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 FDQ49_02620  554235 ..  554264 + -15.3  -3.06312   ACAATTAAATCTCAA       TAAAAAGTCATCC TTAG GGATGACTTTTTA        TTGGCTCAAAAATTT 100 40
 FDQ49_02635  557848 ..  557864 +  -5.1  -5.20534   TAATAAAATTTTAAA              GCTCC TGTTTAT GGAGC              TTTTTCTTGCTTGGT  79 38
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 FDQ49_02710  574232 ..  574256 +   -10    -4.431   TTCGCACACTAAAAA          GCCAGCCTTG AAAAA CAAAGCTGGC          TTTTATAAATGAATC 100 43
 FDQ49_02725  578024 ..  578047 +  -9.7   -4.8667   TTAATCAAATTTAAA          GCACTTCAA AACGAC TTGAAGTGC           TTTTTATCAAATGTA 100 37
 FDQ49_02730  579459 ..  579479 +    -4  -4.86862   CCTTATTTCCACGTA            TGTAGAGT TTATT ACTCTTCA            TTTTAATTTTTTAGG  70 160
        pobR  590008 ..  590035 +    -5  -3.54919   AAATAGACTTAGAAA        CTCTTGTGACC AATTAGA GGT-ACAAGAG        TTTCAACCCATAATT  59 39
 FDQ49_02785  591757 ..  591770 +  -3.9  -4.43307   GCAGCGCACTTAAGA               TAACT GTTA AGTTA                TTCTTTTATTAGAAG  62 125
 FDQ49_02790  592216 ..  592239 +  -3.2   -3.5553   ACAGGTGAGGTTAAA          GGTAAATG AAATCACG CATTTGCC           TATTTGGGTTTGTTT  50 17
 FDQ49_02795  592799 ..  592822 +  -9.7  -3.08464   TTCCTGTTTAAATAA          TAAAAGCCC ATTAAC GGGCTTTTA           TTAAATGAATAGTGG  78 250
 FDQ49_02810  596024 ..  596034 +  -6.8   -2.8577   AGATCAAAAATTTCA                 TGGC GCA GCCA                 CTTTCGATATTCAAT  57 353
 FDQ49_02820  597033 ..  597048 +    -9  -4.66163   AGGGGGAAATAAAAA              CAGCCT TGGG AGGCTG               TTTTTGGGTAGAGGT  89 104
 FDQ49_02830  598745 ..  598755 +  -2.4   -3.3071   CTCCGCCATGCACAC                 CGCC CAA GGCA                 TTCATGTGCTCGTCT  45 421
        paaZ  612237 ..  612265 + -13.2  -5.42259   GCTTAATGTTTAAAT        TGAGATGGGGTC ACCTC GTCCCCATCTCA        TTTTTTTAGCACTCA 100 35
 FDQ49_02910  615777 ..  615799 +  -8.5  -3.05816   TTGATAACTCTCCAA           CGTCAGAAG AACCA CTTTTGACG           TTCACTCACAAGTGA  70 132
 FDQ49_02915  617416 ..  617440 +  -9.4  -5.26875   TAATTTTTTTTTAAA          GGAGTTTATC CAAGA GATGAACTCC          TTTTTTAGTTCAAAG 100 38
 FDQ49_02920  618887 ..  618909 +  -8.5  -5.72616   GCACTTAATAATGAT           TTGGGTTGT TTTAT ACAGCCCAA           TTTTTTTGTCTAAAT 100 60
 FDQ49_02955  625436 ..  625455 + -10.8  -5.65177   TAATATAAGTAAAAA            GAGGCTAA ATCG TTAGCCTC             TTTTTTTATAGATAT 100 42
 FDQ49_02985  630090 ..  630120 +  -3.3  -4.39277   ATCACAAAAATGACT       TGGGATCGTTTTT TCGAT GAAAAAGAACCCA       TTTATTGTGCTGTTG  60 470
 FDQ49_03010  634952 ..  634965 +  -4.5  -2.67189   AAGACCATAAGCAAA               CGCTG CTTA TAGCG                TGGGTTCATTTTGTC  47 421
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 FDQ49_03420  721187 ..  721201 +  -2.1  -5.31545   TTGTGTAAGGTCATT               GGTGA ATAAG TCATC               TTTTTTAATATTCTT  73 514
 FDQ49_03440  724095 ..  724111 +  -3.8  -3.63569   AAAAAGCCTGAATCT              TAAACT GATTG AGTTTA              TTCTTAGAAAATTCA  54 372
 FDQ49_03450  725513 ..  725542 + -12.3  -4.30719   TAAATCTTATTGACA       AAAAAAAGCCCTC TTTA GAGGGCTTTTTTA        TTTATTCTACAGAAA 100 55
 FDQ49_03460  727262 ..  727277 +  -6.1  -4.49958   CTCAATCACAGCAAA              GCCCT TTTAAT AGGGC               TTTCTTTCATAAAAT  74 16
 FDQ49_03480  730721 ..  730746 +  -4.1  -3.30173   TACAAAGTTATAGCT         TTCATAGGA TGTGGTTT TCCTGTGAA          TGTTCCTATCTTTTT  50 49
 FDQ49_03490  732642 ..  732668 +  -3.8  -3.94891   GTGGCGATCTTAATA         GTCGATTTAAAT AAG ATTTGGATAGAC         GTTTTTTTAGTATCT  56 12
 FDQ49_03495  733322 ..  733338 +  -2.3  -3.07227   CACTCCAAACCATTG              CAAATGA GTC TCATTTA              TATATACTTTACTCA  42 60
 FDQ49_03500  735632 ..  735654 +    -7  -4.15006   TAAAACATGGGATTA           GAGCAGTG CCTAAAT CGCTGCTC           TTTTGAAATCAATAT  72 38
 FDQ49_03505  736357 ..  736398 +  -6.7  -3.14463   ATAAAACCATTTATG ATGCAGCTC-TCAAGGTTTT TAT AACACTTTGGCGAGCTGCAA TTAATAAACAACATT  62 37
 FDQ49_03540  743307 ..  743326 +  -6.4  -4.92783   CGATGTCATAAAAAA            TCCCGC AGTGTATG GCGGGA             TTTTTGTAGTGAGTT  80 121
 FDQ49_03570  750089 ..  750105 +  -7.3  -3.18511   AATGCTTCTAAATAA              TTGGCAG CGT TTGCCAA              TTGCATATCTATATC  63 408
        mutS  757803 ..  757832 + -15.9  -3.51232   TCATAATTATTGATT       GAGCAAACATGTC TATG GGCATGTTTGCTC        TTACTTTGAGGAGAA 100 35
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 FDQ49_03610  759069 ..  759086 +  -9.9  -5.26918   ATAATTTCAAAAAAA             GATCAGC AACC GCTGATC              TTTTTTATACCCTAT 100 37
 FDQ49_03615  759921 ..  759948 +  -4.1  -3.88015   TTTCTAAAATATAAA        TCCCCTTGTGC GCTTCA GTTTAAGGGGA         TTTGCTCATTCTATA  57 34
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 FDQ49_03770  789313 ..  789336 +  -7.6    -5.093   AGAGACATAAAAAAA          CCTATCTTCTT TAA AAGA-GATAGG          TTTTCTTGTTTTAGC  90 126
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        benA NONE
        benB  809635 ..  809649 +  -2.1  -3.06183   TAAGACATACCCCCT               CAGTT AACCG GACTG               TTGGCTGAGGGTAAA  42 38
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        benE  812857 ..  812872 +  -3.4  -4.32649   ATTTGGCAATTTTTA              TTTAAT ATAA ATTAAA               TTTCATTTTTAAGAT  57 117
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 FDQ49_03915  815915 ..  815942 +   -15  -4.18908   TATTTTTGTTTCAAT        TGAAGCGGGCTA ATTC TAGTCCGCTTCA         TTATTTTCGACCTAT 100 42
        ahpC  822002 ..  822025 + -11.1  -5.10933   TTTTAAAAACTCGAA          GAACCATCC TTTATC GGATGGTTC           TTTTGTTTTGAATAA 100 52
 FDQ49_03935  822510 ..  822536 +    -6  -4.02108   CTCATAAAATCTGCA         TCTTTTTTAATC AAA GATAAAAAAGGA         TTTACTTCTGCTGCA  69 152
        ahpF  825142 ..  825165 +   -14  -5.27779   TGTTATCGAGCGAAA          GCCTAGCATT GCAA AATGCTAGGC           TTTTTTAATGTTGAA 100 55
 FDQ49_03955  825651 ..  825669 + -10.3  -5.17353   TTCAATATTAAAAAA             GCCCCTA TTGAT TAGGGGC             TTTTTTAATGCATCT 100 47
        trmB  830020 ..  830040 + -12.7  -2.66522   ATTAATTTTTAGCGT            CAATGTGTG ACG CACACATTG            TAAGTTGTATTGAAT 100 234
 FDQ49_03975  831998 ..  832036 + -13.5  -3.62572   ATTTTCTAATAAAAT   TATATTAACTGAACCAA AAATA TTGGTTCAGTTAATCTA   TATTTATGATTAGGT 100 136
 FDQ49_03980  832856 ..  832872 +  -2.3  -4.08216   GTAATAACGGCGAAC              CTTAATT TTT AAATAAG              TTTTAAGCCGAGTGA  52 21
       rlmKL  840658 ..  840671 +  -2.4  -4.33146   GCGGTCCGCTCGGTC               TGGT AGGGCA ACCA                TTTCTAATTTTTTCT  59 128
 FDQ49_04020  841765 ..  841786 + -10.3   -4.4267   TTAAATATAAAAAAA           GAGAATATG TTTC CATATTCTC            TTTTCGGTTTTAGCA 100 37
 FDQ49_04030  845964 ..  845981 +  -4.1  -5.09259   TTATCATAAAAAAAA             GCCAACA TGAC TGTTAGC              TTTTCTTTTCAGGTA  72 494
         crp  847604 ..  847619 +  -7.6  -5.71712   ATGATTTAATAAAGA              GCAAAC TTCG GTTTGC               TTTTTTTATATGCAA 100 50
 FDQ49_04050  848795 ..  848824 + -12.3  -2.78891   TGCCCCTTAAAAACA       AAAAAACGGATGC TTAA GCATCCGTTTTTA        TACTTACATTAAAGT 100 31
        alaS  856999 ..  857024 + -10.5  -2.63079   CACTTTTTGTGTAAC         TGACCCTGAAA AGCC TCTCAGGGTCA          TGGCTTATATGGAAC  78 46
 FDQ49_04085  858390 ..  858423 + -16.2  -3.65812   TAATCAAAGAAAACA     CAGAGCCGCTATAG TTTTTT TTATAGCGGCTCTG      TTATATTAAACGGAA 100 91
        csrA  858847 ..  858874 +   -10  -5.04385   GTTATTCTCTCCCTA        ATTAAAGCGACT TTAT AGTCGCTTTAAA         TTTTTTGGGAGTATA 100 47
 FDQ49_04105  860707 ..  860752 + -10.8  -5.24449   ACAGCCTAAATAAAT TCTATGTTAAAAAAACCGCCT ATCAC AGGCGGTTTTTTTATT-TAGA TTTTTTGGATTTCTG 100 28
 FDQ49_04140  868774 ..  868796 +   -12  -5.90231   CATAATCAACAAAAA           CACCTGCGAA ATA TACGCAGGTG           TTTTTTTATGTTTAT 100 36
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        dinB 1823174 .. 1823197 +  -6.2  -3.04398   TCCTTATGGTAGGTG          TTGTTTTTTT ATCC AAAAGAACAA           GTTTTAAACAAAAAC  59 29
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         psd 2152305 .. 2152320 +    -9  -5.80364   AATAATATTAAAAAA              GAGAGC ATTT GCTCTC               TTTTTTTATTCACAT 100 47
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 FDQ49_11800 2491126 .. 2491166 +  -4.2  -3.36823   ATCTGAAGAAACTCA CTCCTTGCG-TTACTAC TTATTTTC GTATTAATCGTAAGGAG  TTCAGTTTTAAAAGG  50 45
        rrtA 2491815 .. 2491825 +    -4  -3.84961   TCTTTATTGATAAAG                 TTTG ATG CAAA                 TTTGATCGTTGAATA  55 84
 FDQ49_11810 2494235 .. 2494255 + -12.7  -4.68994   CTTAATAAATAAAAA            GCTAGTTCA GAG TGAACTAGC            TTTTTGCATGATAAT 100 121
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 FDQ49_11860 2504200 .. 2504213 +  -8.1  -5.65177   CACTTGAAGAATTAA               CCGCT ATAT AGCGG                TTTTTTTGTGCCTAT  95 39
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 FDQ49_11875 2506426 .. 2506450 + -10.1  -5.55769   TCACTAAGTTTTGAA          CCCTATTTTTG AAC CAATAATAGGG          TTTTTTATTATACCC 100 52
 FDQ49_11885 2508653 .. 2508663 +  -2.6  -3.34962   CCAAGTTTTTGCTTC                 TTAT AAA ATAA                 TTCTAAAATATCAAG  46 389
        wrbA 2510459 .. 2510474 + -10.4   -5.7946   ATAAAAATAAAAAAA              GAGCGG AAGT CCGCTC               TTTTTTTATTGAAAC 100 44
 FDQ49_11915 2513810 .. 2513835 +  -6.9   -4.1196   TCATTAATGAAAAAA         TGTGGATAACT TTTA GGATATCCACA          TTTTAAAAATGAATT  72 34
 FDQ49_11935 2519197 .. 2519212 +  -3.3  -4.42238   TTAATTTTAGATGAT              GAATG ATGGAA CATTC               TTTTAATTGGCATAA  60 37
 FDQ49_11940 2519894 .. 2519916 + -11.4  -2.71791   GAAATTACAATTAAA           GGTAGCTATT AAG AGTAGCTACC           ATTTCACAGAAAAAT  85 14
 FDQ49_11945 2521129 .. 2521147 +  -6.7  -5.56264   AAATGAATTGGAAAA             GCACTCT CTTGT AGGGTGC             TTTTTTATATTTGAA  90 51
 FDQ49_11950 2521524 .. 2521546 +  -9.2  -4.19238   ATAACCAAATAAAAA           GGCCTGTT TATAAAT AACAGGCC           TTTTAAAATTCACAC  88 37
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        pssA NONE
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         rrf 2531504 .. 2531529 + -15.5  -6.28967   GCTCATTATTCTAAA         CACCCCCATTC TAAA GAGTGGGGGTG          TTTTTTTTGTTTGTC 100 38
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 FDQ49_12115 2551996 .. 2552023 + -15.8  -4.12599   AACCCTGTGATGTAA        TAAAAAAGCCGC ATAA GCGGCTTTTTTA         TTTTCGAAAATTATT 100 26
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       coaBC 2582028 .. 2582044 +  -9.4  -6.21477   CACCAAATAAAAAAA              CCGCGA ATAAA TCGCGG              TTTTTTTTTAGTCTT 100 47
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        glnE 2597459 .. 2597470 +  -4.4  -2.66748   GATTTTATAACAATT                TGGA GTGT TCCA                 TGAATTTGGCTGATC  46 39
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        baeS 2624082 .. 2624092 +  -5.4  -2.80699   AAAAGGAAAATGGCC                 CATG AAA CATG                 TAATGTTGGTTGAAG  52 43
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        secA 2648017 .. 2648055 + -14.3  -3.96624   AAAATTTAATTTTCG  TGATAAAAAAAGCAGAAC AATC GTTCTGCTTTTTTT-TCA   TTTGTAGTAAGCCTG 100 32
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        typA 2677970 .. 2677989 + -10.8   -5.5604   ATGAAAAAAGACAAA            CCGCTAAA TTCG TTTAGCGG             TTTTTTATTGCTTAC 100 51
        mscL 2678653 .. 2678669 + -10.9   -5.4833   TTTCAAATAAAAAAA              CGGTACT TAG AGTACCG              TTTTTTATTACATCA 100 46
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 FDQ49_12870 2711061 .. 2711074 +  -3.9  -3.04144   TAATTTGTGACCATA               CTTTA TTTT TAAAG                TATTGCAAGTGCAGC  46 41
 FDQ49_12875 2711160 .. 2711189 +  -6.5   -2.6927   CCCCGTCCGCTGCGC       CATTCTCTTGATT CCCT GATCTAGAGGATG        TAATGTATAAAGACT  57 24
 FDQ49_12880 2711332 .. 2711348 +  -5.2  -5.24449   TTAAAAAATTATATA              CACTAA TTTAT TTAGTG              TTTTTTGCATTTCTG  79 54
 FDQ49_12905 2719337 .. 2719372 +  -9.8  -3.25479   CGCGACAAGCAAAAA    GCCAAGCACTCTCTTG ATTT TAAGAGAGTGGTTTGC     TTGAGTCTTTAATCA  80 9
 FDQ49_12920 2720822 .. 2720853 +  -5.2  -3.10082   CCAGTTTAGACATTC      GCCCAAAAGTATAT GTAA ATATGCTTATTGGC       TTAAATCCAGTTTTT  54 50
 FDQ49_12925 2721134 .. 2721151 +  -7.7  -5.80003   AAATGTACTGAAAAA             GTCCCTA TTGC TAGGGGC              TTTTTTGTTTATTGC 100 39
 FDQ49_12930 2722706 .. 2722725 +  -8.6  -5.60993   GTAATTTTCAAAAAA            GCCTCTTA GAAA TAAGGGGC             TTTTTTTATGGAGCA 100 37
 FDQ49_12935 2723865 .. 2723877 +  -6.2   -5.4505   GAAAATTAAATAAAA                GCCC GAGAA GGGC                TTTTTTGTTGAAAAA  86 58
 FDQ49_12940 2725300 .. 2725311 +  -2.2  -2.62184   AAAAGCTGTATATGG                CTCT TAAG GGAG                 TCATATGCAAAGCAA  39 62
        sbmA 2726703 .. 2726716 +  -9.5  -5.65177   ATAAATAAATGAAAA               CCCGC GAAA GCGGG                TTTTTTTATGGCTAT 100 33
 FDQ49_12955 NONE
 FDQ49_12960 2729309 .. 2729329 +  -9.7  -3.59031   TATTTTAGTAATAAA            GCCTGCTAT CTA AGAGCAGGC            TTCATTGTATTTAGT  83 54
 FDQ49_12990 2735185 .. 2735197 +  -3.3  -3.07655   AAGTTTAAGGATTAG                GCGGT GCA ACCGA                ATATTTTTTCAAGAC  45 39
        mreC NONE
        mreD 2736507 .. 2736523 +  -3.7  -4.28432   TTTATTATTGTTTAG              CAAAATG GCG CATTTAG              TTTTAGCTTCCAGTT  60 9
 FDQ49_13005 NONE
 FDQ49_13010 2738688 .. 2738699 +    -3   -4.2231   AACTGAAATTTTACT                TTCA TTCA TGAA                 TTTTAAATACTACTT  57 74
 FDQ49_13015 2738951 .. 2738977 +  -3.7  -5.13741   CCGCGCAATTAAAAA         ATAAGGGGC CATTTCAAA GCCCCTTAA         TTTTTCTTAACTTGC  70 22
        thrH 2742096 .. 2742110 + -11.4  -5.38047   ATGGACAATAAAAAA               GGCGCT TAA AGCGCC               TTTTTTATATGAATG 100 43
 FDQ49_13045 2746225 .. 2746235 +  -5.4  -3.13299   AATATGGTACAGAAG                 CCAT TAA ATGG                 TGTTCCATATGATAG  54 195
 FDQ49_13060 2749182 .. 2749197 +  -7.6  -5.64274   GACTAAGTGAAAAAA              CCTAGA ATCT TCTAGG               TTTTTTTATGCCTAA  95 47
 FDQ49_13065 NONE
 FDQ49_13070 2751267 .. 2751305 +  -6.8  -4.14859   AGTTAATTTAATCTG   TGACAGTTTAGGTGAACG GCA TGTTTGCCTAAACTGAAA   TTTATAATTATTAAT  72 35
        hchA 2752447 .. 2752466 +  -8.6  -5.36314   ATTATAAACAAAAAA            GCTATTGC TAAG GCAATGGC             TTTTTTCATGTTTTA 100 138
 FDQ49_13085 2753459 .. 2753475 +  -2.9  -3.92178   TTATGTATGTAATTA              CCTGATG CAG CATAGGG              TTTACTTGCCATGAT  53 496
        nudC 2755856 .. 2755875 + -10.8  -5.36314   GTCTTAAATAAAAAA            GCCATTGT CGAG ACAATGGC             TTTTTTCATGTTTTA 100 72
        prpF 2758847 .. 2758867 + -14.1  -5.32944   TCATTTAAATGAAAA            GCCTCTCTA CGA TAGAGAGGC            TTTTTTACTTCTGAC 100 44
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 FDQ49_13120 2760337 .. 2760368 + -18.2  -3.69734   CAATAATACTCAATA      TGAAAACGGCGACC ATCA GGTCGCCGTTTTTA       TTTCAATGACTTATT 100 35
 FDQ49_13145 2765251 .. 2765283 + -10.1  -3.56568   AGCGTTAAAATTGGT      TTTGATTGCGGTAAT AAA ATTAATGCAATCAAA      TTTGGAGAATAGTTG  83 443
 FDQ49_13150 2766706 .. 2766735 + -15.9  -5.63103   TGCTTCTTAGCTAAT       TGAGTCGAGATTC ATAT GAGTCTCGACTCA        TTTTTTTAATTGAAA 100 49
 FDQ49_13155 NONE
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 FDQ49_13165 2770553 .. 2770584 +   -14  -3.24256   GGTTTTACATTTACA      TGAAACAAGAGCTT AACT AAGCTCTTGTTTTA       ATTGTTTTTCGAACT 100 10
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 FDQ49_13200 2776773 .. 2776800 + -12.8  -3.54408   TGAAATATAGAAAAA        CCCAGAACCTGT TTGC ACAGATTCTGGG         TTCGTTTAACTAAAA 100 44
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 FDQ49_13215 2781414 .. 2781428 +  -2.8  -3.14132   GAAATAAAAAAGAGA               TTTTGC CGT GCTAAA               TTGATGGAAAAACCC  43 34
 FDQ49_13220 2781973 .. 2782003 +  -9.8  -3.11798   GTACTCAACCGAACT       CCCATAATATGGTT AGC ACCCACATTATGGG       CTTGTTGTTTTAAAC  73 104
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 FDQ49_13275 2793623 .. 2793639 + -12.3  -5.63504   TTAGCTTAAGAAAAA              GCCCACA TTT TGTGGGC              TTTTTTTATGGAATT 100 44
        lolA 2794558 .. 2794583 + -14.1  -5.04597   ATTGTGCTTCGTTAA         GAAAGCCACCT AAAA GGGTGGCTTTC          TTTTTATATATCAAT 100 43
 FDQ49_13285 2795537 .. 2795552 +  -2.6  -2.76422   TTTTTTAGTGTTAAG              GGCT-TA CAC TATAGCC              AGTTTTTTACCCATA  41 101
        serS 2796831 .. 2796861 +  -5.5  -2.59927   CGCCCATATATGGGT       GGTGCAACGTTTA TTGAC TAAGCTTTGCATC       TAAATTGTGCACGTT  54 5
        cobA NONE
 FDQ49_13300 2798861 .. 2798880 +  -5.7  -5.59357   CCTAAATACAAAAAA            TGAGGCC CTAGGT GGCCTTA             TTTTTTTGATCTAAT  88 44
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        odhB 2819629 .. 2819655 + -11.7  -3.87815   TCGAATAAATACCTA         CCAGGATAGAG CGATC CTCTATCTTGG         TTTATGGAGATAAAA 100 46
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        sucD 2823350 .. 2823375 +  -9.1  -5.49729   TAAATCTTTAAAAAA         TACCGCATC TGAAAAAT GATGCGGTA          TTTTTTTGCATCATT 100 50
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 FDQ49_13470 2852313 .. 2852344 + -10.2  -5.00616   CTTTTAAAAAATAGG      TGCCTATCTGGC-CG AAT TGAGCCAGACAGGCA      TTTTTTAGCGAACAA 100 27
 FDQ49_13490 2854807 .. 2854822 + -10.4  -3.23572   TCTTAAATGTAAAAA              CCCCTC AATT GAGGGG               TCTTATAGCCTAAGT  83 59
 FDQ49_13510 2860032 .. 2860042 +    -4  -2.80935   GATACTTTTAGCAAA                 TTGT CTA ACAA                 TCTGGTGCCTGAAAT  47 147
 FDQ49_13515 2860731 .. 2860749 +  -8.9  -6.12458   AAATTCAATAAAAAA             GCGAGAA TTAAT TTCTCGC             TTTTTTATTTTTTTA 100 54
        rlmE 2862545 .. 2862557 +  -3.4  -3.90316   TTAGGTTATCCGCAA                GCAA GACAA TTGC                TGTTTTTAAGACGAT  54 84
 FDQ49_13535 2864520 .. 2864561 + -15.5  -3.29324   GCAATGAATTAAGTT GATTAATAAAAAAGCCACA ATCA TGTGGCTTTTTTATTTGTC  TTAAATTTCGATAAA 100 29
        folP 2865599 .. 2865614 +  -5.4  -3.64142   AAAATATGTTATAAG              CGGCAA GTTT TTGCTG               TTGTGTAATCTTTTG  59 126
 FDQ49_13545 2865933 .. 2865955 +  -9.2  -4.20883   AGAGTTGGTGATGAA           TCGAGAGTGG TGA TTACTCTCGA           TTTTCAAAATTTTTA  89 13
 FDQ49_13560 2868426 .. 2868443 +  -7.7  -5.42259   CTATAGAAAAGTAGA             GGGTTGC TGAG GTAACCC              TTTTTTTAGGCATAA  95 43
        folD 2869793 .. 2869803 +  -3.2   -3.1355   CATCCGCAAAACTCG                 TCAG CTA CTGG                 TTAGCTATAGATGAG  45 136
 FDQ49_13580 2870575 .. 2870596 + -10.2  -6.12328   CGTAAGTTTTTATAA           GACGCTGT AAAAGA ACAGCGTC            TTTTTTTTATATTAT 100 16
        glpK 2874458 .. 2874470 +  -6.3  -4.82678   TTTTGATTGTTGTTT                CATCA ATT TGATG                TTTTAATTTTTATAA  78 125
 FDQ49_13600 2876028 .. 2876062 + -14.5  -3.60792   AAGATGATGCCGCAT     AATAAAAAAGGCCGC ATGAA GCGGCCTTTTTTATA     TTTAGCAATTAGAAG 100 24
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 FDQ49_13615 2880093 .. 2880123 +    -7  -3.14211   TGACATCTAAATATT       TTGTTATTGCTCTG GAT TAAAGCAATAACGA       TTAATCAAAAAGACT  62 146
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        groL 2882156 .. 2882197 + -17.7    -3.551   ATAAACATCAACGTC TAAATAAAAAAATCCCTGC ATTT GCAGGGATTTTTTTATTTC  TTATATAAATTAAGA 100 40
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 FDQ49_13650 2888953 .. 2888982 + -16.7  -3.95449   CATCATTCAGCCTAA       TAAAAAAGCCTCC AACT GGAGGCTTTTTTA        TTTACTGTGTTATGG 100 26
        ttcA 2892450 .. 2892480 + -11.4  -2.88861   AATTAAGTAAGTCAA       TTAAAGGCACTT TATAAAC AAGTGCCTTTAA       TGTATCAAAATACTA  85 44
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        greB NONE
 FDQ49_13690 2895286 .. 2895306 + -11.9  -6.32216   CCAAAATTCTTAAAA            GCCCTTGTT AAT GACAAGGGC            TTTTTTTTTATGTCT 100 38
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 FDQ49_13715 2904947 .. 2904982 +  -7.2   -4.4648   CTAAGCATTACTTGG    TAAAAGTAAGTTCTTTG TAT CAAAGTA-TTACTTTTA    TTTTGTAATGAGGCT  79 62
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        adeD NONE
        adeE 2915633 .. 2915643 +  -5.4  -3.42354   ATTTATAGCATGAGG                 GTCT AAA AGAC                 TTATCACTTAGAATG  57 77
 FDQ49_13775 2917948 .. 2917967 +    -5   -3.1789   CCTTCGCCTAATGTC            CCTGCAAT CACA ATTACAGG             TATATTGTGCGCCTT  53 208
 FDQ49_13785 2921757 .. 2921777 +  -8.3  -3.65046   TGAAATCTAAGCAAA            TGGCGCT CTAAACA AGCGCCA            TTCTTGAAATAAAGG  74 60
        fdhD 2922615 .. 2922628 +  -2.4  -2.64422   CGTTCAATATGATTG               GCTT AAAACG AAGC                TCATCTAACATCTCT  39 48
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        genX 2925249 .. 2925294 + -12.9   -4.0098   CGAAATTGCCTGAGG GCGAGCAAATAAAAAAGCCACA TAT TGTGGCTTTTTTATTTGGA-GC TTATTTAAATTAAGC 100 28
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        lysA NONE
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 FDQ49_13845 2934278 .. 2934298 + -11.2  -4.72486   TTTAACTATTATTTA            GCGTGCTA TGGGT TAGCACGC            TTTTTAAAATTTATC 100 44
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 FDQ49_13875 2940341 .. 2940351 +    -4  -5.18726   ATTTTAACTTATTAA                 TTCT AAT AGAA                 TTTTTATTGTAAAAA  75 249
        gyrA 2943256 .. 2943285 + -10.9  -4.08111   AAAACGTTTTAAAAT       AAAAAAAGGAAGC CTAG GCTTCCTTTTTTA        TTTCTCGTCTATTTA 100 39
        serC 2953675 .. 2953699 +   -13  -5.06585   AGTAAATCAAAAAAA          TAAAGCCCTC AAAAA GAGGGCTTTA          TTTTTATATAATTTA 100 40
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        lolD 2958687 .. 2958712 + -10.6  -4.11394   CATTAAATCACATTG         TTAAAGCCCA CTGAGT TGGGCTTTAA          TTTTGCCCCTAAAAT  95 49
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        purL 2990200 .. 2990221 + -13.1   -4.1523   ATATAAAAATTGAAA           TAAGCCACC GTCA GGTGGCTTA            TTTGTATGTAGTACA 100 40
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 FDQ49_14940 3170716 .. 3170735 +  -8.6  -5.10208   TTCAGCTATAAAAAA            GCCAACTG ATCG TAGTTGGC             TTTTTATTAGGATTG 100 45
        glnA 3177160 .. 3177189 + -16.7  -3.37499   GTAATACGTATTTCG       TAAAAAAGCCTGC TTAT GCAGGCTTTTTTA        TTGCTTGGAATGTTG 100 37
 FDQ49_14965 NONE
 FDQ49_14970 3178683 .. 3178700 +  -6.3  -5.80248   CCGTGAGGTTGAAAA             GTGTTCT ATGC AGAGCAC              TTTTTTTATGTCTTA  95 50
 FDQ49_14975 3180264 .. 3180281 +    -7  -5.64304   TTTAGCTTAAGAAAA             GAGCCT TTATAT AGGCTC              TTTTTTGTTATATTG  90 58
 FDQ49_14980 3181018 .. 3181036 +   -11  -4.62302   TCATACAAATAAAAA             CCCACTCG TAA TGAGTGGG             TTTTTAAGAATCTTG 100 504
 FDQ49_15015 3184531 .. 3184545 +   -10  -5.64274   ACCTCAATAAAAAAA               GCCTCA TCG TGAGGC               TTTTTTTATGACTAC 100 42
 FDQ49_15050 3195618 .. 3195641 + -12.6  -3.11784   AATTTCTCCTAAAAA          TAAAAGCGTC GAGT GACGCTTTTA           TGGTTATTTATTAAT 100 465
 FDQ49_15070 3201100 .. 3201117 + -12.7  -5.85244   GTTTTTCATAAAAAA             GCCCGCA AACT TGCGGGC              TTTTTTATTTTCATT 100 51
        rpsB 3207571 .. 3207593 + -15.6  -5.06414   CGTCGAGAGTGCAAA           CGGCCCAGAG TTT CTTTGGGCCG           TTTTTGTTGAACAGA 100 95
 FDQ49_15100 3208533 .. 3208545 + -10.5  -5.65177   GTATCTTCAAAAAAA                GCCCC TAT GGGGC                TTTTTTTATCCCTGT 100 44
 FDQ49_15105 3209104 .. 3209122 +  -4.6   -3.8599   GCAATTTTGTTCTAT             GCATCTTT TTA AAACATGC             TATGTTTTTTTTAGA  59 68
 FDQ49_15110 3210044 .. 3210067 +  -3.4  -2.88663   CTGCATAGAAGAAAA          TCTATAAATAT TTA ATATT-ATAGA          TGTCTAGAGATGAAT  43 87
 FDQ49_15115 NONE
 FDQ49_15120 3211119 .. 3211141 + -10.7  -4.64144   AATCAGTAAATTTAA           GCTGAATCT AAAAA AGATTCAGC           TTTTTAAAAATTATT 100 32
 FDQ49_15180 3221901 .. 3221928 +   -10  -5.27938   TTATTTTAGATTTGA        TGGCTCATTTTT TATA AAAATTGAGCCA         TTTTTATTTAAAACT 100 134
 FDQ49_15185 3223310 .. 3223323 +  -9.5   -5.8187   TGTGTATATAAAAAA               GCGCC GTAA GGCGC                TTTTTTTATTAACTA 100 43
        adeL 3230545 .. 3230566 +  -2.3  -2.70446   AATTATTTCGGCAGA           AGAGTAATT TAGA AATTGCTCA            AGTTTTTATCACCTT  39 138
 FDQ49_15210 3231400 .. 3231432 + -12.2  -2.52586   CATTTACTAATGATG      TGAAAAATGTCGGC TAAGT GCCGACATTTTTAA      ATCTATTCTCATCTC 100 31
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 FDQ49_15225 3233682 .. 3233723 +  -8.1  -3.89085   AATAAGCTGTTGATA CCGAGTATGGTGAAACTTT TTTA ACATTCTCATCATACTCGG  TTGCTTTTTAATTAT  79 36
 FDQ49_15250 3238585 .. 3238602 +  -8.4  -5.63517   AGCTATAAAAAAAAA             CCGAGG ACTTTA CCTCGG              TTTTTTATTTAGAAA  95 45
        tsaA 3240449 .. 3240464 +  -4.6  -3.24232   TCCTTGTACAATTAC              TGCTGC AATC GCTGCA               TGTATTTCAAACAAA  51 240
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 FDQ49_15275 3244014 .. 3244032 +  -7.4  -4.45175   CTTATAATATTTATA             GCCGCA CTGATGA TGCGGC             TTTGCTTTTTTAATA  79 54
 FDQ49_15280 3244728 .. 3244741 +  -2.3  -2.75844   CATACGGGGACTAGG               CTACC GTAT GGGAG                ATTTAAAATGAAAAC  40 1
 FDQ49_15285 3246105 .. 3246124 + -10.8  -3.03203   CATGAAATACAAAAA            TAGCATGG TTGC CCATGCTA             TCCATTTTTTGTTTT  83 23
 FDQ49_15295 3247395 .. 3247422 + -11.5  -3.19157   TAAAAAGACATAAAA        GCATTAAAAGC TAGAGC GCTTTTAATGC         TTGCTGAGCTTCCTG  91 38
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 FDQ49_15315 3251803 .. 3251852 +  -9.4  -5.28166   TCGGCGACATGGATG TCGCCAGTTGAGCAAACAGTAC ATGGAA GTACTGTTTGCTCAACAAAAGA TTTTTGTTACTTTTC 100 92
 FDQ49_15330 3254821 .. 3254849 + -14.1  -3.07816   AATCATTTATCGTAA        TAAAAAAGGAGGC TAA GCTTCCTTTTTTA        TTGGCTGACTGAAAA 100 39
 FDQ49_15335 3256132 .. 3256149 +    -7  -5.48063   ATAGTTTTAAAAAAA             GCCTAC CTTTGA GTAGGC              TTTTTTATATTACCT  89 45
        pheA 3259156 .. 3259175 +  -4.4  -2.75481   ACGTTGGAATAATGA            CATATATCC AAA GGA-ATATG            TCATTAAGCTTAAAA  47 47
 FDQ49_15355 3261535 .. 3261562 +  -9.2  -4.73297   ACACAATAGCAACGG        CAGCAG-CGAGCT AAA GGCTTGGCTGCTG        TTTGTTTATTGCTTA 100 71
 FDQ49_15360 3262027 .. 3262048 + -13.1  -4.68846   TATTTTGTGAAGAGA           GGGTGAACA TATT TGTTCACCC            TTTTGATTTATTAAT 100 52
 FDQ49_15365 3263712 .. 3263756 +  -4.6  -4.04188   TAGAGTCATTTTTAA TTTATCAGCGTCGATTTTA ATAAAGGC TAAAA-CTGCGCTGATAAA TTCTTATCTTTGAAT  62 73
 FDQ49_15370 3265293 .. 3265306 +  -6.7  -3.73106   TTTAAGAAATAAGAA               GCTCA GTTA TGAGC                TTCTTAAACTTTTAC  69 45
        yaaA NONE
 FDQ49_15390 3268935 .. 3268949 +  -6.4   -3.1552   AAATAGGATTTTGCG               CAGCAG CAA TTGCTG               TATTCATGAGTACGC  58 266
 FDQ49_15420 3272146 .. 3272169 + -11.8  -5.40464   TTGATGAATCATGGA          CGCTCCAATT TTTG AATTGGGGCG           TTTTTGTTTATAATG 100 56
        rhlB 3273385 .. 3273404 + -10.8  -5.54192   TTGCTAATAAAAAAA            TCCCAATC AATT GATTGGGA             TTTTTTTCAATTAAT 100 34
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 FDQ49_15455 3277847 .. 3277861 +  -4.3  -2.99458   TAACATATCAAAATA               TGCTT ATGTC AAGCA               TGGTGTTTTGTGCTG  48 38
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 FDQ49_15465 3279525 .. 3279542 +  -2.6  -3.35197   TCCTTTTTATTAATT             CCTAGC TTGTCT GCGAGG              TTGCTATGTGTGGAG  45 28
        purF 3281098 .. 3281126 + -16.2   -4.4648   AGAATAGAAATAGCC        GAAAAAAGCGGG TGTTT CCCGCTTTTTTC        TTTTATGATGAAACT 100 34
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 FDQ49_15485 3284843 .. 3284887 +  -4.3   -5.9003   AATGTTATAGTGAAA GCCTGCTCATATGATGTAAGA AAC TCAAGCATTATATGAATGGGC TTTTTTTGTTAGTTT  89 80
 FDQ49_15490 3286462 .. 3286472 +  -5.4  -4.35327   GAGAGGGGGAATTAA                 GCTA ATT TAGC                 TTTAATTTTTGCTGA  67 126
        tsaD 3288278 .. 3288289 +  -4.4   -3.1552   ACCGCGTTGGCCAAT                GACA GAAT TGTC                 TATTCCTAAATAAAA  49 1
 FDQ49_15520 3292063 .. 3292078 +    -4  -4.42639   ACAGCCAGAGTCTTA              TTATGC TGAA GCATGA               TTTTGCTTCCCATAT  63 10
 FDQ49_15525 3292912 .. 3292933 +  -3.1   -3.4277   CAATTTACACGGTCA           GTTTTTTTT AGAA AAAAAACAC            TTGTCACTGTTAGAT  48 66
 FDQ49_15530 3293059 .. 3293078 +    -8  -3.56937   TCTTCGCCCCCACCA            CTTTAAGT TAAG ACTTAAAG             TTGATTTGAATGTTA  72 26
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 FDQ49_15540 3293307 .. 3293324 +  -5.6  -5.71983   CCACCATTGAAAAAA             GCAAGA CGATGA TCTTGC              TTTTTTTATGATTAA  93 35
 FDQ49_15545 3293450 .. 3293466 + -10.1  -5.56264   GCCAAGATTCAAAAA              GCTCCTG TTA CGGGAGC              TTTTTTATGTTTAAC 100 36
 FDQ49_15550 3295504 .. 3295518 +  -2.8  -4.33755   CGTATTATTTTTAGC               CATGCT CGC GGTATG               TTTATTGCTGTTGCT  55 122
 FDQ49_15560 3307835 .. 3307845 +  -5.4  -2.76261   CGAAGCTGTTGCAAG                 TGGT GTA ACCA                 GTTTGACACTTGCAG  52 288
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 FDQ49_15575 3309232 .. 3309255 + -11.1  -3.28005   AGTATTGTTGAAAAA          TGCTTCCAC CTCTGA GTGGAAGCA           TAATTTTCATTTTTA  87 77
 FDQ49_15585 3310767 .. 3310783 +  -3.7  -5.07275   GAGCCTTATTCATAA              TAATGAC ATT GTCAATA              TTTTTGTATATATCA  70 427
 FDQ49_15590 3311392 .. 3311404 +  -3.5   -3.3506   TTAAAATATACAGTT                TTTTT TGG AAAAA                TTATAAAAATTTAAA  49 148
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 FDQ49_15600 3312373 .. 3312406 + -12.8  -2.71263   TTTTGAATCTTAATA     TATAAAAAGCCTAT CATTAA ATAGGCTTTTTATA      TAATTAGGGGAAATT 100 21
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 FDQ49_15610 3313507 .. 3313525 +    -9  -3.57767   TATCAAATACTTTGT             CTGTTTTA TTT TAAAACAG             TTGTCACTTTTTGTG  77 266
 FDQ49_15615 3314606 .. 3314648 +  -8.6  -2.54204   TAGGGCTGGTTTAGA TAAATATCCCAAAGTACATG GGC TAAGTACTTTGGGATATACA GGTTTTAAATTTTAC  70 27
 FDQ49_15630 3318442 .. 3318466 +  -7.1  -3.53224   CTTATAGATATTTAT          GAGCATCGGGG GTG TCTGGATGCTC          TTTAAAAACCAAATG  68 43
 FDQ49_15635 3320111 .. 3320131 +  -9.8   -4.8622   AATGTCTGCAACAAA            GGGAAAAC ATCAG GTTTTCCC            TTTTTCATTAGCAAA 100 39
 FDQ49_15640 3321630 .. 3321663 +  -9.8  -5.33848   ATTTTTATGATAGAA     ATAAAAAGCTCCTT AATAAA AAGGAGCTTTTTAC      TTTTTTAATTCTCGT 100 56
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 FDQ49_15665 3325356 .. 3325373 +  -9.9  -6.11229   AGCTACATCTTTTTG             CCACATC ACCC GATGTGG              TTTTTTTATTTTAAT 100 129
 FDQ49_15670 3325916 .. 3325934 + -10.3  -4.87893   GTTATAAATACCATG             GCCCGAA CTAGT TTCGGGC             TTTTTCATTGAAATT 100 45
 FDQ49_15675 3326967 .. 3326986 +  -2.2  -4.39426   TAAGAGTTTTTATAT            TAATAAAG ATGA CTTTATCA             TTTTCTCCAGATCTC  56 462
        gltS 3330324 .. 3330335 +  -7.2  -5.65177   TGTTTAATCAAAAAA                GCCC GTAA GGGC                 TTTTTTTATGGGTGT  90 34
 FDQ49_15700 3332468 .. 3332497 +  -6.3  -2.56122   TTACCAATCCGTTAA       TTTTGAGGAGGGC GCTA GCCCTCCACAGCG        AGTTTTATCATGAAA  57 26
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 FDQ49_15710 3333763 .. 3333796 + -12.5  -4.84363   TAAGATTGTTTGAAG     TTGGGTCCAGAGAGT AGGT ACTGTCTGGACCCTA      TTTTTAATGATTTAA 100 38
 FDQ49_15715 3335753 .. 3335787 +  -7.2  -4.52589   CTGATTAGTTATAAC     GCTCAGTAATGGCTTT AAA AGAACTTTTACTGAGC     TTTTCTATAGGAGGA  81 33
 FDQ49_15735 3339144 .. 3339171 + -10.7  -4.18018   TAATTAATTGAGTGA        CAGGTTTACTC AGAGAC GAGTGAACCTG         TTTTAAATGGAGGGA 100 54
 FDQ49_15740 3339735 .. 3339755 +  -4.9  -4.09511   ATTACAATTGAGTTT            TAAGAAAAT GAA ATTTTTTTA            TTTTAAGGCAATGTT  62 23
 FDQ49_15745 3340262 .. 3340273 +    -3  -3.52234   TGATTACATGGTGAT                TTGT ATGA ACAA                 TTCTGCATTTATTAA  48 27
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 FDQ49_15775 3347294 .. 3347311 +  -6.3  -4.34557   TTCAAGATCGAGTTG             GTCATCA TCTT TGGTGAC              TTTGATTTTTAACTT  72 381
 FDQ49_15785 3348040 .. 3348066 +  -2.5  -3.33845   ATATAAAAATATTTT         TTAAATTTC TCTATACAT GAAATTTAA         TTAAATTGTCTTTTT  45 74
 FDQ49_15790 3348555 .. 3348587 + -15.2  -3.34522   TTTTTAAATCTTTAA      TATAAAAGCCCTAT ATTAA ATAGGGCTTTTATA      TTAATTAAAGGGTAT 100 217
 FDQ49_15795 3349916 .. 3349947 +  -8.2  -3.92522   TTCTTAAAATATTAA      TTGGTAGAAAGAGT TTCT ATTCTTTTTGCCAA       TTTCTAAGATTAAGA  79 437
 FDQ49_15800 3350448 .. 3350458 +  -2.6  -3.43511   TTGATAAATATTAGA                 TTTA TAA TAAA                 TATTTAAGTGGTATT  46 27
 FDQ49_15805 3351168 .. 3351185 +  -6.9  -3.12584   TGGTGAGGCTAGGAG             GGGCACG CTTG CGTGCGC              TGGTTTCCTTTTGTA  62 416
 FDQ49_15815 3352118 .. 3352143 +  -9.7  -3.08464   TCTAAAAACTCAGAG         CAACCCAAGCT ATTG GGCTTGGGCTG          TTAAATGCCTAATAC  78 36
 FDQ49_15825 3353593 .. 3353611 +  -3.1  -3.29461   GAAAAGATTAAAATA             GCAATAC CAAGA GTTTTGC             TTATCAACAAAGTTG  47 25
         ada 3354750 .. 3354764 +  -5.6  -4.05669   GCTAACTCTATAAAA               GCGGGC TTA GCTTGC               TGTTTTTATAGCGTT  68 36
 FDQ49_15835 3355656 .. 3355676 + -11.2  -4.98522   AGAATTAATAGAAAA            GTGAGGCT GCTAG AGCCTCAC            TTTTTATATGCAGTT 100 45
 FDQ49_15860 3361317 .. 3361329 +  -3.5  -3.80893   AGCATTTACGGTAAT                TTTTA TTC TAAAA                TTTCCATTGTCCGAT  54 27
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