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 HWQ22_09905 1131179 .. 1131206 +  -7.8  -2.91276   AGGCACTGTGAATGA        GTGGGAATCTTT TAAA AGAGGTTCTCAC         CTTTATAAACCCAGA  66 77
 HWQ22_09910 1132741 .. 1132766 +  -6.2  -3.28924   TTTACTGGTTAATAA         GATTACGCTC GGGGGA GAGAGTAATC          TTATAAAAAAGAATC  61 403
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 HWQ22_09925 1136141 .. 1136162 +  -3.1  -3.00994   TATTAATTCAATCAT           TTCCTTA AGGAAAAG TAAGGAA            TATATCTAAAGTTAA  45 35
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 HWQ22_09990 1154770 .. 1154781 +    -3  -3.82098   GCTGTGACTAAGAAA                TTAG GAAG CTAA                 TTTCGCTTGGTTATG  52 68
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 HWQ22_10040 1164350 .. 1164369 +  -7.9  -4.12942   AGCAGTGACTAAAAA            GCCCTTT CATATA AAAGGGC             TTTTAAGCAGTTTAA  77 29
 HWQ22_10055 1167176 .. 1167209 +  -6.9  -3.24902   CCAAATCGAGGTCAT     CATATTCGTTCAAGGT CTT ACCTTGC-TGAATATG     TTCCTGATAATGTTG  63 45
        basA 1170265 .. 1170305 + -12.2  -2.94333   ATAGAAAAATTGAAA  TGTGCTTAAAAGCAGA GTCGAGATG TTTGCTTTTAAGCACA  TGGTTGGTTTTAGGG  90 37
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        bauC 1174856 .. 1174866 +  -3.2  -3.14404   TGCGCTGACGGTTCG                 TACC CGA GGTG                 TTGCATGATTCATGT  45 7
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 HWQ22_10095 1179007 .. 1179036 + -16.7  -2.82453   TAATCTTCAACCGAA       TAAAAAAACCCGC AATC GCGGGTTTTTTTA        TGATATTCATATTTT 100 48
        basE NONE
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        basG 1187389 .. 1187403 +  -2.2   -3.3422   GGTGGTTAGGAAGTT               TTTGAT GCA ATTAAA               GTTTTTAAAAAAATA  44 118
 HWQ22_10125 1187564 .. 1187575 +  -4.4  -2.54098   TTTAAAGTTATCTCA                TCTG ATGA CAGA                 CTCTTCCTTGGCACC  48 41
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        barB 1190766 .. 1190797 +  -8.3  -3.36837   GCGCAGAAACCTGAT      TTAAGCATTTTTT ATAAAA GAAAAATGCTTAA       TATTTGGAGAATTCT  71 48
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        basI 1192319 .. 1192337 +    -4  -2.98034   CATTGAAAACTAAAT             TTGTTATT GAT AATAATAA             TCATTTGCATTAATG  47 28
        basJ 1193697 .. 1193713 +  -9.4   -3.8125   AAATTTAATAAAAAA              GCCTGC ATAAA GCAGGC              TCTTTTAATTAAGAG  83 112
 HWQ22_10160 1196340 .. 1196350 +    -4  -3.75067   GAATATAGTGCTAAA                 TATC TAG GATA                 GTTTTTTGTGCAATA  53 14
 HWQ22_10165 1197143 .. 1197153 +  -2.6  -5.46706   TCAAGGTAATTGGAA                 TTTA AGA TAAA                 TTTTTCTTTTACACT  72 16
 HWQ22_10170 1197784 .. 1197801 +  -9.1  -5.33331   GTTTGAAATTGAAAA             CCCTGTC ATTT GGCAGGG              TTTTTCTTATATTTA 100 41
 HWQ22_10175 1199744 .. 1199768 +  -7.3  -6.09196   TACCTATAAAAAATA          GAGAAATAG ATGATGA CTATTTCTC          TTTTTTTATTTTAGG 100 47
 HWQ22_10185 1202250 .. 1202266 +  -7.9  -4.87133   TCAGCTATAAAAAAA              GCCCAAC ATT GTCGGGC              TTTTATTTAGGCAGT  87 163
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        xdhC 1207967 .. 1207982 +  -7.6  -6.09888   TTTGATGTAAAAAAA              TGATCC CAAA GGATCA               TTTTTTTTGTTCGAA 100 23
 HWQ22_10225 1213651 .. 1213683 +  -4.3  -5.27938   TAAGAATGATGTATG     GATGCAGTGAAGTG GTACAG CATTT-GCTGCATC      TTTTTATTTAAAACT  77 38
 HWQ22_10230 1216437 .. 1216456 +  -8.6  -5.45652   TTCAGCCATAAAAAA            GCCAACTG ATCG TAGTTGGC             TTTTTTATTAAGGGT 100 45
        glnA 1222896 .. 1222925 + -16.7  -3.37499   GTAATACATACTTCA       TAAAAAAGCCTGC TTAT GCAGGCTTTTTTA        TTGCTTGGAATGTTG 100 37
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        ubiA 1224419 .. 1224436 +  -6.3  -5.80248   CCGTGAGGTTGAAAA             GTGTTCT ATGC AGAGCAC              TTTTTTTATGTCTTA 100 50
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 HWQ22_10270 1226740 .. 1226758 + -10.3  -4.62302   TCATACAAATAAAAA             CCCACTC ATAAG GAGTGGG             TTTTTAAGAATCTTG  95 503
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 HWQ22_10340 1241338 .. 1241351 +  -8.1  -4.48877   CTCCTAAAAATAAAA               GCGTC GAGT GACGC                TTTTATGGCTGTTTA  85 469
        sthA 1246810 .. 1246841 +   -11  -5.06816   TAAATAAGTTTTTCA      TGAAAAAGCCCACA AACT TGCGGGCTTTTTTA       TTTTTATTAGACCAT 100 44
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 HWQ22_10390 1254279 .. 1254292 +  -9.5  -5.77988   GTATCTTCAAAAAAA               GCCCC CTAT GGGGC                TTTTTTTATCTCTGT 100 44
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 HWQ22_10625 1302693 .. 1302710 +    -7  -6.01369   ATAGTTTCAAAAAAA             GCCTAC CTTTGA GTAGGC              TTTTTTTATTATTTA 100 43
        pheA 1304974 .. 1305005 +  -6.8  -2.70932   TCACTCATGTTGGAA      TAATGACATGTATCA AGA TGG-GCATGTCATTA      TGCTTAAAAAACAAA  59 41
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        yaaA NONE
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        rhlB 1317578 .. 1317597 + -10.8  -5.96521   TTGCTAATAAAAAAA            TCCCAATC AAAT GATTGGGA             TTTTTTTTGATTAAT 100 34
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 HWQ22_10745 1323719 .. 1323736 +  -2.6  -3.35197   TCCTTTTTATTAATT             CCTAGC TTGTCT GCGAGG              TTGCTATGTGTGGAG  44 28
        purF 1325292 .. 1325320 + -16.2   -4.4648   AGAATAGAAATAGCC        GAAAAAAGCGGG TATTT CCCGCTTTTTTC        TTTTATGATGAAACT 100 34
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        tsaD 1332867 .. 1332878 +  -2.2  -3.79445   TTGGTAAGAAGAAGT                TGAG TGGC CTCG                 TTTAAATTGATAATT  51 404
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 HWQ22_10840 1341772 .. 1341791 + -10.8  -5.17353   TAATTTTTATTATTA            GGGAAAAC AGCC GTTTTCCC             TTTTTTCATGACTGT 100 38
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 HWQ22_10870 1347015 .. 1347032 +  -9.9  -5.98781   AGCTATACCTTTTTG             CCACATC ACCC GATGTGG              TTTTTTTTCATTATG 100 130
 HWQ22_10875 1347580 .. 1347598 +  -6.7  -5.46657   CATTTTAAATAAAAA             GCTCGAA CTAGA TTCGGGC             TTTTTTATTGAAATA  93 46
 HWQ22_10880 1348546 .. 1348581 +  -7.9   -2.7166   CTGAAGATTTAAAAA   GTA--ATCTTTCCTCTG TTTC CAGAGGAAAGATAGTAC    ATATTCATTTTTTGA  65 378
        gltS 1353488 .. 1353499 +  -7.2  -5.24531   GCTTAATTAAAAAAA                GCCC GTAA GGGC                 TTTTTTATGGGGCAT  91 35
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       aadA1 1385851 .. 1385874 +   -16  -3.06133   TAACAATTCGTTCAA          GCCGACGCCGC TTC GCGGCG-CGGC          TTAACTCAAGCGTTA 100 45
 HWQ22_11070 1386328 .. 1386345 +  -4.7  -3.07233   AAGTCGCTGCGGAGG             CCGACGC CATG GTGACGG              TGTTCGGCATTCTGA  52 11
        sul1 1387368 .. 1387391 + -16.8  -3.22841   AACAGACAAGAAAAA          GCCCCAACTG ATAA CAGTTGGGGC           TTCAGTATTGTGATT 100 218
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        mgtA 1550025 .. 1550041 +  -2.3  -2.91924   CAATAAAACAATAGG              TGCAA AATGAAA TTGCA              ATTTCTACAACATAC  41 35
 HWQ22_11830 1550759 .. 1550810 + -10.5  -4.06903   TAATTAATTTAACGA GAGTTTGCGCTTAATTTTTTATGA ATTTC TC-TAAATGATGAAGCGCAAACTC TTTCGTTTAAGCCTT  91 34
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        aceI 1555976 .. 1555997 + -13.1   -5.1675   TAGATTGAAATGAAA           TAAGCACCC AGAT GGGTGCTTA            TTTTTTGGTCGATAA 100 47
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 HWQ22_13020 1802026 .. 1802062 +  -8.1  -4.19817   TGATTCAAATATAAA    CCCTAAAAGCAAAAC AGCGATG GGCTTGCTTTTAGGG    TTTTAAATAAATGGA  83 46
 HWQ22_13055 1808241 .. 1808257 +  -5.9  -3.32268   AGATTAAGTCATTTT              TGAGATA GTG TGTCTCA              TTAATATGGATTTTA  59 90
 HWQ22_13060 1809818 .. 1809843 + -13.5   -4.6645   GTAAAATAATGACAA         GAATCTAAAGG TATT CCTTTAGATTC          TTTTGTATATCTATA 100 37
 HWQ22_13065 1811948 .. 1811962 +  -4.3  -5.27923   ACTCATGGCTATAAG               GAATC CGGTC GATTC               TTTTTTGTAAAATTG  77 93
 HWQ22_13085 NONE
 HWQ22_13090 1824134 .. 1824144 +  -5.4  -2.77167   AAAATTGAAGTAGCT                 CCAA TTT TTGG                 TCATTAAGGTTATTG  52 8
 HWQ22_13095 1824687 .. 1824722 + -12.2   -3.2404   AGATTAGATATATAA    TTAAAAAAACCAGC GCTACTTA GCTGGTTTTTTTAA     TTGCTACCTGTTTAT  90 77
 HWQ22_13100 1825199 .. 1825216 +  -7.7  -5.46657   TTAATTAAATAAAAA             GCTCATC GGAA GATGGGC              TTTTTTGTTGGAGTA 100 55
 HWQ22_13120 1829772 .. 1829782 +  -3.2   -2.5507   TCATTACCCCATAAA                 TCGA GCA TCGG                 CTATTCCTTGAATGC  42 130
 HWQ22_13130 1832492 .. 1832510 +  -5.2  -3.37245   CTGCGATATGCTGGG             GGTGCGAT TTA ATCGCGAC             TTCATATTCAGGTAA  54 239
 HWQ22_13140 NONE
 HWQ22_13145 1834341 .. 1834380 +  -6.5  -2.76362   ATTGAAATTAATATA  GGTCTCATTGTTAGTCG TAAAGC CTACCAATAATGAGGCC   ATGTTTAATATTTTA  57 53
 HWQ22_13150 1835245 .. 1835264 +  -7.8  -4.63952   ATTTAATGTCAAGAA            GGGGCTCA TGAT TTAGCCCC             TTTCTTATTTATACT  82 55
 HWQ22_13165 1838722 .. 1838734 +  -4.9  -2.59569   GGGATAATTTCTTTA                TCATT ATT AATGA                GTATTACTTTGCAGC  50 209
 HWQ22_13170 1839974 .. 1839996 +  -5.6  -4.83243   TTTAATGTAATTACA           GCCACTTT AATATCA GAAGTGGC           TTTCTTTTATCTGAG  74 36
 HWQ22_13175 1840369 .. 1840381 +  -6.3   -3.1706   ATTATTGTGCTTACT                GACTA CTA TAGTC                TTGGTAAGGTAAATT  59 181
 HWQ22_13180 1845385 .. 1845403 +  -8.9  -5.57396   CATAGAAACTAAAAA             GAGACCA GTGAA TGGTCTC             TTTTTTCTTAATTAT 100 56
 HWQ22_13195 1848928 .. 1848958 + -14.3  -5.10497   ACCTAAATGTAGAAG       TAAAAAGAGACCA ACTTG TGGTCTCTTTTTA       TTTTTTAGATCGCTT 100 69
 HWQ22_13215 1854663 .. 1854688 +  -7.6  -4.27316   TAAGTAAAGTCCTCA         GCCTCAAGTT ATAGAA GACTTGGGGC          TTTTAAATTAAAAGA  80 34
 HWQ22_13220 1855837 .. 1855851 +  -2.8  -2.55847   GATACCCAAAATTAA               TGGC AGTGATC GCCA               ATTCATGTGAGAGTT  40 26
 HWQ22_13225 NONE
 HWQ22_13230 1858135 .. 1858169 + -11.6  -5.67967   ATTGCTTTAATTTTA     GCGGTACTTGATGA ATAGACA TAATCAAGTACCGC     TTTTTTTCTGGTACT 100 42
 HWQ22_13240 NONE
 HWQ22_13245 NONE
 HWQ22_13250 1861670 .. 1861713 + -15.6  -3.85539   GATTAATTCAGACAT TATTTGAGCTGTGCATACTA TGCG TAGTGTGTACAGCTCAAAGA TTTAATATCAATGTG 100 35
 HWQ22_13255 NONE
 HWQ22_13260 NONE
 HWQ22_13265 1864859 .. 1864871 +  -2.7   -3.2056   AAGACAAAACCATTG                TGATT CCT GATCA                TTCGTGGCTGTAAAT  44 0
 HWQ22_13270 1865595 .. 1865611 +  -2.3  -4.81814   TGTCTTAAACCAGCG              GTGAA AAGTCCG TTCAC              TTTTATTATGGTCAT  64 245
 HWQ22_13280 1867187 .. 1867213 + -12.5   -3.1505   AAATTAGACTTGAAA         TATATAGTGGC TTTGT GCCACTATATA         TTCATCGAAGGTCAT  90 146
 HWQ22_13285 NONE
 HWQ22_13290 1869647 .. 1869676 + -12.9  -3.24146   GCATAACTGAGTTTA       GATGAGCCGTTGC ATGA GTATCGGCTCATC        ATTTTCATTGAGAGG 100 35
 HWQ22_13295 1870465 .. 1870480 +  -3.2  -4.63479   TGAGCTTTCTGACTA              GCGCAT CTTA ATGCAC               TTTTGATTTATAATG  62 25
 HWQ22_13300 1872234 .. 1872248 +   -10  -3.08135   TTAGTAATAAAAAAA               CCACTC AAT GAGTGG               GTTTCATTGTTTAAA  81 326
 HWQ22_13305 1872818 .. 1872829 +    -3  -2.77416   GGTCATGATAAAAGA                TTGA AAAA TCAA                 TAGTGTCTTAATAAT  42 11
 HWQ22_13310 1873160 .. 1873177 +  -6.9  -5.56264   AGCACTGGTATTAAA             GCTCGCC AAAA GGTGGGC              TTTTTTATATTTGAA 100 94
 HWQ22_13315 1874002 .. 1874019 +  -5.5  -5.19819   ATTAATTTTCAAAAT             GCTCATC ATTT GGTGGGC              TTTTTACTTTTCTTT  80 36
 HWQ22_13320 1874835 .. 1874845 +  -6.8  -4.95484   TAAAGAGTTTAGCCT                 CCTC CGA GAGG                 TTTTCTTTCGTGCTA  85 84
 HWQ22_13325 1875956 .. 1875966 +    -4  -3.21436   GATACGTGAGACTAA                 TACT TAT AGTA                 ATTTTAATGTCAGTT  49 228
 HWQ22_13330 NONE
 HWQ22_13335 1876529 .. 1876555 +  -2.3  -3.17146   TATCAATTTTTAACT         TAAGAGCTCCC GAATA GTGAGTTTTTA         TATGTTATAAAAAGA  42 28
 HWQ22_13340 1876971 .. 1876992 + -10.9  -4.17002   TTTGTTTTTTTATGG           CCCGTTTCT GATT AGAAGCGGG            TTCTTTAATTTCGTA 100 103
 HWQ22_13345 1877678 .. 1877707 +  -9.4  -3.47187   TATAAGCTTCAAGAA       GCCCCGCTAAATA TCGAT TAT-TGGCGGGGC       ATTTGTTTTATAATA  80 45
 HWQ22_13350 1878560 .. 1878570 +  -2.6  -3.36749   ATGAGTTGAAGTAAT                 TTTA ATT TAAA                 TTAATGTTAAAGCTC  44 27
 HWQ22_13355 1878933 .. 1878955 +  -7.8  -4.19276   ATTTATTTTTATGTA           TTTAAGGCTT TCA AAGCCTTGAG           TTTTCAGGGTTTTAC  80 55
 HWQ22_13360 NONE
        iaaH 1881743 .. 1881758 +  -3.4  -3.82519   TAAAAGGCTATTTAA              TAATTT TGAA AAATTA               TATTTTCTAAGTGAT  54 350
 HWQ22_13370 NONE
 HWQ22_13375 NONE
 HWQ22_13380 NONE
 HWQ22_13385 1887311 .. 1887337 + -10.2  -3.27022   CGGTTTTTAACACTT         CGACACGCCT TGTATTT AGGCGTGTTG         TTGGTGTCGAATACA  82 64
 HWQ22_13390 NONE
 HWQ22_13395 1889782 .. 1889795 +  -8.1  -5.33331   GTAATTTTAATGAAG               CCCAC GAAA GTGGG                TTTTTGTTATATTTA 100 54
 HWQ22_13400 1890861 .. 1890881 +  -2.5   -4.3534   AAGTAAGGAGCAAGA            CCATGAAAC GTT GTTTATTGG            TTTTACTCCTTGGGC  58 35
 HWQ22_13405 1891517 .. 1891539 +  -8.5  -4.55118   TCTTAAAAATAAAAA           GACAACGGA TTTAT TTCGTTGTC           TTTTATCTCAACTTA  89 35
 HWQ22_13415 1892881 .. 1892900 +  -5.8  -4.61199   ACTCCGCATCAGAAT            TTATTCCT TCTG AGGAATAG             TTTTGTGTGTAAACT  74 317
 HWQ22_13420 1894011 .. 1894023 +  -9.1   -3.3487   TTTATCCCACAAACA                CCCCA AGC TGGGG                TATATTTAATTAAAT  77 163
 HWQ22_13425 1895208 .. 1895228 + -11.2  -5.30686   ACTTTACACATACTA            GCCTCATC CCCAC GATGAGGC            TTTTTTATGAGTATT 100 67
 HWQ22_13430 1895956 .. 1895973 +  -9.1  -4.59424   AAAGCAATTTAAAAA             GCCCTGA ATAT TCGGGGC              TTTTCATTTAAATTT  90 252
 HWQ22_13445 1898102 .. 1898125 +  -5.3  -4.12942   TGCTAATTAAATAAA          CACGGATAT ATCAAA ACATCCGTG           TTTTAAAAGATTTAA  64 92
 HWQ22_13465 1902043 .. 1902069 + -13.2  -4.26188   AAATGAATGAGTTAA         GGTAGAACTTAT ACT ATAGGTTCTACC         TTTTAAGTCTATACA 100 21
        adeA NONE
        adeB 1909539 .. 1909570 + -16.8  -3.29471   CATCTTAAGTTCAAT      GCATCAGGGGAAAT ACCA ATTTCCTCTGATGC       TTCATATGCTCAAAA 100 33
        adeC 1911382 .. 1911403 +  -5.9  -3.86015   CACATACTTCATTCC           GCCAT-GTTG GCC CAGCCATGGC           TTTATAGGAAACCTC  63 402
 HWQ22_13520 1917381 .. 1917407 +  -8.8  -3.62224   AATTTTAATCTAAAA         TTACACAGTGTC ATT GACATGGTGTAA         TTGTTAAAGCAATAT  77 175
 HWQ22_13525 NONE
 HWQ22_13530 NONE
 HWQ22_13535 1920820 .. 1920845 +  -3.3  -2.55267   GGCGTCCAGTTTAAT         CCAGCTAAAAA CTAC TTTATAACTGG          TAGCTTAAAATATTT  44 53
 HWQ22_13540 1922276 .. 1922296 +  -3.4  -4.87592   TTAATTCTTTTCCAG            TTACATAG TAGCC TTATGTAA            TTTTCTTATCTCTAC  66 247
 HWQ22_13545 1923088 .. 1923117 + -11.5  -4.53705   ATAATTAATTGATAG       CGGGGTTTCTATG TCCG CATGGGAACCCTG        TTTTGTGTAGCACTT 100 37
 HWQ22_13555 1925086 .. 1925096 +  -2.6   -3.9993   CAAATAAAACTTCAG                 TAAT CAG ATTA                 TCTTTTTAATAAATT  53 23
 HWQ22_13560 NONE
 HWQ22_13565 1928701 .. 1928730 + -13.9  -4.60487   CAATGGCTACTGTAA       CTATTGAATATGA TTAA TCATATTCAATAG        TTTTTAAACCTAATA 100 9
 HWQ22_13570 1929807 .. 1929823 +  -9.4  -5.74086   TATAAGTCATAAAAA              GGGCTG AATCA CAGCCC              TTTTTTATTTCATTT 100 51
 HWQ22_13585 1934407 .. 1934431 +  -2.9  -4.07306   AATTTAAGTATAAAA          GAACTGC CAATAACCAAA GCAGTTC          TTTATAGTTCAGTAT  55 39
 HWQ22_13600 1938413 .. 1938425 +  -2.6  -4.10552   ACTTATCTGAAGCAT                TGCC CTTTA GGCG                TTTAATTTGATACGC  55 330
 HWQ22_13655 1948851 .. 1948877 + -13.2  -4.86033   TCATTTAAGAATGCA         TAAAGGACAGTA TGA TGCTGTCCTTTA         TTTTTATAACAGTTT 100 42
        antA NONE
        antB NONE
        antC 1957526 .. 1957556 + -11.4  -4.81851   CTAAACCTGAAATGA       TTCAATATACTCTT ATA AGGGGTATATTGAA       TTTTTGCATTTAAGT 100 64
 HWQ22_13710 1959002 .. 1959029 + -10.8  -5.97575   AAAAAATAGATAAAA        GCCTTTTATATT TGTT GATATAAAAGGC         TTTTTTTTATGACTT 100 44
 HWQ22_13750 1968119 .. 1968135 +  -5.1  -3.54051   TTTAAGAAGGCAGAA              CCCTGAT AGG ATAAGGG              TTCTGTGAAATTTGT  56 1
 HWQ22_13770 1972489 .. 1972501 +  -3.5  -3.98907   AAGCTTATGGATAAG                TTAAA TTC TTTAA                TTCTTATAATTTTTA  56 71
 HWQ22_13775 1973750 .. 1973766 +  -3.8  -4.01737   TAGCTTATATGCGTC              TTAAGT TTTGT ACTTAA              TTTGATATTATTCAT  58 96
 HWQ22_13780 NONE
 HWQ22_13785 1975293 .. 1975305 +  -4.8   -3.0094   TCTTAGCCCTATCAA                GCAC CGGAT GTGC                TGTCTATAAATAAGA  52 93
 HWQ22_13790 1976759 .. 1976784 +  -2.5  -2.73124   CTTTTTAATTTAGTG         GCGCCTTTAGT TTAG GCTAAAGGCAA          ATTTAGCAAATACAC  40 33
 HWQ22_13795 1977997 .. 1978036 + -13.2  -2.75229   AAATTTAATTTAAAA  TTAAAAGAAGATGTAAGG ATTT TCTTACATCTTCTTTTTA   TAATTAAAACTTTTA 100 33
 HWQ22_13820 1983193 .. 1983233 + -23.1  -3.36518   GTCGGCTTAATTCCT  GAAATAAAAAAAGGAGCTT ATA AAGCTCCTTTTTTTATTTC  TTCTACAACTTTTAA 100 31
 HWQ22_13830 1987263 .. 1987291 +   -14  -4.28254   TCATTAATTAAATGA        GATGCCTTCTGT CCCAA GCAGAAGGCATC        TTTTAGCTCTTAGCA 100 34
        chrA 1996143 .. 1996168 + -13.4  -3.87576   CATAATCTCAATAAG         GCCGAACAGT TCCTTT ACTGTTCGGC          TATTTATATTTTTAA 100 72
 HWQ22_13885 1997436 .. 1997448 +  -5.5  -3.15346   CTTTGCATGACATAT                TGGTG AGG CGCCA                TATTCATGGACTGTT  54 182
 HWQ22_13895 1999205 .. 1999222 +  -8.4  -5.64274   AAAAAATTGTGAGAA             GCAGGC ATAAAA GCCTGC              TTTTTTTATAAATCA 100 16
 HWQ22_13920 2005247 .. 2005260 +  -3.1  -2.62735   AAAACATAAGCTTTA               GCTAG GTAT TTAGC                TCGTCTAAAGCGTAT  42 25
 HWQ22_13925 2006236 .. 2006251 +    -9  -5.27923   TACTTTAATAAAAAA              GAGCGA TGAT TCGCTC               TTTTTTATAGGCTTA  95 33
        lipA NONE
 HWQ22_13965 2015778 .. 2015802 + -11.6  -4.62336   TTGAATAAAATAAAA          GGGAGAATAT GTAGA ATATTCTCCC          TTTTTAAGATGAGAT 100 33
 HWQ22_13975 2018166 .. 2018189 +  -9.7  -4.66609   AATAAAAATAGAAAA          GCCACATAA TTTTGT TTATGTGGC           TTTTTAAATACGCTG  93 72
 HWQ22_14015 2025190 .. 2025227 + -13.8  -3.33315   TTAAAACTACCACTG   GATACTTCTTTAGTTA GCTCTA TGACTAAAGAAGTATC    TTATCAACATGTTAA 100 37
 HWQ22_14055 2031960 .. 2031976 +  -9.4  -4.53705   TTTAGGCATAAAAAA              GCCCTC TATAT GAGGGC              TTTTATCTAACGCTT  91 42
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 HWQ22_15420 2311210 .. 2311227 +  -2.7  -4.81359   AATCAGCCGTTGTAC             CTTTGTT TACT AGCAAGG              TTTTATCTTTAAGTT  65 438
 HWQ22_15450 2314977 .. 2314994 +  -2.6  -5.11063   ACTAATAAAAAAAAA             TCGGAC ACCAAG GCCCGA              TTTTTATTAAATGAT  66 88
 HWQ22_15470 2321706 .. 2321721 +  -7.6     -6.13   TTACCAATTAAAAAA              GAAGCT TTAA AGCTTC               TTTTTTTTTACATCT 100 47
 HWQ22_15480 2322984 .. 2323012 +  -7.5  -3.10343   GTCATTTAGGAAAAA        GTTACTGACTC ACTTTTC GGGTCGGTAAC        TTAAATAATAAATAT  67 43
 HWQ22_15490 2324185 .. 2324209 + -15.9  -3.30007   TTAAAATAATAAAAA          TAAAGGAGGCA TAA TGCCTCCTTTA          TTCTCAAAAACTGTT 100 43
 HWQ22_15500 NONE
 HWQ22_15505 2327271 .. 2327298 + -11.4  -6.23545   CATAATTTAGAAAAA        GCCCTGAAAG CGTTTAAA CTTTCAGGGC         TTTTTTTTATTTAAG 100 44
 HWQ22_15520 2331855 .. 2331876 +  -3.9  -3.67417   AAAATCAGCAAGTTA           TTTAAAATT TATA AATTTTAAG            TTTACAGTTAAATAT  53 168
 HWQ22_15525 2332260 .. 2332271 +  -5.8  -3.18383   TCGATCATTTAGGAA                GGTG ACCT CACC                 TTCCTAAATCAAAAT  59 67
 HWQ22_15530 2332668 .. 2332698 +    -7  -5.58179   GGTCCATAGCTATAA       GCTTATTTCCTA TTGGCCC TGGGAAATAGGC       TTTTTTATTGTCCTA 100 52
 HWQ22_15550 2335579 .. 2335596 +  -4.1  -3.05844   GCGGGCCACCAGATT             GGAGCTT TTCA AAGGTCC              TGTTCGAATCGCAAC  47 468
 HWQ22_15560 2337399 .. 2337431 + -13.5  -3.02639   TAAAAATTAATCATT      CCCCCATCAGGTGAA ATC TTCACATGATGGGGC      TGCTTATTTAAAAAT 100 31
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 HWQ22_15605 2348944 .. 2348963 +    -5  -4.43221   TATTTCTGTATTAAA            TGCCTCTT TAAA AAGAAGCA             TTTTCTACCCTATTT  67 180
 HWQ22_15615 2353693 .. 2353710 +  -9.9   -5.4833   TCTCAAAATAAAAAA             GTCATCC TTAG GGATGAC              TTTTTTATTGGCTCA 100 49
 HWQ22_15630 2357300 .. 2357316 +  -5.1  -5.24551   TAATAAAATATCTAA              GCTCC TATTTAT GGAGC              TTTTTCTTGCTTTGC  79 38
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 HWQ22_15680 2368474 .. 2368506 + -12.1  -4.64861   CCATTGAACCGGATA      TCCATTCATCACAAC AGC GCAGTGATGAATGGA      TTTATTTTGCAGAGC 100 41
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 HWQ22_15690 2370637 .. 2370655 +    -6  -2.62983   TGATGCAAAAAATCA             GCACAATT AAA ACTTGTGC             TGATCTCAAAATAGG  55 16
 HWQ22_15700 2372702 .. 2372728 +    -8    -3.254   CTTACCCAATAAAAA         GCCAGCCTTG AAAAAAA CAAAGCTGGC         TCTTATAAATGGATC  71 43
 HWQ22_15715 2376496 .. 2376519 +  -6.1   -4.8667   TTAATCAAATTTTAA          GCACTTTAA AACGAC TTGAAGTGC           TTTTTATCAAATGTA  80 37
 HWQ22_15720 2377953 .. 2377990 +  -8.5  -3.08992   TTCATTTTAATTTTT   TAGGTAAGCTTAGCTCC CAAG GGAGCTAAGCTTAAAAA    TATATTGGCCTAAAT  72 182
        pobR 2388463 .. 2388490 +  -6.5   -3.6284   AAATAAACTTAGAAA        CTCTTGTTATCT ATTAG AGATA-CAAGAG        TTTCAACTCATAATT  64 39
 HWQ22_15775 2390123 .. 2390144 +  -4.3  -5.37865   CTTAAAAATAAAAAA           GCCTCGTCC ACTT GAACAAGGC            TTTTTTAATTATTCA  81 42
 HWQ22_15830 2400747 .. 2400757 +  -2.6  -2.57564   AAGGTAAATAGACCT                 TTAT TGA ATAA                 GTTATAGGGAAATAC  40 59
 HWQ22_15835 2401066 .. 2401099 + -12.1  -4.37734   AGGGATCTAAATTGC     T-GAATTGATTTCTCA ACT TGAGAAATCAATTCTA     TTTTAAGTTGTTATA 100 31
 HWQ22_15860 2405848 .. 2405860 +  -3.5  -3.78091   TAATGGAACAGAAGG                TTTTT ATT AAAAA                TGTTATTTTATGATT  54 68
 HWQ22_15865 2407043 .. 2407074 + -13.4  -4.68424   AATATTTAAAATATT      TATTAGACAATTAA ATAT TTAATTGTCTAATA       TTTTTAAATACCTTA 100 12
        paaZ 2422356 .. 2422384 + -13.2  -5.42259   GCTTAATGTTTAAAA        TGAGATGGGGTC ACCTC GTCCCCATCTCA        TTTTTTTAACACTCA 100 35
 HWQ22_15955 2425897 .. 2425919 +  -8.5  -3.12999   TTGATAACTCTCCAA           CGTCAGAAG AAGCA CTTTTGACG           TTCACTCTCAAGTGA  72 132
 HWQ22_15960 2427534 .. 2427558 +  -9.4  -5.63103   TTTAATTTTTTTAAA          GGAGTTTATC CAAGA GATGAACTCC          TTTTTTTAGTTCAAA 100 36
        abaF 2429007 .. 2429027 +  -9.8  -5.72616   CACTTAATAATGATT            TGGGTTGT TCTAT ACAACCCA            TTTTTTTATCTAAAT 100 61
 HWQ22_16000 2435555 .. 2435574 + -10.8  -5.96219   AATAGAAGTAAAAAA            GAGGCTAA ATCG TTAGCCTC             TTTTTTTTATAGATA 100 43
 HWQ22_16020 2439619 .. 2439635 +  -5.1  -3.54051   TTTAAGAAGGCAGAA              CCCTGAT AGG ATAAGGG              TTCTGTGAAATTTGT  56 1
 HWQ22_16030 2441316 .. 2441336 +  -6.3  -2.53876   ACTTAGACGAGCTTT            GTTTTATTA GAA TAATAAAGC            TAGCTTAAAATAAGA  56 150
 HWQ22_16035 2441976 .. 2442001 +  -3.4  -4.37711   CTAAGCGAAGTTAAA         CACCAAAA ATTTTTACTC TTTTGGTG          TTTTAGCTTTAATCA  61 37
 HWQ22_16060 2447076 .. 2447089 +  -4.5  -2.67189   AAGACCATAAGCAAA               CGCTG CTTA TAGCG                TGGGTTCATTTTATC  47 419
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 HWQ22_16165 2471808 .. 2471826 + -13.2  -5.04601   GTAAGACATTAAAAA             GCCCAAGT TCA ACTTGGGC             TTTTTGCTTTATGGA 100 41
 HWQ22_16200 2477040 .. 2477063 + -11.1  -4.54727   AAGCATAATAAAAAA          GAGAGCATC AATATC GATGCTCTC           TTTTAGTTTAAGCGA 100 33
 HWQ22_16225 2484272 .. 2484285 +  -8.1  -5.52079   ATACCCACTAAAAAA               GCCCA GTGA TGGGC                TTTTTATTTTAGTGT 100 48
 HWQ22_16235 2485897 .. 2485932 +  -4.3  -4.57569   CTTTATTAATTAAAA    TATTATCTGATTG TATTACGACT TAATCAGATAATA     TTTTTACAGCGATAC  68 73
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 HWQ22_16310 2508943 .. 2508965 +  -5.1  -3.78861   TGAAAAAGGCTAATT           TAAATAATT AGCTA AATTATTTA           TCTTGTTTTATATCG  60 57
 HWQ22_16315 2509531 .. 2509561 +  -5.7  -4.17048   TTTAAACCAGCAATA       TATAGAAGTAT GGTGGACGA ATACTTCTATA       TTCTTTTACGAAGGA  69 84
 HWQ22_16335 NONE
 HWQ22_16340 2513788 .. 2513812 + -10.1  -3.57971   ATCTATCAATTTAAA          TGGCTCTTTTT TTC AGGAAGAGCCA          TTTACCCATAAATAT  86 45
 HWQ22_16345 2514970 .. 2514996 +  -5.2  -3.32984   CTGCAACCAGAAAAA         CAGGAATTAATA CTT TATAAAATCCTG         TCTTATCAATTTTAA  54 452
 HWQ22_16375 2521992 .. 2522004 +  -4.9  -4.59853   TTGTTGTACTTTTCT                TGAAT TAC ATTCA                TTTTTAAAGACTTGA  69 218
        mutS 2524729 .. 2524758 + -11.6  -3.51232   TCATAATCACTCATT       GAGCAAACATGT GTATAG GCATGTTTGCTC        TTACTTTAAGGAGAA  90 35
 HWQ22_16385 2525309 .. 2525329 +  -4.1  -3.84422   CATTTACTTTGTACA            CTTTAAG CTCATTA CTTAAAG            ATTTTTTGTCTATCG  56 20
 HWQ22_16390 2525992 .. 2526009 +  -9.9  -5.26918   AAATAATTTCAAAAA             GATCAGC AACC GCTGATC              TTTTTTATACCCTAT 100 35
 HWQ22_16395 2526843 .. 2526870 +  -6.3  -3.88015   TTTCTAAAATATAAA        TCCCCTTATGC GCTTCA GTTTAAGGGGA         TTTGCTCATTCTATA  66 34
 HWQ22_16400 2527709 .. 2527753 + -16.1   -2.8934   TTTATTACCCCTGCT TTTCCATATAGTTATCCACAA GAT TTGCGGATAACTATATGCAAA TCTCATCATTTAGCC 100 92
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 HWQ22_16465 2540289 .. 2540314 + -11.3   -5.8187   TCCAAAATTCAAAAA         CCACTTAATTC GAAA GAATTAGGTGG          TTTTTTTATTGGCTG 100 37
 HWQ22_16490 2545386 .. 2545397 +  -4.4  -3.37755   ATTTGGCCCATTAAC                TGAG TCCG CTCA                 TCTTTAGGAATATCT  52 237
 HWQ22_16510 2548173 .. 2548209 +  -8.9  -2.97951   TGGTGGTTAAAAAAA    TACCTTCCAAATATAAG GTG TTAATATTTGGAAGGCA    CTTTGTAATCAGCTA  73 127
 HWQ22_16530 2551123 .. 2551165 + -13.8  -5.26316   ATTTTATGAAAGTGA GCCAACTTG-TAAGGCTAT AACTCA ATAGCTTTAGCAAGTTGGC TTTTTTATAAGCTGA 100 45
 HWQ22_16550 2553515 .. 2553538 +  -8.2  -5.25805   CTTGATATAAAAAAA          CCTATCTCAT TTAA AAGAGATAGG           TTTTTTCGCTTTATT  93 126
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 HWQ22_16570 2555770 .. 2555801 +  -8.8  -3.14211   ATTTCCATAAAAAAA      GCCCATTTCTAC TTCTCATT GAAGAAATGGGC       TTAGTGAACACCACT  72 41
 HWQ22_16585 2557647 .. 2557672 +  -6.9  -3.86822   TAGTCAAGTCATACA         GAAAAAGTACC CGTA GGTGCTTCTTC          TTTATCGACCAGTTG  69 54
 HWQ22_16590 2558807 .. 2558821 + -11.4    -4.386   ATAGGCATTAAAAAA               GCCCGT TTC ACGGGC               TTTTCTGCAACGTTG 100 378
 HWQ22_16610 2562807 .. 2562837 +   -12  -3.33509   CAATAAGATATAAAA       TTGCATAGCTTCAA CCT TTGAGGCTATGCAC       TTCCCTTATTTAAAA  89 35
        benA NONE
        benB NONE
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 HWQ22_16635 2567851 .. 2567870 + -12.2  -5.14985   CCGGTCGGAGGTGGA            GATCAGGG TTAA CCCTGATC             TTTTTATATATTTGG 100 14
        benE 2569204 .. 2569219 +  -3.4  -4.32649   ATTTGGCAATTTTTA              TTTAAT ATAA ATTAAA               TTTCATTTTTAAGAT  58 116
 HWQ22_16645 2570945 .. 2570963 +  -8.1  -3.91506   AGCAGTAAACATAAA             TGCGCCG AGGAC TGGCGCA             TCTTTTTGGAAATGG  77 33
 HWQ22_16650 2572261 .. 2572288 + -11.4  -4.53475   TATTTTTGATTCAAC        TAAAGCGGGCTA ATTT TGGCTCGCTTTA         TTATTTTTGTGCCAT 100 42
        ahpC 2578341 .. 2578374 + -12.6  -4.18018   TTAGATTTTAGAAAC     CTAAAGAACCATCC TTTATC GGATGGTTCTTTTG      TTTTGAATAAGCACA 100 47
 HWQ22_16670 2578938 .. 2578949 +  -2.2  -3.13773   AAACCCCACCTTTAG                GCTT CATT AGGC                 GTTTTAAATCTGGCC  43 236
        ahpF 2581492 .. 2581515 +   -14  -5.14563   TATCATTTAATTCAA          GCCTAGCATT ACAA AATGCTAGGC           TTTTTTAATACGAGA 100 56
 HWQ22_16690 2581989 .. 2582029 +   -23  -4.15508   CACTAATTCGCTTTA  GCATTAAAAAAGCCCCTA TTGCT TAGGGGCTTTTTTAATGC  TTTTGAAAATTGCTT 100 35
        trmB 2586169 .. 2586191 +  -9.9  -4.57516   ATTAAGTAAGAAACA           GGGCTTAGT AACAA ACTAGGCCC           TTTTCATTTCAATAT  93 32
 HWQ22_16710 2587089 .. 2587101 +  -4.7  -2.88653   AGATATTCTGATCTC                CCCGC ATT GCAGG                TCCTGTTTGCATTTG  48 155
       rlmKL 2594663 .. 2594682 +  -5.8  -2.53581   TTGAAAAGGAAGTTA            TCATTACT TCAC GGTAATGA             TAACTTCACCATGTA  54 48
 HWQ22_16750 2595851 .. 2595872 + -10.3   -4.4267   TTAAATATAAAAAAA           GAGAATATG TTTC CATATTCTC            TTTTCGGTTTTAGCA  95 37
 HWQ22_16760 2600049 .. 2600066 +  -4.1  -5.75538   CTTATCATAAAAAAA             GCCAACA TGAC TGTTAGC              TTTTTATTTTTTAGG  86 491
         crp 2601679 .. 2601702 +  -3.2  -3.41024   TCTAACGACGAATAC          TATGACACAT CTCA ATGAGTTATA           TCTTATCTTAAACAA  48 81
 HWQ22_16780 2602879 .. 2602894 +  -7.6  -5.71712   ATTATTGAATAAAAA              GCAAAC TTCG GTTTGC               TTTTTTTATATGCAA 100 134
 HWQ22_16785 2604075 .. 2604092 + -11.3  -4.63184   CTTAAAAAACAAAAA             CGGATGC TCAA GCATCCG              TTTTTAACATCAGTT 100 36
        alaS 2612238 .. 2612263 + -10.5  -2.63079   CACTTTTTGTGTAAC         TGACCCTGACA AGCC TCTCAGGGTCA          TGGCTTATATGGAAC  80 46
 HWQ22_16820 2613629 .. 2613662 + -16.2  -3.65812   TAATCAAAGAAAACA     CAGAGCCGCTATAG TTTTTT TTATAGCGGCTCTG      TTATATTAAACGGAA 100 91
        csrA 2614086 .. 2614113 +   -10  -5.04385   GTTGTTCTCTCCCTA        ATTAAAGCGACT TTAT AGTCGCTTTAAA         TTTTTTGGGAATATA 100 47
 HWQ22_16840 2615969 .. 2615985 +  -9.4  -5.96894   TCAATGTTAAAAAAA              CCGCCT ATCAC AGGCGG              TTTTTTTATTTAGAT 100 43
 HWQ22_16875 2624019 .. 2624044 + -13.4  -5.28826   CATAAATAGTAAAAA         CACCTGCGTA GAAGTA TACGCAGGTG          TTTTTTATCACATTT 100 36
 HWQ22_16890 2626692 .. 2626709 +  -6.9  -2.76291   GGATCGTCGGCAGCC             AGCCGGT ATTC ACCGGCA              TCAATTTTCAGATTG  57 312
 HWQ22_16915 2632297 .. 2632314 +  -4.9  -3.14564   CGCCAGTTAATAGTT             TGCGCAAC GTT GTTGC-CA             TTGCTGCAGGCATCG  53 389
        argG 2638771 .. 2638788 + -11.3  -5.95539   TATAAGGTCAAAAAA             GCCACCT CTAT AGGTGGC              TTTTTTTATTTAAAG 100 46
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