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 CDL62_00135   43883 ..   43903 +  -4.1     -2.89   ATATGGAATTTTCAG            GATGTAA GAATAAA TTACATC            TAATTCTCTAAACGT  47 19
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 CDL62_00145   46760 ..   46783 +  -9.7  -4.45077   TTTTTAAACTATTAA          GAGAGAACT CATTTC AGTTCTCTC           TTTTCATAATTTTTA  91 90
 CDL62_00150   47668 ..   47686 + -11.8  -6.22802   ATAATTATTAAAAAA             GCTGTCAA AAA TTGACAGC             TTTTTTTTTGTAAAA 100 53
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 CDL62_00165   51270 ..   51295 + -16.3  -5.03314   ACTTTAAAGCAAAAA         GAAAGCCGGTT TTTC AACCGGCTTTC          TTTTTTGGACATAAA 100 55
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 CDL62_00305   90522 ..   90554 +  -2.1  -3.00525   CTCATTTTTTTAGCA      TATTATAAGGAATTA TGA TAAATCCTCAAAATA      TCTGATTTCGAAAAA  42 82
 CDL62_00310   91837 ..   91855 +  -6.1  -2.95388   CAGGCAAGTTGAGAC             CTCATTT CGAAA AAATGAG             TCTCTCAATTACATG  58 61
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 CDL62_00320   93177 ..   93189 +  -5.5  -3.58184   ATTAAGAGTTATGAT                GCGGA TAC TTCGC                TTATGGTTCTGCTAT  59 95
 CDL62_00325   93420 ..   93445 + -14.9  -5.86976   CACATATATTCAAAA         CGCTGTAAATC GATT GATTTACAGCG          TTTTTTGTTTTCTGG 100 51
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 CDL62_00420  118008 ..  118034 + -13.9  -4.34402   ATAACTAAAGATAAA         GGCGAAATTCT AATAA AGAATTTCGCC         TTTTGGTATAACGCA 100 62
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 CDL62_00440  125621 ..  125657 + -15.5  -2.50443   CGAAAAAACAATGTA    TAAAAACAGAGGTTTAT CTC ATAAACCTCTGTTTTAA    ATTAATAGCATATGG 100 47
 CDL62_00445  127356 ..  127376 +    -9  -4.98522   TATTTTGCGCAAAAA            GAGCCCTT TAAAC GAGGGCTC            TTTTTATCTGACATT  95 60
 CDL62_00450  128739 ..  128763 + -13.7  -5.33848   GCATATTGAATCTAA          GGAGAACTTCG TTG TGAAGTTCTCC          TTTTTTAATTCTACT 100 53
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        nspC  130877 ..  130890 +  -3.9  -3.61654   AAAAGAATGGGGTGA               TGATT AATT AATCA                TTTGCAATACCTCTC  53 26
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 CDL62_00630  178879 ..  178906 + -14.4  -2.72829   AGACAAATGTGTATA        TAAAAAGTGTGG TTTC CCACACTTTTTA         ATTTAAGCCAATGTC 100 91
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 CDL62_00665  189978 ..  189997 + -10.8  -5.72622   AATGTAACAAAAAAA            CCACGAAA CTAT TTTCGTGG             TTTTTTATTTCTCAA 100 59
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 CDL62_00705  208579 ..  208592 +  -5.3  -3.05596   GAAGCGCATAGAATT               GATCT CCAG AGATC                TTAAATACCCGGCTA  51 228
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 CDL62_01385  379103 ..  379119 +  -9.5  -4.49556   TGTAGCATAGACGGT              TATGACC AAC GGTCATA              TTTCTTTGATAAAAA  91 31
 CDL62_01390  379452 ..  379482 + -13.5  -5.88197   TGAACAATGAAAAAA      GGTTGGT-AACTGC TTTA GCAGTTAACCAACC       TTTTTTTATATTTGA 100 56
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         zwf NONE
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 CDL62_01650  442160 ..  442170 +  -3.2   -3.2256   CCGTGGGCGCAAGTT                 TGAC TAC GTCG                 GTTTTCAATTCTTTG  46 81
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 CDL62_07085 1865488 .. 1865526 + -10.3  -2.72511   ATAATTCACCCCTAA   ATCCCCCAAGGGGGA CTTTAAGCC TCCCACTTGGGGGAG   GTTTGGAGGGGTGAA  80 108
        pdxH 1868392 .. 1868406 +    -5  -3.35775   TGATGTGAGTGGAAA               GCAGAA TGG TTTTGC               TCTTTCCCAGATCGT  54 387
        ispG 1870925 .. 1870935 +  -2.6  -3.45023   CCGAAAATTAGCTCC                 TTTT ATC AAAA                 TTATAATGCTGATAA  46 30
 CDL62_07110 1871984 .. 1872007 + -11.2  -2.72049   CTATCTGAGGTGTGC          CGGTTTTATT CATG AATAAAACCG           TGCTTGAGACATCTA  82 174
 CDL62_07165 1884147 .. 1884163 +  -8.1  -2.82516   AGAAACGCGCCATCA              TATTGAC TTT GTCAATA              TGTGCTCATAACGGA  68 74
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        purE 2251179 .. 2251202 +    -9  -5.26316   TAATTTAATCTTTTG          TTATGACGTA TTTT TGCGTCATAA           TTTTTTATGACGTAA  95 79
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 CDL62_08815 2253434 .. 2253444 +  -8.2  -2.56728   AGTGGATTTTATGCT                 GCCC GAA GGGC                 GTTGCTGTCGATGAT  67 1
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        ccsB 2271587 .. 2271617 + -11.5  -2.66733   TTATGGCAAGAATTA       GAATGAAAAAAAA CTTGA TTTTTTTTCATTC       TGCTGTAACTTCACA  86 193
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        trpS 2316356 .. 2316368 +  -7.7  -3.34517   CAGGTATTATTGTCC                CGGAT TTC ATCCG                TATTTCAGAAGAGCT  66 102
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 CDL62_09475 2394089 .. 2394101 +    -2  -3.27022   GCACGAATCACTACA                TTCA GGGTA TGAA                TTACTGTAAAATCAA  44 74
 CDL62_09480 2396841 .. 2396851 +  -3.2  -3.22584   TAGATAAAATCTAAA                 CAGC AAG GTTG                 TCTGTGTGTTTTTGG  46 163
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 CDL62_09505 2403605 .. 2403615 +  -2.6  -2.89117   AGACCAACGCAAAAG                 TATA ACA TATA                 ATTTACTGCTATGAT  42 87
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 CDL62_09560 2416639 .. 2416656 +  -2.7  -3.14962   ACTCTAATAATTCCT             CAATTAG CAGG CAAATTG              TAATTTTGCTGGTAA  43 113
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 CDL62_09570 2418632 .. 2418667 +    -9  -3.57462   TCACCCCTCCAAACC    TCCCCCAAGTGGGA GGTTTAAG TCGCCCTTGGGGGA     TTTAGGGGTAAAATA  80 71
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 CDL62_09590 2422650 .. 2422674 +  -5.1  -2.88758   TAATAGTTCGTTAAG          CTTTTGTATCT GTC AGATATACAAG          TATATGCAGAATTGT  51 98
 CDL62_09595 2423996 .. 2424025 +  -5.1  -4.30844   ATAAACAGAATTTAT       TAAGTAGAATTGT CAAG ACAATTCTACACA        TTTTGATAATACGCT  64 325
 CDL62_09600 2427315 .. 2427353 + -19.1  -3.66666   TTTAAATAAGCAAAA   CAACAACGCCCCAATAA TATTT TTATTGGGGCGTTGCTG   TTTAAAGATTTTGCC 100 49
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 CDL62_09615 2430592 .. 2430614 +  -8.4  -5.07486   CTCTTTTGTTCCGTT           GACGCGAGTT TGC AACTCGTGCC           TTTTTGTTAGAACTG  91 52
 CDL62_09620 2431997 .. 2432037 +  -2.6  -3.25595   ATTGATTATTAGCAA  TATAAATGGGGAGCTAAT TTGTT GTTAGCTCCCTATACAAA  TCATTTTAATTTTAA  44 69
 CDL62_09625 2433466 .. 2433483 +  -4.1  -3.59738   GAAATGCTTAACTCT             CAACTCA ACAT TGAGATG              TTTGAAACTCTAGTA  53 289
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 CDL62_09640 2436429 .. 2436446 +  -6.3  -3.20858   AAAGTTCTTAACTCT             CAACTCA ACAT TGGGTTG              TTCGTGACTCTAGTA  61 241
 CDL62_09645 2436997 .. 2437007 +    -4  -2.89607   TAAGAAGTCTGTTGA                 TACA TGT TGTA                 TGGTTCATCTTTTAA  47 107
 CDL62_09650 2438518 .. 2438528 +  -5.4   -4.4891   GATGTTTTCGGTTTC                 GAGA GGG TCTC                 TTTTATAGTCGTACA  73 253
 CDL62_09665 2443535 .. 2443546 +  -4.4  -3.57144   TACTTCACATTAACT                GCAA TGAA TTGC                 TTTAAGGGTAAAAAA  56 316
        topA 2455591 .. 2455601 +    -4  -2.52635   GCTGCAAAGAAATAG                 GTTT TTA AAAC                 ATTAATCGTGGAGAT  45 26
 CDL62_09715 2456855 .. 2456871 +  -4.5  -3.53012   AAAATAAAACAGAGG              TTTAAGT GCA ACTTAGA              TTTGAAAAAGCCGGA  54 114
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 CDL62_09735 2461863 .. 2461874 +    -3  -3.16177   CTTAAGTTCCATTAC                TCTA ACGA TAGA                 TTAACTATATAAGAT  45 10
 CDL62_09740 2462827 .. 2462848 + -14.5    -5.626   TGAAAAAATAATAAG           GGGGTTGTC ATGC GACAACCCC            TTTTTTTATAAACTG 100 74
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 CDL62_09755 2465881 .. 2465891 +  -6.8  -4.64676   CTATCAAAGCCTGAG                 GCTC TAT GAGC                 TTTTATTAAAAATCA  79 83
 CDL62_09765 2469694 .. 2469709 +  -3.9  -3.19874   ATTAAACGAAACTAA              CTGCC TGGTTT GGCGG               TATTGCATCTTTATT  49 82
 CDL62_09770 2470044 .. 2470055 +  -4.4  -4.46212   AATAGAAAGATAAAA                TTGC AAAG GCAA                 TTTTATGATAAAACA  65 144
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         rrf 2473191 .. 2473212 + -10.9   -5.7946   ACCTTAGATAAAGAA           GCCGATTCA GCAA TGAGTCGGC            TTTTTTTGTTGAGAC 100 38
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 CDL62_09795 2482335 .. 2482356 +  -8.9  -3.64465   TTGCTGAGTTCTTTG           GCAATTTTT CGTA AAAAATTGC            GTTTTTGATTTTGGC  80 47
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 CDL62_09815 2491697 .. 2491711 +  -6.4  -2.80479   ATTTATAAATTAATC               TGTCCT TTC AGGACG               TAAATTTTCATTGCG  58 438
 CDL62_09820 2493013 .. 2493025 +  -2.6  -2.72227   TCAATCGCGTCGGCC                CCGC AAAAG GTGG                TCATTGGGAGGTGTT  40 57
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 CDL62_09845 2498831 .. 2498847 +    -3  -4.70583   TACTTGATCATTTTT              CGCAAT TACAT ATTGTG              TTTTGTATTGGTAAA  62 45
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 CDL62_09870 2505188 .. 2505204 + -10.9  -4.81852   CTAATATATATCGAA              TATCGCG ATA CGCGATA              TTTTCTTCATTATAA 100 296
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         fkp 2544739 .. 2544773 + -12.3  -4.14013   ATAATTTTCTCCGTA    GCTCCCAGCATCCTAT TTAC ATAGGATGC-GGCAGC     TTTTCCAGAATTTTC 100 53
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        cysQ 2583854 .. 2583875 + -10.2  -4.13282   CAATGAATTAAAAAA           GGATTGCC CATGAA GGCAATCC            TTTTAAAAATATGCT  90 52
        folB 2585917 .. 2585929 +  -2.7  -3.35522   TGGCTGGATAGATTT                TATGA TTT TCGTA                TATTTGACAGAATTA  44 122
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        folE 2689261 .. 2689271 +    -4  -4.26589   CTCCAAATAAAGGGC                 TACT TAT AGTA                 TTTTCCCTCTGTAGT  61 147
 CDL62_10570 2693233 .. 2693256 +   -14   -3.6993   ACAATAACTTATTTG          GGGTAAAGCA TTGC TGCTTTACCC           TCTTTTCCATCAATA 100 40
 CDL62_10615 2703955 .. 2703970 +  -3.3  -4.01992   TGCTTTTATAATTTG              TCCAA CCATTT TTGGA               TTCTCTTTTAATCTT  56 74
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 CDL62_11745 3023158 .. 3023181 + -16.8  -3.29829   ATATGGAGCATGAAA          CGAGTCCCGA GGCT TCGGGACTCG           TTCTCCCGAAGTCTC 100 301
 CDL62_11750 3025681 .. 3025699 +    -3  -3.33095   ATAAGATTATTGGTA             TAGGCGCT TAG ACCGCCCA             ATATTTTTTTTAATG  46 47
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 CDL62_11765 3031389 .. 3031401 +  -2.7  -3.58269   TTCGTCACTCGGTGA                GTAAA GTG TTTGC                TTTAAAAGTGAATTA  48 41
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 CDL62_11775 3037979 .. 3038005 + -12.4  -4.87318   TTTTTAATCAATAGA         TCTAATCCCGTT AAT ATCGGGATTAGA         TTTTTAGATTTTAGA 100 183
 CDL62_11780 3038724 .. 3038738 +  -4.2  -4.56093   TTCACAGAAACAGGG               GCTGTC TTC GGTAGC               TTTTGTAATTGACTT  65 44
 CDL62_11785 3039298 .. 3039322 + -13.1  -5.69023   GTTTGAGTTTAGTAA          TAAAAGAGACT TAT AGTCTCTTTTA          TTTTTTTGATCTTTT 100 86
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 CDL62_11795 3048346 .. 3048369 +   -14  -5.14965   AAAAAATAACGAATA          GGGATTGAGT TTTA ACTCAATCCC           TTTTTTGATAAAAGT 100 120
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        raiA 3072394 .. 3072418 +  -9.3  -3.06162   GTAAGTTATACAATA          GGCTGGTTATC AAA GGTGATCAGCC          TATTGGAATGAAATA  74 134
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         tuf 3074034 .. 3074067 + -11.9  -3.55071   GTATATAGAACACAA     TGGTTGAAAGCGGCA TAAT TGTTGTTTTCAACCA      TTTACACGGGTGTAG  91 48
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        trpB 3236928 .. 3236963 +   -15  -3.78022   CTGACTAATAATACA    T-TTCCGGCTGTATCAT TTT ATGATGCAGCCGGAATA    TTTAATACATCTGCA 100 52
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 CDL62_12695 3303885 .. 3303895 +  -2.6  -2.84634   TGATTGGGATTTTGT                 TATT CTT AATA                 TCTAATAGTCTAAAA  42 80
 CDL62_12700 3306200 .. 3306252 + -18.1  -5.00616   ACACATAAGTTTAAT GTTCGAAGTTTTAAGTTCAAAGTTG AGT CAACCTTGAACCTAAAACTTCAAAC TTTTTTAAACCACAA 100 60
 CDL62_12705 3307190 .. 3307224 + -14.4  -5.18726   ATCTAATTTTACACA     TCGGAAAGTCATCCCT GAA AGGGACGGTTTTCCGA     TTTTTATTGTCCAAA 100 155
 CDL62_12710 3308686 .. 3308706 +  -7.6   -5.5112   ATTGAAGAATCAGAA            GGGGCATA CGTGT TATGCCTC            TTTTTTATTAATAAA 100 167
 CDL62_12720 3312282 .. 3312318 + -11.7  -4.68593   ATATAAGAGTTAAGA    CAATAGAGGGCTTCACG ATA TGTAAGGTCCTCTATTG    TTTTTAAATGGTAAC 100 73
 CDL62_12725 3322713 .. 3322749 + -17.5  -4.38171   AAGCGCAGTGATAAA    TTATTGAGGGCTTCACT TTT AGTGAAGCCCTCAATTG    TTTTAATATCATATC 100 85
 CDL62_12730 3333263 .. 3333291 + -10.4  -4.15066   TAAGAGTTAAAACAA        TAGAGGGCTTCA CCATA TGGAGTCCTCTA        TTTAGTTTATGGGTG  91 76
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 CDL62_12740 3334468 .. 3334494 +  -3.6  -3.06265   GATTGACAATATGCA         CACGAAGTTCAC ATA GTGGCCATTGTG         TCTCCTTTGTGCCCT  46 254
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 CDL62_12775 3343809 .. 3343825 +  -2.1  -2.62184   ATAGGGTGATATTAG              CAACCAG AGC CAGGTAG              TGATATGGAAGAGCA  40 9
 CDL62_12780 3344792 .. 3344813 + -15.9  -4.28254   AAGTTATTTTTAAAA           GGGCTTCGC AACC GCGAAGCCC            TTTTGCATATTACAA 100 55
 CDL62_12785 3345353 .. 3345381 + -14.1  -3.61103   AGGGTAAAAAGAATA        TTTGGGATTCAAT CTC ATTGAGTCCCAAA        TTTCAACTAAAGTTG 100 110
 CDL62_12790 3349569 .. 3349589 + -11.9  -5.48063   TAAAAGACGAAAAAA            GACCCGTAT CCC ATGCGGGTC            TTTTTTGTGTTCAAT 100 50
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 CDL62_12815 3356206 .. 3356217 +  -2.2  -3.21218   GTTGAGTTTGGTGAT                TCTC CTTC GGGA                 TTAGTGGTGAGCGAT  44 82
 CDL62_12820 3356999 .. 3357029 +  -7.7  -2.87622   TGTAGGGTGGAATTG       AGTTTAAAGTGCA TTTTT TGCGCTTTAAACG       ATTATTATACCGCTC  66 36
 CDL62_12825 3358325 .. 3358341 +  -3.8  -2.87243   AAGAAATGTTTCAAT              TAAACT TAAAC AGTTTA              TAATTGTCCTCATAA  47 87
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 CDL62_12845 3363607 .. 3363621 +  -5.8  -2.51223   GAGCAATAAATTATA               GAATTT TTA AAATTC               ATATATATTATTGGA  54 255
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 CDL62_12855 3363848 .. 3363873 +   -12  -4.75063   AAATAAAAACAAAAA         CCGCATGAAA CATTGA TTTCATGCGG          TTTTTGACGTTTTAT 100 61
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 CDL62_12885 3367687 .. 3367704 +  -4.9  -3.23452   ACAGGAGATGGGGAG             GTTGATT AATA AATCGAC              TTCAGTTGTGAAGAT  54 17
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 CDL62_12895 3368881 .. 3368907 + -13.8  -5.88565   CTCTAAAGTCTACAG         CCGGCATCAGGT TTA ATCTGATGTCGG         TTTTTTTCTTCTCAA 100 430
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 CDL62_12905 3374422 .. 3374433 +  -3.6  -3.80461   TGGGGGAGGCTTAAA                GTCC CACC GGGC                 TTTAGTGATGAATTA  54 141
 CDL62_12910 3375508 .. 3375544 +  -3.1  -3.16564   ATAATAATCAGCTGT    TTTATGTAATTCAGATT ATA ATTCTGAATTGCAAAAC    TCTTACATTCAATTG  45 180
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 CDL62_12920 3377756 .. 3377782 +  -7.4  -3.54784   TTATAATCCCGATAA         CTATTTGTTTAC GAA GTAAACAAGTCG         TTGATTCTATTCACT  68 7
 CDL62_12925 3378712 .. 3378738 + -12.2  -4.83615   TGTAAAAAGTTTTTC         AACCCCCCGGAC ACT GTCCAGGGGGTA         TTTTTATGAGAAATA 100 74
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 CDL62_12935 3384924 .. 3384945 + -13.1  -4.95484   TATGTCAATTAGAAA           TGGCTATCC GTTC GGATAGCCA            TTTTGTTTCCTGATC 100 53
 CDL62_12940 3387952 .. 3387971 +  -3.6  -3.64487   TCTAGGATCGTTGAT            GGATAC ATACATGA GTATCC             TTATTGACCATGTCC  52 71
 CDL62_12945 3389234 .. 3389259 + -13.5  -6.09196   ATTTATAAAATTAAA         CCACTAATGTA GCTT TACATTAGTGG          TTTTTTTGTTTTGGA 100 83
 CDL62_12950 3390845 .. 3390880 +  -5.4  -3.98378   TTGTTTCTAATAAAA    TGGGGCACAAACCCGGT TTA AGCGAGTTGGT-CCCCA    TTCTTATTCAATCTG  64 56
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 CDL62_12960 3393413 .. 3393427 +  -4.2  -3.75629   AATTAGTGTTGCAAT               GGAGGA GTT TCATCC               TTTACCTTAAAGATC  53 1
 CDL62_12965 3393918 .. 3393928 +  -6.8  -2.80821   TTGTTTTTTGAAAAG                 TGGG TGT CCCA                 TGGTATCTTTAGAGC  61 56
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 CDL62_12975 3395999 .. 3396020 +  -3.7  -3.62597   CACAAAATACATTCC           GGCTTCAAA AGTT TTTGGGGTC            TTATTAACCCGTGGC  54 366
        thiS NONE
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 CDL62_13030 3405015 .. 3405025 +  -2.6   -2.6583   TCCGTTGACTTCGTT                 TTTA TCG TAAA                 TCAATTTGACATGTC  40 16
        thiH 3406131 .. 3406147 +  -3.7  -3.86822   TGGAAGGACTGGTCG              CTCTATT TGC AAGAGAG              TTTGTAAACCAATTA  54 2
 CDL62_13040 3406782 .. 3406797 +    -4  -3.77008   AAACCAAGACGATTA              TAGGTT ATGT GACCTA               CTTTTTTGCTTACTA  56 278
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 CDL62_13060 3408360 .. 3408379 +    -3  -3.86346   ATCCTTTTTCCACCT            TAATA-GGA GCA TCCATATTA            TTTGTGAAAACCTGA  53 44
 CDL62_13085 3412400 .. 3412439 +  -9.4  -4.90002   GGGTTCTTGCCGGGT  GAATTGGCCCGTTTCATA ATTT TATGAAACGGGTTTCTTC   TTTTGTTGTATATTG 100 66
 CDL62_13090 3413533 .. 3413547 +  -5.6  -2.71712   TAGGAATAAAAATAG               GTGCCA TGA TGGCCC               ATTTGGCCGAAGCAC  51 369
 CDL62_13105 3416978 .. 3416997 +  -6.5  -2.80975   ATAAAGGACCTGCAA            CTCTTTC CGTCCT GAAAGAG             ATTTAAATGCTAAAT  58 141
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 CDL62_13115 3420284 .. 3420327 + -24.4  -4.66833   GATTAACACAATATA TACATAAAAAAAAGTGCCGT TACA ACGGCACTTTTTTTTATGTA TTTTTACCATTCCCA 100 35
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 CDL62_13145 3426908 .. 3426918 +  -5.4  -3.75437   TTAAGATACATGACT                 TCTG CTT CAGA                 TTTCATGCCCTGATT  60 416
 CDL62_13160 3429870 .. 3429885 +  -6.8  -5.40072   AATTATTACTAGAAG              GGTGGC GAAA GTCACC               TTTTTTTGGAAGAGC  93 54
 CDL62_13165 3433567 .. 3433607 + -11.3  -4.10179   ACCATTTCCTTTAAT  TCAGTTGCGAAATTCTCCT TAG AAGAGTGTTTTGCAACTGA  TTTATATAGCTTATA 100 52
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 CDL62_13175 3437848 .. 3437858 +  -2.6    -3.922   ACGAAGTCTGAATTA                 TTTT AAC AAAA                 TTTAATTCAGAATTT  51 293
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 CDL62_13200 3449379 .. 3449428 + -13.2   -2.9789   ATTTTATATTAACAT AAAAACAAAGAGACG-CCATACA TCATT TGTATGGACGTCTCTTCGTTTTA CTTATTTGCAGTTGT 100 41
 CDL62_13220 3455668 .. 3455679 +  -2.2  -4.13973   TTATGAATAAGATAT                TCCT GTAA AGGG                 TTATTTCTAATATCT  52 51
        trxB 3456826 .. 3456854 + -10.4  -5.28778   TGACAATCATCTAAA        CCACAGATATAC TTCAT GTATTTCTGTGG        TTTTTTATAGGTAAT 100 47
 CDL62_13230 3458031 .. 3458055 + -11.5  -5.07486   AAAATACCATGCTAT          GCTTCCGGT AAAATGA ACCGGAAGC          TTTTTGTTCACGATG  95 142
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 CDL62_13275 3465186 .. 3465198 +  -3.3  -5.33921   TTTTAGGAAATTACT                TGCAG CGA CGGCA                TTTTTTGCTTACTTT  76 216
 CDL62_13280 3466623 .. 3466635 +  -3.3   -3.1247   GGTGTGTTTGGTGGT                TCCCC CCT GAGGA                TTAGGTGTGAGAGAT  46 52
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        serB 3489521 .. 3489534 +  -2.3  -2.70932   CTGTTGCTGTTTCCA               TCGAC GAGT GACGA                TAATTGAAAGGCGAA  40 216
 CDL62_13375 3494191 .. 3494216 + -16.2  -3.50869   ACTGTCAAAAAAAGA         GGCTGTCCCG TGATTT CGGGACAGCC          TTCTGTAAAATGATA 100 70
 CDL62_13400 3502597 .. 3502643 + -15.7  -4.44667   CAGATTCGCGTCTGG TTTGA-TTAATTGATGAAATGC TAAA GCATTTCATCAATTAAATCAAG TTTCTTATTCAACAA 100 44
 CDL62_13410 3505974 .. 3505988 +  -2.8  -4.14013   CATCAAACAGTTTGT               CAATAC TCT GTATGG               TTTTGCCGGCTTTTC  57 517
 CDL62_13420 3511499 .. 3511511 +  -3.5  -2.56164   AATGACCAGTGAAAG                TTTAA AGT TTAAA                GTTGATAGTTGGGAG  44 52
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 CDL62_13430 3514464 .. 3514486 +  -5.6  -3.38812   GCAGCAGCAACCGTT           TTAGAATTGG TTA CCGCTTCTAA           TATTCTTCCACAACA  58 3
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 CDL62_13445 3517563 .. 3517584 +  -6.7  -4.19238   GTATGACAGCGCAAG           CAACAGACAA ATG TTG-CTGTTG           TTTTCAGCTTCCAGA  73 425
 CDL62_13475 3524458 .. 3524475 + -11.3  -4.78149   AGAAATAAAAAAAAA             GCTGTCG TTTC CGACAGC              TTTTTCGATTATGCG 100 73
 CDL62_13485 3528658 .. 3528698 + -22.9  -4.41206   AAGTCTTTAAGTTAA  GAAACATACGGCAGGGA TTTTTTT TCCCTGCCGTATGTTTC  TTTTATGGCCTGCTT 100 164
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 CDL62_13495 3530086 .. 3530114 +   -12   -5.5353   TAAAGAATTTTAAAA        GATAAAAGAAAC TTATT GTTTCTTTTATC        TTTTTTGTTCATATA 100 59
 CDL62_13500 3531582 .. 3531596 +  -4.2  -2.79952   ATTTTAAATATTTGT               TCCGTG CAA CACTGA               TGGTTACATTGATGT  47 72
 CDL62_13505 3532540 .. 3532571 +    -9  -2.78463   GAAATTTAATACTTT      CTTTATATCTTTGT TTTA ACAAAGATATAAAC       TATGCTAAGGCAACT  72 76
        recN 3534303 .. 3534319 +  -5.2  -4.99043   ATAGTCTTAATAAAG              CCAAAA AAAAG TTTTGG              TTTTATTTCTGAGCA  76 100
 CDL62_13515 3535325 .. 3535358 + -13.5  -2.94218   TCTTTTGATATACAG     TAT-AAAAGCCTCCTT TTT AAGGAGGCTTTTTATA     TGTATCCTACAAGCT 100 130
 CDL62_13520 NONE
 CDL62_13525 3537762 .. 3537796 +  -8.1  -4.90266   GTTGATGATTTTTAA    GACCTATAATACTCCT AGTT ACGAGT-TTATAGGTC     TTTTTAATTCATCGG  90 57
 CDL62_13535 NONE
        nifJ 3544278 .. 3544297 + -11.4  -5.63504   GCGATAGAATTAAAA            GCTGCCTC CTAC GGGGCAGC             TTTTTTTGTAACATT 100 50
 CDL62_13550 3546862 .. 3546877 +    -4  -3.52813   GGCATCTTTTCAAGT              TCGTCT TTCA AGATGA               TGTCTTTTGTCGTTT  52 308
        galE NONE
        rfbB 3551250 .. 3551277 +   -13  -3.76402   AGTGCTATCAAGCTT        GTTTGAACAAAT CCTG ATTTGTTCAAAC         TTTCATCAATAAAAT 100 94
 CDL62_13575 3551791 .. 3551804 +  -2.3  -5.28755   TTTGTCCGTAACACT               CCAGG ACAA CCTCG                TTTTTTAATATCTTT  68 149
 CDL62_13595 NONE
 CDL62_13600 3560275 .. 3560291 +  -2.3  -3.12892   TATCCACCTATAAGT              GCAAT GATGCAA ATTGC              TGTTAGAATCTTTTT  43 406
 CDL62_13615 3564573 .. 3564594 +  -2.3  -3.77206   CTCGTTTGATATGGA           TTCTGTAAA TTGA TTTACGGGG            TTTGATGGAATTATA  50 70
 CDL62_13620 3565530 .. 3565550 +  -9.8   -5.8187   ATCTGAACTTTTTTG            CCAGACTA ATATA TAGTCTGG            TTTTTTTATTAAATA 100 54
 CDL62_13625 3566495 .. 3566515 +  -7.5  -4.92812   GTTAATTTATATGAA            GAGTCTGCT ATT GGCGGGCTC            TTTGTTTTATTCTAA  87 225
 CDL62_13630 3567634 .. 3567647 +  -4.5  -2.62371   TTATAAATGAAAGTA               TGGCC ATCA GGTCA                GTTGATTAACTAAAT  48 212
 CDL62_13635 NONE
 CDL62_13640 3571821 .. 3571838 + -11.3  -3.02434   CAATTGCCACAACTC             GTCCCGA CACC TCGGGAC              TCGTTTCATTCAAAT  87 84
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 CDL62_13650 3576447 .. 3576490 + -19.2  -5.24531   AATGAATAATGAAAA TATCGCTCAACATCTTTATC GAAA GATAACGATGTTGAGCGATG TTTTTTATCCAACCT 100 66
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 CDL62_14745 3872586 .. 3872607 +  -8.1  -3.85698   TATATAAAATATTGG           GGTTTACGT GTTT ATGTAAACC            TTTCTACCCCGCACC  77 62
 CDL62_14755 3873899 .. 3873927 +  -4.7  -4.59773   AGAATAGTTAAAAAC        TTCGATGATTTGA TTT TTAAAGCATTGAA        TTTTTCGGAATCCGA  69 378
 CDL62_14765 NONE
 CDL62_14770 3878769 .. 3878782 +  -6.7  -4.02021   CGTTGTGTGCAGTGC               GACCT GCAA AGGTC                TTTAATTGATTGATT  71 300
        ltrA 3880998 .. 3881025 +  -2.1  -3.61715   TTAGAAATGCCCGAG       CTGCG--TGATGG GAAA CTATCATGCGCAG        TTCTTAGGGGGCGTA  47 18
 CDL62_14780 3881613 .. 3881624 +    -3  -3.39668   ACAGACTATAGACTC                GTTA TCTG TAAC                 TTGTAGAGTTTAAAA  48 111
 CDL62_14785 3882400 .. 3882413 +  -6.7  -4.02021   CGTTGTATGCAGTGC               GACCT GCAA AGGTC                TTTAATTGATTGATT  71 146
        ltrA 3884629 .. 3884656 +  -2.1  -3.61715   TTAGAAATGCCCGAG       CTGCG--TGATGG GAAA CTATCATGCGCAG        TTCTTAGGGGGCGTA  47 18
 CDL62_14795 3888670 .. 3888687 +  -4.1  -2.60714   GTGCTAAAATCAAAG             GTTGTAG CCCG CTTCAAC              ATTGTAACGATTTGA  46 272
 CDL62_14800 3890814 .. 3890824 +  -2.6  -2.82742   GATTATTACAACTAA                 TTAA CTA TTAA                 TGATTATGAAACAAT  42 26
 CDL62_14805 3891925 .. 3891938 +  -8.1  -3.53343   CGTTTTCTCATCGGA               GAGGG AAAG CCCTC                TTTCAGAAAGGAATT  68 401
 CDL62_14830 3895706 .. 3895718 +  -6.3  -2.59068   TTAAAAATCAAATCA                TCGAA TTT TTCGA                CTATTCTCAGTTTTA  56 103
 CDL62_14860 3903250 .. 3903261 +  -2.2  -3.05596   CAACTACTTTTGATA                CGAGC TGT GC-CG                TTCGATAACGCACTG  42 270
 CDL62_14870 3905491 .. 3905501 +  -4.6  -3.30124   CAGTGGCTTTTTTGC                 GGGC TGC GTCC                 TTGTCCGCCGTCACA  52 234
 CDL62_14875 3906792 .. 3906803 +    -3  -3.70331   CCCAAAATCATCCAG                GATT AGTA AATC                 TGTTTTAACTAACTT  50 270
 CDL62_14890 3909632 .. 3909652 +  -4.7  -2.78018   TGACTTGCATTGGAA            TCTTCTCTG TTG CAGGGAAAA            TCATTCGTAAAAAGT  48 337
 CDL62_15015 3944231 .. 3944243 +  -6.3  -2.59068   TTAAAAATCAAATCA                TCGAA TTT TTCGA                CTATTCTCAGTTTTA  56 103
 CDL62_15030 3947332 .. 3947343 +    -3  -4.27742   TTTTGATAATTAATT                TCAA TGTG TTGA                 TTATTTGCTTTTTCT  57 392
 CDL62_15125 3973355 .. 3973365 +  -5.4  -3.92641   CAGACACACTCTTTG                 CCAA GTT TTGG                 TTTGTGGGTCGGCTT  61 402
 CDL62_15140 3978974 .. 3978991 +  -4.1   -4.1552   TTGCTTTTTGGGAGT             GAATTGC TTTA GCAATCC              TTTATTCAGAAACTG  61 476
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 CDL62_15195 3995666 .. 3995676 +  -4.6  -3.31322   CCAGTGGCTTTTTGC                 GGGC TGC GTCC                 TTGTCCGCCGTTACA  52 233
 CDL62_15205 3997059 .. 3997075 +  -3.7  -4.86731   AAAGTCAATATGGAT              TTTTCTC GAG GAGATAA              TTTTGTTTCAACACC  71 505
 CDL62_15410 4047323 .. 4047335 +  -2.7  -2.81471   AAGTTCTGTTTTATA                GGAAT CAA ATTTC                TCTAATGACCTTGTA  42 350
 CDL62_15590 4090993 .. 4091004 +  -5.8  -2.55545   CGAATTCTTCTTTCA                CAGG AGTA CCTG                 GTATATTGTTAAACG  50 236
 CDL62_15600 4091958 .. 4091968 +  -4.6  -3.31322   CAGTGGCTTTTTTGC                 GGGC TGC GTCC                 TTGTCCGCCGTTACA  52 82
 CDL62_15620 4094104 .. 4094116 +  -6.3  -2.59068   TTAAAAATCAAATCA                TCGAA TTT TTCGA                CTATTCTCAGTTTTA  56 103
 CDL62_15660 4101944 .. 4101956 +  -6.3  -2.59068   TTAAAAATCAAATCA                TCGAA TTT TTCGA                CTATTCTCAGTTTTA  56 103
 CDL62_15695 4113228 .. 4113242 +  -3.6  -3.82656   ATAATATCTTGCAAT               TTATTC TTT GAGTAA               TCTTTATATTTTGAC  54 413
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 CDL62_15750 4123299 .. 4123309 +    -4  -3.97051   AATCACAAGACTTAT                 TTGA ACA TCAA                 TTATTTAGGGTGTTT  58 248
 CDL62_15795 4133280 .. 4133292 +  -2.7  -2.81471   AAGTTCTGTTTTATA                GGAAT CAA ATTTC                TCTAATGACCTTGTA  42 196
 CDL62_15810 4134904 .. 4134916 +  -6.3  -2.59068   TTAAAAATCAAATCA                TCGAA TTT TTCGA                CTATTCTCAGTTTTA  56 103
 CDL62_15825 4140651 .. 4140668 +  -8.4  -3.54424   CCCCAAGACTTTAAG             CCTCCC ACTTGG GGGAGG              TTTGGAGGGGTGAAA  73 144
 CDL62_15830 4141616 .. 4141640 +  -4.3  -4.58085   CACATTTCTTCGCAA          TCCAATATTCA TAC TGAATACTGGC          TTTATTTCTCCCTGT  69 259
 CDL62_15870 4153625 .. 4153659 + -14.4   -5.9873   GTTCTATATAAAAAA     TCGCAACTCTTTGCAT ATG ATGCTTAGAGTTGCGA     TTTTTTTTGTGATAA 100 48
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 CDL62_15920 4168319 .. 4168329 +  -2.4  -3.63627   TAGCCAATTGCTCTT                 ACGG TCT CCGG                 TTTCCGCTCTCCAGC  48 81
 CDL62_15965 4178016 .. 4178026 +  -3.2  -3.28712   TAGCGATTCCAGCGT                 TCTC ACC GAGG                 TTGTGCCAACGGCAA  48 391
 CDL62_15975 4179969 .. 4179981 +  -4.1  -3.96932   GTGCAACCATGGTTA                TACTG TAA CGGTA                TTTCTGGGTATATAT  58 18
 CDL62_15985 4182686 .. 4182710 +  -2.1  -4.17089   GAATTCCTTTTGCGG          GGTAGTGAAAT TGC ATTTTTCTCCC          TTTTACAGGTTTGGC  56 512
 CDL62_15995 4184852 .. 4184862 +    -4  -3.07013   TATGGCCTCTCCAGA                 TTTG GAG CAAA                 TATATTGCCCCCATA  47 396
 CDL62_16015 4191265 .. 4191278 +  -3.9  -3.91911   TCTCTCATTCCGTTT               GAAAT GCAG ATTTC                TTTGATTACAGTAAC  56 45
 CDL62_16020 4192126 .. 4192141 +  -4.6   -3.2916   GTAATTTATGAACAT              GCATCC AAAT GGTTGC               TGTTAAATTTTTAAA  52 137
 CDL62_16025 4194545 .. 4194566 +  -5.9  -2.57136   CAGAGTAAAAGTTGA           TCAATCAGT TATC ACTGCTTGA            ATTGGTCATTAATAA  54 26
 CDL62_16030 4195781 .. 4195801 +  -6.9  -2.91681   GACTTGACACTAGAC            CTGATATCT CAG AGAAATCAG            TATCTAAAATTAAAC  61 172
 CDL62_16040 4198618 .. 4198635 +  -3.5  -3.87815   GTTTATAGATTTAAA             TAATTCT AAAG AGAGTTA              TTTGTGCGCATACAA  54 118
 CDL62_16045 4209134 .. 4209159 + -14.9  -3.09759   AAGATAGTAACCCAA         TTGCAACAGGT TTAA ACCTGTTGCAA          TTAAGTCCCTATATT 100 46
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        rnpB NONE
 CDL62_16070 4214745 .. 4214762 +  -9.9  -5.60993   TATAAAACAAAAAAA             GCAGCAT ATTT ATGCTGC              TTTTTTTATGGGGCC 100 60
 CDL62_16090 4219150 .. 4219164 +  -2.8  -2.89602   TGTATCAGGGATTGT               CCTTCT TTG ACAAGG               CTTTCCTCTGAAACG  42 63
 CDL62_16105 4222052 .. 4222081 + -14.5  -4.90778   ATATAGAACAAATTG       CAGGTTAAACCTT TTTT GAGGTTTAACCTG        TTTTATTTAAATCGA 100 60
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 CDL62_16115 4224485 .. 4224514 +  -4.3  -4.36063   CTATGCAACCTACAT       TTTAAGATGAGCT AAGC AGCCCATCTTCAG        TTTTGGTGGTGTTAT  65 168
 CDL62_16120 4226788 .. 4226814 +   -16  -4.33417   TAGGTCAATATGAAG         GAGTGATGCCGA TTT TCGGCATCATTC         TTTATTCTGAATAAA 100 49
         icd 4237763 .. 4237791 + -15.4  -3.32963   TCAATAAATATTAAT       G-CCACCAGCCTC ATTT GAGGCTGGTGGAC        TTATAACATCAAGCT 100 34
 CDL62_16175 4240185 .. 4240206 +  -6.7  -2.93995   ATTTTCAATTTGTTT           GTTTACTAA CAGA TTGGTAAAC            CTTTCCTGATTTCTG  61 110
        ilvD 4242131 .. 4242163 +    -2  -2.90011   TGACAAAAATAGCTA      CAGCACTATCAGTC AGCCG GAATAATATTGCTG      ATTATTGCCTTTTTA  41 175
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 CDL62_16235 4256618 .. 4256630 +  -4.9  -3.36175   ACATAGCTGATTGGT                TACAA GCC TTGTA                TTATCCATCAGCGTT  54 151
 CDL62_16250 4260121 .. 4260156 + -11.4   -5.3104   AATGCTTAAGTAATA    CACCATTTACAAAGGA GCAA TCTTTTATAAATGGTG     TTTTGTTTTTCATAC 100 124
 CDL62_16275 4264588 .. 4264602 +   -10  -3.66874   ATTTCCGGTCTTTGG               TTCCGC TGT GCGGAA               TTTCGCTACACTTCA  86 114
 CDL62_16295 4268933 .. 4268950 +  -3.5  -2.64062   GGAATTATTTAATTT             TGAAAAT GAAC ATTTTCG              CTTACTGTTGATGTC  44 66
 CDL62_16300 4269994 .. 4270032 +   -25  -3.83502   AAAAACAGGTATAAA   CAATTGAGCGAAATTGGT TAT ACCAATTTCGCTCAATTG   TTTAATATCCGAATA 100 27
 CDL62_16335 4277991 .. 4278003 +  -4.9  -5.25893   TCTCTGTTTAAAAAA                TGATT TAA AATCA                TTTTTTACTCTATGT  79 23
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 CDL62_16390 4288140 .. 4288150 +    -4  -3.80174   GGCATATGGTTTTAT                 CATT GTC AATG                 TTATTCTGCCCGTGT  57 421
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 CDL62_16410 4290572 .. 4290591 +  -2.2  -3.61182   TCAATAATTGTGCGT            CAATAATA AAAA TATTATAG             TATGTTTTTAATTAG  47 41
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 CDL62_16435 4295845 .. 4295871 + -10.4  -6.09133   ACTGGAAAAAAGAAA         GAATAATTTGTA GCT TGCAAATTATTC         TTTTTTTTTCACATG 100 123
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 CDL62_16470 4309944 .. 4309972 + -16.9  -4.48221   CTCTAGTAAACTAAA        TACCCTGCCAAGA GCT TTTTGGCAGGGTA        TTTTATCCCTTAATA 100 63
 CDL62_16475 4310860 .. 4310883 +  -8.2  -5.66868   TAAGAGTAAAAAAAA          GAGAGCAACT ATTT AATTGCTCTC           TTTTTTTAATTCATT 100 45
 CDL62_16485 4314476 .. 4314493 +  -7.7  -2.90813   TGGGCGACTGATTTA             CTGTGCC TAAT GGTACAG              TCCTTTCGAGACATG  66 183
 CDL62_16490 4316752 .. 4316781 +  -5.8  -3.67792   CATTGAGGCATTTGT       CC-GCTACGAGTT TTTAT AACTCGTAGAAGG       TTTGCATGACTCTGA  62 7
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        pyrB 4319416 .. 4319431 +  -3.2  -3.14132   TGAGTAAGCATAGCT              CTTGAG GCTA CTCTAG               TTGATGCGAAAGGAG  45 116
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 CDL62_16520 4321899 .. 4321923 + -14.5   -3.3581   GCCTCAGTAATGATT          CCTTTAAAACG TAA CGTTTTAAAGG          CTTTTTCAACATCGT 100 365
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 CDL62_16535 4327711 .. 4327721 +    -4   -5.4588   GAAAAAATGGCATGA                 TCAT TGA ATGA                 TTTTTTATAATTTTA  77 26
 CDL62_16540 4328511 .. 4328533 + -16.4  -5.70829   TTAAGCACAAAAAAA           GAGGACATCC AAT GGATGTCCTC           TTTTTTTGTGCTGTT 100 52
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 CDL62_16555 4335208 .. 4335238 + -18.6  -2.99947   CTTTACAAGAGTAGA       TTAAAATACCGGGT AAT ACCCGGTATTTTAA       TATATATGCAAATTA 100 27
 CDL62_16580 4342046 .. 4342058 +  -7.7  -3.75153   GTTGGATCGATAAAA                TTGGC GGT GCCAA                TTTGGATTGCAGAAG  70 148
 CDL62_16625 4352459 .. 4352482 +  -7.6  -3.09834   TTTAATGTCTAAATG          GGATTTAATGG CTG CCAT-AAATCC          TTCGGTGGTCAGATA  63 155
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 CDL62_15585 4089148 .. 4089158 -    -4  -2.73799   TCTATAAATAAGGGA                 TTTG CTT CAAA                 AAAATGGACTGCCCC  46 196
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 CDL62_15570 4084826 .. 4084843 -  -3.5   -2.8733   CGGGGCAGAAAACAT             GATTTAA TCGC TTAAACC              CCAATGTTTGATACA  45 56
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        ltrA 3912021 .. 3912031 -    -4  -3.09987   TCAATACTCACCGAA                 CAAA ACT TTTG                 ACGGTATTCAAAATT  48 310
 CDL62_14900 3911239 .. 3911251 -  -4.1   -4.4874   TTCAAAAATCTAAAA                CGCTT TCA AAACG                CACGGAACTCGTTAT  62 481
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 CDL62_14885 3907286 .. 3907296 -  -2.6  -2.82742   ATTGTTTCATAATCA                 TTAA TAG TTAA                 TTAGTTGTAATAATC  42 26
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 CDL62_14840 3896675 .. 3896686 -  -4.4   -4.0896   AAAGTTTGCGCAAAA                GCTA ATTT TAGC                 TCTATTTTATTCTGA  60 67
 CDL62_14835 3895682 .. 3895710 -  -4.7  -4.59773   TCGGATTCCGAAAAA        TTCAATGCTTTAA AAA TCAAATCATCGAA        TTTTTCGACTATTCT  69 273
 CDL62_14825 3894989 .. 3895003 -    -5  -3.85165   CATTTTAAACCGAAA               TCACTG GCA CAATGA               AACCGAAATCGGTGG  60 0
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 CDL62_14815 3893476 .. 3893489 -  -6.7  -4.02021   AATCAATCAATTAAA               GACCT TTGC AGGTC                GCACTTTGCCTAACG  71 177
        ltrA 3891307 .. 3891318 -    -3  -3.70331   AAGTTAGTTAAAACA                GATT TACT AATC                 CTGGATGATTTTGGG  50 314
 CDL62_14760 3873764 .. 3873774 -  -4.6  -3.31322   TGTAACGGCGGACAA                 GGAC GCA GCCC                 GCAAAAAGCCACTGG  52 233
 CDL62_14750 3872769 .. 3872781 -  -6.3  -2.59068   TAAAATTGAGAATAG                TCGAA AAC TTCGA                TGATTTGATTTTTAA  56 105
 CDL62_14700 3861543 .. 3861555 -  -4.9  -2.85503   GGTGAATATTTAAAG                TCAAT TGG ATTGA                ATGACAGACAAGTAA  50 202
 CDL62_14675 3855272 .. 3855299 -  -2.1  -3.61715   TACGCCCCCTAAGAA       CTGCGCATGATAG TTTC CCATCA--CGCAG        CTCGGGCATTTCTAA  47 18
 CDL62_14670 3853928 .. 3853938 -  -5.4  -3.97042   TTATTACCAATCAAA                 TGTC TTG GACA                 GCAAATACGATTAGC  65 411
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 CDL62_14640 3846740 .. 3846753 -  -6.7  -4.02021   AATCAATCAATTAAA               GACCT TTGC AGGTC                GCACTGTGCACAACG  71 172
        ltrA 3844497 .. 3844524 -  -2.1  -3.61715   TACGCCCCCTAAGAA       CTGCGCATGATAG TTTC CCATCA--CGCAG        CTCGGGCATTTCTAA  47 18
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 CDL62_14615 3840434 .. 3840445 -    -3  -3.25014   AATTAATCAATCTAA                CTTA TCCA TAAG                 CTCTTTTTACTATAG  46 10
 CDL62_14610 3839752 .. 3839774 -  -2.7  -2.99178   TGAAGAATATAATGA          CCATTGCAGA AAAA TCTGCT-TGG           AAAAGGAAGGTAACT  43 49
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 CDL62_14495 3817502 .. 3817514 -  -6.3  -3.03038   TATATCCAAATGATA                TACGA TCT TCGTA                TTGTTTGTAAAAAGT  59 215
 CDL62_14490 3817127 .. 3817157 - -15.7  -3.96542   CCAAATAAACGCAAA       GAGCACAAAGATT CATTT AATCTTTGTGCTC       TTTTATATTAGATTG 100 11
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 CDL62_14455 3804532 .. 3804567 - -11.4  -4.34402   GTGTGTAGAGTAAAA    CAAGATAAGGTAAGTT ATAT AACTTACCTTACTTTG     AAATCCCGCAAAGGA 100 70
 CDL62_14450 3803464 .. 3803485 - -13.1  -5.27206   CAGAGATAATAAAAA           GGCTGAAAC TTGT GTTTCAGCC            TTTTTAATGATTTCC 100 44
 CDL62_14420 3796698 .. 3796720 -  -7.7  -3.37879   AGTAATTGGAATCAA           CCTCCGTGC ATAAA ACACGGAAG           TTGAAAGAGTTTAAT  71 36
 CDL62_14415 3794737 .. 3794764 -  -8.6   -3.4759   ATTTATTACAACGAA        TTAAGGTATAAC AATT GTTATGCCTTAA         TTTATTTTGTTGTAC  76 100
 CDL62_14410 3793586 .. 3793610 -  -3.7  -4.11371   TAAGATTTTTGAAAA         TAAGCCT-GA TATGCT TCAAGGCTTA          AGTAAAGTTACCAAA  59 439
 CDL62_14400 3792777 .. 3792790 -  -2.4  -4.60041   ATTTACGCCTAAAAA               CACA CGACAC TGTG                TCAATAGCATTTCAA  61 80
 CDL62_14390 3790988 .. 3790998 -  -6.8  -5.00616   TGGTTTTTCAAAAAA                 GCAC GTG GTGC                 TTTTTTGTACAGCTT  85 68
 CDL62_14385 3789912 .. 3789922 -  -2.6  -2.57344   GAGGTTCGTTACAAC                 TTAA TAA TTAA                 TGCTACAGCAAGATT  40 40
 CDL62_14380 3788108 .. 3788137 - -10.8  -5.54338   CAACTAAAATAAAAA       TGGAGTTGTCGG TTAATT CGGACAACTCCA        TTTTTTATAACTAAT 100 52
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 CDL62_14290 3768218 .. 3768262 - -18.9  -3.73775   CGCATTGTTATTAAA GCACAAAGCAGACAAACTCAC GAC ATGAGTTTGTCTGCTTTGTAG TTTAGCCGGATTTCC 100 40
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 CDL62_14220 3754247 .. 3754293 -  -9.1  -5.34555   GTAGATTATAAAAAA CATGTATCAAGCAGGATTAATT CAAG AATTAATCCTGCTTGATT-ATT TTATATCACTCCCAG 100 31
 CDL62_14200 3745442 .. 3745452 -    -4  -4.13748   TTTAAAAATATGAAA                 TAGT TAT ACTA                 TACAAAGACGTAATA  58 143
 CDL62_14195 3744279 .. 3744296 -    -7  -3.66356   ATTCTGAACCTGAAA             CAGCAG ATGTTG CTGCTG              ATCCGGTGGTTGCTT  66 232
 CDL62_14180 3739969 .. 3739996 - -14.4  -6.14618   TATAAAACAAAAAAA        GTCTTTGGTTTT TTTA AAAACCAAAGAC         TTTAAGTTAATATGA 100 60
 CDL62_14175 3738221 .. 3738234 -  -5.3  -3.76224   TTTTTATCTAGTAAA               GCAAT CTTA ATTGC                TTATTTATTCCTGAA  59 30
 CDL62_14170 3737282 .. 3737302 - -14.1  -5.16237   AATTGGATTAAAAAA            GGCTTTCGA ATT TCGAAAGCC            TTTTTTATTATTATC 100 36
 CDL62_14155 3733227 .. 3733243 -  -9.5  -2.95966   AAAATCAAAGACAAG              CTCTGAA AGG TTCAGAG              GTCTACTGAGTCGTT  75 20
 CDL62_14140 3729677 .. 3729700 -  -2.6  -3.61398   TTCCGCGCTTAAGAA          TAAATAATACC GGA GG-ATCATTTA          TAGAAACTGACAGCA  48 397
 CDL62_14130 3728367 .. 3728404 - -16.5  -4.79223   TGATATTATGAAAAA   GAATAAGCCTCATAGCC ATGC GGTTATGAGGCTTATCC    TTTTGTTATAAGGGT 100 134
 CDL62_14120 3724832 .. 3724847 -  -4.7    -5.626   CATCTCAGAAAAAAA              TAGGG GCGTAG CCCTA               ATATCTTCATAGAAG  85 236
        ablA 3722722 .. 3722732 -    -4  -2.55429   TTAAGACAATAAACT                 GTTA ATC TAAC                 TCTGCTCGCCATCCT  45 21
        ablB 3721805 .. 3721823 -  -9.6  -4.81249   TTTTAAATTGAAAAA             GCTCTGAA TGA CTCAGAGC             TTTCTTAAAGATACT 100 43
 CDL62_14105 3719869 .. 3719891 -  -4.9  -3.75332   ATGCGCTAATTGAAA           TTCTTCAGA ATGTA TCTGAAGCA           GTCATGGATGTTCGT  58 482
 CDL62_14085 3710462 .. 3710499 - -15.9  -3.54022   AAAGGGGTATAAATA   TAAAAGAGGCTACCAAA CGAT TTTGGCAACCTCTTTTA    ACCTTAACCCTAACC 100 97
 CDL62_14080 3709543 .. 3709589 -   -11  -4.98436   GTAACATGATAAAAA TAACAACATGCAAGAAGTGCTT GTA AAGCACTTCTTGAGTGATGTAA CAGGCATTTCTTTTT 100 194
 CDL62_14070 3707786 .. 3707802 -  -2.3  -3.66908   CGCTCCCAAAATCAA              TACATCA AAA TGATTTA              TATAAAAAAATGCCG  47 151
 CDL62_14065 3705959 .. 3705969 -  -2.6  -2.82742   ATTGTTTCATAATCA                 TTAA TAG TTAA                 TTAGTTGTAATAATC  42 26
 CDL62_14060 3705206 .. 3705216 -  -5.4  -2.71712   TCCTTTTTGTTAAAG                 GTTC AAA GAAC                 GTGATGGACTGACAA  52 43
 CDL62_14055 3704109 .. 3704119 -  -5.4  -5.33921   AAACGAATTAAAAAA                 TGAC TAC GTCA                 AATTTCGTTTAGCGT  84 121
 CDL62_13975 3692288 .. 3692298 -  -5.4    -2.974   CCAAGAGGGAAAGGA                 CCTA AAT TAGG                 GCTGTTAATATTGAG  53 361
 CDL62_13930 3685569 .. 3685579 -  -3.2  -3.25604   TCATTGAATGAAAAT                 GTAG ATC CCAC                 CGTCCGTGAAGATTT  46 252
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 CDL62_13895 3680078 .. 3680090 -  -6.2   -4.4634   AACTGGAAGAAGAAA                CCGG CCTTT CCGG                TGTAAAGGTTAAGCA  74 226
 CDL62_13880 3676195 .. 3676219 -  -4.4  -5.56264   TTTAAATATAAAAAA          TCCTCTTT TTTTTAACG AAAGAGGA          TTTTTTTGTAGTCTG  83 276
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 CDL62_13840 3662488 .. 3662508 - -14.1  -2.98942   ATGTTTCCACATACA            CACCACGTT GAA AACGTGGTG            TTGCTAGAGAGGAGA 100 46
        queF 3660275 .. 3660309 - -17.4  -3.50572   ATCGATTTTATATAA     GCAACAAAGCACGAAT TAT ATTCGTGCTTTGTTGT     ATTTATATTCAGTGT 100 203
 CDL62_13810 3653403 .. 3653415 -  -7.7  -2.85056   ATGGCGAATTTAAAG                GGCAA CCC TTGCC                TTCTGAAACTTATTC  62 121
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 CDL62_13795 3646244 .. 3646256 -  -2.7  -3.20303   CAGGTAAACAGAAAT                TTACC AAT GATAA                TCAAATTGTGTCTAT  44 145
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 CDL62_13785 3638519 .. 3638532 -  -6.7  -3.34895   GTTATTTGCAACCAA               TGGCT CTGA AGCCA                TTGACCTCCTTTTTG  62 452
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 CDL62_13765 3630002 .. 3630026 -  -2.9  -3.37556   CCGAAAATAATTTAA          TAATTCATTTG CTC CAGATGTATTA          GAGTAACTTGCATAA  48 189
 CDL62_13760 3629355 .. 3629371 -  -6.5   -2.6342   GCCCAAATGAATCGA              CCATCTG TTG CAGAAGG              AAATTGGCTGTGGAG  54 191
 CDL62_13740 3619025 .. 3619035 -  -8.2  -3.23638   TGAAACAGGTAGTAA                 CCGG AAA CCGG                 TATTGATTTATCCCC  71 422
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 CDL62_13715 3605228 .. 3605247 - -10.7  -5.62288   GTAATAAAAGAAAAA            GTCGCCC TATTGG GGGCGAC             TTTTGTTCTTGTATT 100 51
 CDL62_13710 3604016 .. 3604051 -   -18  -5.31519   AGACTTAAACAAAAA    GAGAGTATTCTAAAAT CTTG ATTTTAGAATACTCTC     TTTAACATCTGTGTA 100 59
 CDL62_13680 3589065 .. 3589095 - -14.9  -6.32017   AATAAATAAAAAAAA      CCATCCGG-AAACC TATT GGTTTACCGGATGG       ATCCACGCACACATT 100 70
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 CDL62_13610 3561405 .. 3561419 -  -2.1  -3.61654   TACATCTAGGGTAAA               CCCAT AGAGA ATGGA               TGATAAAACCCCCTA  47 111
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 CDL62_12045 3109341 .. 3109365 - -15.9  -2.95388   GATTTAATGGATATA          CTATTTCTGCC ACA GGCAGAAATAG          TATCTGCTAATTAAT 100 46
 CDL62_12030 3103687 .. 3103714 - -13.6  -3.10244   GGGGTGAAGAAAGTA        CGAATGAGGACA AAGA TGTCCTCATTCA         ATTGTTTTGTTCGTA 100 52
 CDL62_12025 3102303 .. 3102318 -    -9  -2.66812   AAGTTTAGTAGATGA              GTTGCC TCTT GGCAAC               GAAAGAAATAATTGT  72 341
 CDL62_12020 3100645 .. 3100672 - -18.6  -3.34013   GAGTTGTTGAATGAA        TTCCCGCAAGCA ATTT TGCTTGCGGGAA         TTTCTCTAAATTAAT 100 70
 CDL62_12015 3099971 .. 3099986 -  -3.2  -2.87444   TGAGAAACAGAGAAC              CCATCA TTAG TGGTGG               ATTGCATATGATTTT  43 72
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 CDL62_11980 3093284 .. 3093311 - -11.4  -2.60992   AATCTGTTTAAAGAT        TTTTAGTCCCGA TTTA TCGGGACTAACA         TCCTTTTTATCTATA  86 107
        hrpB 3090112 .. 3090122 -  -4.6  -3.28791   AGGTCTTTGTGATAA                 CCGA CAC CCGG                 TGGGGGAGCAGAGCG  52 300
 CDL62_11955 3085483 .. 3085511 - -15.4   -3.5947   AACTTTGATATATAA        CAAAGGCTGCCC GCTAA AGGCAGCCTTTG        TTTTTATGCATTATC 100 29
         fba 3066857 .. 3066879 - -12.8  -5.82036   ATAAGAAACAAAAAA           GGAGTTTCCA TAA CGGAAACTCC           TTTTTATATTTTCTA 100 52
 CDL62_11855 3063467 .. 3063483 -  -3.7  -3.10493   TCTTGAACACATACA              GATCAAG AAA CTTTATC              CATGCGGAGAAGGTG  48 122
 CDL62_11830 3056911 .. 3056923 -    -2  -3.14132   GCTTGTTTTTAGGAA                TTGT TTTTT ACAA                ATGTATAACAGTTGT  42 289
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 CDL62_11815 3053238 .. 3053256 -  -8.8  -3.54424   CCGGAGGTGTTGAAA             GAGGGACG TGA CGTCACTC             TGGTTACTTATGGTT  72 433
        cobO 3050399 .. 3050411 -  -3.4  -2.79492   GGTGGAACCTTAAAT                CTTC TTCTG GAAG                TCTCTGTTTCCTTAA  45 37
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 CDL62_11710 3016335 .. 3016352 -  -8.5  -4.44914   TATTCAACAAAATAA             CAAAACC ACCG GGTTTTG              TGTGTTATACTTTTT  88 60
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 CDL62_11695 3009538 .. 3009574 - -23.3  -2.91912   TCACGGAGTTATACA    CAAAGAGCGCAAAGGCT AAT AACCTTTGCGCTCTTTG    TGTGTTCTTCATGTT 100 95
 CDL62_11690 3006069 .. 3006104 - -13.4  -4.46212   TCTTCCATTACAAAA    TTAAACAGGGTTGTCG TTTA CGACAACCCTGTTTTG     TTACATATTAAAGTT 100 48
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        gldJ 2880028 .. 2880047 - -12.2  -5.68039   AAATGCATAAAAAAA            GGCTGGTT CAAA AACCAGCC             TTTAAATTTCATATA 100 54
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