STP1_RS00030    5824 ..    5859 +  -9.1  -4.64361   TTAAACATGGACAAA    GCCAGTAAATGAGTT TATATT GACCCGTTTACTGGC     TTTTGATATTTTTTA  93 65
STP1_RS00135   26436 ..   26469 + -11.2  -5.73978   CTTATTAAATATTTA     TCGCTTTACTCAAT GTTTTA ATTGTGTAAAGCGA      TTTTTTATTTATGAT 100 45
STP1_RS00140   26982 ..   27016 + -16.6  -4.64861   CTAAATAATATAAAA     AGAGCACCGATTGAAG TGA TTTCAATCGGTGCTCC     TTTATTTTGAGGAAC 100 33
STP1_RS00185 NONE
STP1_RS00190   67542 ..   67568 + -13.9  -5.71712   ATTTATAGACGAAAA         GCACAAACCTT ACTTC AAGGTTTGTGC         TTTTTTTATGTACGA 100 40
STP1_RS00320   94203 ..   94237 + -12.2  -2.86682   ACAAGAATTTAAAGA     GGCGTAGAAGGAATGA TAT TTAAACCTTCTACGCC     ATATTTATTATGATT  93 41
STP1_RS00345   99901 ..   99925 + -15.1  -2.78696   TATAGTATTAAAAGC          GCCCTTGCACA TCA TGTGTAAGGGC          ATTAGTTATTTATAA 100 43
STP1_RS00380  106065 ..  106101 +  -3.3   -4.7339   TGATAATAATAAAAA   CCAAT-GATACTTA TTTGATGCTT TAAGTATCTATTGG    TTTTTAACGTTTATT  64 19
STP1_RS00400  109215 ..  109245 + -12.1  -4.97666   ATAGATATAGCAAAA       GCCATTAAATGAA GGTAA TTCATTTAGTGGC       TTTTTGTAATATATT 100 37
STP1_RS00410  111063 ..  111100 + -12.9  -4.73432   AATACCAAAATAAAA   GCACAAAGATGAAATGA AATT TCAAATCATCTTTGTGC    TTTATTTATATTTAA 100 65
STP1_RS00420  114192 ..  114205 +  -2.3  -3.35813   TGATAATTATATGAG               CACCC ATCA GCGTG                TTCATTACAATAGCA  44 104
STP1_RS00425  115224 ..  115265 + -13.4  -5.59962   ACTAGACATAAAAAA TCATGTCTACA-GTATGAC ATTGA GTCATATTTGTAGACATGA TTTTTATTTATTTTA 100 36
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STP1_RS00555  141287 ..  141327 +  -7.1   -5.1485   ACATATTAAAATAAA GCAGTAGTC-ATCGTTATC AAATA GATT-CGATTGACTACTGC TTTTTGTATTGCTTC  86 44
STP1_RS00565  142761 ..  142806 + -12.1   -5.7946   ATTATTTATGTATTA TGAGTGAAATGTATAAGGC AAATTAAA GCCTTGTACGTATCACTCA TTTTTTTATTCAAAA 100 59
STP1_RS00715  171871 ..  171896 + -12.7  -5.50925   TAATCTATAAAAAGA         CCGAATCACAT GTAA ATGTGGTTCGG          TTTTTTGTGTTAGTT 100 56
STP1_RS00815  190703 ..  190740 + -13.8  -4.49352   ACAAATAATAATTAA   TAAAAGCTAGTTC-ACC TATTT GGTTGAACTAGCTTTTA   TTTGTATTTTAGTAT 100 33
STP1_RS00980  222450 ..  222478 +  -9.7   -4.8048   TATTTAATTCAATCA        TACTGAAACGTGA TAT TGGCGTTTCAGTA        TTTTTAATATAAAAA 100 43
STP1_RS00995  225049 ..  225092 +    -7  -5.63517   TCTAAATAAAAAAAA GATAGCTTGCCTAT-ATGTAG CAA TTACATTATAGACAAACTATC TTTTTTGTTTACAAC 100 32
STP1_RS01110  249044 ..  249086 +  -8.8  -5.09225   TTCAATAATTTAAAA GCTATGAGA-ATCAATACA AAACAA TGTATTAATTTCTCATAGC TTTTTTAAGTAAAAT  95 33
STP1_RS01140  255829 ..  255870 +  -6.8   -5.2204   TGAATAAACTTAAAA GACGTATATC-ACAGCTTT GCAAA AAAGCTTTTGATATACGCC TTTTTATTAATTCTA  88 34
STP1_RS01285  289985 ..  290031 + -10.6  -5.61596   CTAAAAATAAGTAAA TAATTAGCCAGTAAATGATTT ATCATC AAATCATTTACTGGCTT-TTA TTTTTTTATCAAACT 100 48
STP1_RS01330  302803 ..  302849 + -10.6  -5.99154   TTCTTAACTCATTTA CACTAGTTATCTA-TAAAGAC TTACAC GTCTTTAATGGATAATTAGTG TTTTTTTATTTGCTG 100 46
STP1_RS01340  304844 ..  304882 + -22.8  -4.45168   TATCTTTAACATTAT   TAACGCCCTCAAATGAGT AAG ATTCATTTGAGGGCGTTA   TTTATATTTTGAAGA 100 44
STP1_RS01350  306716 ..  306741 + -14.9  -5.40625   AATCATCATTATTGC         GCCAGTAAATG AACT CATTTACTGGC          TTTTTTATATGCTAT 100 67
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STP1_RS01395  316589 ..  316614 +  -7.5  -5.80364   TATGTTTATATTCTT         CACCCTTTCTC TTTG GAGATTGGGTG          TTTTTTTATTCCCAT 100 41
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STP1_RS01415  321318 ..  321332 +  -4.4  -3.14865   ATATATTCTGTAGCT               TTATTA TTA TAATAA               TATGTCTCTTATATT  52 94
STP1_RS01430  324730 ..  324770 + -19.4  -3.07845   ATCAAACAATAAAAT  TAATGCCCGTAAAAATCA AATCA TGATTTTTACGGGCGTTA  TATATAATTATTATT 100 29
STP1_RS01450  327703 ..  327737 + -18.9   -5.2853   TTGCAGAATAAATAA     CAGGTATGGATGAAA TTAGT TTTCATCCATACCTG     TTTTATTTTTACCTA 100 30
STP1_RS01470  332670 ..  332696 + -12.4  -4.24887   AGTTAAATAACAAAA         CCCGGTAATG ATCATTA CATTACCGGG         TTTCTTAAGTATATT 100 35
STP1_RS01485  337128 ..  337139 +    -3  -2.55036   CATTTGATGATATTA                GATT TCAA AATC                 GCTTCTTTTATTAGT  42 0
STP1_RS01490  338637 ..  338680 + -14.2  -3.28265   CTATAACTATAAAAA ATAGCTATGATGAAATCTAT CGTC ATAGATTTCTTCATAGCTAA TCTTAGTATGTTTAT 100 327
STP1_RS01545  352357 ..  352379 +  -4.8  -2.89267   GATAATCATCATATG           CTGTAACCCA TAA TGGGTTGCGA           TGTGCTATGGTTGGG  51 288
STP1_RS01590  361835 ..  361860 + -14.9  -4.16904   ATAAAATCAAAAAAG         CAGAGTCTAGA TTTT TCTAGACTCTG          TTTATATATAATCTT 100 40
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STP1_RS01625  380443 ..  380466 +  -8.1  -5.27779   GGTTAACGCGAAAAA          GAAGGGACC GAAAAA GGCCCCTTC           TTTTTTGATATTAAA  93 44
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STP1_RS01745  401650 ..  401675 +  -9.8  -4.15453   CTTCTATCTACTACA         GGGGGAATGA ATTCAA TCATTCCCTC          TTTTAAAATACCTTC  93 55
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STP1_RS01840  414541 ..  414551 +  -5.4  -4.96848   GACTAAGAAATGAGG                 CATG TTG CATG                 TTTTTATGTACAAGA  75 206
STP1_RS01845  415120 ..  415150 +  -9.9  -5.67967   AGGTTTAAATATAAA       CTGTCAGTCAA CTTATTATC TTGACTGACAG       TTTTTTTATGGTAAT 100 39
STP1_RS01850  416369 ..  416397 + -14.7  -5.22312   GTATGGAAACACCAA        TCCCCTCACTATT TGC GGTAGTGAGGGGA        TTTTTTAGTGTAGCT 100 118
STP1_RS01895  427708 ..  427751 + -15.7  -3.02079   TGATGATATTTCATA AAAAAGCTAGGAAGATTAA TACAAT TTAATCTTCCTAGCTTTTA ATTATTATATTGTTT 100 25
STP1_RS02030  446384 ..  446408 + -10.1  -5.11389   GACGCCTTTTATTAA          TCCAAGACATA ACC TTTGTCTTGGA          TTTTATTTATATTAT 100 102
STP1_RS02035  447835 ..  447870 + -17.9  -4.12037   CAATCCAAACAGAAA    GAAGAGCTTAAAGCA CTAAAA TGCTTTAAGCTCTTC     TTTGTCATATTTATA 100 69
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STP1_RS02115  462885 ..  462932 +  -7.3  -4.42806   CCACTCCATTAATAC GGGGGTGAGTTTAAGAATTCATT TCCA AATGAGTTCTTT--CTCACTCCC TTTCTTTACAAATAA  76 138
STP1_RS02120  464249 ..  464284 +  -6.3  -5.03945   AATCATTAAATTAAA   GGCCAAGTGGAATTGAT AAAC ATCA-T-CCACCTGGCC    TTTTTATAATTATTG  82 39
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STP1_RS02970  630574 ..  630606 + -12.1  -4.43668   TAATTAAATAAAAAT      GAGGTCGAGACAAAA GCT TTATGTCTCAACCTC      TTCTTTATTTATTAG 100 34
STP1_RS02990  634571 ..  634620 + -10.3  -4.76171   AATAATATTTTCATA AAAAATAAGCCAGGATGTTAG CAATGAAA CTAACATCCTGGTTTATTTAA TTTTATAATTTTTTA 100 41
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STP1_RS05220 1056014 .. 1056033 + -10.8   -5.5604   TCAATAATATTTCAT            GAGCACAT CAAT ATGTGCTC             TTTTTTATTGCTTAA 100 34
STP1_RS05225 1057165 .. 1057208 +  -7.6  -5.42164   AAAATATAATAAAAA GGGTGAATACAAACAAAC-TG ATT CATGTCTGTTTCAATTCACCC TTTTTATTATTTATC  95 32
STP1_RS05235 1058545 .. 1058582 +  -9.4   -3.6318   GAGAACACTCAATTA   GATGTGGGATAATG ACATCATTAA CATTATTCCACATC    ATTTTTTAAAAGTTT  84 46
STP1_RS05240 1059478 .. 1059498 + -14.1   -5.4756   CAATCATAATAAAAA            GGTAGGACA AAG TGTCCTACC            TTTTTTGTTACGCTT 100 32
STP1_RS05275 1066371 .. 1066409 +  -6.9   -3.9151   TATCACATATCAAAA  CGCGTTGTAGTG-AT-TCA ATA TGATGTTCACCACAACGCG  TCTTTTATCATTTAA  70 41
STP1_RS05290 1069055 .. 1069084 +  -6.5  -4.30576   CTTTTATATGAAAAA       GCACTCAAGAG CTTTTATA CTCTTAAGTGC        TTTTAATAATACAAA  72 349
STP1_RS05315 1075227 .. 1075277 + -15.9  -3.28979   AATGGAGAAAATAGT TAATATTGAAAAAAGACGTGGGGC CTTT GCCTCACGTCTTTTTT-AATAGTA TTGCCTTATCTGTTA 100 23
STP1_RS05340 1080562 .. 1080594 +  -2.8  -5.75599   TGTTATATTCCAAAC     AAACCCTA-GCAAAA ATTA TTTGGCATAGGGTTA      TTTTTTTATGATTTC  78 54
STP1_RS05365 1084912 .. 1084957 + -16.6  -3.15961   AAATATTGAAAAATA AAGGGTCATATTATTGATTA CACATT TAATCAATAATATGACCCTA TTAAATGATATTTTA 100 59
STP1_RS05400 1092674 .. 1092704 + -12.1  -5.77632   AAATGACGTCGAACG       CTGCTAATAAAGT TTCGT ACTTTATTGGCAG       TTTTTTTATGCTTTT 100 113
STP1_RS05405 1093348 .. 1093385 +  -8.8  -5.90231   TAAAGACATTTAAAA  GGACATTGTTACTGCAAT TGGG ATTGCA--AACAATGTCC   TTTTTTTATATTTAT 100 38
STP1_RS05415 1096658 .. 1096671 +  -8.1  -3.77831   AAATACGTATCTAGC               CAGGC TCTT GCCTG                TTTAAATATTGGTAA  75 484
STP1_RS05425 1097240 .. 1097272 +  -9.3  -4.81852   CGTCAAATGATACTA      TAGACTAGGCTAA TTTATTT TAAGCCTAGTCTA      TTTTGTTACTTATAC 100 18
STP1_RS05435 1100506 .. 1100545 + -20.4  -4.67692   TTTCTAATTTAAACT  GATAACACGATGGAAATG TTAT TATTTCCATCGTGTTATC   TTTGTTTCATTTTCA 100 41
STP1_RS05475 1107567 .. 1107580 +  -3.8  -3.28684   TATAAATGACAACAC               CAGC GAAACA GCTG                TTAATATAGATGATT  49 64
STP1_RS05480 1110158 .. 1110173 +  -4.8  -2.59564   TGTGCCAATTACTTT              TAAGTT ATAC AACTTA               GTTATAAAATGAAGA  50 58
STP1_RS05485 1110435 .. 1110466 +  -4.4  -5.40004   TAAATAAAGATTAAA      ACGGGAGCGA CCTTAATGGGTA TCGCTCCCGC       TTTTTTAATTTACTC  78 34
STP1_RS05530 1122135 .. 1122150 +  -2.6  -5.27779   AGGCGTTGTAAAATG              CTATTT TTAT GAATAG               TTTTTTACTATTGAG  68 94
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STP1_RS05540 1123519 .. 1123550 + -21.8  -3.81137   AACTCATTTAAAAAA      GGCACTCAGTTTCC AGTT GGAAACTGAGTGCC       TTTAACTATTTAACA 100 39
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STP1_RS05565 1126473 .. 1126483 +  -6.8  -3.33037   TTCATTAATGGTGAT                 GGCA AAA TGCC                 TTGGTAATTTCAAAT  65 8
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STP1_RS05575 1128931 .. 1128960 + -11.5  -4.42976   ATACAAGCGATGACG       GCAGTCTTATGAG ATTT CTCATTAGGCTGC        TTTCTTAGTTTGTAA 100 520
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STP1_RS05595 1132842 .. 1132881 + -12.4  -4.68506   ATCTAATTAATATGA  TGACCCAGAGTAAAAGATA TAA TATCTTC-GCTCTGGGTCA  TTTTTAAAATTGCTT 100 35
STP1_RS05605 1134296 .. 1134324 + -10.3  -5.89921   TAATTAATATAAGAA        GGTCGAGACATAA CAT TTTTGTCCCGACC        TTTTTTTATTCTGCT 100 38
STP1_RS05615 1136762 .. 1136791 + -15.1  -4.99947   ATACCATATATTTAA       GAAAGGACCACTC CTCA GAGTGGCCCTTTC        TTTTGTTTAATTAAA 100 40
STP1_RS05655 1144684 .. 1144713 +   -10  -3.66017   CAATAATGTAACAAA       GCCTGGGGCAAG ACACGA CTTACCTCAGGC        TTCATTTCTAATTAT  86 50
STP1_RS05685 1152088 .. 1152125 + -15.8  -5.06089   ATATAAACATAAATA   GAGCCGTTCCACAA TAATTATCGC TTGTGGAACGGCTC    TTTTATTTATAGTTT 100 40
STP1_RS05700 1156367 .. 1156379 +  -6.3  -3.87075   ATTCAAATGAACAAA                CTCAA CTA TTGAG                TTTGTAAGAACTACT  66 221
STP1_RS05705 1158007 .. 1158037 + -17.8  -5.28481   TTACATTGAAAGAAA       CACCTCTAGTGCAT TGT ATGCATTAGAGGTG       TTTTTTAATTAACTA 100 42
STP1_RS05720 1160916 .. 1160955 + -16.1    -3.405   ACTAATTTTCATATT  TAAA-AAAGGTCGTGCAG GAAAA CTGCACGACCTTTCTTTA  TATTATCCTTTATGT 100 36
STP1_RS05745 1166409 .. 1166440 +   -11  -3.78229   TAACAAAACAAAAAA      CTCAACCAAGGC TCATTTAC GCTTTGGTTGAG       TTAATTTTAATTATT  93 56
STP1_RS05800 1181498 .. 1181523 + -14.9  -4.88711   CGAAGATAAGTAAAA         GGCTAAAGGAT ATCA ATCCTTTAGCC          TTTTTAATATGTTAT 100 28
STP1_RS05920 1210526 .. 1210558 + -13.6  -4.39568   AACTTTGATACTAAA      TAATCCGAGATGAG CGTGA CTCATCCCGGATTA      TTTTAATGTATGCAT 100 40
STP1_RS05935 1215102 .. 1215114 +  -6.3  -3.87075   ATTCAAATGAACAAA                CTCAA CTA TTGAG                TTTGTAAGAACTACT  66 271
STP1_RS05975 1223386 .. 1223396 +    -4  -4.27796   CGTTCATGAGTCTGG                 TTTG AAT CAAA                 TTTTCAAATTTCTTC  61 123
STP1_RS05990 1229553 .. 1229596 + -17.8  -4.79053   ACTCGGATTACACCA TTAAAAAGAGCGAGACAAAG TTAA CTTTGTCTCGCTTGTTTTAA TTTATTTTGATCTTT 100 44
STP1_RS06000 1232295 .. 1232322 +  -6.3  -5.72616   CTAAATACCTATTAA        GTGGTGGTGAGT ATTTA ACTCTCC-CCAC        TTTTTTTATATAAAT  95 86
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STP1_RS06010 1236628 .. 1236660 + -13.6  -5.84432   GTAACAATCATGTAA      GCAGGACTTGAG CTATCTATT CTCAAGTCCTGC      TTTTTTTGTGTTGTC 100 69
STP1_RS06015 1237457 .. 1237472 +  -4.8  -4.67353   ATTGTTATTTTAAAC              TAGAAT GACT ATTCTA               TTTTTAAATGAGTGA  70 112
STP1_RS06020 1238060 .. 1238083 +  -8.3  -3.18433   AATTAAACCAACGAT          GAGATTGAT AACTAA ATCAATCTC           TCTCATTTTTAAACT  71 35
STP1_RS06025 1239378 .. 1239417 + -16.7   -5.1383   ATGTCCAAATTAAAA  TAGCCAGTTAATGGGGT TCTAAC ACCGCATTAACTGGCTA   TTTTTCTATATTATT 100 69
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STP1_RS06045 1243137 .. 1243157 + -11.2  -5.63517   GCAAATAATTACACG            GAGGTCAC ATTAA GTGACCTC            TTTTTTATTTGGGAG 100 33
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STP1_RS06070 1247976 .. 1248002 + -15.3  -3.24245   AATACTACATTTAAA         GCGTCGTTCAA AGTCA TTGAACGACGC         TTCCCTTATGAGTAA 100 39
STP1_RS06105 1254773 .. 1254799 +  -8.7  -3.86634   ATTAAATATGAGAAA         CCCTGCTCGAT CACGT GTCGAACAGGG         TTATTAATTAATTAT  78 43
STP1_RS06115 1256953 .. 1256977 + -20.1  -4.16305   TTTTTTACCAATAAA          GGCGTCTCGCA TTG TGCGAGACGCC          TTATTATTTATGAAT 100 89
STP1_RS06130 1262505 .. 1262532 +  -7.1  -4.40561   TGGCGACAGACGAAA        CCAGTACGT GAAGACAAAA ACGTACTGG         TTATTTTTAGGCAAC  76 46
STP1_RS06140 1263641 .. 1263656 +  -6.2  -2.93113   TTGTATATTGGTTCT              GACAAT ATGC ATTGTC               TCATTATCTCTACTT  56 173
STP1_RS06160 1266822 .. 1266859 + -13.7   -3.2594   CGTTTGATATAAAAA   TAACCGGGATAAGTGC ACAGCTA GCACT-ATCCCGGTTA   TCATTTTATTGAGAT 100 42
STP1_RS06175 1269013 .. 1269040 + -12.9  -5.56568   ATATATTAAATAAAA        CGGTTTTCTAC ATATAC GTAGAAAACCG         TTTTTTTCATACTCT 100 40
STP1_RS06185 1271343 .. 1271373 +   -17   -5.8187   TTAAAATATTTAAAA       CAGGCCGTAAAACG ATA CGTTTTACGACCTG       TTTTTTTATTGAGTC 100 41
STP1_RS06190 1272089 .. 1272124 + -13.6  -3.23945   TTAATGTATAAAAAA    TAGCCAAGAATGAT CTACACCT ATCATTCTTGGCTA     ATTTATTATATCGTA 100 37
STP1_RS06210 1274558 .. 1274582 +  -7.9  -5.39721   CTATCATCATTTAAA          GGATTTCGCTT GTA AAGTGAGGTCC          TTTTTTATGTCCTAA  95 88
STP1_RS06215 1276157 .. 1276195 +  -7.6  -5.35721   ATATCAATAAAAAAA   TCATCACCTATACC ACTTATTCTTG GGTAAAGGTGATGA   TTTTTCTTATTCTGT  91 49
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STP1_RS06235 1279704 .. 1279741 +   -10  -5.48163   ATATACAACATAAAA   GCAGTAGTAAGTCATT TTAAAC ACTGACCTACTACTGC    TTTTTTAATTTATTT 100 41
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STP1_RS06250 1282727 .. 1282758 +  -8.8  -4.15029   AATAATTTAAATAAA      CCTGTTCTCCAC AACTTGAA GTTGAGAACAGG       TTATTTATATGGGAT  81 36
STP1_RS06255 1283701 .. 1283712 +    -3  -3.82455   TAGATCCACCATATT                GATA AGGT TATC                 TGTTTTACTATTAAT  52 519
STP1_RS06280 1287400 .. 1287424 +  -5.8  -5.51612   ATAGCAACGTACTGA          CCTTCATC AATCTATCG GATGAAGG          TTTTATTTTTTATAT  86 37
STP1_RS06285 1287985 .. 1287997 +  -3.4  -3.36878   GCGCATGTTATCTTA                GTAC CTCAC GTAC                TTCTAGATACATGCG  49 59
STP1_RS06340 1295187 .. 1295222 +  -7.6  -4.69656   AATAGTAAAATTGAA    GGAGGTTGAGACATAA AGAT TTTTGTCCTGACCTCC     TTTTGTTAAATAGTT  83 36
STP1_RS06345 1296865 .. 1296888 + -10.3   -3.4948   CCAATACAACCATAC          GGGGTGGGA CATAAT TTCCACCCC           ATTTTTCATATCATT  88 125
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STP1_RS06365 1301097 .. 1301115 +  -3.1  -3.74747   CACATGCTTGTTATA             CGTTGAT TTTCC ATCATCG             TTTGATACAACTTGG  52 481
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STP1_RS06880 1422837 .. 1422876 + -10.3  -5.48787   CTCATAACACATAAA TAACTCCCAATCATGCGAT TGTT ATCGC--GATTGGGAGTTG  TTTTTTATATCTTAT 100 34
STP1_RS06890 1425024 .. 1425040 +  -9.5  -3.15366   TTAGTATTTCTTATG              CATGAGT TTC ACTCATG              TATTCCCATTTTAAA  79 364
STP1_RS06910 1430294 .. 1430308 +  -7.2  -2.99584   TAAGATGAGATATCC               CCAATT ATT AATTGG               ATATTTTCTTATAAA  65 45
STP1_RS06915 1431164 .. 1431197 +  -6.7  -4.63089   GACCATATAAATCAA     GCGCAGTACTTAACA ATCA TGTTCTGTACTACGC      TTATTTTTTAGACTG  76 50
STP1_RS06935 1435830 .. 1435868 +  -7.7   -4.1391   TTATAAAAATTAAGA   CCCCTTCTATATT TAAACAAATAGCC AATATAGAAGGGG   TTATTATTCTATTTT  77 45
STP1_RS06960 1440501 .. 1440526 +  -3.3  -2.84195   TCCATTCTTTTTCTC         TACTTCTACGT CATA ACGTAGAAACA          CTTCATTTTGATCTT  44 166
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STP1_RS08155 1700333 .. 1700343 +  -2.6  -3.42078   TAGGATATATTTGTT                 TTTT TAG AAAA                 TTCTGATAGAATATA  45 116
STP1_RS08160 1701364 .. 1701389 + -11.2  -6.01187   ATATAAGTTACCAAA         GCGAAGTCGG GATAGA TCGACTTCGC          TTTTTTTATTTGGTT 100 43
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STP1_RS08175 1703223 .. 1703235 +  -3.5  -3.66742   ACACTACATAGTGAC                TTAAA TTA TTTAA                TTCTAGTTGTTTGTG  50 69
STP1_RS08180 1705003 .. 1705026 + -11.8  -5.02502   TAATATAGTGGAAAA          CACCAATCAC AATA GTGGTTGGTG           TTTTTATGTAATGTA 100 38
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STP1_RS08210 1705941 .. 1705953 +  -3.3  -2.66695   TACCGGTTCGATTCC                GGTCC TCG GCACC                ATCTTTAATAAGCGC  44 12
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STP1_RS08230 1707895 .. 1707907 +  -6.3  -3.07013   TGCGGCTGGATCACC                TCCTT TCT AAGGA                TATATTCGGAACATC  60 16
STP1_RS08235 1711211 .. 1711225 +  -7.2  -4.34008   TAATCAAAATTTATG               TTTTGC GAC GCAAAA               TTATTTTACTTACTA  76 32
STP1_RS08240 1711415 .. 1711430 +    -9  -5.71983   GCGATGAGCCGCATT              GAGACC GCAA GGTCTC               TTTTTTTATGCTTAA 100 53
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STP1_RS08340 1731697 .. 1731707 +  -5.4   -3.4314   GTAAACAATCCATAT                 TGTC TAT GACA                 TCTTATTGCACTTTA  57 103
STP1_RS08345 1732553 .. 1732585 +   -18  -4.57569   TATATTTAAATTACA      TCAAGCCTAGAACA ATTTA TGTTCTAGGCTTGA      TTTTTGAAAAGATAA 100 47
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        rplL 1734036 .. 1734080 +   -14  -3.93984   TAATCACATTCTTTG AGAAGTTAAAAACCCCGTTAT CGCG ATAACGGGGTTTTTAA-TTCA TTTATAGCTAAATTT 100 86
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STP1_RS08365 1738545 .. 1738568 +  -7.4  -2.71097   TAGAATGATAGAGGC          GGAGCGATTT TTAA ATGTCGCTCC           TACCTTTCTAAAATT  62 58
STP1_RS08370 1742279 .. 1742322 + -13.5  -4.49556   ACTGAATAATTGATA TAATGATCAAGAGGTTAGA CTTAGT TCTAACCTCTTGATTCTTA TTTATTTCATAAAAA 100 32
STP1_RS08375 1742678 .. 1742699 +  -6.7   -3.5323   TATATTGAATGAGAA           TTAGTAAGT GTCT GCTTACTAA            ATTTTATTTAACCTT  66 22
STP1_RS08380 1743185 .. 1743211 +  -4.7  -2.78216   AAACCTAAAAATTAA         TTTTTAAGATT ACGTA AATTTTAAAAA         TAATTAATCACAATA  51 26
STP1_RS08385 1743750 .. 1743761 +    -3  -3.52204   CTTTTACCCTGAGTA                TGTT CCGT AACA                 TTGGTTTACCAATAA  49 49
        fusA 1746081 .. 1746114 +  -8.4  -2.64803   CAACTTAATCAAACA     TCTTCTCATGATGGT GAGAA ACTATCATGAG-AGA     TAAATTTGAAAATAA  70 179
         tuf 1747366 .. 1747382 +  -9.4  -6.04953   ATTCGATATATCAAA              GACCCC ATAAC GGGGTC              TTTTTTTATTTCTAT 100 48
STP1_RS08405 1750064 .. 1750084 +  -9.7  -4.86939   TATTCAACAAATAAA            GCACTCGTA TAC TGCGGGTGC            TTTTTAAATTTATTG 100 47
STP1_RS08410 1750709 .. 1750739 +  -4.1   -4.7908   ATAAACAAAATCGCA      GAGATGGTAAAGAC GTTT GTCTA-ACTATCTC       TTTATTTATATTTTT  66 117
STP1_RS08415 1752254 .. 1752284 + -10.7  -4.65458   ATGGCTAATGCGTAA      GAACCACTACATCA TAAA TGAT-TAGTGGTTC       TTTATTATTTCTCTC 100 447
STP1_RS08440 1757838 .. 1757873 + -11.4  -5.38951   AATATTAAATTTTAG    CACTTAGTGAGTTGAA GATG TTGAATTCACTAAGTG     TTTTTTGTATCAATT 100 39
STP1_RS08445 1758975 .. 1758987 +  -6.3  -3.87075   ATTCAAATGAACAAA                CTCAA CTA TTGAG                TTTGTAAGAACTACT  66 220
STP1_RS08455 1763045 .. 1763081 +  -9.8  -5.47159   TAATAAATGTTAGTT   TTACTCCTTCTAAT-TA TTTT TACATTAGAAGGAGTGA    TTTTTTATCTTCGAA 100 61
STP1_RS08460 1764354 .. 1764382 + -13.3  -5.52384   AAATTTTAAATTAAT        GCTAGGAGCCTTT ATT AAAGGTTTCTAGC        TTTTTTTAATAAGCA 100 40
STP1_RS08465 1765283 .. 1765330 +   -10  -3.80929   TTATTAAATAAAAAA GCTCCCGAC-TTTGTGGCCAC TATAGAT GTGGTTACTAATGTTGGGAGC TTATATATTTGGTTT  89 50
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STP1_RS08490 1768903 .. 1768915 +  -3.5  -4.28713   ATATTCATTTTAGAA                TTAAA GTA TTTAA                TTTGTTAATGATATT  59 196
STP1_RS08495 1772667 .. 1772703 + -14.7  -4.91712   TACAATATTTATTAA    TGGTAAAAGCCAGGTTT AAA AAACCTGGCTTTTATTG    TTTTTATAAGTTACA 100 54
STP1_RS08500 1774399 .. 1774427 + -15.5  -4.99861   TAAAGGGTAATAAAA        TTCCCAAGGTACA AAA TGTATCTTGGGAA        TTTTTATGATTACTA 100 38
STP1_RS08510 1777424 .. 1777470 + -12.7  -5.12916   CATATGACAAAATAA AAAATGCAGTGCTTCCAAATAT ATCA AT-TTTGGAAGTACTGCATTTC TTTTATTATTTTCTA 100 26
STP1_RS08530 1780422 .. 1780432 +    -4  -3.37522   GTTTAAAATAAAAGT                 TTAC AGG GTAA                 TTCATTCAATGAGAT  50 63
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STP1_RS08540 1781679 .. 1781703 + -12.3  -5.60993   AATAAATCATATAAA          GTAACTCTCAT GAA ATGAGAGTTGC          TTTTTTTATAGAAAA 100 36
STP1_RS08545 1782439 .. 1782467 +  -3.9  -4.23758   AATAGATAATTTTTA        TGTCAGCGAAG CGTTATA CTTTGTTGGCA        TTTTAAATATCAAAT  58 40
STP1_RS08550 1784656 .. 1784691 + -17.2  -5.13344   TACTTATTAAAGAAA    GGCTAAAAGGTGAAAT TTGA ATTTCATCTTTTAGCC     TTTTTATGTTGCTAT 100 106
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STP1_RS08585 1790157 .. 1790167 +    -4  -4.72272   ATTGGTAACGGTGAA                 TCAA TAT TTGA                 TTTTTAATAAAAAAA  66 8
STP1_RS08590 1790659 .. 1790669 +  -3.2  -4.93365   CGGGTATATGAATAT                 CTCG AGG TGAG                 TTTTTAATTATGGAA  65 116
STP1_RS08595 1792171 .. 1792213 + -15.8  -5.76237   AATCATAAAAATATA GTCATGGTGAGTGAAGAGAG AAT CTCTTTATACTCATCATGAC TTTTTTATTTATATA 100 33
        eutD 1795856 .. 1795870 +  -3.6  -2.78798   ATTACTGCTGCACAG               TCATTA CAA TAATGG               ATTTAGGTAACAAAT  45 14
STP1_RS08620 1796791 .. 1796806 +  -6.2  -3.25072   TAACTATGTGCTTGA              GACTAA CCGC TTAGTC               TTAGCTTATGATGCA  61 107
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STP1_RS08645 1802283 .. 1802320 + -10.2  -3.84183   ACCTTTTTAGAAAAT   TGCCCGTAAAGAAACTA ACGCA TAGTTT-TTTACGGGTA   TATTTTATAATAGAA  89 73
STP1_RS08650 1803062 .. 1803078 +  -2.3  -4.45517   TACTATAACTTAATG              TATTGGG GGT CTTAATA              TTTTATGAGTCGTTT  57 78
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STP1_RS08665 1805704 .. 1805740 + -16.1  -4.70353   AAACCACAAAAAAAG    CTAACCTCGCGATATTA GTA TATTATCGTGAGGTTAG    TTTTAGTTTATTATA 100 39
STP1_RS08690 1810736 .. 1810765 + -10.1  -5.28414   AGACAGGATAAAATG       AGTGGATAAGCTA TTTT TGGCTTATCCACC        TTTTTATATTTATTA 100 264
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        argS 1812959 .. 1812985 +  -8.1  -4.06785   TAAAATGTGATTAAA         CCCTTATAGCT ACTAC GGTTATAAGGG         TGTTTTTATGACTAT  78 43
STP1_RS08705 1813741 .. 1813754 +  -2.5  -2.82987   AGTCATATTGAATGA               TAATT GATA AATTA                TATAATAGATATTGA  41 102
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STP1_RS08715 1814853 .. 1814884 +  -9.6  -5.54907   ATTAAATTCAATCTA      CTGCATTACAAG CTTGTCTA CTTGTAGTGCAG       TTTTTATTTTGTAAG 100 51
STP1_RS08720 1816394 .. 1816426 +  -9.4  -5.06816   TTTGCATACTGTGAA      TATCCTATTACTAT AAAGC ATAGTGATGGGATA      TTTTTATTAAAAAAT 100 73
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STP1_RS08740 1820171 .. 1820181 +  -2.6   -4.0348   GTAATGATGTTGTCA                 TATT AGT AATA                 TTTGTAGTATACTAT  51 96
STP1_RS08745 1820776 .. 1820833 +  -5.2  -4.61868   AATTTTAAATATGAA TAGCCGACAAACTGATGTTGAGTTACTT TTTT AAGTCTCTCAAAAT--GTTTGTCGGTTA TTTTGTGTGTAAATG  70 53
STP1_RS08750 1821807 .. 1821833 + -13.2   -5.1523   TAGTGTTGAAAGTAG         GTCTTCATTTGA TTT TCAAATGGAGAC         TTTTTATATTGTAAA 100 41
STP1_RS08755 1823211 .. 1823262 + -14.1  -2.72461   GATAACGACTTATTA AAAAAGGGATTTTATCACACGTGT TAATT ACACGAG-GATAAAATCCCTTTTG ATTTCAGACACGTTA 100 36
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STP1_RS08820 1833431 .. 1833466 +  -9.8  -4.67563   TTAGATTAGAATAAA    GCTATCGTGTATCCAT AAAA ATGGGTGTGCGGTAGC     TTTTAATTTATATTA 100 45
STP1_RS08825 1836009 .. 1836033 + -18.7  -4.86133   TTAAACAATAGGAAA          GCTCGTGAGGT AAG ACCTCACGAGC          TTTTTCCTGTATATA 100 46
STP1_RS08845 1840026 .. 1840038 +  -4.9  -2.56715   ATAATTTGATTAATA                TATAC ACA GTATA                TAGATTGATCGCAAT  49 188
STP1_RS08855 1841794 .. 1841830 + -11.9  -4.94222   ATGAACATAAGAAAA   GGCAATCA-TGTGTTA TGTAAT TAACACAGTGATTGCC    TTTTTATGGGTTGTT 100 45
STP1_RS08865 1843972 .. 1843999 + -10.8  -5.86976   AAAAGACGCATTCTA        GTAGACCAACGAT GTA AT-GTTGGTCTAC        TTTTTTATTTTATGG 100 55
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STP1_RS08875 1846266 .. 1846280 +  -2.8  -3.16647   TTAAAGAAATAATGG               TCAATC ATC GTTTGA               ATTTTAATGAATAAC  43 29
STP1_RS08880 1846810 .. 1846844 + -12.2  -4.90381   CGTATTTATAATAAA     GGACAAAGCCAAGACG AGA TGTCTATGCTTTGTCC     TTTTATTGTCTTGAA 100 44
STP1_RS08890 1850098 .. 1850125 +   -15  -5.43487   ATTTTATATTATAAA        GCACATACGCTC GGAT GAGTGTATGTGC         TTTTTTGTATAATTT 100 42
STP1_RS08895 1851565 .. 1851605 +  -9.9  -4.77036   TAAAAATTGATGTTA  CACCTTCTATTGCTAGA CTCTTTT TCTAGTAATCGGAGGTG  TTTTTAATGATGAAA 100 43
STP1_RS08900 1852900 .. 1852934 +  -8.1  -5.15634   GATGTTATCCATATA    CCGTTTTAAGT-AGCA AACC TGTTAACTTAGAACGG     TTTTTTGATACCGTA  91 43
STP1_RS08905 1853889 .. 1853904 +    -4  -3.72027   TAGTGACTTATGATT              TATGTC AAAA GGCATA               TTCTTCATAAACAAT  54 0
STP1_RS08910 NONE
STP1_RS08915 1855984 .. 1856016 + -13.7  -4.19704   GTATAAAATATGTAA      TTAAAGTGGCATGTG CGT TACATGTCACTTTAA      TTTTACATGCAATTG 100 35
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STP1_RS08925 NONE
STP1_RS08930 1858083 .. 1858093 +    -4   -2.8499   AATGAAAGTTAAGGA                 TATC TGT GATA                 TGATTAATATTAAAT  46 68
STP1_RS08935 1858672 .. 1858703 + -11.1  -5.19328   TATTTTTAAATAAAG      GTCATTGAAATGA GTCTTA TCGTTTCAATGAC       TTTTTATTGTGAAAT 100 53
STP1_RS08940 1860062 .. 1860094 +   -13   -5.2422   GATTTAATCTTAAAA      GCAATTCATCTTTT TAAAT AGAAGATGAATTGC      TTTTTTAATGTAATT 100 80
STP1_RS08945 1861224 .. 1861258 +   -10  -5.28778   ATAAATAAAGCAAAA     CACCGTAAATCGACCA CTA TAGTCGCATTACGGTG     TTTTTTATACATGAT 100 37
STP1_RS08955 NONE
STP1_RS08960 1863566 .. 1863580 +  -2.8  -2.93357   AAAGTTGGCAAAGGG               TACATG GCG CATGAA               TAATTTAAAATGGTT  41 8
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STP1_RS08975 1867409 .. 1867445 +  -9.1  -3.90889   AATATCAATAAAAAA   GGATTTCATTGTA-AT CATAAA ATGTACAATGAAATCC    TTTAAGTTTATGATT  84 39
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STP1_RS08990 1869967 .. 1869994 + -13.6  -5.31456   CGATTTAAATAGTCA        GGTTGAGCG-GTT AAG AACTCGCTCAACC        TTTTTTATACATTAA 100 55
STP1_RS08995 1870977 .. 1871005 + -12.6  -4.34859   AAGATAATAAAAAAA        CACCAACAAAGT GATGG GCTTTGTTGGTG        TTTATATATTTTGAT 100 103
STP1_RS09005 1872879 .. 1872894 +  -6.2  -3.64703   CATTAAAGATATTCT              TCGATT GGCT AATCGA               TTTAGATAAACAAAA  64 1
STP1_RS09010 1875433 .. 1875449 +  -2.3  -2.82353   ATTTTCAGATATTTA              GGATAAT GTT ATTATAC              GTTGTCTGTTGATAT  40 89
STP1_RS09015 1875857 .. 1875880 +    -9  -5.88197   ATATCTACATATAAG          TTAGTTCCTA ATTT TAGGAGCTAA           TTTTTTTATGTTTAA 100 41
STP1_RS09020 1876726 .. 1876738 +  -4.1  -3.62275   ATGTTCAAAATGTAT                TCCAT AAT GTGGA                TTTAAAATAATGACT  52 3
STP1_RS09025 1877237 .. 1877272 +  -9.9  -5.49569   AAATAGATGAATTTA    GCATACCTATGAG AGCAAACTAA CTCGTAGGTATGC     TTTTTTATGTTAATG 100 35
STP1_RS09030 NONE
STP1_RS09035 1879075 .. 1879089 +  -3.6  -3.81755   ACAGATTCGCTTAAT               GAATAG AGG TTATTC               TTATGTTTAAAGAAT  53 50
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STP1_RS09045 1880818 .. 1880849 + -10.4  -4.64048   TAGGAAATTGAAAAA      TCCCTAAATGAA TGCATAAC TTCATTTAGGGA       TTTGTTTATATGCTG 100 48
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STP1_RS09060 1882864 .. 1882886 +  -4.9  -2.52623   AATAAAGCTGGTACA           GATTAGTCT AATTA AGACCAATC           ATCTTCTAAGCAACA  50 20
STP1_RS09065 1883397 .. 1883428 +  -7.3  -3.82442   TATCTAATATAATAG      CGCGATATGAATC ATAAAC GTTTCATAGCGCG       TTAATTTTATATTAA  71 55
STP1_RS09070 1884042 .. 1884092 + -11.6  -4.74103   AAATATAAAACAAAA CGTCAAGAAGTAGAATGGTTA AATATATGAC TAA-CATTCTACTTCTTGGCG TTTTTCAGTTGGAAA 100 40
STP1_RS09075 1884762 .. 1884773 +    -3  -2.59564   GATGTAGCGCTAGCA                TTGT TAAA ACAA                 CTTATGAAATAGGAG  42 2
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STP1_RS09085 1886119 .. 1886169 + -16.8  -2.72379   AATGAATTAGAAATA TAAATAAAGCCAGAAAATGTAAT TTAATT ATTACATTTTCTGGCTTT-TTTA TAGTTAAGAGATTAA 100 299
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STP1_RS09115 1892532 .. 1892563 + -11.8  -5.04325   ATTACAATACAAAAA      TGCTCTAAAATACT GAGA AGTACTTTAGAGCA       TTTTTATACTTTAAA 100 61
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STP1_RS09130 1895189 .. 1895199 +  -2.6   -3.0264   CAATGGGGCATGACA                 TTTT ATA AAAA                 TGTTAGAAAGGATTT  42 18
STP1_RS09135 1895553 .. 1895593 +  -7.2   -5.2197   GTATTTAATGAAAAA CTCTGTTATTTCAATGTTA TAAT TAAT-TTGAAATAGCGGAG  TTTTTGATTTTTATC  91 4
STP1_RS09140 1896638 .. 1896650 +  -3.5  -3.65542   ATAAGTATATCTATT                TTAAA TAA TTTAA                TATTTTAAAAGTGAG  50 82
STP1_RS09145 1898332 .. 1898359 + -13.5  -5.42259   AATGAAAGATGAATA        GCTTGGCGGTC GAAAGA GATCGCCAAGC         TTTTTTTACGAATGA 100 43
STP1_RS09150 1900310 .. 1900324 +  -5.8  -3.13177   CTTCATAGAATATCT               TTAATG GTT CATTAA               TTAAATATACCGTAT  57 481
STP1_RS09165 1902311 .. 1902334 + -11.8  -5.59962   AAATGATAATAGACG          CCATTCAGCG AAAA CGTTGAATGG           TTTTTATTTATTTTA 100 35
STP1_RS09170 1903125 .. 1903152 + -10.6  -5.38249   TTCACATATGAGATA        GCACATGCTTAC TAAT GGGAGCATGTGC         TTTTTTGTGATTACT 100 25
STP1_RS09175 1903825 .. 1903837 +  -2.7  -4.90917   AATGAATGTTTTTGA                TTGTT TTT GACAA                TTTTTGATTGAATTT  63 140
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STP1_RS09190 1907552 .. 1907580 + -11.2  -5.61881   TGAATAATAGATTTT       TAGCCCTTGTCGT TTAA ACGACAAGGG-TA        TTTTTATTTTTACAA 100 34
STP1_RS09195 1909086 .. 1909101 +  -7.6  -2.60571   TAATATGGAGGTGAA              TCCCTA GAAA TAGGGA               ATTAATTGGAAACTT  65 254
STP1_RS09200 1910478 .. 1910505 +  -7.1  -4.48902   TATCTATGATGAAAA        GACGCTTAAGC TATTAT GTTTAAGTGTC         TTTATTTACGTGTAT  78 47
STP1_RS09205 1911419 .. 1911429 +  -2.6  -2.54193   AGTAGCGATAGGTGA                 TTTA AAA TAAA                 TGAGTTGAAGTAATG  40 16
STP1_RS09210 1912936 .. 1912966 + -10.7  -4.65458   GTGGCTAATGCGTAA      GAACCACTACATCA TAAA TGAT-TAGTGGTTC       TTTATTATTTCTGTC 100 197
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STP1_RS09245 1918181 .. 1918191 +  -2.6  -3.36803   ATCAAATGGAGTAGA                 TAAT GAC ATTA                 TTATGGATAGGATTA  45 69
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STP1_RS09260 1920354 .. 1920383 +  -5.9  -4.62069   ACATCAACAATACAT       TAGCTAGT-TATTG GAC CAATCTACTAGCTA       TTTTTAACGTCAAAA  72 271
STP1_RS09265 1922617 .. 1922644 + -12.9  -6.20267   AATAATTCAATAAAA        CCGAATTGAGT ATAAGC ACTCAATTCGG         TTTTTTTATTTTTGA 100 36
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STP1_RS09280 1927661 .. 1927699 +  -5.3    -4.946   GAATTAAGATTTAAA   CTCGATGTACATCACAT GATAA ATGTGTCTTGCATCGAG   TTTTTCATGTTTAAT  75 60
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STP1_RS09290 1930353 .. 1930399 + -10.4   -5.4148   AGTCTGATAAACATA GCCTCAATG-GTATGGAACAT AATGGA ATGTTTCGTTCTCATTGAGGC TTTTTTGATTCTTTA 100 44
STP1_RS09295 1931583 .. 1931601 +  -3.2  -3.69256   ATTGACGTATTACAA             CATTTTGA ATT TTAAAGTG             TTATATTAGGTAAGT  49 11
STP1_RS09300 1932225 .. 1932278 +  -3.5  -4.62471   AATGATAAATAAAAA CAGGAGCT-AGCC-CTTATCC-TA AAATTGTCG TATGGATGAGTGGTTGAGCTCCTG TTTTTGCGAGTTAGC  62 29
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STP1_RS09330 1940046 .. 1940056 +  -5.4  -3.22909   CCTTGAAATACATAA                 CCTT AAT AAGG                 ATTTTGGTAGTTTAA  56 189
STP1_RS09335 1941113 .. 1941160 + -17.4  -5.71712   ATAATATAGATTTAG CCCTAATTTTACTTTATTTGTG TGGA CGCAATTAAAGTGAAATTAGGG TTTTTTTATGTCAGA 100 37
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STP1_RS09355 1945170 .. 1945203 + -14.1  -4.57516   AAATAAGGAAAGAAA     GCGCTAAAAGCAT TAAATCAT ATGCTTTTAGCGC      TTTTGCTTTGGATAT 100 35
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STP1_RS09380 1948789 .. 1948821 + -12.3  -4.77438   AATTAAATGAGGAAA      GCCATTTTATTAC GTATAGA GTAATAAAATGGC      TTTTTAATAGTGAGT 100 97
STP1_RS09385 1950220 .. 1950257 +   -15  -2.81625   ATAATGATAAAAATA   GCACCCCTAAGTATCT AATCTA AGACGCTTAGGGGTGC    TGATATATTATTGAT 100 37
STP1_RS09410 1955688 .. 1955743 + -12.2  -4.69962   CTAAATATCACAAAA GCTATCTAAAA-CAGAGTCTCGATTTC ATC GTTATTTAGACTCTGATTTTAGATAGC TTATTTTTTAATCTG 100 37
STP1_RS09420 1957410 .. 1957445 +  -9.2   -5.4505   TTAGAATGTTAAGAG    GACATATGGAATTGTT AAAT GACAATTCGGTATGTC     TTTTTTATTGGAGGG 100 37
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STP1_RS09440 1963207 .. 1963230 +  -9.6  -5.09895   TATTATATAGTTGAA          GCCTGAGACA ATGT TGTCTTGGGC           TTTTTTGGGTGCATA 100 56
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STP1_RS09450 1965774 .. 1965806 + -11.5  -4.32583   CTATAGTTTTATATA      GCAGTAACGTAAT TTATATT ATTACGTTGCTGC      TTATTTTAATATTAA  95 54
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STP1_RS09510 1980224 .. 1980282 + -10.1  -3.27523   TGATAAAACTAAAAG CCATG-TCT-CATATATAGAACACATTGT ATA ATCATGTATTCTATATATGAAGATCATGG CTTTCTTCTGTTAAT  83 88
STP1_RS09520 1981236 .. 1981268 +  -9.3  -5.67283   GAAGTTCAACAAAAA      GAAGTCAGGAC AATCATTTAAG GTCCTGACTTC      TTTTTTATTTAAATT 100 69
STP1_RS09535 1984054 .. 1984071 +  -7.1  -3.53733   TCGTCATAGCGATTT             TGATGAA AATG TTCATCA              TCTTTATAACGTGGA  69 287
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STP1_RS09545 1986692 .. 1986722 +  -8.4  -5.25893   AATAAAGCTTATGAG      TAAGCGG-GGAGC ACAAAC GCTTCTCCGCTTA       TTTTTTAATATATGT 100 88
STP1_RS09550 1987988 .. 1988001 +  -2.4   -3.0395   TTTTTCTCAGACATA               TTCG GGAAAA CGAA                TGTTGAAAGATATAT  42 59
        tpiA NONE
STP1_RS09560 1990357 .. 1990384 +  -9.3  -3.41708   ATAGAAAATGTGTTT        CAAATAAGGGA TTTAGT TCCCTTGTTTG         TTAACTTTTCGTTAA  82 44
         eno 1991853 .. 1991880 + -11.4  -4.84274   ATCCTAGAAACATAA        CCCGTTACAG AGTTGAGG CTGTAACGGG         TTTTTAATATGCTTA 100 94
STP1_RS09570 1992437 .. 1992448 +  -4.4  -3.07816   GTCGTATCAATTAAG                CGTA AAAG TACG                 TTCAATCGATAGAAG  50 2
STP1_RS09575 1992764 .. 1992786 +  -4.9  -5.73978   ATCTTGGTTTATAAG          GTCCGACGAT GTTC AT-GTCGGGC           TTTTTTATTTATAAT  83 27
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STP1_RS09685 2011733 .. 2011752 + -12.2  -4.46587   AAATAAATGAAAATA            GAGCAGTC TGAT GACTGCTC             TTCTTTTCTTACTGA 100 35
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STP1_RS09700 2013443 .. 2013461 +  -3.2  -3.09908   CTTTGTATACGAGGG             GGATTTTT ATG AAAGATTC             ATTATTTTGGAAAAA  44 43
STP1_RS09705 2013648 .. 2013661 +  -2.5  -2.58272   AGCGCTTATATTGTT               TATTA AATG TAATA                TCACTTCATAATATA  40 40
STP1_RS09710 2014167 .. 2014195 +  -9.7  -4.93898   TTTGAGTGGTTGACT        TAACCTGCAATTC CTA GAATTGTGGGTTG        TTTTTATACTAGTAT 100 296
STP1_RS09725 2017430 .. 2017460 +  -6.3  -3.90729   CATAGAGAGATATTA      GCCATCCAAAATAT AAAA AAATTTTGG-TGGC       TTTATCCAACTTATT  68 36
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STP1_RS09740 2019530 .. 2019540 +    -4  -3.44848   TTTGATTCAATGAAA                 TTTG TTA CAAA                 TATTTAGTGCAAAAG  50 303
STP1_RS09745 2019788 .. 2019804 +  -8.7  -5.63504   AATAACATTTTCAAA              GCAACCG TCA TGGTTGC              TTTTTTTATGCCATT 100 39
STP1_RS09775 2023219 .. 2023235 +  -3.7  -4.25074   GATAATTTTTGTACA              GTAAGTG AAA CGTTTAC              TTTTAAGATTTAATG  59 229
STP1_RS09795 2024747 .. 2024760 +  -5.3  -4.26792   TTGGTTTAAAGCATG               CCAAA CGTC TTTGG                TTTTAAAATTTATAT  66 56
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STP1_RS09825 2028926 .. 2028957 +  -5.2  -3.10175   TTACAATCTGGACAC      CAACCTG-CTTCG AATTTGA CGATGACAGGTTG      ATTGTTTTGGACAGT  54 376
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STP1_RS09840 2030064 .. 2030086 +  -6.3    -5.626   AATAATATTAGTAAA           CTCCTCGAT CTCGT ATCAAGGAG           TTTTTTTATAGGCTG  95 36
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        glpK 2452113 .. 2452160 + -10.3  -5.67063   AGGAAATCGAGAAAT GAGAGATTTATTCGTACAATTA AATGG TAATTGTG-GGATAAGTCTCTC TTTTTTTATACTAAA 100 119
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