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        fusA  839639 ..  839661 + -12.1  -2.77899   GTTAAAAACCAAGTG           CTCATGGAG CGACC CTCCATGAG           TAGTTAATAAAGGAA  87 75
         tuf  840894 ..  840911 + -10.5  -5.71712   TTTTCAGTGAAAAAA             GCGCTCC TTTT GGGGCGC              TTTTTTTATATCCAA 100 45
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 NT399_04010  843089 ..  843105 +  -9.5  -5.89827   AAACTGACTGGAAAA              GAGCAAT TTA ATTGCTC              TTTTTTTTACTCGTT 100 42
        rimI  844128 ..  844140 +  -6.3  -3.28416   CATCGGCATGGCGCT                CGTTA ATG TAACG                TTCATATAGATCATA  60 519
 NT399_04035  849634 ..  849647 +  -8.1  -5.71983   TATAGTTAAAATTAA               GCCTC TTCG GAGGC                TTTTTTTATGGTTAA 100 45
        rhtC  850402 ..  850416 +  -7.1  -5.93252   TTAAATAAGAAAAAA               GCCTC TTTAT GAGGC               TTTTTTATTTTTAAG 100 43
 NT399_04075  855711 ..  855724 +  -8.1  -5.64274   TTATTGTTTCAAAAA               CCACC TTCG GGTGG                TTTTTTTATGGGTGA 100 49
         rep  857898 ..  857920 +    -2  -5.85011   AATATTTGGCAAATT           TAAAAGCTTT ATT AAAGCGTTAA           TTTTTTTAATTTTTA  78 3
         dut  858422 ..  858446 + -12.3  -4.62471   AAAAAATAATGAAAA          GAAACGCTTGT TTT ACAAGTGTTTC          TTTTTACACCTTGAA 100 50
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        argB  860961 ..  860977 +  -4.4  -5.63504   TATTTTTTATTAAAA              GATCAC GCTAA GTGGTC              TTTTTTTATGCCATT  83 48
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         fur  866083 ..  866104 + -11.7  -5.60993   AAAACAAATAAAAAA           GGAAGGTTA CGTT TAACCTTCC            TTTTTTTATGAAGAA 100 57
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 NT399_08230 1711382 .. 1711394 +  -3.5  -2.70298   GCAATTTTAGGCTTT                TAATA TGT TATTA                CTTGTCGTTGAAGGC  44 216
 NT399_08235 1712256 .. 1712270 +  -4.4  -4.57569   TCTTTGGAAAATTGA               TTTAAA CCA TTTAAA               TTTTTGAGAAAGTGA  68 104
 NT399_08240 1713316 .. 1713333 +  -8.4  -3.38191   TGATTTATAAAAAAA             GCAGGC TTTTAT GCCTGC              TTCTCACAATTTTTT  73 50
 NT399_08250 1715290 .. 1715306 +  -8.7  -3.03243   ATTGGTTTCTCCTGA              GCTGCGT CAA ATGCAGC              TCTTGCCGCATCAAT  72 53
 NT399_08260 1716368 .. 1716393 + -13.4  -2.81326   TTAAAAATATAAATA         GCCGAACAGT AAAGGA ACTGTTCGGC          CTTATTGAGATTATG 100 37
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 NT399_08285 1722238 .. 1722259 +  -6.7  -3.27784   TGACTTTAAAGCTAT           TCAGCT-TGT AAC ACAGAGCTGA           TGTGTTGTCTTACCT  63 4
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 NT399_08305 1725257 .. 1725281 + -10.1  -4.15201   CTAAGTGCTAAAAAA          TGCCTTCTG CTTGGGA CAGAAGGCA          TTTCATTTAATTAAT  90 30
 NT399_08315 1729330 .. 1729346 + -10.9  -5.63517   GGAACAAATAAAAAA              GGAGCTT TAA AAGCTCC              TTTTTTATTTCAGGA 100 51
 NT399_08325 1731375 .. 1731401 +  -3.8  -3.11584   CCTACTGCATCGTAT         CAATAATTTAGG CAT TCAAGATTATTG         TCTGTTAAATAATCT  48 20
 NT399_08330 1732083 .. 1732109 +  -8.1  -5.60993   TTGAAACAGTTTACA        GTCCGCATTCTT CCCC AAGG-TGCGGAC         TTTTTTTATCAAAAA 100 415
 NT399_08335 1733498 .. 1733508 +  -2.6   -3.6682   TAAATTCTTTGATAA                 TTTA GAG TAAA                 TTTCAATAAGTCAAA  48 155
 NT399_08340 1734522 .. 1734549 + -11.5  -4.69549   TTTAATTATAAAAAA        GAAGATGTAAG AAAATC CTTACATCTTC         TTTTAATTTTAAATT 100 45
 NT399_08380 1742432 .. 1742444 +    -2  -3.13925   GAAGATTTTGAGTTT                TTGA TTATC TCAA                CTTATTTCTTGGTGG  42 214
 NT399_08390 1743845 .. 1743862 +  -4.9   -3.2827   CAAACCTACTCCGAC             GCAGCCAT CCA AT-GCTGC             TTAATGATTAAATCC  54 299
 NT399_08400 1756480 .. 1756510 + -11.3  -4.97312   GACTAATTCACTAGA       CGAAGAAGATGAG AATCG CTCATCTTCTTCA       TTTTTCCTTAATTTT 100 35
 NT399_08405 1757381 .. 1757403 + -14.2  -4.09864   ACTTTAACCTCTTTG           CAGCTGGCTG TAC CAGCTAGCTG           TTTTACAAAATAAAT 100 54
 NT399_08410 1757876 .. 1757891 +  -7.6  -5.26918   GCAGAAAATTTAAAA              GACTTC TTCG GAAGTC               TTTTTTATCACATCT  91 41
 NT399_08435 1762986 .. 1763005 +  -3.6   -4.6038   AAGATTAAGATTAAA            GATTGCAT AACG ATGAAATC             TTTTGATTTGGTATA  63 33
        modA 1763927 .. 1763943 +  -3.7  -3.00574   ATGGCTTTAGCGTGT              TGGCT CCAGTCA AGCCA              TGATGTTTTCTCTAA  46 6
        modB NONE
 NT399_08450 1765302 .. 1765317 +  -3.3  -2.58544   AACTTACGAGAGTCG              GAGTT ATAGAG AACTC               ATTCTGAGCCTGCGG  44 67
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 NT399_08460 1767156 .. 1767172 + -10.9  -4.99035   TTTAAAATATAAAAA              GCAGATC ATC GATCTGC              TTTTTATATGGGTGG 100 61
 NT399_08465 1768052 .. 1768078 +   -11  -2.66602   AAACTGTTATAAAAA         TAAAGGACAGCA TCA TACTGTCCTTTA         TGCATTCTTAAATGA  82 50
        ppk1 1772266 .. 1772294 +  -8.9  -4.18697   CTGGGTAAGGCATAA        GTCATAACAGAAC ATT GACCTGTTATGAC        TTTTCAAATGCTTTT  88 33
        pqqA 1772575 .. 1772609 +   -13  -3.97388   TTTCTATTCAAATCT     GTCATAAGCCCTAG TCTTGTT CTAGGGCTTATGTC     TTTCTAATAAGATAT 100 44
        pqqB NONE
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        pqqD NONE
        pqqE NONE
 NT399_08505 1776983 .. 1777015 + -10.7   -5.5074   AGTGGTTTTCACTTG      CGCTCATTTCTTTTT GAG AAGTAGAAATGGGCG      TTTTTTATTGCCTTA 100 197
 NT399_08510 1777580 .. 1777597 +  -7.7  -3.83768   TAAAGTTAAATGCAA             GGGTTCA TACG TGAGCCC              TTTAAATATTATTTT  74 38
 NT399_08515 1778098 .. 1778129 + -13.2  -2.70979   TAAAATTAGAAATGA      TTGAGGCGAAAC AACAAAAC GTTTCGCCTCAA       TACATTTAATTAAGA 100 66
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 NT399_08535 1781640 .. 1781655 +  -8.2  -5.31456   GTTAAAATTTAGCAA              CCGCCT TTTG GGGCGG               TTTTTTGTGGCTTAA  93 89
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 NT399_08580 1794336 .. 1794368 + -10.8   -4.1964   AATAAAATCAAGTTG      TAAAAAAGGTTGTC ATCAA GACAACCTTTTTAA      TTTTAAAGTATTAAG 100 307
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 NT399_08595 1799400 .. 1799429 + -13.9  -4.96468   TATAAGCATTTTTTT       GAATCATTGTTTA AATT TAAACAATGATTC        TTTTATTTAAATTTC 100 70
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 NT399_08650 1809798 .. 1809833 + -12.9  -2.62184   TCAGACCTTATAGTT    TTCCATGCATGTGCAT CATGA ATG-ACATGCATGGAA    TCCTCTAAAACGGCA  95 46
        fghA 1811270 .. 1811282 +  -7.7  -3.51232   ATCCCCCAATAATTT                GATGC AAT GCATC                TTGGTTTCAACCAAA  68 450
 NT399_08665 1812978 .. 1812992 +  -4.3  -5.06505   ATTTTTTTAAAAAAA               TAGAC GACTG GTCTA               TTTTTATGTATAGTT  73 484
 NT399_08680 1815143 .. 1815186 +    -4  -5.38497   GAGGGTCTGAGTTAA TAGCTTTCTTTCCTTTATTT TTCT ATATACAGGAAGGAAGGGTA TTTTTTAATTTAGAT  77 135
 NT399_08685 1816367 .. 1816418 +    -9   -2.6155   CGCAGATTAGTATTG ACTAAGTGAGTTATTTTGCCAACCG TTG TGGTTGGCAAAATAAGG-ACTTAGG ATTGCTGTTGCCAGC  72 31
 NT399_08700 1818618 .. 1818630 +  -7.7  -3.51232   ATCCCCCAATAATTT                GATGC AAT GCATC                TTGGTTTCAACCAAA  68 119
 NT399_08720 1820577 .. 1820597 + -10.4  -3.06671   ACCAAAAAGAAATGA            GGCACCGT GATCG GCGGTGCC            TCTTCAGATCAATCT  83 67
        clpK 1823632 .. 1823642 +  -8.2  -3.12606   CTGATCGCGCTGTTG                 CCGC TGG GCGG                 TTCGCTGCTGTATGG  70 179
       yfdX2 1825170 .. 1825196 + -23.8  -3.33671   GTTCTGAAACCGCTG         GAGAGGGGGCGC ATA GCGCCCCCTCTC         TTGTCCCATGAGTGT 100 34
     hdeD-GI 1825886 .. 1825899 +  -2.4  -2.57244   CAAACCAAAATCTAT               GGAT ATGAGC ATCC                TCGATTCATACCTCC  40 49
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 NT399_08820 1840919 .. 1840945 +  -8.1  -2.55074   ATCAGTAAAAATGCA         TCAGAGGAAAT TGAGT ATTTCCCCTGA         TGCATTGAACTTAAG  67 135
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        adeS 1847328 .. 1847338 +  -2.6  -5.04325   CTAACCTAACCAGAT                 TTAT AAA ATAA                 TTTTTATAATTTAAA  66 106
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 NT399_08880 1854513 .. 1854529 +  -2.2    -4.788   AAATTTAAATGAAAA              GCCC CAATATTCA GGGC              TTTTTAAATTGCTTT  62 39
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 NT399_09100 1906901 .. 1906918 +  -9.9  -5.72622   AAGATTTAATCAAAA             GAGACCA TTAA TGGTCTC              TTTTTTATTTATAAC 100 54
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 NT399_09170 1921375 .. 1921395 + -10.5  -4.68424   CAATATAGATTAAAG            TAAGGATGC ACG GCGTCCTTA            TTTTTAAATCAATTA  95 33
 NT399_09175 1922631 .. 1922661 +  -7.9  -3.21912   AATACCACTTCCAAA      TAAAACTAGGACTA ACTT TA-TCCTAGTTTTA       TTGCTGACTTAAAAC  69 131
 NT399_09185 1924671 .. 1924707 + -10.3  -4.35044   TCCATTTATTTAAAA    CCCTAAAAGCAAGCC CATCGCT GTTTTGCTTTTAGGG    TTTATATTTGAATCA  95 60
 NT399_09195 1925996 .. 1926019 +  -3.9  -3.01001   AAAACTCCGTAATTC          CTTAAAGGT ATATTG ACCTTAAAG           TGTGCTTTAAACATA  48 29
 NT399_09200 1926900 .. 1926928 +    -9  -5.10933   TATTCATATTAAAAA        GCCAATTACAGA TTAAC TCTCTAATTGGC        TTTTCTTTTAAGTAA  95 51
 NT399_09240 1936509 .. 1936532 +  -6.1  -2.89683   TATTCTTGAAAAAGA          TGATCTTGT TAAAAC ACAAGGTCA           TCTATACCATAGGAT  58 45
 NT399_09245 1937545 .. 1937555 +  -5.4  -5.04356   TATCCTGAAAGTTAG                 CTTC TGA GAAG                 TTTTTAATTCTTTCA  81 281
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        catC 1940663 .. 1940692 +  -2.9   -2.9006   GTTCGTGATGATGAT       TCGTAAATAGAAA GAAT TTTCTAAATGCGA        TCTCTGAAGTCCATT  43 20
        catA 1941759 .. 1941792 + -10.5  -2.89178   GCTTAATTGAAAGTG     TATGTGAGTTAAAAG TTCG CTTTTGACTCACAAA      ATTTACTCCATTTAT  81 35
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 NT399_09280 1943318 .. 1943334 +  -5.1  -5.28166   GAGGCAAGGAAGCCT              CCTCTGT TCA ACAAAGG              TTTTTGTTACTTTTG  79 116
        pcaF 1944845 .. 1944856 +  -2.2  -3.53012   CATTGATTATTGAAC                GTGT TGAA GCAC                 TTTAAGGAGAAACAA  46 9
        pcaD 1945670 .. 1945685 +  -6.8  -5.05601   AATGATTCAAAAAAA              TGGCCT ATAG GGGCCA               TTTTTATATCTCATA  85 44
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 NT399_13545 2847667 .. 2847680 +  -8.1  -5.64274   GGTGCCATAAAGAAT               CCAGC GTAA GCTGG                TTTTTTTATGCCTGA 100 59
 NT399_13550 2848044 .. 2848066 +  -7.8  -3.14683   CAAAAATTTTGAAAA           TCGAGAGT AATCACC ACTCTCGA           TTCATCACCAACTCT  67 16
        yhbY 2852678 .. 2852689 +    -3   -2.8203   GTTCGTCACGCACAC                TTAG CAAA CTAA                 CTTATTGACTACTTA  43 14
 NT399_13580 2853252 .. 2853270 +  -8.9  -5.52096   TTAAAAAACAAAAAA             GCGAGAA ATTAA TTCTCGC             TTTTTTATTAACTTT 100 37
        carA NONE
        carB 2858600 .. 2858624 + -17.2  -5.62552   TTTTTTTCCGATAAG          TCCCGCCACC TTATC GGTGGCGGGA          TTTTTTCATTTTTTT 100 41
        greA 2859179 .. 2859194 + -10.4  -5.56264   ACTTAAGTTATAAAA              CCCCTC AATT GAGGGG               TTTTTTATATTTCAG 100 56
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 NT399_13650 2870755 .. 2870769 +  -7.2  -2.74817   TCTTAACTTTTAAAT               CTTTGT GCA ACAAAG               CCTTTTTCTACTTAT  62 61
        trpS 2876097 .. 2876125 +  -8.3   -5.9667   ACAGATTCGTTGTTC        TACGCAGTGAT CACCCCA ATCATTGCGTA        TTTTTTTGTCTTTTT 100 288
 NT399_13700 2884531 .. 2884549 + -13.2  -3.76232   AAAATTAAAAAAAAA             CGCACATC AAG GATGTGCG             TTCTCTATTTGCGCA 100 422
        gltA 2890164 .. 2890179 + -10.4  -5.96219   CATTAATGTAAAAAA              GCTGCC TAAT GGCAGC               TTTTTTTTATAAATA 100 53
 NT399_13740 2891760 .. 2891781 + -11.7  -5.31059   TAGATTTTCAAAAAA           GGCATTTAG TTTT CTAAATGCC            TTTTTTAATTCATAT 100 48
        rpoD 2894968 .. 2894987 + -11.4  -3.62096   AGAAAGAGCTATAAA            CGCCTGCG ATGA TGCAGGCG             TTTCACATGATGAGG  93 82
 NT399_13760 2895299 .. 2895337 +   -12  -3.89903   AACTGCGCTTTAATT   TTAAAATGCCATGACA AATTTAA TGTCATGGCATTTTTA   TTTATACCAATCTTT 100 28
        lipB 2896161 .. 2896178 +  -7.1   -3.1243   TGGAATAAAAATATA             TTAGAGT AATT ACTCTAA              ATTTGCTTTTGCATA  64 53
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 NT399_13775 2897968 .. 2897994 +   -11   -5.4492   AAGCAAAAAGCTAAA         GGTCTGATTTTT ATG ACAAATCAGACC         TTTTTTATATCTATG 100 60
 NT399_13780 2899592 .. 2899607 + -10.4    -5.626   ATGAATAATAAAAAA              GGCGCT TAAA AGCGCC               TTTTTTTATGGACTC 100 33
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        adeK 2916801 .. 2916816 +  -6.8  -5.45652   CACTTTCTTATAAAA              GCTCAC TTCG GTGGGC               TTTTTTATTGCAACT  93 50
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