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 IC772_03300  671838 ..  671850 +  -4.8  -3.36878   ATTCTAAGTAACTAT                TCCG AAAAA CGGA                TTGTCGATGGCTAAA  54 34
 IC772_03305  674414 ..  674459 + -15.1  -4.20025   ATAACAAATAAACCT TTGCTATAAAAAAAGCCCAGA TTGA TCTGGGCTTTTTTTATATTGA TTTATATTAAAGCTT 100 30
 IC772_03310  676204 ..  676215 +  -2.2  -3.28912   TCAACCATTTAAGGA                GCGT GCAT ATGC                 TTAATATAGCTCTAC  44 10
 IC772_03315  676710 ..  676740 + -14.2  -3.43081   TAAGATATGCTGACA       TAAATAATCCCGCA ATT TGCGGGATTTTTTA       TATTTAAAATTATGT 100 38
 IC772_03335  680573 ..  680590 + -11.3  -5.80364   CTGAACAGTAAAAAA             GCGACTC GTTA GAGTCGC              TTTTTTTATTACGAT 100 50
        typA  688280 ..  688299 + -10.8  -5.71638   TTGAAAAAGAAAAAA            CCGCTAAA TTAA TTTAGCGG             TTTTTTTAATTGTTA 100 51
        mscL  688956 ..  688986 + -14.3  -3.14625   TAAGCAGATTTCAAA       TAAAAAACGGTAC CTAGC GTACCGTTTTTTA       TAGTTATTTTATCGA 100 38
 IC772_03380  690333 ..  690343 +  -6.8  -4.25848   TTCTAAAAGATGATA                 GCCA AAC TGGC                 TTTTAATAGGACCTT  73 81
 IC772_03395  692071 ..  692090 +  -2.2   -3.1372   AGTCGATAATTCTAA            TCTGGAAA TCAA TTTTTAGA             TATTGATGAAGAGTG  42 32
 IC772_03400 NONE
 IC772_03405  695459 ..  695480 + -13.1  -5.46706   TTTTTAGTTGATCAG           CGGGCAAAT TAAG ATTTGCCCG            TTTTTATTTTCAGAT 100 34
 IC772_03410  696428 ..  696473 +  -6.9  -5.55664   GGGCTTATCGCTTTG TGGTGGTAAAACAAAAGCCCC ATAC GGGGCTATTGTTTCTTTACTA TTTTTTTGGTGCTGG 100 17
 IC772_03430  699758 ..  699777 + -10.8  -6.04324   ATCCTAAAGAAAAAA            GTGAGTAG AGAG CTACTCAC             TTTTTTCTTTTTTAA 100 61
 IC772_03435  700246 ..  700258 +  -3.5  -3.63968   TAAATTTTTTTTTGG                TAAAA GTC TTTTA                TTTAAAACTTTAAAA  52 46
 IC772_03440  700684 ..  700710 +  -8.1  -4.70659   TTTTAATTACATTTT        GGTAGGGG-TAC TCAT GTAGCCTCTACC         TTTTTAACTGTCAGC  85 49
 IC772_03445  701240 ..  701259 + -10.8  -5.95539   AAGATAATAAAAAAA            CTGCTTCT TTTT AGAAGCAG             TTTTTTTATTTGAGG 100 59
        pilG NONE
 IC772_03475  709241 ..  709258 +  -6.9  -3.33162   CATAAAAACATAAAC             GGCGGGT CTAA GCCCGTC              TTATAGGATCGAGTA  63 51
 IC772_03480  709814 ..  709835 +  -6.7  -4.82901   TTATAAACTAATTTT           TATGCTGTT AATA AACAGTATA            TTTTTCTGGGGAGAA  83 30
 IC772_03485  711950 ..  711976 + -11.1  -4.13014   TAAATTGGGGGATGA         GAATAGCTATT CTTAT AATAGCTATTC         TTTTAAAAGTATGAG  93 38
 IC772_03490 NONE
 IC772_03495  717078 ..  717095 +  -9.9  -5.67063   TTTATAAAGTAAAAA             GGAACTC AAAT GAGTTCC              TTTTTTTATGATGAC 100 34
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 IC772_03530  723203 ..  723214 +    -3   -3.3879   GATGCTCTTATTTAT                TTGT CTGA ACAA                 TCTTTAACCTAAATT  48 2
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 IC772_03555  723947 ..  723976 +  -6.5  -2.62263   CCCCGTCCGCTGCGC       CATTCTCTTGATT CCCT GATCTAGAGGATG        TAATCTAAAAAGGCT  57 24
 IC772_03560  724276 ..  724302 +    -3  -5.52909   TCAGGTTTAACTAAA        GCTGCCA-TGC CGTAAA GCAATAGCAGC         TTTTTTTCAATATTA  77 213
 IC772_03585  732115 ..  732137 +  -6.3  -3.67989   CAGGCAAAAAGTAAA           CCTCTCTCA TAATT TAAGAGAGG           TTTACATAAACTTTT  64 14
 IC772_03595  733601 ..  733616 +  -2.6   -3.4285   GACATTCGCTCAAAA              GTATAT GTAA ATATGC               TTATGGCTTAAATCC  46 58
 IC772_03600  733899 ..  733930 +  -3.8  -4.21351   TTTTCTTAAATGTAC      TGAAAAAGTCCC AATTTTGA GGGGCTTTTTTG       TTTATTGCAGTATTT  60 32
 IC772_03605  735479 ..  735498 +  -8.6  -5.60993   GTAATTTTCAAAAAA            GCCTCTTA GAAA TAAGGGGC             TTTTTTTATACACCA 100 37
 IC772_03610  736637 ..  736649 +  -6.2   -5.4505   GAAAATTAAATAAAA                GCCC GAGAA GGGC                TTTTTTGTTGAAAAA  88 58
 IC772_03615  738073 ..  738084 +  -4.4  -2.62184   AAAAGCTGTATATGG                CTCT TAAG AGAG                 TCATATACGAAGCAA  48 62
        sbmA  739519 ..  739547 + -13.4  -3.39668   TATAAATAAGTTTAT        TTCTGCTAACTA AATAA TAGTTAGCAGAA        TTATCAAATTTCAAA 100 76
 IC772_03635  742745 ..  742761 +  -5.9  -4.21773   TTTAAAAATAGGTAT              CTTGATG ATT TATCAAG              TTGTTTCTGTTGGGG  69 150
 IC772_03640  743655 ..  743668 +  -2.5  -3.29649   GATAATAGTTGAAAT               TATTT ATGG AAATA                TTCATATAATACAAT  44 29
 IC772_03645  744810 ..  744837 +  -3.4  -2.78384   TACTTTGCGGTTACA        GAGTCATAACAG GTAA CTTTGGTGACTC         TGTGATAAAAAGAAC  44 42
 IC772_03650  745420 ..  745448 +    -9  -4.42238   TTTCTATTTTAACAA        TAAAGCCTGC TATTTAAGT GCAGGCTTTA        TTTTAATTGGGATAA  89 50
 IC772_03680  751300 ..  751312 +  -3.3  -3.07655   AAGTTTAAGGATTAG                GCGGT GCA ACCGA                ATATTTTTTCAAGAC  46 39
        mreC NONE
        mreD  752622 ..  752638 +  -3.7  -4.28432   TTTATTATTGTTTAG              CAAAATG GCG CATTTAG              TTTTAGCTTCCAGTT  58 9
 IC772_03695 NONE
         rng  754803 ..  754814 +    -3   -4.2231   AACTGAAATTTTACT                TTCA TTCA TGAA                 TTTTAAATACTACTT  57 74
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        thrH  758211 ..  758225 + -11.4  -5.28778   ATGGACAATAAAAAA               GGCGCT TTA AGCGCC               TTTTTTATAAGTGAT 100 43
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 IC772_03750  765297 ..  765312 +  -7.6  -5.96219   GACTAAGTGAAAAAA              CCTAGA ATCT TCTAGG               TTTTTTTTATGCCTA 100 47
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        hchA  768469 ..  768489 +  -6.2   -5.9873   TACTGGTTAAAAAAA            TAGGGCTT TTATT AAGTCCTA            TTTTTTTTATAATAA 100 44
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        nudC  773667 ..  773686 + -10.8  -4.98616   GCCTTAAATAAAAAA            GCCATTGT CGAG ACAATGGC             TTTTTCATGTTTTAA 100 71
        prpF  776656 ..  776680 + -17.3  -4.23758   GTTATTTAAATGAAA          GAGCCTCTCTA CTA TAGAGAGGCTC          TTTTGCATGTGGCAT 100 43
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        rpmA  811538 ..  811554 + -12.3  -5.63504   TTTAGCTTTAAAAAA              GCCCACA TTT TGTGGGC              TTTTTTTATGGAATT 100 43
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        cobA  816217 ..  816241 +  -4.4  -3.06796   GAACTAGTGGGTTAA          TCATTATCTT CGATC AAGTTAATGA          TTGCCTGAGCTAACC  50 34
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        sucD  841443 ..  841468 +  -9.1  -5.49729   TGAATCTTTAAAAAA         TACCGCATC TGAAAAAT GATGCGGTA          TTTTTTTGCATCATT 100 50
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 IC772_04160  865419 ..  865429 +  -5.4  -3.59738   GTATTGCTGATAACT                 CGAT AAA ATCG                 TTTGAAGCTGTGATG  59 43
 IC772_04170 NONE
 IC772_04175  867299 ..  867330 +  -3.7  -5.00616   CATTTAAAAAATAGA      TACCTACCTGACT AAATTG AGCCAGATAGGTG       TTTTTTAGCGAACAA  69 27
 IC772_04205  874472 ..  874490 +  -8.9  -5.93252   AAAATTAATAAAAAA             GCGAGAA TCAAT TTCTCGC             TTTTTTATTTTTAAA 100 53
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        ftsH  878266 ..  878295 + -15.3  -4.23794   AATTAAGTTAATTAA       TAAAAAAGCCACA TTCA TGTGGCTTTTTTA        TTTGTCTTAAATTCG 100 35
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 IC772_04245  882161 ..  882178 +  -7.7  -5.50499   GCATAAAAGAATAGG             GGGTTAC ATAT GTAGCCC              TTTTTTTAGATATAA 100 42
        folD  883485 ..  883500 +  -4.8  -3.91434   TTTGAGGTAGAAATA              CATTAA AAAT TTAATG               TTTCTGCGATGCTTT  60 93
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        glpK  888213 ..  888225 +  -6.3  -4.82678   TTTAGATTGTTGTTT                CATCA ATT TGATG                TTTTAATTTTTATAA  80 121
        glpD  889785 ..  889815 + -17.1  -3.04322   GATGATGCCGCATAA       TAAAAAAGGCCGC ATAAA GCGGCCTTTTTTA       TATTCAGCAATTAGA 100 26
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        groL  895998 ..  896020 + -13.6   -5.1417   GTTTGTTACAAAAAA           GGTCACAAAT TTT ATTTGTGACC           TTTTTAATTTTATAG 100 128
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        ttcA  932152 ..  932182 + -11.4  -2.87344   ATTTGAACAAGTCAA       TTAAAGGCACTT TATAAAC AAGTGCCTTTAA       TGTATCAAAACACTA  86 44
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 IC772_05375 1136648 .. 1136673 + -16.3  -5.75478   ATAGTTAGTATAAAA         CGGCTCATTCA TATC TGAATGAGCCG          TTTTTTTATATGCTT 100 40
 IC772_05380 1137608 .. 1137625 +  -9.9  -4.65263   TCTTTAAAATAAAAA             GCCGTTT AAAT AAACGGC              TTTCTTTTCAAAACT  93 34
 IC772_05385 1140491 .. 1140532 + -14.2  -3.64049   AAGCAATAACTAACT TA-TCAAATAAAAAGCCAC ATGAA GTGGCTTTTTATTTGAGTA TTTAAAGCTTATTAA 100 32
 IC772_05395 1141679 .. 1141700 +  -8.7    -3.695   CCGATAATATAAAAA           GTCGAGACA TCTA TGTCGCGAC            TTTAAGATATTTACC  77 34
 IC772_05405 1143745 .. 1143780 +  -5.5  -2.68986   ATTCCTATTTTAATA    TACCGATTGGTACTG TTAAGC CTATATCAATCGGTA     CTTATGATGTCCTAT  52 47
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        hemL 1145800 .. 1145816 +  -9.4  -4.99134   GAAGTAAGCAAAAAA              GCCCGT GTTAA ACGGGC              TTTTTAATTTGAGCT 100 34
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 IC772_05425 1147353 .. 1147391 +  -7.1  -4.54727   CTTTCAATGAGTAAT  TTTTGTAGC-GAAA-CAAT TTA ATTGGTTTCTGCTGCAAAA  TTTTGCTTTAAAGAC  80 49
        rapA 1150323 .. 1150351 + -17.7   -3.1319   ATAAATGATGAGTCA        TAAAAAAGCGCCT TTA AGGCGCTTTTTTA        TTGAATAAATTTTAA 100 37
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 IC772_05450 1154575 .. 1154592 + -11.3   -5.0133   AAATAAGTCAAAAAA             GCCCTGA AATT TCAGGGC              TTTTTTAGAGCAATA 100 35
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 IC772_05465 1158708 .. 1158726 +  -5.9   -5.4833   TTGATAACAAAAAAA             GCTCGGT TTATT GCCGGGC             TTTTTTATTACATAA  86 46
 IC772_05470 1160419 .. 1160437 + -10.3  -5.18643   AAATATTAATTTTAA             GGCGGAT CTAAT ATCCGCC             TTTTATTTTCATTCA 100 39
 IC772_05480 1162876 .. 1162902 + -13.8  -2.83164   TTAAAGCAACTTATG         TCCGAAGGTCGG TTT CTGATCTTCGGA         TGTAGTGCTGAATAA 100 84
 IC772_05485 1164362 .. 1164389 + -12.8  -4.60808   TTTACAGTGATATTG        CGGTTATCTGAC AAAG GGCAGATAACCG         TTTATCTTTTTGTCA 100 51
 IC772_05490 1165831 .. 1165858 + -12.1  -4.96848   TTTGTTTTGAATAGG        GGCTGGTGATC CCAAGT GATCATCAGCC         TTTTTGTCTAACACG 100 41
        pstC NONE
        pstA 1168727 .. 1168740 +  -5.3  -2.57244   ATTGATATTACGAAT               TCCTT AGAA AAGGA                TAAGTTAGTGAATAC  51 63
 IC772_05505 1169627 .. 1169639 +  -4.8  -6.11243   GCTGTAAAAGAAAAA                GAGC CTTGT GCTC                TTTTTTTTATTCAAT  95 47
 IC772_05515 NONE
 IC772_05520 1173867 .. 1173881 + -11.4  -4.93968   ATGTAAAATATAAAA               GCGCTC AAT GAGCGC               TTTTTACTTATGGCT 100 49
        surE 1182298 .. 1182314 +  -6.6  -3.96447   GTGAATAAAGAAAAA              GAGGAA CATGT TTCCTC              TTACTTTTTTGGTAC  71 64
 IC772_05575 NONE
 IC772_05580 1184253 .. 1184272 + -12.2  -5.38047   AATTGATGTATAAAA            GGGCTTGT GATT ACAAGCCC             TTTTTTATATGAGTA 100 46
 IC772_05590 NONE
        gloA 1189743 .. 1189756 +  -6.7  -2.93393   AGTATGATGAAGACC               TGACC AAAT GGTCA                ATTTATCAACTGGGC  61 102
 IC772_05600 1190880 .. 1190891 +  -4.4  -3.82499   TTGTGGTGTTGATCT                GCTT GAAA AAGC                 TTTCCTCAATTTAAT  58 134
        rpmE 1191205 .. 1191232 + -15.8  -5.08824   TACTTCAGAACGAAA        TAAAAAACGGGC TTAT GCCCGTTTTTTA         TTTTTTAAATAACAA 100 41
         efp 1196805 .. 1196824 + -10.8  -5.60993   TACACTATTATCGAA            GGGATGAT GTAA ATCATCCC             TTTTTTTATGCGAAA 100 52
 IC772_05630 NONE
 IC772_05635 1199373 .. 1199397 +  -9.3  -4.77757   CTCTGCTAAACAAAA          CGGTATGTGGT TGA ACCATGTGCCG          TTTTACTTTTTGGAA  93 54
 IC772_05640 1199620 .. 1199635 +  -7.5  -5.79595   CAGCAATTTAAAAAA              CCGCC TTAAAT GGCGG               TTTTTTCTTTTCGGG 100 57
 IC772_05645 1201815 .. 1201837 +  -8.6  -5.73672   TTATTAAAGGTAAAG           GCTTAAATTT AGA AGATTTAAGC           TTTTTTTGCTTGTTT 100 82
 IC772_05650 1202548 .. 1202583 +    -4  -3.44888   TAGATATAGCGGATA    TGGAATAAAGCCCTGA ATAA TCAGAGCGTCATTTCA     TCTTTAAATCTAATT  51 48
 IC772_05675 1206051 .. 1206075 +  -6.5  -4.56597   TTGTATGACTGAAAA          GCCCTAAGTTA AAG TAATTTAAGGC          TTTTTAGGGCAGAGC  76 52
 IC772_05685 NONE
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 IC772_05700 1210892 .. 1210903 +    -3  -5.29846   AGCAATATATCGCGT                CTTT TGCC AAAG                 TTTTTATTTAAGATT  71 3
 IC772_05715 1213959 .. 1213972 +  -3.9  -4.11751   GAGAGTGGTAGTGTG               TAACT TTTG AGTTA                TTTTGAAAGGTTACT  58 80
 IC772_05720 1214708 .. 1214723 +  -7.6  -3.97947   TCAGCTTCTTTTACG              TCTGGA ATAA TCCAGA               TTTGTAATAGATGGA  73 344
 IC772_05735 1217870 .. 1217880 +    -4   -3.0353   GAGTATAGTGCTAAA                 TATC TAG GATA                 GTTCTTTGTGCGCCA  48 14
 IC772_05740 1218679 .. 1218697 +  -3.2   -4.9934   TAATTGGAATTTAAA             GTAAAAAT TTC ATTTTCAC             TTTTTATCATATTAT  67 22
 IC772_05745 1219314 .. 1219331 +  -9.1  -5.33331   GTTTGAAATTGAAAA             CCCTGTC ATTT GGCAGGG              TTTTTCTTATATTTA 100 41
        xdhB NONE
        xdhC 1228294 .. 1228309 +  -7.6  -6.09888   TTTGATGTAAAAAAA              TGATCC CAAA GGATCA               TTTTTTTTGTTCGAA 100 23
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 IC772_05810 NONE
 IC772_05815 1234741 .. 1234779 + -19.3   -2.7808   CATATCTTATAGGAT   TTAAATCAAAGCCTTGA CTCTT TCAAGGCTTTGATTTAA   TGCTATTAAATATTT 100 96
        glnA 1240290 .. 1240305 + -10.4  -5.87996   GTATTTCGTAAAAAA              GCCTGC TTAT GCAGGC               TTTTTTTATTGCTTG 100 44
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        ubiA 1241807 .. 1241824 +  -6.3  -5.80248   CCGTAAGGTTGAAAA             GTGTTCT ATGC AGAGCAC              TTTTTTTATGTCTTA 100 50
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 IC772_05850 1243984 .. 1244002 +   -11  -4.62302   TCATATAAATAAAAA             CCCACTCG TAA TGAGTGGG             TTTTTAAGAATCTTG 100 505
 IC772_05885 1247488 .. 1247518 + -14.3  -2.81815   ACGTTAAAATCTAAA       TAAAAAAAGCCTC GTAAA GAGGCTTTTTTTA       TGATTACTCATTAGG 100 34
 IC772_05920 1258584 .. 1258597 +  -8.1  -4.48877   CTCCTAAAAATAAAA               GCGTC GAGT GACGC                TTTTATGGCTATTTA  85 469
        sthA 1264059 .. 1264076 + -12.7  -5.85244   TTTCTCAATAAAAAA             GCCCGCA AACT TGCGGGC              TTTTTTATTTTCATT 100 51
        rpsB 1270535 .. 1270557 + -15.6  -5.06414   CGTCGAGATTGCAAA           CGGCCCAGAG TTT CTTTGGGCCG           TTTTTGTTGAAAAGA 100 95
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 IC772_06095 1296657 .. 1296700 + -10.6  -3.72395   AATAAGCTGTTCATA CCGAGTAAGGTG-AAATTTTT TAA AAGAATTCGCATCTTACTCGG TTGCTTTTAAATTAT  87 36
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        tsaA 1303423 .. 1303438 +  -4.6  -3.24232   TCCTTGTACAATTAC              TGCTGC AATA GCTGCA               TGTATTTCAAACAAA  52 240
 IC772_06140 1306525 .. 1306535 +  -2.6  -5.10208   ATTACGTGTTGTGCC                 TTTA AAT TAAA                 TTTTTCTTAAGATTC  66 16
 IC772_06145 1306989 .. 1307007 +  -7.4  -4.45175   CATATACCATTTATA             GCCGCA CGAATGA TGCGGC             TTTGCTTTTTTAATA  79 54
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 IC772_06155 1309080 .. 1309099 + -10.8  -3.03203   CATGAAATACAAAAA            TAGCATGG TTGC CCATGCTA             TCCATTTTTTGTTTT  84 23
 IC772_06165 1310370 .. 1310397 + -11.5  -3.20367   TAAAAAGATATAAAA        GCATTAAAAGC TAGAGT GCTTTTAATGC         TTGCTGAGCTTCTTG  88 38
 IC772_06180 NONE
 IC772_06185 1314701 .. 1314714 +  -3.9  -3.14132   AGTTTAAACCGATTC               GTTTT GTTT AAAAC                TTAATAAGACAGAAA  48 15
 IC772_06195 1317802 .. 1317817 +  -6.8   -5.4833   TATGCTTGATAAAAA              GGGAGC TTCG GCTTCC               TTTTTTATTGGCTGA  93 45
 IC772_06200 1319106 .. 1319123 +    -7  -5.48063   AATAGTTTAAAAAAA             GCCTAC CTTTGA GTAGGC              TTTTTTATATTACCT  93 44
        pheA 1322110 .. 1322142 +  -2.9  -2.72463   TCACTCATGTTGGAA     TAATGGCATGTATC AAAATA GA-GCATGTCATTA      TGCTTAAAAATAAAT  42 41
 IC772_06220 1324495 .. 1324522 +  -9.2  -4.73297   ACACAATAGCAACGG        CAGCAG-CGAGCT AAA GGCTTGGCTGCTG        TTTGTTTATTGCTTA  90 71
 IC772_06225 1324987 .. 1325008 + -13.1  -5.48514   TATTTTGTGAAGAAA           GGGTGAACA TATT TGTTCACCC            TTTTTATTTATTAAT 100 52
 IC772_06230 1326672 .. 1326716 +  -4.6  -3.96842   TAGAGTCATTTTTAA TTTATCAGCGTCGATTTTA ATAAAGGC TAAAA-CTGCGCTGATAAA TTCTTATCTTCGAAT  60 73
 IC772_06235 1328249 .. 1328268 + -10.8  -3.37939   TTTTTTAAGAAATAA            GAAGCTCA GTTA TGAGCTTC             TTAAATTTTAACCTT  87 41
 IC772_06265 1334615 .. 1334649 + -10.1   -3.1541   TTACTGTGCTTATGA     AATGATGGGCATAGA CTCAA TCTATGCCCATCAAA     TATACTTTATTTCAT  81 44
        yaaA 1336235 .. 1336252 + -11.3  -2.85583   CGGTAACTATCGTGA             GGTGGCA TGGA TGCCACC              GTTTCGCTGTATTAC  86 67
 IC772_06305 1339744 .. 1339767 +   -14  -5.40464   TTGATGAATCATGGA          CGCTCCAATT TTTG AATTGGAGCG           TTTTTGTTTATAATG 100 57
        rhlB 1340983 .. 1341002 + -10.8  -5.54192   TTGTTAATAAAAAAA            TCCCAATC AGTT GATTGGGA             TTTTTTTCACTTAAT 100 34
 IC772_06320 NONE
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 IC772_06335 NONE
 IC772_06340 1345446 .. 1345460 +  -4.3  -2.99458   TAACATATCAAAATA               TGCTT ATGTC AAGCA               TGGTGTTTTGTGCTA  50 38
 IC772_06345 NONE
 IC772_06350 1347124 .. 1347141 +  -2.6  -3.35197   TCCTTTTTATTAATT             CCTAGC TTGTCT GCGAGG              TTGCTATGTGTGGAG  44 28
        purF 1348697 .. 1348725 + -16.2   -4.4648   AGAATAGAAATAGCC        GAAAAAAGCGGG TGTTT CCCGCTTTTTTC        TTTTATGATGAAACT 100 34
 IC772_06360 NONE
 IC772_06365 NONE
 IC772_06370 1352442 .. 1352487 +  -7.7  -5.85737   AATGTTATAGTGAAA GCCTATTGATATGATGCAAGA TAAT TCAAGCATTGTATGAATAGGC TTTTTTTGTTGGTCT 100 80
 IC772_06375 1354070 .. 1354080 +  -5.4  -4.35327   AGAGGAGGGAATTAA                 GCTA ACT TAGC                 TTTAATTTTTGCTGA  69 134
        tsaD 1356117 .. 1356132 +    -4  -3.38725   AGCAATCCAAGAAAA              GCG-CTT GGG AAGTCGC              ATTTTCTTGCCCGTT  50 232
 IC772_06405 1359674 .. 1359687 +  -3.1  -3.29981   CAACCAGAGTCTTAC               TATGC TGAA GCATG                ATTTTGCTTCTCATA  46 11
 IC772_06410 1360521 .. 1360541 +  -4.1   -2.6518   ACAATTTACACGGTC            AGTTTTTTT AGA AAAAAAACA            CTTGTCACTGTTAGA  46 65
 IC772_06415 1360668 .. 1360687 +    -8  -3.56937   TCTTCGCCCCCACCA            CTTTAAGT TAAG ACTTAAAG             TTGATTTGAATGTTA  73 26
 IC772_06420 NONE
 IC772_06425 1360916 .. 1360933 +  -5.6  -5.71983   CCACCATTGAAAGAA             GCAAGA CGATGA TCTTGC              TTTTTTTATGATTAA  91 35
 IC772_06430 1361061 .. 1361077 +  -5.8  -6.02914   CAAAATTCAAAAAAA              GCTCCT ATTAC GGGAGC              TTTTTTTTGTCTAGC 100 38
 IC772_06435 NONE
 IC772_06440 NONE
 IC772_06445 1375576 .. 1375599 +  -6.8  -4.71382   CTATTTTCGAGAGAT          GTGGACAAGTC TGG GG-TTGTCCAC          TTTTTCGGTGATTAT  79 61
 IC772_06450 1376333 .. 1376383 +   -13   -3.2056   TTATAAAGGAAATAT TACTTTATAAAATATGCCTATCAA TTT TAGATAGGCATATTTTATAATCTA TTAATGCCTATGAGT 100 52
 IC772_06455 1376941 .. 1376965 +  -5.8  -3.65425   CGATTGATTTTCTCA          GTTGCGAA TGCTTATTT TTCGCAAC          TTTAAAATATCTAGA  62 200
 IC772_06460 1377939 .. 1377958 +  -7.9  -5.00895   TAAACGCATAAAAAA            TAGGAGG AATTGG CCTCCTA             TTTTTATATGATAAC  89 38
 IC772_06470 1379722 .. 1379739 +  -2.7  -4.87626   ATGATGATTATGTTC             GGGTAGT GCCT ACTATTC              TTTTTGATATTGAAA  63 518
 IC772_06480 1380640 .. 1380659 +  -7.9  -5.30155   CAGGCCACGCTAAAA            CCCACTT AATTTA AAGTGGG             TTTTTTAGTTAGTAG  91 43
 IC772_06485 1381573 .. 1381592 +    -5  -5.32944   ACTATATTAGTAAAA            GCCACTTA ATTT TAAGTGGG             TTTTTTAGTTATCAG  82 246
 IC772_06490 1382455 .. 1382475 +  -8.3  -5.13741   ATATTTTAATAAAAA            GCCTATCTA ATA TTGATAGGC            TTTTTATTGAATTAG  93 80
 IC772_06495 1382963 .. 1382998 +  -2.8  -4.61873   TACACATCCTGATGA    TTTTGTTGTTTATTAG AATT TTTATAAATAGCAAAA     TTTTAATTTATAAAA  60 10
 IC772_06500 1383656 .. 1383691 +  -2.8  -4.61873   TACACATCCTGATGA    TTTTGTTGTTTATTAG AATT TTTATAAATAGCAAAA     TTTTAATTTATAAAA  60 10
 IC772_06505 1384135 .. 1384151 +  -3.7  -3.31144   ATTTTTGAAAAATGG              GGAAGTT GAA GATTTCC              TTCTCAGAATGCACC  48 180
 IC772_06510 1384822 .. 1384840 +    -9  -3.57767   TATCAAATACTTTGT             CTGTTTTA TTT TAAAACAG             TTGTCACTTTTTGTG  80 268
 IC772_06515 1385921 .. 1385963 +  -7.9  -2.54204   TTGGTTTGGTTTAGA TAAATATCCCAAAGTACAT GGGCA AGGTACTTTGGGATATACA GGTTTTAAATTTTAC  64 27
 IC772_06530 1389796 .. 1389818 +  -4.2  -2.71144   AGAGACATTTCATGG           GTATCTATAA CGG TAATAGATGC           TCATTAAAAAAACTA  46 46
 IC772_06535 1391467 .. 1391486 + -10.8  -5.14965   TAATTTTTACTATCA            GGGAAAAC AGCA GTTTTCCC             TTTTTTCATGAAAGT 100 38
 IC772_06540 1393380 .. 1393397 +  -9.9  -6.09888   GCGTTACATCTTTTG             CCACATC ACCC GATGTGG              TTTTTTTTATTAAAA 100 451
 IC772_06550 1394571 .. 1394590 +  -2.2  -4.39426   TGAGAGTTTTTATAT            TAATAAAG ATGA CTTTATCA             TTTTCTCCAGATCTC  57 459
        gltS 1399433 .. 1399444 +  -7.2  -5.64274   GCTTAATTAGAAAAA                GCCC GTAA GGGC                 TTTTTTTATGGGTAC 100 35
 IC772_06605 1405550 .. 1405563 +  -8.1  -6.17184   TCAATTTTTCAGTAA               TCGCC TTCG GGCGA                TTTTTTTTTAATCAT 100 57
 IC772_06610 1407179 .. 1407198 + -12.2  -3.19091   AACAACTCATTGCTG            CCCAAGCT ATTC AGCTTGGG             TTGCTAAATACCTAT  90 39
 IC772_06625 1409631 .. 1409649 +  -3.1  -3.29461   GAAAAGATTAAAATA             GCAATAC CAAGA GTTTTGC             TTATCAACAAAGTTG  46 25
         ada NONE
 IC772_06635 1411677 .. 1411728 + -12.7  -4.88217   TAGATAAACAATAAA TAGGT-CGTAAAAAAAGTGAGGCT GCTAG AGCCTCACTTTTTATATGTACTTA TTTTCCTTTTTTGGT 100 38
 IC772_06660 NONE
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 IC772_06680 1421285 .. 1421314 + -13.8  -5.85244   AATTTTCTAACACAA       GCCTTTATCTGT CTAAGA ACAGATAAAGGC        TTTTTTATTTTAGTT 100 44
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 IC772_06735 1431276 .. 1431295 +  -2.2  -3.87373   TTGGTCACTTTTTAT            TTAAAAAG AGAC CTTTGTAA             TTTCTACAGCCTATC  50 6
 IC772_06740 1432722 .. 1432735 +  -2.4  -5.14645   TAGTTTAGGATCAAA               TGGT TTATCT ACCA                TTTTTCTTAAGTTAT  69 94
 IC772_06765 1436002 .. 1436015 +  -3.1  -3.23853   CAGATGAGTGAACCT               GCTGT AACC ATAGC                TGTTCCTTGCCAAAA  46 102
 IC772_06775 1438598 .. 1438634 +  -3.2   -5.0065   GATATTTTAAAATAA    CTAACTAATTTATC CTTATTTTA GATTGATTAGTTAG    TTTTATTTATCCATC  67 71
 IC772_06780 1439912 .. 1439926 +  -7.1  -5.42131   TAAATGTTAAAAAAA               GCCTC AGTTC GAGGC               TTTTTTATATGGTTA 100 38
 IC772_06790 1442257 .. 1442267 +  -4.6  -4.61807   CCTTTAAAGCAGCTT                 GTGG TGC CCGC                 TTTATATTTTATTTT  68 448
 IC772_06795 1443817 .. 1443839 +   -10   -3.6943   CAATACTATAAAAAA           GTATGAGTAA TAG TTACTCATGC           TTATGCTTTTAAGTG  86 232
        mnmG 1456480 .. 1456497 +  -7.7  -5.86976   TTAGTATGTAAAAAA             GCTCAGT CTAT ACTGGGC              TTTTTTATTTTCTGA 100 46
 IC772_06865 NONE
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 IC772_06875 NONE
 IC772_06880 1461787 .. 1461825 + -16.4  -3.29459   CGTTAAAAATGACTT   TAAATAAAAAATCCAAGC TCT GCTTGGATTTTTTATTGA   TTAAATTATTAAGTG 100 35
 IC772_06945 1475268 .. 1475308 + -11.5  -4.41177   AACTGTTTATTTTGG  CCATTCAATTTAAATAATT TAA AGTTAATTAGATTGAATGG  TTTTAAATTTATATA 100 48
        pgaA NONE
        pgaB 1479890 .. 1479935 +  -2.7   -4.9792   GTCTAGCGAATGAGG GGAAAAAGTAATGAGAGTATT ACTC GATATTCTATTTGCTTTTGCC TTTTTATATCCGCTA  66 15
        pgaC NONE
        pgaD 1481618 .. 1481637 +  -7.9  -5.79595   AACTGAATGAAAAAA            GCATGGT ATTACA ACCATGC             TTTTTTATTTTCAAG 100 35
        prfA NONE
        prmC 1487357 .. 1487381 +  -4.5  -4.35313   TTGTGGAGTTTGCTC          TAAAAAATC ATAAAGC GATTTTTTA          TCTTTTTTAATTTTA  66 411
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 IC772_07030 1494908 .. 1494922 +  -2.8  -3.63569   AAGGTCAGTTTAAAT               TTATGG ATG CCATTA               TTATTGAAGGCTTGA  48 39
        folB NONE
 IC772_07040 1495774 .. 1495786 +  -6.3  -3.90922   ATCCATACTGAAATC                CACTA AAT TAGTG                TTATTTCAGGACAAT  66 115
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 IC772_07095 1515638 .. 1515664 + -14.6  -4.68705   TCTAAATGTATGAAT         TAAGAGCTCACT TTA AGTGGGCTCTTA         TTTTATTAAGGTTAT 100 36
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 IC772_07105 1517632 .. 1517651 + -12.2   -4.0098   ACAAGACATCGTCAA            CACTCCAC TAAG GTGGAGTG             TTCTTTCAATTCAAA 100 45
 IC772_07110 1520543 .. 1520566 +   -14  -5.64274   TAAATGAGTTAAAAA          TAAGGGCTGA TTAA TCAGCCCTTA           TTTTTTTATGAATAA 100 59
 IC772_07115 1521858 .. 1521874 +  -7.9  -4.59773   TGCCTACATGAAAAA              GCCCCAT CAC AAGGGGC              TTTTTAAAACTAAAA  82 512
 IC772_07125 NONE
 IC772_07130 1525570 .. 1525601 + -13.2  -2.78695   AGACTAGTATTTTGG      TCAAAAAGTCTGGC GGTA GTCAGGCTTTTTGA       ATTGCTTTCTCTACA 100 34
 IC772_07140 1527451 .. 1527474 + -11.8  -4.21343   GCAGAGTGATGAAAT          GAAAAGGGCC GTTA GGCCTTTTTC           TTTGTATATGTTAAA 100 32
 IC772_07145 1528658 .. 1528673 +  -2.5  -5.31519   CATTAGTAATGAAAA              GGTAC TTAGAT GTGCC               TTTTTATTTGCCTAT  69 58
 IC772_07155 1529670 .. 1529682 +  -2.7  -3.11359   AAAGTTTTAAAACTG                CGTTA AAA TAATG                GTTTGGTTTTAAAGA  43 92
 IC772_07160 1530429 .. 1530482 +  -2.7  -3.01134   AAACAATGAAATGTC TGAAATTCACTGTCTTTAATGAAG CCCATTT TTTCAT-AGAGGCGGTGAGATTCA TGATTGTTCGTTTGA  43 43
        tsaE 1532845 .. 1532855 +  -2.4  -3.19463   TTTGTACCAGACTTT                 GCAG GAA CAGC                 TTCATGACTGATGAA  44 4
        mutL 1534799 .. 1534813 +  -2.1  -3.13773   ACTAGATAAATTATT               TGCTC GAGGA GAGTA               GTTTTACATGTCAAA  42 10
        miaA NONE
         hfq 1536379 .. 1536421 + -18.1  -3.59262   AATCGTTAATTGATT ACCATAAAAAAACCAGTCA TAAAC TGACTGGTTTTTTTATGGC TTTAAAAATATAAAA 100 32
 IC772_07200 1537364 .. 1537387 + -11.2  -2.86591   TACTATGAAATAGGA          GTTCAAAAGA AAGC TCTTTTGAAC           TCTACTAAGTTTTAT  83 28
 IC772_07225 1541692 .. 1541711 +   -10  -5.41143   GAAAATATTAAAAAA            GCCCAACT ATAA GGTTGGGC             TTTTTTTCGGAGGTC 100 154
 IC772_07255 1549677 .. 1549697 +  -4.7  -3.73534   CAGTTAAGTGATTTT            TTGATCTAG CCA CTGGAACAA            TTGTTGATAGACTTG  58 34
 IC772_07270 1553933 .. 1553945 +  -3.5  -2.97109   CGATTAGCTTTATTA                TTTAT TGA ATAAA                GTTTGATTGGCTTAA  45 14
 IC772_07275 1554416 .. 1554435 +    -5  -2.87132   GTGCTATCGAATGAA            CAGACATA AATG TATGGCTG             TATATACACAAAAGC  51 94
 IC772_07280 1555292 .. 1555319 + -13.6  -3.39772   GTGAGTCTAATCTGA        TACAGGCATAGC TTAG GTTATGCCTGTA         TGTTTAAAAGTTTGA 100 37
        pepN 1560679 .. 1560702 + -10.4  -4.17523   TTTAACAATACTTAA          TAAAGGTCTC GTAT GAGGCCTTTA           TTTTGACCATTATTT  95 44
 IC772_07305 1561721 .. 1561756 +  -7.6  -3.51232   TAAGTTCTGTTCATT    GTTGTCGCTAGCTCTT TTGT AAGAGCTAGCTCTAGC     TTAATTTGAGAAAAG  71 50
 IC772_07310 1562499 .. 1562511 +  -3.5  -3.42985   ACACTTTAAGAGGCT                TATAT GAA ATATA                TTATAGGTGTCTTAT  50 32
 IC772_07315 NONE
 IC772_07320 1566152 .. 1566162 +  -2.6  -3.74703   ATAAAAAAACGATTT                 TTTT AAT AAAA                 TATTTTAAATATTAT  48 203
 IC772_07325 NONE
 IC772_07330 1567429 .. 1567463 + -13.1  -3.20361   TAAATTATTAAATAA     TCTACGCTCTTTTAG CCTGA TTGAAAGAGCGTAGA     TTAAATTAAACTTTT 100 60
 IC772_07335 NONE
 IC772_07340 NONE
 IC772_07345 NONE
 IC772_07350 1570550 .. 1570567 +  -7.1  -2.56432   CTTTAATCGAATAGA             GCTTTTT ACGT AAAAAGC              GTTCGTAATGTTCGG  59 149
 IC772_07370 1574227 .. 1574260 + -14.9   -2.8937   GCCTCTGTAGGCAAG     CCGATAAAATGAATT TTAT GATTCATTTTATCGG      TGTATCACAGTATAT 100 57
 IC772_07385 1576671 .. 1576686 +  -8.2  -4.43213   CTCAAGATAATAAAA              GCCCCG AAGT TGGGGC               TTTTACTGTATTAGG  85 45
 IC772_07430 1591247 .. 1591279 +  -7.2  -5.69023   TAAGTGGTACAAGAA     TGCTATCTTCTTTGA ATTT TCAA-GTAGATAGCA      TTTTTTTAATATTTT 100 38
 IC772_07435 1591976 .. 1591986 +  -2.6  -3.63073   TTGATGAGCTTAATT                 TTTT TAG AAAA                 TTATTACCAAATATA  48 208
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 IC772_07445 1593209 .. 1593224 + -10.4   -5.4477   TGTAAATAACTATAA              GCACCG ATAA CGGTGC               TTTTTTTGAAAATTT 100 32
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 IC772_08490 1809587 .. 1809598 +  -2.2  -2.71101   TCTACCGATACCTTA                GCTG GTAT TAGC                 TACATTCTTTAGGAG  40 2
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 IC772_08500 1811335 .. 1811346 +    -3  -2.64107   ACATCGAGACTAGTT                TTAG ATAT CTAA                 TGCTCTCGCGATTTA  42 14
 IC772_08505 1812359 .. 1812385 +  -9.6  -3.80018   CATAAGTCCCATTAA         GCTGATAAATTG AAT TGATTTATCAGC         TTCTTCATATCTAGC  83 36
        feaR 1813635 .. 1813645 +  -5.4  -2.71731   AGTGCATTTTAACTA                 TCTG ATT CAGA                 TAGTTCAGGGATAGA  52 199
        tynA 1816093 .. 1816105 +  -7.7  -4.24562   ATTTTCTCAGGTTGT                GAGAG GGA CTCTC                TTTGTCTCATTTTTT  80 134
 IC772_08520 1817337 .. 1817348 +    -3  -3.11476   TGATTCTGCAATACA                TCTA TTAA TAGA                 TCCTTTTAAATGAAT  45 18
 IC772_08525 1818895 .. 1818909 +  -7.1  -5.49729   TGCAGATATAAAAAA               TGGCC CTATA GGCCA               TTTTTTTGAATCATT 100 55
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 IC772_08570 1827632 .. 1827651 +  -9.4  -3.29626   ATTTAAGATGGTTAA            GCTTAAAG TTAA CTTTAAGC             TTAGTATAAATATTC  78 453
 IC772_08580 1828571 .. 1828589 +  -5.3  -5.72622   TAAACTTTAAAAAAA            GAGGC-CT ATTA AGTGCCTC             TTTTTTATTTATAAC  91 51
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 IC772_08590 1831062 .. 1831089 + -11.4  -4.47118   ATGTTTATAAATAGT        CCCGAATAAGGA GTTA TTCTTGTTCGGG         TTATTTTTAAATATT 100 60
 IC772_08595 1831824 .. 1831854 + -14.9  -4.86939   TATTTATATGAAAAA       GACGAATTGCAGG GCTGG CCTGTAATTCGTC       TTTTTAGATTTATTG 100 53
 IC772_08610 1834044 .. 1834076 +  -7.1  -4.04474   AAGTTATAAATAAGA      TAAGCCGGATACT GCAAATG AGCATTCGGCTTA      TTTATATCAAACTAT  74 51
 IC772_08625 1836432 .. 1836451 +  -2.8  -3.95584   TGCTTAATTCATTAC            TAGGTACG TGTC TGTTCCTA             TTTAATTACTAAACA  51 34
 IC772_08630 1838608 .. 1838628 +  -7.6  -4.76213   AAGGTTTAACCAAAA           TGGGGC-GT ATTC ACAGCCCCA            TTTTATTAAGTTTAT  87 61
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 IC772_08655 1843716 .. 1843733 +  -7.1  -2.79655   AGACCACATCAGAGT             TATTCCT TCTG AGGAATA              CTTATATGTGTGTGC  63 241
 IC772_08660 1844821 .. 1844831 +  -2.6  -6.11644   AAGATTGTGATTTTA                 TTAA ATA TTAA                 TTTTTTTTTGAATGA  85 146
 IC772_08665 1846688 .. 1846698 +    -4  -2.59135   TTTCTTATTAATTTA                 CTTT AGA AAAG                 ACTTTATTTATGAAC  45 30
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 IC772_08675 1853492 .. 1853509 +  -3.4  -4.96646   TTTTCATTGAAAAAA             GAGACT CTTTAT GGTCTC              TTTTTACTTATATAA  69 61
 IC772_08680 1853929 .. 1853946 +  -7.7  -5.54264   TTAGTTAAATAAAAA             GCTCATC GGAA GATGGGC              TTTTTTTCAATCTTT 100 56
 IC772_08685 1855319 .. 1855346 +  -7.9  -3.17392   TTACGGTAAAAAAAG        CCCTGCTAAATA TTGAT TAT-TAGCAGGG        TTCGATTAAAGGATG  67 69
 IC772_08705 1859827 .. 1859852 +  -9.9  -3.13403   GTTGGAAAATGATAA         GGCGGTTCTAAA ACT TTTA-AACCGCC         TCTTACTAGAAGCAC  73 169
 IC772_08715 1861813 .. 1861828 +  -3.4  -2.63913   CAGTAAACAGAATAT              TTTATA AGGA TATAAA               TCATGTCAAATACTG  44 35
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 IC772_08735 1865901 .. 1865929 +  -9.6   -2.7185   TTCCACCGAAAATAT        ATGTCTGTGCCA AAGGA TGGCGCAGACAA        TAGTTAAAGGATGAT  74 51
 IC772_08740 1867237 .. 1867254 +  -7.7  -5.64006   TTCATCATTAAAAAA             GAGACCG TAAA TGGTCTC              TTTTTTTGATTACGT 100 54
 IC772_08755 1870761 .. 1870777 + -10.8  -4.73448   AAATGATAAAACGAA              GGCCGC GAGAA GCGGCC              TTTTTAACTCTGTCT 100 41
 IC772_08770 1876004 .. 1876015 +  -4.4  -2.82015   ATGGTGAGCACCTTG                CCAA AGCG TTGG                 TGTCATGAATATGGA  49 6
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 IC772_08785 1878644 .. 1878654 +  -6.8  -3.55487   ATAAACAGAGGCAGG                 GCTG GTG CAGC                 TTCTAATTCATATAA  64 381
 IC772_08795 1880100 .. 1880126 + -10.3   -3.1505   AAAATAGACTTGAAA         TATATGGTGGC TTTGT GCCACTATATA         TTCATCGAAGATCAT  83 146
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 IC772_08805 1882559 .. 1882590 +  -9.4  -5.06414   CGCATAACTGAGTTT      AGATGAGCCGTTGC ATGT GTATCGGCTCATCA       TTTTTATTGAGAGGC 100 34
 IC772_08810 1883378 .. 1883393 +  -3.2  -4.16182   TGAGCTTTCTGACTA              GCGCAT CTTG ATGCAC               TTTGATTTATAATGC  57 25
 IC772_08815 1885143 .. 1885162 +  -3.7   -3.3164   CAAAATTTAATAAGC            TTTTCAA ATTACA TTGAAAA             TTCTGAAAATCACTT  48 323
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 IC772_08835 1887146 .. 1887161 +    -9  -4.30576   TTAAGGCTTTCAAAG              CCCTGA GTTT TCAGGG               TTTTACTCATAGCCA  88 71
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        iaaH 1889709 .. 1889737 + -10.5  -2.78867   TTATCTGGAAAAATA        TAAGTCATTTTAC TCG GTAGAGTGACTTA        ATTATTAAAAATTAC  80 119
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 IC772_08865 1895527 .. 1895555 +  -8.9  -3.50393   TCGATTTTTAACACT        TCGACACGCCT TGTATTT AGGCGTGTTGG        TTGTGTCGAATACAC  78 63
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 IC772_08875 1898004 .. 1898015 +  -4.4  -2.69073   GTAGGTCATCAATGC                GCAA AAAT TTGC                 TCAATTCTTATGAAT  48 59
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 IC772_08890 1900801 .. 1900816 +    -4  -3.92746   GCCTACATTGCCAGT              CGGTTCT CGC AGA-CCG              TATTTTTGGACTACA  56 283
 IC772_08895 1901816 .. 1901836 +  -2.6  -4.79352   TTGAGGGGGATTGGG            TGAGGAGT AAATA ATTTCTCA            TTTTGTTATCACTAG  63 23
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 IC772_08905 1903761 .. 1903774 +  -9.5   -4.7416   GAATTATAGAAGAAA               GCGCC TAAG GGCGC                TTTTTAAAATTTTAA 100 18
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 IC772_08940 1910586 .. 1910597 +    -3  -4.65263   ATACGATAGGGGGTT                TCTT AAAT AAGA                 TTTGTTTTAAGACGT  62 57
 IC772_08945 1911510 .. 1911525 +  -3.4  -4.26903   GTATTGGCTGCGCCT              TAAAAT ACCA ATTTTA               TTTTGGTCACATGCA  58 23
 IC772_08955 1915379 .. 1915393 +  -6.4  -2.71335   TTTAGAAAATTGATA               TAGCCG TTT CGGTTA               TAAATTCTTGTGTTA  57 28
 IC772_08960 1916746 .. 1916771 + -13.5  -3.84825   TTGAGATTCATTAAA         GGCTTCAATAA TTAA TTATTGAAGCC          TTTAATGTAAATAAA 100 37
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 IC772_08990 1928021 .. 1928034 +  -5.3  -4.07687   CACCTTGACCAATAT               CCTAA TAAG TTAGG                TTTTAAGGGACAGGT  64 248
 IC772_09025 1935840 .. 1935882 + -16.7  -4.66537   TAACATAAAAATTAG GGTGAATCGTTTATCATTT GATCA AAATAATAAACGATTCACC TTTTATCTTAAAAAA 100 78
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        adeB 1957477 .. 1957514 +   -10  -4.04922   AATAACCTATAAAAC   TCATTGAGGCGAAACA GTTAAG TGTCTCGCCTCAATCA    TTTCTAGATTTATAT  90 29
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        entS 1988205 .. 1988224 + -10.8  -4.54727   ACCCTAAAAAAGAAA            GAAGGCAA TTTA TTGCCTTC             TTTTGCTTTAAGCAA 100 41
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 IC772_09225 1991512 .. 1991526 +  -3.5  -4.57569   TAACAATGCTCGACC               CAGTG CTACA CGCTG               TTTTTCACCACCTGA  64 264
        antA NONE
        antB NONE
        antC 1997161 .. 1997190 +  -9.5  -5.01042   TAAAACCTGAAATGA       TTCAATATACTCT GTAG GGGGTATATTGAA        TTTTTCATTTAAATT 100 65
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         bla 2011575 .. 2011592 +  -4.1  -5.03747   GATAAAAATTTAAAA             GCCCT GATGATGG AGGGC              TTTTTTAGAAACTTT  70 66
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 IC772_09420 2032738 .. 2032771 + -11.3  -4.63527   AAAAACTAAAAGTTA     GATATTCTTCTAGAG CTTT TTTTAGAAGAATATC      TTTTTAAAATAATAA 100 39
        chrA 2034749 .. 2034768 +  -2.9  -4.14598   ATCCGTTCATCATCA            CTAAATG CAACTT CGTTTAG             TTTAATTTGATTGGG  57 522
 IC772_09435 2036200 .. 2036215 + -10.4  -4.88736   AAAAAGTTGTGAGAA              GCAGGC CTAA GCCTGC               TTTTTATAAATCATA 100 16
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 IC772_09465 2043128 .. 2043143 +    -9  -5.03145   TACTTTAATAAAAAA              GAGCGA ATCA TCGCTC               TTTTTTACAGCCTTA  95 33
        lipA 2051332 .. 2051348 +  -2.3  -3.02511   CACCGAAGCCATTTT              CAAAAGA AGA TGTTTTG              TCTTAGCGCAATCCG  42 3
 IC772_09505 2052658 .. 2052684 + -12.5  -4.11394   TTGAATAAAATAAAA         GGGAGAATATT GTATA AATATTCTCCC         TTTTCAAGATCAGCT 100 33
 IC772_09515 2055052 .. 2055075 +  -8.2  -4.78572   ATCAATAAATAAAAA          GCCACATACT TTAA ATTATGTGGC           TTTTCTTAATTCAAC  90 75
 IC772_09555 2062070 .. 2062109 + -13.9  -3.14602   ATTAAAATTACCACT  GGATACTTCTTTGGTTA ACTTGA TGACTAAAGAAGTATCC   TATTAATAAGCTAAA 100 36
 IC772_09595 2068815 .. 2068843 + -11.9  -3.73995   TTTAAAAACAACTAC        GAAAAAGCCCT GATATAA AGGGCTTTTTC        ATTTTTTATAAACCA  95 36
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 IC772_09625 2072700 .. 2072717 + -12.7  -5.95539   TTTAAAGAGTTAAAA             GCGGAGC TTAG GCTCCGC              TTTTTTTATTTAAAA 100 41
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 IC772_09655 2079741 .. 2079764 +  -8.1  -5.21459   AATATTAGTCGTGTA          GCCAACTCC AATTTA GGCGTTGGC           TTTCTTTTTATTTTT  93 33
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 IC772_09680 2084195 .. 2084212 + -11.3  -5.54338   AAGATTGAAAATTAA             GCCCTCA TTTT TGAGGGC              TTTTTATTTTGCTTG 100 52
 IC772_09725 2093250 .. 2093261 +    -3  -4.06527   TTAATCTAGTTCCTC                TTTC TGGA GAAA                 TTGTATTTTAATTTT  55 67
 IC772_09730 2094960 .. 2094973 +  -2.4  -3.53281   TACTCTTTTTTTGAA               TGTC AGTAAC GACA                TAGTTTTTTCTTATA  46 170
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 IC772_09740 2097563 .. 2097586 +   -14  -2.72991   TAAAATAAGAGCGTT          GCAAGGAAGT TAAA ACTTCCTTGC           TGCTTAGCACTGTCC 100 33
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 IC772_09770 2103870 .. 2103888 +    -6  -2.50113   TTAAAAATAAAAAAA             CTTGACTA TTT TAGTCGGG             ATTCATAAAATCCTA  54 74
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 IC772_09780 2105620 .. 2105640 +    -7  -4.12456   GTTGAATGGGCAGAA            CACTAATT ATTGA AATTAGTG            TTTTAACCCTCATAT  71 20
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 IC772_09905 2135314 .. 2135343 +  -2.1  -2.74605   ATTTCAAACATTGTT       TGTCTACAGTTTC AGGA GTAACTATGGGCA        TGACTTTTACAGACA  40 112
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 IC772_09955 2145966 .. 2145978 +  -7.7  -4.13945   AATGAGTAGAACCAT                CAAGC ATT GCTTG                TTTTGGAGTCACAAT  77 114
 IC772_10100 2170995 .. 2171006 +  -4.4  -3.17714   GTACTTATGAAAATT                TACG TAGC CGTA                 TTGGTGAAGATTTAG  50 427
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         maf 2175869 .. 2175889 +  -2.5  -3.66666   ATTAGCTTATTTATA            GGTTATCTC CAT GACACAACC            TTTAACCGTTTTAGG  48 46
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 IC772_10140 2178092 .. 2178111 +  -5.8  -3.19913   GATTCCAAACCAGAA            TATACAGA CCTG TCTGTATG             TGTTCCATTATATCT  59 149
 IC772_10145 2179017 .. 2179027 +  -2.6  -4.55826   TCTTTCTTACCACTT                 TAAT AAT ATTA                 TTTTAATATTTTAAA  60 291
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 IC772_10170 2184244 .. 2184255 +    -3  -2.67667   CGACAAAAATCGTTG                TCTT TAAA AAGA                 ATGTTTAATGAATCG  42 6
 IC772_10175 2185375 .. 2185388 +  -2.3  -3.62893   GTAGTCCAAGCAACT               GGCGT AAAG ACCCC                TATTTATAATGTTAT  47 3
        gcvH 2185843 .. 2185862 +  -9.4  -5.65177   AGTATTTGATAAAAA            CCAGTTTA CTTT TAAACTGG             TTTTTTTATACATGT 100 58
 IC772_10185 2186930 .. 2186944 +  -8.6  -3.06162   AAAAAATTCTTTTGT               GGTTGA ATC TCAACC               TCTTGAAATGCCGTA  72 340
        putP 2188522 .. 2188558 + -12.6  -4.74084   AGTGTATAAAAATGA   GTAAAATAAAAAGGGGC TTAG GCCCCTTTTTATTT-GC    TTTTAGTTTTGATTT 100 32
        putA 2192936 .. 2192957 +  -8.8  -5.68438   TAATTTATTTAAAAA           GCCCAAAT CTCAGT ATTTGGGC            TTTTTTGTTTAATGA 100 45
 IC772_10205 2193480 .. 2193501 +  -3.1  -3.03513   TTTTATTCAAAATGT           CTTAAATCA TTTC TAATTTAAG            TATCCTATTTGTTTA  45 10
        trmA 2194717 .. 2194739 +  -9.3  -4.69027   TGTAACCAAATTTTA           TAAGGAGAT TAAAT ATCTCCTTA           TTTTTCAATGCATTT  90 55
 IC772_10215 2195174 .. 2195190 +    -8  -5.28315   TTCATTAATAATAAA              GCCAGT CTTGT ACTGGC              TTTTTTGCATTTTAT  93 33
 IC772_10225 2196737 .. 2196754 +  -9.9  -4.57569   CATCTAATTAAAAAA             GTCCTCA CAAT TGAGGAC              TTTTTAGAAAACTCA  93 34
 IC772_10235 2198023 .. 2198045 +  -7.8  -3.12717   CACATCCGTGTGCCA           TTCCAATGAG CCA CTCATTGAAA           TATCTATTGCTAGGT  65 69
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 IC772_10260 2203119 .. 2203143 +  -5.1  -4.95843   ATAGAATATAAAAAA         GGCCT-AATC ATTTAA GATTTAGGCC          TTTTATCTTTTATAT  75 44
        ruvC 2206534 .. 2206553 +  -2.2  -3.76176   TCCAAGTGTGAAGCC            TGATTTAA GAAA TTAAACCA             TTGTTGATAAATTTG  49 493
        queG 2208698 .. 2208715 +  -2.7  -2.56914   GCTTTAATACGAATT             CTGTATG ATTA TGTACAG              TGAATTAATGCCATC  40 65
        bioB 2209755 .. 2209772 + -11.3  -5.72616   ATCAAGAATTTAAAA             GCCCTGA TCAT TCAGGGC              TTTTTTTATATAGAT 100 45
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 IC772_10880 2328411 .. 2328435 + -15.9  -3.29829   TAAAAATCATAAAAA          TAAAGGAGGCA TAA TGCCTCCTTTA          TTCTCAAAAACTGTC 100 46
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 IC772_10895 2331732 .. 2331763 + -11.7  -4.41616   CTAACATGATTTGAA      AAAGCCCTGAAAG CTTCAA CTTTCAGGGCTTC       TTTATTTAAGCCGGT 100 44
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 IC772_10940 2341688 .. 2341708 +  -5.4  -2.94622   AAATTTCCAGATACA            GGTAGGAA TGATT TCCCTACC            TGTATAAATATGTAT  53 40
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 IC772_10990 2354721 .. 2354740 +  -2.1  -4.43221   TATCTCTGTATCAAA            TGCCTCT CTCAAC AGAAGCA             TTTTCTACCCTATTT  57 180
 IC772_11000 2359481 .. 2359498 +  -9.9   -5.4833   TCTCAAAATAAAAAA             GTCATCC TTAG GGATGAC              TTTTTTATTAGCTCA 100 61
         alr 2371315 .. 2371330 +  -3.2  -5.77734   TTCTTATATAAAAAA              GAGCAT TTTC ATGCCC               TTTTTATTTTTATTT  81 137
        pobR 2373529 .. 2373541 +  -6.3  -4.07568   GTGATTTAAATAGAC                CAAGA AAC TCTTG                TTTTCAAAACAGGGA  68 32
 IC772_11065 2375196 .. 2375219 +  -2.2  -4.86001   GCTTAAAATAAAAGA          GGCCTCGTCC ACTT GAACATGGCC           TTTTTGTGCAGTCAT  62 35
 IC772_11085 2379991 .. 2380014 +    -9  -3.74303   TGCCTGTCGGACTTT          GAAAAGTGAT TTAG ATCGCTTTTC           TTCATTTTCAATTTT  80 24
 IC772_11090 2381808 .. 2381819 +  -4.4     -3.67   TTGTCAAAAAGGTGC                CGAT GTTG ATCG                 TGTTTTAGGAATTAG  56 441
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 IC772_11115 2390142 .. 2390160 + -10.3  -4.50627   ACATGAATTAAAAAA             TGGGAGC TGTTT GCTCCCA             TTTATTTAATGCGTA  95 368
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 IC772_11130 2391789 .. 2391799 +  -2.6  -3.09718   AACTGATAAATCTCA                 TATA AAG TATA                 TAATTTTAGAAATTC  43 40
 IC772_11135 2392382 .. 2392414 +  -4.3  -3.99779   GGGTATTAGTTAACA      TAAAAGCAGCTTA CTAATCA TAGACTGCTTTTA      TTTAGTTAAATTTTG  60 62
        paaZ 2406203 .. 2406231 + -13.2  -5.42259   GCTTAATGTTTAAAA        TGAGATGGGGTC ACCTC GTCCCCATCTCA        TTTTTTTAGCACTCA 100 35
 IC772_11215 2409183 .. 2409194 +  -4.4  -4.74801   ATTTGCTTGCTGGGT                TTGG TGAA CCAA                 TTTTTGGTGGAGTTA  72 497
 IC772_11235 2411601 .. 2411618 +  -4.3  -4.32903   AAATAAGATTAATAT             TATTTTA AATT TAAAATA              TTTTCGCTATTTAGT  62 186
 IC772_11245 2413791 .. 2413816 +  -7.7   -5.2853   CTAAAAAAGTAAAAG         CACCAAAAG CTATAATT CTTTTGGTG          TTTTATTTTTAAATC  91 37
 IC772_11265 2418315 .. 2418328 +  -4.5  -2.67189   AAGACCATGAGTAAA               CGCTG CTTA TAGCG                TGGGTTCATTTTGTC  47 421
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 IC772_11380 2445358 .. 2445376 + -13.2   -5.5454   GAAAGACATTAAAAA             GCCCAAGT TGA ACTTGGGC             TTTTTATTTATTTGG 100 41
 IC772_11415 2450930 .. 2450953 + -11.1  -4.98531   AGCATAAGATTTAAA          GAGAGCATC AATATC GATGCTCTC           TTTTTAATTTAGGCC 100 34
 IC772_11435 2456775 .. 2456798 +  -9.7  -5.18561   ACCCGCCCTATCAAA          TAAAAGCCC TATTAC GGGCTTTTA           TTTTTTAAATATTTC 100 40
 IC772_11445 2459227 .. 2459237 +  -2.6  -4.09827   TCTTTTTTCAACATT                 TTTT TGC AAAA                 TTTCCTTATATTCTA  55 406
 IC772_11535 2474256 .. 2474268 +  -4.1  -3.09784   AGATATTAAACTGCG                CCGTT AGA AATGG                ATTTATTCCCCCTAC  48 468
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 IC772_11585 2482980 .. 2482994 +   -10  -5.19998   ATCAATAAGAAAAAA               CCCACA ATC TGTGGG               TTTTCTTTTAATTAT 100 33
 IC772_11630 2494688 .. 2494727 +  -7.3  -2.95527   TCGTTAAGCATATAA  GCCCATCATGAGTGGCTT TTAGC AATTC-CTTATGATGGGC  TGATTTGGAGTTATT  63 34
 IC772_11635 2495179 .. 2495193 +  -2.9  -4.47977   TATATAAAATAATTA               GATAA CTGAT TTATC               TTGTTTTATATTCTT  60 56
 IC772_11640 2495750 .. 2495786 +  -5.4  -4.39002   AGTATAAACCAGCAG    GTATATAGAAGTAT GGTGGACGA ATACTTCTATATTC    TTTTATGAAGGATTT  69 82
 IC772_11660 2499091 .. 2499105 +  -2.9  -4.44667   TGAAAAAGCCTGAAT               CTTAA ACTGA TTAAG               TTTATTCTTAGAAAG  60 370
 IC772_11675 2501430 .. 2501445 + -10.4   -5.1523   TTAGTCAATAAAAAA              GCCCTC AAAT GAGGGC               TTTTTCTATTCTACA 100 341
 IC772_11685 2503158 .. 2503183 +  -7.6   -3.1886   CTTAGCTAAATGATG         GCAAAGCCCT TTTAAT AGGGCTTTCC          TTCATAAAATTAGAT  69 32
 IC772_11700 2505938 .. 2505963 +  -6.3  -3.48031   TACAAAGCCACACCT         TTCATAGGA TTTGGTTT TCCTATGAA          TATATTTATCTTTTC  62 49
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 IC772_11740 2514884 .. 2514898 +  -5.7  -3.23042   GTAGCAAATAAAAGC               CAGCA ATAAC TGCTG               TTCATGATCAATATT  54 392
 IC772_11760 2518122 .. 2518135 +  -3.9  -3.58536   CTACTTAGTAGGAAC               CAATA AGCT TATTG                TTTAAAAATGACTTT  53 109
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 IC772_11785 2526893 .. 2526912 +    -8   -4.8667   GTTTTGAAATAAAAA            TGAGTTAT AACT ATAACTCA             TTTTTATGAAATCTA  90 234
 IC772_11815 2573329 .. 2573348 +    -3  -4.58283   TGATACTCAAAACTT            TATGTTTT GAAA AAAATATA             TTTTTCAAGAGATTA  62 43
 IC772_11820 2574874 .. 2574890 +  -2.9  -2.82488   ATTGATGATCAAGGA              CAAGGAG CAT CTTCATG              ATTGATTTATCTTTG  43 8
        cydB NONE
 IC772_11830 2576254 .. 2576296 + -13.1  -5.32565   TTGAAAAATCTGACC T-AACAAGAAAAGACCATGC ACAA GCATGGTCTTTTCTTCTTTA TTTTTTACTTAATTA 100 23
 IC772_11835 2577347 .. 2577357 +    -4  -3.26031   ACTACGCGTTATCGG                 GTTT AAA AAAC                 TGTATTTCCCATGAG  49 62
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 IC772_11845 2579397 .. 2579443 + -14.1  -3.17723   ATAACTTGTTCAGAT TGAACCATAAAAAA-CCCGCAA AATA TTGCGGGATTTTTTGTAGTTCA TTGAATTACCAATGA 100 78
 IC772_11910 2601283 .. 2601296 +  -3.9  -4.68424   TTCCACATATCCACA               CTTAA TTTC TTAAG                TTTTTCAATAGATTC  69 161
 IC772_11920 2603170 .. 2603199 + -10.2  -3.70902   TATACCCTGACTCTC       TGTGCAAAGCCCT TTCGT AGGGCTTT-CACA       TTTAAATGTACAACC  86 41
 IC772_11935 2606935 .. 2606950 +  -3.2  -5.80951   GTGCAATAAAAAAAA              CGAGTC ATTT GACTGG               TTTTTTGTTTTCAGT  81 188
        mutS 2610555 .. 2610584 + -15.9  -3.51232   TCATAATCATTGATT       GAGCAAACATGTC TATG GGCATGTTTGCTC        TTACTTTAAGGAGAA 100 35
 IC772_11950 2611135 .. 2611156 +  -2.4   -5.1287   CATTTGCTTTGCCTA           CTTTAAGT CTCGAT ATTTAAAG            TTTTTTGGGTATCAG  69 20
 IC772_11955 2611819 .. 2611836 +  -9.9  -5.26918   AATAATTTCAAAAAA             GATCAGC AACC GCTGATC              TTTTTTATACCCTAT 100 36
 IC772_11960 2612671 .. 2612698 + -15.8  -5.34365   TTTTTAAAATTAATA        TCCCCTAATACA CTTT TGTATTAGGGGA         TTTTTGTTGTTCTCA 100 34
 IC772_11965 2613594 .. 2613638 + -16.1   -2.8934   TTTATTACCCTCGCT TTTCCATATAGTTATCCACAA CAT TTGCGGATAACTATATGCAAA TCTGATCATTTAGCC 100 92
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 IC772_12030 2626176 .. 2626201 + -11.3   -5.8187   TCCAAAATTTAAAAA         CCACTTAATTC GAAA GAATTAGGTGG          TTTTTTTATTGGCTA 100 37
 IC772_12050 2629755 .. 2629777 +  -8.5  -5.03314   TCAATGAATGACTAA          GCCCTTAGCT TTCG AGC-AAGGGC           TTTTTTACGCCTAAA  95 252
 IC772_12060 2631932 .. 2631944 +  -7.7  -2.89683   GCCGCGCTCGTATAG                CCCAA CCC TTGGG                TATCTGCAGTCCAGT  62 370
 IC772_12075 2633715 .. 2633725 +    -4   -2.9006   TTTAGCAAGCACATG                 GTTA AAG TAAC                 TGTATCAAGTACCTT  47 111
 IC772_12095 2636695 .. 2636753 +  -6.5  -4.85599   AACCAAACAAAAAAA GACCAACTTGTT-AAG-TGCTTTACAGC CCTTTC GCT-TAAAACAGCTTTAGCAAGTTGGTC TTTTTATAAGCTCAC  80 59
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 IC772_12130 2641355 .. 2641386 + -10.2  -3.18383   GATTTCATAAAAAAA      GCCCATTCCTAC TTCTCATT GAAGGAATGGGC       TTAGTGAATACCACT  82 41
 IC772_12145 2643173 .. 2643198 + -14.9  -4.08064   TCGTCGCTATATATA         GAAAAAGCACC CTCG GGTGCTTTTTC          TTTTAACGACCAGTT 100 54
 IC772_12150 2644342 .. 2644356 + -11.4   -4.3739   ACAGGCATTAAAAAA               GCCCGT TTC ACGGGC               TTTTCTGCAACGGTG 100 388
 IC772_12170 2648341 .. 2648363 + -10.6   -4.4634   TGCAATAATGAATAA           GGCCTAACAT TTA AAGTTAGGCC           TTTATTCTTGAGCTT  95 33
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 IC772_12195 2652020 .. 2652033 +  -2.4  -3.54935   CACTGGAATTAATCA               CAAC ATAGAC GTTG                TTTAACAAAGATTTA  46 29
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 IC772_12210 2655215 .. 2655229 +  -4.3  -5.14563   CAGATTTTTAAAAAT               CGTTA AGGAA TAACG               TTTTTTAGTGACAAG  77 154
 IC772_12215 2656160 .. 2656194 +  -8.6  -3.25202   CTTTCTAAAACACAT     CAACGCATAGCTTCAG CTT TTGAGGCTATGCACTG     CTTTATTTAAAAATC  74 33
        benA NONE
        benB 2659333 .. 2659347 +  -2.1  -3.06183   TAAGACATACCCCCT               CAGTT AAACG GACTG               TTGGCTGAGGGTAAA  42 38
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 IC772_12245 2661204 .. 2661223 + -12.2   -4.7078   TCAGTCGGAGGTGGA            GATCAGGG TTAA CCCTGATC             TTTTTGCATGATTGG 100 14
        benE 2662508 .. 2662550 +  -3.7  -5.49234   AAATAAAGCCTCAAT CGCCAAATTAGGA-T-GCAAA TAA TTTGCTAATTCTGATTTGGCA TTTTTTATTGAATAT  76 67
 IC772_12255 2664311 .. 2664329 +  -4.5  -3.91506   AGCAGTAAAAATACA             TGCGTCG AGGAC TGGCGCA             TCTTTTTGGAAATGG  58 33
 IC772_12260 2665627 .. 2665654 + -16.4  -4.18506   TATTTTTGATTCAAA        TGAAGCGGGCCA CTTT TGGCTCGCTTCA         TTATTTTCGACCTAA 100 42
        ahpC 2671721 .. 2671738 +  -7.7  -5.87996   CAATACGTCTAAAAA             CCATCCT TTTT AGGGTGG              TTTTTTTATTGATTA 100 56
 IC772_12280 2672163 .. 2672180 + -11.3  -3.54672   GCTTAATTATAAAAA             TCAGCCC GCTT GGGCTGA              TCTGTTTTATATCTT  90 35
 IC772_12290 2674848 .. 2674858 +  -8.2  -2.79023   CCAGTTCAGTAACAT                 GGCG TTT CGCC                 TCATTACTACGATTA  62 322
        ahpF 2677247 .. 2677270 +   -14  -5.27779   TCTTATTAAACGAAA          GCCTAGCATT GCAA AATGCTAGGC           TTTTTTAATATTGAA 100 57
 IC772_12310 2677753 .. 2677771 + -10.3  -5.16237   TCTAATATTAAAAAA             GCCCCTA TTGAT TAGGGGC             TTTTTTAATACACTT 100 46
        trmB 2681925 .. 2681945 +  -9.8  -4.91977   AAGTAAACAACAAAA            GGCTTAGT TCATT ACTAAGCC            TTTTATCTTTTAATA 100 35
 IC772_12330 2682853 .. 2682869 +  -5.1  -4.44448   CTGATCTCCCCTTAC              TGCAGGC CCA GTTTGCA              TTTGTTTCGGATCGT  68 166
       rlmKL 2690505 .. 2690532 +  -3.4  -4.98352   TAAAACGATCTGCCC        GATCTGGTAATG CAAC CATTTCTAGTTC         TTTCTTTTCTTTAAT  70 124
 IC772_12370 2691614 .. 2691635 + -10.3   -4.4267   TTAAATATAAAAAAA           GAGAATATG TTTC CATATTCTC            TTTTCGGTTTTAGCA  95 37
 IC772_12385 2700094 .. 2700111 +  -4.1  -5.26119   ATTATCTTAAAAAAA             GCCAACA TCAC TGTTAGC              TTTTCTTTTTCAGGC  74 495
         crp 2701733 .. 2701748 +  -7.6  -5.71712   ATGATTTAATAAAAA              GCAAAC TTCG GTTTGC               TTTTTTTATATGCAA 100 50
 IC772_12405 2702927 .. 2702944 + -11.3   -4.9792   CCTTAAAATAAAAAA             CGGATGC TTAA GCATCCG              TTTTTATATGAACTG 100 35
        alaS 2711315 .. 2711336 + -10.3  -3.32333   ATAAGCCCTATCAAT           TATGTACAC ATAC GTGTACATA            TTCGTACTTATATCT  83 243
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 IC772_12450 2714358 .. 2714370 +  -6.3  -4.05321   TGCACAATAACAGAC                GTCAA TTT TTGAC                TTCTATTTGTTTATC  68 31
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 IC772_12810 2765038 .. 2765071 + -16.2  -3.65812   TAATCAAAGAAAACA     CAGAGCCGCTATAG TTTTTT TTATAGCGGCTCTG      TTATATTAAACGGAA 100 91
        csrA 2765494 .. 2765521 +   -10  -5.42862   GTTATTCTCTCCCTA        ATTAAAGCGACT TTCT AGTCGCTTTAAA         TTTTTTTGGGAGTAT 100 47
 IC772_12830 2767365 .. 2767381 +  -9.4  -5.96894   TCAATGTTAAAAAAA              CCGCCT ATCAA AGGCGG              TTTTTTTATTTAGAT 100 43
 IC772_12865 2775415 .. 2775438 +   -14  -5.80248   CCATAATCAACAAAA          CACCTGCATA GTTA TATGCAGGTG           TTTTTTTATATATTG 100 35
 IC772_12875 2777585 .. 2777606 +  -5.1  -4.44548   TTAATTGGCTTGTAA           CCAGTCACT ACTC AATGGCTGG            TTTTCCTTAAATCTA  67 37
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 IC772_12885 2780051 .. 2780084 +  -8.4  -4.33621   CGTTGTTAGGAATGA     GCAGTGTATTTT TGTTTTTTAT AAAATACACTGC      TTTCTTCATTGAATC  83 61
 IC772_12890 2781029 .. 2781053 +  -6.5  -3.80133   GGTTGTTTAACCGCA         TGGCATGAGG TGTTTT CC-CATGCCA          TCTTTTATAAGCATG  66 52
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 IC772_12905 2784547 .. 2784588 +  -3.2  -3.14404   CAGCAAAATAAAAAC AGT-GGTCAGCATTCTCTTG ATTT TAAGAGA-TGCTGACTGACA TTAAATGCTTAGTAT  45 30
 IC772_12910 2785826 .. 2785840 +  -4.3  -3.38046   CGCCAATACCCTACT               TGTTC CACCT GAACA               TATTTGGGATGAAGG  54 343
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 IC772_12940 2794935 .. 2794966 +   -14  -3.92324   TTGAGCTTTAATTCT      GGAGTTCCTTTATT CAGA AATAAAGGAACTTC       TTTCATCTTAAGCGC 100 30
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 IC772_12965 2800182 .. 2800195 +  -8.1  -3.65902   ATGCAAAAAATTAAA               GCGCA GTGA TGCGC                TTTCCATGGAGTGAA  75 84
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 IC772_12980 2804651 .. 2804675 +  -9.4  -4.98531   AATAATTCAAAACAA          GAGGTTCTGT CACAT ATAGAACCTC          TTTTTAATTTCGAGA 100 36
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 IC772_12995 2807469 .. 2807488 +  -5.7  -5.83211   CCAATAAGATAAAAA            GAGAGCT GACCTA GGCTCTC             TTTTTTATTTTGCTA  95 44
 IC772_13000 2808973 .. 2808987 +  -5.8  -3.49568   AACTGAACGGGACAA               TGAAAA ACT TTTTCA               TATTCTTCTGCATAG  58 507
 IC772_13010 2811183 .. 2811197 +  -7.8  -5.28826   TAAATTATAAAAAAA               GCCTCG TAA TGAGGC               TTTTTTATGGGGTTT  91 41
 IC772_13030 2816190 .. 2816205 +  -4.8  -3.75578   ATTTAAAACATAATA              CATATA GTAT TATATG               TTATATGTTATATGT  58 285
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 IC772_13040 2818501 .. 2818520 + -10.8  -4.11484   TATCCGCTTCATTAA            GCTAAGTC TTTT GACTTAGC             TTTTAGAGAATTCGC  93 49
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 IC772_13065 2824544 .. 2824566 + -10.7  -4.67697   TTGAACATGCTAAAA           GGCTTATTC TATTT GAATAAGCC           TTTCTTGTTTTAGGA  95 37
 IC772_13070 2825343 .. 2825353 +    -4  -3.04792   CCTGCTTAAACTCAA                 CTTT TAT AAAG                 TGTTCCAAATCATAA  48 90
 IC772_13090 2827981 .. 2828012 + -17.6  -2.72344   TTTTAAAATCTCTGA      GAAAGACAGACAAA TATC TTTGTCTGTCTTTC       TCATTAAAACTAAGA 100 73
 IC772_13100 2829709 .. 2829739 + -10.6  -3.34646   CCTTCATTTATAAAA       GATCATTAAAGATG TAA CGCCTTTAATGATC       TATATTTATCGCATT  83 47
 IC772_13110 2830998 .. 2831015 +  -3.5  -3.74347   AGTAAGGATAAATAA             TTGACAA GTTA TTGTTAA              TTTGAGGTTTATAAA  52 399
 IC772_13130 2835120 .. 2835133 +  -2.5  -3.93166   TATAATAAAATATAA               TATTT AAAA AAATA                TTGATTTTTTAAAAG  51 19
 IC772_13135 2836299 .. 2836309 +  -5.4  -2.77283   ATCTTAGGCTTAGTA                 GCTA TGG TAGC                 TGGATTTATTGATGC  52 66
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 IC772_13195 2850426 .. 2850446 + -11.1  -4.24002   ACCCATATAAAAAAA            GCCCCTGCT ATT AACAGGGGC            TTTTCGAATTTGGCG 100 297
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 IC772_13215 2855573 .. 2855586 +  -2.4   -3.3442   AAAGCATCATATCAA               GCTT ATAAGA AAGC                TATTATGATATTGTC  44 297
        yddG 2857070 .. 2857095 + -13.4   -5.1417   CTTCTTAATTTTTTG         GTCACAGCCA TCATTC TGGCTGTGAC          TTTTTACTTTTATCA 100 33
 IC772_13295 2875661 .. 2875673 +  -3.5   -4.8048   ACCAACCCTTAAAAT                TAAAT ATT ATTTA                TTTTTAATATAAAAA  66 205
 IC772_13350 2888216 .. 2888246 + -10.6   -5.4251   CGTAAACAAGTTTAA       TAAAGCCTGACTAT CCC AAAGTTAGGCTTTA       TTTTTTATCTATGCA 100 169
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        argG 2907430 .. 2907447 + -11.3  -4.74013   TATGACGTCAAAAAA             GCCACCT CTAT AGGTGGC              TTTTCTATATTTAAA 100 47
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         lon 2972107 .. 2972122 +    -9   -5.8187   TGAAAAATAAAAAAA              GAGAGC TTCG GCTCTC               TTTTTTTGTTACATA 100 42
        rlmH 2972870 .. 2972885 +    -4  -4.08216   ATCACCGCGCATAAA              TGGAAC AACC GTTTCA               TTTTAAGAACAATCC  58 27
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         nth 2978450 .. 2978470 + -12.6  -3.87075   CTTGATGAAAGAAAA            GAGCCCTC ACAAA GAGGGCTC            TTTATCACAAATAAT 100 231
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 IC772_13890 3021938 .. 3021960 + -16.4  -3.45634   AGATATTTTAAATAA           CAAAGGCGCT TGA AGCGCCTTTG           TTATAAGTCTTGTTT 100 13
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 IC772_13910 3027748 .. 3027778 +  -7.7  -2.79452   ACGGAAAAAGTTGTA      CCAAAGCAAGCC ACCCCATC GGCT-GCTTTGG       GTTCTATTGAACAAT  66 118
 IC772_13915 3028704 .. 3028722 +  -3.2  -2.59738   TTTCTTAATTAAAAG             TAGATC AAAAAAC GATCTA             ATAATTTTTATAGTA  42 70
 IC772_13920 3029438 .. 3029451 +  -3.9  -3.21747   TTGGCATAGATAATG               TATAC ACCT GTATA                TTAATGATACCGTAC  49 524
 IC772_13925 3031040 .. 3031059 + -10.8  -5.59357   ATAATGAAATTAAAA            GCCCAATT TTCG AATTGGGC             TTTTTTTGATCTAAT 100 37
        metH 3038371 .. 3038392 +  -8.7  -3.93638   TTAAGCAATAAAAAA           TCCCCTCTA TTTA TTGAGGGGA            TTTATAAAATTCATT  79 43
 IC772_13950 3040591 .. 3040605 +  -5.8  -3.87149   TTTACGATTTTAGAG               TCATTT ATT AAATGA               TTTGAATTTCCTCAA  64 28
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 IC772_13970 3044763 .. 3044783 +  -3.9   -2.9155   GGGTTAAATCAATAA            CGATTGTGC TTT GGTCAATCG            TCTCATCTTGCAAAA  46 243
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        betA 3084727 .. 3084763 + -18.4  -3.77196   CGCGTCATAAAACCG    TTAAGGGCATATTTCT TATAC AGAAATATGCCCTTAA    TTTAATAGGTACTGC 100 31
         mqo 3086898 .. 3086927 + -13.1  -5.41746   GTATAAGTAAAATAT       CAAAAGGATGAAT TTCG ATTCGTCCTTTTG        TTTTTTTAAGACCTT 100 51
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 IC772_15460 3351993 .. 3352017 +  -3.6  -4.86621   TATAAACATAAAAAA          GATTGTGATT AATAA GATCACAACC          TTTTTAATTAAACAT  66 76
         add 3355078 .. 3355100 +  -8.4  -2.88544   GATTCGAACCTGTGA           CCATCCGCTT AGA AGGCGGATGC           TCTATCCAACTGAGC  66 486
 IC772_15545 3365728 .. 3365747 +  -2.2  -4.59773   AAAGGCTGTCCTACT            TTTAAACA TGCT TGCTTAAA             TTTTTCAGGGTGAAG  61 150
 IC772_15580 3371468 .. 3371483 + -10.4  -5.48303   AGATAATAAAAAAAA              GACCGC TTTT GCGGTC               TTTTTTTCAGGTTCT 100 47
 IC772_15615 3381428 .. 3381446 +  -5.9  -2.71144   GAACAATAATACCCT             GCGCACG TAATT CCTGCGC             TAGTTGCCCAGCCTC  51 148
 IC772_15680 3395266 .. 3395306 +  -4.2  -4.50058   TAATTAAAGAGGAAA TCAAGGTATTGTATCTACT ATAT AGAA-AGGCAATACCTTGA  TTTTGATTATACATC  62 38
        gigA NONE
        gigB 3396946 .. 3396960 +  -2.8  -2.65344   TGAACAAGTATCTGA               TAAGCA AAA TGCCTA               AATTTTATTGCTAAT  40 10
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        polA 3408464 .. 3408482 +   -11  -5.69473   TAAACCAATAAAAAA             GGGCTGTG AAA TACAGCCC             TTTTTTTATCGTCTC 100 49
        trxA 3414229 .. 3414250 + -10.3  -5.45726   CGTTATAGATGAAAA           TACGCTATA CCTA TATAGCGTA            TTTTTTTCGGCTATA 100 48
         rho 3415820 .. 3415837 +  -9.9  -5.72053   TTATCATCGAGAAAA             GCTACTC TATT GAGTAGC              TTTTTTATTTGGTTG 100 50
 IC772_15780 3416499 .. 3416515 +    -8  -5.71983   AGATTAGATAAAAAA              GAGGAC TTTAT GTCCTC              TTTTTTTATGCTTAA 100 51
 IC772_15800 3421524 .. 3421568 +  -3.1  -3.89346   TGATAAAGCAACTCT GTT-ATT-CCGAAGCCGAACT CTGGT AGTTCGGCTTCACCAATTAAC TTTGCTCCTATTTTT  54 60
        nreB 3424787 .. 3424810 + -11.2  -2.79505   ATTAAATCATTTTAA          TAAAAGCATC TTCG GATGCTTTTA           CTTTAAATAAAGTCT  83 40
 IC772_15850 3430641 .. 3430691 + -19.5  -3.10732   GGAGCGCGTTTAAAT ATTTTCAAATAAAAAAGCGACGT ATTGA ACGTCGCTTTTTTATTTGAAAGG TATTAGCCTTGATCT 100 28
 IC772_15900 3438214 .. 3438259 + -16.5  -4.46514   TATTTATCTAGAAAG TAGCTTATAAAAAAGGCCGTC AATT GACGGCCTTTTTTATAGATTA TTTATTTAGATAAAT 100 23
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 IC772_15910 3440457 .. 3440473 +  -2.3  -3.63627   CTTAATTTCCCTGCA              CAAAATT CAC AATATTG              TTTGAAATATAGAGA  47 67
        lpoB 3441128 .. 3441156 +  -3.2  -2.91264   GTTAATTACTTTCTA        GCATGGCA CTTTTCTACCTGT TGCCATGC        TATATGAATAAAAAG  43 50
 IC772_15920 3442183 .. 3442212 + -13.7  -2.84807   AATTCATTGGTAAAT       AAAAAAGGCCGTC AATT GACGGCCTTTTTA        CTTAGTTTATTTAAA 100 28
 IC772_15945 3450724 .. 3450741 +  -5.6  -3.71649   AACCTGTAAAAAAGG             CATGAC TGACCT GTCATG              TTTCCAATTTACAGC  59 45
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 IC772_15955 3452468 .. 3452480 +  -2.7  -2.93207   GTAGTAGAGCAATAA                TAAAC GGA GTTTG                TATATGGGTCGTCTT  42 26
 IC772_15960 3453290 .. 3453301 +    -3  -3.35679   ATAAACTGTTACTAG                TTTC GTTT GAAA                 TTCTGAGTGAAAACC  46 37
        rsfS 3453782 .. 3453799 + -12.7  -5.99154   TTGCTTTTAAAAAAA             GCGGCTC TTTT GAGCCGC              TTTTTTTATTTACTA 100 46
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        dusA 3461767 .. 3461791 +  -7.9  -3.29829   TAAAAGAGCATCAGG          TTTAAGCGCGC TCA GCGCCTTTAAA          TTGTAAGAAAATGTG  69 21
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        secB 3496520 .. 3496534 +  -8.5  -5.88197   CTCTAAACAAAAAAA               CCGCG TAATT CGCGG               TTTTTTTATATTTAC 100 52
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        tatC 3562463 .. 3562484 +  -6.6  -5.61881   AACTTTTCTTTAAAA           GCCCAGAT ATTAAA ATTTGGGC            TTTTTATTTTTGAAC 100 50
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        ptsP 3618046 .. 3618063 +  -9.9  -5.46657   AAATACTAAAAAAAA             GGAGAGT TTTA ACTCTCC              TTTTTTATTGAACTA 100 39
        katG 3620723 .. 3620743 + -14.1  -5.36441   GTCAAAATCAAAAAA            GCCAGTTCA CAT TGAACTGGC            TTTTTTATATACAAC 100 46
        hcaR 3623464 .. 3623518 +  -8.4  -3.10977   AATTAGTTAGAAAAT CTAAATTAAAGTATAAAATAAATG CATTTAA TATTTATTTTATACTTTAATGAAG TAATTTAATTTTCGA  70 78
 IC772_16775 3624468 .. 3624482 +  -2.8  -3.71792   CGTGTAATGGTAGGG               TGTGAT TCA ATCGCG               TTCATTTTCAATTGC  50 162
 IC772_16800 3631466 .. 3631487 + -11.7  -6.25741   GCTAATTTAAACAAA           CCTAGTCAT TTCG ATGACTAGG            TTTTTTTTGTTATTT 100 59
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 IC772_16815 3633772 .. 3633792 + -11.2  -5.97979   ACCAAATTCTAAAAA            GCCTCTCA CAATT TGAGAGGC            TTTTTTTATTGTTAT 100 37
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        abeM 3638756 .. 3638786 + -14.3  -4.39002   TTAAGCCAAACCTAA       TAAAAAAGCCGAT GAAAA ATCGGCTTTTTTA       TTTTATGCAGACTTT 100 26
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 IC772_16865 3644170 .. 3644195 + -10.6  -3.38316   TGACAGATGCCTTTG         GTTACTTTGG GCAAAA CCAAAGTAAC          TTAATTAGCTACTCC  85 382
 IC772_16890 3647662 .. 3647672 +  -5.4  -2.71731   GTTGAATCGATTCAA                 TGAG TTG CTCA                 TGGTTACCACGTGGA  51 150
 IC772_16920 3653852 .. 3653871 + -13.6  -5.80364   AATTCCTTAAAAAAA            CTCCCCTC AAAT GAGGGGAG             TTTTTTTATTAGAAT 100 39
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         lnt 3657817 .. 3657840 +  -3.9  -4.17958   ATCAACGTTCCAACA          TACCTCCAA CAAGGC TTGGAGCTA           TTTGTTCAAAATATT  60 513
 IC772_16950 3658174 .. 3658192 +  -5.3  -4.53705   TTTAAAAAATGAAAA             CGTAGAT ATTGA GTCTACG             TTTTATCTAAAAATT  69 36
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 IC772_16975 3665032 .. 3665046 +   -10  -3.08173   TGCCGTTGTCCTGCT               TGCAGC TTC GCTGCA               TTCCCTAAGCTTGAT  81 117
 IC772_16980 3665994 .. 3666020 + -16.8  -4.19927   TAATTACTCACCTCA         TAAAAAGGCGGT CAA ACCGCCTTTTTA         TTTATCTATAGTTTT 100 38
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 IC772_16995 3668230 .. 3668247 + -12.7  -4.14243   TGAGCTAACGTGATG             GGCGGCA TGGA TGCCGCC              TTTTGGGCTGCGGTA 100 75
 IC772_17015 3673864 .. 3673883 + -12.2  -4.61231   CTATAAAATAAAAAA            CCCAAGCA TTTC TGCTTGGG             TTTTTGGCGCTGTAG 100 56
 IC772_17035 3684453 .. 3684474 +  -9.5  -5.46698   CCTATCGTAATTTTT           TAAGGCACG TGAC TGTGCCTTA            TTTTTTGCTTTTAAA 100 47
 IC772_17040 3685941 .. 3685973 +   -13  -4.15006   GCAGTAATATTTAAA     CAGTTAAAGG-AGAC CTTA GTCTGCCTTTAACTG      TTTTAAAATCGCTCT 100 49
 IC772_17050 3688313 .. 3688332 +    -5  -3.48027   CGGCACATAGAAAAA            CTCAACCT CACG AAGTTGAG             ATTTTATTCATTATA  56 47
        ubiE NONE
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 IC772_17070 3692883 .. 3692897 +  -4.3  -2.84504   ATTCCCTTACCAAAA               GACTT AAAGG AAGTC               TCCTCTTTAACAGCT  48 300
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 IC772_17090 3697025 .. 3697035 +  -3.2  -3.34013   GGCGCCTTTAAGTCT                 TCGA AAG TCGG                 TTGGTTGAAGCGCTC  46 7
 IC772_17095 3698621 .. 3698641 +  -5.5   -4.0683   TGCGTTTTTATTATT            CAAGTTG CGCAATA CAACTTG            TTTCTCGCTTTATTT  64 200
 IC772_17100 3701590 .. 3701611 +  -3.7  -2.66593   GTCTGGTCCTGTACC           TCATGGGGA GAAA TCATCATGA            TCAGTTTAGAATTCT  44 4
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        recN 3721336 .. 3721358 +  -2.6  -5.00616   CTATATAGATAAAAG           GGTCGTGAGA CCC TCTAGCGACA           TTTTTTGAGGGAGAA  66 105
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        ruvX 3722388 .. 3722404 +  -6.6  -5.52096   ATAAAAGTAAAAAAA              GCATGT TTTAC ACATGC              TTTTTTATTGAGTTT 100 37
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        fadA 3738429 .. 3738447 + -11.7  -5.60993   ACCAAGATAAAAAAA             TCCCCGC TCAGT GCGGGGA             TTTTTTTATCGACCA 100 46
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 IC772_17320 3743406 .. 3743419 +  -4.5  -3.34404   CGTGAGTACTTTCTT               GCGTT TAGA AGCGC                TGTTCTAATTGCTAC  52 4
 IC772_17325 3744500 .. 3744519 +  -7.8  -5.36441   TTTATCCACAAAAAA            GCCCCTGA CAGT TCAGAGGC             TTTTTTATATCGAAA 100 73
 IC772_17355 3751013 .. 3751042 + -15.3  -3.69333   AAAGCTTTCCACCAA       TAAAATAAGCGCT CAAA AGCGCTTATTTTA        TTTCAATAAATTCTA 100 23
        argH NONE
 IC772_17515 3782077 .. 3782102 + -14.9  -5.47218   TATCGTCATTGAGAA         GGCAGATCTAT ATAC ATAGATCTGCC          TTTTTTTACGTGAAA 100 58
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        thiC 3789485 .. 3789501 +  -3.7   -2.5294   AATAAATAGATTTCG              TCCTGAT CGA ATCATGA              GTATTGTCGAGCGTC  44 88
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        cpdA 3791054 .. 3791072 + -13.2  -2.52775   TATATGATGACGACC             CGATGGGA AAA TCCCATCG             ATGGTTTTCTATAAA 100 138
        dksA NONE
      gluQRS 3792596 .. 3792614 + -10.3  -4.83615   TTTATAAATAAAAAA             GCCCGAT TTGAT ATCGGGC             TTTTTATAACAACTA 100 34
        xerD 3798825 .. 3798840 +  -6.2  -3.90112   ATGATTTGAAATTCA              TCAAAC AATC GTTTGA               TTTCGTTCACAAAGG  66 55
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 IC772_17610 3802519 .. 3802537 + -10.3  -5.77632   AGGTTTTATAAGAAA             CGGCTGT TTAAT ACAGCCG             TTTTTTTATGCTTTT 100 47
 IC772_17620 3804482 .. 3804504 +  -9.3  -3.07443   TTGCGATTCGCTACG           GTCTGATTA AACCA TAATCAGAC           TTACATGCACTCTCC  74 9
 IC772_17625 3806064 .. 3806076 +  -4.9  -3.88817   TCAGAATAGAGTGCC                CAATA ATA TATTG                ATTTTTTATTAGGTT  60 12
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        mdtD 3842355 .. 3842366 +  -2.2  -3.45433   TTCCAAAAAATACAC                CTGT GTAA GCAG                 TTGCATTTTTAGCAT  46 18
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        dinB 3844366 .. 3844391 +  -4.1  -2.85378   CATGTATTTGCAACA         TGCC-AAAGCAA CCT TTACTTTAGGCA         TATCGTCCTGTGATT  47 136
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 IC772_18150 3905643 .. 3905664 + -12.3  -5.98675   CTCCAAATTTAAAAG           GCCCTAGTC GAAA GACTGGGGC            TTTTTTCTTTTTATC 100 36
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        abaI 3924762 .. 3924799 + -19.5  -3.54424   TTTTCACTCGCCAAA   TTTCAAAAGCCCTAGTC AAAA GATTAGGGCTTTTGAAA    TTTGAACGACTCAAA 100 107
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 IC772_18395 3961571 .. 3961592 + -10.9  -4.19483   TGACAAAAGTAGTCT           GGGCTAAGC ATTA GCTTAGCTC            TTTATCTCTGTGTCG 100 19
 IC772_18400 3962295 .. 3962313 + -13.2  -5.76633   CCCAAATACGAAAAA             GCCCAACA GGA TGTTGGGC             TTTTTTTATATCTGA 100 207
 IC772_18450 3972261 .. 3972273 +  -3.3  -4.26871   GTGAAATTATCAGGT                GCTTC ACG GTAGC                TTTATTGATACATTA  58 248
 IC772_18455 3973605 .. 3973618 +  -9.5  -5.76633   ACATCTATTAAAAAA               GGCGC TTCG GCGCC                TTTTTTTATGTCTCG 100 42
 IC772_18480 3981005 .. 3981030 + -14.9  -4.76312   AGAGCTCATCTCAAA         GAGATGGAACA TTAT TGTTCCATCTC          TTTTTGGCTATTCTG 100 42
 IC772_18550 NONE
 IC772_18555 3997917 .. 3997928 +    -3  -3.21064   CAAGATTGGCGCACT                CAAT TATA ATTG                 TATATTAGTTGTAAA  46 17
 IC772_18560 4000162 .. 4000179 + -11.3  -6.01187   TAAGTTTTCATAAAA             CCGGATC AAGT GATCCGG              TTTTTTTATTTAATT 100 45
 IC772_18565 4001069 .. 4001092 +   -14  -5.41143   GAAATAATAACAATC          CAGGAGAGTA ATTA TACTCTCCTG           TTTTTTTGGAAAATG 100 34
 IC772_18570 4001827 .. 4001844 +    -7  -5.83211   TAAGCTCAAAAAAAA             GCGATC ATTTAA GATCGC              TTTTTTATTTTAATG 100 47
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        apbC 3245710 .. 3245726 - -12.3  -5.64873   CCGAACAATAAAAAA              CCCGACT TAA AGTCGGG              TCGGATGAATCAAAA 100 35
 IC772_14940 3244673 .. 3244705 -  -4.2  -5.24129   CCTGTTTATAAAAAA      CAAGAAGATGCCCT TTAAG AACCCATCTTCTTG      CCTATAATTAAATTA  74 41
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         ffh 3230718 .. 3230752 - -15.3  -3.84985   GACTAAAACACAGAA     CAAAATAAAAGGCGC TCTAG GCGCCTTTTATTTTA     TGAATTTATTTCTTT 100 31
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        rhtC 3151480 .. 3151509 - -15.3  -3.41222   GCTTAAGCTTAAACA       TAAAAAAGCCTCT TTTA AGAGGCTTTTTTA        ATTATCTGGATTTAC 100 37
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 IC772_13115 2831162 .. 2831181 -  -5.7  -5.22312   ATTTATATTAAAAAA            GGAGTGA CTTTAC TCACCCC             TTTCTTATTAAATAT  83 48
 IC772_13105 2829709 .. 2829739 - -10.6  -4.42386   CCTTCATTTATAAAA       GATCATTAAAGATG TAA CGCCTTTAATGATC       TATATTTATCGCATT  95 158
 IC772_13095 2827974 .. 2828019 - -14.3  -4.11371   TAATAGTTTTTAAAA TCTCTGAGAAAGACAGACAAA TATC TTTGTCTGTCTTTCTCATTAA AACTAAGATCTAATG 100 28
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 IC772_13075 2825295 .. 2825336 - -10.5  -3.19246   CTAATTTCAATTGAA TTAAGCAGGTAAAATCAATT TTC AACTGACTCT-CCTGCTTAA ACTCAACTTTTATAA  83 109
 IC772_13025 NONE
        astA 2813021 .. 2813045 -  -2.8   -3.2241   TATTCCTCATAAAAT          GTGGTGAGTT GTAAA AACTCACTGC          CTAATTAACCGCCAT  44 26
 IC772_13015 2811183 .. 2811197 -  -7.1  -5.75599   TAAATTATAAAAAAA               GCCTC GTAAT GAGGC               TTTTTTATGGGGTTT 100 79
 IC772_13005 2808456 .. 2808469 -  -2.5  -2.52464   TTGCTCTGTAATCCA               TTTTT GCAG AAAAA                GTTACTTTCTCGATT  40 63
        mhpT 2796281 .. 2796301 -  -7.6  -3.66095   AAATCTGTAGTGAAA            GTATGAGG ATCTA CCCCATAC            TTTCGTTAAAACTTA  73 38
 IC772_12950 2795698 .. 2795716 -  -3.2  -3.16564   CTTCGATGCTAGCAA             GTTCATTT GCA AAATGAAA             TAAATTTTCTGTGTG  45 99
 IC772_12945 2794668 .. 2794688 -  -2.6  -3.84246   CGTCTAATGATGAAA            CTTTCACT ATTGA AGTTAAAG            GTACGGGGCGCCGAA  53 311
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 IC772_12925 2789661 .. 2789691 - -10.7  -4.00124   CAGTTGATAACTAAA       GTTAAAACATTGC TGCTC ACAATGTTTTAAC       TTGTCTTTAATTTAA  91 54
 IC772_12920 2787231 .. 2787248 -  -8.5  -5.60993   CGTTTTATAAAAAAA             GCCTATT TAAA AATAGGC              TTTTTTATTTCGCTT 100 47
 IC772_12895 2780514 .. 2780534 -  -7.5  -4.02571   CAAGCGACTAAACAA            GCCAAGCTC AAA AAGCTAGGC            AAACTCCCCTCCACG  73 500
 IC772_12870 2775407 .. 2775446 - -14.6  -2.60688   CAACCATGCCATAAT  CAACAAAACACCTGCATA GTTA TATGCAGGTGTTTTTTTA   TATATTGAAATTAAA 100 43
 IC772_12860 2773153 .. 2773168 -  -6.2   -2.9326   AGAATCATAGTAAAT              CCTAAA AAAT TTTAGG               GAGACGACAGTAATT  58 68
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 IC772_12850 2770702 .. 2770727 -  -9.1  -5.24796   CCTAGATAATAAAAA         GCCCATTTCAA TCAA TCAAAATGGGC          TTTTATAAATTAATT  95 39
 IC772_12845 2770008 .. 2770028 - -10.5  -5.56264   TTGAAACACAAAAAA            GCTGCATAA CCC CTATGCAGC            TTTTTTACTATACGT 100 142
 IC772_12840 2768415 .. 2768432 - -11.3  -5.65927   CATCTAAAGAAAAAA             GGGTGTG GTAA CACACCC              TTCGATAACTTCCTT 100 94
 IC772_12835 2767365 .. 2767381 -  -9.4  -5.47399   TCAATGTTAAAAAAA              CCGCCT ATCAA AGGCGG              TTTTTTTATTTAGAT 100 35
 IC772_12825 2766130 .. 2766155 -  -5.5  -5.63103   CTCCAATGAAAAAAA         GAGGCTGA-TCA ATA TGAATCAGCCTT         CTTTAAAACTTAAAT  87 47
        rnhB 2765036 .. 2765073 - -12.9  -5.03713   AATAATCAAAGAAAA   CACAGAGCCGCTATA GTTTTTTT TATAGCGGCTCTGTT    ATATTAAACGGAAAG 100 495
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 IC772_12740 2755465 .. 2755485 -  -8.3   -3.3344   ATTGAATGCCTAGAA            GCCTGATCC TCG AAATCAGGC            TTTTTTTATTTCTAA  71 20
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 IC772_12725 2753901 .. 2753916 -    -4  -3.08046   GCCCCACGCTAAAAT              CTCGAA TTTA TTCAAG               CCGCCTCTCCTTTAC  48 21
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 IC772_12710 2753169 .. 2753193 -  -2.1  -3.18582   TACGGTATTCAGCAA          TGCTGACTGAT GAC ATCAAGCACCA          CCTTTCAGCAAATTT  44 16
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 IC772_12700 2751926 .. 2751943 -  -6.9  -5.86976   GCACAAAATAAAAAA             GCCCACC GATT GGCGAGC              TCTTAAATTCATTCT 100 102
 IC772_12695 2751593 .. 2751622 -  -9.4  -5.17507   AAAATTTAATAAAAA       GCCCCGCCA-ATA ATCGA TATTTAGCGGGGC       CGTTTGTGCCGTAAT 100 61
 IC772_12690 2751010 .. 2751024 -  -4.2  -5.52023   ACTAGCAATAAAAAA               CCGC TTTAAGG GCGG               TTCATCTAAAATTCA  81 48
 IC772_12685 2750156 .. 2750174 - -13.2   -4.7629   TCATCAATTTAAAAA             GCTTGCCT AGT AGGCAAGC             TCCCCCTTTTTTGAT 100 453
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 IC772_12670 2748335 .. 2748348 -  -8.1  -5.46629   AACAGGTCAAAAAAA               GAGCC TTAA GGCTC                AGTTGATTACGCAGT 100 24
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 IC772_12645 2743474 .. 2743489 -  -8.2   -5.4833   GCAGGCAATAAAAAA              GCGCCC TTTA GGACGC               TTCATTTCTATAAAT 100 43
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 IC772_12635 2741606 .. 2741623 - -11.3  -4.74103   TCTTTAATGTAAAAA             GAGGGCT TAAT AGCCCTC              TTATAGTGAGATGTT 100 47
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 IC772_12620 2740116 .. 2740137 -  -9.5  -3.36327   CGACTCTACTCATAA           TATCCCCCT GCTC AGAGGGATA            TTAGATCAAGTATTT  78 39
 IC772_12615 2739451 .. 2739464 -  -8.1   -5.4505   TGCTCCAATAAAAAA               CCCAC CGAA GTGGG                CTTTGAATTATTCAA 100 33
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 IC772_12585 2736821 .. 2736836 - -10.4  -5.49809   TAAACTCCAAAAAAA              GCAGCC CTAA GGCTGC               TATCAGATTAATATT 100 40
 IC772_12580 2735971 .. 2736009 -  -6.1   -2.9062   TTGATGAGATAATTA   TAACCCTAGGGTTGTTT TCAGT AAATACCTCTAGGGTTA   TTTTTTAGTAGAATG  58 286
 IC772_12570 2735256 .. 2735273 - -11.3  -3.65294   TGTCACATAAAGCAA             GACCACC CGAA GGTGGTC              TTTTAAATCAGGCTA  93 38
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 IC772_12550 2733667 .. 2733680 -  -9.5   -5.4833   CTAGGCAATAAAAAA               CCCGC TTTC GCGGG                TTAATTGTTTAATTT 100 44
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 IC772_12480 2718399 .. 2718414 -  -6.8  -4.41348   CTTTTCTTAAATAAA              GCCCTC CTCA AAGGGC               TTTCACACAGATTCC  78 108
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 IC772_12425 2705670 .. 2705690 -  -8.3  -3.76413   TGTTAAAATTGGAAA            CCATCAGTA AAA TACTGTTGG            CGTTTAAATCTTTTC  75 29
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 IC772_12410 2702920 .. 2702952 - -11.6  -4.07568   CCCCGCTCCTTAAAA     TA-AAAAACGGATGC TTAA GCATCCGTTTTTATA      TGAACTGAAAGTTTT 100 46
 IC772_12395 2700094 .. 2700111 -  -6.3  -5.44721   ATTATCTTAAAAAAA             GCCAACA TCAC TGTTAGC              TTTTCTTTTTCAGGC  88 53
 IC772_12390 2699270 .. 2699283 -  -3.9  -4.02534   AGGGAAATTTACAAA               TTCTT TTGG AAGAA                AACGCTTTTTTAATG  59 363
 IC772_12380 2694520 .. 2694545 - -15.5  -4.13748   TTTAAAAAGATTAAA         GGCAGTCCCTC ACTT GAGAGACTGCC          TCATCAGATAGCTAA 100 41
        clpB 2691614 .. 2691635 - -10.3  -5.88197   TTAAATATAAAAAAA           GAGAATATG TTTC CATATTCTC            TTTTCGGTTTTAGCA 100 49
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 IC772_12355 2687590 .. 2687619 -  -9.5  -3.89348   AACTTTACAGAATAA       GACCCTAAATT GACCAGAA AATTTAGGGTC        GCGCAAAGATTACCT  83 35
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 IC772_12345 2685182 .. 2685206 - -14.4  -4.43844   CTAGTATTTACAAAA          CAGGCAGATC ACAAA GATCTGCCTG          TTTATATTTTGAATA 100 60
 IC772_12340 2683539 .. 2683557 - -11.8    -5.252   GATCTCTATAAAAAA             GCTTCTCA AAA TGAGAAGC             TTTTTTCAAATCAGA 100 77
 IC772_12335 2682523 .. 2682540 -  -2.7   -3.1372   GATTCTTGACCAACA             GCTTG CAAAAACT CAAGC              CTATGTTGCAGGAAC  44 212
 IC772_12320 2678507 .. 2678523 -  -2.3  -4.02132   GCGTAAATTTATAAA              TTAGTTA CAC TATCTAA              TATTCTTGAAAAAGT  52 117
 IC772_12315 2677753 .. 2677771 - -10.3  -5.27779   TCTAATATTAAAAAA             GCCCCTA TTGAT TAGGGGC             TTTTTTAATACACTT 100 49
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 IC772_12295 2674319 .. 2674346 -  -4.1  -4.26344   ATATTTCGACCAAAA        CCTTGCAAC-GC TATTT GCAGCAGCAAGG        CGTTGAATTCCATGC  61 222
 IC772_12285 2672163 .. 2672180 - -11.3  -4.98255   GCTTAATTATAAAAA             TCAGCCC GCTT GGGCTGA              TCTGTTTTATATCTT 100 48
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 IC772_12155 2644342 .. 2644356 - -11.4  -5.17353   ACAGGCATTAAAAAA               GCCCGT TTC ACGGGC               TTTTCTGCAACGGTG 100 253
 IC772_12140 2641823 .. 2641833 -  -2.6  -2.69725   CCTGAAAAATAAATT                 TTTA ATA TAAA                 TAATCGGTTAAGTTT  40 39
 IC772_12135 2641355 .. 2641386 - -10.2    -5.626   GATTTCATAAAAAAA      GCCCATTCCTAC TTCTCATT GAAGGAATGGGC       TTAGTGAATACCACT 100 220
 IC772_12120 2639520 .. 2639531 -  -4.4  -4.30576   TTCGTATCATGAAAA                GTGA TACA TCAC                 AGAGCATAATATTTT  62 41
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 IC772_12100 2636695 .. 2636753 -  -6.5  -6.01187   AACCAAACAAAAAAA GACCAACTTG-TTAAG-TGCTTTACAGC CCTTTC GCT-TAAAACAGCTTTAGCAAGTTGGTC TTTTTATAAGCTCAC 100 29
 IC772_12090 2635209 .. 2635228 -  -2.1  -5.47218   GTTCATGTAAAAAAA            CCCAC AAAGGAAGAA GTGGG             TTTTTTAACTAAATC  71 112
 IC772_12085 2634682 .. 2634708 -  -5.4  -4.13728   CATAGACCGTTAAAA         CTATAAAAATTT AAT AAACTTTTATAA         ATATTAAGTTTAATT  64 218
 IC772_12080 2633376 .. 2633390 -  -2.9  -3.04715   TACCTCTCTGAAAAT               TTAAG AAAAA CTTAA               TTAATGAGTAAATTA  45 426
 IC772_12070 2632717 .. 2632733 - -10.9  -5.67283   AATTGAAATAAAAAA              CCTACTC AAT GAGTAGG              TTCGATTTACATGTA 100 44
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 IC772_12055 2629755 .. 2629777 -  -8.5  -3.30554   TCAATGAATGACTAA          GCCCTTAGCT TTCG AGC-AAGGGC           TTTTTTACGCCTAAA  74 60
 IC772_12045 2627822 .. 2627847 -  -9.1  -4.87318   TCCAAAATTCAAAAA         CCACTTAATTC GAAA GAATTAGGTGG          TTTTTTTATTAGCTA  93 118
 IC772_12040 2626987 .. 2627009 -  -9.2  -3.37568   GAGATATAAAAATTA           TAAAGGCGAT TGA AGCGCCTTTA           TTTCAACGAATTTAA  78 23
 IC772_12035 2626176 .. 2626201 -  -9.1  -4.87318   TCCAAAATTTAAAAA         CCACTTAATTC GAAA GAATTAGGTGG          TTTTTTTATTGGCTA  93 163
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 IC772_12015 2622819 .. 2622834 -    -4  -4.73633   CAACAATATATAAAA              CTC-TGG TAT CCATGAG              CAGGAATAGCCTACC  65 60
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 IC772_11900 2597810 .. 2597834 - -10.1  -2.92562   TAAAAGACTAACAAG          TTTACTACCGG CCT CTGGTAGTAAA          ACCTCTAATCCAGGA  79 363
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        dmeF 2582283 .. 2582337 -  -7.2  -4.44667   CGGGCGAATAAGAAA CCATTGGCACGACAACGCTCCTCGCC CGACT AGCAAAGTACGTTG-CG-GCCAAAGG TCTCGCCTAGCTCAC  79 249
 IC772_11855 2581222 .. 2581244 -   -12  -4.03137   ATACAACGAATGAAA           CGCGCTGG CACATGT CCAGCGCG           TTAATATTTATCAGA 100 36
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 IC772_11810 2572114 .. 2572142 -  -7.7   -3.0003   AAATAATGAATTAGA        TCAATTTCATACA AGT TGTATAAAATTAA        ATCGCGAACTGAATT  67 22
 IC772_11805 2569750 .. 2569783 -  -4.7   -4.9725   ACCTCCATAGAAAAA     TACAGCGATTAAGACT AAA AG-CTAAATCTCTGTA     TTTTTTACTCATTCA  75 54
 IC772_11800 2568242 .. 2568277 -  -9.2  -2.71119   ATTTACTTATATAAT    CAGCCTACTGAA GGAATCTTATGT TTCAGTAGGCTG     GTGAAAACCATCAAA  72 58
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        metC 2503153 .. 2503187 -    -8  -3.71148   TAAAACTTAGCTAAA    TGATGGCAAAGCCCT TTTAAT AGGGCTTT-CCTTCA     TAAAATTAGATGATC  75 197
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        pobA 2371315 .. 2371330 -  -5.4  -5.36441   TTCTTATATAAAAAA              GAGCAT TTTC ATGCCC               TTTTTATTTTTATTT  84 46
 IC772_11040 2367927 .. 2367942 -  -7.6  -3.36785   TGACAGTTTAATTAA              TCTGGT TTAA ACCAGA               TTTCATTTTTATGCT  69 34
 IC772_11035 2366591 .. 2366608 -  -3.3  -4.60255   AGAAGGTCCCAAAAA             GCTCACG AACT CGCCAGC              TTTCAGGTCTAAATT  63 239
 IC772_11025 2363898 .. 2363911 -  -2.4  -2.76404   TTTAGCTAAAACTTA               GTGA TCGCTT TCAC                GCCATTGCTGACTTC  40 9
 IC772_11020 2362615 .. 2362630 -  -7.6  -3.37895   TTCAATATACATCAA              TCTGGT TTAA ACCAGA               TGACAAACTAGTAAA  71 33
        phnW 2361412 .. 2361422 -  -2.6  -3.46068   CCTTTAATTCAAATA                 TTTT AAT AAAA                 ACTATGCTGTTAAAG  46 27
 IC772_11010 2360534 .. 2360549 -  -6.8  -5.66684   TAACTTATAAAAAAA              CCCGCT TCAT AGCAGG               TTCTTTTTACAAAAC 100 48
 IC772_11005 2359481 .. 2359498 -  -9.9  -5.79595   TCTCAAAATAAAAAA             GTCATCC TTAG GGATGAC              TTTTTTATTAGCTCA 100 46
 IC772_10995 2354721 .. 2354740 -  -4.3  -3.72893   TATCTCTGTATCAAA            TGCCTCT CTCAAC AGAAGCA             TTTTCTACCCTATTT  56 102
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 IC772_10950 2343155 .. 2343177 -  -3.6  -3.80772   TAAAGAAAAAACAGA           TTATTCAA GGTCTTG TTGAATAA           ATTAAAAGTCATAAC  54 27
 IC772_10945 2341686 .. 2341710 - -10.8  -2.91429   TAAAATTTCCAGATA          CAGGTAGGAA TGATT TCCCTACCTG          TATAAATATGTATTA  83 38
 IC772_10935 2339088 .. 2339098 -  -3.2  -3.14527   GAACTTCTATCAACA                 TCAC TTA GCGA                 TAACAACAACCTATG  45 345
 IC772_10930 2337978 .. 2337996 -  -9.6  -5.97979   ATAACAATAAAAAAA             GCCCACTT AAT AAGTAGGC             TTTGTTAAATAAAAC 100 44
 IC772_10905 2333957 .. 2333967 -    -4  -3.11222   GTTGAAGTTGAAAAC                 GTTT ATC AAAC                 TAGTTTTTAAACGTA  48 25
        katE 2331735 .. 2331760 - -14.1  -4.63928   ACATGATTTGAAAAA         GCCCTGAAAGC TTCA ACTTTCAGGGC          TTCTTTATTTAAGCC 100 34
 IC772_10885 2328405 .. 2328441 - -16.9  -3.32317   AGTTTATAAAAATCA    TAAAAATAAAGGAGGCA TAA TGCCTCCTTTATTCTCA    AAAACTGTCTGCTTA 100 38
        umuD 2327202 .. 2327230 -  -8.2   -4.7497   GTCATTCAGCAAAAA        GTTACTGACTCA CTTTT CGGGTCAGTAAC        TTGAATAGTAAAATA  90 51
 IC772_10865 2325924 .. 2325939 -  -7.6  -5.72207   TTGAAACTAAAAAAA              GAAGCT TTAA AGCTTC               TTTTTTTATATCTGA 100 47
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 IC772_10850 2319522 .. 2319532 -    -4  -3.01712   TCTTTTTGTTGAATA                 TTCA CAA TGAA                 TTCCTCGTATTACAA  48 163
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 IC772_10835 2318229 .. 2318241 -  -6.3   -4.5081   AAATACTGAAACAAA                TGCAA TTT TTGCA                GTTGCCCAAAGTCCC  74 80
 IC772_10825 2316899 .. 2316925 -  -2.4  -3.97674   TCATGATTCAAATAA         TAAAAATTTAGT ACG ACAAAATATTTA         AGAAGGCTTTCGCTC  53 6
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