-dependent enzyme
EQ029_RS11520	PF00291	Pyridoxal-phosphate dependent enzyme
EQ029_RS11535	PF00209	Sodium:neurotransmitter symporter family
EQ029_RS11550	PF12146	Serine aminopeptidase, S33
EQ029_RS11560	PF01569	PAP2 superfamily
EQ029_RS11570	PF10057	Uncharacterized conserved protein (DUF2294)
EQ029_RS11575	PF10070	Uncharacterized protein conserved in bacteria (DUF2309)
EQ029_RS11580	PF00361	Proton-conducting membrane transporter
EQ029_RS11580	PF00662	NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 N-terminus
EQ029_RS11590	PF06993	Protein of unknown function (DUF1304)
EQ029_RS11600	PF13673	Acetyltransferase (GNAT) domain
EQ029_RS11605	PF02386	Cation transport protein
EQ029_RS11615	PF03592	Terminase small subunit 
EQ029_RS11615	PF10668	Phage terminase small subunit
EQ029_RS11690	PF14659	Phage integrase, N-terminal SAM-like domain
EQ029_RS11690	PF00589	Phage integrase family
EQ029_RS11695	PF00117	Glutamine amidotransferase class-I
EQ029_RS11695	PF00958	GMP synthase C terminal domain
EQ029_RS11700	PF00478	IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
EQ029_RS11700	PF00571	CBS domain
EQ029_RS11705	PF00860	Permease family
EQ029_RS11715	PF11181	Heat induced stress protein YflT
EQ029_RS11730	PF00375	Sodium:dicarboxylate symporter family
EQ029_RS11735	PF00881	Nitroreductase family
EQ029_RS11745	PF00578	AhpC/TSA family
EQ029_RS11750	PF07992	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
EQ029_RS11750	PF13192	Thioredoxin domain
EQ029_RS11760	PF00300	Histidine phosphatase superfamily (branch 1)
EQ029_RS11765	PF01810	LysE type translocator
EQ029_RS11830	PF13977	BetI-type transcriptional repressor, C-terminal
EQ029_RS11830	PF00440	Bacterial regulatory proteins, tetR family
EQ029_RS11835	PF00239	Resolvase, N terminal domain
EQ029_RS11835	PF02796	Helix-turn-helix domain of resolvase
EQ029_RS11840	PF00171	Aldehyde dehydrogenase family
EQ029_RS11850	PF00724	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
EQ029_RS11865	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS11895	PF06039	Malate:quinone oxidoreductase (Mqo)
EQ029_RS11900	PF01638	HxlR-like helix-turn-helix
EQ029_RS11905	PF00215	Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
EQ029_RS11910	PF01965	DJ-1/PfpI family
EQ029_RS11955	PF01084	Ribosomal protein S18
EQ029_RS11960	PF00436	Single-strand binding protein family
EQ029_RS11965	PF01250	Ribosomal protein S6
EQ029_RS11980	PF01926	50S ribosome-binding GTPase
EQ029_RS11980	PF06071	Protein of unknown function (DUF933)
EQ029_RS11985	PF06107	Bacterial protein of unknown function (DUF951)
EQ029_RS11990	PF00924	Mechanosensitive ion channel
EQ029_RS11995	PF02195	ParB-like nuclease domain
EQ029_RS11995	PF17762	HTH domain found in ParB protein
EQ029_RS12000	PF01053	Cys/Met metabolism PLP-dependent enzyme
EQ029_RS12005	PF01053	Cys/Met metabolism PLP-dependent enzyme
EQ029_RS12010	PF02574	Homocysteine S-methyltransferase
EQ029_RS12010	PF02219	Methylenetetrahydrofolate reductase
EQ029_RS12015	PF01717	Cobalamin-independent synthase, Catalytic domain
EQ029_RS12015	PF08267	Cobalamin-independent synthase, N-terminal domain
EQ029_RS12030	PF12848	ABC transporter
EQ029_RS12030	PF16326	ABC transporter C-terminal domain
EQ029_RS12030	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS12040	PF00903	Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily
EQ029_RS12050	PF00703	Glycosyl hydrolases family 2
EQ029_RS12050	PF02836	Glycosyl hydrolases family 2, TIM barrel domain
EQ029_RS12050	PF02837	Glycosyl hydrolases family 2, sugar binding domain
EQ029_RS12055	PF00106	short chain dehydrogenase
EQ029_RS12060	PF03786	D-mannonate dehydratase (UxuA)
EQ029_RS12065	PF02614	Glucuronate isomerase
EQ029_RS12075	PF00294	pfkB family carbohydrate kinase
EQ029_RS12085	PF12833	Helix-turn-helix domain
EQ029_RS12095	PF00933	Glycosyl hydrolase family 3 N terminal domain
EQ029_RS12100	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS12100	PF00571	CBS domain
EQ029_RS12105	PF00528	Binding-protein-dependent transport system inner membrane component
EQ029_RS12110	PF04069	Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
EQ029_RS12115	PF13302	Acetyltransferase (GNAT) domain
EQ029_RS12130	PF10502	Signal peptidase, peptidase S26 
EQ029_RS12140	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS12145	PF02687	FtsX-like permease family
EQ029_RS12155	PF04650	YSIRK type signal peptide
EQ029_RS12155	PF10425	C-terminus of bacterial fibrinogen-binding adhesin
EQ029_RS12155	PF00746	LPXTG cell wall anchor motif
EQ029_RS12155	PF17210	SdrD B-like domain
EQ029_RS12155	PF17961	Bacterial Ig domain
EQ029_RS12180	PF02195	ParB-like nuclease domain
EQ029_RS12180	PF17762	HTH domain found in ParB protein
EQ029_RS12185	PF02527	rRNA small subunit methyltransferase G
EQ029_RS12190	PF01134	Glucose inhibited division protein A
EQ029_RS12190	PF13932	GidA associated domain
EQ029_RS12195	PF12631	MnmE helical domain
EQ029_RS12195	PF01926	50S ribosome-binding GTPase
EQ029_RS12195	PF10396	GTP-binding protein TrmE N-terminus
EQ029_RS12200	PF00825	Ribonuclease P
EQ029_RS12205	PF00468	Ribosomal protein L34
EQ029_RS12245	PF13610	DDE domain
EQ029_RS12250	PF01965	DJ-1/PfpI family
EQ029_RS12275	PF03412	Peptidase C39 family
EQ029_RS12275	PF00664	ABC transporter transmembrane region
EQ029_RS12275	PF00005	ABC transporter
EQ029_RS12280	PF00239	Resolvase, N terminal domain
EQ029_RS12280	PF02796	Helix-turn-helix domain of resolvase
EQ029_RS12295	PF13610	DDE domain
EQ029_RS12305	PF01022	Bacterial regulatory protein, arsR family
EQ029_RS12310	PF00403	Heavy-metal-associated domain
EQ029_RS12315	PF13610	DDE domain
EQ029_RS12320	PF03601	Conserved hypothetical protein 698
EQ029_RS12325	PF00126	Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
EQ029_RS12325	PF03466	LysR substrate binding domain
EQ029_RS12350	PF13673	Acetyltransferase (GNAT) domain
EQ029_RS12365	PF02796	Helix-turn-helix domain of resolvase
EQ029_RS12365	PF00239	Resolvase, N terminal domain
EQ029_RS12380	PF01740	STAS domain
EQ029_RS12380	PF00916	Sulfate permease family
EQ029_RS12385	PF00582	Universal stress protein family
EQ029_RS12400	PF13610	DDE domain
EQ029_RS12410	PF02525	Flavodoxin-like fold
EQ029_RS12420	PF00479	Glucose-6-phosphate dehydrogenase, NAD binding domain
EQ029_RS12420	PF02781	Glucose-6-phosphate dehydrogenase, C-terminal domain
EQ029_RS12425	PF03446	NAD binding domain of 6-phosphogluconate dehydrogenase
EQ029_RS12425	PF00393	6-phosphogluconate dehydrogenase, C-terminal domain
EQ029_RS12430	PF00342	Phosphoglucose isomerase
EQ029_RS12435	PF00215	Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
EQ029_RS12440	PF01380	SIS domain
EQ029_RS12445	PF01638	HxlR-like helix-turn-helix
EQ029_RS12460	PF01022	Bacterial regulatory protein, arsR family
EQ029_RS12470	PF13610	DDE domain
EQ029_RS12475	PF09254	Restriction endonuclease FokI, C terminal
EQ029_RS12475	PF02981	Restriction endonuclease FokI, recognition domain
EQ029_RS12475	PF16902	Type-2 restriction enzyme D3 domain
EQ029_RS12475	PF02980	Restriction endonuclease FokI, catalytic domain
