IUJ46_RS00035 NONE
        htpX    7546 ..    7577 +  -3.8  -5.51046   AAGGTTAAAAAACAT      GTGAGCGTTTGGG GTTTTTG CTCAAGC-CTCAC      TTTTTTATGTCTTTG  79 22
IUJ46_RS00045    8514 ..    8531 +  -3.5  -3.58703   TGAAATAGTCTAGGA             TATGAGA TGAA TTTCATA              GTTTTCTTTCTGGGA  50 223
        covR    9456 ..    9486 +  -8.4  -4.27316   AAGCTGTAAATATTG       TTAGAGTTCGTCTT TCT GAGGTGGACTCTAA       TTTTACATTAGAGAA  83 212
        nrdR NONE
IUJ46_RS00065 NONE
        dnaI NONE
         der   14976 ..   15008 +  -8.5  -4.92783   TCTCATCATTGATAA      GGACTGTGTTGTGTA TGT TACAGGAGACAGTCC      TTTTTATAATACCTT  95 79
IUJ46_RS00080 NONE
IUJ46_RS00085 NONE
        murC   20446 ..   20460 + -11.4  -4.58466   TAACCAATAACATGT               CCTGCC TTA GGCAGG               TTTTCTCATTCTAAA 100 31
IUJ46_RS00095   20974 ..   20988 +  -4.2  -3.68738   GAAACTTTAGAATCA               CAGCTG ATT CAACTG               TTGGTTTGTTAAAAA  55 31
        mltG   22648 ..   22694 + -23.5  -3.33696   TGTGAATAGTCAAAT TCAGTAAACACAAACATGGTGC TTAA GCACCATGTTTGTGTTT-CTGA TTCGTTCAAAAAAGA 100 19
        greA   23219 ..   23261 +  -4.8   -4.5477   AATTAATCCGATGAA GCCATTATTTGCCTAACCAC TAA GTGTTTTGGTTGCTAATGGC TTTTCTAGTATCTTC  69 35
IUJ46_RS00130   27417 ..   27429 +  -4.1   -2.6891   GAATCCTCATTTTCA                GCTTG ATT TAAGC                TAATATGATATAATA  47 15
IUJ46_RS00135 NONE
IUJ46_RS00140   28673 ..   28704 + -14.8  -3.02511   AAGAAATGATTAACA      TTAAAAAGTGAGTA TAAC TACTCACTTTTTAA       TGTTAACAGGATAAG  95 28
IUJ46_RS00145   29212 ..   29235 + -11.1  -4.82667   GGGTTTAAAAAGAAA          CTCAGTTGG CTATTT CCAACTGAG           TTTTTCATATCGTCA 100 147
        racE NONE
IUJ46_RS00155 NONE
IUJ46_RS00160 NONE
IUJ46_RS00165 NONE
        xerD NONE
IUJ46_RS00175 NONE
        scpB   34030 ..   34041 +    -3  -4.14013   AGCAAATGGCGTTTA                CAAA AGGA TTTG                 TTTTAAGGCGTTTTA  57 60
IUJ46_RS00185 NONE
        yidD   35164 ..   35178 +  -4.3  -3.38112   AAATAAGCATTCGTT               GGTTT AAATC AAACC               TGTTATGATTTAAGT  53 89
IUJ46_RS00195   35832 ..   35889 + -22.5  -3.73402   ACTAAAATAATGGAC TTTTTAAAAGCGTCAGTTTTTGGCAAC ATGC GTTGTCAGTAGCTGACGCTTTTAAAAA TTTAGTCAAAGCTAT 100 31
IUJ46_RS00200 NONE
IUJ46_RS00205   37397 ..   37435 +  -6.9  -4.72729   TTAAATCATTTAGAA   TAACATTGGCAAGCA TCACCCCCT TGATTGCCAGTGTTA   TTTTAGTTTTAGTTA  83 67
IUJ46_RS00210 NONE
IUJ46_RS00215 NONE
IUJ46_RS00220   40623 ..   40643 + -11.2   -4.7254   CAGATTATTGAGGAA            GACTAGGC TCCAT GCCTAGTC            TTTTTGATGAAAAGT 100 20
        pflA   41511 ..   41527 +  -7.3  -4.67556   AAGAGCTGTTATAGG              GTTGAGG TTT CTTCAAC              TTTTTAAAGTATTAT  83 39
IUJ46_RS00230   42582 ..   42606 +    -5  -4.47873   AAAGACGCTTTAAAA          GGACTTGATT TTTTT GACCAAGTCC          TTTTGTCACTCTTCT  69 44
IUJ46_RS00235   43299 ..   43323 +  -9.4   -4.7329   GCACCATAGAAAAGA          GCTAGGAACA AGGAC TGTTCTTAGC          TTTTTGAGTGCTTTT 100 32
IUJ46_RS00265   50548 ..   50574 +  -5.3  -5.84381   TAATGACACCAAGAA        CGATTTCG-TGA GTGC TTATCGAAATCG         TTTTTTTCTTAATGA  91 43
         upp   51392 ..   51403 +  -4.4  -3.90744   TTGTTTAAAAAATCA                GAGA GATT TCTC                 TTCTTTAAAGGAAAA  59 90
IUJ46_RS00275   52159 ..   52182 +  -6.8   -5.0916   AGGATCTCTGCAAAA          GTATTCTAGA AACT TCTAGGATGC           TTTTTCTCTTAGAAA  84 43
IUJ46_RS00280   53081 ..   53103 +  -4.2   -4.7329   TGGTCCTAAAATAGA          GCACTG-CA AAGATA TGCCAGTGC           TTTTTAGCTCATTTT  70 198
         tmk NONE
IUJ46_RS00290 NONE
IUJ46_RS00295   55037 ..   55053 +  -2.1  -4.32046   GCTATGGACCGTGTG              GCAGGCC ACT GTGCTGC              TTTCGTTTTTGGGAA  57 119
        yabA NONE
        rsmI   56528 ..   56546 +  -2.5  -2.52464   CTTTACCAACAATTT            C-ATGACT TATA AGTCATCG             TAGATTAGGAGAAAA  41 14
IUJ46_RS00310   56968 ..   56994 +  -9.6    -4.323   AACTAAGAGAAAAAA         GACCATCAAT TGGATTT ATTGATGGTC         TTTTAGGTGTTTAAA 100 35
IUJ46_RS00320   58295 ..   58352 + -11.7  -4.62471   TTTAGGATAATGCGA CAAAGTCTCAAAAAAGGACAAGGC AACATTATAAC GCCTTGTCCTTTTTTGGGA-TCTG TTTTTAGAAATTAGA 100 31
        lctO   60837 ..   60850 +  -3.9  -2.72829   ATTAACATTAAACTG               GTTTT AGTT AAAAC                ATTTAGGAGGGTATC  45 257
        scpC   65939 ..   65977 + -20.6  -3.87505   AGGAACAGACATAAA   GACCATAAAAGCAAGCCA GTT TGGCTTGCTTTTATGGTG   TTATTGTCGTGTGCT 100 153
IUJ46_RS00340   67319 ..   67338 +  -6.4  -3.02881   AAGAAAGTTCATTTA            GGGTAAGT TTTT ACTCACCC             TCCTTTGATTGACTG  59 55
        metG   69552 ..   69575 +  -6.8  -5.64006   CTATTATTCAAAAAA          CCTAAGCA AGAACATG TGCTTAGG           TTTTTTTGATTGCCT  89 48
        nrdF NONE
        nrdI NONE
        nrdE   73741 ..   73768 +   -10  -5.44119   CACTCGACCTTTCAA        GACAAGCAAG CATCAGCT CTTGCTTGTC         TTTTTTTGGCCTCAA 100 90
IUJ46_RS00370   75838 ..   75858 + -13.3   -5.2696   CCCTTTAGTAGTCAG            GCCACCTCT GAT AGGGGTGGC            TTTTTTGGGTTTTAG 100 235
IUJ46_RS00375   76184 ..   76218 + -17.4  -3.54129   CGCACGCAATCAACA     GCACAAAAAGCACC CCTGACA GGTGCTTTTTGTGC     TTTAGCCAACCTATA 100 56
IUJ46_RS00385   77905 ..   77926 +    -3  -5.27335   ATCCAGATATATATA           GTAGCAGAG TAATT CTC-GCTGC           TTTTTATTTCAACGC  74 52
IUJ46_RS00400 NONE
IUJ46_RS00405 NONE
IUJ46_RS00410   82137 ..   82160 + -12.4  -5.00884   TTGAAAGACGTGTTT          TCACGAGGGG GAGC CCCCTCGTGC           TTTTTTGGCAAAAAT 100 88
IUJ46_RS00415   83757 ..   83798 +  -9.1  -3.28712   TAGCTAGGCAAATGC CTAAGAAAGACA-GACTT ATTGCTG AAGTCCTGTCTTTTTTAG TTATCACAAGCCGCA  77 38
        glmU NONE
IUJ46_RS00425 NONE
        macP NONE
IUJ46_RS00435 NONE
IUJ46_RS00440   87382 ..   87419 + -24.5  -5.40072   AGCCCCTCAAAAAAA   GAGGCCACACTCATTTA AATT TAAATGAGTGTGGCCTC    TTTTTTTGAGGAGAC 100 65
IUJ46_RS00450   89177 ..   89207 +  -6.2  -5.05113   AAAATAAGATAACAA       TAAAGCACAGCGAT TTT AGTGTTGTGCTTTG       TTTTATTTATGTAAA  83 34
IUJ46_RS00455 NONE
IUJ46_RS00460   90860 ..   90871 +  -2.2  -5.43414   AATAGTAGCAAATAA                CATC AAAG GGTG                 TTTTTTATATGTCAT  74 73
IUJ46_RS00470   94391 ..   94423 + -16.5  -5.69473   GCAGACAAACTAAAA      GAACCTGACGTCTCA TGA TGAGATGTTAGGTTC      TTTTTTTGTGATGTC 100 28
        rplK NONE
        rplA   96326 ..   96350 +  -5.8  -5.42265   AGACAAATTTCTGAA          GACAAATCTT CACTA GAGGTTTGTC          TTTTTTATGGTTTAA  86 76
        pyrH NONE
         frr NONE
IUJ46_RS00500   98884 ..   98900 + -10.9  -5.46657   AATAGGATAAAAATG              CTTTGCC ACT GGCAAAG              TTTTTTGTTACAATG 100 31
        msrA NONE
IUJ46_RS00510   99688 ..   99702 +  -5.7  -4.12198   TACGTGGATAAAAAA               GAGTC ATATC GACTC               TTTTGAAGGGTTATC  66 41
IUJ46_RS00515  101016 ..  101033 +  -7.7  -5.06103   ATGCTATTAAAAAAA             CTCACGT TTAG GCGTGAG              TTTTTTGACAATTCT  88 44
IUJ46_RS00520  103104 ..  103127 + -10.4    -5.243   CTTAGAGTAGTTAAA          GCTGATAAGT TTAG GCTTATCAGC           TTTTTTGATGATTTA 100 46
IUJ46_RS00525 NONE
IUJ46_RS00530  104936 ..  104950 +  -4.2  -2.68719   GATTTACCTAGCATT               CCCATT TTT AAGGGG               CTTGTGGTATAATGG  47 46
        ybeY NONE
IUJ46_RS00540  106027 ..  106040 +  -2.4  -3.25942   GGACAAGACGGTTAA               GCTT AGTGAC AAGC                TTGATCTGAAGCCCT  44 93
         era NONE
IUJ46_RS00550  107542 ..  107557 +    -9  -5.63103   TGAAAGACGATATTC              GAGAGC TTAT GCTCTC               TTTTTTTGCTTCCAA  95 96
IUJ46_RS00560 NONE
IUJ46_RS00565  109223 ..  109245 +  -4.2  -3.89822   TTTGTCGCTTGATTT           CTTTATTGAG TGA TTCAATCAAG           TTTGTAGAGTAAATA  57 378
IUJ46_RS00580  110671 ..  110706 +    -5   -3.3164   GTAGCTTTGGTAGCG    TCATTATTTGTTTTTA TCGA TAAAAGAAAATAGTGA     TTATGCCAATGAATT  54 202
IUJ46_RS00585  111284 ..  111318 +  -8.8  -5.46657   TCATCTTTGCCAAAG     CTCGTCATTTTATATG ATT TATATAGAATTACGAG     TTTTTTGTTAGACTA  95 327
IUJ46_RS00590 NONE
IUJ46_RS00595  113019 ..  113041 +  -3.4  -4.83615   AAGATAAATAAAGAA          GAGGTCAGG GAACTA CC-GGCCTC           TTTTTGTCCGAAATA  68 83
        rgg2  115498 ..  115508 +  -5.4    -4.005   GGGGATGAGGACTGG                 TCTG AGG CAGA                 TTTATGAGTTGCTTT  63 8
        mutM NONE
        coaE  117194 ..  117206 +  -3.5  -2.74523   TTAGCGCATCAAGGG                TTATA TGT TATAA                TAGTATTAAGAGTGA  43 115
IUJ46_RS00625 NONE
IUJ46_RS00630 NONE
        rpmG NONE
        secG  120541 ..  120567 +  -6.6  -5.60993   CAAGTAAATAAGGAG         TGAGCTTGAC AGAGTTA GTCTAGCTCA         TTTTTTTATCAGCGA  89 30
         rnr NONE
        smpB NONE
IUJ46_RS00655  124222 ..  124242 +    -4  -5.44119   TTTAGCACAAAAAAA            CAGAGTTA GTTCA TATCTCTG            TTTTTTTAAAATAGG  79 89
        ccpA  131288 ..  131303 +    -9  -4.74453   TCTTCAATACTAAAA              TCAGCC TTAG GGCTGA               TTTTTGCATGTCTTA  93 89
IUJ46_RS00700 NONE
IUJ46_RS00705  133907 ..  133934 + -10.6  -6.09196   TAAGGTGGAACCACG        CTGATTGCGTCC TTTG GGATGCGGTCAG         TTTTTTTGTTTTGGA 100 243
        thrS  136068 ..  136085 +  -5.5  -5.47159   AATCAATGGCAAAAA             GAGGTCC TTAT GGGCTTC              TTTTTCTTTCTTAAA  84 39
IUJ46_RS00715 NONE
IUJ46_RS00730  138740 ..  138779 +   -14  -3.08961   CAAGGTTTGTCAATA  CCATAAAAAAGTTAAG-TG TCA CAGCTTAGCTTTTTTATGG  TGTCTAATTCTTTAT  93 51
IUJ46_RS00735 NONE
IUJ46_RS00740 NONE
IUJ46_RS00745  142641 ..  142674 +  -5.6  -3.48288   TTAGAAAAATATAGT     TTTGTGATTTTT TATTAACCAC AAAAATCACAAA      TTGTAATATCAATTA  57 115
        yycF NONE
        vicK NONE
IUJ46_RS00760  145611 ..  145643 + -12.1  -5.27399   AGAGAATATGCAAAG      TAGCGCTGATTGGTG ATA TACCAGTCAGGGCTA      TTTTTTGATGTCTTA 100 55
         rnc NONE
         smc  150262 ..  150280 +  -9.6  -5.52909   TGACCAATTAAAAAA             CAGAAGGG AGT TCCTTCTG             TTTTTTTGGATGTTC 100 30
        shp3  151534 ..  151554 + -11.3   -3.3854   TAGGTGTACACTTAA            GTCTTTAGA GTA TCTAAAGAC            TTATAGGTAATGGTT  89 44
IUJ46_RS00785 NONE
IUJ46_RS00790 NONE
        cofE NONE
IUJ46_RS00800 NONE
IUJ46_RS00805 NONE
IUJ46_RS00810 NONE
IUJ46_RS00815  158361 ..  158371 +  -2.6  -4.84363   GTATGTAAGTAAATT                 TATT TAT AATA                 TTTTTGATACTTTGA  66 126
IUJ46_RS00820  160119 ..  160132 +  -2.5  -3.95883   TGATTAACAAAAACA               TTTTT GCGA AAAAA                TATTTTTAAGTAATA  53 34
IUJ46_RS00825  161453 ..  161494 +  -8.9  -6.02919   TTTTTCAAAGTAAAG GCACTAAGTTGATCTGA CTTACACA TCTTATCAACTTAGTGC  TTTTTTTATTTCTAG 100 75
IUJ46_RS00850 NONE
IUJ46_RS00855 NONE
IUJ46_RS00860 NONE
IUJ46_RS00865  165673 ..  165690 +  -7.7  -5.60993   AGAAATATACCGAAA             GCACTTC AAAG GAGGTGC              TTTTTTTGTACCCCA  93 82
IUJ46_RS00880 NONE
IUJ46_RS00885 NONE
IUJ46_RS00890 NONE
IUJ46_RS00895 NONE
IUJ46_RS00900 NONE
IUJ46_RS00905  171723 ..  171755 +  -8.7  -4.44187   GTCTCTACTAAAAAA     TACTCCGTCTTCTA TGAAAC TAGAA-ACGGAGTA      TTTCTGTTTGTCTAT  89 155
IUJ46_RS00915 NONE
IUJ46_RS00920  175010 ..  175020 +  -2.6  -3.93708   TTAGAAGAGGAGAGT                 TAAT GGG ATTA                 TTTGATCGTTTATTT  53 23
        ftsY  176572 ..  176599 +   -15  -4.85129   TTATAACAGCAAAAA        CCAGTCTCGTTT TATT GAACGAGACTGG         TTTTTAGTATGTCAT 100 35
IUJ46_RS00935 NONE
IUJ46_RS00940 NONE
IUJ46_RS00945  182518 ..  182544 +  -8.9  -5.54885   GATAAAACTCAAAAA         GCATTTGTTTT GATAA AAAACAAGTGC         TTTTTTATTAGTCTT  95 83
IUJ46_RS00965  186932 ..  186942 +  -5.4  -2.88822   GCCTATTGCCACCGC                 GTGA CAC TCAC                 TAATTATGTCCAAGA  52 12
IUJ46_RS00970  187360 ..  187375 +  -5.4  -5.07652   ACTTATGGAAAAAAA              TCAGTC GTAA GACTGG               TTTTATTTTGCGAAA  79 16
IUJ46_RS00975  187790 ..  187825 +  -8.4   -4.7629   TTGATATGTAAGTAA    GCGAAGGGTCTTATCA ACTA TGATGAGGCTTTTTGC     TTTTTGACTTAGTAA  86 110
        hprK NONE
         lgt NONE
IUJ46_RS00990 NONE
IUJ46_RS00995  190720 ..  190735 +  -3.3  -6.20267   ACTGAAGAAGGGGGG              GATTG TGGCTT CAATC               TTTTTTTGTTTTTGA  95 117
IUJ46_RS01005  192203 ..  192232 +  -5.8  -3.30159   CGTTAAATAAGTAAT       CCTTGTCTTG AGTGAGTGGG CAAGACAGGG        TTATGACACCATTAC  59 31
IUJ46_RS01010  193590 ..  193642 +  -7.3  -5.77853   TAACAAGAAATACTA GAGGCCCTCTTTTTCCAA--ATGGT ATACG ACCATAGTTGGGAAAAGAGAGCCTG TTTTTTTTGAAAATT 100 41
IUJ46_RS01015  194274 ..  194293 +  -9.4  -2.72661   ACTGTTAATAAACCA            GTCTTCAT GGTA ATGAAGAC             TGGTTAGAGATAATA  72 303
IUJ46_RS01030  197031 ..  197063 +  -6.4  -4.05714   GTTAGCTTTTTTTAT      TATTTTCTAGTGGT TTTAC ACCTCTAGAAAAGA      TTTATCATTCCAAAT  69 118
IUJ46_RS01055 NONE
IUJ46_RS01060  201470 ..  201501 + -16.2  -3.01791   TTAGTAACTATAATA      TAAAATAGACTTGG CACG CCAAGTCTATTTTA       TATTAACCAAGAAGT 100 37
         ppc  206798 ..  206808 +  -2.4  -4.79949   GAATTTTAAAGGTTA                 GCCC TTG GAGC                 TTCTTTTTTTGAGGA  62 91
IUJ46_RS01080  208187 ..  208201 +  -8.6  -4.16943   AATAATATTCTAAAA               TCTCCT TTA AGGAGA               TTTTAGAATATAGAC  85 36
         tuf  209782 ..  209798 + -10.8  -4.87807   CTTAAGTTTGAAGAA              GCCCCC AATTC GGGGGC              TTTTTGCTATCTTAA 100 81
        tpiA  210726 ..  210771 + -22.4  -3.21062   GATTTCCTTAACTAA GTCATCTAAAAAAGAAAAGG TTAAAT CCTTTTCTTTTTTAGATGAC TTAACTCTTACTATA 100 26
IUJ46_RS01115  216465 ..  216491 +    -6  -5.27335   AATCTTAAACAGCGA         GACTTGTTTA AGAAAAA TAAACAGGTC         TTTTTATTTGAACAA  84 184
IUJ46_RS01120  219231 ..  219254 +   -14  -5.67967   TAATAGACGCTAAAA          GGTTTGAGAC AATT GTCTCAAACC           TTTTTTTATAATCGT 100 38
IUJ46_RS01160 NONE
IUJ46_RS01165 NONE
IUJ46_RS01170 NONE
IUJ46_RS01175  229627 ..  229642 +  -3.4  -2.85784   TGGCTTTAGTGCTAG              TAAAAA CGTT TTTTTA               TCATTCATTCAATTA  44 61
IUJ46_RS01180  230867 ..  230884 +  -6.3  -2.91912   AGAAGGATCATAATA             CTGCTTT GACA AAGGCAG              TATCTGAGTCCATGA  58 355
        queG  232335 ..  232364 +  -2.9  -3.90316   GTTGGAATTAATCCG       TCATAAATGGC AATTTTAA GCCTTTTATGG        TATTTTTAAGAACCT  53 7
        prfB NONE
        ftsE NONE
        ftsX  235334 ..  235376 + -19.5  -2.74514   TCAAGAGAAGAAAAG CACCCCAAAAGTTAGATGT TTGAT GTATCTAACTTTTGGGGTG TCATTCAAAATTTAG 100 206
IUJ46_RS01215  239689 ..  239729 + -10.8  -4.74801   TAGTAGAAACGGACT  GTTTTCTGATATAATGGA AAGGA TCTATTATATCAGAAAAA  TTTTTAATGGCGTTA 100 12
IUJ46_RS01220 NONE
        asnS  242601 ..  242635 + -12.5  -3.14931   ATTAGACCCTAATAA     TACAAAAAGTTCATG TCATC TATGAACTTTTTGTA     TTGGTAAGAAGTGAG  91 29
        rapZ NONE
IUJ46_RS01235 NONE
        whiA  245794 ..  245817 + -10.4  -5.71712   TATAGAACATTTTTA          TCGTATGAGC CTTT GTTCATACGA           TTTTTTTGTCTAAAA 100 36
IUJ46_RS01260  249506 ..  249516 +  -2.6  -4.70319   TACCTGTTAAATCGT                 TAAT TAT ATTA                 TTTTGCTTTTGGTAA  65 435
IUJ46_RS01270 NONE
IUJ46_RS01275  251044 ..  251054 +  -5.4  -3.16288   AGTCAATAGAATTGA                 CGTT AGA AACG                 TATTGATAAAGTTTC  55 183
IUJ46_RS01285 NONE
IUJ46_RS01290  251660 ..  251674 +  -2.8  -3.95555   ACAAGTAGCTATACA               TCCGTT AGC AACGAA               TTTATAGATGATTGT  53 65
IUJ46_RS01295  251965 ..  251991 +  -3.8  -4.12198   TACAACTTAACGTTT         TACAAAGTTGTA TTT TACAAAGTTGTA         TTTTACAAAGTTGTA  59 31
IUJ46_RS01300 NONE
IUJ46_RS01305 NONE
IUJ46_RS01310 NONE
IUJ46_RS01315 NONE
IUJ46_RS01320 NONE
IUJ46_RS01325 NONE
IUJ46_RS01330  254618 ..  254629 +  -4.4  -3.87149   GTAATTAAGAGGTTG                CTAG ATGA CTAG                 TTTAGATTTACTCGG  57 14
IUJ46_RS01335  255427 ..  255453 +  -2.4  -2.95113   TTTTTTAATAACCTA         TTGCAAAG TGAAGCTCGGC CTTTGCAA         GTTTAAATTTTCCGA  41 33
IUJ46_RS01340  255915 ..  255929 +  -4.2  -3.05935   TCTTTGAAACCCTTG               GCATTC GCG GGGTGC               TTGAATGAGCAATCT  50 3
IUJ46_RS01345 NONE
IUJ46_RS01350 NONE
IUJ46_RS01355 NONE
IUJ46_RS01360 NONE
IUJ46_RS01365 NONE
IUJ46_RS01370 NONE
IUJ46_RS01375 NONE
IUJ46_RS01380 NONE
IUJ46_RS01385 NONE
IUJ46_RS01390  258981 ..  258999 +  -7.4   -2.6155   CCAATAACGGTATCA             CGCACG TTCGACT CGTGCG             GTTGGTATTGACCGA  63 41
IUJ46_RS01395  259683 ..  259713 +  -7.9  -2.70003   GCTGGAATTAATATG       GAATAATTATGTA CTTTA TATATAATTATTC       ATGTTATTATAGTAC  63 30
IUJ46_RS01400  261134 ..  261150 +  -7.3  -5.89921   AACTGTTTATGGCAG              TCATCAC ATA GTGGTGA              TTTTTTTGTTATGGT 100 15
IUJ46_RS01415  262510 ..  262531 +  -2.9  -2.55545   AATATTCGGAAAATA           CCCCCTTCA TTTT TAAACGGGG            CTATATTGTTCGGAA  41 74
IUJ46_RS01420 NONE
IUJ46_RS01425 NONE
IUJ46_RS01430 NONE
IUJ46_RS01435 NONE
IUJ46_RS01440 NONE
IUJ46_RS01445 NONE
IUJ46_RS01450  267360 ..  267372 +  -5.5   -5.4505   GAAGAAATTTTACAA                GGGCT ATG AGCTC                TTTTTTATTGGAGGA  84 17
IUJ46_RS01455 NONE
IUJ46_RS01460 NONE
IUJ46_RS01465 NONE
IUJ46_RS01470 NONE
IUJ46_RS01475 NONE
IUJ46_RS01480  270796 ..  270816 +  -4.7   -5.3104   TTATGTAATTTTTAA            GGTCGCA GCTTAAA TGTGACC            TTTTATTTTTGATAA  80 33
IUJ46_RS01485 NONE
IUJ46_RS01490 NONE
IUJ46_RS01495 NONE
IUJ46_RS01500 NONE
IUJ46_RS01505 NONE
        hylP NONE
IUJ46_RS01515 NONE
IUJ46_RS01520 NONE
IUJ46_RS01525 NONE
IUJ46_RS01530 NONE
IUJ46_RS01535 NONE
IUJ46_RS01540  283942 ..  283962 + -11.8  -4.23988   TTAGATAAGACAAAT            GCCCTCGC TTTTT GCGGGGGC            TGTTTTTTGGTATCC 100 37
IUJ46_RS01545 NONE
IUJ46_RS01550  285457 ..  285479 + -11.3  -5.33866   TAAATAAAAAACCAA           CCGCTCAGA TAATT TCTGGGCGG           TTTTTTGTGCGTTTA 100 34
IUJ46_RS01570  288336 ..  288355 +   -10  -5.05782   TAATAGTGAAGCTAA            GGCTGAGC AACT GCTTAGCC             TTTTTTACGATAACT 100 38
IUJ46_RS01575  290037 ..  290062 +  -9.1  -5.38054   ATCTTAACTCACTAA         GCAAATCTTCT TTTA AGGAGGTTTGC          TTTTTCTTTGTGGAG 100 40
IUJ46_RS01580 NONE
IUJ46_RS01585  292170 ..  292188 +  -8.8  -5.53436   AGGTCAAAAGAAAAA             CCCTCCTG ATA CAGGAAGG             TTTTTTGTATTGTCT  95 85
IUJ46_RS01600  294383 ..  294402 +  -6.4  -4.92239   ACTATTTAGTAAAAA            TGTCAGGG ACTT CCTTGGCA             TTTTTAGATTTTTAA  83 42
IUJ46_RS01605 NONE
IUJ46_RS01610 NONE
        rplS  296577 ..  296593 +  -9.5  -5.01497   GTAATAGAATAAAAA              GACTAGA GTC TCTAGTC              TTTTTATGTCGTCGT 100 59
IUJ46_RS01620  296879 ..  296895 +  -6.6  -5.62288   ATTGTCACTGAAAAA              GCCTTT ACATC AAAGGC              TTTTTGTTTTATTCC 100 40
IUJ46_RS01635 NONE
        gyrB  300191 ..  300223 + -10.1  -3.33171   GGGACAGCGTTAATG      CATAGGTATTGAG ACCGCCC CTTAATACCTATG      TTAGTCCTTATTAAG  79 148
        ezrA  302170 ..  302188 +  -8.9  -5.17507   TTTTGATACTTGAAA             GTCGTGA TATTC TCACGAC             TTTTTATTAGCTTTT  95 35
         eno  304423 ..  304441 + -13.2  -5.04601   ATTAAAGAATAGAAA             GCTTGGGA AAA TCCCAAGC             TTTTTGCTTTCTAAA 100 164
IUJ46_RS01675  314296 ..  314321 + -14.9   -5.1101   TACTATATTTTCAAA         CCAAGGTGATT TTGA AATCACCTTGG          TTTTTTGGATCGTAA 100 68
        sagA  315428 ..  315467 +   -16  -3.29972   TGATGCTAACGTCTC  AGGTAATTAGCAGGTACT AGAT AGTACCTGCTAATTACTA   TATGTTTAGTAAAAT 100 174
        sagB NONE
IUJ46_RS01695 NONE
IUJ46_RS01700 NONE
IUJ46_RS01705 NONE
IUJ46_RS01710 NONE
IUJ46_RS01715 NONE
IUJ46_RS01720 NONE
IUJ46_RS01725  323453 ..  323491 +  -9.1  -5.00412   TTAGCTAACTACCAG   GTAGCCCTTTTATTG GCTTATATG CAATAAAAGGGTTGC   TTTTTGCTTATATTT 100 71
IUJ46_RS01730  326900 ..  326913 +  -3.1  -3.43217   TGTAACCGTTGCTTT               GCAACC CTT GGT-GC               TTAGTTCCCTTTCAC  48 215
IUJ46_RS01735  327508 ..  327529 +  -4.3  -5.57729   GCATCATACTCAAAA           GAGTTGGGT CAAT ACCCTTCTC            TTTTTTATGTTGTTT  82 45
        ligA  329622 ..  329634 +  -5.5  -2.79327   GATTGAAGATGAAGA                TTGGC TAC GCCAG                CTTTAAGTGAGGTAA  52 7
IUJ46_RS01745  330795 ..  330817 +  -7.7  -5.20216   TCAATTTATTCATAT           GAGGGGCCT ATTTG AGGTCTCTC           TTTTTTGATCATATG  88 144
IUJ46_RS01750 NONE
        atpB NONE
        atpF NONE
IUJ46_RS01765 NONE
        atpA NONE
IUJ46_RS01775  335523 ..  335542 +  -3.7  -2.59927   ATTGTCAGCATTCAA            TTTTATC AATCGA GATAAAA             TGACTTATGGGACTT  45 68
        atpD NONE
IUJ46_RS01785  337512 ..  337522 +  -5.4  -3.86571   AGGATAAGTAAGAAA                 GGTT TTT AACC                 TATTATTTTGTTTAC  61 60
IUJ46_RS01790 NONE
        murA NONE
IUJ46_RS01800  339525 ..  339539 +   -10   -4.8667   TAAATTTACTGGAAA               GTAGGC CTT GCCTAC               TTTTTATAGCATCTG 100 22
        pheS  341592 ..  341619 +  -9.8  -2.91144   GGAAATGACTCAAAT        CACGGCTTGAGA GCTT TCTCTAGCCGAG         TGATTTGGGCACTAA  76 188
        pheT  344053 ..  344071 +  -6.6  -5.84432   ACGCTAAGAAAAAAA             CTGGGCCT CTA AGGCTCCG             TTTTTTTCTGTTATA  95 34
IUJ46_RS01820 NONE
IUJ46_RS01825 NONE
IUJ46_RS01830 NONE
IUJ46_RS01835  346772 ..  346796 +  -8.7  -5.65177   GATATTAGAAAAAAA          CCAAACAAG CACAGCA CTTGTTTGG          TTTTTTTCTAAGTGT  95 60
        rexB NONE
        addA  354814 ..  354824 +  -5.4  -3.12936   AGGATTTTACGAAAT                 GCTT GAA AAGC                 TATTGACCTTTGAAT  54 88
IUJ46_RS01855  355713 ..  355723 +  -2.6  -3.29739   AAGTAATAAGGTTAA                 TAAA AAC TTTA                 TTAGTATCCGTTGGA  45 35
        rpsU  356037 ..  356057 +  -6.9   -5.8096   GGATAAAAAATAAAA            CAGTTCTCA CAA TTAGAACTG            TTTTTATTTTTTATC 100 42
        dnaG NONE
        rpoD  359567 ..  359599 + -14.3  -2.71497   AAGAGACTTTATAGA      GGACTAAAATCGTCC AGT GGACGATTTTAGGTC      GTTCCTTTGAAATAA  93 19
IUJ46_RS01880  360162 ..  360176 +  -2.8  -3.72302   ATCATTGATAGTAAA               GGGATG AAA TATTCC               CTTTTTTGATGTAGA  51 40
        rfbD  361152 ..  361175 + -11.8  -4.78764   TAAGTATTCTAAAAA          GAGTTGGCTT TCTA AGGCCAACTC           TTTTTCATGGGTTTA 100 38
IUJ46_RS01890 NONE
IUJ46_RS01895 NONE
IUJ46_RS01900 NONE
IUJ46_RS01905 NONE
IUJ46_RS01910 NONE
IUJ46_RS01915 NONE
IUJ46_RS01920  370705 ..  370727 +  -4.3  -2.80946   TAATTCTTAAGGTCT           TATTCGTTT ATAAA AAATGAATA           CTCTTTTAAAATCTT  48 140
IUJ46_RS01925 NONE
IUJ46_RS01930 NONE
IUJ46_RS01935 NONE
IUJ46_RS01940  374577 ..  374615 + -10.6   -4.5265   AAACTCTTAATTAGA   GGCTTTAAAAAACTTA GCTTGAA TAAGTATTTTAAAGCC   TTTTATGCTATAATT 100 39
        pepT NONE
IUJ46_RS01950  376392 ..  376413 +  -5.1  -3.90112   CAGCATGATAAAAAA           GCCCTTACT CGAG GGTAAGAGC            TTTAGTTGGGCAAGA  62 8
IUJ46_RS01960 NONE
         cmk  377923 ..  377946 + -13.2  -4.40526   TGGAATATTATGTGT          GCGGGCTTGA TTTA TCAAGTCCGC           TTTCGTTTTTCTCTA 100 135
        infC NONE
        rpmI  378728 ..  378762 +  -2.3  -3.61774   AACGTATCAAAGCAA    TGGTTACTGGTCTTTA ATTT TAAAGGC-AGTAGACA     TTTACGAGTATTATA  47 9
        rplT  379228 ..  379246 +  -6.7  -5.22006   AGAAACAAAAATGAA             GGAGACG ATGGA CGTCTTC             TTTTTATTATACTCA  85 91
IUJ46_RS01990 NONE
        aroD  383622 ..  383673 +  -4.9  -2.95166   TCTCTAACTAGTGAA TGGTCTAAAAATATTATTTCT ACAATAGTTA AGAAATGATGTTTTTAGATTA ATGTTTTTAAAATAA  51 30
        aroC  384881 ..  384893 +  -3.3  -4.52047   AAGCAATTTTAGATA                GCGAG ATA CTGGC                TTTTATGGTATCATA  62 29
IUJ46_RS02005  385302 ..  385329 +  -3.5  -5.34055   AAGATAGGAAAAAAA        CAGATTGCTGGC AGCTC GTCAG-GATCTG        TTTTTTAGTGTTTAT  74 48
        gorA  386879 ..  386924 +  -4.9   -5.4833   TAAGGCAATAAAAAA TGATGTTAACAGTTTTTGAGGA AAG TCTTCTA-AACTGCTAGCATCG TTTTTTGTTAGGTGA  83 52
IUJ46_RS02025 NONE
        thiI  391335 ..  391348 +  -3.1  -5.15634   TGATACTATTGAAAA               GCCTCT ATA AG-GGC               TTTTTTGCTGCAATG  71 79
IUJ46_RS02035 NONE
        rplU NONE
IUJ46_RS02045 NONE
        rpmA  393820 ..  393847 +  -8.4  -6.11229   AACATCGCATTATAT        AAGGCTTTCCAG GTGT CTGGAAAGCCGA         TTTTTTTATTTTGCT 100 47
IUJ46_RS02055 NONE
        lspA NONE
IUJ46_RS02065  396737 ..  396756 + -10.8   -4.2793   CTATATTTTGCTGAA            TCTCCTTG TTTC CAAGGAGA             TCTTTTTATTTGAAT 100 367
        pyrR NONE
IUJ46_RS02075  398571 ..  398593 +  -2.7   -3.9461   TCATCTTATATCAGG           TACTTCCTG AAAAA TAGGAAGAA           TTGTTGTTAGACCAC  53 9
IUJ46_RS02080 NONE
IUJ46_RS02085  400900 ..  400916 +  -4.4  -3.79849   GAGAAGTGCTGACTT              TACCGC TTCTT GTGGTA              TTCTTGGTATCATTA  57 216
        carB  404124 ..  404149 + -10.7  -5.55698   TAAAAATTAAAAAAA         TCATTTTTAAG AAAA CTTAAAAATGA          TTTTTTTAGATTATA 100 38
IUJ46_RS02095 NONE
IUJ46_RS02100  406277 ..  406288 +  -2.2  -3.67597   TCACAACGGATACTA                CAGC TAGT GTTG                 TTATTGACTAGGAGG  47 3
IUJ46_RS02105  407712 ..  407741 + -12.3  -2.57564   GTGATACATCTCTTA       TTTCTAGCTGAAC TTCG GTTCGGCTAGGAA        GTTGTCAGGCAATGA  86 206
IUJ46_RS02110  409521 ..  409565 + -18.3  -2.63636   TAGTCTTTATTAAAG GTTTAAGGAAAGTGTCAAG AAAAAAA CTTGACACTTTCTTTAAAC TGAGTTATACTGTTT 100 28
        rpsP NONE
IUJ46_RS02120  410192 ..  410216 + -15.9  -4.65895   GAGATGGATTGAAAA          GCTTGTTGACT TAA AGTCAACAAGC          TTTTTGAATAGCAAA 100 51
IUJ46_RS02125 NONE
IUJ46_RS02130  414575 ..  414623 + -22.9  -3.70511   AACGCTAAAAAACAA GCATACTCTTTTTTACAGCATAG TGA CTATGTTGTAAAAAGGGGTATGC TTATTAGGTGCTCTT 100 76
IUJ46_RS02140  416237 ..  416250 +  -5.3  -3.04322   GAGCTCATAAAATAA               TGACT AGTG AGTCA                TCTTGCCAAATTCAA  54 26
        rimM NONE
        trmD NONE
IUJ46_RS02155  418707 ..  418718 +  -4.4  -2.53346   AAGTTTCAAGAGCAG                TAGC AACA GCTA                 ATATTCAGTTTGTCA  47 50
IUJ46_RS02160 NONE
IUJ46_RS02165  420874 ..  420905 +  -9.6  -5.58179   TATCAAATCGTTATA      CTCAATATTATGGC TAAA GCTTTAATATTGAG       TTTTTTGTTATGCTG 100 45
IUJ46_RS02170 NONE
        pfkB NONE
IUJ46_RS02180  424703 ..  424724 +  -8.1  -5.23316   TTTTTCTTACTAAAA           CTAGAATCT GTCA AGGTTCTAG            TTTTTTGCTATACTA  90 54
IUJ46_RS02185 NONE
IUJ46_RS02190  426291 ..  426323 + -19.5  -4.74084   TCTATTTTAAGTAAA      GGATTTAGTTCTGTA TTG TACAGAACTAAATCC      TTTTAGTTTTACTTT 100 91
IUJ46_RS02210  428913 ..  428924 +  -2.2  -5.59357   GGTGCAGTACAAGAC                CACT AACG GGTG                 TTTTTTTGGTATAAT  78 63
IUJ46_RS02215 NONE
IUJ46_RS02220  430400 ..  430429 +  -5.1  -3.10641   TGTGATAGAACCCAA       TTAGCCTAATC ACACTTTA GATTGGGCTAG        TTGGATGATAGGTTA  52 94
IUJ46_RS02225 NONE
IUJ46_RS02230  433902 ..  433947 + -16.4  -3.80625   CTTAATGTCATACAA AAACACCCCAAACGTTAGAT TTTTTT ATCTAACGTTTGGGGTGTAG TTTACATTATGGCGC 100 389
IUJ46_RS02235  434245 ..  434258 +  -4.5  -2.95994   AGAACTTATTAACAA               TCTGC TGAT GCAGG                TCAATTTTTATTTGG  48 96
IUJ46_RS02240  434848 ..  434868 +    -4  -5.40072   TAATTTAACAAAAAA            CCTAGAGT AGGAC GCTTTAGG            TTTTTTTGGCAAAGA  79 33
IUJ46_RS02250 NONE
IUJ46_RS02255 NONE
IUJ46_RS02260  439783 ..  439799 +  -9.4  -4.71482   ATAAACGATGCTTAA              CCAGCC CATGA GGCTGG              TTTTTAACGTTTAAT 100 92
         mvk NONE
        mvaD NONE
IUJ46_RS02275 NONE
         fni  443970 ..  444000 + -17.1  -3.85509   GAAATAAAGATTAAA       CACCCATGTAAAC CAATT GTTTACATGGGTG       TTTGCCTTATATTAG 100 199
IUJ46_RS02295  447529 ..  447551 +  -6.4  -3.74872   ACTTTATTTAGATTT           TTTGTGAGCA TTT TGTTCATAAA           TTTGGTAAAATAAAT  66 41
IUJ46_RS02300 NONE
IUJ46_RS02305 NONE
        clpX NONE
        yihA  450278 ..  450295 +  -4.1  -5.18726   TTATCTATGCTAAAA             CATTCTC AGTA GAGGGTG              TTTTTCTTATCGAAA  76 55
IUJ46_RS02320  451233 ..  451250 +  -2.7   -5.1925   CACTAGTTGTCCTTC             TTTTAGG ATTG CCTGAAG              TTTTTTGACTTCTGG  75 119
        rpiA  454343 ..  454355 +  -4.8   -2.7555   TACTGTTTTAGAAGC                GCCT ACAGC AGGC                TAGTCTTAGCATATA  50 10
IUJ46_RS02335 NONE
        arsC NONE
IUJ46_RS02345  457000 ..  457027 +    -2    -3.543   AAAATAATCACGGAG        TGTGAGTTCCAT GAAT GTTGAACTCAGA         TTCTAGCTTTTCTAA  47 127
        deoD NONE
IUJ46_RS02355  459470 ..  459480 +  -3.2  -4.45544   TCTCAAGTCGTCCAT                 GCTT AAT AGGC                 TTTTAGTTGCTAGAG  62 440
IUJ46_RS02365  461003 ..  461026 + -12.4  -4.81685   TTTTAGTTTGCTGTA          GCCTCGCTTC TTTG GTAGCGAGGC           TTTTTGGTGCTTAAT 100 231
        pyrF NONE
        pyrE  462505 ..  462523 +  -3.2  -4.38744   CTCTTTAGCCCCAAT             TCAAAATG TTA TGTTTTGA             TTGTTTTGTCTACAT  60 77
IUJ46_RS02380  464084 ..  464104 +  -5.5  -2.80074   TTTGAGGCAGCAGGA            TTATTGAAG ATT CCTCAATAA            TAATCTTATAAAACA  52 5
IUJ46_RS02385 NONE
IUJ46_RS02390  465787 ..  465815 +  -9.7  -4.33928   TAAAAAACGAATATT        AACCCTGGAAATA TCA TATTTTCAGGGTC        TTTCTATTTAAAATG 100 48
IUJ46_RS02395  466536 ..  466557 +  -2.2  -2.76492   GGCATGACTGGCGTA           GATTGGCT AAAATA AGCCAGCC            ATTTCAACTAAATAG  40 11
IUJ46_RS02400  467972 ..  467996 + -13.7  -4.33767   AGTTAAAACAAAAAA          GCTTGACTTTC AGA GAAAGTCAGGC          TTTTAGTAAATTTAT 100 47
        parE NONE
        parC  473280 ..  473305 + -10.7  -4.49344   GGTAGCTAGAACACG         TTAAAAAGAGT GAAA ACTCTTTTTAA          TTTTATGATAAATTT 100 22
IUJ46_RS02420  474435 ..  474450 +    -9  -5.50313   GTAGATTAAAATAGA              GCTTGC TCTT GCAAGC               TTTTTTGATTTTGTG  95 32
IUJ46_RS02425  474750 ..  474775 +  -7.8  -3.61517   ACACTTGCCAGCTTA         CAAAAACTAT GATAGA ATAGTTTTTG          TTGTTACGGAAAGAT  71 53
IUJ46_RS02430  474878 ..  474893 +  -4.8  -4.52589   ATTTCGGAAACTAAT              CTAATT AGAA AATTAG               TTTTCTGTAAAAAAA  69 40
IUJ46_RS02435  475075 ..  475090 +    -9  -4.64334   ATATTGTTATCAAAA              GCTAGC ATTG GCTAGC               TTTTGTTGGAGGATT  89 111
        rpsA  476325 ..  476354 + -15.3  -3.79995   GAATTGTAATAAATC       TAAAAAGTTGAGG TTTT CCTCAACTTTTTA        TTGTCTTCTGGTTAG 100 32
IUJ46_RS02445  476728 ..  476738 +  -5.4  -4.58663   TAATTAATGATGAGA                 TGGT GAA ACCA                 TTTTTAGCAAGTGCT  71 248
IUJ46_RS02455  478363 ..  478382 +  -7.2  -5.31275   CCTAATATCTCAAAA            CAAATCAG GAAA CTGGTTTG             TTTTTTGTGATACAG  89 36
IUJ46_RS02460 NONE
IUJ46_RS02465  480378 ..  480401 +  -3.1  -5.29445   ACGCGCAGCTTTTTT          GCGGTTTTC TTCAAT GAAAGCAGC           TTTTTCTTCTTCAGG  76 176
        miaA NONE
        hflX NONE
IUJ46_RS02485 NONE
         rnz NONE
IUJ46_RS02495 NONE
        recJ  487479 ..  487498 +  -2.2  -3.82665   AATAATGTCAGAAGT            CTTATTTT ACGA AAAATATG             TTTCGTGATATAATG  50 96
IUJ46_RS02505  488120 ..  488141 +  -3.1  -4.41047   ATTTAAAGTAGTAAA           GGCTATAGAT TCG ATTT-TAGCC           TTTTGATTGAGGGAT  60 68
IUJ46_RS02510 NONE
         nth  489478 ..  489506 +  -7.5  -5.61596   ATCAAGATACTTATG        GAAAATCGAAAGC CTA GCCTTTGGTTTTC        TTTTTTTATGGAGGT  93 9
IUJ46_RS02520 NONE
IUJ46_RS02525 NONE
IUJ46_RS02530 NONE
        rfbA NONE
IUJ46_RS02540  493715 ..  493730 +  -2.6  -3.61654   AACAACATACTCAGA              TGATTG GGAT TAATCA               TTTGAGGTGGATATG  48 44
        rfbB  494990 ..  495029 + -19.7  -4.39386   AAATAAAACATTAAA  GAACCTTGTCATATCAA CGATAA TTGATATGACAAGGTTC   TTTTGATAGTTTAAA 100 35
IUJ46_RS02550  495717 ..  495731 +  -4.2  -3.19157   TATCATTTTCCCAAA               GAAAGG AAC CCTATC               TTAATGCCCTTAATA  51 65
IUJ46_RS02555 NONE
IUJ46_RS02560  498159 ..  498196 + -13.6  -5.32565   ATCAGAATAAAAAAA   CAGTTCTCCTAGGGGA AATAAC TTTCCTAGGAGAGCTG    TTTTTTAGTTGCTTA 100 31
IUJ46_RS02570  501331 ..  501349 +  -3.2  -2.63623   AACGGTTATTTTTAT             CATTTTTA GTT TTAAAATG             CTCTATTTTAGACAC  43 140
IUJ46_RS02575 NONE
IUJ46_RS02580  503200 ..  503224 +  -6.5  -5.38497   AATCAACGATCTAAA          TCATTGACTAA TAA TAAGTCAGTGA          TTTTTTGATTTCCAT  85 39
IUJ46_RS02585  505061 ..  505088 +  -9.3  -4.19735   CGTTAGTGAAAATAG        GAAGGTTAGGCA AAAAC TGCCTA-CCTTC        TTTGATTTTAACAAC  89 35
IUJ46_RS02590  505959 ..  505971 +  -4.1  -2.87051   ACCAAAAAGAAGAAA                GGTTG TCT TAACC                ATTTCCTAGTACAAC  48 15
IUJ46_RS02595  506336 ..  506347 +  -2.2  -4.54306   ACTAGGCTGAAAATG                TCCT CAAA AGGG                 TATTTTTTTGTTAGA  59 36
IUJ46_RS02600  508282 ..  508308 +  -7.5  -4.94992   ATAGAATCATAAAAA        TAAGCTTTAGCA GTTT TGCTAA-GCTTA         TTTTTATCGCTTTGC  88 29
IUJ46_RS02605 NONE
IUJ46_RS02610  510697 ..  510736 +  -5.9  -3.17219   TATCCCGTGTCGCGG CA-CCTCACCTTTCGTATG TTTT CGTA-GCAAGGTGAGGATG  TTGATGGCGCTTATC  59 134
IUJ46_RS02615  512441 ..  512455 +  -7.2  -2.52464   CGTGGGTGCGTCAAC               GAAATC AAA GATTTC               TGACTTACCGCAAAA  60 284
        lpdA  514351 ..  514390 + -16.7  -4.98522   CACAACTATGAACTG  CACCCCAAACGTTAG ATATAAAACC CTAACGTTTGGGGTG   TTTTTGTATGACATT 100 104
IUJ46_RS02630  518653 ..  518664 +  -4.4  -3.78958   AAGCGAACTATCGTG                TCCT ACTT AGGA                 GTTTTTGTTTGATGA  57 93
        cdaA NONE
IUJ46_RS02650 NONE
        glmM  524205 ..  524232 +  -9.2  -4.94222   GTCAACAATTGGAAA        GAGGCTTGGG GCGTTTAG CCCAAGTCTC         TTTTTATAAATTGTT 100 82
IUJ46_RS02660 NONE
        hemW NONE
IUJ46_RS02670 NONE
IUJ46_RS02675 NONE
IUJ46_RS02680  528315 ..  528335 + -10.5  -5.72207   CTAAAAATGATAAAA            CAAGCGTTT TGA AAGCGCTTG            TTTTTTTGGTTTGCA 100 66
        cas9 NONE
        cas1 NONE
        cas2 NONE
        csn2  534874 ..  534894 +    -4  -5.95539   TAGTTTGTGTGTGAA            TATGCGCT TTTGT GGCGTATA            TTTTTTTGTTTCCAA  90 180
IUJ46_RS02715  537639 ..  537650 +    -3  -4.48449   ATCTGCCAAGAAAGG                CAAT GACA ATTG                 TTTATGTTTTAGTAG  62 85
IUJ46_RS02720 NONE
IUJ46_RS02725  538777 ..  538789 +  -4.1  -4.79949   TGATAAGTTTGGCAT                CTCAG AAG TTGAG                TTATTTTTTTAAAAC  70 1
IUJ46_RS02730 NONE
IUJ46_RS02735  539887 ..  539909 +    -2  -4.39998   TCAAAAAATTTAACA           CCATCAAT TTCAGTT ACTGATGG           TTTCTTGTATGGATG  59 62
IUJ46_RS02750  540607 ..  540618 +    -3  -2.76046   GGTCTGACGACATTA                TTAG GGCT CTAA                 TGGTATTGAGATTAA  43 65
IUJ46_RS02755 NONE
        dnaB NONE
IUJ46_RS02765 NONE
IUJ46_RS02770 NONE
IUJ46_RS02775 NONE
IUJ46_RS02780 NONE
IUJ46_RS02785  544692 ..  544714 +  -6.4  -4.32436   TGTGAGAAAGATACT           GACAAAAATT GGA AATTTTAGTC           TTTTGCTCATCCTCT  74 36
IUJ46_RS02790  545083 ..  545096 +  -2.4  -3.54424   ATGTCAAAGTGAATA               CTGA AAGCAC TCAG                TTTACGGGAATAAAA  47 125
IUJ46_RS02795 NONE
IUJ46_RS02800 NONE
IUJ46_RS02805 NONE
         ssb NONE
IUJ46_RS02815 NONE
IUJ46_RS02820 NONE
IUJ46_RS02825  547419 ..  547440 +  -9.5  -5.18355   ATTATTTCTAAAGGA           GACAAGAGC AAAT GTTCTTGTC            TTTTTACTTTTTAGG 100 134
IUJ46_RS02830  548025 ..  548038 +  -8.1  -3.11522   AATAGATGATGCTGT               GGCTG ATTT CAGCC                TGTAATATTTTTTTA  68 7
IUJ46_RS02835 NONE
IUJ46_RS02840  548953 ..  548966 +  -2.4  -4.10429   CAATTTAAAAAGGAA               CATG ATTATC CATG                TTTTAAAAAATAATT  54 215
IUJ46_RS02845 NONE
IUJ46_RS02850  549720 ..  549735 +  -4.7  -2.77781   AAAGGACACCCCCCG              GTCGA AAAAAA TCGAC               TCAATTTTGCTGCCG  51 56
IUJ46_RS02855  550125 ..  550137 +  -3.3  -2.70452   AAATAATACCAATTT                TGCGG ACC CCTCA                GATTTTCTTTAGGAG  43 1
IUJ46_RS02860  551899 ..  551912 +  -6.7  -5.64274   TGGTATTAATAAAAG               CACCT TTTT AGGTG                TTTTTTTATAACTCA  89 32
IUJ46_RS02865 NONE
IUJ46_RS02870 NONE
IUJ46_RS02875 NONE
IUJ46_RS02880 NONE
IUJ46_RS02885 NONE
IUJ46_RS02890 NONE
IUJ46_RS02895 NONE
IUJ46_RS02900 NONE
IUJ46_RS02905  557418 ..  557437 +  -6.4  -3.11936   AAAAATCCTAAGCCC            AGTCAGCT CTAC AGCTGACG             ATTTTGGGCTTGATC  59 30
IUJ46_RS02910  557994 ..  558010 +  -8.7  -4.32046   GGACAGTTAGGATAA              GGTCTCG TTT TGAGACC              TTTGATTTTTAGGGA  89 208
IUJ46_RS02915 NONE
IUJ46_RS02920 NONE
IUJ46_RS02925 NONE
IUJ46_RS02930 NONE
IUJ46_RS02935 NONE
IUJ46_RS02940 NONE
IUJ46_RS02945 NONE
IUJ46_RS02950 NONE
IUJ46_RS02955 NONE
IUJ46_RS02960  570857 ..  570880 + -10.3   -5.4492   CAAGATAAGACAAAA          CCGCTCAGA TTAATT TCTGGGCGG           TTTTTTGTGTGTCTA 100 80
IUJ46_RS02985  572827 ..  572850 +  -6.8  -5.54894   AATCCATAAATTAAA          CAGACT-GCAG TTT TTGCCAGTCTG          TTTTTTTAGTCCATT  87 116
IUJ46_RS02990  573533 ..  573549 +  -2.2  -4.42238   TAAACTTAAAGCTTA              CATGAC AAGTG GTCCTG              TTTTAATTGGGATAA  57 441
        lepA  575809 ..  575825 +  -5.3  -3.39274   CATTCGCACATAATG              TTATAAT AAT ATTATAA              TGTTATCTCATTATT  57 131
        slc2  576819 ..  576840 + -13.1  -5.08824   GGAAAGTAAAACTCA           GAGAGAACC TCAA GGTTCTCTC            TTTTTTGAATCAAGA 100 65
        msrB  577472 ..  577484 +  -6.3  -2.94218   GGTCAGTTTTACAAG                CCTTT GTA AAAGG                TCTATAATAGGGAAT  58 95
IUJ46_RS03015  578547 ..  578567 + -11.3  -5.80248   GGTAATCAGACACGA            GAAATCAGT TTG ACTGATTTC            TTTTTTTGTATCTTA 100 36
IUJ46_RS03020  579145 ..  579164 +  -2.2  -3.32022   GTCCCTGAGACAAAT            TCAGAAGA TGAC TTTTTTGA             TTAATATCTAGGAGG  44 2
IUJ46_RS03025 NONE
IUJ46_RS03030 NONE
IUJ46_RS03035  581347 ..  581380 + -14.1   -5.0925   TCTCCTAGCAATAAA     GGTAAGTAAGACAAG TTTT CTTGTTTTGCTTACC      TTTTTCCTTTTAAGA 100 44
IUJ46_RS03040 NONE
IUJ46_RS03045 NONE
IUJ46_RS03050  584979 ..  584990 +  -3.6  -5.48787   TGTCAACTTGAAAAA                GGTC CTAA GGCC                 TTTTTTCTATGTTAT  79 59
IUJ46_RS03060 NONE
IUJ46_RS03065  587032 ..  587045 +  -3.9  -2.66634   AGCGTAGTCATTTTT               TGAAA TCGA TTTCA                TAATCTGGTAGACTA  45 62
IUJ46_RS03070  588548 ..  588571 +  -4.8  -3.75169   GCGTTACACTCTTCT          TTTTTAAAGT CAAA ATTTTAAAAA           TTTGATAAACTAGTA  59 86
        uvrC  590510 ..  590533 +  -3.3  -3.01712   TTATGATTTTAAAAA          CTATTTTAT GGTAAA ATAAAATGG           TATTAAAAAAAACAG  45 150
IUJ46_RS03080 NONE
        pepV  592727 ..  592749 + -16.4  -4.51097   TTATGACAGCAAAAA           GAGCTGGAAC ACT GTTCCAGCTC           TTTTGTGATGATTAG 100 46
        rplJ NONE
        rplL  595516 ..  595541 +  -7.6  -5.58522   GTTTCTTGCCAAAAA         TCCTGCCCAA AAAATC TTTGGCAGGA          TTTTTATTTTCTATA  93 128
IUJ46_RS03120 NONE
IUJ46_RS03125  600491 ..  600530 +  -5.2  -5.60993   TTGATTGAAACTGGA  GTATTTCAGGCAAAAAAT CGTA AATTTTTGGCTAAAATAC   TTTTTTTCTGAACAA  86 46
IUJ46_RS03130  600821 ..  600846 +  -6.9    -4.258   ATTTATAAATTTAGG         GGAGTAGACTG ATTT TAGTTTGCTCC          TTTATTAGTAGATAA  75 88
IUJ46_RS03135 NONE
IUJ46_RS03140 NONE
IUJ46_RS03145 NONE
IUJ46_RS03150  603854 ..  603885 +  -4.6  -2.80472   GATTACTAGCTTATA      TTTAATAGTCTTGT CCAA ATAGGACAATTAAA       CATTTTTTAATCAAA  48 138
IUJ46_RS03155  604154 ..  604201 +   -10  -4.63048   TCATAATAAATAAAA GTCTCGCCTTGATTTGTTCATT GACA ACTGAATAAACCGAGGTGGGAC TTTCTTGTTTGTCGA 100 28
        pbp3  607260 ..  607291 +   -14  -4.99134   AAACAATCAAAAAAA      GACAGTTATGAAAG AATT TTTTCATAACTGTC       TTTTTAGTTTACAGT 100 63
IUJ46_RS03180 NONE
        folE NONE
        folP  611307 ..  611322 +  -4.7   -2.5547   CTAATCAAGACATTG              TGGCT GTGTTG AGCCA               GTTGATGTGAGGACT  49 0
        folB NONE
        folK  612287 ..  612301 +  -7.1  -5.51402   TTTGATATAATAGTA               TCGGC TTTAT GCCGA               TTTTTTTACGTGTAT  93 117
        murB NONE
IUJ46_RS03210 NONE
IUJ46_RS03215 NONE
IUJ46_RS03220 NONE
IUJ46_RS03225  617061 ..  617079 +  -7.4  -4.84527   ATAAGCACTCAAAAA             GGCTGG TATTTCT CCAGCC             TTTTTAATGTATCGA  88 37
IUJ46_RS03240 NONE
IUJ46_RS03245  622016 ..  622062 + -19.3  -3.12378   AAGTTATACTTTAAA TCACAAAATAAGTAGAAGCATA TTTC TA-GCTTCTACTTATTTTGTGA TTAGCTAATATCATT 100 61
        aphA  624127 ..  624154 +  -6.2  -5.15969   AATTTCTTTCATCAC        CCCACTGAGTAA CCAA TAGCCCAGTGGG         TTTTTTGGGTTACAG  83 73
IUJ46_RS03260  625815 ..  625848 +  -3.4  -3.18024   ATCACAATTCGGAAA    GTTCGA-G-CTT-GTCT TTT AGACTAAGTCTTCGAAC    GTTTTACTGCTAGAG  47 51
IUJ46_RS03265 NONE
IUJ46_RS03270  627862 ..  627883 +  -6.7    -5.626   GCTATTCAAAAAAAA           CAAGTTTCCT AAA AGGAA-CTTG           TTTTTTTGTCGAATA  89 14
        radC NONE
IUJ46_RS03310 NONE
IUJ46_RS03315 NONE
IUJ46_RS03320 NONE
         pta  636917 ..  636937 +  -6.8  -5.76949   TGACATTATTAAAAA            CGAGTTGG CCAGA CCATCTCG            TTTTTTTTGAAGGTG  89 107
IUJ46_RS03340 NONE
IUJ46_RS03345  641292 ..  641312 +  -6.1  -5.27399   AGAAATAAACAGAAA            TGTTGGTCC GTA GGACTGGCA            TTTTTTCGTCTCTTA  84 33
        guaC  642525 ..  642540 +  -6.2  -3.70149   GTCAAAAATTCTATT              TGGAAT GGTG ATTCCA               TTTAAATGATATGGA  62 5
IUJ46_RS03355 NONE
IUJ46_RS03360  644723 ..  644737 +  -7.1  -5.39721   TGAATAATTAAAAAA               CGGCT AATTG AGCCG               TTTTTTCTGTGATCA  93 34
IUJ46_RS03375 NONE
        prfA NONE
        prmC NONE
IUJ46_RS03390 NONE
IUJ46_RS03395 NONE
IUJ46_RS03400 NONE
IUJ46_RS03405 NONE
IUJ46_RS03410  652480 ..  652492 +  -2.7  -3.40522   ATTGAACTGATGAGC                CTTTT TTA GAAAG                TTATCATGAAACGAT  47 17
IUJ46_RS03415 NONE
IUJ46_RS03420  655957 ..  655970 +  -3.9     -3.37   AATAAAGTTCGTCTT               TTAAC AAAG GTTAA                CTTTTTAAGCCTTCC  51 36
IUJ46_RS03425  657574 ..  657598 +  -7.7  -5.54079   ATCTGATAGGAAAAA          GCCAGAGCAGT TCA GCAGCACTGGC          TTTTTTGCTTTTTAA  93 42
        gyrA NONE
IUJ46_RS03440  662135 ..  662148 +  -3.9   -3.1241   ATTCTTATAACCAAG               TATCT ACCT AGATA                TATCTTAAATATAAT  47 15
IUJ46_RS03445  662920 ..  662939 +  -6.6  -4.48175   CGTATTAATGTTTTT            TTATCTAT TGCG ATAGATAA             TTTTACTTCAATTTT  76 304
IUJ46_RS03450  663655 ..  663668 +  -8.1  -5.30189   AAGATAAGACAAAAA               GTGCC ATTA GGCAC                TTTTTTAATCTTCTG  90 57
        ylqF NONE
IUJ46_RS03475  667641 ..  667657 +  -5.9  -6.28401   CTAATCCTTAAAAAG              TTCTGTT TTT AGCAGAA              TTTTTTTCTTTTTTA  95 30
        dprA NONE
        topA  670779 ..  670808 +  -6.6  -5.95539   AATTAAATAAAAAAA       GAATTGGAAC TCCTTGTCTT GTTCCAATTC        TTTTTTTATTTACAA  95 31
IUJ46_RS03500  673309 ..  673352 + -14.3  -5.49569   AACAACTGATTTGAC GTCCATTATAAAGGAAT AATTCTAAAA ATTCCTTTATAATGGAC TTTTTTGTATTAGTC 100 39
IUJ46_RS03505 NONE
IUJ46_RS03510  674793 ..  674819 + -15.4  -5.52807   AAAAGGGTTCCCGTA         GAAAGAGACTAA CGC TTAGTCTCTTTC         TTTTTCTTTCTTCTT 100 44
       trmFO  676285 ..  676314 +  -3.6  -5.30155   AACACTAAAAAAGAG       TTCCTTTTCAGT TGAGTT GCTGAAGAGGAC        TTTTTTACTTGCTGA  76 39
IUJ46_RS03520 NONE
IUJ46_RS03525 NONE
IUJ46_RS03530 NONE
IUJ46_RS03535  679722 ..  679744 +  -6.3  -5.14563   AATAAATCATTATCA           GGAGTTGGA AGCAA TCTAGCTCC           TTTTTTAGTAGAAAG  84 70
IUJ46_RS03555 NONE
IUJ46_RS03560 NONE
IUJ46_RS03565  685393 ..  685414 +  -2.2  -4.06384   TTCCTTTGAGCTAAT           GGCGCTTG GTATGG CAGGTGTC            TTTATCGTGTTAGGC  52 87
        citD NONE
        citE NONE
        citF NONE
        citX NONE
IUJ46_RS03590  690291 ..  690317 +  -8.1  -5.49569   GAACAATACCAAAAA         CCTACCTGATT TTGAT AATCAGATAGG         TTTTTTATCTTAGTA  93 99
IUJ46_RS03610  694845 ..  694874 + -10.9   -4.9251   AATGAATTTCACATC       AAAAAGAGACGAA AATT TTCGTCTCTTTTA        TTTTCGTTTTTTCTT 100 115
        guaA  700825 ..  700876 + -25.8  -3.85786   TGAATGGGAATAACA GAATAAACATTAAAAGACTCGC-CA AAA TGAGCGAGTCTTTTAATGTTTATTC TTTAACTGTTTTCGT 100 28
IUJ46_RS03660  707211 ..  707238 + -14.4  -3.62591   ATAGTAGCAAAAAAA        TACCTAACAGAT TTTT ATCTGTTAGGTA         TTTAAACCTTATCCC 100 347
        coaB NONE
        coaC NONE
IUJ46_RS03725  719638 ..  719670 +  -8.7  -4.42851   AATTAGCTTTCACAA      TAACCGAGTTTTT CTCTTTT AAAAACTTGGTTA      TTTTAACTTTCTTAC  89 39
IUJ46_RS03730  721562 ..  721584 +  -9.2  -4.88711   AAAGACAAGCAAAAA           GAACTAAGCC GCT GACTTAGTTC           TTTTTAGTCTATTCT 100 69
        coaA  729414 ..  729429 +  -2.6  -3.26596   AAACGCATATATTTT              CTATAT AATA ATGTAG               TTAGATTAATTTGGA  45 53
        rpsT  729706 ..  729717 +  -5.8    -5.626   AATATCCAATGAAAA                CTCC AGCT GGAG                 TTTTTTTATACGGTA  88 43
IUJ46_RS03875  752022 ..  752042 +  -9.8  -3.52111   ACAGCAACAAAAAAA            GTTTGAGG TGGGC CCTCAAAC            TTATAATCCTTTTCG  81 147
IUJ46_RS03920  759827 ..  759843 +  -3.7  -2.73099   AAGTTCAAGACGCTA              GGCTT TTTTCTT AAGCC              CCTTTTTATGGTATA  45 85
IUJ46_RS03925  761213 ..  761246 +  -2.5  -5.42259   GAAATAGTTAAAAAA     TTCCTACAATTTGTT TTTA AACAGATCATAGGGA      TTTTTTTAAGAATAC  76 116
IUJ46_RS03980 NONE
IUJ46_RS03985 NONE
IUJ46_RS03990  775995 ..  776034 + -13.3  -5.52909   CAGTAAGCGTTAAGA  CTTTCTTTTAAACTATG ACACAC TATAGTTTAAAAGAAAG   TTTTTTTCAGTGTTC 100 35
        ssrA  777199 ..  777214 +  -4.7  -5.98675   CATAACTTACTAAAA              CCTTG TTACAT CAAGG               TTTTTTCTTTTTGTC  93 59
        speA  778555 ..  778573 + -13.2  -4.76963   TTATTAATGTAAAAA             CCGCTCAT TTG ATGAGCGG             TTTTGTCTTATCTAA 100 99
IUJ46_RS04250  810581 ..  810597 +  -4.4  -5.86976   TAAAATTAAGATAAG              TGCTGC CGTTA GTAGCA              TTTTTTCTTTTCTCC  91 59
IUJ46_RS04255  810903 ..  810932 +  -5.7  -5.48213   TTCGTTATTTCTAAA       CCAGCAATCGC CCGCTACT GCGTTTGTTGG        TTTTTCTTTTCCGTA  84 41
IUJ46_RS04265  811775 ..  811785 +  -3.2  -3.67141   ATCATCTATTAAGAA                 CTGA TTA TCGG                 TTTCAATGACGTTAT  52 143
IUJ46_RS04275  812522 ..  812534 +  -6.2  -5.56263   AACTCCCCCCTTTCC                GCCC CTTGT GGGC                TTTTTATTTTGTAAT  86 39
IUJ46_RS04285  813869 ..  813887 +  -3.1  -2.62656   AGTTATTCGGGAAAT             CATAGCT AACGA AGCTACG             GTTGTGAATGAGTTT  43 17
IUJ46_RS04290 NONE
IUJ46_RS04295  816110 ..  816125 +  -4.7  -5.98675   CATAACTTACTAAAA              CCTTG TTACAT CAAGG               TTTTTTCTTTTTGTC  93 120
IUJ46_RS04300  817026 ..  817055 + -13.1  -5.07941   ATATTTTGCTAAAAA       GATTGATTTCGGT GTAC ATCGAAATCAATC        TTTTTATATCATTTT 100 53
IUJ46_RS04320  823826 ..  823881 +   -13  -3.78775   TTTTTGTTTTACTAG TAGCTTAGTGCTACTTAAATTTTTAA CTCT TTAAAAGTTTACGTAACACTTAGCTA TTTCATCCTAACAAG  95 177
IUJ46_RS04325 NONE
IUJ46_RS04330  826162 ..  826188 +  -9.5   -4.7497   TTACAACATACCAAA         CCTTCTAAGGG CAAGC CCTTTAGGAGG         TTTTTGATAAATAAG 100 42
IUJ46_RS04335  827146 ..  827173 + -11.4  -5.24989   CCTTGTAACTCAAAA        CCTTGCCTCTTT AGAT AAAGAAGCAAGG         TTTTTTGATGTCTAA 100 71
IUJ46_RS04410 NONE
IUJ46_RS04415  847056 ..  847079 +   -14  -5.31059   TCCAAAAAATAATAA          GGCAAGGAAA CAGG TTTCCTTGCC           TTTTTTGGTTACTGT 100 63
        pnuC  855508 ..  855530 +  -9.2  -4.92239   AAAAAGGTCAAAAAA           GGATGAGG GCCTAAG CCTCATCC           TTTTTCAATTTTTCA 100 20
IUJ46_RS04480  858955 ..  858965 +  -5.4  -4.30844   TCCCCTTCTGCAAGG                 CTAG GGT CTAG                 TTTTAATGGTCCCAT  67 153
IUJ46_RS04490  860110 ..  860134 +  -7.2  -4.96646   GAAAAGAACCAAAAA          GGTAAGCAAT CCCTA AGTGCTTACC          TTTTTGGTTATCTCA  88 48
IUJ46_RS04500  863341 ..  863365 + -13.7  -5.11033   CAATAAAGGAAAAAA          GTCCCAATTCT CAG AGAGTTGGGAC          TTTTTTAGCCTTCTA 100 81
        birA  881520 ..  881541 + -10.2  -3.77906   AACGAGATAAAACGT           GGGTAAGG GCAAAA CCTTACCC            TTATGTATTTCAGTT  87 261
IUJ46_RS04595  884668 ..  884692 +  -2.2  -3.08464   CCCTTGACGATGATG          TGCTTTTTTA AACTA TAAAAGAGCC          TTGACTAAATAATAC  42 15
IUJ46_RS04610  886925 ..  886955 + -17.2  -3.89614   GGCTACTAAAAACAA       CAATCCAATTACTT CAA AAGTAATTGGATTG       TTTAGTATATCAATT 100 67
IUJ46_RS04635 NONE
        nrdE  895018 ..  895045 +  -8.5  -4.07868   TTAAACTTATTATTA        CCGGTAGAACT TTGGTC GGTTCTACTGG         TTTATCTCGATATCC  82 277
        nrdF NONE
IUJ46_RS04650  897638 ..  897664 + -14.5  -3.23395   AAAAATATGGAGAAA         GTGCGTTCCCA GGACA TGGGAGCGCAC         TTCGTCATGCTCAAT  95 317
        queA  913068 ..  913078 +  -6.8  -3.53733   TCGTTTCTTTAGCTT                 TGGC GAT GCCA                 TGTTTGTCAACTAAA  64 1
IUJ46_RS04720  914329 ..  914354 +    -9  -5.14563   CATTAATCTCAAAAA         GCTTGACCTG AAGAAA CAGGCCAAGC          TTTTTTAATGAGCAA  95 35
IUJ46_RS04765 NONE
IUJ46_RS04770  922442 ..  922466 +  -7.3  -5.71983   AAAAGAAAAGAAAAA          TCATTGAGA CTTATCA TCTCAATGA          TTTTTTTATGCTTCA  93 19
IUJ46_RS04830  937338 ..  937371 + -12.7  -4.62069   TTAATAGTCAAAAAA     GCTTGGAAA-TGTGCA CTT TGTACACTTTCCAAGC     TTTTTAAAATGGGAA 100 43
        sda3  941265 ..  941305 + -10.8  -4.06491   TCTAGATTGTGAACA  TTATCCCAAATGTTAGAT TATTT ATTTAATATTTGGGGTAA  TTTGTATAAAGTTAA  93 66
IUJ46_RS04850  941948 ..  941969 +  -7.2  -4.76963   CTTAAACACAAAAAA           CCGCCCTC GATTAA GAGAGCGG            TTTTGTCTTATCTAA  83 44
IUJ46_RS05080 NONE
IUJ46_RS05085  971852 ..  971893 +    -7  -2.78032   CGTGAGGCGAATCTA GTATAGTAAA-A-ACCTGCT TCGC AGTAGGTCTCTTTACTATAC CTATTTTAACAGAAA  62 76
IUJ46_RS05090  973106 ..  973141 +  -9.7  -4.61199   CCTGAACACAAAAAA    GCCCACTGCACAGGC TACAAC GCTTGTACAATGGGC     TTTTATATATGCAAT 100 64
IUJ46_RS05180  991488 ..  991511 +  -8.2  -4.11744   ATTAACGTTAGCTAA          GAGAGTTTCT ATAA GGAGACTCTC           TCTTTTTCTATCAAT  81 36
IUJ46_RS05185 NONE
IUJ46_RS05190  992439 ..  992462 +  -8.2   -5.7946   GCTATTCAGACAAAA          CTTAGCCCTT CTAA AAGAGCTAAG           TTTTTTTATTAGCGA 100 51
IUJ46_RS05280 1011269 .. 1011281 +  -4.1  -4.57073   GATTATTTTGGATTG                TGCTT CTA GAGCA                TTTTTAGGCCAGATA  67 6
IUJ46_RS05355 1026830 .. 1026873 +  -7.6  -5.10208   AAATCTCATCAAAAA GCGAGTAAACGAA-AACCT AAATGAC AGGACATTCGTTTACTCGC TTTTTGTTAACCTTC  88 105
IUJ46_RS05455 1047357 .. 1047384 +  -9.3  -5.64274   GCATCTATAAAAAAA        TACTGTCCTAA TAAGAT TTAGGGCAGTA         TTTTTTTATAGCTAG 100 34
IUJ46_RS05460 NONE
        aroB 1049835 .. 1049857 +  -9.2  -4.68645   TTGAATACGTAAAAA           GAGAAGATGA GCG TCACCTTCTC           TTTTGCTTTTCCATA 100 393
IUJ46_RS05525 1064703 .. 1064713 +  -5.4   -3.2827   ACATCTACAAAGACA                 TCCT AAA AGGA                 TTGCTGATTAGCTAC  55 91
IUJ46_RS05545 NONE
IUJ46_RS05550 1073676 .. 1073701 + -14.1  -3.28783   TAACATATTCAAAAA         GAGTCTGGGAC TATT GTCTCAGACTC          TTAAGTTGATTTTGA  95 63
        sda3 1078566 .. 1078606 + -10.8  -4.06491   TCTAGATTGTGAACA  TTATCCCAAATGTTAGAT TATTT ATTTAATATTTGGGGTAA  TTTGTATAAAGTTAA  93 66
IUJ46_RS05575 1079252 .. 1079273 +  -7.2  -3.54768   TTATAACACAAAAAA           CCGCCCTC AATCAA GAGAGCGG            TTGGCTTTTTATTTA  68 45
IUJ46_RS05820 1113799 .. 1113824 +  -4.7   -4.9792   CGGTTTTTATCAGTT         CAGGGTCTATC TTAT GATAGGCTCTC          TTTTTCTCTCCGCTA  75 56
IUJ46_RS05835 NONE
IUJ46_RS05840 NONE
IUJ46_RS05845 NONE
IUJ46_RS05850 1118614 .. 1118625 +    -3  -3.03094   ACGCTGTAATATCAA                TGTT TTAA AACA                 ATTTGCTTGTATATA  45 121
        recX NONE
IUJ46_RS05860 1120202 .. 1120237 +  -7.6  -2.61004   GTTTTTCGTTGTGGT    AAAAGTGGCGTCAATG TTAA TGTTGACGCCACTTGG     CATTTTTGAGCCTAG  63 172
IUJ46_RS05940 1131041 .. 1131075 +  -5.2  -4.59376   CATCAACAAAAGTGA     TATGGCTTTATTATCA GAG TGATAGTAAATCTGTA     TTTTACTTTAATAAT  71 42
        cysK 1132098 .. 1132126 +  -8.2  -4.94672   AGACGAAATAAAAAA        GGGTTTGGAACT ACTAA GGTTCCAGACTC        TTTTTAGTGTTCTTT  90 30
IUJ46_RS06020 NONE
IUJ46_RS06025 NONE
IUJ46_RS06030 NONE
IUJ46_RS06035 1151065 .. 1151097 +    -5  -4.46212   ATAAATTTGGAGAGA     TAAAGAGGCTGTATC TTGT GAT-CTGTCTCTTTA      TTTTCTAATAAGGAG  69 37
IUJ46_RS06040 NONE
IUJ46_RS06045 1153118 .. 1153141 +  -8.2  -5.81622   TTATTAATCAAAAAA          CTGAGACAAG TTGC CTTATCTCAG           TTTTTTTGATTTTCT 100 132
        recU NONE
       pbp1a 1160128 .. 1160154 + -10.8  -4.96848   TAATCTAAATAAAAA         GCGAGTCCACGT TCT GTGAGGACTCGC         TTTTTATATGACACA 100 120
IUJ46_RS06255 1201422 .. 1201432 +  -6.8  -5.75342   ATTTCTTCTATCAAG                 GCAG AAA CTGC                 TTTTTTTTGACCACG 100 356
IUJ46_RS06265 1202897 .. 1202953 +   -12  -4.62069   GGCTGCTATGGGCTT GCCT--CTATTAACGTAAAAAGGTTCCT TTT GGGAACCTTTTTACGTTAATTGTTAGTC TTTTTGAGCTACAAG 100 10
IUJ46_RS06315 1210595 .. 1210605 +  -2.4  -4.37486   GCAAAAGTGATTTGC                 CCCC AGA GAGG                 TGTTTTTGTTTTGCT  57 95
IUJ46_RS06335 1214792 .. 1214808 +    -8  -6.04378   ATAACTCCTACCTGC              CACCAG TTAAT CTGGTG              TTTTTTTTGTAGTTT 100 49
IUJ46_RS06395 NONE
IUJ46_RS06400 1225204 .. 1225229 +  -9.1  -5.47159   TTATTTGAAATCACA         GACAGCTATCA TCTT TGATACCTGTC          TTTTTTATATTCAAA 100 61
IUJ46_RS06425 1230225 .. 1230248 +    -9  -4.06864   TAGTAGCAAACGAAA          CCACTATTTT TCAG AAAATGGTGG           TTCTTCTTCTGTCAA  82 38
IUJ46_RS06430 NONE
IUJ46_RS06435 NONE
IUJ46_RS06440 1233393 .. 1233417 + -10.8  -5.43621   TGTAATCAACCAATG          GAAGTCTGAG ATGAA CTCAGGCTTC          TTTTTTATGCTTTAT 100 36
IUJ46_RS06445 1234136 .. 1234150 +  -2.8  -3.36564   GCCAAAGCGCTCCAG               CATCTT CAT AAGCTG               TGCTTTTTCTATCGT  47 306
        serS 1235533 .. 1235562 + -13.7  -4.07678   TAAATAATAAATTCA       CCCCAGAGATCAT TAAA GTGATTTCTGGGG        TTTACTATTTTAAAG 100 34
IUJ46_RS06600 1263012 .. 1263027 +  -3.9  -3.64192   GCTAAGGCATCAACT              TGCCC AATCAG GGGCG               TTTCAACATGTTTTT  54 407
IUJ46_RS06610 1265190 .. 1265231 + -18.4   -2.9587   ATAATCTAGCTTCCT TTAGAAATGTCCCACTAA AACATA TTAGTGGGACATTTCTAG  TACTTTAAGCTTTAA 100 37
IUJ46_RS06730 NONE
IUJ46_RS06735 1301135 .. 1301193 + -17.1  -3.15699   CAATCACTAATTACT CTAAAAGACAAACAAGCTTACTCTTTC TAGAT GCGAGAGTATGCTTGTTTGTCTTTTAA TATTCGTACATAAAT 100 53
IUJ46_RS06770 1308498 .. 1308509 +  -2.2  -2.91695   CTGTGTCAGACGACT                GGCT CCAA AGTC                 TCATTTGACACTAAC  41 83
IUJ46_RS06775 1309337 .. 1309353 +  -8.7  -4.71791   TAGTCAACTAAAAAA              CAGTCCG AAA TGGACTG              TTTGTTTATTAGTCT  93 133
        mutY 1312364 .. 1312382 +  -5.3  -5.29846   AATGCTTAATCGCAA             GTGAACT ATAAC GGTTCAC             TTTTTGTTTACAATT  82 32
IUJ46_RS06805 1313033 .. 1313071 +   -17  -3.09933   TGAAGTTAGTAGGTC   ATAAAATAAAGCTCAGCG TGA CGCTGGGCTTTATTTTAG   TTAACTCAATTCAGC 100 38
        rnhC NONE
        lepB 1318985 .. 1319000 + -10.4  -4.35874   TTTAATTAGAAAAAA              CCTGCC TTTG GGCAGG               TTTTCAGTTATCTTG 100 32
IUJ46_RS06845 NONE
IUJ46_RS06850 1322080 .. 1322111 + -20.4  -5.24531   AAATAATGGACCAAA      GAAGCTGATTAGGG AAAT CCCTAATCAGCTTC       TTTTTTCTCCAAAAT 100 43
        pflB 1325818 .. 1325857 + -15.3   -5.1925   ATAACTTATAAAAAA  GAACAGCCATCTCATTT GATTCA AAATGAGATGGCTATTC   TTTTTTCACTTATAA 100 58
IUJ46_RS06875 1328850 .. 1328877 +  -4.9  -4.98616   AAATAGATAAGATAA        CGTTTCTGG GAATCACTAA CCAGAGACG         TTTTTAATATTTTAC  75 31
IUJ46_RS06890 NONE
IUJ46_RS06895 1334865 .. 1334888 +  -6.8   -5.5604   AATTAACAAAGAAAA          GTGCTTAG CAATATAA CTAAGCAC           TTTTTTGTTAATTGG  87 35
IUJ46_RS06905 NONE
IUJ46_RS06910 1336203 .. 1336228 + -12.7  -5.66684   CTAAAAAAACAAAAA         CTAGCTTGAGA AGGA TCTCAGGCTAG          TTTTTTTATGAGTTA 100 37
IUJ46_RS06930 1339684 .. 1339708 +  -9.4  -4.70266   TTCATAGCTAAAAAA          GCCTATTATC ACTAA GATAGTAGGC          TTTTTAACTCCTATT 100 34
IUJ46_RS06950 1343503 .. 1343518 +  -4.7  -2.84265   ATTAATACCTGACTC              CCACA CTTAGA TGTGG               AGTTTTTTGATATTA  51 72
        rpsN 1344049 .. 1344076 + -14.3  -5.00616   TACTTATCATCATGA        CAACCCGGTAT GCCAAG ATACCGGGTTG         TTTTTTCAAAGGGAG 100 113
IUJ46_RS06975 NONE
        rnjA 1348558 .. 1348582 +  -4.3  -5.15526   ATTATCAAACTAAAA          CCAGTCC TCATAGAACAT GGACTGG          TTTTTAGTTTTCTAT  76 109
IUJ46_RS07060 1365127 .. 1365174 + -10.3  -3.71649   TATAATCTTAAAAAA TCCTTTTTTCTAGAA-AAAACA CCAAT TGTTTTATTCCAGAAAAAAGGG TTTAGGATTTACGGA  87 41
IUJ46_RS07125 NONE
IUJ46_RS07130 NONE
IUJ46_RS07135 1381387 .. 1381415 +  -8.9  -4.90525   TAAAAGACAAAAAAA        CACCACAGTAG ATGATTA CTACTGTGGCG        TTTTATTTAAAATTG  95 38
IUJ46_RS07210 1397641 .. 1397684 + -11.3  -3.06815   TTAGCCATCAACATA CCTCTTAAGTAGATTTTGGT TCGTT ACCATG-TCTACTTAAGAGG TGTCTTCAAAGCGCT  84 313
IUJ46_RS07215 NONE
IUJ46_RS07220 1398637 .. 1398658 + -10.9  -5.18357   AATAACACGTTAAAA           GCCTTAGCA GTCT TGCTAGGGC            TTTTTTGGTAGATTA 100 36
IUJ46_RS07330 1417120 .. 1417136 +  -6.7   -3.0558   AACCACTATCTGACT              TTTCTTT AAA AAAGAAA              TGATTTGTGATATAG  59 61
         def 1417800 .. 1417827 + -11.5   -3.2794   TTGATTTTAGACTAA        CAAAAAAAGGC CCTTTA GCCTTTTTTTG         TTAGTCTAAATAGCC  87 26
         ska 1439266 .. 1439295 +  -5.1  -5.26918   TAACTGACAAAAAAA       GCAAGCAAC ACGCTATCAACA GTTGCTTGC        TTTTTTCTAACCTCT  80 66
        nrdI 1444428 .. 1444473 + -24.4  -3.29273   GGTTACTGACATGAC TAAAGAGGTCTAACCAGCTC TACCTT GAGCTGGTTAGACCTCTTTG TGTTCTCCTAATCCC 100 291
        pabB NONE
IUJ46_RS07460 NONE
IUJ46_RS07465 1454125 .. 1454139 +  -7.2  -2.50479   TTTAAAAATCGCAAC               CGATTT CAA AAATCG               ATAATTTTGCTTGAA  60 49
        ssrS NONE
IUJ46_RS07475 1454479 .. 1454492 +  -5.3  -3.99187   CTATACATGAAAAAA               CCTTT GTTT AAAGG                CTTTTTTTGCTTGTC  63 43
IUJ46_RS07480 NONE
IUJ46_RS07485 1455653 .. 1455668 +  -7.6   -5.4148   CTATTCAGACTGAAA              GCCTTT GTTT AAAGGC               TTTTTTGCTTGTTTC  93 79
        smeZ NONE
IUJ46_RS07500 NONE
IUJ46_RS07505 NONE
IUJ46_RS07510 NONE
IUJ46_RS07515 NONE
IUJ46_RS07520 1462289 .. 1462319 + -12.8  -4.47007   ACAAAATCACACCAT       TAAAAAAACCAGCT TAC AGCTGGTTTTTTAA       TTATTTTAATTTTTC 100 75
IUJ46_RS07620 1488808 .. 1488845 + -14.4  -5.86965   CTATCACTGATAACA   TTCACGCTAAGCCT CATTCTAGCT AGGCTTAGCGTGAA    TTTTTTTTGCTGACT 100 78
        ropB 1493740 .. 1493762 +  -6.3  -5.02715   GAGGCTCTTTAAAAA           GCTAACGCT CTTAT GGTGTTAGC           TTTTTGATTTGGTAT  84 39
IUJ46_RS07655 1495662 .. 1495690 + -14.7  -5.48303   CAACAATAAGCAAAA        CAAGTCTAGGAAG TGA CTCCCTAGACTTG        TTTTTTTGAGGTTAT 100 32
IUJ46_RS07700 1505545 .. 1505563 +  -6.8  -4.59982   TGTGTAAGGTATATG             TTTTGCAG TAT TTGCAAAA             TTTATTTACTTCTAG  79 481
IUJ46_RS07725 NONE
IUJ46_RS07730 1510030 .. 1510066 + -19.7  -4.34859   ACGCAGTCTTAAACG    CTCAAAAGGCTAGGAAA TAA TCTCCTAGCCTTTTGAG    TTTATCTGTTTTCAT 100 6
IUJ46_RS07740 1513588 .. 1513608 +  -8.3  -3.39327   GAAGTCAAAAAATAA            GGTCTCACA CTT TGTGAAACC            TTATCGGTATAGGAG  72 92
        ahpC NONE
        ahpF 1523289 .. 1523316 + -13.6  -5.32608   ACAGCATATTTAAAA        GAAGTTTTGAGC TAAC GCTCAAAGCTTC         TTTTTTAAATTTTTT 100 42
IUJ46_RS07805 1526941 .. 1526961 +  -5.5  -3.16676   AGCTAAAAATGTAAG            CGTTATCTA AAG TAGATAACC            TATTCCCTTAATGAG  55 49
        ftcD NONE
IUJ46_RS07815 NONE
IUJ46_RS07820 NONE
IUJ46_RS07825 1530863 .. 1530886 +  -3.9  -3.80733   TTAGTGGGATAAAGA          TAGGCATCA CACTAC TCATGCCTA           TTCTTCTCCAATGAA  55 37
IUJ46_RS07830 NONE
        hutH 1533992 .. 1534017 +  -7.5  -3.61178   ACTTCTTTAACTAGA         GGGGCTGTGGC AGAG GTCATGGCCTC          TTTAGACTAACTAAC  71 51
IUJ46_RS07840 1535141 .. 1535162 + -10.2  -4.48175   ACAACATAGCTAAAA           CCCTCTGA TTCACT TCAGAGGG            TTTTCCTTAGCTTTT 100 28
        rpsB 1539377 .. 1539405 +    -3  -5.00616   CAATCGAAAACCAAA        CGGGGCAGAAAG CAAAC CGCTCTGTCTCG        TTTTTTGAAACCAAA  68 88
         tsf 1540516 .. 1540541 +  -7.6  -5.24796   GATAAGTCTAAAAAA         GGCAACCTTC TTTCCT GAGGGTTGTC          TTTTTGTTGTGTCAA  89 53
        treR 1547413 .. 1547431 + -13.2  -3.96867   TAAAGACAGAAAAAA             GCCTTGCA AAA TGCAAGGC             TTGCTTTTCTTTTTC 100 38
IUJ46_RS07885 1549058 .. 1549081 +  -4.6  -2.67981   CATCCTTGGACAAGA          CTAGTTTTCT TGAC AGAAAGCAAG           TAACTTTACTACAAT  47 22
        yaaA 1549826 .. 1549839 +  -8.1  -5.34055   GTCTATATCAAAAAA               GAGGC CTAG GCCTC                TTTTTTAGTCTTTAT  90 17
        argS 1570901 .. 1570930 + -11.6   -5.5208   TAAGTAATAACATTA       CTAAGGCTGTCA CATTTA TGACAGTCTTAG        TTTTTTATATTATAA 100 38
IUJ46_RS07995 1571282 .. 1571313 +    -9  -4.04811   AGTGGGGGACCAAAA      TAAAAATACAGG CTGTTTGA CCTGTATTTTTA       TTTATCATAATTTCT  82 23
        rpmF NONE
        rpmG 1578144 .. 1578170 + -10.9   -5.5762   GGATATTGAAGTTAA         GCCCTGTTATC ATTTG GATGGCAGGGC         TTTTTTATATTTGGT 100 178
IUJ46_RS08040 NONE
        cadX 1579642 .. 1579659 +  -2.7  -2.85503   CAAGTTGTCTAAGTA             TTGCCAA GACA TTTGCAA              ATTTCAATATTCAAA  42 419
IUJ46_RS08060 1581919 .. 1581944 +  -6.9  -5.32699   ATTGAGATGAGAAAA         GCCTATGAAAT GAAC GTTTCAAAGGC          TTTTTTCGTGTTTAA  89 305
IUJ46_RS08070 1583745 .. 1583772 +  -9.2  -5.29846   ACTAGTGCTCTATCT        CCCCTTAGATTT TTCA ATATCTGAGGGG         TTTTTCTTTGCAATT 100 78
IUJ46_RS08080 NONE
IUJ46_RS08085 NONE
IUJ46_RS08090 1586628 .. 1586657 +  -7.9   -6.3578   AAATAAGACAAAAAA       CAGCATCTAGTGT AACT GCCTTAGATGCTG        TTTTTTTTTTGAGGT 100 90
IUJ46_RS08100 1589738 .. 1589752 +  -8.6  -4.94992   TGAGATACAAAAAAA               GCCTAT TAA ATAGGC               TTTTTGTAAGTTTAA  95 141
       sdaAB NONE
       sdaAA 1603090 .. 1603127 + -14.5   -4.1552   AGACAATTAAATACC   AAAAACCTATTGTTAGT AAAT ACTAACAATAGGTTTTA    TTTCTTCCAGCCATG 100 380
        hasA NONE
        hasB NONE
        hasC 1614757 .. 1614798 + -20.6   -5.4148   AAGCTTTGGAAAAAA GTAAAGTACCAACACATT CAAAGT AATGTGTTGGTACTTTAC  TTTTTTCCTTGTTTA 100 0
        yaaA NONE
        recF 1616626 .. 1616644 +  -9.6  -5.30189   ATAACATCAAAAAAG             GGTTCAGT TAA ACTGAGCC             TTTTTTGATATTATG 100 40
IUJ46_RS08245 NONE
IUJ46_RS08250 1623552 .. 1623575 +  -9.6  -4.18259   TATGATAAATGAGGT          GGCTAAGAAG ATCT CTTCCTAGCC           TCTTTTTTAAAATTT  93 46
IUJ46_RS08255 1626240 .. 1626290 +  -8.6  -2.78495   AATGAGTCAATATAC TAAAAGTATCTCAAGAGCTAGA CAAATAT TCTAATACTTGAGATGCTTTTA TCGATTTTACTAATA  69 75
IUJ46_RS08275 1628074 .. 1628088 +  -6.4  -5.88197   ATCAAAGATAAAAAA               GCACTG TTT TAGTGC               TTTTTTTGTATTTAC  95 36
IUJ46_RS08285 1630166 .. 1630194 + -17.7  -4.55093   TATTACATTTTATCA        CATAAAACAGTCC AAA GGACTGTTTTATG        TTTCTTATTCTATCC 100 58
IUJ46_RS08290 1630974 .. 1631013 + -17.6  -6.04324   TGATGATGAATTAAA  CAGAATTATCAACAAGCTA AAG TAGCTTGTTGATA-TTCTG  TTTTTTCTTTTTTAG 100 1
        dnaA NONE
        dnaN 1633889 .. 1633902 +  -3.8  -5.97979   CTAAGTAAGAAAAAG               CTCC CTTTTA GGAG                TTTTTTTGTTATTAT  93 37
IUJ46_RS08305 1634286 .. 1634298 +  -4.1   -3.6053   ACAATGACGAAAGTT                GTAGC ACA GTTAC                TTAGTTTCTCGGCAA  55 162
        ychF 1635617 .. 1635637 +  -7.6  -3.16106   AAAACAATATCAGAA            GGTTGGAA GAACA TTCCAGCC            CTTTTGGCATTTTAG  67 48
         pth NONE
         mfd NONE
IUJ46_RS08325 NONE
IUJ46_RS08330 NONE
IUJ46_RS08335 NONE
        tilS NONE
         hpt NONE
        ftsH 1645794 .. 1645818 + -11.6  -5.24129   GAATGATATAAAAAA          GCTGAACTTA TAGAT TAAGTTCAGC          TTTTTTATCAACACA 100 35
IUJ46_RS08355 1647611 .. 1647647 +  -6.6  -3.16683   AATATTTAAAATTAC    CCAACCCCTAGATAAT TGATT AGTCTCTAGGGGTTGA    TTGGTACAATGACAT  61 136
IUJ46_RS08360 1649657 .. 1649670 +  -2.3  -3.06796   TATTTAGTTTTGAGA               GGTCT TGTG GGGCC                TTAGCTCAGCTGGGA  42 69
IUJ46_RS08365 1650010 .. 1650027 +  -7.1  -2.50994   TATTTAATAAGTTTT             CTAGTTT AAAA AAACTAG              GTTAATAAGGTTAAG  60 296
IUJ46_RS08370 NONE
         rrf NONE
IUJ46_RS08380 NONE
IUJ46_RS08385 NONE
IUJ46_RS08390 NONE
IUJ46_RS08395 NONE
IUJ46_RS08400 NONE
IUJ46_RS08405 NONE
IUJ46_RS08410 NONE
IUJ46_RS08415 NONE
IUJ46_RS08420 1653917 .. 1653931 +  -4.2  -3.06261   GGGACCAAGGTGTCG               CAGGTT CGA ATCCTG               TCTTCCCGATTAGAA  50 1
IUJ46_RS08425 1655658 .. 1655671 +  -2.3  -3.06796   TATTTAGTTTTGAGA               GGTCT TGTG GGGCC                TTAGCTCAGCTGGGA  42 69
IUJ46_RS08430 1656011 .. 1656028 +  -7.1  -2.50994   TATTTAATAAGTTTT             CTAGTTT AAAA AAACTAG              GTTAATAAGGTTAAG  60 296
IUJ46_RS08435 NONE
         rrf NONE
IUJ46_RS08445 NONE
IUJ46_RS08450 NONE
IUJ46_RS08455 NONE
IUJ46_RS08460 NONE
IUJ46_RS08465 NONE
IUJ46_RS08470 NONE
IUJ46_RS08475 NONE
IUJ46_RS08480 NONE
IUJ46_RS08485 1659918 .. 1659932 +  -4.2  -3.06737   GGGACCAAGGTGTCG               CAGGTT CGA ATCCTG               TCTTCCCGATTAATG  50 1
IUJ46_RS08490 NONE
IUJ46_RS08495 NONE
IUJ46_RS08500 NONE
IUJ46_RS08505 1660310 .. 1660323 +  -3.9   -2.8082   ATCCTGCTCCCGCAA               TACAT AAGT ATGTA                GTTGTTGGCTCGGTA  46 25
IUJ46_RS08510 NONE
IUJ46_RS08515 1660517 .. 1660535 +  -4.5  -2.70932   CTATATCAATAAAAG             CTTGGGC GCGTA GCTCAGG             TGGTTAGAGCGCACG  47 53
IUJ46_RS08520 1660571 .. 1660592 +  -2.1  -2.50821   TAAGCGTGAGGTCGG           TGGTTCGAG TCCA CTCGTGCCC            ATATATATTTGGAGA  39 2
IUJ46_RS08525 1660737 .. 1660749 +  -5.5  -5.70829   ATAAAGGGGAAAGAA                GACGG TTA TCGTC                TTTTTTTGTAATCTT  86 72
IUJ46_RS08530 1663372 .. 1663393 + -11.7  -4.90869   CTAACATATTATTTA           GGTTAGAAC AGTT GTTCTAACC            TTTTTGATTACTCCT 100 37
IUJ46_RS08535 1664586 .. 1664608 +  -9.9  -4.75174   ATTAAACTTAACGAA           GCCTGAGAT AATAG ATCTCGGGC           TTTTTGACTTGAATA 100 36
        recO 1665560 .. 1665573 +  -2.5  -3.24425   TTTCAGAATATGCTA               TAATA AAAA TATTA                TTAATAGATTGTGTA  45 69
        plsX NONE
IUJ46_RS08550 1666865 .. 1666900 +   -18  -3.53091   CGTTTGACTTAGTTA    GAATAATAAAAAGAGC GTAA GCTCTTTTTATTATTC     TTTAAAAACGAACCT 100 29
IUJ46_RS08555 1667773 .. 1667792 +  -3.6  -2.88961   AAAAAGATGGAACTT            ACTGAAAT CTCA ATTTCAGA             TGTCCTCCTATTTTC  46 82
IUJ46_RS08560 1671569 .. 1671581 +  -7.7  -4.59773   ACAGGGAAGTAAAAA                GGTTC AGT GAACC                TTTTTAGCCCTCGCC  82 29
        purF NONE
        purM 1674351 .. 1674361 +    -4  -4.56597   GTTCGTTTTCCTATT                 TTTC TAC GAAA                 TTTTTCGGCAAGCCG  65 146
        purN 1675066 .. 1675089 +  -2.4  -4.14652   AAAGATAAACATCTC          CTAGGCGCAAG CGT CTT-CGTCGAG          TTTCCTATTTTTCCT  54 139
        purH 1676692 .. 1676712 +    -4   -5.4505   GCATTAATAAAAAAA            TGTGGTCT AATTA AAACCACA            TTTTTTATTAAAAGA  79 34
        purD 1679577 .. 1679599 +  -5.6  -3.16564   CTGACGTGGGTTCGT           CTTCGAAATC AAA GATTTCGGAC           TTACCTCATATTTTT  55 219
        purE NONE
        purK NONE
IUJ46_RS08605 NONE
        purB 1684204 .. 1684219 +  -4.7  -5.63517   TTAATATAAAAAAAA              GAAGG TGATTC CCTTC               TTTTTTATTTAAAAA  86 37
        rgg4 1685239 .. 1685250 +  -4.4  -3.45707   AAAAGTTATTAACAG                GACA AAAA TGTC                 ATTTTTAAATATTTA  53 29
        ruvB NONE
IUJ46_RS08625 NONE
IUJ46_RS08630 NONE
IUJ46_RS08635 1689255 .. 1689276 +  -2.2  -5.18726   ATGTCTAAGAGATAA           GTCAGATC CATTGT GCTCTGGC            TTTTTCTTGTGAACA  67 50
        adhE 1692205 .. 1692236 + -12.6  -5.19275   GTTGATACCAGGAAA      TGATTTCTTATGAT TAAA GTCATAAGAAATCA       TTTTATTTTCTAAAT 100 49
        adhP 1693511 .. 1693555 +   -14  -4.30978   TGATTCCAAATAAAA TAGCACTCTCGAGTATCAGAAA ACA TTTTTG--ACTCGAGAGTGCTA TTTTGATACATTGAA 100 87
IUJ46_RS08650 1695116 .. 1695137 +  -5.9  -6.06723   AAAAGTACCAAGAAA           TTACCTTTC ATTA GGAAGGTAG            TTTTTTTTTGAAAAA  95 12
        rpsJ 1695742 .. 1695752 +    -4  -5.49568   CAGAAGCTTTTGTGT                 TAGA TTT TCTA                 TTTTTATTTTGAGTT  79 129
        rplC NONE
        rplD NONE
IUJ46_RS08670 NONE
        rplB 1698348 .. 1698358 +  -5.4  -4.15222   GAAATAGCGTTACAA                 TAGC TTT GCTA                 TTTATTCCGCCAACT  66 67
        rpsS NONE
        rplV NONE
        rpsC NONE
        rplP NONE
        rpmC NONE
        rpsQ NONE
        rplN NONE
        rplX 1701425 .. 1701441 +  -5.1  -3.14132   CGTTACAGCAAAAAA              TCAGGCG AAG TGCTTGA              TTAATCACGAAGGAA  52 5
        rplE NONE
IUJ46_RS08725 1702221 .. 1702257 + -10.4  -2.60194   TTGGTAAAAATATGA    CACAAAACTTAATTTG TTCTT CAGATTAAGTCTTGTG    CTTAATTAAAACGGT  78 34
        rpsH NONE
        rplF 1703563 .. 1703577 +  -4.3  -2.62246   AGTTCAATCGACAAC               TTGTC AATGA GACAA               ATTGATTAAAATTAA  47 88
        rplR NONE
        rpsE NONE
        rpmD 1704682 .. 1704698 +  -8.1  -2.70932   AATAAGTTATAACTG              TGAAATC TCT GATTTCA              TAATTAAAAACGAGC  66 36
        rplO 1705323 .. 1705342 +  -5.1  -3.39784   TCAATCGAAGTCATC            TAATGAG GGGATA CTCATTA             TGTTCTTAAAAATAC  55 23
        secY 1706653 .. 1706669 + -10.9   -4.1922   GCAGAATAGAATACA              GGTTGAC ATT GTCAACC              TTCTATTTTGTTTTT 100 32
IUJ46_RS08765 1707445 .. 1707462 +  -7.1  -3.24188   AATAAATTATACAAA             TCTACTT GCAT AAGTAGA              TTAGTAATGATATAC  65 36
        infA NONE
        rpmJ NONE
        rpsM NONE
        rpsK NONE
IUJ46_RS08790 NONE
        rplQ 1710204 .. 1710254 + -12.9  -4.92791   ATTGTTAATATGTAA CGCTTGTTTATGAAAGGTATCTA AGCTA TAGAAACTTTTTATAAGCAGGCG TTTTGTTGTATTATG 100 148
IUJ46_RS08800 1712495 .. 1712508 +  -2.3  -3.06796   TATTTAGTTTTGAGA               GGTCT TGTG GGGCC                TTAGCTCAGCTGGGA  42 69
IUJ46_RS08805 1712848 .. 1712865 +  -7.1  -2.50994   TATTTAATAAGTTTT             CTAGTTT AAAA AAACTAG              GTTAATAAGGTTAAG  60 296
IUJ46_RS08810 NONE
         rrf NONE
IUJ46_RS08820 1716054 .. 1716077 +  -4.6  -3.04415   GGTCAGCGGTTCGAT          CCCGTTAA CTCCCATT TTAGCGGG           TGTAGTTTAGTGGTA  50 10
IUJ46_RS08825 1716175 .. 1716193 +  -4.5  -2.70932   CTATATCAATAAAAG             CTTGGGC GCGTA GCTCAGG             TGGTTAGAGCGCACG  47 53
IUJ46_RS08830 1716259 .. 1716269 +  -2.6  -3.44586   CGTGCCCATTATCTA                 TAAT TAT ATTA                 TTATGGTCCGTTGGT  47 32
IUJ46_RS08835 NONE
IUJ46_RS08840 NONE
IUJ46_RS08845 1716529 .. 1716542 +  -3.9   -2.8082   ATCCTGCTCCCGCAA               TACAT AAGT ATGTA                GTTGTTGGCTCGGTA  46 25
IUJ46_RS08850 1716622 .. 1716632 +  -2.6  -3.63744   TTCCGTCTCGCGCCA                 TTAA AGT TTAA                 TATTTTACGGAAAGA  48 24
IUJ46_RS08855 1716697 .. 1716713 +  -4.3  -3.42395   CGCTCCTTCGGGTTC              GGGGGTT CGA ATCCCTC              TCTTTCCATCCTAAA  53 1
IUJ46_RS08860 NONE
IUJ46_RS08865 NONE
IUJ46_RS08870 NONE
IUJ46_RS08875 1717070 .. 1717101 + -10.4  -4.43012   GGCCGCCGGTATACT      TGAAAAACAAGGTT TGTA AACCTTGTTTTTTG       TTTTGATCTTAAGCT 100 30
IUJ46_RS08885 NONE
IUJ46_RS08890 NONE
IUJ46_RS08895 1720815 .. 1720839 + -15.9  -4.57482   TTTTAATAAGAAAAA          TCCTCACATGT TTA ACATGTGAGGA          TTTATTTATAAATGC 100 35
       pbp1b 1725026 .. 1725062 +  -7.4  -4.15325   CAGTTAGGAAGAACA    GCAGTTAAATCACACT GATAA AGTCAGATTTAGCTGC    TCTTTTTGTGTCTAT  78 112
        rpoB 1728781 .. 1728791 +  -2.6  -4.03811   ATAAGCAATCAATTC                 TTAT TAA ATAA                 TTATTTACTGGTCTG  53 37
        rpoC 1732512 .. 1732527 +  -4.6  -5.38951   AATAATCTCATGAAA              GGGTCC TTAG GGGCTC               TTTTTTGTCTGAGTT  79 36
IUJ46_RS08925 1733048 .. 1733074 +  -6.8  -5.95539   CAAAATAAGTTAAAA         GAAAATATCA CTTCTTC TGATATTTTC         TTTTTTTGTTTACGA  95 55
        tadA NONE
IUJ46_RS08935 NONE
IUJ46_RS08940 NONE
IUJ46_RS08945 NONE
IUJ46_RS08950 NONE
IUJ46_RS08955 NONE
IUJ46_RS08960 1736723 .. 1736737 +  -2.9  -3.43264   CCCAAACAATATAGT               CAATA AATAG TATTG               TTGTCATAAATCCTT  47 20
IUJ46_RS08965 1737772 .. 1737783 +    -3  -5.58179   GGAAACTGAGTAATG                TCAA TTAA TTGA                 TTTTTTGTTATAATA  77 18
IUJ46_RS08970 1739060 .. 1739084 + -12.3  -5.28826   GTCTCAATAGATTAA          CCAAGTAAGGT AAC ACTTTACTTGG          TTTTTTATGAGGTTT 100 51
IUJ46_RS08975 1739523 .. 1739545 +    -2  -3.32561   TACGAGTCAGGTTCT           TTGTTAGATG ACT TGTCTAACGG           TTGAGTTTCCTGTCT  44 19
IUJ46_RS08990 NONE
IUJ46_RS08995 NONE
IUJ46_RS09000 1743254 .. 1743273 +  -7.2  -5.66338   ATGACCAGAAAAAAA            GGATTAGG AGCC CTTAATCC             TTTTTTCTTATGTTT  93 75
IUJ46_RS09005 1743877 .. 1743908 +  -3.9  -3.21416   CCTTACGAGTATGAA      CAAAGTTTCAA GTGCTAGATG TTGGAACTTTG       TTCATCATAGGAATA  49 151
         cpa NONE
        sipA 1751232 .. 1751246 +    -5  -3.53012   CGATTAAGAAACCAT               TAAGCT AAA GGCTTA               TTTAAAAAAGGAGAG  57 23
        fctA NONE
       srtC1 NONE
        fctB 1753747 .. 1753770 +    -4   -5.4505   AAGAAAAACCAAAAA          TTCCTTTA CTTAATGA TAAAGGAA           TTTTTTATTGCCCCA  79 91
IUJ46_RS09085 1759515 .. 1759534 +  -2.1   -3.1739   TTTTAAGGTCTGAGT            CCAGC AATTAGAAGC GCTGG             TTCATGAAATAATCT  44 86
IUJ46_RS09095 NONE
IUJ46_RS09100 NONE
IUJ46_RS09105 1763317 .. 1763339 +  -4.3  -3.60525   CAACAATGTCTATTT          TG-ACATCTT GGCT AAGATGTACA           TTGTGTCTCAGTAAC  54 284
IUJ46_RS09115 1764402 .. 1764416 +  -3.6  -2.56914   GAAGCAGTTATAGTG               TCTTAT GTA ATGAGA               TAGATTGGTGGAATA  45 28
IUJ46_RS09120 1765491 .. 1765501 +  -5.4  -3.37236   CTTTTAACAAGATAG                 CAGT TAT ACTG                 TTATCACATTGGCTT  57 61
IUJ46_RS09125 NONE
IUJ46_RS09130 NONE
IUJ46_RS09135 1768697 .. 1768716 +  -6.5  -2.74605   TCTTAAATAAAATTG            GATAAGG TATGGT CCTTATC             TAGATTTTAAAAAAC  57 21
IUJ46_RS09140 NONE
IUJ46_RS09145 NONE
IUJ46_RS09150 NONE
IUJ46_RS09155 NONE
IUJ46_RS09160 1774059 .. 1774069 +    -4  -2.78712   ACGATGACAAAGGTT                 TTTG TTG CAAA                 TGATTGAGTTGACCA  46 8
IUJ46_RS09165 1774798 .. 1774835 +  -5.6  -4.66609   TTAAGTAGTAAAAAA   GCAAGCCATCA-AAGGG ATTAA CCTAACTGATGGCTTGC   TTTTTAAGTAGCGTG  74 76
IUJ46_RS09180 1778769 .. 1778791 +    -7   -4.7339   GTCTAGTATGACAAA           GAGTTGGATA GCG TTTCCAGCTC           TTTTTACCGTTTGTT  83 44
IUJ46_RS09185 1780135 .. 1780164 + -10.1  -4.72986   AAACTGTACAATACC       GTCCAGAGTCG TCACGAAC CGACTTTGGAC        TTTTTAATAAAGGTG 100 40
        nusG 1780842 .. 1780872 + -10.6  -5.26875   CTATAGGCTCTCAAA       GGTTTGATGGTA TAAGTAT TACCATCAGACC       TTTTTTAGTTGGAAG 100 35
         nga 1782691 .. 1782705 +    -5  -4.20817   CTTATATGGAAGATA               TTTCTG ATC CAGAAG               TTATTTTAGAGTATG  64 169
IUJ46_RS09210 1785470 .. 1785498 +  -7.5  -5.45726   AAAATGAATTAAAAA        CAGCCTTTAAC TGCTAAT GTGAAAGGCTG        TTTTTTTAGGATATG  93 42
IUJ46_RS09230 1788550 .. 1788561 +  -4.4  -4.71061   ATTAGCCGATTTTGA                GCAA GCAC TTGC                 TTTTTAAGTCTGGCT  70 7
        leuS 1791339 .. 1791362 +   -14  -4.83593   ACTTATCTAGAAAAA          CCACAAGAAC GAAG GTTCTTGTGG           TTTTTAATCGTTGTT 100 120
IUJ46_RS09240 1793002 .. 1793012 +  -5.4  -4.07687   CTGCATCTTAAGAAA                 TAGC TCT GCTA                 TTTTAACAAAACAAT  63 43
IUJ46_RS09245 NONE
IUJ46_RS09250 1793986 .. 1794015 +  -2.2  -4.07568   TGGAAAGGATAAGAA       CTCTTAACCA GTTTGCACGG TGGCTAAGAG        TTTTAGGAAAAAGAG  52 71
IUJ46_RS09255 NONE
IUJ46_RS09260 NONE
IUJ46_RS09265 1796341 .. 1796363 +  -9.9  -4.19258   TGTTAATCATTGTTT           GGGCAAGTC CTTTT GACTTGTCC           TTTTCGATGAACTGT  93 99
IUJ46_RS09270 1798215 .. 1798243 +  -3.1  -3.10796   TCTAAAATTGAAAAA        CTCATTCATCGCG AGC TGCTATGAGTAAG        TGTTAAGTCGTCAAA  45 2
        ulaG 1799923 .. 1799936 +  -3.1   -4.8236   ATAATATAGTTATGT               TCTGT TCCG GCAGA                TTCTTTTTTTAAGTA  65 366
IUJ46_RS09280 NONE
IUJ46_RS09285 1803039 .. 1803058 +  -8.6  -4.74103   ATAGCAAATAGAGAA            GTCTAGGA ATTA TCCTAGGC             TTTTTAGGTTAACCA  93 55
        polA 1805776 .. 1805795 +  -3.6   -4.2092   TAGCTGGTACGAAGC            CAAATAAG TTTT CTTACTTG             TTATTTCTCATTTTG  59 19
IUJ46_RS09295 NONE
        perR 1806962 .. 1806981 +  -7.2  -3.57144   TAACCCTTAAATAAA            GGCATTAT AAAT ATAGTGCC             TTTACAAATCAAAAA  68 44
IUJ46_RS09305 1807566 .. 1807580 +  -4.3  -3.15581   AAAGATCGAAAAAGA               GATTC TTAGT GAATC               TATGTATTAATATTT  51 193
IUJ46_RS09310 NONE
IUJ46_RS09315 1809534 .. 1809556 + -11.4  -4.74706   TATCATTAACAACGA           GAGAGAATCA GAT TGGTTCTCTC           TTTTTGGATGTTCAA 100 82
        nadC 1813742 .. 1813786 + -15.4  -4.62054   TTGGACAAATAATTA TTGAAAGGATTTAGTTCTGT ATTGG ACAGGACTAAATCCTTTTAG TTTTGCTTTAATTCG 100 328
         tgt 1817409 .. 1817444 +  -9.8  -5.71712   AAAAATGCTATGATC    CTGGAACTGAGGGCGA TCTA TCGTCTTTGGTTTCAG     TTTTTTTGTATAGAC 100 43
IUJ46_RS09355 NONE
IUJ46_RS09360 1818494 .. 1818525 +   -16  -4.76041   TTAAGTTGTGTTGAA      CAGGTCTTGGCAGA TTTA TCTGCTAGGACCTG       TTTTTGGTGGGTCTC 100 57
IUJ46_RS09365 NONE
        tadA 1820023 .. 1820049 +  -5.1  -4.56775   ATAGAATATACAAAA         GGGCGTTTCCA AGTAC TAGAAGCGCTC         TTTTTCAGACCCAAT  69 152
         ffs 1822039 .. 1822050 +    -3  -3.88015   CTTTTTTTGTTGACT                TTAC TAAA GTAA                 TTTCCTCCTTCTATA  52 24
        speG 1823067 .. 1823078 +  -7.2   -5.2112   TTATTACGGTAAAGC                GGCC TCAG GGCC                 TTTTTTCATGATATT  89 246
IUJ46_RS09390 1824772 .. 1824806 + -18.1  -3.32294   AAGTAAAAGGGATAA     TAAAGTGCGCTTCCA GAACA TGGGAGCGCACTTTA     TTATACCAAATTTCA 100 146
IUJ46_RS09400 1828350 .. 1828367 +  -3.5  -3.56837   AAGATGATGAAAAAA             GAGATTCT CAA AGAA-CTC             TTCTAGTCTTTACGA  50 179
IUJ46_RS09405 1829250 .. 1829303 + -20.9  -3.58802   TAGGATGAAATGACT TA-AAAACCATAAAAATAAGGAGGGA TTT TCCCTCCTTATTTTTATGGTTTTGTC TTCTCTAGTGCTTTG 100 83
IUJ46_RS09420 NONE
IUJ46_RS09425 1833685 .. 1833700 +  -3.2  -3.85088   AGGAAGGGAGGAGTA              GTGATG AAAA CAGCAC               GTTTTTTCTGGTTTT  52 25
IUJ46_RS09430 1835483 .. 1835500 +  -8.4  -5.14563   AATAGATGGCATCAG             CTCCGC GTCTTA GCGGAG              TTTTTTGGTGAACAA  90 36
IUJ46_RS09435 1836372 .. 1836394 +  -2.6  -5.31545   ATGGCATGATTAAAA           GTGGTCCGTT TAA AGTTGACCGC           TTTTTTGCTATTCTT  72 40
IUJ46_RS09440 1836942 .. 1836968 +  -8.8  -3.31726   AAATGCTTATGACAG         CAGACCTATTCT TTA AGAGTGGGTTTG         TCTTGTATAGGGGAG  73 54
        radA 1838512 .. 1838522 +  -3.2  -3.85817   AACTAACAGCAAAAA                 TAGC TCT GCTG                 TTTCTCAAAAGGAGT  52 182
IUJ46_RS09450 1839059 .. 1839074 +    -9  -5.93252   AGTAGCCAAGTTGTA              GAGCTG AATT CAGCTC               TTTTTTATTTTTAAA 100 43
IUJ46_RS09455 1839899 .. 1839916 +  -4.1  -5.44119   CAAAATAACATAAAA             TCAGCTT TTTA GGGCTGA              TTTTTTTCGCCTAAG  82 42
        gltX 1841572 .. 1841595 +  -6.1  -5.39755   GTCACGACAACGAAA          GATTGAAGA TTAAGT TCTTCAGTC           TTTTTTATCGTTATC  86 88
IUJ46_RS09465 NONE
IUJ46_RS09470 NONE
IUJ46_RS09475 1845550 .. 1845563 +  -9.5   -5.1675   AAATCAGTATTAAAG               CCCGG CTTG CCGGG                TTTTTTGATAGGTAA 100 301
        rnpA NONE
IUJ46_RS09485 NONE
IUJ46_RS09490 1847906 .. 1847934 +  -8.3  -5.36441   AGATCCTAAAAAGAA        TCTTTGGTAGTTA GTT TAGCTATCGAAGA        TTTTTTGTATGGCCA  90 39
        rpmH 1848367 .. 1848389 +  -5.6  -5.15117   TACAACTAAAGTAAA           CCAAGAGT GCTCGAG GCTCTTGG           TTTTTTAACGTTTTC  79 51
IUJ46_RS09500 NONE
IUJ46_RS09505 1850704 .. 1850746 +  -7.1  -5.26119   TGTTCCTAACAAGTG GCTTCTTTTCAATGCACAT GTCAA ATGGTCACTGGAAAGAAGC TTTTCTTTTTAGAAA  89 42
IUJ46_RS09510 NONE
IUJ46_RS09515 NONE
IUJ46_RS09520 NONE
IUJ46_RS09525 NONE
IUJ46_RS09530 1855307 .. 1855353 +  -7.4  -3.93963   ACGACCCTTTAAAAA GAAAACAACGCCCTTTTTGCTA TTG TAGTCTAAAGGTCGTTATTTTC TTTGTCAATAATAGT  76 107
IUJ46_RS09540 NONE
        rnmV 1857827 .. 1857845 +  -3.1  -2.78384   AATAAAATATAACAG             CCCCATT AACTG AATGGCG             TGTCCTGGCAAAAAA  44 48
        rsmA 1859033 .. 1859044 +  -4.4  -4.90266   TACCTCAAAAAATCA                TCAG TGAT CTGA                 TTTTTAGTTGATAAA  73 268
        rsgA NONE
         rpe NONE
IUJ46_RS09565 NONE
IUJ46_RS09570 NONE
IUJ46_RS09575 1863642 .. 1863664 +  -9.3  -4.77216   TTTTGATGTGCTTAA           CACTTATGA TGGTT TCATAAGTG           TTTTTGGCTCTTGTT 100 83
        purR NONE
IUJ46_RS09585 1867354 .. 1867384 +  -4.1   -5.1166   TCTATTTGACATGAA      GTGCCGTCT-GTGT TATT ATATTAGACGGTAC       TTTTTACTTTTGGTC  76 77
        rpsL NONE
        rpsG 1868705 .. 1868725 +  -9.7  -4.75372   CAAATATTTAGATAA            CGGGTAGGT CCT GCCTATCCG            TTTTTGCTAAATAGT 100 316
        fusA 1870870 .. 1870896 +  -8.9  -5.21709   AATAACCACCACTAA        GAGGTTGAGGAT AACT ATCCT-AACCTC         TTTTTTAGTGTAACA  95 36
         gap 1872373 .. 1872399 +  -5.2  -5.72616   AACTGTATACAAAAA         GGCTAAGATG GAAGGGG TGTCTTAGCC         TTTTTTTGTCTGACT  86 181
IUJ46_RS09625 1877081 .. 1877092 +  -3.6  -4.08216   ATTAGTGGTGGTGGC                GGCG GCGG TGCC                 TTTTAAAAAAGCTGC  57 8
IUJ46_RS09630 1878027 .. 1878050 + -12.4  -4.83759   ATCGTTTAGGATGTT          GCGACAGACC TTGG GGACTGTCGC           TTTTTAAATTTCCTT 100 49
        mecA NONE
IUJ46_RS09640 1880144 .. 1880160 +  -3.7  -3.94438   CCATTATAAAAAAAG              CAGTG CAAATGA CACTG              TCTTTTCTTGAGATG  57 83
        sufC 1880997 .. 1881020 +  -2.5  -2.84707   TTTGGAGACAATTAC          TTTAGCTTT CTACAA AAAGCTAGG           TGATGTTCTATATAC  42 44
        sufD NONE
IUJ46_RS09655 NONE
IUJ46_RS09660 NONE
        sufB 1885577 .. 1885616 + -13.9  -3.54158   AACACGTAAGATAAC  ATATCAAAAACCTCTGT GCTTTG ACAGAGGTTTTTGATAA   TTCATTATTGGCGTC 100 133
IUJ46_RS09680 1890510 .. 1890553 + -15.6  -3.01924   GAAAAATAAAACGAT GTTCAAAAGAACTTTCTCGT TTAT GTGAGGGAGTTCTTTTGAAC TATTGAGGACAACTA 100 32
IUJ46_RS09685 NONE
IUJ46_RS09690 NONE
IUJ46_RS09695 NONE
IUJ46_RS09700 1895182 .. 1895197 +  -3.3  -5.86465   AGAACTCGTCTTTGT              CCATT TTTTAT AATGG               TTTTTTTGTCTTCTT  89 216
IUJ46_RS09705 1897569 .. 1897582 +  -2.3  -3.06796   TATTTAGTTTTGAGA               GGTCT TGTG GGGCC                TTAGCTCAGCTGGGA  42 69
IUJ46_RS09710 1897922 .. 1897939 +  -7.1  -2.50994   TATTTAATAAGTTTT             CTAGTTT AAAA AAACTAG              GTTAATAAGGTTAAG  60 296
IUJ46_RS09715 NONE
         rrf NONE
IUJ46_RS09725 1901139 .. 1901156 +  -6.3  -5.61824   GGCGGAGTAGAGAGA             GGTAGGA AGCG TCCTATC              TTTTTTTGCATTTTA  89 33
IUJ46_RS09730 1901296 .. 1901319 +   -14  -5.73339   GCATAATGAAAAAAA          CAACAGGACA TTAA TGTCCTGTTG           TTTTTTTGTGGTTCT 100 37
IUJ46_RS09735 1902158 .. 1902185 + -12.2  -5.04597   AATCATTTGTGATTA        TCTTATCAGGAG TTGA CTCTTGATAAGA         TTTTTGTATATCAGT 100 323
IUJ46_RS09745 1903665 .. 1903681 +  -4.4  -3.75832   ATGAAGAGAAAGTTT              TCATGC GTACG GCGTGA              TTTAACTATGGTTTT  57 9
IUJ46_RS09750 NONE
        yqeH 1905383 .. 1905393 +  -3.2  -3.92542   GGTTGCTGTCATTGT                 TCGT AAA GCGA                 TTATTTAAAAATAAA  55 7
        yhbY 1905731 .. 1905758 +  -5.6  -4.36914   TAAAGTTAAAGCAAT        CTAGTCCTTTTA TTTG TATAGGGACTGG         TTTTATGAGACGAGG  69 22
IUJ46_RS09765 NONE
        yqeK NONE
        rsfS 1907416 .. 1907434 +  -6.7  -4.60487   AATGTTACAAAGAGA             CCTTGTC AATAC GACAGGG             TTTTTGAGGATGATA  76 39
IUJ46_RS09780 1908271 .. 1908281 +  -5.4    -3.224   AAAAGAGTTCATTAG                 GCAT TAA ATGC                 TATTATCAAAGCTTA  55 103
IUJ46_RS09785 1909545 .. 1909565 +    -7  -5.41746   ATAAAAAATGAGAGG            CTCAATTA AACTC TAATTGAG            TTTTTTTGGGGGCTT  93 17
IUJ46_RS09790 1910773 .. 1910794 +  -8.1  -4.68994   ATAGAATAATAAAAA           GAGTTGAAA TCTA TTTCAGCTC            TTTTTAAGTGATGCT  86 47
IUJ46_RS09795 1911809 .. 1911832 +  -2.5  -4.91109   TAAACCATCTATTAA          CCAGTTATTC ATCTA GAA-GACTGG          TTTTTCTGATCGGAA  66 38
IUJ46_RS09800 1913151 .. 1913166 +  -5.4  -2.83409   GTCATGATTATGCAG              GCGATG AAAA CATTGC               TATCGTAGATTACTG  52 206
IUJ46_RS09805 1914473 .. 1914484 +    -3  -3.30203   CGGTGTTATTGAAAA                CAAA ACGA TTTG                 TTGGGTTATTGATAA   0 214
        pbp3 1886918 .. 1886941 -  -6.8  -5.24003   AATAAAAATGAAAAA          GACTG-CAGAA GTA CTCTGTCAGTC          AATGTCATACAAAAA  85 54
IUJ46_RS09670 1885578 .. 1885615 - -17.4  -3.42884   ACACGTAAGATAACA   TATCAAAAACCTCTGT GCTTTG ACAGAGGTTTTTGATA    ATTCATTATTGGCGT 100 31
IUJ46_RS09620 NONE
IUJ46_RS09615 1872665 .. 1872693 -  -2.5  -5.15969   TTTGAATTGAAAAAA        GACCCAACT GGCATAGAAAT AGTTGGATC        CTTTATCTTATTTTA  69 33
IUJ46_RS09610 1872373 .. 1872399 -  -3.8  -4.98522   AACTGTATACAAAAA         GGCTAAGA TGGAAGGGGTG TCTTAGCC         TTTTTTTGTCTGACT  70 69
IUJ46_RS09535 1855307 .. 1855353 -  -7.4  -4.58663   ACGACCCTTTAAAAA GAAAACAACGCCCTTTTTGCTA TTG TAGTCTAAAGGTCGTTATTTTC TTTGTCAATAATAGT  82 8
IUJ46_RS09415 NONE
        galU 1829248 .. 1829304 - -15.5  -2.98761   AGTAGGATGAAATGA CTTAAAAACCATAAAAATAAGGAGGGA TTT TCCCTCCTTATTTTTATGGTTTTGTCT TCTCTAGTGCTTTGC 100 12
IUJ46_RS09395 1824765 .. 1824813 - -20.6  -4.43309   CAAGGTTAAGTAAAA GGGATAATAAAGTGCGCTTCCA GAACA TGGGAGCGCACTTTATTATACC AAATTTCAGATAAGA 100 212
IUJ46_RS09375 1820023 .. 1820049 -  -3.6  -4.72127   ATAGAATATACAAAA         GGGCGTTTCCAA GTA CTAGAAGCGCTC         TTTTTCAGACCCAAT  67 486
IUJ46_RS09345 1815091 .. 1815131 - -12.7  -4.45201   TTTCATAAAAAAATA  GCACCCCAATCGTTAGA TTTTGTG TCTAACTTTTGGGGTGC  AGTTCAAGGGCTATT 100 61
IUJ46_RS09340 1813644 .. 1813658 -  -2.9  -3.25088   CGCCAAATCCATGAA               GAAAA TTTTG TTTTC               AGAAATCACGATTCA  45 106
IUJ46_RS09330 1810775 .. 1810801 - -14.5  -3.23395   ATTGAGCATGACGAA         GTGCGCTCCCA TGTCC TGGGAACGCAC         TTTCTCCATATTTTT  95 257
IUJ46_RS09225 1786539 .. 1786567 -  -2.4   -3.2672   ATCTGAATAAGAAAT        GTGGCGACCT AGGATTAGA AAACCGCCAC        GAGATGGTTTTTTAT  44 77
IUJ46_RS09220 1786185 .. 1786212 -   -12  -4.88407   TTAGCCAATCAAAAA        GCCTAAGGCTGC TTAT GCAGTCCTAGGC         TTTTCATAACCGTAG 100 80
IUJ46_RS09215 1785470 .. 1785498 -  -7.5  -4.97312   AAAATGAATTAAAAA        CAGCCTTTAAC TGCTAAT GTGAAAGGCTG        TTTTTTTAGGATATG  88 182
IUJ46_RS09175 NONE
IUJ46_RS09170 1774798 .. 1774835 -  -6.5   -5.2189   TTAAGTAGTAAAAAA  GCAAGCCATCAA--AGG GATTAA CCTAACTGATGGCTTGC   TTTTTAAGTAGCGTG  85 57
IUJ46_RS09110 1762752 .. 1762765 -  -2.3  -4.45577   AGAAATTGCAGAAAA               TGGAG ATAT CGCCA                ATTACCTGATTCCAG  59 440
IUJ46_RS09080 1756868 .. 1756888 - -13.3  -4.20769   AGATTGTAATAGAAA            CTGGTGGAC TTT GCCCACCAG            TTTTTTGGGGTACGG 100 171
        tnpB 1755422 .. 1755447 -  -6.9  -4.66987   TATACCTGAAGAAAA         GCCATGAGTTC AATA GAAATCATGAC          TTTTTGAAATTTTTA  83 9
IUJ46_RS09060 NONE
IUJ46_RS09055 1753747 .. 1753770 -  -4.7  -5.24003   AAGAAAAACCAAAAA          TTCCTTTAC TTAATG ATAAAGGAA           TTTTTTATTGCCCCA  80 123
        rofA 1746588 .. 1746607 -  -4.3  -5.25893   ATAGACAGTAAAAAA            TCCCAGAG AATGA CTC-GGGA            TTAAGTTAAGGTGTG  79 73
        hslO 1745641 .. 1745657 -  -3.7  -2.74877   AAAGGAAGAATTAAG              CTTTATC ACT GATAATG              GCCTCCAAATCACTT  45 4
        dusB NONE
IUJ46_RS09010 1743731 .. 1743743 -  -6.3  -3.31461   GATTTAGTCTTAGAA                GAAGA TAC TCTTC                CCTTTTGATAGAGGA  61 293
        pepA NONE
        proC NONE
        tyrS 1721252 .. 1721265 -  -8.1  -5.14563   CTCCTTATGAAAAAA               CGAGC CAGA GCTCG                TTTAATCGGTTATCT  90 39
IUJ46_RS08900 1720815 .. 1720839 - -15.9  -5.29445   TTTTAATAAGAAAAA          TCCTCACATGT TTA ACATGTGAGGA          TTTATTTATAAATGC 100 31
IUJ46_RS08585 1676692 .. 1676712 -  -6.2  -5.84381   GCATTAATAAAAAAA            TGTGGTCT AATTA AAACCACA            TTTTTTATTAAAAGA  93 54
        rlmH 1628074 .. 1628088 -  -5.7   -5.5762   ATCAAAGATAAAAAA               GCACT GTTTT AGTGC               TTTTTTTGTATTTAC  84 156
IUJ46_RS08265 1626773 .. 1626787 -    -5  -6.20267   GGAAAAAGAAAAAAA               TTGCCA AAA TGACAA               TTGCGATAGTCCGTA  95 29
IUJ46_RS08260 1626656 .. 1626674 - -10.4  -5.99154   TACTAAATAAAAAAA             TCCTAAGA TTA TCTTAGGA             AATATCTTATCACTC 100 37
        trpS 1619410 .. 1619428 -  -3.2  -4.53777   TTTAATCAAAAATAA             GACTATAT AAA ACATAATC             TCTACTATCCTGTAA  62 117
        guaB 1617686 .. 1617708 -  -6.2  -5.47159   TTTTAATATAAAAAA           GAGCTGGCAC AAT ATGTCAGCCC           TTAAAGTTACTAAAT  86 48
IUJ46_RS08230 1616612 .. 1616657 - -12.3  -3.20382   TCTGATATTCACTAA TAACATCAAAAAAGGGTTCAGT TAA ACTGAGCC-TTTTTTGATATTA TGTGGCGATTAAGAT  91 34
IUJ46_RS08200 NONE
IUJ46_RS08195 NONE
IUJ46_RS08190 NONE
        pgsA NONE
IUJ46_RS08180 NONE
IUJ46_RS08175 NONE
IUJ46_RS08170 1604049 .. 1604089 - -12.1  -4.84642   CTCAAATGAAGAAAA  GTACCTCAATCATTAGATA TTG TATCTAACTTTTGAGGTAC  AATTCACTTCTTACT 100 70
IUJ46_RS08165 1603095 .. 1603122 - -14.4    -4.946   ATTAAATACCAAAAA        CCTATTGTTAGT AAAT ACTAACAATAGG         TTTTATTTCTTCCAG 100 51
        mnmA 1599626 .. 1599636 -  -2.6  -4.60889   AACTATTTTTAAAAA                 TAAT GTG ATTA                 TATTTAAAATATACA  60 150
IUJ46_RS08145 1598609 .. 1598623 -  -4.2  -3.03124   GTTTAGCCTTCAATA               CGGACA ATA TGTCCT               GGCCATTTAGCCAAC  50 69
        mnmG 1596593 .. 1596609 -  -5.8  -5.34555   TTATACCATAAAAAA              GCCCTG AAATA CAGAGC              TTCCACTTGCTTTGA  84 61
IUJ46_RS08135 NONE
        rplI NONE
        dnaB NONE
IUJ46_RS08120 1592425 .. 1592437 -  -9.1  -5.28942   TATTGTAAAGAAAAA                GCCTC TAT GAGGC                AAAAATCAATCTAAA 100 31
IUJ46_RS08115 NONE
IUJ46_RS08110 1590437 .. 1590451 -  -2.8  -3.61164   AACGGTTTAAAAAAT               CCTG ATTCGTG CAGG               GGGTTTTCGCCTAAA  48 164
        rpsD 1589738 .. 1589752 -  -8.6  -5.76633   TGAGATACAAAAAAA               GCCTAT TAA ATAGGC               TTTTTGTAAGTTTAA  95 49
IUJ46_RS08095 1586585 .. 1586603 -  -7.5  -5.64304   CAAGACAATAAAAAA             CTTGACA GAAAT TGTCAAG             TTATTGTCAAAATAA  93 103
IUJ46_RS08075 1583716 .. 1583727 -  -4.4  -4.82901   GTTTGTTGACAAAAA                GTTG ACGC CAAC                 AAACTAGTGCTCTAT  70 37
IUJ46_RS08065 1581919 .. 1581944 -  -6.2  -4.51378   ATTGAGATGAGAAAA         GCCTATGAAA TGAACG TTTCAAAGGC          TTTTTTCGTGTTTAA  74 196
        hisS 1576046 .. 1576083 - -11.5  -4.83243   CTTACAGAAAACAAA   CAGGTGCAACTCC-CTTC TAA AAAGAGAAGTTACACCTG   TTTTAGTGATTATCT 100 86
        aspS NONE
IUJ46_RS08010 NONE
IUJ46_RS08005 NONE
IUJ46_RS08000 1571282 .. 1571313 -  -9.7  -4.25283   AGTGGGGGACCAAAA      TAAAAATACAGGC TGTTTG ACCTGTATTTTTA       TTTATCATAATTTCT  93 23
        argR 1568232 .. 1568247 -  -3.2  -2.65409   TAATCATCAATTAAT              GGCTGA TGAC TGAGCC               TATCTTCTAGTTCTT  43 247
        mutS 1565532 .. 1565555 -  -7.5  -5.24796   TTGACAGAACAAAAA          GATGCCTTC AATATA GAAAGCATC           TTTTTCATTTTCAGC  89 48
        mutL NONE
IUJ46_RS07965 NONE
        ruvA 1561622 .. 1561635 -  -5.3  -2.53641   GAACCCATGAGCAAC               GTTTC ATGT GAAAC                ACCTACCCTTTCATT  51 28
IUJ46_RS07955 1561049 .. 1561075 -  -8.9  -5.15634   CATTTTATCAAAAAA         TCTTCCAATTC ACGAA GAATTAGAAGA         TTCTATTGAAAACAC  95 18
IUJ46_RS07950 1559683 .. 1559698 -  -2.6  -3.23216   CGTCAGCAGGATTAA              TCTACA TAAT TGTAAA               CCATATCCTACTATA  45 55
        recA 1558486 .. 1558497 -  -7.2   -4.6644   AATACATTTTAAAAA                GCCC TGAA GGGC                 TCTTTTTAATCTTCA  83 31
         spx 1557799 .. 1557811 -  -7.7  -5.47821   AGGTATTTAAAAAAA                GCTCT ACA AGAGC                TTTTAGAGTGCAGCA  93 28
IUJ46_RS07935 NONE
        ruvX NONE
IUJ46_RS07925 1556658 .. 1556672 -  -5.7   -5.6473   ATAACATTAAAAAAA               TAGCC CTCAC GGCTA               CTTTTTAACATAGTG  86 52
IUJ46_RS07920 1554676 .. 1554719 -   -10  -5.68023   CGACAACTAAAAAAA TCAATATATTGTG-TCAAG TTTTTTG CTCGAACACAATATATTGA TATTAAATTACTTTT 100 33
        nrdD 1552357 .. 1552387 - -10.7  -4.06533   GAAACCATTAAACAA       TAAAAGATTGCTT GCATG AAGCAACCTTTTA       AGCATATCATATTTC  93 70
IUJ46_RS07910 NONE
IUJ46_RS07905 1551137 .. 1551153 -  -3.7  -3.26471   TTATTTCCATATCAA              TTCCTAA TCC TTAGGCA              ACTCTACCGTTAACT  49 12
IUJ46_RS07900 NONE
        nrdG 1549826 .. 1549839 -  -8.1  -5.21709   GTCTATATCAAAAAA               GAGGC CTAG GCCTC                TTTTTTAGTCTTTAT  90 194
IUJ46_RS07880 1547413 .. 1547431 - -13.2  -5.51046   TAAAGACAGAAAAAA             GCCTTGCA AAA TGCAAGGC             TTGCTTTTCTTTTTC 100 273
        treP 1544406 .. 1544434 - -11.2  -3.63744   TTCCTCCCTAAAATA       GTTTCAGGAACTG ATCT CAGTTCCTGAA-C        GTTTTCTCTTAGTAA  90 43
        treC 1542730 .. 1542750 - -13.3  -4.37527   TGACAATCAGCAAAA            GCCTGAGGC CTA ACCTCAGGC            TTTTAGTTAGTTATC 100 32
        pepO 1540584 .. 1540608 - -13.7  -5.32565   TAAGGAAGCAAAAAA          CTGATCCTGTG TTT CACAGAATCAG          TCATTTTTATAATCA 100 71
IUJ46_RS07845 1535141 .. 1535162 - -10.2  -4.28977   ACAACATAGCTAAAA           CCCTCTGA TTCACT TCAGAGGG            TTTTCCTTAGCTTTT 100 32
        hutI 1523289 .. 1523316 - -11.4   -4.2535   ACAGCATATTTAAAA        GAAGTTTTGAGC TAAC GCTCAAAGCTTC         TTTTTTAAATTTTTT 100 39
IUJ46_RS07785 1520629 .. 1520665 -    -6  -5.75538   CGCAAAAAATAAAAA   CCTTGATTTAACAACGT TTTC ACGAAGTTAA-TCAAGG    CTTGTTTTGTATATA  88 39
IUJ46_RS07780 1519912 .. 1519935 -  -7.4  -5.42514   GTAGAAATCAAAAAA          GCAGTTGCTG TTTC CAACATCTGC           TTCTCTTTAGTTACT  93 50
IUJ46_RS07775 NONE
IUJ46_RS07770 1516716 .. 1516744 -  -9.8  -3.75015   AGAATCTTTAGTAAA       GTTAGCACTC-AT GTTC ATCGAGTGCTAAC        TTTATATTCTATTTT  83 140
       groES NONE
        groL 1514615 .. 1514651 -  -7.4  -5.68023   TCACAACTAAAAAAA    CAAAGATGGGATATCA TGAGT CGAAATCCAATCTTTG    TTCTTTTTTCATAGT  93 98
IUJ46_RS07750 1513728 .. 1513748 -  -6.9  -3.58365   TAGTATACTAGATAA            GACTTAAAG AAA CCTTAAGCC            AAAAAAACAACAAGA  68 426
IUJ46_RS07735 1510028 .. 1510068 - -14.9  -3.57792   TGACGCAGTCTTAAA  CGCTCAAAAGGCTAGGAAA TAA TCTCCTAGCCTTTTGAGTT  TATCTGTTTTCATAG 100 95
IUJ46_RS07720 1508083 .. 1508099 -    -3  -2.77222   ACTATGATCTTAAAG              TAACCT TGATT AGGTCA              TCGAAATATGCTTTG  43 18
       pbp2a NONE
        rpmG NONE
        secE 1505264 .. 1505283 - -13.6  -5.34555   TGATACTACAAAAAA            GGCTGGGA ATAC TCCCAGCC             TAGGCTTTTCCAAGC 100 68
IUJ46_RS07695 NONE
IUJ46_RS07690 1502392 .. 1502414 -  -5.5  -5.99154   CATCAAACAAAAAAA          GCCC-TGACC GTTT GGTCTTGGGC           CTCTATAAATATCAT  93 59
IUJ46_RS07685 NONE
IUJ46_RS07680 NONE
IUJ46_RS07675 1500145 .. 1500164 -  -5.7  -5.00616   TCTTTTTCTAAAAAA            CCACCTC TAACTG GAGATGG             TCTCAAGAATTTGGT  77 51
IUJ46_RS07670 NONE
IUJ46_RS07665 NONE
IUJ46_RS07660 1495657 .. 1495695 -   -17  -3.01329   CCAACCAACAATAAG   CAAAACAAGTCTAGGAAG TGA CTCCCTAGACTTGTTTTT   TTGAGGTTATCTGGC 100 67
        sdaB 1493860 .. 1493879 -  -7.2  -5.06735   GACAAATCATAAAAA            GCAATGAC GACA ATCATTGC             TTTTTCTAGTATTTT  88 113
IUJ46_RS07640 1492154 .. 1492166 -  -3.3  -4.07568   TGGTTTTGGTCAAAA                GACGC TAT GAGTC                GTTGCACTTATCATC  55 74
        speB NONE
IUJ46_RS07630 1490209 .. 1490240 - -12.4  -4.31329   TCAAAAATCGTAAAA      GGACTGAGTCCCAT CTCT ACAGAACTCAGTCC       TTTACCTTGGCATCT 100 225
        prsA 1488874 .. 1488907 - -15.6  -2.60496   CTGGTTTTTAAATAT     TAAAGACTCTATCC TTATTT GGATAGAGTCTTTA      GCTTTATGACATTGC 100 149
IUJ46_RS07615 NONE
IUJ46_RS07610 1487382 .. 1487419 -  -2.8  -5.45802   TTTGGAAAACAAAAA   TCATATAACCGTTC GCTCACATAA GCACGGGTATATGA    TTTTGTACATTTGCG  76 154
IUJ46_RS07605 NONE
IUJ46_RS07600 NONE
IUJ46_RS07595 1483916 .. 1483937 -  -5.9  -3.14136   GTATCAAGCAGCTAA           GGATGAC ATCAAAGG GTCATCC            TTTTTGACTTTTATG  57 54
IUJ46_RS07590 NONE
IUJ46_RS07585 NONE
IUJ46_RS07580 NONE
IUJ46_RS07575 1479721 .. 1479758 - -10.9  -5.36314   CAAAAGACCAAAAAA   CTTCCAATAACTTAG CTCGTGCT CTAAATTATTGGAAG    ATTATTTGACCTATT 100 44
         mga 1477367 .. 1477381 -  -4.2  -4.24342   TTTTTTAGGAAGAAA               CCCTCA TTT TCAGGG               TTTAACTCTAATAAT  62 117
         emm 1475821 .. 1475842 - -13.1  -4.60797   CTTCTATACATAAAA           GAGAGAACC GACT GGTTCTCTC            TTGATGTTCACTCAG 100 58
IUJ46_RS07560 1474479 .. 1474500 - -13.1  -4.60797   CTTCTATACATAAAA           GAGAGAACC GACT GGTTCTCTC            TTGATGTTCACTCAG 100 58
         sic 1472970 .. 1472994 - -10.1  -5.38348   AAAAACACTAAAAAA          GACAAACACCA AAT CGATGTTTGTC          TTCAATCTGTTCTAG 100 458
      scpA/B NONE
        fbpA 1466278 .. 1466304 - -16.8  -5.50499   GCACATCTAAAAAAA         TAGAGAGAACCA AAT TGGTTCTCTCTA         TTAAATAAGCTCTTA 100 56
         lmb NONE
IUJ46_RS07530 1462566 .. 1462582 -  -6.7  -2.66787   CTAACATGGATACCA              TTTCTTT GCA AAAGAAA              ACCGCTATTATCCAA  57 132
IUJ46_RS07525 1462297 .. 1462311 -   -10  -5.56568   ACACCATTAAAAAAA               CCAGCT TAC AGCTGG               TTTTTTAATTATTTT 100 34
IUJ46_RS07495 1456583 .. 1456595 -  -4.9  -2.58999   CTTTTATACACTAAG                CTATT CCA AATAG                ATTGAATCCTCTAAA  50 263
IUJ46_RS07450 NONE
        prmA NONE
IUJ46_RS07440 1447929 .. 1447954 -  -3.9  -5.87996   GAAGCAATAAAAAAA         GGCCGTTGACA CAAT CGTGAACTGCC          TGTCCGTTTCTTTAG  90 72
IUJ46_RS07435 1445417 .. 1445428 -  -2.2  -2.73771   CCATAGGGCCTAAAC                CAGC TATG GCTA                 TTACCTATCACTATC  40 54
IUJ46_RS07430 1444432 .. 1444469 -   -23  -3.82218   ACTGACATGACTAAA   GAGGTCTAACCAGCTC TACCTT GAGCTGGTTAGACCTC    TTTGTGTTCTCCTAA 100 112
        slc1 1442187 .. 1442212 - -12.7  -4.72272   GCTCCCGACCAAAAA         TAGAGAGAACC AAGG GGCTCTCTCTA          TTATGTTTGCTTATC 100 65
IUJ46_RS07415 NONE
         dtd 1439266 .. 1439295 -  -8.7  -5.66684   TAACTGACAAAAAAA       GCAAGCAACACGCT ATC AACA-GTTGCTTGC       TTTTTTCTAACCTCT  95 53
IUJ46_RS07400 1436677 .. 1436694 -  -4.1   -5.1675   CCAGGCAGCAAAAAA             GAAAGCC CTGT GCCTTTC              CTAATATTTCAACAA  76 26
        ugpC 1435217 .. 1435249 - -11.5  -3.54488   TTTGCGCAAATAACA      TGATAAAAAGGCTGG AAC CCAACCTTTTTATGA      ATATCGCTTATACCT  90 40
IUJ46_RS07390 1433463 .. 1433493 - -11.3  -4.32649   ATCTCAAAAATTAAA      CAGCCAAAACGAGT TTCC ACTCGCTT-GGCTG       TTGGGTAAACTCAAA 100 54
IUJ46_RS07385 NONE
IUJ46_RS07380 1429320 .. 1429331 -  -2.2  -2.90496   GTCTTCTTTAAACGA                GACGC TAA GCG-C                AGTGCTTTACTCACG  41 32
        yajC 1428825 .. 1428846 -  -3.1  -5.83211   GATCAAAACAAAAAA           GTTTGGCATA TTT CAT-CCAAAC           TTTCCCCGCCTTAAT  89 36
IUJ46_RS07370 NONE
IUJ46_RS07365 NONE
        rseP 1425667 .. 1425700 - -12.6  -3.15544   TTTCATTTTGAGTAA     GACCTCAACCCT TGCAAATCTT AGGGTTGAGGTC      TTTTTCGATCTTTAA  91 75
IUJ46_RS07355 1423659 .. 1423683 -    -5  -4.80882   AGTTCACAGCAAAAA         GAGGCCACTCT AAAC AG-GCAGCCTC          TTCATTTCTTTTTTA  72 38
IUJ46_RS07350 1419028 .. 1419042 -  -3.6  -2.62616   TGACTTTGCATATTA               CTATCA TCA TGATAA               TCTAGAAAAAGTCAT  45 27
IUJ46_RS07345 1418474 .. 1418488 -  -7.2  -2.94199   TATGTAGTAATTATA               TCTTCT CTA AGAAGA               GCTGTAAAGAGATTT  62 43
IUJ46_RS07340 1417808 .. 1417819 -  -3.6  -5.85737   AGACTAACAAAAAAA                GGCC CTTT AGCC                 TTTTTTTGTTAGTCT  90 39
IUJ46_RS07325 1416548 .. 1416558 -  -3.2  -2.85147   CTTAAGCAACAGAAC                 TAGC AAG GCCA                 AATAGCCAAGAGGCT  44 1
        rpsO 1415942 .. 1415979 - -15.9  -2.78384   TTTTTCTTCATGATA   CAACAAAAGATACCTCA TCAC TGAGATACCTTTTGTTG    TTAAATAAAATCATC 100 153
IUJ46_RS07315 NONE
IUJ46_RS07310 1412947 .. 1412964 -  -4.9  -3.69256   ACCCATCTAAGATAA             TCAAAAG ACTT CCTTTGA              AACCAACAGCTCCAA  57 479
IUJ46_RS07300 1411239 .. 1411256 -  -4.1   -6.0458   ACAAAGCAAAAAAAA             GCAGG TTGGTATG CCTGC              TTTCGTCTCCTAATA  93 41
         pnp NONE
IUJ46_RS07290 NONE
        cysE 1407069 .. 1407087 - -11.8  -4.90266   TTTATTAACGAAAAA             CCTTCACA ACC TGTGAAGG             CTTCAGAAAGTAGAC 100 462
IUJ46_RS07280 NONE
        cysS NONE
IUJ46_RS07270 1405017 .. 1405040 -    -9  -4.29738   TCAGACCTATGAAAA          TAAGAGTCTCC TAG GG-GACTCTTA          TGAGGATATCAATTG  89 23
IUJ46_RS07265 1404014 .. 1404024 -    -4  -2.66634   GAGTTTATTATACCA                 TGAA TGC TTCA                 AAATAAATGCATAGA  45 46
        rlmB NONE
IUJ46_RS07255 1402703 .. 1402717 -  -4.9  -5.52986   ATTTTATCAAAAAAA               CCCGC ACTTG GCGAG               TCGTAATTCTCATTA  83 38
IUJ46_RS07250 1401739 .. 1401762 -  -8.2   -5.2189   TTAAGCAGCAAAAAA          GGATTGAGGA TTTC TCTTCAATCC           TTATAAGGGATTAAC  90 36
IUJ46_RS07245 NONE
IUJ46_RS07240 1400907 .. 1400923 -  -6.5  -2.65298   TCGATTTAGGAGAAT              GGCAGAG CTG CTCTGCT              GGTGTTAACGAGAAT  57 30
        rplM NONE
        rpsI 1399798 .. 1399824 - -12.4  -5.77632   AAAACGACAAAAAAA         GCACCTTGCAAG AGA CTTGCAAAATGC         TTGTAATCGTTGATG 100 52
        lacA NONE
        lacB 1395158 .. 1395174 -  -5.1  -2.86124   TTTATTCAAATATTA              GTCGTGA TAT TCACCAC              GGTCCCATTTTTCTA  51 6
IUJ46_RS07195 NONE
        lacD NONE
IUJ46_RS07185 NONE
IUJ46_RS07180 1391096 .. 1391133 - -11.7  -4.59511   AATATCTTTCAAAAA   TAAAGTTCCCAAA-ACAA TTT TTGTGTTTGAGAACTTTA   CGACATTTAAACTGT 100 45
        lacG 1389533 .. 1389550 -  -2.7   -3.3334   AACCCGATCTTACAA             CTAATGG ATTA CCATCAA              CAGCAAATAATACTA  45 134
IUJ46_RS07170 1388942 .. 1388968 - -12.4  -4.68994   ACCACTACTTAAAAA         TCCTGCCTAGAC TGA GTCTAAACAGGA         AATTTTTAGTCTGCT 100 58
IUJ46_RS07165 NONE
IUJ46_RS07160 NONE
IUJ46_RS07155 NONE
IUJ46_RS07150 1384098 .. 1384112 -  -4.4   -2.7644   ACTTAATCGTTAAAG               TTAAAA GAT TTTTAA               AATTAATTTTTGATT  47 28
IUJ46_RS07145 NONE
IUJ46_RS07140 1381888 .. 1381910 - -11.4  -3.17714   GGAAATCCCTAGCAA           CGACACAAGT AAA ACTTATGTCG           TTTGATTATCTGCAA  87 42
IUJ46_RS07120 1374165 .. 1374179 -  -2.9  -2.85987   ATCGAAAATAGATGA               GTTTA CTTAT TAAAC               TGAGCTATCAATAGC  42 13
IUJ46_RS07115 1372176 .. 1372189 -  -2.3  -3.06796   TCCCAGCTGAGCTAA               GGCCC CACA AGACC                TCTCAAAACTAAATA  42 69
IUJ46_RS07110 1371819 .. 1371836 -  -7.1  -2.50994   CTTAACCTTATTAAC             CTAGTTT TTTT AAACTAG              AAAACTTATTAAATA  60 296
IUJ46_RS07105 NONE
         rrf NONE
IUJ46_RS07095 1368602 .. 1368619 -  -6.3  -5.61824   TAAAATGCAAAAAAA             GATAGGA CGCT TCCTACC              TCTCTCTACTCCGCC  89 33
IUJ46_RS07090 1368439 .. 1368462 -   -14  -5.73339   AGAACCACAAAAAAA          CAACAGGACA TTAA TGTCCTGTTG           TTTTTTTCATTATGC 100 37
IUJ46_RS07085 1367795 .. 1367807 -  -6.3  -3.10701   GAAAGACGTATTGAA                GCTTA CTC TAAGC                TACTAGCGATTTAAA  59 116
        truA NONE
IUJ46_RS07075 NONE
IUJ46_RS07070 NONE
IUJ46_RS07065 1365127 .. 1365174 - -10.3  -5.11033   TATAATCTTAAAAAA TCCTTTTTTCTAGAA-AAAACA CCAAT TGTTTTATTCCAGAAAAAAGGG TTTAGGATTTACGGA 100 27
         tig 1362609 .. 1362635 -  -8.1  -5.69262   TTAGAAAAAGAAAAA         CCAGACTAGAA AGACG TTCTAATCCGG         CTTGTACGTTTTGTT  93 52
        rpoE 1361748 .. 1361772 -  -2.8  -5.54907   TCTAGAAAACAAAAA          TAGCCCCCTA TTAAC TAGAGAGCTT          TTGCCTGACCTCATA  76 123
IUJ46_RS07045 1360014 .. 1360030 -  -8.1  -2.62038   CTTAAAACCACTAAT              TGCTATT TTT AATAGCA              GCTGTAACAAAAGCG  66 4
IUJ46_RS07040 NONE
IUJ46_RS07035 1358745 .. 1358767 -  -9.2  -5.95166   TTTAACCAAAAAAAA           GAGACGAATC AAT GATTCACCTC           TTACATTATGCGGAG 100 34
IUJ46_RS07030 1357651 .. 1357664 -  -8.1  -5.13473   ATTATATCTAAAAAA               GCCCT CAAG AGGGC                TTTAGGGTGTTTAAT  90 49
        rpmB 1357087 .. 1357121 -  -8.9  -3.08696   ATGGATAGAAATAAG    CTAATAAAAA-AAGCC CTAA GGCTTATTTCTATTAG     ATGCGTTCTACTTTA  71 22
IUJ46_RS07020 NONE
IUJ46_RS07015 1354894 .. 1354915 -  -7.3  -5.09685   CAATATAGACAAAAA           GAGTCAGAC CTTT GCCTAACTC            CTCTTTTTTTATTAT  88 47
IUJ46_RS07010 1353645 .. 1353655 -  -2.6  -2.84203   AAAAGTCAATACAAC                 TTAA CAT TTAA                 TCAATACTATGTTGT  42 180
IUJ46_RS07005 1352724 .. 1352735 -    -3  -2.70932   CCTCTTTTTCAATTA                CTTT ATTT AAAG                 CTTTTTAAACTTTTA  43 16
IUJ46_RS07000 1351295 .. 1351312 -  -7.7  -5.65513   GATCAACTAAAAAAA             GACATGC ATCA GCATGCC              CTTTACTATATATTA  93 50
IUJ46_RS06995 1350516 .. 1350532 -  -2.3  -3.00298   CCTGTCAAGTATATA              TGTTATA TTA TCTAACA              TCACTGTGTTTTTTG  42 16
IUJ46_RS06990 1350077 .. 1350095 -  -3.2   -3.5365   TTAAATTTTATACAA             TTCATATC TTA AATACGAA             AATTACCAATATGCT  50 15
        glnA 1348669 .. 1348691 - -10.6  -4.19258   ATAGCTCATCCAAAA           GACCCACTCA ACT TGAGCAGGTC           CTGATAAGTCTAATA 100 35
        tsaB NONE
        rimI NONE
        tsaD 1344052 .. 1344073 - -10.2  -3.45023   TTATCATCATGACAA           CCCGGTAT GCCAAG ATACCGGG            TTGTTTTTTCAAAGG  85 84
         udp NONE
IUJ46_RS06940 NONE
        deoC 1339684 .. 1339708 -  -7.2   -5.1287   TTCATAGCTAAAAAA          GCCTATTATC ACTAA GATAGTAGGC          TTTTTAACTCCTATT  88 87
IUJ46_RS06925 1337738 .. 1337752 -  -7.8  -5.00616   TTTTCCTCCAAAAAA               GACCCT GAT AGGGCC               TTCGTCATTTTTTGT  88 43
IUJ46_RS06920 1337085 .. 1337100 -  -4.6  -2.58663   ACCTAGCGTTATAAG              CAAGGG CTAA CCCTAG               GAATTTTTTTATTTT  47 59
IUJ46_RS06915 1336203 .. 1336228 - -10.5  -5.86609   CTAAAAAAACAAAAA         CTAGCTTGAGA AGGA TCTCAGGCTAG          TTTTTTTATGAGTTA 100 45
IUJ46_RS06900 1334865 .. 1334888 -  -7.5  -5.13527   AATTAACAAAGAAAA          GTGCTTAGC AATATA ACTAAGCAC           TTTTTTGTTAATTGG  88 72
IUJ46_RS06885 1330156 .. 1330196 -  -4.1  -4.97957   CACACAATAATAAAA GCGGTAAAGAAAAGGACC ATAAAA GG-CCTTATCTTTATCAC  TTTATTTCATAGTAT  73 359
IUJ46_RS06880 1329125 .. 1329149 -  -4.3  -5.38951   AACTCATATAAAAAA          GACAAGTTC CTTAAGC GAGCTTGTC          TTGAGTCTAAAAGAA  79 56
IUJ46_RS06870 NONE
IUJ46_RS06865 1325818 .. 1325857 - -17.5   -5.3236   ATAACTTATAAAAAA  GAACAGCCATCTCATTT GATTCA AAATGAGATGGCTATTC   TTTTTTCACTTATAA 100 131
        dinB 1322071 .. 1322120 - -12.3  -4.43307   GCTGTAATAAAATAA TGGACCAAAGAAGCTGATTAGGG AAAT CCCTAATCAGCTTCTTTTTTCTC CAAAATGAGGCGGAC 100 60
IUJ46_RS06830 NONE
IUJ46_RS06825 1316407 .. 1316436 -  -7.3  -4.41348   TTTCTCGTAAATAAA       GAACCTAAAGGTGA AAC TCA-CTCCAGGTTC       TTATATTAGTCACAA  78 48
IUJ46_RS06820 NONE
IUJ46_RS06815 NONE
        trxA 1313039 .. 1313065 - -13.8  -4.40804   TAGTAGGTCATAAAA         TAAAGCTCAGCG TGA CGCTGGGCTTTA         TTTTAGTTAACTCAA 100 32
IUJ46_RS06795 1310598 .. 1310617 -  -6.4  -2.70932   CTTTTGGTCTAATGA            CTCACTAC TTTT GGAGTGAG             TAAGTGAGGTATACT  57 150
        rpsF 1310284 .. 1310297 -  -3.1  -2.60723   TTAGTTGGAATTAAG               CGTCA AGTT TAACG                ATCATGTGACGAAGA  43 7
IUJ46_RS06785 1309760 .. 1309771 -    -3  -2.52676   TATTCGTTCAATCCA                TTCT GACT AGAA                 TGGAAGATCGTCATC  42 20
        rpsR 1309337 .. 1309353 -    -8  -5.28481   TAGTCAACTAAAAAA              CAGTCC GAAAT GGACTG              TTTGTTTATTAGTCT  90 34
        uvrA 1304442 .. 1304459 -  -7.7  -4.55826   TTTAAAAGATTAAAA             GGAGCTC AAAC GAACTCC              TAATCCTATTGTTGT  82 31
IUJ46_RS06760 NONE
IUJ46_RS06755 NONE
         efp NONE
IUJ46_RS06745 NONE
        nusB 1301141 .. 1301187 - -13.9  -4.17023   CTAATTACTCTAAAA GACAAACAAGCTTACTCTTTC TAGAT GCGAGAGTATGCTTGTTTGTC TTTTAATATTCGTAC 100 86
IUJ46_RS06725 1296547 .. 1296564 -  -2.7  -4.46926   CATGGCAGGACAAAA             GAGCT GCTTAGTT AGCTC              TTTTGTCCTTATTTG  60 34
IUJ46_RS06720 1293228 .. 1293266 - -12.7  -4.54477   TCAAAACCTATAAAA   GACTAAAAATCTGGGAC TATTC ATCTCAGATTTTTAGTC   TTTTGGTTAATCAAT 100 114
IUJ46_RS06715 NONE
        manA 1291054 .. 1291066 -  -4.9  -2.57795   GTCATTATGAATCTA                GTTTT CTG AAAAC                AAAAGTTTCTTCATG  49 118
IUJ46_RS06700 1289783 .. 1289807 -    -5  -3.56862   AGAAAGGTTGGTAAA          GTTATCACGC CGTAC GCATGAAAAC          TTTCTCTTCATCCTT  57 5
        secA 1287121 .. 1287157 - -11.7  -3.79071   GTTAGAAGATTTAAA    CAGTGAGAAGCTGAGAA TTA TTCTCAGCTTCTTTCTA    TATACCTAACTTTGT  90 58
        acpS NONE
         alr 1285627 .. 1285639 -  -2.7   -3.0263   ATGATTTTCTTAATA                TATCC GAG GAATA                CGGTCACTTAAAAGG  43 7
IUJ46_RS06680 1283894 .. 1283920 -  -9.5  -5.89921   ATCACAATAAAAAAA         GACAATAGCCC TAATC GTGCTATTGTC         TCAAAATCATTTATT 100 128
         shr 1279587 .. 1279599 -  -3.4  -3.61774   TATAACATCTCCAAA                TGTG AAAAA CACA                CCTATCTTGCGACTA  50 133
IUJ46_RS06670 NONE
        isdE NONE
IUJ46_RS06660 NONE
IUJ46_RS06655 NONE
IUJ46_RS06650 NONE
IUJ46_RS06645 NONE
IUJ46_RS06640 NONE
IUJ46_RS06635 NONE
IUJ46_RS06630 1269592 .. 1269626 - -11.5  -2.60508   GAGGTCTCAAAAATC     CCGAGTGGCGTCAAT ACGAG ATTGACGCCACTCTT     TTACCACAGCAAAAA  83 228
        recG 1267312 .. 1267327 -  -4.7  -3.06009   GAAAATGGGTTAATA              CTGCT TCACAT AGCAG               TCTCATCGTAAAGCA  52 137
IUJ46_RS06620 NONE
IUJ46_RS06615 1265197 .. 1265224 - -12.9  -3.85817   AGCTTCCTTTAGAAA        TGTCCCACTAA AACATA TTAGTGGGACA         TTTCTAGTACTTTAA  95 328
IUJ46_RS06605 1262662 .. 1262672 -  -3.2  -4.71318   AACACCAAAAAACAA                 GCAG CAT CTAC                 AACGAAATTGCTTGT  65 106
IUJ46_RS06595 1260566 .. 1260579 -  -4.5  -3.39948   TTATAACAAAGCTAA               CTCGC TTTT GCAAG                GAATTATCAGAAAAT  53 179
        codY 1259700 .. 1259718 - -10.4  -5.28683   ATTAACAGCAAAAAA             CATCTCTT TTC AAGAGATG             TTGTCTTTTTCTATT 100 40
IUJ46_RS06585 1258958 .. 1258968 -  -3.2  -3.02739   CCTAACCCATACATA                 CGGT AAA ACCA                 CATAGAGCAATGATT  45 89
IUJ46_RS06580 1258217 .. 1258252 -   -20  -5.24989   CCATACAGCAAAAAA    CTTCCTGACTAAGGTC AGAA AACCTTAGTCAGGAAG     TGTGACAAACTAAAC 100 42
        gatC NONE
        gatA NONE
        gatB NONE
IUJ46_RS06560 1254519 .. 1254539 -  -4.1  -4.25104   CGTGCCTGAGTAAAA            TAGAAAAAA CAA TTCCTTCTA            TTAAGATAGATAGAC  62 104
IUJ46_RS06555 1254129 .. 1254154 - -13.3  -4.58395   TTTATGTTGCAAAAA         GGCTGCTTGGA AACT TCCATGCAGCC          TTTTTTTAATACCTT 100 31
IUJ46_RS06550 NONE
IUJ46_RS06545 NONE
IUJ46_RS06540 1251734 .. 1251760 - -13.2  -5.63857   AAAAACTCAAAAAAA         TTAGCACTCTTT TAT AAAGAGCGCTAA         TTTCAGTCATAGTTT 100 28
        hrcA NONE
        grpE NONE
        dnaK 1247955 .. 1247976 -  -8.8  -4.67353   TTATTTAGCCAAAAA           CAGAGGTT TGGTAC AACCTCTG            AATTCGGATATTAAT  93 61
        dnaJ 1246549 .. 1246584 -  -9.9  -5.47218   TTTGACGTAAAAAAA    CGTATAACTTCGGGA AAATTA TCCTGAAATTATACG     TTTGACATCTTTAAA 100 36
IUJ46_RS06515 1245531 .. 1245543 -  -4.9  -3.14284   CTCCTAGCAATAAAC                TTTGA CAA TCAAA                TTATATCAAAGGTCA  52 66
IUJ46_RS06510 NONE
IUJ46_RS06505 1244077 .. 1244089 -  -7.7  -3.85817   ATTTGTTTTTATAAA                TGTGC TAG GCACA                TGAATAACTAGATTC  73 33
IUJ46_RS06500 1243642 .. 1243654 -  -4.9  -3.93867   AAATAAGGAGAATAA                TTTGA TAA TCAAA                CTATTATAGTAAGAA  62 183
        fabK NONE
        fabD NONE
        fabG NONE
        fabF NONE
        accB NONE
        fabZ NONE
IUJ46_RS06465 NONE
        accD NONE
IUJ46_RS06455 1235533 .. 1235562 - -10.8  -2.82317   TAAATAATAAATTCA       CCCCAGAGATCA TTAAAG TGATTTCTGGGG        TTTACTATTTTAAAG  81 209
IUJ46_RS06420 1227547 .. 1227574 -  -2.8  -6.00086   ATATCAGAAAAAAAA        CATACTTCCAAGC ACT ACCTAGAAG-ATG        ACTCCAATAAGGTAT  91 127
        tsaE NONE
IUJ46_RS06410 NONE
IUJ46_RS06405 1225268 .. 1225291 -   -11  -5.19879   TTTTAAACATAAAAA          CCCTCAGAAC GTTA GGTCTGAGGG           TTGATATTAGCAGGA 100 13
IUJ46_RS06390 NONE
IUJ46_RS06385 NONE
IUJ46_RS06380 NONE
        trmB 1221017 .. 1221039 -  -6.4  -3.78775   CTCTCCATTACTAAA           GAAGTTAATA CTG TATCAACTCC           TTTATGTTATCATAT  66 58
IUJ46_RS06370 1220825 .. 1220846 -  -8.7  -4.68724   CCACTTAATACAAAA           GTGGCGAGA CATA TCCCACCAC            CTTTCTGTATTATTT  93 100
        rimP 1220166 .. 1220178 -  -3.3  -3.20307   TTAATACGATCAATA                GCCCC CTA AAGGC                TCCCTTAATTCCTTT  47 124
        nusA NONE
IUJ46_RS06355 NONE
IUJ46_RS06350 NONE
        infB 1215279 .. 1215307 - -12.5  -4.16943   TTCCACATTTTAAAA        CAAAAGCTAGGCT GAA AGCCCAGCTTATG        ACATTGCTACCTGTT 100 175
        rbfA 1214848 .. 1214872 - -13.7  -5.03201   AATAACAATTAAAAA          GAGCCCTATCA TAA TGATAAGGCTC          TTTCTGTCATAACAT 100 55
IUJ46_RS06325 NONE
IUJ46_RS06320 1210361 .. 1210372 -  -4.4  -4.67011   AATTCTATTGAAAAA                TACC TCTT GGTA                 GATAACCAAAAATTC  72 382
IUJ46_RS06310 NONE
IUJ46_RS06305 NONE
IUJ46_RS06300 1207149 .. 1207181 -   -10  -3.02144   TTATTTCTTTCAAGA     CAAAGCACT-TGTGG GTTC CCACAGAGCGCCTTG      CCTTACATGAGAAAT  77 114
        lacA NONE
        lacB NONE
IUJ46_RS06285 NONE
        lacD 1204483 .. 1204511 - -11.2  -5.37345   TGTAAGGATAAAAAA        GCAAGGATAAAA CCCAT TTTCATCCTTGC        TACAAAAGATTCAAA 100 102
IUJ46_RS06275 NONE
IUJ46_RS06270 1202908 .. 1202940 -   -18  -3.14132   GCTTGCCTCTATTAA      CGTAAAAAGGTTCC TTTTG GGAACCTTTTTACG      TTAATTGTTAGTCTT 100 33
IUJ46_RS06260 1201120 .. 1201130 -  -2.6  -3.54177   CGTAAAATCAATCAA                 TAAA CGT TTTA                 GACGGCTATCTTAGT  48 115
IUJ46_RS06250 1198501 .. 1198528 -   -10  -5.08824   TTGGGATTCAAAAAA        GAAAACGTGGAT GATC ATTCACGTTTTC         TCTTTTTTTAAAGCT 100 33
        nagA 1197218 .. 1197265 -    -2  -5.22481   CATAAAGAAAGAAAA TACAAAAAGAATTGGCCTGCCA GACA TAGCTACCCCAATCCTTTTGTA TCTCTTAGGCATCAA  70 30
IUJ46_RS06240 1196274 .. 1196297 -  -6.8  -5.00884   ACCGTTTTCAAAAAA          GATTTAGCGA ATTA TGGCTAAATC           TTTGTAGTTCCTTAA  83 37
IUJ46_RS06235 1195387 .. 1195436 - -17.3   -5.1675   CTAGGCACCAAAAAA CCGCATTTTGATGCTCCTAAATC ATAA GACCTAGGGGCGTCAAAACGCGG TTCCACCCTAATTTA 100 233
        glyQ 1194146 .. 1194170 - -13.1  -2.78798   AGGGGGGACGCAAAG          TGAAATTATCC AGT GGATAATTTCA          GAAAACAAAAGTGTT  87 210
        glyS NONE
IUJ46_RS06220 1191498 .. 1191524 -   -11  -3.99592   AGTCATCACGATAAA         CAAAAAGCAGTT CAG AGCTGCTTTTTG         TCTTATGATTTTGGG  93 28
IUJ46_RS06215 1190857 .. 1190898 - -13.2  -4.81644   CAAAGAAAATCAAAA GACCCAACAATCACTCTG CTAATC CAGAGTCATCATTGGGTC  ATAAAGAGAACTAAG 100 135
        glpO NONE
IUJ46_RS06200 1186527 .. 1186552 -  -6.9  -4.02396   TAAAGAAAATGCAAA         GGAGCTGGCCTA TGA TA-GCCAACCCC         TTTAGTGATGGTTAG  73 37
IUJ46_RS06195 NONE
IUJ46_RS06190 1183627 .. 1183642 -  -6.2  -2.98282   ACCAAGTATCACACA              GTTTTG TGTG CAAAAC               TAGACTTAGCTGCTG  57 3
         fsa 1182814 .. 1182842 -  -8.1  -3.44124   ACGATGAATATAAGA        GAGCCTGTTGACA CAG TGGCCACAGACTC        TTTAGCCTTATTTTT  72 33
         tkt 1180606 .. 1180631 - -13.5  -5.44119   TTTATTTTAAAAAAA         CAGAGTAAATC AAAT GATTTACTCTG          TTTGGGATGTTTAAC 100 41
IUJ46_RS06175 NONE
IUJ46_RS06170 NONE
IUJ46_RS06165 1177745 .. 1177760 -  -6.8  -5.34555   TTATAGCATAAAAAA              CAGCCC CAGA GGACTG               TTTTTCCGAATAATG  85 52
        proB NONE
IUJ46_RS06155 NONE
IUJ46_RS06150 1175249 .. 1175267 -  -5.2  -3.22388   CAGCCAACTTAGCAA             GCACTGAC TTA GCCACTGC             CTCTAGAGTTTCAAC  55 256
        rsmH NONE
        ftsL NONE
       pbp2X NONE
        mraY 1170469 .. 1170484 -  -4.7    -3.317   AGAGACAAGCAAAAG              GAGTG GGACAA CACTC               GCAAAATCAGCATTT  54 113
IUJ46_RS06125 NONE
IUJ46_RS06120 NONE
IUJ46_RS06115 1167286 .. 1167303 -  -5.5  -4.99312   AACATAACAAGAAAA             GCCCAGG GATA CCTAGAC              CTTTTTATTATAACA  77 52
IUJ46_RS06110 NONE
        trxB NONE
IUJ46_RS06100 1164377 .. 1164388 -    -3  -3.86897   GCTAGGGTTTAGAAA                TAAC TTGA GTTA                 TCGCTAAAGTAAAAA  52 110
IUJ46_RS06095 NONE
        nadE 1161967 .. 1161982 -  -7.6   -5.4505   TTCTTCAAGAAAAAA              GTTAGG ATAA CCTAAC               TTTTTTTGTTTTCTT  93 65
        pepC 1160128 .. 1160154 -  -9.4  -5.33026   TAATCTAAATAAAAA         GCGAGTCCAC GTTCTGT GAGGACTCGC         TTTTTATATGACACA 100 371
IUJ46_RS06070 1156652 .. 1156663 -    -3  -3.81926   TAGTTCAAAAAGCAA                GTAT TTAA ATAC                 CAATACCCCTAAAAA  52 48
        gpsB NONE
        rnpB 1155822 .. 1155837 -    -9  -5.04868   TTAAATCAAATAAAA              GCTAGC AAAT GCTAGC               TTAACCTATTATGCA  95 44
IUJ46_RS06055 NONE
IUJ46_RS06050 1153118 .. 1153141 - -10.4  -5.30155   TTATTAATCAAAAAA          CTGAGACAAG TTGC CTTATCTCAG           TTTTTTTGATTTTCT 100 40
IUJ46_RS06015 1146596 .. 1146610 -  -2.8  -4.03885   TTTTAAAAAAATTAA               CATTTG GGC CAAGTG               GTTGAGAACCCTACT  53 36
IUJ46_RS06010 1144859 .. 1144884 - -13.5  -3.98484   AAGGCAAGTCATAAA         GAAAAAGAGGA TAAT TCCTCTTTTTC          TACTTGGCATAATCA 100 25
         gmk NONE
        rpoZ 1143788 .. 1143810 -  -8.6  -5.32699   CTAAATATGAAAAAA           TCTAAGATTT CTG AAACCTTAGA           TTTTTTCTCCTTCTT  95 21
IUJ46_RS05995 NONE
         fmt NONE
        rsmB NONE
IUJ46_RS05980 NONE
        pknB 1136328 .. 1136370 -  -7.9  -4.68994   ACGAGTAGTTAAAAA GAATAGTTAGTGGCATGCC AGTAA AACATGAGACTAACTATTC TTTGTTAAGGTGTTT  83 30
        liaF NONE
IUJ46_RS05965 NONE
IUJ46_RS05960 NONE
IUJ46_RS05955 NONE
IUJ46_RS05950 1132098 .. 1132126 -  -3.1  -5.69793   AGACGAAATAAAAAA        GGGTTTGGAAC TACTAAG GTTCCAGACTC        TTTTTAGTGTTCTTT  82 10
IUJ46_RS05935 NONE
IUJ46_RS05930 1128365 .. 1128384 -    -5  -3.14848   TGCTTTCATGAAAAT            TTGCAAGT TTTA ACGTGCAA             TTGACAAACTTTTAA  52 15
        raiA 1127493 .. 1127516 -  -4.6  -6.20267   GGAAAAAGAAAAAAA          CGCGCTTT ATATTCTG AAAACGCG           CTTTTTCATATTTTT  95 255
IUJ46_RS05920 1125261 .. 1125274 -  -2.3  -3.06796   TCCCAGCTGAGCTAA               GGCCC CACA AGACC                TCTCAAAACTAAATA  42 69
IUJ46_RS05915 1124904 .. 1124921 -  -7.1  -2.50994   CTTAACCTTATTAAC             CTAGTTT TTTT AAACTAG              AAAACTTATTAAATA  60 296
IUJ46_RS05910 NONE
         rrf NONE
IUJ46_RS05900 NONE
IUJ46_RS05895 NONE
IUJ46_RS05890 NONE
IUJ46_RS05885 NONE
IUJ46_RS05880 1121287 .. 1121305 -  -4.5  -2.73364   CGTGCACTCTAACCA             CCTGAGC TACGC GCCCAAG             CTAATAGCTTGGAAA  47 56
IUJ46_RS05875 1121211 .. 1121221 -  -2.6  -3.44586   ACCAACGGACCATAA                 TAAT ATA ATTA                 TAGATAATGGGCACG  47 32
IUJ46_RS05870 1121025 .. 1121080 - -16.8  -4.86621   ATCTGCAATTAAAAA TAAACAATAAAAAGCTTAAATTTGTT ATAC AACAAATTTAAGCTTTTTATCATTAA AATACAATCAACCAA 100 77
IUJ46_RS05830 NONE
IUJ46_RS05825 1113412 .. 1113431 -  -6.6  -3.58905   ACTTTTTATATACAA            TATATTGA TTTT TCAATATA             GTCTTGATATAATAT  64 460
IUJ46_RS05815 NONE
IUJ46_RS05810 NONE
IUJ46_RS05805 1112636 .. 1112647 -    -3  -2.61322   ATATCTTCTAAATAC                TGAT TATC ATCA                 CCATTTGTTCGGTAG  43 65
IUJ46_RS05800 NONE
IUJ46_RS05795 NONE
IUJ46_RS05790 NONE
IUJ46_RS05785 NONE
IUJ46_RS05780 NONE
IUJ46_RS05775 NONE
         ssb NONE
IUJ46_RS05765 NONE
IUJ46_RS05760 NONE
IUJ46_RS05755 1107612 .. 1107623 -  -2.2  -4.09685   TCTTATCTGCTAAAA                CGTC ATCA GACA                 TCTTTATTTTGCATC  54 137
IUJ46_RS05750 NONE
IUJ46_RS05745 NONE
IUJ46_RS05740 NONE
IUJ46_RS05735 NONE
IUJ46_RS05730 NONE
IUJ46_RS05725 NONE
IUJ46_RS05720 1104309 .. 1104325 -  -5.1  -3.25787   TATCGAACAGGAACA              GTCGG AATCGAA CCGAC              TTGCAACCGTTGTCC  54 506
IUJ46_RS05710 1102139 .. 1102154 -  -4.6  -3.10775   ATTCGTAGTTAAAAG              GGCGTC TAAT GACGTC               TTTTTGTTTATTTGA  50 58
IUJ46_RS05705 NONE
IUJ46_RS05700 NONE
IUJ46_RS05695 NONE
IUJ46_RS05690 1097595 .. 1097617 -  -9.2  -5.37345   TTTAAGTACAAAAAA           GCACCTAGCT TTT AGCTAAATGC           TCTAGATTTAATAAG 100 60
IUJ46_RS05685 1097244 .. 1097259 -  -5.4  -5.21236   AAGGCATAATAAAAA              GCCGTA TTGC TACGAC               TTTGACTTCTAAAGG  82 65
IUJ46_RS05680 NONE
IUJ46_RS05675 1095691 .. 1095704 -  -2.3  -3.18383   ACCTCCATCGACTAA               GACTC GAGA GCGTC                ATCTTCCTCTCTCTT  44 58
IUJ46_RS05670 NONE
IUJ46_RS05665 NONE
IUJ46_RS05660 NONE
IUJ46_RS05655 NONE
IUJ46_RS05650 1093707 .. 1093737 - -13.5  -5.00616   TTCCTCCTTAAAAAA       TATAAGGTTGAGC AGTTA GCCCAACCTTATA       AAACCTCACTTGGGA 100 21
IUJ46_RS05645 NONE
IUJ46_RS05640 NONE
IUJ46_RS05635 NONE
IUJ46_RS05630 NONE
IUJ46_RS05625 NONE
IUJ46_RS05620 NONE
IUJ46_RS05615 NONE
IUJ46_RS05610 NONE
IUJ46_RS05605 NONE
IUJ46_RS05600 1082065 .. 1082075 -  -5.4   -3.6692   GGCCAGTGGAAAATA                 TAGC ACC GCTA                 TTGCTATGATGACGG  59 67
IUJ46_RS05595 1080768 .. 1080788 - -11.8  -4.23988   GGATACCAAAAAACA            GCCCCCGC AAAAA GCGAGGGC            ATTTGTCTTATCTAA 100 37
IUJ46_RS05590 NONE
IUJ46_RS05585 1079697 .. 1079712 -  -5.4  -3.63922   ACTTTTTGCAAAACA              CCGTCAG TCT CTG-CGG              ATTGTTTTTTTAATT  59 153
IUJ46_RS05580 1079252 .. 1079273 -  -9.4   -5.5208   TTATAACACAAAAAA           CCGCCCTC AATCAA GAGAGCGG            TTGGCTTTTTATTTA 100 34
IUJ46_RS05565 1077263 .. 1077275 -  -4.8  -2.57132   TTGTGGCTTTACAAT                GTCG TTCCT CGAC                TATTCCCCGACTTCT  49 55
        rlmD 1075737 .. 1075758 -    -3  -3.23733   CTGAGCTTATAAAAC           TTGAGTTG TTATTG CCACTCAA            TCATACACGTTTTTG  47 26
        rocA 1073676 .. 1073701 - -11.9  -4.74453   TAACATATTCAAAAA         GAGTCTGGGAC TATT GTCTCAGACTC          TTAAGTTGATTTTGA 100 63
IUJ46_RS05540 1068434 .. 1068447 -  -4.5  -3.06796   CTTTACCTGAGCTAA               CCAGC TCAT GCTAG                TAACGTCTTTTTTAG  50 37
IUJ46_RS05535 NONE
IUJ46_RS05530 1065153 .. 1065193 -  -9.7  -3.81557   CTTTCCAAAGAAATA  CAAGAGCCTCGATCCTCTT AAC ATGAGGAAAAAGGCCCTTG  TTTAATCATTGGTAA  83 80
IUJ46_RS05520 NONE
IUJ46_RS05515 1061650 .. 1061665 -    -9  -3.34332   ATGATTAGATAAAAT              CTGGTC TTGT GACCAG               TTCCTTAAGTCCTAT  75 37
IUJ46_RS05510 1060103 .. 1060122 -  -7.8  -4.81212   CTCATCAGAAGAAAA            GAGCTGAG ATTT CCCAGCCC             TCAACTTATAATCAA  83 54
IUJ46_RS05505 NONE
IUJ46_RS05500 NONE
IUJ46_RS05495 NONE
IUJ46_RS05490 1052503 .. 1052529 -  -5.8  -3.57561   TTTCAACCTTGTAAA         GGCGCCTTTCAC GTA ATAAAGGACGCC         TATTTGTTTTTTATT  62 102
IUJ46_RS05485 1051570 .. 1051583 -  -3.9  -3.52877   ATTAATATATCATAA               TTAAG CTTA CTTAA                AAAGTGTTACTCATC  52 32
IUJ46_RS05480 NONE
IUJ46_RS05475 NONE
IUJ46_RS05470 1049835 .. 1049857 - -11.4  -4.74706   TTGAATACGTAAAAA           GAGAAGATGA GCG TCACCTTCTC           TTTTGCTTTTCCATA 100 70
IUJ46_RS05450 NONE
IUJ46_RS05445 1046199 .. 1046225 - -13.8  -4.17906   AATGAAACCAAATAA         TCCCTGCCTAGA TAA CCTAGACAGGGA         CGAATTTCGTGTTAC 100 240
IUJ46_RS05435 NONE
IUJ46_RS05430 1042596 .. 1042619 - -10.4  -4.73613   CTATTAGTAAGAAAA          GAACACAGTT TTTC AACTGCGTTC           TAAACACTATGATTT 100 32
       cas5c NONE
       cas8c NONE
       cas7c 1036456 .. 1036470 -  -4.3  -2.88999   TCGGCATAGACCATA               CTAGA GTCCT TCTAG               GATTTCAAGCGTTAA  48 11
        cas4 NONE
       cas1c NONE
        cas2 1033979 .. 1034005 -  -7.3  -4.69027   AAAGGCATGTAAAAA         CCCGACCTC ATTAAAAGA GAGATCGGG         TTCATCTTTCAATCC  83 474
       ccdA2 NONE
IUJ46_RS05385 NONE
        msrB 1031293 .. 1031308 -  -7.5  -3.87815   CCTTATCTTTATAAA              GGGCC TTGCAT GGCCC               TCTCATACTAGTCTT  73 73
IUJ46_RS05375 NONE
IUJ46_RS05370 1028757 .. 1028769 -  -7.7  -3.04144   TTCCTATCTCCAATA                CCCTA ACT TAGGG                AAATGGCTGACATGC  66 54
IUJ46_RS05365 NONE
IUJ46_RS05360 1026830 .. 1026873 - -10.5  -4.75404   AAATCTCATCAAAAA GCGAGTAAACGAA-AACCTA AATGA CAGGACATTCGTTTACTCGC TTTTTGTTAACCTTC 100 68
IUJ46_RS05350 1025392 .. 1025405 -  -2.5  -4.62336   ATCTTAGTGTAAAAA               TTTAT ACTT ATAAA                TTAAAATAAGTCAGA  60 75
        arcA NONE
IUJ46_RS05340 NONE
        argF 1022228 .. 1022268 -  -9.2  -4.52873   TTTTCATAAAAATAA GCCGTTCTAGTT-CCG-GTC AAG GACGCGAAAACCAGAACGAC TTGTCATGTAGTTAA  93 122
IUJ46_RS05330 1020680 .. 1020690 -  -5.4   -2.6927   AGGTGTGATATAGGA                 TTCC ATA GGAA                 CCTCCTATCTGTTAA  51 37
IUJ46_RS05325 NONE
        arcC 1018219 .. 1018252 - -14.9  -4.37711   CTATCAAAGCTAAAA     GAAAAGGCTAATTCT CAAT AAAATTAGCCTTTTC      TAATACTATTATTGT 100 157
        asnA NONE
        rsmD NONE
        coaD NONE
IUJ46_RS05300 1014808 .. 1014856 -  -4.5  -5.08824   GTTTTATGTAAAAAA TGATTGAACCCAAAAGACTGGTC AAG GATCTGTCTATCTGGTTCAACCG TTTTTTATGAGTTAA  76 81
IUJ46_RS05295 1013448 .. 1013462 -  -2.8  -3.65002   AGTAATGACAGATAA               CTTCTT TTA AAGTAG               AAGGTAAATCCCAAT  48 84
IUJ46_RS05290 NONE
        rlmN 1011302 .. 1011323 -  -8.8  -5.37043   AGGCCAGATAAAAAA           CCTAGTCA TTTTAG TGACTAGG            AATATTTTGTCATCA  95 72
IUJ46_RS05275 1009861 .. 1009884 -  -6.1  -5.26316   TGATTCCATAAAAAA          GAAGCCAAT TTTATC ATTGACTTC           TTTTATCCTAAGGCA  84 48
IUJ46_RS05270 NONE
IUJ46_RS05265 NONE
IUJ46_RS05260 1008086 .. 1008116 -  -5.5  -3.69434   TTAATCAATTGTAAA       TGTTTTCAGACTT TCAGC AAGTCTGGATACA       GCAAAAAAAGGAATT  59 96
        typA 1006088 .. 1006132 - -10.4  -2.76737   TAGGAACTTGTAAAC GCAAAAAGACCTTTAAAAAA TGACT TTTCTTAAATATCTTTTTGC TATTTTATTTAGTTA  78 56
IUJ46_RS05250 1005704 .. 1005733 -  -9.5   -5.2189   TGAACTATTAAAAAA       GGACTGATATTGTC TAA AACAA-ATCAGTCC       TTTTATCGTATAAAA 100 82
        murD NONE
IUJ46_RS05240 NONE
IUJ46_RS05235 1001710 .. 1001731 - -10.3  -5.69473   TATACCATAAAAAAA           CGTAAAATG TTAT CATTTTACG            TTTTTTGTTATATAA 100 125
        ftsA 1000264 .. 1000279 -  -2.6  -3.91084   TTACTTTTAATCAAA              CATACT CCCA AATATG               CCACGAACACGTTCT  53 1
        ftsZ  998906 ..  998918 -  -4.1   -2.8372   TATTTGTCAGTAAAT                CCATT ATT AACGG                TTTTTAAAGAATGGA  48 19
IUJ46_RS05220 NONE
IUJ46_RS05215 NONE
IUJ46_RS05210 NONE
IUJ46_RS05205 NONE
IUJ46_RS05200  995691 ..  995701 -  -3.2  -3.10622   AATACTTAGGGAATA                 CGAG ACT CTCA                 TCATCTCCCGCTTGC  45 76
        ileS  992614 ..  992637 - -13.2  -5.14965   AGCTCTACTAAAAAA          CCATCAGGTC CTAA GACCCGATGG           TTGTCTTCTTACTCA 100 66
IUJ46_RS05175  988633 ..  988647 -  -7.8  -5.88565   TTGACAATAAAAAAA               CCTGCC TCA GGCAAG               TCTCTTTACTATGTC 100 45
IUJ46_RS05170 NONE
IUJ46_RS05165  987063 ..  987105 -   -24  -3.73968   AAATGCCTTAGCAAA TTATAAAAGGAAGTCCTAAA TCA TTTAGGACTTCCTTTTATAA TTCATAGAACAGATT 100 40
IUJ46_RS05160  985435 ..  985446 -    -3  -4.18506   TCAGCTCCAAAACAA                GAAA TCGC TTTC                 TCTAAGGGAGACAAC  57 141
IUJ46_RS05155 NONE
IUJ46_RS05150  982575 ..  982594 -  -2.8  -5.98675   CAGAAAAACAAAAAA            GGAAGCCA TTGC TGACTTCT             TATATTCTCTTATGT  91 59
        xseA NONE
IUJ46_RS05140 NONE
IUJ46_RS05135 NONE
IUJ46_RS05130 NONE
IUJ46_RS05125 NONE
        recN  977096 ..  977122 -  -7.4  -4.09285   TATGAAAATATCAAA         TACCAAACATAA TCT TAATGTTTGGCA         AGTAGTTCACGAGCC  78 13
IUJ46_RS05115  975928 ..  975969 -  -5.9  -4.64591   TAACGAGATACAAAA CGAGGCAAAAGT-CAACCTT TTC ACGCTTGAACATTTGCCCCG TCTTTTACAACTACA  74 53
IUJ46_RS05110 NONE
IUJ46_RS05105 NONE
IUJ46_RS05100  973475 ..  973488 -  -3.9  -3.04322   CTTAATGCTTTAACA               GATAT TATC ATATC                TAAAAAAAGCGATTA  47 67
IUJ46_RS05095  973106 ..  973141 - -11.9  -5.47159   CCTGAACACAAAAAA    GCCCACTGCACAGGC TACAAC GCTTGTACAATGGGC     TTTTATATATGCAAT 100 40
IUJ46_RS05075  970082 ..  970094 -  -4.9  -2.78384   GTCCTTTCTACTATA                TGATT TTA AATCA                TATAGTGTTTAAAAT  51 34
IUJ46_RS05070 NONE
IUJ46_RS05065 NONE
IUJ46_RS05060  968957 ..  968970 -  -2.4  -3.81951   TTGCACATTAGCAAA               TTGC ACATTA GCAA                ATTAGGTATTAGCAA  50 27
IUJ46_RS05055 NONE
IUJ46_RS05050 NONE
IUJ46_RS05045  968100 ..  968114 -  -2.8  -2.71924   TATTTTCTCCTAAAT               CGCA TATTTCT TGCG               CAATTGCCGCAATAG  41 5
IUJ46_RS05040 NONE
IUJ46_RS05035 NONE
IUJ46_RS05030 NONE
IUJ46_RS05025 NONE
IUJ46_RS05020 NONE
IUJ46_RS05015  965080 ..  965094 -  -4.2  -3.05935   AGATTGCTCATTCAA               GCACCC CGC GAATGC               CAAGGGTTTCAAAGA  50 3
IUJ46_RS05010 NONE
IUJ46_RS05005 NONE
IUJ46_RS05000  963539 ..  963557 -  -7.4   -2.6155   TCGGTCAATACCAAC             CGCACG AGTCGAA CGTGCG             TGATACCGTTATTGG  63 41
IUJ46_RS04995 NONE
IUJ46_RS04990  962434 ..  962446 -  -2.7  -3.05224   ATATTTGCCTAAAAT                CACTT TTT AAATG                CAAAAGATGACCAGT  43 12
IUJ46_RS04985 NONE
IUJ46_RS04980 NONE
IUJ46_RS04975 NONE
IUJ46_RS04970  958926 ..  958946 -  -6.2  -4.77165   TTGGGCATAAGAAAA           GCACC-AGA TTGC TCTAGGTGC            TTAATATATTGCGTT  77 26
IUJ46_RS04965 NONE
IUJ46_RS04960  958409 ..  958424 -  -5.4  -5.19328   AGGGCACAATAAAAA              GCCGTA TTGC TACGAC               TTTGATTTCTAAAGG  79 60
IUJ46_RS04955  956913 ..  956926 -  -4.5  -5.55664   TTAGCAGTAAAAAAA               CACCC TTTC GGATG                TCGTTTTTTAACAGC  82 33
IUJ46_RS04950 NONE
IUJ46_RS04945 NONE
IUJ46_RS04940  955263 ..  955274 -  -5.8  -2.71731   TTTACCTCCTAACCA                GGCA AGAG TGCC                 TCTAATTCAGGTTTC  55 7
IUJ46_RS04935 NONE
IUJ46_RS04930 NONE
IUJ46_RS04925 NONE
IUJ46_RS04920  953968 ..  953979 -    -3  -3.61715   TATCTCCTTTAATAA                TGAT TAAT ATCA                 AATACAGCTTGATAA  50 7
IUJ46_RS04915 NONE
IUJ46_RS04910 NONE
IUJ46_RS04905 NONE
IUJ46_RS04900 NONE
IUJ46_RS04895 NONE
IUJ46_RS04890 NONE
IUJ46_RS04885 NONE
IUJ46_RS04880 NONE
IUJ46_RS04875 NONE
IUJ46_RS04870 NONE
IUJ46_RS04865 NONE
IUJ46_RS04860 NONE
IUJ46_RS04855  941948 ..  941969 -  -9.4  -5.56264   CTTAAACACAAAAAA           CCGCCCTC GATTAA GAGAGCGG            TTTTGTCTTATCTAA 100 55
IUJ46_RS04840  939773 ..  939814 - -11.1  -5.88197   CCAAATATAAAAAAA GAACCTTGTCGCTATCAAT AAAC ATCGATAGCAACAAGATTT  TTCTAGACGAATTAT 100 224
        cadA  937338 ..  937371 - -14.1   -5.1615   TTAATAGTCAAAAAA     GCTTGGAAATGTGCAC TTT GTACAC-TTTCCAAGC     TTTTTAAAATGGGAA 100 274
IUJ46_RS04825  935427 ..  935442 -    -9  -5.35354   TATAGAACCAAAAAA              CCAGAC CAAA GTCTGG               TTTTTAAGTTATTCA  95 34
IUJ46_RS04820 NONE
IUJ46_RS04815  934060 ..  934091 - -10.3  -5.01732   AATTTTCCTAAAAAA      TG-CAAGCCCTTTC AACAA GAAAGGGCTCGTCA      TTATCATATAACTAT 100 54
IUJ46_RS04810  933177 ..  933201 -  -4.3  -4.59919   AAATTATAAAAAGAA          GACTGAGAA TAGGACG CCCTCAGTC          TAAAAAAATATTTTC  67 41
        recR  931789 ..  931801 -  -3.3  -3.04715   TAGCCTTTTCAAAAC                CTCTC TTT GCGAG                TAAAGGCACCAACAT  45 46
IUJ46_RS04800  930545 ..  930560 -  -4.8   -3.8637   TTATAGCACAAAACA              TTAGAA AAAT TTCTAA               AATGTCAAACTCCCT  59 140
IUJ46_RS04795  929068 ..  929082 -  -2.8  -2.94076   TCATGAGAGAACAAG               CCTTTC TCT GAAAGT               TTTATAAAAATCAAG  42 36
IUJ46_RS04790  928256 ..  928279 -  -9.6  -2.60032   TTTTTTTTAAAAATC          GAGCCTGGAA ATCA TCCCAGACTC           TTCTTATTATAGCTG  75 64
IUJ46_RS04785  926240 ..  926256 -  -5.1  -4.56597   TCTCTTTTCTAAAAA              GGCAG TGCGAAG CTGCC              TTATAAACCTTTTAA  69 295
IUJ46_RS04780  924564 ..  924597 -  -9.1  -4.37658   AACTTTTTCAGAAAA     TTAAAAAGAGCTGAC TCTC ATCAACTCTCTTTAA      GCTTATTCACCTTTG  93 28
IUJ46_RS04775  922442 ..  922466 -    -8  -5.70761   AAAAGAAAAGAAAAA          TCATTGAGAC TTATC ATCTCAATGA          TTTTTTTATGCTTCA  93 31
IUJ46_RS04760 NONE
IUJ46_RS04755 NONE
IUJ46_RS04750 NONE
        holA NONE
        sodA  915615 ..  915635 -  -9.8  -5.13521   AAAGCACTTAAAAAA            CCAATCTC TTTTT GAGATTGG            AAACCCTTTTCTTAT 100 37
IUJ46_RS04735 NONE
IUJ46_RS04730 NONE
IUJ46_RS04725  914329 ..  914354 - -11.2  -4.67904   CATTAATCTCAAAAA         GCTTGACCTG AAGAAA CAGGCCAAGC          TTTTTTAATGAGCAA 100 104
        nagB  911080 ..  911095 -  -3.3  -3.93868   CTTGCAAAAGAAATA              GAAGT TACAAG ACTTC               TTCTTAAATGAAGTT  55 88
IUJ46_RS04705 NONE
IUJ46_RS04700 NONE
        pepF  907162 ..  907216 - -21.9  -5.40873   AATATAAAAAGAAAA TGACCGATAGAAATGGAGATTCACA CCAAC TGTGAATCTCCATTTCTATCAATCC TAAACTCTTTTTGTC 100 57
IUJ46_RS04690  905632 ..  905649 -    -7  -5.75478   AATTATATAAAAAAA             CCCTAG GCTTTG CTAGGG              TTTACTTTTAAATTT  93 52
IUJ46_RS04685  904877 ..  904887 -  -2.6  -2.60244   TCTTTAACTAATTTA                 TTAT AAC ATAA                 ATTTATCAATGTTAC  41 41
        prsA  903570 ..  903584 -  -4.2  -2.54181   CAATACAAAACAAGT               CCATCT CAC AGAGGG               CGAAAACCGCGGTAC  47 226
        alaS  900748 ..  900767 -  -6.5  -5.56264   TTCAAATATAAAAAA            CCAAGTT CTAAAT AACTTGG             TTTTTTATGGATTTA  87 38
IUJ46_RS04670 NONE
IUJ46_RS04665  899411 ..  899430 -  -2.2  -3.92542   GCTATTTTTAAATAA            TTAATGAA TCCT TTCATAAA             CAGTCTCCTTTTAGG  52 41
IUJ46_RS04660  898521 ..  898533 -  -7.7  -2.56164   TTCGCAACTATTAAG                CAAGC TCA GCTTG                AGATTTTTAAATATA  63 224
IUJ46_RS04630 NONE
        ptsP  889946 ..  889965 -  -8.6   -5.1675   TTAGCTAGCAAAAAA            GAGCTGGT TTAA ACCAACTC             TTTAACCCTTTAATC  95 35
IUJ46_RS04620  888318 ..  888353 - -14.4  -5.69023   AAAACATTAAAAAAA    TAAACAAAAAGTTAAG TTAA CCTAACTTTTTGTTTA     TTTTTTTTATTACTG 100 35
IUJ46_RS04615  886922 ..  886958 - -15.5  -4.73388   AAGGGCTACTAAAAA    CAACAATCCAATTACTT CAA AAGTAATTGGATTGTTT    AGTATATCAATTCTA 100 61
         udk  885040 ..  885062 -  -7.1   -4.9645   AGCACAACAATAAAA           GAGCAGATT TAAAT AATCTACTC           AGCCACTTCCACTAT  88 37
IUJ46_RS04600  884243 ..  884254 -  -3.6  -3.03124   CCCTATTGTCGAAGA                GCCC ATTA AGGC                 TTCTTCGGCTATTTT  45 502
IUJ46_RS04590 NONE
        dnaX  881519 ..  881542 -  -6.7  -2.60947   TAACGAGATAAAACG          TGGGTAAGG GCAAAA CCTTACCCT           TATGTATTTCAGTTT  57 40
IUJ46_RS04580  881120 ..  881144 -    -8  -5.38054   GTTTACAAAGAAAAA          TCACTTGTTC TTAAT AAACAAGTGA          CCTTTATAGAAAATA  93 140
IUJ46_RS04570  877674 ..  877693 -  -7.9  -5.44119   TTTATTTCAAAAAAA            CCTCAAG GTTATT CTTGAGG             TTCTCTTGATAGTCA  93 93
        metK  875979 ..  876007 -  -5.4  -5.64873   TTTAATAACAAAAAA        GCAGAGTAAG ATTTTTTCA CTTACTCTAC        TTTTTTAATAAAGTT  86 46
IUJ46_RS04560  874576 ..  874593 -  -9.9  -5.48063   ATGTAATATAAAAAA             GAGAAGC GTTA GCTTCTC              TTTAGTCTTCGATTA 100 27
        grab  873538 ..  873555 -  -6.3  -5.00846   TAAATATCAGAAAAA             GAGAATC TTTC GATTCCC              TTGTTTCATTTGCTA  83 54
IUJ46_RS04550 NONE
        spxR NONE
IUJ46_RS04540 NONE
IUJ46_RS04535  869620 ..  869647 -  -6.4    -5.252   CATCCTCATAAAAAA        TGAAGCAAGAAA ATAG TTTCTCACTCCA         CGACTTATTATCTTT  85 47
        aroA NONE
IUJ46_RS04525  867677 ..  867687 -  -2.6  -2.78738   TCAAAATTTTAATCA                 TTAT AGA ATAA                 TCAAGATTATTTCCT  42 129
IUJ46_RS04520  866095 ..  866118 -  -8.2  -5.02074   CCATTGCTCAAAAAA          GAAGAGCAAC TTTA GTTACTCTCC           ATTATACCATATCTT  90 39
        rlmD  864568 ..  864584 -  -5.9  -3.09349   GAAAGCATAGACACA              CTTAGCT GGA AGCTAAA              TAGCTAGATAATGAC  57 136
IUJ46_RS04505  863341 ..  863365 - -11.5  -5.46129   CAATAAAGGAAAAAA          GTCCCAATTCT CAG AGAGTTGGGAC          TTTTTTAGCCTTCTA 100 52
IUJ46_RS04495  860095 ..  860148 - -12.1  -5.13722   CGGAGTAAAACAAAA GAAAAGAACCAAAAAGGTAAGCAATC CCT AAGTGCTTACCTTTTTGGTTATCT-C AATCAATAAAATAGC 100 84
IUJ46_RS04485  858780 ..  858824 - -13.2  -4.62054   CGAATTAAAGCAAAA CTAAAAGGACTTAGTCCTGT CCAAT ACAGAACTAAATCCTTTCAA TAATTATTTGTCCAA 100 77
IUJ46_RS04475  857098 ..  857109 -  -3.6  -5.44119   TTTACTTTAAAAAAA                CGCC TTTC AGCG                 TTTCCTTACATTAAT  79 31
        obgE  855716 ..  855738 -  -4.2  -2.85779   TAACACACAAGAGCA           CTATCACACT GCT ATTGTAATAG           ATTGCCTTAATCCAC  48 32
IUJ46_RS04465  855508 ..  855530 -  -9.2  -5.16472   AAAAAGGTCAAAAAA           GGATGAGG GCCTAAG CCTCATCC           TTTTTCAATTTTTCA 100 13
IUJ46_RS04455 NONE
IUJ46_RS04450 NONE
IUJ46_RS04445 NONE
IUJ46_RS04440 NONE
IUJ46_RS04435 NONE
IUJ46_RS04430  848745 ..  848758 -  -3.8  -4.20354   AAGGTAACCTTAAAA               GCAG CGGTGT CTGC                CTAACACAATTATCT  59 139
IUJ46_RS04425 NONE
IUJ46_RS04420  847050 ..  847085 - -10.6    -5.055   CTAACTTCCAAAAAA    TAATAAGGCAAGGAAA CAGG TTTCCTTGCCTTTTTT     GGTTACTGTTATTAT 100 106
        uvrB  841713 ..  841729 -  -2.3  -3.62746   TCTACTCGAAAAAAC              CTAACTT GAC AAGCTAA              AAGTCATATTATTAA  47 216
IUJ46_RS04400  841519 ..  841533 -  -2.2  -4.11484   GTCAATCTCCTAAAA               TTCATT ATA AATAAA               GTTACTTTGACCATG  54 5
        dltA NONE
        dltB NONE
        dltC NONE
        dltD NONE
IUJ46_RS04375  835885 ..  835942 - -13.8  -4.88918   TCAGCGTAAATAAAA CAAAAGCTCTATAATCTCTTGAATGG GTAAAT CCACTGTAGAGATTATAGAGCTTTTT GAATATCAAAAAAGT 100 279
IUJ46_RS04365  834280 ..  834310 -  -3.3  -3.74137   AAACTAACAGAAATA       GAAGCTGGG CGTACTTCTTTAT CCCAGCCTC       CCTTCTTTGCCTTAT  52 37
IUJ46_RS04360 NONE
        amyA NONE
IUJ46_RS04350 NONE
IUJ46_RS04345 NONE
IUJ46_RS04340  827146 ..  827173 - -13.6  -4.27316   CCTTGTAACTCAAAA        CCTTGCCTCTTT AGAT AAAGAAGCAAGG         TTTTTTGATGTCTAA 100 68
IUJ46_RS04315  821128 ..  821150 -  -4.2  -5.40474   AGTTTCCTAAAAAAA           GTAACATTCC TTA AAAATGCTAC           TTTTTTTGTTCTTAA  82 37
        malQ NONE
        glgP  817172 ..  817202 - -12.8  -4.41895   AAGTCTGAAGTAAAA       TCATAAGACAGCAG AAA CTACTGTCTTATAA       TTTAGTTTAAGCATG 100 78
IUJ46_RS04280  812353 ..  812368 -  -5.4  -3.67498   CAATTGCTAACAGAA              GGGACA ATAT TATCCC               AAAAGCTAAGCTTAC  60 195
IUJ46_RS04270  811598 ..  811610 -  -5.5  -3.91488   AATGTCCTTAAAGAA                GAAGG TAT CCCTC                TTACACCAACTTCTA  63 61
IUJ46_RS04260  810787 ..  810801 -  -7.2  -2.52795   AAGGTGCTGAAGTTA               CGAAAA TGA TTTTCG               CCGATGGTAACGAAT  59 221
IUJ46_RS04245 NONE
IUJ46_RS04240 NONE
IUJ46_RS04235 NONE
IUJ46_RS04230  808089 ..  808105 -    -3  -3.14132   CGTCTTCGTCACCAA              GTATCA TATTC CGATAC              CTCTTCTTGTTTAGA  45 2
IUJ46_RS04225 NONE
IUJ46_RS04220 NONE
IUJ46_RS04215 NONE
IUJ46_RS04210 NONE
IUJ46_RS04205 NONE
         ssb NONE
IUJ46_RS04195 NONE
IUJ46_RS04190 NONE
IUJ46_RS04185  803862 ..  803873 -  -2.2  -4.09685   TCTTATCTGCTAAAA                CGTC ATCA GACA                 TCTTTATTTTGCATC  54 137
IUJ46_RS04180 NONE
IUJ46_RS04175 NONE
IUJ46_RS04170 NONE
IUJ46_RS04165 NONE
IUJ46_RS04160 NONE
IUJ46_RS04155 NONE
IUJ46_RS04150  800918 ..  800938 -  -2.6  -3.32317   ACTGTATAAAAACTA            GCTAAAAA CTCCT TTCTCAGC            AAGCAACACACCCTC  45 2
IUJ46_RS04145 NONE
IUJ46_RS04140 NONE
IUJ46_RS04135 NONE
IUJ46_RS04130 NONE
IUJ46_RS04125  796038 ..  796053 -  -5.4  -5.25699   AGGACATAATAAAAA              GCCGTA TTGC TACGAC               TCTAAAAATTTGTTT  82 155
IUJ46_RS04120 NONE
IUJ46_RS04115 NONE
IUJ46_RS04110 NONE
IUJ46_RS04105 NONE
IUJ46_RS04100 NONE
IUJ46_RS04095 NONE
IUJ46_RS04090  792696 ..  792708 -  -3.5  -2.71712   TTTCTCCTTTTAAAC                TTTTA CTT TAAAA                CCGTACGAAACCTTG  43 7
IUJ46_RS04085 NONE
IUJ46_RS04080 NONE
IUJ46_RS04075 NONE
IUJ46_RS04070 NONE
IUJ46_RS04065 NONE
IUJ46_RS04060 NONE
IUJ46_RS04055 NONE
IUJ46_RS04050 NONE
IUJ46_RS04045 NONE
IUJ46_RS04040 NONE
IUJ46_RS04035 NONE
IUJ46_RS04030  780288 ..  780298 -  -6.8  -4.27316   TCCTTTAATTTAAAA                 TGGC TTT GCCA                 GCAAATGGCGCTGAG  74 4
IUJ46_RS04025 NONE
IUJ46_RS04020 NONE
IUJ46_RS04015  778555 ..  778573 - -13.2   -4.7629   TTATTAATGTAAAAA             CCGCTCAT TTG ATGAGCGG             TTTTGTCTTATCTAA 100 55
IUJ46_RS04005  777199 ..  777214 -  -4.7  -4.32049   CATAACTTACTAAAA              CCTTG TTACAT CAAGG               TTTTTTCTTTTTGTC  67 128
IUJ46_RS03995  776066 ..  776089 -  -6.8  -5.99154   TAGTAAATAAAAAAA          CCGTCTTCCAT CAA ATAGAAG-CGG          TTTATCAAATTAACA 100 48
IUJ46_RS03975 NONE
        pfkA  769745 ..  769755 -    -4   -3.3164   AACTTATTGTGACAA                 TGAA CGG TTCA                 AAGCTGCAAAGTCTA  49 3
         pyk  768121 ..  768143 -  -6.4  -5.21709   TTTGATATCAAAAAA           GGTTAGAA TATTGCC TTCTAACC           TTTAGGTAAATAGTT  85 50
        lepB  767376 ..  767401 -  -9.1  -5.71983   CTAATTATAAAAAAA         GTAGAGTAGCC TGAC AACTACTCTAC          TTCTACAAATCCAAA 100 17
        glmS  765362 ..  765384 - -12.8  -5.61881   TCCTAAAAACAAAAA           GCAACCACCT AAC AGATGGTTGC           CTTATCCATTATAAT 100 44
IUJ46_RS03950  764843 ..  764861 -  -8.9  -4.03995   TTTTTTATAAAAATA             CAACCAG ATCAG CTGGTTG             CGTATTATTATTAGA  82 36
IUJ46_RS03945 NONE
IUJ46_RS03940 NONE
IUJ46_RS03935  762619 ..  762630 -  -5.8  -5.95539   TGTTAAACAAAAAAA                GGAC AAGT GTCC                 TTTTTAAGATTTAAT  93 29
         cfa  761213 ..  761246 -  -2.5  -5.18561   GAAATAGTTAAAAAA     TTCCTACAATTTGTT TTTA AACAGATCATAGGGA      TTTTTTTAAGAATAC  69 270
        pcrA  755555 ..  755589 - -13.1  -5.89947   GAAATCTAAAAAAAA     TGAGCTTCCTACT CACTTATAT AGTAGGAAGCTCA     TTTTTTTCTTATTTT 100 34
IUJ46_RS03910 NONE
        amaP NONE
IUJ46_RS03900 NONE
IUJ46_RS03895 NONE
IUJ46_RS03890 NONE
IUJ46_RS03885  752785 ..  752804 - -12.2   -4.8543   TAACCGTGACAAAAA            GAGCTGGT AAAT ACCAGCTC             AAACTTATCACCACC 100 68
IUJ46_RS03880  752022 ..  752042 -  -9.8  -5.85737   ACAGCAACAAAAAAA            GTTTGAGG TGGGC CCTCAAAC            TTATAATCCTTTTCG 100 26
IUJ46_RS03870 NONE
IUJ46_RS03865  747818 ..  747839 -  -3.1  -3.72893   TATCTTTCTATTAAA           TTATAGTAT TTAG ATACTATCA            TAATATGATTAACTT  52 74
IUJ46_RS03860 NONE
IUJ46_RS03855  746180 ..  746202 -  -3.4  -5.23316   TATTATAGCAAAAAA           GCTCAGGA AGTTAAG TCCCAAGC           TGTCATAGATAAGAA  74 56
IUJ46_RS03850  744702 ..  744712 -    -4  -2.70932   TTTTCTCTCTAATTA                 GTAA TTG TTAC                 TGATTCTATTCTACC  45 109
        truB NONE
IUJ46_RS03840 NONE
IUJ46_RS03835 NONE
IUJ46_RS03830 NONE
IUJ46_RS03825 NONE
IUJ46_RS03820 NONE
IUJ46_RS03815 NONE
        pstC NONE
        pstA NONE
        pstB NONE
        pstB NONE
        phoU  734715 ..  734734 -  -9.4  -3.26546   CATAATAGATCAACA            GATGATAC CTAA GTATCATC             TCTGTCTACATATAT  77 169
IUJ46_RS03785  732101 ..  732122 -  -5.1  -5.31275   GCTCACTACAAAAAA           GAGCTGGAA AGTC CCCCAACTC            TTTTGCTTATGGTCT  80 39
IUJ46_RS03780 NONE
IUJ46_RS03775  729647 ..  729672 -  -6.8  -4.97405   ATTCACAAAAACAAA         GCAAGCCGCG ATAAAG CACGCCTTGC          TGCAAAACTTGGCTA  83 166
IUJ46_RS03760  727566 ..  727614 - -15.7  -3.09516   CTCTTTACTATTTAA GCAAACCTAATTTAAATGAGCAA TTG TTGATTATTTAAATTAGGCTTGC TTTATACTTCTTAAT 100 16
IUJ46_RS03755  726529 ..  726539 -  -4.6  -4.42594   GAAAGTAAATATAAA                 GCCA AGA CGGC                 TAGATAACAGAAATT  64 49
IUJ46_RS03750  725379 ..  725400 -  -7.2  -4.62336   ATCTCAGTTTAAAAA           GAGCGACC GACAAA GGTCGCGC            TTCTTGTTCTTAAAC  80 42
IUJ46_RS03745 NONE
IUJ46_RS03740 NONE
IUJ46_RS03735  721562 ..  721584 - -11.4  -5.00412   AAAGACAAGCAAAAA           GAACTAAGCC GCT GACTTAGTTC           TTTTTAGTCTATTCT 100 172
IUJ46_RS03710 NONE
IUJ46_RS03705 NONE
IUJ46_RS03700 NONE
IUJ46_RS03695 NONE
IUJ46_RS03690 NONE
IUJ46_RS03685 NONE
IUJ46_RS03680 NONE
IUJ46_RS03675  709593 ..  709627 -  -4.2  -4.19371   TAAAGCGGGAAGAAA     GGAGCGCTTGCTCGAA TTA TTCGAGCAATTTTTCC     TAAAAGAGACCGAGG  62 25
         cls  707791 ..  707811 - -12.7  -5.81622   ATAAAATTAAAAAAA            GGATTGAGA ATA TCTCAATCC            AAGGGGCATTCTTAA 100 179
IUJ46_RS03665  707211 ..  707238 - -14.4  -5.56568   ATAGTAGCAAAAAAA        TACCTAACAGAT TTTT ATCTGTTAGGTA         TTTAAACCTTATCCC 100 74
IUJ46_RS03655 NONE
IUJ46_RS03650  704025 ..  704038 -  -8.1  -5.14965   ACTGTCATCAAAAAA               GCCGT CAAA ACGGC                TTTATAGTTATTTCA  90 117
IUJ46_RS03645  702333 ..  702346 -  -5.3   -6.0427   ATTAGATAAAAAAAA               GATGT AGTC ACATC                TTTTTTGGTTGGTGA  93 131
IUJ46_RS03640  700823 ..  700878 - -23.2  -3.68222   GTTGAATGGGAATAA CAGAATAAACATTAAAAGACTCGC-CA AAA TGAGCGAGTCTTTTAATGTTTATTCTT TAACTGTTTTCGTAT 100 11
IUJ46_RS03630 NONE
IUJ46_RS03625  696857 ..  696874 -  -8.5  -3.60048   GTTCGTGTAAAAAAG             GAAGTCA TAAA TGACTTC              TTTACTAATTATTTT  77 30
IUJ46_RS03620 NONE
         ffh  694850 ..  694869 - -10.8  -4.80882   ATTTCACATCAAAAA            GAGACGAA AATT TTCGTCTC             TTTTATTTTCGTTTT 100 28
        xerS  692257 ..  692268 -  -4.4   -3.6215   CCAATTGATGTTAAA                GAAG CTGT CTTC                 ATGATTCTCTAATAT  55 407
IUJ46_RS03600 NONE
        citC  690291 ..  690317 - -10.3  -4.93316   GAACAATACCAAAAA         CCTACCTGATT TTGAT AATCAGATAGG         TTTTTTATCTTAGTA 100 35
IUJ46_RS03550  681534 ..  681567 -  -5.4  -4.58663   ATGAGTTCTGAAAAA     TTAAAGCCATGCTC ACAAAA GGACATGACTTTAA      TCATCTCATAAGGAA  71 65
IUJ46_RS03545 NONE
        citG  679500 ..  679512 -  -4.1  -3.37761   TGGTAACAAAGTGAA                CCCTA TGA TAGGA                GCAGCAGGTGTTTCA  50 390
IUJ46_RS03465 NONE
IUJ46_RS03460  664640 ..  664656 -  -8.1  -3.63991   TACCACTTCTAAGAA              TTGATGT CTT ACATCAA              ATCATCACATTAAGC  73 70
IUJ46_RS03455  663655 ..  663668 -  -8.1  -5.18995   AAGATAAGACAAAAA               GTGCC ATTA GGCAC                TTTTTTAATCTTCTG  90 30
IUJ46_RS03430  657694 ..  657707 -  -6.7  -5.48213   CAGGCAAAACAAAAA               GAGAC CGAA GTCTC                TTTTGTGATTAGTTT  87 34
IUJ46_RS03370  645742 ..  645761 - -13.6  -3.27475   CTTTTTAGCAGAATA            CCCCCACT AAGG AGTGGGGG             AAGGTCATTATGATT  93 33
IUJ46_RS03365  644723 ..  644737 -  -7.1  -5.37865   TGAATAATTAAAAAA               CGGCT AATTG AGCCG               TTTTTTCTGTGATCA  89 66
IUJ46_RS03335  637927 ..  637940 -  -3.9  -2.81281   CTATTTAAAATCAAG               TTTAG TGAT CTAAA                ATGGAAGGGCCTGAT  46 13
IUJ46_RS03305  632751 ..  632772 -    -6  -5.09762   ATTTTAACAGAAAAA           CAGAAAAA TTTCAG TTTTTCTG            TCGCTTTTAGCCATT  83 39
IUJ46_RS03300 NONE
IUJ46_RS03295 NONE
IUJ46_RS03290  630058 ..  630075 -  -7.1   -5.1101   GTATGAGTTAAAAAA             GCTAAAA TTAG TTTTAGC              ACTATATAATAGTAT  88 155
IUJ46_RS03285 NONE
IUJ46_RS03280  628463 ..  628477 -  -2.8  -3.45027   ATCCTTCAGGAAATA               TTGAAC CTA GTTCTA               ACGATTATTGCTTTA  48 152
IUJ46_RS03250  622016 ..  622062 - -19.3  -3.64371   AAGTTATACTTTAAA TCACAAAATAAGTAGAAGCATA TTTC TA-GCTTCTACTTATTTTGTGA TTAGCTAATATCATT 100 26
IUJ46_RS03235 NONE
IUJ46_RS03230  617061 ..  617079 -  -7.4  -4.71382   ATAAGCACTCAAAAA             GGCTGG TATTTCT CCAGCC             TTTTTAATGTATCGA  83 50
IUJ46_RS03175  607260 ..  607291 - -13.3  -5.73672   AAACAATCAAAAAAA      GACAGTTATGAAA GAATTT TTTCATAACTGTC       TTTTTAGTTTACAGT 100 73
        mnmE  592727 ..  592749 - -16.4  -4.82667   TTATGACAGCAAAAA           GAGCTGGAAC ACT GTTCCAGCTC           TTTTGTGATGATTAG 100 50
IUJ46_RS02980  572184 ..  572218 -  -4.8  -3.78934   CTTTTGTTATAATAA     GGACAGGGTAGGGGAG TTA CTGCTCCCCTCTGTCC     ATTAGCGATTACTTA  59 34
IUJ46_RS02975  571723 ..  571738 -  -4.7  -5.52079   AGACTAAAACAAAAA              GTCCT TTTTAT AGGAC               TGTTTTTGTTGCCAG  83 122
IUJ46_RS02970  571306 ..  571329 -  -9.6  -3.22091   ACGGCAATTTACCAA          TAAAGGGGGC AGTT GCCCTCTTTA           TACTAAAATTCAAAT  79 28
IUJ46_RS02965  570857 ..  570880 -  -8.1  -4.79373   CAAGATAAGACAAAA          CCGCTCAGA TTAATT TCTGGGCGG           TTTTTTGTGTGTCTA  86 63
IUJ46_RS02740  539573 ..  539592 -  -6.4  -4.99134   ATGTGAAAGCAAAAA            GCACATGC GGGA ACATGCGC             TTAACAAAAATGAAT  83 280
IUJ46_RS02710  536322 ..  536345 -  -8.2  -5.12916   TATAAAATAATAAAA          GCGATAACCA GAAA TAGTTACCGC           TTAGGTGTGGCAGCT  90 199
IUJ46_RS02705  534764 ..  534776 -  -3.4   -3.1855   CTTTTCAAGACTGAA                GTCT AGCTG AGAC                AAATAGTGCGATTAC  47 176
IUJ46_RS02640 NONE
IUJ46_RS02635  518633 ..  518665 -  -5.7  -4.76171   GAAAAAACTATAAAA     CTCCTAAGC-GAAC TATCGT GTCCTACTTAGGAG      TTTTTGTTTGATGAC  74 54
        hylA  514624 ..  514656 -  -9.3  -4.83677   AAAATAAAACGAAAA      GGACTTAGTCCTCTA CAA TACAGAACTAAATCC      TTTACTTCAAATAGA 100 315
       fbp54  498159 ..  498196 -  -7.7  -5.89921   ATCAGAATAAAAAAA   CAGTTCTCCTAGGGGAA ATAA CTTTCCTAGGAGAGCTG    TTTTTTAGTTGCTTA 100 41
IUJ46_RS02470  480294 ..  480321 -  -3.3  -5.20216   GAGATTACTAAAAAA        GAGGCCGGCAC TTTAAT GTGCTAGTCTC         TTTTAAATTGATCCA  71 49
IUJ46_RS02450  476521 ..  476536 -  -2.6  -5.43487   AAATCATATAAAAAA              GCCTTAT TTG AT-AGGC              TCTTTTTGTTTCTTG  76 354
        plsY  467972 ..  467996 - -11.5  -5.80951   AGTTAAAACAAAAAA          GCTTGACTTTC AGA GAAAGTCAGGC          TTTTAGTAAATTTAT 100 37
IUJ46_RS02360  459070 ..  459105 -  -2.5  -5.17353   ATATTTATCAAAAAA    CACGATAACTTGACC GATACA GGTCTTACTACCGTG     TTTTTTAGTATGACG  69 54
IUJ46_RS02325  451124 ..  451156 -  -3.3  -4.05085   AGTGCTAAAAAAAAG      TCCGTCAAGTGTATA ACG TAGTCACAAGACGGA      TTTTTTCATGTTTTG  55 66
IUJ46_RS02290 NONE
IUJ46_RS02285  443963 ..  444006 - -11.3  -4.63044   ATGTATAGAAATAAA GATTAAACACCCATGTAAAC CAATT GTTTACATGGGTGTTTG-CC TTATATTAGTTGTTT 100 45
IUJ46_RS02245  434848 ..  434858 -  -5.4   -5.5074   TAATTTAACAAAAAA                 CCTA GAG TAGG                 ACGCTTTAGGTTTTT  84 89
        ideS  426681 ..  426715 -  -3.6  -4.11141   TGCCAGACAAAAATA     CCCCAATTATTAGA TTTTTTG TCTAACTTTTGGGG     CGCAATTCAATCTGA  59 491
IUJ46_RS02135  414572 ..  414626 - -16.8  -5.12707   TTAAACGCTAAAAAA CAAGCATACTCTTTTTTACAGCATAG TGA CTATGTTGTAAAAAGGGGTATGCTTA TTAGGTGCTCTTAAT 100 103
IUJ46_RS02020 NONE
IUJ46_RS02015  386499 ..  386510 -  -4.4  -4.09015   AAAACAGACGAGAAA                TTGG ACTA CCAA                 AACGTTGCTACTGTG  61 455
IUJ46_RS01985  379409 ..  379432 - -11.2  -5.45652   ATCGCCAATAAAAAA          GAAGCAAAAT TATT ATTTTGCTTC           TAGTCAGATCATTAA 100 46
IUJ46_RS01955  376392 ..  376413 -  -6.6  -5.32882   CAGCATGATAAAAAA           GCCCTTAC TCGAGG GTAAGAGC            TTTAGTTGGGCAAGA  85 8
        mscL  356110 ..  356131 -  -8.1  -5.58454   TTGATATCAAAAAAA           GTAGTTAGA CATG CCTAACTAC            TTTATCAAAAATCGC  93 42
IUJ46_RS01840  346772 ..  346796 - -10.1  -5.69473   GATATTAGAAAAAAA          CCAAACAAGCA CAG CACTTGTTTGG          TTTTTTTCTAAGTGT 100 68
IUJ46_RS01670 NONE
IUJ46_RS01665  305584 ..  305597 -  -4.5    -3.494   CAAGTTTTGATAGAA               GCGAC TCAA GTCAC                GTAGCAGCTGATAAA  53 490
IUJ46_RS01650  302170 ..  302188 -  -8.9  -3.63627   TTTTGATACTTGAAA             GTCGTGA TATTC TCACGAC             TTTTTATTAGCTTTT  77 129
IUJ46_RS01625  296571 ..  296599 - -14.9  -3.71686   CGTAACGTAATAGAA        TAAAAAGACTAGA GTC TCTAGTCTTTTTA        TGTCGTCGTGACAAT 100 250
IUJ46_RS01595  292517 ..  292544 -    -2  -3.20858   CATCATAGTTATTAA        CCATTCTAGTGT AACA AAACTTGAATGA         CTTGACAAGGCTTTT  44 63
IUJ46_RS01590  292170 ..  292188 -   -11  -5.46706   AGGTCAAAAGAAAAA             CCCTCCTG ATA CAGGAAGG             TTTTTTGTATTGTCT 100 44
IUJ46_RS01565  286366 ..  286383 -  -9.1  -4.24342   TTTTTTACCAACAAA             GAGGAGC GGCA GCCCCTC              TTAATTAAAATTCAA  89 30
IUJ46_RS01560 NONE
IUJ46_RS01555  285457 ..  285479 -  -9.1  -4.07772   TAAATAAAAAACCAA           CCGCTCAGA TAATT TCTGGGCGG           TTTTTTGTGCGTTTA  85 63
IUJ46_RS01410 NONE
IUJ46_RS01405  260767 ..  260779 -  -6.3  -6.12458   GAAAAAAATAAAAAA                CTAAC ACA GTTAG                AACAGTTACAACAGT 100 516
IUJ46_RS01280  250971 ..  250995 - -11.5  -4.72863   GTAAAGAAACTAAAA          GAAGCCCATCC AAA GGATAGACTTC          AATTCAATGTAAACA 100 57
IUJ46_RS01265  248852 ..  248869 - -11.3  -3.41745   TGGTGACAATATCAA             GAGGGCT AAGA AGCCCTC              TCCCCTAACGGGGTA  89 351
IUJ46_RS01255 NONE
IUJ46_RS01250  247406 ..  247447 -  -4.1  -2.78032   TTTCTGTTAAAATAG GTATAGTAAAGAGACCTAC GGCAAA GCAGGT-T-TTTACTATAC TAGATTCGCCTCACG  48 77
IUJ46_RS01245  245496 ..  245518 -  -5.6    -3.794   TTTGAAGCCATCAAA           TTACTTCGAG AAG CTCGAAATGA           TATTAACCGTGCCAA  63 467
IUJ46_RS01205  235333 ..  235377 - -14.6  -4.90381   TTCAAGAGAAGAAAA GCACCCCAAAAGTTAGAT GTTTGATGT ATCTAACTTTTGGGGTGT CATTCAAAATTTAGT 100 111
IUJ46_RS01155 NONE
IUJ46_RS01150 NONE
IUJ46_RS01145  223935 ..  223950 -  -4.8  -4.15222   AGTGCCTGTAACAAA              TTGATA TCCA TATCAA               TCTCCTTTATTCATT  64 39
IUJ46_RS01140 NONE
IUJ46_RS01135  222294 ..  222345 -  -8.9  -5.07652   CTTTCCAAAAGAAAA GAGACCTCATCATGTGCTTAGGAA CTATT TCCCTATGCTCATAAC-AGGTCTC TATGAACCATTAAGC  95 35
IUJ46_RS01130 NONE
IUJ46_RS01125  219231 ..  219254 -   -14  -4.19472   TAATAGACGCTAAAA          GGTTTGAGAC AATT GTCTCAAACC           TTTTTTTATAATCGT 100 73
IUJ46_RS01110  214239 ..  214266 - -14.4  -4.90266   TGTAGTAACTAAAAA        GATTGAAGAAAG TACT CTTTCTTCAATC         TTAGAATGGAGACAA 100 296
        yidA NONE
IUJ46_RS01100 NONE
IUJ46_RS01095  210726 ..  210771 - -22.4  -3.34013   GATTTCCTTAACTAA GTCATCTAAAAAAGAAAAGG TTAAAT CCTTTTCTTTTTTAGATGAC TTAACTCTTACTATA 100 78
        pepF NONE
IUJ46_RS01065  201465 ..  201506 - -20.7  -2.81815   TTTAATTAGTAACTA TAATATAAAATAGACTTGG CACG CCAAGTCTATTTTATATTA  ACCAAGAAGTGCTTT 100 23
IUJ46_RS01050  199150 ..  199171 -  -8.1  -5.36441   TGGTGACATAAAAAA           CTCCTTTTG TGCA CAAAAAGAG            TATCGCTTTCCAATC  90 266
        thiT  198524 ..  198547 -  -7.6  -5.88197   CTAAACATAAAAAAA          TGGTATAACA ACAT TATTATACCA           TTTTTTTAATGTAAG 100 58
IUJ46_RS01040  197950 ..  197962 -  -2.7  -4.57787   ATAATACTAAACAAA                GACTA GCT TAATC                AAGGCGAAAAACTTA  60 73
IUJ46_RS01035  196670 ..  196684 -  -7.1  -3.10597   GTCGTCAGCTAAAAC               CAGGC ACTAA GCCTG               TTTATGATGTGGCTA  63 387
        lysS  194271 ..  194296 - -14.9  -4.16842   GCTACTGTTAATAAA         CCAGTCTTCAT GGTA ATGAAGACTGG          TTAGAGATAATAAAA 100 98
IUJ46_RS01020  193723 ..  193747 -  -6.6  -5.64274   TGAGTCATAAAAAAA          GTGAAAAAAA GATGA TTTTTTCCAC          TTTAATTTCGAATAG  89 371
IUJ46_RS01000  190762 ..  190781 -  -7.2  -6.02914   TTGACACAAAAAAAA            GAGTCACGT AAA ACG-GACTC            TGGAAGTTACATCAG 100 32
IUJ46_RS00960  184307 ..  184333 - -10.3  -2.91099   TAGATGATAAAAGAG        GAGGCTGAAACA CGAA TGTT-CAGCCTC         GACTGATACGTTTTG  79 116
IUJ46_RS00955 NONE
IUJ46_RS00950  182518 ..  182544 -  -6.7  -4.89729   GATAAAACTCAAAAA         GCATTTGTTTT GATAA AAAACAAGTGC         TTTTTTATTAGTCTT  83 40
IUJ46_RS00930  176572 ..  176599 - -14.3  -4.90906   TTATAACAGCAAAAA        CCAGTCTCGTT TTATTG AACGAGACTGG         TTTTTAGTATGTCAT 100 42
IUJ46_RS00845 NONE
IUJ46_RS00840  163231 ..  163276 -  -6.4  -3.07005   AATCAATGGCTAATA GTGAGGA-GGATTT-GCCGATA GAGT TATCAGCTAAATCCATCCCCAT AATCACGTTTAACCC  59 103
IUJ46_RS00830  161453 ..  161494 -  -9.6  -3.03151   TTTTTCAAAGTAAAG GCACTAAGTTGATCTGAC TTACAC ATCTTATCAACTTAGTGC  TTTTTTTATTTCTAG  77 37
        rgg3  150380 ..  150405 -   -12  -4.60949   TAGAGTACAAAGAAA         GCCTTGGAAA TAGCAG TTTCCAAGGC          TTTTTAGCTGTCGAT 100 130
IUJ46_RS00690 NONE
IUJ46_RS00685 NONE
IUJ46_RS00680  127827 ..  127852 - -14.9  -5.42198   GGTTAAAAAATAAAA         CAACAGAAGCT TTAA AGCTTCTGTTG          TTAATAGTATTAGTT 100 35
IUJ46_RS00675 NONE
IUJ46_RS00670 NONE
IUJ46_RS00665 NONE
         pcp  124222 ..  124242 -    -4  -5.67063   TTTAGCACAAAAAAA            CAGAGTTA GTTCA TATCTCTG            TTTTTTTAAAATAGG  84 57
        shp2  114008 ..  114021 -  -5.3  -2.83522   ATTCGTTGATTAAAT               GGTTA TAAA TAACC                TTAGCCTTGTCGTAG  52 490
        stcA  113268 ..  113292 - -10.8  -5.06451   GATTAGCTTAAAAAA          GAACACTACC GAAAT GGTAGTGTCC          ACTGATTTTAGGAGA 100 42
IUJ46_RS00555  107418 ..  107429 -  -4.4  -3.64822   AGTGTCTCAGCCAAA                CATC GCCT GATG                 TTAGAGGAATATTTT  56 372
IUJ46_RS00475   94391 ..   94423 - -12.1  -4.65153   GCAGACAAACTAAAA      GAACCTGACGTCTCA TGA TGAGATGTTAGGTTC      TTTTTTTGTGATGTC 100 60
IUJ46_RS00465   90897 ..   90950 -  -3.5  -2.96321   GTCATCAAAAGACCA TAAAAAACCTTATCAAACCA-AGG TATTTAG CCTATTATCTGATAAGGTTTTTTT AAGCATGATTTAGTT  45 35
IUJ46_RS00445   87382 ..   87419 - -24.5  -5.40474   AGCCCCTCAAAAAAA   GAGGCCACACTCATTTA AATT TAAATGAGTGTGGCCTC    TTTTTTTGAGGAGAC 100 49
IUJ46_RS00395 NONE
        spej   78060 ..   78072 -  -2.7  -4.87665   CTCTAGCCATAAAAA                TACCT CTT AAGTA                GATTTTGATTATTTA  66 144
IUJ46_RS00380   76182 ..   76220 - -15.5  -3.37344   TTCGCACGCAATCAA   CAGCACAAAAAGCACCC CTGAC AGGTGCTTTTTGTGCTT   TAGCCAACCTATAGC 100 52
IUJ46_RS00365   73841 ..   73853 -  -4.8  -5.81032   GAACGTCAAAAAAAA                GGAC ATGGA GTCC                TTTTTTTGGCGATCG  91 53
IUJ46_RS00325   58310 ..   58338 - -10.3  -5.07107   CAAAGTCTCAAAAAA        GGACAAGGCAACA TTA TAACGCCTTGTCC        TTTTTTGGGATCTGT 100 50
IUJ46_RS00315   56968 ..   56994 -  -9.6  -5.50925   AACTAAGAGAAAAAA         GACCATCAAT TGGATTT ATTGATGGTC         TTTTAGGTGTTTAAA 100 36
IUJ46_RS00260   47250 ..   47263 -  -6.7  -5.40625   ATAGCATAGAAAAAA               GGCTT AACA AAGCC                TTTTTTGATGTGATT  87 125
IUJ46_RS00255   46343 ..   46356 -  -6.7  -3.12847   AATAAAGTTATTGAA               GCTGA TAAG TCAGC                ACTATAGGACAGTTG  59 4
IUJ46_RS00250 NONE
IUJ46_RS00245 NONE
IUJ46_RS00240   43299 ..   43323 -  -7.9  -3.89814   GCACCATAGAAAAGA          GCTAGGAACAA GGA CTGTTCTTAGC          TTTTTGAGTGCTTTT  73 39
IUJ46_RS00120   25118 ..   25128 -  -3.2  -3.29144   GTACTTTTTGCATAA                 GAAG GGC CTCC                 TTGCTTTTATTATAG  47 76
IUJ46_RS00115   24811 ..   24827 -  -2.3  -3.85817   AGTTTTTTTCAGAAA              TTCACAA TAG TTCTGAA              GGCCGATTTTTACTT  50 35
        yidC   23385 ..   23408 -  -3.1  -5.17488   AATACCAAAAGAAAA          GACCAGCAC CTTAAT GTACTGACC           CCAAAAAGTTGGACA  71 449
        rsmG    5155 ..    5172 -  -5.6  -5.23016   AAATAAGTTAAAAAA             GCTAAG TTTCAT CTTAGC              CTTTGGTACTATTTT  82 39
        ktrB NONE
        ktrA    3009 ..    3032 - -11.1  -5.27399   TAACATAGTAAAAAA          CATCCTTGG AAAACG CCAAGGATG           TTTTTTTATTATTTA   0 34
