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    ACL_1070 1107372 .. 1107394 +    -5   -6.4753   TTGACTCAAGCATAA           TCTATAGA TAGTAAT TCTATAGA           TTTTTTTTTATTTGC 100 15
    ACL_1074 1110203 .. 1110246 +  -8.4  -4.12315   GAATATTGATTAAAA TAATCAAACCTGAGCTAAGTT TCA GGCTTAACTCAGG-TTGATTG TTTGATTATTAGTTT  81 72
    ACL_1085 1119616 .. 1119631 +  -3.4  -4.68593   ATCTAAATCAACGTT              TTATAA GTAT TTATAA               TTTTTCAATAATAGG  64 10
        pfk2 1130228 .. 1130255 + -14.3  -4.85782   AAGTTCTAAATTGTA        GAAGCCTAACC AATTTC GGTTAGGCTTC         TTTCTTTTTAAACGC 100 39
    ACL_1093 1131679 .. 1131714 +  -9.2  -5.16133   GGTCTATAAAAAGAA    GCATAATCTTATGATA CTCG TAACTTAAGATTATGC     TTTTTATGTTATAAT  95 32
    ACL_1094 1133204 .. 1133240 + -15.3  -4.20025   TCATGATCCAAACAT    AAAAACCGTGTAGACTC AAT GTGTCTACACGGTTTTA    TTTATCTTAAGGATT 100 13
         ada 1139030 .. 1139048 +  -3.2  -4.96848   GAAGGGGGAAAGTAT             TTATGAAG AAA CTTTATGA             TTTTTATCTAAACCA  65 20
    ACL_1102 1139914 .. 1139945 +   -11  -3.89226   AGACATTAATAAAAA      CAGGTGAAGTCATA TGAA TATGATTTCTCCTG       TATTATTTTTATCTG  95 32
    ACL_1110 1147762 .. 1147778 +  -8.7  -5.01553   AGCACATATAAAAAA              CGCACTT TAT GAGTGCG              TTTTATTTATAAGTT  95 40
    ACL_1121 1185583 .. 1185627 +  -8.8  -4.30704   TGTCAATGATAAAAA CAACCTAC-AAATGGGAGAGA CTAG TTTCACACATTTAGTAGGTTG TTCTTCTTTTATATT  83 367
        clpB 1188890 .. 1188930 + -12.3  -4.86939   ATTAGTCTCATAAAT TAAA-ATATCCCTATCAC TAATTT GTGATAGGGATATCTTTA  TTTTTGGATTTGTTC 100 28
    ACL_1126 1190640 .. 1190672 + -18.7  -5.65927   AATTAAAAAAAGAAA      CTGCGTTATACCTTA AAT TAGGGTATAACGCAG      TTTTTTATTTGGATA 100 39
    ACL_1141 1200062 .. 1200078 +  -6.6  -4.61873   TAGACAAATAAAAAA              CTCACA GTTCA TGTGAG              TTTTAATTTATAAAA  76 38
    ACL_1162 NONE
    ACL_1163 1218832 .. 1218848 +  -2.9  -3.05384   GCCTAGTACAATCGA              ACCTACT ACA AGTGGGA              TTGCATAAAAGGGAA  45 508
    ACL_1177 1230822 .. 1230845 +    -9  -5.67063   TAAACACTTAACAAA          CGTTTAAACT TCTA AGTTTAGACG           TTTTTTTATCATAAA 100 38
       pepB2 1235524 .. 1235556 + -14.4  -5.38054   CCGCGAAATTACATT      TCGTCCTTAGAAGT TTTAT ACTTTTAAGGACGA      TTTTTATTTATAGAA 100 232
        trpS 1236585 .. 1236600 +  -6.2  -5.94713   CTTGAAAAGAAAAAA              GTGATT TTAT AATCAC               TTTTTTTTATACCAT 100 22
         def 1245705 .. 1245738 + -11.1  -5.42605   GCTGAATAAACTTAA     GGCTTAGAACCCAAA TTGA TATGAGTTCTAAGCC      TTTTATTTTTATTGA 100 32
    ACL_1199 NONE
        rpsD 1251855 .. 1251874 +  -9.4  -5.98675   GTTTACAAAAGTAAA            GGACATTT TATT AAATGTCC             TTTTTTCTTTTTCTA 100 44
    ACL_1211 1260091 .. 1260130 +  -9.6  -5.24799   TTTAATGGACTATAT  AAAAACACTTTAAACTAA ATTT TAAGTTTAAAGTGTTTTA   TTTTTATGTTTATGA 100 13
    ACL_1218 1267161 .. 1267183 +  -9.2  -5.19916   TATTAAAAGATAAAA           GAGAATTTCC TAA GGAAACTCTC           TTTTTTAAATCTTTT 100 42
    ACL_1224 1274955 .. 1274982 + -13.5  -5.29445   ATATATATAAGGAAA        CAGGGCGTACC GATTAA GGTATGCCCTG         TTTTTATTATTCACC 100 40
    ACL_1226 1278334 .. 1278359 + -12.7  -4.82518   TTAAGATACAATAAA         CACCAAGGCAT GCGC ATGTCTTGGTG          TTTTCTTAATATTTT 100 27
    ACL_1227 1278788 .. 1278814 + -12.5  -5.39721   TAATATAAAAATATA         GACGTTATTCA ATGGA TGAATAACGTC         TTTTTTCTATAGTAA 100 38
    ACL_1241 1294805 .. 1294833 + -17.6  -4.32436   AATCTATAAATAAAA        CAGGTGGTGCAA TTATC TTGCACCACCTG        TTTTACTACTCATAT 100 44
    ACL_1278 1334915 .. 1334933 +  -8.9   -6.4275   TGACGTTGAACCTAA             GAGCGAT AAATA ATCGCTC             TTTTTTTTATTTTTC 100 13
    ACL_1279 1335797 .. 1335843 +  -4.2  -4.82819   CATAATTTAATAAAA TTAAGTTTTCAA-TGATA-TGA TTTGT TCATTTTCAATTGAAAACTTAA TTTTGTTATGCTATA  68 57
    ACL_1280 1335965 .. 1335983 +  -8.2  -5.94713   TCTAATAATAAGCAA             TGTTGCAT ACG ATGCAGCA             TTTTTTTTATACACT 100 41
       mgtA2 1338934 .. 1338966 +    -8  -5.61596   TTCATCAACAATAAA     TACTGTGACTTATGA AGTA TTA-AAGTCACAGTA      TTTTTTTATACCCCT 100 72
    ACL_1282 1341055 .. 1341081 +  -9.6  -4.69656   ATAAGAAATAATCCA         TCCCTTTTTC CCTATAT GAAAAAGGGA         TTTTCTTACGTCATT 100 37
    ACL_1283 NONE
    ACL_1284 NONE
    ACL_1285 NONE
    ACL_1286 1345161 .. 1345186 +  -9.1   -5.4659   ACAAATTAAAAATAA         TACCAGTCACT TCAA AATGACTGGTA          TTTTTATTTATGTTG 100 32
       lplA2 1366320 .. 1366331 +    -3  -3.35597   CCAGCTGCACTATAG                TGTA CTAA TACA                 TATTTAAACCATAAA  46 370
    ACL_1318 1376971 .. 1377004 + -14.9  -5.09762   AAAGAAGAACAATAA     TCATAATGAAGATGG ATTT CTATCTTCATTATGA      TTTTTATGTTAAAGT 100 26
    ACL_1319 1377642 .. 1377658 + -10.9  -4.49644   AAGTACATTAAAAAA              CTCAAGC CTA GCTTGAG              TTTTAAATTTTTAGT 100 40
    ACL_1323 NONE
    ACL_1324 NONE
    ACL_1325 1383592 .. 1383602 +  -6.8  -2.94872   AAAAGACATTCACAC                 GGTC TTT GACC                 TATAATCTATTTAAA  61 10
    ACL_1326 NONE
        ispA 1384863 .. 1384889 + -11.1  -4.81644   AGAAAATAATAAAAA         GAACTATCAAA TTTAT TTTGATAGTTC         TTTTACTTTTGTTTA 100 32
        purB 1391624 .. 1391664 + -16.6  -2.73676   AAAGTCTTTAAAACA  TAATAAAAGTCACATATC TATTT GATGTGTGACTTTTATTA  TCCCTTTACTTTAGG 100 23
    ACL_1369 NONE
    ACL_1370 1432476 .. 1432486 +  -2.6  -3.63305   TATATCATGAATTAA                 TTTT TAC AAAA                 TTTACACATTCTATA  47 26
    ACL_1371 1434150 .. 1434175 + -10.6  -5.10968   ATTAATTAAACAAAA         GAGTTCACTT AGCTGG AAGTGAACTC          TTTTTGTATGTTAGT 100 56
        hslO 1442855 .. 1442874 + -10.8  -5.59655   AAATAGCATTAAAAA            GGGATGAA AAAT TTCATCCC             TTTTTTGTTAGTTTG 100 35
    ACL_1384 NONE
         hpt NONE
        ftsH NONE
    ACL_1387 1449349 .. 1449363 +  -3.5  -5.14965   ATTTCCGAAGAAAAA               CGGTC TTTAT GATCG               TTTTTTAATGGAAAT  69 14
        lysS 1450916 .. 1450933 +  -9.9  -5.30616   TAATATATCAAAAAA             CCTCCAA TATT TTGGAGG              TTTTTATTTGCATGA 100 38
    ACL_1421 1484530 .. 1484540 +    -4  -3.12856   GAAGTGAGGGTAGAT                 TATC ATG GATA                 TACTTTATATTAGTT  48 34
    ACL_1422 1486100 .. 1486120 + -12.7  -5.49729   CCAAAATAATTAGGG            TGTCTGGAA AAC TTCCAGACA            TTTTTTTGCATAATT 100 257
        rpmH 1496698 .. 1496714 -  -2.3   -4.6951   ACTACCTAAAACAAA              TAAACAA TAT TTGTTAA              TGATCTGGTAGTCCT  59 69
        rnpA NONE
    ACL_1431 NONE
    ACL_1430 1494160 .. 1494180 -  -6.9  -5.76949   TAGGTGTAAAAAAAA            TATCTCCAA TCA TGGGAGATA            TTTTATAATTTAAGT 100 43
    ACL_1429 1493133 .. 1493150 -    -2  -3.91801   AAAAGACTATAATAA             CACTCA TACCGG TGAGTA              AAATAATTTCTGTAG  50 49
    ACL_1428 1491757 .. 1491785 - -17.7  -4.46073   TTTTAATATAATAAA        GTCCTTAGACTAA AAT TTAGTCTAAGGAC        GAATAATCGCGGTAC 100 285
        asnS 1490345 .. 1490357 -  -3.5  -4.41494   TATTTTGAATTAAAA                TAAAA TGT TTTTA                GGTGTTCTAGGGAAT  59 7
        phrB 1488933 .. 1488952 -  -7.2  -5.13473   ATGAGATGTAAAAAA            GACCACTT CATG AAGTGATC             TTTATAGTGTATTGA  86 27
    ACL_1425 NONE
    ACL_1424 NONE
    ACL_1423 1485580 .. 1485592 -  -4.1  -4.42619   TAATATTTTAGAAAA                CGCTT ATG AAGCA                CTACTTCACGTGGAA  62 304
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    ACL_1417 NONE
        crtI NONE
    ACL_1415 NONE
    ACL_1414 1477163 .. 1477189 -  -5.3  -5.94597   CAATATTAAAAAAAA        GCAAAACTACAC ACCC GTGT-GTTTTAC         GCAATAAATAGGTTT 100 451
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    ACL_1412 NONE
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    ACL_1410 NONE
    ACL_1409 1469280 .. 1469310 - -15.6  -5.18371   TTTTAGAAAAGAAAA       GCCTATGCTTCATT CTT AAAGAAGCATAGGC       TCTAATTTTTTATCA 100 77
    ACL_1408 NONE
    ACL_1407 1466938 .. 1466968 -  -6.3  -5.19328   ATTTGATAATAAAAA       CCACTTAATACTA CAATT TAATTTTAAGTGG       TTTCATTGTGTTAAA  86 53
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    ACL_1405 NONE
    ACL_1404 NONE
        trmE 1463011 .. 1463025 -  -5.8  -2.99433   TAATTATATCATATA               TAAGTT TGA AACTTA               ACTATTTTCCAAGAC  57 27
        dnaX NONE
    ACL_1401 NONE
        recR 1460351 .. 1460367 -  -3.7  -3.69373   TAAACACTTCAATAA              TGCAACA ACT TTTTGCA              ATTAAGATAAATTTT  50 39
    ACL_1399 1459666 .. 1459684 - -10.3  -5.30616   GTATTCAAATAAAAA             TGCGCCT ATTTA AGGCGCA             TAATTTAAGAATTTA 100 69
    ACL_1398 1458609 .. 1458635 -  -4.7  -5.74684   TAATAAAAAGAAAAA        GATAGATA-TTA TACA TAACTATCTATC         TTTGATATTTGGGCG  87 17
    ACL_1397 1457602 .. 1457619 -  -9.9  -5.59962   TAAAATAAATAAAAA             GTCTCCT AAAA AGGAGAC              TTCTTTGAATTGTCG 100 132
        pyrG 1455911 .. 1455923 -  -4.9  -3.01791   ATCGTTTTGCCAATA                GATAT TAT ATATC                TAATTGTATTTTTTT  52 58
    ACL_1395 NONE
    ACL_1394 1454404 .. 1454421 -  -8.5  -5.13741   TTAAGGTAAGAAAAA             GGAATGA TTTC TCATTCC              TTTATAATTCCTAAT  95 19
    ACL_1393 NONE
    ACL_1392 NONE
    ACL_1391 1451854 .. 1451870 -  -3.8  -3.19175   TTCTAATATATCTAA              TAACTT CATAT AAGTTA              CCTCCTTAGAGTTTT  49 31
    ACL_1390 NONE
    ACL_1389 1450916 .. 1450933 -  -9.9  -5.27399   TAATATATCAAAAAA             CCTCCAA TATT TTGGAGG              TTTTTATTTGCATGA 100 50
         maf 1444722 .. 1444753 - -10.4  -5.77734   AAATAAAAATAAAAA      CCTATAAATCAGTT ATCG AATTGATTTATAGG       TTTTAGTTAATTTCA 100 38
    ACL_1382 NONE
    ACL_1381 NONE
    ACL_1380 1442855 .. 1442874 - -10.8  -4.81734   AAATAGCATTAAAAA            GGGATGAA AAAT TTCATCCC             TTTTTTGTTAGTTTG 100 33
         duS 1440743 .. 1440760 -  -6.3  -5.75342   TTTTCCTAAAAAAAA             GACACTT TATC AAGTGCC              TAATTAGAAGGTGTG 100 164
    ACL_1377 1439217 .. 1439238 -  -9.5  -5.30189   TATAATATCAAAAAA           TGTCGCTTC CGTA GAAACGACA            TTTTATATTTATATC 100 60
    ACL_1376 1438084 .. 1438096 -  -9.1  -5.66926   TTAAAAAAAATAAAA                GGCAC TAC GTGCC                TAATATTTTTTAAAT 100 25
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        rbsK NONE
    ACL_1373 1435251 .. 1435262 -  -5.8  -2.70932   CTGTGGTTGCAATTA                CAGC GGCT GCTG                 TTAATGTTGACATAC  55 510
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        rimI NONE
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        hprK NONE
    ACL_1344 1402103 .. 1402113 -  -2.6  -2.77416   ATTATTAATACATCA                 TAAA TCA TTTA                 TTATTACCTCTTAAA  41 36
       trxB4 NONE
    ACL_1342 NONE
        acpT 1399904 .. 1399914 -    -4  -2.62157   CATCAATTTTACAAC                 CTAA ACT TTAG                 TTTCTAATACAACAA  45 15
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        ftsZ  737858 ..  737874 -    -3  -3.12407   AACATAATCTTAATA              CCTTTC GTTAA AAAAGG              CTTCCGCCTCTTTTA  44 38
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    ACL_0561  598616 ..  598650 - -12.4  -5.35815   TAGACTAAATAAAAA     GCCTTAAAGATTATAC AAA ATGTAATCTTTAAGGC     TTTTATCTTTAAAAT 100 34
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    ACL_0517  540288 ..  540315 -  -7.1  -4.54821   ACCCTAATTATAAAA        CAAAACCCGCT AAGCTA AGCAGGTTTTA         ATAAAAGGGGACGAA  78 46
    ACL_0514  538585 ..  538641 -   -15  -3.86658   GTATAAAATATATAA TTATAACGAAACAGATACATAAAAGCA AAAA TGCTTT-ATGTATCTGTTTTGTTATAG GTGATAAAAAGATAA 100 68
    ACL_0502  525919 ..  525970 - -11.2  -4.61527   AAAATCTTCTAAAAA GACGATTAAAAAAGAGAAATTCAA TATT TTGGATTTCTCTTTCTTTATCGTA AATAAAATATTTAGT 100 43
    ACL_0484  507805 ..  507820 -  -6.2  -6.18768   AAAACATAAAAAAAA              TACTTC GAAC GAAGTA               TTTTTTATTTATTAG 100 37
    ACL_0452  474982 ..  475009 -  -9.2  -5.28176   TTTATGTATAAAAAA        GGACCATCTTTC ATTC GAAAGGTGATCC         TTTTTGTTTTATTTT 100 34
    ACL_0448  469287 ..  469317 -  -6.9  -4.88258   AAAAGTATAAGAAAA       GGGCAGTTGTT TTTAGTGTG AACAGCTGCCC       TTATTATTTAACTAT  83 41
        phnA  444005 ..  444020 -  -6.2  -6.10295   TTAACATAAAAAAAA              CAAACT TGTT AGTTTG               CTTTTTTAACAAAGT 100 18
    ACL_0422  442472 ..  442494 -  -8.5  -5.05113   TGTATATAAAGAAAA           GCTCAATCC TATTT AGATTGAGC           CTCAATGATTATTAA  95 45
        ibpA  441866 ..  441884 -  -3.8  -5.68039   AAATGTATAAAAAAA             GAACCCAA GTA CTGGGTTT             TGGTAAACTGGAATT  80 60
    ACL_0420  440451 ..  440485 - -15.2  -6.01369   TAAAGAATAAAAAAA     CTCTAACTAGACCCAA AAA TTAGGTCTAGATAGAG     TTTTTAAACTATATA 100 43
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    ACL_0368  385147 ..  385171 -  -7.2   -5.9218   CATATAAGAAAAAAA          TCCAAGTCAT TTATT AGGACTTGGA          TTTGTTTTTAGAGAG 100 50
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        fbpA NONE
        sodA  311345 ..  311365 -  -8.4   -6.4753   TTAAATAAAAAAAAA            CCAAGAAA ATAAA TTTCTTGG            GTAAGTAGTTTAAAT 100 325
    ACL_0297  306762 ..  306795 -  -9.8  -5.03945   TAATAACTATAAAAA     GAAGCAGAAATATC AAATTA GATATTTCTGCTTT      TATTTTGTTTAACGC 100 34
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        rpmB  254712 ..  254725 -  -6.7  -5.97979   AGAACAATAAAAAAA               GGCAT CTAA ATGCC                TTAGTTTATCTACAA 100 54
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    ACL_0244  240086 ..  240108 -  -5.6  -5.55695   TAATAAGATAAAAAA           TAGAGACAAT TTA ATCGTCTCTG           TTTTTTATAATGTAT  86 45
    ACL_0240  235540 ..  235560 -  -5.5  -5.75478   AAGTATATAAAAAAA            CTCCTTT GGATTAA AAAGGAG            TTTATATATATTATG  93 36
    ACL_0239  235113 ..  235137 -  -7.9  -5.62219   AATATACTAAAAAAA          CGAATCCTAAA ATT TCAAGGATTCG          TTTTTTATAGATGAA 100 30
    ACL_0225  216981 ..  217009 - -10.5  -6.00814   AATAATTAAAAAAAA        TACGCATATAC TGGAGAT GTATATGCGTA        TTATTATTTATATAT 100 72
    ACL_0223  214459 ..  214494 - -13.6  -5.46629   AACACTTTAAAAAAA    TAAGGATAACTTATCA AATT TGATAGGTTATCCTTA     TTTATTATGACAGGG 100 30
    ACL_0210  200955 ..  200974 - -10.8  -5.08178   ATATATATAGAAAAA            TGCGACTA TTTC TAGTCGCA             TTTAAACTTGTATAT 100 48
    ACL_0207  198010 ..  198039 -  -5.9  -5.26155   ATAGAAATAGAAAAA       TATTTCAAAAAGT ATAG ACTCTTTGAAATC        AATGCAGCATATTTA  84 98
         dps  190746 ..  190762 - -10.9  -5.97979   ACAATAACAAAAAAA              CCTGGAA AAT TTCCAGG              TTTTTGTTTATATGC 100 44
    ACL_0165  150625 ..  150651 - -10.3  -5.10163   AATCCCAAAATAAAA         TCCATTCAAGC AAATG ACTTGAATGGA         TGGGTTTATTGTTAT 100 37
    ACL_0164  149249 ..  149278 - -13.8  -3.67705   ATATATAAATCATAA       TAACCCAATCAC TTTCAT GTGATTGGGTTA        TTTCTATATGGATAA 100 408
    ACL_0135  118035 ..  118075 - -14.9  -5.02074   TTATTGTTGAAAAAA  TATAAATGGTGTAGCGTGA AAT TCACGCTACACCATTTTCC  TTTATTTAAACATTT 100 31
    ACL_0131  112004 ..  112021 -  -9.9  -3.36327   GTAGTTGATTTACAA             TCACCCA TTAT TGGGTGA              TTGTTTTATTAATGA  85 84
    ACL_0122 NONE
       trxB1 NONE
    ACL_0120  103722 ..  103740 -  -8.2  -5.38549   TTTAAATAACAAAAA             TCCTATCA GCA CGATAGGA             TTTTTTTATGGATGT  95 47
    ACL_0040   47397 ..   47421 - -10.1  -2.88544   TCGCACCTGCATATA          TTGAGGATATC TCT GATATCCACAA          GACAGAACCGTATGT  79 467
    ACL_0027   31156 ..   31187 -   -11  -5.10765   AAACAAATAATAAAA      TAACGGTTTGATAC CTAA GCATCAAACCGTTT       TTACTATTTATTACT 100 29
    ACL_0012   16427 ..   16452 -    -9  -5.86465   AATAACAGAAAAAAA         GCTCACCATC TTTAAT GATGGAGAGC          ATATAGAAGAAAATG 100 176
