MKD39_RS12555 NONE
        dnaN NONE
        yaaA NONE
MKD39_RS12560 NONE
        copZ NONE
        recF NONE
MKD39_RS12570 NONE
MKD39_RS12575 NONE
        gyrB NONE
MKD39_RS12580 NONE
MKD39_RS12585 NONE
        gyrA    9313 ..    9342 + -19.5  -4.94222   GATTCCTTCAACAAA       CAAGACTTCCCTG ATAC CAGGGAAGTCTTG        TTTTTATAGCTTATT 100 83
MKD39_RS12605 NONE
MKD39_RS12610 NONE
        serS   12186 ..   12217 + -11.1   -6.2845   CAGTAGCCGACTAAA      CTGAGAAAATGCTC TTACC GAGC-TTTTCTCAG      TTTTTTTTTATCCTT 100 101
MKD39_RS00045 NONE
MKD39_RS00050   13605 ..   13616 +    -3   -2.6186   GAACCCAACAACTAA                CAAT TGAA ATTG                 GTTATACAATTAGAT  42 49
MKD39_RS12620 NONE
MKD39_RS00055 NONE
MKD39_RS12625 NONE
MKD39_RS00060 NONE
MKD39_RS12630 NONE
MKD39_RS00065 NONE
        rplI   18388 ..   18409 +  -3.7  -3.06501   CATTAGAACTACTTA           CTTAAGCGT ATAA ACACTTAGG            TTAAGTAAAAATATG  47 79
MKD39_RS12645 NONE
        dnaB NONE
MKD39_RS12650 NONE
MKD39_RS00080 NONE
MKD39_RS12655   21786 ..   21810 + -11.6  -6.06723   AACATCATTTATTTG          TAGGCATTGA TTCGT TCAATGCCTA          TTTTTTTTTAGAAAC 100 5
MKD39_RS00085 NONE
MKD39_RS00090   22150 ..   22171 +  -9.5  -5.66684   CCGTCGAGACCGTAT           TGCTTATCC AAAA GGATAGGCA            TTTTTTTATGCCTTC 100 27
        yycF NONE
MKD39_RS12675 NONE
        walK NONE
        yycH NONE
        yycI   27339 ..   27373 +  -7.2  -5.07523   GAACAGGAAGAATAG     TAAGTGTGTGGGGCAA CGA TGGTCTCATGCACTTA     TTTTATTTGTATGTG  88 42
MKD39_RS00115   28404 ..   28440 + -11.1  -6.08342   AATTATTTAGACGAA    CGACCTACTTACAAA ATTAGTA TTTGTGAGTAGGTTG    TTTTTTTATTTATTG 100 39
        rlmH   29473 ..   29506 +  -4.7  -3.00476   TATGCAATATATGAT     ACAATTCATTCAAAT GTAT ATTTGAATGAGGTGC      TCTATGGTTCAGACT  52 224
MKD39_RS00125 NONE
MKD39_RS12695 NONE
MKD39_RS00130   30495 ..   30521 +  -8.1  -3.88178   TGACTTAAATATAAA         GAAACGCTC ACATTAAAC GAGCGTTTC         TTTGAATTCTTGTAT  76 33
MKD39_RS00150   33427 ..   33454 + -10.1  -3.31726   ATTTTGACATAAATA        CTACATTTGTA ATATAC TACAAATGTAG         TCTTATATAAGGAGG  83 152
        mecA   35480 ..   35530 + -15.9  -2.67428   TACGATATAGATGAA TAACAAAACAGTGAAGCAATCCGT AACG ATGG-TTGCTTCACTGTTTTATTA TGAATTATTAATAAG 100 23
MKD39_RS00175   38989 ..   39003 +  -5.7   -3.2178   AATCGAAAACATTTA               TACCC ATAGG GGGTA               TGTGTTATAGTATAA  58 217
MKD39_RS00180 NONE
MKD39_RS00185   41723 ..   41772 +  -9.1  -5.24989   AAATAGATATAAAGA TATCCTCCTTAATCAATAAT TTAAATAACTT ATTATTG-TTAAGGAGGATA TTTTTTAGTGTGTAA 100 65
MKD39_RS00190   42920 ..   42952 +    -8  -5.35222   GATAAGTGAAAAAAA      GACAATTTCTAT TGAAATAAT ATAGAAATTGTC      TTTTTTATAAATTTT  93 297
MKD39_RS00200   45564 ..   45574 +  -2.6  -3.97108   GGCAGGTATGGTAGA                 TTAA AAG TTAA                 TTATGTTTTGAAATT  51 146
MKD39_RS00205   46099 ..   46126 +  -3.5  -3.64184   ATAACAAATAATATA        CTCTATTAAGT CCCACA ACTTGAGAGAG         CTTTTTGTATATATT  50 79
MKD39_RS00215 NONE
MKD39_RS00220 NONE
MKD39_RS00225 NONE
MKD39_RS00230   49733 ..   49763 + -11.2  -5.32699   AGACTTATCATAGCC       ACGCCTGGAACA TTACTTT TGTTCCAGGCGA       TTTTTTAATATTTAC 100 40
MKD39_RS00235 NONE
MKD39_RS00240   51225 ..   51251 +  -8.1  -3.88178   TGACTTAAATATAAA         GAAACGCTC ACATTAAAC GAGCGTTTC         TTTGAATTCTTGTAT  76 33
MKD39_RS00265   54363 ..   54390 +  -8.5  -4.83246   ATGGAAATTCATAAA        GCATCCTTCAT CACAAA GTGAAGGGTGC         TTTGTTTATTTATAA  95 77
MKD39_RS00270   55421 ..   55456 + -11.4  -5.22006   TAATGTGAAAATTCA    TAAAGCATCCCTCATCT CAA AG-TGAAGGATGCTTTA    TTTTTATTATGATAA 100 57
MKD39_RS00275   55847 ..   55861 +  -2.8  -2.64099   GCATTGTGAACTTCA               CGAAAT CAT ATTACG               ATTGTAGTAACAAAA  40 61
MKD39_RS00280   56463 ..   56484 + -13.1   -5.6473   AAGCTTATATGACAA           TCCAACACG ATCT CGTGTTGGA            TTTTTTTAGTGTTAT 100 66
MKD39_RS00290   58947 ..   58978 +  -9.5  -4.76423   ATATTTATTAAAATA      GGCAGCTAGCAGA TTAAAT TCTACTAGCTGTC       TTTTGTATATTTATG 100 348
MKD39_RS00295   60632 ..   60676 +  -6.7  -4.17417   AATAAATTTAAAAAA GTGAGCGGG--A-TGACATAAC TAGG GTAATGTCAATATCCCGCTCAC TTTATGTGTAATTGG  72 55
MKD39_RS00315   64877 ..   64899 + -11.3   -5.8901   CACGGGTGTTACAAA           CTCGTCCCT CTTGT AGGGACGGG           TTTTTTATTTTATAT 100 387
        thrS   66878 ..   66907 + -11.6  -4.84527   CTTTGAATCAACCTA       GCCTATCAGAGT ATGAAC ACTTTGATAGGC        TTTTTAATGTCTAGA 100 49
MKD39_RS00325 NONE
MKD39_RS00330 NONE
MKD39_RS00335   69498 ..   69510 +  -7.7  -2.91695   CTACTTTATCATTTT                GTCAG TAG CTGAC                TGATTTGAAAATGCG  66 456
MKD39_RS00340 NONE
MKD39_RS00345   73072 ..   73109 +  -9.4  -3.14848   TATTGAAACTAAAGA   AGCCAGTAAATGAAGTT GTTAA AACT-CATTTACTGGCA   ATTTTAATAGGAGGA  79 294
MKD39_RS00365   77172 ..   77222 +    -7  -5.60993   ACTTAAGATGGCTTT AACACCTTGC-ACATTGCGTTAA AGTAAG TTAACGCTCTGTTGCGAGGTGTC TTTTTTTATAAAAGA 100 80
        brnQ   79022 ..   79034 +  -6.3  -2.71712   TAGTACTATTTAAAA                CGTAA TTA TTACG                ATTTAAAACGAGCGA  57 343
MKD39_RS00375 NONE
MKD39_RS00380 NONE
MKD39_RS00385 NONE
MKD39_RS00390 NONE
MKD39_RS00395 NONE
MKD39_RS00400   84669 ..   84681 +  -2.7  -3.63018   GATAAAATCTAAAGT                CTTTG ATT TAAAG                TTGTATGTCATGATT  47 304
MKD39_RS00410   86015 ..   86045 + -14.2  -4.74611   TAATATGAATTATCG       GTCTAGGACAACTA TAA TGGTTGTCTTAGAC       TTCTTTTTTGTAATA 100 38
MKD39_RS00415   87443 ..   87456 +  -2.3  -3.38339   TCAGTATAATTTGGC               CGAGT AATA ACACG                TTCGTATTGCCTAAT  45 496
MKD39_RS00425 NONE
MKD39_RS00430   89488 ..   89529 +  -3.4  -3.79849   GAATTAAGTACTATT TATATAAGTAATTAAAAT TTAAAT ATTTTGATTATATATATA  TTATTGATATAATTA  53 83
MKD39_RS00435   90652 ..   90692 + -12.1  -5.00616   ATTATGTCTTATTAT  GACCCTATTATTGAGATTT TGA AAATCTTGATGATTGGGTC  TTTTTTAAAACCAAA 100 73
MKD39_RS00440   91217 ..   91235 +  -2.5  -3.32946   GATAAGTCGTCGTCC             GTTATAT CTTAC ATGTAAC             TATTATGGTTACAAG  43 36
MKD39_RS00445   92031 ..   92071 +  -7.1  -4.95843   AATAAGCAAACGAAG GACGTGGAAC-A-GAATTC TTTAT GAATTCATTGTCCCACGTC TTTTGTCTTTTCTAT  85 85
MKD39_RS00460 NONE
MKD39_RS00465   94959 ..   95002 + -12.6  -3.50734   ATAATTAAAATAAAA CTCCCTCCAAGTAAGCTTTGA AAA TCATGGCT-ACTTTGAGGGAG TTAATTATATGACTT 100 37
MKD39_RS00480   98129 ..   98147 +  -4.6  -2.53876   TGTGTAGATGATGGG             GAATAGCG TAC TGTTATTC             TCAATTCAAGTGACC  48 20
MKD39_RS00485   98945 ..   98958 +  -5.3  -3.03159   CATTATTCATTAATA               TGACA CATT TGTCA                TATTAAAAAAATTAA  54 57
MKD39_RS00490   99519 ..   99568 + -13.4  -2.80074   ATATACGAATGAAAA TAAGCATCACCTATTATGAAAAGC GAAT GCTTTT--TAATAGGTGGTGCTTA TCATGTTATGACGCA 100 93
MKD39_RS00505  103486 ..  103496 +  -2.4  -3.38435   ATAAATTGAATTACA                 AGCG TTT CGCA                 ATTTATTTTAAAAAG  45 50
MKD39_RS00520 NONE
        rbsK NONE
        rbsD NONE
MKD39_RS00535 NONE
        rbsC NONE
MKD39_RS00545  111931 ..  111960 +  -8.8  -5.30155   TGTTTGAAATAAAAA       GATTCTGAGACTG TAAAT CA-TCTCAGAATC       TTTTTTAATTAATAA 100 44
        panB NONE
        panC NONE
MKD39_RS00565  115177 ..  115200 + -11.8   -4.9792   GTAAAATTGATTTGA          TCCGGTAGCT TAAA AGCTATCGGA           TTTTTGTGTGGGCTA 100 66
MKD39_RS00570  116680 ..  116690 +  -6.8  -3.89215   AACATTCGTTGTAAT                 GCAC GTT GTGC                 TTTAGGTTTCTCACC  66 493
MKD39_RS00580 NONE
MKD39_RS00585 NONE
MKD39_RS00590 NONE
MKD39_RS00595 NONE
MKD39_RS00600 NONE
MKD39_RS00605 NONE
MKD39_RS00610  122334 ..  122359 +  -6.2  -5.40072   ATTATATTAAAAAGA         GTGCTCCA AAAATTATAA TGGAGCAC          TTTTTTTGCAAGAAA  89 31
MKD39_RS00615  123352 ..  123382 + -10.6  -5.27923   TAAGTTCAAACCCAA       GTTCTCAGGTTAAT TAA ATTAGACTGAGAAC       TTTTTTATAGGGTTC 100 41
MKD39_RS00620  124065 ..  124101 +  -5.4  -5.27206   AGCAACATAAATTAA   GGTTCAACGTGCAGTTAA TGA TTAAC--CACATTGAACC   TTTTTATTATGTCTA  80 66
MKD39_RS00635  127782 ..  127816 +  -7.3  -5.68438   TGAATCTCGCGAAAA     TAGGATCTCAAACAT TTTAT ATGTATGAGGTTCTA     TTTTTTATTTAATAA 100 38
        arsB  129611 ..  129621 +  -3.2   -3.0281   ACTTAAGTGAGGTAA                 CGGA TAT TTCG                 TCTATGATTCGTCTA  44 357
MKD39_RS00645  130493 ..  130531 + -17.1  -5.32944   GTTTTTGAAATACAA   GCATCATCAAAATGAAT CATTT ATTCATTTTGGTGATGC   TTTTTTAATTGTAAG 100 43
MKD39_RS00650  132198 ..  132227 +  -8.6  -2.82595   TCATAACAATGTAAA       GGCGGGTTTCTA AATAAA TAGGAACCAGCC        CTTTAAATGCTTGAA  71 138
MKD39_RS00655  132694 ..  132729 + -17.2  -4.33281   AACCCTAGAGAAATA    GCCAGTAAATGAGTTT TAAC AAATTCATTTACTGGC     TTCTTTATTTACAAT 100 96
MKD39_RS00665  135641 ..  135658 +  -6.3  -3.07344   GATCAATAAACAAGC             CGTTGAA GGTA TTCAGCG              TATCTTGAGAGCTGC  60 468
MKD39_RS00675 NONE
MKD39_RS00680 NONE
MKD39_RS00685  140358 ..  140399 + -10.3  -5.47159   AATAATTCGATGATA TGCATCTCAACTGTAGGAT GAAA ATCCAATGTTTGAGATGCA  TTTTTTATATTCAAA 100 115
MKD39_RS00690  142212 ..  142251 +  -3.2   -4.4959   AATAAAATAACAAAA GCACATTGC--A-CTTGAT AGTTA ATCAAGCTTTGCAATGTGC TTTTAATTCGTTAAG  60 36
MKD39_RS00705  146014 ..  146039 + -10.5  -5.24129   ATGTAGTAGATGATG         TGCGCTTCTCT TTTT AGGGAAGCGTA          TTTTTTATCGAAAAA 100 35
MKD39_RS00710  147306 ..  147337 +  -7.4  -4.70534   ATATGTATTACCCCA      TAGCCTCC-TACCAT TTA AAGGTATGGAGGTTA      TTTTATGTCTGTTTA  81 83
MKD39_RS00715 NONE
MKD39_RS00720  149247 ..  149298 +  -7.1  -4.06781   ATATAGATAAATAAA GATGCCTACAT-A-TTGGAATCAA AGCATTA TTG-TTCCAAATCATGTAGGCATC TTTGTAAATTTTACT  72 45
MKD39_RS00730  150731 ..  150773 +  -4.4  -2.81421   TAAATTTTTAGAATA GGGAGAGAGGC--AGAATTT TATAT GAATTCTTTGTCTTTCTCCC ACTTTTTATATTTAG  49 38
MKD39_RS00735 NONE
MKD39_RS00740  152497 ..  152519 +  -9.2  -5.96894   CAACCGTAATACAAC           TCTCTAGCCA ACT TGGTTAGAGG           TTTTTTTATTTGAGT 100 32
        lpdA NONE
MKD39_RS00750 NONE
MKD39_RS00755  156138 ..  156148 +  -5.4  -3.39895   TGAACTAATTGAAGA                 CTTG AAA CAAG                 TTAATTCATAGGCAA  57 4
MKD39_RS00760  157502 ..  157533 +  -5.8  -4.39166   ATTTAATTTGATTAA      GACCCTCAGTAC ACAAAAAA GTGCGGGGGGTC       TTTTCATGTCTCAAA  70 51
        lpdA  159489 ..  159509 +  -9.9   -3.1505   ATTTTTTAAAATACA            CTATCTTAT ATT ATAAGATAG            TTAATAAAAGGTGAT  83 397
MKD39_RS00770 NONE
MKD39_RS00775  160761 ..  160771 +    -4  -3.05816   AGATTTAACTTTTTA                 TTGA AAA TCAA                 TTAGCTAAAAAATAG  48 157
MKD39_RS00785  162847 ..  162874 + -10.6  -5.68438   TCAATATTTATGTCA        GAATCAGCGACT TTCT AGGCGCTGGTTC         TTTTTTGTTTGGTAA 100 48
        rarD  164151 ..  164192 +  -6.2  -5.28176   CAAGCAAAGCAAGCT GGGAG-TGGACGACGAATTCA ATA TGAATTC-T-GTTCAGCTCCC TTTTTTCTGAATAAA  86 199
MKD39_RS00800  168002 ..  168020 +  -6.1   -3.6761   CTTGCTTTGCTTGTA             GAATTTC TTAGT GAAATTC             TCTTTGTTGGGGCCC  64 122
MKD39_RS00805  168886 ..  168912 +  -8.9  -5.49568   AATTGAATAGTAGAT         GAGATTTTTAC TTAGT GTAGAAATCTC         TTTTTCTTTTGAATT 100 115
MKD39_RS00810 NONE
MKD39_RS00815  171115 ..  171161 + -14.2  -4.49337   CAATATTGAAATTAA TACCCTTGTAAG-ATAAAAGT CGATAA ACTTTTATACTTGCAAGGGTA TTTTCTCAATTATGA 100 54
MKD39_RS00820 NONE
MKD39_RS00825 NONE
MKD39_RS00830  174834 ..  174879 +  -7.7  -5.28176   ATAATCCATAAATAT TCCTCTTGTAAGATGGTGGTG TATA CACTTTTATCTTATAGGGGGA TTTTTTATGAATAAG  91 75
MKD39_RS00835  178099 ..  178134 + -11.4  -3.07355   AAATAATATATAAAT    TAAGAGCACGCTAA TCTGAAAT TTAGTGTGCTCTTA     TCATTATTATTTAGA  91 35
MKD39_RS00845  180064 ..  180077 +  -2.4  -3.11292   AACAGAACCATTGGT               GTCA TTATTT TGAC                GTTTGTATTAACAGT  42 90
MKD39_RS00850  180857 ..  180873 +  -9.5  -5.80364   AGAGAATTAATTTGA              GAGACTA ATT TAGTCTC              TTTTTTTATTGACCT 100 18
MKD39_RS00855 NONE
MKD39_RS00860  181908 ..  181934 +  -8.1  -3.93262   ATATAAATAAACTAA         GCACAAAGC AGTTATTAA GCTTTGTGC         TTTAGTATGTTAGCC  78 35
MKD39_RS00865  182749 ..  182759 +  -2.6  -4.28069   AAGGCGTTTTTGGCA                 TAAT AGG ATTA                 TTTCTTGGATTATAT  55 324
MKD39_RS00870 NONE
MKD39_RS00875  183732 ..  183752 +  -3.2  -3.17194   TTTTAATTTTAGACT            GACCCTCT ATTCC GGAAGGTC            TTAAATTAAAAAAAT  46 35
MKD39_RS00880  184296 ..  184336 + -13.5  -4.33182   ACATAATATGGAGTA  GGGAGTGAGACAGAATTTA ACT TGAATTCAGTTTCATTCCC  TTGTTTTATACATAG 100 42
MKD39_RS00890  186018 ..  186046 + -13.3  -5.24989   TAGCACTAAAATAAA        CCTTCTTTGTATC GTC GTTACAAAGAAGG        TTTTTTGGTATATAA 100 38
        argF NONE
        arcC  188324 ..  188363 +    -8  -5.55664   AATAAATAAGTTGAA  CCTGGGCTTAATGTAAGTG ATT TACATACGT-AAGCTCAGG  TTTTTTTAGTGGTCG  95 92
MKD39_RS00945  195114 ..  195141 +  -4.2  -3.86571   GAATATGTTGATTAA        GGCTGGGATATT TTAA GATATTCTAGTC         TATTGTTTTGTTTAA  54 112
        bioB  196375 ..  196392 +  -2.8  -4.07687   TTTTACCCTTATCTG             TATTTC TATATT GAAATA              TTTTAAAGCCACAAT  53 170
MKD39_RS00970  200069 ..  200103 +  -5.2  -4.06993   ATAAATATATATAGT    GAGATATCTCAGC ACAATTTTTA GCTGAG-TATCTC     CTTTTTTTTAAAATT  63 42
        nagA  204232 ..  204249 +  -3.5  -2.96042   ATTCGCGTTTAAAGA             TATACAT TCTA GTGTATA              TATGTAGTAAATGTT  46 82
MKD39_RS00990  204564 ..  204596 + -14.3  -5.56263   CATAAAATGAAAAAA      CAGAAAGCGGATTGG TTA TCAATCCACTTTCTG      TTTTTGTTTTATGCT 100 36
MKD39_RS01005  207030 ..  207070 +  -7.1  -3.42663   AGAAAGAATGAGTGG GGAGTGGGAC--TGAATTC TATAT GAATTCGGTGTCCCACTTC TATTTAGATCCTGCT  67 30
MKD39_RS01015  209106 ..  209122 +    -3  -2.61582   TAACAACAGAATATG              TAACAC AAGGG GTGTTG              ATTATGCATCAAGTC  42 57
MKD39_RS01020  210667 ..  210700 + -13.3  -4.64844   AAAATAATATTTTGT     TGCGAGTTGAACACA AGTT TTTGTTCGACTCGCA      TTTTATGTCTCTAGA 100 34
MKD39_RS01025  211640 ..  211654 +  -3.6  -3.97511   GGCATAGTAAACATA               TTACTT TAA AAGTAG               TTGTTATATTACATG  55 84
MKD39_RS01030  212361 ..  212388 + -12.1  -4.39568   GATAAATAAAAATAA        GCAGGACTTCG ACGGAA TGAAGTCCTGC         TTTTACTGTGTAAAT 100 32
MKD39_RS01040  214159 ..  214184 +  -7.7  -5.16572   ATACGCAATAAAAAG         CAATGCCTA AGTTTTGA TAGGCATTG          TTTTTTAACTTAAAT  89 63
MKD39_RS01085  223032 ..  223061 + -10.1  -4.65722   AAAGCATAATAAAAA       CAAGCGTGGCT TTTTAATC AGTCACGCTTG        TTTGTTTATATATAA 100 32
MKD39_RS01105  227675 ..  227700 +  -7.6  -3.92592   TAACACACCATAAAA         CCCCTCACTA GCGCAA TAGTGAGAGG          TTTGGTGTTGCCAAT  75 67
MKD39_RS01110  229630 ..  229667 +  -8.5  -4.80178   AAGAATAATATAAAA   CAGCTTATAGTACACAT CACA AAGTGCACCATAAGCTG    TTTTCTTAATTAATA  90 117
MKD39_RS01115  231092 ..  231123 + -10.3  -4.02315   AAATAATTAGTCGAA      CTCTGAGAATTGC ATTATG GTAGTTCTCAGAG       TTTCAATTTTTCATT  91 35
        pbp4  232472 ..  232498 +  -6.6  -4.63527   TTAAATTAGAAAAAA         TGTCGCTAAGTT TTC ATCTTGGCGATA         TTTTTCAAATAATGA  79 50
MKD39_RS01130  235111 ..  235137 +  -9.5  -2.93149   GTAGATAAAATTCAC         CCCCACATG ACGAATTAG CATGTGGGG         ATATTTGTTTAGTTT  77 43
MKD39_RS01170  242747 ..  242763 +  -3.8  -3.16177   AGATTAACATAGTGA              CATTTT GATTG AAAATG              TTGCATATATGGAAT  49 172
MKD39_RS01175  244149 ..  244190 + -16.1  -3.80597   GTTGAGTTGAAGAAA CACCTCTAGTGTCAGTGTG TCAT CGTACTGATATTAGAGGTG  TTCTATTATAGTTAT 100 43
MKD39_RS01190  247803 ..  247839 +  -9.6  -3.76048   TCGCAGTAGCTGACT    GAACTGAGATAGCT CTTAAATCT AGCTTTCTCAGTTC    TTGTGTTCCTTGCGG  86 179
        phnC NONE
        phnE NONE
        phnE  250429 ..  250440 +  -4.4  -5.19003   GATATGAGTGGCGTC                CCAT TACC ATGG                 TTTATTTTTTATGTT  76 129
MKD39_RS01210  251173 ..  251215 +  -9.4  -3.73858   AGAAGTTATAAAAAA GAGGCTATCGCTTATAGGT TAATAC ACCTTTAA-TGATAGCCTC TTCATTTTCATATGC  86 39
MKD39_RS01220  253027 ..  253056 + -12.3  -3.33336   AAAGAAGTGTAAGGA       TAAGGTTGAGACG AATA CGTTTCAACCTTG        TATCTATTTTATGTT  95 29
MKD39_RS01225  265302 ..  265312 +  -2.6  -2.82775   ATGTGGGAGATAGAT                 TTAT AAA ATAA                 TCACTTTTCTATAAA  41 49
       secY2 NONE
        asp1 NONE
        asp2 NONE
        asp3 NONE
       secA2  272706 ..  272718 +  -4.1   -3.1552   TTAGTAGTACATTTT                CCTTA AAA TGAGG                TGTTCATAGATGACA  49 20
        gtfA NONE
        gtfB  275581 ..  275631 + -12.1  -5.86976   AATGAGGATAATAAA GCTTTTGAGATGAATGAAGACTT ACAAA AAGTCGACTTTTATCTCAAAAGC TTTTTTGTTTTGTAA 100 40
MKD39_RS01280 NONE
MKD39_RS01285  278990 ..  279000 +  -5.4  -3.31144   GGAACAGAAGATACA                 GAAG TTA CTTC                 TTCTGAAGATGACGC  56 46
MKD39_RS01290  279436 ..  279454 +    -4  -2.65808   AAAGTCCTTCTATTT             TTTTAATT ATA AATTGAAA             TGAGTTGTTAGAGAT  45 68
MKD39_RS01295 NONE
MKD39_RS01300  280931 ..  280965 + -16.6  -3.45054   AGTGAACAATAAAAA     ATAGGACGTGTGATGA TAG TCATCGCACGTCCTAC     TTGTACATTATAAAG 100 36
MKD39_RS01315 NONE
MKD39_RS01320  284071 ..  284101 +    -7  -5.02323   GCAAATGACAAAAAA       GCAATCTCAC TCTTAATTTAT GTGAGATTGC       TTTTATTTATCATAA  86 33
MKD39_RS01345  291152 ..  291162 +  -2.6  -3.34902   AATAGAAGTATAAGT                 TTTA AAT TAAA                 TGTTATATAATGAAG  45 88
MKD39_RS01350  293310 ..  293359 +  -7.5  -5.00616   AATAAATACAAACTT AAAGCGTGGATAAC-TGAGTAA TCATTAC TTACTTATGTTATCTACGCTTA TTTTTTGGAAAAGAG  89 36
MKD39_RS01355  295259 ..  295289 + -14.8  -5.17353   AATTAAATATTAGAA       CTGTCAACGGTGTC TAC GACGCTGTTGGCAG       TTTTTTAATAGGTAT 100 47
MKD39_RS01360  297039 ..  297071 + -13.7  -4.88711   AATCTAATAAAAATA      GGCAATTTCTATTGT AAT AAAATAGAAATTGCC      TTTTTGATCTATTAT 100 63
MKD39_RS01370  302328 ..  302381 + -10.7  -3.29892   ACGGAAACGATATTT GTACTATAAAAAGCATTCTAACCT TATAAAT GGGCTAGAATGCTTTTTAT-GTGC TATATATTTATTGTT  90 43
MKD39_RS01380  303669 ..  303699 + -10.5  -4.19648   ATAATATTTAGAAGA       GCGCATAAATGGG ACTTC CTCATCTATGCGC       TTTAATTTATCTCTA  91 37
MKD39_RS01390  305157 ..  305195 +  -3.1  -4.99035   GCATAACTTGAAAGA   CACCTCAATAGTTGGAT GATAA ATCTTACTTTTGGGGCG   TTTTTATGTAAATAA  65 40
MKD39_RS01395  305942 ..  305952 +  -2.6  -2.56271   TAATGCATAAAAAAC                 TTTT CTT AAAA                 ATATTATCATACGAA  40 174
        arcA NONE
        arcD NONE
MKD39_RS01410  309789 ..  309812 +  -8.2  -5.14985   ATAATTGCTACTTAA          GACGTTGGTG ACAT TACTAACGTC           TTTTTGTATGTTTGG  91 112
MKD39_RS01415  310816 ..  310831 +  -2.6  -4.03413   TACGAATTTGCAAAA              TAGCAT CATC ATGTTA               TTTATGTCCCAGGCT  51 183
MKD39_RS01420  311953 ..  311987 + -12.3  -4.30253   AAGCACATAAATAGA     GCCTTCCATTTCG AATTTTAAA CGAAGTGGAAGGC     TTGTTTCTATTTATA 100 31
MKD39_RS01425 NONE
MKD39_RS01430  314142 ..  314173 + -12.5  -3.22874   ACTGAATAACGAAAA      GTCCTCTATTTCA AATGAA TGAAGTAGAGGAC       CTTTGTTGTATAAAG  95 59
MKD39_RS01440  315878 ..  315907 +  -6.4  -3.73813   ATATAATGTAAAAAA       GCCTGTGACATG GTAGAA CATGCGACAGGC        TTATATTAATAATTG  66 35
MKD39_RS01450  318193 ..  318220 + -14.3  -4.39889   ACTGAATAAGAAAAA        GGCATTGCGTA AATGAC TACGCAATGCC         TTTTAATATGATTAT 100 46
MKD39_RS01460  319191 ..  319222 + -13.2  -5.59879   ATATTAATGTTTTAA      GCCAAGATATCTCT GTGT AGAAATATCTTGGC       TTTTTTATATTTATG 100 34
MKD39_RS01465 NONE
MKD39_RS01470 NONE
MKD39_RS01475 NONE
MKD39_RS01480 NONE
MKD39_RS01485 NONE
MKD39_RS01490 NONE
        wecB NONE
MKD39_RS01500  328084 ..  328097 +  -3.9  -2.82516   ATTAAAAAAAATATA               TCTAA ATAA TTAGA                TATAGTGGTGAGAAA  46 13
MKD39_RS01505 NONE
         wzy  330561 ..  330571 +  -2.6  -4.21194   AAAATTAAATTTAAA                 TAAA TAT TTTA                 TTTTGGGTGATAAAA  53 23
MKD39_RS01515 NONE
MKD39_RS01520 NONE
MKD39_RS01525 NONE
MKD39_RS01530 NONE
        wecB NONE
MKD39_RS01540  336789 ..  336824 + -18.6  -4.28432   CTTAACTAAATGAAA    GCACTTTGTCGATGAT ATAA ATCATTGACAAAGTGC     TTTTAAATTGCAATT 100 32
MKD39_RS01550  338966 ..  339010 +  -2.4  -5.28683   TATAATCTTTATTAT GTGAAGCGGTACGTTGAAATAG TCA TTATTTCG--GTATCGCTTCAG TTTTTTGATGTTCAT  68 75
MKD39_RS01555 NONE
MKD39_RS01560  339950 ..  339961 +    -3  -2.64218   GAAGAATGTGGGATA                TAAG GTGT CTTA                 ATTATGCTGAAAGCT  42 13
MKD39_RS01565  340881 ..  340920 +  -5.8  -6.14618   TCAATATTGTAAGCT  AGCCATCAACATTTGTAA GAAA TTATCAATGTTGTTGGCA   TTTTTTTGTTTTATG 100 45
MKD39_RS01570 NONE
MKD39_RS01575 NONE
MKD39_RS01580  345084 ..  345105 + -10.9  -4.87291   GTTGAGTCGTTTAAA           GAGTGAGAC GAGT GTCTCGCTC            TTTTTAATTGCAATA 100 43
MKD39_RS01585 NONE
MKD39_RS01590  348112 ..  348139 +  -2.2  -3.30619   CTTTCTTCGGCTTTA        TTTTTTTAGGTA AATT TATATAAAAAAA         TTATAGAAAATCGTT  43 67
MKD39_RS01595  349201 ..  349216 +  -2.6  -3.26546   TATTATTCTGACAAT              TCTGAT AGGT ATTAGA               TTAATAAATTTGTGA  43 166
MKD39_RS01600  350057 ..  350091 +  -2.8  -4.21974   GCAAAACCTTTAAAA     TATGTCCGACAATAAA TAG TGTACAGACGGACATA     TTTCTTACATAATAA  53 95
MKD39_RS01605 NONE
        cysI  353750 ..  353767 +  -3.4   -2.7728   TGTTGCTAAAGTTCA             TGGAGG ACAAGA CTTCCA              TAGTTAAAGTTTGAG  45 1
        cobA NONE
MKD39_RS01620  355231 ..  355242 +  -2.2  -2.88999   CAATCACAAGTTTAA                TGTC AGGG GGCA                 TGTGATATATGAGAA  40 26
MKD39_RS01625 NONE
         sat NONE
        cysC  357976 ..  358009 + -13.3  -5.13473   ATCTAGAAGCATCCT     GTGTGTTGCCAGTTT TTAT AGACTGACAACACAC      TTTTTTGCATATCGT 100 35
MKD39_RS01640  359532 ..  359582 +  -9.5  -5.03945   ATTGAATAATTAAAC TCATAATCCTCCTTATAAG-CAT GTCGCTA ATGTCTTATAAGGGGGATT-TGA TTTTTATCATTATTA 100 75
MKD39_RS01645  360811 ..  360839 + -12.5  -5.48213   TGAAATCACTTTTAA        CCACGATTCCTTA TCA TACGGAGTCGTGG        TTTTTCTTTTGAGTA 100 43
MKD39_RS01650  361252 ..  361288 + -11.1  -4.74504   ATAATGATTATAAAC   CCCTTGGAAG-ATGCT ATATCA AGCATACTTTCAAGGG    TTTTTAAATTGAAAT 100 37
MKD39_RS01655  362764 ..  362802 +  -9.1  -5.08255   GATTATAGATTGTAA  GGCCACT-AATTTTGGGT AAAT ACTCAAAGTTTAGTGGTC   TTTTCTTTTGAAAAT  95 33
MKD39_RS01660  364756 ..  364800 + -12.4  -5.15381   TATAAATAAAAAAGA GCTAGCAGATTCTTCAAAGT TTTAC ACTTTAGAAAATCTGCTAGC TTTTTTAAATATCTT 100 36
        betB  367132 ..  367165 +  -2.6  -4.51765   TCCATGCTAGAGCTT     TAGAGTCGTTATATT AATTA ACTATG-CGACTCTA     TTTATTTGAGTTATA  58 45
        betA  369093 ..  369139 + -14.7  -3.48703   CTAGTTATCCCTGCG GGGGGAGTGGGACAATGAATTCA AAA TGAATTC-T-GACTCACTCCCCC TTACTATTTAACTTT 100 158
MKD39_RS01680  371530 ..  371570 + -21.7  -5.26875   AAGTATGTATAAATT  GGATAATGACAAAAATTAA TCA TTAATTTTTGTCATTATCC  TTTTTTAATTCAAAA 100 29
MKD39_RS01685 NONE
MKD39_RS01690  374264 ..  374303 +  -6.6  -5.40072   GATAACCATTTAACA  GAAGTATATGCAAGCATT TATC AATGTTCACATATGCTTC   TTTTTTTCGGGAAAA  91 46
MKD39_RS01695 NONE
MKD39_RS01700  375971 ..  375983 +  -3.4  -2.74144   ATACAAATTTAATAG                TAGC TCAGT GCTA                GTTTAGAAATGAAGG  44 60
MKD39_RS01705  376502 ..  376512 +    -4  -3.33087   ATATAAAGATTAAGC                 CAAT GTC ATTG                 TTATCGACATATGTT  50 46
MKD39_RS01710  378267 ..  378301 + -11.6  -4.67478   TCAATGTATAAAAGA     CACCTCGTTAAATG CTTTGGT CATCTAACGAGGTG     TTATTTTTGTGTTTG 100 49
MKD39_RS01725  379705 ..  379721 +  -3.8  -4.49906   TATAAGTTGGGAACC              TATCAT ACAAG ATGATA              TTTATTTAACTGTTA  63 96
        ppdK NONE
MKD39_RS01740  383850 ..  383877 +   -10  -4.77165   TGAGATGAATTTAAA        CACTTAGTTGCA TATC TGTAACTAGGTG         TTTTCTTATAAAAAA 100 87
         lqo  385612 ..  385644 + -13.6  -5.59564   GTTAATAATAAGTAA      GAGTCGCTTGAG AGTTTATAG CTCAAGCGACTC      TTTTTTTAACTTTCT 100 46
MKD39_RS01755  388084 ..  388135 +  -6.9  -5.14965   TAGAATACAACATAA GCTTTCAATCATTTTCAAAGCGTAG CTAA CT-TGCTTTGGAT-TGGTTGAAAGC TTTTTTAATGAGAAT  84 63
MKD39_RS01760 NONE
MKD39_RS01765  389406 ..  389444 +  -6.2  -5.06414   GATGAAGAATAATCG   TAAATACTATTCTGACAG GGT TTGTTGGGGTGGTATTTA   TTTTTGTTAAAAAAC  82 29
MKD39_RS01780  391997 ..  392007 +    -4  -3.51232   AAAGTAGGGAGTTTT                 TGAA CCC TTCA                 TTCATTTAAAAAGGC  50 176
MKD39_RS01785  392793 ..  392830 + -14.5  -4.88736   GTTTAATATGAAAAA   TAGAGTGTATAGAAAGT AACT ATTTTCTGTACACTCTA    TTTTTATGCGTGATG 100 40
MKD39_RS01790  394430 ..  394453 +   -14  -5.37043   CAATAACAAAAAAGG          CGAGATGACT TTGA AGTCATCTCG           TTTTTTCTATGAGAT 100 35
MKD39_RS01805  396911 ..  396934 +  -9.6  -4.40561   ATCCATATTAAACTA          CCCGCAAAGT AATA GCTTTGTGGG           TTCTTTTTAAAAAGA  88 43
MKD39_RS01810  398485 ..  398513 + -11.8  -5.08367   GTAACACGAAAAGAA        GCACCTATCTCA ATCGA TGAGACAGGTGC        TTTTTCATTTGTATT 100 37
        alsS NONE
        budA  403276 ..  403307 +  -4.4  -5.42514   GACAAAATGATAAAA      TAGGCTGAGACA TTTTATTT TGTCCCAGCCTC       TTTTTTAATTTATAA  78 178
MKD39_RS01830  404324 ..  404372 + -10.6  -3.01712   TAGATGATATATAAA TTTAAAAGCCAGTAAGTGAATT TTTTT AATTCATCTGCTGGCTTTTAGG TATTGAGAAAAGGAA  84 67
MKD39_RS01840  405373 ..  405404 +  -9.6   -5.0925   AATAAATAATGTATG      GCTTCTAATTACTG ATAT TAGTGATTAGGAGC       TTTTTAATTTTAAAA 100 32
MKD39_RS01845  407268 ..  407299 +  -3.8  -4.86621   TGTCCTTTATTTTTA      CACCTAGTAC CAAGTCACAAAC GTGCTAGGTG       TTTTTCATTAAAGAT  68 149
MKD39_RS01850 NONE
MKD39_RS01855 NONE
MKD39_RS01860  408471 ..  408513 +  -7.3  -3.50491   TTAACTATTATTCAA CTCCTTAATTATTATATAA TAAAT TCATATAATGCTTAAGGAG TCATTTTTTATGTTA  67 37
MKD39_RS01865  409244 ..  409289 +  -9.3  -4.79752   AGCAATTTTAAAGAA AATGACTCCTAATTTGAAG TTTAATCC TTTCAAATTAGGAGTCGTA TTTTATATTGTTCGA 100 30
MKD39_RS01880  411812 ..  411865 + -15.6  -4.93547   AAATATTGGCGTAAT TAATAACTATGGGTGGTACAGGTA CAGTGA TACCGGTGCCACCCATGTTTATTA TTTTTCATTAATTGA 100 27
MKD39_RS01905  415057 ..  415082 + -13.4  -2.78695   AGCTAAAAATCAAAA         GCCCTCGAAA AATCAA TTTCGAGGGC          CTTACTTTGTATACA 100 39
MKD39_RS01925  417973 ..  417994 +  -9.5  -6.14618   GATATCATTACTAAT           CTGAAGCAC AATT GTGTTTCAG            TTTTTTTATTTTATA 100 56
MKD39_RS01930  419318 ..  419355 +  -9.5  -5.03314   CCATTTGTTAAATAG   GAATTGATAAAGTGTTGA TTA TCG-CATTTTATCAATTC   TTTTTTGAAAATGAG 100 41
MKD39_RS01935  420920 ..  420953 +  -8.3  -5.12474   GGATGAATCATGGAA     CCAAGAAACGATT GATTATAG AAACGTTTCTTGG      TTTTTCTATGTTATA  91 63
MKD39_RS01940  422096 ..  422119 +   -11   -5.9362   GAGTTATCGAGGGAA          GAGGTCGACT TTAA GGTCGGCCTC           TTTTTTTGTGTTTTA 100 70
MKD39_RS01945 NONE
        crtI NONE
MKD39_RS01955 NONE
MKD39_RS01960 NONE
        crtI  427954 ..  427989 +    -7  -5.37593   CATAGTCATAACTAA    GCTATATGTCACTATC AATT GAGAATGATATATAGC     TTTTTTAATTTGAAA  95 229
MKD39_RS01970 NONE
MKD39_RS01975  430518 ..  430533 +  -4.7  -3.90318   GTTTAATTTCGCTAG              TGCTG ATTCAA CAGCA               TTTCTACAATGATCA  62 334
MKD39_RS01995  434596 ..  434630 + -11.6  -4.66537   AAAATTTTAATGTAT     TGAGCCATAAAGGTGT CTA GTGCCTTTATGGCTTA     TTTTATGTTGAAGAA 100 44
MKD39_RS02000  435474 ..  435488 +  -2.9  -4.19817   GTAGAATGAAATTAA               TGATA CAAAT TATCA               TTTTAAGTAAGTCAA  55 199
        pruA  437157 ..  437197 + -13.6  -5.38326   AACATTTCTAAATAA  TTAGTCAGTAAATGAGTG TAGTC CATTCATTTACTGACTTA  TTTTTATTTCATTAA 100 84
MKD39_RS02020  439502 ..  439518 +  -6.7  -2.79915   TGGGTCCGGGACTAT              GAATTAA GAA TTAATTC              TGTCCTACAATCCAT  61 93
MKD39_RS02025  440572 ..  440610 + -11.9  -3.14978   CTAACGCAAACTAAA   TAAGCGTATGATTCTAC AAATG GTAGATTCACACGCTTA   TATCTATTAATGTTG  95 37
MKD39_RS02035  441572 ..  441618 + -17.6  -3.43071   TTACACGTAAATAAA GAGGCGTTCGAGATAAGAGC CTAAATT GCTCTTATTTTGAATGCCTC TTAATTAATATCAAC 100 51
MKD39_RS02045 NONE
MKD39_RS02050  445544 ..  445598 +  -2.9  -5.06089   ACAATATTTAGAAAA GCCACTAATTACGAGTAAGGTTCTT AAATC AAGACCTCGATTCATAAGTAGTGGC TTTTATTTATCATTT  67 40
MKD39_RS02065  447712 ..  447742 + -15.7  -5.67063   ATAGATAAACAAAAA       TAGAGAAGCGTTT AAATG AAACGCTTCTCTA       TTTTTTTATCGTAAA 100 70
MKD39_RS02070 NONE
MKD39_RS02075 NONE
MKD39_RS02080  450842 ..  450870 + -19.1  -5.65177   GAAATAGATTCGACA        CACTGACAAAAGC AAT GCTTTTGTCAGTG        TTTTTTTATGAATAT 100 41
MKD39_RS02085  452490 ..  452548 +  -8.7   -5.1675   TTACTATTCGATTAG GCATGAGCAGATAAGCT-ATCAT-TAT TTTTGTC ATAAATGATGAGCTTATTTGGTCATGC TTTTTTAATGCGTAA  95 181
        ptsG  454620 ..  454662 + -18.8  -3.07895   ATGACAATTAAATAA TAAAACAAGCCTGGGACA ACATATG TGTCTCAGGCTTGTTTTA TGTGTTGGCAGTCGA 100 26
MKD39_RS02100 NONE
MKD39_RS02105  457115 ..  457125 +    -4  -3.09664   CAACGTAACTTGAAA                 CATT CAT AATG                 ATATTTTTATTAAAT  47 334
MKD39_RS02115  459272 ..  459290 +  -3.8  -2.62171   TCGTACCTAATAACG             TTGTCTCC TTA GGTGATAA             GTATTTGAGACTATC  45 288
MKD39_RS02125 NONE
MKD39_RS02130  460501 ..  460532 +  -3.8  -4.54343   TTTGAAACGGTTTCT      TCTTTAGCAACA TCATCACT TGTTGCTGAAGC       TTTATTTAACTTTGT  65 120
        pgsB NONE
        pgsC NONE
MKD39_RS02150 NONE
MKD39_RS02155 NONE
MKD39_RS02160  465663 ..  465690 +  -9.2  -3.24745   ATAATATTTTTGAGA        GGCTGGGACA AAATAAAA TGTCTCAGCC         TACTTTATTATTTTG  78 59
        xylB  467513 ..  467550 + -15.9  -3.03243   AGATTAATTCAATGA   TAATAAACTGGAGCAGC AATG GTTGTTCCAGTTTATTA    TGTTAAAAACTAAAT 100 34
MKD39_RS02170 NONE
MKD39_RS02175  469634 ..  469644 +  -2.6  -3.05384   ATATAGTCACTTAAA                 TATA TCC TATA                 TTAAATAGAGGGGGA  42 7
       sdaAA  470580 ..  470616 + -14.7  -5.22794   TAATTGAAATTAGAA    GCCATTCTTGAATGTCA ATA TAACATTTAAGAATGGC    TTTTTTAATACTTAT 100 43
        srtA  472558 ..  472592 + -10.2  -5.72207   ATTAAGTCATCAGGA     GTGATACTAGATATCT AAT ATATATCTTGTATCAC     TTTTTTTAATTTAAC 100 101
MKD39_RS02200  473554 ..  473585 + -13.2  -4.67607   TAAAATAGCTTAAAA      AAGGAGAATTCTCA ATTT TGAGAATTCTCCTG       TTTATTTATTAAACA 100 33
MKD39_RS02215  477357 ..  477392 + -17.1  -4.94992   ATTTAAATTGAATGA    GAGCTATCTGCAAAG CTGAGA CTTTGCAGGTAGCTC     TTTTTATGAGTTTAA 100 73
MKD39_RS02220  478473 ..  478517 +  -4.4  -2.55297   AAAAATTTAAGATTA AGGGAGTGGGAC-A-GAATTCT TTT AAAATTCGTCGTCCCACCCCCA ATCTATTTAAAATGA  48 39
MKD39_RS02235  481035 ..  481067 +  -5.7  -4.86033   TGAATAAATAAAAAA     TATCCCCA-ATCCT TTTATT AGGAGATGGGGATA      TTTTTATACCAATTT  78 30
MKD39_RS02245 NONE
MKD39_RS02250 NONE
MKD39_RS02255 NONE
MKD39_RS02260  485690 ..  485724 + -11.6  -3.23419   ATTCATAATGGAAAA     GGACTCAAAGATGT ATGGTTC GCATCTTTGGGTCC     ATTTTAATGTATCCT  93 33
MKD39_RS02270  488832 ..  488866 +   -13  -5.77988   AAAGTAATATATAAA     TGGCACTTTCTATTTC AGT GATTTAGAAAGTGCCA     TTTTTTTATATGTGT 100 42
MKD39_RS02310  497258 ..  497293 +  -9.9  -4.09923   CATTCCTAGAATCTA    GCCAGTAAGTGGGTT TTAATT AATTCATTTACTGGC     TTATTTAATTACATT  91 61
MKD39_RS02315  497783 ..  497827 + -12.6  -4.91712   AATATACATTACTAA GGTAGGATTTGAAATCTATGTC ACA GATAT-GATTTCAA-TCCTACC TTTTTGTAAATTAGA 100 60
MKD39_RS02320 NONE
MKD39_RS02325  500353 ..  500398 + -13.7  -4.93365   ATCATAATTAGTAGT TGCAAACCTTTATGTCTGGACG CAT TGTTCA-ATATAAAGGTTTGCA TTTTTAATTATAAAA 100 34
MKD39_RS02330  501223 ..  501272 +  -3.1  -5.38497   AACGATTAGTTTAAA GTATAACTTGATGAATTGTACGTA ACT TGCA-ACAATTCTATAAGTTATAC TTTTTTAATTTGCCT  73 41
MKD39_RS02335  502266 ..  502294 +  -8.1  -3.70902   TATATGTAAAAATGT        CTTGCTCGTGACG TAG CGTCATGAGGTAG        TTTCAATGTAGGAGG  76 66
MKD39_RS02340  503059 ..  503079 +    -9  -5.24449   TTCAATCATGGTTTT           CCCGGTCCA TCTG TGG-CCGGG            TTTTTTAAATTTATA 100 44
MKD39_RS02345 NONE
        gntK NONE
MKD39_RS02355  506845 ..  506862 +    -7   -5.7946   AATGCAAAATGTAAA             GCCACT CCAACA AGTGGC              TTTTTTTATTAACAC 100 52
MKD39_RS02360 NONE
        galU  508740 ..  508765 +  -6.9  -3.34984   GAAGTATAAATTCCA         CTCATCTCAGT TTCC GCTAAGATGAG          CTTTTTGGGAAATAT  65 355
MKD39_RS02370  509856 ..  509886 + -14.2  -5.20783   TGGCTCTATAATAAA       TTGGACTGATGACT AAA AATCATCAGTCCAA       TTTTTATGTTTGAAT 100 224
MKD39_RS02375  511297 ..  511314 +  -6.3  -3.59979   GCTTAATCTCAATAT             TTGGACT CATC AGTCCGA              TTTGACGTAGAGCCA  64 35
MKD39_RS02385  514553 ..  514567 +  -2.8  -3.11072   GTAATTTGAAGTAGC               TCATTC AGG GAAAGA               TATCTCTTAAGTAAC  42 27
MKD39_RS02390  515164 ..  515194 + -16.4  -5.95946   ATGAGTCCAAATATT       GAGATTAAGCAACC TTA GGTTGTTTAATCTC       TTTTTTTGTTGTTGA 100 236
MKD39_RS02405 NONE
MKD39_RS02410  519121 ..  519146 +    -9  -3.95858   GTTTACAAAAATAAA         GGCAATGGTC ATGAGC GACCAATGCC          TATTTTATATGTTAT  84 45
MKD39_RS02430  525851 ..  525876 + -14.1  -3.74693   AGGTTAATATTATAA         CCCCAGTCTAT GGCA GTAGACTGGGG          TTTAGTGACGTCAAA 100 71
MKD39_RS02440  527737 ..  527753 +  -2.9  -5.37345   ACAACGAGTAATGCT              CAAGTCG TTA CAGCTTG              TTTTTTATGATTAAA  70 59
MKD39_RS02455 NONE
MKD39_RS02460  532714 ..  532732 +  -6.8  -3.76492   TTCTCTATTATTATT             TCGATTAT TTG GTAATCGA             TTTACTCCGATTGAA  68 11
MKD39_RS02465 NONE
        fetB  534357 ..  534404 + -13.1  -2.91126   TGAAGATAAATAAAT TAAAAAGTCAGTTTTCACTTG AATCAC CAAATGAAAACTGACTTTTAA TCTACTATGCTTTGT 100 28
MKD39_RS02485  537005 ..  537022 +  -2.1  -3.05463   ACAGTGCGTAGCTGT             TTTTTTT ATGT AAAAAGA              TTAAATGAAAGGAGT  41 103
MKD39_RS02490  538348 ..  538390 +  -9.4  -4.88895   TCTAGTCATCCTTGC GGGGGTGGGACGACGAATTT AAAAA GAATTC-T-GTCCCACTCCC TTTCTTTATTTATTT 100 153
MKD39_RS02505  542340 ..  542377 +  -8.6  -4.70266   TTTAGAATGAAAGAA   GCATTTAATCAACATC GCTAAA GATGAAGATTAAATGC    TTTTTAAATGATGTT  90 42
MKD39_RS02515 NONE
MKD39_RS02520 NONE
MKD39_RS02525 NONE
MKD39_RS02530  547512 ..  547541 + -15.9   -4.6856   GTTACAAATGAAAAA       GAACCTGAGCACA ACAT TGTGTTCAGGTTC        TTTTTAAAATGTTTA 100 43
MKD39_RS02555  553363 ..  553391 + -11.2  -5.18357   AGTTTTTAATAGTGA        GATATCGAATTC GATTA GAGTTCGATATC        TTTTTTAATAAATTA 100 51
MKD39_RS02560  554672 ..  554702 + -16.4  -5.95946   ATGAGTCCTAATATT       GAGATTAAGCAACC TTA GGTTGTTTAATCTC       TTTTTTTGTTGTTGA 100 244
MKD39_RS02570 NONE
MKD39_RS02575  557621 ..  557660 +   -24  -3.98627   TTATTAGTAAAAGAA  GCACTGTTACAAGCTAAT TGCA ATTAGCTTGTAACAGTGC   TTGTTGTATTGATGG 100 42
MKD39_RS02590  562234 ..  562269 + -16.4  -4.10085   TAAACTTATAGAAAA    GCCCATAGATAATGCA AGGT TACATTATCTATGGGC     TTTAATTGATTTTTA 100 38
MKD39_RS02605  567468 ..  567484 +  -3.7  -3.71917   GTACGACCAGGGGCA              TTAAAGC TAC GCTCTAA              TTTGGACTTTGCAAT  55 132
MKD39_RS02615  568721 ..  568758 + -10.1  -3.93216   ATACAGTAATTAAAA   GAACTGAGAAGGCGCT CTTTTTA AGCGT-TTCTCAGTTC   TTGTTATACTTTCAC  91 81
MKD39_RS02645 NONE
MKD39_RS02650  575961 ..  575973 +  -3.5  -3.36919   GGTTTTGCTAAAAAT                TTAAT TAG ATTAA                TTATACGGATTTTAT  49 137
MKD39_RS02655  577007 ..  577056 +  -9.7  -4.02424   AATAGTGATTACGAA TAAAGAAGCCAGTAAATGA CTCTTAAAAACT TCATTTACTAGCTTCTTTA TTTATAATACTTCGT  87 100
MKD39_RS02665  579390 ..  579423 +  -8.2  -4.42235   GCCAATATGATAAAA     GAAGGCTGAGAC ATTTTATTTA GTCCCAGCCTTC      TTCTTTTTAGGAGTT  81 164
MKD39_RS02675 NONE
MKD39_RS02680 NONE
MKD39_RS02685 NONE
MKD39_RS02690  583686 ..  583724 +    -7  -5.75822   ATTAATAATAAAAAA  CACTTTTCTAAAGTTCA TAAAGT TGAACCT-AGAAAAGTG   TTTTTTTGATTTATA 100 36
MKD39_RS02700 NONE
MKD39_RS02705  586325 ..  586357 +  -6.4  -5.47399   AAAGATTAATTTAAA      GAAGAATTGTAGTG TACAT CGCTAGGATTCTTC      TTTTTTTAAAATTAG  89 131
        adcA  588069 ..  588082 +  -2.5  -2.91994   AGAAATGTTAGCACA               TTAAA AAAT TTTAA                ATTTGAATCTTTTTA  41 22
MKD39_RS02715  588753 ..  588798 + -15.7  -5.02287   AAAAATACTTATATG GCTTCCTACAAAGTAGACATT AATG AATGTAAACTTTGTAGGGAGC TTTTATATTTTTGTA 100 53
MKD39_RS02720 NONE
MKD39_RS02725  589609 ..  589649 + -17.2  -5.47218   ATAGTAAATTACTAA  GTGAGATAGAATCGTGTC TACAT GATACGATTTTATCTCAC  TTTTTTTACCTAAAA 100 37
MKD39_RS02730  590571 ..  590611 +  -7.1   -5.5074   AGTAATCAATAATAG GGTTGTGTTATC-ACTAA GTTAAA TGAGTAGATAGCACAACC  TTTTTTATTGAATTA  95 36
MKD39_RS02735  591479 ..  591499 + -11.9  -5.66338   ATTAGGATTTATAAG            CTGAGGCAC AAT GTGTCTCAG            TTTTTTATTGTATTT 100 36
        nirB NONE
        nirD NONE
        cobA NONE
MKD39_RS02755 NONE
        narH NONE
        narJ  601347 ..  601361 +    -5  -2.81186   TCTAGAAATTCCAAA               TGAGGT GAC ATCTCA               TGCTTAATCAATTTT  51 4
        narI NONE
        nreA NONE
        nreB NONE
        nreC  604249 ..  604273 +  -5.8  -5.09895   ATGATGAAAATGAAA          CTGAGACA GATTAGTAA TGTCTCAG          TTTTTTGCGTACATA  80 41
MKD39_RS02790  605630 ..  605679 + -10.3  -4.88495   AAATAAATTTATACA TTAAAAAGAGCAATACAAAGCTA AACA TAGTTTTGTATTGCTCTTTAACA TTTTATTCTGTATAT 100 35
MKD39_RS02805  607467 ..  607499 + -12.1  -5.02201   AGTAATGAAAAATAA      GGAGAACAGAATTCA TAA TGATTTCTGATCTCC      TTTTTATAGTATTTT 100 72
MKD39_RS02810  608927 ..  608950 + -11.1  -5.08169   AATCTGACATTTTTA          GTATCGAGC ACATAG GCTCGATAC           TTTTTTAGGCTCTAT 100 47
MKD39_RS02840  616717 ..  616747 + -14.2  -5.04175   AATAAACGAAATAAA       GTCGACATTCTG ATTTATG CAGAATGTCGAC       TTTTTGTATAATTAG 100 36
MKD39_RS02855  619811 ..  619844 + -11.1  -4.92385   AGAGTTTAAATCTAG     CCCTCGATTTAGCAG ATTG CTATTAAATCGGGGG      TTTTATTTCAATATA 100 40
MKD39_RS02860  620582 ..  620593 +  -4.4  -3.91984   CGATGATGATAGGAT                CACT ACTC AGTG                 TTATTTACGGAATCT  59 224
MKD39_RS02870 NONE
MKD39_RS02875  624110 ..  624120 +  -2.6  -3.39505   AAACAAGTAACGCAA                 TATT ACA AATA                 TTGTCACTGTAAAGT  45 165
MKD39_RS02880  624611 ..  624654 +  -7.9  -5.74122   ATTGGATTGAAGTGA GACTTTTCATTTTAATAGCAC AATC GTGTTATTAA--TGAAAAGTC TTTTTTTATCTAATA 100 40
MKD39_RS02885 NONE
MKD39_RS02890  626306 ..  626316 +    -4  -3.10236   TGTATTTATATTGTT                 TCAT TCT ATGA                 TATTGAGATTGGATT  48 82
MKD39_RS02900 NONE
        efeB NONE
MKD39_RS02910  631534 ..  631567 + -10.5   -4.4078   GATAGTAAAATGAAA     CCTCGAG-ACTTGT GGGAATA ACAAGTACTCGAGG     TTTATTAGTTATTAT  91 49
MKD39_RS02925  633330 ..  633369 +  -5.1  -3.69883   GCCAATATATATATG  TATGTAGCCTGAGGTAT TGAATT GTGTCCCAGGCTATATA   TTAATTATTTATTAT  57 167
MKD39_RS02935  637084 ..  637118 + -16.7  -4.75308   ATTATTTCAAAAATA     GCCCGTAAATGAATT GTAAA AATTCGTTTACGGGC     TTTTTGAATATTCAT 100 69
         mqo  640138 ..  640182 + -12.3  -4.90869   ATAAAATAACATTAA GCTCCTTAAAAAGTTTGCACT TTA AGTGTTTACTTTATAAGGAGC TTTTTCATTAGTAAT 100 54
MKD39_RS02970 NONE
MKD39_RS02975  645183 ..  645220 + -15.7   -5.0538   CAGCTATAATCATTT   TGCGGGAGTGGAACA AAACATAC TGTTCCACTCCCGCC    TTTTTTAAAATAGAA 100 105
MKD39_RS02985 NONE
MKD39_RS02990  648486 ..  648496 +  -2.6  -2.91383   TTTTATTCCAACTTA                 TTAA ATT TTAA                 TCTATACATAAAAAT  41 231
MKD39_RS02995  649804 ..  649847 + -25.8  -3.37344   AATACAGTATCAAAT TGAAGAAGCCATTAATTGAG TTAA CTCAATTAATGGCTTCTTCA TTGATTAAATGCAAC 100 81
MKD39_RS03005  651190 ..  651216 +  -2.9  -2.83258   ATTCATAAAGACTAA         GGAGGTCATAG AATGA CAACGACCTTC         ATTGTTGGATATATT  43 26
MKD39_RS03010  653285 ..  653317 +  -9.4   -5.7946   GACATTATTTTTAAA     GTATCGG-TACACTT CTTT AAGTGTAATCGATAC      TTTTTTTATTAGAAA 100 54
MKD39_RS03020  655197 ..  655233 +  -7.4  -5.07486   ATCACGTAGGTAATT    GAACTGAGAAGGGC ATTTAATTG GTCATTCTCAGTTC    TTTTTGTTGAAGATG  86 99
        corA NONE
         fni  658398 ..  658427 + -13.7  -5.31877   AATTACACAAATAAA       GCAAGTTGAGAGT TTGG ACTCCCAACTTGC        TTTTTTATAATGCCT 100 78
MKD39_RS03055 NONE
MKD39_RS03060  661722 ..  661764 + -10.8   -5.4387   TGAATAAATGTTTTA CGCAAACGCTGTCTATTAAA AAT TTTAATAGAGAGCGTTTTCA TTTTTTAATTTATAT 100 34
MKD39_RS03065 NONE
MKD39_RS03070  663296 ..  663333 + -17.3  -3.34404   TAAAGTAAAAAACAT   TAAAGCGGGTAGATCGT CAGT ACGATTTATCCGCTTTA    TATTATGCTTAATAG 100 38
MKD39_RS03080  664875 ..  664910 + -12.9  -3.65996   AATAAATAAAAATAA    GCCAGAAAATGAA-CT AAGAA AGATTCATTTTCTGGC    TATTTGTATGTGCAC 100 41
        hutG  668818 ..  668852 +  -3.1  -5.33921   TTCAAACATGAAAGA    GTAGAACGTTGAATTCG CGT TGAATTC--TGTTCTAC    TTTTTTAATTACTTT  70 107
MKD39_RS03105 NONE
MKD39_RS03110  672264 ..  672291 +  -8.5   -5.0916   AGAATATAAATCCAA        CGCAAGGGTTT CAAAAA AGACTCTTGCG         TTTTTATGTTGAAAG  95 48
MKD39_RS03115  673013 ..  673023 +  -2.6  -4.82901   ATCTTGTAACTTTAA                 TAAT AAA ATTA                 TTTTTATAAAGGAAA  63 108
MKD39_RS03120  674409 ..  674421 +  -3.5  -2.74514   GAAAAATTAAAATAA                TTAAA TAT TTTAA                TAGTTCAAAGTTTGG  44 89
MKD39_RS03125  675107 ..  675148 + -14.6  -4.43815   TTACTAAGGTGGATA CCCCAACAAGGAGAGTTT ACAAAG ACAATCTCCTTGTTGGGG  TTTTGATGTGTTAAT 100 124
MKD39_RS03135  677801 ..  677833 +  -7.3  -5.73339   TGGACAAGTGAAAAA     GACAATTTCTAATG AAATAA CAT-AGAAATTGTC      TTTTTTTATAATTGT 100 74
MKD39_RS03145 NONE
MKD39_RS03150  679832 ..  679848 +  -2.3  -2.71693   TTCCATCTCTTTTTT              TATGACT GAA AATCATA              TGAGTTTAGTTAATG  39 108
MKD39_RS03165  682322 ..  682352 + -14.2  -5.20783   GGGCTCTATAATAAA       TTGGACTGATGACT AAA AATCATCAGTCCAA       TTTTTATGTTTGAAT 100 142
MKD39_RS03170  683763 ..  683780 +  -6.3  -3.59979   GCTTAATCTCAATAT             TTGGACT CATC AGTCCGA              TTTGACGTAGAGCCC  64 35
MKD39_RS03205  690771 ..  690783 +  -3.5  -3.40371   TTAATCATTTTAATA                TATAA TAA TTATA                TTAATTCATAAAATA  49 92
MKD39_RS03210  691814 ..  691858 +  -2.5  -5.77853   ATACTAGGAAATTTA TAGAGGTAGGACAATGAGA-GA GAAA TCATTTCA--GTCCTATCTCTA TTTTTTTTAAAAATT  78 77
        fdhF NONE
MKD39_RS03220  695650 ..  695666 +  -8.1   -2.9415   AAGGGGTGGGATAAT              GAATTCA AAT TGAATTC              TGTCTCGCTCCTTTC  69 161
MKD39_RS03225 NONE
MKD39_RS03230 NONE
MKD39_RS03235  698057 ..  698100 +  -7.8  -3.51234   AAGACGGATACTGAA GACTAATTAAGCATATAAGTT AAT GATTAATATGCTTAAT-AGTC TGTTTCAGTTTCCGT  70 44
MKD39_RS03265 NONE
        nhaC  704790 ..  704820 +   -15  -5.95946   ATGAGTCCAAATATT       GAGATTAAGCAACT TTA AGTTGTTTAATCTC       TTTTTTTGTTGTTGA 100 342
MKD39_RS03285  708800 ..  708814 +  -2.9  -3.09015   GAATTCAAGTCAATG               TCTAT CTTTA ATAGA               TTGGGTAAATATAGA  44 129
MKD39_RS03290 NONE
MKD39_RS03295  710374 ..  710388 +  -2.9  -4.58773   GATGTAACTTGTTAT               TGATA ATTAA TATCA               TTTTAATTTCATAAA  60 355
MKD39_RS03300  710895 ..  710934 +    -3  -5.24799   CGTTTATTCATAAAA  GACTTAAGCTTTGAGAGAT TCA ATCTCATTGA-CTTAAGTC  TTTTTGTGTTTATAA  70 45
MKD39_RS03305  712203 ..  712230 +  -8.6  -5.63517   AACTATAGTTTTTAA        GTCTTGATCAAT AATT ATTGATTAAGGC         TTTTTTATTTCACAA 100 50
MKD39_RS03310  713289 ..  713317 + -14.1  -5.22039   ATTTATGATATTTAA        GCTATGATTACAT ATA ATGTAGTCATAGC        TTTTTTAAATTTACA 100 66
MKD39_RS03315  714305 ..  714333 +  -9.1  -3.25719   ATTCTCCTTCTTGAA        TGTAAACTTTTTA TTT TATAAAGTTTACA        TTAGTGGTATAATCA  78 27
MKD39_RS03320 NONE
MKD39_RS03325  715724 ..  715766 +   -18    -3.794   AAGTTAATTAAATAA GCCACAGAGTAGTTTGAA CTAATTA TTCCAACTACTCTGTGGC TTTAATACGTTCAGG 100 30
        modA NONE
        modB NONE
MKD39_RS03345  718947 ..  718993 +  -5.9  -4.23615   AATCTAGTCAACATT GCGGGGGTGGGCCGAAGAATTCA TAT TGCATTC-T-GTACCACTCCCGC TTTGTTCGATATAAT  68 138
MKD39_RS03350 NONE
MKD39_RS03355  720985 ..  721003 +  -5.3  -3.90491   ATACCAGCAATTTGT             GCAGTGT TAAGT ACATTGC             CTTTTTTATTAGTAT  63 443
MKD39_RS03365 NONE
        mobB NONE
MKD39_RS03375 NONE
        moaD NONE
        mobA NONE
        moaA  725294 ..  725324 + -14.2  -5.93252   GTGGTTAGATAACAT       CTCTAGCAATGGTT TAT GACTATTGCTAGAG       TTTTTTATTTTTGGA 100 33
MKD39_RS03395  726087 ..  726114 +    -7  -3.57639   CAAAATGATAAAATA        GGCTGAGACA TTTTATTT TGTCCCAGCC         TCTTTCTACATATTA  69 172
MKD39_RS03410  729041 ..  729051 +  -6.8  -2.91924   GAAATAATATTTTAA                 TCGC ACG GCGA                 GTTTGTCGACACTCA  61 357
MKD39_RS03415  730383 ..  730393 +  -2.6  -2.82327   AAAGGCAAATAGTCA                 TTAA CGA TTAA                 ATTTAAATCTGAACG  41 29
MKD39_RS03420  733723 ..  733780 + -13.8  -3.18912   AAGCCTGGGACATTA TGATATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATT TTTTC AATGTTTACTTTGAAGGG-GCATATCA TTAATCAATGACTCA 100 48
MKD39_RS03435  735534 ..  735563 + -11.6  -4.75372   ATAAATATGAAAAAA       GCAAGCAATTCT ACTTTA AGGATTGCTTGC        TTTTTACTGCATAGT 100 41
MKD39_RS03455 NONE
MKD39_RS03460  742057 ..  742085 + -12.6  -5.49809   GGTTAATAAGGAAAA       GGACGATG-CTCT ATTA AGAGACATCGTCC        TTTTTTTACCATTTA 100 35
        rpsJ NONE
        rplC NONE
        rplD NONE
        rplW NONE
        rplB NONE
        rpsS NONE
        rplV NONE
        rpsC NONE
        rplP NONE
        rpmC NONE
        rpsQ NONE
        rplN NONE
        rplX NONE
        rplE NONE
MKD39_RS03540 NONE
        rpsH  749967 ..  749977 +  -3.2  -3.14881   AAGGAGGTGCCATAA                 CATG AGT CGTG                 TTGGTAAGAAAATTA  46 49
        rplF NONE
        rplR NONE
        rpsE NONE
        rpmD NONE
        rplO  752056 ..  752072 +  -2.2  -2.84325   TTGATGCAAAAGGTG              GAGCAC ACGAG GTGATC              TAATGTTTCAAACGC  40 6
        secY NONE
MKD39_RS03580  754185 ..  754198 +  -3.1  -3.24381   TTCGTATCGTTGAAG               TTGTC TATT GACGA                TTACCTTACTATTGT  46 174
        infA NONE
        rpmJ NONE
        rpsM NONE
        rpsK  755385 ..  755395 +  -2.4   -3.0439   GTCGTCCACCAAAAC                 GTCG TCG CGTC                 TAATTTATAATAGAT  42 12
MKD39_RS03605 NONE
        rplQ  757133 ..  757173 +  -4.8  -5.45802   AGTCATCCTTAATAG GGGGCAGGACAATGGATTCG AAA TGAATTC-T-GTCCGGTCCC TTTTTATTTTGAAAA  79 339
MKD39_RS03615 NONE
MKD39_RS03620 NONE
MKD39_RS03625 NONE
        truA NONE
        rplM  761215 ..  761229 +  -3.5  -3.33696   ACAACAACCAGAAAA               CTACG AGTTA CGTGG               TTAATTAGAAGGAGG  49 7
        rpsI  761730 ..  761753 +  -7.5  -5.37043   ACTGAAATGTTTAAA          GCACTTTTC AATTTC GAGAAGTGC           TTTTTTGTATGCAAT  91 110
MKD39_RS03650  763587 ..  763622 + -17.2  -4.33281   AACCCTAGAGAAATA    GCCAGTAAATGAGTTT TAAC AAATTCATTTACTGGC     TTCTTTATTTACAAT 100 64
MKD39_RS03685  770983 ..  770998 +  -6.1  -3.96291   CTTTATTATGATGTA              GCGCA CTATGT TGCGC               TTTCTCCCCTTTATA  68 118
MKD39_RS03740 NONE
MKD39_RS03745 NONE
MKD39_RS03750 NONE
MKD39_RS03755 NONE
MKD39_RS03760 NONE
MKD39_RS03765  789921 ..  789958 +  -7.9  -5.10767   TTTAATGAAATTCAA   GAGCTAATTATTCTCAT ATTT ATGATGAAAATTAGCTC    TTTTTATATTGCATA  89 36
MKD39_RS03770  791975 ..  792002 +  -8.5  -5.38951   ATTTAGATTAAAAAA        CTGTCAACTAC ATAGCG GAAGTTGACAG         TTTTTTATATAACTT 100 504
MKD39_RS03785  793014 ..  793025 +    -3  -3.16676   CTACCAAATAATGAG                TGTA TGAA TACA                 TATTGAATTAATCAC  46 41
MKD39_RS03790 NONE
MKD39_RS03795  794953 ..  794985 +  -2.8  -5.95539   TTAGAGAATTTAAAA      TAGGGTTGATGATT TTATC GGTCATCAGTCTTA      TTTTTTTATTTAAGG  82 37
        sdrM NONE
MKD39_RS03805  797008 ..  797030 +  -7.8  -3.93288   AAGAAATAGCAAGCA           TTTAGTTTGC TTG GCATACTAAA           TTTGGTTGGATAAAA  75 32
MKD39_RS03810  798542 ..  798572 +  -6.9  -5.82281   AATCTGATATTGATA       GAAGTTAGCCAAC AAATA GTGAGCTAACTTC       TTTTTTTATATATTT 100 40
MKD39_RS03815  799777 ..  799806 + -13.8  -4.60746   AGGTTCTATAATAAA       TTGGACTGATGA CAAAAT TCATCAGTCCAA        TTTTCATGTTTTTGA 100 63
MKD39_RS03820  801262 ..  801286 + -12.3  -5.47159   GAGCCAAAATATTGA          CGCATGGAATT TTG AATTTCATGCG          TTTTTTCTATTGCAA 100 77
MKD39_RS03825  803550 ..  803567 +  -7.1  -2.78596   ACAGGTTTCTTAAGA             TTAGAAC TCAC GTTCTAA              TATGGTAGAAACATA  63 331
MKD39_RS03830  806517 ..  806531 +  -7.2  -3.04026   CAATTTATTTCAATG               TTTTGC GAA GCAAAA               TCATTTACTTACTAT  65 38
         rrf NONE
MKD39_RS03840  806771 ..  806784 +  -8.1  -3.14881   TCGAATCCTACCTGC               GGAGC CATG GCTCC                TTGGTCAAGCGGTTA  71 19
MKD39_RS03845 NONE
MKD39_RS03850 NONE
MKD39_RS03855 NONE
MKD39_RS03860 NONE
MKD39_RS03865  807193 ..  807212 + -12.2  -5.94713   ATGGCTCACTTATTA            GCACTCCT GTAT AGGAGTGC             TTTTTTTTATAAAAT 100 31
        cdaA NONE
MKD39_RS03875 NONE
        glmM  810554 ..  810587 +  -5.5  -5.63374   ACAATTTTCGTTTTC     CTTCAAAGTT-TACAT TTA ATGTGTAGCTTTGGAG     TTTTTTTAATATTAA  88 54
        glmS  813120 ..  813158 +  -4.2  -6.02919   TAGTTACCCTAGTGG  GAGCAAGATATTAAATTC ATTAA GAATTTGA--TCTTGCTC  TTTTTTTATTTGTAA  91 148
MKD39_RS03890  814021 ..  814038 +  -3.5  -2.90571   AAAAATCGATTTTCT             TTACACCT GAT AGG-GTAA             TCTCGTTGCACAATT  45 8
MKD39_RS03895  815011 ..  815046 + -17.2  -4.33281   AACCCTAGAGAAATA    GCCAGTAAATGAGTTT TAAC AAATTCATTTACTGGC     TTCTTTATTTACAAT 100 72
MKD39_RS03910  819030 ..  819042 +  -4.1  -4.53036   AACATAAAATTGATT                CGTCA TGT TGATG                TTTTGGTGTTTCTAA  67 147
MKD39_RS03925  821137 ..  821171 +    -6   -4.2572   ATTATTTCAGTTGTG    GTGGGATAATGAATTC TAATT GAATTC-T-ATCCCAC    TTCTTTATGTGTTTT  68 104
MKD39_RS03930  822304 ..  822314 +    -4  -3.97344   GAAGGAGACTTTACA                 CTAA TCA TTAG                 TTATATTTGATTTTT  56 5
MKD39_RS03935  822620 ..  822663 + -11.4  -4.60255   TTAAATTAATGCATA GGGGAATATTTAGAAT-TATT AAT AATGGATTCTGAATGTTCCCC TTTTTAGCAACTTAT 100 37
MKD39_RS03940  824224 ..  824249 +  -9.8  -5.17786   CTTAAGATAACTAAA         CCTGAGACGT TTTACT ATGTCTCAGG          TTTTTAATTTTATTA 100 41
MKD39_RS03945  824796 ..  824811 +  -4.8  -2.80195   ATAAACGCATCTAAT              TGATAA AATA TTATCA               TAATTGATAATGAGT  51 27
MKD39_RS03950  825494 ..  825526 +   -10  -4.90002   ATTAATATATAAAAA      GGTGCTTGAGAT TTCATTATC GTCTCAAGCACC      TTTTATTATCTATTA 100 40
        deoC  827074 ..  827084 +  -5.4  -3.75024   ATTCAAGGCTTAGAG                 TCAG ATT CTGA                 TTATTAATAATGCAA  61 8
        deoB NONE
MKD39_RS03975  830018 ..  830051 + -15.6  -5.48213   AAGAGAAAAGTAAAA     CCACCAATACTTAA ATATAC TTAAGTATTGGTGG      TTTTTATTTTAAATA 100 41
MKD39_RS03985 NONE
MKD39_RS03990  833301 ..  833343 +  -3.6  -4.69962   TCAATGCGTCAATTT GGGAGCAAGACATGGCATTC ATCAA GAATAC-A-GTCTTGGTCCC TTATTTTTTAGTATA  64 153
MKD39_RS03995  834199 ..  834228 + -10.9  -5.30686   AGATGAATTGTTAAA       CCCTTAATCAC ATCTTTTG GTGATTAAGGG        TTTTTTATAAATATT 100 130
MKD39_RS04005  836194 ..  836208 +  -4.3  -3.14468   ATATAATTAAAAAAT               TCTTC GAAAG GAAGA               TTAGCTATAATGAAA  52 116
        rpoE  836838 ..  836870 +  -9.2  -6.20267   GTGTATAAATCATAT     ACGCTCCC-CTTACA GATA TGTGAGAGGGAGCGA      TTTTTTTATTTTTCA 100 127
MKD39_RS04015  838569 ..  838606 + -13.7  -4.48072   AAATAATATAATAAA   TCAACCCTTACGT-ACTG AAA TGGTGACGTAAGGGTTGA   TTTTATAATGAATAT 100 35
MKD39_RS04025  840243 ..  840268 +   -12   -5.4182   GATGTTTTGAACTAG         GAGTGAAACG TTAAGT CGTTTCACTC          TTTTTCTTTATAATT 100 55
MKD39_RS04030  841825 ..  841837 +  -3.5  -3.10715   ATTAGCTTTTTCTGG                TATAA TAA TTATA                TTAGATACTAATAAG  46 83
MKD39_RS04035  842379 ..  842395 +  -5.9  -4.21922   ACTCTTTTGCTATTT              CATACTA AGA TGGTATG              TTTAATTTTCAATGA  68 115
MKD39_RS04040  843912 ..  843954 +  -9.5  -4.64657   AATTTATATATTATT TATAACAGTTCATGGAA-TA TTTT TAGTTCCATGAGCTGTTTTA TTTTTGGAAATTTAA 100 52
         rho  845549 ..  845559 +  -5.4  -2.70932   AAACTCACAAATAAC                 TCTG TTC CAGA                 TGGTTCAGGGCAAAG  52 106
MKD39_RS04050 NONE
MKD39_RS04055 NONE
        prfA NONE
        prmC  848503 ..  848534 +  -7.5  -4.41353   ATGGTAAAACTCAAA      GTTACTTATCTGA TAAAAT TTAGATGAGTAAC       TTTTCATATATATGA  78 34
MKD39_RS04070 NONE
MKD39_RS04075  850087 ..  850112 +  -8.4   -4.9755   ATAAGTTATAATGAA         GAAGTATAGC TAGTTT GCTATGCTTC          TTTTTAATTATGTAT  95 78
MKD39_RS04080 NONE
MKD39_RS04085 NONE
         upp NONE
        wecB NONE
MKD39_RS04100 NONE
        atpB NONE
        atpE  855256 ..  855281 +  -6.2  -3.89235   AATAAGAAAATTTCA         TGGCGAAG-TC ACTTG GATCTTCGCCG         TTCGTTTTATTTAAT  68 36
MKD39_RS04115 NONE
MKD39_RS04120 NONE
        atpA NONE
        atpG NONE
        atpD NONE
MKD39_RS04140  860691 ..  860720 + -13.1  -5.53436   TAAAATAATTAAAAA       GGTTTGGAAACTA ACTT TAGTTTTCAAACC        TTTTTTATGTTGTAT 100 33
MKD39_RS04145  861039 ..  861055 +  -4.5  -2.79912   GTGAAATTTTTATTT              CAATAAT GAG GTTATTG              TAAATTCTTTTTAAA  49 20
        murA NONE
        fabZ  863037 ..  863064 + -11.4  -3.43245   CAAAATGATAAAGTA        GGCTGAGACA TTTAATTT TGTCTCAGCC         TCATTTTTATTCTCT  93 171
MKD39_RS04165  864157 ..  864190 + -11.9  -3.18321   TTAATTATACTCATG     GCCTCTCTTATATAA AGAA TTTTATAAGGGAGGC      TATTAAATTATCCAT  95 82
MKD39_RS04170  865174 ..  865201 + -10.7  -5.95449   ATTATTTTAAAGTAA        GAGTGGAACAG TGAATT TTGTTCCACTC         TTTTTTGTTTTGTTT 100 53
        tenA NONE
        thiD NONE
        thiM NONE
        thiE NONE
        yidC  869356 ..  869384 +   -14  -5.14477   ACTAGTAAGTAAAAA        GGTCGATATCCT TACGT AGGGTATCGACC        TTTTTTGGCTCTATA 100 56
MKD39_RS04200  871306 ..  871321 +  -6.2  -4.27467   TGTTTTTAAACAATC              TAAAGC ATTG GCTTTA               TTTGTTAACTTATCA  72 495
        csoR NONE
MKD39_RS04220  873812 ..  873824 +  -3.5  -3.15638   ATTAGGTTGATAATT                TAAAA TAA TTTTA                TTAAATATCAATTTT  47 31
MKD39_RS04225  874107 ..  874142 + -17.2  -4.33281   AACCCTAGAGAAATA    GCCAGTAAATGAGTTT TAAC AAATTCATTTACTGGC     TTCTTTATTTACAAT 100 81
MKD39_RS04240 NONE
MKD39_RS04245  880087 ..  880125 +  -4.1  -5.72207   TACTATCAATCTAAG  CAAGTCACTAATTAGGAAT CTA AATCCT--TTAGTGGCTTG  TTTTTTTACTTTAAA  80 54
MKD39_RS04250  881871 ..  881892 +  -6.6  -4.39318   AATTTTATAATCAAA           CCATCTCA TGCTTT TGAGGTGG            TTTTAAATTTGATTA  74 56
MKD39_RS04255 NONE
MKD39_RS04260 NONE
MKD39_RS04265 NONE
        acpS  884918 ..  884934 +  -3.7  -3.08464   AAAAATAATTTCTAC              CTCGT ATTTTGA ACGAG              TTAAATCAATAATAA  46 53
         alr NONE
        mazE NONE
MKD39_RS04285  886912 ..  886934 + -13.6   -5.1287   TAGTCTTTAGTTGTT           GACTTTAGGT AAT ACCTAAAGTC           TTTTTTAAATATAAA 100 185
MKD39_RS04290  888098 ..  888117 +    -8  -2.66249   TAAATCTAACTATGG            GTATACTT ACTA AAGTATAC             ATATTATTAGTAACA  67 62
MKD39_RS04295 NONE
        rsbW NONE
        sigB  889831 ..  889871 +    -2  -6.09196   CTAGTCATCTTTGTG GGGGTGGGACAATGAATTCA CTA TGAATTC-TA-TCCGACTCC TTTTTTTCTTTTGAA  81 144
MKD39_RS04310 NONE
MKD39_RS04315  892579 ..  892617 +  -2.5  -5.47159   AGTAACTAAAATTGA   AATTCAGGTCTACTTTT ACAAA AATTGTAGATCTGAATA   TTTTTGTTTATTAAA  71 47
MKD39_RS04320 NONE
MKD39_RS04325  893059 ..  893069 +    -4   -2.7364   GAACAGTAACTTAAT                 TGTT ACA AACA                 CTATTTAGTATTATG  45 91
MKD39_RS04330  894765 ..  894781 +  -6.7  -3.02856   AAATGAAAATTGCAT              TCAAAAT TAT ATTTTGA              TATACTATTTTGATG  62 133
MKD39_RS04335  898032 ..  898046 +  -7.2  -3.04026   CAATTTATTTCAATG               TTTTGC GAA GCAAAA               TCATTTACTTACTAT  65 38
         rrf  898214 ..  898229 +    -9  -5.60993   GCCAGGCAAATTATT              GAGACC GAAA GGTCTC               TTTTTTTATGCACAA 100 34
        tsaE NONE
        tsaB NONE
        rimI NONE
        tsaD  914381 ..  914393 +  -3.5  -3.97674   ATTTATATTATTTAT                TTAAT CGA ATTAA                TTATTTCAATAATCA  55 41
MKD39_RS04420  917591 ..  917613 +  -9.2  -5.01042   ATATTTATATTCTTG           CATCCTTCTT TAT AAGAGGGGTG           TTTTTAATTTGCGTT  95 46
MKD39_RS04425 NONE
MKD39_RS04430  919196 ..  919208 +  -4.9  -4.57073   GCTATTTCAATTTAG                TATCA TTA TGATA                TTTTTAAAGGAAGTG  68 113
MKD39_RS04435  920469 ..  920479 +  -2.6  -3.78778   AAATTAAATAAGAGA                 TATT GAT AATA                 TTATTAGTCTAATAC  49 20
MKD39_RS04440  921583 ..  921598 +  -3.4  -3.09908   AATGATAAAATTATA              TTAAAT TTAG ATTTAA               ATTATTTTGGAGGAA  46 75
MKD39_RS04445 NONE
MKD39_RS04450  924080 ..  924113 +  -9.7  -5.28778   TAAATGATAAAAATT     GCCAGCAAATGATTT TAGT AATTCATTTACTGGC      TTTTTTATGCCTGAT 100 34
MKD39_RS04485  931154 ..  931197 +  -9.1   -3.6914   AACTAAAATAGAAAA CGCATCTATTATTGTCATT TGAAAT GATGAGATTAATAGATGCG TTCATTTATTAAAAT  80 35
       groES NONE
        groL  934178 ..  934216 + -12.6  -5.38951   AAATAATCCTTTTGA   GACGTTTTCCATGAGTTT ACT AAACTTTTGGGAAGCGTC   TTTTTTGTATGAGTT 100 112
MKD39_RS04510 NONE
MKD39_RS04515  937710 ..  937724 +  -7.8  -5.63517   AATCAGTGCACAAAA               GGCCCT TTA AGGGTC               TTTTTTATTTAGAAA 100 147
MKD39_RS04530  940524 ..  940541 +  -7.7  -5.60993   AATGGTAAATTTTAA             CGTCTAC TTAT GTAGGCG              TTTTTTTATACCAAA 100 26
MKD39_RS04570  946279 ..  946306 + -14.3  -3.58766   GACCATACACAAAAA        CCCCTAACTTG CCGTCA CAAGTTAGGGG         TTGTGTAATGTAATT 100 43
MKD39_RS04575  946623 ..  946654 +    -9  -5.43553   AAATAACATTTTAGA      CTCTATAT-TAGCGT TTG ACGTTAGATATAGAG      TTTTATTTTTTAAAT 100 35
MKD39_RS04580 NONE
MKD39_RS04585 NONE
MKD39_RS04590 NONE
MKD39_RS04595 NONE
MKD39_RS04600  950386 ..  950420 + -18.2  -3.36313   TTGATATCCAAAAAA     GAGGGTAGTAAAACAA ATT TTGTTTTATTACCCTC     TTACTATATATACTT 100 55
MKD39_RS04610 NONE
MKD39_RS04615 NONE
MKD39_RS04620  953216 ..  953242 +  -2.3    -5.243   AATCACTTATATAAG         TCGACGAAC GATTTTAAA GTTCGTCTA         TTTTTTAATAATTTG  67 66
MKD39_RS04630  954812 ..  954839 + -10.7  -5.65927   ATAATAGTAATTTAA        CCAGTGACTTC CGTTTT GAAGTTACTGG         TTTTTTATTTCAATA 100 40
MKD39_RS04635  955986 ..  956011 +  -9.7  -4.67168   TAAGTAAAATACTAA         GCCACGGCAGT GTAA AATGTCGTGGC          TTTTTGCAAATTTTT 100 38
MKD39_RS04655  960398 ..  960446 + -17.1  -3.66999   GAACACAACCCAACA ATAAATAGCCAGTAAATACGTTT TGA AGACGCATTTACTGGCTATTTAA TTTCGATACATCAGT 100 58
MKD39_RS04670 NONE
        nadE NONE
MKD39_RS04680 NONE
MKD39_RS04685  965768 ..  965804 +  -7.5  -5.19328   AATTAATTTTATTAA    GAGTGAAAAGAAGCT AAAGTAC AACTTCTTTTTACTC    TTTTTATTATCGGAT  91 65
        purB NONE
MKD39_RS04695  967730 ..  967775 +  -6.9  -4.08271   ATTTATAAATTGAAA TGCTCCCTTCAAAATTGACAA TAAT TTGGATATTTTGATGGGAGCG TTCTGTTTTATATTG  72 58
MKD39_RS04700  968659 ..  968678 +  -2.2  -3.25223   AAATAAAAAAGGAGT            CTAATAAA TGAA TTCATTAG             TTAATAATATGAATA  43 15
        pcrA NONE
        ligA NONE
MKD39_RS04715  974087 ..  974134 + -11.7  -4.03645   ATTTATAATAATTAA CATAAAACTACGGATAACGCCTA CAAG TTGG-GTTATCCGTAGTTTT-TG TTTAATATTATTATT 100 26
        gatC NONE
        gatA NONE
        gatB  979389 ..  979421 + -12.1  -4.71222   TAAAGCATCATTTAA      GGTTTGTTTCCTATC ATG GTTAGGGAACAAGCC      TTTTAATTTTGGTGT 100 64
MKD39_RS04740 NONE
        rlmD NONE
MKD39_RS04750 NONE
        dinB  984113 ..  984129 +  -2.3    -3.745   CGTGAAAATCTAATT              TATAATG TTT CATTAAA              TGTTTTAGTCCGTAA  50 223
MKD39_RS04770 NONE
MKD39_RS04775  987520 ..  987555 +  -4.8  -5.73978   ATAAGCAATTAAAAA    TGACGTACCGGA TCTATAGAATTT TCCAGTACGTCA     TTTTTTATTTGTCAT  83 49
         map  989512 ..  989545 +  -4.8  -5.42514   TATATATAATGAAAA    CCAGTAAAATGAGATG ACAA CG-CTCATT-TACTGG     TTTTTTAGTTTATAC  79 84
MKD39_RS04800 NONE
        liaF NONE
MKD39_RS04810 NONE
        vraR  994512 ..  994540 + -10.4  -5.73563   GATTCAATAAAAAAA        GGTTGAGGCA ATAAACCGA TGCCTCAACC        TTTTTTTAATTTAAT 100 31
MKD39_RS04835 NONE
MKD39_RS04840 NONE
MKD39_RS04845  998999 ..  999034 + -17.2  -4.33281   AACCCTAGAGAAATA    GCCAGTAAATGAGTTT TAAC AAATTCATTTACTGGC     TTCTTTATTTACAAT 100 114
MKD39_RS04860 NONE
MKD39_RS04865 1003076 .. 1003113 + -12.9  -5.47159   TTCGCAATATTTAAT   GAACTGAGAAGAGACTT TAAT ATGTCTTTTCTCGGTTC    TTTTTTGTATTCAAA 100 101
        sgtB 1004147 .. 1004189 +    -6  -4.99035   CGTAATTATAATTTA GTCTTCATAAAGTATTCATT ATATA AATGAA--CTTTATGAGGAC TTTTTATATAGGTAA  78 69
        recX NONE
MKD39_RS04880 NONE
MKD39_RS04885 NONE
MKD39_RS04890 1008180 .. 1008203 +  -8.2  -2.56122   AAGTGAACTTGGCAT          CTTTGCCAAC TTAC GTTGGTGAAG           GATTTTCTAATGGCA  66 467
        mutY 1011330 .. 1011357 +    -2  -3.58305   TATAAGTAATTTTTG        GAAGCTATATTA AAAA TAGTAACGCTTC         TTTAAAGACTTAATT  46 52
MKD39_RS04910 NONE
MKD39_RS04915 1013935 .. 1013965 + -16.4  -5.95946   ATGAGTCCTAATATT       GAGATTAAGCAACC TTA GGTTGTTTAATCTC       TTTTTTTGTTGTTGA 100 91
         bcp NONE
MKD39_RS04940 NONE
        perR 1020284 .. 1020315 + -10.2   -5.5353   GACAAAATGATAAAA      GAGGCTGAGACA TTTTATTT TGTCCCAGCCTC       TTTTTTATTAATCTA 100 175
MKD39_RS04950 1022427 .. 1022439 +  -6.3  -3.07013   TGCGGCTGGATCACC                TCCTT TCT AAGGA                TATATTCGGAACATC  60 20
MKD39_RS04955 1022595 .. 1022625 +  -2.7  -3.06796   TTCGAGTCCACTCAG      GCCCACCATTAAATA AAA TAGTTA-TGG-GGGC      TTAGCTCAGCTGGGA  42 18
MKD39_RS04960 1022853 .. 1022870 +  -7.1  -2.78596   ACAGGTTTCTTAAGA             TTAGAAC TCAC GTTCTAA              TATGGTGGAAACATA  63 183
MKD39_RS04965 1025820 .. 1025834 +  -7.2  -3.04026   CAATTTATTTCAATG               TTTTGC GAA GCAAAA               TCATTTACTTACTAT  65 38
         rrf 1025985 .. 1025995 +  -5.4  -2.79133   CGCTAGAGTAGGACG                 TTGC CAG GCAA                 TATAATGGAGAATTA  53 17
MKD39_RS04975 1026052 .. 1026064 +  -3.3  -2.83119   CAAGCAGAGGGTCGG                CGGTT CGA ACCCG                TCATTCTCCACCATT  45 0
MKD39_RS04980 1026180 .. 1026196 +  -4.4  -3.15249   CCGGCACCATCTATT              TTGAGC CATTA GCTCAG              TTGGTAGAGCATCTG  52 32
MKD39_RS04985 NONE
MKD39_RS04990 1026335 .. 1026358 +  -2.2  -3.09516   TGGGGGTTCGACTCC          CTTCACCCGC ATAC GCGGAAGTAG           TTCAGTGGTAGAACA  41 15
MKD39_RS04995 NONE
MKD39_RS05000 1026538 .. 1026554 +  -2.2  -3.06312   GCACCATATATAATT              TTGCGC CCGTA GCTCAA              TTGGATAGAGCGTTT  41 35
MKD39_RS05005 NONE
MKD39_RS05010 1026672 .. 1026686 +  -4.2  -3.04144   GGGACCAAGGGGTCG               CAGGTT CGA ATCCTG               TCTTCCCGATAGGAA  48 1
MKD39_RS05015 NONE
MKD39_RS05020 NONE
MKD39_RS05025 NONE
MKD39_RS05030 1027073 .. 1027089 +  -4.3  -3.24709   GGCTTAACGGCTCGC              GGGGGTT CGA ATCCCTC              TTCCTCCGTATTTTA  52 1
MKD39_RS05035 NONE
MKD39_RS05040 NONE
MKD39_RS05045 NONE
MKD39_RS05050 1027480 .. 1027495 +  -6.2  -3.08312   TTCCCGTCGAGACCG              CCATTA CAAA TAATGG               TTCAGTAGCTCAGTT  60 23
MKD39_RS05055 NONE
MKD39_RS05060 NONE
MKD39_RS05065 NONE
MKD39_RS05070 1027819 .. 1027830 +  -3.6   -3.2963   CGATTCCTACTGTCC                CTGC CATG GCGG                 TTGTGGCGAAGTGGT  47 19
MKD39_RS05075 NONE
MKD39_RS05080 NONE
MKD39_RS05085 1028060 .. 1028079 +    -5  -2.84586   AAATCCGGTTGCCGC            CTCCATGCA CGA TGCG-GGAG            TAGTTCAATTTTAGA  51 20
MKD39_RS05090 NONE
MKD39_RS05095 NONE
MKD39_RS05100 1028512 .. 1028525 +  -6.7  -5.72622   CGCTCCATGTTTTTG               CTTCC AAAT GGAAG                TTTTTTATTTATCAA 100 34
MKD39_RS05105 1028643 .. 1028672 + -12.3  -6.28401   GGTATAATTCTTAAT       GTGGAAATGTTGT TTTA GCAACGTTTCCAC        TTTTTTTGTTTTTTA 100 37
MKD39_RS05110 1030078 .. 1030115 +    -5  -5.51165   CTAGTTAACCTGTCA   GGGTGAGACAAAAATT TAAATC GAATTTTGTTTCACTC    TTTTTTTAAAATTTT  79 148
MKD39_RS05115 NONE
MKD39_RS05120 1032374 .. 1032409 + -11.3  -3.98859   AGTAAACAAATAACA    GCGAGTCTGAGACAT TATTTC ATGTTTCAAACTCGC     TATTTTTAAATTGAA  95 43
        queG NONE
        trmL 1034248 .. 1034264 +  -3.7  -4.06491   TCTAATAGGGTAATT              TAACGAA TAA TACGTTA              TTTATATGACATTGA  55 141
MKD39_RS05135 NONE
MKD39_RS05140 1035125 .. 1035155 +  -9.2  -5.52384   TAGTTATGAACTAAG       TAACCTAAGATGTT AAA GATGTCTTAGGTTA       TTTTTTTAATGAAGC 100 75
MKD39_RS05145 1035733 .. 1035769 +    -6  -5.77988   TTTTTTCAAAGATAG    TAGCGATTGGGACATT AAATC ATTGTTTCAATCGTTA    TTTTTTTATATCTAT  95 77
        fumC 1037300 .. 1037331 +   -11  -4.22676   ATATAACTAATAAAA      GGAGTAACTGTCTA TGAA TCGATAGTTACTCC       TTATTATTTATTCAT  95 52
MKD39_RS05160 1039436 .. 1039449 +  -5.3  -3.63059   TAACAAAGGAACAAC               GCTTT CTTT AAAGC                TTCCTTTGTAAATTG  59 1
MKD39_RS05165 1040194 .. 1040204 +  -2.6  -4.39386   AGTTAGCAAATAAAT                 TAAT TTA ATTA                 TTTTGATAATTTCGC  55 113
MKD39_RS05170 1041053 .. 1041082 +  -4.3  -4.23077   ATATTAATTAAAAGA       CGAGCCTAAGATAT TTG ATATCGC-GGCTCG       ATTTTTTTATTTTCA  61 243
MKD39_RS05175 NONE
MKD39_RS05180 1042765 .. 1042796 +   -19  -5.24989   TTGTTAGCACAATAA      GCTACAAAGCTTTC AATT GAAAGCTTTGTAGC       TTTTTTAATATATAA 100 41
MKD39_RS05185 NONE
MKD39_RS05190 NONE
        yhaM 1047964 .. 1048019 +  -8.7  -4.32669   TAGACTAATTTAAAA GCGTTTTTA-CC-TTACAATGTCAATT AATG AATAGACAATGTAGTGGGTAAAAACGC TTGTTTTATACAATT  83 33
MKD39_RS05220 NONE
MKD39_RS05225 1053019 .. 1053068 +  -5.1   -5.3321   CTTAAAGATTAAAAA GGTTGCCTA-TGACTAGAACAAGT TAA ACTAAATCTAGTTAACAGGCAACC TTTTTATTATTCCTT  77 29
        hemE NONE
        hemH NONE
        hemY 1057290 .. 1057305 +  -3.2  -3.63589   TTAAACACTTTTTTT              GAGGTG AAAT TGCCTC               TTTAAAAGTGTTTTG  49 45
MKD39_RS05250 1057981 .. 1058002 +  -5.1  -5.31855   TTTAAACTAATTTAA           GTAGGGAGT TAAA GCTACCTAC            TTTTTATTATTAATA  77 76
MKD39_RS05255 NONE
MKD39_RS05260 NONE
MKD39_RS05265 NONE
MKD39_RS05270 1058673 .. 1058686 +  -3.1  -3.72576   CCCCATAATCGTTTA               CTACG CGGG TGTAG                TTTAATGGCAAAACC  51 36
MKD39_RS05275 NONE
MKD39_RS05280 1058828 .. 1058841 +  -8.1  -3.14881   TCGAATCCTACCTGC               GGAGC CATG GCTCC                TTGGTCAAGCGGTTA  71 19
MKD39_RS05285 1058914 .. 1058935 +  -9.5  -5.75478   TAGGAGTCATACAAA           CAGAAGTGA AATA TCGCTTCTG            TTTTTTTATGTAATT 100 29
MKD39_RS05290 1059336 .. 1059362 + -11.7  -4.52047   AACAAGCAGAAAAAG         GAGCTAGTGTA GTGGA TACGCTAGCTC         TTTTCTCATATCATA 100 305
        menE NONE
        menC 1062278 .. 1062292 +  -2.8   -3.0517   TCTTTTTTAAAGGAA               CTGGAT CAA ATCCAC               CTTTATGTAGTGGAT  43 54
        ytkD NONE
MKD39_RS05315 1063777 .. 1063819 +  -4.3  -4.76644   GAAGAAATATAATAA GACAACGTATAAGGTTT CAGTATAGT ATGCCTTATACATTGTC TTTTTAATAAATATT  68 29
        metK NONE
MKD39_RS05330 1068132 .. 1068174 +  -9.4   -5.0925   TCTAGTCATCCTTGC GGGGGTGGGACGACGAATTT AAAAA GAATTC-T-GTCCCACTCCC TTTTTAATTTTGAGG 100 139
MKD39_RS05335 1069148 .. 1069192 + -16.1  -4.62441   ATAAAAATATAAAAA TACACTTCATAGTTGCAAGAT TTA ATCTTAAAACTATGAAGTGTA TTTATTTATATCGAA 100 40
MKD39_RS05355 1071362 .. 1071373 +    -3    -3.524   ATTAACACTTTCATG                TCTA TGTG TAGA                 TTCTCTAAATCAATC  49 99
MKD39_RS05360 1071997 .. 1072008 +    -3  -3.13742   TTTTGTACTAAATGA                TACA ATAA TGTA                 CTTTCTTGCCATTTT  45 43
MKD39_RS05375 1073395 .. 1073421 +  -5.3  -5.45802   GCTTTATAGAATCAA         GTAATGAAATT CTATA GGTTTCATTAC         TTTTTATTTTGCAAA  82 55
MKD39_RS05380 1074516 .. 1074546 + -14.2  -5.20783   TGGCTCTATAATAAA       TTGGACTGATGACT AAA AATCATCAGTCCAA       TTTTTATGTTTGAAT 100 117
MKD39_RS05385 1075957 .. 1075974 +  -6.3  -3.59979   GCTTAATCTCAATAT             TTGGACT CATC AGTCCGA              TTTGACGTAGAGCCA  64 35
MKD39_RS05390 1078125 .. 1078161 +  -9.5  -4.67641   GAATATACATTTGGT    CTCCCTATGCCTTTAAG CAC TTTATTGGTATAGGGAG    TTTTAATTTTGAGGT 100 402
        ribD NONE
MKD39_RS05400 NONE
        ribB NONE
        ribE 1081542 .. 1081579 +  -6.3  -5.69068   TTTTAATTAAAAATA   CAAATCCTCGACAAAGT ATTA GCAGTGTCGAGGATTTA    TTTTTTATCTTTTTA  95 35
MKD39_RS05420 1083749 .. 1083789 +  -5.7  -5.14563   TTAGTCTTCCTTGAG GAGCTGGGACTAAGAATTC GATAA GAATTCT--GTTCTAGCTC TTTTTTGGTAAACAA  80 137
MKD39_RS05425 1085286 .. 1085302 +  -3.7  -3.86283   TAGCATTTTACACAG              GAGTC TGGACTT GACTC              TTTAATGTAAGTTAA  53 60
MKD39_RS05430 1085904 .. 1085933 + -12.3  -5.57729   TTTTCGACAAAACAA       TCCACTCCATAAT TAAA ACTATGGAGTGGA        TTTTTTATATTATTT 100 90
MKD39_RS05445 NONE
        leuS NONE
MKD39_RS05455 1091849 .. 1091876 + -11.4  -5.54079   TTTAATCATGCATAA        GCGACTGACA AATTCAAA TGTCAGTCGC         TTTTTTGATTTTTAA 100 36
MKD39_RS05460 NONE
MKD39_RS05465 1098555 .. 1098582 +  -8.5  -5.28683   GAATTTATTTGGAAA        TCAGACTTCAC ATAATA GTGGGGTCTGA         TTTTTTAGTATTAAT 100 46
MKD39_RS05470 1104019 .. 1104068 + -16.9  -5.11112   TGCAAGATGAATAGT AAACTCCCTAAGATTATTCTA CATATTAC TAGAATAATCTTAGGGAGTTC TTTTTATTAAAATTT 100 66
MKD39_RS05485 NONE
MKD39_RS05490 NONE
MKD39_RS05495 1109729 .. 1109759 + -10.7  -5.68438   ATCTAAGATGTTTTT      GAACCTGA-ACATT GAAA AATGTATCAGGTTC       TTTTTTATTTAATAA 100 51
        pepV NONE
         dat 1112652 .. 1112681 +    -5   -4.5442   ATAAATTAGAATATA       TGGCTCTTGAAA ACTATA TTTCTCGAGCCA        TTTTCTAATTGAAAG  68 422
MKD39_RS05510 NONE
        trmB 1114279 .. 1114322 + -15.6  -4.45117   GTTCTAATCACCCTA CAGGAGTGGTACAATGATTCA TTA TGAATGAT-GTGCCACTCCTG TTTATTTAGGCTCTA 100 144
MKD39_RS05525 1116796 .. 1116837 + -12.5  -4.70353   TACATGTAAAAAAAT GGTAAGAGGAGTGGGCATAT TTT AT-TTCCCACTTCTCTTGCC TTTTACTTTATTATA 100 90
MKD39_RS05535 NONE
MKD39_RS05540 1118699 .. 1118716 +  -2.8  -4.32177   ACTCTAACTTATTTT             TTTGTA ATTGAC TACAAA              TTTATTGTAAAATAG  55 74
MKD39_RS05545 NONE
MKD39_RS05550 NONE
MKD39_RS05555 NONE
        murC NONE
MKD39_RS05565 1126089 .. 1126121 + -10.1  -4.77165   ATGATTCAATCAAAT      GCACTTAAATGAG GTTTTTA CTTATTTAAGTGC      TTTTCTTATAGGAGG 100 42
MKD39_RS05570 1127780 .. 1127827 +  -8.8  -5.36441   TATTCATTCATTATA TGGAGTGGATTCAGAAATCTA TATATAT TAGATTTTTGA-TTCGCTCCA TTTTTTATATCGAAA 100 69
MKD39_RS05575 NONE
        ccpA 1130521 .. 1130573 + -27.5  -2.99471   TAAGTTATAGTTGTT TTAAGGGAGCGGTATGATGATTTTA AAA TTAAATCATCATACCGCTCCCTTAG TGTGTATACCAATGA 100 123
        acsA 1134289 .. 1134312 +  -9.6   -5.2189   AATGAATATAAGTAA          GCTAGGACAA TTAT TGGTCCTAGC           TTTTTTAATGATTAA 100 46
MKD39_RS05600 1136319 .. 1136349 +  -7.6  -5.68039   ATGTTACGTTGAAAA       CTGTCGACAAAG CGCAAAA CTTTGGCGGCAG       TTTTTTTATGAATTT 100 75
        tyrS 1138989 .. 1139026 +  -9.3  -3.49687   AGGTGTAATTTTATT   GGCAATGTAGCGAAATCT TAT AGACTTTGC-GCATTGCC   CTTTTTATGAAAAAT  82 43
MKD39_RS05615 1139584 .. 1139604 +  -9.8  -4.76087   GATTAAACTTAAAAA            CTCGCTTA CAAGT TAAGCGAG            TTTATTTGTTATATA 100 43
MKD39_RS05620 1141106 .. 1141141 + -13.5  -3.38118   TTTAAGCATTAAGAA    GGCCAGTAATTGATT TTGAAT AATCATTTACTGGCC     TTATGAGTAAATTCT 100 36
MKD39_RS05630 1143269 .. 1143308 +  -3.1  -5.63236   CTAATTAACAATAAA  CACTCTATTTA-ATGACT CTAAT AGTTATTTTAATAGGGTG  TTTTTGTTTTTAAAT  77 51
        nagE 1145144 .. 1145179 + -14.3  -5.64873   CTGTTGTTCAATTAA    CTGATGAATTTTAGG AGGCTA CCTAGAATTCATCAG     TTTTTTATTATTGAC 100 127
MKD39_RS05640 1146425 .. 1146468 +  -8.9  -2.96031   AATCATTAGTATTAA TACGCCCCTCAGTGATGAA GTAAAA TCCATCATAGAGGGGCATA ATTATTTCAAGTAGA  76 67
MKD39_RS05660 1150672 .. 1150696 + -10.8  -3.86981   CTATGAATAAAAAAA         CCACCCATTCC ATAA GGAA-GGGTGG          TTGTTCATTATCATG  93 56
        ezrA 1153923 .. 1153959 +  -5.4  -5.48163   AGTAGTCTATTTTGA   GGTGGGATAATGAATTCG TAA TGAATTC-T-ATCCCATC   TTTTTTGATTTGTTT  82 114
MKD39_RS05680 NONE
        thiI NONE
MKD39_RS05690 1157402 .. 1157418 +  -2.4  -3.07487   AGATATGATTCAGTT              TTAAAT GATTG ATTTAA              GTTTTACCACTGTCG  42 39
         tpx NONE
MKD39_RS05700 NONE
MKD39_RS05705 1160344 .. 1160379 + -14.3  -5.09225   TAATTTATTAATACT    GACAACATGCATTGT AATTGG ACAATGTATGTTGTC     TTTTTTAAATAAAAT 100 38
         ald 1162257 .. 1162312 +  -9.3  -5.40464   ATAATTGATTTAATA TAAATAATCCAGTTGAGTACATAGT TATTTT ACTATTAACTCAACTGGATTTTTAA TTTTTATTTATCATA 100 40
MKD39_RS05725 1164266 .. 1164304 +  -8.4  -3.68435   TAATGAAATTAATAA   GCACAAAGGTGATT TATACATGAAC AATCATCTTTGTGC   TATTATTTTGACGCA  76 76
MKD39_RS05735 NONE
MKD39_RS05740 NONE
MKD39_RS05745 1170516 .. 1170551 + -11.6  -4.66537   AAAATTATGATATAG    TAAACTGATGA-TTTAT AAA ATAAAGTCATCAGTTTA    TTTTATCTTAAAAAA 100 55
MKD39_RS05750 1171924 .. 1171934 +    -4   -3.1332   GTATTATTTCTAACT                 CATA TTT TATG                 TTCGATCATATATTA  48 77
        accD NONE
MKD39_RS05760 1173963 .. 1173979 +  -3.8  -3.44325   TGTTCACCCTTTTTT              TATTTC GAAAA GAAATA              TTGATTATAAAACGT  50 183
        pfkA NONE
         pyk 1176944 .. 1176975 +  -5.3  -5.41359   CAATAATTGATTAAA      CTGGGAATAAGCTC GTGAA GAGTTT-TTCTCAG      TTTTTTCATTTCATT  82 130
MKD39_RS05775 1178160 .. 1178197 + -14.5  -3.31365   TTATTACAAAAACAA   GCCAGTAAATGAATT TTTATGTT AATTCATTTACTGGC    TATTATAATCTCGTA 100 79
MKD39_RS05785 1181054 .. 1181064 +  -2.6  -2.64981   GAAGAAAGATAAATT                 TTAA ACT TTAA                 TAGATTTCACAATAT  40 29
         icd 1182491 .. 1182525 +  -5.3  -5.55769   CAATTTTTAACAAAA    GTGGAACATTGAATTTA TAT TAAATTC--TGTTCCGC    TTTTTTATTATGAAG  82 154
MKD39_RS05795 1183439 .. 1183449 +  -2.6  -2.87794   AGAGAGACCTAAAGC                 TTAA TGC TTAA                 ATTTCATCATAGATT  41 22
MKD39_RS05800 1185219 .. 1185267 +  -6.2  -5.96894   ATACAATTATTTTAA GGCCTTTCGTATACTTGCACCAA AAAT TTGGT-TGAGGATATGAAAGCCC TTTTTTTATTTAAAT 100 105
        polA NONE
        mutM NONE
        coaE 1189658 .. 1189688 + -16.4  -5.95946   ATGAGTCCTAATATT       GAGATTAAGCAACC TTA GGTTGTTTAATCTC       TTTTTTTGTTGTTGA 100 157
         gap 1192291 .. 1192334 + -11.3  -5.38839   ATCACTATAAATTAA AACGAGACTGTTAAATCTT TTGACT AAGATTTGATAGTCTCGTA TTTTATTTTTATGTG 100 47
        nrdR NONE
MKD39_RS05835 NONE
        dnaI 1195537 .. 1195560 + -10.3  -5.63517   TGGTACCACGACGAA          CTCGTCCCT TTTTTT AGGGGCGAG           TTTTTTATTTCAACG 100 260
        thrS 1197797 .. 1197824 + -13.6  -5.42265   CATAGATTAAGCAGA        TGGTTGCATATC TAAA GGTATGCAACCA         TTTTTTATGCTTTAA 100 262
MKD39_RS05850 1199594 .. 1199616 + -14.2   -4.8622   ATGTGTATGAGAGAA           GAGCGGGCAT TCT ATGCTCGCTC           TTTTTGCTTGGAAAA 100 182
        infC NONE
        rpmI NONE
        rplT 1200831 .. 1200848 +  -8.5  -6.09196   AATTGATTTATAAAA             GATGACT TTGA AGTCATC              TTTTTTTGTTTTCAA 100 39
MKD39_RS05870 NONE
MKD39_RS05875 1202496 .. 1202506 +    -4  -2.73338   ATTTTATTAATAGTC                 TTGA TGG TCAA                 CTTTGAGCAAATTAT  45 9
         tig 1204010 .. 1204042 +  -7.9  -3.18571   TAATTAAAATTTAAA     GTAGCAGG-TGCAT CAATAT ATGTAACCTGCTAC      TCTATGTTTCAAGCA  68 60
        clpX 1205541 .. 1205571 + -10.6  -5.95946   ATGAGTCCTAATATT       GAGAGTAAGCAACT TTA AGTTGTTTAATCTC       TTTTTTTGTTGTTGA 100 171
        yihA 1207698 .. 1207726 + -11.9  -5.15634   TTATAATTATTTTAA        TCTAAGCAGAGGT CAA ACTTCTGTTTAGA        TTTTTTAATGGGATA 100 35
        hemA NONE
MKD39_RS05905 1210033 .. 1210050 +  -2.7  -2.70932   TTTTACAACACATTT             CACTTGA ATTT TCAAATG              TCATTAGGAGGCAAC  40 19
        hemC NONE
MKD39_RS05915 NONE
        hemB NONE
        hemL 1213995 .. 1214033 +  -6.2  -4.72272   TGTTATGAAATAAAA  TGAGGTTAGGACTTTCA ACTAGA TGAC-GTCTTAACCTCA   TTTTTAATGAAAGAA  77 41
MKD39_RS05930 1215526 .. 1215538 +  -4.1   -3.5616   AATAACCTTGTGCTT                GTGAT ACA ATCGC                TTCTAACTTTTTACG  55 415
MKD39_RS05940 NONE
MKD39_RS05945 1220054 .. 1220102 +  -5.5  -4.57482   AAATTTGAAATAGTA TATCCTCAAGTCATTTAGGCTA ACTTTA TA-CCTATGTGACTCGGGGATA TTTGTTTATCACTAA  70 39
        radC NONE
MKD39_RS05955 NONE
MKD39_RS05965 1222910 .. 1222920 +  -2.6  -3.58037   ACGTTATGGTTAAGT                 TATA AAC TATA                 TTTCAAAGGTTGGTG  47 74
MKD39_RS05970 1223094 .. 1223147 +  -4.1  -4.36592   TACTGAGTTTATTAA GATTAGGTACCACTAACTATTTTACG CAT TGCGAAATAGTC-GTGCTATCTAATC TCTTTTTTATTCAAA  61 55
        mreC NONE
        mreD 1224737 .. 1224751 +  -4.3  -3.21276   ATTAATATAGGAGGT               GCAAA GTATG TTTGC               TATTATCGAAACAGG  52 156
        rplU NONE
MKD39_RS05990 NONE
        rpmA 1225688 .. 1225711 + -11.8  -5.40279   TTTTTGTCTAGTTAA          CACCAGAAGT GAAT GCTTCTGGTG           TTTTATTTTGTTTTA 100 41
        obgE NONE
MKD39_RS06005 NONE
        ruvA NONE
        ruvB NONE
        queA NONE
         tgt NONE
        yajC 1231757 .. 1231786 + -10.1   -5.1764   TTTATTTATTTAAAA       CTGTCGACAAAGT TCAT ACTATGTTGACAG        TTTTTATATTATATG 100 59
       secDF 1234243 .. 1234272 + -14.5  -4.95758   GTATAAATTATTAGG       GAGTAGGACATTG CATT CAATGTTCTACTC        TTTTTCTAGTATCAT 100 35
        recJ NONE
MKD39_RS06045 1237240 .. 1237285 +  -8.7  -5.29385   ATGTCTAACAATTTT TGGGAATGAGATAATGAATTC GTAATG GGATTC-T-ATCTCATTCCCA TTTTTTCGTTAAATT 100 77
MKD39_RS06050 NONE
         dtd NONE
MKD39_RS06060 1241365 .. 1241398 + -14.1   -5.7946   GCAACACGGCGATTC     GTCCCTTGTATAGTA GAAA TGCTATATAAGGGAC      TTTTTTTATTAAAGA 100 304
        hisS NONE
        aspS 1244534 .. 1244563 +    -8  -5.00923   GATATAAATACATTA       GTCATCGAAATC ACAATA GATTTTGGTGAC        TTTTATTTAGTGTTT  91 57
        ssrS 1244925 .. 1244949 + -10.8  -5.48623   CACGGACTCTACCGG          TACGCAAGGC TTTAT GTCTTGCGTA          TTTTTATTTGTCTTT 100 29
MKD39_RS06080 1245817 .. 1245831 +    -5  -2.86164   GAATCAAATTTAAAA               GTCATT TAT AATGGC               TAATTGATTCATAGT  51 53
MKD39_RS06090 NONE
MKD39_RS06095 1247917 .. 1247939 +  -7.8   -5.4251   TAATTAAATTTTTGA           GGGATAACAT TTG ATGTTATCGC           TTTTTTATGTGTAAA  95 38
MKD39_RS06105 NONE
        mnmA 1251770 .. 1251780 +  -2.6  -3.69252   TTGACTTAAAATAAA                 TTTT GCA AAAA                 TATTGTTTATGTCTT  47 121
MKD39_RS06115 NONE
MKD39_RS06120 1255213 .. 1255240 +  -4.9  -6.20267   GTGGTACCGCGAAAA        CGTTCGTCC CTTTTTTTGA GGATGAACG         TTTTTTTGTTTTTAG 100 251
        alaS NONE
MKD39_RS06130 NONE
        ruvX NONE
MKD39_RS06140 1259156 .. 1259166 +    -4   -4.5536   TGCTCCTTTTTTGAT                 TGAT TAA ATCA                 TGTTTTTTTTACATA  63 177
MKD39_RS06145 NONE
MKD39_RS06150 NONE
MKD39_RS06155 NONE
         udk NONE
        greA 1263506 .. 1263543 + -14.5  -5.52986   TGCATATTTATATCG   GCTATGAAGAAATCA AGTAACAA TGATTTCTTCATAGC    TTTTTTTAATAACCT 100 105
        pxpB NONE
MKD39_RS06175 NONE
MKD39_RS06180 NONE
MKD39_RS06185 NONE
        pxpA 1268243 .. 1268259 +  -3.7  -3.28791   AATTAACGAAGGAAG              GCATTGA TAT TCAATCC              TTATAAGGGGGAGCT  47 3
MKD39_RS06195 1269582 .. 1269614 +  -5.7  -5.07107   TATATAATTCTTTAA      GGCTGTTTCTATTAA ATT TCAATAGAAATGGTC      TTTTTTACAAGTTTA  80 73
MKD39_RS06200 NONE
MKD39_RS06205 NONE
        yqeH NONE
        aroE 1272917 .. 1272939 +  -2.1  -3.05384   ATATGCAGTACTAAA           CAAATTAAA AGGAG TTTAATATG           TTAACTGGAAAACAA  41 7
        yhbY NONE
MKD39_RS06225 1273792 .. 1273802 +  -2.6  -3.14881   ATAAGAGAGGAAGGA                 TTTT ATG AAAA                 TTGATAAAGCGATTG  43 11
        yqeK NONE
        rsfS NONE
MKD39_RS06240 1275471 .. 1275508 + -10.7  -5.63517   AATAAATAAAGTAAA   CTCATCTCCTTGAACGT TTAT ACATATAAGGAGATGAG    TTTTTTGTTTAAAGA 100 36
MKD39_RS06245 1276239 .. 1276251 +  -2.7  -2.89797   TTATTGGCTTCTATT                TAAGG ATA CTTTA                TAATATTTATAACAA  41 47
MKD39_RS06250 1276923 .. 1276933 +    -4  -3.02324   TAACTTTAGAACACT                 TTCA TAA TGAA                 TATAATTTAAATAAA  48 202
MKD39_RS06255 NONE
        holA 1280097 .. 1280132 + -17.2  -4.33281   AACCCTAGAGAAATA    GCCAGTAAATGAGTTT TAAC AAATTCATTTACTGGC     TTCTTTATTTACAAT 100 141
        lepA NONE
        hemW NONE
        hrcA NONE
        grpE 1287445 .. 1287463 +  -3.3  -3.36327   CCATATATTAAATTT             TAAAATT GGAGG AATTTTA             TTATGAGTAAAGTAA  49 55
        dnaK 1289362 .. 1289390 + -11.2  -5.54907   AATGTAAGTCAAAAA        GTCAAAGTCAAT TGAAC ATTGGCTTTGAC        TTTTTCTTTTATAAC 100 86
        dnaJ NONE
        prmA NONE
MKD39_RS06310 NONE
        mtaB 1293628 .. 1293655 +  -4.4  -3.66356   TCTGAAGAAGGTGTA        TTATTATAATTT TTAA AATTTATAATAA         TTTGGAATTGACCAT  55 17
        rpsU 1293990 .. 1294018 + -16.9  -5.47159   ATTAATTATATATAT        GCTCTCGATTAGT TAA ACTAGTCGAGAGC        TTTTTTATGTTAAAG 100 73
MKD39_RS06325 NONE
        floA NONE
MKD39_RS06335 1296558 .. 1296593 +  -8.4  -4.99947   ATTAAAGATTATATT    TAACCCGAATTTCATT TTTA AATGATTTTCGGGTTG     TTTTATTTAATTAAA  95 66
MKD39_RS06340 NONE
        ybeY NONE
MKD39_RS06350 NONE
         cdd NONE
         era NONE
        recO 1300713 .. 1300740 + -14.2   -3.2613   TACTCACACTTAAAA        CCCCACCACAAA GAAA TTTGAGGTGGGG         TTAGTACTAATTATT 100 51
MKD39_RS06375 NONE
MKD39_RS06380 1303957 .. 1303968 +    -3  -2.94993   ATAGTTTTAATTTAT                CTTT AAAC AAAG                 TATAATATTATGACT  43 37
        dnaG 1305875 .. 1305903 + -13.5  -2.83903   AATAGTATTTCTATT        TAATAACCATTAT TGT ATAATGGTTATTA        TGCGTTTTTAACGGG 100 90
        rpoD 1307353 .. 1307380 +  -5.6  -4.08042   TTTAGAAAAATGCTA        GACTGAGACA CTTAACTT TGTCCCAGTC         TCTTTTTATAGTAAA  68 161
MKD39_RS06395 NONE
MKD39_RS06400 NONE
MKD39_RS06405 NONE
MKD39_RS06410 1311602 .. 1311642 +    -5  -3.55554   TTAATAATTTTCACA GGAGTGATACATTGAATTTT ACA ATAATTC--TGTATCGCTCC ATTTTATTATCTTTC  57 148
MKD39_RS06415 1312501 .. 1312511 +  -2.6  -3.07895   AGAATGTTGTGAAGT                 TTAA AAT TTAA                 TATATTAGGAGTAAC  42 22
MKD39_RS06420 NONE
MKD39_RS06425 1313943 .. 1313972 +  -4.4  -5.47821   TATTAGCAATCTAAA       CTGAGAAAGT GTTAATTGTA GCTTTCTCAG        TTTTTTTGAGTCAGT  78 130
MKD39_RS06430 1315551 .. 1315570 +  -4.4  -3.41581   GTATTAATATTAGTT            GCAAGCAAA TAT TTTG-TTGC            TTAGTTAATAACTTG  53 158
MKD39_RS06435 1316248 .. 1316268 + -11.9  -5.80364   TCTCCTATTTAACAT            GTGGTCTCT ATA AGAGGCCAC            TTTTTTTATTAAAAT 100 48
MKD39_RS06440 NONE
        rpmG 1318784 .. 1318824 +  -9.2  -5.99154   CAAGTCATCCTTACA GGGGCAAGACTATGAATCCA TAA TGGATTC-T-GTCTAGCTCC TTTTTTTATTTCATC 100 145
MKD39_RS06450 NONE
MKD39_RS06455 NONE
MKD39_RS06460 NONE
MKD39_RS06465 NONE
MKD39_RS06470 NONE
MKD39_RS06475 1323048 .. 1323077 +  -9.4  -5.42862   ATAAAGTAAATTCTT       CACCTCTTACGT TTATAT ATGTAGGAGGTG        TTTTTTTGAAACTAT 100 42
       comGA NONE
       comGB NONE
       comGC 1325478 .. 1325492 +  -4.4  -2.90496   TTACCTTATTAATTT               TAATAA TAA TTATTA               TGATTTCCCCAAGCA  49 76
       comGD 1326176 .. 1326190 +  -4.4  -4.24948   TGCTAATATCCTTAT               TAATTA CTA TAATTA               TTTTAACTATAATAC  61 341
MKD39_RS06500 1327363 .. 1327385 +  -9.9  -5.25803   GATTAAGTGTATAAA           CAGGGTAGC TATTT GCTACTCTG           TTTTTTATAAAAATT 100 161
        gcvT NONE
       gcvPA NONE
       gcvPB 1331353 .. 1331385 + -16.5  -3.28785   ATAATTTAAAACTTT      GACCCTGTAACCAAT TTA ATTGATTACAGGGTC      TTCCCTATTTTAAAC 100 37
MKD39_RS06525 1332891 .. 1332923 + -15.1  -6.37666   ATAAAAAATAAAAAA      TCATAGGATGGCTAA TAT TTGGTCATCCTATGA      TTTTTTTTATTTTCT 100 30
MKD39_RS06540 1334927 .. 1334940 +  -3.1  -3.37533   TATTTGAGGAGGAAA               CTGAA TGAT TTCGG                TTAATGATTTTAAAA  47 49
         efp 1335504 .. 1335530 + -11.8  -5.60864   TTAACAGTAGCTAAA         GTCTTTCTAATT ACT AATTGGAAAGAC         TTTTTTTAATATCTA 100 41
        accB NONE
        accC NONE
MKD39_RS06560 NONE
        nusB NONE
        xseA NONE
MKD39_RS06575 NONE
MKD39_RS06580 1340791 .. 1340828 +  -6.3  -3.73756   TATCATTAGTATTAA   CCCTTCAAAGCTACTGT TTAA AAACTGGCGTTGAAGGG    TGTTTTAGTACACTA  66 42
        argR NONE
        recN 1343236 .. 1343273 +    -6  -3.33671   GTAATTCATTGAATT   TATTAATAATTATTTT TGCTGT AAAATAATTATTAACA    TTATAAAATGAATAT  60 37
        lpdA NONE
MKD39_RS06600 NONE
MKD39_RS06605 NONE
MKD39_RS06610 1348259 .. 1348274 +  -3.4  -4.66057   AAGATTGAAAGGTGA              TTTAAA TGGA TTTAAA               TTTTGATTTATATAT  64 123
MKD39_RS06615 NONE
MKD39_RS06620 1349739 .. 1349774 + -17.2  -4.33281   ATTCCTAGCAAAATA    GCCAGTAAATGAGTTT TTAT AAATTCATTTACTGGC     TTCTTTATTTACAAT 100 73
MKD39_RS06635 1351991 .. 1352006 +  -4.8  -3.75437   TTATTGACTTAGTAG              CTAAAT CGTA ATTTAG               TTTAGTGAAGTACTT  59 15
        gndA 1353498 .. 1353525 + -11.5  -5.03145   CGCATACTAGTTACA        GAAGTAAACCA ATTCAA TGGTTTACTTC         TTTTTTAAAAAATTA 100 42
MKD39_RS06645 NONE
MKD39_RS06650 1356325 .. 1356351 +  -2.3  -2.62168   TAATTCATAAGCAAT         ATTAGGACATA CTTTT TTTGTCCTAAC         CTCGTTTTCTTTTGA  39 38
MKD39_RS06655 1356591 .. 1356618 + -14.3  -3.18582   GCCACACCAAAAAAA        TCCCCTCACTA CTGGCA TAGTGAGGGGA         TTGGTGCATAAAATG 100 52
         rnz 1360568 .. 1360612 +  -7.2  -4.14511   AAAATTACAAAGTAA GAGACTAGGATATAGAAGTC ACAGA GAAATCATTATCCTAGTCTC TTTTACAGTAAAATT  75 80
        dfrG 1362308 .. 1362330 +  -9.9  -5.04325   AAAGATAAAGCACAA           GAGCTTGGG ATTAC TCCAAGCTC           TTTTTGTCATTTGAA 100 68
MKD39_RS06695 NONE
MKD39_RS06700 1366434 .. 1366453 +  -2.8  -3.80569   ATCAATTAAATTAAA            TTGCGACA TAAT TGTCTCGA             TTTCACTATGTTTTA  51 475
MKD39_RS06710 1367619 .. 1367633 +  -5.8  -3.64609   TTGGTAATTTAGTAA               TTGAAA TAT TTTCAA               TTTAAAATGATTATA  62 74
MKD39_RS06715 1368133 .. 1368164 +  -8.2  -4.28713   ATAGATTAACTTATA      GACTAGGACAAT TTTAAATC ATTGTCTTAGTC       TTTCTTAATACTATT  81 37
        xerD 1369374 .. 1369388 +  -5.8  -3.93256   TAAGTATTAATAATC               TGTTTT TCA AAAACA               TTATTTACCGGTATG  67 291
MKD39_RS06730 NONE
        scpB NONE
MKD39_RS06740 1371842 .. 1371879 +   -16  -5.40474   AAGTATATTTTACAA   TAGCAAGAGAAATTAA ATGATA TTAATTTCTCTTGCTA    TTTTTTTCACAAAGT 100 44
MKD39_RS06745 NONE
MKD39_RS06750 1374469 .. 1374505 +  -2.5  -5.09895   GTTTATTTTAACTAA   GAGCAA-ACATCAT CAACTTAAGA ATGGTGTATTGCTC    TTTTTTAAATAAGTC  65 56
MKD39_RS06755 1375325 .. 1375361 + -16.9  -4.11412   TATTATCATAAAAAA    CCTCCTAATGTTGAA CTTATTA TTCAACATTAGGAGG    TTTCATTATTGATTC 100 30
MKD39_RS06765 NONE
MKD39_RS06770 1378053 .. 1378063 +  -2.6  -3.65313   GTTATACTGAAAAAT                 TAAA ATA TTTA                 TTTAAAGTATAGTTG  47 3
        ebpS 1379876 .. 1379917 + -13.3  -4.44046   ATAAACCCTAGAGAA ATAGCCAGTAAATGAATTT TAAC AAATTCATTTACTGGCTTC  TTTATTTACAATACG 100 69
MKD39_RS06785 1382916 .. 1382965 + -13.9  -2.83271   AAACAGCGGTATAGT TAATAAGAGCTGAGAACGACGCAA CAT TAGTGTC-TTCTCAGCTCTTATCA TCCTTATGAAGATAA 100 54
         cmk 1384785 .. 1384841 +  -9.3  -4.24787   AGACAAATAAGGACA GCTATTTAGAGTGATTCGTA-TTTAA CTAAGT TTAAAGTGCGAATTATTTTAAATAGC TATTTTTATTCTATA  88 39
        rpsA 1386284 .. 1386316 + -15.9  -4.73108   TATCATACAAACTCA      TTCCCAATTAAAGTT TAA GACTTTAATTGGGAA      TTTTCATTTTCTCAC 100 49
         der NONE
MKD39_RS06810 1388849 .. 1388886 + -10.1  -2.66106   AATTTTTCGCAGATT   TGTACATAAAATACTGA TATT TCAGTGTTTTAAGTGCA    TAAATTATTGCGGTA  78 65
MKD39_RS06815 1389300 .. 1389332 +    -8  -5.35222   GATAAGTGAAAAAAA      GACAATTTCTAT TGAAATAAT ATAGAAATTGTC      TTTTTTATAAATTTT  93 75
MKD39_RS06825 NONE
MKD39_RS06830 NONE
MKD39_RS06835 1393678 .. 1393708 + -16.4  -4.15222   TTGAAAGCGCTTTAA       CAACCTGTTACTAT TAA ATAGTAGCAGGTTG       TTTGTTACACAAAAT 100 53
         ndk 1394351 .. 1394393 +  -9.5  -5.72207   TTTAGTCAACATTTT AAAGGTAGGACAATGAATTCA AAA TGAATTC-T-GTCCTACCTTC TTTTTTTAATTTGAA 100 129
        aroC NONE
        aroB NONE
        aroA NONE
MKD39_RS06860 NONE
MKD39_RS06865 NONE
MKD39_RS06870 NONE
MKD39_RS06875 1401422 .. 1401462 +    -5  -6.04324   AGATATCCTTATAAG AGAGTAGAACAATGAATTCA AGA TGAATTC-T-GTTCTGCTCC TTTTTTATTTTTTAA  95 146
MKD39_RS06880 NONE
        bshA NONE
MKD39_RS06890 NONE
MKD39_RS06895 NONE
MKD39_RS06900 NONE
        asnS 1409398 .. 1409425 + -10.6  -4.70879   ACCATATTAATTTAC        TCGTCCAGTCAG CATG TTGACTGGACGC         TTTTTCAACTTTAAA 100 56
MKD39_RS06910 NONE
         nth NONE
MKD39_RS06920 1411219 .. 1411266 + -13.9   -2.9856   TTGTATCAATGAATA TAAAGAAAGGCAATTTCTATT TGATGT AATAGAAATTGCCTTCTTTTA ATTATTTAACATTTC 100 118
MKD39_RS06935 NONE
MKD39_RS06940 NONE
        gpsB 1415830 .. 1415852 +  -6.4  -3.47078   GTATTCAATTAGCAA           CAGATATTCT ATA AAAATATCTG           TTATAGTATAAAATA  62 98
        rnpB 1416293 .. 1416314 +  -8.7  -5.77571   TCATGAACTAGTTTA           GCTCTCCCA TTGA TTGGAGAGC            TTTTTGTTTTTTACT 100 44
MKD39_RS06955 1417594 .. 1417632 + -12.8   -3.1355   TAATCAATTCATTAG   CACTCTTATTATTACT GATGTAA AGTGATAATAAGAGTG   TTAAATATAGATACA 100 95
MKD39_RS06960 1418486 .. 1418523 +  -2.8  -5.65927   TGCCTACCAGATTAA   G-AATAGCCTGTTACAT TAAGT ATGTCTCAGGCTGTTAC   TTTTTTATTTGAATG  74 183
MKD39_RS06965 NONE
MKD39_RS06970 1422911 .. 1422938 +  -3.4  -5.10497   ATAACTTAGGACAAA        GACTCGAGAC TGTAATAT GTTTCGAGCC         TTTTTTAACTACATT  69 37
MKD39_RS06975 1436057 .. 1436086 +  -7.2  -5.10154   TACTAATTAGAAAAA       TCCACTGAAATC TTAAAT GATATCGGTGGA        TTTTTGATTTTAAAT  86 53
MKD39_RS06980 1439483 .. 1439518 + -12.8  -4.33281   AACCCTAGAGAAATA    GCCAGTAAATGAGTTT TAAC AATTTCATTTACTGGC     TTCTTTATTTACAAT 100 79
MKD39_RS07000 NONE
MKD39_RS07005 NONE
MKD39_RS07010 NONE
MKD39_RS07015 1445022 .. 1445060 + -16.5  -6.11229   GTACTCACTTTTCAA   TCCCAAATATAAAATTA AAAAC TAATTTTATATTTGGGA   TTTTTTTATTTTAAT 100 144
MKD39_RS07020 1446086 .. 1446106 +  -3.3  -4.24123   CAATTAAGGCACCAA            TTGCAGTAT AAT ATGCTGGAA            TTTTGCGATTATTAA  57 15
MKD39_RS07025 NONE
       fakB2 1447564 .. 1447580 +  -3.8  -4.09822   TCATTGTGAGTAGAT              TACTTT AAATA AAAGTA              TTTATATCGTAAATT  58 81
        msrA NONE
        msrB NONE
MKD39_RS07045 NONE
MKD39_RS07050 1449419 .. 1449456 +   -10  -4.76171   CTAGTCATCTTAGCG   GGGGTGGAAC-GAATTC TTTAC GAATTCTGTCCCACTCC   TTTTGTGCTTTTTTA 100 140
MKD39_RS07055 NONE
MKD39_RS07060 NONE
MKD39_RS07065 NONE
MKD39_RS07070 1453312 .. 1453348 +  -8.9  -5.41746   GCTACGTAAAATATA    TCGAGATACATTCTT AAAATGC GAGATTGTATCTCGA    TTTTTTTAAAGGATT 100 32
MKD39_RS07080 NONE
MKD39_RS07085 1455872 .. 1455894 +    -7   -5.1675   ATATTTAAATCGAAA           CTGGGACAAT TAA GTTGTTCCGG           TTTTTTAATGCATAA  86 41
MKD39_RS07090 NONE
        sucB 1460264 .. 1460289 +  -9.8  -5.48063   TCAAACTAATATTGA         TACAACGGCG TCACAT CGTCGTTGTA          TTTTTTATCTTAAAT 100 59
MKD39_RS07100 NONE
MKD39_RS07105 1461150 .. 1461160 +  -2.6   -3.5535   GAGGGCTTGTTGATA                 TTTA TTA TAAA                 ATTTTATTTAAATTC  47 336
MKD39_RS07110 NONE
MKD39_RS07115 1462427 .. 1462454 +  -2.2  -5.14965   GGTTATTTTGAAAAA        GTAATCGTTGA AATATAC TCAAC-ATTAC        TTTTTTAATGCAACT  64 83
MKD39_RS07120 NONE
MKD39_RS07125 1465224 .. 1465234 +  -2.6  -3.97406   AGAATATAAGATTTC                 TATT TTA AATA                 TTTATCAACTTTTCA  51 41
        brnQ 1466704 .. 1466749 + -11.5  -4.58644   ACGAATTAATTATAT TAAAAAAGCACATCA-AACTCA TTT TGAGTTGTGATGTGCTTTACTA TTTTAGTTATTCCTT 100 49
        msaA 1469487 .. 1469521 +  -2.3  -3.92592   AATTGTCACATGTAT     TTTTTGTAATATGCG AATAA TGCATATTGAAAGAA     TTTAGTCTTGGAGGT  50 171
        cspA 1469778 .. 1469799 +  -8.8  -5.80951   TATTGACTTTAGTAA           CACCTTAC CAAGAT GTAAGGTG            TTTTTTATTTTGGCT 100 57
        cvfB 1483065 .. 1483112 +    -8  -5.28778   GCTTTCAGTCACCTT TACGGGAGTGATACA-ATTTT TCATTAT AAATTCTGTATCACTCCCGTC TTTTTTATAGATAAT  93 192
MKD39_RS07215 1484267 .. 1484290 +   -14  -3.35934   ATTCAAGGGGTATTA          CAAGGTAGCA ACAC TGCTACCTTG           TTCTCGAATATATGG 100 73
        pstC NONE
        pstA NONE
        pstB NONE
        phoU 1487935 .. 1487970 + -13.6   -4.3586   AATCAAACAATTAAA    CCCTGATAA-GACTGAT TAA ATCAGTTATTATCAGGG    TTTTACTATAAATCA 100 67
MKD39_RS07245 1490814 .. 1490825 +    -3  -5.37593   AAACAAGACCGTATC                GTTA TTAA TAAC                 TTTTTTAGTTTCAGC  74 511
MKD39_RS07270 1496697 .. 1496713 +  -3.8   -2.7634   ATCATTTGCAGTCAT              TGATAT GAGAG ATATCA              CTTTAACATCAAATT  45 346
MKD39_RS07315 NONE
MKD39_RS07325 1507210 .. 1507233 +  -8.8   -4.4518   TAAAGTCGTAAAAAA          GAGTGCACCC AATC GAGTGCGCTC           TTTTACGTTTTAGTT  83 80
        msrA 1509023 .. 1509033 +  -5.4  -3.68557   TATAAACCAAAAATC                 TTGG TTC CCAA                 TTTGGACTATATTTT  59 175
        plsY 1520933 .. 1520960 +  -9.2  -5.47431   AATACCGATAATAAT        GCATTAAGCGTA TCAA TTCGCTTAGTGC         TTTTTTATATCTTCA 100 45
MKD39_RS07375 1521422 .. 1521453 +  -5.2  -5.53991   GCATATATAAAAGAA      CTGAGAAGACGCTCC CAT GTAGCAT-TTCTCAG      TTTTTTTAATACATA  82 68
        mscL 1527385 .. 1527423 + -12.6  -5.27477   ATAATCATATTTTAA   GACCGTATGACAATATTG AAT TAATTTTGCCATACGGTC   TTTTTTAATTCCACT 100 37
        lexA 1536546 .. 1536582 + -18.3  -5.36689   ATTTCTATATACAAA    GAACTAGCAAAGTCTAC AAT GTAAACTTTGCTAGTTC    TTTTGTTTTTCATTT 100 80
MKD39_RS07465 1542759 .. 1542801 +  -6.6  -5.95539   AATTAAATAATAAAA TGCGAG-CACTAAAA-GTAT AGTAA ATCCTTTTTAGTGACTCGCA TTTTTTTGTTTCAAC 100 35
MKD39_RS07470 1543286 .. 1543300 +  -5.8  -2.94422   TATACTCATGCCTTA               TTTTGT ATT ACAAAA               GTGTTTTTAAAGCTG  56 106
MKD39_RS07495 1549002 .. 1549055 +   -10  -4.19414   AAGCATAGTTAAAAA GCATCTAGTATTTAAGTAGTCATGT TTTGT ACATTCC-ACTTAAATATTAGATGC TTCTTTATAATTTGT  91 33
MKD39_RS07505 1550794 .. 1550842 + -12.8  -4.67353   AATTAATTCATTAAG TAAGCGATTGACA-GTGAATC TACATACT GATACACGTGTCAATCGCTTA TTTTTAACTCCATAA 100 35
MKD39_RS07515 1551782 .. 1551832 + -13.6  -5.88197   TTTACTTGCAAAAAT AATGGGAGTAAGACAAAGAATTCA AAC TGAATTTTTTATCTTACTCCCAAC TTTTTTTATATTTAA 100 66
MKD39_RS07520 1552235 .. 1552250 +  -3.3  -3.65812   GGACATAAAGTGTTT              TGGTT CTTGGA AACCA               TTCTCTTAAGAGCAA  50 100
MKD39_RS07555 1558760 .. 1558805 + -13.7   -3.0439   TTAGAGTTAATTTAA CATCTGAAAAACAGGACTTCCT AAA AGGAAATCCTGTTTTTTA-ATG TAGTTTATAATAAAT 100 26
MKD39_RS07730 1588875 .. 1588893 +  -4.6  -4.43307   TTGTGAATAATAATC             TATGAGTT TCC AACTCACA             TTGTTTTCTTCCCAC  64 461
MKD39_RS07790 1594027 .. 1594072 +  -7.9  -4.00445   CTGCTATCCAACTAT CATTCAAGTGGTATTTA TTATTGAACGTT TTAATACCACTTGAATG TTGTTCTTGATGATG  76 86
MKD39_RS07840 1598348 .. 1598368 +  -3.4  -2.95129   GAGACGCTAATTTAT            TACTAATT TTTTT AGTTAGTA            TAATTGTGTCTCTTT  45 44
MKD39_RS07845 NONE
MKD39_RS07850 1599563 .. 1599579 +    -8  -4.03995   ATAAATAATAATTAT              GGGTAG CTTGT CTACCC              TATTTTTATACAACA  78 33
MKD39_RS07855 1600828 .. 1600853 +  -6.1    -3.524   TTTTCAAATAAAAAA         GAAGCTAAGGC AAGT GCCTTAACTCC          TTATATCCCTAAGTC  64 107
MKD39_RS07880 1605925 .. 1605963 + -13.5   -5.0916   TTAATACAATAAAAA   GCTTCATTATAGAGT GAAATAGCA ACTCTATAATGAAGC   TTTTTATATTACAAA 100 49
MKD39_RS07970 1626508 .. 1626546 +  -8.5  -5.14563   CTAATCATCTATTTG  GAGTGAGACTATGAATTCG TAA TGAATTCA-A-TCTCACTC  TTTTTTAATGACAAC  95 158
MKD39_RS07980 1629929 .. 1629948 +    -3  -4.77775   ATTATATAATCAATC            TTTATAAG TCCT TTTATAAA             TTTCTTTTCTACCAT  62 161
MKD39_RS08210 NONE
MKD39_RS08215 1688668 .. 1688712 +   -11  -3.85698   TGTGAATAAAAATAA TAAAGCTTCCAATC-TCAACT TGAA AGAAGAAGATTGGAAGCTTTA TTTGTAAGACAAACG  93 80
        rpmB 1707929 .. 1707951 +  -8.5  -5.96521   TAATGCACTAAAAAA           TGCCTTCAT ATGTG GTGAAGGCA           TTTTTTTTGCTTAAT 100 47
MKD39_RS08360 1717314 .. 1717357 +  -7.9  -4.67173   GTAATTAAAGTAAAA GAGTTACGCAA-T-TTAG-GAT TCC ATCTCTAATAATTGCGTAACTC TTATTTTTTACATTA  83 37
MKD39_RS08385 1723855 .. 1723898 + -15.6  -6.20267   ACTATATAATAAAAA TAGGATTAGAACCAAATGCA TTTA TACATTCGGTTCTAATCCTA TTTTTTTATTTTTCA 100 54
MKD39_RS08550 1760867 .. 1760905 + -11.2  -2.63208   AATATGGAAAAGCTA   TGGAGTGATAAAAGTTCT ATC AGAATCTTTACCACTCCA   ACTTTTTGCATAAAA  87 49
MKD39_RS08585 1763573 .. 1763594 + -10.9  -5.60556   ATATTTTTAGGTTGA           GAACGCTGT TATG ACGGCGTTC            TTTTTATTTTGTCTT 100 60
        rnhC 1778343 .. 1778374 +  -8.9  -4.51197   AAATAAATTTATAAA      GAGACGAATTC CATTAATACA GAATTCGTCTC       TTTTACTTCATTATC  88 35
MKD39_RS08680 1785647 .. 1785659 +  -4.9  -4.16921   AATTATGTACTTCAA                CATTT GAT AAATG                TTTTACAGATTCTTC  64 441
MKD39_RS08695 1787195 .. 1787208 +  -2.5  -3.17928   TGCATACTTGAGTAT               TAAAT ATCT ATTTA                CTTTTGCGTTAGTGT  43 375
MKD39_RS08705 1788217 .. 1788253 +  -9.7  -4.30995   CGCTATAAAGTAAAA    GGAGAAAGAAATC AAATGCATTAC GATTTCTTTCTCC    TTATTTTATGACAAA  88 44
MKD39_RS08730 1792558 .. 1792586 + -19.1  -4.86621   CCTATTAGTATAAAA        GGAGATGTGAATG GTT CATTCACATCTCC        TTTTTAATTAAAAAT 100 41
MKD39_RS08750 1798949 .. 1798961 +    -2  -2.79803   AGTATGTTACGCATA                TAGA GGTGA TCTA                ATTTGCGTGAAGTTC  40 12
MKD39_RS08755 1799193 .. 1799228 + -12.1  -3.73509   GTTTTACTCAAAAAA    GCCAGTAAATGAAAT GACAAA ATCTCATTTACTGGC     TTTCAAATTTAATGT  95 63
MKD39_RS08765 1801419 .. 1801475 +  -9.8  -5.86976   TTTAATATAGAAAAA TGTCTCGGT-AGTAAAATTTGGAAG AAATTCAC CTTTCAAAGTTGACTGACCGAGACA TTTTTTATTTTCTAA 100 36
MKD39_RS08775 1803209 .. 1803219 +  -5.4  -3.78682   TGATTTAAAAATGCA                 CTTG TAA CAAG                 CTTTTTTAATTCTAG  61 148
MKD39_RS08780 1804777 .. 1804825 +  -9.9  -4.91977   CTTTAAAGAATTATA AAAAAATCTAACGATTTAGCATT ATA AATACTAAGTCGTTAGATTTTAG TTTTATATTTTAATA 100 25
         def 1818175 .. 1818208 + -12.7  -6.28967   AACAATTTTATTTTG     CTCAAACTACTTTCA ACGA TGAAACTAGTTTGAG      TTTTTTTTATTTGTA 100 47
MKD39_RS08855 NONE
MKD39_RS08860 1820597 .. 1820632 + -17.2  -4.33281   ATTCCTAGAGAAATA    GCCAGTAAATGAGTTT TAAC AAATTCATTTACTGGC     TTCTTTATTTACAAT 100 82
MKD39_RS08890 1825207 .. 1825240 +  -9.1  -6.14618   TCATCACACTAATAA     CCTAAC-ACTAAAAAG GAA CTATTTAGTTGTTAGG     TTTTTTTATTTTGTA 100 43
        graF 1833891 .. 1833922 +  -8.9  -5.95286   GTAGTTAACTAAAAA      CTGAGAGAACGCTC TTTCC GAGC-TTTTCTCAG      TTTTTTATTTTTAAT 100 111
MKD39_RS08935 NONE
MKD39_RS08940 NONE
MKD39_RS08945 1837081 .. 1837114 + -14.8  -5.22943   TACCTCATAAAAAAA     TAGGGCGTATCACTG TCCAT CAG-GATACGCCCTA     TTTTTTACATTTACT 100 31
        folD 1849811 .. 1849847 + -21.9  -4.42976   CTTTATACAATAAAA    GCACAGGGATGATGTTT ATT AAATATCATCCCTGTGC    TTTATTCATTTATAA 100 404
MKD39_RS09015 1851643 .. 1851663 +  -8.4  -5.71712   ATGACAAATTTTTGA            GATGAGAT GAATA ATCTCATC            TTTTTTTGTGTCAAA 100 42
        qoxA NONE
        qoxB NONE
        qoxC NONE
        qoxD 1855939 .. 1855977 + -17.1  -4.65032   TTTATCTCACACAAA  GAACCTGTTATGAAACTC GTCA GAGTTTCA-AACAGGTTC   TTTCTTTATGCTTTC 100 48
        rihC 1856977 .. 1857015 +  -7.6  -3.51394   ATTTAAATTAAAAAA   GCTATAACAAAATGCATT TTT ATTACATTTCGTTATAGC   TCTCTTTATTTGGTT  70 44
MKD39_RS09050 NONE
MKD39_RS09055 1860415 .. 1860445 + -14.3  -5.82281   ATCAAATAATTTCCA       CTCCTTTTTACAA ATTTG TTGTAAAAAGGAG       TTTTTTTATATCTTT 100 40
MKD39_RS09060 1861060 .. 1861070 +  -5.4  -2.87136   TATTTTAAATTATCA                 TTGC TTA GCAA                 TATCGTCCTTAGTAA  53 124
MKD39_RS09065 1865393 .. 1865425 + -13.7  -5.05301   TGGACAAATTAAAAA      GACAATTTCTATTGA TAA TCTATAGAAATTGTC      TTTTTATAATTATTT 100 119
MKD39_RS09080 1867957 .. 1867983 +    -6  -4.42765   ATTATTCTAAAAATT         TTGTAGTAACAT TCA AGGTTACTATAA         TTTGGTTTTTTGAGG  70 104
MKD39_RS09085 1869197 .. 1869227 +  -7.7    -3.727   AAAGGACACTTAAAA       TAGTGGTTAACTG TCAAT CAGTTTATCACTA       TTTAAGTGTCCTAAA  73 52
MKD39_RS09110 1875377 .. 1875387 +  -3.2  -4.73633   TTCAAAGGTAATGGC                 GTAC CTA GTGC                 TTTTATGTCTTCTTC  65 383
MKD39_RS09120 1876095 .. 1876109 +  -4.4  -3.49884   CAAAAATTTAATCAG               TAATTT TAG AAATTA               TCTTTAATAATGTGT  53 30
MKD39_RS09125 1876281 .. 1876319 + -10.6  -4.48741   AATAAAATGTAAAAA  GGTCTATTCGCTAACTT TGATTT AAG-TAGTGAATAGACC   TTTTATAATGAGTTA  93 36
MKD39_RS09135 1877386 .. 1877424 +  -9.8  -4.19215   TTTAATTTTAAATCA   TACGGGACTTTTATATTA ATA TAGTGTAAATGTTCCGTA   TATTTTTTAAATATA  91 48
MKD39_RS09140 NONE
MKD39_RS09145 1877757 .. 1877792 + -17.2  -4.33281   AACCCTAGAGAAATA    GCCAGTAAATGAGTTT TAAC AAATTCATTTACTGGC     TTCTTTATTTACAAT 100 100
MKD39_RS09155 NONE
MKD39_RS09160 1881319 .. 1881329 +  -5.4   -2.6078   CAACTGAAATACACT                 GCAA TGG TTGC                 TCAATTAATGTTGAT  52 34
MKD39_RS09165 1881489 .. 1881519 +  -6.9  -3.55453   ATAAATAAAAATATA       GCGGCTATAGA ATTAACTCC TCAATAGCCGC       TTAGTTATATTAATA  66 33
MKD39_RS09175 1882875 .. 1882887 +  -6.3  -3.05596   GTTATTAATCATAAA                CGATA TAC TATCG                TTGAATAAGAAGGTA  60 5
MKD39_RS09180 1883546 .. 1883581 + -12.8  -4.33281   AACCCTAGAGAAATA    GCCAGTAAATGAGTTT TAAC AATTTCATTTACTGGC     TTCTTTATTTACAAT 100 57
MKD39_RS09225 NONE
MKD39_RS09230 1897854 .. 1897891 + -10.9  -5.48213   ATAAAACACTAAAAA   TCTAGTTAATGTACA TCATACAC TGTACATTAGCTAGA    TTTTTATTTTACATA 100 51
MKD39_RS09245 1900771 .. 1900809 + -11.2  -4.84359   TTAAAAAACGTTTCA   GTAGTGAACTTGAATTTA CAA TGCATTCAAGTTCACTTC   TTTTTGTAAACATAA 100 53
MKD39_RS09285 1908780 .. 1908790 +  -2.6  -3.02461   TAAAAATTCATGTTA                 TATT AGT AATA                 TATTAACGGAAATTG  42 79
MKD39_RS09290 NONE
        yjbH 1910015 .. 1910051 +  -7.5  -4.58943   GGATAGCTAACAATA   GCCATTCAATG-ATGA TTATAT TCATGCATTGGGTGGC    TTGTTTTTGTGTACA  80 40
        trpS 1915991 .. 1916023 +    -8  -5.35222   GATAAGTGAAAAAAA      GACAATTTCTAT TGAAATAAT ATAGAAATTGTC      TTTTTTATAAATTTT  93 81
MKD39_RS09345 1922739 .. 1922756 +  -6.3  -3.59979   GCTTAATCTCAATAT             TTGGACT CATC AGTCCGA              TTTGACGTAGAGCCG  64 35
MKD39_RS09370 1927252 .. 1927290 + -14.1  -3.18031   ATTCTACATACAAAA   ATAGACCAAGGACATTA TCAAT TAGTGTCCTTGGTCTAA   TATCATTTTTCAAAA 100 44
MKD39_RS09385 1929941 .. 1929977 + -11.1  -5.10064   ACAATACGTTAAAAA    CGCTTGGAATTTGAATT TAA AACTCAAATTTCAAGTG    TTTTTCTATATTAAA 100 61
MKD39_RS09405 NONE
MKD39_RS09410 1938395 .. 1938413 +  -7.4   -2.8352   TGGTTGCCTCCACCA             CCATGGCT AGC AGCCATGA             ATTCTTGAATTAACA  64 307
MKD39_RS09455 NONE
        argH 1953551 .. 1953567 +  -3.1  -3.62591   ATATTGAGTGAACAT              TAATTAT ATA ATAGTTA              TTTAAAGCTTCTGCA  49 110
MKD39_RS09465 1954707 .. 1954744 +  -7.2  -4.74787   GAATCAAAACAAAAA   CGCTATAACTTGTT TCATTCCCAT AACAAGCTATAGCG    TTTATTTATGTTTAT  81 116
MKD39_RS09495 NONE
MKD39_RS09500 NONE
MKD39_RS09505 NONE
       mnhC1 NONE
MKD39_RS09515 NONE
MKD39_RS09520 NONE
MKD39_RS09525 NONE
MKD39_RS09530 1966655 .. 1966693 + -16.8   -5.9218   TCAAGTCACAATTGC   GGGTGGAGACAGAATTCA AAA TGATTTCTGTCCCCGCCC   TTTTTTTATTGTCTA 100 95
MKD39_RS09535 1968016 .. 1968064 +  -2.5   -5.4505   TATTTCTTATAAAAA AGCAGGCGTAGGAT--AGAATTC TTTAT GAATTCACCGTCCCACGCCTGCG TTTTTTCTTAAACAA  71 103
MKD39_RS09570 1975346 .. 1975394 + -11.9  -5.24531   AACGGTTAGTATTAA AATAAGGGGTAGAATAGAATTCA TGA TGAATTCTATTCTACCCCCGACC TTTTTTCTCAAGAAT 100 32
MKD39_RS09580 1976157 .. 1976192 + -17.2  -4.33281   AACCCTAGAGAAATA    GCCAGTAAATGAGTTT TAAC AAATTCATTTACTGGC     TTCTTTATTTACAAT 100 95
MKD39_RS09585 1978424 .. 1978440 +  -8.1  -2.63357   TCATTAAATTCTGGA              GAGTTTA TTT TAAACTC              ATATTTACGATGATT  66 369
MKD39_RS09630 1985614 .. 1985631 +  -8.5   -2.8916   ATATAATCTTGAATA             CTCGAAA AACG TTTCGAG              ATTTCAGCTTTTTTA  69 288
MKD39_RS09695 1999202 .. 1999231 +  -8.5   -5.1167   ATATTTATAATGAAA       CGGACCCATAAGG TTAA TCTAATGGGCCCG        TTTTTCTGTTAAATT  95 63
MKD39_RS09710 2001756 .. 2001788 + -18.7  -4.17355   TCTTTCTAAATAATA      GAAACTCCGTAATCA AAA TGGTTACGGAGTTTC      TTTCATTATTATTTC 100 32
MKD39_RS09750 2006898 .. 2006942 + -14.7  -2.75807   GCTATGCCCGTGTAA TAATAAAGACGGTTGAGACA TTTATT TGTC-CAGCCGTCTTTATTA ATTCTAGTATTTTGA 100 148
MKD39_RS09765 2008895 .. 2008931 +  -6.7  -5.68039   CATGTACTAATAATT    TTAGACACAAAAATCTT TTA GGGATTTTTGTGTCTTC    TTTTTTTGTGAATTT 100 54
MKD39_RS09770 2009670 .. 2009684 +  -2.2  -2.85205   CTCTAGACATTTAAT               TTATAG CCT TTATAA               TAATTGATATATTCT  40 75
MKD39_RS09775 2010394 .. 2010442 + -12.7  -4.51238   CTTAATTATAGTAGT AGGCTAGAACTTAAAATAACTTA TCA TAAGTGTTTTTAGGTTCTAGCCA TTTCTGTTTTGTAGA 100 50
MKD39_RS09785 2011924 .. 2011934 +  -5.4  -4.13973   TTTAACATGTAATTA                 GCAA CTT TTGC                 TTATTTCTAGTATAT  65 315
MKD39_RS09795 2012633 .. 2012643 +  -2.6  -3.55622   TGGTATATACATTCT                 TTTA ATA TAAA                 TTTAGGAGGCTTACG  47 21
MKD39_RS09800 2012861 .. 2012888 +  -5.8  -5.76237   TAGCGTAGAATTAAA        GAACAAAA-TGAC ATT GTTATTTTTGTTC        TTTTTTATTTATATC  95 38
MKD39_RS09805 2013564 .. 2013586 +  -9.2  -5.26875   TATCTATAGTAAAAA           GAGTAGCTTT GAA ATAGCTACTC           TTTTTTAGTTAGACA 100 42
MKD39_RS09815 2014763 .. 2014818 +    -8  -4.68479   TAAAGTTCATAGACT TAGAGAGAGGCA-AG-C-TATCACATG TTAAT TATGTGATTTGACTATGCCTCTCTCTA TTTTACTTCTTTTCT  87 41
MKD39_RS09825 NONE
MKD39_RS09830 2016842 .. 2016887 +    -5  -5.26119   TACAAGCAAAGCAAG TTGGGAGTGGGACGATGAATTT AAAA AAATTC-TA-TCCTACTCCCAG TTTTATTTTTACGAA  77 197
MKD39_RS09835 2017192 .. 2017202 +    -4  -3.20232   GTAATTAGATGTTAA                 TTAC AAG GTAA                 TATGTATTATATTAT  49 79
MKD39_RS09840 2018038 .. 2018072 +  -9.5  -5.38497   TTAATTCAATTACTT    TACCGGGATAA-TCAA CTTT TCGACTTATCCCGGTA     TTTTTTAATTTAAAT 100 66
MKD39_RS09845 2018380 .. 2018420 +  -5.8  -5.26918   TAACTAATAGCAAAA CAAGCATTTACATGTTTC TTTAATT GAAAC--GTAAATGCTTG TTTTTTCTGCAATAT  84 34
MKD39_RS09865 2023783 .. 2023795 +  -4.9  -5.13722   GAATGTATTTACTTT                TTAAC ACT GTTAA                TTTTCTTTTGGTCAA  77 516
MKD39_RS09965 2036186 .. 2036201 +  -2.6  -2.92171   TTATATTCACAAGTG              TGATTT AAAT GAATCA               TAATTTAAACCTATC  41 7
MKD39_RS09970 2037624 .. 2037642 +  -7.4  -4.18294   CGATGCAGAGTGCTA             TTACGCAG CTA CTGCGAAA             TTATTGTTTGATTTG  78 367
MKD39_RS10035 2050736 .. 2050770 +  -8.1  -3.77196   TTAAAAAAGTAAAAA    GTGAGACT-TGAAACA TGAC TGTTTCAAAATCTCAC     TTTGATAACTACTAA  76 37
MKD39_RS10045 2051932 .. 2051954 +  -7.6  -3.40403   ATAGATATACAAAGA           GCCCACACGA TTC TCGCATGGGC           TTCTACTAAAGGGAG  70 48
MKD39_RS10050 NONE
MKD39_RS10055 2053340 .. 2053365 +    -9  -3.02698   TAGTCATAAAAAAAC         GGGGAGTGTT AGTTTA AACACCCCCC          ATTTCTATGCCATGG  76 43
MKD39_RS10165 2080091 .. 2080143 +  -4.4   -5.1471   ACTAATTAATAAAAA ACCTTGTTTGTATAACACTACCTAA TCAT TTAAGTAGTTAT-TACAAACAAGGC TTTATTTTTTATCAT  73 32
MKD39_RS10175 2082679 .. 2082734 +  -2.3  -5.75478   AGAAACGTAAAAGAA GTCAACATATTGA-TTAACCAAATTAT TAAT AT-ATCTGGTTATCTAAATATGTTGAC TTTTTTTATGTAATT  77 39
MKD39_RS10180 NONE
MKD39_RS10185 2084173 .. 2084188 +  -3.2  -3.38118   CTAAGGGGATGTCTT              GCTATG AAAG CACAGC               TTATAGATAGATTAT  47 37
        pepT 2085419 .. 2085463 +  -8.8  -4.84262   AAATATAATAAATAA GGCAAACCACAATTACC-ATG CTTA TATAGGTAATTGCAGTTTGCC TTTTGTTAGTTATTC  95 39
MKD39_RS10210 2088852 .. 2088874 +  -2.9  -3.82505   ACTTTGAAGATATAT          TTCAAAAGTT GTAA AACTTT-GAA           TTCTGTTGTCGTTTT  51 12
        murB NONE
MKD39_RS10220 2090226 .. 2090267 + -17.7  -3.03811   TATTTTGAATTATAA TAAAGGCTTAGTAACGATT GAAA GATTGTTACTAAGCCTTTA  TACTTTACGTTTTTA 100 26
MKD39_RS10265 NONE
        queF 2101328 .. 2101356 +  -7.5   -5.4148   TAAAAGATTAACTTA        ACCACTAAATTGT CAA ACATTTTAGTGGA        TTTTTTCATTATTTG  95 38
MKD39_RS10275 2103179 .. 2103207 +  -6.8  -6.02345   AAGTTATCATAAGCC        CCTTCATAGTAT TTTAT AAGCTATGAAGG        TTTTTTTTATAATTC 100 83
MKD39_RS10280 2104748 .. 2104787 +  -9.7  -4.34008   TATACTAATATAAAA GCGATTAAGGTTAATGATA GGGT TATCAT-A-CCTTAATCGC  TTATTTTAATTACTC  88 49
MKD39_RS10320 2115738 .. 2115771 + -14.1  -4.35353   ATTGAAATACAAACA     AAAAACGAGTTGAAC GTTT GTTCAACTCGTTTTG      TTATTATTTTTGGTT 100 136
        queC NONE
        queD NONE
        queE 2124821 .. 2124832 +  -4.4  -2.89564   TTTAATTGGTATAAT                GTTC TAAT GAAC                 TATGTGAGATAGGAG  49 97
MKD39_RS10375 2125463 .. 2125503 + -15.8  -4.86293   CATATAGAAAATAAA  TAAACGCTTGAAGTTTCA TCATT TAAAACTTCAAGCGTTTA  TTTTGATTTTTATTA 100 23
MKD39_RS10385 2128120 .. 2128137 +  -6.3  -3.59979   GCTTAATCTCAATAT             TTGGACT CATC AGTCCGA              TTTGACGTAGAGCCA  64 35
MKD39_RS10430 2138344 .. 2138384 +   -13  -3.70033   ATGTATAAATTAAAT TAGCCCATAGATGACATAT TTAG ATATGT-ATCTATGGGTTA  TTATATGTATTCCTC 100 45
MKD39_RS10435 2139653 .. 2139701 +  -8.3  -5.61913   CCTTCTAACAAAAGT AAATTGGAGTGAGACAACATTTA ATT TGATTGCTATCTCACTCCAATTA TTTTTTATATTTGTT 100 505
MKD39_RS10465 2144950 .. 2144992 + -17.3  -4.07885   TATATTTATCAATAA CGAAAAGCCTGAGTTATCT ATAAC AGATACCTCAGGTTTTTCG TTTTAAGACAACGTA 100 96
MKD39_RS10480 2149536 .. 2149560 + -12.3  -5.53991   TTACGCCACATAACA          TCGTCAAAGAT TTA ATCTTTGGCGA          TTTTTTTAGTCAATG 100 65
MKD39_RS10485 NONE
MKD39_RS10490 NONE
MKD39_RS10495 2151650 .. 2151661 +  -4.4  -3.10082   ATTTTCTGCAGTAAA                GCTA TAAA TAGC                 TTCAATCCCCTTTTT  50 260
MKD39_RS10520 NONE
MKD39_RS10545 2159376 .. 2159388 +  -3.4  -5.68023   CCGATTTAAAAATGC                GCTT TTAAC AAGC                TTTTTTTAATTCTAA  79 117
MKD39_RS10575 2165866 .. 2165896 +    -2  -5.31456   AAATATAGAGTATAA      GAGCAG-CTAATT AAGTTA AATTGGATTGCTC       TTTTTTCTGCATTAA  67 47
MKD39_RS10615 2174251 .. 2174290 +  -6.5  -4.91084   TTGGAAATTAAAAAA  GGCTTACTTCCTTAATG ATTTAA CATATAGGAAATAAGCC   TTTTATTCTTAGCTA  80 160
MKD39_RS10695 2192719 .. 2192731 +  -3.5  -2.88268   ACTTGACTTATCAAA                TTTAT ATG ATAAA                ATATTTTAGTTGAAA  45 83
        pbp4 2194246 .. 2194284 + -14.1  -4.28361   TTAAGTTAAACAAAG   AAGCCAGCAAATGAATT CAAAA AGTTCATTTGCTGGCTC   TTTTAATAGGATTAA 100 210
        tagH 2199032 .. 2199063 +  -9.5   -3.8613   ATAAAAAATTTTAAA      GGCGGATTCA-GCC CTCTC GACTTGAATCCGCC      TTCTTCATATTTAAA  86 52
MKD39_RS10735 2200907 .. 2200937 + -16.4  -5.95946   ATGAGTCCTAATATT       GAGATTAAGCAACC TTA GGTTGTTTAATCTC       TTTTTTTGTTGTTGA 100 102
MKD39_RS10755 2206977 .. 2206995 +  -2.4   -5.1675   CATTCATAGGAGGAT             ATCATGAA AAT TTCATGGA             TTTTTTGGTGGATAA  65 121
MKD39_RS10760 2207255 .. 2207298 +  -8.4  -3.16035   AAATTAAGTAGATTT GAGGGAGTAGGACAATGAAT CTAAAC ATTC-T-GTCCAACTCCCTC CTCTTTTTATTTAAT  74 61
MKD39_RS10805 2214908 .. 2214929 +  -8.1   -2.9732   CGATAAAGTTGAGGT           GGTTAAAAC ACAA GTTTTAGCC            TAATTTAACTTAAAA  70 1
MKD39_RS10810 2215315 .. 2215346 + -11.8  -5.71983   TCTAGTCAACCTTGC      GAAGCTAGGAT-GAA GAA TTCTGTCCTAGCTTC      TTTTTTTATAATTAA 100 152
MKD39_RS10815 2216414 .. 2216430 +  -2.3  -3.28265   CTGTTACGCCTCTTT              TAGTTTT TAC AACACTA              TATTAGTATCTTTAT  43 23
MKD39_RS10820 2217473 .. 2217500 +  -4.2  -4.23007   TTGTTAATCCTTCAT        CATCACTACT TCAAAAAT AGCAGTGATG         TTTTGCAATTGTATA  58 6
        sarA 2218268 .. 2218303 +   -15  -5.43414   ATTTTAAATAACAAA    GCCAGTAAATGAAATT CGTA AATTTCACTTACTGGC     TTTTTTGTATATCAT 100 103
MKD39_RS10895 2231156 .. 2231183 + -14.3  -3.21354   AGCCACACCTAAAAA        TCCCCTCACTA CGGCAA TAGTGAGGGGA         TTGGTGCATCTATGC 100 49
MKD39_RS10910 NONE
MKD39_RS10920 2234157 .. 2234168 +    -3  -4.01137   TGGTTTTGAACGAGT                GAAA CGAG TTTC                 TTCTTGTCTTGCTTT  53 43
MKD39_RS10925 NONE
MKD39_RS10930 NONE
MKD39_RS10935 NONE
 aph(2'')-Ia 2238080 .. 2238109 + -13.8  -5.36364   CGGTTCTATAATAAA       TTGGACTGATGA CAAAAT TCATCAGTCCAA        TTTTTATGTTTTTGA 100 361
MKD39_RS10950 2239786 .. 2239809 +  -8.2  -2.56122   AAGTGAACTTGGCAT          CTTTGCCAAC TTAC GTTGGTGAAG           GATTTTCTAATGGCA  67 298
      msr(A) NONE
MKD39_RS10975 2245756 .. 2245782 +    -8   -5.1523   TAATCAATGAGAAAA         GCAACGCACTAT ATT AAAATGCGTTGC         TTTTTCTATTATCGA  91 517
MKD39_RS10990 NONE
MKD39_RS10995 NONE
MKD39_RS11000 2250035 .. 2250061 +  -6.6  -4.63172   TCGTTAATAGAAAAA         GCAATGTACTTT AAT ATAGGACATTGC         TTTTCTCATTTACTA  79 34
MKD39_RS11005 2250883 .. 2250900 +  -5.5  -4.85599   TTGTACAAGAAAAAA             GAGTACG AATT CGCACTC              TTTTTCTAAACTAAG  75 122
MKD39_RS11020 2252356 .. 2252400 + -14.7  -2.90711   TTCTTAAACATTCAT TTATCACAAAAAGAGAGTGC CAATTC GCACTCTCTTTTTGTG-TAG TAATATTATTTAAAT 100 34
MKD39_RS11045 2255632 .. 2255643 +    -3  -2.72461   AGAAATAAACGAGAA                CTAA ATTT TTAG                 ATTTGCCAAAAATTA  42 14
MKD39_RS11050 2255840 .. 2255864 + -11.5  -5.63103   AATGATTTTGAACTA          TGAGTGGCTAG CAT TTGGCCACTCA          TTTTTTTGCTTGCAC 100 47
MKD39_RS11055 2256613 .. 2256638 +  -4.1  -2.50021   GAATATAAGTTATAA         TACATTCAAAA ATAT TTTTGAATGAG          GTGCTTTATGTTTTC  45 223
MKD39_RS11060 NONE
MKD39_RS11065 2257835 .. 2257858 +  -7.4  -4.58943   TGGCATGGCGAAAAT          CCGTAGATCT GAAG AGACCTGCGG           TTCTTTTTATATAGA  82 232
MKD39_RS11100 2263469 .. 2263485 +  -2.3  -3.22841   CTTCAGGAGGACACA              TCAAATG ACA CATTTTA              ATTTATTAGTTATTG  43 8
MKD39_RS11105 2264785 .. 2264805 +  -2.7  -4.18934   CCTTTAATGATTTGT            TTAATATTT AAA AAATTTTAA            TTTATTAAAATACTG  53 15
MKD39_RS11110 2265248 .. 2265277 + -14.5  -5.80364   ATTAGACCTAATTAA       GCGCTTAGAAGAT AAAT ATCTTCTAAGTGC        TTTTTTTATTACAAT 100 42
MKD39_RS11120 2267273 .. 2267305 + -10.7  -2.63089   CTCAACAACAAAAAA      AGAGATTAAACAACC TAA GGTTGCTTAATCTCA      ATATTTGGACTCATC  84 49
MKD39_RS11150 2274014 .. 2274054 +  -9.9  -5.38054   TGATATTCATAACTT GTTCCCTTCTAAGCT-TG CTTGAA CATGGCTTTGAAGGGAAC  TTTTTATTTATAGAA 100 67
MKD39_RS11155 NONE
MKD39_RS11160 2275986 .. 2276010 + -13.6  -4.66833   GTTGATAATAGAAAA         GCGCGTGGCTC CCTA GAGCC-CGCGC          TTTTTAAAGTTAAAC 100 57
        thiD 2280077 .. 2280116 +  -5.3  -3.03286   TAAACTCAAACTAAC CTCCTCAAT-AA-AGTCTT TATT AAGACCATTCATTGAGGAG  CTATTTTATTTAAGT  54 61
        vraX 2280756 .. 2280783 +   -15  -3.98113   AAATAAAATAAAAAA        CGCATTGATGCG AACG TGCATCAATGCG         TTTAATTGATAATTA 100 319
MKD39_RS11230 NONE
       bshB2 NONE
       folE2 2289535 .. 2289554 + -10.7   -4.3208   GTATTTAAAATAAAA            CCAGGCC ATGTAA GGCCTGG             TTTTAAGTTCTACCC  95 465
MKD39_RS11295 NONE
MKD39_RS11300 2309189 .. 2309218 +  -5.1  -4.95854   TTAACATAAACAAAA       CGCTACACA TTTCAAACTCTT TGTGTAGCG        TTTTTACATTTTTTA  72 37
MKD39_RS11330 2314427 .. 2314459 +    -8  -5.35222   GGATAAGTGAAAAAA      GACAATTTCTAT TGAAATAAT ATAGAAATTGTC      TTTTTTATAAATTTT  93 366
MKD39_RS11355 2322689 .. 2322726 + -12.3  -4.66388   ATTTCAAATTTAAAA   CCGTGTAGATGACA-GTT AAC AATATGTCATTTACACGG   TTTCTTTATAATTTT 100 40
MKD39_RS11380 2328224 .. 2328259 + -12.8  -4.33281   AACCCTAGAGAAATA    GCCAGTAAATGAGTTT TAAC AATTTCATTTACTGGC     TTCTTTATTTACAAT 100 214
MKD39_RS11440 2346384 .. 2346408 + -11.5  -3.60661   TATAAATAACAATAA          CCTGTGACATT CGA AAAGTCACAGG          TTCTATAATTAAATA  93 83
MKD39_RS11535 2364333 .. 2364371 + -10.6    -5.055   AATATCGAAATTAAA   TAACCTAGAACTTC CAATTTATAAA GAAGTTCTAGGTTA   TTTTTTGCAAATTGA 100 39
MKD39_RS11550 2367339 .. 2367375 +  -9.5  -3.11584   ACTGTATAGTGAAAA    AAGCACGTCCATAAGTT AAA AACTTATCGACGTGCCA    TCGTTTATATTAAGT  78 32
MKD39_RS11900 2438466 .. 2438477 +  -3.6  -2.82015   CTATTTGAATAATGA                CGCT GAGG GGCG                 TATAATCACTCTGAC  45 75
MKD39_RS11905 NONE
MKD39_RS11910 2440507 .. 2440542 +  -8.4  -4.38748   GTTCTCTCAAAAATA    GCCAGTAAATGAGTCT TGAT AAATTCATTCACTGGC     TTGTTTATTTATAAG  83 84
MKD39_RS11925 2441839 .. 2441878 + -13.3  -5.54894   CAATAATATAAAAAA  GCTAATCAAAA-GAAGTA AAGTA TACTTCCTTTTGATTAGC  TTTTTTTGATAAATT 100 35
MKD39_RS11945 2446216 .. 2446229 +  -3.9  -3.72315   CATATCCCTTTTTAA               TATCA AAAC TGATA                TGTTTTAGATGTAGT  54 72
MKD39_RS11950 2446837 .. 2446862 + -10.5   -5.1764   TCAATTAGTAAAAAA         GGTTAGCCACA TATG TGTGACTAACC          TTTTTATATTGTATG 100 33
MKD39_RS11960 2448838 .. 2448850 +  -7.7  -5.02074   CTGATTTGAAAATGC                GCTTG AAT CAAGC                TTTTTTCAAACCTAG  89 215
MKD39_RS12005 NONE
MKD39_RS12010 2459118 .. 2459142 +  -7.2  -3.25478   AAACCACAAATATGC          CTCAACATGC GAGAA GTATGTTGGG          ATTTCCTTTTTTAGT  66 304
MKD39_RS12020 2462172 .. 2462186 +  -8.6  -4.94147   GTAATATTAAAAGCA               TGGAGT GTA ACTCCA               TTTTCTTCTATTATT  95 109
MKD39_RS12050 NONE
MKD39_RS12055 2465773 .. 2465793 +  -5.5   -5.3104   TTTAAAAGGAGGTTG            CTATGCTAA TAT TTATCATAG            TTTTATTTTTGATCA  80 73
MKD39_RS12085 2474019 .. 2474054 + -12.8   -5.1287   TTTTAAACTTTGAGA    CCGTGAAATGAACGTA GTTT TAAGTTCATTTTACGG     TTTTTTCAATCTCAA 100 51
MKD39_RS12090 NONE
MKD39_RS12095 2475644 .. 2475680 + -11.2   -5.4387   AACTCTTTATACAAA   GGTGAGAC-A-GAATTCA TTT TGAATTCATTGTCTCACC   TTTTTTCATTTCTAT 100 91
MKD39_RS12100 2477267 .. 2477321 +  -5.4  -4.57482   TAATATTTAAAAAAA GCGTAGCTAAAACATTACAAT-GTTT ATTTC GAACAATTGTAATCATT-AGCTACGC TTTATTTATAAATAG  70 38
MKD39_RS12110 2479081 .. 2479122 +  -4.6  -5.71638   TTAGCCATTATTGAA CGGGATATGAAATCTTCAT AATTA ATGTTGATTTC-TATTCCG TTTTTTTAATTATTC  82 76
        ahpC 2480025 .. 2480038 +  -5.3  -3.26473   GTAAAATTTAAGGAG               GCATT AAAG AATGC                TTAATGCTGATTTAA  56 30
        ahpF 2481645 .. 2481671 + -11.7  -6.02914   TATCTTCATATATAG         CAGAGACGTTT CTTAC AAGCGTCTCTG         TTTTTTTTATGTGAG 100 112
MKD39_RS12125 2482564 .. 2482591 +  -8.6  -4.75308   CTAGGCACATAAAAA        TCCAAACCGT-TA AAA TATGCGGTTTGGA        TTTTTGCGTGTTAAT  90 64
MKD39_RS12140 2484555 .. 2484574 + -13.6  -4.31433   TTCATTAAATCAAAA            CCACCCGT GTGA ACGGGTGG             TTTGTTCTACGGCTA 100 44
MKD39_RS12150 2486354 .. 2486367 +  -3.9  -2.87211   AGGGTCATTAAATAG               TTTTG GGCA CAAAA                TATATAAAACAACCT  46 468
MKD39_RS12155 NONE
MKD39_RS12160 2487715 .. 2487728 +  -6.7  -3.68359   TTTTGAAATAAAAAA               TCGAC TAAG GTCGA                TTATGGTTTTGCACC  66 72
MKD39_RS12165 NONE
MKD39_RS12170 2488529 .. 2488545 +  -5.1  -2.65354   GTATAATAATGGAGT              CGCCT ATCTCTC AGGCG              TCAATTTGACGTAGG  50 173
MKD39_RS12175 2488693 .. 2488729 + -15.3  -2.92463   ATAGCCACACCTACA    ACAATCCCCTCACTATT TGC GGTAGTGAGGGGATTGG    TGTATCCATGCTGGA 100 47
MKD39_RS12180 2489728 .. 2489748 +  -2.7  -4.14739   GAAGATGCAGATAAA            TTTATTTTT GAA ATAAATAAA            TTTTGGAATGAGTGG  53 229
MKD39_RS12185 2490483 .. 2490510 +  -3.5   -4.7629   ATAAATGAGAAAAAA        GCAACGCA-CTT TAAAT AAGATACGTTGC        TTTTTCGATTGATGA  64 136
       blaR1 NONE
        blaI 2493909 .. 2493944 +   -15   -5.4251   ATATTATTAAAGATG    AGAGTGTACAGAAAAT AACC ATTTTCTGTACACTCG     TTTTTTATGTCTAAA 100 123
MKD39_RS12205 2494818 .. 2494839 +  -8.7  -4.28651   ATATATAAAAAGAAA           GCTGAGCAA TTTT TGGCTCAGC            TTTTAAAATTTTCAT  83 190
MKD39_RS12240 2503362 .. 2503376 +  -4.2  -3.78193   TATCAATAAAAAGGA               GGGAAT TAT ATGCCC               TATTTATATTTAATA  54 121
         qac 2503947 .. 2503969 +  -7.8  -5.47846   GCATAATTCACTAAA           CCAGTTTGTG TTT TACAAATTGG           TTTTATTTTTTGGTT  95 278
MKD39_RS12260 NONE
MKD39_RS12265 2506704 .. 2506714 +    -4  -2.51969   GCTATTTGATGATTA                 CAAT AAA ATTG                 ATCTTACCTTATTGC  45 167
        sat4 NONE
aph(3')-IIIa 2508758 .. 2508807 + -16.3  -4.40358   TTGTTTTAGTACCTA GATTTAGATGTCTAAAAAGCTT TAACTAC AAGCTTTTTAGACATCTAA-TC TTTTCTGAAGTACAT 100 32
MKD39_RS12285 2509895 .. 2509918 +  -7.4  -4.58943   TGGCATGGCGAAAAT          CCGTAGATCT GAAG AGACCTGCGG           TTCTTTTTATATAGA  82 321
MKD39_RS12295 2512176 .. 2512199 +  -7.4  -4.58943   TGGCATGGCGAAAAT          CCGTAGATCT GAAG AGACCTGCGG           TTCTTTTTATATAGA  82 89
MKD39_RS12305 NONE
MKD39_RS12310 2515000 .. 2515028 + -14.7  -4.68593   CATTATATGCACCAA        TCCCCTCACTACT CGC AATAGTGAGGGGA        TTTTTAGGTGCTGGC 100 340
MKD39_RS12345 2521341 .. 2521372 +  -8.8  -5.33785   AATTTCTATTAAATG      CCTGTCATACTATA TATT TAGTGTATGACAGG       TTTTTTATCATAATT 100 39
MKD39_RS12350 2522671 .. 2522706 + -17.2  -4.33281   AACCCTAGAGAAATA    GCCAGTAAATGAGTTT TAAC AAATTCATTTACTGGC     TTCTTTATTTACAAT 100 96
MKD39_RS12375 2526962 .. 2526973 +  -4.4  -2.87468   ACACTTTATTTTTAC                GAAC ACTT GTTC                 TATAATATAGTCGAG  49 55
MKD39_RS12380 2527219 .. 2527264 +  -3.5  -5.89659   AACAATATAAAAAAA GCAATGTAAGTCTC-CT-GTC ATTCAA GCCAAGCGAAACTTACATTGC TTTTTATTTTTTTAT  84 55
MKD39_RS12405 NONE
MKD39_RS12410 NONE
MKD39_RS12415 NONE
        metE NONE
MKD39_RS12425 2538651 .. 2538696 +  -2.7  -4.46587   TAATATTAATAAAAA TCCTGCCACATCAACCGTTAC GTGTAA GTGCCGGT--ATATGGCAGGA TTATTTTATTGATAC  58 92
MKD39_RS12435 2541494 .. 2541516 + -11.4  -4.91573   TTCATACGATTAAAG           GGATAGTTGA TAA TCAGCTATCC           TTTTTCCTATATTTT 100 52
        bstA NONE
MKD39_RS12445 2542574 .. 2542609 +  -2.7  -5.59357   CAATAAAAAATTAAA    CGCTTAACAGAGTTTA TTACT TCAAA-CTGTTAAGCG    TTTTTTTAATATACT  74 35
MKD39_RS12470 NONE
MKD39_RS12475 2548144 .. 2548155 +  -2.2  -2.85574   TCAGCCTTAGGTGGT                GTCG CAAA TGAC                 GTTTAATCAAATTAC  40 8
MKD39_RS12480 NONE
MKD39_RS12485 2550425 .. 2550471 + -12.5  -5.50723   CTACAAGCTAAGTAA GT-TGGGGGTAGGATAGAATTC AAAA GGATTCTATCCTACCCCTTTGC TTTTTATTTTAATAA 100 194
MKD39_RS12490 2554254 .. 2554283 +  -9.4  -4.93547   GTGAAATTTTTAAAA       AACCTAAGAAGC ATTTCC GCTTCTTAGGTC        TTTTTAATTGATTAC 100 37
        rpmH 2562207 .. 2562228 -  -9.5  -6.02546   TCAAACGAAAAAAAA           GACCACTGA GAAG TCAGTGATC            TTATGCTGATAAAAC 100 26
        rnpA 2561712 .. 2561747 -  -5.4  -3.23274   TCGCTCATAATGTAA    GACTTCGGTTTGTCTA ACCT CAGACTAACAGGAGTC     TAAAATCCCCCTACC  56 44
        mnmE NONE
        mnmG NONE
        rsmG NONE
         noc 2556528 .. 2556561 -  -9.1  -5.80817   TTGAACATAAAAAAA     CACTAAGATAATTCA ATTT TTAATCATCTTAGTG      CTAATATTTAGTGAT 100 92
MKD39_RS12510 NONE
MKD39_RS12505 NONE
MKD39_RS12500 2555035 .. 2555046 -  -4.4   -2.8806   AAATCCTTTTACATA                CTGA TATA TCAG                 CATTTGCAAGACTTC  49 102
MKD39_RS12495 2554256 .. 2554281 - -12.7  -5.07107   GAAATTTTTAAAAAA         CCTAAGAAGCA TTTC CGCTTCTTAGG          TCTTTTTAATTGATT 100 39
        lepB 2545993 .. 2546015 - -10.6  -5.96894   ACTGAAATAAAAAAA           CGATGAAGTC TAA GACTCCACCG           ACAATAAATTTTATT 100 57
MKD39_RS12460 NONE
MKD39_RS12455 2543275 .. 2543304 - -10.1  -4.90296   AAAACTTTATAAAAA       GGCTGAGCAATTA AATT CAATCGCTCAACC        TCGTAATCATTACCG 100 52
MKD39_RS12450 2542574 .. 2542609 -  -2.7  -4.51301   CAATAAAAAATTAAA    CGCTTAACAGAGTTTA TTACT TCAAA-CTGTTAAGCG    TTTTTTTAATATACT  58 46
MKD39_RS12430 2538651 .. 2538696 -  -2.7  -5.19251   TAATATTAATAAAAA TCCTGCCACATCAACCGTTAC GTGTAA GTGCCGGT--ATATGGCAGGA TTATTTTATTGATAC  68 31
MKD39_RS12400 2529657 .. 2529680 -    -4  -3.53224   TATTTCCTTGGCAAA          GCCTAAGATGT AAC ACATCTTA-AC          TCACTCTTTCATAGA  52 72
MKD39_RS12395 NONE
MKD39_RS12390 NONE
        ychF 2527219 .. 2527264 -  -5.7  -5.86465   AACAATATAAAAAAA GCAATGTAAGTCTC-CT-GTC ATTCAA GCCAAGCGAAACTTACATTGC TTTTTATTTTTTTAT  95 92
        rpsF NONE
         ssb NONE
        rpsR 2524671 .. 2524695 - -10.7  -4.00212   AAAGCAAAAAAGTAA          CCCCATAAGCC TTA AGCCTACGGGG          TTTAACCAATACTTA  95 45
MKD39_RS12335 2519603 .. 2519636 - -14.9   -4.7923   AGCCAAATAAAGAAA     CCAGTAAATGAATTT GTTA AAACTCATTTACTGG      CTATTTCTCTAGGGT 100 68
MKD39_RS12320 2515465 .. 2515497 -  -6.4  -6.23545   TTTAAATAAAAAAAA      CGTGAAGTAAGC GAATTTGCA ACTTACCTCACG      GTGTATACCTAAAAT 100 44
MKD39_RS12315 2515000 .. 2515028 - -16.9  -3.20858   CATTATATGCACCAA        TCCCCTCACTACT CGC AATAGTGAGGGGA        TTTTTAGGTGCTGGC 100 50
MKD39_RS12300 2512044 .. 2512060 -  -2.1  -4.59773   TTTGATGCTGAAAAA              CGCATTC ATA GTAAGCG              ACAACCTAAAATGGG  59 98
MKD39_RS12290 2509500 .. 2509512 -  -7.7  -3.17792   AATATCAATTCAATA                TCCTG CAT CAGGA                GGGCAAGAACCGGAA  67 365
MKD39_RS12255 NONE
MKD39_RS12250 2504289 .. 2504310 -  -6.6  -5.77632   AAAAGCATAAAAAAA           CGCTAGCT TTTTTC AGCTAACG            TTAAAATTTTTCGTT 100 93
        fabI 2501228 .. 2501263 - -17.2  -4.33281   ATTGTAAATAAAGAA    GCCAGTAAATGAATTT GTTA AAACTCATTTACTGGC     TATTTCTCTAGGGTT 100 70
MKD39_RS12230 2499010 .. 2499038 -  -2.5  -5.01535   TGATAAGTATAAAAA        GTATAAGCCTTTA CTA TAAAAGATAATAC        CATATATTTCAAATT  65 330
MKD39_RS12225 2498239 .. 2498261 -  -8.6  -5.00884   ATCCTCCTCAAAAAA           TATATGCATG AGT CATACATATA           AATTAATCCTAAATT  95 180
MKD39_RS12220 2496968 .. 2496978 -  -2.6  -3.45031   TTTGTAAAAATTCAA                 TTTT TAA AAAA                 GTTTTCATCGATAAA  45 132
MKD39_RS12210 2495175 .. 2495203 -  -9.8    -5.626   TACTTCATAAAAAAA       TGTCGAC-AAAGT ATAC ACTTTTGTCGACA        TTTCAAGACATTTAT 100 64
MKD39_RS12190 2490483 .. 2490510 -  -5.7  -5.43621   ATAAATGAGAAAAAA        GCAACGCA-CTT TAAAT AAGATACGTTGC        TTTTTCGATTGATGA  86 247
MKD39_RS12135 NONE
MKD39_RS12130 2482564 .. 2482591 -  -7.1  -4.99035   CTAGGCACATAAAAA        TCCAAACCG TTAAAATATG CGGTTTGGA         TTTTTGCGTGTTAAT  85 59
        nfsA 2477267 .. 2477321 -  -6.9  -5.52909   TAATATTTAAAAAAA GCGTAGCTAAAACATTACAAT-GTT TATTTCG AACAATTGTAAT-CATTAGCTACGC TTTATTTATAAATAG  91 42
         xpt 2472417 .. 2472432 -    -4  -4.35524   GTTGTAAACTTAAAA              TGAACG TCTT CATTCA               TTTTCACCTAGTAGT  61 19
MKD39_RS12075 NONE
        guaB 2469592 .. 2469602 -    -4  -2.86271   CCTCTATGACAATCA                 CATT TAA AATG                 AAAAATGCTCCCCAT  46 79
        guaA 2467895 .. 2467925 -   -12  -4.99861   TACGAATTACAAAAA       CAACCCTCTAACCA TTG TGGTTAAAGGGTTT       TATAATTTATATATT 100 41
MKD39_RS12045 2463937 .. 2463956 -  -5.7  -3.35964   TCACAAATAAAATGA            GCCTACC ACTAAG GATAGGC             AAGATATTTATTATT  60 36
MKD39_RS12040 NONE
MKD39_RS12035 NONE
MKD39_RS12030 NONE
MKD39_RS12025 2462096 .. 2462122 - -11.7  -4.47456   ATATTTAATAACAAA         GCCTCCTCTAT GAAAA ATAGAGAAGGC         CTTTATTTATATCAA 100 182
MKD39_RS12000 NONE
MKD39_RS11995 NONE
MKD39_RS11990 2452468 .. 2452509 -  -9.8   -4.2349   CGTTTATACTTAAAA GCACCCTACAAAGTCAGCAT AATA AT-CTAACTTT-TAGGGTGC CTCTTTAAAATTGTA  91 62
MKD39_RS11985 NONE
MKD39_RS11980 NONE
MKD39_RS11975 NONE
MKD39_RS11970 NONE
MKD39_RS11965 2448769 .. 2448796 -    -7  -3.49369   AAACATTAAAATAGA        GGCTGGGACA AAATAAAA TGTCTCAGCC         TATTTTATCATTTTG  67 186
MKD39_RS11955 2446837 .. 2446862 - -12.7   -5.2189   TCAATTAGTAAAAAA         GGTTAGCCACA TATG TGTGACTAACC          TTTTTATATTGTATG 100 45
MKD39_RS11940 NONE
MKD39_RS11935 2443186 .. 2443217 - -13.1  -3.84901   TTTATTAAAAATTAA      GAGGGTGGAACAA AATTGA TTGTCCCACCCCC       ATATGGCTGACTAGA 100 129
MKD39_RS11930 2441839 .. 2441878 - -13.3  -5.55695   CAATAATATAAAAAA  GCTAATCAAAA-GAAGTA AAGTA TACTTCCTTTTGATTAGC  TTTTTTTGATAAATT 100 39
MKD39_RS11920 NONE
MKD39_RS11915 2440507 .. 2440542 - -10.6  -3.90048   GTTCTCTCAAAAATA    GCCAGTAAATGAGTCT TGAT AAATTCATTCACTGGC     TTGTTTATTTATAAG  91 44
        gltB NONE
MKD39_RS11890 NONE
MKD39_RS11885 2431085 .. 2431121 -   -14  -5.08169   ATAGAGCCTAAAAAA    GACAAGTACTCAATAT GTTAT AAATTGAGTACTTGTC    TTTTTTATATTTATT 100 62
        treP 2429444 .. 2429479 -  -2.7   -3.7948   TTAATATGCATTAAA    GACGCTCAAACACTTA ATATG TGAA-GTTTGAACGTC    TTTAATTGTATTAAT  49 40
        treC NONE
        treR NONE
         ffs 2426441 .. 2426474 -  -3.9  -5.37043   ATTCTATACAAAAAA     CG-AGCCTGGGACA AAATCAA TGTCTCAGGCTACA     ATTATATATTGGTAG  74 199
MKD39_RS11860 NONE
        dnaX NONE
MKD39_RS11850 2423564 .. 2423576 -  -6.3  -2.72463   ATGCATCTTTAATTA                CATTC CCG GAATG                TTTAAGCCTTGTGTA  57 10
        recR 2422848 .. 2422874 -  -3.3  -4.58585   CACTCAAATAACAAA        CTTTAAAAAAAT TACG ATTTTTTTAA-G         ATAAATTAAAAAATC  62 109
MKD39_RS11840 2420573 .. 2420589 -  -8.1  -2.78596   TATGTTTCCACCATA              TTAGAAC GTA GTTCTAA              TTTTAAGAAACCTGT  69 333
MKD39_RS11835 2417609 .. 2417623 -  -7.2  -3.04026   ATAGTAAGTAAATGA               TTTTGC TTC GCAAAA               CATTGAAATAAATTG  65 38
         rrf 2417405 .. 2417420 -    -9  -5.60993   TTGTGCATAAAAAAA              GAGACC TTTC GGTCTC               GATATCGGCTCATCG 100 55
MKD39_RS11825 NONE
MKD39_RS11820 NONE
         tmk NONE
MKD39_RS11810 2414274 .. 2414288 -  -3.5   -3.5394   AAATCTGCCTTCAAA               CACCG TCTAT CAGTG               TTCCAGAGCATAAGC  50 114
MKD39_RS11805 NONE
MKD39_RS11800 NONE
        yabA 2411806 .. 2411826 -  -5.6  -3.66288   TAGCTTTTAACATAA            TCTTTTTT CTCCT AAAAAAGA            GATGTCTTTACAACA  62 160
MKD39_RS11790 NONE
MKD39_RS11785 NONE
        rsmI 2409899 .. 2409920 -  -8.9  -2.77701   ATCCTATTAACATTA           CCATAAATT TATT AATTTATGG            GGGATTTCATAAGAT  74 97
        metG 2407755 .. 2407771 -  -2.4  -2.61681   TCCTAATTTTACAAT              TTATTA CTATT TAATAA              CTGCACCATTTGGAA  40 15
MKD39_RS11770 2406914 .. 2406924 -    -4  -4.38712   GTCATGTTTATAAAA                 TCAT ACC ATGA                 CAGACACGGTTTAAC  61 62
        rnmV NONE
        rsmA 2405333 .. 2405348 -  -3.4  -3.61103   CAAGGTTATGTCAAA              TAAAAT TTAA ATTTTA               TCAATGTAGTAGCGC  50 53
MKD39_RS11755 2404927 .. 2404955 - -11.1  -5.60993   TCTTCTACAAAAAAA        GAGTGTTGAACTT AAT AAGCCCAACACCC        AATACATTTTAATTA 100 83
        ispE NONE
        purR NONE
MKD39_RS11740 2402604 .. 2402617 -  -2.4   -3.3482   CAATTCTTTAATCAA               GGAA ATTATA TTCC                TTTTACTTTACCTAC  45 17
       spoVG 2402190 .. 2402221 -   -11  -4.70659   CTTGATATTTAAAAA      GCAGGTTCAACA AATTTAAA TGCTGAACCTGC       CATAATGTATGATTT 100 43
        glmU 2400663 .. 2400673 -  -2.6  -3.95893   AAAAGAGATACCAAA                 TTTT ATC AAAA                 AATTATTTTTTGAGA  51 28
MKD39_RS11725 2399552 .. 2399562 -    -4  -3.44825   AAAACCACGAACGAA                 TGTA TTA TACA                 CGGTTGAAATGTATA  50 62
MKD39_RS11720 2398687 .. 2398728 - -16.2  -5.21506   ATAATAACACAAAAA GGGAGTAGAACA-GAATTC ATTAA GAATTCATGTTCCACTCCC ATAAAGATAACAATC 100 47
         pth NONE
         mfd NONE
MKD39_RS11705 NONE
MKD39_RS11700 NONE
MKD39_RS11695 NONE
MKD39_RS11690 2390993 .. 2391006 -  -3.9  -2.65166   AAACCAGATAATTCA               TTCTT ATTT AAGAA                AAACGATTATCCTTA  45 47
MKD39_RS11685 2390338 .. 2390378 - -14.4  -5.53991   TAGTCATCAAAAAAA GAGTGGAAC-TAAAATTCA TTGT TGAATTTTAAGTTCCACCC  CGCAAAAATAACATA 100 145
        tilS NONE
         hpt 2388214 .. 2388224 -    -4  -5.16151   TAAAGCTAACAAAAA                 TTGT AAC ACAA                 CACTTCTCTTAAAGG  71 237
        ftsH 2385933 .. 2385971 - -13.4  -5.24989   CTACATATTAAAAAA   TCTCCTTTGACTAAGG GGAATTG CCTTACTCAAAGGAGA   TAATAATCCAGTTTA 100 44
        hslO 2384825 .. 2384852 -  -6.4  -5.24129   TTTCCCTATAAAAAA        GGCAATAAAC ACGTGATG GTTTATCGCC         TTTAGTATATTTTTA  86 42
        cysK 2383657 .. 2383687 -  -8.3  -5.21709   CTTTATACTAAAAAA       TAGCTGGCTCCGC CTTTT ACGAAACCAGCCA       TTTCTTATTTAAAAC  93 71
        folP NONE
        folB NONE
        folK 2381741 .. 2381756 -  -4.8  -3.53012   TTTCTCTCCTTTAAA              TTTCAT TTCA ATGAAA               ATTATTCCATGGATT  57 195
        lysS 2379784 .. 2379800 -  -2.3  -3.18728   ATTTTCAATAGTTAA              TTTTACA CTT TGTTAAA              GTTATCTTTACAAGT  43 457
         rrf NONE
MKD39_RS11630 NONE
MKD39_RS11625 2379420 .. 2379436 -  -4.4  -3.15249   CAGATGCTCTACCAA              CTGAGC TAATG GCTCAA              AGATGGTGCCGGCCA  52 29
MKD39_RS11620 NONE
MKD39_RS11615 NONE
MKD39_RS11610 NONE
MKD39_RS11605 NONE
MKD39_RS11600 2378985 .. 2378999 -  -4.2  -3.05066   AAGAAGTCGGGAAGA               CAGGAT TCG AACCTG               CGACCCCTTGGTCCC  48 1
MKD39_RS11595 2378800 .. 2378810 -    -4   -2.7364   CATAATACTAAATAG                 TGTT TGT AACA                 TTTAAGTTACTGTTT  45 100
MKD39_RS11590 2376890 .. 2376906 -  -8.1  -2.90392   TATGTTTCAACCATA              TTAGAAC GTA GTTCTAA              TTTTAAGAAACCTGT  69 331
MKD39_RS11585 2373926 .. 2373940 -  -7.2  -3.04026   ATAGTAAGTAAATGA               TTTTGC TTC GCAAAA               CATTGAAATAAATTG  65 38
         rrf 2373746 .. 2373757 -  -5.8  -5.64274   TTAGCCACAAAAAAA                GACC TATC GGTC                 AAAGTGGTTGCCTGG  90 35
MKD39_RS11575 2371992 .. 2372004 -  -6.3  -3.07013   GATGTTCCGAATATA                TCCTT AGA AAGGA                GGTGATCCAGCCGCA  60 20
MKD39_RS11570 2371654 .. 2371670 -  -8.1  -2.90392   TATGTTTCAACCATA              TTAGAAC GTA GTTCTAA              TTTTAAGAAACCTGT  69 184
MKD39_RS11565 2368690 .. 2368704 -  -7.2  -3.04026   ATAGTAAGTAAATCA               TTTTGC TTC GCAAAA               CATTGAAATAAATTG  65 38
         rrf 2368507 .. 2368522 -    -9  -5.64274   TTAGGCATAAAAAAA              GAGACC TTTC GGTCTC               AATAATTTGCCTGGC 100 34
MKD39_RS11555 2367341 .. 2367373 - -16.5   -5.1287   TGTATAGTGAAAAAA      GCACGTCCATAAGTT AAA AACTTATCGACGTGC      CATCGTTTATATTAA 100 66
        pdxS NONE
        pdxT 2364333 .. 2364371 - -11.3  -4.10159   AATATCGAAATTAAA   TAACCTAGAACTTCC AATTTATAA AGAAGTTCTAGGTTA   TTTTTTGCAAATTGA  95 78
MKD39_RS11530 NONE
MKD39_RS11525 NONE
MKD39_RS11520 NONE
MKD39_RS11515 2358356 .. 2358386 -  -9.2  -4.35327   TCATTAAAAATTAAA      GCTGAGACAT-TC GAGTAT GATATGTCTCAGC       TTATATTTAACATTA  86 52
        radA NONE
MKD39_RS11505 2355524 .. 2355535 -    -3  -3.79251   TATTGTAGCACTAAA                TCAA TACT TTGA                 TAAGTCACTTGTTTA  51 222
        gltX 2353477 .. 2353511 - -13.7  -3.31331   TCTAAATAAAATAAT     TAGCGCCCCTAACAC TTAAG ATGCTAGAGGCGCTA     CTGCACGGTTCCACT 100 347
        cysE NONE
        cysS NONE
MKD39_RS11485 NONE
        rlmB NONE
MKD39_RS11475 NONE
MKD39_RS11470 2348969 .. 2348979 -    -4  -2.75074   CTCATTTTAATACCA                 GTAT ACT ATAC                 ATAAACCTAAGATTA  45 80
        rpmG NONE
        secE NONE
        nusG 2347844 .. 2347860 -  -9.5  -3.91897   CCTCCCACTCATAAA              CATTTCG TGA CGAAATG              AGCGCTATAAAAACG  87 132
        rplK 2347275 .. 2347286 -  -4.4  -2.95521   CCCAGACTAATCATA                GACA ATAT TGTC                 GTTGTCATTTCTGTT  49 96
        rplA 2346300 .. 2346330 -   -15  -5.95946   TCAACAACAAAAAAA       GAGATTAAACAACT TAA AGTTGCTTAATCTC       AATATTTGGACTCAT 100 132
        rplJ NONE
        rplL 2343456 .. 2343497 - -14.7  -3.27674   ATTTTACTAGAAAAT GAAGTAAAAACCCCGTTAT CGTG ATAACGGGGTTTTAATTTC  TCAAAGAATTCAGGT 100 110
MKD39_RS11425 2342598 .. 2342628 -  -5.4  -3.35597   TTGACCTGCCAAACA       GATTCACCCCTCAA ATA TTGTGTGATGAACC       AATACGCGTAAAAAT  57 198
        rpoB 2338873 .. 2338885 -  -4.8  -3.43338   ATTTACATCAATCAA                GGAG CCTAC CTCC                TTCAATTTAGATTAG  55 183
        rpoC 2335166 .. 2335210 -  -7.5  -4.61916   ATAAAAAATAAAGAA CGAGAGCGAGAC-TATC-ATCT CAAA AGATTGATAAGTCCCG-TCTCG TCAATATTGAAATAA  80 67
MKD39_RS11410 2334774 .. 2334798 -  -2.9  -4.88918   TTAGGTTAAATAAAA          TTTAGTAAGCA ATA CACTTACTAAT          TCTCATTCAATAACG  65 21
        rpsL NONE
        rpsG 2333671 .. 2333685 -  -4.2  -3.11955   ATAAGTACTATTGAA               TATGGC GAT GCCCTA               AGCATGAGCCATCTT  48 90
        fusA 2331382 .. 2331420 - -11.3  -3.07236   AAAGTTATTTCAATA   TTATCTCTCATGATAGT TTCTC ACCATCATGAGACATAA   TGATTGTTAGAATTC  91 152
         tuf 2330061 .. 2330093 -    -8  -5.35222   AAAATTTATAAAAAA      GACAATTTCTAT ATTATTTCA ATAGAAATTGTC      TTTTTTTCACTTATC  93 90
MKD39_RS11375 2325390 .. 2325417 -    -7  -5.29445   TTGTAACAATAAAAA        GACTGGGACAAT GAAT ATCATCCCAGAC         TAAAAATTCTATCTT  91 51
MKD39_RS11370 NONE
MKD39_RS11365 NONE
MKD39_RS11360 2322689 .. 2322726 -  -8.6  -4.35926   ATTTCAAATTTAAAA   CCGTGTAGATGACA GTTAACAATA TGTCATTTACACGG    TTTCTTTATAATTTT  83 172
MKD39_RS11350 2318464 .. 2318486 -  -4.8  -5.27709   GGATAAAAAAAGAAA           CCCTCAAACA TTT CGTCTGAGGT           TCTGTGTTATATGAC  77 59
MKD39_RS11345 2317154 .. 2317183 -  -8.7  -5.83211   CATTAAAATAAAAAA       CTAGAAACCTCGA TTTC TCAAGATTTCCAG        CTCTTTAAACTCACC 100 41
MKD39_RS11340 2316261 .. 2316296 - -17.2  -4.33281   ATTGTAAATAAAGAA    GCCAGTAAATGAATTT GTTA AAACTCATTTACTGGC     TATTTCTCTAGGGTT 100 182
MKD39_RS11325 2312345 .. 2312365 - -10.5  -5.09762   ATTTTAATATAAAAA            CACCTGTCA TAG TAACAGGTG            TCTAAGCTAAGATAA 100 370
MKD39_RS11320 2311706 .. 2311720 -  -2.8   -2.5333   TCAATCATAATATAT               TGGTTT ACT AATCCA               TCAAAACGTTTATTC  40 121
MKD39_RS11315 2310619 .. 2310658 - -10.2  -3.08696   ACCGATATAAATAAT  TCACCCCGAAAATTAGATT TTT AATCTAACAC-CGGGGTGA  TTTTTCATTATAAAA  81 241
MKD39_RS11310 2309979 .. 2309989 -    -4  -2.87136   TTATTAACCATTATA                 TTGT AAT ACAA                 ATTCTTATCTTAGAC  46 73
MKD39_RS11305 2309189 .. 2309218 -  -5.1  -5.10033   TTAACATAAACAAAA       CGCTACACA TTTCAAACTCTT TGTGTAGCG        TTTTTACATTTTTTA  74 43
        tadA 2307293 .. 2307313 -  -4.1  -3.67026   AAAAACCATCTTAAA            GTTAAAATT TAA AATCTCAAC            TTGAACACTTAATTC  52 80
MKD39_RS11285 NONE
MKD39_RS11280 2305705 .. 2305722 -  -9.9  -5.95539   CGTTAAATAAAAAAA             GAGCGAT ATCT ATCGCTC              TTTAAACTCGTTTCT 100 76
MKD39_RS11275 2303956 .. 2303967 -    -3  -3.18404   TCAAAATTTAATAGA                TAGT TACC ACTA                 TTTGGAGTGTTCTGT  46 75
MKD39_RS11270 2301237 .. 2301266 - -15.2  -4.22652   TCATAGTATTTAAAA       TAAAACCAGGCC ATGTAA GGCCTGGTTTTA        AGTTCTACCCAAAAT 100 56
MKD39_RS11265 NONE
MKD39_RS11260 2297364 .. 2297394 - -14.2  -5.20783   ATTCAAACATAAAAA       TTGGACTGATGATT TTT AGTCATCAGTCCAA       TTTATTATAGAGCCA 100 118
MKD39_RS11250 2289530 .. 2289559 - -15.2  -4.22652   TCATAGTATTTAAAA       TAAAACCAGGCC ATGTAA GGCCTGGTTTTA        AGTTCTACCCAAAAT 100 56
MKD39_RS11245 2288713 .. 2288733 -  -7.7  -4.48299   TTACACGTAAAGAAA            TTACAATTG AAG CAACTGTAA            CAACACTATGCCCAT  82 393
        hxlA NONE
        hxlB 2285661 .. 2285693 -  -9.9  -5.18357   TAATCTATTAAAAAA      TCCAACCGATGCCTT TTA AGGGAATCGATTGGA      TTAAATAAACACTAT 100 41
MKD39_RS11215 NONE
MKD39_RS11210 NONE
MKD39_RS11205 NONE
MKD39_RS11200 2282373 .. 2282418 -  -7.3  -6.01725   AATAAAAACAAAAAA GGCTATAATTAAAAATTAATA ATTT TATCAATTTCTAATTATAACT AGTTTTACCCCATTA 100 7
MKD39_RS11195 2280756 .. 2280783 - -14.3  -5.95449   AAATAAAATAAAAAA        CGCATTGATGC GAACGT GCATCAATGCG         TTTAATTGATAATTA 100 51
MKD39_RS11180 NONE
MKD39_RS11175 2278033 .. 2278043 -    -4  -4.62783   CATTCAGTTTAAAAA                 TCAA ATA TTGA                 TTCTCCATTACCAAT  63 8
MKD39_RS11170 NONE
MKD39_RS11165 2275981 .. 2276015 - -13.7  -3.21924   CTATTGTTGATAATA    GAAAAGCGCGTGGCTC CCTA GAGCC-CGCGCTTTTT     AAAGTTAAACTATTT 100 35
         pta NONE
MKD39_RS11140 2271070 .. 2271125 -   -15  -3.09516   CCGCCTACCAGGCAA GGATGACTAGGTTTGAAAAAACGCTTG ACT CAAGCGCATTTTCAAACC-AGTCAGCT ACTGACAACATGATA 100 118
         mvk NONE
        mvaD NONE
MKD39_RS11125 2267274 .. 2267304 - -16.4  -5.95946   TCAACAACAAAAAAA       GAGATTAAACAACC TAA GGTTGCTTAATCTC       AATATTTGGACTCAT 100 128
MKD39_RS11115 2265248 .. 2265277 - -12.3   -3.3941   ATTAGACCTAATTAA       GCGCTTAGAAGAT AAAT ATCTTCTAAGTGC        TTTTTTTATTACAAT  95 110
MKD39_RS11095 2261916 .. 2261944 -  -7.6  -5.28176   TTCAGTTATAAAAAA       CTCTTACACACAT ATAA ACG-GTGTAAGAG        CATCAATTACTTTAT  91 62
MKD39_RS11090 2261117 .. 2261127 -  -2.6  -3.38316   TTACTATGGAATTAA                 TAAT GAA ATTA                 TATCACAGTACTTAT  45 98
MKD39_RS11085 NONE
MKD39_RS11080 NONE
MKD39_RS11075 2258620 .. 2258655 - -16.4  -4.15998   ATTGAAATTAAATAA    GCCAGTAAGTGTATTT ATAC AAATGCACTTACTGGC     TGTTTTAAGCGTAGT 100 65
MKD39_RS11070 2257596 .. 2257614 -  -4.7  -4.28487   GACGATAAAATTAAA             GATTTTT TCTGT AAAAATC             AAGAGGGATTTTGAA  65 203
MKD39_RS11040 2253908 .. 2253929 -  -8.9  -3.76224   CCGCTATTTATTAAA           CTATTGAAA ATAG TTTCAATAG            TTTAATGGTATTTGA  82 27
MKD39_RS11035 NONE
MKD39_RS11030 2252882 .. 2252917 -    -5   -3.9638   GATTAATACAAAACA    TAACTTTACC-ACTTTT TTA AAAAGTCGATAGAGTTA    TCTTGAAATTCACTT  61 35
MKD39_RS11025 2252368 .. 2252389 - -10.2   -4.9218   CATTTATCACAAAAA           GAGAGTGC CAATTC GCACTCTC            TTTTTGTGTAGTAAT 100 110
MKD39_RS11010 2250883 .. 2250900 -  -7.7  -5.55769   TTGTACAAGAAAAAA             GAGTACG AATT CGCACTC              TTTTTCTAAACTAAG  95 48
MKD39_RS10985 NONE
MKD39_RS10980 2245756 .. 2245782 - -10.2  -4.58213   TAATCAATGAGAAAA         GCAACGCACTAT ATT AAAATGCGTTGC         TTTTTCTATTATCGA  93 118
MKD39_RS10965 NONE
MKD39_RS10960 2240680 .. 2240708 - -13.3  -4.89852   CCACACCTACAAAAA        TCCCCTCACTA TTTGCGG TAGTGAGGGGA        TTGGTGTATCCATGT 100 114
MKD39_RS10890 NONE
        argS 2228614 .. 2228649 - -11.4  -3.50447   CCAATCTTTACATAA    TAATACCCTCACAAAT CGAA ATTTATGAGGGTGTTA     TCAAAATTTATATAA  93 50
MKD39_RS10880 2227945 .. 2227963 -  -2.5  -3.29211   TAACGTTAAAGTCAA             TCATTCT TAATT AAAATGA             TCTTCTAAAAATGTG  43 13
MKD39_RS10875 NONE
MKD39_RS10870 2226478 .. 2226513 -  -9.2  -4.84527   TTTAGATATTAAAAA    GCATTGAATATCTCTA AATT TAGAAATACACAATGC     TTTTCTTAACATTAC  95 37
MKD39_RS10865 2225305 .. 2225342 -   -13  -3.21005   TCACAAAAATAATTA   GAACTGAGAAAAACTT GATTTA AAGCCTTTCTCAGTTC    AGTTAGCTACAGGGG 100 114
MKD39_RS10860 NONE
MKD39_RS10855 2223366 .. 2223378 -  -2.7  -4.49556   TTTCTAGTAAATAAA                TCCAT CTT ATGAA                TCTCCTCCTTGTTTA  58 19
MKD39_RS10850 2222543 .. 2222569 -  -3.8  -4.20783   ATTTTATGTAACAAA         TTAGGATGAC GACTGAA GTTATCCTAA         CAACAATTAGTGTTC  58 32
MKD39_RS10845 2221838 .. 2221885 -  -8.1  -4.81083   TTTAATGACGAAAAA TAAGAGCATGACGTT--ATTCAA AAGT TAGAATTTAACGTCATGCTCCTA GTGATGGAATTATAA  87 56
MKD39_RS10840 2220902 .. 2220928 - -13.1  -2.97382   TGCCAATATAATAAC         GCCTGAGACAT TGCTG ATGTCCCAGGC         TCTATTCATAAGTTA 100 113
MKD39_RS10835 2219813 .. 2219843 - -14.2  -5.20783   ATTCAAACATAAAAA       TTGGACTGATGATT TTT AGTCATCAGTCCAA       TTTATTATAGAGCCA 100 112
MKD39_RS10830 2218268 .. 2218303 - -17.2  -4.57581   ATTTTAAATAACAAA    GCCAGTAAATGAAATT CGTA AATTTCACTTACTGGC     TTTTTTGTATATCAT 100 134
MKD39_RS10800 NONE
MKD39_RS10795 NONE
       mnhB2 NONE
       mnhC2 NONE
       mnhD2 NONE
       mnhE2 NONE
       mnhF2 NONE
MKD39_RS10765 2208012 .. 2208069 -  -2.1  -5.59564   ATAAATTTAAAAAAA TGAGATTGAGCATTTCAAAGTAGTAGT TTTA ACTATTACTCATTCATGTTCAATCTCA TTGATTTAATCAATC  74 35
MKD39_RS10750 2203155 .. 2203171 -  -5.2  -2.88708   AGAGAGGATAGGATA              GAATTC CATTT GAATTC              ATTATCCATACCTCA  53 72
MKD39_RS10745 2202315 .. 2202344 - -13.8  -5.36364   TCAAAAACATAAAAA       TTGGACTGATGA ATTTTG TCATCAGTCCAA        TTTATTATAGAACCG 100 79
MKD39_RS10740 2200916 .. 2200928 -  -7.7  -2.57294   AATATTGAGATTAAG                CAACC TTA GGTTG                TTTAATCTCTTTTTT  64 8
MKD39_RS10730 2199032 .. 2199063 - -11.7  -3.84644   ATAAAAAATTTTAAA      GGCGGATTCA-GCC CTCTC GACTTGAATCCGCC      TTCTTCATATTTAAA  95 64
MKD39_RS10720 2197033 .. 2197064 - -11.8  -4.60797   GCTGTATACACAAAA      TCCTTGATAAACGC ATCA ACATTTATCAAGGA       CTTTAAATTATAAGA 100 33
MKD39_RS10715 NONE
MKD39_RS10710 NONE
        tagD 2194245 .. 2194284 - -12.4  -4.50159   CTTAAGTTAAACAAA  GAAGCCAGCAAATGAATTC AAA AAGTTCATTTGCTGGCT-C  TTTTAATAGGATTAA 100 57
MKD39_RS10690 2189529 .. 2189558 - -10.9  -5.00616   TTTCTTTTTAAAAAA       GTAGTTGGAAC AAACTTAA GTTCCAACTAC        CTAATATTCATTACT 100 36
MKD39_RS10685 NONE
MKD39_RS10680 NONE
MKD39_RS10675 2185659 .. 2185700 - -11.9  -3.56837   TTTTAAATAGTACAA TAGAAAGCACTAGAG TTAAATTTACTG CTCTAGTGCTTTCTA  CTTTCAATTTAATTA  95 38
MKD39_RS10670 2184190 .. 2184226 -  -9.5   -5.5943   AAATTATTAAAAAAA    TCGTGGAACGAAATTCA AAT TGAATACTGCTCCACGA    TTCTTTTTAATTGAT 100 60
MKD39_RS10665 2182806 .. 2182821 -  -3.3  -3.13299   TTATCATAGTCAATA              GATGT ATTATA ACATC               TTTGTAAATAACTGA  46 141
MKD39_RS10660 NONE
MKD39_RS10655 NONE
MKD39_RS10650 2179736 .. 2179754 -  -5.4  -3.20029   TTATTCAAACACAGA             GAATTTCA GCG TAAAATTC             ACTACTAAGGTCTGT  56 151
        dhaK NONE
        dhaL NONE
        dhaM NONE
MKD39_RS10630 2176911 .. 2176943 - -13.7  -6.14618   TATAAAACAAAAAAA      CCAGTAAATGTATCT ATT AAACACATTTACTGG      TAATATATCTAAACG 100 87
MKD39_RS10625 2175457 .. 2175482 -  -9.1  -5.10767   CATTTAATAGAAAAA         GCAACCCGTAT AATC ATACGAATTGC          TTTTAAGATTAAAAC  95 77
MKD39_RS10620 2174251 .. 2174290 -  -8.7  -5.37593   TTGGAAATTAAAAAA  GGCTTACTTCCTTAATG ATTTAA CATATAGGAAATAAGCC   TTTTATTCTTAGCTA 100 88
MKD39_RS10610 NONE
        graR NONE
MKD39_RS10600 NONE
MKD39_RS10595 NONE
MKD39_RS10590 2167872 .. 2167883 -    -3  -3.67878   ATTATTGTAAGACAA                CTTT AGAT AAAG                 AATACATTTACAATA  49 224
MKD39_RS10585 NONE
MKD39_RS10580 2166004 .. 2166046 - -12.3  -4.23156   ATATCTAACAAAGAA GGGAGTGGGAC-A-GAATTCT TTT AAAATTCGTCGTCCCACCCCC GCAAGGATGACTAGA 100 149
MKD39_RS10570 2163639 .. 2163657 -  -3.2  -3.87149   GTGATTAAATGTAAA             TTTACCAC AAC ATGATAAA             CAAATCAAAAATACA  51 235
MKD39_RS10565 2161372 .. 2161386 -  -2.8  -2.56011   CAATGTTAAATATAG               TTGCGC AAA ACACAA               TTGAATAGATTTTAT  40 37
MKD39_RS10560 2160845 .. 2160869 -  -6.5  -5.73339   ATAAGCATAAAAAAA          TACTGACAGAA TGT CTTTGTCAGTA          TTCTCGTTCAACATA  95 46
MKD39_RS10555 2160029 .. 2160041 -  -4.1  -3.62096   CTTCATTATTTTAAA                TCCAC ATT ATGGA                AAACATTTTGAACAT  52 3
MKD39_RS10550 2159308 .. 2159334 -  -7.4  -3.94933   TGAATTCTAAAAAGA        GCCTGAG-CAT AATTCA ATGACTCAGGC         TATAAATATATATTG  72 222
MKD39_RS10540 NONE
MKD39_RS10535 2156337 .. 2156349 -  -4.9  -2.90075   CTTTTTTTAATTACA                CATTA TCC TAATG                ATTAGCGAATAAAGT  51 27
MKD39_RS10530 NONE
MKD39_RS10525 2154559 .. 2154573 -  -7.2  -3.09286   AGATGATTTGAAAAC               TCAAAG CCA CTTTGA               TATAAATGACTTAAC  65 50
MKD39_RS10515 NONE
MKD39_RS10510 NONE
MKD39_RS10505 2152091 .. 2152119 -  -5.3  -5.20216   TACATGAGTAAAAAA        GTGCGATATGG ATATAGA CCATAGCACAC        TTTATCCGTCTTTAA  80 59
MKD39_RS10500 2151455 .. 2151469 -  -4.3  -4.45485   ATTATATTTATAAAA               GTGAT TATTT ATCAC               ATAATATAACCATCC  66 62
MKD39_RS10475 NONE
MKD39_RS10470 2144950 .. 2144992 - -15.8  -3.74361   TATATTTATCAATAA CGAAAAGCCTGAGTTATCTA TAA CAGATACCTCAGGTTTTTCG TTTTAAGACAACGTA 100 61
MKD39_RS10460 NONE
MKD39_RS10455 2142861 .. 2142893 -  -4.4  -5.71983   TTAAGCATAAAAAAA     CTTTGTGATAA-C-GT CTT ACTGACTATCACAAAG     TCTATGTCATTCTTA  82 51
MKD39_RS10450 2141140 .. 2141154 -  -4.3  -3.22061   CAATAATTAAAATCA               GAAAC TTTAT GTTTC               GACCTAATGGAAAAC  52 49
MKD39_RS10445 2139656 .. 2139698 - -12.2   -4.3295   TCTAACAAAAGTAAA TTGGAGTGAGACAACATTTA ATT TGATTGCTATCTCACTCCAA TTATTTTTTATATTT 100 33
        norA 2136396 .. 2136442 -  -7.5  -4.50298   TAAATGTAAAAACAA GCAATGACATCGTCAATTTTT CAATT AAAAACGAATGATGCCATTGC CTATTTCATTTAATA  80 76
MKD39_RS10420 2135714 .. 2135748 -  -5.8  -5.65496   TATGAAAAATAAAAA    GAGCGC-TCTTCTCT ATTATA AGAAAAGGCGCGCTC     ATTGTGCGTTATTAG  90 24
        ybaK 2135121 .. 2135159 -  -4.1  -3.80855   CGGTTTAAAAATTAA  CAGATATTACACAATTTG TCAT CCTATT-TGTAATATCTG   TCACTATATTGCTAT  54 37
MKD39_RS10410 NONE
        pfkB NONE
MKD39_RS10400 2131323 .. 2131350 - -10.6    -5.243   TAAAGTATTAAAAAA        TCTCTCGCCCAA TTAT TAGGGCAAGAGA         TTTTTATTTCTATTC 100 35
MKD39_RS10395 2129088 .. 2129127 - -11.7  -4.56736   ATTGAACAATTAAAA GGACTGGGAC-A-GAATTC TTTT GAATTCGTTGTCCCAGCCC  TCAAAGTTGGAAAGA 100 142
MKD39_RS10390 2128084 .. 2128114 - -16.4  -5.95946   TCAACAACAAAAAAA       GAGATTAAACAACC TAA GGTTGCTTAATCTC       AATATTTGGACTCAT 100 75
MKD39_RS10380 2125463 .. 2125503 -   -18  -4.85653   CATATAGAAAATAAA  TAAACGCTTGAAGTTTCA TCATT TAAAACTTCAAGCGTTTA  TTTTGATTTTTATTA 100 38
MKD39_RS10355 NONE
MKD39_RS10350 NONE
MKD39_RS10345 NONE
MKD39_RS10340 NONE
MKD39_RS10335 NONE
MKD39_RS10330 2117753 .. 2117781 -  -3.2    -4.183   TCAACTTTGAAGAAA        TGTTAAAGACTT AACCG AAGACTTAAACA        CTCACTCAAATATGA  55 494
        ltaS 2115743 .. 2115766 -   -14   -5.7827   AATACAAACAAAAAA          CGAGTTGAAC GTTT GTTCAACTCG           TTTTGTTATTATTTT 100 34
MKD39_RS10315 2112410 .. 2112421 -    -3  -2.55508   CAAATGCGATAAGAT                GAAT ATCA ATTC                 GACTTAATAAACTTA  42 413
MKD39_RS10305 NONE
MKD39_RS10300 2108291 .. 2108333 - -22.4  -5.40072   TGCGCTTTAAAAAAA GGAACAAGACAACGAATTCA TGA TTAATTCGTTGTCTTGTTCC AACATTTTCGCGTGA 100 45
MKD39_RS10295 2106633 .. 2106653 -  -6.9   -3.6106   CCTAACATTGTTAAA            TTACAAGTC ATT GACTAGTAA            AAATTTATATTAACT  66 40
        hisC 2105389 .. 2105427 -    -9  -3.28159   GCAAAAATTTAAAAG   GGAGTGCTACAAGACATT TAG AATCTATTATAGCACCCC   TTGCATAATCAACTT  78 103
MKD39_RS10285 2104748 .. 2104787 -  -9.7   -4.7219   TATACTAATATAAAA GCGATTAAGGTTAATGATA GGGT TATCAT-A-CCTTAATCGC  TTATTTTAATTACTC 100 35
        nrdI NONE
        nrdE 2096677 .. 2096689 -  -4.1  -3.05769   TTCTTAAATTAGATA                GCACA GCT TGTAC                ATTCTTCTACACTCA  48 6
        nrdF 2095503 .. 2095553 - -12.3   -5.0916   TTTTTAATACAAAAA TAAGCCACTAAAATC-GTAGTTGTT ATC AACAAC-ACTGAATCTAGTGGCTTA TTAATGTTAGTCTTT 100 46
MKD39_RS10245 NONE
MKD39_RS10240 NONE
MKD39_RS10235 NONE
MKD39_RS10230 2091432 .. 2091453 -  -7.3  -5.40072   TTTCCTCCAAAAAAA           TATCGCCTT ATTC AGGGCGATA            TTGAAAACTTATACT  95 47
MKD39_RS10205 NONE
        ytxJ 2086737 .. 2086780 -  -8.3   -5.4433   ATAGATAAATAAAAA CAGGAGT-GACACGGAATTC ATCTA GAATTCATTGCCCACTCCTG CATGGATGACTAGAG  95 157
MKD39_RS10195 2085416 .. 2085466 - -10.8  -4.55908   AATAAATATAATAAA TAAGGCAAACCACAATTACC-AT GCTTAT ATAGGTAATTGCAGTTTGCCTTT TGTTAGTTATTCATT 100 40
MKD39_RS10170 2080092 .. 2080142 - -10.1   -5.5604   CTAATTAATAAAAAA CCTTGTTTGTATAACACTACCTAA TCAT TTAAGTAGTTAT-TACAAACAAGG CTTTATTTTTTATCA 100 28
       fakB1 2078247 .. 2078293 -  -2.5  -3.24924   TCTGTAGCGATAATA CCAGGTGTAAC-TTGAGTAACTG TCT CA-TCACTTAACGTCACATCTGG ACTTACTAACTTTCC  43 165
MKD39_RS10155 NONE
MKD39_RS10150 NONE
        raiA 2075546 .. 2075584 -  -7.7   -5.3236   ATAAGTTACAAAAAA  GAGTGGAAC-A-GAATTCA TTT TGAATTCATCGTCCCACCC  TTATAAGAATAACTA  91 165
        secA 2072704 .. 2072736 -  -5.7  -4.70659   TTGGATATGTAAAAA     GTAGGAG-CGTGAA TTCTAT TTCACAACTCCCAC      TTATTATTGAACATA  75 45
        prfB 2071476 .. 2071516 -  -4.2  -4.79949   TTTTCAAAAAAATAA  GGAGTAAGATAAAG AATTCAAAACGCA CTCTATCTCACTCC  TATTTTCAATTCTAT  66 45
MKD39_RS10130 2070339 .. 2070378 - -15.3  -5.26918   ATACCGTATAAAAAA  GAGTTCAATAACTATGC TAAATT GCATAGCCATTGAACTC   TGACATCTGAATATA 100 65
MKD39_RS10125 NONE
MKD39_RS10120 NONE
MKD39_RS10115 2067913 .. 2067940 -  -5.6   -5.4433   ACATATAAATAAAAA        TACAAACGTTTG TTCG CTTACGTTTGTA         TTTTCAAAAACATTT  86 203
        uvrB NONE
        uvrA 2062738 .. 2062769 -  -8.9  -5.53991   TAGTTATTAAAAAAA      CTGAGAAAA-GCTC GATAT GAGCGTCTTCTCAG      TTAAGTCAATTAATG 100 96
        hprK NONE
         lgt NONE
MKD39_RS10090 NONE
MKD39_RS10085 NONE
        trxB 2057661 .. 2057675 -  -2.1  -2.70946   CATAATATCATATGA               GCTAC TTATC GTAAC               TATTATTGCGATATC  39 129
        rapZ NONE
MKD39_RS10070 NONE
        whiA 2054578 .. 2054602 -    -5  -5.42259   CTAGTTCTAAAAAAA          GAACTCGCCA ATCCA TGACGAGTTT          ATACTTATAATTCTA  79 30
        clpP 2053339 .. 2053366 -  -9.9  -5.65177   ATAGTCATAAAAAAA        CGGGGAGTGTT AGTTTA AACACCCCCCA         TTTCTATGCCATGGT 100 50
MKD39_RS10040 2050736 .. 2050770 - -10.3  -5.25735   TTAAAAAAGTAAAAA    GTGAGACT-TGAAACA TGAC TGTTTCAAAATCTCAC     TTTGATAACTACTAA 100 46
MKD39_RS10030 2049130 .. 2049145 -  -3.4  -3.09823   TCCTTTAAAATGATA              TTTAAA AAGC TTTAAA               CTTTTTATTACTAAT  46 36
         gap 2047974 .. 2048004 -  -8.4   -5.1244   TTACTAATATAAAAA      TAAGCGGAGAAGC GTTAGT GCTCC-CCGCTTA       CTCATAAGCTAACTT  95 118
MKD39_RS10020 2046726 .. 2046741 -  -7.6  -2.88667   GCTTAGAAAAACGTA              CACCTT TTAT AAGGTG               ATTATTTATCATTAA  66 27
        tpiA NONE
        gpmI 2044211 .. 2044221 -  -5.4  -3.64371   AATTTAGATTCTAAA                 GCTA TTA TAGC                 TTGATTTAATCCTTA  59 138
         eno 2042794 .. 2042821 -  -9.2  -5.30155   TTAGTAATTAAAAAA        CCTGCCACAG TCTCAACT CTGTGACAGG         TAATACATAAGCGTG 100 79
MKD39_RS10000 NONE
        secG 2041815 .. 2041837 -  -6.2  -5.73978   ATTATAAATAAAAAA           GCCCGACATT AAC ATCGTCGGAC           CTTATAAACCAAAGT  95 27
MKD39_RS09990 NONE
         rnr NONE
        smpB 2037770 .. 2037788 -  -2.4  -4.08689   AATAAAATTTATAAA             TCATTACA ATA CGTAGTGA             CTGACTGAACTAAGA  53 194
        ssrA 2037363 .. 2037385 - -10.7  -6.01725   AACAAAAACAAAAAA           CCTATAACC ACAAG GGTTATAGG           CTATATAGTGGAGAC 100 31
MKD39_RS09960 NONE
MKD39_RS09955 NONE
MKD39_RS09950 NONE
MKD39_RS09945 NONE
MKD39_RS09940 NONE
MKD39_RS09935 2033523 .. 2033568 -    -2  -4.65933   TACTTCTAAAACAAA GCACGAAATGGTAAAATAAA AATGTG TTTATTAAACCATTCCATTC TTGTTTAGTAGTTGT  59 49
MKD39_RS09930 2030851 .. 2030883 -  -7.9  -3.25494   TATAACAACATTTAA      TAGTTCCATATTTTT AAA AATTATATGGAACTA      TTATGGTACTCATGG  68 43
MKD39_RS09925 NONE
MKD39_RS09920 2029369 .. 2029394 - -10.5  -5.76633   TTACATATAAAAAAA         GCCATGCACCT ATTA AAGTGCATGAC          CTATAATTTTATGCT 100 34
MKD39_RS09915 NONE
MKD39_RS09910 NONE
MKD39_RS09905 NONE
MKD39_RS09900 2027092 .. 2027111 -  -7.9  -3.35964   TCACAAATAAAATGA            GCCTATC ACTAAG GATAGGC             GTGTATGATATTAAC  70 36
MKD39_RS09895 NONE
MKD39_RS09890 NONE
MKD39_RS09885 2025618 .. 2025633 -  -3.3  -2.78384   TTGTCGTTCATCAGA              TCATC GTAATA GATGA               CGGAATATTTCTTTA  45 113
MKD39_RS09880 2025273 .. 2025303 -  -9.2  -5.25893   ATATATATGAAAAAA       GCAACTAATATC GGGGAAT GACATTAGTTGC       AACTACACAATATCA 100 80
MKD39_RS09875 2023941 .. 2023951 -  -5.4  -4.31379   ATTAACTTATTAAAA                 TCAG CAA CTGA                 ATTATAAATATTATC  67 171
MKD39_RS09870 2023323 .. 2023353 -  -4.8  -2.58253   ATAGAACGCAATTTA       TAAAGGATGTTGTA TAG CATGACATCCTTTA       TTATATAACTTACCG  50 177
MKD39_RS09860 2021385 .. 2021403 -   -11  -6.09196   CTTAAAATAAAAAAA             CGCCACTC AAT GAGTGACG             CTTGAAACGAATTAT 100 192
MKD39_RS09855 2020507 .. 2020529 - -10.7   -5.8901   ATACAAAACAAAAAA           CCTATAACC ACAAG GGTTATAGG           CTATATAGTGGAGAC 100 343
MKD39_RS09850 2018986 .. 2019004 -  -8.2  -5.63103   CGTTAACTAAAAAAA             GAACAAGT CCT ACTTGCTC             TCTTTCCTAAGTTAT 100 205
MKD39_RS09820 2014676 .. 2014686 -    -4  -4.60487   GATGATGCTGAAAAA                 GTTT ATC AAAC                 AATACAACAACGAGA  65 155
MKD39_RS09810 2013564 .. 2013586 -  -9.2  -4.81551   TATCTATAGTAAAAA           GAGTAGCTTT GAA ATAGCTACTC           TTTTTTAGTTAGACA  93 34
MKD39_RS09790 2011500 .. 2011513 -  -3.9  -4.07885   GATGGTGTTCCAAAA               GAATT AATT AATTC                TTGGATGGACAGAAA  57 138
MKD39_RS09780 2010474 .. 2010501 -   -10  -5.54079   TTAAAAAGGAAAAAA        TCTCTACAAGTA ATTG TCCTTGTAGAGA         ATGTTGAGTTAATAT 100 80
        aroD 2007524 .. 2007534 -  -2.6  -2.71011   AGCTCTTCTCAATTA                 TAAA ACC TTTA                 CCTATTAATTTCAAA  40 47
MKD39_RS09755 2006901 .. 2006939 -  -9.8  -3.61517   ATGCCCGTGTAATAA  TAAAGACGGTTGAGACA TTTATT TGTC-CAGCCGTCTTTA   TTAATTCTAGTATTT  86 32
MKD39_RS09745 2005964 .. 2005975 -    -3  -2.76037   ATTTTAAACTATAAC                CAAA TTTC TTTG                 TATTGATCTTCTTTA  42 7
        gcvH 2005429 .. 2005450 -  -5.1  -5.48213   TAGGCAAAATAAAAA           CTCCATGAC CGCA ATCAAGGAG            TTTAAATTAATTATT  79 36
MKD39_RS09735 NONE
MKD39_RS09730 2004386 .. 2004417 - -12.6  -5.28481   TATGTAATTAAAAAA      TGCTTTCTC-ACTTT AGC AAAGTTGAGAAAGCA      TTGATTCATCTTTCT 100 202
MKD39_RS09725 NONE
MKD39_RS09720 NONE
MKD39_RS09715 2001751 .. 2001793 - -14.4  -3.57309   GAAAATCTTTCTAAA TAATAGAAACTCCGTAATCA AAA TGGTTACGGAGTTTCTTTCA TTATTATTTCGCTGG 100 29
MKD39_RS09705 2001140 .. 2001175 - -17.2  -4.33281   ATTGTAAATAAAGAA    GCCAGTAAATGAATTT GTTA AAACTCATTTACTGGC     TATTTCTCTAGGGTT 100 72
        sufC NONE
        sufD NONE
MKD39_RS09680 NONE
MKD39_RS09675 1993908 .. 1993922 -  -5.8  -2.64962   AAAAGTGTAAAAAGT               TAAAGT TGG ACTTTA               GAAATTGCTATCTAT  55 73
        sufB 1992314 .. 1992350 -    -6   -5.4251   TTGAGATATAAAAAA    GCACCAAAGCATTC ACTTAGTTA GAACACTTTGGTAC    TTGTGATTGTTATTA  86 68
MKD39_RS09665 1991330 .. 1991362 -  -5.1  -5.42198   TTTGAAAAAATAAAA     GCAAGGACTGAACTT ATGTA AAGTT-AG-CCTTGC     TTATAAAATGATGAT  79 252
MKD39_RS09660 1990101 .. 1990119 -  -2.5  -3.54741   TATTATTTTCGGAAA            TGTTGCAT TCTC ATGCA-CA             CTCTATTTTTCTAAA  47 43
MKD39_RS09655 NONE
MKD39_RS09650 1988336 .. 1988346 -  -2.6  -3.03286   ATTTAAAGAAAAGAT                 TTAA TAA TTAA                 GTATACACCCATTAT  42 2
MKD39_RS09645 1986895 .. 1986905 -  -2.6  -4.02108   CCTATTATAACGAAA                 TTTA CAT TAAA                 TTAAAACGTAATAAA  51 99
        lipA 1985848 .. 1985886 -  -9.8  -5.18726   CTCGTATAATAAAAA   CTTAGATTACACAATTCA ATT TAAAATGTGCAACCTAAG   TCTCTAAAAACTTAA 100 64
MKD39_RS09635 1985366 .. 1985403 - -10.1  -4.15833   ATTACTATTTTAAAA   GCTGTGAAAAAATCC CTTATCTT AGATTTCTTCACAGC    TCATTTTATTTATTA  91 46
MKD39_RS09625 NONE
MKD39_RS09620 NONE
MKD39_RS09615 1982717 .. 1982764 -  -9.4  -4.79352   TTAGTTATAATAAAA GAACCTCTATCGTTCATGGTTAA ATC TTTACC-TAAACGTTAGAAGTTC TTTAAAATTTATTTA 100 34
MKD39_RS09610 1982209 .. 1982223 -  -5.8   -4.2558   GACTCCTTATTAAAA               TTCATT GTA AATGAA               ATTATTATGTGTATC  68 5
        dltA NONE
        dltB NONE
        dltC NONE
        dltD 1977994 .. 1978026 -    -8  -5.35222   AAAATTTATAAAAAA      GACAATTTCTAT ATTATTTCA ATAGAAATTGTC      TTTTTTCACTTATCC  90 80
MKD39_RS09575 1975348 .. 1975392 - -21.1  -4.30576   CGGTTAGTATTAAAA TAAGGGGTAGAATAGAATTCA TGA TGAATTCTATTCTACCCCCGA CCTTTTTTCTCAAGA 100 54
MKD39_RS09565 NONE
MKD39_RS09560 1973237 .. 1973247 -  -2.6  -4.32436   AGACTATTATTAAAA                 TAAT CAT ATTA                 TCCTGAAGATTACTG  55 83
MKD39_RS09555 1971557 .. 1971597 - -12.2  -4.39748   TATCATATAAAAGAA GGAGTGGAAC-A-GAATTCA CAA TGAATTCGTTGTTCCACCCC CATAAGGATAACTAG 100 159
MKD39_RS09550 1969985 .. 1970026 - -11.1  -3.73953   ATTATGCTTATTAAA TAAGGAGTATAAACACGCA ATAG CACATGTTTCTACTCCTTA  AGCAAATGATTTCTA  93 50
MKD39_RS09545 NONE
MKD39_RS09540 1968017 .. 1968063 -  -8.2  -5.24531   ATTTCTTATAAAAAA GCAGGCGTAGGA-TA-GAATTC TTTAT GAATTCACCGTCCCACGCCTGC GTTTTTTCTTAAACA  93 104
MKD39_RS09490 1959602 .. 1959626 - -10.8  -5.75599   TAAACCATAAAAAAA          CGAATCGACA TCAAC CGTCGATTCG          AAAGATTTGTTCATA 100 49
         ygs 1958974 .. 1959003 - -15.3  -5.33866   CAAACGCATAAAAAA       GCTAACGTTATAT TAAA ATATAACGTTAGC        TTAGCGTGTTAACAG 100 45
MKD39_RS09480 1957571 .. 1957598 -  -7.9  -5.72616   ATTTACATAAAAAAA        GATTATGACAA GAATGA TTGCCATAATC         TATTATAAACTCTAA 100 147
MKD39_RS09475 NONE
MKD39_RS09470 1954707 .. 1954744 -  -9.4  -5.54338   GAATCAAAACAAAAA   CGCTATAACTTGTT TCATTCCCAT AACAAGCTATAGCG    TTTATTTATGTTTAT 100 49
MKD39_RS09450 1949153 .. 1949180 - -10.7  -4.53765   ATATATATTAGAAAA        GTCGATACGGA ATTTAA TCCATATCGAC         TTTGTAAGACATATT 100 69
MKD39_RS09445 NONE
        lepB NONE
        lepB 1947178 .. 1947189 -  -4.4  -3.08992   ACTTATTTTAACACA                GAAC ATAC GTTC                 TTAAAAATGTTTTGT  50 142
        addB NONE
        addA 1939841 .. 1939862 -  -4.5  -2.57344   CAGCGTCTTTATAAT           TGAATGATA GAAA TTTCATTCA            GTATCAACTCCTCAT  48 148
MKD39_RS09420 1938807 .. 1938838 - -18.9  -2.94695   GGCAATATATAATTA      GAGCCTGGGACAT TGATTT ATGTCCCAGGCTC       ACCTGCATTTACTGA 100 141
MKD39_RS09415 1938118 .. 1938160 -  -9.5  -3.53188   GAGATTTATAAAAAG TAGCCCTTAAATGAT TACTGCAAATTCG ATCATTTAAGGGCTA TCCCTATATCATTAA  84 52
MKD39_RS09400 1935332 .. 1935360 -  -6.2  -6.02919   TTATAAATAAAAAAA        CAATAGTACA TCCTAGTTG TGTACTATTG        TTCAAAAGCGATCAA 100 41
MKD39_RS09395 1933057 .. 1933095 - -14.2  -4.91429   AAACTGCAAATAAAA   TAAACCAGTTCAATGATT TAA AATCACTAAACTGGTCTA   GAATGAATTATTTGT 100 33
        clpB 1930154 .. 1930182 -  -8.2  -5.53288   CTGAACTTAAAAAAA        CCTAGAAAGTGC TCATC ACACTCCCTAGG        TTTACCTAAACATTC  95 42
MKD39_RS09380 NONE
        fabF 1927253 .. 1927289 - -15.4  -5.03994   TTCTACATACAAAAA    TAGACCAAGGACATTA TCAAT TAGTGTCCTTGGTCTA    ATATCATTTTTCAAA 100 42
MKD39_RS09365 NONE
MKD39_RS09360 NONE
MKD39_RS09355 1923115 .. 1923128 -  -3.1  -3.34013   GACCGTTTCAAGTAA               GTCAT AAAC ACGAC                GTTTACGGTCTTTTT  47 412
MKD39_RS09335 1919326 .. 1919361 - -17.2  -4.32678   CCTGTAAATAAAGAA    GCCAGTAAATGAATTT GTTA AAACTCATTTACTGGC     TATTTCTCTAGGGTT 100 61
        spxA 1914207 .. 1914225 - -11.8  -5.28176   TTGAGTTACAAAAAA             CAGCACTA AAA TAGTGCTG             TTTCATATTATTATA 100 62
        mecA 1913305 .. 1913328 - -11.8  -5.47159   TCTCAACACAAAAAA          CCGAAGCAAT ATTC ATTGCCTCGG           TAAAAACTTTCATTA 100 38
MKD39_RS09305 1912235 .. 1912246 -    -3  -3.32294   GTAAACCTCCTATAA                TAAC TAAT GTTA                 TAATTTTCTCATTAT  46 60
        pepF 1910216 .. 1910237 -    -8  -5.70829   AAGAGTATAAAAAAA           CGCCGTGT CTGATT ACACGACG            CTAAACAAAGGGGAT 100 196
MKD39_RS09280 NONE
MKD39_RS09275 NONE
MKD39_RS09270 NONE
MKD39_RS09265 NONE
        mgtE NONE
MKD39_RS09255 1901774 .. 1901805 -  -8.8  -3.88498   TGGTCATATAGGAAA      TAGGCTGGGACA AAATAAAA TGTCTCAGCCTA       TTTTATCATTTTGTC  78 183
        fabI 1900830 .. 1900850 -  -7.6  -5.88197   GTAAACATAAAAAAA            CTTGGTGC TGTAC ACACCAAG            TAATTGATTTAATTT 100 42
MKD39_RS09240 1898499 .. 1898511 -  -4.9  -3.42996   TATTAGTTAGCAGAA                CTTTT TTG AAAAG                GTTTACAATATCTAA  55 121
MKD39_RS09235 1897854 .. 1897891 -  -8.7  -4.99972   ATAAAACACTAAAAA   TCTAGTTAATGTACA TCATACAC TGTACATTAGCTAGA    TTTTTATTTTACATA  95 51
MKD39_RS09220 NONE
MKD39_RS09215 NONE
MKD39_RS09210 1891509 .. 1891539 - -12.7  -4.68511   TTTAATACAAATAAA       GAGACCTATGCTA AATAA TAGCAAAGGTCTC       ACTTAGCAAATAAAT 100 258
MKD39_RS09205 1890618 .. 1890656 - -11.3  -4.54323   AATGATAATAATAAA   GCCTTTTAAACTTAATG ATATA CATCAAATCTAAAAGGC   TCGAATCACTTATTT 100 45
MKD39_RS09200 1888484 .. 1888497 -  -2.4  -3.70331   AACTTACTGAAAATA               GACA CTCATT TGTC                ACCTCAACATTATTT  49 35
MKD39_RS09195 1887090 .. 1887121 - -13.2  -5.26875   TTTCTAATCAAAAAA      GCATTCTCAGAATT AATA ATTTCTGAGAATGC       TAATATATTTAACCA 100 34
MKD39_RS09190 1885383 .. 1885415 -    -8  -5.35222   AAAATTTATAAAAAA      GACAATTTCTAT ATTATTTCA ATAGAAATTGTC      TTTTTTTCACTTATC  93 115
MKD39_RS09170 1881485 .. 1881497 -  -4.9  -5.42975   TTAGATAAATAAAAA                TATAG CGG CTATA                GAATTAACTCCTCAA  79 57
MKD39_RS09130 1876281 .. 1876319 -  -8.4  -4.91084   AATAAAATGTAAAAA  GGTCTATTCGCTAACTT TGATTT AAG-TAGTGAATAGACC   TTTTATAATGAGTTA  95 53
MKD39_RS09115 1874728 .. 1874749 -  -3.8  -3.11073   GAGTGGACGTAAAAC           TCTACCTA TTTTAT TAGGTAAA            CGCGCTTCAATTACA  47 394
MKD39_RS09105 NONE
        menD NONE
        menH NONE
        menB 1869185 .. 1869238 -   -15  -5.27477   ACCTTAATTAAAAAA GGACACTTAAAATAGTGGTTAACTG TCAAT CAGTTTATCACTATTT-AAGTGTCC TAAAATTATACATTT 100 60
MKD39_RS09075 1866152 .. 1866176 -  -2.9  -3.18571   CTCGCTAAATATATA          TTTAAACTATG AAT CATTGATTAAA          TCCATTGCTATTGTT  46 39
MKD39_RS09070 1865393 .. 1865425 - -13.7  -5.04601   TGGACAAATTAAAAA      GACAATTTCTATTGA TAA TCTATAGAAATTGTC      TTTTTATAATTATTT 100 184
MKD39_RS09045 1856977 .. 1857015 -   -12  -5.38497   ATTTAAATTAAAAAA   GCTATAACAAAATGCATT TTT ATTACATTTCGTTATAGC   TCTCTTTATTTGGTT 100 31
MKD39_RS09010 1849811 .. 1849847 - -19.7  -4.84311   CTTTATACAATAAAA    GCACAGGGATGATGTTT ATT AAATATCATCCCTGTGC    TTTATTCATTTATAA 100 79
        purE NONE
        purK NONE
MKD39_RS08990 NONE
        purS NONE
        purQ NONE
        purL NONE
        purF NONE
        purM NONE
        purN NONE
        purH NONE
        purD 1837081 .. 1837114 - -14.8    -5.626   TACCTCATAAAAAAA     TAGGGCGTATCACTG TCCAT CAG-GATACGCCCTA     TTTTTTACATTTACT 100 36
MKD39_RS08925 1832174 .. 1832221 - -10.1   -5.7827   AACATAAACAAAAAA GGTGG-ATCGCGAAGTCTAT TTTGTCACC ATAGACTTCACGCTTCCACC TAAGTAAAATTTGAA 100 45
MKD39_RS08920 NONE
MKD39_RS08915 1830035 .. 1830055 -  -5.5  -3.85082   AAATATATTACTAAA            TTCAATTCT AAT AGGATTGAA            ATACTATTATAATTG  61 247
MKD39_RS08910 NONE
        ptsP 1827874 .. 1827906 -    -8  -5.35222   AAAATTTATAAAAAA      GACAATTTCTAT ATTATTTCA ATAGAAATTGTC      TTTTTTTCACTTATC  93 77
MKD39_RS08885 NONE
MKD39_RS08880 1822303 .. 1822323 -  -3.3  -3.81062   AGGAAAAAGCTGAAA            CAATCGACA TCA TGTAGATTA            CTATTAACCAAGTTA  53 86
MKD39_RS08875 1821428 .. 1821442 -  -3.6  -3.18681   TCCTAATGCTATTAA               TACATA TCT CATGTA               GTAGAATCATCACTC  47 182
MKD39_RS08870 1820595 .. 1820634 - -12.4   -4.0492   TAATTCCTAGAGAAA  TAGCCAGTAAATGAGTTT TAAC AAATTCATTTACTGGCTT   CTTTATTTACAATAC 100 444
MKD39_RS08845 1816788 .. 1816811 -  -8.3   -5.1861   TGTATTACTAAAAAA          GATACAGTT TTTTAC AACTGTATC           ATTCCAATCAACTAA  91 62
        pdhA NONE
MKD39_RS08835 1814523 .. 1814535 -  -4.9  -4.86133   CACATAGAGTAAAAA                GTAAA CAT TTTAC                TTACTTCCTATAAGT  72 72
MKD39_RS08830 NONE
        lpdA 1811584 .. 1811624 -   -15   -5.4111   AATAATTATAAAAAA GGGGTGAAACT-AAGTTCA AACA TGAACTTGAGTTGCACCCC  TCTTGGATGTCAAAT 100 102
MKD39_RS08820 1811110 .. 1811126 -  -6.7  -3.13403   CTTTGTTTAGTAATA              TTAAACA TTT TGTTTAA              TGCTTAATAAAAGTA  62 139
MKD39_RS08815 1810539 .. 1810554 -  -3.2  -3.51934   CCCCCTTTATAAATA              TGATGC TGTC GCAACA               ATTAAAATTTCAATT  49 1
MKD39_RS08810 NONE
MKD39_RS08805 NONE
MKD39_RS08800 NONE
MKD39_RS08795 1806711 .. 1806721 -  -2.6  -2.56273   ATTATATCTAATTCA                 TTAT AAA ATAA                 CTACTATTTATAGTC  40 40
MKD39_RS08790 1805423 .. 1805447 -    -8  -4.99638   ATATTGACACAAAAA         CGGTTAAGCCA TATA TGG-TTAACCG          TTTTAAGTGTATATT  91 39
MKD39_RS08785 1804783 .. 1804819 - -13.3  -5.73339   AGAATTATAAAAAAA    TCTAACGATTTAGCATT ATA AATACTAAGTCGTTAGA    TTTTAGTTTTATATT 100 41
MKD39_RS08770 1801419 .. 1801475 -  -8.3  -5.10064   TTTAATATAGAAAAA TGTCTCGGT-AGTAAAATTTGGAAGA AATTCA CCTTTCAAAGTTGACTGACCGAGACA TTTTTTATTTTCTAA  91 30
        typA 1799193 .. 1799228 - -14.3  -5.08824   GTTTTACTCAAAAAA    GCCAGTAAATGAAAT GACAAA ATCTCATTTACTGGC     TTTCAAATTTAATGT 100 72
MKD39_RS08745 1797924 .. 1797958 -  -9.7  -4.89567   GCTTAAAATATAAAA    TGACTGAAAATATTAT AAAC ATAATATTT-CAGTCA     CAATGGTGAGATAAT 100 125
MKD39_RS08740 1796449 .. 1796484 - -11.4  -5.30575   TAAAAATGTAAAAAA    CCTTTACATGAAATCA AGCT TTATTTCACGTAAAGG     TTATCATCCTTATTT 100 47
MKD39_RS08735 1792558 .. 1792586 - -19.1   -4.4891   CCTATTAGTATAAAA        GGAGATGTGAATG GTT CATTCACATCTCC        TTTTTAATTAAAAAT 100 149
        cyoE NONE
MKD39_RS08720 1789916 .. 1789939 - -12.6  -5.27923   TAATGTTACAAAAAA          GACTAAGACA ATGA TGTCTTAGTC           TCAATCAATTTGTAT 100 64
MKD39_RS08715 1788724 .. 1788743 -  -2.3  -2.96274   CCTTCCATAAGTAGA            TTATTTT TCCAAG AAAATAA             GTGAATAATAGTCTT  41 6
MKD39_RS08710 1788217 .. 1788253 - -11.8  -4.61873   CGCTATAAAGTAAAA    GGAGAAAGAAATCAAA TGCAT TACGATTTCTTTCTCC    TTATTTTATGACAAA 100 31
MKD39_RS08700 1786728 .. 1786754 -  -3.8  -3.80697   AGCAAATCAATATAA         TGTACCTATATT CGG AATAGATGTACA         ACCACCAGAAGCATT  55 119
        rsmD NONE
        coaD 1785225 .. 1785274 - -13.3   -5.2204   GATAATTAATAAAAA GAACTAGGACTGAGAAAA-GCTT AATTTA AAGCACTTTCTCAGTCCTAGT-C GGCTAATGCGGATTA 100 108
MKD39_RS08675 1783380 .. 1783390 -  -2.6  -2.97171   TAGGTCATTAAATCA                 TTAT ACA ATAA                 TTTAAAACAACCTGC  42 43
        rpmF 1783099 .. 1783132 -  -6.2  -5.64274   TTATTGATAAAAAAA     GAAGCATCGAACAAC ATTAA ATTGTCC-ATGCTTC     ACTAAAATCATTAAG  95 45
MKD39_RS08665 1781905 .. 1781934 - -13.7  -5.60993   TTTTTCATAAAAAAA       GACTTCCATCCCA AAAC TGGGACGAAAGTC        TTTCCGTGGTACCAC 100 300
        pheS NONE
        pheT 1778343 .. 1778374 - -13.2   -4.0683   AAATAAATTTATAAA      GAGACGAATTCCAT TAAT ACAGAATTCGTCTC       TTTTACTTCATTATC 100 36
        zapA NONE
MKD39_RS08640 1776295 .. 1776307 -  -4.1  -3.14944   GACCAGGACATTTAA                CAAAG AAG CCTTG                TCCTGACCTTATATC  49 50
        polX NONE
MKD39_RS08630 NONE
        trxA 1771615 .. 1771649 -  -8.1  -5.43414   ACTACACATAAAAAA    GAC-GGAGCTATTACAT TCT ATGTAAT-GCCCCAGTC    TCATATAAATTCAAA  95 47
        uvrC 1769520 .. 1769534 -  -5.8  -3.57144   TTGTCCATTGTTAAA               TTATTG TGA CAATAA               TCAATAAATATCGGT  62 277
MKD39_RS08615 NONE
        sdhA NONE
        sdhB 1765991 .. 1766025 -  -4.6  -5.72622   TTTATAAAGAAAAAA    GTAGTTAATCAATTC AATTAA GAATC-ATTAACTAC     TTTTCAAATTATAAT  82 51
        racE NONE
MKD39_RS08595 NONE
MKD39_RS08590 1763660 .. 1763678 -  -7.4  -5.36364   CCAAAAATAGAAAAA             CCCGCCAT GTT ATGACGAG             TTTCTGAGATAATAT  91 305
MKD39_RS08580 NONE
MKD39_RS08575 1762306 .. 1762318 -  -2.7  -3.57144   TGTTTGATTTTTAAA                TTTAG AAA CCAAA                GATTTTACTTAATTC  47 14
MKD39_RS08570 NONE
MKD39_RS08565 NONE
MKD39_RS08560 1761686 .. 1761707 - -12.3  -5.75822   TATAAATTAAAAAAA           GACCAGAGC GCTT GCCCTGGTC            CATGATAATTAGAAT 100 47
MKD39_RS08555 1760867 .. 1760905 - -13.4  -2.77519   AATATGGAAAAGCTA   TGGAGTGATAAAAGTTCT ATC AGAATCTTTACCACTCCA   ACTTTTTGCATAAAA 100 46
        bshC 1758553 .. 1758579 - -11.8  -5.71712   TTTTATACAAAAAAA         CCTATTTTATCA TTT CGATAAAATAGG         TCTAAAGCTTGATTT 100 42
        mraZ NONE
        rsmH NONE
        ftsL NONE
MKD39_RS08525 NONE
        mraY 1753097 .. 1753108 -  -4.4   -2.5955   ATCCTGTATAATTGA                GCAT GCTA ATGC                 ACTCCTATCCATAAT  48 19
        murD NONE
MKD39_RS08510 NONE
        ftsA NONE
        ftsZ 1747546 .. 1747589 -  -5.5  -5.74086   AAAGTAAATAAAAAA GGGAG-AGAAC-ATGAATCCA CAAG TGAATTCGCCGTTCTACTCCC AATTAGGAATGATTA  88 95
        pgeF NONE
MKD39_RS08490 NONE
MKD39_RS08485 NONE
MKD39_RS08480 NONE
MKD39_RS08475 NONE
MKD39_RS08470 1743167 .. 1743179 -  -6.3  -4.35524   TCCTTAAATGTAAAA                GAACT CTA AGTTC                AATTAAAAAGGGACG  72 210
        ileS 1740167 .. 1740209 -  -4.4  -5.19879   TTGTAAATACAAAAA GAGAGTCGGAC-A-GAATTC TTCTC AAATTCGTTGTCCAACTCCC AACTTGCTTTGCTTG  76 205
MKD39_RS08460 1738414 .. 1738457 -  -7.1  -5.88197   TCAAACATAAAAAAA GA-AAAGGCAATTTCTATAA TATAT TCATAGAAATTGTCTTTCTC TCACTAATTCTAAAG 100 93
MKD39_RS08455 NONE
MKD39_RS08450 1736767 .. 1736806 -  -5.2  -5.71712   CTCTATATAAAAAAA  GCTACAGTTACAAATA GATGATGA TATTAGTAACTGTAGT   TCATTATGCGTTTTC  88 29
        lspA NONE
MKD39_RS08440 1734868 .. 1734896 - -16.9   -5.0925   TCTTAAAATTAAAAA        CCCTCATGCCTTT TTC AAAGACATGAGGG        CAAATTTATATACGC 100 418
        pyrR 1734109 .. 1734137 -  -8.4  -5.60993   CCTCTCATAAAAAAA       GTCTCTTTTACAT TTAA ATGTAAA-GAGAC        TAAAAAATCGTAGCA 100 204
MKD39_RS08430 NONE
MKD39_RS08425 NONE
MKD39_RS08420 NONE
MKD39_RS08415 NONE
        carB 1726229 .. 1726239 -  -6.8  -3.66908   TCCTTTGAAAATGAA                 CGAC TTG GTCG                 CCATAATCAGTTTAA  66 88
        pyrF NONE
        pyrE NONE
MKD39_RS08395 1724582 .. 1724594 -  -4.8  -5.72622   TTTATAAACAAAAAA                CGTG GTATA CACG                ACTACTTTTTAACTA  83 76
MKD39_RS08390 1723855 .. 1723898 -   -20  -5.25699   ACTATATAATAAAAA TAGGATTAGAACCAAATGCA TTTA TACATTCGGTTCTAATCCTA TTTTTTTATTTTTCA 100 31
         gmk NONE
        rpoZ 1721062 .. 1721105 -  -2.8  -4.05402   GTTTAATTAAAAAGA CACATCTTATTGA--AAAGT GGTTAT ACTTAAATCAATAAGATGTG CATATAAAAAATTAT  51 55
       coaBC NONE
        priA 1717314 .. 1717357 -  -7.9  -4.62054   GTAATTAAAGTAAAA GAGTTACGCAA-T-TTAG-GAT TCC ATCTCTAATAATTGCGTAACTC TTATTTTTTACATTA  80 33
MKD39_RS08355 NONE
         fmt NONE
        rsmB NONE
        rlmN NONE
MKD39_RS08335 NONE
        pknB 1710289 .. 1710328 - -12.4  -4.24342   TTTTTTACTAAGAAA  CCCTTTTAGCGAATGTGCA TTA TTC-CATTCACTAAAAGGG  TTAAATTTAATATTC 100 32
        rsgA NONE
         rpe NONE
MKD39_RS08315 1707929 .. 1707951 -  -7.8  -5.18357   TAATGCACTAAAAAA           TGCCTTCA TATGTGG TGAAGGCA           TTTTTTTTGCTTAAT  89 42
MKD39_RS08305 NONE
        fakA 1705334 .. 1705375 - -15.5   -4.8048   GCTCCATATGAAAAA TAGCTATGAAGCATTCTAT AGTC ATAGATTACTTCATAGCTA  TTTTAGAAATTAGTT 100 39
MKD39_RS08295 NONE
        recG NONE
        fapR NONE
        plsX NONE
        fabD NONE
        fabG 1698773 .. 1698791 -  -2.5  -4.08216   TCACCTCCTTTAAAA            GT-GTCTA TCCA TAGACTAC             TTTATTTTCCCATTT  53 98
MKD39_RS08265 1698482 .. 1698508 - -12.4   -5.7946   TTCTTAAGAAAAAAA         TCTGAGCCATCT TGT AGACGACTCAGA         TGTAAGTTTTTATTT 100 35
         rnc NONE
         smc NONE
        ftsY NONE
MKD39_RS08245 NONE
         ffh 1691065 .. 1691094 -  -7.3  -4.55446   CAATAAACATCAAAA       TATCGAACACT ATTTGAGA AGCGTTCGATA        TTTTCACTTAATTAA  78 37
        rpsP 1690534 .. 1690552 - -11.7  -4.68593   TTCAGTATTTAAAAA             GGCGCCA TCAGT TGGCGCC             TCTATTACTTTACTT 100 57
        rimM NONE
        trmD 1689214 .. 1689228 -  -3.6  -3.00498   CACACTTGATATATA               TTAGCA TAA TACTAA               TTGTTTTTCAATTGC  46 22
        rplS 1688665 .. 1688715 -  -9.3  -5.11112   AAATGTGAATAAAAA TAATAAAGCTTCCAATC-TCAACT TGAA AGAAGAAGATTGGAAGCTTTATTT GTAAGACAAACGTTG 100 80
        ylqF NONE
MKD39_RS08200 1681486 .. 1681506 -  -2.5  -3.60475   AAGCGCTATTGTAAA            CTGAAAGTG TTC CACTTTTTG            CAATTAATTTAAAAT  47 49
        sucC 1680224 .. 1680237 -  -2.4   -3.5511   TTTTATCTATAAATA               CACT CATCTT AGTG                TTCCCATCCTTTCCT  47 40
        sucD 1679227 .. 1679285 -  -5.6  -3.63073   TAGACTCTTTAACAA TTGATGTTCTCCATTCGAAATTAATA AATTTAA TATCAACTTCGAATAGAGACTGTCAA TAAGAGTCTAGGCAA  62 65
MKD39_RS08185 1677729 .. 1677751 -    -7  -5.33026   CAATTCAAACAAAAA           TCTGAGACCC TTA AAGCCTCAGA           ATTTTTTATATTATA  91 70
        dprA NONE
        topA NONE
       trmFO 1672995 .. 1673036 -  -4.7  -4.65895   TCTTCCACTTAAAAA TCCCCTCCA--TCATATGC ATTGTA GCATATAACATGAAGGGGA CTAAAATAATTAGCT  70 121
        xerC NONE
        hslV 1671548 .. 1671567 -  -3.6  -3.07487   CCATATTTTTAAAAG            TTAAAGTG TTTC CACTATAA             TATTATCATTTGTGA  46 6
        hslU NONE
        codY 1669224 .. 1669252 -  -7.6  -5.18726   TTTTCATAATAAAAA        CTGTTACAAATA ATATA TACTTGCAACAG        TTGAATGTTGGTTAT  89 64
        rpsB 1668194 .. 1668221 -  -8.6  -5.06451   TATTATTTGAAAAAA        GGGCGATAAGCAT TAC AT-CTTATCACCC        ATTTAAACTATATCT  95 40
         tsf 1667110 .. 1667129 -  -6.4  -4.06964   ATATATACAAGTAAA            GAAGACAC TGAC GCGCCTTC             TAACATAAAGTATCA  68 96
        pyrH NONE
         frr 1665653 .. 1665678 -  -5.5  -5.41359   AAGCAAATGAAAAAA         CTGTACCAA AGTCTGAA TTGGCACAG          TTTAGACTAAAATAA  82 116
MKD39_RS08125 NONE
MKD39_RS08120 1663862 .. 1663878 -  -3.1  -3.71924   TAAATTATTCAAGAA              TTTTACT TTT AATAAAA              GGAGTTAAGAATTAC  51 134
        rseP NONE
MKD39_RS08110 1660657 .. 1660690 -  -9.7  -5.52384   TTTTTAGTAAAAAAA     GAGGTTTAGACAAAT ATGA AATTGTCTTAACCTC      ATTTAGCATTATGCA 100 106
MKD39_RS08105 1656055 .. 1656074 -  -7.1  -4.78848   TCGGCAAATAGAAAA            GAGCGGG TATATG CCCACTC             TTTCTGCCTGAGTCT  81 145
        rimP NONE
        nusA NONE
MKD39_RS08090 NONE
MKD39_RS08085 NONE
        infB 1651481 .. 1651505 -  -8.6  -4.68593   TTTATCATTTAAAAA          GGTGGACG GTTTCTCCA CGTCCACC          TATACATATATTGTT  90 46
        rbfA 1650932 .. 1650970 -  -4.9  -5.47399   TTAATTTTAAAAAAA  GAGTAGAAC--TGAAATTA TAC TAATTTCAATGTCCTACCC  CTTAACTATTTAGTA  79 69
        truB NONE
        ribF 1648860 .. 1648874 -  -2.9  -3.23296   AATAATATTTATGAA               TTCTA TTTTC TAGAA               CTCAACTTTAAATAT  46 33
        rpsO 1648454 .. 1648482 -  -7.5  -5.75599   TAAACGATAAAAAAA        GGAAAGTACCA AACTAAA TGGTGCTTTCC        TCTTAATATATAAAA 100 42
         pnp 1646228 .. 1646251 -    -9  -4.84642   TGTAAACTAATAAAA          GACTAGGATGA TAA TC-TCCTAGTC          TTAAAATTATTATTT  95 35
MKD39_RS08050 1644244 .. 1644262 -  -7.4  -3.54516   TAAAAGTATGAAAGA             GGTTGGAA CAA TACCAACC             ACATTTAGACTTATC  69 143
MKD39_RS08045 NONE
MKD39_RS08040 NONE
MKD39_RS08035 NONE
MKD39_RS08030 1638406 .. 1638428 -  -2.7  -2.79098   CTGACCCACCAAGTA           CTAACGCTC TCATT AAGCTTTAG           GCTCCAATCGACTAT  41 15
MKD39_RS08025 1637564 .. 1637576 -  -6.3  -3.53012   GCCCCTTGTTTTAAA                TGGTA ACC TACCA                TCGGAATATTAAAAT  64 163
MKD39_RS08020 NONE
MKD39_RS08015 NONE
        pgsA 1635691 .. 1635702 -    -3  -3.20901   ATTTCACTAATTTAA                TGTT TGAA AACA                 TCTCTACCTTTATAA  46 10
MKD39_RS08005 1634244 .. 1634269 -    -2  -2.77235   TTAACGAGTTAATCA         TCGTATTAAT ATCTTA ATTAATACTA          TACATTTAATTGAAT  40 146
        recA NONE
MKD39_RS07995 NONE
MKD39_RS07990 NONE
MKD39_RS07985 1629630 .. 1629642 -  -2.7  -2.87769   ATCGACTAAAGAGTA                CCAAT CTA ATTGA                ACGACTGAATCAAGA  42 306
         rny 1626619 .. 1626639 - -10.5  -5.80951   ACTGAAAAGAAAAAA            CAGACCCAA AAT TTGGATCTG            TTAAAAATTATTTCG 100 33
MKD39_RS07965 NONE
MKD39_RS07960 NONE
MKD39_RS07955 1622400 .. 1622432 - -10.1  -5.97575   AAGTTATAAAAAAAA      CTCACTTCAAAAC TTAAAGC GTTTTAAAGTGAG      CTCCTACAATTTCTA 100 38
MKD39_RS07950 NONE
MKD39_RS07945 1621198 .. 1621232 -  -2.3  -5.31275   TGCCATTATAAAAAA    TATAGCCTAAGACACA GATT TATGTCCCAGACT-TA     TCTCATTTAAACTTT  67 43
        miaB NONE
MKD39_RS07935 NONE
        thiW 1618452 .. 1618464 -  -6.3  -3.26066   AATAAAGAACACATA                CGTTT CAT AAACG                ACTGAACTTTATTTT  61 89
        mutS NONE
        mutL NONE
MKD39_RS07915 1613030 .. 1613043 -  -6.7  -3.47227   TGCTAACTACCATAA               CAAGC GATT GCTTG                TTGTAACGTAACTAG  65 3
MKD39_RS07910 1611912 .. 1611929 -  -4.9  -2.59102   GAATAATAAGAAAGC             GTACTAT ATGT ATAGCAC              TTTTCCAAAAAAATT  50 72
        glpK 1610231 .. 1610276 - -12.9  -5.05782   ATTTATGCGAAAAAA GAGAGACCTATC-CATACAG AATCAAA CTGTATGTAACAGGTCTCTC AAATCTCGACTGATG 100 95
MKD39_RS07900 1608374 .. 1608413 - -16.8  -5.26316   TTATTTTATAAAAAA  TGAACTGAGATGAGCTTCA TAT TAAAGCTC-TCTCAGTTCA  GATATTAACTGCGAA 100 132
MKD39_RS07895 NONE
        miaA NONE
         hfq 1605925 .. 1605963 - -13.5  -5.29716   TTAATACAATAAAAA   GCTTCATTATAGAGT GAAATAGCA ACTCTATAATGAAGC   TTTTTATATTACAAA 100 156
        hflX NONE
MKD39_RS07870 1602788 .. 1602810 -  -9.2  -5.00884   ACTTTTTTCAAAAAA           TCCCTACTCA ACT CAAGTAGGGA           TACATTTTCTATATC  95 34
MKD39_RS07865 1602250 .. 1602262 -  -3.5  -4.60924   GAAATCCTCCAAAAA                TTTAT TTA ATAAA                CCGTGATAAATCCCC  62 14
        glnA 1600828 .. 1600853 - -10.5  -5.63517   TTTTCAAATAAAAAA         GAAGCTAAGGC AAGT GCCTTAACTCC          TTATATCCCTAAGTC 100 62
MKD39_RS07835 NONE
MKD39_RS07830 NONE
MKD39_RS07825 NONE
MKD39_RS07820 NONE
MKD39_RS07815 NONE
MKD39_RS07810 NONE
         ssb NONE
MKD39_RS07800 NONE
MKD39_RS07795 1593623 .. 1593646 -  -2.6  -4.10007   ATAACTCGTTTAAAA          TTTTAAGATA TGAA TATGTTAAAA           ATACACTTTTTTATA  55 335
MKD39_RS07785 NONE
MKD39_RS07780 NONE
MKD39_RS07775 NONE
MKD39_RS07770 NONE
MKD39_RS07765 NONE
MKD39_RS07760 NONE
MKD39_RS07755 NONE
MKD39_RS07750 NONE
MKD39_RS07745 NONE
MKD39_RS07740 NONE
MKD39_RS07735 NONE
MKD39_RS07725 1587385 .. 1587397 -  -4.9  -3.05384   TCCTTTTTTATTTAA                TTGTA AAC TACAA                TCAAATATTTAACTA  52 34
MKD39_RS07720 NONE
MKD39_RS07715 1586131 .. 1586154 -    -6  -5.20333   TAGGTATAATAAAAA          GACGTACCAC ATAA ATGATACGCC           TTCTGATAAGTATTC  84 122
MKD39_RS07710 1585755 .. 1585775 -  -6.3  -2.58667   GGGTATAAAAATTAT            TTATTTTGA AAT TCAAAACAA            TTTTAATTTTTAAAC  57 35
MKD39_RS07705 NONE
MKD39_RS07700 NONE
MKD39_RS07695 NONE
MKD39_RS07690 NONE
MKD39_RS07685 NONE
MKD39_RS07680 1580152 .. 1580198 -  -6.3  -5.15381   AACATATTTAAAAAA GGTAAGATGATTTT-T-AAATTC ATT GAATTCCATAAAATCACCTCACC ATTTTTTTAATTTAA  82 21
MKD39_RS07675 NONE
MKD39_RS07670 NONE
MKD39_RS07665 1579043 .. 1579077 -  -2.3   -4.8543   CAATTTTTATAAAAA     TAAAAAAATACACCT AATCG ATGTGTTTTTCTTTA     TAATATTGATTTTTA  62 4
MKD39_RS07655 1578002 .. 1578024 - -11.4  -5.63517   TCTTCAAATAAAAAA           GACACAGTAA TAA TTACTGTGCC           TCATCTTTGTTTGTA 100 16
MKD39_RS07650 NONE
MKD39_RS07645 NONE
MKD39_RS07640 NONE
MKD39_RS07635 NONE
MKD39_RS07630 NONE
MKD39_RS07625 NONE
MKD39_RS07620 NONE
MKD39_RS07615 NONE
MKD39_RS07610 1566308 .. 1566327 -  -9.4   -5.1861   CCTAGTATTAAAAAA            CTACCTAT TTAA ATAGGTAG             ATATTAATAAATTCC 100 29
MKD39_RS07605 1565863 .. 1565885 -  -8.5  -5.27335   GCTCCTAAATAAAAA           GAAGTGACT ATATA AGTCACTCC           TTAGTTTTTGTTAGT 100 26
MKD39_RS07600 1564890 .. 1564914 -  -6.4  -5.56264   TTTAAACACAAAAAA          GGGTAGCTAA AAAAA CTGGCTACCC          TTCTATTCTACTTTT  95 33
MKD39_RS07595 NONE
MKD39_RS07590 1563206 .. 1563224 - -11.8  -5.47218   CTTTATTTAAAAAAA             CCATACCT CAT AGGTATGG             TTTATTAATTCTTAA 100 30
MKD39_RS07585 1562592 .. 1562630 - -14.1  -3.34522   ACACTGGGCAACTAA   CAAGGCTCTATCCCTTA TGTAG CAAAAGATAGAGCCTTG   TTTTATTTTTCATCA 100 28
MKD39_RS07575 1560548 .. 1560561 -  -6.7  -4.77122   GGACATAAAAAATAA               CCTTC CGTA GAAGG                TTGAAAAAGTGTATA  79 84
MKD39_RS07570 1560199 .. 1560247 - -10.7  -2.72379   TCAACCCTGCAAGGA TGACTAGAACTGAGAAAA-GCTT GATTT AAGCGCCTTCTCAGTTC-AGTCA GCTACTGTGAATTTG  84 19
MKD39_RS07565 1559696 .. 1559711 -    -4  -3.91716   TTATTTCTTAAAGAA              GTTAAC CATA GCTAAC               AATAAAGTAACTACA  56 263
MKD39_RS07560 1558936 .. 1558949 -  -3.9  -4.56775   ATTCCCCTTTAAAAA               GTATT TTGT AATAC                TGCTAATTTTATTAG  63 399
MKD39_RS07550 NONE
         cls 1555743 .. 1555773 - -12.1   -5.1675   CGAGGTAGCAAAAAA       GAGATTAAGCAAC ATTAA ATTGCTTAATCTC       ATAATTTTTAACTAT 100 59
MKD39_RS07540 NONE
MKD39_RS07535 NONE
MKD39_RS07530 NONE
MKD39_RS07525 1551781 .. 1551833 - -12.3  -4.59773   TTTTACTTGCAAAAA TAATGGGAGTAAGACAAAGAATTCA AAC TGAATTTTTTATCTTACTCCCAACT TTTTTTATATTTAAG 100 506
MKD39_RS07510 1550794 .. 1550842 - -12.8  -2.53677   AATTAATTCATTAAG TAAGCGATTGACA-GTGAATC TACATACT GATACACGTGTCAATCGCTTA TTTTTAACTCCATAA 100 29
MKD39_RS07500 1549002 .. 1549055 -   -10  -4.72333   AAGCATAGTTAAAAA GCATCTAGTATTTAAGTAGTCATGT TTTGT ACATT-CCACTTAAATATTAGATGC TTCTTTATAATTTGT 100 30
MKD39_RS07490 NONE
        thrC NONE
        thrB NONE
MKD39_RS07475 1542759 .. 1542801 -  -6.6  -5.03961   AATTAAATAATAAAA TGCGAG-CACTAAAA-GTAT AGTAA ATCCTTTTTAGTGACTCGCA TTTTTTTGTTTCAAC  84 517
MKD39_RS07460 NONE
        rpmG 1539256 .. 1539282 - -12.5  -5.73672   AAATAATTAAAAAAA         CCGAAGTATAA GATTA TTATACTTCGG         CAAGCTCTAAGTTTA 100 71
        rpsN NONE
        guaC NONE
MKD39_RS07440 1536546 .. 1536582 - -20.5    -4.128   ATTTCTATATACAAA    GAACTAGCAAAGTCTAC AAT GTAAACTTTGCTAGTTC    TTTTGTTTTTCATTT 100 158
MKD39_RS07430 1535434 .. 1535481 -  -7.3  -5.64304   GAATATAACAAAAAA GAGGTCTAGACAAAAGCTATTAA CATT TAAATAGCTTT-GAC-AGACCTC AAATTTATAATTATC 100 36
MKD39_RS07425 NONE
         tkt 1532993 .. 1533016 - -10.4  -4.08485   CTCATTCAAATTAAA          GAAGACTTTC CAAT GAAAGCCTTC           TCAGTTCTCTAATTT  91 52
MKD39_RS07415 1532541 .. 1532570 -  -9.5  -4.98911   TACTACAAAAATAAA       GGATTGTAA-ACCT TAA AGGTACTACAATCC       ATTTAAAAATTATTT 100 35
MKD39_RS07410 1531664 .. 1531700 -  -4.7  -5.37593   GTTCAAACTAAAAAA   GATGGAACAAT-AATT AATTTA AATTCATTGTCCCACC    TATGTTATTAAGCAG  79 279
MKD39_RS07405 NONE
MKD39_RS07400 1527387 .. 1527421 - -10.9  -3.08706   AATCATATTTTAAGA     CCGTATGACAATATT GAATT AATTTTGCCATACGG     TCTTTTTTAATTCCA  88 32
MKD39_RS07390 1525136 .. 1525165 - -12.3  -5.61824   TAAAATTCAAAAAAA       CCCTCAAGTACTT ATAA AAGCACTTAAGGG        CAATAATGTTATTAT 100 53
        acnA 1522151 .. 1522177 - -10.9  -5.49569   TATTAACATAAAAAA         GCCATGCCAAC ATAAA GTCAGCATGGC         TTCAAAGTTCATATA 100 41
MKD39_RS07380 1521414 .. 1521461 - -10.2  -3.03554   TTAACTAAGCATATA TAAAAGAACTGAGAAGACGCTCC CAT GTAGCAT-TTCTCAGTTTTTTTA ATACATATTAGTGAT  81 192
        parE NONE
        parC 1515688 .. 1515700 -  -3.5   -4.4267   CTTTAAAATTGAAAA                TATAA TTT TTATA                ATCCATTAGTCGATT  59 31
MKD39_RS07355 1513950 .. 1513994 - -13.9  -4.75776   AACTTAATGTAAAAA CTCCTTTCAACGTTTTGAA TGAGAGT TTCAACACATTGAAAGGAG TATGAATAAATTCTA 100 63
MKD39_RS07350 NONE
MKD39_RS07345 1511601 .. 1511646 -  -8.6  -4.13561   CTTTCTTAAAAAAGA CGGGAACGAGAC-A-GAATCCA AAAA TGAATTCATTATCTCATTCCCG CTAGGTAACTTAAAC  81 89
        mprF 1508819 .. 1508839 -  -5.4  -4.52873   TTTTTACAAAAAGAA            CCCTGAGC GTTAT GCTCAAGA            ACAACAAGACCGAGC  71 132
MKD39_RS07330 1507210 .. 1507233 -  -8.8  -5.07107   TAAAGTCGTAAAAAA          GAGTGCACCC AATC GAGTGCGCTC           TTTTACGTTTTAGTT  95 35
MKD39_RS07320 1505132 .. 1505144 -  -6.3  -3.98661   TACACCTATTAGAAA                TGTTG CAA CAACA                ATTAGATTCAATTTC  69 433
MKD39_RS07310 1502720 .. 1502750 - -14.1  -5.14563   CCTTTCACTAAAAAA       CGTCAGCCTCCTT ATGTA AAGGACGCTGACG       CGCGGTACCACCTTA 100 473
MKD39_RS07305 1501289 .. 1501302 -  -2.3  -2.82156   CTATAATTAATATCA               TGGTG TTAC CTCCA                ATAAGCTTTTTGCTT  40 9
MKD39_RS07300 NONE
        trpD NONE
        trpC NONE
MKD39_RS07285 NONE
        trpB NONE
        trpA 1495956 .. 1495987 - -10.4  -5.05113   TTTATATAAATAAAA      GAGATTAAGACA TCTGCCAT TGTCTTAATCTC       TAAAAGAATTCTTAT 100 411
MKD39_RS07265 NONE
MKD39_RS07260 1493132 .. 1493166 - -16.7  -3.98214   ACTAGTTACGATAAA     TAAAGGCTGCGACAT CCACC ATGTCACAGCCTTTA     ATAACATCAATTTAT 100 37
MKD39_RS07255 NONE
MKD39_RS07250 1490337 .. 1490386 -  -7.3  -4.77442   AAGATAATAAATAAA GGCGTTTGAAACATTTTAACA TGCTTTTT TGCATATATGTTTCAAACGCC TTTTATTTACTATTC  81 72
        pepF 1487930 .. 1487975 - -11.5  -4.21465   CCCAAAATCAAACAA TTAAACCCTGATAA-GACTGAT TAA ATCAGTTATTATCAGGGTTTTA CTATAAATCAAAATA  95 55
MKD39_RS07205 1480194 .. 1480225 - -13.8  -5.23316   TATGATAGTAAAAAA      CGCACTCCCCAATT TAGT AATAGGGAAGTGCG       TATGTGCTTATATAT 100 40
MKD39_RS07200 NONE
MKD39_RS07195 NONE
        dapA NONE
        dapB NONE
        dapD 1475049 .. 1475079 - -11.3  -4.61824   TAAGAATAACTAAAA      CTGAGAAGG-GCTC AGTT AAGCGCCTTCTCAG       TTCAGTAAGCTATTG 100 105
MKD39_RS07175 NONE
MKD39_RS07170 NONE
        lysA 1471253 .. 1471283 - -14.2  -5.20783   ATTCAAACATAAAAA       TTGGACTGATGATT TTT AGTCATCAGTCCAA       TTTATTATAGAGCCA 100 87
MKD39_RS07160 1469778 .. 1469799 -  -8.8  -3.16881   TATTGACTTTAGTAA           CACCTTAC CAAGAT GTAAGGTG            TTTTTTATTTTGGCT  74 78
MKD39_RS07145 1468606 .. 1468618 -  -2.7  -2.82327   TTTTTATATTTAAAT                CGATT TAA AATCA                GAAAAATCTTCACTC  41 7
MKD39_RS07140 NONE
MKD39_RS07135 1466711 .. 1466742 -   -14   -5.2422   AATTATATTAAAAAA      GCACATCA-AACTCA TTT TGAGTTGTGATGTGC      TTTACTATTTTAGTT 100 39
MKD39_RS06995 1441878 .. 1441916 -  -7.5  -4.59946   AAAATAAGAAAATAA   GGAATGGCATAGATTTC ATTAA GAAATCATTTCCATTCC   CATAATATTCTTTAA  80 37
MKD39_RS06990 1441320 .. 1441352 -    -8  -5.35222   AAAATTTATAAAAAA      GACAATTTCTAT ATTATTTCA ATAGAAATTGTC      TTTTTTTCACTTATC  93 81
        recU NONE
MKD39_RS06925 1411219 .. 1411266 - -13.9  -3.27029   TTGTATCAATGAATA TAAAGAAAGGCAATTTCTATT TGATGT AATAGAAATTGCCTTCTTTTA ATTATTTAACATTTC 100 48
MKD39_RS06790 1382919 .. 1382962 - -13.4  -3.12668   CAGCGGTATAGTTAA TAAGAGCTGAGAACGACGCAA CAT TAGTGTC-TTCTCAGCTCTTA TCATCCTTATGAAGA 100 128
MKD39_RS06760 1375325 .. 1375361 - -17.6  -5.32882   TATTATCATAAAAAA    CCTCCTAATGTTGAAC TTATT ATTCAACATTAGGAGG    TTTCATTATTGATTC 100 56
MKD39_RS06725 1369193 .. 1369207 -  -4.2  -3.25356   TTATAATTAATGTAA               GTAGAG CTA CACTAC               ATTTTATTTTAAATC  49 29
MKD39_RS06705 1365942 .. 1365955 -  -3.9  -4.14345   TAATATTAAATTAAA               TCAAT TTAA ATTGA                AACAAAAGGTGTGTA  59 108
MKD39_RS06690 NONE
MKD39_RS06685 1362308 .. 1362330 -  -9.2  -3.69613   AAAGATAAAGCACAA           GAGCTTGG GATTACT CCAAGCTC           TTTTTGTCATTTGAA  80 32
        proC 1360568 .. 1360612 -  -7.2  -3.67925   AAAATTACAAAGTAA GAGACTAGGATATAGAAGTC ACAGA GAAATCATTATCCTAGTCTC TTTTACAGTAAAATT  69 40
         zwf 1357695 .. 1357737 -  -7.9   -3.3944   TTTTTAATAGAAAAG GGTGGTAGGACAA-AATTTA AAAT CAATTCATTGTCCCACCACC AAAAGAATGACTATA  70 161
MKD39_RS06660 1356591 .. 1356618 -   -15  -5.58454   GCCACACCAAAAAAA        TCCCCTCACTAC TGGC ATAGTGAGGGGA         TTGGTGCATAAAATG 100 133
      prli42 1350534 .. 1350566 -    -8  -5.38321   AAACATTATAAAAAA      GACAATTTCTAT ATAATTTCA ATAGAAATTGTC      TTTATTTACTTATCC  95 79
MKD39_RS06535 NONE
MKD39_RS06530 1332891 .. 1332923 - -10.7  -6.07374   ATAAAAAATAAAAAA      TCATAGGATGGCTAA TAT TTGGTCATCCTATGA      TTTTTTTTATTTTCT 100 32
MKD39_RS06520 1331476 .. 1331498 - -12.2   -5.4148   TAAATAATTAAAAAA           CTCTTAAAGA ACA TCTTTAAGAG           TTAGTAAGCAGACAA 100 45
MKD39_RS06370 1300713 .. 1300740 - -14.2  -4.24204   TACTCACACTTAAAA        CCCCACCACAAA GAAA TTTGAGGTGGGG         TTAGTACTAATTATT 100 50
        rpsT 1281934 .. 1281966 -    -8  -5.35222   AAAATTTATAAAAAA      GACAATTTCTAT ATTATTTCA ATAGAAATTGTC      TTTTTTTCACTTATC  93 72
MKD39_RS06100 1248046 .. 1248073 -  -7.8  -5.02357   TATAAGCAAATAAAA        GGAGTGAGAT TAAATAAT ATCCCACTCC         AAATTATACCTTAAT  89 78
MKD39_RS06085 1245530 .. 1245542 -  -3.5  -4.11394   ACCCTATGGCTAAAA                TTATT CGT AATAA                ACTAAAGCGTCAAGG  57 335
MKD39_RS05960 1221706 .. 1221718 -  -3.5  -2.82635   AGGTGCATTATGACA                TTATT TTT AATAA                TAGGGATTTTGATAC  45 344
MKD39_RS05935 1214935 .. 1214945 -  -2.6  -3.96531   GCACATATTTACAAA                 TAAT AAT ATTA                 ATGAGTTGTTTTTAG  53 343
MKD39_RS05890 1205075 .. 1205096 -  -5.3  -3.40566   ACATTAGATGTAGAA           GCGCTTAAAA ACA TTTTAA-CGC           AACCTAAGAACGCTT  57 462
MKD39_RS05820 1189667 .. 1189679 -  -7.7  -2.57294   AATATTGAGATTAAG                CAACC TTA GGTTG                TTTAATCTCTTTTTT  64 8
MKD39_RS05780 1178160 .. 1178197 - -14.5  -4.56153   TTATTACAAAAACAA   GCCAGTAAATGAATT TTTATGTT AATTCATTTACTGGC    TATTATAATCTCGTA 100 52
MKD39_RS05730 1164266 .. 1164304 -  -6.2  -3.93148   TAATGAAATTAATAA   GCACAAAGGTGATT TATACATGAAC AATCATCTTTGTGC   TATTATTTTGACGCA  68 60
MKD39_RS05720 1162264 .. 1162305 - -11.8  -4.22375   ATTTAATATAAATAA TCCAGTTGAGTACATAGT TATTTT ACTATTAACTCAACTGGA  TTTTTAATTTTTATT 100 36
MKD39_RS05710 1160411 .. 1160439 - -13.3  -4.38748   GTGACAAATAAATAA        TGACGATAAAGTC AAA GACCTTATCGCCA        TATTAAACTCACTTT 100 66
MKD39_RS05670 NONE
        rpsD 1150672 .. 1150696 - -10.8  -5.84381   CTATGAATAAAAAAA         CCACCCATTCC ATAA GGAA-GGGTGG          TTGTTCATTATCATG 100 44
MKD39_RS05655 1149327 .. 1149355 -  -3.1  -3.55453   AATTTAAAAGAGTAA        TCACCATGTTTAT ATG AGATTCATGGTGA        AACTAGCGCAATTTT  49 46
MKD39_RS05650 1148103 .. 1148119 -  -3.7  -2.82586   GACACTAGAATATTA              TGCTTCA CTA TGAATCA              CCTCTGAAAATTTTG  45 6
        serA 1146425 .. 1146468 - -11.1   -3.2396   AATCATTAGTATTAA TACGCCCCTCAGTGATGAA GTAAAA TCCATCATAGAGGGGCATA ATTATTTCAAGTAGA  90 69
MKD39_RS05625 1141106 .. 1141141 - -13.5  -3.77722   TTTAAGCATTAAGAA    GGCCAGTAATTGATT TTGAAT AATCATTTACTGGCC     TTATGAGTAAATTCT 100 59
MKD39_RS05605 1136319 .. 1136349 -  -6.1  -4.11394   ATGTTACGTTGAAAA       CTGTCGACAAAGC GCAAA ACTTTGGCGGCAG       TTTTTTTATGAATTT  70 88
MKD39_RS05590 NONE
MKD39_RS05585 1130529 .. 1130565 - -18.3  -2.52543   AGTTGTTTTAAGGGA    GCGGTATGATGATTTTA AAA TTAAATCATCATACCGC    TCCCTTAGTGTGTAT 100 30
MKD39_RS05530 1116795 .. 1116838 -  -4.6  -5.50499   TTACATGTAAAAAAA TGGTAAGAGGAGTGGGCA-TA TTT TATTTCCCACTTCTCTTGCCT TTTACTTTATTATAA  78 35
MKD39_RS05520 1114377 .. 1114389 -  -7.7  -2.57294   AATATTGAGATTAAG                CAACC TTA GGTTG                TTTAATCTCTTTTTT  64 8
MKD39_RS05480 1105325 .. 1105338 -  -3.1  -2.87881   TAATCGTTTGATACA               TAGAG TAAC CTCCA                TTTGTTAATCATAGT  43 168
MKD39_RS05475 1104022 .. 1104065 - -18.6  -3.96696   AAGATGAATAGTAAA CTCCCTAAGATTATTCTA CATATTAC TAGAATAATCTTAGGGAG TTCTTTTTATTAAAA 100 35
MKD39_RS05440 NONE
MKD39_RS05435 1085901 .. 1085936 - -12.8   -4.3739   GATTTTTCGACAAAA    CAATCCACTCCATAAT TAAA ACTATGGAGTGGATTT     TTTATATTATTTAAA 100 68
MKD39_RS05415 1081540 .. 1081581 -  -5.2  -4.87893   AATTTTAATTAAAAA TACAAATCCTCGACAAAG TATTAG CAGTGTCGAGGATTTATT  TTTTATCTTTTTAAT  75 28
MKD39_RS05370 NONE
MKD39_RS05365 1071507 .. 1071519 -  -6.3  -3.04931   GGAGATAACCACATA                GTATG AAA CATAC                AGAATTTGAAGAGAA  59 469
MKD39_RS05350 NONE
        crcB 1069520 .. 1069559 -  -3.8  -2.78762   ACAGCACCAATACCA  CCACCTACCATAATAAATA GTA TATGTATCATG-TAGGTTG  CCCCCCTAATTTAAC  46 14
MKD39_RS05340 1069148 .. 1069192 - -18.3  -5.38398   ATAAAAATATAAAAA TACACTTCATAGTTGCAAGAT TTA ATCTTAAAACTATGAAGTGTA TTTATTTATATCGAA 100 31
        pckA 1063771 .. 1063825 -  -5.3  -3.70741   AAATGTGAAGAAATA TAATAAGACAACGTATAAGGTTT CAGTATAGT ATGCCTTATACATTGTCTTTTTA ATAAATATTAATTAT  61 37
        yidD 1062187 .. 1062211 -  -4.9  -4.54727   GTCGGTAAATTAAAA          GAGGGGATGAT TTC ATTTTCCCCCC          CTCAAATCGATAAAT  69 60
MKD39_RS05230 1053019 .. 1053068 -  -7.3  -4.93696   CTTAAAGATTAAAAA GGTTGCCTA-TGACTAGAACAAGT TAA ACTAAATCTAGTTAACAGGCAACC TTTTTATTATTCCTT  85 32
MKD39_RS05215 1050414 .. 1050427 -  -3.9  -4.57503   TAATAGAATAAGAAA               TGAAA TAAA TTTCA                GATTCTACAACAATC  63 101
MKD39_RS05210 1049915 .. 1049955 -  -6.1  -4.24342   TTTGGCATTAATAAA  GAGAGTAGCGAAATATTCA TAA TGAATTCAACGCCACTCCC  GTATCACAGTTTAAT  70 56
MKD39_RS05205 1049218 .. 1049258 - -10.6   -5.2189   TTAAGCATTAAAAAA  GTATCGAACTTGAGGCAT TATAT ATGTTTCAAGCTCGATAC  TATGATACTCAGTGA 100 34
MKD39_RS05200 1048049 .. 1048091 - -10.2  -4.06384   TTTGAACACGAGAAA GGGAGCAAGTCAATCAATTC GTTAA GAATTAA--GACTTGCTCCC TTACGATTTAATGTT  91 54
MKD39_RS05155 1037300 .. 1037331 -  -8.8  -4.82756   ATATAACTAATAAAA      GGAGTAACTGTCTA TGAA TCGATAGTTACTCC       TTATTATTTATTCAT  95 33
MKD39_RS04930 1016751 .. 1016793 - -10.9  -5.84381   TGATTAATAAAAAAA CTACAATAAAGGCAACGTTA TAAT TCACGCT-CCTTTATTGTAG GTTATAAATTTACTA 100 38
MKD39_RS04925 1015343 .. 1015372 - -13.8  -5.36364   TCAAAAACATAAAAA       TTGGACTGATGA ATTTTG TCATCAGTCCAA        TTTATTATAGAACCA 100 208
MKD39_RS04920 1013944 .. 1013956 -  -7.7  -2.57294   AATATTGAGATTAAG                CAACC TTA GGTTG                TTTAATCTCTTTTTT  64 8
MKD39_RS04900 1009077 .. 1009130 -  -9.9  -5.13354   GCGACAAAAAATAAA TAAAAGAGTGAATCAGAATCATA GTGTAGTT TATGGTTCTGGTTCACTCTTTTT AAAAATTATTTAGAA 100 31
MKD39_RS04895 NONE
       yfkAB 1000835 .. 1000867 -    -8  -5.35222   AAAATTTATAAAAAA      GACAATTTCTAT ATTATTTCA ATAGAAATTGTC      TTTTTTTCACTTATC  93 96
MKD39_RS04830 NONE
MKD39_RS04825  995832 ..  995875 -  -7.1  -4.34993   TAAATAGTAAAATAA GCGGGAC-A-GAAACCTGTTAT ATA ATAA-AGATTTCATTGTCCCGC CTTACTATGAGTGAA  76 128
MKD39_RS04820  994512 ..  994540 - -10.4   -5.8187   GATTCAATAAAAAAA        GGTTGAGGCA ATAAACCGA TGCCTCAACC        TTTTTTTAATTTAAT 100 55
MKD39_RS04790  989512 ..  989545 -  -4.8   -4.5464   TATATATAATGAAAA     CCAGTAAAATGAG ATGACAACG CTCATT-TACTGG     TTTTTTAGTTTATAC  68 58
MKD39_RS04780  987520 ..  987555 -    -7   -4.9445   ATAAGCAATTAAAAA    TGACGTACCGGA TCTATAGAATTT TCCAGTACGTCA     TTTTTTATTTGTCAT  85 30
        ftnA  984613 ..  984642 - -14.5  -5.08255   ATTCTTAAAATAAAA       TAGAGTGGAAATG AATT CATTTCCACTCCA        GTTATATTTATGAGT 100 151
MKD39_RS04760  983620 ..  983630 -  -2.6  -4.27441   ATGATGATGAAGAAA                 TTTT ACA AAAA                 ATATGGGAACTATCT  58 368
        putP  974094 ..  974128 - -10.9  -4.74767   ATAATTAACATAAAA    CTACGGATAACGCCTA CAAG TTGG-GTTATCCGTAG     TTTTTGTTTAATATT 100 42
MKD39_RS04665 NONE
MKD39_RS04660  960399 ..  960445 - -20.6   -3.7744   AACACAACCCAACAA TAAATAGCCAGTAAATACGTTT TGA AGACGCATTTACTGGCTATTTA ATTTCGATACATCAG 100 104
MKD39_RS04650 NONE
MKD39_RS04645  957510 ..  957537 - -14.4   -5.4505   TTTTTCAATAAAAAA        CAGTTGAATGAA AAGA TTCATTCAACTG         CGTATATAAAGGCGA 100 62
MKD39_RS04640  955986 ..  956011 -  -7.5  -3.57572   TAAGTAAAATACTAA         GCCACGGCAGT GTAA AATGTCGTGGC          TTTTTGCAAATTTTT  71 39
MKD39_RS04625  953178 ..  953205 -  -5.7  -4.70353   CACAATAAAGTAAAA        TGATTGCCT ACACAATAAG AGGCAATCA         CTTATATAAGTCGAC  75 67
MKD39_RS04605  950386 ..  950420 -   -16   -5.1287   TTGATATCCAAAAAA     GAGGGTAGTAAAACAA ATT TTGTTTTATTACCCTC     TTACTATATATACTT 100 41
MKD39_RS04565  944350 ..  944377 -  -9.9  -5.63236   ATCTAAAAATAAAAA        CGAGTCTAGGA ATTATA TCCAAGACTCG         TCTTTTAATTAAGAG 100 334
MKD39_RS04555 NONE
MKD39_RS04550 NONE
MKD39_RS04545 NONE
MKD39_RS04540  941387 ..  941403 -  -4.4   -3.8186   TACCGTAATGAATAA              GGGTAA ACCTG CTACCC              TGGAATATTAATCTT  57 33
MKD39_RS04535  940582 ..  940597 -  -6.1  -3.94812   TTGGAGGGAAAAATA              GGGCA AGTGAA TGCCC               TCAATTATTCTGGTT  68 30
MKD39_RS04525  939385 ..  939401 -    -8  -4.40692   GGTAAAAAATAATAA              GGGTAG GCGGA CTACCC              CGAAATTCATTAAAT  81 35
MKD39_RS04520  937710 ..  937724 -  -5.6  -4.41206   AATCAGTGCACAAAA               GGCCCT TTA AGGGTC               TTTTTTATTTAGAAA  70 261
MKD39_RS04505  933873 ..  933886 -  -2.3  -4.49756   GTTGAAAGATTAAAA               CATGC AGAT GCAGG                TGTTGGATTTAACGC  59 299
MKD39_RS04490  931154 ..  931197 -  -8.4  -4.93333   AACTAAAATAGAAAA CGCATCTATTATTGTCAT TTGAAATG ATGAGATTAATAGATGCG TTCATTTATTAAAAT  95 34
MKD39_RS04480  928569 ..  928597 -  -3.3  -5.30448   AAATAAATATAAAAA       GGACTCAATTTC AACATA GAAAT-GAATCC        TATAGAAACTGAGTC  72 78
MKD39_RS04475  927640 ..  927663 -  -9.7  -5.75342   TTTTTGTAAAAAAAA          CTGTATCCA TAAAAT TGGATACAG           ATTAGTAACTATTTA 100 34
MKD39_RS04470  926383 ..  926394 -  -4.4  -3.70773   TGTCATAGTTAATAA                TCCT CCCT AGGA                 AAAAAGATTGGTAAT  57 7
MKD39_RS04465 NONE
MKD39_RS04460 NONE
MKD39_RS04455  924080 ..  924113 - -11.9  -2.75822   TAAATGATAAAAATT     GCCAGCAAATGATTT TAGT AATTCATTTACTGGC      TTTTTTATGCCTGAT  93 100
MKD39_RS04415  914696 ..  914729 - -11.3  -5.61596   ATTTGTATAAAAAAA     TTAGCTAGAAAGT TAATTAAT ACTTTCTAGCTAA      TGGTAAAATAATGAG 100 44
        ilvD NONE
        ilvB NONE
MKD39_RS04380  907500 ..  907522 -  -6.5  -4.14874   AGAATATTCTTAAAA           TTTAGATAA AGAAA TTATCTAAA           TTATGTGATGTTAGT  70 85
        ilvC NONE
MKD39_RS04370 NONE
        leuB NONE
        leuC NONE
        leuD NONE
        ilvA  900530 ..  900562 -    -8  -5.35222   AAAATTTATAAAAAA      GACAATTTCTAT ATTATTTCA ATAGAAATTGTC      TTTTTTTCACTTATC  93 72
MKD39_RS04235  875944 ..  875976 -    -8  -5.35222   AAAATTTATAAAAAA      GACAATTTCTAT ATTATTTCA ATAGAAATTGTC      TTTTTTTCACTTATC  93 49
         cls NONE
MKD39_RS04205  870810 ..  870840 -   -15  -5.95946   TCAACAACAAAAAAA       GAGATTAAACAACT TAA AGTTGCTTAATCTC       AATATTTGGACTCAT 100 68
MKD39_RS04160  863037 ..  863064 - -11.4  -3.10614   CAAAATGATAAAGTA        GGCTGAGACA TTTAATTT TGTCTCAGCC         TCATTTTTATTCTCT  91 32
MKD39_RS04020  838569 ..  838606 - -12.3  -4.53119   AAATAATATAATAAA   TCAACCCTTACGT-AC TGAAATG GTGACGTAAGGGTTGA   TTTTATAATGAATAT 100 53
        coaW  834199 ..  834228 - -10.9  -3.62032   AGATGAATTGTTAAA       CCCTTAATCAC ATCTTTTG GTGATTAAGGG        TTTTTTATAAATATT  90 49
MKD39_RS03980  830012 ..  830057 - -12.9  -4.94487   TTATAAAAGAGAAAA GTAAAACCACCAATACTTAAA TATA CTTAAGTATTGGTGGTTTTTA TTTTAAATATGAAAT 100 41
        deoD  825494 ..  825526 -  -9.3  -5.10968   ATTAATATATAAAAA      GGTGCTTGAGA TTTCATTATCG TCTCAAGCACC      TTTTATTATCTATTA 100 51
MKD39_RS03920 NONE
        czrB  818922 ..  818962 -   -10  -4.15235   AAGTTGTAAAAAATA GGGGTTAGACA--GAATTCA ATT CGAATTCAACGTCTAACCCC TGATTAATTTTTAAT  91 49
MKD39_RS03905  816847 ..  816879 -    -8  -5.35222   AAAATTTATAAAAAA      GACAATTTCTAT ATTATTTCA ATAGAAATTGTC      TTTTTTTCACTTATC  93 73
MKD39_RS03780  791975 ..  792002 -  -8.5  -5.22312   ATTTAGATTAAAAAA        CTGTCAACTAC ATAGCG GAAGTTGACAG         TTTTTTATATAACTT 100 66
MKD39_RS03775  791233 ..  791246 -  -3.7  -3.56837   TTGCAAATACCAGAA               GCGGC TAAA GCCTC                TGAAACATTATTGAT  52 352
MKD39_RS03735  780495 ..  780530 - -17.2  -4.33281   ATTGTAAATAAAGAA    GCCAGTAAATGAATTT GTTA AAACTCATTTACTGGC     TATTTCTCTAGGGTT 100 95
        lacA NONE
        lacB NONE
MKD39_RS03715 NONE
        lacD NONE
MKD39_RS03705 NONE
MKD39_RS03700 NONE
        lacG  771928 ..  771977 - -11.1   -5.5074   CAAGCCAAGAAAAAA TAA-ATAGGACTGAGAAAAGCTAA ATT TTAGCATTTCCCAATCCTACCTTA CAATTGTATCTATCA 100 74
MKD39_RS03680  768669 ..  768710 -  -3.3  -5.13343   TAAGTCAAAATAAAA TGACGTTTAT-CCTAT TGCCTTTTTTT ATAGGAATAAACGCCA TTTATAAAGAAATAT  69 50
MKD39_RS03675  766977 ..  766987 -  -2.6  -2.58788   TTAATGAAAAACTAT                 TAAT TTA ATTA                 TATAAATATTTATTA  40 103
        amaP NONE
MKD39_RS03665  766092 ..  766102 -  -2.6  -3.55761   TATTTAGTTCTTAAA                 TAAA TTG TTTA                 ACTCCATCTATTTAA  47 23
MKD39_RS03660  765424 ..  765456 -    -8  -5.35222   AAAATTTATAAAAAA      GACAATTTCTAT ATTATTTCA ATAGAAATTGTC      TTTTTTCACTTATCC  93 75
MKD39_RS03645  761773 ..  761797 -  -7.9  -4.67982   TTGTATGCAATAAAA          GCTAGAGATTC ATA AAAACTCTAGC          TTTTGAACTTTATAT  83 41
MKD39_RS03465  742052 ..  742090 - -12.7  -2.78371   TACACGGTTAATAAG  GAAAAGGACGATG-CTCT ATTA AGAGACATCGTCCTTTTT   TTACCATTTATTTGA 100 26
MKD39_RS03450  737394 ..  737430 -    -4  -6.01187   AAGTAAATAAAAAAA    GCATATTAAGAT TTAATGTGTAATT ATCTTAATATGC    TTTAATGGTATGCTA  91 38
MKD39_RS03445 NONE
MKD39_RS03440  735534 ..  735563 -  -9.4  -5.34055   ATAAATATGAAAAAA       GCAAGCAATTCT ACTTTA AGGATTGCTTGC        TTTTTACTGCATAGT 100 50
MKD39_RS03430 NONE
        mspA  733723 ..  733780 - -13.8  -2.62515   AAGCCTGGGACATTA TGATATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATT TTTTC AATGTTTACTTTGAAGGG-GCATATCA TTAATCAATGACTCA 100 85
MKD39_RS03405 NONE
MKD39_RS03400  726033 ..  726045 -  -7.7  -5.02074   CTAGGTTTGAAAAAA                GCTTG ATT CAAGC                GCATTTTCAAATCAG  89 107
        moaC  720598 ..  720609 -  -4.4  -3.00017   TTTAAACTTAAATGA                TAGG TTTC CCTA                 ATTGAAGTTTTGCAT  50 91
        fdhD  715724 ..  715766 - -18.7  -4.09923   AAGTTAATTAAATAA GCCACAGAGTAGTTTGAAC TAATT ATTCCAACTACTCTGTGGC TTTAATACGTTCAGG 100 14
MKD39_RS03280  706371 ..  706393 -  -9.2  -5.22943   AGTAAACGCAAAAAA           GCGATCCA TTTTTTT TGGATCGC           TTTTAAACTTACTAA 100 46
MKD39_RS03275  704767 ..  704784 -  -6.3  -3.59979   TGGCTCTACGTCAAA             TCGGACT GATG AGTCCAA              ATATTGAGATTAAGC  64 35
MKD39_RS03260  700894 ..  700928 - -10.8  -5.23644   AATGAAATACAAAAA     CCTTGAACAACTCCGT AAT AAAGAGTAGTTCAAGG     TTACGTACTGTAATA 100 141
MKD39_RS03255  699965 ..  699978 -  -2.4  -4.74504   ATTTGAACTGAAAAA               GCTT GGTTAA AAGC                GACTTCACAGCCCAG  60 126
MKD39_RS03250 NONE
MKD39_RS03245 NONE
MKD39_RS03240  697987 ..  698001 -  -4.2  -4.06825   GAAAAGAACACCAAA               CCGTTT GTT AAGCGG               ACAAACTAAATTCCT  59 157
MKD39_RS03200  688753 ..  688765 -  -3.4  -3.05816   TTATTGTGTATGGAA                GCAT ATTCA ATGC                AACTCCTTGAAGATA  46 86
MKD39_RS03195  688270 ..  688282 -  -3.5  -2.74597   TTTACATATATATTA                TATAA TTT TTATA                ATTAATTGTTTAAGC  44 149
MKD39_RS03190 NONE
        murQ NONE
MKD39_RS03180 NONE
MKD39_RS03175  683727 ..  683757 - -16.4  -5.95946   TCAACAACAAAAAAA       GAGATTAAACAACC TAA GGTTGCTTAATCTC       AATATTTGGACTCAT 100 204
MKD39_RS03160 NONE
MKD39_RS03155  679652 ..  679668 -  -4.5  -2.52279   TTAGCAAACATATAC              CATTTAA AGT TCAAATG              CGTTCTTTCTTAGTT  47 211
MKD39_RS03140  677970 ..  677998 -  -6.9  -6.17669   AACAAAATAAAAAAA        TGAGAAAATAC TATAAGT GTATCTTCTCA        GATCAGTAAGTTAGA 100 94
MKD39_RS03130  674727 ..  674741 -  -2.8  -3.73647   GGTACGTATCAAGAA               CTCGTT GAC AATGAG               TATATAAAAATGACA  51 483
MKD39_RS03090  666385 ..  666415 - -14.2  -5.36364   TCAAAAACATAAAAA       TTGGACTGATGATT TTT AGTCATCAGTCCAA       TTTATTATAGAGCCT 100 64
MKD39_RS03085  664872 ..  664912 -  -8.7  -5.59962   TAAAATAAATAAAAA TAAGCCAGAAAATGAA-CT AAGAA AGATTCATTTTCTGGC-TA TTTGTATGTGCACTT 100 95
MKD39_RS03075  663296 ..  663333 - -12.9  -3.17392   TAAAGTAAAAAACAT   TAAAGCGGGTAGATCGT CAGT ACGATTTATCCGCTTTA    TATTATGCTTAATAG 100 44
MKD39_RS03050  659705 ..  659725 -  -6.2   -3.8046   GTTAAAAATTTTAAA            TAGCACTT CTTGT AAGCGCTA            TAAATCCCCATATAT  66 252
        gltS  658398 ..  658427 - -15.9  -4.64952   AATTACACAAATAAA       GCAAGTTGAGAGT TTGG ACTCCCAACTTGC        TTTTTTATAATGCCT 100 52
MKD39_RS03030 NONE
MKD39_RS03025  655088 ..  655104 -  -3.8  -4.07124   CATGAGTCACACAAA              GTAATT AAACA AATTAC              TAAGACGATTGATGC  56 230
MKD39_RS03015  653337 ..  653370 -  -3.9  -5.67063   TTTATTAGAAAAAAA     GCCATTGT-GACTAAA TTA TCGCGTCTACAATGGC     AAAAAATATATTATT  80 36
MKD39_RS03000  649803 ..  649848 - -22.3  -3.85082   AAATACAGTATCAAA TTGAAGAAGCCATTAATTGAG TTAA CTCAATTAATGGCTTCTTCAT TGATTAAATGCAACT 100 39
MKD39_RS02980  645109 ..  645125 -  -6.7  -5.64274   CGAGTTATAAAAAAA              TAAACTT AGA AAGTTTA              AATAGTTGTGTCATT 100 125
MKD39_RS02965 NONE
MKD39_RS02960  641197 ..  641217 -    -7  -2.80579   TTTGTAAAATAATAT            CTAACTAA ATTGA TTAGTTAG            TTTCAGGCAATGTCA  63 18
MKD39_RS02955 NONE
MKD39_RS02950  640138 ..  640182 - -10.1  -3.54739   ATAAAATAACATTAA GCTCCTTAAAAAGTTTGCACT TTA AGTGTTTACTTTATAAGGAGC TTTTTCATTAGTAAT  86 40
MKD39_RS02940  637082 ..  637120 - -11.9  -4.64598   TAATTATTTCAAAAA   TAGCCCGTAAATGAATT GTAAA AATTCGTTTACGGGCTT   TTTGAATATTCATAG 100 75
MKD39_RS02930  633224 ..  633252 -  -3.2  -3.93367   GGTGCTAATAAAATA       GGGGAGTTGGGG TTCGGGG CCCCA--TCCCC       TGGTAAGGTTGACTA  53 147
MKD39_RS02920 NONE
        tatC  631534 ..  631567 - -10.5  -4.25388   GATAGTAAAATGAAA     CCTCGAG-ACTTGT GGGAATA ACAAGTACTCGAGG     TTTATTAGTTATTAT  91 37
MKD39_RS02895  626113 ..  626130 -  -4.2  -4.61482   TTTTGGAAAAAATAA             TGGAAT ATATTA ATTCCA              TAGCTGAAAAGGGAA  67 251
MKD39_RS02850 NONE
MKD39_RS02845  616717 ..  616747 - -14.2  -4.66537   AATAAACGAAATAAA       GTCGACATTCTG ATTTATG CAGAATGTCGAC       TTTTTGTATAATTAG 100 44
MKD39_RS02835  614559 ..  614586 -  -9.2  -5.10029   ATTAATTTTAAAAAA        GTTGGGACAACA TATG CGTTGTCTCAAC         TTTTTTGTTTTTCAT  95 150
         rsp NONE
MKD39_RS02825  611047 ..  611080 -  -3.9  -5.96521   ATTAATCAAAAAAAA     GAGTTCAGAACC-TGA TTA TCTTAGTACTGAACTC     TTTAATATAAACAGT  91 51
MKD39_RS02820  610506 ..  610535 -  -8.7  -5.23316   TATGATATTAAAAAA       CTGCCAACAAAGA TTTC TCTTCATTGACAG        TGATTTATTGTAATT 100 40
MKD39_RS02815  609004 ..  609016 -  -7.7  -2.57294   AATATTGAGATTAAG                CAACC TTA GGTTG                TTTAATCTCTTTTTT  64 8
MKD39_RS02800  606162 ..  606179 -  -2.1  -4.13282   ACCATAGTTGTAAAA             TGATACTT TTC AAGTA-CA             TTATAGTAATAGAGA  52 182
MKD39_RS02795  605637 ..  605672 -   -15  -4.84527   TTTATACATTAAAAA    GAGCAATACAAAGCTA AACA TAGTTTTGTATTGCTC     TTTAACATTTTATTC 100 52
MKD39_RS02695  583686 ..  583724 -  -9.2  -5.66229   ATTAATAATAAAAAA  CACTTTTCTAAAGTTCA TAAAGT TGAACCT-AGAAAAGTG   TTTTTTTGATTTATA 100 42
MKD39_RS02670  579390 ..  579423 - -10.4  -4.55023   GCCAATATGATAAAA     GAAGGCTGAGAC ATTTTATTTA GTCCCAGCCTTC      TTCTTTTTAGGAGTT  93 64
MKD39_RS02660  577424 ..  577456 -  -5.8  -5.83211   CATTAAAATAAAAAA      GACAATTCCTAT ATTATTTCA ATAGAAATTGTC      TGTTATACTTATCCA  95 125
MKD39_RS02640 NONE
MKD39_RS02635  571772 ..  571795 -  -8.2  -6.14618   TACAAAATAAAAAAA          GCGACACA GAATTCAT TGTGTCGC           CTAATATAGGTTGAT 100 86
MKD39_RS02630  570384 ..  570415 -  -8.9  -5.58209   TGAAATGCAAAAAAA      CTGAGAAAA-GCTC GATAT GAGCATCTTCTCAG      TTTAGTCGACTACTG 100 106
        scdA NONE
MKD39_RS02620  568721 ..  568758 -  -8.6  -4.48333   ATACAGTAATTAAAA   GAACTGAGAAGGCGCTC TTTTT AAGCGT-TTCTCAGTTC   TTGTTATACTTTCAC  83 44
MKD39_RS02610  567062 ..  567076 -  -2.9  -3.63068   TTAGATCAGGTTAAA               GATAA ACATA TTATC               TTAATGACTCACATT  48 368
MKD39_RS02600  564744 ..  564775 -  -7.5  -5.26155   ATACAAATATAAAAA      CTGAGAAAA-GCTT GATAT AAGCGTCTTCTCAG      TTTTATTTGTTTTTA  91 81
MKD39_RS02595  562234 ..  562269 - -18.6  -4.59081   TAAACTTATAGAAAA    GCCCATAGATAATGCA AGGT TACATTATCTATGGGC     TTTAATTGATTTTTA 100 38
MKD39_RS02585 NONE
        yidC  557618 ..  557663 - -22.3  -4.33708   AAATTATTAGTAAAA GAAGCACTGTTACAAGCTAAT TGCA ATTAGCTTGTAACAGTGCTTG TTGTATTGATGGAAT 100 53
MKD39_RS02565  554376 ..  554388 -  -6.3  -3.98745   CAATTAGGTAAAGAA                CATCA TAT TGATG                CGCCAGTTAACCAAT  69 313
MKD39_RS02550 NONE
MKD39_RS02545  548867 ..  548883 -  -5.3  -3.39439   ACAAATAATAAGACA              TTTATTT ATA AAATAAA              AAAGTATTTAACCTT  57 125
        lrgA NONE
        lrgB  547512 ..  547541 - -13.7  -5.04601   GTTACAAATGAAAAA       GAACCTGAGCACA ACAT TGTGTTCAGGTTC        TTTTTAAAATGTTTA 100 38
MKD39_RS02510  542340 ..  542377 -  -8.6  -4.12296   TTTAGAATGAAAGAA   GCATTTAATCAACATC GCTAAA GATGAAGATTAAATGC    TTTTTAAATGATGTT  81 67
MKD39_RS02500  539837 ..  539864 -  -9.3  -5.78622   CTATTCTAAAAAAAA        CCTAAGTATGA ACGTAG TCACACTTAGG         TTTACAATATTAATC 100 35
MKD39_RS02495 NONE
MKD39_RS02480 NONE
MKD39_RS02475  534352 ..  534408 - -15.8  -4.27467   GAAGATGAAGATAAA TAAATTAAAAAGTCAGTTTTCACTTGA ATCA CCAAATGAAAACTGACTTTT-AATCTA CTATGCTTTGTCCAC 100 26
MKD39_RS02450  529215 ..  529243 - -10.4  -3.48558   AGAAATACTAAGCAA        GAGAAGGCACTT GATAT AAGCACCTTCTC        TTTTTAGTCAGCTAT  88 106
MKD39_RS02445  527716 ..  527750 -  -5.2  -4.58213   TAATGAATCATAAAA    GCTGTAACAAC--GAG TAATG CTCAAGTCGTTACAGC    TTGTTTTTTATGATT  70 39
MKD39_RS02435  525851 ..  525876 - -13.4  -3.52341   AGGTTAATATTATAA         CCCCAGTCTA TGGCAG TAGACTGGGG          TTTAGTGACGTCAAA 100 147
MKD39_RS02425  523106 ..  523134 - -13.3  -5.00895   GGGATTACACAAAAA        TAAACCTCCTCGA AGA TAGAGGAGGTTTA        TGTACATATCTAGTA 100 65
         ppx  521391 ..  521408 -  -3.5  -3.53787   AAGTAAAAGGCATAA             TATCCTA ACTT TAAGATA              GCACACTTGTTTTAA  50 37
MKD39_RS02415  519121 ..  519146 -  -9.7  -4.96501   GTTTACAAAAATAAA         GGCAATGGTCA TGAG CGACCAATGCC          TATTTTATATGTTAT 100 37
MKD39_RS02400  516569 ..  516599 - -14.2  -5.20783   ATTCAAACATAAAAA       TTGGACTGATGATT TTT AGTCATCAGTCCAA       TTTATTATAGAGCCA 100 17
MKD39_RS02395  515068 ..  515095 - -12.2  -3.56366   AATAATGTGTTGAAA        GCCCGTATCT-TA CCA TAGAGATACGGGC        TTCAGTGTATTACAA  95 98
         dcm  511261 ..  511291 - -16.4  -5.95946   TCAACAACAAAAAAA       GAGATTAAACAACC TAA GGTTGCTTAATCTC       AATATTTGGACTCAT 100 179
MKD39_RS02305 NONE
        thiO NONE
        thiS NONE
MKD39_RS02290 NONE
MKD39_RS02285  491717 ..  491753 -  -9.2  -4.98531   TTGTGAAATTAAAAA   TTCATAGTAAATTT-AT TATA ATAAAATTTACTATGAA    TTGCTTGTATAAACC  95 52
MKD39_RS02280  491016 ..  491042 -  -2.8   -5.4833   CTATTTAATAAAAAA         GCCTCAGTCACC AAT GAATTCTGAGGC         TTTCACGTATTACTT  71 35
MKD39_RS02275  488832 ..  488866 -   -13  -4.25437   AAAGTAATATATAAA     TGGCACTTTCTATTTC AGT GATTTAGAAAGTGCCA     TTTTTTTATATGTGT 100 60
MKD39_RS02265  485690 ..  485724 -  -8.7  -4.32482   ATTCATAATGGAAAA     GGACTCAAAGATG TATGGTTCG CATCTTTGGGTCC     ATTTTAATGTATCCT  83 44
        aldA  481035 ..  481067 -  -5.7  -5.80003   TGAATAAATAAAAAA     TATCCCCA-ATCCT TTTATT AGGAGATGGGGATA      TTTTTATACCAATTT  95 39
MKD39_RS02230  479522 ..  479536 -  -2.8  -4.26351   GACTAATGTAATAAA               GGTGTA CTA TAAACC               TCATTCAAGTCTAAA  55 102
MKD39_RS02225  478474 ..  478516 - -12.3  -3.41203   AAAATTTAAGATTAA GGGAGTGGGAC-A-GAATTCT TTT AAAATTCGTCGTCCCACCCCC AATCTATTTAAAATG  95 76
MKD39_RS02205  473556 ..  473583 - -15.8  -5.10077   AAATAGCTTAAAAAA        GGAGAATTCTCA ATTT TGAGAATTCTCC         TGTTTATTTATTAAA 100 49
MKD39_RS02190  471190 ..  471226 - -15.5  -4.62069   AAAAAGACGATAAAA    GAAAAGTAAGTGAGT AAAAGGG ACTCACTTACTTTTC    TTATTTGTCATGCAA 100 26
MKD39_RS02135  460408 ..  460448 -  -3.5   -4.6951   AGTATTTAAAATAAA GTAGGTACATAGTGTCATC AATCA GATGAG-CT-TGCACCTAC TTTTTCAGTATCTGT  64 2
MKD39_RS02120  458788 ..  458804 -  -3.6  -3.35616   GAGGACTATAGAATA              TCGCCG ATTAA CGGTGA              CTTAGAAGGATTAGG  51 341
MKD39_RS02110  456496 ..  456508 -  -6.3   -3.1478   AGCATTTGAGTAATA                TGGAA GCA TTCCA                TCAAATTATTAATAA  59 435
MKD39_RS02095  454620 ..  454662 - -16.6  -4.12899   ATGACAATTAAATAA TAAAACAAGCCTGGGACA ACATATG TGTCTCAGGCTTGTTTTA TGTGTTGGCAGTCGA 100 157
MKD39_RS02060  446316 ..  446330 -  -8.5  -4.78237   TACCCTATAATAAAA               GCGCC ATAAA GGCGC               TTGGTGAGATGATAC  90 70
MKD39_RS02055  445544 ..  445598 -  -5.3  -4.47873   ACAATATTTAGAAAA GCCACTAATTACGAGT-AAGGTTCTTA AAT CAAG-ACCTCGATTCATAAGTAGTGGC TTTTATTTATCATTT  70 58
MKD39_RS02040  441572 ..  441618 -   -11  -4.48299   TTACACGTAAATAAA GAGGCGTTCGAGATAAGAGC CTAAATT GCTCTTATTTTGAATGCCTC TTAATTAATATCAAC 100 42
MKD39_RS02030  440572 ..  440610 - -14.1  -4.10672   CTAACGCAAACTAAA   TAAGCGTATGATTCTAC AAATG GTAGATTCACACGCTTA   TATCTATTAATGTTG 100 32
MKD39_RS02015  438080 ..  438095 -  -4.8   -4.6635   AAACTTTGAACAAAA              TAGAAT GATT ATTCTA               ATTAATCATGTGCTT  70 27
MKD39_RS02010  437160 ..  437194 - -13.1  -3.02639   ATTTCTAAATAATTA     GTCAGTAAATGAGTG TAGTC CATTCATTTACTGAC     TTATTTTTATTTCAT 100 369
MKD39_RS01990  433151 ..  433185 -    -6  -5.60993   TTTCGCATAAAAAAA    GTAGGAC-A-GAATTC TTTTC GAATTCATTGTCCTAC    TACTTCGAATTTGCA  90 108
MKD39_RS01985 NONE
        copZ  430218 ..  430270 - -10.2  -4.88485   GAATTAAAAAAATAA GAGTTGGGCATGGGACA--GAATTAT TTA AAAATTCAATGTCCCATACTCAACTC CTCATATTTTGCCAG 100 135
MKD39_RS01920  416472 ..  416494 - -10.6  -5.60993   TTTTCCATAAAAAAA           CTTCCAAGGC AAT GCCTCAGAAG           TTGAATTATAAGTGT 100 31
MKD39_RS01915 NONE
MKD39_RS01910  415057 ..  415082 - -13.4  -4.78661   AGCTAAAAATCAAAA         GCCCTCGAAA AATCAA TTTCGAGGGC          CTTACTTTGTATACA 100 42
MKD39_RS01890 NONE
MKD39_RS01885  411821 ..  411856 - -12.6  -2.98947   CGTAATTAATAACTA    TGGGTGGTACAGGTAC AGTG ATACCGGTGCCACCCA     TGTTTATTATTTTTC 100 32
MKD39_RS01875 NONE
MKD39_RS01870  409246 ..  409287 -    -9  -4.90525   CAATTTTAAAGAAAA TGACTCCTAATTTGAA GTTTAATCCT TTCAAATTAGGAGTCG  TATTTTATATTGTTC  95 30
MKD39_RS01815  398482 ..  398516 - -12.3   -4.4261   CTGGTAACACGAAAA     GAAGCACCTATCTCA ATCGA TGAGACAGGTGCTTT     TTCATTTGTATTAAT 100 36
MKD39_RS01800  395183 ..  395200 -  -3.5  -3.75229   TAAACCATATTGAAA             CTTTAAA TTAG CTTAAAG              AATGACATATTTGTA  53 111
MKD39_RS01795  394428 ..  394455 -    -7  -5.66229   ATCAATAACAAAAAA        GGCGAGATGACT TTGA AGTCATCTCGTT         TTTTCTATGAGATTT 100 30
MKD39_RS01775  390113 ..  390139 - -10.1  -4.55023   GTGAATATTAGAAAA         GCCGGCCGGTT GAAAT AACCAGTCGGC         TTTTAAATATTCGAG  93 186
MKD39_RS01750  385612 ..  385644 - -13.6  -3.62255   GTTAATAATAAGTAA      GAGTCGCTTGAG AGTTTATAG CTCAAGCGACTC      TTTTTTTAACTTTCT 100 31
MKD39_RS01720 NONE
MKD39_RS01715  378265 ..  378303 - -11.2   -4.4715   TTTCAATGTATAAAA   GACACCTCGTTAAATG CTTTGGT CATCTAACGAGGTGTT   ATTTTTGTGTTTGAT 100 71
MKD39_RS01665  364754 ..  364802 -   -12  -5.72622   CTTATAAATAAAAAA GAGCTAGCAGATTCTTCAAAGT TTTAC ACTTTAGAAAATCTGCTAGCTT TTTTAAATATCTTCT 100 28
MKD39_RS01545  336784 ..  336829 - -16.5   -3.9444   TAAATCTTAACTAAA TGAAAGCACTTTGTCGATGAT ATAA ATCATTGACAAAGTGCTTTTA AATTGCAATTAACCT 100 68
MKD39_RS01455  318193 ..  318220 -   -15  -5.30348   ACTGAATAAGAAAAA        GGCATTGCGTAA ATGA CTACGCAATGCC         TTTTAATATGATTAT 100 40
MKD39_RS01445  315878 ..  315907 -  -8.6  -5.20154   ATATAATGTAAAAAA       GCCTGTGACATG GTAGAA CATGCGACAGGC        TTATATTAATAATTG 100 49
MKD39_RS01435  314142 ..  314173 - -10.3  -4.56736   ACTGAATAACGAAAA      GTCCTCTATTTCA AATGAA TGAAGTAGAGGAC       CTTTGTTGTATAAAG  93 47
MKD39_RS01385  303669 ..  303699 - -11.3  -3.28582   ATAATATTTAGAAGA      GCGCATAAATG-GG ACTT CCTCATCTATGCGC       TTTAATTTATCTCTA  93 94
MKD39_RS01375  302340 ..  302370 -  -7.7  -4.91109   TTTGTACTATAAAAA       GCATTCTAACC TTATAAATG GGCTAGAATGC       TTTTTATGTGCTATA  88 59
MKD39_RS01365  297037 ..  297073 - -11.1  -5.13741   TTAATCTAATAAAAA    TAGGCAATTTCTATTGT AAT AAAATAGAAATTGCCTT    TTTGATCTATTATTT 100 74
MKD39_RS01340  289400 ..  289440 - -12.1  -3.81951   GCGGATAGTATTAAA  GAGCAATCATGTTAATAAA TAT TTAATCAACGTGATTGCTC  AAATTTGCAGGAACT  95 39
MKD39_RS01335  285985 ..  285995 -    -4  -3.01712   TCCTCCTTTTTAATA                 TTAG TCT CTAA                 GTTCGTCATCATGAC  48 15
MKD39_RS01330  284851 ..  284884 - -16.2  -5.42131   GAACGATATAAAAAA     GTGGGAGCGAAACT GAGTTT AGTTTCACTCCCAC      GTAATAATAGCTACG 100 158
MKD39_RS01325  284071 ..  284101 -    -7  -5.42265   GCAAATGACAAAAAA       GCAATCTCAC TCTTAATTTAT GTGAGATTGC       TTTTATTTATCATAA  95 28
MKD39_RS01305  280932 ..  280964 - -17.9  -5.64873   GTGAACAATAAAAAA      TAGGACGTGTGATGA TAG TCATCGCACGTCCTA      CTTGTACATTATAAA 100 52
MKD39_RS01275  277582 ..  277598 -  -2.3  -4.71426   CTTCTACTAATAAAA              TATGAAA CCC CTCCATA              TATTTCACCTCCATG  59 46
MKD39_RS01270 NONE
MKD39_RS01265  275581 ..  275631 -  -9.9  -4.37157   AATGAGGATAATAAA GCTTTTGAGATGAATGAAGACTT ACAAA AAGTCGACTTTTATCTCAAAAGC TTTTTTGTTTTGTAA  91 333
MKD39_RS01215  251173 ..  251215 -  -7.2   -5.3236   AGAAGTTATAAAAAA GAGGCTATCGCTTATAGGT TAATAC ACCTTTAAT-GATAGCCTC TTCATTTTCATATGC  91 99
MKD39_RS01185 NONE
MKD39_RS01180  244149 ..  244190 -  -7.3   -4.1822   GTTGAGTTGAAGAAA CACCTCTAGTGTCAGTGTG TCAT CGTACTGATATTAGAGGTG  TTCTATTATAGTTAT  75 37
MKD39_RS01165  241001 ..  241036 -  -8.3  -3.37568   TAGATATAAAAAGTA    GCCTTCGGATTGTCT GGAGTA AGACATCCTGAAGGC     TTGTATTACAGTGTT  73 31
MKD39_RS01160 NONE
MKD39_RS01155  239924 ..  239938 -  -4.4  -2.83715   TTGATTAGTATTAGA               TTTAAT TCA ATTAAA               GATTAGTTGCTTTTA  49 68
MKD39_RS01150 NONE
MKD39_RS01145  238329 ..  238372 -  -3.8  -4.87037   AATAGAGACGAAAAA GGTTCCAAACACTTGATAGC AGTT GATGCCTCGTGTTTAGAACC AGTATTAATATATTA  68 63
MKD39_RS01140 NONE
MKD39_RS01135  235110 ..  235138 -  -8.2  -2.82775   TGTAGATAAAATTCA        CCCCCACATG ACGAATTAG CATGTGGGGA        TATTTGTTTAGTTTA  69 42
MKD39_RS01125  232472 ..  232498 -  -2.2  -5.42265   TTAAATTAGAAAAAA         TGTCGCTAAGTT TTC ATCTTGGCGATA         TTTTTCAAATAATGA  70 61
MKD39_RS01100  225370 ..  225405 - -12.1  -5.28176   GGTAGTCATAAAAAA    TATCCCTTATGAGCT AATTAA ATCTCATAAGGGATA     TGATTTAGATATTAA 100 37
MKD39_RS01095 NONE
MKD39_RS01090  223032 ..  223061 -  -7.9  -5.25772   AAAGCATAATAAAAA       CAAGCGTGGCT TTTTAATC AGTCACGCTTG        TTTGTTTATATATAA  91 41
MKD39_RS01080 NONE
MKD39_RS01075 NONE
         pcp  218992 ..  219007 -    -9  -6.09196   TTGAAAATAAAAAAA              GAGGGT GGGG ACCCTC               TTTTTAATGTGTTTC 100 29
MKD39_RS01065 NONE
MKD39_RS01060 NONE
MKD39_RS01055 NONE
MKD39_RS01050 NONE
MKD39_RS01045  214158 ..  214185 -  -4.2  -5.12068   TATACGCAATAAAAA        GCAATGCCTA AGTTTTGA TAGGCATTGT         TTTTTAACTTAAATA  71 34
MKD39_RS01035  212358 ..  212391 -  -9.7  -5.38054   TTTGATAAATAAAAA     TAAGCAGGACTTC GACGGAAT GAAGTCCTGCTTT      TACTGTGTAAATAAT 100 119
MKD39_RS01010  206959 ..  206985 -  -6.7  -3.10164   TTATTTATTACTTAA         TGACACACATA TGCAT CATGTGTATCA         ACAAACACGAGACGT  59 124
MKD39_RS01000 NONE
        nagB  204564 ..  204596 - -15.8  -5.50313   CATAAAATGAAAAAA      CAGAAAGCGGATTG GTTAT CAATCCACTTTCTG      TTTTTGTTTTATGCT 100 51
MKD39_RS00980  201078 ..  201095 -  -5.7  -3.31443   CTTACAATAACCCAA             TTATCAT CTAC ATGATAA              ATGACAAAATATAGT  58 107
MKD39_RS00975  199897 ..  199928 -  -6.5  -2.60075   CTGTTGGCAAGTAAT      GCTACTGCTGGTG GTCCTA CAACGGCAGCAGC       TTTAGCTATCAGTAA  57 214
MKD39_RS00965  197204 ..  197233 - -10.8  -5.74288   ATAAAGAACAAAAAA       GGAGGGAAACAG AATTCA CTGTTTCTCTCC        TTAATATAATTACAT 100 35
MKD39_RS00960 NONE
MKD39_RS00955  195841 ..  195856 -  -2.6   -3.8901   GTTGAAATTATGAAA              GCGA-AT CAT ATCTCGC              CATGTTCTGGAGTTA  51 503
MKD39_RS00940 NONE
MKD39_RS00935 NONE
MKD39_RS00930 NONE
MKD39_RS00925 NONE
MKD39_RS00920  189418 ..  189446 -  -7.6  -5.82172   ATGAATATAAAAAAA        CCTATGATTG TAAAATAGT CAATCATAGG        CTTGAAATGAATTCT 100 78
MKD39_RS00915 NONE
MKD39_RS00910 NONE
MKD39_RS00905  188395 ..  188421 -    -8  -5.14563   TTGGGTATCAAAAAA         CCCCTCACTA GTTGGCG TGGTGAGGGG         ACTGGTGTTTACTAA  91 132
MKD39_RS00840  178099 ..  178134 -  -9.2  -3.16659   AAATAATATATAAAT    TAAGAGCACGCTAA TCTGAAAT TTAGTGTGCTCTTA     TCATTATTATTTAGA  78 32
MKD39_RS00795  164115 ..  164133 -  -6.1  -3.44848   GGGCCCCAGCAAAGA             GAATTTC ATCAA GAAATTC             TACAAGCAAAGCAAG  62 157
MKD39_RS00725  149247 ..  149298 -  -7.6  -4.66625   ATATAGATAAATAAA GATGCCTACAT-ATTGGAATCAA AGCATTA TTGTTCCAAATCATGTAGGCATC TTTGTAAATTTTACT  83 60
MKD39_RS00700 NONE
MKD39_RS00695  142207 ..  142256 -  -5.5  -4.64486   AGTAAAATAAAATAA CAAAAGCACATTGC--A-CTTGAT AGTTA ATCAAGCTTTGCAATGTGCTTTTA ATTCGTTAAGAAAAA  73 23
MKD39_RS00630  125328 ..  125342 -  -3.6   -4.1421   CACAGTAAACAATAA               TGATAA AAT CTATCA               TAATTTTGTCTTAAA  57 144
MKD39_RS00625  124065 ..  124101 -  -7.6  -3.69943   AGCAACATAAATTAA   GGTTCAACGTGCAGTTAA TGA TTAAC--CACATTGAACC   TTTTTATTATGTCTA  71 38
MKD39_RS00575  116223 ..  116255 -  -4.8  -5.03405   AATAGTATATAAAAA      CGCTCAGAATGCAA TAAAT TAGCTTTTTGAGCG      ATCTTTATATCTAAC  74 11
MKD39_RS00550  111931 ..  111960 -  -8.8  -5.27335   TGTTTGAAATAAAAA       GATTCTGAGACTG TAAAT CA-TCTCAGAATC       TTTTTTAATTAATAA 100 30
MKD39_RS00515  104909 ..  104958 - -16.1  -3.48822   GATAACAATGTATAA GGCACCTCGTTAATTTAGC TTAGTGATGTTC ACTAAATTAACGAGGTGCC TAATTTATTGTATTT 100 278
MKD39_RS00500  102238 ..  102262 - -15.9  -5.42265   TTAAATCATAAAAAA          GACTGAAACGA TAA TCGTTTCAGTC          GTAAAATAGCGGAGA 100 35
MKD39_RS00495   99519 ..   99568 - -11.2  -4.48333   ATATACGAATGAAAA TAAGCATCACCTATTATGAAAAGC GAAT GCTTTT--TAATAGGTGGTGCTTA TCATGTTATGACGCA 100 142
MKD39_RS00470   94959 ..   95002 - -10.4  -5.19998   ATAATTAAAATAAAA CTCCCTCCAAGTAAGCTTTGA AAA TCATGGCT-ACTTTGAGGGAG TTAATTATATGACTT 100 69
MKD39_RS00455 NONE
MKD39_RS00450   92031 ..   92071 -  -9.3  -2.78072   AATAAGCAAACGAAG GACGTGGAAC-A-GAATTC TTTAT GAATTCATTGTCCCACGTC TTTTGTCTTTTCTAT  77 58
MKD39_RS00420   86913 ..   86929 -  -6.5  -3.59262   CCTGACATTTTCAAA              GCTGGAG AAG CTCAAGC              ACTTGAAGATGTAGA  64 177
MKD39_RS00360 NONE
MKD39_RS00355 NONE
MKD39_RS00350   73073 ..   73108 - -12.9  -4.15998   ATTGAAACTAAAGAA    GCCAGTAAATGAAGTT GTTAA AACT-CATTTACTGGC    AATTTTAATAGGAGG 100 78
MKD39_RS00310   61778 ..   61791 -  -3.1   -4.2558   CAGGTGGTATTAAAA               CAACG TGAA CGTTA                TAGGGAAGGTAGACT  55 171
MKD39_RS00285   56463 ..   56484 - -13.1  -3.47345   AAGCTTATATGACAA           TCCAACACG ATCT CGTGTTGGA            TTTTTTTAGTGTTAT 100 37
MKD39_RS00255 NONE
        arsB NONE
        arsC   51225 ..   51251 -  -9.5  -4.35044   TGACTTAAATATAAA         GAAACGCTCAC ATTAA ACGAGCGTTTC         TTTGAATTCTTGTAT  88 11
MKD39_RS00210   46099 ..   46126 -    -2  -3.42883   ATAACAAATAATATA        CTCTATTAAGTC CCAC AACTTGAGAGAG         CTTTTTGTATATATT  44 440
MKD39_RS00170   37609 ..   37656 -  -3.2  -5.80817   CGTAAGATAAAAAAA TAAGCATATCACTGTAAACT TTAAAAAATC AGTTTA--GTGATATGCTTA TTTATTTCGAGTTAG  81 82
MKD39_RS00165   36002 ..   36050 -  -6.8  -3.10796   TTTTAGTATGTAACA TGTTAAAGGTAAGTCTACCGTC ACTGA AACGTAAGACTCACCTCTAACT TTCTATTGAGACAAA  62 28
MKD39_RS00160   35480 ..   35530 - -15.9  -3.35912   TACGATATAGATGAA TAACAAAACAGTGAAGCAATCCGT AACG ATGG-TTGCTTCACTGTTTTATTA TGAATTATTAATAAG 100 23
        fabI   32528 ..   32559 - -12.6  -2.71268   CTTTATTATAGATTA      TCATCTATATAGAC AAAT ATCTATATAGATGA       TACTTTTTGCGGTTC 100 3
MKD39_RS00145 NONE
        arsB NONE
MKD39_RS12700 NONE
        arsC   30495 ..   30521 -  -9.5  -4.35044   TGACTTAAATATAAA         GAAACGCTCAC ATTAA ACGAGCGTTTC         TTTGAATTCTTGTAT  88 11
MKD39_RS12690   28404 ..   28440 -  -6.7  -3.28684   AATTATTTAGACGAA    CGACCTACTTACAAA ATTAGTA TTTGTGAGTAGGTTG    TTTTTTTATTTATTG  63 131
      tet(K)   26986 ..   27005 -  -7.2  -3.99374   GTTGATGAATAATAA            TAAAGCGC GTCT ACGCTTTA             ATATCAATGATGGTA  73 25
MKD39_RS12680   25575 ..   25588 -  -4.5  -2.80935   ATTTCACTTATGATA               TGCCG CTAA CGACA                TATCTAGGTCAAGTA  49 14
MKD39_RS12670   23728 ..   23739 -    -3  -4.08546   ATGATTAATCAGAAA                GTTA ATGA TAAC                 TCCGTTCAAAAAGCC  55 136
MKD39_RS12665   22610 ..   22624 -  -3.6  -3.16742   TTTAATCTTTACTAA               TTCATT AAG AACGAA               TAATAAAATATAGAA  47 150
MKD39_RS12660 NONE
MKD39_RS12640 NONE
MKD39_RS12635   17580 ..   17594 -  -4.2  -2.80959   GAAGTTCAAGATAAT               GGCATT GCA ATTGCC               CATGGTTCTAACGAA  48 86
MKD39_RS12615   12186 ..   12217 - -11.1  -3.75169   CAGTAGCCGACTAAA      CTGAGAAAATGCTC TTACC GAGC-TTTTCTCAG      TTTTTTTTTATCCTT  93 133
MKD39_RS12600 NONE
MKD39_RS00035    9313 ..    9342 - -19.5   -4.1552   GATTCCTTCAACAAA       CAAGACTTCCCTG ATAC CAGGGAAGTCTTG        TTTTTATAGCTTATT 100 40
MKD39_RS12595    8047 ..    8082 -  -4.2  -3.38768   TTAGATGATTTAGAA    GATGAAGATTTAATTCC TGA AGAAC-AAATCGTCATC    ACATTGAGCCATAAT  53 72
MKD39_RS12590 NONE
MKD39_RS12550     885 ..     898 -  -3.9  -3.49383   AAAAATCGAAGAAGA               GAATT TAGA AATTC                CTGCTGAAGCTTTAA   0 110
