 FAI41_00015    3858 ..    3870 +  -6.3   -5.5604   AATAGTCACATAATA                CGAAT AAT ATTCG                TTTTTTCTTGATTAC  91 77
        gyrB    6345 ..    6355 +  -3.2  -3.18514   GACATTTAACTTTTT                 CTCT TTC AGGG                 TCTGTCTTCTATATG  47 32
        glmU NONE
        glmS    9571 ..    9599 +  -3.3  -3.88777   AGACAATTGCCTTTG        GTAAAAAAGATAG ATT TTATTTTATTTAC        TTGTTATCATCTCTT  55 54
 FAI41_00035   12195 ..   12214 + -12.2  -5.68438   TAAAACAATAAAAAA            GGCACTCA TTTT TGAGTGCC             TTTTTTATTTCATCA 100 49
 FAI41_00050   16883 ..   16893 +  -5.4   -2.5088   GCTGTTTCTGATTTG                 TCTG AGG CAGA                 GTAATTTTAGTTAAT  51 11
 FAI41_00055 NONE
 FAI41_00060   18402 ..   18438 + -19.8  -4.71222   GGTTAAAGAAGAGAT    GGAAGCGTTTGATATA TAACT TATATCAAACGCTTCC    TTTTCCTTTTAATAT 100 7
 FAI41_00075 NONE
 FAI41_00080   22094 ..   22104 +  -2.6   -3.8125   AAACTTAAAGAAAAT                 TAAA ATT TTTA                 TGTTTTCGTTAAAGA  50 23
 FAI41_00085   23037 ..   23047 +  -5.4  -3.30797   CGAAAGTAAGGCGCC                 GGTT AGG AACC                 TCTTCTCCCTTTAGG  56 281
        bioB   30851 ..   30872 + -11.5   -5.1287   TGCTGTTAAATAGAA           TGGAGGGGG GCTG CCCCCTCCC            TTTTTTCCCTATAAG 100 32
 FAI41_00150 NONE
 FAI41_00155   38466 ..   38479 +  -3.1  -2.62024   CGTTTCATTTAAAAA               GAAGG CTAT TCTTC                TGCGTTCTGATCATC  43 59
 FAI41_00160 NONE
 FAI41_00165   39987 ..   40020 + -10.5  -3.05769   CGTAAGTTGTAAAAA     TTTCCCTTCTTTATT AAAA AATGAGGAGGGGAAA      TATCTAATTTCGGGG  78 36
 FAI41_00170 NONE
        miaB NONE
        phoH NONE
        ybeY NONE
 FAI41_00190 NONE
 FAI41_00195 NONE
 FAI41_00200   46352 ..   46364 +  -2.7  -5.17744   TAAAAAGAAGCCCTG                TTGTG CTC CATAA                TTTTTCTTCATCTCT  70 38
        murI   47313 ..   47326 +  -3.1  -5.07107   ATATTTGCTTTTACG               GCATA TTCT TGTGC                TTTTTTAAAAGTTTC  74 127
        pdxH NONE
 FAI41_00235 NONE
        lpxK NONE
 FAI41_00245   56464 ..   56480 +  -8.7  -3.32832   TTCTACGGCCGGCGA              TACTGGC GTA GCCGGTA              TTAAATCTTTTTGAG  73 141
        rsmI   58732 ..   58744 +  -4.1  -4.92669   TTTAAGGGTGATATT                TCCTT GGG AGGGA                TTATTTTTTTGTGTC  74 184
        ubiA   62806 ..   62819 +  -2.3  -3.54488   TGTACCGACACGTTG               TCGCC ATAT GGCAA                TATTCTTTAAAACGG  47 312
 FAI41_00355 NONE
 FAI41_00360   79716 ..   79742 +  -3.8   -4.0174   TATCATCTGGCAGCA         TTAGCTGTGATT TTA AATCAAAGGTAA         TTTCTGCATTATCTT  59 207
 FAI41_00370   80937 ..   80952 +  -3.4  -5.24531   AGCGCTTTATGGTTT              TATTTT CAAT AAAATA               TTTTTTGTAAGAAAT  73 14
 FAI41_00375   81256 ..   81273 +  -2.6  -4.03234   TCACATTGCCATGAT             GAGGCG TGCGCT CTCCTC              TTTCTCTCCGAGGAC  56 165
        ubiG   90336 ..   90355 + -12.2  -2.83403   ATTATTTATGTATGA            GGAAGTCC ATTA GGACTTCC             CTTTCATGAAAGCGA  84 49
        lipB   96808 ..   96818 +  -5.4  -3.41051   TTTTAAAAGAAGTCC                 TAGC GCC GCTA                 TTGTCATCCACCTCA  57 230
 FAI41_00475 NONE
 FAI41_00480   99246 ..   99263 +  -2.8  -4.87318   CTGCCTCACCTGAAA             CAAAAA CAAGCA TTTTTG              TTTTTCCCTTTTGCA  68 229
 FAI41_00555 NONE
 FAI41_00560  118745 ..  118764 +  -4.2  -3.03635   TCTGGGAGTTCTTGT            GCGCTTGG ACAA TTAGGCGC             TGTTAAAGACATTTC  47 518
 FAI41_00605  128395 ..  128426 + -13.1  -3.68071   CCGTTAAAAGAAAAT      GAGGCTGTTTTGG CATTTC CCAAGGCAGCCTC       TATTTTCGCCATTTC 100 114
 FAI41_00625  131379 ..  131396 +  -6.3  -2.92111   GCAGAAAAAGCTGCT             CAAGGAG ATAA CTTCTTG              TCGGTTTTTTAAAAG  55 173
        rplU  132393 ..  132407 +  -4.3  -2.78776   AAGACATCAATTTAG               GCTAA TTCAT TTAGC               ATCTTTTAAGGAGTT  48 21
 FAI41_00640  132791 ..  132802 +    -3  -3.67775   CTTCTATCTGGAAAA                TTTC CCAT GAAA                 TTCTTGGATCAAGCT  50 127
        obgE  133834 ..  133850 +  -9.4  -5.00616   TGACGATGAGAAACA              GGGGGA ATAAA TCCCCC              TTTTTTGAAAAAGAG 100 16
         zwf NONE
        rnpB  136294 ..  136309 +  -6.1  -5.64274   CACTAAATTTTTTGA              CCGCT CATCGT AGCGG               TTTTTTTATGCCTGA  91 69
        mraZ NONE
        rsmH NONE
 FAI41_00675 NONE
 FAI41_00680 NONE
 FAI41_00685 NONE
 FAI41_00690 NONE
 FAI41_00695 NONE
        murD NONE
 FAI41_00705 NONE
        murG NONE
 FAI41_00715 NONE
        murB  150396 ..  150407 +    -3  -3.56325   TGACATTCAATCCAC                CAAT CCAT ATTG                 TTGTCCTTATGGGCG  48 41
 FAI41_00725  151350 ..  151374 +  -2.2  -2.94099   CCAAGGTGCAGGATA          TTTAAGGCGT ATCAA ACGATTTAAA          TCTCTCATGCCGAAC  42 21
 FAI41_00730  152231 ..  152248 +  -2.8  -2.63637   TGAATAAATAATTAC             TTATCA ATAAAA TGATAA              ATTAGTATTCACTTT  41 34
        ftsA  153678 ..  153690 +  -3.4  -4.41528   CCAATATGTTTTAAG                CAGA GTAAA TCTG                TATTTTTTTCAGTTT  62 42
        ftsZ NONE
        lpxC NONE
 FAI41_00750 NONE
        recN NONE
        ligA  161683 ..  161698 +  -7.6  -3.37487   GCTTCTAGAAACAAA              GACTCA TTCA TGAGTC               TCTTTAGGAATATGG  67 13
 FAI41_00765  163084 ..  163102 +  -8.9  -4.43571   TGCAGAATAAAGAAA             TGGGGAA AATCA TTCCCCA             TTTTCATAATTTTCT  90 31
 FAI41_00775  164320 ..  164339 + -12.2  -5.89827   TTATTTGCACAAAAA            TCCTCTGC CTTG GCAGAGGA             TTTTTTTTGATAATT 100 56
        hchA  165373 ..  165402 + -13.9  -4.66987   TAAATCAATAACACA       TAAGAAATAGAGA TTAA TCTCTATTTCTTA        TTTTATTGGACTATA 100 74
 FAI41_00800  169698 ..  169715 +  -8.5  -4.17762   CTAGAAAAACAAAAA             GATTCCT AAAA AGGAATC              TTCTTTTAAAGAATG  79 180
 FAI41_00855  175539 ..  175559 +  -9.8  -4.42464   TTTTTTAAGAAAATT            GGGGATTA AATAA TAATCCCC            TTTGTTTCAGCGATT  91 13
 FAI41_00865  176834 ..  176871 + -18.7  -5.00616   AAAACACCGCTAAAA   GCAAAAGGCTGAACACA AATT TATGTTCAGCCTTTTGC    TTTTTTACGGACGGG 100 28
 FAI41_00920  188463 ..  188483 +  -3.2  -5.37171   GTAATCATTGGCTTT            TGCGGGTC AAAAG GAATCGCA            TTTTTATTTACTGTT  81 259
        hemB NONE
 FAI41_00935  191311 ..  191325 +  -5.7  -4.19953   GAATCACTCACGAGT               GCTGA ATATG TCAGC               TTTTCAGCTTCCATA  67 246
 FAI41_00970  195518 ..  195540 + -10.7  -4.38712   CCCCTCATAAAAAAA           CCTGCTTTT ATTAA AAAAGCAGG           TTTTCTAAAAATCAA  95 47
 FAI41_01010  205030 ..  205043 +  -2.4  -3.16608   ACAAACTAAAGTACG               GATG CGCCTT CATC                TTGCCTCATTTGCCT  43 32
        secG NONE
 FAI41_01020 NONE
 FAI41_01025  207883 ..  207899 +  -2.2  -3.54459   TATCTATAAAAAAAA              GCCTAG AAGGA CTATGC              TTTAGGCACCCTTAA  47 49
 FAI41_01030  209319 ..  209342 + -10.3   -5.4492   ATCACTACAAAGGAA          CGGCAGGGA AATTCA TCTCTGCCG           TTTTTTGTGTGTCTA 100 78
 FAI41_01035  209952 ..  209980 +  -5.3  -5.08088   ACCTGAATTCTTATA        GAGTCCGAATATT AAA GATATTAGGCCTC        TTTTTATTCAGCCTT  81 266
         xth  214202 ..  214221 + -12.2  -4.25074   AAAATAACATAAAAA            CAGGAGGT AAAT ACCTCCTG             TTTTAAAATTTAATC  93 34
 FAI41_01075  217872 ..  217897 + -16.3  -4.86385   TTAGGTAATTATCAA         TAAGGGATGGC GTGA GCCATCCCTTA          TTTCTTTTTCAGCCT 100 58
 FAI41_01080  218560 ..  218575 +    -9  -4.68593   TAGTTAACAAAAAAA              TCCCCT AAGA AGGGGA               TTTTTCAATCATGAG  90 38
 FAI41_01095  221874 ..  221893 +  -7.1  -4.88293   ATATTTTCTGCTTCT            GCCCGTG CCATCA TACGGGC             TTTATTTTTGGGATT  83 161
 FAI41_01110  224057 ..  224071 +  -5.8  -3.61178   ATTTGCTCTATAATC               TCTTTT TCT AAAAGA               TTTGCCATACATAGC  59 86
        secD NONE
        secF  227641 ..  227663 +  -8.5  -5.37593   TTCCAGACAACAAAA          CCCCGTCTTT TCAT AAAG-CGGGG           TTTTTTACTTTAAGG 100 64
 FAI41_01135 NONE
 FAI41_01140  229067 ..  229106 +  -6.6  -4.09685   CTTTAAATTCAAAAA  TAATTGAGTCTTTCCCTA TTTA TGGGGAAAGATGAAATTA   TTTTAAGGACTCCCC  70 50
 FAI41_01145  231339 ..  231351 +  -3.5  -2.58579   AAAATAAAGCCTCTA                TTATT TGG AATAA                ATTATGCCCCATTCA  43 34
 FAI41_01150  232249 ..  232260 +    -3  -2.70268   GGCTGGACGATCCTG                CTTT TAAA AAAG                 AATTTTTAATTACAA  41 5
 FAI41_01155 NONE
 FAI41_01160 NONE
 FAI41_01165  236793 ..  236822 +  -7.1  -4.43501   TTTCTTAAAACAAAA       CTGCCTCGTTTCC TTCT GAAAATGGGGCGG        TTTTATAAATAGCTT  79 48
        pyrF NONE
 FAI41_01210  246154 ..  246168 +  -8.6  -3.92542   TTTTAAGAAGTTCTT               TGTGCA GGC TGCACA               TTATTTAAAAATGAG  80 159
 FAI41_01215  246508 ..  246530 + -13.6  -6.08342   AATTTTCTAAAAAAA           GCACTGTAAA ATT TTTACAGTGC           TTTTTTTGTTTCTTA 100 48
 FAI41_01255  254590 ..  254603 +  -2.3  -4.43189   AAGAACTGATATATC               TGCCC GAGA GAGCA                TTTTATGCCATTCCT  58 45
 FAI41_01270  256796 ..  256813 +  -2.7  -3.53811   AAAAAACTGGAATAT             CAAACTT CCTA AAGTCTG              TTTCCGAAAAATCAG  48 372
        ruvX NONE
 FAI41_01345 NONE
 FAI41_01350  271541 ..  271557 +  -2.9  -2.85197   TCCCTATGAAATGCG              TTACCCT TTA AGGGAAG              ATTTAAAATTTATTC  42 60
 FAI41_01355  272626 ..  272645 +  -3.6  -2.82327   GGAGAATTGGGTGGG            GAAATCCA TGTC TGAATTTC             GTTTAAATCTCAAAA  46 43
 FAI41_01360  273825 ..  273850 +  -6.9  -3.53012   CCTTGACGCTCCAGC         TTGTCCATCTCC TCT GGAGATGG-CGG         TTTAAACCAAGGCGG  62 267
 FAI41_01370  276489 ..  276501 +  -7.7  -3.21276   GACAGCAGTGCCAAA                GCATG GAA CATGC                TGTTATAAGAAAGCA  64 137
 FAI41_01390 NONE
 FAI41_01395  284196 ..  284234 + -17.8  -2.94938   AAATTCTGAAGAGAA   ATATAAAAAAGAGCCTGA AAA TCAGGCTCTTTTTTATAA   TCTATACGCTTTTAA 100 486
 FAI41_01450 NONE
 FAI41_01455 NONE
 FAI41_01460  298228 ..  298258 + -14.2  -3.22917   TAATGGCAGGGCAAA       AATAAAGGGCTTCA AAT TGAAGCCCTTTATC       TCATTTTCATTTAAT 100 21
        ccmA NONE
 FAI41_01480  301975 ..  301995 + -14.1  -5.27335   AATATTAATTTAAAA            GCTTCCTCT TTA AGAGGAAGC            TTTTTCTTTAGCAAG 100 33
         nth  306057 ..  306070 +  -5.3  -4.87626   GCTCTATTGCATAAA               TTGGA AATT TCCAA                TTTTTCCTCTTCCAA  75 278
 FAI41_01510 NONE
 FAI41_01515  310543 ..  310553 +  -2.4  -2.62184   AACATGTTGCGCAGA                 TGCG TAA CGCC                 TAATCTGGAAAGAAA  40 12
        plsY NONE
        dprA NONE
        topA  315065 ..  315081 +  -3.7  -5.25772   AAAAGAAGAATAAAA              TGGGA TTCTGCC TCCCA              TTTTTCTTCTCATTT  78 28
 FAI41_01535  316754 ..  316767 +  -2.3  -2.78318   GCAAATGTATCTGAA               GAAGC TGGC GCCTC                CTTCTGATCTTTTTT  40 409
 FAI41_01545  318258 ..  318269 +  -5.8  -3.92746   TTGGTGGCCATGCCA                CACG CATT CGTG                 TCTTTTTGAAATCCG  65 314
 FAI41_01550 NONE
 FAI41_01555  321128 ..  321139 +    -3  -4.23892   TGACATACATTATAA                TAAG GTGC CTTA                 TTTTAGGTAATTCAA  57 173
 FAI41_01565  323027 ..  323050 +   -14  -5.93809   CTTTTTCATAAAAAA          GAGGGACATT TCTC AATGTCCCTC           TTTTTTTTATCAAAC 100 45
 FAI41_01580  325287 ..  325315 +  -9.7  -2.82516   TCTTTGCTGCAAAAG        CCGCCAGAATA GAAATGA TATTTTGGCGG        TATAATAATACACGA  75 53
 FAI41_01675 NONE
        acnA  347784 ..  347831 +  -2.8  -3.62746   AATCAACCCTTGGCA GAGAAAACAGAGAGGATT TATACATAAAAC CATCCTCTCCGTTTTCCC ATTTTTTAAGGTAGC  48 43
        petA NONE
 FAI41_01690 NONE
 FAI41_01695 NONE
 FAI41_01700 NONE
        fdnG NONE
        fdxH NONE
 FAI41_01715  356312 ..  356354 +  -5.6  -5.94214   ACGCTTTGAAAAAAA GGATTGTAGTGTGGCATTCT CTT AGGATGTCGTCTTGCAGTCC TTTTTTTATTATATT  91 42
        fdhE  357414 ..  357432 + -11.7  -4.52589   ACCTCACAAAAAAAA             GGCGCTC CAATT GAGCGCC             TTTTCTCTCAAAAGG  95 64
 FAI41_01730 NONE
        galE  360084 ..  360094 +    -4  -2.93869   TCTCTTCGCCTTTCG                 CTTT ACC AAAG                 ATTTATCAAATAATG  47 87
 FAI41_01740  361435 ..  361463 +  -8.9  -5.64274   TTTAAAATAAAAAAA        GGCGCTCAAGA TTTTCTC TCTTAAGCGCC        TTTTTTTATGGATGA 100 49
 FAI41_01755  364678 ..  364696 +  -3.9  -2.71119   TAAAATTTGATATAA             TTTTGGC GCATG GTCAAAA             ATTGTCTGAATGCCT  45 402
 FAI41_01800  373585 ..  373610 + -11.3  -5.56372   TGTCCCCTCAATAAA         GCTGGAAGATA ACGC TATTTTCCAGC          TTTTTCTTTTCGTTT 100 48
 FAI41_01805  374954 ..  374972 +  -2.4   -2.7587   GTCCCTCTTTAAAAA             GAATCTAT CCG AAAGGTTC             CTTCTCTAACTTTTT  41 40
 FAI41_01810  377335 ..  377357 +  -6.2  -5.26316   TTATTTCCTTACAGA           GATGGCAGAA TTA TTCCGCCCTC           TTTTTTCTAAGGTAG  89 196
 FAI41_01815  380417 ..  380428 +  -4.4  -3.52204   CGACGATAGCCTAAA                TCCT TTAC AGGA                 TTAGTTTCAAGATAA  54 255
 FAI41_01840  387452 ..  387475 +   -14  -6.09888   TCTTAACGATAAAAA          CGGGATATCA TTTC TGATATCCCG           TTTTTTTTATTGAGA 100 64
 FAI41_01855 NONE
 FAI41_01860 NONE
 FAI41_01865  390054 ..  390070 +  -7.9  -5.53079   ACAGGCGCAGCATTG              CTCCGTC TAT GACGGCG              TTTTTTATGTCTTTT 100 265
 FAI41_01875  391412 ..  391430 +  -3.2  -4.15006   CATAACAAACCAAAG             GACTTA CAGAACC TAAGTC             TTTTGCGCTCCATGT  57 356
 FAI41_01895  394877 ..  394900 +  -2.4  -4.67234   AACATGCGCCATACA          GATAGGACGCA TGA TGCG-CTTCTC          TTTTTCCACTTCGCT  64 432
        ssrA  398651 ..  398672 +  -8.1  -3.05046   AAAACATCTCGCTTT           GTGCAATAA GTTC TTGTTGCAC            CTTTTCCGGCGCTAA  62 202
 FAI41_01940  401962 ..  401980 +  -7.4  -2.67059   ATCCTCCCCCTCCTC             CAGGCG GAGCCAG CGCCTG             ATTCCTCTCTTTTCA  60 6
 FAI41_01945  403132 ..  403155 +  -8.2  -5.27938   ATCCCAATAAAAAAA          GGAAAGCTCT TTTA AAAGCTTTCC           TTTTTCTTTAACGCT 100 45
 FAI41_01955 NONE
 FAI41_01960 NONE
        thiD  406331 ..  406352 +  -5.3  -2.80074   GAAATGCCGTAAACG           TTTGAAGAA AACT TTCTTTAAA            TACTCTTCTAAACGA  52 89
 FAI41_02005  416218 ..  416232 +  -2.8  -3.78442   ATACTGTAAATTAAT               TGTCGA AAA TCAACA               TTATGTCTTCTTATC  50 27
 FAI41_02010 NONE
 FAI41_02015 NONE
 FAI41_02020 NONE
 FAI41_02025  420510 ..  420541 +  -3.2  -3.70919   TGTCGGGATTGAACG      GATGAAATTTTCTA AACT TACAAAATTTTGTC       TTCTTGCGATTTGCC  52 29
 FAI41_02030  421933 ..  421947 +  -3.6  -4.11216   TGACGATGACACTTA               GAGAAA GCC TTTTTC               TTTTGAAAATGAAAC  58 122
 FAI41_02035  422743 ..  422789 +   -14  -4.03978   TGGTTACTAAACCCT CTTTTTTACGCCCCCTAAATCA TCA TAATTTAGGGGGAATAAAAAAG TTTATCTGAAAAATT 100 31
 FAI41_02045  426453 ..  426476 + -15.4   -4.1891   CGAATAATAATAAAA          CAGCTCTGAG AAAA CTCAGAGCTG           TTTATCTTAAAAAGG 100 34
 FAI41_02055  428879 ..  428909 + -12.7  -4.44974   GGTAAAATAAGGCAA       AAAAATAGCGGGG ATAAA CCCCGCTATTTTC       TTTTATAAGCTTTAA 100 36
 FAI41_02090  438786 ..  438838 + -10.9   -4.7329   TAAAATAACGATAGT GGAAAGCCTCCCTTGC-TTTGAAA TTTCAT TTTTAATCGCAAGGGAGGTTTTTC TTTTTCAATCATTTT 100 62
 FAI41_02135 NONE
 FAI41_02140 NONE
 FAI41_02145  452860 ..  452871 +  -4.4  -2.75963   TTCTTCTAAAAAAAA                TACC CCTG GGTA                 ATTTACAATAAAAAT  47 296
 FAI41_02205 NONE
         efp  461296 ..  461328 + -12.9  -4.71061   TTCTTCTTTTCTTTG      CGTGTATTCCTCC CCTTTAC GGAGGAATACATG      TTTTTAAATCTAAAT 100 55
 FAI41_02215  462212 ..  462229 + -11.3  -3.35813   AATAATTGATTGAAA             GGCGGTT TTAT AACCGCC              TTAATTGAAGTGAAA  82 36
 FAI41_02220 NONE
        lepA NONE
 FAI41_02230 NONE
 FAI41_02235 NONE
 FAI41_02240  468152 ..  468162 +  -8.2  -2.97717   CTTTATATCTTTTTA                 GGGC ATT GCCC                 CTTCTTGTGATTTTT  67 100
 FAI41_02245 NONE
 FAI41_02250 NONE
 FAI41_02255 NONE
 FAI41_02260  472176 ..  472192 +  -5.8  -5.11937   TCTTAAAAACAAAAA              GGCAGC AATAA GCTGTC              TTTTTTAAGCTTCTT  83 63
        rlmN  473618 ..  473653 +  -6.4  -3.24365   CTAAAAAACGCTATA    TAGAAAGGG-TTATTGA TTC TTAATCACCCCTTTCTA    TCTTATAAAATGTAA  61 61
 FAI41_02275 NONE
        trpS  476200 ..  476236 + -10.9  -3.13487   GGTTTTAAAAAACGC    TCGGCCAGAAGATGAGT CCT ACAGATATTCTGGCCGA    TGATTTCCTTTTATT  80 33
 FAI41_02285  477545 ..  477564 +  -6.4  -4.09511   TTCTAAAATCTCATC            CGCC-GCTG CAC CAGCCGGTG            TTTTAGAAGGATCTT  68 145
 FAI41_02320 NONE
 FAI41_02325 NONE
 FAI41_02330 NONE
 FAI41_02335 NONE
 FAI41_02340 NONE
 FAI41_02345  488723 ..  488742 +  -7.8  -3.55071   GATCTCTCAGTGATT            TCCAGCGC TTGC GCGCTGCA             TTTAAAAGCGTCTCA  69 131
 FAI41_02360 NONE
 FAI41_02365 NONE
 FAI41_02370 NONE
 FAI41_02375  495137 ..  495164 +  -4.2  -3.58533   CCTTCTTTTAAAAAT        GGAGGAGGGATAA GTT TTGTCA-TCCTCC        TTTAGAAAATTATCC  55 13
 FAI41_02380 NONE
 FAI41_02385 NONE
        rsmA  499720 ..  499744 +  -8.5   -4.2123   CCCCCATACAAAAAA          GACTGGAAGCA ATT TGCCTCCAGCC          TTTCTTGAATCAATC  81 92
        carA NONE
        carB  513263 ..  513292 + -13.7  -4.67943   TAAAACTTGCTTAAA       TGGCGCAGTTTTT TCAC AAAGGCTGCGCCA        TTTTCTATCTTAAGA 100 57
 FAI41_02465  514280 ..  514305 +  -3.3  -5.15117   ACGAAAGAGTCAAAG         CAGCCCAAAAA TAAC TTTTTGCGCTA          TTTTTTCAGCTTTTA  73 12
        greA  515091 ..  515104 +  -2.4  -4.45168   AAGCGGCCTCATTCT               CCTT CCCCAT AAGG                TTTATATTTTAGAGG  58 60
 FAI41_02475  516688 ..  516704 +  -2.2   -4.2558   CTTAAAAACTTTGAA              GTGCTT GAAAA AAGCTC              TTTTGCTAACGGCTG  56 36
 FAI41_02480 NONE
 FAI41_02485  519072 ..  519092 + -11.2  -5.06816   CTTAATTTCATAAAA            GCCCCTAT ATTTC ATAGGGGC            TTTTTCTTAACGCAT 100 36
 FAI41_02530 NONE
 FAI41_02535  529389 ..  529407 +  -7.5  -4.67011   TGGTACCTGCAAATG             TTTCCAG CCCTT CTGGAAA             TTTTTGAATAAAATT  82 404
 FAI41_02590  540563 ..  540588 +  -7.5  -4.64676   ATACCTAAACAAAAA         CCCCCTGCTCT TTTC AGAACAGAGGG          TTTTCTTCGAAGTGA  84 33
        minC  570125 ..  570156 +  -4.6  -5.07652   TTTTCTATTTAACGT      TCTCAGAATCTTTT GTCT AAAATATTCTGACA       TTTTCTTTTAAAGGA  76 212
        minD NONE
        minE  571280 ..  571307 +  -3.5  -4.43307   CCAAAAGGTCTAAAG        CGCTAAGAGAGA TACCT TCTCTCTAA-CG        TTGTTTTCTTGAAAG  62 20
 FAI41_02810  576750 ..  576775 +  -6.9  -5.54079   TCAATAAGGGAAAAA         GAGCCTTTGAT TTTT GTCAAAAGCTC          TTTTTTCATTTTTAC 100 242
 FAI41_02825 NONE
 FAI41_02830 NONE
 FAI41_02835 NONE
 FAI41_02840  581590 ..  581611 +  -5.1  -4.65838   CCAAAATCTCAAAAA           GTCTCTCTA TCTT TGGGGAGGC            TTTTTGACCTCTATG  71 105
 FAI41_02845 NONE
 FAI41_02850 NONE
 FAI41_02855  583468 ..  583487 + -10.7  -4.90525   TCGCCTAAACAAAAA            CCCCCTG CTTTCA CAGGGGG             TTTTCTTTAGCCTTG 100 33
 FAI41_02865  586047 ..  586075 +  -9.6  -4.52857   ACATTCTAATAAAGG        CCCCCTTATGAT TTTCT GTCACAAGGGGG        TTTTCTATCAGCCAT  91 48
 FAI41_02885  589828 ..  589849 + -13.1  -6.06529   TTATGCGTAAAAAAA           GCTGGCTTA TTTT TAAGCCAGC            TTTTTTTTATCTCTC 100 54
 FAI41_02905 NONE
        rsmD  595077 ..  595093 +  -3.7  -3.95435   TCTGTTTATTTATTG              TATCCTG TCC CAGAATA              TTGTGTTTTGGGGCG  56 82
 FAI41_02915  598466 ..  598478 +  -6.3  -3.22102   TCTGGTGAAGAGGAC                GATGA AAA TCATC                TCTTCTAAACCCTGT  58 5
 FAI41_02920  599324 ..  599340 +  -6.7   -3.6944   TTGGGAAAGGATCCT              TTTTTTC CGT GAAAAAA              TCTTTATCTTGCGCC  66 14
 FAI41_02925  599996 ..  600014 + -10.2  -3.93664   GACAAATATAAAAAA             CCCCGCCT TTA AAGCGGGG             TTTCCTGTATTGAAT  85 39
 FAI41_02940  602557 ..  602580 +    -9  -4.45117   ATTACTTGTCCAAAA          GA-GAGGTGAA AAT TTCACCTCCTC          TTTATTTAGAATGTA  90 47
 FAI41_02945  602816 ..  602827 +  -4.4  -3.52787   GTACGAGACGCCATT                TGCT TTAG AGCA                 TTCTCCTGTTACATA  55 28
 FAI41_02950  603065 ..  603076 +  -4.4   -3.3761   GAAATATAGAGCAAA                CAGA ATTT TCTG                 CTTTTCTTCGGGCGA  53 132
 FAI41_02955  604069 ..  604100 + -11.8    -5.252   AAAGGCTTTTTCAAG      GAAGAATCTCAGAG TATC TTTTGAGATTCTTC       TTTTTTATAAAGCTC 100 52
 FAI41_02960  605061 ..  605081 +  -3.3   -4.5448   TTTTGAGAATGTGCG            GCTTTTTTC AAA GAAAGAAGA            TTATTTTTCTGGGTC  64 425
 FAI41_02990 NONE
        mobB  611626 ..  611638 +  -4.8  -3.00017   GAAATACCATGTTCC                CGCT CCGGA AGCG                TCATTTGGATTTGAA  51 512
 FAI41_03010  614889 ..  614916 + -12.9  -4.91109   CAATCAAAAAATAAA        GCGGACAAATA AACAAA TATTTGTCCGC         TTTTTATCATGCACA 100 52
 FAI41_03015 NONE
 FAI41_03020  620559 ..  620591 + -22.3  -4.13014   GTAAAATGTCATCTG      TAGAAGAACCCGCTT TGA AAGCGGGTTCTTCTA      TTTTCCCAGTATAAA 100 37
 FAI41_03035  623359 ..  623380 +  -8.7  -5.45652   ATTACATATTTTAAA           AGCCCACTT TTTC AAGTGGGCC            TTTTTTCTTACGAAT 100 50
 FAI41_03045  624672 ..  624684 +  -2.7  -3.58396   GCTTTGACTTAAGGT                CAAGA GGA TTTTG                CTTTTTACTTTCACA  48 204
        rlmB  625644 ..  625664 + -11.9  -4.56978   GCTTAATGACTTATA            TGCGCTTCA TGT TGGAGCGCA            TTTCTTCTTTCAAAC 100 113
 FAI41_03070 NONE
        rpoH  628912 ..  628946 +  -2.8  -5.10077   TACCGGCTTTGGGAA     CAAGTTCCTAAATATG GAC CATGTAAAGGGACTCG     TTTTTTGAGGTCTTT  70 15
 FAI41_03080  629308 ..  629332 + -12.9  -5.68039   AAATAAAAAGCTTAA          GGGAACAAGTC TTC GTCTTGTTCCC          TTTTTTTATGCCTTT 100 51
 FAI41_03085  629824 ..  629841 +  -8.3  -3.80855   TCTCATAACAGAAAA             GCCCGCC ATAA GACGGGC              TTCCTTTTTAGAGCA  74 63
 FAI41_03110  634544 ..  634555 +  -5.8  -3.78234   ACACACCAGATGGAA                CGTG TCGG CACG                 TTATTCCCTTTCCCT  61 354
 FAI41_03120 NONE
 FAI41_03125  636510 ..  636521 +    -3  -5.25803   TTAAAATTTACCCTC                TGAT ACGC ATCA                 TTTTTTATAGCCATT  74 77
 FAI41_03150 NONE
 FAI41_03155 NONE
        hpnJ NONE
 FAI41_03165 NONE
 FAI41_03170 NONE
 FAI41_03175 NONE
 FAI41_03180  646933 ..  646944 +  -4.4  -5.12474   TCTTTACCCCTTTAA                TCCT TTTC AGGA                 TTTTTCTATCTTCTC  76 26
 FAI41_03185 NONE
 FAI41_03190  648324 ..  648344 + -15.5  -4.17987   AGACCTAAAACAAAA            CCCCCTTGA TTT TCAAGGGGG            TTATTTGCTTATTTC 100 33
 FAI41_03235 NONE
 FAI41_03240  662081 ..  662113 +  -4.9  -4.57837   GCGGTAAGAATCCTT      TCCTAAAAACGAAAA GGA TTCTCGCTTTTAGGC      TTTTTCAGGGCGTGT  71 34
 FAI41_03255 NONE
 FAI41_03260  665767 ..  665791 +   -10  -4.89521   CTCTAAAAGAAAAAA          GGCGGCAATT ATGCA AATCGCCGCC          TTTTCTTTACCGTAT 100 50
 FAI41_03270  666865 ..  666885 + -11.2  -5.14563   CCCCTAAAAAATAAA            GGCAGAGA TTTTT TCTCTGCC            TTTTTTAATCACGAA 100 46
 FAI41_03285 NONE
 FAI41_03290  669754 ..  669775 +    -3  -4.59954   CCTCATCCGCAAAAG           GGATAAAG TTTCCC CTTTAGCC            TATTTTTTTATTATT  62 138
 FAI41_03305  671472 ..  671482 +  -6.8  -4.06851   AGAAGAATTACCCTC                 CTGC CTT GCAG                 TTTCACTTTTTATTT  70 306
        queF  674598 ..  674649 +  -8.2  -3.26042   CGCTGATCTTTTTTA CAAACTGTCTTTTTAAACAAAGAG CTTG CTTGCAGTTTAAAAAGACAGTTAG ATTATTTTTCAATAA  69 35
 FAI41_03325  676121 ..  676147 +  -4.5   -4.1466   ATCTATTAAAACGCT         GAGAAATGTTT CATGC GAACATTGCTC         TTTTACAAATTAAAT  61 45
 FAI41_03330  677561 ..  677571 +    -4  -2.60032   CCTCCTCATCTGTCG                 CTTT ATC AAAG                 GATTTTTCGCCAACA  44 282
 FAI41_03345 NONE
 FAI41_03350  682034 ..  682051 +  -4.1  -2.88999   TGCCTGTTATCTCTT             TGAAGGT AAGC ACCTCCA              TATCGTCTATCGCAG  46 47
 FAI41_03355  684009 ..  684030 +  -3.1  -4.88918   CCGATTTTTGTTTGG           TTTTGGT GGCTTGAA ACCAAAA            TTTTCTTTGCCGTCC  72 194
 FAI41_03370 NONE
 FAI41_03375 NONE
 FAI41_03380 NONE
 FAI41_03385  690239 ..  690281 +  -4.6  -2.83368   GAATCTTATTTAAAG CATTTTCAAAAG-GAGATGA TTTGC TTATCTCGCTTTT-AAAATG ATATTCTTTTCCTCT  48 28
 FAI41_03390 NONE
 FAI41_03395  692601 ..  692622 + -13.1  -3.72576   CCCCCCAAAGATGAA           CAGCCTCTA ATAT TAGAGGCTG            TTTCATAAACAACGA 100 48
 FAI41_03405 NONE
 FAI41_03410 NONE
 FAI41_03415 NONE
 FAI41_03420  699209 ..  699238 + -20.8  -5.45802   AATATTCTTTTTAAA       GCGCCGTCTCCC ATGAAG GGGAGACGGCGC        TTTTTGTTTTCGAAA 100 52
 FAI41_03435  703102 ..  703114 +  -3.4  -3.36256   CTTTCAAAAATCAAT                CCTT TTCAC AAGG                CTTTTTAACCCTCTA  48 5
 FAI41_03440  704003 ..  704013 +  -6.8  -3.62096   ATGCGTTCATGTAAA                 GGGA TAA TCCC                 TTTCCGGTGATGGAA  64 60
 FAI41_03450  706726 ..  706740 +  -2.1  -3.91317   GATCATCAGAATTTC               TCATC AACAA GGTGA               ATTTTTCTTTTATGC  51 110
 FAI41_03455  708301 ..  708315 +  -2.8  -2.80074   ATCGTTTAAAAATAA               GGCAAA TCT TTTGCA               TGCTGTTCTCACGCA  42 63
 FAI41_03460  710214 ..  710228 +  -6.4  -5.09173   ATCCGCCCATAGATT               GCCTTT TTG AGAGGC               TTTTTTAAAATATTG  83 407
 FAI41_03475  714445 ..  714470 + -14.8  -5.45652   TTAATGCGCATAAAA         CCGCCCCTTT TTAAAT AAAGGGGCGG          TTTTTTCTTGACGCT 100 54
        crcB  715051 ..  715065 +  -4.2  -4.63184   TCATCATTAATCTTG               CCGAGA TAT TCTCCG               TTTTTACCATACATT  69 131
 FAI41_03495  716543 ..  716574 +  -2.2  -3.48276   GACATCTTTCTAACG      GATGCGCTTGTGCA ATTT TGCATAACAGCAAC       TTATGTAGAGGCGCA  47 41
 FAI41_03500  717619 ..  717644 + -14.9  -4.45517   TTTTGCACTAAAAAA         GGCTGTTCTTT TTAA AAAGAACAGCC          TTTTCTCAATAGTTT 100 30
 FAI41_03520  722359 ..  722370 +  -7.2  -3.34715   ACAGAAAAACTGCTT                GCGC CTTT GCGC                 TATTTGCACACGATG  65 267
        gloA  723229 ..  723244 +  -2.5  -5.48303   GGAAAGCACCGCACT              GCCTA AACTTC TGGGC               TTTTTTTCGAATTGT  83 497
 FAI41_03550  727206 ..  727246 +  -6.1  -2.67439   AGCGCAACTCTTGAT  AGGTCGCTCCTCTCC CCCCCTTTTTT GCAGAGGAGCGGCCA  CTATTTCCTCAGATT  54 139
 FAI41_03575 NONE
 FAI41_03580  734892 ..  734902 +  -2.4  -3.61715   ATATTTGCAATGCCC                 AGCC CAC GGCA                 TTCTTGCGCAGGATA  49 376
 FAI41_03600  738436 ..  738451 +  -6.2  -2.84051   TGAAATCAGGTCATA              TTTTCC AGCA GGAAAA               GTTTGATCGAGGTCA  55 383
 FAI41_03625 NONE
 FAI41_03630 NONE
 FAI41_03635 NONE
 FAI41_03640  743931 ..  743945 +    -5  -2.76404   GAAGAAAAATTTTAG               TGAACT GAT GGTTCA               TGAATTTTCCCTCAC  50 87
 FAI41_03675 NONE
 FAI41_03680  751264 ..  751278 +  -4.2  -4.42386   ATCATTGCCATCGCT               TTCGCC TAA GGAGAA               TTTTATGACTGAAAA  66 17
 FAI41_03685 NONE
 FAI41_03690 NONE
 FAI41_03695 NONE
        nuoB NONE
        hycH NONE
        hycI  756500 ..  756522 +  -5.7  -3.13343   TTGTTTTTCAATGCT          TACC-CTTCT ATCT AGAAGAGGTA           TTAAATAGTTGGCAT  55 119
 FAI41_03715 NONE
 FAI41_03720  759460 ..  759481 + -14.5  -5.27399   GTTATCAAAAAGAAG           GGATGCCGA GCAA TCGGCATCC            TTTTTTACTGTCTTG 100 58
 FAI41_03725 NONE
 FAI41_03730 NONE
        hypF NONE
 FAI41_03740 NONE
 FAI41_03745 NONE
 FAI41_03750  770585 ..  770598 +  -6.7  -4.93365   CCTTATGTCTATCCT               GAGGA TTAT TCCTC                TTTTTCGTTCTCAAG  82 343
 FAI41_03760  771773 ..  771796 +    -6  -5.45802   CAGGCCATAAAAAAA          GGCTAAGTCT ATTT AGATCTAGCC           TTTTTCTTTTCAAGA  91 20
 FAI41_03780 NONE
 FAI41_03785  777345 ..  777367 +    -7  -5.85011   TCATTAAGAGAAAAA           TTCCCATTCT TTT AGCGTGGGAA           TTTTTTTGCTTTTTA 100 53
 FAI41_03790  778690 ..  778718 + -13.5  -2.62184   AATAGACTCGTTTTA        TATAATACGTATT TCA AATACGTATTATA        TCGTCTAAAAAGAAG  88 336
 FAI41_03795 NONE
 FAI41_03800  781092 ..  781105 +  -6.7  -4.64657   AAAGAAGATATTGAA               GCCTT GCTG AAGGC                TTTTTGAAGATTTCA  78 5
 FAI41_03805  781628 ..  781644 + -12.3  -5.14698   GATGAAACGGAAAAA              GGAAGGC TAA GCCTTCC              TTTTCTTTTGCATTT 100 206
 FAI41_03820  785318 ..  785341 +  -8.1  -3.05597   TCGTAAAAGATAAAA          ATGGCAGGG AAAATC CCCTGCCAC           ATTTTAAGAGATACG  67 54
 FAI41_03835  788504 ..  788529 + -13.3  -4.81851   AGCGTTATTTTGAAC         CCCCGTGCC CCCTTATC GGCACGGGG          TTTTTAAATTTAACT 100 94
 FAI41_03840 NONE
 FAI41_03845 NONE
 FAI41_03850 NONE
 FAI41_03855  790582 ..  790592 +  -2.6  -3.56643   CTTTTACAAGAAAAA                 TATT ATC AATA                 TTTCCGCCATCTACG  48 190
 FAI41_03885 NONE
 FAI41_03890  800755 ..  800765 +  -2.6  -3.91716   CAAATGGCTGAATGA                 TTTT GCA AAAA                 TTATTTAACAAATAG  52 7
 FAI41_03895  802970 ..  802987 +    -4  -3.85817   TCTGCGGTTGGAATC             GGGCCG ATGAAG CGCCCC              TTTATAAGACGCACT  55 398
 FAI41_03905  803853 ..  803881 + -13.9  -3.92577   TAGAAATTTAGAAAA        GAGCTTGGGGGGG ACA TCCTCTCAAGCTC        TATTTTTAAGAATTA 100 73
 FAI41_03920 NONE
 FAI41_03925  808734 ..  808748 +  -4.2  -3.94409   CCGCATTTCCGGCCG               GGTCTG TTG CAGAAC               TTTATCCCTAATATC  57 120
 FAI41_03950 NONE
 FAI41_03955 NONE
        gltB  821153 ..  821169 +  -9.4  -4.58395   TTTGCAACGTAAAAA              GGGTGC GCAAA GCACCC              TTTTTCACGCATAGA  91 46
 FAI41_03965  822929 ..  822946 +  -7.7  -3.60419   GCAATTGTGACAATT             CCCCTTT TAAA AGAGGGG              TTATCCTTTCAAGAT  69 67
 FAI41_03980  824516 ..  824526 +  -5.4   -2.6183   GTCGAATTTAAAGCG                 CTCT TAG AGAG                 ATTATAAGGATTTTT  51 8
 FAI41_03985  825031 ..  825041 +  -5.4  -3.45366   CTATAATAAATGCAA                 GAGA ATT TCTC                 TTAATTCCTTCACCG  57 35
 FAI41_04010 NONE
 FAI41_04015 NONE
 FAI41_04020  829673 ..  829685 +  -4.9  -4.64861   AACTTGGCGGATTAT                CATTA ACC TAATG                TTTATTTTGGAGAAA  71 165
 FAI41_04060 NONE
 FAI41_04065  835722 ..  835744 +  -2.6  -3.31443   ACACTTTCTCAAATA           TTGCGCCGCA TGT TGGGGCATAA           TTGACTTATTCTGGG  46 46
 FAI41_04070  836394 ..  836428 +  -8.7  -4.80736   TTTTTTCGTTTTTTA     GAGACAAGGGGAAAT TTAAC ATTTCGCCTTGTCTG     TTTCTTTATTTACTG 100 42
 FAI41_04075 NONE
 FAI41_04080  837460 ..  837483 + -10.4  -4.58685   ATTGATCAAAATGCA          GGGGATTAAG CTTT TTTAATCCCC           TTTTTCAAGAGCTTT  95 36
 FAI41_04090  839118 ..  839150 +  -5.6  -4.33754   CCGATTTTTGCGGTG      CTGGCGGTTCTTTC TCTGT GAAAGGATCGTCAA      TTTTACCTTGTGCTT  70 356
 FAI41_04110  842262 ..  842277 +    -9  -2.88452   ACAATGGGTTTATTG              GCCTCA CGGT TGAGGC               GTCTTTGTTTGGCCG  67 122
 FAI41_04125 NONE
 FAI41_04130  845885 ..  845905 +  -9.7  -4.08692   TCACAAAAATTAAAA            GCTCACCGA AAT TCGATGAGC            TTTTAAAAAGACTTA  86 60
 FAI41_04140 NONE
 FAI41_04145  848564 ..  848595 + -11.9   -4.4874   TAAAATTTTTCCATT      TTTTTAACAGGTT TATCAC AACCTGTTAAAAA       TTTTGGCTTTTTAAA 100 398
 FAI41_04160 NONE
        cas9  854728 ..  854756 +  -3.2  -4.41237   ATCTTTTTTATTAAA        TAAACGACTC CATAGAAAA GAGGCGTTTA        TTTGTATTCTTTGAT  62 48
        cas1 NONE
        cas2  856539 ..  856555 +  -8.7  -2.71791   TCAGCAGGGAAACCA              CGGCATT GGG GATGCCG              CTTTAACGCAAGCGT  68 445
 FAI41_04185  858199 ..  858225 +  -2.1  -4.90906   TTACCTAGGCATTGG         CCAGCGGGGGC GGGGG GCGTTGGCTGG         TTTTTGATATTGTCC  66 43
 FAI41_04195 NONE
 FAI41_04200 NONE
 FAI41_04205  862268 ..  862282 +  -8.6  -2.52623   CCCGCACTGATTTCG               GGATGA AAA TCATCC               ATATTCTCGGCCGAG  63 327
 FAI41_04215 NONE
 FAI41_04220 NONE
 FAI41_04225 NONE
 FAI41_04230  865037 ..  865053 + -13.7  -5.28755   ATTATAATTTTTCAA              CCCCGCT TTT AGCGGGG              TTTTTTAGTGTCTTT 100 77
 FAI41_04235 NONE
 FAI41_04240 NONE
 FAI41_04245  866900 ..  866916 + -10.1  -5.61689   AAAAACTATTTTCAG              CTCCGCT TCT AGCGGGG              TTTTTTATTGCTTTT 100 46
 FAI41_04250  867423 ..  867442 + -12.2   -4.5366   TTTTAGAAAAATAAA            CCTGTTCC ACGT GGAACAGG             TTTTCACTTTTTTGA 100 27
 FAI41_04260  869202 ..  869232 +  -7.6  -5.01546   AGCTATTATTTAGAA       GCCTCTGCCA TCACCCCACAT TGGCGGAGGC       TTTTTATATAGATTT  89 353
 FAI41_04290 NONE
 FAI41_04295 NONE
 FAI41_04300  878124 ..  878138 +  -4.4  -3.34398   TGCAAATCTTCACAA               TAATTT AAA AAATTA               TCTTTCCAAGGAAGC  53 222
 FAI41_04310 NONE
 FAI41_04315  879470 ..  879484 +  -4.4  -3.01712   TGCAAATCTTCACAA               TAATTT AAA AAATTA               TCTTGCCAAAGAAGC  50 139
 FAI41_04325 NONE
 FAI41_04330 NONE
 FAI41_04335  880434 ..  880448 +  -2.2  -3.01712   AACAAATCTTCACAA               TAATTT AAA GAATTA               TCTTGCCAAAGAAGC  42 42
 FAI41_04340 NONE
 FAI41_04345  882887 ..  882916 +  -7.9  -5.71712   TATTTTTAGATAAAA       GCCTCTGCC TTCCCCCACCCC GGCAGAGGC        TTTTTTTATGTGCGG 100 334
 FAI41_04350  884428 ..  884444 +  -2.1   -5.1523   TTAGAACAATCTTCT              GCCAGCT TTA AGCGGGA              TTTTTATCTTGTCAA  69 250
 FAI41_04355  885168 ..  885182 +  -2.8  -2.54193   GTTTTAAGAGCCCTA               GTTTCA ATA TGAATC               TAGATTAAAATAATA  41 62
 FAI41_04360  885888 ..  885901 +  -5.3  -4.67038   GCCATTTCTTAAACG               CACTT AAGA AAGTG                TTTTAATTTTAAAAA  73 6
 FAI41_04375 NONE
 FAI41_04380 NONE
 FAI41_04385 NONE
 FAI41_04390  891178 ..  891191 +  -9.5  -5.60689   ATGGCTTTAATCCCC               CCCCC TCAA GGGGG                TTTTTTATTATCTAA 100 90
 FAI41_04395 NONE
 FAI41_04400 NONE
 FAI41_04405 NONE
 FAI41_04410  893922 ..  893948 + -15.4  -5.75945   AAATGCTCTTCAAAA         GCGTCATATTTT TAG AAAATATGACGC         TTTTTTTTCGCGCAT 100 53
 FAI41_04415  894949 ..  894963 +  -2.8   -2.8789   AGCCTGATTACATTT               ATCCTT ATA AAGGAA               CTTATTATGCAGATT  42 48
 FAI41_04420 NONE
 FAI41_04425 NONE
 FAI41_04430 NONE
 FAI41_04435  897065 ..  897079 +  -7.1  -3.28712   GCGCTTCCTGCCCAC               GCCAG CGCAT CTGGC               TTATCGGCAAACAAG  63 244
 FAI41_04445 NONE
 FAI41_04450  898883 ..  898894 +    -3  -5.07567   AAACCTTCCGCCCTC                TAAG CGAT CTTA                 TTTTTTAGCCTCTGG  70 23
 FAI41_04470  901566 ..  901577 +  -4.4  -5.27938   AAAAATAAAAGCGGC                TGAG TATT CTCA                 TTTTTCTTTACCCCT  81 33
 FAI41_04475  902336 ..  902347 +    -3   -4.0031   TTTTGGATCATTCAG                TTTC TTTT GAAA                 TTCTTTGATCGGGGT  54 178
 FAI41_04490  905332 ..  905355 +   -11  -5.88197   TAAATCTTTCCGTAC          CCCGTTGGAT GTTT ATCCTACGGG           TTTTTTTATGTTTAA 100 136
 FAI41_04495  905956 ..  905972 +  -4.5  -3.10789   TTTTCTTTTACTTAC              TTCTATT AAA AATAGGA              TCCTTTATGTCTATT  50 59
 FAI41_04500  907139 ..  907153 +  -5.8  -2.83161   GATCAATCTCCCTTC               TATTGA AAT TCAATA               ATCTCTTTTTTATCT  55 10
 FAI41_04505 NONE
 FAI41_04510 NONE
 FAI41_04515 NONE
 FAI41_04520 NONE
 FAI41_04525  910327 ..  910341 +  -9.2  -5.60689   TAAGACTTAAAATTA               CCCTGC CCA GCGGGG               TTTTTTATTCTCTCA 100 49
 FAI41_04530  911324 ..  911337 +  -3.8  -3.46068   CGCCCAATTGCCTCT               CACC CATGCC GGTG                TATTTGGATTGCCCA  52 466
 FAI41_04540  915118 ..  915133 +  -6.1  -4.63932   CTGAAAAATAATCCC              GTGCC CGATAA GGCAC               TTTTCTTCGAAAATC  78 485
 FAI41_04565 NONE
 FAI41_04570 NONE
 FAI41_04575 NONE
 FAI41_04580 NONE
 FAI41_04585 NONE
 FAI41_04590  922612 ..  922634 + -11.3  -6.02919   TATCATTTCTTTCTC          CCGCT-CGGC TTTT GCCGTAGCGG           TTTTTTTATTTCTAA 100 128
 FAI41_04595  923299 ..  923328 +  -9.4  -3.67724   CTTACCTAAAAAAAT       TTCAGGGGAG AAGTTTAAGG CTCCCCTGAA        TATTTCTCTCGTTTA  81 187
 FAI41_04620 NONE
 FAI41_04625 NONE
 FAI41_04630  928561 ..  928576 +  -6.8  -5.64274   CATACTCCCTTTGAC              GCCCTG ATCT TAGGGC               TTTTTTTATGGATAA  93 96
 FAI41_04635  929723 ..  929733 +  -6.8  -3.63805   TTGCTGGGCAATATT                 GTGC GTG GCAC                 TTTCAAGTGTCAGCT  64 248
 FAI41_04655 NONE
 FAI41_04660  933434 ..  933455 + -13.7  -5.10004   CTTTTAAACAAAGAA           CGGCATCGC TTTT GCGGTGCCG            TTTTTCATTCTTTTT 100 51
 FAI41_04665  933971 ..  933996 + -14.1  -4.13814   AAAAATTCTTATATT         TGCCGCCTTTA ATTT TAGAGGCGGCA          TTATTTATAAATTTT 100 39
 FAI41_04670  934611 ..  934635 +  -2.1  -3.68908   ATCTCATAAATGCGG          TCTTTGCGGAA ATT TTCTGGAATGA          TTTCCGTGCCTGTTT  49 32
 FAI41_04675 NONE
 FAI41_04680 NONE
 FAI41_04685 NONE
 FAI41_04690  937448 ..  937471 +  -3.2  -5.78622   TAACATCTCCTCCTT          CTGTAATT-CG TCC CGCAATTACCG          TTTTTTTTAACATGG 100 217
 FAI41_04700  939674 ..  939686 +  -3.3  -3.60948   GAAGTTTAACGCCCT                GCCAG TGT CTGTC                TTTACGCCTCTCTTG  51 479
 FAI41_04710  941856 ..  941867 +    -3  -2.88961   TTTCGGTCTAAAGCG                GTTT TCTT AAAC                 TCTCCTAATCTTTTC  42 16
 FAI41_04715  942694 ..  942709 +  -6.8  -5.77988   TTCTTTCTTTTACTT              CCTGCT TTTT AGCGGG               TTTTTTTATGTATCT  93 66
 FAI41_04720 NONE
 FAI41_04725  944869 ..  944894 +  -9.7  -5.60689   AGTGTTCCTTATGCG         CCTCGTTCGGT TTTC ACCCAACGGGG          TTTTTTATTGTCTAA 100 136
 FAI41_04730 NONE
 FAI41_04735 NONE
 FAI41_04740 NONE
 FAI41_04745 NONE
 FAI41_04750  950491 ..  950505 +  -4.9  -5.60993   ATACTCCCTTTTCTG               GCCCT TTTTC GGGGC               TTTTTTTATGGACAA  88 112
 FAI41_04755 NONE
 FAI41_04760 NONE
 FAI41_04765 NONE
 FAI41_04770  952988 ..  952999 +  -3.6  -2.87132   TCAAAAATCTATCAA                GGCG CCGG TGCC                 TATATCACGCCGCAA  46 180
 FAI41_04775 NONE
 FAI41_04780  953771 ..  953786 + -10.4  -5.24129   TTCCCTTTTTAACCG              GCCCCT CTAA AGGGGC               TTTTTTATCAACACA 100 29
 FAI41_04785  954245 ..  954270 + -14.9  -5.93809   CAACAACAGCGTCTA         GAAGGTCTCTT CCAA AAGAGACCTTC          TTTTTTTTATGAAAG 100 54
 FAI41_04790 NONE
 FAI41_04795  954782 ..  954796 +  -8.6  -2.66899   GCCTCTTACGGTTTA               GCAACA AGT TGTTGC               ATTGCTTCCTTGGCA  68 43
 FAI41_04815  958017 ..  958058 + -14.8  -3.17975   TTCTCTTTTCCAGCT AAAAATAAGGAAGGTGAA AATATA TTCACCTTCCTTATTTTC  CTTTCTGTTCTGTGC 100 60
 FAI41_04820  958758 ..  958771 +  -3.9  -4.34771   TATTTTTCTTGACGC               TTCTT GAGA AAGAA                TTTTCATGCATTTTC  61 19
 FAI41_04825  959518 ..  959530 +  -9.1  -2.90496   AACTGGAAGCTTCAG                GGCAC GAT GTGCC                TCCTTTAAACCAAAA  67 125
 FAI41_04855  963535 ..  963558 + -18.2  -6.02546   ACGATAAATAAAAAA          GCCCCCTAGG AATT CCTAGGGGGC           TTTTTTTTCGTTTAA 100 17
 FAI41_04865 NONE
 FAI41_04895 NONE
 FAI41_04900  973253 ..  973274 + -13.1  -4.41348   ATTAAGATGGCAAAA           GAGAGTGTC CTAG GACACTCTC            TTTATTTCAGGCAAC 100 36
 FAI41_04935  980574 ..  980584 +  -2.6  -4.78326   CCTTCATGACAAAAT                 TTAT TTT ATAA                 TTTCTTTCTTTCAAG  65 15
         rho  982266 ..  982298 + -19.5  -4.52857   CCTAAAAAGTCACAA      TAAAAGCTTAAGGCA AAA TGCCTTAAGCTTTTA      TTTTATCTAAGCGCT 100 52
 FAI41_04945  983626 ..  983644 + -12.4  -6.02546   TTTTCAAAACAAAAA             CCGGCTTC TTA GAGGCCGG             TTTTTTTTGCTTTAA 100 51
        mnmE  985879 ..  985899 +  -2.5  -3.14344   AGCCTGCAAGAAAAA            CGCCCTT AAATCCG AAAGGCG            TTGATAAAGCGCCTA  45 146
 FAI41_04970  988408 ..  988429 + -10.3  -4.19746   TAAAGCGCATCTTGC           GCTTTCATT TCGC AATGAAAGC            TTGTTTTACCCTAAA  90 38
 FAI41_04975 NONE
        mnmG NONE
        rsmG NONE
 FAI41_04990 NONE
 FAI41_04995 NONE
 FAI41_05000  994391 ..  994419 +  -2.5   -5.1167   TTTTGTTTTTAACTT        TTAATGATTTGTA TTT TACAGATCAAAAA        TTTTTATATTAAGTT  70 255
 FAI41_05005  994706 ..  994730 +  -6.6  -4.70583   AAAATAGCATTATAT          TTTGGAAAAT CTATT ATTTTCCAAG          TTTTATCTTGATGAA  78 125
 FAI41_05010  996280 ..  996337 +  -6.5  -4.25256   ATGGGTTTTCTGTTT CGCCCTTCTTTTTCCCCCTTGAAA-AGT TAG ATTATTTTAAGGGTTATAAAGAAAGGCG TTATTTTGATAGAGC  73 339
        ribD NONE
 FAI41_05020 NONE
        ribB  999516 ..  999527 +    -3  -3.78693   TCAACCCTCGACATC                CTTT AATG AAAG                 ATTTTTTATGAGTTT  50 20
 FAI41_05030 1000024 .. 1000040 +    -3  -5.40072   TGCTTTTTAACAACA              CATAGC CTCAT GTTATG              TTTTTTTGACGCACA  74 44
 FAI41_05040 1003468 .. 1003484 +  -9.4    -3.695   AAATAGGACCAAAGA              GGGGGT TAAAT ACCCCC              TTTAAAATGTTTAAC  81 60
 FAI41_05045 1004674 .. 1004697 + -12.6  -4.24002   TTAACTGCTTTTCAA          TGCTCTACTT TATA AAGTAGAGCA           TTTTACACTTTAAAC  95 37
 FAI41_05055 1007340 .. 1007350 +  -3.2  -4.91712   GCTCTGGCCATGAAA                 GAGG GGA TCTC                 TTTTTGTAAATTGCC  72 233
 FAI41_05070 NONE
 FAI41_05075 1011201 .. 1011214 +  -5.3  -3.97368   CCCGAAACGAAACAG               GAAAG GCGA CTTTC                TTTCTCAGTTCAGAA  63 401
        ribB 1013022 .. 1013033 +    -3  -3.78693   TCAACCCTCGACATC                CTTT AATG AAAG                 ATTTTTTATGAGTTT  50 20
 FAI41_05090 1013530 .. 1013546 +    -3  -5.40072   TGCTTTTTAACAACA              CATAGC CTCAT GTTATG              TTTTTTTGACGCACA  74 44
 FAI41_05100 1016974 .. 1016990 +  -9.4    -3.695   AAATAGGACCAAAGA              GGGGGT TAAAT ACCCCC              TTTAAAATGTTTAAC  81 60
 FAI41_05105 1018180 .. 1018203 + -12.6  -4.24002   TTAACTGCTTTTCAA          TGCTCTACTT TATA AAGTAGAGCA           TTTTACACTTTAAAC  95 37
 FAI41_05115 1020846 .. 1020856 +  -3.2  -4.91712   GCTCTGGCCATGAAA                 GAGG GGA TCTC                 TTTTTGTAAATTGCC  72 233
 FAI41_05125 1023605 .. 1023649 +  -5.1  -3.60098   CCGGCATTGTACTCA TTATGGCACCTGTTATG AGAGTAAAAAC CATTGCAGGCGCCATAA TTTGACGTAAAAGCT  57 243
 FAI41_05145 1026793 .. 1026809 +  -5.9  -2.58544   CAAAGAAATGAGATC              GGATTTG AAG TAAATCC              CTTCTACAGATGGGG  54 80
 FAI41_05150 1027346 .. 1027361 +  -6.2  -2.52464   TTTTTTGGTATAAAG              CTGAAA ATAA TTTCAG               TCCATTCAAGAAAAG  54 475
       cas1f NONE
       cas3f 1034268 .. 1034280 +  -3.5  -4.09243   GTTCTTTGATTATAA                TTTTT CTT AAAAA                TTTTAAAAAAGTATA  57 123
        csy1 NONE
        csy2 NONE
        csy3 NONE
       cas6f 1038690 .. 1038707 +  -4.1  -4.77173   ACAGTTCGTGGCCAG             CGGAAGG ATTT CTTTCTG              TTTCTTTTATCGAGA  71 98
         dgt NONE
 FAI41_05275 NONE
 FAI41_05280 1057214 .. 1057225 +  -7.2   -3.1372   ACGGTGATCAATGGC                GGGG TTGC CCCC                 TATTGATGCGGCATC  63 8
 FAI41_05285 1057613 .. 1057633 +  -2.6  -3.78775   AACAATAATGTTCCT            TCTAATGA GACTA TCTTTAGA            TTTAGTCATCCAGAC  50 123
 FAI41_05290 1060374 .. 1060397 + -13.9  -3.64488   CTTTAAAAAGAGTGT          TCGGGGAGG TGGTTC CCTCCCCGA           TATTTTACAGAAATT 100 99
 FAI41_05295 NONE
 FAI41_05300 1061620 .. 1061658 + -10.5   -3.7511   TGAGTTTTCAGCGTT   GGATGGCGGAAAATT GTAAAGGGA AGTTTTCCGCCATTC   TTGTATTGTGAGGAA  86 65
 FAI41_05305 1064454 .. 1064501 + -13.5  -4.10453   ATTGTCTTTCTTTAA ATGCCAATAAGGCGCTCTGCG CCTTTT TGCCGAGCACCTTATTGGCAA TTTTGCGACAGTTTG 100 74
         bfr 1065219 .. 1065236 + -12.7  -5.26316   TGAGAATCAGAGAAA             GGCAGGG ATTT CCCTGCC              TTTTTTATGGCCTAC 100 57
 FAI41_05320 1068518 .. 1068550 + -19.5  -3.55563   ATAAAAATTATAATT      TCTAGTTGCAAATGA TTG TCATTTGCAACTAGA      TTTAAAAAATAAGAT 100 138
 FAI41_05325 NONE
 FAI41_05330 1069338 .. 1069376 + -12.5   -4.8384   TTAGTTTTCAGCGTT   GGGTGACGGAAGGCTAT AAAGG GTAGCCTTCCGCCATTC   TTTTTGGCTTCTTTA 100 37
 FAI41_05335 1070938 .. 1070957 +  -2.2  -3.32832   TTGAGGATGATTATC            GAAGAAAG TAAT TTTTTTTC             TTCCATCTTTTTAAA  45 15
        pstS 1072327 .. 1072341 +  -2.8  -3.89055   AAGATGATCAGAGGT               TTCGAG AGG CTCTAA               TTTCTGCGCATCTGT  52 291
 FAI41_05350 1075276 .. 1075315 +    -3   -4.2074   TTTTCGACATTCATT  GCAAAGAGCCACATG AGTCGGAAAAG CA-GTGGCTCTTTGA  TTTCTGTCTTACCGA  58 238
 FAI41_05365 1077534 .. 1077554 + -18.3  -3.53444   TTGAACTTTTTGAAA            GGGAGGGGG AAT CCCCCTCCC            TTTGAGAGAGGCTGA 100 37
 FAI41_05390 1083818 .. 1083851 + -17.7  -5.00884   ATTGATTTTTAAGAA     TTCTCCCTTCCTTTT CTTT AAAGGGAAGGGAGAA      TTTTTTGAAAGCCAT 100 67
 FAI41_05400 1086677 .. 1086701 +  -4.2  -4.74285   GTCCAGCCGCTTTTT          TCCTTGCCGT AAGTG GCGGTAAGGC          TTTTCTCTTGTGGAT  71 479
 FAI41_05415 1090405 .. 1090435 +  -9.8  -2.97408   TAAGTAAAGCATATT       TGGGGAGGATTTAC TTT GAAAATCCTTTCCA       CTTATTTGACTAAAG  76 71
         ssb NONE
 FAI41_05425 1091866 .. 1091880 +  -5.6  -5.27335   GACCATAATACGTTG               GAGGCG TTC CGGCTC               TTTTTCTTTAAAGAA  83 274
 FAI41_05450 1095838 .. 1095864 +  -8.1  -6.13503   CTGCGTGAAAATAAA        GGGCGATTAGAT GTCT ATCTAG-CGCCC         TTTTTTTTGTTACTC 100 63
 FAI41_05455 NONE
 FAI41_05460 NONE
 FAI41_05465 NONE
 FAI41_05470 1100571 .. 1100587 +  -5.7  -2.78298   TAATCGGGTTTTGGG              CGGCGGC TTT GTCCCCG              GTTCTGCTTTGCTTG  52 291
 FAI41_05480 1103898 .. 1103916 +  -3.2   -2.7035   GGCTAGCCTATAGTA             TGATTTTA TTT TAAAAACA             TCATATATAAATGCG  43 73
 FAI41_05485 1106418 .. 1106431 +  -3.1  -6.06529   TAAAAACATTAAAAA               TGCTT TTGG GAGCA                TTTTTTTTATGTCTG  93 146
 FAI41_05490 1113462 .. 1113472 +  -6.8   -2.8786   GGTGGGCAATTGTCA                 GCGA AAA TCGC                 CTTCTAATTTTTTGG  58 8
 FAI41_05495 1114147 .. 1114161 +  -2.8  -4.04482   ATAGAGATATAACGA               TGCGTT TGG AGCGTA               ATTTTTTTTGAAAGA  55 46
 FAI41_05500 1114901 .. 1114918 + -11.3  -4.21465   TTCGGCTTTGACATG             GTCTGCC AGAT GGCAGAC              TTCTTTGGTTTTGCC  93 79
        cydD NONE
        cydC 1129073 .. 1129090 +  -6.3  -4.00476   CAGGCATATTTTCTT             TTTCCTG AATT CAGGAGA              TTTATAGTGGATTTA  67 72
 FAI41_05560 NONE
        cydB NONE
 FAI41_05570 1132233 .. 1132257 + -18.7  -5.42265   AGTGGAATAAAAAAA          GCCTGCTCCAT GAA ATGGAGCAGGC          TTTTTTGTGGTTTAA 100 162
 FAI41_05595 NONE
 FAI41_05600 NONE
 FAI41_05605 1138815 .. 1138835 +  -3.3    -3.484   TTAAGGAAAAGCAGG            CGTAATTTG GTC TAAAATACG            TTATGATCTGCTGAG  50 37
 FAI41_05610 NONE
 FAI41_05615 1140468 .. 1140488 + -11.9  -2.54434   TTCCGATTTTGGAAA            GAGGCGGAA AAT TTCTGCCTC            ACTTTTGGTTGGAAT  79 127
 FAI41_05625 1143290 .. 1143302 +  -6.3  -3.68757   AAAAGTGATTTTCTT                TTGCT ATA AGCAA                TTATCTAATTTTAGA  63 82
 FAI41_05630 1143627 .. 1143663 + -12.3  -3.31515   CTTCTAAATTTAAAG    CACAGAGGGCGAGGTTG CGG TAGCCTCGCTCTTGGTG    TTCTAAGGCCTCTTT  90 53
        uvrA 1153117 .. 1153141 + -11.5   -3.1637   CACATCCTTTTAAGG          GGGAGGAAAGT TAG GCTTTCCTTCC          TTCCTAAAAATCTGT  84 12
 FAI41_05670 1154819 .. 1154847 +  -9.6  -5.42131   CCCCACCAGTTTTAA        GCCTTGCCTTCT ATTAA GGAAGACAAGGC        TTTTTTATGTGCTTA 100 398
 FAI41_05685 NONE
 FAI41_05690 1157455 .. 1157476 + -14.5  -5.01732   TTAAAACGAGAAAAA           GGCGGATGA AATT TCATCCGCC            TTTTTTAGAAAAATT 100 52
 FAI41_05705 1162143 .. 1162168 +   -12  -5.50499   AATTCCTAAATAAGA         TAATCCCACC CCAACA GGTGGGATTA          TTTTTTTGAATATCC 100 39
        adhP 1163301 .. 1163330 + -20.9   -2.9062   TAAAAGGCTAAAATG       GAAAGGGCGCTGA TTTT TCAGCGCCCTTTC        TGATTATCTGATGAA 100 65
 FAI41_05720 NONE
 FAI41_05725 1166978 .. 1166992 +  -5.6  -3.63515   CTGCTGGAAACACAA               TGCAGC GGG GCGGCA               TTATTGCAAATCACA  59 145
 FAI41_05735 1168890 .. 1168923 + -14.1  -4.08216   GTTAAGTTTTTAAAA     GCAAAGGAAGAAAAT AAAA ATTGTCTTCCTTTGC      TTTTGAAGAAAGTGC 100 28
 FAI41_05745 NONE
 FAI41_05750 NONE
 FAI41_05755 1171640 .. 1171650 +  -8.2  -2.52933   GAGCCATTCTGCCGC                 CCCG AAA CGGG                 ATTGATAGGTTAGGA  59 299
 FAI41_05780 1178312 .. 1178330 + -11.7   -4.1466   CTCAAAAGAAAGAAA             GGGCAGG AAAAA CCTGCCC             TTTTAGAGATTGGAT  91 421
 FAI41_05795 1181031 .. 1181054 + -13.2  -4.51765   AAGCGTCTTTGAAAG          GGCCGAGCAA TGAT TTGCTTGGCC           TTTCTTTGCGTTCTC 100 54
 FAI41_05800 NONE
 FAI41_05805 1184047 .. 1184065 + -10.2  -5.25906   AGCAGTTATAAAAAA             GCCCCGAT TTT AACGGGGC             TTTTTGTTGCTTTAT 100 197
 FAI41_05815 NONE
 FAI41_05820 NONE
 FAI41_05825 1187200 .. 1187212 +  -9.1  -2.91276   TGGCTGACCTCATCA                GCGCT ATA AGCGC                GTTTCTCACCCGAAA  69 449
 FAI41_05845 1192427 .. 1192476 +  -7.4  -2.72661   TTTGGGGGCTTATAT TAAAGATATCCGTGCAGGAAGGGG ATTT TCTTGTCCTGC-CGGA-ATCTTTA TAGTTGAAGATACTA  60 23
 FAI41_05850 NONE
 FAI41_05855 1194724 .. 1194735 +  -4.4  -5.26119   GGTTGGCCTAGCGCT                CTTG CTCT CAAG                 TTTTGTTTTTGCAAG  81 190
 FAI41_05860 1195819 .. 1195838 +  -2.2  -3.09327   CGCTTGAGATAGGAG            TTTATTCT TATG GGAATGAA             TGTTGGATCGGATGA  42 55
 FAI41_05865 NONE
 FAI41_05870 NONE
 FAI41_05875 1198069 .. 1198082 +  -5.3     -3.67   AGTGACGGCTTTTGA               GCATT TTTT AATGC                TATTTTGCGAGTTGC  60 57
 FAI41_05880 1200903 .. 1200921 +    -6  -3.37655   AGAGGATGCGAGGTC             TCAGCCTT TTA AAGCCTGA             TAATTTTTTAAAGAA  59 7
 FAI41_05885 1201955 .. 1201974 +  -2.8  -5.00616   TACAAAACGCCCTAA            TCTGCCTC TTGA GAAGTAGA             TTTTTTGCGAAGAAA  68 7
 FAI41_05895 1203660 .. 1203673 +  -8.1  -3.43722   TTTCAAAATTATAAG               GGGGA AAAA TCCCC                TCTTATGTTGCTAGC  70 27
        miaA NONE
        ilvC 1207377 .. 1207388 +  -2.2   -3.1876   AGTAAATAAGGAGTA                CCGT CCAC ATGG                 TTGATCAGTCGGCTT  43 32
        panB NONE
 FAI41_05930 NONE
 FAI41_05935 1209728 .. 1209746 + -12.4  -5.46129   AATATTTCCTGAAAA             TCCTCGCC AAA GGCGGGGA             TTTTTTGATTTGTTG 100 85
 FAI41_05940 1210508 .. 1210528 +  -7.6  -4.08887   AGAGAAATATAAAAA           CCCCC-ACT AAAA AGTAGGGGG            TTTGCTTTAGGTGAT  76 66
 FAI41_05960 1215606 .. 1215616 +    -4  -3.21099   TTTATGAAAGAGCGA                 TAAG GGG CTTA                 TTCATCGTAAGACCA  48 77
        infA 1215868 .. 1215881 +  -3.8  -2.78798   GATCTCACAAAAGGC               CGGA TTACCT TCCG                CTTTAAATAAGAAAT  46 2
         maf 1216567 .. 1216585 +  -8.9  -4.25074   GATTTGAGTGTGTAA             GAGCTGT ATAGA ACAGCTC             TTTTCCCATTTCATC  83 34
 FAI41_05975 NONE
        yacG 1218117 .. 1218145 +  -4.8  -4.08767   CCCAGTGGATATGCT        TCTTTTTATC GAGACAAGG GATAAAAAGA        TTTTGCCCGAGTAGC  63 114
 FAI41_05985 1218256 .. 1218286 +  -9.8   -6.5058   TATTTAAGAATTAGC       CCAGCAAAAGAACA TTG TTTTCTTCTGCTGG       TTTTTTTTTGTTTAT 100 56
 FAI41_05990 1218921 .. 1218933 +  -2.6  -2.63922   CCAGCCGTAGCAAGC                CGGG CTATT TCCG                ACTTTTTCAGTCCTA  41 115
 FAI41_05995 1219790 .. 1219802 +  -7.7  -3.54424   TCCTTTTCACAATTA                TGCTC TTG GAGCA                TTTCGCCAGATCCCC  69 41
 FAI41_06005 1221339 .. 1221363 + -12.2  -4.96773   ATGGATGTTTGAAAG          CCTGCCTCTT TTTAC GAGAGGCAGG          TTTCTTTTTGGTTAC 100 55
 FAI41_06015 1225592 .. 1225612 +  -8.3  -3.31144   AACAGCCGCCGCCGT            CCTCGTG CGTCATT CACGAGG            TTGTCACCATCAAGG  70 255
 FAI41_06020 1228865 .. 1228888 +  -6.7  -5.50313   GCGTGAAAAGAAAAA          CGGTTTGGG TTCATC TCCAAGCCG           TTTTTTACTTTTGTG  93 52
 FAI41_06025 1231721 .. 1231731 +  -3.2  -4.88222   TCTTTTTTCGGTACT                 GTGA ATT TCGC                 TTTTTAAATTTTCAT  67 8
 FAI41_06030 1232518 .. 1232530 +  -5.5  -3.65224   GGCTTCTGCCACATC                GGCTT TGC AGGCC                TTGTTAAAATAGAGT  59 213
 FAI41_06040 1233979 .. 1233994 +  -4.6  -3.56987   TTTCTCCTATTTGCT              GCGCCT GTTC AAGCGC               TTGTGTGCTGATCTC  55 332
 FAI41_06050 NONE
 FAI41_06055 1236309 .. 1236327 +   -16  -4.60255   TGTTTCAAAAGGAAA             GGGGCGCT TCT AGCGCCCC             TTTTTGAGAGATTAT 100 68
 FAI41_06065 NONE
 FAI41_06070 NONE
 FAI41_06075 NONE
 FAI41_06080 1242689 .. 1242703 +  -7.2  -3.08032   GCAGATAAAAACAGC               TTGAAG CCG CTTCAA               TACTTTTGACAGGCG  60 270
 FAI41_06090 1244773 .. 1244792 +  -9.2   -5.5604   ATTACGGACATGAGA            GGGCTACC GTTT GGCAGCCC             TTTTTTGTTAATTCA 100 52
 FAI41_06130 NONE
 FAI41_06135 NONE
 FAI41_06140 NONE
 FAI41_06145 1257504 .. 1257521 + -10.5  -4.44448   TTTTTCTGTGAGAGA             GGCGGTC GCTT GGCCGCC              TTTATTTGCAATCGT  87 88
 FAI41_06165 1261269 .. 1261284 +  -6.8  -2.64218   GTTCTTGGCCAAAAG              GGC-GGC GTC GCCTGCC              ATTATGATGGGGAAT  57 3
 FAI41_06170 1263139 .. 1263150 +  -4.4  -2.72043   GGTTATTTTGGGAAG                GCAT TAAA ATGC                 GTTTAAAAAAACATT  47 19
 FAI41_06175 NONE
        fdhD NONE
 FAI41_06185 1265427 .. 1265476 + -23.4  -2.82623   AGCGTTTTTAATAGA TAAAAGAAAAGCCCTCTGATTT ATGAAA AAATCAGAGGGCTTTTCTTTTG TGCTTCTAAAGAAAC 100 49
 FAI41_06205 NONE
        atpH NONE
 FAI41_06215 1269159 .. 1269176 +  -4.9  -3.54459   GTAATTAAGGCGAGG             GAGAGACA GAA TGTC-CTC             TTTAAAGGCGCTTAA  57 33
        atpG 1270092 .. 1270104 +  -4.9  -3.05596   GATGACTGCGCCTCG                CTTAA TAT TTAAG                TTAAATGCCCGCCTA  52 58
        atpD NONE
        atpC 1272098 .. 1272116 + -14.6  -6.01369   GCTTTAGTTTGAAAA             GGGAGGCA TTA TGCCTCCC             TTTTTTTGTTATTTA 100 86
 FAI41_06240 NONE
 FAI41_06245 NONE
 FAI41_06250 1275526 .. 1275544 +  -9.6  -3.14132   AGAGAGATTAACTTT             CTTCTTCC TTG GGAAGAGG             TTAGTCAAGAGAAGA  75 321
 FAI41_06255 NONE
         rrf 1278824 .. 1278851 + -14.2  -5.00765   CATCATTTAAAAAAG        CCCCCCTCACAT GAAA ATGTCAGGGGGG         TTTTTGTGCTTAATT 100 50
 FAI41_06265 1279367 .. 1279384 +  -8.5   -5.3236   CTAGTTTGTTGAGAA             TATCCTC TTTT GAGGATA              TTTTTTATGCCTTAT 100 37
 FAI41_06270 NONE
 FAI41_06275 NONE
        ureE NONE
 FAI41_06285 NONE
        ureG NONE
 FAI41_06295 1284568 .. 1284579 +  -4.4  -4.03413   ATACAATGGGAACAC                GCTT CTTA AAGC                 TTTCTATCGCGGGAT  61 124
 FAI41_06300 1284662 .. 1284701 +   -16  -3.18517   TCTTACTCCCGCATC  CAAAAAGAAACCCCTGTT TTTT AACAGGGGTTTTTCTTTG   CTTATTTTCTCAGCT 100 24
 FAI41_06315 1287821 .. 1287840 +    -5  -2.72144   AAAAGTGCTTTTGTT            TTTGCTTG TGAT CAGGCAGA             CTTTGCCAGAGATGA  49 39
 FAI41_06320 NONE
 FAI41_06325 1289580 .. 1289597 +  -9.1  -5.24531   GATAGAAATAAAAAA             GCGTGCT TTTC GGCACGC              TTTTTTATAGGGCAT 100 56
 FAI41_06330 1291072 .. 1291082 +  -4.6  -3.82202   TCTTTTTACTCTTTA                 GCCG TTT TGGC                 TTCTGTTTAGAAATA  57 281
 FAI41_06360 NONE
 FAI41_06365 NONE
 FAI41_06370 NONE
 FAI41_06375 NONE
 FAI41_06380 1305546 .. 1305559 +  -5.3  -3.64523   TGCAGATGATTACTT               TGAGT TGTC ACTCA                TTGGATTTTTTTTGT  58 32
 FAI41_06385 NONE
 FAI41_06390 NONE
 FAI41_06395 1308372 .. 1308385 +  -3.1  -4.18044   TGATTAGCTTCAAAA               CGTTG GCGC CAATG                TTTGATTGTTTCTGC  60 203
        pstC NONE
        pstA NONE
        pstB NONE
        phoU 1315782 .. 1315806 +  -8.5  -6.38655   AGATGAGATTGAAAA          TCCGCTCCCGT TAA AGGGAAGCGGA          TTTTTTTTTATGTTT 100 58
 FAI41_06445 NONE
 FAI41_06450 NONE
 FAI41_06455 NONE
 FAI41_06460 1326098 .. 1326113 +    -9  -4.52589   CCGGATGAAATGGAA              GGGCTT TCTT AAGCCC               TTTTCTGTCGGAGGA  90 14
 FAI41_06480 1329651 .. 1329665 +  -4.4  -2.68823   TTTAATCATTTTTAA               TTAAAA TTT TTTTAA               ATTCTATCGGAGAAG  47 42
 FAI41_06485 1330366 .. 1330383 +  -4.2  -3.41291   CAATTTTGGAGGGAA             TAGAGT GATTAA ACTCTA              ATTTTTGAGCTTATT  53 23
 FAI41_06490 1331475 .. 1331497 +  -3.5  -5.18643   CGAAAAAGCAGGCTT          GGCATAGGAGA TTT TCTCC-A-GCC          TTTTATTTTAGTTCG  73 73
 FAI41_06515 NONE
 FAI41_06520 1337660 .. 1337674 +  -2.1  -5.06414   TAAAGAAGGAAAATA               CCATG CCGCA TATGG               TTTTTGTTGAGCCAG  66 77
 FAI41_06525 NONE
        mnmA NONE
        ahpC 1339852 .. 1339869 +  -9.1  -3.90744   TTATTTCTAAATAGA             GGGAGGT TTGT GCCTCCC              TTGTTTGAGAAACGA  80 43
        ahpF 1341535 .. 1341560 + -12.7  -5.21709   TTCAGTGACGAAAAA         GGGAGAGGTTT TTTA AAATCTCTCCC          TTTTTTAGTATCAAG 100 50
 FAI41_06545 1341909 .. 1341938 + -15.3   -2.7556   AGCATTTAGAAACGC       TATTAAAGAGAGC GTAA GCTCTCTTTAATA        TAATTGAATAGAATT 100 40
 FAI41_06550 1342972 .. 1342982 +    -4  -4.28656   TAAAAGAGTTTGCTC                 TCTT TGC AAGA                 TTTTGAATGTTAGAT  61 38
 FAI41_06555 1343773 .. 1343792 + -12.2  -5.67063   TAATTGTCGTGTAAA            TGCCTCCT TTTT AGGAGGCA             TTTTTTTATGATGAG 100 38
 FAI41_06560 1344132 .. 1344167 + -12.1  -4.11216   AGGATAAAATTTTTA    TGTTTTTGCTGTTCT TATGTC AGCACAGCAAAAACA     TTTTAAGAATAAAAG  93 107
 FAI41_06565 1345566 .. 1345578 +  -4.9  -4.70887   TCAAAGAGGGATCAA                GTAAT TTC ATTAC                TTTATTTGTTCCTAG  71 22
 FAI41_06570 NONE
 FAI41_06575 1347514 .. 1347539 + -17.7  -5.27938   TGATTTATAAGAAAA         GCCCAGCCTAT GAAA ATAGGCTGGGC          TTTTTGTTTCAGGGT 100 50
 FAI41_06600 1352582 .. 1352592 +    -4   -3.9941   CTTTGAGCGGCAGGG                 TGAA TTT TTCA                 TTTCCTTCTAGGGCA  57 103
        nrdD 1355373 .. 1355385 +  -5.5  -2.78032   ACATTTAGAGAATGG                TCGGC TTG GCTGA                ATATTTTCAGGGAAA  52 13
        nrdG NONE
 FAI41_06620 NONE
 FAI41_06625 1358860 .. 1358872 +  -3.3    -5.243   CTTCTAAAAGGAAGC                TGGCC TTT GGCTG                TTTTTTCATCGTTTC  73 81
 FAI41_06630 1359923 .. 1359947 +  -4.3  -4.83615   TTAGACTGGCAGTGC          TTAAAGTTGGT GAA ACCATCTCTAA          TTTTTCTGAGAAATG  73 430
 FAI41_06640 1361336 .. 1361356 +  -2.5  -3.90048   GTAAAACAGGTTCTT            TTAGCGC TTCTACT GCGCTGG            TATTTTTGGCAAGCG  54 261
 FAI41_06655 1365827 .. 1365847 + -14.1  -5.64421   GCCTAGAAGTAAAAA            GGGGAAAGA AAA TCTTTCCCC            TTTTTTATTTAGGAT 100 43
 FAI41_06690 1371399 .. 1371412 +  -3.1  -4.19648   GGATTAAAAAGGAAA               GTCTT CTCG GAGAC                TTTAATTTGTCTATA  59 132
        glnA 1372926 .. 1372944 + -12.4  -5.82281   AATAATTTTTAAAAA             GCCTCCCA ATT TGGGGGGC             TTTTTTTATCTGTTT 100 50
 FAI41_06730 1379976 .. 1379997 +  -2.2  -4.43714   GCGTAAGAGGGAAGA           GGGAGAGG AATAGC CCTCTATC            TTTCTTCTACTTTCT  58 44
 FAI41_06785 1398625 .. 1398635 +  -8.2  -3.33492   CTCTCAGGTTGCCTT                 GGGC TTG GCCC                 TTATCGCCTGCGTCA  70 328
 FAI41_06790 NONE
 FAI41_06795 1401044 .. 1401055 +  -3.6  -4.56597   ATTTAGAATAAGAAA                GCGG CAGA CTGC                 TTTTTACGGACAAAA  66 221
 FAI41_06800 NONE
        murA 1403020 .. 1403048 + -14.7  -3.29144   TAATACACTAAGGCC        TCATCTGAGGGCT TTA AGCGCTCAGATGA        TTCTCAAAGGCATCG 100 38
 FAI41_06820 NONE
 FAI41_06825 NONE
 FAI41_06830 NONE
 FAI41_06835 1409251 .. 1409273 +   -15  -4.36862   CCATTTAAGAGAAGG           GGTGGAGATT TAG AATCTCCACC           TTATTTATTTAGTGT 100 275
 FAI41_06850 1411112 .. 1411138 +  -2.2  -4.41348   ATCACTGGACAATTC         CGGAATTTAAAG AGT CCTGAACTTCCG         TTTATTTGAAGAAAG  58 6
 FAI41_06855 1412561 .. 1412586 + -10.5   -5.7827   CTCATGTATGAAAAA         CGCCGA-TTCCT TAT GGGAAGTCGGCG         TTTTTTGTTTCTATT 100 49
 FAI41_06875 1418139 .. 1418156 +  -2.8  -3.66095   AGGAGATAGATAGAT             TTTTCT TTCAGT AGAAAA              TTTAGCTGGACATTT  50 40
 FAI41_06880 1418717 .. 1418733 +  -5.8  -6.02345   AGAGCTAATAAAAAA              GCCAGT ATTTC GCTGGC              TTTTTTTTGTGCTTA 100 33
        clpB 1423438 .. 1423467 + -13.7  -4.49352   CTAAAAAAGAACAAT       AAAAAAGCGGGCT TTTT AGCCCGCTTTTTG        TTTATCTTTTAATAT 100 45
 FAI41_06905 NONE
 FAI41_06910 NONE
 FAI41_06915 1427091 .. 1427109 +  -9.6  -3.14132   AGAGAGATTAACTTT             CTTCTTCC TTG GGAAGAGG             TTAGTCAAGAGAAGA  75 321
 FAI41_06920 NONE
         rrf 1430388 .. 1430413 + -16.3  -4.98531   ACATCATTTAAAAAA         GCCCTTAAGGT ACTC ACCTTAAGGGC          TTTTTGCTTTCCAAG 100 49
 FAI41_06930 1431351 .. 1431362 +  -5.8  -3.54459   TTCGGTGAGCCACCT                GCCT CATG AGGC                 TTTAAACCCAATTCC  61 17
 FAI41_06940 NONE
 FAI41_06945 NONE
 FAI41_06950 NONE
 FAI41_06955 1435474 .. 1435506 + -11.4  -3.85698   ATGGCGTAATAAAAA      CCCTCTTGCAAAGA AAATA TTTTCGCAAGAGGG      TTTGTACAAAAAGCA  91 48
 FAI41_06965 NONE
 FAI41_06970 1437264 .. 1437284 + -14.1  -5.41746   TAAGATTTTTAAAAA            GGGAGAACT TTT AGTTCTCCC            TTTTTTTGCAGAATT 100 38
        rfaD NONE
 FAI41_07005 NONE
 FAI41_07010 NONE
 FAI41_07015 NONE
 FAI41_07020 NONE
        ychF NONE
        nadD 1446631 .. 1446641 +  -2.6  -4.07877   TTGGGCATATAGTCC                 TAAA TGA TTTA                 TTCTTTATAAAATAA  55 44
        rsfS NONE
 FAI41_07040 1447990 .. 1448004 +  -2.8  -4.01946   GCAAGATGCACATAG               CCTACA CAT TGTAAG               ATTTTTTCTTTGTGA  56 491
 FAI41_07050 NONE
 FAI41_07055 NONE
 FAI41_07060 1450182 .. 1450200 + -11.7  -5.52096   ATCCGTAATTTTAAA             GGGCGCT TTTAT AGCGCCC             TTTTTTGTTAGGTTT 100 33
 FAI41_07065 1451096 .. 1451113 + -12.7  -3.88001   CTGAGGTAGTGGAAA             GGGAGGC ACTA GCCTCCC              TTAATTTTTATGGGG  95 37
 FAI41_07070 NONE
 FAI41_07075 NONE
 FAI41_07080 1453865 .. 1453883 +  -9.6  -3.14132   AGAGAGATTAACTTT             CTTCTTCC TTG GGAAGAGG             TTAGTCAAGAGAAGA  75 321
 FAI41_07085 NONE
         rrf 1457162 .. 1457187 + -16.3  -4.98531   ACATCATTTAAAAAA         GCCCTTAAGGT ACTC ACCTTAAGGGC          TTTTTGCTTTCCAAG 100 49
 FAI41_07110 1461142 .. 1461159 + -12.7  -4.85129   TTTGACTAAAGAAAA             GGCGGCT TTAA AGCCGCC              TTTTTAGTGTCTGCT 100 32
 FAI41_07125 NONE
         map 1466166 .. 1466180 +  -2.8  -3.36823   GCCAACAGGACAGCA               TCAACC TAA GTTTGA               TTAAGTTTTAAAAGA  46 7
         ggt NONE
         ffs NONE
 FAI41_07145 1469986 .. 1469999 +  -2.4  -4.43283   GTTTTAAAAGGGTAG               TCTC GTATAA GAGA                TTTATATTTATATAA  58 34
 FAI41_07150 NONE
        recR NONE
 FAI41_07160 1471766 .. 1471785 +  -6.4  -4.61527   TAAGGCCAAAAAAAA            GACTTGGT AAAA ACCAAGCC             TTTTTCAAAGATTTT  78 38
 FAI41_07170 1473197 .. 1473217 +  -4.1  -4.27686   GTCATAAGCGGTTTT            TTGTAGATT TTT AATTTACAG            TTTTGGATCGTTTTA  61 250
 FAI41_07175 1475018 .. 1475037 +  -9.3   -5.1101   TTGAGTTGAGAAAAA            GGGCACT TTATTT AGTGCCC             TTTTTTGCATCGTAA 100 67
 FAI41_07180 1476190 .. 1476229 +    -3   -5.7827   TTTTAATGTTAAAAA  TGTTCTTGAAGTAGTGTGT AAA GCAC-TTACTTTGGGAGCA  TTTTTTATTTATATT  81 66
 FAI41_07185 1479731 .. 1479743 +  -3.5  -3.91911   ACATCTTAAAAGTAT                TTTTT GAT AAAAA                TTTCATTCGGATAAG  55 32
 FAI41_07190 NONE
 FAI41_07195 1483866 .. 1483890 + -13.6  -5.64274   ATATTGTTTTTAGAA          GCCCCCTCTT TTTTT GAGAGGGGGC          TTTTTTTATGCGTGC 100 44
 FAI41_07205 1487343 .. 1487363 +  -6.3  -3.95621   AAGGAGCGCTTTTTC            TTTTGTTTT TAG AAAACAAAG            TTTCTAAAGTTTCCT  65 47
 FAI41_07210 1488583 .. 1488622 +  -9.4  -5.86332   GACTTCTGAATAAAG  AAATAAAGGCAGGCTG AAAAAACG CAGCCTGCCTTTATAA   TTTTTTTTGGATTAG 100 32
 FAI41_07230 NONE
 FAI41_07235 1494552 .. 1494565 +  -2.5   -2.8829   TAAAAAAAGAATAAT               TTTAA CCTT TTAAA                CTTTGGTGGTCGTCT  42 47
 FAI41_07240 1495905 .. 1495924 +  -7.2  -4.41817   AACTTGGAAATCATG            TTC-TCCCG TAC CGGGACGAA            TTTTAACTTCTTTTA  77 286
        rapZ 1501306 .. 1501323 + -11.3  -5.76633   TTTGAAAATGGAAAA             GCCTCCT GGTC AGGAGGC              TTTTTTTATGTGTCA 100 79
        dusB NONE
 FAI41_07285 NONE
 FAI41_07290 NONE
         hfq 1510422 .. 1510439 +  -3.5  -3.61983   CGTAGCGGCTTTGTT             GGATTTT CCTT AAAATTC              CTTTTCTTTGTGTGA  50 13
        hflX 1511917 .. 1511935 +  -7.4  -3.93401   TTAAAAAATTTGCGA             TTCCGACA TTT TGTCGGCA             TTATTGCTTTATAGA  71 95
 FAI41_07305 1512177 .. 1512191 +   -10  -2.78715   AAATCTCTTGTGATA               CCGTCA AAT TGACGG               TATCATGAAGAGGTT  75 28
 FAI41_07310 1516853 .. 1516887 +  -9.5  -3.96148   GAAAGCGAAAAAAGA    CA-GCATGCAGGATTT TATA AAATCCTGCATGAATG     TTTCTGATGCAAAAG  83 52
 FAI41_07315 1520403 .. 1520423 +  -4.8  -2.95481   AAGTGGAAAGTTTCA           TCCTTCCTG TTTA CAG-AAGGA            ATTTATAAAATCTTT  52 50
 FAI41_07320 1522016 .. 1522033 +  -3.4  -4.08767   CGCATCCCCCAAAAT             CTAGGC GGTGAG GCTTAG              TTTTCAGAGGCTGGA  57 8
 FAI41_07325 NONE
 FAI41_07330 1531228 .. 1531240 +  -4.7  -2.86722   ACTTCTCAAAATCTT                CCGGC TGA GGCGG                TGTCATAATGTCTTT  50 5
 FAI41_07335 NONE
 FAI41_07340 1534576 .. 1534586 +  -5.4  -3.55563   CAGAGAAAAAGGGAA                 GTCA AAA TGAC                 TTTAGAACATCAGAT  58 16
 FAI41_07345 1535989 .. 1536003 +  -4.2  -3.44801   TTTTCTCATTTTAGG               GCTAGA CGT TCTCGC               TAATTTTTTCTAAAG  53 71
 FAI41_07350 1536134 .. 1536153 +  -8.6  -5.77853   TTAGGAAAATTGATT            CTCTGTCT TTTT AGGCAGAG             TTTTTTTTGCCAATT 100 51
        rplM NONE
        rpsI 1540306 .. 1540331 + -13.3   -5.4492   TCAGAATTCAATCAA         TGTCAGCGGGG AATT CCTCGCTGGCA          TTTTTTGTATCTATA 100 69
 FAI41_07375 1541472 .. 1541485 +  -3.1  -3.35224   GAAGATAAGCATGGA               TGGGT AAAA ACCTA                TGTTTAAAAGCATCT  48 5
 FAI41_07380 1542728 .. 1542752 +  -4.9  -5.07107   AGCAGGTTCTTTGGT          GGCATTCCACC CTT GGTAAAGTGCC          TTTTTTCAAAATTTC  76 7
        moaA NONE
        moaC 1544403 .. 1544414 +  -2.2  -3.08977   CGTCATCAATAAGAA                GGCA ATCA TGTC                 TAATATTTTTTCAAA  42 29
 FAI41_07395 NONE
 FAI41_07400 1545250 .. 1545260 +  -2.4   -2.7185   ATCGTTTTTATTCCG                 CCTG TTA CCGG                 TGGTTAAGAGATCGT  40 8
 FAI41_07405 1545951 .. 1545965 +  -5.7  -3.74519   GCTCGCAAAAATCCT               GCTGA GTGAA TCAGC               TTTGATAAGGCTCTT  60 167
 FAI41_07425 1547907 .. 1547940 +  -8.9  -2.87243   CGGTGATGAAGTGCT     AGGTCTTTCCAGAGG ATAT CCTTTGGAAAGAACA      TCCTTATCATGATGG  69 59
 FAI41_07430 NONE
 FAI41_07435 NONE
 FAI41_07440 1550613 .. 1550624 +    -3  -3.35597   AACATGATCAAGGAA                TTCT TGCA AGAA                 TCTTTACCCGCTAGG  46 0
 FAI41_07445 1551619 .. 1551633 +  -4.3  -3.60098   GTTAATGCTGAGGCT               CCTTA AGATG TAAGG               TTTAAAATGACGAAT  55 20
 FAI41_07450 1551853 .. 1551864 +    -3  -4.64048   TACTTGGCAGGTTGG                TGAT GAAA ATCA                 TTTGTTTCTCTGATA  62 44
 FAI41_07455 1552710 .. 1552721 +    -3  -2.92792   CCCGCTTAACCCGAC                TTTC ATGG GAAA                 TGCTTTGGAGTAAGT  42 32
 FAI41_07460 1553953 .. 1553986 +    -4  -4.82901   ATTGGCCTCATTATT    GTCAG-G-GTCTGCTT GTAA AAGCAGACGTGCTGGC     TTTTTGTACGGGCAG  71 289
 FAI41_07475 NONE
        lptG 1559558 .. 1559574 +  -6.6   -3.6968   AGATCTCCACGTCCA              TATGCC CAGTA GGCATA              TTCTTCCCGTTGTAA  66 434
 FAI41_07500 NONE
 FAI41_07505 NONE
 FAI41_07510 1564729 .. 1564747 +  -9.6  -3.14132   AGAGAGATTAACTTT             CTTCTTCC TTG GGAAGAGG             TTAGTCAAGAGAAGA  75 321
 FAI41_07515 NONE
         rrf 1568026 .. 1568051 + -16.3  -4.98531   ACATCATTTAAAAAA         GCCCTTAAGGT ACTC ACCTTAAGGGC          TTTTTGCTTTCCAAG 100 49
 FAI41_07525 1569641 .. 1569663 +  -6.3  -5.55664   TTTTTGTAAAAAAAA          GCCCGTATCT GAAA AGA-GCGGGC           TTTTTTTGATGATGA  91 49
 FAI41_07535 NONE
 FAI41_07540 1572634 .. 1572658 +  -8.6  -2.88887   TTGAAAGAGGGCAAA          GAGGGAAAGT GAAAA ACCTTCCCTC          TCGATTTTATTTAAG  69 58
 FAI41_07550 NONE
 FAI41_07555 1576085 .. 1576096 +  -5.8  -4.11484   TTCGGCGGCTTCCTG                TCCC CAAT GGGA                 TTTTGAAGGGTTCGC  65 391
 FAI41_07570 1578857 .. 1578870 +  -5.9  -5.71712   TCAAAGAAGAAAAAA               GGGGC TTCG GCCTC                TTTTTTTATATAAAA  91 52
        wrbA 1579580 .. 1579593 +  -2.5  -2.71144   AAACTTATAAAATAA               TAAAA GGTT TTTTA                TGCTTGAGAACAGTC  41 26
 FAI41_07580 1581295 .. 1581312 +  -3.4  -5.25803   TTTATAAGGTGAAAG             GGAAGC AACACA GCTTTC              TTTTTTCTGGAGCTT  76 42
 FAI41_07585 1583218 .. 1583241 + -11.8  -5.29846   TTAGCAAAATGAAAA          TCCCCTTGGA AATT TCTAAGGGGA           TTTTTGTTTGACGTT 100 58
 FAI41_07595 NONE
 FAI41_07600 NONE
 FAI41_07605 1586034 .. 1586081 + -24.6  -3.81137   TCAAAACAAAGATCA GCGAAATGAAAATCCCCTTAGA AATT TCTAAGGGGATTTTTGTTTCGC TTTAAATATTTAGGA 100 233
 FAI41_07615 NONE
 FAI41_07620 1588198 .. 1588227 + -15.1  -5.05505   CTAATTATCTGGTCC       CGTCACTCTGCGA AGGC TCGCACAGTGACG        TTTTTGGTTTGTAAT 100 106
 FAI41_07625 1589722 .. 1589735 +  -3.1  -4.34402   TAAAGTTTAAAGGAA               CGTTT TCGT AAGCG                TTTTAATGTAGCAGA  59 44
        rpsP NONE
        rimM NONE
        trmD 1591574 .. 1591585 +    -3  -2.52742   CGTTCAAAAAAAGGA                TCAT TGTA ATGA                 ATATTGTAGAAGCAT  41 112
 FAI41_07645 NONE
 FAI41_07650 1593268 .. 1593289 + -14.5  -5.63645   AGAAATAAAGAAAAA           GCCGAGAGA TTTT TCTCTCGGC            TTTTTTGTCTTTTGC 100 57
 FAI41_07665 1595590 .. 1595608 + -11.8  -5.64274   ATTAAGAACAAAAAA             GACTGCTT TAA AAGCAGTC             TTTTTTTATGCGTGA 100 36
 FAI41_07675 1598777 .. 1598799 +  -2.7  -4.13767   AAGACCGGAAGAGCA           TTCATGGCA TCTTT TGCCGTAAA           TTTTGCGCTAAAAAA  55 4
 FAI41_07680 1600292 .. 1600303 +  -2.2  -5.86061   GCTAACATCAACACG                TGTC ATGG GACG                 TTTTTTTTCATCCGG  91 311
        ispH NONE
        rnhA NONE
 FAI41_07700 1602491 .. 1602505 +  -5.8  -4.00742   TAAATAGGCCATAGT               TTTCTT GAT AAGAAA               TATTTTCGTTTTTCT  67 94
 FAI41_07705 1603565 .. 1603581 +  -3.7  -3.69332   ATATTCTGTCCTCTT              GATTTCA ATT TGATATC              TTTAGACTCTTCTTC  54 151
 FAI41_07710 NONE
 FAI41_07715 NONE
 FAI41_07720 NONE
 FAI41_07725 1606147 .. 1606175 +  -3.1  -3.26262   GTGAAATACAGGGGA        GCGATGAAGCTTT TAA GAAGTCTCATCCC        ATTTTCTGAAATTTC  47 100
 FAI41_07730 1607630 .. 1607643 +  -2.4  -4.04482   TTTTATGGTCGGAAA               CAGT TACCAC ACTG                ATTTTTTTTGAGCAG  53 11
        cysK 1608981 .. 1608999 +    -3  -3.36515   CAAGAGGATCGCTCC             GGACCCAA CCA TTGCGCCC             TCTTTGAGAATAGGG  46 191
 FAI41_07750 1610940 .. 1610952 +  -4.1  -2.95538   GGATCTCTAAAGTTA                CCGTT TGA AATGG                CTATTTTATTAACGC  46 295
 FAI41_07765 1612847 .. 1612864 +  -4.8  -4.41528   AAAAACTCGCAGAAG             GGAGGC TTTTAT GTCTCC              TCTTTTTTTACCTTT  68 208
 FAI41_07775 1615134 .. 1615145 +  -2.2  -3.76952   TTCAGTGTTTTTAGA                CGTT ATTA AGCG                 TTTACATTCAATGAG  51 354
 FAI41_07785 1619348 .. 1619362 +  -2.1  -2.89793   AGAGTTATTGGAAAA               GAGAT AGAAG GTCTC               TCATTCTATAAGTGG  41 19
 FAI41_07790 1620817 .. 1620828 +  -4.4  -3.85389   ATAAATCTTTTCCCA                GAAG GCCT CTTC                 TTTCCCTTCTTCAAG  58 343
        hemA NONE
 FAI41_07835 NONE
 FAI41_07840 1633504 .. 1633532 +  -8.1  -4.80882   GGCATATATTCCCGA        TATGCCGCTTTCC ATT GGAGAGCGGTAAG        TTTTTCCTCTAAAAT  95 87
 FAI41_07885 NONE
 FAI41_07890 NONE
 FAI41_07895 NONE
 FAI41_07900 NONE
 FAI41_07905 NONE
 FAI41_07910 NONE
 FAI41_07915 1651219 .. 1651243 + -15.9  -5.50499   AATGAAAACGAAAAA          GGGCTTTTGAA TTT TTCAAAAGCCC          TTTTTTTAAATATCA 100 52
 FAI41_07945 NONE
 FAI41_07950 NONE
        hemN 1661412 .. 1661427 +  -6.2  -2.73771   ATCTTTATCATTGGC              TTTCTC TCGT GAGAAA               ATTTAAGCAGTGTCA  54 66
 FAI41_07960 NONE
 FAI41_07965 1662831 .. 1662851 +    -9  -5.40474   GTAAATTAAGAAAAA            GCGCCTTA CTTTA TAGGGCGC            TTTTTTTAAAAAGAT 100 37
 FAI41_07970 NONE
 FAI41_07975 1665348 .. 1665367 +  -2.8  -3.68036   GCATAGCGTCCGGCC            GCTTGGAG GGCA TTCTGAGC             TCTTTTCGGATCATT  50 162
 FAI41_08010 1669760 .. 1669774 +  -2.8  -2.73875   TCACTTCCAGCGGCT               TTAGGT GTA ACCAAA               TAATCTTAGAAAACA  41 8
 FAI41_08015 NONE
 FAI41_08020 NONE
 FAI41_08025 NONE
 FAI41_08030 1673502 .. 1673512 +    -4  -3.63694   AGGAATATAGTTCTT                 GAAA TTT TTTC                 TTATTGGCCGTACCT  52 110
 FAI41_08035 1673761 .. 1673792 + -14.6  -5.61913   TGATAAGATAAAAAA      CCCTGATTCTTAGA GAGA TCTGAGAGTCAGGG       TTTTTTATGTTTGTT 100 54
 FAI41_08065 NONE
 FAI41_08070 NONE
 FAI41_08075 1682332 .. 1682358 +    -6  -4.83169   TGTTGGTGAGGGATC         TCATTAACTTTA ATA TAAAGTTGCTGA         TTTTTGTGACCCGGT  78 19
 FAI41_08080 NONE
 FAI41_08085 NONE
 FAI41_08090 NONE
 FAI41_08095 NONE
 FAI41_08100 1686280 .. 1686295 + -10.4  -4.91712   GATTTTATAAAAAAA              GCCCCT AAAA AGGGGC               TTTTTATGGCTTAAA 100 18
 FAI41_08135 1695060 .. 1695081 + -10.9  -3.68359   AAAATAAAAGAAGTG           GGATGACCT TAAG GGGTCATCC            TTCTCCTTTTCCAAG  88 34
 FAI41_08150 1698503 .. 1698519 +  -2.3  -5.65496   TGAAATTTCAGAAAG              AGAAAAA TAA TTTTTCA              TTTTTCTTTTTCATA  80 16
 FAI41_08155 NONE
         eda 1701344 .. 1701375 +  -7.3  -2.97636   TCTAAAAAGGCTTTG      GCGGTCAT-GGGGC TTTCC GCTCTTATGGCCGC      TGGTCTTCTTTTTGA  62 82
 FAI41_08165 NONE
 FAI41_08170 1702556 .. 1702571 +  -4.7  -5.36441   GGTTCTCCGTCAGGA              CCTCT TGCTAT AGAGG               TTTTTTGTGTCGGAC  84 48
 FAI41_08200 1706602 .. 1706612 +    -4  -4.71426   ATTTAGAAAGATGTT                 TCAT ATC ATGA                 TTTTATTCGTGACGA  69 477
        secA 1713986 .. 1713998 +  -3.3  -3.05463   GCGAAATATAAGCAT                TGCTG TGG CCGCA                TTGCGTAAAGAAAGT  45 5
 FAI41_08235 NONE
        ruvC NONE
        ruvA NONE
        ruvB 1716961 .. 1716974 +  -3.7  -4.00042   TTTAGGCATTATTCC               GCCAC AAAG GGGGC                TTATTTAATGGAAAC  56 4
 FAI41_08255 1717529 .. 1717542 +  -5.9  -4.68539   GCGGTTTTGGGTTCA               GGCGG TTTA TCGCC                TTTTGTACTTTTCAT  76 96
        tolQ NONE
        tolR NONE
 FAI41_08270 NONE
        tolB 1721187 .. 1721199 +  -7.7   -4.3739   CGGCTTGACAGATAA                GGCTT CAA AAGCC                TTTTATGGGGAGGTG  82 94
         pal 1721789 .. 1721802 +  -3.8  -3.56687   GTCTGCAAACAGAAA               CGCT ATCACA AGCG                TTCGTTAATTTTATT  52 4
 FAI41_08285 1722817 .. 1722848 +  -8.8  -3.21726   GGCTAATGGATTGAT      TTGTTGGGCGCTTT TTAA AGGGTGCCCAATAA       TTGAATGTTCTAAAA  71 35
        tilS 1724193 .. 1724229 + -11.1  -2.67441   ATGTTGTGATTAGCG    TTTCTAATAAGGCGATG GTT TGTCACCTTATTAGAAA    TAATATGCTGGATTG  78 48
 FAI41_08300 NONE
 FAI41_08305 NONE
         tkt 1730438 .. 1730457 +  -2.2  -3.24709   TGTTAAACTAATCCC            GAAAAACA AGAT TATTTTTC             TTCCTACATATTTTA  43 67
 FAI41_08315 NONE
         gnd 1733323 .. 1733349 +  -2.2  -3.17622   CGATGTTGGTGAGGC         TGCGAAATAGGT TCA GCCTTTATTGCA         TATATTATAGAAGTG  43 16
         pgl NONE
        rpiA 1734800 .. 1734811 +  -4.4  -3.28712   ATTTTTCAGTAAAAT                GAGA TCAC TCTC                 TTCTGAAAAAAGAGG  51 24
 FAI41_08335 NONE
 FAI41_08340 1736680 .. 1736710 + -13.5  -5.45802   AAATAGATAGAAAAA      GGAGGCTT-ACTTC AGTT GAAGTTAAGCCTCC       TTTTTATTTTGGGAA 100 61
        polA NONE
 FAI41_08380 1745546 .. 1745561 +  -4.6  -5.27335   TGCGCTGTTTGCTCG              GAAGGC TTCT GCCGTC               TTTTTCTTTGAGAAG  80 460
 FAI41_08390 1749041 .. 1749053 +  -2.6  -5.33785   TCGCTCCTAAAGGCT                GGCG TGAGC CGTC                TTTTTTGTGCTACTT  74 113
 FAI41_08395 NONE
 FAI41_08400 NONE
 FAI41_08405 1751655 .. 1751670 +  -7.6  -3.12992   CAAAACGTTAAAAAA              GCTTCT TTTG AGAAGC               GTTATTTGTGTCTTT  66 30
        mrdA 1753751 .. 1753761 +  -5.4  -5.03145   TCTGGCGGGTCGGTT                 CTGA GAT TCAG                 TTTTTTCAGCGCTTG  78 176
        rodA 1754988 .. 1755021 + -15.6  -4.98522   TTTAAGGATTAAAAA     GAAAGGCCTTTTAT ACAAAA ATAAAAGGCCTTTC      TTTTTGTATCAGCTT 100 160
 FAI41_08430 1758911 .. 1758952 +  -5.8  -4.44355   TAAGGTCTAACTTGT CAAAAGCGAATGAGACGC TATGGT GCTTCTCATTCGCTAAAG  TTATTTTTAGAGTTA  73 54
        aspS 1760831 .. 1760853 +   -15  -5.25803   AATAAAACTAAAAAA           GCCTCTCTAA AAT TTAGAGAGGC           TTTTTTATAAGCGTT 100 36
 FAI41_08455 NONE
 FAI41_08460 NONE
 FAI41_08465 NONE
        tatC NONE
        serS 1768427 .. 1768446 +  -7.8  -5.11613   AGGTACAGGAAAAAA            GGGGCTGA AAAA TTGGCCCC             TTTTTTACGTCATAT  93 44
 FAI41_08500 NONE
        gorA NONE
 FAI41_08510 1776607 .. 1776624 +  -8.3  -2.62616   TTTCCAAATTCAACA             GCCTGCG CTTT CGCCGGC              TGATCTAAAAGATGA  63 357
 FAI41_08520 1778077 .. 1778089 +  -3.4  -4.14739   AAAAAAGTAAAAATT                GGAA GAGAA TTCC                TTTTAAGGTAAATAG  57 2
 FAI41_08525 NONE
 FAI41_08530 NONE
 FAI41_08535 1780386 .. 1780404 +  -2.5  -2.92293   TGTTATGTAAAGGCA            TGGAAGTC TATT GA-TTCCA             TATAGTGTTAAAATT  42 31
 FAI41_08540 NONE
 FAI41_08545 1781190 .. 1781223 +  -5.9  -5.11389   ACTGAAAATCGGAGA     GCGCAGGGCGACGTA AAAT TACGCTTTTCTGCGC      TTTTCTTTCTCTTCT  83 36
 FAI41_08560 1784919 .. 1784936 + -11.3  -4.98531   TAGTTCATAAAAAAA             GGCAGCT TTTA AGCTGCC              TTTTTCGTTTAAAGA 100 46
        rpsD 1787065 .. 1787102 + -10.7  -3.75832   TTTCGGATTATTTTT   TGGAAAAGGCCTGCC GTATTATG GGCAGGTCTTTTTCG    TTTAAATATAGTTTT  86 42
 FAI41_08575 1788900 .. 1788914 +   -10  -4.00411   CTTGTGAGGATGAGA               GGGGAA AGA TTCCCC               TTATTTAAGGTTTTA  82 215
 FAI41_08595 NONE
 FAI41_08600 1794419 .. 1794429 +    -4  -3.53012   GTAAAAAGAGACAGA                 TTGT CTG ACAA                 TTTAGAACAAGAGCA  52 67
 FAI41_08605 1795881 .. 1795910 +  -6.3  -5.28826   AAAGGCTATTTTCAA       TGGGTCGGCTACC TTGC GGCAGCCAAGCCA        TTTTTTCTGCCATTT  87 406
        yajC 1797186 .. 1797209 + -13.2   -3.9344   ATGAGATAAGAAAAA          GGCCTGCTTT ATAA AAGGCAGGCC           TTTCGTATTGGGATT 100 62
 FAI41_08630 1798467 .. 1798482 +  -3.3  -4.58395   ATCTGGGGACGATAA              CGAAT TTTAAT ATTCG               TTTTTAACAAATAGA  64 16
 FAI41_08635 NONE
 FAI41_08640 NONE
 FAI41_08645 NONE
        lepB NONE
         rnc NONE
 FAI41_08660 1803710 .. 1803739 +  -2.3    -3.551   GATAATAGATGATTG       GATGCTTTTTT-TA AGA TATAAAAAGGCAAC       TTATCTGGCTTGACA  47 53
 FAI41_08665 NONE
 FAI41_08670 NONE
        uppS NONE
 FAI41_08680 NONE
 FAI41_08685 NONE
        rseP 1809064 .. 1809093 +  -7.2  -4.33708   CCAGAGGATATTTGC       TCGTAGCGCTTG CTTATT TAAGCGCTATGG        TTTTACTCATCCTTT  75 178
        bamA NONE
 FAI41_08700 NONE
        lpxD 1813634 .. 1813646 +  -3.5  -4.41348   GAGAAAAGTAAAGTA                TAAAA TAT TTTTA                TTTATTTGGGCAAAG  62 23
        fabZ 1814192 .. 1814233 +  -3.2  -5.19998   AGTGCTATGATTTTG GATCCG-CCAGAGAAATAA TTTCT TTATTTTTCTGTTCCGATC TTTTCTTTTAATTCT  73 8
        lpxA NONE
 FAI41_08720 NONE
 FAI41_08725 NONE
        rnpA NONE
        yidD 1816688 .. 1816704 +  -8.7  -2.91507   CATCCGTGGCATCCA              GGTGGAT TTG ATCCGCC              TGTCTGAAGTGTATT  69 2
        yidC 1818939 .. 1818956 +  -4.2  -3.06815   GTCAAAGAAGATTGG             CAGAAA ACAATG TTTCTG              TATCTTCAAGGGCGT  50 411
        argB NONE
        dapD NONE
        dapE NONE
 FAI41_08765 1822672 .. 1822684 +  -7.7  -3.39471   TGTTAGCAGAGGCTG                CAGCA ATT TGCTG                TTGGTTGAAGTTTGT  65 192
 FAI41_08820 NONE
 FAI41_08825 NONE
        uvrB NONE
        greB NONE
        gshB 1837308 .. 1837321 +  -5.3  -4.59027   TTATGCTCCTTAGAA               TCCTT TGAT AAGGA                TTTTCTGTCATGCTT  73 102
 FAI41_08845 1838288 .. 1838312 + -14.3  -5.61881   ATCCTGATAAAAAAA          GAGCCCCTCAA AAT TGGAGGGGCTC          TTTTTATTTTTAAAG 100 34
        hemC NONE
 FAI41_08885 1850746 .. 1850759 +  -3.7  -3.84389   GGATGCAAAACAACT               GGCGG AAAG CCACC                TTCTCTTGTTGCATC  55 174
 FAI41_08895 NONE
 FAI41_08900 1852720 .. 1852730 +  -2.6  -2.52896   TTTCTTAGTCGCTTA                 TTTT AAA AAAA                 TCGGTTAAAAAATAC  41 51
 FAI41_08905 NONE
 FAI41_08910 NONE
 FAI41_08915 1855872 .. 1855883 +  -2.2  -3.67775   AACAGCTTCTTGATT                TGCA CGGC TGCG                 TTCTTAGGTAGAAGT  49 50
 FAI41_08920 1856303 .. 1856313 +  -6.8   -4.0098   CCCCATAAATAGATA                 GGGA ATT TCCC                 TTATTTAAGTTAAAG  70 50
        groL 1858036 .. 1858061 + -11.9  -5.24989   TCGTTTTATAAAAAA         GAGTCTCTTCC GATC GGGAGAGGCTC          TTTTTTACTATATGG 100 59
 FAI41_08935 NONE
 FAI41_08940 1864645 .. 1864662 +  -3.5  -3.87869   GACGTATTTTTTTAA             TATTTCT CTTT GGAAATA              TTTCTGGACGCTTGA  55 56
 FAI41_08945 1865531 .. 1865570 +   -19  -4.55697   TTAAATGAAAAAGAG  TTATAAAAAAGCTCCCTT TTTA AAGGGAGCTTTTTTATGA   TTTATTTATGGGGGT 100 44
 FAI41_08960 NONE
 FAI41_08965 NONE
 FAI41_08970 NONE
 FAI41_08975 1870885 .. 1870899 +  -7.1  -2.87931   AGATGAGCTCATTAC               GGAGC CATAA GCTCC               TGTATCAAGAATAGC  59 168
        guaA NONE
 FAI41_09005 1875441 .. 1875463 +  -2.1  -5.03145   AAAAACAGAATCATA           CAAAACATT TTAGC AATGTTTTC           TTTTTTGAAGGATTA  66 59
         pyk 1876902 .. 1876950 + -14.2  -2.79183   TCATTTCATAATTGA TTTTAAAGAGCTCGCGGCGGAAA TTAT TTTCC-CCGCGAGTTTTTTATAA TCTCATGCCCCTCCC 100 42
 FAI41_09020 NONE
 FAI41_09025 1880251 .. 1880263 +  -6.3  -2.82471   CACCAGCGTACTTAT                GATGA AAA TCATC                CTTCTTAACCTTTGT  55 5
 FAI41_09030 NONE
 FAI41_09035 NONE
         shc NONE
 FAI41_09045 1886008 .. 1886023 +  -5.4  -5.08824   GTTTCTGAGTATTTG              CGAGAG ATTC CTCTTG               TTTTTTGACTGGAAA  81 33
        rpsB 1886940 .. 1886951 +  -2.2  -5.33405   GAAAAAGAAGAAGCC                GCTT CTTA AGGC                 TTTTTCTTTCATAGA  73 17
 FAI41_09055 1887952 .. 1887975 + -10.4  -5.62045   TAAGATCCTAAAAAA          TCCTTTGTCA TATT TGGCAAAGGA           TTTTTTATTATCTAT 100 61
        recO NONE
        parC NONE
         cls 1892726 .. 1892741 +  -4.8  -3.14344   GTGTGGGCCGACTTC              CTTAAA GCCC TTTAAG               TTAATACGGCCAATA  52 198
 FAI41_09085 NONE
 FAI41_09090 NONE
        smpB 1896988 .. 1897005 + -11.3  -4.88918   AAGAGCATAAAAAAA             GGAGGCA AGAA TGCCTCC              TTTTCTTTACAATCA 100 41
         mfd 1903645 .. 1903663 + -11.8  -3.02263   GCTTTCAGTAAAAGA             GTAAGGCT TAA AGCCTTAC             TCTTGACGACGATAT  83 22
 FAI41_09120 1904869 .. 1904882 +  -3.1  -5.40072   AATATTGAATATGAA               GGATA AATT TGTCC                TTTTTTTGCAGAAGA  76 346
 FAI41_09130 NONE
 FAI41_09135 1909459 .. 1909480 + -13.1  -4.12942   GAAAGAGTCAAAAAA           CTCATTGCC TGAT GGCAATGAG            TTTTAAGAAGTTTAG 100 14
 FAI41_09145 1912170 .. 1912207 +  -4.8  -4.86033   TTACGCTCCATCTTA  CGAGCACGACGAA-CGGC TTCT GCTGATTCG-CGGGCACG   TTTTTCTGAAGGTTT  75 127
 FAI41_09160 1913806 .. 1913832 +  -4.6  -4.15222   CCAAGTGAATTTTTG         TATAGTATTTTA AGC TAAAAGACTGTA         TTTATTCAGCGGAGT  61 33
 FAI41_09165 1914210 .. 1914220 +  -3.2  -3.68962   TAAAAGGTGCTGTTC                 GGGT TTA ATCC                 TTATAGTTTCTTGAC  52 18
        plsX NONE
 FAI41_09175 1916362 .. 1916385 +  -6.2  -3.60074   ACTTGGGGAGCTGTT          CTGTTAAGGAT ATA AT-CTTAACAG          TTTAAGAAATTTATA  61 11
 FAI41_09180 NONE
 FAI41_09185 1916990 .. 1917019 + -15.3  -6.15259   ATCCCGCCTGCCCGA       CCACTTAAAAGAA AATT TTCTTTTAAGTGG        TTTTTTTTTGCCTTC 100 23
 FAI41_09195 1918651 .. 1918663 +  -2.7  -4.37092   CGGACGTTGCTGTTG                CTTAG GTT TTAAG                TTTTATAGAAAAAGT  60 21
        fusA 1920924 .. 1920942 + -13.2  -5.46657   GGGAATGATAGAAAA             GGAAGCTC ATT GAGCTTCC             TTTTTTGTTACCATG 100 64
 FAI41_09215 1923547 .. 1923565 + -13.2  -4.99435   GGGGTGGGGGTTTTG             CGCGCTTT TTT AAAGCGCG             TTTTTCGTTCTTCGA   0 57
        ubiE NONE
       coaBC 1920924 .. 1920942 - -13.2    -4.614   GGGAATGATAGAAAA             GGAAGCTC ATT GAGCTTCC             TTTTTTGTTACCATG 100 82
 FAI41_09190 1916846 .. 1916858 -  -2.7  -3.59649   AAATAATCTTCTAAA                TTCCT TAA AGAAA                CTAGGGGAAACTATT  50 206
 FAI41_09155 1912519 .. 1912534 -  -4.8  -5.03284   AAAAAAACAAATAAA              GAAATA AAAA TATTTC               TTGTAATTTTATAGG  76 34
        rpsU 1911882 .. 1911892 -    -4  -4.05708   AACAGATAAAAAAAT                 TCAA TTT TTGA                 GAGCAGGGGAAATTA  59 263
        trxB 1909459 .. 1909480 - -13.1  -5.18561   GAAAGAGTCAAAAAA           CTCATTGCC TGAT GGCAATGAG            TTTTAAGAAGTTTAG 100 65
 FAI41_09125 1904634 .. 1904662 -  -3.3  -5.55855   TTCAAAAAAAGAAAA       CCCCATTCTACTT TATTG AAGTAG--TGGGG       TTTTGAATGTTTTCT  79 55
 FAI41_09115 1903643 .. 1903665 -   -15  -4.25848   AAGCTTTCAGTAAAA           GAGTAAGGCT TAA AGCCTTACTC           TTGACGACGATATCC 100 20
 FAI41_09105 1897930 .. 1897947 -  -4.9  -4.84359   GTATTTGCATAAAAA             GTG-GCTT AAA AAGCGCAC             ATTTTTTTTGAAAGG  74 45
 FAI41_09100 1896988 .. 1897005 - -11.3  -5.70829   AAGAGCATAAAAAAA             GGAGGCA AGAA TGCCTCC              TTTTCTTTACAATCA 100 49
 FAI41_09080 NONE
 FAI41_09075 1892195 .. 1892211 -  -3.1  -3.05844   GTGCGGAGGTGAATA              TTATTTT TCC AAAACAA              AGCAATCATCATTTT  45 372
 FAI41_09015 1876912 .. 1876940 -   -14  -2.62792   ATTGATTTTAAAGAG       CTCGCGGCGGAAA TTAT TTTCC-CCGCGAG        TTTTTTATAATCTCA  93 10
 FAI41_08995 NONE
 FAI41_08990 NONE
 FAI41_08985 1872105 .. 1872116 -    -3  -4.59376   ATTAGGAAAGTAAAA                TCTT TCGA AAGA                 TCATTATGTTTTATT  62 52
        lysA 1870245 .. 1870258 -  -2.4  -4.62904   AAATATCTGCAAAAA               GAAG CAAATC CTTC                TAAGCATCAAGCCAT  64 517
 FAI41_08955 1865943 .. 1865959 -  -6.7  -3.03798   ATTCGGATAAACAAG              TAGATAA ACA TTATCTA              TGTTTAAGGCTTTTT  60 125
 FAI41_08950 1865530 .. 1865571 - -13.3  -4.12375   ATTAAATGAAAAAGA GTTATAAAAAAGCTCCCTT TTTA AAGGGAGCTTTTTTATGAT  TTATTTATGGGGGTT 100 26
 FAI41_08930 1858036 .. 1858061 -  -7.5  -5.24129   TCGTTTTATAAAAAA         GAGTCTCTTCC GATC GGGAGAGGCTC          TTTTTTACTATATGG  93 33
        secB 1850204 .. 1850217 -  -3.9  -5.54079   CGAAAAACTAAAAAA               TCTTT ACGA AAAGA                TGGGATGTACAGCCA  88 469
        tsaD NONE
 FAI41_08870 NONE
        murJ 1844934 .. 1844947 -  -2.4  -2.62616   TCATCTGGGAGATCA               CTTC TATTAG GAAG                AATGTTTTGTTTTAC  40 18
        mutS NONE
 FAI41_08855 NONE
 FAI41_08850 1838288 .. 1838312 - -14.3  -5.61596   ATCCTGATAAAAAAA          GAGCCCCTCAA AAT TGGAGGGGCTC          TTTTTATTTTTAAAG 100 35
 FAI41_08815 1830142 .. 1830161 -  -3.6  -3.34517   ATTCTGTTTGAAATA            TCGTCTTT CGCA AAAGACTA             TGGTGCCCAGAAGAA  50 26
 FAI41_08810 NONE
 FAI41_08805 NONE
 FAI41_08800 NONE
 FAI41_08795 NONE
        lptB 1826245 .. 1826259 -  -4.2  -2.93929   AAAAGAGACATTATA               GCGAGA AGT TTTCGC               CGAGATAGACTCGTC  50 6
 FAI41_08785 NONE
 FAI41_08780 NONE
        truA 1823916 .. 1823926 -  -2.6  -5.22289   GATTAAAGAGAAAAA                 TTTT AGG AAAA                 AAGATTTTCTTTATA  70 17
 FAI41_08770 1822052 .. 1822062 -  -5.4  -3.25204   TTATTTCTAAATATA                 TGCA GGT TGCA                 GAGCTTGGATTAGTG  54 465
 FAI41_08625 1797186 .. 1797209 -   -11  -5.25699   ATGAGATAAGAAAAA          GGCCTGCTTT ATAA AAGGCAGGCC           TTTCGTATTGGGATT 100 39
        mutT NONE
 FAI41_08610 1795503 .. 1795521 -  -3.2  -4.09511   AAGAGCTCTCTAAAA             GAGTTT ACACTTG AAACTC             TCCTTGTTGTGGAAT  57 11
        alaS NONE
 FAI41_08585 NONE
 FAI41_08580 NONE
 FAI41_08565 1784919 .. 1784936 - -11.3    -5.626   TAGTTCATAAAAAAA             GGCAGCT TTTA AGCTGCC              TTTTTCGTTTAAAGA 100 50
 FAI41_08555 NONE
 FAI41_08550 1780744 .. 1780759 -  -3.3  -3.48807   TGAGGAAAGCTATAA              GAATG ATAAAG CATTC               CAAGCGCATGTTTCT  50 474
 FAI41_08515 1776117 .. 1776133 -  -6.5  -2.60977   GCGCAAAAAACAATT              GCCGC CTCCCGT GCGGC              TGTGATCTATGCCGG  53 180
 FAI41_08495 1770249 .. 1770259 -  -3.2   -4.2349   TCTGGACATTTAAAA                 CCTC ATA GAGA                 AAGATGGATAATTTT  59 84
 FAI41_08490 1769590 .. 1769600 -  -2.6  -3.95674   AAAATTCTGAAAGAA                 TAAT TTC ATTA                 TAATGAGATTCCTGC  52 209
 FAI41_08485 NONE
 FAI41_08480 1768427 .. 1768446 -  -3.5  -5.22312   AGGTACAGGAAAAAA            GGGGC TGAAAAATTG GCCCC             TTTTTTACGTCATAT  73 40
 FAI41_08450 NONE
         xth NONE
 FAI41_08440 1760831 .. 1760853 -   -15  -5.52347   AATAAAACTAAAAAA           GCCTCTCTAA AAT TTAGAGAGGC           TTTTTTATAAGCGTT 100 129
 FAI41_08425 NONE
 FAI41_08420 1754988 .. 1755021 - -15.6  -4.81083   TTTAAGGATTAAAAA     GAAAGGCCTTTTAT ACAAAA ATAAAAGGCCTTTC      TTTTTGTATCAGCTT 100 51
 FAI41_08385 1745059 .. 1745113 - -14.7  -3.50746   CCCCTAAAAAGAAAG TGCTAAAACAAA-AAGGGCTGCCATT GGAA AATGGCAACCCTCGTTTGCTTTAGAA GAATAGGATTATTTG 100 34
 FAI41_08370 NONE
        thiM NONE
        thiE NONE
        thiD NONE
 FAI41_08350 NONE
 FAI41_08345 1736680 .. 1736710 - -13.5   -5.1104   AAATAGATAGAAAAA      GGAGGCTT-ACTTC AGTT GAAGTTAAGCCTCC       TTTTTATTTTGGGAA 100 57
 FAI41_08295 1724230 .. 1724251 -    -6   -3.9712   TCACCTTATTAGAAA           TAATATGC TGGATT GCATATTA            GTGTTGATCAAAAAA  65 136
 FAI41_08225 NONE
        argJ 1708727 .. 1708739 -  -3.4  -3.72989   AAATTTACACTGAAA                GGAA TATTC TTCC                ATCGAATTTCGTTGC  52 48
 FAI41_08215 1707429 .. 1707443 -  -2.9  -3.43492   TTAGACCTAGGACAA               TTTCT TTTTT AGAAA               TTTCTTTACAACAAA  46 2
 FAI41_08210 NONE
 FAI41_08205 NONE
 FAI41_08195 NONE
 FAI41_08190 NONE
 FAI41_08185 1703787 .. 1703800 -  -2.4  -3.77196   TTATTATCTATCAAA               TAGC GCTATG GCTA                ATTCAGAACAAGCTT  49 0
 FAI41_08180 NONE
 FAI41_08175 1702360 .. 1702383 -  -5.4  -3.53012   GGGTCTTCGGTGAAA          TTTATCCTTT CCGA AACGGATAAA           CGTCCTGCCGCTGCA  57 176
 FAI41_08145 NONE
 FAI41_08140 1695054 .. 1695087 -  -7.4  -5.13343   TAATGGAAAATAAAA     GAAGTGGGATGACC TTAAGG GGTCATCCTTCTCC      TTTTCCAAGGGATTG  90 14
 FAI41_08130 1692780 .. 1692815 -  -5.4  -3.14991   GATAAAGCGGAAAAG    CCGACAAAGTGGGATT TAGT AATACCAGCTTGGCGG     AGTTGAGCGCTTATC  55 5
 FAI41_08125 NONE
        queA NONE
         tgt NONE
 FAI41_08110 NONE
 FAI41_08105 1686280 .. 1686295 - -10.4    -5.626   GATTTTATAAAAAAA              GCCCCT AAAA AGGGGC               TTTTTATGGCTTAAA 100 51
 FAI41_08060 NONE
 FAI41_08055 NONE
 FAI41_08050 NONE
 FAI41_08045 1675002 .. 1675019 -  -2.8  -4.95843   AGATAAAATAGAAAA             CAAATT TTATAT AATTTG              TTCCACGCTAGAATG  68 33
 FAI41_08040 1673761 .. 1673792 - -10.2   -5.5208   TGATAAGATAAAAAA      CCCTGATTCTTAGA GAGA TCTGAGAGTCAGGG       TTTTTTATGTTTGTT 100 110
 FAI41_08005 NONE
 FAI41_08000 NONE
 FAI41_07995 1667287 .. 1667310 -    -6  -3.03007   AAGAGTTTCGCAATA          TCTTAGCGCT TCAT ACCGCCAAGA           ATTAGGGTGGAAAAA  56 4
 FAI41_07990 NONE
 FAI41_07985 NONE
 FAI41_07980 NONE
        ispF NONE
 FAI41_07935 NONE
 FAI41_07930 NONE
 FAI41_07925 1654278 .. 1654289 -    -3  -2.51133   GAGTCATTTAGGAAG                CTTT TTTG AAAG                 ATGAATAGTGGAACT  41 6
 FAI41_07920 1651219 .. 1651243 - -15.9  -5.13016   AATGAAAACGAAAAA          GGGCTTTTGAA TTT TTCAAAAGCCC          TTTTTTTAAATATCA 100 31
 FAI41_07880 NONE
 FAI41_07875 NONE
        ccmE NONE
 FAI41_07865 NONE
 FAI41_07860 NONE
 FAI41_07855 NONE
 FAI41_07850 NONE
 FAI41_07845 1633440 .. 1633462 -  -9.2  -5.93252   CCTAAAAAGAAAAAA           TAAAGGGCAA GTT CTGCCCCTTA           TTTGTTTCGTTCTTA 100 45
 FAI41_07825 1629131 .. 1629142 -  -4.4  -4.02707   TAAAGAGGGAAATAA                TCCT CTAG AGGA                 AAGACTACACAAAAA  61 79
 FAI41_07820 1625892 .. 1625924 -  -2.7  -2.73203   AAAAGAAAAAATGAT      GCACCGATAAAGC CTTGATC GCCTTATCGGTTT      TTTTGTGCTTCCCTT  41 42
 FAI41_07815 NONE
 FAI41_07810 1623593 .. 1623622 -  -5.7  -2.86475   CAATGGTATAGGACA       CGATTCAGAGGGTA GAT TTCCCTC-GACTCG       CTAGATGTTCAAGGA  52 0
 FAI41_07805 1623187 .. 1623221 -  -2.1  -4.22948   AAAATTGATCGAAAA    GGAGCGCTCA-TGGCC TGCA AGCGAATAAGCGTTCC     TTTTGTGGTTTTCTG  56 77
 FAI41_07800 1621694 .. 1621716 -  -9.2  -3.60792   GCTGTAAGGTGTAAA           TACGGTGCAA AAT TTGTACCGTA           TAAAGGGAGTGATGC  78 130
 FAI41_07795 1620288 .. 1620299 -    -3  -4.43012   AGGCCAATACCAAAA                TTTC TAAA GAAA                 CGGAGTATGTACTTT  60 513
 FAI41_07780 1614539 .. 1614562 -  -3.2  -4.57073   GAGTGCGGTGAAAAA          CTCAATTATG AAAG CATATTTGAA           GTCGCTCTTGAAGAG  64 318
 FAI41_07760 NONE
 FAI41_07755 1610621 .. 1610637 -  -5.1  -2.62983   CTCAGCGGGAGAGCA              CTACCTT GAC ATGGTAG              GGGTCACAGGTTCAA  48 204
 FAI41_07745 1609644 .. 1609657 -  -5.3  -3.09415   TATAAAGCAGACAGA               GACTT CTTC AAGTC                AAAGAAGCACAAGCT  53 112
        cysE 1608626 .. 1608653 -  -2.8  -3.56378   TGTCAAAACAGAAGA        TGCACTCAAAACA GCA CGTT-TGATTGCA        CGTACAGAGGGAATT  48 200
 FAI41_07685 1599617 .. 1599635 -  -2.4  -3.79687   ATTTGGCAGAAAACA             TTGACG TATTTAT CGCCAA             GCACGCTCTTCGGCC  51 361
 FAI41_07670 1595590 .. 1595608 - -11.8  -5.66229   ATTAAGAACAAAAAA             GACTGCTT TAA AAGCAGTC             TTTTTTTATGCGTGA 100 43
 FAI41_07660 1594104 .. 1594114 -  -5.4   -3.3158   CAAAAAAGGCAGGAA                 TCTC AAA GAGA                 ATTTTTTCGTAACAT  57 17
 FAI41_07655 1593268 .. 1593289 - -14.5  -5.56573   AGAAATAAAGAAAAA           GCCGAGAGA TTTT TCTCTCGGC            TTTTTTGTCTTTTGC 100 52
 FAI41_07610 1586029 .. 1586085 -    -9  -4.75288   TTATATCAAAACAAA GATCAGCGAAATGAAAATCCCCTTAGA AATT TCTAAGGGGATTTTTGTTTCGCTT-TA AATATTTAGGAAGAG 100 200
 FAI41_07590 1583218 .. 1583241 -  -9.6  -4.70319   TTAGCAAAATGAAAA          TCCCCTTGGA AATT TCTAAGGGGA           TTTTTGTTTGACGTT  91 47
 FAI41_07565 1576781 .. 1576792 -  -7.2  -3.43919   GGTAAATTTTAAACA                GGCG GTTG CGCC                 ATAAAAAGTTTAGCG  65 7
        fghA 1575415 .. 1575430 -  -3.2  -4.09511   AATATGCGGTCAAAA              TGAGCC AAAT GTCTCA               GGAAGAGCGCCGTCA  57 374
 FAI41_07545 1572634 .. 1572658 - -10.8    -3.695   TTGAAAGAGGGCAAA          GAGGGAAAGT GAAAA ACCTTCCCTC          TCGATTTTATTTAAG  88 36
 FAI41_07495 1560810 .. 1560822 -  -3.4   -2.8474   CTGCACTGAGAATTA                TTCC GCTGA GGAA                TTTTCTTTAATGAAG  44 10
 FAI41_07490 NONE
 FAI41_07485 1558828 .. 1558838 -  -5.4  -2.63102   AGCACTGGTACAGCA                 CATC ATT GATG                 GGCGTTTAAAGGGAG  50 354
 FAI41_07470 1555611 .. 1555630 -  -2.2    -3.885   ATTTTGAGAGAAGAA            TATGCT GAGTTTAG AGCATA             TGAGATTATAAAAGG  51 31
 FAI41_07465 1553436 .. 1553454 -    -6  -4.56597   CTTTGGGTGGAAAAA             TGCTCTTT GTG AATGAGCA             GTTGACAGATGCTGT  76 269
 FAI41_07420 NONE
 FAI41_07415 NONE
 FAI41_07410 1545376 .. 1545419 -  -9.6  -3.11445   AAAAATGGGCAAAAG CCCTTCAAAAGC-CGGAGGCC GGT GGCTACTGCGCTTTTGAAGGA TGGGTAAGAAATCAT  71 460
 FAI41_07360 NONE
 FAI41_07355 1535949 .. 1535990 -  -2.3  -3.33489   GAAAAAATAAAGAAT GCCCCAAAATGCTTTAAAA TGTA TTTTTTCTCATTTTAGGGC  TAGACGTTCTCGCTA  45 132
 FAI41_07275 1503880 .. 1503894 -  -2.8  -3.02144   CGATTTTTTTGAAGA               GAAATG TTT CATATC               GTCTCGTTTATTGAT  43 47
 FAI41_07270 1501306 .. 1501323 - -11.3   -4.4267   TTTGAAAATGGAAAA             GCCTCCT GGTC AGGAGGC              TTTTTTTATGTGTCA  95 44
 FAI41_07260 1499308 .. 1499333 -  -8.9  -4.57073   GATTCCTTTTAAAAA         TCCCCCAACTC AAAG GAGGAGGGGGA          TTTTCTTAAAAAGCG  90 85
 FAI41_07255 NONE
        thrS 1496327 .. 1496343 -  -3.7  -2.99057   TCTTAAATATAATCA              TGAACCA AGT TGGTTTA              CAGGGGAAGCTTTAA  47 37
 FAI41_07245 1495625 .. 1495659 - -15.1  -3.09844   CTCAGATTCTAAAAG    GGGAGCGCCCAGCCTC TTAA GAGG-TGAACGCTCCC     ATCTTGAAAATGAGA 100 49
 FAI41_07225 NONE
 FAI41_07220 NONE
 FAI41_07215 1488586 .. 1488619 - -15.5  -4.67607   TTCTGAATAAAGAAA     TAAAGGCAGGCTG AAAAAACG CAGCCTGCCTTTA      TAATTTTTTTTGGAT 100 40
 FAI41_07200 1483866 .. 1483890 - -12.9  -3.29263   ATATTGTTTTTAGAA          GCCCCCTCT TTTTTTG AGAGGGGGC          TTTTTTTATGCGTGC  93 31
 FAI41_07165 1471766 .. 1471785 -  -8.6  -5.81032   TAAGGCCAAAAAAAA            GACTTGGT AAAA ACCAAGCC             TTTTTCAAAGATTTT 100 49
 FAI41_07120 1463562 .. 1463575 -  -5.3  -4.05446   GCGGTGAAGCAGAAA               GATTC TTAC GAATC                AATCCGTTCGAGTGT  65 17
 FAI41_07115 1461142 .. 1461159 - -12.7  -4.93877   TTTGACTAAAGAAAA             GGCGGCT TTAA AGCCGCC              TTTTTAGTGTCTGCT 100 42
 FAI41_07105 NONE
        rsgA NONE
 FAI41_07095 1457162 .. 1457187 - -16.3  -5.11613   ACATCATTTAAAAAA         GCCCTTAAGGT ACTC ACCTTAAGGGC          TTTTTGCTTTCCAAG 100 130
 FAI41_07045 1447481 .. 1447521 - -12.5  -2.52464   TTCGGGCGCAATCTA  TTCTGGCTGGCCACCCCTA TCA TCGGGAAGACCGGCCAGAA  TAAAAAGCTTTTAAT  84 43
 FAI41_06995 1440103 .. 1440113 -    -4   -3.1372   TATGGCGGATTAATA                 TTAC TCG GTAA                 TGATTGCTTCAAGGA  48 15
        proC NONE
 FAI41_06985 1438345 .. 1438361 -  -9.5  -2.77701   AGGGTATGAACATTA              TTCTCTC TCA GAGAGAA              GATATGAGCATCTTT  73 100
 FAI41_06980 1438065 .. 1438075 -  -2.6  -5.10497   AAGTTATTTAAAAAA                 TAAA AAT TTTA                 AAATCATCCTCTAAA  70 158
 FAI41_06960 1435474 .. 1435506 - -11.4  -5.06816   ATGGCGTAATAAAAA      CCCTCTTGCAAAGA AAATA TTTTCGCAAGAGGG      TTTGTACAAAAAGCA 100 48
 FAI41_06935 1430844 .. 1430864 -  -3.9  -3.14848   GTCCGTGATGAAAAC            TGGCGGATT GCG AATGCGCCT            TATGGGACATGCCGG  48 525
 FAI41_06900 1423835 .. 1423852 - -12.7  -5.12617   CAATGAGGTAAAAAA             GCGGGCT GAAA AGCCCGC              TTTTTTTGTTTAAGC 100 35
 FAI41_06895 1423444 .. 1423461 - -12.7  -5.70522   AAGAACAATAAAAAA             GCGGGCT TTTT AGCCCGC              TTTTTGTTTATCTTT 100 33
 FAI41_06885 1418717 .. 1418733 -  -5.1  -5.49234   AGAGCTAATAAAAAA              GCCAG TATTTCG CTGGC              TTTTTTTTGTGCTTA  88 62
        dapF 1415038 .. 1415049 -  -2.2  -2.86676   TGGAGGAAGTCAAAG                CAGT TTTA ACCG                 TTAAAAATCAAAGTA  41 66
 FAI41_06865 NONE
        ftsY 1412561 .. 1412586 -  -9.8   -4.7497   CTCATGTATGAAAAA         CGCCGA-TTCC TTATG GGAAGTCGGCG         TTTTTTGTTTCTATT 100 54
 FAI41_06845 1409250 .. 1409274 - -11.5  -2.81072   TCCATTTAAGAGAAG          GGGTGGAGATT TAG AATCTCCACCT          TATTTATTTAGTGTT  82 33
 FAI41_06840 1408952 .. 1408986 -  -5.7  -3.55202   TAGCGGTAAATAATA    TGGCTGTTGGGGACGGC AAT ACCGCCCCC-AC-GACA    ATGTATTCAGGGTAA  58 80
 FAI41_06815 1403602 .. 1403630 -    -9  -5.14563   TCTTTTATTAAAAAA       CCCCTTATGCCTC TATC GAGA-ATAAGGGG        TTTTAAAAAGGGCTG 100 54
 FAI41_06810 1403017 .. 1403051 -   -10  -2.64704   GAATAATACACTAAG     GCCTCATCTGAGGGCT TTA AGCGCTCAGATGATTC     TCAAAGGCATCGGCA  74 7
        dnaK 1394909 .. 1394932 -  -8.9  -5.07652   GGGGGCAAAAGAAAA          CTCCCTCTC AAAAGA GAAAGGGAG           TTTCCTTTATTCGAA 100 57
        dapB 1392790 .. 1392811 -  -2.9  -2.66481   TAAAAGGTTAGAGGA           CGCGCCTAA AAAT TTAGGCGAC            CAAGGCCGATACTAA  41 91
 FAI41_06765 NONE
        trmB NONE
 FAI41_06755 1389033 .. 1389057 -    -8  -4.87626   TGCGAAGATGAAAAA          TAAGAGGAAA GAGAA TTTCCCCTTA          TTATTTCTTACATAC  88 33
 FAI41_06750 NONE
 FAI41_06745 1387174 .. 1387202 - -13.4  -5.77988   ATAGAGATAAAAAAA        TTGCCTCTTTAT TAAAT ATAAAGAGGCAA        AAAATCATTTATTAC 100 58
 FAI41_06740 1380658 .. 1380668 -  -6.8   -2.8786   CCAAAAAATTAGAAG                 GCGA TTT TCGC                 TGACAATTGCCCACC  58 8
 FAI41_06735 1379634 .. 1379644 -    -4  -4.56597   GCGCCTTTGGAAAAA                 TCTT TAA AAGA                 GGGAAAAGACATTCT  66 385
        rfbC NONE
        rfbD 1377053 .. 1377101 -   -10  -3.91488   AATTTTGGCAAAGAA TTTGCCTTTTTATAAAGCAAAA AATCA TGTTGTTTTATAAAAAGACAAA AGCAGGAATCTTCTT  85 370
 FAI41_06715 NONE
 FAI41_06710 1374784 .. 1374811 -  -4.2  -4.05714   ACTTTGAAGGATAAA        GCGTTAGAAATT TTTG AATTTCTTACTC         AAATAGGATCGAGAT  61 20
 FAI41_06705 1374069 .. 1374079 -  -2.6  -2.71101   TGGCGAAAGAAGGCA                 TTTT TTC AAAA                 GCTTAGTTTACAACT  41 28
 FAI41_06700 1372926 .. 1372944 - -10.2  -4.64144   AATAATTTTTAAAAA             GCCTCCCA ATT TGGGGGGC             TTTTTTTATCTGTTT  91 31
 FAI41_06685 1370599 .. 1370618 -  -3.7  -3.18032   CAATAATACTCAAGA            TTTCTAA CAGTTT TTAGAAA             AAGAAGAAATGTAAT  48 118
 FAI41_06680 NONE
 FAI41_06675 NONE
 FAI41_06670 NONE
 FAI41_06665 NONE
 FAI41_06660 1365827 .. 1365847 - -14.1  -4.93365   GCCTAGAAGTAAAAA            GGGGAAAGA AAA TCTTTCCCC            TTTTTTATTTAGGAT 100 105
 FAI41_06650 NONE
 FAI41_06645 1360910 .. 1360924 -  -5.7  -2.65808   ATGCTCAAGAATTTA               TTGCC GAACT GGCAA               CACGCCTCCCTGAAA  50 219
 FAI41_06635 1359015 .. 1359035 -  -3.1  -3.48276   CTCGCCGGTAGAGAA            CGATATGCC TAT GGCGCAGCG            CTGGGTGTGATTTCA  50 515
 FAI41_06605 1352222 .. 1352232 -  -6.8  -3.30457   GGAAAAAGCAAGAGA                 TGCC AAG GGCA                 GAAAACTTCTGATGA  61 301
 FAI41_06595 NONE
 FAI41_06590 1349239 .. 1349262 - -13.2   -5.9362   GAAAATATAAAAAAA          GACGGAAAGC TTAG GCTTCCCGTC           TTTTCAACATTTTTA 100 57
 FAI41_06585 NONE
 FAI41_06580 1347509 .. 1347544 - -17.8  -3.35679   TTTCGTGATTTATAA    GAAAAGCCCAGCCTAT GAAA ATAGGCTGGGCTTTTT     GTTTCAGGGTGAAAG 100 48
 FAI41_06510 1334447 .. 1334461 -  -4.4  -3.93963   ATTAGCAGTCATAAA               TTTTTA AAT TAAAAA               AGATTTGTATCAGCT  59 19
 FAI41_06505 NONE
 FAI41_06500 1332281 .. 1332303 -  -2.1  -3.05268   CAAAAGGGATATATA           CAATTTTAC CTTTT ATAAAACTG           CCAGCCGTGTTTCTG  42 8
 FAI41_06495 1331323 .. 1331335 -  -3.4  -3.74693   CGTGACTGGATGAAA                GAAG GTATT CTTC                CACATGGGACGCCAT  53 190
 FAI41_06475 NONE
 FAI41_06470 NONE
 FAI41_06465 1326098 .. 1326113 -    -9  -3.30701   CCGGATGAAATGGAA              GGGCTT TCTT AAGCCC               TTTTCTGTCGGAGGA  73 18
 FAI41_06440 1318902 .. 1318930 -  -8.3  -4.61873   TTTGATAAAGGAAAA        TTCAAAAAACAGA AAG TCAGTCTTTTGAA        AAATATTATTTATCG  88 35
 FAI41_06435 NONE
 FAI41_06430 1315782 .. 1315806 - -10.7   -4.2535   AGATGAGATTGAAAA          TCCGCTCCCGT TAA AGGGAAGCGGA          TTTTTTTTTATGTTT  90 11
 FAI41_06405 1309440 .. 1309452 -  -6.3  -2.94099   TGCTTTTAGGAGATA                GAAAG GAT CTTTC                TTTTTACAAGCGAAG  56 106
 FAI41_06400 1308122 .. 1308175 -  -5.5  -3.36518   GCAAAAGTCGGAGAA TGCTCTTTTAGAGAATAAAGAGG TAGAAGAT CCTCTTTTTTTCCTAAGAGAACA TCTCTCCCAAGGCCT  57 41
 FAI41_06355 NONE
 FAI41_06350 NONE
 FAI41_06345 NONE
 FAI41_06340 NONE
        bioD 1291120 .. 1291140 -  -6.9  -2.74012   TCATTAGGCCAAGTA            TAAGCGTTG GTA CAATGCTTA            AAAGCTTACTTAAAA  60 57
 FAI41_06310 NONE
 FAI41_06305 1284672 .. 1284691 - -12.2  -4.89063   GCATCCAAAAAGAAA            CCCCTGTT TTTT AACAGGGG             TTTTTCTTTGCTTAT 100 56
 FAI41_06235 1272098 .. 1272116 - -14.6  -4.11216   GCTTTAGTTTGAAAA             GGGAGGCA TTA TGCCTCCC             TTTTTTTGTTATTTA 100 34
 FAI41_06200 1266227 .. 1266247 -  -5.3  -3.09288   CAGCGTGTAAGAAAG            CCTGGATGC ACA GCATTCTGG            TTAGAGATTTGATGT  53 250
        secE NONE
        nusG 1265427 .. 1265476 - -21.2  -3.06815   AGCGTTTTTAATAGA TAAAAGAAAAGCCCTCTGATTT ATGAAA AAATCAGAGGGCTTTTCTTTTG TGCTTCTAAAGAAAC 100 41
 FAI41_06160 1259160 .. 1259175 -  -3.4  -4.47049   AAAGATAAATAGAAA              TTAAAT TCTC ATTTAA               TTTTAAGCATTTTTA  62 364
 FAI41_06155 NONE
 FAI41_06150 1256991 .. 1257001 -  -2.4  -3.48617   AAAAAATGTGAAAGA                 TGCC AAG GGCG                 GTGTTTTGGTTAAGG  47 483
 FAI41_06125 1253395 .. 1253414 -  -5.8  -4.58283   TAAGGCGCTGAAAAA            GAAAGATA AGGA TATCTTCC             ATATGCTGGAAGTTC  76 63
 FAI41_06120 1252215 .. 1252239 -  -9.3  -5.88476   AAAAGAAAGAAAAAA          GGGACGATCTT TGA AAGAGCATCCC          TTCATCGTAACAGCA 100 44
 FAI41_06115 1249882 .. 1249916 - -10.2  -3.03124   TGCGATCTGTGAACA     TTATCCACAGATTC TGTGAAG GATTCTGTGGATAA     AAATTGGAATAACTT  76 119
 FAI41_06110 1247974 .. 1247984 -  -5.4  -3.67597   TTTCCGAGGCAATAA                 GTTC ATT GAAC                 AGAATGGCAGATCGC  60 43
 FAI41_06105 1246625 .. 1246641 -  -3.6   -3.3907   CGAAAGCTCAAGGAA              GACGGC ATGCG ACCGCC              GGTAATCGGAAAATG  50 161
 FAI41_06100 1245380 .. 1245394 -  -2.8  -2.52464   GTGTTTGCCAAGGCA               CTTTCC TAG GCAAAG               CCAAAATAGTTAAAA  41 16
 FAI41_06095 1244773 .. 1244792 - -11.4  -2.86728   ATTACGGACATGAGA            GGGCTACC GTTT GGCAGCCC             TTTTTTGTTAATTCA  82 33
 FAI41_06085 1242390 .. 1242424 - -10.1  -3.05046   GGAGTTCTTTAAAAT     TCTCCCACCGGAT TTTGAAATT ATCCGGCAGGAGA     TTAAAAACTTCTCGT  76 42
 FAI41_06060 1236309 .. 1236327 -   -16  -4.19735   TGTTTCAAAAGGAAA             GGGGCGCT TCT AGCGCCCC             TTTTTGAGAGATTAT 100 37
 FAI41_06045 1233582 .. 1233595 -  -3.1  -3.01726   TCTGGTGACAGAAAG               GCCGCT TCG AGCG-C               AGGCATTAAACGATC  45 206
 FAI41_06035 1232415 .. 1232425 -  -6.8  -3.29947   GAGTTATTATAGGAA                 TGCC ATT GGCA                 TCTGCTCAGCCTGCC  62 31
 FAI41_06010 1221339 .. 1221363 - -11.5  -2.73243   ATGGATGTTTGAAAG          CCTGCCTCT TTTTACG AGAGGCAGG          TTTCTTTTTGGTTAC  81 37
 FAI41_06000 1219762 .. 1219783 - -10.3  -4.18018   CTCTTTTATGGAAAA           TGAAAAGGA TTAA TCCTTTTCA            CAATTATGCTCTTGG  89 13
 FAI41_05955 NONE
 FAI41_05950 NONE
 FAI41_05945 1210508 .. 1210527 -   -10  -5.26155   AGAGAAATATAAAAA            CCCCCACT AAAA AGTAGGGG             GTTTGCTTTAGGTGA 100 42
        serB NONE
 FAI41_05905 NONE
 FAI41_05900 1203660 .. 1203673 -  -8.1  -2.80533   TTTCAAAATTATAAG               GGGGA AAAA TCCCC                TCTTATGTTGCTAGC  66 36
        mutY 1201584 .. 1201600 -  -2.3  -3.47311   AAGCATAAAAAATTA              CTTTC TTTTTGT GAAAG              AGGCTCGATCGCACT  47 376
 FAI41_05840 NONE
        rdgB NONE
 FAI41_05830 1187231 .. 1187243 -  -6.2  -2.62613   TCTCACCCGAAATAG                GCCG AAGCG CGGC                ATTTGCGAGGTTCAT  54 288
        hmpA 1184047 .. 1184065 - -10.2  -5.28778   AGCAGTTATAAAAAA             GCCCCGAT TTT AACGGGGC             TTTTTGTTGCTTTAT 100 50
 FAI41_05790 1178312 .. 1178330 - -11.7   -4.8743   CTCAAAAGAAAGAAA             GGGCAGG AAAAA CCTGCCC             TTTTAGAGATTGGAT 100 54
 FAI41_05785 1178050 .. 1178069 -  -8.6  -5.48825   TATTACTTAAAAAAA            TAGCGTCC TAAT AGACGCTA             TCTTATTGCATTTTT 100 44
 FAI41_05775 1174190 .. 1174206 -  -3.1  -3.96932   ATAGAGAGGGAGAAA              TCTTAAA AAT TTTAAAA              AAGAGGCCATATTTC  55 73
 FAI41_05770 1173457 .. 1173476 -    -5  -4.42238   TGAGTTTAATTAAAA            GGGAAGAT TAAG ATTTTCCC             TTGTGGAGAACGAGT  68 13
 FAI41_05765 1172379 .. 1172399 -    -4   -4.5954   CGAGATGACATAAAA            CCCCTA TTTTGATTT TAGGGG            GAGCTTTTTTTCTGC  66 8
 FAI41_05760 NONE
 FAI41_05740 1168890 .. 1168923 - -14.1  -4.11484   GTTAAGTTTTTAAAA     GCAAAGGAAGAAAAT AAAA ATTGTCTTCCTTTGC      TTTTGAAGAAAGTGC 100 41
 FAI41_05730 1166498 .. 1166513 -  -5.4  -4.08064   AAGCGCTTTTGAAAA              TTGCCC CTCT GGACAA               TATGCGTATTGGAAT  65 372
 FAI41_05715 1163299 .. 1163332 - -13.9  -4.28049   TTTAAAAGGCTAAAA     TGGAAAGGGCGCTGA TTTT TCAGCGCCCTTTCTG      ATTATCTGATGAAGT 100 45
        htpG 1158179 .. 1158200 - -13.1  -5.35224   TTGATAAAAATAAAA           GGCAGAGAA TTGC TTCTCTGCC            TTTCCAGTTTATACA 100 60
 FAI41_05695 1157455 .. 1157476 - -14.5  -5.09245   TTAAAACGAGAAAAA           GGCGGATGA AATT TCATCCGCC            TTTTTTAGAAAAATT 100 41
 FAI41_05680 NONE
 FAI41_05675 1154647 .. 1154658 -    -3  -2.95919   ATTATGTAAGTAAAT                TTTC GGAA GAAA                 GGGAGAATGATATGA  43 227
 FAI41_05660 NONE
        tpiA 1147270 .. 1147285 -  -3.4  -4.39568   AGGGAGAGAGGAAAA              TAAATT GCAA AATTTA               GCCGTTTGATTTTCT  62 213
        thiS NONE
 FAI41_05645 NONE
 FAI41_05640 NONE
 FAI41_05635 1143444 .. 1143456 -  -3.3  -3.96618   TTTAATGGCAAAGAA                CGCCA TGA TGCCG                AAGAATATTGCATGT  55 170
 FAI41_05620 1140259 .. 1140269 -    -4   -4.4784   GAAACCCTAAAGAAA                 CTTT CGG AAAG                 CGATATTGTCGCTGC  66 110
 FAI41_05590 NONE
        folP NONE
        folK 1132940 .. 1132957 -  -2.7  -2.75081   TATTTTTAAAACGGA             GTCATGT TTTT AAATGAC              CAAGTAATTTTTTTA  41 9
        folE 1132233 .. 1132257 - -18.7  -5.80364   AGTGGAATAAAAAAA          GCCTGCTCCAT GAA ATGGAGCAGGC          TTTTTTGTGGTTTAA 100 47
 FAI41_05545 1123253 .. 1123265 -  -7.7  -4.08692   TAATCCTCTCTAAAA                CTCAG TCA CTGAG                AATAATAAAAGCTCA  76 89
 FAI41_05540 NONE
 FAI41_05535 1120290 .. 1120300 -    -4  -3.61777   AAGAGAGCAGAAACA                 TCAT CCC ATGA                 AAGGAAGAGAGGTTT  52 149
        nikA NONE
        nikB NONE
        nikC NONE
 FAI41_05515 NONE
        nikE NONE
        nikR NONE
 FAI41_05445 1093603 .. 1093652 -  -5.1  -2.61116   TTGATAGATAAAATG GGAGT-TCTCGCACCATTCTAAAA ATA TTTTAGAATGGCGCGAGTGACGGG ACTCGAACCCGCGAC  49 10
        queE NONE
        queC NONE
 FAI41_05430 1091384 .. 1091395 -  -4.4   -3.8709   AAAGCGTCGGAGAAA                CTCT CTTT AGAG                 AAACAGGATGCATAT  59 244
 FAI41_05410 NONE
 FAI41_05405 1086068 .. 1086080 -  -7.7  -3.03124   CGGTATCTTTTAAGA                CTGAC GCA GTCAG                CTATTTATTATCTTG  62 153
 FAI41_05395 1083818 .. 1083851 - -15.5  -3.63694   ATTGATTTTTAAGAA     TTCTCCCTTCCTTTT CTTT AAAGGGAAGGGAGAA      TTTTTTGAAAGCCAT 100 116
 FAI41_05385 NONE
 FAI41_05380 NONE
 FAI41_05375 1078138 .. 1078167 -    -8  -5.25906   ATAAAGCAACAAAAA       CCCCTGCATTTCT TAATG AGAAA-GCAGAGG       TTTTTGAAAAGGATC  95 45
 FAI41_05370 1077534 .. 1077554 - -18.3  -3.55622   TTGAACTTTTTGAAA            GGGAGGGGG AAT CCCCCTCCC            TTTGAGAGAGGCTGA 100 42
 FAI41_05360 NONE
 FAI41_05355 1074826 .. 1074842 -    -8  -3.14344   TACGTGTTTGATGAA              TGAGCG GACAA CGCTCA              ATACTGAGAAGGGGG  64 251
 FAI41_05315 1065219 .. 1065236 - -12.7  -4.15657   TGAGAATCAGAGAAA             GGCAGGG ATTT CCCTGCC              TTTTTTATGGCCTAC  95 124
 FAI41_05265 NONE
 FAI41_05260 NONE
        nuoC NONE
        nuoE NONE
        nuoF 1050044 .. 1050064 -  -2.5  -3.14211   ATTCTTTGCCATCAA            CGTAAATTG TAG CCATTTTCG            CATTCTTTCAAATTA  45 52
        nuoG NONE
        nuoH NONE
        nuoI NONE
        nuoJ NONE
        nuoK NONE
        nuoL NONE
        nuoM NONE
        nuoN 1039977 .. 1039990 -  -3.9  -3.61232   TTCCTGATAGAAACA               TCTTT AAAA AAAGA                GAATATATCAGGCAA  52 46
 FAI41_05200 NONE
 FAI41_05195 1038288 .. 1038298 -  -5.4  -3.83502   TATGTTCATATTAAA                 GGTA TTT TACC                 TGTTCCACGTGGAAC  61 371
 FAI41_05160 NONE
 FAI41_05155 1026719 .. 1026731 -  -2.7   -4.2772   CGCAATTAAGAGAAA                GAAAT TTT ATTCC                GGATTAAAAAAAATC  57 210
 FAI41_05140 NONE
 FAI41_05135 NONE
        hemJ NONE
 FAI41_05120 NONE
 FAI41_05110 1018230 .. 1018248 -  -3.8  -5.28826   AAACTTTATAAAAAA             TCAGGAAG AAG CCTCCCAA             AGATGAGGTCGCTAG  78 225
 FAI41_05095 1014630 .. 1014641 -  -4.4  -3.50775   TAAAGAGGAACAATA                CGAT CCCT ATCG                 TTTTCTATTTTAGCG  55 409
 FAI41_05065 NONE
 FAI41_05060 NONE
 FAI41_05050 1004724 .. 1004742 -  -3.8  -5.28826   AAACTTTATAAAAAA             TCAGGAAG AAG CCTCCCAA             AGATGAGGTCGCTAG  78 225
 FAI41_05035 1001124 .. 1001135 -  -4.4  -3.50775   TAAAGAGGAACAATA                CGAT CCCT ATCG                 TTTTCTATTTTAGCG  55 409
 FAI41_04965 NONE
 FAI41_04960  985633 ..  985645 -  -7.7  -3.17075   GCGCTCCCAATGGAA                CTTCG AGC CGAAG                AAATGCGCCTTGCTT  64 176
 FAI41_04950  983626 ..  983644 - -10.2  -5.45802   TTTTCAAAACAAAAA             CCGGCTTC TTA GAGGCCGG             TTTTTTTTGCTTTAA 100 247
 FAI41_04930  979416 ..  979432 -  -2.2  -2.98813   ATGTTAGAATAAGGA              GCGCCT AAAAG AAACGC              TACATCCGCTCCAAG  42 25
 FAI41_04925  978236 ..  978250 -  -4.2  -4.67697   CCCCAAAACAATAAA               GGCGTA CAC TACGCT               TCCTCCATTATGCCT  68 40
 FAI41_04920 NONE
 FAI41_04915  976348 ..  976365 -  -3.3  -3.53012   TTCTTCTCTTCTAAA             TGTGCCG TCTT CAGCTCA              AAAAACAAGAGCTAA  50 65
        recA NONE
        recJ  973253 ..  973274 - -13.1  -4.20042   ATTAAGATGGCAAAA           GAGAGTGTC CTAG GACACTCTC            TTTATTTCAGGCAAC 100 32
 FAI41_04890  970922 ..  970934 -  -2.7  -4.28049   TTTAAAAGCCTAAAA                TTCAT TTA ACGAA                GGTACAACCTTTTCC  57 65
 FAI41_04885  970554 ..  970565 -  -2.2  -2.54896   TTTTTATCCAACCCA                TCCG TATC CAGA                 CCTAATCCAATATTT  40 120
        mdtN NONE
 FAI41_04875 NONE
 FAI41_04870  965439 ..  965462 -  -5.2  -3.71913   TGGACAGGCAAAATA          TCTTCTCCCG ATGA CGGCTGAAGA           AGACCCCAGCATTAT  59 228
 FAI41_04860  963535 ..  963558 - -18.2  -5.73978   ACGATAAATAAAAAA          GCCCCCTAGG AATT CCTAGGGGGC           TTTTTTTTCGTTTAA 100 51
 FAI41_04850 NONE
 FAI41_04845  961718 ..  961730 -  -7.7  -2.72013   ACTTTAAGAAGCAAT                CTCTG CTT CAGAG                CCCTCTTCAAGACAT  63 1
 FAI41_04840 NONE
 FAI41_04835  960668 ..  960689 -  -8.7  -5.77853   AACTGTTAAAAAAAA           CCTGAATGC TTGC GCCTTCAGG            ATCTCTTTTAAAAGC 100 33
 FAI41_04830  959372 ..  959411 -  -6.4  -3.25479   GTAGGAAAGACTTAA  CCCCACGCTATATGCCAA TCTA TCGTGAAATAACGTGGGG   CACCTAAAATCAGTC  61 66
 FAI41_04810  956032 ..  956047 -  -3.2  -3.58343   CGGACGACTTTCAAA              GAAGGC CATA GCATTC               TTTCTAAATCCGGTT  50 114
 FAI41_04805 NONE
 FAI41_04800  954712 ..  954727 -  -3.2   -3.5764   AAGGCTATGCCCAAA              CAC-GGG ATG CCCTGCG              CAGCCTTTCTATGCC  51 70
 FAI41_04705  939247 ..  939271 -  -2.1  -5.90981   CCATAGCAAAAAAAA          TTCTCTATAGT GAG ACCTTAGTGAA          GCGGGGTCATTCCAG  83 18
 FAI41_04695  937104 ..  937119 -    -6  -3.92001   GACATTACAGAAGAA              CCTGGG AAAA CCCCGG               GAAGTCTCTTTCAGC  66 172
 FAI41_04650  930685 ..  930699 -  -2.8   -2.7263   ACGACTCTGCCAAAG               GAACAG AAT CTGTTT               TGCTTTCTGATTTCC  41 75
 FAI41_04645 NONE
 FAI41_04640  929311 ..  929324 -  -9.5  -3.18582   TAGTGGAGGTATTAA               CGGCG TAAT CGCCG                GAAGCGCAAGCGCTT  72 286
 FAI41_04615 NONE
 FAI41_04610 NONE
 FAI41_04605 NONE
 FAI41_04600  923298 ..  923329 -  -5.9  -5.47218   GCTTACCTAAAAAAA      TTTCAGGGGAG AAGTTTAAGG CTCCCCTGAAT       ATTTCTCTCGTTTAA  91 37
 FAI41_04560  917466 ..  917484 -    -3  -3.25304   AAAGACGATCATGAA             GCACATGT TAA ACTGGTGC             CTCAGATTTCGGGGT  45 14
 FAI41_04555 NONE
 FAI41_04550 NONE
 FAI41_04545  914653 ..  914668 -    -4  -4.51196   TCTAAAGCGATAAAA              GCCTAA TATT TTAGAC               AGATTATCCGCCTCT  63 29
 FAI41_04535  910740 ..  910752 -  -6.3  -4.09685   TTGCAGGGGTTAAAA                TCTCT TGC AGAGA                GAGAGGCAAATTATC  68 153
 FAI41_04485 NONE
 FAI41_04480  902188 ..  902207 -  -9.2  -5.03314   GCGAGGTCTAAAAAA            GCGGCGGA AATT TCCGCCGT             TCCCCCTAAAAAACT 100 79
 FAI41_04465 NONE
 FAI41_04460 NONE
 FAI41_04455 NONE
 FAI41_04440  896811 ..  896827 -    -3  -4.56597   GTCGGTTTGGAAAAA             GGCG-AT GTCT ATCCGCC              CTATTTAGAAAATCA  62 139
 FAI41_04370 NONE
 FAI41_04365  885729 ..  885743 - -11.4  -3.09286   ATATTATGGGAAAAG               CAGGGG TCA CCCCTG               AAGAAACCCTTATGA  79 200
 FAI41_04320  879002 ..  879013 -  -4.4  -3.93218   AATGAGTAAAAAAAT                CCAT ATTG ATGG                 CTATGAAATCTATCT  59 358
 FAI41_04305  877923 ..  877947 -  -4.3  -4.30559   AAGAAAAGGCTAAAA          GCTAACTTCGT AAG ACAAAGTAAAC          CTTGTCCATAAAATC  63 117
 FAI41_04285  872009 ..  872028 -  -3.5  -4.44667   TTTTTTAAGAACAAA            GGGCTTC TCCGCT GAAGCTC             TCAAAAAAATATTCA  62 117
 FAI41_04280  871494 ..  871513 -  -5.7  -5.46706   ACGGCAAAAGAAAAA            GCGACCT AATCAA AAGTCGC             TTTAAAGGCTTCAAG  88 11
 FAI41_04275 NONE
 FAI41_04270 NONE
 FAI41_04265  868860 ..  868870 -  -3.2  -5.45802   TGCCCAAAAGAAAAA                 CGCA AAT TGCA                 TTAAAAAATCATTAA  79 407
 FAI41_04255  867423 ..  867442 - -12.2  -4.96501   TTTTAGAAAAATAAA            CCTGTTCC ACGT GGAACAGG             TTTTCACTTTTTTGA 100 102
 FAI41_04210  861738 ..  861750 -  -3.3  -3.77808   TCTATCAGAATATAA                CCCCT TAA AGGCG                GAATATGTCTCTTAT  53 245
 FAI41_04190  857754 ..  857780 -  -3.8  -4.43844   TGATGACGCATAAAA         CCTCAACCCTTT AGA AAAAGGTTAAAA         AACAAATATTTTCTA  63 429
 FAI41_04180  856633 ..  856657 - -12.2  -5.08601   TCATCTCAAGAAAAA          GGCGCTCTTC ATAAA GAAGAACGCC          TAAGACTCTGTTTAA 100 44
 FAI41_04155  848388 ..  848416 -  -6.9  -2.91593   TATTTTTGTATAAAT        CTCCTCTTCTAAA GGA TTTAAAAAAGGAA        TTTTCTAGAGGGCTT  61 229
 FAI41_04150  847755 ..  847775 -  -4.1  -4.13692   TTCAAAAAAGAAATA            TTGATATAA TTT TTACACCAA            ACGGACAACGACTAA  59 419
 FAI41_04135  845879 ..  845911 - -17.3  -4.91109   TCTTCATCACAAAAA      TTAAAAGCTCACCGA AAT TCGATGAGCTTTTAA      AAAGACTTATTGATT 100 32
 FAI41_04120 NONE
 FAI41_04115  841735 ..  841755 -  -4.1  -4.58395   CGCATTTTCGAAAAA            GAATCAA TCTTGCT TTGATTC            TTTCCGCAGAGAAAA  66 438
 FAI41_04105 NONE
 FAI41_04100 NONE
 FAI41_04095  838655 ..  838665 -  -3.2   -4.8622   TGGCGCAACCAAAAA                 TGCC TGG AGCA                 AAACAGCCGACACAA  69 392
 FAI41_04085  837460 ..  837483 -  -9.7  -2.78049   ATTGATCAAAATGCA          GGGGATTAA GCTTTT TTAATCCCC           TTTTTCAAGAGCTTT  75 30
 FAI41_04055 NONE
 FAI41_04050  832614 ..  832640 -  -3.6  -3.14132   CCGTTTGGGGATCAA         GCAACGCTTTTT CCA AACTGGCGTTGC         GCTGTTTCGAGGATT  48 104
 FAI41_04045 NONE
 FAI41_04040  831242 ..  831266 -  -2.2  -2.62098   ATCACGCTAAAAATC         CCCTGCATC TTATGGCG GAT-CAGGG          ATTAGGGGCTCCCTT  40 153
 FAI41_04035  830067 ..  830077 -  -2.6  -5.52384   CCGTGATGAAAAAAA                 TATT TTA AATA                 TTATCGCCAGAAATC  77 26
 FAI41_04005 NONE
 FAI41_04000  826475 ..  826490 -  -4.6   -3.4556   AAAAAATCAAACATA              GCCCCC TTAT AAGGGC               GGTAATGCTTTTAAA  53 16
 FAI41_03995 NONE
 FAI41_03990  825031 ..  825041 -  -5.4  -3.39948   CTATAATAAATGCAA                 GAGA ATT TCTC                 TTAATTCCTTCACCG  57 0
 FAI41_03975  823483 ..  823500 -  -2.1  -4.59773   GCGGATCTTTAAAAA             CAATAATC AGC GATT-TTG             AATAAAGCGCCGGCG  61 14
 FAI41_03970  822630 ..  822652 -  -2.6  -4.62302   GAATATTTCGAAAAA           TCAGCAGATC AAG GACATGCAGA           AGCGCAATTTAATCT  65 320
 FAI41_03945 NONE
 FAI41_03940 NONE
 FAI41_03935  809236 ..  809246 -  -6.8  -3.08966   GGAAATTTCATTTAA                 CGCT TAT AGCG                 AAAGTCCCCCTAAAA  60 85
 FAI41_03930  808625 ..  808649 -  -7.2  -2.90617   ACGCCAAAGGCAAAG         CACGGAATGGC CTGA GCCATCCC-TG          AAATCTTTATTATTT  61 35
 FAI41_03915 NONE
 FAI41_03910  803853 ..  803881 -  -8.8  -4.52803   TAGAAATTTAGAAAA        GAGCTTGGGGGG GACAT CCTCTCAAGCTC        TATTTTTAAGAATTA  90 38
 FAI41_03900  802530 ..  802552 -  -3.4  -5.32608   AAAAAATTCAAAAAA           CGCTTACCAA AAT TTGGCAAGAA           AATCCTGTCAAAGAT  81 94
 FAI41_03880  796174 ..  796191 -  -6.2  -4.57341   AATTTTCCCTAAAAA             GGCGAG TTTTCC CCCGCC              TTTTTCGTGTCAAAA  76 52
 FAI41_03875 NONE
 FAI41_03870 NONE
 FAI41_03865  791351 ..  791365 -  -2.8  -4.20516   CCTCCATGGAAGAAA               GAGAAA AAT CTTCCC               CGCTCCTTTTTAGTT  57 88
 FAI41_03860  790433 ..  790451 -  -3.8  -4.14392   CTTTAAGTCTTAAAA             CTATCTAG CAA CGAGACAG             CCTATCAATATCGTA  58 7
 FAI41_03830  787069 ..  787081 -  -3.3  -4.21812   CCTCACTCAAAAGAA                GGTAC CCC GTGCC                GCTGCTTTTGTCTCT  59 4
 FAI41_03825  785319 ..  785340 - -12.3  -5.28983   CGTAAAAGATAAAAA           TGGCAGGGA AAAT CCCCTGCCA            CATTTTAAGAGATAC 100 30
 FAI41_03815 NONE
 FAI41_03810  781628 ..  781644 - -12.3  -4.82855   GATGAAACGGAAAAA              GGAAGGC TAA GCCTTCC              TTTTCTTTTGCATTT 100 61
 FAI41_03775  772955 ..  772980 -  -6.8  -5.34381   AAAGGCAAATAAAAA         GGCGAAGTGA AAACTA TCCCTCCGCC          CTTTCAAAATCAATT  91 50
 FAI41_03770  772263 ..  772273 -  -3.2   -4.7889   AGAAAGAGCGAAAAA                 CCAG ATG CTGA                 AATGGCCTTTAATTT  67 34
 FAI41_03765  771773 ..  771796 -    -6    -5.626   CAGGCCATAAAAAAA          GGCTAAGTCT ATTT AGATCTAGCC           TTTTTCTTTTCAAGA  91 72
 FAI41_03755  770200 ..  770215 -  -4.6  -2.62642   ACTATGAGGCACAAT              TCGGCT TTAA AGCCGC               TGACATGGCCTCTAT  46 79
        hypA NONE
 FAI41_03665 NONE
        hypB NONE
        hypC  746529 ..  746551 -    -2  -2.74144   TTGGGATCTCTAAAT           TCATCAATAA AGG CCATTGAAGA           CATGCGGAATTAAAT  40 35
        hypD  745295 ..  745313 -  -5.2  -3.08738   AATAATTTCACTTAA             GCACACAT CTA AAGCGTGC             CTGAGAAAGGCGGGA  52 130
        hypE  743876 ..  743886 -  -5.4  -2.83504   CCCCTATGAAAAGAG                 CTGA TCT TCAG                 AGATGCAGAAAGAGG  52 380
 FAI41_03620  740356 ..  740378 - -17.8  -3.04792   GGATTATTTTGAAGA           TCGCAGAGGG TCT CCCTCTGCGA           ACCTTCGATGCAGAA 100 44
 FAI41_03615 NONE
 FAI41_03610  738968 ..  738985 -  -6.9  -5.30686   AAGACTCATAAAAAA             GGAGGCC AAAC GACCCCC              TTTTCTATGCATTAA  95 56
 FAI41_03605  737769 ..  737794 -  -3.1  -3.03771   CGATATCCCCCAAGA         CCGGCGCAATG CCCT CAGCGCGACGA          GAGTCATCCAAGTTG  45 355
 FAI41_03595  736452 ..  736470 -  -6.7  -3.61267   AACCGTAAATCATAA             CTCCCAG TCTCT CTGGGAA             TAAGTCTTTGTCAGA  64 117
 FAI41_03590  735685 ..  735706 -  -6.5  -4.66938   ATTCCTAACAGAAAA           GCCCAGCCT TTTC AGGTTGAGC            TTTTACATAACAGAT  78 145
 FAI41_03585  734448 ..  734473 - -10.5   -6.4275   GAAAAAGAAAAAAAA         GAAAAAGCCGA ATTA CCGGCCTTTTC          ATCAACGCAAAAATG 100 74
 FAI41_03570  731644 ..  731670 - -10.3  -3.09933   TTTTAAGGCATGTAA         GAGGGACTTTT AGGCG AAAAATCCCTC         TTTTAAAAAGACTTA  78 38
 FAI41_03565  730343 ..  730355 -  -6.3  -2.87132   GCCTCTTGGCATATA                GTATC CCC GATAC                TTATATTGCTTCTTC  55 83
 FAI41_03560 NONE
 FAI41_03555  726929 ..  726964 -  -5.6  -5.58179   CACCAGAAGAAAAAA    CCGCTT-CTCAAAAAGA CGC TCTTCTTCAACAAGCGG    CACAGCAGCCTGTTG  93 316
 FAI41_03545 NONE
 FAI41_03540 NONE
 FAI41_03535  723325 ..  723341 -  -3.7   -5.1356   TCTTAGCAACAAAAA              TAGGAAA TCT CTCCCTA              TGGTGTTTTCCAGCT  74 222
 FAI41_03530  722780 ..  722805 -  -7.6  -4.80656   ATGAAGAATAGAAAA         TCTTGGCCTC TCAAAT GAGGTCAAGA          TGCCCAGCAATGGAG  88 218
 FAI41_03515 NONE
 FAI41_03510  718200 ..  718223 -  -5.3  -3.28791   ACCGCTTCCGCAGAA          GAGTGACAC TTATTT GTCTCACTC           CTCATCCCGATAAGC  55 20
 FAI41_03505  717619 ..  717644 - -14.9  -5.14563   TTTTGCACTAAAAAA         GGCTGTTCTTT TTAA AAAGAACAGCC          TTTTCTCAATAGTTT 100 59
 FAI41_03490  715310 ..  715321 -  -7.2  -2.71924   TATTTCCCCCCAAAG                GGGC ATCA GCCC                 TCGTCACAGCTGGAA  60 101
 FAI41_03485  714445 ..  714470 - -14.8   -4.4017   TTAATGCGCATAAAA         CCGCCCCTTT TTAAAT AAAGGGGCGG          TTTTTTCTTGACGCT 100 497
 FAI41_03470  711385 ..  711399 -  -2.8  -3.49618   GCTGGATACAATGAA               CTGGCA CGT TACCAA               ACAACAAAATAAGAG  48 84
 FAI41_03465  709619 ..  709635 -  -5.1  -4.14874   AGAAGAGTTGGAAAA              GATCTTG CAA CAAGAAC              CCAGAATGATCCTTG  63 247
 FAI41_03445  703748 ..  703766 -  -4.6  -4.37092   ATCGGGCGCAGAAAA             TTGGGAAA ATT TTTCACAA             TCACCGCCTCATCTG  66 240
 FAI41_03430  700882 ..  700895 -  -3.9  -3.49516   AAGATTATATTACAA               CATTT TTCA AAATG                CGTTGCATGAACAAT  52 52
 FAI41_03425  699209 ..  699238 - -20.8  -3.54307   AATATTCTTTTTAAA       GCGCCGTCTCCC ATGAAG GGGAGACGGCGC        TTTTTGTTTTCGAAA 100 50
 FAI41_03400  692601 ..  692622 - -13.1  -3.45571   CCCCCCAAAGATGAA           CAGCCTCTA ATAT TAGAGGCTG            TTTCATAAACAACGA  95 73
 FAI41_03365  684363 ..  684381 -  -2.4  -3.99236   GTTAGAAAAAATTAA             GAAGCA TGTTCTG CGCTTC             CTAGCACCCGCTTCT  51 100
 FAI41_03360  683792 ..  683806 -  -2.8  -5.36441   TGCTCATACAAAAAA               CTATGA CCT TCATGG               TAATGAAGAACTTAT  79 196
 FAI41_03340  677767 ..  677788 -  -2.3  -3.04715   TAGGCCCTCTAAAAT           CTAAAGAAA AAAT TCTCTTAAG            CACATCTTTAAACAT  42 33
 FAI41_03335  677317 ..  677332 -    -4   -4.7657   TAAAAATGGGAAAAA              GACTTC AAAC GAAATC               AAAGGATGAAGTCTC  69 57
        typA  671886 ..  671905 -   -10  -5.60993   TTCCCCATAAAAAAA            GGCCGTGA TTTC TCACGACC             TTTAAAAAACAAACA 100 171
 FAI41_03300 NONE
 FAI41_03295  670161 ..  670179 - -14.6  -5.54079   CCAAAAATCAAAAAA             GGCGGAGA AAA TCTCCGCC             TTTGTTTTTTAGCGG 100 34
 FAI41_03280 NONE
 FAI41_03275  666865 ..  666885 - -11.2  -5.04249   CCCCTAAAAAATAAA            GGCAGAGA TTTTT TCTCTGCC            TTTTTTAATCACGAA 100 128
 FAI41_03265  665767 ..  665791 - -12.2  -5.79595   CTCTAAAAGAAAAAA          GGCGGCAATT ATGCA AATCGCCGCC          TTTTCTTTACCGTAT 100 62
 FAI41_03250  662588 ..  662610 - -12.8  -4.07885   TACGTCGCCTTAAAA           GGCAGAAGAA ATT CTCTTCTGCC           TTTTAAACCTCTTTT  95 54
 FAI41_03245  662021 ..  662033 -  -4.7  -4.85599   GGCAGGCTATAAAAA                CGGCC AAT GGCTG                GATCTAAATTTTATG  73 100
        tsaE NONE
 FAI41_03225 NONE
        addB NONE
 FAI41_03215 NONE
 FAI41_03210  650985 ..  650996 -  -4.4  -4.58685   AAACCTTTTGAAAAA                TCCT TCAA AGGA                 CAATGGCAATGGATT  68 171
        trxA  650437 ..  650448 -  -3.6  -4.40572   ATAACCTTGATAAAA                GGCC GCTA AGCC                 CTTAGCCCTCAATAT  63 27
         rnd  649154 ..  649167 -  -5.9  -4.59309   AAAAAAAATCTAAAA               GCGGG AATC CCCAC                CCCTATTTATTTTTT  76 68
 FAI41_03195  648324 ..  648344 - -15.5  -5.11836   AGACCTAAAACAAAA            CCCCCTTGA TTT TCAAGGGGG            TTATTTGCTTATTTC 100 34
        hpnH NONE
 FAI41_03140  637404 ..  637416 -  -2.7  -3.69354   TTGGAGAAGCCTAAA                GCATT TAA AATAC                TCAATGATTTTTATT  50 172
        dksA  636955 ..  636969 -  -4.3  -4.42386   TTCTCATCGAGAAAA               GAGAT TACTC ATCTC               TATGATTTTTTTCGT  66 15
 FAI41_03130  636396 ..  636406 -  -4.6  -3.93984   AAATGGAGTGAGAAA                 GCCC AAA AGGC                 CAGAGATGAGTACAG  59 375
 FAI41_03115  633933 ..  633954 -  -8.7  -2.71791   ACCCTTTGTGGAAAT           TCTTTCCGG CACA CCGGAAAGC            GACTATGGGCCACAG  64 266
         gap  632486 ..  632517 - -15.2  -5.56263   ATGATAAAAGAAAAA      GGGGGAGAAAACGT TCAA ACGCTCCCTCCCCC       TTTTCGGGTCTCTTC 100 83
 FAI41_03100  631126 ..  631151 - -13.3  -4.18018   CTGCCTTACTCAAAA         GAAAGCCCGCC ATAA GACGGGCTTCC          CTTTTTCTTCGTATT 100 94
 FAI41_03095  630571 ..  630589 -   -11  -5.42975   TTATACAAATAAAAA             GGGAGAGC ATA ACTCTCCC             TGCTAATTAAATCTC 100 50
 FAI41_03090  629824 ..  629841 - -10.5  -4.73682   TCTCATAACAGAAAA             GCCCGCC ATAA GACGGGC              TTCCTTTTTAGAGCA 100 64
 FAI41_03065  626036 ..  626065 - -10.7  -3.61902   TTCCAGCAGACATAA       GGAAGCCGCAC ATTTTCGG GTGCGGCGTCC        GTTCTCTTTAGAGGT  82 222
 FAI41_03060  625428 ..  625440 -  -2.6  -3.80625   GGTGCAGAAGGCAAA                GGCA TGCGC CGCC                TCGTAGAAGGAAATT  52 216
 FAI41_03050  624431 ..  624449 -  -6.8  -5.34365   TTAGAAGAAGAAAAA             GTCTCTTT TCT AAAAAGAC             TTTCTGTACTCAAAG  91 97
 FAI41_03040  623360 ..  623379 - -12.2  -4.18401   TTACATATTTTAAAA            GCCCACTT TTTC AAGTGGGC             CTTTTTTCTTACGAA  93 34
        msrP NONE
 FAI41_03025  620564 ..  620586 - -16.4  -3.31263   ATGTCATCTGTAGAA           GAACCCGCTT TGA AAGCGGGTTC           TTCTATTTTCCCAGT 100 28
 FAI41_03005  612554 ..  612571 -  -3.3  -5.08831   TAACAAAAAAAAGAA             TGCGGCG ATTA CGCAACA              TTTTTTTGGGAAAGG  73 66
 FAI41_03000  610841 ..  610851 -  -4.6  -4.08706   CGCTCATGACAGAAA                 CACC CGA GGCG                 GAAACGCTCAATCTC  61 335
 FAI41_02985 NONE
 FAI41_02980  607720 ..  607751 - -13.8  -4.19927   AAAACCATACAGAAA      GGAGGACAAGCACA TAAA TGCACCTGTCCTCC       TTTTTAAAAACCTGA 100 91
 FAI41_02975 NONE
 FAI41_02970 NONE
 FAI41_02965  604603 ..  604637 -    -5  -3.58269   GAACCTATCCGCAAA    GGACATG-GATGGCA CCGCCC TGCCCCCTCATGCCC     TCCATTGCTGTGCTA  57 73
 FAI41_02935 NONE
        ubiM  599996 ..  600014 - -12.4  -5.59879   GACAAATATAAAAAA             CCCCGCCT TTA AAGCGGGG             TTTCCTGTATTGAAT 100 52
 FAI41_02900  592782 ..  592792 -  -3.2  -3.35849   TTTATTAAATTAAGA                 CCTC ACA GAAG                 GCTGTCGCTCTCGCA  48 9
 FAI41_02895  590923 ..  590952 - -12.3  -4.83615   CAGTCTTCATAAAAA       TTTAGATGCCCAC ATCC GCAGGCATCTAAA        TTCTTTAAGCGCAAA 100 57
 FAI41_02890  589828 ..  589849 - -13.1  -5.42259   TTATGCGTAAAAAAA           GCTGGCTTA TTTT TAAGCCAGC            TTTTTTTTATCTCTC 100 52
 FAI41_02880  588277 ..  588287 -  -5.4  -4.08767   TTTATTCTTTCAAAA                 GCAT CGT ATGC                 AAGCTTAATGCCAAA  65 78
 FAI41_02875  587786 ..  587798 -  -4.9   -4.8143   TTAATAATGTAAAAA                TACTA TTT TAGTA                TTTTATTACTGTGAC  74 387
 FAI41_02870  586046 ..  586076 -  -7.6  -3.11726   AACATTCTAATAAAG       GCCCCCTTATGA TTTTCTG TCACAAGGGGGT       TTTCTATCAGCCATT  66 39
 FAI41_02860  583468 ..  583487 - -11.4  -5.27335   TCGCCTAAACAAAAA            CCCCCTGC TTTC ACAGGGGG             TTTTCTTTAGCCTTG 100 65
 FAI41_02820  577463 ..  577479 -  -2.2  -4.08064   AATGCTTCTTGAAAA              TCATGG CGTGT CCTTGA              TAGCTAAAATGAGAA  53 49
 FAI41_02815  576750 ..  576775 -  -8.4   -4.8143   TCAATAAGGGAAAAA         GAGCCTTTGA TTTTTG TCAAAAGCTC          TTTTTTCATTTTTAC  95 60
 FAI41_02805  575810 ..  575822 -  -4.9  -5.38497   ATTCAAAGTAAAAAA                TCTAA AGG TTAGA                GATTATGCGCTCTAA  84 21
 FAI41_02800 NONE
 FAI41_02795  572344 ..  572355 -    -3   -3.6543   TAACGCTTCAAAAGA                GAAT AGCT ATTC                 ATCTAAACCGTCACT  50 20
 FAI41_02790  571280 ..  571307 -  -5.7  -2.79518   CCAAAAGGTCTAAAG        CGCTAAGAGAGA TACCT TCTCTCT-AACG        TTGTTTTCTTGAAAG  52 20
        rplK NONE
 FAI41_02765  567631 ..  567650 -  -7.8  -3.91897   GCTCTCAGGCAGAAA            GAAGGGAG AACA CCCCCCTC             TTATTCCGTTAAAAC  74 54
 FAI41_02760  566804 ..  566823 -  -4.4  -3.56042   TCACTTAAAAATATA            TTCACAAA AATT TTTGTAAA             TTGTCAGATGCTTTA  55 74
 FAI41_02755  566306 ..  566346 -  -9.8  -3.88137   ATAACTTCTCACAAA CGG-CAAGGAAGGGCGATG TAAA CATCTCCCTTCCTCAACCA  GCCCAATAAGGGAAA  85 79
        rpoB  561931 ..  561957 -  -5.1  -3.53343   AACGTGTCTCCGAAA         GAACCGAACTC AGTTA GAGCCCTGTTC         CAGCTCGACGTTAAG  57 8
        rpoC  557327 ..  557342 -  -5.4  -3.95435   TCTGTGAAAATATAA              CTACGT TATT ACGCAG               TCGCAACTTAAATAA  63 139
 FAI41_02740 NONE
        rpsG  556390 ..  556402 -  -2.7  -3.09564   AAAAATTAAAAAGAC                TTACC AAC GATAA                TGGCTGAAAGCACGG  43 13
         tuf  555068 ..  555106 -   -27  -3.06831   GCAAGGCCCATGCAA   TAGACGGCCTTGGAAGTC CAA GACTCCCAAGGCCGTCTA   AGTTTAATAGCAGAT 100 42
        rpsJ NONE
 FAI41_02720 NONE
        rplD NONE
 FAI41_02710 NONE
        rplB NONE
        rpsS NONE
 FAI41_02695 NONE
        rpsC NONE
        rplP NONE
        rpmC NONE
        rpsQ NONE
        rplN NONE
 FAI41_02665 NONE
        rplE  548401 ..  548420 -    -2  -2.57132   TTTTTCTCCTAGAAC            CTTTCGGA AAAT TCCGAGGG             TTTTCTTTGGCGCTC  40 92
        rpsN NONE
        rpsH NONE
 FAI41_02645 NONE
 FAI41_02640  546744 ..  546761 -  -2.7  -2.65298   TTCACGTACCATAAT             TTCTTCT CCTT AGAAGGA              CAGTCCCTTTTCGCG  41 17
 FAI41_02635 NONE
        rpmD NONE
 FAI41_02625  545383 ..  545418 -  -9.1  -4.37886   CTACCTTTCATAAAA    GAGAGCG-CTTGCAGA GACTG CCTGCAAAACGCTCCC    TTAATGCATCATAAA  90 83
        secY NONE
 FAI41_02615  543378 ..  543408 -  -5.6  -3.02263   ACATTTCCCCCAAGA       TTCTTACCTAAGAA ATT TTCTTATGCAAAAA       CCTCCCCTATTTTCT  53 15
        rpsM  542680 ..  542695 -  -4.7  -3.35371   TATATCCTGAATTAA              GACTC ATAAAA GAGTC               AGAAAAAAACATATA  55 47
        rpsK  542198 ..  542220 - -13.6  -3.10244   TCGTTTAAGAAATGA           TAAGGAGATC CAA GATCTCCTTA           TTCCTTCTTTCACCA 100 65
 FAI41_02600 NONE
 FAI41_02595  540563 ..  540588 - -11.9  -5.31519   ATACCTAAACAAAAA         CCCCCTGCTCT TTTC AGAACAGAGGG          TTTTCTTCGAAGTGA 100 52
 FAI41_02585 NONE
 FAI41_02580 NONE
 FAI41_02575  536537 ..  536562 -  -3.1  -5.43414   AGCAGATATAAAAAA         GCCCCCAAGCA TTGC TGTCAGGAGGC          TTTCTACTTTTAGAA  79 46
 FAI41_02570  535715 ..  535726 -    -3  -3.57883   AGAATAGCCCCTAAA                GAAA ATTA TTTC                 CTTTTCAAGCTTTTA  48 38
 FAI41_02565 NONE
 FAI41_02560  533839 ..  533871 - -14.4  -5.52384   CTCGCATTAAAAAAA     CAAAAGCCTCTGTCT TTTC AG-CAGAGGCTTTTG      TACATTTCAAAAATA 100 48
 FAI41_02550 NONE
 FAI41_02545  530723 ..  530751 -  -8.9  -3.14793   GAGACCAACAGAAAT        TTACGGTGAGAGA GTT CCTCTCGCCATAA        TCTCCACAAAAGCGG  71 129
 FAI41_02540  528476 ..  528486 -    -4  -5.25893   ACAGACATCAAAAAA                 GAAA TAA TTTC                 CTATGACGAATAGTT  78 512
 FAI41_02525  526504 ..  526518 -  -4.3  -3.34715   TACCTTGCCGAAATA               GCTTT TCTGC AAAGC               TTTCAAAACAGGTAA  53 166
 FAI41_02520 NONE
 FAI41_02515  521994 ..  522019 - -13.3  -4.81851   AGTTAAATCTAAAAA         CCCCGTGCC GATAAGGG GGCACGGGG          GTTCAAAATAACGCT 100 95
 FAI41_02510 NONE
 FAI41_02505 NONE
 FAI41_02500 NONE
 FAI41_02495 NONE
 FAI41_02490  519072 ..  519092 - -11.9  -4.42788   CTTAATTTCATAAAA            GCCCCTATA TTT CATAGGGGC            TTTTTCTTAACGCAT 100 94
 FAI41_02460  513263 ..  513292 -  -9.3  -3.57309   TAAAACTTGCTTAAA       TGGCGCAGTTTTT TCAC AAAGGCTGCGCCA        TTTTCTATCTTAAGA  78 85
 FAI41_02445 NONE
 FAI41_02440 NONE
        rpoD  503873 ..  503922 - -18.2  -4.05875   CCGAAAAAACCCAAA TATCAAAAGCGCCTCGCTCTTT TTAAAC AAAGAACGAAGCGCTTTTGAAA ACTTCTTAAAATCCC 100 47
 FAI41_02430  503588 ..  503603 -  -2.6  -3.13371   CACGTCACCAATATA              GAAATA ATGA TATTCC               TCCGAAGCGAACGCA  45 43
 FAI41_02425 NONE
 FAI41_02420  502610 ..  502624 -  -7.2  -3.78785   TCAGAAAAACGAGAA               CCTTAT CCA ATAAGG               GGGCTTTCCATTTCT  69 205
 FAI41_02415 NONE
        rpsR NONE
 FAI41_02405  501073 ..  501096 - -14.6  -5.36441   TCTCCATATAAAAAA          GGCTCCG-GGC AGA GCCTCGGAGCC          TTTCCTATAAGAACA 100 56
 FAI41_02400  500474 ..  500499 - -16.9  -4.59853   GGAAGCCTCTAAAAA         GGCGCTGATGC TTCC GCACCAGCGCC          TTTTATAACTTCACA 100 71
 FAI41_02395  499720 ..  499744 - -12.9  -5.36441   CCCCCATACAAAAAA          GACTGGAAGCA ATT TGCCTCCAGCC          TTTCTTGAATCAATC 100 91
 FAI41_02355 NONE
 FAI41_02350  488189 ..  488202 -  -3.7  -3.61894   AACGTTGCCGAAGAA               GCGCC AAAA GGTGC                CGAGGAATATACAAG  53 442
 FAI41_02315  483252 ..  483264 -  -3.3  -2.77192   AATGCCTTTAATAAC                CGCGC CGG ACGCA                TACGATGAGGCACTA  44 81
        rpmI NONE
        rplT  482462 ..  482500 - -14.7  -4.07687   ATTCGCTTTTCAAAA   GAAAAAAGGGAACGCCG TCATG CGGCCTTCCCTTCTCTC   TCAAAAATTCAATCT 100 84
        pheS NONE
 FAI41_02295 NONE
        lpxB  477343 ..  477359 -  -3.6  -4.68705   AGAATTTTAACAAAA              CCGCCA CCTGC TGGGGG              ATCCAAAATAATGAA  66 151
        genX  458486 ..  458519 - -10.7  -5.33866   GAAATTCATAAAAAA     TAAGTATGCT-AATTT TTA AAATTAAGCATACTTA     TCTATGACTTCTAAA 100 70
 FAI41_02195  457403 ..  457421 -  -2.3  -3.57144   TCTTTTATTTTTAAA             GGCACAG CAATT CCTTGCC             TAAACAGCGTACAAT  47 49
 FAI41_02190 NONE
 FAI41_02185 NONE
        zapA NONE
        ssrS NONE
 FAI41_02170 NONE
 FAI41_02165 NONE
 FAI41_02160 NONE
 FAI41_02155 NONE
 FAI41_02150  452300 ..  452319 -  -3.5  -4.56597   CGGCCGCCCTAAAAA            CGCCG GAGGAGTTGG CGGCG             ACCTTACTCCCCTGC  64 356
 FAI41_02130  447165 ..  447177 -  -2.7  -4.29905   ACGACATCAAAACAA                TGCAT TTC ATACA                CGCCAAAAGGATATG  57 275
 FAI41_02125  446137 ..  446158 -  -8.7   -4.9755   AGACATAATGAAAAA           GCCCTTAGA AAAC TCTGAGGGC            TTTTCTTTTTCAACT 100 40
 FAI41_02120 NONE
 FAI41_02115  443273 ..  443294 - -10.2  -5.40072   TTTTCCCTAAAAAAA           GCCCCTTT CTCTAT AAAGGGGC            CTTTTATTCAAAATC 100 41
 FAI41_02110  442114 ..  442137 -  -9.6  -5.49809   TAAATTTCAAAAAAA          GCCTCGCA AAAAATAA TGCGAGGC           TTCCCTTCTTTTAAA 100 61
         acs NONE
 FAI41_02100 NONE
        msrB  438792 ..  438832 -  -6.9  -2.78706   AACGATAGTGGAAAG  CCTCCCTTGCTTTGAAA TTTCATT TTTAATCGCAAGGGAGG  TTTTTCTTTTTCAAT  61 40
 FAI41_02085 NONE
 FAI41_02080 NONE
 FAI41_02075  434874 ..  434892 -  -9.6  -3.14132   TCTTCTCTTGACTAA             CCTCTTCC CAA GGAAGAAG             AAAGTTAATCTCTCT  75 321
 FAI41_02070 NONE
         rrf  431570 ..  431595 - -16.3  -4.98531   CTTGGAAAGCAAAAA         GCCCTTAAGGT GAGT ACCTTAAGGGC          TTTTTTAAATGATGT 100 49
        katG  428884 ..  428904 - -12.6  -5.57054   AATAAGGCAAAAAAA            TAGCGGGG ATAAA CCCCGCTA            TTTTCTTTTATAAGC 100 49
 FAI41_02050  427134 ..  427148 -  -2.9  -3.48276   TCTGCCTCTATAGAA               TTATC TTCCT GATAA               AATCTCGATAATCTT  48 58
 FAI41_02040  422739 ..  422793 -  -6.6  -3.72576   TTGGTGGTTACTAAA CCCTCTTTTTTACGCCCCCTAAATCA TCA TAATTTAGGGGGAATAAAAAAGTTTA TCTGAAAAATTATTC  66 61
 FAI41_02000  414163 ..  414176 -  -3.9  -3.29511   CTTACCCGGGGATAA               TTTCA CCAA TGAAA                TTCATCCCAAAAAAT  50 96
 FAI41_01995 NONE
 FAI41_01990  412808 ..  412818 -  -2.6  -4.38748   CTTAGAAATAAAGAA                 TTAA AAT TTAA                 GGATAAAAATATTTT  60 58
 FAI41_01985 NONE
        lspA  409233 ..  409246 -  -3.9  -3.41602   TTTACTGCATGATAA               GAAAT TTTC ATTTC                GTGCCTCTTAGCCCT  50 33
 FAI41_01975 NONE
        mutL  406459 ..  406471 -  -4.8  -3.08679   GTGCGGCAGTGAACA                CCGT ATTAA ACGG                AATGCTTAAACTAAG  52 337
 FAI41_01950  403132 ..  403155 - -10.4  -5.80364   ATCCCAATAAAAAAA          GGAAAGCTCT TTTA AAAGCTTTCC           TTTTTCTTTAACGCT 100 49
 FAI41_01935 NONE
 FAI41_01930  398043 ..  398084 -  -3.1  -3.22475   GTCAGCCCCATAACA CGCCATCCCCTAAAGA-TAA AAA TTACTCTTACGGAAATAGCG TTTTTTAAAAACCTT  47 434
 FAI41_01920  396972 ..  396989 -  -3.5    -5.055   GCAATGGCCAAAAAA             TTTCTAT CCCC ACAGAAA              TAGCTATGAGAATAA  70 160
 FAI41_01915 NONE
 FAI41_01910  395591 ..  395606 -    -4  -2.92522   CCATTTAACACCAGA              GAAATC ATCT GACTTC               GCAAGCCTCTTCAAA  46 14
        tsaB NONE
        rimI NONE
 FAI41_01890  393614 ..  393633 -  -3.7  -4.72846   GGATATACTTAAAAA            GATTAAA GCGAAA TTTAATC             TTCTTTTTTAGGAAG  69 20
 FAI41_01885  392605 ..  392619 -  -4.2  -2.60763   GCCATATGCTACAAC               GTCTCT CTA AGAGTC               TTTTAGGAAATATCA  47 28
         lnt  390966 ..  390979 -  -3.1  -4.19215   GAGAGGTAAAAAATA               TCCCA TTTC TGGAA                TGGATTAAAAACCAT  60 66
 FAI41_01870  389852 ..  389869 -  -9.1    -5.252   GATTCTTACAAAAAA             GACGCCC ATTT GGACGTC              TTTTTTATGCATATA 100 56
 FAI41_01850  387754 ..  387782 - -12.6  -5.62045   AGATACAAGAAAAAA        GCTCCATACTTC TTTTG GAAATATGGAGC        GGGCGAAGGGATTCG 100 20
 FAI41_01845  387621 ..  387648 - -15.8  -5.85178   AATAGGCAAAAAAAA        GCTCCATATTTC AAAG GAAATATGGAGC         GGGCGAAGGGATTCG 100 20
 FAI41_01835  386368 ..  386384 -  -2.3  -3.28159   CTAAAAACTCAAAAT              TTTCAGA CAT CCTAAAA              CCTTTTTTAACGCCA  43 32
        hsdR NONE
 FAI41_01825 NONE
 FAI41_01820  379968 ..  379981 -  -2.4  -4.62069   CGGCGATGTCAAAAA               TCCA GGCTAT TGGA                CTTCTGAATTTACAG  64 250
 FAI41_01795  372698 ..  372716 -  -8.1  -3.23019   TCATAAATGCAAAAC             GCCCTGC GCCCG GCAGGAC             TCGAACCCGCAACCA  69 10
        ettA  370959 ..  370978 -  -2.8  -3.34716   CTACGCCTTAAAAAT            TACCGAACC ACA GGA-CGGTA            GCGTAAGCGACCCGG  46 5
 FAI41_01785 NONE
        argC  369359 ..  369372 -  -3.8  -3.80551   CAAATACGTATTAAA               TCCG AAAAAA CGGA                TAAACAAGAGAACAG  54 55
 FAI41_01775  366925 ..  366944 - -12.2  -5.93252   TTCAAAAATAAAAAA            GGAGAGGT AAAA ACCTCTCC             TTTTTCTGTGAAACA 100 51
 FAI41_01770  366577 ..  366598 -  -9.5  -5.09762   ATGCCAACACAAAAA           TATCGCCCT AAAA AGGACGATA            ACCGAAAAAAGCGCA 100 189
 FAI41_01765  365107 ..  365125 -  -3.2   -3.2613   AAGAATGATTAGCAA             TTGTTTTT AAT AAGAACAA             ACAATCGCTGCTGAT  47 13
 FAI41_01760  363956 ..  363993 -  -9.4  -3.28327   ACACCAAGAAAAGGA   GCGCCCTTATCTTCTTC AAAAA AAAGAAAATAAGGG-GC   AGTCAAAAGCCTACA  75 269
        rfbB NONE
 FAI41_01745  361435 ..  361463 - -11.1  -6.09196   TTTAAAATAAAAAAA        GGCGCTCAAGA TTTTCTC TCTTAAGCGCC        TTTTTTTATGGATGA 100 52
 FAI41_01725  357414 ..  357432 - -11.7  -5.94713   ACCTCACAAAAAAAA             GGCGCTC CAATT GAGCGCC             TTTTCTCTCAAAAGG 100 52
 FAI41_01670  342567 ..  342581 -  -4.2  -2.93435   TCAAGCATTTAGAGA               TGCTGT ATC ACAGCC               TGAGAAAAATCGGAT  50 4
 FAI41_01665  342047 ..  342081 -  -2.2  -5.75538   TCCAAAAAAGAAAAA     CAATCCTTAACTTTGT TAA AAAAAGTTTAGGACTT     TGCCTCTTTCCTCTA  80 6
 FAI41_01660 NONE
 FAI41_01655 NONE
 FAI41_01650 NONE
 FAI41_01645  337914 ..  337928 -  -2.1  -3.67149   TCATCAAAAGAAAAG               CTGTC ACAAA GACAA               AGCAAAATGCGCCAA  49 109
 FAI41_01640  337418 ..  337439 -  -5.1  -5.37345   CGCAATGATAAAAAA           CAACTCTAC AATT GCAGAGATG            CTGTAAAAATGCATT  84 144
 FAI41_01635  336773 ..  336784 -    -3  -3.50572   ATTTATTTCATATAA                TCTA AACA TAGA                 ATAACGATCATTTTC  48 33
 FAI41_01630 NONE
 FAI41_01625 NONE
 FAI41_01620  333319 ..  333332 -  -2.4   -4.0896   AAATTCGGGGTAAAA               TACG TATTTT CGTA                TTAAGAGAATTTATG  53 36
 FAI41_01615 NONE
        rmuC  330697 ..  330714 -  -3.5  -2.79098   TTTACCGATCAAGCA             TTTTCTC CCAT AAGAAAA              TTGGGCGATTTTTCA  44 1
 FAI41_01605  329658 ..  329671 -  -2.3  -3.86392   TTAAAATGAAAAAAT               GCGCA TAAT TTCGC                TCTGCATATCTTACA  51 163
        gyrA NONE
        coaD NONE
 FAI41_01590  325644 ..  325673 - -10.7  -4.80396   CAAAATATGCAAAAA       GGCAGCCCCAACA AGAA CGTCAGGACTGCC        TTTTTTAAAAAGATT 100 51
 FAI41_01585  325213 ..  325227 -  -5.6  -4.90869   ATGAGCAATTAAAAA               CAGGCG ATT CTCCTG               CCTATGCAGATGAGT  78 172
 FAI41_01575  323663 ..  323688 -  -4.1  -2.82892   AAAAACATTCGAAAT         TCCTATTTTCT TTAA AGAAAAAAAGA          GCAAAGAGAGAAAAT  46 11
 FAI41_01570  323027 ..  323050 -   -14  -5.24129   CTTTTTCATAAAAAA          GAGGGACATT TCTC AATGTCCCTC           TTTTTTTTATCAAAC 100 43
 FAI41_01560  321278 ..  321301 -  -8.4   -2.7395   AGACAGGTTTGAAAT          TTTTATGTTT TATA AAACATAAAA           GGATGTTTATAAATT  65 44
 FAI41_01540  315895 ..  315910 -  -5.4  -3.27923   TTCCAACACCAGTAA              GCACCA CTTT TGGTAC               AAAAACCTATTTTAA  56 478
 FAI41_01505  305424 ..  305437 -  -3.1  -4.16016   TTATGGCGTAATAAA               GCAAA AAAT CTTGC                GTCTCTTGGAAAAGA  60 410
 FAI41_01495  303936 ..  303952 -    -3  -3.56862   ACAAATTTTGGCAAA              GAAAAG CCTCC CTCTTC              ATACATCCTTAGAGA  48 130
 FAI41_01490 NONE
        accC  301975 ..  301995 - -14.1  -4.31688   AATATTAATTTAAAA            GCTTCCTCT TTA AGAGGAAGC            TTTTTCTTTAGCAAG 100 14
 FAI41_01470  299805 ..  299833 -    -2  -3.52919   AGCATGCAACGAGAA       GATATAAAAAATT AAAT AATTTTTT-CATC        CTAAAACTGTCCTTA  47 21
 FAI41_01465  298230 ..  298256 - -16.8  -4.62336   ATGGCAGGGCAAAAA         TAAAGGGCTTCA AAT TGAAGCCCTTTA         TCTCATTTTCATTTA 100 48
        rimP  294615 ..  294632 -  -2.7  -3.23546   AACAAATATATTCAA             CGTCA AAAATTAA TGACG              AAGTCCAGGGGATGA  45 17
        nusA NONE
 FAI41_01435 NONE
        infB NONE
        rbfA NONE
        truB NONE
        rpsO  287879 ..  287898 -  -9.3  -3.47078   CAGTCCACAGGACAA            GGCATCC CCCATT GGATGCC             CCCTCTAACAAATAA  78 41
         pnp NONE
 FAI41_01405  284193 ..  284236 -   -15  -3.08774   TAGAAATTCTGAAGA GAAATATAAAAAAGAGCCTGA AAA TCAGGCTCTTTTTTATAAT-C TATACGCTTTTAAAA 100 45
 FAI41_01400  283402 ..  283418 -  -6.6  -4.37092   ACGTTTTCGAGAAAA              TGGCAA AACCA TTGCCA              GCTCTTGTCTTAAAG  74 351
 FAI41_01385  280352 ..  280365 -  -6.7  -4.56775   AGCGTTTTTTAAAAA               TGACC AATC GGTCA                GAATTTTGGAATGCC  78 152
 FAI41_01380 NONE
 FAI41_01375  276204 ..  276221 -  -4.9  -3.74693   TCCTATGCCAGCAAA             GGC-AGTT TGA AACTCGCC             GATAGCAACCTCGCC  59 202
 FAI41_01365  273601 ..  273629 -  -7.5  -3.97108   AAGGTTAAAATATAA        GGGGAGATTAT CAAAAAC AAAATCTCCCC        TAGCCTTTCTTTTAT  74 37
        gatC NONE
        gatA NONE
        gatB  265380 ..  265405 -  -4.7  -4.66833   TTTTAAGGGTAAAAA         GCGGAGG CGTCAAATCATT CCTCCGC          TTTCTTTAAAAGAAA  71 54
 FAI41_01320  265122 ..  265132 -    -4  -2.90392   CATTTTTTAAGTACA                 GTTT TAG AAAC                 TTGATCGTACAAAAT  46 109
 FAI41_01315  264869 ..  264893 -  -6.4  -5.06585   TAAATTATAGAAAAA          GGCTCTCTCT TTTGG AGAATGAGCC          TTCTTTCTAGCATAA  82 55
 FAI41_01310 NONE
 FAI41_01305  261791 ..  261802 -  -4.4  -4.66163   AGGCTGACGCAAAAA                TGGA TTCG TCCA                 AAGGCTGGCCTTTTG  68 461
 FAI41_01300 NONE
 FAI41_01295  261170 ..  261185 -  -7.6   -3.8253   AAATAAAGGCAAGAA              GCTTCT AAAA AGAAGC               ATAATCCCCCATTTT  74 109
 FAI41_01290  259741 ..  259757 -  -3.7  -2.65271   CATAAGGTGACAGGA              GATTGTT TGG ATCAATC              GTAACGCACCCTTTC  45 55
 FAI41_01285  259434 ..  259447 -  -2.5  -3.83378   TTTTAAAATAGAGAA               TTATT TTGA AATAA                TATTGCGCATTTCAG  52 37
 FAI41_01280  257462 ..  257481 -  -2.2  -2.86747   TATCCATCATAACTA            TGCCCCTAA CTT TTAGGGA-A            TTTCGGCTGTTTTGC  41 18
 FAI41_01275  256214 ..  256234 -  -6.2  -3.88498   TCCTCATACACTAAA            GGCATTTT GATGA AAAACGCC            TCATATTCTATTTAT  65 411
 FAI41_01265  255108 ..  255149 -  -2.4  -4.10007   ACAAGCTTCTCAAAA GAGACTCTT-CCTTCCGAT ACCAA ACAGAAAAGCAAGAGCCTC CTTTTCTCAGGGAGA  53 42
 FAI41_01260  254465 ..  254475 -  -5.4  -3.37198   CGCTTATACACAACA                 GCAT CAA ATGC                 AAAACAGCATCGTCT  56 185
 FAI41_01250 NONE
 FAI41_01245 NONE
 FAI41_01240  251780 ..  251791 -  -4.4  -3.91357   GTACAATTATAATAA                TTCG TCAG CGAA                 GGAAACGCCTGTTAA  59 5
 FAI41_01235 NONE
 FAI41_01230  249706 ..  249718 -  -6.3  -3.53012   GTTTTCTCGTGGAAA                GTCAA TTT TTGAC                AAATAAAACCCAACT  61 158
        proP  248080 ..  248095 -  -3.2   -2.7083   CATTTTATAAACTCA              CTCTCC TCAA GGACAG               GAAATAGACATCCTC  43 44
        proP  246508 ..  246530 - -13.6  -5.41746   AATTTTCTAAAAAAA           GCACTGTAAA ATT TTTACAGTGC           TTTTTTTGTTTCTTA 100 48
 FAI41_01200 NONE
        pdxA NONE
 FAI41_01190  240088 ..  240102 -  -2.8  -3.53444   TCAGCTTTTTTCAAA               GAAATC TTT GCTTTC               TTTAAAAAATTTAAT  48 54
 FAI41_01185 NONE
 FAI41_01180 NONE
 FAI41_01175  238594 ..  238607 -  -3.9  -2.53581   CATATTTCCAATTCA               CTTTA TAGA TAAAG                AATGAATTTAAAAGA  45 33
 FAI41_01170  236793 ..  236822 -  -2.7  -5.07652   TTTCTTAAAACAAAA       CTGCCTCGTTTCC TTCT GAAAATGGGGCGG        TTTTATAAATAGCTT  70 132
 FAI41_01130  227641 ..  227663 -  -8.5  -4.84311   TTCCAGACAACAAAA          CCCCGTCTTT TCAT AAAG-CGGGG           TTTTTTACTTTAAGG  95 35
 FAI41_01115  223643 ..  223653 -    -4  -5.40072   GCTGTTTTAAAAAAA                 TCAT CGA ATGA                 CCTCATCGAAGGAAG  83 371
        nusB NONE
        thiL  221464 ..  221477 -  -2.3  -4.07885   TAGGCTGGGTTAAAA               TTGGC TGGC GCCTA                TTACGTGGCCGCTTT  55 304
 FAI41_01090 NONE
         glk  218560 ..  218575 -    -9   -5.8187   TAGTTAACAAAAAAA              TCCCCT AAGA AGGGGA               TTTTTCAATCATGAG 100 47
        guaB NONE
 FAI41_01065  214196 ..  214227 - -13.2  -3.75762   CGAATTAAAATAACA      TAAAAACAGGAGGT AAAT ACCTCCTGTTTTAA       AATTTAATCCGCTTC 100 29
        uvrC NONE
        pgsA NONE
 FAI41_01045  210069 ..  210082 -  -2.5  -4.11625   AAAACAAAGACCAAA               TTTAA CCTA TTAAA                ATACTCAGATTTTAC  55 37
        rpmG  209696 ..  209727 - -10.3  -3.86897   GCCAGGTGGCACAAA      GGGGATAAGTCAGT AATCA ACCGACT-ATCCCC      TTTGAGAATACTTCA  88 58
 FAI41_01005  202051 ..  202070 -  -4.4  -3.18268   TCTCAAGTAAAATCA            TCATAAAA AAGA TTTTACGA             TCCCTTAAGTCGGCA  51 45
        pdhA  200560 ..  200573 -  -3.9  -4.65895   GCCTGCATCGAAAAA               TTCAT TGTC ATGAA                CTCAACAATCGGCTT  66 313
 FAI41_00990  198570 ..  198581 -    -3  -4.17274   AATTAAAGAACCAAA                GAAT GCGG ATTC                 TCTAGAAAGTTCTTA  55 1
        lpdA  197081 ..  197110 - -13.8  -2.63596   TTTGACTTTATATTA       TCTCTGACTTTC GATGAG GAAAGTCAGAGA        TAATATGTTTTAGAT  93 35
        lipA NONE
 FAI41_00975  195518 ..  195540 - -10.7  -5.60993   CCCCTCATAAAAAAA           CCTGCTTTT ATTAA AAAAGCAGG           TTTTCTAAAAATCAA 100 43
 FAI41_00965  193365 ..  193381 -  -3.7  -5.04265   AAAAAATAGGAAAAA              GAAAGAA GTT TTCCTCC              CTATTCCCTTTTATT  72 43
 FAI41_00960 NONE
 FAI41_00955 NONE
 FAI41_00950 NONE
        grxD NONE
 FAI41_00940  190723 ..  190752 - -12.3  -4.86862   TCCAAAAAATCAAAA       CCTCTCTCC-AGAG CAA CTCTCGGAAAGAGG       CATACCAAATTGGCT 100 376
 FAI41_00925  187789 ..  187807 -  -7.4  -4.58283   CAAGCCGCGCAAAAA             CAGCTCCC TAG AGGAACTG             TCATTTTTGCCAATA  80 473
 FAI41_00915 NONE
 FAI41_00910 NONE
 FAI41_00905 NONE
 FAI41_00900 NONE
 FAI41_00895  182511 ..  182525 -  -2.8  -2.84192   CACATCAGGATTATA               CAGTTC AGG GAAATG               CTCCCTAATAGAGTT  42 341
 FAI41_00890  181818 ..  181828 -  -2.6  -2.72855   GAAATGGCTCAATTA                 TTTT TGA AAAA                 GATTATTAAAATGCC  41 12
 FAI41_00885  179544 ..  179569 - -11.9  -4.82901   CTTTTTCCATAAAAA         GAGGCGACATC CGAA GATATCGCCCC          TCTTTTTGAAATCAA 100 56
 FAI41_00880  179317 ..  179350 -  -7.6  -3.21772   AATCTGGGCATAACA     TAGCGGATTTTTCT GATTTA AAAAACATCCGCTA      AAAGCAAAATCATTT  66 58
        proB NONE
        proA  176825 ..  176881 - -20.6  -4.39746   CACAAAAGAAAAACA CCGC-TAAAAGCAAAAGGCTGAACACA AATT TATGTTCAGCCTTTTGCTTTTTTACGG ACGGGAAAGATAATC 100 20
        msrA  175539 ..  175559 -  -9.8  -2.62244   TTTTTTAAGAAAATT            GGGGATTA AATAA TAATCCCC            TTTGTTTCAGCGATT  74 32
 FAI41_00850 NONE
 FAI41_00845 NONE
 FAI41_00840 NONE
 FAI41_00835 NONE
 FAI41_00830  170782 ..  170792 -  -2.6  -3.29459   CATCTAATAACTTAA                 TTTT ATA AAAA                 GAAAAATCACAGATA  46 42
 FAI41_00825 NONE
 FAI41_00820  170052 ..  170069 -  -8.5  -5.69262   CTAGAAAAACAAAAA             GATTCCT AAAA AGGAATC              TTCTTTTAAAGAATG 100 39
 FAI41_00815  169887 ..  169904 -  -2.7  -4.72201   TTCTACAAAAAAGAA             TTTCTTC TAAA GAGGAAA              AGAGATTTTAAATTT  65 55
 FAI41_00810  169698 ..  169715 -  -8.5  -5.69262   CTAGAAAAACAAAAA             GATTCCT AAAA AGGAATC              TTCTTTTAAAGAATG 100 39
 FAI41_00805  169487 ..  169501 -  -3.5  -3.59087   AATACGATCGTTAAA               GGAAC GTTTG GCTCC               CCTAAAACCTATTTG  51 104
 FAI41_00795  166044 ..  166085 - -14.1  -4.88293   AATCTCAAAAATAAA TATTGAGAATAATAAGCTA TTTT CAGCTCATTATTCTCAACA  AAATGAAATAAATAA 100 48
 FAI41_00790 NONE
 FAI41_00785  165373 ..  165402 - -13.9  -3.32936   TAAATCAATAACACA       TAAGAAATAGAGA TTAA TCTCTATTTCTTA        TTTTATTGGACTATA 100 28
 FAI41_00770  163084 ..  163102 -  -8.9  -4.73677   TGCAGAATAAAGAAA             TGGGGAA AATCA TTCCCCA             TTTTCATAATTTTCT 100 53
 FAI41_00650  133834 ..  133850 -  -9.4  -3.58864   TGACGATGAGAAACA              GGGGGA ATAAA TCCCCC              TTTTTTGAAAAAGAG  78 45
 FAI41_00630  131634 ..  131646 -  -3.3  -3.22995   CCAACCACAAGAAAT                GGATG GGA CAACC                TGTGTCAACGCTGTT  47 160
 FAI41_00620 NONE
 FAI41_00615  128761 ..  128777 -  -2.4  -5.00267   AAGGATAAAAAGAAA              TATTTT TTCAT AAAATA              ACTGCGCCTTTTGCC  66 16
 FAI41_00610  128227 ..  128239 -  -4.1  -2.85004   AAAATGAGAATATCA                TCGAC CCA ATCGA                GAAATGTTTTAATCT  46 42
 FAI41_00600  124313 ..  124325 -  -4.1  -5.00616   CTTGCCCTTAAAAAA                GCATT TTA AACGC                AAGAATACCTCCTTC  72 5
 FAI41_00595 NONE
        sufB NONE
        sufC NONE
 FAI41_00580 NONE
 FAI41_00575 NONE
 FAI41_00570 NONE
 FAI41_00565  118124 ..  118137 -  -2.4  -5.13521   AAACCATCCAAAAAA               GAAG TGTTAC CTTC                TACCCTTGCGGATGA  71 137
 FAI41_00550  115955 ..  115973 -  -4.6    -5.186   CAAAAGACATAAAAA             TCTTTTGA TTT TCCAAAGA             AAATATTTTTTTCTT  76 49
 FAI41_00545  114336 ..  114371 - -17.2  -4.65895   CGCTTTACTTAAAAA    CTTAACTTTTGGGAAA TCTC TCTCCCAAAAGTTAAG     AAAACAGTTCTTAAT 100 82
 FAI41_00540  113645 ..  113665 -  -8.5   -3.1704   AAGAAAATTGTAACA            GTAAATTTT ATA AAAATTTAC            AAATTATTTCTCTTC  69 29
        clpX  112286 ..  112298 -  -4.9  -3.25061   TCATACAGAACAAAT                CAATA TTT TATTG                CACACTGCTTTTTCC  53 50
 FAI41_00530 NONE
 FAI41_00525 NONE
 FAI41_00520 NONE
 FAI41_00515 NONE
 FAI41_00510 NONE
 FAI41_00505 NONE
 FAI41_00500 NONE
 FAI41_00495 NONE
 FAI41_00490  102480 ..  102490 -    -4   -3.3676   CGGAATAGCTCATAA                 TGAT CTT ATCA                 TCTCAAAATCGTTAG  50 70
        dnaE   98537 ..   98547 -  -5.4  -4.55826   GGGAAAATATTAAAA                 TGGA TCG TCCA                 ATAGATCTCATGACG  72 524
 FAI41_00470   97148 ..   97164 -  -2.4  -3.92143   AGATGAAAGGAAGAA              TTTAAA TTTCT TTTAAA              GAGAGTTTTAAAGAA  51 10
 FAI41_00465   96285 ..   96295 -  -2.6  -4.03782   AACACGAGAAGGAAA                 TTTT GCA AAAA                 TTGCAGCCATAGGAC  56 236
 FAI41_00455 NONE
        galU   94697 ..   94727 -  -4.8  -2.96779   TCGGGAAAACAGAAG       GAGCATCTTAAATA TAT TTTTTAAGAAACTC       TCTAACACCTGACGC  52 2
 FAI41_00445 NONE
 FAI41_00440 NONE
        grxC   92159 ..   92183 -  -4.5  -3.27525   CGTTGGGAAAGCCAA          TAAAAAAATAA AGA TTATTTTCCTA          AAAACTTTATTTTAC  51 32
 FAI41_00430   91707 ..   91723 -  -2.3  -4.76191   ACAGATGAAAATAAA              CGTATTT TTT AAATACC              TTTTGCCATCTGACA  64 17
 FAI41_00425   90340 ..   90351 -  -5.8  -3.22298   TTTATGTATGAGGAA                GTCC ATTA GGAC                 TTCCCTTTCATGAAA  58 19
 FAI41_00415 NONE
 FAI41_00410 NONE
 FAI41_00405   86109 ..   86134 -  -5.6  -4.30001   TAAAAAACCAAACAA         GGAAATCAAA TATCTT TTTAATTTCC          ATTCAATCGTGAAAG  67 17
        ispG NONE
 FAI41_00395 NONE
 FAI41_00390 NONE
        prmC NONE
 FAI41_00380   81127 ..   81147 - -12.7  -3.43217   TACCAATATTTAGAA            GTGAGGAAT ATT ATTCCTCAC            CCTTCCCCTCTTCAT  93 15
 FAI41_00365   79055 ..   79069 -  -8.6  -3.84061   CAGAATAAAAGAATA               CGGAAA CTT TTTCCG               CTTTACCTGCCTTAT  75 487
 FAI41_00350   76679 ..   76691 -  -4.1  -4.40173   TAAGCGAAAAAAATA                TCCAT TTT ACGGA                TCGCTTAAGTCCCCT  63 19
 FAI41_00345 NONE
         tmk NONE
 FAI41_00335 NONE
 FAI41_00330 NONE
 FAI41_00325 NONE
 FAI41_00320   70479 ..   70494 -  -4.6  -3.03701   TCCTATTAAATGATA              GCGGAG GCTT CTCCTC               TTGAGAAAGATTTTT  50 233
 FAI41_00315 NONE
        coaE NONE
        dnaQ NONE
 FAI41_00300 NONE
 FAI41_00295   66118 ..   66134 -  -6.7  -3.27951   TATCTTATGAGAAGA              TTTTCTT TTC AAGAAAA              AAATAAGGGAAGTTT  61 17
 FAI41_00290 NONE
 FAI41_00285   63982 ..   64002 -  -4.1  -4.71382   AGAATTATTTAAAAA            CTAATTTTA AGG TAATATTAG            CCATAAGAATGCAAG  66 22
 FAI41_00280   62203 ..   62218 -  -2.6  -3.54475   TGGGCTATGATACAA              TCTATGG CTT CCA-AGA              TATGAAAGATGATCA  48 331
 FAI41_00270   60669 ..   60709 -  -6.4  -4.68846   AGCAAGAAAGGAAAA  GATTAACGCCTTTC TAAAAGATGCGCT GAAAGACGTTAATC  ATTTGATAAACTTAT  78 99
 FAI41_00265 NONE
 FAI41_00260   58530 ..   58554 -  -5.9  -4.18465   TGCCAAAAAAGATAA          TTTATACCAAA GCT CTTGATATAAA          GAATAAACATTCTGA  69 50
 FAI41_00250   56320 ..   56332 -  -6.3  -2.95079   GAAGATGGGACAAAT                CTTTG TAT CAAAG                CCCTCAGCATCAATA  56 52
        fabI NONE
 FAI41_00220   49315 ..   49328 -  -3.1   -2.8333   CCAACCATAAGACCA               GAAAG CTTA CCTTC                AGCGGCATCTGCCTC  44 84
 FAI41_00215   48159 ..   48188 -  -9.5  -3.32963   ATTTCGAGGTTACAA       GCCTCCATTTCTTC AGA AAAGAAATGGAG-C       AACTCCTTTAAAGGA  76 179
 FAI41_00210   46903 ..   46943 -  -6.3  -4.07831   TTAAAAGAAATAGAA  TCACTCTTCCTCTCCTCTT CTA AAAATGAAAGAAAGATTGA  TTGTGTTGCCTTGGG  68 298
 FAI41_00145 NONE
 FAI41_00140 NONE
 FAI41_00135 NONE
 FAI41_00130 NONE
 FAI41_00125   30852 ..   30871 -   -15  -2.88571   GCTGTTAAATAGAAT            GGAGGGGG GCTG CCCCCTCC             CTTTTTTCCCTATAA 100 46
 FAI41_00115   27447 ..   27461 -  -3.6  -5.41941   TAAATCAAACAAAAA               TCACAA ATA TTATGA               TTGTTTGTCTTCCCC  78 228
        fabD NONE
        fabG   25603 ..   25617 -  -4.3  -3.34468   TTCCAATTAAAGAGA               TCTTC TAGAC GAAGA               AAATCTGATTAATTC  53 96
 FAI41_00100   25269 ..   25298 -  -2.7  -5.27477   ATTTTAAGTAAAAAA       TGCGGCGCCTT TTTTATTG ATAGCGCCGCT        AGAATTAAACTGTTC  74 39
        fabF   23914 ..   23934 -  -3.9   -5.3671   AAGATAACGAAAAAA            GGCAACGAA TAA TTCCATGCC            TTTTTCCCCTATTTC  78 62
        mltG   22338 ..   22352 -  -2.9  -4.15222   ACTCTGTTTAATAAA               TTTTC AAAAG GAAAA               TGTGTTTTGCTCAGT  56 432
 FAI41_00070 NONE
 FAI41_00065   18397 ..   18443 - -16.9  -3.97051   AAAGAGGTTAAAGAA GAGATGGAAGCGTTTGATATA TAACT TATATCAAACGCTTCCTTTTC CTTTTAATATGAAAG 100 9
         alr NONE
 FAI41_00040   12185 ..   12224 - -16.8  -4.09243   GACACTCTCTTAAAA  CAATAAAAAAGGCACTCA TTTT TGAGTGCCTTTTTTATTT   CATCATATTTATAAA 100 42
