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        galE 1390923 .. 1390951 + -14.1   -4.9445   ACAATTAAATTCGGA        TAAAAAAGGAGCG ATT TGCTCCTTTTTTA        TTTTTAATTAGTTCT 100 33
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 FDF39_06675 1396351 .. 1396391 +    -2   -4.0641   AATGTTTTACATATA GGCATTT-GTCACTTTTGA AAGG TCAAAAGTAACCAAAAACC  TTTGTCTCGATGACG  52 91
 FDF39_06680 1398301 .. 1398314 +  -9.5  -4.75372   TGAGACATAAAAAAA               GGCGC CGAA GCGCC                TTTTTAATAGATGAT 100 44
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        prpB 1401739 .. 1401757 + -10.4  -3.74251   CTGCCTTGCGCTATT             TTCAAAGC GAT GCTTTGAA             TTTGCTCAGGATATA  87 116
        prpC NONE
        acnD 1405738 .. 1405756 +  -6.7  -5.14965   TATTGTTCAAAAAAG             CCCTATC TTGAT GATGGGG             TTTTTTAATGAGAAT  84 63
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 FDF39_06715 1406861 .. 1406879 + -14.6    -4.946   GTGAAAACTAAAAAA             GCCCGACA TCC TGTCGGGC             TTTTTCGTATTTGGT 100 30
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 FDF39_06765 1414749 .. 1414766 + -11.3  -5.86976   ATGTTTTAATGAAAA             GCCCGAA ACTA TTCGGGC              TTTTTTATTTTATAG 100 32
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        mmsB 1428437 .. 1428449 +  -4.8  -3.54543   AGGCATAACGGTAAA                GCCA AAGGA TGGC                TTTAAACGAATAAAT  57 33
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        guaA 1461271 .. 1461289 + -13.2  -5.46276   ATAATCAAATGAAAA             GGCAGGAT TAA ATCCTGCC             TTTTTTATATCTGTT 100 37
 ant(3'')-II 1462169 .. 1462184 +    -9  -5.87996   CATACGGCTATATAA              GAGTGC TTAA GCACTC               TTTTTTTATTACTTA 100 81
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 FDF39_06970 1463279 .. 1463292 +  -3.1  -3.13522   ATTGATTGTCTCATT               CATAG CACC CTGTG                TATTACTAAAAGACT  45 77
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        atpB 1477450 .. 1477475 +  -8.3   -3.0623   AACATTAATGGTATT         GCCTAACTGTC AAAC GATGGTTGGGC          TGAATTTTTTTTAAT  68 33
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         rrf 1503830 .. 1503857 + -16.4  -5.60993   GCTCATTATTCTAAA        CACCCCAATCTC AAAA GAGGTTGGGGTG         TTTTTTTATAGCAAG 100 38
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        cysK 1505761 .. 1505778 +    -7  -5.37171   TAACCATATAAAAAA             GCCCAT GAATAA ATGGGC              TTTTTATTTAATCTT  89 44
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        pgsA 1646493 .. 1646511 +  -8.9   -5.4505   AAAAGATTTTCAAAA             GCCTTTC CTTGC GAAAGGC             TTTTTTATTGGAAAG  95 46
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        fusA 2225535 .. 2225557 + -12.1  -2.77899   GTTAAAAACCAAGTG           CTCATGGAG CGACC CTCCATGAG           TAGTTAATAAAGGAA  84 75
         tuf 2226790 .. 2226807 + -10.5  -5.71712   TTTTCAGTGAAAAAA             GCGCTCC TTTT GGGGCGC              TTTTTTTATATCGAA 100 45
 FDF39_10865 2227874 .. 2227889 +  -6.8  -4.51787   GAAAGTAAATGAAAA              GGGCTG TTAG CAGTCC               TTATTTTATTGTCTA  76 44
 FDF39_10870 2228986 .. 2229002 +  -9.5  -5.89827   AAACTGACTGGAAAA              GAGCAAT TTA ATTGCTC              TTTTTTTTACTCGTT 100 43
        rimI 2230026 .. 2230038 +  -6.3  -3.28416   CATCGGCATGGCGCT                CGTTA ATG TAACG                TTCATATAGATCATA  60 519
 FDF39_10895 2235534 .. 2235547 +  -8.1  -5.37345   TACAGTTAAAATTAA               GCCTC TTCG GAGGC                TTTTTTATGGTTAAA  90 45
        rhtC 2236301 .. 2236315 +  -7.1  -5.93252   TTAAATAAGAAAAAA               GCCTC TTTAT GAGGC               TTTTTTATTTTTAAG 100 43
 FDF39_10935 2241608 .. 2241621 +  -8.1  -5.64274   TTATTGTTTCAAAAA               CCACC TTCG GGTGG                TTTTTTTATGGGTGA  93 49
         rep 2243795 .. 2243817 +    -2  -5.79588   AATATTTGGCAAATT           TAAAAGCTTT ATT AAAGCGTTAA           TTTTTTTAATTTTAG  83 3
 FDF39_10945 2244318 .. 2244342 + -12.3  -4.62471   AAAAAATAATGAAAA          GAAACGCTTGT TTT ACAAGTGTTTC          TTTTTACACCTTGAA 100 50
 FDF39_10950 NONE
        argB 2246857 .. 2246873 +  -4.4  -5.63504   TATTTTTTATTGAAA              GATCAC GCTAA GTGGTC              TTTTTTTATGCCATT  85 48
 FDF39_10960 2247733 .. 2247744 +    -3  -4.04187   ACAAAATGGCTCAGC                GATA AAGT TATC                 TTATATTTTGTAATA  55 21
 FDF39_10965 2248751 .. 2248782 +  -4.7  -4.93547   TTTTGTTTATTTAAT      AATAAAGTATTTT GTTTAA AAAATACTTTATC       TTTTTAGTTGGTTAA  75 82
 FDF39_10970 2249439 .. 2249463 + -11.5  -5.88565   TATACAGTTAGCGCG          GCAAACTATCG TTT CGGTGGTTTGC          TTTTTTTATTGTGCA 100 62
 FDF39_10980 NONE
 FDF39_10985 2250948 .. 2250980 +  -9.2  -5.06414   ATCAGCTCAATAAGC      AAAACCCCTCAAGT ATTTC ACTAGAGGGGTTTC      TTTTTATTAGAAAAA 100 28
         fur 2251979 .. 2252000 + -11.7  -5.60993   AAAACAAATAAAAAA           GGAAGGTTA CGTT TAACCTTCC            TTTTTTTATGAAGAA 100 57
 FDF39_11010 2255189 .. 2255209 + -16.9  -5.18355   CGCAGAATCTAAAAA            GCCCCGACA GGA TGTCGGGGC            TTTTTAGTTTTTAAC 100 195
 FDF39_11025 2260743 .. 2260769 +  -9.5  -2.53876   ATAATTCATATGAAA         TAGCCACCG ATAAAAAGG CGGTGGCTA         TAAATTAAAATAAAA  72 37
 FDF39_11035 2262031 .. 2262041 +  -5.4  -3.83486   CCACAAAAACTGATA                 CGAT TAG ATCG                 TTATTAAATTTTATA  61 45
 FDF39_11040 2263046 .. 2263059 +  -3.1  -3.41602   GAATATGCTTTGGCA               TCAAC TAAG GTTGG                TTGTCCTAGCATAAG  48 66
 FDF39_11055 2265817 .. 2265829 +  -6.9  -5.63374   TTAAGCATTTAAAAA                GCGCT CAG GGCGC                TTTTTTTCATATTAA  93 51
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 FDF39_11065 2268753 .. 2268770 +  -7.7  -5.42259   ATTAAACATCAAAAA             GCATCTC TTCG GAGGTGC              TTTTTTTAGACCTAC  93 36
         ggt 2271048 .. 2271065 +  -7.7  -5.60993   GCAAACTTTAAAAAA             GCTGTCA TTTT TGGCAGC              TTTTTTTATAAGGGG  93 42
        ssrA 2271600 .. 2271624 +  -9.4  -5.19261   AGAGTTGATCAAAAA          GCCTTAAATC TTAAT GATTTAGGGC          TTTTTTAATGCCTTT 100 73
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 FDF39_11090 2274204 .. 2274220 +  -9.4  -3.38683   AAATTAATGAAAAAA              GGCGCT TAATT AGCGCC              TTAAATTTTGAATCT  79 17
 FDF39_11095 2275321 .. 2275337 +  -9.4  -3.13743   CTATAGAAGATTAAA              GGCGCT TATTT AGCGCC              TTGAATCTCAACTTT  74 27
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 FDF39_11180 2283693 .. 2283718 +  -3.2   -2.9518   GCTGGAAATAAAAAA         CCACTCCCTG CGCCAA CAGGAAATGG          TCTATGGCTGTTCAA  44 30
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 FDF39_11200 2285191 .. 2285203 +  -2.7  -3.21934   GGTTATTCAAGGGGG                TGATC AAT GATTA                ATTTTATCAAGCCCC  45 16
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 FDF39_11230 2290664 .. 2290691 + -14.4  -5.08088   GCGCTTTTTTCGCTA        GGTCTATTTCTT AAAA AAGAAATAGACC         TTTTTATTAGGAATT 100 313
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 FDF39_11255 2294907 .. 2294928 +  -9.5  -5.18726   AATTATGATTCAAAA           TGCCCTATA TCAG TATGGGGCA            TTTTTGTTATGACAG 100 78
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 FDF39_11265 2298320 .. 2298341 +  -8.7  -5.90981   ATGATCAAGAAAAAC           CGCCGTGAT AGTT ATCACGGCA            TTTTTTTTCATATAA 100 51
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 FDF39_11275 2300573 .. 2300589 + -12.3  -5.37593   CTCCCCTAATAAAAA              GCCAGCT ATT AGCTGGC              TTTTTTCATTTCACA 100 75
 FDF39_11285 2302315 .. 2302343 +  -6.9  -5.25803   TATATACAAAAGCAA        TACCCTTAATA CAGTTCT TATTAAGGGTG        TTTTTTATGCAAATT  89 190
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 FDF39_11305 2305121 .. 2305142 +  -4.3  -5.36441   CAAAATGATTTCATA           GTCCTGTTC ATTA GTTCAGGAC            TTTTTTATATGCAAC  79 74
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 FDF39_11315 2305893 .. 2305914 +  -6.6  -5.28176   ACAACTGAAACAATA           GCCTCAAT CACAGC ATTGGGGC            TTTTTTATGGCTAGC  85 70
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 FDF39_11360 2313928 .. 2313942 +  -2.2  -3.10597   AGGTGATGGAGAAAC               TAAATG AGC TATTTA               ATTTTCAATGAAAAA  42 19
 FDF39_11365 2314280 .. 2314297 +  -7.7  -5.56264   AGCTACATTTTCTTT             GTCCTCA ATTT TGGGGAC              TTTTTTATGTTTGGA  93 72
 FDF39_11370 2316181 .. 2316198 + -11.3   -4.6856   AGTAAAACAGATAAG             GGCGCAT TTCG ATGCGCC              TTTTTACCCTATTTA 100 40
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 FDF39_11380 2317167 .. 2317180 +  -6.7  -5.53288   TTAGGAAATGAAAAA               CCACT TTCG AGTGG                TTTTTTTACATTGGA  87 44
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 FDF39_11390 2319357 .. 2319380 +  -8.2  -2.84999   TACTAATTACTCATA          GGTAAGGTCA TTTT TGGCTTTACC           TATAATCCATTTAAT  67 35
 FDF39_11395 2319702 .. 2319719 + -11.3  -3.83026   AGTTCTAAAAAGAAA             GCCAGCT GTAT AGCTGGC              TTTAATATAAGGGGA  90 40
 FDF39_11405 2321497 .. 2321514 +  -5.5   -5.4505   AAGCTGATTTAAAAA             GCTACCT TTTA GGGTGGC              TTTTTTATTAAGACC  84 395
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 FDF39_11420 2322183 .. 2322196 +  -9.5   -5.5353   ACAGATGTGATATAG               CCCGC TTTT GCGGG                TTTTTTATTAATATA 100 31
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 FDF39_11465 2338393 .. 2338409 +  -2.9    -2.981   CCCAACTTAAAATAA              GCTATGG AAC TCATTGC              CTTTATAGATTCACC  43 26
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 FDF39_11475 2341883 .. 2341930 +  -8.2  -4.14633   AATTTTTAACATTGG TATTAGAACATTTAATTAATCTA TTG TTGACTAAT-AAATGTTCTAATA TGTTTTTTGGGAATA  81 39
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 FDF39_11485 2343732 .. 2343747 + -10.4  -4.45175   TTAGAATAAGATAGG              CCCTCC ATTA GGAGGG               TTTCCTTTTTTAATA 100 32
 FDF39_11490 2344740 .. 2344765 + -14.9  -3.51976   AGGTGCTTAACAAAT         GAAAACCAGCT AACT AGCTGGTTTTC          TTAATTTGGGGAGTT 100 111
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 FDF39_11525 2349233 .. 2349250 + -11.3  -5.57396   AGCACTTTAAAAAAA             GCCCTGA ATAT TCAGGGC              TTTTTTATTAATTAT 100 126
 FDF39_11550 2353597 .. 2353621 +  -7.9   -5.4833   GTTTTAAAACAAAAA          GGCTTGATTCT AAA GGGATTAAGCC          TTTTTTCTTGCCTGA  93 269
 FDF39_11555 2355051 .. 2355067 +  -3.7  -3.18452   GTTAGCTGCCGAAAG              TCGGA AACCCAA TCCGA              TTGGCTTAGCATCAT  49 118
 FDF39_11560 2356011 .. 2356041 +  -5.4  -5.71712   AAAATATAACAAAAC       ATCCCTCTAAGTAA GGC TAACTTGGGGGGAA       TTTTTTTATCTAAAA  86 87
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 FDF39_11590 2358399 .. 2358409 +  -4.6  -4.36586   TAAAGTTGCCCAAAC                 TGGC TAC GCCG                 TTGTTTTGGTTGTAT  64 392
         ssb 2361031 .. 2361050 +  -4.2  -4.76123   TTGCTTTGATCGAAA            GCTCCCTA AATA TGGAGAGC             TTTTATTAGTGATTT  70 32
 FDF39_11620 2365106 .. 2365117 +    -3  -3.46534   GGTGCAGTCTAATTA                GATA AAAG TATC                 TCTTTCATAGGATTG  48 432
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 FDF39_11630 2369135 .. 2369151 +  -2.9  -3.38683   TCTGAAAATTTAAAA              GGTGC TTAATTT GCGCC              TTAAATTTTGAATCT  47 17
 FDF39_11635 2370251 .. 2370267 +  -9.4  -3.13743   CTATAGAAGATTAAA              GGCGCT TATTT AGCGCC              TTGAATCTCGACTTT  74 27
 FDF39_11655 2374154 .. 2374168 +    -5  -2.78891   TCAATGATTATGTAC               CAGTTA GAA TAGCTG               TGGTTGACTTACCAT  51 394
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 FDF39_11680 2379056 .. 2379072 +  -9.4  -5.62045   TTAAAAGAACTTTGA              GCACCC AATTC GGGTGC              TTTTTTATTGTCTAT 100 44
 FDF39_11685 2379497 .. 2379510 +  -9.5  -5.14477   TGAAAACAGCTAATG               CCGCC TTCG GGCGG                TTTTTTACATCTATA 100 28
 FDF39_11690 2380201 .. 2380215 +   -10  -4.93696   GGAATTTGTGTGAAA               GCCCTT TAA AAGGGC               TTTTTAATATTTGAA 100 112
 FDF39_11730 2388148 .. 2388172 +  -5.7  -3.55444   GTCCTGATGAGGAAG          GCATTTGGATT AAT GGTCCAATTGC          TTTAGGGCATAGACG  59 152
 FDF39_11750 2393752 .. 2393763 +  -4.4  -3.64184   AATATACTTCGCTTC                GGTT TTTA AACC                 TTTCACGTAGTCTTT  56 337
 FDF39_11770 2398595 .. 2398609 +  -5.8  -3.99898   CTTGACTTGTTTAAA               TGATAA TTA TTATCA               TTTGTAAGTTCCTTG  67 115
 FDF39_11775 2399439 .. 2399449 +  -2.4   -4.2361   TATAAACATTTACGT                 GCAG GAA CAGC                 TTTTGCCGTTGTGTT  54 301
 FDF39_11785 2403622 .. 2403635 +  -3.1  -4.27316   CAATAAACTAAAAAA               TAGCG AAAT CGTTA                TTTTAAATTAAACAA  60 155
 FDF39_11790 2404483 .. 2404514 + -15.4  -5.15117   AAAAATTAATGAATG      CAAAAGGAATCTAC ACAC GTAGGTTCCTTTTG       TTTTTTGGGCTTTTG 100 32
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 FDF39_11810 2408563 .. 2408576 +  -3.9  -4.07486   CGACATTAAACACTC               TATGT TTTT ACATA                CTTTTTTGTTTTGAT  57 510
 FDF39_11820 2409430 .. 2409456 +  -7.3  -3.54741   TAAAGTCCAATCGAG        GCTGAGCC-GAA ATTG TTCAGGCACAGC         TTTACAGGCATAATG  68 71
 FDF39_11865 2422387 .. 2422436 +  -8.9   -4.3115   TTTATATTTTTTGCG TTCAAAGCAGTCTTTTCATTATT GTTA AATAGTGAAAAGACTAAATTGAA TATTTTATTTTTCTT  89 60
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 FDF39_11875 2425180 .. 2425220 +  -7.1  -4.70739   AACCTCATATAAAAC  GATGCTGTGTCATTT AAAATGGAACA AAATGGCATAGCATC  TTTTGATTATTTTTG  83 43
 FDF39_11880 2425946 .. 2425970 + -10.8   -5.4505   ACTTCTTAAAAAAAA          GATCGAACCG CAGCA TGGTTCGATC          TTTTTTCTTCACCGA 100 32
 FDF39_11890 2427770 .. 2427782 +  -6.3  -4.49041   GAAATACTTCAATAT                TCTCT ATG AGAGA                TTTAATTTTTTATAT  76 49
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        pgaC NONE
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 FDF39_13185 2683319 .. 2683340 + -10.2  -4.05402   TTAAGCATTAAAGAA           GGCCGATT CTTATA AATCGGCC            TCTTTTTCATTGGAG  93 49
        rnhB 2684397 .. 2684434 + -12.9  -5.03713   CTTTCCGTTTAATAT   AACAGAGCCGCTATA AAAAAAAC TATAGCGGCTCTGTG    TTTTCTTTGATTATT 100 495
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        pcaU 3561169 .. 3561189 +  -9.9  -3.14881   TTGTTTTTGAGTTTT            TATATCTGT TTG ACAGATATA            TTCGTCACGGCCTTC  73 318
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        ahpC 2780072 .. 2780105 - -12.6  -4.18018   TGTGCTTATTCAAAA     CAAAAGAACCATCC GATAAA GGATGGTTCTTTAG      GTTTTTAAAATCTAA 100 47
 FDF39_13760 2779497 .. 2779508 -  -2.2  -3.13773   GGCCAGATTTAAAAC                GCCT AATG AAGC                 CTAAAGGTGGGGTTT  43 236
 FDF39_13740 2776430 .. 2776468 - -22.1  -4.62872   AGCAATTTTCAAAAA   GCATTAAAAAGCCCCTA AGTGA TAGGGGCTTTTTAATGC   TATAGCTAATTAGTG 100 35
        trmB 2772237 .. 2772271 - -11.7  -2.60423   AGTTTAAGTAATTGA     TTATGGCACTAAGTC ATTAA AACTTAATGCCATAA     TTTTAAATAAAAATA  83 50
 FDF39_13705 2765100 .. 2765111 -  -2.2  -3.46647   CTGATTTAGCAAATA                GCCT AAGT AAGC                 GTGTATATCAATATA  47 368
       rlmKL 2757729 .. 2757748 -  -5.8  -2.53581   TACATGGTGAAGTTA            TCATTACC GTGA AGTAATGA             TAACTTCCTGTTTCA  54 49
 FDF39_13665 2756539 .. 2756560 - -10.3   -4.4267   TGCTAAAACCGAAAA           GAGAATATG GAAA CATATTCTC            TTTTTTTATATTTAA 100 37
 FDF39_13655 2752369 .. 2752410 -  -3.1    -4.015   TGACTCAGTAAAGAA GGTCATTTACTTAGCAACAT CAA ATGCTGCGAAG-AAATGGAC GATGCCAATTCAAAA  55 444
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        alaS 2740013 .. 2740038 - -10.5  -2.63079   GTTCCATATAAGCCA         TGACCCTGAGA GGCT TGTCAGGGTCA          GTTACACAAAAAGTG  78 46
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