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AKN90_RS04700 1008179 .. 1008209 +   -12  -3.52896   CTTAATAACTTGTCA       GCGCCTTATTCT TACCGCT AGGATAAGGCGC       TTATATCCCTGCTGG  91 36
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AKN90_RS04725 1012529 .. 1012542 +  -3.1  -4.22554   GAGGTCTGGCTCAAT               GCTTA AATT TGAGC                TTATTTGTTAACTAC  58 20
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AKN90_RS04755 1019174 .. 1019212 + -21.2  -2.90194   AAAGCTGCCGTTAAG   TTCATACACCATGGCGGC TAA GCCTCCATGGTGTATGAG   TGTCATTACAACAAT 100 27
        polA 1022894 .. 1022911 + -12.7  -2.52896   TTTTATTATTGACCA             GCGCTGC CTTG GCAGCGC              TAAATTAAAAGATAA  86 74
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        bktB 1043745 .. 1043770 + -17.7  -4.71828   CCTAAGGTAACACCA         CTGCTCGGCAA CTCC TTGCCGAGCAG          TTTTATTGCTGCAAT 100 36
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AKN90_RS04940 1062524 .. 1062554 +    -9  -3.01712   AACCACGCTATGTAG       AGCCTGCTACAGCT ATT ACTTGTAGCAGGCC       TGTTAACGCCCCAGG  68 39
        hrpB 1065958 .. 1065979 +  -8.7   -3.6682   AGCGGCAATAAAAAA           GGTGCTAGG ACGT CCTAACACC            TTTCAGTGAGTAGCG  75 72
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        rsxB NONE
        rsxC 1078865 .. 1078884 +  -4.2  -4.60746   ACCGTAATGCCTGCT            GCACCCTG ACTT TACGGTGC             TTTTGATATTTTTGG  68 34
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AKN90_RS05055 1085436 .. 1085462 +  -9.5  -3.25942   CGCTAGCACCTAATA         GCCCTTACTCA CGCAC TGACTAAGGGC         TTAGTCTCACAAGAT  74 35
        plsY 1089744 .. 1089754 +  -8.2  -2.72344   TGGCTTCTAACTCTT                 GGCG TAA CGCC                 TGATTAGCACTGACC  61 207
        rpsU 1091027 .. 1091042 +  -7.5  -4.72486   GAGACACACTAAAGG              CCCGG CTTAGT CCGGG               TTTTTGGCGTTTATA  81 53
        dnaG 1093152 .. 1093169 +  -2.1  -4.56887   AATGGAAATTTATAA             GC-TTTTA TGG TAAAATGC             TTTTATACATTTTTA  60 26
        rpoD 1095120 .. 1095137 + -11.3  -5.65927   TCTGTAGTGTCAAAA             CCCTCGA CTCG TCGAGGG              TTTTTTATTTGCGTC 100 88
AKN90_RS05110 1095441 .. 1095453 +  -4.8   -5.0538   CTAGGATAGTTGCTA                GCCT TTTAT AGGC                TTTTTTCCAATAACA  77 202
AKN90_RS05115 1096308 .. 1096331 + -12.4  -3.40371   TTGTTTACAAAAAAA          TCCCGCCACC GAGA GGTAGCGGGA           TTAATTAATACGCTA  95 49
AKN90_RS05130 1100366 .. 1100382 + -10.9  -3.44553   CCGACTGGACACTGT              CGAGCAA TAA TTGCTCG              TTATAGGGTTTTTCA  79 315
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AKN90_RS05150 1106383 .. 1106401 + -11.7  -3.48924   TAGACTAATACGAAA             GGCGCAG ATGAG CTGCGCC             TTATGTACCACGTGC  89 33
AKN90_RS05155 1108265 .. 1108289 + -12.2  -5.76633   ACCAGCGTCTCAAAA          GCGGTACTGT GCTAA ACGGTACCGC          TTTTTTTATGTCTAG 100 59
AKN90_RS05160 1108989 .. 1109005 +  -2.9   -4.0942   TACGCCCCAACCCGC              CGCTGAG TTG CTTAGCC              TTTCTCTGGTAGCTC  57 131
AKN90_RS05165 1110496 .. 1110542 +  -8.9  -2.84051   ATAAGCTAATGTAAC CGGTTAACAGAGTTATCCCTA TTCTT TGTGGATAACTCTGTTAAAAG CTTTAGTACAAATCG  67 37
AKN90_RS05170 1111620 .. 1111636 +    -8  -4.81083   TAGATTAATAAAAAA              GGCATC ACATG GATGCC              TTTTTGCTGCTTAAA  91 54
AKN90_RS05185 1114940 .. 1114951 +  -7.2  -3.54129   TTTATGCTTCCTGGC                GCGC CTTG GCGC                 TTTAGGACAGCTCTA  66 458
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AKN90_RS11660 1116930 .. 1116944 +  -2.9  -2.53271   TCAGCATCTAAAATT               TTATC TGCCT GATAA               CTATTCTAAGGATGC  41 147
AKN90_RS05195 1118206 .. 1118216 +  -5.4  -4.43879   CCCTCAGTTTACGTG                 CACA GTA TGTG                 TTTTGATTCACTGCT  70 9
AKN90_RS05200 1119190 .. 1119234 + -13.7  -3.22091   CAACACCTTAAACTG GCCTAGCCGCTACCAG-GCG ACACCG CGTGTTGGTAGCGGCTAGGA TTAATAACTTAACGT 100 30
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AKN90_RS05220 1125298 .. 1125308 +  -8.2  -3.66803   AATGCTAACTATCTG                 GCGC TAA GCGC                 TTTGAGCTGTTACGA  73 39
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AKN90_RS05245 1131158 .. 1131185 + -17.2  -5.24129   CTTTGCTAGCTGAAA        GCCGTAAATCCA GTCA TGGATTTACGGC         TTTTTTATCCACACC 100 49
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AKN90_RS05270 1139263 .. 1139287 +  -6.3  -5.33331   GGCCTGGGCCAGCGG          TCACGCCGCAG GAA CCGCGGTGTAA          TTTTTCTTCTGTTTA  89 1
AKN90_RS05275 1140475 .. 1140500 + -10.4  -5.27779   TGGCAGTAAATATAA         GCGAAGCACC TTAATC GGCGCTTCGC          TTTTTTAGTGTTAGA 100 57
AKN90_RS05280 1141279 .. 1141305 +  -4.5  -4.52873   GACGGCGAGGTAAGG         GCCATAGGAAA TAGGC TTTTCTATGCC         TTCTTTTTGTAAGCG  71 306
AKN90_RS05300 1145904 .. 1145923 +  -7.8   -4.3739   CTAAAGAAAAAATAC            CCTCAGCC GCTT GGCTGATG             TTTTCTGCCAACATA  78 137
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AKN90_RS05585 1191508 .. 1191532 +  -8.7   -3.0127   GAGTACTCGGAGGGA          TTTACCCTG CGTAATA CAGGGTAAA          TGTCTGCTTAAATCG  68 12
        hemJ 1193637 .. 1193672 + -16.4  -3.54741   TTTTAAGCGCTCTAT    CGATGTTATGACGC TTTAATTC GCGTCATAACATCG     TTTCAAAAGATGCTA 100 35
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        coq7 1194925 .. 1194952 + -11.4  -2.79796   CCTAGTCTAAAAACA        CAAAAAACACGC CAAG GCGTGCTTTTTG         TGTAATGCAATAAAC  81 42
AKN90_RS05660 1203568 .. 1203583 +  -4.8  -3.86202   CCACGAATAAAGGGA              TTGAAA ATAC TTTCAA               TTTCCTCTGCTGGAA  59 195
AKN90_RS05675 1207983 .. 1208009 + -10.8  -3.61764   GACGAGAGTCTTTAT         TTACGAGCGTCG CTT CGGCGCTCGCAG         TTTAACGCTTAGTGC  84 83
        gshA 1209645 .. 1209670 +  -7.7   -5.4833   GTAGACAAAGAAAAA         CCCAAAAAG CAGCCGCA CTTTTTGGG          TTTTTTGTTAGATGC 100 57
AKN90_RS05695 1214555 .. 1214575 + -11.1  -5.14163   TTCGCTAAGCAAAAA            CGCCGCTCA ATG TCAGCGGCG            TTTTTGTTGCTCGCT 100 51
AKN90_RS05710 1217167 .. 1217195 + -14.8  -5.00642   AGTTAAGTAACTAAA        CAAACCTCTCTA CAGCC TAGAGAGGTTTG        TTTTTATCTAGCTTG 100 85
AKN90_RS05740 1223692 .. 1223702 +    -4  -3.35798   GCAATGCGGCTACAA                 CATT CAA AATG                 TTATGCCTCACACCT  51 74
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AKN90_RS05785 1233556 .. 1233577 + -14.5  -2.71144   CTAAGCCAACCCTCA           CTGCCGCTT AGCT AAGCGGCAG            TGATTGACCGCCCTA 100 37
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AKN90_RS05805 1237053 .. 1237073 + -14.1  -4.19238   TTGCCGAAACAAAAA            TGCCAAGCA AAG TGCTTGGCA            TTTTAGGGTTAACCC 100 52
        phbB 1239519 .. 1239554 +  -5.4   -3.2963   TTGCCATTAACGGCG    GGCAGC-ACATGCAGTA ATT TTCTCCAGGTAGCTGCC    TTGTGGACAACTAAT  55 9
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AKN90_RS05825 1240867 .. 1240884 +  -4.2  -2.99947   AATCGGCGTAGGCTT             TAGATC AAGGAG GATCTA              TGTCTCTCGCCATTA  47 39
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AKN90_RS05840 1244239 .. 1244263 + -15.1  -5.64274   TCTTGGCTTTAACCA          CCGTGCTAGTC CTC GATTAGCACGG          TTTTTTTATGCCTAA 100 45
AKN90_RS05855 1246767 .. 1246779 +  -2.7  -2.89935   GCCAGTGCTTTAGAT                TAGGA AAC TTCTA                TGTATCAGCATCTTT  42 23
        ubiA 1247644 .. 1247658 + -11.4  -3.53444   GTATTTTTCTGGGTA               GCGTGG TGG CCACGC               TTTAGCGGCAACTAG  89 6
        phoB NONE
        phoR 1249758 .. 1249778 +  -5.5  -5.44721   CGCTTAGGCTAATCC            CTTAAGG CCCAGCA CCTTAAG            TTTTTTTGCCCTAGT  87 34
        glnK 1250323 .. 1250338 +    -9   -5.5604   ACTAAACCCTAAAAA              CCTTCC ATCT GGAAGG               TTTTTTATTACTTGA 100 56
AKN90_RS05910 1257608 .. 1257631 +  -8.9  -5.40072   GGTTTTAGCTTAAAA          TCCCAAGCC TTAATC GGTTTGGGA           TTTTTTTGCCCGCAG 100 76
AKN90_RS05915 1259518 .. 1259545 + -14.2  -3.27298   TTTAGCCAACAAAAA        CGCCAAGTATCC CGTT GGCTACTTGGCG         TTAGTGATTGAGCAG 100 36
AKN90_RS05940 1262989 .. 1262999 +  -6.8  -3.56836   TAACTATGCTAGAAA                 CTGC ACT GCAG                 TTTGACGACTAATTT  63 3
AKN90_RS05945 1264446 .. 1264457 +  -4.4  -3.54459   AATCACCGGTACCGA                CAAG CCGA CTTG                 TTTGGCCGAGGTTAA  52 305
AKN90_RS06000 1274112 .. 1274124 +  -3.5  -4.91873   AGCTAAAACACCTAC                TAATT TTT AATTA                TTTTTACTTACTATA  73 16
AKN90_RS06005 1274846 .. 1274876 +   -17  -3.68222   AGCTTCTAACCCGAT       ATATTCAGCCCGCA ATA TGCGGGCTGAATAG       TTATTAGGATTCAAA 100 32
        nudE 1276173 .. 1276200 +  -2.1  -2.97951   GCTTACTCAAGCCTA        CTGATGTTAAGG GAGCA CCTTAATG-CAG        ATTTCTGATGCGCTA  42 3
        cysQ 1277300 .. 1277310 +  -3.2  -3.03338   ATGCTTCGAAGGCAG                 CTCT TGC AGGG                 TCTTAGGAAAGTTAT  45 306
AKN90_RS06030 1279230 .. 1279255 + -10.5  -3.37259   AATCACTGCCATCAA         TAACGGGGCAGT TAA GC-GCCCCGTTA         TATTTAGCGCTGGTT  78 39
AKN90_RS06095 1290692 .. 1290719 + -12.2  -4.72272   CCGTCTGGAACAACT        G-TTAGCGCGTTA AGG TAACGCGCTAAGC        TTTTTACTAGCGGAA 100 13
AKN90_RS06100 1292028 .. 1292050 + -16.4  -5.64274   CAGCGTTAACCGAAA           CGGTATTGGC TCT GCCAATACCG           TTTTTTTATGCCTAG 100 45
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AKN90_RS06110 1294573 .. 1294597 + -12.2  -4.86939   GCGATTGTAATTGAA         CGCCC-CACCT ACTC AGGTGCGGGCG          TTTTTCGCTTTCTTA 100 58
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AKN90_RS06245 1337835 .. 1337850 +  -3.2  -4.21194   CCACCATTGGGATAT              CTGGCA AAAA TGCCAC               TTTTGCGTGCTGCAA  60 306
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        yccS 1352654 .. 1352677 +  -9.6  -4.20354   CTGAAAACAAAAAAA          TCTGCCTAGC ACCA GCTAAGCAGA           TTTTACACTTCACTT  85 17
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        trpA 1362821 .. 1362837 + -10.1  -5.26875   ATTAAAAATGAAAAA              GGCGCTG TGA TAGCGCC              TTTTTTGCTTAACCC 100 55
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        trxA 1377401 .. 1377415 +  -5.7  -3.54602   CGTGATGCACCTCTT               CAAGC CTATC GCTTG               TTCTACTATTACTTA  59 223
         rho 1378784 .. 1378808 +  -6.3  -3.06796   TCAAGTCAGAATTAA          CCTCCCGCCTG CTT TAAGCGGGAGC          TTCCATGCAATACAC  56 81
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        mtgA 1390314 .. 1390327 +  -2.4  -3.31322   AATCCCTGAAGAGCT               CTAG CGTCCC CTAG                TTATAAAAAGTTAAA  45 22
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        atpG 1419833 .. 1419849 +  -9.3  -3.54459   AATTTCAGAAATCGT              CGGCGGC GCT GCCGCGG              TTTAAGAACGGTTCA  76 4
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       cas1e 1489565 .. 1489580 + -10.4  -2.70946   ATATGTTGGTGATTT              CCCCAC GCCC GTGGGG               GTGTTTCTGGGCCGA  74 343
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         def 1511253 .. 1511292 + -13.2  -3.53444   GAGTGGTAGGTGATT  AAAAATTAGCCTTTATGT TCGC GCATAAAGGCTAATTTTG   TTTAGGCAAGACTGA 100 39
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        trkA 1514995 .. 1515008 +  -2.3  -2.72043   TTTAAGCCACTATTA               CCGCT AATC AGCTG                ATTTAACGACGAGTT  40 36
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AKN90_RS07155 1535239 .. 1535267 +  -7.6  -5.93252   AAGAATGTCTTAGAA       GCCCTGTTATTTG CTTG TAAAT-ACAGGGC        TTTTTTATTTTTCCC 100 56
AKN90_RS07160 1536473 .. 1536490 +  -2.7  -3.54039   AAGCGCCAAATAGCT             CGATATT ATTT GATGTCG              CTTTTTAGTTACTGT  48 83
AKN90_RS07215 1547818 .. 1547841 + -12.4   -3.3482   TAACAATTCATTCAA          GCTGACGCCGC TTC GCGGCG-CGGC          TTAATTCAGGCGTTA  95 59
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