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ATA ACAAACA ATTTAAGAGTGACTC 45 15 OCV39_RS19575 NONE OCV39_RS05730 1243431 .. 1243451 + -5.3 -3.15758 AATACTTTAAATCCA GTGGTCTGC GTT GCTCACCAC TTAATGCGGCGTTAT 55 115 OCV39_RS05735 1243916 .. 1243926 + -2.4 -3.67588 TAAGAGTGACTCCCA ACGC GTG GCGG TTTCACTCCGGTTTG 49 50 OCV39_RS05740 1244845 .. 1244862 + -4.2 -2.95877 CTTGCTATACGTAAA GTGATA GAATAG TATCAC TATAGTATTCCTTTG 50 179 OCV39_RS05745 NONE OCV39_RS05750 NONE OCV39_RS19590 1246446 .. 1246471 + -2.5 -4.87592 TGGCTCTAATTTTAG CTCATTTCGCT TCTT AGCCAAGTGCG TTTTATTGTCTATGG 65 101 OCV39_RS19600 1247266 .. 1247278 + -6.3 -3.09803 GCGTTGCTCGCCACT TAACG CGG CGTTA TATTGCATAAGATTC 56 4 OCV39_RS19605 1247918 .. 1247931 + -3.1 -2.54745 CTTATCGAGGTTTTT CTGAG CTTT CTTAG GGTTTTCTAAGTCAG 43 7 OCV39_RS19610 1248986 .. 1249000 + -2.8 -4.95876 CAATTTAAGTGGGAT TCCCAA CGC TTGGTA TTTTTGGTTCTACTT 68 519 OCV39_RS19615 1249847 .. 1249865 + -9.6 -3.92542 CGTCTTGTTTCTCTG GCTCAAAG TCG CTTTGGGC TTATTTCCCAATCAG 83 7 OCV39_RS05765 NONE OCV39_RS05770 NONE OCV39_RS19620 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1319083 + -4 -2.95166 CGATCCGAGTTTCTT C-CACTC TTT GAGTGCG CTCTTTTTGAAATCA 46 293 OCV39_RS06230 NONE OCV39_RS19895 1320328 .. 1320341 + -3.9 -4.21773 AAAATTCAATTTATT TCATA TTGT TATGA TTCTTTCTCTTACAA 61 134 OCV39_RS06235 1320931 .. 1320955 + -15.1 -3.14881 TTTTAGTGATTTTGG CGCAGTGCAGA ACC TCTGCATTGCG TTGCTGCGCAAGTTA 100 106 OCV39_RS06240 1322479 .. 1322489 + -4 -2.85216 GTCAGGGTTCTCGCT CAAA TTC TTTG TCATTCTAGCTAATC 46 404 OCV39_RS06245 NONE OCV39_RS19910 NONE OCV39_RS06255 NONE OCV39_RS19915 NONE OCV39_RS06260 1325719 .. 1325733 + -2.8 -5.04222 GCGTTTAAGACGGAT TCCCAA CGC TTGGCA TTTTTGGTTTGATTC 68 79 OCV39_RS06265 NONE OCV39_RS06270 1326615 .. 1326627 + -9.1 -3.07013 CTATATCTGGGTAAA GAGCC GTT GGCTC TATCTTGCGACAGTG 70 303 catB 1327848 .. 1327858 + -3.2 -3.86194 TCGCACCTTAATTGG GCGT TAT ATGC TTTATCGAAAAAATT 55 139 OCV39_RS06285 NONE OCV39_RS06290 NONE OCV39_RS19935 NONE OCV39_RS06295 NONE OCV39_RS06300 NONE OCV39_RS06305 NONE OCV39_RS06310 NONE OCV39_RS19940 NONE OCV39_RS06315 NONE 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NONE OCV39_RS06685 1392709 .. 1392720 + -5.8 -3.30629 ACGCTTACTACTTGG GTGG TCGT CCAC TGTTATCAGTTATTG 59 40 OCV39_RS06690 NONE OCV39_RS06695 NONE OCV39_RS06700 NONE OCV39_RS06705 NONE OCV39_RS06710 1399384 .. 1399403 + -11.4 -5.03201 GTTATGTTCGTCATT GGGAGGGC TTTT GCTCTCCC TTTTTCATTCTTATT 100 48 OCV39_RS06715 NONE OCV39_RS06720 NONE OCV39_RS06725 NONE OCV39_RS06730 NONE OCV39_RS06735 1401763 .. 1401776 + -3.1 -3.13403 GACAAGTGAGGCGAA GCAAT GATA GTTGC TGTTGATCAAGAGAC 47 19 OCV39_RS06740 NONE OCV39_RS06745 NONE OCV39_RS06750 NONE OCV39_RS06755 NONE OCV39_RS06760 1406486 .. 1406503 + -8.4 -5.00196 GAATTATCCCTTAAA CCCAGC CATTGC GCTGGG TTTTCTTATTTAGAA 95 50 OCV39_RS06765 NONE OCV39_RS06770 NONE OCV39_RS06775 1408463 .. 1408516 + -3.3 -4.33582 ATGTAAACTATAATC CAGTACGAATCGCAATTAATTGTTTA AAG TTATCATTTG-TTGCGGTTCGTAATG TTATTTCTTCTTGGG 59 62 OCV39_RS06780 1409108 .. 1409129 + -10.8 -5.24129 TTTTAATTAACAGAA GCCCTCGC TTTATC GCGGGGGC TTTTTTATGGAGCAA 100 46 OCV39_RS06785 NONE OCV39_RS06790 1412834 .. 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TTTTTTATATTAACT 100 50 OCV39_RS07520 NONE OCV39_RS07525 NONE OCV39_RS07530 1569996 .. 1570014 + -4.6 -4.75472 ATCTTACTTCCGCCA CTCAAGTT GTT AACTTCAG TTTTGTTGATCTGAG 71 157 ttcA 1571087 .. 1571112 + -9 -5.40464 AAGCGCTACAAAAAA GCCCCAACTT AAAATC AAGCTGGGGC TTTTTATTTATACTG 100 93 OCV39_RS07590 1580751 .. 1580767 + -3.1 -3.35679 TTAGCGCTGTTAAAT TAATATT ACC AGTATTA TTGTAAATAACACCG 48 23 OCV39_RS07595 1582029 .. 1582039 + -4 -3.31322 CCGTATTTCACAAAG TTAC AGG GTAA TTATGGACGCTTGCG 50 15 OCV39_RS07600 1583821 .. 1583868 + -11 -3.84585 AGTAAACAAGTTACT CCTAATAACTATAT-TCAGAATC GAA GATTAAGATATATAGTTATTAGG TATTTTATGGTAAAT 89 71 OCV39_RS07610 NONE OCV39_RS07615 NONE OCV39_RS07620 NONE OCV39_RS07625 NONE OCV39_RS07630 NONE OCV39_RS07635 NONE OCV39_RS07640 1587425 .. 1587440 + -8.2 -5.49809 CCTTTATGTGAAATC GGGGGC TTCG GCTCCC TTTTTTTAGGATTTA 100 42 OCV39_RS07645 NONE OCV39_RS07650 NONE OCV39_RS07655 1591077 .. 1591098 + -10.1 -2.62184 CCCTGCTCACGCCAA CCCCCGTCA TGTA TTACGGGGG TACTATCCACGGAAC 74 326 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ACTTGATTGATGTGTT GGG AAAACCTCAATTAAGC TTATTTTGTAAAGAA 56 58 OCV39_RS09775 2077005 .. 2077021 + -12.3 -5.77988 AGAAAGAACACTAAA CCAGCTC ATT GAGCTGG TTTTTTTGTATCTAT 100 51 OCV39_RS09785 2079421 .. 2079450 + -18.1 -4.96848 TCTTTAATCGAATTT TCTGACTAGCTTC ACTC GAAGCTAGTCAGA TTTTTATCTAAGAAA 100 34 pta 2081761 .. 2081784 + -15.4 -5.59655 AGTAACAATTGCAAA GGCACGCTAT AAAA ATAGCGTGCC TTTTTTATTGATTTA 100 62 OCV39_RS09855 2094409 .. 2094426 + -3.4 -3.29211 GCCATGAGATCAATA TCGGCA TCAATC TGCTGA TTCAGTTTAACCTTA 48 166 OCV39_RS09875 2098997 .. 2099016 + -10 -5.1925 GCCAATTTTAAAGAA GCCGTATC TTAG GATGCGGC TTTTTTGCGTTCTAA 100 37 rsxA 2099734 .. 2099752 + -2.4 -3.4252 TCTGGCATTTATGGG CTTTACTG GTT TGGTGAAG TTGTAATGAATAGCA 45 1 rsxB NONE rsxC NONE rsxD NONE rsxG NONE OCV39_RS09905 NONE nth 2106387 .. 2106401 + -2.8 -2.62396 ACGATTTCAAATACA ATTGCT AGG AGCAAA TCATGTCAAACGGTC 41 63 gloA 2106869 .. 2106891 + -12.1 -5.58454 CGCTATAAATGACAA TAGGGCAGT ACAAC ACTGCCCTA TTTTTTTAATATCAG 100 80 rnt 2108624 .. 2108634 + -2.6 -2.6062 ACCGAAACAAACCAA TAAA ACT TTTA CTCTTCTCTAATAAA 41 23 OCV39_RS09930 2110069 .. 2110088 + -10.8 -5.46276 CCTGCCGATCAAAAA TGCGCTAA ATAG TTAGCGCA TTTTTTATATCTATT 100 87 sodB 2112112 .. 2112132 + -15.5 -5.32396 AAACCGAATATTAAA GCCAGCATC ATT GATGCTGGC TTTTCTTTTTCCTAT 100 65 OCV39_RS09950 NONE OCV39_RS09955 2113767 .. 2113788 + -15.9 -3.95836 TTCCAAACAAAAAAA TGCCCCACC TTTC GGTGGGGCA TTGTCTTTTCCCGAT 100 141 OCV39_RS09965 2117764 .. 2117775 + -5.8 -3.0644 CAACGGTTTACGTAA CCTG TTCC CAGG TCTTGCGGGTTAGGT 56 1 OCV39_RS09970 2118786 .. 2118804 + -8.9 -4.34402 TCCCTAACGAAAAAA GCACCTA TAATT TAGGTGC TTTTCATATGGAAAA 83 101 nhaC 2121849 .. 2121866 + -7.7 -5.46276 TCACGCTGAAAAAAA GGAGACG TAAA TGTCTCC TTTTTTGTATCTATT 100 58 OCV39_RS09990 2124963 .. 2125002 + -13.8 -4.49314 TTAAATAAATAACAC ATCTAGCTATTAGGTTCA CTAT TGAACCCAATAGCTAGAA TTATTTTTAATAATA 100 59 OCV39_RS10010 NONE OCV39_RS10015 2130509 .. 2130540 + -13.2 -5.14563 CAAGATTTAGATACT TAAAGTGGGGAGCTT ATT GAGCTCCCC-CTTTA TTTTTTCCTAGCAAA 100 44 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100 62 OCV39_RS10175 2169036 .. 2169054 + -13.2 -6.07374 AGAATGAGACAATAA GCGGTGAA TTA TTCACCGC TTTTTTCTTTTTTGT 100 85 gap 2170860 .. 2170877 + -8.4 -5.28778 CTTTTAAGTATAAAG GGCGAC TTAATT GTCGCC TTTTTTGTACCTGCT 100 89 OCV39_RS10190 2172042 .. 2172072 + -7.7 -5.14965 TATTTATTGGTGACA TGAGGCGC-GGTTT TGGT AAACTTGCGCCTTA TTTTTTAGTAGCAAT 93 113 rlmA 2172943 .. 2172956 + -3.9 -2.77135 CTTTTATCAAAAAGT CAAAA AGGC TTTTG CTATTATTTGTCGAG 46 43 OCV39_RS10200 2174033 .. 2174087 + -5.3 -3.66401 TGACTAGCCCTTAAT GATATTTCTCTTGGTGCCTATTCACTT AAT AAGT-AACAGG-GCCAAGAGATACATC TATTTCCTTTCTAAA 60 34 OCV39_RS10205 2174831 .. 2174846 + -4.8 -3.10052 TTTTCTTTTCTGTCA TAATAG TTTT CTATTA GTTTATTAAAACTGT 52 241 OCV39_RS10210 2176499 .. 2176516 + -9.1 -4.99134 AATAATCAGGTCAAA GCGCTCT GAAC GGAGCGC TTTTTACTTTAGAGT 100 36 OCV39_RS10225 2179344 .. 2179364 + -12.6 -4.77896 AATCACCTAAAAAAA TGCCGCTC TCGTT GAGCGGCA TTTTTAGATTCGTTG 100 31 OCV39_RS10260 2186447 .. 2186468 + -10.1 -5.27023 GCGACAATAAAAAAA CCCAGAGCC TGTT 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OCV39_RS09055 1917228 .. 1917245 - -11.3 -5.42164 TATAAATAATAAAAA GCGCAGA GAGA TCTGCGC TTTTCTGTATCCGTA 100 67 OCV39_RS09045 NONE OCV39_RS09040 1913279 .. 1913303 - -15.9 -4.30014 GCCAGCAATGCAAAA GCCATCTTGAT GGG ATCAAGATGGC ATAACACAAACCTAG 100 232 metE 1909552 .. 1909595 - -11.2 -4.62054 GCAATGAAACGAAAA GGTTGATACCGATTCTCTAT TTAA ATAGCGAATGTGTATCAACC TTTTTTATTTTAGGT 95 154 OCV39_RS08940 NONE OCV39_RS08935 1892065 .. 1892087 - -4.2 -5.64006 ATTCAATGAAAAAAA GCATCTGT TATTTCG ACAAATGC AGATGCTCGTTATCA 86 49 rluB 1890892 .. 1890909 - -4.8 -5.64274 TGAGGCACAAAAAAA CCTGCC ATATTA AGCAGG TTTTTTTATTTAACT 88 50 OCV39_RS08915 1888777 .. 1888787 - -2.4 -4.11404 GGCAGATGAGATAAA TGCG AAG CGCG GTCGTCCTCTTCAAT 55 239 uvrY NONE uvrC NONE pgsA 1883104 .. 1883159 - -16.7 -3.68366 TCACCTTAAAACCAA TAG-ACTAAAACAAAAAAAGCGAACC CCATT GGTTCGCTTTTTTTGTTTTAATTCTT AATGATGCTGCTCAT 100 24 OCV39_RS08890 1882768 .. 1882779 - -5.8 -2.89304 TTTAAAAGAGAGAAT GGAG GCGC CTCC CGGAGTCGAACCGAG 55 12 OCV39_RS08885 1882616 .. 1882628 - -3.4 -2.55784 TAACTCAATGAAGAG TGGT TAGAC ACCA TCTTATGTATCGTCG 43 62 OCV39_RS08880 NONE OCV39_RS08875 1882340 .. 1882361 - -10.9 -5.58454 TTCAGACGAAAAAAA GCCCAATCA TTTC TGATCGGGC TTCTTCAATTTGGAG 100 36 OCV39_RS08870 NONE OCV39_RS08865 1877520 .. 1877538 - -11 -4.29326 TTTAAATCGAACAAA GCCGATGC TCA ACATCGGC TTGGAAGCAAATAAT 90 51 nspC 1876310 .. 1876329 - -12.2 -3.0972 ATACAAATTAAATTA GAGCAGCT CATT AGCTGCTC TTTTTATTTCTATGA 85 54 OCV39_RS08840 1871819 .. 1871845 - -5.9 -6.15717 TAAAGATAAAAAAAA GATAAGCTGAT TTATC ATCGGCTTACC TTTTTCGGCGCACAA 100 65 OCV39_RS08835 1871346 .. 1871371 - -12.6 -4.32046 CTTCCAAAAACGAAA GAGCCAACGC CTCACC GCGCTGGCTC TTCTTTTTTATTCCA 95 59 gyrA 1863230 .. 1863247 - -8.4 -5.64274 TTATGGATAAAAAAA CCGAGC ACAAAG GCTCGG TTTTTGGGGAGAATG 100 58 OCV39_RS08805 1862422 .. 1862454 - -12.2 -3.15292 ATAAATAGCACTCAA CTTCCAATCTAGGA GCAGA TTCTAGATTGGAAG TTGTATCAAGGTTTC 87 39 nrfB NONE nrfC NONE nrfD 1857480 .. 1857501 - -6.5 -5.82388 AAACCTCAAAAAAAA GCCCCACCA AAAT CAGTGGAGC 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437