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        lipA   13853 ..   13876 +  -4.6  -5.68489   AGCCACTTTTATCAA          GTCCTTCT GTTTATTA AGGAGGAC           TTTTTTATTCTTATA  85 125
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        gndA   19617 ..   19665 + -21.2  -2.73364   GTATATATTCTTATT TCTCAACATAAACCCCCACCAC ATCAA GTGGAGGGGGTTTATGTTGTGG TGCTTAAAGTGGAAA 100 236
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        galU   31316 ..   31355 + -13.8  -4.25256   TTAATTCGCAATTTT  AGAAGAGAGTTGCAGTGT GATG ATACTGTAACTCTCTTCA   TTATTTTGCTAAGGA 100 80
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        cadA  115891 ..  115903 +  -3.3  -3.53189   ATGTGTATTTATTTT                GATGC TCC GCTTC                TTGTCGTCTTCAGTT  50 186
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        sppA  128397 ..  128407 +  -3.2  -3.30159   AATCGAACGCACCGC                 GTGC TAT GTAC                 TTATACACCAATTAA  47 0
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        argF  194136 ..  194173 +  -7.2  -5.17353   AAATGAGATTTAAAA   CGTAGCATATCATCTTA TCGTT TTGGA-GATATGCTACG   TTTTTTAATAGCTGT  88 309
D9780_RS00865  199607 ..  199623 +  -3.7   -5.2422   AATGGAATAAATACA              GCATGAA GTT TTCATTC              TTTTTTGATATACTT  76 152
D9780_RS00870  200797 ..  200819 +  -6.2  -2.50307   GCCAGAGGGCGCCGG           CATACTCCTG TTG CAGGCGCATG           ATTCCTAAAACTTTC  54 324
D9780_RS00875  203065 ..  203103 +  -6.9  -5.60993   ATAAATAAACTAGAA   TCTCTATCTAATAGG CGTAAATTC CCTGTTGGATGGAGA   TTTTTTTATACGCAG  93 33
D9780_RS00880  205306 ..  205322 +  -3.7  -4.83615   GCTGCCGCTATGGGA              CTTGG AGGCAAG CCAAG              TTTTTCTAAAACATG  70 132
D9780_RS00885  206209 ..  206225 +  -6.7  -4.24285   AAAATGGGGTGAACG              TAATGAA GGT TTCATTA              TTTATTACATGTGTC  71 69
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D9780_RS00930  215774 ..  215790 +    -8  -4.15143   CCATTCGCCATAAGA              CTTGGC GACAA GCCAAG              TTTATCTACTTGGTT  81 212
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D9780_RS00965  223811 ..  223823 +  -6.3  -4.58395   CTTGGTGAAAAAGAA                GCAAT TAG ATTGC                TTTTTGAACAGTCGA  76 230
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D9780_RS00975  226318 ..  226328 +  -8.2  -4.63218   TACTTTGTTAAACGG                 GCGC CCT GCGC                 TTTTGTTCAACAGAG  84 263
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D9780_RS00985  228143 ..  228156 +  -2.5  -3.72788   CCTCAAATCAATGGT               TAAAT CTTG ATTTA                TTATCTATTGTACCA  51 339
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D9780_RS00995  229500 ..  229510 +  -2.4   -4.2361   CTCCACCGTCTTTAG                 ACGG TAT CCGC                 TTTTAGCCTTATCTT  54 100
        tnpA  230081 ..  230100 +   -10  -3.03811   CATTTATGTCTAAAT            CCATCTGC TTTA GCAGGTGG             TCGTTTAAGTTTTTG  77 119
D9780_RS01005  230487 ..  230498 +  -5.8  -4.32579   CTACGTTGCTAACCG                GGTG CTTG CACC                 TTTGTTATACGGTAT  72 157
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D9780_RS01020  233500 ..  233534 + -10.9  -4.75309   ATTACGTTGTATAAA     TAAAGCAAGCAGAAT GAGTA GTCCTGCTTGCTTTA     TTTTATTAACTTTAC 100 23
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D9780_RS01080  248349 ..  248364 +  -3.2   -4.5123   GTTCCTGCCCTAGAT              GTCCGA CGAA TCGGAG               TTTCTTTCGTACCTT  62 287
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D9780_RS01105  256228 ..  256263 +  -2.8  -3.13073   TAAGGTTGGACATAC    TGAAAACTATCAAA-AT AAA ATGTTAGGTGGTTTTCA    TATGTTAATAGAAAT  43 52
D9780_RS01110  257682 ..  257711 +  -2.3  -4.58303   TTGATTTGGTTTTTT       CATAGATTTTATAG AAG CTATTAAA-CTGTG       TTTTATGCTATTTCA  59 219
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D9780_RS01145  264938 ..  264963 +  -8.4  -2.72344   TGTACTCTATTTTCT         TTCTACAAGC TTTAAC GCTTGTAGAG          TGGTTCGGAATCACG  66 246
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        panF  267647 ..  267673 + -16.7  -2.67958   TCCTAGACCATGAAT         GAAGCCCCCTA ATCAA TAGGGGGCTTC         TACGTTTACATCTTC 100 324
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D9780_RS01370  310475 ..  310498 +  -4.6  -2.72204   CCATCTGTACCACCA          CGAATCGGTT TTAT AATTGGTTCG           ATATTTAAATTTTGC  47 425
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D9780_RS01400  318235 ..  318252 +  -2.7  -5.10208   AGCTGTACATAAAGA             CTTGG TGAAAGTT CCAAG              TTTTTATTAAGCTTC  69 150
D9780_RS01405  319349 ..  319359 +  -2.6  -2.79501   CCGTCATGCATGCGC                 TTTA ACT TAAA                 TCTGATAGCAGTCTC  42 130
D9780_RS01410  321175 ..  321204 + -11.5  -4.37534   TGTGGATTTATGAAA       CGGCGTAAGGAGA AAAC TCTACTTACGTCG        TTTTGCTATGAATTT 100 309
D9780_RS01415  323358 ..  323381 +  -8.9  -2.94144   TTGCGAAAGAAACCT          TCCTCTCCA ACCAAC TGGAGGGGA           TAGTTTCGGTGAGGC  69 46
D9780_RS01420  324616 ..  324647 +  -5.2  -5.07275   GTCGTTAAAACAAAA      GCTGTCTCTTAC GCTTAAAA GTAAAAGGCAGC       TTTTTGTGTGTATCG  79 33
        rsgA  326298 ..  326325 + -12.9  -2.85657   TTATGCTAAGGAGTA        TGCCAAAAGCT GTTTTA AGCTTTTGGCA         TCGTTCAATTTTATC  87 49
         fni  328508 ..  328528 + -14.1  -4.99435   CTCTGCTAGAAGAAA            GCTAGTTGC TCA GCAACTAGC            TTTTTAATTATTAAC 100 21
D9780_RS01445  329597 ..  329608 +  -2.2  -2.55544   GGCTAGATTTTTTAT                CTCT CTTG AGGG                 TGCGTTACATGATGA  39 35
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        murB  350751 ..  350777 +  -8.8  -5.22039   CAAAATAATGGATAG         CAGCAATCAAGT TAA AATTGGTTGCTG         TTTTTTAGATTTAAA  95 33
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        ytzI NONE
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        thiT  389105 ..  389140 +  -8.5  -4.77757   AGCAAATTATAAAAA    CTGTTGCAAATCGTTT TTGTT AAACG-TCTGCAACAG    TTTTGGTTTTTAGAA  93 231
D9780_RS01725  391773 ..  391788 +  -5.4  -2.71712   AAAAGCTCTCGCTCC              GAGTGT AAAA ACGCTC               ATTTCGAACGAAAAA  51 231
D9780_RS01740  393173 ..  393200 +  -7.8  -5.67063   GAAACTAACTATGAA        CCTTTTTGGCAA ATTT TTGCTGGAAAGG         TTTTTTTGTGGTCAA  93 67
D9780_RS01745  393933 ..  393946 +  -2.4  -4.17762   AATAAAAAGGTCATG               CACT CCTAAA AGTG                TTCTTTTAAAAAATA  54 36
D9780_RS01750  396485 ..  396514 +  -8.8   -3.6164   ATTAAAGCGGGTAAA       GCTA-TAGGGAAA AAACA TTTCCCTATTAGC       TTCTCTATAAATATT  77 19
D9780_RS01755  397053 ..  397063 +    -4  -2.63479   AATACTTTACGATCT                 CTTT ATC AAAG                 TGGTGTAAAAGTATT  45 235
D9780_RS01760  397338 ..  397361 +   -14  -6.17669   ATAGATAATAAAAAA          GCTTATCTCC AATA GGAGATAAGC           TTTTTTTCTTTTGTT 100 40
D9780_RS01765  398664 ..  398687 +   -16  -3.43218   AAGTAGTAAATGAAA          GGGAGCGTGC ATCT GCGCGCTCCC           TTAATCTTCGTTCTC 100 35
D9780_RS01770  400565 ..  400598 +  -9.7  -4.61162   CAGGACTTTTTTTAA     TGGTTCCTAACATCA AGTT TGATAATAGGAACCA      TTTCTTGTTTCATCT 100 194
D9780_RS01780  403112 ..  403125 +  -3.7   -2.7035   AATACCGCACCTCGC               GCGCG GGGA CTCGC                TCCTGTCTGAGTGGA  45 117
D9780_RS01785  403932 ..  403948 +  -2.1  -3.42684   AAATTCCCTTCCGCC              GGAGTGG ACC TCGCCCC              TGTTTGAGTGAATTT  45 2
D9780_RS01790 NONE
D9780_RS01800  406696 ..  406717 + -11.7  -4.11906   AAACCACGATAAAAA           GCTTTGCAA AACA TTGCAAAGC            TTCTTTATAACTTAT 100 500
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D9780_RS01815  410514 ..  410537 + -10.4  -4.68103   CAAAATAAAGCAAAA          CTCCTTATTC TCTT GGATAAGGAG           TTTTGTTGAAGTTCC 100 33
D9780_RS01820  412011 ..  412047 +  -9.6  -3.84514   TTGTGCCGAAGTCTC   TAGGTTGGTGTAGGTTC TTTT GAAAC-ACACCAACCTG    TTTCATACTTGAAAT  83 355
D9780_RS01825  412816 ..  412839 + -11.2  -3.02043   CAGCGCTTTCATTAC          GAAAAAGCAT TATG ATGCTTTTTC           TATTCACAAGCGATT  84 73
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        galU  416184 ..  416200 +  -2.3  -2.65476   TGCACTGCAAGTCTA              TTTTTCT CAT AGAAAGG              ATTCTCATAAATGAT  40 46
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D9780_RS01855  419855 ..  419865 +  -2.6  -3.55946   AAAGGGATATATTCT                 TTAA TAC TTAA                 TGTTATTTAAGATGG  48 80
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D9780_RS03745  856336 ..  856375 +  -5.3   -4.9792   GACGAATAATAAAAT TGGAGAAGT--TGCTGTTT ATTG AAACGGTAAAACTTCTCCA  TTTTTATATAAAATG  77 32
D9780_RS03750  857336 ..  857387 + -18.5  -3.59315   AGTGGGTGACTAATA GCACC-TAGAAAAGCCTTTTTACT TACTT AGTAAAAAGGCTTTTCTATGGTGG TTTAGACGTAATTAA 100 180
        spxA  858516 ..  858540 +  -5.1  -5.15969   GGATAATATAAAAAA         CACAG-ACCA GGCCAG TGGTGCTGTG          TTTTTTGCGTTGAAA  77 84
        mecA  859653 ..  859680 +    -7  -5.12172   ATTTCCCTGCAAACA        TATAGGCACTCT GTAT AGAGTGCCTGCG         TTTTATTTATTCATA  88 21
D9780_RS03765  861246 ..  861264 +  -4.7  -2.68755   TAAATAACAAAATAT             TTTTTTC CTATA GAAAAAA             TCGTATAATCGTTCT  50 48
        pepF  863305 ..  863327 +  -4.8   -5.4251   TAGTGTAACAAAAAA           GCAAGATGCT AAA AACATCCTGC           TTTTTTGTGTGTGCC  83 139
        ltrA  865158 ..  865169 +  -5.8  -2.62616   CCGCCGTATACGGAA                CCGT ACGT ACGG                 TGGTGTGAGAGGTCG  55 47
D9780_RS03785  867674 ..  867700 +  -4.5  -2.80344   TAGCAGTGAAAATTC         CCATTTTTTTC AAAAA GAGAAGGATGG         CTTATTAAGTGCACC  48 283
D9780_RS03805  870806 ..  870839 +  -5.5  -3.21912   ATTTTTTATAGATAA     GTTCT-TCATACAAAA CGC TTTCGTGTGATAGAAC     TTCATAGCTTACGCA  55 131
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D9780_RS03815  873113 ..  873125 +  -3.3  -4.72272   TACAGTGGTTCCCGG                GAACG TAT CGTGC                TTTTTGATGGGCAAC  67 518
        mgtE  875247 ..  875280 + -13.5  -5.24989   CAAAAACTCTTACCA     GCTTGTAGAGAAAACA CAT TGTTTT-TCTACAAGC     TTTTTTACTGTCTAA 100 387
D9780_RS03830  876041 ..  876073 + -15.1   -3.6288   AAATGGATGTAAGTT      TGAACACTGAGAC CTTTTTC GTCTCAGTGTTCA      TTTGGAAGTTAGTTT 100 89
D9780_RS03840  877219 ..  877232 +  -3.8  -3.93556   AGATGGGCGTAGATC               GCCA TTTTCT TGGC                TTTGATTAAATAAAT  57 7
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D9780_RS03850  877909 ..  877944 + -14.4  -5.35459   TGACTGACTATTGAA    TATGATGAGAAGTAAT CCTA ATTACTTCTTATCATA     TTTTTTATGCTCTCT 100 50
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D9780_RS03890  887031 ..  887048 +  -4.9  -3.50715   CGTTATTATTACAAT             TTACTCT TCAA GGAGTAA              TTGTATAGCCGTTAT  55 111
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D9780_RS03900  889452 ..  889479 +   -15   -5.0538   ACGATCGTAAAAAAA        GAGGAAGCATCT TTGA AGGTGCTTCCTC         TTTTTTACAGTAAGA 100 85
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D9780_RS03935  895639 ..  895654 +  -4.8  -4.64861   TTAAATGATTAAATT              TTTTTC AAAA GAAAAA               TTTCTTTTGGGACAC  72 29
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D9780_RS04275  957622 ..  957661 + -17.6  -3.43288   GAAAAAATGAAAGAA  TAAAATAGACAAACTTCT CAAA AGAAGTTTGTCTGTTTTA   TTCTAGTCGACTTTG 100 23
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        yunB  976094 ..  976123 +    -8    -5.186   AACGTATATTGTAAA       GACAATGGTAGG TTATTT TCTATCATTGTC        TTTTTCTATGTTTTA  90 278
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D9780_RS04495  999771 ..  999809 +  -3.2  -4.42653   CTTAAAGCAAAAAAA  GCAGGTCTGGC-TAAACG AAACA CGATTATGCCAT-CCTGC  TTTTATGAATGAAAT  60 77
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D9780_RS04520 1004551 .. 1004563 +  -5.5  -4.41177   GATAGTGGTAGCTCC                TGCAC GAC GTGCG                TTTTCGATTTGTGTG  69 311
D9780_RS04530 1007251 .. 1007286 +  -4.2  -5.79526   AACAAAGCTATATTT    GAAGCTAGTTTTCCT AAGTAGG AGGAAA-CTAGCTTA    TTTTTTTTGCGCTAT  91 367
D9780_RS04535 1011971 .. 1012007 + -13.9  -3.69934   GAAGTAATTGCCATT    GCAAAACCTCGCATTTT ATT GGAATGCGAGGTTTTGA    TTTGAAATATTATTT 100 34
D9780_RS04540 1013012 .. 1013048 +  -6.8  -5.38326   ATTATATTAACAAGA   GCAGTGC-AGTC-TTTTA TTT TAGAATGGCTCGCACTGC   TTTTTATTTCCTTCA  85 57
D9780_RS04545 1014457 .. 1014467 +  -2.6   -4.4891   CTAGTAAAATGAGCG                 TTAA CTT TTAA                 TTTTCTCCTACTAAA  60 207
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        menB 1021453 .. 1021479 +  -5.9  -4.64766   ACTTCTATACAAAAA         GCCTTTGCT CCAATCCTA AGCAAGGGC         TTTTTGCACTATCAG  74 284
        menE 1023223 .. 1023244 +  -5.9  -5.08824   GACCTTAATAAATTT           TTGACAAAG ATTG CATTGTCAA            TTTTTTAGCTCAAAA  83 196
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D9780_RS05445 1215065 .. 1215118 +  -9.3  -5.00642   AGAAGAAAAAAAGAA GTTTAATA-GATAAAAAGAGAGCT TAAAACT AGCTCTCTTTTTATCATAATAGGC TTTTTCTATAGGTTA 100 20
D9780_RS05450 1216144 .. 1216158 +  -2.8  -2.89683   GCCAGAAGAAATCGT               TCAAGG TGA CATTGA               TGTATCCGATAAAAT  42 49
D9780_RS05455 1217301 .. 1217325 +  -9.3  -5.04601   TATACGTTGTGAGGA          GCGCTTCATGT ATG AAATGGAGCGC          TTTTTGCTTTGTAAA 100 284
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        adhP 1310416 .. 1310444 +  -2.3  -5.80817   CATAATGGATAAAAA        TGGAGTTTCTGCT TAT AACAGTTGCTCCA        TTTTTTTGTGTTGAC  83 42
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        catA 1326970 .. 1327015 + -10.8  -5.03994   TTACCCGCGTAAGGG CAAACACTTGCTTTTTCGTTT TACCC GAAAGAAAA-GCAAGTGTTTG TTTTTATCTATAGCA 100 68
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        clpX 1342200 .. 1342210 +    -4  -2.81313   GAAGGTGTTTCTTTA                 TACA AAA TGTA                 TCATATTGTAAATCT  46 268
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        minD 1370005 .. 1370035 + -15.7  -2.87564   TATAATACAGTCATA       CAAAAAAAGCAGG CTTTT CCTGCTTTTTTTG       TATATGAAAGCATAC 100 54
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        ptsP 2360267 .. 2360300 + -15.5  -3.61486   ACAGAATAAGTTAGA     TAAAACCGCAGGACG CTTT CGTTTTGCGGTTTTA      TTCTACTATTTTAAT 100 32
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        clpP 2387053 .. 2387087 + -21.7  -3.53091   AACCTGATTAAAGAA     CATAGAAAGCCACCC TTTTT GGGTGGCTTTCTATG     TTTCAGAAACAAACT 100 30
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        ytaF 2526097 .. 2526108 +  -4.4  -2.57522   AAGCTAAAAATACAA                TTGC TTTA GCAA                 ATTCCTCTGGCTTAC  47 498
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        tenA 2699065 .. 2699092 + -11.5  -4.65895   TAAATAAATACAAAT        TCAGTGAAAGA AAACTA TCTTTCACTGA         TTTTTCAATGGACAG 100 77
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        cadA 2872604 .. 2872635 +    -8  -3.08706   TATCAAGACCGATAA      AGCCTTAGGGGATT ACAA ATTTCCCTAAGGCC       TATTAAAATATAATT  68 56
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D9780_RS14845 3202030 .. 3202043 +  -2.5  -3.17516   TAACTCTAAGGGGGA               TTTTT CATG AAAAA                ATTTATATTACTTTC  45 38
D9780_RS14850 3202597 .. 3202617 +  -7.6  -3.82084   AAATAATATTATTTA            GGTGTACA TGATC TGTGCACC            TTCTTAATATTCAAC  73 35
D9780_RS14855 3203425 .. 3203443 +   -11  -3.17075   CGTTACTTAAAATTA             GGTGCGTT TAA AACGCGCC             TTCCCTTAAACCCAA  86 57
D9780_RS14860 3203963 .. 3203979 +  -3.1  -3.53012   CTTTCAGCATCTCAA              TGTAAAT CAC ATTTATA              TTTAGAAAGGAGAAG  50 21
D9780_RS14865 3205240 .. 3205276 + -10.9  -2.55544   CAAAAAAATCAGTGT    TGCCGTTCAACCCTTGT TAT ATAAGGGGTGAGGGGCA    TGACTTACATCATGC  80 59
D9780_RS14880 3208900 .. 3208912 +  -2.7  -2.91276   AGGCTAGTTGGAGGC                TTTCA ATA TGAAG                ATTTCTCCCAAAACA  42 150
D9780_RS14885 3209453 .. 3209479 +  -8.7  -5.53079   TATAGTACAAAAAAA         TGATGGCTTCC TGAAT GGGTGCCATCA         TTTTTTGTGTATTTT  95 371
D9780_RS14895 3212456 .. 3212486 + -17.8  -5.12916   TTACTGGAAGATTAA       TTTACCCACATGAC TTG GTCATGTGGGTAAG       TTTTATTATTTTATA 100 26
D9780_RS15020 3227778 .. 3227827 +  -2.6  -5.14563   GTACGTATAGAAAAA TCCGAAC---GAATTGGAAATCCT CCTAGC AGG-TTTCCAATTCAACGTTCGGA TTTTTTAATGAAAGC  69 72
D9780_RS15100 3242686 .. 3242700 +  -2.8   -4.3953   CGTTCTCGTGTTACT               TGGCTT ATT AAGTCG               TTTATTCTAATTGCA  58 1
         bla 3244109 .. 3244127 +  -4.6  -4.38092   ATAGATTGAATGCGT             CGATGA AAAATAA TCATCG             TTGTTTTGCTTATTC  66 366
D9780_RS15125 3249047 .. 3249060 +  -3.9  -4.82819   TTATTTAATCGTAAA               TATAG AATG CTATA                TTTTCTTATAGTGTA  67 79
D9780_RS15130 3249999 .. 3250028 + -13.7   -2.7558   CACTACTCTTTGGTC       GGCTATCACCTTA TCTT TATGGTGATAGCC        CTGTTTATACTATAG  89 60
D9780_RS15170 3257409 .. 3257427 +    -6  -5.51165   ATTATGTGGGAAAAA             GGGAGA TGGAAAC TCTCCC             TTTTTTTCCAGTTTT  86 95
        phnC NONE
        phnE NONE
        phnE 3260008 .. 3260035 +  -4.7  -2.67934   ATGCTCCTGCAACAG        GAGTATGCCGG CGCCCT CCGGCAAGCCC         GTCTTTAGTCGATCT  50 168
D9780_RS15190 3261877 .. 3261895 +  -6.6  -3.81755   AATTTTTTCCTATGA             CGCTACTC ATT GTGTGGCG             TTCTGTTTAAAAAGT  66 54
D9780_RS15225 3268472 .. 3268499 +  -4.9   -5.1764   CTTTCACATAGAAAA        GAGGCTTATCGC CTGTA GCAATA-GCCTC        TTTTTCTATTGTATG  77 130
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D9780_RS15245 3271386 .. 3271398 +  -2.7   -2.8031   ATGATAGCATATTTA                GTTTA GCT TAAGC                TCCCTTTTCATATTG  42 131
D9780_RS15260 3273569 .. 3273588 +  -3.6  -2.71144   GAAACTTAAACAAGC            GCTTATTA CTCC TAACAAGC             TCATTAAAAGAGGTG  45 469
D9780_RS15280 3276131 .. 3276170 + -15.3  -5.40072   AGCTTTTTATCACGT  TCCCCAGTTTGTTCAAA ATATTA TTTGAACAAACTGGGAA   TTTTTTTGAAACAAA 100 40
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D9780_RS15295 3278814 .. 3278840 +  -7.4  -5.07107   TTAGATAATCGAAAA         GCAGACATTT CTAACCA AGATGTCTGC         TTTTTTACAGGTTTA  88 67
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D9780_RS15380 3295293 .. 3295319 + -13.1  -3.69618   TAAATCTTAACATAG         GCCCACATCTA CATAA TAGGTGTGGGC         TGTTTTACGCTTACG  95 38
D9780_RS15390 3296459 .. 3296501 +  -7.3  -5.01845   AAAGTAAATAAATCA CCACCTCCTCGTAGCTCAT TTCGATT AT-AGTTAC-AGGAGGTGG TTTTTGGTTATTATG  88 34
D9780_RS15405 3297692 .. 3297703 +  -2.2  -5.38054   TGGAATGAGGCTATA                GGCT CTCC AGTC                 TTTTTATTTCTAACA  75 105
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D9780_RS15485 3313193 .. 3313207 +   -10  -2.82834   GTTTTAGTAATCATG               CTCCTG CAA CAGGAG               TATGCTGATGCCCTC  76 399
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D9780_RS15605 3340931 .. 3340947 +    -8  -3.21924   CCGCACATTAAAAAA              CTTGGC TTGTC GCCAAG              TCTTATGGCGAATGA  70 71
D9780_RS15610 3341652 .. 3341679 +  -8.5  -5.09259   GTTGCGTTTTTTCAT        TGCAATCGACT TCTTGT AGTCGATTGCC         TTTTCTTTTAAACTA  95 95
D9780_RS15615 3343303 .. 3343337 + -17.4  -4.76171   TGGCAAAATTATTAA     CAAACGAGCAGTTCTT TGT AAAAACTGCTCGTTTG     TTTTGTGATTTTTTC 100 26
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        ucpA 3372324 .. 3372357 + -13.4  -5.47218   AAATTTTTCAATATA     GGCCATGTAAGGAAA AACAA TTTCCT-ACATGGCC     TTTTTTTGCATAGAA 100 39
D9780_RS15745 3374909 .. 3374932 +    -4  -3.32844   TAAAGTCGCAAGCAC          TCCA-TCTTAT GGT ATAAGGGTGGA          TTCTAGCATGACGAA  49 281
D9780_RS15785 3383349 .. 3383381 +  -4.2  -5.48825   ATGTGAATTTTTCAT     GATGGAG-GGGGT CCTTTTAT ACCCCACTCCATG      TTTTTTTAAGTGCTG  82 35
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D9780_RS15825 3390187 .. 3390228 + -11.3  -3.73072   GTGAGATTAAGATAA GAAATATTTGCAACT-TACA GTT TTTATAGTTGCAAATATTTC TTTGGTAACGCCATT  90 37
D9780_RS15840 3392791 .. 3392814 +  -8.1  -3.15756   TAATAATTTTTATAG          AGGCTTGGC TTCATC GCCAAGCCC           GTTTCTATCTTATTA  70 493
D9780_RS15850 3394804 .. 3394848 + -22.5  -4.39571   TTATTATGCAGCTGT TTGGCTGGTTTGAGTTCGGTA TTG TACTGGACTTAAACCAGCCAA TTTTAACTTTATACG 100 222
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D9780_RS15905 3407920 .. 3407947 +  -8.5  -4.52345   AAGATGTTAAGGTAT        TAAGCCGTGGG CATTGT CTCATGGCTTA         TTTGTTTCATCCTAT  89 39
D9780_RS15910 3409612 .. 3409633 + -13.1  -4.87665   ACAAACTAACTCCCA           CTACCTGCT TCTC AGCAGGTAG            TTTTTCTACGTCACA 100 112
D9780_RS15920 3413214 .. 3413238 +  -5.7  -5.01546   AGAATAACCAAAAAA          CAGTAGCAATT ATA AAACGCTACTG          TTTTTATATGGCTTT  77 151
        ahpC NONE
        ahpF 3415739 .. 3415773 + -13.7  -5.24129   ACCTTTGTGTACAAA     TCCGCTATACTACCT ATCAG GGGTAGTATAGCGGC     TTTTTTATACAGCAA 100 46
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        moaC 3423624 .. 3423645 + -10.2  -4.87786   GTGATTTTCTTTAAA           TAGCAGGG GGTATA CCCTGCTA            TTTTTATACCATTCA 100 101
        ligD 3451687 .. 3451721 +    -5  -5.10461   AGAACGTACCAATCA     CAGAAATAGACTTCTT CAT AAGGAGTCATTTTCGG     TTTTTCTTAACTAGG  77 39
D9780_RS16115 3457951 .. 3457976 + -13.4  -5.45652   AGCGCTAAGACATAA         GCCGAAAAGG ATGAAC CCTTTTCGGC          TTTTTTATTAACAGT 100 64
D9780_RS16130 3463125 .. 3463149 +  -3.6  -5.59655   CAAATGTATAAAAAA         CAGTAGCAACT TTCA AGC-GCTACTG          TTTTTTATTGGTTTA  84 92
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        brnQ 3468766 .. 3468812 +  -5.5  -5.45652   TCTATGAGGGAAATA AAAAAGTGGTTTTAATTAT TTAGCTTTT ATGATTAGAACCACTTTTA TTTTTTCTTCAGCCT  84 61
        recQ 3471302 .. 3471354 + -25.4  -3.53444   TACTTTCCTATAGTG TAAACCAAAACATCCATCTCGAGT TACGC ACTCGAGATGGATGTTTTGCTTTA TTGCTTATTCCCCAA 100 307
D9780_RS16165 3473428 .. 3473460 +   -10  -5.61913   ATAATGACGCATGAA     CAAGAGCGC-CTCTA TTCA TAGAACGCGCTCTTG      TTTTTTGTATTTATT 100 60
        rarD 3479317 .. 3479342 + -16.3  -5.18409   ACGGAATGCATATTT         GAACCCTCTTC TTAG GAAGAGGGTTC          TTTATTTTTGTTTTC 100 260
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D9780_RS16210 3486478 .. 3486506 + -18.3  -5.34555   AGACGGTTAGAAAAA        CTTGGCTTGTCGC ATA GCGATAAGCCAAG        TTTTTTCTAATGTGC 100 81
D9780_RS16265 3500139 .. 3500159 + -11.2  -5.24989   GCGAAAAGAGGGTAA            CCGAGAAC AATGA GTTCTCGG            TTTTTTACTCTATAA 100 26
D9780_RS16270 3501755 .. 3501774 +  -5.1  -3.21354   TGTAAAATCAGAAAC            GAAATCA CATCAT TGATTTC             TTCGTGAATCTATGC  54 10
D9780_RS16275 3502070 .. 3502106 + -16.2  -4.30719   AGAACGGCCATTAAA   GAAGAGCTAGCTGTATA TGAA TA-ACAGCTAGCTCTTC    TTTATTCTGCAAAGC 100 2
D9780_RS16360 3517810 .. 3517832 +  -7.1  -4.89393   TTCATTTAAGAAAAA          CTTGGCTCTG CAAA CA-AGCCAAG           TTTTTCTAACCTTTC  88 426
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D9780_RS16375 3524258 .. 3524286 +  -8.2  -4.62069   AGACCAATTTAATAA        GGAACCTAGC CTCAAACCA GCTGGGTTCC        TTTTTGAGATAGGAA  84 307
         gnd NONE
        gntK 3534584 .. 3534608 +  -4.9  -3.18268   TCCTAGACCATAAAA          TAAGCGAGCTA TAA TCGCTCGCCTG          TCCTTTTCATTCCCC  54 288
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D9780_RS16480 3545671 .. 3545713 + -10.8   -5.5454   ATTATTTTGCCAACT AAAAGTAATAAGCTGCCT CTGATGT AGGCAGCTTATTACTGTA TTTTTATTTCTTTAA 100 24
D9780_RS16510 3554034 .. 3554053 +  -2.2  -3.06183   CATCGTGCTTGAAGA            CTTGATTGT AAT ACGA-CAAG            TTCCATCCCCATACG  42 104
        fdhD 3555227 .. 3555251 +  -2.9   -5.5604   TATCTTTTAAAAAAA          CAGTAGC AATGATAAAAC GCTACTG          TTTTTTATTGGTTGA  76 308
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D9780_RS16530 3559394 .. 3559426 + -19.4  -4.79053   CCTTCTAGACCAAAA      CAAAGGAGCTAAGC TTTTT GCTTAGCTCCTTTG      TTTATTTTGCTGTTT 100 73
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        htpX 3576518 .. 3576528 +  -6.8  -4.89339   CGATCCCTGATAAAT                 GAGG TTG CCTC                 TTTTTATACATGCTT  83 119
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        pstA 3591870 .. 3591885 +  -5.4  -3.28791   TTTTTAGAAAAACTT              GGCTTG TCTC CAAGTC               TTATGGCAAAAGCCT  55 34
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D9780_RS17755 3825852 .. 3825882 + -14.9  -4.71223   ACTTGGGATATACTA       CACCCCTAAAGTT CAAGT GACTTTAGGGGTG       TTTTGTATGTTGTCA 100 373
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D9780_RS17885 3847311 .. 3847328 +  -3.5  -2.79574   AATATCTTATGTTTT             TTATAGT TACC ACTATAG              TGCTTACTGGATGTA  44 68
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